TW201943729A - 抗il—33抗體和彼之組成物、方法及用途 - Google Patents
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Abstract
本發明提供特異性結合IL-33之抗體和其抗原結合片段及彼等之用途和相關方法。
Description
本發明關於特異性結合介白素-33之抗體及其抗原結合片段和彼等之組成物、方法及用途。
IL-33為關鍵之IL-1家族成員,其擴增涉及哮喘和異位性炎症之許多細胞類型的反應。IL-33以高親和力與介白素-1受體樣1(IL1RL1;亦稱為致瘤性抑制因子2[ST2])結合並與IL1RAcP形成三元複合物以形成信號傳導複合物。此信號傳導複合物導致一系列依賴Myddosome(具有MyD88和IRAK家族成員)之事件。此信號傳導最終導致NFKb活化及細胞和細胞因子環境特異性背景中之其他通路。當細胞(諸如肥大細胞或嗜鹼性粒細胞)受到IL-33刺激時會產生第2型細胞因子,諸如如IL-4、5和13。
IL-33在許多哮喘和過敏性疾病之臨床前模型 中顯示出當其活性被藥理學或遺傳學方法阻斷時具有關鍵作用。通路之阻斷已可藉由中和針對IL-33之抗體或受體IL1RL1、IL-33或IL1RL1之遺傳缺失或受體IL1RL1與Fc偶聯之融合蛋白的可溶形式來完成(Coyle et al.,1999,J.Exper.Med 190(7):895-902)。在大多數使用含有蛋白水解過敏原之生理過敏原(諸如塵蟎、蟑螂或鏈格孢真菌)的模型系統中,IL-33在驅動炎症和氣道重塑的其他態樣中具有重要作用(Chu et al.,2013,J.Allergy Clin.Immunol.131:187-200)。在依賴用於致敏化之佐劑(諸如氫氧化鋁(明礬)或尿酸鈉晶體)的藥理學模型中,IL-33在模型之致敏期和誘導第2型細胞因子(諸如IL-5和IL13)中具有重要作用(Hara et al.,2014,J.Immunol.192(9):4032-4042)。IL-33亦被發現在與氣道中之病毒感染相關的炎症反應中具有重要作用。由病毒感染對氣道上皮造成之損傷可能引發IL-33釋出並修改免疫反應之類型。
諸如慢性鼻竇炎併鼻息肉(chronic rhinosinusitis with nasal polyps)(CRSwNP)、異位性皮膚炎(AD)和哮喘之類的疾病為其中可能有多種細胞因子涉及發病機理之疾病。IL-33受體ST2表現在許多與第2型炎症相關的細胞類型中,包括肥大細胞、嗜鹼性粒細胞、Th2-T細胞、第2型先天性淋巴樣細胞,等(Cayrol & Girard,2014,Current Opinion in Immunology 31:31-37;Molofsky et al..2015,Immunity 42(6):1005-1019)。這些細胞類型對IL-33之初級反應為產生炎性細胞因子,尤其是與第2型炎 症相關者,包括IL-5、IL-13、IL-4、IL-31和IL-9(Molofsky et al.,2015,Immunity 42(6):1005-1019;Rivelleseet al,2014,Eur.J.Immunol.44(10):3045-3055;Suzukawaet al.,2008,J.Immunology 181(9):5981-5989;Vocca et al.Immunobiology 220(8):954-963;Maier et al.,2014,J.Immunology 193(2):645-654)。亦產生其他細胞因子及趨化因子,這些因子在驅動另外之炎性細胞類型被募集到組織部位上具重要作用(Cayrol & Girard,2014;Molofsky et al.,2015)。IL-33最初釋出係由身體或黏膜表面之上皮損傷觸發。疾病相關之觸發因素包括具有蛋白水解活性之過敏原、上皮之物理損傷、病毒及身體表面常見之真菌和細菌。在其中該組織富含嗜酸性粒細胞和肥大細胞之疾病中,對上皮之損傷引發級聯反應,從而釋出IL-33,作用在局部靶細胞上,並驅動多種對第2型炎症反應極為重要之細胞因子產生。
本發明提供特異性結合IL-33之抗體(和其抗原結合片段)及彼等之用途和相關方法。本技藝之技術熟習人士使用不超過常規實驗將可察知或能夠確定許多本文所描述之本發明的具體實施態樣之等效物。該類等效物意圖由下列實施態樣(E)涵蓋。
E1.一種特異性結合人IL-33之抗體或其抗原結合片段。
E2.如E1之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含由下列所組成之群組之一的CDR-H1、CDR-H2和CDR-H3序列:SEQ ID NO:14、32、90、94、97、113、118、121、124、126、129、132、135、138、141、144、147、150、152、155、158、161、163、165、167、170、173、176、179、182、184、186、201、204、210、213、216、219、222、225、228、231和234。
E3.如E1至E2中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含由下列所組成之群組之一的CDR-L1、CDR-L2和CDR-L3序列:SEQ ID NO:19、36、81、91、98、115、189、192、195、198和207。
E4.如E1至E3中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含下列(i)至(vi)的一或多者:(i)選自由下列所組成之群組的CDR-L1:SEQ ID NO:20、37、190、193、257、258、259和260,(ii)選自由下列所組成之群組的CDR-L2:SEQ ID NO:21、196、199、261、262、263和264,(iii)選自由下列所組成之群組的CDR-L3:SEQ ID NO:22、38、208、265、266、267和268,(iv)選自由下列所組成之群組的CDR-H1:SEQ ID NO:16、33、269、270和271,(v)選自由下列所組成之群組的CDR-H2:SEQ ID NO:17、34、168、171、174、180、202、205、211、214、217、220、223、226、229、232、235、272、273、 274和275,(vi)選自由下列所組成之群組的CDR-H3:SEQ ID NO:18、35、114、119、122、127、130、133、136、139、142、145、148、153、156、159、177、187、276、277、278和279。
E5.如E1至E4中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含(i)選自由下列所組成之群組的CDR-L1:SEQ ID NO:257、258、259和260,(ii)選自由下列所組成之群組的CDR-L2:SEQ ID NO:261、262、263和264,(iii)選自由下列所組成之群組的CDR-L3:SEQ ID NO:265、266、267和268,(iv)選自由下列所組成之群組的CDR-H1:SEQ ID NO:269、270和271,(v)選自由下列所組成之群組的CDR-H2:SEQ ID NO:272、273、274和275,(vi)選自由下列所組成之群組的CDR-H3:SEQ ID NO:276、277、278和279。
E6.如E1至E5中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含(i)CDR-L1,其包含SEQ ID NO:257,(ii)CDR-L2,其包含SEQ ID NO:261,(iii)CDR-L3,其包含SEQ ID NO:265, (iv)CDR-H1,其包含SEQ ID NO:269,(v)CDR-H2,其包含SEQ ID NO:272,(vi)CDR-H3,其包含SEQ ID NO:276。
E7.如E1至E6中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含(i)CDR-L1,其包含SEQ ID NO:258,(ii)CDR-L2,其包含SEQ ID NO:262,(iii)CDR-L3,其包含SEQ ID NO:266,(iv)CDR-H1,其包含SEQ ID NO:270,(v)CDR-H2,其包含SEQ ID NO:273,(vi)CDR-H3,其包含SEQ ID NO:277。
E8.如E1至E7中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含(i)CDR-L1,其包含SEQ ID NO:259,(ii)CDR-L2,其包含SEQ ID NO:263,(iii)CDR-L3,其包含SEQ ID NO:267,(iv)CDR-H1,其包含SEQ ID NO:271,(v)CDR-H2,其包含SEQ ID NO:274,(vi)CDR-H3,其包含SEQ ID NO:278。
E9.如E1至E8中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含(i)CDR-L1,其包含SEQ ID NO:260,(ii)CDR-L2,其包含SEQ ID NO:264,(iii)CDR-L3,其包含SEQ ID NO:268, (iv)CDR-H1,其包含SEQ ID NO:271,(v)CDR-H2,其包含SEQ ID NO:275,(vi)CDR-H3,其包含SEQ ID NO:278。
E10.如E1至E9中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含(i)CDR-L1,其包含SEQ ID NO:20,(ii)CDR-L2,其包含SEQ ID NO:21,(iii)CDR-L3,其包含SEQ ID NO:208,(iv)CDR-H1,其包含SEQ ID NO:16,(v)CDR-H2,其包含SEQ ID NO:226,(vi)CDR-H3,其包含SEQ ID NO:18。
E11.如E1至E10中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含SEQ ID NO:225之CDR-H1、CDR-H2和CDR-H3序列。
E12.如E1至E11中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含SEQ ID NO:207之CDR-L1、CDR-L2和CDR-L3序列。
E13.如E1至E12中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含下列取代的一或多者:(i)CDR L1中之1、2、3、4、5或6個取代,其經取代成人種系VL序列之對應殘基,(ii)CDR L2中之1、2、3、4或5個取代,其經取代成人VL種系序列之對應殘基,(iii)CDR L3中之1、2、3、4、5或6個取代,其經取代 成人種系VL序列之對應殘基,(iv)CDR H1中之1個取代,其經取代成人種系VH序列之對應殘基,(v)CDR H2中之1、2、3、4、5、6、7或8個取代,其經取代成人種系VH序列之對應殘基,其中該人種系VL序列係選自由下列所組成之群組:DPK9、DPK12、DPK18、DPK24、HK102_V1、DPK1、DPK8、DPK3、DPK21、Vg_38K、DPK22、DPK15、DPL16、DPL8、V1-22、Vλ共有序列、Vλ1共有序列、Vλ3共有序列、VK共有序列、VK1共有序列、VK2共有序列及VK3且該人種系VH係選自由下列所組成之群組:DP54、DP47、DP50、DP31、DP46、DP71、DP75、DP10、DP7、DP49、DP51、DP38、DP79、DP78、DP73、VH3、VH5、VH1及VH4。
E14.如E1至E13中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含源自人種系VH序列的VH框架序列,該人種系VH序列係選自由下列所組成之群組:DP54、DP47、DP50、DP31、DP46、DP71、DP75、DP10、DP7、DP49、DP51、DP38、DP79、DP78、DP73、VH3、VH5、VH1及VH4。
E15.如E1至E14中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含源自人VH3種系序列之框架VH序列。
E16.如E1至E15中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含源自人種系VH序列的VH框架序列,該人種系 VH序列係選自由下列所組成之群組:DP54、DP47、DP50、DP31、DP46、DP49和DP51。
E17.如E1至E16中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含源自人種系VH序列的VH框架序列,該人種系VH序列係選自由下列所組成之群組:DP54、DP47、DP50和DP31。
E18.如E1至E17中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含源自人種系DP54序列之VH框架序列。
E19.如E1至E18中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含源自人種系VL序列的VL框架序列,該人種系VL序列係選自由下列所組成之群組:DPK9、DPK12、DPK18、DPK24、HK102_V1、DPK1、DPK8、DPK3、DPK21、Vg_38K、DPK22、DPK15、DPL16、DPL8、V1-22、Vλ共有序列、Vλ1共有序列、Vλ3共有序列、VK共有序列、VK1共有序列、VK2共有序列及VK3。
E20.如E1至E19中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含源自人種系VL序列的VL框架序列,該人種系VL序列係選自由下列所組成之群組:DPK9、DPK12、DPK18、DPK24、HK102_V1、DPK1、DPK8、DPK3、DPK21、Vg_38K、DPK22、DPK15、VK共有序列、VK1共有序列、VK2共有序列及VK3。
E21.如E1至E20中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含源自人種系VK1序列之VL框架序列。
E22.如E1至E21中任一項之抗體或其抗原結合片段, 該抗體包含源自人種系VL序列的VL框架序列,該人種系VL序列係選自由下列所組成之群組:DPK9、HK102_V1、DPK1和DPK8。
E23.如E1至E22中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含源自人種系DPK9序列之VL框架序列。
E24.如E1至E23中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含VL框架序列和VH框架序列,其中VL框架序列或VH框架序列的一或二者與該抗體來源之人種系序列具有至少90%同一性。
E25.如E1至E24中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含VL框架序列和VH框架序列,其中VL框架序列或VH框架序列的一或二者與該抗體來源之人種系序列具有至少66%、76%、80%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性。
E26.如E1至E25中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含VL框架序列和VH框架序列,其中VL框架序列或VH框架序列的一或二者與該抗體來源之人種系序列相同完全相同。
E27.如E1至E26中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含VH,該VH包含與SEQ ID NO:225具有至少90%同一性之胺基酸序列。
E28.如E1至E27中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含VH,該VH包含與SEQ ID NO:225具有至少92%同一性之胺基酸序列。
E29.如E1至E28中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含VH,該VH包含SEQ ID NO:225之胺基酸序列。
E30.如E1至E29中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含VL,該VL包含與SEQ ID NO:207具有至少66%同一性之胺基酸序列。
E31.如E1至E30中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含VL,該VL包含與SEQ ID NO:207具有至少66%、76%、80%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性之胺基酸序列。
E32.如E1至E31中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含VL,該VL包含SEQ ID NO:207之胺基酸序列。
E33.如E1至E32中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含Fc結構域。
E34.如E33之抗體或其抗原結合片段,其中該Fc結構域為IgA(例如IgA1或IgA2)、IgD、IgE、IgM或IgG(例如IgG1、IgG2、IgG3或IgG4)之Fc結構域。
E35.如E34之抗體或其抗原結合片段,其中該Fc結構域為IgG之Fc結構域。
E36.如E35之抗體或其抗原結合片段,其中該IgG係選自由下列所組成之群組:IgG1、IgG2、IgG3或IgG4。
E37.如E36之抗體或其抗原結合片段,其中該IgG為IgG1。
E38.如E1至E37中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含重鏈,該重鏈包含與SEQ ID NO:244具有至少90%同一性之胺基酸序列。
E39.如E1至E38中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含重鏈,該重鏈包含與SEQ ID NO:244具有至少91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性之胺基酸序列。
E40.如E1至E39中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含重鏈,該重鏈包含SEQ ID NO:244之胺基酸序列。
E41.如E1至E40中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含輕鏈(LC),該輕鏈(LC)包含與SEQ ID NO:209具有至少90%同一性之胺基酸序列。
E42.如E1至E41中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含輕鏈(LC),該輕鏈(LC)包含與SEQ ID NO:209具有至少91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性之胺基酸序列。
E43.如E1至E42中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含輕鏈(LC),該輕鏈(LC)包含SEQ ID NO:209之胺基酸序列。
E44.如E1至E43中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含由寄存於ATCC且具有ATCC登錄編號為PTA-122724之質體編碼的VH序列。
E45.如E1至E44中任一項之抗體或其抗原結合片段, 該抗體包含由寄存於ATCC且具有ATCC登錄編號為PTA-122725之質體編碼的VL序列。
E46.一種抗體或其抗原結合片段,該抗體與如E1至E45中任一項之抗體或其抗原結合片段競爭與人IL-33結合。
E47.一種抗體或其抗原結合片段,該抗體與下列群組之一或多者競爭與人IL-33結合:7E8_嵌合體、9B3_嵌合體、9B3_嵌合體_huJseg、7E8 CDR移植物、IL33-10、9B3 CDR移植物、9B3_1、9B3_2A、9B3_2B、9B3_3、9B3_5、9B3_7 9B3_13、9B3_15、9B3_17、9B3_22、9B3_31V2、9B3_36、9B3_79、9B3_124、9B3_162、7E8H/9B3K、9B3_563、IL33-11、IL33-12、IL33-13、IL33-45、IL33-55、IL33-56、IL33-57、IL33-58、IL33-61、IL33-62、IL33-68、IL33-74、IL33-75、IL33-80、IL33-81、IL33-103、IL33-117、IL33-136、IL33-153、IL33-154、IL33-155、IL33-156、IL33-157、IL33-158、IL33-167、IL33-168、IL33-169、IL33-170、IL33-171、IL33-172、IL33-175、IL33-186、IL33-187、IL33-188、IL33-158-152、IL33-167-153、IL33-158LS及IL33-167LS。
E48.一種抗體或其抗原結合片段,該抗體與IL33-158LS或IL33-158LS之抗原結合片段競爭與人IL-33結合。
E49.如E1至E48中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體或抗原結合片段為Fc融合蛋白、單體 (monobody)、大型抗體(maxibody)、雙功能抗體、scFab、scFv、肽體。
E50.如E1至E49中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體或抗原結合片段以約為或低於選自由下列所組成之群組的KD值與人IL-33結合:約10nM、5nM、2nM、1nM、900pM、800pM、700pM、600pM、500pM、400pM、300pM、250pM、200pM、150pM、100pM、50pM、40pM、30pM、25pM、20pM、15pM、10pM、5pM及1pM。
E51.如E1至E50中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體或其抗原結合片段以約為或低於選自由下列所組成之群組的KD值與食蟹猴IL-33結合:約10nM、5nM、2nM、1nM、900pM、800pM、700pM、600pM、500pM、400pM、300pM、250pM、200pM、150pM、100pM、50pM、40pM、30pM、25pM、20pM、15pM、13pM、10pM、5pM及1pM。
E52.如E1至E51中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體或抗原結合片段與食蟹猴IL-33結合之KD值係在該抗體或其抗原結合片段與人IL-33結合之KD值的1個數量級之內。
E53.如E1至E52中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體或抗原結合片段與人IL-33結合之KD值相較於與食蟹猴IL-33結合之KD值的比例係介於5:1至1:5。
E54.如E1至E53中任一項之抗體或其抗原結合片段, 其中該抗體或其抗原結合片段與人IL-33結合之KD值相較於與食蟹猴IL-33結合之KD值的比例係介於2:1至1:2。
E55.如E1至E54中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體或其抗原結合片段與活性IL-33結合之KD值低於與無活性IL-33結合之KD值。
E56.如E1至E55中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體或其抗原結合片段與活性IL-33結合之KD值較與無活性IL-33結合之KD值低至少10倍。
E57.如E1至E56中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體或其抗原結合片段與活性IL-33結合之KD值較與無活性形式之IL-33結合之KD值低至少10、100、1×103、1×104、1×105、1×106、1×107倍。
E58.如E1至E57中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體或其抗原結合片段與活性IL-33結合,但不與無活性IL-33結合。
E59.如E55至E58中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該活性IL-33之KD值係使用IL-33變體測量,其中在位置208(C208)(根據SEQ ID NO:396編號)之半胱胺酸胺基酸殘基被非半胱胺酸胺基酸殘基取代。
E60.如E55至E59中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該活性IL-33之KD值係使用IL-33變體測量,其中C208和C232(根據SEQ ID NO:396編號)被非半胱胺酸胺基酸殘基取代。
E61.如E55至E60中任一項之抗體或其抗原結合片段, 其中該活性IL-33之KD值係使用還原形式之野生型IL-33測量。
E62.如E55至E61中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該無活性IL-33之KD值係使用非還原形式之野生型IL-33測量。
E63.如E55至E62中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該IL-33為人IL-33。
E64.如E55至E62中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該IL-33為食蟹猴IL-33。
