TW202208395A - 多聚體t細胞調節多肽及其使用方法 - Google Patents

多聚體t細胞調節多肽及其使用方法 Download PDF

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羅納德 西德爾三世
羅多弗 加帕洛
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Abstract

本揭示案提供T細胞調節多聚體多肽,其包含免疫調節多肽且包含抗原決定基呈遞之韋爾姆斯氏瘤(Wilms tumor)肽。T細胞調節多聚體多肽可用於調節T細胞之活性且可用於調節個體之免疫反應。

Description

多聚體T細胞調節多肽及其使用方法
引言
適應性免疫反應涉及存在於T細胞表面上之T細胞受體(T cell receptor,TCR)與抗原呈遞細胞(Antigen Presenting Cells,APC)表面上非共價呈遞之小肽抗原藉由主要組織相容性複合物((Major Histocompatibility Complex)MHC;亦在人類中稱為人類白血球抗原(Human Leukocyte antigen,HLA)複合物)進行的接合。此接合表示免疫系統之靶向機制且為T細胞調節(活化或抑制)及效應物功能之必需分子相互作用。在抗原決定基特異性細胞靶向之後,通過使APC上所見之共刺激蛋白與T細胞上之對應物共刺激蛋白接合來激活經靶向之T細胞。驅動T細胞特異性及活化或抑制需要兩種信號,即抗原決定基/TCR結合及APC共刺激蛋白與T細胞共刺激蛋白之接合。TCR對於給定抗原決定基具有特異性;然而,共刺激蛋白並非抗原決定基特異性的且相反通常在全部T細胞上或大T細胞子集上表現。
本揭示案提供T細胞調節多聚體多肽(T-cell Modulatory Multimeric Polypeptide,TMMP),其包含免疫調節多肽且包含抗原決定基呈遞韋爾姆斯氏瘤(Wilms tumor)肽。T細胞調節多聚體多肽可用於調節T細胞之活性且可用於調節個體中之免疫反應。
aac1:胺基酸簇1
aac2:胺基酸簇2
aac3:胺基酸簇3
aac4:胺基酸簇4
aac5:胺基酸簇5
aac6:胺基酸簇6
KD :親和力常數
k a :締合常數
k d :解離常數
k d /a :締合常數(k a )及解離常數(k d )之比率
圖1A-1F為本揭示案之各種TMMP的示意性描繪。
圖2A-2F為本揭示案之各種經二硫鍵連接之TMMP的示意性描繪。
圖3A-3E提供WT-1多肽之胺基酸序列。圖3A-3E之序列分別列出於SEQ ID NO:399-403中。
圖4A-4E提供本揭示案之TMMP的示範性多肽鏈的胺基酸序列。圖4A-4E之示範性多肽鏈的序列分別列出於SEQ ID NO:405-409中。抗原決定基序列列出如下:圖4D:CMTWNQMNL(SEQ ID NO:266);圖4E:CYTWNQMNL(SEQ ID NO:267)。
圖5A-5H提供免疫球蛋白Fc多肽之胺基酸序列。圖5A-5G之序列分別列出於SEQ ID NO:410-421中。圖5H中描繪之序列列出於SEQ ID NO:487中。
圖6提供來自以下項之β -2微球蛋白(β 2M)前驅物(亦即,包括前導序列)的多重胺基酸序列比對:智人(Homo sapiens)(NP_004039.1;SEQ ID NO:19)、黑猩猩(Pan troglodytes)(NP_001009066.1;SEQ ID NO:19)、恆河獼猴(Macaca mulatta)(NP_001040602.1;SEQ ID NO:20)、歐洲牛(Bos taurus)(NP_776318.1;SEQ ID NO:21)及小家鼠(Mus musculus)(NP_033865.2;SEQ ID NO:22)。胺基酸1-20為信號肽。
圖7A-7C提供對偶基因A*0101(SEQ ID NO:23)、A*1101(SEQ ID NO:24)、A*2402(SEQ ID NO:25)A*3303(SEQ ID NO:26)(圖7A)之全長人類HLA重鏈的胺基酸序列;對偶基因B*0702(SEQ ID NO:27)(圖7B)之全長人類HLA重鏈的胺基酸序列;以及全長人類HLA-C重鏈(SEQ ID NO:28)(圖7C)的胺基酸序列。
圖8提供十一種無前導序列、跨膜結構域及細胞內結構域之成熟I類MHC重鏈胺基酸序列的比對。頂部至底部:SEQ ID NO:41-51。
圖9A-9B提供HLA-A重鏈胺基酸序列(圖9A)及共有序列(圖9B;SEQ ID NO:29)之比對。
圖10A-10B提供HLA-B重鏈胺基酸序列(圖10A;分別為SEQ ID NO:207-213)及共有序列(圖10B;SEQ ID NO:30)之比對。
圖11A-11B提供HLA-C重鏈胺基酸序列(圖11A;分別為SEQ ID NO:214-222)及共有序列(圖11B;SEQ ID NO:31)之比對。
圖12提供HLA-E、HLA-F及HLA-G重鏈(分別為SEQ ID NO:32-34)中各者之共有胺基酸序列。各種胺基酸(Amino Acid,aa)位置係指示為依次編號之「X」殘基;胺基酸84、139及236之位置加雙下劃線。
圖13提供HLA-A(SEQ ID NO:29)、HLA-B(SEQ ID NO:30)、HLA-C(SEQ ID NO:31)、HLA-E(SEQ ID NO:32)、HLA-F(SEQ ID NO:33)及HLA-G(SEQ ID NO:34)之共有胺基酸序列的比對。
圖14A-14J提供本揭示案之經雙二硫鍵連接之TMMP的多肽鏈的胺基酸序列。圖14A-14I之多肽鏈的序列分別列出於SEQ ID NO:422-430中。抗原決定基序列列出如下:圖14B:VLDFAPPGA(SEQ ID NO:259);圖14C:RMFPNAPYL(SEQ ID NO:260);圖14F:VLDFAPPGA(SEQ ID NO:259);圖14G:RMFPNAPYL(SEQ ID NO:260);圖14H:YMFPNAPYL(SEQ ID NO:264);圖14I:YMFPNAPYL(SEQ ID NO:264)及14J(SEQ ID NO:486)。
圖15描繪本揭示案之含有WT1(37-45)抗原決定基的TMMP之表現及穩定性資料。
圖16描繪本揭示案之含有WT1(126-134)抗原決定基的TMMP之表現及穩定性資料。
圖17A-17D提供本揭示案之經雙二硫鍵連接之TMMP的示意性描繪。
圖18A-18C提供本揭示案之經二硫鍵連接之TMMP的構型之實例的示意性描繪。
圖19提供免疫調節多肽於本揭示案之TMMP中的位置之實例的示意性描繪。
圖20A-20R提供本揭示案之TMMP的示範性多肽鏈的胺基酸序列。
圖20A-20R之示範性多肽鏈的序列分別列出於SEQ ID NO:431-448 中。抗原決定基序列列出如下:圖20H:CYTWNQMNL(SEQ ID NO:262);圖20I:CYTWNQMNL(SEQ ID NO:262);圖20J:CYTWNQMNL(SEQ ID NO:262);圖20K:CYTWNQMNL(SEQ ID NO:262);圖20L:CYTWNQMNL(SEQ ID NO:262);圖20M:NYMNLGATL(SEQ ID NO:263);圖20N:NYMNLGATL(SEQ ID NO:263);圖200:NYMNLGATL(SEQ ID NO:263);圖20P:NYMNLGATL(SEQ ID NO:263);圖20Q:NYMNLGATL(SEQ ID NO:263);圖20R:NYMNLGATL(SEQ ID NO:263)。
圖21描繪含有WT1肽抗原決定基及HLA-A*02重鏈之TMMP對抗原特異性CD8+ T細胞擴增之作用。
圖22描繪在10日促發培養後的8日再刺激培養過程中含有WT1肽抗原決定基之TMMP對來自總(Peripheral Blood Mononuclear Cells,外周血單核細胞)PBMC之WT1-特異性CD8+ T細胞之擴增的作用。
圖23描繪由以具有G2C或R12C/G2C構架的含有WT1 37-45之TMMP擴增的WT1-特異性CD8+ T細胞進行之TNF-α 及IFN-γ 產生。
圖24描繪由以具有R12C/G2C構架的含有WT1 126-134之TMMP擴增的WT1-特異性CD8+ T細胞進行之TNF-α 及IFN-γ 產生。
圖25描繪二硫鍵對經IL-2驅動之免疫細胞活化的作用。
圖26描繪與普留淨(proleukine)相比,含有變異體IL-2作為免疫調節多肽之TMMP對CGLL-2增殖的作用。
圖27描繪「1715+2380」TMPP與各種Fc受體之結合。
圖28描繪含有WT1肽抗原決定基235-243(M236Y)及HLA-A*24重鏈之TMMP對抗原特異性CD8+ T細胞擴增之作用。
圖29描繪含有WT1肽抗原決定基239-247(Q240Y)及HLA-A*24重鏈之TMMP對抗原特異性CD8+ T細胞擴增之作用。
圖30描繪具有在位置1或3上經工程化之IL-2多肽、肽抗原決定基 WT1 235-243(M236Y)、HLA-A24重鏈及G2C或R12C/G2C二硫鍵構架的TMMP對CD69表現之誘導。
圖31描繪與普留淨及重組人類IL-2(rhIL-2)相比,TMMP(具有在位置1或3上經工程化之IL-2多肽、肽抗原決定基WT1 239-247(Q240Y)、HLA-A24重鏈及G2C或R12C/G2C二硫鍵構架)對CD69表現之作用。
圖32描繪與普留淨相比,TMMP(具有在位置1或3上經工程化之IL-2多肽、肽抗原決定基WT1 235-243(M236Y)、HLA-A24重鏈及G2C或R12C/G2C二硫鍵構架)對CTLL-2增殖之作用。
圖33描繪與普留淨相比,TMMP(具有在位置1或3上經工程化之IL-2多肽、肽抗原決定基WT1 239-247(Q240Y)、HLA-A24重鏈及G2C或R12C/G2C二硫鍵構架)對CTLL-2增殖之作用。
圖34描繪「3425+3529」TMPP與各種Fc受體之結合。
圖35A-35F提供本揭示案之TMMP的示範性多肽鏈的胺基酸序列,其中該等多肽鏈包含WT-1肽SMTWNQMNL(SEQ ID NO:451)。
圖36A-36F提供本揭示案之TMMP的示範性多肽鏈的胺基酸序列,其中該等多肽鏈包含WT-1肽GCMTWNQMNL(SEQ ID NO:452)。
圖37A-37F提供本揭示案之TMMP的示範性多肽鏈的胺基酸序列,其中該等多肽鏈包含WT-1肽SYTWNQMNL(SEQ ID NO:453)。
圖38A-38E提供本揭示案之TMMP的示範性多肽鏈的胺基酸序列,其中該等多肽鏈包含WT-1肽GCYTWNQMNL(SEQ ID NO:454)。
圖39描繪來自未促發之PBMC的WT137-45特異性CD8+ T細胞之擴增,其中該擴增係由本揭示案之TMMP(「CUE-102/A02 WT137-45 IST」)誘導。
圖40A-40B描繪來自WT137-45肽促發之PBMC的WT137-45特異性CD8+ T細胞之擴增,其中該擴增係由本揭示案之TMMP(「CUE-102/A02 WT137-45 IST」)誘導。
圖41A-41B描繪由本揭示案之TMMP(「CUE-102/A02 WT137-45 IST」)或野生型IL-2誘導的TNF-α 、IL-6及IFN-γ 之產生以及CD69之上調。
圖42A-42B描繪在本揭示案之TMMP(「CUE-102/A02 WT137-45 IST」)存在下,由肽促發之PBMC擴增的WT137-45肽特異性CD8+ T細胞針對肽呈遞之靶細胞的CTL活性。
圖43描繪含有WT1肽抗原決定基WT1 235-243(C235S;M236Y)及HLA-A*24重鏈之TMMP對抗原特異性CD8+ T細胞擴增之作用。
圖44描繪含有WT1肽抗原決定基WT1 239-247(Q240Y)及HLA-A*24重鏈之TMMP對抗原特異性CD8+ T細胞擴增之作用。
圖45描繪在純真HLA-A2(AAD)基因轉殖小鼠中含有WT1肽抗原決定基37-45之TMMP對抗原特異性CD8+ T細胞擴增之作用。
圖46A-46D提供HLA-E重鏈之胺基酸序列。
圖47A-47D提供HLA-G重鏈之胺基酸序列。
交互參照
本申請案主張2020年5月12日提交之美國臨時專利申請案第63/023,834號及2020年6月19日提交之美國臨時專利申請案第63/041,451號之優先權,該等申請案以全文引用方式併入本文。
以文本文件形式提供之序列表以引用方式併入
隨附以文本文件「CUEB-133WO_SeqListing_ST25.txt」提供之序列表創建於2021年5月4日且大小為800 KB。該文本文件之內容以全文引用方式併入本文。
定義
如本文中可互換使用之術語「多核苷酸」及「核酸」係指具有任何長度之核苷酸的聚合物形式,亦即核糖核苷酸或脫氧核糖核苷酸。因此,此術語包括但不限於單鏈、雙鏈或多鏈(Deoxyribonucleic Acid)DNA或(Ribonucleic Acid)RNA、基因組DNA、(complementary DNA)cDNA、DNA-RNA雜合體、或包含嘌呤及嘧啶鹼基或其他天然、化學或生物化學修飾、非天然或衍生化核苷酸鹼基之聚合物。
術語「肽」、「多肽」及「蛋白質」在本文中可互換使用,且係指具有任何長度之胺基酸的聚合物形式,其可包括編碼及非編碼胺基酸、化學或生物化學修飾或衍生化之胺基酸、及具有經修飾肽主鏈之多肽。此外,如本文所用,「多肽」係指包括對天然序列之修飾,諸如缺失、添加及取代(如熟習此項技術者所知,在自然界中通常為保守性的)之蛋白質,只要該蛋白質保持所要活性即可。此等修飾可為故意的,如經由定點突變誘發,或可為偶然的,諸如經由產生蛋白質之宿主之突變或歸因於聚合酶鏈反應(Polymerase Chain Reaction,PCR)擴增或其他重組DNA方法之錯誤。本文對已知多肽中特定殘基或殘基編號之提及應理解為指代野生型多肽中該位置處之胺基酸。就野生型多肽之序列藉由添加或缺失一或多個胺基酸而改變之程度而言,普通熟習此項技術者將理解對特定殘基或殘基編號之提及將相應地改變以便指示經改變之多肽中的相同特定胺基酸,其將理解為位於經改變之位置編號處。例如,若藉由在N端處添加一個胺基酸來改變I類MHC多肽,則對位置84或位置84處之特定殘基之提及應理解為指示在經改變之多肽上的位置85處之胺基酸。同樣,本文對特定位置例如Y84處之特定胺基酸之取代的提及應理解為指示在野生型多肽中位置84處之胺基酸的胺基酸取代。因此,Y84C取代應理解為用Cys殘基取代野生型序列中存在之Tyr殘基。若例如野生型多肽經改變以使來自其野生型胺基酸之位置84處的胺基酸改變為替代胺基酸,則位置84處之胺基酸之取代將理解為指示對替代胺基酸之取代。若在該種情況下,多肽亦因一或多個胺基酸之添加或缺失而改變,則對取代之提及將理解為指示對在經改變之位置編號處的替代氨基酸之取代。對多肽(例如I類MHC多肽)中的「非天然存在之Cys殘基」之提及係指該多肽在相應野生型多肽中 不存在Cys之位置處包含Cys殘基。此可藉由常規蛋白質工程來達成,其中用半胱胺酸取代野生型序列中存在之胺基酸。
多核苷酸或多肽與另一個多核苷酸或多肽具有一定百分比之「序列一致性」意指在比對時在比較兩個序列時鹼基或胺基酸之百分比相同且處於相同相對位置中。序列一致性可以許多不同方式判定。為了判定序列一致性,可使用各種便利方法及在全球資訊網之網址上可獲得之計算機程式(例如BLAST、T-COFFEE、MUSCLE、MAFFT等)來比對序列,該等網址包括ncbi.nlm.nili.gov/BLAST、ebi.ac.uk/Tools/msa/tcoffee/、ebi.ac.uk/Tools/msa/muscle/、mafft.cbrc.jp/alignment/software/。參見,例如Altschul等人(1990),J.Mol.Bioi.215:403-10。除非另有說明,否則使用BLAST電腦程式測定序列一致性。
術語「保守胺基酸取代」係指在蛋白質中具有類似側鏈之胺基酸殘基的可互換性。例如,具有脂族側鏈之胺基酸組由甘胺酸、丙胺酸、纈胺酸、白胺酸及異白胺酸組成;具有脂族羥基側鏈之胺基酸組由絲胺酸及蘇胺酸組成;具有含醯胺側鏈之胺基酸組由天冬醯胺及谷醯胺組成;具有芳族側鏈之胺基酸組由苯丙胺酸、酪胺酸及色胺酸組成;具有鹼性側鏈之胺基酸組由離胺酸、精胺酸及組胺酸組成;具有酸性側鏈之胺基酸組由麩胺酸及天冬胺酸組成;且具有含硫側鏈之胺基酸組由半胱胺酸及甲硫胺酸組成。示範性保守胺基酸取代基為:纈胺酸-白胺酸-異白胺酸、苯丙胺酸-酪胺酸、離胺酸-精胺酸、丙胺酸-纈胺酸-甘胺酸、及天冬醯胺-麩醯胺。
如本文所用,術語「免疫學突觸」或「免疫突觸」通常係指適應性免疫反應之兩個相互作用免疫細胞之間的自然界面,包括例如抗原呈遞細胞(APC)或靶細胞與效應細胞例如淋巴細胞、效應T細胞、自然殺手細胞及其類似物之間的界面。APC與T細胞之間的免疫學突觸通常藉由T細胞抗原受體與主要組織相容性複合物分子之間的相互作用來起 始,例如,如Bromley等人,Annu Rev Immunol.2001;19:375-96中所述,該文獻之揭露內容以全文引用方式併入本文。
「T細胞」包括所有類型的表現CD3之免疫細胞,包括T-輔助細胞(CD4+ 細胞)、細胞毒性T-細胞(CD8+ 細胞)、T-調節性細胞(Treg)及NK-T細胞。
如本文所用,術語「免疫調節多肽」(亦稱為「共刺激多肽」)包括在抗原呈遞細胞(APC)(例如,樹突狀細胞、B細胞及其類似物)上之多肽,其特異性結合T細胞上之同源共免疫調節多肽,從而提供一個信號,除了藉由例如TCR/CD3複合物與以肽裝載之主要組織相容性複合物(MHC)多肽之結合提供的主要信號之外,該信號亦介導T細胞反應,包括但不限於增殖、活化、分化及其類似反應。免疫調節多肽可包括但不限於CD7、B7-1(CD80)、B7-2(CD86)、PD-L1、PD-L2、4-1BBL、OX40L、Fas配位體(FasL)、誘導性共刺激配位體(ICOS-L)、細胞內黏附分子(ICAM)、CD30L、CD40、CD70、CD83、HLA-G、MICA、MICB、HVEM、淋巴毒素β受體、3/TR6、ILT3、ILT4、HVEM、結合Toll配位體受體之激動劑或抗體、以及與B7-H3特異性結合之配位體。
如上文所述,「免疫調節多肽」(在本文中亦稱為「MOD」)特異性結合T細胞上之同源共免疫調節多肽。
本揭示案之TMMP的「免疫調節結構域」(「MOD」)結合可存在於靶T細胞上之同源共免疫調節多肽。
如本文所用,術語「活體內」係指發生在體內的任何過程或程序。
如本文所用,「活體外」係指發生在體外的任何過程或程序。
如本文所用,「異源」意指核苷酸或多肽分別不可見於天然核酸或蛋白質中。
如本文所用,「重組」意指特定核酸(DNA或RNA)為選殖、限制、聚合酶鏈反應(PCR)及/或連接步驟之各種組合的產物,該等組合產生具有與見於自然系統中的內源性核酸可區分之結構性編碼或非編碼序列的構築體。編碼多肽之DNA序列可由cDNA片段或一系列合成寡核苷酸組裝以提供合成核酸,該合成核酸能夠自細胞或無細胞轉錄及轉譯系統中所含之重組轉錄單元表現。
術語「重組表現載體」或「DNA構築體」在本文中可互換使用以指代包含載體及至少一個插入物之DNA分子。重組表現載體通常出於表現及/或繁殖插入物之目的或出於構築其他重組核苷酸序列之目的而生成。插入物可以可操作地連接或不連接至啟動子序列且可以可操作地連接或不連接至DNA調節序列。
如本文所用,術語「親和力」係指兩種試劑(例如抗體與抗原)之可逆結合的平衡常數且表示為解離常數(KD)。如本文所用,術語「親合力」係指兩種或兩種以上試劑之複合物在稀釋後對解離之抵抗。術語「免疫反應性」及「優先結合」在本文中關於抗體及/或抗原結合片段可互換使用。
如本文所用,術語「結合」(例如關於TMMP與T細胞上之多肽(例如T細胞受體)之結合)係指兩個分子之間的非共價相互作用。非共價結合係指兩個分子之間由於例如靜電、疏水性、離子及/或氫鍵相互作用(包括諸如鹽橋及水橋之相互作用)而直接締合。「親和力」係指非共價結合強度,結合親和力的增加與較低KD相關聯。「特異性結合」通常係指配位體與作為其指定之結合位點或受體的部分之結合。「非特異性結合」通常係指配位體與其指定之結合位點或受體以外的部分之結合。如本文所用,「共價結合」或「共價鍵」係指兩個不同分子之間的一或多個共價化學結合之形成。
術語「治療(treatment/treating)」及其類似詞語在本文中用於通常意指獲得所要藥理學及/或生理學作用。該作用可在完全或部分預 防疾病或其症狀方面為預防性的,且/或可在疾病及/或因疾病引起之不良效應的部分或完全治癒方面為治療性的。如本文所用,「治療」涵蓋哺乳動物中疾病或症狀之任何治療,且包括:(a)預防疾病或症狀出現於可能傾向於獲得該疾病或症狀但尚未診斷為患有該疾病之受試者中;(b)抑制疾病或症狀,亦即阻止其發展;及/或(c)緩解疾病,亦即引起疾病消退。治療劑可在疾病或損傷發作之前、期間或之後投與。尤其關注正在發展的疾病之治療,其中該治療使患者之不希望有的臨床症狀穩定或減輕。此類治療理想地在患病組織中的功能完全喪失之前進行。目標療法將理想地在疾病之有症狀階段期間且在一些情況下在疾病之有症狀階段之後投與。
術語「個體(individual)」、「受試者(subject)」、「宿主(host)」及「患者(patient)」在本文中可互換使用且係指需要診斷、處理或治療之任何哺乳動物受試者。哺乳動物包括例如人類、非人靈長類動物、齧齒動物(例如大鼠;小鼠)、兔類動物(例如兔)、有蹄類動物(例如奶牛、綿羊、豬、馬、山羊及類似動物)等。
除非另有說明,否則術語「實質上」旨在包括「完全」及「大體上但不完全」。例如,「實質上不誘導細胞裂解」之Ig Fc意謂完全不誘導細胞裂解或大體上不誘導細胞裂解之Ig Fc。
如本文所用,與量有關使用之術語「約」表示該量可變化所述量之10%。例如,「約100」意謂90-110之量。在範圍之上下文中使用約時,關於範圍之較低量使用的「約」意謂較低量包括比範圍之較低量低10%的量,而關於範圍之較高量使用的「約」意謂較高量包括比範圍之較高量高10%的量。例如,約100至約1000意謂範圍自90擴展至1100。
在進一步描述本揭示案之前,應瞭解本發明不限於所述特定實施例,因此所述實施例當然可變化。亦應理解,本文所用之術語僅係為了描述具體實施例,並不旨在限制,因為本揭示案之範疇僅受所附申請專利範圍之限制。
當提供數值範圍時,應瞭解在彼範圍之上限與下限之間的直至下限之十分之一單位之各間插值(除非上下文另外明確規定)以及在彼陳述之範圍內之任何其他陳述值或間插值皆涵蓋在本發明內。此等較小範圍之上限及下限可獨立地包括在較小範圍中,且亦涵蓋在本揭示案內,屬於陳述之範圍內之任何明確排除之界限。在所陳述範圍包括界限之一者或兩者時,排除彼等包括之界限之任一者或兩者的範圍亦可包括在本揭示案內。
除非另有定義,否則本文使用之所有技術及科學術語具有與本發明所屬領域之普通技術人員通常所理解之相同含義。雖然類似於或等效於本文所述之彼等的任何方法及材料亦可用於實踐或測試本揭示案,但現在描述較佳方法及材料。本文提及之所有公開案均藉由引用併入本文,以公開及描述與公開案相關之方法及/或材料。
必須注意,除非上下文另外明確規定,否則如本文及隨附申請專利範圍中所用,單數形式「一」及「該」包括複數個指示物。因此,舉例而言,提及「T細胞調節多聚體多肽」包括複數個此類多肽且提及「免疫調節多肽」包括提及一或多種免疫調節多肽及其為熟習此項技術者所知之等效物等。應進一步注意申請專利範圍可經起草以排除任何視情況選用之要素。因此,此陳述意欲充當與敘述申請專利範圍要素關聯使用諸如「唯一」、「僅」及其類似術語之排除性術語或使用「否定性」限制的前提基礎。
應瞭解,為明確起見在單獨實施例之情形下描述之本揭示案之某些特徵亦可於單一實施例中組合提供。相反,為簡潔起見在單一實施例之情形下描述之本發明之各種特徵亦可單獨或以任何適合子組合提供。本發明所涉及之實施例的全部組合明確由本發明包括,且就如同各個及每個組合個別地及明確地在本文中揭露一般來揭露於本文中。此外,各種實施例及其要素之所有子組合亦由本揭示案明確包括,且就如同各個及每個此子組合個別地及明確地在本文中揭露一般來揭露於本文中。
本文論述之出版物僅因其揭露內容在本申請案之申請日期之前而加以提供。本文中之任何內容均不應解釋為承認本發明無權先於此出版物。此外,此外,提供之公開日期可不同於可能需要獨立確認之實際公開日期。
本揭示案提供T細胞調節多聚體多肽,其包含免疫調節多肽(「MOD」)且包含抗原決定基呈遞韋爾姆斯氏瘤-1(Wilms Tumor-1,WT-1)肽。TMMP可用於調節T細胞之活性且可用於調節個體中之免疫反應。
T細胞調節多聚體多肽
本揭示案提供一種T細胞調節多聚體多肽(TMMP),其包含:a)第一多肽;及b)第二多肽,其中該TMMP包含抗原決定基;第一主要組織相容性複合物(MHC)多肽;第二MHC多肽;一或多種MOD;以及視情況選用之免疫球蛋白(Immunoglobulin,Ig)Fc多肽或非Ig支架。本揭示案提供一種TMMP,其中該TMMP為異二聚體,其包含:a)包含第一MHC多肽之第一多肽;及b)包含第二MHC多肽之第二多肽,其中第一多肽或第二多肽包含抗原決定基(例如,呈遞抗原決定基之肽);其中該第一多肽及/或該第二多肽包含一或多種可以相同或不同的MOD;及視情況選用之Ig Fc多肽或非Ig支架。本揭示案之TMMP在本文中亦稱為「本揭示案之多聚體多肽」或「synTac」。在一些情況下,存在於本揭示案之TMMP中的肽抗原決定基為WT-1肽。
本揭示案提供一種TMMP,其包含異二聚體多肽,該多肽包含:a)第一多肽,該第一多肽包含:i)肽抗原決定基;及ii)第一MHC多肽;b)第二多肽,該第二多肽包含第二MHC多肽;以及c)至少一種MOD,其中該第一多肽及/或該第二多肽包含至少一種(亦即一或多種)MOD。視情況,第一多肽或第二多肽包含Ig Fc多肽或非Ig支架。該一或多種MOD中之至少一者為呈現出對同源共免疫調節多肽(「co-MOD」)之親和力比相應野生型MOD對co-MOD之親和力有所減小的變異體 MOD。存在於TMMP中的抗原決定基以如下親和力結合至T細胞上之T細胞受體(TCR):至少100μM(例如至少10μM、至少1μM、至少100nM、至少10nM或至少1nM)。TMMP結合至第一T細胞之親和力比TMMP結合第二T細胞之親和力高至少25%,其中第一T細胞在其表面上表現同源co-MOD及以至少100μM之親和力結合抗原決定基的TCR,且其中第二T細胞在其表面上表現同源co-MOD但在其表面上不表現以至少100μM(例如,至少10μM、至少1μM、至少100nM、至少10nM或至少1nM)之親和力結合抗原決定基的TCR。在一些情況下,存在於TMMP中之肽抗原決定基為WT-1肽。
本揭示案提供一種TMMP,其中該TMMP為:
A)異二聚體,其包含:a)包含第一MHC多肽之第一多肽;及b)包含第二MHC多肽之第二多肽,其中該第一多肽或該第二多肽包含抗原決定基(例如,將抗原決定基呈遞至T細胞之肽);其中第一多肽及/或第二多肽包含一或多種可以相同或不同的MOD,且其中該一或多種MOD中之至少一者可為野生型MOD或野生型MOD之變異體,其中該變異體MOD與相應野生型MOD之胺基酸序列相比包含1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20個胺基酸取代;且其中該第一多肽或該第二多肽視情況包含Ig Fc多肽或非Ig支架;或
B)異二聚體,其包含:a)包含第一MHC多肽之第一多肽;及b)包含第二MHC多肽之第二多肽,其中第一多肽或第二多肽包含抗原決定基;其中該第一多肽及/或該第二多肽包含一或多種可以相同或不同的MOD,
其中該一或多種MOD中之至少一者為野生型MOD之變異體,其中該變異體MOD與相應野生型MOD之胺基酸序列相比包含1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20個胺基酸取代,
其中該一或多個MOD中之至少一者為變異體MOD,其呈現出對同源co-MOD之親和力與相應野生型MOD對同源co-MOD之親和力相比有 所減小,且其中抗原決定基以至少10-7 M之親和力結合至T細胞上之TCR,使得:i)該TMMP多肽結合至第一T細胞之親和力比TMMP結合第二T細胞之親和力高至少25%,其中第一T細胞在其表面上表現同源co-MOD及以至少10-7 M之親和力結合抗原決定基的TCR,且其中第二T細胞在其表面上表現同源co-MOD,但在其表面上不表現以至少10-7 M之親和力結合抗原決定基的TCR;且/或ii)當藉由生物層干涉術量測時,對照TMMP與同源co-MOD之結合親和力與包含野生型MOD變異體之TMMP與同源co-MOD之結合親和力的比率範圍為1.5:1至106 :1,其中該對照包含野生型MOD;且其中該變異體MOD與相應野生型MOD之胺基酸序列相比包含1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20個胺基酸取代;且
其中該第一多肽或該第二多肽視情況包含Ig Fc多肽或非Ig支架;或
C)異二聚體,其包含:a)第一多肽,該第一多肽以自N端至C端之次序包含:i)抗原決定基;ii)第一MHC多肽;及b)第二多肽,該第二多肽以自N端至C端之次序包含:i)第二MHC多肽;及ii)視情況選用之Ig Fc多肽或非Ig支架,其中該TMMP包含一或多個可以相同或不同的MOD,其中該一或多個MOD中之至少一者:A)在第一多肽之C端;B)在第二多肽之N端;C)在第二多肽之C端;或D)在第一多肽之C端且在第二多肽之N端,且其中該一或多個MOD中之至少一者可為野生型MOD或野生型MOD之變異體,其中該變異體MOD與相應野生型MOD之胺基酸序列相比包含1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20個胺基酸取代;且
視情況其中該一或多個MOD中之至少一者為變異體MOD,其呈現出對同源co-MOD之親和力與相應野生型MOD對同源co-MOD之親和力相比有所減小,且其中抗原決定基以至少10-7M之親和力結合至T細胞上之TCR,使得:i)該TMMP結合至第一T細胞之親和力比TMMP結合第二T細胞之親和力高至少25%,其中第一T細胞在其表面上表現同源co-MOD 及以至少10-7M之親和力結合抗原決定基的TCR,且其中第二T細胞在其表面上表現同源co-MOD,但在其表面上不表現以至少10-7M之親和力結合抗原決定基的TCR;且/或ii)當藉由生物層干涉術量測時,對照TMMP與同源co-MOD之結合親和力與包含野生型MOD變異體之TMMP與同源co-MOD之結合親和力的比率範圍為1.5:1至106:1,其中該對照包含野生型MOD;且其中該變異體MOD與相應野生型MOD之胺基酸序列相比包含1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20個胺基酸取代。在一些情況下,存在於TMMP中之肽抗原決定基為WT-1肽。
本揭示案提供一種TMMP,其包含:a)第一多肽,該第一多肽以自N端至C端之次序包含:i)抗原決定基;ii)第一MHC多肽;及b)第二多肽,該第二多肽以自N端至C端之次序包含:i)第二MHC多肽;及ii)視情況選用之Ig Fc多肽或非Ig支架。TMMP包含一或多種MOD,其中該一或多種MOD中之至少一者:A)在第一多肽之C端;B)在第二多肽之N端;C)在第二多肽之C端;或D)在第一多肽之C端且在第二多肽之N端。該一或多種MOD中之至少一者為呈現出對同源co-MOD之親和力與相應野生型MOD對同源co-MOD之親和力相比有所減小的變異體MOD。存在於TMMP中的抗原決定基以如下親和力結合至T細胞上之T細胞受體(TCR):至少100μM(例如至少10μM、至少1μM、至少100nM、至少10nM或至少1nM)。TMMP結合至第一T細胞之親和力比TMMP結合第二T細胞之親和力高至少25%,其中第一T細胞在其表面上表現同源co-MOD及以至少100μM之親和力結合抗原決定基的TCR,且其中第二T細胞在其表面上表現同源co-MOD但在其表面上不表現以至少100μM(例如,至少10μM、至少1μM、至少100nM、至少10nM或至少1nM)之親和力結合抗原決定基的TCR。
存在於TMMP中之MOD結合至其同源co-MOD之親和力比相應野生型MOD對同源co-MOD之親和力小至少10%、小平少15%、 小至少20%、小至少25%、小至少30%、小至少35%、小至少40%、小至少45%、小至少50%、小至少55%、小至少60%、小至少65%、小至少70%、小至少75%、小至少80%、小至少85%、小至少90%、小至少95%、或小大於95%。
MOD對其同源co-MOD之減小的親和力與抗原決定基對TCR之親和力的組合提供了TMMP之提高的選擇性。舉例而言,本揭示案之TMMP與結合至第二T細胞相比選擇性地結合至第一T細胞,該第一T細胞呈現出:i)對存在於TMMP中之抗原決定基具有特異性之TCR;及ii)結合至存在於TMMP中之MOD的co-MOD,該第二T細胞呈現出:i)對除了存在於TMMP中之抗原決定基以外的抗原決定基具有特異性之TCR;及ii)結合至存在於TMMP中之MOD的co-MOD。舉例而言,本揭示案之TMMP結合至第一T細胞之親和力比其結合第二T細胞之親和力高至少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至少80%、至少90%、至少2倍、至少2.5倍、至少5倍、至少10倍、至少15倍、至少20倍、至少25倍、至少50倍、至少100倍或大於100倍。
在一些情況下,TMMP當向有需要之個體投與時誘導抗原決定基特異性T細胞反應及抗原決定基非特異性T細胞反應。換言之,在一些情況下,TMMP當向有需要之個體投與時藉由調節第一T細胞之活性來誘導抗原決定基特異性T細胞反應,該第一T細胞呈現出:i)對存在於TMMP中之抗原決定基具有特異性之TCR;ii)結合至存在於TMMP中之MOD的co-MOD;且藉由調節第二T細胞之活性來誘導抗原決定基非特異性T細胞反應,該第二T細胞呈現出:i)對除了存在於TMMP中之抗原決定基以外的抗原決定基具有特異性之TCR;及ii)結合至存在於TMMP中之MOD的co-MOD。抗原決定基特異性T細胞反應與抗原決定基非特異性T細胞反應之比率為至少2:1、至少5:1、至少10:1、至少15:1、至少20:1、至少25:1、至少50:1、或至少100:1。抗原決定基特異性T細胞反應 與抗原決定基非特異性T細胞反應之比率為約2:1至約5:1、約5:1至約10:1、約10:1至約15:1、約15:1至約20:1、約20:1至約25:1、約25:1至約50:1、或約50:1至約100:1、或大於100:1。「調節T細胞之活性」可包括以下各項中之一或多者:i)激活細胞毒性(例如CD8+)T細胞;ii)誘導細胞毒性(例如CD8+)T細胞之細胞毒性活性;iii)誘導細胞毒性(例如CD8+)T細胞對細胞毒素(例如穿孔蛋白;顆粒酶;粒溶蛋白)之產生及釋放;iv)抑制自體反應性T細胞之活性;及其類似效應。
MOD對其同源co-MOD之減小的親和力與抗原決定基對TCR之親和力的組合提供了TMMP之提高的選擇性。因此,舉例而言,TMMP與其結合至第二T細胞之親合力相比以更高親合力結合至第一T細胞,該第一T細胞呈現出:i)對存在於TMMP中之抗原決定基具有特異性之TCR;及ii)結合至存在於TMMP中之MOD的co-MOD,該第二T細胞呈現出:i)對除了存在於TMMP中之抗原決定基以外的抗原決定基具有特異性之TCR;及ii)結合至存在於TMMP中之MOD的co-MOD。
MOC與其同源co-MOD之間的結合親和力可藉由生物層干涉術(Bio-layer Interferometry,BLI),使用經純化之MOD及經純化之同源co-MOD來判定。TMMP與其同源co-MOD之間的結合親和力可藉由BLI,使用經純化之TMMP及同源co-MOD來判定。BLI方法為熟習此項技術者熟知。參見,例如Lad等人(2015)J.Biomol.Screen. 20(4):498-507;以及Shah及Duncan(2014)J.Vis.Exp. 18:e51383。
BLI檢定可使用Octet RED 96(Pal FortéBio)儀器或如下類似儀器進行。TMMP(例如,本揭示案之TMMP;對照TMMP(其中對照TMMP包含野生型免疫調節多肽))經固定於不溶性支撐物(「生物感測器」)。經固定之TMMP為「靶標」。固定可藉由將捕獲抗體固定至不溶性支撐物上來實現,其中捕獲抗體固定TMMP。例如,固定可藉由將抗Fc(例如,抗人類IgG Fc)抗體固定至不溶性支撐物上來實現,其中經固定之抗Fc抗體結合至且固定TMMP(其中TMMP包含IgFc多肽)。共免疫調節 多肽以若干種不同濃度施加於經固定之TMMP,且記錄儀器之反應。檢定在包含25mM HEPES pH 6.8、5%聚(乙二醇)6000、50mM KCl、0.1%牛血清白蛋白及0.02% Tween 20非離子清潔劑之液體介質中進行。共免疫調節多肽與經固定之TMMP之結合在30℃下進行。作為結合親和力之陽性對照,可使用抗I類MHC單株抗體。例如,可使用抗I類HLA單株抗體W6/32(美國典型培養物保藏中心(American Type Culture Collection)編號HB-95;Parham等人(1979)J.Immunol. 123:342),其具有7nM之KD 。標準曲線可使用抗I類MHC單株抗體之連續稀釋液來生成。共免疫調節多肽或抗I類MHCmAb為「分析物」。BLI分析自以下兩個表面反射之白光的干涉圖型:i)經固定之多肽(「靶標」);及ii)內部參考層。結合至生物感測器尖端之分子(「分析物」;例如,共免疫調節多肽;抗HLA抗體)之數目的變化引起干涉圖型之偏移;干涉圖型中之此偏移可即時量測。描述靶標/分析物相互作用之親和力的兩個動力學術語為締合常數(k a )及解離常數(k d )。該兩個術語之比率(k d /a )產生親和力常數KD
BLI檢定在多孔板中進行。為了操作該檢定,限定板佈局,限定檢定步驟,且在Octet Data Acquisition軟體中指派生物感測器。使生物感測器組件水合。將經水合之生物感測器組件及檢定板在Octet儀器上平衡10分鐘。一旦採集資料,即將所採集資料加載至Octet Data Analysis軟體中。在處理窗口中藉由指定參考減法、y軸對準、步間校正及Savitzky-Golay濾波之方法來處理資料。在分析窗口中藉由指定分析(締合及解離)、選擇曲線擬合模型(1:1)、擬合方法(全域)及目標窗口(以秒計)之步驟來分析資料。評價擬合品質。若在3倍範圍內,則對各資料追蹤(分析物濃度)之KD 值取平均值。KD 誤差值應處於親和力常數值之約一個數量級之內;R2 值應高於0.95。參見,例如Abdiche等人(2008)J.Anal.Biochem. 377:209。
除非本文另外說明,否則本揭示案之TMMP對同源共免疫調節多肽之親和力或對照TMMP(其中對照TMMP包含野生型免疫調節多肽)對同源共免疫調節多肽之親和力使用如上文所述之BLI判定。
在一些情況下,i)對照TMMP(其中對照包含野生型免疫調節多肽)與同源共免疫調節多肽之結合親和力同ii)本揭示案之包含野生型免疫調節多肽變異體之TMMP與同源共免疫調節多肽之結合親和力的比率當藉由BLI(如上文所述)量測時為至少1.5:1、至少2:1、至少5:1、至少10:1、至少15:1、至少20:1、至少25:1、至少50:1、至少100:1、至少500:1、至少102 :1、至少5 x 102 :1、至少103 :1、至少5 x 103 :1、至少104 :1、至少105 :1、或至少106 :1。在一些情況下,i)對照TMMP(其中對照包含野生型免疫調節多肽)與同源共免疫調節多肽之結合親和力同ii)本揭示案之包含野生型免疫調節多肽變異體之TMMP與同源共免疫調節多肽之結合親和力的比率當藉由BLI量測時範圍在1.5:1至106 :1內,例如1.5:1至10:1、10:1至50:1、50:1至102 :1、102 :1至103 :1、103 :1至104 :1、104 :1至105 :1、或105 :1至106 :1。
作為實例,在對照TMMP包含野生型IL-2多肽時,且在本揭示案之TMMP包含變異體IL-2多肽(相對於野生型IL-2多肽之胺基酸序列包含1至10個胺基酸取代)作為免疫調節多肽時,i)對照TMMP與IL-2受體(亦即,同源共免疫調節多肽)之結合親和力同ii)本揭示案之TMMP與IL-2受體之結合親和力的比率當藉由BLI量測時為至少1.5:1、至少2:1、至少5:1、至少10:1、至少15:1、至少20:1、至少25:1、至少50:1、至少100:1、至少500:1、至少102:1、至少5 x 102:1、至少103:1、至少5 x 103:1、至少104:1、至少105:1、或至少106:1。在一些情況下,在對照TMMP包含野生型IL-2多肽時,且在本揭示案之TMMP包含變異體IL-2多肽(相對於野生型IL-2多肽之胺基酸序列包含1至10個胺基酸取代)作為免疫調節多肽時,i)對照TMMP與IL-2受體(亦即,同源共免疫調節多肽)之結合親和力同ii)本揭示案之TMMP與IL-2受體之結合親和力的比率當 藉由BLI量測時範圍在1.5:1至106:1內,例如1.5:1至10:1、10:1至50:1、50:1至102:1、102:1至103:1、103:1至104:1、104:1至105:1、或105:1至106:1。
本揭示案之TMMP與靶標T細胞之結合親和力可根據2019年3月14日公開的經公開之(Procalcitonin)PCT申請案WO 2019/051091中所述之程序來量測。參見[0063]。
在一些情況下,當如前述段落中所述進行量測時,與TMMP文庫成員與包含以下各物之對照T細胞之結合相比,本揭示案之TMMP呈現出與靶標T細胞之選擇性結合:i)結合親本野生型免疫調節多肽之同源共免疫調節多肽;及ii)結合至除了TMMP文庫成員中存在之抗原決定基以外的抗原決定基之T細胞受體。
二聚化TMMP
本揭示案之TMMP可經二聚化;亦即,本揭示案提供包含本揭示案之TMMP之二聚體的多聚體多肽。因此,本揭示案提供一種TMMP,其包含:A)第一異二聚體,該第一異二聚體包含:a)第一多肽,該第一多肽包含:i)肽抗原決定基;及ii)第一MHC多肽;及b)第二多肽,該第二多肽包含:i)第二MHC多肽,其中該第一異二聚體包含一或多種MOD;及B)第二異二聚體,該第二異二聚體包含:a)第一多肽,該第一多肽包含:i)肽抗原決定基;及ii)第一MHC多肽;及b)第二多肽,該第二多肽包含:i)第二MHC多肽,其中該第二異二聚體包含一或多種MOD,且其中該第一異二聚體與該第二異二聚體彼此共價連接。在一些情況下,兩個TMMP之胺基酸序列彼此相同。在一些情況下,第一異二聚體與第二異二聚體經由第一異二聚體之第二多肽的C端區域及第二異二聚體之第二多肽的C端區域彼此共價連接。在一些情況下,第一異二聚體與第二異二聚體經由第一異二聚體之第二多肽的C端胺基酸及第二異二聚體之第二多肽的C端區域彼此共價連接;例如,在一些情況下,第一異二聚體之第二多肽的C端胺基酸及第二異二聚體之第二多肽的C端區域直接或經由連接子 彼此連接。連接子可為肽連接子。肽連接子可之長度為1個胺基酸至200個胺基酸(例如,1個胺基酸(aa)至5 aa、5 aa至10 aa、10 aa至25 aa、25 aa至50 aa、50 aa至100 aa、100 aa至150 aa、或150 aa至200 aa)。在一些情況下,第一異二聚體之肽抗原決定基與第二異二聚體之肽抗原決定基包含相同胺基酸序列。在一些情況下,第一異二聚體及第二異二聚體之第一MHC多肽為I類MHC β2-微球蛋白,且其中第一異二聚體及第二異二聚體之第二MHC多肽為I類MHC重鏈。在一些情況下,第一異二聚體之MOD與第二異二聚體之MOD包含相同胺基酸序列。在一些情況下,第一異二聚體之MOD及第二異二聚體之MOD為與相應親本野生型MOD相比包含1至10個胺基酸取代之變異體MOD,且其中該1至10個胺基酸取代導致變異體免疫調節多肽與同源共免疫調節多肽之親和力結合減小。在一些情況下,第一異二聚體之免疫調節多肽及第二異二聚體之免疫調節多肽各自獨立地選自由以下組成之群:IL-2、4-1BBL、PD-L1、CD80、CD86、ICOS-L、OX-40L、FasL、JAG1(CD339)、TGFβ、CD70及ICAM。下文描述適合的MHC多肽、MOD及肽抗原決定基之實例。
MHC多肽
如上文所述,本揭示案之TMMP包括MHC多肽。出於本揭示案之目的,術語「主要組織相容性複合物(MHC)多肽」旨在包括不同物種之MHC多肽,包括人類MHC(亦稱為人類白血球抗原(HLA))多肽、齧齒動物(例如,小鼠、大鼠等)MHC多肽、及其他哺乳動物物種之MHC多肽(例如,兔類動物、非人靈長類動物、犬科動物、貓科動物、有蹄類動物(例如,馬、牛、綿羊、山羊等)、及其類似動物。術語「MHC多肽」旨在包括I類MHC多肽(例如,β-2微球蛋白及I類MHC重鏈)。
在一些情況下,第一MHC多肽為I類MHCβ2M(β2M)多肽,且第二MHC多肽為I類MHC重鏈(H鏈)(「MHC-H」))。在其他情況下,第一MHC多肽為I類MHC重鏈多肽;且第二MHC多肽為β2M多肽。在一些情況下,β2M及MHC-H鏈均為人類來源;亦即,MHC-H鏈為 HLA重鏈或其變異體。除非另外明確說明,否則本揭示案之TMMP不包括I類MHC重鏈之膜錨定結構域(跨膜結構域)或足以將所得TMMP錨定至表現其之細胞(例如, 真核細胞,諸如哺乳動物細胞)的I類MHC重鏈之一部分。在一些情況下,存在於本揭示案之TMMP中的I類MHC重鏈不包括與天然I類MHC重鏈締合之信號肽、跨膜結構域或細胞內結構域(細胞質尾部)。因此,例如,在一些情況下,存在於本揭示案之TMMP中的I類MHC重鏈僅包括I類MHC重鏈之α1、α2、及α3域。在一些情況下,存在於TMMP中之I類MHC重鏈之長度為約270個胺基酸(aa)至約290 aa。在一些情況下,存在於TMMP中之I類MHC重鏈具有之長度為270 aa、271 aa、272 aa、273 aa、274 aa、275 aa、276 aa、277 aa、278 aa、279 aa、280 aa、281 aa、282 aa、283 aa、284 aa、285 aa、286 aa、287 aa、288 aa、289 aa或290 aa。
在一些情況下,TMMP之MHC多肽為人類MHC多肽,其中人類MHC多肽亦稱為「人類白血球抗原」(「HLA」)多肽。在一些情況下,TMMP之MHC多肽為I類HLA多肽,例如,β2-微球蛋白多肽或I類HLA重鏈多肽。I類HLA重鏈多肽包括HLA-A重鏈多肽、HLA-B重鏈多肽、HLA-C重鏈多肽、HLA-E重鏈多肽、HLA-F重鏈多肽及HLA-G重鏈多肽。
I類MHC重鏈
在一些情況下,存在於TMMP中之I類MHC重鏈多肽包含與圖7-13中描繪之任何人類HLA重鏈多肽之全部或部分胺基酸序列(例如,50、75、100、150、200、或250個連續胺基酸)具有至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%、或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列。在一些情況下,I類MHC重鏈之長度為270 aa、271 aa、272 aa、273 aa、274 aa、275 aa、276 aa、277 aa、278 aa、279 aa、280 aa、281 aa、282 aa、283 aa、284 aa、285 aa、286 aa、287 aa、288 aa、289 aa或290 aa。在一些情況下,存在於TMMP中之I類MHC重 鏈多肽包含圖7-13 中描繪之任一胺基酸序列的1-30、1-5、5-10、10-15、15-20、20-25或25-30個胺基酸插入、缺失及/或取代(除了指示為在重鏈共有序列中可變之彼等位置)。在一些情況下,I類MHC重鏈不包括跨膜結構域或細胞質域。作為一實例,TMMP之I類MHC重鏈多肽可包含與圖7A、7B及7C 中任一者描繪之人類HLA-A重鏈多肽的胺基酸25-300(缺乏全部或實質上全部前導序列、跨膜序列及細胞質序列)或胺基酸25-365(缺乏前導序列)具有至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列。
圖7A、7B及7C提供人類白血球抗原(HLA)I類重鏈多肽之胺基酸序列。將信號序列胺基酸1-24加粗且加下劃線。圖7A條目:3A.1為HLA-A重鏈(HLA-A*01:01:01:01或A*0101)(NCBI登錄NP_001229687.1)SEQ ID NO:23;條目3A.2來自HLA-A*1101 SEQ ID NO:24;條目3A.3來自HLA-A*2402 SEQ ID NO:25且條目3A.4來自HLA-A*3303 SEQ ID NO:26。圖7B提供序列HLA-B*07:02:01(HLA-B*0702)NCBI GenBank登錄NP_005505.2(亦參見GenBank登錄AUV50118.1.)。圖7C提供序列HLA-C*0701(GenBank登錄NP_001229971.1)(HLA-C*07:01:01:01或HLA-Cw*070101,HLA-Cw*07參見GenBank登錄CAO78194.1)。
圖8 提供十一種無前導序列或跨膜結構域或細胞內結構域之成熟I類MHC重鏈胺基酸序列的比對。所比對序列為人類HLA-A、HLA-B及HLA-C、小鼠H2K蛋白序列、三種HLA-A變異體(var.1、var.2C及var.2CP)、以及3種人類HLA-A變異體(HLA-A*1101;HLA-A*2402;及HLA-A*3303)。在比對中指出位置(成熟蛋白之84及139),其中半胱胺酸殘基可經引入(例如,藉由取代)以用於形成二硫鍵以使MHC H鏈-β2M複合物穩定。比對中亦展示位置236(成熟多肽之位置),其可由半胱胺酸殘基取代,從而可與β2M形成鏈間二硫鍵(例如,在aa 12處)。箭頭出現於彼等位置各自之上方且將殘基加粗。比對(var.2c)中所示之第七HLA-A序 列展示以C殘基在位置84、139及236處取代之變異體2的序列。框側翼殘基84、139及236展示在五個殘基之彼等六組之任一側上的五個胺基酸之群,該六組表示為aac1(對於「胺基酸簇1」)、aac2(對於「胺基酸簇2」)、aac3(對於「胺基酸簇3」)、aac4(對於「胺基酸簇4」)、aac5(對於「胺基酸簇5」)及aac6(對於「胺基酸簇6」),該等殘基可經獨立地選自以下之1至5個胺基酸置換:(i)任何天然存在之胺基酸或(ii)或除脯胺酸或甘胺酸以外的任何天然存在之胺基酸。
關於圖8 ,在一些情況下:i)aac1(胺基酸簇1)可為胺基酸序列GTLRG(SEQ ID NO:287)或有一或兩個胺基酸缺失或經其他天然存在之胺基酸取代(例如 ,L經I、V、A或F置換)之序列;ii)aac2(胺基酸簇2)可為胺基酸序列YNQSE(SEQ ID NO:288)或有一或兩個胺基酸缺失或經其他天然存在之胺基酸取代(例如, N經Q置換,Q經N置換,且/或E經D置換)之序列;iii)aac3(胺基酸簇3)可為胺基酸序列TAADM(SEQ ID NO:289)或有一或兩個胺基酸缺失或經其他天然存在之胺基酸取代(例如, T經S置換,A經G置換,D經E置換,且/或M經L、V或I置換)之序列;iv)aac4(胺基酸簇4)可為胺基酸序列AQTTK(SEQ ID NO:290)或有一或兩個胺基酸缺失或經其他天然存在之胺基酸取代(例如, A經G置換,Q經N置換,或T經S置換,且/或K經R或Q置換)之序列;v)aac5(胺基酸簇5)可為胺基酸序列VETRP(SEQ ID NO:291)或有一或兩個胺基酸缺失或經其他天然存在之胺基酸取代(例如, V經I或L置換,E經D置換,T經S置換,且/或R經K置換)之序列;且/或vi)aac6(胺基酸簇6)可為胺基酸序列GDGTF(SEQ ID NO:292)或有一或兩個胺基酸缺失或經其他天然存在之胺基酸取代(例如, D經E置換,T經S置換,或F經L、W或Y置換)之序列。
圖9-11 提供成熟I類HLA重鏈胺基酸序列(無前導序列或跨膜結構域或細胞內結構域)之比對。圖9A中經比對之胺基酸序列為以下對偶基因之I類HLA-A重鏈:A*0101、A*0201、A*0301、A*1101、 A*2301、A*2402、A*2407、A*3303及A*3401。圖10A中經比對之胺基酸序列為以下對偶基因之I類HLA-B重鏈:B*0702、B*0801、B*1502、B*3802、B*4001、B*4601及B*5301。圖11A中經比對之胺基酸序列為以下對偶基因之I類HLA-C重鏈:C*0102、C*0303、C*0304、C*0401、C*0602、C*0701、C*0801及C*1502。在比對中指出位置(成熟蛋白之84及139),其中半胱胺酸殘基可經引入(例如,藉由取代)以用於形成二硫鍵以使HLA H鏈-β2M複合物穩定。比對中亦展示位置236(成熟多肽之位置),其可由半胱胺酸殘基取代,從而可與β2M形成鏈間二硫鍵(例如,在aa 12處)。框側翼殘基84、139及236展示在五個殘基之彼等六組之任一側上的五個胺基酸之群,該六組表示為aac1(對於「胺基酸簇1」)、aac2(對於「胺基酸簇2」)、aac3(對於「胺基酸簇3」)、aac4(對於「胺基酸簇4」)、aac5(對於「胺基酸簇5」)及aac6(對於「胺基酸簇6」),該等殘基可經獨立地選自以下之1至5個胺基酸置換:(i)任何天然存在之胺基酸或(ii)或除脯胺酸或甘胺酸以外的任何天然存在之胺基酸。
圖9A、10A及11A 分別提供成熟HLA-A、HLA-B及HLA-C I類重鏈之胺基酸序列的比對。提供成熟蛋白之細胞外部分(無前導序列或跨膜結構域或細胞內結構域)之序列。如圖8 所述,亦展示aa殘基84、139及236以及其側翼殘基(aac1至aac6)之位置,該等殘基可經獨立地選自以下之1至5個胺基酸置換:(i)任何天然存在之胺基酸或(ii)除了脯胺酸或甘胺酸以外的任何天然存在之胺基酸。圖9B、10B及11B 提供分別在圖9A、10A及11A中所提供之HLA-A、HLA-B及HLA-C序列之共有胺基酸序列。共有序列將可變胺基酸位置展示為依次編號之「X」殘基且將胺基酸84、139及236之位置加雙下劃線。
關於圖9A ,在一些情況下:i)aac1(胺基酸簇1)可為胺基酸序列GTLRG(SEQ ID NO:287)或有一或兩個胺基酸缺失或經其他天然存在之胺基酸取代(例如 ,L經I、V、A或F置換)之序列;ii)aac2(胺基酸簇2)可為胺基酸序列YNQSE(SEQ ID NO:288)或有一或兩個胺基酸缺失或經 其他天然存在之胺基酸取代(例如 ,N經Q置換,Q經N置換,且/或E經D置換)之序列;iii)aac3(胺基酸簇3)可為胺基酸序列TAADM(SEQ ID NO:289)或有一或兩個胺基酸缺失或經其他天然存在之胺基酸取代(例如 ,T經S置換,A經G置換,D經E置換,且/或M經L、V或I置換)之序列;iv)aac4(胺基酸簇4)可為胺基酸序列AQTTK(SEQ ID NO:290)或有一或兩個胺基酸缺失或經其他天然存在之胺基酸取代(例如 ,A經G置換,Q經N置換,或T經S置換,且或K經R或Q置換)之序列;v)aac5(胺基酸簇5)可為胺基酸序列VETRP(SEQ ID NO:291)或有一或兩個胺基酸缺失或經其他天然存在之胺基酸取代(例如 ,V經I或L置換,E經D置換,T經S置換,且/或R經K置換)之序列;且/或vi)aac6(胺基酸簇6)可為胺基酸序列GDGTF(SEQ ID NO:292)或有一或兩個胺基酸缺失或經其他天然存在之胺基酸取代(例如 ,D經E置換,T經S置換,或F經L、W或Y置換)之序列。
關於圖10A ,在一些情況下:i)aac1(胺基酸簇1)可為胺基酸序列RNLRG(SEQ ID NO:293)或有一或兩個胺基酸缺失或經其他天然存在之胺基酸取代(例如 ,N經T或I置換;且/或L經A置換;且/或第二R經L置換;且/或G經R置換)之序列;ii)aac2(胺基酸簇2)可為胺基酸序列YNQSE(SEQ ID NO:288)或有一或兩個胺基酸缺失或經其他天然存在之胺基酸取代(例如 ,N經Q置換,Q經N置換,且/或E經D置換)之序列;iii)aac3(胺基酸簇3)可為胺基酸序列TAADT(SEQ ID NO:294)或有一或兩個胺基酸缺失或經其他天然存在之胺基酸取代(例如 ,第一T經S置換;且/或A經G置換;且/或D經E置換;且/或第二T經S置換)之序列;iv)aac4(胺基酸簇4)可為胺基酸序列AQITQ(SEQ ID NO:295)或有一或兩個胺基酸缺失或經其他天然存在之胺基酸取代(例如 ,A經G置換;且/或第一Q經N置換;且/或I經L或V置換;且/或T經S置換;且/或第二Q經N置換)之序列;v)aac5(胺基酸簇5)可為胺基酸序列VETRP(SEQ ID NO:291)或有一或兩個胺基酸缺失或經其他天然存在之胺基酸取代(例如 ,V經I或L置 換,E經D置換,T經S置換,且/或R經K置換)之序列;且/或vi)aac6(胺基酸簇6)可為胺基酸序列GDRTF(SEQ ID NO:296)或有一或兩個胺基酸缺失或經其他天然存在之胺基酸取代(例如 ,D經E置換;且/或T經S置換;且/或R經K或H置換;且/或F經L、W或Y置換)之序列。
關於圖11A ,在一些情況下:i)aac1(胺基酸簇1)可為胺基酸序列RNLRG(SEQ ID NO:293)或有一或兩個胺基酸缺失或經其他天然存在之胺基酸取代(例如 ,N經K置換;且/或L經A或I置換;且/或第二R經H置換;且/或G經T或S置換)之序列;ii)aac2(胺基酸簇2)可為胺基酸序列YNQSE(SEQ ID NO:288)或有一或兩個胺基酸缺失或經其他天然存在之胺基酸取代(例如 ,N經Q置換,Q經N置換,且/或E經D置換)之序列;iii)aac3(胺基酸簇3)可為胺基酸序列TAADT(SEQ ID NO:294)或有一或兩個胺基酸缺失或經其他天然存在之胺基酸取代(例如 ,第一T經S置換;且/或A經G置換;且/或D經E置換;且/或第二T經S置換)之序列;iv)aac4(胺基酸簇4)可為胺基酸序列AQITQ(SEQ ID NO:295)或有一或兩個胺基酸缺失或經其他天然存在之胺基酸取代(例如 ,A經G置換;且/或第一Q經N置換;且/或I經L置換;且/或第二Q經N或K置換)之序列;v)aac5(胺基酸簇5)可為胺基酸序列VETRP(SEQ ID NO:291)或有一或兩個胺基酸缺失或經其他天然存在之胺基酸取代(例如 ,V經I或L置換,E經D置換,T經S置換,且/或R經K或H置換)之序列;且/或vi)aac6(胺基酸簇6)可為胺基酸序列GDGTF(SEQ ID NO:292)或有一或兩個胺基酸缺失或經其他天然存在之胺基酸取代(例如 ,D經E置換;且/或T經S置換;且/或F經L、W或Y置換)之序列。
HLA-A
在一些情況下,TMMP包含HLA-A重鏈多肽。可併入本揭示案之TMMP中的HLA-A重鏈肽序列或其部分包括但不限於以下對偶基因:A*0101、A*0201、A*0301、A*1101、A*2301、A*2402、A*2407、A*3303及A*3401,其在無全部或實質上全部圖9A 中之前導序 列、跨膜序列及細胞質序列的情況下比對。彼等對偶基因中之任一者可包含在位置84、139及/或236(如圖9A 所示)之一或多者處的選自以下之突變:在位置84處酪胺酸至丙胺酸(Y84A);在位置84處酪胺酸至半胱胺酸(Y84C);在位置139處丙胺酸至半胱胺酸(A139C);及在位置236處丙胺酸至半胱胺酸之取代(A236C)。另外,亦可採用與彼等HLA-A對偶基因之序列之全部或一部分(例如,50、75、100、150、200或250個連續胺基酸)具有至少75%(例如,至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%)或100%胺基酸序列一致性之HLA-A序列(例如,其可包含1-25、1-5、5-10、10-15、15-20、20-25、或25-30個胺基酸插入、缺失及/或取代)。
在一些情況下,TMMP包含HLA-A重鏈多肽,其包含以下HLA-A共有胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0029-327
Figure 110116854-A0202-12-0029-328
(SEQ ID NO:29),其中X1為F、Y、S或T;X2為K或R;X3為Q、G、E或R;X4為N或E;X5為R或G;X6為N或K;X7為M或V;X8為H或Q;X9為T或I;X10為D或H;X11為A、V或E;X12為N或D;X13為G或R;X14為T或I;X15為L或A;X16為R或L;X17為G或R;X18為A或D;X19為I、L或V;X20為I、R或M;X21為F或Y;X22為S或P;X23為W或G;X24為R、H、或Q;X25為D或Y;X26為N或K;X27為T或I;X28為K或Q;X29為R 或H;X30為A或T;X31為A或V;X32為H或R;X33為R、L、Q或W;X34為V或A;X35為D或E;X36為R或T;X37為D或E;X38為W或G;X39為P或A;X40為P或A;X41為V或I;X42為S或G;X43為A或S;X44為Q或E;且X45為P或L。
作為一實例,TMMP之I類MHC重鏈多肽可包含與以下人類HLA-A重鏈胺基酸序列具有至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0030-329
Figure 110116854-A0202-12-0030-330
(SEQ ID NO:44)。
在一些情況下,適用於包含在TMMP中之HLA-A重鏈多肽包含以下胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0030-331
Figure 110116854-A0202-12-0030-332
(SEQ ID NO:44)。此HLA-A重鏈多肽亦稱為「HLA-A*0201」或簡稱為「HLA-A02」。在一些情況下,C端Pro不包括在TMMP中。舉例而言,在一些情況下,適用於包含在TMMP中之HLA-A02多肽包含以下胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0030-333
Figure 110116854-A0202-12-0031-334
Figure 110116854-A0202-12-0031-335
(SEQ ID NO:449)。
HLA-A(Y84C;A236C)
在一些情況下,適用於包含在TMMP中之HLA-A重鏈多肽包含與以下人類HLA-A重鏈(Y84C;A236C)胺基酸序列具有至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0031-336
Figure 110116854-A0202-12-0031-337
(SEQ ID NO:488),其中胺基酸84為Cys且其中胺基酸236為Cys。
HLA-A(Y84A;A236C)
在一些情況下,I類MHC重鏈多肽包含Y84A及A236C取代。在一些情況下,I類MHC重鏈多肽包含與以下人類HLA-A重鏈(Y84A;A236C)胺基酸序列具有至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0031-338
Figure 110116854-A0202-12-0032-339
Figure 110116854-A0202-12-0032-340
(SEQ ID NO:48),其中胺基酸84為Ala且胺基酸236為Cys。在一些情況下,Cys-236與包含R12C取代之變異體β2M多肽之Cys-12形成鏈間二硫鍵。
在一些情況下,適用於包含在TMMP中之HLA-A重鏈多肽為包含以下胺基酸序列之HLA-A02(Y84A;A236C)多肽:
Figure 110116854-A0202-12-0032-341
Figure 110116854-A0202-12-0032-342
(SEQ ID NO:48)。
在一些情況下,適用於包含在TMMP中之HLA-A重鏈多肽為包含以下胺基酸序列之HLA-A02(Y84A;A236C)多肽:
Figure 110116854-A0202-12-0032-343
Figure 110116854-A0202-12-0032-344
(SEQ ID NO:46)。
HLA-A(Y84C;A139C)
在一些情況下,I類MHC重鏈多肽包含Y84C及A139C取代。舉例而言,在一些情況下,I類MHC重鏈多肽包含與以下人類HLA-A重鏈(Y84C;A139C)胺基酸序列具有至少75%、至少80%、至少 85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0033-345
Figure 110116854-A0202-12-0033-346
(SEQ ID NO:299),其中胺基酸84為Cys且胺基酸139為Cys。在一些情況下,Cys-84與Cys-139形成鏈內二硫鍵。
HLA-A11(HLA-A *1101)
作為一個非限制性實例,TMMP之I類MHC重鏈多肽可包含與以下人類HLA-A11重鏈胺基酸序列具有至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0033-347
Figure 110116854-A0202-12-0033-348
(SEQ ID NO:300)。此類I類MHC重鏈在亞洲人群中可為突出的,該亞洲人群包括亞洲人種之個體群體。
HLA-A11(Y84A;A236C)
作為一個非限制性實例,在一些情況下,I類MHC重鏈多肽為包含Y84A及A236C取代之HLA-A11對偶基因。舉例而言,在一些情況下,I類MHC重鏈多肽包含與以下人類HLA-A A11重鏈(Y84A; A236C)胺基酸序列具有至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0034-349
Figure 110116854-A0202-12-0034-350
(SEQ ID NO:301),其中胺基酸84為Ala且胺基酸236為Cys。在一些情況下,Cys-236與包含R12C取代之變異體β2M多肽之Cys-12形成鏈間二硫鍵。
HLA-A11(Y84C;A236C)
在一些情況下,存在於TMMP中之I類MHC重鏈多肽包含與以下人類HLA-A A11重鏈(Y84C;A236C)胺基酸序列具有至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0034-351
Figure 110116854-A0202-12-0034-352
(SEQ ID NO:301),其中胺基酸84為Cys且胺基酸236為Cys。
HLA-A24(HLA-A *2402)
作為一個非限制性實例,TMMP之I類MHC重鏈多肽可包含與以下人類HLA-A24(亦稱為HLA-A*2402)重鏈胺基酸序列具有至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0035-353
Figure 110116854-A0202-12-0035-354
(SEQ ID NO:302)。此類I類MHC重鏈在亞洲人群中可為突出的,該亞洲人群包括亞洲人種之個體群體。在一些情況下,胺基酸84為Ala。在一些情況下,胺基酸84為Cys。在一些情況下,胺基酸236為Cys。在一些情況下,胺基酸84為Ala且胺基酸236為Cys。在一些情況下,胺基酸84為Cys且胺基酸236為Cys。
在一些情況下,TMMP之I類MHC重鏈多肽可包含與以下人類HLA-A24(亦稱為HLA-A*2402)重鏈胺基酸序列具有至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0035-355
Figure 110116854-A0202-12-0035-356
(SEQ ID NO:455),其中胺基酸84為Tyr且胺基酸236為Ala(胺基酸84及236呈粗體且加下劃線);且其中I類MHC重鏈具有約275個胺基酸之長度。
在一些情況下,TMMP之I類MHC重鏈多肽可包含與以下人類HLA-A24(亦稱為HLA-A*2402)重鏈胺基酸序列具有至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100% 胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0036-357
Figure 110116854-A0202-12-0036-358
(SEQ ID NO:456),其中胺基酸84為ALA且胺基酸236為ALA(胺基酸84及236呈粗體且加下劃線);且其中I類MHC重鏈具有約275個胺基酸之長度。
在一些情況下,TMMP之I類MHC重鏈多肽可包含與以下人類HLA-A24(亦稱為HLA-A*2402)重鏈胺基酸序列具有至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0036-359
Figure 110116854-A0202-12-0036-360
(SEQ ID NO:457),其中胺基酸84為TYR且胺基酸236為CYS(胺基酸84及236呈粗體且加下劃線);且其中I類MHC重鏈具有約275個胺基酸之長度。
在一些情況下,TMMP之I類MHC重鏈多肽可包含與以下人類HLA-A24(亦稱為HLA-A*2402)重鏈胺基酸序列具有至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0036-361
Figure 110116854-A0202-12-0037-362
Figure 110116854-A0202-12-0037-363
(SEQ ID NO:458),其中胺基酸84為ALA且胺基酸236為CYS(胺基酸84及236呈粗體且加下劃線);且其中I類MHC重鏈具有約275個胺基酸之長度。
在一些情況下,I類MHC重鏈多肽可包含與以下人類HLA-A24(亦稱為HLA-A*2402)重鏈胺基酸序列具有至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0037-364
Figure 110116854-A0202-12-0037-365
(SEQ ID NO:459),其中胺基酸84為CYS且胺基酸236為ALA(胺基酸84及236呈粗體且加下劃線);且其中I類MHC重鏈具有約275個胺基酸之長度。
在一些情況下,TMMP之I類MHC重鏈多肽可包含與以下人類HLA-A24(亦稱為HLA-A*2402)重鏈胺基酸序列具有至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0037-366
Figure 110116854-A0202-12-0038-367
(SEQ ID NO:346),其中胺基酸84為CYS且胺基酸236為CYS(胺基酸84及236呈粗體且加下劃線);且其中I類MHC重鏈具有約275個胺基酸之長度。
HLA-A33(HLA-A *3303)
作為一個非限制性實例,TMMP之I類MHC重鏈多肽可包含與以下人類HLA-A33重鏈胺基酸序列具有至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0038-368
Figure 110116854-A0202-12-0038-369
(SEQ ID NO:303)。此類I類MHC重鏈在亞洲人群中可為突出的,該亞洲人群包括亞洲人種之個體群體。在一些情況下,胺基酸84為Ala。在一些情況下,胺基酸84為Cys。在一些情況下,胺基酸236為Cys。在一些情況下,胺基酸84為Ala且胺基酸236為Cys。在一些情況下,胺基酸84為Cys且胺基酸236為Cys。
HLA-B
在一些情況下,TMMP包含HLA-B重鏈多肽。可併入TMMP中之HLA-B重鏈肽序列或其部分包括但不限於以下對偶基因:B*0702、B*0801、B*1502、B*3802、B*4001、B*4601及B*5301,其在無全部或實質上全部圖10A中之前導序列、跨膜序列及細胞質序列的情況下比對。彼等對偶基因中之任一者可包含在位置84、139及/或236(如圖10A所示)之一或多者處的選自以下之突變:在位置84處酪胺酸至丙胺酸 (Y84A);在位置84處酪胺酸至半胱胺酸(Y84C);在位置139處丙胺酸至半胱胺酸(A139C);及在位置236處丙胺酸至半胱胺酸之取代(A236C)。另外,亦可採用包含與彼等HLA-B對偶基因之全部或一部分序列(例如,50、75、100、150、200或250個連續胺基酸)具有至少75%(例如,至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%)或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列的HLA-B多肽(例如,其可包含1-25、1-5、5-10、10-15、15-20、20-25、或25-30個胺基酸插入、缺失及/或取代)。
在一些情況下,TMMP包含HLA-B重鏈多肽,其包含以下HLA-B共有胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0039-370
Figure 110116854-A0202-12-0039-371
(SEQ ID NO:30),其中X1為H、Y或D;X2為A或S;X3為M或V;X4為A、S或T;X5為Q或L;X6為A或T;X7為E、M K或T;X8為A或T;X9為E或N;X10為I或K;X11為Y、F、S或C;X12為N或Q;X13為A或T;X14為D或Y;X15為E或V;X16為S或N;X17為T、N或I;X18為A或L;X19為L或R;X20為R或G;X21為T或I;X22為L或I;X23為R或S;X24為R或S;X25為S或T;X26為L或W;X27為E或V;X28為R、D、L或W;X29為A或T;X30為L、E或T;X31為E或D;X32為K或T;X33為E或Q;且X34為I或V。
作為一實例,TMMP之I類MHC重鏈多肽可包含與以下人類HLA-B重鏈胺基酸序列具有至少75%、至少80%、至少85%、至少 90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0040-372
Figure 110116854-A0202-12-0040-373
(SEQ ID NO:207)。
HLA-B(Y84A;A236C)
作為一個非限制性實例,在一些情況下,I類MHC重鏈多肽為包含Y84A及A236C取代之HLA-B多肽。舉例而言,在一些情況下,I類MHC重鏈多肽包含與以下人類HLA-B重鏈(Y84A;A236C)胺基酸序列具有至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0040-374
Figure 110116854-A0202-12-0040-375
(SEQ ID NO:305),其中胺基酸84為Ala且胺基酸236為Cys。在一些情況下,Cys-236與包含R12C取代之變異體β2M多肽之Cys-12形成鏈間二硫鍵。
HLA-B(Y84C;A139C)
在一些情況下,I類MHC重鏈多肽包含Y84C及A139C取代。舉例而言,在一些情況下,I類MHC重鏈多肽包含與以下人類HLA-B重鏈(Y84C;A139C)胺基酸序列具有至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一 致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0041-376
Figure 110116854-A0202-12-0041-377
(SEQ ID NO:306),其中胺基酸84為Cys且胺基酸139為Cys。在一些情況下,Cys-84與Cys-139形成鏈內二硫鍵。
HLA-B *0702
作為一實例,在一些情況下,存在於TMMP中之I類MHC重鏈多肽包含圖10A中之HLA-B*0702(SEQ ID NO:207)的胺基酸序列或與該序列之全部或一部分(例如,50、75、100、150、200或250個連續胺基酸)具有至少75%(例如,至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%)或100%胺基酸序列一致性之序列(例如,其可包含1-25、1-5、5-10、10-15、15-20、20-25、或25-30個胺基酸插入、缺失及/或取代)。在一些情況下,在本揭示案之TMMP之HLA-B重鏈多肽與 8中之經序列標記之HLA-B或 10A中之經標記之「B*0702具有小於100%一致性時,其可包含在位置84、139及/或236中之一或多者處的選自以下之突變:在位置84處酪胺酸至丙胺酸之取代(Y84A);在位置84處酪胺酸至半胱胺酸之取代(Y84C);在位置139處丙胺酸至半胱胺酸(A139C);及在位置236處丙胺酸至半胱胺酸之取代(A236C)。在一些情況下,本揭示案之TMMP之HLA-B重鏈多肽包含Y84A及A236C取代。在一些情況下,本揭示案之TMMP之HLA-B*0702重鏈多肽包含Y84C及A139C取代。在一些情況下,本揭示案之TMMP之HLA-B重鏈多肽包含Y84C、A139C及A236C取代。
HLA-C
在一些情況下,TMMP包含HLA-C重鏈多肽。可併入本揭示案之TMMP中的HLA-C重鏈多肽或其部分包括但不限於以下對偶基因:C*0102、C*0303、C*0304、C*0401、C*0602、C*0701、C*0801及C*1502,其在無全部或實質上全部圖11A中之前導序列、跨膜序列及細胞質序列的情況下比對。彼等對偶基因中之任一者可包含在位置84、139及/或236(如 11A所示)中之一或多者處的選自以下之突變:在位置84處酪胺酸至丙胺酸之取代(Y84A);在位置84處酪胺酸至半胱胺酸之取代(Y84C);在位置139處丙胺酸至半胱胺酸之取代(A139C);及在位置236處丙胺酸至半胱胺酸之取代(A236C)。另外,亦可採用包含與彼等HLA-C對偶基因之全部或一部分序列(例如,50、75、100、150、200或250個連續胺基酸)具有至少75%(例如,至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%)或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列的HLA-C多肽(例如,其可包含1-25、1-5、5-10、10-15、15-20、20-25、或25-30個胺基酸插入、缺失及/或取代)。
在一些情況下,TMMP包含HLA-C重鏈多肽,其包含以下HLA-C共有胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0042-378
Figure 110116854-A0202-12-0042-379
(SEQ ID NO:31),其中X1為C或G;X2為R或K;X3為F、Y、S或D;X4為R或W;X5為H或R;X6為A或S;X7為Q或R;X8為A或E;X9為N或K;X10為T或A;X11為S或N;X12為N或K;X13為A或D; X14為G或R;X15為T或I;X16為L或I;X17為W或R;X18為C、Y、F或S;X19為L或V;X20為Y或H;X21為D或N;X22為Y、F、S或L;X23為L或W;X24為E、A或T;X25為R、L或W;X26為L或T;X27為E或K;X28為E或K;X29為H或P;X30為R或V;X31為W或R;X32為V或M;X33為E或Q;X34為M或V;X35為P或Q;X36為R或S;且X37為P或G。
作為一實例,TMMP之I類MHC重鏈多肽可包含與以下人類HLA-C重鏈胺基酸序列具有至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0043-380
Figure 110116854-A0202-12-0043-381
(SEQ ID NO:219)。
HLA-C(Y84A;A236C)
作為一個非限制性實例,在一些情況下,I類MHC重鏈多肽為包含Y84A及A236C取代之HLA-C多肽。舉例而言,在一些情況下,I類MHC重鏈多肽包含與以下人類HLA-C重鏈(Y84A;A236C)胺基酸序列具有至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0043-382
Figure 110116854-A0202-12-0044-383
Figure 110116854-A0202-12-0044-384
(SEQ ID NO:308),其中胺基酸84為Ala且胺基酸236為Cys。在一些情況下,Cys-236與包含R12C取代之變異體β2M多肽之Cys-12形成鏈間二硫鍵。
HLA-C(Y84C;A139C)
在一些情況下,I類MHC重鏈多肽包含Y84C及A139C取代。舉例而言,在一些情況下,I類MHC重鏈多肽包含與以下人類HLA-C重鏈(Y84C;A139C)胺基酸序列具有至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0044-385
Figure 110116854-A0202-12-0044-386
(SEQ ID NO:397),其中胺基酸84為Cys且胺基酸139為Cys。在一些情況下,Cys-84與Cys-139形成鏈內二硫鍵。
HLA-C *0701
在一些情況下,TMMP之I類MHC重鏈多肽包含圖11A中之HLA-C*0701的胺基酸序列(圖8中之經標記之HLA-C)或與該序列之全部或一部分(例如,50、75、100、150、200或250個連續胺基酸)具有至少75%(例如,至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%)或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列(例如,其可包含1-25、1-5、5-10、10-15、15-20、20-25、或25-30個胺基酸插入、缺失及/或取代)。在一些情況下,在TMMP之HLA-C重鏈多肽與圖11A中的經序列標記之HLA-C*0701具有小於100%一致性時,其可包含在位置84、139及/ 或236中之一或多者處的選自以下之突變:在位置84處酪胺酸至丙胺酸之取代(Y84A);在位置84處酪胺酸至半胱胺酸之取代(Y84C);在位置139處丙胺酸至半胱胺酸(A139C);及在位置236處丙胺酸至半胱胺酸之取代(A236C)。在一些情況下,TMMP之HLA-C重鏈多肽包含Y84A及A236C取代。在一些情況下,T-細胞-MMP或其抗原決定基偶聯物之HLA-C*0701重鏈多肽包含Y84C及A139C取代。在一些情況下,本揭示案之TMMP之HLA-C重鏈多肽包含Y84C、A139C及A236C取代。
非經典HLA-E、HLA-F及HLA-G I類MHC重鏈
在一些情況下,TMMP包含非經典I類MHC重鏈多肽。可併入本揭示案之TMMP中的非經典HLA重鏈多肽或其部分包括但不限於HLA-E、HLA-F及HLA-G對偶基因之彼等。HLA-E、HLA-F及HLA-G重鏈多肽之胺基酸序列(以及HLA-A、HLA-B及HLA-C對偶基因)可見於全球資訊網hla.alleles.org/nomenclature/index.html、歐洲生物信息研究所(www(dot)ebi(dot)ac(dot)uk,該研究所為歐洲分子生物學實驗室(EMBL)之一部分)、及美國國家生物技術信息中心(www(dot)ncbi(dot)nlm(dot)nih(dot)gov)。
適合的HLA-E對偶基因之非限制性實例包括但不限於HLA-E*0101(HLA-E*01:01:01:01)、HLA-E*01:03(HLA-E*01:03:01:01)、HLA-E*01:04、HLA-E*01:05、HLA-E*01:06、HLA-E*01:07、HLA-E*01:09及HLA-E*01:10。適合的HLA-F對偶基因之非限制性實例包括但不限於HLA-F*0101(HLA-F*01:01:01:01)、HLA-F*01:02、HLA-F*01:03(HLA-F*01:03:01:01)、HLA-F*01:04、HLA-F*01:05及HLA-F*01:06。適合的HLA-G對偶基因之非限制性實例包括但不限於HLA-G*0101(HLA-G*01:01:01:01)、HLA-G*01:02、HLA-G*01:03(HLA-G*01:03:01:01)、HLA-G*01:04(HLA-G*01:04:01:01)、HLA-G*01:06、HLA-G*01:07、HLA-G*01:08、HLA-G*01:09:HLA-G*01:10、HLA-G*01:10、HLA-G*01:11、HLA-G*01:12、HLA-G*01:14、HLA-G*01:15、 HLA-G*01:16、HLA-G*01:17、HLA-G*01:18:HLA-G*01:19、HLA-G*01:20及HLA-G*01:22。無前導序列、跨膜序列及細胞質序列中之全部或實質上全部之彼等HLA E、HLA-F及HLA-G對偶基因之共有序列提供於 12中,且將其與 13中之上文提及的HLA-A、HLA-B及HLA-C對偶基因之共有序列進行比對。
