TW200418988A - Method for diagnosing prostate cancer - Google Patents

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TW200418988A
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Yusuke Nakamura
Toyomasa Katagiri
Hidewaki Nakagawa
Shuichi Nakatsuru
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Oncotherapy Science Inc
Japan President Univ Tokyo
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Description

200418988 玖、發明說明: 【發明所屬之技術領域】 本發明相關於診斷攝護腺癌的方法。 【先前技術】 攝護腺癌(PRC)是男性最常見的惡性腫瘤之一,也是重要的全球性健康 問題。在美國,該疾病是癌症致死的第二常見病因(1)。pRC的發生率在= 開發國家持續成長,導因於西式飲食的盛行及族群老化。在日本,也有俞 來愈多的病患死於此病,皆肇因於接受了西方世界的生活型態(2)。近來= PRC的診斷是依據血清中攝護腺專一性抗原(PSA)的增加。早期診斷提供治 療性手術的機會。患有器官侷限性PRC的病人經治療後有約7〇%可以藉由放· 射線攝護腺切除術治癒(3, 4)。大多數較嚴重或復發的病患,需接受雄性素 切除治療,因為PRC的生長早期須依賴雄性素。雖然這些病患開始時對於 雄性素切除治療有反應,最終仍會發展成不依賴雄性素的pRC,屆時,其腫 瘤將不再對雄性素切除治療有反應。 治療PRC在臨床上最嚴重的問題之一,就是不依賴雄性素的pRC對其 他治療亦無反應,因此,了解不依賴雄性素生長的機制,以及建立雄性& 切除治療以外的抗PRC治療方法,是解決prC的當務之急。 另一方面,攝護腺上皮内腫瘤(PIN)是微小傷害的特有形式,一般相信 是卩队的前驅(^^1〇0^丨成1986)。?1辦皮認為是介於低惡性度及高參 惡性度間的連續體,高惡性度的PIN被認為是侵入性惡性腫瘤更接近的前 驅。鬲惡性度的PIN與PRC常會同時存在,且二者有相似的染色體及基因變 化(Qian ey al·,1999)。但是,PIN發展的機制與從pin演變到PRC的過程 依然不清楚。因此,充分地PIN基因體表現模式分析是了解其分子層次之致 癌、發展及防禦策略的必要步驟。 使用cDNA陣列技術可以得到正常及惡性瘤細胞各自完整的基因表現模 式’也可以比較一者的基因表現(Okabe et al·,Cancer Res 61:2129-37 (2001); Kitahara et al., Cancer Res 61: 3544-9 (2001); Lin et al., Oncogene 21:4120-8 (2002); Hasegawa et al., Cancer Res 62:7012-7 5 200418988 (2002))。該方法可以揭露癌細胞複雜的性質,也幫助對於致癌機制的了 解。檢疋腫瘤内失調的基因可以對個別癌症有更精確的診斷,進而發展新 型治療標的(Bienz and Clevers,Cell 103:311-20(2000))。為了 由基因 體寬廣的角度來研究腫瘤機制,以及發現診斷及發展新治療藥劑的標的分 子,本發明人等已採用23040個基因的CDNA陣列分析腫瘤細胞的表現模式 (Okabe et al., Cancer Res 61:2129-37 (2001); Kitahara et al., Cancer Res 61:3544-9 (2001); Linetal., Oncogene 21:4120-8 (2002); Hasegawa et al., Cancer Res 62:7012-7 (2002))。 設計為致癌機制的研究也已促進抗腫瘤藥劑的分子標的檢定。例如, 法呢基轉移酶抑制劑,原本用於抑制與Ras(其活化依賴法呢基化)相關的生 長訊息路徑’將之用於治療依賴Ras腫瘤的動物模式也非常有效(Heetal.,響
Cell 99:335-45 (1999))。人體臨床試驗中,使用抗癌藥物與抗HER2單株 抗體’搓杜滋美(trastruzmab),或其組合,已用於拮抗原致癌基因受體 HER2/neu;且臨床上已有不錯的成效,且能增加乳癌患者的整體存活率(Lin et al·,Cancer Res 61:6345-9 (2001))。路胺酸激酶抑制劑,STI-57卜
能選擇性的抑制bcr-abl融合蛋白,已用於慢性骨髓性白血病的治療, bcr-abl路胺酸激酶的持續活化對於白血球轉形扮演很重要的角色。諸如此 類的試劑皆設計來抑制特定基因產物致癌的活性(Fujita et aL,Cancer Res 61:7722-6 (2001))。因此,在癌細胞内常見表現量提高的基因產物可 能可以做為新式抗癌藥物的潛在目標。 I 目前已證明出CD8+細胞毒殺性T-細胞(CTLs)會辨認表現在MHC Class I 上之與癌細胞相關抗原(TAAs)來源的抗原決定位胜肽,進而溶解腫瘤細 胞。自發現MAGE家族為第一個TAAs例子後,許多的TAAs已用免疫方法發現 (Boon, Int J Cancer 54: 177-80 (1993); Boon and van der Bruggen, J Exp Med 183: 725-9 (1996); van der Bruggen et al., Science 254: 1643-7 (1991); Brichard et al., J Exp Med 178: 489-95 (1993); Kawakami et al_,J Exp Med 180: 347-52 (1994))。其中某些TAAs已用於臨床發展免 疫/台療的才示的。目如發現的TAAs包含MAGE(van der Bruggen et al.,Science 254: 1643-7 (1991)), gpl〇〇(Kawakami et al., J Exp Med 180: 347-52 6 (1994)), SART(Shichijo et al·, J Exp Med 187: 277-88 (1998)),以 及NY-ESO-l(Chen et al·,Proc Natl Acad Sci USA 94·· 1914-8 (1997))。 另一方面,能專一性的在腫瘤細胞内大量表現的基因產物,已確認為誘發 細胞免疫反應的標的。這些基因產物包含p53(Umanoetal.,Brit J Cancer 84: 1052-7 (2001)), HER2/neu(Tanaka et al., Brit J Cancer 84: 94-9 (2001)),CEA(Nukaya et al·,Int J Cancer 80: 92-7 (1999)等等。 雖然有關於TAAs的基礎及臨床研究有顯著成就(Rosenbeg et al., Nature Med 4: 321-7 (1998); Mukherji et al., Proc Natl Acad Sci USA 92: 8078-82 (1995); Hu et al·, Cancer Res 56: 2479-83 (1996)),但 只有少數候選TAAs能用於治療腺癌,包含直腸癌。TAAs在癌細胞内大量表 現,且僅在癌細胞内表現,此性質亦可作為免疫治療標的的候選者。更進· 一步,檢定出新的,能誘導有效又專一的抗癌免疫反應之TAAs,可預期能 促進胜肽疫苗策略於不同癌症的臨床使用(Boon and can der Bruggen,J Exp Med 183: 725-9 (1996); van der Bruggen et al., Science 254: 1643-7 (1991); Brichard et al., J Exp Med 178: 489-95 (1993); Kawakami et al., J Exp Med 180: 347-52 (1994); Shichijo et al., J Exp Med 187: 277-88 (1998); Chen et al., Proc Natl Acad Sci USA 94: 1914-8 (1997); Harris, J Natl Cancer Inst 88: 1442-5 (1996); Butterfield et al., Cancer Res 59: 3134-42 (1999); Vissers et al., Cancer Res 59: 5554-9 (1999); van der Burg et al·,J Immunol 156: 3308-14 (1996); Tanaka_ et al., Cancer Res 57: 4465-8 (1997); Fujie et al., Int J Cancer 80: 169-72 (1999); Kikuchi et al., Int J Cancer 81: 459-66 (1999); Oiso et al·, Int J Cancer 81: 387-94 (1999))。 有多數報導指出,來自健康個體的周邊單核血球(PBMCs),受胜肽刺激 後產生顯著量的介白素T,但於51Cr-釋放試驗中對於HLA-A24或-A0201腫 / 瘤細胞並沒有毒殺效應(Kawano et al.,Cance Res 60: 3550-8 (2000); Nishizaka et al., Cancer Res 60: 4830-7 (2000); Tamura et al., Jpn J Cancer Res 92: 762-7 (2001))。然而,HLA-A24或HLA-A0201 二者在日 本及咼加索人中是最普遍的HLA對偶基因(Date et al.,Tissue Antigens 47: 200418988 93-101 (1996); Kondo et al·, J Immunol 155: 4307-12 (1995); Kubo et al., J Immunol 152: 3913-24 (1994); Imanishi et al., Proceeding of the eleventh International Hictocompatibi1ity Workshop and Conference Oxford University Press, Oxford, 1065 (1992); Williams et al·,Tissue Antigen 49: 129 (1997))。因此,表現在這些HLA的癌症 抗原胜肽,可能特別有用於治療在曰本或高加索人的癌症。此外,目前已 知,在試管中高濃度的胜肽會誘發低親和性的CTL,產生許多專一性胜肽 /MHC複合物於抗原表現細胞(apCs)上,進而能有效活化這些 CTL(Alexander-Miller et al., Proc Natl Acad Sci USA 93: 4102-7 (1996))。
【發明内容】 本务明疋依據與PRC或pin相關的基因表現特性的發現。在prc或pin 中表現不同的基因,總稱為PRC核酸或PRC聚核嵌,其相關編碼多胜肽 總稱為PRC聚狀鍵或prc蛋白。 依此,本發明揭露一種用以診斷一個體之PRC及PIN,或是個體發展為 PRC及PIN的傾向之方法,藉由測定源於患者的生物樣本内(如組織樣本), PRC相關基因表現量。PRC相關基因是指一基因在pRC或piN細胞内之表現程 度不同於在正常細胞者。正常細胞係來自攝護腺組織。pRC相關基因包含如 。#該基隨正常基嗎表現量械較,有如增域減低之丨 交·戈表此心者已有或是有發展為PRC或是PIN的危險。 組表現量是指_於正常健康的個體、或是已知未患有PRC與 的單一表現表。正料败表現量是㈣單―參考人群 ]^㈣數個表現特徵。勤,對驗表現量可以是來自 =則心胞表現特徵的㈣庫。正f個體是指不具槪侧的臨床症 PRC ^88' 296~321 ^458-5^ 危險。相反地,相較已嫩有發展為PRC或是™的 歡止$對照組表現$,測試樣本之PRC 89—2H似, 8 200418988 538-692表現量減少,顯示該個體已有或是有發展為pRc或是piN的危險。 另外,可將樣本帽G侧的基g絲現舰與 較。該PRC對照組表現量是指患有PRC或piN人群中,.相關的基因的表現 特徵。 相較於對照組表現量,基因表現量的增減為1〇%、25%、5〇% 因表現量之增對照組表現量之卜2,5或更多倍。表現量是由pRc相^ 基因採針之雜交實驗測定’如於__,以測定pRG糊基因探針與該病人 組織樣本之基因轉錄產物的雜交程度。 來自病人的組織樣本可以是測試縣内任何喊,測試對象係如已知 患有或是可能有PRC或PIN的病人。例如組織包括表皮細胞。 組織的表皮細胞。 % % 本發明也提供PRC參考表現特徵,該基因是pRC卜692内二個或多個美 因。另外,本發明也提供PRC參考表現特徵,該基因是pRC卜88、pRc 89一29^ PRC 2%-32卜 PRC 322-457、PRC 458-537或PRC 538-692内二個或多個基
本發明亦揭露一種檢定具有抑制或增加pRC相關的基因,如pRc 1 -692,的表現量或是活性之試劑的方法,藉由接觸能表現相關基因的 細胞與試劑,以及測定PRC相關基因的表現量。上述測試細胞是表皮細胞, 如來自攝護腺組織的表皮細胞。與正常對照組細胞相較,若表現量下降, 表不該試劑是PRC相關基因的抑制劑,能降低pRC或piN的症狀。相反地 與正常對照組相較,若表現量或活性上升,表示該試劑是pRC相關基因之 表現或功能的提升劑,能降低PRC或PIN的症狀,如pRC 89—295、pRC 322-457、PRC 538-692。 本發明揭露一種套組,含有偵測試劑,能結合至兩個或多個pRC核酸 序列或是結合至該核酸序列所編碼之基因產物。本發明亦揭露一種核酸陣 列’能與兩個或多個PRC核酸序列結合。 、本發明揭硌治療方法,包括一種用以治療或預防一個體中之prc、pin 或一者,包含給予該個體一反義組合物。該反義組合物能減少特定目標基 因之表現,如該反義組合物包括一核苷酸,其與選自pRC卜88,296_321, 9 200418988 458-537的序列互補。另-種方法包括以下步驟,給予個體一小干擾 RNA(siRNA)組合物。該siRNA能降低選自PRC卜咫,296_321,奶8—537之核 sit序列的表現量。另-種方法’藉由給予患者催化性腿(db〇zyme)組合物 用以治療或預防PRC、PIN或二者。該核酸專一性的恤零匕组合物能減少 選自PRC丨普296-321,-537核酸的表現量。其他治療方法包括給予 個體-化合物,其可增加PRC 89—295,微―457 ’ 538—撕之表現,或pRc 89-295,3M-457,538-692所編碼之多胜肽的活性。另外,可以給予患者 PRC89-295,32H57,538-692所編碼的蛋白以治療pRC、piN或二者。該蛋 白可以直接給m,或是在活體内表現,如給與宿主細胞表現載體,或 是能負調節標記基因的細胞。活_現基因已是孰知的領域。 本發明亦揭紐苗或疫苗接财法。例如,—種用以治療或偷一個# 體之PRC、PIN或二者之方法,包含給予個體一疫苗,該疫苗包括一擇自哪 卜88、’ 296-321 ’ 458-537核酸序列所編碼之多胜肽,或是其免疫活性片段。 免疫活性片段是-多胜肽,其長度短於長度完整,自然界發生,能誘發免 疫反應的蛋白。例如,至少具有8個殘基長度且能活化免疫細胞如_細 胞。免疫細胞的活化係以細胞增生,細胞激素的上升(如丨卜2),或是抗 的產生來偵測。 — 除非另有解釋,本篇所職術性或科學性辭彙,與_般熟知此技蔽人士 =用相同。雖餘似或相同的方法、材料,在本篇可以做為例子或二 =適的材料記載於後。本篇所提文獻、專利、及其t請等,皆併人參考文 獻。右有任何衝突,以本篇特殊性的鱗,包含定義為[本篇 馨 法及例子僅用於闡釋而非用以限定本發明。 本發明的他點在於偵測出臨床所有症狀前,就能夠檢定出此疾病。1 的特性及優點將會在之後的敘述及專利申請中顯現。 、 【實施方式】 •本發明是輯PRG或p職患者,其表皮細麟多彳目核酸序縣現 不同之發現。絲現差異性係藉由綜合cl)_陣列系統來檢S。 1 cDNA微陣列是檢定基因的有效功具,可能應用於發展新式治療用分子 10 200418988 目標(Ishiguro et al.,2002; Yagyu et al·,2002)。近來,對於PRC的 基礎研究,利用基因資訊及新的技術,已有快速地進展,但利用組織差異 性來研究人類PRCs,最常遇到的問題就是無法抽離出純質的樣本,以利分 子分析。過去的研究使用大量癌組織,但郤沒有防止非癌細胞的污染,非 癌細胞包括基質細胞、微管細胞、纖維肌細胞、發炎細胞,及其他良性缺 損的表皮細胞,包括如PINs。然而,電射微切技術能克服這些問題,使我 們獲得純種PRC及PIN細胞(Emmert-Buck et al·,1996)。我們亦比較癌細 胞與其它正常表皮細胞的基因表現。該步驟能防止特定基因表現來干擾數 據。本研究是首次報導出精確PRCsAPINs的表現特徵,伴隨遍。該數據提 供重要攝護腺癌化過程的訊息,及幫助找出治療或預防pRC的目標基因。 來自2 0個PRCs及10個p I Ns癌細胞的基因表現特徵已利用c·a陣列分丨 析,該陣列代表23, 040個基因,伴隨著電射微切割的分析。比較由電射切 割2臨床pm及正常的表皮細胞巾基因魏·,在PRG及PIN細胞中, 鑑定出88個基因為正調控,2_基因為負調節。在pRC細胞中,%個基為 正調控,*有136個基因為負調控。在PIN細胞中,_基因為正調控,土 155 個基㈣負調控。此外,挑選出患者血清或痰_測得與癌症相關的蛋白 之候選分子標記,並發現某些潛在可研發人繊味刚之訊息抑制策略。 西在此檢定出表現不同的基因,可做為pRC或是piN的臨床診斷標記與基 因標的,其表現量可以被調控來治療或減輕PRC或PIN的症狀。 、土 ”在PRC、PIN患者内表現異常(及增加或減少)的基因收錄在表, 為” PRC相關基因”,’’pRc核酸,,,或是” prc聚核苷酸,,,其相對廡^ 1 的多胜肽總稱為” PRC多胜肽,,或是” pRC蛋白”。除非另有說明,^『、 ίΰΐΐΓΐ揭露的序列(即PRC卜692)。前述所提的基因出現時皆伴隨 藉由測量在細胞樣本内不同基因的表現,得以診斷pR(^pi 測夏不同基目對各種試#|的反應,可以檢定能治療PRG或piN的試劑。 本發明牽涉到侧(即測量)在表3-8中,至少-個,或全部片 現。使用GeneBankTM資料庫的序列資訊,PRC相關基因可以採 = 知之技術而被侧及測量。例如,相對應pRC序列之資料庫的序列,可以二 11 200418988 築偵,PRC腿序列的探針,如使用北方墨點雜交分析。探針包含參考序列 中至少10、20、50、1〇〇、2〇〇個核普酸。另一個例子,序列可用以構築專 -性增幅PRC;賊的引子,如利用反轉錄酶聚合反應。將測試細麟(如患 者的,織樣本 > 中-個或多個PRC相關基因的表現量與參考細胞群内基因的 表現量比較。參考細料包含已知的比較參數,如pRG細誠非pRc細胞。 測試θ細胞群内基因表特徵與參考細胞群比較,是否就能表示為PRC或 PIN ’或疋有發展的可能’需依賴參考細胞群的組成。例如,若參考細胞群 由非PRC細胞喊’當胞群與參考細胞群的表麟徵_時,代表測 试細胞群為細C㈣。献地,參考細胞群由pRG細胞組斜,當測試細 胞群與參考細胞群的表賴徵相同時,絲測試細胞群含有PRC細胞。 測。式細胞群内PRC標記基因的表現量,在下列情形被視為有改變:與參_ 考細胞群標記基因的表現量比較時,其變化達1〇,15,2 〇,5 〇, 或以上的倍數。 · · 參考細胞群與測試細胞群間基因表現的差異,將利用對照組核酸(如守 4基因)來標準化。例如,已知_組個不會隱或非動胞而表現不 同。測試與參考滅中之龍減因可时鮮化二者之間的核量。對 照組基因為肌動蛋白、6—磷酸葡糖脫氫酶,核糖體蛋ρι。 將測試細胞群與多種參考細胞群比較。每_個參考細麟可能有各自 =同的參數。測試細胞群可以與另—個參考細胞群相較(如嫩細
