TW201716374A - 化合物及方法 - Google Patents
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Abstract
揭示的是具有下式的化合物:□其中R1、R2與R3係如本案所定義,及其製備與使用方法,包括作為BMP1、TLL1及/或TLL2的抑制劑及在治療和BMP1、TLL1及/或TLL2活性相關的疾病的用途。
Description
本發明關於抑制BMP1(亦已知為BMP-1、第1型骨形成蛋白(bone morphogenic protein 1)、第1型骨形態發生蛋白(bone morphogenetic protein 1)、膠原蛋白原C-蛋白酶、與膠原蛋白原C-內肽酶)、第1型特洛德樣(Tolloid-like 1)(TLL1)及/或第2型特洛德樣(TLL2)金屬蛋白酶,包括同功異型體,尤其是RNA剪接變異體所編碼的多種同功異型體的化合物,及其製備與使用方法。明確地說,本發明關於作為BMP1、TLL1及/或TLL2抑制劑的反向異羥肟酸(reverse hydroxamate)化合物。
纖維狀膠原蛋白為細胞外基質的構成部分,其支持組織完整性並維持用於正常生理功能的細胞微環境。第I-III型膠原蛋白一纖維狀膠原蛋白家族的主要同功異型體一被合成為含有N-端與C-端原肽的膠原蛋白原前驅物。該膠原蛋白原係藉由脯胺酸羥基化進行轉譯後改質,並分泌至血管周圍空間供進一步加工。膠原蛋白的N-端原肽後續被ADAMTS(A Distintegrin And Metalloprotease with ThromboSpondin repeats)(帶有血小板反應蛋白重複的解聚素和金屬蛋白酶)家族的蛋白酶切割,而C-端原肽則被包括BMP1、TLL1與TLL2的特洛德家族金屬蛋白酶加工(Hopkins,D.R.et al.,Matrix Biology,2007,26,508-523)。N-端與C-端原肽的切割係使得膠原蛋白進一步成熟,導致離胺酸殘基交聯並形成不溶的原纖維結構(Shoulders,M.D.et al.,Annual
Review of Biochemistry,2009,78,929-958)。
儘管BMP1、TLL1與TLL2蛋白是由分別的基因所編碼,此家族亦包括BMP1的同功異型體,包括BMP1的多種同功異型體,該等是由相同基因產物的選擇性剪接得到(參閱譬如Takahara,K.,et al.,The Journal of Biological Chemistry,1994,269.32572-32578;以及Cvetjeticanin,B.et al.,Medical Hypotheses,2014,83,656-658)。BMP1的原始發現形式被命名為BMP-1-1或BMP1-1。剪接變異體RNA轉錄本所編碼的其他BMP1同功異型體已說明位於轉錄級別並以依序字尾命名,譬如BMP-1-2、BMP-1-3、BMP-1-4、BMP-1-5、BMP-1-6、與BMP-1-7(參閱譬如Wozney et al.,Science(1988),242:1528-1534;Kessler et al.,Science,(1996)271:360-362;Li et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA(1996),93:5127-5130;Janitz et al.,J.Mol.Med.(1998),76:141-146;Takahara et al.,J.Biol.Chem.(1994),269:32572-32578;以及Ge and Greenspan,Birth Defect Res.(2006),78:47-68)。
亦確認蛋白級別的眾多BMP1同功異型體在各種疾病患者及在健康人類的血液中循環(參閱譬如國際專利申請案號WO2008/011193 A2與WO2013/163479 A1、與Grgurevic et al.,J.Am.Soc.Nephrol.(2011),21:681-692)。此外,BMP1在各種疾病當中加工膠原蛋白原導致纖維化與疤痕組織形成的角色以及在各種疾病患者身上發現包含個別BMP1同功異型體的血液圖譜已使BMP 1成為開發新療法的有吸引力的目標(參閱譬如WO2008/011193 A2;WO2013/163479 A1;Grgurevic et al.,J.Am.Soc.Nephrol.(2011),21:681-692,Cvetjeticanin,B.et al.,Medical Hypotheses,2014,83,656-658;以及Turtle et al.,Expert Opin.Ther.Patents(2004),14(8):1185-1197)。
就TLL1而言,可能存在高達六個理論的RNA剪接變異體
(www.ensembl.org;基因識別碼ENSG00000038295)並已報導至少兩個表現蛋白(www.uniprot.org,基因識別碼O43897)。已報導編碼TLL2之基因的三個RNA剪接變異體(www.ensembl.org;基因識別碼ENSG00000095587),其中一個被認為編碼功能性蛋白(www.uniprot.org,基因識別碼Q9Y6L7)。
細胞外基質(ECM)蛋白,包括膠原蛋白的過度產生可能導致各種器官或組織的纖維化病變,其可和增加的組織剛性、實質性置換、失常的電導度、硬化性傷口癒合(例如梗塞與燒傷)、及/或異常的細胞-細胞交互作用相關。舉例來說,在下列的患者持續觀察到增加的纖維化與膠原蛋白產生:急性和慢性心臟疾病,譬如心臟衰竭、心律不整、肥厚型心肌病變、與心肌梗塞(Lopez,B.et al.,Circulation,2010,121,1645-1654;Ho,C.Y.,et al.,New England Journal of Medicine,2010,363,552-563;Kostin,S.et al.,Cardiovascular Research,2002,54,361-379;參閱F.,et al.,Current Pharmaceutical Design,2005,11,477-487;Cvetjeticanin,B.et al.Medical Hypotheses,2014,83,656-658)、慢性阻塞性肺病(“COPD”)(Salazar,L.M.,et al.,Lung,2011,189,101-109)、肝硬化與非酒精性脂肪肝(“NASH”)(Bataller、R.,et al.,Journal of Clinical Investigation,2005,115,209-218)、特發性肺纖維化(Chakraborty,S,et al.,Expert Opin Investig Drugs,2014,23,893-910)、膠原血管疾病,譬如全身性紅斑狼瘡、類風濕關節炎與硬皮病(Eckes,B.,et al.,J Mol Med,2014,92,913-924)、肌肉失養症(譬如Serrano,A.C.,et al.,Experimental Cell Research,2010,316,3050-3058;Klingler,W.,et al.,Acta Myoligica,XXXI,2012,184-195)、慢性腎病(Liu,Y.,Nature Reviews Nephrology,2011,7,684-696)、急性腎損傷(Molitoris,B.,The Journal of clinical Investigation,2014,124,2355-2363;Venkatachalam,M.A.et al.,Am J Physiol Renal Physiol 298:F1078-F1094,2010)、糖尿病性腎臟病變(Sun,
Y.M.,et a.,Biochemical and Biophysical Research Communications,2013,433,359-361)、瘢瘤、傷口癒合、沾黏、肥厚以及譬如和燒傷、手術與其他創傷相關的其他疤痕(Meier K.,et al.,Expert Opinion on Emerging Drugs,2006,11,39-47;Malecaze,F.,et al.,Investigative Opthalmology and Visual Science,2014,55,6712-6721;van der Weer,W.et al.,Burns,2009,35,15-29)、中風、多發性硬化與脊髓損傷(Fernández-Klett,F.and Piller,J.Brain Pathology,2014,24,404-13;Rimar,D.et al.,Arthritis & Rheumatology,Vol.66,No.3,March 2014,726-730)。因此,藉由靶向(多個)BMP1、TLL1及/或TLL2途徑來減少過度膠原蛋白產生與成熟可為治療纖維化病變,例如該等疾病的有效治療策略。此係受到在小型動物的心臟與腎臟疾病模型使用抑制BMP1、TLL1及/或TLL2活性的藥劑的新近發表研究支持(Grgurevic,L.,et al.,Joumal of the AmericanSociety of Nephrology,2011,21,681-692;He,W.,et al.,Proceedings of the National Academy of Sciences,2010,107,21110-21115;Cvetjeticanin,B.et al.,Medical Hypotheses,2014,83,656-658;國際專利申請案號WO2008/011193 A2與WO2013/163479 A1)。
特洛德家族的金屬蛋白酶(BMP1、TLL1與TLL2)在膠原蛋白之外具有另外的受質,其亦可有助於它促進ECM蛋白產生的角色。舉例來說,已顯示第1型離胺醯基氧化酶(LOX1)的原型為BMP1的受質,被BMP1切割而增強該LOX酶活性,藉此引發膠原蛋白交聯(Uzel,M.I.,et al.,Journal of Biological Chemistry,2001,276,22537-22543)。於是,BMP1亦經由此機制,舉例來說,在青光眼(Tovar-Vidales,T.,et al.,Investigative Ophthalmology & Visual Science,2013,54,4741-4748)及在心臟舒張功能障礙(López,B.,et al.,American Journal of Physiology-Heart and Circulatory Physiology,2010,299,H1-H9)的病理組織剛性發展中具有一定角色。BMP1亦切割另外的膠原蛋
白,譬如影響原纖維尺寸與形狀的膠原蛋白原V與XII,還有非原纖維狀膠原蛋白原VII(Hopkins,D.R.et al.,Matrix Biology,2007,26,508-523)。亦已顯示休眠型TGF-貝他結合蛋白(LTBP)被BMP1切割,使得TGF-貝他的作用增強,引發進一步的膠原蛋白產生(Ge,G.,et al.,Journal of Cell Biology,2006,175,111-120)。TGF-貝他受到BMP1的調控亦可在其他病理扮演角色,例如控制癌細胞轉移與侵襲(Wu,X.,et al.Oncogene,2014,33,1506-1514)。同樣地,BMP1、TLL1及/或TLL2亦藉由蛋白分解方式加工交互作用的蛋白來活化更廣大範圍的其他TGF-貝他樣分子,例如BMPs2與4(Hopkins,D.R.et al.,Matrix Biology,2007,26,508-523)。BMP1及其各式受質的組合作用表明了BMP1、TLL1與TLL2為組織ECM產生/成熟的關鍵調控劑以及特洛德家族的金屬蛋白酶成員是抗纖維化治療干預的特別有效目標。
BMP1、TLL1與TLL2亦可經由另外的受質加工影響其他生物途徑。尤其,彼等可經由促進肌肉生長抑制素(myostatin)的活化影響肌肉生物學。肌肉生長抑制素為負向調控肌肉生長的激素(Lee,S.J.,2004,Annual Review of Cell & Developmental Biology,20,61-86)。已證實BMP1切割肌肉生長抑制素的抑制型原肽,於是增強肌肉生長抑制素活性(Wolfman N.M.,et al.,Proceedings of the National Academy of Sciences,2003,100,15842-15846)。剔除小鼠的TLL2證實增強的肌肉質量,藉此為金屬蛋白酶與肌肉生長抑制素之間的連結提供支持(Lee,S.J.,PLoS one,2008,3,e1628)。BMP1、TLL1及/或TLL2的抑制劑因此可有益於肌肉功能或肌肉質量減少的疾病,包括肌營養不良症、肌少症(sarcopenia)、以及和譬如心臟衰竭、CKD、COPD、癌症或老年相關的惡病質。
總而言之,BMP1、TLL1與TLL2的生物學為彼等在膠原蛋白加工、組裝與交聯,進而形成維持組織完整性與合宜細胞微環境的原纖維狀膠原蛋
白網絡的關鍵角色提供有力的支持。此蛋白家族在,舉例來說,發生在心臟、肺、骨骼肌、腎、肝、皮膚、血管系統、神經系統、與眼的纖維性病況的病因學亦可扮演重要角色,該等金屬蛋白酶的抑制劑可提供廣大效益,作為用於治療下列和纖維化相關的疾病的抗纖維化劑,例如心肌梗塞、心臟衰竭、心律不整、肥厚型心肌病變、慢性腎病(CKD)、後急性腎損傷、糖尿病性腎臟病變、移植後延遲移植物功能、慢性阻塞性肺病(COPD)、特發性肺纖維化(IPF)、肝硬化、非酒精性脂肪肝(NASH)、肌肉失養症(譬如裘馨氏(Duchenne)、貝克氏(Becker)、肢帶型(limb-girdle)、先天型、顏面肩胛肱骨型、肌強直型、眼咽型、遠端型、與艾瑞二氏(Emery-Dreifuss))、青光眼、角膜疤痕、瘢瘤、傷口癒合、沾黏、肥厚性疤痕以及譬如和燒傷、手術與其他創傷相關的其他疤痕、中風、膠原血管疾病,例如全身性紅斑狼瘡、類風濕關節炎與硬皮病、脊髓損傷與多發性硬化。而且,基於對肌肉生長抑制素生物學的影響,BMP1、TLL1與TLL2抑制劑可具有在肌肉疾病的另外治療應用,尤其是肌肉失養症(譬如裘馨氏(Duchenne)、貝克氏(Becker)、肢帶型、先天型、顏面肩胛肱骨型、肌強直型、眼咽型、遠端型、與艾瑞二氏(Emery-Dreifuss))、肌少症、以及和譬如心臟衰竭、CKD、COPD、癌症或老年相關的惡病質。
在一態樣中,本發明關於式(I)化合物:
(I)及彼等的鹽,其中:W1、W2、W3與W4之一或兩者為N且其餘為CRa,或W1、W2、W3與W4之各者為CRa,其中各個Ra為H,或一個Ra選自F、CF3、與CO2H,且其餘為H;R1選自H、(C1-C4)直鏈烷基、與被一個羥基取代的(C1-C4)直鏈烷基;R2選自H、(C1-C11)烷基、(C1-C3)烷基(C3-C6)環烷基、(C1-C3)烷基-苯基、(C1-C3)烷基-萘基、與(C1-C3)烷基-雜環基,其中雜環基為具有5-6個環原子的單環,其中1-2個環原子係選自氮、氧與硫,且,其中該(C1-C11)烷基、(C1-C3)烷基(C3-C6)環烷基、(C1-C3)烷基-苯基、(C1-C3)烷基-萘基、與(C1-C3)烷基-雜環基係任擇地被獨立地選自(C1-C4)烷基、(C1-C4)烷氧基、鹵基、與氰基的1-2個基團取代;R3選自苯基與雜芳基,其中該苯基與雜芳基係任擇地被獨立地選自下列的1-3個基團取代:(C1-C6)烷基,其任擇地被獨立地選自下列的1-3個基團取代:氟(譬如-CF3);-CO2H;-P(O)RfRg;NRaRb,其中Ra選自H與(C1-C4)烷基且Rb選自(C1-C4)烷基,其被1-3個-CO2H或-P(O)RfRg取代;以及-C(O)NRaRb,其中Ra與Rb係獨立地選自H與(C1-C4)烷基,其中該(C1-C4)烷基係任擇地被獨立選自下列的1-3個基團取代:羥基、-CO2H、-C(O)O(C1-C4)烷基與-P(O)RfRg;環丙基,其任擇地被1個-CO2H取代;-C(O)NRaRb,其中Ra與Rb係獨立地選自H與(C1-C4)烷基,其中該(C1-C4)烷基係任擇地被獨立選自下列的1-3個基團取代:羥基、-CO2H、-C(O)O(C1-C4)烷基、-P(O)RfRg、NRcRd與N+ RcRdRe;
(C1-C6)烷氧基,其任擇地被獨立選自下列的1-3個取代基取代:鹵基、羥基、-CO2H、(C3-C6)環烷基、-C(O)NH2與吡咯啶基;四氫吡咯基;(C3-C6)環烷氧基,其任擇地被獨立選自下列的1-3個取代基取代:鹵基、羥基、與-CO2H;-NRaRb,其中Ra與Rb係獨立地選自H與(C1-C4)烷基,其中該(C1-C4)烷基係任擇地被獨立選自下列的1-3個基團取代:酮基與-CO2H;-SRa,其中Ra選自H與(C1-C4)烷基;-CO2H;-C(NOH)NH2;氰基;-C(O)O(C1-C4)烷基;-C(O)CO2H;-P(O)RfRg;-OP(O)RfRg;鹵基;羥基;硝基;-NHSO2(C1-C2)烷基;-SO3H;-SO2(C1-C2)烷基;-SO2NRcRd;-SO2NHC(O)(C1-C2)烷基;-B(OH)2;以及酮基;其中在各種情況中:Rc、Rd與Re係獨立地選自H與(C1-C2)烷基;以及Rf與Rg係獨立地選自羥基、(C1-C2)烷基與(C1-C2)烷氧基;以及n為0或1。
根據式(I)之化合物,或彼等的鹽,尤其是藥學上可接受之鹽為BMP1、TLL1及/或TLL2的抑制劑。
據此,本發明亦關於一種抑制BMP1、TLL1及/或TLL2的方法,該方法包含以根據式(I)之化合物,或彼等的鹽,尤其是藥學上可接受之鹽接觸包含該(多個)蛋白的一生物材料。
本發明再關於一種在需要接受治療之一個體(譬如人類或其他哺乳動物,尤其是人類)治療和BMP1、TLL1及/或TLL2活性相關的疾病的方法,該方法包括,舉例來說,治療BMP1、TLL1及/或TLL2之抑制係具治療效益的疾病,該方法包含投予該個體以一治療有效量的根據式(I)之化合物、或彼等的藥學上可接受之鹽。本發明亦提供一種用於療法的式(I)化合物、或彼
等的藥學上可接受之鹽,譬如在治療和BMP1、TLL1及/或TLL2活性相關的疾病時作為活性治療物質。本發明亦提供一種式(I)化合物、或彼等的藥學上可接受之鹽在製備用於治療和BMP1、TLL1及/或TLL2活性相關的疾病之醫藥品的用途。本發明再指涉一種藥學組成物,其包含根據式(I)之化合物、或彼等的藥學上可接受之鹽,以及一或多個藥學上可接受之賦形劑。尤其,本發明係指涉一種用於治療和BMP1、TLL1及/或TLL2活性相關的疾病的藥學組成物,其中該組成物包含根據式(I)之化合物、或彼等的藥學上可接受之鹽,以及一或多個藥學上可接受之賦形劑。
在一些具體例中,該和BMP1、TLL1及/或TLL2活性相關的疾病是選自該等和身體器官或組織的病理性纖維化病況相關的疾病,譬如下列的此類病況:心臟(譬如心肌梗塞(“MI”)、心臟衰竭(譬如射血分率減少之心臟衰竭、射血分率正常之心臟衰竭)、心律不整(譬如心房顫動)、肥厚型心肌病變)、肺(譬如慢性阻塞性肺病(“COPD”)、特發性肺纖維化(“IPF”))、腎(譬如糖尿病性腎臟病變、後急性腎損傷、慢性腎病(“CKD”)、移植後延遲移植物功能)、肝(譬如肝硬化、非酒精性脂肪肝(“NASH”))、眼(譬如青光眼、角膜疤痕)、骨骼肌(譬如肌營養不良症,包括裘馨氏、貝克氏、肢帶型、先天型、顏面肩胛肱骨型、肌強直型、眼咽型、遠端型、與艾瑞二氏)、皮膚(譬如瘢瘤、傷口癒合、沾黏、肥厚性疤痕以及譬如和燒傷、手術與其他創傷相關的其他疤痕),該血管系統(譬如中風、與膠原血管疾病,例如全身性紅斑狼瘡、類風濕關節炎與硬皮病)、與神經系統(譬如脊髓損傷、多發性硬化)。在一些具體例中,該和BMP1、TLL1及/或TLL2活性相關的疾病是選自特徵在於減少的肌肉功能和/或質量的肌肉疾病,譬如肌肉失養症(譬如裘馨氏、貝克氏、肢帶型、先天型、顏面肩胛肱骨型、肌強直型、眼咽型、遠端型、與艾瑞二氏)、肌少症、以及和譬如心臟衰竭、CKD、COPD、癌症或老年
相關的惡病質。
本發明的其他態樣將依照本揭示內容來理解。
在說明書通篇所提供的式(I)的各式基團與取代基基團的另擇定義係意圖特定個別地說明本案揭示的各個化合物物種,還有一或多個化合物物種的群組。本發明的範疇包括該等基團與取代基基團定義的任何組合。熟習此藝者將理解到本發明化合物僅為該等預期是「化學穩定」的化合物。
如本案所用,術語「烷基」代表可為直鏈或支鏈的飽和碳氫部分,除非另有述明。術語「C1-C2烷基」、「C1-C3烷基」、「C1-C4烷基」、「C1-C6烷基」、與「C1-C11烷基」指的是分別含有1-2、1-3、1-4、1-6、或1-11個碳原子的烷基團或部分。例示性烷基包括,但不限於甲基(Me)、乙基(Et)、正丙基、異丙基(iPr)、正丁基、二級丁基、異丁基、三級丁基、戊基(亦已知為正戊基)、與2-乙基丁基,還有己基、庚基、辛基、壬基、癸基和十二基,包括該等基團的支鏈異構物。
如本案所用,術語「環烷基」指的是非芳香、飽和、環狀碳氫環部分。術語「(C3-C6)環烷基」指的是具有三至六個環碳原子的非芳香環狀碳氫環部分。例示性「(C3-C6)環烷基」基團包括環丙基、環丁基、環戊基、與環己基。
「烷氧基」指的是經由氧聯結原子接附的烷基。術語「(C1-C4)烷氧基」與「(C1-C6)烷氧基」指的是分別含有1-4或1-6個碳原子、經由氧聯結原子接附的直-或支-鏈烴基。「(C1-C4)烷氧基」與「(C1-C6)烷氧基」可分別另稱為-O(C1-C4烷基)與-O(C1-C6烷基)。例示性烷氧基包括,但不限於,甲氧基、乙氧基、正丙氧基、異丙氧基、正丁氧基、二級丁氧基,異丁氧基、三級丁氧基、戊氧基、和己氧基,包括該等基團的支鏈異構物。
「環烷氧基」指的是經由氧聯結原子接附的環烷基。術語「(C3-C6)環
烷氧基」指的是具有3至6個環碳原子、經由氧聯結原子接附的環烷基。「(C3-C6)環烷氧基」可另稱為-O(C3-C6)環烷基。例示性環烷氧基包括環丙基氧基、環丁基氧基、環戊基氧基、與環己基氧基。
雜環基(heterocyclic)(或稱作雜環基(heterocyclyl))基團或部分為具有由至少兩個不同元素(碳與氮、氧及/或硫之一或多者)構成的環成員原子的單-或雙-環基團或部分。該(多)環可為飽和或部分不飽和(非芳香)或完全不飽和(芳香)。雜環基涵蓋雜環烷基與雜芳基。舉例來說,雜環基可為具有5-10個環原子(即「5-10員」)的環狀基團或部分,其中1-4個環原子為選自氮、氧與硫的雜原子,譬如具有5-6個環原子的單環,其中1-2個環原子為選自氮、氧與硫的雜原子,或具有9-10個環原子的雙環,其中1-4個環原子為選自氮、氧與硫的雜原子。
「雜環烷基」代表具有5-6個環原子的飽和或部分不飽和非芳香族、單環基之基團或部分,其中1-2個環原子為選自氮、氧與硫的雜原子。雜環烷基的示範例包括,但不限於,哌啶基(piperidyl)(或哌啶基(piperidinyl))、哌嗪基、嗎啉基、四氫呋喃基(tetrahydrofuryl)(或四氫呋喃基(tetrahydrofuranyl))、四氫吡喃基、四氫噻吩基、與硫基嗎啉基,包括前述部分的各式位置異構物。
「雜芳基」指的是單-或雙-環基團或部分,其中至少一環為芳香族,具有5-10個環原子,其中1-4個環原子為選自氮、氧與硫的雜原子。在雙環雜芳基中,至少一環為芳香族而其他環可為芳香族、或飽和或不飽和非芳香族,至少一環為雜環基,其他環可為雜環基或碳環。於是,此術語涵蓋但不限於含有至少一芳香碳環或雜環部分的雙環雜環基化合物,譬如稠合至雜環烷基環部分的苯環部分。雜芳基的示範例包括,但不限於,噻吩基、吡咯基、咪唑基、吡唑基、呋喃基(furyl)(或呋喃基(furanyl)、異噻唑基、異
噁唑基、噁唑基、噁二唑基、噻唑基、吡啶基(pyridyl)(或吡啶基(pyridinyl))、吡嗪基、嘧啶基、噠嗪基、三嗪基、三唑基、四唑基、吲唑基、苯并噻吩基、苯并呋喃基、苯并噻唑基、苯并咪唑基、苯并噁唑基、苯并噁唑基、苯并噻二唑基、苯并三唑基、2,3-二氫苯并異噻唑基、與1,1-二氧橋基-2,3-二氫苯并異噻唑基(譬如1,1-二氧橋基-2,3-二氫苯并[d]異噻唑基),包括前述部分的各式位置異構物。
當提到特定的雜環基、雜烷基或雜芳基(譬如吡啶基)時,意圖的是涵蓋各式位置異構物的任何一者(譬如2-吡啶基、3-吡啶基等)。
在一些具體例中,本發明之化合物包含了包含至少一個氮環原子的5-員或6-員單環雜芳基,譬如本案特別揭示的此類基團。所選擇的5-員雜芳基含有一個氮,任擇地含有一個氧環原子或1、2或3個額外的氮環原子。所選擇的6-員雜芳基含有1、2、或3個氮環雜原子。
在其他具體例中,本發明之化合物包含9-員或10-員雙環雜芳基,譬如本案特別揭示的此類基團。所選擇的9-10員雜芳基含有一個氮、氧或硫環雜原子,任擇地含有1、2、或3個額外的氮環原子。
欲被理解的是,術語雜環基、雜芳基、與雜環烷基係意圖涵蓋穩定的雜環基,其中一環氮雜原子任擇地被氧化(譬如含有N-氧化物的雜環基,譬如吡啶-N-氧化物),或其中一環硫雜原子任擇地被氧化(譬如含有碸或亞碸部分的雜環基,譬如四氫噻吩基-1-氧化物[四氫噻吩基亞碸]、四氫噻吩基-1,1-二氧化物[四氫噻吩基碸],或1,1-二氧橋基-2,3-二氫苯并異噻唑基[譬如1,1-二氧橋基-2,3-二氫苯并[d]異噻唑基])。
當術語「烷基」係用於和其他基團組合時,譬如「(C1-C3)烷基-(C3-C6)環烷基」、「(C1-C3)烷基-苯基」與「(C1-C3)烷基-雜環基」,該烷基部分係意圖涵蓋二價直或支-鏈烴基且該環烷基、苯基、與雜環基部分係如本案所
定義。舉例來說,在「(C1-C3)烷基-苯基」中,它的(C1-C3)烷基部分為聯結至芳族基團苯基的二價直或支-鏈碳基,並由出現在苄基(-CH2-苯基)的鍵結配置代表。此類基團的特定例子包括(環戊基)甲基、2-苯基乙基、3-苯基丙基、與2-萘基乙基。
「酮基」代表雙鍵氧部分;舉例來說,假使直接接附至碳原子係形成羰基部分(C=O)。術語「鹵素」與「鹵基(halo)」代表氯、氟、溴或碘取代基。「羥基(hydroxy)」或「羥基(hydroxyl)」係意圖指稱-OH基。「氰基」意指-CN基。「硝基」意指-NO2基。“COO”與“CO2”可互換使用(譬如COOH與CO2H;COOEt與CO2Et分別可互換)。PO3H2與P(O)(OH)2可互換使用。
在指定數值範圍,譬如碳數量範圍或雜原子數量範圍時,該範圍係意圖涵蓋對應於該範圍內特定整數的特定具體例,還有在最廣義的範圍內的任何整數範圍。
如本案所用,術語「本發明的(多個)化合物(compound(s)of the invention)」或「本發明的(多個)化合物(compound(s)of this invention)」意指上文所定義、呈任何形式的式(I)化合物(包括更特定的具體例),即,任何鹽或非鹽形式(譬如游離酸或鹼形式,或鹽,尤其是彼等的藥學上可接受之鹽)及其任何物理形式(譬如包括非固體形式(譬如液體或半固體形式)、與固體形式(譬如非晶或晶質形式、特殊多形態形式、溶劑合物形式,包括水合物形式(譬如單-、二-與半水合物))、與各式形式的混合物。
據此,包括在本發明內的是本案定義的式(I)化合物(包括更特定的具體例),其呈現彼等的任何鹽或非鹽形式與任何物理形式、以及各種形式的混合物。儘管此等係包括在本發明內,將理解到本案定義的式(I)化合物一呈現彼等的任何鹽或非鹽形與任何物理形式一可具有多變的活性位準、不同的生體可用率與用於調配目的的不同操作特性。
如本案所用,術語「任擇地被取代」指示一基團、環或部分(例如烷基、環烷基、烷氧基、環烷氧基,雜環烷基、苯基、雜芳基、碳環或雜環基團、環或部分)可未被取代,或該基團、環或部分可如定義般被一或多個(多個)取代基。在不止一個基團、環或部分可被眾多另擇(多個)取代基取代的情況中,各別基團、環或部分的選定(多個)取代基可相同或不同,即(多個)取代基係獨立地為各別基團、環或部分選擇。在不止一個取代基係選自眾多可能的取代基時,該等取代基可相同或不同,即該取代基係獨立地選擇。
如本案所用,術語「一(a)」、「一(an)」與「該(the)」係意圖包括所指示部分的一或多者,除非另有指示。
如本案所用,「BMP1、TLL1及/或TLL2」涵蓋BMP1、TLL1與TLL2的一或多者,包括彼等的同功異型體(尤其包括RNA剪接變異體所轉錄的同功異型體)。於是,舉例來說,如本案所用BMP1可包括同功異型體BMP-1-1、BMP-1-2、BMP-1-3、BMP-1-4、BMP-1-5、BMP-1-6、與BMP-1-7的一或多者。
所有文獻/出版品皆以參照方式整體併入本揭示內容。
在一態樣中,本發明係指涉一種式(I)化合物:
或彼等的鹽,其中:W1、W2、W3與W4之一或兩者為N且其餘為CRa,或W1、W2、W3與W4
之各者為CRa,其中各個Ra為H,或一個Ra選自F、CF3、與CO2H、且其餘為H;R1選自H、(C1-C4)直鏈烷基、與被一個羥基取代的(C1-C4)直鏈烷基;R2選自H、(C1-C11)烷基、(C1-C3)烷基(C3-C6)環烷基、(C1-C3)烷基-苯基、(C1-C3)烷基-萘基、與(C1-C3)烷基-雜環基,其中雜環基為具有5-6個環原子的單環,其中1-2個環原子係選自氮、氧與硫,且,其中該(C1-C11)烷基、(C1-C3)烷基(C3-C6)環烷基、(C1-C3)烷基-苯基、(C1-C3)烷基-萘基、與(C1-C3)烷基-雜環基係任擇地被獨立地選自(C1-C4)烷基、(C1-C4)烷氧基、鹵基、與氰基的1-2個基團取代;R3選自苯基與雜芳基,其中該苯基與雜芳基係任擇地被獨立地選自下列的1-3個基團取代:(C1-C6)烷基,其任擇地被獨立地選自下列的1-3個基團取代:氟(譬如-CF3);-CO2H;-P(O)RfRg;NRaRb,其中Ra選自H與(C1-C4)烷基且Rb選自(C1-C4)烷基,其被1-3個-CO2H或-P(O)RfRg取代;以及-C(O)NRaRb,其中Ra與Rb係獨立地選自H與(C1-C4)烷基,其中該(C1-C4)烷基係任擇地被獨立選自下列的1-3個基團取代:羥基、-CO2H、-C(O)O(C1-C4)烷基與-P(O)RfRg;環丙基,其任擇地被1個-CO2H取代;-C(O)NRaRb,其中Ra與Rb係獨立地選自H與(C1-C4)烷基,其中該(C1-C4)烷基係任擇地被獨立選自下列的1-3個基團取代:羥基、-CO2H、-C(O)O(C1-C4)烷基、-P(O)RfRg、NRcRd與N+ RcRdRe;(C1-C6)烷氧基,其任擇地被獨立選自下列的1-3個取代基取代:鹵基、羥基、-CO2H、(C3-C6)環烷基、-C(O)NH2與吡咯啶基;四氫吡咯基;(C3-C6)環烷氧基,其任擇地被獨立選自下列的1-3個取代基取代:鹵基、羥基、與-CO2H;
-NRaRb,其中Ra與Rb係獨立地選自H與(C1-C4)烷基,其中該(C1-C4)烷基係任擇地被獨立選自下列的1-3個基團取代:酮基與-CO2H;-SRa,其中Ra選自H與(C1-C4)烷基;-CO2H;-C(NOH)NH2;氰基;-C(O)O(C1-C4)烷基;-C(O)CO2H;-P(O)RfRg;-OP(O)RfRg;鹵基;羥基;硝基;-NHSO2(C1-C2)烷基;-SO3H;-SO2(C1-C2)烷基;-SO2NRcRd;-SO2NHC(O)(C1-C2)烷基;-B(OH)2;以及酮基;其中在各種情況中:Rc、Rd與Re係獨立地選自H與(C1-C2)烷基;以及Rf與Rg係獨立地選自羥基、(C1-C2)烷基與(C1-C2)烷氧基;以及n為0或1。
在式(I)化合物的一些具體例中,W1、W2、W3與W4之一或兩者為N且其餘為CRa。