適合的HLA-E重鏈多肽之胺基酸序列提供於 46A-46D中,其中圖46A提供HLA-E*01:01(野生型)之胺基酸序列;圖46B提供具有Y84C及A2346C取代的HLA-E*01:01之胺基酸序列;圖46C提供HLA-E*01:03(野生型)之胺基酸序列;且圖46D提供具有Y84C及A2346C取代的HLA-E*01:03之胺基酸序列。
適合的HLA-G重鏈多肽之胺基酸序列提供於 47A-7D中,其中圖47A提供HLA-G*01:01(野生型)之胺基酸序列;圖47B提供具有Y84C及A2346C取代的HLA-G*01:01之胺基酸序列;圖47C提供HLA-G*01:04(野生型)之胺基酸序列;且圖47D提供具有Y84C及A2346C取代的HLA-G*01:04之胺基酸序列。
圖12 提供HLA-E、HLA-F及HLA-G中各者之共有序列,其中可變aa位置指示為依次編號之「X」殘基且aa 84、139及236之位置加雙下劃線。
圖13 提供在圖9-13中給出之HLA-A、HLA-B、HLA-C、HLA-E、HLA-F及HLA-G之共有胺基酸序列的比對。各序列中之可變殘基經列出為「X」,其中序列編號已移除。如圖8所示,指示aa84、139及236及其側翼之五胺基酸簇之位置,該五胺基酸簇可經獨立地選自以下之1至5個胺基酸置換:(i)任何天然存在之胺基酸或(ii)除了脯胺酸或甘胺酸以外的任何天然存在之胺基酸。
上文提及之HLA-E、HLA-F及/或HLA-G對偶基因中之任一者可包含如圖13 所示之共有序列在位置84、139及/或236中之一或多者處的取代。在一些情況下,該等取代可選自:位置84酪胺酸至丙胺酸 (Y84A)或半胱胺酸(Y84C),或在HLA-F情況下,為R84A或R84C取代;位置139丙胺酸至半胱胺酸(A139C),或在HLA-F情況下,為V139C;及在位置236處丙胺酸至半胱胺酸之取代(A236C)。另外,亦可採用與圖13 所列之共有序列中任一者之全部或一部分(例如,50、75、100、150、200或250個連續胺基酸)具有至少75%(例如,至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%)或100%胺基酸序列一致性之HLA-E、HLA-F及/或HLA-G序列(例如,除了其中列出之可變殘基的變化以外,該等序列亦可包含1-25、1-5、5-10、10-15、15-20、20-25、或25-30個胺基酸插入、缺失及/或取代)。
小鼠H2K
在一些情況下,存在於TMMP中之I類MHC重鏈多肽包含小鼠H2K(SEQ ID NO:45)(圖8 中之小鼠H2K)的胺基酸序列或與該序列之全部或一部分(例如,50、75、100、150、200或250個連續胺基酸)具有至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之序列(例如,其可包含1-25、1-5、5-10、10-15、15-20、20-25、或25-30個胺基酸插入、缺失及/或取代)。在一些情況下,在TMMP之小鼠H2K重鏈多肽與圖8 中之經序列標記之小鼠H2K具有小於100%一致性時,其可包含在位置84、139及/或236中之一或多者處的選自以下之突變:在位置84處酪胺酸至丙胺酸(Y84A);在位置84處酪胺酸至半胱胺酸(Y84C);在位置139處丙胺酸至半胱胺酸(A139C);及在位置236處丙胺酸至半胱胺酸之取代(A236C)。在一些情況下,TMMP之小鼠H2K重鏈多肽包含Y84A及A236C取代。在一些情況下,本揭示案之TMMP之小鼠H2K重鏈多肽包含Y84C及A139C取代。在一些情況下,本揭示案之TMMP之小鼠H2K重鏈多肽包含Y84C、A139C及A236C取代。
示範性組合
以下表1呈現可併入本揭示案之TMMP中的I類MHC重鏈序列修飾之各種組合。
Figure 110116854-A0202-12-0048-387
Figure 110116854-A0202-12-0049-388
Figure 110116854-A0202-12-0050-389
β-2微球蛋白
本揭示案之TMMP之β2-微球蛋白(β2M)多肽可為人類β2M多肽、非人靈長類動物β2M多肽、鼠類β2M多肽及類似物。在一些 情況下,β2M多肽包含與圖6中描繪之β2M多肽胺基酸序列具有至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列。在一些情況下,β2M多肽包含與圖6中描繪之β2M胺基酸序列之胺基酸21至119具有至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列。
在一些情況下,適合的β2M多肽包含以下胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0051-392
Figure 110116854-A0202-12-0051-393
Figure 110116854-A0202-12-0051-394
(SEQ ID NO:311);且I類HLA重鏈多肽包含以下胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0051-390
Figure 110116854-A0202-12-0051-391
(SEQ ID NO:309),其中指示為{C}之半胱胺酸殘基在α1與α2-1螺旋之間形成二硫鍵且(C)殘基與位置12處之β2M多肽半胱胺酸形成二硫鍵。在以上序列中,「aa1」為「胺基酸簇1」;「aa2」為「胺基酸簇2」;「aa3」為「胺基酸簇3」;「aa4」為「胺基酸簇4」;「aa5」為「胺基酸簇5」;且「aa6」為「胺基酸簇6」;參見,例如圖10。aa1、aa2、aa3、aa4、aa5及aa6在每次出現時經選擇且經獨立地選擇為1-5個胺基酸殘基,其中胺基酸殘基i)獨立地選自任何天然存在(例如編碼)之胺基酸或ii)除了脯胺酸或甘胺酸以外的任何天然存在之胺基酸。
在一些情況下,MHC多肽相對於參考MHC多肽(其中參考MHC多肽可為野生型MHC多肽)包含單一胺基酸取代,其中單一胺基酸取代以半胱胺酸(Cys)殘基取代一胺基酸。此等半胱胺酸殘基當存在於本揭示案之TMMP之第一多肽的MHC多肽中時,可以與存在於TMMP之第二多肽鏈中的半胱胺酸殘基形成二硫鍵。
在一些情況下,TMMP之第一多肽中的第一MHC多肽及/或TMMP之第二多肽中的第二MHC多肽包括胺基酸取代以用半胱胺酸取代胺基酸,其中第一MHC多肽中之經取代半胱胺酸與第二MHC多肽中之半胱胺酸形成二硫鍵,其中第一MHC多肽中之半胱胺酸與第二MHC多肽中之經取代半胱胺酸形成二硫鍵,或其中第一MHC多肽中之經取代半胱胺酸與第二MHC多肽中之經取代半胱胺酸形成二硫鍵。
舉例而言,在一些情況下,HLA β2-微球蛋白及I類HLA重鏈中之以下殘基對之一經半胱胺酸取代(其中殘基編號為成熟多肽之彼等):1)β2M殘基12,I類HLA重鏈殘基236;2)β2M殘基12,I類HLA重鏈殘基237;3)β2M殘基8,I類HLA重鏈殘基234;4)β2M殘基10,I類HLA重鏈殘基235;5)β2M殘基24,I類HLA重鏈殘基236;6)β2M殘基28,I類HLA重鏈殘基232;7)β2M殘基98,I類HLA重鏈殘基192;8)β2M殘基99,I類HLA重鏈殘基234;9)β2M殘基3,I類HLA重鏈殘基120;10)β2M殘基31,I類HLA重鏈殘基96;11)β2M殘基53,I類HLA重鏈殘基35;12)β2M殘基60,I類HLA重鏈殘基96;13)β2M殘基60,I類HLA重鏈殘基122;14)β2M殘基63,I類HLA重鏈殘基27;15)β2M殘基Arg3,I類HLA重鏈殘基Gly120;16)β2M殘基His31,I類HLA重鏈殘基Gln96;17)β2M殘基Asp53,I類HLA重鏈殘基Arg35;18)β2M殘基Trp60,I類HLA重鏈殘基Gln96;19)β2M殘基Trp60,I類HLA重鏈殘基Asp122;20)β2M殘基Tyr63,I類HLA重鏈殘基Tyr27;21)β2M殘基Lys6,I類HLA重鏈殘基Glu232;22)β2M殘基Gln8,I類HLA重鏈殘基Arg234;23)β2M殘基Tyr10,I類HLA重鏈殘基Pro235;24)β2M殘 基Ser11,I類HLA重鏈殘基Gln242;25)β2M殘基Asn24,I類HLA重鏈殘基Ala236;26)β2M殘基Ser28,I類HLA重鏈殘基Glu232;27)β2M殘基Asp98,I類HLA重鏈殘基His192;及28)β2M殘基Met99,I類HLA重鏈殘基Arg234。I類MHC/HLA重鏈之胺基酸編號係參考成熟I類MHC/HLA重鏈,無信號肽。舉例而言,在一些情況下,成熟HLA-A胺基酸序列之殘基236經Cys取代。在一些情況下,成熟HLA-B胺基酸序列之殘基236經Cys取代。在一些情況下,成熟HLA-C胺基酸序列之殘基236經Cys取代。在一些情況下,圖6中描繪之胺基酸序列的殘基32(對應於成熟β2M之Arg-12)經Cys取代。
在一些情況下,β2M多肽包含以下胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0053-395
Figure 110116854-A0202-12-0053-396
(SEQ ID NO:310)。在一些情況下,β2M多肽包含以下胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0053-397
Figure 110116854-A0202-12-0053-398
Figure 110116854-A0202-12-0053-399
(SEQ ID NO:311)。
在一些情況下,I類HLA重鏈多肽包含HLA-A*2402胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0053-400
Figure 110116854-A0202-12-0053-401
(SEQ ID NO:455)。
在一些情況下,I類HLA重鏈多肽包含HLA-A*2402胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0054-402
Figure 110116854-A0202-12-0054-403
(SEQ ID NO:456)。
在一些情況下,I類HLA重鏈多肽包含以下胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0054-404
Figure 110116854-A0202-12-0054-405
(SEQ ID NO:459)。
在一些情況下,I類HLA重鏈多肽包含以下胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0054-406
Figure 110116854-A0202-12-0054-407
(SEQ ID NO:457)。
在一些情況下,I類HLA重鏈多肽包含以下胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0054-408
Figure 110116854-A0202-12-0055-409
在一些情況下,I類HLA重鏈多肽包含以下胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0055-410
Figure 110116854-A0202-12-0055-411
(SEQ ID NO:346)。
在一些情況下,I類HLA重鏈多肽包含以下胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0055-412
Figure 110116854-A0202-12-0055-413
(SEQ ID NO:44)。
在一些情況下,I類HLA重鏈多肽包含以下胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0055-414
Figure 110116854-A0202-12-0056-415
Figure 110116854-A0202-12-0056-416
(SEQ ID NO:312)。
在一些情況下,I類HLA重鏈多肽包含以下胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0056-417
Figure 110116854-A0202-12-0056-418
(SEQ ID NO:46)。
在一些情況下,β2M多肽包含以下胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0056-419
Figure 110116854-A0202-12-0056-420
Figure 110116854-A0202-12-0056-421
(SEQ ID NO:311);且TMMP之I類HLA重鏈多肽包含以下胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0056-422
Figure 110116854-A0202-12-0056-423
(SEQ ID NO:312),其中加下劃線且呈粗體之Cys殘基在TMMP中彼此形成二硫鍵。
在一些情況下,β2M多肽包含以下胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0057-424
Figure 110116854-A0202-12-0057-425
Figure 110116854-A0202-12-0057-426
(SEQ ID NO:311);且TMMP之I類HLA重鏈多肽包含以下胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0057-427
Figure 110116854-A0202-12-0057-428
(SEQ ID NO:457),其中I類HLA重鏈多肽中胺基酸236處之Cys殘基與β2M多肽之殘基12處的Cys在TMMP中彼此形成二硫鍵。
在一些情況下,β2M多肽包含以下胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0057-571
Figure 110116854-A0202-12-0057-572
(SEQ ID NO:311)。
在一些情況下,TMMP之第一多肽與第二多肽通過以下各物彼此經二硫鍵連接:i)存在於連接第一多肽鏈中之肽抗原決定基與β2M多肽之連接子中的Cys殘基;及ii)存在於第二多肽鏈中之I類MHC重鏈中的Cys殘基。在一些情況下,存在於I類MHC重鏈中之Cys殘基為作為Y84C取代引入之Cys。在一些情況下,連接第一多肽鏈中之肽抗原決定基與β2M多肽之連接子為GCGGS(G4S)n(SEQ ID NO:315),其中n為1、2、3、4、5、6、7、8或9。舉例而言,在一些情況下,連接子包含胺基酸序列GCGGSGGGGSGGGGSGGGGS(SEQ ID NO:316)。作為另一實例,連接子包含胺基酸序列GCGGSGGGGSGGGGS(SEQ ID NO:317)。 TMMP之經二硫鍵連接的第一多肽與第二多肽之實例示意性描繪於圖2A-2F中。
經多個二硫鍵鍵結之TMMP
在一些情況下,本揭示案之TMMP之第一多肽與第二多肽藉由至少兩個二硫鍵(亦即,兩個鏈間二硫鍵)彼此連接。此類經多個二硫鍵連接之TMMP之實例示意性描繪於圖17A及17B以及圖18A-18C中。另外,在TMMP包含IgFc多肽時,異二聚體TMMP可經二聚化,使得二硫鍵連接兩個異二聚體TMMP中之IgFc多肽。此種排列示意性描繪於圖17C及17D中,其中二硫鍵由虛線表示。除非另外說明,否則在此部分中的經多個二硫鍵連接之TMMPP中所述之至少兩個二硫鍵並非指代連接經二聚化TMMP中之IgFc多肽的二硫鍵。
如上文所述,在一些情況下,TMMP之第一多肽與第二多肽藉由至少兩個二硫鍵(亦即,兩個鏈間二硫鍵)彼此連接。舉例而言,在一些情況下,TMMP之第一多肽與第二多肽藉由2個鏈間二硫鍵彼此連接。作為另一實例,在一些情況下,TMMP之第一多肽與第二多肽藉由3個鏈間二硫鍵彼此連接。作為另一實例,在一些情況下,本揭示案之TMMP之第一多肽與第二多肽藉由4個鏈間二硫鍵彼此連接。
在一些情況下,在TMMP之第一多肽中的肽抗原決定基藉由包含Cys之連接子連接至β2M多肽時,至少兩個二硫鍵中之至少一者連接該連接子中之Cys與第二多肽之I類MHC重鏈中之Cys。在一些情況下,在TMMP之第一多肽中的肽抗原決定基藉由連接子連接至I類MHC重鏈多肽時,至少兩個二硫鍵中之至少一者連接該連接子中之Cys與存在於第二多肽之β2M多肽中之Cys。
在一些情況下,經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)與包括該至少兩個二硫鍵中僅一者之對照TMMP相比呈現出增加的穩定性。在一些情況下,經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)與包括該至少兩個二硫鍵中僅一者之對照 TMMP相比呈現出增加的活體外穩定性。舉例而言,在一些情況下,經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)與包括該至少兩個二硫鍵中僅一者之對照TMMP相比呈現出至少5%、至少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少50%、至少2倍、至少5倍或至少10倍更大之活體外穩定性。
經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)與包括該至少兩個二硫鍵中僅一者之對照TMMP相比是否呈現出增加的活體外穩定性,可藉由隨時間且/或在指定條件下且/或在TMMP純化期間量測存在於樣品中的經二硫鍵連接之異二聚體TMMP之量來判定。
舉例而言,在一些情況下,當TMMP在37℃下保存一段時間(例如,約1週至約2週、約2週至約4週、或約4週至約2個月之時間段)時,經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)與包括該至少兩個二硫鍵中僅一者之對照TMMP相比呈現出至少5%、至少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少50%、至少2倍、至少5倍、或至少10倍更大之活體外穩定性。例如,在一些情況下,在37℃下在活體外 保存經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)達28日之後剩餘的經二硫鍵連接之異二聚體TMMP之量與在37℃下在活體外 保存對照TMMP(包括存在於經多個二硫鍵連接之TMMP中的至少兩個二硫鍵中僅一者之TMMP)達28日之後剩餘的經二硫鍵連接之異二聚體TMMP之量相比係至少5%、至少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少50%、至少2倍、至少5倍、或至少10倍更多。
作為一實例,包含如圖14A及14B中所描繪之多肽1715及2380的經雙二硫鍵連接之TMMP與包含多肽2405及2380之TMMP相比呈現出更大的活體外穩定性,其中多肽2405描繪於圖14D中,其中此類TMMP包含僅一個二硫鍵聯,其中單一二硫鍵在以下各物之間形成:i)在抗原決定基與β2M之間的G2C連接子之Cys;與ii)藉由I類MHC重鏈中之Y84C取代提供之Cys。作為另一實例,包含如圖14A及14B中所描繪 之多肽1715及2380的經雙二硫鍵連接之TMMP與包含多肽1380及2380之TMMP相比呈現出更大的活體外穩定性,其中多肽1380描繪於圖14E中,其中此類TMMP包含僅一個二硫鍵聯,其中單一二硫鍵在以下各物之間形成:i)藉由β2M多肽中之R12C取代提供之Cys;與ii)藉由I類MHC重鏈中之A236C取代提供之Cys。
在一些情況下,經多個二硫鍵連接之TMMP與包括該至少兩個二硫鍵中僅一者之對照TMMP相比呈現出增加的活體內穩定性。舉例而言,在一些情況下,經多個二硫鍵連接之TMMP與包括該至少兩個二硫鍵中僅一者之對照TMMP相比呈現出至少5%、至少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少50%、至少2倍、至少5倍、或至少10倍更大之活體內穩定性。
在一些情況下,在經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)中存在兩個二硫鍵使得經二硫鍵連接之異二聚體TMMP之產生與在TMMP為包括該至少兩個二硫鍵中僅一者之對照TMMP時產生的經二硫鍵連接之異二聚體TMMP之量相比有所增加。舉例而言,經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)可在活體外 細胞培養之哺乳動物細胞中產生,其中哺乳動物細胞在液體細胞培養基中培養。TMMP可分泌至細胞培養基中。細胞可裂解,從而生成細胞裂解物,且TMMP可存在於細胞裂解物中。TMMP可自細胞培養基及/或細胞裂解物中純化。舉例而言,在TMMP包含IgG1 Fc多肽時,細胞培養基及/或細胞裂解物可與經固定之蛋白A接觸(例如,細胞培養基及/或細胞裂解物可施用至蛋白A管柱,其中蛋白A固定於珠粒上)。存在於細胞培養基及/或細胞裂解物中之TMMP結合至經固定之蛋白A。在洗滌管柱以移除未結合之材料後,使結合之TMMP溶離,從而生成蛋白A溶離物。存在於蛋白A溶離物中的經二硫鍵連接之異二聚體TMMP之量與在TMMP為包括存在於經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)中之至少兩個二硫鍵中僅一者之對照TMMP時存在於蛋白A溶離物中的經二 硫鍵連接之異二聚體TMMP之量相比至少0.5%、至少1%、至少2%、至少3%、至少4%、至少5%、至少6%、至少7%、至少8%、至少9%或至少10%更多。在一些情況下,溶離物中為非聚集之經二硫鍵連接之異二聚體TMMP的總TMMP蛋白之百分比為至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%或至少99%。蛋白A溶離物可經受尺寸排阻層析(Size-Exclusion Chromatography,SEC)及/或一或多個其他額外純化步驟。
在一些情況下,TMMP包含至少一種異二聚體,其包含:a)第一多肽,該第一多肽包含:i)WT1肽抗原決定基,其中該WT1肽之長度為至少4個胺基酸(例如,4個胺基酸至25個胺基酸;例如WT1肽具有之長度為4、5、6、7、8、9、10-15、15-20、或20-25個胺基酸);及ii)第一MHC多肽;b)第二多肽,該第二多肽包含第二MHC多肽,及c)至少一種MOD,其中該第一多肽及/或該第二多肽包含MOD,且其中該異二聚體在第一多肽與第二多肽之間包含2個二硫鍵(亦即,該異二聚體包含:i)連接第一多肽與第二多肽之第一二硫鍵;及ii)連接第一多肽與第二多肽之第二二硫鍵)。換言之,第一多肽包含之第一Cys殘基與第二多肽中之第一Cys殘基形成二硫鍵(第一二硫鍵);且第一多肽包含之第二Cys殘基與第二多肽中之第二Cys殘基形成二硫鍵(第二二硫鍵)。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽,該第一多肽以自N端至C端之次序包含:i)肽抗原決定基;ii)肽連接子;及iii)β2M多肽;及b)第二多肽,該第二多肽包含I類MHC重鏈多肽,其中該第一多肽及該第二多肽中之一者或二者包含至少一種MOD,其中該TMMP包含:a)以下各物之間的第一二硫鍵聯:i)存在於肽抗原決定基與β2M多肽之間的連接子中之Cys;與ii)引入至I類MHC重鏈多肽中之第一Cys;及b)第一多肽與第二多肽之間的至少一個第二二硫鍵聯,其中該至少一個第二二硫鍵聯係在以下各物之間:i)第一多肽中在存在於連接子中之Cys之C端 的Cys;與ii)第二多肽中在引入至I類MHC重鏈多肽中之第一Cys之C端的Cys。
在一些情況下,在TMMP之第一多肽或第二多肽中的第一二硫鍵形成Cys殘基與第二二硫鍵形成Cys殘基彼此間隔約10個胺基酸至約200個胺基酸。例如,在一些情況下,在TMMP之第一多肽或第二多肽中之第一二硫鍵形成Cys殘基與第二二硫鍵形成Cys殘基間隔約10個胺基酸(aa)至約15 aa、約15 aa至約20 aa、約20 aa至約25 aa、約25 aa至約30 aa、約30 aa至約40 aa、約40 aa至約50 aa、約50 aa至約60 aa、約60 aa至約70 aa、約70 aa至約80 aa、約80 aa至約90 aa、約90 aa至約100 aa、約100 aa至約110 aa、約110 aa至約120 aa、約120 aa至約130 aa、約130 aa至約140 aa、約140 aa至約150 aa、約150 aa至約160 aa、約160 aa至約170 aa、約170 aa至約180 aa、約180 aa至約190 aa、或約190 aa至約200 aa。
作為一實例,在一些情況下,在TMMP之第一多肽中的第一二硫鍵形成Cys殘基與第二二硫鍵形成Cys殘基彼此間隔約10個胺基酸至約80個胺基酸殘基。舉例而言,在一些情況下,第一多肽中之第二二硫鍵形成Cys殘基在第一多肽中之第一二硫鍵形成Cys殘基之C端的約10個胺基酸至約80個胺基酸(例如,約10個胺基酸(aa)至約15 aa、約15 aa至約20 aa、約20 aa至約25 aa、約25 aa至約30 aa、約30 aa至約40 aa、約40 aa至約50 aa、約50 aa至約60 aa、約60 aa至約70 aa、或約70 aa至約80 aa)處。在一些情況下,第一多肽中之第二二硫鍵形成Cys殘基在第一多肽中之第一二硫鍵形成Cys殘基之C端的10 aa、11 aa、12 aa、13 aa、14 aa、15 aa、16 aa、17 aa、18 aa、19 aa、20 aa、21 aa、22 aa、23 aa、24 aa或25 aa處。在一些情況下,第一多肽中之第二二硫鍵形成Cys殘基在第一多肽中之第一二硫鍵形成Cys殘基之C端的15 aa處。在一些情況下,第一多肽中之第二二硫鍵形成Cys殘基在第一多肽中之第一二硫鍵形成Cys 殘基之C端的20 aa處。在一些情況下,第一多肽中之第二二硫鍵形成Cys殘基在第一多肽中之第一二硫鍵形成Cys殘基之C端的25 aa處。
在一些情況下,在本揭示案之TMMP之第二多肽中的第一二硫鍵形成Cys殘基與第二二硫鍵形成Cys殘基彼此間隔約140個胺基酸至約160個胺基酸。舉例而言,在一些情況下,第二多肽中之第二二硫鍵形成Cys殘基在第二多肽中之第一二硫鍵形成Cys殘基之C端的約140個胺基酸至約160個胺基酸處。在一些情況下,第二多肽中之第二二硫鍵形成Cys殘基在第二多肽中之第一二硫鍵形成Cys殘基之C端的140個胺基酸(aa)、141 aa、142 aa、143 aa、144 aa、145 aa、146 aa、147 aa、148 aa、149 aa、150 aa、151 aa、152 aa、153 aa、154 aa、155 aa、156 aa、157 aa、158 aa、159 aa或160 aa處。
經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)可包含:a)第一多肽,該第一多肽包含:i)WT1肽(例如,具有4個胺基酸至約25個胺基酸之WT1肽);及ii)第一MHC多肽,其中該第一多肽包含介於WT1肽與第一MHC多肽之間的肽連接子,其中該肽連接子包含Cys殘基,且其中該第一MHC多肽為包含引入Cys殘基之胺基酸取代的β2M多肽;b)及第二多肽,該第二多肽包含第二MHC多肽,其中該第二MHC多肽為I類重鏈,其包含基於HLA-A*0201(圖9A中描繪)之胺基酸編號或在另一種I類重鏈對偶基因中之相應位置處的Y84C取代及A236C取代,其中該TMMP包含介於肽連接子中之Cys殘基與I類重鏈之胺基酸位置84或另一種I類重鏈對偶基因之相應位置處的Cys殘基之間的二硫鍵,且其中該TMMP包含介於β2M多肽中引入之Cys殘基與I類重鏈之胺基酸位置236或另一種I類重鏈對偶基因之相應位置處的Cys之間的二硫鍵;及c)至少一種MOD,其中該第一多肽及/或第二多肽包含該至少一種MOD。實例示意性地描繪於圖17A及圖17B中。
在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列GCGGS(SEQ ID NO:318)。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列GCGGS(GGGGS)n (SEQ ID NO:319),其中n為1至10之整數。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列GCGGS(GGGGS)n(SEQ ID NO:398),其中n為1。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列GCGGS(GGGGS)n(SEQ ID NO:320),其中n為2。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列GCGGS(GGGGS)n(SEQ ID NO:321),其中n為3。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列GCGGS(GGGGS)n(SEQ ID NO:322),其中n為4。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列GCGGS(GGGGS)n(SEQ ID NO:323),其中n為5。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列GCGGS(GGGGS)n(SEQ IDNO:324),其中n為6。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列GCGGS(GGGGS)n(SEQ ID NO:325),其中n為7。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列GCGGS(GGGGS)n(SEQ ID NO:326),其中n為8。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列GCGGS(GGGGS)n(SEQ ID NO:327),其中n為9。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列GCGGS(GGGGS)n(SEQ ID NO:328),其中n為10。
在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列CGGGS(SEQ ID NO:329)。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列CGGGS(GGGGS)n(SEQ ID NO:330),其中n為1至10之整數。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列CGGGS(GGGGS)n(SEQ ID NO:331),其中n為1。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列CGGGS(GGGGS)n(SEQ ID NO:332),其中n為2。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列CGGGS(GGGGS)n(SEQ ID NO:333),其中n為3。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列CGGGS(GGGGS)n(SEQ ID NO:334),其中n為4。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列CGGGS(GGGGS)n(SEQ ID NO:335),其中n為5。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列CGGGS(GGGGS)n(SEQ ID NO:336),其中n為6。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列CGGGS(GGGGS)n(SEQ ID NO:337),其中n為7。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列CGGGS(GGGGS)n(SEQ ID NO:338),其中n為8。在一 些情況下,肽連接子包含胺基酸序列CGGGS(GGGGS)n(SEQ ID NO:339),其中n為9。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列CGGGS(GGGGS)n(SEQ ID NO:340),其中n為10。
以下為包含基於HLA-A*0201(圖9A中描繪)之胺基酸編號或在另一種I類重鏈對偶基因之相應位置處之Y84C取代及A236C取代的I類MHC重鏈之非限制性實例。
HLA-A
在一些情況下,經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)包含:a)第一多肽,該第一多肽包含:i)AFP肽(例如,具有4個胺基酸至約25個胺基酸之1 AFP肽);及ii)第一MHC多肽,其中該第一多肽包含介於AFP肽與第一MHC多肽之間的肽連接子,其中該肽連接子包含Cys殘基,且其中該第一MHC多肽為包含引入Cys殘基之胺基酸取代的β2M多肽;及b)第二多肽,其包含HLA-C I類MHC重鏈,該重鏈包含與以下胺基酸序列具有至少60%、至少70%、至少80%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0065-429
Figure 110116854-A0202-12-0065-430
(SEQ ID NO:342),其中胺基酸84為Cys且胺基酸236為Cys;及c)至少一種MOD,其中該第一多肽及/或該第二多肽包含該至少一種MOD。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列GCGGS(SEQ ID NO:318)。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列GCGGS(GGGGS)n(SEQ ID NO:319),其中n為1至10之整數。在一些情況下,β2M多肽包含R12C取代。舉例而言,β2M多 肽可包含與以下胺基酸序列具有至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0066-431
Figure 110116854-A0202-12-0066-432
(SEQ ID NO:311),其中胺基酸12為Cys。該至少一種MOD可為對靶標T細胞發揮活化/刺激作用或對靶標T細胞發揮抑制/抑制性(suppressing/inhibitory)效應的多肽。舉例而言,該至少一種MOD可為細胞介素(例如,IL2多肽、IL7多肽、IL12多肽、IL15多肽、IL17多肽、IL21多肽、IL27多肽、IL-23多肽、TGFβ多肽及類似物;且包括全部家族成員,例如IL17A、IL-17B、IL-17C、IL-17D、IL-17E、IL-17F、IL-17E)、4-1BBL多肽、ICOS-L多肽、OX-40L多肽、CD80多肽、CD86多肽(CD80及CD86亦分別稱為B7-1及B7-2)、CD40多肽、CD70多肽、JAG1(CD339)多肽、ICAM(CD540多肽、PD-L1多肽、FasL多肽、PD-L2多肽、PD-1H(VISTA)多肽、ICOS-L(CD275)多肽、GITRL多肽、HVEM多肽、CXCL10多肽、CXCL9多肽、CXCL11多肽、CXCL13多肽、及CX3CL1多肽、半乳糖凝集素-9多肽、CD83多肽、CD30L多肽、HLA-G多肽、MICA多肽、MICB多肽、HVEM(CD270)多肽、淋巴毒素β受體多肽、3/TR6多肽、ILT3多肽、ILT4多肽、CXCL10多肽、CXCL9多肽、CXCL11多肽、CXCL13多肽或CX3CL1多肽。此等MOD可為野生型多肽或野生型多肽之變異體。在一些情況下,MOD為活化(「刺激」)免疫調節多肽;例如,MOD可對T細胞產生活化/刺激效應。活化MOD之實例包括例如CD80、CD86、4-1BBL、OX40L、CD70、ICOS-L、CD40、ICAM(CD54)、IL2、IL7、IL12、IL15、IL17、IL21、IL27、IL23、GITRL、TGFβ及淋巴毒素β受體。在一些情況下,MOD為抑制(「抑制性」)免疫調節多肽;例如,MOD可對T細胞產生抑制/抑制性效應。抑制性MOD之實例包括例如PD-1H、PD-L1、PD-L2、TGFβ、FasL、HVEM、半乳糖凝集素-9、ILT3及ILT4。視情形而定,TGFβ多肽可產生活化/刺激效應或抑制/抑制性效應。
在一些情況下,經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)包含:a)第一多肽,該第一多肽包含:i)WT1肽(例如,具有4個胺基酸至約25個胺基酸之WT1肽);及ii)第一MHC多肽,其中該第一多肽包含介於WT1肽與第一MHC多肽之間的肽連接子,其中該肽連接子包含Cys殘基,且其中該第一MHC多肽為包含引入Cys殘基之胺基酸取代的β2M多肽;及b)第二多肽,該第二多肽包含I類HLA-A MHC重鏈,該重鏈包含與以下胺基酸序列具有至少60%、至少70%、至少80%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0067-433
Figure 110116854-A0202-12-0067-434
(SEQ ID NO:346),其中胺基酸84為Cys且胺基酸236為Cys;及c)至少一種MOD,其中該第一多肽及/或該第二多肽包含該至少一種免疫調節多肽。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列GCGGS(SEQ ID NO:318)。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列GCGGS(GGGGS)n(SEQ ID NO:319),其中n為1至10之整數。在一些情況下,β2M多肽包含R12C取代。舉例而言,β2M多肽可包含與以下胺基酸序列具有至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0067-435
Figure 110116854-A0202-12-0067-436
(SEQ ID NO:311),其中胺基酸12為Cys。該至少一種MOD可為對靶標T細胞發揮活化/刺激作用或對靶標T細胞發揮抑制/抑制性(suppressing/inhibitory)效應的多肽。舉例而言,該至少一種MOD可為細胞 介素(例如,IL2多肽、IL7多肽、IL12多肽、IL15多肽、IL17多肽、IL21多肽、IL27多肽、IL-23多肽、TGFβ多肽及類似物;且包括全部家族成員,例如ILI7A、IL-17B、IL-17C、IL-17D、IL-17E、IL-17F、IL-17E)、4-1BBL多肽、ICOS-L多肽、OX-40L多肽、CD80多肽、CD86多肽(CD80及CD86亦分別稱為B7-1及B7-2)、CD40多肽、CD70多肽、JAG1(CD339)多肽、ICAM(CD540多肽、PD-L1多肽、FasL多肽、PD-L2多肽、PD-1H(VISTA)多肽、ICOS-L(CD275)多肽、GITRL多肽、HVEM多肽、CXCL10多肽、CXCL9多肽、CXCL11多肽、CXCL13多肽、及CX3CL1多肽、半乳糖凝集素-9多肽、CD83多肽、CD30L多肽、HLA-G多肽、MICA多肽、MICB多肽、HVEM(CD270)多肽、淋巴毒素β受體多肽、3/TR6多肽、ILT3多肽、ILT4多肽、CXCL10多肽、CXCL9多肽、CXCL11多肽、CXCL13多肽及CX3CL1多肽。此等MOD可為野生型多肽或野生型多肽之變異體。其中,以下MOD可產生活化/刺激效應:CD80、CD86、4-1BBL、OX40L、CD70、ICOS-L、CD40、ICAM(CD54)、IL2、IL7、IL12、IL15、IL17、IL21、IL27、IL23、GITRL、TGFβ、淋巴毒素β受體、3/TR6、ILT3、ILT4、CXCL10、CXCL9、CXCL11、CXCL13及CX3CL1。其中,以下MOD可產生抑制/抑制性效應:PD-1H、PD-L1、PD-L2、TGFβ、FasL、HVEM、半乳糖凝集素-9、ILT3、ILT4。視情形而定,TGFβ多肽可產生活化/刺激效應或抑制/抑制性效應。在一些情況下,該至少一種MOD為親和力減小之變異體,如本文其他位置所述。在一些情況下,該第一多肽或該第二多肽包含Ig Fc多肽。
在一些情況下,該至少一種MOD為親和力減小之變異體,如本文其他位置所述。在一些情況下,該第一多肽或該第二多肽包含Ig Fc多肽。
在一些情況下,經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)包含I類HLA-A重鏈多肽。在一些情況下,存在於本揭示案之經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP) 中的HLA-A重鏈多肽包含與圖9A中描繪之HLA-A*0101、HLA-A*0201、HLA-A*0202、HLA-A*1101、HLA-A*2301、HLA-A*2402、HLA-A*2407、HLA-A*3303或HLA-A*3401胺基酸序列具有至少95%、至少98%或至少99%胺基酸序列一致性之胺基酸序列,其中HLA-A重鏈多肽包含Y84C及A236C取代。
HLA-A *0101(Y84C;A236C)
在一些情況下,存在於經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)中的HLA-A重鏈多肽包含與以下HLA-A*0101(Y84C;A236C)胺基酸序列具有至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0069-437
Figure 110116854-A0202-12-0069-438
(SEQ ID NO:343),其中胺基酸84為Cys且胺基酸236為Cys。
HLA-A *0201(Y84C;A236C)
在一些情況下,存在於經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)中的HLA-A重鏈多肽包含與以下HLA-A*0201(Y84C;A236C)胺基酸序列具有至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0069-439
Figure 110116854-A0202-12-0070-440
Figure 110116854-A0202-12-0070-441
(SEQ ID NO:342),其中胺基酸84為Cys且胺基酸236為Cys。
HLA-A *0202(Y84C;A236C)
在一些情況下,存在於經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)中的HLA-A重鏈多肽包含與以下HLA-A*0202(Y84C;A236C)胺基酸序列具有至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0070-442
Figure 110116854-A0202-12-0070-443
(SEQ ID NO:341),其中胺基酸84為Cys且胺基酸236為Cys。
HLA-A *1101(Y84C;A236C)
在一些情況下,存在於經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)中的HLA-A重鏈多肽包含與以下HLA-A*1101(Y84C;A236C)胺基酸序列具有至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0070-444
Figure 110116854-A0202-12-0070-445
(SEQ ID NO:344),其中胺基酸84為Cys且胺基酸236為Cys。
HLA-A *2301(Y84C;A236C)
在一些情況下,存在於經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)中的HLA-A重鏈多肽包含與以下HLA-A*2301(Y84C;A236C)胺基酸序列具有至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0071-446
Figure 110116854-A0202-12-0071-447
(SEQ ID NO:345),其中胺基酸84為Cys且胺基酸236為Cys。
HLA-A *2402(Y84C;A236C)
在一些情況下,存在於經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)中的HLA-A重鏈多肽包含與以下HLA-A*2402(Y84C;A236C)胺基酸序列具有至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0071-448
Figure 110116854-A0202-12-0071-449
(SEQ ID NO:346),其中胺基酸84為Cys且胺基酸236為Cys。
HLA-A *2407(Y84C;A236C)
在一些情況下,存在於經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)中的HLA-A重鏈多肽包含與以下HLA- A*2407(Y84C;A236C)胺基酸序列具有至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0072-450
Figure 110116854-A0202-12-0072-451
(SEQ ID NO:347),其中胺基酸84為Cys且胺基酸236為Cys。
HLA-A *3303(Y84C;A236C)
在一些情況下,存在於經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)中的HLA-A重鏈多肽包含與以下HLA-A*3303(Y84C;A236C)胺基酸序列具有至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0072-452
Figure 110116854-A0202-12-0072-453
(SEQ ID NO:348),其中胺基酸84為Cys且胺基酸236為Cys。
HLA-A *3401(Y84C;A236C)
在一些情況下,存在於經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)中的HLA-A重鏈多肽包含與以下HLA-A*3401(Y84C;A236C)胺基酸序列具有至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0073-454
Figure 110116854-A0202-12-0073-455
(SEQ ID NO:349),其中胺基酸84為Cys且胺基酸236為Cys。
HLA-B
在一些情況下,經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)包含:a)第一多肽,該第一多肽包含:i)WT1肽(例如,具有4個胺基酸至約25個胺基酸之WT1肽);及ii)第一MHC多肽,其中該第一多肽包含介於WT1肽與第一MHC多肽之間的肽連接子,其中該肽連接子包含Cys殘基,且其中該第一MHC多肽為包含引入Cys殘基之胺基酸取代的β2M多肽;及b)第二多肽,該第二多肽包含HLA-B I類MHC重鏈,該重鏈包含與以下胺基酸序列具有至少60%、至少70%、至少80%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0073-456
Figure 110116854-A0202-12-0073-457
(SEQ ID NO:350),其中胺基酸84為Cys且胺基酸236為Cys;及c)至少一種MOD,其中該第一多肽及/或該第二多肽包含該至少一種MOD。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列GCGGS(SEQ ID NO:318)。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列GCGGS(GGGGS)n(SEQ ID NO:319),其中n為1至10之整 數。在一些情況下,β2M多肽包含R12C取代。舉例而言,β2M多肽可包含與以下胺基酸序列具有至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0074-458
Figure 110116854-A0202-12-0074-459
(SEQ ID NO:311),其中胺基酸12為Cys。該至少一種MOD可為對靶標T細胞發揮活化/刺激作用或對靶標T細胞發揮抑制/抑制性(suppressing/inhibitory)效應的多肽。舉例而言,該至少一種MOD可為細胞介素(例如,IL2多肽、IL7多肽、IL12多肽、IL15多肽、IL17多肽、IL21多肽、IL27多肽、IL-23多肽、TGFβ多肽及類似物;且包括全部家族成員,例如IL17A、IL-17B、IL-17C、IL-17D、IL-17E、IL-17F、IL-17E)、4-1BBL多肽、ICOS-L多肽、OX-40L多肽、CD80多肽、CD86多肽(CD80及CD86亦分別稱為B7-1及B7-2)、CD40多肽、CD70多肽、JAG1(CD339)多肽、ICAM(CD540多肽、PD-L1多肽、FasL多肽、PD-L2多肽、PD-1H(VISTA)多肽、ICOS-L(CD275)多肽、GITRL多肽、HVEM多肽、CXCL10多肽、CXCL9多肽、CXCL11多肽、CXCL13多肽、及CX3CL1多肽、半乳糖凝集素-9多肽、CD83多肽、CD30L多肽、HLA-G多肽、MICA多肽、MICB多肽、HVEM(CD270)多肽、淋巴毒素β受體多肽、3/TR6多肽、ILT3多肽、ILT4多肽、CXCL10多肽、CXCL9多肽、CXCL11多肽、CXCL13多肽或CX3CL1多肽。此等MOD可為野生型多肽或野生型多肽之變異體。在一些情況下,MOD為活化(「刺激」)免疫調節多肽;例如,MOD可對T細胞產生活化/刺激效應。活化MOD之實例包括例如CD80、CD86、4-1BBL、OX40L、CD70、ICOS-L、CD40、ICAM(CD54)、IL2、IL7、IL12、IL15、IL17、IL21、IL27、IL23、GITRL、TGFβ及淋巴毒素β受體。在一些情況下,免疫調節多肽為抑制(「抑制性」)MOD;例如,MOD可對T細胞產生抑制/抑制性效應。抑制性MOD之實例包括例如PD- 1H、PD-L1、PD-L2、TGFβ、FasL、HVEM、半乳糖凝集素-9、ILT3及ILT4。視情形而定,TGFβ多肽可產生活化/刺激效應或抑制/抑制性效應。
.在一些情況下,該至少一種MOD為親和力減小之變異體,如本文其他位置所述。在一些情況下,該第一多肽或該第二多肽包含Ig Fc多肽。
在一些情況下,經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)包含I類HLA-B重鏈多肽。在一些情況下,存在於經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)中的HLA-B重鏈多肽包含與圖10A中描繪之HLA-B*0702、HLA-B*0801、HLA-B*1502、HLA-B*3802、HLA-B*4001、HLA-B*4601或HLA-B*5301胺基酸序列具有至少95%、至少98%或至少99%胺基酸序列一致性之胺基酸序列,其中HLA-B重鏈多肽包含Y84C及A236C取代。
HLA-B *0702(Y84C;A236C)
在一些情況下,存在於經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)中的HLA-B重鏈多肽包含與以下HLA-B*0702(Y84C;A236C)胺基酸序列具有至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0075-460
Figure 110116854-A0202-12-0075-461
(SEQ ID NO:350),其中胺基酸84為Cys且胺基酸236為Cys。
HLA-B *0801(Y84C;A236C)
在一些情況下,存在於經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)中的HLA-B重鏈多肽包含與以下HLA-B*0801(Y84C;A236C)胺基酸序列具有至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0076-462
Figure 110116854-A0202-12-0076-463
(SEQ ID NO:351),其中胺基酸84為Cys且胺基酸236為Cys。
HLA-B *1502(Y84C;A236C)
在一些情況下,存在於經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)中的HLA-B重鏈多肽包含與以下HLA-B*1502(Y84C;A236C)胺基酸序列具有至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0076-464
Figure 110116854-A0202-12-0076-465
(SEQ ID NO:352),其中胺基酸84為Cys且胺基酸236為Cys。
HLA-B *3802(Y84C;A236C)
在一些情況下,存在於經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)中的HLA-B重鏈多肽包含與以下HLA-B*3802(Y84C;A236C)胺基酸序列具有至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0077-466
Figure 110116854-A0202-12-0077-467
(SEQ ID NO:353),其中胺基酸84為Cys且胺基酸236為Cys。
HLA-B *4001(Y84C;A2346C)
在一些情況下,存在於經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)中的HLA-B重鏈多肽包含與以下HLA-B*4001(Y84C;A236C)胺基酸序列具有至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0077-468
Figure 110116854-A0202-12-0077-469
(SEQ ID NO:354),其中胺基酸84為Cys且胺基酸236為Cys。
HLA-B *4601(Y84C;A236C)
在一些情況下,存在於經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)中的HLA-B重鏈多肽包含與以下HLA-B*4601(Y84C;A236C)胺基酸序列具有至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0078-470
Figure 110116854-A0202-12-0078-471
(SEQ ID NO:355),其中胺基酸84為Cys且胺基酸236為Cys。
HLA-B *5301(Y84C;A236C)
在一些情況下,存在於經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)中的HLA-B重鏈多肽包含與以下HLA-B*5301(Y84C;A236C)胺基酸序列具有至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0078-472
Figure 110116854-A0202-12-0078-473
(SEQ ID NO:356),其中胺基酸84為Cys且胺基酸236為Cys。
HLA-C
在一些情況下,經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)包含:a)第一多肽,該第一多肽包含:i)WT-1肽(例如,具有4個胺基酸至約25個胺基酸之1WT-1肽);及ii)第一MHC多肽,其中該第一多肽包含介於WT-1肽與第一MHC多肽之間的肽連接子,其中該肽連接子包含Cys殘基,且其中該第一MHC多肽為包含引入Cys殘基之胺基酸取代的β2M多肽;及b)第二多肽,其包含HLA-C I類MHC重鏈,該重鏈包含與以下胺基酸序列具有至少60%、至少70%、至少80%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0079-474
Figure 110116854-A0202-12-0079-475
(SEQ ID NO:357),其中胺基酸84為Cys且胺基酸236為Cys;及c)至少一種MOD,其中該第一多肽及/或該第二多肽包含該至少一種MOD。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列GCGGS(SEQ ID NO:318)。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列GCGGS(GGGGS)n(SEQ ID NO:319),其中n為1至10之整數。在一些情況下,β2M多肽包含R12C取代。舉例而言,β2M多肽可包含與以下胺基酸序列具有至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0079-476
Figure 110116854-A0202-12-0079-477
(SEQ ID NO:311),其中胺基酸12為Cys。該至少一種MOD可為對靶標T細胞發揮活化/刺激作用或對靶標T細胞發揮抑制/抑制性(suppressing/inhibitory)效應的多肽。舉例而言,該至少一種MOD可為細胞 介素(例如,IL2多肽、IL7多肽、IL12多肽、IL15多肽、IL17多肽、IL21多肽、IL27多肽、IL-23多肽、TGFβ多肽及類似物;且包括全部家族成員,例如IL17A、IL-17B、IL-17C、IL-17D、IL-17E、IL-17F、IL-17E)、4-1BBL多肽、ICOS-L多肽、OX-40L多肽、CD80多肽、CD86多肽(CD80及CD86亦分別稱為B7-1及B7-2)、CD40多肽、CD70多肽、JAG1(CD339)多肽、ICAM(CD540多肽、PD-L1多肽、FasL多肽、PD-L2多肽、PD-1H(VISTA)多肽、ICOS-L(CD275)多肽、GITRL多肽、HVEM多肽、CXCL10多肽、CXCL9多肽、CXCL11多肽、CXCL13多肽、及CX3CL1多肽、半乳糖凝集素-9多肽、CD83多肽、CD30L多肽、HLA-G多肽、MICA多肽、MICB多肽、HVEM(CD270)多肽、淋巴毒素β受體多肽、3/TR6多肽、ILT3多肽、ILT4多肽、CXCL10多肽、CXCL9多肽、CXCL11多肽、CXCL13多肽或CX3CL1多肽。此等MOD可為野生型多肽或野生型多肽之變異體。在一些情況下,免疫調節多肽為活化(「刺激」)MOD;例如,MOD可對T細胞產生活化/刺激效應。活化免疫調節多肽之實例包括例如CD80、CD86、4-1BBL、OX40L、CD70、ICOS-L、CD40、ICAM(CD54)、IL2、IL7、IL12、IL15、IL17、IL21、IL27、IL23、GITRL、TGFβ及淋巴毒素β受體。在一些情況下,MOD為抑制(「抑制性」)免疫調節多肽;例如,MOD可對T細胞產生抑制/抑制性效應。抑制性MOD之實例包括例如PD-1H、PD-L1、PD-L2、TGFβ、FasL、HVEM、半乳糖凝集素-9、ILT3及ILT4。視情形而定,TGFβ多肽可產生活化/刺激效應或抑制/抑制性效應。
在一些情況下,該至少一種MOD為親和力減小之變異體,如本文其他位置所述。在一些情況下,該第一多肽或該第二多肽包含Ig Fc多肽。
在一些情況下,經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)包含I類HLA-C重鏈多肽。在一些情況下,存在於經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)中的HLA- C重鏈多肽包含與圖11A中描繪之HLA-C*0102、HLA-C*0303、HLA-C*0304、HLA-C*0401、HLA-C*0602、HLA-C*0701、HLA-C*0702、HLA-C*0801或HLA-C*1502胺基酸序列具有至少95%、至少98%或至少99%胺基酸序列一致性之胺基酸序列,其中HLA-C重鏈多肽包含Y84C及A236C取代。
HLA-C *01:02(Y84C;A236C)
在一些情況下,存在於經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)中的HLA-C重鏈多肽包含與以下HLA-C*01:02(Y84C;A236C)胺基酸序列具有至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0081-478
Figure 110116854-A0202-12-0081-479
(SEQ ID NO:358),其中胺基酸84為Cys且胺基酸236為Cys。
HLA-C *0303(Y84C;A236C)
在一些情況下,存在於經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)中的HLA-C重鏈多肽包含與以下HLA-C*03:03(Y84C;A236C)胺基酸序列具有至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0081-480
Figure 110116854-A0202-12-0082-481
Figure 110116854-A0202-12-0082-482
(SEQ ID NO:359),其中胺基酸84為Cys且胺基酸236為Cys。
HLA-C *0304(Y84C;A236C)
在一些情況下,存在於經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)中的HLA-C重鏈多肽包含與以下HLA-C*03:04(Y84C;A236C)胺基酸序列具有至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0082-483
Figure 110116854-A0202-12-0082-484
(SEQ ID NO:360),其中胺基酸84為Cys且胺基酸236為Cys。
HLA-C *0401(Y84C;A236C)
在一些情況下,存在於經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)中的HLA-C重鏈多肽包含與以下HLA-C*04:01(Y84C;A236C)胺基酸序列具有至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0082-485
Figure 110116854-A0202-12-0083-486
Figure 110116854-A0202-12-0083-487
(SEQ ID NO:361),其中胺基酸84為Cys且胺基酸236為Cys。
HLA-C *0602(Y84C;A236C)
在一些情況下,存在於經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)中的HLA-C重鏈多肽包含與以下HLA-C*06:02(Y84C;A236C)胺基酸序列具有至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0083-488
Figure 110116854-A0202-12-0083-489
(SEQ ID NO:362),其中胺基酸84為Cys且胺基酸236為Cys。
HLA-C *0701(Y84C;A236C)
在一些情況下,存在於經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)中的HLA-C重鏈多肽包含與以下HLA-C*07:01(Y84C;A236C)胺基酸序列具有至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0083-490
Figure 110116854-A0202-12-0084-491
(SEQ ID NO:357),其中胺基酸84為Cys且胺基酸236為Cys。
HLA-C *0702(Y84C;A236C)
在一些情況下,存在於經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)中的HLA-C重鏈多肽包含與以下HLA-C*07:02(Y84C;A236C)胺基酸序列具有至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0084-492
Figure 110116854-A0202-12-0084-493
(SEQ ID NO:404),其中胺基酸84為Cys且胺基酸236為Cys。
HLA-C *0801(Y84C;A236C)
在一些情況下,存在於經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)中的HLA-C重鏈多肽包含與以下HLA-C*08:01(Y84C;A236C)胺基酸序列具有至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0084-494
Figure 110116854-A0202-12-0085-495
(SEQ ID NO:363),其中胺基酸84為Cys且胺基酸236為Cys。
HLA-C *1502(Y84C;A236C)
在一些情況下,存在於經多個二硫鍵連接之TMMP(例如,經雙二硫鍵連接之TMMP)中的HLA-C重鏈多肽包含與以下HLA-C*15:02(Y84C;A236C)胺基酸序列具有至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0085-496
Figure 110116854-A0202-12-0085-497
(SEQ ID NO:364),其中胺基酸84為Cys且胺基酸236為Cys。
支架多肽
TMMP可包含Fc多肽或可包含另一種適合的支架多肽。
適合的支架多肽包括基於抗體之支架多肽及非基於抗體之支架。非基於抗體之支架包括例如白蛋白、XTEN(延長重組)多肽、運鐵蛋白、Fc受體多肽、彈性蛋白樣多肽(參見,例如Hassouneh等人(2012)Methods Enzymol. 502:215;例如,包含五肽重複單元(Val-Pro-Gly-X-Gly;SEQ ID NO:59)之多肽,其中X為除了脯胺酸以外的任何胺基酸)、白蛋白結合多肽、絲樣多肽(參見,例如Valluzzi等人(2002)Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. 357:165)、絲-彈性蛋白-樣多肽(SELP;參見,例如Megeed等人(2002)Adv Drug Deliv Rev. 54:1075)及類似物。適合的XTEN多肽包括例如WO 2009/023270、WO 2010/091122、WO 2007/103515、US 2010/0189682及US 2009/0092582中揭露之彼等;亦參見Schellenberger等 人(2009)Nat Biotechnol. 27:1186)。適合的白蛋白多肽包括例如人類血清白蛋白。
適合的支架多肽在一些情況下將為半衰期延長之多肽。因此,在一些情況下,與缺乏支架多肽之對照TMMP相比,適合的支架多肽增加TMMP之活體內 半衰期(例如,血清半衰期)。舉例而言,在一些情況下,與缺乏支架多肽之對照TMMP相比,支架多肽使TMMP之活體內 半衰期(例如,血清半衰期)增加了至少約10%、至少約15%、至少約20%、至少約25%、至少約50%、至少約2倍、至少約2.5倍、至少約5倍、至少約10倍、至少約25倍、至少約50倍、至少約100倍、或大於100倍。作為一實例,在一些情況下,與缺乏Fc多肽之對照TMMP相比,Fc多肽使TMMP之活體內 半衰期(例如,血清半衰期)增加了至少約10%、至少約15%、至少約20%、至少約25%、至少約50%、至少約2倍、至少約2.5倍、至少約5倍、至少約10倍、至少約25倍、至少約50倍、至少約100倍、或大於100倍。
Fc多肽
在一些情況下,本揭示案之TMMP之第一多肽鏈及/或第二多肽鏈包含Fc多肽。TMMP之Fc多肽可為人類IgG1 Fc、人類IgG2 Fc、人類IgG3 Fc、人類IgG4 Fc等。在一些情況下,Fc多肽包含與圖5A-5G或5H中描繪之Fc區的胺基酸序列具有至少約70%、至少約75%、至少約80%、至少約85%、至少約90%、至少約95%、至少約98%、至少約99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列。在一些情況下,Fc區包含與圖5A中描繪之人類IgG1 Fc多肽具有至少約70%、至少約75%、至少約80%、至少約85%、至少約90%、至少約95%、至少約98%、至少約99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列。在一些情況下,Fc區包含與圖5A中描繪之人類IgG1 Fc多肽具有至少約70%、至少約75%、至少約80%、至少約85%、至少約90%、至少約95%、至少約98%、至少約99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列;且包含N77取代;例如,Fc多 肽包含N77A取代。在一些情況下,Fc多肽包含與圖5A中描繪之人類IgG2 Fc多肽具有至少約70%、至少約75%、至少約80%、至少約85%、至少約90%、至少約95%、至少約98%、至少約99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列;例如,Fc多肽包含與圖5A中描繪之人類IgG2 Fc多肽的胺基酸99-325具有至少約70%、至少約75%、至少約80%、至少約85%、至少約90%、至少約95%、至少約98%、至少約99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列。在一些情況下,Fc多肽包含與圖5A中描繪之人類IgG3 Fc多肽具有至少約70%、至少約75%、至少約80%、至少約85%、至少約90%、至少約95%、至少約98%、至少約99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列;例如,Fc多肽包含與圖5A中描繪之人類IgG3 Fc多肽的胺基酸19-246具有至少約70%、至少約75%、至少約80%、至少約85%、至少約90%、至少約95%、至少約98%、至少約99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列。在一些情況下,Fc多肽包含與圖5B中描繪之人類IgM Fc多肽具有至少約70%、至少約75%、至少約80%、至少約85%、至少約90%、至少約95%、至少約98%、至少約99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列;例如,Fc多肽包含與圖5B中描繪之人類IgM Fc多肽的胺基酸1-276具有至少約70%、至少約75%、至少約80%、至少約85%、至少約90%、至少約95%、至少約98%、至少約99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列。在一些情況下,Fc多肽包含與圖5C中描繪之人類IgA Fc多肽具有至少約70%、至少約75%、至少約80%、至少約85%、至少約90%、至少約95%、至少約98%、至少約99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列;例如,Fc多肽包含與圖5C中描繪之人類IgA Fc多肽的胺基酸1-234具有至少約70%、至少約75%、至少約80%、至少約85%、至少約90%、至少約95%、至少約98%、至少約99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列。
在一些情況下,Fc多肽包含與圖5C中描繪之人類IgG4 Fc多肽具有至少約70%、至少約75%、至少約80%、至少約85%、至少約 90%、至少約95%、至少約98%、至少約99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列。在一些情況下,Fc多肽包含與圖5C中描繪之人類IgG4 Fc多肽的胺基酸100至327具有至少約70%、至少約75%、至少約80%、至少約85%、至少約90%、至少約95%、至少約98%、至少約99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列。
在一些情況下,IgG4 Fc多肽包含以下胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0088-498
Figure 110116854-A0202-12-0088-499
(SEQ ID NO:365)。
在一些情況下,存在於TMMP中之Fc多肽包含圖5A中描繪之胺基酸序列(人類IgG1 Fc)。在一些情況下,存在於TMMP中之Fc多肽包含圖5A中描繪之胺基酸序列(人類IgG1 Fc),例外之處為以除天冬醯胺以外之胺基酸進行之N297取代(圖5A中描繪之胺基酸序列之N77)。在一些情況下,存在於TMMP中之Fc多肽包含圖5C中描繪之胺基酸序列(包含N297A取代之人類IgG1 Fc,該取代為圖5A中描繪之胺基酸序列之N77)。在一些情況下,存在於TMMP中之Fc多肽包含圖5A中描繪之胺基酸序列(人類IgG1 Fc),例外之處為以除白胺酸以外之胺基酸進行之L234取代(圖5A中描繪之胺基酸序列之L14)。在一些情況下,存在於TMMP中之Fc多肽包含圖5A中描繪之胺基酸序列(人類IgG1 Fc),例外之處為以除白胺酸以外之胺基酸進行之L235取代(圖5A中描繪之胺基酸序列之L15)。在一些情況下,IgG1 Fc多肽包含圖5A中描繪之C端Lys。在其他情況下,IgG1 Fc多肽不包含圖5A中描繪之C端Lys。
在一些情況下,存在於TMMP中之Fc多肽包含圖5E中描繪之胺基酸序列。在一些情況下,Fc多肽包含圖5E中描繪之胺基酸序列,但無C端Lys。在一些情況下,存在於TMMP中之Fc多肽包含圖5F 中描繪之胺基酸序列。在一些情況下,Fc多肽包含圖5F中描繪之胺基酸序列,但無C端Lys。在一些情況下,存在於TMMP中之Fc多肽包含圖5G中描繪之胺基酸序列(包含L234A取代及L235A取代之人類IgG1 Fc,該等取代對應於圖5G中描繪之胺基酸序列之位置14及15)。在一些情況下,Fc多肽包含圖5G中描繪之胺基酸序列,但無C端Lys。在一些情況下,存在於TMMP中之Fc多肽包含圖5A中描繪之胺基酸序列(人類IgG1 Fc),例外之處為以除脯胺酸以外之胺基酸進行之P331取代(圖5A中描繪之胺基酸序列之P111);在一些情況下,該取代為P331S取代。在一些情況下,存在於TMMP中之Fc多肽包含圖5A中描繪之胺基酸序列(人類IgG1 Fc),例外之處為以除白胺酸以外之胺基酸進行之L234及L235取代(圖5A中描繪之胺基酸序列之L14及L15)。在一些情況下,存在於TMMP中之Fc多肽包含圖5A中描繪之胺基酸序列(人類IgG1 Fc),例外之處為以除白胺酸以外之胺基酸進行之L234及L235取代(圖5A中描繪之胺基酸序列之L14及L15)及以除脯胺酸以外之胺基酸進行之P331取代(圖5A中描繪之胺基酸序列之P111)。在一些情況下,存在於TMMP中之Fc多肽包含圖5E中描繪之胺基酸序列(包含L234F、L235E及P331S取代(對應於圖5E中描繪之胺基酸序列之胺基酸位置14、15及111)的人類IgG1 Fc)。在一些情況下,存在於TMMP中之Fc多肽為包含L234A及L235A取代(以Ala對圖5A中描繪之胺基酸序列的L14及L15進行之取代)之IgG1 Fc多肽,如圖5G所描繪。
在一些情況下,存在於TMMP中之Fc多肽具有以下胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0089-500
Figure 110116854-A0202-12-0090-501
(SEQ ID NO:489);且具有226個胺基酸之長度。
連接子
本揭示案之TMMP可包括一或多個連接子,其中該一或多個連接子介於以下一或多者之間:i)I類MHC多肽及Ig Fc多肽,其中此連接子在本文中稱為「L1」;ii)MOD及I類MHC多肽,其中此連接子在本文中稱為「L2」;iii)第一MOD及第二MOD,其中此連接子在本文中稱為「L3」;iv)肽抗原(「抗原決定基」)及I類MHC多肽;v)I類MHC多肽及二聚化多肽(例如,二聚化對之第一成員或第二成員);以及vi)二聚化多肽(例如,二聚化對之第一成員或第二成員)及IgFc多肽。
如本文所用,短語「TMMP之任意兩個組分之間的肽連接子」係指TMMP內任意兩個相鄰多肽之間的肽連接子。例如,如本文所用,短語「TMMP之任意兩個組分之間的肽連接子」係指以下一或多項之間的肽係指:i)肽與β2M多肽;ii)β2M多肽與I類MHC重鏈多肽;iii)I類MHC重鏈多肽與Ig Fc多肽;iv)I類MHC重鏈多肽與MOD;v)Ig Fc多肽與MOD;vi)第一MOD與第二MOD。
適合的連接子(亦稱為「間隔子」)可容易選擇且可具有許多適合長度中之任一者,諸如1個胺基酸至25個胺基酸、3個胺基酸至20個胺基酸、2個胺基酸至15個胺基酸、3個胺基酸至12個胺基酸,包括4個胺基酸至10個胺基酸、5個胺基酸至9個胺基酸、6個胺基酸至8個胺基酸、或7個胺基酸至8個胺基酸。適合的連接子長度可為1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25個胺基酸。在一些情況下,連接子之長度為25個胺基酸至50個胺基酸,例如長度為25至30、30至35、35至40、40至45、或45至50個胺基酸。
示範性連接子包括甘胺酸聚合物(G)n、甘胺酸-絲胺酸聚合物(包括例如(GS)n、(GSGGS)n(SEQ ID NO:366)及(GGGS)n(SEQ ID NO:367),其中n為至少一之整數)、甘胺酸-丙胺酸聚合物、丙胺酸-絲胺酸聚合物、及此項技術中已知之其他可撓性連接子。可使用甘胺酸及甘胺酸-絲胺酸聚合物;Gly及Ser皆相對未結構化,且因此可充當組分之間的中性系鏈。可使用甘胺酸聚合物;甘胺酸甚至比丙胺酸顯著更易進入phi-psi空間,且比具有更長側鏈之殘基受限少得多(參見Scheraga,Rev.Computational Chem. 11173-142(1992))。示範性連接子可包含胺基酸序列,包括但不限於GGSG(SEQ ID NO:368)、GGSGG(SEQ ID NO:369)、GSGSG(SEQ ID NO:370)、GSGGG(SEQ ID NO:371)、GGGSG(SEQ ID NO:372)、GSSSG(SEQ ID NO:373)及其類似序列。示範性連接子可包括例如Gly(Ser4)n(SEQ ID NO:374),其中n為1、2、3、4、5、6、7、8、9或10。在一些情況下,連接子包含胺基酸序列(GSSSS)n(SEQ ID NO:375),其中n為4。在一些情況下,連接子包含胺基酸序列(GSSSS)n(SEQ ID NO:376),其中n為5。在一些情況下,連接子包含胺基酸序列(GGGGS)n(SEQ ID NO:377),其中n為1。在一些情況下,連接子包含胺基酸序列(GGGGS)n(SEQ ID NO:378),其中n為2。在一些情況下,連接子包含胺基酸序列(GGGGS)n(SEQ ID NO:379),其中n為3。在一些情況下,連接子包含胺基酸序列(GGGGS)n(SEQ ID NO:380),其中n為4。在一些情況下,連接子包含胺基酸序列(GGGGS)n(SEQ ID NO:381),其中n為5。在一些情況下,連接子包含胺基酸序列(GGGGS)n(SEQ ID NO:382),其中n為6。在一些情況下,連接子包含胺基酸序列(GGGGS)n(SEQ ID NO:383),其中n為7,在一些情況下,連接子包含胺基酸序列(GGGGS)n(SEQ ID NO:384),其中n為8,在一些情況下,連接子包含胺基酸序列(GGGGS)n(SEQ ID NO:385),其中n為9,在一些情況下,連接子包含胺基酸序列(GGGGS)n(SEQ ID NO:386),其中n為10。在一些情況下,連接子包含胺基酸序列AAAGG(SEQ ID NO:283)。
在一些情況下,存在於TMMP之第一多肽中的連接子多肽所包括的半胱胺酸殘基可與存在於TMMP之第二多肽中的半胱胺酸殘基 形成二硫鍵。在一些情況下,舉例而言,適合的連接子包含胺基酸序列GCGGSGGGGSGGGGS(SEQ ID NO:317)。作為另一實例,適合的連接子可包含胺基酸序列GCGGS(G4S)n(SEQ ID NO:315),其中n為1、2、3、4、5、6、7、8或9。舉例而言,在一些情況下,連接子包含胺基酸序列GCGGSGGGGSGGGGSGGGGS(SEQ ID NO:316)。作為另一實例,連接子包含胺基酸序列GCGGSGGGGSGGGGS(SEQ ID NO:317)。
抗原決定基
在一些情況下,存在於TMMP中之抗原決定基(呈遞一或多個抗原決定基之肽)為WT-1肽,例如,連同MHC一起向TCR呈遞抗原決定基之WT-1肽。WT-1同功型之胺基酸序列呈現於圖3A-3E中。呈遞一或多個抗原決定基之WT-1肽在本文中稱為「WT-1肽」或「WT-1抗原決定基」。在一些情況下,存在於本揭示案之TMMP中的WT-1抗原決定基可為與圖3A-3E中任一者描繪之WT-1胺基酸序列具有至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列的4至25個連續胺基酸(例如,4個胺基酸(aa)、5 aa、6 aa、7 aa、8 aa、9 aa、10-15 aa、15-20 aa、或20-25 aa)之肽。在一些情況下,存在於本揭示案之TMMP中的WT-1抗原決定基可為與圖3A中描繪之WT-1胺基酸序列具有至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列的4至25個連續胺基酸(例如,4個胺基酸(aa)、5 aa、6 aa、7 aa、8 aa、9 aa、10-15 aa、15-20 aa、或20-25 aa)之肽。在一些情況下,存在於TMMP中之WT-1抗原決定基可為與圖3B中描繪之WT-1胺基酸序列具有至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列的4至25個連續胺基酸(例如,4個胺基酸(aa)、5 aa、6 aa、7 aa、8 aa、9 aa、10-15 aa、15-20 aa、或20-25 aa)之肽。在一些情況下,存在於本揭示案之TMMP中的WT-1抗原決定基可為與圖3C中描繪之WT-1胺基酸序列具有至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列的4至25個連續胺基酸(例如,4個 胺基酸(aa)、5 aa、6 aa、7 aa、8 aa、9 aa、10-15 aa、15-20 aa、或20-25 aa)之肽。在一些情況下,存在於TMMP中之WT-1抗原決定基可為與圖3D中描繪之WT-1胺基酸序列具有至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列的4至25個連續胺基酸(例如,4個胺基酸(aa)、5 aa、6 aa、7 aa、8 aa、9 aa、10-15 aa、15-20 aa、或20-25 aa)之肽。在一些情況下,存在於本揭示案之TMMP中的WT-1抗原決定基可為與圖3E中描繪之WT-1胺基酸序列具有至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列的4至25個連續胺基酸(例如,4個胺基酸(aa)、5 aa、6 aa、7 aa、8 aa、9 aa、10-15 aa、15-20 aa、或20-25 aa)之肽。在一些情況下,存在於TMMP中的WT-1抗原決定基之長度為6個胺基酸。在一些情況下,存在於TMMP中的WT-1抗原決定基之長度為7個胺基酸。在一些情況下,存在於TMMP中的WT-1抗原決定基之長度為8個胺基酸。在一些情況下,存在於TMMP中的WT-1抗原決定基之長度為9個胺基酸。在一些情況下,存在於TMMP中的WT-1抗原決定基之長度為10個胺基酸。在一些情況下,存在於TMMP中的WT-1抗原決定基之長度為11個胺基酸。在一些情況下,存在於TMMP中的WT-1抗原決定基之長度為6個胺基酸至25個胺基酸。在一些情況下,存在於TMMP中的WT-1抗原決定基之長度為6個胺基酸至20個胺基酸。在一些情況下,存在於TMMP中的WT-1抗原決定基之長度為7個胺基酸至25個胺基酸。在一些情況下,存在於TMMP中的WT-1抗原決定基之長度為7個胺基酸至20個胺基酸。在一些情況下,存在於TMMP中的WT-1抗原決定基之長度為至少4個胺基酸,長度為至少6個胺基酸,或長度為至少7個胺基酸。
