SK153295A3 - A truncated keratinocyte growth factor (kgf) having increased biological activity - Google Patents
A truncated keratinocyte growth factor (kgf) having increased biological activity Download PDFInfo
- Publication number
- SK153295A3 SK153295A3 SK1532-95A SK153295A SK153295A3 SK 153295 A3 SK153295 A3 SK 153295A3 SK 153295 A SK153295 A SK 153295A SK 153295 A3 SK153295 A3 SK 153295A3
- Authority
- SK
- Slovakia
- Prior art keywords
- kgf
- growth factor
- fragment
- keratinocyte growth
- sequence
- Prior art date
Links
- 108090000385 Fibroblast growth factor 7 Proteins 0.000 title claims abstract description 191
- 102000003972 Fibroblast growth factor 7 Human genes 0.000 title claims abstract description 189
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 title description 10
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 title description 9
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims abstract description 101
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims description 170
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims description 83
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims description 61
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 52
- 241000701447 unidentified baculovirus Species 0.000 claims description 46
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims description 44
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 claims description 36
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 claims description 31
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 claims description 28
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 claims description 27
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims description 24
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 claims description 19
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 claims description 19
- 230000002297 mitogenic effect Effects 0.000 claims description 17
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 claims description 15
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 12
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 12
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims description 10
- 210000002510 keratinocyte Anatomy 0.000 claims description 9
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 claims description 8
- 210000005253 yeast cell Anatomy 0.000 claims description 8
- 231100000135 cytotoxicity Toxicity 0.000 claims description 5
- 230000003013 cytotoxicity Effects 0.000 claims description 5
- 239000003053 toxin Substances 0.000 claims description 5
- 231100000765 toxin Toxicity 0.000 claims description 5
- 230000029663 wound healing Effects 0.000 claims description 5
- 206010052428 Wound Diseases 0.000 claims description 4
- 208000027418 Wounds and injury Diseases 0.000 claims description 4
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 claims description 4
- 108010039491 Ricin Proteins 0.000 claims description 2
- 108010084592 Saporins Proteins 0.000 claims description 2
- 238000012258 culturing Methods 0.000 claims description 2
- 102000016607 Diphtheria Toxin Human genes 0.000 claims 1
- 108010053187 Diphtheria Toxin Proteins 0.000 claims 1
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 abstract description 26
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 abstract description 25
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 abstract description 24
- 238000003556 assay Methods 0.000 abstract description 5
- 101001060261 Homo sapiens Fibroblast growth factor 7 Proteins 0.000 abstract description 3
- 102000057239 human FGF7 Human genes 0.000 abstract description 3
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 130
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 64
- 235000014680 Saccharomyces cerevisiae Nutrition 0.000 description 60
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 54
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 54
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 41
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 34
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 26
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 26
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 25
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 25
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 22
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 22
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 22
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 21
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 20
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 20
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 20
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 20
- 230000027455 binding Effects 0.000 description 19
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 19
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 19
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 18
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 18
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 16
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 16
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 15
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 15
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 15
- IXKSXJFAGXLQOQ-XISFHERQSA-N WHWLQLKPGQPMY Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C1=CNC=N1 IXKSXJFAGXLQOQ-XISFHERQSA-N 0.000 description 14
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 14
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 13
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 description 12
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 description 12
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 description 11
- 102000004163 DNA-directed RNA polymerases Human genes 0.000 description 10
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 10
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 10
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 10
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 10
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 10
- 230000005030 transcription termination Effects 0.000 description 10
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 9
- 210000002919 epithelial cell Anatomy 0.000 description 9
- 108090000626 DNA-directed RNA polymerases Proteins 0.000 description 8
- 102000018233 Fibroblast Growth Factor Human genes 0.000 description 8
- 108050007372 Fibroblast Growth Factor Proteins 0.000 description 8
- 108090000386 Fibroblast Growth Factor 1 Proteins 0.000 description 8
- 102000003971 Fibroblast Growth Factor 1 Human genes 0.000 description 8
- 101710182846 Polyhedrin Proteins 0.000 description 8
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 8
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 8
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 8
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 8
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 8
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 8
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 8
- 230000008488 polyadenylation Effects 0.000 description 8
- 239000000047 product Substances 0.000 description 8
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 8
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 8
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 8
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 8
- 102000007698 Alcohol dehydrogenase Human genes 0.000 description 7
- 108010021809 Alcohol dehydrogenase Proteins 0.000 description 7