=’或^ -個參考細胞群鱗PRG細胞者(正常_)比較。測試細胞包 各已知,、有或可能具有PRC之病人的組織或細胞樣本。 測試細胞得自體組織或是體液,例如生物性液(如錢或血清)。例如, 純化自組織者。較佳地,測試細胞群含有表皮細胞。表皮細胞 疋由已知或可能為癌細胞而來。 參考細胞群的組織來源與職細胞她。較佳地 對照組)或獄細胞株(負對照組)。另外,對照^ 參數或狀脱知的細胞嚼。 敎由操 受測者以哺乳類為佳。可以是人類卩 I苗,馬,或牛。 非人的靈長類,小鼠’大鼠,狗, 12 200418988 本發明所述的基因表現,是由熟知的技藝測定蛋白質或核酸量。例如, 北方墨點分析使用探針,專一性地與一個或多個核酸辨識,作為測量的工 具。亦可用反轉錄酶聚合反應,如使用專一性引子相對應於表現不同的基 因。亦可測定蛋白的表現量或活性,該蛋白由前述基因轉錄。該方法包含 免疫分析’依據與編碼蛋白對應的抗體。該編碼蛋白的活性亦是已知。
診斷PRC或PIN PRC或PIN的診斷是測量一個或多個pRC核酸序列的表現量,該序列來 自測試細胞群(即來自患者的生物樣本)。較佳地,受測細胞群包含表皮細 胞,如攝護腺組織的細胞。基因的表現也可以從血液或其它體液而來,如 尿液。其它生物樣本可以用來測量蛋白表現。如患者血液中、或血清中蛋 白量可以由免疫分析或生物性分析。 ( 一個或多個PRC相關基因(如PRC丨―692)的表現,經測定受測細胞或生 物樣本後,與正$對知、組細胞的表現量比較。正常對照組表現量是已知未 患有PRC個體的PRC相關基因表現特徵。其高低變化顯示此患者已有或是 有發展為PRC或是PIN的危險。例如,與正常的表現量相比較,受測樣本 群中,PRC 1-88、PRC 296-32;l、PRC 458-537基因表現的上升表示此患者 已有或是有發展為PRC或是PIN的危險。相反地,受測樣本中,pRC89—295、 PRC 322-457、PRC 538-692基因表現的表現下降,表示此患者已有或是有 發展為PRC或是PIN的危險。 當與正常對照組樣本相較’一個或多個PRC相關基因有改變時,表示 此患者已有或是有發展為PRC或是PIN的危險。例如,至少有1%、.25%、 50%、6G%、8G%、9G%或更多的PRC相關基因⑽卜88、pRC 296 321、观 458-537、PRC 89-295、PRC322-457、pRC538—692)改變。 欲估計受測樣本中PRC卜692基_表現量,可技酸卜692&腿 或其編碼蛋白。定髓_方法e是熟知_域。例如,減胁pRc卜哪 的mRNA表現严,可以由北方墨點分析或反轉譯酶聚合反應測定。由於观 1-692的核甘酸序列已被發表,任何熟知 或引子來定量pm PRC 1 692的細表現可以藉其所編散蛋自的活性或量來分析。以下 13 200418988 δ己所編碼的蛋白質。另一方面 質的活性。 ==方法。例如,免疫分析是測量生物材料中蛋白量的工具。任何生 用,量其蛋白量與ΓΓ如分析血液材料可以測得其血清標 ,合適的方法可以測量PRC丨-692所編碼蛋白 本發明亦揭露-種診斷PRC或ΡΙΝ的試劑。該試劑含有一化合物, =明中的聚核舰與多胜肽結合。較佳地,寡核^:酸與PRC卜^中聚核 酉义結合,或一抗體與PRC 1 -692中的多胜肽結合。 — 本發明中,PRC 1-692有效地用於診斷PRWPINcjpRC卜娜可用於診 斷PRC或PIN。PRC 296-457亦可做為PRC專-性標記來診斷pRC。更進一步二 PRC 458-692可做為診斷PiN或PIN的專一性標記。 夕’ 檢定抑制或提昇PRC相關基因表現的試劑 ^ 篩選能抑制PRC相關基因化合物,包含將測試化合物與表現正調控pRc 相關基因的細胞接觸,測定該基因的表現量。與正常對照組比較,基因表 現的表現下降,表示該試劑是正調控PRC相關基因的抑制劑,且可用於抑^ PRC或PIN。 篩選能提昇負調控PRC相關基因的化合物,包含將測試化合物與表現 PRC相關基因的細胞接觸,測定該基因的表現量或活性。與正常對照組比 較,基因表現或活性的上昇,表示該試劑能提昇負調控pRC相關基因的量 或活性。 受測細胞是任何表現PRC相關基因的細胞。例如,表皮細胞,包含攝護 腺細胞或其衍生細胞。例如,衍生自PRC細胞的株化細胞(imm〇rtalized拳 cell)。另外,受測細胞是經由PRC相關基因轉染,或經由調控序列(提昇子 序列)轉染的細胞,該序列來自接合到一報導基因的PRC相關基因。 分析治療患者PRC或PIN的效力 本篇所檢定出表現不同的PRC相關基因,亦也用於PRC及PIN治療的追 蹤。測試細胞是由正在接受PRC或PIN治療的患者而來。若有需要,受測細 胞是由不同的時間點取出,可以是治療前,治療中,或治療後。PRC相關基 因的表現測定後與參考細胞比較,該參考細胞的PRC狀況是已知且未經過治 療手續。 14 200418988 若參考細胞不含有PRC細胞,則受測細胞及參考細胞pRC相關基因表現 量若相同,絲該治療有效。但若麵不同,職示雜紐果或診斷结 果不佳。 α 上述有效程度”,是指病理上正調控基因的表現量下降,病理上負 調控的基因下降’或是频積、傳紐、轉雜等減少。當治療是預防性 地施行’有效是指延置或防止PRC或ΡΙΝ的發生,或是延置、防止、或減輕 PRC或PIN的症狀。攝護腺癌的評估是依據臨床的標準程序。 有效性的測定結合任何診斷或治療PRC或piN的方法。pRC的診斷可以藉 由症狀的異常,如棑尿時開始或結束因難,疼痛,頻尿,或血尿。 曰 選擇適於個體來治療PRC或PIN的藥劑 個體間遺傳背景的不同會導致藥物代謝的不同。用於抑制pRC或piN的肇 藥劑,能夠藉由改變患者内PRC表現特徵至非PRC狀態。依此,本篇所揭露 表現不同的PRC相關基因,可用為測試可能用來治療或預防pRC、pIN的抑制 劑,以決定該藥劑的適合度。 檢定PRC或PIN的抑制劑時,將受測細胞與藥劑接觸,測定pRC卜_基 因的表現量。 受測細胞含有表現PRC相關基因的PRC或PIN細胞。較佳地,該細胞是表 皮細胞。例如,受測細胞與受測試劑接觸,測定的受測細胞基因表現特徵 與參考細胞比較,如PRC參考細胞表現特徵或非PRC參考細胞表現特徵。 相較於正常細胞,若導致PRC i—88、PRC 296-321、PRC 458-537等基傷 因表現減少,或PRC 89-295、PRC 322-457、PRC 538-692等基因表現增加, 則表示該藥劑有治療能力。 測試試劑可以是任何化合物或組合物。例如,可以是免疫調控試劑。 檢定治療試劑的篩選分析 本發明所提表現不同的基因,可以用於檢定治療PRC或PIN。該方法依 據此藥劑是不能轉移PRC 1-692基因表現特徵至非PRC狀態。 本發明中PRC 1-692基因,可用來篩選能治療或預防PRC、PIN的試劑。 PRC 1-295基因可用為篩選治療或預防pRC或PIN的試劑。pRC296-457可用為 筛選治療或預防PRC試劑的PRC專一性標記。pRC458-692可用為篩選能治療 15 200418988 或預防PIN或PRC試劑的PIN專一性標記。 該方法中,將受測細胞與受測藥劑或組合藥劑接觸(同 測定PRC 1-692基因的表現量。該表現量與未接受藥 ^去,依序地),
相關基因的表現量比較。 、…考、細胞中,PRC 這此藥劑將會做更進一步防止PRC在動物或個體的測試: 之後的實關t,本發明提供-方法,㈣篩選可能治療或預 能夠提昇表現過低的基因,或抑制表現過高的基因,比 ............................... 見為有潛力的 防roc 或PIN的試劑。如前述所提,控制標記基因的表現量,亦可以批丨 PIN的發生或發展。因此,有潛力的試劑可以藉由標記基因的表二 來篩選。在本發明中,該方法包含下列步驟: 里5 / ,a)將測試化合物與選自PRC1-692群組内的核酸序列所編碼的多峨接 觸, b) 測疋化合物與多胜狀間的結合活性;以及 c) 選擇一個結合到多胜肽上的化合物。 另外,該方法亦包含下列步驟: a) 將職化合物絲現—❹個標記基_細胞接觸,該標記基因選 自PRC 1-692群組,以及 b) 遥擇能夠減低選自PU8、296-32卜458-537標記基因表現量, 或是增加選自P獅-295、322_457、538_692標記基因表現量等化合物。 ”能表現標記基因的細胞包含,來自PRC的細胞。該細胞可用於本發明
師選工作。 I 另外,本發明的篩選方法亦包含下列步驟: a) 將測魏合物與—錄肽接觸,該多峨是由順_692群組中的核 酸序列所編碼; b) 測定步驟(a)裏多胜肽的活性;以及 c) 挑選此抑制多胜肽活性的化合物,該多胜肽係由pRC卜從、296—321、 458-537的序列編碼,或是挑選能增進多胜肽活性的化合物,該多胜肽係由 PRC 89 295、322-457、538-692的序列所編碼,二者活性皆相對於沒有經 化合物處理的多胜肽。 16 200418988
A 夾中Γ來碑選的蛋白可以利用重組方式,從標記基因的序列而 ^ 熟知此象何生物活性蛋 另外,本發_篩選方法亦包含下列步驟: 其因合物與細胞接觸,該細胞含有一載體,其上有一個或多個標記 土 :其及文此調節的報導基因’標記基因選自PRC 1-692 0 b)’貝j疋5亥報導基因的活性;以及 296-3$:^卩^導基因表現的化合物,該報導基因是選自PRC卜88, 該報增__現的化合物, 相對於對照組。 微哪、538-692的負調控序列,二者皆 碎I適的報導細及是熟知的技藝。帛㈣勒報導基因可以由 記基_轉_涯來製備。—旦標記基 的序列來製備報導基因。若調押區次 L為已矣了用則述 資訊從資料庫裏分離出調控的貝料知,可以利用標記基因的序列 篩選出來的化合m麵難絲 亦 用於治療或預防PRC或PIN。 π贫曰錢亦可應 另外,化合物中具有抑制活性的結構經過加入、刪除、置換,兮化人 物仍納入本發明所篩選的試劑。 冊滕倾6亥化合 給予人體或其它哺乳動物本發明分離的藥物時,可 在已知的藥學組合物,上述哺乳動物可 -次,里· 狗、綿羊、豬、牛、猴、狒、及猿。 天三既、兔、猫、 片膠囊、絲囊,或疋非口服的注射液, 存 體的懸浮液。化合物和缝學可接受細齡,如^接^液 植物油、乳化劑、懸浮劑、介面活性劑、穩定劑、香味劑、接受劑、 防腐劑、H、料。触合物崎性成分的量 、 可以混合成㈣或膠囊的添加物有;結合劑,如娜以玉^ 膠(仕agacanth _〇、阿拉伯膠;賦形劑,如結辛胳/、树 米殿粉、明膠、海藻酸;潤滑劑,如硬 *、、隹素,膨脹$卜如玉 J々硬月曰錢’甜味劑,如果糖、乳糖或糖 17 200418988 =,香未劑’如n吾岩白珠油(Gaultheria aden。伽ix ◦⑴、楼桃。 ^單-藥劑組合物是雜時’其液態載體,如油,也可吨含在上述成份 内。用於注射的無菌組合物,可以使用一般給予藥物的載體,如無菌水。 生理食塩水、葡萄糖、及其它等張溶液,包含佐劑,如山黎醇、甘露 糖、甘露醇、及氣化納,可以用做注射溶液。上述試劑可以與合適的溶解 液合用,如酒精、乙醇、聚醇’如丙烯甘油、聚乙稀甘油、非離子表面活 性劑,如P〇lyS〇rbate 80Tl\^HCO-50。 芝麻油或大㈣可用為油質液體,可能可赠安息#酸甲苯咖㈣ benzoate)或苯甲醇合用,也可以組成為緩衝液,如碟酸鹽,醋酸納鹽;止 痛劑,如普魯卡因氫氣酸鹽(procaine hydr〇chI〇Hde);穩定劑,如苯甲 醇及紛;及抗氧化劑。上述注射劑也可包裝成合適的安瓶(華W。 φ 热知此技藝的人士可以用其了解的方法給預患此藥學組合物,包含 有,脈内、靜脈内、皮下、鼻腔内、經支氣管、肌肉、或是口服。使用的 劑量依據患者體重、年齡及施藥的方法改變,但熟悉此技藝的人士可以選 用固定合適的方法。若該藥物是由DNA編碼,可以將職接入一載體,用做 基因治療。使_繼雜患者體重、年齡及施_方法改變,但熟悉此 技藝的人士可以選用固定合適的方法。 雖然與本發明蛋白接合及改變·_量,是依據症狀,—般是每天 0.1到100毫克,建議每天1.0到50毫克,每天1〇到2〇毫克,當以口服方式 給予正常成人(體重約6〇公斤)。 當以注射方式給予時(-般正常人體重約60公斤),雖然要考慮患者、籲 器官、症狀、施藥方式’等等’-般是每天0.01到30毫克,建議每天〇… 20毫克,每天0.1到1〇毫克,以靜脈注射方式給予。給予其它動物也是依此 規則,只需要轉換成給予60公斤體重所相對應的用量。 評估患有PRC或PIN的患者的診斷 本發明亦提供-方法’評估患有PRC或是pin患者的診斷,藉由比較 測試細胞及參考細胞内PRC相關基因的表現,該參考細胞是由不同疾病患 者而來。比較受測細胞及參考細胞的表現量或特徵,評估診斷結果。 與正常對照組比較,若有減少(PRC 89-295, PRC 322-457,PRC 538-692) 18 200418988 氟 或^加(PRC 1-88, PRC 296-321,PRC 458-537),表示診斷不佳。若結 於前述相反,則表示診斷結果可信。 〜 套組 本發明包含-PRC偵測試劑,能與PRC碰序列結合或辨識的核 =i或疋與其編碼蛋白結合的抗體。所有試劑包裝成套組。試劑以不同的 容器裝載,核酸或抗體(與固態載體結合或是分別地與陣列用試劑裝在一 起),對照組試劑(正或負對照組),可偵測標記。說明書(紙式、錄^帶、 =、CD-ROM等)也包含在内。該檢驗方式可以是北方墨點分析或三:治 tLIAS〇 σ 例如,PRC的試劑可以固定在固態基質上,含有_ pRC的位置。苴上 上含有許多位置,含有嫌。測試帶上含有減正的触組。或者,餐 =、區位不同於測試帶。理想的情形,不同的測試區含有不同量的核酸, =有低。在加入測試樣本後,測試區上的信號可用來定量樣本中即 3里。測郝可以已合適的形狀,如柱狀或雜,寬度與測試帶相同。 另外’套組内含有核酸陣列。該核酸可依專一地與服 1-692 „ 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25> 4〇 ^ 5〇 ^ 的核酸表現’皆能被陣列的測試帶辨識。該陣列可以在固態基質或, 吴國專利號5, 744, 305。 、 陣列及多樣性組 ㈣Ϊ發明亦包含—核酸受質陣列。其上的序列相對應於哪1-692内的邊 核S夂序列。若其中的核酸表現量為2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, Μ i « 25,40或50或更多,則可以用此陣列偵測。 ,’, 2财包含-多樣性核酸組。該核酸是存於液態或是固態,如固定 ===膜上。其上的核酸包含PRC卜聊。在許多具 含 2,3,4,5,6,7,8,9,10,15,2〇,25 4〇或5〇或更多 抑制PRC或PIN的方法 ! 觀來繼、有PRC或PIN的患者之方法,藉由減少™ 卜明,PRC296.,PRC458-537的表現或活性,或是增加__295,哪 200418988 322-457, PRC 538-692的表現或活性。化合物可以預防性地或是治雜地 給予患者。患者可以職床上鮮方式蚊,或是_絲誠活性的變 異(如PRC卜692)。治療試劑包含細胞週期、細胞生長、蛋白激酶抑制劑。 本發明中PRC 1-692適於做為治療或預防pRC或piN的分子目標。哪 1-295用於治療或是防止PRC及PIN。pRC296—457適於做為治療或預防嫩 的分子目標。PRC 458-692用於治療或是防止piN,最終防止pRC。 治療的方法包含增加基因的表現量、功能、或二者,該基因是pRc或 PIN樣本細胞内表現較低的。在這些方法中,受測者給予有效的化合物,來 增加原本祕量低的基因。給藥可叹全雜或是局部性。治賴化合物 可以是表現量低的蛋白、生物活性片段、具轉譯能力的序列、能在pRC或 PIN細胞内表現的控制元素;如能夠增加表現量的試劑,正調控原本表現低_ 的基因。藉由給藥來拮抗原本表現異常基因的效應。 _ 冶療的方法包含減少基因的表現量、功能、或二者,該基因是PRC或 PIN樣本細胞内表現較高的。治療方式可以是給予一核酸,可以抑制或拮 抗,過度表現的基因量,可利用反義rNA或是干擾RNA來達成。 口 另外,可以棚化合物來抑制過度表現基因的產物。如湘抗體來與 蛋白結合。 ' 如前所述,相對應於PRC 1-88,296-321,458-537的反義序列,可以 減少PRC 1-88,296-321,458-537的表現量。相對應於ρπ 1—88,296-321 458-537(在PRC或PIN内表現量尚)的反義序列,適於治療ρπ或pm。特別 地,對應於PRC 1-88,296-321,458-537或其mRNA的核酸序列,經由結人 來抑制PRC 1-88, 296-321,458-53基因的轉錄及轉譯,終止蛋白的功^二 本篇所用的反義核酸,一類是完全互補於目標基因,另一類是有一個核苷 酸不互補,但只要能專一性地與其目標基因結合。例如,本篇所用反^核 酸,包含相似性達70%,80%,90%,95%,可高達連續15個核苷酸相同。適 當的演算法可以用來決定相似性。 本發明所用的反義核酸,藉由與目標基因的DNA或mRNA,抑制轉譯或轉 錄能力,mRNA的分解,蛋白表現量的抑制,最後抑制蛋白的功能。 本發明所提的反義核酸可以製備到其它包裝,如擦劑(liniment)或小 20 200418988 瓶(poultice),混入合適的基質。 顆粒、膠囊、微脂膠囊, 等張劑,溶劑、穩定劑、 ’或疋經由血管到損害位 °如微脂粒,聚離胺酸, 若有需要,該衍生物可以包埋到藥片、藥粉、 注射物、液體、喷劑、冷凍乾燥劑,加入賦形劑, 防腐劑、止痛劑。可用下列已知方式製備。 反義核酸衍生物’可以直接給予至病痛位置 置。反義固定基質可用來增加持續性及膜穿透性 膽固醇,lipofectin,或其衍生物。 反義核酸可以抑制本發明所述蛋白絲現,藉此抑制該蛋白的活性。 本發明的反義減包含修飾娜核·。例如硫基倾射以給予抗籲 核酸酶的活性。 3臟可以減低標記基因的表現量。所謂的_八是指雙股腿分子,用 以抑制mRNA的轉譯。使用標準方式來移入以,包含一般轉染臟的方式。 本篇中碰A包含有正股或反義核酸序列,用以抑制正調控的標記基因,如 PRC卜88, 296-321,458-537。製配siRNA的方式,是同時在一轉錄產物内 產生正股及互補核酸,二者形成髮夾的結構。 本發明所用的方法,是要改變原本為正調控基因的表現。3疆可以結 合到PL,296-321’ 458-537等的轉錄物’進而抑制其蛋白的表現。 =用的募核槪長度為至少_,也可以是域轉錄長度。建議為丨㈣核 苷酸,更建議為少於75,50,25等核苷酸長度。 設計si RNAs的方式是使用AmM〇n網站 (http://www· ambion. com/techlib/misc/siRNA—finder, html)所提供的軟 體。其遵循下列程序。 選擇siRNA目標位置: 1·由每一個轉錄產物的AUG起始碼開始,向下尋找从雙核苷酸。記錄其 發生頻率以及3端附近19個核驻酸做為siRNA目標位置。Tuschl等人建議 在5及3非轉譯區(UTR),以及靠近起始碼附近的位置(約75個鹼基),做 為siRNA的目標位置,因為在調控蛋白結合位置有較多的含量。UTR結合蛋 21 200418988 » 白或轉譯起始複合物可能干擾3:[1?姒内核酸酶的結合。 2. 將可能的位置比對人類基因資料庫,刪除任何有相似 似性比對可以在麵所提供的觀了軟體 ^ WWW. ncbi· nlm· nih· g0v/BLAST/。 ”,.同址為 3. 合成通過上述檢驗的序列。