E65.如E1至E64中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體或抗原結合片段與食蟹猴IL-33之結合KD值相較於與人IL-33之結合KD值的比率範圍之下限值係選自由下列所組成之群組:0.5、0.6、0.7、0.8、0.9、1.0、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2.0、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、3.0、3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9、4.0、4.1、4.2、4.3、4.4、4.5和6.2,且該比率範圍之上限值係選自由下列所組成之群組:1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2.0、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、3.0、3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9、4.0、4.1、4.2、4.3、4.4、4.5、6.2、9、9.2和10。
E66.如E1至E55中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體或抗原結合片段與食蟹猴IL-33之結合KD值相較於與人IL-33之結合KD值的比率係介於約0.5至約3.0之 間。
E67.如E1至E56中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體或抗原結合片段與食蟹猴IL-33之結合KD值相較於與人IL-33之結合KD值的比率係介於約1.2至約2.4之間。
E68.如E1至E57中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體或抗原結合片段與食蟹猴IL-33之結合KD值相較於與人IL-33之結合KD值的比率係介於約1至約2之間。
E69.如E1至E58中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體或抗原結合片段與食蟹猴IL-33之結合KD值相較於與人IL-33之結合KD值的比率係介於約1.3至約2.3之間。
E70.如E1至E59中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體或抗原結合片段與食蟹猴IL-33之結合KD值相較於與人IL-33之結合KD值的比率係介於約1.3至約1.8之間。
E71.如E1至E70中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體或抗原結合片段與SEQ ID NO:5之食蟹猴IL-33的結合KD值相較於與SEQ ID NO:3之人IL-33的結合KD值之比率係介於約1.0至約2.3之間。
E72.如E1至E71中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體或抗原結合片段與SEQ ID NO:5之食蟹猴IL-33的結合KD值相較於與SEQ ID NO:3之人IL-33的結合KD值之比率係介於約1.0至約2.0之間。
E73.如E1至E72中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體或抗原結合片段與SEQ ID NO:5之食蟹猴IL-33的結合KD值相較於與SEQ ID NO:3之人IL-33的結合KD值之比率係介於約1.3至約1.8之間。
E74.如E1至E73中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體或抗原結合片段與SEQ ID NO:5之食蟹猴IL-33的結合KD值相較於與SEQ ID NO:3之人IL-33的結合KD值之比率的測量係藉由比較用於中和食蟹猴和人IL-33之HEK293 ST2 NFκB報告子分析的結果來進行。
E75.如E1至E74中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體或抗原結合片段與SEQ ID NO:397之食蟹猴IL-33的結合KD值相較於與SEQ ID NO:1之人IL-33的結合KD值之比率係介於約4至約10之間。
E76.如E1至E75中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體或抗原結合片段與SEQ ID NO:397之食蟹猴IL-33的結合KD值相較於與SEQ ID NO:1之人IL-33的結合KD值之比率係介於約4.2至約9.2之間。
E77.如E1至E76中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體或抗原結合片段與SEQ ID NO:397之食蟹猴IL-33的結合KD值相較於與SEQ ID NO:1之人IL-33的結合KD值之比率為約4.2。
E78.如E1至E77中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體或抗原結合片段與SEQ ID NO:397之食蟹猴IL-33的結合KD值相較於與SEQ ID NO:1之人IL-33的結合 KD值之比率為約6.2。
E79.如E1至E78中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體或抗原結合片段與SEQ ID NO:397之食蟹猴IL-33的結合KD值相較於與SEQ ID NO:1之人IL-33的結合KD值之比率為約9.2。
E80.如E1至E79中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體或抗原結合片段與SEQ ID NO:397之食蟹猴IL-33的結合KD值相較於與SEQ ID NO:1之人IL-33的結合KD值之比率的測量係藉由比較用於中和食蟹猴和人IL-33之HEK293 ST2 NFκB報告子分析的結果來進行。
E81.如E50至E80中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該KD值係藉由表面等離子共振(SPR)測量。
E82.如E50至E81中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該KD值係藉由表面等離子共振(SPR)測量且該IL-33為固定的。
E83.如E1至E82中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中在食蟹猴中終末半衰期為至少約15天。
E84.如E1至E83中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中在食蟹猴中終末半衰期為至少約16天。
E85.如E1至E84中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中在食蟹猴中終末半衰期為至少約18天。
E86.如E1至E85中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中在人體中終末半衰期為至少約30天。
E87.如E1至E86中任一項之抗體或其抗原結合片段, 其中在人體中終末半衰期為至少約50天。
E88.如E1至E87中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中在人體中終末半衰期為至少約55天。
E89.如E1至E88中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中在人體中終末半衰期為至少約60天。
E90.如E1至E89中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中在人體中終末半衰期為至少約65天。
E91.如E1至E90中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中在人體中終末半衰期為至少約70天。
E92.如E1至E91中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中在人體中終末半衰期為至少約75天。
E93.如E1至E92中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中在人體中終末半衰期為至少約80天。
E94.如E1至E93中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中在人體中終末半衰期為至少約85天。
E95.如E1至E94中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中在人體中終末半衰期為至少約90天。
E96.如E1至E95中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體在親和力捕捉自身交互作用奈米粒子光譜分析法(affinity-capture self-interaction nanoparticle spectroscopy assay)中之最大吸收波長相對於空白組係小於15nm。
E97.如E1至E96中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體在親和力捕捉自身交互作用奈米粒子光譜分析 法中之最大吸收波長相對於空白組係小於10nm。
E98.如E1至E97中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體在親和力捕捉自身交互作用奈米粒子光譜分析法中之最大吸收波長相對於空白組係小於5nm。
E99.如E1至E98中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體在親和力捕捉自身交互作用奈米粒子光譜分析法中之最大吸收波長相對於空白組係小於1nm。
E100.如E1至E99中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體之DNA結合分數相對於空白組標準化係低於19。
E101.如E1至E100中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體之DNA結合分數相對於空白組標準化係低於15。
E102.如E1至E101中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體之DNA結合分數相對於空白組標準化係低於10。
E103.如E1至E102中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體之DNA結合分數相對於空白組標準化係低於7.55。
E104.一種抗體或其抗原結合片段,該抗體與如E1至E103中任一項之抗體或其抗原結合片段競爭結合。
E105.一種抗體或其抗原結合片段,該抗體與如E1至E104中任一項之抗體或其抗原結合片段結合相同之抗原決定部位。
E106.一種抗體或其抗原結合片段,該抗體包含選自由下列所組成之群組之抗體的CDR:7E8_嵌合體、9B3_嵌合體、9B3_嵌合體_huJseg、7E8 CDR移植物、IL33-10、9B3 CDR移植物、9B3_1、9B3_2A、9B3_2B、9B3_3、9B3_5、9B3_7 9B3_13、9B3_15、9B3_17、9B3_22、9B3_31V2、9B3_36、9B3_79、9B3_124、9B3_162、7E8H/9B3K、9B3_563、IL33-11、IL33-12、IL33-13、IL33-45、IL33-55、IL33-56、IL33-57、IL33-58、IL33-61、IL33-62、IL33-68、IL33-74、IL33-75、IL33-80、IL33-81、IL33-103、IL33-117、IL33-136、IL33-153、IL33-154、IL33-155、IL33-156、IL33-157、IL33-158、IL33-167、IL33-168、IL33-169、IL33-170、IL33-171、IL33-172、IL33-175、IL33-186、IL33-187、IL33-188、IL33-158-152、IL33-167-153、IL33-158LS及IL33-167LS。
E107.一種抗體或其抗原結合片段,該抗體包含選自由下列所組成之群組之抗體的VL和VH:7E8_嵌合體、9B3_嵌合體、9B3_嵌合體_huJseg、7E8 CDR移植物、IL33-10、9B3 CDR移植物、9B3_1、9B3_2A、9B3_2B、9B3_3、9B3_5、9B3_7 9B3_13、9B3_15、9B3_17、9B3_22、9B3_31V2、9B3_36、9B3_79、9B3_124、9B3_162、7E8H/9B3K、9B3_563、IL33-11、IL33-12、IL33-13、IL33-45、IL33-55、IL33-56、IL33-57、IL33-58、IL33-61、IL33-62、IL33-68、IL33-74、IL33-75、 IL33-80、IL33-81、IL33-103、IL33-117、IL33-136、IL33-153、IL33-154、IL33-155、IL33-156、IL33-157、IL33-158、IL33-167、IL33-168、IL33-169、IL33-170、IL33-171、IL33-172、IL33-175、IL33-186、IL33-187、IL33-188、IL33-158-152、IL33-167-153、IL33-158LS及IL33-167LS。
E108.一種抗體或其抗原結合片段,該抗體係選自由下列所組成之群組:7E8_嵌合體、9B3_嵌合體、9B3_嵌合體_huJseg、7E8 CDR移植物、IL33-10、9B3 CDR移植物、9B3_1、9B3_2A、9B3_2B、9B3_3、9B3_5、9B3_7 9B3_13、9B3_15、9B3_17、9B3_22、9B3_31V2、9B3_36、9B3_79、9B3_124、9B3_162、7E8H/9B3K、9B3_563、IL33-11、IL33-12、IL33-13、IL33-45、IL33-55、IL33-56、IL33-57、IL33-58、IL33-61、IL33-62、IL33-68、IL33-74、IL33-75、IL33-80、IL33-81、IL33-103、IL33-117、IL33-136、IL33-153、IL33-154、IL33-155、IL33-156、IL33-157、IL33-158、IL33-167、IL33-168、IL33-169、IL33-170、IL33-171、IL33-172、IL33-175、IL33-186、IL33-187、IL33-188、IL33-158-152、IL33-167-153、IL33-158LS及IL33-167LS。
E109.一種經分離之核酸分子,其包含一或多個編碼如E1至E108中任一項之抗體或其抗原結合片段之核苷酸序列。
E110.一種經分離之核酸分子,其包含如SEQ ID NO: 398、399、400和401之一或多者所示明之核酸序列。
E111.一種經分離之核酸分子,其包含如SEQ ID NO:398所示明之核酸序列。
E112.一種經分離之核酸分子,其包含如SEQ ID NO:399所示明之核酸序列。
E113.一種經分離之核酸分子,其包含如SEQ ID NO:400所示明之核酸序列。
E114.一種經分離之核酸分子,其包含如SEQ ID NO:401所示明之核酸序列。
E115.一種經分離之核酸分子,其包含該寄存於ATCC且具有ATCC登錄編號為PTA-122724之核酸分子的編碼序列。
E116一種經分離之核酸分子,其包含該寄存於ATCC且具有ATCC登錄編號為PTA-122725之核酸分子的編碼序列。
E117.一種載體,其包含如E109至E116中任一項之核酸分子。
E118.一種宿主細胞,其包含如E109至E116中任一項之核酸分子或如E117之載體。
E119.如E118之宿主細胞,其中該細胞為哺乳動物細胞。
E120.如E119之宿主細胞,其中該宿主細胞為CHO細胞、HEK-293細胞或Sp2.0細胞。
E121.一種製造抗體或其抗原結合片段之方法,其包 含在該抗體或其抗原結合片段係由如E119至E120中任一項之宿主細胞表現之條件下培養該宿主細胞。
E122.如E121之方法,其進一步包含將該抗體或其抗原結合片段分離出。
E123.一種醫藥組成物,其包含如E1至E108中任一項之抗體或其抗原結合片段及醫藥上可接受之載體或賦形劑。
E124.一種降低IL-33之活性的方法,其包含對有需要降低IL-33之活性的個體投予治療有效量之如E1至E108中任一項之抗體或其抗原結合片段,或如E123之醫藥組成物。
E125.一種治療發炎性疾病之方法,其包含對有需要治療發炎性疾病之個體投予治療有效量之如E1至E108中任一項之抗體或其抗原結合片段,或如E123之醫藥組成物。
E126.一種治療異位性皮膚炎之方法,其包含對有需要治療異位性皮膚炎之個體投予治療有效量之如E1至E108中任一項之抗體或其抗原結合片段,或如E123之醫藥組成物。
E127.一種治療發炎性腸病之方法,其包含對有需要治療發炎性腸病之個體投予治療有效量之如E1至E108中任一項之抗體或其抗原結合片段,或如E123之醫藥組成物。
E128.如E121至E127中任一項之方法,其中該個體為人。
E129.如E121至E128中任一項之方法,其包含經由靜 脈內途徑投予該抗體或其抗原結合片段或醫藥組成物。
E130.如E121至E128中任一項之方法,其包含經由皮下途徑投予該抗體或其抗原結合片段或醫藥組成物。
E131.如E121至E130中任一項之方法,其中該抗體或其抗原結合片段或醫藥組成物約每週投予二次、每週投予一次、每二週投予一次、每三週投予一次、每四週投予一次、每五週投予一次、每六週投予一次、每七週投予一次、每八週投予一次、每九週投予一次、每十週投予一次、每月投予二次、每月投予一次、每二個月投予一次、每三個月投予一次或每四個月投予一次。
E132.如E1至E108中任一項之抗體或其抗原結合片段或如E123之醫藥組成物,其係作為藥物。
E133.如E1至E108中任一項之抗體或其抗原結合片段或如E123之醫藥組成物,其係用於降低個體之IL-33的活性。
E134.如E1至E108中任一項之抗體或其抗原結合片段或如E123之醫藥組成物,其係用於治療個體之發炎性疾病。
E135.如E1至E108中任一項之抗體或其抗原結合片段或如E123之醫藥組成物,其係用於治療個體之異位性皮膚炎。
E136.一種治療醫學病症之方法,其包含對有需要治療醫學病症之個體投予治療有效量之如E1至E108中任一項之抗體或其抗原結合片段或如E123之醫藥組成物。
E137.如E106之方法,其中該醫療病症係選自由下列所組成之群組:發炎性腸病、過敏症、過敏性鼻炎、過敏性結膜炎、春季型角膜結膜炎(vernal keratoconjunctivitis)、季節性過敏、寵物過敏、氣喘、食物過敏、花生過敏、異位性皮膚炎、慢性鼻竇炎伴鼻息肉(CRSwNP)、過敏性鼻炎、支氣管炎、慢性阻塞性肺病(COPD)、呼吸系統疾病病毒性惡化、兒童和成人之病毒感染(呼吸道融合病毒(RSV)、鼻病毒、流行性感冒)、蕁麻疹、嗜酸性粒細胞食道炎、慢性纖維化、肝纖維化、非酒精性脂肪性肝炎(NASH)、慢性腎臟病、特發性肺纖維化(IPF)、硬皮病、系統性硬化症、急性腎損傷、敗血症、胰臟炎、第1型糖尿病、移植物抗宿主病(GVHD)、組織移植、阿玆海默氏症、類風濕性關節炎:腸易激症候群(IBS)、克隆(Crohn)氏病、潰瘍性結腸炎、多發性硬化症、牛皮癬、乳糜瀉及雷諾(Raynaud)氏病或徵候。
第1A至1C圖之圖形顯示與經捕捉之大鼠7E8 Fab結合之IL-33的表面等離子體共振痕跡。第1A圖顯示大鼠7E8 Fab與經固定之人IL-33(mm2)結合的情形。第1B圖顯示在沒有還原劑之存在下,大鼠7E8 Fab與經固定之人IL-33(WT)結合的情形。第1C圖顯示在還原劑(DTT)之存在下,大鼠7E8 Fab與經固定之人IL-33(WT)結合的情形。
第2A至2B圖之圖形顯示經優化之抗IL-33可變 區與人DP-54/DPK9種系之序列比對。第2A圖顯示IL33-158-152/IL33-158LS之VH(SEQ ID NO:225)和VL(SEQ ID NO:207)與人種系序列DP-54/JH4(SEQ ID NO:7)和DPK9/JK4(SEQ ID NO:11)之比對。第2B圖顯示IL33-167-153/IL33-167LS之VH(SEQ ID NO:210)和VL(SEQ ID NO:91)與人種系序列DP-54/JH4(SEQ ID NO:7)和DPK9/JK4(SEQ ID NO:11)之比對。
第3A至3B圖之圖形顯示細胞因子與固定在芯片上之本發明抗體之結合情形。第3A圖顯示細胞因子與經固定之IL33-158LS Fab之結合情形。第3B圖顯示細胞因子與經固定之7E8 Fab之結合情形。
抗體之“抗原結合片段”係指保留特異性結合抗原之能力(較佳為具有基本上相同之結合親和力)的全長抗體之片段。抗原結合片段之實例包括(i)Fab片段,其係由VL、VH、CL和CH1結構域所組成之單價片段;(ii)F(ab')2片段,其為包含二個藉由鉸鏈區之二硫橋連接的Fab片段之二價片段;(iii)Fd片段,其係由VH和CH1結構域所組成;(iv)Fv片段,其係由抗體單臂之VL和VH結構域所組成,(v)dAb片段(Ward et al.,1989 Nature 341:544-546),其係由VH結構域所組成;及(vi)分離出之互補決定區(CDR)、二硫鍵連接之Fvs(dsFv)和抗獨特型 (抗-Id)抗體和胞內抗體。此外,雖然Fv片段的二個結構域,VL和VH,係由不同的基因編碼,它們可使用重組方法藉由合成之連接子接合而使得它們能夠以單一蛋白鏈之形式製成,其中該VL和VH區配對以形成單價分子(稱為單鏈Fv(scFv));參見,例如Bird et al.Science 242:423-426(1988)及Huston et al.,1988,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85:5879-5883。其他形式之單鏈抗體,諸如雙功能抗體(diabody)亦涵蓋在內。雙功能抗體為二價雙特異性抗體,其中VH和VL結構域係表現在單一多肽鏈上,但使用因太短而無法允許在同一鏈上的該二個結構域之間形成配對的連接子,從而迫使該結構域與另一鏈的互補結構域配對並產生二個抗原結合位點(參見,例如Holliger et al,1993,.Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90:6444-6448;Poljak et al.,1994,Structure 2:1121-1123)。
抗體“可變結構域”係指抗體輕鏈(VL)之可變區或抗體重鏈(VH)之可變區(單獨或組合的)。如本技藝所已知,重鏈和輕鏈之可變區各自由四個框架區(FR)組成,該四個框架區藉由三個互補決定區(CDR)連接,並促成抗體之抗原結合位點的形成。
“互補決定區”(CDR)可根據Kabat、Chothia、Kabat和Chothia二者之累積、AbM、接觸、North之定義及/或構象定義或本技藝所周知之任何CDR測定方法鑑別。參見,例如Kabat et al.,1991,Sequences of Proteins of Immunological Interest,5th ed.(高度可變區);Chothia et al.,1989,Nature 342:877-883(結構環結構)。特定抗體中構成CDR之胺基酸殘基的特性可使用本技藝所周知之方法測定。CDR之AbM定義為Kabat和Chothia之間的折衷且係使用Oxford Molecular之AbM抗體建模軟體(Accelrys®)。CDR之“接觸”定義係基於MacCallum et al.,1996,J.Mol.Biol.,262:732-745中所示明之觀察列的抗原接觸。CDR之“構型”定義係基於對抗原結合具有焓貢獻之殘基(參見,例如Makabe et al.,2008,J.Biol.Chem.,283:1156-1166)。North已使用不同之較佳的CDR定義組來鑑別典型之CDR構型(North et al.,2011,J.Mol.Biol.406:228-256)。於另一方法中(本文稱為CDR之“構型定義”),CDR之位置可被認為是對抗原結合具有焓貢獻之殘基(Makabe et al.,2008,J Biol.Chem.283:1156-1166)。還有其他CDR邊界定義可能未嚴格遵循上述方法其中一者,但仍將與至少一部分之Kabat CDR重疊,儘管CDR可能因鑑於預測或實驗發現特定之殘基或殘基群組,甚至整個CDR並不會顯著影響抗原結合而縮短或延長。如本文所使用之CDR可指由本技藝已知之任何方法(包括方法的組合)定義的CDR。本文所使用之方法可利用根據這些方法任一者所定義之CDR。在任一指定之包含一個以上之CDR的實施態樣方面,該CDR(或抗體之其他殘基)可根據Kabat、Chothia、North、延伸的、AbM、接觸及/或構型定義的任一者定義。
可變結構域中之殘基係根據Kabat編號,Kabat為用於編輯抗體之重鏈可變結構域或輕鏈可變結構域的編 號系統。參見Kabat et al.,1991,Sequences of Proteins of Immunological Interest,5th Ed.Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,MD.。使用此編號系統,該實際線性胺基酸序列可含有對應於縮短之可變結構域的FR或CDR之較少胺基酸或插入可變結構域之FR或CDR的額外胺基酸。例如,重鏈可變結構域可在H2之殘基52之後包括單一胺基酸插入子(根據Kabat為殘基52a)及在重鏈FR殘基82之後包括插入之殘基(例如根據Kabat為殘基82a、82b和82c)。指定抗體之殘基的Kabat編號可藉由比對抗體序列與“標準”Kabat編號序列之同源區來測定。可用於指派Kabat編號的演算法有多種。本文使用Abysis發佈之2.3.3版本(www.abysis.org)中執行的演算法來指派可變區CDR-L1、CDR-L2、CDR-L3、CDR-H2和CDR-H3之Kabat編號。Abm定義係用於CDR-H1。