- 108090000379 Fibroblast growth factor 2 Proteins 0.000 description 7
- 102000003974 Fibroblast growth factor 2 Human genes 0.000 description 7
- 241000235648 Pichia Species 0.000 description 7
- 108091081024 Start codon Proteins 0.000 description 7
- 102000044159 Ubiquitin Human genes 0.000 description 7
- 108090000848 Ubiquitin Proteins 0.000 description 7
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 7
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 7
- 241000193830 Bacillus <bacterium> Species 0.000 description 6
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 6
- IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N Dimethylsulphoxide Chemical compound CS(C)=O IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 6
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 6
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 6
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 6
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 6
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 6
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 6
- 230000029279 positive regulation of transcription, DNA-dependent Effects 0.000 description 6
- 230000006798 recombination Effects 0.000 description 6
- 238000005215 recombination Methods 0.000 description 6
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 description 6
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 6
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 6
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 5
- 101150021185 FGF gene Proteins 0.000 description 5
- 101710182396 Fibroblast growth factor receptor 3 Proteins 0.000 description 5
- 102100027842 Fibroblast growth factor receptor 3 Human genes 0.000 description 5
- QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N L-tryptophane Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N 0.000 description 5
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 5
- QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N Tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 208000036142 Viral infection Diseases 0.000 description 5
- 230000000975 bioactive effect Effects 0.000 description 5
- 230000001851 biosynthetic effect Effects 0.000 description 5
- 150000001768 cations Chemical class 0.000 description 5
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 5
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 5
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 5
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 5
- 230000003248 secreting effect Effects 0.000 description 5
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 5
- 241001515965 unidentified phage Species 0.000 description 5
- 230000009385 viral infection Effects 0.000 description 5
- 241001203868 Autographa californica Species 0.000 description 4
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 description 4
- ULGZDMOVFRHVEP-RWJQBGPGSA-N Erythromycin Chemical compound O([C@@H]1[C@@H](C)C(=O)O[C@@H]([C@@]([C@H](O)[C@@H](C)C(=O)[C@H](C)C[C@@](C)(O)[C@H](O[C@H]2[C@@H]([C@H](C[C@@H](C)O2)N(C)C)O)[C@H]1C)(C)O)CC)[C@H]1C[C@@](C)(OC)[C@@H](O)[C@H](C)O1 ULGZDMOVFRHVEP-RWJQBGPGSA-N 0.000 description 4
- 108091029865 Exogenous DNA Proteins 0.000 description 4
- HTTJABKRGRZYRN-UHFFFAOYSA-N Heparin Chemical compound OC1C(NC(=O)C)C(O)OC(COS(O)(=O)=O)C1OC1C(OS(O)(=O)=O)C(O)C(OC2C(C(OS(O)(=O)=O)C(OC3C(C(O)C(O)C(O3)C(O)=O)OS(O)(=O)=O)C(CO)O2)NS(O)(=O)=O)C(C(O)=O)O1 HTTJABKRGRZYRN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 102000014150 Interferons Human genes 0.000 description 4
- 108010050904 Interferons Proteins 0.000 description 4
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 4
- UTPGJEROJZHISI-UHFFFAOYSA-N Pleniradin-acetat Natural products C1=C(C)C2C(OC(=O)C)CC(C)(O)C2CC2C(=C)C(=O)OC21 UTPGJEROJZHISI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 241000256251 Spodoptera frugiperda Species 0.000 description 4
- 241000194017 Streptococcus Species 0.000 description 4
- 108700026226 TATA Box Proteins 0.000 description 4
- 239000012190 activator Substances 0.000 description 4
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 4
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 4
- ATDGTVJJHBUTRL-UHFFFAOYSA-N cyanogen bromide Chemical compound BrC#N ATDGTVJJHBUTRL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 210000002950 fibroblast Anatomy 0.000 description 4
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 4
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 4
- 102000006602 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Human genes 0.000 description 4
- 108020004445 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Proteins 0.000 description 4
- 230000013595 glycosylation Effects 0.000 description 4
- 238000006206 glycosylation reaction Methods 0.000 description 4
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 4
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 4
- 230000035876 healing Effects 0.000 description 4
- 229920000669 heparin Polymers 0.000 description 4
- 229960002897 heparin Drugs 0.000 description 4
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 4
- 229940079322 interferon Drugs 0.000 description 4
- 210000003292 kidney cell Anatomy 0.000 description 4
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 4
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 4
- 210000003491 skin Anatomy 0.000 description 4
- 230000004936 stimulating effect Effects 0.000 description 4
- NHBKXEKEPDILRR-UHFFFAOYSA-N 2,3-bis(butanoylsulfanyl)propyl butanoate Chemical compound CCCC(=O)OCC(SC(=O)CCC)CSC(=O)CCC NHBKXEKEPDILRR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 241000589876 Campylobacter Species 0.000 description 3
- 241000222120 Candida <Saccharomycetales> Species 0.000 description 3
- 241000699802 Cricetulus griseus Species 0.000 description 3
- 241000588722 Escherichia Species 0.000 description 3
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108700028146 Genetic Enhancer Elements Proteins 0.000 description 3
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108091092195 Intron Proteins 0.000 description 3
- 241000235649 Kluyveromyces Species 0.000 description 3
- WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N 0.000 description 3
- HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N L-histidine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 3
- 241000186660 Lactobacillus Species 0.000 description 3
- 241000589516 Pseudomonas Species 0.000 description 3
- 102000007056 Recombinant Fusion Proteins Human genes 0.000 description 3
- 108010008281 Recombinant Fusion Proteins Proteins 0.000 description 3
- 241000235070 Saccharomyces Species 0.000 description 3
- 241000235346 Schizosaccharomyces Species 0.000 description 3
- 229920002684 Sepharose Polymers 0.000 description 3
- 241000191940 Staphylococcus Species 0.000 description 3
- 108700005077 Viral Genes Proteins 0.000 description 3
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 3
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 3
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 3
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 3
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 3
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 3
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 3
- 239000003636 conditioned culture medium Substances 0.000 description 3
- 238000010828 elution Methods 0.000 description 3
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 3
- 239000003102 growth factor Substances 0.000 description 3