在式(I)化合物的一些具體例中,W1為N且其餘為CRa。
在式(I)化合物的一些具體例中,W1以及W2與W3之一者為N,以及W4為CRa。
在式(I)化合物的一些具體例中,W1、W2、W3與W4之各者為CRa。
在式(I)化合物的一些具體例中,各個Ra為H。
在式(I)化合物的一些具體例中,R1為H或(C1-C4)直鏈烷基,在更特定的具體例中,H、甲基或乙基,在甚至更特定的具體例中,H或乙基且又更尤其是乙基。在一些具體例中,R1是被一個羥基取代的(C1-C4)直鏈烷基;在特定具體例中,-CH2OH。
在式(I)化合物的一些具體例中,R2為H。
在一些具體例中,R2係選自任擇地被取代的下列:(C1-C11)烷基(譬如C3-C7烷基,譬如C4-C6烷基),在更特定的具體例中,正戊基(即戊基),或2-
乙基丁基,更甚至尤其為戊基。
在一些具體例中,R2係選自任擇地被取代的下列:(C1-C3)烷基(C3-C6)環烷基,在更特定的具體例中,環丙基甲基或環戊基甲基。
在一些具體例中,R2係選自任擇地被取代的下列:(C1-C3)烷基-苯基,在特定具體例中,苄基、2-苯基乙基(即苯基乙基),或3-苯基丙基(即苯基丙基)。
在一些具體例中,R2選自(C1-C3)烷基-萘基;在特定具體例中,2-萘基乙基。
在一些具體例中,該R2基團係根據式(I)定義被取代。在一些具體例中,該R2基團未被取代。
在本發明化合物(譬如式(I)化合物)的一些具體例中,R1與R2具有(R)立體化學。
在本發明化合物(譬如式(I)化合物)的一些具體例中,R3為苯基、吡啶基、噠嗪基、嘧啶基、噁唑基、四唑基、吡唑基、吲唑基、或1,1-二氧橋基-2,3-二氫苯并[d]異噻唑基(在更特定具體例中,苯基、吡啶基、吲唑基、或1,1-二氧橋基-2,3-二氫苯并[d]異噻唑基),包括彼等的各種位置異構物,其中此類基團係根據式(I)的上文定義任擇地被取代,包括式(I)的更特定具體例。在更特定的具體例中,R3為苯基,其係根據式(I)定義任擇地被取代,包括式(I)的更特定具體例。在本發明化合物(譬如式(I)化合物)的更特定具體例中,R3為3,4-或3,5-雙取代苯基,其中該取代基係根據式(I)定義選擇,包括式(I)的更特定具體例(該位置係相對於苯環接至式(I)化合物其餘部分的接附點)。
在一些具體例中,R3為苯基,其在3-位置被乙氧基取代,以及,在4或5位置被-P(O)(OH)2或-CO2H取代(尤其是-P(O)(OH)2,尤其在5-位置)。
在一些具體例中,R3為苯基,其在3-位置被乙氧基取代,以及,在4或5位置被-OCH2CO2H、或-C(O)NHCH(CO2H)(CH2CO2H)取代(尤其是-C(O)NHCH(CO2H)(CH2CO2H),尤其在4-位置)。
在一些具體例中,R3為苯基,其在3-位置被--OCH2CO2H取代,以及,在4或5位置(尤其在4-位置)被-C(O)NHCH(CO2H)(CH2CO2H)取代。
在本發明化合物(譬如式(I)化合物)的一些具體例中,R3為苯基,其被獨立地選自下列的1-3個基團取代:-OCH3、-OC2H5、-OC3H7、-OCH(CH3)2、-OCF3、-OCHF2、-OCH2CF3、-OCH2CHF2、-OC2H4-吡咯啶基;四氫吡咯基、-OCH2CO2H、-OCH2C(O)NH2、-CO2H、-CH3、環丙烷基-1-甲酸、-CH2CO2H、-C(CH3)2CO2H、-CH(CH3)CO2H、-CF2CO2H、-CH2C(O)NHCH(CO2H)(CH2CO2H)、-CH2P(O)(OH)2、-CH2N(CH3)(CH2CO2H)、-CH2NHCH2P(O)(OH)2、-C(NH2)(NOH)、氰基、硝基、羥基、-SO2NH2、-SO2N(CH3)2、-SO2NH(CH3)、-SO2CH3、-SO2NHC(O)C2H5、-SO3H、-SCH3、-SC2H5、-C(O)OCH3、-C(O)OC(CH3)3、-C(O)NHCH3、-C(O)NH(C2H4NH2)、-C(O)NHC2H4N+(CH3)3、-C(O)NHCH(CO2H)(CH2CO2H)、-C(O)NHCH(CO2H)(C2H4CO2H)、-C(O)NHCH2CO2H、-C(O)N(CH2CO2H)2、-C(O)NHCH2P(O)(OH)2、-C(O)NHC(CH2OH)3、氟、-NH2、-N(CH3)2、-P(O)(CH3)(OC2H5)、-P(O)(OCH3)2、-P(O)(CH3)(OH)、-P(O)(OH)(OCH3)、與-P(O)(OH)2。在一些具體例中,R3為苯基,其被獨立地選自下列的1-3個基團取代:-OC2H5、OCH2CO2H、CONHCH(CO2H)(CH2CO2H)、P(O)(OH)2、CO2H、CH2CO2H、CH2CONHCH(CO2H)(CH2CO2H)、OH、與SO3H,在更特定的具體例中,獨立地選自:-OC2H5、OCH2CO2H、-CONHCH(CO2H)(CH2CO2H)、與P(O)(OH)2。
在一些具體例中,R3為苯基,其被獨立地選自下列的1-3個基團取代:甲基、乙基、異丙基、CF3、CH2CO2H、CH(CH3)2(CO2H)、CH2CONHCH(CO2H)(CH2CO2H)、1-CO2H環丙基、CONH2、CONHCH(CO2H)(CH2CO2H)、OCH3、OC2H5、OCH(CH3)2、OCF3、OCH2CF3、OCH2CO2H、N(CH3)2、SH、CO2H、CN、CO2C2H5、P(O)(OH)2、F、OH、NHSO2CH3、SO3H、SO2CH3、SO2NH2、與B(OH)2。
在式(I)化合物的一些具體例中,R3為任擇地被取代的雜芳基,如上文為式(I)定義者。在一些具體例中,R3為包含5-6個環原子的任擇地被取代的單環雜芳基環,其包含選自氮、氧、與硫的1-4個雜原子。在式(I)化合物的一些具體例中,R3係任擇地被下列取代:吡啶基、噠嗪基、嘧啶基、噁唑基、四唑基、吡唑基、吲唑基,或1,1-二氧橋基-2,3-二氫苯并[d]異噻唑基。在一些具體例中,R3係任擇地被下列取代:吡啶基、嘧啶基、噠嗪基、吡唑基、四唑基、或噁唑基。
在雜芳基R3的前述具體例中,此類R3基團可根據式(I)所定義被任擇地取代。
在式(I)化合物的若干前述具體例中,其中R3為雜芳基,該雜芳基環被獨立地選自下列的1-3個基團取代:-OCH3、-OC2H5、-OC3H7、-OCH(CH3)2、-OCF3、-OCHF2、-OCH2CF3、-OCH2CHF2、-OC2H4-吡咯啶基;四氫吡咯基、-OCH2CO2H、-OCH2C(O)NH2、-CO2H、-CH3、環丙烷基-1-甲酸、-CH2CO2H、-C(CH3)2CO2H、-CH(CH3)CO2H、-CF2CO2H、-CH2C(O)NHCH(CO2H)(CH2CO2H)、-CH2P(O)(OH)2、-CH2N(CH3)(CH2CO2H)、-CH2NHCH2P(O)(OH)2、-C(NH2)(NOH)、氰基、硝基、羥基、-SO2NH2、-SO2N(CH3)2、-SO2NH(CH3)、-SO2CH3、-SO2NHC(O)C2H5、-SO3H、-SCH3、-SC2H5、-C(O)OCH3、-C(O)OC(CH3)3、
-C(O)NHCH3、-C(O)NH(C2H4NH2)、-C(O)NHC2H4N+(CH3)3、-C(O)NHCH(CO2H)(CH2CO2H)、-C(O)NHCH(CO2H)(C2H4CO2H)、-C(O)NHCH2CO2H、-C(O)N(CH2CO2H)2、-C(O)NHCH2P(O)(OH)2、-C(O)NHC(CH2OH)3、氟、-NH2、-N(CH3)2、-P(O)(CH3)(OC2H5)、-P(O)(OCH3)2、-P(O)(CH3)(OH)、-P(O)(OH)(OCH3)、與-P(O)(OH)2。
在一些具體例中,該雜芳基R3基團被獨立地選自下列的1-3個基團取代:-OC2H5、OCH2CO2H、CONHCH(CO2H)(CH2CO2H)、P(O)(OH)2、CO2H、CH2CO2H、CH2CONHCH(CO2H)(CH2CO2H)、OH、與SO3H,在更特定的具體例中,選自:-OC2H5、OCH2CO2H、CONHCH(CO2H)(CH2CO2H)、與P(O)(OH)2。在一些具體例中、R3為雜芳基,其被獨立地選自下列的1-3個基團取代:甲基、乙基、異丙基、CF3、CH2CO2H、CH(CH3)2(CO2H)、CH2CONHCH(CO2H)(CH2CO2H)、1-CO2H環丙基、CONH2、CONHCH(CO2H)(CH2CO2H)、OCH3、OC2H5、OCH(CH3)2、OCF3、OCH2CF3、OCH2CO2H、N(CH3)2、SH、CO2C2H5、CN、CO2C2H5、P(O)(OH)2、F、OH、NHSO2 CH3、SO3H、SO2CH3、SO2NH2、與B(OH)2。
在式(I)化合物的一些具體例中,n為0。在式(I)化合物的其他具體例中,n為1。
在式(I)化合物的一些具體例中,R1為(C1-C4)直鏈烷基;R2為(C1-C11)烷基;R3為苯基,其係根據式(I)所定義被取代;以及n為0。在更特定的此類具體例中,R3苯基被獨立地選自-OC2H5、OCH2CO2H、-CONHCH(CO2H)(CH2CO2H)、與P(O)(OH)2的1-2個基團或1-3個基團取代。在甚至更特定的具體例中,R3苯基被獨立地選自-OC2H5、OCH2CO2H、-CONHCH(CO2H)(CH2CO2H)、與P(O)(OH)2的2個基團3,4-或3,5-雙取代。
據此,本發明化合物包括式(I)化合物,或彼等的鹽,尤其是彼等的藥
學上可接受之鹽。本發明的代表性化合物包括本案說明的特定化合物,譬如實施例的化合物,還有彼等的任何另擇立體異構物、游離酸/鹼形式、鹽形式、以及另擇鹽形式(尤其是彼等的藥學上可接受之鹽或另擇鹽形式),若適用的話。
據此,在一些具體例中,本發明之該化合物為選自由下列所構成之群組的化合物:
或彼等的鹽(在更特定的具體例中,彼等的藥學上可接受之鹽)。
在一些具體例中,本發明之該化合物為選自由下列所構成之群組的化合物:
或彼等的鹽(在更特定的具體例中,彼等的藥學上可接受之鹽)。
在一些具體例中,本發明之該化合物為選自由下列所構成之群組的化合物:
或彼等的鹽(在更特定的具體例中,彼等的藥學上可接受之鹽)。
在一些具體例中,本發明之該化合物為選自由下列所構成之群組的化合物:
(在更特定的具體例中,彼等的藥學上可接受之鹽)。
在一些具體例中,本發明係關於一種抑制BMP1、TLL1及/或TLL2的方法,該方法包含以本發明之化合物接觸包含該(多個)蛋白的一生物材料。在一些具體例中,該接觸係於體外進行,以及該生物材料為,譬如細胞培養物或細胞組織。在其他具體例中,該接觸係於體內進行。
在其他具體例中,本發明係關於一種在需要接受治療之一個體(譬如人類或其他哺乳動物)治療和BMP1、TLL1及/或TLL2活性相關的疾病的方法,該方法包含投予該個體以一治療有效量的本發明之化合物(尤其是式(I)化合物或彼等的藥學上可接受之鹽)。本發明再進一步關於一種本發明之化合物或包含本發明化合物(尤其是式(I)化合物或彼等的藥學上可接受之鹽)的藥學組成物治療和BMP1、TLL1及/或TLL2活性相關的疾病的用途。本發明再關於一種用於療法的本發明之化合物((尤其是式(I)化合物或彼等的藥學上可接受之鹽),尤其是在治療和BMP1、TLL1及/或TLL2活性相關的疾病時作為活性治療物質。本發明再關於一種本發明之化合物(尤其是式(I)化合物或彼等的藥學上可接受之鹽)在製備用於治療和BMP1、TLL1及/或TLL2活性相關的疾病之醫藥品的用途。
在一些具體例中,該和BMP1、TLL1及/或TLL2活性相關的疾病選自該等和身體器官或組織的病理性纖維化病況相關的疾病,譬如心臟、肺、腎、
肝、眼、骨骼肌、皮膚、該血管系統、與神經系統的此類病況,譬如心肌梗塞(“MI”)、心臟衰竭(譬如射血分率減少之心臟衰竭、射血分率正常之心臟衰竭)、心律不整(譬如心房顫動)、肥厚型心肌病變、慢性阻塞性肺病(“COPD”)、特發性肺纖維化(“IPF”)、糖尿病性腎臟病變、後急性腎損傷、慢性腎病(“CKD”)、移植後延遲移植物功能、肝硬化、非酒精性脂肪肝(“NASH”)、青光眼、角膜疤痕、肌肉失養症(包括裘馨氏、貝克氏、肢帶型、先天型、顏面肩胛肱骨型、肌強直型、眼咽型、遠端型、與艾瑞二氏)、瘢瘤、傷口癒合、沾黏、肥厚性疤痕以及譬如和燒傷、手術與其他創傷相關的其他疤痕、中風、膠原血管疾病(例如全身性紅斑狼瘡、類風濕關節炎與硬皮病)、脊髓損傷、與多發性硬化。
在一些具體例中,該和BMP1、TLL1及/或TLL2活性相關的疾病選自特徵在於減少的肌肉功能和/或質量的肌肉疾病,譬如肌肉失養症(譬如裘馨氏、貝克氏、肢帶型、先天型、顏面肩胛肱骨型、肌強直型、眼咽型、遠端型、與艾瑞二氏)、肌少症、以及和譬如心臟衰竭、CKD、COPD、癌症或老年相關的惡病質。
根據式(I)之化合物可含有一或多個不對稱中心(亦稱作(多個)對掌中心),且因此可以個別鏡像異構物、非對映鏡像異構物、或其他立體異構形式、或以彼等的混合物存在。對掌中心,例如對掌碳、硫或磷亦可出現在本發明之化合物。當出現在本發明化合物的對掌中心的立體化學(譬如化合物名稱或本案繪示的任何化學結構)未被指明時,則該化合物、化合物名稱、或結構係意圖涵蓋所有個別立體異構物及其所有混合物。於是,含有一或多個對掌中心的根據式(I)之化合物可出現為消旋混合物、鏡像異構地富集混合物、或鏡像異構地純的個別立體異構物。
含有一或多個不對稱中心的根據式(I)之化合物的個別立體異構物可藉
由熟習此藝者習知的解析。舉例來說,此類解析可藉由下列執行(1)形成非對映鏡像異構鹽、錯合物或其他衍生物;(2)立體異構物-特異試劑,舉例來說,藉由酶氧化或還原的選擇反應;或(3)在對掌性環境,舉例來說,在對掌性支撐,例如結合對掌性配體的矽膠或在對掌性溶劑的存在下的氣-液相或液相層析。熟習此藝者將理解到在所欲立體異構物藉由上述分離流程之一轉換成另一個化學實體時,需要另外的步驟釋出所欲形式。或者,特定的立體異構物可藉由使用光學活性試劑、受質、催化劑或溶劑的不對稱合成來合成,或藉由不對稱轉化將一個鏡像異構物轉換成另一者。
應當理解本發明化合物的固體形式可存在晶質形式、非晶質形式或彼等的混合物。此類晶質形式亦可存在多晶現象(即發生不同晶質形式的能力)。該等不同晶質形式通常習初為「多晶形物」。多晶形物具有相同的化學組成,差別在晶質固態的堆疊、幾何配置、以及其他描述性質。多晶形物,因此,可能具有不同的物理性質,例如形狀、密度、硬度、變形性、穩定性、與溶解性質。多晶形物通常展現不同熔點、IR光譜、與X-光繞射圖樣,其可用於辨識。熟習此藝者將理解到可藉由,舉例來說,改變或調整用於使化合物結晶/再結晶的條件來製造不同的多晶形物。
因為用於醫藥的潛力,式(I)化合物的鹽較佳為藥學上可接受之鹽。適宜的藥學上可接受之鹽包括Berge,S.M.et al.,Journal of Pharmaceutical Sciences,1977,66,1-19所述者。
當本發明之化合物為鹼(含有鹼性部分)時,所欲的鹽形式可藉由本領域習知的任何適宜方法製備,包括以下列處理游離鹼:無機酸,例如氫氯酸、氫溴酸、硫酸、硝酸、磷酸等等,或有機酸,例如乙酸、三氟乙酸、馬來酸、琥珀酸、扁桃酸、富馬酸、蘋果酸、丙酮酸、草酸、乙醇酸、水楊酸等等,或吡喃糖苷酸,例如葡醣醛酸或半乳醣醛酸,或阿伐-羥基酸,例如
檸檬酸或酒石酸,或胺基酸,例如天門冬胺酸或穀胺酸,或芳香族酸,例如苄酸或肉桂酸,或磺酸,例如對甲苯磺酸、甲磺酸、乙磺酸或等等。
適宜的酸式加成鹽包括乙酸鹽、對胺基苄酸鹽、抗壞血酸鹽、天門冬胺酸鹽、苯磺酸鹽、苄酸鹽、碳酸氫鹽、雙亞甲基水楊酸鹽、硫酸氫鹽、酒石酸氫鹽、硼酸鹽、依地酸鈣(calcium edetate)、右旋樟腦磺酸鹽、碳酸鹽、克拉維酸鹽(clavulanate)、檸檬酸鹽、環己基胺基磺酸鹽、依地酸鹽、乙二磺酸鹽(edisylate)、月桂基硫酸鹽(estolate)、乙磺酸鹽(esylate)、乙二磺酸鹽、乙磺酸基、甲酸鹽、富馬酸鹽、葡庚糖酸鹽、葡糖酸鹽、穀胺酸鹽、乙醇酸鹽、乙醇亞砷酸鹽、己基間苯二酚鹽、海巴明鹽(hydrabamine)、氫溴酸鹽、氫氯酸鹽、二氫氯酸鹽、羥基富馬酸鹽、磷酸氫鹽、氫碘酸鹽、羥基馬來酸鹽、羥基琥珀酸鹽、羥基萘酸鹽、羥乙基磺酸鹽、衣康酸鹽、乳酸鹽、乳糖酸鹽、月桂酸鹽、蘋果酸鹽、蘋果酸鹽、扁桃酸鹽、甲磺酸鹽、甲基硫酸鹽、蘋果酸單鉀、黏酸鹽、萘磺酸鹽、硝酸鹽、N-甲基葡糖胺、草酸鹽、草醯乙酸鹽、雙羥萘酸鹽(pamoate)(恩波酸鹽(embonate))、棕櫚油酸鹽(palmate)、棕櫚酸鹽(palmitate)、雙羥萘酸鹽(pamoate)(恩波酸鹽(embonate))、泛酸鹽、磷酸鹽/二磷酸鹽、丙酮酸鹽、聚半乳醣醛酸鹽、丙酸鹽、糖二酸鹽、水楊酸鹽、硬脂酸鹽、鹼式醋酸鹽、琥珀酸酯、硫酸鹽、丹寧酸鹽、酒石酸鹽、茶氯酸鹽(teoclate)、甲苯磺酸鹽、三乙碘化物、三氟乙酸鹽和戊酸鹽。
其他例示性酸式加成鹽包括焦硫酸鹽、亞硫酸鹽、亞硫酸氫鹽、癸酸鹽、辛酸鹽、丙烯酸鹽、異丁酸鹽、己酸鹽、庚酸鹽、丙炔酸鹽、草酸鹽、丙二酸鹽、辛二酸鹽、癸二酸鹽、丁炔-1,6-二酸鹽、己炔-1,6-二酸鹽、氯苄酸鹽、甲基苄酸鹽、二硝基苄酸鹽、羥基苄酸鹽、甲氧基苄酸鹽、鄰苯二甲酸鹽、苯基乙酸鹽、苯基丙酸鹽、苯基丁酸鹽、乳酸鹽、γ-羥基丁酸鹽、
扁桃酸鹽、與磺酸鹽、例如二甲苯磺酸鹽、丙磺酸鹽、萘-1-磺酸鹽和萘-2-磺酸鹽。
假使本發明之鹼性化合物係單離為鹽,則該化合物的對應游離鹼形式可藉由本領域習知的任何適宜方法製備,包括以無機或有機鹼,適宜為具有比該化合物游離鹼形式更高pKa的無機或有機鹼處理該鹽。
當本發明化合物為酸(含有酸性部分)時,所欲的鹽可藉由本領域習知的任何適宜方法製備,包括以下列處理游離酸:無機或有機鹼,例如胺(一級、二級、三級或四級)、鹼金屬或鹼土金屬氫氧化物、烷氧化物(譬如(C1-4)烷氧化物)、烷基酯(譬如(C1-4)烷基酯,譬如乙酸酯),或等等。適宜鹽的例示例子包括衍生自胺基酸,例如甘胺酸、離胺酸、與精胺酸的有機鹽、氨、一級、二級、三級、與四級胺、環狀胺、與胺基糖,譬如2-胺基-2-去氧糖,例如N-甲基-D-葡糖胺、二乙胺、異丙基胺、三甲基胺、乙二胺、二環己基胺、乙醇胺、膽鹼、哌啶、嗎啉、哌嗪、Tris(亦已知為THAM,或參(羥基甲基)胺基甲烷)、2-胺基-2-羥基甲基-丙-1,3-二醇、與2-胺基-2-(羥基甲基)-1,3-丙二醇)、葡甲胺(亦已知為1-去氧-1-(甲基胺基)-D-葡萄糖醇)、半乳糖胺,葡糖胺、與N-乙醯基葡糖胺,還有衍生自鈉、鈣、鉀、鎂、錳、鐵、銅、鋅、鋁、與鋰的無機鹽(譬如此類鹼金屬與鹼土金屬的氫氧化物、(C1-4)烷氧化物、與(C1-4)烷基酯)。
以無機或有機鹼處理含有游離酸的式(I)化合物,或以酸處理含有游離鹼的式(I)化合物,以形成式(I)化合物的鹽可藉由本領域習知的方法完成。舉例來說,該游離酸可和適宜的溶劑(譬如其中的游離酸可溶)混摻並以鹼處理,同時攪拌,並任擇地加熱及/或溫度循環。同樣地,就含有游離鹼的式(I)化合物而言,該游離鹼可和適宜的溶劑(譬如其中的游離鹼可溶)混摻並以酸處理,同時攪拌,並任擇地加熱及/或溫度循環。本發明的某些化合物可
和下列的一或多個等效物形成鹽:酸(假使該化合物含有鹼性部分)或鹼(假使該化合物含有酸性部分)。本發明的範疇包括所有可能化學計量與非化學計量鹽形式在內。
具有鹼性與酸性部分的本發明之化合物可呈兩性離子、鹼性部分的酸式加成鹽或酸性部分的鹼鹽的形式。
本發明亦提供本發明化合物的一個藥學上可接受之鹽轉換成本發明化合物的另一個藥學上可接受之鹽。
在一些具體例中,本發明之化合物為下列的鹽,譬如藥學上可接受之鹽:(S)-2-(5-乙氧基-3'-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)-[1,1'-聯苯]-3-基甲醯胺基)琥珀酸;(S)-2-(2-(羧基甲氧基)-4-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)苄醯胺基)琥珀酸;或(3-乙氧基-5-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)苯基)膦酸,包括此類鹽的所有可能化學計量與非化學計量形式。
式(I)化合物及其鹽(包括藥學上可接受之鹽)可呈溶劑合物的形式。就式(I)化合物的溶劑合物而言,包括式(I)化合物之鹽的溶劑合物,係呈晶質形式,熟習此藝者將理解到可形成藥學上可接受之溶劑合物,其中溶劑分子係在結晶期間併入晶格。溶劑合物可涉及非水性溶劑,例如乙醇、異丙醇、二甲亞碸、乙酸、乙醇胺、與乙酸乙酯,或彼等可涉及水作為併入晶格的溶劑。溶劑台物,其中水為併入晶格的溶劑,通常稱作「水合物」。溶劑合物包括化學計量的溶劑合物和含有不定份量的(多個)合併溶劑的組成物,譬如一水合物包括化學計量的水合物與含有不定份量的水的組成物。本發明包括所有此類溶劑合物,尤其是水合物。應當理解術語「彼等的鹽,尤其是藥學上可接受之鹽,或彼等的溶劑合物」等等在提到式(I)化合物時
係涵蓋式(I)化合物的鹽、式(I)化合物的藥學上可接受之鹽、式(I)化合物的溶劑合物、式(I)化合物的鹽的溶劑合物、與式(I)化合物的藥學上可接受之鹽的溶劑合物(舉例來說,其中水為合併溶劑,該溶劑合物為水合物)。
因為本發明之化合物,尤其是式(I)化合物,以及彼等的藥學上可接受之鹽,或彼等的溶劑合物(譬如水合物)係意圖用於藥學組成物,將容易理解到彼等係各自較佳提供實質上純的形式,舉例來說,至少60%純、更適宜地至少75%純且較佳至少85%,尤其至少98%純(%係以重量對重量為準)。化合物的不純製劑可用來製備用於藥學組成物的更純淨形式。
式(I)化合物可藉由使用以下流程繪示的合成流程或利用有經驗的有機化學家的知識獲得。該等流程所提供的合成係適用於運用適當前驅物製造具有各式不同R1、R2與R3基團的本發明之化合物。熟習此藝者將理解到在製備本發明化合物(譬如式(I)化合物,彼等的鹽,及/或彼等的溶劑合物)時,可能需要及/或希望保護分子或適當中間物內的一或多個敏感基團,以避免非所欲的副反應。根據本發明使用的適宜保護基團係熟習此藝者眾所周知,並可以習用方式使用。參閱,舉例來說,“Protective groups in organic synthesis”by T.W.Green and P.G.M Wuts(Wiley & Sons,1991)或“Protecting Groups”by P.J.Kocienski(Georg Thieme Verlag,1994)。若必要時,後續的去保護作用係得到一般揭示的天然化合物。儘管流程係以式(I)化合物顯示,但彼等為可用於製作本發明之化合物的例示方法。
化合物名稱係使用命名程式Chem Draw Ultra v12.0的軟體產生,其係取自Perkin Elmer,940 Winter Street,WalthaM,Massachusetts,02451,USA.(http://www.perkinelmer.com/)。
在通用方法中,式(I)化合物可根據反應流程1-4製備:
1.使(II)與(III)在醯胺偶合劑(譬如EDC/HOBT、HATU或HBTU)、鹼和適宜溶劑的存在下,於室溫或於高溫反應(流程1)。2.脫苄基化作用可經由氫化作用,使用催化劑,例如Pd/C與氫源(譬如氫氣或甲酸銨)達成。3.若有必要,再甲醯化作用可利用CDI/甲酸溶於溶劑,例如DCM的預混溶液於室溫達成,以形成(I)。或者,再甲醯化作用可經由和5-甲基-2-硫代-1,3,4-噻二唑-3(2H)-甲醛在溶劑,例如DCM中,於室溫反應來達成(Yazawa,H.,et al.,Tetrahedron Letters,1985,26(31),3703-6)。再甲醯化作用可能在所有脫苄基化步驟之後皆需要,但為了簡潔起見,在後續流程中將略去。熟習此藝者可理解的是,合成步驟的順序可更動或視必要省略。
1.使(IV)與(V)在醯胺偶合劑、鹼與溶劑的存在下,於室溫或高溫反應(流
程2)。2.脫苄基化作用可如流程1所述般達成,以生成(I)。
1.使(VI)與(V)在醯胺偶合劑、鹼與溶劑的存在下,於室溫或高溫反應,以形成(I)(流程3)。
在通用方法中,式(I)化合物-其中n=0且R3係直接接附至內環(Ia)-可根據流程4製備。1.使(VII)(其中X=Br或Cl)和適當的硼酸或硼酸酯(R3-“B”)衍生物(VIII)在催化劑(譬如Pd(PPh3)4或Pd(dppf)Cl2),無機鹼(譬如碳酸鉀或碳酸鈉水溶液)與適宜的溶劑(譬如1,4-二噁烷或DME/水)的存在下,於高溫在微波照射或標準加熱下反應。在一些情況下,該R3-“B”(VIII)係由對應溴化物(R3-Br)在偶合反應(譬如鈴木)原地形成。2.脫苄基化作用可如流程1所述般達成。
1.使胺(VI)和3-(6-甲基-4,8-二酮基-1,3,6,2-二氧雜環戊硼烷-2-基)苄酸(IX)與偶合劑與鹼,在溶劑中反應(流程7)。2.使適當的溴化物,R3-Br(XXXV)在催化劑(譬如Pd(dppf)Cl2)與無機鹼(譬如碳酸鈉水溶液)的存在下,於溶劑中、於高溫反應,以形成(Ib)。
在通用方法中,式(I)化合物-其中R3含有羧酸(譬如式(Ic或Ih))或膦酸(譬如式(Id或Ii))-可根據流程1-5及/或如流程6概述般,由彼等的對應酯官能(Xc)、(Xd)、(Xh)、與(Xg)製備。流程6中的轉換係以苯環R3例示,然而,流程6同樣應用至本案揭示之所有R3具體例的對應式(1c-d)分子的製備。1.脫苄基化作用可如流程1所述般達成。2.就式(Xc)與式(Xh)化合物而言,酯水解可藉由和氫氧化鋰在溶劑中反應達成,酯的去保護可經由和酸在溶劑中反應達成,就式(Xd)與式(Xg)而言,水解可另擇地藉由和TMS-Br在適宜溶劑中反應達成。此外,該等步驟的順序可改變,其中當以適當的起始材料開始時,1.酯水解且隨後2.脫苄基化作用可產生(Ic)或(Id)。此外,可利用萬用的脫苄基化作用,假使利用適當的酯(譬如苄酯)。熟習此藝者可理解的是,若有必要,合成步驟的順序可更動或省略。
在通用方法中,式(I)化合物-其中R3含有胺(譬如式(Ie))-可根據流程1-5及/或如流程7概述般,由彼等的對應受保護胺(Xe)製備。1.Fmoc胺的去保護係藉由以胺鹼,例如吡咯烷在適當的溶劑中處理(Xe)。2.脫苄基化作用可如流程1所述般達成,以生成(Ie)。流程7中的轉換係以苯環R3例示,然而,流程7同樣應用至本案揭示之所有R3具體例的對應式(Ie)分子的製備。
在通用方法中,式(I)化合物-其中該內環含有羧酸(譬如式(If))-可根據流程1-5及/或如流程8概述般製備。1.使胺(VI)和(XI)、偶合劑與鹼,在溶劑下反應(流程8)。2.使適當的硼酸或硼酸酯,R3-“B”(VIII)在催化劑(譬如Pd(dppf)Cl2)與無機鹼的存在下,於溶劑中反應。3.水解裂解酯,以形成(If)。應注意到步驟2與3可顛倒,以形成(If)。
在通用方法中,式(I)化合物-其中遠端環含有硫醇(譬如式(Ig))-可根據流程1-5及/或如流程9概述般製備。1.使胺(VI)與(XII)和偶合劑與鹼,在溶劑中反應(流程9)。2.使硫醇保護基團在Et3SiH、TFA的存在下及在溶劑,例如DCM中反應,以生成(Ig)。流程9中的轉換係以苯環R3例示,然而,流程
6同樣應用至本案揭示之所有R3具體例的對應式(1g)分子的製備。
在通用方法中,式(II)化合物-其中R1為H-可根據下列流程10或11製備。在通用方法中,式(II)化合物可另擇地根據下列流程12或13製備。
1.使甲醛O-苄基肟(XIV)和NaI與TMS-Cl或TMS-OTf預混溶液反應,隨後以鹼和(XIII)化合物在溶劑中處理(流程10)。2.在R’非為H而是選自C1-2烷基的情況中,酯水解可藉由和氫氧化鋰與溶劑反應達成。3.內醯胺形成可藉由和磷醯三氯在鹼,例如2,6-二甲基吡啶與溶劑的存在下,於高溫反應來達成。4.對掌性分離可使用熟習此藝者習知的技術在此階段進行。5.內醯胺開環可藉由和氫氧化鋰在溶劑中的反應完成。6.甲醯化作用可如流程1所述般達成。熟習此藝者可理解的是,若有必要,合成步驟可省略。
1.在-78℃至0℃,使適當的(XVIII)鏡像異構物和鹼,例如丁基鋰反應,接著和醯氯(XIX)與溶劑,例如THF反應(流程11)。2.使TiCl4在鹼和溶劑的存在下反應,接著和((氯甲氧基)甲基)苯反應。3.和過氧化氫與氫氧化鋰於
溶劑,於0℃反應,隨後4.脫苄基化作用可經由氫化達成。5.和O-苄基胲氫氯酸鹽在偶合與溶劑的存在下反應。6.內醯胺形成可藉由和DIAD與三苯膦在溶劑中反應達成。7.內醯胺開環可藉由和氫氧化鋰在溶劑中的反應達成。8.甲醯化作用可利用CDI/甲酸溶於溶劑的混合物達成,以生成(II)。
1.使適當的(XVIII)鏡像異構物和鹼,例如丁基鋰反應,接著和適當的醯氯(XIX)在適宜溶劑,例如THF中反應(流程12)。2.使TiCl4在鹼,例如DIPEA的存在下和添加劑,例如NMP在溶劑中反應,接著和適當的醛(XXIII)反應。3.和O-苄基胲氫氯酸鹽在溶劑,例如THF,在三甲基鋁的存在下反應。4.使用適宜的鹼,例如吡啶和甲磺醯氯反應。5.和四丁基氫氧化銨在溶劑中反應。6.甲醯化作用可利用CDI/甲酸溶於溶劑,例如DCM的混合物於室溫達成,以形成(II)。
1.使適當的(XVIII)鏡像異構物和鹼,例如丁基鋰反應,接著和醯氯(XIX)在溶劑,例如THF中反應(流程13)。2.和鹼,例如NaHMDS在溶劑,例如THF中,於-78℃反應,接著和適當的醯氯(XXV)反應。3.和O-苄基胲氫氯酸鹽在乙酸鈉的存在下,於溶劑,例如甲醇中反應。4.和氰基硼氫化鈉在例如二氯乙烷與乙酸的溶劑混合物中反應。5.甲醯化作用可利用CDI/甲酸溶於溶劑,例如DCM的混合物於室溫達成。6.和過氧化氫與氫氧化鋰在適宜溶劑,例如甲醇與水的混合物中,於0℃反應,以形成(II)。
在通用方法中,式(III)化合物可根據下列流程14-16製備。
在通用方法中,式(III)化合物-其中n=0且R3係直接接附至內環-可根據流程14製備。1.使(XXIX)(其中X=Br或Cl)在偶合劑、鹼與溶劑與胺(XXX)的存在下反應(流程11)。2.和適當硼酸或硼酸酯(R3-“B”)汙生物(VIII)在催化劑(譬如Pd(dppf)Cl2)與無機鹼的存在下,於溶劑中、於高溫或微波照射下反應。3.Fmoc的去保護可藉由和二級胺,例如哌啶,或吡咯烷,在溶劑,例如DCM中反應達成,以形成結構(III)化合物。熟習此藝者可理解的是合成步驟的順序可更動。
1.在R’非為H而是選自C1-2烷基的情況中,酯水解可藉由使式(XXXI)化
合物和氫氧化鋰在溶劑,例如甲醇與水的混合物中反應達成,以形成酸(R’=H)(流程15)。2.醯胺形成可藉由和草醯氯在溶劑,例如DMF中反應,接著和(XXX)在鹼,例如DIPEA的存在下,在溶劑,例如DCM中反應來達成。或者,醯胺形成可藉由和(XXXI)在偶合劑,例如HATU、鹼、溶劑與(XXX)的存在下反應達成。3.Fmoc的去保護可藉由和二級胺,例如吡咯烷或嗎啉在適宜溶劑,例如DCM中反應達成。
在通用方法中,式(III)化合物可根據反應流程16製備。1.使化合物(XXXII)和(XXXIII)在鹼和溶劑的存在下反應。2.在溶劑中,和PIFA重排,以形成(III)。
在通用方法中,式(IV)化合物可根據流程17製備。
1.使式(II)化合物和(XXX)在偶合劑與鹼,例如DIPEA的存在下,在溶劑中反應(流程17)。2.Fmoc的去保護可藉由和二級胺,例如嗎啉在溶劑,例如乙腈中反應達成。
在通用方法中,式(VI)化合物可根據流程18或19製備。
流程18
在通用方法中,式(VI)化合物可根據反應流程18製備。1.使化合物(II)和(XXXIV)在偶合劑、鹼與溶劑的存在下反應。2.胺保護基團(PG=Cbz或Fmoc)的去保護作用與脫苄基化作用可在流程1所述類似條件下達成,以生成胺(VI)。就PG=Cbz的情況而言,去保護作用與脫苄基化作用可在一個步驟完成。