存在於TMMP中的抗原決定基之長度可為約4個胺基酸至約25個胺基酸,例如,抗原決定基之長度可為4個胺基酸(aa)至10 aa、10 aa至15 aa、15 aa至20 aa、或20 aa至25 aa。舉例而言,存在於TMMP中的抗原決定基之長度可為4個胺基酸(aa)、5 aa、6 aa、7、aa、8 aa、9 aa、10 aa、11 aa、12 aa、13 aa、14 aa、15 aa、16 aa、17 aa、18 aa、19 aa、20 aa、21 aa、22 aa、23 aa、24 aa或25 aa。在一些情況下,存在於TMMP中之抗原決定基之長度為5個胺基酸至10個胺基酸,例如5 aa、6 aa、7 aa、8 aa、9 aa或10 aa。
存在於TMMP中的WT-1抗原決定基為T細胞特異性結合之肽,亦即,抗原決定基由WT-1抗原決定基特異性T細胞特異性結合。抗原決定基特異性T細胞結合具有參考胺基酸序列之抗原決定基,但實質上不結合與參考胺基酸序列不同之抗原決定基。舉例而言,抗原決定基特異性T細胞結合具有參考胺基酸序列之抗原決定基,且結合與參考胺基酸序列不同之抗原決定基,若有的話,則其親和力小於10-6 M、小於10-5 M或小於10-4 M。抗原決定基特異性T細胞可結合對其具有特異性之抗原決定基,其親和力為至少10-7 M、至少10-8 M、至少10-9 M或至少10-10 M。
適於包含在TMMP中的WT-1肽之實例包括但不限於CMTWNQMNLGATLKG(SEQ ID NO:223)、WNQMNLGATLKGVAA(SEQ ID NO:224)、CMTWNYMNLGATLKG(SEQ ID NO:225)、WNYMNLGATLKGVAA(SEQ ID NO:226)、MTWNQMNLGATLKGV(SEQ ID NO:227)、TWNQMNLGATLKGVA(SEQ ID NO:228)、CMTWNLMNLGATLKG(SEQ ID NO:229)、MTWNLMNLGATLKGV(SEQ ID NO:230)、TWNLMNLGATLKGVA(SEQ ID NO:231)、WNLMNLGATLKGVAA(SEQ ID NO:232)、MNLGATLK(SEQ ID NO:233)、MTWNYMNLGATLKGV(SEQ ID NO:234)、TWNYMNLGATLKGVA(SEQ ID NO:235)、CMTWNQMNLGATLKGVA(SEQ ID NO:236)、CMTWNLMNLGATLKGVA(SEQ ID NO:237)、CMTWNYMNLGATLKGVA(SEQ ID NO:238)、GYLRNPTAC(SEQ ID NO:239)、GALRNPTAL(SEQ ID NO:240)、YALRNPTAC(SEQ ID NO:241)、GLLRNPTAC(SEQ ID NO:242)、RYRPHPGAL(SEQ ID NO:243)、YQRPHPGAL(SEQ ID NO:244)、RLRPHPGAL(SEQ ID NO:245)、RIRPHPGAL(SEQ ID NO:246)、QFPNHSFKHEDPMGQ(SEQ ID NO:247)、HSFKHEDPY(SEQ ID NO:248)、QFPNHSFKHEDPM(SEQ ID NO:249)、QFPNHSFKHEDPY(SEQ ID NO:250)、KRPFMCAYPGCNK(SEQ ID NO:251)、KRPFMCAYPGCYK(SEQ ID NO:252)、FMCAYPGCY(SEQ ID NO:253)、FMCAYPGCK(SEQ ID NO:254)、KRPFMCAYPGCNKRY(SEQ ID NO:255)、SEKRPFMCAYPGCNK(SEQ ID NO:256)、KRPFMCAYPGCYKRY(SEQ ID NO:257)、NLMNLGATL(SEQ ID NO:258)、VLDFAPPGA(SEQ ID NO:259);RMFPNAPYL(SEQ ID NO:260);CMTWNQMN(SEQ ID NO:261);CYTWNQMNL(SEQ ID NO:262);NYMNLGATL(SEQ ID NO:263);YMFPNAPYL(SEQ ID NO:264);SLGEQQYSV(SEQ ID NO:265);CMTWNQMNL(SEQ ID NO:266);及NQMNLGATL(SEQ ID NO:267)。在一些情況下,存在於TMMP中之WT-1肽為CMTWNQMN(SEQ ID NO:261)。在一些情況下,存在於TMMP中之WT-1肽為CYTWNQMNL(SEQ ID NO:262)。
在一些情況下,存在於TMMP中之WT-1肽呈遞HLA-A*2402限制性抗原決定基。呈遞HLA-A*2402限制性抗原決定基之WT-1肽包括例如CMTWNQMN(SEQ ID NO:261);NYMNLGATL(SEQ ID NO:263)(WT-1 239-247;Q240Y);CYTWNQMNL(SEQ ID NO:262)(WT-1 235-243);CMTWNQMNL(SEQ ID NO:266)(WT-1 235-243);NQMNLGATL(SEQ ID NO:267)(WT-1 239-247);及NLMNLGATL(SEQ ID NO:258)(WT-1 239-247;Q240L)。
在一些情況下,存在於TMMP中之WT-1肽呈遞HLA-A*0201限制性抗原決定基。呈遞HLA-A*0201限制性抗原決定基之WT-1肽包括例如VLDFAPPGA(SEQ ID NO:259)(WT-1 37-45);RMFPNAPYL(SEQ ID NO:260)(WT-1 126-134);YMFPNAPYL(SEQ ID NO:264)(WT-1 126-134;R126Y);SLGEQQYSV(SEQ ID NO:265)(WT-1 187-195);及NLMNLGATL(SEQ ID NO:258)(WT-1 239-247;Q240L)。
在一些情況下,存在於TMMP中之WT-1肽呈遞HLA-A*2402限制性抗原決定基並且不具有N端Cys。例如,當WT-1肽包含N端Cys時,N端Cys可由Ser置換。作為另一實例,當WT-1肽包含N端Cys時,Gly可添加至N端上。舉例而言,存在於TMMP中之WT-1肽可包含胺基酸序列X1 X2 X3 TWNQMNL(SEQ ID NO:460)或X2 X3 TWNQMNL(SEQ ID NO:461),其中X1 、X2 及X3 各自獨立地為任何胺基酸,限制條件為N端胺基酸不為Cys,且其中WT-1肽抗原決定基具有9至25個胺基酸之長度。在此等實施例之一些中,WT-1肽具有9個胺基酸或10個胺基酸之長度。適於包含在TMMP中的WT-1肽之實例包括但不限於SMTWNQMNL(SEQ ID NO:451)、GCMTWNQMNL(SEQ ID NO:452)、SYTWNQMNL(SEQ ID NO:453)或GCYTWNQMNL(SEQ ID NO:454)。在一些情況下,存在於本揭示案之TMMP中的WT-1肽具有胺基酸序列SMTWNQMNL(SEQ ID NO:451);且具有9個胺基酸之長度。在一些情況下,存在於TMMP中之WT-1肽具有胺基酸序列GCMTWNQMNL(SEQ ID NO:452);且具有10個胺基酸之長度。在一些情況下,存在於TMMP中之WT-1肽具有胺基酸序列SYTWNQMNL(SEQ ID NO:453);且具有9個胺基酸之長度。在一些情況下,存在於TMMP中之WT-1肽具有胺基酸序列GCYTWNQMNL(SEQ ID NO:454);且具有10個胺基酸之長度。
HLA/肽結合檢定
給定肽(例如,WT-1肽)是否結合I類HLA(包含HLA重鏈及β2M多肽)及在結合至HLA複合物時是否可有效呈遞抗原決定基至TCR可使用許多熟知方法中之任一者來判定。檢定包括結合檢定及T細胞活化檢定。
基於細胞之結合檢定
作為一實例,基於細胞之肽誘導穩定性檢定可用於判定肽-I類HLA結合。在此檢定中,允許目標肽結合至(Transporter Associated with Antigen Processing)TAP缺陷型細胞,亦即具有與抗原加工(TAP)機構相關之缺陷型轉運蛋白且因此具有更少表面I類分子之細胞。此類細胞包括例如人類T2細胞株(T2(174 x CEM.T2;美國典型培養物保藏中心(ATCC)編號CRL-1992)。Henderson等人(1992)Science 255:1264。在未將胞質肽缺陷型TAP介導轉運至內質網中之情況下,經組裝之I類複合物為結構上不穩定的,且在細胞表面上僅瞬時保留。然而,當T2細胞與能夠結合I類之外源肽一起溫育時,表面肽-I類HLA複合物為穩定的且可藉由流動式細胞測量術,使用例如全抗I類單株抗體來偵測。藉由添加肽使細胞表面上之肽-HLA複合物具有穩定性及隨之而來的延長之壽命,由此驗證了其身份。分析可使用流動式細胞測量術進行,例如其中全-I類HLA抗體包含螢光標記。肽與HLA H鏈之各種對偶基因形式之結合可藉由遺傳修飾T2細胞以表現目標對偶基因HLA H鏈來進行測試。
以下為T2檢定評定肽與HLA A*0201之結合的用途之非限制性實例。將T2細胞在細胞培養基中洗滌,且濃縮至106 個細胞/ml。將目標肽在細胞培養基中製備且連續稀釋,從而提供濃度200μM、100μM、20μM及2μM。將細胞與各肽稀釋液1:1混合以得到200μL最終體積及100μM、50μM、10μM及1μM最終肽濃度。A HLA A*0201結合肽、GILGFVFTL(SEQ ID NO:395)及非-HLA A*0201-限制性肽、HPVGEADYF(SEQ ID NO:396)(HLA-B*3501)分別作為陽性對照及陰性對照包括在內。將細胞/肽混合物保持在37℃ 5% CO2[A1] 下十分鐘;接著在室溫下溫育隔夜。隨後將細胞在37℃下溫育2小時且用經螢光標記之抗人類HLA抗體染色。接著將細胞用磷酸鹽緩衝鹽水洗滌兩次且使用流動式細胞測量術分析。使用抗-HLA抗體染色之平均螢光強度(MFI)量測結合強度。
生物化學結合檢定
可在無細胞之活體外檢定系統中對HLA多肽(HLA重鏈多肽與β2M多肽之複合物)與目標肽之結合進行測試。舉例而言,使經標記之參考肽(例如,經螢光標記)結合至HLA多肽(HLA重鏈多肽與β2M多肽之複合物),以形成HLA-參考肽複合物。對目標測試肽置換來自HLA-參考肽複合物的經標記之參考肽之能力進行測試。相對結合親和力經計算為置換所結合之參考肽所需的測試肽之量。參見,例如van der Burg等人(1995)Human Immunol. 44:189。
作為另一實例,目標肽可與HLA分子(HLA重鏈與β2M多肽之複合物)一起溫育,且可以免疫檢定形式量測HLA/肽複合物之穩定性。將目標肽穩定化HLA分子之能力與呈遞已知T細胞抗原決定基之對照肽的能力相比較。穩定性之偵測係基於使用抗HLA抗體所偵測之HLA/肽複合物的天然構象之存在或不存在。參見,例如Westrop等人(2009)J.Immunol.Methods 341:76;Steinitz等人(2012)Blood 119:4073;及美國專利第9,205,144號。
T細胞活化檢定
給定肽是否結合I類HLA(包含HLA重鏈及β2M多肽)及在結合至HLA複合物時是否可有效呈遞抗原決定基至TCR可藉由評定T細胞對肽-HLA複合物之反應來判定。可量測之T細胞反應包括例如干擾素-γ(IFNγ)產生、細胞毒性活性及其類似反應。
ELISPOT檢定
適合的檢定包括例如酶聯免疫斑點(Enzyme-Linked Immunospot,ELISPOT)檢定。在此檢定中,在呈遞目標肽與I類HLA之複合物的抗原呈遞細胞(APC)之後量測CD8+ T細胞之IFNγ產生。將IFNγ之抗體固定在多孔板之孔上。將APC添加至孔中,且將其與目標肽一起溫育一段時間,使得該肽結合APC表面上之I類HLA。將對該肽具有特異性之CD8+ T細胞添加至孔中,且將該板溫育約24小時。接著洗滌該等孔,且使用可偵測標記之抗IFNγ抗體偵測結合至經固定之抗IFNγ抗體之任何 IFNγ。可使用比色檢定。舉例而言,可偵測標記之抗IFNγ抗體可為生物素標記之抗IFNγ抗體,其可使用例如偶聯至鹼性磷酸酶之鏈親和素來偵測。添加BCIP/NBT(5-溴-4-氯-3-吲哚基磷酸酯/硝基藍四唑鎓)溶液,以使檢定顯色。IFNγ分泌T細胞之存在藉由色斑來鑑定。陰性對照包括未與該肽接觸之APC。可使用表現各種HLA H鏈對偶基因之APC來判定目標肽是否有效結合至包含特定HLA H鏈之I類HLA分子。
細胞毒性檢定
給定肽是否結合至特定I類HLAH鏈及在結合至包含H鏈之I類HLA複合物時是否可有效呈遞抗原決定基至TCR亦可使用細胞毒性檢定來判定。細胞毒性檢定涉及將靶細胞與細胞毒性CD8+ T細胞一起溫育。靶細胞在其表面上展示出包含目標肽之肽/I類HLA複合物及包含有待測試之HLA H鏈之I類HLA分子。靶細胞可經放射性標記,例如經51 Cr放射性標記。靶細胞是否有效呈遞抗原決定基至細胞毒性CD8+ T細胞上之TCR,從而由CD8+ T細胞誘導針對靶細胞之細胞毒性活性,係藉由量測51 Cr自裂解之靶細胞之釋放來判定。特異性細胞毒性可經計算為肽存在下細胞毒性活性之量減去肽不存在下細胞毒性活性之量。
用肽-HLA四聚體偵測抗原特異性T細胞
作為另一實例,使用螢光或重金屬標籤生成肽-HLA複合物之多聚體(例如,四聚體)。接著可使用多聚體經由流動式細胞測量術(FACS)或質量細胞計數(CyTOF)鑑別及定量特異性T細胞。抗原決定基特異性T細胞之偵測提供肽結合之HLA分子能夠結合至抗原特異性T細胞子集上之特異性TCR的直接證據。參見,例如Klenerman等人(2002)Nature Reviews Immunol. 2:263。
免疫調節多肽(「MOD」)
在一些情況下,存在於TMMP中之MOD為野生型(「wt」)MOD。如上所論述,在其他情況下,存在於TMMP中之MOD為對co-MOD之親和力與相應野生型MOD對co-MOD之親和力相比有所減 小的wt MOD之變異體。呈現出對co-MOD之減小親和力的適合的MOD與野生型MOD相比可具有1個胺基酸(aa)至20 aa差異。舉例而言,在一些情況下,存在於TMMP中之變異體MOD之胺基酸序列與相應野生型MOD相差1 aa、2 aa、3 aa、4 aa、5 aa、6 aa、7 aa、8 aa、9 aa或10 aa。作為另一實例,在一些情況下,存在於TMMP中之變異體MOD的胺基酸序列與相應野生型MOD相差11 aa、12 aa、13 aa、14 aa、15 aa、16 aa、17 aa、18 aa、19 aa或20 aa。
如上所論述,MOD可包含wt免疫調節多肽之變異體,其可呈現出與其co-MOD之減少的結合,包括例如與co-MOD之一或多個鏈或結構域之減少的結合。舉例而言,存在於TMMP中之變異體MOD可結合其co-MOD之親和力比相應野生型MOD對co-MOD之親和力小至少10%、小至少15%、小至少20%、小至少25%、小至少30%、小至少35%、小至少40%、小至少45%、小至少50%、小至少55%、小至少60%、小至少65%、小至少70%、小至少75%、小至少80%、小至少85%、小至少90%、小至少95%或小大於95%。免疫調節多肽與同源共免疫調節多肽之示範性對包括但不限於:
a)4-1BBL(免疫調節多肽)與4-1BB(同源共免疫調節多肽);
b)PD-L1(免疫調節多肽)與PD1(同源共免疫調節多肽);
c)IL-2(免疫調節多肽)與IL-2受體(同源共免疫調節多肽);
d)CD80(免疫調節多肽)與CD86(同源共免疫調節多肽);
e)CD86(免疫調節多肽)與CD28(同源共免疫調節多肽);
f)OX40L(CD252)(免疫調節多肽)與OX40(CD134)(同源共免疫調節多肽);
g)Fas配位體(免疫調節多肽)與Fas(同源共免疫調節多肽);
h)ICOS-L(免疫調節多肽)與ICOS(同源共免疫調節多肽);
i)ICAM(免疫調節多肽)與LFA-1(同源共免疫調節多肽);
j)CD30L(免疫調節多肽)與CD30(同源共免疫調節多肽);
k)CD40(免疫調節多肽)與CD40L(同源共免疫調節多肽);
l)CD83(免疫調節多肽)與CD83L(同源共免疫調節多肽);
m)HVEM(CD270)(免疫調節多肽)與CD160(同源共免疫調節多肽);
n)JAG1(CD339)(免疫調節多肽)與Notch(同源共免疫調節多肽);
o)JAG1(免疫調節多肽)與CD46(同源共免疫調節多肽);
p)CD80(免疫調節多肽)與CTLA4(同源共免疫調節多肽);
q)CD86(免疫調節多肽)與CTLA4(同源共免疫調節多肽);及
r)CD70(免疫調節多肽)與CD27(同源共免疫調節多肽)。
如圖19示意性示出,MOD(亦即,一或多種MOD)可存在於TMMP之多個位置中之任一者處。圖19描繪變異體IL-2多肽之兩個副本之位置;然而,MOD可為如本文所述之多種MOD中之任一者。如圖19所描繪,MOD可:1)在I類MHC重鏈之N端;2)在I類MHC重鏈之C端及Ig Fc多肽之N端;換言之,介於I類MHC重鏈與Ig Fc多肽之間;3)在Ig Fc多肽之C端;4)在肽抗原決定基之N端;或5)在β2M多肽之C端。
PD-L1-野生型及變異體
存在於TMMP中之MOD為野生型PD-L1多肽或變異體PD-L1多肽。
在一些情況下,存在於TMMP中之MOD為PD-L1多肽。在一些情況下,TMP之PD-L1多肽包含與SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2或SEQ ID NO:3中列出之PD-L1胺基酸序列具有至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列。PD-L1變異體MOD描述於2019年3月14日公開的經公開之PCT申請案WO 2019/051091中。參見[00157]-[00169]。
在一些情況下,變異體PD-L1多肽呈現出與PD-1(例如,包含SEQ ID NO:3中列出之胺基酸序列的PD-1多肽)之結合親和力與包含SEQ ID NO:1或SEQ ID NO:2中列出之胺基酸序列的PD-L1多肽之結 合親和力相比有所減小。舉例而言,在一些情況下,本揭示案之變異體PD-L1多肽結合PD-1(例如,包含SEQ ID NO:3中列出之胺基酸序列的PD-1多肽)之結合親和力比包含SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2或SEQ ID NO:3中列出之胺基酸序列的PD-L1多肽之結合親和力小至少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少35%、至少40%、至少45%、小至少50%、小至少55%、小至少60%、小至少65%、小至少70%、小至少75%、小至少80%、小至少85%、小至少90%、小至少95%或小大於95%。
CD80-野生型及變異體
存在於TMMP中之MOD為野生型CD80多肽或變異體CD80多肽。CD80變異體MOD描述於2019年3月14日公開的經公開之PCT申請案WO 2019/051091中。參見[00170]-[00196]。
在一些情況下,存在於TMMP中之MOD為CD80多肽。在一些情況下,TMMP之CD80多肽包含與SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6及SEQ ID NO:7中列出之胺基酸序列具有至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列。
在一些情況下,變異體CD80多肽表現出對CD28之結合親和力與包含SEQ ID NO:4中列出之胺基酸序列之CD80多肽對CD28之結合親和力相比有所減小。舉例而言,在一些情況下,變異體CD80多肽結合CD28之結合親和力比包含SEQ ID NO:4中列出之胺基酸序列的CD80多肽對CD28(例如,包含SEQ ID NO:5、6或7中之一者列出之胺基酸序列的CD28多肽)之結合親和力小至少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少35%、至少40%、至少45%、小至少50%、小至少55%、小至少60%、小至少65%、小至少70%、小至少75%、小至少80%、小至少85%、小至少90%、小至少95%或小大於95%。
CD86-野生型及變異體
存在於TMMP中之MOD為野生型CD86多肽或變異體CD86多肽。CD80變異體MOD描述於2019年3月14日公開的經公開之PCT申請案WO 2019/051091中。參見[00197]-[00228]。
在一些情況下,存在於TMMP中之MOD為CD86多肽。在一些情況下,TMMP之CD86多肽包含與SEQ ID NO:8或SEQ ID NO:9中列出之CD86胺基酸序列具有至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列。
4-1BBL-野生型及變異體
存在於TMMP中之MOD為野生型4-1BBL多肽或變異體4-1BBL多肽。4-1BBL變異體MOD描述於2019年3月14日公開的經公開之PCT申請案WO 2019/051091中。參見[00229]-[00324]。
在一些情況下,存在於TMMP中之MOD為4-1BBL多肽。在一些情況下,TMMP之4-1BBL多肽包含與SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:13或SEQ ID NO:14中列出之4-1BBL胺基酸序列具有至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列。
在一些情況下,變異體4-1BBL多肽呈現出對4-1BB之結合親和力與包含SEQ ID NO:10-13中之一者列出之胺基酸序列之4-1BBL多肽之結合親和力相比有所減小。舉例而言,在一些情況下,當在相同條件下測定時,本揭示案之變異體4-1BBL多肽結合4-1BB之結合親和力比包含SEQ ID NO:10-13中之一者列出之胺基酸序列的4-1BBL多肽對4-1BB多肽(例如,包含SEQ ID NO:14中列出之胺基酸序列的4-1BB多肽)之結合親和力小至少10%、小至少15%、小至少20%、小至少25%、小至少30%、小至少35%、小至少40%、小至少45%、小至少50%、小至少55%、小至少60%、小至少65%、小至少70%、小至少75%、小至少80%、小至少85%、小至少90%、小至少95%或小大於95%。
IL-2變異體
在一些情況下,存在於本揭示案之TMMP中的變異體MOD為變異體IL-2多肽。野生型IL-2結合至IL-2受體(IL-2R),亦即包含IL-2Rα、IL-2Rβ及IL-2Rγ之異三聚體多肽。
野生型IL-2胺基酸序列可為如下:
Figure 110116854-A0202-12-0104-575
Figure 110116854-A0202-12-0104-573
Figure 110116854-A0202-12-0104-574
(SEQ ID NO:15)。
野生型IL2結合至細胞表面上之IL2受體(IL2R)。在一些情況下,IL2受體為包含α鏈(IL-2Rα;亦稱為CD25)、β鏈(IL-2Rβ;亦稱為CD122:及γ鏈(IL-2Rγ;亦稱為CD132)之異三聚體多肽。人類IL-2Rα、IL2Rβ及IL-2Rγ之胺基酸序列可為如下。
人類IL-2Rα:
Figure 110116854-A0202-12-0104-503
Figure 110116854-A0202-12-0104-502
Figure 110116854-A0202-12-0104-504
(SEQ ID NO:16)。
人類IL-2Rβ:
Figure 110116854-A0202-12-0104-576
Figure 110116854-A0202-12-0104-505
Figure 110116854-A0202-12-0105-506
Figure 110116854-A0202-12-0105-508
(SEQ ID NO:17)。
人類IL-2Rγ:
Figure 110116854-A0202-12-0105-510
Figure 110116854-A0202-12-0105-507
Figure 110116854-A0202-12-0105-509
(SEQ ID NO:18)。
在一些情況下,當TMMP包含變異體IL-2多肽時,「同源co-MOD」為包含有包含胺基酸序列SEQ ID NO:16、17及18之多肽的IL-2R。
在一些情況下,變異體IL-2多肽呈現出對IL-2R之結合親和力與包含SEQ ID NO:15中列出之胺基酸序列之IL-2多肽之結合親和力相比有所減小。舉例而言,在一些情況下,當在相同條件下測定時,變異體IL-2多肽結合IL-2R之結合親和力比包含SEQ ID NO:15中列出之胺基酸序列的IL-2多肽對IL-2R多肽(例如,包含有包含SEQ ID NO:16-18中列出之胺基酸序列之多肽的IL-2R)之結合親和力小至少10%、小至少15%、小至少20%、小至少25%、小至少30%、小至少35%、小至少40%、小至少45%、小至少50%、小至少55%、小至少60%、小至少 65%、小至少70%、小至少75%、小至少80%、小至少85%、小至少90%、小至少95%或小大於95%。
在一些情況下,變異體IL-2多肽對IL-2R之結合親和力為100nM至100μM。作為另一實例,在一些情況下,變異體IL-2多肽對IL-2R(例如,包含有包含SEQ ID NO:16-18中列出之胺基酸序列之多肽的IL-2R)之結合親和力為約100nM至150nM、約150nM至約200nM、約200nM至約250nM、約250nM至約300nM、約300nM至約350nM、約350nM至約400nM、約400nM至約500nM、約500nM至約600nM、約600nM至約700nM、約700nM至約800nM、約800nM至約900nM、約900nM至約1μM至約1μM至約5μM、約5μM至約10μM、約10μM至約15μM、約15μM至約20μM、約20μM至約25μM、約25μM至約50μM、約50μM至約75μM、或約75μM至約100μM。
在一些情況下,變異體IL-2多肽與SEQ ID NO:15中列出之IL-2胺基酸序列相比具有單一胺基酸取代。在一些情況下,變異體IL-2多肽與SEQ ID NO:15中列出之IL-2胺基酸序列相比具有2至10個胺基酸取代。在一些情況下,變異體IL-2多肽與SEQ ID NO:15中列出之IL-2胺基酸序列相比具有2個胺基酸取代。在一些情況下,變異體IL-2多肽與SEQ ID NO:15中列出之IL-2胺基酸序列相比具有3個胺基酸取代。在一些情況下,變異體IL-2多肽與SEQ ID NO:15中列出之IL-2胺基酸序列相比具有4個胺基酸取代。在一些情況下,變異體IL-2多肽與SEQ ID NO:15中列出之IL-2胺基酸序列相比具有5個胺基酸取代。在一些情況下,變異體IL-2多肽與SEQ ID NO:15中列出之IL-2胺基酸序列相比具有6個胺基酸取代。在一些情況下,變異體IL-2多肽與SEQ ID NO:15中列出之IL-2胺基酸序列相比具有7個胺基酸取代。在一些情況下,變異體IL-2多肽與SEQ ID NO:15中列出之IL-2胺基酸序列相比具有8個胺基酸取代。在一些情況下,變異體IL-2多肽與SEQ ID NO:15中列出之IL-2胺基酸序列相比 具有9個胺基酸取代。在一些情況下,變異體IL-2多肽與SEQ ID NO:15中列出之IL-2胺基酸序列相比具有10個胺基酸取代。
適合的IL-2變異體包括一種多肽,其包含與以下胺基酸序列中之任一者具有至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0107-511
Figure 110116854-A0202-12-0107-512
Figure 110116854-A0202-12-0107-513
(SEQ ID NO:181),其中X為除了Phe以外之任何胺基酸。在一些情況下,X為Ala。在一些情況下,X為Met。在一些情況下,X為Pro。在一些情況下,X為Ser。在一些情況下,X為Thr。在一些情況下,X為Trp。在一些情況下,X為Tyr。在一些情況下,X為Val。在一些情況下,X為His;
Figure 110116854-A0202-12-0107-514
Figure 110116854-A0202-12-0107-515
Figure 110116854-A0202-12-0107-516
(SEQ ID NO:182),其中X為除了Asp以外之任何胺基酸。在一些情況下,X為Ala;
Figure 110116854-A0202-12-0107-517
Figure 110116854-A0202-12-0107-518
Figure 110116854-A0202-12-0107-519
(SEQ ID NO:183),其中X為除了Glu以外之任何胺基酸。在一些情況下,X為Ala。
Figure 110116854-A0202-12-0107-520
Figure 110116854-A0202-12-0107-521
Figure 110116854-A0202-12-0107-522
(SEQ ID NO:184),其中X為除了His以外 之任何胺基酸。在一些情況下,X為Ala。在一些情況下,X為Thr。在一些情況下,X為Asn。在一些情況下,X為Cys。在一些情況下,X為Gln。在一些情況下,X為Met。在一些情況下,X為Val。在一些情況下,X為Trp;
Figure 110116854-A0202-12-0108-523
Figure 110116854-A0202-12-0108-524
Figure 110116854-A0202-12-0108-525
(SEQ ID NO:185),其中X為除了His以外之任何胺基酸。在一些情況下,X為Ala。在一些情況下,X為Arg。在一些情況下,X為Asn。在一些情況下,X為Asp。在一些情況下,X為Cys。在一些情況下,X為Glu。在一些情況下,X為Gln。在一些情況下,X為Gly。在一些情況下,X為Ile。在一些情況下,X為Lys。在一些情況下,X為Leu。在一些情況下,X為Met。在一些情況下,X為Phe。在一些情況下,X為Pro。在一些情況下,X為Ser。在一些情況下,X為Thr。在一些情況下,X為Tyr。在一些情況下,X為Trp。在一些情況下,X為Val;
Figure 110116854-A0202-12-0108-526
Figure 110116854-A0202-12-0108-527
Figure 110116854-A0202-12-0108-528
(SEQ ID NO:186),其中X為除了Tyr以外之任何胺基酸。在一些情況下,X為Ala;
Figure 110116854-A0202-12-0108-529
Figure 110116854-A0202-12-0108-530
Figure 110116854-A0202-12-0108-531
(SEQ ID NO:187),其中X為除了Gln以外之任何胺基酸。在一些情況下,X為Ala;
Figure 110116854-A0202-12-0109-532
Figure 110116854-A0202-12-0109-533
Figure 110116854-A0202-12-0109-534
(SEQ ID NO:188),其中X1 為除了His以外之任何胺基酸,且其中X2 為除了Phe以外之任何胺基酸。在一些情況下,X1 為Ala。在一些情況下,X2 為Ala。在一些情況下,X1 為Ala;且X2 為Ala;在一些情況下,X1 為Thr;且X2 為Ala;
Figure 110116854-A0202-12-0109-535
Figure 110116854-A0202-12-0109-536
Figure 110116854-A0202-12-0109-537
(SEQ ID NO:189),其中X1 為除了Asp以外之任何胺基酸;且其中X2 為除了Phe以外之任何胺基酸。在一些情況下,X1 為Ala。在一些情況下,X2 為Ala。在一些情況下,X1 為Ala;且X2 為Ala;
Figure 110116854-A0202-12-0109-538
Figure 110116854-A0202-12-0109-539
Figure 110116854-A0202-12-0109-540
(SEQ ID NO:190),其中X1 為除了Glu以外之任何胺基酸;其中X2 為除了Asp以外之任何胺基酸;且其中X3 為除了Phe以外之任何胺基酸。在一些情況下,X1 為Ala。在一些情況下,X2 為Ala。在一些情況下,X3 為Ala。在一些情況下,X1 為Ala;X2 為Ala;且X3 為Ala;
Figure 110116854-A0202-12-0109-541
Figure 110116854-A0202-12-0109-542
Figure 110116854-A0202-12-0109-543
(SEQ ID NO:191),其中X1 為除了His以外之任何胺基酸;其中X2 為除了Asp以外之任何胺基酸;且其中X3 為除 了Phe以外之任何胺基酸。在一些情況下,X1 為Ala。在一些情況下,X2 為Ala。在一些情況下,X3 為Ala。在一些情況下,X1 為Ala;X2 為Ala;且X3 為Ala;
Figure 110116854-A0202-12-0110-544
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Figure 110116854-A0202-12-0110-546
(SEQ ID NO:192),其中X1 為除了Asp以外之任何胺基酸;其中X2 為除了Phe以外之任何胺基酸;且其中X3 為除了Gln以外之任何胺基酸。在一些情況下,X1 為Ala。在一些情況下,X2 為Ala。在一些情況下,X3 為Ala。在一些情況下,X1 為Ala;X2 為Ala;且X3 為Ala;
Figure 110116854-A0202-12-0110-547
Figure 110116854-A0202-12-0110-548
Figure 110116854-A0202-12-0110-549
(SEQ ID NO:193),其中X1 為除了Asp以外之任何胺基酸;其中X2 為除了Phe以外之任何胺基酸;且其中X3 為除了Tyr以外之任何胺基酸。在一些情況下,X1 為Ala。在一些情況下,X2 為Ala。在一些情況下,X3 為Ala。在一些情況下,X1 為Ala;X2 為Ala;且X3 為Ala;
Figure 110116854-A0202-12-0110-550
Figure 110116854-A0202-12-0110-551
Figure 110116854-A0202-12-0110-552
(SEQ ID NO:194),其中X1 為除了His以外之任何胺基酸;其中X2 為除了Asp以外之任何胺基酸;其中X3 為除了Phe以外之任何胺基酸;且其中X4 為除了Tyr以外之任何胺基酸。在一些情況下,X1 為Ala。在一些情況下,X2 為Ala。在一些情況下,X3 為Ala。 在一些情況下,X4 為Ala。在一些情況下,X1 為Ala;X2 為Ala;X3 為Ala;且X4 為Ala;
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Figure 110116854-A0202-12-0111-554
Figure 110116854-A0202-12-0111-555
(SEQ ID NO:195),其中X1 為除了Asp以外之任何胺基酸;其中X2 為除了Phe以外之任何胺基酸;其中X3 為除了Tyr以外之任何胺基酸;且其中X4 為除了Gln以外之任何胺基酸。在一些情況下,X1 為Ala。在一些情況下,X2 為Ala。在一些情況下,X3 為Ala。在一些情況下,X4 為Ala。在一些情況下,X1 為Ala;X2 為Ala;X3 為Ala;且X4 為Ala;
Figure 110116854-A0202-12-0111-556
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Figure 110116854-A0202-12-0111-558
(SEQ ID NO:196),其中X1 為除了His以外之任何胺基酸;其中X2 為除了Asp以外之任何胺基酸;其中X3 為除了Phe以外之任何胺基酸;其中X4 為除了Tyr以外之任何胺基酸;且其中X5 為除了Gln以外之任何胺基酸。在一些情況下,X1 為Ala。在一些情況下,X2 為Ala。在一些情況下,X3 為Ala。在一些情況下,X4 為Ala。在一些情況下,X5 為Ala。在一些情況下,X1 為Ala;X2 為Ala;X3 為Ala;X4 為Ala;X5 為Ala;且
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Figure 110116854-A0202-12-0111-561
(SEQ ID NO:197),其中X1 為除了His以外之任何胺基酸;其中X2 為除了Phe以外之任何胺基酸;且其中X3 為除了Gln以外之任何胺基酸。在一些情況下,X1 為Ala。在一些情況下,X2 為Ala。在一些情況下,X3 為Ala。在一些情況下,X1 為Ala;X2 為Ala;且X3 為Ala。
在一些情況下,適合的變異體IL-2多肽包含與以下胺基酸序列具有至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0112-562
Figure 110116854-A0202-12-0112-563
Figure 110116854-A0202-12-0112-564
(SEQ ID NO:490),亦即變異體IL-2多肽具有野生型IL-2之胺基酸序列,但含有H16A及F42A取代(以粗體顯示)。或者,可採用上述序列,但在H16及/或F42處具有除了Ala以外之取代,例如H16T可用於代替H16A。在一些情況下,存在於TMMP中之變異體IL-2多肽包含以下胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0112-565
Figure 110116854-A0202-12-0112-566
Figure 110116854-A0202-12-0112-567
(SEQ ID NO:490)。在一些情況下,存在於TMMP中之變異體IL-2多肽包含以下胺基酸序列:
Figure 110116854-A0202-12-0112-568
Figure 110116854-A0202-12-0112-569
Figure 110116854-A0202-12-0112-570
(SEQ ID NO:491)。在一些情況下,M包含此類變異體IL-2多肽之兩個拷貝。
額外多肽
除了上文所述之彼等多肽之外,本揭示案之TMMP之多肽亦可包括一或多種多肽。適合的額外多肽包括抗原決定基標籤及親和力結構域。該一或多種額外多肽可包括在TMMP之多肽鏈之N端、在TMMP之多肽鏈之C端、或在TMMP之多肽鏈內部。
抗原決定基標籤
適合的抗原決定基標籤包括但不限於血球凝集素(hemagglutinin,HA;例如,YPYDVPDYA(SEQ ID NO:271);FLAG(例如,DYKDDDDK(SEQ ID NO:272);c-myc(例如,EQKLISEEDL;SEQ ID NO:273)及類似物。
親和力結構域
親和力結構域包括可與結合配偶體,諸如固定在固體支撐物上可用於鑑別或純化之結合配偶體相互作用之肽序列。編碼多個連續單一胺基酸諸如組胺酸之DNA序列當融合至經表現之蛋白時可用於藉由與樹脂管柱諸如鎳瓊脂糖之高親和力結合來一步純化重組蛋白。示範性親和力結構域提供於2019年3月14日公開的經公開PCT申請案WO 2019/051091中。參見[00355]。
藥物偶聯物
本揭示案之TMMP之多肽鏈可包含連接(例如,共價附接)至多肽鏈之小分子藥物。舉例而言,在本揭示案之TMMP包含Fc多肽時,Fc多肽可包含共價連接之小分子藥物。在一些情況下,小分子藥物為癌症化學治療劑,例如細胞毒性劑。此類藥物偶聯物及適合的化療劑之揭示內容提供於2019年3月14日公開的經公開PCT申請案WO 2019/051091中。參見[00356]-[00363]。
示範性TMMP
本揭示案之TMMP包含至少一種異二聚體,其包含:a)第一多肽,該第一多肽包含:i)WT-1肽抗原決定基;及ii)第一MHC多肽;b)第二多肽,該第二多肽包含第二MHC多肽;及c)至少一種MOD,其中該第一多肽及/或該第二多肽包含MOD。因此,在一些情況下,TMMP包含至少一種異二聚體,其包含:a)第一多肽,該第一多肽包含:i)WT-1肽抗原決定基;ii)第一MHC多肽;及iii)至少一種MOD;及b)第二多肽,該第二多肽包含第二MHC多肽。在其他情況下,TMMP包含至少一種異二聚體,其包含:a)第一多肽,該第一多肽包含:i)WT-1肽抗原 決定基;及ii)第一MHC多肽;及b)第二多肽,該第二多肽包含:i)第二MHC多肽;及ii)至少一種MOD。在一些情況下,TMMP包含至少一種異二聚體,其包含:a)第一多肽,該第一多肽包含:i)WT-1肽抗原決定基;ii)第一MHC多肽;及iii)至少一種MOD;及b)第二多肽,該第二多肽包含:i)第二MHC多肽;及ii)至少一種MOD。在一些情況下,該至少一種MOD為野生型免疫調節多肽。在其他情況下,該至少一種MOD為呈現出與共免疫調節多肽之親和力與相應野生型MOD對共免疫調節多肽之親和力相比有所減小的變異體MOD。在一些情況下,TMMP包含兩種MOD,其中該兩種MOD具有相同胺基酸序列。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽,該第一多肽以自N端至C端之次序包含:i)WT-1肽抗原決定基;ii)第一MHC多肽;及iii)至少一種MOD;及b)第二多肽,該第二多肽以自N端至C端之次序包含:i)第二MHC多肽;及ii)Ig Fc多肽。在一些情況下,第一MHC多肽為β2M多肽;且第二MHC多肽為HLA重鏈多肽。在一些情況下,HLA重鏈多肽為HLA-A24多肽。在一些情況下,HLA重鏈多肽為具有Y84C取代之HLA-A24多肽。在一些情況下,HLA重鏈多肽為具有Y84C取代及在位置236處之Ala的HLA-A24多肽。在一些情況下,HLA重鏈多肽為具有Y84A取代之HLA-A24多肽。在一些情況下,HLA重鏈多肽為具有Y84A取代及A236C取代之HLA-A24多肽。在一些情況下,HLA重鏈多肽為具有Y84C取代及A236C取代之HLA-A24多肽。在一些情況下,β2M多肽包含位置12處之Arg(R12)。在一些情況下,β2M多肽包含R12C取代。在一些情況下,HLA重鏈多肽為具有A236C取代之HLA-A24多肽。在一些情況下,第一多肽以自N端至C端之次序包含:i)WT-1肽抗原決定基;ii)第一MHC多肽;及iii)兩種MOD,其中該兩種MOD具有相同胺基酸序列。在一些情況下,Ig Fc多肽為人類IgG1 Fc多肽。在一些情況下,Ig Fc多肽為包含L234A及L235A取代之IgG1 Fc多肽。在一些情況下,第一多肽與第二多肽兩者彼此間以二硫鍵連接。在一些情況下,MOD為包含 H16A及F42A取代之變異體IL-2多肽。在一些情況下,MOD為包含H16T及F42A取代之變異體IL-2多肽。在一些情況下,肽連接子介於以下中之一或多者之間:i)第二MHC多肽與Ig Fc多肽;ii)抗原決定基與第一MHC多肽;iii)第一MHC多肽與MOD;及(當TMMP在第一多肽鏈上包含兩種MOD時)iv)介於兩種MOD之間。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列AAAGG(SEQ ID NO:283)。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列(GGGGS)n(SEQ ID NO:284),其中n為1至10之整數(例如,其中n為2、3或4)。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列GCGGS(GGGGS)n(SEQ ID NO:319),其中n為1至9之整數(例如,其中n為2、3或4)。在一些情況下,WT-1肽抗原決定基為CMTWNQMN(SEQ ID NO:261)。在一些情況下,WT-1肽抗原決定基為CYTWNQMNL(SEQ ID NO:262)。在一些情況下,WT-1肽抗原決定基為SMTWNQMNL(SEQ ID NO:451)。在一些情況下,WT-1肽抗原決定基為GCMTWNQMNL(SEQ ID NO:452)。在一些情況下,WT-1肽抗原決定基為SYTWNQMNL(SEQ ID NO:453)。在一些情況下,WT-1肽抗原決定基為GCYTWNQMNL(SEQ ID NO:454)。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽,該第一多肽以自N端至C端之次序包含:i)WT-1肽抗原決定基;及ii)第一MHC多肽;及b)第二多肽,該第二多肽以自N端至C端之次序包含:i)至少一種MOD;ii)第二MHC多肽;及iii)Ig Fc多肽。在一些情況下,第一MHC多肽為β2M多肽;且第二MHC多肽為HLA重鏈多肽。在一些情況下,HLA重鏈多肽為HLA-A24多肽。在一些情況下,HLA重鏈多肽為具有A236C取代之HLA-A24多肽。在一些情況下,HLA重鏈多肽為具有Y84C取代之HLA-A24多肽。在一些情況下,HLA重鏈多肽為具有Y84C取代及在位置236處之Ala的HLA-A24多肽。在一些情況下,HLA重鏈多肽為具有Y84A取代之HLA-A24多肽。在一些情況下,HLA重鏈多肽為具有Y84A取代及A236C取代之HLA-A24多肽。在一些情況下,HLA重鏈多肽為具有Y84C取代及A236C取代之HLA-A24多肽。在一些情況下,β2M多肽包含 位置12處之Arg(R12)。在一些情況下,β2M多肽包含R12C取代。在一些情況下,第二多肽以自N端至C端之次序包含:i)兩種MOD,其中該兩種MOD具有相同胺基酸序列;ii)第二MHC多肽;及iii)Ig Fc多肽。在一些情況下,Ig Fc多肽為人類IgG1 Fc多肽。在一些情況下,Ig Fc多肽為包含L234A及L235A取代之IgG1 Fc多肽。在一些情況下,第一多肽與第二多肽兩者彼此間以二硫鍵連接。在一些情況下,MOD為包含H16A及F42A取代之變異體IL-2多肽。在一些情況下,MOD為包含H16T及F42A取代之變異體IL-2多肽。在一些情況下,肽連接子介於以下中之一或多者之間:i)第二MHC多肽與Ig Fc多肽;ii)抗原決定基與第一MHC多肽;iii)第一MHC多肽與MOD;及(當TMMP在第二多肽鏈上包含兩種MOD時)iv)介於兩種MOD之間。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列AAAGG(SEQ ID NO:283)。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列(GGGGS)n(SEQ ID NO:284),其中n為1至10之整數(例如,其中n為2、3或4)。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列GCGGS(GGGGS)n(SEQ ID NO:319),其中n為1至9之整數(例如,其中n為2、3或4)。在一些情況下,WT-1肽抗原決定基為CMTWNQMN(SEQ ID NO:261)。在一些情況下,WT-1肽抗原決定基為CYTWNQMNL(SEQ ID NO:262)。在一些情況下,WT-1肽抗原決定基為SMTWNQMNL(SEQ ID NO:451)。在一些情況下,WT-1肽抗原決定基為GCMTWNQMNL(SEQ ID NO:452)。在一些情況下,WT-1肽抗原決定基為SYTWNQMNL(SEQ ID NO:453)。在一些情況下,WT-1肽抗原決定基為GCYTWNQMNL(SEQ ID NO:454)。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽,該第一多肽以自N端至C端之次序包含:i)WT-1肽抗原決定基;及ii)第一MHC多肽;及b)第二多肽,該第二多肽以自N端至C端之次序包含:i)第二MHC多肽;ii)Ig Fc多肽;及iii)至少一種MOD。在一些情況下,第一MHC多肽為β2M多肽;且第二MHC多肽為HLA重鏈多肽。在一些情況下,HLA重鏈多肽為HLA-A24多肽。在一些情況下,HLA重鏈多肽為具有A236C 取代之HLA-A24多肽。在一些情況下,HLA重鏈多肽為具有Y84C取代之HLA-A24多肽。在一些情況下,HLA重鏈多肽為具有Y84C取代及在位置236處之Ala的HLA-A24多肽。在一些情況下,HLA重鏈多肽為具有Y84A取代之HLA-A24多肽。在一些情況下,HLA重鏈多肽為具有Y84A取代及A236C取代之HLA-A24多肽。在一些情況下,HLA重鏈多肽為具有Y84C取代及A236C取代之HLA-A24多肽。在一些情況下,β2M多肽包含位置12處之Arg(R12)。在一些情況下,β2M多肽包含R12C取代。在一些情況下,第二多肽以自N端至C端之次序包含:i)第二MHC多肽;ii)Ig Fc多肽;及iii)兩種MOD,其中該兩種MOD具有相同胺基酸序列。在一些情況下,Ig Fc多肽為人類IgG1 Fc多肽。在一些情況下,Ig Fc多肽為包含L234A及L235A取代之IgG1 Fc多肽。在一些情況下,第一多肽與第二多肽兩者彼此間以二硫鍵連接。在一些情況下,MOD為包含H16A及F42A取代之變異體IL-2多肽。在一些情況下,MOD為包含H16T及F42A取代之變異體IL-2多肽。在一些情況下,肽連接子介於以下中之一或多者之間:i)第二MHC多肽與Ig Fc多肽;ii)抗原決定基與第一MHC多肽;iii)Ig Fc多肽與MOD;及(當TMMP在第二多肽鏈上包含兩種MOD時)iv)介於該兩種免疫調節多肽之間。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列AAAGG(SEQ ID NO:283)。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列(GGGGS)n(SEQ ID NO:284),其中n為1至10之整數(例如,其中n為2、3或4)。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列GCGGS(GGGGS)n(SEQ ID NO:319),其中n為1至9之整數(例如,其中n為2、3或4)。在一些情況下,WT-1肽抗原決定基為CMTWNQMN(SEQ ID NO:261)。在一些情況下,WT-1肽抗原決定基為CYTWNQMNL(SEQ ID NO:262)。在一些情況下,WT-1肽抗原決定基為SMTWNQMNL(SEQ ID NO:451)。在一些情況下,WT-1肽抗原決定基為GCMTWNQMNL(SEQ ID NO:452)。在一些情況下,WT-1肽抗原決定基為SYTWNQMNL(SEQ ID NO:453)。在一些情況下,WT-1肽抗原決定基為GCYTWNQMNL(SEQ ID NO:454)。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽,該第一多肽以自N端至C端之次序包含:i)WT-1肽抗原決定基;及ii)第一MHC多肽;及b)第二多肽,該第二多肽以自N端至C端之次序包含:i)至少一種MOD;ii)第二MHC多肽;及iii)Ig Fc多肽。在一些情況下,第一MHC多肽為β2M多肽;且第二MHC多肽為HLA重鏈多肽。在一些情況下,HLA重鏈多肽為HLA-A24多肽。在一些情況下,HLA重鏈多肽為具有A236C取代之HLA-A24多肽。在一些情況下,Ig Fc多肽為人類IgG1 Fc多肽。在一些情況下,Ig Fc多肽為包含L234A及L235A取代之IgG1 Fc多肽。在一些情況下,第一多肽與第二多肽兩者彼此間以二硫鍵連接。在一些情況下,MOD為包含H16A及F42A取代之變異體IL-2多肽。在一些情況下,MOD為包含H16T及F42A取代之變異體IL-2多肽。在一些情況下,WT-1肽抗原決定基為CMTWNQMN(SEQ ID NO:261)。在一些情況下,WT-1肽抗原決定基為CYTWNQMNL(SEQ ID NO:262)。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽,該第一多肽以自N端至C端之次序包含:i)至少一種MOD;ii)WT-1肽抗原決定基;及iii)第一MHC多肽;及b)第二多肽,該第二多肽以自N端至C端之次序包含:i)第二MHC多肽;及ii)Ig Fc多肽。在一些情況下,第一MHC多肽為β2M多肽;且第二MHC多肽為HLA重鏈多肽。在一些情況下,HLA重鏈多肽為HLA-A24多肽。在一些情況下,HLA重鏈多肽為具有A236C取代之HLA-A24多肽。在一些情況下,第一多肽以自N端至C端之次序包含:i)兩種MOD,其中該兩種MOD具有相同胺基酸序列;ii)WT-1肽抗原決定基;及iii)第一MHC多肽。在一些情況下,Ig Fc多肽為人類IgG1 Fc多肽。在一些情況下,Ig Fc多肽為包含L234A及L235A取代之IgG1 Fc多肽。在一些情況下,第一多肽與第二多肽兩者彼此間以二硫鍵連接。在一些情況下,MOD為包含H16A及F42A取代之變異體IL-2多肽。在一些情況下,MOD為包含H16T及F42A取代之變異體IL-2多肽。在一些情況下,肽連接子介於以下中之一或多者之間:i)第二MHC多肽與Ig Fc多肽; ii)抗原決定基與第一MHC多肽;iii)MOD與抗原決定基;及(當TMMP在第一多肽鏈上包含兩種MOD時)iv)介於兩種MOD之間。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列AAAGG(SEQ ID NO:283)。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列(GGGGS)n(SEQ ID NO:284),其中n為1至10之整數(例如,其中n為2、3或4)。在一些情況下,WT-1肽抗原決定基為CMTWNQMN(SEQ ID NO:261)。在一些情況下,WT-1肽抗原決定基為CYTWNQMNL(SEQ ID NO:262)。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽,該第一多肽以自N端至C端之次序包含:i)WT-1肽抗原決定基;及ii)第一MHC多肽;及b)第二多肽,該第二多肽以自N端至C端之次序包含:i)第二MHC多肽;ii)至少一種MOD;及iii)Ig Fc多肽。在一些情況下,第一MHC多肽為β2M多肽;且第二MHC多肽為HLA重鏈多肽。在一些情況下,HLA重鏈多肽為HLA-A24多肽。在一些情況下,HLA重鏈多肽為具有A236C取代之HLA-A24多肽。在一些情況下,第二多肽以自N端至C端之次序包含:i)第二MHC多肽;ii)兩種MOD,其中該兩種MOD具有相同胺基酸序列;及iii)Ig Fc多肽。在一些情況下,Ig Fc多肽為人類IgG1 Fc多肽。在一些情況下,Ig Fc多肽為包含L234A及L235A取代之IgG1 Fc多肽。在一些情況下,第一多肽與第二多肽兩者彼此間以二硫鍵連接。在一些情況下,MOD為包含H16A及F42A取代之變異體IL-2多肽。在一些情況下,MOD為包含H16T及F42A取代之變異體IL-2多肽。在一些情況下,肽連接子介於以下中之一或多者之間:i)第二MHC多肽與免疫調節多肽;ii)MOD與Ig Fc多肽;iii)抗原決定基與第一MHC多肽;iii)第一MHC多肽與MOD;及(當TMMP在第二多肽鏈上包含兩種MOD時)iv)介於該兩種MOD之間。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列AAAGG(SEQ ID NO:283)。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列(GGGGS)n(SEQ ID NO:284),其中n為1至10之整數(例如,其中n為2、3或4)。在一些情 況下,WT-1肽抗原決定基為CMTWNQMN(SEQ ID NO:261)。在一些情況下,WT-1肽抗原決定基為CYTWNQMNL(SEQ ID NO:262)。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽,該第一多肽以自N端至C端之次序包含:i)至少一種MOD;ii)WT-1肽抗原決定基;及iii)第一MHC多肽;及b)第二多肽,該第二多肽以自N端至C端之次序包含:i)第二MHC多肽;及ii)Ig Fc多肽。在一些情況下,第一MHC多肽為β2M多肽;且第二MHC多肽為HLA重鏈多肽。在一些情況下,HLA重鏈多肽為HLA-A24多肽。在一些情況下,HLA重鏈多肽為具有A236C取代之HLA-A24多肽。在一些情況下,HLA重鏈多肽為具有Y84C取代之HLA-A24多肽。在一些情況下,HLA重鏈多肽為具有Y84C取代及在位置236處之Ala的HLA-A24多肽。在一些情況下,HLA重鏈多肽為具有Y84A取代之HLA-A24多肽。在一些情況下,HLA重鏈多肽為具有Y84A取代及A236C取代之HLA-A24多肽。在一些情況下,HLA重鏈多肽為具有Y84C取代及A236C取代之HLA-A24多肽。在一些情況下,β2M多肽包含位置12處之Arg(R12)。在一些情況下,β2M多肽包含R12C取代。在一些情況下,第一多肽以自N端至C端之次序包含:i)兩種MOD,其中該兩種MOD具有相同胺基酸序列;ii)WT-1肽抗原決定基;及iii)第一MHC多肽。在一些情況下,Ig Fc多肽為人類IgG1 Fc多肽。在一些情況下,Ig Fc多肽為包含L234A及L235A取代之IgG1 Fc多肽。在一些情況下,第一多肽與第二多肽兩者彼此間以二硫鍵連接。在一些情況下,MOD為包含H16A及F42A取代之變異體IL-2多肽。在一些情況下,MOD為包含H16T及F42A取代之變異體IL-2多肽。在一些情況下,肽連接子介於以下中之一或多者之間:i)第二MHC多肽與Ig Fc多肽;ii)抗原決定基與第一MHC多肽;iii)MOD與抗原決定基;及(當TMMP在第一多肽鏈上包含兩種免疫調節多肽時)iv)介於兩種MOD之間。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列AAAGG(SEQ ID NO:283)。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列(GGGGS)n(SEQ ID NO:284),其中n為1至10之整數(例如,其中n為 2、3或4)。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列GCGGS(GGGGS)n(SEQ ID NO:319),其中n為1至9之整數(例如,其中n為2、3或4)。在一些情況下,WT-1肽抗原決定基為CMTWNQMN(SEQ ID NO:261)。在一些情況下,WT-1肽抗原決定基為CYTWNQMNL(SEQ ID NO:262)。在一些情況下,WT-1肽抗原決定基為SMTWNQMNL(SEQ ID NO:451)。在一些情況下,WT-1肽抗原決定基為GCMTWNQMNL(SEQ ID NO:452)。在一些情況下,WT-1肽抗原決定基為SYTWNQMNL(SEQ ID NO:453)。在一些情況下,WT-1肽抗原決定基為GCYTWNQMNL(SEQ ID NO:454)。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽,該第一多肽以自N端至C端之次序包含:i)WT-1肽抗原決定基;及ii)第一MHC多肽;及b)第二多肽,該第二多肽以自N端至C端之次序包含:i)第二MHC多肽;ii)至少一種MOD;及iii)Ig Fc多肽。在一些情況下,第一MHC多肽為β2M多肽;且第二MHC多肽為HLA重鏈多肽。在一些情況下,HLA重鏈多肽為HLA-A24多肽。在一些情況下,HLA重鏈多肽為具有A236C取代之HLA-A24多肽。在一些情況下,HLA重鏈多肽為具有Y84C取代之HLA-A24多肽。在一些情況下,HLA重鏈多肽為具有Y84C取代及在位置236處之Ala的HLA-A24多肽。在一些情況下,HLA重鏈多肽為具有Y84A取代之HLA-A24多肽。在一些情況下,HLA重鏈多肽為具有Y84A取代及A236C取代之HLA-A24多肽。在一些情況下,HLA重鏈多肽為具有Y84C取代及A236C取代之HLA-A24多肽。在一些情況下,β2M多肽包含位置12處之Arg(R12)。在一些情況下,β2M多肽包含R12C取代。在一些情況下,第二多肽以自N端至C端之次序包含:i)第二MHC多肽;ii)兩種MOD,其中該兩種MOD具有相同胺基酸序列;及iii)Ig Fc多肽。在一些情況下,Ig Fc多肽為人類IgG1 Fc多肽。在一些情況下,Ig Fc多肽為包含L234A及L235A取代之IgG1 Fc多肽。在一些情況下,第一多肽與第二多肽兩者彼此間以二硫鍵連接。在一些情況下,MOD為包含H16A及F42A取代之變異體IL-2多肽。在一些情況下,MOD為包含H16T及F42A 取代之變異體IL-2多肽。在一些情況下,肽連接子介於以下中之一或多者之間:i)第二MHC多肽與MOD;ii)MOD與Ig Fc多肽;iii)抗原決定基與第一MHC多肽;iii)第一MHC多肽與MOD;及(當TMMP在第二多肽鏈上包含兩種MOD時)iv)介於該兩種MOD之間。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列AAAGG(SEQ ID NO:283)。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列(GGGGS)n(SEQ ID NO:284),其中n為1至10之整數(例如,其中n為2、3或4)。在一些情況下,肽連接子包含胺基酸序列GCGGS(GGGGS)n(SEQ ID NO:319),其中n為1至9之整數(例如,其中n為2、3或4)。在一些情況下,WT-1肽抗原決定基為CMTWNQMN(SEQ ID NO:261)。在一些情況下,WT-1肽抗原決定基為CYTWNQMNL(SEQ ID NO:262)。在一些情況下,WT-1肽抗原決定基為SMTWNQMNL(SEQ ID NO:451)。在一些情況下,WT-1肽抗原決定基為GCMTWNQMNL(SEQ ID NO:452)。在一些情況下,WT-1肽抗原決定基為SYTWNQMNL(SEQ ID NO:453)。在一些情況下,WT-1肽抗原決定基為GCYTWNQMNL(SEQ ID NO:454)。
如上文所述且如圖19示意性示出,MOD(亦即,一或多種MOD)可存在於本揭示案之TMMP的多個位置中之任一者處。圖19描繪變異體IL-2多肽之兩個副本之位置;然而,MOD可為如本文所述之多種MOD中之任一者。如圖19所描繪,MOD可;1)在I類MHC重鏈之N端(位置1);2)在I類MHC重鏈之C端及Ig Fc多肽之N端;換言之,介於I類MHC重鏈與Ig Fc多肽之間(位置2);3)在Ig Fc多肽之C端(位置3);4)在肽抗原決定基之N端(位置4);或5)在β2M多肽之C端(位置5)。「位置1」係指MOD在與I類MHC重鏈相同之多肽鏈上且在I類MHC重鏈之N端的位置;例如,其中TMMP包含:a)第一多肽,該第一多肽以自N端至C端之次序包含:i)肽抗原決定基(例如,WT-1肽);及ii)β2M多肽;及b)第二多肽,該第二多肽以自N端至C端之次序包含:i)一或多種MOD;及ii)I類MHC重鏈多肽。「位置2」係指MOD在與I類MHC重 鏈相同之多肽鏈上且在I類MHC重鏈之C端而非多肽鏈之C端的位置;例如,其中TMMP包含:a)第一多肽,該第一多肽以自N端至C端之次序包含:i)肽抗原決定基(例如,WT-1肽);及ii)β2M多肽;及b)第二多肽,該第二多肽以自N端至C端之次序包含:i)I類MHC重鏈多肽;ii)一或多種MOD;及iii)Ig Fc多肽。「位置3」係指MOD在與I類MHC重鏈相同之多肽鏈上且在多肽鏈之C端的位置;例如,其中TMMP包含:a)第一多肽,該第一多肽以自N端至C端之次序包含:i)肽抗原決定基(例如,WT-1肽);及ii)β2M多肽;及b)第二多肽,該第二多肽以自N端至C端之次序包含:i)I類MHC重鏈多肽;ii)Ig Fc多肽;及iii)一或多種MOD。「位置4」係指MOD在與β2M多肽相同之多肽鏈上且在肽抗原決定基及β2M多肽之N端的位置;例如,其中TMMP包含:a)第一多肽,該第一多肽以自N端至C端之次序包含:i)一或多種MOD;ii)肽抗原決定基(例如,WT-1肽);及iii)β2M多肽;及b)第二多肽,該第二多肽包含I類MHC重鏈多肽(例如,第二多肽,該第二多肽以自N端至C端之次序包含:i)I類MHC重鏈多肽;及ii)Ig Fc多肽。「位置5」係指MOD在與β2M多肽相同之多肽鏈上且在β2M多肽之C端(例如,多肽鏈之C端)的位置;例如,其中TMMP包含:a)第一多肽,該第一多肽以自N端至C端之次序包含:i)肽抗原決定基(例如,WT-1肽);及ii)β2M多肽;及iii)一或多種MOD;及b)第二多肽,該第二多肽包含I類MHC重鏈多肽(例如,第二多肽,該第二多肽以自N端至C端之次序包含:i)I類MHC重鏈多肽;及ii)Ig Fc多肽。
另外,如上文所討論且如圖18A-18C示意性描繪,TMMP之第一多肽鏈及第二多肽鏈可由一或多個二硫鍵連接。舉例而言,TMMP可包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含具有R12C取代之β2M多肽;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含具有A236C取代之I類MHC重鏈多肽,使得二硫鍵在第一多肽鏈中β2M多肽之位置12處的Cys與第二多肽鏈中I類MHC重鏈多肽之位置236處的Cys之間形成。作為另一實 例,TMMP可包含:a)第一多肽,該第一多肽以自N端至C端之次序包含:i)肽抗原決定基;ii) 肽連接子,該肽連接子包含GCGGS(G4S)n (SEQ ID NO:315)序列,其中n為1、2或3;及iii)β2M多肽;及b)第二多肽,該第二多肽包含具有Y84C取代之I類MHC重鏈多肽,使得二硫鍵在第一多肽鏈之肽連接子中的Cys與第二多肽鏈之I類MHC重鏈多肽之位置84處的Cys之間形成。在其他實例中,TMMP可包含:a)第一多肽,該第一多肽以自N端至C端之次序包含:i) 肽抗原決定基;ii)肽連接子,該肽連接子包含GCGGS(G4S)n (SEQ ID NO:315)序列,其中n為1、2或3;及iii)β2M多肽,該多肽具有R12C取代;及b)第二多肽,該第二多肽包含具有Y84C取代及A236C取代之I類MHC重鏈多肽,使得:i)第一二硫鍵在第一多肽鏈之肽連接子中的Cys與第二多肽鏈之I類MHC重鏈多肽之位置84處的Cys之間形成;且ii)第二二硫鍵在第一多肽鏈之β2M多肽之位置12處的Cys與第二多肽鏈之I類MHC重鏈多肽之位置236處的Cys之間形成。為簡明起見,第一二硫鍵稱為「G2C/Y84C」;且第二二硫鍵稱為「R12C/A236C」。TMMP可包括:a)G2C/Y84C二硫鍵而無R12C/A236C二硫鍵;b)R12C/A236C二硫鍵而無G2C/Y84C二硫鍵;或c)G2C/Y84C二硫鍵及R12C/A236C二硫鍵。
TMMP可包括:a)G2C/Y84C二硫鍵而無R12C/A236C二硫鍵;及b)在位置1處之至少一種免疫調節多肽。TMMP可包括:a)G2C/Y84C二硫鍵而無R12C/A236C二硫鍵;及b)在位置2處之至少一種MOD。本揭示案之TMMP可包括:a)G2C/Y84C二硫鍵而無R12C/A236C二硫鍵;及b)在位置3處之至少一種MOD。TMMP可包括:a)G2C/Y84C二硫鍵而無R12C/A236C二硫鍵;及b)在位置4處之至少一種MOD。TMMP可包括:a)G2C/Y84C二硫鍵而無R12C/A236C二硫鍵;及b)在位置5處之至少一種MOD。
TMMP可包括:a)R12C/A236C二硫鍵而無G2C/Y84C二硫鍵;及在位置1處之至少一種MOD。TMMP可包括:a)R12C/A236C二 硫鍵而無G2C/Y84C二硫鍵;及在位置2處之至少一種MOD。TMMP可包括:a)R12C/A236C二硫鍵而無G2C/Y84C二硫鍵;及b)在位置3處之至少一種MOD。本揭示案之TMMP可包括:a)R12C/A236C二硫鍵而無G2C/Y84C二硫鍵;及b)在位置4處之至少一種免疫調節多肽。TMMP可包括:a)R12C/A236C二硫鍵而無G2C/Y84C二硫鍵;及在位置5處之至少一種MOD。
TMMP可包括:a)G2C/Y84C二硫鍵及R12C/A236C二硫鍵;及b)及在位置1處之至少一種MOD。TMMP可包括:a)G2C/Y84C二硫鍵及R12C/A236C二硫鍵;及b)及在位置2處之至少一種MOD。TMMP可包括:a)G2C/Y84C二硫鍵及R12C/A236C二硫鍵;及b)及在位置3處之至少一種MOD。本揭示案之TMMP可包括:a)G2C/Y84C二硫鍵及R12C/A236C二硫鍵;及b)及在位置4處之至少一種MOD。TMMP可包括:a)G2C/Y84C二硫鍵及R12C/A236C二硫鍵;及b)及在位置5處之至少一種MOD。
本揭示案之TMMP之第一多肽鏈及第二多肽鏈的胺基酸序列之非限制性實例提供於圖4A-4K及圖20A-20R中。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖4D所描繪之指示為「2752」的胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖4C所描繪之指示為「3159」的胺基酸序列。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖4E所描繪之指示為「2753」的胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖4C所描繪之指示為「3159」的胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置3處的MOD;及b)R12C/A236C二硫鍵(而非G2C/Y84C二硫鍵)。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖4D所描繪之指示為「2752」的胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖4B所描繪之指示為「2750」的胺基酸序列。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖4E所描繪之指示為「2753」的胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖4B所描繪之指示為「2750」的胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置1處的MOD;及b)R12C/A236C二硫鍵(而非G2C/Y84C二硫鍵)。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖4D所描繪之指示為「2752」的胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖4A所描繪之指示為「3158」的胺基酸序列。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖4E所描繪之指示為「2753」的胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖4A所描繪之指示為「3158」的胺基酸序列。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖14B所描繪之指示為「2380」的胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖14A所描繪之指示為「1715」的胺基酸序列。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈以自N端至C端之次序包含:i)序列VLDEAPPGA(SEQ ID NO:259)之WT-1肽;ii)具有胺基酸序列GCGGSGGGGSGGGGS(SEQ ID NO:317)之連接子;及iii)包含位置12處之Cys的β2M多肽(例如,具有SEQ ID NO:311中列出之胺基酸序列的β2M);及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈以自N端至C端之次序包含:i)包含H16A及F42A取代(亦即包含位置16及42處之Ala,例如SEQ ID NO:188中列出之胺基酸序列,其中X1 為Ala且其中X2 為Ala)之變異體IL-2多肽;ii)(GGGGS)4連接子;iii)包含H16A及F42A取代(亦即包含位置16及42處之Ala,例如SEQ ID NO:188中列出之胺基酸序列,其中X1 為Ala且其中X2 為Ala)之變異體IL-2多肽;iv)(GGGGS)4連接子;v)包含位置84及236處之Cys的HLA A0202重鏈(例如,包含SEQ ID NO:341中列出之胺基酸序列的HLA重鏈多肽);vi)AAAGG連接子;及vii)Ig Fc多肽。在一些情況下,Ig Fc多肽包含與圖5A-5G或5H中 描繪之Fc區之胺基酸序列具有至少約95%、至少約98%、至少約99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列。在一些情況下,Ig Fc多肽為變異體Ig Fc多肽,其相對於野生型多肽包含一或多個序列變異,其中Ig Fc多肽經由補體依賴性細胞毒性(Complement Dependent Cytotoxicity,CDC)及/或抗體依賴性細胞毒性(Antibody-Dependent Cell-Mediated Cytotoxicity,ADCC)誘導細胞裂解之能力係降低或實質上消除的。在一些情況下,Ig Fc多肽為包含L234A及/或L235A取代(圖5H中描繪之胺基酸序列中的L14及L15)之變異體人類IgG1 Fc多肽。在一些情況下,Ig Fc多肽包含圖5H中描繪及SEQ ID NO:487中列出之胺基酸序列。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈以自N端至C端之次序包含:i)序列VLDFAPPGA(SEQ ID NO:259)之WT-1肽;ii)具有胺基酸序列GCGGSGGGGSGGGGS(SEQ ID NO:317)之連接子;及iii)包含位置12處之Cys的β2M多肽(例如,具有SEQ ID NO:311中列出之胺基酸序列的β2M);及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈以自N端至C端之次序包含:i)包含H16A及F42A取代(亦即包含位置16及42處之Ala,例如SEQ ID NO:188中列出之胺基酸序列,其中X1 為Ala且其中X2 為Ala)之變異體IL-2多肽;ii)(GGGGS)4連接子;iii)包含H16A及F42A取代(亦即包含位置16及42處之Ala,例如SEQ ID NO:188中列出之胺基酸序列,其中X1 為Ala且其中X2 為Ala)之變異體IL-2多肽;iv)(GGGGS)4連接子;v)包含位置84及236處之Cys的HLA A0202重鏈(例如,包含SEQ ID NO:341中列出之胺基酸序列的HLA重鏈多肽);vi)AAAGG連接子;及vii)包含位置14及15處之Ala但缺乏C端Lys的Ig Fc多肽(例如,包含圖5H中描繪及SEQ ID NO:487中列出之胺基酸序列的Ig Fc多肽)。例如,在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖14B所描繪之指示為「2380」的胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖14J所描繪之指示為「1715」的胺基酸序列。圖14J中描繪之構築體(「無C端Lys之1715」)在本文中亦稱為「1715△」。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖14B所描繪之指示為「2381」的胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖14A所描繪之指示為「1715」或如圖14A所描繪且在SEQ ID NO:486中列出之指示為1715△的胺基酸序列。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖14B所描繪之指示為「2380」的胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖14D所描繪之指示為「2405」的胺基酸序列。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖14B所描繪之指示為「2381」的胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖14D所描繪之指示為「2405」的胺基酸序列。在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖14F所描繪之指示為「2762」的胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖14D所描繪之指示為「2405」的胺基酸序列。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖14B所描繪之指示為「2380」的胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖14E所描繪之指示為「1380」的胺基酸序列。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖14B所描繪之指示為「2381」的胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖14E所描繪之指示為「1380」的胺基酸序列。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖20A所描繪之指示為「3592」的胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20H所描繪之指示為「3188」的胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置1處的MOD;及b)G2C/Y84C二硫鍵及R12C/A236C二硫鍵兩者。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖20B所描繪之指示為「3425」的胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20H所描繪之指示為「3188」的胺基酸序列。 此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置3處的MOD;及b)G2C/Y84C二硫鍵及R12C/A236C二硫鍵兩者。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖20C所描繪之指示為「3196」的胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20I所描繪之指示為「3604」的胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置5處的MOD;及b)G2C/Y84C二硫鍵及R12C/A236C二硫鍵兩者。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖20D所描繪之指示為「2764」的胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20J所描繪之指示為「3603」的胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置5處的MOD;及b)R12C/A236C二硫鍵(而非G2C/Y84C二硫鍵)。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖20E所描繪之指示為「3593」的胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20K所描繪之指示為「3192」的胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置1處的MOD;及b)G2C/Y84C二硫鍵(而非R12C/A236C二硫鍵)。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖20F所描繪之指示為「3426」的胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20K所描繪之指示為「3192」的胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置3處的MOD;及b)G2C/Y84C二硫鍵(而非R12C/A236C二硫鍵)。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖20G所描繪之指示為「3197」的胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20L所描繪之指示為「3605」的胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置5處的MOD;及b)G2C/Y84C二硫鍵(而非R12C/A236C二硫鍵)。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖20A所描繪之指示為「3592」的胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20M所描繪之指示為「3529」的胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置1處的MOD;及b)G2C/Y84C二硫鍵及R12C/A236C二硫鍵兩者。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖20B所描繪之指示為「3425」的胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20M所描繪之指示為「3529」的胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置3處的MOD;及b)G2C/Y84C二硫鍵及R12C/A236C二硫鍵兩者;且亦包含WT1 239-247(Q240Y)抗原決定基。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖20C所描繪之指示為「3196」的胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20N所描繪之指示為「3709」的胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置3處的MOD;及b)G2C/Y84C二硫鍵及R12C/A236C二硫鍵兩者。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖4B所描繪之指示為「2750」的胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20O所描繪之指示為「3528」的胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置1處的MOD;及b)R12C/A236C二硫鍵(而非G2C/Y84C二硫鍵)。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖4C所描繪之指示為「3159」的胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20O所描繪之指示為「3528」的胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置3處的MOD;及b)R12C/A236C二硫鍵(而非G2C/Y84C二硫鍵)。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖20D所描繪之指示為「2764」的胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20P所描繪之指示為「3708」的胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置5處的MOD;及b)R12C/A236C二硫鍵(而非G2C/Y84C二硫鍵)。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖20E所描繪之指示為「3593」的胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20Q所描繪之指示為「3530」的胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置1處的MOD;及b)G2C/Y84C二硫鍵(而非R12C/A236C二硫鍵)。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖20F所描繪之指示為「3426」的胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20Q所描繪之指示為「3530」的胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置3處的MOD;及b)G2C/Y84C二硫鍵(而非R12C/A236C二硫鍵)。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖20G所描繪之指示為「3197」的胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20R所描繪之指示為「3710」的胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置5處的MOD;及b)G2C/Y84C二硫鍵(而非R12C/A236C二硫鍵)。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖20F所描繪之指示為「3426」的胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20M所描繪之指示為「3529」的胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置3處的MOD;及b)G2C/Y84C二硫鍵(而非R12C/A236C二硫鍵);且亦包括WT1 239-247(Q240Y)抗原決定基。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖20B所描繪之指示為「3425」的胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖200所描繪之指示為「3528」的胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置3處的MOD;及b)R12C/A236C二硫鍵(而非G2C/Y84C二硫鍵);且亦包括WT1 239-247(Q240Y)抗原決定基。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖20B所描繪之指示為「3425」的胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20Q所描繪之指示為「3530」的胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置3處的MOD;及b)G2C/Y84C二硫鍵(而非R12C/A236C二硫鍵);且亦包括WT1 239-247(Q240Y)抗原決定基。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖4C所描繪之指示為「3159」的胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20H所描繪之指示為「3188」的胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置3處的MOD;及b)R12C/A236C二硫鍵(而非G2C/Y84C二硫鍵);且亦包括WT1 235-243(M236Y)抗原決定基。
