JP2022536581A - 多量体ｔ細胞調節性ポリペプチド及びその使用方法 - Google Patents

多量体ｔ細胞調節性ポリペプチド及びその使用方法 Download PDF

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Abstract

本開示は、免疫調節ポリペプチド、ＭＵＣ１エピトープ提示ペプチド、及びクラスＩ ＭＨＣポリペプチドを含むＴ細胞調節多量体ポリペプチドを提供する。Ｔ細胞調節多量体ポリペプチドは、Ｔ細胞の活性の調節、及び個体における免疫応答の調節に有用である。本開示は、ａ）第１のポリペプチドと、ｂ）第２のポリペプチドとを含むＴ細胞調節多量体ポリペプチド（ＴＭＭＰ）を提供し、ＴＭＭＰは、ＭＵＣ１ペプチドと、第１の主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）ポリペプチドと、第２のＭＨＣポリペプチドと、１つ以上の免疫調節ポリペプチドと、任意選択で免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドまたは非Ｉｇスキャフォールドと、を含む。TIFF2022536581000211.tif22128

Description

相互参照
本出願は、２０１９年６月１９日に出願された米国仮特許出願第６２／８６３，７５４号の利益を主張するものであり、これらの出願は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
序文
適応免疫応答は、主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ、ヒトにおいてはヒト白血球抗原（ＨＬＡ）複合体とも呼ばれる）による、Ｔ細胞の表面上に存在するＴ細胞受容体（ＴＣＲ）の、抗原提示細胞（ＡＰＣ）の表面上に非共有提示された低分子ペプチド抗原との結合によって行われる。この結合は免疫系の標的化機構を表し、Ｔ細胞調節（活性化または抑制）とエフェクター機能に必要不可欠な分子相互作用である。エピトープ特異的な細胞標的化に続き、標的化Ｔ細胞は、ＡＰＣ上に存在する共刺激タンパク質の、Ｔ細胞上の対応共刺激タンパク質との結合により活性化される。エピトープ／ＴＣＲ結合と、ＡＰＣ共刺激タンパク質のＴ細胞共刺激タンパク質との結合の両方のシグナルは、Ｔ細胞の特異性及び活性化または抑制を駆動するのに必要とされる。ＴＣＲは任意のエピトープに特異的であるが、共刺激タンパク質はエピトープ特異的ではなく、その代わりに、全てのＴ細胞上または多くのＴ細胞サブセット上に概ね発現している。
概要
本開示は、免疫調節ポリペプチド、クラスＩ ＨＬＡポリペプチド（クラスＩ ＨＬＡ重鎖ポリペプチド、及びβ２ミクログロブリンポリペプチド）、ならびにＴ細胞受容体にエピトープを提示するムチン－１（ＭＵＣ１）ペプチドを含む、Ｔ細胞調節多量体ポリペプチド（ＴＭＭＰ）を提供する。ＴＭＭＰは、Ｔ細胞の活性化を調節するのに、また個体における免疫応答を調節するのに有用である。
図１Ａ～１Ｆは、本開示の様々なＴＭＭＰの概略図である。 図１Ａの説明を参照のこと。 図１Ａの説明を参照のこと。 図１Ａの説明を参照のこと。 図１Ａの説明を参照のこと。 図１Ａの説明を参照のこと。 図２Ａ～２Ｆは、本開示の様々なジスルフィド結合ＴＭＭＰの概略図である。 図２Ａの説明を参照のこと。 図２Ａの説明を参照のこと。 図２Ａの説明を参照のこと。 図２Ａの説明を参照のこと。 図２Ａの説明を参照のこと。 図３Ａ～３Ｇは、免疫グロブリンＦｃポリペプチドのアミノ酸配列を提供する。配列は、配列番号１９～３０に記載されている。 図３－１の説明を参照のこと。 図３－１の説明を参照のこと。 図３－１の説明を参照のこと。 ホモ・サピエンス（Ｈｏｍｏ ｓａｐｉｅｎｓ）（ＮＰ＿００４０３９．１；配列番号３１）、チンパンジー（Ｐａｎ ｔｒｏｇｌｏｄｙｔｅｓ）（ＮＰ＿００１００９０６６．１；配列番号３１）、アカゲザル（Ｍａｃａｃａ ｍｕｌａｔｔａ）（ＮＰ＿００１０４０６０２．１；配列番号３２）、ウシ（Ｂｏｓ ｔａｕｒｕｓ）（ＮＰ＿７７６３１８．１；配列番号３３）、及びマウス（Ｍｕｓ ｍｕｓｃｕｌｕｓ）（ＮＰ＿０３３８６５．２；配列番号３４）からのベータ－２ミクログロブリン（β２Ｍ）前駆体（すなわち、リーダー配列を含む）の複数のアミノ酸配列アラインメントを提供する。アミノ酸１～２０はシグナルペプチドである。 図５Ａ～５Ｃは、対立遺伝子Ａ＊０１０１（配列番号３５）、Ａ＊１１０１（配列番号３６）、Ａ＊２４０２（配列番号３７）、及びＡ＊３３０３（配列番号３８）の全長ヒトＨＬＡ重鎖（図７Ａ）、対立遺伝子Ｂ＊０７０２の全長ヒトＨＬＡ重鎖（配列番号３９）（図７Ｂ）、ならびに全長ヒトＨＬＡ－Ｃ重鎖（配列番号４０）（図７Ｃ）のアミノ酸配列を提供する。 図５－１の説明を参照のこと。 図６は、リーダー配列、膜貫通ドメイン、及び細胞内ドメインを除いた、１１種の成熟ＭＨＣクラスＩ重鎖アミノ酸配列のアラインメントを提供する。配列は、上から順に、配列番号４１～５１である。 図６－１の説明を参照のこと。 図７Ａ～７Ｂは、ＨＬＡ－Ａ重鎖アミノ酸配列（それぞれ、図７Ａ；配列番号５２～６０）のアラインメント及びコンセンサス配列（図７Ｂ：６１）を提供する。 図７Ａの説明を参照のこと。 図８Ａ～８Ｂは、ＨＬＡ－Ｂ重鎖アミノ酸配列（それぞれ、図８Ａ；配列番号６２～６８）のアラインメント及びコンセンサス配列（図８Ｂ；配列番号６９）を提供する。 図８Ａの説明を参照のこと。 図９Ａ～９Ｂは、ＨＬＡ－Ｃ重鎖アミノ酸配列（それぞれ、図９Ａ；配列番号７０～７８）のアラインメント及びコンセンサス配列（図９Ｂ；配列番号７９）を提供する。 図９Ａの説明を参照のこと。 ＨＬＡ－Ｅ、ＨＬＡ－Ｆ、及びＨＬＡ－Ｇ重鎖のそれぞれについてのコンセンサスアミノ酸配列（それぞれ、配列番号８０～８２）を提供する。可変アミノ酸（ａａ）の位置を、連続番号を付した「Ｘ」残基として示す。アミノ酸８４、１３９、及び２３６の位置には二重下線を引いている。 ＨＬＡ－Ａ（配列番号８３）、ＨＬＡ－Ｂ（配列番号８４）、ＨＬＡ－Ｃ（配列番号８５）、ＨＬＡ－Ｅ（配列番号８６）、ＨＬＡ－Ｆ（配列番号８７）、及びＨＬＡ－Ｇ（配列番号８８）のコンセンサスアミノ酸配列のアラインメントを提供する。 図１２Ａ～１２Ｄは、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰの概略図を提供する。 図１２Ａの説明を参照のこと。 図１２Ａの説明を参照のこと。 図１２Ａの説明を参照のこと。 図１３ＡおよびＢは、本開示のＴＭＭＰに含まれるのに適したポリペプチドの例のアミノ酸配列を提供する。配列は、それぞれ配列番号５９４～５９５に記載される。 図１３Ａの説明を参照のこと。 図１４Ａ～１４Ｌは、本開示のＴＭＭＰに含まれるのに適したポリペプチドの例のアミノ酸配列を提供する。配列は、それぞれ配列番号５９６～６０７に記載される。 図１４－１の説明を参照のこと。 図１４－１の説明を参照のこと。 図１５Ａ～１５Ｃは、本開示のジスルフィド結合ＴＭＭＰの構成の例の概略図を提供する。 図１５Ａの説明を参照のこと。 図１５Ａの説明を参照のこと。 本開示のＴＭＭＰの免疫調節ポリペプチドの位置の例の概略図を提供する。
定義
用語「ポリヌクレオチド」及び「核酸」は、本明細書において同じ意味で用いられ、任意の長さを有するヌクレオチドのポリマー形態（リボヌクレオチドまたはデオキシリボヌクレオチドのいずれか）のことを意味する。それゆえ、この用語は、一本鎖、二本鎖、もしくは多本鎖のＤＮＡもしくはＲＮＡ、ゲノムＤＮＡ、ｃＤＮＡ、ＤＮＡ－ＲＮＡハイブリッド、または、プリン塩基及びピリミジン塩基、もしくは、その他の天然ヌクレオチド塩基、化学的に修飾したヌクレオチド塩基もしくは生化学的に修飾したヌクレオチド塩基、非天然ヌクレオチド塩基、もしくは誘導体化されたヌクレオチド塩基を含むポリマー、を含むがこれらに限定されない。
用語「ペプチド」、「ポリペプチド」及び「タンパク質」は、本明細書において同じ意味で用いられ、任意の長さを有するアミノ酸のポリマー形態のことを意味し、コード及び非コードアミノ酸、化学的にもしくは生化学的に修飾もしくは誘導体化されたアミノ酸、及び、修飾ペプチド主鎖を有するポリペプチドを含んでいてもよい。
ポリヌクレオチドまたはポリペプチドは、別のポリヌクレオチドまたはポリペプチドに対する特定のパーセント「配列同一性」を有し、そのことは、アラインして２つの配列を比較する際に、塩基またはアミノ酸のパーセンテージが同一であり、同一の相対位置にあることを意味する。配列同一性については多数の異なる方法を用いて測定することができる。配列同一性を測定するために、様々な簡便な方法、及び、ｗｏｒｌｄ ｗｉｄｅ ｗｅｂにおいて、ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｌｉ．ｇｏｖ／ＢＬＡＳＴ、ｅｂｉ．ａｃ．ｕｋ／Ｔｏｏｌｓ／ｍｓａ／ｔｃｏｆｆｅｅ／、ｅｂｉ．ａｃ．ｕｋ／Ｔｏｏｌｓ／ｍｓａ／ｍｕｓｃｌｅ／、ｍａｆｆｔ．ｃｂｒｃ．ｊｐ／ａｌｉｇｎｍｅｎｔ／ｓｏｆｔｗａｒｅ／を含むサイトで利用可能なコンピュータプログラム（例えば、ＢＬＡＳＴ、Ｔ－ＣＯＦＦＥＥ、ＭＵＳＣＬＥ、ＭＡＦＦＴなど）を使用して配列をアラインしてもよい。例えば、Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．（１９９０），Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｉ．２１５：４０３－１０を参照されたい。
用語「保存的アミノ酸置換」とは、類似した側鎖を有するアミノ酸残基のタンパク質における互換性のことを意味する。例えば、脂肪族側鎖を有するアミノ酸の基は、グリシン、アラニン、バリン、ロイシン、及びイソロイシンから構成され、脂肪族ヒドロキシル側鎖を有するアミノ酸の基はセリン及びスレオニンから構成され、アミド含有側鎖を有するアミノ酸の基はアスパラギン及びグルタミンから構成され、芳香族側鎖を有するアミノ酸の基は、フェニルアラニン、チロシン、及びトリプトファンから構成され、塩基性側鎖を有するアミノ酸の基は、リジン、アルギニン、及びヒスチジンから構成され、酸性側鎖を有するアミノ酸の基はグルタミン酸及びアスパラギン酸から構成され、硫黄含有側鎖を有するアミノ酸の基はシステイン及びメチオニンから構成される。例示的な保存的アミノ酸置換基は、バリン－ロイシン－イソロイシン、フェニルアラニン－チロシン、リジン－アルギニン、アラニン－バリン－グリシン、及びアスパラギン－グルタミンである。
本明細書で使用する場合、用語「免疫学的シナプス」または「免疫シナプス」とは一般に、適応免疫応答の２つの相互作用する免疫細胞間の自然境界面（例えば、抗原提示細胞（ＡＰＣ）または標的細胞と、エフェクター細胞（例えば、リンパ球）、エフェクターＴ細胞、ナチュラルキラー細胞などとの間の境界面を含む）のことを意味する。ＡＰＣとＴ細胞との間の免疫学的シナプスは通常、例えば、Ｂｒｏｍｌｅｙ ｅｔ ａｌ．，Ａｎｎｕ Ｒｅｖ Ｉｍｍｕｎｏｌ．２００１；１９：３７５－９６（その開示全体は参照により本明細書に組み込まれる）に記載されているように、Ｔ細胞抗原受容体と主要組織適合遺伝子複合体分子との相互作用によって開始される。
「Ｔ細胞」は、ＣＤ３を発現する全ての型の免疫細胞を含み、例えば、ヘルパーＴ細胞（ＣＤ４＋細胞）、細胞傷害性Ｔ細胞（ＣＤ８＋細胞）、Ｔ制御性細胞（Ｔｒｅｇ）、及びＮＫ－Ｔ細胞を含む。
本明細書で使用する場合、用語「免疫調節ポリペプチド」（「共刺激ポリペプチド」とも呼ばれる）としては、Ｔ細胞上の関連共免疫調節ポリペプチドに特異的に結合し、それにより、例えば、ＴＣＲ／ＣＤ３複合体がペプチド結合主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）ポリペプチドと結合することによりもたらされた一次シグナルに加えて、増殖、活性化、分化などを含むがこれらに限定されないＴ細胞応答を介在するシグナルをもたらす、抗原提示細胞（ＡＰＣ）（例えば、樹状細胞、Ｂ細胞など）上のポリペプチドが挙げられる。免疫調節ポリペプチドとしては、ＣＤ７、Ｂ７－１（ＣＤ８０）、Ｂ７－２（ＣＤ８６）、ＰＤ－Ｌ１、ＰＤ－Ｌ２、４－１ＢＢＬ、ＯＸ４０Ｌ、Ｆａｓリガンド（ＦａｓＬ）、誘導性共刺激リガンド（ＩＣＯＳ－Ｌ）、細胞間接着分子（ＩＣＡＭ）、ＣＤ３０Ｌ、ＣＤ４０、ＣＤ７０、ＣＤ８３、ＨＬＡ－Ｇ、ＭＩＣＡ、ＭＩＣＢ、ＨＶＥＭ、リンホトキシンベータ受容体、３／ＴＲ６、ＩＬＴ３、ＩＬＴ４、ＨＶＥＭ、Ｔｏｌｌリガンド受容体に結合するアゴニストまたは抗体、及び、Ｂ７－Ｈ３に特異的に結合するリガンドを挙げることができるがこれらに限定されない。
上に記載したように、「免疫調節ポリペプチド」（本明細書ではまた「ＭＯＤ」と呼ぶ）は、Ｔ細胞上の関連共免疫調節ポリペプチドに特異的に結合する。
本開示のＴＭＭＰの「免疫調節ドメイン」（「ＭＯＤ」）は、標的Ｔ細胞上に存在し得る関連共免疫調節ポリペプチドに結合する。
本発明で使用する場合、「非相同」とは、天然の核酸またはタンパク質それぞれには見られない、ヌクレオチドまたはポリペプチドのことを意味する。
本明細書で使用する場合、「組換え」とは、特定の核酸（ＤＮＡまたはＲＮＡ）が、天然系に存在する内在性核酸と識別することが可能な構造コードまたは非コード配列を有する構築物をもたらすクローニング工程、制限工程、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）工程及び／またはライゲーション工程の様々な組み合わせによる生成物であることを意味する。ポリペプチドをコードするＤＮＡ配列を、ｃＤＮＡ断片または一続きの合成オリゴヌクレオチドからアセンブルして、細胞内または無細胞転写及び翻訳系内に含有される組換え転写単位が発現可能な合成核酸を得てもよい。
用語「組換え発現ベクター」または「ＤＮＡ構築物」は本明細書において同じ意味で用いられ、ベクターと少なくとも１つのインサートを含むＤＮＡ分子のことを意味する。組換え発現ベクターは通常、インサート（複数可）を発現及び／または増殖させることを目的として、または、その他の組換えヌクレオチド配列を構築するために、作製される。インサート（複数可）は、プロモーター配列に機能的に連結してもしなくてもよく、ＤＮＡ調節配列に機能的に連結してもしなくてもよい。
本発明で使用する場合、用語「親和性」とは、２つの物質（例えば、抗体及び抗原）の可逆結合における平衡定数のことを意味し、また解離定数（ＫＤ）で表される。親和性は、無関係なアミノ酸配列に対する抗体親和性の、少なくとも１倍超、少なくとも２倍超、少なくとも３倍超、少なくとも４倍超、少なくとも５倍超、少なくとも６倍超、少なくとも７倍超、少なくとも８倍超、少なくとも９倍超、少なくとも１０倍超、少なくとも２０倍超、少なくとも３０倍超、少なくとも４０倍超、少なくとも５０倍超、少なくとも６０倍超、少なくとも７０倍超、少なくとも８０倍超、少なくとも９０倍超、少なくとも１００倍超、もしくは、少なくとも１，０００倍超、またはそれ以上であってもよい。標的タンパク質に対する抗体の親和性は、例えば、約１００ナノモル（ｎＭ）～約０．１ｎＭ、約１００ｎＭ～約１ピコモル（ｐＭ）、もしくは、約１００ｎＭ～約１フェムトモル（ｆＭ）、またはそれ以上であってもよい。本明細書で使用する場合、用語「結合力」とは、希釈後における、２つ以上の物質の複合体の解離に対する抵抗力のことを意味する。用語「免疫反応性」及び「優先的に結合する」は、抗体及び／または抗原結合断片に関し、本明細書において同じ意味で用いられる。
本明細書で使用する場合（例えば、ＴＭＭＰのＴ細胞上のポリペプチド（例えば、Ｔ細胞受容体）への結合に関して）、用語「結合」とは、２つの分子間の非共有結合相互作用のことを意味する。非共有結合とは、例えば、塩橋及び水素橋などの相互作用を含む、静電結合、疎水結合、イオン結合及び／または水素結合の相互作用による、２つの分子間の直接会合のことを意味する。非共有結合相互作用は通常、１０－６Ｍ未満、１０－７Ｍ未満、１０－８Ｍ未満、１０－９Ｍ未満、１０－１０Ｍ未満、１０－１１Ｍ未満、１０－１２Ｍ未満、１０－１３Ｍ未満、１０－１４Ｍ未満、または１０－１５Ｍ未満の解離定数（ＫＤ）を特徴とする。「親和性」とは、非共有結合の強度のことを意味し、高い結合親和性は低いＫＤと相関している。「特異的結合」とは通常、少なくとも約１０－７Ｍ以上、例えば、５×１０－７Ｍ、１０－８Ｍ、５×１０－８Ｍ、１０－９Ｍ以上の親和性を有する結合のことを意味する。「非特異的結合」とは通常、約１０－７Ｍ未満の親和性を有する結合（例えば、１０－６Ｍ、１０－５Ｍ、１０－４Ｍの親和性を有する結合）（例えば、リガンドの指定結合部位または受容体以外の部分へのリガンドの結合）のことを意味する。しかしながら、一部の文脈、例えば、ＴＣＲとペプチド／ＭＨＣ複合体との間の結合において、「特異的結合」は、１μＭ～１００μＭ、または、１００μＭ～１ｍＭの範囲内であってもよい。本明細書で使用する場合、「共有結合（ｃｏｖａｌｅｎｔ ｂｉｎｄｉｎｇ）」または「共有結合（ｃｏｖａｌｅｎｔ ｂｏｎｄ）」とは、２つの異なる分子間に１つ以上の共有化学結合が形成されることを意味する。
本発明で使用する場合、用語「治療」、「治療すること」などは通常、所望の薬理学的効果及び／または生理学的効果を得ることを意味する。その効果は、疾患またはその症状を完全にまたは部分的に予防するという観点において予防的であり得、及び／または、疾患及び／またはその疾患に起因する副作用の部分的または完全な治癒という観点において治療的であり得る。本明細書で使用する場合、「治療」は、哺乳動物における疾患または症状の任意の治療を包含し、（ａ）その疾患または症状にかかりやすいが、まだそれを有すると診断されていない対象における疾患または症状の発症を予防すること、（ｂ）その疾患または症状を抑制すること、すなわち、その発症を阻止すること、及び／または、（ｃ）その疾患を軽減すること、すなわち、その疾患を退行させること、を含む。疾患または傷害の発症前、その間、またはその後に、治療薬を投与してもよい。進行中の疾患の治療（治療は患者の望ましくない臨床症状を安定化または抑制する）には特に利点がある。このような治療は、望ましくは、罹患組織の機能が完全に喪失される前に実施される。本療法は、望ましくは、疾患の症候期中に、一部の例では、疾患の症候期後に投与される。
用語「個体」、「対象」、「宿主」及び「患者」は本明細書において同じ意味で用いられ、診断、治療または療法が望まれる任意の哺乳動物対象のことを意味する。哺乳動物としては、例えば、ヒト、非ヒト霊長類、げっ歯類（例えば、ラット、マウス）、ウサギ目（例えば、ウサギ）、有蹄類（例えば、ウシ、ヒツジ、ブタ、ウマ、ヤギなど）などが挙げられる。
用語「抗体」及び「免疫グロブリン」は、任意のアイソタイプの抗体または免疫グロブリン、抗原への特異的結合を保持する抗体の断片（これらに限定されないが、Ｆａｂ、Ｆｖ、ｓｃＦｖ、及びＦｄ断片、キメラ抗体、ヒト化抗体、一本鎖抗体（ｓｃＡｂ）、単一ドメイン抗体（ｄＡｂ）、単一ドメイン重鎖抗体、単一ドメイン軽鎖抗体、ナノボディ、二重特異性抗体、多特異性抗体、ならびに抗体及び非抗体タンパク質の抗原結合（ａｎｔｉｇｅｎ－ｂｉｎｄｉｎｇ）（本明細書で抗原結合（ａｎｔｉｇｅｎ ｂｉｎｄｉｎｇ）とも称される）部分を含む融合タンパク質を含む）を含む。抗体は、例えば、放射性同位体、検出可能な生成物を生成する酵素、蛍光タンパク質などで検出可能に標識することができる。抗体は、特異的結合対のメンバー、例えば、ビオチン（ビオチン－アビジン特異的結合対のメンバー）などの他の部分に更にコンジュゲートされ得る。用語には、抗原への特異的結合を保持するＦａｂ’、Ｆｖ、Ｆ（ａｂ’）２、及び／または他の抗体断片、ならびにモノクローナル抗体も包含される。本明細書で使用する場合、モノクローナル抗体は、同一の細胞群によって産生される抗体であり、これらの全ては、反復細胞複製によって単一の細胞から産生された。すなわち、細胞のクローンは、単一の抗体種のみを産生する。モノクローナル抗体は、ハイブリドーマ産生技術を使用して産生することができるが、当業者に既知の他の産生方法を使用することもできる（例えば、抗体ファージディスプレイライブラリに由来する抗体）。抗体は、一価または二価であり得る。抗体は、ジスルフィド結合によって接続された２本の重鎖及び２本の軽鎖の４本のポリペプチド鎖からなる「Ｙ字型」分子であるＩｇ単量体であり得る。
本明細書で使用する場合、用語「ヒト化免疫グロブリン」は、異なる起源の免疫グロブリンの一部を含む免疫グロブリンを意味し、少なくとも１つの部分は、ヒト起源のアミノ酸配列を含む。例えば、ヒト化抗体は、必要不可欠特異性を有する非ヒト起源の免疫グロブリンに由来する部分、例えば、マウス、及びヒト起源の免疫グロブリン配列（例えば、キメラ免疫グロブリン）に由来する部分、従来の技術（例えば、合成）によって化学的に結合された部分、または遺伝子工学技術を使用して連続ポリペプチドとして調製された部分（例えば、キメラ抗体のタンパク質部分をコードするＤＮＡは、連続ポリペプチド鎖を産生するために発現され得る）を含むことができる。ヒト化免疫グロブリンの別の例は、非ヒト起源の抗体に由来する相補性決定領域（ＣＤＲ）と、ヒト起源の軽鎖及び／または重鎖に由来するフレームワーク領域（例えば、フレームワーク変化の有無にかかわらず、ＣＤＲグラフト抗体）とを含む１つ以上の免疫グロブリン鎖を含有する免疫グロブリンである。キメラまたはＣＤＲグラフト一本鎖抗体も、ヒト化免疫グロブリンという用語によって包含される。例えば、米国特許第４，８１６，５６７号、欧州特許第０，１２５，０２３Ｂ１号、米国特許第４，８１６，３９７号、欧州特許第０，１２０，６９４Ｂ１号、ＷＯ８６／０１５３３、欧州特許第０，１９４，２７６Ｂ１号、米国特許第５，２２５，５３９号、欧州特許第０，２３９，４００Ｂ１号、及び欧州特許出願第０，５１９，５９６Ａ１号を参照されたい。一本鎖抗体に関して、米国特許第４，９４６，７７８号、米国特許第５，４７６，７８６号、及びＢｉｒｄ ｅｔ ａｌ．（１９８８）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４２：４２３も参照されたい。
用語「ナノボディ」（Ｎｂ）は、本明細書で使用する場合、天然重鎖抗体に由来する最小の抗原結合断片または単一可変ドメイン（ＶＨＨ）を意味し、当業者に既知である。これらは、ラクダ類に見られる重鎖のみの抗体に由来する（Ｈａｍｅｒｓ－Ｃａｓｔｅｒｍａｎ ｅｔ ａｌ．（１９９３）Ｎａｔｕｒｅ ３６３：４４６、Ｄｅｓｍｙｔｅｒ ｅｔ ａｌ．（１９９６）Ｎａｔｕｒｅ Ｓｔｒｕｃｔｕｒａｌ Ｂｉｏｌ．３：８０３、及びＤｅｓｍｙｔｅｒ ｅｔ ａｌ．（２０１５）Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｓｔｒｕｃｔ．Ｂｉｏｌ．３２：１）。「ラクダ科」では、軽鎖ポリペプチドを欠く免疫グロブリンが見出される。「ラクダ類」は、旧世界のラクダ類（Ｃａｍｅｌｕｓ ｂａｃｔｒｉａｎｕｓ及びＣａｍｅｌｕｓ ｄｒｏｍｅｄａｒｉｕｓ）ならびに新世界のラクダ類（例えば、Ｌｌａｍａ ｐａｃｃｏｓ、Ｌｌａｍａ ｇｌａｍａ、Ｌｌａｍａ ｇｕａｎｉｃｏｅ、及びＬｌａｍａ ｖｉｃｕｇｎａ）から構成される。単一可変ドメイン重鎖抗体は、本明細書において、ナノボディまたはＶＨＨ抗体と称される。
「抗体断片」は、インタクトな抗体の一部、例えば、インタクトな抗体の抗原結合領域または可変領域を含む。抗体断片の例としては、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、及びＦｖ断片、ダイアボディ、線形抗体（Ｚａｐａｔａ ｅｔ ａｌ．Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｅｎｇ．８（１０）：１０５７－１０６２（１９９５））、ドメイン抗体（ｄＡｂ；Ｈｏｌｔ ｅｔ ａｌ．（２００３）Ｔｒｅｎｄｓ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．２１：４８４）、一本鎖抗体分子、ならびに抗体断片から形成された多特異性抗体が挙げられる。抗体のパパイン消化は、「Ｆａｂ」断片と呼ばれる、各々が単一の抗原結合部位を有する２つの同一の抗原結合断片と、容易に結晶化する能力を反映した名称である残りの「Ｆｃ」断片とを産生する。ペプシン処理は、２つの抗原結合部位を有し、それでも抗原に架橋結合することができるＦ（ａｂ’）２断片をもたらす。
「Ｆｖ」は、完全な抗原認識部位及び抗原結合部位を含有する最小の抗体断片である。この領域は、密接な非共有結合性会合状態にある１つの重鎖可変ドメインと１つの軽鎖可変ドメインとの二量体からなる。各可変ドメインの３つのＣＤＲがＶＨ－ＶＬ二量体の表面上の抗原結合部位を画定するように相互作用するのは、この構成においてである。合わせて、６つのＣＤＲは、抗体に抗原結合特異性を付与する。しかしながら、単一可変ドメイン（または抗原に対して特異的な３つのＣＤＲのみを含むＦｖの半分）でも、結合部位全体よりも低い親和性であるが、抗原を認識しそれに結合する能力を有する。
「Ｆａｂ」断片は、軽鎖の定常ドメイン及び重鎖の第１の定常ドメイン（ＣＨ１）も含有する。Ｆａｂ断片は、抗体ヒンジ領域からの１つ以上のシステインを含む重鎖ＣＨ１ドメインのカルボキシル末端におけるいくつかの残基の付加により、Ｆａｂ’断片とは異なる。Ｆａｂ’－ＳＨは、定常ドメインのシステイン残基（複数可）が遊離チオール基を有するＦａｂ’に対する、本明細書における名称である。Ｆ（ａｂ’）２抗体断片は、元々、ヒンジシステインを間に有するＦａｂ’断片の対として産生された。抗体断片の他の化学的結合も既知である。
任意の脊椎動物種からの抗体（免疫グロブリン）の「軽鎖」は、それらの定常ドメインのアミノ酸配列に基づいて、カッパ及びラムダと呼ばれる２つの明確に異なる種類のうちの１つに割り当てることができる。それらの重鎖の定常ドメインのアミノ酸配列に応じて、免疫グロブリンを異なるクラスに割り当てることができる。免疫グロブリンには、５つの主要なクラス：ＩｇＡ、ＩｇＤ、ＩｇＥ、ＩｇＧ、及びＩｇＭがあり、これらのクラスのいくつかは更に、サブクラス（アイソタイプ）、例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ、及びＩｇＡ２に分類することができる。サブクラスは、種類、例えば、ＩｇＧ２ａ及びＩｇＧ２ｂに更に分類することができる。
「一本鎖Ｆｖ」または「ｓＦｖ」または「ｓｃＦｖ」抗体断片は、抗体のＶＨ及びＶＬドメインを含み、これらのドメインは、単一のポリペプチド鎖に存在する。いくつかの実施形態では、Ｆｖポリペプチドは、ｓＦｖが抗原結合のための所望の構造を形成することを可能にする、ＶＨドメインとＶＬドメインとの間にポリペプチドリンカーを更に含む。ｓＦｖの概説については、Ｐｌｕｃｋｔｈｕｎ ｉｎ Ｔｈｅ Ｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｙ ｏｆ Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ，ｖｏｌ．１１３，Ｒｏｓｅｎｂｕｒｇ ａｎｄ Ｍｏｏｒｅ ｅｄｓ．，Ｓｐｒｉｎｇｅｒ－Ｖｅｒｌａｇ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，ｐｐ．２６９－３１５（１９９４）を参照されたい。
用語「ダイアボディ」は、２つの抗原結合部位を有する小さい抗体断片を意味し、この断片は、同じポリペプチド鎖内で重鎖可変ドメイン（ＶＨ）が軽鎖可変ドメイン（ＶＬ）に接続したもの（ＶＨ－ＶＬ）を含む。同じ鎖上の２つのドメイン間での対合を可能にするには短すぎるリンカーを使用することにより、これらのドメインは別の鎖の相補的ドメインと対合させられ、２つの抗原結合部位を作り出す。ダイアボディは、例えば、ＥＰ４０４，０９７、ＷＯ９３／１１１６１、及びＨｏｌｌｉｎｇｅｒ ｅｔ ａｌ．（１９９３）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９０：６４４４－６４４８により完全に記載されている。
本明細書で使用する場合、用語「ＣＤＲ」または「相補性決定領域」は、重鎖及び軽鎖ポリペプチドの両方の可変領域内に見出される非連続抗原結合部位を意味することが意図される。ＣＤＲは、Ｋａｂａｔ ｅｔ ａｌ（１９７７）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２５２：６６０９、Ｋａｂａｔ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．Ｄｅｐｔ．ｏｆ Ｈｅａｌｔｈ ａｎｄ Ｈｕｍａｎ Ｓｅｒｖｉｃｅｓ，“Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｏｆ ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ ｉｎｔｅｒｅｓｔ”（１９９１）（本明細書において、Ｋａｂａｔ １９９１とも称される）により、Ｃｈｏｔｈｉａ ｅｔ ａｌ．（１９８７）Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１９６：９０１（本明細書において、Ｃｈｏｔｈｉａ １９８７とも称される）、及びＭａｃＣａｌｌｕｍ ｅｔ ａｌ．（１９９６）Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２６２：７３２（定義は、互いに比較された場合、アミノ酸残基の重複またはサブセットを含む）により記載されている。それにもかかわらず、抗体またはグラフト抗体またはそのバリアント型のＣＤＲを意味するいずれかの定義の適用は、本明細書で定義及び使用される用語の範囲内であることが意図される。上記の引用文献のそれぞれによって定義される、ＣＤＲを包含するアミノ酸残基を、比較として以下の表２に示す。
（表２）ＣＤＲの定義
Figure 2022536581000002
１ 残基の付番は、Ｋａｂａｔ ｅｔ ａｌ．，１９９１（上記）の命名法に従う。
２ 残基の付番は、Ｃｈｏｔｈｉａ ｅｔ ａｌ．（上記）の命名法に従う。
３ 残基の付番は、ＭａｃＣａｌｌｕｍ ｅｔ ａｌ．（上記）の命名法に従う。
本明細書で使用する場合、用語「ＣＤＲ－Ｌ１」、「ＣＤＲ－Ｌ２」、及び「ＣＤＲ－Ｌ３」は、それぞれ、軽鎖可変領域における第１、第２、及び第３のＣＤＲを意味する。本明細書で使用する場合、用語「ＣＤＲ－Ｈ１」、「ＣＤＲ－Ｈ２」、及び「ＣＤＲ－Ｈ３」は、それぞれ、重鎖可変領域における第１、第２、及び第３のＣＤＲを意味する。本明細書で使用する場合、用語「ＣＤＲ－１」、「ＣＤＲ－２」、及び「ＣＤＲ－３」は、それぞれ、いずれかの鎖の可変領域の第１、第２、及び第３のＣＤＲを意味する。
本明細書で使用する場合、用語「フレームワーク」は、抗体可変領域に関して使用される場合、抗体の可変領域内のＣＤＲ領域外の全てのアミノ酸残基を意味することが意図される。可変領域フレームワークは、一般に、約１００～１２０アミノ酸の長さの不連続アミノ酸配列であるが、ＣＤＲの外側のそれらのアミノ酸のみを参照することが意図される。本明細書で使用する場合、用語「フレームワーク領域」は、ＣＤＲによって分離されるフレームワークの各ドメインを意味することが意図される。
本発明を更に説明する前に、本発明が記載する特定の実施形態に限定されることはなく、それゆえ当然変化し得るということを理解されたい。本明細書で用いる専門用語は、特定の実施形態を説明するためだけのものであり、本発明の範囲は添付の特許請求の範囲によってのみ限定されることから、限定することを意図するものではないということを理解されたい。
数値の範囲を提供する場合、その範囲の上限と下限との間にある各介在値（文脈上明確に指示しない限り、下限値の単位の１０分の１まで）、及び、その明示範囲内の任意のその他明示値または介在値が本発明に包含されることを理解されたい。これら狭めた範囲の上限値及び下限値は、その狭めた範囲内に独立して含まれていてもよく、また、明示範囲内において特に除外した任意の値に従い、本発明に包含される。明示範囲がそれら上限値及び下限値のうちの１つまたは両方を含む場合、それら包含される上限値及び下限値のいずれかまたは両方を除外する範囲もまた本発明に包含される。
別途定義しない限り、本明細書で使用する全ての技術用語及び科学用語は、本発明が属する技術分野の当業者が一般に理解する意味と同一の意味を有する。本明細書に記載の方法及び物質と同様または同等の任意の方法及び物質を、本発明の実施または試験において使用することもできるが、好ましい方法及び物質については以下で説明する。本明細書で言及する全ての刊行物は、それら刊行物が引用する内容と関連させて本方法及び／または物質を開示及び説明するために、参照により本明細書に組み込まれる。
本明細書及び添付の特許請求の範囲で使用される単数形「ａ」、「ａｎ」、及び「ｔｈｅ」は、文脈上明確に指示しない限り、複数の指示対象を含むことに留意すべきである。それゆえ、例えば、「Ｔ細胞調節多量体ポリペプチド」への言及は、複数のそのようなポリペプチドを含み、「免疫調節ポリペプチド」への言及は、１つ以上の免疫調節ポリペプチド及び当業者に周知のその同等物などへの言及を含む。更に、特許請求の範囲が任意の要素を除外するように作成されてもよいということに留意されたい。したがって、この記述は、クレーム要素の列挙と関連させて、「単に」、「のみ」などの排他的な用語の使用、または、「否定的な」限定の使用が、先行詞として機能することを意図するものである。
分かりやすく、個々の実施形態との関係において記載した本発明における特定の特徴を、更に、単一の実施形態内において組み合わせて提供してもよいということを理解されたい。逆の言い方をすれば、簡潔とするため、単一の実施形態との関係において記載した本発明における様々な特徴を、更に、別々に、または、任意の好適な副組み合わせで提供してもよい。本発明に属する実施形態の全ての組み合わせは、本発明により明示的に包含され、全ての組み合わせが個別にかつ明確に開示されるかのように本明細書において開示される。加えて、様々な実施形態及びそれらの要素における全ての副組み合わせもまた、本発明により明示的に包含され、全てのこのような副組み合わせが個別にかつ明確に本明細書において開示されるかのように、本明細書において開示される。
本明細書に記載する刊行物は、単に本願の出願日前にそれらの開示を提供したに過ぎない。本明細書におけるいずれの内容も、本発明が、先行発明によりこのような刊行物に先行する権利を持たないことを認めるものとして解釈されるべきではない。更に、提供した刊行物の日付は実際の刊行日とは異なる場合があり、個別に確認する必要が生じる場合がある。
詳細な説明
本開示は、免疫調節ポリペプチドを含み、エピトープ提示ペプチドを含むＴ細胞調節多量体ポリペプチドを提供する。ＴＭＭＰは、Ｔ細胞の活性化を調節するのに、また個体における免疫応答を調節するのに有用である。
Ｔ細胞調節多量体ポリペプチド
本開示は、ａ）第１のポリペプチドと、ｂ）第２のポリペプチドとを含むＴ細胞調節多量体ポリペプチド（ＴＭＭＰ）を提供し、ＴＭＭＰは、ＭＵＣ１ペプチドと、第１の主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）ポリペプチドと、第２のＭＨＣポリペプチドと、１つ以上の免疫調節ポリペプチドと、任意選択で免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドまたは非Ｉｇスキャフォールドと、を含む。本明細書で使用する場合、用語「ＭＵＣ１ペプチド」は、ＭＵＣ１ペプチドが、ＭＨＣ複合体に結合する際にＭＵＣ１エピトープをＴ細胞受容体（ＴＣＲ）に提示する、少なくとも４アミノ酸長、例えば４アミノ酸～約２５アミノ酸（例えば、４アミノ酸（ａａ）、５ａａ、６ａａ、７ａａ、８ａａ、９ａａ、１０ａａ、１１ａａ、１２ａａ、１３ａａ、１４ａａ、１５ａａ、１６ａａ、１７ａａ、１８ａａ、１９ａａ、２０ａａ、２１ａａ、２２ａａ、２３ａａ、２４ａａ、または２５ａａ、長さが４～２０アミノ酸、６～１８アミノ酸、８～１５アミノ酸、８～１２アミノ酸、５～１０アミノ酸、１０～２０アミノ酸、及び１５～２５アミノ酸の範囲内を含む）を有するペプチドを意味する。本明細書で使用する場合、用語「ＭＵＣ１エピトープ」は、ＭＵＣ１タンパク質上に見出されるエピトープを意味する。本明細書で使用する場合、用語「ＭＵＣ１」及び「ＭＵＣ１タンパク質」は同義であり、（ｉ）成熟ＭＵＣ１タンパク質（以下で説明）、（ｉｉ）成熟ＭＵＣ－１タンパク質の構成要素、例えば、ＭＵＣ１－Ｎ、ＭＵＣ－１ Ｃ、及びＭＵＣ１－Ｃの細胞外領域、膜貫通ドメイン、及び細胞質尾部（すべて以下で説明する）、ならびに（ｉｉｉ）ヒトのがんに発生する（ｉ）及び（ｉｉ）のバリアント型（例えば、突然変異形態、スプライスバリアント、アイソフォーム、低グリコシル化形態、切断形態などを含む）のうちの１つのアミノ酸配列を有するタンパク質を意味する。本明細書で使用する場合、用語「ＭＵＣ１ポリペプチド」は、ＭＵＣ１タンパク質のすべてもしくは一部に見られるアミノ酸の配列を有するポリペプチド、または特定されている場合、ＭＵＣ１タンパク質のすべてもしくは一部に見られるアミノ酸の配列に対して少なくとも８０％の配列同一性を有するポリペプチドを意味する。
ＭＵＣ１（腫瘍関連上皮膜抗原、腫瘍関連上皮ムチン、ＣＤ２２７抗原、乳癌関連抗原ＤＦ３、ピーナッツ反応性尿中ムチン、多型上皮ムチン、がん関連ムチン、クレブスフォンデンルンゲン－６、エピシアリン、ＰＥＭ、Ｈ２３Ａｇ、ＥＭＡ、ＭＵＣ－１／ＳＥＣ、ＡＤＭＣＫＤ１、ＭＡＭ６、がん抗原１５－３（ＣＡ１５－３）、及びＭＣＡとしても知られる）は、単層の腺上皮の頂端面に発現する多型膜貫通糖タンパク質である。Ｎａｔｈ ａｎｄ Ｍｕｋｈｅｒｊｅｅ（２０１４）Ｔｒｅｎｄｓ Ｍｏｌ．Ｍｅｄ．２０：３３２。ＭＵＣ１遺伝子は、シグナルペプチド配列を含む単一ポリペプチド鎖前駆体をコードする。翻訳直後にシグナルペプチド配列が除去され、ＭＵＣ１前駆体の残りの部分は、さらに２つのペプチドフラグメント：長いＮ末端サブユニット（ＭＵＣ１－ＮまたはＭＵＣ１ａ）と短いＣ末端サブユニット（ＭＵＣ１－Ｃまたは ＭＵＣ１６）に切断される。成熟ＭＵＣ１は、安定した水素結合を介して結合したＭＵＣ１－ＮとＭＵＣ１－Ｃを含む。細胞外ドメインであるＭＵＣ１－Ｎには、２０アミノ酸残基の２５～１２５の可変数タンデムリピート（ＶＮＴＲ）が含まれる。ＭＵＣ１－Ｃには、短い細胞外領域（約５３アミノ酸）、膜貫通ドメイン（約２８アミノ酸）、及び細胞質尾部（約７２アミノ酸）が含まれる。ＭＵＣ１の細胞質尾部（ＭＵＣ１－ＣＴ）には、成長因子受容体と細胞内キナーゼによってリン酸化される高度に保存されたセリンとチロシンの残基が含まれる。ヒトＭＵＣ１は、様々な種類のＭＵＣ１ ＲＮＡ選択的スプライシングから生じる複数のアイソフォームで存在する。全長ヒトＭＵＣ１アイソフォーム１タンパク質前駆体（アイソフォーム１、Ｕｎｉｐｒｏｔ Ｐ１５９４１－１）のアミノ酸配列を以下に提供する。ヒトＭＵＣ－１の少なくとも１６の他のアイソフォームがこれまでに報告されており（Ｕｎｉｐｒｏｔ Ｐ１５９４１－２からＰ１５９４１－１７）、アイソフォーム１の配列と比較して、様々な挿入、欠失、または置換が含まれている。これらのアイソフォームは、アイソフォーム２、３、４、５、６、Ｙ、８、９、Ｆ、Ｙ－ＬＳＰ、Ｓ２、Ｍ６、ＺＤ、Ｔ１０、Ｅ２、及びＪ１３として知られている（それぞれＵｎｉｐｒｏｔ Ｐ１５９４１－２からＰ１５９４１－１７）。全長ヒトＭＵＣ１アイソフォーム１前駆体タンパク質は、１２５５アミノ酸から構成されており、アミノ酸１～２３にシグナルペプチド配列を含む。成熟ＭＵＣ１タンパク質のＭＵＣ１－Ｎ及びＭＵＣ１－Ｃドメインは、それぞれアミノ酸２４～１０９７及び１０９８～１２５５から構成される。
本開示はＴＭＭＰを提供し、本開示はＴＭＭＰを提供し、ＴＭＭＰは、ａ）第１のＭＨＣポリペプチドを含む第１のポリペプチドと、ｂ）第２のＭＨＣポリペプチドを含む第２のポリペプチドとを含む、ヘテロ二量体であり、第１のポリペプチドまたは第２のポリペプチドはＭＵＣ１ペプチドを含み、第１のポリペプチド及び／または第２のポリペプチドは、同一であるかまたは異なっていてもよい１つ以上の免疫調節ポリペプチドと、任意選択で、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドまたは非Ｉｇスキャフォールドとを含む。本開示のＴＭＭＰは、本明細書において「本開示の多量体ポリペプチド」または「ｓｙｎＴａｃ」とも称される。
本開示は、ａ）ｉ）ＭＵＣ１ペプチドと、ｉｉ）第１のＭＨＣポリペプチドとを含む第１のポリペプチドと、ｂ）第２のＭＨＣポリペプチドを含む第２のポリペプチドと、ｃ）少なくとも１つの免疫調節ポリペプチド（第１及び／または第２のポリペプチドは、少なくとも１つ（すなわち、１つ以上）の免疫調節ポリペプチドを含む）とを含むヘテロ二量体ポリペプチドを含むＴＭＭＰを提供する。任意選択で、第１または第２のポリペプチドは、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドまたは非Ｉｇスキャフォールドを含む。１つ以上の免疫調節ポリペプチドのうちの少なくとも１つは、関連共免疫調節ポリペプチドに対する対応する野生型免疫調節ポリペプチドの親和性と比較して、関連共免疫調節ポリペプチドに対する低い親和性を示すバリアント型免疫調節ポリペプチドである。本開示のＴＭＭＰ内に存在するＭＵＣ１ペプチドは、Ｔ細胞上のＴ細胞受容体（ＴＣＲ）に少なくとも１００μＭ（例えば、少なくとも１０μＭ、少なくとも１μＭ、少なくとも１００ｎＭ、少なくとも１０ｎＭ、または、少なくとも１ｎＭ）の親和性で結合する。本開示のＴＭＭＰは、ＴＭＭＰが第２のＴ細胞に結合する親和性よりも少なくとも２５％高い親和性で第１のＴ細胞に結合し、第１のＴ細胞はその表面上に、関連共免疫調節ポリペプチド、及びＭＵＣ１ペプチド／ＭＨＣ複合体に少なくとも１００μＭの親和性で結合するＴＣＲを発現し、第２のＴ細胞はその表面上に、関連共免疫調節ポリペプチドを発現するが、その表面上に、ＭＵＣ１ペプチド／ＭＨＣ複合体に少なくとも１００μＭ（例えば、少なくとも１０μＭ、少なくとも１μＭ、少なくとも１００ｎＭ、少なくとも１０ｎＭ、または少なくとも１ｎＭ）の親和性で結合するＴＣＲを発現しない。
本開示はＴＭＭＰを提供し、ＴＭＭＰは、
Ａ）ヘテロ二量体であって、ａ）第１のＭＨＣポリペプチドを含む第１のポリペプチドと、ｂ）第２のＭＨＣポリペプチドを含む第２のポリペプチドとを含む、ヘテロ二量体（第１のポリペプチドまたは第２のポリペプチドはＭＵＣ１ペプチドを含み、第１のポリペプチド及び／または第２のポリペプチドは、同一であるかまたは異なっていてもよい１つ以上の免疫調節ポリペプチドを含み、１つ以上の免疫調節ポリペプチドのうちの少なくとも１つは、野生型免疫調節ポリペプチドまたは野生型免疫調節ポリペプチドのバリアント型であってもよく、バリアント型免疫調節ポリペプチドは、対応する野生型免疫調節ポリペプチドのアミノ酸配列と比較して、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０のアミノ酸置換を含み、第１のポリペプチドまたは第２のポリペプチドは、任意選択で、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドまたは非Ｉｇスキャフォールドを含む）、または
Ｂ）ヘテロ二量体であって、ａ）第１のＭＨＣポリペプチドを含む第１のポリペプチドと、ｂ）第２のＭＨＣポリペプチドを含む第２のポリペプチドとを含む、ヘテロ二量体（第１のポリペプチドまたは第２のポリペプチドはＭＵＣ１ペプチドを含み、第１のポリペプチド及び／または第２のポリペプチドは、同一であるかまたは異なっていてもよい１つ以上の免疫調節ポリペプチドを含み、
１つ以上の免疫調節ポリペプチドのうちの少なくとも１つは、野生型免疫調節ポリペプチドのバリアント型であり、バリアント型免疫調節ポリペプチドは、対応する野生型免疫調節ポリペプチドのアミノ酸配列と比較して、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０のアミノ酸置換を含み、
１つ以上の免疫調節ドメインのうちの少なくとも１つは、関連共免疫調節ポリペプチドに対する対応する野生型免疫調節ポリペプチドの親和性と比較して、関連共免疫調節ポリペプチドに対する低い親和性を示すバリアント型免疫調節ポリペプチドであり、ＭＵＣ１ペプチド／ＭＨＣ複合体は、Ｔ細胞上のＴＣＲに少なくとも１０－７Ｍの親和性で結合し、それにより、ｉ）ＴＭＭＰポリペプチドが、第１のＴ細胞に対し、ＴＭＭＰが第２のＴ細胞に結合する親和性に比べて少なくとも２５％高い親和性で結合し、第１のＴ細胞がその表面上に、関連共免疫調節ポリペプチド及び少なくとも１０－７Ｍの親和性でＭＵＣ１ペプチド／ＭＨＣ複合体に結合するＴＣＲを発現し、第２のＴ細胞がその表面上に、関連共免疫調節ポリペプチドを発現するが、その表面上に、少なくとも１０－７Ｍの親和性でＭＵＣ１ペプチド／ＭＨＣ複合体に結合するＴＣＲを発現せず、及び／またはｉｉ）関連共免疫調節ポリペプチドに対する対照ＴＭＭＰ（対照は、野生型免疫調節ポリペプチドを含む）の結合親和性の、関連共免疫調節ポリペプチドに対する野生型免疫調節ポリペプチドのバリアント型を含むＴＭＭＰの結合親和性との比が、バイオレイヤー干渉法によって測定された場合に、１．５：１～１０６：１の範囲にあり、バリアント型免疫調節ポリペプチドは、対応する野生型免疫調節ポリペプチドのアミノ酸配列と比較して、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０のアミノ酸置換を含み、
第１のポリペプチドまたは第２のポリペプチドは、任意選択で、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドまたは非Ｉｇスキャフォールドを含む）、または
Ｃ）ヘテロ二量体であって、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＵＣ１ペプチド、ｉｉ）第１のＭＨＣポリペプチドを含む第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）第２のＭＨＣポリペプチド、及びｉｉ）任意選択で、免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドまたは非Ｉｇスキャフォールドを含む第２のポリペプチドとを含む、ヘテロ二量体を含み、ＴＭＭＰは、同一であるかまたは異なっていてもよい１つ以上の免疫調節ドメインを含み、１つ以上の免疫調節ドメインのうちの少なくとも１つは、Ａ）第１のポリペプチドのＣ末端、Ｂ）第２のポリペプチドのＮ末端、Ｃ）第２のポリペプチドのＣ末端、またはＤ）第１のポリペプチドのＣ末端及び第２のポリペプチドのＮ末端にあり、１つ以上の免疫調節ドメインのうちの少なくとも１つは、野生型免疫調節ポリペプチドまたは野生型免疫調節ポリペプチドのバリアント型であってもよく、バリアント型免疫調節ポリペプチドは、対応する野生型免疫調節ポリペプチドのアミノ酸配列と比較して、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０のアミノ酸置換を含み、
任意選択で、１つ以上の免疫調節ドメインのうちの少なくとも１つは、関連共免疫調節ポリペプチドに対する対応する野生型免疫調節ポリペプチドの親和性と比較して、関連共免疫調節ポリペプチドに対する低い親和性を示すバリアント型免疫調節ポリペプチドであり、ＭＵＣ１ペプチド／ＭＨＣ複合体は、Ｔ細胞上のＴＣＲに少なくとも１０－７Ｍの親和性で結合し、それにより、ｉ）ＴＭＭＰが、第１のＴ細胞に対し、ＴＭＭＰが第２のＴ細胞に結合する親和性に比べて少なくとも２５％高い親和性で結合し、第１のＴ細胞がその表面上に、関連共免疫調節ポリペプチド及び少なくとも１０－７Ｍの親和性でＭＵＣ１ペプチド／ＭＨＣ複合体に結合するＴＣＲを発現し、第２のＴ細胞がその表面上に、関連共免疫調節ポリペプチドを発現するが、その表面上に、少なくとも１０－７Ｍの親和性でＭＵＣ１ペプチド／ＭＨＣ複合体に結合するＴＣＲを発現せず、及び／またはｉｉ）関連共免疫調節ポリペプチドに対する対照ＴＭＭＰ（対照は、野生型免疫調節ポリペプチドを含む）の結合親和性の、関連共免疫調節ポリペプチドに対する野生型免疫調節ポリペプチドのバリアント型を含むＴＭＭＰの結合親和性との比が、バイオレイヤー干渉法によって測定された場合に、１．５：１～１０６：１の範囲にあり、バリアント型免疫調節ポリペプチドは、対応する野生型免疫調節ポリペプチドのアミノ酸配列と比較して、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０のアミノ酸置換を含む。
本開示は、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＵＣ１ペプチド、ｉｉ）第１のＭＨＣポリペプチドを含む第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）第２のＭＨＣポリペプチド、及びｉｉ）任意選択で、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドまたは非Ｉｇスキャフォールドを含む第２のポリペプチドとを含む、ＴＭＭＰを提供する。本開示のＴＭＭＰは、１つ以上の免疫調節ポリペプチドを含み、１つ以上の免疫調節ポリペプチドのうちの少なくとも１つは、Ａ）第１のポリペプチドのＣ末端、Ｂ）第２のポリペプチドのＮ末端、Ｃ）第２のポリペプチドのＣ末端、またはＤ）第１のポリペプチドのＣ末端及び第２のポリペプチドのＮ末端にある。１つ以上の免疫調節ポリペプチドのうちの少なくとも１つは、関連共免疫調節ポリペプチドに対する対応する野生型免疫調節ポリペプチドの親和性と比較して、関連共免疫調節ポリペプチドに対する低い親和性を示すバリアント型免疫調節ポリペプチドである。本開示のＴＭＭＰ内に存在するＭＵＣ１ペプチド／ＭＨＣ複合体は、Ｔ細胞上のＴ細胞受容体（ＴＣＲ）に少なくとも１００μＭ（例えば、少なくとも１０μＭ、少なくとも１μＭ、少なくとも１００ｎＭ、少なくとも１０ｎＭ、または、少なくとも１ｎＭ）の親和性で結合する。本開示のＴＭＭＰは、ＴＭＭＰが第２のＴ細胞に結合する親和性よりも少なくとも２５％高い親和性で第１のＴ細胞に結合し、第１のＴ細胞はその表面上に、関連共免疫調節ポリペプチド、及びＭＵＣ１ペプチド／ＭＨＣ複合体に少なくとも１００μＭの親和性で結合するＴＣＲを発現し、第２のＴ細胞はその表面上に、関連共免疫調節ポリペプチドを発現するが、その表面上に、ＭＵＣ１ペプチド／ＭＨＣ複合体に少なくとも１００μＭ（例えば、少なくとも１０μＭ、少なくとも１μＭ、少なくとも１００ｎＭ、少なくとも１０ｎＭ、または、少なくとも１ｎＭ）の親和性で結合するＴＣＲを発現しない。
一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するＭＵＣ１ペプチド／ＭＨＣ複合体は、Ｔ細胞上のＴＣＲに、約１０－４Ｍ～約５ｘ１０－４Ｍ、約５ｘ１０－４Ｍ～約１０－５Ｍ、約１０－５Ｍ～５ｘ１０－５Ｍ、約５ｘ１０－５Ｍ～１０－６Ｍ、約１０－６Ｍ～約５ｘ１０－６Ｍ、約５ｘ１０－６Ｍ～約１０－７Ｍ、約１０－７Ｍ～約５ｘ１０－７Ｍ、約５ｘ１０－７Ｍ～約１０－８Ｍ、または約１０－８Ｍ～約１０－９Ｍの親和性で結合する。別の方法で表すと、一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するＭＵＣ１ペプチド／ＭＨＣ複合体は、Ｔ細胞上のＴＣＲに、約１ｎＭ～約５ｎＭ、約５ｎＭ～約１０ｎＭ、約１０ｎＭ～約５０ｎＭ、約５０ｎＭ～約１００ｎＭ、約０．１μＭ～約０．５μＭ、約０．５μＭ～約１μＭ、約１μＭ～約５μＭ、約５μＭ～約１０μＭ、約１０μＭ～約２５μＭ、約２５μＭ～約５０μＭ、約５０μＭ～約７５μＭ、約７５μＭ～約１００μＭの親和性で結合する。
一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在する免疫調節ポリペプチドは、関連共免疫調節ポリペプチドに対する対応する野生型免疫調節ポリペプチドの親和性に比べて少なくとも１０％低い、少なくとも１５％低い、少なくとも２０％低い、少なくとも２５％低い、少なくとも３０％低い、少なくとも３５％低い、少なくとも４０％低い、少なくとも４５％低い、少なくとも５０％低い、少なくとも５５％低い、少なくとも６０％低い、少なくとも６５％低い、少なくとも７０％低い、少なくとも７５％低い、少なくとも８０％低い、少なくとも８５％低い、少なくとも９０％低い、少なくとも９５％低い、または９５％超低い親和性でその関連共免疫調節ポリペプチドに結合する。
一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するバリアント型免疫調節ポリペプチドは、関連共免疫調節ポリペプチドに対して、１ｎＭ～１００ｎＭまたは１００ｎＭ～１００μＭの結合親和性を有する。例えば、一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するバリアント型免疫調節ポリペプチドは、関連共免疫調節ポリペプチドに対して、約１００ｎＭ～１５０ｎＭ、約１５０ｎＭ～約２００ｎＭ、約２００ｎＭ～約２５０ｎＭ、約２５０ｎＭ～約３００ｎＭ、約３００ｎＭ～約３５０ｎＭ、約３５０ｎＭ～約４００ｎＭ、約４００ｎＭ～約５００ｎＭ、約５００ｎＭ～約６００ｎＭ、約６００ｎＭ～約７００ｎＭ、約７００ｎＭ～約８００ｎＭ、約８００ｎＭ～約９００ｎＭ、約９００ｎＭ～約１μＭ、約１μＭ～約５μＭ、約５μＭ～約１０μＭ、約１０μＭ～約１５μＭ、約１５μＭ～約２０μＭ、約２０μＭ～約２５μＭ、約２５μＭ～約５０μＭ、約５０μＭ～約７５μＭ、または約７５μＭ～約１００μＭの結合親和性を有する。一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するバリアント型免疫調節ポリペプチドは、関連共免疫調節ポリペプチドに対して、約１ｎＭ～約５ｎＭ、約５ｎＭ～約１０ｎＭ、約１０ｎＭ～約５０ｎＭ、約５０ｎＭ～約１００ｎＭの結合親和性を有する。
免疫調節ポリペプチドの関連共免疫調節ポリペプチドに対する免疫調節ポリペプチドの低い親和性と、ＴＣＲに対するＭＵＣ１ペプチドの親和性とを組み合わせることにより、本開示のＴＭＭＰの向上した選択性がもたらされる。例えば、本開示のＴＭＭＰは、ｉ）ＴＭＭＰ内に存在するエピトープ以外のエピトープに特異的なＴＣＲとｉｉ）ＴＭＭＰ内に存在する免疫調節ポリペプチドに結合する共免疫調節ポリペプチドを提示する第２のＴ細胞への結合と比較して、ｉ）ＴＭＭＰ内に存在するＭＵＣ１ペプチドに特異的なＴＣＲとｉｉ）ＴＭＭＰ内に存在する免疫調節ポリペプチドに結合する共免疫調節ポリペプチドの両方を提示する第１のＴ細胞に選択的に結合する。例えば、本開示のＴＭＭＰは、第１のＴ細胞に対して、第２のＴ細胞に結合する親和性と比べて、少なくとも１０％、少なくとも１５％、少なくとも２０％、少なくとも２５％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも２倍、少なくとも２．５倍、少なくとも５倍、少なくとも１０倍、少なくとも１５倍、少なくとも２０倍、少なくとも２５倍、少なくとも５０倍、少なくとも１００倍、または１００倍超高い親和性で結合する。
一部の例では、本開示のＴＭＭＰは、それを必要とする個体に投与する際に、エピトープ特異的Ｔ細胞応答とエピトープ非特異的Ｔ細胞応答の両方を誘導する。言い換えると、一部の例では、本開示のＴＭＭＰは、それを必要とする個体に投与する際に、ｉ）ＴＭＭＰ内に存在するＭＵＣ１エピトープに特異的なＴＣＲとｉｉ）ＴＭＭＰ内に存在する免疫調節ポリペプチドに結合する共免疫調節ポリペプチドの両方を提示する第１のＴ細胞の活性化を調節することによって、エピトープ特異的Ｔ細胞応答を誘導し、ｉ）ＴＭＭＰ内に存在するＭＵＣ１エピトープ以外のエピトープに特異的なＴＣＲとｉｉ）ＴＭＭＰ内に存在する免疫調節ポリペプチドに結合する共免疫調節ポリペプチドを提示する第２のＴ細胞の活性化を調節することによって、エピトープ非特異的Ｔ細胞応答を誘導する。エピトープ特異的Ｔ細胞応答とエピトープ非特異的Ｔ細胞応答の比率は、少なくとも２：１、少なくとも５：１、少なくとも１０：１、少なくとも１５：１、少なくとも２０：１、少なくとも２５：１、少なくとも５０：１、または、少なくとも１００：１である。エピトープ特異的Ｔ細胞応答とエピトープ非特異的Ｔ細胞応答の比率は、約２：１～約５：１、約５：１～約１０：１、約１０：１～約１５：１、約１５：１～約２０：１、約２０：１～約２５：１、約２５：１～約５０：１、もしくは、約５０：１～約１００：１、または、１００：１超である。Ｔ細胞の「活性化を調節すること」としては、ｉ）細胞傷害性（例えば、ＣＤ８＋）Ｔ細胞を活性化させること、ｉｉ）細胞傷害性（例えば、ＣＤ８＋）Ｔ細胞の細胞傷害活性を誘導すること、ｉｉｉ）細胞傷害性（例えば、ＣＤ８＋）Ｔ細胞による細胞毒（例えば、パーフォリン、グランザイム、グラニュライシン）の産生及び放出を誘導すること、ｉｖ）自己反応性Ｔ細胞の活性化を抑制すること、などのうちの１つ以上を挙げることができる。
免疫調節ポリペプチドの関連共免疫調節ポリペプチドに対する免疫調節ポリペプチドの低い親和性と、ＴＣＲに対するＭＵＣ１エピトープの親和性とを組み合わせることにより、本開示のＴＭＭＰの向上した選択性がもたらされる。それゆえ、例えば、本開示のＴＭＭＰは、ｉ）ＴＭＭＰ内に存在するエピトープ以外のエピトープに特異的なＴＣＲとｉｉ）ＴＭＭＰ内に存在する免疫調節ポリペプチドに結合する共免疫調節ポリペプチドを提示する第２のＴ細胞に本開示のＴＭＭＰが結合する結合力よりも高い結合力で、ｉ）ＴＭＭＰ内に存在するＭＵＣ１エピトープに特異的なＴＣＲとｉｉ）ＴＭＭＰ内に存在する免疫調節ポリペプチドに結合する共免疫調節ポリペプチドの両方を提示する第１のＴ細胞に結合する。
免疫調節ポリペプチドとその関連共免疫調節ポリペプチドとの間の結合親和性は、精製された免疫調節ポリペプチド及び精製された関連共免疫調節ポリペプチドを使用して、バイオレイヤー干渉法（ＢＬＩ）によって決定することができる。ＴＭＭＰとその関連共免疫調節ポリペプチドとの間の結合親和性は、精製されたＴＭＭＰ及び関連共免疫調節ポリペプチドを使用して、ＢＬＩによって決定することができる。ＢＬＩ法は、当業者に周知である。例えば、Ｌａｄ ｅｔ ａｌ．（２０１５）Ｊ．Ｂｉｏｍｏｌ．Ｓｃｒｅｅｎ．２０（４）：４９８－５０７及びＳｈａｈ ａｎｄ Ｄｕｎｃａｎ（２０１４）Ｊ．Ｖｉｓ．Ｅｘｐ．１８：ｅ５１３８３を参照されたい。
ＢＬＩアッセイは、以下のように、Ｏｃｔｅｔ ＲＥＤ ９６（Ｐａｌ ＦｏｒｔｅＢｉｏ）装置、または同様の装置を使用して実行することができる。ＴＭＭＰ（例えば、本開示のＴＭＭＰ、対照ＴＭＭＰ（対照ＴＭＭＰは、野生型免疫調節ポリペプチドを含む））は、不溶性支持体（「バイオセンサー」）上に固定化される。固定化されたＴＭＭＰが「標的」である。捕捉抗体を不溶性支持体上に固定することによって、固定化をもたらすことができ、捕捉抗体は、ＴＭＭＰを固定化する。例えば、固定化は、抗Ｆｃ（例えば、抗ヒトＩｇＧ Ｆｃ）抗体を不溶性支持体上に固定化することによってもたらすことができ、固定化された抗Ｆｃ抗体は、ＴＭＭＰ（ＴＭＭＰはＩｇＦｃポリペプチドを含む）に結合し、それを固定化する。共免疫調節ポリペプチドを、いくつかの異なる濃度で、固定化されたＴＭＭＰに適用し、装置の応答を記録する。アッセイは、２５ｍＭのＨＥＰＥＳ（ｐＨ６．８）、５％ポリ（エチレングリコール）６０００、５０ｍＭのＫＣｌ、０．１％ウシ血清アルブミン、及び０．０２％Ｔｗｅｅｎ２０非イオン性界面活性剤を含む液体培地で行う。共免疫調節ポリペプチドの固定化されたＴＭＭＰへの結合を３０℃で行う。結合親和性の陽性対照として、抗ＭＨＣクラスＩモノクローナル抗体を使用することができる。例えば、７ｎＭのＫＤを有する抗ＨＬＡクラスＩモノクローナル抗体Ｗ６／３２（Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｔｙｐｅ Ｃｕｌｔｕｒｅ Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ Ｎｏ．ＨＢ－９５；Ｐａｒｈａｍ ｅｔ ａｌ．（１９７９）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１２３：３４２）を使用することができる。標準曲線は、抗ＭＨＣクラスＩモノクローナル抗体の段階希釈を使用して生成され得る。共免疫調節ポリペプチドまたは抗ＭＨＣクラスＩ ｍＡｂは、「分析物」である。ＢＬＩは、ｉ）固定化されたポリペプチド（「標的」）から、及びｉｉ）内部参照層からの２つの表面から反射される白色光の干渉パターンを分析する。バイオセンサー先端に結合した分子（「分析物」；例えば、共免疫調節ポリペプチド；抗ＨＬＡ抗体）の数の変化は、干渉パターンのシフトを引き起こし、干渉パターンにおけるこのシフトは、リアルタイムで測定することができる。標的／分析物相互作用の親和性を説明する２つの動態用語は、会合定数（ｋａ）及び解離定数（ｋｄ）である。これらの２つの項（ｋｄ／ａ）の比は、親和性定数ＫＤを生じる。
ＢＬＩアッセイは、マルチウェルプレートで実行される。アッセイを実行するには、プレートレイアウトを画定し、アッセイ工程を定義し、バイオセンサーをＯｃｔｅｔ Ｄａｔａ Ａｃｑｕｉｓｉｔｉｏｎソフトウェアにおいて割り当てる。バイオセンサアセンブリは水和されている。水和したバイオセンサアセンブリ及びアッセイプレートは、Ｏｃｔｅｔ装置上で１０分間平衡化される。データが取得されると、取得されたデータがＯｃｔｅｔ Ｄａｔａ Ａｎａｌｙｓｉｓソフトウェアにロードされる。データは、参照減算、ｙ軸アラインメント、工程間補正、及びＳａｖｉｔｚｋｙ－ Ｇｏｌａｙフィルタリングの方法を指定して、処理ウィンドウで処理される。データは、分析する工程（会合及び解離）、曲線適合モデル（１：１）、フィッティング法（グローバル）、及び目的のウィンドウ（秒単位）を指定して、分析ウィンドウで分析される。適合の品質を評価する。各データトレース（分析物濃度）のＫＤ値は、３倍の範囲内であれば平均化することができる。ＫＤ誤差値は、親和性定数値の１桁以内でなければならない。Ｒ２値は０．９５を超えなければならない。例えば、Ａｂｄｉｃｈｅ ｅｔ ａｌ．（２００８）Ｊ．Ａｎａｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．３７７：２０９を参照されたい。
本明細書に特に明記しない限り、関連共免疫調節ポリペプチドに対する本開示のＴＭＭＰの親和性、または関連共免疫調節ポリペプチドに対する対照ＴＭＭＰ（対照ＴＭＭＰは、野生型免疫調節ポリペプチドを含む）の親和性は、上述のようにＢＬＩを使用して決定される。
一部の例では、ｉ）関連共免疫調節ポリペプチドに対する対照ＴＭＭＰ（対照は、野生型免疫調節ポリペプチドを含む）の結合親和性の、ｉｉ）関連共免疫調節ポリペプチドに対する野生型免疫調節ポリペプチドのバリアント型を含む本開示のＴＭＭＰの結合親和性との比は、（上述のように）ＢＬＩによって測定する際に、少なくとも１．５：１、少なくとも２：１、少なくとも５：１、少なくとも１０：１、少なくとも１５：１、少なくとも２０：１、少なくとも２５：１、少なくとも５０：１、少なくとも１００：１、少なくとも５００：１、少なくとも１０２：１、少なくとも５×１０２：１、少なくとも１０３：１、少なくとも５×１０３：１、少なくとも１０４：１、少なくとも１０５：１、または少なくとも１０６：１である。一部の例では、ｉ）関連共免疫調節ポリペプチドに対する対照ＴＭＭＰ（対照は、野生型免疫調節ポリペプチドを含む）の結合親和性の、ｉｉ）関連共免疫調節ポリペプチドに対する野生型免疫調節ポリペプチドのバリアント型を含む本開示のＴＭＭＰの結合親和性との比は、ＢＬＩによって測定する際に、１．５：１～１０６：１、例えば、１．５：１～１０：１、１０：１～５０：１、５０：１～１０２：１、１０２：１～１０３：１、１０３：１～１０４：１、１０４：１～１０５：１、または１０５：１～１０６：１の範囲である。
一例として、対照ＴＭＭＰが野生型ＩＬ－２ポリペプチドを含み、本開示のＴＭＭＰが免疫調節ポリペプチドとしてバリアント型ＩＬ－２ポリペプチド（野生型ＩＬ－２ポリペプチドのアミノ酸配列に対して１～１０のアミノ酸置換を含む）を含む場合、ｉ）ＩＬ－２受容体（すなわち、関連共免疫調節ポリペプチド）に対する対照ＴＭＭＰの結合親和性の、ｉｉ）ＩＬ－２受容体に対する本開示のＴＭＭＰの結合親和性との比は、ＢＬＩによって測定する際に、少なくとも１．５：１、少なくとも２：１、少なくとも５：１、少なくとも１０：１、少なくとも１５：１、少なくとも２０：１、少なくとも２５：１、少なくとも５０：１、少なくとも１００：１、少なくとも５００：１、少なくとも１０２：１、少なくとも５×１０２：１、少なくとも１０３：１、少なくとも５×１０３：１、少なくとも１０４：１、少なくとも１０５：１、または少なくとも１０６：１である。一部の例では、対照ＴＭＭＰが野生型ＩＬ－２ポリペプチドを含み、本開示のＴＭＭＰが免疫調節ポリペプチドとしてバリアント型ＩＬ－２ポリペプチド（野生型ＩＬ－２ポリペプチドのアミノ酸配列に対して１～１０のアミノ酸置換を含む）を含む場合、ｉ）ＩＬ－２受容体（すなわち、関連共免疫調節ポリペプチド）に対する対照ＴＭＭＰの結合親和性の、ｉｉ）ＩＬ－２受容体に対する本開示のＴＭＭＰの結合親和性との比は、ＢＬＩによって測定する際に、１．５：１～１０６：１、例えば、１．５：１～１０：１、１０：１～５０：１、５０：１～１０２：１、１０２：１～１０３：１、１０３：１～１０４：１、１０４：１～１０５：１、または１０５：１～１０６：１の範囲である。
別の例として、対照ＴＭＭＰが野生型ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドを含み、本開示のＴＭＭＰが免疫調節ポリペプチドとしてバリアント型ＰＤ－Ｌ１ポリペプチド（野生型ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドのアミノ酸配列に対して１～１０のアミノ酸置換を含む）を含む場合、ｉ）ＰＤ－１ポリペプチド（すなわち、関連共免疫調節ポリペプチド）に対する対照ＴＭＭＰの結合親和性の、ｉｉ）ＰＤ－１ポリペプチドに対する本開示のＴＭＭＰの結合親和性との比は、ＢＬＩによって測定する際に、少なくとも１．５：１、少なくとも２：１、少なくとも５：１、少なくとも１０：１、少なくとも１５：１、少なくとも２０：１、少なくとも２５：１、少なくとも５０：１、少なくとも１００：１、少なくとも５００：１、少なくとも１０２：１、少なくとも５×１０２：１、少なくとも１０３：１、少なくとも５×１０３：１、少なくとも１０４：１、少なくとも１０５：１、または少なくとも１０６：１である。
別の例として、対照ＴＭＭＰが野生型ＣＤ８０ポリペプチドを含み、本開示のＴＭＭＰが免疫調節ポリペプチドとしてバリアント型ＣＤ８０ポリペプチド（野生型ＣＤ８０ポリペプチドのアミノ酸配列に対して１～１０のアミノ酸置換を含む）を含む場合、ｉ）ＣＴＬＡ４ポリペプチド（すなわち、関連共免疫調節ポリペプチド）に対する対照ＴＭＭＰの結合親和性の、ｉｉ）ＣＴＬＡ４ポリペプチドに対する本開示のＴＭＭＰの結合親和性との比は、ＢＬＩによって測定する際に、少なくとも１．５：１、少なくとも２：１、少なくとも５：１、少なくとも１０：１、少なくとも１５：１、少なくとも２０：１、少なくとも２５：１、少なくとも５０：１、少なくとも１００：１、少なくとも５００：１、少なくとも１０２：１、少なくとも５×１０２：１、少なくとも１０３：１、少なくとも５×１０３：１、少なくとも１０４：１、少なくとも１０５：１、または少なくとも１０６：１である。
別の例として、対照ＴＭＭＰが野生型ＣＤ８０ポリペプチドを含み、本開示のＴＭＭＰが免疫調節ポリペプチドとしてバリアント型ＣＤ８０ポリペプチド（野生型ＣＤ８０ポリペプチドのアミノ酸配列に対して１～１０のアミノ酸置換を含む）を含む場合、ｉ）ＣＤ２８ポリペプチド（すなわち、関連共免疫調節ポリペプチド）に対する対照ＴＭＭＰの結合親和性の、ｉｉ）ＣＤ２８ポリペプチドに対する本開示のＴＭＭＰの結合親和性との比は、ＢＬＩによって測定する際に、少なくとも１．５：１、少なくとも２：１、少なくとも５：１、少なくとも１０：１、少なくとも１５：１、少なくとも２０：１、少なくとも２５：１、少なくとも５０：１、少なくとも１００：１、少なくとも５００：１、少なくとも１０２：１、少なくとも５×１０２：１、少なくとも１０３：１、少なくとも５×１０３：１、少なくとも１０４：１、少なくとも１０５：１、または少なくとも１０６：１である。
別の例として、対照ＴＭＭＰが野生型４－１ＢＢＬポリペプチドを含み、本開示のＴＭＭＰが免疫調節ポリペプチドとしてバリアント型４－１ＢＢＬポリペプチド（野生型４－１ＢＢＬポリペプチドのアミノ酸配列に対して１～１０のアミノ酸置換を含む）を含む場合、ｉ）４－１ＢＢポリペプチド（すなわち、関連共免疫調節ポリペプチド）に対する対照ＴＭＭＰの結合親和性の、ｉｉ）４－１ＢＢポリペプチドに対する本開示のＴＭＭＰの結合親和性との比は、ＢＬＩによって測定する際に、少なくとも１．５：１、少なくとも２：１、少なくとも５：１、少なくとも１０：１、少なくとも１５：１、少なくとも２０：１、少なくとも２５：１、少なくとも５０：１、少なくとも１００：１、少なくとも５００：１、少なくとも１０２：１、少なくとも５×１０２：１、少なくとも１０３：１、少なくとも５×１０３：１、少なくとも１０４：１、少なくとも１０５：１、または少なくとも１０６：１である。
別の例として、対照ＴＭＭＰが野生型ＣＤ８６ポリペプチドを含み、本開示のＴＭＭＰが免疫調節ポリペプチドとしてバリアント型ＣＤ８６ポリペプチド（野生型ＣＤ８６ポリペプチドのアミノ酸配列に対して１～１０のアミノ酸置換を含む）を含む場合、ｉ）ＣＤ２８ポリペプチド（すなわち、関連共免疫調節ポリペプチド）に対する対照ＴＭＭＰの結合親和性の、ｉｉ）ＣＤ２８ポリペプチドに対する本開示のＴＭＭＰの結合親和性との比は、ＢＬＩによって測定する際に、少なくとも１．５：１、少なくとも２：１、少なくとも５：１、少なくとも１０：１、少なくとも１５：１、少なくとも２０：１、少なくとも２５：１、少なくとも５０：１、少なくとも１００：１、少なくとも５００：１、少なくとも１０２：１、少なくとも５×１０２：１、少なくとも１０３：１、少なくとも５×１０３：１、少なくとも１０４：１、少なくとも１０５：１、または少なくとも１０６：１である。
標的Ｔ細胞に対する本開示のＴＭＭＰの結合親和性は、以下の方法で測定することができる：Ａ）本開示のＴＭＭＰを、ｉ）親野生型免疫調節ポリペプチドに結合する関連共免疫調節ポリペプチドとｉｉ）エピトープに結合するＴ細胞受容体をその表面上に発現する標的Ｔ細胞に接触させる（ＴＭＭＰはエピトープタグを含み、その結果、ＴＭＭＰは標的Ｔ細胞に結合する）、Ｂ）標的Ｔ細胞に結合したＴＭＭＰを、エピトープタグに結合する蛍光標識結合因子（例えば、蛍光標識された抗体）に接触させて、ＴＭＭＰ／標的Ｔ細胞／結合因子複合体を生成する、Ｃ）フローサイトメトリーを使用して、ＴＭＭＰ／標的Ｔ細胞／結合因子複合体の平均蛍光強度（ＭＦＩ）を測定する。エピトープタグは、例えば、ＦＬＡＧタグ、ヘマグルチニンタグ、ｃ－ｍｙｃタグ、ポリ（ヒスチジン）タグなどであり得る。ＴＭＭＰライブラリメンバーの濃度範囲にわたり測定されたＭＦＩにより、親和性の指標がもたらされる。ＴＭＭＰライブラリメンバーの濃度範囲にわたり測定されたＭＦＩにより、ＴＭＭＰの最大半量の有効濃度（ＥＣ５０）がもたらされる。一部の例では、標的Ｔ細胞に対する本開示のＴＭＭＰのＥＣ５０はｎＭの範囲であり、対照Ｔ細胞に対するＴＭＭＰのＥＣ５０（対照Ｔ細胞は、その表面上に、ｉ）親野生型免疫調節ポリペプチドに結合する関連共免疫調節ポリペプチドとｉｉ）ＴＭＭＰ内に存在するエピトープに結合しないＴ細胞受容体を発現する）は、μＭの範囲である。一部の例では、対照Ｔ細胞に対する本開示のＴＭＭＰのＥＣ５０の、標的Ｔ細胞に対するＴＭＭＰのＥＣ５０との比は、少なくとも１．５：１、少なくとも２：１、少なくとも５：１、少なくとも１０：１、少なくとも１５：１、少なくとも２０：１、少なくとも２５：１、少なくとも５０：１、少なくとも１００：１、少なくとも５００：１、少なくとも１０２：１、少なくとも５×１０２：１、少なくとも１０３：１、少なくとも５×１０３：１、少なくとも１０４：１、少なくとも１０５：１、または少なくとも１０６：１である。対照Ｔ細胞に対する本開示のＴＭＭＰのＥＣ５０の、標的Ｔ細胞に対するＴＭＭＰのＥＣ５０との比は、ＴＭＭＰの選択性を示す。
一部の例では、前段落に記載されるように測定された場合、本開示のＴＭＭＰは、ｉ）親野生型免疫調節ポリペプチドに結合する関連共免疫調節ポリペプチドとｉｉ）ＴＭＭＰライブラリメンバー内に存在するエピトープ以外のエピトープに結合するＴ細胞受容体を含む対照Ｔ細胞へのＴＭＭＰライブラリメンバーの結合と比較して、標的Ｔ細胞への選択的結合を示す。
二量体化されたＴＭＭＰ
本開示のＴＭＭＰは二量体化され得る。すなわち、本開示は、本開示のＴＭＭＰの二量体を含む多量体ポリペプチドを提供する。それゆえ、本開示は、Ａ）ａ）ｉ）ＭＵＣ１ペプチドと、ｉｉ）第１の主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）ポリペプチドとを含む第１のポリペプチドと、ｂ）ｉ）第２のＭＨＣポリペプチドを含む第２のポリペプチドとを含む、第１のヘテロ二量体（第１のヘテロ二量体は１つ以上の免疫調節ポリペプチドを含む）と、Ｂ）ａ）ｉ）ＭＵＣ１ペプチドと、ｉｉ）第１のＭＨＣポリペプチドとを含む第１のポリペプチドと、ｂ）ｉ）第２のＭＨＣポリペプチドを含む第２のポリペプチドとを含む、第２のヘテロ二量体（第２のヘテロ二量体は１つ以上の免疫調節ポリペプチドを含み、第１のヘテロ二量体及び第２のヘテロ二量体は互いに共有結合している）とを含む、ＴＭＭＰを提供する。一部の例では、２つのＴＭＭＰは、アミノ酸配列において互いに同一である。一部の例では、第１のヘテロ二量体及び第２のヘテロ二量体は、第１のヘテロ二量体の第２のポリペプチドのＣ末端領域及び第２のヘテロ二量体の第２のポリペプチドのＣ末端領域を介して互いに共有結合している。一部の例では、第１のヘテロ二量体及び第２のヘテロ二量体は、第１のヘテロ二量体の第２のポリペプチドのＣ末端アミノ酸及び第２のヘテロ二量体の第２のポリペプチドのＣ末端領域を介して互いに共有結合しており、例えば、一部の例では、第１のヘテロ二量体の第２のポリペプチドのＣ末端アミノ酸及び第２のヘテロ二量体の第２のポリペプチドのＣ末端領域は、直接またはリンカーを介したいずれかで互いに連結している。リンカーは、ペプチドリンカーであってもよい。ペプチドリンカーは、１アミノ酸～２００アミノ酸（例えば、１アミノ酸（ａａ）～５ａａ、５ａａ～１０ａａ、１０ａａ～２５ａａ、２５ａａ～５０ａａ、５０ａａ～１００ａａ、１００ａａ～１５０ａａ、または１５０ａａ～２００ａａ）の長さを有し得る。一部の例では、第１のヘテロ二量体のペプチドエピトープ及び第２のヘテロ二量体のペプチドエピトープは、同じアミノ酸配列を含む。一部の例では、第１及び第２のヘテロ二量体の第１のＭＨＣポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩ β２－ミクログロブリンであり、第１及び第２のヘテロ二量体の第２のＭＨＣポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩ重鎖である。一部の例では、第１のヘテロ二量体の免疫調節ポリペプチド及び第２のヘテロ二量体の免疫調節ポリペプチドは、同一のアミノ酸配列を含む。一部の例では、第１のヘテロ二量体の免疫調節ポリペプチド及び第２のヘテロ二量体の免疫調節ポリペプチドは、対応する親野生型免疫調節ポリペプチドと比較して、１～１０のアミノ酸置換を含むバリアント型免疫調節ポリペプチドであり、１～１０のアミノ酸置換は、バリアント型免疫調節ポリペプチドの関連共免疫調節ポリペプチドへの親和性結合の低下をもたらす。一部の例では、第１のヘテロ二量体の免疫調節ポリペプチド及び第２のヘテロ二量体の免疫調節ポリペプチドは、それぞれ独立して、ＩＬ－２、４－１ＢＢＬ、ＰＤ－Ｌ１、ＣＤ８０、ＣＤ８６、ＩＣＯＳ－Ｌ、ＯＸ－４０Ｌ、ＦａｓＬ、ＪＡＧ１（ＣＤ３３９）、ＴＧＦβ、ＣＤ７０、及びＩＣＡＭからなる群から選択される。好適なＭＨＣポリペプチド、免疫調節ポリペプチド、及びペプチドエピトープの例を以下に記載する。