1.使式(II)化合物和(XXXIII)在偶合劑、鹼與溶劑的存在下反應。2.在溶劑中,和PIFA重排且隨後3.脫苄基化作用可在流程1所述類似條件下達成,以生成胺(VI)。
關於以上流程:式(V)、(VIII)、(IX)、(XI)、(XII)、(XIII)、(XIV)、(XVIII)、(XIX)、(XXV)、XXIX)、(XXX)、(XXXI)、(XXXII)、(XXXIII)、(XXXIV)化合物可從市場採購或可藉由文獻習知方法或藉由熟習此藝者習知的方法製備。
製備本發明化合物的另外細節可在此後的中間物與實施例段落找到。
本發明之化合物的用途
本發明之化合物為BMP1、TLL1及/或TLL2活性的抑制劑,尤其可用於治療和BMP1、TLL1及/或TLL2活性相關的疾病,包括,舉例來說,治療
BMP1、TLL1及/或TLL2之抑制係具治療效益的疾病。舉例來說,本發明之化合物尤其可用於治療組織ECM(細胞外基質)產生及/或成熟之抑制將是有益,或肌肉生長抑制素活性之抑制將是有益的疾病。
在一些具體例中,該和BMP1、TLL1及/或TLL2活性相關的疾病是選自和身體器官或組織的病理性纖維化病況相關的疾病,譬如下列的此類病況:心臟(譬如心肌梗塞(“MI”)、心臟衰竭(譬如射血分率減少之心臟衰竭、射血分率正常之心臟衰竭)、心律不整(譬如心房顫動)、肥厚型心肌病變),肺(譬如慢性阻塞性肺病(“COPD”)、特發性肺纖維化(“IPF”)),腎(譬如糖尿病性腎臟病變、後急性腎損傷、慢性腎病(“CKD”)、移植後延遲移植物功能),肝(譬如肝硬化、非酒精性脂肪肝(“NASH”)),眼(譬如青光眼、角膜疤痕),骨骼肌(譬如肌營養不良症,包括裘馨氏、貝克氏、肢帶型、先天型、顏面肩胛肱骨型、肌強直型、眼咽型、遠端型、與艾瑞二氏),皮膚(譬如瘢瘤、傷口癒合、沾黏、肥厚性疤痕以及譬如和燒傷、手術與其他創傷相關的其他疤痕),血管系統(譬如中風、與膠原血管疾病,例如全身性紅斑狼瘡、類風濕關節炎與硬皮病),及神經系統(譬如脊髓損傷、多發性硬化)。
在一些具體例中,該和BMP1、TLL1及/或TLL2活性相關的疾病是選自特徵在於減少的肌肉功能和/或質量的肌肉疾病,譬如肌肉失養症(譬如裘馨氏、貝克氏、肢帶型、先天型、顏面肩胛肱骨型、肌強直型、眼咽型、遠端型、與艾瑞二氏)、肌少症、以及和譬如心臟衰竭、CKD、COPD、癌症或老年相關的惡病質。
據此,本發明提供一種在需要接受治療之一個體(譬如人類或其他哺乳動物,尤其是人類)治療和BMP1、TLL1及/或TLL2活性相關的疾病,舉例來說,本案列舉的疾病的方法,該方法包含投予該個體以一治療有效量的式(I)化合物,或彼等的鹽,尤其是彼等的藥學上可接受之鹽。
在一些具體例中,本發明化合物是在MI後投藥(即投至已罹患MI的個體),譬如用以治療和心肌梗塞相關的纖維化。在一些具體例中,本發明化合物是在MI後投藥,譬如用以預防和心肌梗塞相關的纖維化。
在一些具體例中,該治療方法包含投予本案所述特定化合物,譬如實施例的化合物,或其任何另擇異構物、游離酸/鹼形式、鹽形式、或另擇的鹽形式(尤其是藥學上可接受之鹽或另擇的藥學上可接受之鹽形式),如果適用的話。
在一些具體例中,該治療方法包含投予(S)-2-(5-乙氧基-3'-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)-[1,1'-聯苯]-3-基甲醯胺基)琥珀酸;(S)-2-(2-(羧基甲氧基)-4-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)苄醯胺基)琥珀酸;或(3-乙氧基-5-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)苯基)膦酸。在一些具體例中,該治療方法包含投予下列的藥學上可接受之鹽:(S)-2-(5-乙氧基-3'-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)-[1,1'-聯苯]-3-基甲醯胺基)琥珀酸;(S)-2-(2-(羧基甲氧基)-4-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)苄醯胺基)琥珀酸;或(3-乙氧基-5-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)苯基)膦酸。
本發明亦提供一種用於療法的式(I)化合物,或彼等的鹽,尤其是彼等的藥學上可接受之鹽。本發明係明確地提供一種式(I)化合物、或彼等的藥
學上可接受之鹽在治療和BMP1、TLL1及/或TLL2活性相關的疾病,舉例來說,本案列舉的疾病時,作為活性治療物質的用途。
在一些具體例中,用於療法,譬如用於治療和BMP1、TLL1及/或TLL2活性相關的疾病的化合物為本案所述特定化合物,譬如實施例的化合物,或彼等的任何另擇異構物、游離酸/鹼形式、鹽形式、或另擇鹽形式(尤其是藥學上可接受之鹽或另擇的藥學上可接受之鹽形式),若適用的話。
在一些具體例中,用於該療法的化合物為(S)-2-(5-乙氧基-3'-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)-[1,1'-聯苯]-3-基甲醯胺基)琥珀酸;(S)-2-(2-(羧基甲氧基)-4-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)苄醯胺基)琥珀酸;或(3-乙氧基-5-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)苯基)膦酸。在一些具體例中,用於該療法的化合物為下列的藥學上可接受之鹽:(S)-2-(5-乙氧基-3'-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)-[1,1'-聯苯]-3-基甲醯胺基)琥珀酸;(S)-2-(2-(羧基甲氧基)-4-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)苄醯胺基)琥珀酸;或(3-乙氧基-5-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)苯基)膦酸。
本發明亦提供式(I)化合物,或彼等的鹽,尤其是彼等的藥學上可接受之鹽在製造用於治療和BMP1、TLL1及/或TLL2活性相關的疾病,舉例來說,本案列舉的疾病之醫藥品的用途。
在一些具體例中,本發明提供本案所述特定化合物,譬如實施例的化合物,或彼等的任何另擇異構物、游離酸/鹼形式、鹽形式、或另擇鹽形式(尤其是藥學上可接受之鹽或另擇的藥學上可接受之鹽形式),若適用的話,在
製造用於治療和BMP1、TLL1及/或TLL2活性相關的疾病之醫藥品的用途。
在一些具體例中,本發明提供(S)-2-(5-乙氧基-3'-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)-[1,1'-聯苯]-3-基甲醯胺基)琥珀酸;(S)-2-(2-(羧基甲氧基)-4-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)苄醯胺基)琥珀酸;或(3-乙氧基-5-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)苯基)膦酸在製造用於治療和BMP1、TLL1及/或TLL2活性相關的疾病之醫藥品的用途。在一些具體例中,本發明提供(S)-2-(5-乙氧基-3'-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)-[1,1'-聯苯]-3-基甲醯胺基)琥珀酸;(S)-2-(2-(羧基甲氧基)-4-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)苄醯胺基)琥珀酸;或(3-乙氧基-5-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)苯基)膦酸的藥學上可接受之鹽在製造用於治療和BMP1、TLL1及/或TLL2活性相關的疾病之醫藥品的用途。
和BMP1、TLL1及/或TLL2活性相關的疾病的治療可使用本發明之化合物作為單一療法,以或雙重或多重組合療法來達成。舉例來說,本發明之化合物可和選自由下列所構成群組的一或多個治療活性劑組合投予:抗凝血劑、血管收縮素-轉化酶(ACE)抑制劑、血管收縮素II受體阻斷劑(ARBs)、貝他(“β”)-阻斷劑、醛固酮拮抗劑、利尿劑、血管擴張劑、降膽固醇藥物(譬如他汀類、纖維酸類、菸鹼酸、樹脂類)、他汀類、血小板拮抗劑、抗心律不整藥、鈣通道阻斷劑、促紅細胞生成劑(ESAs)、鐵、貝他促效劑、吸入或口服類固醇、抗膽鹼能藥、茶鹼、PdE4抑制劑、抗生素、其他抗纖維化劑、PdE5抑制劑、免疫調節劑、腦啡肽酶(neprilysin)抑制劑、與洋地黃製劑,譬如本領域習知的任何此類藥劑,以及彼等的組合。該等類別的特定治療
劑包括該等列於美國藥典(USP)者。將理解到特定活性劑可落於一或多個前述類別。此類劑可以,譬如本領域習知的治療有效量投予,或本領域習知的較少或較多份量,前提是該投予量在治療上是有效的。
舉例來說,心臟疾病的治療可包括投予選自下列群組的一或多劑:抗凝血劑、ACE抑制劑、ARBs、β-阻斷劑、醛固酮拮抗劑、利尿劑、血管擴張劑(譬如硝酸鹽)、降膽固醇藥物(譬如他汀類、纖維酸類、菸鹼酸、樹脂類)、血小板拮抗劑、抗心律不整藥、鈣通道阻斷劑、腦啡肽酶抑制劑、洋地黃製劑,以及彼等的組合。在特定例子中,心房顫動、心臟衰竭、或肥厚型心肌病變的治療可包含投予一或多個此類劑。
作為另一例子,CKD的治療可包括投予選自下列的一或多劑:ESAs、鐵、ACE抑制劑、ARBs、β-阻斷劑、利尿劑、鈣通道阻斷劑、他汀類,以及彼等的組合。
在其他例示性具體例中,COPD的治療可包括投予選自下列群組的一或多劑:貝他促效劑、吸入或口服類固醇、抗膽鹼能藥、茶鹼、PdE4抑制劑、抗生素,以及彼等的組合,
舉例來說,特發性肺纖維化可包括投予選自下列群組的一或多劑:抗纖維化劑、PdE5抑制劑、免疫調節劑,以及彼等的組合。
可用於和本發明之一或多個化合物組合,舉例來說,以治療心臟疾病的其他治療活性劑的特定例子包括:抗凝血劑,例如:達肝素(dalteparin)(FRAGMIN)、達那肝素(danaparoid)(ORGARAN)、依諾肝素(enoxaparin)(LOVENOX)、肝素、亭扎肝素(tinzaparin)(INNOHEP)、華法林(warfarin)(COUMADIN)、阿替普酶(alteplase)、阿司匹靈、阿德肝素(ardeparin)、磺達肝素(fondaparinux)、來匹盧定(lepirudin)、地塞米松(desirudin)、比伐盧定(bivalirudin)、尿激酶、利伐
沙班(rivaroxaban)、阿哌沙班(apixaban)、達比加群(dabigatran)、阿加曲班(argatroban);ACE抑制劑,例如貝那普利(benazepril)(LOTENSIN)、卡托普利(captopril)(CAPOTEN)、依那普利(enalapril)(VASOTEC)、福辛普利(fosinopril)(MONOPRIL)、賴諾普利(lisinopril)(PRINIVIL,ZESTRIL)、莫昔普利(moexipril)(UNIVASC)、培哚普利(perindopril)(ACEON)、喹那普利(quinapril)(ACCUPRIL)、雷米普利(Ramipril)(ALTACE)、群多普利(trandolapril)(MAVIK)、咪達普利(imidapril);ARBs,例如坎地沙坦(candesartan)(ATACAND)、依普沙坦(eprosartan)(TEVETEN)、厄貝沙坦(irbesartan)(AVAPRO)、氯沙坦(losartan)(COZAAR)、替米沙坦(telmisartan)(MICARDIS)、纈沙坦(valsartan)(DIOVAN)、奧美沙坦(olmesartan)、阿齊沙坦(azilsartan);貝他阻斷劑,例如醋丁洛爾(acebutolol)(SECTRAL)、阿替洛爾(atenolol)(TENORMIN)、倍他洛爾(betaxolol)(KERLONE)、比索洛爾(bisoprolol)/氫氯噻嗪(hydrochlorothiazide)(ZIAC)、比索洛爾(ZEBETA)、卡替洛爾(carteolol)(CARTROL)、美托洛爾(metoprolol)(LOPRESSOR,TOPROL XL)、納多洛爾(nadolol)(CORGARD)、普萘洛爾(propranolol)(INDERAL)、索他洛爾(sotalol)(BETAPACE)、噻嗎洛爾(timolol)(BLOCADREN);醛固酮拮抗劑,例如螺內酯(spironolactone)、依普利酮(eplerenone)、坎利酮(canrenone)(坎利酮鉀)、丙利酮(prorenone)(丙利酮鉀)、美替拉酮(mexrenone)(美替拉酮鉀);利尿劑,例如阿米洛利(amiloride)(MIDAMOR)、布美他尼(bumetanide)(BUMEX)、氯噻嗪(chlorthiazide)(DIURIL)、氯噻酮(chlorthalidone)(HYGROTON)、呋塞米(furosemide)(LASIX)、氫氯噻嗪(hydro-chlorothiazide)
(ESIDRIX,HYDRODIURIL)、吲達帕胺(indapamide)(LOZOL)、螺內酯(spironolactone)(ALDACTONE)、美托拉宗(metolazone)、托拉塞米(torsemide)、氨苯蝶啶(triamterene);血管擴張劑,例如硝基甘油、異山梨醇二硝酸酯(Isordil)、異山梨醇單硝酸酯、奈西立肽(nesiritide)(NATRECOR)、肼屈嗪(hydralazine)(APRESOLINE)
降膽固醇藥物,譬如他汀類,例如阿托伐他汀(atorvastatin)、氟伐他汀(fluvastatin)、洛伐他汀(lovastatin)、匹伐他汀(pitavastatin)、普伐他汀(pravastatin)、瑞舒伐他汀(rosuvastatin)、辛伐他汀(simvastatin),包括組合產品,例如ADVICOR(洛伐他汀/菸酸延長釋放)、Simcor(辛伐他汀/菸酸延長釋放)、與VYTORIN(辛伐他汀/依替米貝(ezetimibe));菸鹼酸(菸酸)、纖維酸類,例如吉非貝齊(gemfibrozil)(Lopid)、非諾貝特(fenofibrate)(TRICOR,FIBRICOR)、氯貝特(clofibrate);血小板拮抗劑,例如阿斯匹靈(aspirin)、梯可比定(ticlopidine)、氯吡格雷(clopidogrel)(PLAVIX)、雙嘧達莫(dipyridamole);抗心律不整藥,例如奎尼丁(quinidine)、普魯卡因胺(procainamide)、雙異丙吡胺(disopyramide)、利度卡因(lidocaine)、苯妥英(phenytoin)、每息禮定(mexiletine)、托卡胺(tocainide)、英卡胺(encainide)、氟卡尼(flecainide)、普羅帕酮(propafenone)、莫瑞西定(moricizine)、卡菲蒂羅(carvedilol)、普萘洛爾(propranolol)、艾司洛爾(esmolol)、噻嗎洛爾(timolol)、美托洛爾(metoprolol)、阿替洛爾(atenolol)、比索洛爾(bisoprolol)、胺碘酮(amiodarone)、索他洛爾(sotalol)、依布利特(ibutilide)、多非利特(dofetilide)、決奈達隆(dronedarone)、維拉帕米(verapamil)、地爾硫卓(diltiazem)、腺苷、地高辛(digoxin)、硫酸鎂;
鈣通道阻斷劑,例如氨氯地平(amlodipine)(NORVASC,LOTREL)、苄普地爾(bepridil)(VASCOR)、地爾硫卓(diltiazem)(CARDIZEM,TIAZAC)、菲多地平(felodipine)(PLENDIL)、尼費地平(nifedipine)(ADALAT,PROCARDIA)、尼莫地平(nimodipine)(NIMOTOP)、尼索地平(nisoldipine)(SULAR)、維拉帕米(verapamil)(CALAN,ISOPTIN,VERELAN)、伊拉地平(isradipine)、尼卡地平(nicardipine);腦啡肽酶抑制劑,例如沙庫必崔(sacubitril),包括,譬如沙庫必崔與纈沙坦(valsartan)的組合,例如LCZ696;洋地黃製劑,例如地高辛(digoxin)、洋地黃毒苷(digitoxin)。
組合療法包括以分開劑型或以單一劑型共同投予治療活性劑。組合療法可涉及同時投予或分開投予治療活性劑,其可為實質上同時或實質上分開投予。通常,組合療法將涉及投予各別劑,俾使各別劑的治療有效量係以至少一重疊期存在個體的身體。
在一些具體例中,組合療法包含投予本案所述特定化合物,譬如實施例的化合物,或彼等的任何另擇異構物、游離酸/鹼形式、鹽形式、或另擇的鹽形式(尤其是藥學上可接受之鹽或另擇的藥學上可接受之鹽形式),若適用的話,以及一或多個額外治療活性劑。
在一些具體例中,組合療法包含投予(S)-2-(5-乙氧基-3'-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)-[1,1'-聯苯]-3-基甲醯胺基)琥珀酸;(S)-2-(2-(羧基甲氧基)-4-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)苄醯胺基)琥珀酸;或(3-乙氧基-5-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)苯基)膦酸,以及一或多個額外的治療活性劑。在一些具體例中,組合療法包含投予下列的藥學上可接受之鹽:(S)-2-(5-乙氧基
-3'-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)-[1,1'-聯苯]-3-基甲醯胺基)琥珀酸;(S)-2-(2-(羧基甲氧基)-4-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)苄醯胺基)琥珀酸;或(3-乙氧基-5-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)苯基)膦酸,以及一或多個額外的治療活性劑。
據此,本發明提供一種組成物,其包含a)式(I)化合物或彼等的藥學上可接受之鹽及b)組合夥伴。如本案所用,適宜的組合夥伴包括一或多個其他治療活性劑,例如上文以分類說明或更特定地說明者。
本發明更提供一種在需要接受治療之一個體(譬如人類或其他哺乳動物,尤其是人類)治療和BMP1、TLL1及/或TLL2活性相關的疾病的方法,該方法包含投予該個體以一治療有效量的a)式(I)化合物或彼等的藥學上可接受之鹽及b)組合夥伴。該組合的個別組分可藉由任何方便的途徑在分開或合併的藥學調配物中依序或同時投予。
本發明更提供a)式(I)化合物或彼等的藥學上可接受之鹽及b)組合夥伴的組合。
在該組成物中,本發明之方法與組合包含組合夥伴,適宜的組合夥伴包括其他治療活性劑,例如上文以分類說明或更特定地說明者。
在該組成物的一些具體例中,本發明之方法與組合包含組合夥伴,式(I)化合物或彼等的藥學上可接受之鹽為本案所述特定化合物,譬如實施例的化合物,或任何另擇異構物、游離酸/鹼形式、藥學上可接受之鹽形式或其另擇的藥學上可接受之鹽形式,如果適用的話;在各式更特定具體例中,式(I)化合物或彼等的藥學上可接受之鹽為(S)-2-(5-乙氧基-3'-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)-[1,1'-聯苯]-3-基甲醯胺基)琥珀酸;(S)-2-(2-(羧基甲氧基)-4-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-羥
基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)苄醯胺基)琥珀酸;(3-乙氧基-5-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)苯基)膦酸;或彼等的藥學上可接受之鹽。
「治療有效量」係意圖指稱化合物的份量,在投至需要接受此類治療之一個體時,係足以實現治療,如本案所定義者。於是,舉例來說,本發明化合物,譬如式(I)化合物或彼等的藥學上可接受之鹽的治療有效量是此類劑,在投至需要接受治療之一個體(譬如人類)時,足以調節或抑制BMP1、TLL1及/或TLL2活性的量,俾使由該活性媒介或抑制的疾病病況係減少、減輕或避免。相當於此類份量的給定化合物份量將取決於下列因素而有所不同,例如特定化合物(譬如特定化合物的效力(pIC50)與生物半衰期)、疾病病況及其嚴重性、以及該需要接受治療之個體身份(譬如年齡、身高和體重),但仍可由熟習此藝者依照常規決定。同樣地,化合物的治療歷時與投藥時間週期(劑量之間的時間週期與劑量時點,譬如餐前/和餐/餐後)將根據該需要接受治療之個體身份(譬如體重)而有所不同,特定化合物及其性質(譬如藥學特性)、疾病及其嚴重性與使用的明確組成物與方法,但仍可由熟習此藝者決定。
在一些具體例中,0.1mg至1000mg(譬如0.1-500mg,或0.1-100mg)的本發明化合物,尤其是式(I)化合物或彼等的藥學上可接受之鹽係以一天兩次、一天一次、一週一次、或介於其間的頻率投予。在一些具體例中,本發明化合物,尤其是式(I)化合物或彼等的藥學上可接受之鹽係以每劑少於100mg(譬如每劑0.1-<100mg)的份量皮下投予。
「治療(Treat)」、「治療(treating)」或「治療(treatment)」係意圖指稱至少緩解一個體的疾病。用於緩解疾病的治療方法包括以任何習用可接受方式使用本發明之化合物,舉例來說,用以避免、延緩、預防、治療、改
善或治癒疾病。於是,治療可涉及至少緩解疾病的一或多個症狀。可尤其易感於使用本發明化合物之治療的特定疾病包括該等說明於本案者。
本發明之化合物可藉由任何適宜投藥途徑投予,包括全身性與局部性投藥。全身性投藥包括口服投藥、非經腸投藥、穿皮投藥、直腸投藥、以及藉由吸入投藥。口服投藥包括腸內(消化道)與頰內或舌下投藥。非經腸投藥指的是腸內、穿皮、或藉由吸入以外的投藥途徑,通常藉由注射或輸注進入組織或血液。非經腸投藥包括靜脈內、肌內、皮下、皮內、與穿皮植入物注射或輸注。吸入指的是投至個體的肺部,不論是經由嘴或經由鼻通道吸入。局部投藥包括施用至皮膚。
用於療法時,在投至一個體前,本發明之化合物將通常但不一定調配成藥學組成物。據此,本發明亦係指涉包含本發明化合物的藥學組成物,尤其是式(I)化合物或彼等的藥學上可接受之鹽,以及一或多個藥學上可接受之賦形劑。
本發明之藥學組成物可製備並包裝成批量形式,其中可提取本發明化合物的有效量且隨後,例如以粉劑、糖漿、與注射溶液給予該個體。另擇地,本發明之藥學組成物可製備並包裝成單元劑型。就口服施用而言,舉例來說,可投予一或多個錠劑或膠囊。一劑藥學組成物含有至少一治療有效量的本發明化合物(即,式(I)化合物,或彼等的鹽,尤其是藥學上可接受之鹽)。當製備成單元劑型時,該藥學組成物可含有0.1mg至1000mg(譬如0.1-500mg,或0.1-100mg)的本發明化合物。
該藥學組成物可包括一或多個本發明化合物及/或一或多個藥學上可接受之賦形劑。本發明之藥學組成物通常含有一個本發明化合物。然而,在某些具體例中,本發明之藥學組成物含有不止一個本發明化合物。此外,本發明之藥學組成物可任擇地再包含一或多個額外的藥學活性化合物,譬
如上文藉由分類或更特地說明的治療活性劑。
在一些具體例中,該藥學組成物包含a)0.01-100mg的式(I)化合物或彼等的藥學上可接受之鹽與b)0.001-900mg的一或多個藥學上可接受之賦形劑。在一些具體例中,該藥學組成物包含a)0.01-100mg/mL的式(I)化合物或彼等的藥學上可接受之鹽與b)0.001-900mg/mL的一或多個藥學上可接受之賦形劑。
在一些具體例中,該藥學組成物係視適包含本案所述特定化合物,譬如實施例的化合物、或任何另擇立體異構物、游離酸/鹼形式、藥學上可接受之鹽形式,或其另擇藥學上可接受之鹽形式。
在一些具體例中,該藥學組成物包含(S)-2-(5-乙氧基-3'-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)-[1,1'-聯苯]-3-基甲醯胺基)琥珀酸;(S)-2-(2-(羧基甲氧基)-4-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)苄醯胺基)琥珀酸;或(3-乙氧基-5-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)苯基)膦酸,以及一或多個藥學上可接受之賦形劑。在一些具體例中,該藥學組成物包含(S)-2-(5-乙氧基-3'-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)-[1,1'-聯苯]-3-基甲醯胺基)琥珀酸;(S)-2-(2-(羧基甲氧基)-4-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)苄醯胺基)琥珀酸;或(3-乙氧基-5-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)苯基)膦酸的藥學上可接受之鹽,以及一或多個藥學上可接受之賦形劑。
如本案所用,「藥學上可接受之賦形劑」意指意圖用於治療疾病的(多個)藥學活性成分(譬如本發明化合物)以外的一材料、組成物或載劑。藥學
上可接受之賦形劑係涉及提供有益於藥學組成物的性質或功能,舉例來說,一賦形劑可涉及改變組成物的物理、感受、穩定性、或藥代動力學性質,舉例來說,在賦予組合物形式或稠度、在堆積活性成分(譬如供方便、準確的分配)、在加強療法(譬如促進藥物吸收或溶解度,或其他藥代動力學性質)、在製造方法(譬如作為操作或加工助劑)、在穩定該組成物,或在加強個體順服度(譬如加強組成物的適口性或外觀)。在混摻時,各別賦形劑必須相容於藥學組成物的其他成分,俾使在投至一個體時,不會發生實質上降低本發明化合物(或任何其他活性成分,若出現的話)的效力的交互作用,以及將產生足夠高純度的藥學組成物的交互作用,使其在藥學上可接受。
本發明之化合物與藥學上可接受之賦形劑(excipient)或多個賦形劑(excipients)通常將會調配成適於以所欲投藥途徑投至個體的劑型。習用劑型包括該等適於(1)口服投藥,例如錠劑、膠囊、囊片、藥丸、口含片、藥片、粉劑、糖漿、酏劑、懸浮液、溶液、乳劑、藥囊(sachets)與藥包(cachets);(2)非經腸投藥,例如無菌溶液、懸浮液、親液劑(lyophiles)、微粒、奈米載體、植入物、預製植入物與重組粉末;(3)透皮投藥,例如透皮貼片;(4)直腸投藥,例如栓劑;(5)吸入,例如氣霧劑與溶液;以及(6)局部投藥,例如乳霜、軟膏、洗劑、溶液、糊膏、噴霧劑、泡沫、凝膠、皮膚貼片、與透皮貼片或噴霧劑。
適宜的藥學上可接受之賦形劑將取決於所選特定劑型而有所不同。此外,適宜的藥學上可接受之賦形劑可依據彼等可在組成物發揮之特定功能來挑選。舉例來說,某些藥學上可接受之賦形劑可依據彼等的下列能力來挑選:有助於製造均一劑型、有助於製造穩定劑型、有助於在一旦投至個體,將本發明之化合物或多個化合物從一器官、或身體部位攜帶或運送至另一器官、或身體部位、及/或加強個體順服度。
適宜的藥學上可接受之賦形劑包括下列類型的賦形劑:稀釋劑、填充劑、黏結劑、崩解劑、潤滑劑、助流劑、粒化劑、包衣劑、潤濕劑、溶劑、共-溶劑、懸浮劑、乳化劑、甜味劑、加味劑、掩味劑、著色劑、防結塊劑、保濕劑、螯合劑、塑化劑、增黏劑、抗氧化劑、防腐劑、穩定劑、表面活性劑、載劑和緩衝劑。熟習此藝者將理解到某些藥學上可接受之賦形劑可發揮不止一種功能並可發揮另擇功能,其取決於調配物內存在多少賦形劑及調配物內存在什麼其他成分。
熟習此藝者擁有本領域的知識和技術,使得他們能夠選擇適宜的藥學上可接受之賦形劑用於本發明的適當份量。此外,熟習此藝者可取得說明藥學上可接受之賦形劑並可用於選擇適宜藥學上可接受之賦形劑的眾多資源。例子包括Remington's Pharmaceutical Sciences(Mack Publishing Company)、The Handbook of Pharmaceutical Additives(Gower Publishing Limited)、與The Handbook of Pharmaceutical Excipients(the American Pharmaceutical Association and the Pharmaceutical Press),包括當前與過去的版本。
本發明的藥學組成物係使用熟習此藝者所習知的技術與方法來製備。本領域普遍使用的若干方法係說明於Remington's Pharmaceutical Sciences(Mack Publishing Company)。
在一態樣中,本發明係指涉固體口服劑型,例如錠劑或膠囊,其包含一有效量之本發明化合物與稀釋劑或填充劑、與任擇地黏結劑、崩解劑、及/或潤滑劑。適宜的稀釋劑與填充劑包括乳糖、蔗糖、葡萄糖、甘露醇、山梨醇、澱粉(譬如玉米澱粉、馬鈴薯澱粉和預膠化澱粉)、纖維素及其衍生物(譬如微晶纖維素)、硫酸鈣、和磷酸氫鈣。適宜的黏結劑包括澱粉(譬如玉米澱粉、馬鈴薯澱粉和預膠化澱粉)、明膠、阿拉伯膠、藻酸鈉、藻酸、
黃蓍膠、瓜爾膠、聚維酮(povidone)、和纖維素及其衍生物(譬如微晶纖維素)。適宜的潤滑劑包括硬脂酸、硬脂酸鎂、硬脂酸鈣、與滑石。
在另一態樣中,本發明係指涉非經腸調配物,譬如原位凝膠、微球、奈米球、奈米懸浮液,或凍乾產品,以在皮下和/或肌內投藥之後控制化合物的釋放,該調配物包含本發明化合物、表面活性劑及/或聚合載劑及/或助溶賦形劑及/或控制滲透力的賦形劑。適宜的表面活性劑包括聚山梨酯、聚乙烯醇、聚乙烯基吡咯烷酮以及彼等的組合。適宜的聚合載劑包括聚乙二醇、聚甲基丙烯酸酯、乙烯乙酸乙烯酯共聚物、聚乳酸、聚氧乙烯脂肪酸酯、聚(乳酸-共-乙醇酸)、聚(ε-己內酯)、聚(對二氧雜環己酮)、聚(酸酐酯)以及彼等的組合。適宜的助溶賦形劑包括正甲基吡咯烷酮、聚乙氧基化蓖麻油(譬如CREMOPHOR,例如CREMOPHOR EL)、聚山梨酯、Solutol®(Macrogol 15羥基硬脂酸酯Ph.Eur;Polyoxyl 15羥基硬脂酸酯USP)、乙醇以及彼等的組合。適宜的控制滲透力的賦形劑(在親液劑的情況中,使凍乾材料膨大)包括甘露醇、蔗糖、甘胺酸、與聚乙烯基吡咯烷酮。
原位凝膠可藉由將本發明化合物溶於溶劑相與(多個)不溶於水的聚合載劑來製備。隨後,譬如藉由伽瑪照射將溶液滅菌。
奈米懸浮液或微米尺寸懸浮液可藉由合併本發明化合物、表面活性劑、聚合載劑與控制水相滲透力的賦形劑,隨後在水相中將該組合球磨或微米流體化,將化合物顆粒尺寸製成小於5μM,譬如小於1μm,或譬如介於100nm至小於5μm或至小於1μm之間來製備。將奈米懸浮液滅菌,譬如利用藉由末端加熱滅菌或伽瑪照射技術。