具有抗原決定基SMTWNQMNL(WT1(235-243;C235S))之示範性TMMP
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖35A所描繪之胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖4B所描繪之胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置1處的MOD;及b)R12C/A236C二硫鍵(而非G2C/Y84C二硫鍵)。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖35A所描繪之胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈 包含如圖4C所描繪之胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置3處的MOD;及b)R12C/A236C二硫鍵(而非G2C/Y84C二硫鍵)。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖35B所描繪之胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20A所描繪之胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置1處的MOD;及b)G2C/Y84C二硫鍵及R12C/A236C二硫鍵兩者。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖35B所描繪之胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20B所描繪之胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置3處的MOD;及b)G2C/Y84C二硫鍵及R12C/A236C二硫鍵兩者。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖35C所描繪之胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20E所描繪之胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置1處的MOD;及b)G2C/Y84C二硫鍵(而非R12C/A236C二硫鍵)。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖35C所描繪之胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20F所描繪之胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置3處的MOD;及b)G2C/Y84C二硫鍵(而非R12C/A236C二硫鍵)。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖35D所描繪之胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20G所描繪之胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置5處的MOD;及b)G2C/Y84C二硫鍵(而非R12C/A236C二硫鍵)。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖35E所描繪之胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20C所描繪之胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置5處的MOD;及b)G2C/Y84C二硫鍵及R12C/A236C二硫鍵兩者。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖35F所描繪之胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20D所描繪之胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置5處的MOD;及b)R12C/A236C二硫鍵(而非G2C/Y84C二硫鍵)。
具有抗原決定基GCMTWNQMNL(WT1(235-243;G-1))之示範性TMMP
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖36A所描繪之胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖4B所描繪之胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置1處的MOD;及b)R12C/A236C二硫鍵(而非G2C/Y84C二硫鍵)。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖36A所描繪之胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖4C所描繪之胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置3處的MOD;及b)R12C/A236C二硫鍵(而非G2C/Y84C二硫鍵)。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖36B所描繪之胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20A所描繪之胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置1處的MOD;及b)G2C/Y84C二硫鍵及R12C/A236C二硫鍵兩者。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖36B所描繪之胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20B所描繪之胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置3處的MOD;及b)G2C/Y84C二硫鍵及R12C/A236C二硫鍵兩者。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖36C所描繪之胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20E所描繪之胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置1處的MOD;及b)G2C/Y84C二硫鍵(而非R12C/A236C二硫鍵)。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖36C所描繪之胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20F所描繪之胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置3處的MOD;及b)G2C/Y84C二硫鍵(而非R12C/A236C二硫鍵)。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖36D所描繪之胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20G所描繪之胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置5處的免疫調節多肽;及b)G2C/Y84C二硫鍵(而非R12C/A236C二硫鍵)。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖36E所描繪之胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20C所描繪之胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置5處的MOD;及b)G2C/Y84C二硫鍵及R12C/A236C二硫鍵兩者。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖36F所描繪之胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20D所描繪之胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置5處的MOD;及b)R12C/A236C二硫鍵(而非G2C/Y84C二硫鍵)。
具有抗原決定基SYTWNQMNL(WT1(235-243;C235S;M236Y))之示範性TMMP
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖37A所描繪之胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖4B所描繪之胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置1處的MOD;及b)R12C/A236C二硫鍵(而非G2C/Y84C二硫鍵)。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖37A所描繪之胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖4C所描繪之胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置3處的MOD;及b)R12C/A236C二硫鍵(而非G2C/Y84C二硫鍵)。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖37B所描繪之胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20A所描繪之胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置1處的MOD;及b)G2C/Y84C二硫鍵及R12C/A236C二硫鍵兩者。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖37B所描繪之胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20B所描繪之胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置3處的MOD;及b)G2C/Y84C二硫鍵及R12C/A236C二硫鍵兩者。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖37C所描繪之胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20E所描繪之胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置1處的MOD;及b)G2C/Y84C二硫鍵(而非R12C/A236C二硫鍵)。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖37C所描繪之胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20F所描繪之胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置3處的MOD;及b)G2C/Y84C二硫鍵(而非R12C/A236C二硫鍵)。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖37D所描繪之胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20G所描繪之胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置5處的MOD;及b)G2C/Y84C二硫鍵(而非R12C/A236C二硫鍵)。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖37E所描繪之胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20C所描繪之胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置5處的MOD;及b)G2C/Y84C二硫鍵及R12C/A236C二硫鍵兩者。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖37F所描繪之胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈 包含如圖20D所描繪之胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置5處的MOD;及b)R12C/A236C二硫鍵(而非G2C/Y84C二硫鍵)。
具有抗原決定基GCYTWNQMNL(WT1(235-243;G-1;M236Y))之示範性TMMP
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖38A所描繪之胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖4B所描繪之胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置1處的MOD;及b)R12C/A236C二硫鍵(而非G2C/Y84C二硫鍵)。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖38A所描繪之胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖4C所描繪之胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置3處的MOD;及b)R12C/A236C二硫鍵(而非G2C/Y84C二硫鍵)。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖38B所描繪之胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20A所描繪之胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置1處的MOD;及b)G2C/Y84C二硫鍵及R12C/A236C二硫鍵兩者。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖38B所描繪之胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20B所描繪之胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置3處的MOD;及b)G2C/Y84C二硫鍵及R12C/A236C二硫鍵兩者。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖38C所描繪之胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20E所描繪之胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置1處的MOD;及b)G2C/Y84C二硫鍵(而非R12C/A236C二硫鍵)。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖38C所描繪之胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈 包含如圖20F所描繪之胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置3處的MOD;及b)G2C/Y84C二硫鍵(而非R12C/A236C二硫鍵)。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖38D所描繪之胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20G所描繪之胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置5處的MOD;及b)G2C/Y84C二硫鍵(而非R12C/A236C二硫鍵)。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖38E所描繪之胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20C所描繪之胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置5處的MOD;及b)G2C/Y84C二硫鍵及R12C/A236C二硫鍵兩者。
在一些情況下,TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖38F所描繪之胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖20D所描繪之胺基酸序列。此種TMMP包含:a)如圖19描繪之在位置5處的MOD;及b)R12C/A236C二硫鍵(而非G2C/Y84C二硫鍵)。
生成多聚體T細胞調節多肽之方法
根據2019年3月14日公開的經公開之PCT申請案WO 2019/051091提供獲得包含一或多種變異體MOD之TMMP的方法,該一或多種變異體MOD呈現出對同源co-MOD之親和力與相應親本野生型免疫調節多肽對共免疫調節多肽之親和力相比更低。參見[00364]-[00387]。
核酸
本揭示案提供一種核酸,其包含編碼本揭示案之TMMP的核苷酸序列。
在一些情況下,TMMP之個別多肽鏈係在單獨的核酸中編碼。在一些情況下,TMMP之全部多肽鏈均在單一核酸中編碼。在一些情況下,第一核酸包含編碼TMMP之第一多肽的核苷酸序列;且第二核酸包含編碼TMMP之第二多肽的核苷酸序列。在一些情況下,單一核酸包含編碼TMMP之第一多肽及TMMP之第二多肽的核苷酸序列。
編碼多聚體多肽之個別多肽鏈的單獨核酸
本揭示案提供包含編碼TMMP之核苷酸序列的核酸。如上文所述,在一些情況下,TMMP之個別多肽鏈係在單獨的核酸中編碼。在一些情況下,編碼TMMP之單獨多肽鏈的核苷酸序列可操作地連接至轉錄控制元件,例如啟動子,諸如在真核細胞中起作用之啟動子,其中該啟動子可為組成型啟動子或誘導型啟動子。
本揭示案提供第一核酸及第二核酸,其中第一核酸包含編碼TMMP之第一多肽的核苷酸序列,其中第一多肽以自N端至C端之次序包含:a)抗原決定基(例如,T細胞抗原決定基);b)第一MHC多肽;及c)MOD(例如,如上文所述之野生型MOD或親和力減小的變異體MOD);且其中第二核酸包含編碼TMMP之第二多肽的核苷酸序列,其中第二多肽以自N端至C端之次序包含:a)第二MHC多肽;及b)Ig Fc多肽。適合的T細胞抗原決定基、MHC多肽、MOD及Ig Fc多肽如上文所述。在一些情況下,編碼第一多肽及第二多肽之核苷酸序列可操作地連接至轉錄控制元件。在一些情況下,轉錄控制元件為在真核細胞中起作用之啟動子。在一些情況下,核酸存在於單獨的表現載體中。
本揭示案提供第一核酸及第二核酸,其中第一核酸包含編碼TMMP之第一多肽的核苷酸序列,其中第一多肽以自N端至C端之次序包含:a)抗原決定基(例如,T細胞抗原決定基);及b)第一MHC多肽;且其中第二核酸包含編碼TMMP之第二多肽的核苷酸序列,其中第二多肽以自N端至C端之次序包含:a)MOD(例如,如上文所述之野生型MOD或親和力減小的變異體MOD);b)第二MHC多肽;及c)Ig Fc多肽。適合的T細胞抗原決定基、MHC多肽、MOD及Ig Fc多肽如上文所述。在一些情況下,編碼第一多肽及第二多肽之核苷酸序列可操作地連接至轉錄控制元件。在一些情況下,轉錄控制元件為在真核細胞中起作用之啟動子。在一些情況下,核酸存在於單獨的表現載體中。
編碼存在於多聚體多肽中之兩種或兩種以上多肽的核酸
本揭示案提供一種核酸,其包含至少編碼TMMP之第一多肽及第二多肽的核苷酸序列。在一些情況下,在本揭示案之TMMP包括第一多肽、第二多肽及第三多肽時,核酸包括編碼第一多肽、第二多肽及第三多肽之核苷酸序列。在一些情況下,編碼TMMP之第一多肽及第二多肽之核苷酸序列包括插入編碼第一多肽之核苷酸序列與編碼第二多肽之核苷酸序列之間的蛋白水解可裂解之連接子。在一些情況下,編碼TMMP之第一多肽及第二多肽之核苷酸序列包括插入編碼第一多肽之核苷酸序列與編碼第二多肽之核苷酸序列之間的內部核糖體進入位點(Internal Ribosome Entry Dite,IRES)。在一些情況下,編碼TMMP之第一多肽及第二多肽之核苷酸序列包括插入編碼第一多肽之核苷酸序列與編碼第二多肽之核苷酸序列之間的核糖體跳躍信號(或順式作用水解酶元件,CHYSEL(SEQ ID NO:394))。核酸之實例在下文中描述,在蛋白水解可裂解之連接子提供於編碼TMMP之第一多肽與第二多肽的核苷酸序列之間;在該等實施例之任一者中,IRES或核糖體跳躍信號可用於代替編碼蛋白水解可裂解之連接子的核苷酸序列。
在一些情況下,第一核酸(例如,重組表現載體、(messenger RNA)mRNA、病毒RNA等)包含編碼本揭示案之TMMP之第一多肽鏈的核苷酸序列;且第二核酸(例如,重組表現載體、mRNA、病毒RNA等)包含編碼本揭示案之TMMP之第二多肽鏈的核苷酸序列。在一些情況下,編碼第一多肽之核苷酸序列及編碼第二多肽之第二核苷酸序列各自可操作地連接至轉錄控制元件,例如啟動子,諸如在真核細胞中起作用之啟動子,其中該啟動子可為組成型啟動子或誘導型啟動子。
本揭示案提供一種核酸,該核酸包含編碼重組多肽之核苷酸序列,其中該重組多肽以自N端至C端之次序包含:a)抗原決定基(例如,T細胞抗原決定基);b)第一MHC多肽;c)MOD(例如,如上文所述之野生型MOD或親和力減小的變異體MOD);d)蛋白水解可裂解之連接子;e)第二MHC多肽;及f)Ig Fc多肽。本揭示案提供一種核酸,該核酸包含 編碼重組多肽之核苷酸序列,其中該重組多肽以自N端至C端之次序包含:a)第一前導肽;b)抗原決定基;c)第一MHC多肽;d)MOD(例如,如上文所述之親和力減小的變異體);e)蛋白水解可裂解之連接子;f)第二前導肽;g)第二MHC多肽;及h)Ig Fc多肽。本揭示案提供一種核酸,該核酸包含編碼重組多肽之核苷酸序列,其中該重組多肽以自N端至C端之次序包含:a)抗原決定基;b)第一MHC多肽;c)蛋白水解可裂解之連接子;d)MOD(例如,如上文所述之親和力減小的變異體);e)第二MHC多肽;及f)Ig Fc多肽。在一些情況下,第一前導肽及第二前導肽為β2-M前導肽。在一些情況下,核苷酸序列可操作地連接至轉錄控制元件。在一些情況下,轉錄控制元件為在真核細胞中起作用之啟動子。
適合的MHC多肽四上文所述。在一些情況下,第一MHC多肽為β2-微球蛋白多肽;且其中第二MHC多肽為I類MHC重鏈多肽。在一些情況下,β2-微球蛋白多肽包含與圖6中描繪之β2M胺基酸序列具有至少85%胺基酸序列一致性之胺基酸序列。在一些情況下,I類MHC重鏈多肽為HLA-A、HLA-B、HLA-C、HLA-E、HLA-F、HLA-G、HLA-K或HLA-L重鏈。在一些情況下,I類MHC重鏈多肽包含與圖3A-3C中任一者所描繪之胺基酸序列具有至少85%胺基酸序列一致性之胺基酸序列。
適合的Fc多肽係上文所述。在一些情況下,Ig Fc多肽為IgG1 Fc多肽、IgG2 Fc多肽、IgG3 Fc多肽、IgG4 Fc多肽、IgA Fc多肽或IgM Fc多肽。在一些情況下,Ig Fc多肽包含與圖5A-5H中描繪之胺基酸序列具有至少85%胺基酸序列一致性之胺基酸序列。
適合的MOD係上文所述。
適合的蛋白水解可裂解之連接子係上文所述。在一些情況下,蛋白水解可裂解之連接子包含選自以下之胺基酸序列:a)LEVLFQGP(SEQ ID NO:388);b)ENLYTQS(SEQ ID NO:389);c)DDDDK (SEQ ID NO:390);d)LVPR(SEQ ID NO:391);及e)GSGATNFSLLKQAGDVEENPGP(SEQ ID NO:392)。
在一些情況下,介於抗原決定基與第一MHC多肽之間的連接子包含第一Cys殘基,且第二MHC多肽包含提供第二Cys殘基之胺基酸取代,使得第一Cys殘基及第二Cys殘基提供連接子與第二MHC多肽之間的二硫鍵聯。在一些情況下,第一MHC多肽包含提供第一Cys殘基之胺基酸取代,且第二MHC多肽包含提供第二Cys殘基之胺基酸取代,使得第一Cys殘基及第二Cys殘基提供第一MHC多肽與第二MHC多肽之間的二硫鍵聯。
本揭示案提供一種核酸,其包含編碼TMMP之核苷酸序列,其中TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈以自N端至C端之次序包含:i)序列VLDFAPPGA(SEQ ID NO:259)之WT-1肽;ii)具有胺基酸序列GCGGSGGGGSGGGGS(SEQ ID NO:317)之連接子;及iii)包含位置12處之Cys的β2M多肽(例如,具有SEQ ID NO:311中列出之胺基酸序列的β2M);及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈以自N端至C端之次序包含:i)包含H16A及F42A取代(亦即包含位置16及42處之Ala,例如SEQ ID NO:188中列出之胺基酸序列,其中X1 為Ala且其中X2 為Ala)之變異體IL-2多肽;ii)(GGGGS)4連接子;iii)包含H16A及F42A取代(亦即包含位置16及42處之Ala,例如SEQ ID NO:188中列出之胺基酸序列,其中X1 為Ala且其中X2 為Ala)之變異體IL-2多肽;iv)(GGGGS)4連接子;v)包含位置84及236處之Cys的HLA A0202重鏈(例如,包含SEQ ID NO:341中列出之胺基酸序列的HLA重鏈多肽);vi)AAAGG連接子;及vii)Ig Fc多肽。在一些情況下,Ig Fc多肽為變異體Ig Fc多肽,其相對於野生型多肽包含一或多個序列變異,其中Ig Fc多肽經由補體依賴性細胞毒性(CDC)及/或抗體依賴性細胞毒性(ADCC)誘導細胞裂解之能力係降低或實質上消除的。在一些情況下,Ig Fc多肽為包含L234A及/或L235A取代(圖5H中描繪之胺基酸序列中的L14及L15)的變異體人類IgG1 Fc多肽。在一些情況下,Ig Fc多肽 包含圖5H中描繪之胺基酸序列。在一些情況下,第一多肽及第二多肽在單獨的核酸中編碼;例如,本揭示案提供第一核酸,其包含編碼第一多肽之核苷酸序列;及第二核酸,其包含編碼第二多肽之核苷酸序列。在其他情況下,單一核酸包含編碼第一多肽及第二多肽之核苷酸序列;例如,本揭示案提供一種核酸,其包含編碼第一多肽之第一核苷酸序列及編碼第二多肽之第二核苷酸序列。在一些情況下,該或該等核酸存在於一或多個表現載體中。
本揭示案提供一種核酸,其包含編碼TMMP之核苷酸序列,其中TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈以自N端至C端之次序包含:i)序列VLDFAPPGA(SEQ ID NO:259)之WT-1肽;ii)具有胺基酸序列GCGGSGGGGSGGGGS(SEQ ID NO:317)之連接子;及iii)包含位置12處之Cys的β2M多肽(例如,具有SEQ ID NO:311中列出之胺基酸序列的β2M);及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈以自N端至C端之次序包含:i)包含H16A及F42A取代(亦即包含位置16及42處之Ala,例如SEQ ID NO:188中列出之胺基酸序列,其中X1 為Ala且其中X2 為Ala)之變異體IL-2多肽;ii)(GGGGS)4連接子;iii)包含H16A及F42A取代(亦即包含位置16及42處之Ala,例如SEQ ID NO:188中列出之胺基酸序列,其中X1 為Ala且其中X2 為Ala)之變異體IL-2多肽;iv)(GGGGS)4連接子;v)包含位置84及236處之Cys的HLA A0202重鏈(例如,包含SEQ ID NO:341中列出之胺基酸序列的HLA重鏈多肽);vi)AAAGG連接子;及vii)包含位置14及15處之Ala但缺乏C端Lys的Ig Fc多肽(例如,包含圖5H中描繪及SEQ ID NO:487中列出之胺基酸序列的Ig Fc多肽)。在一些情況下,第一多肽及第二多肽在單獨的核酸中編碼;例如,本揭示案提供第一核酸,其包含編碼第一多肽之核苷酸序列;及第二核酸,其包含編碼第二多肽之核苷酸序列。在其他情況下,單一核酸包含編碼第一多肽及第二多肽之核苷酸序列;例如,本揭示案提供一種核酸,其包含編碼第一多肽之第一核苷酸序列及編碼第 二多肽之第二核苷酸序列。在一些情況下,該或該等核酸存在於一或多個表現載體中。
本揭示案提供一種核酸,其包含編碼TMMP之核苷酸序列,其中TMMP包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈包含如圖14B所描繪且如SEQ ID NO:423中列出之指示為「2380」的胺基酸序列;及b)第二多肽鏈,該第二多肽鏈包含如圖14J所描繪且如SEQ ID NO:486中列出之胺基酸序列1715△。在一些情況下,本揭示案提供:i)第一核酸,該第一核酸包含編碼如圖14B所描繪且如SEQ ID NO:423中列出之2380多肽;及ii)第二核酸,該第二核酸包含編碼如圖14J所描繪且如SEQ ID NO:486中列出之1715△多肽。在一些情況下,第一核酸在第一表現載體中且第二核酸在第二表現載體中。在一些情況下,本揭示案提供一種核酸,其包含:i)第一核苷酸序列,其編碼如圖14B所描繪且如SEQ ID NO:423中列出之2380多肽;及ii)第二核苷酸序列,其編碼如圖14J所描繪且如SEQ ID NO:486中列出之1715△多肽。在一些情況下,核酸在表現載體中。適合的表現載體在下文中描述。
重組表現載體
本揭示案提供包含本揭示案之核酸的重組表現載體。在一些情況下,重組表現載體為非病毒載體。在一些情況下,重組表現載體為病毒構築體,例如重組腺相關病毒構築體(參見,例如美國專利第7,078,387號)、重組腺病毒構築體、重組慢病毒構築體、重組逆轉錄病毒構築體、非整合病毒載體等。
適合的表現載體包括但不限於病毒載體(例如,基於以下之病毒載體:牛痘病毒;脊髓灰質炎病毒;腺病毒(參見,例如Li等人,Invest Opthalmol Vis Sci 35:2543 2549,1994;Borras等人,Gene Ther 6:515 524,1999;Li及Davidson,PNAS 92:7700 7704,1995;Sakamoto等人,H Gene Ther 5:1088 1097,1999;WO 94/12649、WO 93/03769;WO 93/19191;WO 94/28938;WO 95/11984及WO 95/00655);腺相關病毒(參 見,例如Ali等人,Hum Gene Ther 9:81 86,1998,Flannery等人,PNAS 94:6916 6921,1997;Bennett等人,Invest Opthalmol Vis Sci 38:2857 2863,1997;Jomary等人,Gene Ther 4:683 690,1997,Rolling等人,Hum Gene Ther 10:641 648,1999;Ali等人,Hum Mol Genet 5:591 594,1996;Srivastava in WO 93/09239,Samulski等人,J.Vir.(1989)63:3822-3828;Mendelson等人,Virol.(1988)166:154-165;以及Flotte等人,PNAS(1993)90:10613-10617);SV40;單純疱疹病毒;人類免疫缺陷病毒(參見,例如Miyoshi等人,PNAS 94:10319 23,1997;Takahashi等人,J Virol 73:7812 7816,1999);逆轉錄病毒載體(例如,鼠類白血病病毒、脾壞死病毒、及源自逆轉錄病毒諸如勞斯肉瘤病毒(Rous Sarcoma Virus)、哈維肉瘤病毒(Harvey Sarcoma Virus)、禽白血病病毒、慢病毒、人類免疫缺陷病毒、骨髓增殖性肉瘤病毒及乳腺腫瘤病毒之載體);及其類似物。
大量適合的表現載體為熟習此項技術者所知,且許多表現載體為市售的。以下載體作為實例提供;對於真核宿主細胞:pXT1、pSG5(Stratagene)、pSVK3、pBPV、pMSG及pSVLSV40(Pharmacia)。然而,可使用任何其他載體,只要其與宿主細胞相容。
視所利用之宿主/載體系統而定,在表現載體中可使用許多適合的轉錄及轉譯控制元件中之任一者,包括組成型及誘導型啟動子、轉錄增強子元件、轉錄終止子等(參見,例如Bitter等人(1987)Methods in Enzymology,153:516-544)。
在一些情況下,編碼DNA靶向RNA及/或定點修飾多肽之核苷酸序列可操作地連接至控制元件,例如轉錄控制元件,諸如啟動子。轉錄控制元件可在真核細胞例如哺乳動物細胞;或原核細胞(例如細菌或古細菌細胞)中起作用。在一些情況下,編碼DNA靶向RNA及/或定點修飾多肽之核苷酸序列可操作地連接至允許編碼DNA靶向RNA及/或定點修飾多肽之核苷酸序列在原核細胞及真核細胞中表現之多個控制元件。
適合的真核細胞啟動子(在真核細胞中起作用之啟動子)之非限制性實例包括來自以下之彼等啟動子:巨細胞病毒(Cytomegalovirus,CMV)即刻早期、單純疱疹病毒(Herpes Simplex Virus,HSV)胸苷激酶、早期及晚期SV40、來自逆轉錄病毒之長末端重複序列(Long Terminal Repeat,LTR)、及小鼠金屬硫蛋白-I。適當載體及啟動子之選擇正處於一般熟習此項技術者之水準內。表現載體亦可含有用於轉譯起始之核糖體結合位點及轉錄終止子。表現載體亦可包括用於擴增表現之適當序列。
遺傳修飾之宿主細胞
本揭示案提供一種遺傳修飾之宿主細胞,其中該宿主細胞經本揭示案之核酸遺傳修飾。
適合的宿主細胞包括真核細胞,諸如酵母細胞、昆蟲細胞及哺乳動物細胞。在一些情況下,宿主細胞為哺乳動物細胞株之細胞。適合的哺乳動物細胞株包括人類細胞株、非人靈長類動物細胞株、齧齒動物(例如小鼠、大鼠)細胞株等。適合的哺乳動物細胞株包括但不限於HeLa細胞(例如,美國典型培養物保藏中心(ATCC)號CCL-2)、CHO細胞(例如,ATCC號CRL9618、CCL61、CRL9096)、293細胞(例如,ATCC號CRL-1573)、Vero細胞、NIH 3T3細胞(例如,ATCC號CRL-1658)、Huh-7細胞、BHK細胞(例如,ATCC號CCL10)、PC12細胞(ATCC號CRL1721)、COS細胞、COS-7細胞(ATCC號CRL1651)、RAT1細胞、小鼠L細胞(ATCC號CCLI.3)、人類胚胎腎(HEK)細胞(ATCC號CRL1573)、HLHepG2細胞及其類似物。
在一些情況下,宿主細胞為已經遺傳修飾使得其並未合成內源性MHC β2-M之哺乳動物細胞。
在一些情況下,宿主細胞為已經遺傳修飾使得其並未合成內源性I類MHC重鏈之哺乳動物細胞。在一些情況下,宿主細胞為已經遺傳修飾使得其並未合成內源性MHC β2-M且使得其並未合成內源性I類MHC重鏈之哺乳動物細胞。
組成物
本揭示案提供包含本揭示案之TMMP(synTac)的組成物,包括醫藥組成物。本揭示案提供包含TMMP之組成物,包括醫藥組成物。本揭示案提供包含本揭示案之核酸或重組表現載體的組成物,包括醫藥組成物。
包含多聚體多肽之組成物
除了本揭示案之TMMP以外,本揭示案之組成物亦可包含以下中之一或多者:鹽,例如NaCl、MgCl2 、KCl、MgSO4 等;緩衝劑,例如Tris緩衝液、N-(2-羥乙基)哌嗪-N'-(2-乙烷磺酸)(HEPES)、2-(N-嗎啉基)乙烷磺酸(MES)、2-(N-嗎啉基)乙烷磺酸鈉鹽(MES)、3-(N-嗎啉基)丙烷磺酸(MOPS)、N-參[羥乙基]甲基-3-胺基丙烷磺酸(TAPS)等;增溶劑;清潔劑,例如非離子性清潔劑,諸如Tween-20等;蛋白酶抑制劑;甘油;及其類似物。
組成物可包含醫藥學上可接受之賦形劑,多種賦形劑為此項技術中已知的且不必在本文中詳細論述。醫藥學上可接受之賦形劑已充分描述於多個出版物中,包括例如「Remington:The Science and Practice of Pharmacy」,第19版(1995)或最新版本,Mack Publishing Co;A.Gennaro(2000)"Remington:The Science and Practice of Pharmacy",第20版,Lippincott,Williams,& Wilkins;Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems(1999)H.C.Ansel等人編,第7版,Lippincott,Williams,& Wilkins;及Handbook of Pharmaceutical Excipients(2000)A.H.Kibbe等人編,第3版.Amer.Pharmaceutical Assoc。
醫藥組成物可包含TMMP及醫藥學上可接受之賦形劑。在一些情況下,本醫藥組成物將適用於向受試者投與,例如將為無菌的。例如,在一些情況下,本醫藥組成物將適用於向人類受試者投與,例如其中組成物為無菌的且不含可偵測之熱原及/或其他毒素。
蛋白質組成物可包含其他組分,諸如醫藥級之甘露醇、乳糖、澱粉、硬脂酸鎂、糖精鈉、滑石、纖維素、葡萄糖、蔗糖、鎂、碳酸鹽及其類似物。組成物可含有接近生理條件所需之醫藥學上可接受之輔助物質,諸如pH調節劑及緩衝劑、毒性調節劑及其類似物,例如乙酸鈉、氯化鈉、氯化鉀、氯化鈣、乳酸鈉、鹽酸鹽、硫酸鹽、溶劑合物(例如,混合型離子鹽、水、有機物)、水合物(例如,水)及其類似物。
舉例而言,組成物可包括水溶液、粉末形式、顆粒、錠劑、丸劑、栓劑、膠囊劑、懸浮劑、噴霧劑及其類似物。組成物可根據下文所述之各種投與途徑調配。
在TMMP作為可注射物(例如,皮下、腹膜內、肌肉內及/或靜脈內)直接投與至組織中時,調配物可以即用劑型或以非水性形式(例如,可重構之保存穩定的粉末)或水性形式(諸如,由醫藥學上可接受之載劑及賦形劑構成之液體)提供。亦可提供含蛋白質之調配物以便在投與後延長TMMP之血清半衰期。舉例而言,TMMP可提供於脂質體調配物中,製備為膠體,或使用用於延長血清半衰期之其他習知技術。多種方法可用於製備脂質體,如例如Szoka等人1980 Ann.Rev.Biophys.Bioeng. 9:467,美國專利第4,235,871號、第4,501,728號及第4,837,028號中所述。製劑亦可以受控釋放或緩慢釋放形式提供。
適用於非經腸投與之調配物之其他實例包括等張無菌注射溶液、抗氧化劑、抑菌劑、及使調配物與預定接受者之血液等張的溶質、懸浮劑、增溶劑、增稠劑、穩定劑及防腐劑。舉例而言,本醫藥組成物可存在於容器,例如無菌容器,諸如注射器中。調配物可於單位劑量或多劑量密封容器(諸如安瓿及小瓶)中提供,且可儲存於冷凍乾燥(凍乾)條件下,其僅需要在臨使用前添加無菌液體賦形劑,例如注射用水。臨時注射溶液及懸浮液可自無菌散劑、顆粒及錠劑製備。
TMMP在調配物中之濃度可廣泛變化(例如,自小於約0.1重量%(通常為或至少約2重量%)至多達20重量%至50重量%或更大)且 通常將主要基於流體體積、黏度、及基於患者之因素,根據所選之特定投與模式及患者需求而選擇。
本揭示案提供包含本揭示案之組成物(例如液體組成物)之容器。容器可為例如注射器、安瓿及其類似物。在一些情況下,容器為無菌的。在一些情況下,容器及組成物二者均為無菌的。
本揭示案提供包含TMMP之組成物,包括醫藥組成物。組成物可包含:a)本揭示案之TMMP;及b)如上文所述之賦形劑。在一些情況下,賦形劑為醫藥學上可接受之賦形劑。
在一些情況下,TMMP存在於液體組成物中。因此,本揭示案提供包含TMMP之組成物(例如液體組成物,包括醫藥組成物)。在一些情況下,本揭示案之組成物包含:a)本揭示案之TMMP;及b)鹽水(例如,0.9% NaCl)。在一些情況下,組成物為無菌的。在一些情況下,組成物適用於向人類受試者投與,例如其中組成物為無菌的且不含可偵測之熱原及/或其他毒素。因此,本揭示案提供一種組成物,其包含:a)本揭示案之TMMP;及b)鹽水(例如,0.9% NaCl),其中該組成物為無菌的且不含可偵測之熱原及/或其他毒素。
包含核酸或重組表現載體之組成物
本揭示案提供包含本揭示案之核酸或重組表現載體的組成物,例如醫藥組成物。多種醫藥學上可接受之賦形劑為此項技術中已知且不必在本文中詳細論述。醫藥學上可接受之賦形劑已充分描述於多個出版物中,包括例如A.Gennaro(2000)「Remington:The Science and Practice of Pharmacy」,第20版,Lippincott,Williams,& Wilkins;Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems(1999)H.C.Ansel等人編,第7版,Lippincott,Williams,& Wilkins;及Handbook of Pharmaceutical Excipients(2000)A.H.Kibbe等人編,第3版.Amer.Pharmaceutical Assoc。
本揭示案之組成物可包括:a)一或多種核酸或一或多種重組表現載體,其包含編碼TMMP之核苷酸序列;及b)以下中之一或多 者:緩衝劑、界面活性劑、抗氧化劑、親水性聚合物、糊精、螯合劑、懸浮劑、增溶劑、增稠劑、穩定劑、抑菌劑、潤濕劑及防腐劑。適合的緩衝劑包括但不限於(諸如N,N-雙(2-羥乙基)-2-胺基乙烷磺酸(BES)、雙(2-羥乙基)胺基-參(羥甲基)甲烷(BIS-Tris)、N-(2-羥乙基)哌嗪-N'3-丙烷磺酸(EPPS或HEPPS)、甘胺醯甘胺酸、N-2-羥乙基哌嗪-N'-2-乙烷磺酸(HEPES)、3-(N-嗎啉基)丙烷磺酸(MOPS)、哌嗪-N,N'-雙(2-乙烷磺酸)(PIPES)、碳酸氫鈉、3-(N-參(羥甲基)-甲基-胺基)-2-羥基-丙烷磺酸)TAPSO、(N-參(羥甲基)甲基-2-胺基乙烷磺酸(TES)、N-參(羥甲基)甲基-甘胺酸(Tricine)、參(羥甲基)-胺基甲烷(Tris)等)。適合的鹽包括例如NaCl、MgCl2 、KCl、MgSO4 等。
本揭示案之醫藥調配物可包括約0.001%至約90%(w/w)之量的本揭示案之核酸或重組表現載體。在調配物之以下描述中,「本核酸或重組表現載體」應理解為包括本揭示案之核酸或重組表現載體。舉例而言,在一些情況下,本調配物包含本揭示案之核酸或重組表現載體。
本核酸或重組表現載體可與其他化合物或化合物混合物摻合,以其他化合物或化合物混合物包封,與其他化合物或化合物混合物偶聯,或以其他方式與其他化合物或化合物混合物締合;此類化合物可包括例如脂質體或受體靶向分子。本核酸或重組表現載體可與幫助攝取、分佈及/或吸收之一或多種組分一起組合於調配物中。
本核酸或重組表現載體組成物可經調配成許多可能劑型中之任一者,諸如但不限於錠劑、膠囊、凝膠膠囊、液體糖漿、軟凝膠、栓劑及灌腸劑。本核酸或重組表現載體組成物亦可經調配成水性、非水性或混合介質中之懸浮液。水性懸浮液可進一步含有增加懸浮液黏度之物質,包括例如羧甲基纖維素鈉、山梨糖醇及/或葡聚糖。懸浮液亦可含有穩定劑。
包含本核酸或重組表現載體之調配物可為脂質體調配物。如本文所用,術語「脂質體」意指由以一個或多個球形雙層排列之兩 親性脂質構成的囊泡。脂質體為單層或多層囊泡,其具有由親脂性材料形成之膜及含有待遞送之組成物的水性內腔。陽性脂質體為帶正電脂質體,其可與帶負電DNA分子相互作用以形成穩定複合物。咸信pH敏感性或帶負電之脂質體截留DNA,而非與其複合。陽離子及非陽離子脂質體皆可用於遞送本核酸或重組表現載體。
脂質體亦包括「空間上穩定之」脂質體,如本文所用,該術語係指包含一或多種特化脂質之脂質體,該特化脂質當併入脂質體中時導致其循環壽命相對於缺乏此類特化脂質之脂質體有所增加。空間上穩定之脂質體之實例為如下之彼等,其中脂質體之囊泡形成脂質之一部分包含一或多種醣脂或以一或多種親水性聚合物諸如聚乙二醇(PEG)部分衍生化。脂質體及其用途進一步描述於美國專利第6,287,860號中,其以全文引用方式併入本文。
調配物及組成物亦可包括界面活性劑。界面活性劑於藥物產品、調配物及乳液中之用途為此項技術中所熟知。界面活性劑及其用途進一步描述於美國專利第6,287,860號中。
在一實施例中,包括各種滲透增強劑以實現核酸之有效遞送。除了幫助非親脂性藥物擴散穿過細胞膜以外,滲透增強劑亦增強親脂性藥物之滲透性。滲透增強劑可經分類為屬五大類別之一者,亦即界面活性劑、脂肪酸、膽鹽、螯合劑及非螯合非界面活性劑。滲透增強劑及其用途進一步描述於美國專利第6,287,860號中,其以全文引用方式併入本文。
用於經口投與之組成物及調配物包括散劑或顆粒、微粒、奈米微粒、水或非水性介質中之懸浮液或溶液、膠囊、凝膠膠囊、小藥囊、錠劑或微型錠劑。可期望增稠劑、調味劑、稀釋劑、乳化劑、分散助劑或黏合劑。適合的口服調配物包含如下之彼等,其中本反義核酸與滲透增強劑界面活性劑及螯合劑中之一或多者一起投與。適合的界面活性劑包括但不限於脂肪酸及/或其酯或鹽、膽酸及/或其鹽。適合的膽酸/鹽及脂 肪酸及其用途進一步描述於美國專利第6,287,860號中。滲透增強劑,例如脂肪酸/鹽與膽酸/鹽組合之組合亦為適合的。示範性適合組合為月桂酸、癸酸及UDCA之鈉鹽。其他滲透增強劑包括但不限於聚氧乙烯-9-月桂基醚及聚氧乙烯-20-十六烷基醚。適合的滲透增強劑亦包括丙二醇、二甲亞碸、三乙醇胺、N,N-二甲基乙醯胺、N,N-二甲基甲醯胺、2-吡咯啶酮及其衍生物、四氫糠醇及AZONETM
調節T細胞活性之方法
本揭示案提供一種選擇性調節抗原決定基特異性T細胞之活性的方法,該方法包括使T細胞與本揭示案之TMMP接觸,其中使T細胞與TMMP接觸選擇性調節抗原決定基特異性T細胞之活性。在一些情況下,該接觸在活體外 發生。在一些情況下,該接觸在活體內 發生。在一些情況下,該接觸離體 發生。
在一些情況下,例如,在靶標T細胞為CD8+ T細胞時,TMMP包含I類MHC多肽(例如,β2-微球蛋白及I類MHC重鏈)。
在TMMP包括作為活化多肽之免疫調節多肽時,T細胞與TMMP之接觸激活抗原決定基特異性T細胞。在一些情況下,抗原決定基特異性T細胞為對存在於癌細胞上之抗原決定基有特異性之T細胞,且抗原決定基特異性T細胞與TMMP之接觸提高T細胞對癌細胞之細胞毒性活性。在一些情況下,抗原決定基特異性T細胞為對存在於癌細胞上之抗原決定基有特異性之T細胞,且抗原決定基特異性T細胞與TMMP之接觸增加抗原決定基特異性T細胞之數目。
在一些情況下,抗原決定基特異性T細胞為對存在於病毒感染細胞上之抗原決定基有特異性之T細胞,且抗原決定基特異性T細胞與TMMP之接觸提高T細胞對病毒感染細胞之細胞毒性活性。在一些情況下,抗原決定基特異性T細胞為對存在於病毒感染細胞上之抗原決定基有特異性之T細胞,且抗原決定基特異性T細胞與TMMP之接觸增加抗原決定基特異性T細胞之數目。
在TMMP包括作為抑制性多肽之免疫調節多肽時,T細胞與TMMP之接觸抑制抗原決定基特異性T細胞。在一些情況下,抗原決定基特異性T細胞為對存在於自體抗原上之抗原決定基有特異性之自體反應性T細胞,且該接觸減少自體反應性T細胞之數目。
本揭示案提供一種調節個體中之免疫反應的方法,該方法包括向該個體投與有效量之TMMP。投與TMMP誘導抗原決定基特異性T細胞反應(例如,WT-1抗原決定基特異性T-細胞反應)及抗原決定基非特異性T細胞反應,其中抗原決定基特異性T細胞反應與抗原決定基非特異性T細胞反應之比率為至少2:1。在一些情況下,抗原決定基特異性T細胞反應與抗原決定基非特異性T細胞反應之比率為至少5:1。在一些情況下,抗原決定基特異性T細胞反應與抗原決定基非特異性T細胞反應之比率為至少10:1。在一些情況下,抗原決定基特異性T細胞反應與抗原決定基非特異性T細胞反應之比率為至少25:1。在一些情況下,抗原決定基特異性T細胞反應與抗原決定基非特異性T細胞反應之比率為至少50:1。在一些情況下,抗原決定基特異性T細胞反應與抗原決定基非特異性T細胞反應之比率為至少100:1。在一些情況下,個體為人類。在一些情況下,該調節增加對癌細胞(例如表現WT-1之癌細胞)之細胞毒性T細胞反應。在一些情況下,該投與為靜脈內、皮下、肌肉內、全身性、淋巴管內、治療部位遠端、局部、或治療部位處或附近之投與。
本揭示案提供一種選擇性遞送共刺激(亦即,免疫調節)多肽至靶標T細胞之方法,該方法包括使混合T細胞群與本揭示案之TMMP接觸,其中該混合T細胞群包含靶標T細胞及非靶標T細胞,其中靶標T細胞對存在於TMMP內之抗原決定基有特異性(例如,其中靶標T細胞對存在於TMMP內之WT-1抗原決定基有特異性),且其中該接觸步驟遞送存在於TMMP內之一或多種共刺激多肽(免疫調節多肽)至靶標T細胞。在一些情況下,該T細胞群在活體外 。在一些情況下,該T細胞群在個體活體內 。在一些情況下,該方法包括向個體投與TMMP。在一些情況下,T細 胞為細胞毒性T細胞。在一些情況下,混合T細胞群為自個體獲得之活體外 混合T細胞群,且接觸步驟導致靶標T細胞之活化及/或增殖,從而生成經活化及/或增殖之靶標T細胞群;在該等情況之一些下,該方法進一步包含向個體投與經活化及/或增殖之靶標T細胞群。
本揭示案提供一種偵測自個體獲得之混合T細胞群中結合目標抗原決定基(例如,WT-1抗原決定基)之靶標T細胞之存在的方法,該方法包括:a)使混合T細胞群與TMMP在活體外 接觸,其中TMMP包含目標抗原決定基(例如,WT-1抗原決定基);及b)偵測T細胞響應於該接觸之活化及/或增殖,其中經活化及/或增殖之T細胞指示靶標T細胞之存在。
治療方法
本揭示案提供一種治療個體之方法,該方法包括向個體投與有效治療個體之量的本揭示案之TMMP或一或多種編碼TMMP之核酸。亦提供一種TMMP,其係用於治療人類或動物體之方法中。在一些情況下,本揭示案之治療方法包括向有需要之個體投與包含編碼TMMP之核苷酸序列之一或多種重組表現載體。在一些情況下,本揭示案之治療方法包括向有需要之個體投與包含編碼TMMP之核苷酸序列之一或多種mRNA分子。在一些情況下,本揭示案之治療方法包括向有需要之個體投與本揭示案之TMMP。可治療之病狀包括例如如下文所述之癌症及自體免疫病症。
在一些情況下,TMMP當向有需要之個體投與時誘導抗原決定基特異性T細胞反應及抗原決定基非特異性T細胞反應。換言之,在一些情況下,TMMP當向有需要之個體投與時藉由調節第一T細胞之活性來誘導抗原決定基特異性T細胞反應,該第一T細胞呈現出:i)對存在於TMMP中之抗原決定基有特異性之TCR;ii)結合至存在於TMMP中之免疫調節多肽的共免疫調節多肽;且藉由調節第二T細胞之活性來誘導抗原決定基非特異性T細胞反應,該第二T細胞呈現出:i)對除了存在於TMMP中之抗原決定基以外的抗原決定基有特異性之TCR;及ii)結合至存 在於TMMP中之免疫調節多肽的共免疫調節多肽。抗原決定基特異性T細胞反應與抗原決定基非特異性T細胞反應之比率為至少2:1、至少5:1、至少10:1、至少15:1、至少20:1、至少25:1、至少50:1、或至少100:1。抗原決定基特異性T細胞反應與抗原決定基非特異性T細胞反應之比率為約2:1至約5:1、約5:1至約10:1、約10:1至約15:1、約15:1至約20:1、約20:1至約25:1、約25:1至約50:1、或約50:1至約100:1、或大於100:1。「調節T細胞之活性」可包括以下各項中之一或多者:i)激活細胞毒性(例如CD8+ )T細胞;ii)誘導細胞毒性(例如CD8+ )T細胞之細胞毒性活性;iii)誘導細胞毒性(例如CD8+ )T細胞對細胞毒素(例如穿孔蛋白;顆粒酶;粒溶蛋白)之產生及釋放;iv)抑制自體反應性T細胞之活性;及其類似效應。
MOD對其同源co-MOD之減小的親和力與抗原決定基對TCR之親和力的組合提供了本揭示案之TMMP的提高的選擇性。因此,舉例而言,TMMP與其結合至第二T細胞之親合力相比以更高親合力結合至第一T細胞,該第一T細胞呈現出:i)對存在於TMMP中之抗原決定基具有特異性之TCR;及ii)結合至存在於TMMP中之免疫調節多肽的共免疫調節多肽,該第二T細胞呈現出:i)對除了存在於TMMP中之抗原決定基以外的抗原決定基具有特異性之TCR;及ii)結合至存在於TMMP中之免疫調節多肽的co-MOD。
本揭示案提供一種選擇性調節個體中抗原決定基特異性T細胞之活性的方法,該方法包括向該個體投與有效量之TMMP或一或多種包含編碼TMMP之核苷酸序列的核酸(例如,表現載體;mRNA;等),其中TMMP選擇性調節個體中抗原決定基特異性T細胞之活性。選擇性調節抗原決定基特異性T細胞之活性可治療個體之疾病或病症。因此,本揭示案提供一種治療方法,其包含向有需要之個體投與有效量之TMMP。
在一些情況下,MOD為活化多肽,且TMMP激活抗原決定基特異性T細胞。在一些情況下,抗原決定基為癌症相關抗原決定基,且TMMP提高對於癌症相關抗原決定基有特異性之T細胞之活性。在一些 情況下,MOD為活化多肽,且TMMP激活WT-1抗原決定基特異性T細胞。在一些情況下,T細胞為T輔助細胞(CD4+ 細胞)、細胞毒性T細胞(CD8+ 細胞)、或NK-T-細胞。在一些情況下,抗原決定基為WT-1抗原決定基,且TMMP提高對表現WT-1抗原決定基之癌細胞有特異性之T細胞(例如,T輔助細胞(CD4+ 細胞)、細胞毒性T細胞(CD8+ 細胞)、及/或NK-T-細胞)之活性。CD4+ T細胞之活化可包括增加CD4+ T細胞之增殖及/或誘導或增加由CD4+ T細胞釋放之細胞介素。NK-T細胞及/或CD8+細胞之活化可包括:增加NK-T-細胞及/或CD8+細胞之增殖;及/或誘導由NK-T-細胞及/或CD8+細胞釋放細胞介素諸如干擾素γ。在一些情況下,本揭示案之TMMP減少調節性T(Treg)細胞之增殖及/或活性。Treg為FoxP3+ 、CD4+ T細胞。在一些情況下,例如,在本揭示案之TMMP包含抑制性免疫調節多肽(例如,PD-L1、FasL及其類似物)時,TMMP減少Treg之增殖及/或活性。
在一些情況下,MOD為活化多肽,且TMMP激活抗原決定基特異性T細胞。在一些情況下,抗原決定基為癌症相關抗原決定基,且TMMP提高對於癌症相關抗原決定基有特異性之T細胞之活性。
在TMMP包含WT-1肽抗原決定基時,可向患有表現WT-1之癌症的個體投與TMMP。表現WT1之癌症包括白血病、結締組織增生性小圓細胞腫瘤、胃癌、結腸癌、肺癌、乳癌、生殖細胞腫瘤、卵巢癌、子宮癌、甲狀腺癌、肝癌、腎癌、卡波西氏肉瘤(Kaposi's sarcoma)、肉瘤、肝細胞癌、韋爾姆斯氏瘤、急性骨髓性白血病(Acute Myeloid Leukemia,AML)、骨髓增生異常症候群(Myelodysplastic Syndrome,MDS)、非小細胞肺癌(Non-Small-Cell Lung Carcinoma,NSCLC)、骨髓瘤、胰臟癌、結腸直腸癌、間皮瘤、軟組織肉瘤、神經胚細胞瘤及腎胚細胞瘤。
在TMMP包含WT-1肽抗原決定基時,可向有需要之個體投與TMMP以治療個體之急性骨髓性白血病(AML)。在TMMP包含WT-1肽抗原決定基時,可向有需要之個體投與TMMP以治療個體之骨髓瘤。 在TMMP包含WT-1肽抗原決定基時,可向有需要之個體投與TMMP以治療個體之卵巢癌。在本揭示案之TMMP包含WT-1肽抗原決定基時,可向有需要之個體投與TMMP以治療個體之胰臟癌。在TMMP包含WT-1肽抗原決定基時,可向有需要之個體投與TMMP以治療個體之非小細胞肺癌(NSCLC)。在TMMP包含WT-1肽抗原決定基時,可向有需要之個體投與TMMP以治療個體之結腸直腸癌(Colorectal Cancer,CRC)。在TMMP包含WT-1肽抗原決定基時,可向有需要之個體投與TMMP以治療個體之乳癌。在TMMP包含WT-1肽抗原決定基時,可向有需要之個體投與TMMP以治療個體之韋爾姆斯氏瘤。在本揭示案之TMMP包含WT-1肽抗原決定基時,可向有需要之個體投與TMMP以治療個體之間皮瘤。在TMMP包含WT-1肽抗原決定基時,可向有需要之個體投與TMMP以治療個體之軟組織肉瘤。在TMMP包含WT-1肽抗原決定基時,可向有需要之個體投與TMMP以治療個體之神經胚細胞瘤。在TMMP包含WT-1肽抗原決定基時,可向有需要之個體投與TMMP以治療個體之腎胚細胞瘤。
本揭示案提供一種治療個體之癌症的方法,該方法包括向該個體投與有效量的本揭示案之TMMP或一或多種包含編碼TMMP之核苷酸序列的核酸(例如,表現載體;mRNA;等),其中TMMP包含作為癌症抗原決定基之T細胞抗原決定基,且其中TMMP包含刺激性MOD。在一些情況下,TMMP之「有效量」為當以一或多個劑量向有需要之個體投與時減少個體中病毒感染細胞之數目之量。舉例而言,在一些情況下,本揭示案之TMMP之「有效量」為以下之量:當以一或多個劑量向有需要之個體投與時,與在投與TMMP之前或在未以TMMP投與時個體中癌細胞之數目相比使個體中癌細胞之數目減少至少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至少80%、至少90%或至少95%。在一些情況下,TMMP之「有效量」為當以一或多個劑量向有需要之個體投與時減少個體中癌細胞之數目至不可偵測水準之量。
在一些情況下,TMMP之「有效量」為當以一或多個劑量向有需要之個體投與時減少個體中之腫瘤質量之量。舉例而言,在一些情況下,TMMP之「有效量」為以下之量:當以一或多個劑量向有需要之個體(患有腫瘤之個體)投與時,與在投與TMMP之前或在未以TMMP投與時個體中之腫瘤質量相比使個體中之腫瘤質量減少至少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至少80%、至少90%或至少95%。在一些情況下,TMMP之「有效量」為當以一或多個劑量向有需要之個體(患有腫瘤之個體)投與時減小個體中之腫瘤體積之量。舉例而言,在一些情況下,TMMP之「有效量」為以下之量:當以一或多個劑量向有需要之個體(患有腫瘤之個體)投與時,與在投與TMMP之前或在未以TMMP投與時個體中之腫瘤體積相比使個體中之腫瘤體積減小至少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至少80%、至少90%或至少95%。在一些情況下,TMMP之「有效量」為當以一或多個劑量向有需要之個體投與時增加個體之存活時間之量。舉例而言,在一些情況下,TMMP之「有效量」為以下之量:當以一或多個劑量向有需要之個體投與時,與在未以TMMP投與時個體之預期存活時間相比使個體之存活時間增加至少1個月、至少2個月、至少3個月、3個月至6個月、6個月至1年、1年至2年、2年至5年、5年至10年或大於10年。
在一些情況下,TMMP之「有效量」為以下之量:當作為單一療法或如下論述之組合療法之一部分(例如,與免疫檢查點抑制劑之組合療法之一部分)以一或多個劑量向有需要之個體投與時降低個體之總體腫瘤負荷,亦即,體內的癌症之量,或替代地,使患者中之總腫瘤負荷保持相對穩定持續足以使患者具有如藉由標準RECIST準則所判定之確定的「穩定疾病」之時期。參見,例如Aykan及Ozatli(2020)World J.Clin.Oncol. 11:53。
在一些情況下,TMMP之有效量為以下之量:當作為單一療法或如下論述與例如免疫檢查點抑制劑之組合療法之一部分以一或多個劑量向有需要之個體投與時使腫瘤體積減小足夠量且持續足夠時期,以使得患者具有如藉由標準RECIST準則所判定之確定的「穩定疾病」。
在一些情況下,TMMP之有效量為以下之量:當作為單一療法或如下論述與例如免疫檢查點抑制劑之組合療法之一部分以一或多個劑量向有需要之個體投與時使腫瘤體積減小足夠量且持續足夠時期,以使得患者具有如藉由標準RECIST準則所判定之確定的「完全反應」。
在一些情況下,抗原決定基特異性T細胞為對存在於病毒感染細胞上之抗原決定基有特異性之T細胞,且抗原決定基特異性T細胞與TMMP之接觸提高T細胞對病毒感染細胞之細胞毒性活性。在一些情況下,抗原決定基特異性T細胞為對存在於病毒感染細胞上之抗原決定基有特異性之T細胞,且抗原決定基特異性T細胞與TMMP之接觸增加抗原決定基特異性T細胞之數目。
因此,本揭示案提供一種治療個體之病毒感染的方法,該方法包括向該個體投與有效量之TMMP或一或多種包含編碼TMMP之核苷酸序列的核酸,其中TMMP包含作為病毒抗原決定基之T細胞抗原決定基,且其中TMMP包含刺激性MOD。在一些情況下,TMMP之「有效量」為當以一或多個劑量向有需要之個體投與時減少個體中病毒感染細胞之數目之量。舉例而言,在一些情況下,TMMP之「有效量」為以下之量:當以一或多個劑量向有需要之個體投與時,與在投與TMMP之前或在未以TMMP投與時個體中病毒感染細胞之數目相比使個體中病毒感染細胞之數目減少至少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至少80%、至少90%或至少95%。在一些情況下,TMMP之「有效量」為當以一或多個劑量向有需要之個體投與時減少個體中病毒感染細胞之數目之量。
因此,本揭示案提供一種治療個體之感染的方法,該方法包括向該個體投與有效量之TMMP或一或多種包含編碼TMMP之核苷酸序列的核酸,其中TMMP包含作為病原體相關抗原決定基之T細胞抗原決定基,且其中TMMP包含刺激性免疫調節多肽。在一些情況下,本揭示案之TMMP之「有效量」為當以一或多個劑量向有需要之個體投與時減少個體中病原體之數目之量。舉例而言,在一些情況下,TMMP之「有效量」為以下之量:當以一或多個劑量向有需要之個體投與時,與在投與TMMP之前或在未以TMMP投與時個體中病原體之數目相比使個體中病原體之數目減少至少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至少80%、至少90%或至少95%。在一些情況下,TMMP之「有效量」為當以一或多個劑量向有需要之個體投與時減少個體中病原體之數目至不可偵測水準之量。病原體包括病毒、細菌、原蟲及其類似物。
在一些情況下,MOD為抑制性多肽,且TMMP抑制抗原決定基特異性T細胞之活性。在一些情況下,抗原決定基為自體抗原決定基,且TMMP選擇性抑制對自體抗原決定基有特異性之T細胞的活性。
本揭示案提供一種治療個體之自體免疫病症的方法,該方法包括向該個體投與有效量之TMMP或一或多種包含編碼TMMP之核苷酸序列的核酸,其中TMMP包含作為自體抗原決定基之T細胞抗原決定基,且其中TMMP包含抑制性MOD。在一些情況下,TMMP之「有效量」為以下之量:當以一或多個劑量向有需要之個體投與時,與在投與TMMP之前或在未以TMMP投與時個體中自體反應性T細胞之數目相比使個體中自體反應性T細胞之數目減少至少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至少80%、至少90%或至少95%。在一些情況下,TMMP之「有效量」為當以一或多個劑量向有需要之個體投與時減少個體中Th2細胞介素之產生的 量。在一些情況下,TMMP之「有效量」為當以一或多個劑量向有需要之個體投與時減輕個體中的一或多種與自體免疫疾病相關之症狀的量。
如上文所述,在一些情況下,在進行本治療方法時,作為TMMP本身 向有需要之個體投與TMMP。在其他情況下,在進行本治療方法時,向有需要之個體投與一或多種包含編碼TMMP的核苷酸序列之核酸。因此,在其他情況下,向有需要之個體投與本揭示案之一或多種核酸,例如,本揭示案之一或多種重組表現載體。
調配物
適合的調配物係上文所述,其中適合的調配物包括醫藥學上可接受之賦形劑。在一些情況下,適合的調配物包含:a)TMMP;及b)醫藥學上可接受之賦形劑。在一些情況下,適合的調配物包含:a)包含編碼TMMP的核苷酸序列之核酸;及b)醫藥學上可接受之賦形劑;在一些情況下,核酸為mRNA。在一些情況下,適合的調配物包含:a)第一核酸,該第一核酸包含編碼TMMP之第一多肽的核苷酸序列;b)第二核酸,該第二核酸包含編碼TMMP之第二多肽的核苷酸序列;及c)醫藥學上可接受之賦形劑。在一些情況下,適合的調配物包含:a)包含編碼TMMP的核苷酸序列之重組表現載體;及b)醫藥學上可接受之賦形劑。在一些情況下,適合的調配物包含:a)第一重組表現載體,其包含編碼TMMP之第一多肽的核苷酸序列;b)第二重組表現載體,其包含編碼TMMP之第二多肽的核苷酸序列;及c)醫藥學上可接受之賦形劑。
適合的醫藥學上可接受之賦形劑係上文所述。
劑量
適合的劑量可由主治醫師或其他合格醫務人員基於各種臨床因素來判定。如醫學技術中所熟知,用於任一患者之劑量視許多因素而定,包括患者之體型、身體表面積、年齡、待投與之特定多肽或核酸、患者之性別、投與時間及途徑、一般健康狀況、及同時投與之其他藥物。本揭示案之TMMP可投與之量介於1ng/kg體重與20mg/kg體重/劑量之 間,例如在0.1mg/kg體重至10mg/kg體重之間,例如在0.5mg/kg體重至5mg/kg體重之間;然而,設想低於或高於此示範性範圍之劑量,特別是考慮到上述因素。若方案為連續輸注,則其亦可處於1μg至10mg/kg體重/min之範圍內。本揭示案之TMMP可投與之量為約1mg/kg體重至50mg/kg體重,例如約1mg/kg體重至約5mg/kg體重、約5mg/kg體重至約10mg/kg體重、約10mg/kg體重至約15mg/kg體重、約15mg/kg體重至約20mg/kg體重、約20mg/kg體重至約25mg/kg體重、約25mg/kg體重至約30mg/kg體重、約30mg/kg體重至約35mg/kg體重、約35mg/kg體重至約40mg/kg體重、或約40mg/kg體重至約50mg/kg體重。
在一些情況下,TMMP之適合劑量為0.01μg至100g/kg體重、0.1μg至10g/kg體重、1μg至1g/kg體重、10μg至100mg/kg體重、100μg至10mg/kg體重、或100μg至1mg/kg體重。一般熟習此項技術者可容易基於所量測之滯留時間及所投與之藥劑在體液或組織中之濃度來估計給藥之重複率。在成功治療之後,可能期望使患者經歷維持療法以預防疾病狀態之復發,其中TMMP的經投與之維持劑量的範圍為0.01μg至100g/kg體重、0.1μg至10g/kg體重、1μg至1g/kg體重、10μg至100mg/kg體重、100μg至10mg/kg體重、或100μg至1mg/kg體重。
熟習此項技術者將易於瞭解,劑量水準可隨特定TMMP、症狀嚴重程度及受試者對副作用之易感性而變化。給定化合物之較佳劑量可容易由熟習此項技術者藉由多種方式判定。
在一些情況下,投與多個劑量的TMMP、本揭示案之核酸、或本揭示案之重組表現載體。TMMP、本揭示案之核酸、或本揭示案之重組表現載體之投與頻率可根據多種因素中之任一者而變化,該等因素為例如症狀之嚴重性等。舉例而言,在一些情況下,TMMP、本揭示案之核酸、或本揭示案之重組表現載體每月一次、每月兩次、每月三次、每隔一週一次(qow)、每週一次(qw)、每週兩次(biw)、每週三次(tiw)、每週四 次、每週五次、每週六次、每隔一日一次(qod)、每日一次(qd)、每日兩次(qid)、或每日三次(tid)投與。
TMMP、本揭示案之核酸、或本揭示案之重組表現載體的投與持續時間,例如投與TMMP、本揭示案之核酸、或本揭示案之重組表現載體的時間段,可根據多種因素中之任一者而變化,該等因素為例如患者反應等。舉例而言,TMMP、本揭示案之核酸、或本揭示案之重組表現載體可投與之時間段的範圍為約一日至約一週、約兩週至約四週、約一個月至約兩個月、約兩個月至約四個月、約四個月至約六個月、約六個月至約八個月、約八個月至約1年、約1年至約2年、或約2年至約4年、或更長時間。
投與途徑
活性劑(本揭示案之TMMP、本揭示案之核酸、或本揭示案之重組表現載體)係使用任何可用之方法及適用於藥物遞送之途徑(包括活體內離體 方法以及全身性及局部投與途徑)向個體投與。
習知及醫藥學上可接受之投與途徑包括腫瘤內、腫瘤周圍、肌肉內、淋巴管內、氣管內、顱內、皮下、皮內、局部施用、靜脈內、動脈內、經直腸、經鼻、經口、以及其他經腸及非經腸投與途徑。投與途徑在需要時可經組合或根據TMMP及/或所要效果而調整。TMMP或本揭示案之核酸或重組表現載體可以單一劑量或以多個劑量投與。
在一些情況下,靜脈內投與TMMP、核酸、或重組表現載體。在一些情況下,肌肉內投與本揭示案之TMMP、本揭示案之核酸、或本揭示案之重組表現載體。在一些情況下,淋巴管內投與TMMP、核酸、或重組表現載體。在一些情況下,局部投與TMMP、核酸、或重組表現載體。在一些情況下,腫瘤內投與TMMP、核酸、或重組表現載體。在一些情況下,腫瘤周圍投與TMMP、核酸、或重組表現載體。在一些情況下,顱內投與TMMP、核酸、或重組表現載體。在一些情況下,皮下投與TMMP、核酸、或重組表現載體。
在一些情況下,靜脈內投與TMMP。在一些情況下,肌肉內投與TMMP。在一些情況下,局部投與TMMP。在一些情況下,腫瘤內投與TMMP。在一些情況下,腫瘤周圍投與TMMP。在一些情況下,顱內投與TMMP。在一些情況下,皮下投與TMMP。在一些情況下,淋巴管內投與TMMP。
TMMP、核酸、或重組表現載體可使用任何可用之習知方法及適用於遞送習知藥物之途徑(包括全身性或局部途徑)向宿主投與。一般而言,預期用於本揭示案之方法中的投與途徑包括但不一定限於經腸、非經腸及吸入途徑。
除了吸入投與以外的非經腸投與途徑包括但不一定限於局部、經皮、皮下、肌肉內、眼眶內、囊內、脊柱內、胸骨內、腫瘤內、淋巴管內、腫瘤周圍及靜脈內途徑,亦 除通過消化道以外的任何投與途徑。可進行非經腸投與以實現本揭示案之TMMP、本揭示案之核酸、或本揭示案之重組表現載體的全身性或局部遞送。在需要全身性遞送時,遞送通常涉及醫藥製劑之侵襲性或全身性吸附性局部或黏膜投與。
組合療法
在一些情況下,本揭示案之用於治療個體之癌症的方法包括:a)投與TMMP;及b)投與至少一種額外治療劑或治療性治療。適合的額外治療劑包括但不限於小分子癌症化學治療劑及免疫檢查點抑制劑。適合的額外治療性治療包括例如輻射、手術(例如,手術切除腫瘤)及其類似操作。
本揭示案之治療方法可包含共投與TMMP及至少一種額外治療劑。「共投與」意指向個體投與TMMP及至少一種額外治療劑兩者,但不一定在同一時間投與,以便實現治療作用,該治療作用為已投與TMMP及至少一種額外治療劑之結果。TMMP及至少一種額外治療劑之投與可為實質上同時的,例如,可在投與至少一種額外治療劑之約1分鐘至約24小時內(例如,在約1分鐘內、在約5分鐘內、在約15分鐘內、在約 30分鐘內、在約1小時內、在約4小時內、在約8小時內、在約12小時內、或在約24小時內)向個體投與TMMP。在一些情況下,向正經歷使用至少一種額外治療劑之治療或已經歷使用至少一種額外治療劑之治療的個體投與本揭示案之TMMP。TMMP之投與可在不同時間且/或以不同頻率發生。
作為一實例,本揭示案之治療方法可包含共投與TMMP及免疫檢查點抑制劑,諸如對免疫檢查點有特異性之抗體。「共投與」意指向個體投與TMMP及免疫檢查點抑制劑(例如,對免疫檢查點多肽有特異性之抗體)兩者,但不一定在同一時間投與,以便實現治療作用,該治療作用為已投與TMMP及免疫檢查點抑制劑(例如,對免疫檢查點多肽有特異性之抗體)之結果。TMMP及免疫檢查點抑制劑(例如,對免疫檢查點多肽有特異性之抗體)之投與可為實質上同時的,例如,可在投與免疫檢查點抑制劑(例如,對免疫檢查點多肽有特異性之抗體)之約1分鐘至約24小時內(例如,在約1分鐘內、在約5分鐘內、在約15分鐘內、在約30分鐘內、在約1小時內、在約4小時內、在約8小時內、在約12小時內、或在約24小時內)向個體投與TMMP。在一些情況下,向正經歷使用免疫檢查點抑制劑(例如,對免疫檢查點多肽有特異性之抗體)之治療或已經歷使用該免疫檢查點抑制劑之治療的個體投與本揭示案之TMMP。TMMP及免疫檢查點抑制劑(例如,對免疫檢查點多肽有特異性之抗體)之投與可在不同時間且/或以不同頻率發生。
示範性免疫檢查點抑制劑包括靶向以下免疫檢查點多肽之抑制劑:諸如CD27、CD28、CD40、CD122、CD96、CD73、CD47、OX40、GITR、CSF1R、JAK、PI3K δ、PI3K γ、TAM、精胺酸酶、CD137(亦稱為4-1BB)、ICOS、A2AR、B7-H3、B7-H4、BTLA、CTLA-4、LAG3、TIM3、VISTA、CD96、TIGIT、CD122、PD-1、PD-L1及PD-L2。在一些情況下,免疫檢查點多肽為選自以下之刺激性檢查點分子:CD27、CD28、CD40、ICOS、OX40、GITR、CD122及CD137。在一些情 況下,免疫檢查點多肽為選自以下之抑制性檢查點分子:A2AR、B7-H3、B7-H4、BTLA、CTLA-4、IDO、KIR、LAG3、PD-1、TIM3、CD96、TIGIT及VISTA。
在一些情況下,免疫檢查點抑制劑為對免疫檢查點多肽有特異性之抗體。在一些情況下,抗免疫檢查點抗體為單株抗體。在一些情況下,抗免疫檢查點抗體經人源化或去人源化,使得抗體實質上未在人類中引發免疫反應。在一些情況下,抗免疫檢查點抗體為人源化單株抗體。在一些情況下,抗免疫檢查點抗體為去人源化單株抗體。在一些情況下,抗免疫檢查點抗體為全人類單株抗體。在一些情況下,抗免疫檢查點抗體抑制免疫檢查點多肽與免疫檢查點多肽之配位體的結合。在一些情況下,抗免疫檢查點抗體抑制免疫檢查點多肽與免疫檢查點多肽之受體的結合。
適合的抗免疫檢查點抗體包括但不限於納武單抗(nivolumab)(Bristol-Myers Squibb)、派姆單抗(pembrolizumab)(Merck)、皮地利珠單抗(pidilizumab)(Curetech)、AMP-224(GlaxoSmithKline/Amplimmune)、MPDL3280A(Roche)、MDX-1105(Medarex,Inc./Bristol Myer Squibb)、MEDI-4736(Medimmune/AstraZeneca)、阿維魯單抗(arelumab)(Merck Serono)、伊匹珠單抗(ipilimumab)(YERVOY,(Bristol-Myers Squibb)、曲美木單抗(tremelimumab)(Pfizer)、皮地利珠單抗(CureTech,Ltd.)、IMP321(Immutep S.A.)、MGA271(Macrogenics)、BMS-986016(Bristol-Meyers Squibb)、利魯單抗(lirilumab)(Bristol-Myers Squibb)、烏瑞魯單抗(urelumab)(Bristol-Meyers Squibb)、PF-05082566(Pfizer)、IPH2101(Innate Pharma/Bristol-Myers Squibb)、MEDI-6469(MedImmune/AZ)、CP-870,893(Genentech)、莫木利珠單抗(Mogamulizumab)(Kyowa Hakko Kirin)、瓦利魯單抗(Varlilumab)(CelIDex Therapeutics)、阿維魯單抗(Avelumab)(EMD Serono)、加利昔單抗(Galiximab)(Biogen Idec)、AMP-514(Amplimmune/AZ)、AUNP 12(Aurigene及Pierre Fabre)、伊多莫德(Indoximod)(NewLink Genetics)、NLG-919(NewLink Genetics)、INCB024360(Incyte);KN035;及其組合。舉例而言,在一些情況下,免疫檢查點抑制劑為抗PD-1抗體。適合的抗PD-1抗體包括例如納武單抗、派姆單抗(亦稱為MK-3475)、皮地利珠單抗、SHR-1210、PDR001及AMP-224。在一些情況下,抗PD-1單株抗體為納武單抗、派姆單抗或PDR001。適合的抗PD1抗體描述於美國專利公佈第2017/0044259號中。關於披地單抗,參見,例如Rosenblatt等人(2011)J.Immunother. 34:409-18.在一些情況下,免疫檢查點抑制劑為抗CTLA-4抗體。在一些情況下,抗CTLA-4抗體為伊匹珠單抗或曲美木單抗。關於曲利木單抗,參見,例如Ribas等人(2013)J.Clin.Oncol. 31:616-22。在一些情況下,免疫檢查點抑制劑為抗PD-L1抗體。在一些情況下,抗PD-L1單株抗體為BMS-935559、MEDI4736、MPDL3280A(亦稱為RG7446)、KN035或MSB0010718C。在一些實施例中,抗PD-L1單株抗體為MPDL3280A(阿特珠單抗)或MEDI4736(德瓦魯單抗)。關於德瓦魯單抗,參見,例如WO 2011/066389。關於阿特珠單抗,參見,例如美國專利第8,217,149號。
適於治療之受試者
適於以本揭示案之方法進行治療之受試者包括患有癌症之個體,包括已經診斷為患有癌症之個體、已對癌症進行治療但未能回應於該治療之個體、及已對癌症進行治療且最初回應於該治療但隨後變成該治療難治之個體。適於以本揭示案之方法進行治療之受試者包括患有感染(例如,病原體諸如細菌、病毒、原蟲等之感染)之個體,包括已經診斷為患有感染之個體及已對感染進行治療但未能回應於該治療之個體。適於以本揭示案之方法進行治療之受試者包括患有細菌感染之個體,包括已經診斷為患有細菌感染之個體及已對細菌感染進行治療但未能回應於該治療之個體。適於以本揭示案之方法進行治療之受試者包括患有病毒感染之個體,包括已經診斷為患有病毒感染之個體及已對病毒感染進行治療但未能 回應於該治療之個體。適於以本揭示案之方法進行治療之受試者包括患有自體免疫疾病之個體,包括已經診斷為患有自體免疫疾病之個體及已對自體免疫疾病進行治療但未能回應於該治療之個體。
本揭示案之非限制性態樣之實例
態樣組A
上文所述之本發明主題之態樣(包括實施例)單獨或在與一或多個其他態樣或實施例組合時可為有益的。不限於以上描述,下文提供本揭示案之編號1-95的某些非限制性態樣。如熟習此項技術者在閱讀本揭示案之後將顯而易知,可使用個別編號之態樣中之各者或將其與前述或以下個別編號之態樣中之任一者組合。此旨在提供全部此等態樣組合之支持且不限於下文明確提供之態樣之組合:
態樣1.一種T細胞調節多聚體多肽,其包含:至少一種異二聚體,該異二聚體包含:a)第一多肽,該第一多肽包含:i)韋爾姆斯氏瘤-1(WT-1)肽抗原決定基;及ii)第一主要組織相容性複合物(MHC)多肽;b)第二多肽,該第二多肽包含第二MHC多肽;及c)至少一種免疫調節多肽,其中該第一多肽及/或該第二多肽包含該免疫調節多肽。
態樣2.如態樣1之T細胞調節多聚體多肽,其中一或多個免疫調節結構域中之至少一者為變異體免疫調節多肽,其呈現出對同源共免疫調節多肽之親和力與相應野生型免疫調節多肽對該同源共免疫調節多肽之親和力相比有所減小,且其中該抗原決定基以至少10-7 M之親和力結合至T細胞上之T細胞受體(TCR),使得:i)該T細胞調節多聚體多肽結合至第一T細胞之親和力比該T細胞調節多聚體多肽結合第二T細胞之親和力高至少25%,其中該第一T細胞在其表面上表現該同源共免疫調節多肽及以至少10-7 M之親和力結合該抗原決定基之TCR,且其中該第二T細胞在其表面上表現該同源共免疫調節多肽,但在其表面上不表現以至少10-7 M之親和力結合該抗原決定基之TCR;且/或ii)當藉由生物層干涉術量測時,對照T細胞調節多聚體多肽與同源共免疫調節多肽之結合親和力與包 含野生型免疫調節多肽變異體之該T細胞調節多聚體多肽與該同源共免疫調節多肽之結合親和力的比率範圍為1.5:1至106 :1,其中該對照包含該野生型免疫調節多肽。
態樣3.如態樣2之T細胞調節多聚體多肽,其中:a)該T細胞調節多聚體多肽結合至該第一T細胞之親和力比其結合該第二T細胞之親和力高至少50%、至少2倍、至少5倍或至少10倍;且/或b)該變異體免疫調節多肽結合該共免疫調節多肽之親和力為約10-4 M至約10-7 M、約10-4 M至約10-6 M、約10-4 M至約10-5 M;且/或c)其中當藉由生物層干涉術量測時,對照T細胞調節多聚體多肽與同源共免疫調節多肽之結合親和力與包含野生型免疫調節多肽之變異體的該T細胞調節多聚體多肽與該同源共免疫調節多肽之結合親和力的比率為至少10:1、至少50:1、至少102 :1或至少103 :1,其中該對照包含該野生型免疫調節多肽。
態樣4.如態樣1-3中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該第一多肽或該第二多肽包含免疫球蛋白(Ig)Fc多肽。
態樣5.如態樣4之T細胞調節多聚體多肽,其中該Ig Fc多肽為IgG1 Fc多肽。
態樣6.如態樣5之T細胞調節多聚體多肽,其中IgG1 Fc多肽包含選自以下之一或多個胺基酸取代:N297A、L234A、L235A、L234F、L235E及P331S。
態樣7.如態樣1-6中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中:a1)該第一多肽以自N端至C端之次序包含:i)該WT-1肽抗原決定基;ii)該第一MHC多肽;及iii)至少一種免疫調節多肽;且b2)該第二多肽以自N端至C端之次序包含:i)該第二MHC多肽;及ii)免疫球蛋白(Ig)Fc多肽;或a2)該第一多肽以自N端至C端之次序包含:i)該WT-1肽抗原決定基;及ii)該第一MHC多肽;且b2)該第二多肽以自N端至C端之次序包含:i)至少一種免疫調節多肽;ii)該第二MHC多肽;及iii)Ig Fc多肽;或a3)該第一多肽以自N端至C端之次序包含:i)該WT-1肽抗原決定基; 及ii)該第一MHC多肽;且b3)該第二多肽以自N端至C端之次序包含:i)該第二MHC多肽;及ii)Ig Fc多肽;及iii)至少一種免疫調節多肽;或a4)該第一多肽以自N端至C端之次序包含:i)該WT-1肽抗原決定基;及ii)該第一MHC多肽;且b4)該第二多肽以自N端至C端之次序包含:i)該第二MHC多肽;及ii)至少一種免疫調節多肽;或a5)該第一多肽以自N端至C端之次序包含:i)該WT-1肽抗原決定基;及ii)該第一MHC多肽;且b5)第二多肽以自N端至C端之次序包含:i)至少一種免疫調節多肽;及ii)該第二MHC多肽;或a6)該第一多肽以自N端至C端之次序包含:i)該WT-1肽抗原決定基;ii)該第一MHC多肽;及iii)至少一種免疫調節多肽;且b6)該第二多肽包含:i)該第二MHC多肽。
態樣8.如態樣1-7中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該第一多肽包含介於該WT-1抗原決定基與該第一MHC多肽之間的肽連接子且/或其中該第二多肽包含介於該免疫調節多肽與該第二MHC多肽之間的肽連接子。
態樣9.如態樣8之T細胞調節多聚體多肽,其中該肽連接子包含胺基酸序列(GGGGS)n(SEQ ID NO:284),其中n為1至10之整數。
態樣10.如態樣1-9中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該第一MHC多肽為β2-微球蛋白多肽;且其中該第二MHC多肽為I類MHC重鏈多肽。
態樣11.如態樣1-10中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該至少一種免疫調節多肽係選自由以下組成之群:細胞介素(例如,IL2多肽、IL7多肽、IL12多肽、IL15多肽、IL17多肽、IL21多肽、IL27多肽、IL-23多肽、TGFβ多肽及其類似物;且包括全部家族成員,例如IL17A、IL-17B、IL-17C、IL-17D、IL-17E、IL-17F、IL-17E)、4-1BBL多肽、ICOS-L多肽、OX-40L多肽、CD80多肽、CD86多肽(CD80及CD86亦分別稱為B7-1及B7-2)、CD40多肽、CD70多肽、JAG1(CD339)多肽、 ICAM(CD540多肽、PD-L1多肽、FasL多肽、PD-L2多肽、PD-1H(VISTA)多肽、ICOS-L(CD275)多肽、GITRL多肽、HVEM多肽、CXCL10多肽、CXCL9多肽、CXCL11多肽、CXCL13多肽、及CX3CL1多肽、半乳糖凝集素-9多肽、CD83多肽、CD30L多肽、HLA-G多肽、MICA多肽、MICB多肽、HVEM(CD270)多肽、淋巴毒素β受體多肽、3/TR6多肽、ILT3多肽、ILT4多肽、CXCL10多肽、CXCL9多肽、CXCL11多肽、CXCL13多肽、及CX3CL1多肽、及其組合。
態樣12.如態樣1-11中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該至少一種免疫調節多肽為IL-2多肽。
態樣13.如態樣1-12中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該多聚體多肽包含至少兩種免疫調節多肽,且其中該等免疫調節多肽中之至少兩者為相同的。
態樣14.如態樣13之T細胞調節多聚體多肽,其中該兩種或更多種免疫調節多肽係串聯在一起。
態樣15.如態樣1-14中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該第一多肽與該第二多肽彼此共價連接。
態樣16.如態樣15之T細胞調節多聚體多肽,其中該共價鍵係經由二硫鍵。
態樣17.如態樣1-16中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該第一MHC多肽或介於該抗原決定基與該第一MHC多肽之間的連接子包含提供第一Cys殘基之胺基酸取代,其中該第二MHC多肽包含提供第二Cys殘基之胺基酸取代,且其中該二硫鍵聯係在該第一Cys殘基與該第二Cys殘基之間。
態樣18.如態樣1-17中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該WT-1肽抗原決定基具有之長度為約4個胺基酸至約25個胺基酸。
態樣19.如態樣1-18中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該WT-1肽抗原決定基包含選自由以下組成之群的胺基酸序列: NLMNLGATL(SEQ ID NO:258)、NYMNLGATL(SEQ ID NO:263)、CMTWNQMNLGATLKG(SEQ ID NO:223)、WNQMNLGATLKGVAA(SEQ ID NO:224)、CMTWNYMNLGATLKG(SEQ ID NO:225)、WNYMNLGATLKGVAA(SEQ ID NO:226)、MTWNQMNLGATLKGV(SEQ ID NO:227)、TWNQMNLGATLKGVA(SEQ ID NO:228)、CMTWNLMNLGATLKG(SEQ ID NO:229)、MTWNLMNLGATLKGV(SEQ ID NO:230)、TWNLMNLGATLKGVA(SEQ ID NO:231)、WNLMNLGATLKGVAA(SEQ ID NO:232)、MNLGATLK(SEQ ID NO:233)、MTWNYMNLGATLKGV SEQ ID NO:234)、TWNYMNLGATLKGVA(SEQ ID NO:235)、CMTWNQMNLGATLKGVA(SEQ ID NO:236)、CMTWNLMNLGATLKGVA(SEQ ID NO:237)、CMTWNYMNLGATLKGVA(SEQ ID NO:238)、GYLRNPTAC(SEQ ID NO:239)、GALRNPTAL(SEQ ID NO:240)、YALRNPTAC(SEQ ID NO:241)、GLLRNPTAC(SEQ ID NO:242)、RYRPHPGAL(SEQ ID NO:243)、YQRPHPGAL(SEQ ID NO:244)、RLRPHPGAL(SEQ ID NO:245)、RIRPHPGAL(SEQ ID NO:246)、QFPNHSFKHEDPMGQ(SEQ ID NO:247)、HSFKHEDPY(SEQ ID NO:248)、QFPNHSFKHEDPM(SEQ ID NO:249)、QFPNHSFKHEDPY(SEQ ID NO:250)、KRPFMCAYPGCNK(SEQ ID NO:251)、KRPFMCAYPGCYK(SEQ ID NO:252)、FMCAYPGCY(SEQ ID NO:253)、FMCAYPGCK(SEQ ID NO:254)、KRPFMCAYPGCNKRY(SEQ ID NO:255)、SEKRPFMCAYPGCNK(SEQ ID NO:256)、KRPFMCAYPGCYKRY(SEQ ID NO:257)、NLMNLGATL(SEQ ID NO:258)、VLDFAPPGA(SEQ ID NO:259)、RMFPNAPYL(SEQ ID NO:260)、CMTWNQMN(SEQ ID NO:261)、CYTWNQMNL(SEQ ID NO:262)、NYMNLGATL(SEQ ID NO:263)、YMFPNAPYL(SEQ ID NO:264)、SLGEQQYSV(SEQ ID NO:265)、CMTWNQMNL(SEQ ID NO:266)及NQMNLGATL(SEQ ID NO:267)。
態樣20.如態樣1-18中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該WT-1肽包含胺基酸序列CMTWNQMNL(SEQ ID NO:266)或CYTWNQMNL(SEQ ID NO:262)。
態樣21.如態樣1-20中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該第一MHC多肽或該第二MHC多肽包含:a)與圖9A中描繪之HLA-A*0101、HLA-A*0201、HLA-A*0201、HLA-A*1101、HLA-A*2301、HLA-A*2402、HLA-A*2407、HLA-A*3303或HLA-A*3401胺基酸序列具有至少95%胺基酸序列一致性之胺基酸序列;或b)與圖10A中描繪之HLA-B*0702、HLA-B*0801、HLA-B*1502、HLA-B*3802、HLA-B*4001、HLA-B*4601或HLA-B*5301胺基酸序列具有至少95%胺基酸序列一致性之胺基酸序列;或c)與圖11A中描繪之HLA-C*0102、HLA-C*0303、HLA-C*0304、HLA-C*0401、HLA-C*0602、HLA-C*0701、HLA-C*0702、HLA-C*0801或HLA-C*1502具有至少95%胺基酸序列一致性之胺基酸序列。
態樣22.如態樣1-20中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該第一MHC多肽為β2M多肽,且其中該第二MHC多肽包含與HLA-A*2402多肽具有至少95%胺基酸序列一致性之胺基酸序列。
態樣23.如態樣1-20中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該第一MHC多肽為β2M多肽,且其中該第二MHC多肽為HLA-A*1101多肽。
態樣24.如態樣1-20中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該第一MHC多肽為β2M多肽,且其中該第二MHC多肽包含與HLA-A*3303多肽具有至少95%胺基酸序列一致性之胺基酸序列。
態樣25.如態樣1-20中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該第一MHC多肽為β2M多肽,且其中該第二MHC多肽包含與HLA-A*0201多肽具有至少95%胺基酸序列一致性之胺基酸序列。
態樣26.如態樣21-25中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該MHC重鏈多肽包含在位置236處之Cys。
態樣27.如態樣21-26中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該β2M多肽包含在位置12處之Cys。
態樣28.如態樣1-27中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該免疫調節多肽為包含以下之變異體IL-2多肽:i)H16A取代及F42A取代;或ii)H16T取代及F42A取代。
態樣29.如態樣4-28中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該多聚體多肽包含第一異二聚體及第二異二聚體,且其中該第一異二聚體與該第二異二聚體藉由介於該第一異二聚體與該第二異二聚體之Ig Fc多肽之間的一或多個二硫鍵來共價結合。
態樣30.一種核酸,其包含編碼根據態樣1-28中任一項之第一多肽或第二多肽的核苷酸序列,其中該第一多肽或該第二多肽包含至少一個免疫調節結構域。
態樣31.一種表現載體,其包含如態樣30之核酸。
態樣32.一種選擇性調節對於韋爾姆斯氏瘤-1(WT-1)抗原決定基具有特異性之T細胞之活性的方法,該方法包括使該T細胞與根據態樣1-29中任一項之T細胞調節多聚體多肽接觸,其中該接觸選擇性調節該WT-1抗原決定基特異性T細胞之活性。
態樣33.一種治療患有癌症之患者的方法,該方法包括向該患者投與有效量的包含根據態樣1-29中任一項之T細胞調節多聚體多肽之醫藥組成物。
態樣34.如態樣33之方法,其中該癌症為肝細胞癌、胰臟癌、胃癌、結腸直腸癌、肝胚細胞瘤或卵巢卵黃囊瘤。
態樣35.如態樣33或態樣34之方法,其中該投與係肌肉內投與。
態樣36.如態樣33或態樣34之方法,其中該投與係靜脈內投與。
態樣37.一種調節個體之免疫反應的方法,該方法包括向該個體投與有效量的如態樣1-29中任一項之T細胞調節多聚體多肽(TMMP),其中該投與誘導抗原決定基特異性T細胞反應(例如,對於存在於該TMMP中之該WT-1抗原決定基有特異性之T細胞反應)及抗原決定基非特異性T細胞反應,其中該抗原決定基特異性T細胞反應與該抗原決定基非特異性T細胞反應之比率為至少2:1。
態樣38如態樣37之方法,其中該抗原決定基特異性T細胞反應與該抗原決定基非特異性T細胞反應之比率為至少5:1。
態樣39.如態樣37之方法,其中該抗原決定基特異性T細胞反應與該抗原決定基非特異性T細胞反應之比率為至少10:1。
態樣40.如態樣37之方法,其中該抗原決定基特異性T細胞反應與該抗原決定基非特異性T細胞反應之比率為至少25:1。
態樣41.如態樣37之方法,其中該抗原決定基特異性T細胞反應與該抗原決定基非特異性T細胞反應之比率為至少50:1。
態樣42.如態樣37之方法,其中該抗原決定基特異性T細胞反應與該抗原決定基非特異性T細胞反應之比率為至少100:1。
態樣43.如態樣37-42中任一項之方法,其中該個體為人類。
態樣44.如態樣37-43中任一項之方法,其中該調節包含增強對癌細胞(例如表現WT-1之癌細胞)之細胞毒性T細胞反應。
態樣45.如態樣37-44中任一項之方法,其中該投與為靜脈內、皮下、肌肉內、全身性、淋巴管內、治療部位遠端、局部、或治療部位處或附近之投與。
態樣46.如態樣37-45中任一項之方法,其中該抗原決定基非特異性T細胞反應小於由包含相應野生型免疫調節多肽之對照T細胞調節多聚體多肽誘導之抗原決定基非特異性T細胞反應。
態樣47.一種選擇性遞送共刺激(亦即,免疫調節)多肽至靶標T細胞之方法,該方法包括使混合T細胞群與如態樣1-29中任一項之T細胞調節多聚體多肽(TMMP)接觸,其中該混合T細胞群包含該靶標T細胞及非靶標T細胞,其中該靶標T細胞對存在於該TMMP內之該抗原決定基有特異性(例如,其中該靶標T細胞對存在於該TMMP內之該WT-1抗原決定基有特異性),且其中該接觸遞送存在於該TMMP內之該一或多種共刺激多肽至該靶標T細胞。
態樣48.如態樣47之方法,其中該T細胞群在活體外。
態樣49.如態樣47之方法,其中該T細胞群在個體活體內。
態樣50.如態樣49之方法,其包含向該個體投與該多聚體多肽。
態樣51.如態樣47-50中任一項之方法,其中該靶標T細胞為細胞毒性T細胞。
態樣52.如態樣47之方法,其中該混合T細胞群為自個體獲得之活體外混合T細胞群,且其中該接觸導致該靶標T細胞之活化及/或增殖,從而生成經活化及/或增殖之靶標T細胞群。
態樣53.如態樣52之方法,其進一步包括向該個體投與該經活化及/或增殖之靶標T細胞群。
態樣54.一種偵測自個體獲得之混合T細胞群中結合目標WT-1抗原決定基之靶標T細胞之存在的方法,該方法包括:a)使該混合T細胞群與如態樣1-29中任一項之T細胞調節多聚體多肽(TMMP)在活體外接觸,其中該TMMP包含目標WT-1抗原決定基;及b)偵測T細胞響應於 該接觸之活化及/或增殖,其中經活化及/或增殖之T細胞指示靶標T細胞之存在。
態樣55.一種T細胞調節多聚體多肽,其包含:至少一種異二聚體,該異二聚體包含:a)第一多肽,該第一多肽包含:i)韋爾姆斯氏瘤-1(WT-1)肽抗原決定基,其中該WT-1肽具有之長度為約4個胺基酸至約25個胺基酸;及ii)第一主要組織相容性複合物(MHC)I類多肽;b)第二多肽,該第二多肽包含第二I類MHC多肽,及c)至少一種免疫調節多肽,其中該第一多肽及/或該第二多肽包含該免疫調節多肽,且其中該第一多肽與該第二多肽經由至少2個二硫鍵彼此共價連接。
態樣56.如態樣55之T細胞調節多聚體多肽,其中該至少一種免疫調節多肽中之至少一者為變異體免疫調節多肽,其呈現出對同源共免疫調節多肽之親和力與相應野生型免疫調節多肽對該同源共免疫調節多肽之親和力相比有所減小,且其中該抗原決定基以至少10-7 M之親和力結合至T細胞上之T細胞受體(TCR),使得:i)該T細胞調節多聚體多肽結合至第一T細胞之親和力比該T細胞調節多聚體多肽結合第二T細胞之親和力高至少25%,其中該第一T細胞在其表面上表現該同源共免疫調節多肽及以至少10-7 M之親和力結合該抗原決定基之TCR,且其中該第二T細胞在其表面上表現該同源共免疫調節多肽,但在其表面上不表現以至少10-7 M之親和力結合該抗原決定基之TCR;且/或ii)當藉由生物層干涉術量測時,對照T細胞調節多聚體多肽與同源共免疫調節多肽之結合親和力與包含野生型免疫調節多肽變異體之該T細胞調節多聚體多肽與該同源共免疫調節多肽之結合親和力的比率範圍為1.5:1至106 :1,其中該對照包含該野生型免疫調節多肽。
態樣57.如態樣56之T細胞調節多聚體多肽,其中:a)該T細胞調節多聚體多肽結合至該第一T細胞之親和力比其結合該第二T細胞之親和力高至少50%、至少2倍、至少5倍或至少10倍;且/或b)該變異體免疫調節多肽結合該共免疫調節多肽之親和力為約10-4 M至約10-7 M、約10-4 M至約10-6 M、約10-4 M至約10-5 M;且/或c)其中當藉由生物層干涉術量測時,對照T細胞調節多聚體多肽與同源共免疫調節多肽之結合親和力與包含野生型免疫調節多肽之變異體的該T細胞調節多聚體多肽與該同源共免疫調節多肽之結合親和力的比率為至少10:1、至少50:1、至少102 :1或至少103 :1,其中該對照包含該野生型免疫調節多肽。
態樣58.如態樣55-57中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該第一多肽或該第二多肽包含免疫球蛋白(Ig)Fc多肽。
態樣59.如態樣58之T細胞調節多聚體多肽,其中該Ig Fc多肽為IgG1 Fc多肽。
態樣60.如態樣58之T細胞調節多聚體多肽,其中該Ig Fc多肽為IgG4 Fc多肽。
態樣61.如態樣59之T細胞調節多聚體多肽,其中IgG1 Fc多肽包含選自以下之一或多個胺基酸取代:N297A、L234A、L235A、L234F、L235E及P331S。
態樣62.如態樣55-61中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中
a1)該第一多肽以自N端至C端之次序包含:
i)該WT-1肽抗原決定基;
ii)該第一I類MHC多肽;且
iii)至少一種免疫調節多肽;且
b1)該第二多肽以自N端至C端之次序包含:
i)該第二I類MHC多肽;及
ii)免疫球蛋白(Ig)Fc多肽;或
a2)該第一多肽以自N端至C端之次序包含:
i)該WT-1肽抗原決定基;及
ii)該第一I類MHC多肽;且
b2)該第二多肽以自N端至C端之次序包含:
i)至少一種免疫調節多肽;
ii)該第二I類MHC多肽;及
iii)Ig Fc多肽;或
a3)該第一多肽以自N端至C端之次序包含:
i)該WT-1肽抗原決定基;及
ii)該第一I類MHC多肽;且
b3)該第二多肽以自N端至C端之次序包含:
i)該第二I類MHC多肽;及
ii)Ig Fc多肽;及
iii)至少一種免疫調節多肽;或
a4)該第一多肽以自N端至C端之次序包含:
i)該WT-1肽抗原決定基;及
ii)該第一I類MHC多肽;且
b4)該第二多肽以自N端至C端之次序包含:
i)該第二I類MHC多肽;及
ii)至少一種免疫調節多肽;或
a5)該第一多肽以自N端至C端之次序包含:
i)該WT-1肽抗原決定基;及
ii)該第一I類MHC多肽;且
b5)第二多肽以自N端至C端之次序包含:
i)至少一種免疫調節多肽;及
ii)該第二I類MHC多肽;或
a6)該第一多肽以自N端至C端之次序包含:
i)該WT-1肽抗原決定基;
ii)該第一I類MHC多肽;且
iii)至少一種免疫調節多肽;且
b6)該第二多肽包含:
i)該第二I類MHC多肽。
態樣63.如態樣55-62中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該第一MHC多肽為β2-微球蛋白多肽;且其中該第二MHC多肽為I類MHC重鏈多肽。
態樣64.如態樣55-63中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該至少一種免疫調節多肽係選自由以下組成之群:細胞介素(例如,IL2多肽、IL7多肽、IL12多肽、IL15多肽、IL17多肽、IL21多肽、IL27多肽、IL-23多肽、TGFβ多肽及其類似物;且包括全部家族成員,例如IL17A、IL-17B、IL-17C、IL-17D、IL-17E、IL-17F、IL-17E)、4-1BBL多肽、ICOS-L多肽、OX-40L多肽、CD80多肽、CD86多肽(CD80及CD86亦分別稱為B7-1及B7-2)、CD40多肽、CD70多肽、JAG1(CD339)多肽、ICAM(CD540多肽、PD-L1多肽、FasL多肽、PD-L2多肽、PD-1H(VISTA)多肽、ICOS-L(CD275)多肽、GITRL多肽、HVEM多肽、CXCL10多肽、CXCL9多肽、CXCL11多肽、CXCL13多肽、及CX3CL1多肽、半乳糖凝集素-9多肽、CD83多肽、CD30L多肽、HLA-G多肽、MICA多肽、MICB多肽、HVEM(CD270)多肽、淋巴毒素β受體多肽、3/TR6多肽、ILT3多肽、ILT4多肽、CXCL10多肽、CXCL9多肽、CXCL11多肽、CXCL13多肽、及CX3CL1多肽、及其組合。
態樣65.如態樣55-63中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該至少一種免疫調節多肽為IL-2多肽。
態樣66.如態樣55-65中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該多聚體多肽包含至少兩種免疫調節多肽,且其中該等免疫調節多肽中之至少兩者為相同的。
態樣67.如態樣66之T細胞調節多聚體多肽,其中該兩種或更多種免疫調節多肽係串聯在一起。
態樣68.如態樣55-67中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中:a)第一二硫鍵係在以下各物之間:i)存在於該WT-1肽抗原決定 基與該第一I類MHC多肽之間的連接子中之Cys,其中該第一I類MHC多肽為β2M多肽;與ii)經由Y84C取代引入該第二I類MHC多肽中之Cys殘基,其中該第二I類MHC多肽為I類MHC重鏈多肽;且b)第二二硫鍵係在以下各物之間:i)經由R12C取代引入該β2M多肽中之Cys殘基;與ii)經由A236C取代引入該I類MHC重鏈多肽中之Cys殘基。
態樣69.如態樣68之T細胞調節多聚體多肽,其中該連接子包含胺基酸序列GCGGS(SEQ ID NO:318)。
態樣70.如態樣69之T細胞調節多聚體多肽,其中該連接子包含胺基酸序列GCGGS(GGGGS)n(SEQ ID NO:319),其中n為1至10之整數。
態樣71.如態樣55-70中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該WT-1肽抗原決定基具有之長度為約4個胺基酸至約15個胺基酸。
態樣72.如態樣55-71中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該WT-1肽抗原決定基包含選自由以下組成之群的胺基酸序列:NLMNLGATL(SEQ ID NO:258)、NYMNLGATL(SEQ ID NO:263)、CMTWNQMNLGATLKG(SEQ ID NO:223)、WNQMNLGATLKGVAA(SEQ ID NO:224)、CMTWNYMNLGATLKG(SEQ ID NO:225)、WNYMNLGATLKGVAA(SEQ ID NO:226)、MTWNQMNLGATLKGV(SEQ ID NO:227)、TWNQMNLGATLKGVA(SEQ ID NO:228)、CMTWNLMNLGATLKG(SEQ ID NO:229)、MTWNLMNLGATLKGV(SEQ ID NO:230)、TWNLMNLGATLKGVA(SEQ ID NO:231)、WNLMNLGATLKGVAA(SEQ ID NO:232)、MNLGATLK(SEQ ID NO:233)、MTWNYMNLGATLKGV SEQ ID NO:234)、TWNYMNLGATLKGVA(SEQ ID NO:235)、CMTWNQMNLGATLKGVA(SEQ ID NO:236)、CMTWNLMNLGATLKGVA(SEQ ID NO:237)、CMTWNYMNLGATLKGVA(SEQ ID NO:238)、GYLRNPTAC(SEQ ID NO:239)、GALRNPTAL(SEQ ID NO:240)、YALRNPTAC(SEQ ID NO:241)、GLLRNPTAC(SEQ ID NO:242)、RYRPHPGAL(SEQ ID NO:243)、YQRPHPGAL(SEQ ID NO:244)、RLRPHPGAL(SEQ ID NO:245)、RIRPHPGAL(SEQ ID NO:246)、QFPNHSFKHEDPMGQ(SEQ ID NO:247)、HSFKHEDPY(SEQ ID NO:248)、QFPNHSFKHEDPM(SEQ ID NO:249)、QFPNHSFKHEDPY(SEQ ID NO:250)、KRPFMCAYPGCNK(SEQ ID NO:251)、KRPFMCAYPGCYK(SEQ ID NO:252)、FMCAYPGCY(SEQ ID NO:253)、FMCAYPGCK(SEQ ID NO:254)、KRPFMCAYPGCNKRY(SEQ ID NO:255)、SEKRPFMCAYPGCNK(SEQ ID NO:256)、KRPFMCAYPGCYKRY(SEQ ID NO:257)、NLMNLGATL(SEQ ID NO:258)、VLDFAPPGA(SEQ ID NO:259)、RMFPNAPYL(SEQ ID NO:260)、CMTWNQMN(SEQ ID NO:261)、CYTWNQMNL(SEQ ID NO:262)、NYMNLGATL(SEQ ID NO:263)、YMFPNAPYL(SEQ ID NO:264)、SLGEQQYSV(SEQ ID NO:265)、CMTWNQMNL(SEQ ID NO:266)及NQMNLGATL(SEQ ID NO:267)。
態樣73.如態樣55-71中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該WT-1肽包含胺基酸序列VLDFAPPGA(SEQ ID NO:259)或RMFPNAPYL(SEQ ID NO:260)。
態樣74.如態樣55-73中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該第一I類MHC多肽或該第二I類MHC多肽包含:a)與圖9A中描繪之HLA-A*0101、HLA-A*0201、HLA-A*0201、HLA-A*1101、HLA-A*2301、HLA-A*2402、HLA-A*2407、HLA-A*3303或HLA-A*3401胺基酸序列具有至少95%胺基酸序列一致性之胺基酸序列;b)與圖10A中描繪之HLA-B*0702、HLA-B*0801、HLA-B*1502、HLA-B*3802、HLA-B*4001、HLA-B*4601或HLA-B*5301胺基酸序列具有至少95%胺基酸序列一致性之胺基酸序列;或c)與圖11A中描繪之HLA-C*0102、HLA-C*0303、HLA-C*0304、HLA-C*0401、HLA-C*0602、HLA-C*0701、 HLA-C*0702、HLA-C*0801或HLA-C*1502具有至少95%胺基酸序列一致性之胺基酸序列。
態樣75.如態樣55-74中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該第一MHC多肽為β2M多肽,且其中該第二MHC多肽包含與HLA-A*2402多肽具有至少95%胺基酸序列一致性之胺基酸序列。
態樣76.如態樣55-74中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該第一MHC多肽為β2M多肽,且其中該第二MHC多肽為HLA-A*1101多肽。
態樣77.如態樣55-74中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該第一MHC多肽為β2M多肽,且其中該第二MHC多肽包含與HLA-A*3303多肽具有至少95%胺基酸序列一致性之胺基酸序列。
態樣78.如態樣55-74中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該第一MHC多肽為β2M多肽,且其中該第二MHC多肽包含與HLA-A*0201多肽具有至少95%胺基酸序列一致性之胺基酸序列。
態樣79.如態樣55-78中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該至少一種免疫調節多肽為包含以下之變異體IL-2多肽:i)H16A取代及F42A取代;或ii)H16T取代及F42A取代。
態樣80.如態樣55-79中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該多聚體多肽包含第一異二聚體及第二異二聚體。
態樣81.一種核酸,其包含編碼根據態樣55-80中任一項之第一多肽或第二多肽的核苷酸序列,其中該第一多肽或該第二多肽包含至少一個免疫調節結構域。
態樣82.一種表現載體,其包含如態樣81之核酸。
態樣83.一種選擇性調節對於韋爾姆斯氏瘤-1(WT-1)抗原決定基具有特異性之T細胞之活性的方法,該方法包括使該T細胞與根據態樣55-80中任一項之T細胞調節多聚體多肽接觸,其中該接觸選擇性調節該WT-1抗原決定基特異性T細胞之活性。
態樣84.一種治療患有癌症之患者的方法,該方法包括向該患者投與有效量的包含根據態樣55-80中任一項之T細胞調節多聚體多肽之醫藥組成物。
態樣85.如態樣84之方法,其中該癌症表現WT-1蛋白。
態樣86.如態樣84或態樣85之方法,其中該癌症為急性骨髓性白血病、骨髓瘤、卵巢癌、胰臟癌、非小細胞肺癌、結腸直腸癌、乳癌、韋爾姆斯氏瘤、間皮瘤、軟組織肉瘤、神經胚細胞瘤或腎胚細胞瘤。
態樣87.如態樣84-86中任一項之方法,其中該投與係肌肉內投與。
態樣88.如態樣84-86中任一項之方法,其中該投與係靜脈內投與。
態樣89.如態樣84-88中任一項之方法,其進一步包括向該個體投與一或多種檢查點抑制劑。
態樣90.如態樣89之方法,其中該檢查點抑制劑為結合至選自由以下組成之群之多肽的抗體:CD27、CD28、CD40、CD122、CD96、CD73、CD47、OX40、GITR、CSF1R、JAK、PI3K δ、PI3K γ、TAM、精胺酸酶、CD137、ICOS、A2AR、B7-H3、B7-H4、BTLA、CTLA-4、LAG3、TIM3、VISTA、CD96、TIGIT、CD122、PD-1、PD-L1及PD-L2。
態樣91.如態樣90之方法,其中該檢查點抑制劑為對PD-1、PD-L1或CTLA4有特異性之抗體。
態樣92.如態樣89之方法,其中該一或多種檢查點抑制劑係選自由以下組成之群:納武單抗、派姆單抗、披地單抗、AMP-224、MPDL3280A、MDX-1105、MEDI-4736、阿維魯單抗、伊匹珠單抗、曲利木單抗、披地單抗、IMP321、MGA271、BMS-986016、利魯單抗、烏瑞魯單抗、PF-05082566、IPH2101、MEDI-6469、CP-870,893、莫木利珠單 抗、瓦利魯單抗、阿維單抗、加利昔單抗、AMP-514、AUNP 12、伊多莫德、NLG-919、INCB024360、KN035、及其組合。
態樣93.一種調節個體之免疫反應的方法,該方法包括向該個體投與有效量的如態樣55-80中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該投與誘導抗原決定基特異性T細胞反應及抗原決定基非特異性T細胞反應,其中該抗原決定基特異性T細胞反應與該抗原決定基非特異性T細胞反應之比率為至少2:1。
態樣94.一種選擇性遞送免疫調節多肽至靶標T細胞之方法,該方法包括使混合T細胞群與如態樣55-80中任一項之T細胞調節多聚體多肽接觸,其中該混合T細胞群包含該靶標T細胞及非靶標T細胞,其中該靶標T細胞對存在於該T細胞調節多聚體多肽內之該WT-1抗原決定基具有特異性,且其中該接觸遞送存在於該T細胞調節多聚體多肽內之該一或多種免疫調節多肽至該靶標T細胞。
態樣95.一種偵測自個體獲得之混合T細胞群中結合韋爾姆斯氏瘤-1(WT-1)抗原決定基之靶標T細胞之存在的方法,該方法包括:a)使該混合T細胞群與如態樣55-80中任一項之T細胞調節多聚體多肽在活體外接觸,其中該T細胞調節多聚體多肽包含該WT-1抗原決定基;及b)偵測T細胞響應於該接觸之活化及/或增殖,其中經活化及/或增殖之T細胞指示該靶標T細胞之存在。
態樣組B
上文所述之本發明主題之態樣(包括實施例)單獨或在與一或多個其他態樣或實施例組合時可為有益的。不限於以上描述,下文提供本揭示案之編號1-36的某些非限制性態樣。如熟習此項技術者在閱讀本揭示案之後將顯而易知,可使用個別編號之態樣中之各者或將其與前述或以下個別編號之態樣中之任一者組合。此旨在提供全部此等態樣組合之支持且不限於下文明確提供之態樣之組合:
態樣1.一種T細胞調節多聚體多肽,其包含:至少一種異二聚體,該異二聚體包含:a)第一多肽,該第一多肽包含:i)韋爾姆斯氏瘤-1(WT-1)肽抗原決定基,其中該WT-1肽之長度為至少4個胺基酸;及ii)第一I類主要組織相容性複合物(MHC)多肽;b)第二多肽,該第二多肽包含第二I類MHC多肽,及c)至少一種活化免疫調節多肽,其中該第一多肽及/或該第二多肽包含該免疫調節多肽,且其中該WT-1肽抗原決定基包含選自由以下組成之群的胺基酸序列:NLMNLGATL(SEQ ID NO:258)、NYMNLGATL(SEQ ID NO:263)、CMTWNQMNLGATLKG(SEQ ID NO:223)、WNQMNLGATLKGVAA(SEQ ID NO:224)、CMTWNYMNLGATLKG(SEQ ID NO:225)、WNYMNLGATLKGVAA(SEQ ID NO:226)、MTWNQMNLGATLKGV(SEQ ID NO:227)、TWNQMNLGATLKGVA(SEQ ID NO:228)、CMTWNLMNLGATLKG(SEQ ID NO:229)、MTWNLMNLGATLKGV(SEQ ID NO:230)、TWNLMNLGATLKGVA(SEQ ID NO:231)、WNLMNLGATLKGVAA(SEQ ID NO:232)、MNLGATLK(SEQ ID NO:233)、MTWNYMNLGATLKGVSEQ ID NO:234)、TWNYMNLGATLKGVA(SEQ ID NO:235)、CMTWNQMNLGATLKGVA(SEQ ID NO:236)、CMTWNLMNLGATLKGVA(SEQ ID NO:237)、CMTWNYMNLGATLKGVA(SEQ ID NO:238)、GYLRNPTAC(SEQ ID NO:239)、GALRNPTAL(SEQ ID NO:240)、YALRNPTAC(SEQ ID NO:241)、GLLRNPTAC(SEQ ID NO:242)、RYRPHPGAL(SEQ ID NO:243)、YQRPHPGAL(SEQ ID NO:244)、RLRPHPGAL(SEQ ID NO:245)、RIRPHPGAL(SEQ ID NO:246)、QFPNHSFKHEDPMGQ(SEQ ID NO:247)、HSFKHEDPY(SEQ ID NO:248)、QFPNHSFKHEDPM(SEQ ID NO:249)、QFPNHSFKHEDPY(SEQ ID NO:250)、KRPFMCAYPGCNK(SEQ ID NO:251)、KRPFMCAYPGCYK(SEQ ID NO:252)、FMCAYPGCY(SEQ ID NO:253)、FMCAYPGCK(SEQ ID NO:254)、 KRPFMCAYPGCNKRY(SEQ ID NO:255)、SEKRPFMCAYPGCNK(SEQ ID NO:256)、KRPFMCAYPGCYKRY(SEQ ID NO:257)、NLMNLGATL(SEQ ID NO:258)、VLDFAPPGA(SEQ ID NO:259)、RMFPNAPYL(SEQ ID NO:260)、CMTWNQMN(SEQ ID NO:261)、CYTWNQMNL(SEQ ID NO:262)、NYMNLGATL(SEQ ID NO:263)、YMFPNAPYL(SEQ ID NO:264)、SLGEQQYSV(SEQ ID NO:265)、CMTWNQMNL(SEQ ID NO:266)及NQMNLGATL(SEQ ID NO:267),視情況其中該第一多肽或該第二多肽包含免疫球蛋白(Ig)Fc多肽。
態樣2.如態樣1之T細胞調節多聚體多肽,其中該一或多個免疫調節結構域中之至少一者為變異體免疫調節多肽,其呈現出對同源共免疫調節多肽之親和力與相應野生型免疫調節多肽對該同源共免疫調節多肽之親和力相比有所減小,且其中該抗原決定基以至少10-7 M之親和力結合至T細胞上之T細胞受體(TCR),使得:
i)該T細胞調節多聚體多肽結合至第一T細胞之親和力比該T細胞調節多聚體多肽結合第二T細胞之親和力高至少25%,其中該第一T細胞在其表面上表現該同源共免疫調節多肽及以至少10-7 M之親和力結合該抗原決定基之TCR,且其中該第二T細胞在其表面上表現該同源共免疫調節多肽但在其表面上不表現以至少10-7 M之親和力結合該抗原決定基之TCR;且/或
ii)當藉由生物層干涉術量測時,對照T細胞調節多聚體多肽對同源共免疫調節多肽之結合親和力與包含野生型免疫調節多肽之變異體的該T細胞調節多聚體多肽對該同源共免疫調節多肽之結合親和力的比率範圍為1.5:1至106 :1,其中該對照包含該野生型免疫調節多肽。
態樣3.如態樣2之T細胞調節多聚體多肽,其中:
a)該T細胞調節多聚體多肽結合至該第一T細胞之親和力比其結合該第二T細胞之親和力高至少50%、至少2倍、至少5倍或至少10倍;且/或
b)該變異體免疫調節多肽結合該共免疫調節多肽之親和力為約10-4 M至約10-7 M、約10-4 M至約10-6 M、約10-4 M至約10-5 M;且/或
c)其中當藉由生物層干涉術量測時,對照T細胞調節多聚體多肽對同源共免疫調節多肽之結合親和力與包含野生型免疫調節多肽之變異體的該T細胞調節多聚體多肽對該同源共免疫調節多肽之結合親和力的比率為至少10:1、至少50:1、至少102 :1或至少103 :1,其中該對照包含該野生型免疫調節多肽。
態樣4.如態樣1-3中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中
a1)該第一多肽以自N端至C端之次序包含:
i)該WT-1肽抗原決定基;
ii)該第一MHC多肽;且
iii)至少一種免疫調節多肽;且
b1)該第二多肽以自N端至C端之次序包含:
i)該第二MHC多肽;及
ii)免疫球蛋白(Ig)Fc多肽;或
a2)該第一多肽以自N端至C端之次序包含:
i)該WT-1肽抗原決定基;及
ii)該第一MHC多肽;且
b2)該第二多肽以自N端至C端之次序包含:
i)至少一種免疫調節多肽;
ii)該第二MHC多肽;及
iii)Ig Fc多肽;或
a3)該第一多肽以自N端至C端之次序包含:
i)該WT-1肽抗原決定基;及
ii)該第一MHC多肽;且
b3)該第二多肽以自N端至C端之次序包含:
i)該第二MHC多肽;及
ii)Ig Fc多肽;及
iii)至少一種免疫調節多肽;或
a4)該第一多肽以自N端至C端之次序包含:
i)該WT-1肽抗原決定基;及
ii)該第一MHC多肽;且
b4)該第二多肽以自N端至C端之次序包含:
i)該第二MHC多肽;及
ii)至少一種免疫調節多肽;或
a5)該第一多肽以自N端至C端之次序包含:
i)該WT-1肽抗原決定基;及
ii)該第一MHC多肽;且
b5)第二多肽以自N端至C端之次序包含:
i)至少一種免疫調節多肽;及
ii)該第二MHC多肽;或
a6)該第一多肽以自N端至C端之次序包含:
i)該WT-1肽抗原決定基;
ii)該第一MHC多肽;且
iii)至少一種免疫調節多肽;且
b6)該第二多肽包含:
i)該第二MHC多肽。
態樣5.如態樣1-4中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中:
a)該第一MHC多肽為β2-微球蛋白多肽;且該第二MHC多肽為I類MHC重鏈多肽;或
b)該第一MHC多肽為I類MHC重鏈多肽;且該第二MHC多肽為β2-微球蛋白多肽。
態樣6.如態樣5之T細胞調節多聚體多肽,其中:
a)該第一多肽以自N端至C端之次序包含:
i)該WT-1肽抗原決定基;及
ii)該β2-微球蛋白多肽;且
b)該第二多肽以自N端至C端之次序包含:
i)至少一種免疫調節多肽;
ii)該I類MHC重鏈多肽;及
iii)Ig Fc多肽。
態樣7.如態樣5之T細胞調節多聚體多肽,其中:
a)該第一多肽以自N端至C端之次序包含:
i)該WT-1肽抗原決定基;及
ii)該β2-微球蛋白多肽;且
b)該第二多肽以自N端至C端之次序包含:
i)該I類MHC重鏈多肽;及
ii)Ig Fc多肽;及
iii)至少一種免疫調節多肽。
態樣8.如態樣1-7中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該至少一種免疫調節多肽係選自由以下組成之群:細胞介素、4-1BBL多肽、ICOS-L多肽、OX-40L多肽、CD80多肽、CD86多肽、CD40多肽、CD70多肽及其組合。
態樣9.如態樣1-8中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該至少一種免疫調節多肽為IL-2多肽。
態樣10.如態樣1-9中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該多聚體多肽包含至少兩種免疫調節多肽,且其中該等免疫調節多肽中之至少兩者為相同的,視情況其中該兩種或更多種免疫調節多肽係串聯在一起。
態樣11.如態樣1-10中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該免疫調節多肽為變異體IL-2多肽,其呈現出對IL-2受體之親和力與野生型IL-2多肽對該IL-2受體之親和力相比有所減小。
態樣12.如態樣11之T細胞調節多聚體多肽,其中該變異體IL-2多肽包含:i)H16A取代及F42A取代;或ii)H16T取代及F42A取代。
態樣13.如態樣1-12中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該第一多肽與該第二多肽彼此共價連接,視情況其中該共價鍵聯係經由二硫鍵。
態樣14.如態樣1-13中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該第一MHC多肽或介於該抗原決定基與該第一MHC多肽之間的連接子包含提供第一Cys殘基之胺基酸取代,其中該第二MHC多肽包含提供第二Cys殘基之胺基酸取代,且其中該二硫鍵聯係在該第一Cys殘基與該第二Cys殘基之間。
態樣15.如態樣1-14中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該多肽包含在以下各物之間的二硫鍵:i)存在於該WT-1肽抗原決定基與該第一I類MHC多肽之間的連接子中之Cys,其中該第一I類MHC多肽為β2M多肽;與ii)經由Y84C取代引入該第二I類MHC多肽中之Cys殘基,其中該第二I類MHC多肽為I類MHC重鏈多肽。
態樣16.如態樣1-14中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該多肽包含在以下各物之間的二硫鍵:i)經由R12C取代引入該第一I類MHC多肽中之Cys殘基,其中該第一I類MHC多肽為β2M多肽;與ii)經由A236C取代引入該第二I類MHC多肽中之Cys殘基,其中第二I類MHC多肽為I類MHC重鏈多肽。
態樣17.如態樣1-14中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該多肽包含在以下各物之間的第一二硫鍵:i)存在於該WT-1肽抗原決定基與該第一I類MHC多肽之間的連接子中之Cys,其中該第一I類MHC 多肽為β2M多肽;與ii)經由Y84C取代引入該第二I類MHC多肽中之Cys殘基,其中該第二I類MHC多肽為I類MHC重鏈多肽;及在以下各物之間的第二二硫鍵:i)經由R12C取代引入該β2M多肽中之Cys殘基;與ii)經由A236C取代引入該I類MHC重鏈多肽中之Cys殘基。
態樣18.如態樣15或態樣17之T細胞調節多聚體多肽,其中介於該WT-1肽抗原決定基與該第一MHC之間的該連接子為GCGGS(G4S)n(SEQ ID NO:315),其中n為1、2、3、4、5、6、7、8或9。
態樣19.如態樣1-18中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該WT-1肽抗原決定基具有之長度為約4個胺基酸至約25個胺基酸。
態樣20.如態樣1-19中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該WT-1肽包含胺基酸序列CMTWNQMNL(SEQ ID NO:266)、CYTWNQMNL(SEQ ID NO:262)、NYMNLGATL(SEQ ID NO:263)、VLDFAPPGA(SEQ ID NO:259)、YMFPNAPYL(SEQ ID NO:264)、SLGEQQYSV(SEQ ID NO:265)、RMFPNAPYL(SEQ ID NO:260)及NLMNLGATL(SEQ ID NO:258)。
態樣21.如態樣1-20中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該第一MHC多肽或該第二MHC多肽包含:
a)與圖9A中描繪之HLA-A*0101、HLA-A*0201、HLA-A*0201、HLA-A*1101、HLA-A*2301、HLA-A*2402、HLA-A*2407、HLA-A*3303或HLA-A*3401胺基酸序列具有至少95%胺基酸序列一致性之胺基酸序列;或
b)與圖10A中描繪之HLA-B*0702、HLA-B*0801、HLA-B*1502、HLA-B*3802、HLA-B*4001、HLA-B*4601或HLA-B*5301胺基酸序列具有至少95%胺基酸序列一致性之胺基酸序列;或
c)與圖11A中描繪之HLA-C*0102、HLA-C*0303、HLA-C*0304、HLA-C*0401、HLA-C*0602、HLA-C*0701、HLA-C*0702、HLA-C*0801或HLA-C*1502具有至少95%胺基酸序列一致性之胺基酸序列。
態樣22.如態樣1-21中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該第一MHC多肽為β2M多肽,且其中該第二MHC多肽包含與HLA-A*2402多肽具有至少95%胺基酸序列一致性之胺基酸序列,且其中該抗原決定基係選自由以下組成之群:RMFPNAPYL(SEQ ID NO:260)、CYTWNQMNL(SEQ ID NO:262)及NYMNLGATL(SEQ ID NO:263)。
態樣23.如態樣1-21中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該第一MHC多肽為β2M多肽,且其中該第二MHC多肽包含與HLA-A*0201多肽具有至少95%胺基酸序列一致性之胺基酸序列,且其中該抗原決定基係選自由以下組成之群:VLDFAPPGA(SEQ ID NO:259)、RMFPNAPYL(SEQ ID NO:260)及YMFPNAPYL(SEQ ID NO:264)。
態樣24.如態樣1-23中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該多聚體多肽包含第一異二聚體及第二異二聚體,且其中該第一異二聚體與該第二異二聚體藉由介於該第一異二聚體與該第二異二聚體之Ig Fc多肽之間的一或多個二硫鍵來共價結合。
態樣25.一種核酸,其包含編碼如態樣1-24中任一項之第一多肽或第二多肽的核苷酸序列。
態樣26.一種表現載體,其包含如態樣25之核酸。
態樣27.一種選擇性調節對於韋爾姆斯氏瘤-1(WT-1)抗原決定基具有特異性之T細胞之活性的方法,該方法包括使該T細胞與根據態樣1-24中任一項之T細胞調節多聚體多肽接觸,其中該接觸選擇性調節該WT-1抗原決定基特異性T細胞之活性。
態樣28.一種治療患有癌症之患者的方法,該方法包括向該患者投與有效量的包含根據態樣1-24中任一項之T細胞調節多聚體多肽之醫藥組成物。
態樣29.如態樣28之方法,其中該癌症為急性骨髓性白血病、骨髓瘤、卵巢癌、胰臟癌、非小細胞肺癌、結腸直腸癌、乳癌、韋爾姆斯氏瘤、間皮瘤、軟組織肉瘤、神經胚細胞瘤或腎胚細胞瘤。
態樣30.如態樣28或態樣29之方法,其進一步包括向該個體投與一或多種檢查點抑制劑。
態樣31.如態樣30之方法,其中該檢查點抑制劑為結合至選自由以下組成之群之多肽的抗體:CD27、CD28、CD40、CD122、CD96、CD73、CD47、OX40、GITR、CSF1R、JAK、PI3K δ、PI3K γ、TAM、精胺酸酶、CD137、ICOS、A2AR、B7-H3、B7-H4、BTLA、CTLA-4、LAG3、TIM3、VISTA、CD96、TIGIT、CD122、PD-1、PD-L1及PD-L2。
態樣32.如態樣31之方法,其中該檢查點抑制劑為對PD-1、PD-L1或CTLA4有特異性之抗體。
態樣33.如態樣30之方法,其中該一或多種檢查點抑制劑係選自由以下組成之群:納武單抗、派姆單抗、披地單抗、AMP-224、MPDL3280A、MDX-1105、MEDI-4736、阿維魯單抗、伊匹珠單抗、曲利木單抗、披地單抗、IMP321、MGA271、BMS-986016、利魯單抗、烏瑞魯單抗、PF-05082566、IPH2101、MEDI-6469、CP-870,893、莫木利珠單抗、瓦利魯單抗、阿維單抗、加利昔單抗、AMP-514、AUNP 12、伊多莫德、NLG-919、INCB024360、KN035、及其組合。
態樣34.一種調節個體之免疫反應的方法,該方法包括向該個體投與有效量的如態樣1-24中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該投與誘導抗原決定基特異性T細胞反應及抗原決定基非特異性T細胞反應,且其中該抗原決定基特異性T細胞反應與該抗原決定基非特異性T細胞反應之比率為至少2:1。
態樣35.一種選擇性遞送免疫調節多肽至靶標T細胞之方法,該方法包括使混合T細胞群與如態樣1-24中任一項之T細胞調節多聚 體多肽接觸,其中該混合T細胞群包含該靶標T細胞及非靶標T細胞,其中該靶標T細胞對存在於該T細胞調節多聚體多肽內之該WT-1抗原決定基具有特異性,且其中該接觸遞送存在於該T細胞調節多聚體多肽內之該一或多種免疫調節多肽至該靶標T細胞。
態樣36.一種偵測自個體獲得之混合T細胞群中結合WT-1抗原決定基之靶標T細胞之存在的方法,該方法包括:a)使該混合T細胞群與如態樣1-24中任一項之T細胞調節多聚體多肽在活體外接觸,其中該T細胞調節多聚體多肽包含該WT-1抗原決定基;及b)偵測T細胞響應於該接觸之活化及/或增殖,其中經活化及/或增殖之T細胞指示該靶標T細胞之存在。
態樣組C
上文所述之本發明主題之態樣(包括實施例)單獨或在與一或多個其他態樣或實施例組合時可為有益的。不限於以上描述,下文提供本揭示案之編號1-37的某些非限制性態樣。如熟習此項技術者在閱讀本揭示案之後將顯而易知,可使用個別編號之態樣中之各者或將其與前述或以下個別編號之態樣中之任一者組合。此旨在提供全部此等態樣組合之支持且不限於下文明確提供之態樣之組合:
態樣1.一種T細胞調節多聚體多肽,其包含:
至少一種異二聚體,該至少一種異二聚體包含:
a)第一多肽,該第一多肽包含:
i)韋爾姆斯氏瘤-1(WT-1)肽抗原決定基,其包含胺基酸序列X1 X2 X3 TWNQMNL(SEQ ID NO:460)或X2 X3 TWNQMNL(SEQ ID NO:461),其中X1 、X2 及X3 各自獨立地為任何胺基酸,限制條件為N端胺基酸不為Cys,且其中WT-1肽抗原決定基具有9至25個胺基酸之長度;及
ii)第一I類主要組織相容性複合物(MHC)多肽;
b)第二多肽,該第二多肽包含第二I類MHC多肽,及
c)至少一種活化免疫調節多肽,
其中第一多肽及/或第二多肽包含至少一種免疫調節多肽,且視情況其中第一多肽或第二多肽包含免疫球蛋白(Ig)Fc多肽。
態樣2.如態樣1之T細胞調節多聚體多肽,其中該一或多個免疫調節多肽中之至少一者為變異體免疫調節多肽,該變異體免疫調節多肽呈現出對同源共免疫調節多肽之親和力與相應野生型免疫調節多肽對該同源共免疫調節多肽之親和力相比有所減小。
態樣3.如態樣2之T細胞調節多聚體多肽,其中當藉由生物層干涉術量測時,野生型免疫調節多肽與同源共免疫調節多肽之結合親和力同變異體免疫調節多肽與該同源共免疫調節多肽之結合親和力的比率為至少1.5:1。
態樣4.如態樣2或3之T細胞調節多聚體多肽,其中該變異體免疫調節多肽結合該共免疫調節多肽之親和力選自由以下組成之群:約10-4 M至約10-7 M、約10-4 M至約10-6 M、及約10-4 M至約10-5 M。
態樣5.如態樣1-4中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中:
a1)該第一多肽以自N端至C端之次序包含:
i)該WT-1肽抗原決定基;及
ii)該第一MHC多肽;且
b1)該第二多肽以自N端至C端之次序包含:
i)該至少一種免疫調節多肽;
ii)該第二MHC多肽;及
iii)Ig Fc多肽;或
a2)該第一多肽以自N端至C端之次序包含:
i)該WT-1肽抗原決定基;及
ii)該第一MHC多肽;且
b2)該第二多肽以自N端至C端之次序包含:
i)該第二MHC多肽;
ii)該至少一種免疫調節多肽;及
iii)Ig Fc多肽;或
a3)該第一多肽以自N端至C端之次序包含:
i)該WT-1肽抗原決定基;及
ii)該第一MHC多肽;且
b3)該第二多肽以自N端至C端之次序包含:
i)該第二MHC多肽;
ii)Ig Fc多肽;及
iii)該至少一種免疫調節多肽;或
a4)該第一多肽以自N端至C端之次序包含:
i)該至少一種免疫調節多肽;
ii)該WT-1肽抗原決定基;
ii)該第一MHC多肽;且
b4)該第二多肽以自N端至C端之次序包含:
i)該第二MHC多肽;及
ii)該Ig Fc多肽;或
a5)該第一多肽以自N端至C端之次序包含:
i)該WT-1肽抗原決定基;
ii)該第一MHC多肽;且
iii)該至少一種免疫調節多肽;且
b5)該第二多肽以自N端至C端之次序包含:
i)該第二MHC多肽;及
ii)免疫球蛋白(Ig)Fc多肽。
態樣6.如態樣1-4中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中:
a)該第一MHC多肽為β2-微球蛋白多肽;且該第二MHC多肽為I類MHC重鏈多肽;或
b)該第一MHC多肽為I類MHC重鏈多肽;且該第二MHC多肽為β2-微球蛋白多肽。
態樣7.如態樣6之T細胞調節多聚體多肽,其中:
a)該第一多肽以自N端至C端之次序包含:
i)該WT-1肽抗原決定基;及
ii)該β2-微球蛋白多肽;且
b)該第二多肽以自N端至C端之次序包含:
i)該至少一種免疫調節多肽;
ii)該I類MHC重鏈多肽;及
iii)Ig Fc多肽。
態樣8.如態樣6之T細胞調節多聚體多肽,其中:
a)該第一多肽以自N端至C端之次序包含:
i)該WT-1肽抗原決定基;及
ii)該β2-微球蛋白多肽;且
b)該第二多肽以自N端至C端之次序包含:
i)該I類MHC重鏈多肽;及
ii)Ig Fc多肽;及
iii)至少一種免疫調節多肽。
態樣9.如態樣1-8中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該至少一種免疫調節多肽係選自由以下組成之群:細胞介素、4-1BBL多肽、ICOS-L多肽、OX-40L多肽、CD80多肽、CD86多肽、CD40多肽、CD70多肽及其組合。
態樣10.如態樣1-9中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該至少一種免疫調節多肽包含IL-2多肽。
態樣11.如態樣1-10中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該多聚體多肽包含至少兩種免疫調節多肽,且其中該等免疫調節多肽中之至少兩者為相同的,視情況其中該兩種或更多種免疫調節多肽係串聯在一起。
態樣12.如態樣1-11中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該至少一種免疫調節多肽中之一或多者為變異體IL-2多肽,其呈現出對IL-2受體之親和力與野生型IL-2多肽對該IL-2受體之親和力相比有所減小。
態樣13.如態樣12之T細胞調節多聚體多肽,其中該一或多種變異體IL-2多肽包含:i)H16A取代及F42A取代;或ii)H16T取代及F42A取代。
態樣14.如態樣1-13中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該第一多肽與該第二多肽彼此共價連接,視情況其中該共價鍵聯係經由二硫鍵。
態樣15.如態樣1-14中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該第一MHC多肽或介於該抗原決定基與該第一MHC多肽之間的連接子包含提供第一Cys殘基之胺基酸取代,其中該第二MHC多肽包含提供第二Cys殘基之胺基酸取代,且其中該二硫鍵聯係在該第一Cys殘基與該第二Cys殘基之間。
態樣16.如態樣1-15中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該多肽包含在以下各物之間的二硫鍵:i)存在於該WT-1肽抗原決定基與該第一I類MHC多肽之間的連接子中之Cys,其中該第一I類MHC多肽為β2M多肽;與ii)經由Y84C取代引入該第二I類MHC多肽中之Cys殘基,其中該第二I類MHC多肽為I類MHC重鏈多肽。
態樣17.如態樣1-15中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該多肽包含在以下各物之間的二硫鍵:i)經由R12C取代引入該第一I類MHC多肽中之Cys殘基,其中該第一I類MHC多肽為β2M多肽;與ii) 經由A236C取代引入該第二I類MHC多肽中之Cys殘基,其中第二I類MHC多肽為I類MHC重鏈多肽。
態樣18.如態樣1-15中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該多肽包含在以下各物之間的第一二硫鍵:i)存在於該WT-1肽抗原決定基與該第一I類MHC多肽之間的連接子中之Cys,其中該第一I類MHC多肽為β2M多肽;與ii)經由Y84C取代引入該第二I類MHC多肽中之Cys殘基,其中該第二I類MHC多肽為I類MHC重鏈多肽;及在以下各物之間的第二二硫鍵:i)經由R12C取代引入該β2M多肽中之Cys殘基;與ii)經由A236C取代引入該I類MHC重鏈多肽中之Cys殘基。
態樣19.如態樣16或態樣18之T細胞調節多聚體多肽,其中介於該WT-1肽抗原決定基與該第一MHC之間的該連接子為GCGGS(GGGGS)n(SEQ ID NO:319),其中n為1、2、3、4、5、6、7、8或9。
態樣20.如態樣1-19中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該WT-1肽抗原決定基之長度為9個胺基酸或10個胺基酸。
態樣21.如態樣1-20中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該Ig Fc多肽包含圖5D、圖5E、圖5F、圖4G及圖5H中描繪之胺基酸序列中之一者。
態樣22.如態樣1-21中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該WT-1肽包含胺基酸序列SMTWNQMNL(SEQ ID NO:451)、GCMTWNQMNL(SEQ ID NO:452)、SYTWNQMNL(SEQ ID NO:453)或GCYTWNQMNL(SEQ ID NO:454)。
態樣23.如態樣1-21中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該第一MHC多肽或該第二MHC多肽包含與圖7A.3中描繪之HLA-A*2402胺基酸序列之胺基酸25-299具有至少95%胺基酸序列一致性的胺基酸序列。
態樣24.如態樣1-23中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該第一MHC多肽為β2M多肽,且其中該第二MHC多肽包含與HLA-A24多肽具有至少95%胺基酸序列一致性之胺基酸序列,其中該抗原決定基選自由以下組成之群:SMTWNQMNL(SEQ ID NO:451)、GCMTWNQMNL(SEQ ID NO:452)、SYTWNQMNL(SEQ ID NO:453)及GCYTWNQMNL(SEQ ID NO:454),且其中該Ig Fc多肽包含圖5G或圖5H中描繪之胺基酸序列。
態樣25.如態樣1之T細胞調節多聚體多肽,其中:a)該第一多肽包含圖37B中描繪之胺基酸序列;且b)該第二多肽包含圖20B中描繪之胺基酸序列。
態樣26.如態樣1-25中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該多聚體多肽包含第一異二聚體及第二異二聚體,且其中該第一異二聚體與該第二異二聚體藉由介於該第一異二聚體與該第二異二聚體之Ig Fc多肽之間的一或多個二硫鍵來共價結合。
態樣27.一種核酸,其包含編碼如態樣1-26中任一項之第一多肽或第二多肽的核苷酸序列。
態樣28.一種表現載體,其包含如態樣27之核酸。
態樣29.一種選擇性調節對於韋爾姆斯氏瘤-1(WT-1)抗原決定基具有特異性之T細胞之活性的方法,該方法包括使該T細胞與根據態樣1-26中任一項之T細胞調節多聚體多肽接觸,其中該接觸選擇性調節該WT-1抗原決定基特異性T細胞之活性。
態樣30.一種治療患有癌症之患者的方法,該方法包括向該患者投與有效量的包含根據態樣1-26中任一項之T細胞調節多聚體多肽之醫藥組成物。
態樣31.如態樣30之方法,其中該癌症為急性骨髓性白血病、骨髓瘤、卵巢癌、胰臟癌、非小細胞肺癌、結腸直腸癌、乳癌、韋爾姆斯氏瘤、間皮瘤、軟組織肉瘤、神經胚細胞瘤或腎胚細胞瘤。
態樣32.如態樣30或31之方法,其進一步包括向該個體投與一或多種檢查點抑制劑。
態樣33.如態樣32之方法,其中該檢查點抑制劑為結合至選自由以下組成之群之多肽的抗體:CD27、CD28、CD40、CD122、CD96、CD73、CD47、OX40、GITR、CSF1R、JAK、PI3K δ、PI3K γ、TAM、精胺酸酶、CD137、ICOS、A2AR、B7-H3、B7-H4、BTLA、CTLA-4、LAG3、TIM3、VISTA、CD96、TIGIT、CD122、PD-1、PD-L1及PD-L2。
態樣34.如態樣33之方法,其中該檢查點抑制劑為對PD-1、PD-L1或CTLA4有特異性之抗體。
態樣35.如態樣33或34之方法,其中該一或多種檢查點抑制劑係選自由以下組成之群:納武單抗、派姆單抗、皮地利珠單抗、AMP-224、MPDL3280A、MDX-1105、MEDI-4736、阿維魯單抗、伊匹珠單抗、曲美木單抗、皮地利珠單抗、IMP321、MGA271、BMS-986016、利魯單抗、烏瑞魯單抗、PF-05082566、IPH2101、MEDI-6469、CP-870,893、莫木利珠單抗、瓦利魯單抗、阿維魯單抗、加利昔單抗、AMP-514、AUNP 12、伊多莫德、NLG-919、INCB024360、KN035及其組合。
態樣36.一種調節個體之免疫反應的方法,該方法包括向該個體投與有效量的如態樣1-26中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該投與誘導抗原決定基特異性T細胞反應及抗原決定基非特異性T細胞反應,且其中該抗原決定基特異性T細胞反應與該抗原決定基非特異性T細胞反應之比率為至少2:1。
態樣37.一種選擇性遞送免疫調節多肽至靶標T細胞之方法,該方法包括使混合T細胞群與如態樣1-26中任一項之T細胞調節多聚體多肽接觸,其中該混合T細胞群包含該靶標T細胞及非靶標T細胞,其中該靶標T細胞對存在於該T細胞調節多聚體多肽內之該WT-1抗原決定 基具有特異性,且其中該接觸遞送存在於該T細胞調節多聚體多肽內之該一或多種免疫調節多肽至該靶標T細胞。
態樣38.一種偵測自個體獲得之混合T細胞群中結合WT-1抗原決定基之靶標T細胞之存在的方法,該方法包括:
a)使該經混合之T細胞群與如態樣1-26中任一項之T細胞調節多聚體多肽在活體外 接觸,其中該T細胞調節多聚體多肽包含該WT-1抗原決定基;以及
b)偵測T細胞回應於該接觸之活化及/或增殖,其中經活化及/或增殖之T細胞指示該靶標T細胞之存在。
態樣39.一種T細胞調節多聚體多肽(TMMP),其包含:至少一種異二聚體,該至少一種異二聚體包含:a)第一多肽鏈,該第一多肽鏈以自N端至C端之次序包含:i)韋爾姆斯氏瘤-1(WT-1)肽,其中該WT-1肽具有胺基酸序列VLDFAPPGA(SEQ ID NO:259);ii)具有胺基酸序列GCGGSGGGGSGGGGS(SEQ ID NO:317)之連接子;及iii)包含SEQ ID NO:311中列出之胺基酸序列的β2-微球蛋白多肽;及b)第二多肽,該第二多肽以自N端至C端之次序包含:i)包含SEQ ID NO:188中列出之胺基酸序列的變異體IL-2多肽,其中X1 為Ala且其中X2 為Ala;ii)(GGGGS)4連接子;iii)包含SEQ ID NO:188中列出之胺基酸序列的變異體IL-2多肽,其中X1 為Ala且其中X2 為Ala;iv)包含SEQ ID NO:341中列出之胺基酸序列的主要組織相容性複合物(MHC)重鏈多肽;v)包含胺基酸序列AAAGG之連接子;及vi)免疫球蛋白(Ig)Fc多肽。
態樣40.如態樣39之TMMP,其中該Ig Fc多肽為變異體Ig Fc多肽,其相對於野生型多肽包含一或多個序列變異,其中該Ig Fc多肽經由補體依賴性細胞毒性(CDC)及/或抗體依賴性細胞毒性(ADCC)誘導細胞裂解之能力係降低或實質上消除的,視情況其中該Ig Fc多肽包含與圖5A-5G或5H中描繪之Fc區之胺基酸序列具有至少約95%、至少約98%、至少約99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列。
態樣41.如態樣40之TMMP,其中該Ig Fc多肽為包含L234A及/或L235A取代(圖5H中描繪之胺基酸序列中的L14及L15)的變異體人類IgG1 Fc多肽。
態樣42.如態樣39-41中任一項之TMMP,其中該第一多肽包含具有圖14B及SEQ ID NO:423中列出之胺基酸序列的構築體2380;且其中該第二多肽包含具有圖14J及SEQ ID NO:486中列出之胺基酸序列的構築體1715△。
態樣43.一種TMMP,其包含如態樣39-42中任一項之異二聚體的同二聚體。
態樣44.一種核酸,其包含編碼如態樣39-42中任一項之第一多肽及/或第二多肽的核苷酸序列。
態樣45.一種表現載體,其包含如態樣44之核酸。
態樣46.一種遺傳修飾之宿主細胞,其中該宿主細胞經態樣44之核酸或態樣45之表現載體遺傳修飾。
態樣47.一種製備T細胞調節多聚體多肽(TMMP)之方法,該方法包括將如態樣46之遺傳修飾之宿主細胞在培養基中在使得該宿主細胞合成該TMMP之條件下在活體外培養。
態樣48.一種選擇性調節對於韋爾姆斯氏瘤-1(WT-1)抗原決定基具有特異性之T細胞之活性的方法,該方法包括使該T細胞與根據態樣39-43中任一項之T細胞調節多聚體多肽接觸,其中該接觸選擇性調節該WT-1抗原決定基特異性T細胞之活性。
態樣49.一種治療患有與WT-1相關之癌症之患者的方法,該方法包括向該患者投與有效量的包含根據態樣39-43中任一項之T細胞調節多聚體多肽之醫藥組成物。
態樣50.如態樣49之方法,其中該癌症為急性骨髓性白血病、骨髓瘤、卵巢癌、胰臟癌、非小細胞肺癌、結腸直腸癌、乳癌、韋爾姆斯氏瘤、間皮瘤、軟組織肉瘤、神經胚細胞瘤或腎胚細胞瘤。
態樣51.如態樣49或50之方法,其進一步包括向該個體投與一或多種免疫檢查點抑制劑。
態樣52.如態樣51之方法,其中該免疫檢查點抑制劑為結合至選自由以下組成之群之多肽的抗體:CD27、CD28、CD40、CD122、CD96、CD73、CD47、OX40、GITR、CSF1R、JAK、PI3K δ、PI3K γ、TAM、精胺酸酶、CD137、ICOS、A2AR、B7-H3、B7-H4、BTLA、CTLA-4、LAG3、TIM3、VISTA、CD96、TIGIT、CD122、PD-1、PD-L1及PD-L2。
態樣53.如態樣52之方法,其中該免疫檢查點抑制劑為對PD-1、PD-L1或CTLA4有特異性之抗體。
態樣54.如態樣52或53之方法,其中該一或多種免疫檢查點抑制劑係選自由以下組成之群:納武單抗、派姆單抗、皮地利珠單抗、AMP-224、MPDL3280A、MDX-1105、MEDI-4736、阿維魯單抗、伊匹珠單抗、曲美木單抗、皮地利珠單抗、IMP321、MGA271、BMS-986016、利魯單抗、烏瑞魯單抗、PF-05082566、IPH2101、MEDI-6469、CP-870,893、莫木利珠單抗、瓦利魯單抗、阿維魯單抗、加利昔單抗、AMP-514、AUNP 12、伊多莫德、NLG-919、INCB024360、KN035及其組合。
實例
提出以下實例以便向此項技藝中普通技術人員提供關於如何製作及使用本發明之完整披露及描述,而無意於限制發明人認為其發明之範疇,亦不欲表示以下實驗為進行之所有或僅有實驗。已盡力確保所用數值(例如量、溫度等)之準確性,但應考慮一些實驗誤差及偏差。除非另外指示,否則份為重量份,分子量為重量平均分子量,溫度以攝氏度表示,且壓力為大氣壓或接近大氣壓。可使用標準縮寫,例如,bp,鹼基對;kb,千鹼基;pl,皮升;s或sec,秒;min,分鐘;h或hr,小時; aa,胺基酸;kb,千鹼基;bp,鹼基對;nt,核苷酸;i.m.,肌肉內;i.p.,腹膜內;s.c.,皮下;及其類似縮寫。
實例1
測試經由兩個二硫鍵連接TMMP異二聚體之兩個多肽鏈對穩定性及產生之影響。
生成以下TMMP:a)包含1715+2380多肽之TMMP;及b)包含1715多肽及2381多肽之TMMP。多肽鏈之胺基酸序列提供於圖14A-14C中。如圖15及圖16所示,TMMP包括:i)A02:01對偶基因之I類HLA-A重鏈多肽;及ii)IL2(H16A;F42A)免疫調節(「MOD」)多肽之兩個拷貝。2380多肽包含WT1肽WT1(37-45),而2381多肽包含WT1肽WT1(126-134)。1715-2380 TMMP為包含1715多肽及2380多肽之異二聚體的同二聚體。同樣,1715-2381 TMMP為包含1715多肽及2381多肽之異二聚體的同二聚體。因此,TMMP包括:i)1715+2380異二聚體之2個拷貝,由存在於1715多肽中之IgFc多肽之間的2個二硫鍵連接;或ii)1715+2381異二聚體之2個拷貝,由存在於1715多肽中之IgFc多肽之間的2個二硫鍵連接。此排列示意性描繪於圖17C中。
TMMP 1715+2380為經雙二硫鍵連接之異二聚體:a)第一二硫鍵聯係在以下各物之間:i)存在於WT1肽與2380多肽之β2M鏈之間的連接子中之Cys;與ii)藉由Y84C取代引入存在於1715多肽中之I類重鏈中的Cys;且b)第二二硫鍵聯係在以下各物之間:i)藉由R12C取代引入存在於2380多肽中之β2M多肽中的Cys;與ii)藉由A236C取代引入存在於1715多肽中之I類重鏈中的Cys。
TMMP 1715+2381為經雙二硫鍵連接之異二聚體:a)第一二硫鍵聯係在以下各物之間:i)存在於WT1肽與2381多肽之β2M鏈之間的連接子中之Cys;與ii)藉由Y84C取代引入存在於1715多肽中之I類重鏈中的Cys;且b)第二二硫鍵聯係在以下各物之間:i)藉由R12C取代引 入存在於2381多肽中之β2M多肽中的Cys;與ii)藉由A236C取代引入存在於1715多肽中之I類重鏈中的Cys。
在ExpiCHO細胞(其係改自中國倉鼠卵巢(Chinese Hamster Ovary,CHO)細胞;ThermoFisher;參見例如Jain等人(2017)Protein Expr.Purif. 134:38)中產生TMMP且將其自該等細胞生長之細胞培養基中純化。進行兩個純化步驟。在第一步驟中,使細胞培養基變澄清,且使澄清之細胞培養基經歷蛋白A管柱純化。在第二純化步驟中,使來自蛋白A管柱之溶離物經歷尺寸排阻層析。
對經純化之TMMP之穩定性進行測試。在將經純化之TMMP保存於液體溶液(含有365mM NaCl之磷酸鹽緩衝鹽水(PBS),pH 7.4)中在37℃下達28日或在42℃下達28日之後,判定所存在的異二聚體TMMP之量。
另外,使經純化之TMMP經歷3次冷凍/解凍循環。
結果描繪於圖15及圖16中。
如圖15所示,1715-2380異二聚體(在圖15中亦稱為「單體」)之同二聚體佔來自蛋白A管柱之溶離物的80%。如圖16所示,1715-2381異二聚體(在圖16中亦稱為「單體」)之同二聚體佔來自蛋白A管柱之溶離物的79%。
發現異二聚體1715-2380及1715-2381之同二聚體對於3次冷凍/解凍循環係穩定的。
各種TMMP之肽/HLA、IL-2及Fc結構域的解折疊溫度錶示為Tm (℃),其提供於圖15及圖16中。另外,發生聚集之溫度(Tm ℃)提供於圖15及圖16中。
進行穩定性檢定(在4℃、37℃及42℃下之10日活體外穩定性),比較雙二硫鍵鍵結之TMMP的穩定性與單二硫鍵鍵結之TMMP的穩定性。資料展示於下表2-4中。
下表2展示在含有WT-1肽VLDFAPPGA(SEQ ID NO:259)之TMMP下獲得的結果:
Figure 110116854-A0202-12-0208-246
NA=數據不可用
表2之中間數據行提供包含WT-1肽VLDFAPPGA(SEQ ID NO:259)之雙二硫鍵鍵結之TMMP的活體外穩定性數據,與僅具有這兩個二硫鍵之一的單二硫鍵TMMP相比(左側數據行及右側數據行)。
僅在β2M多肽(「R12C」)中的位置12處之Cys與I類MHC重鏈(「A236C」)之胺基酸236處的Cys之間具有二硫鍵的單二硫鍵 TMMP係如此之不穩定,以致於不能以足夠的量純化以進行穩定性檢定。此等數據提供於表2之左側數據行中。
可產生僅在以下之間具有二硫鍵之單二硫鍵TMMP:i)介於WT-1抗原決定基與β2M多肽(「G2C」)之間的連接子;與ii)I類MHC重鏈(「Y84C」)之胺基酸84處的Cys;然而,它在活體外的穩定性不如雙二硫鍵鍵結之TMMP。例如,雙二硫鍵TMMP之冷凍/解凍值(表示在指定次數之冷凍/解凍循環後剩餘的單體%及由此TMMP之穩定性)在連續的冷凍/解凍循環中保持穩定和不變,但此單二硫鍵TMMP之冷凍/解凍值在連續的冷凍/解凍循環中下降,表明不穩定。此外,第三次冷凍/解凍循環之冷凍/解凍值顯著低於雙二硫鍵鍵結之TMMP。此等數據提供於表2之右側數據行中。
在用含有WT-1肽RMFPNAPYL(SEQ ID NO:260)之TMMP製得的TMMP下獲得類似結果:結果提供於下表3中。
Figure 110116854-A0202-12-0209-247
Figure 110116854-A0202-12-0210-248
表3之中間數據行提供包含WT-1肽RMFPNAPYL(SEQ ID NO:260)之雙二硫鍵鍵結之TMMP的活體外穩定性數據,與僅具有這兩個二硫鍵之一的單二硫鍵TMMP相比(左側數據行及右側數據行)。數據表明,雙二硫鍵鍵結之TMMP在活體外比任何一種單二硫鍵TMMP皆更穩定。
左側數據行之數據係針對僅在β2M多肽(「R12C」)中的位置12處之Cys與I類MHC重鏈(「A236C」)之胺基酸236處的Cys之間具有二硫鍵的單二硫鍵TMMP。與雙二硫鍵鍵結之TMMP相比,此單二硫鍵TMMP在37℃下呈現出不穩定性。
右側數據行之數據係針對僅在以下之間具有二硫鍵之單二硫鍵TMMP:i)介於WT-1抗原決定基與β2M多肽(「G2C」)之間的連接子;與ii)I類MHC重鏈(「Y84C」)之胺基酸84處的Cys。同樣,雙二硫鍵TMMP之冷凍/解凍值在連續的冷凍/解凍循環中保持穩定和不變,但此單二硫鍵TMMP之冷凍/解凍值在連續的冷凍/解凍循環中下降,表明不穩定。此外,第三次冷凍/解凍循環之冷凍/解凍值顯著低於雙二硫鍵鍵結之TMMP。
在用含有WT-1肽YMFPNAPYL(SEQ ID NO:264)之TMMP製得的TMMP下獲得類似結果:結果提供於下表4中。
表4
Figure 110116854-A0202-12-0211-249
表4之中間數據行提供包含WT-1肽YMFPNAPYL(SEQ ID NO:264)之雙二硫鍵鍵結之TMMP的活體外穩定性數據,與僅具有這兩個二硫鍵之一的單二硫鍵TMMP相比(左側數據行及右側數據行)。數據表明,雙二硫鍵鍵結之TMMP在活體外比任何一種單二硫鍵TMMP皆更穩定。
左側數據行之數據係針對僅在β2M多肽(「R12C」)中的位置12處之Cys與I類MHC重鏈(「A236C」)之胺基酸236處的Cys之間具有二硫鍵的單二硫鍵TMMP。與雙二硫鍵鍵結之TMMP相比,此單二硫鍵TMMP在37℃下呈現出不穩定性。
右側數據行之數據係針對僅在以下之間具有二硫鍵之單二硫鍵TMMP:i)介於WT-1抗原決定基與β2M多肽(「G2C」)之間的連 接子;與ii)I類MHC重鏈(「Y84C」)之胺基酸84處的Cys。同樣,雙二硫鍵TMMP之冷凍/解凍值在連續的冷凍/解凍循環中保持穩定和不變,但此單二硫鍵TMMP之冷凍/解凍值在連續的冷凍/解凍循環中下降,表明不穩定。此外,第三次冷凍/解凍循環之冷凍/解凍值顯著低於雙二硫鍵鍵結之TMMP。
實例2:包含WT1抗原決定基、HLA-A*02重鏈、異二聚體之2個多肽鏈之間的一個或兩個二硫鍵、及位置1處之變異體IL-2免疫調節多肽的TMMP之生物化學表徵
此項研究中所用之構築體匯總於表5中。
Figure 110116854-A0202-12-0212-250
該等構築體之多肽鏈之胺基酸序列提供於圖14A-14I中。
「G2C」指示TMMP包括以下各物之間的二硫鍵:i)在肽抗原決定基與β2M多肽之間的肽連接子中之Cys;與ii)在I類MHC重鏈之位置84處的Cys,其中I類MHC重鏈具有Y84C取代。
「R12C」指示TMMP包括以下各物之間的二硫鍵:i)在β2M多肽之位置12處之Cys,其中β2M多肽具有R12C取代;與ii)在I類MHC重鏈之位置236處的Cys,其中I類MHC重鏈具有A236C取代。
「G2C+R12C」指示TMMP包括「G2C」二硫鍵及「R12C」二硫鍵。
WT-1(37-45)為VLDFAPPGA(SEQ ID NO:259)。
WT-1(126-134)為RMFPNAPYL(SEQ ID NO:260)。
WT-1(126-134(R126Y))為YMFPNAPYL(SEQ ID NO:264)且亦稱為「126-134模擬抗原決定基」。
IL-2「位置1」示意性描繪於圖19中。
結果
測試TMMP模擬CD8+ T細胞之抗原特異性增殖的能力。TMMP包括以下各物作為抗原決定基:i)WT1 37-45;ii)WT1 126-134;或iii)WT1 126-134(R126Y)。全部TMMP包括A02對偶基因I類MHC重鏈。
將自人類供體獲得之外周血單核細胞(PBMC)在活體外 與不同濃度(0nM、10nM、100nM、300nM或1000nM)之TMMP一起溫育10日。在10日溫育期之後,判定對抗原決定基有特異性之細胞的數目。來自兩個供體(「Leukopak 7及Leukopak 12」)之PBMC的資料展示於圖21 中。
圖21中呈現之資料表明在兩個供體中,WT1特異性TMMP可在10日刺激培養期間誘導來自總PBMC之WT1特異性CD8+ T細胞的擴增。此擴增在具有低或不可偵測之WT1特異性T細胞前軀體之PBMC中達成,表明TMMP能夠在來自未促發或純真庫之供體中誘導抗原特異性反應。資料表明對3個經選擇之WT1肽(37-45、126-134及126-134 R126Y)中之任一者有特異性且在兩個經測試之二硫鍵構架(G2C及R12C/G2C)之任一者上的TMMP誘導來自總PBMC之WT1特異性CD8+ T細胞的擴增。
活體外 在重組人類IL-2存在下以所指示之WT1肽刺激來自不同人類供體(L7、L10及L12)之PBMC達10日且接著以含有相同肽且含有G2C二硫鍵或R12C及G2C二硫鍵兩者之TMMP再刺激8日。資料描繪於圖22 中。
圖22中呈現之資料表明在來自三個供體之PBMC中,含有WT1之TMMP可在10日促發培養之後的8日再刺激培養期間自總PBMC擴增WT1特異性CD8+ T細胞。此擴增自具有可偵測數目之WT1特異性T細胞前軀體之細胞發生,表明TMMP能夠在具有經促發/預先存在的WT-1特異性T細胞庫之供體中擴增抗原特異性T細胞。資料表明對3種WT1肽(37-45、126-134及126-134 R126Y)中之任一者有特異性且在兩個經測試之二硫鍵構架(G2C及R12C/G2C)之任一者上的TMMP誘導此類擴增。