Ambi〇n公司會選擇多個序列來檢驗。 淑ίΓ月所提反義寡核脊酸及slRNA抑制前述所提的多胜肽生成",進而抑 上、,物雖。另外,表現抑侧,如前述所提反餘贿酸及“腿等, σ p制本發明所提的蛋白活性。因此包含反義寡核替酸及si繼的植合物, 可用來治療PRC或PIN。 另外可以利用化合物來結合及抑制基因產物的功能。如利用抗體结 合過度表現的基因產物。 本發明所提的抗體,特別指與正調控標記基因所編碼的蛋白相結合 者:或其片段。該抗體是指有特殊結構的免疫蛋白,只會專一性地與其來 源抗體結合(如正調控的基因產物),或是相關蛋白。該抗體可能僅是一片 段或是修飾品,只要是能與標記產物結合。例如,抗體片段可以是阼匕 F(ab’)2, Fv,或是單-Fv(scFv),其中來自η及L的Fv片段可以用合適的 連接子相結合(Huston J· S. et al· Proc· NatL Acad· Sci· U S A· 85.5879-5883 (1988))。或者是用酵素,如木瓜酶(卿ain)或胃蛋白酵素 (pepsin),來產生片段。或者將該片段的序列接合到合適的載體,送入合 適佰主細胞來表現(請參見C〇 M· S· etal. J. Immunol. 152:2968-2976· (1994); Better Μ· and Horwitz A· H. Methods Enzymol· 178:476-496 (1989); Pluckthun A. and Skerra A. Methods Enzymol. 178:497-515 (1989); Lamoyi E. Methods Enzymol. 121:652-663 (1986); Rousseaux J. et al. Methods Enzymol. 121:663-669 (1986); Bird R. E. and Walker B. W· Trends Biotechnol· 9:132-137 (1991))。 抗體可以接合多種的分子,如聚乙二醇(pEG)。本發明也提供此種抗 體。該修飾抗體可以用化學方式來生成。該方法也是熟知的技藝。 抗體也可以是一嵌合抗體,由非人體抗體的可變區與人體的固定區組 成,固定區還可以是;含有互補決定區①DR)的人體化抗體、人體抗體的框 22 200418988 架區(FR)、及固定區。該抗體可以用已知的技術來產生。 針對癌細胞内專一分子的癌症治療,已在臨床發展及抗癌藥物上證 實,如治療乳癌的曲妥組單抗(trastuzumab (Herceptin)),治療慢性淋巴 癌的依麥替尼布(imatinib methylate (Gleevec)),治療非小細胞肺癌 (NSCLC) 口服新藥gefitinib (Iressa),以及治療B細胞淋巴癌或套狀細胞淋 巴瘤(mantle cell lymphoma)的抗CD-20單抗“美羅華” (Mabthera)或稱 Rituximab (Ciardiello F, Tortora G. A novel approach in the treatment of cancer: targeting the epidermal growth factor receptor. Clin Cancer Res. 2001 Oct;7(10):2958-70. Review. ; Slamon DJ,
Leyland-Jones B, Shak S, Fuchs H, Paton V, Bajamonde A, Fleming T, Eiermann W, Wolter J, Pegram M, Baselga J, Norton L. Use of® chemotherapy plus a monoclonal antibody against HER2 for metastatic breast cancer that overexpresses HER2. N Engl J Med. 2001 Mar 15;344(ll):783-92.; Rehwald U, Schulz H, Reiser M, Sieber M, Staak JO, Morschhauser F, DriessenC, Rudiger T, Muller-Hermelink K, Diehl V, Engert A. Treatment of relapsed CD20+ Hodgkin lymphoma with the monoclonal antibody rituximab is effective and well tolerated: results of a phase 2 trial of the German Hodgkin Lymphoma Study Group. Blood. 2003 Jan 15;101(2):420-424. ; Fang G, Kim CN, Perkins CL, Ramadevi N, Winton E, Wittmann S and Bhalla KN. (2000). Blood, 96, φ 2246-2253·)。上述藥物較傳統抗癌藥物有效,因為它們只針對轉形細胞。 因此,這些藥物不僅增進患者的存活機會及生活品質,也證實了分子層次 的癌症治療觀念。另外,藥物可以與化療用藥合併使用(Gianni L. (2〇〇2). Oncology, 63 Suppl 1, 47-56. ; Klejman A, Rushen L, Morrione A,
Slupianek A and Skorski T· (2002). Oncogene, 21, 5868-5876·)。因 此,未來的癌症治療方向,可能為傳統用藥與目標專一性的藥物合用,如 針對血管生成癌或侵略性癌。 操作方式可以分為體外或試管内(如培養細胞於該試劑),或是活體内 (如給予個體試劑)。給予-蛋白或蛋白組合,或是一核酸分子或其組合, 23 200418988 藉此平衡表現異常基因的活性及表現量。 表現表現量或活性升高的疾病,可以給予治療劑枯抗過度 表現基錄。該治療目的是為了治癒或是預防。 物、療r方t包含 =胜肽,或表現量過低基因的相似物、衍生 的校r . r、1 U、現里過夕基因的抗體;(i⑴能編碼表現量過低基因 區;^j、Lvii能損壞的反義核酸或核酸’如插入一個或多個基因的轉譯 啦料&ΛΑ(εΐΚΜ) ’(V1)調奸(如抑侧、激制及括抗劑, 刪合物之間的交互作用。該功能受損的反義分子用來 244: 1288^ 1 太刀子的功此’利用同源重組方式,請參見Capecchi, Science Ζ44· 1288-1292 1989)。 激動=為活性較低的疾病,可以給予_來增加活性,如使用孀 物、了治癒或是預防。藥劑可以是多胜肚,相似物、衍生 月奴寺寻,或是一激動劑來增加其生物可受性。 表現量的增減變化可以用下列方式測量,定 樣本(如由生檢組織)以及體外測請或多‘量、= 驗(如^方的=。本領域所熟知的方法包括,但不限於’免疫試 的’免疫沉殿法、接著之sds聚丙酿胺電泳分析、免疫細 糊峨、墨麟、原繼法等)以 t防性的治療是在病狀發生祕行,藉此獅或延緩疾病。 治療性的方法是將藥劑與細胞接觸,該藥劑調控表現異常的基因活 性。、y調控蛋白質活性之_包括核酸或蛋白質、這些蛋白質之天然配位 子夕胜月太擬胜肽、或其他小分子。例如,藥劑能刺激可區別其表現不 足之基因的一個或多個蛋白質活性。 #本發明揭露一種用以治療或預防一個體之PRC之方法,包含給予個體疫 ,盆該疫苗,括由PRC 1—88, 296 321, 458—537序列所編碼之多胜狀,或 是其有效片段,或是編碼該多胜肽之聚核苷酸或其片段。給予該多胜肽可 誘導個,抵抗癌症。為達此目的,由pRC卜88,296_321,458—537序列所 、’扁馬的夕胜狀或其免疫有效片段,或是編碼該多胜狀之聚核脊酸等,皆可 24 200418988 以使用。多胜肽或其免疫有效片段,皆是治療PRC或pIN的有效疫苗。在某 些情況下,蛋白或片段可以結合到τ細胞受體或是抗原表現細胞(APC),如 巨噬細胞、樹突細胞(DCs)、或B細胞。其中又以樹突細胞最適合。 本發明揭露一疫苗,用以治療或預防PRC,該疫苗能誘導個體抵抗癌症 的能力。由PRC 1-88,296-321,458-537序列所編碼之多胜肽或其片段建 議為HLA-A24或HLA~A*0201限制抗原決定位,其誘導強烈且專一性的免疫反 應以抗表現PRC 1-88,296-321,458-537之PRC或PIN細胞。本發明也因此 包含使用多胜肽來誘導抗癌免疫反應。一般來說,抗癌免疫反應包含如下: -誘發細胞毒性淋巴球抗腫瘤, -誘發辨識癌細胞的抗體,
-誘發抗癌細胞激素之生產。 I 因此,當一蛋白接種至一動物時,若能誘發免疫反應,該蛋白則有抗 癌免疫力。該能力能藉由活體、試管的免疫反應來觀察。 例如’測量細胞毒性τ淋巴球(CTL)的方法已是熟知技藝。外來物質一 旦進入活體,則會藉由APCs來表現在T或B細胞上。此時,T細胞會分化細胞 毒性T細胞,且複製(τ細胞的活化)。因此,CTL的誘發可以藉APC呈現該多 胜肽於T細胞來評估。此外,APC能活化CD4+ T cells,CD8+ T cells,巨 噬細胞,嗜伊紅白血球,自然殺手細胞。CD4+ τ cells,CD8+ T cells也 能用來評估胜肽引發免疫反應的能力。 使用DCs來當作APC,藉此來評估CTL的誘發能力,已是熟知的技藝。DC 是APC中’具有最強的CTL誘發能力。此方法是將受測多胜肽與j)C接觸,之 後將此DC與T細胞接觸。測量T細胞是否有毒性能力推知受測多胜肽的誘發 能力。抗癌的CTL活性,可以用51Cr標記的癌細胞溶解做為指標。另外,使 用3H胸腺嘧啶接受能力或LDH(乳糖去氫酶)來評估癌細胞損害層度,已是熟 知技藝。 … 除了DC細胞以外,血中白血球單核細胞(pbmcs)也可做為apc細胞。CTL 的誘發亦可以增加,當培養PBMCs於GM-CSF及IL-4的環境下,或是培養於鑰 孔蟲戚血藍蛋白(KLH)以及IL-7。 經測試後證實,具有CTL活性的多胜肽是含有DC或是CTL誘發力。因此, 25 200418988 能誘發CTL抵抗癌細胞的多胜肽,能做為抗癌疫苗。另外,就也能誘發见 抵抗癌細胞,亦可做為疫苗。CTL本身因為受到Apc的辭,因而 1 = ,性,也能做為疫苗。上述利用抗癌免疫方式的治療方二嶋細: 疫治療。 -般而言’利用多胜肽行細胞免疫治療時,結合多樣的結構且與财 觸,能夠增加其效力。因此,當使用蛋白片段來激發D(:時,可以使用混合 的片段。 /tb。 另外,多胜肽誘發抗癌免疫的反應,可以利用抗癌抗體的產生來證與。 例如,當動物接種蛋自後產生抗體,若抗體能抑體内癌細胞的生^, 則證實該多胜肽具有抗癌免疫能力。 、 抗癌免疫可以藉本發㈣疫絲騎,依此可m療或預隨C或籲 PIN。冶療或預防的方法有抑制癌細胞的生長、退化、及停止發生。其它有 =少致死率,血中癌_標記、減緩可測定的徵狀等。上述絲或預:皆 需有統計上的意義。例如,使用疫苗來治療或預防,相較於沒有用疫苗者白, 至J要有5%或更低的指標。如使用史氏t—test,the Mann—呢忖 或是ANOVA。 秘丄上述具有免疫能力的蛋白或其載體,可以與增效劑(ad扣柯於)合用。 ^放蜊的功用,在於能增加具免疫能力蛋白的免疫反應。包含有霍亂毒素、 J門式菌毒素、明礬等。此外,本發明的疫苗可以於合適的藥學載體合用。 =水、生理食塩水、磷酸鹽緩衝液、培養液、等等。疫苗也可以含有σ稃定 劑:严孚劑、Ρ方腐劑、介面活性劑、等等。疫苗可以全身注射或是局部^。· 給藥方式可以是單次,或是多次。 、§使用APC或CTL做為疫苗時,癌細胞可以被治療或預防,藉由活體外 f式。更專一地,接受治療或預防的患者PBMCs,經由收集與多胜肽與體外 妾觸,活化APC或CTL,再注入患者體内。APC可以利用載體來誘發,該載體 栽睪出的夕胜肽於體外進入。試管内誘發的apc或CTL可以在給藥前選 、出來。藉由選殖及培養具有損害目標細胞活性的細胞,細胞免疫治療可 以有效地施行。另外,本發明挑選的ApT4CTL,除了用於個體本身外, 可用於其它個體。 、 26 200418988 慝 另外,本Μ亦提供絲療或細敝長賴( 抑制PRC或PIN的藥學組合物 藥學組合物包含適於口服、栓劑、鼻用、塗抹、 =:=吸入及™ 適於口服的組合物含有膠囊、cachet或藥片,内含有有效劑量。另外 27刀1顆粒及Tf,懸/子液、礼化液。給予的有效81 (tolus) 舐劑(electuary)或糊齊!。口服用的藥片及膠囊含有賦形劑,結 劑、潤滑劑、分散劑及潤濕劑。藥片是用壓縮或模製,最佳地盘一或種< f組合。壓縮的藥片已合適的機器壓縮,有效成分如藥粉或顆粒能自由 級動,祕性地與結合劑、潤滑劑、稀釋劑、介面活性及分散劑混人。模 製的藥片可以用合適的機器,混合粉末化合物,關性液體稀釋劑來^。、 樂片可以越知的技藝來包埋。口服㈣製備可以是水雜或是油性縣浮 液、乳化劑、㈣、關(eUxirs胸式,或是能水或是其它合適^配 合使用的乾燥品。該液體的製備可以含有傳統填加物,如懸浮劑、乳 非液態载體(如可食用油),或防腐劑。藥片可以選擇性地製備,^ 效成份能緩慢及可控製的釋放。—套藥片含有每天可願的藥片。,、 注射用的組合物包含水溶液及非水溶液無菌液,内含有抗氧化劑 衝劑、液_(bacteri⑽ats),以及維持藥劑在患者▲中等張強度的^ 質:水溶液赠水驗無難浮液,包含_瓶增賴。触合物可以 是早-早①或是多鮮元’如密封的小管或試管歧存於冷床乾燥 (ly_ilized)下只須要無菌液载體在使用前加人,如食塩水,注射液等。 組合物可以是連續地輯。料製備的注驗賴浮液,可以用益菌粉、 膠囊、及前述的藥片製備。 … 直腸栓劑包含標準載體,如可可油、聚⑽甘油。口部用的塗泳组合 物’如舌下腺(sublinguai)及頰側(buccal),包含# 1〇咖卿,含有有效 成份於芬香基質内(果糖,阿拉伯膠(acacia),山羊刺樹膠(加⑽她)), 27 200418988 有效絲於明I、甘油、果糖、阿拉伯膠(acaeia)等基質的錠劑。 是液體噴劑或是藥粉,或是滴劑。滴劑可以是液態或是 非液怨的,含有一或多種分散劑、溶劑、或懸浮劑。 ,用吸人方式日^,藥物利用充氣機(insufflator)、喷霧式 力㈣^式給^ °壓力包可以含有合適的推進劑,如二氯 二、元’二魏甲烧、二氣四氟乙烧、二氧化碳、或其它。使用壓力包 纣,可以附有一壓力計來測量使用量。 使用吸人方式時,組合物可以用乾燥粉的樣式,如混合藥粉予合適的 土貝,·如乳糖及澱粉。該藥劑可以為單元藥劑形式,與膠囊、匣 (cartridge) ^ . ^>&(blister)f ^ ^ 其它組合物包含可植入式儀器及吸咐塊,用來釋放藥劑。 《 若有須要,上述組合物可調鶴加強釋放有效成份。該藥學組合物可 含有其它,抗生素、免疫抑制劑或防腐劑。 值得注意的是,除了前述成似外,本發明敝合物可时有傳統試 劑,如芬香試劑。 較佳的組合物單元含有有效劑量,或合適的比例。 前述的組合物,如多胜肽及有機化合物,以口服或注入方式每天每公 斤給予〇· 1到250毫克。成人使用的劑量是每天每公斤5毫克到17· 5克, 較仏地疋母天母公斤5耄克到1〇克,最佳地是每天每公斤1〇〇毫克到3克。 使用的藥片或是其它形式,含有單—有效劑量,或是含 5〇〇毫克,或是1〇〇到500毫克。 使用的劑量依據許多因素,如年齡、性別、疾病特性、嚴重程度等。 治療的方式也會因狀況及嚴重程度改變。 本發明將由以下實施例闡釋,但不用於限定本發明。下例的例子闡述 檢定在PRC或PIN細胞内表現不同的基因。 實施例1:測試樣本的製備 患者組織及正常組織經評估後’檢定表現不同的基因。該方法如下。 患者,組織樣本及雷射補捉微切割(LCM) PRC的樣本,從26個患者上經攝護腺切除術取得,包含攝護腺中的非 28 200418988 癌細胞。攝護腺腺癌及嚴重的PINs可以由病理專科醫師來診斷。洲個患者 中,20個有癌症’ 1〇個有嚴重的PINs,提供足夠的rna量及品質來進行微 陣列分析。表格1是臨床上及病理上的資料。樣品皆存於TissueTek OCT 培養液(櫻花牌)以及-80°C下。冷凍的組織由冷凍組織切片機分成8-am的 切片,並用蘇木紫及伊紅(hematoxylin and eosin)來分析區域。為防止癌 細胞與非癌細胞混合,使用製造商提供的程序,經修飾後,用EZ Cut LCM 系統(SL Microtest GmbH)來製備樣本。 ^1臨床病I邑特徼 病例 年齡 ---- —PSA (ng/ml) 1 76 17.0 2 73 14.0 3 73 59.2 4 56 8.6 5 73 1.8 6 61 8.9 7 71 11.4 8 69 9.5 9 66 9.6 10 62 6.7 11 56 35.0 12 66 12.0 13 65 4.1 14 77 12.3 15 69 10.4 16 68 14.1 17 NA(b) 10.5 18 ΝΑ ΝΑ 19 63 4.5 20 67 9.8
分期 %〗刀割損傷 pT2aN0M0 rp(a) pT2aN0M0 T pT3aN0M0 T pT2bN0M0 T pT2aN0M0 PIN pT2bN0M0 T pT2bN0M0 T pT2aN0M0 PIN pT3aN0M0 T pT2aN0M0 PIN pT3bN0M0 PIN pT2bN0M0 T pT2bN0M0 T pT2bN0M0 T,PIN pT2bN0M0 T pT3aN0M0 T, PIN pT2bN0M0 T NA T pT2bN0M0 T pT3aN0M0 T
29 200418988 21 63 12.4 22 73 13.0 23 75 10.0 24 67 3.3 25 64 5.7
PT3N0M0 T pT3bNlM0 T pT2aNlM0 Τ, PIN pT3aN0M0 Τ, PIN pT2bN0M0 PIN 38.0 pT3aN0M0 pin (a)rp " -~ ——~ ---------- T代表攝護腺癌(b)NA :未取得 抽取RNA及T7-促進子RNA增幅 經雷射補捉細胞的全RM量經抽取後置入350 “ 1 RLT溶解緩衝液 (QIAGEN)。經30單位的DNase I(QIAGEN#丨單位的抑制劑存在下 ΠΌΥ0Β0, 〇saka,japan),至溫反應3〇分鐘,以除去所有·Α。再經7〇它,修 10分鐘的抑制,RNAs使用RNeasy Mini Kit(QIAGEN)來抽取,之後這些受 DNase處理的RNAs用T7-促進子RNA增幅方式來增加量。經過二次增幅, 每個樣本可以得到50-l00/zg增幅RNA(aRNA)。癌細胞或非癌細胞中θ21 g的增幅aRNA,於Cy5-Dctp及Cy3-dCTP的存在下,再經反轉錄反應。 製備cDNA徵陣列 基因體cDNA徵陣列是含有23,040 cDNAs,選自UniGene database(build#131) ^ National Center for Biotechnology Information (NCBI)。簡單而言,該cDNAs是由反轉錄聚核酶反應,使用純化自不同人 體器官的poly(A)+RNA做為模板;增幅的長度約為2〇〇至ii〇〇bp,不含有 重複及poly(A)序列。增幅的產物以二重複的方式點在type—7玻璃片上 (Amersham Bioscience),使用 Array Spotter Generation III(Amersham
Bioscience)。每一片含有52守護基因,用來標準化不同螢光染劑的強度。 雜交及收取資料 又 雜交及清洗的方式皆依據之前所述,由自動玻片處理器執行(Amersham
