TR201815667T4 - Peptit. - Google Patents

Peptit. Download PDF

Info

Publication number
TR201815667T4
TR201815667T4 TR2018/15667T TR201815667T TR201815667T4 TR 201815667 T4 TR201815667 T4 TR 201815667T4 TR 2018/15667 T TR2018/15667 T TR 2018/15667T TR 201815667 T TR201815667 T TR 201815667T TR 201815667 T4 TR201815667 T4 TR 201815667T4
Authority
TR
Turkey
Prior art keywords
peptide
peptides
cells
pop
cell
Prior art date
Application number
TR2018/15667T
Other languages
English (en)
Inventor
Wraith David
Streeter Heather
Ordonez Laurence
Original Assignee
Apitope Tech Bristol Limited
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Apitope Tech Bristol Limited filed Critical Apitope Tech Bristol Limited
Publication of TR201815667T4 publication Critical patent/TR201815667T4/tr

Links

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/0005Vertebrate antigens
    • A61K39/0007Nervous system antigens; Prions
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/0005Vertebrate antigens
    • A61K39/0008Antigens related to auto-immune diseases; Preparations to induce self-tolerance
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P25/00Drugs for disorders of the nervous system
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00Drugs for immunological or allergic disorders
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/46Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
    • C07K14/47Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
    • C07K14/4701Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals not used
    • C07K14/4713Autoimmune diseases, e.g. Insulin-dependent diabetes mellitus, multiple sclerosis, rheumathoid arthritis, systemic lupus erythematosus; Autoantigens
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/705Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/57Medicinal preparations containing antigens or antibodies characterised by the type of response, e.g. Th1, Th2
    • A61K2039/577Medicinal preparations containing antigens or antibodies characterised by the type of response, e.g. Th1, Th2 tolerising response

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Rheumatology (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Diabetes (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Rehabilitation Therapy (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Neurology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Neurosurgery (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Marine Sciences & Fisheries (AREA)

Abstract

Bir MHC molekülüne in vitro bağlanabilen ve antijen prosesi (diğer bir deyişle bir apitop) olmaksızın bir T hücresine sunulabilen bir peptit sağlanır, bu peptit, aşağıdaki proteolipit protein (PLP) peptitlerinden tümünü veya bunun bir bölümünü içerir: PLP 36-61: HE ALTGTEKLIET YF SKN YQD YEYLI (SEQ ID NO. 1) PLP 179-206: TWTTCQSIAFPSKTSASIGSLCADARMY (SEQ ID NO. 2) PLP 207-234: GVLPWNAFPGKVCGSNLLSICKTAEFQM (SEQ ID NO. 3). Aynı zamanda, bu tür bir peptitin, bir farmasötik bileşim içinde kullanımı ve bu tür bir peptit kullanılarak bir hastalığın tedavi edilmesine ve/veya önlenmesine yönelik bir yöntem sağlanır.