ＭＨＣポリペプチド
上述のように、本開示のＴＭＭＰは、ＭＨＣポリペプチドを含む。本開示の目的のために、用語「主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）ポリペプチド」は、ヒトＭＨＣ（ヒト白血球抗原（ＨＬＡ）ポリペプチドとも称される）、げっ歯類（例えば、マウス、ラットなど）ＭＨＣポリペプチド、及び他の哺乳動物種のＭＨＣポリペプチド（例えば、ウサギ、非ヒト霊長類、イヌ、ネコ、有蹄動物（例えば、ウマ、ウシ、ヒツジ、ヤギなど）などを含む様々な種のＭＨＣポリペプチドを含むこと意味する。用語「ＭＨＣポリペプチド」は、クラスＩ ＭＨＣポリペプチド（例えば、β－２ミクログロブリン及びＭＨＣクラスＩ重鎖）を含むことを意味する。
一部の例では、第１のＭＨＣポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩ β２Ｍ（β２Ｍ）ポリペプチドであり、第２のＭＨＣポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩ重鎖（Ｈ鎖）（「ＭＨＣ－Ｈ」））である。その他の例では、第１のＭＨＣポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドであり、第２のＭＨＣポリペプチドは、β２Ｍポリペプチドである。一部の例では、β２Ｍ及びＭＨＣ－Ｈ鎖の両方は、ヒト起源である。すなわち、ＭＨＣ－Ｈ鎖は、ＨＬＡ重鎖、またはそのバリアント型である。特に明記しない限り、本開示のＴＭＭＰは、ＭＨＣクラスＩ重鎖の膜アンカードメイン（膜貫通領域）、または得られたＴＭＭＰをそれが発現する細胞（例えば、哺乳動物細胞などの真核細胞）に固定するのに十分なＭＨＣクラスＩ重鎖の一部を含まない。一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するＭＨＣクラスＩ重鎖は、シグナルペプチド、膜貫通ドメイン、または天然のＭＨＣクラスＩ重鎖と会合した細胞内ドメイン（細胞質尾部）を含まない。それゆえ、例えば、一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するＭＨＣクラスＩ重鎖は、ＭＨＣクラスＩ重鎖のα１、α２、及びα３ドメインのみを含む。一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するＭＨＣクラスＩ重鎖は、約２７０アミノ酸（ａａ）～約２９０ａａの長さを有する。一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するＭＨＣクラスＩ重鎖は、２７０ａａ、２７１ａａ、２７２ａａ、２７３ａａ、２７４ａａ、２７５ａａ、２７６ａａ、２７７ａａ、２７８ａａ、２７９ａａ、２８０ａａ、２８１ａａ、２８２ａａ、２８３ａａ、２８４ａａ、２８５ａａ、２８６ａａ、２８７ａａ、２８８ａａ、２８９ａａ、または２９０ａａの長さを有する。
一部の例では、ＴＭＭＰのＭＨＣポリペプチドは、ヒトＭＨＣポリペプチドであり、ヒトＭＨＣポリペプチドは、「ヒト白血球抗原」（「ＨＬＡ」）ポリペプチドとも称される。一部の例では、ＴＭＭＰのＭＨＣポリペプチドは、クラスＩ ＨＬＡポリペプチド、例えば、β２－ミクログロブリンポリペプチド、またはクラスＩ ＨＬＡ重鎖ポリペプチドである。クラスＩ ＨＬＡ重鎖ポリペプチドには、ＨＬＡ－Ａ重鎖ポリペプチド、ＨＬＡ－Ｂ重鎖ポリペプチド、ＨＬＡ－Ｃ重鎖ポリペプチド、ＨＬＡ－Ｅ重鎖ポリペプチド、ＨＬＡ－Ｆ重鎖ポリペプチド、及びＨＬＡ－Ｇ重鎖ポリペプチドが含まれる。
ＭＨＣクラスＩ重鎖
一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、図７～１３に示されるヒトＨＬＡ重鎖ポリペプチドのいずれかのアミノ酸配列の全部または一部（例えば、５０、７５、１００、１５０、２００、または２５０連続アミノ酸）に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。一部の例では、ＭＨＣクラスＩ重鎖は、２７０ａａ、２７１ａａ、２７２ａａ、２７３ａａ、２７４ａａ、２７５ａａ、２７６ａａ、２７７ａａ、２７８ａａ、２７９ａａ、２８０ａａ、２８１ａａ、２８２ａａ、２８３ａａ、２８４ａａ、２８５ａａ、２８６ａａ、２８７ａａ、２８８ａａ、２８９ａａ、または２９０ａａの長さを有する。一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、図７～１３に示されるアミノ酸配列のいずれか１つの１～３０、１～５、５～１０、１０～１５、１５～２０、２０～２５、または２５～３０アミノ酸の挿入、欠失、及び／または置換（重鎖コンセンサス配列において可変であることが示されるそれらの位置に加えて）を含む。一部の例では、ＭＨＣクラスＩ重鎖は、膜貫通ドメインまたは細胞質ドメインを含まない。一例として、本開示のＴＭＭＰのＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、図５Ａ、５Ｂ、及び５Ｃのいずれか１つに示されるヒトＨＬＡ－Ａ重鎖ポリペプチドのアミノ酸２５～３００（リーダー配列、膜貫通配列、及び細胞質配列の全てまたは実質的に全てを欠く）またはアミノ酸２５～３６５（リーダーを欠く）に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る。
図５Ａ、図５Ｂ、及び図５Ｃは、ヒト白血球抗原（ＨＬＡ）クラスＩ重鎖ポリペプチドのアミノ酸配列を提供する。シグナル配列、アミノ酸１～２４は太字で下線が引かれている。図５Ａエントリ：３Ａ．１は、ＨＬＡ－Ａ重鎖（ＨＬＡ－Ａ＊０１：０１：０１：０１またはＡ＊０１０１）（ＮＣＢＩアクセッションＮＰ＿００１２２９６８７．１）、配列番号３５であり、エントリ３Ａ．２は、ＨＬＡ－Ａ＊１１０１ 配列番号３６からであり、エントリ３Ａ．３は、ＨＬＡ－Ａ＊２４０２ 配列番号３７からであり、エントリ３Ａ．４は、ＨＬＡ－Ａ＊３３０３ 配列番号３８からである。図５Ｂは、配列ＨＬＡ－Ｂ＊０７：０２：０１（ＨＬＡ－Ｂ＊０７０２）ＮＣＢＩ ＧｅｎＢａｎｋアクセッションＮＰ＿００５５０５．２を提供する（ＧｅｎＢａｎｋアクセッションＡＵＶ５０１１８．１も参照されたい）。図５Ｃは、ＨＬＡ－Ｃ＊０７０１（ＧｅｎＢａｎｋアクセッションＮＰ＿００１２２９９７１．１）（ＨＬＡ－Ｃ＊０７：０１：０１：０１またはＨＬＡ－Ｃｗ＊０７０１０１、ＨＬＡ－Ｃｗ＊０７を提供する（ＧｅｎＢａｎｋ受入ＣＡＯ７８１９４．１を参照されたい）。
図６は、リーダー配列または膜貫通ドメインまたは細胞内ドメインを除いた、１１種の成熟ＭＨＣクラスＩ重鎖アミノ酸配列のアラインメントを提供する。アラインされた配列は、ヒトＨＬＡ－Ａ、ＨＬＡ－Ｂ、及びＨＬＡ－Ｃ、マウスＨ２Ｋタンパク質配列、ＨＬＡ－Ａの３つのバリアント型（ｖａｒ．１、ｖａｒ．２Ｃ、及びｖａｒ．２ＣＰ）、ならびに３つのヒトＨＬＡ－Ａバリアント型（ＨＬＡ－Ａ＊１１０１、ＨＬＡ－Ａ＊２４０２、及びＨＬＡ－Ａ＊３３０３）である。ＭＨＣ Ｈ鎖－β２Ｍ複合体を安定化するためのジスルフィド結合の形成のためにシステイン残基が導入され得る（例えば、置換によって）位置（成熟タンパク質の８４及び１３９）がアラインメントに示される。アラインメントには（成熟ポリペプチドの）２３６位も示されており、これは、β２Ｍと鎖間ジスルフィド結合を形成することができるシステイン残基によって（例えば、ａａ１２において）置換され得る。これらの各位置の上に矢印が表示され、残基は太字である。アラインメント（ｖａｒ．２ｃ）に示される第７のＨＬＡ－Ａ配列は、８４位、１３９位、及び２３６位のＣ残基で置換されたバリアント型２の配列を示す。隣接する残基８４、１３９、及び２３６のボックスは、（ｉ）任意の天然アミノ酸、または（ｉｉ）プロリンもしくはグリシンを除く任意の天然アミノ酸から独立して選択される１～５つのアミノ酸に置き換えられ得る、ａａｃ１（「アミノ酸クラスター１」）、ａａｃ２（「アミノ酸クラスター２」）、ａａｃ３（「アミノ酸クラスター３」）、ａａｃ４（「アミノ酸クラスター４」）、ａａｃ５（「アミノ酸クラスター５」）、及びａａｃ６（「アミノ酸クラスター６」）で示される、これらの６組の５つの残基のいずれかの側の５つのアミノ酸の基を示す。
図６に関して、一部の例では、ｉ）ａａｃ１（アミノ酸クラスター１）は、アミノ酸配列ＧＴＬＲＧ（配列番号９８）、あるいは１つもしくは２つのアミノ酸が欠失しているか、または他の天然アミノ酸で置換されているその配列（例えば、ＬがＩ、Ｖ、Ａ、もしくはＦに置き換えられる）であってもよい、ｉｉ）ａａｃ２（アミノ酸クラスター２）は、アミノ酸配列ＹＮＱＳＥ（配列番号９９）、あるいは１つもしくは２つのアミノ酸が欠失しているか、または他の天然アミノ酸で置換されているその配列（例えば、ＮがＱに置き換えられる、ＱがＮに置き換えられる、及び／またはＥがＤに置き換えられる）であってもよい、ｉｉｉ）ａａｃ３（アミノ酸クラスター３）は、アミノ酸配列ＴＡＡＤＭ（配列番号１００）、あるいは１つもしくは２つのアミノ酸が欠失しているか、または他の天然アミノ酸で置換されているその配列（例えば、ＴがＳに置き換えられる、ＡがＧに置き換えられる、ＤがＥに置き換えられる、及び／またはＭがＬ、Ｖ、もしくはＩに置き換えられる）であってもよい、ｉｖ）ａａｃ４（アミノ酸クラスター４）は、アミノ酸配列ＡＱＴＴＫ（配列番号１０１）、あるいは１つもしくは２つのアミノ酸が欠失しているか、または他の天然アミノ酸で置換されているその配列（例えば、ＡがＧに置き換えられるか、ＱがＮに置き換えられるか、またはＴがＳに置き換えられる、及び／またはＫがＲもしくはＱに置き換えられる）、ｖ）ａａｃ５（アミノ酸クラスター５）は、アミノ酸配列ＶＥＴＲＰ（配列番号１０２）、あるいは１つもしくは２つのアミノ酸が欠失しているか、または他の天然アミノ酸で置換されているその配列（例えば、ＶがＩもしくはＬに置き換えられる、ＥがＤに置き換えられる、ＴがＳに置き換えられる、及び／またはＲがＫに置き換えられる）であってもよい、及び／またはｖｉ）ａａｃ６（アミノ酸クラスター６）は、アミノ酸配列ＧＤＧＴＦ（配列番号１０３）、あるいは１つもしくは２つのアミノ酸が欠失されているか、または他の天然アミノ酸で置換されているその配列（例えば、ＤがＥに置き換えられるか、ＴがＳに置き換えられるか、またはＦがＬ、Ｗ、もしくはＹに置き換えられる）であってもよい。
図７～９は、（リーダー配列または膜貫通ドメインまたは細胞内ドメインを除いた）成熟ＨＬＡクラスＩ重鎖アミノ酸配列のアラインメントを提供する。図７Ａのアラインされたアミノ酸配列は、以下の対立遺伝子のＨＬＡ－ＡクラスＩ重鎖である：Ａ＊０１０１、Ａ＊０２０１、Ａ＊０３０１、Ａ＊１１０１、Ａ＊２３０１、Ａ＊２４０２、Ａ＊２４０７、Ａ＊３３０３、及びＡ＊３４０１。図８Ａのアラインされたアミノ酸配列は、以下の対立遺伝子のＨＬＡ－ＢクラスＩ重鎖である：Ｂ＊０７０２、Ｂ＊０８０１、Ｂ＊１５０２、Ｂ＊３８０２、Ｂ＊４００１、Ｂ＊４６０１、及びＢ＊５３０１。図９Ａのアラインされたアミノ酸配列は、以下の対立遺伝子のＨＬＡ－ＣクラスＩ重鎖である：Ｃ＊０１０２、Ｃ＊０３０３、Ｃ＊０３０４、Ｃ＊０４０１、Ｃ＊０６０２、Ｃ＊０７０１、Ｃ＊０８０１、及びＣ＊１５０２。ＨＬＡ Ｈ鎖－β２Ｍ複合体を安定化するためのジスルフィド結合の形成のためにシステイン残基が導入され得る（例えば、置換によって）位置（成熟タンパク質の８４及び１３９）がアラインメントに示される。アラインメントには（成熟ポリペプチドの）２３６位も示されており、これは、β２Ｍと鎖間ジスルフィド結合を形成することができるシステイン残基によって（例えば、ａａ１２において）置換され得る。隣接する残基８４、１３９、及び２３６のボックスは、（ｉ）任意の天然アミノ酸、または（ｉｉ）プロリンもしくはグリシンを除く任意の天然アミノ酸から独立して選択される１～５つのアミノ酸に置き換えられ得る、ａａｃ１（「アミノ酸クラスター１」）、ａａｃ２（「アミノ酸クラスター２」）、ａａｃ３（「アミノ酸クラスター３」）、ａａｃ４（「アミノ酸クラスター４」）、ａａｃ５（「アミノ酸クラスター５」）、及びａａｃ６（「アミノ酸クラスター６」）で示される、これらの６組の５つの残基のいずれかの側の５つのアミノ酸の基を示す。
図７Ａ、８Ａ、及び９Ａは、それぞれ成熟ＨＬＡ－Ａ、ＨＬＡ－Ｂ、及びＨＬＡ－ＣクラスＩ重鎖のアミノ酸配列のアラインメントを提供する。配列は、（リーダー配列または膜貫通ドメインまたは細胞内ドメインを除いた）成熟タンパク質の細胞外部分のために提供される。図６に記載されるように、（ｉ）任意の天然アミノ酸、または（ｉｉ）プロリンもしくはグリシンを除く任意の天然アミノ酸から独立して選択される１～５つのアミノ酸に置き換えられ得る、ａａ残基８４、１３９、及び２３６の位置、ならびにそれらの隣接残基（ａａｃ１～ａａｃ６）の位置も示される。図７Ｂ、８Ｂ、及び９Ｂは、それぞれ、図７Ａ、８Ａ、及び９Ａに提供されるＨＬＡ－Ａ、ＨＬＡ－Ｂ、及びＨＬＡ－Ｃ配列のコンセンサスアミノ酸配列を提供する。コンセンサス配列は、連続番号を付した「Ｘ」残基としての可変アミノ酸位置を示し、アミノ酸８４、１３９、及び２３６の位置には二重下線を引いている。
図７Ａに関して、一部の例では、ｉ）ａａｃ１（アミノ酸クラスター１）は、アミノ酸配列ＧＴＬＲＧ（配列番号９８）、あるいは１つもしくは２つのアミノ酸が欠失しているか、または他の天然アミノ酸で置換されているその配列（例えば、ＬがＩ、Ｖ、Ａ、もしくはＦに置き換えられる）であってもよい、ｉｉ）ａａｃ２（アミノ酸クラスター２）は、アミノ酸配列ＹＮＱＳＥ（配列番号９９）、あるいは１つもしくは２つのアミノ酸が欠失しているか、または他の天然アミノ酸で置換されているその配列（例えば、ＮがＱに置き換えられる、ＱがＮに置き換えられる、及び／またはＥがＤに置き換えられる）であってもよい、ｉｉｉ）ａａｃ３（アミノ酸クラスター３）は、アミノ酸配列ＴＡＡＤＭ（配列番号１００）、あるいは１つもしくは２つのアミノ酸が欠失しているか、または他の天然アミノ酸で置換されているその配列（例えば、ＴがＳに置き換えられる、ＡがＧに置き換えられる、ＤがＥに置き換えられる、及び／もしくはＭがＬ、Ｖ、もしくはＩに置き換えられる）であってもよい、ｉｖ）ａａｃ４（アミノ酸クラスター４）は、アミノ酸配列ＡＱＴＴＫ（配列番号１０１）、あるいは１つもしくは２つのアミノ酸が欠失しているか、または他の天然アミノ酸で置換されているその配列（例えば、ＡがＧに置き換えられるか、ＱがＮに置き換えられるか、またはＴがＳに置き換えられる、及び／またはＫがＲもしくはＱに置き換えられる）、ｖ）ａａｃ５（アミノ酸クラスター５）は、アミノ酸配列ＶＥＴＲＰ（配列番号１０２）、あるいは１つもしくは２つのアミノ酸が欠失しているか、または他の天然アミノ酸で置換されているその配列（例えば、ＶがＩもしくはＬに置き換えられる、ＥがＤに置き換えられる、ＴがＳに置き換えられる、及び／またはＲがＫに置き換えられる）であってもよい、及び／またはｖｉ）ａａｃ６（アミノ酸クラスター６）は、アミノ酸配列ＧＤＧＴＦ（配列番号１０３）、あるいは１つもしくは２つのアミノ酸が欠失されているか、または他の天然アミノ酸で置換されているその配列（例えば、ＤがＥに置き換えられるか、ＴがＳに置き換えられるか、またはＦがＬ、Ｗ、もしくはＹに置き換えられる）であってもよい。
図８Ａに関して、一部の例では、ｉ）ａａｃ１（アミノ酸クラスター１）は、アミノ酸配列ＲＮＬＲＧ（配列番号１０４）、あるいは１つもしくは２つのアミノ酸が欠失しているか、または他の天然アミノ酸で置換されているその配列（例えば、ＮがＴもしくはＩに置き換えられる、及び／またはＬがＡに置き換えられる、及び／または第２のＲがＬに置き換えられる、及び／またはＧがＲに置き換えられる）であってもよい、ｉｉ）ａａｃ２（アミノ酸クラスター２）は、アミノ酸配列ＹＮＱＳＥ（配列番号９９）、あるいは１つもしくは２つのアミノ酸が欠失しているか、または他の天然アミノ酸で置換されているその配列（例えば、ＮがＱに置き換えられる、ＱがＮに置き換えられる、及び／またはＥがＤに置き換えられる）であってもよい、ｉｉｉ）ａａｃ３（アミノ酸クラスター３）は、アミノ酸配列ＴＡＡＤＴ（配列番号１０５）、あるいは１つもしくは２つのアミノ酸が欠失しているか、または他の天然アミノ酸で置換されているその配列（例えば、第１のＴがＳに置き換えられる、及び／またはＡがＧに置き換えられる、及び／またはＤがＥに置き換えられる、及び／または第２のＴがＳに置き換えられる）であってもよい、ｉｖ）ａａｃ４（アミノ酸クラスター４）は、アミノ酸配列ＡＱＩＴＱ（配列番号１０６）、あるいは１つもしくは２つのアミノ酸が欠失しているか、または他の天然アミノ酸で置換されているその配列（例えば、ＡがＧに置き換えられる、及び／または第１のＱがＮに置き換えられるか、及び／またはＩがＬもしくはＶに置き換えられる、及び／またはＴがＳに置き換えられる、及び／または第２のＱがＮに置き換えられる）、ｖ）ａａｃ５（アミノ酸クラスター５）は、アミノ酸配列ＶＥＴＲＰ（配列番号１０２）、あるいは１つもしくは２つのアミノ酸が欠失しているか、または他の天然アミノ酸で置換されているその配列（例えば、ＶがＩもしくはＬに置き換えられる、ＥがＤに置き換えられる、ＴがＳに置き換えられる、及び／またはＲがＫに置き換えられる）であってもよい、及び／またはｖｉ）ａａｃ６（アミノ酸クラスター６）は、アミノ酸配列ＧＤＲＴＦ（配列番号１０７）、あるいは１つもしくは２つのアミノ酸が欠失されているか、または他の天然アミノ酸で置換されているその配列（例えば、ＤがＥに置き換えられる、及び／またはＴがＳに置き換えられる、及び／またはＲがＫもしくはＨに置き換えられる、及び／またはＦがＬ、Ｗ、もしくはＹに置き換えられる）であってもよい。
図９Ａに関して、一部の例では、ｉ）ａａｃ１（アミノ酸クラスター１）は、アミノ酸配列ＲＮＬＲＧ（配列番号１０４）、あるいは１つもしくは２つのアミノ酸が欠失しているか、または他の天然アミノ酸で置換されているその配列（例えば、ＮがＫによって置き換えられる、及び／またはＬがＡもしくはＩに置き換えられる、及び／または第２のＲがＨに置き換えられる、及び／またはＧがＴもしくはＳに置き換えられる）であってもよい、ｉｉ）ａａｃ２（アミノ酸クラスター２）は、アミノ酸配列ＹＮＱＳＥ（配列番号９９）、あるいは１つもしくは２つのアミノ酸が欠失しているか、または他の天然アミノ酸で置換されているその配列（例えば、ＮがＱに置き換えられる、ＱがＮに置き換えられる、及び／またはＥがＤに置き換えられる）であってもよい、ｉｉｉ）ａａｃ３（アミノ酸クラスター３）は、アミノ酸配列ＴＡＡＤＴ（配列番号１０５）、あるいは１つもしくは２つのアミノ酸が欠失しているか、または他の天然アミノ酸で置換されているその配列（例えば、第１のＴがＳに置き換えられる、及び／またはＡがＧに置き換えられる、及び／またはＤがＥに置き換えられる、及び／または第２のＴがＳに置き換えられる）であってもよい、ｉｖ）ａａｃ４（アミノ酸クラスター４）は、アミノ酸配列ＡＱＩＴＱ（配列番号１０６）、あるいは１つもしくは２つのアミノ酸が欠失しているか、または他の天然アミノ酸で置換されているその配列（例えば、ＡがＧに置き換えられる、及び／または第１のＱがＮに置き換えられるか、及び／またはＩがＬに置き換えられる、及び／または第２のＱがＮもしくはＫに置き換えられる）、ｖ）ａａｃ５（アミノ酸クラスター５）は、アミノ酸配列ＶＥＴＲＰ（配列番号１０２）、あるいは１つもしくは２つのアミノ酸が欠失しているか、または他の天然アミノ酸で置換されているその配列（例えば、ＶがＩもしくはＬに置き換えられる、ＥがＤに置き換えられる、ＴがＳに置き換えられる、及び／またはＲがＫもしくはＨに置き換えられる）であってもよい、及び／またはｖｉ）ａａｃ６（アミノ酸クラスター６）は、アミノ酸配列ＧＤＧＴＦ（配列番号１０３）、あるいは１つもしくは２つのアミノ酸が欠失されているか、または他の天然アミノ酸で置換されているその配列（例えば、ＤがＥに置き換えられる、及び／またはＴがＳに置き換えられる、及び／またはＦがＬ、Ｗ、もしくはＹに置き換えられる）であってもよい。
ＨＬＡ－Ａ
一部の例では、本開示のＴＭＭＰは、ＨＬＡ－Ａ重鎖ポリペプチドを含む。本開示のＴＭＭＰに組み込まれ得るＨＬＡ－Ａ重鎖ペプチド配列またはその部分としては、限定されないが、対立遺伝子：Ａ＊０１０１、Ａ＊０２０１、Ａ＊０３０１、Ａ＊１１０１、Ａ＊２３０１、Ａ＊２４０２、Ａ＊２４０７、Ａ＊３３０３、及びＡ＊３４０１が挙げられ、図７Ａのリーダー配列、膜貫通配列、及び細胞質配列の全て、または実質的に全てを含めずにアラインされる。これらの対立遺伝子のいずれも、８４位、１３９位、及び／または２３６位（図７Ａに示される）の１つ以上で、以下から選択される突然変異を含んでいてもよい：８４位でのチロシンからアラニンへの置換（Ｙ８４Ａ）、８４位でのチロシンからシステインへの置換（Ｙ８４Ｃ）、１３９位でのアラニンからシステインへの置換（Ａ１３９Ｃ）、及び２３６位でのアラニンからシステインへの置換（Ａ２３６Ｃ）。加えて、ＨＬＡ－Ａ対立遺伝子の配列の全部または一部（例えば、５０、７５、１００、１５０、２００、または２５０連続アミノ酸）に対して、少なくとも７５％（例えば、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％）または１００％のアミノ酸配列同一性を有するＨＬＡ－Ａ配列もまた、使用してよい（例えば、それは、１～２５、１～５、５～１０、１０～１５、１５～２０、２０～２５、または２５～３０アミノ酸の挿入、欠失、及び／または置換を含み得る）。
一部の例では、本開示のＴＭＭＰは、以下のＨＬＡ－Ａコンセンサスアミノ酸配列、
Figure 2022536581000003
（Ｘ１は、Ｆ、Ｙ、Ｓ、またはＴであり、Ｘ２は、ＫまたはＲであり、Ｘ３は、Ｑ、Ｇ、Ｅ、またはＲであり、Ｘ４は、ＮまたはＥであり、Ｘ５は、ＲまたはＧであり、Ｘ６は、ＮまたはＫであり、Ｘ７は、ＭまたはＶであり、Ｘ８は、ＨまたはＱであり、Ｘ９は、ＴまたはＩであり、Ｘ１０は、ＤまたはＨであり、Ｘ１１は、Ａ、Ｖ、またはＥであり、Ｘ１２は、ＮまたはＤであり、Ｘ１３は、ＧまたはＲであり、Ｘ１４は、ＴまたはＩであり、Ｘ１５は、ＬまたはＡであり、Ｘ１６は、ＲまたはＬであり、Ｘ１７は、ＧまたはＲであり、Ｘ１８は、ＡまたはＤであり、Ｘ１９は、Ｉ、Ｌ、またはＶであり、Ｘ２０は、Ｉ、Ｒ、またはＭであり、Ｘ２１は、ＦまたはＹであり、Ｘ２２は、ＳまたはＰであり、Ｘ２３は、ＷまたはＧであり、Ｘ２４は、Ｒ、Ｈ、またはＱであり、Ｘ２５は、ＤまたはＹであり、Ｘ２６は、ＮまたはＫであり、Ｘ２７は、ＴまたはＩであり、Ｘ２８は、ＫまたはＱであり、Ｘ２９は、ＲまたはＨであり、Ｘ３０は、ＡまたはＴであり、Ｘ３１は、ＡまたはＶであり、Ｘ３２は、ＨまたはＲであり、Ｘ３３は、Ｒ、Ｌ、Ｑ、またはＷであり、Ｘ３４は、ＶまたはＡであり、Ｘ３５は、ＤまたはＥであり、Ｘ３６は、ＲまたはＴであり、Ｘ３７は、ＤまたはＥであり、Ｘ３８は、ＷまたはＧであり、Ｘ３９は、ＰまたはＡであり、Ｘ４０は、ＰまたはＡであり、Ｘ４１は、ＶまたはＩであり、Ｘ４２は、ＳまたはＧであり、Ｘ４３は、ＡまたはＳであり、Ｘ４４は、ＱまたはＥであり、Ｘ４５は、ＰまたはＬである）を含むＨＬＡ－Ａ重鎖ポリペプチドを含む。
一例として、ＴＭＭＰのＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、以下のヒトＨＬＡ－Ａ重鎖アミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る：
ＧＳＨＳＭＲＹＦＦＴＳＶＳＲＰＧＲＧＥＰＲＦＩＡＶＧＹＶＤＤＴＱＦＶＲＦＤＳＤＡＡＳＱＲＭＥＰＲＡＰＷＩＥＱＥＧＰＥＹＷＤＧＥＴＲＫＶＫＡＨＳＱＴＨＲＶＤＬＧＴＬＲＧＹＹＮＱＳＥＡＧＳＨＴＶＱＲＭＹＧＣＤＶＧＳＤＷＲＦＬＲＧＹＨＱＹＡＹＤＧＫＤＹＩＡＬＫＥＤＬＲＳＷＴＡＡＤＭＡＡＱＴＴＫＨＫＷＥＡＡＨＶＡＥＱＬＲＡＹＬＥＧＴＣＶＥＷＬＲＲＹＬＥＮＧＫＥＴＬＱＲＴＤＡＰＫＴＨＭＴＨＨＡＶＳＤＨＥＡＴＬＲＣＷＡＬＳＦＹＰＡＥＩＴＬＴＷＱＲＤＧＥＤＱＴＱＤＴＥＬＶＥＴＲＰＡＧＤＧＴＦＱＫＷＡＡＶＶＶＰＳＧＱＥＱＲＹＴＣＨＶＱＨＥＧＬＰＫＰＬＴＬＲＷＥＰ（配列番号１０８）。
一部の例では、本開示のＴＭＭＰに含めるのに好適なＨＬＡ－Ａ重鎖ポリペプチドは、以下のアミノ酸配列を含む：
ＧＳＨＳＭＲＹＦＦＴＳＶＳＲＰＧＲＧＥＰＲＦＩＡＶＧＹＶＤＤＴＱＦＶＲＦＤＳＤＡＡＳＱＲＭＥＰＲＡＰＷＩＥＱＥＧＰＥＹＷＤＧＥＴＲＫＶＫＡＨＳＱＴＨＲＶＤＬＧＴＬＲＧＹＹＮＱＳＥＡＧＳＨＴＶＱＲＭＹＧＣＤＶＧＳＤＷＲＦＬＲＧＹＨＱＹＡＹＤＧＫＤＹＩＡＬＫＥＤＬＲＳＷＴＡＡＤＭＡＡＱＴＴＫＨＫＷＥＡＡＨＶＡＥＱＬＲＡＹＬＥＧＴＣＶＥＷＬＲＲＹＬＥＮＧＫＥＴＬＱＲＴＤＡＰＫＴＨＭＴＨＨＡＶＳＤＨＥＡＴＬＲＣＷＡＬＳＦＹＰＡＥＩＴＬＴＷＱＲＤＧＥＤＱＴＱＤＴＥＬＶＥＴＲＰＡＧＤＧＴＦＱＫＷＡＡＶＶＶＰＳＧＱＥＱＲＹＴＣＨＶＱＨＥＧＬＰＫＰＬＴＬＲＷＥＰ（配列番号１０９）。このＨＬＡ－Ａ重鎖ポリペプチドは、「ＨＬＡ－Ａ＊０２０１」または単に「ＨＬＡ－Ａ０２」とも称される。一部の例では、Ｃ末端Ｐｒｏは、本開示のＴＭＭＰに含まれない。例えば、一部の例では、本開示のＴＭＭＰに含めるのに好適なＨＬＡ－Ａ０２ポリペプチドは、以下のアミノ酸配列を含む：
ＧＳＨＳＭＲＹＦＦＴＳＶＳＲＰＧＲＧＥＰＲＦＩＡＶＧＹＶＤＤＴＱＦＶＲＦＤＳＤＡＡＳＱＲＭＥＰＲＡＰＷＩＥＱＥＧＰＥＹＷＤＧＥＴＲＫＶＫＡＨＳＱＴＨＲＶＤＬＧＴＬＲＧＹＹＮＱＳＥＡＧＳＨＴＶＱＲＭＹＧＣＤＶＧＳＤＷＲＦＬＲＧＹＨＱＹＡＹＤＧＫＤＹＩＡＬＫＥＤＬＲＳＷＴＡＡＤＭＡＡＱＴＴＫＨＫＷＥＡＡＨＶＡＥＱＬＲＡＹＬＥＧＴＣＶＥＷＬＲＲＹＬＥＮＧＫＥＴＬＱＲＴＤＡＰＫＴＨＭＴＨＨＡＶＳＤＨＥＡＴＬＲＣＷＡＬＳＦＹＰＡＥＩＴＬＴＷＱＲＤＧＥＤＱＴＱＤＴＥＬＶＥＴＲＰＡＧＤＧＴＦＱＫＷＡＡＶＶＶＰＳＧＱＥＱＲＹＴＣＨＶＱＨＥＧＬＰＫＰＬＴＬＲＷＥ（配列番号１１０）。
ＨＬＡ－Ａ（Ｙ８４Ａ；Ａ２３６Ｃ）
一部の例では、ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドはＹ８４Ａ置換及びＡ２３６Ｃ置換を含む。例えば、一部の例では、ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、以下のヒトＨＬＡ－Ａ重鎖（Ｙ８４Ａ、Ａ２３６Ｃ）アミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む：
Figure 2022536581000004
、配列中、アミノ酸８４はＡｌａであり、アミノ酸２３６はＣｙｓである。一部の例では、Ｃｙｓ－２３６は、Ｒ１２Ｃ置換を含むバリアント型β２ＭポリペプチドのＣｙｓ－１２と鎖間ジスルフィド結合を形成する。
一部の例では、本開示のＴＭＭＰに含めるのに好適なＨＬＡ－Ａ重鎖ポリペプチドは、以下のアミノ酸配列を含む、ＨＬＡ－Ａ０２（Ｙ８４Ａ；Ａ２３６Ｃ）ポリペプチドである：
Figure 2022536581000005
。
一部の例では、本開示のＴＭＭＰに含めるのに好適なＨＬＡ－Ａ重鎖ポリペプチドは、以下のアミノ酸配列を含む、ＨＬＡ－Ａ０２（Ｙ８４Ａ；Ａ２３６Ｃ）ポリペプチドである：
Figure 2022536581000006
。
ＨＬＡ－Ａ（Ｙ８４Ｃ；Ａ１３９Ｃ）
一部の例では、ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドはＹ８４Ｃ置換及びＡ１３９Ｃ置換を含む。例えば、一部の例では、ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、以下のヒトＨＬＡ－Ａ重鎖（Ｙ８４Ｃ、Ａ１３９Ｃ）アミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む：
Figure 2022536581000007
、配列中、アミノ酸８４はＣｙｓであり、アミノ酸１３９はＣｙｓである。一部の例では、Ｃｙｓ－８４は、Ｃｙｓ－１３９と鎖内ジスルフィド結合を形成する。
ＨＬＡ－Ａ１１（ＨＬＡ－Ａ＊１１０１）
１つの非限定例として、ＴＭＭＰのＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、以下のヒトＨＬＡ－Ａ１１重鎖アミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る：
ＧＳＨＳＭＲＹＦＹＴＳＶＳＲＰＧＲＧＥＰＲＦＩＡＶＧＹＶＤＤＴＱＦＶＲＦＤＳＤＡＡＳＱＲＭＥＰＲＡＰＷＩＥＱＥＧＰＥＹＷＤＱＥＴＲＮＶＫＡＱＳＱＴＤＲＶＤＬＧＴＬＲＧＹＹＮＱＳＥＤＧＳＨＴＩＱＩＭＹＧＣＤＶＧＰＤＧＲＦＬＲＧＹＲＱＤＡＹＤＧＫＤＹＩＡＬＮＥＤＬＲＳＷＴＡＡＤＭＡＡＱＩＴＫＲＫＷＥＡＡＨＡＡＥＱＱＲＡＹＬＥＧＴＣＶＥＷＬＲＲＹＬＥＮＧＫＥＴＬＱＲＴＤＰＰＫＴＨＭＴＨＨＰＩＳＤＨＥＡＴＬＲＣＷＡＬＧＦＹＰＡＥＩＴＬＴＷＱＲＤＧＥＤＱＴＱＤＴＥＬＶＥＴＲＰＡＧＤＧＴＦＱＫＷＡＡＶＶＶＰＳＧＥＥＱＲＹＴＣＨＶＱＨＥＧＬＰＫＰＬＴＬＲＷＥ（配列番号１１５）。このようなＭＨＣクラスＩ重鎖は、アジア系の個体の集団を含むアジア系集団において顕著であり得る。
ＨＬＡ－Ａ１１（Ｙ８４Ａ；Ａ２３６Ｃ）
１つの非限定例として、一部の例では、ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、Ｙ８４Ａ置換及びＡ２３６Ｃ置換を含むＨＬＡ－Ａ１１対立遺伝子である。例えば、一部の例では、ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、以下のヒトＨＬＡ－Ａ Ａ１１重鎖（Ｙ８４Ａ；Ａ２３６Ｃ）アミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む：
Figure 2022536581000008
、配列中、アミノ酸８４はＡｌａであり、アミノ酸２３６はＣｙｓである。一部の例では、Ｃｙｓ－２３６は、Ｒ１２Ｃ置換を含むバリアント型β２ＭポリペプチドのＣｙｓ－１２と鎖間ジスルフィド結合を形成する。
ＨＬＡ－Ａ２４（ＨＬＡ－Ａ＊２４０２）
１つの非限定例として、本開示のＴＭＭＰのＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、以下のヒトＨＬＡ－Ａ２４重鎖アミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る：
ＧＳＨＳＭＲＹＦＳＴＳＶＳＲＰＧＲＧＥＰＲＦＩＡＶＧＹＶＤＤＴＱＦＶＲＦＤＳＤＡＡＳＱＲＭＥＰＲＡＰＷＩＥＱＥＧＰＥＹＷＤＥＥＴＧＫＶＫＡＨＳＱＴＤＲＥＮＬＲＩＡＬＲＹＹＮＱＳＥＡＧＳＨＴＬＱＭＭＦＧＣＤＶＧＳＤＧＲＦＬＲＧＹＨＱＹＡＹＤＧＫＤＹＩＡＬＫＥＤＬＲＳＷＴＡＡＤＭＡＡＱＩＴＫＲＫＷＥＡＡＨＶＡＥＱＱＲＡＹＬＥＧＴＣＶＤＧＬＲＲＹＬＥＮＧＫＥＴＬＱＲＴＤＰＰＫＴＨＭＴＨＨＰＩＳＤＨＥＡＴＬＲＣＷＡＬＧＦＹＰＡＥＩＴＬＴＷＱＲＤＧＥＤＱＴＱＤＴＥＬＶＥＴＲＰＡＧＤＧＴＦＱＫＷＡＡＶＶＶＰＳＧＥＥＱＲＹＴＣＨＶＱＨＥＧＬＰＫＰＬＴＬＲＷＥＰＳＳＱＰＴＶＰＩＶＧＩＩＡＧＬＶＬＬＧＡＶＩＴＧＡＶＶＡＡＶＭＷＲＲＮＳＳＤＲＫＧＧＳＹＳＱＡＡＳＳＤＳＡＱＧＳＤＶＳＬＴＡＣＫＶ（配列番号１１７）。このようなＭＨＣクラスＩ重鎖は、アジア系の個体の集団を含むアジア系集団において顕著であり得る。一部の例では、アミノ酸８４はＡｌａである。一部の例では、アミノ酸８４はＣｙｓである。一部の例では、アミノ酸２３６はＣｙｓである。一部の例では、アミノ酸８４はＡｌａであり、アミノ酸２３６はＣｙｓである。一部の例では、アミノ酸８４はＣｙｓであり、アミノ酸２３６はＣｙｓである。
ＨＬＡ－Ａ３３（ＨＬＡ－Ａ＊３３０３）
１つの非限定例として、本開示のＴＭＭＰのＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、以下のヒトＨＬＡ－Ａ３３重鎖アミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る：
ＧＳＨＳＭＲＹＦＴＴＳＶＳＲＰＧＲＧＥＰＲＦＩＡＶＧＹＶＤＤＴＱＦＶＲＦＤＳＤＡＡＳＱＲＭＥＰＲＡＰＷＩＥＱＥＧＰＥＹＷＤＲＮＴＲＮＶＫＡＨＳＱＩＤＲＶＤＬＧＴＬＲＧＹＹＮＱＳＥＡＧＳＨＴＩＱＭＭＹＧＣＤＶＧＳＤＧＲＦＬＲＧＹＱＱＤＡＹＤＧＫＤＹＩＡＬＮＥＤＬＲＳＷＴＡＡＤＭＡＡＱＩＴＱＲＫＷＥＡＡＲＶＡＥＱＬＲＡＹＬＥＧＴＣＶＥＷＬＲＲＹＬＥＮＧＫＥＴＬＱＲＴＤＰＰＫＴＨＭＴＨＨＡＶＳＤＨＥＡＴＬＲＣＷＡＬＳＦＹＰＡＥＩＴＬＴＷＱＲＤＧＥＤＱＴＱＤＴＥＬＶＥＴＲＰＡＧＤＧＴＦＱＫＷＡＳＶＶＶＰＳＧＱＥＱＲＹＴＣＨＶＱＨＥＧＬＰＫＰＬＴＬＲＷＥＰＳＳＱＰＴＩＰＩＶＧＩＩＡＧＬＶＬＦＧＡＶＦＡＧＡＶＶＡＡＶＲＷＲＲＫＳＳＤＲＫＧＧＳＹＳＱＡＡＳＳＤＳＡＱＧＳＤＭＳＬＴＡＣＫＶ（配列番号１１８）。このようなＭＨＣクラスＩ重鎖は、アジア系の個体の集団を含むアジア系集団において顕著であり得る。一部の例では、アミノ酸８４はＡｌａである。一部の例では、アミノ酸８４はＣｙｓである。一部の例では、アミノ酸２３６はＣｙｓである。一部の例では、アミノ酸８４はＡｌａであり、アミノ酸２３６はＣｙｓである。一部の例では、アミノ酸８４はＣｙｓであり、アミノ酸２３６はＣｙｓである。
ＨＬＡ－Ｂ
一部の例では、本開示のＴＭＭＰは、ＨＬＡ－Ｂ重鎖ポリペプチドを含む。本開示のＴＭＭＰに組み込まれ得るＨＬＡ－Ｂ重鎖ペプチド配列またはその部分としては、限定されないが、対立遺伝子：Ｂ＊０７０２、Ｂ＊０８０１、Ｂ＊１５０２、Ｂ＊３８０２、Ｂ＊４００１、Ｂ＊４６０１、及びＢ＊５３０１が挙げられ、図８Ａのリーダー配列、膜貫通配列、及び細胞質配列の全て、または実質的に全てを含めずにアラインされる。これらの対立遺伝子のいずれも、８４位、１３９位、及び／または２３６位（図８Ａに示される）の１つ以上で、以下から選択される突然変異を含んでいてもよい：８４位でのチロシンからアラニンへの置換（Ｙ８４Ａ）、８４位でのチロシンからシステインへの置換（Ｙ８４Ｃ）、１３９位でのアラニンからシステインへの置換（Ａ１３９Ｃ）、及び２３６位でのアラニンからシステインへの置換（Ａ２３６Ｃ）。加えて、ＨＬＡ－Ｂ対立遺伝子の配列の全部または一部（例えば、５０、７５、１００、１５０、２００、または２５０連続アミノ酸）に対して、少なくとも７５％（例えば、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％）または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＨＬＡ－Ｂポリペプチドもまた、使用してよい（例えば、それは、１～２５、１～５、５～１０、１０～１５、１５～２０、２０～２５、または２５～３０アミノ酸の挿入、欠失、及び／または置換を含み得る）。
一部の例では、本開示のＴＭＭＰは、以下のＨＬＡ－Ｂコンセンサスアミノ酸配列を含むＨＬＡ－Ｂ重鎖ポリペプチドを含む：
Figure 2022536581000009
、配列中、Ｘ１は、Ｈ、Ｙ、またはＤであり、Ｘ２は、ＡまたはＳであり、Ｘ３は、ＭまたはＶであり、Ｘ４は、Ａ、Ｓ、またはＴであり、Ｘ５は、ＱまたはＬであり、Ｘ６は、ＡまたはＴであり、Ｘ７は、Ｅ、Ｍ Ｋ、またはＴであり、Ｘ８は、ＡまたはＴであり、Ｘ９は、ＥまたはＮであり、Ｘ１０は、ＩまたはＫであり、Ｘ１１は、Ｙ、Ｆ、Ｓ、またはＣであり、Ｘ１２は、ＮまたはＱであり、Ｘ１３は、ＡまたはＴであり、Ｘ１４は、ＤまたはＹであり、Ｘ１５は、ＥまたはＶであり、Ｘ１６は、ＳまたはＮであり、Ｘ１７は、Ｔ、Ｎ、またはＩであり、Ｘ１８は、ＡまたはＬであり、Ｘ１９は、ＬまたはＲであり、Ｘ２０は、ＲまたはＧであり、Ｘ２１は、ＴまたはＩであり、Ｘ２２は、ＬまたはＩであり、Ｘ２３は、ＲまたはＳであり、Ｘ２４は、ＲまたはＳであり、Ｘ２５は、ＳまたはＴであり、Ｘ２６は、ＬまたはＷであり、Ｘ２７は、ＥまたはＶであり、Ｘ２８は、Ｒ、Ｄ、Ｌ、またはＷであり、Ｘ２９は、ＡまたはＴであり、Ｘ３０は、Ｌ、Ｅ、またはＴであり、Ｘ３１は、ＥまたはＤであり、Ｘ３２は、ＫまたはＴであり、Ｘ３３は、ＥまたはＱであり、Ｘ３４は、ＩまたはＶである。
一例として、本開示のＴＭＭＰのＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、以下のヒトＨＬＡ－Ｂ重鎖アミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る：
ＧＳＨＳＭＲＹＦＹＴＳＶＳＲＰＧＲＧＥＰＲＦＩＳＶＧＹＶＤＤＴＱＦＶＲＦＤＳＤＡＡＳＰＲＥＥＰＲＡＰＷＩＥＱＥＧＰＥＹＷＤＲＮＴＱＩＹＫＡＱＡＱＴＤＲＥＳＬＲＮＬＲＧＹＹＮＱＳＥＡＧＳＨＴＬＱＳＭＹＧＣＤＶＧＰＤＧＲＬＬＲＧＨＤＱＹＡＹＤＧＫＤＹＩＡＬＮＥＤＬＲＳＷＴＡＡＤＴＡＡＱＩＴＱＲＫＷＥＡＡＲＥＡＥＱＲＲＡＹＬＥＧＥＣＶＥＷＬＲＲＹＬＥＮＧＫＤＫＬＥＲＡＤＰＰＫＴＨＶＴＨＨＰＩＳＤＨＥＡＴＬＲＣＷＡＬＧＦＹＰＡＥＩＴＬＴＷＱＲＤＧＥＤＱＴＱＤＴＥＬＶＥＴＲＰＡＧＤＲＴＦＱＫＷＡＡＶＶＶＰＳＧＥＥＱＲＹＴＣＨＶＱＨＥＧＬＰＫＰＬＴＬＲＷＥＰ（配列番号１１９）。
ＨＬＡ－Ｂ（Ｙ８４Ａ、Ａ２３６Ｃ）
１つの非限定例として、一部の例では、ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、Ｙ８４Ａ置換とＡ２３６Ｃ置換を含むＨＬＡ－Ｂポリペプチドである。例えば、一部の例では、ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、以下のヒトＨＬＡ－Ｂ重鎖（Ｙ８４Ａ、Ａ２３６Ｃ）アミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む：
Figure 2022536581000010
、配列中、アミノ酸８４はＡｌａであり、アミノ酸２３６はＣｙｓである。一部の例では、Ｃｙｓ－２３６は、Ｒ１２Ｃ置換を含むバリアント型β２ＭポリペプチドのＣｙｓ－１２と鎖間ジスルフィド結合を形成する。
ＨＬＡ－Ｂ（Ｙ８４Ｃ、Ａ１３９Ｃ）
一部の例では、ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドはＹ８４Ｃ置換及びＡ１３９Ｃ置換を含む。例えば、一部の例では、ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、以下のヒトＨＬＡ－Ｂ重鎖（Ｙ８４Ｃ、Ａ１３９Ｃ）アミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む：
Figure 2022536581000011
、配列中、アミノ酸８４はＣｙｓであり、アミノ酸１３９はＣｙｓである。一部の例では、Ｃｙｓ－８４は、Ｃｙｓ－１３９と鎖内ジスルフィド結合を形成する。
ＨＬＡ－Ｂ＊０７０２
一例として、一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、図８ＡのＨＬＡ－Ｂ＊０７０２（配列番号６２）のアミノ酸配列、またはその配列の全部もしくは一部（例えば、５０、７５、１００、１５０、２００、または２５０連続アミノ酸）に対して、少なくとも７５％（例えば、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％）または１００％のアミノ酸配列同一性を有する配列（例えば、それは、１～２５、１～５、５～１０、１０～１５、１５～２０、２０～２５、または２５～３０アミノ酸の挿入、欠失、及び／または置換を含み得る）を含む。一部の例では、本開示のＴＭＭＰのＨＬＡ－Ｂ重鎖ポリペプチドが、図６においてＨＬＡ－Ｂとラベル付けされた配列、または図８Ａにおいて「Ｂ＊０７０２」とラベル付けされた配列に対して１００％未満の同一性を有する場合、それは、８４位、１３９位、及び／または２３６位のうちの１つ以上で、以下から選択される突然変異を含んでいてもよい：８４位でのチロシンからアラニンへの置換（Ｙ８４Ａ）、８４位（Ｙ８４Ｃ）でのチロシンからシステインへの置換、１３９位でのアラニンからシステイン（Ａ１３９Ｃ）、及び２３６位でのアラニンからシステインへの置換（Ａ２３６Ｃ）。一部の例では、本開示のＴＭＭＰのＨＬＡ－Ｂ重鎖ポリペプチドは、Ｙ８４Ａ及びＡ２３６Ｃ置換を含む。一部の例では、本開示のＴＭＭＰのＨＬＡ－Ｂ＊０７０２重鎖ポリペプチドは、Ｙ８４Ｃ及びＡ１３９Ｃ置換を含む。一部の例では、本開示のＴＭＭＰのＨＬＡ－Ｂ重鎖ポリペプチドは、Ｙ８４Ｃ、Ａ１３９Ｃ、及びＡ２３６Ｃ置換を含む。
ＨＬＡ－Ｃ
一部の例では、本開示のＴＭＭＰは、ＨＬＡ－Ｃ重鎖ポリペプチドを含む。本開示のＴＭＭＰに組み込まれ得るＨＬＡ－Ｃ重鎖ペプチド配列またはその部分としては、限定されないが、対立遺伝子：Ｃ＊０１０２、Ｃ＊０３０３、Ｃ＊０３０４、Ｃ＊０４０１、Ｃ＊０６０２、Ｃ＊０７０１、Ｃ＊０８０１、及びＣ＊１５０２が挙げられ、図９Ａのリーダー配列、膜貫通配列、及び細胞質配列の全て、または実質的に全てを含めずにアラインされる。これらの対立遺伝子のいずれも、８４位、１３９位、及び／または２３６位（図９Ａに示される）の１つ以上で、以下から選択される突然変異を含んでいてもよい：８４位でのチロシンからアラニンへの置換（Ｙ８４Ａ）、８４位でのチロシンからシステインへの置換（Ｙ８４Ｃ）、１３９位でのアラニンからシステインへの置換（Ａ１３９Ｃ）、及び２３６位でのアラニンからシステインへの置換（Ａ２３６Ｃ）。加えて、ＨＬＡ－Ｃ対立遺伝子の配列の全部または一部（例えば、５０、７５、１００、１５０、２００、または２５０連続アミノ酸）に対して、少なくとも７５％（例えば、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％）または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＨＬＡ－Ｃポリペプチドもまた、使用してよい（例えば、それは、１～２５、１～５、５～１０、１０～１５、１５～２０、２０～２５、または２５～３０アミノ酸の挿入、欠失、及び／または置換を含み得る）。
一部の例では、本開示のＴＭＭＰは、以下のＨＬＡ－Ｃコンセンサスアミノ酸配列を含むＨＬＡ－Ｃ重鎖ポリペプチドを含む：
Figure 2022536581000012
、配列中、Ｘ１は、ＣまたはＧであり、Ｘ２は、ＲまたはＫであり、Ｘ３は、Ｆ、Ｙ、Ｓ、またはＤであり、Ｘ４は、ＲまたはＷであり、Ｘ５は、ＨまたはＲであり、Ｘ６は、ＡまたはＳであり、Ｘ７は、ＱまたはＲであり、Ｘ８は、ＡまたはＥであり、Ｘ９は、ＮまたはＫであり、Ｘ１０は、ＴまたはＡであり、Ｘ１１は、ＳまたはＮであり、Ｘ１２は、ＮまたはＫであり、Ｘ１３は、ＡまたはＤであり、Ｘ１４は、ＧまたはＲであり、Ｘ１５は、ＴまたはＩであり、Ｘ１６は、ＬまたはＩであり、Ｘ１７は、ＷまたはＲであり、Ｘ１８は、Ｃ、Ｙ、Ｆ、またはＳであり、Ｘ１９は、ＬまたはＶであり、Ｘ２０は、ＹまたはＨであり、Ｘ２１は、ＤまたはＮであり、Ｘ２２は、Ｙ、Ｆ、Ｓ、またはＬであり、Ｘ２３は、ＬまたはＷであり、Ｘ２４は、Ｅ、Ａ、またはＴであり、Ｘ２５は、Ｒ、Ｌ、またはＷであり、Ｘ２６は、ＬまたはＴであり、Ｘ２７は、ＥまたはＫであり、Ｘ２８は、ＥまたはＫであり、Ｘ２９は、ＨまたはＰであり、Ｘ３０は、ＲまたはＶであり、Ｘ３１は、ＷまたはＲであり、Ｘ３２は、ＶまたはＭであり、Ｘ３３は、ＥまたはＱであり、Ｘ３４は、ＭまたはＶであり、Ｘ３５は、ＰまたはＱであり、Ｘ３６は、ＲまたはＳであり、Ｘ３７は、ＰまたはＧである。
一例として、本開示のＴＭＭＰのＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、以下のヒトＨＬＡ－Ｃ重鎖アミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る：
ＣＳＨＳＭＲＹＦＤＴＡＶＳＲＰＧＲＧＥＰＲＦＩＳＶＧＹＶＤＤＴＱＦＶＲＦＤＳＤＡＡＳＰＲＧＥＰＲＡＰＷＶＥＱＥＧＰＥＹＷＤＲＥＴＱＮＹＫＲＱＡＱＡＤＲＶＳＬＲＮＬＲＧＹＹＮＱＳＥＤＧＳＨＴＬＱＲＭＹＧＣＤＬＧＰＤＧＲＬＬＲＧＹＤＱＳＡＹＤＧＫＤＹＩＡＬＮＥＤＬＲＳＷＴＡＡＤＴＡＡＱＩＴＱＲＫＬＥＡＡＲＡＡＥＱＬＲＡＹＬＥＧＴＣＶＥＷＬＲＲＹＬＥＮＧＫＥＴＬＱＲＡＥＰＰＫＴＨＶＴＨＨＰＬＳＤＨＥＡＴＬＲＣＷＡＬＧＦＹＰＡＥＩＴＬＴＷＱＲＤＧＥＤＱＴＱＤＴＥＬＶＥＴＲＰＡＧＤＧＴＦＱＫＷＡＡＶＶＶＰＳＧＱＥＱＲＹＴＣＨＭＱＨＥＧＬＱＥＰＬＴＬＳＷＥＰ（配列番号１２３）。
ＨＬＡ－Ｃ（Ｙ８４Ａ、Ａ２３６Ｃ）
１つの非限定例として、一部の例では、ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、Ｙ８４Ａ置換とＡ２３６Ｃ置換を含むＨＬＡ－Ｃポリペプチドである。例えば、一部の例では、ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、以下のヒトＨＬＡ－Ｃ重鎖（Ｙ８４Ａ、Ａ２３６Ｃ）アミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む：
Figure 2022536581000013
、配列中、アミノ酸８４はＡｌａであり、アミノ酸２３６はＣｙｓである。一部の例では、Ｃｙｓ－２３６は、Ｒ１２Ｃ置換を含むバリアント型β２ＭポリペプチドのＣｙｓ－１２と鎖間ジスルフィド結合を形成する。
ＨＬＡ－Ｃ（Ｙ８４Ｃ、Ａ１３９Ｃ）
一部の例では、ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドはＹ８４Ｃ置換及びＡ１３９Ｃ置換を含む。例えば、一部の例では、ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、以下のヒトＨＬＡ－Ｃ重鎖（Ｙ８４Ｃ、Ａ１３９Ｃ）アミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む：
Figure 2022536581000014
、配列中、アミノ酸８４はＣｙｓであり、アミノ酸１３９はＣｙｓである。一部の例では、Ｃｙｓ－８４は、Ｃｙｓ－１３９と鎖内ジスルフィド結合を形成する。
ＨＬＡ－Ｃ＊０７０１
一部の例では、本開示のＴＭＭＰのＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、図９ＡのＨＬＡ－Ｃ＊０７０１（図６においてＨＬＡ－Ｃとラベル付けされている）のアミノ酸配列、またはその配列の全部もしくは一部（例えば、５０、７５、１００、１５０、２００、または２５０連続アミノ酸）に対して、少なくとも７５％（例えば、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％）または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む（例えば、それは、１～２５、１～５、５～１０、１０～１５、１５～２０、２０～２５、または２５～３０アミノ酸の挿入、欠失、及び／または置換を含み得る）。一部の例では、本開示のＴＭＭＰのＨＬＡ－Ｃ重鎖ポリペプチドが図９ＡにおけるＨＬＡ－Ｃ＊０７０１とラベル付けされた配列に対して１００％未満の同一性を有する場合、それは、８４位、１３９位、及び／または２３６位の１つ以上で、以下から選択される突然変異を含んでいてもよい：８４位でのチロシンからアラニンへの置換（Ｙ８４Ａ）、８４位でのチロシンからシステインへの置換（Ｙ８４Ｃ）、１３９位でのアラニンからシステイン（Ａ１３９Ｃ）、及び２３６位でのアラニンからシステインへの置換（Ａ２３６Ｃ）。一部の例では、本開示のＴＭＭＰのＨＬＡ－Ｃ重鎖ポリペプチドは、Ｙ８４Ａ及びＡ２３６Ｃ置換を含む。一部の例では、Ｔ細胞ＭＭＰのＨＬＡ－Ｃ＊０７０１重鎖ポリペプチドまたはそのエピトープコンジュゲートは、Ｙ８４Ｃ及びＡ１３９Ｃ置換を含む。一部の例では、本開示のＴＭＭＰのＨＬＡ－Ｃ重鎖ポリペプチドは、Ｙ８４Ｃ、Ａ１３９Ｃ、及びＡ２３６Ｃ置換を含む。
非古典的ＨＬＡ－Ｅ、ＨＬＡ－Ｆ、及びＨＬＡ－Ｇ ＭＨＣクラスＩ重鎖
一部の例では、本開示のＴＭＭＰは、非古典的ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドを含む。非古典的ＨＬＡ重鎖ポリペプチドまたはその一部のうち、本開示のＴＭＭＰに組み込まれ得るものとして、限定されないが、ＨＬＡ－Ｅ、ＨＬＡ－Ｆ、及びＨＬＡ－Ｇ対立遺伝子のものが挙げられる。ＨＬＡ－Ｅ、ＨＬＡ－Ｆ、及びＨＬＡ－Ｇ重鎖ポリペプチド（及びＨＬＡ－Ａ、ＨＬＡ－Ｂ、及びＨＬＡ－Ｃ対立遺伝子）のアミノ酸配列は、ワールドワイドウェブｈｌａ．ａｌｌｅｌｅｓ．ｏｒｇ／ｎｏｍｅｎｃｌａｔｕｒｅ／ｉｎｄｅｘ．ｈｔｍｌ、Ｅｕｒｏｐｅａｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ（ＥＭＢＬ）の一部であるＥｕｒｏｐｅａｎ Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ（ｗｗｗ．ｅｂｉ．ａｃ．ｕｋ）及びＮａｔｉｏｎａｌ Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏｒ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ（ｗｗｗ．ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ）に見出され得る。
適切なＨＬＡ－Ｅ対立遺伝子の非限定的な例として、ＨＬＡ－Ｅ＊０１０１（ＨＬＡ－Ｅ＊０１：０１：０１：０１）、ＨＬＡ－Ｅ＊０１：０３（ＨＬＡ－Ｅ＊０１：０３：０１：０１）、ＨＬＡ－Ｅ＊０１：０４、ＨＬＡ－Ｅ＊０１：０５、ＨＬＡ－Ｅ＊０１：０６、ＨＬＡ－Ｅ＊０１：０７、ＨＬＡ－Ｅ＊０１：０９、及びＨＬＡ－Ｅ＊０１：１０が挙げられるが、これらに限定されない。適切なＨＬＡ－Ｆ対立遺伝子の非限定的な例として、ＨＬＡ－Ｆ＊０１０１（ＨＬＡ－Ｆ＊０１：０１：０１：０１）、ＨＬＡ－Ｆ＊０１：０２、ＨＬＡ－Ｆ＊０１：０３（ＨＬＡ－Ｆ＊０１：０３：０１：０１）、ＨＬＡ－Ｆ＊０１：０４、ＨＬＡ－Ｆ＊０１：０５、及びＨＬＡ－Ｆ＊０１：０６が挙げられるが、これらに限定されない。好適なＨＬＡ－Ｇ対立遺伝子の非限定的な例としては、ＨＬＡ－Ｇ＊０１０１（ＨＬＡ－Ｇ＊０１：０１：０１：０１）、ＨＬＡ－Ｇ＊０１：０２、ＨＬＡ－Ｇ＊０１：０３（ＨＬＡ－Ｇ＊０１：０３：０１：０１）、ＨＬＡ－Ｇ＊０１：０４（ＨＬＡ－Ｇ＊０１：０４：０１：０１）、ＨＬＡ－Ｇ＊０１：０６、ＨＬＡ－Ｇ＊０１：０７、ＨＬＡ－Ｇ＊０１：０８、ＨＬＡ－Ｇ＊０１：０９：ＨＬＡ－Ｇ＊０１：１０、ＨＬＡ－Ｇ＊０１：１０、ＨＬＡ－Ｇ＊０１：１１、ＨＬＡ－Ｇ＊０１：１２、ＨＬＡ－Ｇ＊０１：１４、ＨＬＡ－Ｇ＊０１：１５、ＨＬＡ－Ｇ＊０１：１６、ＨＬＡ－Ｇ＊０１：１７、ＨＬＡ－Ｇ＊０１：１８：ＨＬＡ－Ｇ＊０１：１９、ＨＬＡ－Ｇ＊０１：２０、及びＨＬＡ－Ｇ＊０１：２２が挙げられるが、これらに限定されない。リーダー配列、膜貫通配列、及び細胞質配列の全てまたは実質的に全てを含まないそれらのＨＬＡ Ｅ、ＨＬＡ－Ｆ、及びＨＬＡ－Ｇ対立遺伝子のコンセンサス配列を図１０に提供し、図１１において、上記のＨＬＡ－Ａ、ＨＬＡ－Ｂ、及びＨＬＡ－Ｃ対立遺伝子のコンセンサス配列とアラインする。
図１は、ＨＬＡ－Ｅ、ＨＬＡ－Ｆ、及びＨＬＡ－Ｇのそれぞれについてのコンセンサス配列を示し、可変ａａ位置を、連続番号を付した「Ｘ」残基として示し、ａａ８４、１３９、及び２３６の位置には二重下線を引いている。
図１１は、図７～１１に示すＨＬＡ－Ａ、ＨＬＡ－Ｂ、ＨＬＡ－Ｃ、ＨＬＡ－Ｅ、ＨＬＡ－Ｆ、及びＨＬＡ－Ｇのコンセンサスアミノ酸配列のアラインメントを提供する。各配列中の可変残基は、連続番号付けを除去して「Ｘ」として列挙される。図６に示されるように、ａａ８４、１３９、及び２３６の位置は、（ｉ）任意の天然アミノ酸、または（ｉｉ）プロリンもしくはグリシンを除く任意の天然アミノ酸から独立して選択される１～５つのアミノ酸に置き換えられ得る、それらの隣接する５アミノ酸クラスターで示される。
上記のＨＬＡ－Ｅ、ＨＬＡ－Ｆ、及び／またはＨＬＡ－Ｇ対立遺伝子のいずれも、コンセンサス配列について図１１に示すように、８４位、１３９位、及び／または２３６位のうちの１つ以上で置換を含み得る。一部の例では、置換は以下から選択され得る：８４位でのチロシンからアラニン（Ｙ８４Ａ）もしくはシステイン（Ｙ８４Ｃ）、またはＨＬＡ－Ｆの場合はＲ８４ＡもしくはＲ８４Ｃ置換、１３９位のアラニンからシステイン（Ａ１３９Ｃ）、またはＨＬＡ－Ｆの場合はＶ１３９Ｃ、及び２３６位でのアラニンからシステインへの置換（Ａ２３６Ｃ）。加えて、図１１に記載のコンセンサス配列のいずれかの全部または一部（例えば、５０、７５、１００、１５０、２００、または２５０連続アミノ酸）に対して、少なくとも７５％（例えば、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％）または１００％のアミノ酸配列同一性を有するＨＬＡ－Ｅ、ＨＬＡ－Ｆ、及び／またはＨＬＡ－Ｇ配列もまた、使用してよい（例えば、配列は、図中に列挙される可変残基での変化に加えて、１～２５、１～５、５～１０、１０～１５、１５～２０、２０～２５、または２５～３０アミノ酸の挿入、欠失、及び／または置換を含み得る）。
マウスＨ２Ｋ
一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、マウスＨ２Ｋのアミノ酸配列（配列番号４５）（図６のマウスＨ２Ｋ）、またはその配列の全部もしくは一部（例えば、５０、７５、１００、１５０、２００、または２５０連続アミノ酸）に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、もしくは１００％のアミノ酸配列同一性を有する配列を含む（例えば、それは、１～２５、１～５、５～１０、１０～１５、１５～２０、２０～２５、または２５～３０アミノ酸の挿入、欠失、及び／または置換を含み得る）。一部の例では、本開示のＴＭＭＰのマウスＨ２Ｋ重鎖ポリペプチドが、図６においてマウスＨ２Ｋとラベル付けされた配列に対して１００％未満の同一性を有する場合、それは、８４位、１３９位及び／または２３６位のうちの１つ以上で、以下から選択される突然変異を含んでいてもよい：８４位でのチロシンからアラニン（Ｙ８４Ａ）、８４位でのチロシンからシステイン（Ｙ８４Ｃ）、１３９位でのアラニンからシステイン（Ａ１３９Ｃ）、及び２３６位でのアラニンからシステインへの置換（Ａ２３６Ｃ）。一部の例では、本開示のＴＭＭＰのマウスＨ２Ｋ重鎖ポリペプチドは、Ｙ８４Ａ及びＡ２３６Ｃ置換を含む。一部の例では、本開示のＴＭＭＰのマウスＨ２Ｋ重鎖ポリペプチドは、Ｙ８４Ｃ及びＡ１３９Ｃ置換を含む。一部の例では、本開示のＴＭＭＰのマウスＨ２Ｋ重鎖ポリペプチドは、Ｙ８４Ｃ、Ａ１３９Ｃ及びＡ２３６Ｃ置換を含む。
組み合わせ例
以下の表１は、本開示のＴＭＭＰに組み込むことができるＭＨＣクラスＩ重鎖配列修飾の様々な組み合わせを示す。
（表１）
Figure 2022536581000015
Figure 2022536581000016
β２ミクログロブリン
本開示のＴＭＭＰのβ２－ミクログロブリン（β２Ｍ）ポリペプチドは、ヒトβ２Ｍポリペプチド、非ヒト霊長類β２Ｍポリペプチド、マウスβ２Ｍポリペプチドなどであり得る。一部の例では、β２Ｍポリペプチドは、図６に記載のβ２Ｍアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または、１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。一部の例では、β２Ｍポリペプチドは、図４に記載のβ２Ｍアミノ酸配列のアミノ酸２１～１１９に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
一部の例では、好適なβ２Ｍポリペプチドは、以下のアミノ酸配列、
ＩＱＲＴＰＫＩＱＶＹ ＳＣＨＰＡＥＮＧＫＳ ＮＦＬＮＣＹＶＳＧＦ ＨＰＳＤＩＥＶＤＬＬＫＮＧＥＲＩＥＫＶＥ ＨＳＤＬＳＦＳＫＤＷ ＳＦＹＬＬＹＹＴＥＦ ＴＰＴＥＫＤＥＹＡＣ ＲＶＮＨＶＴＬＳＱＰ ＫＩＶＫＷＤＲＤＭ（配列番号１２６）を含み、ＨＬＡクラスＩ重鎖ポリペプチドは、以下のアミノ酸配列、
ＧＳＨＳＭＲＹＦＦＴＳＶＳＲＰＧＲＧＥＰＲＦＩＡＶＧＹＶＤＤＴＱＦＶＲＦＤＳＤＡＡＳＱＲＭＥＰＲＡＰＷＩＥＱＥＧＰＥＹＷＤＧＥＴＲＫＶＫＡＨＳＱＴＨＲＶＤＬ（ａａ１）｛Ｃ｝（ａａ２）ＡＧＳＨＴＶＱＲＭＹＧＣＤＶＧＳＤＷＲＦＬＲＧＹＨＱＹＡＹＤＧＫＤＹＩＡＬＫＥＤＬＲＳＷ（ａａ３）｛Ｃ｝（ａａ４））ＨＫＷＥＡＡＨＶＡＥＱＬＲＡＹＬＥＧＴＣＶＥＷＬＲＲＹＬＥＮＧＫＥＴＬＱＲＴＤＡＰＫＴＨＭＴＨＨＡＶＳＤＨＥＡＴＬＲＣＷＡＬＳＦＹＰＡＥＩＴＬＴＷＱＲＤＧＥＤＱＴＱＤＴＥＬ（ａａ５）Ｉ（ａａ６）ＱＫＷＡＡＶＶＶＰＳＧＱＥＱＲＹＴＣＨＶＱＨＥＧＬＰＫＰＬＴＬＲＷＥＰ（配列番号１２７）（｛Ｃ｝で示すシステイン残基は、α１へリックスとα２－１へリックスの間にジスルフィド結合を形成し、ｔＩＩ残基は、１２位のβ２Ｍポリペプチドシステインとジスルフィド結合を形成する）を含む。上記の配列において、「ａａ１」は「アミノ酸クラスター１」であり、「ａａ２」は「アミノ酸クラスター２」であり、「ａａ３」は「アミノ酸クラスター３」であり、「ａａ４」は「アミノ酸クラスター４」であり、「ａａ５」は「アミノ酸クラスター５」であり、「ａａ６」は「アミノ酸クラスター６」であり、例えば、図８を参照されたい。ａａ１、ａａ２、ａａ３、ａａ４、ａａ５、及びａａ６のそれぞれの存在は、１～５アミノ酸残基であり、１～５アミノ酸残基となるように独立して選択され、それらアミノ酸残基は、ｉ）任意の天然（例えば、コード）アミノ酸から独立して選択されるか、または、ｉｉ）プロリンはグリシンを除く任意の天然アミノ酸である。
一部の例では、ＭＨＣポリペプチドは、参照ＭＨＣポリペプチド（参照ＭＨＣポリペプチドは野生型ＭＨＣポリペプチドであってもよい）と比較して単一のアミノ酸置換を含み、その単一のアミノ酸置換は、アミノ酸をシステイン（Ｃｙｓ）残基で置換する。このようなシステイン残基は、本開示のＴＭＭＰの第１のポリペプチドのＭＨＣポリペプチド内に存在する場合、本開示のＴＭＭＰの第２のポリペプチド鎖内に存在するシステイン残基とジスルフィド結合を形成し得る。
一部の例では、本開示のＴＭＭＰの第１のポリペプチド内の第１のＭＨＣポリペプチド、及び／または、本開示のＴＭＭＰの第２のポリペプチド内の第２のＭＨＣポリペプチドは、アミノ酸をシステインで置換するアミノ酸置換を含み、第１のＭＨＣポリペプチド内の置換システインは、第２のＭＨＣポリペプチド内のシステインとジスルフィド結合を形成し、第１のＭＨＣポリペプチド内のシステインは、第２のＭＨＣポリペプチド内の置換システインとジスルフィド結合を形成する、または、第１のＭＨＣポリペプチド内の置換システインは、第２のＭＨＣポリペプチド内の置換システインとジスルフィド結合を形成する。
例えば、一部の例では、ＨＬＡ β２－ミクログロブリン及びＨＬＡクラスＩ重鎖における以下の残基対のうちの１つが、システインで置換されている（残基番号は、成熟ポリペプチドのものである）：１）β２Ｍ残基１２、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基２３６、２）β２Ｍ残基１２、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基２３７、３）β２Ｍ残基８、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基２３４、４）β２Ｍ残基１０、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基２３５、５）β２Ｍ残基２４、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基２３６、６）β２Ｍ残基２８、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基２３２、７）β２Ｍ残基９８、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基１９２、８）β２Ｍ残基９９、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基２３４、９）β２Ｍ残基３、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基１２０、１０）β２Ｍ残基３１、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基９６、１１）β２Ｍ残基５３、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基３５、１２）β２Ｍ残基６０、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基９６、１３）β２Ｍ残基６０、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基１２２、１４）β２Ｍ残基６３、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基２７、１５）β２Ｍ残基Ａｒｇ３、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基Ｇｌｙ１２０、１６）β２Ｍ残基Ｈｉｓ３１、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基Ｇｌｎ９６、１７）β２Ｍ残基Ａｓｐ５３、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基Ａｒｇ３５、１８）β２Ｍ残基Ｔｒｐ６０、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基Ｇｌｎ９６、１９）β２Ｍ残基Ｔｒｐ６０、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基Ａｓｐ１２２、２０）β２Ｍ残基Ｔｙｒ６３、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基Ｔｙｒ２７、２１）β２Ｍ残基Ｌｙｓ６、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基Ｇｌｕ２３２、２２）β２Ｍ残基Ｇｌｎ８、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基Ａｒｇ２３４、２３）β２Ｍ残基Ｔｙｒ１０、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基Ｐｒｏ２３５、２４）β２Ｍ残基Ｓｅｒ１１、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基Ｇｌｎ２４２、２５）β２Ｍ残基Ａｓｎ２４、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基Ａｌａ２３６、２６）β２Ｍ残基Ｓｅｒ２８、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基Ｇｌｕ２３２、２７）β２Ｍ残基Ａｓｐ９８、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基Ｈｉｓ１９２、及び２８）β２Ｍ残基Ｍｅｔ９９、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基Ａｒｇ２３４。ＭＨＣ／ＨＬＡクラスＩ重鎖のアミノ酸付番は、シグナルペプチドを含まない成熟ＭＨＣ／ＨＬＡクラスＩ重鎖を基準としている。例えば、一部の例では、成熟ＨＬＡ－Ａアミノ酸配列の残基２３６はＣｙｓで置換されている。一部の例では、成熟ＨＬＡ－Ｂアミノ酸配列の残基２３６はＣｙｓで置換されている。一部の例では、成熟ＨＬＡ－Ｃアミノ酸配列の残基２３６はＣｙｓで置換されている。一部の例では、図４に記載のアミノ酸配列の残基３２（成熟β２ＭのＡｒｇ－１２に対応する）はＣｙｓで置換されている。
一部の例では、β２Ｍポリペプチドは、アミノ酸配列を含む：
Figure 2022536581000017
。一部の例では、β２Ｍポリペプチドは、アミノ酸配列を含む：
Figure 2022536581000018
。
一部の例では、ＨＬＡクラスＩ重鎖ポリペプチドは、アミノ酸配列を含む：
Figure 2022536581000019
。
一部の例では、ＨＬＡクラスＩ重鎖ポリペプチドは、アミノ酸配列を含む：
Figure 2022536581000020
。
一部の例では、ＨＬＡクラスＩ重鎖ポリペプチドは、アミノ酸配列を含む：
Figure 2022536581000021
。
一部の例では、β２Ｍポリペプチドは、以下のアミノ酸配列、
Figure 2022536581000022
を含み、本開示のＴＭＭＰのＨＬＡクラスＩ重鎖ポリペプチドは、以下のアミノ酸配列、
Figure 2022536581000023
（下線を付した太字のＣｙｓ残基は、ＴＭＭＰ内において互いにジスルフィド結合を形成する）を含む。
一部の例では、β２Ｍポリペプチドは、アミノ酸配列を含む：
Figure 2022536581000024
。
一部の例では、本開示のＴＭＭＰの第１のポリペプチドと第２のポリペプチドは、ｉ）第１のポリペプチド鎖内のペプチドエピトープとβ２Ｍポリペプチドとを接続するリンカー内に存在するＣｙｓ残基及びｉｉ）第２のポリペプチド鎖内のＭＨＣクラスＩ重鎖内に存在するＣｙｓ残基を介して、互いにジスルフィド結合している。一部の例では、ＭＨＣクラスＩ重鎖内に存在するＣｙｓ残基は、Ｙ８４Ｃ置換として導入されたＣｙｓである。一部の例では、第１のポリペプチド鎖内のペプチドエピトープとβ２Ｍポリペプチドとを接続するリンカーは、ＧＣＧＧＳ（Ｇ４Ｓ）ｎ（配列番号１３６）（ｎは１、２、３、４、５、６、７、８、または９である）である。例えば、一部の例では、リンカーはアミノ酸配列ＧＣＧＧＳＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号１３７）を含む。別の例では、リンカーはアミノ酸配列ＧＣＧＧＳＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号１３８）を含む。ジスルフィド結合した本開示のＴＭＭＰの第１のポリペプチドと第２のポリペプチドの例を、図２Ａ～２Ｆに概略的に示す。
多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ
一部の例では、本開示のＴＭＭＰの第１のポリペプチド及び第２のポリペプチドを、少なくとも２つのジスルフィド結合（すなわち、２つの鎖間ジスルフィド結合）によって互いに連結する。このような多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰの例を、図１２Ａ及び１２Ｂに概略的に示す。加えて、本開示のＴＭＭＰがＩｇＦｃポリペプチドを含む場合、ヘテロ二量体ＴＭＭＰを二量体化することができ、ジスルフィド結合が２つのヘテロ二量体ＴＭＭＰ内のＩｇＦｃポリペプチドを連結する。このような配置を、図１２Ｃ及び１２Ｄに概略的に示し、図中、ジスルフィド結合を破線で表す。特に明記しない限り、本節における多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰＰに記載する少なくとも２つのジスルフィド結合は、二量体化ＴＭＭＰのＩｇＦｃポリペプチドを連結するジスルフィド結合を指すものではない。
上記のように、一部の例では、本開示のＴＭＭＰの第１のポリペプチド及び第２のポリペプチドを、少なくとも２つのジスルフィド結合（すなわち、２つの鎖間ジスルフィド結合）によって互いに連結する。例えば、一部の例では、本開示のＴＭＭＰの第１のポリペプチド及び第２のポリペプチドを、２つの鎖間ジスルフィド結合によって互いに連結する。別の例として、一部の例では、本開示のＴＭＭＰの第１のポリペプチド及び第２のポリペプチドを、３つの鎖間ジスルフィド結合によって互いに連結する。別の例として、一部の例では、本開示のＴＭＭＰの第１のポリペプチド及び第２のポリペプチドを、４つの鎖間ジスルフィド結合によって互いに連結する。
一部の例では、本開示のＴＭＭＰの第１のポリペプチド内のペプチドエピトープを、Ｃｙｓを含むリンカーによってβ２Ｍポリペプチドに連結する場合、少なくとも２つのジスルフィド結合のうちの少なくとも１つは、リンカー内のＣｙｓを第２のポリペプチド内のＭＨＣクラスＩ重鎖のＣｙｓに連結する。一部の例では、本開示のＴＭＭＰの第１のポリペプチド内のペプチドエピトープをリンカーによってＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに連結する場合、少なくとも２つのジスルフィド結合のうちの少なくとも１つは、リンカー内のＣｙｓを第２のポリペプチドに存在するβ２Ｍポリペプチド内のＣｙｓに連結する。
一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）は、少なくとも２つのジスルフィド結合のうちの１つのみを含む対照ＴＭＭＰに比べて高い安定性を示す。一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）は、少なくとも２つのジスルフィド結合のうちの１つのみを含む対照ＴＭＭＰに比べて、高いｉｎ ｖｉｔｒｏ安定性を示す。例えば、一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）は、少なくとも２つのジスルフィド結合のうちの１つのみを含む対照ＴＭＭＰに比べて、ｉｎ ｖｉｔｒｏでの安定性が、少なくとも５％、少なくとも１０％、少なくとも１５％、少なくとも２０％、少なくとも２５％、少なくとも５０％、少なくとも２倍、少なくとも５倍、または少なくとも１０倍高い。
本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰが、少なくとも２つのジスルフィド結合のうちの１つのみを含む対照ＴＭＭＰと比較して、高いｉｎ ｖｉｔｒｏ安定性を示すかどうかを、時間の経過と共に及び／または特定の条件下で及び／またはＴＭＭＰの精製中に、試料中に存在するジスルフィド結合ヘテロ二量体ＴＭＭＰの量を測定することによって判定することができる。
例えば、一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）は、ＴＭＭＰを３７℃で一定期間（例えば、約１週間～約２週間、約２週間～約４週間、または約４週間～約２ヶ月間）保存した場合、少なくとも２つのジスルフィドのうちの１つのみを含む対照ＴＭＭＰに比べて、少なくとも５％、少なくとも１０％、少なくとも１５％、少なくとも２０％、少なくとも２５％、少なくとも５０％、少なくとも２倍、少なくとも５倍、または少なくとも１０倍高いｉｎ ｖｉｔｒｏ安定性を示す。例えば、一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）を３７℃で２８日間、ｉｎ ｖｉｔｒｏで保存した後に残存するジスルフィド結合ヘテロ二量体ＴＭＭＰの量は、対照ＴＭＭＰ（多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰに存在する少なくとも２つのジスルフィド結合のうちの１つのみを含むＴＭＭＰ）を３７℃で２８日間、ｉｎ ｖｉｔｒｏで保存した後に残存するジスルフィド結合ヘテロ二量体ＴＭＭＰの量に比べて、少なくとも５％、少なくとも１０％、少なくとも１５％、少なくとも２０％、少なくとも２５％、少なくとも５０％、少なくとも２倍、少なくとも５倍、または少なくとも１０倍多い。
一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰは、少なくとも２つのジスルフィド結合のうちの１つのみを含む対照ＴＭＭＰに比べて、より高いｉｎ ｖｉｖｏ安定性を示す。例えば、一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰは、少なくとも２つのジスルフィド結合のうちの１つのみを含む対照ＴＭＭＰに比べて、少なくとも５％、少なくとも１０％、少なくとも１５％、少なくとも２０％、少なくとも２５％、少なくとも５０％、少なくとも２倍、少なくとも５倍、または少なくとも１０倍高いｉｎ ｖｉｖｏ安定性を示す。
一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）に２つのジスルフィド結合が存在することは、ＴＭＭＰが少なくとも２つのジスルフィド結合のうちの１つのみを含む対照ＴＭＭＰである場合に生成されるジスルフィド結合ヘテロ二量体ＴＭＭＰの量に比べて、ジスルフィド結合ヘテロ二量体ＴＭＭＰの産生量を高める。例えば、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）を、哺乳動物細胞を液体細胞培養培地で培養するｉｎ ｖｉｔｒｏ細胞培養において、哺乳動物細胞内で産生することができる。ＴＭＭＰは、細胞培養培地に分泌され得る。細胞を溶解して細胞溶解物を生成することができ、ＴＭＭＰを細胞溶解物中に存在させることができる。ＴＭＭＰは、細胞培養培地及び／または細胞溶解物から精製することができる。例えば、ＴＭＭＰがＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドを含む場合、細胞培養培地及び／または細胞溶解物を、固定化したプロテインＡと接触させることができる（例えば、細胞培養培地及び／または細胞溶解物を、プロテインＡをビーズに固定化させたプロテインＡカラムにアプライすることができる）。細胞培養培地及び／または細胞溶解物中に存在するＴＭＭＰが固定化されたタンパク質Ａに結合する。カラムを洗浄して未結合物質を除去した後、結合したＴＭＭＰが溶出され、タンパク質Ａ溶出液を生成する。プロテインＡ溶出液中に存在するジスルフィド結合ヘテロ二量体ＴＭＭＰの量は、ＴＭＭＰが多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）に存在する少なくとも２つのジスルフィド結合のうちの１つのみを含む対照ＴＭＭＰである場合、プロテインＡ溶出液中に存在するジスルフィド結合ヘテロ二量体ＴＭＭＰの量に比べて、少なくとも０．５％、少なくとも１％、少なくとも２％、少なくとも３％、少なくとも４％、少なくとも５％、少なくとも６％、少なくとも７％、少なくとも８％、少なくとも９％、または少なくとも１０％高い。一部の例では、非凝集ジスルフィド結合ヘテロ二量体ＴＭＭＰである溶出液中の総ＴＭＭＰタンパク質の割合は、少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、または少なくとも９９％である。プロテインＡ溶出液は、サイズ排除クロマトグラフィー（ＳＥＣ）及び／または１つ以上の他の追加の精製工程に供することができる。