Biosciences)(17)。雜交信號的強度由ArrayVision電腦軟體計算 (Amersham Biosciences),且去除背景值。每一個Cy3—及Cy5信號的強度 由52個守護基因來標準化。每一個表現量的閥值是由背景波動來計算。當 Cy3-及Cy5信號的強度低於閥值時,該基因視為無表現。Cy3—及Cy5信號 30 200418988 強度比率做為相對表現比率。其它的基因使用原始資料計算Cy3—及Cy5信 號強度比率。 實施例2 ··檢定PRC相關基因 檢定到的PRC或PIN相關基因由下列方式分析。首先,在大於5〇%的案 例中’相對表現量可被計算’或有正調控、貞難的基因先被挑選。每個 基因依其Cy5/Cy3強度比例可以分成四個範疇:正調控(在大於50%的資 料中,表現比例大於3.0 ;⑵負調控(在大於5〇%的資料中,表現比例小於 女0.33) , (3)無變化(在大於50%的資料中,表現比例大於介於〇· 33到 3· 0) ’(4)未表現者(或表現量低於閥值)。上述的範疇,可以定義來測量一 些基因’其表現比例的改變為常見,《是對某一些次群有專一性。要侧 PRC或PIN細胞内,常見的正調控或負調控的基因,要從μ,·個基因的籲 表現特徵來篩選,其中大於5G%的PRC案例中(如範轉⑴,⑵,〇r⑶), 表現比例大於3. 0或小於〇. 33。 右PRC或PIN内常見的正調控,或是負調控基因被檢定後,基因由以 下方^分析。更進-步,當PRC或PIN内常見的正調控,或是負調控基因 被檢定基因由以下方式分析。首先,在大於5〇%的案例中,相對表現量 可被什异,或有正調控 '負調控的基因先被挑選。每個基因依其Cy5/Cy3 強度比例可以分成四個範曹··⑸正調控(在大於5〇%的資料中,表現比例大 於5.0,(6)負調控(在大於5〇%的資料中,表現比例小於安〇幻;(乃無變 ,(在大於50%的資料中,表現比例介於〇· 2到5· 〇);⑻未表現者(或表現 塁,於閥值)。上述的範蜂,可以定義來測量一些基因,其表現比例的改變 為常見’或是對某-些次群有專一性。要侧pRC或ρΐΝ細胞内,常見的 正調控或負調控的基因,要從23,〇4〇個基因的表現特徵來篩選,其^大於 50=PRC案例令(如範蜂⑸,⑹,〇:Κ7)),表現比例大於5 〇或小於〇 2。 檢定PRC細胞内臨床上相關基因的表現特徵 在PRC細胞内利用微陣列析約23, 〇〇〇個基因。若Cy5及Cy3訊號低於 閥值者,將被排除在外。8〇個在piN及pINs的正調控基因,其表現量比例 大於3·0,被檢定出來(見表3),207個負調控基因,其表現量比例小於 〇· 33,亦被檢定出來(見表4)。26個pRC的正調控基因,其表現量比例大 31 200418988 於5· 0,亦被檢定出來(見表5),136個負調控基因,其表現量比例小於〇· 2 , 亦被檢定出來(見表6)。 在正調控基因中,α-甲乙醯輔酶A[外]消旋酶(AMACR)已被報導為過表 現於(13)。另外,正調控元素包含代謝用基因、訊息傳導、轉錄因子、細 胞週期、致癌基因、細胞吸咐、細胞骨架等。嗅覺受體,第族,亞科E, 第2成員(OR51E2),攝護腺專一性的G-蛋白結合受體(psgr),以及在PRC 内過表現基因l(POVl)已被報導在PRCs内是過表現(Luoetal·,2002; Cole etal·,1998; Xuetal·,2000)(見表 5)。 80個在PIN的正調控基因,其表現量比例大於& 〇,被檢定出來(見表 乃’ 155個在PIN的負調控基因,其表現量比例小於〇. 2,亦被檢定出來(見 表 8)。 ( <為證實微陣列分析的基因表現結果,本發明使用半定量反轉錄聚合反 ,來確定。其中有四個正調控基因被選來執行。每一個樣本的aRM取3//g 來<文半疋里反轉錄聚合反應,使用隨機引子(p〇che)及II <Xife Technologies,Inc·)。每一組cDNA經由稀釋後,使用表2的引子 來進仃,轉錄聚合反應。肌動蛋白(ACTB)做為内部對照組。反轉錄聚合反 應經由最佳化後,確定產物的強度在增幅的線性範圍内。 比較4個正調控基因的表現比例(AMACR,H〇XC6,p〇vl,ABHD2 ^k!C20〇RF1〇2),其表現量在大部份的例子中是過度表現,其結果與微陣列 刀析中大部份受測例子相似(第1圖)。該結果證實本發明檢定pRC細胞内 正调控基因的可信度。 癌及PINs中正調控某因 PRC 編號 —---— 登錄號 --_ Hs. 代號 名稱 1 已知功能 M93107 76893 BDH 3—經基丁酸去氫酶(心臟,粒 2 3 U89281 L41559 11958 3192 R0DH PCBD 線體) 3—羥基類固醇表異構酶 丙二酮四氫喋呤合成酵素/配 32 200418988 4 AJ130733 128749 AMACR 5 S77410 89472 AGTR1 6 AI080640 413945 AGR2 7 丽—000487 88251 ARSA 8 AF071202 139336 ABCC4 9 丽—000060 78885 BTD 10 D90276 12 CEACAM4 11 AB030905 406384 CBX3 12 BF106962 20415 FAM3B 13 AI817172 29423 C0LEC12 14 丽—005436 288862 D10S170 15 U31556 2331 E2F5 16 AF039918 80975 ENTPD5 17 L10340 2642 EEF1A2 18 AI984005 380785 XP0T 19 丽一000166 333303 GJB1 20 AF040260 105435 GMDS 21 AF236056 182793 G0LPH2 22 AF055013 203862 GNAI1 對化輔因子肝細胞核因子1 alpha(TCFl) alpha-甲乙醯-C〇A外消旋酶 第1型血管收縮素Π接受器 前端成分2同源種(Xenepus laevis) 芳香硫酸酶(arylsulfatase A) ATP-結合套組,亞-家族 C(CFTR/MRP),成員 4 生物素酶 Φ 癌胚抗原相關的結合分子4 chromobox 同源種 3(HP1 gamma同源種,果蠅) 染色體21開放讀碼區11 膠原凝集素亞族成員12 DNA片段染色體1〇(獨特)17〇 E2F轉錄因子5,pl30-結合 外核苷三磷酸二磷酸水解酶5 真核轉譯延長因子1 alpha exportin,tRNA(核傳送因子 for tRNAs) 通道蛋白質,beta 1, 32kDa(間隙連接蛋白32, Charcot-Marie-Tooth 神經 系病,X-連結) GDP-甘露糖4, 6-脫水酵素 高爾基體磷酸蛋白2 鳥甘酸結合蛋白(G蛋白), 33 200418988
NM—000856 75295 GUCY1A3 S82986 820 H0XC6 U42408 18141 LAD1 M88468 130607 MVK D56064 167 MAP2 AI302799 68583 MIPEP AB002387 118483 MY06 R22536 220324 FLJ13052 AI246554 31547 NDUFA8 AA858162 124673 NCAG1 AI805082 303171 0R51E2 U79240 79337 PASK BF690393 83383 PRDX4 AK025460 286049 PSA NM_021200 380812 PLEKHB1 L14778 272458 PPP3CA 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 AF044588 344037 PRC1 NM—006765 71119 N33 ΝΜ_012342 78776 NMA M77836 79217 PYCR1 alpha活性抑制多胜肽1 鳥苷酸環化酵素1,可溶, alpha 3 同源盒C6 ladinin 1 沒曱戊酸激酶(mevalonate激 酉母)(mevalonic aciduria) 微管結合蛋白2 粒線體中間肽酵素 肌球蛋白VI NAD酵素 _只脫氫酵素(泛醌)1 alpha 亞複合物,8,19kDa NCAG1 嗅覺受體,家族51,亞科E, 成員2 PAS領域含絲胺酸/經丁胺酸 激酶 peroxiredoxin 4 碟絲胺酸轉胺酶 0 含pleckstrin同源種y領域, 家族B(evectins)成員1 蛋白質磷酸酶3(正式為2B), 催化亞基,alpha異型 (calcineurin A alpha) 分裂細胞1的調控蛋白 假定的攝護腺癌抑制子 假定的通膜蛋白 吡咯啉-5-羧基late還原酶1 34 200418988 43 D42063 199179 RANBP2 RAN結合蛋白2 44 AF064824 103755 RIPK2 受體-作用絲胺酸-經丁胺酸 激酶2 45 N78357 302136 RIMS1 突觸細胞膜外吐作用 46 L10333 99947 RTN1 神經内分泌特異蛋白 (reticulon 1) 47 Y18418 272822 RUVBL1 RuvB-類似 1(E. coli) 48 U80456 27311 SIM2 單心同源種2(果蠅) 49 AF269150 8203 SMBP SM-11044結合蛋白 50 U17566 84190 SLC19A1 溶質結合子家族19(葉酸傳送 酶),成員1 彳 51 D88308 11729 SLC27A2 >谷質結合子家族27(葉酸傳送 酶),成員2 52 AF007216 5462 SLC4A4 浴質結合子豕族4,碳酸氫鈉 輔傳送子,成員4 53 AD001528 89718 SMS 精素合成酶 54 M32313 552 SRD5A1 類固醇-5-alpha-還原酶, alpha 多胜肽 1(3-oxo—5 alpha-類固醇delta 4-去氫 酶alpha 1) ^ 55 L15203 82961 TFF3 三葉因子3(腸) 56 M91670 174070 E2-EPF 泛激素結合子蛋白 57 AW135763 未知功能 6375 HT010 不明下視丘蛋白HT010 58 AA206763 7991 C20orfl02 染色體20開放讀碼區1〇2 59 AI989530 240845 DKFZP434D146 DKFZP434D146 蛋白 60 AI192351 76285 DKFZP564B167 DKFZP564B167 蛋白 61 AI133467 95612 ESTs 62 H17800 438858 ESTs 35 200418988 63 AI732103 ESTs 64 AI671006 5794 ESTs,中度類似假設蛋白 FLJ20234[人類][人類] 65 AA420675 188826 ESTs,中度類似 RL39_HUMAN 60S核糖體蛋白L39[人類] 66 AI700341 110406 ESTs,稍微類似假設蛋白 FLJ20489[人類][人類] 67 BF057183 355809 ESTs,稍微類似男性專一性致 死性3-類似1異型 68 H05758 355684 ESTs,稍微類似神經絲蛋白 [人類] { 69 AA743348 120591 人類 cDNA FLJ35632 fis,無 性繁殖系 SPLEN2011678. 70 AA679304 5740 人類 cDNA FLJ40165 fis,無 性繁殖系 TESTI2015962. 71 AK027019 381105 人類 cDNA: FLJ23366 fis,無 性繁殖系HEP15665. 72 AA994004 128790 人類mRNA全長插入的cDNA無 性繁殖系 EUROIMAGE 1628928 73 H09779 283851 人 類 mRNA; cDNA DKFZp547G036(源自無性繁殖 系 DKFZp547G036) , 74 BE254330 14846 人 類 mRNA; cDNA DKFZp564D016(源自無性繁殖 系 DKFZp564D016) 75 AL157505 21380 人 類 mRNA; cDNA DKFZp586P1124(源自無性繁 殖系 DKFZp586P1124) 76 AI217963 434541 人類,無性繁殖系 36 200418988 IMAGE:4429946, mRNA 77 BF724600 22247 人類,無性繁殖系 IMAGE:5302158, mRNA 78 NMJJ12066 128702 20D7-FC4 假設性蛋白質20D7-FC4 79 AB029008 84045 FLJ20288 FLJ20288 蛋白 80 AK026325 235873 FLJ22672 假設性蛋白質FLJ22672 81 R55332 379386 LOCI 15286 假設性蛋白質LOCI 15286 82 H12084 31110 MGC34827 假設性蛋白質MGC34827 83 D29954 13421 KIAA0056 KIAA0056 蛋白 84 AB020637 167115 KIAA0830 KIAA0830 蛋白 85 AB023157 131945 KIAA0940 KIAA0940 蛋白 86 AB032981 102657 KIAA1155 KIAA1155 蛋白 87 AB032983 21894 KIAA1157 KIAA1157 蛋白 88 AB033091 446390 KIAA1265 KIAA1265 蛋白 表4常見攝護腺癌及PINs中負調控基因 PRC 編號 登錄號 Hs. 代號 名稱 已知功能 89 NM一002526 153952 NT5E 5’ 一核苷酸酵素,外(CD73) 90 NM一005159 118127 ACTC 肌動蛋白,alpha,心肌 91 NM—001615 378774 ACTG2 肌動蛋白,gamma 2,平滑肌, 腸道 92 AL117643 99954 ACVR1B 弟IB型活化素a受體 93 BG105547 324470 ADD3 adducin 3(gamma) 94 AF245505 72157 DKFZp564I1922 adlican 95 N74230 193228 AGXT2 丙胺酸-乙酸酸轉氨酶2 96 K03000 76392 ALDH1A1 乙醛脫氫酵素(aldehyde dehydrogenase)l 家族,成員 37 200418988 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 M28443 300280 AMY2A AF286598 9271 AM0T NM一000700 78225 ANXA1 D00017 217493 ANXA2 丽—001155 118796 ANXA6 AK027126 160786 ASS AA054346 32168 AUTS2 AL117565 6607 AXUD1 AB004066 171825 BHLHB2 M14745 79241 BCL2 S67310 69771 BF M69225 198689 BPAG1 X63629 2877 CDH3 R45979 252387 CELSR1 111 112 113 AF134640 7235 CACNG3 D17408 21223 _ K01144 84298 CD74 114 115 丽一001878 183650 CRABP2 NM_002996 80420 CX3CL1 A1 殺粉,alpha 2A;膜臟
Angiomotin 膜聯蛋白A1 膜聯蛋白A2 膜聯蛋白A6 精胺酸琥珀酸合成酶 自閉症相關因子2 AXIN1正調控1 含基本螺旋-環-螺旋領域,第 B類,2 丨 B-細胞CLL/淋巴瘤2 B-因子,properdin 大皰性類天皰瘡抗原1, 230/240kDa 約黏蛋白3,type 1,P-妈黏 蛋白(胎盤) 妈钻素,EGF LAG seven-pass G-type 受體 1 (flaming0 同源 種,果蠅) 鈣通道,voltage-依賴, gamma亞單元3 鈣結合蛋白1,基本,潤滑肌 肉 CD74抗原組織相容性復合體 固定多胜肽,class II抗原一 相關) 細胞内視黃酸結合蛋白2 化學活性受體化學活性 38 200418988 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 116 117 118 119 120 U16306 81800 CSPG2 AV648364 356416 CBX7 AF000959 110903 CLDN5 NM_001831 75106 CLU L02870 1640 C0L7A1 AF018081 78409 C0L18A1 丽—001733 1279 C1R J04080 434029 CIS K02765 284394 C3 AF007162 408767 CRYAB L12579 147049 CUTL1 丽」)00076 106070 CDKN1C BF183952 412999 CSTA NM—004078 10808C CSRP1 J04813 104117 CYP3A5 AF070590 90869 LOC90957 (C-X3-C motif)配位子 1 硫酸軟骨素蛋白多醣硫酸維 骨素蛋白多醋2(versican) chromobox 同源種 7 claudin 5(缺乏通膜蛋白於 先天性鰐咽閉合功能不全症 候群) 凝聚素(SP-40,40,sulfated glyco蛋白2,睪固酮抑制的 攝護腺訊息2) 膠原蛋白,第VII型,alpha^ 1(表皮分解性水皰症,營養 不良性,顯性及隱性) 膠原蛋白,第XVIII型,aipha 1 補體1,r亞組合物 補體1,s亞組合物 補體3
結晶性,alpha B cut-類似1,CCAAT位移蛋白 (果蠅) 週期素依賴性激酶抑制齊j lC(p57, Kip2) 半胱胺酸蛋白酵素抑制劑 ACstefin A) 富含半胱胺酸甘胺酸蛋白i 細胞色素P450,家族3,亞 科A,多胜肽5 DEAH-盒RNA/DNA解旋酵素 39 200418988 132 ΝΜ—004394 75189 DAP 133 D83407 156007 DSCR1L1 134 L11329 1183 DUSP2 135 AW002941 339283 ERAP140 136 J04162 176663 FCGR3A 137 Μ87770 278581 FGFR2 138 Χ02761 287820 FN1 139 丽—001456 195464 FLNA 140 U60115 239069 FHL1 141 L42176 8302 FHL2 142 U28963 380901 GPS2 143 AW949747 169946 GATA3 144 ΑΚ021685 234896 GMNN 145 BF115308 132760 G6PT1 146 NMJ02083 2704 GPX2 147 ΝΜ_002084 386793 GPX3 148 ΑΑ290738 301961 GSTM1 149 ΝΜ—002081 2699 GPC1 150 Μ55543 171862 GBP2 151 丽—000186 250651 HF1 152 ΑΚ000415 250666 HES1 153 ΑΑ522530 111244 RTP801 154 ΑΑ490691 421136 HOXD11 AAM73547 死亡相關蛋白 唐氏症重要區域基因卜類似 1 ' 雙重專一性磷酸酵素2 内質網相關蛋白14〇 kDa Fc片段IgG,低親和性^匕 受體(CD16) 5 纖維牙細胞生長因子受體2 纖維結合素結合蛋白1 絲蛋白A, alpha(肌動蛋白結魯 合蛋白280) ° 4與1/2 LIM領域1 4與1/2 LIM領域2 G蛋白路徑抑制子2 GATA結合蛋白3 geminin,DNA複製抑制劑 葡萄糖-6-填酸酵素,輪$ (葡萄糖-6-磷酸)蛋白1 殼胱甘肽過氧化酶2(腸胃道 殼胱甘肽過氧化酶3(血漿) 麩胱甘S-轉酶Ml glypican 1 鳥嘌呤結合蛋白2,干擾素〜 誘發 Η因子1(補體) 毛及分裂增強子1,(果蠅) HIF-1 反應 RTP801 同源盒D11 40 200418988 155 J02770 156 S81914 157 M87790 158 L08488 159 M31159 160 M59911 161 X52186 162 NM_006435 163 NM—002198 164 AF020201 165 M25629 166 X14640 167 X07696 168 NM.000422 169 Y00503 170 M21389 171 X03212 172 剛—000226 173 D14520 174 U07643 175 D37766 176 AW139663 177 AF002672 36602 IF 76095 IER3 102950 IGLJ3 32309 INPP1 77326 IGFBP3 265829 ITGA3 85266 ITGB4 174195 IFITM2 80645 IRF1 166154 JAG2 123107 KLK1 74070 KRT13 80342 KRT15 2785 KRT17 182265 KRT19 433845 KRT5