Description

TARIFNAME Mevcut bulus proteolipit proteinden (PLP) peptitler ile ilgilidir. Özellikle, bulus bir MHC molekülüne baglanabilen ve antijen prosesi olmaksizin bir T-hücresine in vitro sunulabilen PLPlnin hidrofilik bölgelerinden birinden türetilebilir peptitler ile ilgilidir.
Bulus ayni zamanda bir hastaligin tedavisinde ve/veya bunun önlenmesinde bu tür peptitlerin kullanimi ile ilgilidir.
ALTYAP l Multipl skleroz (MS) sinir aksonlarinin demiyelinizasyonu ile karakterize edilen, merkezi sinir sistemini etkileyen kronik dejeneratif bir hastaliktir. MS, çok sayida fiziksel ve mental semptomlara yol açabilir ve sik sekilde fiziksel ve bilissel bozukluklara ilerler.
Hastaligin baslamasi genellikle genç yetiskinlerde (20-40 yas) meydana gelir, kadinlarda daha yaygindir ve dünya çapinda 1 milyondan fazla kisiyi etkiler.
MS'in hastalik süreci degiskendir ve uykuda bekleyebilir veya zaman içinde istikrarli bir sekilde ilerleyebilir. MS'in birçok alt türü, ilerlemenin modellerine bagli olarak açiklanmistir. MS sahibi bir Insan, hassasiyet kaybi veya karincalanma, Ignelenme veya uyusma (hipoestezi ve paraestezi), kas zayifliklari, klonüs, kas spazmlari veya harekette zorlanma gibi his degisiklikleri; koordinasyon ve denge (ataksi) ile zorluklar; konusmada (disartri) veya yutmada (disfaji) problemler, görsel problemler (nistagmus, fosfenler dahil olmak üzere optik nörit veya diplopi), yorgunluk, akut veya kronik agri ve mesane ve bagirsak zorluklari dahil olmak üzere tüm nörolojik semptom veya isaretlerden sikayetçi olabilir.
MS'in mevcut durumda, içinde vücudun kendi immün sisteminin miyeline saldirdigi ve buna hasar verdigi immüne aracili bir bozukluk olduguna inanilir.
MS'e yönelik bilinen hiçbir çare yoktur. Mevcut birçok terapinin, bir ataktan (nüks) sonra fonksiyonun eski haline getirilmesi, yeni ataklarin (nükslerin) derece veya sikliginin önlenmesi veya azaltilmasi veya bozuklugun kapsaminin önlenmesi veya azaltilmasinda yararli oldugu kanitlanmistir. Bununla birlikte, mevcut birkaç MS terapisi, yan etkiler ile iliskilendirilmistir veya zayif sekilde tolere edilir. Dolayisiyla, MS'e yönelik, MS'in tedavi edilmesinde ve MSlin semptomlarinin hafifletilmesi veya azaltilmasinda etkili olan alternatif terapilere yönelik bir ihtyiaç bulunur.
BULUSUN KISA AÇIKLAMASI Mevcut bulusçular, hücrelere sahip sabit antijen tarafindan T-hücrelerine sunulabilen proteolipit proteininden (PLP) türetilebilen birkaç peptit tanimlamistir. Bu peptitler, multipl skleroz gibi demiyelinizan hastaliklarin önlenmesinde ve/veya tedavi edilmesinde kullanisli olabilir.
Bir birinci açida, bu nedenle mevcut bulus bir MHC molekülüne in vitro baglanabilen ve antijen prosesi olmaksizin bir T hücresine sunulabilen ve asagidaki PLP peptitlerinden seçilen bir peptit saglar: Bir ikinci açida, bir demiyelinizan hastaligin tedavi edilmesi ve/veya önlenmesinde kullanima yönelik bulusun birinci açisina göre bir peptit saglanir.
Bir üçüncü açida, mevcut bulus, bulusun birinci açisina göre bir veya daha fazla peptit(ler) içeren bir farmasötik bilesimi saglar.
Burada açiklanan, özneye bulusun birinci açisina göre bir peptitin uygulanmasina yönelik adimi içeren, aynisina ihtiyaci olan bir öznede bir demiyelinizan hastaligin tedavi edilmesine ve/veya önlenmesine yönelik bir yöntemdir.
Burada açiklanan, bir demiyelinizan hastaligin önlenmesi ve/veya tedavi edilmesinde kullanima yönelik bir ilacin imalatinda bulusun birinci açisina göre bir peptitin kullanimidir.
Bulusun ikinci açisi ile baglantili olarak, hastalik multipl skleroz olabilir.
SEKILLERIN KISA AÇIKLAMASI Sekil 1 - Sekil 1: Üç PLP peptit bölgesi, in vitro ve in vivo yanit verir ve yanit, DR2 baglama tahminine iliskilendirilir. A, genis çerçevede in siliko (IEDB ve NetMHCII yöntemleri) HLA-DRB1*1501'e PLP peptitlerin baglama tahminini ve bu peptitlerin, bu farelerdeki proliferatif bir yanitini indüklemek üzere kabiliyetini temsil eder. B ve C, bu uzun peptitlerin 4'ünün, EAE'yi (2 ayri deney) indüklemek üzere kabiliyetini temsil eder.
Sekil 2 - HEAL-26 içinde apitoplarin tanimlanmasi Sekil 3 - TWTT-28 içinde apitoplarin tanimlanmasi Sekil 4 - GVLP-28 içinde apitoplarin tanimlanmasi Sekil 5 - Tolerizasyon protokolü Sekil 6 - HEAL-26 veya POP-4 ile önceden muamele edilen farelerden LNC'nin proliferasyonu ve sitokin üretimidir. A, HEAL-26 veya POP-4 apitopu ile önceden muamele edilen farelerden LNC'nin timidin kaynasmasinin +/- ortalama standart hatasinin (SEM) ortalamasini temsil eder.
Sekil 7 - HEAL-26 veya POP-4 ile önceden muamele edilen farelerden SPL'nin proliferasyonu ve sitokin üretimidir. A, HEAL-26 veya POP-4 apitop ile önceden muamele edilen farelerden SPL'nin timidin kaynasmasinin +/- SEM temsil eder.
Sekil 8 - TWTT-28 ile önceden muamele edilen farelerden LNC'nin proliferasyonu ve sitokin üretimidir. A, TWTT-28 apitop ile önceden muamele edilen farelerden LNC'nin timidin kaynasmasinin +/- SEM temsil eder.
Sekil 9 - TWTT-28 ile önceden muamele edilen farelerden SPL'nin proliferasyonu ve sitokin üretimidir. A, TWTT-28 apitop ile önceden muamele edilen farelerden SPL'nin timidin kaynasmasinin +/- SEM temsil eder.
Sekil 10 - POP-15 ile önceden muamele edilen farelerden LNC*nin proliferasyonu ve sitokin üretimidir. A, POP-15 apitop ile önceden muamele edilen farelerden LNC'nin timidin kaynasmasinin +/- SEM temsil eder.
Sekil 11 - POP-15 ile önceden muamele edilen farelerden SPL'nin proliferasyonu ve sitokin üretimidir. A, POP-15 apitop ile önceden muamele edilen farelerden SPL'nin timidin kaynasmasinin +/- SEM temsil eder.
Sekil 12 - POP-22 ile önceden muamele edilen farelerden LNClnin proliferasyonu ve sitokin üretimidir. A, POP-22 apitop ile önceden muamele edilen farelerden LNC'nin timidin kaynasmasinin +/- SEM temsil eder.
Sekil 13 - POP-22 ile önceden muamele edilen farelerden SPL'nin proliferasyonudur. A, POP-22 apitop ile önceden muamele edilen farelerden SPL7nin timidin kaynasmasinin +/- SEM temsil eder.
Sekil 14 - POP-22 veya GVLP-28 ile önceden muamele edilen farelerden LNC`nin proliferasyonu ve sitokin üretimidir. A, POP-22 (sol panel) veya GVLP- 28 (sag panel) apitop ile önceden muamele edilen farelerden LNC”nin timidin kaynasmasinin +/- SEM temsil eder.
Sekil 15 - POP-22 ve GVLP-28 ile önceden muamele edilen farelerden SPL'nin proliferasyonu ve sitokin üretimidir. A, POP-22 veya GVLP-28 apitop ile önceden muamele edilen farelerden SPL'nin timidin kaynasmasinin +/- SEM temsil eder.
Sekiller 6 ila 15'in her birine yönelik, B, timidin kaynasmasinin stimülasyon indeksini gösterir. C, kültür üst fazinda salgilanan sitokinin miktarini temsil eder. B ve C'de, doz basina her bir nokta, ayri bir fareyi temsil eder ve bar, medyani temsil eder. p Mann- Whitney testi kullanilarak hesaplanmistir. Sadece düsük p degerleri gösterilir. Bir <.05 p degeri önemli olarak düsünülür.
DETAYLI AÇIKLAMA Bir birinci açida, mevcut bulus bir peptit ile ilgilidir.
Peptitler baglar tarafindan tipik olarak birbirine baglanmis, bir dizi kalinti, tipik olarak L-amino asitler anlamina gelmek üzere normal anlaminda kullanilir. Terim, modifiye edilmis peptitler ve sentetik peptit analoglari içerir.
Mevcut bulusun bir peptiti, bir majör histokompatibilite kompleksi (MHC) sinif l veya lI molekülüne in vitro baglanabilen ve antijen prosesi olmaksizin bir T hücresine sunulabilen bir uzunluga sahiptir. Diger bir deyisle, peptitler bir veya her iki uçta herhangi bir kirpma gerektirmeksizin MHC molekülünün peptit baglama olugu içine dogrudan baglanabilir.