抗體中之特定胺基酸殘基位置亦可根據Kabat編號。
“框架”(FR)殘基為除了CDR殘基之外的抗體可變結構域殘基。VH或VL結構域框架包含為下列結構安排之四個框架亞區FR1、FR2、FR3和FR4,其間穿插著CDR:FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4。
“抗原決定部位”係指與抗體特異性結合之抗原範圍或區域,例如包含與抗體交互作用之殘基的範圍或區域。抗原決定部位可為線性或構型的。
“優先結合”或“特異性結合”(本文中可互換使 用)抗原決定部位之抗體為本技藝中充分了解之術語,而測定該等特異性或優先結合之方法亦為本技藝所周知。相較於分子與其他細胞或物質之結合,若該分子更頻繁地、更快速地、以較長之持續時間及/或以較高之親和力與特定之細胞或物質反應或聯結,則該分子被稱為顯示出“特異性結合”或“優先結合”。相較於抗體與其他物質之結合,若該抗體以較高之親和力、結合力、更容易及/或以較長之持續時間與靶的結合,則該抗體係“特異性結合”或“優先結合”靶的。例如特異性或優先結合IL-33抗原決定部位之抗體係以較該抗體與其他IL-33抗原決定部位或非IL-33抗原決定部位結合之更高親和力、結合力、更容易及/或以較長之持續時間與IL-33抗原決定部位結合。經由閱讀此定義亦可理解,例如特異性或優先結合第一靶的之抗體(或部分或抗原決定部位)可能或可能不特異性或優先結合第二靶的。因此,“特異性結合”或“優先結合”不一定需要(儘管其可包括)排他性結合。一般而言,但不一定,對結合之引用意味著優先結合。“特異性結合”或“優先結合”包括識別並與樣品中之特定分子結合,但基本上不識別或與其他分子結合的化合物,例如蛋白質、核酸、抗體,等。例如可識別並與樣品中之同源配體或結合伴侶(例如與腫瘤抗原結合之抗人腫瘤抗原抗體)結合,但基本上不識別或與樣品中之其他分子結合的抗體或肽受體係與該同源配體或結合伴侶特異性結合。因此,在指定之分析條件下,該具體指定之結合部分(例如抗體或其抗原結合 部分或受體或其配體結合部分)優先結合特定之靶分子且不以顯著量與存在於該測試樣品中之其他組分結合。
可用來選擇特異性結合所欲分子之抗體或肽的分析格式有多種。例如固相ELISA免疫分析、免疫沉澱、BIAcoreTM(GE Healthcare,紐澤西州Piscataway)、螢光活化之細胞分選(FACS)、OctetTM(FortéBio,Inc.,加州Menlo Park)和西方點墨分析等多種分析可用來鑑定與抗原特異性反應之抗體或與同源配體或結合伴侶特異性結合之受體或其配體結合部分。通常,特異性或選擇性反應將至少為背景信號或干擾之二倍,更常為超過背景之10倍,甚至更具體地,當該平衡解離常數(KD)1μM(較佳為100nM,更佳為10nM,再更較佳為100pM,再更佳為10pM,且甚至更佳為1pM)時,抗體被說是與抗原“特異性結合”。
當與抗體有關時,本文所使用之術語“競爭”意指第一抗體或其抗原結合部分與抗原結合會減少隨後該相同抗原與第二抗體或其抗原結合部分之結合。一般而言,第一抗體與抗原之結合創造空間位阻、構型改變,或結合至共有之抗原決定部位(或其部分),從而使該第二抗體與相同抗原的結合減少。標準競爭分析可用於測定二種抗體是否彼此競爭。一種用於抗體競爭之合適分析涉及使用Biacore技術,此Biacore技術可使用表面等離子體共振(SPR)技術(通常使用生物傳感器系統(諸如BIACORE®系統))來測量交互作用的程度。例如,SPR可用於體外競爭 性結合抑制分析中以測定抗體抑制第二抗體結合之能力。另一種用於測量抗體競爭之分析係使用基於ELISA之方法。
此外,國際專利申請案第WO2003/48731號中描述基於抗體之競爭作用的用於“分類(binning)”抗體之高通量過程。若一抗體(或片段)減少另一抗體(或片段)與IL-33之結合,則存在競爭作用。例如可藉由依次加入不同抗體來使用依序結合競爭分析。可添加第一抗體以達到接近飽和之結合。然後,加入第二抗體。若未檢測到第二抗體與IL-33結合,或與無第一抗體存在之並行分析(該值可以設定為100%)相比較時結合顯著減少(例如減少至少約10%、至少約20%、至少約30%、至少約40%、至少約50%、至少約60%、至少約70%、至少約80%或至少約90%),則該二種抗體被認為彼此競爭。實施例4中提供藉由SPR進行之示例性抗體競爭分析(及重疊之抗原決定部位分析)。
“Fc融合”蛋白為其中一或多個多肽可操作地連接Fc多肽之蛋白質。Fc融合蛋白將免疫球蛋白之Fc區與融合伴侶結合。
術語“治療”包括預防性及/或治療性治療。若該治療係在病症之臨床表現之前投予,則該治療被認為是預防性的。治療性治療包括,例如改善或降低疾病之嚴重性或縮短疾病之長度。
抗體之結合親和力可以KD值表示,該KD值係指特定之抗原-抗體交互作用的解離速率。KD為解離之速率(亦稱為“解離速率(koff)”)對結合之速率(或“結合速率(kon)”的比率。因此,KD等於koff/kon且係以莫耳濃度(M)表示,KD值越小,該結合親和力越強。抗體之KD值可使用本技藝完善設立之方法測定。用於測量Kd的一種示例性方法為表面等離子體共振(SPR),其通常使用生物傳感器系統,諸如BIACORE®系統。BIAcore動力學分析包含分析抗原與該表面上具有固定分子(例如包含抗原決定部位結合結構域之分子)之芯片的結合及解離。用於測定抗體之Kd的另一方法係使用生物膜干涉技術(Bio-Layer Interferometry),通常使用OCTET®技術(Octet QKe系統,ForteBio)。此外或另外,亦可使用可從Sapidyne Instruments(愛達荷州Boise)取得之KinExA®(動力學排除分析(Kinetic Exclusion Assay))分析。
於一些態樣中,該KD值係藉由表面等離子共振(SPR)測量。該IL-33可被固定住。該IL-33可被固定在固體表面上。該IL-33可,例如藉由共價偶聯(諸如胺偶聯)被固定在在芯片上。該芯片可為CM5傳感器芯片。
當分析物與配體結合時,蛋白質累積在傳感器表面上導致折射率增加。該折射率變化係採實時測量(在動力學分析實驗中之採樣係每0.1s進行一次),該結果係採反應單位相對於時間來繪製(RU)(稱為傳感圖)。重要 的是,若運行和樣品緩衝液之折射率存有差異亦會產生反應(背景反應)。必須從傳感圖減去此背景反應以取得實際結合反應。背景反應係經由注射分析物通過對照流動池或參考流動池(flow cell)來記錄,該對照流動池或參考流動池之傳感器表面上不具有配體或具有固定之不相關的配體。實時測量結合交互作用之結合和解離允許計算結合和解離速率常數及對應之親和常數。一個RU代表每平方毫米結合1pg蛋白質。在實行中通常需要每平方毫米結合超過50pg之分析物以產生良好之可重複反應。可固定之IL-33介於85至370RU。可固定之IL-33介於85至225RU。
抗體與IL-33解離之反應可監測約3600秒。可進行SPR分析並在約15℃至約37℃之間收集資料。可進行SPR分析並在約25℃至37℃之間收集資料。可進行SPR分析並在約37℃收集資料。可進行SPR分析並在37℃收集資料。該KD值可使用BIAcore T200儀器,藉由SPR測量。該SPR速率及親和力可經由將所得之傳感圖資料擬合至BIAcore T200評估軟體1.0版中之1:1模型來測定。收集速率可為約1Hz。
術語“IL-33分子”係指顯示出與野生型IL-33之序列同一性高於IL-1族細胞因子之另一成員的分子(該等比較係在相同物種內進行)。術語IL-33分子包括突變體、變體、截短、片段、剪接變體及融合蛋白之IL-33樣部分。
IL-33係以前體形式產生,該前體形式具有負責轉位至細胞核和與染色質結合之N端結構域,及與ST2 受體交互作用並負責IL-33之生物活性的C端12-股β-三葉形結構域。由UniProtKB/Swiss-Prot登錄編號O95760.1所代表之全長人IL-33形式在本文中係以SEQ ID NO:396提供。
當IL-33從細胞釋出後,該N端結構域被裂解,導致C端結構域釋出,具有較全長蛋白質高之活性。許多不同蛋白酶,包括IL-33之細胞來源的內源性蛋白酶(諸如鈣蛋白酶(calpain))及源自炎症細胞(諸如肥大細胞和嗜中性粒細胞)之外源性蛋白酶均可裂解IL-33前體分子。該IL-33之精確裂解位點將根據存在之蛋白酶而變化。來自SEQ ID NO:396之胺基酸112至270的重組型IL-33 C端結構域為代表性IL-33 C端活性形式,並被指定為SEQ ID NO:1。
IL-33之結構表明其為具有四個游離半胱胺酸殘基(C208、C232、C227和C259,根據SEQ ID NO:396之編號)的β-三葉蛋白。證據表明IL-33以活性形式(這四個半胱胺酸被還原)及無活性形式(半胱胺酸殘基對之間具有二硫鍵,包括介於C208-C259和C227-C232對之間的二硫鍵)存在,這似乎與實質之構型變化(包括對高親和力ST2結合位點之破壞)相一致,從而對喪失ST2結合提供可能之結構解釋(Cohen et al.,2015,Nature Communications 6:8327;doi:10.1038/ncomms9327)。突變證據進一步表明半胱胺酸殘基C208和C232亦可能形成導致IL-33去活化之二硫鍵(Cohen et al.,2015)。
IL-33之組成上活性形式可藉由將一或多個半胱胺酸殘基突變成非半胱胺酸殘基來產生。殘基C208已被發現對去活化過程特別重要,殘基C232之突變亦似乎賦予對去活化之抗性。證據亦表明介於C208-C259和C227-C232之間的可能的二硫鍵並非去活化的全部來源,因為C227和C259中之突變不能賦予類似水準之對去活化的抗性;因此IL-3之二硫鍵形成可能有幾種方式。(Cohen_2015)。
“活性IL-33”可被定義為能夠與ST2結合之IL-33分子。活性IL-33可被定義為缺乏一或二個分子內共價鍵的IL-33分子,該缺乏之一或二個分子內共價鍵係介於位置208、227、232和259(根據SEQ ID NO:396之編號)之殘基對之間。活性IL-33可被定義為缺乏二個分子內共價鍵之IL-33分子,該缺乏之二個分子內共價鍵係介於位置208、227、232和259(根據SEQ ID NO:396之編號)之殘基對之間。於一些態樣中,活性IL-33為缺乏介於殘基208和259之間的共價鍵之IL-33分子。於一些態樣中,活性IL-33為缺乏介於殘基227和232之間的共價鍵之IL-33分子。於一些態樣中,活性IL-33為缺乏殘基208和227之間的共價鍵之IL-33分子。於一些態樣中,活性IL-33為缺乏殘基208和232之間的共價鍵之IL-33分子。於一些態樣中,活性IL-33為缺乏殘基對208/259和227/232、或殘基對208/232和227/229之間的共價鍵之IL-33分子。因此,活性IL-33包括還原形式之野生型IL-33和突變形式之IL-33,其中在位置 編號208、227、232和259處至少有一、二、三或四個殘基不是半胱胺酸。於一些態樣中,殘基208和232至少一者不是半胱胺酸。於一些態樣中,至少殘基208不是半胱胺酸。於一些態樣中,至少殘基208和232不是半胱胺酸。於一些態樣中,各殘基208、227、232和259無一為半胱胺酸。於一些態樣中,殘基208、227、232和259的一或多者為絲胺酸。該共價鍵可為二硫鍵。上述殘基編號係根據SEQ ID NO:1之編號。於一些態樣中,活性IL-33包含含有SEQ ID NO:1之完全還原分子。於一些態樣中,活性IL-33包含含有SEQ ID NO:4之完全還原分子。於一些態樣中,活性IL-33包含含有SEQ ID NO:3之分子。於一些態樣中,活性IL-33包含含有SEQ ID NO:5之分子。
無活性IL-33可被定義為以低於活性IL-33之親和力至少10倍的親和力與ST2結合之IL-33分子。於一些態樣中,無活性IL-33以低於活性IL-33至少100倍之親和力與ST2結合。於一些態樣中,無活性IL-33以低於活性IL-33至少1000倍之親和力與ST2結合。於一些態樣中,無活性IL-33以低於活性IL-33至少4個數量級之親和力與ST2結合。於一些態樣中,無活性IL-33以低於活性IL-33至少5個數量級之親和力與ST2結合。於一些態樣中,無活性IL-33在208/259和227/232殘基對之一或二者之間包含共價鍵。於一些態樣中,無活性IL-33在208/232和227/259殘基對之一或二者之間包含共價鍵。於一些態樣中,無活性IL-33在殘基208和232之間包含共價鍵。於一些態樣中,無活性 IL-33在殘基208和259之間包含共價鍵。於一些態樣中,無活性IL-33在殘基227和232之間包含共價鍵。於一些態樣中,無活性IL-33在208/259和227/232二個殘基對之間包含共價鍵。該殘基之一或多者可為半胱胺酸。該共價鍵之一或二者可為可為二硫鍵。前述殘基編號係根據SEQ ID NO:396之編號。
於一些態樣中,該IL-33為人IL-33。於一些態樣中,該野生型IL-33之序列為SEQ ID NO:1。於一些態樣中,該IL-33為大鼠IL-33。於一些態樣中,該IL-33為小鼠IL-33。於一些態樣中,該IL-33為靈長類動物IL-33。於一些態樣中,該IL-33為猿IL-33。於一些態樣中,該IL-33為猴IL-33。於一某些態樣中,該IL-33為食蟹猴IL-33。
活性IL-33之KD可使用IL-33變體測量,該IL-33變體中至少C208被另一胺基酸殘基取代。於一些態樣中,活性IL-33之KD可使用IL-33變體測量,該IL-33變體中至少C232被另一胺基酸殘基取代。於一些態樣中,活性IL-33之KD可使用IL-33變體測量,該IL-33變體中至少C208和C232被取代。於一些態樣中,活性IL-33之KD可使用IL-33變體測量,該IL-33變體中至少C208、C227、C232和C259被取代。於一些態樣中,該半胱胺酸殘基之一或多者被絲胺酸取代。
於一些態樣中,本發明提供拮抗性IL-33抗 體。IL-33途徑之高親和力拮抗劑可能對多種細胞類型和多個組織隔室有效,在該多種細胞類型和多個組織隔室中IL-33被認為作用於其靶細胞上。於一些態樣中,本發明之抗體可接近IL-33從細胞(尤其是上皮細胞和內皮細胞)釋出之部位。於一些態樣中,本發明提供可分在肺和其他組織內之胞外空間的IL-33抗體,該IL-33抗體可有效地與細胞表面受體競爭與IL-33結合並具有相當長之半衰期,以允許較不頻繁地給藥。本發明之抗體具有潛力修改驅動哮喘發展及與哮喘相關之炎症的重要途徑。
中和或“阻斷”抗體係指與IL-33之結合具有下列情況的抗體:(i)干擾、限制或抑制IL-33或IL-33片段與IL-33受體組分(例如ST2、IL-1 RAcP,等)之間的交互作用;及/或(ii)導致IL-33之生物學功能至少一者受抑制。測定本發明抗體之中和作用的分析描述於本文他處且為本技藝所周知。
本發明提供特異性結合IL-33之抗體。於一些態樣中,本發明提供中和至少50%之IL-33的抗體或其抗原結合片段。於一些態樣中,本發明提供中和至少60%之IL-33的抗體或其抗原結合片段。於一些態樣中,本發明提供中和至少70%之IL-33的抗體或其抗原結合片段。於一些態樣中,本發明提供中和至少80%之IL-33的抗體或其抗原結合片段。於一些態樣中,本發明提供中和至少90%之IL-33的抗體或其抗原結合片段。於一些態樣中,本發明提供中和至少95%之IL-33的抗體或其抗原結合片段。於一些態樣 中,本發明提供中和至少96%之IL-33的抗體或其抗原結合片段。於一些態樣中,本發明提供中和至少97%之IL-33的抗體或其抗原結合片段。於一些態樣中,本發明提供中和至少98%之IL-33的抗體或其抗原結合片段。於一些態樣中,本發明提供中和至少99%之IL-33的抗體或其抗原結合片段。
該抗體或其抗原結合片段可選自由下列所組成之群組:7E8_嵌合體、9B3_嵌合體、9B3_嵌合體_huJseg、7E8 CDR移植物、IL33-10、9B3 CDR移植物、9B3_1、9B3_2A、9B3_2B、9B3_3、9B3_5、9B3_7、9B3_13、9B3_15、9B3_17、9B3_22、9B3_31V2、9B3_36、9B3_79、9B3_124、9B3_162、7E8H/9B3K、9B3_563、IL33-11、IL33-12、IL33-13、IL33-45、IL33-55、IL33-56、IL33-57、IL33-58、IL33-61、IL33-62、IL33-68、IL33-74、IL33-75、IL33-80、IL33-81、IL33-103、IL33-117、IL33-136、IL33-153、IL33-154、IL33-155、IL33-156、IL33-157、IL33-158、IL33-167、IL33-168、IL33-169、IL33-170、IL33-171、IL33-172、IL33-175、IL33-186、IL33-187、IL33-188、IL33-158-152、IL33-167-153、IL33-158LS和IL33-167LS、彼等之抗原結合片段及彼等之突變體、變體、衍生物和基本上相似之版本。
於一些態樣中,該CDR包含SEQ ID NO:257、261、265、269、272和276。這些CDR序列根據所有可用之資料(ABS加突變加大鼠組庫)、測試之VH種系及基於建模之突變併入共有序列以保留/改善與IL-33之結合或減少多重反應性或序列不利條件,但不會中斷結合。
CDR H1:基於總體可用資訊,用於CDR H1之廣泛共有序列為SEQ ID NO:269。用於CDR H1之共有序列的進一步細化子集為SEQ ID NO:270,包括從優化親代大鼠抗體7E8和9B3及擴增之二元取代(ABS)所得之結果。用於優化之7E8的共有CDR H1序列為26GF(T/E)F(S/E)(N/S)YWMY32(SEQ ID NO:270)。從9B3進行之CDR H1取代(其引入S31N突變或引入T28E或S30E突變)允許保留全部活性。擴增之二元取代誘變顯示出對位置35之Y具強烈偏好而非DP54種系殘基S。用於優化之7E8,處理位置31處之9B3序列及位置35處之ABS偏好的共有CDR H1序列為SEQ ID NO:271。
CDR H2:基於總體可用資訊,用於CDR H2之廣泛共有序列為SEQ ID NO:272。用於CDR H2之共有序列的進一步細化子集為SEQ ID NO:273,包括從優化7E8和9B3及擴增之二元取代(ABS)所得之結果。用於優化之7E8的共有CDR H2序列為50(S/A)I(T/N)(P/N)(N/D)(G/A)(G/S/H)(N/D/E)(T/K/D/E)YY(P/V/L)(D/E)SV(K/Q)G66(SEQ ID NO:273)。引入突變S50A、G55A、G56H、N57D、N57E、T58D、T58E、 D62E或K65Q允許保留人IL-33中和效力,而不會實質增加非特異性結合。N54I、N54L、N54V、N54Y和N54W允許保留人IL-33中和效力,但引入增加之非特異性結合。將CDR H2從9B3取代成7E8,此取代引入四個變化(T52N、P53N、N54D和P61L),允許保留對人IL-33之強中和作用,但導致對食蟹猴IL-33之中和效力降低。擴增之二元取代誘變顯示出對位置50、52和53之S、T和P具強烈偏好而非DP54種系殘基N、K和Q,但容許併入DP54種系突變N54D、G56S、N57E、T58K和P61V。用於優化之7E8,處理位置52和53處之ABS偏好及容許用於中和人IL-33之9B3序列的共有CDR H2序列為SEQ ID NO:274。用於優化之7E8,處理位置52和53處之ABS偏好的共有CDR H2序列為SEQ ID NO:275。
CDR H3:基於總體可用資訊,用於CDR H3之廣泛共有序列為SEQ ID NO:276。用於CDR H3之共有序列的進一步細化子集為SEQ ID NO:277,包括從優化7E8和9B3及分析來自以人IL-33免疫化之大鼠抗體組庫之序列所得的結果。用於優化之7E8的共有CDR H3序列為99G(H/Y)Y(Y/S)(Y/H)(T/S/N)(S/A)YS(L/F)(G/S)Y110(SEQ ID NO:278)。引入突變H100Y、Y103H、T104N、T104S或S105A允許保留人IL-33之中和效力,而不會實質增加非特異性結合。突變S105D和S105N導致損失人IL-33中和效力。將CDR H3從9B3取代成7E8,此取代引入突變Y102S、T104S、L108F和G109S,允許保留對人IL-33之強 中和效力,但導致對食蟹猴IL-33之中和效力降低。併入從以人IL-33免疫化之大鼠的抗體組庫鑑別之7E8相關之CDR H3序列顯示出下列胺基酸與高度之人IL-33中和效力兼容:R100、F101、N104、I108、A109、H110、N110、S110和F110。用於優化之7E8,處理容許用於中和人IL-33之9B3序列的共有CDR H3序列為SEQ ID NO:279。
CDR L1:基於總體可用資訊,用於CDR L1之廣泛共有序列為SEQ ID NO:257。用於CDR L1之共有序列的進一步細化子集為SEQ ID NO:258,包括從優化7E8和9B3及擴增之二元取代(ABS)所得之結果。用於優化之7E8的共有CDR L1序列為24(K/R)AS(Q/H)(N/S)I(N/S)(K/S)HLD34(SEQ ID NO:259)。擴增之二元取代誘變顯示出對位置32和34之H和D具強烈偏好而非DPK9種系殘基Y32和N 34,但容許併入DPK9種系突變K24R、N28S、N30S和K31S。將9B3輕鏈取代成7E8輕鏈(其包括輕鏈序列變異Q27H)允許保留IL-33中和效力,但不引入非特異性結合。引入突變N30H、K31R和H32Y允許保留人IL-33中和效力,但增加非特異性結合,而突變N30Y、N30D、N30W、K31E和K31D會降低效力及/或引入較高之非特異性結合。用於優化之7E8,處理位置32和34處之ABS偏好而不允許位置27處之輕鏈序列變化的共有CDR L1序列為SEQ ID NO:260。
CDR L2:基於總體可用資訊,用於CDR L2之廣泛共有序列為SEQ ID NO:261。用於CDR L2之共有 序列的進一步細化子集為SEQ ID NO:262,包括從優化7E8和9B3及擴增之二元取代(ABS)所得之結果。用於優化之7E8的共有CDR L2序列為50F(T/A)(N/S)(N/S)LQ(T/S)56(SEQ ID NO:263)。擴增之二元取代誘變顯示出對位置50處之F具強烈偏好而非DPK9種系殘基A,但容許併入DPK9種系突變T51A、N52S、N53S和T56S。引入突變N52Y或N53R允許保留人IL-33中和效力,但增加非特異性結合,而突變F50H、T56D、T56E和T56Q降低效力及/或引入較高之非特異性結合。用於優化之7E8而不容許位置53處之變化的共有CDR L2序列為SEQ ID NO:264。
CDR L3:基於總體可用資訊,用於CDR L3之廣泛共有序列為SEQ ID NO:265。用於CDR L3之共有序列的進一步細化子集為SEQ ID NO:266,包括從優化7E8和9B3及擴增之二元取代(ABS)所得之結果。用於優化之7E8的共有CDR L3序列為89(F/Q)QY(N/Y)(N/S/Q/R)GWT96(SEQ ID NO:267)。引入突變N93Q允許保留人IL-33中和效力但不會實質增加非特異性結合,而突變N93R允許人IL-33中和效力且少量增加非特異性結合。突變N92R和G94R允許保留人IL-33中和效力,但導致非特異性結合增加。將9B3輕鏈取代成7E8輕鏈(其包括輕鏈序列變異N93S)允許保留IL-33中和效力而不引入非特異性結合。擴增之二元取代誘變顯示出對位置91和94處之Y和G具強烈偏好而非DPK9種系殘基S和T,但 容許併入DPK9種系突變F89Q、N92Y和N93S。保留大鼠J段殘基W95強烈優於取代人JK4殘基W95L。用於優化之7E8,處理位置91和94處之ABS偏好而不允許併入位置93處之R的共有CDR L3序列為SEQ ID NO:268。
於一些態樣中,該抗體或其抗原結合片段包含CDR-L1、CDR-L2、CDR-L3、CDR-H1、CDR-H2和CDR-H3,該CDR-L1含有SEQ ID NO:257、CDR-L2含有SEQ ID NO:261、CDR-L3含有SEQ ID NO:265、CDR-H1含有SEQ ID NO:269、CDR-H2含有SEQ ID NO:272且CDR-H3含有SEQ ID NO:276。
於一些態樣中,該抗體或其抗原結合片段包含CDR-L1、CDR-L2、CDR-L3、CDR-H1、CDR-H2和CDR-H3,該CDR-L1含有SEQ ID NO:258、CDR-L2含有SEQ ID NO:262、CDR-L3含有SEQ ID NO:266、CDR-H1含有SEQ ID NO:270、CDR-H2含有SEQ ID NO:273且CDR-H3含有SEQ ID NO:277。
於一些態樣中,該抗體或其抗原結合片段包含CDR-L1、CDR-L2、CDR-L3、CDR-H1、CDR-H2和CDR-H3,該CDR-L1含有SEQ ID NO:259、CDR-L2含有SEQ ID NO:263、CDR-L3含有SEQ ID NO:267、CDR-H1含有SEQ ID NO:271、CDR-H2含有SEQ ID NO:274且CDR-H3含有SEQ ID NO:278。
於一些態樣中,該抗體或其抗原結合片段包含CDR-L1、CDR-L2、CDR-L3、CDR-H1、CDR-H2和 CDR-H3,該CDR-L1含有SEQ ID NO:260、CDR-L2含有SEQ ID NO:264、CDR-L3含有SEQ ID NO:268、CDR-H1含有SEQ ID NO:271、CDR-H2含有SEQ ID NO:275且CDR-H3含有SEQ ID NO:279。
於一些態樣中,該抗體或其抗原結合片段包含CDR-L1、CDR-L2、CDR-L3、CDR-H1、CDR-H2和CDR-H3,該CDR-L1含有SEQ ID NO:20、CDR-L2含有SEQ ID NO:21、CDR-L3含有SEQ ID NO:208、CDR-H1含有SEQ ID NO:16、CDR-H2含有SEQ ID NO:226且CDR-H3含有SEQ ID NO:18。
於一些態樣中,該抗體或其抗原結合片段包含SEQ ID NO:225之CDR-H1、CDR-H2和CDR-H3序列。
於一些態樣中,該抗體或其抗原結合片段包含SEQ ID NO:207之CDR-L1、CDR-L2和CDR-L3序列。