微球與奈米球可藉由本領域習知的各種方法製備,包括涉及包括本發明化合物與(多個)聚合物的水/油/水乳化方法、溶劑/油/水乳化方法、油/水乳化方法、有機相分離或熔融擠出/低溫球磨技術,以控制藥物遞送。將顆
粒製成小於100μm作為微球及介於100nm至小於1μm之間作為奈米球。微球與奈米球可繼續進一步加工,包括凍乾,並需要滅菌,譬如經由伽瑪照射。
凍乾產品可適宜地包括0.01-100mg/ml濃度的本發明化合物、表面活性劑、聚合載劑、與助溶賦形劑。提供凍乾產品的一般條件涉及形成產品成分的溶液或懸浮液、將該溶液或懸浮液降至玻璃轉變之下,提供差壓以拉出水相和/或溶劑相,並緩慢升高溫度以形成凍乾塊。
下列實施例係例示本發明。該等實施例並非意圖限制本發明之範疇,而是提供熟習此藝者製備與使用本發明之化合物、組成物、與方法的指導。儘管說明了本發明的特定具體例,但熟習此藝者將理解到,可進行各式改變與更動,而無逸離本發明之精神與範疇。
熟習此藝者將理解到純化方法(使用酸性或鹼性改質劑)或化合物後處理流程(使用酸性或鹼性條件)可能導致形成標題化合物的鹽(舉例來說,標題化合物的氫溴酸、甲酸、氫氯酸、三氟乙酸、或銨鹽)。本發明意圖涵蓋此類鹽。在實施例中,母體化合物係以結構繪示。
在下列實驗說明中,可使用下列縮寫:
步驟1:甲醛O-苄基肟
經由加液漏斗將O-苄基胲氫氯酸鹽(308g,1930mmol)溶於三級丁基甲醚(1800ml)的懸浮液加至氫氧化鈉(93g,2316mmol)溶於水(570ml)的溶液。以水(15ml)潤洗該漏斗並使反應攪拌10分鐘。隨後經由加液漏斗以~20分鐘慢慢添加甲醛(37% wt,溶於水,150ml,2015mmol)。以水(15ml)潤洗該漏斗並使反應混合物於25℃攪拌3小時。隨後層分離,有機相以0.2N HCl(480ml)、5% NaHCO3溶液(300ml)、與10%鹽水溶液(480ml)洗滌。隨後將有機層分離並濃縮,給予如同無色油狀物的標題化合物(247g,90%產率)。MS(m/z)136.1(M+H+)。
步驟2:2-(((苄氧基)胺基)甲基)庚酸
在氮下,於室溫,將乙腈(1250ml)與碘化鈉(931g,6213mmol)填至6l
反應器容器。使混合物劇烈攪拌10分鐘,隨後添加氯三甲基矽烷(790ml,6224mmol)。於室溫攪拌15分鐘後,使反應冷卻至15℃。添加三乙胺(870ml,6242mmol)。隨後慢慢添加庚酸(264ml,1864mmol),使溫度維持低於35℃。以乙腈(50ml)潤洗加液漏斗。使混合物於室溫攪拌15分鐘並添加甲醛O-苄基肟(247g,1827mmol)。以乙腈(120ml)潤洗加液漏斗。使反應於室溫攪拌17小時。隨後使反應混合物冷卻至12℃並以硫代硫酸鈉(491g,3107mmol)溶於水(2250ml)的新鮮製備溶液淬熄,使溫度維持低於30℃。使反應攪拌20分鐘,隨後以6N HCl(330ml,1980mmol)將反應的pH調至pH~4。攪拌10分鐘後,添加乙酸乙酯(500ml)。使混合物攪拌5分鐘,隨後層遂分離。水層以乙酸乙酯(1750ml)回萃。合併的有機層以水(2 x 1250ml)與5%鹽水(1250ml)洗滌,隨後分離並濃縮,給予620g粗製產品,如同黃色油狀物。使粗製殘餘物預吸附至矽膠上並藉由快速層析純化(ISCO Torrent,1.5kg RediSep管柱,1-5% DCM/MeOH(6回)),給予三批標題化合物:如同無色油狀物(176g,35%產率)、如同白色固體(206g,41%產率)及如同無色油狀物(8g,2%產率)。MS(m/z)266.1(M+H+)。
步驟3:1-(苄氧基)-3-戊基氮雜環丁-2-酮
在氮流下,將6l反應器填以甲苯(1750ml)與2,6-二甲基吡啶(232ml,1990mmol)。添加磷醯三氯(99ml,1061mmol)並使混合物加熱至50℃。以40分鐘添加2-(((苄氧基)胺基)甲基)庚酸(176g,663mmol)溶於甲苯(1050ml)的溶液,同時使溫度維持低於55℃。以甲苯(100ml)潤洗加液漏斗。隨後使反應混合物於50℃攪拌1小時。隨後使反應混合物冷卻至20℃,隨後倒出。反應器以甲苯(400ml)潤洗並和反應混合物合併。隨後將反應器填以水(1600ml)與Na2CO3(239g,2255mmol)。將反應混合物慢慢加至Na2CO3溶液,同時使溫度維持低於35℃。添加容器以甲苯(400ml)潤洗。使雙相混合物於35
℃攪拌30分鐘。層分離,將水層倒出。使有機相於3℃過夜,隔天早上升溫至35℃,之後繼續後處理。有機相係以下列依序洗滌,以避免乳化形成:濃HCl(123ml)與10%鹽水(1400ml)的混合溶液,10%鹽水溶液(900ml),5% NaHCO3溶液(900ml),攪拌10分鐘,隨後10%鹽水溶液(900ml)。將有機相分離並濃縮,給予如同黃色油狀物的粗製產物。使粗製殘餘物預吸附至矽膠上並藉由快速層析純化(ISCO Torrent 1.5kg RediSep管柱,DCM/MeOH 0-5%),得到如同黃色油狀物的標題化合物(87g,52%產率)。MS(m/z)248.1(M+H+)。
步驟4:(R)-1-(苄氧基)-3-戊基氮雜環丁-2-酮
將1-(苄氧基)-3-戊基氮雜環丁-2-酮(220g,889mmol)投至利用SFC-70 Thar prep系統的對掌性分離。(Chiralpak AS-H管柱,於室溫,15%異丙醇,50g/min,5分鐘運行時間,濃度250mg/ml)。將適當的分段濃縮,產生兩批標題化合物(13.5g,53.5mmol,6.0%產率,>96% ee)與(87g,345mmol,38.8%產率,96% ee)。MS(m/z)248.1(M+H+)。
步驟5:(R)-2-(((苄氧基)胺基)甲基)庚酸
對(R)-1-(苄氧基)-3-戊基氮雜環丁-2-酮(10.0g,40.4mmol)溶於THF(108ml)與水(53.9ml)的懸浮液以逐滴方式添加氫氧化鋰(4.84g,202mmol)溶於水(53.9ml)的新鮮製備溶液。隨後使反應於室溫攪拌18小時。隨後使反應冷卻至-5℃並逐滴添加1M HCl,直到獲得pH 5。反應以乙酸乙酯萃取兩次,合併的有機層隨後以鹽水洗滌,乾燥並濃縮,給予如同濃稠清澈油狀物的標題化合物,其不經進一步純化或定性即使用。
步驟6:(R)-2-((N-(苄氧基)甲醯胺基)甲基)庚酸
將甲酸(4.65ml,121mmol)逐滴加至CDI(19.7g,121mmol)溶於DCM(79ml)的溶液,並於室溫攪拌45分鐘。隨後添加(R)-2-(((苄氧基)胺基)甲基)
庚酸(10.7g,40.4mmol)溶於DCM(79ml)的溶液,並使反應於室溫攪拌2小時。反應以1M HCl分配,有機層係藉由疏水玻璃料收集並濃縮,給予濃稠黃色油狀物,將其溶於最少量的DCM並通過Si塞(250g矽膠,DCM,50:50 DCM:醚且醚係於250ml分段)。將最清澈的分段濃縮,產生如同清澈油狀物的標題化合物(3.65g,97% ee)。將額外的分段濃縮,產生8g橙色油狀物,其係藉由快速層析純化(ISCO Companion,120g,15-100%乙酸乙酯/己烷),給予額外批次如同橙色油狀物的標題化合物(2.38g,97% ee與1.38g,97% ee)。MS(m/z)294.1(M+H+)。
步驟1:4-苯基丁醯氯
於0℃,將草醯氯(6ml,68.5mmol)加至4-苯基丁酸(7g,42.6mmol)溶於DCM(207ml)與幾滴DMF的溶液。並使反應升溫至室溫過夜,隨後濃縮,給予如同黃色油狀物的標題化合物,其不經進一步純化或定性即使用。
步驟2:(S)-4-苄基-3-(4-苯基丁醯基)噁唑烷-2-酮
於-78℃、N2之下,將正丁基鋰(2.7M,溶於庚烷,16.7ml,45.2mmol)逐滴加至(S)-4-苄基噁唑烷-2-酮(7.28g,41.1mmol)溶於THF(91ml)的溶液。於-78℃攪拌30分鐘後,添加4-苯基丁醯氯(7.5g,41.1mmol),並使反應於-78℃攪拌1.5小時,隨後於0℃攪拌2小時。隨後添加NH4Cl(150ml),混合物以EtOAc(2 x)萃取。合併的有機層以Na2SO4乾燥,過濾並濃縮,給予如同白色結晶的標題化合物(13.2g,99%產率)。MS(m/z)324.2(M+H+)。
步驟3:(S)-4-苄基-3-((R)-2-((苄氧基)甲基)-4-苯基丁醯基)噁唑烷-2-酮
於0℃,將DIPEA(8.28ml,47.4mmol)逐滴加至(S)-4-苄基-3-(4-苯基丁醯基)噁唑烷-2-酮(13.9g,43.1mmol)與TiCl4(4.99ml,45.3mmol)溶於DCM(122ml)的溶液。於0℃攪拌1.5小時後,添加((氯甲氧基)甲基)苯(11.99ml,86mmol),並使反應於0℃攪拌3小時。隨後反應以水(150ml)淬熄並以DCM(2 x)萃取。將合併的有機層分離,以MgSO4乾燥並濃縮。殘餘物係經由快速層析純化(ISCO,320g管柱,己烷:5分鐘;0-10% EtOAc/己烷:15分鐘;10-30%:EtOAc/DCM:5分鐘),給予如同清澈油狀物的標題化合物(14.7g,77%產率)。MS(m/z)444.2(M+H+)。
步驟4:(R)-2-((苄氧基)甲基)-4-苯基丁酸
(S)-4-苄基-3-((R)-2-((苄氧基)甲基)-4-苯基丁醯基)噁唑烷-2-酮(14.7g,33.0mmol)溶於THF(78ml)與水(25.9ml)的混合物係以過氧化氫(30%溶於水,27.0ml,264mmol)處理,接著於0℃添加氫氧化鋰(1.58g,66.1mmol)。並使反應升溫至室溫過夜。THF係於減壓下移除,殘餘物以DCM萃取。以水(2 x)洗滌DCM層。隨後經由添加6N HCl,將合併的水性層酸化至pH 3,隨後以EtOAc萃取(4 x)。合併的乙酸乙酯萃取液以Na2SO4乾燥,過濾並濃縮,給予如同清澈油狀物的標題化合物(9.5g)。MS(m/z)267.1(M-17+)。
步驟5:(R)-2-(羥基甲基)-4-苯基丁酸
在N2之下,將(R)-2-((苄氧基)甲基)-4-苯基丁酸(9.5g,33.4mmol)溶於乙醇(130ml)的溶液加至Pd/C(2.94g,2.76mmol),將反應投至氫化作用,於Parr振盪器以~35psi於室溫過夜。隨後將反應經由Celite®墊過濾並將濾液濃縮,給予如同清澈油狀物的標題化合物(6.65g)。MS(m/z)177.1(M-17+)。
步驟6:(R)-N-(苄氧基)-2-(羥基甲基)-4-苯基丁醯胺
於0℃,將EDC(6.56g,34.2mmol)加至(R)-2-(羥基甲基)-4-苯基丁酸(6.65g,34.2mmol)、O-苄基胲氫氯酸鹽(5.46g,34.2mmol)、與DMAP(8.37g,68.5mmol)溶於DCM(143ml)的溶液,並使反應升溫至室溫過夜。隨後添加1N HCl(55ml),反應以DCM(2 x)萃取。合併的有機萃取液以Na2SO4乾燥,過濾並濃縮,給予如同白色固體的標題化合物(9.52g,93%產率)。MS(m/z)300.1(M+H+)。
步驟7:(R)-1-(苄氧基)-3-苯乙基氮雜環丁-2-酮
於0℃,將DIAD(7.42ml,38.2mmol)加至(R)-N-(苄氧基)-2-(羥基甲基)-4-苯基丁醯胺(9.52g,31.8mmol)與三苯膦(10.0g,38.2mmol)溶於THF(200ml)的溶液,並使反應升溫至室溫,達3.5小時。隨後添加水(100ml),反應以DCM(2 x)萃取。合併的有機層以MgSO4乾燥並濃縮。使殘餘物和Et2O(3 x)研磨並過濾移除固體。將濾液濃縮並經由快速層析純化(ISCO,220g管柱,0-20% EtOAc/己烷:15分鐘,20% EtOAc/己烷:10分鐘),給予如同清澈油狀物的標題化合物(5.06g,57%產率)。MS(m/z)282.1(M+H+)。
步驟8:(R)-2-(((苄氧基)胺基)甲基)-4-苯基丁酸
溶於THF(54ml)、甲醇(18ml)與水(18ml)的(R)-1-(苄氧基)-3-苯乙基氮雜環丁-2-酮(5.06g,18.0mmol)係以氫氧化鋰(4.30g,180mmol)於室溫處理1.5天。在減壓下移除揮發物,添加6N HCl將殘餘物酸化至~pH 5-6。混合物以EtOAc(2 x)萃取,合併的有機層以Na2SO4乾燥,過濾並濃縮,給予如同清澈油狀物的標題化合物(5.7g)。MS(m/z)300.1(M+H+)。
步驟9:(R)-2-((N-(苄氧基)甲醯胺基)甲基)-4-苯基丁酸
將甲酸(1.5ml,39.1mmol)逐滴加至CDI(6.3g,38.9mmol)溶於DCM(320ml)的溶液,並使反應攪拌40分鐘,之後逐滴添加(R)-2-(((苄氧基)胺基)甲基)-4-苯基丁酸(5g,16.7mmol)溶於DCM(40ml)的溶液。使反應於室溫
攪拌2小時,隨後以1N HCl快速洗滌。將有機層分離,以水洗滌,以Na2SO4乾燥,過濾並濃縮,給予如同黏稠黃色油狀物的標題化合物(5.8g)。MS(m/z)328.1(M+H+)。
步驟1:(R)-4-苄基-3-庚醯基噁唑烷-2-酮
將(R)-4-苄基噁唑烷-2-酮(9.95g,56.2mmol)溶於無水THF(100ml),並使混合物於乾冰丙酮浴中冷卻。在氮下,以5分鐘添加BuLi(2.7M,溶於己烷,20.8ml,56.2mmol),導致顏色變成暗黃。添加溶於二噁烷的HCl研磨,該顏色退掉,隨後以足夠的BuLi再處理,使混合物轉為微黃。隨後添加庚醯氯(8.87ml,57.3mmol)。使混合物攪拌~30分鐘,隨後添加額外的庚醯氯(3ml)。隨後反應以慢慢加水(10ml)淬熄。注意到固體形成,添加額外的水,以獲得溶液。添加EtOAc(300ml),層遂分離。有機層以飽和碳酸鈉水溶液洗滌,隨後以硫酸鈉乾燥,過濾並濃縮。將殘餘物溶於庚烷,隨後濃縮成濃稠油狀物。將殘餘物溶於庚烷(100ml)並使混合物於丙酮/乾冰浴中冷卻,同時攪拌。過濾收集所得沉澱物並於真空乾燥過夜,給予如同白色固體的標題化合物(15.1g,93%產率),其不經進一步純化或定性即使用。
步驟2:(R)-4-苄基-3-((R)-2-((S)-1-羥基丙基)庚醯基)噁唑烷-2-酮
在N2下、冰-丙酮浴中,對(R)-4-苄基-3-庚醯基噁唑烷-2-酮(15g,51.8mmol)溶於DCM(300ml)的溶液添加TiCl4(6.00ml,54.4mmol)。隨後慢慢添加DIPEA(9.96ml,57.0mmol),接著添加NMP(9.98ml,104mmol)並使
混合物攪拌15分鐘。隨後添加丙醛(7ml,95mmol)並使反應攪拌1.5小時。隨後添加AcOH溶於DCM(15ml,50:50體積之混合)的溶液淬熄反應。添加洛瑟耳鹽(Rochelles鹽)水溶液,接著添加aq.HCl(50% v/v),以溶解任何固體。隨後層分離,水相以額外的DCM萃取。合併的有機萃取液係以aq.NaHSO3處理30分鐘,隨後使該層於分離漏斗中靜置過夜。隨後將有機層分離,經由矽膠塞(~3cm)過濾,將濾液合併,濃縮並於真空乾燥,給予標題化合物(19g,87%產率),其不經進一步純化即使用。
步驟3:(R)-N-(苄氧基)-2-((S)-1-羥基丙基)庚醯胺
使THF煮沸逸出2l JLR以N2沖掃該反應器,同時冷卻至室溫。添加O-苄基胲氫氯酸鹽(16.0g,100mmol)並以N2沖掃該容器。隨後添加THF(800ml)並使混合物冷卻至0℃。隨後慢慢添加三甲基鋁(50ml,2M,溶於甲苯,100mmol)。使白色淤漿攪拌15分鐘,獲得清澈溶液。隨後經由套管以5分鐘添加(R)-4-苄基-3-((R)-2-((S)-1-羥基丙基)庚醯基)噁唑烷-2-酮(18g,51.8mmol)溶於THF(200ml)的溶液,並使混合物於0℃攪拌1.5小時。使反應混合物升溫至5℃。另外,將O-苄基胲氫氯酸鹽(5g,31mmol)溶於THF(100ml),並於0℃以三甲基鋁(17ml,2M,溶於甲苯,34mmol)處理。使混合物攪拌,直到獲得溶液,隨後經由套管加至主要反應。隨後添加sat.aq.KHSO4淬熄反應。添加HCl溶液(500ml水,500ml濃HCl),層遂分離。將有機層縮減體積並再和水相合併,經由旋轉蒸發器移除揮發物,並形成白色沉澱物formed。固體係藉由過濾收集,並以10% HCl洗滌,隨後以水洗滌。濾塊隨後以甲苯(2 x 100ml)洗滌並風乾,給予標題化合物(10.7g,70.1%產率)。MS(m/z)294.3(M+H+)。
步驟4:(3R,4R)-1-(苄氧基)-4-乙基-3-戊基氮雜環丁-2-酮
將(R)-N-(苄氧基)-2-((S)-1-羥基丙基)庚醯胺(4.61g,15.7mmol)溶於吡
啶(14ml)並於冰浴冷卻。隨後添加甲磺醯氯(2.45ml,31.4mmol),使內部溫度維持低於10℃。隨後使反應攪拌2小時。反應係藉由添加TBME(23ml)稀釋並添加1M HCl(46ml),同時施行冷卻。短暫攪拌後,層遂分離。有機層以1M HCl(23ml)、sat.aq.NaHCO3(9ml)與鹽水(9ml)洗滌,隨後濃縮至最小容積,隨後溶於丙酮(46ml)。添加K2CO3(6.51g,47.1mmol)並使反應於50℃加熱1小時。隨後使反應冷卻至室溫並過濾。以丙酮(2 x 23ml)潤洗燒瓶與濾塊。將濾液濃縮,給予標題化合物(4.26g),其不經進一步純化即使用。
步驟5:(R)-2-((R)-1-((苄氧基)胺基)丙基)庚酸
將(3R,4R)-1-(苄氧基)-4-乙基-3-戊基氮雜環丁-2-酮(356g,1.27mol)溶於2-甲基四氫呋喃(3560ml)。添加四丁基氫氧化銨(40%水溶液,1245ml,1.90mol)。使反應加熱至50℃,歷時2小時,隨後冷卻至室溫。反應以水稀釋(1780ml)並以6M HCl(338ml)酸化至pH 3-4。相遂分離,將有機相濃縮至5分之一體積(1780ml),其不經進一步純化即使用。
步驟6:(R)-2-((R)-1-(N-(苄氧基)甲醯胺基)丙基)庚酸
使羰基二咪唑(822g,5.07mol)懸浮於2-甲基四氫呋喃(5340ml)並冷卻至0℃。經由加液漏斗逐滴添加甲酸(88%,276ml,6.33mol)。使反應於5℃攪拌10分鐘,隨後升溫至室溫,達額外的30分鐘。使反應回冷至5℃,並添加溶於2-甲基四氫呋喃的(R)-2-((R)-1-((苄氧基)胺基)丙基)庚酸酸(1780ml溶液,得自先前步驟)。使反應升溫至室溫並攪拌40分鐘。在分開的容器中,使羰基二咪唑(279g,1.72mol)懸浮於2-甲基四氫呋喃(1500ml)並冷卻至0℃。經由加液漏斗逐滴添加甲酸(88%,93.8ml,2.16mol)並於5℃攪拌10分鐘,隨後升溫至室溫,達額外的30分鐘。隨後於5℃,經由加液漏斗將此混合物逐滴添加至原始反應。使反應升溫至室溫並攪拌60分鐘。隨後使反
應冷卻至10℃並添加NaOH(4M,2122ml)至pH 9來淬熄。相遂分離,有機相以6M HCl與鹽水(4561ml)的1:1混合物(v/v)洗滌。相遂分離,將有機相濃縮至3.5之一體積(1246ml),給予標題化合物,如同溶於2-甲基四氫呋喃之30重量%溶液(1.15kg,等於346g粗製標題產品)。
步驟5與6係以(3R,4R)-1-(苄氧基)-4-乙基-3-戊基氮雜環丁-2-酮(365g)規模重複,提供第二批的(R)-2-((R)-1-(N-(苄氧基)甲醯胺基)丙基)庚酸,如同溶於2-甲基四氫呋喃的36重量%溶液(1.09kg,等於363g粗製標題產品)。此方法(步驟5與6)係以20g規模再次重複,提供(R)-2-((R)-1-(N-(苄氧基)甲醯胺基)丙基)庚酸,如同溶於2-甲基四氫呋喃的30重量%溶液(66g,等於19.8g粗製標題產品)。
將粗製標題化合物溶於2-甲基四氫呋喃的30重量%溶液(1.15kg,346g粗製)濃縮,和己烷共沸三次,隨後以己烷(2500ml)稀釋。以先前SFC純化得到的結晶做為溶液的晶種。隨後使氮通過溶液,同時攪拌過夜。將所得晶質材料弄破,以己烷稀釋並於室溫攪拌30分鐘,隨後過濾,給予如同淡黃色晶質固體的標題化合物(275g)。
將粗製標題化合物的36重量%(1.09kg,363g粗製)與30重量%(66.04g,19.8g粗製)濃縮,和甲醇共沸三次並和來自初始30重量%批次的濾液合併。殘餘物以甲醇稀釋成200mg/ml濃度並藉由SFC純化(Thar SFC-70,DEAP管柱,5μM,30 x 250mM,i.d.,以35%等張甲醇共溶劑沖提,60g/min,運行7分鐘),給予如同黃色油狀物的標題化合物。該油狀物以己烷(2500ml)稀釋,以先前單離得到的結晶做為溶液的晶種。將氮通過溶液,同時攪拌過夜。將所得晶質材料弄破,以己烷稀釋,並於室溫攪拌30分鐘,隨後過濾,給予如同淡黃色晶質固體的標題化合物(360g)。MS(m/z)322.0(M+H+)。
中間物4係藉由類似於中間物3所說明的方法,從4-苯基丁醯氯製備。
中間物5可根據WO2009061879第55頁在中間物A詳細說明的流程製備。
步驟1:(9H-芴-9-基)甲基(2-胺基-2-酮基乙基)胺基甲酸酯
2-胺基乙醯胺氫氯酸鹽(231g,2.09mol)溶於DCM(4l)的混合物係於0℃以DIPEA(1.1l,6.27mol)處理,隨後以(9H-芴-9-基)甲基碳醯氯(541g,2.09mol)逐滴處理。使此混合物攪拌1小時並升溫至室溫,隨後以水(2l)處理。過濾收集白色沉澱物,隨後以水、DCM、水與Et2O充分洗滌,隨後風乾,給予如同白色固體的標題化合物(618g,80%產率)。MS(m/z)297.0(M+H+)。
步驟2:(9H-芴-9-基)甲基(胺基甲基)胺基甲酸酯,三氟乙酸鹽
對[雙(三氟乙氧基)碘]苯(109g,253mmol)、水(800ml)、與THF(800ml)的溶液添加(9H-芴-9-基)甲基(2-胺基-2-酮基乙基)胺基甲酸酯(50g,169mmol),並以頂置式攪拌器使混合物攪拌60分鐘。添加乙醚(1l)與己烷(250ml),層遂分離。水相以乙醚(600ml)洗滌。將合併的有機萃取液濃縮至350ml總體積,隨後添加己烷(600ml),同時攪拌。使混合物再攪拌1.5小時,隨後過濾收集沉澱物,生成如同灰白色固體的標題化合物(32.8g,51%產率)。MS(m/z)269.1(M+H+)。
步驟1:(R)-(9H-芴-9-基)甲基((2-((N-(苄氧基)甲醯胺基)甲基)庚醯胺基)
甲基)胺基甲酸酯
將(R)-2-((N-(苄氧基)甲醯胺基)甲基)庚酸(1.13g,3.84mmol)溶於DMF(10.8ml)並以HATU(1.46g,3.84mmol)處理。添加9H-芴-9-基)甲基(胺基甲基)胺基甲酸酯氫氯酸鹽(1.17g,3.84mmol),接著添加DIPEA(2.01ml,11.5mmol)。使反應於室溫攪拌18小時。反應隨後以EtOAc稀釋(100ml)與水(50ml)。層遂分離,水相以EtOAc(50ml)洗滌。合併的有機萃取液以鹽水洗滌(1 x 20ml)、以MgSO4乾燥,過濾,並濃縮。殘餘物係藉由快速層析純化(120g矽膠管柱,30% EtOAc/己烷,10分鐘;30-50% EtOAc/己烷,3分鐘;50% EtOAc/己烷,15分鐘),生成如同白色固體的標題化合物(1.4g,67.1%產率)。MS(m/z)544.3(M+H+)。
步驟2:(R)-N-(胺基甲基)-2-((N-(苄氧基)甲醯胺基)甲基)庚醯胺
使(R)-(9H-芴-9-基)甲基((2-((N-(苄氧基)甲醯胺基)甲基)庚醯胺基)甲基)胺基甲酸酯(1.4g,2.6mmol)懸浮於乙腈(12ml)並於室溫以嗎啉(6ml,68.9mmol)處理。使反應於室溫攪拌2小時。過濾收集形成的白色固體並以醚洗滌。將合併的濾液濃縮,殘餘物係藉由快速層析純化(40g管柱,100% DCM,5分鐘;0-10% MeOH/DCM,12分鐘;10% MeOH/DCM,5分鐘,生成如同清澈、無色油狀物的標題化合物(0.66g,80%產率),其不經進一步純化即使用。
對(R)-N-(胺基甲基)-2-((N-(苄氧基)甲醯胺基)甲基)庚醯胺(55mg,0.17
mmol)溶於EtOH(10ml)的溶液添加Pd/C(10% wt,Degussa wet,30mg)。使反應混合物於室溫氫化30分鐘。過濾移除催化劑,以EtOH洗滌。在減壓下抽乾溶劑,給予如同灰色固體的標題化合物(40mg,80%純度),其不經進一步純化即使用。
步驟1:(R)-N-(2-胺基-2-酮基乙基)-3-(N-(苄氧基)甲醯胺基)-2-(環戊基甲基)丙醯胺
使(R)-3-(N-(苄氧基)甲醯胺基)-2-(環戊基甲基)丙酸(2.23g,7.30mmol)、2-胺基乙醯胺、氯化氫(0.97g,8.76mmol)、HOBt(0.22g,1.46mmol)、EDC(4.20g,21.9mmol)與DIPEA(6.38ml,36.5mmol)溶於DMF(10ml)與THF(10ml)的溶液於室溫攪拌18小時。反應以EtOAc與NH4Cl稀釋,並以EtOAc萃取(3 x)。合併的有機物以鹽水洗滌(2 x)、以Na4SO4乾燥,過濾並濃縮。殘餘物係藉由快速層析純化(ISCO,120g管柱,65mm/min沖提,0-10% MeOH/DCM,達45min)。將所欲分段合併並濃縮,給予標題化合物(2.27g,6.28mmol,86%產率)。MS(m/z)362.2(M+H+)。
步驟2:(R)-N-(胺基甲基)-3-(N-(苄氧基)甲醯胺基)-2-(環戊基甲基)丙醯胺
將[雙(三氟乙氧基)碘]苯(4.05g,9.42mmol)溶於乙腈(15.7ml)。對此溶液加水(15.7ml),接著添加(R)-N-(2-胺基-2-酮基乙基)-3-(N-(苄氧基)甲醯胺基)-2-(環戊基甲基)丙醯胺(2.27g,6.28mmol)並使反應混合物於室溫攪拌過
夜。反應以DCM與飽和NaHCO3稀釋,並以DCM萃取三次。合併的有機物以鹽水洗滌兩次,以Na2SO4乾燥,過濾並濃縮。將殘餘物溶於MeOH,通過20g SCX管柱,以MeOH洗滌且隨後以溶於MeOH的1M Et3N洗滌。將鹼性沖提液濃縮,給予標題化合物(1.45g,4.35mmol,69%產率)。
步驟1:(S)-4-苄基-3-庚醯基噁唑烷-2-酮
使(S)-4-苄基噁唑烷-2-酮(10.0g,56.4mmol)溶於無水THF(166ml)的溶液冷卻至-78℃,之後以BuLi(2.5M,溶於己烷)(22.6ml,56.4mmol)於氮下慢慢處理。使所得混合物於-78℃攪拌1小時,之後慢慢加入庚醯氯(8.39g,56.4mmol)。以水(3ml)淬熄之後,使反應分配於鹽水(30ml)與EtOAc(150ml)之間。層遂分離,有機層以鹽水(20ml)洗滌,以Na2SO4乾燥,並濃縮成黃色油狀物。此油狀物係藉由快速層析純化(ISCO,220g管柱,100ml/min,0-20% EtOAc/己烷,達5倍管柱體積,隨後維持在20% EtOAc,直到產物沖出)。將純的分段濃縮,給予如同清澈油狀物的標題化合物(13.8g,47.7mmol,85%產率)。MS(m/z)290.2(M+H+)。
步驟2:(R)-1-((S)-4-苄基-2-酮基噁唑烷-3-基)-2-戊基戊-1,3-二酮
使(S)-4-苄基-3-庚醯基噁唑烷-2-酮(13.0g,44.9mmol)溶於無水THF(200ml)的溶液冷卻至-78℃,之後以鈉雙(三甲矽基)醯胺(51.7ml,51.7mmol)於氮下慢慢處理。使所得混合物於-78℃攪拌1小時,之後慢慢加入丙醯氯(5.40g,58.4mmol)並使反應混合物攪拌3小時。快速添加檸檬酸溶液(~4
g,溶於20ml水)以淬熄反應。在減壓下移除溶劑,使殘餘物分配於EtOAc與水之間,以鹽水洗滌,以Na2SO4乾燥並過濾。濃縮濾液,提供如同黃色油狀物的標題化合物(16.5g,43.0mmol,96%產率)。MS(m/z)346.2(M+H+)。
步驟3:(S)-4-苄基-3-((R)-2-((E)-1-((苄氧基)亞胺基)丙基)庚醯基)噁唑烷-2-酮
對(R)-1-((S)-4-苄基-2-酮基噁唑烷-3-基)-2-戊基戊-1,3-二酮(16.5g,47.8mmol)溶於乙醇(113ml)與水(12.5ml)的溶液添加乙酸鈉(4.70g,57.3mmol)與O-苄基胲、氯化氫(9.15g,57.3mmol)。使所得懸浮液於室溫攪拌整個週末,隔天過濾。固體以1:1水:EtOH洗滌。該固體為單一異構物。將濾液濃縮,以EtOAc與NaHCO3稀釋。將固體併至濾液,將EtOAc分離,濃縮並藉由快速層析純化(ISCO,330g管柱,0-20% EtOAc/己烷,達30分鐘)。單離了兩峰:單一異構物(5.58g,12.4mmol)與兩異構物的混合物(E/Z)。收集兩異構物的混合物,給予標題化合物(8.51g,18.9mmol),其用於下一步驟。MS(m/z)451.3(M+H+)。
步驟4:(4S)-4-苄基-3-((2R)-2-(1-((苄氧基)胺基)丙基)庚醯基)噁唑烷-2-酮
將(S)-4-苄基-3-((R)-2-((E)-1-((苄氧基)亞胺基)丙基)庚醯基)噁唑烷-2-酮(8.51g,18.9mmol)溶於乙酸(62.9ml)並冷卻至0℃,之後一次性添加氰基硼氫化鈉(1.20g,18.9mmol)。5分鐘後,添加額外的氰基硼氫化鈉(1.19g,18.9mmol)。使混合物升溫至室溫並攪拌21小時。隔天,在旋轉蒸發器移除乙酸,並使殘餘物和甲苯共沸。將所得油狀物溶於EtOAc,以水、1M Na2CO3與鹽水洗滌。有機層以Na2SO4乾燥,過濾並濃縮,給予淺黃色油狀物。該油狀物係藉由快速層析純化(ISCO,330g管柱,10-25% EtOAc/己烷,達30分
鐘),獲得標題化合物(7.51g,14.9mmol,79%產率)。MS(m/z)453.3(M+H+)。
步驟5:N-((4R)-4-((S)-4-苄基-2-酮基噁唑烷-3-羰基)壬-3-基)-N-(芣氧基)甲醯胺
對雙-(1H-咪唑l-1-基)甲酮(10.8g,66.4mmol)溶於DCM(94ml)的溶液添加甲酸(3.18ml,83mmol)。使混合物攪拌1小時,之後添加溶於DCM(94ml)的(4S)-4-苄基-3-((2R)-2-(1-((苄氧基)胺基)丙基)庚醯基)噁唑烷-2-酮(7.51g,16.6mmol)。使所得混合物於室溫攪拌20小時。反應以DCM與NH4Cl稀釋,並以DCM萃取三次。合併的有機層以鹽水洗滌兩次,以Na2SO4乾燥,過濾並濃縮,給予淺黃色油狀物。該油狀物係藉由快速層析純化(ISCO,330g管柱,0-20% EtOAc/己烷,達30分鐘)。單離了兩峰:單一異構物(1.89g,3.93mmol,23.7%產率)與兩異構物的混合物。收集兩異構物的混合物,給予標題化合物(4.37g,9.09mmol,54.8%產率),其用於下一步驟。MS(m/z)481.3(M+H+)。
步驟6:(R)-2-((R)-1-(N-(苄氧基)甲醯胺基)丙基)庚酸
將N-((4R)-4-((S)-4-苄基-2-酮基噁唑烷-3-羰基)壬-3-基)-N-(苄氧基)甲醯胺(4.37g,9.09mmol)溶於THF(74.8ml)與水(15.0ml),並使溶液於冰-水浴中冷卻。添加過氧化氫(1.14ml,37.3mmol),接著隨即添加氫氧化鋰(0.26g,10.9mmol)。並使反應升溫至室溫,並於室溫攪拌5.5小時,隨後在冰櫃靜置過夜。反應以DCM與水稀釋。水層以乙酸乙酯與氫氯酸(1N,10ml)稀釋,並以乙酸乙酯萃取三次。有機層以鹽水洗滌兩次,以Na2SO4乾燥,過濾並濃縮,留下油狀物,其係藉由快速層析純化(矽膠,溶於DCM的0%至4%甲醇作為沖提液),以單離兩異構物。所分離的兩異構物為R,S異構物(1.05g,2.95mmol,32.4%產率)與標題化合物、R,R異構物(0.54g,1.52mmol,16.7
%產率)。MS(m/z)322.2(M+H+)。