MHC sinif I moleküllere baglanan peptitler, tipik olarak 7 ila 13, daha genel olarak 8 ila amino asit boyundadir. Peptitin baglanmasi, peptitin ana zincirindeki atomlar ile tüm MHC sinif I moleküllerinin peptit-baglama olugundaki degismez yerler arasindaki temaslar yoluyla iki ucunda stabilize edilir. Peptitin amino ve karboksi terminusu baglayan olugun her iki ucunda degismez yerler bulunur. Peptit boyunda degiskenler, siklikla gerekli esneklige olanak saglayan prolin veya glisin kalintilarda, peptit belkemiginde bir kivrimlama tarafindan barindirilir.
MHC sinif Il moleküllerine baglayan peptitler, tipik olarak 8 ile 20 arasinda amino asit boyuna, daha genel olarak 10 ile 17 arasinda amino asit boyuna sahiptir ve daha uzun olabilir. Bu peptitler, (MHC sinif I peptit baglama olugunun aksine) her iki uçta açik olan MHC II peptit baglama olugu boyunca uzatilmis bir uyusumda uzanir. Peptit, peptit baglama olugunu kaplayan korunan kalintilar ile baslica ana zincir atom temaslari tarafindan yerinde tutulur.
Mevcut bulusun peptiti, kimyasal yöntemler (Peptide Chemistry, A practical Textbook.
Mikos Bodansky, Springer-Verlag, Berlin.) kullanilarak yapilabilir. Örnegin, kati faz ayrilabilir ve hazirlayici yüksek performans likit kromatografisi (örnegin, Creighton (1983) Proteins Structures And Molecular Principles, WH Freeman and Co, New York NY) ile saflastirilabilir. Otomatiklestirilmis sentez, örnegin imalatçi tarafindan saglanan talimatlar ile uyumlu olarak ABI 43 1 A Peptit Sentezleyici (Perkin Elmer) kullanilarak elde edilebilir.
Peptit alternatif olarak, rekombinant araçlar ile veya daha uzun bir polipeptitten klevaj ile yapilabilir. Örnegin, peptit miyelin proteolipit proteininden klevaj ile elde edilebilir. Bir peptititn bilesimi, amino asit analizi veya dizilemesi (örnegin, Edman bozunum Miyelin proteolipit proteini (PLP) Miyelin, genel olarak bir nöronun sadece aksonu etrafinda, bir katman, miyelin kilifi olusturan bir dielektrik (elektriksel olarak izole edici) materyaldir. Bu, sinir sisteminin uygun sekilde isleyisine yönelik oldukça önemlidir. Miyelin olusturan proteinlerden bazilari, miyelin temel proteini (MBP), miyelin oligodendrosit glikoproteini (MOG) ve Merkezi sinir sistemi (CNS) miyelininin en bol miktarda proteini olan, miyelin proteolipit proteini (PLP), bir hidrofobik integral membran proteinidir.
Insan PLP dizisi, SEQ ID No. 16ida gösterilir Bulusun peptiti, PLP dizisinin bir hidrofolik bölgesinden türetilebilir. Peptit, bir antijen sunan hücre tarafindan antijenin dogal prosesi ile meydana gelen antijenin bir parçasindan türetilebilir.
PLP”nin hidrofilik bölgeleri, bunlardir: PLP 104-135: KTTICGKGLSATVTGGQKGRGSRGQHQAHSLE (SEQ ID No.
PLP 119-150: GQKGRGSRGQHQAHSLERVCHCLGKWLGHPDK (SEQ ID No.
Peptit, asagidaki proteolipit protein (PLP) bölgesinin bir parçasini içerir: Peptit, asagidaki bölgenin bir parçasini içerir: Peptit, asagidaki PLP peptitlerden seçilir: Apitoplar Adapte edilebilen bir immün yanitinda, T Ienfositleri, bir protein antijenin iç epitoplarini taniyabilir. Antijen sunan hücreler (APC), protein antijenleri toplar ve bunlari kisa peptit parçalara bozar. Bir peptit, hücre içinde bir majör histokompatibilite kompleksi (MHC) sinif l veya II molekülüne baglanabilir ve hücre yüzeyine tasinabilir. Bir MHC molekülü ile baglantili olarak hücre yüzeyinde sunuldugunda, peptit bir T hücresi tarafindan (T hücre reseptörü (TCR) vasitasiyla) taninabilir, bu durumda. peptit, bir T hücre epitopudur.
T-hücre epitoplari, öz veya yabanci, herhangi bir antijene, adapte edilebilen immün yanitinda merkezi bir görev görür. Hipersensitivite hastaliklarda (alerji, otoimmün hastaliklari ve transplant reddi içerir) T hücre epitoplari tarafindan görülen merkezi görev, deney modellerinin kullanimi vasitasiyla gösterilmistir. Adjuvan ile kombinasyon halinde sentetik peptitlerin (T hücre epitoplarinin yapisina bagli olarak) enjeksiyonu ile indükleyici veya alerjik hastaliklarin indüklenmesi mümkündür.
Bunun aksine, çözünebilir formda peptit epitoplarin uygulanmasi yoluyla özel peptit epitoplara karsi immünolojik toleransin indüklenmesinin mümkün oldugu gösterilmistir. Çözünebilir peptit antijenlerinin uygulanmasi, deneysel otoimmün ensefalomiyelitinde (EAE - multipl skleroza (MS) yönelik bir model) (Metzler and Wraith (1993) Int. deneysel modellerinde (yukarida oldugu üzere Anderton and Wraith (1998)'de incelenmistir) hastaligin inhibe edilmesine yönelik etkili bir araç olarak gösterilmistir. Bu ayni zamanda, EAE'de (yukarida oldugu üzere Anderton and Wraith (1998)) devam eden bir hastaligin tedavi edilmesine yönelik bir araç olarak gösterilmistir.
Tolerojenik peptitlerin hastaligi tedavi etmek veya önlemek üzere kullanimi, önemli ölçüde ilgi çekmistir. Buna yönelik bir neden, bazi tolerojenik epitoplarin, ayni doku içinde ayri antijenlere yönelik T hücrelerini azaltarak regüle edebildiginin gösterilmesidir. “Seyirci supresyonu” olarak bilinen bu fenomen, verilen bir antijen içinde birden fazla epitopa (tercih edildigi üzere tüm epitoplar) ve verilen bir hastaliga yönelik birden fazla antijene, özel bir tolerojenik peptit (yukarida oldugu üzere Anderton and Wraith (1998)) kullanilarak tolerans indüklemenin mümkün olmasi gerektigi anlamina gelir. Bu, özel bir hastalik içindeki patojenik antijenlerinin tümünün tanimlanmasina yönelik ihtiyaci gereksiz kilar.
Peptitler ayni zamanda, nispeten düsük maliyetleri ve peptit analoglarinin degistirilmis immünolojik özellikler ile üretilebilmesinden dolayi terapiye yönelik faydali bir seçenektir. Peptitler dolayisiyla, MHC veya TCR ile etkilesimlerini degistirmek üzere modifiye edilebilir.
Bu yaklasim ile olasi bir problem, T hücre epitoplari olarak görev gören tüm peptitlerin tolerans indükleyemediginin gösterilmesidir. Miyelim temel protein (MBP) peptiti (89- 101), immünizasyondan sonra bir immünodominant antijendir ve ayni zamanda T hücre reaktivitesi ve EAE'nin indüksiyonuna yönelik hazirlama ile ilgili olarak oldukça etkili bir immünojeniktir. Bununla birlikte, bu peptitin solüsyonda uygulanmasi durumunda tolerans indüklemede etkisiz oldugu gösterilmistir (yukarida oldugu üzere Anderton and Wraith (1998)).
Toleransi indüklemek üzere T hücre epitoplarinin kabiliyetinde gözlemlenen hiyerarsiye yönelik birçok açiklama sunulmustur (yukarida oldugu üzere Anderton and Wraith (1998)'de incelenmistir). Özellikle, MHC'ye yönelik peptitin afinitesi ile tolerojenisite arasinda bir korelasyon bulundugu (yukarida oldugu üzere Liu and Wraith (1995)), ancak bunun gözlemlemelerden bazilari ile uymadigi sunulmustur. Örnegin, tolerojenik olmayan MBP [89-1011, nispeten yüksek afinite ile I-As'e baglanir. Dolayisiyla, hangi peptitlerin toleransi indükleyecegini öngörmek kolay degildir.
Mevcut bulusçular, bir peptip epitopunun antijen prosesi olmaksizin immatür APC tarafindan sunulacak uygun bir boyuta sahip olmasi halinde, bu, immünolojik toleransi indükleyebilir (Uluslararasi patent basvuru numarasi PCT/GBO1/03702). Bazi T hücre epitoplarinin tolerojenik oldugu ve digerlerinin tolerans indükleyemedigine dair gözlemleme, bu nedenle bazi epitoplarin, bir MHC molekülü tarafindan sunulabilmelerinden önce antijen proses gerektirmesi ile açiklanabilir. Ayrica proses gerektiren bu epitoplar, adjuvan ile kombinasyon halinde enjekte edildiginde hastaligi indüklemek üzere kapasitelerine ragmen, çözünebilir bir formda uygulandiginda tolerans indüklemez.
Ayrica proses gerektirmeyen epitoplar, tolerans indükleyebilir ve bulusçular tarafindan Antijen prosese Bagimsiz Sunum Sistemleri (AP/PS) Mevcut bulusun peptitleri bir MHC moleküle in vitro baglanabilir ve antijen prosesi olmaksizin bir T hücreye sunulabilir.