23881 KRT7 2783 KRT9 84728 KLF5 105938 LTF 75517 LAMB3 166254 VMP1 152944 LOH11CR2A 1因子(補體) 迅早期反應3 免疫球蛋白lambda結合3 肌醇聚填酸-1-填酸酵素 胰島素-類似生長因子結合蛋 白3 整合素,alpha 3(抗原 CD49C,841^3亞單元卩1^-3 受體) 整合素,beta 4 干擾素誘發透膜蛋白2(1-8D)鲁 干擾素調控因子1 jagged 2 kallikrein 1,腎/胰/唾腺 角蛋白13 角蛋白15 角蛋白17 角蛋白19 角蛋白5(單純性大庖性表皮 鬆 懈 症 ,φ Dowling-Meara/Kobner/Webe W r-Cockayne types) 角蛋白7 角蛋白9(表皮掌55角皮癥) Kruppe卜類似因子5(腸) 乳糖轉移素 血清層連蛋白,beta 3 類鼠濾泡直向同源物膜蛋白1 異質體性缺乏,11,染色體 41 200418988 AI814306 42438 LSM6 Z68179 77667 LY6E BE621666 296398 LAPTM4B M33906 198253 HLA-DQA1 K01171 409805 HLA-DRA M15178 318720 HLA-DRB4 BF697545 365706 MGP AW298180 2256 MMP7 AF017418 104105 MEIS2 BF971884 118786 MT2A NM_005928 3745 MFGE8 J05581 89603 MUC1 AA628530 405873 ISYNA1 J02854 9615 MYL9 AF005888 173162 NOC4 AA886412 69285 NRP1 L31881 35841 NFIX X75918 82120 NR4A2 M13692 572 ORM1 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 區域2,基因a
LSM6同源種,U6小細胞核RNA 相關(S. cerevisiae)
淋巴球抗原6複合物,基因 座E 溶素體相關蛋白透膜4 beta 組織相容性複合體,第Η型, DQ alpha 1 組織相容性複合體,第Η 型,DR alpha 組織相容性複合體,第iiU 型,DR beta 4 基質Gla蛋白 基貝金屬蛋白酵素 7(matrilysin, uterine)
Meisl,類髓外位病毒整合位 置1同源種2(鼠) 金屬硫蛋白2A 乳脂球-EGF因子8蛋白 枯液質1,穿透膜 肌-肌醇1-鱗酸合成酶A1 · 肌凝蛋白,輕多Μ月太9,調控 COX4之鄰位 神經菌毛素1 細胞核因子I/X(CCAAT一結合 轉錄因子) 細胞核受體亞科4,第A群成 員2 ’ 血清黏蛋白1 42 200418988 197 U90878 75807 PDLIM1 198 NM—005036 998 PPARA 199 AF035959 24879 PPAP2C 200 A 腦3723 18079 PIGQ 201 D00244 77274 PLAU 202 AF091434 43080 PDGFC 203 AF027208 112360 PR0ML1 204 AL045876 430637 PTGDS 205 BF510741 5648 PSMD9
206 M65066 1519 PRKAR1B 207 AW249758 96593 ARHF 208 X73427 75256 RGS1 209 U72066 29287 RBBP8 210 丽一003979 194691 RAI3 211 L20688 83656 ARHGDIB 212 X64652 241567 RBMS1 213 AA173755 301198 R0B01 214 AF132734 107394 SEC8 215 NM_004636 82222 SEMA3B PDZ 及 LIM 領域 l(eifin) 過氧化體增生活化受體 alpha 磷酸酵素第2C型 磷化肌醇多糖,第Q型 胞漿素元活化子,尿激酶 血小板生長因子C prominin-類似 1(鼠) 攝護腺素D2合成酶 21kDa(腦) 蛋白解體(pros〇me,φ macropain)26S 亞單元,非 -ATPase, 9 蛋白激酶,cAMP-依賴,調 控,type I,beta ras同源種基因家族,成員 F(絲狀偽族) ' G-蛋白調控子傳訊1 視網膜胚細胞瘤結合蛋白8 維他命A酸誘發3
Rho GDP解離抑制劑_ (GDI)beta RNA結合單元,單股作用蛋白 1 環形,軸突導引受體,同源種 1(果蠅) 分泌蛋白SEC8 sema領域,免疫球蛋白領威 (Ig),短基本領域,分 43 200418988 221 222 223 224 225 226
216 217 218 219 220 227 228 229 230 M93056 183583 SERPINB1 M13690 151242 SERPING1 丽—006456 288215 STHM AF070609 75379 SLC1A3 AF215636 5944 SLC11A3 U59299 90911 SLC16A5 Y08110 101657 S0RL1 M81635 160483 ST0M U15131 79265 ST5 BF514189 345728 S0CS3 AI423028 71622 SMARCD3 U21847 82173 TIEG U54831 75248 T0P2B S95936 396489 TF M77349 118787 TGFBI 泌,(semaphorin)3B 絲胺酸(半胱胺酸)蛋白酶抑 制劑,clade B(ovalbumin), 成員1 絲胺酸(半脱胺酸)蛋白酶抑 制劑,clade G(C1抑制劑), 成員1 唾液酸轉酶 溶質結合子家族1(神經膠細 胞高親和性麵胺酸轉移子), 成員3 i 溶質結合子家族11(氫離子一 結合二價金屬離子轉移子), 成員3 >谷質結合子家族16(單緩酸轉 移子),成員5 sort il in-相關受體,包含 L(第DLR型)A重複 1 致腫瘤之抑制作用5 細胞激素抑制子3 SWI/SNF相關,基質相關,肌動 蛋白依賴性基因體調控子,亞 科d,成員3 TGFB誘發早期生長反應 拓樸異構酵素(DNA) II beta 180kDa 運鐵蛋白 轉形生長因子,beta-誘發, 44 68kDa 231 NM.003186 433399 TAGLN Transgel in 232 M98479 75307 TGM2 轉麩胺醯胺酵素2(C多牲月大 蛋白-楚酿 ^ 胺 -gamma-glutamyl 轉酉每) 233 L24203 82237 TRIM29 含三區分單元29 234 AF208860 159651 TNFRSF21 腫瘤壞死因子受體超級家族 成員21 、, 235 U44839 171501 USP11 泛激素專一性蛋白酶Η 236 L13852 16695 UBE1L 泛激素—活化酵素E1-類似 237 X63187 2719 WFDC2 WAP 4-雙硫核領域2 φ 238 AF122922 284122 WIF1 WNT抑制劑因子1 239 AA909999 50216 ZFD25 鋅手指蛋白質(ZFD25) 240 AA916688 未知功能 85155 ZFP36L1 鋅手指蛋白質36,C3H type-類似1 241 AB002384 101359 C6orf32 染色體6開放讀碼區32 242 AA620628 186486 ESTs 243 AA632025 444752 ESTs 244 AA904658 117299 ESTs 245 AI022658 292171 ESTs 攀 246 AI027791 132296 ESTs 247 AI338011 132147 ESTs 248 AI732637 277901 ESTs 249 BE868254 380149 ESTs 250 H53099 420009 ESTs 251 N95414 55168 ESTs,稍裰 200418988 [人類] [人類] 45 200418988 252 BG163478 405950 ESTs,稍微類似BAI1_人類腦 專一性血管生成抑制劑1前 驅物[人類] 253 AI342255 24192 人類 cDNAFLJ20767 fis,無 性繁殖系COL06986. 254 AI651212 4283 人類〇圓八?以31125:^3,無 性繁殖系 IMR322000819. 255 AW967916 31944 人類 cDNA FLJ33236 fis,無 性繁殖系 ASTR02002571. 256 AI566720 380045 人類 cDNA FLJ34528 fis,無 性繁殖系 HLUNG2008066 { 257 W93000 59389 人類 cDNA FLJ38601 fis,無 性繁殖系HEART2003781 258 BE885999 397414 人類〇1)似1以20860衍3,無 性繁殖系ADKA01632. 259 AK025909 288741 人類〇0—叶以22256衍3,無 性繁殖系HRC02860. 260 AK025953 380437 人類〇0财:?以22300衍8,無 性繁殖系HRC04759. 261 BF311166 110783 人類 cDNA:FLJ22365 fis,無^ 性繁殖系HRC06613. 262 AI097529 8136 人類無性繁殖系23698 mRNA 序列 263 AI269367 101307 人類HUT11蛋白mRNA,部分 3,UTR 264 N58556 323053 人類mRNA全長cDNA無性繁殖 系 EUROIMAGE 26539. 265 ALII 0236 321022 人 類 mRNA;cDNA DKFZp566P1124(源自無性繁 46 200418988 266 BF791544 351680 267 AV733210 367688 268 AA456955 78026
殖系 DKFZp566P1124) 人類,無性繁殖系 IMAGE:4103364, mRNA 人類,無性繁殖系 IMAGE:4794726, mRNA 人類,類似假設蛋白 C130031J23,無性繁殖系 IMAGE:3445545, mRNA,部分 cds 269 AL120399 343567 270 BE539165 355793 271 AA709155 104800 272 AK001061 30925 273 AK001431 5105 274 AI709055 115412 275 AK026058 27556 276 AW271223 5890 277 N31935 220745 278 AK001839 206501 279 AK022547 8694 280 AA180145 351270 281 AK024828 69388 282 AV758898 366 283 AW888223 59384 284 AA133590 377830 285 L13720 207251 286 AI206046 50535 LOCI 51568 假設性蛋白質BC009491 DKFZp313M0720 假設性蛋白質DKFZP313M07201 FLJ10134 假設性蛋白質FLJ10134 FLJ10199 假設性蛋白質FLJ10199 FLJ10569 假設性蛋白質FLJ10569 FLJ13881 假設性蛋白質FLJ13881 FLJ22405 假設性蛋白質FLJ22405 FLJ23306 假設性蛋白質FLJ23306 FLJ25604 假設性蛋白質FLJ25604 L0C57228 假設性蛋白質源自無性繁殖 系643 LOC56965 假設性蛋白質源自 EUROIMAGE 1977056 LOCI52485 假設性蛋白質LOCI 52485 L0C221749 假設性蛋白質L0C221749 MGC27165 假設性蛋白質MGC27165 MGC3047 假設性蛋白質MGC3047 MGC44669 假設性蛋白質MGC44669 MGC5560 假設性蛋白質MGC5560 MGC7036 假設性蛋白質MGC7036 47 200418988 287 AB002319 8663 KIAA0321 KIAA0321 蛋白 288 AB011125 105749 KIAA0553 KIAA0553 蛋白 289 AB037797 24684 KIAA1376 KIAA1376 蛋白 290 AI741882 278436 KIAA1474 KIAA1474 蛋白 291 AA521149 17767 KIAA1554 KIAA1554 蛋白 292 N62352 24790 KIAA1573 KIAA1573 蛋白 293 AW976121 301444 KIAA1673 KIAA1673 294 AI890497 28501 KIAA1754 KIAA1754 蛋白 295 T78873 9587 KIAA2002 KIAA2002 蛋白 表5 常見於20種攝護腺癌的正調控基因 < PRC 登錄號 Hs_ 代號 名稱 編號 已知功能 296 X12433 99364 ABHD2 含 abhydrolase 領域 2 297 AF039018 135281 ALP alpha-輔肌動蛋白—2-相關 LIM蛋白 298 AJ130733 128749 AMACR alpha-甲基丙烯-CoA消旋酶 299 J02611 75736 APOD 載體蛋白D 300 AF071202 139336 ABCC4 ATP-結合套組,亞-家族 CCCFTR/MRP),成員 4 301 AA633487 108708 CAMKK2 鈣/鈣鍵合蛋白-依賴蛋白激 酶激酶2,beta 302 AF001436 12289 CDC42EP2 CDC42 受體蛋白(Rh〇 GTPase 結合)2 303 BF981201 408061 FABP5 脂肪酸結合蛋白5(牛皮癖-相 關) 304 D14446 107 FGL1 纖維素原-類似1 305 S82986 820 H0XC6 同源盒C6 48 200418988 306 AF064493 4980 LDB2 LIM領域結合2 307 AI767296 123655 NPR3 鈉尿多胜肽受體C/鳥苷酸鈉 環合酶 C (atrionatriuretic peptide 受體 C) 308 AA858162 124673 NCAG1 NCAG1 309 AI805082 303171 OR51E2 1 嗅覺受體,家族51,亞科E, 成員2(攝護腺-專一性G蛋白 -結合受體) 310 AF045584 18910 POV1 攝護腺癌細胞過表現基因1 311 AI298501 21192 SDK1 sidekick同源種1(雞) 312 U80456 27311 SIM2 單心同源種2(果蠅) 1 313 AD001528 89718 SMS 精素合成酶 314 N21096 99291 STXBP6 syntax in 結 合蛋白 6(amisyn) 315 L15203 未知功能 82961 TFF3 Trefoil 因子 3(腸) 316 D14657 81892 KIAA0101 KIAA0101基因產物 317 AI989530 240845 DKFZP434D146 DKFZP434D146 蛋白 318 NMJ12066 128702 20D7-FC4 假設性蛋白質20D7-FC4 319 AA206763 7991 C20orfl02 染色體20開放讀碼區102 320 AI700341 110406 ESTs,稍微類似假設性蛋白 FLJ20489[人類] 321 AI003798 23799 人類,無性繁殖系 IMAGE:4791783, mRNA 表6 常見於20種攝護腺癌的負調控基因 ----- PRC 登錄號 Hs. 代號 名稱 編號 已知功能 49 200418988 322 AI827230 374481 APCDD1 腺瘤病息肉症coli向下調控 1 323 BF965257 74120 APM2 I 脂細胞專一性2 324 AF245505 72157 DKFZp564I1922 Adiican 325 D00017 217493 ANXA2 膜聯蛋白A2 326 NM一001155 118796 ANXA6 膜聯蛋白A6 327 AK027126 160786 ASS 精胺酸號ίό酸合成酶 328 W91908 6079 GALNAC4S-6ST Β細胞RAG相關蛋白 329 AB004066 171825 BHLHB2 含基本螺旋-環-螺旋領域,第 B型,2 330 M14745 79241 BCL2 B-細胞CLL/淋巴瘤2 331 S67310 69771 BF B-因子,properdin 332 M69225 198689 BPAG1 類天泡瘡抗原1,230/240kDa 333 X63629 2877 CDH3 鈣黏蛋白3,第1型,p-鈣黏 蛋白(胎盤) 334 AF134640 7235 CACNG3 鈣通道,電壓調控型,gamma 亞單元3 335 M94345 82422 CAPG 蓋蛋白(肌動蛋白 絲),gelsolin-類似 336 AF035752 139851 cm 凹陷蛋白2 337 K01144 84298 CD74 CD74抗原 338 AI750036 22116 CDC14B CDC14細胞分裂循環14同源 種 B(S· cerevisiae) 339 NM.002996 80420 CX3CL1 化學活性(C-X3-C單元)配位 子1 340 AF000959 110903 CLDN5 Claudin 5(透膜蛋白於先天 性齡咽閉合功能不全症候群 偵測到) 341 NM—001831 75106 CLU clusterin(SP-40,40,硫酸 50 200418988 化糖蛋白2,睪丸素—抑制攝 護腺訊息2) 342 丽一001733 1279 C1R 補體1,亞組合物 343 K02765 284394 C3 補體3 344 D13639 75586 CCND2 週期素D2 345 BF183952 412999 CSTA 半胱胺酸蛋白酵素抑制劑A (stefin A) 346 M62401 82568 CYP27A1 細胞色素P450,家族27,亞 科A,多胜肽1 347 J04813 104117 CYP3A5 細胞色素P450,家族3,亞科 A,多胜肽5 348 X90579 166079 CYP3A5P2 細胞色素P450,家族3,亞科 A,多胜肽5偽基因2 349 AW956111 79404 D4S234E DNA 片段染色體 4(unique)234表現序列 350 AB012955 129867 KIP2 DNA-依賴蛋白激酶催化性亞 單元-作用蛋白2 351 D83407 156007 DSCR1L1 唐氏症重要區基因1一類似1 352 L11329 1183 DUSP2 一元專一性填酸酵素2 353 NM—001421 151139 ELF4 E74-類似因子4(ets領域轉 錄因子) 354 AW300770 61265 FAM3D 豕知帶有序列類似性之家族 3,成員D ' 355 D84239 111732 FCGBP IgG結合蛋白之fc片段 356 AF182316 234680 FER1L3 fer-1-類似 3,myoferlin(C. elegans) 357 M87770 278581 FGFR2 纖維芽細胞生長因子受體2 358 丽一001456 195464 FLNA 絲蛋白A,alpha(肌動蛋白結 合蛋白280)