該抗體或抗原結合片段可包含VH,該VH包含與SEQ ID NO:225具有至少90%同一性之胺基酸序列。該VH可包含與SEQ ID NO:225具有至少91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性之胺基酸序列。該VH可包含SEQ ID NO:225之胺基酸序列。
該抗體或抗原結合片段可包含VL,該VL包含與SEQ ID NO:207具有至少90%同一性之胺基酸序列。該VL可包含與SEQ ID NO:207具有至少91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性之胺基酸序列。該VL可包含SEQ ID NO:207之胺基酸序列。
該抗體或抗原結合片段可包含HC,該HC包含與SEQ ID NO:244具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性之胺基酸序列。該HC可包含SEQ ID NO:244之胺基酸序列。
該抗體或抗原結合片段包含LC,該LC包含與SEQ ID NO:209具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性之胺基酸序列。該LC可包含SEQ ID NO:209之胺基酸序列。
於一些態樣中,該抗體或其抗原結合片段包含CDR-L1、CDR-L2、CDR-L3、CDR-H1、CDR-H2和CDR-H3,該CDR-L1含有SEQ ID NO:20、CDR-L2含有SEQ ID NO:21、CDR-L3含有SEQ ID NO:22、CDR-H1含有SEQ ID NO:16、CDR-H2含有SEQ ID NO:211且CDR-H3含有SEQ ID NO:18。
於一些態樣中,該抗體或其抗原結合片段包含SEQ ID NO:210之CDR-H1、CDR-H2和CDR-H3序列。
於一些態樣中,該抗體或其抗原結合片段包含SEQ ID NO:91之CDR-L1、CDR-L2和CDR-L3序列。
該抗體或抗原結合片段可包含VH,該VH包含與SEQ ID NO:210具有至少90%同一性之胺基酸序列。該VH可包含與SEQ ID NO:210具有至少91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性之胺基酸序列。該VH可包含SEQ ID NO:210之胺基酸序列。
該抗體或抗原結合片段可包含VL,該VL包含 與SEQ ID NO:91具有至少90%同一性之胺基酸序列。該VL可包含與SEQ ID NO:91具有至少91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性之胺基酸序列。該VL可包含SEQ ID NO:91之胺基酸序列。
該抗體或抗原結合片段可包含HC,該HC包含與SEQ ID NO:245具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性之胺基酸序列。該HC可包含SEQ ID NO:245之胺基酸序列。
該抗體或抗原結合片段可包含LC,該LC包含與SEQ ID NO:93具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性之胺基酸序列。該LC可包含SEQ ID NO:93之胺基酸序列。
於某些實施態樣中,該抗體或其抗原結合片段包含下列重鏈CDR序列:(i)包含SEQ ID NO:16之CDR-H1,包含SEQ ID NO:226之CDR-H2和包含SEQ ID NO:18之CDR-H3;及/或(ii)下列輕鏈CDR序列:包含SEQ ID NO:20之CDR-L1、包含SEQ ID NO:21之CDR-L2和包含SEQ ID NO:208之CDR-L3。
於某些實施態樣中,在CDR-L1中做出相對於SEQ ID NO:20而言不超過11個、或不超過10個、不超過9個、不超過8個、不超過7個、不超過6個、不超過5個、不超過4個、不超過3個、不超過2個或不超過1個取代。於 某些實施態樣中,在CDR-L2中做出相對於SEQ ID NO:21而言不超過6個、不超過5個、不超過4個、不超過3個、不超過2個或不超過1個取代。於某些實施態樣中,在CDR-L3中做出相對於SEQ ID NO:208而言不超過8個、不超過7個、不超過6個、不超過5個、不超過4個、不超過3個、不超過2個或不超過1個取代。於一些實施態樣中,在CDR-H1中做出相對於SEQ ID NO:16而言不超過10個、不超過9個、不超過8個、不超過7個、不超過6個、不超過5個、不超過4個、不超過3個、不超過2個或不超過1個取代。於一些實施態樣中,在CDR-H2中做出相對於SEQ ID NO:211而言不超過17個、不超過16個、不超過15個、不超過14個、不超過13個、不超過12個、不超過11個、或不超過10個、不超過9個、不超過8個、不超過7個、不超過6個、不超過5個、不超過4個、不超過3個、不超過2個、或不超過1個取代。於一些實施態樣中,在CDR-H3中做出相對於SEQ ID NO:18而言不超過12個、不超過11個、或不超過10個、不超過9個、不超過8個、不超過7個、不超過6個、不超過5、不超過4個、不超過3個、不超過2個、或不超過1個取代。於某些實施態樣中,該取代所改變之結合親和力(KD)值不超過1000倍、不超過100倍或10倍。於某些實施態樣中,該取代為根據表1之保守性取代。
於某些實施態樣中,該取代為人種系取代,其中CDR殘基被對應之人種系殘基取代以增加人胺基酸含量並可能降低抗體之致免疫性。例如若使用人種系DPK9框架及示例性抗體IL-33-158LS,則該IL33-158LS抗體之CDR-L1(SEQ ID NO:20)與人種系DPK9之比對如下:
在位置25、26、27、29、33和34方面,該人種系殘基和對應之IL33-158LS殘基相同且種系取代是不可能的。在位置24、28、30、31和32(粗體且下方劃線)方面,該人種系殘基和對應之IL33-158LS殘基不相同。這些位置處之IL33-158LS的殘基可對應之人種系DPK9殘基替代以進一步增加人殘基含量。
用於在抗體CDR中引入人種系殘基之方法和集合庫詳細描述於美國臨時申請案62/162,905及(Townsend et al.,2015,Proc.Natl.Acad.Sci.USA.112(50):15354-15359)中,其全部內容以引用方式併入本文。
該抗體或其抗原結合片段可包含VH框架,該VH框架可包含人種系VH框架序列。該VH框架序列可來自人VH3種系、VH1種系、VH5種系或VH4種系。較佳之人種系重鏈框架為源自VH1、VH3或VH5種系之框架。例如可使用來自下列種系之VH框架:IGHV3-23、IGHV3-7或IGHV1-69(種系名稱係基於IMGT種系定義)。較佳之人種系輕鏈框架為源自VK或Vλ種系之框架。例如可使用來自下列種系之VL框架:IGKV1-39或IGKV3-20(種系名稱係根據IMGT種系定義)。另外或此外,該構架序列可為人種系共有框架序列,諸如人Vλ1共有序列、VK1共有序列、VK2共有序列,VK3共有序列、VH3種系共有序列、VH1種系共有序列、VH5種系共有序列或VH4種系共有序列之框架。人種系框架之序列可從各種公開之資料庫取得,諸如V-base、IMGT、NCBI或Abysis。
該抗體或其抗原結合片段可包含VL框架,該VL框架包含人種系VL框架序列。該VL框架可包含一或多個胺基酸取代、添加或缺失,同時仍保留與該抗體來源之種系相似之功能和結構。於一些態樣中,該VL框架與人種系VL框架序列具有至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%同一性。於一些態樣中,該抗體或其抗原結合片段包含VL框架,該VL框架相對於人種系VL框架序列而言包含1、2、3、4、5、6、7、8、9、10個胺基酸取代、添加或缺失。於一些態樣中,該1、2、3、4、 5、6、7、8、9或10個胺基酸取代、添加或缺失僅在框架區中。於一些態樣中,該%同一性係基於與VL之相似性,不包括本文定義為CDR的那些部分。
該人種系VL框架可為DPK9(IMGT名稱:IGKV1-39)之框架。該人種系VL框架可為DPK12(IMGT名稱:IGKV2D-29)之框架。該人種系VL框架可為DPK18(IMGT名稱:IGKV2-30)之框架。該人種系VL框架可為DPK24(IMGT名稱:IGKV4-1)之框架。該人種系VL框架可為HK102_V1(IMGT名稱:IGKV1-5)之框架。該人種系VL框架可為DPK1(IMGT名稱:IGKV1-33)之框架。該人種系VL框架可為DPK8(IMGT名稱:IGKV1-9)之框架。該人種系VL框架可為DPK3(IMGT名稱:IGKV1-6)之框架。該人種系VL框架可為DPK21(IMGT名稱:IGKV3-15)之框架。該人種系VL框架可為Vg_38K(IMGT名稱:IGKV3-11)之框架。該人種系VL框架可為DPK22(IMGT名稱:IGKV3-20)之框架。該人種系VL框架可為DPK15(IMGT名稱:IGKV2-28)之框架。該人種系VL框架可為DPL16(IMGT名稱:IGLV3-19)之框架。該人種系VL框架可為DPL8(IMGT名稱:IGLV1-40)之框架。該人種系VL框架可為V1-22(IMGT名稱:IGLV6-57)之框架。該人種系VL框架可為人Vλ共有序列之框架。該人種系VL框架可為人Vλ1共有序列之框架。該人種系VL框架可為人Vλ3共有序列之框架。該人種系VL框架可為人VK共有序列之框架。該人種系VL框架可為人VK1共有序列之框架。該人種系 VL框架可為人VK2共有序列之框架。該人種系VL框架可為人VK3共有序列之框架。
於一些態樣中,該VL框架為DPK9。其他類似之框架區亦被預測可遞送本發明之有益抗體,本發明之有益抗體包含下列群組之CDR:SEQ ID NO:257、261和265;或SEQ ID NO:258、262和266;或SEQ ID NO:259、263和267;或SEQ ID NO:260、264、268;或SEQ ID NO:20、21和208;其他類似之框架區包括DPK5、DPK4、DPK1、IGKV1-5*01、DPK24、DPK21、DPK15、IGKV1-13*02、IGKV1-17*01、DPK8、IGKV3-11*01和DPK22,這些框架區與DPK-9之FW區分別具有99、97、97、96、80、76、66、97、97、96、76和74%同一性且在下列共同結構特徵(Kabat編號)中包含一或更少個胺基酸差異(A)緊接在CDR之下(游標區)的殘基、L2、L4、L35、L36、L46、L47、L48、L49、L64、L66、L68、L69、L71,(B)VH/VL鏈包裝殘基:L36、L38、L44、L46、L87及(C)典型CDR結構支持殘基L2、L48、L64、L71(參見Lo,“Antibody Humanization by CDR Grafting”,(2004)Antibody Engineering,Vol.248,Methods in Molecular Biology pp 135-159;以及O’Brien and Jones,“Humanization of Monoclonal Antibodies by CDR Grafting”,(2003)Recombinant Antibodies for Cancer Therapy,Vol.207,Methods in Molecular Biology pp 81-100)。特佳者為分別與DPK9分享99、97、97、96、80、 76、66%同一性之DPK5、DPK4、DPK1、IGKV1-5*01、DPK24、DPK21、DPK15的框架區,且在這些常見之結構特徵中不具有胺基酸差異。於一些態樣中,該%同一性係基於與VL之相似性,不包括本文定義為CDR的那些部分。
本發明抗體(及片段)之CDR-L1、CDR-L2和CDR-L3中之殘基可被如表2中所示之對應的種系殘基所取代。
該抗體或其抗原結合片段可包含VH框架,該VH框架包含人種系VH框架序列。該VH框架可包含一或多個胺基酸取代、添加或缺失,同時仍保留與該抗體來源之種系類似的功能和結構。於一些態樣中,該VH框架與人種系VH框架序列具有至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%同一性。於一些態樣中,該抗體或其抗原結合片段包含VH框架,該VH框架相對於人種系VH框架序列而言包含1、2、3、4、5、6、7、8、9、10個胺基酸取代、添加或缺失。於一些態樣中,該1、2、3、4、5、6、7、8、9或10個胺基酸取代、添加或缺失僅在框架區中。於一些態樣中,該%同一性係基於與VH之相似性,不包括本文定義為CDR的那些部分。
該人種系VH框架可為DP54或IGHV3-7之框架。該人種系VH框架可為DP47或IGHV3-23之框架。該人種系VH框架可為DP71或IGHV4-59之框架。該人種系VH框架可為DP75或IGHV1-2_02之框架。該人種系VH框架可為DP10或IGHV1-69之框架。該人種系VH框架可為DP7或IGHV1-46之框架。該人種系VH框架可為DP49或IGHV3-30之框架。該人種系VH框架可為DP51或IGHV3-48之框架。該人種系VH框架可為DP38或IGHV3-15之框架。該人種系VH框架可為DP79或IGHV4-39之框架。該人種系VH框架可為DP78或IGHV4-30-4之框架。該人種系VH框架可為DP73或IGHV5-51之框架。該人種系VH框架可為DP50或IGHV3-33之框架。該人種系VH框架可為DP46或IGHV3-30-3之框架。該人種系VH框架可為DP31或IGHV3-9之框架。該人種系VH框架可為人VH種系共有序列之框架。該人種系VH框架可為人VH3種系共有序列之框架。該人種系VH框架可為人VH5種系共有序列之框架。該人種系VH框架可為人VH1種系共有序列之框架。該人種系VH框架可為人VH4種系共有序列之框架。
於一些態樣中,該VH框架為DP-54。其他類似之框架區亦被預測可遞送本發明之有益抗體,本發明之有益抗體包含下列群組之CDR:SEQ ID NO:269、272和276;或SEQ ID NO:270、273和277;或SEQ ID NO:271、274和278;或SEQ ID NO:271、275和278;或SEQ ID NO:16、226和18;類似之框架區包括DP-50、IGHV3- 30*09、IGHV3-30*15、IGHV3-48*01、DP-77、DP-51、IGHV3-66*01、DP-53、DP-48、IGHV3-53*01、IGHV3-30*02和DP-49,這些框架區與DP-54之FW區分別具有93、92、92、99、97、97、96、96、94、94、93和92%同一性且在下列共同結構特徵(Kabat編號)中包含一或更少個胺基酸差異(A)緊接在CDR之下(游標區)的殘基、H2、H47、H48和H49、H67、H69、H71、H73、H93、H94,(B)VH/VL鏈包裝殘基:H37、H39、H45、H47、H91、H93及(C)典型CDR結構支持殘基H24、H71、H94(參見Lo 2004、和O'Brien and Jones 2003)。特佳者為分別與DP-54具有93、92和92%同一性之DP-50、IGHV3-30*09、IGHV3-30*15的框架區且在這些共同結構特徵中沒有胺基酸差異。於一些態樣中,該%同一性係基於與VH之相似性,不包括本文定義為CDR的那些部分。
本發明抗體(及片段)之CDR-H1、CDR-H2和CDR-H3中之殘基可被如表3中所示之對應種系殘基所取代。
於某些實施態樣中,本文所描述之抗體或其抗原結合片段包含(i)VH,其包含與SEQ ID NO:225具有至少50%、至少60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少 94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%同一性之胺基酸序列,及/或(ii)VL,其包含與SEQ ID NO:207具有至少50%、至少60%、至少66%、至少70%、至少75%、至少76%、至少80%、至少85%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%同一性之胺基酸序列。這些VL和VH序列之任何組合亦包含在本發明中。
於某些實施態樣中,本文所描述之抗體或其抗原結合片段包含(i)HC,其包含與SEQ ID NO:244具有至少50%、至少60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%同一性之胺基酸序列;及/或(ii)LC,其包含與SEQ ID NO:209具有至少50%、至少60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%同一性之胺基酸序列。這些HC和LC序列之任何組合亦包含在本發明中。
於某些實施態樣中,本文所描述之抗體或其抗原結合片段包含Fc結構域。該Fc結構域可源自IgA(例如IgA1或IgA2)、IgD、IgE或IgG(例如IgG1、IgG2、IgG3或IgG4)。
於一些實施態樣中,本文所描述之抗體或其 抗原結合片段包含(i)VH,其包含與下列群組的其中一者具有至少50%、至少60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%同一性之胺基酸序列:SEQ ID NO:14、32、43、54、61、72、90、94、97、101、106、111、113、118、121、124、126、129、132、135、138、141、144、147、150、152、155、158、161、163、165、167、170、173、176、179、182、184、186、201、204、210、213、216、219、222、225、228、231和234,及/或(ii)VL,其包含與下列群組的任一者具有至少50%、至少60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%同一性之胺基酸序列:SEQ ID NO:19、36、47、56、65、76、81、84、86、88、91、98、103、108、115、189、192、195、188和207。這些VL和VH序列之任何組合亦包含在本發明中。於一些態樣中,該VH並非選自由下列所組成之群組的一或多者:SEQ ID NO:43、54和101。於一些態樣中,該VL並非選自由下列所組成之群組的一或多者:SEQ ID NO:47、56和103。
本發明亦提供與本文所描述之任何抗體或其抗原結合片段競爭與人IL-33結合之抗體或其抗原結合片段,諸如本文所提供之任一抗體(或其抗原結合片段)。例 如若抗體或其抗原結合部分與人IL-33之結合阻礙隨後IL33-158LS與人IL-33之結合,則該抗體或其抗原結合部分與IL33-158LS競爭與人IL-33結合。
本發明亦提供與本文所描述之任何抗體或其抗原結合片段結合至相同之人IL-33抗原決定部位的抗體或其抗原結合片段,諸如本文所提供之抗體或其抗原結合片段的任一者。例如,抗體競爭分析(和重疊抗原決定部位分析)可藉由如本文所詳細描述之SPR評估。
本發明提供之抗體及抗原結合片段包括單株抗體、多株抗體、抗體片段(例如Fab、Fab'、F(ab')2、Fv、Fc、等)、嵌合抗體、雙特異性抗體、異軛合抗體(heteroconjugate antibody)、單鏈(ScFv)、其突變體、包含抗體部分之融合蛋白、結構域抗體(dAb)、人化抗體及包含具有所需特異性之抗原識別位點的免疫球蛋白分子之任何其他修飾構型,包括抗體之糖基化變體、抗體之胺基酸序列變體及經共價修飾之抗體。該抗體和抗原結合片段可為小鼠、大鼠、人或任何其他來源(包括嵌合抗體或人化抗體)。於一些實施態樣中,該抗體為單株抗體。於一些實施態樣中,該抗體為嵌合抗體、人化抗體或人抗體。於某些實施態樣中,該抗體為人抗體。於某些實施態樣中,該抗體為人化抗體。
本發明之代表性物質於2015年12月23日寄存 於美國典型培養物寄存中心,美國維吉尼亞州馬納薩斯大學大道10801號,20110-2209。具有ATCC編號PTA-122724之載體VH-IL33-158LS包含編碼抗體IL33-158LS之重鏈可變區的DNA插入子,而具有ATCC編號PTA-122725之載體VL-IL33-158LS包含編碼抗體IL33-158LS之輕鏈可變區的DNA插入子。這些寄存物之存放係根據國際間承認之用於專利程序的微生物寄存布達佩斯條約(布達佩斯條約)及依據該條約之規則。這確保從寄存之日起30年該存活培養物的維持。該寄存物將根據布達佩斯條約之條款由ATCC提供並受輝瑞公司和ATCC之間的協議管制,此協議確保該寄存之培養物後代在相關的美國專利案發佈時或在任何美國或外國專利申請案(以先到者為準)開放給公眾時的永久和無限制可用性,並確保由美國專利和商標專員依據35 USC第122條及據此之監理規則(包括37 CFR 1.14節,特別參考886 OG 638)決定具有權利者可取得該後代。
本申請案之受讓人已同意若該寄存物質之培養物在合適之條件下培養時死亡或遺失或受損,該物質將在通知時及時被更換成另一相同物質。寄存物質之可用性不應被理解為允許在違背任何政府當局根據其專利法所授予之權利下實施本發明。
本發明亦提供編碼本文所描述之任一抗體(包括抗體部分和修飾之抗體)的多核苷酸。本發明亦提供製 造本文所描述之任何多核苷酸的方法。多核苷酸可藉由本技藝已知之程序製造和表現。
所需抗體、定義之抗體片段或其抗原結合片段的序列及編碼該等抗體或其片段之核酸可使用標準測序技術測定。編碼所需抗體、定義之抗體片段或其抗原結合片段之核酸序列可被插入用於重組製造和表徵的各種載體(諸如選殖和表現載體)中。編碼該重鏈、定義之抗體片段或該重鏈之抗原結合片段的核酸及編碼該輕鏈、定義之抗體片段或該輕鏈之抗原結合片段的核酸可被選殖在相同的載體或不同的載體中。
於一態樣中,本發明提供多核苷酸,該多核苷酸編碼下列任一IL-33抗體及彼等之抗原結合部分的胺基酸序列:7E8_嵌合體、9B3_嵌合體、9B3_嵌合體_huJseg、7E8 CDR移植物、IL33-10、9B3 CDR移植物、9B3_1、9B3_2A、9B3_2B、9B3_3、9B3_5、9B3_7 9B3_13、9B3_15、9B3_17、9B3_22、9B3_31V2、9B3_36、9B3_79、9B3_124、9B3_162、7E8H/9B3K、9B3_563、IL33-11、IL33-12、IL33-13、IL33-45、IL33-55、IL33-56、IL33-57、IL33-58、IL33-61、IL33-62、IL33-68、IL33-74、IL33-75、IL33-80、IL33-81、IL33-103、IL33-117、IL33-136、IL33-153、IL33-154、IL33-155、IL33-156、IL33-157、IL33-158、IL33-167、IL33-168、IL33-169、IL33-170、IL33-171、IL33-172、IL33-175、IL33-186、IL33-187、IL33-188、IL33-158-152、 IL33-167-153、IL33-158LS和IL33-167LS。
本發明提供編碼抗體或其抗原結合片段之胺基酸序列的多核苷酸,該抗體或其抗原結合片段與選自由下列所組成之群組的抗體結合至基本上相同的抗原決定部位:7E8_嵌合體、9B3_嵌合體、9B3_嵌合體_huJseg、7E8 CDR移植物、IL33-10、9B3 CDR移植物、9B3_1、9B3_2A、9B3_2B、9B3_3、9B3_5、9B3_7 9B3_13、9B3_15、9B3_17、9B3_22、9B3_31V2、9B3_36、9B3_79、9B3_124、9B3_162、7E8H/9B3K、9B3_563、IL33-11、IL33-12、IL33-13、IL33-45、IL33-55、IL33-56、IL33-57、IL33-58、IL33-61、IL33-62、IL33-68、IL33-74、IL33-75、IL33-80、IL33-81、IL33-103、IL33-117、IL33-136、IL33-153、IL33-154、IL33-155、IL33-156、IL33-157、IL33-158、IL33-167、IL33-168、IL33-169、IL33-170、IL33-171、IL33-172、IL33-175、IL33-186、IL33-187、IL33-188、IL33-158-152、IL33-167-153、IL33-158LS和IL33-167LS。
本發明提供編碼抗體或其抗原結合片段之胺基酸序列的多核苷酸,該抗體或其抗原結合片段與選自由下列所組成之群組的抗體競爭與IL-33結合:7E8_嵌合體、9B3_嵌合體、9B3_嵌合體_huJseg、7E8 CDR移植物、IL33-10、9B3 CDR移植物、9B3_1、9B3_2A、9B3_2B、9B3_3、9B3_5、9B3_7 9B3_13、9B3_15、9B3_17、9B3_22、9B3_31V2、9B3_36、9B3_79、 9B3_124、9B3_162、7E8H/9B3K、9B3_563、IL33-11、IL33-12、IL33-13、IL33-45、IL33-55、IL33-56、IL33-57、IL33-58、IL33-61、IL33-62、IL33-68、IL33-74、IL33-75、IL33-80、IL33-81、IL33-103、IL33-117、IL33-136、IL33-153、IL33-154、IL33-155、IL33-156、IL33-157、IL33-158、IL33-167、IL33-168、IL33-169、IL33-170、IL33-171、IL33-172、IL33-175、IL33-186、IL33-187、IL33-188、IL33-158-152、IL33-167-153、IL33-158LS和IL33-167LS。
本發明提供編碼一或多種蛋白質之多核苷酸,該多核苷酸包含選自由下列所組成之群組的胺基酸序列:(i)SEQ ID NO:1至279。
本發明提供多核苷酸,其包含如SEQ ID NO:398、399、400和401之一或多者所示明之核酸序列。本發明提供包含如SEQ ID NO:398所示明之核酸序列的多核苷酸。本發明提供包含如SEQ ID NO:399所示明之核酸序列的多核苷酸。本發明提供包含如SEQ ID NO:400所示明之核酸序列的多核苷酸。本發明提供包含如SEQ ID NO:401所示明之核酸序列的多核苷酸。