測試藉由與含有WT1 37-45肽且含有G2C二硫鍵或R12C及G2C二硫鍵兩者之TMMP接觸來進行擴增之CD8+ T細胞響應於呈遞WT1-37-45肽或不相關肽(SL9)之靶細胞(T2細胞)而產生TNF-α及IFN-γ之能力。使用佛波醇12-肉豆蔻酸鹽13-乙酸鹽(PMA)及離子黴素(ionomycin)(「iono」)作為陽性對照。使用以培養基處理之CD8+ T細胞作為陰性對照。將藉由TMMP擴增之CD8+ T細胞與以WT1肽或不相關肽(來自HIV之SL9肽)裝載之『靶細胞』(T2細胞)一起溫育。將CD8+ T細胞對以WT 37-45肽脈衝處理之T2細胞的反應(如藉由IFN-γ及TNF-α之產生所指示)與對以SL9肽脈衝處理之T2細胞的反應相比較。資料展示於圖23 中。
圖23中呈現之資料證明以含有具有G2C或R12C/G2C構架之TMMP的WT1 37-45擴增之WT1 37-45-特異性CD8+ T細胞的選擇性多官能性。僅在識別呈遞WT1 37-45肽而非SL9肽之靶細胞時觀測到所量 測之反應(TNF-α及IFN-γ產生)。陽性及陰性對照孔顯示在不存在刺激時(如在僅有培養基之孔中所見)CD8+ T細胞不存在基線活性且抗原特異性細胞及非抗原特異性細胞能夠在強抗原非特異性刺激(PMA+離子黴素)後顯示功能性反應。
使用相同檢定,測試藉由含有WT1 126-134肽(「WT1 126」)且含有R12C及G2C二硫鍵之TMMP擴增之CD8 T細胞響應於呈遞WT1-126-134肽、WT1-126-134 R126Y肽或不相關肽(SL9)之靶細胞(T2細胞)而產生TNF-α及IFN-γ之能力。資料展示於圖24 中。
圖24中呈現之資料證明以R12C/G2C構架上之WT1 126-134特異性Immuno-STAT擴增之WT1 126-134特異性CD8+ T細胞的選擇性多官能性。僅在識別呈遞WT1 126-134肽或WT1 126-134 R126Y肽而非SL9肽之靶細胞時觀測到所量測的反應(TNF-α及IFN-γ產生)。陽性及陰性對照孔顯示在不存在刺激時(如在僅有培養基之孔中所見)CD8+ T細胞不存在基線活性且抗原特異性細胞及非抗原特異性細胞能夠在強抗原非特異性刺激(PMA+離子黴素)後顯示功能性反應。
測試二硫鍵對經IL-2驅動之免疫細胞活化的作用。CD69為大部分淋巴細胞及一些其他免疫細胞上之早期活化標記物。在不同類型之刺激條件(包括IL-2刺激)下,細胞上調CD69。評定在NK細胞、CD4+ T細胞及CD8+ T細胞上之CD69上調。CD69上調表明存在於TMMP中之IL-2多肽為有活性的且其功能與對照(重組人類IL-2)相比有所減弱。將來自不同人類供體之PBMC與表中列出之各種TMMP(「IST」)一起溫育。包括包含CMV抗原決定基或MART-1抗原決定基之TMMP作為對照。展示來自一人類供體(Leukopak 6)之資料。資料展示於圖25 中。圖25展示作為容易響應於IL-2而上調CD69的細胞之相關及代表性實例的NK細胞上之CD69上調。在CD8+ T細胞閘(cell gate)及CD4+ T細胞閘上觀測到類似資料。
圖25中呈現之資料表明在位置1上經工程化至在各種二硫鍵構架(R12C、G2C及R12C/G2C)上建立之HLA-A02特異性Immuno-STAT中的IL-2免疫調節多肽為功能性的(如藉由在相關免疫細胞表面上誘導CD69所觀測到的)且與野生型重組人類IL-2相比有所減弱。
為了評價存在於TMMP中之變異體IL-2免疫調節多肽之效力,進行CTLL-2增殖檢定。CTLL-2細胞依賴於IL-2進行生長;因此,CTLL-2增殖為存在於培養基中之IL-2之量及/或功效的量度(例如,其中IL-2由與TMMP接觸之T細胞產生)。Gillis等人(1978)J.Immunol. 120:2027。
資料展示於圖26 中。圖26中呈現之資料表明在位置1上經工程化至在各種二硫鍵構架(R12C、G2C及R12C/G2C)上建立之HLA-A02特異性Immuno-STAT(TMMP)中的IL-2免疫調節多肽為功能性的(如藉由CTLL-2增殖之誘導所觀測到的)且與普留淨相比有所減弱。
測試該等實驗中所用之TMMP結合至FcRn之能力。TMMP包括可結合至FcRn之Ig Fc區。結合至FcRn為活體內 半衰期延長之指示。Souders等人(2015)MAbs 7:912。「1715+2380」TMPP之資料展示於圖27 中。
測試「1715+2380」TMPP結合至其他Fc受體之能力。「1715+2380」TMPP包括具有LALA取代之Ig Fc區,其減少Ig Fc與FcRI、RIIA、IIB、IIIA-F及IIIB之結合,從而減弱經Ig Fc介導之效應物功能。資料展示於圖27 中。
材料與方法
圖21
使用分離術儀器獲得來自兩個健康供體之Leukopak。將Leukopak以等體積之室溫磷酸鹽緩衝鹽水(PBS)稀釋。藉由如下密度梯度離心自經稀釋之leukopak分離PBMC:在50mL錐形管中以13mL Ficoll-Paque使30mL經稀釋之leukopak處於下層,且在400g下在室溫下在無制 動器之擺動桶式轉子中離心30分鐘。自血漿-Ficoll界面收集單核細胞層(淋巴細胞、單核細胞及血小板),將其轉移至新的50mL錐形管中且藉由在室溫下在300g下離心10分鐘來以3倍過量PBS洗滌。在小心移除上清液後,使細胞再懸浮且藉由在室溫下在200g下離心10分鐘來以50mL PBS洗滌以移除血小板。在洗滌及血小板移除後,將所獲得之PBMC自50mL管中彙集,在PBS中再懸浮,計數,藉由在300g下離心10分鐘來沉澱,且使其以50x106個細胞/ml之最終濃度再懸浮於細胞冷凍培養基中。
由如上文所述之兩個leukopak製備人類健康供體PBMC。在實驗當日,在37℃水浴中使細胞解凍且在溫熱的ImmunoCultTM-XF Cell Expansion Media(Stemcell Technologies)中藉由在350 x g下離心6分鐘來洗滌。移除上清液,且使細胞再懸浮於ImmunoCultTM培養基中。使用Countess自動化細胞計數器(Invitrogen,CA)來評定活細胞計數。調整培養基體積以使細胞濃度為5x106個細胞/ml且在6孔板中每孔接種2mL細胞(等同於10x106個細胞)。在4ml培養基之總體積中,將PBMC以指定量之Immuno-STAT或僅以培養基刺激。將細胞在37℃、5% CO2下刺激10日,其中在第5日及第7日藉由自孔中抽吸2mL培養上清液且再添加2mL新鮮培養基來更換培養基。
在培養後,收穫細胞且藉由在350 x g下離心5分鐘來沉澱,藉由Countess自動化細胞計數器(Invitrogen,CA)判定活細胞計數,且藉由用以下各物染色來處理細胞以用於流動式細胞測量術:生存力染劑、適當的WT1肽特異性HLA-A*0201四聚體(MBL International)及針對CD69、CD3、CD14、CD19、CD127、CD56、CD4(Biolegend)、CD8、CD25(BD Biosciences)之抗體。洗滌經染色之細胞且藉由流動式細胞測量術進行分析。
使用Attune NxT流動式細胞測量儀(Invitrogen)進行資料採集。將所採集之資料輸出為fcs文檔且使用Flowjo軟體(Tree Star,OR)進行分析。
基於藉由流動式細胞測量術分析之抗原特異性T細胞之頻率、體積及事件及在培養結束時收穫之細胞的總體積及數目,計算每孔抗原特異性T細胞之數目且繪製為所示曲線圖。
圖22
將來自兩個供體之PBMC用10μg/ml指定肽及50U/ml重組人類IL-2擴增10日。在6孔板中在每孔4ml Immunocult培養基中以總計1千萬個細胞進行擴增。將細胞在37℃、5% CO2下刺激10日,其中在第5日及第7日藉由自孔中抽吸2mL培養上清液且再添加具有50U/ml重組人類IL-2之2mL新鮮培養基來更換培養基。在培養後,收穫細胞且藉由在350g下離心5分鐘來沉澱,藉由Countess自動化細胞計數器(Invitrogen,CA)判定活細胞計數。在六孔板之至少3個孔中進行每種刺激條件。使用來自一個孔之PBMC來在用以下各物染色後藉由流動式細胞測量術評估培養物中WT1特異性CD8+ T細胞之頻率/量:生存力染劑、適當的WT1肽特異性HLA-A*0201四聚體(MBL International)及針對CD69、CD3、CD14、CD19、CD127、CD56、CD4(Biolegend)、CD8、CD25(BD Biosciences)之抗體。洗滌經染色之細胞且藉由流動式細胞測量術進行分析。使用至少兩個孔,使用來自Stem Cell Technologies之CD8+ T細胞陰性選擇套組富集CD8+ T細胞。在先前用絲裂黴素C以1:2比率處理之自體PBMC存在下,將經純化之CD8+ T細胞用指定TMMP再刺激8日,其中在每孔4ml體積之Immunocult培養基中具有最終5百萬-1千萬個細胞。以先前確定對於供體與特定TMMP之組合而言最佳的濃度使用TMMP。
在培養時,收穫細胞且藉由在350g下離心5分鐘來沉澱,藉由Countess自動化細胞計數器(Invitrogen,CA)判定活細胞計數,且藉由用以下各物染色來處理以用於流動式細胞測量術:生存力染劑、適當的WT1肽特異性HLA-A*0201四聚體(MBL International)及針對CD69、CD3、CD14、CD19、CD127、CD56、CD4(Biolegend)、CD8、CD25(BD Biosciences)之抗體。洗滌經染色之細胞且藉由流動式細胞測量術進行分析。
使用Attune NxT流動式細胞測量儀(Invitrogen)進行資料採集。將所採集之資料輸出為fcs文檔且使用Flowjo軟體(Tree Star,OR)進行分析。
基於藉由流動式細胞測量術分析之抗原特異性T細胞之頻率、體積及事件及在培養結束時收穫之細胞的總體積及數目,計算每孔抗原特異性T細胞之數目且繪製為所示曲線圖。
圖23
將來自兩個供體之PBMC用10μg/ml WT1 37-45肽及50U/ml重組人類IL-2擴增10日。在6孔板中在每孔4ml Immunocult培養基中以總計1千萬個細胞進行擴增。將細胞在37℃、5% CO2下刺激10日,其中在第5日及第7日藉由自孔中抽吸2mL培養上清液且再添加具有50U/ml重組人類IL-2之2mL新鮮培養基來更換培養基。在培養後,收穫細胞且藉由在350g下離心5分鐘來沉澱,藉由Countess自動化細胞計數器(Invitrogen,CA)判定活細胞計數。在六孔板之至少3個孔中進行該刺激。使用來自一個孔之PBMC來在用以下各物染色後藉由流動式細胞測量術評估培養物中WT1 37-45肽特異性CD8+ T細胞之頻率/量:生存力染劑、適當的WT1 37-45肽特異性HLA-A*0201四聚體(MBL International)及針對CD69、CD3、CD14、CD19、CD127、CD56、CD4(Biolegend)、CD8、CD25(BD Biosciences)之抗體。洗滌經染色之細胞且藉由流動式細胞測量術進行分析。使用Attune NxT流動式細胞測量儀(Invitrogen)進行資料採集。將所採集之資料輸出為fcs文檔且使用Flowjo軟體(Tree Star,OR)進行分析。
使用至少兩個孔,使用來自Stem Cell Technologies之CD8+ T細胞陰性選擇套組富集CD8+ T細胞。在先前用絲裂黴素C以1:2比率處理之自體PBMC存在下,將經純化之CD8+ T細胞用G2C或 R12C/G2C構架上之指定WT1 37-45特異性Immuno-STAT再刺激8日,其中在每孔4ml體積之Immunocult培養基中具有最終5百萬-1千萬個細胞。以先前確定對於該供體而言最佳之濃度使用G2C或R12C/G2C構架上之WT1 37-45特異性Immuno-STAT。
在培養後,收穫細胞且藉由在350g下離心5分鐘來沉澱,藉由Countess自動化細胞計數器(Invitrogen,CA)判定活細胞計數,且使用來自Stem Cell Technologies之CD8+ T細胞陰性選擇套組富集CD8+ T細胞。
將靶細胞T2細胞(ATCC)在37℃、5% CO2 下用5μg/mL WT1 37-45肽或人類免疫缺陷病毒-1(HIV-1)Gag77-85 SL9肽脈衝處理2小時。在肽裝載後,將T2細胞洗滌兩次且再懸浮於ImmunoCultTM-XF Cell Expansion Media(Stemcell Technologies)中。
將經富集之CD8+ T細胞及經肽裝載之T2細胞以1:1比率(各自1x106 個細胞)混合於96孔板中,每孔200μL之總體積。將培養基及佛波醇12-肉豆蔻酸鹽13-乙酸鹽(PMA)/離子黴素分別作為陰性對照及陽性對照添加至對照孔中。在刺激後0.5至1小時,將針對CD107a之染色抗體直接添加至孔中。將細胞刺激5小時,用PBS洗滌且在冰上使用FVS780針對生存力進行染色10分鐘。將細胞洗滌,在室溫下用WT1 37-45肽特異性四聚體(以APC及PE標記)染色15分鐘。隨後,將細胞洗滌,且在冰上用針對CD3及CD8之抗體染色30分鐘。將經染色之細胞洗滌兩次且在4℃下再懸浮於細胞內(IC)固定緩衝液中隔夜。次日,將細胞洗滌且再懸浮於滲透緩衝液中且在室溫下溫育5分鐘。將經滲透之細胞洗滌且用針對干擾素-γ(IFN-γ)、腫瘤壞死因子-α(TNF-α)之抗體染色,在室溫下再懸浮於滲透緩衝液中達30分鐘。將經染色之細胞洗滌,再懸浮於2mL FACS緩衝液中,且將其轉移至96孔深板中。使用Attune NxT流動式細胞測量儀(Thermofisher Scientific,MA)進行資料採集。將所採集之資料輸出為fcs文檔且使用Flowjo軟體(Tree Star,OR)進行分析。
圖24
將來自兩個供體之PBMC用10μg/ml WT1 126-134肽及50U/ml重組人類IL-2擴增10日。在6孔板中在每孔4ml Immunocult培養基中以總計1千萬個細胞進行擴增。將細胞在37℃、5% CO2下刺激10日,其中在第5日及第7日藉由自孔中抽吸2mL培養上清液且再添加具有50U/ml重組人類IL-2之2mL新鮮培養基來更換培養基。在培養後,收穫細胞且藉由在350g下離心5分鐘來沉澱,藉由Countess自動化細胞計數器(Invitrogen,CA)判定活細胞計數。在六孔板之至少3個孔中進行該刺激。使用來自一個孔之PBMC來在用以下各物染色後藉由流動式細胞測量術評估培養物中WT1 126-134肽特異性CD8+ T細胞之頻率/量:生存力染劑、適當的WT1 126-134肽特異性HLA-A*0201四聚體(MBL International)及針對CD69、CD3、CD14、CD19、CD127、CD56、CD4(Biolegend)、CD8、CD25(BD Biosciences)之抗體。洗滌經染色之細胞且藉由流動式細胞測量術進行分析。使用Attune NxT流動式細胞測量儀(Invitrogen)進行資料採集。將所採集之資料輸出為fcs文檔且使用Flowjo軟體(Tree Star,OR)進行分析。
使用至少兩個孔,使用來自Stem Cell Technologies之CD8+ T細胞陰性選擇套組富集CD8+ T細胞。在先前用絲裂黴素C以1:2比率處理之自體PBMC存在下,將經純化之CD8+ T細胞用R12C/G2C構架上之WT1 126-134特異性Immuno-STAT再刺激8日,其中在每孔4ml體積之Immunocult培養基中有最終5百萬-1千萬個細胞。以先前確定對於該供體而言最佳之濃度使用R12C/G2C構架上之WT1 126-134特異性Immuno-STAT。
在培養後,收穫細胞且藉由在350g下離心5分鐘來沉澱,藉由Countess自動化細胞計數器(Invitrogen,CA)判定活細胞計數,且使用來自Stem Cell Technologies之CD8+ T細胞陰性選擇套組富集CD8+ T細胞。
將靶細胞T2細胞(ATCC)在37℃、5% CO2 下用5μg/mL WT1 126-134肽、WT1 126-134 R126Y肽或人類免疫缺陷病毒-1(HIV-1)Gag77-85 SL9肽脈衝處理2小時。在肽裝載後,將T2細胞洗滌兩次且再懸浮於ImmunoCultTM-XF Cell Expansion Media(Stemcell Technologies)中。
將經富集之CD8+ T細胞及經肽裝載之T2細胞以1:1比率(各自1x106 個細胞)混合於96孔板中,每孔200μL之總體積。將培養基及佛波醇12-肉豆蔻酸鹽13-乙酸鹽(PMA)/離子黴素分別作為陰性對照及陽性對照添加至對照孔中。在刺激後0.5至1小時,將針對CD107a之染色抗體直接添加至孔中。將細胞刺激5小時,用PBS洗滌且在冰上使用FVS780針對生存力進行染色10分鐘。將細胞洗滌,在室溫下用WT1 126-134肽特異性四聚體(以APC及PE標記)染色15分鐘。隨後,將細胞洗滌,且在冰上用針對CD3及CD8之抗體染色30分鐘。將經染色之細胞洗滌兩次且在4℃下再懸浮於細胞內(IC)固定緩衝液中隔夜。次日,將細胞洗滌且再懸浮於滲透緩衝液中且在室溫下溫育5分鐘。將經滲透之細胞洗滌且用針對干擾素-γ(IFN-γ)、腫瘤壞死因子-α(TNF-α)之抗體染色,在室溫下再懸浮於滲透緩衝液中達30分鐘。將經染色之細胞洗滌,再懸浮於2mL FACS緩衝液中,且將其轉移至96孔深板中。使用Attune NxT流動式細胞測量儀(Thermofisher Scientific,MA)進行資料採集。將所採集之資料輸出為fcs文檔且使用Flowjo軟體(Tree Star,OR)進行分析。
圖25
由自Hemacare(Northridge,CA)獲得之leukopak製備人類健康供體PBMC且在-150℃下保持低溫保存,直至實驗當日。
在實驗當日在水浴中解凍細胞1分鐘,將其用10mL溫熱的ImmunoCultTM-XF Cell Expansion Media(Stemcell Technologies,Vancouver,Canada)洗滌,藉由離心(350g,5分鐘)沉澱,且使其再懸浮於10mL培養基中。使用Countess自動化細胞計數器(Invitrogen,CA)計數細 胞,調整培養基體積以使細胞濃度達3.8x106個細胞/mL且將237.5uL細胞懸浮液添加至圓底96孔板中。
於Immunocult培養基中製備指定Immuno-STAT及rh-IL-2之20X稀釋液系列。為了刺激PBMC,將12.5μL 20X稀釋液系列添加至含有細胞之孔中且混合以獲得最終檢定藥物濃度。將PBMC在37℃、5% CO2 下溫育20至24小時。
在刺激後,藉由在350g下離心5分鐘來使細胞沉澱。收集上清液,將其冷凍並保存在-20℃下,直至進一步分析。將經沉澱之PBMC用PBS洗滌兩次且在4℃下在50μL可固定之活細胞/死細胞FVS780染劑中染色10分鐘。用200μL染色緩衝液淬滅染色且藉由離心(350 x g,5分鐘)來使細胞沉澱。將細胞在4℃下用50μL體積中針對CD3、CD4、CD8、CD14、CD19、CD56及CD69之抗體染色30分鐘。在染色後,將細胞用染色緩衝液洗滌,藉由離心(350 x g,5分鐘)沉澱,使其再懸浮於130μL染色緩衝液中且藉由流動式細胞測量術,使用Attune®流動式細胞測量儀進行分析。將所採集之資料輸出為fcs文檔且使用Flowjo軟體(Tree Star,OR)進行分析。
對在IL-2刺激後上調CD69敏感的不同細胞子集評定CD69上調。基於染色中所用之表面標記物的表現水準,形成閘門以鑑別NK細胞、CD8+ T細胞、CD4+ T細胞。
圖26
在檢定前一日,將CTLL-2細胞用培養基洗滌且以1x105 個細胞/ml在75-T燒瓶中在37C、5% CO2下培養24小時以用於IL-2饑餓。在24小時饑餓培養後,將細胞以5000個細胞/孔接種在100微升/孔的具有蓋之96孔細胞培養簇平底板(Costar corning,目錄號3599)中。在刺激前使用Vi細胞生存力分析儀(Beckman-Coulter)檢查細胞生存力及計數。
於補充有10% HI FBS之完全RPMI中製備經指定之Immuno-STAT(TMMP)或普留淨(Prometheus Therapeutics)之稀釋液系列(10 點;3倍稀釋步驟)作為最終檢定濃度之2X儲備液。將100μL此2X稀釋液系列添加至先前接種在96孔板中之細胞中且經混合以獲得最終檢定藥物濃度。重複三次測試各濃度。在37C、5% CO2下將細胞溫育三日。
在培養三日後,將來自各孔之100μL細胞轉移至平底白色經組織培養物處理之96孔板中。根據由製造商提供之說明書,使用CellTiter-Glo Luminescent細胞生存力檢定套組(Promega目錄號G7571)來製備100μL CellTiter-Glo®試劑,且將其添加至細胞中。藉由將板置於回轉式振盪器上2分鐘來混合細胞與CellTiter-Glo®試劑以誘導細胞裂解。接著在室溫下將板溫育10分鐘以使發光信號穩定。量測發光且在Biotek synergy neo2多模式讀取器軟體Gen5 3.04上記錄。
圖27
在Octet HTX系統(ForteBio)上進行所有實驗。在檢定緩衝液中使Anti-penta-his(HIS1K)動力學級別生物感測器(ForteBio,#18-5122)水合且在pH 1.7甘胺酸中預調節。對除了FcRn以外的全部檢定使用檢定緩衝液。用於FcRn之緩衝液為PBS、0.1%牛血清白蛋白(BSA)、0.02% Tween-20 pH 7.2。用於FcRn試劑之檢定緩衝液為PBS、0.1% BSA、0.02% Tween-20 pH 6。
將各經His標記之受體以5μg/mL(FcRI例外:10ug/mL)之濃度固定於HIS1K生物感測器上120秒。接著將經抗原裝載之HIS1K生物感測器浸入各個別抗體以300nM開始之7點1:3稀釋液系列中。使用僅含有檢定緩衝液之孔來測試緩衝液與經裝載之生物感測器之間的非特異性結合。觀測締合達60秒,隨後觀測解離60秒。在HIS1K裝載後,使用解離緩衝液建立短基線(60秒)。
實例3:包含WT1抗原決定基、HLA-A*24重鏈、異二聚體之2個多肽鏈之間的一個或兩個二硫鍵、及位置1、3或5處之變異體IL-2免疫調節多肽的TMMP之生物化學表徵
此項研究中所用之構築體匯總於表6中。
Figure 110116854-A0202-12-0225-251
該等構築體之多肽鏈之胺基酸序列提供於圖10A-10R中。
「G2C」指示TMMP包括以下各物之間的二硫鍵:i)在肽抗原決定基與β2M多肽之間的肽連接子中之Cys;與ii)在I類MHC重鏈之位置84處的Cys,其中I類MHC重鏈具有Y84C取代。
「R12C」指示TMMP包括以下各物之間的二硫鍵:i)在β2M多肽之位置12處之Cys,其中β2M多肽具有R12C取代;與ii)在I類MHC重鏈之位置236處的Cys,其中I類MHC重鏈具有A236C取代。
「G2C+R12C」指示TMMP包括「G2C」二硫鍵及「R12C」二硫鍵。
WT1(235-243(M236Y))為CYTWNQMNL(SEQ ID NO:262)且亦稱為「126235模擬抗原決定基」。
WT1(239-247(Q240Y))為NYMNLGATL(SEQ ID NO:263)。
IL-2「位置1」、位置3」及「位置5」示意性描繪於圖19中。
材料與方法
TMMP對抗原特異性(AgS)CD8+ T細胞之數目的影響
使用分離術儀器獲得來自健康供體之Leukopak。將Leukopak以等體積之室溫磷酸鹽緩衝鹽水(PBS)稀釋。藉由如下密度梯度離心自經稀釋之leukopak分離PBMC:在50mL錐形管中以13mL Ficoll-Paque使30mL經稀釋之leukopak處於下層,且在400g下在室溫下在無制動器之擺動桶式轉子中離心30分鐘。自血漿-Ficoll界面收集單核細胞層(淋巴細胞、單核細胞及血小板),將其轉移至新的50mL錐形管中且藉由在室溫下在300g下離心10分鐘來以3倍過量PBS洗滌。在小心移除上清液後,使細胞再懸浮且藉由在室溫下在200g下離心10分鐘來以50mL PBS洗滌以移除血小板。在洗滌及血小板移除後,將所獲得之PBMC自50mL管中彙集,在PBS中再懸浮,計數,藉由在300g下離心10分鐘來沉澱,且使其以50x106個細胞/ml之最終濃度再懸浮於細胞冷凍培養基中。
在實驗當日,在37℃水浴中使細胞解凍且在溫熱的ImmunoCultTM-XF Cell Expansion Media(Stemcell Technologies)中藉由在350 x g下離心6分鐘來洗滌。移除上清液,且使細胞再懸浮於ImmunoCultTM培養基中。使用Countess自動化細胞計數器(Invitrogen,CA)來評定活細胞計數。調整培養基體積以使細胞濃度為5x106個細胞/ml且在6孔板中每孔接種2mL細胞(等同於10x106個細胞)。在4ml培養基之總體積中,將PBMC以指定量之Immuno-STAT或僅以培養基刺激。將細胞在37℃、5% CO2下刺激10日,其中在第5日及第7日藉由自孔中抽吸2mL培養上清液且再添加2mL新鮮培養基來更換培養基。
在培養後,收穫細胞且藉由在350 x g下離心5分鐘來沉澱,藉由Countess自動化細胞計數器(Invitrogen,CA)判定活細胞計數,且藉由用以下各物染色來處理細胞以用於流動式細胞測量術:生存力染劑、適當的WT1肽特異性HLA-A*2402四聚體(MBL International)及針對CD69、CD3、CD14、CD19、CD127、CD56、CD4(Biolegend)、CD8、CD25(BD Biosciences)之抗體。洗滌經染色之細胞且藉由流動式細胞測量術進行分析。
使用Attune NxT流動式細胞測量儀(Invitrogen)進行資料採集。將所採集之資料輸出為fcs文檔且使用Flowjo軟體(Tree Star,OR)進行分析。
基於藉由流動式細胞測量術分析之抗原特異性T細胞之頻率、體積及事件及在培養結束時收穫之細胞的總體積及數目,計算每孔抗原特異性T細胞之數目且繪製為所示曲線圖。
將自人類供體(指定為「Leukopak 7」、「Leukopak 18」及「Leukopak 6」)獲得之外周血單核細胞(PBMC)在活體外 與不同濃度(0nM、10nM、100nM、300nM或1000nM)之TMMP一起溫育10日。在10日溫育期之後,判定對抗原決定基有特異性之細胞的數目。
二硫鍵對經IL-2驅動之免疫細胞活化之作用
測試二硫鍵對經IL-2驅動之免疫細胞活化的作用。CD69為大部分淋巴細胞及一些其他免疫細胞上之早期活化標記物。在不同類型之刺激條件(包括IL-2刺激)下,細胞上調CD69。評定在NK細胞、CD4+ T細胞及CD8+ T細胞上之CD69上調。CD69上調表明存在於TMMP中之IL-2多肽為有活性的且其功能與對照(重組人類IL-2)相比有所減弱。將來自不同人類供體之PBMC與圖13及圖14之表中列出之各種TMMP(「IST」)一起溫育。包括包含CMV抗原決定基或MART-1抗原決定基之TMMP作為對照。
變異體IL-2對CTLL-2增殖之作用
為了評價存在於TMMP中之變異體IL-2免疫調節多肽之效力,進行CTLL-2增殖檢定。CTLL-2細胞依賴於IL-2進行生長;因此,CTLL-2增殖為存在於培養基中之IL-2之量及/或功效的量度(例如,其中IL-2由與TMMP接觸之T細胞產生)。Gillis等人(1978)J.Immunol. 120:2027。
在檢定前一日,將CTLL-2細胞用培養基洗滌且以1x105個細胞/ml在75-T燒瓶中在37C、5% CO2下培養24小時以用於IL-2饑餓。在24小時饑餓培養後,將細胞以5000個細胞/孔接種在100微升/孔的具有蓋之96孔細胞培養簇平底板(Costar corning,目錄號3599)中。在刺激前使用Vi細胞生存力分析儀(Beckman-Coulter)檢查細胞生存力及計數。
於補充有10% HI FBS之完全RPMI中製備經指定之Immuno-STAT(TMMP)或普留淨(Prometheus Therapeutics)之稀釋液系列(10點;3倍稀釋步驟)作為最終檢定濃度之2X儲備液。將100μL此2X稀釋液系列添加至先前接種在96孔板中之細胞中且經混合以獲得最終檢定藥物濃度。重複三次測試各濃度。在37C、5% CO2下將細胞溫育三日。
在培養三日後,將來自各孔之100μL細胞轉移至平底白色經組織培養物處理之96孔板中。根據由製造商提供之說明書,使用CellTiter-Glo Luminescent細胞生存力檢定套組(Promega目錄號G7571)來製 備100μL CellTiter-Glo®試劑,且將其添加至細胞中。藉由將板置於回轉式振盪器上2分鐘來混合細胞與CellTiter-Glo®試劑以誘導細胞裂解。接著在室溫下將板溫育10分鐘以使發光信號穩定。量測發光且在Biotek synergy neo2多模式讀取器軟體Gen5 3.04上記錄。
與Fc受體之結合
在Octet HTX系統(ForteBio)上進行所有實驗。在檢定緩衝液中使Anti-penta-his(HIS1K)動力學級別生物感測器(ForteBio,#18-5122)水合且在pH 1.7甘胺酸中預調節。對除了FcRn以外的全部檢定使用檢定緩衝液。用於FcRn之緩衝液為PBS、0.1%牛血清白蛋白(BSA)、0.02% Tween-20 pH 7.2。用於FcRn試劑之檢定緩衝液為PBS、0.1% BSA、0.02% Tween-20 pH 6。
將各經His標記之受體以5μg/mL(FcRI例外:10ug/mL)之濃度固定於HIS1K生物感測器上120秒。接著將經抗原裝載之HIS1K生物感測器浸入各個別抗體以300nM開始之7點1:3稀釋液系列中。使用僅含有檢定緩衝液之孔來測試緩衝液與經裝載之生物感測器之間的非特異性結合。觀測締合達60秒,隨後觀測解離60秒。在HIS1K裝載後,使用解離緩衝液建立短基線(60秒)。
結果
結果展示於圖28-34 中。
圖28及圖29中提供之數據表明,包含WT1 235-243 R236Y、在不同位置具有免疫調節多肽(IL-2)並具有單個二硫鍵或兩個二硫鍵的TMMP可在10日之刺激培養過程中擴增來自總PBMC之WT1特異性CD8+ T細胞。此擴增在具有低或不可偵測之WT1特異性T細胞前軀體之PBMC中達成,表明此等TMMP能夠在來自未促發或純真庫之供體中誘導抗原特異性反應。
圖30中呈現之資料表明,在位置1或3上經工程化至在各種二硫鍵構架(G2C及R12C/G2C)上建立之WT1 235-243 M236Y特異性 HLA-A24 TMMP中的IL-2多肽為功能性的(如藉由在相關免疫細胞表面上誘導CD69所觀測到的),與CMV及MART-1特異性HLA-A02 TMMP之活性相當,而與野生型重組人類IL-2相比有所減弱。
圖31中呈現之資料表明,在位置1、3或5上經工程化至在各種二硫鍵構架(R12C、G2C及R12C/G2C)上建立之WT1 239-247 Q240Y特異性HLA-A24 TMMP中的IL-2多肽為功能性的(如藉由在相關免疫細胞表面上誘導CD69所觀測到的),與CMV及MART-1特異性HLA-A02 Immuno-STAT之活性相當,而與野生型重組人類IL-2相比有所減弱。
圖32中呈現之資料表明,在位置1或3上經工程化至在各種二硫鍵構架(G2C及R12C/G2C)上建立之WT1 235-243 M236Y特異性HLA-A24 TMMP中的IL-2多肽為功能性的(如藉由CTLL-2增殖之誘導所觀測到的)且與普留淨相比有所減弱且與野生型重組人類IL-2相比有所減弱。
圖33中呈現之資料表明,在位置1、3或5上經工程化至在各種二硫鍵構架(R12C、G2C及R12C/G2C)上建立之WT1 239-247 Q240Y特異性HLA-A24 TMMP中的IL-2多肽為功能性的(如藉由CTLL-2增殖之誘導所觀測到的)且與野生型重組人類IL-2相比有所減弱。
圖34中呈現之資料表明「3425+3529」TMPP能夠結合至FcRn。「3425+3529」TMPP包括具有LALA取代之Ig Fc區。如圖34所示,「3425+3529」TMPP展示Ig Fc與FcRI、RIIA、IIB、IIIA-F及IIIB之結合減少。
實例4
對包含1715(無C端Lys,亦即具有SEQ ID NO:486中列出之序列的1715△)+2380多肽之TMMP進行測試。多肽鏈之胺基酸序列提供於圖14J (無C端離胺酸之1715,亦即1715△)及圖14B (2380)中。1715△+2380 TMMP包括:i)A02:01對偶基因之I類HLA-A重鏈多肽;及ii)IL2(H16A;F42A)免疫調節(「MOD」)多肽之兩個拷貝。2380多肽包含 WT1肽WT1(37-45)。1715△-2380 TMMP為包含1715△多肽及2380多肽之異二聚體的同二聚體。因此,TMMP包括:i)1715△+2380異二聚體之2個拷貝,由介於1715△多肽中存在的IgFc多肽之間的2個二硫鍵連接。
TMMP 1715△+2380為經雙二硫鍵連接之異二聚體:a)第一二硫鍵聯係在以下各物之間:i)存在於WT1肽與2380多肽之β2M鏈之間的連接子中之Cys;與ii)藉由Y84C取代引入存在於1715△多肽中之I類重鏈中的Cys;且b)第二二硫鍵聯係在以下各物之間:i)藉由R12C取代引入存在於2380多肽中之β2M多肽中的Cys;與ii)藉由A236C取代引入存在於1715△多肽中之I類重鏈中的Cys。
測試TMMP 1715△+2380對PBMC之作用。資料示於圖39-42 中。TMMP 1715△+2380在下文中亦稱為「CUE-102/A02 WT137-45 Immuno-STAT」、「CUE-102/A02 WT137-45 IST」,或簡稱為「CUE-102/A02」。
圖39 所示,CUE-102/A02 WT137-45 IST誘導來自未促發之PBMC的WT137-45 特異性CD8+ T細胞之擴增。將健康供體PBMC在ImmunocultTM 培養基中用CUE-102/A02 WT137-45 Immuno-STAT(IST)刺激10日。將在CUE-102/A02不存在下培養之細胞用作陰性對照。在用WT137-45 特異性四聚體染色之後,藉由流動式細胞測量術偵測肽特異性CD8+ T細胞。
圖40A-40B 所示,CUE-102/A02 WT137-45 IST誘導來自促發之PBMC的WT137-45 特異性CD8+ T細胞之擴增。將健康供體PBMC在重組人類IL-2存在下用WT137-45 肽促發10日。接著藉由磁力分離富集CD8+ T細胞,並在經絲裂黴素C處理之自體PBMC存在下在ImmunocultTM 培養基中用CUE-102/A02 WT137-45 IST再刺激8日。將在CUE-102/A02不存在下再刺激之細胞用作陰性對照。在用WT137-45 特異性四聚體染色之後,藉由流動式細胞測量術偵測肽特異性CD8+ T細胞。
圖41A-41B 所示,親和力降低的含IL-2之CUE-102/A02 WT137-45 IST與野生型IL-2相比減輕與全身IL-2激活相關之風險。將五份健康供體PBMC在ImmunocultTM 培養基中用Proleukin®(IL-2)或CUE-102/A02 WT137-45 IST刺激18小時。刺激後,收穫上清液,並藉由免疫檢定評估TNF-α、IL-6及IFN-γ之含量(圖41A)。對來自相同培養孔之細胞藉由流動式細胞測量術評價NK細胞、CD4+ T細胞及CD8+ T細胞之CD69上調(圖41B)。將在Proleukin®(IL-2)或CUE-102/A02 WT137-45 IST不存在下培養之細胞用作陰性對照。
圖42A-42B 所示,經CUE-102/A02 WT137-45 IST擴增之T細胞為多功能CTL,其識別並殺傷WT137-45 肽呈遞之靶細胞。將健康供體PBMC在重組人類IL-2存在下用WT137-45 肽促發10日並在經絲裂黴素C處理之自體PBMC存在下在ImmunocultTM 培養基中用WT137-45 肽或CUE-102/A02 WT137-45 IST擴增8日。使用WT137-45 特異性PE標記之四聚體,藉由基於磁珠之分離富集WT137-45 特異性CD8+ T細胞。圖42A:經CUE-102/A02 WT137-45 IST擴增之WT137-45 特異性T細胞表現效應分子IFN-γ及TNF-α;並且在與用同源WT137-45 肽而非對照不相關肽(SL9)脈衝處理之靶T2細胞相互作用4小時後,上調去顆粒標記物CD107a。圖42B:經擴增之WT137-45 特異性T細胞在不同的T效應細胞:靶細胞比率下執行的隔夜培養中殺傷經同源WT137-45 肽脈衝處理之T2細胞,而非經對照肽脈衝處理之T2細胞。藉由流動式細胞測量術比較在隔夜培養時用同源肽與對照肽脈衝處理之活T2細胞的比率來評估特異性殺傷。
實例5
測試TMMP模擬CD8+ T細胞之抗原特異性增殖的能力。TMMP包括以下各物作為抗原決定基:i)WT1 235-243(C235S;M236Y);或ii)WT1 239-247(Q240Y)。全部TMMP均包括A24對偶基因I類MHC重鏈。
測試TMMP模擬CD8+ T細胞之抗原特異性增殖的能力。TMMP包括以下各物作為抗原決定基:i)WT1 235-243(C235S;M236Y);或ii)WT1 239-247(Q240Y)。全部TMMP均包括A24對偶基因I類MHC重鏈。TMMP包括:a)「重鏈」多肽,其包含:i)包含Y84C及A236C取代的A24:02對偶基因之I類HLA-A重鏈多肽;ii)IL2(H16A;F42A)免疫調節(「MOD」)多肽之兩個拷貝;及iii)包含L234A及L235A取代之IgG1 Fc多肽;及b)「輕鏈」多肽構築體3973(圖37B)或3529(圖20M),其包含:i)WT1 235-243(C235S;M236Y)或WT1 239-247(Q240Y));及ii)包含R12C取代之β-2微球蛋白多肽。重鏈多肽與輕鏈多肽係藉由2個二硫鍵結合。「重鏈」包含圖20B中描繪之鏈3425之胺基酸序列。TMMP包含「重」及「輕」鏈異二聚體之同二聚體,藉由各自IgG1 Fc區之間形成的二硫鍵結合。
將自人類供體獲得之外周血單核細胞(PBMC)在活體外 與不同濃度(0nM、10nM、100nM、300nM或1000nM)之TMMP一起溫育10日。在10日溫育期之後,判定對抗原決定基有特異性之細胞的數目。來自健康人類供體(Leukopak 22(「L22」);Leukopak 24(「L24」);Leukopak 29(「L29」);及Leukopak 31(「L31」))之PBMC資料示於圖43 中。來自健康人類供體(Leukopak 24(「L24」);Leukopak 30(「L30」);及Leukopak 31(「L31」))之PBMC資料示於圖44 中。
圖43及圖44中呈現之資料表明,WT1特異性TMMP可在10日刺激培養過程中誘導來自總PBMC之WT1特異性T細胞的擴增。
材料與方法
使用分離術儀器獲得來自健康供體之Leukopak。將Leukopak以等體積之室溫磷酸鹽緩衝鹽水(PBS)稀釋。藉由如下密度梯度離心自經稀釋之leukopak分離PBMC:在50mL錐形管中以13mL Ficoll-Paque使30mL經稀釋之leukopak處於下層,且在400g下在室溫下在無制動器之擺動桶式轉子中離心30分鐘。自血漿-Ficoll界面收集單核細胞層(淋 巴細胞、單核細胞及血小板),將其轉移至新的50mL錐形管中且藉由在室溫下在300g下離心10分鐘來以3倍過量PBS洗滌。在小心移除上清液後,使細胞再懸浮且藉由在室溫下在200g下離心10分鐘來以50mL PBS洗滌以移除血小板。在洗滌及血小板移除後,將所獲得之PBMC自50mL管中彙集,在PBS中再懸浮,計數,藉由在300g下離心10分鐘來沉澱,且使其以50x106個細胞/ml之最終濃度再懸浮於細胞冷凍培養基中。
由如上文所述之兩個leukopak製備人類健康供體PBMC。在實驗當日,在37℃水浴中使細胞解凍且在溫熱的ImmunoCultTM-XF Cell Expansion Media(Stemcell Technologies)中藉由在350 x g下離心6分鐘來洗滌。移除上清液,且使細胞再懸浮於ImmunoCultTM培養基中。使用Vi-Cell XR自動化細胞計數器(Beckman-Coulter)來評定活細胞計數。調整培養基體積以使細胞濃度為5x106個細胞/ml且在6孔板中每孔接種2mL細胞(等同於10x106個細胞)。在4ml培養基之總體積中,將PBMC用指定量之Immuno-STAT肽(10ug/mL)及IL-2(50IU/mL)或僅用培養基刺激。將細胞在37℃、5% CO2下刺激10日,其中在第5日及第7日藉由自孔中抽吸2mL培養上清液且再添加2mL新鮮培養基來更換培養基。
在培養後,收穫細胞且藉由在350 x g下離心5分鐘來沉澱,藉由Vi-Cell XR自動化細胞計數器(Beckman-Coulter)判定活細胞計數,且藉由用以下各物染色來處理細胞以用於流動式細胞測量術:生存力染劑、適當的WT1肽特異性HLA-A*24:02四聚體(MBL International)及針對CD3、CD14、CD19、CD56、CD4(Biolegend)、CD8(BD Biosciences)之抗體。洗滌經染色之細胞且藉由流動式細胞測量術進行分析。
使用Attune NxT流動式細胞測量儀(Invitrogen)進行資料採集。將所採集之資料輸出為fcs文檔且使用Flowjo軟體(Tree Star,OR)進行分析。
抗原特異性CD8+ T細胞之絕對數量繪製於所示圖中,描繪了作為Immuno-STAT濃度之函數的抗原特異性細胞之擴增。
實例6
純真HLA-A2(AAD)基因轉殖小鼠每週一次靜脈內給予30mg/kg之TMMP,該TMMP包含由異二聚體1715-2380(「TMMP 1715-2380」)形成之同二聚體,總共三個劑量。第一劑由瞬時轉染之細胞株產生的TMMP 1715-2380組成,而後續兩劑由穩定細胞株產生的TMMP 1715-2380組成。接著在最後一次給藥後7日量測外周血單核細胞(PBMC)中WT1 37-45特異性CD8+ T細胞之頻率。在蛋白質轉運抑制劑及抗CD107a抗體存在下,用WT1 37-45肽在37℃下再刺激經分離之PBMC持續5小時,以量測去顆粒情況。接著用WT1 37-45/A02四聚體、生存力染劑及細胞表面標記物(包括CD3、CD4、CD8、CD45、CD11b、CD19及CD44)對細胞進行表面染色,繼之針對IFN-γ、TNF-α及顆粒酶B進行細胞內染色。藉由分析CD8+ T細胞群內四聚體+細胞之頻率(定義為單一、活的、CD11b-、CD19-、CD45+、CD3+、CD4-)來偵測抗原特異性細胞。發現經處理之小鼠中WT1 37-45特異性(「% AgS」)CD8+ T細胞之頻率高於未用TMMP 1715-2380處理之純真小鼠中觀察到的頻率(參見圖45)。
儘管已參考本發明之特定實施例描述本發明,但熟練技術者應瞭解,在不背離本發明之真實精神及範圍之情況下,可進行各種改變且可以等效物替換。此外,可進行許多修改以使特定情況、材料、物質組成、方法、一或多個方法步驟適合於本發明之目標、精神及範疇。所有此類修改均旨在屬本文隨附申請專利範圍之範圍內。
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<213> 恆河獼猴(Macaca mulatta)
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<213> 歐洲牛(Bos Taurus)
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<213> 小家鼠(Mus musculus)
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<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (9)..(9)
<223> Xaa為苯丙胺酸、酪胺酸、絲胺酸或蘇胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (44)..(44)
<223> Xaa為離胺酸或精胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (62)..(62)
<223> Xaa為麩醯胺、甘胺酸、麩胺酸或精胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (63)..(63)
<223> Xaa為天冬醯胺或麩胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (65)..(65)
<223> Xaa為精胺酸或甘胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (66)..(66)
<223> Xaa為天冬醯胺或離胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (67)..(67)
<223> Xaa為甲硫胺酸或纈胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (70)..(70)
<223> Xaa為組胺酸或麩醯胺
<220>
<221> 位點
<222> (73)..(73)
<223> Xaa為蘇胺酸或異白胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (74)..(74)
<223> Xaa為天冬胺酸或組胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (76)..(76)
<223> Xaa為丙胺酸、纈胺酸或麩胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (77)..(77)
<223> Xaa為天冬醯胺或天冬胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (79)..(79)
<223> Xaa為甘胺酸或精胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (80)..(80)
<223> Xaa為蘇胺酸或精胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (81)..(81)
<223> Xaa為白胺酸或丙胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (82)..(82)
<223> Xaa為精胺酸或白胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (83)..(83)
<223> Xaa為甘胺酸或精胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (90)..(90)
<223> Xaa為丙胺酸或天冬胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (95)..(95)
<223> Xaa為異白胺酸、白胺酸或纈胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (97)..(97)
<223> Xaa為異白胺酸、精胺酸或甲硫胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (99)..(99)
<223> Xaa為苯丙胺酸或酪胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (105)..(105)
<223> Xaa為絲胺酸或脯胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (107)..(107)
<223> Xaa為色胺酸或甘胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (114)..(114)
<223> Xaa為精胺酸、組胺酸或麩醯胺
<220>
<221> 位點
<222> (116)..(116)
<223> Xaa為天冬胺酸或酪胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (127)..(127)
<223> Xaa為天冬醯胺或離胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (142)..(142)
<223> Xaa為蘇胺酸或異白胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (144)..(144)
<223> Xaa為離胺酸或麩醯胺
<220>
<221> 位點
<222> (145)..(145)
<223> Xaa為精胺酸或組胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (149)..(149)
<223> Xaa為丙胺酸或蘇胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (150)..(150)
<223> Xaa為丙胺酸或纈胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (151)..(151)
<223> Xaa為組胺酸或精胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (156)..(156)
<223> Xaa為精胺酸、白胺酸、麩醯胺或色胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (158)..(158)
<223> Xaa為纈胺酸或丙胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (161)..(161)
<223> Xaa為天冬胺酸或麩胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (163)..(163)
<223> Xaa為精胺酸或蘇胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (166)..(166)
<223> Xaa為天冬胺酸或麩胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (167)..(167)
<223> Xaa為色胺酸或甘胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (184)..(184)
<223> Xaa為脯胺酸或丙胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (193)..(193)
<223> Xaa為脯胺酸或丙胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (194)..(194)
<223> Xaa為纈胺酸或異白胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (207)..(207)
<223> Xaa為絲胺酸或甘胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (246)..(246)
<223> Xaa為丙胺酸或絲胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (253)..(253)
<223> Xaa為麩醯胺或麩胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (276)..(276)
<223> Xaa為脯胺酸或白胺酸
<400> 29
Figure 110116854-A0202-12-0285-317
Figure 110116854-A0202-12-0286-318
Figure 110116854-A0202-12-0287-319
<210> 30
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (9)..(9)
<223> Xaa為組胺酸、酪胺酸或天冬胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (11)..(11)
<223> Xaa為丙胺酸或絲胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (12)..(12)
<223> Xaa為甲硫胺酸或纈胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (24)..(24)
<223> Xaa為丙胺酸、絲胺酸或蘇胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (32)..(32)
<223> Xaa為麩醯胺或白胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (41)..(41)
<223> Xaa為丙胺酸或蘇胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (45)..(45)
<223> Xaa為麩胺酸、甲硫胺酸、離胺酸或蘇胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (46)..(46)
<223> Xaa為丙胺酸或蘇胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (63)..(63)
<223> Xaa為麩胺酸或天冬醯胺
<220>
<221> 位點
<222> (66)..(66)
<223> Xaa為異白胺酸或離胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (67)..(67)
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<220>
<221> 位點
<222> (70)..(70)
<223> Xaa為天冬醯胺或麩醯胺
<220>
<221> 位點
<222> (71)..(71)
<223> Xaa為丙胺酸或蘇胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (74)..(74)
<223> Xaa為天冬胺酸或酪胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (76)..(76)
<223> Xaa為麩胺酸或纈胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (77)..(77)
<223> Xaa為絲胺酸或天冬醯胺
<220>
<221> 位點
<222> (80)..(80)
<223> Xaa為蘇胺酸、天冬醯胺或異白胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (81)..(81)
<223> Xaa為丙胺酸或白胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (82)..(82)
<223> Xaa為白胺酸或精胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (83)..(83)
<223> Xaa為精胺酸或甘胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (94)..(94)
<223> Xaa為蘇胺酸或異白胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (95)..(95)
<223> Xaa為白胺酸或異白胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (97)..(97)
<223> Xaa為精胺酸或絲胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (131)..(131)
<223> Xaa為精胺酸或絲胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (143)..(143)
<223> Xaa為絲胺酸或蘇胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (147)..(147)
<223> Xaa為白胺酸或色胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (152)..(152)
<223> Xaa為麩胺酸或纈胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (156)..(156)
<223> Xaa為精胺酸、天冬胺酸或白胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (158)..(158)
<223> Xaa丙胺酸或蘇胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (163)..(163)
<223> Xaa為白胺酸、麩胺酸或蘇胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (177)..(177)
<223> Xaa為麩胺酸或天冬胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (178)..(178)
<223> Xaa為離胺酸或蘇胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (180)..(180)
<223> Xaa為麩胺酸或麩醯胺
<220>
<221> 位點
<222> (194)..(194)
<223> Xaa為異白胺酸或纈胺酸
<400> 30
Figure 110116854-A0202-12-0291-320
Figure 110116854-A0202-12-0292-321
Figure 110116854-A0202-12-0293-322
<210> 31
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (1)..(1)
<223> Xaa為半胱胺酸或甘胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (6)..(6)
<223> Xaa為精胺酸或離胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (9)..(9)
<223> Xaa為苯丙胺酸、酪胺酸、絲胺酸或天冬胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (14)..(14)
<223> Xaa為精胺酸或色胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (21)..(21)
<223> Xaa為組胺酸或精胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (24)..(24)
<223> Xaa為丙胺酸或絲胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (35)..(35)
<223> Xaa為麩醯胺或精胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (49)..(49)
<223> Xaa為丙胺酸或精胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (66)..(66)
<223> Xaa為天冬醯胺或離胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (73)..(73)
<223> Xaa為蘇胺酸或丙胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (77)..(77)
<223> Xaa為絲胺酸或天冬醯胺
<220>
<221> 位點
<222> (80)..(80)
<223> Xaa為天冬醯胺或離胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (90)..(90)
<223> Xaa為丙胺酸或天冬胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (91)..(91)
<223> Xaa為甘胺酸或精胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (94)..(94)
<223> Xaa為蘇胺酸或異白胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (95)..(95)
<223> Xaa為白胺酸或異白胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (97)..(97)
<223> Xaa為色胺酸或精胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (99)..(99)
<223> Xaa為半胱胺酸、酪胺酸、苯丙胺酸或絲胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (103)..(103)
<223> Xaa為白胺酸或纈胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (113)..(113)
<223> Xaa為酪胺酸或組胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (114)..(114)
<223> Xaa為天冬胺酸或天冬醯胺
<220>
<221> 位點
<222> (116)..(116)
<223> Xaa為酪胺酸、苯丙胺酸、絲胺酸或白胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (147)..(147)
<223> Xaa為白胺酸或色胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (152)..(152)
<223> Xaa為麩胺酸、丙胺酸或蘇胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (156)..(156)
<223> Xaa為精胺酸、白胺酸或色胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (163)..(163)
<223> Xaa為白胺酸或蘇胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (173)..(173)
<223> Xaa為麩胺酸或離胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (177)..(177)
<223> Xaa為麩胺酸或離胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (184)..(184)
<223> Xaa為組胺酸或脯胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (194)..(194)
<223> Xaa為精胺酸或纈胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (219)..(219)
<223> Xaa為色胺酸或精胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (248)..(248)
<223> Xaa為纈胺酸或甲硫胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (253)..(253)
<223> Xaa為麩胺酸或離胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (261)..(261)
<223> Xaa為甲硫胺酸或纈胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (267)..(267)
<223> Xaa為脯胺酸或麩醯胺
<220>
<221> 位點
<222> (273)..(273)
<223> Xaa為精胺酸或絲胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (275)..(275)
<223> Xaa為脯胺酸或甘胺酸
<400> 31
Figure 110116854-A0202-12-0297-323
Figure 110116854-A0202-12-0298-324
Figure 110116854-A0202-12-0299-325
<210> 32
<211> 284
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (89)..(89)
<223> Xaa為離胺酸或麩胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (107)..(107)
<223> Xaa為精胺酸或甘胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (157)..(157)
<223> Xaa為精胺酸或甘胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (158)..(158)
<223> Xaa為丙胺酸或纈胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (255)..(255)
<223> Xaa為麩醯胺或脯胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (267)..(267)
<223> Xaa為脯胺酸或絲胺酸
<400> 32
Figure 110116854-A0202-12-0300-326
Figure 110116854-A0202-12-0301-1261
<210> 33
<211> 284
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (7)..(7)
<223> Xaa為酪胺酸或苯丙胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (50)..(50)
<223> Xaa為脯胺酸或麩醯胺
<220>
<221> 位點
<222> (251)..(251)
<223> Xaa為絲胺酸或脯胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (278)..(278)
<223> Xaa為脯胺酸或白胺酸
<400> 33
Figure 110116854-A0202-12-0302-1262
Figure 110116854-A0202-12-0303-1263
Figure 110116854-A0202-12-0304-1264
<210> 34
<211> 284
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (13)..(13)
<223> Xaa為絲胺酸或苯丙胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (27)..(27)
<223> Xaa為酪胺酸或組胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (31)..(31)
<223> Xaa為蘇胺酸、絲胺酸或甲硫胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (34)..(34)
<223> Xaa為白胺酸或纈胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (54)..(54)
<223> Xaa為麩醯胺或精胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (81)..(81)
<223> Xaa為脯胺酸或白胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (100)..(100)
<223> Xaa為甘胺酸或天冬胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (104)..(104)
<223> Xaa為甘胺酸或纈胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (105)..(105)
<223> Xaa為絲胺酸或半胱胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (110)..(110)
<223> Xaa為白胺酸或異白胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (159)..(159)
<223> Xaa為酪胺酸或組胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (169)..(169)
<223> Xaa為組胺酸或精胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (171)..(171)
<223> Xaa為酪胺酸或組胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (178)..(178)
<223> Xaa為甲硫胺酸或蘇胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (185)..(185)
<223> Xaa為脯胺酸或丙胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (219)..(219)
<223> Xaa為精胺酸、色胺酸或麩醯胺
<220>
<221> 位點
<222> (258)..(258)
<223> Xaa為蘇胺酸或甲硫胺酸
<220>
<221> 位點
<222> (275)..(275)
<223> Xaa為離胺酸或麩胺酸
<400> 34
Figure 110116854-A0202-12-0306-1265
Figure 110116854-A0202-12-0307-1266
Figure 110116854-A0202-12-0308-1267
<210> 35
<400> 35
000
<210> 36
<400> 36
000
<210> 37
<400> 37
000
<210> 38
<400> 38
000
<210> 39
<400> 39
000
<210> 40
<400> 40
000
<210> 41
<211> 275
<212> PRT
<213> 智慧人(Homo sapiens)
<400> 41
Figure 110116854-A0202-12-0309-1268
Figure 110116854-A0202-12-0310-1269
<210> 42
<211> 275
<212> PRT
<213> 智慧人(Homo sapiens)
<400> 42
Figure 110116854-A0202-12-0310-1270
Figure 110116854-A0202-12-0311-1271
Figure 110116854-A0202-12-0312-1272
<210> 43
<211> 275
<212> PRT
<213> 智慧人(Homo sapiens)
<400> 43
Figure 110116854-A0202-12-0312-1273
Figure 110116854-A0202-12-0313-1274
Figure 110116854-A0202-12-0314-1275
<210> 44
<211> 276
<212> PRT
<213> 智慧人(Homo sapiens)
<400> 44
Figure 110116854-A0202-12-0314-1276
Figure 110116854-A0202-12-0315-1277
Figure 110116854-A0202-12-0316-1278
<210> 45
<211> 274
<212> PRT
<213> 小家鼠(Mus musculus)
<400> 45
Figure 110116854-A0202-12-0316-1279
Figure 110116854-A0202-12-0317-1280
<210> 46
<211> 275
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 46
Figure 110116854-A0202-12-0318-1281
Figure 110116854-A0202-12-0319-1282
<210> 47
<211> 275
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 47
Figure 110116854-A0202-12-0320-1283
Figure 110116854-A0202-12-0321-1284
<210> 48
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 48
Figure 110116854-A0202-12-0321-1285
Figure 110116854-A0202-12-0322-1286
Figure 110116854-A0202-12-0323-1287
<210> 49
<211> 276
<212> PRT
<213> 智慧人(Homo sapiens)
<400> 49
Figure 110116854-A0202-12-0323-1288
Figure 110116854-A0202-12-0324-1289
Figure 110116854-A0202-12-0325-1290
<210> 50
<211> 276
<212> PRT
<213> 智慧人(Homo sapiens)
<400> 50
Figure 110116854-A0202-12-0325-1291
Figure 110116854-A0202-12-0326-1292
Figure 110116854-A0202-12-0327-1293
<210> 51
<211> 276
<212> PRT
<213> 智慧人(Homo sapiens)
<400> 51
Figure 110116854-A0202-12-0327-1294
Figure 110116854-A0202-12-0328-1295
<210> 52
<211> 219
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (8)..(8)
<223> 除了天冬胺酸以外的任何胺基酸
<400> 52
Figure 110116854-A0202-12-0329-1296
Figure 110116854-A0202-12-0330-1297
<210> 53
<211> 219
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (36)..(36)
<223> 除了異白胺酸以外的任何胺基酸
<400> 53
Figure 110116854-A0202-12-0330-1298
Figure 110116854-A0202-12-0331-1299
Figure 110116854-A0202-12-0332-1300
<210> 54
<211> 219
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (54)..(54)
<223> 除了麩醯胺以外的任何胺基酸
<400> 54
Figure 110116854-A0202-12-0332-1301
Figure 110116854-A0202-12-0333-1302
<210> 55
<211> 208
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (19)..(19)
<223> 除了天冬醯胺以外的任何胺基酸
<400> 55
Figure 110116854-A0202-12-0334-1303
Figure 110116854-A0202-12-0335-1304
<210> 56
<211> 208
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (63)..(63)
<223> 除了天冬醯胺以外的任何胺基酸
<400> 56
Figure 110116854-A0202-12-0335-1305
Figure 110116854-A0202-12-0336-1306
<210> 57
<211> 208
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (67)..(67)
<223> 除了異白胺酸以外的任何胺基酸
<400> 57
Figure 110116854-A0202-12-0337-1307
Figure 110116854-A0202-12-0338-1308
<210> 58
<211> 208
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (86)..(86)
<223> 除了離胺酸以外的任何胺基酸
<400> 58
Figure 110116854-A0202-12-0338-1309
Figure 110116854-A0202-12-0339-1310
<210> 59
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (4)..(4)
<223> 除了脯胺酸以外的任何胺基酸
<400> 59
Figure 110116854-A0202-12-0340-1311
<210> 60
<211> 208
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (157)..(157)
<223> 除了麩醯胺以外的任何胺基酸
<400> 60
Figure 110116854-A0202-12-0340-1312
Figure 110116854-A0202-12-0341-1313
<210> 61
<211> 208
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (158)..(158)
<223> 除了天冬胺酸以外的任何胺基酸
<400> 61
Figure 110116854-A0202-12-0342-1314
Figure 110116854-A0202-12-0343-1315
<210> 62
<211> 208
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (25)..(25)
<223> 除了白胺酸以外的任何胺基酸
<400> 62
Figure 110116854-A0202-12-0343-1316
Figure 110116854-A0202-12-0344-1317
Figure 110116854-A0202-12-0345-1318
<210> 63
<211> 208
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (31)..(31)
<223> 除了酪胺酸以外的任何胺基酸
<400> 63
Figure 110116854-A0202-12-0345-1319
Figure 110116854-A0202-12-0346-1320
<210> 64
<211> 208
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (33)..(33)
<223> 除了麩醯胺以外的任何胺基酸
<400> 64
Figure 110116854-A0202-12-0347-1321
Figure 110116854-A0202-12-0348-1322
<210> 65
<211> 208
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (38)..(38)
<223> 除了甲硫胺酸以外的任何胺基酸
<400> 65
Figure 110116854-A0202-12-0348-1323
Figure 110116854-A0202-12-0349-1324
<210> 66
<211> 208
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (39)..(39)
<223> 除了纈胺酸以外的任何胺基酸
<400> 66
Figure 110116854-A0202-12-0350-1325
Figure 110116854-A0202-12-0351-1326
<210> 67
<211> 208
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (49)..(49)
<223> 除了異白胺酸以外的任何胺基酸
<400> 67
Figure 110116854-A0202-12-0351-1327
Figure 110116854-A0202-12-0352-1328
<210> 68
<211> 208
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (53)..(53)
<223> 除了酪胺酸以外的任何胺基酸
<400> 68
Figure 110116854-A0202-12-0353-1329
Figure 110116854-A0202-12-0354-1330
<210> 69
<211> 208
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (60)..(60)
<223> 除了天冬胺酸以外的任何胺基酸
<400> 69
Figure 110116854-A0202-12-0354-1331
Figure 110116854-A0202-12-0355-1332
<210> 70
<211> 208
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (108)..(108)
<223> 除了苯丙胺酸以外的任何胺基酸
<400> 70
Figure 110116854-A0202-12-0356-1333
Figure 110116854-A0202-12-0357-1334
<210> 71
<211> 208
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (156)..(156)
<223> 除了絲胺酸以外的任何胺基酸
<400> 71
Figure 110116854-A0202-12-0357-1335
Figure 110116854-A0202-12-0358-1336
<210> 72
<211> 208
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (111)..(111)
<223> 除了脯胺酸以外的任何胺基酸
<400> 72
Figure 110116854-A0202-12-0359-1337
Figure 110116854-A0202-12-0360-1338
<210> 73
<211> 224
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (61)..(61)