步驟7:(9H-芴-9-基)甲基(((R)-2-((R)-1-(N-(芣氧基)甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺基甲酸酯
將(R)-2-((R)-1-(N-(苄氧基)甲醯胺基)丙基)庚酸(406mg,1.26mmol)溶於DMF(3.6ml)並以(9H-芴-9-基)甲基(胺基甲基)胺基甲酸酯,三氟乙酸鹽(483mg,1.26mmol)處理。添加HATU(480mg,1.26mmol),接著添加許尼希氏鹼(0.66ml,3.79mmol)。使反應混合物於室溫攪拌18小時。反應以水稀釋與EtOAc。層遂分離,有機物以Na2SO4乾燥,過濾,並濃縮並藉由快速層析純化(ISCO,120g管柱,0-10% MeOH/DCM,達30分鐘),給予如同黃色油狀物的標題化合物(530mg,0.93mmol,73.4%產率)。MS(m/z)572.3(M+H+)。
步驟8:(R)-N-(胺基甲基)-2-((R)-1-(N-(苄氧基)甲醯胺基)丙基)庚醯胺
將(9H-芴-9-基)甲基(((R)-2-((R)-1-(N-(苄氧基)甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺基甲酸酯(6.67g,11.7mmol)溶於乙腈(22.6ml),並添加吡咯烷(24.1ml,292mmol)。使混合物於室溫攪拌,直到移除所有fmoc。將溶液濃縮並藉由快速層析純化(ISCO,0-10% MeOH/DCM,達30分鐘),給予標題化合物(2.2g,6.30mmol,54%產率)。MS(m/z)350.3(M+H+)。
步驟9:(R)-N-(胺基甲基)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺
將(R)-N-(胺基甲基)-2-((R)-1-(N-(苄氧基)甲醯胺基)丙基)庚醯胺(2.2g,6.30mmol)溶於乙醇(126ml)並沖氮。隨後添加Pd/C(0.67g,0.630mmol),接著加H2氣球。使混合物於室溫攪拌2小時,之後經由Celite®過濾,以EtOAc洗滌且隨後濃縮。使所得固體懸浮於EtOAc並過濾,給予如同褐色固體的標題化合物(1.2g,4.63mmol,81%產率)。MS(m/z)259.35(M+H+)。
中間物10的另擇合成:(R)-N-(胺基甲基)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙
基)庚醯胺
步驟1:苄基(胺基甲基)胺基甲酸酯,三氟乙酸鹽
在氮下,對4頸的2l圓底燒瓶填入苄基(2-胺基-2-酮基乙基)胺基甲酸酯(300g,1442mmol)與DCM(8400ml),接著加水(26ml)。對反應混合物添加PIFA(682g,1586mmol)並使混合物維持於23℃,達1小時。添加產物的晶種材料(2wt%)並使反應混合物再維持1小時。使混合物冷卻至18-20℃,達1小時,隨後將懸浮液過濾並以20% DCM:正庚烷(3000ml)洗滌且隨後風乾,給予如同白色固體的標題化合物(389g,91%產率)。
步驟2:苄基(((R)-2-((R)-1-(N-(苄氧基)甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺基甲酸酯
對4頸圓底燒瓶填入(R)-2-((R)-1-(N-(苄氧基)甲醯胺基)丙基)庚酸(190g,592mmol)與乙腈(1900ml),接著添加三乙胺(175ml,1256mmol)。使反應混合物冷卻至0-5℃並添加HATU(247g,650mmol)。使反應混合物升溫至23℃並維持1小時,以形成HATU-酸加成物。在分開的圓底燒瓶中,使苄基(胺基甲基)胺基甲酸酯,三氟乙酸鹽(365g,1184mmol)與乙腈(3800ml)合併並冷卻至10-15℃。將三乙胺(963ml,6909mmol)慢慢加至反應混合物。隨後將所製備的HATU-酸加成物混合物加至苄基(胺基甲基)胺基甲酸酯溶液。使合併混合物升溫至23℃並維持1小時。反應混合物在減壓下濃縮。將MTBE(3420ml)與水(2375ml)加至殘餘物並攪拌15分鐘。層遂分離,使有機層通過60-120矽膠。將濾液在減壓下濃縮,殘餘物以MTBE(950ml)稀釋並冷卻至0-5℃。使漿狀物維持1小時並過濾,獲得如同白色固體的標題化合物(170g,65%產率)。
步驟3:(R)-N-(胺基甲基)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺
對5l壓力反應容器,填入苄基(((R)-2-((R)-1-(N-(苄氧基)甲醯胺基)丙
基)庚醯胺基)甲基)胺基甲酸酯(180g,372mmol)與乙醇(3600ml)。添加鈀/碳10wt%(18.0g,16.9mmol),反應容器以氮沖掃脫氣。反應混合物以5.0kg/cm2氫氣於20-25℃加壓4小時。隨後將混合物經由矽藻土過濾,矽藻土塞以乙醇(900ml)洗滌。將濾液在40-45℃、減壓下濃縮。粗製產品以正庚烷(900ml)漿化,過濾,並於35-40℃乾燥6小時,獲得如同白色固體的標題化合物(89g,90%產率)。
步驟1:2-甲基-6-苯基-4-(三氟甲基)吡啶
在小瓶中合併2-氯-6-甲基-4-(三氟甲基)吡啶(1.12g,5.73mmol)、苯基硼酸(1.75g,14.3mmol)與乙酸鉀(2.81g,28.6mmol)。使內容物懸浮於DMF(17.4ml)並以氮氣將混合物脫氣。隨後添加Tris(0.66g,0.57mmol),並使反應接受140℃微波照射10分鐘,隨後於160℃照射20分鐘。將反應混合物倒進水中並添加EtOAc。將混合物過濾,層遂分離。水相以EtOAc萃取。合併的有機萃取液以水(6 x)、鹽水洗滌且隨後以Na2SO4乾燥,過濾並在減壓下濃縮。殘餘物係藉由快速層析純化(40g矽膠管柱,100%己烷:10分鐘,0-20% EtOAc/己烷,20分鐘),給予如同無色液體的標題化合物(1.07g,79%產率)。MS(m/z)238.1(M+H+)。
步驟2:6-苯基-4-(三氟甲基)吡啶甲酸
對2-甲基-6-苯基-4-(三氟甲基)吡啶(1.07g,4.50mmol)溶於吡啶(5ml)的溶液添加四丁基過錳酸銨(5.00g,13.5mmol)溶於吡啶(4.5ml)的溶液。使反應於80℃攪拌75小時。將反應倒至水與冰的混合物中,隨後添加NaHSO3
溶液(40%溶於水),直到反應轉為淡黃。隨後加2N HCl將混合物酸化,並以EtOAc萃取。合併的有機層隨後以1N HCl與鹽水洗滌,以Na2SO4乾燥,過濾並濃縮。再將殘餘物投至相同條件下的反應,並於80℃加熱4小時。添加額外的四丁基過錳酸銨(1.67g,4.50mmol),並使反應攪拌過夜。將反應倒至水與冰的混合物中,隨後添加NaHSO3溶液(40%,溶於水),直到反應轉為淡黃。隨後加2N HCl將混合物酸化,並以EtOAc萃取。合併的有機層隨後以1N HCl與鹽水洗滌,以Na2SO4乾燥,過濾並濃縮。殘餘物係藉由快速層析純化(40g矽膠管柱,100% DCM:10分鐘,15分鐘,0-10% MeOH/DCM:10分鐘,10% MeOH/DCM),給予標題化合物(0.88g,73%產率)。MS(m/z)268.0(M+H+)。
將甲基6-氯吡嗪-2-甲酸酯(0.57g,3.30mmol)、苯基硼酸(0.48g,3.96mmol)、PdCl2(dppf)-CH2Cl2加成物(0.14g,0.17mmol)與碳酸鈉(1M,9.91ml,9.91mmol)溶於1,4-二噁烷(6.61ml)的混合物投至100℃微波照射6分鐘。隨後將反應經由Celite®墊過濾,隨後以EtOAc萃取。經由添加1N HCl將水相酸化至~pH 2-3。收集所得沉澱物。隨後將水相濃縮並使所得固體懸浮於甲醇(10ml)。使懸浮液攪拌5分鐘,隨後藉由過濾收集固體。將固體單離物合併,給予如同褐色固體的標題化合物(0.99g)。MS(m/z)201.1(M+H+)。
中間物13係藉由類似於中間物12所說明的方法,從指定的溴化物與硼酸製備。
使甲基6'-甲氧基-[2,2'-聯吡啶]-6-甲酸酯(0.12g,0.48mmol)與氫氧化鋰(0.05g,1.92mmol)溶於甲醇(3ml)與水(1.8ml)的混合物於室溫攪拌3小時。隨後將溶劑移除,並添加1N HCl將殘餘物酸化至~pH 2,以EtOAc(3 x)萃取。合併的有機萃取液以Na2SO4乾燥,過濾並濃縮,給予如同灰白色固體的標題化合物。(0.11g,96%產率)。MS(m/z)231.1(M+H+)。
對乙基2-乙氧基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧雜環戊硼烷-2-基)苄酸酯(439mg,1.37mmol)與6-溴-5-氟吡啶甲酸(302mg,1.37mmol)溶於1,4-二噁烷(6.9ml)的溶液添加碳酸鈉(436mg,4.11mmol)溶於水(2ml)的溶液。將反應沖氮並添加PdCl2(dppf)-CH2Cl2加成物(112mg,0.14mmol),使反應於80℃加熱18小時。隨後使反應冷卻至室溫並濃縮。使殘餘物分配於水與EtOAc之間並將水相酸化。層遂分離,水相以另外的EtOAc(3 x 20ml)萃取。合併
的有機萃取液以MgSO4乾燥,過濾,並濃縮,給予如同橙色固體的標題化合物(129mg,28%產率)。MS(m/z)334.0(M+H+)。
中間物16-17係藉由類似於中間物15所說明的方法,從二甲基(2-乙氧基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧雜環戊硼烷-2-基)苯基)膦酸酯與指定的氯化物製備。
中間物18-19係藉由類似於中間物15所說明的方法,從乙基2-乙氧基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧雜環戊硼烷-2-基)苄酸酯與指定的氯化物製備。
於90℃,將過錳酸鉀(2.50g,15.8mmol)分多次加至2-溴-3-氟-6-甲基吡啶(1g,5.26mmol)溶於水(22ml)的懸浮液。使反應攪拌3小時,隨後趁熱經由Celite®過濾,以熱水洗滌。添加6N HCl將濾液酸化至pH 1。過濾收集所得沉澱物,給予標題化合物(0.15g,13%產率)。MS(m/z)219.9(M+H+)。
步驟1:甲基3-((3-酮基丁-2-基)胺甲醯基)苄酸酯
3-胺基丁-2-酮(1.32g,10.7mmol)、3-(甲氧基羰基)苄酸(1.92g,10.7mmol)、EDC(2.46g,12.8mmol)與HOBt(0.33g,2.14mmol)溶於DCM(40ml)的混合物係以DIPEA(5.60ml,32.0mmol)處理並使反應於室溫攪拌30分鐘。反應隨後以水洗滌,有機層係藉由疏水玻璃料收集,以1M HCl洗滌,經由疏水玻璃料收集且隨後濃縮。殘餘物係藉由快速層析純化(ISCO CombiFlasH,40g矽膠管柱,20-100% EtOAc/己烷),給予如同淡黃色油狀物的標題化合物(1.17g,44%產率)。MS(m/z)250.1(M+H+)。
步驟2:甲基3-(4,5-二甲基噁唑-2-基)苄酸酯
使甲基3-((3-酮基丁-2-基)胺甲醯基)苄酸酯(827mg,3.32mmol)、硫酸(1.00ml,18.8mmol)與乙酸酐(1.00ml,10.6mmol)的溶液於90℃加熱2.5小時。隨後將水加至反應,過濾收集所得沉澱物,給予如同米色固體的標題化合物(414mg,54%產率)。MS(m/z)232.1(M+H+)。水性濾液以乙酸乙酯萃取。乙酸乙酯層以鹽水洗滌,並濃縮,給予額外批次的如同橙色固體
的標題化合物(270mg,80%純度,28%產率)。MS(m/z)232.1(M+H+)。
步驟3:3-(4,5-二甲基噁唑-2-基)苄酸
將氫氧化鈉(6.47ml,12.9mmol)加至甲基3-(4,5-二甲基噁唑-2-基)苄酸酯(748mg,3.23mmol)溶於甲醇(5ml)與四氫呋喃(5ml)的溶液並使反應於室溫攪拌30分鐘。在減壓下移除揮發物,添加2M HCl將殘餘物調至pH 5,以乙酸乙酯萃取。層遂分離,水層以乙酸乙酯萃取兩次。隨後將合併的乙酸乙酯分段濃縮,給予如同淡黃色固體的標題化合物(819mg),其不經進一步純化即使用。MS(m/z)218.1(M+H+)。
步驟1:甲基3-(2-甲基噁唑-5-基)苄酸酯
甲基3-甲醯基苄酸酯(200mg,1.22mmol)與N-次甲基-1-甲苯磺醯基乙胺(256mg,1.22mmol)溶於甲醇(5ml)的混合物係以碳酸鉀(337mg,2.44mmol)處理並使反應於室溫攪拌1小時。將額外的N-次甲基-1-甲苯磺醯基乙胺(51.2mg,0.24mmol)加至反應,使反應再攪拌2.5小時。隨後將反應濃縮,將乙酸乙酯與水加至殘餘物。層遂分離,有機層以鹽水洗滌並濃縮。殘餘物係藉由快速層析純化(ISCO CombiFlasH,12g矽膠管柱,10-70% EtOAc/己烷,給予如同白色固體的標題化合物(160mg,61%產率)。MS(m/z)218.1(M+H+)。
步驟2:3-(2-甲基噁唑-5-基)苄酸
將氫氧化鈉(2M,1.47ml,2.95mmol)加至甲基3-(2-甲基噁唑-5-基)苄酸酯(160mg,0.74mmol)溶於甲醇(2ml)與四氫呋喃(2ml)的溶液,使反應
於室溫攪拌1小時。在減壓下移除揮發物並添加1M HCl將殘餘物酸化至pH 5,以乙酸乙酯(2 x)萃取。合併的有機萃取液以鹽水洗滌,隨後濃縮,給予如同白色固體的標題化合物(180mg,100%產率)。MS(m/z)204.1(M+H+)。
將(2-氟-3-甲氧基苯基)硼酸(3.98g,23.4mmol)、磷酸二氫鉀(2.49g,18.3mmol)、磷酸三鉀(3.89g,18.3mmol)與3-溴-2-氟苄酸(4.00g,18.3mmol)加至DME(70ml)、水(52ml)與EtOH(20ml)的脫氣混合物。將混合物脫氣,隨後添加PdCl2(dbpi)(436mg,0.9mmol)並使反應於60℃攪拌5小時。將反應縮減體積且隨後添加1M NaOH溶液(150ml)稀釋並以乙醚(150ml)洗滌。層遂分離,使水層冷卻至0℃並添加HCl(37%)酸化。將水相過濾並將收集的固體溶於EtOAc(400ml),以鹽水(100ml)洗滌,以Na2SO4乾燥,隨後經由矽膠塞過濾,以EtOAc洗滌。將有機相濃縮,給予一固體,使其和環己烷/EtOH混合物於70℃研磨1小時。隨後使混合物冷卻並過濾。使收集的固體風乾,給予如同灰白色固體的標題化合物(4.27g,88%產率)。MS(m/z)264.8(M+H+)。
中間物24-25係藉由類似於中間物23所說明的方法,從指定的溴化物與硼酸製備。
步驟1:甲基3-((6-甲氧基吡啶-3-基)氧基)苄酸酯
使5-溴-2-甲氧基吡啶(6.5g,34.6mmol),甲基3-羥基苄酸酯(7.89g,51.9mmol)、2-(二甲基胺基)乙酸氫氯酸鹽(1.45g,10.4mmol)、碘化銅(I)(1.98g,10.4mmol)與Cs2CO3(22.5g,69.1mmol)溶於1,4-二噁烷(100ml)的混合物於N2下、於90℃攪拌2天。反應隨後以DCM與水稀釋。層遂分離,水相以DCM萃取(3 x)。合併的有機萃取液以鹽水洗滌(2 x),以Na2SO4乾燥,過濾並濃縮。殘餘物係經由快速層析純化(ISCO,120g矽膠管柱,65ml/min,0-40% EtOAc/DCM,達45分鐘),給予標題化合物(2.85g,32%產率)。MS(m/z)260.1(M+H+)。
步驟2:3-((6-甲氧基吡啶-3-基)氧基)苄酸
使甲基3-((6-甲氧基吡啶-3-基)氧基)苄酸酯(2.85g,11.0mmol)與氫氧化鋰(1.38g,33.0mmol)溶於乙醇(30ml)與水(10ml)的混合物攪拌3小時。在減壓下移除揮發物,添加2M HCl將殘餘混合物調至pH 5,以EtOAc(3 x)萃取。合併的有機萃取液以鹽水洗滌(2 x),以Na2SO4乾燥,過濾並濃縮,給予標題化合物(2.7g,100%產率)。MS(m/z)246.1(M+H+)。
步驟3:3-((6-甲氧基吡啶-3-基)氧基)苄醯氯
對3-((6-甲氧基吡啶-3-基)氧基)苄酸(2.7g,11.0mmol)溶於DCM(50ml)的混合物添加DMP(5滴),接著慢慢添加草醯氯(1.93ml,22.0mmol)。使反
應攪拌1小時,隨後濃縮。將殘餘物溶於DCM與己烷,隨後濃縮,給予標題化合物,其不經進一步純化或定性即使用。
步驟1:(3-溴苯基)(2,4,6-三甲氧基苄基)硫烷
3-溴苯硫醇(0.87g,4.59mmol)與TFA(6ml)溶於無水DCM(30ml)的溶液係於0℃以(2,4,6-三甲氧基苯基)甲醇(1g,5.05mmol)溶於DCM(15ml)的溶液處理,並使反應攪拌15分鐘,之後升溫至室溫並攪拌30分鐘。反應以DCM稀釋並以Na2CO3洗滌。將有機物分離,以鹽水洗滌,以Na2SO4乾燥,過濾並濃縮。殘餘物係藉由快速層析純化(Biotage SP1,SNAP矽膠管柱,0-10% EtOAc/環己烷),給予如同無色油狀物的標題化合物(1.4g,83%產率)。MS(m/z)370.8(M+H+)。
步驟2:甲基3'-((2,4,6-三甲氧基苄基)硫基)-[1,1'-聯苯]-3-甲酸酯
在氮下,對(3-溴苯基)(2,4,6-三甲氧基苄基)硫烷(1.4g,3.87mmol)、(3-(甲氧基羰基)苯基)硼酸(0.91g,5.04mmol)、磷酸二氫鉀(0.53g,3.87mmol)、磷酸三鉀(0.83g,3.87mmol)、PdCl2(dbpf)(0.09g,0.19mmol)與1,1'-雙(貳-三級丁基膦基)二茂鐵(0.09g,0.19mmol)的混合物添加DME(17ml)、水(13ml)與EtOH(4.5ml),並以N2將反應脫氣10分鐘。使反應於室溫攪拌過夜,隨後於60℃加熱5小時。反應隨後以DCM稀釋並經由Celite®過濾。濾液以水與鹽水洗滌,隨後將有機層分離,以Na2SO4乾燥,過濾並濃縮。殘餘物係藉由快速層析純化(Biotage SP1,SNAP矽膠管柱,0-10% EtOAc/環己烷),給予標題化合物(1.2g,75%產率)。MS(m/z)424.9(M+H+)。
步驟3:3'-((2,4,6-三甲氧基苄基)硫基)-[1,1'-聯苯]-3-甲酸
甲基3'-((2,4,6-三甲氧基苄基)硫基)-[1,1'-聯苯]-3-甲酸酯(1.2g,2.83mmol)溶於THF(10ml)與水(5ml)的溶液係以LiOH單水合物(0.40g,9.53mmol)處理並於室溫攪拌3小時。添加額外的LiOH單水合物(0.30g,7.15mmol)並使反應攪拌過夜。反應隨後以DCM稀釋並添加1M HCl酸化至pH 2。將水溶液以DCM(3 x)萃取。合併的有機萃取液以鹽水洗滌,以Na2SO4乾燥,過濾並濃縮。殘餘物係藉由快速層析純化(Biotage SP1,SNAP矽膠管柱,20-50% EtOAc/環己烷),給予標題化合物(0.84g,72%產率)。MS(m/z)411.0(M+H+)。
步驟4:3'-巰基-[1,1'-聯苯]-3-甲酸
3'-((2,4,6-三甲氧基苄基)硫基)-[1,1'-聯苯]-3-甲酸(0.40g,0.97mmol)溶於DCM(14ml)的溶液係於氮下,以TFA(1.4ml)與Et3SiH(0.4ml)於室溫處理45分鐘。將反應濃縮,殘餘物以2N NaOH溶液提取,以Et2O萃取。添加1N HCl將水相調至pH 2,以Et2O萃取。將有機層分離,以Na2SO4乾燥,過濾並濃縮。給予標題化合物(0.22g,96.9%產率)。MS(m/z)230.9(M+H+)。
步驟5:3'-((9H-呫吨-9-基)硫基)-[1,1'-聯苯]-3-甲酸
3'-驗基-[1,1'-聯苯]-3-甲酸(238mg,1.03mmol)與TFA(0.03ml)溶於1,2-二甲氧基乙烷(1.6ml)的溶液於室溫、N2下攪拌10分鐘。隨後添加9,9a-二氫-4aH-呫吨-9-醇(226mg,1.10mmol),並使反應於室溫攪拌30分鐘。隨後添加Et2O,使懸浮液於冰浴中攪拌20分鐘。將反應過濾,白色固體以Et2O洗滌,收集,隨後於45℃真空乾燥,給予如同白色固體的標題化合物(251mg,60%產率)。MS(m/z)409.0(M-H-)。
步驟1:N-(2-胺基-2-酮基乙基)-6-溴甲吡啶醯胺
於室溫,對6-溴吡啶甲酸(5.0g,24.8mmol)、2-胺基乙醯胺氫氯酸鹽(3.28g,29.7mmol)與DIPEA(13ml,74.4mmol)溶於THF(100ml)的懸浮液添加BOP(12g,27.1mmol)。使反應於40℃攪拌16小時,隨後冷卻至室溫並加水(25ml)與EtOAc(100ml)稀釋。層遂分離,有機相以飽和碳酸氫鈉溶液(3 x 25ml)洗滌。將水相合併並以EtOAc(3 x 50ml)萃取。合併的有機萃取液隨後以鹽水洗滌(25ml),以硫酸鎂乾燥,過濾並濃縮。使殘餘物預吸附至矽膠上並藉由快速層析純化(ISCO CombiFlasH,330g Silicycle管柱,1至5% MeOH/DCM),給予如同白色固體的標題化合物(6.1g,91%產率)。MS(m/z)260.0(M+2+)。
步驟2:N-(胺基甲基)-6-溴甲吡啶醯胺氫氯酸鹽
於室溫,對[雙(三氟乙氧基)碘]苯(1.83g,4.26mmol)溶於乙腈(6ml)與水(6ml)的溶液添加N-(2-胺基-2-酮基乙基)-6-溴甲吡啶醯胺(1.0g,3.87mmol)。使反應於室溫攪拌24小時。反應隨後以水(75ml)稀釋,並添加濃HCl(8ml)酸化。所得混合物以醚(75ml)萃取。在真空中將水相抽乾,給予如同白色固體的標題化合物(0.96g,93%產率)。MS(m/z)232.0(M+2+)。
步驟1:N-(2-胺基-2-酮基乙基)-6-苯基甲吡啶醯胺
使6-苯基吡啶甲酸(1.0g,5.02mmol)、2-胺基乙醯胺氫氯酸鹽(0.67g,6.02mmol)、HOBt(0.15g,1.00mmol)、EDC(2.89g,15.06mmol)與DIPEA
(4.38ml,25.1mmol)溶於THF(20.7ml)的溶液於50℃攪拌18小時。隨後使反應冷卻並縮減體積。加水,過濾收集所得固體並風乾,給予如同白色固體的標題化合物(0.59g,46%產率)。MS(m/z)256.1(M+H+)。
步驟2:N-(胺基甲基)-6-苯基甲吡啶醯胺
對[雙(三氟乙氧基)碘]苯(1.48g,3.45mmol)溶於乙腈(5.8ml)的溶液加水(5.8ml),接著添加N-(2-胺基-2-酮基乙基)-6-苯基甲吡啶醯胺(0.59g,2.30mmol)並使反應於室溫攪拌過夜。隨後添加1N HCl,反應以Et2O(2 x)洗滌。層遂分離,將水相濃縮,給予如同白色固體的標題化合物(0.39g,56%產率)。MS(m/z)211.1(M-16+)。將Et2O相濃縮,殘餘物係經由快速層析純化(ISCO,0-5% MeOH/DCM),給予標題化合物(0.13g,21%產率)。MS(m/z)211.1(M-16+)。
中間物30係藉由類似於中間物29所說明的方法,從6-(3-甲氧基苯基)吡啶甲酸製備。
步驟1:(9H-芴-9-基)甲基((6-苯基-4-(三氟甲基)吡啶甲醯胺基)甲基)胺基甲酸酯
對6-苯基-4-(三氟甲基)吡啶甲酸(0.88g,3.29mmol)溶於DMF(1.53ml)的溶液添加(9H-芴-9-基)甲基(胺基甲基)胺基甲酸酯(0.88g,3.29mmol)、HATU(1.25g,3.29mmol)與DIPEA(1.15ml,6.58mmol)並使反應攪拌2小時。隨後以水(10ml)淬熄反應,並以EtOAc稀釋(30ml)。層遂分離,有機層以水洗滌,以Na2SO4乾燥,過濾並濃縮。殘餘物係藉由快速層析純化(40g矽膠管柱,0-100% EtOAc/己烷,25分鐘梯度),給予標題化合物(0.62g,36%產率)。MS(m/z)541.1(M+23+)。
步驟2:N-(胺基甲基)-6-苯基-4-(三氟甲基)甲吡啶醯胺
將哌啶(3.33ml,33.6mmol)加至(9H-芴-9-基)甲基((6-苯基-4-(三氟甲基)吡啶甲醯胺基)甲基)胺基甲酸酯(870mg,1.68mmol)於乙腈(5.07ml)的懸浮液。使反應混合物攪拌3小時,隨後和以250mg規模在相同條件執行的反應合併,並濃縮。殘餘物係藉由快速層析純化(40g矽膠管柱,100% DCM:10分鐘,0-10% MeOH:15分鐘,10-15% MeOH:10分鐘),給予標題化合物(227mg,46%產率)。MS(m/z)279.0(M-16+)。
中間物32係藉由類似於中間物31所說明的方法,從6-苯基吡嗪-2-甲酸氫氯酸鹽製備。
步驟1:(9H-芴-9-基)甲基((6-溴-5-氟吡啶甲醯胺基)甲基)胺基甲酸酯
使(9H-芴-9-基)甲基(胺基甲基)胺基甲酸酯三氟乙酸鹽(0.49g,1.28mmol)、(9H-芴-9-基)甲基(胺基甲基)胺基甲酸酯氫氯酸鹽(0.6g,1.97mmol)、6-溴-5-氟吡啶甲酸(0.74g,3.38mmol)、HATU(1.54g,4.05mmol)與DIPEA(1.77ml,10.1mmol)溶於DMF(15.1ml)的溶液於室溫攪拌2小時。隨後加水並將反應置於冰櫃過夜。隨後使反應升溫至室溫,過濾收集固體,以水洗滌並風乾,給予如同灰色固體的標題化合物(1.23g,77%產率)。MS(m/z)472.1(M+2+)。
步驟2:(9H-芴-9-基)甲基((5-氟-6-苯基吡啶甲醯胺基)甲基)胺基甲酸酯
將(9H-芴-9-基)甲基((6-溴-5-氟吡啶甲醯胺基)甲基)胺基甲酸酯(0.4g,0.85mmol)、苯基硼酸(0.12g,1.02mmol)、碳酸鈉(1M,2.55ml,2.55mmol)與PdCl2(dppf)-CH2Cl2加成物(0.04g,0.04mmol)溶於1,4-二噁烷(4ml)的混合物投至100℃微波照射6分鐘。反應以DCM(2 x)萃取。使有機層通過相分離器並濃縮。殘餘物係經由快速層析純化(ISCO,40g管柱,0-20% EtOAc/DCM:15分鐘,20% EtOAc/DCM:10分鐘),給予如同灰白色固體的標題化合物。(0.27g,67%產率)。MS(m/z)468.2(M+H+)。
步驟3:N-(胺基甲基)-5-氟-6-苯基甲吡啶醯胺
(9H-芴-9-基)甲基((5-氟-6-苯基吡啶甲醯胺基)甲基)胺基甲酸酯(0.27g,0.57mmol)於乙腈(2ml)的懸浮液係以吡咯烷(1ml,12.1mmol)處理並於室溫攪拌1小時。將反應濃縮,殘餘物係經由快速層析純化(ISCO,40g矽膠管柱,0-5% MeOH/DCM:10分鐘,5% MeOH/DCM:10分鐘,5-10% MeOH/DCM:5分鐘,10% MeOH/DCM:5分鐘),給予如同白色固體的標
題化合物(0.13g,93%產率)。MS(m/z)229.1(M-16+)。
將N-(胺基甲基)-6-溴甲吡啶醯胺(200mg,0.87mmol)、2-乙氧基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧雜環戊硼烷-2-基)苄酸(279mg,0.96mmol)、PdCl2(dppf)-CH2Cl2加成物(71mg,0.09mmol)與碳酸鈉(1M,2.61ml,2.61mmol)在微波小瓶中合併,並添加1,4-二噁烷(1.09ml)。將小瓶密封並於50℃加熱2小時。反應加水稀釋,並以DCM與乙酸乙酯萃取。隨後將水相減至~1/3體積並藉由OASIS管柱純化(6g,以水洗滌,以甲醇沖提)。將甲醇分段濃縮,將殘餘物溶於DCM並藉由Si SPE純化(0-10%甲醇/DCM),給予不純的產物。將水分段濃縮,使殘餘物懸浮於甲醇並過濾。將收集的固體和單離的不純產物合併,溶於甲醇並藉由SCX純化(2 x 5g管柱,以甲醇洗滌,以溶於DCM的10% 2M氨/甲醇溶液沖提)。將氨/甲醇分段濃縮,給予如同黃色固體的標題化合物(171mg,62%產率)。MS(m/z)299.0(M-16+)。
步驟1:(9H-芴-9-基)甲基((3-(1H-吡唑-1-基)芣醯胺基)甲基)胺基甲酸酯
3-(1H-吡唑-1-基)苄酸(351mg,1.86mmol)、(9H-芴-9-基)甲基(胺基甲基)胺基甲酸酯三氟乙酸鹽(750mg,1.86mmol)、EDC(429mg,2.24mmol)與HOBt(57.1mg,0.37mmol)溶於DCM(6ml)的混合物係以DIPEA(0.98
ml,5.59mmol)處理並於室溫攪拌17小時。隨後將反應過濾並收集固體,給予如同灰白色固體的標題化合物(262mg,32%產率)。MS(m/z)439.2(M+H+)。
步驟2:N-(胺基甲基)-3-(1H-吡唑-1-基)苄醯胺
將哌啶(1.18ml,12.0mmol)加至(9H-芴-9-基)甲基((3-(1H-吡唑-1-基)苄醯胺基)甲基)胺基甲酸酯(262mg,0.6mmol)於乙腈(3ml)懸浮液,並使反應於室溫攪拌17小時。隨後將反應過濾並將濾液濃縮。殘餘物係藉由快速層析純化(5g矽膠SPE管柱,DCM、乙醚、乙酸乙酯、丙酮與甲醇),給予如同橙色油狀物的標題化合物(116mg,76%產率),其不經進一步純化即用於下一步驟。MS(m/z)200.1(M-16+)。
中間物36-39係藉由類似於中間物35所說明的方法,從(9H-芴-9-基)甲基(胺基甲基)胺基甲酸酯三氟乙酸鹽與指定的酸製備。
中間物40係藉由類似於中間物35所說明的方法,在步驟2使用吡咯烷(吡咯烷)代替哌啶,從(9H-芴-9-基)甲基(胺基甲基)胺基甲酸酯、三氟乙酸鹽與指定的酸製備。
步驟1:N-(2-胺基-2-酮基乙基)-2,2'-二氟-3'-甲氧基-[1,1'-聯苯]-3-甲醯胺
將TBTU(5.72g,17.8mmol)加至2,2'-二氟-3'-甲氧基-[1,1'-聯苯]-3-甲酸(4.27g,16.2mmol)、2-胺基乙醯胺氫氯酸鹽(1.88g,17.0mmol)與DIPEA(8.47ml,48.6mmol)溶於DCM(60ml),並使反應於室溫攪拌整個週末。隨後將反應過濾,固體以DCM(2 x 5ml)洗滌。隨後過濾收集固體並風乾,給予如同白色固體的標題化合物(5g,96%產率)。MS(m/z)320.8(M+H+)。
步驟2:N-(胺基甲基)-2,2'-二氟-3'-甲氧基-[1,1'-聯苯]-3-甲醯胺氫氯酸鹽
於室溫,對PIFA(8.05g,18.7mmol)溶於乙腈/水(1:1,60ml)的溶液添加N-(2-胺基-2-酮基乙基)-2,2'-二氟-3'-甲氧基-[1,1'-聯苯]-3-甲醯胺(5g,15.6mmol),並使反應攪拌過夜。添加額外PIFA(2g,6.24mmol)並使反應攪拌過夜。在減壓下移除揮發物,隨後添加1M HCl(100ml)與異丙醚(50ml)。層遂分離,水相以乙醚(100ml)洗滌,隨後抽乾,給予如同米色固體的標題化合物(2.76g,54%產率)。MS(m/z)292.8(M+H+)。
中間物42-43係藉由類似於中間物41所說明的方法,從2-胺基乙醯胺氫氯酸鹽與指定的酸製備。
步驟1:N-(2-胺基-2-酮基乙基)-3-((6-甲氧基吡啶-3-基)氧基)苄醯胺
對3-((6-甲氧基吡啶-3-基)氧基)苄醯氯(2.90g,11.0mmol)與2-胺基乙醯胺氫氯酸鹽(1.68ml,22.0mmol)溶於DCM(50ml)的混合物慢慢添加三乙胺(6.14ml,44.0mmol)。使反應攪拌1小時,隨後濃縮。殘餘物以水稀釋,過濾並收集固體,給予標題化合物(3.0g,90%產率),其不經進一步純化即使用。MS(m/z)302.1(M+H+)。