Bir peptitin, bir “proses içermeyen” sistem kullanilarak bir MHC moleküle antijen prosesi olmaksizin baglanabilip baglanamadigini test etmek mümkündür. Bu tür bir sistem, T hücrelerine MHC molekülleri vasitasiyla antijen sunabilmelidir, ancak antijeni isleyememelidir. Dolayisiyla peptitler, bir antijen prosese bagimsiz sunum sistemi (APIPS) kullanilarak bir MHC moleküle in vitro baglanabilme ve antijen prosesi olmaksizin bir T hücreye sunulabilme kapasitelerine yönelik test edilebilir.
APIPS örnekleri, asagidaki unsurlari içerir: a) sabit APC (CD28'e antikorlar ile veya bunlar olmaksizin): b) Sinif I veya II MHC molekülleri içeren Iipit membranlari (CD28'e antikorlar ile veya bunlar olmaksizin); ve c) plaka-bag formunda saflastirilmis dogal veya rekombinant MHC (CD28”e antikorlar ile veya bunlar olmaksizin).
T hücre yanitlarini arastirmak üzere, örnegin bir polipeptit içinde minimal epitopu arastirmak üzere çalismalarda, kesilmis peptitlere yanitlari ölçerek, sabit APC'nin formaldehit (genel olarak paraformaldehit) veya glutaraldehit kullanilarak sabitlenebilir.
Lipit membranlar (düzlemsel membranlar veya lipozomlar olabilir), yapay lipitler kullanilarak hazirlanabilir veya APC'den plazma membran/mikrosomal fraksiyonlar olabilir.
Kullanimda, APlPS bir doku kültür plakasinin gözlerine uygulanabilir. Peptit antijenleri akabinde eklenir ve APIPS'in MHC parçasina peptitin baglanmasi, seçilen T hücre hatlari veya klonlarinin eklenmesi yoluyla saptanir. T hücre hatti veya klonunun aktivasyonu, teknikte bilinen yöntemlerden herhangi biri yoluyla, örnegin 3H-timidin kaynasmasi veya sitokin salgilamasi vasitasiyla ölçülebilir.
Bir peptitin, bir APIPS tarafindan bir T hücreye sunulabilmesi halinde, akabinde bu, antijen prosesi olmaksizin MHC molekülüne baglanabilir ve bir apitoptur.
Tolerans Mevcut bulusun peptitleri, proteolipit proteine toleransi indükleyebilir.
Burada kullanildigi üzere, “tolerojenik”, toleransi indükleyebilme anlamina gelir.
Tolerans, bir antijene yanit vermedeki basarisizliktir. Öz antijenlere tolerans, immün sisteminin oldukça önemli bir özelligidir, bunun kaybedilmesi durumunda, otoimmün hastaliklar ortaya çikabilir. Adapte edilebilen immün sistemi, kendi dokulari içinde bulunan öz antijenlerin otoimmün ataklari önlenirken, oldukça çok çesitli bulasici ajanlara yanit verme kapasitesini sürdürmelidir. Bu, timüs (merkezi tolerans) içinde apoptotik hücre ölümüne immatür T Ienfositlerin hassasiyeti tarafindan genis kapsamda kontrol edilir. Bununla birlikte, timüs içinde tüm öz antijenler saptanmamistir. böylece kendiliginden reaktif timositlerin ölümü, tamamlanmamis halde kalir. Dolayisiyla ayni zamanda bu ile toleransin, periferal dokular (periferal tolerans) içinde matür kendiliginden reaktif T Ienfositleri tarafindan elde edilebildigi mekanizmalar bulunur.
Merkezi ve periferal toleransin mekanizmalarinin bir incelemesi, Anderton et al (1999) Tolerans, CD4+ T hücrelerinin en az bir parçasinda anerjinin indüksiyonundan ortaya çikabilir veya bu ile karakterize edilebilir. Bir T hücreyi aktive etmek amaciyla, bir peptitin T hücrelere iki sinyal dagitabilen bir “profesyonel” APC ile iliskilenmesi gereklidir. Birinci sinyal (sinyal (1)), APC'nin hücre yüzeyi üzerinde MHC-peptit kompleksi ile dagitilir ve TCR vasitasiyla T hücre tarafindan alinir. Ikinci sinyal (sinyal (2)) CD80 ve CD86 gibi APC'nin yüzeyi üzerindeki kostimülatör moleküller ile dagitilir ve T hücrenin yüzeyi üzerinde CD28 tarafindan alinir. Bir T hücrenin, sinyalin (2) yoklugunda sinyali (1) almasi durumunda. aktive edilmedigi ve anerjik hale geldigi düsünülür. Anerjik T hücreleri, sonraki antijenik yüklemeye dayaniklidir ve diger immün yanitlari bastirabilir. Anerjik T hücrelerinin, T hücre toleransina aracilik etmek ile ilgisi olduguna inanilir.
MHC moleküller ile baglantili olarak sunulabilmelerinden önce proses gerektiren peptitler, matür antijen sunan hücreler tarafindan idare edilmelerinin gerekli olmasindan dolayi tolerans indüklemez. Matür antijen sunan hücreler (makrofajlar, B hücreler ve dendritik hücreler gibi), antijeni isleyebilir, ancak ayni zamanda T hücre aktivasyonuna yol açaran bir T hücreye sinyalleri ((1) ve (2)) dagitabilir. Apitoplar diger yandan immatür APC üzerinde sinif II MHC`yi baglayabilecektir. Dolayisiyla, bunlar, T hücre anerjisi ve toleransina yol açarak, kostimülasyon olmaksizin T hücrelerine sunulacaktir.
Apitoplar ayni zamanda matür APC'nin hücre yüzeyinde MHC molekülleri baglayabilir.
Bununla birlikte, immün sistemi, matür APC'den oldukaç daha çok immatür içerir (dendritik hücrelerin %10'dan azinin aktive edildigi önerilmistir, Summers et al. (2001) Am. J. Pathol. @: 285-295). Bir apitopa varsayilan pozisyon bu nedenle aktivasyon yerine, enerji/tolerans olacaktir.
Tolerans indüklendiginde, antijen spesifik CD4+ T hücrelerinin hizla çogalma kapasitesinin azaltildigi gösterilmistir. Ayni zamanda, bu hücreler tarafindan IL-2, IFN-y ve lL-4 üretimi azaltilarak regüle edilir, ancak IL-10 üretimi arttirilir. Peptit indüklü tolerans halinde farelerdeki IL-10 nötralizasyonu, hastaliga yönelik duyarliligi tamamen eski haline getirdigi gösterilmistir. Regülatör hücrelerin popülasyonunun, IL-1O üreten ve immün regülasyona aracilik eden toleransli halde devam ettigi önerilmistir (Burkhart Toleransin indüksiyonu bu nedenle, asagidakiler dahil olmak üzere çesitli teknikler yoluyla izlenebilir: (a) buna yönelik peptitin in vivo bir hedef epitopu oldugu hastaliga temas etmek üzere azaltilmis duyarlilik; (b) CD4+ T hücrelerinde anerjinin indüksiyonu (antijen ile sonraki yükleme ile in vitro saptanabilir olandir): (c) asagidakiler dahil olmak üzere, CD4+ T hücre popülasyonunda degisimler (i) poliferasyonda indirgeme; (ii) örnegin, lL-2, IFN-v ve lL-4 üretiminde azalarak regülasyon; ve (iii) lL-10 üretiminde artistir..
Hedef hastaliklar Bulusun peptiti bir hastaligin tedavisinde ve/veya önlenmesinde kullanilabilir.
Hastalik, adrenolökodistrofi, kaybolan ak madde hatsaligi veya multipl skleroz (MS) gibi bir demiyelinizan hastalik olabilir.
Mevcut bulusun peptiti özellikle multipl sklerozun (MS) tedavisinde ve/veya önlenmesinde kullanislidir. Multipl skleroz (MS) CNS ak madde boyunca yayilan ve çesitli yerlerde ve zamanlarda meydana gelen multipl demiyelinizan lezyonlar ile karakterize edilen kronik bir inflamatuvar hastaliktir (McFarlin and McFarland, 1982 ile aracilik edildigi düsünülür.
Farmasötik bilesim Bir ikinci açida, mevcut bulus, bulusun birinci açisinin bir veya daha fazla peptit(ler) içeren bir farmasötik bilesimi ile ilgilidir.
Mevcut bulusçular, “seyirci bastirmaya” ragmen, toleransin etkili bir sekilde indüklenmesi amaciyla birçok farkli T hücre klonunun hedeflenmesi gerekli olabilir.
Dolayisiyla, birçok peptit, bir hastaligi önlemek veya tedavi etmek amaciyla bir bireye uygulanabilir.
Farmasötik bilesim, örnegin 1 ile 20 arasinda apitop, örnegin 1 ila 15, 2 ila 8 veya 4 ila 6 apitop içerebilir.
Iki veya daha fazla apitop bulundugunda, farmasötik bilesim bir kit formunda olabilir, burada apitoplarin bazilari veya her biri, es zamanli, ayri veya dizisel uygulamaya yönelik ayri olarak saglanir.
Alternatif olarak (veya ilave olarak) farmasötik bilesimin (veya bunun herhangi bir bölümünün) çoklu dozda uygulanacak olmasi halinde, her bir doz ayri olarak paketlenebilir.
Farmasötik bilesim apitopun veya bunun her birinin terapötik olarak veya profilaktik olarak etkili bir miktarini ve istege bagli olarak farmasötik olarak kabul edilebilir bir tasiyici, seyrelti veya eksipiyan içerebilir.