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000002744 homologous recombination Methods 0.000 description 3
- 230000006801 homologous recombination Effects 0.000 description 3
- 229940088597 hormone Drugs 0.000 description 3
- 239000005556 hormone Substances 0.000 description 3
- 230000001976 improved effect Effects 0.000 description 3
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 3
- 229940039696 lactobacillus Drugs 0.000 description 3
- 229920002521 macromolecule Polymers 0.000 description 3
- 238000012423 maintenance Methods 0.000 description 3
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 3
- 230000037353 metabolic pathway Effects 0.000 description 3
- 125000001360 methionine group Chemical group N[C@@H](CCSC)C(=O)* 0.000 description 3
- -1 metonine Chemical compound 0.000 description 3
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 3
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 3
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 3
- 210000004940 nucleus Anatomy 0.000 description 3
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 description 3
- 210000001672 ovary Anatomy 0.000 description 3
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 3
- 229920002401 polyacrylamide Polymers 0.000 description 3
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 3
- 238000010188 recombinant method Methods 0.000 description 3
- 235000004400 serine Nutrition 0.000 description 3
- 241000894007 species Species 0.000 description 3
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 3
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 3
- 210000003556 vascular endothelial cell Anatomy 0.000 description 3
- REAWNMHCBIUKLZ-ZYHUDNBSSA-N (3R,4R)-4-(hydroxymethyl)-3-(6-methylheptanoyl)oxolan-2-one Chemical compound CC(C)CCCCC(=O)[C@H]1[C@H](CO)COC1=O REAWNMHCBIUKLZ-ZYHUDNBSSA-N 0.000 description 2
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000256118 Aedes aegypti Species 0.000 description 2
- 108010077805 Bacterial Proteins Proteins 0.000 description 2
- 108020004513 Bacterial RNA Proteins 0.000 description 2
- 206010004146 Basal cell carcinoma Diseases 0.000 description 2
- 241000255789 Bombyx mori Species 0.000 description 2
- OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N Calcium Chemical compound [Ca] OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000222128 Candida maltosa Species 0.000 description 2
- 241000699800 Cricetinae Species 0.000 description 2
- 241000701022 Cytomegalovirus Species 0.000 description 2
- 229920002307 Dextran Polymers 0.000 description 2
- 241000255601 Drosophila melanogaster Species 0.000 description 2
- 239000006144 Dulbecco’s modified Eagle's medium Substances 0.000 description 2
- 208000017452 Epidermal disease Diseases 0.000 description 2
- 241000701959 Escherichia virus Lambda Species 0.000 description 2
- 108010058643 Fungal Proteins Proteins 0.000 description 2
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 2
- 229930182566 Gentamicin Natural products 0.000 description 2
- CEAZRRDELHUEMR-URQXQFDESA-N Gentamicin Chemical compound O1[C@H](C(C)NC)CC[C@@H](N)[C@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](NC)[C@@](C)(O)CO2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N CEAZRRDELHUEMR-URQXQFDESA-N 0.000 description 2
- WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N Glutamic acid Natural products OC(=O)C(N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101150069554 HIS4 gene Proteins 0.000 description 2
- 229920000209 Hexadimethrine bromide Polymers 0.000 description 2
- 244000285963 Kluyveromyces fragilis Species 0.000 description 2
- 235000014663 Kluyveromyces fragilis Nutrition 0.000 description 2
- 241001138401 Kluyveromyces lactis Species 0.000 description 2
- 241000235058 Komagataella pastoris Species 0.000 description 2
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N L-aspartic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 description 2
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N L-phenylalanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 2
- AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N L-threonine Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N 0.000 description 2
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 2
- KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N L-valine Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 2
- 230000004988 N-glycosylation Effects 0.000 description 2
- 125000000729 N-terminal amino-acid group Chemical group 0.000 description 2
- 241000320412 Ogataea angusta Species 0.000 description 2
- 101150012394 PHO5 gene Proteins 0.000 description 2
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 2
- 108010076039 Polyproteins Proteins 0.000 description 2
- 201000004681 Psoriasis Diseases 0.000 description 2
- 230000006819 RNA synthesis Effects 0.000 description 2
- 241000235347 Schizosaccharomyces pombe Species 0.000 description 2
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- BQCADISMDOOEFD-UHFFFAOYSA-N Silver Chemical compound [Ag] BQCADISMDOOEFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 244000057717 Streptococcus lactis Species 0.000 description 2
- 235000014897 Streptococcus lactis Nutrition 0.000 description 2
- 102000019197 Superoxide Dismutase Human genes 0.000 description 2
- 108010012715 Superoxide dismutase Proteins 0.000 description 2
- 239000004098 Tetracycline Substances 0.000 description 2
- AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N Threonine Natural products CC(O)C(N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 description 2
- 108700009124 Transcription Initiation Site Proteins 0.000 description 2
- KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N Valine Natural products CC(C)C(N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000235013 Yarrowia Species 0.000 description 2
- 241000235015 Yarrowia lipolytica Species 0.000 description 2
- 238000007792 addition Methods 0.000 description 2
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 description 2
- APKFDSVGJQXUKY-INPOYWNPSA-N amphotericin B Chemical compound O[C@H]1[C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](C)O[C@H]1O[C@H]1/C=C/C=C/C=C/C=C/C=C/C=C/C=C/[C@H](C)[C@@H](O)[C@@H](C)[C@H](C)OC(=O)C[C@H](O)C[C@H](O)CC[C@@H](O)[C@H](O)C[C@H](O)C[C@](O)(C[C@H](O)[C@H]2C(O)=O)O[C@H]2C1 APKFDSVGJQXUKY-INPOYWNPSA-N 0.000 description 2
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 2
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 2
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 2
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 2
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 2
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 2
- 235000003704 aspartic acid Nutrition 0.000 description 2
- 210000003578 bacterial chromosome Anatomy 0.000 description 2
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 2
- 108010051210 beta-Fructofuranosidase Proteins 0.000 description 2
- OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N beta-carboxyaspartic acid Natural products OC(=O)C(N)C(C(O)=O)C(O)=O OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000004166 bioassay Methods 0.000 description 2
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 2
- 229910052791 calcium Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000011575 calcium Substances 0.000 description 2
- 229910000389 calcium phosphate Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000001506 calcium phosphate Substances 0.000 description 2
- 235000011010 calcium phosphates Nutrition 0.000 description 2
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 2