一部の例では、本開示のＴ細胞調節多量体ポリペプチドは、ａ）ｉ）ＭＵＣ１ペプチド（ＭＵＣ１ペプチドは、少なくとも４アミノ酸長、例えば４アミノ酸～約２５アミノ酸（例えば、４アミノ酸（ａａ）、５ａａ、６ａａ、７ａａ、８ａａ、９ａａ、１０ａａ、１１ａａ、１２ａａ、１３ａａ、１４ａａ、１５ａａ、１６ａａ、１７ａａ、１８ａａ、１９ａａ、２０ａａ、２１ａａ、２２ａａ、２３ａａ、２４ａａ、または２５ａａ、そして長さが４～２０アミノ酸、６～１８アミノ酸、８～１５アミノ酸、８～１２アミノ酸、５～１０アミノ酸、１０～２０アミノ酸、及び１５～２５アミノ酸の範囲内のペプチド）を有する）と、ｉｉ）第１のＭＨＣポリペプチドとを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）第２のＭＨＣポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、ｃ）少なくとも１つの免疫調節ポリペプチド（第１及び／または第２のポリペプチドは、免疫調節ポリペプチドを含む）とを含む、少なくとも１つのヘテロ二量体を含み、ヘテロ二量体は、第１のポリペプチドと第２のポリペプチドとの間に少なくとも２つのジスルフィド結合（例えば、２つのジスルフィド結合）（例えば、ヘテロ二量体は、ｉ）第１のポリペプチドと第２のポリペプチドとを連結する第１のジスルフィド結合、及びｉｉ）第１のポリペプチドと第２のポリペプチドとを連結する第２のジスルフィド結合を含む）を含む。別の言い方をすれば、第１のポリペプチドは、第２のポリペプチドの第１のＣｙｓ残基とジスルフィド結合（第１のジスルフィド結合）を形成する第１のＣｙｓ残基を含み、第１のポリペプチドは、第２のポリペプチドの第２のＣｙｓ残基とジスルフィド結合（第２のジスルフィド結合）を形成する第２のＣｙｓ残基を含む。
一部の例では、本開示のＴＭＭＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＵＣ１ペプチド、ｉｉ）ペプチドリンカー、及びｉｉｉ）β２Ｍポリペプチドを含む第１のポリペプチド、ならびにｂ）ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドを含む第２のポリペプチド（第１及び第２のポリペプチドの一方または両方が、少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドを含む）を含み、ＴＭＭＰは、ａ）ｉ）ＭＵＣ１ペプチドとβ２Ｍポリペプチドの間のリンカーに存在するＣｙｓと、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに導入された第１のＣｙｓとの間の第１のジスルフィド結合、及びｂ）第１のポリペプチドと第２のポリペプチドとの間の少なくとも第２のジスルフィド結合を含み、少なくとも第２のジスルフィド結合は、ｉ）第１のポリペプチド内の、リンカーに存在するＣｙｓに対してＣ末端のＣｙｓと、ｉｉ）第２のポリペプチド内の、ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに導入された第１のＣｙｓに対してＣ末端のＣｙｓとの間に存在する。
一部の例では、本開示のＴＭＭＰの第１または第２のポリペプチドにおける第１及び第２のジスルフィド結合形成Ｃｙｓ残基は、互いに約１０アミノ酸～約２００アミノ酸離れている。例えば、一部の例では、ＴＭＭＰの第１または第２のポリペプチドにおける第１及び第２のジスルフィド結合形成Ｃｙｓ残基は、約１０アミノ酸（ａａ）～約１５ａａ、約１５ａａ～約２０ａａ、約２０ａａ～約２５ａａ、約２５ａａ～約３０ａａ、約３０ａａ～約４０ａａ、約４０ａａ～約５０ａａ、約５０ａａ～約６０ａａ、約６０ａａ～約７０ａａ、約７０ａａ～約８０ａａ、約８０ａａ～約９０ａａ、約９０ａａ～約１００ａａ、約１００ａａ～約１１０ａａ、約１１０ａａ～約１２０ａａ、約１２０ａａ～約１３０ａａ、約１３０ａａ～約１４０ａａ、約１４０ａａ～約１５０ａａ、約１５０ａａ～約１６０ａａ、約１６０ａａ～約１７０ａａ、約１７０ａａ～約１８０ａａ、約１８０ａａ～約１９０ａａ、または約１９０ａａ～約２００ａａである。
一例として、一部の例では、本開示のＴＭＭＰの第１のポリペプチドにおける第１及び第２のジスルフィド結合形成Ｃｙｓ残基は、互いに約１０アミノ酸～約８０アミノ酸残基離れている。例えば、一部の例では、第１のポリペプチドにおける第２のジスルフィド結合形成Ｃｙｓ残基は、第１のポリペプチドの第１のジスルフィド結合形成Ｃｙｓ残基に対して、約１０アミノ酸～約８０アミノ酸（例えば、約１０アミノ酸（ａａ）～約１５ａａ、約１５ａａ～約２０ａａ、約２０ａａ～約２５ａａ、約２５ａａ～約３０ａａ、約３０ａａ～約４０ａａ、約４０ａａ～約５０ａａ、約５０ａａ～約６０ａａ、約６０ａａ～約７０ａａ、または約７０ａａ～約８０ａａ）Ｃ末端側である。一部の例では、第１のポリペプチドにおける第２のジスルフィド結合形成Ｃｙｓ残基は、第１のポリペプチドの第１のジスルフィド結合形成Ｃｙｓ残基に対して、１０ａａ、１１ａａ、１２ａａ、１３ａａ、１４ａａ、１５ａａ、１６ａａ、１７ａａ、１８ａａ、１９ａａ、２０ａａ、２１ａａ、２２ａａ、２３ａａ、２４ａａ、または２５ａａ Ｃ末端側である。一部の例では、第１のポリペプチドの第２のジスルフィド結合形成Ｃｙｓ残基は、第１のポリペプチドの第１のジスルフィド結合形成Ｃｙｓ残基に対して１５ａａ Ｃ末端側である。一部の例では、第１のポリペプチドの第２のジスルフィド結合形成Ｃｙｓ残基は、第１のポリペプチドの第１のジスルフィド結合形成Ｃｙｓ残基に対して２０ａａ Ｃ末端側である。一部の例では、第１のポリペプチドの第２のジスルフィド結合形成Ｃｙｓ残基は、第１のポリペプチドの第１のジスルフィド結合形成Ｃｙｓ残基に対して２５ａａ Ｃ末端側である。
別の例として、一部の例では、本開示のＴＭＭＰの第２のポリペプチドにおける第１及び第２のジスルフィド結合形成Ｃｙｓ残基は、互いに約１４０アミノ酸～約１６０アミノ酸離れている。例えば、一部の例では、第２のポリペプチドの第２のジスルフィド結合形成Ｃｙｓ残基は、第２のポリペプチドの第１のジスルフィド結合形成Ｃｙｓ残基に対して約１４０アミノ酸～約１６０アミノ酸 Ｃ末端側である。一部の例では、第２のポリペプチドの第２のジスルフィド結合形成Ｃｙｓ残基は、第２のポリペプチドにおける第１のジスルフィド結合形成Ｃｙｓ残基に対して、１４０アミノ酸（ａａ）、１４１ａａ、１４２ａａ、１４３ａａ、１４４ａａ、１４５ａａ、１４６ａａ、１４７ａａ、１４８ａａ、１４９ａａ、１５０ａａ、１５１ａａ、１５２ａａ、１５３ａａ、１５４ａａ、１５５ａａ、１５６ａａ、１５７ａａ、１５８ａａ、１５９ａａ、または１６０ａａ Ｃ末端側である。
本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）は、例えば、ａ）ｉ）ＭＵＣ１ペプチド（例えば４アミノ酸～約２５アミノ酸長のＭＵＣ１ペプチドであり、該ペプチドがＭＨＣポリペプチドと複合体を形成する際にＴＣＲによって結合する）、及びｉｉ）第１のＭＨＣポリペプチドとを含む、第１のポリペプチド（第１のポリペプチドは、ＭＵＣ１ペプチドと第１のＭＨＣポリペプチドとの間にペプチドリンカーを含み、ペプチドリンカーは、Ｃｙｓ残基を含み、第１のＭＨＣポリペプチドは、Ｃｙｓ残基を導入するアミノ酸置換を含むβ２Ｍポリペプチドである）と、ｂ）第２のＭＨＣポリペプチドを含む、第２のポリペプチド（第２のＭＨＣポリペプチドは、ＨＬＡ－Ａ＊０２０１（図７Ａに示す）のアミノ酸付番に基づくＹ８４Ｃ置換及びＡ２３６Ｃ置換、または別のクラスＩ重鎖対立遺伝子の対応する位置における置換を含むクラスＩ重鎖であり、ＴＭＭＰは、ペプチドリンカーのＣｙｓ残基と、クラスＩ重鎖のアミノ酸８４位または別のクラスＩ重鎖対立遺伝子の対応する位置のＣｙｓ残基との間にジスルフィド結合を含み、ＴＭＭＰは、β２Ｍポリペプチドの導入されたＣｙｓ残基と、クラスＩ重鎖のアミノ酸２３６位または別のクラスＩ重鎖対立遺伝子の対応する位置のＣｙｓとの間にジスルフィド結合を含む）と、ｃ）少なくとも１つの免疫調節ポリペプチド（第１及び／または第２のポリペプチドは少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドを含む）とを含み得る。例を図１２Ａ及び図１２Ｂに概略的に示す。
一部の例では、ペプチドリンカーは、アミノ酸配列ＧＣＧＧＳ（配列番号１３９）を含む。一部の例では、ペプチドリンカーは、アミノ酸配列ＧＣＧＧＳ（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１４０）を含み、配列中、ｎは、１～１０の整数である。一部の例では、ペプチドリンカーは、アミノ酸配列ＧＣＧＧＳ（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１４０）を含み、配列中、ｎは１である。一部の例では、ペプチドリンカーは、アミノ酸配列ＧＣＧＧＳ（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１４０）を含み、配列中、ｎは２である。一部の例では、ペプチドリンカーは、アミノ酸配列ＧＣＧＧＳ（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１４０）を含み、配列中、ｎは３である。一部の例では、ペプチドリンカーは、アミノ酸配列ＧＣＧＧＳ（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１４０）を含み、配列中、ｎは４である。一部の例では、ペプチドリンカーは、アミノ酸配列ＧＣＧＧＳ（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１４０）を含み、配列中、ｎは５である。一部の例では、ペプチドリンカーは、アミノ酸配列ＧＣＧＧＳ（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１４０）を含み、配列中、ｎは６である。一部の例では、ペプチドリンカーは、アミノ酸配列ＧＣＧＧＳ（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１４０）を含み、配列中、ｎは７である。一部の例では、ペプチドリンカーは、アミノ酸配列ＧＣＧＧＳ（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１４０）を含み、配列中、ｎは８である。一部の例では、ペプチドリンカーは、アミノ酸配列ＧＣＧＧＳ（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１４０）を含み、配列中、ｎは９である。一部の例では、ペプチドリンカーは、アミノ酸配列ＧＣＧＧＳ（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１４０）を含み、配列中、ｎは１０である。
一部の例では、ペプチドリンカーは、アミノ酸配列ＣＧＧＧＳ（配列番号１４１）を含む。一部の例では、ペプチドリンカーは、アミノ酸配列ＣＧＧＧＳ（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１４２）を含み、配列中、ｎは、１～１０の整数である。一部の例では、ペプチドリンカーは、アミノ酸配列ＣＧＧＧＳ（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１４２）を含み、配列中、ｎは１である。一部の例では、ペプチドリンカーは、アミノ酸配列ＣＧＧＧＳ（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１４２）を含み、配列中、ｎは２である。一部の例では、ペプチドリンカーは、アミノ酸配列ＣＧＧＧＳ（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１４２）を含み、配列中、ｎは３である。一部の例では、ペプチドリンカーは、アミノ酸配列ＣＧＧＧＳ（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１４２）を含み、配列中、ｎは４である。一部の例では、ペプチドリンカーは、アミノ酸配列ＣＧＧＧＳ（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１４２）を含み、配列中、ｎは５である。一部の例では、ペプチドリンカーは、アミノ酸配列ＣＧＧＧＳ（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１４２）を含み、配列中、ｎは６である。一部の例では、ペプチドリンカーは、アミノ酸配列ＣＧＧＧＳ（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１４２）を含み、配列中、ｎは７である。一部の例では、ペプチドリンカーは、アミノ酸配列ＣＧＧＧＳ（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１４２）を含み、配列中、ｎは８である。一部の例では、ペプチドリンカーは、アミノ酸配列ＣＧＧＧＳ（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１４２）を含み、配列中、ｎは９である。一部の例では、ペプチドリンカーは、アミノ酸配列ＣＧＧＧＳ（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１４２）を含み、配列中、ｎは１０である。
以下は、ＨＬＡ－Ａ＊０２０１のアミノ酸付番（図７Ａに示す）に基づくＹ８４Ｃ置換及びＡ２３６Ｃ置換、または別のクラスＩ重鎖対立遺伝子の対応する位置における置換を含むＭＨＣクラスＩ重鎖の非限定的な例である。
ＨＬＡ－Ａ
一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）は、ａ）ｉ）ＭＵＣ１ペプチド（例えば４アミノ酸～約２５アミノ酸長のＭＵＣ１ペプチドであり、該ペプチドがＭＨＣポリペプチドと複合体を形成する際にＴＣＲによって結合する）と、ｉｉ）第１のＭＨＣポリペプチドとを含む、第１のポリペプチド（第１のポリペプチドは、ペプチドと第１のＭＨＣポリペプチドとの間にペプチドリンカーを含み、ペプチドリンカーは、Ｃｙｓ残基を含み、第１のＭＨＣポリペプチドは、Ｃｙｓ残基を導入するアミノ酸置換を含むβ２Ｍポリペプチドである）と、ｂ）以下のアミノ酸配列に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＨＬＡ－Ａ ＭＨＣクラスＩ重鎖を含む第２のポリペプチド：
Figure 2022536581000025
、配列中、アミノ酸８４はＣｙｓであり、アミノ酸２３６はＣｙｓであると、ｃ）少なくとも１つの免疫調節ポリペプチド（第１及び／または第２のポリペプチドは、少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドを含む）とを含む。一部の例では、ペプチドリンカーは、アミノ酸配列ＧＣＧＧＳ（配列番号１３９）を含む。一部の例では、ペプチドリンカーは、アミノ酸配列ＧＣＧＧＳ（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１４０）を含み、配列中、ｎは、１～１０の整数である。一部の例では、β２Ｍポリペプチドは、Ｒ１２Ｃ置換を含む。例えば、β２Ｍポリペプチドは、以下のアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る：
Figure 2022536581000026
、配列中、アミノ酸１２はＣｙｓである。少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドは、サイトカイン、４－１ＢＢＬポリペプチド、Ｂ７－１ポリペプチド、Ｂ７－２ポリペプチド、ＩＣＯＳ－Ｌポリペプチド、ＯＸ－４０Ｌポリペプチド、ＣＤ８０ポリペプチド、ＣＤ８６ポリペプチド、ＰＤ－Ｌ１ポリペプチド、ＦａｓＬポリペプチド、またはＰＤ－Ｌ２ポリペプチドであり得る。一部の例では、本明細書の他の場所に記載のように、少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドは、親和性が低下したバリアント型である。一部の例では、第１または第２のポリペプチドは、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む。
一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）は、ＨＬＡ－ＡクラスＩ重鎖ポリペプチドを含む。一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）内に存在するＨＬＡ－Ａ重鎖ポリペプチドは、図７Ａに示すＨＬＡ－Ａ＊０１０１、ＨＬＡ－Ａ＊０２０１、ＨＬＡ－Ａ＊０２０２、ＨＬＡ－Ａ＊１１０１、ＨＬＡ－Ａ＊２３０１、ＨＬＡ－Ａ＊２４０２、ＨＬＡ－Ａ＊２４０７、ＨＬＡ－Ａ＊３３０３、またはＨＬＡ－Ａ＊３４０１アミノ酸配列に対して、少なくとも９５％、少なくとも９８％、または少なくとも９９％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、ＨＬＡ－Ａ重鎖ポリペプチドはＹ８４Ｃ及びＡ２３６Ｃ置換を含む。
ＨＬＡ－Ａ＊０１０１（Ｙ８４Ｃ；Ａ２３６Ｃ）
一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）内に存在するＨＬＡ－Ａ重鎖ポリペプチドは、以下のＨＬＡ－Ａ＊０１０１（Ｙ８４Ｃ、Ａ２３６Ｃ）アミノ酸配列に対して、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む：
Figure 2022536581000027
、配列中、アミノ酸８４はＣｙｓであり、アミノ酸２３６はＣｙｓである。
ＨＬＡ－Ａ＊０２０１（Ｙ８４Ｃ；Ａ２３６Ｃ）
一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）内に存在するＨＬＡ－Ａ重鎖ポリペプチドは、以下のＨＬＡ－Ａ＊０２０１（Ｙ８４Ｃ、Ａ２３６Ｃ）アミノ酸配列に対して、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む：
Figure 2022536581000028
、配列中、アミノ酸８４はＣｙｓであり、アミノ酸２３６はＣｙｓである。
ＨＬＡ－Ａ＊０２０２（Ｙ８４Ｃ；Ａ２３６Ｃ）
一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）内に存在するＨＬＡ－Ａ重鎖ポリペプチドは、以下のＨＬＡ－Ａ＊０２０２（Ｙ８４Ｃ、Ａ２３６Ｃ）アミノ酸配列に対して、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む：
Figure 2022536581000029
、配列中、アミノ酸８４はＣｙｓであり、アミノ酸２３６はＣｙｓである。
ＨＬＡ－Ａ＊１１０１（Ｙ８４Ｃ；Ａ２３６Ｃ）
一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）内に存在するＨＬＡ－Ａ重鎖ポリペプチドは、以下のＨＬＡ－Ａ＊１１０１（Ｙ８４Ｃ、Ａ２３６Ｃ）アミノ酸配列に対して、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む：
Figure 2022536581000030
、配列中、アミノ酸８４はＣｙｓであり、アミノ酸２３６はＣｙｓである。
ＨＬＡ－Ａ＊２３０１（Ｙ８４Ｃ；Ａ２３６Ｃ）
一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）内に存在するＨＬＡ－Ａ重鎖ポリペプチドは、以下のＨＬＡ－Ａ＊２３０１（Ｙ８４Ｃ、Ａ２３６Ｃ）アミノ酸配列に対して、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む：
Figure 2022536581000031
、配列中、アミノ酸８４はＣｙｓであり、アミノ酸２３６はＣｙｓである。
ＨＬＡ－Ａ＊２４０２（Ｙ８４Ｃ；Ａ２３６Ｃ）
一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）内に存在するＨＬＡ－Ａ重鎖ポリペプチドは、以下のＨＬＡ－Ａ＊２４０２（Ｙ８４Ｃ、Ａ２３６Ｃ）アミノ酸配列に対して、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む：
Figure 2022536581000032
、配列中、アミノ酸８４はＣｙｓであり、アミノ酸２３６はＣｙｓである。
ＨＬＡ－Ａ＊２４０７（Ｙ８４Ｃ；Ａ２３６Ｃ）
一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）内に存在するＨＬＡ－Ａ重鎖ポリペプチドは、以下のＨＬＡ－Ａ＊２４０７（Ｙ８４Ｃ、Ａ２３６Ｃ）アミノ酸配列に対して、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む：
Figure 2022536581000033
、配列中、アミノ酸８４はＣｙｓであり、アミノ酸２３６はＣｙｓである。
ＨＬＡ－Ａ＊３３０３（Ｙ８４Ｃ；Ａ２３６Ｃ）
一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）内に存在するＨＬＡ－Ａ重鎖ポリペプチドは、以下のＨＬＡ－Ａ＊３３０３（Ｙ８４Ｃ、Ａ２３６Ｃ）アミノ酸配列に対して、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む：
Figure 2022536581000034
、配列中、アミノ酸８４はＣｙｓであり、アミノ酸２３６はＣｙｓである。
ＨＬＡ－Ａ＊３４０１（Ｙ８４Ｃ；Ａ２３６Ｃ）
一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）内に存在するＨＬＡ－Ａ重鎖ポリペプチドは、以下のＨＬＡ－Ａ＊３４０１（Ｙ８４Ｃ、Ａ２３６Ｃ）アミノ酸配列に対して、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む：
Figure 2022536581000035
、配列中、アミノ酸８４はＣｙｓであり、アミノ酸２３６はＣｙｓである。
ＨＬＡ－Ｂ
一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）は、ａ）ｉ）少なくとも４アミノ酸長のＭＵＣ１ペプチド（例えば４アミノ酸～約２５アミノ酸長のＭＵＣ１ペプチドであり、該ペプチドがＭＨＣポリペプチドと複合体を形成する際にＴＣＲによって結合する）と、ｉｉ）第１のＭＨＣポリペプチドとを含む、第１のポリペプチド（第１のポリペプチドは、ペプチドと第１のＭＨＣポリペプチドとの間にペプチドリンカーを含み、ペプチドリンカーは、Ｃｙｓ残基を含み、第１のＭＨＣポリペプチドは、Ｃｙｓ残基を導入するアミノ酸置換を含むβ２Ｍポリペプチドである）と、ｂ）以下のアミノ酸配列に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＨＬＡ－Ｂ ＭＨＣクラスＩ重鎖を含む第２のポリペプチド：
Figure 2022536581000036
、配列中、アミノ酸８４はＣｙｓであり、アミノ酸２３６はＣｙｓであると、ｃ）少なくとも１つの免疫調節ポリペプチド（第１及び／または第２のポリペプチドは、少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドを含む）とを含む。一部の例では、ペプチドリンカーは、アミノ酸配列ＧＣＧＧＳ（配列番号１３９）を含む。一部の例では、ペプチドリンカーは、アミノ酸配列ＧＣＧＧＳ（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１４０）を含み、配列中、ｎは、１～１０の整数である。一部の例では、β２Ｍポリペプチドは、Ｒ１２Ｃ置換を含む。例えば、β２Ｍポリペプチドは、以下のアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る。
Figure 2022536581000037
、配列中、アミノ酸１２はＣｙｓである。少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドは、サイトカイン、４－１ＢＢＬポリペプチド、Ｂ７－１ポリペプチド、Ｂ７－２ポリペプチド、ＩＣＯＳ－Ｌポリペプチド、ＯＸ－４０Ｌポリペプチド、ＣＤ８０ポリペプチド、ＣＤ８６ポリペプチド、ＰＤ－Ｌ１ポリペプチド、ＦａｓＬポリペプチド、またはＰＤ－Ｌ２ポリペプチドであり得る。一部の例では、本明細書の他の場所に記載のように、少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドは、親和性が低下したバリアント型である。一部の例では、第１または第２のポリペプチドは、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む。
一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰは、ＨＬＡ－ＢクラスＩ重鎖ポリペプチドを含む。一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）内に存在するＨＬＡ－Ｂ重鎖ポリペプチドは、図８Ａに示すＨＬＡ－Ｂ＊０７０２、ＨＬＡ－Ｂ＊０８０１、ＨＬＡ－Ｂ＊１５０２、ＨＬＡ－Ｂ＊３８０２、ＨＬＡ－Ｂ＊４００１、ＨＬＡ－Ｂ＊４６０１、またはＨＬＡ－Ｂ＊５３０１アミノ酸配列に対して、少なくとも９５％、少なくとも９８％、または少なくとも９９％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、ＨＬＡ－Ｂ重鎖ポリペプチドはＹ８４Ｃ及びＡ２３６Ｃ置換を含む。
ＨＬＡ－Ｂ＊０７０２（Ｙ８４Ｃ、Ａ２３６Ｃ）
一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）に存在するＨＬＡ－Ｂ重鎖ポリペプチドは、以下のＨＬＡ－Ｂ＊０７０２（Ｙ８４Ｃ、Ａ２３６Ｃ）アミノ酸配列に対して、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む：
Figure 2022536581000038
、配列中、アミノ酸８４はＣｙｓであり、アミノ酸２３６はＣｙｓである。
ＨＬＡ－Ｂ＊０８０１（Ｙ８４Ｃ、Ａ２３６Ｃ）
一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）に存在するＨＬＡ－Ｂ重鎖ポリペプチドは、以下のＨＬＡ－Ｂ＊０８０１（Ｙ８４Ｃ、Ａ２３６Ｃ）アミノ酸配列に対して、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む：
Figure 2022536581000039
、配列中、アミノ酸８４はＣｙｓであり、アミノ酸２３６はＣｙｓである。
ＨＬＡ－Ｂ＊１５０２（Ｙ８４Ｃ、Ａ２３６Ｃ）
一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）に存在するＨＬＡ－Ｂ重鎖ポリペプチドは、以下のＨＬＡ－Ｂ＊１５０２（Ｙ８４Ｃ、Ａ２３６Ｃ）アミノ酸配列に対して、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む：
Figure 2022536581000040
、配列中、アミノ酸８４はＣｙｓであり、アミノ酸２３６はＣｙｓである。
ＨＬＡ－Ｂ＊３８０２（Ｙ８４Ｃ、Ａ２３６Ｃ）
一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）に存在するＨＬＡ－Ｂ重鎖ポリペプチドは、以下のＨＬＡ－Ｂ＊３８０２（Ｙ８４Ｃ、Ａ２３６Ｃ）アミノ酸配列に対して、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む：
Figure 2022536581000041
、配列中、アミノ酸８４はＣｙｓであり、アミノ酸２３６はＣｙｓである。
ＨＬＡ－Ｂ＊４００１（Ｙ８４Ｃ、Ａ２３４６Ｃ）
一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）に存在するＨＬＡ－Ｂ重鎖ポリペプチドは、以下のＨＬＡ－Ｂ＊４００１（Ｙ８４Ｃ、Ａ２３６Ｃ）アミノ酸配列に対して、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む：
Figure 2022536581000042
、配列中、アミノ酸８４はＣｙｓであり、アミノ酸２３６はＣｙｓである。
ＨＬＡ－Ｂ＊４６０１（Ｙ８４Ｃ、Ａ２３６Ｃ）
一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）に存在するＨＬＡ－Ｂ重鎖ポリペプチドは、以下のＨＬＡ－Ｂ＊４６０１（Ｙ８４Ｃ、Ａ２３６Ｃ）アミノ酸配列に対して、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む：
Figure 2022536581000043
、配列中、アミノ酸８４はＣｙｓであり、アミノ酸２３６はＣｙｓである。
ＨＬＡ－Ｂ＊５３０１（Ｙ８４Ｃ、Ａ２３６Ｃ）
一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）に存在するＨＬＡ－Ｂ重鎖ポリペプチドは、以下のＨＬＡ－Ｂ＊５３０１（Ｙ８４Ｃ、Ａ２３６Ｃ）アミノ酸配列に対して、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む：
Figure 2022536581000044
、配列中、アミノ酸８４はＣｙｓであり、アミノ酸２３６はＣｙｓである。
ＨＬＡ－Ｃ
一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）は、ａ）ｉ）少なくとも４アミノ酸長のＭＵＣ１ペプチド（例えば４アミノ酸～約２５アミノ酸長のＭＵＣ１ペプチドであり、該ペプチドがＭＨＣポリペプチドと複合体を形成する際にＴＣＲによって結合する）、及びｉｉ）第１のＭＨＣポリペプチドとを含む、第１のポリペプチド（第１のポリペプチドは、ペプチドと第１のＭＨＣポリペプチドとの間にペプチドリンカーを含み、ペプチドリンカーは、Ｃｙｓ残基を含み、第１のＭＨＣポリペプチドは、Ｃｙｓ残基を導入するアミノ酸置換を含むβ２Ｍポリペプチドである）と、ｂ）以下のアミノ酸配列に対して、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＨＬＡ－Ｃ ＭＨＣクラスＩ重鎖を含む第２のポリペプチド：
Figure 2022536581000045
、配列中、アミノ酸８４はＣｙｓであり、アミノ酸２３６はＣｙｓであると、ｃ）少なくとも１つの免疫調節ポリペプチド（第１及び／または第２のポリペプチドは、少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドを含む）とを含む。一部の例では、ペプチドリンカーは、アミノ酸配列ＧＣＧＧＳ（配列番号１３９）を含む。一部の例では、ペプチドリンカーは、アミノ酸配列ＧＣＧＧＳ（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１４０）を含み、配列中、ｎは、１～１０の整数である。一部の例では、β２Ｍポリペプチドは、Ｒ１２Ｃ置換を含む。例えば、β２Ｍポリペプチドは、以下のアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る：
Figure 2022536581000046
、配列中、アミノ酸１２はＣｙｓである。少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドは、サイトカイン、４－１ＢＢＬポリペプチド、Ｂ７－１ポリペプチド、Ｂ７－２ポリペプチド、ＩＣＯＳ－Ｌポリペプチド、ＯＸ－４０Ｌポリペプチド、ＣＤ８０ポリペプチド、ＣＤ８６ポリペプチド、ＰＤ－Ｌ１ポリペプチド、ＦａｓＬポリペプチド、またはＰＤ－Ｌ２ポリペプチドであり得る。一部の例では、本明細書の他の場所に記載のように、少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドは、親和性が低下したバリアント型である。一部の例では、第１または第２のポリペプチドは、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む。
一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）は、ＨＬＡ－ＣクラスＩ重鎖ポリペプチドを含む。一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）内に存在するＨＬＡ－Ｃ重鎖ポリペプチドは、図９Ａに示すＨＬＡ－Ｃ＊０１０２、ＨＬＡ－Ｃ＊０３０３、ＨＬＡ－Ｃ＊０３０４、ＨＬＡ－Ｃ＊０４０１、ＨＬＡ－Ｃ＊０６０２、ＨＬＡ－Ｃ＊０７０１、ＨＬＡ－Ｃ＊０７０２、ＨＬＡ－Ｃ＊０８０１、またはＨＬＡ－Ｃ＊１５０２アミノ酸配列に対して、少なくとも９５％、少なくとも９８％、または少なくとも９９％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、ＨＬＡ－Ｃ重鎖ポリペプチドはＹ８４Ｃ及びＡ２３６Ｃ置換を含む。
ＨＬＡ－Ｃ＊０１：０２（Ｙ８４Ｃ；Ａ２３６Ｃ）
一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）内に存在するＨＬＡ－Ｃ重鎖ポリペプチドは、以下のＨＬＡ－Ｃ＊０１：０２（Ｙ８４Ｃ、Ａ２３６Ｃ）アミノ酸配列に対して、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む：
Figure 2022536581000047
、配列中、アミノ酸８４はＣｙｓであり、アミノ酸２３６はＣｙｓである。
ＨＬＡ－Ｃ＊０３０３（Ｙ８４Ｃ；Ａ２３６Ｃ）
一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）内に存在するＨＬＡ－Ｃ重鎖ポリペプチドは、以下のＨＬＡ－Ｃ＊０３：０３（Ｙ８４Ｃ、Ａ２３６Ｃ）アミノ酸配列に対して、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む：
Figure 2022536581000048
、配列中、アミノ酸８４はＣｙｓであり、アミノ酸２３６はＣｙｓである。
ＨＬＡ－Ｃ＊０３０４（Ｙ８４Ｃ；Ａ２３６Ｃ）
一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）内に存在するＨＬＡ－Ｃ重鎖ポリペプチドは、以下のＨＬＡ－Ｃ＊０３：０４（Ｙ８４Ｃ、Ａ２３６Ｃ）アミノ酸配列に対して、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む：
Figure 2022536581000049
、配列中、アミノ酸８４はＣｙｓであり、アミノ酸２３６はＣｙｓである。
ＨＬＡ－Ｃ＊０４０１（Ｙ８４Ｃ；Ａ２３６Ｃ）
一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）内に存在するＨＬＡ－Ｃ重鎖ポリペプチドは、以下のＨＬＡ－Ｃ＊０４：０１（Ｙ８４Ｃ、Ａ２３６Ｃ）アミノ酸配列に対して、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む：
Figure 2022536581000050
、配列中、アミノ酸８４はＣｙｓであり、アミノ酸２３６はＣｙｓである。
ＨＬＡ－Ｃ＊０６０２（Ｙ８４Ｃ；Ａ２３６Ｃ）
一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）内に存在するＨＬＡ－Ｃ重鎖ポリペプチドは、以下のＨＬＡ－Ｃ＊０６：０２（Ｙ８４Ｃ、Ａ２３６Ｃ）アミノ酸配列に対して、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む：
Figure 2022536581000051
、配列中、アミノ酸８４はＣｙｓであり、アミノ酸２３６はＣｙｓである。
ＨＬＡ－Ｃ＊０７０１（Ｙ８４Ｃ；Ａ２３６Ｃ）
一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）内に存在するＨＬＡ－Ｃ重鎖ポリペプチドは、以下のＨＬＡ－Ｃ＊０７：０１（Ｙ８４Ｃ、Ａ２３６Ｃ）アミノ酸配列に対して、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む：
Figure 2022536581000052
、配列中、アミノ酸８４はＣｙｓであり、アミノ酸２３６はＣｙｓである。
ＨＬＡ－Ｃ＊０７０２（Ｙ８４Ｃ；Ａ２３６Ｃ）
一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）内に存在するＨＬＡ－Ｃ重鎖ポリペプチドは、以下のＨＬＡ－Ｃ＊０７：０２（Ｙ８４Ｃ、Ａ２３６Ｃ）アミノ酸配列に対して、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む：
Figure 2022536581000053
、配列中、アミノ酸８４はＣｙｓであり、アミノ酸２３６はＣｙｓである。
ＨＬＡ－Ｃ＊０８０１（Ｙ８４Ｃ；Ａ２３６Ｃ）
一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）内に存在するＨＬＡ－Ｃ重鎖ポリペプチドは、以下のＨＬＡ－Ｃ＊０８：０１（Ｙ８４Ｃ、Ａ２３６Ｃ）アミノ酸配列に対して、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む：
Figure 2022536581000054
、配列中、アミノ酸８４はＣｙｓであり、アミノ酸２３６はＣｙｓである。
ＨＬＡ－Ｃ＊１５０２（Ｙ８４Ｃ；Ａ２３６Ｃ）
一部の例では、本開示の多重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ（例えば、二重ジスルフィド結合ＴＭＭＰ）内に存在するＨＬＡ－Ｃ重鎖ポリペプチドは、以下のＨＬＡ－Ｃ＊１５：０２（Ｙ８４Ｃ、Ａ２３６Ｃ）アミノ酸配列に対して、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む：
Figure 2022536581000055
、配列中、アミノ酸８４はＣｙｓであり、アミノ酸２３６はＣｙｓである。
スキャフォールドポリペプチド
ＴＭＭＰは、Ｆｃポリペプチドを含み得るか、または別の好適なスキャフォールドポリペプチドを含み得る。
好適なスキャフォールドポリペプチドには、抗体ベースのスキャフォールドポリペプチド及び非抗体ベースのスキャフォールドが含まれる。非抗体ベースのスキャフォールドとしては、例えば、アルブミン、ＸＴＥＮ（伸長組換え）ポリペプチド、トランスフェリン、Ｆｃ受容体ポリペプチド、エラスチン様ポリペプチド（例えば、Ｈａｓｓｏｕｎｅｈ ｅｔ ａｌ．（２０１２）Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｅｎｚｙｍｏｌ．５０２：２１５を参照されたい、例えば、（Ｖａｌ－Ｐｒｏ－Ｇｌｙ－Ｘ－ Ｇｌｙ、配列番号５９）のペンタペプチド反復単位を含むポリペプチド（Ｘは、プロリン以外の任意のアミノ酸である）を含むポリペプチド）、アルブミン結合ポリペプチド、シルク様ポリペプチド（例えば、Ｖａｌｌｕｚｚｉ ｅｔ ａｌ．（２００２）Ｐｈｉｌｏｓ Ｔｒａｎｓ Ｒ Ｓｏｃ Ｌｏｎｄ Ｂ Ｂｉｏｌ Ｓｃｉ．３５７：１６５を参照されたい）、シルク－エラスチン様ポリペプチド（ＳＥＬＰ；例えば、Ｍｅｇｅｅｄ ｅｔ ａｌ．（２００２）Ａｄｖ Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖ Ｒｅｖ．５４：１０７５を参照されたい）などが挙げられる。好適なＸＴＥＮポリペプチドとしては、例えば、ＷＯ２００９／０２３２７０、ＷＯ２０１０／０９１１２２、ＷＯ２００７／１０３５１５、ＵＳ２０１０／０１８９６８２、及びＵＳ２００９／００９２５８２に開示されているものが挙げられ、Ｓｃｈｅｌｌｅｎｂｅｒｇｅｒ ｅｔ ａｌ．（２００９）Ｎａｔ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．２７：１１８６）も参照されたい。好適なアルブミンポリペプチドとしては、例えば、ヒト血清アルブミンが挙げられる。
好適なスキャフォールドポリペプチドは、一部の例では、半減期を延長するポリペプチドである。それゆえ、一部の例では、好適なスキャフォールドポリペプチドは、スキャフォールドポリペプチドを欠く対照ＴＭＭＰと比較して、ＴＭＭＰのｉｎ ｖｉｖｏ半減期（例えば、血清半減期）を増加させる。例えば、一部の例では、スキャフォールドポリペプチドは、スキャフォールドポリペプチドを欠く対照ＴＭＭＰと比較して、ＴＭＭＰのｉｎ ｖｉｖｏ半減期（例えば、血清半減期）を、少なくとも約１０％、少なくとも約１５％、少なくとも約２０％、少なくとも約２５％、少なくとも約５０％、少なくとも約２倍、少なくとも約２．５倍、少なくとも約５倍、少なくとも約１０倍、少なくとも約２５倍、少なくとも約５０倍、少なくとも約１００倍、または１００倍超増加させる。一例として、一部の例では、Ｆｃポリペプチドは、Ｆｃポリペプチドを欠く対照ＴＭＭＰと比較して、ＴＭＭＰのｉｎ ｖｉｖｏ半減期（例えば、血清半減期）を、少なくとも約１０％、少なくとも約１５％、少なくとも約２０％、少なくとも約２５％、少なくとも約５０％、少なくとも約２倍、少なくとも約２．５倍、少なくとも約５倍、少なくとも約１０倍、少なくとも約２５倍、少なくとも約５０倍、少なくとも約１００倍、または１００倍超増加させる。
Ｆｃポリペプチド
一部の例では、本開示のＴＭＭＰの第１及び／または第２のポリペプチド鎖は、Ｆｃポリペプチドを含む。本開示のＴＭＭＰのＦｃポリペプチドは、ヒトＩｇＧ１ Ｆｃ、ヒトＩｇＧ２ Ｆｃ、ヒトＩｇＧ３ Ｆｃ、ヒトＩｇＧ４ Ｆｃなどであり得る。一部の例では、Ｆｃポリペプチドは、図３Ａ～３Ｇに示されるＦｃ領域のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。一部の例では、Ｆｃ領域は、図３Ａに示されるヒトＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドに対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。一部の例では、Ｆｃ領域は、図３Ａに示されるヒトＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドに対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、Ｎ７７の置換を含み、例えば、Ｆｃポリペプチドは、Ｎ７７Ａ置換を含む。一部の例では、Ｆｃポリペプチドは、図３Ａに示されるヒトＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドに対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、例えば、Ｆｃポリペプチドは、図３ Ａに示されるヒトＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドのアミノ酸９９～３２５に対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。一部の例では、Ｆｃポリペプチドは、図３Ａに示されるヒトＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドに対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、例えば、Ｆｃポリペプチドは、図３ Ａに示されるヒトＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドのアミノ酸１９～２４６に対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。一部の例では、Ｆｃポリペプチドは、図３Ｂに示されるヒトＩｇＭ Ｆｃポリペプチドに対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、例えば、Ｆｃポリペプチドは、図３Ｂに示されるヒトＩｇＭ Ｆｃポリペプチドのアミノ酸１～２７６に対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。一部の例では、Ｆｃポリペプチドは、図３Ｃに示されるヒトＩｇＡ Ｆｃポリペプチドに対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、例えば、Ｆｃポリペプチドは、図３ Ｃに示されるヒトＩｇＡ Ｆｃポリペプチドのアミノ酸１～２３４に対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
一部の例では、Ｆｃポリペプチドは、図３Ｃに示されるヒトＩｇＧ４ Ｆｃポリペプチドに対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。一部の例では、Ｆｃポリペプチドは、図３Ｃに示されるヒトＩｇＧ４ Ｆｃポリペプチドのアミノ酸１００～３２７に対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
一部の例では、ＩｇＧ４ Ｆｃポリペプチドは、以下のアミノ酸配列を含む：
Figure 2022536581000056
。
一部の例では、ＴＭＭＰ内に存在するＦｃポリペプチドは、図３Ａに示されるアミノ酸配列（ヒトＩｇＧ１ Ｆｃ）を含む。一部の例では、ＴＭＭＰ内に存在するＦｃポリペプチドは、Ｎ２９７（図３Ａに示されるアミノ酸配列のＮ７７）の、アスパラギン以外のアミノ酸との置換を除いて、図３Ａに示されるアミノ酸配列（ヒトＩｇＧ１ Ｆｃ）を含む。一部の例では、ＴＭＭＰ内に存在するＦｃポリペプチドは、図３Ｃに示されるアミノ酸配列（図３Ａに示されるアミノ酸配列のＮ７７であるＮ２９７Ａ置換を含むヒトＩｇＧ１ Ｆｃ）を含む。一部の例では、ＴＭＭＰ内に存在するＦｃポリペプチドは、Ｌ２３４（図３Ａに示されるアミノ酸配列のＬ１４）の、ロイシン以外のアミノ酸との置換を除いて、図３Ａに示されるアミノ酸配列（ヒトＩｇＧ１ Ｆｃ）を含む。一部の例では、ＴＭＭＰ内に存在するＦｃポリペプチドは、Ｌ２３５（図３Ａに示されるアミノ酸配列のＬ１５）の、ロイシン以外のアミノ酸との置換を除いて、図３Ａに示されるアミノ酸配列（ヒトＩｇＧ１ Ｆｃ）を含む。
一部の例では、ＴＭＭＰ内に存在するＦｃポリペプチドは、図３Ｅに示されるアミノ酸配列を含む。一部の例では、ＴＭＭＰ内に存在するＦｃポリペプチドは、図３Ｆに示されるアミノ酸配列を含む。一部の例では、ＴＭＭＰ内に存在するＦｃポリペプチドは、図５Ｇに示されるアミノ酸配列（図３Ｇに示されるアミノ酸配列の１４位及び１５位に対応するＬ２３４Ａ置換及びＬ２３５Ａ置換を含むヒトＩｇＧ１ Ｆｃ）を含む。一部の例では、ＴＭＭＰ内に存在するＦｃポリペプチドは、Ｐ３３１（図３Ａに示されるアミノ酸配列のＰ１１１）の、プロリン以外のアミノ酸との置換を除いて、図３Ａに示されるアミノ酸配列（ヒトＩｇＧ１ Ｆｃ）を含み、一部の例では、置換はＰ３３１Ｓ置換である。一部の例では、ＴＭＭＰ内に存在するＦｃポリペプチドは、Ｌ２３４及びＬ２３５（図３Ａに示されるアミノ酸配列のＬ１４及びＬ１５）におけるロイシン以外のアミノ酸との置換を除いて、図３Ａに示されるアミノ酸配列（ヒトＩｇＧ１ Ｆｃ）を含む。一部の例では、ＴＭＭＰ内に存在するＦｃポリペプチドは、Ｌ２３４及びＬ２３５（図３Ａに示されるアミノ酸配列のＬ１４及びＬ１５）におけるロイシン以外のアミノ酸との置換、ならびにＰ３３１（図３Ａに示されるアミノ酸配列のＰ１１１）におけるプロリン以外のアミノ酸との置換を除いて、図３Ａに示されるアミノ酸配列（ヒトＩｇＧ１ Ｆｃ）を含む。一部の例では、ＴＭＭＰ内に存在するＦｃポリペプチドは、図３Ｅに示されるアミノ酸配列（Ｌ２３４Ｆ、Ｌ２３５Ｅ、及びＰ３３１Ｓ置換（図３Ｅに示されるアミノ酸配列のアミノ酸１４位、１５位、及び１１１位に対応する）を含むヒトＩｇＧ１ Ｆｃ）を含む。一部の例では、ＴＭＭＰ内に存在するＦｃポリペプチドは、図３Ｇに示されるように、Ｌ２３４Ａ及びＬ２３５Ａ置換（図３Ａに示されるアミノ酸配列のＬ１４及びＬ１５のＡｌａとの置換）を含むＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。
腫瘍ターゲティングポリペプチド
本開示のＴＭＭＰは、腫瘍ターゲティングポリペプチド（ＴＴＰ）を含むことができる。例えば、ＴＴＰは、がん細胞上に存在するＭＵＣ１ポリペプチドに特異的であり得る。一部の例では、ＴＴＰは、ＭＵＣ１の切断形態に特異的である、例えば、Ｆｅｓｓｌｅｒ ｅｔ ａｌ．（２００９）Ｂｒｅａｓｔ Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ．Ｔｒｅａｔ．１１８：１１３を参照されたい。ＴＴＰは、ＭＵＣ１以外のがん関連抗原に特異的であり得る。一部の例では、ＴＴＰは、抗体である。一部の例では、ＴＴＰは、一本鎖Ｔ細胞受容体（ｓｃＴＣＲ）である。
一部の例では、ＴＴＰは、抗体である。一部の例では、ＴＴＰは、一本鎖抗体である。一部の例では、ＴＴＰは、ｓｃＦｖである。一部の例では、ＴＴＰは、ナノボディ（単一ドメイン抗体（ｓｄＡｂ）とも称される）である。一部の例では、ＴＴＰは、重鎖ナノボディである。一部の例では、ＴＴＰは、軽鎖ナノボディである。一部の例では、ＴＴＰは、グリコシル化されたＭＵＣ１ペプチドに特異的な抗体であり、例えば、Ｎａｉｔｏ ｅｔ ａｌ．（２０１７）ＡＣＳ Ｏｍｅｇａ ２：７４９３及びＵＳ１０，０１７，５８０を参照されたい。一部の例では、ＴＴＰは、ＭＵＣ１以外のがん関連抗原に特異的な抗体である。
抗ＭＵＣ１抗体
１つの非限定的な例として、ＴＴＰは、ＭＵＣ１に特異的な一本鎖Ｆｖであり得る。例えば、Ｓｉｎｇｈ ｅｔ ａｌ．（２００７）Ｍｏｌ．Ｃａｎｃｅｒ Ｔｈｅｒ．６：５６２、Ｔｈｉｅ ｅｔ ａｌ．（２０１１）ＰＬｏＳＯｎｅ ６：ｅ１５９２１、Ｉｍａｉ ｅｔ ａｌ．（２００４）Ｌｅｕｋｅｍｉａ １８：６７６、Ｐｏｓｅｙ ｅｔ ａｌ．（２０１６）Ｉｍｍｕｎｉｔｙ ４４：１４４４、ＥＰ３１３０６０７、ＥＰ３１６４４１８、ＷＯ２００２／０４４２１７、及びＵＳ２０１８／０１１２００７を参照されたい。一部の例では、ＴＴＰは、ＭＵＣ１ペプチドＶＴＳＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳＴＡＰＰＡＨＧ（配列番号３１９）に特異的なｓｃＦｖである。一部の例では、ＴＴＰは、ＭＵＣ１ペプチドＳＮＩＫＦＲＰＧＳＶＶＶＱＬＴＬＡＦＲＥＧＴＩＮＶＨＤＶＥＴＱＦＮＱＹＫＴＥＡＡＳＲＹ（配列番号３２０）に特異的なｓｃＦｖである。一部の例では、ＴＴＰは、ＭＵＣ１ペプチドＳＶＶＶＱＬＴＬＡＦＲＥＧＴＩＮＶＨＤＶＥＴＱＦＮＱＹＫＴＥＡＡＳＲＹ（配列番号３２１）に特異的なｓｃＦｖである。一部の例では、ＴＴＰは、ＭＵＣ１ペプチドＬＡＦＲＥＧＴＩＮＶＨＤＶＥＴＱＦＮＱＹ（配列番号３２２）に特異的なｓｃＦｖである。一部の例では、ＴＴＰは、ＭＵＣ１ペプチドＳＮＩＫＦＲＰＧＳＶＶＶＱＬＴＬＡＡＦＲＥＧＴＩＮ（配列番号３２３）に特異的なｓｃＦｖである。
一例として、抗ＭＵＣ１抗体は、アミノ酸配列ＲＹＧＭＳ（配列番号３２４）を有するＶＨ ＣＤＲ１、アミノ酸配列ＴＩＳＧＧＧＴＹＩＹＹＰＤＳＶＫＧ（配列番号３２５）を有するＶＨ ＣＤＲ２、アミノ酸配列ＤＮＹＧＲＮＹＤＹＧＭＤＹ（配列番号３２６）を有するＶＨ ＣＤＲ３、アミノ酸配列ＳＡＴＳＳＶＳＹＩＨ（配列番号３２７）を有するＶＬ ＣＤＲ１、アミノ酸配列ＳＴＳＮＬＡＳ（配列番号３２８）を有するＶＬ ＣＤＲ２、及びアミノ酸配列ＱＱＲＳＳＳＰＦＴ（配列番号３２９）を有するＶＬ ＣＤＲ３を含み得る。例えば、ＵＳ２０１８／０１１２００７を参照されたい。
別の例としては、抗ＭＵＣ１抗体は、アミノ酸配列ＧＹＡＭＳ（配列番号３３０）を有するＶＨ ＣＤＲ１、アミノ酸配列ＴＩＳＳＧＧＴＹＩＹＹＰＤＳＶＫＧ（配列番号３３１）を有するＶＨ ＣＤＲ２、アミノ酸配列ＬＧＧＤＮＹＹＥＹＦＤＶ（配列番号３３２）を有するＶＨ ＣＤＲ３、アミノ酸配列ＲＡＳＫＳＶＳＴＳＧＹＳＹＭＨ（配列番号３３３）を有するＶＬ ＣＤＲ１、アミノ酸配列ＬＡＳＮＬＥＳ（配列番号３３４）を有するＶＬ ＣＤＲ２、及びアミノ酸配列ＱＨＳＲＥＬＰＦＴ（配列番号３３５）を有するＶＬ ＣＤＲ３を含み得る。例えば、ＵＳ２０１８／０１１２００７を参照されたい。
別の例としては、抗ＭＵＣ１抗体は、アミノ酸配列ＤＹＡＭＮ（配列番号３３６）を有するＶＨ ＣＤＲ１、アミノ酸配列ＶＩＳＴＦＳＧＮＩＮＦＮＱＫＦＫＧ（配列番号３３７）を有するＶＨ ＣＤＲ２、アミノ酸配列ＳＤＹＹＧＰＹＦＤＹ（配列番号３３８）を有するＶＨ ＣＤＲ３、アミノ酸配列ＲＳＳＱＴＩＶＨＳＮＧＮＴＹＬＥ（配列番号３３９）を有するＶＬ ＣＤＲ１、アミノ酸配列ＫＶＳＮＲＦＳ（配列番号３４０）を有するＶＬ ＣＤＲ２、及びアミノ酸配列（ＦＱＧＳＨＶＰＦＴ（配列番号３４１）を有するＶＬ ＣＤＲ３を含み得る。例えば、ＵＳ２０１８／０１１２００７を参照されたい。
別の例としては、アミノ酸配列ＧＹＡＭＳ（配列番号３４２）を有するＶＨ ＣＤＲ１、アミノ酸配列ＴＩＳＳＧＧＴＹＩＹＹＰＤＳＶＫＧ（配列番号３４３）を有するＶＨ ＣＤＲ２、アミノ酸配列ＬＧＧＤＮＹＹＥＹ（配列番号３４４）を有するＶＨ ＣＤＲ３、アミノ酸配列ＴＡＳＫＳＶＳＴＳＧＹＳＹＭＨ（配列番号３４５）を有するＶＬ ＣＤＲ１、アミノ酸配列ＬＶＳＮＬＥＳ（配列番号３４６）を有するＶＬ ＣＤＲ２、及びアミノ酸配列ＱＨＩＲＥＬＴＲＳＥ（配列番号３４７）を有するＶＬ ＣＤＲ３を含み得る。例えば、ＵＳ２０１８／０１１２００７を参照されたい。
標的
上に記載したように、一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するＴＴＰは、ＭＵＣ１、またはＭＵＣ１以外のがん関連抗原（「ＣＡＡ」）に特異的であり得る。一部の例では、ＴＴＰの標的は、がん細胞の表面上のペプチド／ＨＬＡ（ｐＨＬＡ）複合体であり、ペプチドは、がん関連ペプチド（例えば、がん関連抗原のペプチド断片）であってよい。
ＣＡＡｓ
本開示のＴＭＰＰ内に存在する腫瘍ターゲティングポリペプチドにより標的化され得るＣＡＡｓには、例えば、ＮＹ－ＥＳＯ（Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ Ｅｓｏｐｈａｇｅａｌ Ｓｑｕａｍｏｕｓ Ｃｅｌｌ Ｃａｒｃｉｎｏｍａ １）、ＭＡＲＴ－１（Ｔ細胞１によって認識される黒色腫抗原、Ｍｅｌａｎ－Ａとしても知られる）、ＨＰＶ（ヒト乳頭腫ウイルス）Ｅ６、ＢＣＭＡ（Ｂ細胞成熟抗原）、ＣＤ１２３、ＣＤ１３３、ＣＤ１７１、ＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２２、ＣＤ３０、ＣＤ３３、ＣＥＡ（がん胎児抗原）、ＥＧＦＲ（上皮成長因子受容体）、ＥＧＦＲｖＩＩＩ（上皮成長因子受容体バリアント型ＩＩＩ）、ＥｐＣＡＭ（上皮細胞接着分子）、ＥｐｈＡ２（エフリンＡ型受容体２）、ジシアロガングリオシドＧＤ２、ＧＰＣ３（グリピカン－３）、ＨＥＲ２、ＩＬ１３Ｒａｌｐｈａ２（インターロイキン１３受容体サブユニットアルファ－２）、ＬｅＹ（ジフコシル化２型血液関連抗原）、ＭＡＧＥ－Ａ３（黒色腫関連抗原３）、黒色腫糖タンパク質、メソセリン、ミエリン、ＮＫＧ２Ｄ（ナチュラルキラー群２Ｄ）、リガンド、ＰＳＭＡ（前立腺特異的膜抗原）、及びＲＯＲ１（Ｉ型受容体チロシンキナーゼ様オーファン受容体）が含まれる。
本開示のＴＭＰＰ内に存在するＴＴＰにより標的化され得るＣＡＡｓには、１７－１Ａ抗原、アルファ－フェトプロテイン（ＡＦＰ）、アルファ－アクチニン－４、Ａ３、Ａ３３抗体に特異的な抗原、ＡＲＴ－４、Ｂ７、Ｂａ ７３３、ＢＡＧＥ、ｂｃｌ－２、ｂｃｌ－６、ＢＣＭＡ、ＢｒＥ３－抗原、ＣＡ１２５、ＣＡＭＥＬ、ＣＡＰ－１、炭酸脱水酵素ＩＸ（ＣＡＩＸ）、ＣＡＳＰ－８／ｍ、ＣＣＬ１９、ＣＣＬ２１、ＣＤ１、ＣＤ１ａ、ＣＤ２、ＣＤ３、ＣＤ４、ＣＤ５、ＣＤ８、ＣＤ１１Ａ、ＣＤ１４、ＣＤ１５、ＣＤ１６、ＣＤ１８、ＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２１、ＣＤ２２、ＣＤ２３、ＣＤ２５、ＣＤ２９、ＣＤ３０、ＣＤ３２ｂ、ＣＤ３３、ＣＤ３７、ＣＤ３８、ＣＤ４０、ＣＤ４０Ｌ、ＣＤ４４、ＣＤ４５、ＣＤ４６、ＣＤ５２、ＣＤ５４、ＣＤ５５、ＣＤ５９、ＣＤ６４、ＣＤ６６ａ－ｅ、ＣＤ６７、ＣＤ７０、ＣＤ７０Ｌ、ＣＤ７４、ＣＤ７９ａ、ＣＤ７９ｂ、ＣＤ８０、ＣＤ８３、ＣＤ９５、ＣＤ１２３、ＣＤ１２６、ＣＤ１３２、ＣＤ１３３、ＣＤ１３８、ＣＤ１４７、ＣＤ１５４、ＣＤ１７１、ＣＤＣ２７、ＣＤＫ－４／ｍ、ＣＤＫＮ２Ａ、ＣＥＡ、ＣＥＡＣＡＭ５、ＣＥＡＣＡＭ６、補体因子（Ｃ３、Ｃ３ａ、Ｃ３ｂ、Ｃ５ａ、及びＣ５など）、結腸特異的抗原－ｐ（ＣＳＡｐ）、ｃ－Ｍｅｔ、ＣＴＬＡ－４、ＣＸＣＲ４、ＣＸＣＲ７、ＣＸＣＬ１２、ＤＡＭ、Ｄｉｃｋｋｏｐｆ関連タンパク質（ＤＫＫ）、ＥＤ－Ｂフィブロネクチン、上皮成長因子受容体（ＥＧＦＲ）、ＥＧＦＲｖＩＩＩ、ＥＧＰ－１（ＴＲＯＰ－２）、ＥＧＰ－２、ＥＬＦ２－Ｍ、Ｅｐ－ＣＡＭ、ＥｐｈＡ２、ＥｐｈＡ３、線維芽細胞活性化タンパク質（ＦＡＰ）、線維芽細胞成長因子（ＦＧＦ）、Ｆｌｔ－１、Ｆｌｔ－３、葉酸結合タンパク質、葉酸受容体、Ｇ２５０抗原、ガングリオシド（ＧＣ２、ＧＤ３、及びＧＭ２など）、ＧＡＧＥ、ＧＤ２、ｇｐ１００、ＧＰＣ３、ＧＲＯ－１３、ＨＬＡ－ＤＲ、ＨＭ１．２４、ヒト絨毛性ゴナドトロピン（ＨＣＧ）及びそのサブユニット、ＨＥＲ２、ＨＥＲ３、ＨＭＧＢ－１、低酸素誘導因子（ＨＩＦ－１）、ＨＩＦ－１ａ、ＨＳＰ７０－２Ｍ、ＨＳＴ－２、Ｉａ、ＩＦＮ－ガンマ、ＩＦＮ－アルファ、ＩＦＮ－ベータ、ＩＦＮ－Ｘ、ＩＬ－４Ｒ、ＩＬ－６Ｒ、ＩＬ－１３Ｒ、ＩＬ１３Ｒａｌｐｈａ２、ＩＬ－１５Ｒ、ＩＬ－１７Ｒ、ＩＬ－１８Ｒ、ＩＬ－２、ＩＬ－６、ＩＬ－８、ＩＬ－１２、ＩＬ－１５、ＩＬ－１７、ＩＬ－１８、ＩＬ－２３、ＩＬ－２５、ＩＬＧＦ、ＩＬＧＦ－１Ｒ、インスリン様成長因子－１（ＩＧＦ－１）、ＩＧＦ－１Ｒ、インテグリンαＶβ３、インテグリンα５β１、ＫＣ４－抗原、キラー細胞免疫グロブリン様受容体（ＫＩＲ）、Ｋｒａｓ、ＫＳ－１－抗原、ＫＳ１－４、ＬＤＲ／ＦＵＴ、Ｌｅガンマ、マクロファージ遊走阻止因子（ＭＩＦ）、ＭＡＧＥ、ＭＡＧＥ－３、ＭＡＲＴ－１、ＭＡＲＴ－２、ｍＣＲＰ、ＭＣＰ－１、黒色腫糖タンパク質、メソセリン、ＭＩＰ－１Ａ、ＭＩＰ－１Ｂ、ＭＩＦ、ムチン（ＭＵＣ１、ＭＵＣ２、ＭＵＣ３、ＭＵＣ４、ＭＵＣ５ａｃ、ＭＵＣ１３、ＭＵＣ１６、ＭＵＭ－１／２、及びＭＵＭ－３など）、ＮＣＡ６６、ＮＣＡ９５、ＮＣＡ９０、ＮＹ－ＥＳＯ－１、ＰＡＭ４抗原、膵臓癌ムチン、ＰＤ－１、ＰＤ－Ｌ１、ＰＤ－１受容体、胎盤成長因子、ｐ５３、ＰＬＡＧＬ２、前立腺酸性ホスファターゼ、ＰＳＡ、ＰＲＡＭＥ、ＰＳＭＡ、Ｐ１ＧＦ、ＲＳＳ、ＲＡＮＴＥＳ、ＳＡＧＥ、ｉｔｕｘｉｍａｂｒｖ ｉｔｕｘｉｍａｂｒｖｉｖｉｎ－２Ｂ、Ｔ１０１、ＴＡＣ、ＴＡＧ－７２、テネイシン、Ｔｈｏｍｓｏｎ－Ｆｒｉｅｄｅｎｒｅｉｃｈ抗原、Ｔｎ抗原、ＴＮＦ－アルファ、腫瘍壊死抗原、ＴＲＡＧ－３、ＴＲＡＩＬ受容体、血管内皮成長因子（ＶＥＧＦ）、ＶＥＧＦ受容体（ＶＥＧＦＲ）、ならびにＷＴ－１が含まれるが、これらに限定されない。
一部の例では、ＣＡＡは、血液がんに関連する抗原である。このような抗原の例としては、ＢＣＭＡ、Ｃ５、ＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２２、ＣＤ２５、ＣＤ３０、ＣＤ３３、ＣＤ３８、ＣＤ４０、ＣＤ４５、ＣＤ５２、ＣＤ５６、ＣＤ６６、ＣＤ７４、ＣＤ７９ａ、ＣＤ７９ｂ、ＣＤ８０、ＣＤ１３８、ＣＴＬＡ－４、ＣＸＣＲ４、ＤＫＫ、ＥｐｈＡ３、ＧＭ２、ＨＬＡ－ＤＲベータ、インテグリンαＶβ３、ＩＧＦ－Ｒ１、ＩＬ６、ＫＩＲ、ＰＤ－１、ＰＤ－Ｌ１、ＴＲＡＩＬＲ１、ＴＲＡＩＬＲ２、トランスフェリン受容体、及びＶＥＧＦが挙げられるが、これらに限定されない。一部の例では、ＣＡＡは、ＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２２、ＣＤ２５、ＣＤ３８、ＣＤ４０、ＣＤ４５、ＣＤ７４、ＣＤ８０、ＣＴＬＡ－４、ＩＧＦ－Ｒ１、ＩＬ６、ＰＤ－１、ＴＲＡＩＬＲ２、またはＶＥＧＦなどの悪性Ｂ細胞により発現される抗原である。
一部の例では、ＣＡＡは、固形腫瘍に関連する抗原である。このような抗原の例としては、ＣＡＩＸ、カドヘリン、ＣＥＡ、ｃ－ＭＥＴ、ＣＴＬＡ－４、ＥＧＦＲファミリーメンバー、ＥｐＣＡＭ、ＥｐｈＡ３、ＦＡＰ、葉酸結合タンパク質、ＦＲ－アルファ、ガングリオシド（ＧＣ２、ＧＤ３、及びＧＭ２など）、ＨＥＲ２、ＨＥＲ３、ＩＧＦ－１Ｒ、インテグリンαＶβ３、インテグリンα５β１、Ｌｅガンマ、Ｌｉｖ１、メソセリン、ムチン、ＮａＰｉ２ｂ、ＰＤ－１、ＰＤ－Ｌ１、ＰＤ－１受容体、ｐｇＡ３３、ＰＳＭＡ、ＲＡＮＫＬ、ＲＯＲ１、ＴＡＧ－７２、テネイシン、ＴＲＡＩＬＲ１、ＴＲＡＩＬＲ２、ＶＥＧＦ、ＶＥＧＦＲ、及び上記に列挙される他のものが挙げられるが、これらに限定されない。
ペプチド／ＨＬＡ複合体
一部の例では、ＴＴＰの標的は、がん細胞の表面上のペプチド／ＨＬＡ（ｐＨＬＡ）複合体であり、ペプチドは、がん関連ペプチド（例えば、がん関連抗原のペプチド断片）であってよい。がん関連ペプチドは当該技術分野で既知である。一部の例では、がん関連ペプチドは、ＨＬＡ－Ａ＊０２０１重鎖及びβ２Ｍポリペプチドを含むＨＬＡ複合体に結合する。
一部の例では、がん細胞の表面上のｐＨＬＡに存在するペプチドエピトープは、ＨＬＡ－Ａ＊０１０１、Ａ＊０２０１、Ａ＊０３０１、Ａ＊１１０１、Ａ＊２３０１、Ａ＊２４０２、Ａ＊２４０７、Ａ＊３３０３、及び／またはＡ＊３４０１などのＨＬＡ重鎖を含むＨＬＡ複合体に結合する。一部の例では、がん細胞の表面上のｐＨＬＡに存在するペプチドエピトープは、ＨＬＡ－Ｂ＊０７０２、Ｂ＊０８０１、Ｂ＊１５０２、Ｂ＊３８０２、Ｂ＊４００１、Ｂ＊４６０１、及び／またはＢ＊５３０１などのＨＬＡ重鎖を含むＨＬＡ複合体に結合する。一部の例では、がん細胞の表面上のｐＨＬＡに存在するペプチドエピトープは、Ｃ＊０１０２、Ｃ＊０３０３、Ｃ＊０３０４、Ｃ＊０４０１、Ｃ＊０６０２、Ｃ＊０７０１、Ｃ＊７０２、Ｃ＊０８０１、及び／またはＣ＊１５０２などのＨＬＡ重鎖を含むＨＬＡ複合体に結合する。
一部の例では、がん関連ペプチドは、以下のがん関連抗原のうちのいずれか１つの、少なくとも４アミノ酸長、例えば４アミノ酸～約２５アミノ酸長（例えば、４アミノ酸（ａａ）、５ａａ、６ａａ、７ａａ、８ａａ、９ａａ、１０ａａ、１１ａａ、１２ａａ、１３ａａ、１４ａａ、１５ａａ、１６ａａ、１７ａａ、１８ａａ、１９ａａ、２０ａａ、２１ａａ、２２ａａ、２３ａａ、２４ａａ、または２５ａａ、長さが４～２０アミノ酸、６～１８アミノ酸、８～１５アミノ酸、８～１２アミノ酸、５～１０アミノ酸、１０～２０アミノ酸、及び１５～２５アミノ酸の範囲内を含む）のペプチドである：ＭＵＣ１ポリペプチド、ＬＭＰ２ポリペプチド、上皮成長因子受容体（ＥＧＦＲ）ｖＩＩＩポリペプチド、ＨＥＲ－２／ｎｅｕポリペプチド、黒色腫抗原ファミリーＡ、３（ＭＡＧＥ Ａ３）ポリペプチド、ｐ５３ポリペプチド、変異体ｐ５３ポリペプチド、ＮＹ－ＥＳＯ－１ポリペプチド、葉酸ヒドロラーゼ（前立腺特異的膜抗原；ＰＳＭＡ）ポリペプチド、がん胎児抗原（ＣＥＡ）ポリペプチド、Ｔ細胞によって認識される黒色腫抗原（ｍｅｌａｎＡ／ＭＡＲＴ１）ポリペプチド、Ｒａｓポリペプチド、ｇｐ１００ポリペプチド、プロテイナーゼ３（ＰＲ１）ポリペプチド、ｂｃｒ－ａｂｌポリペプチド、チロシナーゼポリペプチド、ｉｔｕｘｉｍａｂｒｖｉｖｉｎポリペプチド、前立腺特異的抗原（ＰＳＡ）ポリペプチド、ｈＴＥＲＴポリペプチド、肉腫転位ブレークポイントポリペプチド、滑膜肉腫Ｘ（ＳＳＸ）ブレークポイントポリペプチド、ＥｐｈＡ２ポリペプチド、酸性ホスファターゼ、前立腺（ＰＡＰ）ポリペプチド、アポトーシスの黒色腫阻害剤（ＭＬ－ＩＡＰ）、上皮細胞接着分子（ＥｐＣＡＭ）ポリペプチド、ＥＲＧ（ＴＭＰＲＳＳ２ ＥＴＳ融合）ポリペプチド、ＮＡ１７ポリペプチド、ペアードボックス－３（ＰＡＸ３）ポリペプチド、未分化リンパ腫キナーゼ（ＡＬＫ）ポリペプチド、アンドロゲン受容体ポリペプチド、サイクリンＢ１ポリペプチド、Ｎ－ｍｙｃがん原遺伝子（ＭＹＣＮ）ポリペプチド、Ｒａｓホモログ遺伝子ファミリーメンバーＣ（ＲｈｏＣ）ポリペプチド、チロシナーゼ関連タンパク質－２（ＴＲＰ－２）ポリペプチド、メソセリンポリペプチド、前立腺幹細胞抗原（ＰＳＣＡ）ポリペプチド、黒色腫関連抗原－１（ＭＡＧＥ Ａ１）ポリペプチド、シトクロムＰ４５０ １Ｂ１（ＣＹＰ １Ｂ１）ポリペプチド、胎盤特異的タンパク質１（ＰＬＡＣ１）ポリペプチド、ＢＯＲＩＳポリペプチド（ＣＣＣＴＣ結合因子またはＣＴＣＦとしても知られる）、ＥＴＶ６－ＡＭＬポリペプチド、乳癌抗原ＮＹ－ＢＲ－１ポリペプチド（アンキリン反復ドメイン含有タンパク質３０Ａとしても知られる）、Ｇタンパク質シグナル伝達の調節因子（ＲＧＳ５）ポリペプチド、Ｔ細胞によって認識される扁平上皮癌細胞抗原（ＳＡＲＴ３）ポリペプチド、炭酸脱水酵素ＩＸポリペプチド、ペアードボックス－５（ＰＡＸ５）ポリペプチド、ＯＹ－ＴＥＳ１（精巣抗原、アクロシン結合タンパク質としても知られる）ポリペプチド、精子タンパク質１７ポリペプチド、リンパ球細胞特異的タンパク質－チロシンキナーゼ（ＬＣＫ）ポリペプチド、高分子量黒色腫関連抗原（ＨＭＷ－ＭＡＡ）、Ａキナーゼアンカータンパク質－４（ＡＫＡＰ－４）、滑膜肉腫Ｘブレイクポイント２（ＳＳＸ２）ポリペプチド、Ｘ抗原ファミリーメンバー１（ＸＡＧＥ１）ポリペプチド、Ｂ７ホモログ３（Ｂ７Ｈ３、ＣＤ２７６としても知られる）ポリペプチド、レグマインポリペプチド（ＬＧＭＮ１、アスパラギニルエンドペプチダーゼとしても知られる）、Ｉｇ及びＥＧＦホモロジードメインを有するチロシンキナーゼ－２（Ｔｉｅ－２、アンジオポエチン－１受容体としても知られる）ポリペプチド、Ｐ抗原ファミリーメンバー４（ＰＡＧＥ４）ポリペプチド、血管内皮成長因子受容体２（ＶＥＧＦ２）ポリペプチド、ＭＡＤ－ＣＴ－１ポリペプチド、線維芽細胞活性化タンパク質（ＦＡＰ）ポリペプチド、血小板由来成長因子受容体ベータ（ＰＤＧＦβ）ポリペプチド、ＭＡＤ－ＣＴ－２ポリペプチド、Ｆｏｓ関連抗原－１（ＦＯＳＬ）ポリペプチド、ヒト乳頭腫ウイルス（ＨＰＶ）抗原、アルファ－フェトプロテイン（ＡＦＰ）抗原、及びウィルムス腫瘍－１（ＷＴ１）抗原。
例えば、一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するＴＴＰは、ａ）ＨＬＡ重鎖（例えば、ＨＬＡ－Ａ＊０２０１重鎖またはＨＬＡ－Ａ＊２４０２重鎖）及びβ２Ｍポリペプチドを含むＨＬＡ複合体に結合したＷＴ－１ペプチド、ｂ）クラスＩ ＨＬＡ重鎖及びβ２Ｍポリペプチドを含むＨＬＡ複合体に結合したＨＰＶペプチド、ｃ）クラスＩ ＨＬＡ重鎖及びβ２Ｍポリペプチドを含むＨＬＡ複合体に結合したメソセリンペプチド、ｄ）クラスＩ ＨＬＡ重鎖及びβ２Ｍポリペプチドを含むＨＬＡ複合体に結合したＨｅｒ２ペプチド、またはｅ）クラスＩ ＨＬＡ重鎖及びβ２Ｍポリペプチドを含むＨＬＡ複合体に結合したＢＣＭＡペプチドに結合する。
一部の例では、がん関連ペプチドは、以下のメソセリンアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するメソセリンポリペプチドの、少なくとも４アミノ酸長、例えば４アミノ酸～約２５アミノ酸長（例えば、４アミノ酸（ａａ）、５ａａ、６ａａ、７ａａ、８ａａ、９ａａ、１０ａａ、１１ａａ、１２ａａ、１３ａａ、１４ａａ、１５ａａ、１６ａａ、１７ａａ、１８ａａ、１９ａａ、２０ａａ、２１ａａ、２２ａａ、２３ａａ、２４ａａ、または２５ａａ、長さが４～２０アミノ酸、６～１８アミノ酸、８～１５アミノ酸、８～１２アミノ酸、５～１０アミノ酸、１０～２０アミノ酸、及び１５～２５アミノ酸の範囲内を含む）のペプチドである：
ＬＡＧＥ ＴＧＱＥＡＡＰＬＤＧ ＶＬＡＮＰＰＮＩＳＳ ＬＳＰＲＱＬＬＧＦＰ ＣＡＥＶＳＧＬＳＴＥ ＲＶＲＥＬＡＶＡＬＡ ＱＫＮＶＫＬＳＴＥＱ ＬＲＣＬＡＨＲＬＳＥ ＰＰＥＤＬＤＡＬＰＬ ＤＬＬＬＦＬＮＰＤＡ ＦＳＧＰＱＡＣＴＲＦ ＦＳＲＩＴＫＡＮＶＤ ＬＬＰＲＧＡＰＥＲＱ ＲＬＬＰＡＡＬＡＣＷ ＧＶＲＧＳＬＬＳＥＡ ＤＶＲＡＬＧＧＬＡＣ ＤＬＰＧＲＦＶＡＥＳ ＡＥＶＬＬＰＲＬＶＳ ＣＰＧＰＬＤＱＤＱＱ ＥＡＡＲＡＡＬＱＧＧ ＧＰＰＹＧＰＰＳＴＷ ＳＶＳＴＭＤＡＬＲＧ ＬＬＰＶＬＧＱＰＩＩ ＲＳＩＰＱＧＩＶＡＡ ＷＲＱＲＳＳＲＤＰＳ ＷＲＱＰＥＲＴＩＬＲ ＰＲＦＲＲＥＶＥＫＴ ＡＣＰＳＧＫＫＡＲＥ ＩＤＥＳＬＩＦＹＫＫ ＷＥＬＥＡＣＶＤＡＡ ＬＬＡＴＱＭＤＲＶＮ ＡＩＰＦＴＹＥＱＬＤ ＶＬＫＨＫＬＤＥＬＹ ＰＱＧＹＰＥＳＶＩＱ ＨＬＧＹＬＦＬＫＭＳ ＰＥＤＩＲＫＷＮＶＴ ＳＬＥＴＬＫＡＬＬＥ ＶＮＫＧＨＥＭＳＰＱ ＶＡＴＬＩＤＲＦＶＫ ＧＲＧＱＬＤＫＤＴＬ ＤＴＬＴＡＦＹＰＧＹ ＬＣＳＬＳＰＥＥＬＳ ＳＶＰＰＳＳＩＷＡＶ ＲＰＱＤＬＤＴＣＤＰ ＲＱＬＤＶＬＹＰＫＡ ＲＬＡＦＱＮＭＮＧＳ ＥＹＦＶＫＩＱＳＦＬ ＧＧＡＰＴＥＤＬＫＡ ＬＳＱＱＮＶＳＭＤＬ ＡＴＦＭＫＬＲＴＤＡ ＶＬＰＬＴＶＡＥＶＱ ＫＬＬＧＰＨＶＥＧＬ ＫＡＥＥＲＨＲＰＶＲ ＤＷＩＬＲＱＲＱＤＤ ＬＤＴＬＧＬＧＬＱＧ ＧＩＰＮＧＹＬＶＬＤ ＬＳＭＱＥＡＬＳＧＴ ＰＣＬＬＧＰＧＰＶＬ ＴＶＬＡＬＬＬＡＳＴ ＬＡ（配列番号１７６）。例えば、ｐＨＬＡ複合体に存在するメソセリンペプチドは、ｉ）ＫＬＬＧＰＨＶＥＧＬ（配列番号５２６）、ｉｉ）ＨＬＡ－Ａ＊２４０２／β２Ｍに結合することができるＡＦＹＰＧＹＬＣＳＬ（配列番号１７７）、ｉｉｉ）ＶＬＰＬＴＶＡＥＶ（配列番号１７８）、ｉｖ）ＥＬＡＶＡＬＡＱＫ（配列番号１７９）、ｖ）ＡＬＱＧＧＧＰＰＹ（配列番号１８０）、ｖｉ）ＦＹＰＧＹＬＣＳＬ（配列番号１８１）、ｖｉｉ）ＬＹＰＫＡＲＬＡＦ（配列番号１８２）、ｖｉｉｉ）ＬＬＦＬＬＦＳＬＧＷＶＧＰＳＲ（配列番号１８３）、ｉｘ）ＶＮＫＧＨＥＭＳＰＱＡＰＲＲＰ（配列番号１８４）、ｘ）ＦＭＫＬＲＴＤＡＶＬＰＬＴＶＡ（配列番号１８５）、またはｘｉ）ＤＡＡＬＬＡＴＱＭＤ（配列番号１８６）であり得る。
一部の例では、がん関連ペプチドは、以下のＨｅｒ２（受容体型チロシンプロテインキナーゼｅｒｂＢ２）アミノ酸配列に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するＨｅｒ２ポリペプチドの、少なくとも４アミノ酸長、例えば４アミノ酸～約２５アミノ酸長（例えば、４アミノ酸（ａａ）、５ａａ、６ａａ、７ａａ、８ａａ、９ａａ、１０ａａ、１１ａａ、１２ａａ、１３ａａ、１４ａａ、１５ａａ、１６ａａ、１７ａａ、１８ａａ、１９ａａ、２０ａａ、２１ａａ、２２ａａ、２３ａａ、２４ａａ、または２５ａａ、長さが４～２０アミノ酸、６～１８アミノ酸、８～１５アミノ酸、８～１２アミノ酸、５～１０アミノ酸、１０～２０アミノ酸、及び１５～２５アミノ酸の範囲内を含む）のペプチドである：
ＭＥＬＡＡＬＣＲＷＧ ＬＬＬＡＬＬＰＰＧＡ ＡＳＴＱＶＣＴＧＴＤ ＭＫＬＲＬＰＡＳＰＥ ＴＨＬＤＭＬＲＨＬＹ ＱＧＣＱＶＶＱＧＮＬ ＥＬＴＹＬＰＴＮＡＳ ＬＳＦＬＱＤＩＱＥＶ ＱＧＹＶＬＩＡＨＮＱ ＶＲＱＶＰＬＱＲＬＲ ＩＶＲＧＴＱＬＦＥＤ ＮＹＡＬＡＶＬＤＮＧ ＤＰＬＮＮＴＴＰＶＴ ＧＡＳＰＧＧＬＲＥＬ ＱＬＲＳＬＴＥＩＬＫ ＧＧＶＬＩＱＲＮＰＱ ＬＣＹＱＤＴＩＬＷＫ ＤＩＦＨＫＮＮＱＬＡ ＬＴＬＩＤＴＮＲＳＲ ＡＣＨＰＣＳＰＭＣＫ ＧＳＲＣＷＧＥＳＳＥ ＤＣＱＳＬＴＲＴＶＣ ＡＧＧＣＡＲＣＫＧＰ ＬＰＴＤＣＣＨＥＱＣ ＡＡＧＣＴＧＰＫＨＳ ＤＣＬＡＣＬＨＦＮＨ ＳＧＩＣＥＬＨＣＰＡ ＬＶＴＹＮＴＤＴＦＥ ＳＭＰＮＰＥＧＲＹＴ ＦＧＡＳＣＶＴＡＣＰ ＹＮＹＬＳＴＤＶＧＳ ＣＴＬＶＣＰＬＨＮＱ ＥＶＴＡＥＤＧＴＱＲ ＣＥＫＣＳＫＰＣＡＲ ＶＣＹＧＬＧＭＥＨＬ ＲＥＶＲＡＶＴＳＡＮ ＩＱＥＦＡＧＣＫＫＩ ＦＧＳＬＡＦＬＰＥＳ ＦＤＧＤＰＡＳＮＴＡ ＰＬＱＰＥＱＬＱＶＦ ＥＴＬＥＥＩＴＧＹＬ ＹＩＳＡＷＰＤＳＬＰ ＤＬＳＶＦＱＮＬＱＶ ＩＲＧＲＩＬＨＮＧＡ ＹＳＬＴＬＱＧＬＧＩ ＳＷＬＧＬＲＳＬＲＥ ＬＧＳＧＬＡＬＩＨＨ ＮＴＨＬＣＦＶＨＴＶ ＰＷＤＱＬＦＲＮＰＨ ＱＡＬＬＨＴＡＮＲＰ ＥＤＥＣＶＧＥＧＬＡ ＣＨＱＬＣＡＲＧＨＣ ＷＧＰＧＰＴＱＣＶＮ ＣＳＱＦＬＲＧＱＥＣ ＶＥＥＣＲＶＬＱＧＬ ＰＲＥＹＶＮＡＲＨＣ ＬＰＣＨＰＥＣＱＰＱ ＮＧＳＶＴＣＦＧＰＥ ＡＤＱＣＶＡＣＡＨＹ ＫＤＰＰＦＣＶＡＲＣ ＰＳＧＶＫＰＤＬＳＹ ＭＰＩＷＫＦＰＤＥＥ ＧＡＣＱＰＣＰＩＮＣ ＴＨＳＣＶＤＬＤＤＫ ＧＣＰＡＥＱＲＡＳＰ ＬＴＳＩＩＳＡＶＶＧ ＩＬＬＶＶＶＬＧＶＶ ＦＧＩＬＩＫＲＲＱＱ ＫＩＲＫＹＴＭＲＲＬ ＬＱＥＴＥＬＶＥＰＬ ＴＰＳＧＡＭＰＮＱＡ ＱＭＲＩＬＫＥＴＥＬ ＲＫＶＫＶＬＧＳＧＡ ＦＧＴＶＹＫＧＩＷＩ ＰＤＧＥＮＶＫＩＰＶ ＡＩＫＶＬＲＥＮＴＳ ＰＫＡＮＫＥＩＬＤＥ ＡＹＶＭＡＧＶＧＳＰ ＹＶＳＲＬＬＧＩＣＬ ＴＳＴＶＱＬＶＴＱＬ ＭＰＹＧＣＬＬＤＨＶ ＲＥＮＲＧＲＬＧＳＱ ＤＬＬＮＷＣＭＱＩＡ ＫＧＭＳＹＬＥＤＶＲ ＬＶＨＲＤＬＡＡＲＮ ＶＬＶＫＳＰＮＨＶＫ ＩＴＤＦＧＬＡＲＬＬ ＤＩＤＥＴＥＹＨＡＤ ＧＧＫＶＰＩＫＷＭＡ ＬＥＳＩＬＲＲＲＦＴ ＨＱＳＤＶＷＳＹＧＶ ＴＶＷＥＬＭＴＦＧＡ ＫＰＹＤＧＩＰＡＲＥ ＩＰＤＬＬＥＫＧＥＲ ＬＰＱＰＰＩＣＴＩＤ ＶＹＭＩＭＶＫＣＷＭ ＩＤＳＥＣＲＰＲＦＲ ＥＬＶＳＥＦＳＲＭＡ ＲＤＰＱＲＦＶＶＩＱ ＮＥＤＬＧＰＡＳＰＬ ＤＳＴＦＹＲＳＬＬＥ ＤＤＤＭＧＤＬＶＤＡ ＥＥＹＬＶＰＱＱＧＦ ＦＣＰＤＰＡＰＧＡＧ ＧＭＶＨＨＲＨＲＳＳ ＳＴＲＮＭ（配列番号１８７）。