Ayni zamanda, mevcut bulusun farmasötik bilesiminde, apitop veya bunun her biri, herhangi bir uygun baglayici(lar), yaglayici(lar), süspanse ajani(lari), kaplama ajani(lari) veya çözünme ajani(lari) ile karistirilabilir.
Uygulama Peptit, adjuvanin yoklugunda çözünebilirformda uygulanabilir.
Peptit, bir mukozal, subkütanöz veya intradermal yol ile intranazal olarak uygulanabilir. Çalismalar, intraperitoneal olarak (i.p.), intravenöz olarak (i.v.) veya intranazal olarak (i.n.) veya oral olarak çözünebilir formda verildiginde peptitin, T hücre toleransi indükleyebildigini göstermistir (Anderton and Wraith (1998); yukarida oldugu üzere Liu Farelerdeki çalismalar, tolerans indüklemek üzere gerekli olan peptit uygulamasinin süresinin, alicidaki T hücrelerin öncül frekansina bagli oldugunu göstermistir (yukarida oldugu üzere Burkhart et al (1999)). Birçok deney çalismasinda, peptitin tekrarlanan dozlarinin, toleransi indüklemek üzere gerekli oldugu gösterilmistir (yukarida oldugu üzere Burkhart et al (1999)). Peptitin tam dozu ve dozlarinin sayisi bu nedenle bireye bagli olacaktir; bununla birlikte, tercih edilen bir düzenleme, birçok doz uygulanir.
Birçok peptitin es zamanli olarak uygulanmasi halinde, bunlar, tekli veya çoklu dozlarda uygulamaya yönelik uygun olan bir “kokteyl" formunda olabilir. Alternatif olarak, çoklu dozlarin verilmesi ancak dozlar arasindaki peptitlerin nispi konsantrasyonlarinin degistirilmesi tercih edilebilir.
Tercih edilen bir düzenlemede, bir “doz eskalasyonu” protokolüne uygulabilir, burada birçok doz, asendan konsantrasyonlarda hastaya verilir. Bu tür bir yaklasim, örnegin bal zehiri alerjisine karsi immünoterapötik uygulamalrda fosfolipaz A2 peptitlere yönelik ÖRNEKLER Asagidaki örnekler, mevcut bulusu göstermek üzere islev görür, ancak bunun bir sinirlandirilmasi olarak yorumlanmamalidir. Bulus özel olarak, bu örneklerde açiklanan spesifik düzenlemeler ile ilgilidir ÖRNEK 1 - Proteolipit protein (PLP) dizisinin hidrofilik kisimlarinin arastirmasi Materyaller ve Yöntemler Antiienler PLP'nin genis ölçüde bir hidrofobik protein olmasindan dolayi, dizinin hidrofilik kisimlarinin kullanilmasi gerekli olmustur. Bu amaca yönelik, hidropatisite çalismalari gerçeklestirilmistir ve sekiz peptit, asagidaki gibi, PLP molekülünün hidrofilik domenlerinden sentezlenmistir: 36-61 (26mer): HEALTGTEKLIETYFSKNYQDYEYLI-NH2 88-119 (32mer): EGFYTTGAVRQIFGDYKTTICGKGLSATVTGG-NH2 104-135 (32mer): KTTICGKGLSATVTGGQKGRGSRGQHQAHSLE-NH2 119-150 (32mer): GQKGRGSRGQHQAHSLERVCHCLGKWLGHPDK-NH2 179-206 (28mer):TWTTCQSIAFPSKTSASIGSLCADARMY-N H2 192-219 (28mer): TSASIGSLCADARMYGVLPWNAFPGKVC-NH2 207-234 (28mer): GVLPWNAFPGKVCGSNLLSICKTAEFQM-NH2 260-276 (17mer): ATYNFAVLKLMGRGTKF-NH2 Her bir peptite yönelik, iri sil/'co çalismalar DR2 (HLA-DRB1*1501) baglama kapasitesini tahmin etmek üzere gerçeklestirilmistir ve in vitro (proliferasyon deneyi) ve in vivo (EAE indüksiyonu) çalismalari, yaniti arastirmak üzere gerçeklestirilmistir.
Sonuçlar Sekil 1'de gösterilir. Üç peptit in vitro ve in vivo çalismalarda yanit verdigi gösterilmistir ve bu, DR2 baglama tahmini ile iliskilendirilmistir. Bu peptitler, HEAL-26, TWTT-28 ve GVLP-28'dir (peptiti tanimlamak üzere yukaridaki dizilerde koyu olarak gösterilen ilk dört amino asit kullanilmistir). Örnek 2 - HEAL-26 içinde Apitoplarin Tanimlanmasi HEAL-26'yi kapsayan 15-mer örtüsen peptitlerin bir paneli, standart F-moc kimyasi kullanilarak sentezlenmistir. Her bir peptit, asagidaki gösterildigi üzere, 1 amino asit ile yerinden çikarilmistir.
HEAL-26 peptit Dizi POP-1 HEALTGTEKLIETYF POP-2 EALTGTEKLIETYFS POP-3 ALTGTEKLIETYFSK POP-4 LTGTEKLIETYFSKN POP-5 TGTEKLIETYFSKNY POP-6 GTEKLIETYFSKNYQ POP-7 TEKLIETYFSKNYQD POP-8 EKLlETYFSKNYQDY POP-9 KLIETYFSKNYQDYE POP-10 LIETYFSKNYQDYEY POP-11 IETYFSKNYQDYEYL POP-12 ETYFSKNYQDYEYLI Peptitler, DR2 farelerinden HEAL-26 spesifik hibridomlar kullanilarak analiz edilmistir.
Bu peptitlerden, POP-4, POP-7 ve POP-8 apitop olarak tanimlanmistir. Örnek 3 - TWTT-28 içinde Apitoplarin Tanimlanmasi TWTT-28'yi kapsayan 15-mer örtüsen peptitlerin bir paneli. standart F-moc kimyasi kullanilarak sentezlenmistir. Her bir peptit, 1 amino asit ile yerinden çikarilmistir.
Peptitler, DR2 farelerinden TWTT-28 spesifik hibridomlar kullanilarak analiz edilmistir.
Asagidaki diziye sahip olan, POP-14 ila POP-18 peptitler, apitop olarak tanimlanmistir: TWTT-28 peptitler Dizi POP-14 WTTCQSIAFPSKTSA POP-15 TTCQSIAFPSKTSAS POP-16 TCQSIAFPSKTSASI POP-17 CQSIAFPSKTSASIG POP-18 QSIAFPSKTSASIGS Örnek 4 - GVLP-28 içinde Apitoplarin Tanimlanmasi GVLP-28'yi kapsayan 15-mer örtüsen peptitlerin bir paneli, standart F-moc kimyasi kullanilarak sentezlenmistir. Her bir peptit, 1 amino asit ile yerinden çikarilmistir.
Peptitler, DR2 farelerinden TWTT-28 spesifik hibridomlar kullanilarak analiz edilmistir.
Asagidaki diziye sahip, peptit POP-22 bir apitop olarak tanimlanmistir: VLPWNAFPGKVCGSN. ÖRNEK 5 - Ex vivo tolerans deneyi Toleransi indüklemek üzere apitoplarin kabiliyetini degerlendirmek amaciyla, bulusçular ilk olarak bir immün yanitini ex vivo indüklemek üzere bu apitoplarin kabiliyetini belirlemistir. Bu amaca yönelik, HLA-DRB1*1501 fareleri, ayri bir apitopun bir doz eskalasyonu ile önceden muamele edilmistir ve akabinde karsilik gelen uzun peptit ile hazirlanmistir. Hazirlamadan 10 gün sonra, splenositler (SPL) ve lenf dügüm hücreleri (LNC) kültürlenmistir ve 3H-timidin kaynasmasi ile bunlarin proliferasyonunu ve multipleks sitokin profil sistemleri ile sitokin üretimini degerlendirmek üzere 3 gün boyunca karsilik gelen uzun peptit ile stimüle edilmistir (Sekil 5).
Tolerizasyon çalismasi, POP-4 ön muamelesinin, lenf dügümü (Sekil 6) ve dalakta (Sekil 7) T hücre proliferasyonunun inhibisyonunu ve Th1/Th17 sitokin üretiminin bastirilmasini (IFN-y, TNF-oi ve IL-17'nin önemli düsüsü) indükledigini gösterir. HEAL- 26 (Sekil 6 ve 7) poliferasyonu düsürür ve SPL ve LNClde IL-17 üretimini düsürür.
Ancak, fareler HEAL-26 ile önceden muamele edildiginde Th1/Th17 sitokinden Th2 sitokinlere bir degisim gösteren IL-5'te bir artis ayni zamanda gözlemlenir.
POP-15 ve TWTT-28, SPL ve LNC'nin proliferasyonunu ve sitokin üretimini oldukça iyi sekilde inhibe eder. POP-15'e yönelik, splenositlere yönelik proliferasyonda sifir farklilik bulunur, ancak sitokin üretiminde az miktarda degisiklikler bulunur. POP-15 ile muamele edilen fareler, daha az IFN-y (statik olarak önemli), daha az GM-CSF ve daha az IL-17 üretir. Ilaveten, fareler POP-15 ile muamele edildiginde, LNC içinde proliferasyon ve sitokinlerin (IFN-y, GM-CSF ve IL-17) önemli bir inhibisyonu bulunur.
POP-22'e yönelik, sonuçlar, PBS farelerin oldukça düsük bir yanitindan dolayi, daha az belirgindir. Bununla birlikte, POP-22 ve GVLP-28 ile bir ön muamelenin bir etkisinin gözlemlenmesi mümkündür. Stimülasyon indeksi, POP-22 (Sekil 12 ve 14) ve GVLP- 28 (Sekil 14) ile LNC proliferasyonunda bir düsüs gösterir. Bu hücreler ile IL-17 üretiminin önemli bir inhibisyonu, fareler Pop-22 veya GVLP-28 ile önceden muamele edildiginde ayni zamanda gözlemlenir.
Mategal ve Yöntemler HLA-DRB1*1501 fareleri (DR2 fareleri) Lars Fugger (LS Madsen et al. A humanized model for multiple sclerosis using HLA-DR2 and a human T-cell receptor. Nature genet çikan DR2 fareleri, HLA-DRBt*1501 molekülü ifade eder ancak fare MHC molekülünü Pepüder Uzun peptitler ve 15-mer peptitleri GL Biochem Ltd (Sangay, Çin) tarafindan sentezlenmistir ve -80°C'de dimetil sülfoksit (DMSO, Sigma-Aldrich, Saint Louis, MA) içinde depolanmistir.