<223> 除了天冬醯胺以外的任何胺基酸
<400> 73
Figure 110116854-A0202-12-0360-1339
Figure 110116854-A0202-12-0361-1340
Figure 110116854-A0202-12-0362-1341
<210> 74
<211> 224
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (66)..(66)
<223> 除了天冬胺酸以外的任何胺基酸
<400> 74
Figure 110116854-A0202-12-0362-1342
Figure 110116854-A0202-12-0363-1343
<210> 75
<211> 224
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (70)..(70)
<223> 除了色胺酸以外的任何胺基酸
<400> 75
Figure 110116854-A0202-12-0364-1344
Figure 110116854-A0202-12-0365-1345
<210> 76
<211> 224
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (91)..(91)
<223> 除了組胺酸以外的任何胺基酸
<400> 76
Figure 110116854-A0202-12-0365-1346
Figure 110116854-A0202-12-0366-1347
Figure 110116854-A0202-12-0367-1348
<210> 77
<211> 110
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (61)..(61)
<223> 除了天冬醯胺以外的任何胺基酸
<400> 77
Figure 110116854-A0202-12-0367-1349
Figure 110116854-A0202-12-0368-1350
<210> 78
<211> 110
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (66)..(66)
<223> 除了天冬胺酸以外的任何胺基酸
<400> 78
Figure 110116854-A0202-12-0368-1351
Figure 110116854-A0202-12-0369-1352
<210> 79
<211> 110
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (70)..(70)
<223> 除了色胺酸以外的任何胺基酸
<400> 79
Figure 110116854-A0202-12-0369-1353
Figure 110116854-A0202-12-0370-1354
<210> 80
<211> 110
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (91)..(91)
<223> 除了組胺酸以外的任何胺基酸
<400> 80
Figure 110116854-A0202-12-0370-1355
Figure 110116854-A0202-12-0371-1356
<210> 81
<211> 224
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (41)..(41)
<223> 除了纈胺酸以外的任何胺基酸
<400> 81
Figure 110116854-A0202-12-0371-1357
Figure 110116854-A0202-12-0372-1358
<210> 82
<211> 110
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (41)..(41)
<223> 除了纈胺酸以外的任何胺基酸
<400> 82
Figure 110116854-A0202-12-0373-1359
<210> 83
<211> 224
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (35)..(35)
<223> 除了麩醯胺以外的任何胺基酸
<400> 83
Figure 110116854-A0202-12-0374-1360
Figure 110116854-A0202-12-0375-1361
<210> 84
<211> 110
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (35)..(35)
<223> 除了麩醯胺以外的任何胺基酸
<400> 84
Figure 110116854-A0202-12-0375-1362
Figure 110116854-A0202-12-0376-1363
<210> 85
<211> 224
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (33)..(33)
<223> 除了苯丙胺酸以外的任何胺基酸
<400> 85
Figure 110116854-A0202-12-0376-1364
Figure 110116854-A0202-12-0377-1365
<210> 86
<211> 110
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (33)..(33)
<223> 除了苯丙胺酸以外的任何胺基酸
<400> 86
Figure 110116854-A0202-12-0378-1366
<210> 87
<211> 224
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (72)..(72)
<223> 除了白胺酸以外的任何胺基酸
<400> 87
Figure 110116854-A0202-12-0379-1367
Figure 110116854-A0202-12-0380-1368
<210> 88
<211> 110
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (72)..(72)
<223> 除了白胺酸以外的任何胺基酸
<400> 88
Figure 110116854-A0202-12-0381-1369
<210> 89
<211> 224
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (59)..(59)
<223> 除了酪胺酸以外的任何胺基酸
<400> 89
Figure 110116854-A0202-12-0382-1370
Figure 110116854-A0202-12-0383-1371
<210> 90
<211> 110
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (59)..(59)
<223> 除了酪胺酸以外的任何胺基酸
<400> 90
Figure 110116854-A0202-12-0383-1372
Figure 110116854-A0202-12-0384-1373
<210> 91
<211> 224
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (61)..(61)
<223> 除了天冬醯胺以外的任何胺基酸
<220>
<221> 位點
<222> (91)..(91)
<223> 除了組胺酸以外的任何胺基酸
<400> 91
Figure 110116854-A0202-12-0384-1374
Figure 110116854-A0202-12-0385-1375
<210> 92
<211> 110
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (61)..(61)
<223> 除了天冬醯胺以外的任何胺基酸
<220>
<221> 位點
<222> (91)..(91)
<223> 除了組胺酸以外的任何胺基酸
<400> 92
Figure 110116854-A0202-12-0386-1376
Figure 110116854-A0202-12-0387-1377
<210> 93
<211> 224
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (66)..(66)
<223> 除了天冬胺酸以外的任何胺基酸
<220>
<221> 位點
<222> (91)..(91)
<223> 除了組胺酸以外的任何胺基酸
<400> 93
Figure 110116854-A0202-12-0387-1378
Figure 110116854-A0202-12-0388-1379
<210> 94
<211> 110
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (66)..(66)
<223> 除了天冬醯胺以外的任何胺基酸
<220>
<221> 位點
<222> (91)..(91)
<223> Xaa可為除了His以外的任何胺基酸
<400> 94
Figure 110116854-A0202-12-0389-1380
<210> 95
<211> 224
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (61)..(61)
<223> 除了天冬醯胺以外的任何胺基酸
<220>
<221> 位點
<222> (66)..(66)
<223> 除了天冬胺酸以外的任何胺基酸
<220>
<221> 位點
<222> (91)..(91)
<223> 除了組胺酸以外的任何胺基酸
<400> 95
Figure 110116854-A0202-12-0390-1381
Figure 110116854-A0202-12-0391-1382
<210> 96
<211> 110
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (61)..(61)
<223> 除了天冬醯胺以外的任何胺基酸
<220>
<221> 位點
<222> (66)..(66)
<223> 除了天冬胺酸以外的任何胺基酸
<220>
<221> 位點
<222> (91)..(91)
<223> 除了組胺酸以外的任何胺基酸
<400> 96
Figure 110116854-A0202-12-0392-1383
Figure 110116854-A0202-12-0393-1384
<210> 97
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (47)..(47)
<223> 除了離胺酸以外的任何胺基酸
<400> 97
Figure 110116854-A0202-12-0393-1385
Figure 110116854-A0202-12-0394-1386
<210> 98
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (147)..(147)
<223> 除了麩醯胺以外的任何胺基酸
<400> 98
Figure 110116854-A0202-12-0394-1387
Figure 110116854-A0202-12-0395-1388
<210> 99
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (11)..(11)
<223> 除了甲硫胺酸以外的任何胺基酸
<400> 99
Figure 110116854-A0202-12-0396-1389
Figure 110116854-A0202-12-0397-1390
<210> 100
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (12)..(12)
<223> 除了苯丙胺酸以外的任何胺基酸
<400> 100
Figure 110116854-A0202-12-0397-1391
Figure 110116854-A0202-12-0398-1392
<210> 101
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (14)..(14)
<223> 除了麩醯胺以外的任何胺基酸
<400> 101
Figure 110116854-A0202-12-0398-1393
Figure 110116854-A0202-12-0399-1394
<210> 102
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (15)..(15)
<223> 除了白胺酸以外的任何胺基酸
<400> 102
Figure 110116854-A0202-12-0400-1395
Figure 110116854-A0202-12-0401-1396
<210> 103
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (16)..(16)
<223> 除了纈胺酸以外的任何胺基酸
<400> 103
Figure 110116854-A0202-12-0401-1397
Figure 110116854-A0202-12-0402-1398
<210> 104
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (18)..(18)
<223> 除了麩醯胺以外的任何胺基酸
<400> 104
Figure 110116854-A0202-12-0403-1399
<210> 105
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (19)..(19)
<223> 除了天冬醯胺以外的任何胺基酸
<400> 105
Figure 110116854-A0202-12-0404-1400
Figure 110116854-A0202-12-0405-1401
<210> 106
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (20)..(20)
<223> 除了纈胺酸以外的任何胺基酸
<400> 106
Figure 110116854-A0202-12-0405-1402
Figure 110116854-A0202-12-0406-1403
<210> 107
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (21)..(21)
<223> 除了白胺酸以外的任何胺基酸
<400> 107
Figure 110116854-A0202-12-0407-1404
Figure 110116854-A0202-12-0408-1405
<210> 108
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (22)..(22)
<223> 除了白胺酸以外的任何胺基酸
<400> 108
Figure 110116854-A0202-12-0408-1406
Figure 110116854-A0202-12-0409-1407
<210> 109
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (23)..(23)
<223> 除了異白胺酸以外的任何胺基酸
<400> 109
Figure 110116854-A0202-12-0409-1408
Figure 110116854-A0202-12-0410-1409
<210> 110
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (24)..(24)
<223> 除了天冬胺酸以外的任何胺基酸
<400> 110
Figure 110116854-A0202-12-0411-1410
Figure 110116854-A0202-12-0412-1411
<210> 111
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (25)..(25)
<223> 除了甘胺酸以外的任何胺基酸
<400> 111
Figure 110116854-A0202-12-0412-1412
Figure 110116854-A0202-12-0413-1413
<210> 112
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (26)..(26)
<223> 除了脯胺酸以外的任何胺基酸
<400> 112
Figure 110116854-A0202-12-0413-1414
Figure 110116854-A0202-12-0414-1415
<210> 113
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (27)..(27)
<223> 除了白胺酸以外的任何胺基酸
<400> 113
Figure 110116854-A0202-12-0415-1416
Figure 110116854-A0202-12-0416-1417
<210> 114
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (28)..(28)
<223> 除了絲胺酸以外的任何胺基酸
<400> 114
Figure 110116854-A0202-12-0416-1418
Figure 110116854-A0202-12-0417-1419
<210> 115
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (29)..(29)
<223> 除了色胺酸以外的任何胺基酸
<400> 115
Figure 110116854-A0202-12-0418-1420
<210> 116
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (30)..(30)
<223> 除了酪胺酸以外的任何胺基酸
<400> 116
Figure 110116854-A0202-12-0419-1421
Figure 110116854-A0202-12-0420-1422
<210> 117
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (31)..(31)
<223> 除了絲胺酸以外的任何胺基酸
<400> 117
Figure 110116854-A0202-12-0420-1423
Figure 110116854-A0202-12-0421-1424
<210> 118
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (32)..(32)
<223> 除了天冬胺酸以外的任何胺基酸
<400> 118
Figure 110116854-A0202-12-0422-1425
Figure 110116854-A0202-12-0423-1426
<210> 119
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (33)..(33)
<223> 除了脯胺酸以外的任何胺基酸
<400> 119
Figure 110116854-A0202-12-0423-1427
Figure 110116854-A0202-12-0424-1428
<210> 120
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (34)..(34)
<223> 除了甘胺酸以外的任何胺基酸
<400> 120
Figure 110116854-A0202-12-0424-1429
Figure 110116854-A0202-12-0425-1430
<210> 121
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (35)..(35)
<223> 除了白胺酸以外的任何胺基酸
<400> 121
Figure 110116854-A0202-12-0426-1431
Figure 110116854-A0202-12-0427-1432
<210> 122
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (37)..(37)
<223> 除了甘胺酸以外的任何胺基酸
<400> 122
Figure 110116854-A0202-12-0427-1433
Figure 110116854-A0202-12-0428-1434
<210> 123
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (38)..(38)
<223> 除了纈胺酸以外的任何胺基酸
<400> 123
Figure 110116854-A0202-12-0428-1435
Figure 110116854-A0202-12-0429-1436
<210> 124
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (39)..(39)
<223> 除了絲胺酸以外的任何胺基酸
<400> 124
Figure 110116854-A0202-12-0430-1437
Figure 110116854-A0202-12-0431-1438
<210> 125
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (40)..(40)
<223> 除了白胺酸以外的任何胺基酸
<400> 125
Figure 110116854-A0202-12-0431-1439
Figure 110116854-A0202-12-0432-1440
<210> 126
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (41)..(41)
<223> 除了蘇胺酸以外的任何胺基酸
<400> 126
Figure 110116854-A0202-12-0433-1441
<210> 127
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (42)..(42)
<223> 除了甘胺酸以外的任何胺基酸
<400> 127
Figure 110116854-A0202-12-0434-1442
Figure 110116854-A0202-12-0435-1443
<210> 128
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (43)..(43)
<223> 除了甘胺酸以外的任何胺基酸
<400> 128
Figure 110116854-A0202-12-0435-1444
Figure 110116854-A0202-12-0436-1445
<210> 129
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (44)..(44)
<223> 除了白胺酸以外的任何胺基酸
<400> 129
Figure 110116854-A0202-12-0437-1446
Figure 110116854-A0202-12-0438-1447
<210> 130
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (45)..(45)
<223> 除了絲胺酸以外的任何胺基酸
<400> 130
Figure 110116854-A0202-12-0438-1448
Figure 110116854-A0202-12-0439-1449
<210> 131
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (46)..(46)
<223> 除了酪胺酸以外的任何胺基酸
<400> 131
Figure 110116854-A0202-12-0439-1450
Figure 110116854-A0202-12-0440-1451
<210> 132
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (48)..(48)
<223> 除了麩胺酸以外的任何胺基酸
<400> 132
Figure 110116854-A0202-12-0441-1452
Figure 110116854-A0202-12-0442-1453
<210> 133
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (49)..(49)
<223> 除了天冬胺酸以外的任何胺基酸
<400> 133
Figure 110116854-A0202-12-0442-1454
Figure 110116854-A0202-12-0443-1455
<210> 134
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (50)..(50)
<223> 除了蘇胺酸以外的任何胺基酸
<400> 134
Figure 110116854-A0202-12-0443-1456
Figure 110116854-A0202-12-0444-1457
<210> 135
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (51)..(51)
<223> 除了離胺酸以外的任何胺基酸
<400> 135
Figure 110116854-A0202-12-0445-1458
Figure 110116854-A0202-12-0446-1459
<210> 136
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (52)..(52)
<223> 除了麩胺酸以外的任何胺基酸
<400> 136
Figure 110116854-A0202-12-0446-1460
Figure 110116854-A0202-12-0447-1461
<210> 137
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (64)..(64)
<223> 除了苯丙胺酸以外的任何胺基酸
<400> 137
Figure 110116854-A0202-12-0448-1462
<210> 138
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (65)..(65)
<223> 除了苯丙胺酸以外的任何胺基酸
<400> 138
Figure 110116854-A0202-12-0449-1463
Figure 110116854-A0202-12-0450-1464
<210> 139
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (66)..(66)
<223> 除了麩醯胺以外的任何胺基酸
<400> 139
Figure 110116854-A0202-12-0450-1465
Figure 110116854-A0202-12-0451-1466
<210> 140
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (67)..(67)
<223> 除了白胺酸以外的任何胺基酸
<400> 140
Figure 110116854-A0202-12-0452-1016
Figure 110116854-A0202-12-0453-1017
<210> 141
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (68)..(68)
<223> 除了麩胺酸以外的任何胺基酸
<400> 141
Figure 110116854-A0202-12-0453-1018
Figure 110116854-A0202-12-0454-1019
<210> 142
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (69)..(69)
<223> 除了白胺酸以外的任何胺基酸
<400> 142
Figure 110116854-A0202-12-0454-1020
Figure 110116854-A0202-12-0455-1021
<210> 143
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (70)..(70)
<223> 除了精胺酸以外的任何胺基酸
<400> 143
Figure 110116854-A0202-12-0456-1022
Figure 110116854-A0202-12-0457-1023
<210> 144
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (71)..(71)
<223> 除了精胺酸以外的任何胺基酸
<400> 144
Figure 110116854-A0202-12-0457-1024
Figure 110116854-A0202-12-0458-1025
<210> 145
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (72)..(72)
<223> 除了纈胺酸以外的任何胺基酸
<400> 145
Figure 110116854-A0202-12-0458-1026
Figure 110116854-A0202-12-0459-1027
<210> 146
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (73)..(73)
<223> 除了纈胺酸以外的任何胺基酸
<400> 146
Figure 110116854-A0202-12-0460-1028
Figure 110116854-A0202-12-0461-1029
<210> 147
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (75)..(75)
<223> 除了甘胺酸以外的任何胺基酸
<400> 147
Figure 110116854-A0202-12-0461-1030
Figure 110116854-A0202-12-0462-1031
<210> 148
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (76)..(76)
<223> 除了麩胺酸以外的任何胺基酸
<400> 148
Figure 110116854-A0202-12-0463-1032
<210> 149
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (77)..(77)
<223> 除了甘胺酸以外的任何胺基酸
<400> 149
Figure 110116854-A0202-12-0464-1033
Figure 110116854-A0202-12-0465-1034
<210> 150
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (78)..(78)
<223> 除了絲胺酸以外的任何胺基酸
<400> 150
Figure 110116854-A0202-12-0465-1035
Figure 110116854-A0202-12-0466-1036
<210> 151
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (104)..(104)
<223> 除了天冬胺酸以外的任何胺基酸
<400> 151
Figure 110116854-A0202-12-0467-1037
Figure 110116854-A0202-12-0468-1038
<210> 152
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (105)..(105)
<223> 除了白胺酸以外的任何胺基酸
<400> 152
Figure 110116854-A0202-12-0468-1039
Figure 110116854-A0202-12-0469-1040
<210> 153
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (106)..(106)
<223> 除了脯胺酸以外的任何胺基酸
<400> 153
Figure 110116854-A0202-12-0469-1041
Figure 110116854-A0202-12-0470-1042
<210> 154
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (109)..(109)
<223> 除了絲胺酸以外的任何胺基酸
<400> 154
Figure 110116854-A0202-12-0471-1043
Figure 110116854-A0202-12-0472-1044
<210> 155
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (110)..(110)
<223> 除了絲胺酸以外的任何胺基酸
<400> 155
Figure 110116854-A0202-12-0472-1045
Figure 110116854-A0202-12-0473-1046
<210> 156
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (111)..(111)
<223> 除了麩胺酸以外的任何胺基酸
<400> 156
Figure 110116854-A0202-12-0473-1047
Figure 110116854-A0202-12-0474-1048
<210> 157
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (113)..(113)
<223> 除了精胺酸以外的任何胺基酸
<400> 157
Figure 110116854-A0202-12-0475-1049
Figure 110116854-A0202-12-0476-1050
<210> 158
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (114)..(114)
<223> 除了天冬醯胺以外的任何胺基酸
<400> 158
Figure 110116854-A0202-12-0476-1051
Figure 110116854-A0202-12-0477-1052
<210> 159
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (115)..(115)
<223> 除了絲胺酸以外的任何胺基酸
<400> 159
Figure 110116854-A0202-12-0478-1053
<210> 160
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (117)..(117)
<223> 除了苯丙胺酸以外的任何胺基酸
<400> 160
Figure 110116854-A0202-12-0479-1054
Figure 110116854-A0202-12-0480-1055
<210> 161
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (130)..(130)
<223> 除了麩醯胺以外的任何胺基酸
<400> 161
Figure 110116854-A0202-12-0480-1056
Figure 110116854-A0202-12-0481-1057
<210> 162
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (131)..(131)
<223> 除了精胺酸以外的任何胺基酸
<400> 162
Figure 110116854-A0202-12-0482-1058
Figure 110116854-A0202-12-0483-1059
<210> 163
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (132)..(132)
<223> 除了白胺酸以外的任何胺基酸
<400> 163
Figure 110116854-A0202-12-0483-1060
Figure 110116854-A0202-12-0484-1061
<210> 164
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (133)..(133)
<223> 除了甘胺酸以外的任何胺基酸
<400> 164
Figure 110116854-A0202-12-0484-1062
Figure 110116854-A0202-12-0485-1063
<210> 165
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (134)..(134)
<223> 除了纈胺酸以外的任何胺基酸
<400> 165
Figure 110116854-A0202-12-0486-1064
Figure 110116854-A0202-12-0487-1065
<210> 166
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (135)..(135)
<223> 除了組胺酸以外的任何胺基酸
<400> 166
Figure 110116854-A0202-12-0487-1066
Figure 110116854-A0202-12-0488-1067
<210> 167
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (136)..(136)
<223> 除了白胺酸以外的任何胺基酸
<400> 167
Figure 110116854-A0202-12-0488-1068
Figure 110116854-A0202-12-0489-1069
<210> 168
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (137)..(137)
<223> 除了組胺酸以外的任何胺基酸
<400> 168
Figure 110116854-A0202-12-0490-1070
Figure 110116854-A0202-12-0491-1071
<210> 169
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (138)..(138)
<223> 除了蘇胺酸以外的任何胺基酸
<400> 169
Figure 110116854-A0202-12-0491-1072
Figure 110116854-A0202-12-0492-1073
<210> 170
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (139)..(139)
<223> 除了麩胺酸以外的任何胺基酸
<400> 170
Figure 110116854-A0202-12-0493-1074
<210> 171
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (141)..(141)
<223> 除了精胺酸以外的任何胺基酸
<400> 171
Figure 110116854-A0202-12-0494-1075
Figure 110116854-A0202-12-0495-1076
<210> 172
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (143)..(143)
<223> 除了精胺酸以外的任何胺基酸
<400> 172
Figure 110116854-A0202-12-0495-1077
Figure 110116854-A0202-12-0496-1078
<210> 173
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (144)..(144)
<223> 除了組胺酸以外的任何胺基酸
<400> 173
Figure 110116854-A0202-12-0497-1079
Figure 110116854-A0202-12-0498-1080
<210> 174
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (146)..(146)
<223> 除了色胺酸以外的任何胺基酸
<400> 174
Figure 110116854-A0202-12-0498-1081
Figure 110116854-A0202-12-0499-1082
<210> 175
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (148)..(148)
<223> 除了白胺酸以外的任何胺基酸
<400> 175
Figure 110116854-A0202-12-0499-1083
Figure 110116854-A0202-12-0500-1084
<210> 176
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (149)..(149)
<223> 除了蘇胺酸以外的任何胺基酸
<400> 176
Figure 110116854-A0202-12-0501-1085
Figure 110116854-A0202-12-0502-1086
<210> 177
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (150)..(150)
<223> 除了麩醯胺以外的任何胺基酸
<400> 177
Figure 110116854-A0202-12-0502-1087
Figure 110116854-A0202-12-0503-1088
<210> 178
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (151)..(151)
<223> 除了甘胺酸以外的任何胺基酸
<400> 178
Figure 110116854-A0202-12-0503-1089
Figure 110116854-A0202-12-0504-1090
<210> 179
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (153)..(153)
<223> 除了蘇胺酸以外的任何胺基酸
<400> 179
Figure 110116854-A0202-12-0505-1091
Figure 110116854-A0202-12-0506-1092
<210> 180
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (154)..(154)
<223> 除了纈胺酸以外的任何胺基酸
<400> 180
Figure 110116854-A0202-12-0506-1093
Figure 110116854-A0202-12-0507-1094
<210> 181
<211> 133
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (42)..(42)
<223> 除了苯丙胺酸以外的任何胺基酸
<400> 181
Figure 110116854-A0202-12-0508-1095
<210> 182
<211> 133
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (20)..(20)
<223> 除了天冬胺酸以外的任何胺基酸
<400> 182
Figure 110116854-A0202-12-0509-1096
<210> 183
<211> 133
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (15)..(15)
<223> 除了麩胺酸以外的任何胺基酸
<400> 183
Figure 110116854-A0202-12-0510-1097
Figure 110116854-A0202-12-0511-1098
<210> 184
<211> 133
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (16)..(16)
<223> 除了組胺酸以外的任何胺基酸
<400> 184
Figure 110116854-A0202-12-0511-1099
Figure 110116854-A0202-12-0512-1100
<210> 185
<211> 133
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (16)..(16)
<223> 除了組胺酸以外的任何胺基酸
<400> 185
Figure 110116854-A0202-12-0512-1101
Figure 110116854-A0202-12-0513-1102
<210> 186
<211> 133
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (45)..(45)
<223> 除了酪胺酸以外的任何胺基酸
<400> 186
Figure 110116854-A0202-12-0513-1103
Figure 110116854-A0202-12-0514-1104
<210> 187
<211> 133
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (126)..(126)
<223> 除了麩醯胺以外的任何胺基酸
<400> 187
Figure 110116854-A0202-12-0515-1105
<210> 188
<211> 133
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (16)..(16)
<223> 除了組胺酸以外的任何胺基酸
<220>
<221> 位點
<222> (42)..(42)
<223> 除了苯丙胺酸以外的任何胺基酸
<400> 188
Figure 110116854-A0202-12-0516-1106
Figure 110116854-A0202-12-0517-1107
<210> 189
<211> 133
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (20)..(20)
<223> 除了天冬胺酸以外的任何胺基酸
<220>
<221> 位點
<222> (42)..(42)
<223> 除了苯丙胺酸以外的任何胺基酸
<400> 189
Figure 110116854-A0202-12-0517-1108
Figure 110116854-A0202-12-0518-1109
<210> 190
<211> 133
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (15)..(15)
<223> 除了麩胺酸以外的任何胺基酸
<220>
<221> 位點
<222> (20)..(20)
<223> 除了天冬胺酸以外的任何胺基酸
<220>
<221> 位點
<222> (42)..(42)
<223> 除了苯丙胺酸以外的任何胺基酸
<400> 190
Figure 110116854-A0202-12-0519-1110
<210> 191
<211> 133
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (16)..(16)
<223> 除了組胺酸以外的任何胺基酸
<220>
<221> 位點
<222> (20)..(20)
<223> 除了天冬胺酸以外的任何胺基酸
<220>
<221> 位點
<222> (42)..(42)
<223> 除了苯丙胺酸以外的任何胺基酸
<400> 191
Figure 110116854-A0202-12-0520-1111
Figure 110116854-A0202-12-0521-1112
<210> 192
<211> 133
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (20)..(20)
<223> 除了天冬胺酸以外的任何胺基酸
<220>
<221> 位點
<222> (42)..(42)
<223> 除了苯丙胺酸以外的任何胺基酸
<220>
<221> 位點
<222> (126)..(126)
<223> 除了麩醯胺以外的任何胺基酸
<400> 192
Figure 110116854-A0202-12-0521-1113
Figure 110116854-A0202-12-0522-1114
<210> 193
<211> 133
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (20)..(20)
<223> 除了天冬胺酸以外的任何胺基酸
<220>
<221> 位點
<222> (42)..(42)
<223> 除了苯丙胺酸以外的任何胺基酸
<220>
<221> 位點
<222> (45)..(45)
<223> 除了酪胺酸以外的任何胺基酸
<400> 193
Figure 110116854-A0202-12-0523-1115
Figure 110116854-A0202-12-0524-1116
<210> 194
<211> 133
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (16)..(16)
<223> 除了組胺酸以外的任何胺基酸
<220>
<221> 位點
<222> (20)..(20)
<223> 除了天冬胺酸以外的任何胺基酸
<220>
<221> 位點
<222> (42)..(42)
<223> 除了苯丙胺酸以外的任何胺基酸
<220>
<221> 位點
<222> (45)..(45)
<223> 除了酪胺酸以外的任何胺基酸
<400> 194
Figure 110116854-A0202-12-0524-1117
Figure 110116854-A0202-12-0525-1118
<210> 195
<211> 133
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (20)..(20)
<223> 除了天冬胺酸以外的任何胺基酸
<220>
<221> 位點
<222> (42)..(42)
<223> 除了苯丙胺酸以外的任何胺基酸
<220>
<221> 位點
<222> (45)..(45)
<223> 除了酪胺酸以外的任何胺基酸
<220>
<221> 位點
<222> (126)..(126)
<223> 除了麩醯胺以外的任何胺基酸
<400> 195
Figure 110116854-A0202-12-0526-1119
Figure 110116854-A0202-12-0527-1120
<210> 196
<211> 133
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (16)..(16)
<223> 除了組胺酸以外的任何胺基酸
<220>
<221> 位點
<222> (20)..(20)
<223> 除了天冬胺酸以外的任何胺基酸
<220>
<221> 位點
<222> (42)..(42)
<223> 除了苯丙胺酸以外的任何胺基酸
<220>
<221> 位點
<222> (45)..(45)
<223> 除了酪胺酸以外的任何胺基酸
<220>
<221> 位點
<222> (126)..(126)
<223> 除了麩醯胺以外的任何胺基酸
<400> 196
Figure 110116854-A0202-12-0528-1121
<210> 197
<211> 133
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (16)..(16)
<223> 除了組胺酸以外的任何胺基酸
<220>
<221> 位點
<222> (42)..(42)
<223> 除了苯丙胺酸以外的任何胺基酸
<220>
<221> 位點
<222> (126)..(126)
<223> 除了麩醯胺以外的任何胺基酸
<400> 197
Figure 110116854-A0202-12-0529-1122
Figure 110116854-A0202-12-0530-1123
<210> 198
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 198
Figure 110116854-A0202-12-0530-1124
Figure 110116854-A0202-12-0531-1125
Figure 110116854-A0202-12-0532-1126
<210> 199
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 199
Figure 110116854-A0202-12-0532-1127
Figure 110116854-A0202-12-0533-1128
<210> 200
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 200
Figure 110116854-A0202-12-0534-1129
Figure 110116854-A0202-12-0535-1130
<210> 201
<400> 201
000
<210> 202
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 202
Figure 110116854-A0202-12-0536-1131
Figure 110116854-A0202-12-0537-1132
<210> 203
<400> 203
000
<210> 204
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 204
Figure 110116854-A0202-12-0538-1133
Figure 110116854-A0202-12-0539-1134
<210> 205
<400> 205
000
<210> 206
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 206
Figure 110116854-A0202-12-0540-1135
Figure 110116854-A0202-12-0541-1136
<210> 207
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 207
Figure 110116854-A0202-12-0541-1137
Figure 110116854-A0202-12-0542-1138
Figure 110116854-A0202-12-0543-1139
<210> 208
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 208
Figure 110116854-A0202-12-0543-1140
Figure 110116854-A0202-12-0544-1141
Figure 110116854-A0202-12-0545-1142
<210> 209
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 209
Figure 110116854-A0202-12-0545-1143
Figure 110116854-A0202-12-0546-1144
Figure 110116854-A0202-12-0547-1145
<210> 210
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 210
Figure 110116854-A0202-12-0547-1146
Figure 110116854-A0202-12-0548-1147
Figure 110116854-A0202-12-0549-1148
<210> 211
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 211
Figure 110116854-A0202-12-0549-1149
Figure 110116854-A0202-12-0550-1150
Figure 110116854-A0202-12-0551-1151
<210> 212
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 212
Figure 110116854-A0202-12-0551-1152
Figure 110116854-A0202-12-0552-1153
<210> 213
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 213
Figure 110116854-A0202-12-0553-1154
Figure 110116854-A0202-12-0554-1155
<210> 214
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 214
Figure 110116854-A0202-12-0555-1156
Figure 110116854-A0202-12-0556-1157
<210> 215
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 215
Figure 110116854-A0202-12-0556-1158
Figure 110116854-A0202-12-0557-1159
Figure 110116854-A0202-12-0558-1160
<210> 216
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 216
Figure 110116854-A0202-12-0558-1161
Figure 110116854-A0202-12-0559-1162
Figure 110116854-A0202-12-0560-1163
<210> 217
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 217
Figure 110116854-A0202-12-0560-1164
Figure 110116854-A0202-12-0561-1165
Figure 110116854-A0202-12-0562-1166
<210> 218
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 218
Figure 110116854-A0202-12-0562-1167
Figure 110116854-A0202-12-0563-1168
Figure 110116854-A0202-12-0564-1169
<210> 219
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 219
Figure 110116854-A0202-12-0564-1170
Figure 110116854-A0202-12-0565-1171
<210> 220
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 220
Figure 110116854-A0202-12-0566-1172
Figure 110116854-A0202-12-0567-1173
<210> 221
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 221
Figure 110116854-A0202-12-0568-1174
Figure 110116854-A0202-12-0569-1175
<210> 222
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 222
Figure 110116854-A0202-12-0569-1176
Figure 110116854-A0202-12-0570-1177
Figure 110116854-A0202-12-0571-1178
<210> 223
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 223
Figure 110116854-A0202-12-0571-1179
<210> 224
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 224
Figure 110116854-A0202-12-0572-1180
<210> 225
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 225
Figure 110116854-A0202-12-0572-1181
<210> 226
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 226
Figure 110116854-A0202-12-0572-1182
<210> 227
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 227
Figure 110116854-A0202-12-0573-1183
<210> 228
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 228
Figure 110116854-A0202-12-0573-1184
<210> 229
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 229
Figure 110116854-A0202-12-0573-1185
<210> 230
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 230
Figure 110116854-A0202-12-0574-1186
<210> 231
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 231
Figure 110116854-A0202-12-0574-1187
<210> 232
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 232
Figure 110116854-A0202-12-0574-1188
<210> 233
<211> 8
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 233
Figure 110116854-A0202-12-0574-1189
Figure 110116854-A0202-12-0575-1190
<210> 234
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 234
Figure 110116854-A0202-12-0575-1191
<210> 235
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 235
Figure 110116854-A0202-12-0575-1192
<210> 236
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 236
Figure 110116854-A0202-12-0575-1193
Figure 110116854-A0202-12-0576-1194
<210> 237
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 237
Figure 110116854-A0202-12-0576-1195
<210> 238
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 238
Figure 110116854-A0202-12-0576-1196
<210> 239
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 239
Figure 110116854-A0202-12-0577-1197
<210> 240
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 240
Figure 110116854-A0202-12-0577-1198
<210> 241
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 241
Figure 110116854-A0202-12-0577-1199
<210> 242
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 242
Figure 110116854-A0202-12-0578-1200
<210> 243
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 243
Figure 110116854-A0202-12-0578-1201
<210> 244
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 244
Figure 110116854-A0202-12-0578-1202
<210> 245
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 245
Figure 110116854-A0202-12-0579-1203
<210> 246
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 246
Figure 110116854-A0202-12-0579-1204
<210> 247
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 247
Figure 110116854-A0202-12-0579-1205
<210> 248
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 248
Figure 110116854-A0202-12-0580-1206
<210> 249
<211> 13
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 249
Figure 110116854-A0202-12-0580-1207
<210> 250
<211> 13
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 250
Figure 110116854-A0202-12-0580-1208
<210> 251
<211> 13
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 251
Figure 110116854-A0202-12-0580-1209
Figure 110116854-A0202-12-0581-1210
<210> 252
<211> 13
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 252
Figure 110116854-A0202-12-0581-1211
<210> 253
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 253
Figure 110116854-A0202-12-0581-1212
<210> 254
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 254
Figure 110116854-A0202-12-0581-1213
<210> 255
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 255
Figure 110116854-A0202-12-0582-1214
<210> 256
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 256
Figure 110116854-A0202-12-0582-1215
<210> 257
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 257
Figure 110116854-A0202-12-0582-1216
<210> 258
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 258
Figure 110116854-A0202-12-0583-1217
<210> 259
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 259
Figure 110116854-A0202-12-0583-1218
<210> 260
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 260
Figure 110116854-A0202-12-0583-1219
<210> 261
<211> 8
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 261
Figure 110116854-A0202-12-0584-1220
<210> 262
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 262
Figure 110116854-A0202-12-0584-1221
<210> 263
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 263
Figure 110116854-A0202-12-0584-1222
<210> 264
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 264
Figure 110116854-A0202-12-0585-1223
<210> 265
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 265
Figure 110116854-A0202-12-0585-1224
<210> 266
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 266
Figure 110116854-A0202-12-0585-1225
<210> 267
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 267
Figure 110116854-A0202-12-0586-1226
<210> 268
<400> 268
000
<210> 269
<400> 269
000
<210> 270
<400> 270
000
<210> 271
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 271
Figure 110116854-A0202-12-0586-1227
<210> 272
<211> 8
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 272
Figure 110116854-A0202-12-0587-1228
<210> 273
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 273
Figure 110116854-A0202-12-0587-1229
<210> 274
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 274
Figure 110116854-A0202-12-0587-1230
<210> 275
<211> 6
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 275
Figure 110116854-A0202-12-0588-1231
<210> 276
<400> 276
000
<210> 277
<400> 277
000
<210> 278
<211> 8
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 278
Figure 110116854-A0202-12-0588-1232
<210> 279
<400> 279
000
<210> 280
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 280
Figure 110116854-A0202-12-0588-1233
Figure 110116854-A0202-12-0589-1234
<210> 281
<211> 4
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 281
Figure 110116854-A0202-12-0589-1235
<210> 282
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 282
Figure 110116854-A0202-12-0589-1236
<210> 283
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 283
Figure 110116854-A0202-12-0590-1237
<210> 284
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (1)..(4)
<223> 位置1至4處之殘基可重複1至10次
<400> 284
Figure 110116854-A0202-12-0590-1238
<210> 285
<400> 285
000
<210> 286
<400> 286
000
<210> 287
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 287
Figure 110116854-A0202-12-0591-1239
<210> 288
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 288
Figure 110116854-A0202-12-0591-1240
<210> 289
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 289
Figure 110116854-A0202-12-0591-1241
<210> 290
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 290
Figure 110116854-A0202-12-0591-1242
Figure 110116854-A0202-12-0592-1243
<210> 291
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 291
Figure 110116854-A0202-12-0592-1244
<210> 292
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 292
Figure 110116854-A0202-12-0592-1245
<210> 293
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 293
Figure 110116854-A0202-12-0592-1246
<210> 294
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 294
Figure 110116854-A0202-12-0593-1247
<210> 295
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 295
Figure 110116854-A0202-12-0593-1248
<210> 296
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 296
Figure 110116854-A0202-12-0593-1249
<210> 297
<400> 297
000
<210> 298
<400> 298
000
<210> 299
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 299
Figure 110116854-A0202-12-0594-1250
Figure 110116854-A0202-12-0595-1251
Figure 110116854-A0202-12-0596-1252
<210> 300
<211> 275
<212> PRT
<213> 智慧人(Homo sapiens)
<400> 300
Figure 110116854-A0202-12-0596-1253
Figure 110116854-A0202-12-0597-1254
<210> 301
<211> 275
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 301
Figure 110116854-A0202-12-0598-1255
Figure 110116854-A0202-12-0599-1256
<210> 302
<211> 341
<212> PRT
<213> 智慧人(Homo sapiens)
<400> 302
Figure 110116854-A0202-12-0599-1257
Figure 110116854-A0202-12-0600-1258
Figure 110116854-A0202-12-0601-1259
<210> 303
<211> 341
<212> PRT
<213> 智慧人(Homo sapiens)
<400> 303
Figure 110116854-A0202-12-0602-1260
Figure 110116854-A0202-12-0603-779
<210> 304
<400> 304
000
<210> 305
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 305
Figure 110116854-A0202-12-0604-780
Figure 110116854-A0202-12-0605-781
<210> 306
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 306
Figure 110116854-A0202-12-0606-782
Figure 110116854-A0202-12-0607-784
<210> 307
<400> 307
000
<210> 308
<211> 276
<212> PRT
<213> 智慧人(Homo sapiens)
<400> 308
Figure 110116854-A0202-12-0608-785
Figure 110116854-A0202-12-0609-786
<210> 309
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (79)..(83)
<223> 胺基酸79至83中之任一者或全部可均存在或不存在,且各胺基酸可包括任何天然存在之胺基酸
<220>
<221> 二硫鍵
<222> (84)..(139)
<220>
<221> 位點
<222> (85)..(89)
<223> 胺基酸85至89中之任一者或全部可均存在或不存在,且各胺基酸可包括任何天然存在之胺基酸
<220>
<221> 位點
<222> (134)..(138)
<223> A胺基酸134至138中之任一者或全部可均存在或不存在,且各胺基酸可包括任何天然存在之胺基酸
<220>
<221> 位點
<222> (140)..(144)
<223> 胺基酸140至144中之任一者或全部可均存在或不存在,
且各胺基酸可包括任何天然存在之胺基酸
<220>
<221> 位點
<222> (231)..(235)
<223> 胺基酸231至235中之任一者或全部可均存在或不存在,且各胺基酸可包括任何天然存在之胺基酸
<220>
<221> 二硫鍵
<222> (236)..(236)
<223> The residue at position位置236處之殘基與位置12處之beta2M多肽半胱胺酸形成二硫鍵
<220>
<221> 位點
<222> (237)..(241)
<223> 胺基酸237至241中之任一者或全部可均存在或不存在, 且各胺基酸可包括任何天然存在之胺基酸
<400> 309
Figure 110116854-A0202-12-0611-787
Figure 110116854-A0202-12-0612-788
<210> 310
<211> 99
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 310
Figure 110116854-A0202-12-0612-789
Figure 110116854-A0202-12-0613-790
<210> 311
<211> 99
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 311
Figure 110116854-A0202-12-0613-791
Figure 110116854-A0202-12-0614-792
<210> 312
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 312
Figure 110116854-A0202-12-0614-793
Figure 110116854-A0202-12-0615-794
Figure 110116854-A0202-12-0616-795
<210> 313
<400> 313
000
<210> 314
<400> 314
000
<210> 315
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (6)..(10)
<223> 位置6至10處之胺基酸可重複1、2、3、4、5、6、7、8或9次