步驟2:N-(胺基甲基)-3-((6-甲氧基吡啶-3-基)氧基)苄醯胺
[雙(三氟乙氧基)碘]苯(6.42g,14.9mmol)溶於乙腈(30ml)與水(30ml)的混合物係以N-(2-胺基-2-酮基乙基)-3-((6-甲氧基吡啶-3-基)氧基)苄醯胺(3.0g,9.96mmol)處理並使反應攪拌過夜。反應隨後加水(100ml)稀釋,並以Et2O(2 x)萃取。層遂分離,將水相濃縮。將殘餘物溶於Na2CO3水溶液(0.4M)並以DCM(6 x)萃取。層遂分離,合併的有機萃取液以硫酸鈉乾燥,過濾並濃縮,給予標題化合物(1.45g,53%產率)。MS(m/z)257.1(M-16+)。
步驟1:N-(2-胺基-2-酮基乙基)-[1,1'-聯苯]-3-甲醯胺
將EDC(1.04g,5.43mmol)加至[1,1'-聯苯]-3-甲酸(0.90g,4.52mmol)、2-胺基乙醯胺氫氯酸鹽(0.5g,4.52mmol)、HOBt(0.83g,5.43mmol)與N-甲基嗎啉(1.49ml,13.6mmol)於DCM(5ml)的懸浮液,並使反應攪拌過夜。隨後使反應吸附至矽膠上並藉由快速層析純化(ISCO,80g矽膠管柱,0-10% MeOH/DCM:20分鐘,10% MeOH/DCM:10分鐘),給予標題化合物(1.09g,95%產率)。MS(m/z)254.9(M+H+)。
步驟2:N-(胺基甲基)-[1,1'-聯苯]-3-甲醯胺氫氯酸鹽
將PIFA(3.65g,8.49mmol)溶於乙腈(10.6ml)與水(10.6ml)的溶液加至含有N-(2-胺基-2-酮基乙基)-[1,1'-聯苯]-3-甲醯胺(1.08g,4.25mmol)的100ml燒瓶,並以乙腈(5ml)潤洗燒瓶側邊。使反應於室溫攪拌過夜,隨後分配於Et2O與1N HCl之間。層遂分離,水層以Et2O萃取,隨後濃縮並於真空乾燥,給予如同褐色固體的標題化合物(0.31g,28%產率),其不經進一步純化即使用。MS(m/z)227.0(M+H+)。
步驟1:N-(2-胺基-2-酮基乙基)-3-溴苄醯胺
2-胺基乙醯胺氫氯酸鹽(2.75g,24.9mmol)溶於DCM(100ml)的溶液係以三乙胺(10.4ml,74.6mmol)處理並攪拌15分鐘。隨後使反應於水浴中冷卻,隨後添加3-溴苄酸(5.0g,24.9mmol),接著添加T3P®(50% wt,溶於
EtOAc,22.2ml,37.3mmol)。使反應於室溫攪拌過夜。隨後加水(100ml),並使混合物攪拌~15分鐘。將混合物過濾,固體以DCM(50ml)與水(50ml)洗滌。收集固體並於真空乾燥四天,給予標題化合物(6.18g,97%產率)。MS(m/z)256.9(M+)。
步驟2:N-(胺基甲基)-3-溴苄醯胺氫氯酸鹽
使[雙(三氟乙氧基)碘]苯(10.3g,24.0mmol)溶於乙腈(50ml)與水(50ml)的溶液攪拌,直到形成清澈溶液。隨後添加N-(2-胺基-2-酮基乙基)-3-溴苄醯胺(6.18g,24.0mmol)並使反應於室溫攪拌6小時。反應隨後以1N HCl(200ml)稀釋並以醚(2 x 100ml)洗滌。將水層體積縮減,過濾並以醚研磨該固體,給予如同白色固體的標題化合物(2.3g,36%產率)。MS(m/z)230.9(M+H+)。將濾液濃縮並以醚研磨殘餘物,過濾收集固體,給予一額外批次如同白色固體的標題化合物(0.52g,8%產率)。MS(m/z)229.0(M+)。
對N-(胺基甲基)-6-溴甲吡啶醯胺二氫氯酸鹽(0.96g,3.17mmol)與2,6-lutidine(1.5ml,12.9mmol)溶於DMF(12ml)的懸浮液添加(R)-2-((N-(苄氧基)甲醯胺基)甲基)庚酸(0.93g,3.17mmol)溶於DMF(3ml)的溶液。接著添加HATU(1.21g,3.17mmol)。反應混合物於室溫攪拌2小時。隨後加水(15ml)並以EtOAc(50ml)與鹽水(15ml)使混合物分層。層遂分離and水相extracted with額外EtOAc(2 x 50ml)。合併的有機萃取液以鹽水洗滌(15ml),以硫酸鎂乾燥,過濾並濃縮。使殘餘物預吸附至矽膠上並藉由快速層
析純化(ISCO CombiFlasH,120g Silicycle管柱,5-75% EtOAc(+1% MeOH)/己烷),給予兩批如同無色油狀物的標題化合物(0.84g,42%產率and 1.03g,61%產率)。MS(m/z)505.1(M+)。
將(R)-2-((R)-1-(N-(苄氧基)甲醯胺基)丙基)庚酸(3.2g,9.46mmol)溶於DMF(32.9ml)並以N-(胺基甲基)-6-溴甲吡啶醯胺(2.29g,9.46mmol)、HBTU(4.30g,11.4mmol)與DIPEA(4.96ml,28.4mmol)處理。使反應於室溫攪拌1.5小時,隨後分配於水與EtOAc之間。將有機層分離,以水洗滌,以Na2SO4乾燥,過濾並濃縮。殘餘物係藉由快速層析純化(ISCO,120g管柱,0-50% EtOAc/DCM達15分鐘),給予如同白色泡沫的標題化合物(3g,59.5%產率)。MS(m/z)533.2(M+)。
使N-(胺基甲基)-3-溴苄醯胺氫氯酸鹽(0.42g,1.58mmol)、(R)-2-((N-(苄氧基)甲醯胺基)甲基)-4-苯基丁酸(0.57g,1.58mmol)、EDC(0.61g,3.16mmol)、HOBt(0.29g,1.89mmol)、與N-甲基嗎啉(0.52ml,4.73mmol)溶
於DCM(12ml)的混合物於室溫攪拌過夜。隨後添加1N HCl(20ml)與DCM(10ml)並使混合物攪拌10分鐘。隨後層分離,將有機層濃縮,給予標題化合物(0.86mg,91%產率),其不經進一步純化即使用。MS(m/z)540.1(M+2+)。
中間物50係藉由類似於中間物49所說明的方法,從N-(胺基甲基)-3-溴苄醯胺氫氯酸鹽與指定的酸製備。
N-(胺基甲基)-3-溴苄醯胺氫氯酸鹽(1.90g,7.16mmol)與(R)-2-((N-(苄氧基)甲醯胺基)甲基)庚酸(2.31g,7.87mmol)溶於DCM(40ml)的混合物係以三乙胺(2ml,14.3mmol)處理。隨後使反應於水浴中冷卻,並逐滴添加T3P®(50% wt,溶於EtOAc,6.39ml,10.7mmol),隨後使反應於室溫攪拌2小時。隨後加水(100ml)與DCM(50ml)稀釋反應。層遂分離,將有機層濃縮。殘餘物以醚研磨並過濾。收集的固體以DCM與醚洗滌,隨後真空乾燥3天,給予如同灰白色固體的標題化合物(1.22g,30%產率)。MS(m/z)506.1
(M+2+)。
對N-(胺基甲基)-3-溴苄醯胺氫氯酸鹽(438mg,1.65mmol)與(R)-2-((R)-1-(N-(苄氧基)甲醯胺基)丙基)庚酸(530mg,1.65mmol)溶於DCM(10ml)與DIPEA(0.86ml,4.95mmol)的混合物添加HATU(752mg,2mmol),並使反應於室溫攪拌3.5小時。反應係藉由添加DCM(10ml)稀釋並以水(2 x 20ml)洗滌。有機層係經由疏水玻璃料收集並濃縮。殘餘物係藉由快速層析純化(ISCO Combiflash Rf,40g矽膠管柱,20-100% EtOAc/己烷),給予如同白色固體的標題化合物(476mg,54%產率)。MS(m/z)534.1(M+2+)。
步驟1:乙基3-溴-5-乙氧基苄酸酯
3-溴-5-羥基苄酸(10g,46.1mmol)與碳酸鉀(31.8g,230mmol)溶於乙腈(453ml)的混合物係以碘乙烷(8.19ml,101mmol)處理並使反應於迴流加熱過夜。隨後使反應冷卻至室溫並過濾。將濾液濃縮,使殘餘物分配於DCM與水之間。有機層係經由疏水玻璃料收集並濃縮,給予如同黃色油狀物的
標題化合物(12.2g,97%產率)。MS(m/z)275.0(M+2+)。
步驟2:3-溴-5-乙氧基苄酸
對乙基3-溴-5-乙氧基苄酸酯(5g,18.3mmol)溶於甲醇(18.3ml)的溶液添加氫氧化鈉(2M,9.15ml,18.3mmol)並使反應攪拌3小時。在真空移除有機物,其餘溶液以乙酸乙酯萃取。層遂分離並藉由添加2M HCl將水相調成pH 4,隨後以乙酸乙酯萃取兩次。合併的有機萃取液以鹽水洗滌,隨後乾燥及濃縮,給予如同白色固體的標題化合物(3.44g,97%產率)。MS(m/z)247.0(M+2+)。
將碘乙烷(17.2ml,213mmol)逐滴加至4-溴-2-羥基苄酸(22g,101mmol)與碳酸鉀(70.1g,507mmol)溶於乙腈(659ml)的混合物,並使反應混合物加熱至80℃。3.5小時後,添加DMF(300ml)。使溫度降至50℃並使反應攪拌過夜。隨後使反應混合物冷卻至室溫,和以5g規模使用相同條件執行的另一反應合併,並過濾。在真空移除揮發物,添加乙酸乙酯(500ml)。混合物以水洗滌兩次,隨後將有機層分離及濃縮,給予標題化合物(34g,100%產率),其不經進一步純化即使用。MS(m/z)273.0(M+H+)。
將碘乙烷(6.12ml,76mmol)逐滴加至甲基4-溴-2-羥基苄酸酯(5.0g,21.6mmol)與碳酸鉀(8.97g,64.9mmol)溶於DMF(80ml)的混合物,並使反應混合物於室溫攪拌過夜。隨後將混合物過濾,以EtOAc稀釋並以水洗滌兩次。將有機層分離且隨後濃縮,給予標題化合物(5.61g,100%產率)。MS(m/z)261.0(M+2+)。
對甲基4-溴-2-乙氧基苄酸酯(5.6g,21.6mmol)溶於乙醇(25ml)與THF(25ml)的混合物添加NaOH(2M,10.3ml,20.5mmol)並使反應攪拌2小時。同樣地,對乙基4-溴-2-乙氧基苄酸酯(33.9g,124mmol)溶於乙醇(146ml)與THF(146ml)的混合物添加NaOH(2M,62.1ml,124mmol),並使反應於室溫攪拌2小時。隨後將兩反應合併,以供後處理,在真空移除揮發物,殘餘水溶液以DCM萃取。隨後經由添加6N HCl,將水層調至~pH 4。隨後使混合物攪拌,過濾收集淡黃色固體,以水洗滌並風乾,給予標題化合物(33g,92%產率),其不經進一步純化即使用。MS(m/z)513.0(2M+23+)。
對250ml燒瓶添加乙腈(158ml)、3-溴-5-碘酚(12.1g,40.5mmol)、碳酸鉀(28.0g,202mmol)、與碘乙烷(3.60ml,44.5mmol)。使反應於80℃加熱
過夜且隨後冷卻至室溫。將反應過濾,固體以乙腈洗滌。將濾液濃縮,使殘餘物和己烷攪拌,隨後過濾且固體以己烷洗滌。將己烷濃縮,給予如同黃色油狀物的標題化合物(13.2g,100%產率)。MS(m/z)328.9(M+2+)。
於0℃,以30分鐘對4-溴-2-乙氧基苯胺(8.78g,40.6mmol)溶於乙腈(105ml)的溶液逐滴添加I2(20.6g,81mmol)與三級丁基亞硝酸鹽(5.79ml,48.8mmol)溶於乙腈(400ml)的溶液並使反應攪拌1.5小時。混合物隨後以水性Na2SO3淬熄,同時使溫度維持低於10℃,隨後以己烷(3 x 500ml)萃取。合併的己烷萃取液以MgSO4乾燥,過濾並濃縮。殘餘物係藉由快速層析純化(ISCO,330g管柱,0-5% EtOAc/己烷,達30分鐘),給予如同清澈油狀物的標題化合物(6g,45%產率)。MS(m/z)327.2(M+H+)。
對250ml燒瓶添加1-溴-3-乙氧基-5-碘苯(13.2g,40.5mmol)、Pd(OAc)2(0.91g,4.05mmol)與三甲基磷酸酯(10.8ml,92mmol)。使反應加熱至105℃,歷時1小時。添加額外的Pd(OAc)2(0.91g,4.05mmol)。在額外的1.5小時後,添加Pd(OAc)2(0.91g,4.05mmol)連同三甲基亞磷酸酯(4.79ml,40.5
mmol),並使反應溫度增至~110℃。添加三甲基亞磷酸酯(5.98ml,50.6mmol),觀察反應在1小時後完成。使反應冷卻至室溫,以Et2O稀釋,隨後過濾。將濾液濃縮,使殘餘物和己烷攪拌。將己烷傾出並以額外的己烷重複此過程兩次。合併的己烷傾析液以水洗滌,以Na2SO4乾燥,過濾並濃縮,給予如同橙色油狀物的標題化合物(7.56g,60%產率)。MS(m/z)309.0(M+)。
中間物59的另擇合成:二甲基(3-溴-5-乙氧基苯基)膦酸酯
對溶於1,4-二噁烷(469ml)的1-溴-3-乙氧基-5-碘苯(53.7g,164mmol)添加三甲基亞磷酸酯(48.5ml,411mmol),接著添加Pd(OAc)2(4.61g,20.5mmol)。使反應於105℃迴流過夜。LCMS指示起始材料未完全消耗。添加額外的三甲基亞磷酸酯(9.70ml,82mmol)與Pd(OAc)2(0.37g,1.64mmol),使反應再迴流2小時,隨後冷卻,並分配於DCM與水之間。將DCM層分離,以鹽水洗滌,通過疏水玻璃料並濃縮,獲得如同暗紅色油狀物的粗製材料。將粗製油狀物裝至矽膠匣上並藉由快速層析純化(ISCO Torrent,750g管柱,100% DCM,達20分鐘,0-5% MeOH/DCM,達20分鐘,隨後5% MeOH/DCM,再40分鐘。將所欲分段合併並濃縮,給予如同暗紅色液體的標題化合物(51g,165mmol,100%產率)。MS(m/z)(309.0/311.0)(溴同位素)。
中間物60係藉由類似於中間物59的另擇合成所說明的方法,從指定的碘化物製備。
步驟1:(4-溴-2-乙氧基苯基)甲醇
對250ml燒瓶添加4-溴-2-乙氧基苄酸(10.3g,41.8mmol)與THF(50ml)。使溶液於冰浴中冷卻至0℃,隨後以~15分鐘逐滴添加BH3.THF(1M,46.0ml,46.0mmol),同時使溫度保持低於20℃。隨後使反應混合物於室溫攪拌5小時,隨後小心加至飽和aq.K2CO3溶液(50ml)。該懸浮液以水(100ml)稀釋,將THF層分離並濃縮。水層以EtOAc(3 x)萃取。將得自濃縮THF層的殘餘物和有機萃取液合併,合併的溶液以鹽水洗滌,隨後以Na2SO4乾燥,過濾並濃縮,給予如同黃色固體的標題化合物(9.68g)。MS(m/z)213.0(M-17+)。
步驟2:4-溴-1-(氯甲基)-2-乙氧基苯
對100ml燒瓶添加(4-溴-2-乙氧基苯基)甲醇(9.68g,41.9mmol)與硫醯氯(13.8ml,189mmol)。使溶液加熱至迴流15分鐘,隨後冷卻至室溫。隨後將反應濃縮,將殘餘物溶於EtOAc並以飽和aq.NaHCO3洗滌。層遂分離。水層以額外的EtOAc萃取,合併的有機萃取液以Na2SO4乾燥,過濾並濃縮,給予如同黃色固體的標題化合物(9.8g)。MS(m/z)212.2(相當於損失氯的部分)。
步驟1:2-(4-溴-2-乙氧基苯基)乙腈
對100ml燒瓶添加4-溴-1-(氯甲基)-2-乙氧基苯(6.01ml,39.3mmol)、DMF(33.3ml)與氰化鈉(2.18g,43.2mmol)。在氮下,使溶液於室溫攪拌過夜。反應隨後以添加NH4Cl、EtOAc與水稀釋。層遂分離,水層以額外EtOAc萃取。合併的有機層以鹽水洗滌(2 x),以Na2SO4乾燥,過濾並濃縮,給予如同深色油狀物的標題化合物(9.4g),其不經進一步純化即使用。
步驟2:2-(4-溴-2-乙氧基苯基)乙酸
對250ml燒瓶添加2-(4-溴-2-乙氧基苯基)乙腈(5.79ml,39.3mmol),接著添加NaOH(11.5g,288mmol)溶於水(140ml)的溶液。使反應加熱至迴流5小時,隨後冷卻至室溫並攪拌7小時。反應以DCM萃取,在快速攪拌同時,添加6N HCl將水相酸化。使所得懸浮液於室溫攪拌15分鐘,隨後過濾。固體在減壓下乾燥,給予如同淡黃色固體的標題化合物(8.9g)。MS(m/z)278.0(M+18+)。
步驟1:乙基3-溴-5-乙氧基苄酸酯
3-溴-5-羥基苄酸(10g,46.1mmol)與碳酸鉀(31.8g,230mmol)溶於乙腈(453ml)的混合物係以碘乙烷(8.19ml,101mmol)處理並使反應於迴流加熱過夜。隨後使反應冷卻至室溫並過濾。將濾液濃縮,使殘餘物分配於DCM與水之間。有機層係經由疏水玻璃料收集並濃縮,給予如同黃色油狀物的標題化合物(12.2g,97%產率)。MS(m/z)275.0(M+2)。
步驟2:3-溴-5-乙氧基苄酸
對乙基3-溴-5-乙氧基苄酸酯(5.0g,18.3mmol)溶於甲醇(18.3ml)的溶液添加氫氧化鈉(2M,9.15ml,18.3mmol)並使反應攪拌3小時。在真空移除揮發物,其餘溶液以乙酸乙酯萃取。層遂分離,添加2M HCl將水相調至pH 4。水層隨後以乙酸乙酯萃取兩次。合併的有機萃取液以鹽水洗滌,隨後乾燥及濃縮,給予如同白色固體的標題化合物(3.44g,97%產率)。MS(m/z)247.0(M+2)。
步驟1:乙基5-乙氧基-2-羥基苄酸酯
使5-乙氧基-2-羥基苄酸(3.2g,17.6mmol)溶於EtOH(35ml)、甲苯(11ml)與濃H2SO4(0.88ml)的混合物於迴流加熱12小時。隨後將反應濃縮。將固體溶於EtOAC(100ml),以飽和NaHCO3洗滌,以MgSO4乾燥並濃縮,給予如同白色固體的標題化合物(2.75g)。
步驟2:乙基3-溴-5-乙氧基-2-羥基苄酸酯
將乙基5-乙氧基-2-羥基苄酸酯(500mg,2.4mmol)溶於冰醋酸(2.5ml)並以乙酸鈉(213mg,2.6ml)處理,使混合物於冰浴中冷卻。隨後將混合物移離冰浴,並逐滴添加溴(125μl,2.45mmol)溶於乙酸(1ml)的溶液。使反應於室溫攪拌1小時且隨後濃縮。水(20ml),隨後添加sat.aq.NaHCO3溶液(50ml),混合物以乙酸乙酯(50ml)萃取。以2g規模、於相同條件下重複反應,合併的乙酸乙酯萃取液以MgSO4乾燥並濃縮。使殘餘物從己烷結晶,給予
如同粉色固體的標題化合物(2g)。
步驟1:(S)-二甲基2-(4-溴-2-羥基苄醯胺基)琥珀酸酯
對含有(S)-二甲基2-胺基琥珀酸酯氫氯酸鹽(5.46g,27.6mmol)與4-溴-2-羥基苄酸(5g,23.0mmol)溶於DMF(50ml)的溶液添加DIPEA(12.1ml,69.1mmol),接著添加1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-醇(3.74g,27.6mmol)與EDC(5.30g,27.6mmol)。使反應攪拌18小時並經由LCMS監測,顯示所欲產物。反應混合物以NH4Cl aq.soln.稀釋,以乙醚(3 x 50ml)萃取,以MgSO4乾燥,在矽膠上過濾濃縮。藉由快速層析純化(ISCO,80g管柱,0-50% EtOAc/己烷)得到如同黃色玻璃的標題化合物(3.1g,37.2%產率)。MS(m/z)362.0(M+H+)。
步驟2:(S)-二甲基2-(4-溴-2-(2-甲氧基-2酮基乙氧基)苄醯胺基)琥珀酸酯
對含有(S)-二甲基2-(4-溴-2-羥基苄醯胺基)琥珀酸酯(3.09g,8.58mmol)溶於丙酮(40ml)的溶液添加甲基2-乙酸溴(0.89ml,9.44mmol)與碳酸鉀(2.37g,17.2mmol)。使反應攪拌3小時並經由LCMS監測,顯示所欲產物。反應以水稀釋並以EtOAc(3 x 50ml)萃取。合併的有機層以MgSO4乾燥,在矽膠上過濾濃縮。藉由快速層析純化(Isco,40g管柱,0-70%乙基EtOAc/己烷)得到如同無色玻璃的標題化合物(3.5g,95%產率)。MS(m/z)434.1(M+H+)。
將4-溴-2-乙氧基苄酸(0.5g,2.040mmol)、二甲基2,2'-氮烷二基二乙酸酯(0.33g,2.040mmol)、EDC(0.39g,2.040mmol)、1-羥基-7-15氮雜苯并三唑(0.31g,2.04mmol)與N-甲基嗎啉(0.22ml,2.04mmol)溶於DMF。使反應混合物於室溫攪拌18小時。隨後將反應倒進水中並以乙酸乙酯(50ml)稀釋。層遂分離,水層以DCM(每次50ml)洗滌兩次。層遂分離,將有機層合併,以鹽水洗滌,以硫酸鈉乾燥,過濾並濃縮。殘餘物係藉由快速層析純化(ISCO,0-50%乙酸乙酯/己烷),給予標題化合物(0.64g,81%產率)。MS(m/z)390.3(M+H+)。
於RT將HATU(10.55g,27.8mmol)加至4-溴苄酸(4.65g,23.13mmol)與(R)-二甲基2-胺基琥珀酸酯氫氯酸鹽(5.49g,27.8mmol)溶於DMF(46.3ml)的攪動混合物。隨後添加TEA(9.67ml,69.4mmol),並使混合物攪拌18h。添加EtOAc與鹽水。有機物以鹽水洗滌(2x more),隨後將合併的洗液以EtOAc(1x)回萃。合併的有機物以MgSO4乾燥,過濾,並濃縮。使用ISCO RF(0-60% EtOAc/Hex)純化,得到(R)-二甲基2-(4-溴苄醯胺基)琥珀酸酯(7.656g,22.02mmol,95%產率)。MS(m/z)344(M+H+)。
對100-mL圓底燒瓶添加溶於DCM(8mL)的4-溴苄酸(706mg,3.51mmol)、(S)-二甲基2-胺基琥珀酸酯氫氯酸鹽(694mg,3.51mmol)、2,4,6-三丙基-1,3,5,2,4,6-三氧雜三膦酸2,4,6-三氧化物(3.14ml,5.27mmol)與三乙胺(1.468ml,10.54mmol)。使所得混合物於23℃攪拌2H,之後使混合物分配於EtOAc與水之間。將有機相分離並以1N HCl、飽和碳酸氫鈉、與鹽水洗滌。隨後以MgSO4乾燥,過濾,並藉由旋轉蒸發器濃縮。粗製的(S)-二甲基2-(4-溴苄醯胺基)琥珀酸酯(1.07g,3.11mmol,89%產率)係直接帶進下一反應,作為粗製混合物。MS(m/z)344(M+H+)。
對含有(S)-二甲基2-胺基戊二酸酯、氯化氫(4.63g,21.89mmol)與4-溴苄酸(4g,19.90mmol)溶於DMF(75mL)的溶液添加HATU(7.45g,19.59mmol),接著添加DIPEA(8.55ml,49.0mmol)。使反應攪拌18h。反應混合物以aq.NH4Cl稀釋,以乙醚萃取,以MgSO4乾燥,過濾並在SiO2上濃縮。在SiO2(80g)上,以溶於己烷的0-50%乙酸乙酯作為沖提液,藉由ISCO上的快速層析純化,得到如同無色固體的所欲產物。MS(m/z)357.9(M+H+)。
對含有(S)-二甲基2-胺基戊二酸酯、氯化氫(3.80g,17.95mmol)與4-溴-2-乙氧基苄酸(4g,16.32mmol)溶於DMF(75mL)的溶液添加HATU(7.45g,19.59mmol),接著添加DIPEA(8.55ml,49.0mmol)。使反應攪拌18h。反應混合物以aq.NH4Cl稀釋,以乙醚萃取,以MgSO4乾燥,過濾並在SiO2上濃縮。在SiO2(80g)上,以溶於己烷的0-50%乙酸乙酯作為沖提液,藉由ISCO上的快速層析純化,得到如同無色固體的所欲產物。MS(m/z)402(M+H+)。
將HATU(1.615g,4.25mmol)加至含有4-溴-2-氯苄酸(1g,4.25mmol)與許尼希氏鹼(1.56ml,8.92mmol)溶於DCM(21.23ml)的RT溶液。使反應於RT攪拌5分鐘,隨後以(S)-貳-三級丁基2-胺基琥珀酸酯、氯化氫(1.197g,4.25mmol)處理。使反應於RT攪拌過夜。反應以水淬熄並攪拌1h。隨後添加10ml 1N HCl,層遂分離。有機層以水(1 x 10ml)洗滌、以MgSO4乾燥,過濾,並濃縮。粗製產物係於Combiflash Rf上純化,使用120g矽膠金匣,於80ml/min,以0% EtOAc/己烷至20% EtOAc/己烷達15min,隨後20% EtOAc/己烷達15min的梯度沖提。將所欲分段於減壓下濃縮,提供如同清澈、無色油狀物的標題化合物(1.528g,3.30mmol,78%產率)。MS(m/z)
351.9(M-2tBu+H+)。
對1-(苄氧基)-3-溴-5-碘苯(1.00g,2.57mmol)、DIEA(0.449ml,2.57mmol)、與二苄基膦酸酯(0.454ml,2.056mmol)的脫氣混合物添加Tris(0.149g,0.129mmol)。使所得混合物於80℃攪拌3h。將混合物濃縮。使用ISCO Rf純化(0-100% EtOAc/Hex),得到如同清澈、濃稠油狀物的二苄基(3-(苄氧基)-5-溴苯基)膦酸酯(318mg,0.608mmol,23.64%產率)。MS(m/z)523.2(M+H+)。
將溴化苄(4.78ml,40.1mmol)加至3-溴-5-碘酚(10.00g,33.5mmol)與碳酸鉀(13.87g,100mmol)溶於乙腈(33.5ml)的漿狀物。使所得混合物攪拌18h。加水與過量EtOAc。有機物以水(2x)與鹽水(1x)洗滌。合併的洗液係使用EtOAc(2x)回萃。合併的有機物以MgSO4乾燥,過濾,並濃縮,得到如同橙色油狀物的1-(苄氧基)-3-溴-5-碘苯(14.06g,33.3mmol,99%產率)。MS(m/z)388.9(M+H+)。
對含有(S)-二甲基2-胺基琥珀酸酯氫氯酸鹽(5.51g,27.9mmol)與4-溴-2-甲基苄酸(5g,23.25mmol)溶於DMF(100mL)的溶液添加HATU(10.61g,27.9mmol),接著添加DIPEA(12.18ml,69.8mmol)。使反應攪拌18h。反應混合物以aq.NH4Cl稀釋,以乙醚萃取,以MgSO4乾燥,過濾並在SiO2上濃縮。在SiO2(80g)上,以溶於己烷的0-50%乙酸乙酯作為沖提液,藉由ISCO上的快速層析純化,得到如同無色固體的標題產物。MS(m/z)360(M+H+)。
(S)-二苄基2-(4-溴-2-氟苄醯胺基)琥珀酸酯
將HATU(868mg,2.28mmol)加至含有4-溴-2-氟苄酸(500mg,2.28mmol)與許尼希氏鹼(1.20ml,6.85mmol)溶於DCM(11.42mL)的RT溶液。攪拌5分鐘後,將(S)-二苄基2-胺基琥珀酸酯,4-甲基苯磺酸鹽(1110mg,2.28mmol)加至反應。使反應於RT攪拌24h。反應以DCM與20mL 1N HCl稀釋。層遂分離,水層以DCM(1x20mL)洗滌。合併的有機物以MgSO4乾燥,過濾,並在矽膠上濃縮純化。粗製產物係在Combiflash Rf上純化,使用80g矽膠匣,於60mL/min以從0% EtOAc/己烷跑至20%EtOAc/己烷達15min且隨後20% EtOAc/己烷達10min的梯度沖提。將所欲分段於減壓下濃縮,提
供標題化合物(S)-二苄基2-(4-溴-2-氟苄醯胺基)琥珀酸酯(1.11g,2.15mmol,94%產率),如同清澈、無色油狀物,其慢慢結晶成無色固體。MS(m/z)514.1(M+H+)。
將PdCl2(dppf)-CH2Cl2加成物(1.00g,1.22mmol)加至二甲基(3-溴-5-乙氧基苯基)膦酸酯(7.56g,24.46mmol)、雙戊醯二硼(9.32g,36.7mmol)、與乙酸鉀(9.60g,98mmol)溶於1,4-二噁烷(48.9ml)的混合物並使反應於105℃加熱3小時。隨後使反應冷卻至室溫,添加Et2O與水稀釋。使混合物攪拌5分鐘,隨後層遂分離。水層以額外Et2O萃取。將合併的Et2O萃取液過濾並濃縮,給予暗色殘餘物。將己烷加至殘餘物並使溶液攪拌5分鐘。將己烷傾出,並再重複此過程兩次。合併的己烷傾析液以Na2SO4乾燥,過濾並濃縮,給予橙色油狀物,其藉由快速層析純化(ISCO,330g管柱,0-100% EtOAc/DCM,達20分鐘,隨後0-20% MeOH/DCM,達20分鐘),給予如同橙色油狀物的標題化合物(6.5g,60%產率),其靜置後結晶。MS(m/z)275.1(和硼酸質量一致)。
中間物67-74與300-307係藉由類似於中間物66所說明的方法,從指定的溴化物製備。
使3-溴-5-乙氧基苄酸(3.44g,14.0mmol)、雙戊醯二硼(5.35g,21.1mmol)、PdCl2(dppf)-CH2Cl2加成物(1.15g,1.40mmol)與乙酸鉀(6.89g,70.2mmol)溶於1,4-二噁烷(35.1ml)的混合物於迴流加熱18小時。隨後使反應冷卻並濃縮。使殘餘物分配於EtOAc與2M NaOH之間。層遂分離,隨後添加HCl將水相酸化至pH 4並以乙酸乙酯萃取兩次。合併的有機萃取液隨後以鹽水洗滌,乾燥並濃縮。將殘餘物溶於DCM並藉由快速層析純化(ISCO CombiflasH,120g矽膠管柱,20-100% EtOAc/己烷),給予如同白色固體的標題化合物(1.69g,80%純度,41%產率),其不經進一步純化即使用。MS(m/z)293.1(M+H+)。
對2-乙氧基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧雜環戊硼烷-2-基)苄酸(500mg,1.71mmol)與(S)-二甲基2-胺基琥珀酸酯氫氯酸鹽(406mg,2.05mmol)溶於DCM(5.95ml)的混合物添加DIPEA(0.90ml,5.13mmol)與HATU(781mg,2.05mmol)。使反應混合物於室溫攪拌2小時,隨後以水洗滌,層遂分離。將DCM層濃縮,殘餘物係經由快速層析純化(ISCO Combiflash Rf,80g管柱,20-100% EtOAc/己烷),生成如同淡黃色固體的標題化合物(638mg,86%產率)。MS(m/z)436.2(M+H+)。
中間物77-78係藉由類似於中間物76所說明的方法,從(S)-二甲基2-胺基琥珀酸酯氫氯酸鹽與指定的酸製備。
對3-乙氧基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧雜環戊硼烷-2-基)苄酸(3.8g,13.0mmol)與(9H-芴-9-基)甲基(2-胺基乙基)胺基甲酸酯氫氯酸鹽(4.15g,13.0mmol)溶於DCM(45ml)的混合物添加HATU(5.94g,15.6mmol)與DIPEA(6.82ml,39.0mmol)並使反應於室溫攪拌2小時。隨後縮減反應體積,加醚,並將所得懸浮液過濾。固體以醚洗滌。將醚濾液縮減體積並過濾。使合併的單離固體於5:1醚:DCM的混合物中攪拌20分鐘。隨後過濾收集,以DCM與醚洗滌並於真空乾燥過夜。使固體預吸附在矽膠上並藉由快速層析純化(Si塞,100%己烷(200ml)、25% EtOAc/己烷(200ml)、100% DCM(200ml)、50% EtOAc/己烷(500ml)、75% EtOAc/己烷(500ml)、100% EtOAc(500ml)與100% MeOH(200ml)),給予一白色固體,使其於真空乾燥過夜,給予如同白色固體的標題化合物(2.8g,39%產率)。MS(m/z)557.2(M+H+)。原始濾液以水洗滌,層遂分離,將有機相通過相分離器並濃縮。殘餘物係經由快速層析純化(ISCO Combiflash Rf,120g管柱,25-100% EtOAc/己烷),給予一固體,使其於真空乾燥過夜,給予額外一批如同白色固體的標題化合物(3.0g,41%產率)。MS(m/z)557.2(M+H+)。
將甲基4-溴-2-羥基苄酸酯(250mg,1.08mmol)、雙戊醯二硼(330mg,1.30mmol)、乙酸鉀(425mg,4.33mmol)、PdCl2(dppf)-CH2Cl2加成物(44.2mg,0.05mmol)與1,4-二噁烷(6ml)在微波小瓶中合併。反應小瓶隨後在微
波反應器於140℃照射20分鐘。隨後使反應混合物冷卻至室溫,以EtOAc與鹽水(10ml)稀釋並經由0.45uM PTFE玻璃料過濾。隨後層分離,將有機層通過疏水玻璃料,濃縮並經由SiO2層析純化(ISCO Combiflash Rf並以溶於DCM的0至10%甲醇沖提20分鐘,25g管柱),生成所欲化合物。MS(m/z)279.1.