一部の例では、がん関連ペプチドは、以下のＢＣＭＡアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するＢＣＭＡポリペプチドの、少なくとも４アミノ酸長、例えば４アミノ酸～約２５アミノ酸長（例えば、４アミノ酸（ａａ）、５ａａ、６ａａ、７ａａ、８ａａ、９ａａ、１０ａａ、１１ａａ、１２ａａ、１３ａａ、１４ａａ、１５ａａ、１６ａａ、１７ａａ、１８ａａ、１９ａａ、２０ａａ、２１ａａ、２２ａａ、２３ａａ、２４ａａ、または２５ａａ、長さが４～２０アミノ酸、６～１８アミノ酸、８～１５アミノ酸、８～１２アミノ酸、５～１０アミノ酸、１０～２０アミノ酸、及び１５～２５アミノ酸の範囲内を含む）のペプチドである：
ＭＬＱＭＡＧＱＣＳＱ ＮＥＹＦＤＳＬＬＨＡ ＣＩＰＣＱＬＲＣＳＳ ＮＴＰＰＬＴＣＱＲＹ ＣＮＡＳＶＴＮＳＶＫ ＧＴＮＡＩＬＷＴＣＬ ＧＬＳＬＩＩＳＬＡＶ ＦＶＬＭＦＬＬＲＫＩ ＳＳＥＰＬＫＤＥＦＫ ＮＴＧＳＧＬＬＧＭＡ ＮＩＤＬＥＫＳＲＴＧ ＤＥＩＩＬＰＲＧＬＥ ＹＴＶＥＥＣＴＣＥＤ ＣＩＫＳＫＰＫＶＤＳ ＤＨＣＦＰＬＰＡＭＥ ＥＧＡＴＩＬＶＴＴＫ ＴＮＤＹＣＫＳＬＰＡ ＡＬＳＡＴＥＩＥＫＳ ＩＳＡＲ（配列番号１８８）。
一部の例では、がん関連ペプチドは、以下のＷＴ－１アミノ酸配列に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するＷＴ－１ポリペプチドの、少なくとも４アミノ酸長、例えば４アミノ酸～約２５アミノ酸長（例えば、４アミノ酸（ａａ）、５ａａ、６ａａ、７ａａ、８ａａ、９ａａ、１０ａａ、１１ａａ、１２ａａ、１３ａａ、１４ａａ、１５ａａ、１６ａａ、１７ａａ、１８ａａ、１９ａａ、２０ａａ、２１ａａ、２２ａａ、２３ａａ、２４ａａ、または２５ａａ、長さが４～２０アミノ酸、６～１８アミノ酸、８～１５アミノ酸、８～１２アミノ酸、５～１０アミノ酸、１０～２０アミノ酸、及び１５～２５アミノ酸の範囲内を含む）のペプチドである：
ＭＤＦＬＬＬＱＤＰＡ ＳＴＣＶＰＥＰＡＳＱ ＨＴＬＲＳＧＰＧＣＬ ＱＱＰＥＱＱＧＶＲＤ ＰＧＧＩＷＡＫＬＧＡ ＡＥＡＳＡＥＲＬＱＧ ＲＲＳＲＧＡＳＧＳＥ ＰＱＱＭＧＳＤＶＲＤ ＬＮＡＬＬＰＡＶＰＳ ＬＧＧＧＧＧＣＡＬＰ ＶＳＧＡＡＱＷＡＰＶ ＬＤＦＡＰＰＧＡＳＡ ＹＧＳＬＧＧＰＡＰＰ ＰＡＰＰＰＰＰＰＰＰ ＰＨＳＦＩＫＱＥＰＳ ＷＧＧＡＥＰＨＥＥＱ ＣＬＳＡＦＴＶＨＦＳ ＧＱＦＴＧＴＡＧＡＣ ＲＹＧＰＦＧＰＰＰＰ ＳＱＡＳＳＧＱＡＲＭ ＦＰＮＡＰＹＬＰＳＣ ＬＥＳＱＰＡＩＲＮＱ ＧＹＳＴＶＴＦＤＧＴ ＰＳＹＧＨＴＰＳＨＨ ＡＡＱＦＰＮＨＳＦＫ ＨＥＤＰＭＧＱＱＧＳ ＬＧＥＱＱＹＳＶＰＰ ＰＶＹＧＣＨＴＰＴＤ ＳＣＴＧＳＱＡＬＬＬ ＲＴＰＹＳＳＤＮＬＹ ＱＭＴＳＱＬＥＣＭＴ ＷＮＱＭＮＬＧＡＴＬ ＫＧＨＳＴＧＹＥＳＤ ＮＨＴＴＰＩＬＣＧＡ ＱＹＲＩＨＴＨＧＶＦ ＲＧＩＱＤＶＲＲＶＰ ＧＶＡＰＴＬＶＲＳＡ ＳＥＴＳＥＫＲＰＦＭ ＣＡＹＰＧＣＮＫＲＹ ＦＫＬＳＨＬＱＭＨＳ ＲＫＨＴＧＥＫＰＹＱ ＣＤＦＫＤＣＥＲＲＦ ＳＲＳＤＱＬＫＲＨＱ ＲＲＨＴＧＶＫＰＦＱ ＣＫＴＣＱＲＫＦＳＲ ＳＤＨＬＫＴＨＴＲＴ ＨＴＧＥＫＰＦＳＣＲ ＷＰＳＣＱＫＫＦＡＲ ＳＤＥＬＶＲＨＨＮＭ ＨＱＲＮＭＴＫＬＱＬ ＡＬ（配列番号１８９）。
ＷＴ－１ペプチドの非限定的な例としては、ＲＭＦＰＮＡＰＹＬ（配列番号１９０）、ＣＭＴＷＮＱＭＮ（配列番号１９１）、ＣＹＴＷＮＱＭＮＬ（配列番号１９２）、ＣＭＴＷＮＱＭＮＬＧＡＴＬＫＧ（配列番号１９３）、ＷＮＱＭＮＬＧＡＴＬＫＧＶＡＡ（配列番号１９４）、ＣＭＴＷＮＹＭＮＬＧＡＴＬＫＧ（配列番号１９５）、ＷＮＹＭＮＬＧＡＴＬＫＧＶＡＡ（配列番号１９６）、ＭＴＷＮＱＭＮＬＧＡＴＬＫＧＶ（配列番号１９７）、ＴＷＮＱＭＮＬＧＡＴＬＫＧＶＡ（配列番号１９８）、ＣＭＴＷＮＬＭＮＬＧＡＴＬＫＧ（配列番号１９９）、ＭＴＷＮＬＭＮＬＧＡＴＬＫＧＶ（配列番号２００）、ＴＷＮＬＭＮＬＧＡＴＬＫＧＶＡ（配列番号２０１）、ＷＮＬＭＮＬＧＡＴＬＫＧＶＡＡ（配列番号２０２）、ＭＮＬＧＡＴＬＫ（配列番号２０３）、ＭＴＷＮＹＭＮＬＧＡＴＬＫＧＶ（配列番号２０４）、ＴＷＮＹＭＮＬＧＡＴＬＫＧＶＡ（配列番号２０５）、ＣＭＴＷＮＱＭＮＬＧＡＴＬＫＧＶＡ（配列番号２０６）、ＣＭＴＷＮＬＭＮＬＧＡＴＬＫＧＶＡ（配列番号２０７）、ＣＭＴＷＮＹＭＮＬＧＡＴＬＫＧＶＡ（配列番号２０８）、ＧＹＬＲＮＰＴＡＣ（配列番号２０９）、ＧＡＬＲＮＰＴＡＬ（配列番号２１０）、ＹＡＬＲＮＰＴＡＣ（配列番号２１１）、ＧＬＬＲＮＰＴＡＣ（配列番号２１２）、ＲＹＲＰＨＰＧＡＬ（配列番号２１３）、ＹＱＲＰＨＰＧＡＬ（配列番号２１４）、ＲＬＲＰＨＰＧＡＬ（配列番号２１５）、ＲＩＲＰＨＰＧＡＬ（配列番号２１６）、ＱＦＰＮＨＳＦＫＨＥＤＰＭＧＱ（配列番号２１７）、ＨＳＦＫＨＥＤＰＹ（配列番号２１８）、ＱＦＰＮＨＳＦＫＨＥＤＰＭ（配列番号２１９）、ＱＦＰＮＨＳＦＫＨＥＤＰＹ（配列番号２２０）、ＫＲＰＦＭＣＡＹＰＧＣＮＫ（配列番号２２１）、ＫＲＰＦＭＣＡＹＰＧＣＹＫ（配列番号２２２）、ＦＭＣＡＹＰＧＣＹ（配列番号２２３）、ＦＭＣＡＹＰＧＣＫ（配列番号２２４）、ＫＲＰＦＭＣＡＹＰＧＣＮＫＲＹ（配列番号２２５）、ＳＥＫＲＰＦＭＣＡＹＰＧＣＮＫ（配列番号２２６）、ＫＲＰＦＭＣＡＹＰＧＣＹＫＲＹ（配列番号２２７）、ＮＬＭＮＬＧＡＴＬ（配列番号２２８）、及びＮＹＭＮＬＧＡＴＬ（配列番号２２９）が挙げられる。一部の例では、がん関連ペプチドは、ヒト乳頭腫ウイルス（ＨＰＶ）ペプチドに対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するＨＰＶポリペプチドの、少なくとも４アミノ酸長、例えば４アミノ酸～約２５アミノ酸長（例えば、４アミノ酸（ａａ）、５ａａ、６ａａ、７ａａ、８ａａ、９ａａ、１０ａａ、１１ａａ、１２ａａ、１３ａａ、１４ａａ、１５ａａ、１６ａａ、１７ａａ、１８ａａ、１９ａａ、２０ａａ、２１ａａ、２２ａａ、２３ａａ、２４ａａ、または２５ａａ、長さが４～２０アミノ酸、６～１８アミノ酸、８～１５アミノ酸、８～１２アミノ酸、５～１０アミノ酸、１０～２０アミノ酸、及び１５～２５アミノ酸の範囲内を含む）のペプチドである。ＨＰＶペプチドは、ＨＰＶ Ｅ６ポリペプチドまたはＨＰＶ Ｅ７ポリペプチドのペプチドであり得る。ＨＰＶエピトープは、例えば、ＨＰＶ１６、ＨＰＶ１８、ＨＰＶ３１、ＨＰＶ３３、ＨＰＶ３５、ＨＰＶ３９、ＨＰＶ４５、ＨＰＶ５１、ＨＰＶ５２、ＨＰＶ５６、ＨＰＶ５８、ＨＰＶ５９、ＨＰＶ６８、ＨＰＶ７３、またはＨＰＶ８２を含む、様々な遺伝子型のいずれかのＨＰＶのエピトープであり得る。ＨＰＶペプチドの非限定的な例としては、Ｅ６ １８－２６（ＫＬＰＱＬＣＴＥＬ；配列番号２３０）、Ｅ６ ２６－３４（ＬＱＴＴＩＨＤＩＩ；配列番号２３１）、Ｅ６ ４９－５７（ＶＹＤＦＡＦＲＤＬ；配列番号２３２）、Ｅ６ ５２－６０（ＦＡＦＲＤＬＣＩＶ；配列番号２３３）、Ｅ６ ７５－８３（ＫＦＹＳＫＩＳＥＹ；配列番号２３４）、Ｅ６ ８０－８８（ＩＳＥＹＲＨＹＣＹ；配列番号２３５）、Ｅ７ ７－１５（ＴＬＨＥＹＭＬＤＬ；配列番号２３６）、Ｅ７ １１－１９（ＹＭＬＤＬＱＰＥＴ；配列番号２３７）、Ｅ７ ４４－５２（ＱＡＥＰＤＲＡＨＹ；配列番号２３８）、Ｅ７ ４９－５７（ＲＡＨＹＮＩＶＴＦ（配列番号２３９）、Ｅ７ ６１－６９（ＣＤＳＴＬＲＬＣＶ；配列番号２４０）、及びＥ７ ６７－７６（ＬＣＶＱＳＴＨＶＤＩ；配列番号２４１）、Ｅ７ ８２－９０（ＬＬＭＧＴＬＧＩＶ；配列番号２４２）、Ｅ７ ８６－９３（ＴＬＧＩＶＣＰＩ；配列番号２４３）ならびにＥ７ ９２－９３（ＬＬＭＧＴＬＧＩＶＣＰＩ；配列番号２４４）が挙げられる。
抗体
上述のように、一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するＴＴＰは、抗体である。一部の例では、ＴＴＰは、ＣＡＡに特異的な抗体である。一部の例では、ＴＴＰは、がん細胞の表面上のペプチド／ＨＬＡ複合体に特異的な抗体であり、ペプチドは、がん関連ペプチド（例えば、がん関連抗原のペプチドフラグメント）であり得る。
本開示のＴＭＭＰに含めることができるＣＡＡ標的化抗体の非限定的な例としては、アビツズマブ（抗ＣＤ５１）、ＬＬ１（抗ＣＤ７４）、ＬＬ２またはＲＦＢ４（抗－ＣＤ２２）、ベルツズマブ（ｈＡ２０、抗ＣＤ２０）、リツキシマブ（抗ＣＤ２０）、オビヌツズマブ（ＧＡ１０１、抗ＣＤ２０）、ダラツズマブ（抗ＣＤ３８）、ランブロリズマブ（抗ＰＤ－１受容体）、ニボルマブ（抗ＰＤ－１受容体）、イピリムマブ（抗ＣＴＬＡ－４）、ＲＳ７（抗ＴＲＯＰ－２）、ＰＡＭ４またはＫＣ４（両方とも抗ムチン）、ＭＮ－１４（抗ＣＥＡ）、ＭＮ－１５またはＭＮ－３（抗ＣＥＡＣＡＭ６）、Ｍｕ－９（抗結腸特異的抗原－ｐ）、Ｉｍｍｕ ３１（抗アルファ－フェトプロテイン）、Ｒ１（抗ＩＧＦ－１Ｒ）、Ａ１９（抗ＣＤ１９）、ＴＡＧ－７２（例えば、ＣＣ４９）、Ｔｎ、Ｊ５９１またはＨｕＪ５９１（抗ＰＳＭＡ）、ＡＢ－ＰＧ１－ＸＧ１－０２６（抗ＰＳＭＡ二量体）、Ｄ２／Ｂ（抗ＰＳＭＡ）、Ｇ２５０（抗炭酸脱水酵素ＩＸ）、Ｌ２４３（抗ＨＬＡ－ＤＲ）アレムツズマブ（抗ＣＤ５２）、オポルツズマブ（抗ＥｐＣＡＭ）、ベバシズマブ（抗ＶＥＧＦ）、セツキシマブ（抗ＥＧＦＲ）、ゲムツズマブ（抗ＣＤ３３）、イブリツモマブ（抗ＣＤ２０）、パニツムマブ（抗ＥＧＦＲ）、トシツモマブ（抗ＣＤ２０）、ＰＡＭ４（クリバツズマブとしても知られる；抗ムチン）、トラスツズマブ（抗ＨＥＲ２）、ペルツズマブ（抗ＨＥＲ２）、ポラツズマブ（抗ＣＤ７９ｂ）、オファツムマブ（抗ＣＤ２０）、及びアネツマブ（抗メソセリン）が挙げられるが、これらに限定されない。
一部の例では、腫瘍ターゲティングポリペプチドは、抗体である。一部の例では、腫瘍ターゲティングポリペプチドは、一本鎖抗体である。一部の例では、腫瘍ターゲティングポリペプチドは、ｓｃＦｖである。一部の例では、腫瘍ターゲティングポリペプチドは、ナノボディ（単一ドメイン抗体（ｓｄＡｂ）とも称される）である。一部の例では、腫瘍ターゲティングポリペプチドは、重鎖ナノボディである。一部の例では、腫瘍ターゲティングポリペプチドは、軽鎖ナノボディである。
様々な腫瘍抗原結合抗体のＶＨ及びＶＬアミノ酸配列は、このような抗体の軽鎖及び重鎖ＣＤＲであるため、当該技術分野において既知である。例えば、Ｌｉｎｇ ｅｔ ａｌ．（２０１８）Ｆｒｏｎｔｉｅｒｓ Ｉｍｍｕｎｏｌ．９：４６９、ＷＯ２００５／０１２４９３、ＵＳ２０１９／０１１９３７５、ＵＳ２０１３／００６６０５５を参照されたい。以下は、腫瘍抗原結合抗体の非限定的な例である。
抗Ｈｅｒ２
一部の例では、抗Ｈｅｒ２抗体は、ａ）以下のアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖：
ＤＩＱＭＴＱＳＰＳＳＬＳＡＳＶＧＤＲＶＴＩＴＣＲＡＳＱＤＶＮＴＡＶＡＷＹＱＱＫＰＧＫＡＰＫＬＬＩＹＳＡＳＦＬＹＳＧＶＰＳＲＦＳＧＳＲＳＧＴＤＦＴＬＴＩＳＳＬＱＰＥＤＦＡＴＹＹＣＱＱＨＹＴＴＰＰＴＦＧＱＧＴＫＶＥＩＫＲＴＶＡＡＰＳＶＦＩＦＰＰＳＤＥＱＬＫＳＧＴＡＳＶＶＣＬＬＮＮＦＹＰＲＥＡＫＶＱＷＫＶＤＮＡＬＱＳＧＮＳＱＥＳＶＴＥＱＤＳＫＤＳＴＹＳＬＳＳＴＬＴＬＳＫＡＤＹＥＫＨＫＶＹＡＣＥＶＴＨＱＧＬＳＳＰＶＴＫＳＦＮＲＧＥＣ（配列番号２４８）と、ｂ）以下のアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖：
ＥＶＱＬＶＥＳＧＧＧＬＶＱＰＧＧＳＬＲＬＳＣＡＡＳＧＦＮＩＫＤＴＹＩＨＷＶＲＱＡＰＧＫＧＬＥＷＶＡＲＩＹＰＴＮＧＹＴＲＹＡＤＳＶＫＧＲＦＴＩＳＡＤＴＳＫＮＴＡＹＬＱＭＮＳＬＲＡＥＤＴＡＶＹＹＣＳＲＷＧＧＤＧＦＹＡＭＤＹＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳＡＳＴＫＧＰＳＶＦＰＬＡＰＳＳＫＳＴＳＧＧＴＡＡＬＧＣＬＶＫＤＹＦＰＥＰＶＴＶＳＷＮＳＧＡＬＴＳＧＶＨＴＦＰＡＶＬＱＳＳＧＬＹＳＬＳＳＶＶＴＶＰＳＳＳＬＧＴＱＴＹＩＣＮＶＮＨＫＰＳＮＴＫＶＤＫＫＶＥＰＫＳＣＤＫＴＨＴＣＰＰＣＰＡＰＥＬＬＧＧＰＳＶＦＬＦＰＰＫＰＫＤＴＬＭＩＳＲＴＰＥＶＴＣＶＶＶＤＶＳＨＥＤＰＥＶＫＦＮＷＹＶＤＧＶＥＶＨＮＡＫＴＫＰＲＥＥＱＹＮＳＴＹＲＶＶＳＶＬＴＶＬＨＱＤＷＬＮＧＫＥＹＫＣＫＶＳＮＫＡＬＰＡＰＩＥＫＴＩＳＫＡＫＧＱＰＲＥＰＱＶＹＴＬＰＰＳＲＥＥＭＴＫＮＱＶＳＬＴＣＬＶＫＧＦＹＰＳＤＩＡＶＥＷＥＳＮＧＱＰＥＮＮＹＫＴＴＰＰＶＬＤＳＤＧＳＦＦＬＹＳＫＬＴＶＤＫＳＲＷＱＱＧＮＶＦＳＣＳＶＭＨＥＡＬＨＮＨＹＴＱＫＳＬＳＬＳＰＧＫ（配列番号２４９）とを含む。
一部の例では、抗Ｈｅｒ２抗体は、上記に提供される軽鎖アミノ酸配列に存在する軽鎖可変領域（ＶＬ）と、上記に提供される重鎖アミノ酸配列に存在する重鎖可変領域（ＶＨ）とを含む。例えば、抗Ｈｅｒ２抗体は、ａ）アミノ酸配列に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有する以下のアミノ酸配列を含むＶＬ：ＤＩＱＭＴＱＳＰＳＳＬＳＡＳＶＧＤＲＶＴＩＴＣＲＡＳＱＤＶＮＴＡＶＡＷＹＱＱＫＰＧＫＡＰＫＬＬＩＹＳＡＳＦＬＹＳＧＶＰＳＲＦＳＧＳＲＳＧＴＤＦＴＬＴＩＳＳＬＱＰＥＤＦＡＴＹＹＣＱＱＨＹＴＴＰＰＴＦＧＱＧＴＫＶＥＩＫ（配列番号２５０）と、ｂ）以下のアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＨ：ＥＶＱＬＶＥＳＧＧＧＬＶＱＰＧＧＳＬＲＬＳＣＡＡＳＧＦＮＩＫＤＴＹＩＨＷＶＲＱＡＰＧＫＧＬＥＷＶＡＲＩＹＰＴＮＧＹＴＲＹＡＤＳＶＫＧＲＦＴＩＳＡＤＴＳＫＮＴＡＹＬＱＭＮＳＬＲＡＥＤＴＡＶＹＹＣＳＲＷＧＧＤＧＦＹＡＭＤＹＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳ（配列番号２５１）とを含む。一部の例では、抗Ｈｅｒ２抗体は、Ｎ末端からＣ末端の順に、ａ）以下のアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＨ：ＥＶＱＬＶＥＳＧＧＧＬＶＱＰＧＧＳＬＲＬＳＣＡＡＳＧＦＮＩＫＤＴＹＩＨＷＶＲＱＡＰＧＫＧＬＥＷＶＡＲＩＹＰＴＮＧＹＴＲＹＡＤＳＶＫＧＲＦＴＩＳＡＤＴＳＫＮＴＡＹＬＱＭＮＳＬＲＡＥＤＴＡＶＹＹＣＳＲＷＧＧＤＧＦＹＡＭＤＹＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳ（配列番号２５２）と、ｂ）リンカーと、ｃ）以下のアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＬ：ＤＩＱＭＴＱＳＰＳＳＬＳＡＳＶＧＤＲＶＴＩＴＣＲＡＳＱＤＶＮＴＡＶＡＷＹＱＱＫＰＧＫＡＰＫＬＬＩＹＳＡＳＦＬＹＳＧＶＰＳＲＦＳＧＳＲＳＧＴＤＦＴＬＴＩＳＳＬＱＰＥＤＦＡＴＹＹＣＱＱＨＹＴＴＰＰＴＦＧＱＧＴＫＶＥＩＫ（配列番号２５３）とを含む。好適なリンカーは、本明細書の他の箇所に記載され、例えば、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号２５４）を含み、ｎは、１～１０（例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０）の整数である。
一部の例では、抗Ｈｅｒ２抗体は、上記に提供される軽鎖アミノ酸配列に存在するＶＬ ＣＤＲ１、ＶＬ ＣＤＲ２、及びＶＬ ＣＤＲ３と、上記に提供される重鎖アミノ酸配列に存在するＶＨ ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、及びＣＤＲ３とを含む。一部の例では、ＶＨ及びＶＬ ＣＤＲは、Ｋａｂａｔによって定義されるとおりである（例えば、上記の表２、及びＫａｂａｔ １９９１を参照されたい）。一部の例では、ＶＨ及びＶＬ ＣＤＲは、Ｃｈｏｔｈｉａによって定義されるとおりである（例えば、上記の表２、及びＣｈｏｔｈｉａ １９８７を参照されたい）。
例えば、抗Ｈｅｒ２抗体は、アミノ酸配列ＲＡＳＱＤＶＮＴＡＶＡ（配列番号２５５）を有するＶＬ ＣＤＲ１、アミノ酸配列ＳＡＳＦＬＹ（配列番号２５６）を有するＶＬ ＣＤＲ２、アミノ酸配列ＱＱＨＹＴＴＰＰ（配列番号２５７）を有するＶＬ ＣＤＲ３、アミノ酸配列ＧＦＮＩＫＤＴＹ（配列番号２５８）を有するＶＨ ＣＤＲ１、アミノ酸配列ＩＹＰＴＮＧＹＴ（配列番号２５９）を有するＶＨ ＣＤＲ２、及びアミノ酸配列ＳＲＷＧＧＤＧＦＹＡＭＤＹ（配列番号２６０）を有するＶＨ ＣＤＲ３を含み得る。
一部の例では、抗Ｈｅｒ２抗体は、ｓｃＦｖ抗体である。例えば、抗Ｈｅｒ２ ｓｃＦｖは、以下のアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る：ＥＶＱＬＶＥＳＧＧＧＬＶＱＰＧＧＳＬＲＬＳＣＡＡＳＧＦＮＩＫＤＴＹＩＨＷＶＲＱＡＰＧＫＧＬＥＷＶＡＲＩＹＰＴＮＧＹＴＲＹＡＤＳＶＫＧＲＦＴＩＳＡＤＴＳＫＮＴＡＹＬＱＭＮＳＬＲＡＥＤＴＡＶＹＹＣＳＲＷＧＧＤＧＦＹＡＭＤＹＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳＤＩＱＭＴＱＳＰＳＳＬＳＡＳＶＧＤＲＶＴＩＴＣＲＡＳＱＤＶＮＴＡＶＡＷＹＱＱＫＰＧＫＡＰＫＬＬＩＹＳＡＳＦＬＹＳＧＶＰＳＲＦＳＧＳＲＳＧＴＤＦＴＬＴＩＳＳＬＱＰＥＤＦＡＴＹＹＣＱＱＨＹＴＴＰＰＴＦＧＱＧＴＫＶＥＩＫ（配列番号２６１）。
別の例として、一部の例では、抗Ｈｅｒ２抗体は、ａ）以下のアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域（ＶＬ）：
ＤＩＱＭＴＱＳＰＳＳＬＳＡＳＶＧＤＲＶＴＩＴＣＫＡＳＱＤＶＳＩＧＶＡＷＹＱＱＫＰＧＫＡＰＫＬＬＩＹＳＡＳＹＲＹＴＧＶＰＳＲＦＳＧＳＧＳＧＴＤＦＴＬＴＩＳＳＬＱＰＥＤＦＡＴＹＹＣＱＱＹＹＩＹＰＹＴＦＧＱＧＴＫＶＥＩＫＲＴＶＡＡＰＳＶＦＩＦＰＰＳＤＥＱＬＫＳＧＴＡＳＶＶＣＬＬＮＮＦＹＰＲＥＡＫＶＱＷＫＶＤＮＡＬＱＳＧＮＳＱＥＳＶＴＥＱＤＳＫＤＳＴＹＳＬＳＳＴＬＴＬＳＫＡＤＹＥＫＨＫＶＹＡＣＥＶＴＨＱＧＬＳＳＰＶＴＫＳＦＮＲＧＥＣ（配列番号２６２）と、ｂ）以下のアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖可変領域（ＶＨ）：
ＥＶＱＬＶＥＳＧＧＧＬＶＱＰＧＧＳＬＲＬＳＣＡＡＳＧＦＴＦＴＤＹＴＭＤＷＶＲＱＡＰＧＫＧＬＥＷＶＡＤＶＮＰＮＳＧＧＳＩＹＮＱＲＦＫＧＲＦＴＬＳＶＤＲＳＫＮＴＬＹＬＱＭＮＳＬＲＡＥＤＴＡＶＹＹＣＡＲＮＬＧＰＳＦＹＦＤＹＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳＡＳＴＫＧＰＳＶＦＰＬＡＰＳＳＫＳＴＳＧＧＴＡＡＬＧＣＬＶＫＤＹＦＰＥＰＶＴＶＳＷＮＳＧＡＬＴＳＧＶＨＴＦＰＡＶＬＱＳＳＧＬＹＳＬＳＳＶＶＴＶＰＳＳＳＬＧＴＱＴＹＩＣＮＶＮＨＫＰＳＮＴＫＶＤＫＫＶＥＰＫＳＣＤＫＴＨＴＣＰＰＣＰＡＰＥＬＬＧＧＰＳＶＦＬＦＰＰＫＰＫＤＴＬＭＩＳＲＴＰＥＶＴＣＶＶＶＤＶＳＨＥＤＰＥＶＫＦＮＷＹＶＤＧＶＥＶＨＮＡＫＴＫＰＲＥＥＱＹＮＳＴＹＲＶＶＳＶＬＴＶＬＨＱＤＷＬＮＧＫＥＹＫＣＫＶＳＮＫＡＬＰＡＰＩＥＫＴＩＳＫＡＫＧＱＰＲＥＰＱＶＹＴＬＰＰＳＲＥＥＭＴＫＮＱＶＳＬＴＣＬＶＫＧＦＹＰＳＤＩＡＶＥＷＥＳＮＧＱＰＥＮＮＹＫＴＴＰＰＶＬＤＳＤＧＳＦＦＬＹＳＫＬＴＶＤＫＳＲＷＱＱＧＮＶＦＳＣＳＶＭＨＥＡＬＨＮＨＹＴＱＫＳＬＳＬＳＰＧ（配列番号２６３）とを含む。
一部の例では、抗Ｈｅｒ２抗体は、上記に提供される軽鎖アミノ酸配列に存在するＶＬと、上記に提供される重鎖アミノ酸配列に存在するＶＨとを含む。例えば、抗Ｈｅｒ２抗体は、ａ）アミノ酸配列に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有する以下のアミノ酸配列を含むＶＬ：ＤＩＱＭＴＱＳＰＳＳＬＳＡＳＶＧＤＲＶＴＩＴＣＫＡＳＱＤＶＳＩＧＶＡＷＹＱＱＫＰＧＫＡＰＫＬＬＩＹＳＡＳＹＲＹＴＧＶＰＳＲＦＳＧＳＧＳＧＴＤＦＴＬＴＩＳＳＬＱＰＥＤＦＡＴＹＹＣＱＱＹＹＩＹＰＹＴＦＧＱＧＴＫＶＥＩＫ（配列番号２６４）と、ｂ）アミノ酸配列に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＨ：ＥＶＱＬＶＥＳＧＧＧＬＶＱＰＧＧＳＬＲＬＳＣＡＡＳＧＦＴＦＴＤＹＴＭＤＷＶＲＱＡＰＧＫＧＬＥＷＶＡＤＶＮＰＮＳＧＧＳＩＹＮＱＲＦＫＧＲＦＴＬＳＶＤＲＳＫＮＴＬＹＬＱＭＮＳＬＲＡＥＤＴＡＶＹＹＣＡＲＮＬＧＰＳＦＹＦＤＹＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳ（配列番号２６５）とを含み得る。
一部の例では、抗Ｈｅｒ２抗体は、上記に提供される軽鎖アミノ酸配列に存在するＶＬ ＣＤＲ１、ＶＬ ＣＤＲ２、及びＶＬ ＣＤＲ３と、上記に提供される重鎖アミノ酸配列に存在するＶＨ ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、及びＣＤＲ３とを含む。一部の例では、ＶＨ及びＶＬ ＣＤＲは、Ｋａｂａｔによって定義されるとおりである（例えば、上記の表２、及びＫａｂａｔ １９９１を参照されたい）。一部の例では、ＶＨ及びＶＬ ＣＤＲは、Ｃｈｏｔｈｉａによって定義されるとおりである（例えば、上記の表２、及びＣｈｏｔｈｉａ １９８７を参照されたい）。
例えば、抗ＨＥＲ２抗体は、アミノ酸配列ＫＡＳＱＤＶＳＩＧＶＡ（配列番号２６６）を有するＶＬ ＣＤＲ１、アミノ酸配列ＳＡＳＹＲＹ（配列番号２６７）を有するＶＬ ＣＤＲ２、アミノ酸配列ＱＱＹＹＩＹＰＹ（配列番号２６８）を有するＶＬ ＣＤＲ３、アミノ酸配列ＧＦＴＦＴＤＹＴＭＤ（配列番号２６９）を有するＶＨ ＣＤＲ１、アミノ酸配列ＡＤＶＮＰＮＳＧＧＳＩＹＮＱＲＦＫＧ（配列番号２７０）を有するＶＨ ＣＤＲ２、及びアミノ酸配列ＡＲＮＬＧＰＳＦＹＦＤＹ（配列番号２７１）を有するＶＨ ＣＤＲ３を含み得る。
一部の例では、抗Ｈｅｒ２抗体は、ｓｃＦｖである。例えば、一部の例では、抗Ｈｅｒ２ ｓｃＦｖは、以下のアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む：
ＥＶＱＬＶＥＳＧＧＧＬＶＱＰＧＧＳＬＲＬＳＣＡＡＳＧＦＮＩＫＤＴＹＩＨＷＶＲＱＡＰＧＫＧＬＥＷＶＡＲＩＹＰＴＮＧＹＴＲＹＡＤＳＶＫＧＲＦＴＩＳＡＤＴＳＫＮＴＡＹＬＱＭＮＳＬＲＡＥＤＴＡＶＹＹＣＳＲＷＧＧＤＧＦＹＡＭＤＹＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳＤＩＱＭＴＱＳＰＳＳＬＳＡＳＶＧＤＲＶＴＩＴＣＲＡＳＱＤＶＮＴＡＶＡＷＹＱＱＫＰＧＫＡＰＫＬＬＩＹＳＡＳＦＬＹＳＧＶＰＳＲＦＳＧＳＲＳＧＴＤＦＴＬＴＩＳＳＬＱＰＥＤＦＡＴＹＹＣＱＱＨＹＴＴＰＰＴＦＧＱＧＴＫＶＥＩＫ（配列番号２７２）。
抗ＣＤ１９
抗ＣＤ１９抗体は、当該技術分野で既知であり、任意の抗ＣＤ１９抗体のＶＨ及びＶＬ、またはＶＨ及びＶＬ ＣＤＲは、本開示のＴＭＭＰで使用することができる。例えば、ＷＯ２００５／０１２４９３を参照されたい。
一部の例では、抗ＣＤ１９抗体は、アミノ酸配列ＫＡＳＱＳＶＤＹＤＧＤＳＹＬＮ（配列番号２７３）を含むＶＬ ＣＤＲ１、アミノ酸配列ＤＡＳＮＬＶＳ（配列番号２７４）を含むＶＬ ＣＤＲ２、及びアミノ酸配列ＱＱＳＴＥＤＰＷＴ（配列番号２７５）を含むＶＬ ＣＤＲ３を含む。一部の例では、抗ＣＤ１９抗体は、アミノ酸配列ＳＹＷＭＮ（配列番号２７６）を含むＶＨ ＣＤＲ１、アミノ酸配列ＱＩＷＰＧＤＧＤＴＮＹＮＧＫＦＫＧ（配列番号２７７）を含むＶＨ ＣＤＲ２、及びアミノ酸配列ＲＥＴＴＴＶＧＲＹＹＹＡＭＤＹ（配列番号２７８）を含むＶＨ ＣＤＲ３を含む。一部の例では、抗ＣＤ１９抗体は、アミノ酸配列ＫＡＳＱＳＶＤＹＤＧＤＳＹＬＮ（配列番号２７９）を含むＶＬ ＣＤＲ１、アミノ酸配列ＤＡＳＮＬＶＳ（配列番号２８０）を含むＶＬ ＣＤＲ２、アミノ酸配列ＱＱＳＴＥＤＰＷＴ（配列番号２８１）を含むＶＬ ＣＤＲ３、アミノ酸配列ＳＹＷＭＮ（配列番号２８２）を含むＶＨ ＣＤＲ１、アミノ酸配列ＱＩＷＰＧＤＧＤＴＮＹＮＧＫＦＫＧ（配列番号２８３）を含むＶＨ ＣＤＲ２、及びアミノ酸配列ＲＥＴＴＴＶＧＲＹＹＹＡＭＤＹ（配列番号２８４）を含むＶＨ ＣＤＲ３を含む。
一部の例では、抗ＣＤ１９抗体は、ｓｃＦｖである。例えば、一部の例では、抗ＣＤ１９ ｓｃＦｖは、以下のアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む：ＤＩＱＬＴＱＳＰＡＳＬＡＶＳＬＧＱＲＡＴＩＳＣＫＡＳＱＳＶＤＹＤＧＤＳＹＬＮＷＹＱＱＩＰＧＱＰＰＫＬＬＩＹＤＡＳＮＬＶＳＧＩＰＰＲＦＳＧＳＧＳＧＴＤＦＴＬＮＩＨＰＶＥＫＶＤＡＡＴＹＨＣＱＱＳＴＥＤＰＷＴＦＧＧＧＴＫＬＥＩＫＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳＱＶＱＬＱＱＳＧＡＥＬＶＲＰＧＳＳＶＫＩＳＣＫＡＳＧＹＡＦＳＳＹＷＭＮＷＶＫＱＲＰＧＱＧＬＥＷＩＧＱＩＷＰＧＤＧＤＴＮＹＮＧＫＦＫＧＫＡＴＬＴＡＤＥＳＳＳＴＡＹＭＱＬＳＳＬＡＳＥＤＳＡＶＹＦＣＡＲＲＥＴＴＴＶＧＲＹＹＹＡＭＤＹＷＧＱＧＴＴＶＴＶＳ（配列番号２８５）。
抗メソセリン
抗メソセリン抗体は、当該技術分野で既知であり、任意の抗メソセリン抗体のＶＨ及びＶＬ、またはＶＨ及びＶＬ ＣＤＲは、本開示のＴＭＭＰで使用することができる。例えば、Ｕ．Ｓ．２０１９／００００９４４、ＷＯ２００９／０４５９５７、ＷＯ２０１４／０３１４７６、ＵＳＰＮ８，４６０，６６０、ＵＳ２０１３／００６６０５５、及びＷＯ２００９／０６８２０４を参照されたい。
一部の例では、抗メソセリン抗体は、ａ）以下のアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖：
ＤＩＡＬＴＱＰＡＳＶＳＧＳＰＧＱＳＩＴＩＳＣＴＧＴＳＳＤＩＧＧＹＮＳＶＳＷＹＱＱＨＰＧＫＡＰＫＬＭＩＹＧＶＮＮＲＰＳＧＶＳＮＲＦＳＧＳＫＳＧＮＴＡＳＬＴＩＳＧＬＱＡＥＤＥＡＤＹＹＣＳＳＹＤＩＥＳＡＴＰＶＦＧＧＧＴＫＬＴＶＬＧＱＰＫＡＡＰＳＶＴＬＦＰＰＳＳＥＥＬＱＡＮＫＡＴＬＶＣＬＩＳＤＦＹＰＧＡＶＴＶＡＷＫＧＤＳＳＰＶＫＡＧＶＥＴＴＴＰＳＫＱＳＮＮＫＹＡＡＳＳＹＬＳＬＴＰＥＱＷＫＳＨＲＳＹＳＣＱＶＴＨＥＧＳＴＶＥＫＴＶＡＰＴＥＳＳ（配列番号２８６）と、
ｂ）以下のアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖：
ＱＶＥＬＶＱＳＧＡＥＶＫＫＰＧＥＳＬＫＩＳＣＫＧＳＧＹＳＦＴＳＹＷＩＧＷＶＲＱＡＰＧＫＧＬＥＷＭＧＩＩＤＰＧＤＳＲＴＲＹＳＰＳＦＱＧＱＶＴＩＳＡＤＫＳＩＳＴＡＹＬＱＷＳＳＬＫＡＳＤＴＡＭＹＹＣＡＲＧＱＬＹＧＧＴＹＭＤＧＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳＡＳＴＫＧＰＳＶＦＰＬＡＰＳＳＫＳＴＳＧＧＴＡＡＬＧＣＬＶＫＤＹＦＰＥＰＶＴＶＳＷＮＳＧＡＬＴＳＧＶＨＴＦＰＡＶＬＱＳＳＧＬＹＳＬＳＳＶＶＴＶＰＳＳＳＬＧＴＱＴＹＩＣＮＶＮＨＫＰＳＮＴＫＶＤＫＫＶＥＰＫＳＣＤＫＴＨＴＣＰＰＣＰＡＰＥＬＬＧＧＰＳＶＦＬＦＰＰＫＰＫＤＴＬＭＩＳＲＴＰＥＶＴＣＶＶＶＤＶＳＨＥＤＰＥＶＫＦＮＷＹＶＤＧＶＥＶＨＮＡＫＴＫＰＲＥＥＱＹＮＳＴＹＲＶＶＳＶＬＴＶＬＨＱＤＷＬＮＧＫＥＹＫＣＫＶＳＮＫＡＬＰＡＰＩＥＫＴＩＳＫＡＫＧＱＰＲＥＰＱＶＹＴＬＰＰＳＲＤＥＬＴＫＮＱＶＳＬＴＣＬＶＫＧＦＹＰＳＤＩＡＶＥＷＥＳＮＧＱＰＥＮＮＹＫＴＴＰＰＶＬＤＳＤＧＳＦＦＬＹＳＫＬＴＶＤＫＳＲＷＱＱＧＮＶＦＳＣＳＶＭＨＥＡＬＨＮＨＹＴＱＫＳＬＳＬＳＰＧＫ（配列番号２８７）とを含む。
一部の例では、抗メソセリン抗体は、上記に提供される軽鎖アミノ酸配列に存在するＶＬと、上記に提供される重鎖アミノ酸配列に存在するＶＨとを含む。例えば、抗メソセリン抗体は、ａ）以下のアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＬ：ＤＩＡＬＴＱＰＡＳＶＳＧＳＰＧＱＳＩＴＩＳＣＴＧＴＳＳＤＩＧＧＹＮＳＶＳＷＹＱＱＨＰＧＫＡＰＫＬＭＩＹＧＶＮＮＲＰＳＧＶＳＮＲＦＳＧＳＫＳＧＮＴＡＳＬＴＩＳＧＬＱＡＥＤＥＡＤＹＹＣＳＳＹＤＩＥＳＡＴＰＶＦＧＧＧＴＫ（配列番号２８８）と、Ｂ）以下のアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＨ：ＱＶＥＬＶＱＳＧＡＥＶＫＫＰＧＥＳＬＫＩＳＣＫＧＳＧＹＳＦＴＳＹＷＩＧＷＶＲＱＡＰＧＫＧＬＥＷＭＧＩＩＤＰＧＤＳＲＴＲＹＳＰＳＦＱＧＱＶＴＩＳＡＤＫＳＩＳＴＡＹＬＱＷＳＳＬＫＡＳＤＴＡＭＹＹＣＡＲＧＱＬＹＧＧＴＹＭＤＧＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳ（配列番号２８９）とを含む。
一部の例では、抗メソセリン抗体は、上記に提供される軽鎖アミノ酸配列に存在するＶＬ ＣＤＲ１、ＶＬ ＣＤＲ２、及びＶＬ ＣＤＲ３と、上記に提供される重鎖アミノ酸配列に存在するＶＨ ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、及びＣＤＲ３とを含む。一部の例では、ＶＨ及びＶＬ ＣＤＲは、Ｋａｂａｔによって定義されるとおりである（例えば、上記の表２、及びＫａｂａｔ １９９１を参照されたい）。一部の例では、ＶＨ及びＶＬ ＣＤＲは、Ｃｈｏｔｈｉａによって定義されるとおりである（例えば、上記の表２、及びＣｈｏｔｈｉａ １９８７を参照されたい）。
例えば、抗メソセリン抗体は、アミノ酸配列ＴＧＴＳＳＤＩＧＧＹＮＳＶＳ（配列番号２９０）を有するＶＬ ＣＤＲ１、アミノ酸配列ＬＭＩＹＧＶＮＮＲＰＳ（配列番号２９１）を有するＶＬ ＣＤＲ２、アミノ酸配列ＳＳＹＤＩＥＳＡＴＰ（配列番号２９２）を有するＶＬ ＣＤＲ３、アミノ酸配列ＧＹＳＦＴＳＹＷＩＧ（配列番号２９３）を有するＶＨ ＣＤＲ１、アミノ酸配列ＷＭＧＩＩＤＰＧＤＳＲＴＲＹＳＰ（配列番号２９４）を有するＶＨ ＣＤＲ２、及びアミノ酸配列ＧＱＬＹＧＧＴＹＭＤＧ（配列番号２９５）を有するＶＨ ＣＤＲ３を含み得る。
抗メソセリン抗体は、ｓｃＦｖであり得る。１つの非限定的な例として、抗メソセリンｓｃＦｖは、以下のアミノ酸配列を含み得る：
Figure 2022536581000057
、配列中、ＶＨ ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、及びＣＤＲ３は、下線が付されており、ＶＬ ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、及びＣＤＲ３は、太字で示され、下線が付されている。
１つの非限定的な例として、抗メソセリンｓｃＦｖは、以下のアミノ酸配列を含み得る：
Figure 2022536581000058
、配列中、ＶＨ ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、及びＣＤＲ３は、下線が付されており、ＶＬ ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、及びＣＤＲ３は、太字で示され、下線が付されている。
抗ＢＣＭＡ
抗ＢＣＭＡ（Ｂ細胞成熟抗原）は、当該技術分野で既知であり、任意の抗ＢＣＭＡ抗体のＶＨ及びＶＬ、またはＶＨ及びＶＬ ＣＤＲは、本開示のＴＭＭＰで使用することができる。例えば、ＷＯ２０１４／０８９３３５及びＵＳ２０１９／０１５３０６１を参照されたい。
一部の例では、抗ＢＣＭＡ抗体は、ａ）以下のアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖：
ＱＳＶＬＴＱＰＰＳＡＳＧＴＰＧＱＲＶＴＩＳＣＳＧＳＳＳＮＩＧＳＮＴＶＮＷＹＱＱＬＰＧＴＡＰＫＬＬＩＦＮＹＨＱＲＰＳＧＶＰＤＲＦＳＧＳＫＳＧＳＳＡＳＬＡＩＳＧＬＱＳＥＤＥＡＤＹＹＣＡＡＷＤＤＳＬＮＧＷＶＦＧＧＧＴＫＬＴＶＬＧＱＰＫＡＡＰＳＶＴＬＦＰＰＳＳＥＥＬＱＡＮＫＡＴＬＶＣＬＩＳＤＦＹＰＧＡＶＴＶＡＷＫＡＤＳＳＰＶＫＡＧＶＥＴＴＴＰＤＳＫＱＳＮＮＫＹＡＡＳＳＹＬＳＬＴＰＥＱＷＫＳＨＲＳＹＳＣＱＶＴＨＥＧＳＴＶＥＫＴＶＡＰＴＥＣＳ（配列番号２９８）と、
ｂ）以下のアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖：
ＥＶＱＬＶＥＳＧＧＧＬＶＫＰＧＧＳＬＲＬＳＣＡＡＳＧＦＴＦＧＤＹＡＬＳＷＦＲＱＡＰＧＫＧＬＥＷＶＧＶＳＲＳＫＡＹＧＧＴＴＤＹＡＡＳＶＫＧＲＦＴＩＳＲＤＤＳＫＳＴＡＹＬＱＭＮＳＬＫＴＥＤＴＡＶＹＹＣＡＳＳＧＹＳＳＧＷＴＰＦＤＹＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳＡＳＴＫＧＰＳＶＦＰＬＡＰＳＳＫＳＴＳＧＧＴＡＡＬＧＣＬＶＫＤＹＦＰＥＰＶＴＶＳＷＮＳＧＡＬＴＳＧＶＨＴＦＰＡＶＬＱＳＳＧＬＹＳＬＳＳＶＶＴＶＰＳＳＳＬＧＴＱＴＹＩＣＮＶＮＨＫＰＳＮＴＫＶＤＫＫＶＥＰＫＳＣＤＫＴＨＴＣＰＰＣＰＡＰＥＬＬＧＧＰＳＶＦＬＦＰＰＫＰＫＤＴＬＭＩＳＲＴＰＥＶＴＣＶＶＶＤＶＳＨＥＤＰＥＶＫＦＮＷＹＶＤＧＶＥＶＨＮＡＫＴＫＰＲＥＥＱＹＮＳＴＹＲＶＶＳＶＬＴＶＬＨＱＤＷＬＮＧＫＥＹＫＣＫＶＳＮＫＡＬＰＡＰＩＥＫＴＩＳＫＡＫＧＱＰＲＥＰＱＶＹＴＬＰＰＳＲＥＥＭＴＫＮＱＶＳＬＴＣＬＶＫＧＦＹＰＳＤＩＡＶＥＷＥＳＮＧＱＰＥＮＮＹＫＴＴＰＰＶＬＤＳＤＧＳＦＦＬＹＳＫＬＴＶＤＫＳＲＷＱＱＧＮＶＦＳＣＳＶＭＨＥＡＬＨＮＨＹＴＱＫＳＬＳＬＳＰＧＫ（配列番号２９９）とを含む。
一部の例では、抗メソセリン抗体は、上記に提供される軽鎖アミノ酸配列に存在するＶＬと、上記に提供される重鎖アミノ酸配列に存在するＶＨとを含む。例えば、抗ＢＣＭＡ抗体は、以下のアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＬ：
ＱＳＶＬＴＱＰＰＳＡＳＧＴＰＧＱＲＶＴＩＳＣＳＧＳＳＳＮＩＧＳＮＴＶＮＷＹＱＱＬＰＧＴＡＰＫＬＬＩＦＮＹＨＱＲＰＳＧＶＰＤＲＦＳＧＳＫＳＧＳＳＡＳＬＡＩＳＧＬＱＳＥＤＥＡＤＹＹＣＡＡＷＤＤＳＬＮＧＷＶＦＧＧＧＴＫＬＴＶＬＧ（配列番号３００）と、Ｂ）以下のアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＨ：
ＥＶＱＬＶＥＳＧＧＧＬＶＫＰＧＧＳＬＲＬＳＣＡＡＳＧＦＴＦＧＤＹＡＬＳＷＦＲＱＡＰＧＫＧＬＥＷＶＧＶＳＲＳＫＡＹＧＧＴＴＤＹＡＡＳＶＫＧＲＦＴＩＳＲＤＤＳＫＳＴＡＹＬＱＭＮＳＬＫＴＥＤＴＡＶＹＹＣＡＳＳＧＹＳＳＧＷＴＰＦＤＹＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳＡＳＴＫＧＰＳＶ（配列番号３０１）とを含み得る。
一部の例では、抗ＢＣＭＡ抗体は、上記に提供される軽鎖アミノ酸配列に存在するＶＬ ＣＤＲ１、ＶＬ ＣＤＲ２、及びＶＬ ＣＤＲ３と、上記に提供される重鎖アミノ酸配列に存在するＶＨ ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、及びＣＤＲ３とを含む。一部の例では、ＶＨ及びＶＬ ＣＤＲは、Ｋａｂａｔによって定義されるとおりである（例えば、上記の表２、及びＫａｂａｔ １９９１を参照されたい）。一部の例では、ＶＨ及びＶＬ ＣＤＲは、Ｃｈｏｔｈｉａによって定義されるとおりである（例えば、上記の表２、及びＣｈｏｔｈｉａ １９８７を参照されたい）。
例えば、抗ＢＣＭＡ抗体は、アミノ酸配列ＳＳＮＩＧＳＮＴ（配列番号３０２）を有するＶＬ ＣＤＲ１、アミノ酸配列ＮＹＨを有するＶＬ ＣＤＲ２、アミノ酸配列ＡＡＷＤＤＳＬＮＧＷＶ（配列番号３０３）を有するＶＬ ＣＤＲ３、アミノ酸配列ＧＦＴＦＧＤＹＡ（配列番号３０４）を有するＶＨ ＣＤＲ１、アミノ酸配列ＳＲＳＫＡＹＧＧＴＴ（配列番号３０５）を有するＶＨ ＣＤＲ２、及びアミノ酸配列ＡＳＳＧＹＳＳＧＷＴＰＦＤＹ（配列番号３０６）を有するＶＨ ＣＤＲ３を含み得る。
抗ＢＣＭＡ抗体は、ｓｃＦｖであり得る。１つの非限定的な例として、抗ＢＣＭＡ ｓｃＦｖは、以下のアミノ酸配列を含み得る：ＱＶＱＬＶＱＳＧＡＥＶＫＫＰＧＳＳＶＫＶＳＣＫＡＳＧＧＴＦＳＮＹＷＭＨＷＶＲＱＡＰＧＱＧＬＥＷＭＧＡＴＹＲＧＨＳＤＴＹＹＮＱＫＦＫＧＲＶＴＩＴＡＤＫＳＴＳＴＡＹＭＥＬＳＳＬＲＳＥＤＴＡＶＹＹＣＡＲＧＡＩＹＮＧＹＤＶＬＤＮＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳＤＩＱＭＴＱＳＰＳＳＬＳＡＳＶＧＤＲＶＴＩＴＣＳＡＳＱＤＩＳＮＹＬＮＷＹＱＱＫＰＧＫＡＰＫＬＬＩＹＹＴＳＮＬＨＳＧＶＰＳＲＦＳＧＳＧＳＧＴＤＦＴＬＴＩＳＳＬＱＰＥＤＦＡＴＹＹＣＱＱＹＲＫＬＰＷＴＦＧＱＧＴＫＬＥＩＫＲ（配列番号３０７）。
別の例として、抗ＢＣＭＡ ｓｃＦｖは、以下のアミノ酸配列を含み得る：ＤＩＱＭＴＱＳＰＳＳＬＳＡＳＶＧＤＲＶＴＩＴＣＳＡＳＱＤＩＳＮＹＬＮＷＹＱＱＫＰＧＫＡＰＫＬＬＩＹＹＴＳＮＬＨＳＧＶＰＳＲＦＳＧＳＧＳＧＴＤＦＴＬＴＩＳＳＬＱＰＥＤＦＡＴＹＹＣＱＱＹＲＫＬＰＷＴＦＧＱＧＴＫＬＥＩＫＲＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳＱＶＱＬＶＱＳＧＡＥＶＫＫＰＧＳＳＶＫＶＳＣＫＡＳＧＧＴＦＳＮＹＷＭＨＷＶＲＱＡＰＧＱＧＬＥＷＭＧＡＴＹＲＧＨＳＤＴＹＹＮＱＫＦＫＧＲＶＴＩＴＡＤＫＳＴＳＴＡＹＭＥＬＳＳＬＲＳＥＤＴＡＶＹＹＣＡＲＧＡＩＹＮＧＹＤＶＬＤＮＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳ（配列番号３０８）。
一本鎖Ｔ細胞受容体
上述のように、一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するＴＴＰは、ｓｃＴＣＲである。ＴＴＰは、がん細胞の表面上のペプチド／ＨＬＡ複合体に特異的なｓｃＴＣＲであり、ペプチドは、がん関連ペプチド（例えば、がん関連抗原のペプチドフラグメント）であり得る。ＨＬＡ複合体に結合したがん関連ペプチドに特異的なｓｃＴＣＲのアミノ酸配列は、当該技術分野で既知である。例えば、ＵＳ２０１９／０１３５９１４、ＵＳ２０１９／００６２３９８、及びＵＳ２０１８／０３７１０４９を参照されたい。
ｓｃＴＣＲは、好適なペプチドリンカー配列を介して共有結合されたアルファ鎖可変領域（Ｖα）と、ベータ鎖可変領域（Ｖβ）とを含む。例えば、Ｖαは、ＶαのＣ末端及びＶβのＮ末端に融合した好適なペプチドリンカー（Ｌ）配列を介してＶβに共有結合され得る。ｓｃＴＣＲは、Ｖα－Ｌ－Ｖβの構造を有し得る。ｓｃＴＣＲは、Ｖβ－Ｌ－Ｖαの構造を有し得る。ｓｃＴＣＲはまた、定常ドメイン（定常領域とも称される）を含み得る。一部の例では、ｓｃＴＣＲは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲα鎖可変ドメインポリペプチド、ｉｉ）ペプチドリンカー、ｉｉｉ）ＴＣＲβ鎖可変ドメインポリペプチド、及びｉｖ）ＴＣＲβ鎖定常領域細胞外ドメインポリペプチドを含む。一部の例では、ｓｃＴＣＲは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲβ鎖可変ドメインポリペプチド、ｉｉ）ペプチドリンカー、ｉｉｉ）ＴＣＲα鎖可変ドメインポリペプチド、及びｉｖ）ＴＣＲα鎖定常領域細胞外ドメインポリペプチドを含む。
ペプチドががん関連ペプチドである、ペプチド／ＨＬＡ複合体に特異的なｓｃＴＣＲのアミノ酸配列は、当該技術分野で既知である。例えば、ＵＳ２０１９／０１３５９１４、ＵＳ２０１９／００６２３９８、ＵＳ２０１８／０３７１０４９、ＵＳ２０１９／０１４４５６３、及びＵＳ２０１９／０１１９３５０を参照されたい。
例えば、ｓｃＴＣＲは、ＨＬＡ－Ａ＊０２０１重鎖及びβ２Ｍポリペプチドを含むＨＬＡ複合体に結合したＳＬＬＭＷＩＴＱＣペプチドなどのＮＹ－ＥＳＯエピトープに特異的であり得る。一例として、このようなｓｃＴＣＲは、ｉ）以下のアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＴＣＲα鎖可変領域：ＭＱＥＶＴＱＩＰＡＡＬＳＶＰＥＧＥＮＬＶＬＮＣＳＦＴＤＳＡＩＹＮＬＱＷＦＲＱＤＰＧＫＧＬＴＳＬＬＬＩＱＳＳＱＲＥＱＴＳＧＲＬＮＡＳＬＤＫＳＳＧＲＳＴＬＹＩＡＡＳＱＰＧＤＳＡＴＹＬＣＡＶＲＰＴＳＧＧＳＹＩＰＴＦＧＲＧＴＳＬＩＶＨＰＹ（配列番号３５３）、配列中、アミノ酸２０は、ＶまたはＡであり得る；アミノ酸５１は、Ｑ、Ｐ、Ｓ、Ｔ、またはＭであり得る；アミノ酸５２は、Ｓ、Ｐ、Ｆ、またはＧであり得る；アミノ酸５３は、Ｓ、Ｗ、Ｈ、またはＴであり得る；アミノ酸９４は、Ｐ、Ｈ、またはＡであり得る；アミノ酸９５は、Ｔ、Ｌ、Ｍ、Ａ、Ｑ、Ｙ、Ｅ、Ｉ、Ｆ、Ｖ、Ｎ、Ｇ、Ｓ、Ｄ、またはＲであり得る；アミノ酸９６は、Ｓ、Ｌ、Ｔ、Ｙ、Ｉ、Ｑ、Ｖ、Ｅ、Ａ、Ｗ、Ｒ、Ｇ、Ｈ、Ｄ、またはＫであり得る；アミノ酸９７は、Ｇ、Ｄ、Ｎ、Ｖ、Ｓ、Ｔ、またはＡであり得る；アミノ酸９８は、Ｇ、Ｐ、Ｈ、Ｓ、Ｔ、Ｗ、またはＡであり得る；アミノ酸９９は、Ｓ、Ｔ、Ｙ、Ｄ、Ｈ、Ｖ、Ｎ、Ｅ、Ｇ、Ｑ、Ｋ、Ａ、Ｉ、またはＲであり得る；アミノ酸１００は、Ｙ、Ｆ、Ｍ、またはＤであり得る；アミノ酸１０１は、Ｉ、Ｐ、Ｔ、またはＭであり得る；かつアミノ酸１０３は、ＴまたはＡであり得ると、ｉｉ）以下のアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＴＣＲβ鎖可変領域：ＭＧＶＴＱＴＰＫＦＱＶＬＫＴＧＱＳＭＴＬＱＣＡＱＤＭＮＨＥＹＭＳＷＹＲＱＤＰＧＭＧＬＲＬＩＨＹＳＶＧＡＧＩＴＤＱＧＥＶＰＮＧＹＮＶＳＲＳＴＴＥＤＦＰＬＲＬＬＳＡＡＰＳＱＴＳＶＹＦＣＡＳＳＹＶＧＮＴＧＥＬＦＦＧＥＧＳＲＬＴＶＬ（配列番号３５４）、配列中、アミノ酸１８は、ＭまたはＶであり得る；アミノ酸５０は、Ｇ、Ｖ、またはＩであり得る；アミノ酸５２は、ＧまたはＱであり得る；アミノ酸５３は、Ｉ、Ｔ、またはＭであり得る；アミノ酸５５は、ＤまたはＲであり得る；アミノ酸５６は、ＱまたはＲであり得る；アミノ酸７０は、ＴまたはＩであり得る；アミノ酸９４は、Ｙ、Ｎ、またはＦであり得る；アミノ酸９５は、ＶまたはＬであり得る；かつアミノ酸９７は、Ｎ、Ｇ、またはＤであり得る）とを含む。例えば、一部の例では、ｓｃＴＣＲは、ｉ）以下のアミノ酸配列を含むＴＣＲα鎖可変領域：ＭＱＥＶＴＱＩＰＡＡＬＳＶＰＥＧＥＮＬＶＬＮＣＳＦＴＤＳＡＩＹＮＬＱＷＦＲＱＤＰＧＫＧＬＴＳＬＬＬＩＭＳＨＱＲＥＱＴＳＧＲＬＮＡＳＬＤＫＳＳＧＲＳＴＬＹＩＡＡＳＱＰＧＤＳＡＴＹＬＣＡＶＲＰＴＳＧＧＳＹＩＰＴＦＧＲＧＴＳＬＩＶＨＰＹ（配列番号３５５）と、以下のアミノ酸配列を含むＴＣＲβ鎖可変領域：ＭＧＶＴＱＴＰＫＦＱＶＬＫＴＧＱＳＭＴＬＱＣＡＱＤＭＮＨＥＹＭＳＷＹＲＱＤＰＧＭＧＬＲＬＩＨＹＳＶＳＡＧＩＴＤＱＧＥＶＰＮＧＹＮＶＳＲＳＴＴＥＤＦＰＬＲＬＬＳＡＡＰＳＱＴＳＶＹＦＣＡＳＳＹＶＧＮＴＧＥＬＦＦＧＥＧＳＲＬＴＶＬ（配列番号３５６）とを含み得る。
別の例として、ｓｃＴＣＲは、ＨＬ重鎖及びβ２Ｍポリペプチドを含むＨＬＡ複合体に結合したＨＰＶペプチドエピトープ（例えば、アミノ酸配列ＹＩＩＦＶＹＩＰＬ（ＨＰＶ１６ Ｅ５６３－７１；配列番号３５７）、ＫＬＰＱＬＣＴＥＬ（ＨＰＶ１６ Ｅ６１１－１９；配列番号３５８）、ＴＩＨＥＩＩＬＥＣＶ（ＨＰＶ１６ Ｅ６；配列番号３５９）、ＹＭＬＤＬＱＰＥＴ（ＨＰＶ１６ Ｅ７１１－１９；配列番号３６０）、ＴＬＧＩＶＣＰＩ（ＨＰＶ１６ Ｅ７８６－９３；配列番号３６１）、ＫＣＩＤＦＹＳＲＩ（ＨＰＶ１８ Ｅ６６７－７５；配列番号３６２）、またはＦＱＱＬＦＬＮＴＬ（ＨＰＶ１８ Ｅ７８６－９４；配列番号３６３）のＨＰＶペプチド）に特異的であり得る。一例として、このようなｓｃＴＣＲは、ｉ）以下のアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＴＣＲα鎖可変領域：ＭＥＴＬＬＧＬＬＩＬＱＬＱＬＱＷＶＳＳＫＱＥＶＴＱＩＰＡＡＬＳＶＰＥＧＥＮＬＶＬＮＣＳＦＴＤＳＡＩＹＮＬＱＷＦＲＱＤＰＧＫＧＬＴＳＬＬＬＩＱＳＳＱＲＥＱＴＳＧＲＬＮＡＳＬＤＫＳＳＧＲＳＴＬＹＩＡＡＳＱＰＧＤＳＡＴＹＬＣＡＶＲＥＴＳＧＳＲＬＴＦＧＥＧＴＱＬＴＶＮＰＤ（配列番号３６４）と、ｉｉ）アミノ酸配列に対して少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＴＣＲβ鎖可変領域：ＭＧＩＲＬＬＣＲＶＡＦＣＦＬＡＶＧＬＶＤＶＫＶＴＱＳＳＲＹＬＶＫＲＴＧＥＫＶＦＬＥＣＶＱＤＭＤＨＥＮＭＦＷＹＲＱＤＰＧＬＧＬＲＬＩＹＦＳＹＤＶＫＭＫＥＫＧＤＩＰＥＧＹＳＶＳＲＥＫＫＥＲＦＳＬＩＬＥＳＡＳＴＮＱＴＳＭＹＬＣＡＳＳＦＷＧＲＳＴＤＴＱＹＦＧＰＧＴＲＬＴＶＬ（配列番号３６５）とを含む。
例示的な構成
ＴＴＰは、本開示のＴＭＭＰの第１のポリペプチド及び／または第２のポリペプチドに存在し得る。したがって、本開示のＴＭＭＰは、以下を含む少なくとも１つのヘテロ二量体を含み得る：ａ）ｉ）ペプチドエピトープ、及びｉｉ）第１のＭＨＣポリペプチドを含む第１のポリペプチド、ｂ）第２のＭＨＣポリペプチドを含む第２のポリペプチド、ｃ）少なくとも１つの免疫調節ポリペプチド（第１及び／または第２のポリペプチドは、免疫調節ポリペプチドを含む）、ｄ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドまたは非Ｉｇスキャフォールド （第１及び／または第２のポリペプチドは、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドまたは非Ｉｇスキャフォールドを含む）、及びｅ）腫瘍ターゲティングポリペプチド（ＴＴＰ）（第１及び／または第２のポリペプチドは、ＴＴＰを含む）。これらの構成要素は、任意の様々な構成に配置され得る。例えば、一部の例では、 本開示のＴＭＭＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＵＣ１ペプチド、ｉｉ）第１のＭＨＣポリペプチド、及びｉｉｉ）少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドを含む第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）第２のＭＨＣポリペプチド、ｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド、及びｉｉｉ）ＴＴＰを含む第２のポリペプチドとを含む。別の例として、一部の例では、本開示のＴＭＭＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＵＣ１ペプチド、及びｉｉ）第１のＭＨＣポリペプチドを含む第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）少なくとも１つの免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）第２のＭＨＣポリペプチド、ｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド、及びｉｖ）ＴＴＰを含む第２のポリペプチドとを含む。別の例として、一部の例では、本開示のＴＭＭＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＵＣ１ペプチド、及びｉｉ）第１のＭＨＣポリペプチドを含む第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）第２のＭＨＣポリペプチド、ｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド、ｉｉｉ）少なくとも１つの免疫調節ポリペプチド、及びｉｖ）ＴＴＰを含む第２のポリペプチドとを含む。別の例として、一部の例では、本開示のＴＭＭＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＵＣ１ペプチド、及びｉｉ）第１のＭＨＣポリペプチドを含む第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）少なくとも１つの免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）第２のＭＨＣポリペプチド、ｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド、及びｉｖ）ＴＴＰを含む第２のポリペプチドとを含む。別の例として、一部の例では、本開示のＴＭＭＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）少なくとも１つの免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＵＣ１ペプチド、及びｉｉｉ）第１のＭＨＣポリペプチドを含む第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）第２のＭＨＣポリペプチド、ｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド、及びｉｉｉ）ＴＴＰを含む第２のポリペプチドとを含む。別の例として、一部の例では、本開示のＴＭＭＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＵＣ１ペプチド、及びｉｉ）第１のＭＨＣポリペプチドを含む第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）第２のＭＨＣポリペプチド、ｉｉ）少なくとも１つの免疫調節ポリペプチド、ｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド、及びｉｖ）ＴＴＰを含む第２のポリペプチドとを含む。
リンカー
本開示のＴＭＭＰは、１つ以上のリンカーを含み得、１つ以上のリンカーは、ｉ）ＭＨＣクラスＩポリペプチドとＩｇ Ｆｃポリペプチドとの間（このようなリンカーは、本明細書では、「Ｌ１」と称される）、ｉｉ）免疫調節ポリペプチドとＭＨＣクラスＩポリペプチドとの間（このようなリンカーは、本明細書では、「Ｌ２」と称される）、ｉｉｉ）第１の免疫調節ポリペプチドと第２の免疫調節ポリペプチドとの間（このようなリンカーは、本明細書では、「Ｌ３」と称される）、ｉｖ）ペプチド抗原（「エピトープ」）とＭＨＣクラスＩポリペプチドとの間、ｖ）ＭＨＣクラスＩポリペプチドと二量化ポリペプチド（例えば、二量体化対の第１または第２のメンバー）との間、及びｖｉ）二量体化ポリペプチド（例えば、二量体化対の第１または第２のメンバー）とＩｇＦｃポリペプチドとの間にある。
好適なリンカー（「スペーサー」とも称される）は、容易に選択することができ、１アミノ酸～２５アミノ酸、３アミノ酸～２０アミノ酸、２アミノ酸～１５アミノ酸、３アミノ酸～１２アミノ酸、４アミノ酸～１０アミノ酸、５アミノ酸～９アミノ酸、６アミノ酸～８アミノ酸、または７アミノ酸～８アミノ酸などのいくつかの好適な長さのいずれかのものであり得る。好適なリンカーは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、または２５アミノ酸の長さであり得る。一部の例では、リンカーは、２５アミノ酸～５０アミノ酸、例えば、２５～３０、３０～３５、３５～４０、４０～４５、または４５～５０アミノ酸の長さを有する。
例示的なリンカーには、グリシンポリマー（Ｇ）ｎ、グリシン－セリンポリマー（例えば、（ＧＳ）ｎ、（ＧＳＧＧＳ）ｎ（配列番号３６６）及び（ＧＧＧＳ）ｎ（配列番号３６７）を含む、ｎは、少なくとも１の整数である）、グリシン－アラニンポリマー、アラニン－セリンポリマー、ならびに当該技術分野で既知の他の可動性リンカーが含まれる。グリシン及びグリシン－セリンポリマーを使用することができ、Ｇｌｙ及びＳｅｒの両方は比較的構造不定であり、したがって、成分間の中性のテザーとして機能することができる。グリシンポリマーを使用することができ、グリシンは、更にアラニンよりも有意にファイ－プサイ空間にアクセスし、より長い側鎖を有する残基よりも大幅に制限が少ない（Ｓｃｈｅｒａｇａ，Ｒｅｖ．Ｃｏｍｐｕｔａｔｉｏｎａｌ Ｃｈｅｍ．１１１７３－１４２（１９９２）を参照されたい）。例示的なリンカーは、ＧＧＳＧ（配列番号３６８）、ＧＧＳＧＧ（配列番号３６９）、ＧＳＧＳＧ（配列番号３７０）、ＧＳＧＧＧ（配列番号３７１）、ＧＧＧＳＧ（配列番号３７２）、ＧＳＳＳＧ（配列番号３７３）などを含むが、これらに限定されない、アミノ酸配列を含み得る。例示的なリンカーは、例えば、Ｇｌｙ（Ｓｅｒ４）ｎ（配列番号３７４）を含み得、配列中、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０である。一部の例では、リンカーは、アミノ酸配列（ＧＳＳＳＳ）ｎ（配列番号３７５）を含み、ｎは、４である。一部の例では、リンカーは、アミノ酸配列（ＧＳＳＳＳ）ｎ（配列番号３７６）を含み、ｎは、５である。一部の例では、リンカーは、アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号３７７）を含み、ｎは、１である。一部の例では、リンカーは、アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号３７８）を含み、ｎは、２である。一部の例では、リンカーは、アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号３７９）を含み、ｎは、３である。一部の例では、リンカーは、アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号３８０）を含み、ｎは、４である。一部の例では、リンカーは、アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号３８１）を含み、ｎは、５である。一部の例では、リンカーは、アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号３８２）を含み、ｎは、６である。一部の例では、リンカーはアミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号３８３）を含み、ｎは７である。一部の例では、リンカーはアミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号３８４）を含み、ｎは８である。一部の例では、リンカーはアミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号３８５）を含み、ｎは９である。一部の例では、リンカーはアミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号３８６）を含み、ｎは１０である。一部の例では、リンカーは、アミノ酸配列ＡＡＡＧＧ（配列番号３８７）を含む。
一部の例では、本開示のＴＭＭＰの第１のポリペプチドに存在するリンカーポリペプチドは、本開示のＴＭＭＰの第２のポリペプチドに存在するシステイン残基とジスルフィド結合を形成することができるシステイン残基を含む。一部の例では、例えば、好適なリンカーは、アミノ酸配列
Figure 2022536581000059
を含む。別の例として、好適なリンカーは、アミノ酸配列ＧＣＧＧＳ（Ｇ４Ｓ）ｎ（配列番号３８９）を含み得、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、８、または９である。例えば、一部の例では、リンカーはアミノ酸配列ＧＣＧＧＳＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号３９０）を含む。別の例では、リンカーはアミノ酸配列ＧＣＧＧＳＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号３９１）を含む。
ＭＵＣ１ペプチド
上述のように、本開示のＴＭＭＰは、典型的には少なくとも約４アミノ酸長であるＭＵＣ１ペプチドを含み、ＭＨＣ／ペプチド複合体（例えば、ＨＬＡ／ペプチド複合体）内にある場合、Ｔ細胞にＭＵＣ１エピトープを提示する。
本開示のＴＭＭＰに存在するＭＵＣ１ペプチドは、長さが少なくとも４アミノ酸、例えば４アミノ酸～約２５アミノ酸長（例えば、４アミノ酸（ａａ）、５ａａ、６ａａ、７ａａ、８ａａ、９ａａ、１０ａａ、１１ａａ、１２ａａ、１３ａａ、１４ａａ、１５ａａ、１６ａａ、１７ａａ、１８ａａ、１９ａａ、２０ａａ、２１ａａ、２２ａａ、２３ａａ、２４ａａ、または２５ａａ、長さが４～２０アミノ酸、６～１８アミノ酸、８～１５アミノ酸、８～１２アミノ酸、５～１０アミノ酸、１０～２０アミノ酸、及び１５～２５アミノ酸の範囲内を含む）を有することができる。
本開示のＴＭＭＰに存在するＭＵＣ１エピトープは、Ｔ細胞によって特異的に結合するペプチド、すなわちエピトープ特異的Ｔ細胞によって特異的に結合するエピトープである。エピトープ特異的Ｔ細胞は、参照アミノ酸配列を有するエピトープに結合するが、参照アミノ酸配列とは異なるエピトープに実質的に結合しない。例えば、エピトープ特異的Ｔ細胞は、参照アミノ酸配列を有するエピトープに結合し、存在する場合、参照アミノ酸配列とは異なるエピトープに、１０－６Ｍ未満、１０－５Ｍ未満、または１０－４Ｍ未満の親和性で結合する。エピトープ特異的Ｔ細胞は、それが特異的であるエピトープに、少なくとも１０－７Ｍ、少なくとも１０－８Ｍ、少なくとも１０－９Ｍ、または少なくとも１０－１０Ｍの親和性で結合することができる。
一部の例では、好適なＭＵＣ１ペプチドは、以下のＭＵＣ１アミノ酸配列（全長ヒトＭＵＣ１アイソフォーム１タンパク質前駆体（アイソフォーム１、Ｕｎｉｐｒｏｔ Ｐ１５９４１－１））に対して少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＵＣ１ポリペプチドの少なくとも４アミノ酸長、例えば４アミノ酸～約２５アミノ酸（例えば、４アミノ酸（ａａ）、５ａａ、６ａａ、７ａａ、８ａａ、９ａａ、１０ａａ、１１ａａ、１２ａａ、１３ａａ、１４ａａ、１５ａａ、１６ａａ、１７ａａ、１８ａａ、１９ａａ、２０ａａ、２１ａａ、２２ａａ、２３ａａ、２４ａａ、または２５ａａ、長さが４～２０アミノ酸、６～１８アミノ酸、８～１５アミノ酸、８～１２アミノ酸、５～１０アミノ酸、１０～２０アミノ酸、及び１５～２５アミノ酸の範囲内を含む）のペプチドである：
ＭＴＰＧＴＱＳＰＦＦ ＬＬＬＬＬＴＶＬＴＶ ＶＴＧＳＧＨＡＳＳＴ ＰＧＧＥＫＥＴＳＡＴ ＱＲＳＳＶＰＳＳＴＥ ＫＮＡＶＳＭＴＳＳＶ ＬＳＳＨＳＰＧＳＧＳ ＳＴＴＱＧＱＤＶＴＬ ＡＰＡＴＥＰＡＳＧＳ ＡＡＴＷＧＱＤＶＴＳ ＶＰＶＴＲＰＡＬＧＳ ＴＴＰＰＡＨＤＶＴＳ ＡＰＤＮＫＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＮＲＰＡＬＧＳ ＴＡＰＰＶＨＮＶＴＳ ＡＳＧＳＡＳＧＳＡＳ ＴＬＶＨＮＧＴＳＡＲ ＡＴＴＴＰＡＳＫＳＴ ＰＦＳＩＰＳＨＨＳＤ ＴＰＴＴＬＡＳＨＳＴ ＫＴＤＡＳＳＴＨＨＳ ＳＶＰＰＬＴＳＳＮＨ ＳＴＳＰＱＬＳＴＧＶ ＳＦＦＦＬＳＦＨＩＳ ＮＬＱＦＮＳＳＬＥＤ ＰＳＴＤＹＹＱＥＬＱ ＲＤＩＳＥＭＦＬＱＩ ＹＫＱＧＧＦＬＧＬＳ ＮＩＫＦＲＰＧＳＶＶ ＶＱＬＴＬＡＦＲＥＧ ＴＩＮＶＨＤＶＥＴＱ ＦＮＱＹＫＴＥＡＡＳ ＲＹＮＬＴＩＳＤＶＳ ＶＳＤＶＰＦＰＦＳＡ ＱＳＧＡＧＶＰＧＷＧ ＩＡＬＬＶＬＶＣＶＬ ＶＡＬＡＩＶＹＬＩＡ ＬＡＶＣＱＣＲＲＫＮ ＹＧＱＬＤＩＦＰＡＲ ＤＴＹＨＰＭＳＥＹＰ ＴＹＨＴＨＧＲＹＶＰ ＰＳＳＴＤＲＳＰＹＥ ＫＶＳＡＧＮＧＧＳＳ ＬＳＹＴＮＰＡＶＡＡ ＴＳＡＮＬ（配列番号５７３）。
一部の例では、好適なＭＵＣ１ペプチドは、以下のＨｏｍｏ ｓａｐｉｅｎｓ ＭＵＣ１アイソフォーム２アミノ酸配列に対して少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＵＣ１ポリペプチドの少なくとも４アミノ酸長、例えば４アミノ酸～約２５アミノ酸（例えば、４アミノ酸（ａａ）、５ａａ、６ａａ、７ａａ、８ａａ、９ａａ、１０ａａ、１１ａａ、１２ａａ、１３ａａ、１４ａａ、１５ａａ、１６ａａ、１７ａａ、１８ａａ、１９ａａ、２０ａａ、２１ａａ、２２ａａ、２３ａａ、２４ａａ、または２５ａａ、長さが４～２０アミノ酸、６～１８アミノ酸、８～１５アミノ酸、８～１２アミノ酸、５～１０アミノ酸、１０～２０アミノ酸、及び１５～２５アミノ酸の範囲内を含む）のペプチドである：
ＭＴＰＧＴＱＳＰＦＦ ＬＬＬＬＬＴＶＬＴＡ ＴＴＡＰＫＰＡＴＶＶ ＴＧＳＧＨＡＳＳＴＰ ＧＧＥＫＥＴＳＡＴＱ ＲＳＳＶＰＳＳＴＥＫ ＮＡＦＮＳＳＬＥＤＰ ＳＴＤＹＹＱＥＬＱＲ ＤＩＳＥＭＦＬＱＩＹ ＫＱＧＧＦＬＧＬＳＮ ＩＫＦＲＰＧＳＶＶＶ ＱＬＴＬＡＦＲＥＧＴ ＩＮＶＨＤＶＥＴＱＦ ＮＱＹＫＴＥＡＡＳＲ ＹＮＬＴＩＳＤＶＳＶ ＳＤＶＰＦＰＦＳＡＱ ＳＧＡＧＶＰＧＷＧＩ ＡＬＬＶＬＶＣＶＬＶ ＡＬＡＩＶＹＬＩＡＬ ＡＶＣＱＣＲＲＫＮＹ ＧＱＬＤＩＦＰＡＲＤ ＴＹＨＰＭＳＥＹＰＴ ＹＨＴＨＧＲＹＶＰＰ ＳＳＴＤＲＳＰＹＥＫ ＶＳＡＧＮＧＧＳＳＬ ＳＹＴＮＰＡＶＡＡＴ ＳＡＮＬ（配列番号５７４）。
一部の例では、好適なＭＵＣ１ペプチドは、 以下のＨｏｍｏ ｓａｐｉｅｎｓ ＭＵＣ１アイソフォーム３アミノ酸配列に対して少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＵＣ１ポリペプチドの少なくとも４アミノ酸長、例えば４アミノ酸～約２５アミノ酸（例えば、４アミノ酸（ａａ）、５ａａ、６ａａ、７ａａ、８ａａ、９ａａ、１０ａａ、１１ａａ、１２ａａ、１３ａａ、１４ａａ、１５ａａ、１６ａａ、１７ａａ、１８ａａ、１９ａａ、２０ａａ、２１ａａ、２２ａａ、２３ａａ、２４ａａ、または２５ａａ、長さが４～２０アミノ酸、６～１８アミノ酸、８～１５アミノ酸、８～１２アミノ酸、５～１０アミノ酸、１０～２０アミノ酸、及び１５～２５アミノ酸の範囲内を含む）のペプチドである：
ＭＴＰＧＴＱＳＰＦＦ ＬＬＬＬＬＴＶＬＴＶ ＶＴＧＳＧＨＡＳＳＴ ＰＧＧＥＫＥＴＳＡＴ ＱＲＳＳＶＰＳＳＴＥ ＫＮＡＦＮＳＳＬＥＤ ＰＳＴＤＹＹＱＥＬＱ ＲＤＩＳＥＭＦＬＱＩ ＹＫＱＧＧＦＬＧＬＳ ＮＩＫＦＲＰＧＳＶＶ ＶＱＬＴＬＡＦＲＥＧ ＴＩＮＶＨＤＶＥＴＱ ＦＮＱＹＫＴＥＡＡＳ ＲＹＮＬＴＩＳＤＶＳ ＶＳＤＶＰＦＰＦＳＡ ＱＳＧＡＧＶＰＧＷＧ ＩＡＬＬＶＬＶＣＶＬ ＶＡＬＡＩＶＹＬＩＡ ＬＡＶＣＱＣＲＲＫＮ ＹＧＱＬＤＩＦＰＡＲ ＤＴＹＨＰＭＳＥＹＰ ＴＹＨＴＨＧＲＹＶＰ ＰＳＳＴＤＲＳＰＹＥ ＫＶＳＡＧＮＧＧＳＳ ＬＳＹＴＮＰＡＶＡＡ ＴＳＡＮＬ（配列番号５７５）。
一部の例では、好適なＭＵＣ１ペプチドは、 以下のＨｏｍｏ ｓａｐｉｅｎｓ ＭＵＣ１アイソフォーム５アミノ酸配列に対して少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＵＣ１ポリペプチドの少なくとも４アミノ酸長、例えば４アミノ酸～約２５アミノ酸（例えば、４アミノ酸（ａａ）、５ａａ、６ａａ、７ａａ、８ａａ、９ａａ、１０ａａ、１１ａａ、１２ａａ、１３ａａ、１４ａａ、１５ａａ、１６ａａ、１７ａａ、１８ａａ、１９ａａ、２０ａａ、２１ａａ、２２ａａ、２３ａａ、２４ａａ、または２５ａａ、長さが４～２０アミノ酸、６～１８アミノ酸、８～１５アミノ酸、８～１２アミノ酸、５～１０アミノ酸、１０～２０アミノ酸、及び１５～２５アミノ酸の範囲内を含む）のペプチドである：
ＭＴＰＧＴＱＳＰＦＦ ＬＬＬＬＬＴＶＬＴＶ ＶＴＧＳＧＨＡＳＳＴ ＰＧＧＥＫＥＴＳＡＴ ＱＲＳＳＶＰＳＳＴＥ ＫＮＡＩＰＡＰＴＴＴ ＫＳＣＲＥＴＦＬＫＣ ＦＣＲＦＩＮＫＧＶＦ ＷＡＳＰＩＬＳＳＶＳ ＤＶＰＦＰＦＳＡＱＳ ＧＡＧＶＰＧＷＧＩＡ ＬＬＶＬＶＣＶＬＶＡ ＬＡＩＶＹＬＩＡＬＡ ＶＣＱＣＲＲＫＮＹＧ ＱＬＤＩＦＰＡＲＤＴ ＹＨＰＭＳＥＹＰＴＹ ＨＴＨＧＲＹＶＰＰＳ ＳＴＤＲＳＰＹＥＫＶ ＳＡＧＮＧＧＳＳＬＳ ＹＴＮＰＡＶＡＡＴＳ ＡＮＬ（配列番号５７６）。
一部の例では、好適なＭＵＣ１ペプチドは、 以下のＨｏｍｏ ｓａｐｉｅｎｓ ＭＵＣ１アイソフォーム６アミノ酸配列に対して少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＵＣ１ポリペプチドの少なくとも４アミノ酸長、例えば４アミノ酸～約２５アミノ酸（例えば、４アミノ酸（ａａ）、５ａａ、６ａａ、７ａａ、８ａａ、９ａａ、１０ａａ、１１ａａ、１２ａａ、１３ａａ、１４ａａ、１５ａａ、１６ａａ、１７ａａ、１８ａａ、１９ａａ、２０ａａ、２１ａａ、２２ａａ、２３ａａ、２４ａａ、または２５ａａ、長さが４～２０アミノ酸、６～１８アミノ酸、８～１５アミノ酸、８～１２アミノ酸、５～１０アミノ酸、１０～２０アミノ酸、及び１５～２５アミノ酸の範囲内を含む）のペプチドである：
ＭＴＰＧＴＱＳＰＦＦ ＬＬＬＬＬＴＶＬＴＶ ＶＴＧＳＧＨＡＳＳＴ ＰＧＧＥＫＥＴＳＡＴ ＱＲＳＳＶＰＳＳＴＥ ＫＮＡＦＮＳＳＬＥＤ ＰＳＴＤＹＹＱＥＬＱ ＲＤＩＳＥＭＡＶＣＱ ＣＲＲＫＮＹＧＱＬＤ ＩＦＰＡＲＤＴＹＨＰ ＭＳＥＹＰＴＹＨＴＨ ＧＲＹＶＰＰＳＳＴＤ ＲＳＰＹＥＫＶＳＡＧ ＮＧＧＳＳＬＳＹＴＮ ＰＡＶＡＡＴＳＡＮＬ（配列番号５７７）。
一部の例では、好適なＭＵＣ１ペプチドは、 以下のＨｏｍｏ ｓａｐｉｅｎｓ ＭＵＣ１アイソフォーム７アミノ酸配列に対して少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＵＣ１ポリペプチドの少なくとも４アミノ酸長、例えば４アミノ酸～約２５アミノ酸（例えば、４アミノ酸（ａａ）、５ａａ、６ａａ、７ａａ、８ａａ、９ａａ、１０ａａ、１１ａａ、１２ａａ、１３ａａ、１４ａａ、１５ａａ、１６ａａ、１７ａａ、１８ａａ、１９ａａ、２０ａａ、２１ａａ、２２ａａ、２３ａａ、２４ａａ、または２５ａａ、長さが４～２０アミノ酸、６～１８アミノ酸、８～１５アミノ酸、８～１２アミノ酸、５～１０アミノ酸、１０～２０アミノ酸、及び１５～２５アミノ酸の範囲内を含む）のペプチドである：
ＭＴＰＧＴＱＳＰＦＦ ＬＬＬＬＬＴＶＬＴＡ ＴＴＡＰＫＰＡＴＶＶ ＴＧＳＧＨＡＳＳＴＰ ＧＧＥＫＥＴＳＡＴＱ ＲＳＳＶＰＳＳＴＥＫ ＮＡＦＮＳＳＬＥＤＰ ＳＴＤＹＹＱＥＬＱＲ ＤＩＳＥＭＡＶＣＱＣ ＲＲＫＮＹＧＱＬＤＩ ＦＰＡＲＤＴＹＨＰＭ ＳＥＹＰＴＹＨＴＨＧ ＲＹＶＰＰＳＳＴＤＲ ＳＰＹＥＫＶＳＡＧＮ ＧＧＳＳＬＳＹＴＮＰ ＡＶＡＡＴＳＡＮＬ（配列番号５７８）。
一部の例では、好適なＭＵＣ１ペプチドは、 以下のＨｏｍｏ ｓａｐｉｅｎｓ ＭＵＣ１アイソフォーム８アミノ酸配列に対して少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＵＣ１ポリペプチドの少なくとも４アミノ酸長、例えば４アミノ酸～約２５アミノ酸（例えば、４アミノ酸（ａａ）、５ａａ、６ａａ、７ａａ、８ａａ、９ａａ、１０ａａ、１１ａａ、１２ａａ、１３ａａ、１４ａａ、１５ａａ、１６ａａ、１７ａａ、１８ａａ、１９ａａ、２０ａａ、２１ａａ、２２ａａ、２３ａａ、２４ａａ、または２５ａａ、長さが４～２０アミノ酸、６～１８アミノ酸、８～１５アミノ酸、８～１２アミノ酸、５～１０アミノ酸、１０～２０アミノ酸、及び１５～２５アミノ酸の範囲内を含む）のペプチドである：
ＭＴＰＧＴＱＳＰＦＦ ＬＬＬＬＬＴＶＬＴＶ ＶＴＧＳＧＨＡＳＳＴ ＰＧＧＥＫＥＴＳＡＴ ＱＲＳＳＶＰＳＳＴＥ ＫＮＡＩＰＡＰＴＴＴ ＫＳＣＲＥＴＦＬＫＣ ＦＣＲＦＩＮＫＧＶＦ ＷＡＳＰＩＬＳＳＶＷ ＧＷＧＡＲＬＧＨＲＡ ＡＧＡＧＬＣＳＧＣＡ ＧＨＣＬＳＨＣＬＧＣ ＬＳＶＰＰＫＥＬＲＡ ＡＧＨＬＳＳＰＧＹＬ ＰＳＹＥＲＶＰＨＬＰ ＨＰＷＡＬＣＡＰ（配列番号５７９）。
一部の例では、好適なＭＵＣ１ペプチドは、 以下のＨｏｍｏ ｓａｐｉｅｎｓ ＭＵＣ１アイソフォーム９アミノ酸配列に対して少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＵＣ１ポリペプチドの少なくとも４アミノ酸長、例えば４アミノ酸～約２５アミノ酸（例えば、４アミノ酸（ａａ）、５ａａ、６ａａ、７ａａ、８ａａ、９ａａ、１０ａａ、１１ａａ、１２ａａ、１３ａａ、１４ａａ、１５ａａ、１６ａａ、１７ａａ、１８ａａ、１９ａａ、２０ａａ、２１ａａ、２２ａａ、２３ａａ、２４ａａ、または２５ａａ、長さが４～２０アミノ酸、６～１８アミノ酸、８～１５アミノ酸、８～１２アミノ酸、５～１０アミノ酸、１０～２０アミノ酸、及び１５～２５アミノ酸の範囲内を含む）のペプチドである：
ＭＴＰＧＴＱＳＰＦＦ ＬＬＬＬＬＴＶＬＴＶ ＶＴＧＳＧＨＡＳＳＴ ＰＧＧＥＫＥＴＳＡＴ ＱＲＳＳＶＰＳＳＴＥ ＫＮＡＶＳＭＴＳＳＶ ＬＳＳＨＳＰＧＳＧＳ ＳＴＴＱＧＱＤＶＴＬ ＡＰＡＴＥＰＡＳＧＳ ＡＡＴＷＧＱＤＶＴＳ ＶＰＶＴＲＰＡＬＧＳ ＴＴＰＰＡＨＤＶＴＳ ＡＰＤＮＫＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳ ＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳ ＡＰＤＮＲＰＡＬＧＳ ＴＡＰＰＶＨＮＶＴＳ ＡＳＧＳＡＳＧＳＡＳ ＴＬＶＨＮＧＴＳＡＲ ＡＴＴＴＰＡＳＫＳＴ ＰＦＳＩＰＳＨＨＳＤ ＴＰＴＴＬＡＳＨＳＴ ＫＴＤＡＳＳＴＨＨＳ ＴＶＰＰＬＴＳＳＮＨ ＳＴＳＰＱＬＳＴＧＶ ＳＦＦＦＬＳＦＨＩＳ ＮＬＱＦＮＳＳＬＥＤ ＰＳＴＤＹＹＱＥＬＱ ＲＤＩＳＥＭＦＬＱＩ ＹＫＱＧＧＦＬＧＬＳ ＮＩＫＦＲＰＧＳＶＶ ＶＱＬＴＬＡＦＲＥＧ ＴＩＮＶＨＤＶＥＴＱ ＦＮＱＹＫＴＥＡＡＳ ＲＹＮＬＴＩＳＤＶＳ ＶＳＤＶＰＦＰＦＳＡ ＱＳＧＡＧＶＰＧＷＧ ＩＡＬＬＶＬＶＣＶＬ ＶＡＬＡＩＶＹＬＩＡ ＬＡＶＣＱＣＲＲＫＮ ＹＧＱＬＤＩＦＰＡＲ ＤＴＹＨＰＭＳＥＹＰ ＴＹＨＴＨＧＲＹＶＰ ＰＳＳＴＤＲＳＰＹＥ ＫＶＳＡＧＮＧＧＳＳ ＬＳＹＴＮＰＡＶＡＡ ＴＳＡＮＬ（配列番号５８０）。
一部の例では、好適なＭＵＣ１ペプチドは、 以下のＨｏｍｏ ｓａｐｉｅｎｓ ＭＵＣ１アイソフォーム１１アミノ酸配列に対して少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＵＣ１ポリペプチドの少なくとも４アミノ酸長、例えば４アミノ酸～約２５アミノ酸（例えば、４アミノ酸（ａａ）、５ａａ、６ａａ、７ａａ、８ａａ、９ａａ、１０ａａ、１１ａａ、１２ａａ、１３ａａ、１４ａａ、１５ａａ、１６ａａ、１７ａａ、１８ａａ、１９ａａ、２０ａａ、２１ａａ、２２ａａ、２３ａａ、２４ａａ、または２５ａａ、長さが４～２０アミノ酸、６～１８アミノ酸、８～１５アミノ酸、８～１２アミノ酸、５～１０アミノ酸、１０～２０アミノ酸、及び１５～２５アミノ酸の範囲内を含む）のペプチドである：
ＭＴＰＧＴＱＳＰＦＦ ＬＬＬＬＬＴＶＬＴＡ ＴＴＡＰＫＰＡＴＶＶ ＴＧＳＧＨＡＳＳＴＰ ＧＧＥＫＥＴＳＡＴＱ ＲＳＳＶＰＳＳＴＥＫ ＮＡＬＳＴＧＶＳＦＦ ＦＬＳＦＨＩＳＮＬＱ ＦＮＳＳＬＥＤＰＳＴ ＤＹＹＱＥＬＱＲＤＩ ＳＥＭＦＬＱＩＹＫＱ ＧＧＦＬＧＬＳＮＩＫ ＦＲＰＧＳＶＶＶＱＬ ＴＬＡＦＲＥＧＴＩＮ ＶＨＤＶＥＴＱＦＮＱ ＹＫＴＥＡＡＳＲＹＮ ＬＴＩＳＤＶＳＶＳＤ ＶＰＦＰＦＳＡＱＳＧ ＡＧＶＰＧＷＧＩＡＬ ＬＶＬＶＣＶＬＶＡＬ ＡＩＶＹＬＩＡＬＡＶ ＣＱＣＲＲＫＮＹＧＱ ＬＤＩＦＰＡＲＤＴＹ ＨＰＭＳＥＹＰＴＹＨ ＴＨＧＲＹＶＰＰＳＳ ＴＤＲＳＰＹＥＫＶＳ ＡＧＮＧＧＳＳＬＳＹ ＴＮＰＡＶＡＡＴＳＡ ＮＬ（配列番号５８１）。
一部の例では、好適なＭＵＣ１ペプチドは、 以下のＨｏｍｏ ｓａｐｉｅｎｓ ＭＵＣ１アイソフォーム１２アミノ酸配列に対して少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＵＣ１ポリペプチドの少なくとも４アミノ酸長、例えば４アミノ酸～約２５アミノ酸（例えば、４アミノ酸（ａａ）、５ａａ、６ａａ、７ａａ、８ａａ、９ａａ、１０ａａ、１１ａａ、１２ａａ、１３ａａ、１４ａａ、１５ａａ、１６ａａ、１７ａａ、１８ａａ、１９ａａ、２０ａａ、２１ａａ、２２ａａ、２３ａａ、２４ａａ、または２５ａａ、長さが４～２０アミノ酸、６～１８アミノ酸、８～１５アミノ酸、８～１２アミノ酸、５～１０アミノ酸、１０～２０アミノ酸、及び１５～２５アミノ酸の範囲内を含む）のペプチドである：
ＭＴＰＧＴＱＳＰＦＦ ＬＬＬＬＬＴＶＬＴＡ ＴＴＡＰＫＰＡＴＶＶ ＴＧＳＧＨＡＳＳＴＰ ＧＧＥＫＥＴＳＡＴＱ ＲＳＳＶＰＳＳＴＥＫ ＮＡＦＮＳＳＬＥＤＰ ＳＴＤＹＹＱＥＬＱＲ ＤＩＳＥＭＦＬＱＩＹ ＫＱＧＧＦＬＧＬＳＮ ＩＫＦＲＰＧＳＶＶＶ ＱＬＴＬＡＦＲＥＧＴ ＩＮＶＨＤＶＥＴＱＦ ＮＱＹＫＴＥＡＡＳＲ ＹＮＬＴＩＳＤＶＳＶ ＷＧＷＧＡＲＬＧＨＲ ＡＡＧＡＧＬＣＳＧＣ ＡＧＨＣＬＳＨＣＬＧ ＣＬＳＶＰＰＫＥＬＲ ＡＡＧＨＬＳＳＰＧＹ ＬＰＳＹＥＲＶＰＨＬ ＰＨＰＷＡＬＣＡＰ（配列番号５８２）。
一部の例では、好適なＭＵＣ１ペプチドは、 以下のＨｏｍｏ ｓａｐｉｅｎｓ ＭＵＣ１アイソフォーム１３アミノ酸配列に対して少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＵＣ１ポリペプチドの少なくとも４アミノ酸長、例えば４アミノ酸～約２５アミノ酸（例えば、４アミノ酸（ａａ）、５ａａ、６ａａ、７ａａ、８ａａ、９ａａ、１０ａａ、１１ａａ、１２ａａ、１３ａａ、１４ａａ、１５ａａ、１６ａａ、１７ａａ、１８ａａ、１９ａａ、２０ａａ、２１ａａ、２２ａａ、２３ａａ、２４ａａ、または２５ａａ、長さが４～２０アミノ酸、６～１８アミノ酸、８～１５アミノ酸、８～１２アミノ酸、５～１０アミノ酸、１０～２０アミノ酸、及び１５～２５アミノ酸の範囲内を含む）のペプチドである：
ＭＴＰＧＴＱＳＰＦＦ ＬＬＬＬＬＴＶＬＴＡ ＴＴＡＰＫＰＡＴＶＶ ＴＧＳＧＨＡＳＳＴＰ ＧＧＥＫＥＴＳＡＴＱ ＲＳＳＶＰＳＳＴＥＫ ＮＡＩＹＫＱＧＧＦＬ ＧＬＳＮＩＫＦＲＰＧ ＳＶＶＶＱＬＴＬＡＦ ＲＥＧＴＩＮＶＨＤＶ ＥＴＱＦＮＱＹＫＴＥ ＡＡＳＲＹＮＬＴＩＳ ＤＶＳＶＳＤＶＰＦＰ ＦＳＡＱＳＧＡＧＶＰ ＧＷＧＩＡＬＬＶＬＶ ＣＶＬＶＡＬＡＩＶＹ ＬＩＡＬＡＶＣＱＣＲ ＲＫＮＹＧＱＬＤＩＦ ＰＡＲＤＴＹＨＰＭＳ ＥＹＰＴＹＨＴＨＧＲ ＹＶＰＰＳＳＴＤＲＳ ＰＹＥＫＶＳＡＧＮＧ ＧＳＳＬＳＹＴＮＰＡ ＶＡＡＴＳＡＮＬ（配列番号５８３）。
一部の例では、好適なＭＵＣ１ペプチドは、 以下のＨｏｍｏ ｓａｐｉｅｎｓ ＭＵＣ１アイソフォーム１４アミノ酸配列に対して少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＵＣ１ポリペプチドの少なくとも４アミノ酸長、例えば４アミノ酸～約２５アミノ酸（例えば、４アミノ酸（ａａ）、５ａａ、６ａａ、７ａａ、８ａａ、９ａａ、１０ａａ、１１ａａ、１２ａａ、１３ａａ、１４ａａ、１５ａａ、１６ａａ、１７ａａ、１８ａａ、１９ａａ、２０ａａ、２１ａａ、２２ａａ、２３ａａ、２４ａａ、または２５ａａ、長さが４～２０アミノ酸、６～１８アミノ酸、８～１５アミノ酸、８～１２アミノ酸、５～１０アミノ酸、１０～２０アミノ酸、及び１５～２５アミノ酸の範囲内を含む）のペプチドである：
ＭＴＰＧＴＱＳＰＦＦ ＬＬＬＬＬＴＶＬＴＧ ＧＥＫＥＴＳＡＴＱＲ ＳＳＶＰＳＳＴＥＫＮ ＡＩＹＫＱＧＧＦＬＧ ＬＳＮＩＫＦＲＰＧＳ ＶＶＶＱＬＴＬＡＦＲ ＥＧＴＩＮＶＨＤＶＥ ＴＱＦＮＱＹＫＴＥＡ ＡＳＲＹＮＬＴＩＳＤ ＶＳＶＳＤＶＰＦＰＦ ＳＡＱＳＧＡＧＶＰＧ ＷＧＩＡＬＬＶＬＶＣ ＶＬＶＡＬＡＩＶＹＬ ＩＡＬＡＶＣＱＣＲＲ ＫＮＹＧＱＬＤＩＦＰ ＡＲＤＴＹＨＰＭＳＥ ＹＰＴＹＨＴＨＧＲＹ ＶＰＰＳＳＴＤＲＳＰ ＹＥＫＶＳＡＧＮＧＧ ＳＳＬＳＹＴＮＰＡＶ ＡＡＴＳＡＮＬ（配列番号５８４）。
一部の例では、好適なＭＵＣ１ペプチドは、 以下のＨｏｍｏ ｓａｐｉｅｎｓ ＭＵＣ１アイソフォーム１５アミノ酸配列に対して少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＭＵＣ１ポリペプチドの少なくとも４アミノ酸長、例えば４アミノ酸～約２５アミノ酸（例えば、４アミノ酸（ａａ）、５ａａ、６ａａ、７ａａ、８ａａ、９ａａ、１０ａａ、１１ａａ、１２ａａ、１３ａａ、１４ａａ、１５ａａ、１６ａａ、１７ａａ、１８ａａ、１９ａａ、２０ａａ、２１ａａ、２２ａａ、２３ａａ、２４ａａ、または２５ａａ、長さが４～２０アミノ酸、６～１８アミノ酸、８～１５アミノ酸、８～１２アミノ酸、５～１０アミノ酸、１０～２０アミノ酸、及び１５～２５アミノ酸の範囲内を含む）のペプチドである：