- 238000005341 cation exchange Methods 0.000 description 2
- 238000005277 cation exchange chromatography Methods 0.000 description 2
- 230000010261 cell growth Effects 0.000 description 2
- 230000004663 cell proliferation Effects 0.000 description 2
- 229960005091 chloramphenicol Drugs 0.000 description 2
- WIIZWVCIJKGZOK-RKDXNWHRSA-N chloramphenicol Chemical compound ClC(Cl)C(=O)N[C@H](CO)[C@H](O)C1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1 WIIZWVCIJKGZOK-RKDXNWHRSA-N 0.000 description 2
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 2
- 230000003750 conditioning effect Effects 0.000 description 2
- 210000004087 cornea Anatomy 0.000 description 2
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 2
- LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I dipotassium trisodium dihydrogen phosphate hydrogen phosphate dichloride Chemical compound P(=O)(O)(O)[O-].[K+].P(=O)(O)([O-])[O-].[Na+].[Na+].[Cl-].[K+].[Cl-].[Na+] LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I 0.000 description 2
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 2
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 2
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 2
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 2
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 2
- 238000005538 encapsulation Methods 0.000 description 2
- 230000003511 endothelial effect Effects 0.000 description 2
- 239000006167 equilibration buffer Substances 0.000 description 2
- 229960003276 erythromycin Drugs 0.000 description 2
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 2
- 229960002518 gentamicin Drugs 0.000 description 2
- 235000013922 glutamic acid Nutrition 0.000 description 2
- 239000004220 glutamic acid Substances 0.000 description 2
- 150000004676 glycans Chemical class 0.000 description 2
- 230000002414 glycolytic effect Effects 0.000 description 2
- 206010073071 hepatocellular carcinoma Diseases 0.000 description 2
- 231100000844 hepatocellular carcinoma Toxicity 0.000 description 2
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 2
- 230000003463 hyperproliferative effect Effects 0.000 description 2
- 239000002596 immunotoxin Substances 0.000 description 2
- 239000000411 inducer Substances 0.000 description 2
- 230000002458 infectious effect Effects 0.000 description 2
- AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N isoleucine Natural products CCC(C)C(N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229960000310 isoleucine Drugs 0.000 description 2
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 2
- 239000000463 material Substances 0.000 description 2
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 2
- 210000003716 mesoderm Anatomy 0.000 description 2
- 238000000520 microinjection Methods 0.000 description 2
- 238000013508 migration Methods 0.000 description 2
- 230000005012 migration Effects 0.000 description 2
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 2
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 2
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 2
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 2
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 2
- COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N phenylalanine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000002953 phosphate buffered saline Substances 0.000 description 2
- 230000026731 phosphorylation Effects 0.000 description 2
- 238000006366 phosphorylation reaction Methods 0.000 description 2
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 description 2
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 description 2
- 229920002981 polyvinylidene fluoride Polymers 0.000 description 2
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 2
- 239000013615 primer Substances 0.000 description 2
- 230000008569 process Effects 0.000 description 2
- 210000001938 protoplast Anatomy 0.000 description 2
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 2
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 2
- 230000003362 replicative effect Effects 0.000 description 2
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 2
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 2
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 2
- 239000012465 retentate Substances 0.000 description 2
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 2
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 2
- 229910052709 silver Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000004332 silver Substances 0.000 description 2
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 2
- 229960002180 tetracycline Drugs 0.000 description 2
- 229930101283 tetracycline Natural products 0.000 description 2
- 235000019364 tetracycline Nutrition 0.000 description 2
- 150000003522 tetracyclines Chemical class 0.000 description 2
- QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H tricalcium bis(phosphate) Chemical compound [Ca+2].[Ca+2].[Ca+2].[O-]P([O-])([O-])=O.[O-]P([O-])([O-])=O QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H 0.000 description 2
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000701161 unidentified adenovirus Species 0.000 description 2
- 239000004474 valine Substances 0.000 description 2
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N (2S)-2-Amino-3-hydroxypropansäure Chemical compound OC[C@H](N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- GZCWLCBFPRFLKL-UHFFFAOYSA-N 1-prop-2-ynoxypropan-2-ol Chemical compound CC(O)COCC#C GZCWLCBFPRFLKL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108020004465 16S ribosomal RNA Proteins 0.000 description 1
- OSJPPGNTCRNQQC-UWTATZPHSA-N 3-phospho-D-glyceric acid Chemical compound OC(=O)[C@H](O)COP(O)(O)=O OSJPPGNTCRNQQC-UWTATZPHSA-N 0.000 description 1
- 102000013563 Acid Phosphatase Human genes 0.000 description 1
- 108010051457 Acid Phosphatase Proteins 0.000 description 1
- 101100295756 Acinetobacter baumannii (strain ATCC 19606 / DSM 30007 / JCM 6841 / CCUG 19606 / CIP 70.34 / NBRC 109757 / NCIMB 12457 / NCTC 12156 / 81) omp38 gene Proteins 0.000 description 1
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 1
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 1
- 102100034044 All-trans-retinol dehydrogenase [NAD(+)] ADH1B Human genes 0.000 description 1
- 101710193111 All-trans-retinol dehydrogenase [NAD(+)] ADH4 Proteins 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N Alpha-Lactose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)O[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N 0.000 description 1
- 244000144725 Amygdalus communis Species 0.000 description 1
- 244000105975 Antidesma platyphyllum Species 0.000 description 1
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 1
- DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N Asparagine Natural products OC(=O)C(N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101710154607 Azurocidin Proteins 0.000 description 1
- 235000014469 Bacillus subtilis Nutrition 0.000 description 1
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 1
- 241000701822 Bovine papillomavirus Species 0.000 description 1
- 101100408682 Caenorhabditis elegans pmt-2 gene Proteins 0.000 description 1
- 241000222122 Candida albicans Species 0.000 description 1
- 108010001857 Cell Surface Receptors Proteins 0.000 description 1
- 102000000844 Cell Surface Receptors Human genes 0.000 description 1
- 108020004635 Complementary DNA Proteins 0.000 description 1
- JPVYNHNXODAKFH-UHFFFAOYSA-N Cu2+ Chemical compound [Cu+2] JPVYNHNXODAKFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000003155 DNA primer Substances 0.000 description 1