51 200418988 359 L42176 8302 FHL2 4及1/2 LIM領域2 360 NM—000165 74471 GJA1 縫隙連接蛋白,alpha i 43kDa(connexin 43) 361 AW949747 169946 GATA3 GATA結合蛋白3 362 NM_002083 2704 GPX2 麩胺基過氧化酶2(胃腸) 363 NM_002084 386793 GPX3 糙胺基過氧化酶3(血漿) 364 AA290738 301961 GSTM1 麩胱甘硫轉移Ml 365 NM„002081 2699 GPC1 glypican 1 366 M55543 171862 GBP2 鳥甘酸結合蛋白2,干擾辛_ 誘導型 367 AA666119 92287 GBP3 鳥甘酸結合蛋白3 368 丽」)00186 250651 HF1 Η因子1(補體) 369 AA490691 421136 H0XD11 同源盒D11 370 J02770 36602 IF I因子(補體) 371 S81914 76095 IER3 迅早期反應基因3 372 AV646610 34853 ID4 DM結合抑制劑4,顯性負螺 旋-環-螺旋蛋白 373 L08488 32309 INPP1 肌醇多磷酸-1-去磷酸 374 M31159 77326 IGFBP3 胰島素生長因子結合蛋白3 375 M59911 265829 ITGA3 整合素,alpha 3(抗原 CD49C,VLA-3 受體之 alpha 3 亞單元) 376 X52186 85266 ITGB4 整合素,beta 4 377 AF020201 166154 JAG2 Jagged 2 378 X14640 74070 KRT13 角蛋白13 379 X07696 80342 KRT15 角蛋白15 380 M21389 433845 KRT5 角蛋白5(單純性大庖性表皮 鬆 懈 症 Dowlmg-Meara/Kobner/Webe 52 200418988
X03212 23881 KRT7 AF287272 84728 KLF5 Y00711 234489 LDHB U07643 105938 LTF M13452 377973 LMNA D37766 75517 LAMB3 L13210 79339 LGALS3BP AF002672 152944 L0H11CR2A BE621666 296398 LAPTM4B L08895 78995 MEF2C
AA779709 M33906 7457 198253 MAGE-E1 HLA-DQA1 AW298180 2256 MMP7 AF017418 104105 MEIS2 J02854 9615 MYL9 AF203032 198760 NEFH M12267 75485 OAT 381 382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 r''Cockayne types) 角蛋白7
Kmppel-類似因子5(腸)
乳酸脫氫B 乳酸轉移素 核纖層蛋白A/C 層枯連蛋白,beta 3 親醣蛋白質,半乳糖酶-結 合,水溶性,3結合蛋白 異質性消失,11,染色體區域 2,基因A 溶菌體相關蛋白穿透膜4 beta MADS盒轉譯增強因子2,多重 性的縮胺酸C(肌細胞增強因 子2C) MAGE-E1 蛋白 主要組織相容複合物,第II 型,DQ alpha 1 基質的金屬蛋白酵素 7(matrilysin,子宮)
Meisl,骨髓親外性病毒整合 位置1同源種2(小鼠) 肌凝蛋白,輕多重性的縮胺 酸9,調控性 神經細纖維,重多重性的縮 胺酸200kDa 鳥胺酸轉胺酶 (gyrateatrophy) 53 200418988 398 U90878 75807 PDLIM1 399 M22430 76422 PLA2G2A 400 D00244 77274 PLAU 401 AL045876 430637 PTGDS 402 AF043498 423634 PSCA 403 NM一006394 278503 RIG 404 丽一003979 194691 RAI3 405 AA173755 301198 R0B01 406 AW965789 66450 SENP1 407 M93056 183583 SERPINB1 408 M13690 151242 SERPING1 409 W73992 132792 SDCCAG43 410 X51441 332053 SAA1 411 丽一006456 288215 STHM 412 AF215636 5944 SLC11A3 413 U59299 90911 SLC16A5 414 M55531 33084 SLC2A5 PDZ 及 LIM 領域 l(elf in) 磷脂酶A2,第IIA群(血小板, 滑囊液) 血纖維分解原活化劑,尿激 酶 攝護腺素D2合成酵素21kDa (腦) 攝護膝幹細胞抗原 調控于神經膠質瘤 維生素A酸誘發3 環形,軸突引導受體,同源種· 1(果蠅) sent r i n/SUMO-專一性蛋白酶 絲胺酸(或半胱胺酸)蛋白酶 抑 制 素 , clade B(ovalbumin),成員 1 絲胺酸(或半胱胺酸)蛋白酶 抑制素,cladeG(Cl抑制劑), 成員1 血清學上定義的結腸癌抗原| 43 零 血清殿粉A1 唾液酸轉酶 溶質結合子家族11(氫離子-結合雙價金屬離子載運體), 成員3 溶質結合子家族16(黏膜單羧 酸轉移子),成員5 溶質結合子家族2(輔助型葡 54 200418988 415 M81635 160483 ST0M 416 BF514189 345728 S0CS3 417 AI423028 71622 SMARCD3 418 AK001617 24948 SNCAIP 419 U21847 82173 TIEG 420 M12670 5831 TIMP1 421 U54831 75248 T0P2B 422 NM—003241 2387 TGM4 423 W72411 137569 TP73L 424 D88154 103665 VILL 425 X63187 2719 WFDC2 426 AF122922 284122 WIF1 427 AA916688 85155 ZFP36L1 428 BF055342 326801 ZNF6 未知功能 429 AA706316 32343 ZD52F10 430 U57961 181304 13CDNA73 431 AA709155 104800 FLJ10134 432 AK001021 22505 FLJ10159 433 AA180145 351270 LOCI52485 434 AA133590 377830 MGC44669 萄糖/果醣運輸),成員5 stomatin 細胞素訊息傳遞的抑制基因3 SWI/SNF相關的,聯合基質 的,染色質的肌動蛋白依賴 性調節,亞科d,成員3 突觸蛋白,alpha作用蛋白 (synphilin) TGFB誘發早期生長反應 金屬蛋白酵素的組織抑制因 子1(紅血球加強活動,膠原· 蛋白酶抑制劑) 拓樸異構酵素(DNA) II beta 180kDa 轉麩胺酶4(攝護腺) 腫瘤蛋白p73-類似 vi 11 in-類似 MP 4-雙硫核領域2 WNT抑制因子1 鋅手指蛋白36,C3H type-類φ 似1 鋅手指蛋白6(CMPX1) 假設性基因ZD52F10 假設性蛋白質CG003 假設性蛋白質FLJ10134 假設性蛋白質FLJ10159 假設性蛋白質L0C152485 假設性蛋白質MGC44669 55 200418988 NM_014766 75137 KIAA0193 AI741882 278436 KIAA1474 BF431643 15420 KIAA1500 N62352 24790 KIAA1573 T78873 9587 KIAA2002 AK022877 49476 AI566720 380045 BE885999 397414 AK025909 288741 AI269367 101307 AL050204 28540 AV733210 367688 AI027791 132296 BF111819 21470 AA632025 444752 BE868254 380149 AW510657 156044 AA620628 186486 AI769569 112472 T79422 119237 AI052358 131741 435 436 437 438 439 440 441 442 443 444 445 446 447 448 449 450 451 452 453 454 455 KIAA0193基因產物 KIAA1474 蛋白 KIAA1500 蛋白 KIAA1573 蛋白 KIAA2002 蛋白 人類 cDNAFLJ12815fis,無 性繁殖系 NT2RP2002546. 人類 cDNAFLJ34528 fis,無 性繁殖系 HLUNG2008066. 人類cDNA:FLJ20860 fis,無 性繁殖系ADKA01632. 人類〇0恥:?1^】22256负3,無 性繁殖系HRC02860.
人類HUT11蛋白mRNA,部分 3,UTR 人 類 mRNA; cDNA DKFZp586F1223(源自無性繁 殖系 DKFZp586F1223) 人類,無性繁殖系
IMAGE:4794726, mRNA ESTs ESTs ESTs ESTs ESTs ESTs ESTs ESTs ESTs
56 200418988 456 N95414 55168 ESTs,稍微類似神經絲蛋白 [人類] [人類] 457 BG163478 405950 ESTs,稍微類似BAI1_人類腦-專一性血管生長抑制劑1前 驅物[人類] 表7 10個PINs的正調控基因 PRC 登錄號 Hs. 代號 名稱 _ 編號 已知功能 458 BE466450 50628 AP4S1 承接器-相關蛋白複合物4, sigma 1亞單元 459 AW612403 293970 ALDH6A1 酸脫氫酶6家族,成員A1 460 AJ130733 128749 AMACR a 1 pha-曱基丙稀-C〇A消旋酶 461 丽一001642 279518 APLP2 類澱粉beta(A4)類先驅物蛋 白2 462 X59066 405985 ATP5A1 ATP合成酶,H+傳送,粒線體 F1複合物,alpha亞單元,同 質體1 φ 463 AF071202 139336 ABCC4 ATP-結合套組,亞-家族 CCCFTR/MRP),成員 4 464 A 腿 9038 44592 HMT-1 beta-1,4甘露糖轉酶 465 AF231023 55173 CELSR3 鈣黏蛋白,EGF LAG seven-pass G-type 受體 3(flamingo 同源種,果4¾) 466 AI817172 29423 COLEC12 膠原凝集素亞-家族成員12 467 Z21488 143434 CNTN1 contactin 1 468 AF255443 268281 CRNKL1 Crn,crooked neck-類似 1 (果 57 200418988 NMJJ05436 288862 D10S170 AI697792 21189 DNAJA2 AF039918 80975 ENTPD5 AF176699 49526 FBXL4 M99487 1915 FOLH1 丽—000159 184141 GCDH AW967035 159572 HS3ST3B1 丽一005333 211571 HCCS U26726 1376 HSD11B2 U89281 11958 RODH U42408 18141 LAD1 L25931 152931 LBR Z30137 49998 LDB3 AF001174 57732 MAPK11 M92449 264330 ASAHL W23499 118654 ASAH2 R22536 220324 FLJ13052 AA704060 8248 NDUFS1 AI805082 303171 OR51E2 469 470 471 472 473 474 475 476 477 478 479 480 481 482 483 484 485 486 蠅) DMA片段染色體丨〇(獨特)17〇 DnaJ(Hsp40)同源種,亞科A, 成貝2 外核脊三碟酸二鱗酸水解酶5 F-盒及白胺酸-豐富重複蛋白 4 葉酸水解酵素(攝護腺-專一 性膜抗原)1 戊二基輔酶A去氫酶 硫酸乙醯肝素(葡萄胺 糖)3-〇-硫轉移酶3B1 全細胞色素c合成酶(細胞色 素c原血紅素-解離酶) lib-羥類固醇去氫酶2 3-羥類固醇表異構酵素 ladinin 1 lamin B受體 LIM領域結合3 活化有絲分裂原激酶11 N-丙稀抱合糖脂醇胺基水解 酶(酸腦胺酶)-類似 N-丙烯抱合糖脂醇胺基水解 酶(非-溶素體腦胺酶)2 NAD激酶 NADH去氫酶(泛醌)Fe-S蛋白 1,75kDa(NADH-co 酵素 Q 還 原酶) 嗅覺受體,家族51,亞科E, 58 487 200418988 488 AK025460 286049 PSA 成貝2 磷絲胺酸轉化酶 489 NM_021200 380812 PLEKHB1 含pleckstrin同源種領域, 490 AI346354 75871 PRKCBP1 家族B(evectins)成員1 蛋白激酶C結合蛋白1 491 AF044588 344037 PRC1 細胞質分裂的蛋白調節1 492 NM—012342 78776 丽A 可能存在的穿透膜蛋白 493 AL041152 13264 RC3 rabconnectin-3 494 L10333 99947 RTN1 reticulon 1 495 M32313 552 SRD5A1 類固醇-5-alpha-還原酶, 496 U04735 352341 STCH alpha多胜肽1 壓力70蛋白質伴護子,聯合 497 U66035 125565 TIMM8A 的微粒體,60kDa 内粒線體膜8同源種A(酵母 498 AA907673 432605 UGCG 菌) UDP-葡萄糖腦胺糖基轉酶 499 AA164237 279840 ZNF222 鋅手指蛋白222 500 NM—006300 193583 ZNF230 鋅手指蛋白230 501 未知功能 AK023414 22972 FLJ13352 假設性蛋白質FLJ13352 502 AI341472 274337 FLJ20666 假設性蛋白質FLJ20666 503 N48613 311163 FLJ30162 假設性蛋白質FLJ30162 504 BG179141 7962 FLJ30525 假設性蛋白質FLJ30525 505 AW971484 105069 LOC148418 假設性蛋白質L0C148418 506 AK000569 107444 LOC90075 假設性蛋白質LOC90075 507 D43948 76989 KIAA0097 KIAA0097基因產物 508 AB011085 301658 KIAA0513 KIAA0513基因產物 509 A腿 1127 43107 KIAA0555 KIAA0555基因產物 510 AI151160 155983 KIAA0677 KIAA0677基因產物 59 200418988 511 T55178 9846 KIAA1040 KIAA1040 蛋白 512 AI094513 21896 KIAA1136 KIAA1136 蛋白 513 AA206763 7991 C20orfl02 染色體20開放讀碼區ι〇2 514 AF131828 7961 C9orf25 染色體9開放讀碼區25 515 AA825819 7535 LOC55871 LOC55871 516 AW135763 6375 HT010 不明下視丘蛋白HT010 517 AK025329 7158 DKFZP566H073 蛋白 518 AL390127 433788 人 類 mRNA; cDNA DKFZp761P06121 519 AI074176 31535 人類,無性繁殖系 IMAGE:3460742,mRNA,部分 cds 520 AI133467 95612 ESTs 521 BF514823 119065 ESTs 522 AA897408 190065 ESTs 523 AI478401 104591 ESTs 524 AA430571 104881 ESTs 525 AA521342 101428 ESTs 526 N62332 102728 ESTs 527 H17800 438858 ESTs 528 AA826048 117887 ESTs 529 AA677094 117035 ESTs 530 AA682521 117261 ESTs 531 AI554006 112694 ESTs 532 AI004966 445098 ESTs 533 N52767 23406 EST 534 BF109251 353121 ESTs,稍微類似假設性蛋白質 FLJ20378 535 AI700341 110406 ESTs,稍微類似假設性蛋白
60 200418988 質 FLJ20489 536 537 AA743154 AI352507 373991 263600 ESTs,稍微類似神經絲蛋白 ESTs,稍微類似虹17_HUMM 60S核醣蛋白L17(L23) 表8 10個PINs的負調控基因 PRC 編號 登錄號 Hs. 代號 名稱 538 已知功能 K03000 76392 ALDH1A1 酸脫氫酶1家族,成員A1 539 AF055024 153489 ASB1 含錨蛋白重覆區及SOCS盒1 540 M81844 87268 ANXA8 膜聯蛋白A8 541 X82206 153961 ACTR1A ARP1肌動蛋白絲相關蛋白1 542 AW014316 1578 BIRC5 同源種 A,centractin alpha (yeast) 含桿狀病毒IAP重複 543 S67310 69771 BF 5(survivin) B-因子,補體 544 AF132972 279772 CGI-38 大腦特殊蛋白 545 BE826171 100686 BCMP11 乳癌膜蛋白11 546 AF134640 7235 CACNG3 妈通道,依賴電壓,2細贴亞 547 AF177775 76688 CES1 單元3 脫酸酯酶1(單核球/巨噬細 548 Z18951 74034 CAV1 胞絲胺酸S旨解酶1) 凹陷蛋白1,caveolae蛋白, 549 K01144 84298 CD74 22kDa CD74抗原 550 NM_002996 80420 CX3CL1 趨化激素(C-X3-C單元)配體 61 200418988