對100ml圓底燒瓶添加3-乙氧基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧雜環戊硼烷-2-基)苄酸(607mg,2.078mmol)與二甲基2,2'-氮烷二基二乙酸酯氫氯酸鹽(411mg,2.078mmol)。將固體溶於DCM(10ml),隨後依序添加DIPEA(1.089ml,6.23mmol)與HATU(948mg,2.493mmol)。使混合物攪拌20H,此刻以飽和水性NaHCO3溶液淬熄反應。有機相以EtOAc稀釋並分離,隨後以飽和NH4Cl水溶液與鹽水洗滌。隨後以MgSO4乾燥,過濾,並藉由旋轉蒸發器濃縮。藉由ISCO進行純化(80g管柱,溶於己烷的0%至100% EtOAc),得到二甲基2,2'-((3-乙氧基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧雜環戊硼烷-2-基)苄醯基)氮烷二基)二乙酸酯(256mg,0.588mmol,28.3%產率)。MS(m/z)436.3(M+H+)。
對100ml圓底燒瓶添加溶於1,4-二噁烷(10ml)的二甲基2,2'-((4-溴-2-乙氧基苄醯基)氮烷二基)二乙酸酯(773mg,1.99mmol)、雙戊醯二硼(758mg,2.99mmol)、與乙酸鉀(586mg,5.97mmol)。以N2將混合物脫氣5min,此刻添加PdCl2(dppf)-CH2Cl2加成物(81mg,0.100mmol)。使所得混合物於100℃攪拌3h。LCMS顯示所欲質量,使粗製溶液冷卻至RT並繼續下一反應。MS(m/z)436.3(M+H+)。
對20ml小瓶添加溶於乙腈(10ml)的甲基3-羥基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧雜環戊硼烷-2-基)苄酸酯(866mg,3.11mmol)與碳酸鉀(861mg,6.23mmol),接著添加甲基乙酸溴(0.344ml,3.74mmol)。使小瓶加熱至80℃並攪拌1h。添加另一份0.240ml甲基乙酸溴與450mg碳酸鉀。於80℃再攪拌18h。分配於EtOAc與水之間,將有機相分離並以水與鹽水洗滌。隨後以MgSO4乾燥,過濾,並藉由旋轉蒸發器濃縮。藉由ISCO進行純化(120g管柱,溶於己烷的0%至100% EtOAc),得到如同白色固體的甲基3-(2-甲氧基-2-
酮基乙氧基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧雜環戊硼烷-2-基)苄酸酯(150mg,0.428mmol,13.76%產率)。MS(m/z)351.2(M+H+)。
將溶於DCM(1ml)的(R)-N-(胺基甲基)-2-((N-(苄氧基)甲醯胺基)甲基)庚醯胺(0.1g,0.31mmol)加至6'-甲氧基-[2,2'-聯吡啶]-6-甲酸(0.07g,0.31mmol)、HATU(0.13g,0.34mmol)、與DIPEA(0.16ml,0.93mmol)溶於DMF(1ml)的溶液,並使反應於室溫攪拌過夜。反應隨後以EtOAc(2x)萃取。合併的有機萃取液以水洗滌,以Na2SO4乾燥,過濾並濃縮。殘餘物以CDI(0.04g,0.23mmol)與甲酸(0.01ml,0.31mmol)溶於DCM(2ml)的預混溶液處理並使反應於室溫攪拌過夜。反應隨後以1N HCl與水洗滌。將有機層分離,以Na2SO4乾燥,過濾並濃縮。殘餘物係藉由快速層析純化(ISCO,24g管柱,0-40% EtOAc/DCM:30分鐘,40% EtOAc/DCM:10分鐘),給予如同濃稠油狀物的標題化合物(0.07g,42%產率)。MS(m/z)534.3(M+H+)。
中間物83係藉由類似於中間物82所說明的方法,稍微更改鹼、溶劑與偶合劑,從(R)-N-(胺基甲基)-2-((N-(苄氧基)甲醯胺基)甲基)庚醯胺與指定的酸製備。
使EDC(423mg,2.20mmol)、(R)-N-(胺基甲基)-3-(N-(苄氧基)甲醯胺基)-2-(環戊基甲基)丙醯胺(245mg,0.74mmol)、HOBt(22.5mg,0.15mmol)、3-苯氧基苄酸(189mg,0.88mmol)與DIPEA(0.64ml,3.67mmol)溶於DMF(5ml)與THF(5ml)的溶液於室溫攪拌18小時。反應隨後以添加NH4Cl與EtOAc稀釋。混合物以EtOAc(3 x)萃取與合併的有機層以鹽水洗滌(2 x),以Na2SO4乾燥,過濾並濃縮。殘餘物係藉由快速層析純化(ISCO,120g矽膠管柱,65ml/min,0-60% EtOAc/DCM達45分鐘),給予標題產品(380mg,98%產率)。MS(m/z)530.3(M+H+)。
中間物86係藉由類似於中間物84所說明的方法,從(R)-N-(胺基甲基)-2-((N-(苄氧基)甲醯胺基)甲基)庚醯胺與指定的酸製備。
將6-(3-乙氧基-4-(乙氧基羰基)苯基)-5-氟吡啶甲酸(129mg,0.39mmol)與(R)-N-(胺基甲基)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺(100mg,0.39mmol)溶於無水DMF(1.8ml)並以DIPEA(0.14ml,0.77mmol)處理,接著以HATU(161mg,0.42mmol)處理。使反應於室溫攪拌18小時,隨後倒進水中,混合物以EtOAc(3 x 50ml)萃取。合併的有機萃取液以MgSO4乾燥,過濾,並濃縮。殘餘物係藉由逆相HPLC純化(Waters,Starise,30 x 150mM,30-70% CH3CN/水(+0.1% TFA)),給予標題化合物(61mg,27%產率)。MS(m/z)575.2(M+H+)。
使(R)-2-((N-(苄氧基)甲醯胺基)甲基)-4-苯基丁酸(0.13g,0.4mmol)、N-(胺基甲基)-6-苯基甲吡啶醯胺氫氯酸鹽(0.12g,0.44mmol)、EDC(0.19g,0.99mmol)、HOBt(0.01g,0.08mmol)、與DIPEA(0.21ml,1.19mmol)溶於THF(3ml)的溶液於50℃攪拌過夜。隨後將反應濃縮且殘餘物係藉由快速層析純化(ISCO,0-70% EtOAc/DCM:15分鐘;70% EtOAc/DCM:10分鐘),給予如同濃稠清澈油狀物的標題化合物(0.14g,62%產率)。MS(m/z)537.3(M+H+)。
中間物89-91與93-97係藉由類似於中間物88所說明的方法,稍微更改鹼、溶劑與偶合劑,從(R)-2-((N-(苄氧基)甲醯胺基)甲基)庚酸與指定的胺製備。
將N-(胺基甲基)-6-苯基-4-(三氟甲基)甲吡啶醯胺(227mg,0.77mmol)、HATU(292mg,0.77mmol)與DIPEA(0.27ml,1.54mmol)加至(R)-2-((N-(苄氧基)甲醯胺基)甲基)庚酸(226mg,0.77mmol)溶於DMF(3.6ml)的溶液,並使反應於室溫攪拌18小時。隨後將水(10ml)與EtOAc(30ml)加至反應,層遂分離。有機層以水洗滌,以Na2SO4乾燥,過濾並濃縮,給予標題化合物(378mg,86%產率)。MS(m/z)571.2(M+H+)。
中間物99-104係藉由類似於中間物98所說明的方法,從(R)-2-((N-(苄氧基)甲醯胺基)甲基)庚酸與指定的胺製備。
中間物105係藉由類似於中間物98所說明的方法,從(2R,3R)-3-(N-(苄氧基)甲醯胺基)-2-苯乙基戊酸與指定的胺製備。
對(R)-N-((2-((N-(苄氧基)甲醯胺基)甲基)庚醯胺基)甲基)-6-溴甲吡啶醯胺(150mg,0.3mmol)、(4-氟苯基)硼酸(50mg,0.36mmol)與PdCl2(dppf)-CH2Cl2加成物(8mg,9.80μmol)溶於1,4-二噁烷(1.8ml)的溶液添加aq.Na2CO3溶液(10%,0.95ml,0.89mmol)並將反應投至100℃微波照射5分鐘。隨後使反應分配於乙酸乙酯(10ml)與水(1ml)之間,層遂分離。The有機相以鹽水(1ml)洗滌,以硫酸鈉乾燥並濃縮。使殘餘物預吸附至矽膠上並藉由快速層析純化(ISCO CombiFlasH,12g ISCO RediSep管柱,5-50% EtOAc(+1% MeOH)/己烷),給予如同無色油狀物的標題化合物(103mg,60%產率)。MS(m/z)521.3(M+H+)。
中間物107-112係藉由類似於中間物106所說明的方法,從(R)-N-((2-((N-(苄氧基)甲醯胺基)甲基)庚醯胺基)甲基)-6-溴甲吡啶醯胺與指定的硼酸製備。
中間物113-118係藉由類似於中間物106所說明的方法,從(R)-N-((3-(N-(苄氧基)甲醯胺基)-2-(環戊基甲基)丙醯胺基)甲基)-3-溴苄醯胺與指定的硼酸製備。
中間物119係藉由類似於中間物106所說明的方法,從
N-(((R)-2-((R)-1-(N-(苄氧基)甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)-3-溴苄醯胺與指定的硼酸酯/硼酸製備。
中間物120-140與142係藉由類似於中間物106所說明的方法,從(R)-N-((2-((N-(苄氧基)甲醯胺基)甲基)庚醯胺基)甲基)-3-溴苄醯胺與指定的硼酸酯/硼酸製備。
中間物143-149係藉由類似於中間物106所說明的方法,從(R)-N-((3-(N-(苄氧基)甲醯胺基)-2-(環戊基甲基)丙醯胺基)甲基)-3-溴苄醯胺與指定的硼酸製備。
中間物150-151係藉由類似於中間物106所說明的方法,從(R)-N-((2-((N-(苄氧基)甲醯胺基)甲基)-4-苯基丁醯胺基)甲基)-3-溴苄醯胺與指定的硼酸製備。
中間物152-154係藉由類似於中間物106所說明的方法,從N-(((R)-2-((R)-1-(N-(苄氧基)甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)-3-溴苄醯胺與指定的硼酸酯/硼酸製備。
中間物155係藉由類似於中間物106所說明的方法,從N-(((R)-2-((R)-1-(N-(苄氧基)甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)-6-溴甲吡啶醯胺與指定的硼酸酯/硼酸製備。
使3-乙氧基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧雜環戊硼烷-2-基)苄酸(304mg,1.04mmol)、N-(((R)-2-((R)-1-(N-(苄氧基)甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)-6-溴甲吡啶醯胺(505mg,0.95mmol)、PdCl2(dppf)-CH2Cl2加成物(58.0mg,0.07mmol)與aq.Na2CO3(1M,2.84ml,2.84mmol)溶於1,4-二噁烷(7.34ml)的混合物於70℃攪拌2小時。反應隨後以水與DCM稀釋,層遂分離,添加HCl將水相酸化並以DCM(3 x)萃取。將合併的有機萃取液濃縮且殘餘物係藉由快速層析純化(ISCO Rf,0-20% MeOH/DCM),給予如同深色固體的標題化合物(586mg,100%產率)。MS(m/z)619.3(M+H+)。
中間物157-172與500-511係藉由類似於中間物156所說明的方法,從N-(((R)-2-((R)-1-(N-(苄氧基)甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)-6-溴甲吡啶醯
胺與指定的硼酸酯/硼酸製備。
中間物173係藉由類似於中間物156所說明的方法,從(R)-N-((2-((N-(苄氧基)甲醯胺基)甲基)庚醯胺基)甲基)-6-溴甲吡啶醯胺與指定的硼酸酯/硼酸製備。
中間物174-178係藉由類似於中間物156所說明的方法,從N-(((R)-2-((R)-1-(N-(苄氧基)甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)-3-溴苄醯胺與指定的硼酸酯/硼酸製備。
使(S)-二甲基2-(3-乙氧基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧雜環戊硼烷-2-基)苄醯胺基)琥珀酸酯N-(((R)-2-((R)-1-(N-(苄氧基)甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)-3-溴苄醯胺(105mg,0.2mmol)、PdCl2(dppf)-CH2Cl2加成物(12.1mg,0.02mmol)與Na2CO3(1M,0.59ml,0.59mmol)溶於1,4-二噁烷(1.53ml)的混合物於70℃攪拌60分鐘。隨後使反應冷卻至室溫,以MeOH與水(10ml)稀釋。隨後添加LiOH(1.74mmol)並使反應攪拌1小時。隨後將反應酸化,以水稀釋並以EtOAc(3 x)萃取。將合併的有機萃取液濃縮,給予標題化合物(145mg),其不經進一步純化或定性即使用。
使二甲基(3-乙氧基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧雜環戊硼烷-2-基)苯基)膦酸酯(505mg,1.42mmol)、N-(((R)-2-((R)-1-(N-(苄氧基)甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)-6-溴甲吡啶醯胺(687mg,1.29mmol)、PdCl2(dppf)-CH2Cl2加成物(79mg,0.1mmol)與Na2CO3(1M,3.86ml,3.86mmol)溶於1,4-二噁烷(9.98ml)的混合物於50℃攪拌10分鐘。隨後使反應冷卻並以DCM萃取。將有機層濃縮且殘餘物係藉由快速層析純化(ISCO,40g矽膠管柱,0-100% EtOAc/DCM,5% MeOH/DCM),給予如同棕色固體的標題化合物(586mg,67%產率)。MS(m/z)683.0(M+H+)。
使3'-((9H-呫吨-9-基)硫基)-[1,1'-聯苯]-3-甲酸(251mg,0.61mmol)、DIPEA(0.28ml,1.6mmol)、HOBt(107mg,0.8mmol)與EDC(152mg,0.8mmol)溶於DCM(6ml)的溶液於氮下、於室溫攪拌15分鐘,隨後於氮下逐滴加至(R)-N-(胺基甲基)-2-((N-羥基甲醯胺基)甲基)庚醯胺(240mg,0.78mmol)溶於DCM(3ml)的溶液。使反應於室溫攪拌過夜。隨後添加DCM稀釋反應,並以飽和碳酸氫鈉溶液洗滌。有機層以鹽水洗滌,以硫酸鈉乾燥,過濾並濃縮。殘餘物係藉由快速層析純化(Biotage SP1,NH管柱,0-15% MeOH/DCM),給予標題化合物(165mg,43%產率)。MS(m/z)646(M+23+)。
將Pd/C(299mg,0.28mmol)加至二甲基(3-(6-(((R)-2-((R)-1-(N-(苄氧基)甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)-5-乙氧基苯基)膦酸酯(586mg,0.86mmol)並將反應沖氮。添加乙醇(4ml),接著添加甲醇(70ml),將反應置於氫氣氛(氣球)4小時。隨後使反應經由Celite®過濾並濃縮。殘餘物係藉由快速層析純化(ISCO,40g矽膠管柱,0-5% MeOH/DCM:15分鐘,5% MeOH/DCM:5分鐘),給予如同黏稠棕色油狀物的標題化合物(408mg,88%產率)。MS(m/z)593.0(M+H+)。
中間物183-185與600-608係藉由類似於中間物182所說明的方法,從指定的中間物製備。
於0℃,對二甲基(4-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-(苄氧基)甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)-2-乙氧基苯基)膦酸酯(531mg,0.78mmol)溶於DCM(7.53ml)的溶液添加溴三甲基矽烷(0.25ml,1.94mmol)。並使反應升溫至室溫,攪拌1小時,隨後濃縮。使殘餘物和DCM共沸兩次,給予標題化合物(509mg,100%產率),其不經進一步純化即使用。MS(m/z)655.3(M+H+)。
(9H-芴-9-基)甲基(2-(3-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-(苄氧基)甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)-5-乙氧基苄醯胺基)乙基)胺基甲酸酯(234mg,0.27mmol)溶於乙腈(4ml)的懸浮液係以吡咯烷(0.6ml,7.26mmol)處理並攪拌2小時。隨後將反應濃縮且殘餘物係藉由快速層析純化(ISCO,40g管柱;0-15% MeOH+0.1% TEA/DCM,給予如同褐色固體的標題化合物(170mg),其不經進一步純化即使用。MS(m/z)661.0(M+H+)。
對著反應燒瓶,將(S)-二甲基2-(3'-((((R)-2-((R)-1-(N-(苄氧基)甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)-3-(2-甲氧基-2-酮基乙氧基)-[1,1'-聯苯]-4-基甲醯胺基)琥珀酸酯(450mg,0.45mmol)與Pd/C(47.6mg,0.05mmol)的混合物沖N2。添加甲醇(4.47ml),將混合物抽真空並回填N2(3 x)。隨後將混合物抽真空並回填H2(過量)。使所得混合物氫化18小時,隨後抽真空並沖N2(3 x)。混合物係在N2下經由針筒過濾器以MeOH過濾。將濾液濃縮至乾。將濾液再投至先前反應條件,同時將甲酸銨(282mg,4.47mmol)加至反應混合
物。需要額外的甲酸銨(282mg,4.47mmol)與Pd/C(47.6mg,0.05mmol)完成反應。將混合物在N2下過濾,以MeOH洗滌並濃縮。將濃縮物溶於DCM,過濾並濃縮。使用ISCO Rf純化(0-10% MeOH/EtOAc),得到標題化合物(133mg,0.18mmol,39.5%產率。MS(m/z)。715.4(M+H+)。
對反應燒瓶添加乙基3'-((((R)-2-((R)-1-(N-(苄氧基)甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)-5-乙氧基-2-羥基-[1,1'-聯苯]-3-甲酸酯(221mg,0.33mmol)、Pd/C(35.5mg,0.03mmol)與DCM(0.500ml)。混合物以甲醇(2.0ml)稀釋並添加甲酸銨(105mg,1.67mmol)。使反應混合物於室溫攪拌1小時。將反應混合物經由Celite®塞以甲醇(10ml)過濾,將濾液濃縮。將殘餘物再溶於乙酸乙酯與甲醇,將所得溶液經由相分離器過濾,濃縮並藉由SiO2層析純化(ISCO Combiflash Rf並以溶於乙酸乙酯的0至10%甲醇沖提,達20分鐘,25g管柱),提供標題化合物。MS(m/z)572.2.(M+H+)。
中間物191-195係藉由類似於中間物190所說明的方法,從指定的中間物製備。
中間物196-197係藉由類似於中間物87所說明的方法,稍微更改鹼、溶劑與偶合劑,從(R)-N-(胺基甲基)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺與指定的酸製備。
將多聚甲醛(3.15g,105mmol)與AcOH(1.091ml,19.07mmol)加至三苯甲胺(24.97g,96mmol)溶於甲苯(502ml)的混合物。使所得混合物加熱至80℃達1h。添加二苄基膦酸酯(21.06ml,95mmol)並使混合物於迴流攪拌3h。使反應冷卻至RT,添加TEA(5.31ml,38.1mmol),將混合物濃縮。使用ISCO Rf純化(0-50% EtOAc/Hex)得到如同無色固體的二苄基((三苯甲基胺基)甲基)膦酸酯(45.83g,86mmol,90%產率)。MS(m/z)534.3(M+H+)。
對二苄基((三苯甲基胺基)甲基)膦酸酯(17.61g,33.0mmol)溶於甲醇(165ml)的攪動混合物添加HCl(4M in二噁烷)(12.38ml,49.5mmol)。使所得混合物於RT攪拌15min,隨後濃縮至乾,得到(雙(苄氧基)磷醯基)氯化甲胺(19.66g,33.0mmol)。產率係以定量推定(55重量%)。產物為無色固體。MS(m/z)292.1(M+H+)。
對4-溴-2-乙氧基苄酸(10.00g,40.8mmol)與HATU(17.07g,44.9mmol)溶於乙腈(102ml)、DIEA(21.38ml,122mmol)的攪動溶液添加DIEA(21.38ml,122mmol)。將所得混合物加至(雙(苄氧基)磷醯基)氯化甲胺(20.06g,61.2mmol)溶於DMF(102ml)的攪動漿狀物。使所得混合物攪拌1hr,隨後儲存於冰櫃過夜。下一步,加水,接著添加EtOAc。有機物以鹽水洗滌(2x)。合併的洗液係使用EtOAc回萃。合併的有機物以MgSO4乾燥,過濾,濃縮並使用ISCO Rf純化(0-100% EtOAc/Hex),得到如同黃色油狀物的二苄基((4-溴-2-乙氧基苄醯胺基)甲基)膦酸酯(14.93g,28.8mmol,70.6%產率)。MS(m/z)518.2(M+H+)。
中間物703-705係藉由類似於中間物702所說明的方法,從指定的中間物製備。
對二苄基((4-溴-2-乙氧基苄醯胺基)甲基)膦酸酯(50mg,0.096mmol)、雙戊醯二硼(36.7mg,0.145mmol)、與乙酸鉀(47.3mg,0.482mmol)溶於1,4-二噁烷(0.386mL)的溶液添加PdCl2(dppf)-CH2Cl2加成物(3.94mg,4.82μmol)。將燒瓶插入於100℃預熱的加熱塊中3h。隨後添加N-(((R)-2-((R)-1-(N-(苄氧基)甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)-6-溴甲吡啶醯胺(61.8mg,0.116mmol)與水(0.1mL),使反應混合物於室溫持續攪拌30min。添加額外PdCl2(dppf)-CH2Cl2加成物(3.94mg,4.82μmol)與K2CO3(0.289ml,0.289mmol)並使反應攪拌18h。反應混合物以EtOAc稀釋並進行
EtOAc/H2O萃取。進行最後的鹽水洗滌,收集有機層,於真空濃縮,並經由ISCO純化來純化(12g管柱,EtOAc/己烷,100%己烷至100% EtOAc),給予如同灰白色固體的標題化合物(83.7mg,32%產率)。MS(m/z)622(M+H+)。
中間物707-709係藉由類似於中間物706所說明的方法,從指定的中間物製備。
將異構物(R)-1-(N-(苄氧基)甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)-5-乙氧基苄酸(600mg,0.97mmol)溶於乙醇(3.59ml),並將反應沖氮。隨後添加Pd/C(155mg,0.15mmol),將反應置於氫氣氛(氣球)並於室溫攪拌5小時。反應異構物隨後以乙酸乙酯洗滌。將濾液濃縮並藉由逆相HPLC純化(Waters,X-Bridge PrepShield RP C18,5μM,30 x 150mM,10-50% CH3CN/水+0.1% NH4OH,14分鐘梯度)。將含有產物的分段合併,酸化並以DCM與乙酸乙酯萃取。將合併的有機萃取液濃縮,使所得固體懸浮於乙腈並攪拌1小時,隨後藉由過濾收集並風乾,給予如同灰白色固體的標題化合物(180mg,35%產率)。
實施例2-43、45-49與200-205係藉由類似於實施例1所說明的方法,從指定的中間物製備。
將(R)-N-((2-((N-(苄氧基)甲醯胺基)甲基)庚醯胺基)甲基)-3-(5-甲基噁唑-2-基)苄醯胺(61mg,0.12mmol)溶於甲醇(1ml)的溶液加至波曼氏催化劑(Pearlman's catalyst)(8.5mg,0.01mmol),將混合物沖氮3次,隨後置於氫氣氛(氣球)並於室溫攪拌2小時。隨後將反應經由Celite®過濾,Celite®以甲醇洗滌。將濾液濃縮並將DCM加至殘餘物。過濾收集所得沉澱物,給予如同灰白色固體的標題化合物(25mg,47%產率)。
實施例52係藉由類似於實施例51所說明的方法,從指定的中間物製備。
對沖氮小瓶添加3'-((((R)-2-((R)-1-(N-(苄氧基)甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)-5-乙氧基-[1,1'-聯苯]-3-甲酸(138mg,0.22mmol),接著添加Pd/C(10% wt,15mg,0.01mmol)。隨後添加DCM(0.5ml),接著添加甲醇(1.5ml)。隨後添加甲酸銨(89mg,1.41mmol)並使反應攪拌3小時,隨後過夜。隨後將反應經由Celite®塞過濾,Celite®以MeOH(10ml)洗滌。將濾液濃縮,殘餘物係藉由逆相HPLC純化(Waters,XBridge Prep Shield RP,C18 5μM,ODB 30 X 150mm管柱,20-60% CH3CN/水+0.1% NH4OH,達15分鐘,2回注入),給予如同褐色固體的標題化合物(49mg,31%產率)。
實施例54-84係藉由類似於實施例53所說明的方法,從指定的中間物製備。
使3'-((9H-呫吨-9-基)硫基)-N-(((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)-[1,1'-聯苯]-3-甲醯胺(0.17g,0.27mmol)溶於DCM/TFA/Et3SiH的98:1:1混合物(26ml)的溶液於氮下、於室溫攪拌20分鐘。反應隨後添加DCM稀釋並倒進飽和碳酸氫鈉溶液,隨後添加1M HCl將混合物酸化至pH 3。層遂分離,水相以DCM萃取(3 x)。合併的有機萃取液隨後以鹽水洗滌,以Na2SO4乾燥,過濾並濃縮。殘餘物係藉由逆相快速層析純化(C18管柱,0-100% CH3CN/水),給予標題化合物(80mg,68%產率)。
對20ml小瓶添加(S)-二甲基2-(3-乙氧基-5-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲
醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)苄醯胺基)琥珀酸酯(200mg,0.3mmol)、甲醇(6ml)與水(2ml),接著添加LiOH(42.8mg,1.79mmol)。使混合物於室溫攪拌4小時,隨後在氮氣流下將體積減至~4-5ml。隨後添加1N HCl將剩餘溶液酸化。將水溶液傾出,將固體溶於EtOAc並共沸3次。水層以EtOAc萃取兩次。將EtOAc層分離,並和初始的EtOAc單離物合併。合併的EtOAc單離物隨後以水洗滌,層遂分離。水相以額外的EtOAc(3 x)萃取,將合併的有機萃取液濃縮,給予如同紅/棕色固體的標題化合物(140mg,73%產率)。
實施例87-97與300-308係藉由類似於實施例86所說明的方法,從指定的中間物製備。
於0℃,將TMSBr(0.38ml,2.93mmol)加至二甲基(3-乙氧基-5-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)苯基)膦酸酯(0.58g,0.99mmol)溶於DCM(10ml)的溶液。隨後使反應於室溫攪拌過夜。隨後添加額外的TMSBr(0.2ml,1.54mmol)與DCM(5ml,並使反應攪拌2小時。隨後添加1N HCl(5ml),過濾收集所得固體並風乾。隨後使固體懸浮於4:1 CH3CN/EtOAc混合物(6ml)達30分鐘,隨後藉由過濾收集並風乾,給予如同黃色固體的標題化合物(370mg,59%產率)。
實施例99-100係藉由類似於實施例98所說明的方法,從指定的中間物製備。
將6-(4-(二甲氧基磷醯基)-3-乙氧基苯基)吡嗪-2-甲酸(134mg,0.38mmol)與(R)-N-(胺基甲基)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺(99mg,0.38mmol)溶於無水DMF(1.28ml)並以DIPEA(0.13ml,0.76mmol)處理,
接著以HATU(159mg,0.42mmol)處理。使反應於室溫攪拌2小時。隨後將反應倒進水中並以EtOAc(3 x 50ml)萃取。合併的有機萃取液以MgSO4乾燥,過濾,並濃縮。將殘餘物溶於DCM(2ml)並以溴三甲基矽烷(0.11ml,0.86mmol)於0℃處理。使反應升溫至室溫並攪拌2小時。隨後以sat.aq.氯化銨溶液淬熄反應,收集所形成的沉澱物並溶於DMSO,藉由逆相HPLC純化(Waters,Sunfire Prep C18,35 x 150mM,10-50% CH3CN/水(+0.1% TFA)、17分鐘run),給予如同褐色泡沫的標題化合物(47mg,22%產率)。
實施例102係藉由類似於實施例101所說明的方法,從(R)-N-(胺基甲基)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺與指定的酸製備。
步驟1:3-溴-5-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)苄酸
於0℃,對溶於DCM(19.3ml)的3-溴-5-(甲氧基羰基)苄酸(0.50g,1.93
mmol)添加(R)-N-(胺基甲基)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺(0.60g,2.32mmol)、HATU(0.88g,2.32mmol)與DIPEA(0.34ml,1.93mmol)。將冰浴移除並使反應於室溫攪拌。在升溫至室溫時,觀察到固體溶化。攪拌20min後,添加DMF(2ml)以溶解。攪拌1小時後,反應以水稀釋,並以DCM萃取,隨後層遂分離。有機層以水、鹽水洗滌,以MgSO4乾燥並濃縮。將所得白色固體溶於MeOH,並添加0.30mg K2CO3,使混合物攪拌1小時。將混合物過濾並將濾液濃縮。以攪拌將殘餘物溶於EtOAc,以水與鹽水洗滌。將水層酸化至pH 3,將所得固體過濾並乾燥,給予如同白色固體的標題化合物(0.17g,0.34mmol,17.7%產率)。MS(m/z)488.1(M+2+)。
步驟2:5-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)-[1,1'-聯苯]-3-甲酸
使3-溴-5-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)苄酸(0.07g,0.14mmol)、苯基硼酸(0.02g,0.17mmol)、K2CO3(0.06g,0.43mmol)、Silicat DPP-Pd(0.03g,7.20μmol)溶於乙醇(1.6ml)的懸浮液於100℃微波加熱12分鐘。加熱12分鐘後,添加額外的苯基硼酸(0.01g,0.09mmol)與Silicat DPP-Pd(0.01g,2.4μmol)並於100℃微波再加熱5分鐘。將反應經由以MeOH潤洗的玻璃料過濾,並將濾液濃縮。將粗製材料溶於DMSO(3ml)並藉由逆相HPLC純化(Waters,Sunfire prep C18 OBD,30x 150mM,30至70%(CH3CN/水)+0.1%TFA))。將所欲分段合併並凍乾,給予如同白色固體的標題化合物(0.004g,8.05μmol,5.60%產率)。
步驟1:2-乙基己基3-((3-溴-5-乙氧基苯基)硫基)丙酸酯
將1-溴-3-乙氧基-5-碘苯(2g,6.12mmol)溶於甲苯(16.9ml)並加至含有溶於無水甲苯(1ml)的Xantphos(0.18g,0.31mmol)與Pd2(dba)3(0.14g,0.15mmol)的燒瓶。將許尼希氏鹼(2.14ml,12.2mmol)加至反應,接著添加2-乙基己基3-巰基丙酸酯(1.39ml,6.12mmol)。將燒瓶沖氮,配上冷凝器,於迴流加熱16小時。使反應冷卻至室溫並經由Celite®過濾。殘餘固體以甲苯洗滌。將合併的有機物濃縮成棕色油狀物,其係藉由快速層析純化(ISCO,120g管柱,85ml/min沖提,0-10% EtOAc/己烷,達15分鐘,接著添加10% EtOAc/己烷,維持10分鐘,254nm偵測),給予如同清澈油狀物的標題化合物。MS(m/z)418.9(M+2+)。
步驟2:3-溴-5-乙氧基苯磺酸
將鈉(31.2mg,1.36mmol)從浸在煤油中的主塊切下,以己烷洗滌,並秤至己烷小瓶。隨後將該固體加至乙醇(2ml)。將溶於乙醇(4.2ml)的2-乙基己基3-((3-溴-5-乙氧基苯基)硫基)丙酸酯(515mg,1.23mmol)加至乙氧化鈉的新鮮製備溶液。反應混合物於室溫攪拌1小時。反應以1N HCl淬熄並濃縮。使粗製油狀物分配於EtOAc與水之間。有機物以MgSO4乾燥,過濾,並濃縮成淺黃色油狀物。將該油狀物溶於乙腈(7ml)並以過氧化氫(1.26ml,12.3mmol)與甲基三氧錸(VII)(30.8mg,0.12mmol)處理。使反應於室溫攪拌3小時。反應以MnO2催化量淬熄,隨後濃縮。所得固體以己烷洗滌並於真空乾燥,給予如同褐色固體的標題化合物(256mg,103%產率)。
步驟3:N-(((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)-3-(6-甲基-4,8-二酮基-1,3,6,2-二氧雜環戊硼烷-2-基)苄醯胺
將3-(6-甲基-4,8-二酮基-1,3,6,2-二氧雜環戊硼烷-2-基)苄酸(235mg,0.85mmol)與(R)-N-(胺基甲基)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺(220mg,0.85mmol)溶於DMF(2.53ml)並以許尼希氏鹼(0.30ml,1.70mmol)與HATU(355mg,0.93mmol)處理。使反應於室溫攪拌18小時。將反應倒進水中。產物以EtOAc萃取。有機物以MgSO4乾燥,過濾,並在矽膠上濃縮。該材料係使用固體裝載藉由快速層析純化(ISCO,40g管柱,40ml/min沖提,0-100% EtOAc/己烷,達30分鐘,254nm偵測),給予如同白色固體的不純標題化合物(462mg,105%產率),其以反應順序繼續下一步驟。MS(m/z)519.0(M+H+)。
步驟4:5-乙氧基-3'-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)-[1,1'-聯苯]-3-磺酸
對N-(((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)-3-(6-甲基-4,8-二酮基-1,3,6,2-二氧雜環戊硼烷-2-基)苄醯胺(462mg,0.89mmol)與3-溴-5-乙氧基苯磺酸(223mg,0.79mmol)溶於1,4-二噁烷(3.97ml)的溶液添加碳酸鈉(252mg,2.38mmol)溶於水(0.5ml)的溶液。將PdCl2(dppf)-CH2Cl2加成物(64.8mg,0.079mmol)加至該反應,並使混合物於80℃加熱5小時。使反應冷卻至室溫,將反應溶液傾離所形成的固體沉澱物。此沉澱物以EtOAc洗滌。將合併的洗液與反應溶液濃縮並藉由快速層析純化(ISCO,80g管柱,60ml/min沖提,20% MeOH/DCM,254nm偵測),給予如同褐色殘餘物的標題化合物。
步驟1:3-溴-5-(甲氧基羰基)苄酸
將氫氧化鈉(0.29g,7.32mmol)加至二甲基5-溴異鄰苯二甲酸酯(2g,7.32mmol)於丙酮(30ml)與水(15ml)的懸浮液,並使反應於室溫攪拌1小時。此刻達到清澈溶液。使反應於室溫攪拌過夜。在真空下移除丙酮,殘餘溶液以乙酸乙酯萃取。隨後將水層調至pH4並以乙酸乙酯萃取兩次。有機物隨後以鹽水洗滌,乾燥並濃縮,給予如同60%純白色固體的標題化合物(1.23g,2.85mmol,38.9%產率)。MS(m/z)259.0/260.9(溴同位素s)。
步驟2:甲基3-溴-5-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)苄酸酯
於0℃,3-溴-5-(甲氧基羰基)苄酸(100mg,0.39mmol)於乙腈(1.83ml)的懸浮液係以HATU(147mg,0.39mmol)處理,接著以DIPEA(0.20ml,1.16mmol)處理。添加DIPEA數分鐘後,獲得清澈溶液,在10分鐘後轉為暗棕色。隨後將(R)-N-(胺基甲基)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺(100mg,0.39mmol)溶於DMF(1.83ml)的溶液加至該反應。2.5小時後,加水稀釋反應,將有機層分離,以碳酸氫鈉、鹽水洗滌且隨後經由疏水玻璃料收集並濃縮。殘餘物係藉由Si SPE純化(5g,DCM、醚、乙酸乙酯、丙酮),給予如同75%純黃色油狀物的標題化合物(93mg,0.19mmol,48.1%產率)。MS(m/z)500.0/502.0(溴同位素)。