- 230000006820 DNA synthesis Effects 0.000 description 1
- 101710088194 Dehydrogenase Proteins 0.000 description 1
- 101000686777 Escherichia phage T7 T7 RNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 241000206602 Eukaryota Species 0.000 description 1
- 108091008794 FGF receptors Proteins 0.000 description 1
- 108010074860 Factor Xa Proteins 0.000 description 1
- 108090000382 Fibroblast growth factor 6 Proteins 0.000 description 1
- 102100028075 Fibroblast growth factor 6 Human genes 0.000 description 1
- 102100028071 Fibroblast growth factor 7 Human genes 0.000 description 1
- 241000192125 Firmicutes Species 0.000 description 1
- 101150038242 GAL10 gene Proteins 0.000 description 1
- 102100024637 Galectin-10 Human genes 0.000 description 1
- 102100039556 Galectin-4 Human genes 0.000 description 1
- 108010010803 Gelatin Proteins 0.000 description 1
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 1
- 230000010556 Heparin Binding Activity Effects 0.000 description 1
- 102000005548 Hexokinase Human genes 0.000 description 1
- 108700040460 Hexokinases Proteins 0.000 description 1
- 101000608765 Homo sapiens Galectin-4 Proteins 0.000 description 1
- 101001071515 Homo sapiens Gastrin-releasing peptide Proteins 0.000 description 1
- 101001002657 Homo sapiens Interleukin-2 Proteins 0.000 description 1
- 101001033034 Homo sapiens UDP-N-acetylglucosamine-dolichyl-phosphate N-acetylglucosaminephosphotransferase Proteins 0.000 description 1
- 108090000144 Human Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000003839 Human Proteins Human genes 0.000 description 1
- 241000701024 Human betaherpesvirus 5 Species 0.000 description 1
- 241000701044 Human gammaherpesvirus 4 Species 0.000 description 1
- 108010060231 Insect Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000006992 Interferon-alpha Human genes 0.000 description 1
- 108010047761 Interferon-alpha Proteins 0.000 description 1
- 102000004195 Isomerases Human genes 0.000 description 1
- 108090000769 Isomerases Proteins 0.000 description 1
- ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N L-Proline Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N L-alanine Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P L-argininium(2+) Chemical compound NC(=[NH2+])NCCC[C@H]([NH3+])C(O)=O ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P 0.000 description 1
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- LEVWYRKDKASIDU-IMJSIDKUSA-N L-cystine Chemical compound [O-]C(=O)[C@@H]([NH3+])CSSC[C@H]([NH3+])C([O-])=O LEVWYRKDKASIDU-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N L-glutamine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N L-lysine Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- 108010054278 Lac Repressors Proteins 0.000 description 1
- 241000194034 Lactococcus lactis subsp. cremoris Species 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N Lactose Natural products OC[C@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)C(O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N 0.000 description 1
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 1
- 108091027974 Mature messenger RNA Proteins 0.000 description 1
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 1
- 108700011259 MicroRNAs Proteins 0.000 description 1
- 241000713333 Mouse mammary tumor virus Species 0.000 description 1
- 101100334732 Mus musculus Fgfr2 gene Proteins 0.000 description 1
- 101001033276 Mus musculus Interleukin-3 Proteins 0.000 description 1
- 229930193140 Neomycin Natural products 0.000 description 1
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 206010067482 No adverse event Diseases 0.000 description 1
- 108700020497 Nucleopolyhedrovirus polyhedrin Proteins 0.000 description 1
- 108010047956 Nucleosomes Proteins 0.000 description 1
- DDCDFWZABQOMLU-BTVCFUMJSA-N O=CC(O)COP(O)(O)=O.OP(=O)(O)OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)C=O Chemical compound O=CC(O)COP(O)(O)=O.OP(=O)(O)OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)C=O DDCDFWZABQOMLU-BTVCFUMJSA-N 0.000 description 1
- 206010030113 Oedema Diseases 0.000 description 1
- 102000015636 Oligopeptides Human genes 0.000 description 1
- 108010038807 Oligopeptides Proteins 0.000 description 1
- 101710116435 Outer membrane protein Proteins 0.000 description 1
- 239000002033 PVDF binder Substances 0.000 description 1
- 206010034133 Pathogen resistance Diseases 0.000 description 1
- 102000035195 Peptidases Human genes 0.000 description 1
- 102000007079 Peptide Fragments Human genes 0.000 description 1
- 102000012288 Phosphopyruvate Hydratase Human genes 0.000 description 1
- 108010022181 Phosphopyruvate Hydratase Proteins 0.000 description 1
- 108091000080 Phosphotransferase Proteins 0.000 description 1
- 229920000954 Polyglycolide Polymers 0.000 description 1
- 241001505332 Polyomavirus sp. Species 0.000 description 1
- ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N Proline Natural products OC(=O)C1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004365 Protease Substances 0.000 description 1
- 102100029796 Protein S100-A10 Human genes 0.000 description 1
- 101710110950 Protein S100-A10 Proteins 0.000 description 1
- 108090000412 Protein-Tyrosine Kinases Proteins 0.000 description 1
- 102000004022 Protein-Tyrosine Kinases Human genes 0.000 description 1
- 101100084022 Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) lapA gene Proteins 0.000 description 1
- 101100408135 Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) phnA gene Proteins 0.000 description 1
- 206010037660 Pyrexia Diseases 0.000 description 1
- LCTONWCANYUPML-UHFFFAOYSA-M Pyruvate Chemical compound CC(=O)C([O-])=O LCTONWCANYUPML-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 108010009460 RNA Polymerase II Proteins 0.000 description 1
- 102000009572 RNA Polymerase II Human genes 0.000 description 1
- 102100037486 Reverse transcriptase/ribonuclease H Human genes 0.000 description 1
- 241000714474 Rous sarcoma virus Species 0.000 description 1
- 241000700584 Simplexvirus Species 0.000 description 1
- 101000693688 Spodoptera frugiperda Allatostatin Proteins 0.000 description 1
- 235000014962 Streptococcus cremoris Nutrition 0.000 description 1
- 241000187398 Streptomyces lividans Species 0.000 description 1
- 101710181863 Structural DNA-binding protein p10 Proteins 0.000 description 1
- 108010022394 Threonine synthase Proteins 0.000 description 1
- 102000009843 Thyroglobulin Human genes 0.000 description 1
- 108010034949 Thyroglobulin Proteins 0.000 description 1
- 108091023040 Transcription factor Proteins 0.000 description 1
- 241000255993 Trichoplusia ni Species 0.000 description 1
- 102100038413 UDP-N-acetylglucosamine-dolichyl-phosphate N-acetylglucosaminephosphotransferase Human genes 0.000 description 1
- 101710086987 X protein Proteins 0.000 description 1
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 1
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 1
- 230000021736 acetylation Effects 0.000 description 1
- 238000006640 acetylation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 1
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 1
- 210000004404 adrenal cortex Anatomy 0.000 description 1
- 239000000556 agonist Substances 0.000 description 1
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 description 1
- 125000003158 alcohol group Chemical group 0.000 description 1
- 102000004139 alpha-Amylases Human genes 0.000 description 1
- 108090000637 alpha-Amylases Proteins 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-PHYPRBDBSA-N alpha-D-galactose Chemical compound OC[C@H]1O[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-PHYPRBDBSA-N 0.000 description 1