本發明提供多核苷酸,其包含寄存於ATCC且具有登錄編號PTA-122724及登錄編號PTA-122725之核酸分子的DNA插入子之編碼序列的一或二者。本發明提供多核苷酸,其包含寄存於ATCC且具有登錄編號PTA-122724之核酸分子。本發明提供多核苷酸,其包含寄存於ATCC 且具有登錄編號PTA-122725之核酸分子。
本發明提供包含一或多個如SEQ ID NO:398、399、400和401之一或多者所示明之核酸分子的細胞。本發明提供包含一或多個如SEQ ID NO:398和399所示明之核酸分子的細胞。本發明提供包含一或多個如SEQ ID NO:400和401所示明之核酸分子的細胞。
於另一態樣中,本發明提供編碼抗IL-33抗體之多核苷酸及其變體,其中該等變體多核苷酸與本文所揭示之任一具體指定之核酸序列具有至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少87%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列同一性。這些量並不意圖限制,且所列舉之百分比之間的增量被具體設想為本揭示內容的一部分。
本發明提供由本文所描述之核酸分子編碼的多肽。
於一實施態樣中,該VH和VL結構域或其抗原結合部分或全長HC或LC係由分別之多核苷酸編碼。或者,VH和VL二者或其抗原結合部分,或HC和LC係由單一多核苷酸編碼。
與任一該等序列互補之多核苷酸亦包含在本揭示內容內。多核苷酸可為單股(編碼或反義)或雙股且可為DNA(基因組、cDNA或合成的)或RNA分子。RNA分子包括HnRNA分子,該HnRNA分子含有內含子並以一對一之 方式對應於DNA分子及不含有內含子之mRNA分子。另外之編碼或非編碼序列可以,但不必要存在於本揭示內容之多核苷酸內,且多核苷酸可以,但不必連接其他分子及/或支持材料。
多核苷酸可包含天然序列(即,編碼抗體或其部分之內源序列)或可包含該等序列之變體。多核苷酸變體含有一或多個取代、添加、缺失及/或插入,從而使得所編碼之多肽的免疫反應性相對於天然免疫反應性分子未減弱。對經編碼之多肽的免疫反應性的影響通常可依本文之描述進行評估。於一些實施態樣中,變體顯示出與編碼天然抗體或其部分之多核苷酸序列具有至少約70%同一性,於一些實施態樣中,至少約80%同一性,於一些實施態樣中,至少約90%同一性,且於一些實施態樣中,至少約95%同一性。這些量並不意圖限制,且所列舉之百分比之間的增量被具體設想為本揭示內容的一部分。
當依下述對齊以為最大對應時,若二個序列中之核苷酸或胺基酸序列相同,該二個多核苷酸或多肽序列被稱為“完全相同”。二個序列之間的比較通常係經由在比較窗口上比較該二個序列來進行,以識別並比較具序列相似性之局部區域。本文所使用之“比較窗口”係指具有至少約20個連續位置(通常為30至約75個,或40至約50個)之節段,其中可在將二個序列最佳對準後,將序列與具有相同數目之連續位置的參考序列進行比較。
用於比較之序列的最佳比對可使用 Lasergene®生物資訊軟體套裝(DNASTAR®公司,威斯康辛州麥迪遜)中之MegAlign®程式,利用默認參數進行。該程式體現下列參考文獻中描述的幾種比對方案:Dayhoff,M.O.,1978,A model of evolutionary change in proteins-Matrices for detecting distant relationships.In Dayhoff,M.O.(ed.)Atlas of Protein Sequence and Structure,National Biomedical Research Foundation,Washington DC Vol.5,Suppl.3,pp.345-358;Hein J.,1990,Unified Approach to Alignment and Phylogenes pp.626-645 Methods in Enzymology vol.183,Academic Press,Inc.,San Diego,CA;Higgins,D.G.and Sharp,P.M.,1989,CABIOS 5:151-153;Myers,E.W.and Muller W.,1988,CABIOS 4:11-17;Robinson,E.D.,1971,Comb.Theor.11:105;Santou,N.,Nes,M.,1987,Mol.Biol.Evol.4:406-425;Sneath,P.H.A.and Sokal,R.R.,1973,Numerical Taxonomy the Principles and Practice of Numerical Taxonomy,Freeman Press,San Francisco,CA;Wilbur,W.J.and Lipman,D.J.,1983,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 80:726-730。
於一些實施態樣中,“序列同一性之百分比”係藉由在具有至少20個位置之比較窗上比較二個經最佳比對之序列來測定,其中該在比較窗中之多核苷酸或多肽序列的部分相較於該用於該二個序列之最佳比對的參考序列(其不包含添加或缺失)而言可包含20%或更少(通常為5%至15%,或10%到12%)之添加或缺失(即,間隙)。百分比之 計算係先測定出現在二個序列中之完全相同的核酸鹼基或胺基酸殘基的位置數以產生匹配位置之數目,將匹配之位置數除以參考序列中之位置的總數(即,窗口大小)並將結果乘以100以得到序列同一性之百分比。
變體亦可能,或者基本上與天然基因或其一部分或補體同源。該等多核苷酸變體能夠在中等嚴格條件下與編碼天然抗體(或其互補序列)之天然存在的DNA序列雜交。
合適之“中等嚴格條件”包括在5X SSC、0.5%SDS、1.0mM EDTA(pH8.0)之溶液中預先洗滌;在50℃至65℃,5X SSC中雜交一整夜;接著在65℃下以含有0.1%SDS之各2X、0.5X和0.2X SSC洗滌二次,20分鐘。
如本文所使用之“高度嚴格條件”或“高嚴格性條件”係指下列者:(1)採用低離子強度和高溫進行洗滌,例如50℃之0.015M氯化鈉/0.0015M檸檬酸鈉/0.1%十二烷基硫酸鈉;(2)在雜交過程中採用變性劑,諸如甲醯胺,例如42℃之50%(v/v)甲醯胺加上0.1%牛血清白蛋白/0.1% Ficoll/0.1%聚乙烯吡咯啶酮/50mM磷酸鈉緩衝液,pH 6.5與750mM氯化鈉、75mM檸檬酸鈉;或(3)採用42℃之50%甲醯胺、5X SSC(0.75M氯化鈉、0.075M檸檬酸鈉)、50mM磷酸鈉(pH 6.8)、0.1%焦磷酸鈉、5X Denhardt氏溶液、經超音波處理之鮭魚精子DNA(50μg/mL)、0.1%SDS和10%硫酸葡聚醣,並以42℃之0.2X SSC(氯化鈉/檸檬酸鈉)及55℃之50%甲醯胺中洗滌,隨後以55℃之含有EDTA之0.1X SSC 進行高嚴格性洗滌。本技藝之技術熟習人士將理解如何依需要調整溫度、離子強度,等以適應,諸如探針長度,等因子。
本技藝之一般技術人士將理解由於遺傳密碼之簡併性,有許多的核苷酸序列編碼如本文所描述之多肽。這些多核苷酸中有些僅與任何天然基因之核苷酸序列具最少的同源性。儘管如此,本揭示內容具體考量由於密碼子使用之差異而有不同變化的多核苷酸。此外,包含本文所提供之多核苷酸序列的基因之等位基因係在本發明之範圍內。等位基因為由於一或多個突變,諸如缺失、添加及/或取代核苷酸而被改變的內源基因。所產生之mRNA和蛋白質可能,但不一定具有改變之結構或功能。等位基因可使用標準技術(諸如雜交、擴增及/或資料庫序列比較)鑑定。
本揭示內容之多核苷酸可使用化學合成、重組方法或PCR取得。化學合成多核苷酸之方法為本技藝所周知,不需要在此詳細描述。本技藝之技術熟習人士可使用本文提供之序列及市售之DNA合成儀來產生所需之DNA序列。
為了使用重組方法製備多核苷酸,可將包含所需序列之多核苷酸插入合適之載體中,且該載體可再被引入用於複製和擴增之合適的宿主細胞中,本文中將進一步討論。多核苷酸可藉由本技藝已知之任何方式插入宿主細胞中。細胞可藉由直接攝取、內吞作用(endocytosis)、 轉染、F接合或電穿孔引入外源多核苷酸來轉化。一旦引入後,該外源多核苷酸可以未經整合之載體(諸如質體)形式保持在細胞內或被整合入宿主細胞基因組中。如此擴增之多核苷酸可藉由本技藝所周知之方法從宿主細胞中分離。參見,例如Sambrook et al.,1989。
或者,PCR允許複製DNA序列。PCR技術為本技藝所周知且描述於美國專利案第4,683,195、4,800,159、4,754,065和4,683,202號及PCR:The Polymerase Chain Reaction,Mullis et al.eds.,Birkauswer Press,Boston,1994中。
RNA可藉由下述方法取得:使用在合適之載體中的經分離之DNA並將其插入合適之宿主細胞中。當該細胞複製時,該DNA被轉錄成RNA,RNA隨後可使用本技藝之技術熟習人士所周知的方法(例如Sambrook et al.,1989中所示明者)分離。
合適之選殖和表現載體可包括各種組分,諸如啟動子、增強子及其他轉錄調控序列。該載體亦可經建構以允許隨後將抗體可變結構域選殖入不同的載體中。合適之選殖載體可根據標準技術構建,或可從本技藝中可用之大量選殖載體中選擇。雖然所選擇之選殖載體可能根據所欲使用之宿主細胞而有變化,有用之選殖載體通常將具有自我複製之能力,可能擁有用於特定之限制性內切酶的單一靶的及/或可能攜帶用於可用來選擇含有該載體之選殖株的標記物之基因。合適之實例包括質體和細菌病毒, 例如pUC18、pUC19、Bluescript(例如pBS SK+)和其衍生物、mp18、mp19、pBR322、pMB9、ColE1、pCR1、RP4、噬菌體DNA及穿梭載體,諸如pSA3和pAT28。這些和許多其他選殖載體可從商品供應商,諸如BioRad、Strategene和Invitrogen公司取得。進一步提供表現載體。表現載體通常為可複製之多核苷酸構建體,該可複製之多核苷酸構建體含有根據本揭示內容之多核苷酸。這暗示表現載體在宿主細胞中必須以附加體或染色體DNA的組成部分形式複製。合適之表現載體包括,但不限於質體、病毒載體,包括腺病毒、腺相關病毒、逆轉錄病毒、黏粒及揭示於PCT刊物第WO 87/04462號中之表現載體。載體組分通常可包括,但不限於下列群組之一或多者:信號序列;複製起點;一或多個標記基因;合適之轉錄控制元件(諸如啟動子、增強子和終止子)。為了表現(即,轉譯),時常亦需要一或多個轉譯控制元件,諸如核糖體結合位點、轉譯起始位點和終止密碼子。
含有所欲多核苷酸之載體及/或該多核苷酸本身可藉由任何數目之適當方法(包括電穿孔、利用氯化鈣、氯化銣、磷酸鈣、DEAE-葡聚醣或其他物質進行轉染;基因槍(microprojectile bombardment);脂質體轉染(lipofection);及感染,例如其中該載體為感染劑,諸如牛痘病毒)引入宿主細胞中。引入載體或多核苷酸之選擇通常將取決於該宿主細胞之特性。
該抗體或其抗原結合片段可利用合適之宿主 細胞重組製造。編碼該抗體或其抗原結合片段之核酸可選殖入表現載體中,然後該表現載體可再被引入宿主細胞(諸如大腸桿菌(E.coli)細胞、酵母細胞、昆蟲細胞、猿猴COS細胞、中國倉鼠卵巢(CHO)細胞或骨髓瘤細胞(其中該細胞不另外產生免疫球蛋白))中以達成在重組宿主細胞中合成抗體。本技藝所熟知之多種細胞中,較佳之宿主細胞包括本技藝中周知之多種細胞,尤其是CHO細胞、人胚胎腎(HEK)293細胞或Sp2.0細胞。抗體片段可藉由蛋白水解或其他降解全長抗體之方法、藉由重組方法、或藉由化學合成製造。抗體之多肽片段,尤其是至多約50個胺基酸之較短的多肽可藉由化學合成很方便地製造。用於化學合成蛋白質和肽類之方法為本技藝所已知且可從市場取得。
本發明之抗體或其抗原結合片段可為親和力成熟的。例如,親和力成熟抗體可藉由本技藝中已知之程序(Marks et al.,1992,Bio/Technology,10:779-783;Barbas et al.,1994,Proc Nat.Acad.Sci,USA 91:3809-3813;Schier et al.,1995,Gene,169:147-155;Yelton et al.,1995,J.Immunol.,155:1994-2004;Jackson et al.,1995,J.Immunol.,154(7):3310-9;Hawkins et al.,1992,J.Mol.Biol.,226:889-896;和WO2004/058184)產生。
於一些態樣中,本發明提供使用抗IL-33抗體或其抗原結合片段抑制IL-33活性之治療方法,其中該治 療方法包含投予治療有效量之包含抗體或其抗原結合片段的醫藥組成物。該受治療之病症為藉由除去、抑制或降低IL-33活性或信號傳導而被改進、改善、抑制或預防的任何疾病或病症。
於一些態樣中,該病症為發炎性疾病或病症、或具有至少一種與該發炎性疾病或病症相關之症狀的病況。該發炎性疾病或病症或症狀之嚴重性、持續時間或發生頻率可經緩解或減少。
本發明之抗體及其抗原結合片段可能在其中發揮效力的黏膜或身體表面之過敏及其他疾病包括:過敏、過敏性鼻炎、過敏性結膜炎、春季型角膜結膜炎(vernal keratoconjunctivitis)、季節性過敏、寵物過敏、哮喘、食物過敏、花生過敏、異位性皮膚炎、具有鼻息肉之慢性鼻竇炎(rhinosinusitis)(CRSwNP)、過敏性鼻炎、支氣管炎、慢性阻塞性肺病(COPD)、呼吸系統疾病病毒性惡化、兒童和成人病毒感染(呼吸道融合病毒(RSV))、鼻病毒、流感)、蕁麻疹(urticarias)和嗜酸粒細胞性食管炎。涉及慢性纖維化之疾病亦可藉由本發明之抗體及其抗原結合片段治療。這些包括:肝纖維化、非酒精性脂肪性肝炎(NASH)、慢性腎臟病、特發性肺纖維化(IPF)、硬皮病、系統性硬化症。涉及急性組織損傷的疾病亦可藉由本發明之抗體及其抗原結合片段治療,包括:急性腎損傷、敗血症、胰臟炎、第1型糖尿病、移植物抗宿主病(GVHD)、組織移植。可以本發明之抗體及其抗原結合片段治療的其他 慢性退化性或慢性發炎性疾病包括:阿玆海默氏病、類風濕性關節炎、炎性腸病:大腸激躁症候群(irritable bowel syndrome)(IBS)、克隆氏(Crohn)症、潰瘍性結腸炎。可以本發明之抗體及其抗原結合片段治療之其他疾病包括多發性硬化症、牛皮癬、乳糜瀉(celiac disease)和雷諾(Raynaud)氏病。
該抗體及其抗體片段可與一或多種另外之治療活性化合物組合投予。該另外之治療活性化合物包括針對IL-1a、IL-1b、IL-2、IL-3、IL-4、IL-5、IL-6、IL-8、IL-9、IL-10、IL-12、IL-13、IL-17、IL-18、IL-21、IL-23、IL-25、IL-26、IL-31、IL36、IFNα、IFNγ之拮抗劑或其各別受體的一或多者之拮抗劑、NSAIDs、類固醇和皮質類固醇。
本發明之抗IL-33抗體亦可用於檢測及/或測量樣品中之IL-33或IL-33表現細胞,例如用於診斷目的。例如抗IL-33抗體或其片段可用來診斷特徵為IL-33異常表現(例如過度表現、表現不足、缺乏表現,等)之病症或疾病。用於IL-33之示例性診斷分析可包含例如將從患者取得之樣品與本發明之抗IL-33抗體接觸,其中該抗IL-33抗體係以可檢測之標記或報告分子標記。
如本文所使用之“醫藥上可接受之載體”或“醫藥上可接受之賦形劑”包括任何當與活性成分組合時可允許該成分保留生物活性且與該個體之免疫系統不反應的物質。實例包括,但不限於任何標準藥學載體,諸如磷酸鹽 緩衝之鹽水溶液、水、乳劑(諸如油/水乳劑)及各種類型之潤濕劑。用於投予霧化劑或腸胃道外投予之較佳稀釋劑為磷酸鹽緩衝之鹽水(PBS)或生理(0.9%)鹽水。包含該等載體之組成物係藉由為人周知之常規方法配製(參見,例如Remington's Pharmaceutical Sciences,18th edition,A.Gennaro,ed.,Mack Publishing Co.,Easton,PA,1990;及Remington,The Science and Practice of Pharmacy,20th Ed.,Mack Publishing,2000)。
本發明之抗體或其抗原結合片段可配製成醫藥組成物。在凍乾製劑或水溶液之形式中,該醫藥組成物可進一步包含醫藥上可接受之載體、賦形劑及/或穩定劑(Remington:The Science and practice of Pharmacy 20th Ed.,2000,Lippincott Williams and Wilkins,Ed.K.E.Hoover)。可接受之載體、賦形劑或穩定劑為在投予接受者之劑量和濃度下對接受者無毒,且可包含緩衝劑,諸如磷酸鹽、檸檬酸鹽和其他有機酸;抗氧化劑,包括抗壞血酸和甲硫胺酸;防腐劑(諸如十八烷基二甲苄基氯化銨;六甲基氯化銨;苯扎氯銨、苄索氯銨;苯酚、丁醇或苄醇;對羥基苯甲酸烷基酯,諸如對羥基苯甲酸甲酯或對羥基苯甲酸丙酯;兒茶酚;間苯二酚;環己醇;3-戊醇;及間甲酚);低分子量(少於約10個殘基)多肽;蛋白質,諸如血清白蛋白、明膠或免疫球蛋白;親水性聚合物,諸如聚 乙烯吡咯啶酮;胺基酸,諸如甘胺酸、麩胺醯胺、天門冬醯胺、組胺酸、精胺酸或離胺酸;單醣、雙醣及其他碳水化合物,包括葡萄糖、甘露糖或葡聚醣;螯合劑,諸如EDTA;糖類,諸如蔗糖、甘露醇、海藻糖或山梨糖醇;形成鹽之抗衡離子,諸如鈉;金屬複合物(例如Zn-蛋白複合物);及/或非離子性表面活性劑,諸如TWEENTM、PLURONICSTM或聚乙二醇(PEG)。本文中進一步描述醫藥上可接受之賦形劑。
如本文所使用之藥物、化合物或醫藥組成物之“有效劑量”、“有效量”或“治療有效量”為足以使任何一或多種有益或期望之結果起作用的量。在預防性用途方面,有益或期望之結果包括排除或降低疾病之風險、減輕疾病之嚴重性或延遲疾病開始,包括疾病之生物化學、組織學及/或行為症狀、其併發症及在該疾病發展過程中呈現之中間病理表型。在治療用途方面,有益或期望之結果包括臨床結果,諸如減少發炎或由活性IL-33高度表現所導致之一或多種症狀、減少治療該疾病所需之其他藥物的劑量、增強另一種藥物之效果及/或延緩患者疾病之進展。有效劑量可在一或多次給藥中投予。為了本發明之目的,藥物、化合物或醫藥組成物之有效劑量為足以直接或間接完成預防或治療性治療的量。如在臨床背景下所理解的,藥物、化合物或醫藥組成物之有效劑量可與或可不與 另一藥物、化合物或醫藥組成物結合來達達成。因此,在投予一或多種治療劑之背景下,可考慮“有效劑量”,而單一試劑若與一或多種其他試劑結合時,則可考慮以有效量給予以可能實現或實現理想之結果。
“個人”或“個體”為哺乳動物,更佳為人。哺乳動物亦包括,但不限於農場動物、運動動物、寵物、靈長類動物、馬、狗、貓、小鼠和大鼠。
於一些實施態樣中,該方法或用途包含投予初始劑量為約0.025mg/kg至約20mg/kg之本發明的抗體、或其抗原結合片段、或醫藥組成物。初始劑量之後可為一或多個接續劑量。於一些實施態樣中,可以至少任一下列頻率投予一或多個接續劑量:每週、每隔一週、每三週、每四週、每五週、每六週、每七週、每八週、每九週、每十週、每十一週或每十二週。
於一些實施態樣中,該方法或用途包含投予初始劑量為約0.25mg至約2000mg之本發明的抗體或其抗原結合片段。於一些實施態樣中,該抗體或其抗原結合片段係每週、隔週、每三週、每四週、每五週、每六週、每七週、每八週、每九週、每十週、每十一週或每十二週投予。
本發明亦提供包含本發明之抗體或其抗原結合片段及使用用法說明的套組或製品。因此,於一些實施 態樣中,提供套組或製品,該套組或製品包含容器、該容器內之包含抗IL-33拮抗劑抗體的組成物及仿單,該仿單含有投予治療有效量之抗-IL-33拮抗劑抗體以治療有需要治療之患者的用法說明。
於某些實施態樣中,該套組可同時含有具有乾燥蛋白質之第一容器及具有水性調製劑之第二容器。於某些實施態樣中,包括含有單室和多室之經預填充的注射器(例如液體注射器和凍乾劑注射器(lyosyringe))之套組。
關於本發明之抗體或其抗原結合片段的用途之用法說明通常包括關於用於所欲治療之劑量、給藥方案和投予途徑的資訊。該容器可為單位劑量、散裝(例如多劑量包裝)或亞單位劑量。本發明之套組中所提供之用法說明通常為書寫在標籤或仿單(例如包含在該套組中之紙張)上的用法說明,但機器可閱讀之用法說明(例如磁碟或光碟上所記載之用法說明)亦可接受。
本發明之套組係在合適之包裝中。合適之包裝包括,但不限於小瓶、瓶子、罐子、軟性包裝(例如密封之聚酯薄膜(Mylar)或塑膠袋),等。與特定裝置,諸如吸入器、鼻部投予裝置(例如霧化器)或諸如微型泵之輸注裝置組合使用之包裝,亦在考慮之內。套組可具有無菌進入口(例如該容器可能為靜脈內溶液袋或具有可被皮下注射針刺穿之塞子的小瓶)。該容器亦可具有無菌進入口(例如該容器可為靜脈內溶液袋或具有可被皮下注射針刺穿之塞子的小瓶)。該容器可進一步包含第二藥學活性劑。
套組可視需要地提供額外組分,諸如緩衝劑和解釋資訊。通常,該套組包含容器和在該容器上或與該容器聯結之標籤或仿單。
當與可測量之數字變量一起使用時,“約”或“近似”係指該變量之指示值及該變量之所有在該指示值之實驗誤差內(例如在該平均值之95%信賴區間內)或在該指示值之10%以內(以較大者為準)的數值。數字範圍包括界定該範圍之數字。
如本文所使用之“載體”意指能夠投遞且較佳地,在宿主細胞中表現所欲之一或多個基因或序列的構建體。載體之實例包括,但不限於病毒載體、裸出之DNA或RNA表現載體、質體、黏粒或噬菌體載體、與陽離子縮合劑聯結之DNA或RNA表現載體、包封在脂質體中之DNA或RNA表現載體及某些真核細胞,如生產細胞。
如本技藝所已知之術語“同一性”係指藉由比較序列所測定之二或更多個多肽分子或二或更多個核酸分子的序列之間的關係。本技藝中,“同一性”亦意指藉由將核苷酸或胺基酸序列之字串間進行匹配所測定之多肽或核酸分子序列(視情況而定)之間的序列相關程度。“同一性”係測量二或更多個具有間隙對齊的序列之間的全同匹配百分比,間隙對齊係藉由電腦程式之特定數學模型(即“演算法”)處理。
術語“相似性”為相關概念,但相對於“同一性”,其係指相似性之測量,該相似性之測量同時包括全同匹配和保守性取代匹配。由於保守性取代適用於多肽,且不適用於核酸分子,故相似性僅涉及多肽序列比較。若二個多肽序列具有,例如10/20個完全相同之胺基酸,且其餘部分均為非保守性取代,則該同一性和相似性百分比均為50%。若在該相同實例中,多出5個位置為保守性取代,則該同一性百分比仍為50%,但相似性百分比將為75%(15/20)。因此,在其中存在保守性取代的情況中,二個多肽序列之間的相似程度將高於該二個序列之間的同一性百分比。
本文描述示例性方法和材料,但亦可使用類似或等同於本文所描述之方法和材料者來實踐或測試本發明。該材料、方法及實施例僅用於說明而不意圖用來限制。
藉由多次皮下注射,以在明礬佐劑中之重組人IL-33(SEQ ID NO:1),胺基酸S112-T270(R&D Systems,明尼蘇達州Minneapolis;目錄編號3625-IL/CF)將Sprague-Dawley大鼠免疫化。亦篩選顯示出對固定在經鏈親和素塗層之ELISA盤上的生物素化之人IL-33具結合活 性的血清,以用於阻斷10ng/ml生物素化之人IL-33與人ST2-Fc(SEQ ID NO:2)結合,該人ST2-Fc(SEQ ID NO:2)已被固定在ELISA盤上之抗人Fc捕捉。為了進行分析,以二硫蘇糖醇(DTT)將野生型IL-33還原或使用人IL-33變體,mm2(SEQ ID NO:3)(其中所有四個半胱胺酸殘基經突變成絲胺酸)來維持細胞因子活性。從具有最高效價之大鼠中,將富集在經IL-33塗層之小珠上的雜交瘤和培養之B細胞進行篩選以選出與人IL-33結合、阻斷人IL-33/ST2-Fc結合及中和穩定表現ST2之HEK-293細胞上之人IL-33活性和受NFkB反應性啟動子控制之表現分泌型鹼性磷酸酶之質體的抗體。鑑定出227種IL-33結合抗體,其中6種抗體(30A1、30B11、7E8、9B3、12F9和14D8)亦中和IL33-ST2結合及報告細胞活性,且選出該等抗體以用於分子選殖和隨後之分析。
使用SMART®cDNA合成系統(Clontech Laboratories Inc.of Mountain View,加州)選殖中和抗IL-33抗體之重鏈和輕鏈可變區,然後進行PCR擴增。使用RNEasy套組(Qiagen)和SMART® Ⅱ A oligo(Clontech Laboratories公司)與Superscript Ⅱ TM逆轉錄酶(Clontech實驗室公司)從1μg總RNA合成cDNA,該1μg總RNA係從約500,000個選殖之B細胞(14D8、12F9)或7E8、9B3、30A1、30B11雜交瘤細胞分離出。然後使用與SMART Ⅱ A oligo序列黏合之引物及大鼠恆定區特異性引物(用於輕鏈之大鼠κ和用於重鏈之大鼠IgG1)與GoTaq Green聚合酶主混合物(Promega),藉由PCR擴增cDNA。將重鏈和輕鏈PCR產物分殖入pCR4-TOPO載體(Invitrogen)中並測定該核酸序列。該方法的優點在於不需要預先知道DNA序列之訊息。此外,所產生之DNA序列未由使用簡併PCR引物而被改變。
然後,將可變重鏈區選殖入含有經過突變以消除效應子功能(Leu234Ala、Leu235Ala和Gly237Ala,EU編號;美國專利案第5,624,821號))之人IgG1恆定區(SEQ ID NO:9)的pSMED2哺乳動物表現載體中,產生嵌合重鏈。將可變輕鏈區選殖入含有人κ恆定區(SEQ ID NO:30)之pSMEN3哺乳動物表現載體中以產生嵌合輕鏈。在抗體9B3、14D8、30A1和30B11之情況中,亦使用最接近之人κ鏈J段(SEQ ID NO:12、82)來替代大鼠κ鏈J區段,以改善該嵌合抗體之表現。
在實施例1中描述之基於HEK293 ST2 NFkB細胞的報告子分析中該六個嵌合抗體顯示出與人IL-33結合並中和其活性,如表4中所示。
亦使用HEK293 ST2 NFkB分析,以食蟹猴IL-33之變體(其中該變體之三個半胱胺酸殘基經突變成絲胺酸(SEQ ID NO:5))測試該嵌合抗體以測定其中和食蟹猴IL33之能力。7E8、30A1和30B11能分別在IC50為0.21、2.95和0.20nM時中和食蟹猴IL-33,而12F8和14B8則不,且9B3僅顯示出微弱之中和作用(表5)。