步驟3:5-乙氧基-5'-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲
基)胺甲醯基)-[1,1'-聯苯]-3,3'-二甲酸
對甲基3-溴-5-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)苄酸酯(90mg,0.18mmol)、3-乙氧基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧雜環戊硼烷-2-基)苄酸(79mg,0.27mmol)與PdCl2(dppf)-CH2Cl2加成物(14.7mg,0.02mmol)溶於1,4-二噁烷(0.80ml)的混合物添加Na2CO3(1M,溶於水)(0.54ml,0.54mmol)並使反應於100℃微波加熱5分鐘。添加DCM與2M NaOH稀釋反應。層遂分離,隨後將水層調至pH4並以DCM萃取。有機層係藉由疏水玻璃料收集並濃縮,給予暗棕色油狀物,隨後將其再溶於最少量DCM並藉由Si SPE純化(5g,DCM、醚、乙酸乙酯、丙酮與溶於DCM的10%甲醇),但並無單離出所欲產物。水層含有一些固體,其以過濾收集(3.8mg)。材料的分析顯示在後處理期間已發生水解,已形成二-酸材料,但整體樣本係用於分析。將濾液濃縮,給予29mg,其藉由Si SPE再純化(1g,DCM、醚、乙酸乙酯、丙酮與溶於DCM的10%甲醇),給予淺橙色固體的標題化合物(14mg,0.02mmol,11.6%產率)。
在濃重氮氣流下,將Pd-C(13.30mg,0.125mmol)加至含有(S)-貳-三級丁基2-(4-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-(苄氧基)甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)-2-氯苄醯胺基)琥珀酸酯(209mg,0.250mmol)溶於乙醇(5ml)的RT溶液。反應以氫針沖15min,隨後在氫氣球正壓下攪拌6h。反應混
合物係經由矽藻土過濾。矽藻土以甲醇洗滌。將合併的有機物濃縮成清澈、橙色膜。將膜溶於二噁烷並濃縮,以移除任何過量乙醇。將殘餘物溶於5ml DCM並以三氟乙酸(385μl,5.00mmol)處理。使反應攪拌過夜。將反應濃縮,提取於二噁烷(10ml),並再次濃縮,以移除任何殘存TFA。將濃縮的粗製產品溶於0.5ml DMSO並經由HPLC純化(Waters Xbridge 30x150mm乙腈:水NH4OH 10-50%流速:50ml/min梯度時間:26min)。
MS(m/z)634.3(M+H+)。
實施例1-43、45-49、51-105、200-205、300-308、與400的光譜數據:
分析方法:
aLCMS方法:Agilent 1100系列LC/MSD SL或VL,使用正電噴霧[ES+ve,給予M+H+],配有Xorbax Eclipse XDB-C8 5.0μm管柱(4.6mm x 150mM,i.d.),以下列沖提:溶於水的0.05% TFA(溶劑A)以及溶於CH3CN的0.05% TFA(溶劑B),使用下列沖提梯度10-100%(溶劑B)達10.0min並維持在100%達1.6min,於1.0ml/min流速。
bLCMS方法:Agilent 1100系列LC/MSD SL或VL,使用正電噴霧[ES+ve,給予M+H+],配有Sunfire C18 5.0μm管柱(3.0mm x 50mM,i.d.),以下列沖提:溶於水的0.05% TFA(溶劑A)以及溶於CH3CN的0.05% TFA(溶劑B),使用下列沖提梯度:10-100%(溶劑B)達2.5min並維持在100%達1.7min,於1.0ml/min流速。
cLCMS方法:Agilent 1200系列LC/MSD SL或VL,使用正電噴霧[ES+ve,給予M+H+],配有Sunfire C18 5.0μm管柱(3.0mm x 50mM,i.d.),以下列沖提:溶於水的0.1% TFA(溶劑A)以及溶於CH3CN的0.1% TFA(溶劑B),使用下列沖提梯度:10-100%(溶劑B)達2.5min並維持在100%達1.7min,於1.0ml/min流速。
d UPLC方法:Acquity UPLC with SQD MSD,使用正電噴霧[ES+ve,給予M+H+],配有BEH C18 1.7μm管柱(2.1mm x 50mm i.d.),以下列沖提:溶於水的0.1%甲酸(溶劑A)以及溶於CH3CN的0.1%甲酸(溶劑B),使用下列沖提梯度:3-100%(溶劑B)達1.5min並維持在100%達0.4min,於1.0ml/min流速。
e LCMS方法:Shimadzu 10Avp,帶有Sedere Sedex 75C與PE Sciex Single Quadrupole 150EX,使用正電噴霧[ES+ve,給予M+H+],配有Thermo Hypersil Gold C18 1.9μm管柱(2.1mm x 20mm i.d.),以下列沖提:溶於水的0.02% TFA(溶劑A)以及溶於CH3CN的0.02% TFA(溶劑B),使用下列沖提梯度:
4-95%(溶劑B)達1.88min並維持在4%達0.9min,於1.4ml/min流速。
f LCMS方法:Shimadzu 10Avp,帶有Sedere Sedex 75C與Waters ZQ單一Quadrupole,使用正電噴霧[ES+ve,給予M+H+],配有Thermo Hypersil Gold C18 1.9μm管柱(2.1mm x 20mm i.d.),以下列沖提:溶於水的0.02% TFA(溶劑A)以及溶於CH3CN的0.02% TFA(溶劑B),使用下列沖提梯度:4-95%(溶劑B)達1.88min並維持在4%達0.9min,於1.4ml/min流速。
gLCMS方法:Agilent 1200系列LC/MSD SL或VL,使用正電噴霧[ES+ve,給予M+H+],配有Zorbax C18 5.0μm管柱(4.6mm x 150mM,i.d.),以下列沖提:溶於水的0.1% TFA(溶劑A)以及溶於CH3CN的0.1% TFA(溶劑B),使用下列沖提梯度:10-100%(溶劑B)達12.5min並維持在100%達1.8min,於1.0ml/min流速。
hLCMS方法:Agilent 1200系列LC/MSD SL或VL,使用正電噴霧[ES+ve,給予M+H+],配有Sunfire C18 2.5μm管柱(2.1mm x 20mM,i.d.),以下列沖提:溶於水的0.05% TFA(溶劑A)以及溶於CH3CN的0.05% TFA(溶劑B),使用下列沖提梯度:10-100%(溶劑B)達2.5min並維持在100%達0.2min,於1.3ml/min流速。
iLCMS方法:Agilent 1200系列LC/MSD SL或VL,使用正電噴霧[ES+ve,給予M+H+],配有Agilent Eclipse XBD-C18 5.0μm管柱(4.6mm x 250mM,i.d.),以下列沖提:溶於水的0.05% TFA(溶劑A)以及溶於CH3CN的0.05% TFA(溶劑B),使用下列沖提梯度:1-99%(溶劑B)達10min,於1.0ml/min流速。
jUPLC方法:Acquity UPLC,帶有SQD MSD,使用正電噴霧[ES+ve,給予M+H+],配有Thermo Hypersil Gold C18 1.9μM,(20mm x 2.1mm i.d.),以下列沖提:溶於水的0.02% TFA(溶劑A)以及溶於CH3CN的0.02% TFA(溶
劑B),使用下列沖提梯度:0.5-98%(溶劑B)達1.9min,於1.6ml/min流速。
藥學組成物
實施例A-錠劑係使用習用方法製備並如以下調配:
實施例B-膠囊係使用傳統方法製備並如以下調配:
實施例C-奈米懸浮液與微米尺寸的懸浮液係使用習用研磨技術製備,例如水性珠磨法,並如以下調配:
實施例D-熔融擠出物係使用習用熔融擠出技術與低溫球磨法(cryomilling)製備,以達到以下的合宜顆粒尺寸:
實施例E-凍乾產品係藉由傳統方法製備並如以下調配:
緩衝液組分係購自Sigma-Aldrich(St.Louis,MO)或等效供應商。原肌肉生長抑制素肽受質係由American Peptide Company(Sunnyvale,CA)客製合成,其係使用在Hopkins,D.R.,et al.,2007 Matrix Biology,26,508-523所回顧的切割位點周圍的肌肉生長抑制素蛋白序列(Uniprot,寄存號O14793)。高酶BMP1切割試驗所使用的膠原蛋白原肽受質係由21st Century Biochemicals(Marlboro,MA)客製合成,其係使用在Hopkins,D.R.,et al.,
2007 Matrix Biology,26,508-523所回顧的切割位點周圍的膠原蛋白原Iα蛋白序列(Uniprot,寄存號P02452)。
製備人類BMP1蛋白:
帶有位於N-端的人類RAGE信號序列(NM_001136的aa1-22)與位於C-端的FLAG-6xHis表位標記,編碼人類BMP1胺基酸23-721的DNA序列(NM_001199.3)係使用PCR技術擴增。將所得Rgss-BMP1(23-721)-FLAG-6xHis片段亞選殖進入pCDN,一種由CMV促進子驅動並含有DHFR基因以供在無核苷細胞培養基選擇的哺乳動物表現載體。使此構築體以電穿孔方式進入CHOE1a細胞。選擇之後,得自個別選殖體的條件培養基係使用BMP1試驗分析原肌肉生長抑制素衍生的肽酶活性(參見下方試驗)。得自具最高活性的數個選殖體的條件培養基係經由西方墨點法分析,以確認表現。具最高活性與肽酶活性的選殖體係用於蛋白表現。
從分泌穩定轉染CHO細胞系的人類BMP1(121-721)的成熟形式被純化。所有純化步驟係於4℃執行。以Watson Marlow滲濾系統(A/G Technology Corpraton,型號# UFP-10-C-55),使用10kDa截斷匣,將10l條件培養基濃縮至1.2l。後續在帶有5l的50mM Tris緩衝液、pH 8.0、含有0.5M NaCl、20%甘油、1mM CHAPS、5mM CaCl2、10μM ZnCl2、與20mM咪唑的相同系統上進行緩衝液交換。將滲濾介質投至使用50ml,30ml、與15ml樹脂體積的連續鎳NTA超流層析(Qiagen,Valencia,CA),分別於4℃過夜,並保留含有大部分BMP1的未結合分段。將100ml此未結合分段稀釋在1000ml 50mM Tris緩衝液、pH 8.0、含有20%甘油、10mM NaCl、5mM CaCl2、10μM ZnCl2、與1mM CHAPS並施用至20ml Q Sepharose Fast Flow(GE Healthcare Life Sciences)。將含有BMP1的Q Sepharose未結合部分在Viva Spin的10kDa截斷匣上進一步濃縮(Viviproducts,Littleton,MA)。
含有三個胺基酸置換I156V、N221S、V284A,編碼全長原生人類TLL1天然變化型的DNA序列(NM_012464.4)係由人類心臟與腦cDNA擴增並亞選殖進入pCDN表現載體。使該質體以電穿孔方式進入CHOE1A細胞。選擇之後,將表現高TLL1位準的選殖體放大並用於蛋白純化。
所有純化步驟係於4℃執行。CHO條件培養基係以5mM Tris緩衝液、pH 8.4稀釋成3-倍,人類TLL1係藉由Source 30 Q樹脂(GE Healthcare Life Sciences)捕獲。在以50mM Tris緩衝液、pH 8.0充分洗滌後,人類TLL1係以溶於50mM Tris緩衝液、pH 8.0的0至0.5M NaCl線性梯度沖提。在以20mM Tris緩衝液、pH 7.4稀釋成3.6-倍後,得自Source 30Q池的人類TLL1係隨後捕獲在Macro-prep陶瓷羥基磷灰石(HA)第I型40μm樹脂(BioRad,Hercules,CA)上。HA樹脂係以20mM Tris緩衝液、pH 7.4洗滌,人類TLL1係以0.5M磷酸鉀緩衝液,pH 7.4以線性梯度從洗滌緩衝液沖提。得自HA池的人類TLL1係以40%硫酸銨飽和度進行鹽分級並以含有0.25M NaCl and 7mM CaCl2的20mM Tris緩衝液,pH 7.0再溶。
帶有位於N-端的人類RAGE信號序列與位於C-端的Avi-6xHis表位標記(GGLNDIFEAQKIEWHEHHHHHH),編碼人類TLL2胺基酸26-1015的DNA序列(NM_012465)係從DNA模板以PCR擴增。藉由GatewayTM重組(Life Technologies,Grand Island,NY)將Rgss-TLL2 Avi-6xHis片段亞選殖進入pCDN表現載體。使DHFR缺失CHOE1a細胞於37℃,5% CO2維持在補充有核苷的MR1培養基(Life Technologies)。使線性質體DNA以電穿孔方式進入細胞,使選殖體在無核苷培養基生成。選殖體係於原肌肉生長抑制素衍生的肽酶試驗(參見下方)篩選TLL2活性,該試驗容許辨識表現最佳化位準
之TLL2活性形式的選殖體。
穩定表現TLL2 CHO細胞的條件培養基係藉由滲濾濃縮,如同BMP1所述。325ml濃縮培養基係藉由鎳NTA超流層析純化(20ml Ni-NTA SF,於4℃過夜)。該樹脂以15mM至100mM咪唑線性梯度洗滌,以溶於緩衝液A(50mM Tris、pH 8.0、0.5M NaCl、20%甘油、1mM CHAPS、5mM CaCl2、10μM ZnCl2)的0.3M咪唑沖提蛋白。
BMP1肽酶活性受到測試本發明化合物的抑制係藉由監測原肌肉生長抑制素肽受質被重組成熟BMP1蛋白(BMP1(121-721)-Flag-His)切割來測量。雙重標記肽((5-FAM)-ELIDQYDVQRDDSSDGSLED-K(5,6TAMRA)-CONH2)的FRET淬熄係藉由BMP1-催化的切割緩解。此試驗係以10μl端點試驗在384孔格式中運行,其中反應含有0.5nM BMP1與0.8μM原肌肉生長抑制素肽受質,於25mM HEPES緩衝液、pH 7.5、含有0.01% Brij-35清潔劑、5mM CaCl2、與1μM ZnCl2。試驗係藉由添加5μl酶溶液至預先分配溶於DMSO的100nl測試化合物溶液的黑色低容積試驗盤(Greiner 784076)來運行。10分鐘後,添加5μl受質,並使反應於周遭溫度再培育60分鐘。反應以5μl 0.5M EDTA淬熄且該盤係於使用480nm激發濾光片與540nm發射濾光片的ViewLux(Perkin Elmer)多標記盤讀取器上讀取。測試化合物係於10mM濃度的純DMSO中製備。就抑制曲線而言,使用三倍連續稀釋將化合物稀釋於DMSO,並於11個濃度測試(100μM-1.7nM,最終1% DMSO)。回應係正規化至每盤的未受抑制與無酶控制組。劑量回應曲線係使用ActivityBase的四參數邏輯擬合分析,結果係以pIC50值表示。
根據此試驗,實施例1-43、45-49、51-105、200-205、300-308與400的
化合物被測試並展現pIC50>6.9。
使用高酶濃度試驗可為有益的,譬如在Habig,M.,et al.,Journal of Biomolecular Screening,2009,14,679-689中所討論的。
此試驗係以10μl端點試驗於384孔格式運行,其中反應含有50nM BMP1酶與6μM膠原蛋白原I肽受質((5-FAM)-DGGRYYRADDANVVRD-K(5,6-TAMRA)-CONH2),於25mM HEPES緩衝液、pH 7.5、含有0.01% Brij-35清潔劑、5mM CaCl2、與1μM ZnCl2。試驗係藉由添加5μl酶溶液至預先分配溶於DMSO的100nl測試化合物溶液的黑色低容積試驗盤(Greiner 784076)來運行。10分鐘後,添加5μl受質,並使反應於周遭溫度再培育30分鐘。反應以5μl 0.5M EDTA淬熄且該盤係於使用480nm激發濾光片與540nm發射濾光片的ViewLux(Perkin Elmer)多標記盤讀取器上讀取。數據擬合與化合物製備係如上文在低酶濃度說明般進行。
根據此試驗,實施例1-43、45-49、51-105、200-205、300-308與400的化合物被測試並展現pIC50>6.6。
人類TLL1與TLL2重組酶的抑制係以10ul端點試驗於384孔格式,使用以上人類BMP1酶抑制試驗的相同原肌肉生長抑制素肽受質測試。TLL1反應含有2nM TLL1與0.8μM原肌肉生長抑制素肽受質,於25mM HEPES緩衝液、pH 7.5、含有0.01% Brij-35清潔劑、5mM CaCl2、與1μM ZnCl2。TLL1試驗係藉由添加5μl酶溶液至預先分配溶於DMSO的100nl測試化合物溶液的黑色低容積試驗盤(Greiner 784076)來運行。在預培育酶與抑制劑10分鐘之後,添加5μl受質溶液。使TLL1反應於周遭溫度再培育60分鐘。TLL2反
應含有18nM TLL2與5μM原肌肉生長抑制素肽受質,於25mM HEPES緩衝液、pH 7.5、含有0.01% Brij-35清潔劑、5mM CaCl2、與1μM ZnCl2。TLL2試驗係不經酶-抑制劑的預先培育,藉由添加5μl酶與5μl受質溶液至預先分配溶於DMSO的100nl化合物溶液的黑色低容積試驗盤(Greiner 784076)來運行。使TLL2反應於周遭溫度培育60分鐘。TLL1與TLL2反應係以5μl 0.5M EDTA淬熄且盤係於使用480nm激發濾光片與540nm發射濾光片的ViewLux(Perkin Elmer)多標記盤讀取器上讀取。數據擬合與化合物製備係如上文在人類BMP1酶抑制試驗說明般進行。
根據此試驗,實施例1-25、27、29-43、45-49、51-104、200-205、300-308與400的化合物係於TLL1酶抑制試驗被測試並展現pIC50>6.4。
根據此試驗,實施例1-25、27、29-43、45-49、51-104、200-205、300-308與400的化合物係於TLL2酶抑制試驗被測試並展現pIC50>6.2。
以上酶試驗結果指出受測化合物為BMP1、TLL1與TLL2酶活性之一或多者的強效抑制劑。在生化試驗中,使用單離酶與肽受質,受測化合物抑制該等金屬蛋白酶之一或多者。
Chen,C.Z.C.,et al.,British Journal of Pharmacology,2009,158,1196-1209說明的膠原蛋白沉積測定的改編版本係用於檢查化合物對膠原蛋白原I加工與膠原蛋白沉積的效應。在改編試驗中,利用的是人類心臟纖維母細胞。膠原蛋白原I的加工係藉由PICP ELISA試驗測定,成熟膠原蛋白的沉積係藉由免疫染色測定。
人類心臟纖維母細胞係在FGM-3培養基(Lonza,#CC-3132)於5% CO2的37℃加濕培育箱培養並維持,直到第6代。隨後將彼等以每孔10,000至
15,000個細胞種至裝有伊格氏最小基本培養基(EMEM,ATCC # 30-2003)的96孔黑壁透明底盤,該培養基含有10%胎牛血清(FBS,Life Technologies # 10082147)、1% Glutamax(Life Technologies #35050061)與1%青黴素和鏈黴素(Life Technologies # 15070063)。將該等培養基置於37℃培育器。隔天,抽吸除去培養基,細胞以磷酸鹽緩衝鹽水潤洗。擁擠培養基(亦稱作ficoll培養基)係藉由添加112.5mg/ml的ficoll70與75mg/ml ficoll400(分別為GE healthcare # 17-0310-10與17-0300-10)、100μM抗壞血酸、1% Glutamax與1%青黴素和鏈黴素至EMEM培養基製備。將測試化合物(溶於DMSO)稀釋進入擁擠培養基且隨後加至該細胞。在擁擠培養基的最終DMSO濃度係少於0.3%。細胞係於37℃培育器處理24至48hr。在處理期結束時,收集細胞培養基。按照製造商的流程,培養基中的PICP位準係藉由PICP ELISA試驗(Quidel #8003)測定。測試化合物的效力係使用Graphpad Prism軟體6.0將PICP位準-相對於未處理控制組-擬合至log(抑制劑)vs.回應算式並以pIC50表示。
就一些化合物而言,除了PICP位準以外,成熟膠原蛋白的沉積係藉由免疫染色測量。在處理期結束時,培養盤上的細胞係以100%甲醇(預冷至-20℃)固定10min。隨後細胞係以小鼠的抗成熟膠原蛋白I抗體(1:500稀釋,Sigma#C2456)、抗小鼠二級抗體Alexa647(1:500稀釋,Invitrogen#A21236)與Hoechst(用於細胞核,2μg/ml,Invitrogen#H3596)免疫染色。螢光影像採集係使用Operetta高內容成像系統(Perkin Elmer)完成。對於各別影像場,成熟膠原蛋白染色強度係以細胞核數量正規化。正規化膠原蛋白位準係用於以Graphpad Prism軟體計算測試化合物效力,如上所述。
在此試驗中,實施例1-43、45-49、51-105、200-205、300-308與400的化合物係於PICP細胞抑制試驗被測試並展現pIC50>4.7。
在此試驗中,實施例1、26、28、39、87、88、90、94、101、102的化合物係於成熟膠原蛋白細胞抑制試驗被測試並展現pIC50>5.8。
以上細胞試驗結果證實受測化合物係藉由纖維母細胞-在體內驅動纖維化的細胞類型-產生的原生酶抑制了膠原蛋白原受質的加工。
鑑於上述,本發明之化合物應具有在病理纖維化驅動的各式各樣疾病、以及關於該等酶的其他體內受質的疾病-譬如其中肌肉功能或肌肉質量減少-作為抗纖維化劑的效益。
Claims (51)
- 一種式(I)化合物:
- 根據請求項1之化合物或彼等的鹽,其中W1、W2、W3與W4之一或兩者為N且其餘為CRa。
- 根據請求項1之化合物或彼等的鹽,其中W1為N且其餘為CRa。
- 根據請求項1之化合物或彼等的鹽,其中W1以及W2與W3之一者為N,以及W4為CRa。
- 根據請求項1之化合物或彼等的鹽,其中W1、W2、W3與W4之各者為CRa。
- 根據前述請求項中任一項之化合物或彼等的鹽,其中各個Ra為H。
- 根據前述請求項中任一項之化合物或彼等的鹽,其中R1為H或(C1-C4)直鏈烷基。
- 根據請求項7之化合物或彼等的鹽,其中R1為H或乙基。
- 根據請求項7之化合物或彼等的鹽,其中R1為乙基。
- 根據前述請求項中任一項之化合物或彼等的鹽,其中R2為(C1-C11)烷基(譬如C3-C7烷基,譬如C4-C6烷基)。
- 根據請求項10之化合物或彼等的鹽,其中R2為戊基。
- 根據請求項1-9中任一項之化合物或彼等的鹽,其中R2為(C1-C3)烷基(C3-C6)環烷基(譬如環丙基甲基)。
- 根據請求項1-9中任一項之化合物或彼等的鹽,其中R2為(C1-C3)烷基-苯基(譬如苯基乙基)。
- 根據前述請求項中任一項之化合物或彼等的鹽,其中R3為苯基,其係如請求項1所定義般任擇地被取代。
- 根據請求項14之化合物或彼等的鹽,其中R3為苯基,其被獨立地選自下列的1-3個基團取代:-OCH3、-OC2H5、-OC3H7、-OCH(CH3)2、-OCF3、-OCHF2、-OCH2CF3、-OCH2CHF2、-OC2H4-吡咯啶基、-OCH2CO2H、-OCH2C(O)NH2、-CO2H、-CH3、環丙烷基-1-甲酸、-CH2CO2H、-C(CH3)2CO2H、-CH(CH3)CO2H、-CF2CO2H、-CH2C(O)NHCH(CO2H)(CH2CO2H)、-CH2P(O)(OH)2、-CH2N(CH3)(CH2CO2H)、-CH2NHCH2P(O)(OH)2、-C(NH2)(NOH)、氰基、硝基、羥基、-SO2NH2、-SO2N(CH3)2、-SO2NH(CH3)、-SO2CH3、-SO2NHC(O)C2H5、-SO3H、-SCH3、-SC2H5、-C(O)OCH3、-C(O)OC(CH3)3、 -C(O)NHCH3、-C(O)NH(C2H4NH2)、-C(O)NHC2H4N+(CH3)3、-C(O)NHCH(CO2H)(CH2CO2H)、-C(O)NHCH(CO2H)(C2H4CO2H)、-C(O)NHCH2CO2H、-C(O)N(CH2CO2H)2、-C(O)NHCH2P(O)(OH)2、-C(O)NHC(CH2OH)3、氟、-NH2、-N(CH3)2、-P(O)(CH3)(OC2H5)、-P(O)(OCH3)2、-P(O)(CH3)(OH)、-P(O)(OH)(OCH3)、與-P(O)(OH)2。
- 根據請求項14之化合物或彼等的鹽,其中R3為苯基,其被選自下列的1-3個基團取代:甲基、乙基、異丙基、-CF3、-CH2CO2H、-CH(CH3)2(CO2H)、-CH2CONHCH(CO2H)(CH2CO2H)、1-CO2H環丙基、-CONH2、-CONHCH(CO2H)(CH2CO2H)、-OCH3、-OC2H5、-OCH(CH3)2、-OCF3、-OCH2CF3、-OCH2CO2H、-N(CH3)2、-SH、-CO2H、-CN、-CO2C2H5、-P(O)(OH)2、-F、-OH、-NHSO2CH3、-SO3H、-SO2CH3、-SO2NH2、與-B(OH)2。
- 根據請求項14之化合物或彼等的鹽,其中R3為苯基,其被獨立地選自下列的1-3個基團取代:-OC2H5、-OCH2CO2H、-CONHCH(CO2H)(CH2CO2H)、-P(O)(OH)2、-CO2H、-CH2CO2H、-CH2CONHCH(CO2H)(CH2CO2H)、-OH、與-SO3H。
- 根據請求項14之化合物或彼等的鹽,其中R3為苯基,其被獨立地選自下列的1-3個基團取代:-OC2H5、-OCH2CO2H、-CONHCH(CO2H)(CH2CO2H)、與-P(O)(OH)2。
- 根據請求項14-18中任一項之化合物或彼等的鹽,其中該R3經取代苯基為3,4-或3,5-雙取代苯基(譬如3-乙氧基與4-或5--P(O)(OH)2或-CO2H;3-乙氧基與4-或5--OCH2CO2H或-C(O)NHCH(CO2H)(CH2CO2H);3--OCH2CO2H與4-或5--C(O)NHCH(CO2H)(CH2CO2H))。
- 根據請求項1-13中任一項之化合物或彼等的鹽,其中R3為雜芳基,其係 如請求項1所定義般任擇地被取代。
- 根據請求項20之化合物或彼等的鹽,其中R3為包含5-6個環原子的單環雜芳基,其包含1-4個選自氮、氧與硫的雜原子(譬如吡啶基、嘧啶基、噠嗪基、吡唑基、四唑基、或噁唑基),其係如請求項1所定義般任擇地被取代。
- 根據請求項20或21之化合物或彼等的鹽,其中R3為雜芳基,其被獨立地選自下列的1-3個基團取代::-OCH3、-OC2H5、-OC3H7、-OCH(CH3)2、-OCF3、-OCHF2、-OCH2CF3、-OCH2CHF2、-OC2H4-吡咯啶基、-OCH2CO2H、-OCH2C(O)NH2、-CO2H、-CH3、環丙烷基-1-甲酸、-CH2CO2H、-C(CH3)2CO2H、-CH(CH3)CO2H、-CF2CO2H、-CH2C(O)NHCH(CO2H)(CH2CO2H)、-CH2P(O)(OH)2、-CH2N(CH3)(CH2CO2H)、-CH2NHCH2P(O)(OH)2、-C(NH2)(NOH)、氰基、硝基、羥基、-SO2NH2、-SO2N(CH3)2、-SO2NH(CH3)、-SO2CH3、-SO2NHC(O)C2H5、-SO3H、-SCH3、-SC2H5、-C(O)OCH3、-C(O)OC(CH3)3、-C(O)NHCH3、-C(O)NH(C2H4NH2)、-C(O)NHC2H4N+(CH3)3、-C(O)NHCH(CO2H)(CH2CO2H)、-C(O)NHCH(CO2H)(C2H4CO2H)、-C(O)NHCH2CO2H、-C(O)N(CH2CO2H)2、-C(O)NHCH2P(O)(OH)2、-C(O)NHC(CH2OH)3、氟、-NH2、-N(CH3)2、-P(O)(CH3)(OC2H5)、-P(O)(OCH3)2、-P(O)(CH3)(OH)、-P(O)(OH)(OCH3)、與-P(O)(OH)2。
- 根據請求項20或21之化合物或彼等的鹽,其中R3為雜芳基,其被選自下列的1-3個基團取代:甲基、乙基、異丙基、-CF3、-CH2CO2H、-CH(CH3)2(CO2H)、-CH2CONHCH(CO2H)(CH2CO2H)、-1-CO2H環丙基、-CONH2、-CONHCH(CO2H)(CH2CO2H)、-OCH3、-OC2H5、-OCH(CH3)2、-OCF3、 -OCH2CF3、-OCH2CO2H、-N(CH3)2、-SH、-CO2H、-CN、-CO2C2H5、-P(O)(OH)2、-F、-OH、-NHSO2CH3、-SO3H、-SO2CH3、-SO2NH2、與-B(OH)2。
- 根據請求項20或21之化合物或彼等的鹽,其中R3為雜芳基,其被獨立地選自下列的1-3個基團取代:-OC2H5、-OCH2CO2H、-CONHCH(CO2H)(CH2CO2H)、-P(O)(OH)2、-CO2H、-CH2CO2H、-CH2CONHCH(CO2H)(CH2CO2H)、-OH、與-SO3H。
- 根據請求項20或21之化合物或彼等的鹽,其中R3為雜芳基,其被獨立地選自下列的1-3個基團取代:-OC2H5、-OCH2CO2H、-CONHCH(CO2H)(CH2CO2H)、與-P(O)(OH)2。
- 根據前述請求項中任一項之化合物或彼等的鹽,其中n為0。
- 根據前述請求項中任一項之化合物或彼等的鹽,其中n為1。
- 一種化合物,其選自由下列構成之群組:
- 一種化合物,其選自由下列構成之群組:
- 一種化合物,其選自由下列構成之群組:
- 一種化合物,其選自由下列構成之群組:
- 根據前述請求項中任一項之化合物或彼等的鹽,其中該鹽為該化合物的藥學上可接受之鹽。
- 一種藥學組成物,其包含根據請求項32之化合物或彼等的藥學上可接受之鹽,以及一或多個藥學上可接受之賦形劑。
- 一種藥學組成物,其包含選自下列的化合物:(S)-2-(5-乙氧基-3'-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)-[1,1'-聯苯]-3-基甲醯胺基)琥珀酸;(S)-2-(2-(羧基甲氧基)-4-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)苄醯胺基)琥珀酸;以及(3-乙氧基-5-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)苯基)膦酸;或彼等的藥學上可接受之鹽;以及一或多個藥學上可接受之賦形劑。
- 一種在需要接受治療之人類中治療和BMP1、TLL1及/或TLL2活性相關的 疾病的方法,該方法包含投予該人類以一治療有效量的根據請求項32之化合物或彼等的藥學上可接受之鹽。
- 一種在需要接受治療之人類中治療和BMP1、TLL1及/或TLL2活性相關的疾病的方法,該方法包含投予該人類以一治療有效量的選自下列的化合物:(S)-2-(5-乙氧基-3'-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)-[1,1'-聯苯]-3-基甲醯胺基)琥珀酸;(S)-2-(2-(羧基甲氧基)-4-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)苄醯胺基)琥珀酸;以及(3-乙氧基-5-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)苯基)膦酸;或彼等的藥學上可接受之鹽。
- 根據請求項32之式(I)化合物或彼等的藥學上可接受之鹽,其係用於治療和BMP1、TLL1及/或TLL2活性相關的疾病。
- 根據請求項32之式(I)化合物或彼等的藥學上可接受之鹽,其係用於療法。
- 根據請求項37或38使用之化合物或彼等的藥學上可接受之鹽,其為選自下列的化合物:(S)-2-(5-乙氧基-3'-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)-[1,1'-聯苯]-3-基甲醯胺基)琥珀酸;(S)-2-(2-(羧基甲氧基)-4-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)苄醯胺基)琥珀酸;以及(3-乙氧基-5-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)苯基)膦酸;或彼等的藥學上可接受之鹽。
- 一種根據請求項32之化合物或彼等的藥學上可接受之鹽的用途,該用途係製造用於治療和BMP1、TLL1及/或TLL2活性相關的疾病之醫藥品。
- 一種選自下列的化合物的用途:(S)-2-(5-乙氧基-3'-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)-[1,1'-聯苯]-3-基甲醯胺基)琥珀酸;(S)-2-(2-(羧基甲氧基)-4-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)苄醯胺基)琥珀酸;以及(3-乙氧基-5-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)苯基)膦酸;或彼等的藥學上可接受之鹽,該用途係製造用於治療和BMP1、TLL1及/或TLL2活性相關的疾病之醫藥品。
- 根據請求項35-41中任一項之方法、化合物或用途,其中該和BMP1、TLL1及/或TLL2活性相關的疾病選自和心臟、肺、腎、肝、眼、皮膚、骨骼肌、血管系統或神經系統的病理性纖維化病況相關的疾病。
- 根據請求項42之方法、化合物或用途,其中該疾病選自:心肌梗塞、心臟衰竭、心律不整、肥厚型心肌病變、慢性阻塞性肺病(“COPD”)、特發性肺纖維化(“IPF”)、糖尿病性腎臟病變、後急性腎損傷、慢性腎病(“CKD”)、移植後延遲移植物功能、肝硬化、非酒精性脂肪肝(“NASH”)、青光眼、角膜疤痕、肌營養不良症、瘢瘤、傷口癒合、沾黏、肥厚性疤痕以及譬如和燒傷、手術與其他創傷相關的疤痕、中風、膠原血管疾病、全身性紅斑狼瘡、類風濕關節炎、硬皮病、脊髓損傷、與多發性硬化。
- 根據請求項35-41中任一項之方法、化合物或用途,其中該和BMP1、TLL1及/或TLL2活性相關的疾病選自特徵在於減少的肌肉功能和/或質量的肌 肉疾病。
- 根據請求項44之方法、化合物或用途,其中該肌肉疾病選自:肌營養不良症、肌少症(sarcopenia)、以及和譬如心臟衰竭、CKD、COPD、癌症或老年相關的惡病質。
- 一種組成物,包含a)根據請求項32之式(I)化合物或彼等的藥學上可接受之鹽;以及b)組合夥伴。
- 一種組成物,包含a)選自下列的化合物:(S)-2-(5-乙氧基-3'-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)-[1,1'-聯苯]-3-基甲醯胺基)琥珀酸;(S)-2-(2-(羧基甲氧基)-4-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)苄醯胺基)琥珀酸;以及(3-乙氧基-5-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)苯基)膦酸;或彼等的藥學上可接受之鹽;以及b)組合夥伴。
- 一種在需要接受治療之人類中治療和BMP1、TLL1及/或TLL2活性相關的疾病的方法,該方法包含投予該人類以一治療有效量的a)根據請求項32之式(I)化合物或彼等的藥學上可接受之鹽;以及b)組合夥伴。
- 一種在需要接受治療之人類中治療和BMP1、TLL1及/或TLL2活性相關的疾病的方法,該方法包含投予該人類以一治療有效量的a)選自下列的化合物:(S)-2-(5-乙氧基-3'-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)-[1,1'-聯苯]-3-基甲醯胺基)琥珀酸;(S)-2-(2-(羧基甲氧基)-4-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)苄醯胺基)琥珀酸;以及 (3-乙氧基-5-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)苯基)膦酸;或彼等的藥學上可接受之鹽;以及b)組合夥伴。
- 一種下列的組合物:a)根據請求項32之式(I)化合物或彼等的藥學上可接受之鹽;以及b)組合夥伴。
- 一種下列的組合物:a)選自下列的化合物:(S)-2-(5-乙氧基-3'-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)-[1,1'-聯苯]-3-基甲醯胺基)琥珀酸;(S)-2-(2-(羧基甲氧基)-4-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)苄醯胺基)琥珀酸;以及(3-乙氧基-5-(6-((((R)-2-((R)-1-(N-羥基甲醯胺基)丙基)庚醯胺基)甲基)胺甲醯基)吡啶-2-基)苯基)膦酸;或彼等的藥學上可接受之鹽;以及b)組合夥伴。
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