- 229940024171 alpha-amylase Drugs 0.000 description 1
- 230000033115 angiogenesis Effects 0.000 description 1
- 210000004102 animal cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000005557 antagonist Substances 0.000 description 1
- 210000002403 aortic endothelial cell Anatomy 0.000 description 1
- 101150042295 arfA gene Proteins 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000009582 asparagine Nutrition 0.000 description 1
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 description 1
- 230000002238 attenuated effect Effects 0.000 description 1
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 description 1
- 230000006696 biosynthetic metabolic pathway Effects 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 210000004204 blood vessel Anatomy 0.000 description 1
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 1
- 230000003139 buffering effect Effects 0.000 description 1
- 108091006374 cAMP receptor proteins Proteins 0.000 description 1
- 244000309466 calf Species 0.000 description 1
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 1
- 229940095731 candida albicans Drugs 0.000 description 1
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 1
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 1
- 239000013553 cell monolayer Substances 0.000 description 1
- 238000001516 cell proliferation assay Methods 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 1
- 210000004978 chinese hamster ovary cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000002759 chromosomal effect Effects 0.000 description 1
- 238000012761 co-transfection Methods 0.000 description 1
- 238000004440 column chromatography Methods 0.000 description 1
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 1
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 1
- 239000000356 contaminant Substances 0.000 description 1
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 1
- 229920001577 copolymer Polymers 0.000 description 1
- 229910001431 copper ion Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 1
- 150000001945 cysteines Chemical class 0.000 description 1
- 229960003067 cystine Drugs 0.000 description 1
- 230000009089 cytolysis Effects 0.000 description 1
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000003111 delayed effect Effects 0.000 description 1
- 238000000432 density-gradient centrifugation Methods 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 1
- 238000007865 diluting Methods 0.000 description 1
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 1
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 1
- 206010013023 diphtheria Diseases 0.000 description 1
- 239000003995 emulsifying agent Substances 0.000 description 1
- 210000002472 endoplasmic reticulum Anatomy 0.000 description 1
- 210000002889 endothelial cell Anatomy 0.000 description 1
- 108010028531 enomycin Proteins 0.000 description 1
- 230000007613 environmental effect Effects 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- 210000002615 epidermis Anatomy 0.000 description 1
- 230000008556 epithelial cell proliferation Effects 0.000 description 1
- 210000003560 epithelium corneal Anatomy 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 101150016624 fgfr1 gene Proteins 0.000 description 1
- 102000052178 fibroblast growth factor receptor activity proteins Human genes 0.000 description 1
- 238000007667 floating Methods 0.000 description 1
- 239000000417 fungicide Substances 0.000 description 1
- 229930182830 galactose Natural products 0.000 description 1
- 210000001035 gastrointestinal tract Anatomy 0.000 description 1
- 239000008273 gelatin Substances 0.000 description 1
- 229920000159 gelatin Polymers 0.000 description 1
- 235000019322 gelatine Nutrition 0.000 description 1
- 235000011852 gelatine desserts Nutrition 0.000 description 1
- 239000003862 glucocorticoid Substances 0.000 description 1
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000009424 haa Nutrition 0.000 description 1
- 230000036541 health Effects 0.000 description 1
- 102000043635 human AZU1 Human genes 0.000 description 1
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 description 1
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 description 1
- 230000000984 immunochemical effect Effects 0.000 description 1
- 238000010166 immunofluorescence Methods 0.000 description 1
- 230000016784 immunoglobulin production Effects 0.000 description 1
- 239000012535 impurity Substances 0.000 description 1
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 1
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 1
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 1
- 230000009545 invasion Effects 0.000 description 1
- 238000004255 ion exchange chromatography Methods 0.000 description 1
- 238000005304 joining Methods 0.000 description 1
- 229960000318 kanamycin Drugs 0.000 description 1
- 229930027917 kanamycin Natural products 0.000 description 1
- SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N kanamycin Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CN)O[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N 0.000 description 1
- 229930182823 kanamycin A Natural products 0.000 description 1
- 108010029560 keratinocyte growth factor receptor Proteins 0.000 description 1
- 210000003734 kidney Anatomy 0.000 description 1
- 101150066555 lacZ gene Proteins 0.000 description 1
- 239000008101 lactose Substances 0.000 description 1
- 238000011031 large-scale manufacturing process Methods 0.000 description 1
- 239000010410 layer Substances 0.000 description 1
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-M leucinate Chemical compound CC(C)CC(N)C([O-])=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 1
- 125000003071 maltose group Chemical group 0.000 description 1
- 229910052751 metal Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000002184 metal Substances 0.000 description 1
- 229910021645 metal ion Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000002679 microRNA Substances 0.000 description 1
- 239000003226 mitogen Substances 0.000 description 1
- 230000000877 morphologic effect Effects 0.000 description 1
- 229960004927 neomycin Drugs 0.000 description 1
- 210000001020 neural plate Anatomy 0.000 description 1
- 231100000252 nontoxic Toxicity 0.000 description 1
- 231100000956 nontoxicity Toxicity 0.000 description 1
- 238000007899 nucleic acid hybridization Methods 0.000 description 1
- 210000001623 nucleosome Anatomy 0.000 description 1
- 238000002515 oligonucleotide synthesis Methods 0.000 description 1
- 101150087557 omcB gene Proteins 0.000 description 1
- 101150115693 ompA gene Proteins 0.000 description 1
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 1
- 230000007030 peptide scission Effects 0.000 description 1
- 210000001322 periplasm Anatomy 0.000 description 1
- 101150009573 phoA gene Proteins 0.000 description 1
- 102000020233 phosphotransferase Human genes 0.000 description 1
- 238000007747 plating Methods 0.000 description 1
- 229920000747 poly(lactic acid) Polymers 0.000 description 1
- 238000002264 polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 239000004633 polyglycolic acid Substances 0.000 description 1
- 239000004626 polylactic acid Substances 0.000 description 1
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 1
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 1
- 230000004481 post-translational protein modification Effects 0.000 description 1
- 230000001124 posttranscriptional effect Effects 0.000 description 1
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 1