根據使用Octet生物傳感器之競爭分析將六個 中和抗體分組到抗原決定部位小組中。在經鏈親和素塗層之Octet尖端裝填10μg/ml生物素-hIL-33(mm2)150秒,轉移至阻斷緩衝液(1%BSA,在PBS中)中50秒,然後轉移到含有該六個抗體其中一者之孔內290秒以允許第一抗體與IL-33結合。然後將尖端轉移到含有第二抗體的第二孔中290秒。若該第二抗體顯示出生物傳感器信號增加高於前述由第一抗體所產生者,則抗體被評分為非競爭性,而若該第二抗體未製造額外增加之信號,則該抗體被評分為競爭性(表6)。基於這些競爭資料,抗體7E8、9B3、30A1和30B11界定一個抗原決定部位小組,而12F9和14D8界定第二個非重疊之抗原決定部位。
藉由互補決定區(CDR)移植(以下稱為“CDR移植”)產生中和大鼠抗體7E8、9B3、12F9和30B11之人化形式。將重鏈CDR移植到具有JH4段(SEQ ID NO:8)之人DP-54框架區(VH3子群;SEQ ID NO:7)上,而輕鏈CDR被移 植到具有JK4節段(SEQ ID NO:12)之人DPK9框架區(VKI子群;SEQ ID NO:11)上。將人化VH區接合到效應子功能突變之人IgG1恆定區(SEQ ID NO:9),然後分殖入專有表現載體中以產生經移植CDR之重鏈SEQ ID NO:92(7E8 CDR移植物)、99(9B3 CDR移植物)、104(12F9 CDR移植物)和109(30B11 CDR移植物)。經移植CDR之30B11的第二種形式在重鏈之位置71處併入大鼠殘基(纈胺酸),而非種系精胺酸殘基,所產生之重鏈稱為SEQ ID NO:112。將人化VL區與人κ恆定區(SEQ ID NO:13)融合,然後分殖入專有表現載體以產生經移植CDR之輕鏈SEQ ID NO:93(7E8 CDR移植物)、SEQ ID NO:100(9B3 CDR移植物)、SEQ ID NO:105(12F8 CDR移植物)和SEQ ID NO:110(30B11 CDR移植物)。7E8亦被移植在其他VH3種系框架(DP47,登錄編號CAA78217.1;DP31,登錄編號CAA78203.1;DP50,登錄編號CAA78220.1)並與經移植CDR之7E8(SEQ ID NO:92、93)具有類似之基於細胞的活性和非特異性結合。
經移植CDR之7E8、9B3、12F9和30B11在實施例1所描述之HEK293 ST2 NFkB報告子分析中顯示出中和人IL-33之活性。尤其是,經移植CDR之7E8顯示出IC50為0.019nM,與7E8雜交瘤7E8(表7)所表現之0.024nM IC50 幾乎一致。經移植CDR之12F9顯示出在高濃度下僅部分抑制(表7),而非完全抑制,嵌合型12F9(表4)所觀察到之IC50為2.71nM。經移植CDR之9B3和30B11的IC50值分別為0.520和0.368nM(表7),相對於這些抗體之嵌合形式,活性約降低10倍(表4)。含有重鏈框架回復突變R71V之經移植CDR之30B11的第二形式顯示出與該嵌合體相較下效力之降低情況類似(0.278nM vs 0.028nM IC50)(表7、表4)。
經移植CDR之7E8和7E8雜交瘤在以食蟹猴IL-33進行之ST2 NFkB報告子分析中進一步顯示出具有類似之中和效力(分別為0.069nM和0.032nM;表8),類似於它們在以人IL-33(mm2)進行之ST2 NFkB報告子分析中的活性(經移植CDR之7E8和7E8雜交瘤二者均為0.043nM IC50;表8)。經移植CDR之7E8和可溶性人IL-33受體ST2-Fc顯示出對人IL-33(mm2)(分別為0.043nM和0.056nM)及保留野生型半胱胺酸殘基之人IL-33(分別為3.21nM和1.89nM;表8)具有類似之中和效力。
經移植CDR之7E8進一步顯示中和由培養之人肺纖維母細胞產生之天然人IL-33的活性。將人肺纖維母細胞系HFL-1(ATCC)的早期傳代生長在DMEM+10%經熱去活化之胎牛血清(FBS)+L-麩胺醯胺/青黴素/鏈黴素+1/100HEPES中。當細胞達到95至100%匯合時,移除培養基並以不含血清之相同培養基替換,再培養24小時。然後移除培養基,以20ng/ml TNF-α替換,再另外培養14小時。藉由胰蛋白酶分解來收穫細胞,將細胞離心沉澱成小丸並在無血清之培養基中冷凍。藉由在-20℃下進行5次凍融循環來製備溶胞產物,使其達到10mM DTT並將樣品離心再稀釋以評估IL-33活性。HFL-1細胞溶胞產物顯示出在HEK293 ST2 NFkB報告子分析中活化NFkB報告基因且該活性可部分被可溶性人ST2-Fc(SEQ ID NO:2)和多株抗IL-33中和抗體阻斷。大鼠抗體7E8、9B3、30A11和30B11和嵌合體以及嵌合型14D8可完全阻斷活性,表示這些抗體 可識別並中和在人初代細胞中產生之內源性IL-33。
為了在不受配體濃度影響之分析中測量抗體與IL-33之結合親和力,以HEK293 ST2 NFkB報告子分析系統設計實驗,其中可進行Schild分析以計算分析獨立性和配體濃度獨立性之7E8對IL-33的親和力測量值(Arunlakshana and Schild,1959)。在NFκB ST2報告子分析中,在多個7E8 CDR移植物(SEQ ID NOS:92,93)的濃度下測定IL-33之EC50並計算出IL-33(mm2)之kB為6.01pM,野生型IL-33(R&D)之kB為83.45pM(表10)。
當該共刺激物為IL-12時,IL-33亦為從血液中之天然殺手細胞產生IFNγ的有效共刺激劑。藉由Ficoll從新鮮之肝素化人血中純化人外周血單核細胞(PBMC),再以IL-12處理2小時,然後以5pM之IL-33和抗IL-33抗體之 劑量滴定混合物處理之。加入IL-33後20小時收集培養上清液,並藉由MSD盤式分析儀(Meso Scale Diagnostics,馬利蘭州Rockville)測量IFNγ之水準。在人PBMC中,類似於在HEK293 ST2 NFkB報告子分析中觀察到之結果,7E8在二個供體中抑制IL-33(mm2)所得之kB計算值為1.04pM和6.64pM。因此,7E8 CDR移植物對IL-33(mm2)之表觀親和力非常高,而在野生型IL-33方面係在個位數皮莫耳範圍內且低於100pM。
使用BIAcore T200儀器藉由表面等離振子體共振測量與人和食蟹猴IL-33之結合。將抗人Fc抗體固定在CM5芯片上並捕捉抗IL-33抗體。將人IL-33(mm2)或食蟹猴IL-33在3.9-125nM之濃度範圍內以50μl/min之速度流過芯片45秒並允許離解240-1500秒。如下列表11中所示,測定親和力值。所有抗體與人IL-33結合,親和力範圍係在171至540pM。經捕捉之嵌合型12F9和嵌合型14D8不與 溶液中之125nM食蟹猴IL-33結合,而經移植CDR之7E8、嵌合型9B3、嵌合型30A1和嵌合型30B11與溶液相之人和食蟹猴IL-33結合。
由於以捕捉之IgG形式測量之抗體的表觀親和力較其在溶液相中之IL-33中和效力明顯為低(實施例11),進行二種替換方式來測定親和力。為了除去IgG分子的2個結合臂呈現二價的影響,藉由木瓜蛋白酶裂解經移植CDR之7E8(SEQ ID NO:92、93)來製備單價抗IL-33抗體Fab片段。藉由二種方法測量Fab片段親和力,使用BIAcore儀器,藉由捕捉在芯片上之Fab或IL-33進行表面等離子體共振,並使用KinExA儀器與溶液中二Fab和IL-33測量溶液平衡親和力。
表面等離子體共振實驗係以二種格式進行。當藉由抗人Fab捕捉套組(GE Healthcare公司目錄編號28958325)捕捉7E8 Fab時,所測得之對IL-33(mm2)的親和力為249.5pM,而對IL-33(R&D)之親和力為290pM(表12),類似於以類式格式捕捉之IgG所取得的結果(表11)。 然而,當生物素化之hIL-33(mm2)被捕捉在經鏈親和素塗層之BIAcore生物傳感器上並將7E8 Fab滴定系列注射在傳感器表面上,所測得之7E8 Fab對IL-33(mm2)的親和力為3.06pM(表12)。不欲受任何特定理論之束縛,這二種格式的結果之間的差異可能來自基質效果,例如在pH 7.4,可預期列溶液中之帶正電荷的Fab(pI 8.52)對帶負電荷之CM5傳感器芯片具吸引力,同樣地,溶液中帶負電荷之IL-33(IL-33mm2為pI 5.2,IL-33WT為pI 4.45,生物素化之IL-33 mm2為pI 5.48)對具帶負電荷之CM5傳感器芯片具排斥力(Drake et al.2012,Anal.Biochem.429(1):58-69)。測量親和力之正交方法描述於下列實施例10中。
為了評估7E8與野生型IL33之結合,根據製造商之方案使用胺耦合套組(目錄編號BR100050,GE Healthcare)將具有野生型半胱胺酸殘基(SEQ ID NO:4)之重組IL33蛋白與CM5傳感器芯片(目錄編號BR100530,GE Healthcare)共價耦合。以非還原之IL-33和在固定之前已經在室溫以3mM DTT還原3小時之IL-33樣品進行平行研究。被固定之IL-33水準類似(在非還原和還原IL-33方面分別為293和370個共振單位)。活化流動池1並阻斷之以作為參考流動池。使用10mM HEPES pH 7.4、0.15M NaCl、3mM EDTA、0.05%P-20(HBS-EP+)作為運行和樣品緩衝液,流速為每分鐘50μl,將大鼠親本Fab 7E8進行一系列滴定。監控解離3600秒。在37℃下,在Biacore T200儀器(GE Healthcare)上,以1Hz之收集速率進行Biacore動力學分 析。經由將所得之傳感圖資料擬合至Biacore T200評估軟體版本1.0(GE Healthcare)之1:1模型來測定速率常數和親和力。大鼠7E8 Fab對已用DTT預處理之野生型人IL-33的親和力經測量為44.23pM(表12),而7E8 Fab並未與非還原之IL-33結合(第1圖)。此觀察結果表明7E8選擇性地與活性IL-33結合,而不與已藉由氧化被去活化之IL-33結合,並表明在治療設置中存有經去活化之IL-33將不會干擾從7E8衍生之抗體與活性IL-33結合的能力。
為了處理在不同試劑取向中藉由等離振子共振測量之親和力中與格式相關的差異,使用正交方法來評估7E8 Fab對IL-33之親和力,二種結合夥伴均在溶液中。使用動力學排除分析(KinExA)儀器(型號3200,Sapidyne)來測定7E8 Fab對huIL-33(mm2)(SEQ ID NO:3)和huIL33wt(SEQ ID NO:4)之結合親和力。在使用前將HuIL33wt在3mM DTT中還原至少2小時。在室溫下使用固定之抗原分析格式測定親和力。經由在25℃下溫育72小時來達到平衡結合。使用KinExAPro軟體版本 3.6.5(Sapidyne)進行資料分析。使用“親和力標準”模型來分析資料並測定huIL33mm2和還原之huIL33wt的表觀KD及表觀活性濃度。適當時,使用“漂移校正”。在獨立實驗中取得多條曲線(包括控制受體和KD二者)並使用“n曲線分析”工具分析以取得KD和活性濃度之整體最佳擬合值。該軟體報告具95%信賴區間之各個最佳擬合值。KinExA分析顯示出7E8 Fab以非常高之親和力與人IL-33結合,hIL-33之mm2形式測得之KD為0.35pM,還原WT形式測得之KD為4.04pM(表13)。這些結果與藉由Schild分析所分析之基於細胞之分析的結果一致(實施例8),其顯示出在溶液平衡條件下,7E8 CDR移植物在溶液中以低皮莫耳親和力與IL-33結合。
使用三種方法來鑑定對抗體7E8之功能至關重要的胺基酸。首先,系統性檢查大鼠mAb-CDR序列和人種系CDR序列之間的不同CDR殘基以測定哪些位置需要原始大鼠序列及哪些位置容許改變。此方法處理重鏈CDR-H1 和CDR-H2及輕鏈CDR-L1、CDR-L2和CDR-L3中之序列。第二種方法(實施例12)處理CDR-H3中序列變異(未經編碼在種系中)的容許度。藉由下一代測序(NGS)測定存在於經免疫化之大鼠的脾臟B細胞(親本7E8源自於此)中的序列變異並測定在CDR-H3之各個位置處的變異頻率。測試變體CDR序列之子集的功能以決定所觀察之序列變化的影響。檢查功能性CDR殘基的第三種方法為在抗體工程處理過程中檢查特定之經工程處理的胺基酸變體(參見實施例14至16)。
用於判定關鍵CDR殘基之方法已有描述,藉由該方法從含有人種系殘基或在各CDR位置(除了CDR-H3外)處之對應的囓齒動物殘基的集合庫中選擇功能性抗體變體(Townsend et al.,2015)。建構噬菌體scFv集合庫,其中將7E8之所有與人種系(DP54/DPK9)不同的CDR位置隨機處理,從而使得約50%之該選殖株編碼該位置之大鼠7E8胺基酸,而約50%之該選殖株編碼人種系胺基酸(表14)。製備集合庫並對人IL-33(mm2)進行3至4輪選擇。回收保留與IL-33結合之選殖株並測定其序列。從該實驗,其中可觀察到人序列之結合選殖株少於約20%的位置被定義為大鼠必須殘基。大鼠殘基被優先保留在11個位置(重鏈殘基Y35、S50、T52和P53;輕鏈殘基H32、D34、F50、N53、Y91、G94和W95),表示這些殘基被人種系殘基替代是極不利的。輕鏈中之F50被A取代的情況並未觀察到,這表明F為該位置之極佳胺基酸。大鼠和人殘基被發現在重鏈 殘基54(N/D)、56、(G/S)、57(N/E)、58(T/K)和61(P/V)和輕鏈殘基24(K/R)、28(N/S)、30(N/S)、31(K/S)、52(N/S)、56(T/S)、89(F/Q)、92(N/Y)和93(N/S)之頻率類似,表示這些位置之大鼠序列不具關鍵性。輕鏈中之位置51編碼大鼠7E8選殖株中之蘇胺酸殘基,但在人類DPK9種系序列中則偏好編碼之丙胺酸,86%之結合選殖株中有併入此胺基酸(表14)。雖然集合庫中位置51處丙胺酸密碼子的起始頻率為68%,高於大多數,但類似於數種其他殘基,在所選擇之選殖株中其他具有類似之起始偏好的位置(例如在起始集合庫中位置L24之精胺酸密碼子的頻率為65%,而位置L30之絲胺酸密碼子的頻率為63%)具有幾乎相等的胺基酸分佈。此觀察表明丙胺酸在位置51之極高偏好。
抗體相關於實施例1中所描述之IL-33中和抗體所能容許之CDR H3序列變異係藉由將與該抗體來源相同之動物的免疫組庫定序來進行檢查。從經免疫化之大鼠的脾組織分離出RNA,依實施例2中之描述藉由逆轉錄-RACE PCR製備並在Roche FLX+儀器上進行下一代定序。從62,484個序列reads鑑定出具有與實施例1中之中和抗體所具者相關之CDR3序列的VH基因組。計算在該獨特CDR3序列組內各位置處之胺基酸與中和抗體序列分岐的 頻率,不調整該群體中各CDR3序列的頻率(表15)。來自7E8和9B3之CDR3中被強力保留之序列(未加權樣品中之變化<15%)為G99、H100、Y101、Y103、S105、Y106和S107。在大鼠組庫中所鑑定出之72個序列變體中並未觀察到Y106中之變化,且來自Y103、S105和S107之變化僅在少於3%之序列中觀察到。
將表16中所顯示之與9B3和7E8相關的CDRH3序列子集選殖入嵌合型9B3重鏈之框架中,產生之重鏈由SEQ ID NO:116、120、123、125、128、131、134、137、140、143、146、149、151、154、157和160指明。將這些重鏈與嵌合型9B3輕鏈(SEQ ID NO:117)共同轉染,表現所產生之抗體,純化之並藉由BIAcore分析IL-33解離速率及在HEK293 ST2 NFkB報告分析中抑制IL-33信號傳導。在與125nM IL-33(mm2)結合後,依實施例9中之描述,使用被固定之抗人Fc抗體捕捉的完整IgG測量解離速率。二種分析均顯示出與親本9B3所具者相比較,存在於大鼠組庫中之大多數CDRH3序列變體的解離速率或中和效力的變化很少或沒有變化,表示所觀察到之序列變化是 被充分容許的變化。所有測試之18種抗體的解離速率均在9B3之解離速率的2.5倍以內。在18種抗體中有4種可觀察到基於細胞之效力降低高達4倍。效力之較大變化不能歸因於特定的單一變化,因為這四種抗體全部含有在其他變體中所觀察到之具有最小功能影響的突變。在這些抗體中之另外取代的背景下,以化學上相似之側鏈取代二個被高度保留的胺基酸(抗體9B3-22中之芳香族側鏈取代Y101F及抗體9B3-7中之帶正電荷之側鏈取代H100R)不會導致抗體功能顯著變化。綜合而論,在免疫化組庫中觀察到之胺基酸序列變化表明在抗體9B3及與其密切相關之7E8的CDR H3中,殘基G99、H100、Y101、Y103、S105、Y106和S107或具有化學上相似之側鏈的殘基為較有利的。
抗體與除了其靶的外之分子的非特異性結合已被提出為體內快速清除的機制(Hötzel et al.,2010,MAbs 4(6):753-760)。該等多重反應性非靶的結合之證據可透過測量與膜製劑(Xu et al.,2013,Protein Eng.Des.Select.26(10):663-70;)、桿狀病毒顆粒(Hötzel et al.,2012,mAbs 4:753-60)或帶負電荷之受質,諸如DNA、胰島素和肝素(Tiller et al.,2008,J.Immunol.Methods 329(1-2):112-124)結合來取得。
用於DNA和胰島素之ELISA係使用低嚴格性方 案,該低嚴格性方案最初係研發用於檢測來自狼瘡患者之低親和力自身抗體(Tiller et al.,2008)。將在PBS中之5μg/ml胰島素或10μg/ml單股或雙股DNA塗層在Nunc Maxisorp ELISA盤上一整夜。以水洗滌孔3次,然後在室溫下以ELISA緩衝液(PBS/0.05% Tween/1mM EDTA)阻斷1小時。將在ELISA緩衝液中之3-10μg/ml抗體在孔中在室溫下溫育1小時,並以水洗滌孔3次,在室溫下與在ELISA緩衝液中稀釋5000倍之與HRP軛合的山羊抗人IgG1一起溫育1小時。以水洗滌3次後,以TMB顯色5分鐘,再以0.1M硫酸終止反應。用於結合桿狀病毒(BV)顆粒之ELISA係根據Hotzel,2012中所描述之方法。在每個孔中加入在50mM碳酸鈉緩衝液(pH9.6)中之4% BV懸浮液以將抗原固定在Nunc Maxisorp ELISA盤中,並允許顆粒在4℃下吸附在盤上一整夜。以阻斷緩衝液(PBS/0.5%BSA)在室溫下將孔阻斷1小時。以PBS洗滌3次後,將在阻斷緩衝液中之10μg/ml抗體加入ELISA孔中並在室溫下溫育1小時。以PBS洗滌盤6次並與20ng/ml HRP-山羊抗人抗體(Jackson ImmunoResearch Cat No.109-035-008)在室溫下溫育1小時。將盤在PBS中洗滌6次,在每個孔中加入25μl之TMB受質並允許發展15分鐘,然後藉由在每個孔中加入1M磷酸終止之。在任何步驟中緩衝液中均未添加洗滌劑。將10μg/ml Ab之A450信號對來自空白孔之信號標準化以用於比較樣品。
嵌合型和經移植CDR之7E8被發現在低嚴格性 多重反應性ELISA中與DNA和胰島素適度結合,而嵌合型9B3顯示出DNA和胰島素結合接近陰性對照抗體,儘管序列類似7E8(表17)。7E8之CDR-H2被其9B3對應部分替代可造成多重反應性被部分降低,而替換CDR H1或CDR H3的影響最小。
9B3之人IL-33(mm2)阻斷活性低於7E8所具者(在HEK293 ST2 NFkB分析中9B3之人IL-33(mm2)阻斷活性為0.264nM,而7E8之人IL-33(mm2)阻斷活性為0.059nM)。此差異在抑制食蟹猴IL-33時更顯著:7E8之抑制效力(0.131nM)類似於其對人IL-33之抑制效力,而9B3對食蟹猴IL-33之抑制效力實質上較弱,在20nM時僅部分阻斷。以9B3 CDR H2替代7E8 CDR H2導致對食蟹猴IL-33之效力大為損失(0.131nM IC50降至3.46nM),類似地,以9B3 CDR H3替代7E8 CDR H3導致對食蟹猴IL-33之效力損失(7.65nM)。因此,CDR H2同時攜帶7E8/9B3族之IL-33中和抗體的特異性和非特異性活性的決定簇,而CDR H3攜帶特異性活性之決定簇。
多重反應性與CDR中之正電荷不平衡有關(Datta-Mannan et al.,2015,MAbs 7(3):483-493)。7E8和9B3的輕鏈之間無電荷差異。檢查7E8和9B3之CDR-H2和CDR-H3序列(SEQ ID NO:17、34、18和35)顯示出四個CDR-H2和四個CDR-H3差異,其中僅有一個(在位置54, 7E8之N及9B3之D)會導致電荷差異。以N54D突變修飾7E8以產生IL33-45(重鏈SEQ ID NO:169),其僅對多重反應性具有適度效果,但顯著降低食蟹猴IL-33中和效力,該方式類似於以9B3之CDR H2替代7E8之CDR H2所觀察到者(表18)。為此,需要另外之序列變體以鑑定允許保留7E8對人和食蟹猴IL-33之活性,同時降低7E8之多重反應性的序列變化。
在7E8中製造一系列突變以鑑定可降低多重反應性,但不損失活性之變化。儘管以天門冬胺酸取代CDR H2中之N54可略微降低多重反應性,但導致基於細胞之活性降低,以其他胺基酸(I、L、V、W、Y)替代N54可增加與桿狀病毒之非特異性結合,同時使基於細胞之活性保持 完整。
如同藉由與桿狀病毒粒子、DNA或胰島素結合所測量者,以二個帶負電荷之殘基(天門冬胺酸或麩胺酸)的任一者替代CDR H2殘基N57會導致多重反應性顯著降低,但這些突變不會降低中和活性(表19)。令人驚訝的是,對重鏈之CDR3(S105D)添加負電荷會同時導致多重反應性和基於細胞之活性的不良變化,而對輕鏈添加負電荷(突變N30D、K31D、T56D或T56E)會增加多重反應性。因此,N57D和N57E變體之不尋常在於它們改善多重反應性而不損害中和人或食蟹猴IL-33的效力。這些結果表明負電荷的位置,而非僅可變結構域上之總電荷,是重要的。
將一系列被預測將引入負電荷、除去疏水殘基或修飾位置57附近之殘基的另外之重鏈CDR突變連同N57E一起檢查。在CDR-H2併入個別突變(S50A、T58D;表20)之具有N57E突變的7E8之多重反應性大致上維持低下,而在基於HEK293 ST2 NFkB細胞之分析中(表21),具有N57E突變之7E8的效力藉由併入S50A或T58D而基本上 沒有變化。類似地,具有N57E突變之7E8的多重反應性藉由在CDR H1(T28E)、H2(G56H、T58D、D62E、S63A或K65Q)或H3(H100Y、Y102H、Y103H、Y103W、T104N或T104S)中併入另外之個別突變而大致上維持低下。同樣地,在基於HEK293 ST2 NFkB細胞之分析中,具有N57E突變之7E8的效力藉由在CDR H1(T28E)、H2(K65Q)或H3(H100Y、T104N或T104S)中併入另外之個別突變而基本上沒有變化。
在幾乎與實施例8中所描述之用於PBMC分析所使用者完全相同的安排中,藉由IL-12之共刺激,IL-33可刺激在人全血中產生IFNγ,所不同的是與用於PBMC之5pM IL-33相比較,全血反應所需之IL-33的濃度較高(100pM)。類似於在HEK293 ST2 NFkB分析中所觀察到之結果,藉由併入個別突變S50A或T58D,具有N57E突變之7E8的全血效力基本上沒有變化(表21)。同樣地,藉由在CDR H1(T28E)、H2(S63A或K65Q)或H3(Y103H、T104N或T104S)中併入另外之個別突變,具有N57E突變之7E8的效力基本上沒有變化。
將設計用來排除轉譯後修飾之可能位點的突變(輕鏈N93Q,其除去可能之NG天門冬醯胺脫醯胺位點(Chelius et al.,2005,Anal.Chem.77(18):6004-6011))與抗體IL33-136中之重鏈突變N57E合併,結果發現導致保留基於細胞之活性(表21)並部分保留改善之多重反應性(表20)。
檢查這些突變與二個另外之重鏈突變(G55A,其允許除去可能之NG天門冬醯胺脫醯胺位點及D62E,其除去可能之DS天門冬胺酸異構化位點(Chelius,D.,et al.(2005))之組合的活性和多重反應性,並鑑定一組選殖株, 該組選殖株具有約為起始選殖株7E8 CDR移植物之二倍的基於細胞之活性(在HEK293 ST2 NFkB報告子分析、人全血和人PBMC分析中)及在陰性對照抗體之二倍內的多重反應性(表22、表23)。
產生抗體IL33-158和IL33-167的二種重鏈變體形式,一種變體Fc(SEQ ID NO:237)在Fc中含有突變L234A L235A和G237A以降低效應子功能(描述於美國專利案第5,624,821號)並刪除C端之離胺酸殘基以降低產物異質性,另一變體(SEQ ID NO:238)含有L234A L235A和G237A突變,C端離胺酸缺失和雙突變M432L N438S以增 進在酸性pH下與新生兒Fc受體FcRn結合,預期將導致體內半衰期延長(Zalevsky et al.,2010,Nature Biotechnol.28(2):157-159)。在載體pRY19中建立各構建體並將其穩定轉染入CHO細胞中。所產生之抗體為IL33-158-152(SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:209)、IL33-167-153(SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:93)、IL33-158LS(SEQ ID NO:244SEQ ID NO:209)和IL33-167LS(SEQ ID NO:245、SEQ ID NO:93)。該經優化之抗體與對應之人種系序列之可變區的序列比對顯示於第2圖中。
由經穩定轉染之CHO細胞產生之抗體L33-158LS(SEQ ID NO:244、SEQ ID NO:209)和IL33-167LS(SEQ ID NO:245、SEQ ID NO:93)顯示出與陰性對照單株抗體貝伐單抗(表24)相當之多重反應性水準。這些水準與IL33-158(SEQ ID NO:227、SEQ ID NO:209)和IL33-167(SEQ ID NO:212、SEQ ID NO:93)之水準相當(顯示於表22中),表示加入恆定區突變L234A、L235A、G237A、M432L和N438S突變並刪除C端離胺酸基本上不會改變所產生之分子的多重反應性。
由經穩定轉染之CHO細胞產生的抗體IL33-158-152(SEQ ID NO:241、SEQ ID NO:209)、IL33-167-153(SEQ ID NO:242、SEQ ID NO:93)、IL33-158LS(SEQ ID NO:244、SEQ ID NO:209)和IL33-167LS(SEQ ID NO:245、SEQ ID NO:93)顯示出在HEK293 ST2 NFkB報告子分析中對人IL-33(mm2)、人IL-33(WT)和食蟹猴IL-33(cys mut)之IL-33中和作用類似於親本抗體7E8 CDR移植物(SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:93)。