ＭＴＰＧＴＱＳＰＦＦ ＬＬＬＬＬＴＶＬＴＡ ＴＴＡＰＫＰＡＴＶＶ ＴＧＳＧＨＡＳＳＴＰ ＧＧＥＫＥＴＳＡＴＱ ＲＳＳＶＰＳＳＴＥＫ ＮＡＦＬＱＩＹＫＱＧ ＧＦＬＧＬＳＮＩＫＦ ＲＰＧＳＶＶＶＱＬＴ ＬＡＦＲＥＧＴＩＮＶ ＨＤＶＥＴＱＦＮＱＹ ＫＴＥＡＡＳＲＹＮＬ ＴＩＳＤＶＳＶＳＤＶ ＰＦＰＦＳＡＱＳＧＡ ＧＶＰＧＷＧＩＡＬＬ ＶＬＶＣＶＬＶＡＬＡ ＩＶＹＬＩＡＬＡＶＣ ＱＣＲＲＫＮＹＧＱＬ ＤＩＦＰＡＲＤＴＹＨ ＰＭＳＥＹＰＴＹＨＴ ＨＧＲＹＶＰＰＳＳＴ ＤＲＳＰＹＥＫＶＳＡ ＧＮＧＧＳＳＬＳＹＴ ＮＰＡＶＡＡＴＳＡＮ Ｌ（配列番号５８５）。
好適なＭＵＣ１ペプチドの非限定的な例としては、ｉ）ＳＴＡＰＰＡＨＧＶ（配列番号５８６）、ｉｉ）ＳＴＡＰＰＶＨＮＶ（配列番号５８７）、ｉｉｉ）ＳＬＡＰＰＶＨＮＶ（配列番号５８８）、ｉｖ）ＳＬＡＰＰＡＨＧＶ（配列番号５８９）、ｖ）ＳＡＰＤＴＲＰＡＰ（配列番号５９０）、ｖｉ）ＶＴＳＡＰＤＴＲＰＡＰＧＳＴＡＰＰＡＨＧ（配列番号５９１）、ｖｉｉ）ＰＤＴＲＰＡＰＧＳＴＡＰＰＡＨＧＶＴＳＡ（配列番号５９２）、及びｖｉｉｉ）ＬＬＬＬＴＶＬＴＶ（配列番号５９３）が挙げられる。
一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するＭＵＣ１ペプチドは、ＨＬＡ－Ａ、ＨＬＡ－Ｂ、ＨＬＡ－Ｃ、ＨＬＡ－Ｅ、ＨＬＡ－Ｆ、またはＨＬＡ－Ｇ対立遺伝子に特異的なエピトープを提示する。一実施形態では、ＴＭＭＰ内に存在するＭＵＣ１ペプチドは、ＨＬＡ－Ａ＊０１０１，Ａ＊０２０１、Ａ＊０３０１、Ａ＊１１０１、Ａ＊２３０１、Ａ＊２４０２、Ａ＊２４０７、Ａ＊３３０３、及び／またはＡ＊３４０１に限定されるエピトープを提示する。一実施形態では、ＴＭＭＰ内に存在するエピトープペプチドは、ＨＬＡ－ Ｂ＊０７０２、Ｂ＊０８０１、Ｂ＊１５０２、Ｂ＊３８０２、Ｂ＊４００１、Ｂ＊４６０１、及び／またはＢ＊５３０１に限定されるエピトープを提示する。一実施形態では、ＴＭＭＰ内に存在するエピトープペプチドは、Ｃ＊０１０２、Ｃ＊０３０３、Ｃ＊０３０４、Ｃ＊０４０１、Ｃ＊０６０２、Ｃ＊０７０１、Ｃ＊７０２、Ｃ＊０８０１、及び／またはＣ＊１５０２に限定されるエピトープを提示する。
一例として、ＭＵＣ１ペプチドＳＴＡＰＰＡＨＧＶ（配列番号５８６）は、β２Ｍポリペプチド及びＡ＊１１０１ ＨＬＡ－Ａ重鎖を含むＨＬＡ複合体に結合するとエピトープを提示する。別の例としては、ＭＵＣ１ペプチドＳＴＡＰＰＡＨＧＶ（配列番号５８６）は、β２Ｍポリペプチド及びＡ＊０２０１ ＨＬＡ－Ａ重鎖を含むＨＬＡ複合体に結合するとエピトープを提示する。別の例としては、ＭＵＣ１ペプチドＳＴＡＰＰＶＨＮＶ（配列番号５８７）は、β２Ｍポリペプチド及びＡ＊０２０１ ＨＬＡ－Ａ重鎖を含むＨＬＡ複合体に結合するとエピトープを提示する。別の例としては、ＭＵＣ１ペプチドＳＬＡＰＰＶＨＮＶ（配列番号５８８）は、β２Ｍポリペプチド及びＡ＊０２０１ ＨＬＡ－Ａ重鎖を含むＨＬＡ複合体に結合するとエピトープを提示する。別の例としては、ＭＵＣ１ペプチドＳＬＡＰＰＡＨＧＶ（配列番号５８９）は、β２Ｍポリペプチド及びＡ＊０２０１ ＨＬＡ－Ａ重鎖を含むＨＬＡ複合体に結合するとエピトープを提示する。
ＨＬＡ／ペプチド結合アッセイ
所与のペプチド（例えば、ＭＵＣ１エピトープを含むＭＵＣ１ペプチド）がクラスＩ ＨＬＡ（ＨＬＡ重鎖及びβ２Ｍポリペプチドを含む）に結合するかどうか、ならびにＨＬＡ複合体に結合すると、ＴＣＲに効果的にエピトープを提示することができるかどうかは、いくつかの周知の方法のうちのいずれかを使用して決定することができる。アッセイとしては、結合アッセイ及びＴ細胞活性化アッセイが挙げられる。
細胞ベースの結合アッセイ
一例として、細胞ベースのペプチド誘導安定化アッセイを使用して、ペプチド－ＨＬＡクラスＩ結合を決定することができる。このアッセイでは、目的のペプチドは、ＴＡＰ欠損細胞、すなわち、抗原処理関連トランスポーター（ＴＡＰ）機構に欠陥を有する細胞に結合することができ、その結果、表面クラスＩ分子にほとんど結合しない。このような細胞としては、例えば、ヒトＴ２細胞株（Ｔ２（１７４×ＣＥＭ．Ｔ２；Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｔｙｐｅ Ｃｕｌｔｕｒｅ Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ（ＡＴＣＣ）Ｎｏ．ＣＲＬ－１９９２）が挙げられる。Ｈｅｎｄｅｒｓｏｎ ｅｔ ａｌ．（１９９２）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２５５：１２６４。細胞質ペプチドの小胞体内への効率的なＴＡＰ媒介輸送がなければ、組み立てられたクラスＩ複合体は構造的に不安定であり、細胞表面に一過性に保持されるだけである。しかしながら、Ｔ２細胞をクラスＩに結合可能な外因性ペプチドと共にインキュベートすると、表面ペプチド－ＨＬＡクラスＩ複合体が安定化され、フローサイトメトリーによって、例えば、汎抗クラスＩモノクローナル抗体で検出することができる。ペプチドの添加による細胞表面上のペプチド－ＨＬＡ複合体の安定化及び結果としての寿命の増加は、それらの同一性を検証する。例えば、汎ＨＬＡクラスＩ抗体が蛍光標識を含む場合、フローサイトメトリーを使用して、分析を実行することができる。ペプチドの様々な対立遺伝子形態のＨＬＡ Ｈ鎖への結合は、目的の対立遺伝子ＨＬＡ Ｈ鎖を発現するようにＴ２細胞を遺伝子修飾することによって試験することができる。
以下は、ＨＬＡ Ａ＊０２０１へのペプチド結合を評価するためのＴ２アッセイの使用の非限定的な例である。Ｔ２細胞を細胞培養培地で洗浄し、１０６細胞／ｍｌまで濃縮した。目的のペプチドを細胞培養培地において調製し、連続希釈して、２００μＭ、１００μＭ、２０μＭ及び２μＭの濃度を得る。細胞を各ペプチド希釈液と１：１で混合し、最終体積２００μＬ、ならびに最終ペプチド濃度１００μＭ、５０μＭ、１０μＭ、及び１μＭを得る。ＨＬＡ Ａ＊０２０１結合ペプチド、ＧＩＬＧＦＶＦＴＬ、及び非ＨＬＡ Ａ＊０２０１限定ペプチド、ＨＰＶＧＥＡＤＹＦ（ＨＬＡ－Ｂ＊３５０１）は、それぞれ、陽性対照及び陰性対照として含まれる。細胞／ペプチド混合物を３７℃、５％ＣＯ２で１０分間保持し、次いで室温で一晩インキュベートする。次いで、細胞を３７℃で２時間インキュベートし、蛍光標識された抗ヒトＨＬＡ抗体で染色する。細胞をリン酸緩衝生理食塩水で２回洗浄し、フローサイトメトリーを使用して分析する。抗ＨＬＡ抗体染色の平均蛍光強度（ＭＦＩ）を使用して結合の強度を測定する。
生化学的結合アッセイ
ＨＬＡポリペプチド（β２Ｍポリペプチドと複合体化されたＨＬＡ重鎖ポリペプチド）は、無細胞ｉｎ ｖｉｔｒｏアッセイ系において目的のペプチドへの結合について試験され得る。例えば、標識された参照ペプチド（例えば、蛍光標識された）を、ＨＬＡポリペプチド（β２Ｍポリペプチドと複合体化されたＨＬＡ重鎖ポリペプチド）に結合させて、ＨＬＡ参照ペプチド複合体を形成する。目的の試験ペプチドがＨＬＡ参照ペプチド複合体から標識された参照ペプチドを置換する能力を試験する。相対結合親和性は、結合した参照ペプチドを置換するために必要な試験ペプチドの量として計算される。例えば、ｖａｎ ｄｅｒ Ｂｕｒｇ ｅｔ ａｌ．（１９９５）Ｈｕｍａｎ Ｉｍｍｕｎｏｌ．４４：１８９を参照されたい。
別の例として、目的のペプチドは、ＨＬＡ分子（β２Ｍポリペプチドと複合体化されたＨＬＡ重鎖）とインキュベートされ得、ＨＬＡ／ペプチド複合体の安定化は、イムノアッセイ形式で測定され得る。目的のペプチドがＨＬＡ分子を安定化する能力を、既知のＴ細胞エピトープを提示する対照ペプチドと比較する。安定化の検出は、抗ＨＬＡ抗体を使用して検出されたＨＬＡ／ペプチド複合体の天然コンフォメーションの存在または不在に基づいている。例えば、Ｗｅｓｔｒｏｐ ｅｔ ａｌ．（２００９）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ ３４１：７６、Ｓｔｅｉｎｉｔｚ ｅｔ ａｌ．（２０１２）Ｂｌｏｏｄ １１９：４０７３、及び米国特許第９，２０５，１４４号を参照されたい。
Ｔ細胞活性化アッセイ
所与のペプチドがクラスＩ ＨＬＡ（ＨＬＡ重鎖及びβ２Ｍポリペプチドを含む）に結合するかどうか、ならびにＨＬＡ複合体に結合すると、ＴＣＲにエピトープを効果的に提示することができるかどうかは、ペプチド－ＨＬＡ複合体に対するＴ細胞応答を評価することによって決定され得る。測定され得るＴ細胞応答は、例えば、インターフェロン－ガンマ（ＩＦＮγ）産生、細胞傷害活性などを含む。
ＥＬＩＳＰＯＴアッセイ
好適なアッセイとしては、例えば、酵素結合免疫スポット（ＥＬＩＳＰＯＴ）アッセイが挙げられる。このアッセイでは、ＣＤ８＋Ｔ細胞によるＩＦＮγの産生を、ＨＬＡクラスＩと複合体化された目的のペプチドを提示する抗原提示細胞（ＡＰＣ）で追跡して測定する。ＩＦＮγに対する抗体は、マルチウェルプレートのウェル上に固定化される。ＡＰＣをウェルに添加し、ペプチドがＡＰＣの表面上のＨＬＡクラスＩに結合するように、目的のペプチドと一定期間インキュベートする。ペプチドに特異的なＣＤ８＋Ｔ細胞をウェルに添加し、プレートを約２４時間インキュベートする。次いで、ウェルを洗浄し、固定化された抗ＩＦＮγ抗体に結合した任意のＩＦＮγを、検出可能に標識された抗ＩＦＮγ抗体を使用して検出する。比色アッセイを使用することができる。例えば、検出可能に標識された抗ＩＦＮγ抗体は、例えば、アルカリホスファターゼにコンジュゲートされたストレプトアビジンを使用して検出され得る、ビオチン標識された抗ＩＦＮγ抗体であり得る。ＢＣＩＰ／ＮＢＴ（５－ブロモ－４－クロロ－３－インドリルホスフェート／ニトロブルーテトラゾリウム）溶液を添加し、アッセイを展開する。ＩＦＮγ分泌Ｔ細胞の存在は、有色斑によって特定される。陰性対照には、ペプチドと接触していないＡＰＣが含まれる。様々なＨＬＡ Ｈ鎖対立遺伝子を発現するＡＰＣを使用して、目的のペプチドが特定のＨＬＡ Ｈ鎖を含むＨＬＡクラスＩ分子に効果的に結合するかどうかを決定することができる。
細胞傷害性アッセイ
所与のペプチドが特定のＨＬＡクラスＩ Ｈ鎖に結合するかどうか、及びＨ鎖を含むＨＬＡクラスＩ複合体に結合すると、エピトープをＴＣＲに効果的に提示することができるかどうかも、細胞傷害性アッセイを用いて決定することができる。細胞傷害性アッセイは、細胞傷害性ＣＤ８＋Ｔ細胞と共に標的細胞をインキュベートすることを伴う。標的細胞は、その表面上に、目的のペプチドを含むペプチド／ＨＬＡクラスＩ複合体、及び試験されるＨＬＡ Ｈ鎖を含むＨＬＡクラスＩ分子を提示する。標的細胞は、例えば、５１Ｃｒで放射性標識され得る。標的細胞が細胞傷害性ＣＤ８＋Ｔ細胞上のＴＣＲにエピトープを効果的に提示し、それによりＣＤ８＋Ｔ細胞による標的細胞に対する細胞傷害活性を誘導するかどうかが、溶解した標的細胞からの５１Ｃｒの放出を測定することによって決定される。特定の細胞傷害性は、ペプチドの存在下での細胞傷害活性の量から、ペプチドの不在下での細胞傷害活性の量を引いたものとして計算することができる。
ペプチド－ＨＬＡ四量体を用いた抗原特異的Ｔ細胞の検出
別の例として、ペプチド－ＨＬＡ複合体の多量体（例えば、四量体）は、蛍光または重金属タグで生成される。次いで、多量体を使用して、フローサイトメトリー（ＦＡＣＳ）またはマスサイトメトリー（ＣｙＴＯＦ）を介して特定のＴ細胞を特定及び定量化することができる。エピトープ特異的Ｔ細胞の検出は、ペプチド結合ＨＬＡ分子が抗原特異的Ｔ細胞のサブセット上の特異的ＴＣＲに結合することができるという直接的な証拠を提供する。例えば、Ｋｌｅｎｅｒｍａｎ ｅｔ ａｌ．（２００２）Ｎａｔｕｒｅ Ｒｅｖｉｅｗｓ Ｉｍｍｕｎｏｌ．２：２６３を参照されたい。
免疫調節ポリペプチド
一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在する免疫調節ポリペプチドは、野生型免疫調節ポリペプチドである。他の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在する免疫調節ポリペプチドは、共免疫調節ポリペプチドに対する対応する野生型免疫調節ポリペプチドの親和性と比較して、共免疫調節ポリペプチドに対する低い親和性を有するバリアント型免疫調節ポリペプチドである。共免疫調節ドメインに対する低い親和性を示す好適な免疫調節ドメインは、野生型免疫調節ドメインと１アミノ酸（ａａ）～２０ａａの差異を有し得る。例えば、一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するバリアント型免疫調節ポリペプチドは、アミノ酸配列が、対応する野生型免疫調節ポリペプチドと１ａａ、２ａａ、３ａａ、４ａａ、５ａａ、６ａａ、７ａａ、８ａａ、９ａａ、または１０ａａ異なる。別の例として、一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するバリアント型免疫調節ポリペプチドは、アミノ酸配列が、対応する野生型免疫調節ポリペプチドと１１ａａ、１２ａａ、１３ａａ、１４ａａ、１５ａａ、１６ａａ、１７ａａ、１８ａａ、１９ａａ、または２０ａａ異なる。一例として、一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するバリアント型免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０のアミノ酸置換を含む。一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するバリアント型免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、単一のアミノ酸置換を含む。一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するバリアント型免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、２つのアミノ酸置換（例えば、２つ以下のアミノ酸置換）を含む。一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するバリアント型免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、３つのアミノ酸置換（例えば、３つ以下のアミノ酸置換）を含む。一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するバリアント型免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、４つのアミノ酸置換（例えば、４つ以下のアミノ酸置換）を含む。一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するバリアント型免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、５つのアミノ酸置換（例えば、５つ以下のアミノ酸置換）を含む。一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するバリアント型免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、６つのアミノ酸置換（例えば、６つ以下のアミノ酸置換）を含む。一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するバリアント型免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、７つのアミノ酸置換（例えば、７つ以下のアミノ酸置換）を含む。一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するバリアント型免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、８つのアミノ酸置換（例えば、８つ以下のアミノ酸置換）を含む。一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するバリアント型免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、９つのアミノ酸置換（例えば、９つ以下のアミノ酸置換）を含む。一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するバリアント型免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、１０のアミノ酸置換（例えば、１０以下のアミノ酸置換）を含む。
一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するバリアント型免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、１１のアミノ酸置換（例えば、１１以下のアミノ酸置換）を含む。
一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するバリアント型免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、１２のアミノ酸置換（例えば、１２以下のアミノ酸置換）を含む。
一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するバリアント型免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、１３のアミノ酸置換（例えば、１３以下のアミノ酸置換）を含む。
一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するバリアント型免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、１４のアミノ酸置換（例えば、１４以下のアミノ酸置換）を含む。
一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するバリアント型免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、１５のアミノ酸置換（例えば、１５以下のアミノ酸置換）を含む。
一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するバリアント型免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、１６のアミノ酸置換（例えば、１６以下のアミノ酸置換）を含む。
一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するバリアント型免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、１７のアミノ酸置換（例えば、１７以下のアミノ酸置換）を含む。
一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するバリアント型免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、１８のアミノ酸置換（例えば、１８以下のアミノ酸置換）を含む。
一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するバリアント型免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、１９のアミノ酸置換（例えば、１９以下のアミノ酸置換）を含む。
一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するバリアント型免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、２０のアミノ酸置換（例えば、２０以下のアミノ酸置換）を含む。
上述のように、本開示のＴＭＭＰに含めるのに好適なバリアント型免疫調節ポリペプチドは、関連共免疫調節ポリペプチドに対する対応する野生型免疫調節ポリペプチドの親和性と比較して、関連共免疫調節ポリペプチドに対する低い親和性を示す。
免疫調節ポリペプチド及び関連共免疫調節ポリペプチドの例示的な対としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：
ａ）４－１ＢＢＬ（免疫調節ポリペプチド）及び４－１ＢＢ（関連共免疫調節ポリペプチド）、
ｂ）ＰＤ－Ｌ１（免疫調節ポリペプチド）及びＰＤ１（関連共免疫調節ポリペプチド）、
ｃ）ＩＬ－２（免疫調節ポリペプチド）及びＩＬ－２受容体（関連共免疫調節ポリペプチド）、
ｄ）ＣＤ８０（免疫調節ポリペプチド）及びＣＤ８６（関連共免疫調節ポリペプチド）、
ｅ）ＣＤ８６（免疫調節ポリペプチド）及びＣＤ２８（関連共免疫調節ポリペプチド）、
ｆ）ＯＸ４０Ｌ（ＣＤ２５２）（免疫調節ポリペプチド）及びＯＸ４０（ＣＤ１３４）（関連共免疫調節ポリペプチド）、
ｇ）Ｆａｓリガンド（免疫調節ポリペプチド）及びＦａｓ（関連共免疫調節ポリペプチド）、
ｈ）ＩＣＯＳ－Ｌ（免疫調節ポリペプチド）及びＩＣＯＳ（関連共免疫調節ポリペプチド）、
ｉ）ＩＣＡＭ（免疫調節ポリペプチド）及びＬＦＡ－１（関連共免疫調節ポリペプチド）、
ｊ）ＣＤ３０Ｌ（免疫調節ポリペプチド）及びＣＤ３０（関連共免疫調節ポリペプチド）、
ｋ）ＣＤ４０（免疫調節ポリペプチド）及びＣＤ４０Ｌ（関連共免疫調節ポリペプチド）、
ｌ）ＣＤ８３（免疫調節ポリペプチド）及びＣＤ８３Ｌ（関連共免疫調節ポリペプチド）、
ｍ）ＨＶＥＭ（ＣＤ２７０）（免疫調節ポリペプチド）及びＣＤ１６０（関連共免疫調節ポリペプチド）、
ｎ）ＪＡＧ１（ＣＤ３３９）（免疫調節ポリペプチド）及びＮｏｔｃｈ（関連共免疫調節ポリペプチド）、
ｏ）ＪＡＧ１（免疫調節ポリペプチド）及びＣＤ４６（関連共免疫調節ポリペプチド）、
ｐ）ＣＤ８０（免疫調節ポリペプチド）及びＣＴＬＡ４（関連共免疫調節ポリペプチド）、
ｑ）ＣＤ８６（免疫調節ポリペプチド）及びＣＴＬＡ４（関連共免疫調節ポリペプチド）、ならびに
ｒ）ＣＤ７０（免疫調節ポリペプチド）及びＣＤ２７（関連共免疫調節ポリペプチド）。
一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するバリアント型免疫調節ポリペプチドは、関連共免疫調節ポリペプチドに対して、１００ｎＭ～１００μＭの結合親和性を有する。例えば、一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するバリアント型免疫調節ポリペプチドは、関連共免疫調節ポリペプチドに対して、約１００ｎＭ～１５０ｎＭ、約１５０ｎＭ～約２００ｎＭ、約２００ｎＭ～約２５０ｎＭ、約２５０ｎＭ～約３００ｎＭ、約３００ｎＭ～約３５０ｎＭ、約３５０ｎＭ～約４００ｎＭ、約４００ｎＭ～約５００ｎＭ、約５００ｎＭ～約６００ｎＭ、約６００ｎＭ～約７００ｎＭ、約７００ｎＭ～約８００ｎＭ、約８００ｎＭ～約９００ｎＭ、約９００ｎＭ～約１μＭ、約１μＭ～約５μＭ、約５μＭ～約１０μＭ、約１０μＭ～約１５μＭ、約１５μＭ～約２０μＭ、約２０μＭ～約２５μＭ、約２５μＭ～約５０μＭ、約５０μＭ～約７５μＭ、または約７５μＭ～約１００μＭの結合親和性を有する。
本開示のＴＭＭＰ内に存在するバリアント型免疫調節ポリペプチドは、関連共免疫調節ポリペプチドに対する低い親和性を示す。同様に、バリアント型免疫調節ポリペプチドを含む本開示のＴＭＭＰは、関連共免疫調節ポリペプチドに対する低い親和性を示す。したがって、例えば、バリアント型免疫調節ポリペプチドを含む本開示のＴＭＭＰは、関連共免疫調節ポリペプチドに対して、１００ｎＭ～１００μＭの結合親和性を有する。例えば、一部の例では、バリアント型免疫調節ポリペプチドを含む本開示のＴＭＭＰは、関連共免疫調節ポリペプチドに対して、約１００ｎＭ～１５０ｎＭ、約１５０ｎＭ～約２００ｎＭ、約２００ｎＭ～約２５０ｎＭ、約２５０ｎＭ～約３００ｎＭ、約３００ｎＭ～約３５０ｎＭ、約３５０ｎＭ～約４００ｎＭ、約４００ｎＭ～約５００ｎＭ、約５００ｎＭ～約６００ｎＭ、約６００ｎＭ～約７００ｎＭ、約７００ｎＭ～約８００ｎＭ、約８００ｎＭ～約９００ｎＭ、約９００ｎＭ～約１μＭ、約１μＭ～約５μＭ、約５μＭ～約１０μＭ、約１０μＭ～約１５μＭ、約１５μＭ～約２０μＭ、約２０μＭ～約２５μＭ、約２５μＭ～約５０μＭ、約５０μＭ～約７５μＭ、または約７５μＭ～約１００μＭの結合親和性を有する。
図１６に概略的に示されているように、免疫調節ポリペプチド（すなわち、１つ以上の免疫調節ポリペプチド）は、本開示のＴＭＭＰの様々な位置のいずれかに存在することができる。図１６は、バリアント型ＩＬ－２ポリペプチドの２つのコピーの位置を示すが、免疫調節ポリペプチドは、本明細書に記載されるように、様々な免疫調節ポリペプチドのいずれかであり得る。図１６に示されるように、免疫調節ポリペプチドは、１）ＭＨＣクラスＩ重鎖のＮ末端、２）ＭＨＣクラスＩ重鎖のＣ末端及びＩｇ ＦｃポリペプチドのＮ末端、言い換えれば、ＭＨＣクラスＩ重鎖とＩｇ Ｆｃポリペプチドの間、３）Ｉｇ ＦｃポリペプチドのＣ末端、４）ペプチドエピトープのＮ末端、または５）β２ＭポリペプチドのＣ末端であり得る。
ＰＤ－Ｌ１バリアント型
１つの非限定的な例として、一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するバリアント型免疫調節ポリペプチドは、バリアント型ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドである。野生型ＰＤ－Ｌ１はＰＤ１に結合する。
野生型ヒトＰＤ－Ｌ１ポリペプチドは、以下のアミノ酸配列を含み得る：ＭＲＩＦＡＶＦＩＦＭ ＴＹＷＨＬＬＮＡＦＴ ＶＴＶＰＫＤＬＹＶＶ ＥＹＧＳＮＭＴＩＥＣ ＫＦＰＶＥＫＱＬＤＬ ＡＡＬＩＶＹＷＥＭＥ ＤＫＮＩＩＱＦＶＨＧ ＥＥＤＬＫＶＱＨＳＳ ＹＲＱＲＡＲＬＬＫＤ ＱＬＳＬＧＮＡＡＬＱ ＩＴＤＶＫＬＱＤＡＧ ＶＹＲＣＭＩＳＹＧＧ ＡＤＹＫＲＩＴＶＫＶ ＮＡＰＹＮＫＩＮＱＲ ＩＬＶＶＤＰＶＴＳＥ ＨＥＬＴＣＱＡＥＧＹ ＰＫＡＥＶＩＷＴＳＳ ＤＨＱＶＬＳＧＫＴＴ ＴＴＮＳＫＲＥＥＫＬ ＦＮＶＴＳＴＬＲＩＮ ＴＴＴＮＥＩＦＹＣＴ ＦＲＲＬＤＰＥＥＮＨ ＴＡＥＬＶＩＰＧＮＩ ＬＮＶＳＩＫＩＣＬＴ ＬＳＰＳＴ（配列番号１）。
野生型ヒトＰＤ－Ｌ１外部ドメインは、以下のアミノ酸配列を含み得る：ＦＴ ＶＴＶＰＫＤＬＹＶＶ ＥＹＧＳＮＭＴＩＥＣ ＫＦＰＶＥＫＱＬＤＬ ＡＡＬＩＶＹＷＥＭＥ ＤＫＮＩＩＱＦＶＨＧ ＥＥＤＬＫＶＱＨＳＳ ＹＲＱＲＡＲＬＬＫＤ ＱＬＳＬＧＮＡＡＬＱ ＩＴＤＶＫＬＱＤＡＧ ＶＹＲＣＭＩＳＹＧＧ ＡＤＹＫＲＩＴＶＫＶ ＮＡＰＹＮＫＩＮＱＲ ＩＬＶＶＤＰＶＴＳＥ ＨＥＬＴＣＱＡＥＧＹ ＰＫＡＥＶＩＷＴＳＳ ＤＨＱＶＬＳＧＫＴＴ ＴＴＮＳＫＲＥＥＫＬ ＦＮＶＴＳＴＬＲＩＮ ＴＴＴＮＥＩＦＹＣＴ ＦＲＲＬＤＰＥＥＮＨ ＴＡＥＬＶＩＰＧＮＩ ＬＮＶＳＩＫＩ（配列番号２）。
野生型ＰＤ－１ポリペプチドは、以下のアミノ酸配列を含み得る：ＰＧＷＦＬＤＳＰＤＲ ＰＷＮＰＰＴＦＳＰＡ ＬＬＶＶＴＥＧＤＮＡ ＴＦＴＣＳＦＳＮＴＳ ＥＳＦＶＬＮＷＹＲＭ ＳＰＳＮＱＴＤＫＬＡ ＡＦＰＥＤＲＳＱＰＧ ＱＤＣＲＦＲＶＴＱＬ ＰＮＧＲＤＦＨＭＳＶ ＶＲＡＲＲＮＤＳＧＴ ＹＬＣＧＡＩＳＬＡＰ ＫＡＱＩＫＥＳＬＲＡ ＥＬＲＶＴＥＲＲＡＥ ＶＰＴＡＨＰＳＰＳＰ ＲＰＡＧＱＦＱＴＬＶ ＶＧＶＶＧＧＬＬＧＳ ＬＶＬＬＶＷＶＬＡＶ ＩＣＳＲＡＡＲＧＴＩ ＧＡＲＲＴＧＱＰＬＫ ＥＤＰＳＡＶＰＶＦＳ ＶＤＹＧＥＬＤＦＱＷ ＲＥＫＴＰＥＰＰＶＰ ＣＶＰＥＱＴＥＹＡＴ ＩＶＦＰＳＧＭＧＴＳ ＳＰＡＲＲＧＳＡＤＧ ＰＲＳＡＱＰＬＲＰＥ ＤＧＨＣＳＷＰＬ（配列番号３）。一部の例では、本開示のＴＭＭＰがバリアント型ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドを含む場合、「関連共免疫調節ポリペプチド」は、配列番号３のアミノ酸配列を含むＰＤ－１ポリペプチドである。
一部の例では、バリアント型ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドは、配列番号１または配列番号２に示されるアミノ酸配列を含むＰＤ－Ｌ１ポリペプチドの結合親和性と比較して、ＰＤ－１（例えば、配列番号３に示されるアミノ酸配列を含むＰＤ－１ポリペプチド）に対する低い結合親和性を示す。例えば、一部の例では、本開示のバリアント型ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドは、配列番号１もしくは配列番号２に示されるアミノ酸配列を含むＰＤ－Ｌ１ポリペプチドの結合親和性に比べて、少なくとも１０％、少なくとも１５％、少なくとも２０％、少なくとも２５％、少なくとも３０％、少なくとも３５％、少なくとも４０％、少なくとも４５％、少なくとも５０％低い、少なくとも５５％低い、少なくとも６０％低い、少なくとも６５％低い、少なくとも７０％低い、少なくとも７５％低い、少なくとも８０％低い、少なくとも８５％低い、少なくとも９０％低い、少なくとも９５％低い、または９５％超低い結合親和性で、ＰＤ－１（例えば、配列番号３に示されるアミノ酸配列を含むＰＤ－１ポリペプチド）に結合する。
一部の例では、バリアント型ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドは、ＰＤ－１に対して１ｎＭ～１ｍＭの結合親和性を有する。一部の例では、本開示のバリアント型ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドは、ＰＤ－１に対して１００ｎＭ～１００μＭの結合親和性を有する。別の例として、一部の例では、バリアント型ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドは、ＰＤ１（例えば、配列番号３に示されるアミノ酸配列を含むＰＤ１ポリペプチド）に対して、約１００ｎＭ～１５０ｎＭ、約１５０ｎＭ～約２００ｎＭ、約２００ｎＭ～約２５０ｎＭ、約２５０ｎＭ～約３００ｎＭ、約３００ｎＭ～約３５０ｎＭ、約３５０ｎＭ～約４００ｎＭ、約４００ｎＭ～約５００ｎＭ、約５００ｎＭ～約６００ｎＭ、約６００ｎＭ～約７００ｎＭ、約７００ｎＭ～約８００ｎＭ、約８００ｎＭ～約９００ｎＭ、約９００ｎＭ～約１μＭ、約１μＭ～約５μＭ、約５μＭ～約１０μＭ、約１０μＭ～約１５μＭ、約１５μＭ～約２０μＭ、約２０μＭ～約２５μＭ、約２５μＭ～約５０μＭ、約５０μＭ～約７５μＭ、または約７５μＭ～約１００μＭの結合親和性を有する。
一部の例では、バリアント型ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドは、配列番号１または配列番号２に示されるＰＤ－Ｌ１アミノ酸配列と比較して、単一のアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドは、配列番号１または配列番号２に示されるＰＤ－Ｌ１アミノ酸配列と比較して、２～１０のアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドは、配列番号１または配列番号２に示されるＰＤ－Ｌ１アミノ酸配列と比較して、２つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドは、配列番号１または配列番号２に示されるＰＤ－Ｌ１アミノ酸配列と比較して、３つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドは、配列番号１または配列番号２に示されるＰＤ－Ｌ１アミノ酸配列と比較して、４つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドは、配列番号１または配列番号２に示されるＰＤ－Ｌ１アミノ酸配列と比較して、５つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドは、配列番号１または配列番号２に示されるＰＤ－Ｌ１アミノ酸配列と比較して、６つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドは、配列番号１または配列番号２に示されるＰＤ－Ｌ１アミノ酸配列と比較して、７つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドは、配列番号１または配列番号２に示されるＰＤ－Ｌ１アミノ酸配列と比較して、８つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドは、配列番号１または配列番号２に示されるＰＤ－Ｌ１アミノ酸配列と比較して、９つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドは、配列番号１または配列番号２に示されるＰＤ－Ｌ１アミノ酸配列と比較して、１０のアミノ酸置換を有する。
好適なＰＤ－Ｌ１バリアント型は、以下のアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む：
Figure 2022536581000060
、配列中、Ｘは、Ａｓｐ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである。一部の例では、ＸはＡｒｇである。
好適なＰＤ－Ｌ１バリアント型は、以下のアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む：
Figure 2022536581000061
、配列中、Ｘは、Ｉｌｅ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｓｐである。
好適なＰＤ－Ｌ１バリアント型は、以下のアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む：
Figure 2022536581000062
、配列中、Ｘは、Ｇｌｕ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｒｇである。
ＣＤ８０バリアント型
一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するバリアント型免疫調節ポリペプチドは、バリアント型ＣＤ８０ポリペプチドである。野生型ＣＤ８０はＣＤ２８に結合する。野生型ＣＤ８０はＣＤ８６にも結合する。
ヒトＣＤ８０の外部ドメインの野生型アミノ酸配列は、以下のとおりであり得る。
ＶＩＨＶＴＫ ＥＶＫＥＶＡＴＬＳＣ ＧＨＮＶＳＶＥＥＬＡ ＱＴＲＩＹＷＱＫＥＫ ＫＭＶＬＴＭＭＳＧＤ ＭＮＩＷＰＥＹＫＮＲ ＴＩＦＤＩＴＮＮＬＳ ＩＶＩＬＡＬＲＰＳＤ ＥＧＴＹＥＣＶＶＬＫ ＹＥＫＤＡＦＫＲＥＨ ＬＡＥＶＴＬＳＶＫＡ ＤＦＰＴＰＳＩＳＤＦ ＥＩＰＴＳＮＩＲＲＩ ＩＣＳＴＳＧＧＦＰＥ ＰＨＬＳＷＬＥＮＧＥ ＥＬＮＡＩＮＴＴＶＳ ＱＤＰＥＴＥＬＹＡＶ ＳＳＫＬＤＦＮＭＴＴ ＮＨＳＦＭＣＬＩＫＹ ＧＨＬＲＶＮＱＴＦＮ ＷＮＴＴＫＱＥＨＦＰ ＤＮ（配列番号４）。
野生型ＣＤ２８アミノ酸配列は、以下のとおりであり得る。ＭＬＲＬＬＬＡＬＮＬ ＦＰＳＩＱＶＴＧＮＫ ＩＬＶＫＱＳＰＭＬＶ ＡＹＤＮＡＶＮＬＳＣ ＫＹＳＹＮＬＦＳＲＥ ＦＲＡＳＬＨＫＧＬＤ ＳＡＶＥＶＣＶＶＹＧ ＮＹＳＱＱＬＱＶＹＳ ＫＴＧＦＮＣＤＧＫＬ ＧＮＥＳＶＴＦＹＬＱ ＮＬＹＶＮＱＴＤＩＹ ＦＣＫＩＥＶＭＹＰＰ ＰＹＬＤＮＥＫＳＮＧ ＴＩＩＨＶＫＧＫＨＬ ＣＰＳＰＬＦＰＧＰＳ ＫＰＦＷＶＬＶＶＶＧ ＧＶＬＡＣＹＳＬＬＶ ＴＶＡＦＩＩＦＷＶＲ ＳＫＲＳＲＬＬＨＳＤ ＹＭＮＭＴＰＲＲＰＧ ＰＴＲＫＨＹＱＰＹＡ ＰＰＲＤＦＡＡＹＲＳ（配列番号５）。一部の例では、本開示のＴＭＭＰがバリアント型ＣＤ８０ポリペプチドを含む場合、「関連共免疫調節ポリペプチド」は、配列番号５のアミノ酸配列を含むＣＤ２８ポリペプチドである。
野生型ＣＤ２８アミノ酸配列は、以下のとおりであり得る。ＭＬＲＬＬＬＡＬＮＬ ＦＰＳＩＱＶＴＧＮＫ ＩＬＶＫＱＳＰＭＬＶ ＡＹＤＮＡＶＮＬＳＷ ＫＨＬＣＰＳＰＬＦＰ ＧＰＳＫＰＦＷＶＬＶ ＶＶＧＧＶＬＡＣＹＳ ＬＬＶＴＶＡＦＩＩＦ ＷＶＲＳＫＲＳＲＬＬ ＨＳＤＹＭＮＭＴＰＲ ＲＰＧＰＴＲＫＨＹＱ ＰＹＡＰＰＲＤＦＡＡ ＹＲＳ（配列番号６）
野生型ＣＤ２８アミノ酸配列は、以下のとおりであり得る。ＭＬＲＬＬＬＡＬＮＬ ＦＰＳＩＱＶＴＧＫＨ ＬＣＰＳＰＬＦＰＧＰ ＳＫＰＦＷＶＬＶＶＶ ＧＧＶＬＡＣＹＳＬＬ ＶＴＶＡＦＩＩＦＷＶ ＲＳＫＲＳＲＬＬＨＳ ＤＹＭＮＭＴＰＲＲＰ ＧＰＴＲＫＨＹＱＰＹ ＡＰＰＲＤＦＡＡＹＲ Ｓ（配列番号７）。
一部の例では、バリアント型ＣＤ８０ポリペプチドは、ＣＤ２８に対する配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むＣＤ８０ポリペプチドの結合親和性と比較して、ＣＤ２８に対する低い結合親和性を示す。例えば、一部の例では、バリアント型ＣＤ８０ポリペプチドは、ＣＤ２８（例えば、配列番号５、６、もしくは７のうちの１つに示されるアミノ酸配列を含むＣＤ２８ポリペプチド）に対する配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むＣＤ８０ポリペプチドの結合親和性に比べて、少なくとも１０％、少なくとも１５％、少なくとも２０％、少なくとも２５％、少なくとも３０％、少なくとも３５％、少なくとも４０％、少なくとも４５％、少なくとも５０％低い、少なくとも５５％低い、少なくとも６０％低い、少なくとも６５％低い、少なくとも７０％低い、少なくとも７５％低い、少なくとも８０％低い、少なくとも８５％低い、少なくとも９０％低い、少なくとも９５％低い、または９５％超低い結合親和性で、ＣＤ２８に結合する。
一部の例では、バリアント型ＣＤ８０ポリペプチドは、ＣＤ２８に対して１００ｎＭ～１００μＭの結合親和性を有する。別の例として、一部の例では、本開示のバリアント型ＣＤ８０ポリペプチドは、ＣＤ２８（例えば、配列番号５、配列番号６、または配列番号７に示されるアミノ酸配列を含むＣＤ２８ポリペプチド）に対して、約１００ｎＭ～１５０ｎＭ、約１５０ｎＭ～約２００ｎＭ、約２００ｎＭ～約２５０ｎＭ、約２５０ｎＭ～約３００ｎＭ、約３００ｎＭ～約３５０ｎＭ、約３５０ｎＭ～約４００ｎＭ、約４００ｎＭ～約５００ｎＭ、約５００ｎＭ～約６００ｎＭ、約６００ｎＭ～約７００ｎＭ、約７００ｎＭ～約８００ｎＭ、約８００ｎＭ～約９００ｎＭ、約９００ｎＭ～約１μＭ、約１μＭ～約５μＭ、約５μＭ～約１０μＭ、約１０μＭ～約１５μＭ、約１５μＭ～約２０μＭ、約２０μＭ～約２５μＭ、約２５μＭ～約５０μＭ、約５０μＭ～約７５μＭ、または約７５μＭ～約１００μＭの結合親和性を有する。
一部の例では、バリアント型ＣＤ８０ポリペプチドは、配列番号４に示されるＣＤ８０アミノ酸配列と比較して、単一のアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＣＤ８０ポリペプチドは、配列番号４に示されるＣＤ８０アミノ酸配列と比較して、２～１０のアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＣＤ８０ポリペプチドは、配列番号４に示されるＣＤ８０アミノ酸配列と比較して、２つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＣＤ８０ポリペプチドは、配列番号４に示されるＣＤ８０アミノ酸配列と比較して、３つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＣＤ８０ポリペプチドは、配列番号４に示されるＣＤ８０アミノ酸配列と比較して、４つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＣＤ８０ポリペプチドは、配列番号４に示されるＣＤ８０アミノ酸配列と比較して、５つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＣＤ８０ポリペプチドは、配列番号４に示されるＣＤ８０アミノ酸配列と比較して、６つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＣＤ８０ポリペプチドは、配列番号４に示されるＣＤ８０アミノ酸配列と比較して、７つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＣＤ８０ポリペプチドは、配列番号４に示されるＣＤ８０アミノ酸配列と比較して、８つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＣＤ８０ポリペプチドは、配列番号４に示されるＣＤ８０アミノ酸配列と比較して、９つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＣＤ８０ポリペプチドは、配列番号４に示されるＣＤ８０アミノ酸配列と比較して、１０のアミノ酸置換を有する。
好適なＣＤ８０バリアント型は、以下のアミノ酸配列のうちのいずれか１つに対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む：
Figure 2022536581000063
、配列中、Ｘは、Ａｓｎ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000064
、配列中、Ｘは、Ａｓｎ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000065
、配列中、Ｘは、Ｉｌｅ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000066
、配列中、Ｘは、Ｌｙｓ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000067
、配列中、Ｘは、Ｇｌｎ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000068
、配列中、Ｘは、Ａｓｐ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000069
、配列中、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000070
、配列中、Ｘは、Ｔｙｒ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000071
、配列中、Ｘは、Ｇｌｎ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000072
、配列中、Ｘは、Ｍｅｔ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000073
、配列中、Ｘは、Ｖａｌ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000074
、配列中、Ｘは、Ｉｌｅ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000075
、配列中、Ｘは、Ｔｙｒ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000076
、配列中、Ｘは、Ａｓｐ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000077
、配列中、Ｘは、Ｐｈｅ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000078
、配列中、Ｘは、Ｓｅｒ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；ならびに
Figure 2022536581000079
、配列中、Ｘは、Ｐｒｏ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである。
ＣＤ８６バリアント型
一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するバリアント型免疫調節ポリペプチドは、バリアント型ＣＤ８６ポリペプチドである。野生型ＣＤ８６はＣＤ２８に結合する。一部の例では、本開示のＴＭＭＰがバリアント型ＣＤ８６ポリペプチドを含む場合、「関連共免疫調節ポリペプチド」は、配列番号５のアミノ酸配列を含むＣＤ２８ポリペプチドである。
野生型ヒトＣＤ８６の完全な外部ドメインのアミノ酸配列は、以下のとおりであり得る。
Figure 2022536581000080
野生型ヒトＣＤ８６のＩｇＶドメインのアミノ酸配列は、以下のとおりであり得る。
Figure 2022536581000081
一部の例では、バリアント型ＣＤ８６ポリペプチドは、ＣＤ２８に対する配列番号８または配列番号９に示されるアミノ酸配列を含むＣＤ８６ポリペプチドの結合親和性と比較して、ＣＤ２８に対する低い結合親和性を示す。例えば、一部の例では、バリアント型ＣＤ８６ポリペプチドは、ＣＤ２８（例えば、配列番号５、６、もしくは７のうちの１つに示されるアミノ酸配列を含むＣＤ２８ポリペプチド）に対する配列番号８または配列番号９に示されるアミノ酸配列を含むＣＤ８６ポリペプチドの結合親和性に比べて、少なくとも１０％、少なくとも１５％、少なくとも２０％、少なくとも２５％、少なくとも３０％、少なくとも３５％、少なくとも４０％、少なくとも４５％、少なくとも５０％低い、少なくとも５５％低い、少なくとも６０％低い、少なくとも６５％低い、少なくとも７０％低い、少なくとも７５％低い、少なくとも８０％低い、少なくとも８５％低い、少なくとも９０％低い、少なくとも９５％低い、または９５％超低い結合親和性で、ＣＤ２８に結合する。
一部の例では、バリアント型ＣＤ８６ポリペプチドは、ＣＤ２８に対して１００ｎＭ～１００μＭの結合親和性を有する。別の例として、一部の例では、本開示のバリアント型ＣＤ８６ポリペプチドは、ＣＤ２８（例えば、配列番号５、配列番号５、６，または７のうちの１つに示されるアミノ酸配列を含むＣＤ２８ポリペプチド）に対して、約１００ｎＭ～１５０ｎＭ、約１５０ｎＭ～約２００ｎＭ、約２００ｎＭ～約２５０ｎＭ、約２５０ｎＭ～約３００ｎＭ、約３００ｎＭ～約３５０ｎＭ、約３５０ｎＭ～約４００ｎＭ、約４００ｎＭ～約５００ｎＭ、約５００ｎＭ～約６００ｎＭ、約６００ｎＭ～約７００ｎＭ、約７００ｎＭ～約８００ｎＭ、約８００ｎＭ～約９００ｎＭ、約９００ｎＭ～約１μＭ、約１μＭ～約５μＭ、約５μＭ～約１０μＭ、約１０μＭ～約１５μＭ、約１５μＭ～約２０μＭ、約２０μＭ～約２５μＭ、約２５μＭ～約５０μＭ、約５０μＭ～約７５μＭ、または約７５μＭ～約１００μＭの結合親和性を有する。
一部の例では、バリアント型ＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号８に示されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、単一のアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号８に示されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、２～１０のアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号８に示されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、２つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号８に示されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、３つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号８に示されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、４つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号８に示されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、５つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号８に示されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、６つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号８に示されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、７つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号８に示されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、８つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号８に示されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、９つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号８に示されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、１０のアミノ酸置換を有する。
一部の例では、バリアント型ＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号９に示されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、単一のアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号９に示されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、２～１０のアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号９に示されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、２つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号９に示されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、３つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号９に示されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、４つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号９に示されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、５つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号９に示されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、６つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号９に示されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、７つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号９に示されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、８つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号９に示されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、９つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＣＤ８６ポリペプチドは、配列番号９に示されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、１０のアミノ酸置換を有する。
好適なＣＤ８６バリアント型は、以下のアミノ酸配列のうちのいずれか１つに対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む：
Figure 2022536581000082
、配列中、Ｘは、Ａｓｎ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000083
、配列中、Ｘは、Ａｓｐ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000084
、配列中、Ｘは、Ｔｒｐ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000085
、配列中、Ｘは、Ｈｉｓ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000086
、配列中、Ｘは、Ａｓｎ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000087
、配列中、Ｘは、Ａｓｐ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000088
、配列中、Ｘは、Ｔｒｐ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000089
、配列中、Ｘは、Ｈｉｓ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000090
、配列中、Ｘは、Ｖａｌ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000091
、配列中、Ｘは、Ｖａｌ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000092
、配列中、Ｘは、Ｇｌｎ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000093
、配列中、Ｘは、Ｇｌｎ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000094
、配列中、Ｘは、Ｐｈｅ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000095
、配列中、Ｘは、Ｐｈｅ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000096
、配列中、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000097
、配列中、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000098
、配列中、Ｘは、Ｔｙｒ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000099
、配列中、Ｘは、Ｔｙｒ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000100
、配列中、第１のＸは、Ａｓｎ以外の任意のアミノ酸であり、第２のＸは、Ｈｉｓ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、第１及び第２のＸは両方ともＡｌａである；
Figure 2022536581000101
、配列中、第１のＸは、Ａｓｎ以外の任意のアミノ酸であり、第２のＸは、Ｈｉｓ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、第１及び第２のＸは両方ともＡｌａである；
Figure 2022536581000102
、配列中、Ｘ１は、Ａｓｐ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ２は、Ｈｉｓ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、Ｘ１はＡｌａであり、Ｘ２はＡｌａである；
Figure 2022536581000103
、配列中、第１のＸは、Ａｓｎ以外の任意のアミノ酸であり、第２のＸは、Ｈｉｓ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、第１及び第２のＸは両方ともＡｌａである；
Figure 2022536581000104
、配列中、Ｘ１は、Ａｓｎ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ２は、Ａｓｐ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ３は、Ｈｉｓ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、Ｘ１はＡｌａであり、Ｘ２はＡｌａであり、Ｘ３はＡｌａである；ならびに
Figure 2022536581000105
、配列中、Ｘ１は、Ａｓｎ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ２は、Ａｓｐ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ３は、Ｈｉｓ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、Ｘ１はＡｌａであり、Ｘ２はＡｌａであり、Ｘ３はＡｌａである。
４－１ＢＢＬバリアント型
一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するバリアント型免疫調節ポリペプチドは、バリアント型４－１ＢＢＬポリペプチドである。野生型４－１ＢＢＬは、４－１ＢＢ（ＣＤ１３７）に結合する。
野生型４－１ＢＢＬアミノ酸配列は、以下のとおりであり得る。
Figure 2022536581000106
一部の例では、バリアント型４－１ＢＢＬポリペプチドは、ヒト４－１ＢＢＬの腫瘍壊死因子（ＴＮＦ）相同ドメイン（ＴＨＤ）のバリアント型である。
ヒト４－１ＢＢＬのＴＨＤの野生型アミノ酸配列は、例えば、以下の配列番号１１～１３のうちの１つであり得る。
ＰＡＧＬＬＤＬＲＱＧ ＭＦＡＱＬＶＡＱＮＶ ＬＬＩＤＧＰＬＳＷＹ ＳＤＰＧＬＡＧＶＳＬ ＴＧＧＬＳＹＫＥＤＴ ＫＥＬＶＶＡＫＡＧＶ ＹＹＶＦＦＱＬＥＬＲ ＲＶＶＡＧＥＧＳＧＳ ＶＳＬＡＬＨＬＱＰＬ ＲＳＡＡＧＡＡＡＬＡ ＬＴＶＤＬＰＰＡＳＳ ＥＡＲＮＳＡＦＧＦＱ ＧＲＬＬＨＬＳＡＧＱ ＲＬＧＶＨＬＨＴＥＡ ＲＡＲＨＡＷＱＬＴＱ ＧＡＴＶＬＧＬＦＲＶ ＴＰＥＩＰＡＧＬＰＳ ＰＲＳＥ（配列番号１１）。
Ｄ ＰＡＧＬＬＤＬＲＱＧ ＭＦＡＱＬＶＡＱＮＶ ＬＬＩＤＧＰＬＳＷＹ ＳＤＰＧＬＡＧＶＳＬ ＴＧＧＬＳＹＫＥＤＴ ＫＥＬＶＶＡＫＡＧＶ ＹＹＶＦＦＱＬＥＬＲ ＲＶＶＡＧＥＧＳＧＳ ＶＳＬＡＬＨＬＱＰＬ ＲＳＡＡＧＡＡＡＬＡ ＬＴＶＤＬＰＰＡＳＳ ＥＡＲＮＳＡＦＧＦＱ ＧＲＬＬＨＬＳＡＧＱ ＲＬＧＶＨＬＨＴＥＡ ＲＡＲＨＡＷＱＬＴＱ ＧＡＴＶＬＧＬＦＲＶ ＴＰＥＩＰＡＧＬＰＳ ＰＲＳＥ（配列番号１２）。
Ｄ ＰＡＧＬＬＤＬＲＱＧ ＭＦＡＱＬＶＡＱＮＶ ＬＬＩＤＧＰＬＳＷＹ ＳＤＰＧＬＡＧＶＳＬ ＴＧＧＬＳＹＫＥＤＴ ＫＥＬＶＶＡＫＡＧＶ ＹＹＶＦＦＱＬＥＬＲ ＲＶＶＡＧＥＧＳＧＳ ＶＳＬＡＬＨＬＱＰＬ ＲＳＡＡＧＡＡＡＬＡ ＬＴＶＤＬＰＰＡＳＳ ＥＡＲＮＳＡＦＧＦＱ ＧＲＬＬＨＬＳＡＧＱ ＲＬＧＶＨＬＨＴＥＡ ＲＡＲＨＡＷＱＬＴＱ ＧＡＴＶＬＧＬＦＲＶ ＴＰＥＩＰＡ（配列番号１３）。
野生型４－１ＢＢアミノ酸配列は、以下のとおりであり得る。ＭＧＮＳＣＹＮＩＶＡ ＴＬＬＬＶＬＮＦＥＲ ＴＲＳＬＱＤＰＣＳＮ ＣＰＡＧＴＦＣＤＮＮ ＲＮＱＩＣＳＰＣＰＰ ＮＳＦＳＳＡＧＧＱＲ ＴＣＤＩＣＲＱＣＫＧ ＶＦＲＴＲＫＥＣＳＳ ＴＳＮＡＥＣＤＣＴＰ ＧＦＨＣＬＧＡＧＣＳ ＭＣＥＱＤＣＫＱＧＱ ＥＬＴＫＫＧＣＫＤＣ ＣＦＧＴＦＮＤＱＫＲ ＧＩＣＲＰＷＴＮＣＳ ＬＤＧＫＳＶＬＶＮＧ ＴＫＥＲＤＶＶＣＧＰ ＳＰＡＤＬＳＰＧＡＳ ＳＶＴＰＰＡＰＡＲＥ ＰＧＨＳＰＱＩＩＳＦ ＦＬＡＬＴＳＴＡＬＬ ＦＬＬＦＦＬＴＬＲＦ ＳＶＶＫＲＧＲＫＫＬ ＬＹＩＦＫＱＰＦＭＲ ＰＶＱＴＴＱＥＥＤＧ ＣＳＣＲＦＰＥＥＥＥ ＧＧＣＥＬ（配列番号１４）。一部の例では、本開示のＴＭＭＰがバリアント型４－１ＢＢＬポリペプチドを含む場合、「関連共免疫調節ポリペプチド」は、配列番号１４のアミノ酸配列を含む４－１ＢＢポリペプチドである。
一部の例では、バリアント型４－１ＢＢＬポリペプチドは、配列番号１０～１３のうちの１つに示されるアミノ酸配列を含む４－１ＢＢＬポリペプチドの結合親和性と比較して、４－１ＢＢに対する低い結合親和性を示す。例えば、一部の例では、本開示のバリアント型４－１ＢＢＬポリペプチドは、同じ条件下でアッセイした場合、４－１ＢＢポリペプチド（例えば、配列番号１４に示されるアミノ酸配列を含む４－１ＢＢポリペプチド）に対する配列番号１０～１３のうちの１つに示されるアミノ酸配列を含む４－１ＢＢＬポリペプチドの結合親和性に比べて、少なくとも１０％低い、少なくとも１５％低い、少なくとも２０％低い、少なくとも２５％低い、少なくとも３０％低い、少なくとも３５％低い、少なくとも４０％低い、少なくとも４５％低い、少なくとも５０％低い、少なくとも５５％低い、少なくとも６０％低い、少なくとも６５％低い、少なくとも７０％低い、少なくとも７５％低い、少なくとも８０％低い、少なくとも８５％低い、少なくとも９０％低い、少なくとも９５％低い、または９５％超低い結合親和性で、４－１ＢＢに結合する。
一部の例では、バリアント型４－１ＢＢＬポリペプチドは、４－１ＢＢに対して１００ｎＭ～１００μＭの結合親和性を有する。別の例として、一部の例では、バリアント型４－１ＢＢＬポリペプチドは、４－１ＢＢ（例えば、配列番号１４に示されるアミノ酸配列を含む４－１ＢＢポリペプチド）に対して、約１００ｎＭ～１５０ｎＭ、約１５０ｎＭ～約２００ｎＭ、約２００ｎＭ～約２５０ｎＭ、約２５０ｎＭ～約３００ｎＭ、約３００ｎＭ～約３５０ｎＭ、約３５０ｎＭ～約４００ｎＭ、約４００ｎＭ～約５００ｎＭ、約５００ｎＭ～約６００ｎＭ、約６００ｎＭ～約７００ｎＭ、約７００ｎＭ～約８００ｎＭ、約８００ｎＭ～約９００ｎＭ、約９００ｎＭ～約１μＭ、約１μＭ～約５μＭ、約５μＭ～約１０μＭ、約１０μＭ～約１５μＭ、約１５μＭ～約２０μＭ、約２０μＭ～約２５μＭ、約２５μＭ～約５０μＭ、約５０μＭ～約７５μＭ、または約７５μＭ～約１００μＭの結合親和性を有する。
一部の例では、バリアント型４－１ＢＢＬポリペプチドは、配列番号１０～１３のうちの１つに示される４－１ＢＢＬアミノ酸配列と比較して、単一のアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型４－１ＢＢＬポリペプチドは、配列番号１０～１３のうちの１つに示される４－１ＢＢＬアミノ酸配列と比較して、２～１０のアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型４－１ＢＢＬポリペプチドは、配列番号１０～１３のうちの１つに示される４－１ＢＢＬアミノ酸配列と比較して、２つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型４－１ＢＢＬポリペプチドは、配列番号１０～１３のうちの１つに示される４－１ＢＢＬアミノ酸配列と比較して、３つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型４－１ＢＢＬポリペプチドは、配列番号１０～１３のうちの１つに示される４－１ＢＢＬアミノ酸配列と比較して、４つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型４－１ＢＢＬポリペプチドは、配列番号１０～１３のうちの１つに示される４－１ＢＢＬアミノ酸配列と比較して、５つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型４－１ＢＢＬポリペプチドは、配列番号１０～１３のうちの１つに示される４－１ＢＢＬアミノ酸配列と比較して、６つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型４－１ＢＢＬポリペプチドは、配列番号１０～１３のうちの１つに示される４－１ＢＢＬアミノ酸配列と比較して、７つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型４－１ＢＢＬポリペプチドは、配列番号１０～１３のうちの１つに示される４－１ＢＢＬアミノ酸配列と比較して、８つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型４－１ＢＢＬポリペプチドは、配列番号１０～１３のうちの１つに示される４－１ＢＢＬアミノ酸配列と比較して、９つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型４－１ＢＢＬポリペプチドは、配列番号１０～１３のうちの１つに示される４－１ＢＢＬアミノ酸配列と比較して、１０のアミノ酸置換を有する。
好適な４－１ＢＢＬバリアント型は、以下のアミノ酸配列のうちのいずれか１つに対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む：
Figure 2022536581000107
、配列中、Ｘは、Ｌｙｓ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000108
、配列中、Ｘは、Ｇｌｎ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000109
、配列中、Ｘは、Ｍｅｔ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000110
、配列中、Ｘは、Ｐｈｅ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000111
、配列中、Ｘは、Ｇｌｎ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000112
、配列中、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000113
、配列中、Ｘは、Ｖａｌ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000114
、配列中、Ｘは、Ｇｌｎ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000115
、配列中、Ｘは、Ａｓｎ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000116
、配列中、Ｘは、Ｖａｌ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000117
、配列中、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000118
、配列中、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000119
、配列中、Ｘは、Ｉｌｅ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000120
、配列中、Ｘは、Ａｓｐ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000121
、配列中、Ｘは、Ｇｌｙ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000122
、配列中、Ｘは、Ｐｒｏ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000123
、配列中、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000124
、配列中、Ｘは、Ｓｅｒ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000125
、配列中、Ｘは、Ｔｒｐ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000126
、配列中、Ｘは、Ｔｙｒ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000127
、配列中、Ｘは、Ｓｅｒ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000128
、配列中、Ｘは、Ａｓｐ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000129
、配列中、Ｘは、Ｐｒｏ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000130
、配列中、Ｘは、Ｇｌｙ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000131
、配列中、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000132
、配列中、Ｘは、Ｇｌｙ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000133
、配列中、Ｘは、Ｖａｌ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000134
、配列中、Ｘは、Ｓｅｒ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000135
、配列中、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000136
、配列中、Ｘは、Ｔｈｒ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000137
、配列中、Ｘは、Ｇｌｙ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000138
、配列中、Ｘは、Ｇｌｙ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000139
、配列中、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000140
、配列中、Ｘは、Ｓｅｒ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000141
、配列中、Ｘは、Ｔｙｒ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000142
、配列中、Ｘは、Ｇｌｕ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000143
、配列中、Ｘは、Ａｓｐ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000144
、配列中、Ｘは、Ｔｈｒ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000145
、配列中、Ｘは、Ｌｙｓ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000146
、配列中、Ｘは、Ｇｌｕ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000147
、配列中、Ｘは、Ｐｈｅ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000148
、配列中、Ｘは、Ｐｈｅ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000149
、配列中、Ｘは、Ｇｌｎ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000150
、配列中、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000151
、配列中、Ｘは、Ｇｌｕ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000152
、配列中、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000153
、配列中、Ｘは、Ａｒｇ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000154
、配列中、Ｘは、Ａｒｇ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000155
、配列中、Ｘは、Ｖａｌ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000156
、配列中、Ｘは、Ｖａｌ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000157
、配列中、Ｘは、Ｇｌｙ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000158
、配列中、Ｘは、Ｇｌｕ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000159
、配列中、Ｘは、Ｇｌｙ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000160
、配列中、Ｘは、Ｓｅｒ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000161
、配列中、Ｘは、Ａｓｐ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000162