- 238000004321 preservation Methods 0.000 description 1
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 1
- 230000009465 prokaryotic expression Effects 0.000 description 1
- 235000019833 protease Nutrition 0.000 description 1
- 235000019419 proteases Nutrition 0.000 description 1
- 238000001742 protein purification Methods 0.000 description 1
- 230000006337 proteolytic cleavage Effects 0.000 description 1
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 1
- 239000013014 purified material Substances 0.000 description 1
- 239000012521 purified sample Substances 0.000 description 1
- 238000002310 reflectometry Methods 0.000 description 1
- 230000008439 repair process Effects 0.000 description 1
- 230000004044 response Effects 0.000 description 1
- 210000003705 ribosome Anatomy 0.000 description 1
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 1
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 1
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 1
- 150000003355 serines Chemical class 0.000 description 1
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 1
- 239000012090 serum-supplement Substances 0.000 description 1
- 239000013605 shuttle vector Substances 0.000 description 1
- 239000002356 single layer Substances 0.000 description 1
- 238000002741 site-directed mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 150000003384 small molecules Chemical class 0.000 description 1
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 1
- 238000000638 solvent extraction Methods 0.000 description 1
- 238000001179 sorption measurement Methods 0.000 description 1
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 1
- 238000003860 storage Methods 0.000 description 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 1
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 description 1
- 229940037128 systemic glucocorticoids Drugs 0.000 description 1
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 1
- 229960002175 thyroglobulin Drugs 0.000 description 1
- 230000000699 topical effect Effects 0.000 description 1
- 231100000167 toxic agent Toxicity 0.000 description 1
- 231100000419 toxicity Toxicity 0.000 description 1
- 230000001988 toxicity Effects 0.000 description 1
- 238000010361 transduction Methods 0.000 description 1
- 230000026683 transduction Effects 0.000 description 1
- 238000011426 transformation method Methods 0.000 description 1
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 description 1
- 230000014621 translational initiation Effects 0.000 description 1
- 230000005945 translocation Effects 0.000 description 1
- 101150035767 trp gene Proteins 0.000 description 1
- 101150044170 trpE gene Proteins 0.000 description 1
- 210000004881 tumor cell Anatomy 0.000 description 1
- 108010016264 ubiquitin-Nalpha-protein hydrolase Proteins 0.000 description 1
- 238000000108 ultra-filtration Methods 0.000 description 1
- 230000003827 upregulation Effects 0.000 description 1
- VBEQCZHXXJYVRD-GACYYNSASA-N uroanthelone Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O)C(C)C)[C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC=1NC=NC=1)NC(=O)[C@H](CCSC)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@H](CS)NC(=O)CNC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O)C(C)C)[C@@H](C)CC)C1=CC=C(O)C=C1 VBEQCZHXXJYVRD-GACYYNSASA-N 0.000 description 1
- 230000002792 vascular Effects 0.000 description 1
- 230000000007 visual effect Effects 0.000 description 1
- 238000009736 wetting Methods 0.000 description 1
- 239000000080 wetting agent Substances 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/475—Growth factors; Growth regulators
- C07K14/50—Fibroblast growth factor [FGF]
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
- A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- A61K38/17—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- A61K38/18—Growth factors; Growth regulators
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
- A61K47/50—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
- A61K47/51—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
- A61K47/62—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being a protein, peptide or polyamino acid
- A61K47/64—Drug-peptide, drug-protein or drug-polyamino acid conjugates, i.e. the modifying agent being a peptide, protein or polyamino acid which is covalently bonded or complexed to a therapeutically active agent
- A61K47/6415—Toxins or lectins, e.g. clostridial toxins or Pseudomonas exotoxins
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
- A61K47/50—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
- A61K47/51—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
- A61K47/62—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being a protein, peptide or polyamino acid
- A61K47/64—Drug-peptide, drug-protein or drug-polyamino acid conjugates, i.e. the modifying agent being a peptide, protein or polyamino acid which is covalently bonded or complexed to a therapeutically active agent
- A61K47/642—Drug-peptide, drug-protein or drug-polyamino acid conjugates, i.e. the modifying agent being a peptide, protein or polyamino acid which is covalently bonded or complexed to a therapeutically active agent the peptide or protein in the drug conjugate being a cytokine, e.g. IL2, chemokine, growth factors or interferons being the inactive part of the conjugate
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P17/00—Drugs for dermatological disorders
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P17/00—Drugs for dermatological disorders
- A61P17/02—Drugs for dermatological disorders for treating wounds, ulcers, burns, scars, keloids, or the like
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P5/00—Drugs for disorders of the endocrine system
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Zoology (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Dermatology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Diabetes (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Endocrinology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
Description
SKRÁTENÝ KERATINOCYTOVÝ RASTOVÝ FAKTOR (KGF), MAJÚCI ZVÝŠENÚ BIOLOGICKÚ AKTIVITU
Oblasť techniky
Predložený vynález sa týka všeobecne keratinocytového rastového faktoru (keratinocyte growth factor - KGF). Špecifickejšie sa tento vynález týka skráteného KGF fragmentu a jeho analógov, majúcich zvýšenú biologickú aktivitu a zníženú toxicitu v porovnaní s rekombinantným KGF plnej dĺžky, exprimovaným v systéme hmyzích buniek. Tomuto KGF fragmentu, označenému tu ako KGFdeal_23, chýba prvých 23 aminokyselinových zvyškov od N-konca zrelého KGF plnej dĺžky, kde tento koniec zahrňuje glykozylačné miesto pri aminokyselinových zvyškoch 14 až 16 od N-konca ako je uvedené Finchom, P. W. a spol., Science 245: 752 - 755 (1989) a bol prv pokladaný za prepožičiavajúci KGF jeho epiteliálnu bunečnú špecifickosť.
Doterajší stav techniky
KGF patrí do rodiny fibroblastových rastových faktorov (FGF), ktorých prototypom je bázický FGF (bFGF). KGF je preto tiež označovaný ako FGF-6. Podobne iným FGF je KGF heparín viažuci proteín, ale na rozdiel od iných FGF, má jedinečnú špecifickosť delových buniek. Podrobnejšie sú FGF všeobecne schopné stimulovať proliferáciu a diferenciáciu rôznych typov buniek odvodených od primárneho alebo sekundárneho mezodermu, ako i z neuroektodermu. KGF je podobný iným FGF vo svojej schopnosti stimulovať epiteliálnu bunečnú proliferáciu, ale odlišuje sa od iných FGF svojho neschopnosťou stimulovať endoteliálne bunky alebo proliferáciu fibroblastov, ako popisuje Finch, P.W. a spol.