551 U58514 154138 CHI3L2 552 W19536 363572 CEPT1 553 U16306 81800 CSPG2 554 AF101051 7327 CLDN1 555 AI150272 258811 C0PG2 556 AV712344 285401 CSF2RB 557 NM一001733 1279 C1R 558 K02765 284394 C3 559 AF081287 4076 CTDP1 560 L12579 147049 CUTL1 561 D86977 78054 DDX38 562 M26602 274463 DEFA1 563 AF097021 273321 GW112 564 NM_006182 71891 DDR2 565 丽一001953 73946 ECGF1 566 BF981201 408061 FABP5 567 AF112152 11494 FBLN5 幾丁質酵素3-類似2 膽驗 /ethanolaminephospho 轉酶 軟骨膠硫酸鹽蛋白多醣 2(versican) claudin 1 外被體蛋白複合物,亞單元 gamma 2 聚落刺激因子2受體,beta, 低親合力型(顆粒球—巨嗟細 胞) _ 補體1,r亞組合物 補體3 CTD(羧基端領域,RNA聚合酶 II,多胜肽A)磷酸酵素,亞 單元1 ^ cut-類似1,CCAAT替換蛋白 (果蠅) DEAD/H(Asp-G1u~A1a-Asp/H i s)盒多胜肽38 防禦素,alpha 1,骨髓相關次籲 序 表現不同於造血子代 盤狀領域受體家族,成員2 血管内皮細胞生長因子丨(血 小板-衍生) 脂肪酸結合蛋白5(牛皮癖一 相關) fibulin 5 62 200418988
568 U60115 239069 FHL1 569 NM.002083 2704 GPX2 570 NM_002084 386793 GPX3 571 NM—002081 2699 GPC1 572 AI887814 4953 G0LGA3 573 D21239 9195 GRF2 574 NM—006308 41707 HSPB3 575 AK001601 69594 HMG20A 576 J02770 36602 IF 577 S81914 76095 IER3 578 AI922295 413826 IGHG3 579 X67301 153261 IGHM 580 AW518944 76325 IGJ 581 AK026991 61790 IP04 582 M31159 77326 IGFBP3 583 AK026736 57664 ITGB6 584 丽—002198 80645 IRF1 585 U72882 50842 IFI35 586 M13143 1901 KLKB1 587 U07643 105938 LTF 588 AF025534 77062 LILRB5 4及1/2 LIM領域1 麩胺基過氧化酶2(腸胃道) 麩胺基過氧化酶3(血漿) glypican 1 高爾基自體抗原,golgin亞 科a,3
鳥嘌呤核苷釋放因子2(專一 性for crk proto-致癌基因) 熱休克27kDa蛋白3 高機動群20A I因子(補體) · 早期立即反應3 免疫球蛋白固定重鏈gamma 3(G3m marker) 免疫球蛋白固定重鏈mu 免疫球蛋白J多胜肽,免疫 球蛋白alpha及mu多胜肽之 連結子蛋白 輸入素4 類胰島素因子結合蛋白3 ^ 整合素,beta 6 干擾素的調控因子1 干擾素降低蛋白35 kallikrein B,血漿 (Fletcher 因子 乳酸轉移素 白血球類免疫球蛋白受體, 亞科B(TM及ITIM領域),成 員5 63 200418988 AI563896 1569 LHX2 AA644276 102267 L0X M81141 73931 HLA-DQB1 BF697545 365706 MGP NM_004530 111301 MMP2 AW298180 2256 MMP7 NM_005928 3745 MFGE8 AI023878 406591 MTIF3 J05581 89603 MUC1 M94132 315 MUC2 AJ293659 12909 MC0LN1 J02854 9615 MYL9 AB037787 26229 NLGN2 丽一006169 364345 NNMT S51033 79396 MPG N35034 8121 N0TCH2 丽一006163 75643 NFE2 AW949776 3187 NFX1 M13692 572 0RM1 BF115519 14125 PA26 L03203 103724 PMP22 AA398096 198278 PFKFB4 589 590 591 592 593 594 595 596 597 598 599 600 601 602 603 604 605 606 607 608 609 610 LIM同源盒蛋白2 賴胺醯氧化 主要組織相容複合物,第π 型,DQ beta 1 基質Gla蛋白 母質金屬蛋白酶 2(gelatinase A) 母質金屬蛋白酶 7(matrilysin) 乳脂肪球-表皮細胞因子8蛋 白 < 粒線體轉譯抑制因子3 黏液素1,穿透膜 黏液素2,腸/氣管 mucolipin 1 厚肌纖維絲,輕多胜狀9, 調控性 neuroligin 2 於驗素N-甲基轉酶 N-曱基嘌呤-DNA糖解酵素 Notch同源種2(果蠅) 細胞核因子(紅血球-衍生 2), 45kDa 細胞核轉錄因子,X-盒結合1 血清黏蛋白1 p53調控的PA26細胞核蛋白 周邊髓鞘質蛋白22 6-磷酸果糖-2-激酶/果糠 -2, 6-雙鱗酸酵素4 64 200418988 AI660921 107125 PLVAP D29833 2207 PR0L3 N26005 303090 PPP1R3C BF673741 71119 N33 AI004873 198281 PKM2 H46145 27744 RAB3A AK026092 180040 RIN3 BG054844 6838 ARHE 丽—003979 194691 RAI3 AA927661 201675 RBM5 BF027943 2962 S100P AI719545 278431 SC02 X16150 82848 SELL J05176 234726 SERPINA3 BF126636 332053 SAA1 NM一004175 1575 SNRPD3 AF036109 193665 SLC28A2 AF058918 5699 SEDLP NM—000348 1989 SRD5A2 AF059203 20580 S0AT2 611 612 613 614 615 616 617 618 619 620 621 622 623 624 625 626 627 628 629 630 原生質膜水泡聯合蛋白 脯胺酸豐富3
蛋白磷酸酵素1,調控(抑制 劑)亞單元3C 可月b的攝護腺癌腫瘤抑制子 丙酮酸激酶,肌肉 RAB3A,成員ras致癌基因家 族
Ras及Rab交互子3 ras同源種基因家族,成員E 維他命A酸誘發3 RNA結合領域蛋白5 S100鈣結合蛋白P SCO細胞色素氧化酶缺乏同 源種2(酵母菌) 選擇蛋白L(淋巴球黏合分子 1) 絲胺酸(或半胱胺酸)蛋白酶 抑制劑,clade A,成員3 血清殿粉A1 小細胞核核糖蛋白蛋白D3多 胜肽18kDa 溶質結合子家族28(鈉-結合 核苷酸轉移子),成員2 先天性脊椎骨,,骨后”發育不 良,後期,偽基因 類固醇-5-aipha—還原酶, alpha多胜肽2 固醇0-丙烯轉酶2
65 200418988
AA853967 124574 TAS1R1 AF082185 8375 TRAF4 AI091425 9030 TONDU AA682533 44269 TRIPIN AB025254 283761 PCTAIRE2BP D17517 301 TYR03 AF000993 13980 UTX AW574558 121102 VNN2 H20162 2126 VIPR2 BE382636 25960 MYCN X63187 未知功能 2719 WFDC2 AI042017 23756 Clorfl3 AA614050 267566 C14orf58 AK023453 334721 FLJ13391 BE465676 353196 FLJ14564 AK026924 105642 FLJ21936 AW195243 108812 FLJ22004 BF965831 135121 FLJ22415 AK026486 118183 FLJ22833 AW271223 5890 FLJ23306 AI359551 22015 FLJ90119 BG054529 206501 LOC57228 AI149729 120557 LOC285286 AI089621 22051 MGC15548 631 632 633 634 635 636 637 638 639 640 641 642 643 644 645 646 647 648 649 650 651 652 653 654 味覺受體,第1型,成員1 TNF受體-相關因子4 TONDU Tripin 條道式重複相關PCTAIRE 2 TYR03蛋白酪胺酸激酶 廣泛轉錄三十四肽重複單位 基因,X染色體 vanin 2 腸血管活性多胜受體2 v-myc體聽細胞瘤病毒相關 致癌基因,神經細胞瘤衍生 (禽類) WAP 4-雙硫核領域2 染色體1開放讀碼區13 染色體14開放讀碼區58 假設蛋白FLJ13391 假設蛋白FLJ14564 假設蛋白FLJ21936 假設蛋白FLJ22004 假設蛋白FLJ22415 假設蛋白FLJ22833 假設蛋白FLJ23306 假設蛋白FLJ90119 假設蛋白源自無性繁殖系 643 假設蛋白LOC285286 假設蛋白MGC15548 66 200418988 655 AW005320 236547 MGC22916 656 AI076840 40808 MGC33926 657 AW340131 56382 FLJ32384 658 AK025996 209614 MGC4415 659 AA827188 351605 MGC45417 660 H04833 6336 KIAA0672 661 AB033103 6385 KIAA1277 662 BG054798 26204 KIAA1295 663 AI694131 29002 KIAA1706 664 AL137345 298850 KIAA1936 665 AK025585 380169 666 AB037861 112184 667 W58516 12396 668 AW967916 31944 669 AF052090 106620 670 ALII 0236 321022 671 BE348293 29283 672 AI139601 120590 673 H42381 348805 674 AA180005 115029 675 AA648546 ‘Z30703 676 AI916303 7444 假設蛋白MGC22916 假設蛋白MGC33926 假設蛋白MGC39389 假設蛋白MGC4415 假設蛋白MGC45417 KIAA0672 產物 KIAA1277 蛋白 KIAA1295 蛋白 KIAA1706 蛋白 KIAA1936 蛋白 DKFZp727A071 DKFZP586J0619 蛋白 人類 cDNAFLJ33095 fis,無 性繁殖系 TRACH2000708. 人類 cDNAFLJ33236 fis,無 性繁殖系 ASTR02002571. 人類無性繁殖系23950 mRNA 序列 人 類 mRNA; cDNA DKFZp566P1124(源自無性繁 殖系 DKFZp566P1124) 人類蛋白多醣連結蛋白 mRNA,完整 cds. 人類,無性繁殖系
IMAGE:5750475, raRNA 假設蛋白 DKFZp667B0210 ESTs ESTs ESTs 200418988 677 AA700898 113117 ESTs 678 AI246644 259679 ESTs 679 AI807279 443735 ESTs 680 AI160304 28313 ESTs 681 AA768888 446195 ESTs 682 BE502928 445376 ESTs 683 AA568515 293510 ESTs 684 AI732560 215976 ESTs 685 AI821961 126215 ESTs 686 AA928743 132527 ESTs 687 AA910771 130421 ESTs 688 AA938326 127167 ESTs 689 AA897581 445725 ESTs 690 AA004313 446619 ESTs,高度相似於HIRA-作用 蛋白3 691 H21968 285520 ESTs,中度相似於假設蛋白 FLJ20489 692 AI223250 131365 ESTs,稍微相似於T31613假 設蛋白 Y50E8A. i-Caenorhabditis ^ elegans] 表2半定量反轉錄聚合反應的引子 代號 正向引子 序列 識別號 反向引子 序列 識別號 AMACR 5, -TCATGATCTCCCTCT AAGCACAT-3, 1 5,-TGTTGCTGTGTGTTG GGTATAAG-3, 2 H0XC6 5,-CCTGGGGGTCATTAT GGCATTTT-3, 3 5,-TTCTCCTACTGGCTA AACAAACG-3, 4 68 6200418988 P0V1 5, -GGTGCCTCTTATCTC CTTCT-3, ABHD2 5, -GTACTTGGCTTAAAA GCAACCAG-3, C20ORF -AACCACTTCTTGCGA 102 GTCCTT-3, /3 -肌 -TTGGCTTGACTCAGG 動蛋白 ΑΠΤΑ-3’ 5 -CTTCCCTTTTTATTT CCTCT - 3, 7 5,-CTCAGTGACCTGGAT CTGACCT-3’ 9 5,-TATTCAGGTTGGCTG GTAGTCAC-3, 11 5,-TGGACTTGGGAGAGG ACTGG-3, 8 10 12 產業上的可利用性 本發明所提PRC或PIN的基因表現分析,顧雷射補捉切割及全基因_ cDM微陣列的結合’已經檢定出絲治療或猶癌細胞的基因。依據這些 表現差異的基因,本發明提供能用來診斷pRC或piN的標記基因。 ^本發明所揭露的方法也可用來檢定預防用的目標分子。利用上述資 料’可以更了解PRC、促進新的診斷方式的發展,以及治療藥物以預防試劑 的篩選。這些資訊也助於了解攝護腺癌的發生機制,提供發展新型診斷、 治療、預防PRC等方式的線索。 所有專利,專利申請,及引用文獻皆被完整地併内本發明參考文獻。 此外本毛明已經由洋細說明且附有實例實施例,任何熟悉此技藝的人士, 皆可在本發明的精神及範圍内,做任何修改及潤飾。 參考文獻 1. Greenlee, R. T., Hill-Harmon, Μ. Β., Murray, Τ., and Thun, Μ. Cancer statistics, 2001. CA Cancer J Clin, 51: 15-36., 2001. 2. Kuroishi, T. Epidemiology of prostate cancer. Klinika, 25: 43-48., 1995. 3. Roberts, W. W., Bergstralh, E. J., Blute, M. L., Slezak, J. M·,Carducci,M·,Han,M·,Epstein, J· I·,Eisenberger,M. A.,Walsh, P. C., and Partin, A. W. Contemporary identification of patients at 69 200418988 high risk of early prostate cancer recurrence after radical retropubic prostatectomy. Urology, 57: 1033-1037., 2001. 4. Roberts, S. G., Blute, M. L., Bergstralh, E. J., Slezak, J. M., and Zincke, H. PSA doubling time as a predictor of clinical progression after biochemical failure following radical prostatectomy for prostate cancer. Mayo Clin Proc, 76: 576-581., 2001. 5. Chi, S. G., deVere White, R. W., Meyers, F. J., Siders, D. B., Lee, F., and Gumerlock, P. H. p53 in prostate cancer: frequent expressed transition mutations. J Natl Cancer Inst, 86: 926-933., 1994. 6. Cairns, P., Okami, K., Halachmi, S., Halachmi, N., Esteller, M. , Herman, J. G., Jen, J., Isaacs, W. B., Bova,G. S., and Sidransky, D. Frequent inactivation of PTEN/MMAC1 in primary prostate cancer. Cancer Res, 57: 4997-5000., 1997. 7. Fleming, W. H., Hamel, A., MacDonald, R., Ramsey, E., Pettigrew, N. M.,Johnston, B., Dodd, J. G., and Matusik, R. J. Expression of the c-myc protooncogene in human prostatic carcinoma and benign prostatic hyperplasia. Cancer Res, 46: 1535-1538., 1986.
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Cancer Res. 60, 6568-72. 27.Yagyu, R., Hamamoto, R., Furukawa, Y., 〇kabe> H > Yamamura5 T. & Nakamura, Y. (2002). Int J Oncol, 20, H73-8 【圖式簡單說明】 第1圖S DM瑗脂膠體分析照片,顯示有代表性的5個基因及$—肌動 =白之表現情形,其係利用增幅過之RNA製備出的⑼财進行半定量反轉錄 κ 3鏈反應。;f示示為基因符號。在8個患者内,τ代表癌細胞,n代表正 細胞。 73 200418988 序列表 <110> Oncotherapy Science, Inc.