從經穩定轉染之CHO細胞產生之抗體IL33-158LS(SEQ ID NO:244、SEQ ID NO:209)和IL33-167LS(SEQ ID NO:245、SEQ ID NO:93)顯示出在人PBMC中之IL-33(mm2)中和作用類似於親本抗體7E8 CDR移植物(SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:93)。
從經穩定轉染之CHO細胞產生之抗體IL33-158LS(SEQ ID NO:244、SEQ ID NO:209)和IL33-167LS(SEQ ID NO:245、SEQ ID NO:93)顯示出在人全血中對人IL-33(mm2)和人IL-33(WT)之由IL-33刺激之IFN-γ產製的中和作用類似於親本抗體7E8 CDR移植物(SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:93)之作用。
從經穩定轉染之CHO細胞產生之抗體IL33-158LS(SEQ ID NO:244、SEQ ID NO:209)顯示出人IL-33(mm2)和人IL-33(R&D)中和作用,而市售之Nessy-1未顯示出明顯的中和作用。市售之單株抗體19G8顯示出對人IL-33(mm2)之中和作用較IL33-158LS弱,與對人IL-33(R&D)之中和作用相當(表28)。因此,對由IL-33(mm2)所代表之人IL-33的活性形式的強烈選擇性中和作用為IL33-158LS之特徵性質。
在一系列使用細胞系、初代人單核細胞和人全血之生物分析中,人化之經優化的抗人IL-33抗體IL33-158-152、IL33-167-153、IL33-158LS和IL33-167LS為有效之IL-33生物活性中和劑。
在37℃下,在Biacore T200儀器(GE Healthcare)上,以1Hz之收集速率進行Biacore動力學分析。根據製造商之方案,使用胺偶合套組(目錄編號BR100050,GE Healthcare)將人IL33(mm2)、食蟹猴IL-33和經還原之huIL33wt與CM5傳感器芯片(目錄號BR100530,GE Healthcare)共價偶合。固定量為260RU之人IL-33(mm2)、85RU之食蟹猴IL-33及108-225R之經還原的huIL33(WT)。將流動池1活化並阻斷之以作為參考流動池。以每分鐘50ul之流速注射引導抗IL-33 Fab 158LS、167LS和親本Fab 7E8的滴定系列並監測解離3600秒。稀釋和運行緩衝液為HBS-EP+(10mM HEPES pH 7.4、0.15M NaCl、3mM EDTA、0.05%P-20)。將所得之傳感圖資料擬合在Biacore T200評估軟體1.0版(GE Healthcare)中之1:1模型以測定速率常數和親和力。
依實施例10中之描述藉由表面等離振子共振,以固定在傳感器芯片上之IL-33和在溶液相之Fab片段測量該經優化之抗體IL33-158LS和IL33-167LS的Fab片段之親和力。二種經優化之抗體均顯示出與人IL33(mm2)、人IL33(WT)和食蟹猴IL33的結合親和力相當於該親本經移植CDR之7E8的Fab所表現之親和力(表29)。
為了評估抗IL-33抗體7E8和IL33-158LS之細胞因子特異性,藉由表面等離子體共振,以BIAcore T-200評估一組非靶的細胞因子與這些抗體之結合。該細胞因子小組包括IL-1α、IL-1β、IL-18、IL-36α和IL-36γ。結果(表30,第3圖)顯示出100nM之無關細胞因子並無結合,而抗IL-33抗體7E8和IL33-158LS以非常類似之%RMAX值與IL-33 mm2和還原之IL-33 WT結合。在無還原之情況下,未觀察到與IL-33結合。
在Octet結合分析中測試IL33-158LS阻斷ST2受體與IL-33結合之能力。將抗體或人ST2-Fc(SEQ ID NO:6)捕捉在塗覆抗人Fc之Octet尖端上,以過量之人IgG1對照抗體阻斷游離結合位點並將IL-33(R&D)和第二抗體或ST2-Fc之混合物施放在尖端。該IL33-158LS和人IL-33之複合物能夠與捕捉在Octet尖端之對照的非中和抗IL-33抗體,IL33-271(SEQ ID NO:254,SEQ ID NO:256)結合,相反地,IL33-271和人IL-33之複合物能夠與經固定之IL33-158LS結合。同樣地,人ST2-Fc和IL33-271能夠同時以任一取向與人IL-33結合。然而,經固定之IL33-158LS無法與IL-33和ST2-Fc之複合物結合,相反地,經固定之ST2-Fc無法與IL-33和IL33-158LS之複合物結合。這些結果指示IL33-158LS與ST2-Fc競爭在IL-33上之重疊結合位點。
使用差示掃描量熱法來測定IL33-158-152、IL33-158LS、IL33-167-153和IL33-167LS之穩定性。在此分析方面,以自動進樣器(Malvern儀器公司)將0.3mg/ml之樣品分配在MicroCal VP-Capillary DSC之樣品托盤中,在10℃平衡5分鐘,然後以每小時100℃之速率掃描達到110℃。選擇16秒之過濾期。將原始資料進行基線校正並將蛋白質濃度標準化。使用Origin軟體7.0(OriginLab公司,麻薩諸塞州Northampton)以適當之轉換數將資料擬合至MN2態模型。下列表32顯示在20mM組胺酸pH5.8、8.5%蔗糖、0.05mg/ml EDTA中之分子的熔化溫度(Tm1-Tm3)。所有四個分子顯示出良好之穩定性,在CH2結構域中之第一次轉換(Tm1)高於65℃。此外,引入LS突變對該分子之穩定性的影響非常小(1℃)。
測試IL33-158LS於捕捉天然食蟹猴IL-33之能力。經由靜脈內途徑投予食蟹猴劑量為0.14或14mg/kg之IL33-158LS後,經由腹膜內注射投予氫氧化鋁(明礬)(1mg,在0.1ml中)。注射明礬後達72小時抽取血液樣品。使用免疫親和LC\MS\MS法測量與IL33-158LS結合之總食蟹猴IL-33。將與生物素-軛合之抗人Fc抗體與各血漿樣品一起培育,並在4℃培育一整夜以與所有與抗IL-33抗體結合之細胞因子結合。在各樣品中添加鏈親和素小珠並培育30分鐘,洗滌之,再使用低pH洗提緩衝液將該細胞因子從抗體釋出,然後以Tris緩衝液中和之。然後將具有用於IL-33之特徵序列的延長之穩定的經同位素標記之肽加入各樣品中,再以DTT還原所有樣品,以碘乙醯胺烷基化並以胰蛋白酶分解之。然後以2D奈米UPLC串聯質譜儀系統鑑定該胰蛋白酶肽。對使用20μL血漿之食蟹猴IL-33而言,此分析的定量極限為50pg/mL。與低劑量之0.14mg/kg IL33-158LS相比較,在投予14.3mg/kg之IL33-158LS和明礬挑戰後,與IL33-158LS結合之IL-33隨時間增加(表33)。這些結果表示IL33-158LS係以劑量依賴方式與天然食蟹猴IL-33結合,並產生可用於人類藥效學建模之可測量的效果。
IL33-158LS在食蟹猴中之終末血清半衰期為18天,這容許二室PK模型之參數化。異率指數為0.75之清除速率常數的異率放大推算法(allometric scaling)導致預測 之人血清終末半衰期為41天。與抗體在人體中通常觀察到之半衰期為20天(Brekke and Sandlie(2003),Nature Reviews,Vol 2,pp 52-62)及人類或人化生物治療性IgG抗體通常觀察到之半衰期為17天(從Singh,et al.(Chapter 5.Application of mechanistic pharmacokinetic-pharmacodynamic modeling towards the development of biologics.In:Kumar S,Kumar Singh S,editors.Developability of Biotherapeutics:ComputationalApproaches.CRC Press;2015:p.109-34)所報告之PK參數衍生)相比較,此半衰期明顯較長。
出人意料的是,在健康志願者中之初步評估指出IL33-158LS之血清排除(β相)半衰期為至少50天。於本發明之一些態樣中,該抗體或其抗原結合部分之終末半衰期為至少約50天。於本發明之一些態樣中,該抗體或其抗原結合部分之終末半衰期為至少約55天。於本發明之一些態樣中,該抗體或其抗原結合部分之終末半衰期為至少約60天。於本發明之一些態樣中,該抗體或其抗原結合部分之終末半衰期為至少約65天。於本發明之一些態樣中,該抗體或其抗原結合部分之終末半衰期為至少約70天。於本發明之一些態樣中,該抗體或其抗原結合部分之終末半衰期為至少約75天。於本發明之一些態樣中,該抗體或其抗原結合部分之終末半衰期為至少約80天。於本發明之一些態樣中,該抗體或其抗原結合部分之終末半衰期為至少約85天。於本發明之一些態樣中,該抗體或其抗原結合部分之終末半衰期為至少約90天。該出乎意料地高之半衰期 可能是由於可變區和CDR區,及Fc結構域中之修飾。
產生WO2014164959中所描述之多種hIgG4抗體的IgG1形式(表35)(該經分離之Fab片段的結合特性與Fc區無關,而該完整IgG4之結合性質預期與IgG1基本上完全相同)。H4H9675P(對應於IL33-265)、H4H9659P(對應於IL33-266)和H4H9665P(對應於IL33-267)已被揭露對37℃之人IL-33或猴子IL-33具有最高親和力(WO2014164959之表3 & 6)。初始之功能評估顯示IL33-267較IL33-265和IL-33-266無效。更詳細之評估顯示出IL33-265之效力較IL33-266高8-10倍(表36)。BIAcore分析IgG與固定之野生型人IL-33的結合顯示出IL33-265僅與還原型IL-33結合,而不與非還原型IL-33結合。
產生IgG1抗體IL33-310(SEQ ID NO:287(HC)和SEQ ID NO:288(LC))並從WO2016077381之10C12.38.H6.87Y.581 IgG4(其被揭露為對人和食蟹猴IL-33具有高親和力)衍生。
10C12.38.H6.87Y.581係由WO2016077381之SEQ ID NO:306(HC)和SEQ ID NO:307(LC)所組成。為了取得用於表現之核苷酸序列,使用Vector NTI軟體將可變區序列進行逆轉譯。使用標準恆定κ區之核苷酸序列(其編碼與WO2016077381之SEQ ID NO:307的胺基酸序列相一致之胺基酸序列)用於表現構建體。該標準IgG4恆定區之核苷酸序列編碼之胺基酸序列與WO2016077381之SEQ ID NO:306具有三個相異處且在此三個密碼子被修飾以編碼WO2016077381之SEQ ID NO:306的恆定區。將編碼前導序列SEQ ID NO:402之核苷酸序列置於VH和VL編碼序列之框內上游。表37顯示比較IL-167/LS、IL-158/LS、IL33-265和IL33-310的基於細胞之分析的資料。
IgG1抗體IL33-244係基於APE04909,該APE04909被揭露為WO2015/106080之SEQ ID NO:136和SEQ ID NO:171。APE04909為例如實施例2(體外基於細胞之分析)和實施例5(小鼠中之人IL-33依賴性嗜酸性粒細胞增殖之體內研究,實施例5)中所詳細描述之中和抗體。然而,當根據WO2015/106080之SEQ ID NO:136/171產生抗體時,該抗體之表現很差且具有異質SEC變化形廓。為了排除密碼子不良用法而促成表現差的可能性,使用來自類似,充分表現之抗體的DNA序列作為起點,並經過調節以使用其中需要改變之高頻率人類密碼子編碼上述序列。然而,此步驟之後表現仍然不佳且SEC樣式仍顯示異質性(表38)。
IL33-248在WO2015/099175被描述為3H04和 A25(參見第8圖),而IL33-247在WO2015/099175中被描述為1C04和A10(參見第9圖)。合成來自WO 2015/099175之可變區核苷酸序列並選殖入人IgG1和人λ表現載體(參見表39之來自WO2015/099175的序列)。IL33-247和IL33-248具有不同之抗原決定部位IL-158/LS和IL33-167/LS,在IL33-247方面係產生90.75mgL CM和100%之曲線下面積,而在IL33-248方面係產生36mg/L CM和85.3%之曲線下面積,這亦顯示具有寬持留時間之不對稱峰。
IgG1抗體IL33-312係根據WO16156440之33_640087-7B(SEQ ID NO:615和SEQ ID NO:617)(參見,例如第52圖及實施例11至12)。IgG1抗體IL33-313係根據WO16156440之33640237-2B(SEQ ID NO:623和SEQ ID NO:625)。
在HEK293 ST2 NFkB報告分析中測試抗體IL33-158LS(SEQ ID NO:244、SEQ ID NO:209)、IL33-167LS(SEQ ID NO:245、SEQ ID NO:93)、IL33-265(SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:404)和IL33-310(SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:406)對人IL-33和食蟹猴IL-33之中和作用(表40)。IL33-158LS(SEQ ID NO:244SEQ ID NO:209)顯示出對人IL-33和食蟹猴IL-33之半胱胺酸突變體形式具類似之中和效力(食蟹猴IC50:人IC50比為1.8)。同樣地,IL33-158LS(SEQ ID NO:244、SEQ ID NO:209)對野生型人IL-33和食蟹猴IL-33(SEQ ID NO:397)具類似之中和效力(食蟹猴IC50:人IC50比為4.2)。IL33-167LS(SEQ ID NO:245、SEQ ID NO:93)顯示出對食蟹猴IL-33和人IL-33同樣接近之中和效力。其他二種抗體,IL33-265(SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:404)和IL33-310(SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:406)顯示出對人IL-33和食蟹猴IL-33之中和效力之間具有較大之差異(猴IC50:人IC50比為28.7至超過250)。
第二個實驗中,在HEK293 ST2 NFkB報告子分析中測試IL33-158LS(SEQ ID NO:244、SEQ ID NO:209)、IL33-310(SEQ ID NO:405、SEQ ID NO:406)、IL33-312(SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:408)和IL33-313(SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:410)對人IL-33和食蟹猴IL-33之中和作用(表41)。IL33-158LS和IL33-312對食蟹猴IL-33和人IL-33半胱胺酸突變體具有同樣接近之相關中和效力(食蟹猴IC50:人IC50比分別為1.4和1.1)。IL33-158LS和IL33-312對野生型人IL-33和食蟹猴IL-33的相關中和作用亦類似(食蟹猴IC50:人IC50比分別為9.2和5.4)。IL33-310和IL33-313顯示出對人IL-33和食蟹猴IL-33之中 和效力之間具有較大的差異(猴子IC50:人IC50比為29.2至528.1;表41)。綜合而論,該資料顯示在此高效力之抗人IL-33抗體小組內,IL33-158LS(SEQ ID NO:244、SEQ ID NO:209)具有最類似之野生型人IL-33和食蟹猴IL-33的中和效力,與IL33-312相當。
在37℃下,在Biacore T200儀器(GE Healthcare)上以1Hz之收集速率進行Biacore動力學分析。 根據製造商之方案,使用胺偶合套組(目錄編號BR100050,GE Healthcare)將還原和非還原之野生型人IL-33及經還原之野生型食蟹猴IL-33共價偶合在CM5傳感器芯片(產品目錄編號BR100530,GE Healthcare)上。將流動池1活化並阻斷之以作為參考流動池。於一實驗中,固定量為218RU之還原的野生型人IL-33及248RU之還原的野生型食蟹猴。在該實驗中,以每分鐘50ul之流速注射抗IL-33 Fab 158LS和167LS之滴定系列並監測解離3600秒。在第二實驗中,固定量為130RU之還原的野生型人IL-33、97RU之非還原的野生型人IL-33、88RU之還原的野生型食蟹猴IL-33。在該實驗中,以每分鐘50ul之流速注射抗IL-33 Fab 158LS、167LS和IL33-265之滴定系列並監測解離900秒。該稀釋和運行緩衝液為HBS-EP+(10mM HEPES pH 7.4、0.15M NaCl、3mM EDTA、0.05%P-20)。將所得之傳感圖資料擬合在Biacore T200評估軟體1.0版(GE Healthcare)中之1:1模型以測定速率常數和親和力。亦以此形式測試完整IL33-0310 IgG並觀察到其與還原之人IL-33和還原之食蟹猴IL-33快速結合,以非常慢之速度解離,但不與非還原之人IL-33結合(表Y)。二價IgG之動力學性質不能直接與單價Fab片段之動力學性質相比較且並未呈現於本文中。
抗IL33 Fab 158LS、167LS、IL33-265和抗IL33 IgG抗體IL33-310均與經DTT處理之野生型人IL33和食蟹猴IL33強力結合。相反地,這些抗體無一與非還原之 野生型人IL-33結合(表42)。
IL33-158LS(SEQ ID NO:244 SEQ ID NO:209)之Fab與野生型人IL-33和食蟹猴IL-33(SEQ ID NO:397)之親和力類似(在二個獨立的實驗中,猴子KD:人KD比為1.3和2.3)。IL33-167LS(SEQ ID NO:245,SEQ ID NO:93)顯示出與猴子IL-33和人IL-33之親和力同樣接近。IL33-265(SEQ ID NO:403、SEQ ID NO:1003)顯示出與野生型人IL33和食蟹猴IL33之親和力之間有較大的差異,猴子KD:人KD比為57.8(表42)。
測試抗體IL33-158(SEQ ID NO:227、SEQ ID NO:209)、IL33-158LS(SEQ ID NO:244、SEQ ID NO:209)和IL33-312(SEQ ID NO:407、SEQ ID NO:408)與DNA和胰島素之結合並另外在AC-SINS分析中測試自身交互作用(親和力捕捉自身交互作用奈米粒子光譜分析法;Liu et al.,2014,mAbs 6:483-92)。在AC-SINS分析中,捕捉在金奈米球上之mAb若彼此結合將引起最大吸光度移動,並藉此引起小珠群集,在該分析中之高得分已表明與溶解度和非特異性膜交互作用關聯(Liu et al.,2014,mAbs 6:483-92)。IL33-158和IL33-158LS具有非常低之AC-SINS得分,與陰性對照組之得分相當,而IL33-312之得分與陽性對照組之得分相當(表43)。IL33-312亦具有高DNA結合分數,與陽性對照組之得分相當,而IL33-158和IL33-158LS顯示出較適度之得分。綜合而論,這些結果指示與IL33-312相比較,IL33-158和IL33-158LS具有實質上較低之非特異性結合指標。
因此,本發明已參考上述之代表性實施態樣廣泛揭示和說明。本技藝之技術熟習人士將認知可在不背離本發明之精神和範圍的前提下對本發明做出各種修改。本文中之所有出版物、專利申請案及核發之專利以引用方式併入本文,其程度如同個別出版物、專利申請案或核發之專利的全部內容各自被具體且個別被指明以引用方式併入本發明中。包含在以引用方式併入本文之文本中的定義的排除程度為其與本發明中之定義相抵觸。
可理解的是,為了清楚起見,在分別之實施態樣的背景下所描述之本發明的某些特性亦可組合提供在單一實施態樣中。相反地,為了簡明起見,在單一實施態樣之背景下所描述之本發明的各種特性亦可分別提供或以任何合適之次組合提供。
相關於本發明之一種實施態樣所討論的任何限制可具體考量應用於本發明之任何其他實施態樣。此 外,本發明之任何組成物可用於本發明之任何方法,且本發明之任何方法可用於製造或利用本發明之任何組成物。尤其是,應了解,申請專利範圍中所描述之本發明的任何態樣(單獨或與一或多個另外之申請專利項及/或描述之態樣組合)可與申請專利範圍及/或用法說明及/或序列表及/或附圖以外所提出之本發明的其他態樣組合。
如本文中所發現之具體實施例不在本發明之範圍內,該具體實施例可被明確放棄。
在申請專利範圍中使用之術語“或”係意味“及/或”,除非明確指出僅指替代項或該等替代項相互排斥,儘管本揭示內容支持僅指替代項和“及/或”之定義。如本文之申請專利範圍中所使用者,除非另有明確說明,“一(a或an)”可意指一或多項。如本文之申請專利範圍中所使用者,當與字語“包含”結合使用時,本文中使用之字語“一(a或an)”可意指一項或多於一項。如本文所使用之“另一”可意指至少第二或更多項。除非本文中另外定義,否則與本發明聯合使用之科學和技術術語應具有技藝之一般技術人士所通常理解之含義。此外,除非上下文另有要求,單數術語應包括複數且複數術語應包括單數。本文中參照本發明使用之字語“包含(comprises/comprising)”和字語“具有/包括”係用於具體指定所陳述之特性、整數、步驟或組分的存在,但不預先排除存在或添加一或多種其他特性、整數、步驟、組分或彼等之群組。
儘管所揭示之教示內容已參照各種應用、方 法和組成物描述,應理解的是,在不背離本教示內容和下文中之本發明的申請專利範圍的前提下可做出各種變化和修改。所提供之實施例係為更充分說明所揭示之教示內容,而不意圖限制本文所呈現之教示內容的範圍。雖然本教示內容已就這些示例性實施態樣描述,對這些示例性實施態樣進行多種變化和修改而無需過度實驗是可行的。所有該等變化和修改都在本教示內容之範圍內。
當本發明之態樣或實施態樣係就馬庫什(Markush)組或其他替代項組別描述時,本發明不僅包括整體列出之整個組,亦包括個別組別之各成員和主要組別之所有可能的亞組,還有缺少一或多個該組成員的主要組別。本發明亦設想明確排除申請專利之發明中的一或多個任一組員。
本文所引用之所有參考資料,包括專利、專利申請案、論文、教科書,等及其中所引用之參考資料的全部內容在此以引用方式併入本文,其程度為它們並非已併入本文。在該併入之文獻和類似物中有一或多項與本申請案不同或矛盾的情況中(包括,但不限於定義之術語、術語用法、描述之技術,等),以本申請案為準。
本說明和實施例詳細描述本發明的某些具體實施態樣並描述本發明者所考慮之最佳模式。然而,應理解的是,無論前述內容可能會多麼詳細地出現在文本中,本發明可以多種方式實施且本發明應當根據所附之申請專利範圍及其任何等同物來解釋。
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<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 240
<211> 106
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 241
<211> 450
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 242
<211> 450
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 243
<211> 106
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 244
<211> 450
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 245
<211> 450
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 246
<211> 117
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 247
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 248
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 249
<211> 8
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 250
<211> 108
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 251
<211> 12
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 252
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 253
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 254
<211> 447
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 255
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 256
<211> 215
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 257
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (1)..(1)
<223> Xaa可為K、S、H、T、Q、W、Y、F或R
<220>
<221> MISC_特性
<222> (2)..(2)
<223> Xaa可為A、S或G
<220>
<221> MISC_特性
<222> (3)..(3)
<223> Xaa可為S、A或D
<220>
<221> MISC_特性
<222> (4)..(4) .