HLA-DRB1*1501,e baglanan peptitlerin arastirmasi NetMHCII 2.2 Sunucusu NetMHCII 2.2 sunucusu, yapay nöron aglari kullanilarak peptitlerin HLA-DRBt*1501'e baglanmasini tahmin eder. Tahmin degerleri, nM IC50 degerlerinde verilir. Güçlü ve zayif baglama peptitleri, çiktida belirtilir. Yüksek afinite baglama peptitleri, 50 nM^den az bir ICSO degerine sahiptir ve zayif baglama peptitleri, 500 nM'den az bir ICSO degerine sahiptir. Sonuç, bu sekilde hesaplanan tahmin skoru olarak gösterilir: 1- Immün Epitop Veritabani (IEDB): konsensüs yöntemi Her bir peptite yönelik, dört yöntemin (ARB, kombinatoryal kütüphane, SMM_align ve Sturniolo) her birine yönelik bir siniflama yüzdesi, peptitin skorunun, SWISSPROT veritabanindan seçilen bes milyon rastgele 15 merin skorlari ile kiyaslanarak olusturulmustur. Küçük sayili bir siniflama yüzdesi, yüksek afiniteyi belirtir. Dört yöntemin medyan siniflama yüzdesi akabinde konsensüs yöntemine yönelik siniflamayi olusturmak üzere kullanilmistir. Web sitesi adresi: httpzlltools.immuneepitope.0rg/analyze/html/mhc_lI_binding.html.
Uzun peptitlerin immünojenisitesinin belirlenmesi Hazirlama ve EAE (Deneysel otoimmün ensefalomiyelit) HLA-DRB1*1501 transjenik fareler, kuyrugun tabaninda sunkütanöz olarak PBS (Lonza, Verviers, Belçika) içinde 100 pg uzun peptit veya sadece PBS içeren 100 pl ile ve 4 mg/ml Mikobakterium tüberküloz (MTb, BD Difco, Oxford, BK) ile Tam Freund Adjuvan (CFA: BD Difco, Oxford, BK) ile enjekte edilmistir. EAE çalismasina yönelik, fareler hazirlama ile ayni zamanda ve 2 gün sonra 200ng bogmaca toksini ile enjekte edilmistir. Fareler akabinde, her gün hastaliga yönelik takip edilmistir, tartilmistir ve skorlanmistir.
Hücre kültürü . günde, drenaj Ienfi dügümü ve dalak çikarilmistir ve splenositler ve lenf dügümü hücreleri izole edilmistir ve 96 gözlü düz tabanli plakalarda X-vivo 15 ortaminda (glutamin, penisilin ve steptomisin ile takviyelendirilmistir; Lonza, Verviers, Belçika) kültürlenmistir. 200 pIIgÖZ içinde 0.5x106 hücre/göz profilerasyon deneyine yönelik farkli peptit konsantrasyonlari ile kültürlenmistir.
Proliferasyon deneyi ve sitokin analizi Kültür içinde 3 günden sonra, 60 pl üst faz hasat edilmistir (hücreleri bozmaksizin) ve dondurulmustur. 20 uCi/ml ön seyreltinin (5 mCi stogu; PerkinElmer,Waltham, MA) 25 uI/göz tridiye timidini, 0.5 uCi/gözlük bir nihai konsantrasyon için hücrelere eklenmistir.
Hücreler, 37°C'de inkübe edilmistir. 18 saatten sonra, plakalar dondurulmustur.
Akabinde erimis plakalar hasat edilmistir ve ß-sayaç ile okunmustur (Wallac 1450 MicroBeta TriLux Sivi Sintilasyon Sayaci). Üst faz akabinde Th1/Th2 10plex FlowCytomix Multiplex (Bender) fare ile analiz edilmistir.
T hücre klonlarinin olusumu Hazirlama ve T hücre hatti kurulumu.' 0. günde, bes HLA-DRB1*1501 transjenik fare, kuyruk tabaninda 4 mg/ml Mikobakterium tüberküloz ile CFA'da 100 ug uzun peptit ile enjekte edilmistir. Bir PBS hazirlanmis kontrol grubu, hazirlamaya yönelik kontrol olarak kullanilmistir. 10. günde, drenaj lenf dügümleri ve dalaklar çikarilmistir ve splenositler ve lenf dügüm hücreleri izole edilmistir. Splenositler ve lenf dügüm hücreleri karisitirilmistir ve CD4 T hücreleri, negatif saflastirma kiti (dokunulmamis CD4 T hücreleri; Miltneyi, Bergisch Gladbach, Almanya) kullanilarak saflastirilmistir. CD4 T hücreleri akabinde yaklasik olarak 5x106 hücre/ml'de 1:1'Iik bir oranda HLA-DRB1*1501 farelerinden APC (Antijen sunan hücreler) olarak isina maruz kalmis splenositler (3000 rad) ile ve bir 6 gözlü plaka içinde 10 ug/ml'de bir uzun peptit ile yeniden stimüle edilmistir. Stimülasyon, fetal buzagi serumuna (FCS) yönelik spesifik hücrelerin aktive edilmesini önlemek üzere X- vivo 15 ortaminda yapilmistir. 4. günde, 20 U/ml rekombinant insan lL-2 (R&D, Mineapolis, MN), hücrelere eklenmistir. 7. günde, tüm hücreler hasat edilmistir ve ölü hücreler FicoII yogunluk gradyan ayirma (Histopaque 1083, Sigma-Aldrich, St Louis, MA) yoluyla elimine edilmistir. Hücreler akabinde, 2:1'de APC:CD4 T hücrelerinin bir orani ile DR2 farelerden isina maruz kalmis splenositler ile yeniden stimüle edilmistir.
Uzun peptit, 10 pg/ml'de kültüre eklenmistir. Bu defa, RPMI-%5 FCS (Biosera, Ringmer, BK; hepes, penisilin, streptomisin, glutamin: Lonza; ve ß-merkaptoetanol: gibco ile takviyelendirilmistir) kullanilmistir. 7. günde, hücreler hasat edilmistir, fikole edilmistir ve kaynastirilmistir.
Kaynastirma: 1x106 CD4 T hücre hatti birlikte karistirilmistir ve sert bir pelete yönelik santrifüj üzerindeki en yüksek kirma ayari kullanilarak bir 50 ml içinde serum içermeyen ortamda 37°C'de yikanmistir. Üst faz dökülmüstür ve fazlalik, bir pipet ile çikarilmistir.
Hücreler geri kalan ortamin düsmesi amaciyla 5 dakika boyunca bir su banyosu içinde birakilmistir ve akabinde bir pipet ile çikarilmistir. Hücre peleti yavas ancak derinlemesine sekilde yeniden süspanse edilmistir. Akabinde, 1 ml 37°C PEG (polietilen glikol, %40-50 solüsyon, Sigma-Aldrich, St Louis, MA), hücreler kapak içindeki bir mini su banyosu içinde tutularak 45 saniye boyunca eklenmistir. Hücreler, 45 saniye boyunca 37°C'de inkübe edilmistir. 1 ml 37°C serum içermeyen ortam, tüp girdap yapilarak döndürülürken, 30 saniye boyunca eklenmistir, akabinde 2 ml ayni sekilde eklenmistir ve akabinde 3, 4, 10 ve 30 ml ayrica yukarida oldugu üzere eklenmistir. Tüp oldukça yavas sekilde ters çevrilmistir ve 5 dakika boyunca 37°C'de inkübe edilmistir. Hücreler, akabinde ara verilmeksizin, oda sicakliginda (RT) 1300 rpm'de 5 dakika boyunca santrifüjlenmistir. Üst faz dikkatli sekilde bir pipet ile çikarilmistir (yaklasik olarak 1 ml pelet üzerinde birakilmistir). 50 ml oda sicakliginda serum içermeyen ortam, hücre peleti yerinden oynatilmaksizin eklenmistir. Hücreler yukarida oldugu üzere santrifüjlenmistir ve yikama, tam ortam ile tekrar edilmistir.
Akabinde hücreler 50 ml oda sicakliginda tam ortam %10-FCS içinde yeniden süspanse edilmistir ve dört 96 gözlü düz tabanli plakalar (100 ul /göz) içinde kaplanmistir. 38 ml tam RPMI-%10 FCS akabinde tüpe eklenmistir ve önceki adim, 37°C'de inkübe edilmis 3 dizi seyrelti (toplamda 12 plaka) ile iki defa sonuna kadar tekrar edilmistir. 48 saatten sonra, 100 ul 2x HAT (Hipoksantin-aminopterin-timidin, Sigma-Aldrich, Saint Louis, MA) ortami her bir göze eklenmistir. 6. gün ile hibridomlar görünmeye baslamistir. Klonlar, stabil olana kadar HAT 1X ortaminda muhafaza edilmistir, akabinde 2-3 hafta boyunca HT (Hipoksantin-timidin Sigma-Aldrich, Saint Louis, MA) ortami içine ve akabinde tam RPMI içine çekilmistir. Klonlar, dengesiz (%90 FCS+%10DMSO) hale dönüsebilmelerinden dolayi düzenli olarak dondurulmustur.
Kloniarin antijen-spesifikiiginin degerlendirilmesi 100 ul hibridom hücreleri düz tabanli bir 96 göz plakanin gözleri içinde 5x104 MGAR hücreleri (HLA-DRB1*1501 ifade eden insan hücre hatti, Health Protection Agency Culture Collections, Salisbury, BK) ile kültürlenmistir. 10 ug/ml'de bir uzun peptit içeren 50 ul tam RPMI-%10FCS veya DMSO'nun (peptitin seyreltisi) ayni hacmi gözlere eklenmistir. 48 saatten sonra, 120 ul üst faz çikarilmistir ve bir IL-2 ELISA (Enzime bagli immünosorbent analiz) fare gerçeklestirilmistir. IL-2 olusturan klonlar kullanilan antijeni tanimistir. Geri kalan üst fazlar -20°C'de dondurulmustur. 96 gözlü plakalar (Immunosorb 96 göz, Nunc, Roskilde, Danimarka) SOuI/göz saflastirilmis siçan anti-fare IL-2 yakalama Ab (BD Biosciences, Oxford, BK) ile kaplanmistir, karbonat tamponu içinde 12250 (3.569 NaZCOS (Sigma-Aldrich, Saint Louis, MA), , 1L elgastat suyu; pH 9.5) seyreltilmistir ve 4°C`de bir gece inkübe edilmistir. PBS-Tween (1L 10x PBS, 9L distile su, 0.5 ml Tween (Sigma-Aldrich, Saint Louis, MA)) içinde 2 yikamadan sonra, 200uI/göz PBS-%10 FCS eklenmistir ve 1 saat boyunca oda sicakliginda inkübe edilmistir. PBS-Tween içinde 3 yikamadan sonra, 50 ul üst faz veya IL-2 standart (BD Biosciences, Oxford, BK) seyreltiler (PBS-%10 FCS içinde) gözler içine eklenmistir ve 2 saat boyunca oda sicakliginda inkübe edilmistir. PBS-Tween (Sigma-Aldrich, Saint Louis, MA) içinde 4 yikamadan sonra, %10 FCS/PBS içinde 1:1000 seyreltilmis SOuI/göz biyotin siçan anti-fare IL2 (BD Biosciences, Oxford, BK) eklenmistir ve oda sicakliginda 1 saat boyunca inkübe edilmistir. 4 yikamadan sonra, PBS içinde 1:1000 seyreltilmis Soul/göz ekstravidin peroksidaz (Sigma-Aldrich, Saint Louis, MA) eklenmistir ve oda sicakliginda 30 dakika boyunca inkübe edilmistir. 4 yikamadan sonra, 50uI/göz sübstrat solüsyonu* eklenmistir ve belirgin bir renk degisimi görülene kadar oda sicakliginda inkübe edilmistir. Reaksiyon 50pI/göz 2M H2804 (BDH, Poole, BK) kullanilarak durdurulmustur ve plakalar bir ELISA okuyucu (SpectraMax Pro, Moleküler Cihaz, Sunnyvale, CA) ile 450 nm'de (referans 550nm) okunmustur.