JAPAN AS REPRESENTED BY THE PRESIDENT OF THE UNIVERSITY OF TOKYO <120〉診斷攝護腺癌的方法 <130> ONC-A0216P1 <150〉 60/414,873 <151〉 2002-09-30 <160〉 12 <170> Patentln version 3.1 <210> 1 <211〉 23 <212〉 DNA <213〉人工序列 <220〉 <223〉人工合成之RT-PCR引子序列 <400〉 1 tcatgatctc cctctaagca cat <210〉 2 23
74 200418988 <211〉 23 <212> DNA <213〉人工序列 <220〉 <223〉人工合成之RT-PCR引子序列 <400> 2 23 tgttgctgtg tgttgggtat aag
<210〉 3 <211〉 23 <212> DNA <213〉人工序列 <220〉 <223〉人工合成之RT-PCR引子序列 <400〉 3 cctgggggtc attatggcat ttt <210〉 4 <211〉 23 <212〉 DNA <213〉人工序列 23
75 <220〉 200418988 <223〉人工合成之RT-PCR引子序列 <400〉 4 ttctcctact ggctaaacaa acg 23 <210〉 5 <211〉 20 <212> DNA <213〉人工序列 <220〉 <223〉人工合成之RT-PCR引子序列 <400〉 5 ggtgcctctt atctccttct <210〉 6 <211> 20 <212〉 DNA <213〉人工序列 <220〉 <223〉人工合成之RT-PCR引子序列 <400〉 6 cttccctttt tatttcctct 20 20
76 200418988 <210〉 7 <211> 23 <212> DNA <213〉人工序列 <220〉 <223〉人工合成之RT-PCR引子序列 <400〉 7 gtacttggct taaaagcaac cag <210〉 8 <211〉 22 <212〉 DNA <213〉人工序列 <220〉 <223〉人工合成之RT-PCR引子序列 <400〉 8 ctcagtgacc tggatctgac ct <210〉 9 <211> 21 <212〉 DNA <213〉人工序列 23
22 77 200418988 <220〉 <223〉人工合成之RT-PCR引子序列 <400〉 9 aaccacttct tgcgagtcct t <210〉 10 <211〉 23 <212> DNA <213〉人工序列 <220> <223〉人工合成之RT-PCR引子序列 <400〉 10 23
tattcaggtt ggctggtagt cac
<210〉 11 <211〉 20 <212〉 DNA <213〉人工序列 <220〉 <223〉人工合成之RT-PCR引子序列 <400〉 11 78 200418988 20 ttggcttgac tcaggattta <210〉 12 <211〉 20 <212> DNA <213〉人工序列 <220〉
<223〉人工合成之RT-PCR引子序列 <400〉 12 20 tggacttggg agaggactgg
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Claims (1)

  1. 200418988 拾、申請專利範圍: 1· 一種用以診斷一個體之PRC及/或PIN,或是其發展為PRC及/或piN 之傾向的方法,包含測定源自該個體之生物樣本_ PRC相關基因表現量, 其中與正常雜組之表現量她較,該基因之表現量增加或減少之變化代 表該個體已有或是有發展為pRC及/或PIN的危險。 2·如申請專利範圍第1項的方法,其中該PRC相關基因係擇自PRC1—88 組成之族群,其中相較於正常對照組之表現量,其表現量 體已有或是有發展為PRC或是PIN的危險。 3·如中請專娜圍第2項的方法,其中該表現量之增加至少大於該正 • ϋ w專,圍弟1項的方法,其中該PRC相關基因係擇自籲 PRC89-295組成之族群,其中相較於正常對照組之表現量,其表現量之減少 帶表該個體已有或是有發展為PRC或是PIN的危險。 、 / 5·如巾請專利範圍第4項的方法,其中該表現量之減少至少大於該正 對照組之10%以上。 6.如帽巧|贿1項的方法,其中該方法更包含測定複數個pRc相 關基因的表現量。 、7·如中請專繼目第1項的方法,其巾該表現量是由下列群組中任一方 法來測定: (a) 測定該PRC相關基因之抓财, (b) 測疋該PRC相關基因所編碼之蛋白,以及 籲 (c) 測定該PRC相關的基因所編碼之蛋白的生物活性。 8·Μ凊專利範圍第丨項的方法,其中該表現程度係經由侧pRc相關 土因之探針與該個體之生物樣本巾基因轉錄產物的雜交程度而測定。 9·如申請專利範圍第8項的方法,其中該雜交反應是在DNA陣列上進行。 10·如申請專利範圍第1項的方法,其中該生物樣本包含表皮細胞。 11·如申請專利範圍第㈣的方法,其中該生物樣本包含舰、ρ職二 12·如申請專利範圍第8項的方法,其中該生物樣本包含來自pRc或剛 80 200418988 之表皮細胞。 包含二個或以上之基因的基因表現模式, 包含二個或以上之基因的基因表現模式, 13· —種PRC參考表現特徵, 該基因選自PRC 1-295群組内。 14. 一種PRC參考表現特徵, 該基因選自PRC 1-88群組内。 15. -種PRC參考表現特徵,包含二個或以上之基因的基因表現模式, 該基因選自PRC 89-295群組内。 、 16· -種用以筛選治療或預防pRC、piN或二者之化合物的方法,包含: a) 將測試化合物與選自組内的核酸所編碼的多胜肽接觸, b) 測定測試化合物與多胜肽間的結合活性;以及 c) 選擇一結合到多胜肽上的化合物。 17. —種用以篩選治療或預防pRC、piN或二者之化合物的方法,包含: a)將測試化合物與表現一或多個標記基因的細胞接觸,該一或多個標 記基因選自PRC1-295群組,以及 b)選擇能夠減低一或多個選自pRC丨一88標記基因表覌量,或是增加一 或多個選自PRC89-295標記基因表現量之化合物。 18· —種用以篩選治療或預防pm、pm或二者之化合物的方法,包含: a)將一測試化合物與一多胜肽接觸,該多胜肽是由pRC1—295群組中的 核酸所編碼; b) 測定步驟(a)中之多胜肽的生物活性;以及 c) 與測試化合物不存在時之生物活性比較,以挑選能抑制該多胜肽生響 物活性的化合物,該多胜肽係編碼自pRC卜88的核酸,或是挑選能增進多 胜肽活性的化合物,該多胜肽係編碼自pRC 89_295的序列。 19·如申請專利範圍第17項的方法,其中該細胞包含PRC、PIN,或二者。 20· —種用以篩選治療或預防PRC、PIN或二者之化合物的方法,包含: a) 將一候選化合物與一細胞接觸,該細胞含有一載體,該載體包含一 或多個標記基因的轉錄調控區,及受該轉錄調控區調節的報導基因,其中 該一或多個標記基因係選自pRC 1—295所組成之族群; b) 測定該報導基因的活性;以及 81 200418988 * C)與對照組比較’挑選能抑制該報導基因表現的化合物,該報導基因 是1-88的正調控標記,献挑選能增進該報導基因表現的化合物, 該報導基因是選自PRC 89-295的負調控標記。 21· -種套組,包含一侧試劑,其能與選自pRC卜2 核酸序列結合。 4夕1固 序歹=合一種陣列’包含一核酸’其能與選自PRC卜295中一個或多個核酸 23. -種用以治療或預防一個體之pRC、piN或兩者的方法,包含 ,,合物以降低-多胜肽的表現或活性,該纽肽係編碼自^ 之基因序列。 〇 24·-種用以治療或預防一個體之pRC、piN或二者的方法,包含給 恤合物,該組合物包含一核苷酸序列,互補於選_^ 25. 一種用以治療或預防-個體之PRC、PIN或二者的方法,包含給予兮 HyS1_組合物’其中該3麵組合物能降低選自pRc卜難酸序列的 娜2一6·料種用Γ治療或預防—個體之服'刚或二者的方法,包含給予該 “上有效量之抗體或其片段,其可與任一選自pRc卜崎組成之 基因所編碼的蛋白結合。 、、' ―27· 一種用以治療或預防一個體之PRC、刚或二者的方法,包含給予今 ”免焱活性片奴,或編碼該多胜肽之聚核苷酸。 個俨2H用以治療或預防—個體之·、刚或二者的方法,包含給予該 89_295之表現或活性。 ^ _2_Xf用以治療或預防—個體之、?職二者的方法,包含給予該 所編碼效量之選自PRC 89-295所組成之聚核替酸,或該聚核· 個體Hr以治麵預防—個體之PRC、刚或二者的方法,包含給予該 個體-化合物’該化合物係㈣請專利範酬,項任—項之方法所取^。 82 200418988 A 人—H用以^療或預防一個體之prc、pin或二者的方法,該組合物包 二效里之反義聚核苷酸或小干擾RNA作為活性成分,以抗一選自 於PM序列的多峨,以及-鮮上可接受的載體。 32:-曰種用心療或預防pRC、刚或二者之組合物,該組合物包含一藥 =放里之k體或其片段作為活性成分,其可與由任一選自哪卜抑之 土因所編碼之蛋白結合,以及藥學上可接受的載體。 33. -種用以治療或預防pRC、酬或二者之組合物,該組合物包含一藥 子上有效量之聚贿酸,其係選自p謂—挪,或其編碼❹胜肽以作為 活性成分,以及藥學上可接受的載體。 34. -種用以治療或預防pRC、酬或二者之組合物,該組合物包含一藥 學上有效量之化合物以作為活性成分,該化合物係由如申請專纖__2〇| 項任一項所述之方法選出,以及藥學上可接受的載體。· 35· -顧以診斷-個體之PR(:,献其有發展細⑽傾向的方法,包 含測定源自該個體之生物樣本中一PRC相關基因之表現量,其中與正常對昭 組該基因的表現量相比較,祕因之表現高低變化代表難體/已 有、 發展為卩職危險。 ^ 36·如申請專利範圍第35項的方法,其中該pRG相關基因係擇自由 PRC296-321組成之族群,其中相較於正常對照組之表現量,其表現量高表 示該個體已有或是有發展為PRC的危險。 八 同又 37·如申請專利㈣第36項的方法,其中該表現量的增加至少大於 對照組之10%。 ' · 38·如申請專利範@第35項的方法,其中該PRC相關基因係擇自pRc 322-457組成之族群,其中相較於正常對照組之表現量,其表現量低代表該 個體已有或是有發展為PRC的危險。 _ 39·如申請專利範圍第38項的方法,其中該表現量的減少至少低於正常 對照組之10%。 — ' 40.如申請專利範圍第35項的方法,其中該方法更包含測定複數個哪 相關基因的表現量。 41·如申請專利範圍第35項的方法,其中該表現量是由下列任一方法來 83 200418988 測定: (a) 測定該PRC相關基因的mRNA, (b) 測定該PRC相關基因所編碼之蛋白,以及 (c) 測定PRC相關基因所編碼之蛋白的生物活性。 42.如申請專利範圍郷項的方法,其中該表現量係以侧—pRC相關 基因的麟與該個體之生物樣本巾基畴錄產物的雜交反應而測定。 43·如申請專繼圍第42項的方法,其中雜交反應是在_車列上進 行。 44·如申請專利翻第35項的方法,其中該生物樣本包含表皮細胞。 45.如申請專利範圍第35項的方法,其中該生物樣本包含pRC細胞。 服如申請專利範圍第42項的方法,其中該生物樣本包含來自pRc之表籲 皮細胞。 47· —種PRC參考表現特徵,包含二個或以上的基因表現模式,該基因 選自PRC 295-457群組内。 48· -種PRC參考魏特徵,包含二個或以上的基因祕模式,該基因 選自PRC 296-321群組内。 49. 一種PRC參考表現特徵,包含二個或以上的基因表現模式,該基因 選自PRC 322-457群組内。 50· —種用以篩選治療或預防pRC之化合物的方法,包含·· a) 將一測試化合物與一由選自pRC296_457群組内之核酸所編碼的多胜 肽接觸, 響 b) 測定該測試化合物與該多胜肽間的結合活性 ;以及 c) 選擇一可結合到多胜肽上的化合物。 51·—種用以篩選治療或預防pRC之化合物的方法,包含: a) 將一候選化合物與表現一或多個標記基因的細胞接觸,其中該一或 多個標記基因係選自PRC 296-457之群組,以及 b) 選擇一化合物’其能減低該一或多個選自PRC 1-88群組之標記基因 的表現量’或是能增加該一或多個選自pRC 322—457群組之標記基因的表現 量0 84 200418988 52· —種用以篩選治療或預防prc之化合物的方法,包含: a) 將一測試化合物與一多胜肽接觸,該多胜肽是由選自PRC 296—奶7之 群組中的核酸所編碼; b) 測定步驟(a)中之多胜肽的生物活性;以及 c) 與該測試化合物不存在之生物活性相比較,挑選一能抑制該多胜月太 之生物活性活性的化合物,該多胜肽係由選自PRC 296-321之核酸所編碼,' 或是挑選一能增進該多胜肽之生物活性的化合物,該多胜肽係由選自pRc 322-457之核酸所編碼。 53·如申請專利範圍第51項的方法,其中細胞包含prC細胞。 54. —種用以篩選治療或預防PRC之化合物的方法,包含: a) 將一候選化合物與一細胞接觸,該細胞含有一載體,該載體包含一馨 或多個標記基因的轉錄調控區,及一受該轉錄調控區調節表現的報導基 因’其中該一或多個標記基因係選自PRC 296-457之群組; b) 測定該報導基因的活性;以及 c) 與對知、組比車父,挑選能抑制該報導基因表現的化合物,該報導基因 是選自PRC 296-321之群組的正調控標記基因,或是挑選能增進該報導基因 表現的化合物,該報導基因是選自PRC 322-457之群組的負調控標記。 55· —種套組,包含一偵測試劑,其能與二或多個選自pRC 296—457之 群組的核酸結合。 56· —種陣列,包含一核酸,其能與二或多個選自pRC 296—奶7之群組 的核酸結合。 ° Φ 57· —種用以治療或預防一個體之PRC的方法,包含給予該個體一化合 物以降低一多胜肽的表現或活性,該多胜肽係由選自PRC 296-321之基因所 編碼。 58. —種用以治療或預防一個體之PRC的方法,包含給予該個體一反義 組合物’該組合物包含一核苷酸序列,其能與選自PRC 296-321之群組的編 碼序列互補。 59· —種用以治療或預防一個體之pRC的方法,包含給予該個體一siR财 組合物,該組合物能降低一選自PRC 296_321之群組的核酸序列之表現量。 85 WU418988 ⑼曰一種用以治療或預防一個體之PRC之方法,包含給予該個體一藥學 有效ϊ的抗體或其片段,其可與任—由選自pRC 296—321 編碼之蛋白質結合。 u ^ 種用以治療或預防一個體之PRC的方法,包含給予該個體一疫 田,该疫苗包括一由選自PRc 296_321之群組的核酸所編多 疫活性片段,«編碼該纽肽之雜徽。 肽^、免 62. —種用以治療或預防一個體之pRC的方法,包含給予該個體一 物,以增加PRC 322-457之表現或活性。 口 ⑽·曰-種用以治療或獅_個體之·的方法,包含舒該個體一藥學 的聚核脊酸,該聚核脊酸係選自prc 322-457之群組,或其所編: <夕胜肽。 _ 队-種用以治療或預防一個體之PRC的方法,包含給予該個體一化合 物’該化合物來自如申請專利範圍50—54項任一項之方法。 口 65· —種用以治療或預防pRC之組合物,該組合物包含一藥學上有效旦 之反義聚核或小干擾_乍為活性成分,以抗一由選自勝犯= 群組的聚核脊酸,以及一藥學上可接受的載體。 66· —種用以治療或預防pRC之組合物,該組合物包含一 或其片:支:其可與一由選自瞧—321之任一咖^ 、、、。&,以及一藥學上可接受的載體。 、 67::_㈣療或驗p⑽組合物,触合物包含_ 之聚核甘酸,麟選隨322—457之群組,或其所編躺多胜狀,以作二、 活性成分,以及藥學上可接受的載體。 ' 68. -種用以治療或預防PRC:的組合物,該組合物包含— 之化合物作為活性成分,該化合物係由如巾請專利範__54項任= 法所取得,以及藥學上可接受的載體。. 、 惑万 69. -觀m靖-娜之PIN,或是其發展PIN之傾 定源於個體之生物樣本中PRC相關的基因表現量,其中與正常對昭 量相比較,該表現量之高低變化代表該铺已有或是有發展為piN的危險見 70. 如申請專利範圍第69項的方法,其中該pRc相關基因係選自嫩 86 200418988 458-537組成之群組,其中與正常對照組之表現量相比較,該基因之表現量 高代表該個體已有或是有發展為PIN的危險。 71.如申請專利範圍第70項的方法,其中該表現量的增加至少大於正常 量之10%以上。 72·如申請專利範圍第69項的方法,其中該PRC相關基因係選自 PRC538-692所組成之群組,其中與正常對照組之表現量相比較,該基因之 表現量低代表該個體已有或是有發展為PIN的危險。 73.如申請專利範圍第72項的方法,其中表現量的減少至少大於正常量 10%以上。 74·如申請專利範圍第69項的方法,其中該方法更進一步包含測定複數 個PRC相關基因的表現量。 ^ 75_如申請專利範圍第69項的方法,其中該表現量是由下列群組之任一 方法來測定: (a) 測定該PRC相關基因的他⑽, (b) 測定該PRC相關基因所編碼之蛋白,以及 (c) 測定該PRC相關基因所編碼之蛋白的生物活性。 76·如申清專利範圍第69項的方法,其中該表現程度係經由偵測一嫩 相關基因之探針與該個體之生物樣本中的基因轉錄產物之雜交反應而測 定0 77.如申請專觀圍第76_方法,其中該雜交反應是在腿陣列上進 78·如申請專利範圍第69項的方法, 79.如申請專利範圍第69項的方法, 80·如申請專利範圍第76項的方法, 皮細胞。 其中該生物樣本包含表皮細胞。 其中該生物樣本包含PIN細胞。 其中該生物樣本包含來自PIN的表 包合二個或以上的基因表現模式,該基因 包含二個或以上的基因表現模式,該基因 81· —種PRC參考表現特徵, 選自PRC 458-692之群組。 82. —種PRC參考表現特徵 選自PRC 458-537之群組。 87 200418988 83· —種PRC參考表現特徵,包含二個或以上的基因表現模式,該基因 選自PRC 538-692之群組。 84· —種用以篩選治療或預防piN或預防pRC之化合物的方法,包含 a) 將一測試化合物與一由選自pRC 458—692之群組的核酸所編碼之多胜 肽接觸, b) 測定該測試化合物與該多胜肽間的結合活性 :以及 c) 選擇一結合到多胜肽上的化合物。 85·—種用以篩選治療或預防piN或是預防pRC之化合物的方法,包含: a) 將一候選化合物與表現一或多個標記基因的細胞接觸,其中該一或 多個標記基因係選自PRC 458-692之群組,以及 b) 選擇一化合物,其能減低一或多個選自PRC 458-537之群組的標記基鲁- 因之表現量,或是增加一或多個選自pRC 538—692之群組的標記基因之表現 量。 86. —種用以篩選治療或預防piN或是預防pRC之化合物的方法,包含: a) 將一測試化合物與一多胜肽接觸,該多胜肽是由選自pR(: 458一692之 群組的核酸所編碼; b) 測定步驟(a)中多胜肽的生物活性;以及 c) 與该測试化合物不存在時之生物活性相比較,挑選能抑制該多胜肽 生,活性的化合物’該多胜肽係由選自pRC 458_537之群組的核酸所編碼, 或疋挑選能增進該多胜肽生物活性的化合物,該多胜肽係由選自pRc 、 538-692之群組的核酸所編碼。 87·如申明專利範圍第85項的方法,其中細胞包含pm細胞。 88· -種用以篩選治療或獅piN或是獅pRG之化合物的方法,包含: σ、一候選化合物與一細胞接觸,該細胞含有一載體,該載體包含一 或夕個“祕_轉錄雛區,及受該_難_節表現的報導基因, 其中該一或多個標記基因係選自PRC 458一692之群組; b)測定該報導基因的活性;以及 、 曰c)與對照組比較,挑選能抑制該報導基因表現的化合物,該報導基因 疋選自PRC 458-537之群組的正調控序列,或是挑選能增進該報導基因表現 88 200418988 的化合物,該報導基因是選自PRC 538一692之群組的負調控序列。 89· —種套組,包含一偵測試劑,其能與二或多個選自pRC 458—692之 群組的核酸序列結合。 90· —種陣列,包含一核酸,其能與二或多個選自pRC 458—692之群組 的核酸序列結合。 91. 一種用以於一個體治療或預防piN或預防pRC的方法,包含給予該個 體一化合物,以降低一多胜肽的表現或活性,該多胜肽係由選自pRC 458—537 之群組的基因所編碼。 92· —種用以於一個體治療或預防piN或預防pRC的方法,包含給予該個 體一反義組合物,該組合物包含一核苷酸序列,其互補於一選自pRC 458 537 之群組的編碼序列。 93· —種用以於一個體治療或預防piN或預防pRC的方法,包含給予該個 體一siRNA組合物,其中該組合物能降低選自pRC 458—537之群組的核酸序 列之表現量。 一種於個體用以治療或預防PIN或預防PRC的方法,包含給予該個 體一藥學上有效量的抗體或其片段,其可與由任-選自PRC458-537之群組 的基因所編碼的蛋白結合。 • ·種於個體用以治療或預防PIN或是預防PRC的方法,包含給予該 疫苗’該疫苗包含一由選自pRC 537之群組的核酸所編碼之多胜 肽或”免疫活性片段,或是編碼該多胜肽之聚核脊酸。 96· —種於一個體用以治療或預防piN,或是預防的方法,包含給 _體-一化合物,以增加pRC 538—692之表現或活性。 兮個=^7?種^一個體用以治療或預防PIN,或是預防PRC的方法,包含給予 ^固-藥學上有效量的聚核苷酸,該聚核苷酸係選自pRc 538—692 組,或其所編碼之蛋白質。 吁 則固一種於一個體用以治療或預防™,或是預防PRC的方法,包含給予 :—化合物,該化合物係由如申請專利範圍84-88項任一項之方法所取 "· 一種用以治療或預防™,或是預防PRC的組合物,該組合物包含一 89 200418988 ir 藥學上有效量的反義聚贿酸或小干擾職作為活性成分,以抗-選自PRC 458-537之群組的聚核苷酸,以及一藥學上可接受的載體。 」〇〇· —種用以治療或預防PIN,或是預防PRC的組合物,該組合物包含 藥干上有效里的抗體或其片段,其可與一由任一選自偏一之君导組 的基因所編碼的蛋白質結合,及一藥學上可接受的載體。 “ΙΟΙ. -種用以治療或預防PIN,或是預防PRC的組合物,該組合物包含 一樂學上有效量的聚核替酸,其係選自PRC 538—692 多胜肽,錢藥學上可較的競。 H扁碼的 — 102. —種用以治療或預防PIN,或是預防pRC的組合物,該組 一樂學上有效量的化合物作為活性成分,該化合物係選自如巾 4-88項任-項之方法,以及一藥學上可接受的載體。 90
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