、配列中、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000163
、配列中、Ｘは、Ｐｒｏ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000164
、配列中、Ｘは、Ｓｅｒ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000165
、配列中、Ｘは、Ｓｅｒ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000166
、配列中、Ｘは、Ｇｌｕ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000167
、配列中、Ｘは、Ａｒｇ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000168
、配列中、Ｘは、Ａｓｎ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000169
、配列中、Ｘは、Ｓｅｒ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000170
、配列中、Ｘは、Ｐｈｅ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000171
、配列中、Ｘは、Ｇｌｎ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000172
、配列中、Ｘは、Ａｒｇ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000173
、配列中、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000174
、配列中、Ｘは、Ｇｌｙ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000175
、配列中、Ｘは、Ｖａｌ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000176
、配列中、Ｘは、Ｈｉｓ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000177
、配列中、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000178
、配列中、Ｘは、Ｈｉｓ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000179
、配列中、Ｘは、Ｔｈｒ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000180
、配列中、Ｘは、Ｇｌｕ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000181
、配列中、Ｘは、Ａｒｇ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000182
、配列中、Ｘは、Ａｒｇ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000183
、配列中、Ｘは、Ｈｉｓ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000184
、配列中、Ｘは、Ｔｒｐ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000185
、配列中、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000186
、配列中、Ｘは、Ｔｈｒ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000187
、配列中、Ｘは、Ｇｌｎ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000188
、配列中、Ｘは、Ｇｌｙ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000189
、配列中、Ｘは、Ｔｈｒ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；及び
Figure 2022536581000190
、配列中、Ｘは、Ｖａｌ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである。
ＩＬ－２バリアント型
一部の例では、本開示のＴＭＭＰ内に存在するバリアント型免疫調節ポリペプチドは、バリアント型ＩＬ－２ポリペプチドである。野生型ＩＬ－２は、ＩＬ－２受容体（ＩＬ－２Ｒ）、すなわち、ＩＬ－２Ｒα、ＩＬ－２Ｒβ、及びＩＬ－２Ｒγを含むヘテロ三量体ポリペプチドに結合する。
野生型ＩＬ－２アミノ酸配列は、以下のとおりであり得る。
Figure 2022536581000191
野生型ＩＬ２は、細胞の表面上のＩＬ２受容体（ＩＬ２Ｒ）に結合する。ＩＬ２受容体は、一部の例では、アルファ鎖（ＩＬ－２Ｒα；ＣＤ２５とも称される）、ベータ鎖（ＩＬ－２Ｒβ；ＣＤ１２２とも称される）、及びガンマ鎖（ＩＬ－２Ｒγ；ＣＤ１３２とも称される）を含むヘテロ三量体ポリペプチドである。ヒトＩＬ－２Ｒα、ＩＬ２Ｒβ、及びＩＬ－２Ｒγのアミノ酸配列は、以下のとおりであり得る。
ヒトＩＬ－２Ｒα：ＥＬＣＤＤＤＰＰＥ ＩＰＨＡＴＦＫＡＭＡ ＹＫＥＧＴＭＬＮＣＥ ＣＫＲＧＦＲＲＩＫＳ ＧＳＬＹＭＬＣＴＧＮ ＳＳＨＳＳＷＤＮＱＣ ＱＣＴＳＳＡＴＲＮＴ ＴＫＱＶＴＰＱＰＥＥ ＱＫＥＲＫＴＴＥＭＱ ＳＰＭＱＰＶＤＱＡＳ ＬＰＧＨＣＲＥＰＰＰ ＷＥＮＥＡＴＥＲＩＹ ＨＦＶＶＧＱＭＶＹＹ ＱＣＶＱＧＹＲＡＬＨ ＲＧＰＡＥＳＶＣＫＭ ＴＨＧＫＴＲＷＴＱＰ ＱＬＩＣＴＧＥＭＥＴ ＳＱＦＰＧＥＥＫＰＱ ＡＳＰＥＧＲＰＥＳＥ ＴＳＣＬＶＴＴＴＤＦ ＱＩＱＴＥＭＡＡＴＭ ＥＴＳＩＦＴＴＥＹＱ ＶＡＶＡＧＣＶＦＬＬ ＩＳＶＬＬＬＳＧＬＴ ＷＱＲＲＱＲＫＳＲＲ ＴＩ（配列番号１６）。
ヒトＩＬ－２Ｒβ：ＶＮＧ ＴＳＱＦＴＣＦＹＮＳ ＲＡＮＩＳＣＶＷＳＱ ＤＧＡＬＱＤＴＳＣＱ ＶＨＡＷＰＤＲＲＲＷ ＮＱＴＣＥＬＬＰＶＳ ＱＡＳＷＡＣＮＬＩＬ ＧＡＰＤＳＱＫＬＴＴ ＶＤＩＶＴＬＲＶＬＣ ＲＥＧＶＲＷＲＶＭＡ ＩＱＤＦＫＰＦＥＮＬ ＲＬＭＡＰＩＳＬＱＶ ＶＨＶＥＴＨＲＣＮＩ ＳＷＥＩＳＱＡＳＨＹ ＦＥＲＨＬＥＦＥＡＲ ＴＬＳＰＧＨＴＷＥＥ ＡＰＬＬＴＬＫＱＫＱ ＥＷＩＣＬＥＴＬＴＰ ＤＴＱＹＥＦＱＶＲＶ ＫＰＬＱＧＥＦＴＴＷ ＳＰＷＳＱＰＬＡＦＲ ＴＫＰＡＡＬＧＫＤＴ ＩＰＷＬＧＨＬＬＶＧ ＬＳＧＡＦＧＦＩＩＬ ＶＹＬＬＩＮＣＲＮＴ ＧＰＷＬＫＫＶＬＫＣ ＮＴＰＤＰＳＫＦＦＳ ＱＬＳＳＥＨＧＧＤＶ ＱＫＷＬＳＳＰＦＰＳ ＳＳＦＳＰＧＧＬＡＰ ＥＩＳＰＬＥＶＬＥＲ ＤＫＶＴＱＬＬＬＱＱ ＤＫＶＰＥＰＡＳＬＳ ＳＮＨＳＬＴＳＣＦＴ ＮＱＧＹＦＦＦＨＬＰ ＤＡＬＥＩＥＡＣＱＶ ＹＦＴＹＤＰＹＳＥＥ ＤＰＤＥＧＶＡＧＡＰ ＴＧＳＳＰＱＰＬＱＰ ＬＳＧＥＤＤＡＹＣＴ ＦＰＳＲＤＤＬＬＬＦ ＳＰＳＬＬＧＧＰＳＰ ＰＳＴＡＰＧＧＳＧＡ ＧＥＥＲＭＰＰＳＬＱ ＥＲＶＰＲＤＷＤＰＱ ＰＬＧＰＰＴＰＧＶＰ ＤＬＶＤＦＱＰＰＰＥ ＬＶＬＲＥＡＧＥＥＶ ＰＤＡＧＰＲＥＧＶＳ ＦＰＷＳＲＰＰＧＱＧ ＥＦＲＡＬＮＡＲＬＰ ＬＮＴＤＡＹＬＳＬＱ ＥＬＱＧＱＤＰＴＨＬ Ｖ（配列番号１７）。
ヒトＩＬ－２Ｒγ：ＬＮＴＴＩＬＴＰ ＮＧＮＥＤＴＴＡＤＦ ＦＬＴＴＭＰＴＤＳＬ ＳＶＳＴＬＰＬＰＥＶ ＱＣＦＶＦＮＶＥＹＭ ＮＣＴＷＮＳＳＳＥＰ ＱＰＴＮＬＴＬＨＹＷ ＹＫＮＳＤＮＤＫＶＱ ＫＣＳＨＹＬＦＳＥＥ ＩＴＳＧＣＱＬＱＫＫ ＥＩＨＬＹＱＴＦＶＶ ＱＬＱＤＰＲＥＰＲＲ ＱＡＴＱＭＬＫＬＱＮ ＬＶＩＰＷＡＰＥＮＬ ＴＬＨＫＬＳＥＳＱＬ ＥＬＮＷＮＮＲＦＬＮ ＨＣＬＥＨＬＶＱＹＲ ＴＤＷＤＨＳＷＴＥＱ ＳＶＤＹＲＨＫＦＳＬ ＰＳＶＤＧＱＫＲＹＴ ＦＲＶＲＳＲＦＮＰＬ ＣＧＳＡＱＨＷＳＥＷ ＳＨＰＩＨＷＧＳＮＴ ＳＫＥＮＰＦＬＦＡＬ ＥＡＶＶＩＳＶＧＳＭ ＧＬＩＩＳＬＬＣＶＹ ＦＷＬＥＲＴＭＰＲＩ ＰＴＬＫＮＬＥＤＬＶ ＴＥＹＨＧＮＦＳＡＷ ＳＧＶＳＫＧＬＡＥＳ ＬＱＰＤＹＳＥＲＬＣ ＬＶＳＥＩＰＰＫＧＧ ＡＬＧＥＧＰＧＡＳＰ ＣＮＱＨＳＰＹＷＡＰ ＰＣＹＴＬＫＰＥＴ（配列番号１８）。
一部の例では、本開示のＴＭＭＰがバリアント型ＩＬ－２ポリペプチドを含む場合、「関連共免疫調節ポリペプチド」は、配列番号１６、１７、及び１８のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含むＩＬ－２Ｒである。
一部の例では、バリアント型ＩＬ－２ポリペプチドは、配列番号１５に示されるアミノ酸配列を含むＩＬ－２ポリペプチドの結合親和性と比較して、ＩＬ－２Ｒに対する低い結合親和性を示す。例えば、一部の例では、バリアント型ＩＬ－２ポリペプチドは、同じ条件下でアッセイした場合、ＩＬ－２Ｒ（例えば、配列番号１６～１８に示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドを含むＩＬ－２Ｒ）に対する配列番号１５に示されるアミノ酸配列を含むＩＬ－２ポリペプチドの結合親和性に比べて、少なくとも１０％低い、少なくとも１５％低い、少なくとも２０％低い、少なくとも２５％低い、少なくとも３０％低い、少なくとも３５％低い、少なくとも４０％低い、少なくとも４５％低い、少なくとも５０％低い、少なくとも５５％低い、少なくとも６０％低い、少なくとも６５％低い、少なくとも７０％低い、少なくとも７５％低い、少なくとも８０％低い、少なくとも８５％低い、少なくとも９０％低い、少なくとも９５％低い、または９５％超低い結合親和性で、ＩＬ－２Ｒに結合する。
一部の例では、バリアント型ＩＬ－２ポリペプチドは、ＩＬ－２Ｒに対して１００ｎＭ～１００μＭの結合親和性を有する。別の例として、一部の例では、バリアント型ＩＬ－２ポリペプチドは、ＩＬ－２Ｒ（例えば、配列番号１６～１８に示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドを含むＩＬ－２Ｒ）に対して、約１００ｎＭ～１５０ｎＭ、約１５０ｎＭ～約２００ｎＭ、約２００ｎＭ～約２５０ｎＭ、約２５０ｎＭ～約３００ｎＭ、約３００ｎＭ～約３５０ｎＭ、約３５０ｎＭ～約４００ｎＭ、約４００ｎＭ～約５００ｎＭ、約５００ｎＭ～約６００ｎＭ、約６００ｎＭ～約７００ｎＭ、約７００ｎＭ～約８００ｎＭ、約８００ｎＭ～約９００ｎＭ、約９００ｎＭ～約１μＭ、約１μＭ～約５μＭ、約５μＭ～約１０μＭ、約１０μＭ～約１５μＭ、約１５μＭ～約２０μＭ、約２０μＭ～約２５μＭ、約２５μＭ～約５０μＭ、約５０μＭ～約７５μＭ、または約７５μＭ～約１００μＭの結合親和性を有する。
一部の例では、バリアント型ＩＬ－２ポリペプチドは、配列番号１５に示されるＩＬ－２アミノ酸配列と比較して、単一のアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＩＬ－２ポリペプチドは、配列番号１５に示されるＩＬ－２アミノ酸配列と比較して、２～１０のアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＩＬ－２ポリペプチドは、配列番号１５に示されるＩＬ－２アミノ酸配列と比較して、２つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＩＬ－２ポリペプチドは、配列番号１５に示されるＩＬ－２アミノ酸配列と比較して、３つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＩＬ－２ポリペプチドは、配列番号１５に示されるＩＬ－２アミノ酸配列と比較して、４つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＩＬ－２ポリペプチドは、配列番号１５に示されるＩＬ－２アミノ酸配列と比較して、５つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＩＬ－２ポリペプチドは、配列番号１５に示されるＩＬ－２アミノ酸配列と比較して、６つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＩＬ－２ポリペプチドは、配列番号１５に示されるＩＬ－２アミノ酸配列と比較して、７つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＩＬ－２ポリペプチドは、配列番号１５に示されるＩＬ－２アミノ酸配列と比較して、８つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＩＬ－２ポリペプチドは、配列番号１５に示されるＩＬ－２アミノ酸配列と比較して、９つのアミノ酸置換を有する。一部の例では、バリアント型ＩＬ－２ポリペプチドは、配列番号１５に示されるＩＬ－２アミノ酸配列と比較して、１０のアミノ酸置換を有する。
好適なＩＬ－２バリアント型は、以下のアミノ酸配列のうちのいずれか１つに対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む：
Figure 2022536581000192
、配列中、Ｘは、Ｐｈｅ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである。一部の例では、ＸはＭｅｔである。一部の例では、ＸはＰｒｏである。一部の例では、ＸはＳｅｒである。一部の例では、ＸはＴｈｒである。一部の例では、ＸはＴｒｐである。一部の例では、ＸはＴｙｒである。一部の例では、ＸはＶａｌである。一部の例では、ＸはＨｉｓである；
Figure 2022536581000193
、配列中、Ｘは、Ａｓｐ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000194
、配列中、Ｘは、Ｇｌｕ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである。
Figure 2022536581000195
、配列中、Ｘは、Ｈｉｓ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである。一部の例では、ＸはＴｈｒである。一部の例では、ＸはＡｓｎである。一部の例では、ＸはＣｙｓである。一部の例では、ＸはＧｌｎである。一部の例では、ＸはＭｅｔである。一部の例では、ＸはＶａｌである。一部の例では、ＸはＴｒｐである；
Figure 2022536581000196
、配列中、Ｘは、Ｈｉｓ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである。一部の例では、ＸはＡｒｇである。一部の例では、ＸはＡｓｎである。一部の例では、ＸはＡｓｐである。一部の例では、ＸはＣｙｓである。一部の例では、ＸはＧｌｕである。一部の例では、ＸはＧｌｎである。一部の例では、ＸはＧｌｙである。一部の例では、ＸはＩｌｅである。一部の例では、ＸはＬｙｓである。一部の例では、ＸはＬｅｕである。一部の例では、ＸはＭｅｔである。一部の例では、ＸはＰｈｅである。一部の例では、ＸはＰｒｏである。一部の例では、ＸはＳｅｒである。一部の例では、ＸはＴｈｒである。一部の例では、ＸはＴｙｒである。一部の例では、ＸはＴｒｐである。一部の例では、ＸはＶａｌである；
Figure 2022536581000197
、配列中、Ｘは、Ｔｙｒ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000198
、配列中、Ｘは、Ｇｌｎ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、ＸはＡｌａである；
Figure 2022536581000199
、配列中、Ｘ１は、ＨＩＳ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ２は、ＰＨＥ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、Ｘ１はＡＬＡである。一部の例では、Ｘ２はＡＬＡである。一部の例では、Ｘ１はＡＬＡであり、Ｘ２はＡＬＡである。一部の例では、Ｘ１はＴＨＲであり、Ｘ２はＡＬＡである；
Figure 2022536581000200
、配列中、Ｘ１は、ＡＳＰ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ２は、ＰＨＥ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、Ｘ１はＡＬＡである。一部の例では、Ｘ２はＡＬＡである。一部の例では、Ｘ１はＡＬＡであり、Ｘ２はＡＬＡである；
Figure 2022536581000201
、配列中、Ｘ１は、ＧＬＵ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ２は、ＡＳＰ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ３は、ＰＨＥ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、Ｘ１はＡＬＡである。一部の例では、Ｘ２はＡＬＡである。一部の例では、Ｘ３はＡＬＡである。一部の例では、Ｘ１はＡＬＡであり、Ｘ２はＡＬＡであり、Ｘ３はＡＬＡである；
Figure 2022536581000202
、配列中、Ｘ１は、ＨＩＳ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ２は、ＡＳＰ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ３は、ＰＨＥ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、Ｘ１はＡＬＡである。一部の例では、Ｘ２はＡＬＡである。一部の例では、Ｘ３はＡＬＡである。一部の例では、Ｘ１はＡＬＡであり、Ｘ２はＡＬＡであり、Ｘ３はＡＬＡである；
Figure 2022536581000203
、配列中、Ｘ１は、ＡＳＰ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ２は、ＰＨＥ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ３は、ＧＬＮ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、Ｘ１はＡＬＡである。一部の例では、Ｘ２はＡＬＡである。一部の例では、Ｘ３はＡＬＡである。一部の例では、Ｘ１はＡＬＡであり、Ｘ２はＡＬＡであり、Ｘ３はＡＬＡである；
Figure 2022536581000204
、配列中、Ｘ１は、ＡＳＰ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ２は、ＰＨＥ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ３は、ＴＹＲ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、Ｘ１はＡＬＡである。一部の例では、Ｘ２はＡＬＡである。一部の例では、Ｘ３はＡＬＡである。一部の例では、Ｘ１はＡＬＡであり、Ｘ２はＡＬＡであり、Ｘ３はＡＬＡである；
Figure 2022536581000205
、配列中、Ｘ１は、Ｈｉｓ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ２は、Ａｓｐ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ３は、Ｐｈｅ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ４は、Ｔｙｒ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、Ｘ１はＡＬＡである。一部の例では、Ｘ２はＡＬＡである。一部の例では、Ｘ３はＡＬＡである。一部の例では、Ｘ４はＡＬＡである。一部の例では、Ｘ１はＡＬＡであり、Ｘ２はＡＬＡであり、Ｘ３はＡＬＡであり、Ｘ４はＡＬＡである；
Figure 2022536581000206
、配列中、Ｘ１は、Ａｓｐ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ２は、Ｐｈｅ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ３は、Ｔｙｒ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ４は、Ｇｌｎ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、Ｘ１はＡＬＡである。一部の例では、Ｘ２はＡＬＡである。一部の例では、Ｘ３はＡＬＡである。一部の例では、Ｘ４はＡＬＡである。一部の例では、Ｘ１はＡＬＡであり、Ｘ２はＡＬＡであり、Ｘ３はＡＬＡであり、Ｘ４はＡＬＡである；
Figure 2022536581000207
、配列中、Ｘ１は、Ｈｉｓ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ２は、Ａｓｐ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ３は、Ｐｈｅ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ４は、Ｔｙｒ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ５は、Ｇｌｎ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、Ｘ１はＡＬＡである。一部の例では、Ｘ２はＡＬＡである。一部の例では、Ｘ３はＡＬＡである。一部の例では、Ｘ４はＡＬＡである。一部の例では、Ｘ５はＡＬＡである。一部の例では、Ｘ１はＡＬＡであり、Ｘ２はＡＬＡであり、Ｘ３はＡＬＡであり、Ｘ４はＡＬＡであり、Ｘ５はＡＬＡである；
Figure 2022536581000208
、配列中、Ｘ１は、ＨＩＳ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ２は、ＰＨＥ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ３は、ＧＬＮ以外の任意のアミノ酸である。一部の例では、Ｘ１はＡＬＡである。一部の例では、Ｘ２はＡＬＡである。一部の例では、Ｘ３はＡＬＡである。一部の例では、Ｘ１はＡＬＡであり、Ｘ２はＡＬＡであり、Ｘ３はＡＬＡである。
追加のポリペプチド
本開示のＴＭＭＰのポリペプチド鎖は、上述のポリペプチドに加えて１つ以上のポリペプチドを含み得る。好適な追加のポリペプチドとしては、エピトープタグ及び親和性ドメインが挙げられる。１つ以上の追加のポリペプチドは、ＴＭＭＰのポリペプチド鎖のＮ末端、ＴＭＭＰのポリペプチド鎖のＣ末端、またはＴＭＭＰのポリペプチド鎖内に含まれ得る。
エピトープタグ
好適なエピトープタグとしては、ヘマグルチニン（ＨＡ；例えば、ＹＰＹＤＶＰＤＹＡ（配列番号５４４）、ＦＬＡＧ（例えば、ＤＹＫＤＤＤＤＫ（配列番号５４５）、ｃ－ｍｙｃ（例えば、ＥＱＫＬＩＳＥＥＤＬ；配列番号５４６）などが挙げられるが、これらに限定されない。
親和性ドメイン
親和性ドメインには、特定または精製に有用な、結合パートナー、例えば、固体支持体上に固定化されたものなどと相互作用することができるペプチド配列が含まれる。ヒスチジンなどの複数の連続した単一アミノ酸をコードするＤＮＡ配列は、発現されたタンパク質に融合したときに、ニッケルセファロースなどの樹脂カラムに高い親和性で結合することによって、組換えタンパク質の一段階精製に使用され得る。例示的な親和性ドメインとしては、Ｈｉｓ５（ＨＨＨＨＨ）（配列番号５４７）、ＨｉｓＸ６（ＨＨＨＨＨＨ）（配列番号５４８）、Ｃ－ｍｙｃ（ＥＱＫＬＩＳＥＥＤＬ）（配列番号５４９）、Ｆｌａｇ（ＤＹＫＤＤＤＤＫ）（配列番号５５０）、ＳｔｒｅｐＴａｇ（ＷＳＨＰＱＦＥＫ）（配列番号５５１）、ヘマグルチニン（例えば、ＨＡタグ（ＹＰＹＤＶＰＤＹＡ）（配列番号５５２）、グルタチオン－Ｓ－トランスフェラーゼ（ＧＳＴ）、チオレドキシン、セルロース結合ドメイン、ＲＹＩＲＳ（配列番号５５３）、Ｐｈｅ－Ｈｉｓ－Ｔｈｒ（配列番号５５４）、キチン結合ドメイン、Ｓ－ペプチド、Ｔ７ペプチド、ＳＨ２ドメイン、Ｃ－末端ＲＮＡタグ、ＷＥＡＡＡＲＥＡＣＣＲＥＣＣＡＲＡ（配列番号５５５）、金属結合ドメイン、例えば、亜鉛結合ドメインまたはカルシウム結合ドメイン、例えば、カルシウム結合タンパク質、例えば、カルモジュリン、トロポニンＣ、カルシニュリンＢ、ミオシン軽鎖、リカバリン、Ｓ－モジュリン、ビシニン、ＶＩＬＩＰ、ニューロカルシン、ヒポカルシン、フリクエニン、カルトラクチン、カルパイン大サブユニット、Ｓ１００タンパク質、パルブアルブミン、カルビンディンＤ９Ｋ、カルビンディンＤ２８Ｋ、及びカルレチニン、インテイン、ビオチン、ストレプトアビジン、ＭｙｏＤ、Ｉｄ、ロイシンジッパー配列、ならびにマルトース結合タンパク質が挙げられる。
薬物コンジュゲート
本開示のＴＭＭＰのポリペプチド鎖は、ポリペプチド鎖に結合（例えば、共有結合）した低分子薬物を含んでいてもよい。例えば、本開示のＴＭＭＰがＦｃポリペプチドを含む場合、そのＦｃポリペプチドは、共有結合した低分子薬物を含んでいてもよい。一部の例では、低分子薬物は、がん化学療法剤、例えば、細胞傷害薬である。本開示のＴＭＭＰのポリペプチド鎖は、ポリペプチド鎖に結合（例えば、共有結合）した細胞傷害薬を含んでいてもよい。例えば、本開示のＴＭＭＰがＦｃポリペプチドを含む場合、そのＦｃポリペプチドは、共有結合した細胞傷害薬を含んでいてもよい。細胞傷害薬はプロドラッグを含む。
薬物（例えば、がん化学療法剤）は、直接または間接的に、本開示のＴＭＭＰのポリペプチド鎖に結合していてもよい。例えば、本開示のＴＭＭＰがＦｃポリペプチドを含む場合、薬物（例えば、がん化学療法剤）は、直接または間接的に、Ｆｃポリペプチドに結合していてもよい。直接結合は、アミノ酸側鎖への直接結合を含んでいてもよい。間接的結合は、リンカーを介した結合であってもよい。薬物（例えば、がん化学療法剤）は、チオエーテル結合、アミド結合、カルバメート結合、ジスルフィド結合、またはエーテル結合を介して、本開示のＴＭＭＰのポリペプチド鎖（例えば、Ｆｃポリペプチド）に結合していてもよい。
リンカーとしては、開裂性リンカー及び非開裂性リンカーが挙げられる。一部の例では、リンカーはプロテアーゼ開裂性リンカーである。好適なリンカーとしては、例えば、ペプチド（例えば、２～１０アミノ酸長、例えば、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０アミノ酸長）、アルキル鎖、ポリ（エチレングリコール）、ジスルフィド基、チオエーテル基、酸に不安定な基、感光性基、ペプチダーゼに不安定な基、及び、エステラーゼに不安定な基が挙げられる。好適なリンカーの非限定的な例は、ｉ）Ｎ－スクシンイミジル－［（Ｎ－マレイミドプロピオンアミド）－テトラエチレングリコール］エステル（ＮＨＳ－ＰＥＧ４－マレイミド）、ｉｉ）Ｎ－スクシンイミジル４－（２－ピリジルジチオ）ブタノエート（ＳＰＤＢ）；Ｎ－スクシンイミジル４－（２－ピリジルジチオ）２－スルホブタノエート（スルホ－ＳＰＤＢ）；Ｎ－スクシンイミジル４－（２－ピリジルジチオ）ペンタノエート（ＳＰＰ）；Ｎ－スクシンイミジル－４－（Ｎ－マレイミドメチル）－シクロヘキサン－１－カルボキシ－（６－アミドカプロエート）（ＬＣ－ＳＭＣＣ）；κ－マレイミドウンデカン酸Ｎ－スクシンイミジルエステル（ＫＭＵＡ）；γ－マレイミド酪酸Ｎ－スクシンイミジルエステル（ＧＭＢＳ）；ε－マレイミドカプロン酸Ｎ－ヒドロキシスクシンイミドエステル（ＥＭＣＳ）；ｍ－マレイミドベンゾイル－Ｎ－ヒドロキシスクシンイミドエステル（ＭＢＳ）；Ｎ－（α－マレイミドアセトキシ）－スクシンイミドエステル（ＡＭＡＳ）；スクシンイミジル－６－（β－マレイミドプロピオンアミド）ヘキサノエート（ＳＭＰＨ）；Ｎ－スクシンイミジル４－（ｐ－マレイミドフェニル）ブチレート（ＳＭＰＢ）；Ｎ－（ｐ－マレイミドフェニル）イソシアネート（ＰＭＰＩ）；Ｎ－スクシンイミジル４（２－ピリジルチオ）ペンタノエート（ＳＰＰ）；Ｎ－スクシンイミジル（４－ヨード－アセチル）アミノベンゾエート（ＳＩＡＢ）；６－マレイミドカプロイル（ＭＣ）；マレイミドプロパノイル（ＭＰ）；ｐ－アミノベンジルオキシカルボニル（ＰＡＢ）；Ｎ－スクシンイミジル４－（マレイミドメチル）シクロヘキサンカルボキシレート（ＳＭＣＣ）；Ｎ－スクシンイミジル－４－（Ｎ－マレイミドメチル）－シクロヘキサン－１－カルボキシ－（６－アミドカプロエート）、ＳＭＣＣの「長鎖」類似体（ＬＣ－ＳＭＣＣ）；３－マレイミドプロパン酸Ｎ－スクシンイミジルエステル（ＢＭＰＳ）；Ｎ－スクシンイミジルヨード酢酸（ＳＩＡ）；Ｎ－スクシンイミジルブロモ酢酸（ＳＢＡ）；及びＮ－スクシンイミジル３－（ブロモアセトアミド）プロピオネート（ＳＢＡＰ）である。
文献に記載された、スクシンイミジル４－（Ｎ－マレイミドメチル）－シクロヘキサン－１－カルボキシレート（ＳＭＣＣ）、スルホ－ＳＭＣＣ、マレイミドベンゾイル－Ｎ－ヒドロキシスクシンイミドエステル（ＭＢＳ）、スルホ－ＭＢＳ、またはスクシンイミジル－ヨードアセテートなどの架橋試薬で、ポリペプチド（例えば、Ｆｃポリペプチド）を修飾して、１～１０の反応性基を導入してもよい。次に、修飾Ｆｃポリペプチドを、チオール含有細胞傷害薬と反応させて、コンジュゲートを作製する。
例えば、本開示のＴＭＭＰがＦｃポリペプチドを含む場合、そのＦｃポリペプチドを含むポリペプチド鎖は、式（Ａ）－（Ｌ）－（Ｃ）（式中、（Ａ）はＦｃポリペプチドを含むポリペプチド鎖であり、（Ｌ）は存在する場合リンカーであり、（Ｃ）は細胞傷害薬である）のものであり得る。（Ｌ）は存在する場合、（Ａ）と（Ｃ）を連結させる。一部の例では、Ｆｃポリペプチドを含むポリペプチド鎖は、２つ以上の細胞傷害薬（例えば、２、３、４、もしくは、５、または、５超の細胞傷害薬）を含んでいてもよい。
好適な薬物としては、例えば、ラパマイシンが挙げられる。好適な薬物としては、例えば、全トランス型レチノイン酸（ＡＴＲＡ）などのレチノイド、ビタミンＤ３、ビタミンＤ３類似体などが挙げられる。上に記載したように、一部の例では、薬物は細胞傷害薬である。細胞傷害薬は当技術分野において周知である。好適な細胞傷害薬は、細胞の死をもたらす、細胞死を誘導する、または、何らかの方法で細胞生存能を低下させる、任意の化合物であってもよく、例えば、メイタンシノイド及びメイタンシノイド類似体、ベンゾジアゼピン、タキソイド、ＣＣ－１０６５及びＣＣ－１０６５類似体、デュオカルマイシン及びデュオカルマイシン類似体、エンジイン（カリケアミシンなど）、ドラスタチン及びドラスタチン類似体（アウリスタチンを含む）、トマイマイシン誘導体、レプトマイシン誘導体、メトトレキサート、シスプラチン、カルボプラチン、ダウノルビシン、ドキソルビシン、ビンクリスチン、ビンブラスチン、メルファラン、マイトマイシンＣ、クロラムブシル、ならびに、モルホリノドキソルビシンが挙げられる。
例えば、一部の例では、細胞傷害薬は、真核細胞内における微小管形成を阻害する化合物である。このような薬剤としては、例えば、メイタンシノイド、ベンゾジアゼピン、タキソイド、ＣＣ－１０６５、デュオカルマイシン、デュオカルマイシン類似体、カリケアミシン、ドラスタチン、ドラスタチン類似体、アウリスタチン、トマイマイシン、及びレプトマイシン、または、上記のうちのいずれか１つのプロドラッグが挙げられる。メイタンシノイド化合物としては、例えば、Ｎ（２’）－デアセチル－Ｎ（２’）－（３－メルカプト－１－オキソプロピル）－マイタンシン（ＤＭ１）、Ｎ（２’）－デアセチル－Ｎ（２’）－（４－メルカプト－１－オキソペンチル）－マイタンシン（ＤＭ３）、及び、Ｎ（２’）－デアセチル－Ｎ２－（４－メルカプト－４－メチル－１－オキソペンチル）－マイタンシン（ＤＭ４）が挙げられる。ベンゾジアゼピンとしては、例えば、インドリノベンゾジアゼピン及びオキサゾリジノベンゾジアゼピンが挙げられる。
細胞傷害薬としては、タキソール、サイトカラシンＢ、グラミシジンＤ、臭化エチジウム、エメチン、マイトマイシン、エトポシド、テノポシド、ビンクリスチン、ビンブラスチン、コルヒチン、ドキソルビシン、ダウノルビシン、ジヒドロキシアントラシンジオン、メイタンシンまたはその類似体もしくは誘導体、アウリスタチンまたはその機能的ペプチド類似体もしくは誘導体、ドラスタチン１０もしくは１５またはその類似体、イリノテカンまたはその類似体、ミトキサントロン、ミトラマイシン、アクチノマイシンＤ、１－デヒドロテストステロン、グルココルチコイド、プロカイン、テトラカイン、リドカイン、プロプラノロール、ピューロマイシン、カリケアマイシンまたはその類似体もしくは誘導体、代謝拮抗薬、６メルカプトプリン、６チオグアニン、シタラビン、フルダラビン、５フルオロウラシル、デカルバジン（ｄｅｃａｒｂａｚｉｎｅ）、ヒドロキシ尿素、アスパラギナーゼ、ゲムシタビン、クラドリビン、アルキル化剤、白金誘導体、デュオカルマイシンＡ、デュオカルマイシンＳＡ、ラケルマイシン（ｒａｃｈｅｌｍｙｃｉｎ）（ＣＣ－１０６５）またはその類似体もしくは誘導体、抗生物質、ピロロ［２，１－ｃ］［１，４］ベンゾジアゼピン（ＰＤＢ）ジフテリア毒素、リシン毒素、コレラ毒素、志賀様毒素、ＬＴ毒素、Ｃ３毒素、志賀毒素、百日咳毒素、破傷風毒素、大豆ボウマン－バークプロテアーゼ阻害物質、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ外毒素、アロリン、サポリン、モデシン、ゲラニン、アブリンＡ鎖、モデシンＡ鎖、アルファ－サルシン、Ａｌｅｕｒｉｔｅｓ ｆｏｒｄｉｉタンパク質、ｄｉａｎｔｈｉｎタンパク質、Ｐｈｙｔｏｌａｃｃａ ａｍｅｒｉｃａｎａタンパク質、ｍｏｍｏｒｄｉｃａ ｃｈａｒａｎｔｉａ阻害剤、クルシン、クロチン、ｓａｐａｏｎａｒｉａ ｏｆｆｉｃｉｎａｌｉｓ阻害剤、ゲロニン、ミトゲリン（ｍｉｔｏｇｅｌｌｉｎ）、レストリクトシン、フェノマイシン、エノマイシン毒素；リボヌクレアーゼ（ＲＮａｓｅ）、ＤＮａｓｅ Ｉ、ＳｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃａｌエンテロトキシンＡ、ヤマゴボウ抗ウイルスタンパク質、ジフテリン（ｄｉｐｈｔｈｅｒｉｎ）毒素、及びＰｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ内毒素が挙げられる。
例示的なＴＭＭＰ
本開示のＴＭＭＰは、ａ）ｉ）ＭＵＣ１ペプチドと、ｉｉ）第１のＭＨＣポリペプチドとを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）第２のＭＨＣポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、ｃ）少なくとも１つの免疫調節ポリペプチド（第１及び／または第２のポリペプチドは、免疫調節ポリペプチドを含む）とを含む、少なくとも１つのヘテロ二量体を含む。更に、一部の例では、本開示のＴＭＭＰは、ａ）ｉ）ＭＵＣ１ペプチド、ｉｉ）第１のＭＨＣポリペプチド、及びｉｉｉ）少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドとを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）第２のＭＨＣポリペプチドを含む第２のポリペプチドとを含む、少なくとも１つのヘテロ二量体を含む。その他の例では、本開示のＴＭＭＰは、ａ）ｉ）ＭＵＣ１ペプチド、及びｉｉ）第１のＭＨＣポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）ｉ）第２のＭＨＣポリペプチド、及びｉｉ）少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドと、を含む、第２のポリペプチドとを含む、少なくとも１つのヘテロ二量体を含む。一部の例では、本開示のＴＭＭＰは、ａ）ｉ）ＭＵＣ１ペプチド、ｉｉ）第１のＭＨＣポリペプチド、及びｉｉｉ）少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドとを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）ｉ）第２のＭＨＣポリペプチド、及びｉｉ）少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドと、を含む、第２のポリペプチドとを含む、少なくとも１つのヘテロ二量体を含む。一部の例では、少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドは、野生型免疫調節ポリペプチドである。その他の例では、免疫調節ポリペプチドのうちの少なくとも１つは、共免疫調節ポリペプチドに対する対応する野生型免疫調節ポリペプチドの親和性と比較して、共免疫調節ポリペプチドに対する低い親和性を示すバリアント型免疫調節ポリペプチドである。一部の例では、本開示のＴＭＭＰは、２つの免疫調節ポリペプチドを含み、２つの免疫調節ポリペプチドは、同じアミノ酸配列を有する。一部の例では、少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドは、ＩＬ－２ポリペプチド、例えば、本明細書に記載されるバリアント型ＩＬ－２ポリペプチドである。好適なＭＵＣ１ペプチドについて、本明細書に記載される。
上に記載したように、そして図１６に概略的に示されているように、免疫調節ポリペプチド（すなわち、１つ以上の免疫調節ポリペプチド）は、本開示のＴＭＭＰの様々な位置のいずれかに存在することができる。図１６は、バリアント型ＩＬ－２ポリペプチドの２つのコピーの位置を示すが、免疫調節ポリペプチドは、本明細書に記載されるように、様々な免疫調節ポリペプチドのいずれかであり得る。図１６に示されるように、免疫調節ポリペプチドは、１）ＭＨＣクラスＩ重鎖のＮ末端（位置１）、２）ＭＨＣクラスＩ重鎖のＣ末端及びＩｇ ＦｃポリペプチドのＮ末端、言い換えれば、ＭＨＣクラスＩ重鎖とＩｇ Ｆｃポリペプチドの間（位置２）、３）Ｉｇ ＦｃポリペプチドのＣ末端（位置３）、４）ペプチドエピトープのＮ末端（位置４）、または５）β２ＭポリペプチドのＣ末端（位置５）であり得る。「位置１」は、クラスＩ ＭＨＣ重鎖と同じポリペプチド鎖上の免疫調節ポリペプチドの位置を指し、クラスＩ ＭＨＣ重鎖のＮ末端を指す、例えば、ＴＭＭＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ペプチドエピトープ（例えば、ＭＵＣ１ペプチド）、及びｉｉ）β２Ｍポリペプチドを含む第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）１つ以上の免疫調節ポリペプチド、及びｉｉ）クラスＩ ＭＨＣ重鎖ポリペプチドを含む第２のポリペプチドとを含む。「位置２」は、クラスＩ ＭＨＣ重鎖と同じポリペプチド鎖上の免疫調節ポリペプチドの位置を指し、クラスＩ ＭＨＣ重鎖のＣ末端であるが該ポリペプチド鎖の特定のＣ末端を指さない、例えば、ＴＭＭＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ペプチドエピトープ（例えば、ＭＵＣ１ペプチド）、及びｉｉ）β２Ｍポリペプチドを含む第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）クラスＩ ＭＨＣ重鎖ポリペプチド、ｉｉ）１つ以上の免疫調節ポリペプチド、及びｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第２のポリペプチドとを含む。「位置３」は、クラスＩ ＭＨＣ重鎖と同じポリペプチド鎖上の免疫調節ポリペプチドの位置を指し、ポリペプチド鎖のＣ末端を指す、例えば、ＴＭＭＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ペプチドエピトープ（例えば、ＭＵＣ１ペプチド）、及びｉｉ）β２Ｍポリペプチドを含む第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）クラスＩ ＭＨＣ重鎖ポリペプチド、ｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド、及びｉｉｉ）１つ以上の免疫調節ポリペプチドを含む第２のポリペプチドとを含む。「位置４」は、β２Ｍポリペプチドと同じポリペプチド鎖上の免疫調節ポリペプチドの位置を指し、ペプチドエピトープ及びβ２ＭポリペプチドのＮ末端を指す、例えば、ＴＭＭＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）１つ以上の免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ペプチドエピトープ（例えば、ＭＵＣ１ペプチド）、及びｉｉｉ）β２Ｍポリペプチドとを含む第１のポリペプチドと、ｂ）クラスＩ ＭＨＣ重鎖ポリペプチドを含む第２のポリペプチド、例えば、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）クラスＩ ＭＨＣ重鎖ポリペプチド、及びｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第２のポリペプチドとを含む。「位置５」は、β２Ｍポリペプチドと同じポリペプチド鎖上の免疫調節ポリペプチドの位置を指し、β２ＭポリペプチドのＣ末端（例えば、ポリペプチド鎖の特定のＣ末端）を指す、例えば、ＴＭＭＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ペプチドエピトープ（例えば、ＭＵＣ１ペプチド）、ｉｉ）β２Ｍポリペプチド、及びｉｉｉ）１つ以上の免疫調節ポリペプチドを含む第１のポリペプチドと、ｂ）クラスＩ ＭＨＣ重鎖ポリペプチドを含む第２のポリペプチド、例えば、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）クラスＩ ＭＨＣ重鎖ポリペプチド、及びｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第２のポリペプチドとを含む。
更に、上述のように、図１５Ａ～１５Ｃに概略的に示されているように、本開示のＴＭＭＰの第１のポリペプチド鎖及び第２のポリペプチド鎖は、１つ以上のジスルフィド結合によって連結することができる。例えば、本開示のＴＭＭＰは、ａ）Ｒ１２Ｃ置換を有するβ２Ｍポリペプチドを含む第１のポリペプチド鎖と、ｂ）Ａ２３６Ｃ置換を有するクラスＩ ＭＨＣ重鎖ポリペプチドを含む第２のポリペプチド鎖と、を含むことができ、その結果、第１のポリペプチド鎖のβ２Ｍポリペプチドの１２位のＣｙｓと第２のポリペプチド鎖のクラスＩ ＭＨＣ重鎖ポリペプチドの２３６位のＣｙｓとの間にジスルフィド結合が形成される。別の例としては、本開示のＴＭＭＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ペプチドエピトープ、ｉｉ）ＧＣＧＧＳ（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列中、ｎは１、２、または３）（配列番号１４０）配列を含むペプチドリンカー、及び、ｉｉｉ）β２Ｍポリペプチドを含む第１のポリペプチドと、ｂ）Ｙ８４Ｃ置換を有するクラスＩ ＭＨＣ重鎖ポリペプチドを含む第２のポリペプチドと、を含むことができ、その結果、第１のポリペプチド鎖のペプチドリンカーのＣｙｓと第２のポリペプチド鎖のクラスＩ ＭＨＣ重鎖ポリペプチドの８４位のＣｙｓとの間にジスルフィド結合が形成される。その他の例では、本開示のＴＭＭＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ペプチドエピトープ、ｉｉ）ＧＣＧＧＳ（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列中、ｎは１、２、または３）（配列番号１４０）配列を含むペプチドリンカー、及び、ｉｉｉ）Ｒ１２Ｃ置換を有するβ２Ｍポリペプチドを含む第１のポリペプチドと、ｂ）Ｙ８４Ｃ置換及びＡ２３６Ｃ置換を有するクラスＩ ＭＨＣ重鎖ポリペプチドを含む第２のポリペプチドと、を含むことができ、その結果、ｉ）第１のポリペプチド鎖のペプチドリンカーのＣｙｓと第２のポリペプチド鎖のクラスＩ ＭＨＣ重鎖ポリペプチドの８４位のＣｙｓとの間に第１のジスルフィド結合が形成される、かつｉｉ）第１のポリペプチド鎖のβ２Ｍポリペプチドの１２位のＣｙｓと第２のポリペプチド鎖のクラスＩ ＭＨＣ重鎖ポリペプチドの２３６位のＣｙｓとの間に第２のジスルフィド結合が形成される。簡潔に示すため、第１のジスルフィド結合は「Ｇ２Ｃ／Ｙ８４Ｃ」と称され、第２のジスルフィド結合は「Ｒ１２Ｃ／Ａ２３６Ｃ」と称される。本開示のＴＭＭＰは、ａ）Ｒ１２Ｃ／Ａ２３６Ｃジスルフィド結合ではなくＧ２Ｃ／Ｙ８４Ｃジスルフィド結合、ｂ）Ｇ２Ｃ／Ｙ８４Ｃジスルフィド結合ではなくＲ１２Ｃ／Ａ２３６Ｃジスルフィド結合、またはｃ）Ｇ２Ｃ／Ｙ８４Ｃジスルフィド結合及びＲ１２Ｃ／Ａ２３６Ｃジスルフィド結合を含むことができる。
本開示のＴＭＭＰは、ａ）Ｒ１２Ｃ／Ａ２３６Ｃジスルフィド結合ではなくＧ２Ｃ／Ｙ８４Ｃジスルフィド結合、及びｂ）１位に少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドを含むことができる。本開示のＴＭＭＰは、ａ）Ｒ１２Ｃ／Ａ２３６Ｃジスルフィド結合ではなくＧ２Ｃ／Ｙ８４Ｃジスルフィド結合、及びｂ）２位に少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドを含むことができる。本開示のＴＭＭＰは、ａ）Ｒ１２Ｃ／Ａ２３６Ｃジスルフィド結合ではなくＧ２Ｃ／Ｙ８４Ｃジスルフィド結合、及びｂ）３位に少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドを含むことができる。本開示のＴＭＭＰは、ａ）Ｒ１２Ｃ／Ａ２３６Ｃジスルフィド結合ではなくＧ２Ｃ／Ｙ８４Ｃジスルフィド結合、及びｂ）４位に少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドを含むことができる。本開示のＴＭＭＰは、ａ）Ｒ１２Ｃ／Ａ２３６Ｃジスルフィド結合ではなくＧ２Ｃ／Ｙ８４Ｃジスルフィド結合、及びｂ）５位に少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドを含むことができる。
本開示のＴＭＭＰは、ａ）Ｇ２Ｃ／Ｙ８４Ｃジスルフィド結合ではなくＲ１２Ｃ／Ａ２３６Ｃジスルフィド結合、及び１位に少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドを含むことができる。本開示のＴＭＭＰは、ａ）Ｇ２Ｃ／Ｙ８４Ｃジスルフィド結合ではなくＲ１２Ｃ／Ａ２３６Ｃジスルフィド結合、及び２位に少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドを含むことができる。本開示のＴＭＭＰは、ａ）Ｇ２Ｃ／Ｙ８４Ｃジスルフィド結合ではなくＲ１２Ｃ／Ａ２３６Ｃジスルフィド結合、及び３位に少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドを含むことができる。本開示のＴＭＭＰは、ａ）Ｇ２Ｃ／Ｙ８４Ｃジスルフィド結合ではなくＲ１２Ｃ／Ａ２３６Ｃジスルフィド結合、及び４位に少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドを含むことができる。本開示のＴＭＭＰは、ａ）Ｇ２Ｃ／Ｙ８４Ｃジスルフィド結合ではなくＲ１２Ｃ／Ａ２３６Ｃジスルフィド結合、及び５位に少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドを含むことができる。
本開示のＴＭＭＰは、ａ）Ｇ２Ｃ／Ｙ８４Ｃジスルフィド結合及びＲ１２Ｃ／Ａ２３６Ｃジスルフィド結合、ならびにｂ）１位に少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドを含むことができる。本開示のＴＭＭＰは、ａ）Ｇ２Ｃ／Ｙ８４Ｃジスルフィド結合及びＲ１２Ｃ／Ａ２３６Ｃジスルフィド結合、ならびにｂ）２位に少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドを含むことができる。本開示のＴＭＭＰは、ａ）Ｇ２Ｃ／Ｙ８４Ｃジスルフィド結合及びＲ１２Ｃ／Ａ２３６Ｃジスルフィド結合、ならびにｂ）３位に少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドを含むことができる。本開示のＴＭＭＰは、ａ）Ｇ２Ｃ／Ｙ８４Ｃジスルフィド結合及びＲ１２Ｃ／Ａ２３６Ｃジスルフィド結合、ならびにｂ）４位に少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドを含むことができる。本開示のＴＭＭＰは、ａ）Ｇ２Ｃ／Ｙ８４Ｃジスルフィド結合及びＲ１２Ｃ／Ａ２３６Ｃジスルフィド結合、ならびにｂ）５位に少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドを含むことができる。
本開示のＴＭＭＰは、ａ）ｉ）ＭＵＣ１ペプチド、及びｉｉ）第１のＭＨＣポリペプチドを含む、第１のポリペプチド、ｂ）第２のＭＨＣポリペプチドを含む、第２のポリペプチド、及びｃ）少なくとも１つの免疫調節ポリペプチド（第１及び／または第２のポリペプチドは、免疫調節ポリペプチドを含む）を含む、少なくとも１つのヘテロ二量体を含む。したがって、一部の例では、本開示のＴＭＭＰは、ａ）ｉ）ＭＵＣ１ペプチド、ｉｉ）第１のＭＨＣポリペプチド、及びｉｉｉ）少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）第２のＭＨＣポリペプチドを含む第２のポリペプチドとを含む、少なくとも１つのヘテロ二量体を含む。その他の例では、本開示のＴＭＭＰは、ａ）ｉ）ＭＵＣ１ペプチド、及びｉｉ）第１のＭＨＣポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）ｉ）第２のＭＨＣポリペプチド、及びｉｉ）少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドと、を含む、第２のポリペプチドとを含む、少なくとも１つのヘテロ二量体を含む。一部の例では、本開示のＴＭＭＰは、ａ）ｉ）ＭＵＣ１ペプチド、ｉｉ）第１のＭＨＣポリペプチド、及びｉｉｉ）少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）ｉ）第２のＭＨＣポリペプチド、及びｉｉ）少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドとを含む、少なくとも１つのヘテロ二量体を含む。一部の例では、少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドは、野生型免疫調節ポリペプチドである。他の例では、少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドは、共免疫調節ポリペプチドに対する対応する野生型免疫調節ポリペプチドの親和性と比較して、共免疫調節ポリペプチドに対する低い親和性を示すバリアント型免疫調節ポリペプチドである。一部の例では、本開示のＴＭＭＰは、２つの免疫調節ポリペプチドを含み、２つの免疫調節ポリペプチドは、同じアミノ酸配列を有する。一部の例では、少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドは、ＩＬ－２ポリペプチド、例えば、本明細書に記載されるバリアント型ＩＬ－２ポリペプチドである。一部の例では、ＭＵＣ１ペプチドは、アミノ酸配列ＳＴＡＰＰＶＨＮＶ（配列番号５８７）を有し、９アミノ酸の長さを有する。一部の例では、ＭＵＣ１ペプチドは、アミノ酸配列ＳＬＡＰＰＶＨＮＶ（配列番号５８８）を有し、９アミノ酸の長さを有する。一部の例では、ＭＵＣ１ペプチドは、アミノ酸配列ＳＴＡＰＰＡＨＧＶ（配列番号５８６）を有し、９アミノ酸の長さを有する。一部の例では、ＭＵＣ１ペプチドは、アミノ酸配列ＳＬＡＰＰＡＨＧＶ（配列番号５８９）を有し、９アミノ酸の長さを有する。一部の例では、第２のＭＨＣポリペプチドは、ＨＬＡ－Ａ＊０２０１ポリペプチドに対して少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＨＬＡ重鎖であり、第１のＭＨＣポリペプチドはβ２Ｍポリペプチドである。
一部の例では、本開示のＴＭＭＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＵＣ１ペプチド、ｉｉ）第１のＭＨＣポリペプチド、及びｉｉｉ）少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドを含む第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）第２のＭＨＣポリペプチド、及びｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第２のポリペプチドとを含む。一部の例では、第１のＭＨＣポリペプチドはβ２Ｍポリペプチドであり、第２のＭＨＣポリペプチドはＨＬＡ重鎖ポリペプチドである。一部の例では、ＨＬＡ重鎖ポリペプチドは、ＨＬＡ－Ａ＊０２０１ポリペプチドである。一部の例では、ＨＬＡ重鎖ポリペプチドは、Ａ２３６Ｃ置換を有するＨＬＡ－Ａ＊０２０１ポリペプチドである。一部の例では、第１のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ペプチドエピトープ、ｉｉ）第１のＭＨＣポリペプチド、及びｉｉｉ）２つの免疫調節ポリペプチド（２つの免疫調節ポリペプチドは、同じアミノ酸配列を有する）を含む。一部の例では、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ヒトＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。一部の例では、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、Ｌ２３４Ａ及びＬ２３５Ａ置換を含むＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。一部の例では、第１及び第２のポリペプチドは互いにジスルフィド結合している。一部の例では、免疫調節ポリペプチドは、Ｈ１６Ａ及びＦ４２Ａ置換を含むバリアント型ＩＬ－２ポリペプチドである。一部の例では、免疫調節ポリペプチドは、Ｈ１６Ｔ及びＦ４２Ａ置換を含むバリアント型ＩＬ－２ポリペプチドである。一部の例では、ペプチドリンカーは、ｉ）第２のＭＨＣポリペプチドとＩｇ Ｆｃポリペプチドとの間、ｉｉ）エピトープと第１のＭＨＣポリペプチドとの間、ｉｉｉ）第１のＭＨＣポリペプチドと免疫調節ポリペプチドとの間、及び（ＴＭＭＰが第１のポリペプチド鎖上に２つの免疫調節ポリペプチドを含む場合）ｉｖ）２つの免疫調節ポリペプチド間、のうちの１つ以上の間にある。一部の例では、ペプチドリンカーは、アミノ酸配列ＡＡＡＧＧ（配列番号３８７）を含む。一部の例では、ペプチドリンカーは、アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号２５４）を含み、ｎは、１～１０の整数である（例えば、ｎは、２、３、または４である）。一部の例では、ＭＵＣ１ペプチドは、アミノ酸配列ＳＴＡＰＰＶＨＮＶ（配列番号５８７）を有し、９アミノ酸の長さを有する。一部の例では、ＭＵＣ１ペプチドは、アミノ酸配列ＳＬＡＰＰＶＨＮＶ（配列番号５８８）を有し、９アミノ酸の長さを有する。一部の例では、ＭＵＣ１ペプチドは、アミノ酸配列ＳＴＡＰＰＡＨＧＶ（配列番号５８６）を有し、９アミノ酸の長さを有する。一部の例では、ＭＵＣ１ペプチドは、アミノ酸配列ＳＬＡＰＰＡＨＧＶ（配列番号５８９）を有し、９アミノ酸の長さを有する。
一部の例では、本開示のＴＭＭＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）MUC1ペプチド及びｉｉ）第１のＭＨＣポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）少なくとも１つの免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）第２のＭＨＣポリペプチド、及びｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドと、を含む、第２のポリペプチドとを含む。一部の例では、第１のＭＨＣポリペプチドはβ２Ｍポリペプチドであり、第２のＭＨＣポリペプチドはＨＬＡ重鎖ポリペプチドである。一部の例では、ＨＬＡ重鎖ポリペプチドは、ＨＬＡ－Ａ＊０２０１ポリペプチドである。一部の例では、ＨＬＡ重鎖ポリペプチドは、Ａ２３６Ｃ置換を有するＨＬＡ－Ａ＊０２０１ポリペプチドである。一部の例では、第２のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）２つの免疫調節ポリペプチド（２つの免疫調節ポリペプチドは、同じアミノ酸配列を有する）、ｉｉ）第２のＭＨＣポリペプチド、及びｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む。一部の例では、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ヒトＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。一部の例では、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、Ｌ２３４Ａ及びＬ２３５Ａ置換を含むＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。一部の例では、第１及び第２のポリペプチドは互いにジスルフィド結合している。一部の例では、免疫調節ポリペプチドは、Ｈ１６Ａ及びＦ４２Ａ置換を含むバリアント型ＩＬ－２ポリペプチドである。一部の例では、免疫調節ポリペプチドは、Ｈ１６Ｔ及びＦ４２Ａ置換を含むバリアント型ＩＬ－２ポリペプチドである。一部の例では、ペプチドリンカーは、ｉ）第２のＭＨＣポリペプチドとＩｇ Ｆｃポリペプチドとの間、ｉｉ）エピトープと第１のＭＨＣポリペプチドとの間、ｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドと免疫調節ポリペプチドとの間、及び（ＴＭＭＰが第２のポリペプチド鎖上に２つの免疫調節ポリペプチドを含む場合）ｉｖ）２つの免疫調節ポリペプチド間、のうちの１つ以上の間にある。一部の例では、ペプチドリンカーは、アミノ酸配列ＡＡＡＧＧ（配列番号３８７）を含む。一部の例では、ペプチドリンカーは、アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号２５４）を含み、配列中、ｎは１～１０の整数（例えば、ｎは２、３、または４）である。一部の例では、ＭＵＣ１ペプチドは、アミノ酸配列ＳＴＡＰＰＶＨＮＶ（配列番号５８７）を有し、９アミノ酸の長さを有する。一部の例では、ＭＵＣ１ペプチドは、アミノ酸配列ＳＬＡＰＰＶＨＮＶ（配列番号５８８）を有し、９アミノ酸の長さを有する。一部の例では、ＭＵＣ１ペプチドは、アミノ酸配列ＳＴＡＰＰＡＨＧＶ（配列番号５８９）を有し、９アミノ酸の長さを有する。一部の例では、ＭＵＣ１ペプチドは、アミノ酸配列ＳＬＡＰＰＡＨＧＶ（配列番号５８９）を有し、９アミノ酸の長さを有する。
一部の例では、本開示のＴＭＭＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＵＣ１ペプチド、及びｉｉ）第１のＭＨＣポリペプチドを含む第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）第２のＭＨＣポリペプチド、ｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド、及びｉｉｉ）少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドを含む第２のポリペプチドとを含む。一部の例では、第１のＭＨＣポリペプチドはβ２Ｍポリペプチドであり、第２のＭＨＣポリペプチドはＨＬＡ重鎖ポリペプチドである。一部の例では、ＨＬＡ重鎖ポリペプチドは、ＨＬＡ－Ａ＊０２０１ポリペプチドである。一部の例では、ＨＬＡ重鎖ポリペプチドは、Ａ２３６Ｃ置換を有するＨＬＡ－Ａ＊０２０１ポリペプチドである。一部の例では、第２のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）第２のＭＨＣポリペプチド、ｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド、及びｉｉｉ）２つの免疫調節ポリペプチドを含み、２つの免疫調節ポリペプチドは、同じアミノ酸配列を有する。一部の例では、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ヒトＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。一部の例では、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、Ｌ２３４Ａ及びＬ２３５Ａ置換を含むＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。一部の例では、第１及び第２のポリペプチドは、互いにジスルフィド結合している。一部の例では、免疫調節ポリペプチドは、Ｈ１６Ａ及びＦ４２Ａ置換を含むバリアント型ＩＬ－２ポリペプチドである。一部の例では、免疫調節ポリペプチドは、Ｈ１６Ｔ及びＦ４２Ａ置換を含むバリアント型ＩＬ－２ポリペプチドである。一部の例では、ペプチドリンカーは、ｉ）第２のＭＨＣポリペプチドとＩｇ Ｆｃポリペプチドとの間、ｉｉ）エピトープと第１のＭＨＣポリペプチドとの間、ｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドと免疫調節ポリペプチドとの間、及び（ＴＭＭＰが第２のポリペプチド鎖上に２つの免疫調節ポリペプチドを含む場合）ｉｖ）２つの免疫調節ポリペプチド間、のうちの１つ以上の間にある。一部の例では、ペプチドリンカーは、アミノ酸配列ＡＡＡＧＧ（配列番号３８７）を含む。一部の例では、ペプチドリンカーは、アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号２５４）を含み、配列中、ｎは１～１０の整数（例えば、ｎは２、３、または４）である。一部の例では、ＭＵＣ１ペプチドは、アミノ酸配列ＳＴＡＰＰＶＨＮＶ（配列番号５８７）を有し、９アミノ酸の長さを有する。一部の例では、ＭＵＣ１ペプチドは、アミノ酸配列ＳＬＡＰＰＶＨＮＶ（配列番号５８８）を有し、９アミノ酸の長さを有する。一部の例では、ＭＵＣ１ペプチドは、アミノ酸配列ＳＴＡＰＰＡＨＧＶ（配列番号５８６）を有し、９アミノ酸の長さを有する。一部の例では、ＭＵＣ１ペプチドは、アミノ酸配列ＳＬＡＰＰＡＨＧＶ（配列番号５８９）を有し、９アミノ酸の長さを有する。
一部の例では、本開示のＴＭＭＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＵＣ１ペプチド、及びｉｉ）第１のＭＨＣポリペプチドを含む第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）少なくとも１つの免疫制御ポリペプチド、ｉｉ）第２のＭＨＣポリペプチド、及びｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第２のポリペプチドとを含む。一部の例では、第１のＭＨＣポリペプチドはβ２Ｍポリペプチドであり、第２のＭＨＣポリペプチドはＨＬＡ重鎖ポリペプチドである。一部の例では、ＨＬＡ重鎖ポリペプチドは、ＨＬＡ－Ａ＊０２０１ポリペプチドである。一部の例では、ＨＬＡ重鎖ポリペプチドは、Ａ２３６Ｃ置換を有するＨＬＡ－Ａ＊０２０１ポリペプチドである。一部の例では、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ヒトＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。一部の例では、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、Ｌ２３４Ａ及びＬ２３５Ａ置換を含むＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。一部の例では、第１及び第２のポリペプチドは、互いにジスルフィド結合している。一部の例では、免疫調節ポリペプチドは、Ｈ１６Ａ及びＦ４２Ａ置換を含むバリアント型ＩＬ－２ポリペプチドである。一部の例では、免疫調節ポリペプチドは、Ｈ１６Ｔ及びＦ４２Ａ置換を含むバリアント型ＩＬ－２ポリペプチドである。一部の例では、ＭＵＣ１ペプチドは、アミノ酸配列ＳＴＡＰＰＶＨＮＶ（配列番号５８７）を有し、９アミノ酸の長さを有する。一部の例では、ＭＵＣ１ペプチドは、アミノ酸配列ＳＬＡＰＰＶＨＮＶ（配列番号５８８）を有し、９アミノ酸の長さを有する。一部の例では、ＭＵＣ１ペプチドは、アミノ酸配列ＳＴＡＰＰＡＨＧＶ（配列番号５８６）を有し、９アミノ酸の長さを有する。一部の例では、ＭＵＣ１ペプチドは、アミノ酸配列ＳＬＡＰＰＡＨＧＶ（配列番号５８９）を有し、９アミノ酸の長さを有する。
一部の例では、本開示のＴＭＭＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）少なくとも１つの免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＵＣ１ペプチド、及びｉｉｉ）第１のＭＨＣポリペプチドを含む第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）第２のＭＨＣポリペプチド、及びｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第２のポリペプチドと、を含む。一部の例では、第１のＭＨＣポリペプチドはβ２Ｍポリペプチドであり、第２のＭＨＣポリペプチドはＨＬＡ重鎖ポリペプチドである。一部の例では、ＨＬＡ重鎖ポリペプチドは、ＨＬＡ－Ａ＊０２０１ポリペプチドである。一部の例では、ＨＬＡ重鎖ポリペプチドは、Ａ２３６Ｃ置換を有するＨＬＡ－Ａ＊０２０１ポリペプチドである。一部の例では、第１のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ペプチドエピトープ、ｉｉ）第１のＭＨＣポリペプチド、及びｉｉｉ）２つの免疫調節ポリペプチド（２つの免疫調節ポリペプチドは、同じアミノ酸配列を有する）を含む。一部の例では、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ヒトＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。一部の例では、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、Ｌ２３４Ａ及びＬ２３５Ａ置換を含むＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。一部の例では、第１及び第２のポリペプチドは互いにジスルフィド結合している。一部の例では、免疫調節ポリペプチドは、Ｈ１６Ａ及びＦ４２Ａ置換を含むバリアント型ＩＬ－２ポリペプチドである。一部の例では、免疫調節ポリペプチドは、Ｈ１６Ｔ及びＦ４２Ａ置換を含むバリアント型ＩＬ－２ポリペプチドである。一部の例では、ペプチドリンカーは、ｉ）第２のＭＨＣポリペプチドとＩｇ Ｆｃポリペプチドとの間、ｉｉ）ＭＵＣ１ペプチドと第１のＭＨＣポリペプチドとの間、ｉｉｉ）免疫調節ポリペプチドとＭＵＣ１ペプチドとの間、及び（ＴＭＭＰが第１のペプチド鎖上に２つの免疫調節ポリペプチドを含む場合）ｉｖ）２つの免疫調節ポリペプチド間、のうちの１つ以上の間にある。一部の例では、ペプチドリンカーは、アミノ酸配列ＡＡＡＧＧ（配列番号３８７）を含む。一部の例では、ペプチドリンカーは、アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号２５４）を含み、ｎは、１～１０の整数である（例えば、ｎは、２、３、または４である）。一部の例では、ＭＵＣ１ペプチドは、アミノ酸配列ＳＴＡＰＰＶＨＮＶ（配列番号５８７）を有し、９アミノ酸の長さを有する。I一部の例では、ＭＵＣ１ペプチドは、アミノ酸配列ＳＬＡＰＰＶＨＮＶ（配列番号５８８）を有し、９アミノ酸の長さを有する。一部の例では、ＭＵＣ１ペプチドは、アミノ酸配列ＳＴＡＰＰＡＨＧＶ（配列番号５８６）を有し、９アミノ酸の長さを有する。一部の例では、ＭＵＣ１ペプチドは、アミノ酸配列ＳＬＡＰＰＡＨＧＶ（配列番号５８９）を有し、９アミノ酸の長さを有する。
一部の例では、本開示のＴＭＭＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＵＣ１ペプチド、及びｉｉ）第１のＭＨＣポリペプチドを含む第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）第２のＭＨＣポリペプチド、ｉｉ）少なくとも１つの免疫調節ポリペプチド、及びｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第２のポリペプチドとを含む。一部の例では、第１のＭＨＣポリペプチドはβ２Ｍポリペプチドであり、第２のＭＨＣポリペプチドはＨＬＡ重鎖ポリペプチドである。一部の例では、ＨＬＡ重鎖ポリペプチドは、ＨＬＡ－Ａ＊０２０１ポリペプチドである。一部の例では、ＨＬＡ重鎖ポリペプチドは、Ａ２３６Ｃ置換を有するＨＬＡ－Ａ＊０２０１ポリペプチドである。一部の例では、第２のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）２つの免疫調節ポリペプチド（２つの免疫調節ポリペプチドは、同じアミノ酸配列を有する）、ｉｉ）第２のＭＨＣポリペプチド、及びｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む。一部の例では、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ヒトＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。一部の例では、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、Ｌ２３４Ａ及びＬ２３５Ａ置換を含むＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。一部の例では、第１及び第２のポリペプチドは互いにジスルフィド結合している。一部の例では、免疫調節ポリペプチドは、Ｈ１６Ａ及びＦ４２Ａ置換を含むバリアント型ＩＬ－２ポリペプチドである。一部の例では、免疫調節ポリペプチドは、Ｈ１６Ｔ及びＦ４２Ａ置換を含むバリアント型ＩＬ－２ポリペプチドである。一部の例では、ペプチドリンカーは、ｉ）第２のＭＨＣポリペプチドと免疫調節ポリペプチドとの間、ｉｉ）免疫調節ポリペプチドとＩｇ Ｆｃポリペプチドとの間、ｉｉｉ）ＭＵＣ１ペプチドと第１のＭＨＣポリペプチドとの間、及び（ＴＭＭＰが第２のポリペプチド鎖上に２つの免疫調節ポリペプチドを含む場合）ｉｖ）２つの免疫調節ポリペプチド間、のうちの１つ以上の間にある。一部の例では、ペプチドリンカーは、アミノ酸配列ＡＡＡＧＧ（配列番号３８７）を含む。一部の例では、ペプチドリンカーは、アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号２５４）を含み、ｎは、１～１０の整数である（例えば、ｎは、２、３、または４である）。一部の例では、ＭＵＣ１ペプチドは、アミノ酸配列ＳＴＡＰＰＶＨＮＶ（配列番号５８７）を有し、９アミノ酸の長さを有する。一部の例では、ＭＵＣ１ペプチドは、アミノ酸配列ｇ１４７ＳＬＡＰＰＶＨＮＶ（配列番号５８８）を有し、９アミノ酸の長さを有する。一部の例では、ＭＵＣ１ペプチドは、アミノ酸配列ＳＴＡＰＰＡＨＧＶ（配列番号５８６）を有し、９アミノ酸の長さを有する。一部の例では、ＭＵＣ１ペプチドは、アミノ酸配列ＳＬＡＰＰＡＨＧＶ（配列番号５８９）を有し、９アミノ酸の長さを有する。
１つの非限定的な例として、本開示のＴＭＭＰは、ａ）図１３Ａに示されるアミノ酸配列を含む第１のポリペプチドと、ｂ）図１４Ａに示されるアミノ酸配列を含む第２のポリペプチドとを含むことができる。さらなる例として、本開示のＴＭＭＰは、ａ）図１３Ａに示されるアミノ酸配列を含む第１のポリペプチドと、ｂ）図１４Ｂに示されるアミノ酸配列を含む第２のポリペプチドとを含むことができる。さらなる例として、本開示のＴＭＭＰは、ａ）図１３Ａに示されるアミノ酸配列を含む第１のポリペプチドと、ｂ）図１４Ｃに示されるアミノ酸配列を含む第２のポリペプチドとを含むことができる。さらなる例として、本開示のＴＭＭＰは、ａ）図１３Ａに示されるアミノ酸配列を含む第１のポリペプチドと、ｂ）図１４Ｄに示されるアミノ酸配列を含む第２のポリペプチドとを含むことができる。さらなる例として、本開示のＴＭＭＰは、ａ）図１３Ａに示されるアミノ酸配列を含む第１のポリペプチドと、ｂ）図１４Ｅに示されるアミノ酸配列を含む第２のポリペプチドとを含むことができる。さらなる例として、本開示のＴＭＭＰは、ａ）図１３Ａに示されるアミノ酸配列を含む第１のポリペプチドと、ｂ）図１４Ｆに示されるアミノ酸配列を含む第２のポリペプチドとを含むことができる。さらなる例として、本開示のＴＭＭＰは、ａ）図１３Ａに示されるアミノ酸配列を含む第１のポリペプチドと、ｂ）図１４Ｇに示されるアミノ酸配列を含む第２のポリペプチドとを含むことができる。さらなる例として、本開示のＴＭＭＰは、ａ）図１３Ａに示されるアミノ酸配列を含む第１のポリペプチドと、ｂ）図１４Ｈに示されるアミノ酸配列を含む第２のポリペプチドとを含むことができる。さらなる例として、本開示のＴＭＭＰは、ａ）図１３Ａに示されるアミノ酸配列を含む第１のポリペプチドと、ｂ）図１４Ｉに示されるアミノ酸配列を含む第２のポリペプチドとを含むことができる。さらなる例として、本開示のＴＭＭＰは、ａ）図１３Ａに示されるアミノ酸配列を含む第１のポリペプチドと、ｂ）図１４Ｊに示されるアミノ酸配列を含む第２のポリペプチドとを含むことができる。さらなる例として、本開示のＴＭＭＰは、ａ）図１３Ａに示されるアミノ酸配列を含む第１のポリペプチドと、ｂ）図１４Ｋに示されるアミノ酸配列を含む第２のポリペプチドとを含むことができる。さらなる例として、本開示のＴＭＭＰは、ａ）図１３Ａに示されるアミノ酸配列を含む第１のポリペプチドと、ｂ）図１４Ｌに示されるアミノ酸配列を含む第２のポリペプチドとを含むことができる。