<400> 315
Figure 110116854-A0202-12-0616-796
<210> 316
<211> 20
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 316
Figure 110116854-A0202-12-0617-797
<210> 317
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 317
Figure 110116854-A0202-12-0617-798
<210> 318
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 318
Figure 110116854-A0202-12-0617-799
Figure 110116854-A0202-12-0618-800
<210> 319
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (6)..(10)
<223> 位置6至10處之胺基酸可重複1至10次
<400> 319
Figure 110116854-A0202-12-0618-801
<210> 320
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 320
Figure 110116854-A0202-12-0618-802
<210> 321
<211> 20
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 321
Figure 110116854-A0202-12-0619-803
<210> 322
<211> 25
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 322
Figure 110116854-A0202-12-0619-804
<210> 323
<211> 30
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 323
Figure 110116854-A0202-12-0619-805
Figure 110116854-A0202-12-0620-806
<210> 324
<211> 35
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 324
Figure 110116854-A0202-12-0620-807
<210> 325
<211> 40
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 325
Figure 110116854-A0202-12-0620-808
Figure 110116854-A0202-12-0621-809
<210> 326
<211> 45
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 326
Figure 110116854-A0202-12-0621-810
<210> 327
<211> 50
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 327
Figure 110116854-A0202-12-0621-811
Figure 110116854-A0202-12-0622-812
<210> 328
<211> 55
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 328
Figure 110116854-A0202-12-0622-813
<210> 329
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 329
Figure 110116854-A0202-12-0623-814
<210> 330
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (6)..(10)
<223> 位置6至10處之胺基酸可重複1至10次
<400> 330
Figure 110116854-A0202-12-0623-815
<210> 331
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 331
Figure 110116854-A0202-12-0623-816
<210> 332
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 332
Figure 110116854-A0202-12-0624-817
<210> 333
<211> 20
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 333
Figure 110116854-A0202-12-0624-818
<210> 334
<211> 25
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 334
Figure 110116854-A0202-12-0624-819
<210> 335
<211> 30
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 335
Figure 110116854-A0202-12-0625-820
<210> 336
<211> 35
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 336
Figure 110116854-A0202-12-0625-821
<210> 337
<211> 40
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 337
Figure 110116854-A0202-12-0626-822
<210> 338
<211> 45
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 338
Figure 110116854-A0202-12-0626-823
<210> 339
<211> 50
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 339
Figure 110116854-A0202-12-0627-824
<210> 340
<211> 55
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 340
Figure 110116854-A0202-12-0627-825
Figure 110116854-A0202-12-0628-826
<210> 341
<211> 275
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 341
Figure 110116854-A0202-12-0628-827
Figure 110116854-A0202-12-0629-828
<210> 342
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (6)..(10)
<223> 位置6至10處之殘基可重複1至10次
<400> 342
Figure 110116854-A0202-12-0630-829
Figure 110116854-A0202-12-0631-830
<210> 343
<211> 275
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 343
Figure 110116854-A0202-12-0632-831
Figure 110116854-A0202-12-0633-832
<210> 344
<211> 275
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 344
Figure 110116854-A0202-12-0634-833
Figure 110116854-A0202-12-0635-834
<210> 345
<211> 275
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 345
Figure 110116854-A0202-12-0635-835
Figure 110116854-A0202-12-0636-836
Figure 110116854-A0202-12-0637-837
<210> 346
<211> 275
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 346
Figure 110116854-A0202-12-0637-838
Figure 110116854-A0202-12-0638-839
Figure 110116854-A0202-12-0639-840
<210> 347
<211> 275
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 347
Figure 110116854-A0202-12-0639-841
Figure 110116854-A0202-12-0640-842
Figure 110116854-A0202-12-0641-843
<210> 348
<211> 275
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 348
Figure 110116854-A0202-12-0641-844
Figure 110116854-A0202-12-0642-845
Figure 110116854-A0202-12-0643-846
<210> 349
<211> 275
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 349
Figure 110116854-A0202-12-0643-847
Figure 110116854-A0202-12-0644-848
<210> 350
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 350
Figure 110116854-A0202-12-0645-849
Figure 110116854-A0202-12-0646-850
<210> 351
<211> 275
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 351
Figure 110116854-A0202-12-0647-851
Figure 110116854-A0202-12-0648-852
<210> 352
<211> 275
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 352
Figure 110116854-A0202-12-0648-853
Figure 110116854-A0202-12-0649-854
Figure 110116854-A0202-12-0650-855
<210> 353
<211> 275
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 353
Figure 110116854-A0202-12-0650-856
Figure 110116854-A0202-12-0651-857
Figure 110116854-A0202-12-0652-858
<210> 354
<211> 275
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 354
Figure 110116854-A0202-12-0652-859
Figure 110116854-A0202-12-0653-860
Figure 110116854-A0202-12-0654-861
<210> 355
<211> 275
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 355
Figure 110116854-A0202-12-0654-862
Figure 110116854-A0202-12-0655-863
Figure 110116854-A0202-12-0656-864
<210> 356
<211> 275
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 356
Figure 110116854-A0202-12-0656-865
Figure 110116854-A0202-12-0657-866
Figure 110116854-A0202-12-0658-867
<210> 357
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 357
Figure 110116854-A0202-12-0658-868
Figure 110116854-A0202-12-0659-869
<210> 358
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 358
Figure 110116854-A0202-12-0660-870
Figure 110116854-A0202-12-0661-871
<210> 359
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 359
Figure 110116854-A0202-12-0662-872
Figure 110116854-A0202-12-0663-873
<210> 360
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 360
Figure 110116854-A0202-12-0663-874
Figure 110116854-A0202-12-0664-875
Figure 110116854-A0202-12-0665-876
<210> 361
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 361
Figure 110116854-A0202-12-0665-877
Figure 110116854-A0202-12-0666-878
Figure 110116854-A0202-12-0667-879
<210> 362
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 362
Figure 110116854-A0202-12-0667-880
Figure 110116854-A0202-12-0668-881
Figure 110116854-A0202-12-0669-882
<210> 363
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 363
Figure 110116854-A0202-12-0669-883
Figure 110116854-A0202-12-0670-884
Figure 110116854-A0202-12-0671-885
<210> 364
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 364
Figure 110116854-A0202-12-0671-886
Figure 110116854-A0202-12-0672-887
<210> 365
<211> 223
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 365
Figure 110116854-A0202-12-0673-888
Figure 110116854-A0202-12-0674-889
<210> 366
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (1)..(2)
<223> 位置1至2處之胺基酸可重複至少一次
<220>
<221> 位點
<222> (3)..(7)
<223> 位置3至7處之胺基酸可重複至少一次
<400> 366
Figure 110116854-A0202-12-0674-890
Figure 110116854-A0202-12-0675-891
<210> 367
<211> 4
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (1)..(4)
<223> 位置1至4處之胺基酸可重複至少一次
<400> 367
Figure 110116854-A0202-12-0675-892
<210> 368
<211> 4
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 368
Figure 110116854-A0202-12-0675-893
<210> 369
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 369
Figure 110116854-A0202-12-0676-894
<210> 370
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 370
Figure 110116854-A0202-12-0676-895
<210> 371
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 371
Figure 110116854-A0202-12-0676-896
<210> 372
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 372
Figure 110116854-A0202-12-0677-897
<210> 373
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 373
Figure 110116854-A0202-12-0677-898
<210> 374
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> REPEAT
<222> (1)..(5)
<223> 序列重複n次,其中n為1、2、3、4、5、6、7、8、9或10
<400> 374
Figure 110116854-A0202-12-0677-899
<210> 375
<211> 20
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 375
Figure 110116854-A0202-12-0678-900
<210> 376
<211> 25
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 376
Figure 110116854-A0202-12-0678-901
<210> 377
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 377
Figure 110116854-A0202-12-0678-902
<210> 378
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 378
Figure 110116854-A0202-12-0679-903
<210> 379
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 379
Figure 110116854-A0202-12-0679-904
<210> 380
<211> 20
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 380
Figure 110116854-A0202-12-0679-905
Figure 110116854-A0202-12-0680-906
<210> 381
<211> 25
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 381
Figure 110116854-A0202-12-0680-907
<210> 382
<211> 30
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 382
Figure 110116854-A0202-12-0680-908
<210> 383
<211> 35
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 383
Figure 110116854-A0202-12-0681-909
<210> 384
<211> 40
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 384
Figure 110116854-A0202-12-0681-910
<210> 385
<211> 45
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 385
Figure 110116854-A0202-12-0682-911
<210> 386
<211> 50
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 386
Figure 110116854-A0202-12-0682-912
<210> 387
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 387
Figure 110116854-A0202-12-0683-913
<210> 388
<211> 8
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 388
Figure 110116854-A0202-12-0683-914
<210> 389
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 389
Figure 110116854-A0202-12-0683-915
<210> 390
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 390
Figure 110116854-A0202-12-0684-916
<210> 391
<211> 4
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 391
Figure 110116854-A0202-12-0684-917
<210> 392
<211> 22
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 392
Figure 110116854-A0202-12-0684-918
<210> 393
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (6)..(10)
<223> 位置6至10處之胺基酸可重複1、2或3次
<400> 393
Figure 110116854-A0202-12-0685-919
<210> 394
<211> 6
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 394
Figure 110116854-A0202-12-0685-920
<210> 395
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 395
Figure 110116854-A0202-12-0686-921
<210> 396
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 396
Figure 110116854-A0202-12-0686-922
<210> 397
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 397
Figure 110116854-A0202-12-0686-923
Figure 110116854-A0202-12-0687-924
Figure 110116854-A0202-12-0688-925
<210> 398
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 398
Figure 110116854-A0202-12-0688-926
<210> 399
<211> 502
<212> PRT
<213> 智慧人(Homo sapiens)
<400> 399
Figure 110116854-A0202-12-0688-927
Figure 110116854-A0202-12-0689-928
Figure 110116854-A0202-12-0690-929
Figure 110116854-A0202-12-0691-930
<210> 400
<211> 519
<212> PRT
<213> 智慧人(Homo sapiens)
<400> 400
Figure 110116854-A0202-12-0691-931
Figure 110116854-A0202-12-0692-932
Figure 110116854-A0202-12-0693-933
Figure 110116854-A0202-12-0694-934
<210> 401
<211> 522
<212> PRT
<213> 智慧人(Homo sapiens)
<400> 401
Figure 110116854-A0202-12-0695-935
Figure 110116854-A0202-12-0696-936
Figure 110116854-A0202-12-0697-937
<210> 402
<211> 302
<212> PRT
<213> 智慧人(Homo sapiens)
<400> 402
Figure 110116854-A0202-12-0698-938
Figure 110116854-A0202-12-0699-939
<210> 403
<211> 288
<212> PRT
<213> 智慧人(Homo sapiens)
<400> 403
Figure 110116854-A0202-12-0700-940
Figure 110116854-A0202-12-0701-941
<210> 404
<211> 276
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 404
Figure 110116854-A0202-12-0701-942
Figure 110116854-A0202-12-0702-943
Figure 110116854-A0202-12-0703-944
<210> 405
<211> 817
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 405
Figure 110116854-A0202-12-0703-945
Figure 110116854-A0202-12-0704-946
Figure 110116854-A0202-12-0705-947
Figure 110116854-A0202-12-0706-948
Figure 110116854-A0202-12-0707-949
Figure 110116854-A0202-12-0708-950
<210> 406
<211> 813
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 406
Figure 110116854-A0202-12-0708-951
Figure 110116854-A0202-12-0709-952
Figure 110116854-A0202-12-0710-953
Figure 110116854-A0202-12-0711-954
Figure 110116854-A0202-12-0712-955
Figure 110116854-A0202-12-0713-956
<210> 407
<211> 807
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 407
Figure 110116854-A0202-12-0713-957
Figure 110116854-A0202-12-0714-958
Figure 110116854-A0202-12-0715-959
Figure 110116854-A0202-12-0716-960
Figure 110116854-A0202-12-0717-961
Figure 110116854-A0202-12-0718-962
<210> 408
<211> 123
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 408
Figure 110116854-A0202-12-0718-963
Figure 110116854-A0202-12-0719-964
<210> 409
<211> 123
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 409
Figure 110116854-A0202-12-0719-965
Figure 110116854-A0202-12-0720-966
<210> 410
<211> 227
<212> PRT
<213> 智慧人(Homo sapiens)
<400> 410
Figure 110116854-A0202-12-0720-967
Figure 110116854-A0202-12-0721-968
<210> 411
<211> 325
<212> PRT
<213> 智慧人(Homo sapiens)
<400> 411
Figure 110116854-A0202-12-0721-969
Figure 110116854-A0202-12-0722-970
Figure 110116854-A0202-12-0723-971
<210> 412
<211> 246
<212> PRT
<213> 智慧人(Homo sapiens)
<400> 412
Figure 110116854-A0202-12-0723-972
Figure 110116854-A0202-12-0724-973
Figure 110116854-A0202-12-0725-974
<210> 413
<211> 383
<212> PRT
<213> 智慧人(Homo sapiens)
<400> 413
Figure 110116854-A0202-12-0725-975
Figure 110116854-A0202-12-0726-976
Figure 110116854-A0202-12-0727-977
<210> 414
<211> 276
<212> PRT
<213> 智慧人(Homo sapiens)
<400> 414
Figure 110116854-A0202-12-0727-978
Figure 110116854-A0202-12-0728-979
Figure 110116854-A0202-12-0729-980
<210> 415
<211> 353
<212> PRT
<213> 智慧人(Homo sapiens)
<400> 415
Figure 110116854-A0202-12-0729-981
Figure 110116854-A0202-12-0730-982
Figure 110116854-A0202-12-0731-983
<210> 416
<211> 222
<212> PRT
<213> 智慧人(Homo sapiens)
<400> 416
Figure 110116854-A0202-12-0731-984
Figure 110116854-A0202-12-0732-985
Figure 110116854-A0202-12-0733-986
<210> 417
<211> 327
<212> PRT
<213> 智慧人(Homo sapiens)
<400> 417
Figure 110116854-A0202-12-0733-987
Figure 110116854-A0202-12-0734-988
Figure 110116854-A0202-12-0735-989
<210> 418
<211> 227
<212> PRT
<213> 智慧人(Homo sapiens)
<400> 418
Figure 110116854-A0202-12-0735-990
Figure 110116854-A0202-12-0736-991
<210> 419
<211> 227
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 419
Figure 110116854-A0202-12-0736-992
Figure 110116854-A0202-12-0737-993
Figure 110116854-A0202-12-0738-994
<210> 420
<211> 227
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 420
Figure 110116854-A0202-12-0738-995
Figure 110116854-A0202-12-0739-996
<210> 421
<211> 227
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 421
Figure 110116854-A0202-12-0740-997
Figure 110116854-A0202-12-0741-998
<210> 422
<211> 813
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 422
Figure 110116854-A0202-12-0741-999
Figure 110116854-A0202-12-0742-1000
Figure 110116854-A0202-12-0743-1001
Figure 110116854-A0202-12-0744-1002
Figure 110116854-A0202-12-0745-1003
Figure 110116854-A0202-12-0746-1004
<210> 423
<211> 123
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 423
Figure 110116854-A0202-12-0746-1005
Figure 110116854-A0202-12-0747-1006
<210> 424
<211> 123
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 424
Figure 110116854-A0202-12-0747-1007
Figure 110116854-A0202-12-0748-1008
<210> 425
<211> 812
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 425
Figure 110116854-A0202-12-0748-1009
Figure 110116854-A0202-12-0749-1010
Figure 110116854-A0202-12-0750-1011
Figure 110116854-A0202-12-0751-1012
Figure 110116854-A0202-12-0752-1013
Figure 110116854-A0202-12-0753-1014
<210> 426
<211> 813
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 426
Figure 110116854-A0202-12-0753-1015
Figure 110116854-A0202-12-0754-1016
Figure 110116854-A0202-12-0755-1017
Figure 110116854-A0202-12-0756-1018
Figure 110116854-A0202-12-0757-1019
<210> 427
<211> 123
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 427
Figure 110116854-A0202-12-0758-1020
<210> 428
<211> 123
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 428
Figure 110116854-A0202-12-0759-1021
<210> 429
<211> 123
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 429
Figure 110116854-A0202-12-0760-1022
<210> 430
<211> 123
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 430
Figure 110116854-A0202-12-0761-1023
<210> 431
<211> 812
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 431
Figure 110116854-A0202-12-0762-1024
Figure 110116854-A0202-12-0763-1025
Figure 110116854-A0202-12-0764-1026
Figure 110116854-A0202-12-0765-1027
Figure 110116854-A0202-12-0766-1028
<210> 432
<211> 807
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 432
Figure 110116854-A0202-12-0766-1029
Figure 110116854-A0202-12-0767-1030
Figure 110116854-A0202-12-0768-1031
Figure 110116854-A0202-12-0769-1032
Figure 110116854-A0202-12-0770-1033
Figure 110116854-A0202-12-0771-1034
<210> 433
<211> 506
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 433
Figure 110116854-A0202-12-0771-1035
Figure 110116854-A0202-12-0772-1036
Figure 110116854-A0202-12-0773-1037
Figure 110116854-A0202-12-0774-1038
<210> 434
<211> 507
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 434
Figure 110116854-A0202-12-0774-1039
Figure 110116854-A0202-12-0775-1040
Figure 110116854-A0202-12-0776-1041
Figure 110116854-A0202-12-0777-1042
<210> 435
<211> 812
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 435
Figure 110116854-A0202-12-0778-1043
Figure 110116854-A0202-12-0779-1044
Figure 110116854-A0202-12-0780-1045
Figure 110116854-A0202-12-0781-1046
Figure 110116854-A0202-12-0782-1047
<210> 436
<211> 807
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 436
Figure 110116854-A0202-12-0782-1048
Figure 110116854-A0202-12-0783-1049
Figure 110116854-A0202-12-0784-1050
Figure 110116854-A0202-12-0785-1051
Figure 110116854-A0202-12-0786-1052
Figure 110116854-A0202-12-0787-1053
<210> 437
<211> 506
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 437
Figure 110116854-A0202-12-0787-1054
Figure 110116854-A0202-12-0788-1055
Figure 110116854-A0202-12-0789-1056
Figure 110116854-A0202-12-0790-1057
<210> 438
<211> 123
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 438
Figure 110116854-A0202-12-0790-1058
Figure 110116854-A0202-12-0791-1059
<210> 439
<211> 424
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 439
Figure 110116854-A0202-12-0791-1060
Figure 110116854-A0202-12-0792-1061
Figure 110116854-A0202-12-0793-1062
Figure 110116854-A0202-12-0794-1063
<210> 440
<211> 424
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 440
Figure 110116854-A0202-12-0794-1064
Figure 110116854-A0202-12-0795-1065
Figure 110116854-A0202-12-0796-1066
<210> 441
<211> 123
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 441
Figure 110116854-A0202-12-0797-1067
<210> 442
<211> 424
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 442
Figure 110116854-A0202-12-0798-1068
Figure 110116854-A0202-12-0799-1069
Figure 110116854-A0202-12-0800-1070
<210> 443
<211> 123
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 443
Figure 110116854-A0202-12-0800-1071
Figure 110116854-A0202-12-0801-1072
<210> 444
<211> 424
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 444
Figure 110116854-A0202-12-0801-1073
Figure 110116854-A0202-12-0802-1074
Figure 110116854-A0202-12-0803-1075
Figure 110116854-A0202-12-0804-1076
<210> 445
<211> 123
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 445
Figure 110116854-A0202-12-0804-1077
Figure 110116854-A0202-12-0805-1078
<210> 446
<211> 424
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 446
Figure 110116854-A0202-12-0805-1079
Figure 110116854-A0202-12-0806-1080
Figure 110116854-A0202-12-0807-1081
<210> 447
<211> 123
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 447
Figure 110116854-A0202-12-0808-1082
<210> 448
<211> 424
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 448
Figure 110116854-A0202-12-0809-1083
Figure 110116854-A0202-12-0810-1084
Figure 110116854-A0202-12-0811-1085
<210> 449
<211> 275
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 449
Figure 110116854-A0202-12-0811-1086
Figure 110116854-A0202-12-0812-1087
Figure 110116854-A0202-12-0813-1088
<210> 450
<400> 450
000
<210> 451
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 451
Figure 110116854-A0202-12-0813-1089
<210> 452
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 452
Figure 110116854-A0202-12-0814-1090
<210> 453
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 453
Figure 110116854-A0202-12-0814-1091
<210> 454
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 454
Figure 110116854-A0202-12-0814-1092
<210> 455
<211> 275
<212> PRT
<213> 智慧人(Homo sapiens)
<400> 455
Figure 110116854-A0202-12-0814-1093
Figure 110116854-A0202-12-0815-1094
Figure 110116854-A0202-12-0816-1095
<210> 456
<211> 275
<212> PRT
<213> 智慧人(Homo sapiens)
<400> 456
Figure 110116854-A0202-12-0816-1096
Figure 110116854-A0202-12-0817-1097
Figure 110116854-A0202-12-0818-1098
<210> 457
<211> 275
<212> PRT
<213> 智慧人(Homo sapiens)
<400> 457
Figure 110116854-A0202-12-0818-1099
Figure 110116854-A0202-12-0819-1100
Figure 110116854-A0202-12-0820-1101
<210> 458
<211> 275
<212> PRT
<213> 智慧人(Homo sapiens)
<400> 458
Figure 110116854-A0202-12-0820-1102
Figure 110116854-A0202-12-0821-1103
<210> 459
<211> 275
<212> PRT
<213> 智慧人(Homo sapiens)
<400> 459
Figure 110116854-A0202-12-0822-1104
Figure 110116854-A0202-12-0823-1105
<210> 460
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (1)..(3)
<223> 位置1至3處之胺基酸獨立地為任何胺基酸,限制條件為N端胺基酸不為Cys
<400> 460
Figure 110116854-A0202-12-0824-1106
<210> 461
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<220>
<221> 位點
<222> (1)..(2)
<223> 位置1至2處之胺基酸獨立地為任何胺基酸,限制條件為N端胺基酸不為Cys
<400> 461
Figure 110116854-A0202-12-0824-1107
<210> 462
<211> 123
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 462
Figure 110116854-A0202-12-0825-1108
<210> 463
<211> 123
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 463
Figure 110116854-A0202-12-0825-1109
Figure 110116854-A0202-12-0826-1110
<210> 464
<211> 123
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 464
Figure 110116854-A0202-12-0826-1111
Figure 110116854-A0202-12-0827-1112
<210> 465
<211> 424
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 465
Figure 110116854-A0202-12-0827-1113
Figure 110116854-A0202-12-0828-1114
Figure 110116854-A0202-12-0829-1115
Figure 110116854-A0202-12-0830-1116
<210> 466
<211> 424
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 466
Figure 110116854-A0202-12-0830-1117
Figure 110116854-A0202-12-0831-1118
Figure 110116854-A0202-12-0832-1119
<210> 467
<211> 424
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 467
Figure 110116854-A0202-12-0833-1120
Figure 110116854-A0202-12-0834-1121
Figure 110116854-A0202-12-0835-1122
<210> 468
<211> 124
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 468
Figure 110116854-A0202-12-0835-1123
Figure 110116854-A0202-12-0836-1124
<210> 469
<211> 124
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 469
Figure 110116854-A0202-12-0836-1125
Figure 110116854-A0202-12-0837-1126
<210> 470
<211> 124
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 470
Figure 110116854-A0202-12-0837-1127
Figure 110116854-A0202-12-0838-1128
<210> 471
<211> 425
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 471
Figure 110116854-A0202-12-0838-1129
Figure 110116854-A0202-12-0839-1130
Figure 110116854-A0202-12-0840-1131
Figure 110116854-A0202-12-0841-1132
<210> 472
<211> 425
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 472
Figure 110116854-A0202-12-0841-1133
Figure 110116854-A0202-12-0842-1134
Figure 110116854-A0202-12-0843-1135
<210> 473
<211> 425
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 473
Figure 110116854-A0202-12-0844-1136
Figure 110116854-A0202-12-0845-1137
Figure 110116854-A0202-12-0846-1138
<210> 474
<211> 123
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 474
Figure 110116854-A0202-12-0846-1139
Figure 110116854-A0202-12-0847-1140
<210> 475
<211> 123
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 475
Figure 110116854-A0202-12-0847-1141
Figure 110116854-A0202-12-0848-1142
<210> 476
<211> 123
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 476
Figure 110116854-A0202-12-0848-1143
Figure 110116854-A0202-12-0849-1144
<210> 477
<211> 424
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 477
Figure 110116854-A0202-12-0849-1145
Figure 110116854-A0202-12-0850-1146
Figure 110116854-A0202-12-0851-1147
Figure 110116854-A0202-12-0852-1148
<210> 478
<211> 424
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 478
Figure 110116854-A0202-12-0852-1149
Figure 110116854-A0202-12-0853-1150
Figure 110116854-A0202-12-0854-1151
<210> 479
<211> 424
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 479
Figure 110116854-A0202-12-0855-1152
Figure 110116854-A0202-12-0856-1153
Figure 110116854-A0202-12-0857-1154
<210> 480
<211> 124
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 480
Figure 110116854-A0202-12-0857-1155
Figure 110116854-A0202-12-0858-1156
<210> 481
<211> 124
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 481
Figure 110116854-A0202-12-0858-1157
Figure 110116854-A0202-12-0859-1158
<210> 482
<211> 124
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 482
Figure 110116854-A0202-12-0859-1159
Figure 110116854-A0202-12-0860-1160
<210> 483
<211> 425
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 483
Figure 110116854-A0202-12-0860-1161
Figure 110116854-A0202-12-0861-1162
Figure 110116854-A0202-12-0862-1163
<210> 484
<211> 425
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 484
Figure 110116854-A0202-12-0863-1164
Figure 110116854-A0202-12-0864-1165
Figure 110116854-A0202-12-0865-1166
<210> 485
<211> 425
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 485
Figure 110116854-A0202-12-0865-1167
Figure 110116854-A0202-12-0866-1168
Figure 110116854-A0202-12-0867-1169
Figure 110116854-A0202-12-0868-1170
<210> 486
<211> 812
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 486
Figure 110116854-A0202-12-0868-1171
Figure 110116854-A0202-12-0869-1172
Figure 110116854-A0202-12-0870-1173
Figure 110116854-A0202-12-0871-1174
Figure 110116854-A0202-12-0872-1175
Figure 110116854-A0202-12-0873-1176
<210> 487
<211> 226
<212> PRT
<213> 智慧人(Homo sapiens)
<400> 487
Figure 110116854-A0202-12-0873-1177
Figure 110116854-A0202-12-0874-1178
<210> 488
<211> 275
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 488
Figure 110116854-A0202-12-0875-1179
Figure 110116854-A0202-12-0876-1180
<210> 489
<211> 226
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 489
Figure 110116854-A0202-12-0876-1181
Figure 110116854-A0202-12-0877-1182
Figure 110116854-A0202-12-0878-1183
<210> 490
<211> 133
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 490
Figure 110116854-A0202-12-0878-1184
Figure 110116854-A0202-12-0879-1185
<210> 491
<211> 133
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 491
Figure 110116854-A0202-12-0879-1186
Figure 110116854-A0202-12-0880-1187
<210> 492
<211> 275
<212> PRT
<213> 智慧人(Homo sapiens)
<400> 492
Figure 110116854-A0202-12-0880-1188
Figure 110116854-A0202-12-0881-1189
Figure 110116854-A0202-12-0882-1190
<210> 493
<211> 275
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 493
Figure 110116854-A0202-12-0882-1191
Figure 110116854-A0202-12-0883-1192
<210> 494
<211> 275
<212> PRT
<213> 智慧人(Homo sapiens)
<400> 494
Figure 110116854-A0202-12-0884-1193
Figure 110116854-A0202-12-0885-1194
<210> 495
<211> 275
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 495
Figure 110116854-A0202-12-0886-1195
Figure 110116854-A0202-12-0887-1196
<210> 496
<211> 275
<212> PRT
<213> 智慧人(Homo sapiens)
<400> 496
Figure 110116854-A0202-12-0887-1197
Figure 110116854-A0202-12-0888-1198
Figure 110116854-A0202-12-0889-1199
<210> 497
<211> 275
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 497
Figure 110116854-A0202-12-0889-1200
Figure 110116854-A0202-12-0890-1201
Figure 110116854-A0202-12-0891-1202
<210> 498
<211> 275
<212> PRT
<213> 智慧人(Homo sapiens)
<400> 498
Figure 110116854-A0202-12-0891-1203
Figure 110116854-A0202-12-0892-1204
Figure 110116854-A0202-12-0893-1205
<210> 499
<211> 275
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列
<400> 499
Figure 110116854-A0202-12-0893-1206
Figure 110116854-A0202-12-0894-1207

Claims (54)

  1. 一種T細胞調節多聚體多肽,其包含:
    至少一種異二聚體,其包含:
    a)第一多肽,其包含:
    i)韋爾姆斯氏瘤-1(WT-1)肽抗原決定基,其包含胺基酸序列X1 X2 X3 TWNQMNL(SEQ ID NO:460)或X2 X3 TWNQMNL(SEQ ID NO:461),其中X1 、X2 及X3 中之各者獨立地為任何胺基酸,限制條件為N端胺基酸不為Cys,且其中該WT-1肽抗原決定基之長度為9至25個胺基酸;及
    ii)第一I類主要組織相容性複合物(MHC)多肽;
    b)第二多肽,其包含第二I類MHC多肽,及
    c)至少一種活化免疫調節多肽,
    其中該第一多肽及/或該第二多肽包含至少一種免疫調節多肽,且視情況其中該第一多肽或該第二多肽包含免疫球蛋白(Ig)Fc多肽。
  2. 如請求項1之T細胞調節多聚體多肽,其中該一或多種免疫調節多肽中之至少一者為變異體免疫調節多肽,其呈現出對同族共免疫調節多肽之親和力與相應野生型免疫調節多肽對該同族共免疫調節多肽之親和力相比有所減小。
  3. 如請求項2之T細胞調節多聚體多肽,其中當藉由生物層干涉術量測時,該野生型免疫調節多肽與同族共免疫調節多肽之結合親和力與該變異體免疫調節多肽與該同源共免疫調節多肽之結合親和力之比為至少1.5:1。
  4. 如請求項2或3之T細胞調節多聚體多肽,其中該變異體免疫調節多肽結合該共免疫調節多肽之親和力選自由以下組成之群:約10-4 M至約10-7 M、約10-4 M至約10-6 M及約10-4 M至約10-5 M。
  5. 如請求項1至4中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中:
    a1)該第一多肽以自N端至C端之次序包含:
    i)該WT-1肽抗原決定基;及
    ii)該第一MHC多肽;且
    b1)該第二多肽以自N端至C端之次序包含:
    i)該至少一種免疫調節多肽;
    ii)該第二MHC多肽;及
    iii)Ig Fc多肽;或
    a2)該第一多肽以自N端至C端之次序包含:
    i)該WT-1肽抗原決定基;及
    ii)該第一MHC多肽;且
    b2)該第二多肽以自N端至C端之次序包含:
    i)該第二MHC多肽;
    ii)該至少一種免疫調節多肽;及
    iii)Ig Fc多肽;或
    a3)該第一多肽以自N端至C端之次序包含:
    i)該WT-1肽抗原決定基;及
    ii)該第一MHC多肽;且
    b3)該第二多肽以自N端至C端之次序包含:
    i)該第二MHC多肽;
    ii)Ig Fc多肽;及
    iii)該至少一種免疫調節多肽;或
    a4)該第一多肽以自N端至C端之次序包含:
    i)該至少一種免疫調節多肽;
    ii)該WT-1肽抗原決定基;
    ii)該第一MHC多肽;且
    b4)該第二多肽以自N端至C端之次序包含:
    i)該第二MHC多肽;及
    ii)該Ig Fc多肽;或
    a5)該第一多肽以自N端至C端之次序包含:
    i)該WT-1肽抗原決定基;
    ii)該第一MHC多肽;且
    iii)該至少一種免疫調節多肽;且
    b5)該第二多肽以自N端至C端之次序包含:
    i)該第二MHC多肽;及
    ii)免疫球蛋白(Ig)Fc多肽。
  6. 如請求項1至4中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中:
    a)該第一MHC多肽為β2-微球蛋白多肽;且該第二MHC多肽為I類MHC重鏈多肽;或
    b)該第一MHC多肽為I類MHC重鏈多肽;且該第二MHC多肽為β2-微球蛋白多肽。
  7. 如請求項6之T細胞調節多聚體多肽,其中:
    a)該第一多肽以自N端至C端之次序包含:
    i)該WT-1肽抗原決定基;及
    ii)該β2-微球蛋白多肽;且
    b)該第二多肽以自N端至C端之次序包含:
    i)該至少一種免疫調節多肽;
    ii)該I類MHC重鏈多肽;及
    iii)Ig Fc多肽。
  8. 如請求項6之T細胞調節多聚體多肽,其中:
    a)該第一多肽以自N端至C端之次序包含:
    i)該WT-1肽抗原決定基;及
    ii)該β2-微球蛋白多肽;且
    b)該第二多肽以自N端至C端之次序包含:
    i)該I類MHC重鏈多肽;及
    ii)Ig Fc多肽;及
    iii)至少一種免疫調節多肽。
  9. 如請求項1至8中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該至少一種免疫調節多肽係選自由以下組成之群:細胞介素、4-1BBL多肽、ICOS-L多肽、OX-40L多肽、CD80多肽、CD86多肽、CD40多肽、CD70多肽及其組合。
  10. 如請求項1至9中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該至少一種免疫調節多肽包含IL-2多肽。
  11. 如請求項1至10中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該多聚體多肽包含至少兩種免疫調節多肽,且其中該等免疫調節多肽中之至少兩者為相同的,視情況其中該兩種或更多種免疫調節多肽係串聯的。
  12. 如請求項1至11中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該至少一種免疫調節多肽中之一或多者為變異體IL-2多肽,其呈現出對IL-2受體之親和力與野生型IL-2多肽對該IL-2受體之親和力相比有所減小。
  13. 如請求項12之T細胞調節多聚體多肽,其中該一或多種變異體IL-2多肽包含:i)H16A取代及F42A取代;或ii)H16T取代及F42A取代。
  14. 如請求項1至13中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該第一多肽與該第二多肽彼此共價連接,視情況其中該共價鍵聯係經由二硫鍵。
  15. 如請求項1至14中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該第一MHC多肽或介於該抗原決定基與該第一MHC多肽之間的連接子包含提供第一Cys殘基之胺基酸取代,其中該第二MHC多肽包含提供第二Cys殘基之胺基酸取代,且其中該二硫鍵聯係在該第一Cys殘基與該第二Cys殘基之間。
  16. 如請求項1至15中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該多肽包含在以下各物之間的二硫鍵:i)存在於該WT-1肽抗原決定基與該第一I類MHC多肽之間的連接子中之Cys,其中該第一I類MHC多肽為β2M多肽;與ii)經由Y84C取代引入該第二I類MHC多肽中之Cys殘基,其中該第二I類MHC多肽為I類MHC重鏈多肽。
  17. 如請求項1至15中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該多肽包含在以下各物之間的二硫鍵:i)經由R12C取代引入該第一I類MHC多肽中之Cys殘基,其中該第一I類MHC多肽為β2M多肽;與ii)經由A236C取代引入該第二I類MHC多肽中之Cys殘基,其中該第二I類MHC多肽為I類MHC重鏈多肽。
  18. 如請求項1至15中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該多肽包含:在以下各物之間的第一二硫鍵:i)存在於該WT-1肽抗原決定基與該第一I類MHC多肽之間的連接子中之Cys,其中該第一I類MHC多肽為β2M多肽;與ii)經由Y84C取代引入該第二I類MHC多肽中之Cys殘基,其中該第二I類MHC多肽為I類MHC重鏈多肽;及在以下各物之間的第二二硫鍵:i)經由R12C取代引入該β2M多肽中之Cys殘基;與ii)經由A236C取代引入該I類MHC重鏈多肽中之Cys殘基。
  19. 如請求項16或請求項18之T細胞調節多聚體多肽,其中介於該WT-1肽抗原決定基與該第一MHC之間的該連接子為GCGGS(GGGGS)n(SEQ ID NO:319),其中n為1、2、3、4、5、6、7、8或9。
  20. 如請求項1至19中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該WT-1肽抗原決定基之長度為9個胺基酸或10個胺基酸。
  21. 如請求項1至20中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該Ig Fc多肽包含圖5D、圖5E、圖5F、圖5G及圖5H中描繪之胺基酸序列中之一者。
  22. 如請求項1至21中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該WT-1肽包含胺基酸序列SMTWNQMNL(SEQ ID NO:451)、GCMTWNQMNL(SEQ ID NO:452)、SYTWNQMNL(SEQ ID NO:453)或GCYTWNQMNL(SEQ ID NO:454)。
  23. 如請求項1至21中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該第一MHC多肽或該第二MHC多肽包含與圖7A.3中描繪之HLA-A*2402胺基酸序列之胺基酸25-299具有至少95%胺基酸序列一致性的胺基酸序列。
  24. 如請求項1至23中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該第一MHC多肽為β2M多肽,且其中該第二MHC多肽包含與HLA-A24多肽具有至少95%胺基酸序列一致性之胺基酸序列,其中該抗原決定基選自由以下組成之群:SMTWNQMNL(SEQ ID NO:451)、GCMTWNQMNL(SEQ ID NO:452)、SYTWNQMNL(SEQ ID NO:453)及GCYTWNQMNL(SEQ ID NO:454),且其中該Ig Fc多肽包含圖5G或圖5H中描繪之胺基酸序列。
  25. 如請求項1之T細胞調節多聚體多肽,其中:
    a)該第一多肽包含圖37B中描繪之胺基酸序列;且
    b)該第二多肽包含圖20B中描繪之胺基酸序列。
  26. 如請求項1至25中任一項之T細胞調節多聚體多肽,其中該多聚體多肽包含第一異二聚體及第二異二聚體,且其中該第一異二聚體與該第二異二聚體藉由介於該第一異二聚體與該第二異二聚體之Ig Fc多肽之間的一或多個二硫鍵來共價結合。
  27. 一種核酸,其包含編碼如請求項1至26中任一項之第一多肽或第二多肽的核苷酸序列。
  28. 一種表現載體,其包含如請求項27之核酸。
  29. 一種選擇性調節對於韋爾姆斯氏瘤-1(WT-1)抗原決定基具有特異性之T細胞之活性的方法,該方法包括使該T細胞與如請求項1 至26中任一項之T細胞調節多聚體多肽接觸,其中該接觸選擇性調節該WT-1抗原決定基特異性T細胞之活性。
  30. 一種治療患有癌症之患者的方法,該方法包括向該患者投與有效量的包含如請求項1至26中任一項之T細胞調節多聚體多肽之醫藥組成物。
  31. 如請求項30之方法,其中該癌症為急性骨髓性白血病、骨髓瘤、卵巢癌、胰臟癌、非小細胞肺癌、結腸直腸癌、乳癌、韋爾姆斯氏瘤、間皮瘤、軟組織肉瘤、神經胚細胞瘤或腎胚細胞瘤。
  32. 如請求項30或31之方法,其進一步包括向該個體投與一或多種檢查點抑制劑。
  33. 如請求項32之方法,其中該檢查點抑制劑為結合至選自由以下組成之群之多肽的抗體:CD27、CD28、CD40、CD122、CD96、CD73、CD47、OX40、GITR、CSF1R、JAK、PI3K δ、PI3K γ、TAM、精胺酸酶、CD137、ICOS、A2AR、B7-H3、B7-H4、BTLA、CTLA-4、LAG3、TIM3、VISTA、CD96、TIGIT、CD122、PD-1、PD-L1及PD-L2。
  34. 如請求項33之方法,其中該檢查點抑制劑為對PD-1、PD-L1或CTLA4有特異性之抗體。
  35. 如請求項33或34之方法,其中該一或多種檢查點抑制劑選自由以下組成之群:納武單抗(nivolumab)、派姆單抗(pembrolizumab)、皮地利珠單抗(pidilizumab)、AMP-224、MPDL3280A、MDX-1105、MEDI-4736、阿維魯單抗(arelumab)、伊匹珠單抗(ipilimumab)、曲美木單抗(tremelimumab)、皮地利珠單抗、IMP321、MGA271、BMS-986016、利魯單抗(lirilumab)、烏瑞魯單抗(urelumab)、PF-05082566、IPH2101、MEDI-6469、CP-870,893、莫木利珠單抗(Mogamulizumab)、瓦利魯單抗(Varlilumab)、阿維魯單抗 (Avelumab)、加利昔單抗(Galiximab)、AMP-514、AUNP 12、伊多莫德(Indoximod)、NLG-919、INCB024360、KN035及其組合。
  36. 一種調節個體之免疫反應的方法,該方法包括向該個體投與有效量的如請求項1至26中任一項之T細胞調節多聚體多肽,
    其中該投與誘導抗原決定基特異性T細胞反應及抗原決定基非特異性T細胞反應,且
    其中該抗原決定基特異性T細胞反應與該抗原決定基非特異性T細胞反應之比為至少2:1。
  37. 一種選擇性遞送免疫調節多肽至靶標T細胞之方法,該方法包括使經混合之T細胞群與如請求項1至26中任一項之T細胞調節多聚體多肽接觸,其中該經混合之T細胞群包含該靶標T細胞及非靶標T細胞,其中該靶標T細胞對存在於該T細胞調節多聚體多肽內之該WT-1抗原決定基有特異性,且其中該接觸遞送存在於該T細胞調節多聚體多肽內之該一或多種免疫調節多肽至該靶標T細胞。
  38. 一種偵測自個體獲得之經混合之T細胞群中結合WT-1抗原決定基之靶標T細胞之存在的方法,該方法包括:
    a)使該經混合之T細胞群與如請求項1至26中任一項之T細胞調節多聚體多肽在活體外接觸,其中該T細胞調節多聚體多肽包含該WT-1抗原決定基;及
    b)偵測T細胞回應於該接觸之活化及/或增殖,其中經活化及/或增殖之T細胞指示該靶標T細胞之存在。
  39. 一種T細胞調節多聚體多肽(TMMP),其包含:
    至少一種異二聚體,其包含:
    a)第一多肽,其以自N端至C端之次序包含:
    i)韋爾姆斯氏瘤-1(WT-1)肽,其中該WT-1肽具有胺基酸序列VLDFAPPGA(SEQ ID NO:259);
    ii)具有胺基酸序列GCGGSGGGGSGGGGS(SEQ ID NO:317)之連接子;及
    iii)包含SEQ ID NO:311中列出之胺基酸序列的β2-微球蛋白多肽;及
    b)第二多肽,其以自N端至C端之次序包含:
    i)包含SEQ ID NO:188中列出之胺基酸序列的變異體IL-2多肽,其中X1 為Ala且其中X2 為Ala;
    ii)(GGGGS)4連接子;
    iii)包含SEQ ID NO:188中列出之胺基酸序列的變異體IL-2多肽,其中X1 為Ala且其中X2 為Ala;
    iv)包含SEQ ID NO:341中列出之胺基酸序列的主要組織相容性複合物(MHC)重鏈多肽;
    v)包含胺基酸序列AAAGG之連接子;及
    vi)免疫球蛋白(Ig)Fc多肽。
  40. 如請求項39之TMMP,其中該Ig Fc多肽為變異體Ig Fc多肽,其相對於野生型多肽包含一或多個序列變異,其中該Ig Fc多肽經由補體依賴性細胞毒性(CDC)及/或抗體依賴性細胞毒性(ADCC)誘導細胞裂解之能力係降低或實質上消除的,視情況其中該Ig Fc多肽包含與圖5A-5G或5H中描繪之Fc區之胺基酸序列具有至少約95%、至少約98%、至少約99%或100%胺基酸序列一致性之胺基酸序列。
  41. 如請求項40之TMMP,其中該Ig Fc多肽為包含L234A及/或L235A取代(圖5H中描繪之胺基酸序列中的L14及L15)的變異體人類IgG1 Fc多肽。
  42. 如請求項39至41中任一項之TMMP,其中該第一多肽包含具有圖14B及SEQ ID NO:423中列出之胺基酸序列的構築體2380;且其中該第二多肽包含具有圖14J及SEQ ID NO:486中列出之胺基酸序列的構築體1715△。
  43. 一種TMMP,其包含如請求項39至42中任一項之異二聚體的同二聚體。
  44. 一種核酸,其包含編碼如請求項39至42中任一項之第一多肽及/或第二多肽的核苷酸序列。
  45. 一種表現載體,其包含如請求項44之核酸。
  46. 一種經遺傳修飾之宿主細胞,其中該宿主細胞經如請求項44之核酸或如請求項45之表現載體遺傳修飾。
  47. 一種製備T細胞調節多聚體多肽(TMMP)之方法,該方法包括將如請求項46之經遺傳修飾之宿主細胞在培養基中在使得該宿主細胞合成該TMMP之條件下在活體外培養。
  48. 一種選擇性調節對於韋爾姆斯氏瘤-1(WT-1)抗原決定基有特異性之T細胞之活性的方法,該方法包括使該T細胞與如請求項39至43中任一項之T細胞調節多聚體多肽接觸,其中該接觸選擇性調節該WT-1抗原決定基特異性T細胞之活性。
  49. 一種治療患有與WT-1相關之癌症之患者的方法,該方法包括向該患者投與有效量的包含如請求項39-43中任一項之T細胞調節多聚體多肽的醫藥組成物。
  50. 如請求項49之方法,其中該癌症為急性骨髓性白血病、骨髓瘤、卵巢癌、胰臟癌、非小細胞肺癌、結腸直腸癌、乳癌、韋爾姆斯氏瘤、間皮瘤、軟組織肉瘤、神經胚細胞瘤或腎胚細胞瘤。
  51. 如請求項49或50之方法,其進一步包括向該個體投與一或多種免疫檢查點抑制劑。
  52. 如請求項51之方法,其中該免疫檢查點抑制劑為結合至選自由以下組成之群之多肽的抗體:CD27、CD28、CD40、CD122、CD96、CD73、CD47、OX40、GITR、CSF1R、JAK、PI3K δ、PI3K γ、TAM、精胺酸酶、CD137、ICOS、A2AR、B7-H3、B7-H4、 BTLA、CTLA-4、LAG3、TIM3、VISTA、CD96、TIGIT、CD122、PD-1、PD-L1及PD-L2。
  53. 如請求項52之方法,其中該免疫檢查點抑制劑為對PD-1、PD-L1或CTLA4有特異性之抗體。
  54. 如請求項52或53之方法,其中該一或多種免疫檢查點抑制劑選自由以下組成之群:納武單抗、派姆單抗、皮地利珠單抗、AMP-224、MPDL3280A、MDX-1105、MEDI-4736、阿維魯單抗、伊匹珠單抗、曲美木單抗、皮地利珠單抗、IMP321、MGA271、BMS-986016、利魯單抗、烏瑞魯單抗、PF-05082566、IPH2101、MEDI-6469、CP-870,893、莫木利珠單抗、瓦利魯單抗、阿維魯單抗、加利昔單抗、AMP-514、AUNP 12、伊多莫德、NLG-919、INCB024360、KN035及其組合。
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