<223> Xaa可為Q、H、S、E、D、或T
<220>
<221> MISC_特性
<222> (5)..(5)
<223> Xaa可為N、S、D、R、K、Y、E或G
<220>
<221> MISC_特性
<222> (6)..(6)
<223> Xaa可為I或V
<220>
<221> MISC_特性
<222> (7)..(7)
<223> Xaa可為N、F、K、H、R、L、M、I、E或S
<220>
<221> MISC_特性
<222> (8)..(8)
<223> Xaa可為K、Q、E、R、W、F、Y、N、A、S或H
<220>
<221> MISC_特性
<222> (9)..(9)
<223> Xaa可為H、F、R或W
<220>
<221> MISC_特性
<222> (10)..(10)
<223> Xaa可為L、I、V或A
<220>
<221> MISC_特性
<222> (11)..(11)
<223> Xaa可為D、S或A
<210> 258
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (1)..(1)
<223> Xaa可為K或R
<220>
<221> MISC_特性
<222> (4)..(4)
<223> Xaa可為Q或H
<220>
<221> MISC_特性
<222> (5)..(5)
<223> Xaa可為N或S
<220>
<221> MISC_特性
<222> (6)..(6)
<223> Xaa可為I或V
<220>
<221> MISC_特性
<222> (7)..(7)
<223> Xaa可為N或S
<220>
<221> MISC_特性
<222> (8)..(8)
<223> Xaa可為K、S或N
<210> 259
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (1)..(1)
<223> Xaa可為K或R
<220>
<221> MISC_特性
<222> (4)..(4)
<223> Xaa可為Q或H
<220>
<221> MISC_特性
<222> (5)..(5)
<223> Xaa可為N或S
<220>
<221> MISC_特性
<222> (7)..(7)
<223> Xaa可為N或S
<220>
<221> MISC_特性
<222> (8)..(8)
<223> Xaa可為K或S
<210> 260
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (1)..(1)
<223> Xaa可為K或R
<220>
<221> MISC_特性
<222> (5)..(5)
<223> Xaa可為N或S
<220>
<221> MISC_特性
<222> (7)..(7)
<223> Xaa可為N或S
<220>
<221> MISC_特性
<222> (8)..(8)
<223> Xaa可為K或S
<210> 261
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (1)..(1)
<223> Xaa可為F、W、Y、D、E、G或S
<220>
<221> MISC_特性
<222> (2)..(2)
<223> Xaa可為T、G、R、A、N或V
<220>
<221> MISC_特性
<222> (3)..(3)
<223> Xaa可為N、W、Y、R、F、K,Q、E、D、H或S
<220>
<221> MISC_特性
<222> (4)..(4)
<223> Xaa可為N、F、Y、I、M、Q、L、A、R、G、P或S
<220>
<221> MISC_特性
<222> (5)..(5)
<223> Xaa可為L、I、V或R
<220>
<221> MISC_特性
<222> (6)..(6)
<223> Xaa可為Q、R、K、F、H、L、W、Y、A或E
<220>
<221> MISC_特性
<222> (7)..(7)
<223> Xaa可為T、S、N或Y
<210> 262
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (1)..(1)
<223> Xaa可為F或Y
<220>
<221> MISC_特性
<222> (2)..(2)
<223> Xaa可為A或T
<220>
<221> MISC_特性
<222> (3)..(3)
<223> Xaa可為N或S
<220>
<221> MISC_特性
<222> (4)..(4)
<223> Xaa可為N或S
<220>
<221> MISC_特性
<222> (6)..(6)
<223> Xaa可為Q或E
<220>
<221> MISC_特性
<222> (7)..(7)
<223> Xaa可為T或S
<210> 263
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (2)..(2)
<223> Xaa可為T或A
<220>
<221> MISC_特性
<222> (3)..(3)
<223> Xaa可為N或S
<220>
<221> MISC_特性
<222> (4)..(4)
<223> Xaa可為N或S
<220>
<221> MISC_特性
<222> (7)..(7)
<223> Xaa可為T或S
<210> 264
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (2)..(2)
<223> Xaa可為A或T
<220>
<221> MISC_特性
<222> (3)..(3)
<223> Xaa可為N或S
<220>
<221> MISC_特性
<222> (7)..(7)
<223> Xaa可為T或S
<210> 265
<211> 8
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (1)..(1)
<223> Xaa可為F、Q、W、H或A
<220>
<221> MISC_特性
<222> (2)..(2)
<223> Xaa可為Q、S、T或A
<220>
<221> MISC_特性
<222> (3)..(3)
<223> Xaa可為Y、H或F
<220>
<221> MISC_特性
<222> (4)..(4)
<223> Xaa可為N、W、F、Y、R、K、H或D
<220>
<221> MISC_特性
<222> (5)..(5)
<223> Xaa可為N、S,Q、W、K、R、H、Y、D、G、T或V
<220>
<221> MISC_特性
<222> (6)..(6)
<223> Xaa可為G、R、P、K、W、F、I、N或Q
<220>
<221> MISC_特性
<222> (7)..(7)
<223> Xaa可為W或H
<220>
<221> MISC_特性
<222> (8)..(8)
<223> Xaa可為T、S或Q
<210> 266
<211> 8
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (1)..(1)
<223> Xaa可為F或Q
<220>
<221> MISC_特性
<222> (3)..(3)
<223> Xaa可為Y或F
<220>
<221> MISC_特性
<222> (4)..(4)
<223> Xaa可為N或Y
<220>
<221> MISC_特性
<222> (5)..(5)
<223> Xaa可為N、S、Q、R或Y
<210> 267
<211> 8
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (1)..(1)
<223> Xaa可為F或Q
<220>
<221> MISC_特性
<222> (4)..(4)
<223> Xaa可為N或Y
<220>
<221> MISC_特性
<222> (5)..(5)
<223> Xaa可為N、S、Q或R
<210> 268
<211> 8
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (1)..(1)
<223> Xaa可為F或Q
<220>
<221> MISC_特性
<222> (4)..(4)
<223> Xaa可為N或Y
<220>
<221> MISC_特性
<222> (5)..(5)
<223> Xaa可為N、S或Q
<210> 269
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (2)..(2)
<223> Xaa可為F、Y或H
<220>
<221> MISC_特性
<222> (3)..(3)
<223> Xaa可為T、Q、N、S、E、D、R或Y
<220>
<221> MISC_特性
<222> (4)..(4)
<223> Xaa可為F、Y或H
<220>
<221> MISC_特性
<222> (5)..(5)
<223> Xaa可為S、E、D、T或W
<220>
<221> MISC_特性
<222> (6)..(6)
<223> Xaa可為N、S、T、E、D、H、L、I、Y、R、K或G
<220>
<221> MISC_特性
<222> (7)..(7)
<223> Xaa可為Y、F或H
<220>
<221> MISC_特性
<222> (8)..(8)
<223> Xaa可為W、H、Y、A或G
<220>
<221> MISC_特性
<222> (9)..(9)
<223> Xaa可為M、E、Q或I
<220>
<221> MISC_特性
<222> (10)..(10)
<223> Xaa可為Y、F、H或N
<210> 270
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (3)..(3)
<223> Xaa可為T或E
<220>
<221> MISC_特性
<222> (5)..(5)
<223> Xaa可為S或E
<220>
<221> MISC_特性
<222> (6)..(6)
<223> Xaa可為N或S
<210> 271
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (6)..(6)
<223> Xaa可為N或S
<210> 272
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (1)..(1)
<223> Xaa可為S、A或T
<220>
<221> MISC_特性
<222> (2)..(2)
<223> Xaa可為I或V
<220>
<221> MISC_特性
<222> (3)..(3)
<223> Xaa可為T、H、N或S
<220>
<221> MISC_特性
<222> (4)..(4)
<223> Xaa可為P、N、F或M
<220>
<221> MISC_特性
<222> (5)..(5)
<223> Xaa可為N、I、D、Y或W
<220>
<221> MISC_特性
<222> (6)..(6)
<223> Xaa可為G或A
<220>
<221> MISC_特性
<222> (7)..(7)
<223> Xaa可為G、H、D、E、R、K、Y或S
<220>
<221> MISC_特性
<222> (8)..(8)
<223> Xaa可為N、Y、D、E、Q或H
<220>
<221> MISC_特性
<222> (9)..(9)
<223> Xaa可為T、K、E、S、I、A或D
<220>
<221> MISC_特性
<222> (10)..(10)
<223> Xaa可為Y、H或W
<220>
<221> MISC_特性
<222> (11)..(11)
<223> Xaa可為Y、F或H
<220>
<221> MISC_特性
<222> (12)..(12)
<223> Xaa可為P、V、L、D或S
<220>
<221> MISC_特性
<222> (13)..(13)
<223> Xaa可為D、E、Q或A
<220>
<22 > MISC_特性
<222> (14)..(14)
<223> Xaa可為S、A、N或D
<220>
<221> MISC_特性
<222> (15)..(15)
<223> Xaa可為V、D或T
<220>
<221> MISC_特性
<222> (16)..(16)
<223> Xaa可為K、N、D、S、E或Q
<210> 273
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (1)..(1)
<223> Xaa可為S或A
<220>
<221> MISC_特性
<222> (3)..(3)
<223> Xaa可為T或N
<220>
<221> MISC_特性
<222> (4)..(4)
<223> Xaa可為P或N
<220>
<221> MISC_特性
<222> (5)..(5)
<223> Xaa可為N或D
<220>
<221> MISC_特性
<222> (6)..(6)
<223> Xaa可為G或A
<220>
<221> MISC_特性
<222> (7)..(7)
<223> Xaa可為G、S或H
<220>
<221> MISC_特性
<222> (8)..(8)
<223> Xaa可為N、D或E
<220>
<221> MISC_特性
<222> (9)..(9)
<223> Xaa可為T、K、D或E
<220>
<221> MISC_特性
<222> (12)..(12)
<223> Xaa可為P、V或L
<220>
<221> MISC_特性
<222> (13)..(13)
<223> Xaa可為D或E
<220>
<221> MISC_特性
<222> (16)..(16)
<223> Xaa可為K或Q
<210> 274
<211> 17
<212> PRT
<223> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (1)..(1)
<223> Xaa可為S或A
<220>
<221> MISC_特性
<222> (3)..(3)
<223> Xaa可為T或N
<220>
<221> MISC_特性
<222> (4)..(4)
<223> Xaa可為P或N
<220>
<221> MISC_特性
<222> (5)..(5)
<223> Xaa可為N或D
<220>
<221> MISC_特性
<222> (6)..(6)
<223> Xaa可為G或A
<220>
<221> MISC_特性
<222> (7)..(7)
<223> Xaa可為G或S
<220>
<221> MISC_特性
<222> (8)..(8)
<223> Xaa可為N或E
<220>
<221> MISC_特性
<222> (9)..(9)
<223> Xaa可為T、K或D
<220>
<221> MISC_特性
<222> (12)..(12)
<223> Xaa可為P、V或L
<220>
<221> MISC_特性
<222> (13)..(13)
<223> Xaa可為D或E
<210> 275
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (1)..(1)
<223> Xaa可為S或A
<220>
<221> MISC_特性
<222> (5)..(5)
<223> Xaa可為N或D
<220>
<221> MISC_特性
<222> (6)..(6)
<223> Xaa可為G或A
<220>
<221> MISC_特性
<222> (7)..(7)
<223> Xaa可為G或S
<220>
<221> MISC_特性
<222> (8)..(8)
<223> Xaa可為N或E
<220>
<221> MISC_特性
<222> (9)..(9)
<223> Xaa可為T、K或D
<220>
<221> MISC_特性
<222> (12)..(12)
<223> Xaa可為P或V
<220>
<221> MISC_特性
<222> (13)..(13)
<223> Xaa可為D或E
<210> 276
<211> 12
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (1)..(1)
<223> Xaa可為G、S、A、T或D
<220>
<221> MISC_特性
<222> (2)..(2)
<223> Xaa可為H、K、R或Y
<220>
<221> MISC_特性
<222> (3)..(3)
<223> Xaa可為Y、H、F或S
<220>
<221> MISC_特性
<222> (4)..(4)
<223> Xaa可為Y、H、R或S
<220>
<221> MISC_特性
<222> (5)..(5)
<223> Xaa可為Y、H、W、F、R或S
<220>
<221> MISC_特性
<222> (6)..(6)
<223> Xaa可為T、N、V、I、S、A、G或Y
<220>
<221> MISC_特性
<222> (7)..(7)
<223> Xaa可為S、N、A、Q、D、G、R或Y
<220>
<221> MISC_特性
<222> (8)..(8)
<223> Xaa可為Y、W,H、F、G、D或N
<220>
<221> MISC_特性
<222> (9)..(9)
<223> Xaa可為S、A或G
<220>
<22 > MISC_特性
<222> (10)..(10)
<223> Xaa可為L、M、F或I
<220>
<22 > MISC_特性
<222> (11)..(11)
<223> Xaa可為G、A、Y、S或D
<220>
<221> MISC_特性
<222> (12)..(12)
<223> Xaa可為Y、N、S、F、E、D、H、I或V
<210> 277
<211> 12
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (2)..(2)
<223> Xaa可為H、R或Y
<220>
<22 > MISC_特性
<222> (3)..(3)
<223> Xaa可為Y或F
<220>
<221> MISC_特性
<222> (4)..(4)
<223> Xaa可為Y或S
<220>
<221> MISC_特性
<222> (5)..(5)
<223> Xaa可為Y或H
<220>
<221> MISC_特性
<222> (6)..(6)
<223> Xaa可為T、S或N
<220>
<221> MISC_特性
<222> (7)..(7)
<223> Xaa可為S或A
<220>
<221> MISC_特性
<222> (10)..(10)
<223> Xaa可為L、F或I
<220>
<221> MISC_特性
<222> (11)..(11)
<223> Xaa可為G、S或A
<220>
<221> MISC_特性
<222> (12)..(12)
<223> Xaa可為Y、H、N、S或F
<210> 278
<211> 12
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (2)..(2)
<223> Xaa可為H或Y
<220>
<221> MISC_特性
<222> (4)..(4)
<223> Xaa可為Y或S
<220>
<221> MISC_特性
<222> (5)..(5)
<223> Xaa可為Y或H
<220>
<221> MISC_特性
<222> (6)..(6)
<223> Xaa可為T、S或N
<220>
<221> MISC_特性
<222> (7)..(7)
<223> Xaa可為S或A
<220>
<221> MISC_特性
<222> (10)..(10)
<223> Xaa可為L或F
<220>
<221> MISC_特性
<222> (11)..(11)
<223> Xaa可為G或S
<210> 279
<211> 12
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (4)..(4)
<223> Xaa可為Y或S
<220>
<221> MISC_特性
<222> (6)..(6)
<223> Xaa可為T或S
<220>
<221> MISC_特性
<222> (10)..(10)
<223> Xaa可為L或F
<220>
<221> MISC_特性
<222> (11)..(11)
<223> Xaa可為G或S
<210> 280
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 281
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 282
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 283
<211> 16
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 284
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 285
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 286
<211> 16
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 287
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 288
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 289
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 290
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 291
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 292
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 293
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 294
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 295
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 296
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 297
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 298
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 299
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<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 300
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 301
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 302
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 303
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 304
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 305
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 306
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 307
<211> 12
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 308
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 309
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 310
<211> 16
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 311
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 312
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 313
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 314
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 315
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 316
<211> 14
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 317
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 318
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 319
<211> 13
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 320
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 321
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 322
<211> 12
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 323
<211> 14
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 324
<211> 8
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 325
<211> 12
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (6)..(6)
<223> Xaa可為S或D
<220>
<221> MISC_特性
<222> (8)..(8)
<223> Xaa可為Q或G
<210> 326
<211> 8
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (8)..(8)
<223> Xaa可為N或T
<210> 327
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (8)..(8)
<223> Xaa可為N或T
<220>
<221> MISC_特性
<222> (10)..(10)
<223> Xaa可為F或V
<220>
<221> MISC_特性
<222> (11)..(11)
<223> Xaa可為G或V
<210> 328
<211> 13
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (11)..(11)
<223> Xaa可為A或Y
<220>
<221> MISC_特性
<222> (13)..(13)
<223> Xaa可為N、H或S
<210> 329
<211> 14
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (12)..(12)
<223> Xaa可為A或Y
<220>
<221> MISC_特性
<222> (14)..(14)
<223> Xaa可為N、H或S
<210> 330
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (4)..(4)
<223> Xaa可為K、N或Q
<210> 331
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (8)..(8)
<223> Xaa可為N或S
<210> 332
<211> 12
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (5)..(5)
<223> Xaa可為A或V
<220>
<221> MISC_特性
<222> (8)..(8)
<223> Xaa可為K或S
<210> 333
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 334
<211> 8
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (8)..(8)
<223> Xaa可為N、D、T或A
<210> 335
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (8)..(8)
<223> Xaa可為N、D、T、或A
<210> 336
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 337
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 338
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 339
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 340
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (8)..(8)
<223> Xaa可為N或S
<210> 341
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 342
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 343
<211> 16
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 344
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 345
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (1)..(1)
<223> Xaa可為K或T
<220>
<221> MISC_特性
<222> (2)..(2)
<223> Xaa可為V或I
<220>
<221> MISC_特性
<222> (6)..(6)
<223> Xaa可為A或F
<210> 346
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 347
<211> 12
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (6)..(6)
<223> Xaa可為S或V
<220>
<221> MISC_特性
<222> (7)..(7)
<223> Xaa可為S或V
<210> 348
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 349
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (4)..(4)
<223> Xaa可為S、N、G或H
<210> 350
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 351
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 352
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 353
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 354
<211> 18
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 355
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 356
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 357
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 358
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 359
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 360
<211> 18
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 361
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 362
<211> 18
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 363
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 364
<211> 18
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 365
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 366
<211> 18
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 367
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 368
<211> 18
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 369
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 370
<211> 20
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 371
<211> 12
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 372
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 373
<211> 12
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 374
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 375
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 376
<211> 18
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 377
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (10)..(10)
<223> Xaa可為H或S
<210> 378
<211> 12
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (10)..(10)
<223> Xaa可為H或S
<210> 379
<211> 18
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 380
<211> 20
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 381
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 382
<211> 18
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (8)..(8)
<223> Xaa可為G或S
<210> 383
<211> 20
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (10)..(10)
<223> Xaa可為G或S
<210> 384
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<22 > MISC_特性
<222> (10)..(10)
<223> Xaa可為S、G或H
<210> 385
<211> 18
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (2)..(2)
<223> Xaa可為R、I或S
<210> 386
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
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<223> Xaa可為A或Y
<220>
<221> MISC_特性
<222> (9)..(9)
<223> Xaa可為I或M
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<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (6)..(6)
<223> Xaa可為G或Y
<210> 388
<211> 12
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<220>
<221> MISC_特性
<222> (8)..(8)
<223> Xaa可為N或Y
<210> 389
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 390
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 391
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 392
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<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 393
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 394
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<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 395
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 396
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<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 397
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<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
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<212> DNA
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<220>
<223> 合成構建體
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<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 400
<211> 639
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 401
<211> 1350
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
<210> 402
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<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
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<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
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<220>
<223> 合成構建體
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<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
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<220>
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<212> PRT
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<220>
<223> 合成構建體
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<223> 合成構建體
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<220>
<223> 合成構建體
<210> 410
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<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成構建體
Claims (25)
- 一種特異性結合人IL-33之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含下列(i)至(vi)中任一者:(i)選自由下列所組成之群組的CDR-L1:根據Kabat編號之SEQ ID NO:20、37、190、193、257、258、259和260,(ii)選自由下列所組成之群組的CDR-L2:根據Kabat編號之SEQ ID NO:21、196、199、261、262、263和264,(iii)選自由下列所組成之群組的CDR-L3:根據Kabat編號之SEQ ID NO:22、38、208、265、266、267和268,(iv)選自由下列所組成之群組的CDR-H1:根據Kabat編號之SEQ ID NO:16、33、269、270和271,(v)選自由下列所組成之群組的CDR-H2:根據Kabat編號之SEQ ID NO:17、34、168、171、174、180、202、205、211、214、217、220、223、226、229、232、235、272、273、274和275,及(vi)選自由下列所組成之群組的CDR-H3:根據Kabat編號之SEQ ID NO:18、35、114、119、122、127、130、133、136、139、142、145、148、153、156、159、177、187、276、277、278和279。
- 如申請專利範圍第1項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含SEQ ID NO:225之CDR-H1、CDR-H2和CDR-H3序列,及SEQ ID NO:207之CDR-L1、CDR-L2和CDR-L3序列。
- 如申請專利範圍第1項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含(i)包含根據Kabat編號之SEQ ID NO:20的CDR-L1,(ii)包含根據Kabat編號之SEQ ID NO:21的CDR-L2,(iii)包含根據Kabat編號之SEQ ID NO:208的CDR-L3,(iv)包含根據Kabat編號之SEQ ID NO:16的CDR-H1,(v)包含根據Kabat編號之SEQ ID NO:226的CDR-H2,及(vi)包含根據Kabat編號之SEQ ID NO:18的CDR-H3。
- 如申請專利範圍第1至3項中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含VL框架序列和VH框架序列,其中該VL框架序列和VH框架序列的一或二者與該抗體來源之人種系序列具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性,且其中該VL框架序列來 源之人種系VL序列係選自由下列所組成之群組:DPK9、DPK12、DPK18、DPK24、HK102_V1、DPK1、DPK8、DPK3、DPK21、Vg_38K、DPK22、DPK15、DPL16、DPL8、V1-22、Vλ共有序列、Vλ1共有序列、Vλ3共有序列、V K共有序列、V K1共有序列、V K2共有序列及V K3且其中該VH框架序列來源之人種系VH序列係選自由下列所組成之群組:DP54、DP47、DP50、DP31、DP46、DP71、DP75、DP10、DP7、DP49、DP51、DP38、DP79、DP78、DP73、VH3、VH5、VH1及VH4。
- 如申請專利範圍第1至3項中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含VH和VL,該VH包含與SEQ ID NO:225具有至少90%同一性的胺基酸序列且該VL包含與SEQ ID NO:207具有至少90%同一性的胺基酸序列。
- 如申請專利範圍第1至3項中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含VH和VL,該VH包含SEQ ID NO:225之胺基酸序列且該VL包含SEQ ID NO:207之胺基酸序列。
- 如申請專利範圍第1至3項中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含Fc結構域且其中該Fc結構域為IgA 1、gA 2、IgD、IgE、IgM、IgG 1、IgG 2、IgG 3或IgG 4之Fc結構域。
- 如申請專利範圍第7項之抗體或其抗原結合片段,其中該Fc為IgG 1者。
- 如申請專利範圍第1至3項中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含重鏈(HC)和輕鏈(LC),該HC包含與SEQ ID NO:244具有至少90%同一性的胺基酸序列,且該LC包含與SEQ ID NO:209具有至少90%同一性的胺基酸序列。
- 如申請專利範圍第1至3項中任一項之抗體或其抗原結合片段,該抗體包含重鏈(HC)和輕鏈(LC),該HC包含SEQ ID NO:244之胺基酸序列且該LC包含SEQ ID NO:209之胺基酸序列。
- 一種抗體或其抗原結合片段,該抗體包含由寄存於ATCC且具有ATCC登錄編號為PTA-122724之質體編碼的VH序列及由寄存於ATCC且具有ATCC登錄編號為PTA-122725之質體編碼的VL序列。
- 一種抗體或其抗原結合片段,該抗體與如申請專利範圍第1至11項中任一項之抗體或其抗原結合片段競爭與人IL-33結合。
- 一種抗體或其抗原結合片段,該抗體與下列群組之一或多者競爭與人IL-33結合:7E8_嵌合體、9B3_嵌合體、9B3_嵌合體_huJseg、7E8 CDR移植物、IL33-10、9B3 CDR移植物、9B3_1、9B3_2A、9B3_2B、9B3_3、9B3_5、9B3_79B3_13、9B3_15、9B3_17、9B3_22、9B3_31V2、9B3_36、9B3_79、9B3_124、9B3_162、7E8H/9B3K、9B3_563、IL33-11、IL33-12、IL33-13、IL33-45、IL33-55、IL33-56、IL33-57、IL33-58、IL33-61、IL33-62、IL33-68、IL33-74、IL33-75、IL33-80、IL33-81、IL33-103、IL33-117、IL33-136、IL33-153、IL33-154、IL33-155、IL33-156、IL33-157、IL33-158、IL33-167、IL33-168、IL33-169、IL33-170、IL33-171、IL33-172、IL33-175、IL33-186、IL33-187、IL33-188、IL33-158-152、IL33-167-153、IL33-158LS及IL33-167LS。
- 如申請專利範圍第1至3及11至13項中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體或其抗原結合片段以約為或低於選自由下列所組成之群組的K D值與人IL-33結合:約10nM、5nM、2nM、1nM、900pM、800pM、700pM、600pM、500pM、400pM、300pM、250pM、200pM、150pM、100pM、50pM、40pM、30pM、25pM、20pM、15pM、10pM、5pM及1pM。
- 如申請專利範圍第1至3及11至13項中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體或其抗原結合片段以約為或低於選自由下列所組成之群組的K D值與食蟹猴IL-33結合:約10nM、5nM、2nM、1nM、900pM、800pM、700pM、600pM、500pM、400pM、300pM、250pM、200pM、150pM、100pM、50pM、40pM、30pM、25pM、20pM、15pM、13pM、10pM、5pM及1pM。
- 如申請專利範圍第1至3及11至13項中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體或其抗原結合片段與食蟹猴IL-33結合之K D值係在與人IL-33結合之K D值的10倍之內。
- 如申請專利範圍第1至3及11至13項中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體或其抗原結合片段與活性IL-33結合之K D值低於與無活性IL-33結合之K D值。
- 如申請專利範圍第1至3及11至13項中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中在人體中終末半衰期為至少約31天。
- 一種經分離之核酸分子,其包含:(i)一或多個編碼如申請專利範圍第1至18項中任一項之抗體或其抗原結合片段之核苷酸序列;或者(ii)如SEQ ID NO:398、399、400和401之一或多者 所示之核酸序列;或者(iii)寄存於ATCC且具有登錄編號PTA-122724或登錄編號PTA-122725之核酸分子的編碼序列。
- 一種載體,其包含如申請專利範圍第19項之核酸分子。
- 一種宿主細胞,其包含如申請專利範圍第19項之核酸分子或如申請專利範圍第20項之載體。
- 一種製造抗體或其抗原結合片段之方法,其包含在該抗體或其抗原結合片段係由如申請專利範圍第21項之宿主細胞表現之條件下培養該宿主細胞。
- 一種醫藥組成物,其包含如申請專利範圍第1至18項中任一項之抗體或其抗原結合片段及醫藥上可接受之載體或賦形劑。
- 一種如申請專利範圍第1至18項中任一項之抗體或其抗原結合片段於製備用於治療醫療病症的藥物之用途。
- 如申請專利範圍第24項之用途,其中該醫療病症係選自由下列所組成之群組:發炎性腸病、過敏症、過敏性鼻炎、過敏性結膜炎、春季型角膜結膜炎(vernal keratoconjunctivitis)、季節性過敏、寵物過敏、哮喘、食物過敏、花生過敏、異位性皮膚炎、慢性鼻竇炎伴鼻息肉(CRSwNP)、過敏性鼻炎、支氣管炎、慢性阻塞性肺病(COPD)、呼吸系統疾病病毒性惡化、兒童和成人之病毒感染(呼吸道融合病毒(RSV)、鼻病毒、流行性感冒)、蕁麻疹(urticarias)、嗜酸性粒細胞食道炎、慢性纖維化、肝纖維化、非酒精性脂肪性肝炎(NASH)、慢性腎臟病、特發性肺纖維化(IPF)、硬皮病、系統性硬化症、急性腎損傷、敗血症、胰臟炎、第1型糖尿病、移植物抗宿主病(GVHD)、組織移植、阿玆海默氏症、類風濕性關節炎:腸易激症候群(IBS)、克隆(Crohn)氏病、潰瘍性結腸炎、多發性硬化症、牛皮癬、乳糜瀉及雷諾(Raynaud)氏病或徵候。
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