DMSO içinde ergime 3,3',5,5'-Tetrametilbenzidin, Sigma-Aldrich, Saint Louis, MA), 6 ul hidrojen peroksit (Sigma-Aldrich, Saint Louis, MA).
Antijen prosese bagimsiz sunum sistemi Spesifik klonlar akabinde, sabit veya sabit olmayan MGAR hücreleri ile 15-mer peptitlere (POP-1 ila POP-12) yanitlarina yönelik test edilmistir. Bu amaca yönelik, ayri MGAR hücreler ile kültürlenir. MGAR hücre sabitlenmesine yönelik, 20x106 MGAR hücreler oda sicakliginda 6 ml Paraformaldehit (PFA, BDH, Poole, BK) %05 (pH7) ile dakika boyunca inkübe edilmistir ve akabinde 0.4M'de 6 ml Glisin (Fisher Scientific, Loughborough, BK) reaksiyonu durdurmak üzere eklenmistir. Hücreler akabinde yikanmistir ve RPMI-%1OFCS içinde yeniden süspanse edilmistir. RPMI-%10FCS içinde seyreltmis her bir 15-mer peptitin 10ug/ml`si ayri gözlere eklenmistir. Peptit yerine DMSO içeren bir göz, bir negatif kontrol olarak her bir klona yönelik kullanilmistir ve uzun peptit içeren bir göz, bir pozitif kontrol olarak kullanilmistir. Kültür içinde 48 saatten sonra, 120 pl üst faz hasat edilmistir ve lL-2 üretimini degerlendirmek üzere ELISA yoluyla analiz edilmistir.
Apitop muamelesi ile tolerans indüksiyonu edilmistir. 0. günde,fareler, kuyruk tabaninda 4 mg/ml Mikobakterium tüberküloz ile CFA'da 100 ug uzun peptit ile hazirlanmistir. 10 günden sonra, inguinal lenf dügümleri ve dalak hasat edilmistir. LNC ile proliferasyon ve sitokin üretimi ve splenositler akabinde yukarida açiklandigi üzere analiz edilmistir.
Bulusun açiklanan yöntemleri ve sisteminin çesitli modifikasyonlari ve varyasyonlari, teknikte uzman kisiler tarafindan anlasilacaktir.
Bulusun tercih edilen spesifik düzenlemeler ile baglantili olarak açiklanmis olmasina ragmen, belirtildigi gibi bulusun asiri derecede bu tür spesifik düzenlemelere sinirlandirilmamasi gerektigi anlasilmalidir. Kimya veya moleküler biyoloji veya ilgili alanlarda uzman kisilere açik sekilde olan bulusu gerçeklestirmeye yönelik açiklanan modlarin çesitli modifikasyonlari, mevcut bulus tarafindan kapsanmak üzere amaçlanir.
DIZI LISTESI <110> APITOPE INTERNATIONAL NV MERCK SERONO S.A. <120> PEPTIT <160> 33 <170› Patentln versiyon 3.5 <210> 1 < 211› 26 < 212› PRT < 213› Homo sapiens <400> 1 HL& Giu Ala Leu Thr Gly Thr Giu Lya Leu Ile Giu Thz Tyr Phe Ser 1 5 10 15 Lys Asn Ty: Gln Asp Tyr Glu Ty: Leu Ile <210> 2 < 211› 28 < 212› PRT < 213› Homo sapiens <400> 2 Thz Trp Th: Thz Cys Gin Ser Ile Ala Phe Pzo Ser Lya Thr Ser Ala 1 5 10 15 Set Ile Gly Se: Leu Cya ala Asp Ala Azg Met Tyr <210> 3 < 211› 28 < 212› PRT < 213› Homo sapiens <400> 3 Giy Vai Leu Pro Trp Asn Aia Phe Pro Giy Lya Vai Cys Giy Ser Aan 1 5 10 15 Leu Leu Ser Ile Cys Lya Thr Ala Glu Phe Gln Met <210>4 < 211› 19 < 212› PRT < 213› Homo sapiens <400> 4 Ion Thr Gly Tbr glu Lys Leo Ile Giu îgr Tyr Ph& Sar Lys îgn Tyr <210> 5 < 211› 19 < 212› PRT < 213› Homo sapiens <400> 5 Trp Thr Thz Cys Gln Ser Ile Ala Phe Pro Ser Lys Thr Sor Ala Ser 1 5 10 15 <210> 6 < 211› 15 < 212› PRT < 213› Homo sapiens <400> 6 Val Leu Pro Trp Asn Ala Phe Pro Gly Lys Val Cys Gly Ser Asn 1 5 10 15 <210> 7 < 211› 15 < 212> PRT < 213› Homo sapiens <400> 7 Leu Thr Gly Thr Giu Lys Leu Ile Glu Thr Tyr Phe Ser Lys han 1 5 10 15 <210> 8 < 211› 15 < 212› PRT < 213› Homo sapiens <400> 8 Thr Glu Lys Leu Ile Glu Thr Tyr Phe Ser Lys Asn Tyr Gin Asp 1 5 10 15 <210>9 < 211› 15 < 212› PRT < 213› Homo sapiens <400> 9 Glu Lys Leu Ile Glu Thr Tyr Phe Ser <210> 10 < 211› 15 < 212› PRT < 213› Homo sapiens <400> 10 Trp Thr Thr Cys Gin Ser Ile Ala Phe <210> 11 < 211› 15 < 212› PRT < 213› Homo sapiens <400> 11 Tht Thr Cya Gln Ser Ile Ala Phe Pro <210> 12 < 211› 15 < 212› PRT < 213› Homo sapiens <400> 12 Tht Cys Gln Ser Ile Ala Phe Pro Ser <210> 13 < 211› 15 < 212› PRT < 213› Homo sapiens <400> 13 Cya Gln Ser Ile Ala Phe Pro Ser Lys <210› 14 <211> 15 <212> PRT < 213› Homo sapiens <400> 14 Gln Ser Ile Ala Phe Pro Ser Lya Thr Set Ala Ser Ile Gly Set <210> 15 < 211> 15 < 212› PRT < 213› Homo sapiens <400> 15 Val Leu Pro Trp Asn Ala Phe Pro Gly Lys Val Cys Giy Set han <210> 16 < 211> 276 < 212> PRT < 213› Homo sapiens <400> 16 <210> 17 < 211› 26 < 212> PRT < 213› Homo sapiens <400> 17 His Glu Ala Leu Thr Gly Thr Giu Lys Leu Ile Giu Thz Ty: Phe Ser Lys Asn Tyr Gln Asp Tyr Glu Ty: Leu Ile <210>18 <211> 32 < 212> PRT < 213› Homo sapiens <400> 18 Glu Giy Phe Ty: Thr Thr Giy Ala Val Axg Gin Ile Phe Gly Asp Ty: Lya Thr Thr Ile Cys Gly Lys Gly Leu Ser Ala Thr Val Thr Gly Gly <210>19 <211> 32 < 212> PRT < 213> Homo sapiens <400> 19 Lys Thr Thr Ile Cya Giy Lys Giy Leu Ser Ala Thr Val Thr Gly Giy 1 5 10 15 Gln Lys Gly Arg Gly Ser Arg Gly Gln His Gln Ala His Ser Leu Glu 25 30 <210> 20 < 211› 32 < 212› PRT < 213› Homo sapiens <400> 20 Gly Gin Lys Gly Azg Gly Ser Arg Giy Gin Hia Gin Ala His Ser Leo 1 5 10 15 Glu Arg Val Cys His Cys Leu Gly Lys Tip Leu Gly His Pro Asp Lys 25 30 <210> 21 < 211› 28 < 212› PRT < 213› Homo sapiens <400> 21 Thr Trp Tnz Thr Cys Gin Ser Ile Ala Phe Pzo Ser Lys Thr Ser Ala 1 5 10 15 Ser Ile Gly Ser Leu Cys Ala Asp Ala Azg Met Tyr <210> 22 < 211› 28 < 212› PRT < 213› Homo sapiens <400> 22 rh: Ser Ala Ser Iie Giy Se: Leu Cys Ala Asp Ala Arg Met Tyr Giy 1 5 10 15 Vai Leu Pro Trp Aan Ala Phe Pro Gly Lys Val Cys <210> 23 < 211› 28 < 212› PRT < 213› Homo sapiens <400> 23 Gly Va] Lou Pro Trp Aan Ala Phe Pro Gly Lys Val Cys Gly Sor Asn Lou Lou Ser Ile Cys Lys Thr Âla Glu Ph& Gln Met <210> 24 < 211› 17 < 212› PRT < 213› Homo sapiens <400> 24 Ala Thr Tyr Aan Phe Ala VaL Leu Lys Leu Met Giy Arg Giy In: Lya 1 5 10 15 <210> 25 < 211› 15 < 212› PRT < 213› Homo sapiens <400> 25 His Glu Ala Leu Thr Gly Thr Glu Lys Leu Ile Glu Thr Tyr Phe 1 5 10 l5 <210> 26 < 211› 15 < 212› PRT < 213› Homo sapiens <400> 26 Glu Ala Leu Thr Giy Thr Glu Lys Leu Ile Glu Thr Tyr Phe Ser 1 5 lü 15 <210> 27 < 211› 15 < 212› PRT < 213› Homo sapiens <400> 27 Ala Leo Thr Gly Thr Glu Lys Leu Ile Glu Th: Tyr Phe Ser Lys 1 5 10 15 <210> 28 < 211> 15 < 212> PRT < 213› Homo sapiens <400> 28 Thr Gly Thr Glu Lys Lou Ile GLu Thr Tyr Phe Ser Lys Asn Tyr 1 5 10 15 <210> 29 < 211› 15 < 212› PRT < 213› Homo sapiens <400> 29 Gly Thr Glu Lys Leu Ile Glu Thr Ty: Phe Ser Lys Asn Tyr Cin 1 5 10 15 <210> 30 < 211› 15 < 212› PRT < 213› Homo sapiens <400> 30 Lya Leu Ile Glu Thr Ty: Phe Ser Lys Asn Tyr Gln Asp Tyr Cin 1 5 10 15 <210> 31 < 211› 15 < 212› PRT < 213› Homo sapiens <400> 31 Leu Ile Glu Thr Ty: Phe Set Lya Asu Tyr Gln Asp Tyr Glu Tyr 1 5 10 15 <210> 32 < 211› 15 < 212> PRT < 213› Homo sapiens <400> 32 1 S 10 15 <210> 33 < 211› 15 < 212› PRT < 213› Homo sapiens <400> 33 Glu Thr Tyr Phe Ser Lys Asn Tyr Gln Asp Ty: Glu Tyr Leu Ile 1 5 1.0 l5