１つの非限定的な例として、本開示のＴＭＭＰは、ａ）図１３Ｂに示されるアミノ酸配列を含む第１のポリペプチドと、ｂ）図１４Ａに示されるアミノ酸配列を含む第２のポリペプチドとを含むことができる。さらなる例として、本開示のＴＭＭＰは、ａ）図１３Ｂに示されるアミノ酸配列を含む第１のポリペプチドと、ｂ）図１４Ｂに示されるアミノ酸配列を含む第２のポリペプチドとを含むことができる。さらなる例として、本開示のＴＭＭＰは、ａ）図１３Ｂに示されるアミノ酸配列を含む第１のポリペプチドと、ｂ）図１４Ｃに示されるアミノ酸配列を含む第２のポリペプチドとを含むことができる。さらなる例として、本開示のＴＭＭＰは、ａ）図１３Ｂに示されるアミノ酸配列を含む第１のポリペプチドと、ｂ）図１４Ｄに示されるアミノ酸配列を含む第２のポリペプチドとを含むことができる。さらなる例として、本開示のＴＭＭＰは、ａ）図１３Ｂに示されるアミノ酸配列を含む第１のポリペプチドと、ｂ）図１４Ｅに示されるアミノ酸配列を含む第２のポリペプチドとを含むことができる。さらなる例として、本開示のＴＭＭＰは、ａ）図１３Ｂに示されるアミノ酸配列を含む第１のポリペプチドと、ｂ）図１４Ｆに示されるアミノ酸配列を含む第２のポリペプチドとを含むことができる。さらなる例として、本開示のＴＭＭＰは、ａ）図１３Ｂに示されるアミノ酸配列を含む第１のポリペプチドと、ｂ）図１４Ｇに示されるアミノ酸配列を含む第２のポリペプチドとを含むことができる。さらなる例として、本開示のＴＭＭＰは、ａ）図１３Ｂに示されるアミノ酸配列を含む第１のポリペプチドと、ｂ）図１４Ｈに示されるアミノ酸配列を含む第２のポリペプチドとを含むことができる。さらなる例として、本開示のＴＭＭＰは、ａ）図１３Ｂに示されるアミノ酸配列を含む第１のポリペプチドと、ｂ）図１４Ｉに示されるアミノ酸配列を含む第２のポリペプチドとを含むことができる。さらなる例として、本開示のＴＭＭＰは、ａ）図１３Ｂに示されるアミノ酸配列を含む第１のポリペプチドと、ｂ）図１４Ｊに示されるアミノ酸配列を含む第２のポリペプチドとを含むことができる。さらなる例として、本開示のＴＭＭＰは、ａ）図１３Ｂに示されるアミノ酸配列を含む第１のポリペプチドと、ｂ）図１４Ｋに示されるアミノ酸配列を含む第２のポリペプチドとを含むことができる。さらなる例として、本開示のＴＭＭＰは、ａ）図１３Ｂに示されるアミノ酸配列を含む第１のポリペプチドと、ｂ）図１４Ｌに示されるアミノ酸配列を含む第２のポリペプチドとを含むことができる。
多量体Ｔ細胞調節ポリペプチドの生成方法
本開示は、共免疫調節ポリペプチドに対する対応する親野生型免疫調節ポリペプチドの親和性と比較して、関連共免疫調節ポリペプチドに対してより低い親和性を示す１つ以上のバリアント型免疫調節ポリペプチドを含むＴＭＭＰを得る方法を提供し、その方法は、Ａ）複数のメンバーを含むＴＭＭＰのライブラリを生成することと（各メンバーは、ａ）ｉ）エピトープと、ｉｉ）第１の主要なＭＨＣポリペプチドとを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）ｉ）第２のＭＨＣポリペプチドと、任意選択で、ｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドまたは非Ｉｇスキャフォールドとを含む、第２のポリペプチドとを含み、各メンバーが、第１のポリペプチド、第２のポリペプチド、または第１及び第２のポリペプチドの両方に異なるバリアント型免疫調節ポリペプチドを含む）、Ｂ）関連共免疫調節ポリペプチドに対するライブラリの各メンバーの親和性を決定することと、Ｃ）関連共免疫調節ポリペプチドに対する低い親和性を示すメンバーを選択することとを含む。一部の例では、親和性は、精製されたＴＭＭＰライブラリメンバー及び関連共免疫調節ポリペプチドを使用して、バイオレイヤー干渉法（ＢＬＩ）によって決定される。ＢＬＩ法は、当業者に周知である。ＢＬＩアッセイは上記に記載されている。例えば、Ｌａｄ ｅｔ ａｌ．（２０１５）Ｊ．Ｂｉｏｍｏｌ．Ｓｃｒｅｅｎ．２０（４）：４９８－５０７及びＳｈａｈ ａｎｄ Ｄｕｎｃａｎ（２０１４）Ｊ．Ｖｉｓ．Ｅｘｐ．１８：ｅ５１３８３を参照されたい。
本開示は、Ｔ細胞への選択的結合を示すＴＭＭＰを得る方法を提供し、その方法は、Ａ）複数のメンバーを含むＴＭＭＰのライブラリを生成することと（各メンバーは、ａ）ｉ）エピトープとｉｉ）第１のＭＨＣポリペプチドとを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）ｉ）第２のＭＨＣポリペプチドと、任意選択で、ｉｉ）免疫グロブリン（Ｉｇ） Ｆｃポリペプチドまたは非Ｉｇスキャフォールドとを含む、第２のポリペプチドとを含み、各メンバーは、第１のポリペプチド、第２のポリペプチド、または第１及び第２のポリペプチドの両方に異なるバリアント型免疫調節ポリペプチドを含み、バリアント型免疫調節ポリペプチドは、親野生型免疫調節ポリペプチドとアミノ酸配列が１～１０アミノ酸異なる）、Ｂ）ＴＭＭＰライブラリメンバーを、その表面上に、ｉ）親野生型免疫調節ポリペプチドに結合する関連共免疫調節ポリペプチド及びｉｉ）エピトープに結合するＴ細胞受容体を発現する標的Ｔ細胞と接触させることと（ＴＭＭＰライブラリメンバーが標的Ｔ細胞に結合するように、ＴＭＭＰライブラリメンバーはエピトープタグを含む）、Ｃ）標的Ｔ細胞に結合するＴＭＭＰライブラリメンバーを、エピトープタグに結合する蛍光標識された結合剤と接触させ、ＴＭＭＰライブラリメンバー／標的Ｔ細胞／結合剤複合体を生成することと、Ｄ）フローサイトメトリーを使用してＴＭＭＰライブラリメンバー／標的Ｔ細胞／結合剤複合体の平均蛍光強度（ＭＦＩ）を測定することと（ＴＭＭＰライブラリメンバーの濃度範囲にわたり測定されたＭＦＩにより、親和性及び明らかな結合力の指標がもたらされる）、Ｅ）ｉ）親野生型免疫調節ポリペプチドに結合する関連共免疫調節ポリペプチドと、ｉｉ）ＴＭＭＰライブラリメンバー内に存在するエピトープ以外のエピトープに結合するＴ細胞受容体とを含む、対照Ｔ細胞へのＴＭＭＰライブラリメンバーの結合と比較して、標的Ｔ細胞に選択的に結合するＴＭＭＰライブラリメンバーを選択することとを含む。一部の例では、標的Ｔ細胞に選択的に結合することが確認されたＴＭＭＰライブラリメンバーは、ライブラリから単離される。
一部の例では、親野生型免疫調節ポリペプチドと関連免疫調節ポリペプチドのペアは、
ＩＬ－２とＩＬ－２受容体、
４－１ＢＢＬと４－１ＢＢ、
ＰＤ－Ｌ１とＰＤ－１、
ＣＤ７０とＣＤ２７、
ＴＧＦβとＴＧＦβ受容体、
ＣＤ８０とＣＤ２８、
ＣＤ８６とＣＤ２８、
ＯＸ４０ＬとＯＸ４０、
ＦａｓＬとＦａｓ、
ＩＣＯＳ－ＬとＩＣＯＳ、
ＩＣＡＭとＬＦＡ－１、
ＪＡＧ１とＮｏｔｃｈ、
ＪＡＧ１とＣＤ４６、
ＣＤ８０とＣＴＬＡ４、及び、
ＣＤ８６とＣＴＬＡ４から選択される。
本開示は、共免疫調節ポリペプチドに対する対応する親野生型免疫調節ポリペプチドの親和性と比較して、関連共免疫調節ポリペプチドに対する低い親和性を示す１つ以上のバリアント型免疫調節ポリペプチドを含むＴＭＭＰを得るための方法を提供し、その方法は、複数のメンバーを含むＴＭＭＰのライブラリから、関連共免疫調節ポリペプチドに対する低い親和性を示すメンバーを選択すること（複数のメンバーは、ａ）ｉ）エピトープと、ｉｉ）第１のＭＨＣポリペプチドとを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）ｉ）第２のＭＨＣポリペプチドと、任意選択で、ｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドまたは非Ｉｇスキャフォールドと、を含む、第２のポリペプチドと、を含み、ライブラリのメンバーは、第１のポリペプチド、第２のポリペプチド、または第１のポリペプチド及び第２のポリペプチドの両方に存在する複数のバリアント型免疫調節ポリペプチドを含む）を含む。一部の例では、選択工程は、バイオレイヤー干渉法を使用して、ＴＭＭＰライブラリメンバーと関連共免疫調節ポリペプチドの間の結合親和性を測定することを含む。一部の例では、ＴＭＭＰは上述したとおりである。
一部の例では、方法は、ａ）ｉ）親野生型免疫調節ポリペプチドに結合する関連共免疫調節ポリペプチドとｉｉ）エピトープに結合するＴ細胞受容体をその表面上に発現する標的Ｔ細胞に、選択ＴＭＭＰライブラリメンバーを接触させることと（ＴＭＭＰライブラリメンバーはエピトープタグを含み、その結果、ＴＭＭＰライブラリメンバーは標的Ｔ細胞に結合する）、ｂ）エピトープタグに結合する蛍光標識結合因子に、標的Ｔ細胞に結合した選択ＴＭＭＰライブラリメンバーを接触させて、選択ＴＭＭＰライブラリメンバー／標的Ｔ細胞／結合因子複合体を作製することと、ｃ）フローサイトメトリーを使用して選択ＴＭＭＰライブラリメンバー／標的Ｔ細胞／結合因子複合体の平均蛍光強度（ＭＦＩ）を測定することと（選択ＴＭＭＰライブラリメンバーの濃度範囲にわたり測定されたＭＦＩにより、親和性及び明らかな結合力の指標がもたらされる）、を更に含む。標的Ｔ細胞に選択的に結合する選択ＴＭＭＰライブラリメンバーは、ｉ）親野生型免疫調節ポリペプチドに結合する関連共免疫調節ポリペプチドとｉｉ）ＴＭＭＰライブラリメンバー内に存在するエピトープ以外のエピトープに結合するＴ細胞受容体を含む対照Ｔ細胞へのＴＭＭＰライブラリメンバーの結合と比較して、標的Ｔ細胞に選択的に結合することが確認される。一部の例では、結合因子は、エピトープタグに特異的な抗体である。一部の例では、バリアント型免疫調節ポリペプチドは、対応する親野生型免疫調節ポリペプチドと比較して、１～２０のアミノ酸置換（例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０のアミノ酸置換）を含む。一部の例では、ＴＭＭＰは、２つのバリアント型免疫調節ポリペプチドを含む。一部の例では、２つのバリアント型免疫調節ポリペプチドは、同一のアミノ酸配列を含む。一部の例では、第１のポリペプチドは、２つのバリアント型免疫調節ポリペプチドのうちの１つを含み、第２のポリペプチドは、２つのバリアント型免疫調節ポリペプチドのうちの２つ目を含む。一部の例では、２つのバリアント型免疫調節ポリペプチドは、ＴＭＭＰの同一のポリペプチド鎖上にある。一部の例では、２つのバリアント型免疫調節ポリペプチドは、ＴＭＭＰの第１のポリペプチド上にある。一部の例では、２つのバリアント型免疫調節ポリペプチドは、ＴＭＭＰの第２のポリペプチド上にある。
一部の例では、方法は、選択ＴＭＭＰライブラリメンバーをライブラリから単離することを更に含む。一部の例では、方法は、選択ＴＭＭＰライブラリメンバーをコードするヌクレオチド配列を含む核酸を提供することを更に含む。一部の例では、核酸は組換え発現ベクター内に存在する。一部の例では、ヌクレオチド配列は、真核細胞において機能的である転写制御エレメントに機能的に連結する。一部の例では、方法は、真核生物宿主細胞に核酸を導入し、液体培地内で細胞を培養して、細胞内でコードされた選択ＴＭＭＰライブラリメンバーを合成することを更に含む。一部の例では、方法は、細胞または細胞を含む液体培地から、合成した選択ＴＭＭＰライブラリメンバーを単離することを更に含む。一部の例では、選択ＴＭＭＰライブラリメンバーはＩｇ Ｆｃポリペプチドを含む。一部の例では、方法は、薬物をＩｇ Ｆｃポリペプチドにコンジュゲートすることを更に含む。一部の例では、薬物は、メイタンシノイド、ベンゾジアゼピン、タキソイド、ＣＣ－１０６５、デュオカルマイシン、デュオカルマイシン類似体、カリケアミシン、ドラスタチン、ドラスタチン類似体、アウリスタチン、トマイマイシン、及びレプトマイシン、または、上記のうちのいずれか１つのプロドラッグから選択される細胞傷害薬である。一部の例では、薬物はレチノイドである。一部の例では、親野生型免疫調節ポリペプチドと関連免疫調節ポリペプチドは、ＩＬ－２とＩＬ－２受容体、４－１ＢＢＬと４－１ＢＢ、ＰＤ－Ｌ１とＰＤ－１、ＣＤ７０とＣＤ２７、ＴＧＦβとＴＧＦβ受容体、ＣＤ８０とＣＤ２８、ＣＤ８６とＣＤ２８、ＯＸ４０ＬとＯＸ４０、ＦａｓＬとＦａｓ、ＩＣＯＳ－ＬとＩＣＯＳ、ＩＣＡＭとＬＦＡ－１、ＪＡＧ１とＮｏｔｃｈ、ＪＡＧ１とＣＤ４６、ＣＤ８０とＣＴＬＡ４、及びＣＤ８６とＣＴＬＡ４から選択される。
本開示は、共免疫調節ポリペプチドに対する対応する親野生型免疫調節ポリペプチドの親和性と比較して、関連共免疫調節ポリペプチドに対して低い親和性を示す１つ以上のバリアント型免疫調節ポリペプチドを含むＴＭＭＰを得る方法を提供し、その方法は、Ａ）複数のメンバーを含むＴＭＭＰのライブラリを提供することと（複数のメンバーは、ａ）ｉ）エピトープと、ｉｉ）第１のＭＨＣポリペプチドとを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）ｉ）第２のＭＨＣポリペプチドと、ｉｉ）任意選択でＩｇ Ｆｃポリペプチドまたは非Ｉｇスキャフォールドとを含む、第２のポリペプチドとを含み、ライブラリのメンバーは、第１のポリペプチド、第２のポリペプチド、または第１のポリペプチド及び第２のポリペプチドの両方に存在する複数のバリアント型免疫調節ポリペプチドを含む）、Ｂ）ライブラリから、関連共免疫調節ポリペプチドに対して低い親和性を示すメンバーを選択することとを含む。一部の例では、選択工程は、バイオレイヤー干渉法を使用して、ＴＭＭＰライブラリメンバーと関連共免疫調節ポリペプチドの間の結合親和性を測定することを含む。一部の例では、ＴＭＭＰは上述したとおりである。
一部の例では、方法は、ａ）ｉ）親野生型免疫調節ポリペプチドに結合する関連共免疫調節ポリペプチドとｉｉ）エピトープに結合するＴ細胞受容体をその表面上に発現する標的Ｔ細胞に、選択ＴＭＭＰライブラリメンバーを接触させることと（ＴＭＭＰライブラリメンバーはエピトープタグを含み、その結果、ＴＭＭＰライブラリメンバーは標的Ｔ細胞に結合する）、ｂ）エピトープタグに結合する蛍光標識結合因子に、標的Ｔ細胞に結合した選択ＴＭＭＰライブラリメンバーを接触させて、選択ＴＭＭＰライブラリメンバー／標的Ｔ細胞／結合因子複合体を作製することと、ｃ）フローサイトメトリーを使用して選択ＴＭＭＰライブラリメンバー／標的Ｔ細胞／結合因子複合体の平均蛍光強度（ＭＦＩ）を測定することと（選択ＴＭＭＰライブラリメンバーの濃度範囲にわたり測定されたＭＦＩにより、親和性及び明らかな結合力の指標がもたらされる）、を更に含む。標的Ｔ細胞に選択的に結合する選択ＴＭＭＰライブラリメンバーは、ｉ）親野生型免疫調節ポリペプチドに結合する関連共免疫調節ポリペプチドとｉｉ）ＴＭＭＰライブラリメンバー内に存在するエピトープ以外のエピトープに結合するＴ細胞受容体を含む対照Ｔ細胞へのＴＭＭＰライブラリメンバーの結合と比較して、標的Ｔ細胞に選択的に結合することが確認される。一部の例では、結合因子は、エピトープタグに特異的な抗体である。一部の例では、バリアント型免疫調節ポリペプチドは、対応する親野生型免疫調節ポリペプチドと比較して、１～２０のアミノ酸置換（例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０のアミノ酸置換）を含む。一部の例では、ＴＭＭＰは、２つのバリアント型免疫調節ポリペプチドを含む。一部の例では、２つのバリアント型免疫調節ポリペプチドは、同一のアミノ酸配列を含む。一部の例では、第１のポリペプチドは、２つのバリアント型免疫調節ポリペプチドのうちの１つを含み、第２のポリペプチドは、２つのバリアント型免疫調節ポリペプチドのうちの２つ目を含む。一部の例では、２つのバリアント型免疫調節ポリペプチドは、ＴＭＭＰの同一のポリペプチド鎖上にある。一部の例では、２つのバリアント型免疫調節ポリペプチドは、ＴＭＭＰの第１のポリペプチド上にある。一部の例では、２つのバリアント型免疫調節ポリペプチドは、ＴＭＭＰの第２のポリペプチド上にある。
一部の例では、方法は、選択ＴＭＭＰライブラリメンバーをライブラリから単離することを更に含む。一部の例では、方法は、選択ＴＭＭＰライブラリメンバーをコードするヌクレオチド配列を含む核酸を提供することを更に含む。一部の例では、核酸は組換え発現ベクター内に存在する。一部の例では、ヌクレオチド配列は、真核細胞において機能的である転写制御エレメントに機能的に連結する。一部の例では、方法は、真核生物宿主細胞に核酸を導入し、液体培地内で細胞を培養して、細胞内でコードされた選択ＴＭＭＰライブラリメンバーを合成することを更に含む。一部の例では、方法は、細胞または細胞を含む液体培地から、合成した選択ＴＭＭＰライブラリメンバーを単離することを更に含む。一部の例では、選択ＴＭＭＰライブラリメンバーはＩｇ Ｆｃポリペプチドを含む。一部の例では、方法は、薬物をＩｇ Ｆｃポリペプチドにコンジュゲートすることを更に含む。一部の例では、薬物は、メイタンシノイド、ベンゾジアゼピン、タキソイド、ＣＣ－１０６５、デュオカルマイシン、デュオカルマイシン類似体、カリケアミシン、ドラスタチン、ドラスタチン類似体、アウリスタチン、トマイマイシン、及びレプトマイシン、または、上記のうちのいずれか１つのプロドラッグから選択される細胞傷害薬である。一部の例では、薬物はレチノイドである。一部の例では、親野生型免疫調節ポリペプチドと関連免疫調節ポリペプチドは、ＩＬ－２とＩＬ－２受容体、４－１ＢＢＬと４－１ＢＢ、ＰＤ－Ｌ１とＰＤ－１、ＴＧＦβとＴＧＦβ受容体、ＣＤ８０とＣＤ２８、ＣＤ８６とＣＤ２８、ＯＸ４０ＬとＯＸ４０、ＦａｓＬとＦａｓ、ＩＣＯＳ－ＬとＩＣＯＳ、ＣＤ７０とＣＤ２７、ＩＣＡＭとＬＦＡ－１、ＪＡＧ１とＮｏｔｃｈ、ＪＡＧ１とＣＤ４６、ＣＤ８０とＣＴＬＡ４、及び、ＣＤ８６とＣＴＬＡ４、から選択される。
核酸
本開示は、本開示のＴＭＭＰをコードするヌクレオチド配列を含む核酸を提供する。本開示は、本開示のＴＭＭＰをコードするヌクレオチド配列を含む核酸を提供する。
本開示は、本開示のＴＭＭＰをコードするヌクレオチド配列を含む核酸を提供する。一部の例では、本開示のＴＭＭＰの個々のポリペプチド鎖は、個々の核酸内でコードされる。一部の例では、本開示のＴＭＭＰの全てのポリペプチド鎖は、単一の核酸内でコードされる。一部の例では、第１の核酸は、本開示のＴＭＭＰの第１のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、第２の核酸は、本開示のＴＭＭＰの第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む。一部の例では、単一の核酸は、本開示のＴＭＭＰの第１のポリペプチドと本開示のＴＭＭＰの第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む。
多量体ポリペプチドの個々のポリペプチド鎖をコードする個々の核酸
本開示は、本開示のＴＭＭＰをコードするヌクレオチド配列を含む核酸を提供する。上に記載したように、一部の例では、本開示のＴＭＭＰの個々のポリペプチド鎖は、個々の核酸内でコードされる。一部の例では、本開示のＴＭＭＰの個々のポリペプチド鎖をコードするヌクレオチド配列は、転写制御エレメント、例えば、プロモーター、例えば、真核細胞において機能的であるプロモーターなどに機能的に連結し、プロモーターは、構成的プロモーターまたは誘導性プロモーターであってもよい。
本開示は、第１の核酸及び第２の核酸を提供し、第１の核酸は、本開示のＴＭＭＰの第１のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、第１のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ａ）エピトープ（例えば、Ｔ細胞エピトープ）、ｂ）第１のＭＨＣポリペプチド、及びｃ）免疫調節ポリペプチド（例えば、上述の低い親和性のバリアント型）を含み、第２の核酸は、本開示のＴＭＭＰの第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、第２のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ａ）第２のＭＨＣポリペプチド、及びｂ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む。好適なＴ細胞エピトープ、ＭＨＣポリペプチド、免疫調節ポリペプチド、及びＩｇ Ｆｃポリペプチドについては上述したとおりである。一部の例では、第１のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列及び第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、転写制御エレメントに機能的に連結する。一部の例では、転写制御エレメントは、真核細胞において機能的であるプロモーターである。一部の例では、核酸は、個々の発現ベクター内に存在する。
本開示は、第１の核酸及び第２の核酸を提供し、第１の核酸は、本開示のＴＭＭＰの第１のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、第１のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ａ）エピトープ（例えば、Ｔ細胞エピトープ）、及びｂ）第１のＭＨＣポリペプチドを含み、第２の核酸は、本開示のＴＭＭＰの第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、第２のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ａ）免疫調節ポリペプチド（例えば、上述した低い親和性のバリアント型）、ｂ）第２のＭＨＣポリペプチド、及びｃ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む。好適なＴ細胞エピトープ、ＭＨＣポリペプチド、免疫調節ポリペプチド、及びＩｇ Ｆｃポリペプチドについては上述したとおりである。一部の例では、第１のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列及び第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、転写制御エレメントに機能的に連結する。一部の例では、転写制御エレメントは、真核細胞において機能的であるプロモーターである。一部の例では、核酸は、個々の発現ベクター内に存在する。
多量体ポリペプチド内に存在する２種以上のポリペプチドをコードする核酸
本開示は、本開示のＴＭＭＰの第１のポリペプチド及び第２のポリペプチドを少なくともコードするヌクレオチド配列を含む核酸を提供する。一部の例では、本開示のＴＭＭＰは、第１、第２及び第３のポリペプチドを含み、核酸は、第１、第２及び第３のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む。一部の例では、本開示のＴＭＭＰの、第１のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列及び第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、第１のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列と第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列の間に配置されたタンパク質分解開裂性リンカーを含む。一部の例では、本開示のＴＭＭＰの、第１のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列及び第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、第１のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列と第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列の間に配置された配列内リボソーム進入部位（ＩＲＥＳ）を含む。一部の例では、本開示のＴＭＭＰの、第１のポリペプチド及び第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、第１のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列と第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列との間に配置されたリボソームスキッピングシグナル（またはシス作用性加水分解酵素エレメント、ＣＨＹＳＥＬ）を含む。核酸の例については以下に記載するが、タンパク質分解開裂性リンカーは、本開示のＴＭＭＰの、第１のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列及び第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列の間に配置され、これらの実施形態のいずれかにおいて、ＩＲＥＳまたはリボソームスキッピングシグナルは、タンパク質分解開裂性リンカーをコードするヌクレオチド配列の代わりに使用され得る。
一部の例では、第１の核酸（例えば、組換え発現ベクター、ｍＲＮＡ、ウイルスＲＮＡなど）は、本開示のＴＭＭＰの第１のポリペプチド鎖をコードするヌクレオチド配列を含み、第２の核酸（例えば、組換え発現ベクター、ｍＲＮＡ、ウイルスＲＮＡなど）は、本開示のＴＭＭＰの第２のポリペプチド鎖をコードするヌクレオチド配列を含む。一部の例では、第１のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列と第２のポリペプチドをコードする第２のヌクレオチド配列はそれぞれ、転写制御エレメント、例えば、プロモーター、例えば、真核細胞において機能的であるプロモーターなどに機能的に連結し、プロモーターは、構成的プロモーターまたは誘導性プロモーターであってもよい。
本開示は、組換えポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸を提供し、組換えポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ａ）エピトープ（例えば、Ｔ細胞エピトープ）、ｂ）第１のＭＨＣポリペプチド、ｃ）免疫調節ポリペプチド（例えば、上述した低い親和性のバリアント型）、ｄ）タンパク質分解開裂性リンカー、ｅ）第２のＭＨＣポリペプチド、及びｆ）免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドを含む。本開示は、組換えポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸を提供し、組換えポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ａ）第１のリーダーペプチド、ｂ）エピトープ、ｃ）第１のＭＨＣポリペプチド、ｄ）免疫調節ポリペプチド（例えば、上述した低い親和性のバリアント型）、ｅ）タンパク質分解開裂性リンカー、ｆ）第２のリーダーペプチド、ｇ）第２のＭＨＣポリペプチド、及びｈ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む。本開示は、組換えポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸を提供し、組換えポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ａ）エピトープ、ｂ）第１のＭＨＣポリペプチド、ｃ）タンパク質分解開裂性リンカー、ｄ）免疫調節ポリペプチド（例えば、上述した低い親和性のバリアント型）、ｅ）第２のＭＨＣポリペプチド、及びｆ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む。一部の例では、第１のリーダーペプチド及び第２のリーダーペプチドはβ２－Ｍリーダーペプチドである。一部の例では、ヌクレオチド配列は転写制御エレメントに機能的に連結する。一部の例では、転写制御エレメントは、真核細胞において機能的であるプロモーターである。
好適なＭＨＣポリペプチドについては上述したとおりである。一部の例では、第１のＭＨＣポリペプチドはβ２－ミクログロブリンポリペプチドであり、第２のＭＨＣポリペプチドはＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドである。一部の例では、β２－ミクログロブリンポリペプチドは、図４に記載のβ２Ｍアミノ酸配列に対して少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。一部の例では、ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、ＨＬＡ－Ａ、ＨＬＡ－Ｂ、ＨＬＡ－Ｃ、ＨＬＡ－Ｅ、ＨＬＡ－Ｆ、ＨＬＡ－Ｇ、ＨＬＡ－Ｋ、またはＨＬＡ－Ｌ重鎖である。
好適なＦｃポリペプチドについては上述したとおりである。一部の例では、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチド、ＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチド、ＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチド、ＩｇＧ４ Ｆｃポリペプチド、ＩｇＡ Ｆｃポリペプチド、またはＩｇＭ Ｆｃポリペプチドである。一部の例では、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、図３Ａ～３Ｇに記載のアミノ酸配列に対して少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
好適な免疫調節ポリペプチドについては上述したとおりである。
好適なタンパク質分解開裂性リンカーについては上述したとおりである。一部の例では、タンパク質分解開裂性リンカーは、ａ）ＬＥＶＬＦＱＧＰ（配列番号５５６）、ｂ）ＥＮＬＹＴＱＳ（配列番号５５７）、ｃ）ＤＤＤＤＫ（配列番号５５８）、ｄ）ＬＶＰＲ（配列番号５５９）、及びｅ）ＧＳＧＡＴＮＦＳＬＬＫＱＡＧＤＶＥＥＮＰＧＰ（配列番号５６０）から選択されるアミノ酸配列を含む。
一部の例では、エピトープと第１のＭＨＣポリペプチドの間のリンカーは第１のＣｙｓ残基を含み、第２のＭＨＣポリペプチドは、第２のＣｙｓ残基をもたらすアミノ酸置換を含み、その結果、第１のＣｙｓ残基と第２のＣｙｓ残基は、リンカーと第２のＭＨＣポリペプチドとの間にジスルフィド結合をもたらす。一部の例では、第１のＭＨＣポリペプチドは、第１のＣｙｓ残基をもたらすアミノ酸置換を含み、第２のＭＨＣポリペプチドは、第２のＣｙｓ残基をもたらすアミノ酸置換を含み、その結果、第１のＣｙｓ残基と第２のＣｙｓ残基は、第１のＭＨＣポリペプチドと第２のＭＨＣポリペプチドとの間にジスルフィド結合をもたらす。
組換え発現ベクター
本開示は、本開示の核酸を含む組換え発現ベクターを提供する。一部の例では、組換え発現ベクターは非ウイルスベクターである。一部の例では、組換え発現ベクターは、ウイルス性構築物、例えば、組換えアデノ随伴ウイルス性構築物（例えば、米国特許第７，０７８，３８７号を参照されたい）、組換えアデノウイルス性構築物、組換えレンチウイルス性構築物、組換えレトロウイルス性構築物、非一体型ウイルスベクターなどである。
好適な発現ベクターとしては、ウイルスベクター（例えば、ワクシニアウイルス、ポリオウイルス、アデノウイルス（例えば、Ｌｉ ｅｔ ａｌ．，Ｉｎｖｅｓｔ Ｏｐｔｈａｌｍｏｌ Ｖｉｓ Ｓｃｉ ３５：２５４３ ２５４９，１９９４、Ｂｏｒｒａｓ ｅｔ ａｌ．，Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒ ６：５１５ ５２４，１９９９、Ｌｉ ａｎｄ Ｄａｖｉｄｓｏｎ，ＰＮＡＳ ９２：７７００ ７７０４，１９９５、Ｓａｋａｍｏｔｏ ｅｔ ａｌ．，Ｈ Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒ ５：１０８８ １０９７，１９９９、ＷＯ９４／１２６４９、ＷＯ９３／０３７６９、ＷＯ９３／１９１９１、ＷＯ９４／２８９３８、ＷＯ９５／１１９８４、及びＷＯ９５／００６５５を参照されたい）、アデノ関連ウイルス（例えば、Ａｌｉ ｅｔ ａｌ．，Ｈｕｍ Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒ ９：８１ ８６，１９９８，Ｆｌａｎｎｅｒｙ ｅｔ ａｌ．，ＰＮＡＳ ９４：６９１６ ６９２１，１９９７、Ｂｅｎｎｅｔｔ ｅｔ ａｌ．，Ｉｎｖｅｓｔ Ｏｐｔｈａｌｍｏｌ Ｖｉｓ Ｓｃｉ ３８：２８５７ ２８６３，１９９７、Ｊｏｍａｒｙ ｅｔ ａｌ．，Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒ ４：６８３ ６９０，１９９７，Ｒｏｌｌｉｎｇ ｅｔ ａｌ．，Ｈｕｍ Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒ １０：６４１ ６４８，１９９９、Ａｌｉ ｅｔ ａｌ．，Ｈｕｍ Ｍｏｌ Ｇｅｎｅｔ ５：５９１ ５９４，１９９６、Ｓｒｉｖａｓｔａｖａ ｉｎ ＷＯ９３／０９２３９、Ｓａｍｕｌｓｋｉ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｖｉｒ．（１９８９）６３：３８２２－３８２８、Ｍｅｎｄｅｌｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｖｉｒｏｌ．（１９８８）１６６：１５４－１６５、及びＦｌｏｔｔｅ ｅｔ ａｌ．，ＰＮＡＳ（１９９３）９０：１０６１３－１０６１７を参照されたい）、ＳＶ４０、単純ヘルペスウイルス、ヒト免疫不全ウイルス（例えば、Ｍｉｙｏｓｈｉ ｅｔ ａｌ．，ＰＮＡＳ ９４：１０３１９ ２３，１９９７、Ｔａｋａｈａｓｈｉ ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｖｉｒｏｌ ７３：７８１２ ７８１６，１９９９を参照されたい）に基づくウイルスベクター、レトロウイルスベクター（例えば、マウス白血病ウイルス、脾臓壊死ウイルス、及びラウス肉腫ウイルス、ハーベイ肉腫ウイルス、鳥類白血病ウイルス、レンチウイルス、ヒト免疫不全ウイルス、骨髄増殖性肉腫ウイルス、及び乳房腫瘍ウイルスなどのレトロウイルスに由来するベクター）などが挙げられるが、これらに限定されない。
多数の好適な発現ベクターが当業者に周知であり、その多くは市販されている。真核生物宿主細胞用に、以下のベクター、ｐＸＴ１、ｐＳＧ５（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ）、ｐＳＶＫ３、ｐＢＰＶ、ｐＭＳＧ、及び、ｐＳＶＬＳＶ４０（Ｐｈａｒｍａｃｉａ）を例として提供する。しかしながら、宿主細胞に適合する限りにおいて、任意のその他のベクターを使用してもよい。
利用される宿主／ベクター系に応じて、構成的及び誘導性プロモーター、転写エンハンサーエレメント、転写ターミネーターなどを含む、いくつかの好適な転写及び翻訳制御エレメントのうちのいずれかが、発現ベクターにおいて使用され得る（例えば、Ｂｉｔｔｅｒ ｅｔ ａｌ（１９８７）Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ，１５３：５１６－５４４を参照されたい）。
一部の例では、ＤＮＡ標的化ＲＮＡ及び／または部位特異的修飾ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、制御エレメント、例えば、プロモーターなどの転写制御エレメントに機能的に連結する。転写制御エレメントは、真核細胞（例えば、哺乳動物細胞）または原核細胞（例えば、細菌細胞または古細菌細胞）のいずれかにおいて機能的であってもよい。一部の例では、ＤＮＡ標的化ＲＮＡ及び／または部位特異的修飾ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、原核細胞と真核細胞の両方においてＤＮＡ標的化ＲＮＡ及び／または部位特異的修飾ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列の発現を可能とする複数の制御エレメントに機能的に連結する。
好適な真核細胞プロモーター（真核細胞において機能的なプロモーター）の非限定例としては、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）前初期、単純ヘルペスウイルス（ＨＳＶ）チミジンキナーゼ、初期及び後期ＳＶ４０、レトロウイルス由来長末端反復配列（ＬＴＲ）、及びマウスメタロチオネイン－Ｉからのものが挙げられる。適切なベクター及びプロモーターの選択については、十分に当業者のレベルの範囲内である。発現ベクターはまた、翻訳開始用のリボソーム結合部位及び転写ターミネーターを含有していてもよい。発現ベクターはまた、発現を増幅させるための適切な配列を含んでいてもよい。
遺伝子組換え宿主細胞
本開示は遺伝子組換え宿主細胞を提供し、その宿主細胞は本開示の核酸で遺伝子組換えされている。
好適な宿主細胞としては、イースト菌などの真核細胞、昆虫細胞、及び哺乳動物細胞が挙げられる。一部の例では、宿主細胞は哺乳動物細胞株の細胞である。好適な哺乳動物細胞株としては、ヒト細胞株、非ヒト霊長類細胞株、げっ歯類（例えば、マウス、ラット）細胞株などが挙げられる。好適な哺乳動物細胞株としては、ＨｅＬａ細胞（例えば、Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｔｙｐｅ Ｃｕｌｔｕｒｅ Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ（ＡＴＣＣ）番号ＣＣＬ－２）、ＣＨＯ細胞（例えば、ＡＴＣＣ番号ＣＲＬ９６１８、ＣＣＬ６１、ＣＲＬ９０９６）、２９３細胞（例えば、ＡＴＣＣ番号ＣＲＬ－１５７３）、Ｖｅｒｏ細胞、ＮＩＨ ３Ｔ３細胞（例えば、ＡＴＣＣ番号ＣＲＬ－１６５８）、Ｈｕｈ－７細胞、ＢＨＫ細胞（例えば、ＡＴＣＣ番号ＣＣＬ１０）、ＰＣ１２細胞（ＡＴＣＣ番号ＣＲＬ１７２１）、ＣＯＳ細胞、ＣＯＳ－７細胞（ＡＴＣＣ番号ＣＲＬ１６５１）、ＲＡＴ１細胞、マウスＬ細胞（ＡＴＣＣ番号ＣＣＬＩ．３）、ヒト胎児腎臓（ＨＥＫ）細胞（ＡＴＣＣ番号ＣＲＬ１５７３）、ＨＬＨｅｐＧ２細胞などが挙げられるがこれらに限定されない。
一部の例では、宿主細胞は、内在性ＭＨＣβ２－Ｍを合成しないように遺伝子組換えされた哺乳動物細胞である。
一部の例では、宿主細胞は、内在性ＭＨＣクラスＩ重鎖を合成しないように遺伝子組換えされた哺乳動物細胞である。一部の例では、宿主細胞は、内在性ＭＨＣβ２－Ｍを合成しないように、及び内在性ＭＨＣクラスＩ重鎖を合成しないように遺伝子組換えされた哺乳動物細胞である。
組成物
本開示は、本開示のＴＭＭＰ（ｓｙｎＴａｃ）を含む組成物（医薬組成物を含む）を提供する。本開示は、本開示のＴＭＭＰを含む組成物（医薬組成物を含む）を提供する。本開示は、本開示の核酸または組換え発現ベクターを含む組成物（医薬組成物を含む）を提供する。
多量体ポリペプチドを含む組成物
本開示の組成物は、本開示のＴＭＭＰに加えて、塩、例えば、ＮａＣｌ、ＭｇＣｌ２、ＫＣｌ、ＭｇＳＯ４など；緩衝剤、例えば、トリス緩衝剤、Ｎ－（２－ヒドロキシエチル）ピペラジン－Ｎ’－（２－エタンスルホン酸）（ＨＥＰＥＳ）、２－（Ｎ－モルホリノ）エタンスルホン酸（ＭＥＳ）、２－（Ｎ－モルホリノ）エタンスルホン酸ナトリウム塩（ＭＥＳ）、３－（Ｎ－モルホリノ）プロパンスルホン酸（ＭＯＰＳ）、Ｎ－トリス［ヒドロキシメチル］メチル－３－アミノプロパンスルホン酸（ＴＡＰＳ）など；可溶化剤；界面活性剤、例えば、Ｔｗｅｅｎ－２０などの非イオン性界面活性剤など；プロテアーゼ阻害剤；グリセロールなどのうちの１種以上を含み得る。
組成物は薬学的に許容される賦形剤を含んでいてもよく、その種類は当該技術分野において周知であり、本明細書で詳細に論述する必要はない。薬学的に許容される賦形剤は、例えば、“Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ：Ｔｈｅ Ｓｃｉｅｎｃｅ ａｎｄ Ｐｒａｃｔｉｃｅ ｏｆ Ｐｈａｒｍａｃｙ”，１９ｔｈ Ｅｄ．（１９９５）または最新版、Ｍａｃｋ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ Ｃｏ、Ａ． Ｇｅｎｎａｒｏ（２０００）“Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ：Ｔｈｅ Ｓｃｉｅｎｃｅ ａｎｄ Ｐｒａｃｔｉｃｅ ｏｆ Ｐｈａｒｍａｃｙ”，２０ｔｈ ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ，Ｗｉｌｌｉａｍｓ，＆Ｗｉｌｋｉｎｓ、Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｄｏｓａｇｅ Ｆｏｒｍｓ ａｎｄ Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖｅｒｙ Ｓｙｓｔｅｍｓ（１９９９）Ｈ．Ｃ．Ａｎｓｅｌ ｅｔ ａｌ．，ｅｄｓ ７ｔｈ ｅｄ．，Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ，Ｗｉｌｌｉａｍｓ，＆Ｗｉｌｋｉｎｓ、及びＨａｎｄｂｏｏｋ ｏｆ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｅｘｃｉｐｉｅｎｔｓ（２０００）Ａ．Ｈ．Ｋｉｂｂｅ ｅｔ ａｌ．，ｅｄｓ．，３ｒｄ ｅｄ．Ａｍｅｒ．Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ａｓｓｏｃ．を含む、様々な刊行物において十分に記載されている。
医薬組成物は、本開示のＴＭＭＰと、薬学的に許容される賦形剤と、を含んでいてもよい。一部の例では、本医薬組成物は対象への投与に好適であり、例えば、滅菌されている。例えば、一部の例では、本医薬組成物はヒト対象への投与に好適であり、例えば、組成物は滅菌されており、検出可能な発熱物質及び／またはその他の毒素を含まない。
タンパク質組成物は、その他の成分、例えば、医薬品グレードのマンニトール、ラクトース、デンプン、ステアリン酸マグネシウム、サッカリンナトリウム、タルカム、セルロース、グルコース、スクロース、マグネシウム、カーボネート、などを含んでいてもよい。組成物は、生理学的条件に近づけるのに必要な薬学的に許容される補助剤、例えば、ｐＨ調整剤及びｐＨ緩衝剤、毒性調整剤など、例えば、酢酸ナトリウム、塩化ナトリウム、塩化カリウム、塩化カルシウム、乳酸ナトリウム、塩酸塩、硫酸塩、溶媒和物（例えば、混合イオン性塩、水、有機物質）、水和物（例えば、水）など、を含有していてもよい。
例えば、組成物としては、水性液剤、粉末形状剤、顆粒剤、錠剤、丸剤、坐剤、カプセル剤、懸濁剤、噴霧剤など、を挙げてもよい。組成物は、以下に記載する様々な投与経路に応じて製剤化されてもよい。
本開示のＴＭＭＰが、注射剤として組織へと直接投与される（例えば、皮下、腹腔内、筋肉内、及び／または静脈内）場合、製剤は、既製の剤形、すなわち、非水性形態（例えば、再構成可能な保存安定性のある粉末）または水性形態（例えば、薬学的に許容される担体及び賦形剤からなる液体など）として提供されてもよい。タンパク質含有製剤はまた、投与後におけるＴＭＭＰの血清中半減期を延長するように提供されてもよい。例えば、ＴＭＭＰは、コロイド状に調製されるリポソーム製剤として提供されてもよく、あるいは、血清中半減期を延長するためのその他の従来技術を用いて提供されてもよい。例えば、Ｓｚｏｋａ ｅｔ ａｌ．１９８０ Ａｎｎ．Ｒｅｖ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ｂｉｏｅｎｇ．９：４６７、米国特許第４，２３５，８７１号、第４，５０１，７２８号、及び第４，８３７，０２８号に記載されるように、リポソームを調整するための様々な方法が利用可能である。製剤はまた、制御放出形態または徐放形態で提供されてもよい。
非経口投与に好適な製剤のその他の例としては、等張性滅菌注射用液剤、酸化防止剤、静菌剤、製剤を目的のレシピエントの血液と等張とする溶質、懸濁化剤、可溶化剤、増粘剤、安定化剤、及び、防腐剤、が挙げられる。例えば、本医薬組成物は、容器、例えば、注射器などの滅菌容器で提供されてもよい。製剤は、単回用量または複数回用量の密閉容器、例えば、アンプル及びバイアルなどで提供されてもよく、使用の直前において、注射用の滅菌液体賦形剤（例えば、水）の添加のみを必要とするフリーズドライ（凍結乾燥）状態で保存されてもよい。即時注射用液剤及び即時注射用懸濁剤は、滅菌した散剤、顆粒剤及び錠剤から調製してもよい。
製剤中における本開示のＴＭＭＰの濃度は、広い範囲（例えば、重量比で、約０．１％未満から、通常は（または少なくとも）約２％から、２０％ほどまで、５０％以上まで）で変化し得るが、通常は、主に、液量、粘度、ならびに、選択した特定の投与方法及び患者のニーズに従った患者基準の因子に基づいて選択される。
本開示は、本開示の組成物（例えば、液体組成物）を含む容器を提供する。容器は、例えば、注射器、アンプルなどであってもよい。一部の例では、容器は滅菌されている。一部の例では、容器と組成物の両方は滅菌されている。
本開示は、本開示のＴＭＭＰを含む組成物（医薬組成物を含む）を提供する。組成物は、ａ）本開示のＴＭＭＰと、ｂ）上記の賦形剤と、を含んでいてもよい。一部の例では、賦形剤は薬学的に許容される賦形剤である。
一部の例では、本開示のＴＭＭＰは液体組成物内に存在する。それゆえ、本開示は、本開示のＴＭＭＰを含む組成物（例えば、液体組成物（医薬組成物を含む））を提供する。一部の例では、本開示の組成物は、ａ）本開示のＴＭＭＰと、ｂ）生理食塩水（例えば、０．９％ＮａＣｌ）と、を含む。一部の例では、組成物は滅菌されている。一部の例では、組成物はヒト対象への投与に好適であり、例えば、組成物は滅菌されており、検出可能な発熱物質及び／またはその他の毒素を含まない。それゆえ、本開示は、ａ）本開示のＴＭＭＰと、ｂ）生理食塩水（例えば、０．９％ＮａＣｌ）と、を含む組成物を提供し、組成物は滅菌されており、検出可能な発熱物質及び／またはその他の毒素を含まない。
核酸または組換え発現ベクターを含む組成物
本開示は、組成物、例えば、本開示の核酸または組換え発現ベクターを含む医薬組成物を提供する。多種多様な薬学的に許容される賦形剤は当該技術分野において周知であり、本明細書において詳細に論述する必要はない。薬学的に許容される賦形剤については、例えば、Ａ． Ｇｅｎｎａｒｏ（２０００）“Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ：Ｔｈｅ Ｓｃｉｅｎｃｅ ａｎｄ Ｐｒａｃｔｉｃｅ ｏｆ Ｐｈａｒｍａｃｙ”，２０ｔｈ ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ，Ｗｉｌｌｉａｍｓ，＆Ｗｉｌｋｉｎｓ、Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｄｏｓａｇｅ Ｆｏｒｍｓ ａｎｄ Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖｅｒｙ Ｓｙｓｔｅｍｓ（１９９９）Ｈ．Ｃ．Ａｎｓｅｌ ｅｔ ａｌ．，ｅｄｓ ７ｔｈ ｅｄ．，Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ，Ｗｉｌｌｉａｍｓ，＆Ｗｉｌｋｉｎｓ、及びＨａｎｄｂｏｏｋ ｏｆ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｅｘｃｉｐｉｅｎｔｓ（２０００）Ａ．Ｈ．Ｋｉｂｂｅ ｅｔ ａｌ．，ｅｄｓ．，３ｒｄ ｅｄ．Ａｍｅｒ．Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ａｓｓｏｃ．を含む、様々な刊行物において十分に記載されている。
本開示の組成物は、ａ）ＴＭＭＰをコードするヌクレオチド配列を含む１種以上の核酸または１種以上の組換え発現ベクターと、ｂ）緩衝剤、界面活性剤、酸化防止剤、親水性ポリマー、デキストリン、キレート化剤、懸濁化剤、可溶化剤、増粘剤、安定化剤、静菌剤、湿潤剤、及び、防腐剤のうちの１種以上と、を含んでいてもよい。好適な緩衝剤としては、例えば、Ｎ，Ｎ－ビス（２－ヒドロキシエチル）－２－アミノエタンスルホン酸（ＢＥＳ）、ビス（２－ヒドロキシエチル）アミノ－トリス（ヒドロキシメチル）メタン（ビス－トリス）、Ｎ－（２－ヒドロキシエチル）ピペラジン－Ｎ’３－プロパンスルホン酸（ＥＰＰＳまたはＨＥＰＰＳ）、グリシルグリシン、Ｎ－２－ヒドロキシエチルピペラジン－Ｎ’－２－エタンスルホン酸（ＨＥＰＥＳ）、３－（Ｎ－モルホリノ）プロパンスルホン酸（ＭＯＰＳ）、ピペラジン－Ｎ，Ｎ’－ビス（２－エタン－スルホン酸）（ＰＩＰＥＳ）、重炭酸ナトリウム、３－（Ｎ－トリス（ヒドロキシメチル）－メチル－アミノ）－２－ヒドロキシ－プロパンスルホン酸（ＴＡＰＳＯ）、Ｎ－トリス（ヒドロキシメチル）メチル－２－アミノエタンスルホン酸（ＴＥＳ）、Ｎ－トリス（ヒドロキシメチル）メチル－グリシン（トリシン）、トリス（ヒドロキシメチル）－アミノメタン（トリス）、などが挙げられるがこれらに限定されない。好適な塩としては、例えば、ＮａＣｌ、ＭｇＣｌ２、ＫＣｌ、ＭｇＳＯ４などが挙げられる。
本開示の医薬品製剤は、約０．００１％～約９０％（重量／重量）の量で、本開示の核酸または組換え発現ベクターを含んでいてもよい。以下の製剤の記述において、「本核酸または組換え発現ベクター」は、本開示の核酸または組換え発現ベクターを含むものと理解される。例えば、一部の例では、本製剤は、本開示の核酸または組換え発現ベクターを含む。
本核酸または組換え発現ベクターは、その他の化合物または化合物の混合物と混合してもよく、それらに封入してもよく、それらにコンジュゲートするかまたは別の方法で結合させてもよく、このような化合物としては、例えば、リポソームまたは受容体標的化分子が挙げられる。本核酸または組換え発現ベクターは、取り込み、分散及び／または吸収を補助する１種以上の成分と製剤内で混合してもよい。
本核酸または組換え発現ベクター組成物は、限定するわけではないが例えば、錠剤、カプセル剤、ゲルカプセル剤、液体シロップ剤、ソフトゲル剤、坐剤、及び浣腸剤などの多くの可能な剤形のいずれかへと製剤化してもよい。本核酸または組換え発現ベクター組成物はまた、水性媒体、非水性媒体、または混合媒体中の懸濁剤として製剤化してもよい。水性懸濁剤は、懸濁剤の粘度を上昇させる物質を更に含有していてもよく、それらとしては、例えば、カルボキシメチルセルロースナトリウム、ソルビトール及び／またはデキストランが挙げられる。懸濁剤はまた安定化剤を含有していてもよい。
本核酸または組換え発現ベクターを含む製剤はリポソーム製剤であってもよい。本明細書で使用する場合、用語「リポソーム」とは、１つの球状二重層または複数の球状二重層で配列された両親媒性脂質からなるベシクルのことを意味する。リポソームは、親油性物質と、送達する組成物を含有する水性の内側部とで形成された膜を有するユニラメラまたはマルチラメラベシクルである。カチオン性リポソームは、負に荷電したＤＮＡ分子と相互作用して安定した複合体を形成することができる、正に荷電したリポソームである。ｐＨ感受性または負に荷電したリポソームは、ＤＮＡと複合体を形成するのではなくＤＮＡを取り込むと考えられている。カチオン性リポソームと非カチオン性リポソームの両方は、本核酸または組換え発現ベクターを送達するのに使用することができる。
リポソームとしてはまた「立体安定化」リポソームが挙げられ、本明細書で使用する場合、この用語は、１種以上の特殊な脂質を含むリポソームのことを意味し、それら特殊な脂質をリポソームに組み込むと、このような特殊な脂質を欠くリポソームと比較して向上した循環寿命がもたらされる。立体安定化リポソームの例は、リポソームのベシクル形成脂質部分の一部が、１種以上の糖脂質を含むか、または、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）部分などの１種以上の親水性ポリマーで誘導体化された、立体安定化リポソームである。リポソーム及びその使用については、米国特許第６，２８７，８６０号において更に記載されており、その全体は参照により本明細書に組み込まれる。
本開示の製剤及び組成物はまた、界面活性剤を含んでいてもよい。医薬品製品、製剤及びエマルション剤における界面活性剤の使用については、当該技術分野において周知である。界面活性剤及びその使用については、米国特許第６，２８７，８６０号において更に記載されている。
一実施形態では、核酸の効率的な送達を達成するために、様々な浸透促進剤が含まれている。細胞膜間の非親油性薬物の拡散補助に加え、浸透促進剤はまた、親油性薬物の浸透性を向上させる。浸透促進剤は、５つの広範なカテゴリー、すなわち、界面活性剤、脂肪酸、胆汁塩、キレート化剤、及び非キレート非界面活性剤、のうちの１つに属するように分類され得る。浸透促進剤及びその使用については、米国特許第６，２８７，８６０号において更に記載されており、その全体は参照により本明細書に組み込まれる。
経口投与用の組成物及び製剤としては、散剤もしくは顆粒剤、マイクロ微粒子剤、ナノ微粒子剤、水もしくは水性媒体中の懸濁剤もしくは液剤、カプセル剤、カプセル剤、サッシェ剤、錠剤、または、ミニ錠剤、が挙げられる。増粘剤、風味剤、希釈剤、乳化剤、分散助剤、または結合剤が望ましい場合がある。好適な経口製剤としては、１種以上の浸透促進界面活性剤及びキレート化剤と共に本アンチセンス核酸を投与する経口製剤が挙げられる。好適な界面活性剤としては、脂肪酸及び／またはエステルまたはその塩、胆汁酸及び／またはその塩が挙げられるがこれらに限定されない。好適な胆汁酸／塩及び脂肪酸ならびにその使用については、米国特許第６，２８７，８６０号において更に記載されている。浸透促進剤の組み合わせ、例えば、胆汁酸／塩と組み合わせた脂肪酸／塩も好適である。例示的な好適な組み合わせは、ラウリン酸のナトリウム塩、カプリン酸、及び、ＵＤＣＡである。更なる浸透促進剤としては、ポリオキシエチレン－９－ラウリルエーテル及びポリオキシエチレン－２０－セチルエーテルが挙げられるがこれらに限定されない。好適な浸透促進剤には、プロピレングリコール、ジメチルスルホキシド、トリエタノールアミン、Ｎ，Ｎ－ジメチルアセトアミド、Ｎ，Ｎ－ジメチルホルムアミド、２－ピロリドン及びその誘導体、テトラヒドロフルフリルアルコール、ならびに、ＡＺＯＮＥ（商標）も含まれる。
Ｔ細胞活性化を調節するための方法
本開示は、エピトープ特異的Ｔ細胞（例えば、ＭＵＣ１エピトープに特異的なＴ細胞）の活性化を選択的に調節するための方法を提供し、その方法は、Ｔ細胞を本開示のＴＭＭＰと接触させることを含み、Ｔ細胞を本開示のＴＭＭＰと接触させることにより、エピトープ特異的Ｔ細胞の活性化を選択的に調節する。一部の例では、接触させることはｉｎ ｖｉｔｒｏで生じる。一部の例では、接触させることはｉｎ ｖｉｖｏで生じる。一部の例では、接触させることはｅｘ ｖｉｖｏで生じる。
一部の例では、例えば、標的Ｔ細胞がＣＤ８＋Ｔ細胞である場合、ＴＭＭＰはクラスＩ ＭＨＣポリペプチド（例えば、β２－ミクログロブリン及びクラスＩ ＭＨＣ重鎖）を含む。
本開示のＴＭＭＰが活性化ポリペプチドである免疫調節ポリペプチドを含む場合、Ｔ細胞をＴＭＭＰと接触させることにより、エピトープ特異的Ｔ細胞が活性化される。一部の例では、エピトープ特異的Ｔ細胞は、がん細胞上に存在するエピトープに特異的なＴ細胞であり、エピトープ特異的Ｔ細胞をＴＭＭＰと接触させることにより、がん細胞に対するＴ細胞の細胞傷害活性を向上させる。一部の例では、エピトープ特異的Ｔ細胞は、がん細胞上に存在するエピトープに特異的なＴ細胞であり、エピトープ特異的Ｔ細胞をＴＭＭＰと接触させることにより、エピトープ特異的Ｔ細胞の数を増加させる。
本開示は、個体における免疫応答の調節方法を提供し、方法は、有効量の本開示のＴＭＭＰを個体に投与することを含む。ＴＭＭＰを投与することにより、エピトープ特異的Ｔ細胞応答（例えば、がんエピトープ特異的Ｔ細胞応答；ウイルスエピトープ特異的）及びエピトープ非特異的Ｔ細胞応答が誘導され、エピトープ特異的Ｔ細胞応答の、エピトープ非特異的Ｔ細胞応答との比は、少なくとも２：１である。一部の例では、エピトープ特異的Ｔ細胞応答とエピトープ非特異的Ｔ細胞応答の比は、少なくとも５：１である。一部の例では、エピトープ特異的Ｔ細胞応答とエピトープ非特異的Ｔ細胞応答の比は、少なくとも１０：１である。一部の例では、エピトープ特異的Ｔ細胞応答とエピトープ非特異的Ｔ細胞応答の比は、少なくとも２５：１である。一部の例では、エピトープ特異的Ｔ細胞応答とエピトープ非特異的Ｔ細胞応答の比は、少なくとも５０：１である。一部の例では、エピトープ特異的Ｔ細胞応答とエピトープ非特異的Ｔ細胞応答の比は、少なくとも１００：１である。一部の例では、個体はヒトである。一部の例では、調節することにより、がん細胞、例えば、ＴＭＭＰ内に存在するペプチドエピトープによって提示されるのと同じエピトープを提示する抗原を発現するがん細胞に対する細胞傷害性Ｔ細胞応答を増加させる。一部の例では、投与は、静脈内、皮下、筋肉内、全身、リンパ内、治療部位の遠位、局所、または治療部位もしくはその近位である。
本開示は、共刺激（すなわち、免疫調節）ポリペプチドを標的Ｔ細胞に選択的に送達する方法を提供し、その方法は、Ｔ細胞の混合集団を本開示のＴＭＭＰと接触させることを含み、Ｔ細胞の混合集団は、標的Ｔ細胞及び非標的Ｔ細胞を含み、標的Ｔ細胞は、ＴＭＭＰ内に存在するエピトープに特異的であり（例えば、標的Ｔ細胞は、ＴＭＭＰ内に存在するエピトープに特異的である）、接触工程により、ＴＭＭＰ内に存在する１つ以上の共刺激ポリペプチド（免疫調節ポリペプチド）が標的Ｔ細胞に送達される。一部の例では、Ｔ細胞の集団はｉｎ ｖｉｔｒｏである。一部の例では、Ｔ細胞の集団は、個体内のｉｎ ｖｉｖｏである。一部の例では、方法は、ＴＭＭＰを個体に投与することを含む。一部の例では、Ｔ細胞は細胞傷害性Ｔ細胞である。一部の例では、Ｔ細胞の混合集団は、個体から得られる混合Ｔ細胞のｉｎ ｖｉｔｒｏ集団であり、接触工程は、標的Ｔ細胞の活性化及び／または増殖をもたらし、活性化及び／または増殖した標的Ｔ細胞の集団を生成し、これらの例のいくつかでは、方法は、活性化及び／または増殖した標的Ｔ細胞の集団を個体に投与することを更に含む。
本開示は、個体から得られるＴ細胞の混合集団において、目的のエピトープ（例えば、がんエピトープ、ウイルスエピトープ）に結合する標的Ｔ細胞の存在を検出する方法を提供し、その方法は、ａ）Ｔ細胞の混合集団を本開示のＴＭＭＰとｉｎ ｖｉｔｒｏで接触させることと（ＴＭＭＰは、目的のエピトープ（例えば、がんエピトープ、ウイルスエピトープ）を含む）、ｂ）該接触に応答したＴ細胞の活性化及び／または増殖を検出することとを含み、活性化及び／または増殖したＴ細胞は、標的Ｔ細胞が存在することを示す。
治療方法
本開示は個体を治療するための方法を提供し、その方法は、個体を治療するのに有効な量の、本開示のＴＭＭＰまたはＴＭＭＰをコードする１種以上の核酸を個体に投与することを含む。ヒトまたは動物の体を治療するための方法に使用する本開示のＴＭＭＰも提供する。一部の例では、本開示の治療方法は、本開示のＴＭＭＰをコードするヌクレオチド配列を含む１種以上の組換え発現ベクターを必要とする個体にそれを投与することを含む。一部の例では、本開示の治療方法は、本開示のＴＭＭＰをコードするヌクレオチド配列を含む１種以上のｍＲＮＡ分子を必要とする個体にそれを投与することを含む。一部の例では、本開示の治療方法は、本開示のＴＭＭＰを必要とする個体にそれを投与することを含む。治療可能な病気としては、例えば、がん、例えば、ＭＵＣＩを過剰発現するがんが挙げられる。
一部の例では、本開示のＴＭＭＰは、それを必要とする個体に投与する際に、エピトープ特異的Ｔ細胞応答とエピトープ非特異的Ｔ細胞応答の両方を誘導する。言い換えると、一部の例では、本開示のＴＭＭＰは、それを必要とする個体に投与する際に、ｉ）ＴＭＭＰ内に存在するエピトープに特異的なＴＣＲとｉｉ）ＴＭＭＰ内に存在する免疫調節ポリペプチドに結合する共免疫調節ポリペプチドの両方を提示する第１のＴ細胞の活性化を調節することによって、エピトープ特異的Ｔ細胞応答を誘導し、ｉ）ＴＭＭＰ内に存在するエピトープ以外のエピトープに特異的なＴＣＲとｉｉ）ＴＭＭＰ内に存在する免疫調節ポリペプチドに結合する共免疫調節ポリペプチドを提示する第２のＴ細胞の活性化を調節することによって、エピトープ非特異的Ｔ細胞応答を誘導する。エピトープ特異的Ｔ細胞応答とエピトープ非特異的Ｔ細胞応答の比率は、少なくとも２：１、少なくとも５：１、少なくとも１０：１、少なくとも１５：１、少なくとも２０：１、少なくとも２５：１、少なくとも５０：１、または、少なくとも１００：１である。エピトープ特異的Ｔ細胞応答とエピトープ非特異的Ｔ細胞応答の比率は、約２：１～約５：１、約５：１～約１０：１、約１０：１～約１５：１、約１５：１～約２０：１、約２０：１～約２５：１、約２５：１～約５０：１、もしくは、約５０：１～約１００：１、または、１００：１超である。Ｔ細胞の「活性化を調節すること」としては、ｉ）細胞傷害性（例えば、ＣＤ８＋）Ｔ細胞を活性化させること、ｉｉ）細胞傷害性（例えば、ＣＤ８＋）Ｔ細胞の細胞傷害活性を誘導すること、ｉｉｉ）細胞傷害性（例えば、ＣＤ８＋）Ｔ細胞による細胞毒（例えば、パーフォリン、グランザイム、グラニュライシン）の産生及び放出を誘導すること、ｉｖ）自己反応性Ｔ細胞の活性化を抑制すること、などのうちの１つ以上を挙げることができる。
免疫調節ポリペプチドの関連共免疫調節ポリペプチドに対する免疫調節ポリペプチドの低い親和性と、ＴＣＲに対するエピトープの親和性を組み合わせることにより、本開示のＴＭＭＰの向上した選択性がもたらされる。それゆえ、例えば、本開示のＴＭＭＰは、ｉ）ＴＭＭＰ内に存在するエピトープ以外のエピトープに特異的なＴＣＲとｉｉ）ＴＭＭＰ内に存在する免疫調節ポリペプチドに結合する共免疫調節ポリペプチドを提示する第２のＴ細胞に本開示のＴＭＭＰが結合する結合力よりも高い結合力で、ｉ）ＴＭＭＰ内に存在するエピトープに特異的なＴＣＲとｉｉ）ＴＭＭＰ内に存在する免疫調節ポリペプチドに結合する共免疫調節ポリペプチドの両方を提示する第１のＴ細胞に結合する。
本開示は、個体におけるエピトープ特異的Ｔ細胞の活性化を選択的に調節するための方法を提供し、その方法は、有効量の、本開示のＴＭＭＰ、または、ＴＭＭＰをコードするヌクレオチド配列を含む１種以上の核酸（例えば、発現ベクター、ｍＲＮＡなど）を個体に投与することを含み、ＴＭＭＰは、個体におけるエピトープ特異的Ｔ細胞の活性化を選択的に調節する。エピトープ特異的Ｔ細胞の活性化を選択的に調節することにより、個体における疾患または障害を治療することが可能となる。それゆえ、本開示は、有効量の本開示のＴＭＭＰを必要とする個体にそれを投与することを含む治療方法を提供する。
一部の例では、免疫調節ポリペプチド（「ＭＯＤ」）は活性化ポリペプチドであり、ＴＭＭＰはエピトープ特異的Ｔ細胞を活性化させる。一部の例では、ＴＭＭＰは、ＭＵＣ１エピトープに特異的なＴ細胞の活性を増加する。一部の例では、ＭＯＤは活性化ポリペプチドであり、ＴＭＭＰは、エピトープ特異的Ｔ細胞（例えば、ＭＵＣ１エピトープに特異的なＴ細胞)を活性化する。一部の例では、Ｔ細胞は、Ｔヘルパー細胞（ＣＤ４＋細胞）、細胞傷害性Ｔ細胞（ＣＤ８＋細胞）、またはＮＫ－Ｔ細胞である。一部の例では、エピトープはがんエピトープであり、ＴＭＭＰは、ＭＵＣ１がんエピトープを発現するがん細胞に特異的なＴ細胞（例えば、Ｔヘルパー細胞（ＣＤ４＋細胞）、細胞傷害性Ｔ細胞（ＣＤ８＋細胞）、及び／またはＮＫ－Ｔ細胞）の活性を増加させる。ＣＤ４＋Ｔ細胞の活性化には、ＣＤ４＋Ｔ細胞の増殖の増加、及び／またはＣＤ４＋Ｔ細胞による放出サイトカインの誘導または増強が含まれ得る。ＮＫ－Ｔ細胞及び／またはＣＤ８＋細胞の活性化には、ＮＫ－Ｔ細胞及び／またはＣＤ８＋細胞の増殖の増加、及び／またはＮＫ－Ｔ細胞及び／またはＣＤ８＋細胞によるインターフェロンγなどのサイトカインの放出の誘導が含まれ得る。
本開示のＴＭＭＰは、個体におけるがんを治療するために、それを必要とする個体に投与することができ、がんは、ＴＭＭＰ内に存在するＭＵＣ１ペプチドを発現する。例えば、がんは、がん細胞がＭＵＣ１を過剰発現するがんであり得る。本開示は、個体におけるがんを治療するための方法を提供し、その方法は、有効量の、本開示のＴＭＭＰ、または、ＴＭＭＰをコードするヌクレオチド配列を含む１種以上の核酸（例えば、発現ベクター、ｍＲＮＡなど）を個体に投与することを含み、ＴＭＭＰはＭＵＣ１エピトープであるＴ細胞エピトープを含み、ＴＭＭＰは刺激免疫調節ポリペプチドを含む。一部の例では、「有効量」の本開示のＴＭＭＰとは、それを必要とする個体に１つ以上の用量で投与する際に、個体におけるがん細胞の数を減少させる量のことである。例えば、一部の例では、「有効量」の本開示のＴＭＭＰとは、それを必要とする個体に１つ以上の用量で投与する際に、ＴＭＭＰを投与する前またはＴＭＭＰを投与しない状態における、個体におけるがん細胞の数と比較して、個体におけるがん細胞の数を少なくとも１０％、少なくとも１５％、少なくとも２０％、少なくとも２５％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、または、少なくとも９５％減少させる量のことである。一部の例では、「有効量」の本開示のＴＭＭＰとは、それを必要とする個体に１つ以上の用量で投与する際に、個体におけるがん細胞の数を検出不能レベルにまで減少させる量のことである。
一部の例では、「有効量」の本開示のＴＭＭＰとは、それを必要とする個体に１つ以上の用量で投与する際に、個体における腫瘍重量を減少させる量のことである。例えば、一部の例では、「有効量」の本開示のＴＭＭＰとは、それを必要とする個体（腫瘍を有する個体）に１つ以上の用量で投与する際に、ＴＭＭＰを投与する前またはＴＭＭＰを投与しない状態における、個体における腫瘍重量と比較して、個体における腫瘍重量を少なくとも１０％、少なくとも１５％、少なくとも２０％、少なくとも２５％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、または、少なくとも９５％減少させる量のことである。一部の例では、「有効量」の本開示のＴＭＭＰとは、それを必要とする個体（腫瘍を有する個体）に１つ以上の用量で投与する際に、個体における腫瘍容積を減少させる量のことである。例えば、一部の例では、「有効量」の本開示のＴＭＭＰとは、それを必要とする個体（腫瘍を有する個体）に１つ以上の用量で投与する際に、ＴＭＭＰを投与する前またはＴＭＭＰを投与しない状態における、個体における腫瘍容積と比較して、個体における腫瘍容積を少なくとも１０％、少なくとも１５％、少なくとも２０％、少なくとも２５％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、または、少なくとも９５％減少させる量のことである。一部の例では、「有効量」の本開示のＴＭＭＰとは、それを必要とする個体に１つ以上の用量で投与する際に、個体の生存期間を延長させる量のことである。例えば、一部の例では、「有効量」の本開示のＴＭＭＰとは、それを必要とする個体に１つ以上の用量で投与する際に、ＴＭＭＰを投与しない状態の個体における想定生存期間と比較して、個体の生存期間を少なくとも１ヶ月間、少なくとも２ヶ月間、少なくとも３ヶ月間、３ヶ月間～６ヶ月間、６ヶ月間～１年間、１年間～２年間、２年間～５年間、５年間～１０年間、または、１０年間超、延長させる量のことである。
本開示の方法で治療することができるがんには、がん細胞がＭＵＣ１を過剰発現するがんが挙げられる（例えば、低グリコシル化ＭＵＣ１を過剰発現するがん細胞）。例としては、腺癌及び血液悪性腫瘍が挙げられる。本開示の方法で治療することができるがんの例には、多発性骨髄腫、Ｂ細胞リンパ腫、乳癌、肺癌、卵巣癌、膵臓癌、結腸直腸癌、前立腺癌、腎癌、急性骨髄性白血病、中皮腫、甲状腺癌、頭頸部癌、胃癌、尿路上皮癌、子宮頸癌、及び卵巣子宮内膜癌が挙げられる。
上に記載したように、一部の例では、本治療方法の実施において、本開示のＴＭＭＰは、それを必要とする個体にそれ自体ＴＭＭＰとして投与される。その他の例では、本治療方法の実施において、本開示のＴＭＭＰをコードするヌクレオチド配列を含む１種以上の核酸は、それを必要とする個体に投与される。それゆえ、その他の例では、本開示の１種以上の核酸、例えば、本開示の１種以上の組換え発現ベクターは、それを必要とする個体に投与される。
製剤
好適な製剤については上述したとおりであるが、好適な製剤は薬学的に許容される賦形剤を含む。一部の例では、好適な製剤は、ａ）本開示のＴＭＭＰと、ｂ）薬学的に許容される賦形剤と、を含む。一部の例では、好適な製剤は、ａ）本開示のＴＭＭＰをコードするヌクレオチド配列を含む核酸と、ｂ）薬学的に許容される賦形剤と、を含み、一部の例では、核酸はｍＲＮＡである。一部の例では、好適な製剤は、ａ）本開示のＴＭＭＰの第１のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む第１の核酸と、ｂ）本開示のＴＭＭＰの第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む第２の核酸と、ｃ）薬学的に許容される賦形剤と、を含む。一部の例では、好適な製剤は、ａ）本開示のＴＭＭＰをコードするヌクレオチド配列を含む組換え発現ベクターと、ｂ）薬学的に許容される賦形剤と、を含む。一部の例では、好適な製剤は、ａ）本開示のＴＭＭＰの第１のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む第１の組換え発現ベクターと、ｂ）本開示のＴＭＭＰの第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む第２の組換え発現ベクターと、ｃ）薬学的に許容される賦形剤と、を含む。
好適な薬学的に許容される賦形剤については上述したとおりである。
用量
好適な用量については、様々な臨床因子に基づき、主治医またはその他の資格のある医療関係者が決定することができる。医学技術分野においては周知のことではあるが、任意の１名の患者の用量は、患者の大きさ、体表面積、年齢、投与する特定のポリペプチドまたは核酸、患者の性別、投与期間及び投与経路、全身健康、ならびに、同時に投与するその他の薬物、を含む多くの因子によって決まる。本開示のＴＭＭＰは、用量あたり１ｎｇ／ｋｇ（体重）～２０ｍｇ／ｋｇ（体重）、例えば、０．１ｍｇ／ｋｇ（体重）～１０ｍｇ／ｋｇ（体重）、例えば、０．５ｍｇ／ｋｇ（体重）～５ｍｇ／ｋｇ（体重）の量で投与され得るが、この例示的な範囲未満またはこの例示的な範囲超の用量は、特に上記の因子を考慮して想定される。レジメンが持続注入である場合、１分間あたり体重１キログラムあたり１μｇ～１０ｍｇの範囲であってもよい。本開示のＴＭＭＰは、約１ｍｇ／ｋｇ（体重）～５０ｍｇ／ｋｇ（体重）、例えば、約１ｍｇ／ｋｇ（体重）～約５ｍｇ／ｋｇ（体重）、約５ｍｇ／ｋｇ（体重）～約１０ｍｇ／ｋｇ（体重）、約１０ｍｇ／ｋｇ（体重）～約１５ｍｇ／ｋｇ（体重）、約１５ｍｇ／ｋｇ（体重）～約２０ｍｇ／ｋｇ（体重）、約２０ｍｇ／ｋｇ（体重）～約２５ｍｇ／ｋｇ（体重）、約２５ｍｇ／ｋｇ（体重）～約３０ｍｇ／ｋｇ（体重）、約３０ｍｇ／ｋｇ（体重）～約３５ｍｇ／ｋｇ（体重）、約３５ｍｇ／ｋｇ（体重）～約４０ｍｇ／ｋｇ（体重）、または、約４０ｍｇ／ｋｇ（体重）～約５０ｍｇ／ｋｇ（体重）の量で投与してもよい。
一部の例では、本開示のＴＭＭＰの好適な用量は、体重１ｋｇあたり０．０１μｇ～１００ｇ、体重１ｋｇあたり０．１μｇ～１０ｇ、体重１ｋｇあたり１μｇ～１ｇ、体重１ｋｇあたり１０μｇ～１００ｍｇ、体重１ｋｇあたり１００μｇ～１０ｍｇ、または、体重１ｋｇあたり１００μｇ～１ｍｇである。当業者は、体液または組織中における投与薬剤の測定滞留時間及び濃度に基づき、投与の反復速度を容易に概算することができる。奏効した治療に続き、患者に維持療法を受けさせて疾患状態の再発を予防することが望ましい場合があるが、本開示のＴＭＭＰは、体重１ｋｇあたり０．０１μｇ～１００ｇ、体重１ｋｇあたり０．１μｇ～１０ｇ、体重１ｋｇあたり１μｇ～１ｇ、体重１ｋｇあたり１０μｇ～１００ｍｇ、体重１ｋｇあたり１００μｇ～１０ｍｇ、または、体重１ｋｇあたり１００μｇ～１ｍｇの範囲の維持量で投与される。
特定のＴＭＭＰ、症状の重症度、及び、対象の副作用の受けやすさに応じて用量レベルが変化し得るということを、当業者は容易に理解する。任意の化合物の好ましい用量は、当業者が様々な方法を用いて容易に決定することができる。
一部の例では、複数回用量の、本開示のＴＭＭＰ、本開示の核酸、または、本開示の組換え発現ベクターを投与する。本開示のＴＭＭＰ、本開示の核酸、または本開示の組換え発現ベクターの投与頻度は、様々な因子、例えば、症状の重症度などのいずれかに応じて変化し得る。例えば、一部の例では、本開示のＴＭＭＰ、本開示の核酸、または、本開示の組換え発現ベクターは、月に１回、月に２回、月に３回、１週おき（ｑｏｗ）、週に１回（ｑｗ）、週に２回（ｂｉｗ）、週に３回（ｔｉｗ）、週に４回、週に５回、週に６回、１日おき（ｑｏｄ）、毎日（ｑｄ）、１日２回（ｑｉｄ）、または１日３回（ｔｉｄ）投与される。
本開示のＴＭＭＰ、本開示の核酸、または本開示の組換え発現ベクターの投与の持続期間、例えば、本開示のＴＭＭＰ、本開示の核酸、または、本開示の組換え発現ベクターを投与する期間は、様々な因子、例えば、患者の応答などのいずれかに応じて変化し得る。例えば、本開示のＴＭＭＰ、本開示の核酸、または、本開示の組換え発現ベクターを、約１日間～約１週間、約２週間～約４週間、約１ヶ月間～約２ヶ月間、約２ヶ月間～約４ヶ月間、約４ヶ月間～約６ヶ月間、約６ヶ月間～約８ヶ月間、約８ヶ月間～約１年間、約１年間～約２年間、もしくは、約２年間～約４年間以上の範囲の期間にわたり投与することができる。
投与経路
活性剤（本開示のＴＭＭＰ、本開示の核酸、または、本開示の組換え発現ベクター）は、全身及び局所投与経路に加えて、ｉｎ ｖｉｖｏ法及びｅｘ ｖｉｖｏ法を含む任意の利用可能な方法及び薬物送達に好適な経路を使用して、個体に投与される。