Claims (1)

  1. ISTEMLER . Bir peptit olup, özelligi bir MHC molekülüne in vitro baglanabilmesi ve antijen prosesi olmaksizin bir T hücresine sunulabilmesi ve asagidaki proteolipit protein (PLP) peptitlerinden seçilmesidir: . istem 1'e göre bir peptit olup, özelligi bir demiyelinizan hastaligin tedavisinde ve/veya önlenmesinde kullanima yönelik olmasidir. . istem 2”ye göre kullanima yönelik peptit olup, özelligi hastaligin multipl skleroz olmasidir. . Bir farmasötik bilesim olup, özelligi istem 1`e göre bir veya daha fazla peptit içermesidir.
TR2018/15667T 2013-01-15 2014-01-13 Peptit. TR201815667T4 (tr)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
GBGB1300683.8A GB201300683D0 (en) 2013-01-15 2013-01-15 Peptide

Publications (1)

Publication Number Publication Date
TR201815667T4 true TR201815667T4 (tr) 2018-11-21

Family

ID=47757994

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
TR2018/15667T TR201815667T4 (tr) 2013-01-15 2014-01-13 Peptit.

Country Status (21)

Country Link
US (4) US20150352197A1 (tr)
EP (1) EP2945965B8 (tr)
JP (2) JP6407888B2 (tr)
KR (1) KR102129763B1 (tr)
CN (1) CN105102477B (tr)
AU (1) AU2014206593B2 (tr)
CA (2) CA2897894C (tr)
DK (1) DK2945965T3 (tr)
ES (1) ES2694660T3 (tr)
GB (1) GB201300683D0 (tr)
HK (1) HK1211595A1 (tr)
HU (1) HUE040547T2 (tr)
IL (1) IL239870B (tr)
MX (1) MX369413B (tr)
PL (1) PL2945965T3 (tr)
PT (1) PT2945965T (tr)
RU (1) RU2667428C2 (tr)
SG (1) SG11201505530XA (tr)
TR (1) TR201815667T4 (tr)
WO (1) WO2014111841A2 (tr)
ZA (1) ZA201504986B (tr)

Families Citing this family (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CA3072867A1 (en) * 2017-08-14 2019-02-21 Apitope Technology (Bristol) Limited Method
WO2021144478A2 (en) 2020-05-06 2021-07-22 Imcyse Sa Combination treatment for fumarate-related diseases
KR20240015672A (ko) 2021-06-01 2024-02-05 임시스 에스에이 면역원성 펩티드를 사용한 개선된 치료 방법

Family Cites Families (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6037135A (en) * 1992-08-07 2000-03-14 Epimmune Inc. Methods for making HLA binding peptides and their uses
US9340577B2 (en) * 1992-08-07 2016-05-17 Epimmune Inc. HLA binding motifs and peptides and their uses
IL117976A0 (en) * 1995-04-20 1996-08-04 Brigham & Womens Hospital Modulation of cytokine patterns of human autoreactive t-cell clones
CA2250361A1 (en) * 1996-03-28 1997-10-02 Barbara Wallner Myelin oligodendrocyte glycoprotein peptides and uses thereof
EP1455816A4 (en) * 2000-10-19 2007-03-28 Epimmune Inc HLA CLASS I AND II BINDING PEPTIDES AND THEIR USE
IL146016A0 (en) * 2001-10-17 2002-07-25 Yeda Res & Dev Synthetic peptides and dna sequences and compositions comprising them for treatment of multiple sclerosis
ES2432369T3 (es) * 2004-06-25 2013-12-03 Id Biomedical Corporation Of Quebec Composiciones y métodos para tratar trastornos neurológicos
US8188218B2 (en) * 2006-10-27 2012-05-29 University Of Kansas Bi-functional peptides for multiple sclerosis treatment and diagnosis
US20120076808A1 (en) * 2010-09-27 2012-03-29 China Agricultural University Combined antigen and dna vaccine for preventing and treating autoimmune diseases

Also Published As

Publication number Publication date
SG11201505530XA (en) 2015-08-28
JP2016504412A (ja) 2016-02-12
US20220016226A1 (en) 2022-01-20
ES2694660T3 (es) 2018-12-26
US20190275126A1 (en) 2019-09-12
AU2014206593B2 (en) 2017-09-07
CA3154542A1 (en) 2014-07-24
CN105102477B (zh) 2019-03-19
KR102129763B1 (ko) 2020-07-03
AU2014206593A1 (en) 2015-07-23
IL239870A0 (en) 2015-08-31
WO2014111841A3 (en) 2014-10-30
EP2945965B8 (en) 2018-09-05
MX2015009086A (es) 2016-02-16
JP6407888B2 (ja) 2018-10-17
ZA201504986B (en) 2019-04-24
PL2945965T3 (pl) 2019-08-30
HUE040547T2 (hu) 2019-03-28
GB201300683D0 (en) 2013-02-27
IL239870B (en) 2018-10-31
HK1211595A1 (en) 2016-05-27
KR20150107766A (ko) 2015-09-23
CN105102477A (zh) 2015-11-25
PT2945965T (pt) 2018-11-14
CA2897894C (en) 2022-06-21
EP2945965A2 (en) 2015-11-25
RU2015134357A (ru) 2017-02-22
JP2018193390A (ja) 2018-12-06
DK2945965T3 (en) 2018-11-19
WO2014111841A2 (en) 2014-07-24
CA2897894A1 (en) 2014-07-24
EP2945965B1 (en) 2018-07-25
US20150352197A1 (en) 2015-12-10
MX369413B (es) 2019-11-07
RU2667428C2 (ru) 2018-09-19
US20240148843A1 (en) 2024-05-09

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US20240148843A1 (en) Peptide
JP6476181B2 (ja) ペプチド
US10377800B2 (en) Myelin oligodendrocyte glycoprotein (MOG) peptide
EP1474443B1 (en) Tolerogenic peptides from myelin basic protein
WO2011071039A1 (ja) Hla-dr4エピトープの同定と、関節炎治療への応用