一般的かつ薬学的に許容される投与経路としては、腫瘍内、腫瘍周囲、筋肉内、リンパ管内、気管内、頭蓋内、皮下、皮膚内、局所適用、静脈内、動脈内、経直腸、経鼻、経口、ならびに、その他の経腸及び非経口投与経路、が挙げられる。必要に応じて投与経路を組み合わせてもよく、または、ＴＭＭＰ及び／または所望の効果に応じて投与経路を調整してもよい。本開示のＴＭＭＰ、または、本開示の核酸または組換え発現ベクターを、単回用量または複数回用量で投与してもよい。
一部の例では、本開示のＴＭＭＰ、本開示の核酸、または、本開示の組換え発現ベクターは、静脈内投与される。一部の例では、本開示のＴＭＭＰ、本開示の核酸、または、本開示の組換え発現ベクターは、筋肉内投与される。一部の例では、本開示のＴＭＭＰ、本開示の核酸、または、本開示の組換え発現ベクターは、リンパ管内に投与される。一部の例では、本開示のＴＭＭＰ、本開示の核酸、または、本開示の組換え発現ベクターは、局所的に投与される。一部の例では、本開示のＴＭＭＰ、本開示の核酸、または、本開示の組換え発現ベクターは、腫瘍内に投与される。一部の例では、本開示のＴＭＭＰ、本開示の核酸、または、本開示の組換え発現ベクターは、腫瘍周囲に投与される。一部の例では、本開示のＴＭＭＰ、本開示の核酸、または、本開示の組換え発現ベクターは、頭蓋内に投与される。一部の例では、本開示のＴＭＭＰ、本開示の核酸、または、本開示の組換え発現ベクターは、皮下投与される。
一部の例では、本開示のＴＭＭＰは静脈内投与される。一部の例では、本開示のＴＭＭＰは筋肉内投与される。一部の例では、本開示のＴＭＭＰは局所的に投与される。一部の例では、本開示のＴＭＭＰは腫瘍内に投与される。一部の例では、本開示のＴＭＭＰは腫瘍周囲に投与される。一部の例では、本開示のＴＭＭＰは頭蓋内に投与される。一部の例では、ＴＭＭＰは皮下投与される。一部の例では、本開示のＴＭＭＰはリンパ管内に投与される。
本開示のＴＭＭＰ、本開示の核酸、または、本開示の組換え発現ベクターは、任意の利用可能な一般的な方法、及び、全身または局所経路を含む一般的な薬物の送達に好適な経路を使用して、宿主に投与されてもよい。一般的に、本開示の方法における使用を検討する投与経路としては、経腸経路、非経口経路、及び、吸入経路が挙げられるが必ずしもこれらに限定されるものではない。
吸入投与以外の非経口投与経路としては、局所経路、経皮経路、皮下経路、筋肉内経路、眼窩内経路、嚢内経路、脊髄内経路、胸骨内経路、腫瘍内経路、リンパ管内経路、腫瘍周囲経路、及び、静脈内経路、すなわち、消化管を通る以外の任意の投与経路、が挙げられるが必ずしもこれらに限定されるものではない。非経口投与を実施して、本開示のＴＭＭＰ、本開示の核酸、または、本開示の組換え発現ベクターの全身または局所送達を達成してもよい。全身送達が望まれる場合、投与は通常、浸潤性または全身吸収性の、医薬品製剤の局所または粘膜投与を含む。
治療に好適な対象
本開示の方法を用いた治療に好適な対象としては、がんを有すると診断されている個体と、がんの治療を受けてはいるがその治療に反応を示していない個体と、がんの治療を受けており最初は反応を示していたがその後治療に反応しなくなった個体と、を含む、がんを有する個体が挙げられる。本開示の方法で治療するのに好適な対象は、がん細胞がＭＵＣ１を過剰発現するがん（例えば、低グリコシル化ＭＵＣ１を過剰発現するがん細胞）を有する個体が挙げられる。本開示の方法で治療するのに好適な対象には、多発性骨髄腫、Ｂ細胞リンパ腫、乳癌、肺癌、卵巣癌、膵臓癌、結腸直腸癌、前立腺癌、腎癌、急性骨髄性白血病、中皮腫、甲状腺癌、頭頸部癌、胃癌、尿路上皮癌、子宮頸癌、及び卵巣子宮内膜癌などのがんを有する個体が挙げられる。
本開示の非限定態様の例
態様セットＡ
上述の本主題の実施形態を含む態様は、単独で、または１つ以上の他の態様または実施形態との組み合わせにおいて有益であり得る。前述の説明を制限することなく、１～５１の番号を振った開示のある特定の非限定的な態様を以下に提供する。本開示を通読すれば当業者には明らかであるように、個別に番号を振った態様のそれぞれを、先行または後続の個別に番号を振った態様のいずれかと共に使用するか、または組み合わせてもよい。このことは、態様の全てのこのような組み合わせに対する支持を提供することを意味し、以下において明確に記載する態様の組み合わせに限定されない。
態様１．Ｔ細胞調節多量体ポリペプチドであって、
少なくとも１つのヘテロ二量体であって、
ａ）ｉ）がん細胞上で発現するムチン－１（ＭＵＣ１）抗原に存在するエピトープを含むＭＵＣ１ペプチドであって、前記ＭＵＣ１ペプチドが、少なくとも４アミノ酸の長さを有する、前記ＭＵＣ１ペプチドと、ｉｉ）第１の主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）ポリペプチドと、を含む、第１のポリペプチドと、
ｂ）第２のＭＨＣポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、ｃ）少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドであって、前記第１及び／または前記第２のポリペプチドが、前記免疫調節ポリペプチドを含む、前記免疫調節ポリペプチドと、を含む、前記少なくとも１つのヘテロ二量体を含む、前記Ｔ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様２．前記１つ以上の免疫調節ドメインのうちの少なくとも１つが、関連共免疫調節ポリペプチドに対する対応する野生型免疫調節ポリペプチドの親和性と比較して、前記関連共免疫調節ポリペプチドに対する低い親和性を示すバリアント型免疫調節ポリペプチドであり、前記ＭＵＣ１ペプチド及び前記第１のＭＨＣポリペプチドが、Ｔ細胞上のＴ細胞受容体（ＴＣＲ）に少なくとも１０－７Ｍの親和性で結合する複合体（ＭＵＣ１ペプチド／ＭＨＣ複合体）を形成し、それにより、
ｉ）前記Ｔ細胞調節多量体ポリペプチドが、第１のＴ細胞に対し、前記Ｔ細胞調節多量体ポリペプチドが第２のＴ細胞に結合する親和性に比べて少なくとも２５％高い親和性で結合し、前記第１のＴ細胞がその表面上に、前記関連共免疫調節ポリペプチド及び少なくとも１０－７Ｍの親和性で前記ＭＵＣ１ペプチド／ＭＨＣ複合体に結合するＴＣＲを発現し、前記第２のＴ細胞がその表面上に、前記関連共免疫調節ポリペプチドを発現するが、その表面上に、少なくとも１０－７Ｍの親和性で前記ＭＵＣ１ペプチド／ＭＨＣ複合体に結合するＴＣＲを発現せず、及び／または
ｉｉ）関連共免疫調節ポリペプチドに対する対照Ｔ細胞調節多量体ポリペプチド（前記対照は、野生型免疫調節ポリペプチドを含む）の結合親和性の、前記関連共免疫調節ポリペプチドに対する前記野生型免疫調節ポリペプチドのバリアント型を含む前記Ｔ細胞調節多量体ポリペプチドの前記結合親和性との比が、バイオレイヤー干渉法によって測定された場合に、１．５：１～１０６：１の範囲にある、態様１に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様３．ａ）前記Ｔ細胞調節多量体ポリペプチドが、前記第１のＴ細胞に対して、前記第２のＴ細胞に結合する親和性に比べて、少なくとも５０％、少なくとも２倍、少なくとも５倍、または少なくとも１０倍高い親和性で結合し、及び／またはｂ）前記バリアント型免疫調節ポリペプチドが、約１０－４Ｍ～約１０－７Ｍ、約１０－４Ｍ～約１０－６Ｍ、もしくは約１０－４Ｍ～約１０－５Ｍの親和性で前記共免疫調節ポリペプチドに結合し、及び／またはｃ）関連共免疫調節ポリペプチドに対する対照Ｔ細胞調節多量体ポリペプチド（前記対照は野生型免疫調節ポリペプチドを含む）の前記結合親和性の、前記関連共免疫調節ポリペプチドに対する前記野生型免疫調節ポリペプチドのバリアント型を含む前記Ｔ細胞調節多量体ポリペプチドの前記結合親和性との比が、バイオレイヤー干渉法によって測定された場合に、少なくとも１０：１、少なくとも５０：１、少なくとも１０２：１、または少なくとも１０３：１である、態様２に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様４．前記第１または前記第２のポリペプチドが、免疫グロブリン（Ｉｇ） Ｆｃポリペプチドを含む、態様１～３のいずれか１つに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様５．前記Ｉｇ ＦｃポリペプチドがＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである、態様４に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様６．ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドが、Ｎ２９７Ａ、Ｌ２３４Ａ、Ｌ２３５Ａ、Ｌ２３４Ｆ、Ｌ２３５Ｅ、及びＰ３３１Ｓから選択される１つ以上のアミノ酸置換を含む、態様５に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様７．
ａ１）前記第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）前記ＭＵＣ１ペプチド、
ｉｉ）前記第１のＭＨＣポリペプチド、及び
ｉｉｉ）少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドを含み、かつ
ｂ１）前記第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）前記第２のＭＨＣポリペプチド、及び
ｉｉ）免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドを含むか、または
ａ２）前記第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）前記ＭＵＣ１ペプチド、及び
ｉｉ）前記第１のＭＨＣポリペプチドを含み、かつ
ｂ２）前記第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）少なくとも１つの免疫調節ポリペプチド、
ｉｉ）前記第２のＭＨＣポリペプチド、及び
ｉｉｉ）前記Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含むか、または
ａ３）前記第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）前記ＭＵＣ１ペプチド、及び
ｉｉ）前記第１のＭＨＣポリペプチドを含み、かつ
ｂ３）前記第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）前記第２のＭＨＣポリペプチド、及び
ｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド、及び
ｉｉｉ）少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドを含むか、または
ａ４）前記第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）前記ＭＵＣ１ペプチド、及び
ｉｉ）前記第１のＭＨＣポリペプチドを含み、かつ
ｂ４）前記第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）前記第２のＭＨＣポリペプチド、及び
ｉｉ）少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドを含むか、または
ａ５）前記第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）前記ＭＵＣ１ペプチド、及び
ｉｉ）前記第１のＭＨＣポリペプチドを含み、かつ
ｂ５）第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）少なくとも１つの免疫調節ポリペプチド、及び
ｉｉ）前記第２のＭＨＣポリペプチドを含むか、または
ａ６）前記第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）前記ＭＵＣ１ペプチド、
ｉｉ）前記第１のＭＨＣポリペプチド、及び
ｉｉｉ）少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドを含み、かつ
ｂ６）前記第２のポリペプチドが、
ｉ）前記第２のＭＨＣポリペプチドを含む、態様１～６のいずれか１つに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様８．前記第１のポリペプチドが、前記ＭＵＣ１ペプチドと前記第１のＭＨＣポリペプチドとの間にペプチドリンカーを含み、及び／または前記第２のポリペプチドが、前記免疫調節ポリペプチドと前記第２のＭＨＣポリペプチドとの間にペプチドリンカーを含む、態様１～７のいずれか１つに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様９．前記ペプチドリンカーが、アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）ｎ、(配列番号254),を含み、ｎが１～１０の整数である、態様８に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様１０．前記第１のＭＨＣポリペプチドがβ２－ミクログロブリンポリペプチドであり、前記第２のＭＨＣポリペプチドがＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドである、態様１～９のいずれか１つに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様１１．前記少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドが、サイトカイン、４－１ＢＢＬポリペプチド、Ｂ７－１ポリペプチド、Ｂ７－２ポリペプチド、ＩＣＯＳ－Ｌポリペプチド、ＯＸ－４０Ｌポリペプチド、ＣＤ８０ポリペプチド、ＣＤ８６ポリペプチド、ＰＤ－Ｌ１ポリペプチド、ＦａｓＬポリペプチド、ＰＤ－Ｌ２ポリペプチド、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される、態様１～１０のいずれか１つに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様１２．前記少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドがＩＬ－２ポリペプチドである、態様１～１１のいずれか１つに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様１３．前記多量体ポリペプチドが少なくとも２つの免疫調節ポリペプチドを含み、前記免疫調節ポリペプチドのうちの少なくとも２つが同じである、態様１～１２のいずれか１つに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様１４．前記２つ以上の免疫調節ポリペプチドがタンデムに存在する、態様１３に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様１５．前記第１のポリペプチド及び前記第２のポリペプチドが。互いに共有結合している、態様１～１４のいずれか１つに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様１６．前記共有結合がジスルフィド結合を介してである、態様１５に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様１７．前記β２Ｍポリペプチド及び前記ＭＨＣ重鎖ポリペプチドが、前記β２Ｍポリペプチド中のＣｙｓ残基及び前記ＭＨＣ重鎖ポリペプチド中のＣｙｓ残基を結合するジスルフィド結合によって結合される、態様１６に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様１８．前記β２Ｍポリペプチドのアミノ酸残基１２におけるＣｙｓが、前記ＭＨＣ重鎖ポリペプチドのアミノ酸残基２３６におけるＣｙｓにジスルフィド結合されている、態様１７に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様１９．第１のポリペプチド鎖が、前記ＭＵＣ１ペプチドと前記β２Ｍポリペプチドとの間にリンカーを含み、前記ジスルフィド結合が、前記リンカーに存在するＣｙｓと、前記ＭＨＣ重鎖ポリペプチドのＣｙｓとを連結する、態様１７に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様２０．第１のポリペプチド鎖が、前記ペプチドエピトープと前記β２Ｍポリペプチドとの間にリンカーを含み、前記ジスルフィド結合が、前記リンカー内のＧｌｙ２について置換されたＣｙｓと、前記ＭＨＣ重鎖ポリペプチドのＴｙｒ８４について置換されたＣｙｓとを連結する、態様１７に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様２１．前記第１及び前記第２のポリペプチドが、少なくとも２つのジスルフィド結合を介して互いに共有結合している、態様１～１４のいずれか１つに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様２２．ａ）第１のジスルフィド結合が、ｉ）前記ペプチドエピトープと、第１のＭＨＣクラスＩポリペプチドがβ２Ｍポリペプチドである、前記第１のＭＨＣクラスＩポリペプチドとの間のリンカーに存在するＣｙｓと、ｉｉ）第２のＭＨＣクラスＩポリペプチドがＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドである、前記第２のＭＨＣクラスＩポリペプチドにＹ８４Ｃ置換を介して導入されたＣｙｓ残基との間にあり、ｂ）第２のジスルフィド結合が、ｉ）Ｒ１２Ｃ置換を介して前記β２Ｍポリペプチドに導入されたＣｙｓ残基と、ｉｉ）Ａ２３６Ｃ置換を介して前記ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに導入されたＣｙｓ残基との間にある、態様２１に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様２３．前記リンカーがアミノ酸配列ＧＣＧＧＳ（配列番号１３９）を含む、態様２２に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様２４．前記リンカーがアミノ酸配列ＧＣＧＧＳ（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号１４０）を含み、ｎが１～１０の整数である、態様２２のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様２５．前記ＭＵＣ１ペプチドが、少なくとも４アミノ酸長、例えば４アミノ酸～約２５アミノ酸（例えば、４アミノ酸（ａａ）、５ａａ、６ａａ、７ａａ、８ａａ、９ａａ、１０ａａ、１１ａａ、１２ａａ、１３ａａ、１４ａａ、１５ａａ、１６ａａ、１７ａａ、１８ａａ、１９ａａ、２０ａａ、２１ａａ、２２ａａ、２３ａａ、２４ａａ、または２５ａａ、そして長さが４～２０アミノ酸、６～１８アミノ酸、８～１５アミノ酸、８～１２アミノ酸、５～１０アミノ酸、１０～２０アミノ酸、及び１５～２５アミノ酸の範囲内を含む）のペプチドである、態様１～２４のいずれか１つに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様２６．前記第１または前記第２のＭＨＣポリペプチドが、ａ）図７Ａに示すＨＬＡ－Ａ＊０１０１、ＨＬＡ－Ａ＊０２０１、ＨＬＡ－Ａ＊０２０１、ＨＬＡ－Ａ＊１１０１、ＨＬＡ－Ａ＊２３０１、ＨＬＡ－Ａ＊２４０２、ＨＬＡ－Ａ＊２４０７、ＨＬＡ－Ａ＊３３０３、もしくはＨＬＡ－Ａ＊３４０１アミノ酸配列に対して少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列、またはｂ）図８Ａに示すＨＬＡ－Ｂ＊０７０２、ＨＬＡ－Ｂ＊０８０１、ＨＬＡ－Ｂ＊１５０２、ＨＬＡ－Ｂ＊３８０２、ＨＬＡ－Ｂ＊４００１、ＨＬＡ－Ｂ＊４６０１、もしくはＨＬＡ－Ｂ＊５３０１アミノ酸配列に対して少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列、またはｃ）図９Ａに示すＨＬＡ－Ｃ＊０１０２、ＨＬＡ－Ｃ＊０３０３、ＨＬＡ－Ｃ＊０３０４、ＨＬＡ－Ｃ＊０４０１、ＨＬＡ－Ｃ＊０６０２、ＨＬＡ－Ｃ＊０７０１、ＨＬＡ－Ｃ＊０７０２、ＨＬＡ－Ｃ＊０８０１、もしくはＨＬＡ－Ｃ＊１５０２に対して少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、態様１～２５のいずれか１つに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様２７．前記第１のＭＨＣポリペプチドがβ２Ｍポリペプチドであり、前記第２のＭＨＣポリペプチドが、ＨＬＡ－Ａ＊０２０１ポリペプチドに対して少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、態様１～２５のいずれか１つに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様２８．前記第１のＭＨＣポリペプチドがβ２Ｍポリペプチドであり、前記第２のＭＨＣポリペプチドがＨＬＡ－Ａ＊１１０１ポリペプチドである、態様１～２５のいずれか１つに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様２９．前記第１のＭＨＣポリペプチドがβ２Ｍポリペプチドであり、前記第２のＭＨＣポリペプチドが、ＨＬＡ－Ａ＊３３０３ポリペプチドに対して少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、態様１～２５のいずれか１つに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様３０．前記第１のＭＨＣポリペプチドがβ２Ｍポリペプチドであり、前記第２のＭＨＣポリペプチドが、ＨＬＡ－Ａ＊２４０１ポリペプチドに対して少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、態様１～２５のいずれか１つに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様３１．前記免疫調節ポリペプチドが、ｉ）Ｈ１６Ａ置換及びＦ４２Ａ置換、またはｉｉ）Ｈ１６Ｔ置換及びＦ４２Ａ置換を含むバリアント型ＩＬ－２ポリペプチドである、態様１～３０のいずれか１つに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様３２．前記ＭＵＣ１ペプチドが、アミノ酸配列ＳＴＡＰＰＶＨＮＶ（配列番号５８７）を有し、９アミノ酸の長さを有する、態様１～３１のいずれか１つに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様３３．前記ＭＵＣ１ペプチドが、アミノ酸配列ＳＬＡＰＰＶＨＮＶ（配列番号５８８）を有し、９アミノ酸の長さを有する、態様１～３１のいずれか１つに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様３４．前記ＭＵＣ１ペプチドが、アミノ酸配列ＳＴＡＰＰＡＨＧＶ（配列番号５８６）を有し、９アミノ酸の長さを有する、態様１～３１のいずれか１つに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様３５．前記ＭＵＣ１ペプチドが、アミノ酸配列ＳＬＡＰＰＡＨＧＶ（配列番号５８９）を有し、９アミノ酸の長さを有する、態様１～３１のいずれか１つに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様３６．前記第１のポリペプチド及び／または第２のポリペプチドが、腫瘍ターゲティングポリペプチド（ＴＴＰ）を含む、態様１～３５のいずれか１つに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様３７．前記ＴＴＰが、がん細胞の表面上のがん関連抗原に特異的な抗体である、態様３６に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様３８．前記抗体がｓｃＦｖまたはナノボディである、態様３７に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様３９．前記多量体ポリペプチドが第１及び第２のヘテロ二量体を含み、前記第１及び第２のヘテロ二量体が、前記第１及び第２のヘテロ二量体の前記Ｉｇ Ｆｃポリペプチド間の１つ以上のジスルフィド結合によって共有結合される、態様１～３５のいずれか１つに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様４０．態様１～３９のいずれか１つに記載の第１または第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸であって、前記第１または第２のポリペプチドが少なくとも１つの免疫調節ドメインを含む、前記核酸。
態様４１．態様４０に記載の前記核酸を含む、発現ベクター。
態様４２．ペプチドエピトープに特異的なＴ細胞の活性を選択的に調節する方法であって、前記方法が、前記Ｔ細胞を、態様１～３９のいずれか１つに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチドに接触させることを含み、前記接触させることが、前記エピトープ特異的Ｔ細胞の前記活性を選択的に調節する、前記方法。
態様４３．がんを有する患者を治療する方法であって、態様１～３９のいずれか１つに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチドを含む有効量の医薬組成物を前記患者に投与することを含む、前記方法。
態様４４．前記がんが、腺癌または血液がんである、態様４３に記載の方法。
態様４５．前記がんが、多発性骨髄腫である、態様４４に記載の方法。
態様４６．前記がんが、Ｂ細胞性リンパ腫である、態様４４に記載の方法。
態様４７．前記投与が、筋肉内である、態様４３～４６のいずれか１つに記載の方法。
態様４８．前記投与が、静脈内である、態様４３～４６のいずれか１つに記載の方法。
態様４９．個体における免疫応答を調節する方法であって、前記方法が、態様１～３９のいずれか１つに記載の有効量の前記Ｔ細胞調節多量体ポリペプチドを前記個体に投与することを含み、前記投与が、エピトープ特異的Ｔ細胞応答及びエピトープ非特異的Ｔ細胞応答を誘導し、その場合、前記エピトープ特異的Ｔ細胞応答と前記エピトープ非特異的Ｔ細胞応答の比が少なくとも２：１である、前記方法。
態様５０．免疫調節ポリペプチドを標的Ｔ細胞に選択的に送達する方法であって、前記方法が、Ｔ細胞の混合集団を、態様１～３９のいずれか１つに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチドと接触させることを含み、前記Ｔ細胞の混合集団が、前記標的Ｔ細胞及び非標的Ｔ細胞を含み、前記標的Ｔ細胞が、前記Ｔ細胞調節多量体ポリペプチド内に存在する前記ＭＵＣ１エピトープに特異的であり、前記接触が、前記Ｔ細胞調節多量体ポリペプチド内に存在する前記１つ以上の免疫調節ポリペプチドを前記標的Ｔ細胞に送達する、前記方法。
態様５１．個体から得られたＴ細胞の混合集団において、ＭＵＣ１ペプチドに結合する標的Ｔ細胞の存在を検出する方法であって、前記方法が、ａ）前記Ｔ細胞の混合集団を、態様１～３９のいずれか１つに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチドとｉｎ ｖｉｔｒｏで接触させることであって、前記Ｔ細胞調節多量体ポリペプチドが、前記ペプチドエピトープを含む、ことと、ｂ）前記接触に応答してＴ細胞の活性化及び／または増殖を検出することであって、活性化及び／または増殖したＴ細胞が、前記標的Ｔ細胞の存在を示す、ことと、を含む、前記方法。
態様セットＢ
上述の本主題の実施形態を含む態様は、単独で、または１つ以上の他の態様または実施形態との組み合わせにおいて有益であり得る。前述の説明を制限することなく、１～４９の番号を振った開示のある特定の非限定的な態様を以下に提供する。本開示を通読すれば当業者には明らかであるように、個別に番号を振った態様のそれぞれを、先行または後続の個別に番号を振った態様のいずれかと共に使用するか、または組み合わせてもよい。このことは、態様の全てのこのような組み合わせに対する支持を提供することを意味し、以下において明確に記載する態様の組み合わせに限定されない。
態様１．ａ）ｉ）
Figure 2022536581000209
からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むペプチドエピトープと、ｉｉ）第１のクラスＩ主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）ポリペプチドと、を含む第１のポリペプチド、ｂ）第２のクラスＩ ＭＨＣポリペプチドを含む第２のポリペプチド、ならびに、ｃ）１つ以上の免疫調節ポリペプチド、を含む少なくとも１つのヘテロ二量体であって、前記第１及び／または前記第２のポリペプチドが、前記１つ以上の免疫調節ポリペプチドを含み、任意選択で、前記第１または前記第２のポリペプチドが、免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドを含む、前記少なくとも１つのヘテロ二量体を含む、Ｔ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様２．前記１つ以上の免疫調節ポリペプチドのうちの少なくとも１つが、関連共免疫調節ポリペプチドに対する対応する野生型免疫調節ポリペプチドの親和性と比較して、前記関連共免疫調節ポリペプチドに対する低い親和性を示すバリアント型免疫調節ポリペプチドである、態様１に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様３．関連共免疫調節ポリペプチドに対する前記野生型免疫調節ポリペプチドの結合親和性と、前記関連共免疫調節ポリペプチドに対する前記バリアント型免疫調節ポリペプチドの結合親和性との比が、バイオレイヤー干渉法によって測定された場合に、少なくとも１．５：１である、態様２に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様４．前記バリアント型免疫調節ポリペプチドが、約１０－４Ｍ～約１０－７Ｍ、約１０－４Ｍ～約１０－６Ｍ、または約１０－４Ｍ～約１０－５Ｍからなる群から選択される親和性で、前記共免疫調節ポリペプチドに結合する、態様２に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様５．前記第１または第２のポリペプチドが、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含み、前記Ｉｇ Ｆｃポリペプチドが、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである、態様１～４のいずれか１つに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様６．ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドが、Ｎ２９７Ａ、Ｌ２３４Ａ、Ｌ２３５Ａ、Ｌ２３４Ｆ、Ｌ２３５Ｅ、及びＰ３３１Ｓから選択される１つ以上のアミノ酸置換を含む、態様５に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様７．
ａ１）前記第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）前記ペプチドエピトープ、及び
ｉｉ）前記第１のＭＨＣポリペプチドを含み、かつ
ｂ１）前記第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）前記１つ以上の免疫調節ポリペプチド、
ｉｉ）前記第２のＭＨＣポリペプチド、及び
ｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含むか、または
ａ２）前記第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）前記ペプチドエピトープ、及び
ｉｉ）前記第１のＭＨＣポリペプチドを含み、かつ
ｂ２）前記第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）前記第２のＭＨＣポリペプチド、及び
ｉｉ）前記１つ以上の免疫調節ポリペプチド、及び
ｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含むか、または
ａ３）前記第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）前記ペプチドエピトープ、及び
ｉｉ）前記第１のＭＨＣポリペプチドを含み、かつ
ｂ３）前記第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）前記第２のＭＨＣポリペプチド、及び
ｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド、及び
ｉｉｉ）前記１つ以上の免疫調節ポリペプチドを含むか、または
ａ４）前記第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）前記１つ以上の免疫調節ポリペプチド、
ｉｉ）前記ペプチドエピトープ、及び
ｉｉｉ）前記第１のＭＨＣポリペプチドを含み、かつ
ｂ４）前記第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）前記第２のＭＨＣポリペプチド、及び
ｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含むか、または
ａ５）前記第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）前記ペプチドエピトープ、
ｉｉ）前記第１のＭＨＣポリペプチド、及び
ｉｉｉ）前記１つ以上の免疫調節ポリペプチドを含み、かつ
ｂ５）前記第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）前記第２のＭＨＣポリペプチド、及び
ｉｉ）免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドを含む、態様１～６のいずれか１つに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様８．前記第１のＭＨＣポリペプチドがβ２－ミクログロブリンポリペプチドであり、前記第２のＭＨＣポリペプチドがＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドである、態様１～７のいずれか１つに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様９．前記１つ以上の免疫調節ポリペプチドのうちの少なくとも１つが刺激ポリペプチドである、態様１～８のいずれか１つに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様１０．前記刺激ポリペプチドが、４－１ＢＢＬ、ＩＣＯＳ－Ｌ、ＯＸ－４０Ｌ、ＣＤ８０、ＣＤ８６、ＣＤ７０、サイトカイン、ならびにそれらのバリアント及び組み合わせからなる群から選択される、態様９に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様１１．前記１つ以上の免疫調節ポリペプチドのうちの少なくとも１つがＩＬ－２ポリペプチドである、態様９及び１０のいずれか１つに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様１２．前記免疫調節ポリペプチドがバリアントＩＬ－２ポリペプチドである、態様１１に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様１３．前記バリアントＩＬ－２ポリペプチドが、ｉ）Ｈ１６Ａ置換及びＦ４２Ａ置換、またはｉｉ）Ｈ１６Ｔ置換及びＦ４２Ａ置換を含む、態様１２に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様１４．前記１つ以上の免疫調節ポリペプチドのうちの少なくとも１つが抑制性ポリペプチドであり、任意選択で、前記抑制性ポリペプチドが、ＰＤ－Ｌ１、ＦａｓＬ、サイトカイン、及びＰＤ－Ｌ２、ならびにそれらのバリアント及び組み合わせからなる群から選択される、態様１～８のいずれか１つに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様１５．前記多量体ポリペプチドが、２つ以上の免疫調節ポリペプチドを含み、前記免疫調節ポリペプチドのうちの少なくとも２つが同じである、態様１～１４のいずれか１つに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様１６．前記２つ以上の免疫調節ポリペプチドがタンデムに存在する、態様１５に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様１７．
ａ１）前記第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）前記ペプチドエピトープ、及び
ｉｉ）前記第１のＭＨＣポリペプチドを含み、かつ
ｂ１）前記第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）前記１つ以上の免疫調節ポリペプチド、
ｉｉ）前記第２のＭＨＣポリペプチド、及び
ｉｉｉ）免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドを含む、
態様１～６のいずれかに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様１８．
ａ３）前記第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）前記ペプチドエピトープ、及び
ｉｉ）前記第１のＭＨＣポリペプチドを含み、かつ
ｂ３）前記第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
ｉ）前記第２のＭＨＣポリペプチド、及び
ｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド、及び
ｉｉｉ）前記１つ以上の免疫調節ポリペプチドを含む、
態様１～６のいずれかに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様１９．前記第１のポリペプチド及び前記第２のポリペプチドが、互いに共有結合しており、任意選択で、前記共有結合がジスルフィド結合を介してである、態様１～１８のいずれか１つに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様２０．前記β２Ｍポリペプチド及び前記ＭＨＣ重鎖ポリペプチドが、前記β２Ｍポリペプチド中のＣｙｓ残基及び前記ＭＨＣ重鎖ポリペプチド中のＣｙｓ残基を結合するジスルフィド結合によって結合され、任意選択で、前記β２Ｍポリペプチドのアミノ酸残基１２におけるＣｙｓが、前記ＭＨＣ重鎖ポリペプチドのアミノ酸残基２３６におけるＣｙｓにジスルフィド結合されている、態様１９に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様２１．前記第１のポリペプチド鎖が、前記ペプチドエピトープと前記β２Ｍポリペプチドとの間にリンカーを含み、前記ジスルフィド結合が、前記リンカーに存在するＣｙｓと、前記ＭＨＣ重鎖ポリペプチドのＣｙｓとを連結する、態様１９に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様２２．前記第１のポリペプチド鎖が、前記ペプチドエピトープと前記β２Ｍポリペプチドとの間にリンカーを含み、前記ジスルフィド結合が、前記リンカー内のＧｌｙ２について置換されたＣｙｓと、前記ＭＨＣ重鎖ポリペプチドのＴｙｒ８４について置換されたＣｙｓとを連結する、態様１９に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様２３．前記第１及び前記第２のポリペプチドが、少なくとも２つのジスルフィド結合を介して互いに共有結合している、態様１～１８のいずれか１つに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様２４．ａ）第１のジスルフィド結合が、ｉ）前記ペプチドエピトープと、β２Ｍポリペプチドである第１のＭＨＣクラスＩポリペプチドとの間のリンカーに存在するＣｙｓと、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドである第２のＭＨＣクラスＩポリペプチドにＹ８４Ｃ置換を介して導入されたＣｙｓ残基との間にあり、ｂ）第２のジスルフィド結合が、ｉ）Ｒ１２Ｃ置換を介して前記β２Ｍポリペプチドに導入されたＣｙｓ残基と、ｉｉ）Ａ２３６Ｃ置換を介して前記ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに導入されたＣｙｓ残基との間にある、態様２３に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様２５．前記リンカーが、アミノ酸配列ＧＣＧＧＳを含む、態様２４に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様２６．前記リンカーが、アミノ酸配列ＧＣＧＧＳ（ＧＧＧＧＳ）ｎを含み、ｎが１～１０の整数である、態様２４に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様２７．前記ペプチドエピトープが、少なくとも９アミノ酸長、例えば９アミノ酸～約２５アミノ酸（例えば、１０アミノ酸（ａａ）、１１ａａ、１２ａａ、１３ａａ、１４ａａ、１５ａａ、１６ａａ、１７ａａ、１８ａａ、１９ａａ、２０ａａ、２１ａａ、２２ａａ、２３ａａ、２４ａａ、または２５ａａ、長さが９～２０アミノ酸、９～１８アミノ酸、９～１５アミノ酸、９～１２アミノ酸、９～１０アミノ酸、１０～２０アミノ酸、及び１５～２５アミノ酸の範囲内を含む）のペプチドである、態様１～２６のいずれか一項に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様２８．前記第１または前記第２のＭＨＣポリペプチドが、ａ）図７Ａに示すＨＬＡ－Ａ＊０１０１、ＨＬＡ－Ａ＊０２０１、ＨＬＡ－Ａ＊０２０１、ＨＬＡ－Ａ＊１１０１、ＨＬＡ－Ａ＊２３０１、ＨＬＡ－Ａ＊２４０２、ＨＬＡ－Ａ＊２４０７、ＨＬＡ－Ａ＊３３０３、もしくはＨＬＡ－Ａ＊３４０１アミノ酸配列に対して少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列、またはｂ）図８Ａに示すＨＬＡ－Ｂ＊０７０２、ＨＬＡ－Ｂ＊０８０１、ＨＬＡ－Ｂ＊１５０２、ＨＬＡ－Ｂ＊３８０２、ＨＬＡ－Ｂ＊４００１、ＨＬＡ－Ｂ＊４６０１、もしくはＨＬＡ－Ｂ＊５３０１アミノ酸配列に対して少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列、またはｃ）図９Ａに示すＨＬＡ－Ｃ＊０１０２、ＨＬＡ－Ｃ＊０３０３、ＨＬＡ－Ｃ＊０３０４、ＨＬＡ－Ｃ＊０４０１、ＨＬＡ－Ｃ＊０６０２、ＨＬＡ－Ｃ＊０７０１、ＨＬＡ－Ｃ＊０７０２、ＨＬＡ－Ｃ＊０８０１、もしくはＨＬＡ－Ｃ＊１５０２に対して少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、態様１～２７のいずれか一項に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様２９．前記第１のＭＨＣポリペプチドがβ２Ｍポリペプチドであり、前記第２のＭＨＣポリペプチドが、ＨＬＡ－Ａ＊０２０１ポリペプチドに対して少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、態様１～２７のいずれか一項に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様３０．前記第１のＭＨＣポリペプチドがβ２Ｍポリペプチドであり、前記第２のＭＨＣポリペプチドがＨＬＡ－Ａ＊１１０１ポリペプチドである、態様１～２７のいずれか一項に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様３１．前記第１のＭＨＣポリペプチドがβ２Ｍポリペプチドであり、前記第２のＭＨＣポリペプチドが、ＨＬＡ－Ａ＊３３０３ポリペプチドに対して少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、態様１～２７のいずれか一項に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様３２．前記第１のＭＨＣポリペプチドがβ２Ｍポリペプチドであり、前記第２のＭＨＣポリペプチドが、ＨＬＡ－Ａ＊２４０１ポリペプチドに対して少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、態様１～２７のいずれか一項に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様３３．前記ペプチドエピトープが、アミノ酸配列ＳＴＡＰＰＶＨＮＶを含み、９アミノ酸の長さを有する、態様１～３２のいずれか一項に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様３４．前記ペプチドエピトープが、アミノ酸配列ＳＬＡＰＰＶＨＮＶを含み、９アミノ酸の長さを有する、態様１～３２のいずれか一項に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様３５．前記ペプチドエピトープが、アミノ酸配列ＳＴＡＰＰＡＨＧＶを含み、９アミノ酸の長さを有する、態様１～３２のいずれか一項に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様３６．前記ペプチドエピトープが、アミノ酸配列ＳＬＡＰＰＡＨＧＶを含み、９アミノ酸の長さを有する、態様１～３２のいずれか一項に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様３７．前記第１のポリペプチド及び／または第２のポリペプチドが、腫瘍ターゲティングポリペプチド（ＴＴＰ）を含む、態様１～３６のいずれか一項に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様３８．前記ＴＴＰが、がん細胞の表面上のがん関連抗原に特異的な抗体である、態様３７に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様３９．前記抗体がｓｃＦｖまたはナノボディである、態様３８に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様４０．前記多量体ポリペプチドが、第１及び第２のヘテロ二量体を含み、前記第１及び第２のヘテロ二量体が、前記第１及び第２のヘテロ二量体の前記Ｉｇ Ｆｃポリペプチド間の１つ以上のジスルフィド結合によって共有結合されている、態様１～３７のいずれか１つに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
態様４１．態様１～４０のいずれか１つに記載の第１または第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸。
態様４２．態様４１に記載の核酸を含む発現ベクター。
態様４３．ペプチドエピトープに特異的なＴ細胞の活性を選択的に調節する方法であって、前記方法が、前記Ｔ細胞を、態様１～４０のいずれか１つに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチドに接触させることを含み、前記接触させることが、前記エピトープ特異的Ｔ細胞の前記活性を選択的に調節する、前記方法。
態様４４．がんを有する患者を治療する方法であって、態様１～４０のいずれか１つに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチドを含む有効量の医薬組成物を前記患者に投与することを含む、前記方法。
態様４５．前記がんが、腺癌、血液がん、多発性骨髄腫、Ｂ細胞性リンパ腫からなる群から選択される、態様４４に記載の方法。
態様４６．前記投与が、皮下、腹腔内、筋肉内、皮内、腫瘍内、腫瘍周囲、及び／または静脈内である、態様４４または態様４５に記載の方法。
態様４７．個体における免疫応答を調節する方法であって、前記方法が、態様１～４０のいずれか１つに記載の有効量のＴ細胞調節多量体ポリペプチドを前記個体に投与することを含み、前記投与することが、エピトープ特異的Ｔ細胞応答及びエピトープ非特異的Ｔ細胞応答を誘導し、前記エピトープ特異的Ｔ細胞応答と前記エピトープ非特異的Ｔ細胞応答との比が少なくとも２：１である、前記方法。
態様４８．免疫調節ポリペプチドを標的Ｔ細胞に選択的に送達する方法であって、前記方法が、Ｔ細胞の混合集団を、態様１～４０のいずれか１つに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチドと接触させることを含み、前記Ｔ細胞の混合集団が、前記標的Ｔ細胞及び非標的Ｔ細胞を含み、前記標的Ｔ細胞が、前記Ｔ細胞調節多量体ポリペプチド内に存在する前記ＭＵＣ１エピトープに特異的であり、前記接触が、前記Ｔ細胞調節多量体ポリペプチド内に存在する前記１つ以上の免疫調節ポリペプチドを前記標的Ｔ細胞に送達する、前記方法。
態様４９．個体から得られたＴ細胞の混合集団において、ペプチドエピトープに結合する標的Ｔ細胞の存在を検出する方法であって、前記方法が、ａ）前記Ｔ細胞の混合集団を、態様１～４０のいずれか１つに記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチドとｉｎ ｖｉｔｒｏで接触させることであって、前記Ｔ細胞調節多量体ポリペプチドが、前記ペプチドエピトープを含む、ことと、ｂ）前記接触に応答してＴ細胞の活性化及び／または増殖を検出することであって、活性化及び／または増殖したＴ細胞が、前記標的Ｔ細胞の存在を示す、ことと、を含む、前記方法。
本発明における特定の実施形態を参照して本発明を説明してきたが、本発明の真の趣旨及び範囲を逸脱することなく、様々な変更を行うことが可能であること、また均等物で置き換え可能であることを当業者は理解するであろう。加えて、特定の状態、材料、物質の組成物、プロセス、１つのプロセス工程または複数のプロセス工程について多くの修正を行い、本発明の目的、趣旨及び範囲に適合させることも可能である。全てのこのような修正は、本書に添付する特許請求の範囲の範囲内となることを意図している。

Claims (49)

  1. （ａ）（ｉ）
    Figure 2022536581000210
    からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むペプチドエピトープと、
    （ｉｉ）第１のクラスＩ主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）ポリペプチドと
    を含む第１のポリペプチド、
    （ｂ）第２のクラスＩ ＭＨＣポリペプチドを含む第２のポリペプチド、ならびに
    （ｃ）１つ以上の免疫調節ポリペプチド
    を含む、少なくとも１つのヘテロ二量体であって、
    前記第１及び／または前記第２のポリペプチドが、前記１つ以上の免疫調節ポリペプチドを含み、
    任意選択で、前記第１または前記第２のポリペプチドが、免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドを含む、
    前記少なくとも１つのヘテロ二量体
    を含む、Ｔ細胞調節多量体ポリペプチド。
  2. 前記１つ以上の免疫調節ポリペプチドのうちの少なくとも１つが、関連共免疫調節ポリペプチドに対する対応する野生型免疫調節ポリペプチドの親和性と比較して、前記関連共免疫調節ポリペプチドに対する低い親和性を示すバリアント型免疫調節ポリペプチドである、請求項１に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
  3. 関連共免疫調節ポリペプチドに対する前記野生型免疫調節ポリペプチドの結合親和性と、前記関連共免疫調節ポリペプチドに対する前記バリアント型免疫調節ポリペプチドの結合親和性との比が、バイオレイヤー干渉法によって測定された場合に、少なくとも１．５：１である、請求項２に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
  4. 前記バリアント型免疫調節ポリペプチドが、約１０－４Ｍ～約１０－７Ｍ、約１０－４Ｍ～約１０－６Ｍ、または約１０－４Ｍ～約１０－５Ｍからなる群から選択される親和性で、前記共免疫調節ポリペプチドに結合する、請求項２に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
  5. 前記第１または第２のポリペプチドが、Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含み、前記Ｉｇ Ｆｃポリペプチドが、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである、請求項１～４のいずれか一項に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
  6. ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドが、Ｎ２９７Ａ、Ｌ２３４Ａ、Ｌ２３５Ａ、Ｌ２３４Ｆ、Ｌ２３５Ｅ、及びＰ３３１Ｓから選択される１つ以上のアミノ酸置換を含む、請求項５に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
  7. （ａ１）前記第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
    （ｉ）前記ペプチドエピトープ、及び
    （ｉｉ）前記第１のＭＨＣポリペプチドを含み、かつ
    （ｂ１）前記第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
    （ｉ）前記１つ以上の免疫調節ポリペプチド、
    （ｉｉ）前記第２のＭＨＣポリペプチド、及び
    （ｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含むか、または
    （ａ２）前記第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
    （ｉ）前記ペプチドエピトープ、及び
    （ｉｉ）前記第１のＭＨＣポリペプチドを含み、かつ
    （ｂ２）前記第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
    （ｉ）前記第２のＭＨＣポリペプチド、及び
    （ｉｉ）前記１つ以上の免疫調節ポリペプチド、及び
    （ｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含むか、または
    （ａ３）前記第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
    （ｉ）前記ペプチドエピトープ、及び
    （ｉｉ）前記第１のＭＨＣポリペプチドを含み、かつ
    （ｂ３）前記第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
    （ｉ）前記第２のＭＨＣポリペプチド、及び
    （ｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド、及び
    （ｉｉｉ）前記１つ以上の免疫調節ポリペプチドを含むか、または
    （ａ４）前記第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
    （ｉ）前記１つ以上の免疫調節ポリペプチド、
    （ｉｉ）前記ペプチドエピトープ、及び
    （ｉｉｉ）前記第１のＭＨＣポリペプチドを含み、かつ
    （ｂ４）前記第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
    （ｉ）前記第２のＭＨＣポリペプチド、及び
    （ｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含むか、または
    （ａ５）前記第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
    （ｉ）前記ペプチドエピトープ、
    （ｉｉ）前記第１のＭＨＣポリペプチド、及び
    （ｉｉｉ）前記１つ以上の免疫調節ポリペプチドを含み、かつ
    （ｂ５）前記第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
    （ｉ）前記第２のＭＨＣポリペプチド、及び
    （ｉｉ）免疫グロブリン（Ｉｇ） Ｆｃポリペプチドを含む、
    請求項１～６のいずれか一項に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
  8. 前記第１のＭＨＣポリペプチドがβ２－ミクログロブリンポリペプチドであり、前記第２のＭＨＣポリペプチドがＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドである、請求項１～７のいずれか一項に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
  9. 前記１つ以上の免疫調節ポリペプチドのうちの少なくとも１つが刺激ポリペプチドである、請求項１～８のいずれか一項に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
  10. 前記刺激ポリペプチドが、４－１ＢＢＬ、ＩＣＯＳ－Ｌ、ＯＸ－４０Ｌ、ＣＤ８０、ＣＤ８６、ＣＤ７０、サイトカイン、ならびにそれらのバリアント及び組み合わせからなる群から選択される、請求項９に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
  11. 前記１つ以上の免疫調節ポリペプチドのうちの少なくとも１つがＩＬ－２ポリペプチドである、請求項９及び１０のいずれか一項に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
  12. 前記免疫調節ポリペプチドがバリアントＩＬ－２ポリペプチドである、請求項１１に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
  13. 前記バリアントＩＬ－２ポリペプチドが、（ｉ）Ｈ１６Ａ置換及びＦ４２Ａ置換、または（ｉｉ）Ｈ１６Ｔ置換及びＦ４２Ａ置換を含む、請求項１２に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
  14. 前記１つ以上の免疫調節ポリペプチドのうちの少なくとも１つが抑制性ポリペプチドであり、任意選択で、前記抑制性ポリペプチドが、ＰＤ－Ｌ１、ＦａｓＬ、サイトカイン、及びＰＤ－Ｌ２、ならびにそれらのバリアント及び組み合わせからなる群から選択される、請求項１～８のいずれか一項に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
  15. 前記多量体ポリペプチドが、２つ以上の免疫調節ポリペプチドを含み、前記免疫調節ポリペプチドのうちの少なくとも２つが同じである、請求項１～１４のいずれか一項に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
  16. 前記２つ以上の免疫調節ポリペプチドがタンデムに存在する、請求項１５に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
  17. （ａ１）前記第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
    （ｉ）前記ペプチドエピトープ、及び
    （ｉｉ）前記第１のＭＨＣポリペプチドを含み、かつ
    （ｂ１）前記第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
    （ｉ）前記１つ以上の免疫調節ポリペプチド、
    （ｉｉ）前記第２のＭＨＣポリペプチド、及び
    （ｉｉｉ）免疫グロブリン（Ｉｇ） Ｆｃポリペプチドを含む、
    請求項１～６のいずれか一項に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
  18. （ａ３）前記第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
    （ｉ）前記ペプチドエピトープ、及び
    （ｉｉ）前記第１のＭＨＣポリペプチドを含み、かつ
    （ｂ３）前記第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
    （ｉ）前記第２のＭＨＣポリペプチド、及び
    （ｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド、及び
    （ｉｉｉ）前記１つ以上の免疫調節ポリペプチドを含む、
    請求項１～６のいずれか一項に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
  19. 前記第１のポリペプチド及び前記第２のポリペプチドが、互いに共有結合しており、任意選択で、前記共有結合がジスルフィド結合を介してである、請求項１～１８のいずれか一項に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
  20. 前記β２Ｍポリペプチド及び前記ＭＨＣ重鎖ポリペプチドが、前記β２Ｍポリペプチド中のＣｙｓ残基及び前記ＭＨＣ重鎖ポリペプチド中のＣｙｓ残基を結合するジスルフィド結合によって結合され、任意選択で、前記β２Ｍポリペプチドのアミノ酸残基１２におけるＣｙｓが、前記ＭＨＣ重鎖ポリペプチドのアミノ酸残基２３６におけるＣｙｓにジスルフィド結合されている、請求項１９に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
  21. 前記第１のポリペプチド鎖が、前記ペプチドエピトープと前記β２Ｍポリペプチドとの間にリンカーを含み、前記ジスルフィド結合が、前記リンカーに存在するＣｙｓと、前記ＭＨＣ重鎖ポリペプチドのＣｙｓとを連結する、請求項１９に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
  22. 第１のポリペプチド鎖が、前記ペプチドエピトープと前記β２Ｍポリペプチドとの間にリンカーを含み、前記ジスルフィド結合が、前記リンカー内のＧｌｙ２について置換されたＣｙｓと、前記ＭＨＣ重鎖ポリペプチドのＴｙｒ８４について置換されたＣｙｓとを連結する、請求項１９に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
  23. 前記第１及び前記第２のポリペプチドが、少なくとも２つのジスルフィド結合を介して互いに共有結合している、請求項１～１８のいずれか一項に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
  24. （ａ）第１のジスルフィド結合が、
    （ｉ）前記ペプチドエピトープと、β２Ｍポリペプチドである第１のＭＨＣクラスＩポリペプチドとの間のリンカーに存在するＣｙｓと、
    （ｉｉ）ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドである第２のＭＨＣクラスＩポリペプチドにＹ８４Ｃ置換を介して導入されたＣｙｓ残基と
    の間にあり、
    （ｂ）第２のジスルフィド結合が、
    （ｉ）Ｒ１２Ｃ置換を介して前記β２Ｍポリペプチドに導入されたＣｙｓ残基と、
    （ｉｉ）Ａ２３６Ｃ置換を介して前記ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに導入されたＣｙｓ残基と
    の間にある、
    請求項２３に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
  25. 前記リンカーが、アミノ酸配列ＧＣＧＧＳを含む、請求項２４に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
  26. 前記リンカーがアミノ酸配列ＧＣＧＧＳ（ＧＧＧＧＳ）ｎを含み、ｎが１～１０の整数である、請求項２４に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
  27. 前記ペプチドエピトープが、少なくとも９アミノ酸長、例えば９アミノ酸～約２５アミノ酸（例えば、１０アミノ酸（ａａ）、１１ａａ、１２ａａ、１３ａａ、１４ａａ、１５ａａ、１６ａａ、１７ａａ、１８ａａ、１９ａａ、２０ａａ、２１ａａ、２２ａａ、２３ａａ、２４ａａ、または２５ａａ、長さが９～２０アミノ酸、９～１８アミノ酸、９～１５アミノ酸、９～１２アミノ酸、９～１０アミノ酸、１０～２０アミノ酸、及び１５～２５アミノ酸の範囲内を含む）のペプチドである、請求項１～２６のいずれか一項に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
  28. 前記第１または前記第２のＭＨＣポリペプチドが、
    （ａ）図７Ａに示すＨＬＡ－Ａ＊０１０１、ＨＬＡ－Ａ＊０２０１、ＨＬＡ－Ａ＊０２０１、ＨＬＡ－Ａ＊１１０１、ＨＬＡ－Ａ＊２３０１、ＨＬＡ－Ａ＊２４０２、ＨＬＡ－Ａ＊２４０７、ＨＬＡ－Ａ＊３３０３、もしくはＨＬＡ－Ａ＊３４０１アミノ酸配列に対して少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列、または
    （ｂ）図８Ａに示すＨＬＡ－Ｂ＊０７０２、ＨＬＡ－Ｂ＊０８０１、ＨＬＡ－Ｂ＊１５０２、ＨＬＡ－Ｂ＊３８０２、ＨＬＡ－Ｂ＊４００１、ＨＬＡ－Ｂ＊４６０１、もしくはＨＬＡ－Ｂ＊５３０１アミノ酸配列に対して少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列、または
    （ｃ）図９Ａに示すＨＬＡ－Ｃ＊０１０２、ＨＬＡ－Ｃ＊０３０３、ＨＬＡ－Ｃ＊０３０４、ＨＬＡ－Ｃ＊０４０１、ＨＬＡ－Ｃ＊０６０２、ＨＬＡ－Ｃ＊０７０１、ＨＬＡ－Ｃ＊０７０２、ＨＬＡ－Ｃ＊０８０１、もしくはＨＬＡ－Ｃ＊１５０２に対して少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列
    を含む、
    請求項１～２７のいずれか一項に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
  29. 前記第１のＭＨＣポリペプチドがβ２Ｍポリペプチドであり、前記第２のＭＨＣポリペプチドが、ＨＬＡ－Ａ＊０２０１ポリペプチドに対して少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項１～２７のいずれか一項に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
  30. 前記第１のＭＨＣポリペプチドがβ２Ｍポリペプチドであり、前記第２のＭＨＣポリペプチドがＨＬＡ－Ａ＊１１０１ポリペプチドである、請求項１～２７のいずれか一項に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
  31. 前記第１のＭＨＣポリペプチドがβ２Ｍポリペプチドであり、前記第２のＭＨＣポリペプチドが、ＨＬＡ－Ａ＊３３０３ポリペプチドに対して少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項１～２７のいずれか一項に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
  32. 前記第１のＭＨＣポリペプチドがβ２Ｍポリペプチドであり、前記第２のＭＨＣポリペプチドが、ＨＬＡ－Ａ＊２４０１ポリペプチドに対して少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項１～２７のいずれか一項に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
  33. 前記ペプチドエピトープが、アミノ酸配列ＳＴＡＰＰＶＨＮＶを含み、９アミノ酸の長さを有する、請求項１～３２のいずれか一項に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
  34. 前記ペプチドエピトープが、アミノ酸配列ＳＬＡＰＰＶＨＮＶを含み、９アミノ酸の長さを有する、請求項１～３２のいずれか一項に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
  35. 前記ペプチドエピトープが、アミノ酸配列ＳＴＡＰＰＡＨＧＶを含み、９アミノ酸の長さを有する、請求項１～３２のいずれか一項に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
  36. 前記ペプチドエピトープが、アミノ酸配列ＳＬＡＰＰＡＨＧＶを含み、９アミノ酸の長さを有する、請求項１～３２のいずれか一項に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
  37. 前記第１のポリペプチド及び／または第２のポリペプチドが、腫瘍ターゲティングポリペプチド（ＴＴＰ）を含む、請求項１～３６のいずれか一項に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
  38. 前記ＴＴＰが、がん細胞の表面上のがん関連抗原に特異的な抗体である、請求項３７に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
  39. 前記抗体がｓｃＦｖまたはナノボディである、請求項３８に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
  40. 前記多量体ポリペプチドが第１及び第２のヘテロ二量体を含み、前記第１及び第２のヘテロ二量体が、前記第１及び第２のヘテロ二量体の前記Ｉｇ Ｆｃポリペプチド間の１つ以上のジスルフィド結合によって共有結合されている、請求項１～３７のいずれか一項に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチド。
  41. 請求項１～４０のいずれか一項に記載の第１または第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸。
  42. 請求項４１に記載の核酸を含む発現ベクター。
  43. ペプチドエピトープに特異的なＴ細胞の活性を選択的に調節する方法であって、前記方法が、前記Ｔ細胞を、請求項１～４０のいずれか一項に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチドに接触させることを含み、前記接触させることが、前記エピトープ特異的Ｔ細胞の前記活性を選択的に調節する、前記方法。
  44. がんを有する患者を治療する方法であって、請求項１～４０のいずれか一項に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチドを含む有効量の医薬組成物を前記患者に投与することを含む、前記方法。
  45. 前記がんが、腺癌、血液がん、多発性骨髄腫、Ｂ細胞性リンパ腫からなる群から選択される、請求項４４に記載の方法。
  46. 前記投与が、皮下、腹腔内、筋肉内、皮内、腫瘍内、腫瘍周囲、及び／または静脈内である、請求項４４または請求項４５に記載の方法。
  47. 個体における免疫応答を調節する方法であって、前記方法が、請求項１～４０のいずれか一項に記載の有効量のＴ細胞調節多量体ポリペプチドを前記個体に投与することを含み、前記投与することが、エピトープ特異的Ｔ細胞応答及びエピトープ非特異的Ｔ細胞応答を誘導し、前記エピトープ特異的Ｔ細胞応答と前記エピトープ非特異的Ｔ細胞応答との比が少なくとも２：１である、前記方法。
  48. 免疫調節ポリペプチドを標的Ｔ細胞に選択的に送達する方法であって、前記方法が、Ｔ細胞の混合集団を、請求項１～４０のいずれか一項に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチドと接触させることを含み、前記Ｔ細胞の混合集団が、前記標的Ｔ細胞及び非標的Ｔ細胞を含み、前記標的Ｔ細胞が、前記Ｔ細胞調節多量体ポリペプチド内に存在する前記ＭＵＣ１エピトープに特異的であり、前記接触が、前記Ｔ細胞調節多量体ポリペプチド内に存在する前記１つ以上の免疫調節ポリペプチドを前記標的Ｔ細胞に送達する、前記方法。
  49. 個体から得られたＴ細胞の混合集団において、ペプチドエピトープに結合する標的Ｔ細胞の存在を検出する方法であって、前記方法が、（ａ）前記Ｔ細胞の混合集団を、請求項１～４０のいずれか一項に記載のＴ細胞調節多量体ポリペプチドとｉｎ ｖｉｔｒｏで接触させることであって、前記Ｔ細胞調節多量体ポリペプチドが、前記ペプチドエピトープを含む、ことと、（ｂ）前記接触に応答してＴ細胞の活性化及び／または増殖を検出することであって、活性化及び／または増殖したＴ細胞が、前記標的Ｔ細胞の存在を示す、ことと、を含む、前記方法。
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