(loc. cit.).
FGF, zahrňujúci acidický fibroblastový rastový faktor (aFGF) a bázický fibroblastový rastový faktor (bFGF) sú známe tým, že majú heparín viažuce vlastnosti a majú schopnosť indukovať diferenciáciu a proliferáciu ventrálneho, ako i dorzálneho mezodermu v ranných blastulách, ako popisuje Gospodarovicz a spol., Celí. Biol. Rev. 29: 307 - 314 (1991) a Basilico a spol., Adsv. Cancer Res. 59: 115 - 165 (1992). Odozva buniek na FGF je sprostredkovaná ich väzbou k bunečným povrchovým receptorom (FGFR), od ktorých sú odvodené tri intertypy, ako popisuje Hou a spol., Science 251: 665 - 668 (1991). Vysoko afinitné FGFR sú tyrozín kinázy a zahrňujú Flg receptor (FGFR-1), bek receptor (FGFR-2) a J. Sam receptor (FGFR-3) ako uvádza Lee a spol. Science 245: 57 - 60 (1989), Dionne a spol., EMBO 9: 2685 - 2692 (1990), Miki a spol., Science 251: 72 - 75 (1991), Miki a spol., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89: 246 - 250 (1992) a Dell a spol., J. Biol. Chem., 267: 21225 - 212209 (1992) .
Ako FGFR-1, tak FGFR-2 sú silne exprimované v mezodermáIných a neuroendodermálnych tkanivách a obidva sú schopné viazať aFGF a bFGF s podobnými afinitami. FGFR-3 je KGF receptor, ktorý je špecifický k epiteliálnym bunkám. Je to alternatívny transkript FGFR-2. Na rozdiel od FGFR-2, ktorý vykazuje vysokú afinitu ako pre aFGF, tak bFGF a nevykazuje afinitu pre KGF, FGFR-3 viaže KGF a aFGF s afinitou približne 20 až 1 000 krát vyššou ako bFGF, ako popisuje Miki a spol. (loc. cit.) a Dell a spol. (loc. cit.).
Úzko obmedzená aktivita profilu KGF k epiteliálnym bunkám je žiaduca napríklad ako vo veía typoch aplikácií hojenia rán, tak pri liečení hyperproliferatívnych chorôb epidermu ako je psoriasis a karcinóm bazálnych buniek. V súčasnosti, s výnimkou KGF, neexistuje pre tieto aplikácie žiaden vysoko vhodný mitogenický faktor. Je preto žiaduce, aby KGF bol modifikovaný na zvýšenie svojej potencie a zníženie svojej cytotoxicity pre terapeutické aplikácie.
V poslednej dobe zistili Ron a spol., J. Biol. Chem., 268: 2984 - 2988 (február 1993), že ak bol KGF163 exprimovaný v T7 prokaryotickom expresnom systéme, mal by byt získaný rekombinantný KFG (rKFG) polypeptid, ktorý vykazuje mitogenickú aktivitu. Ak bola rKGF molekula skrátená deléciou 3, 8, 27, 38 a 48 aminokyselinových zvyškov, od N-konca zrelého KGFir-i lb J polypeptidu, mení sa biologická aktivita výsledných molekúl. S deléciou 3a 8 aminokyselinových zvyškov nie je mitogenická aktivita výsledných molekúl ovplyvnená v porovnaní s rKGF plnej dĺžky (rKGF163). Delécia 27 aminokyselinových zvyškov však vedie k 10 až 20krát zníženej mitogenickej aktivite. Delécia 38 a 48 aminokyselinových zvyškov vedie k úplnej strate mitogenickej aktivity a heparín viažucej aktivity. Ron a spol. neboli úspešní pri produkcii akýchkoívek skrátených KFG fragmentov, ktoré vykazujú zvýšenú mitogenickú aktivitu v porovnaní s rKGF163 molekulou.
Podstata vynálezu fragment, ktorý obsahuje plnej dĺžky, KGFno< a mitogenickej
136 aktivity
Jedným predmetom predloženého vynálezu je poskytnúť KGF aminokyselinovú sekvenciu zrelého KGF vykazuje aspoň dvojnásobné zvýšenie porovnaní s rekombinantným KGF plnej dĺžky, rKGFj3g. Zvláštnym predmetom je poskytnutie KGF fragmentu, ktorý nemá sekvenciu obsahujúcu prvých 23 N-koncových aminokyselinových zvyškov, C-N-D-M-T-P-E-Q-M-A-T-N-V-N-C-S-S-PE-R-H-T-R- z rKGF136.
Ďalším z predmetov predloženého vynálezu je poskytnutie KGF fragmentu, ktorý má zníženú cytotoxicitu v porovnaní s KGF163. Ešte ďalším predmetom je poskytnúť konjugát, ktorý obsahuje KGF fragment popísaný vyššie a toxínovú molekulu. Toxínovou molekulou môže byt aspoň jedna z molekúl ricínu A, diftéria toxínu a saporínu.
Ešte ďalším predmetom predloženého vynálezu je poskytnutie terapeutickej kompozície, ktorá obsahuje KGF fragment, ako je popísaný vyššie a farmaceutický prijateľný nosič, napríklad niektorý z tých, ktoré sú vhodné na topickú aplikáciu na íudskú kožu.
Ešte ďalším z predmetov predloženého vynálezu je poskytnúť DNA molekulu, ktorá je zložená z nukleotidovej sekvencie, ktorá kóduje KGF fragment popísaný vyššie.
Ešte ďalším z predmetov predloženého vynálezu je poskytnúť expresný vektor, ktorý obsahuje DNA molekulu, ktorá kóduje KGF fragment, popísaný vyššie a regulátorovú sekvenciu pre expresiu DNA molekuly. Expresným vektorom môže byt napríklad bakulovírus.
Ešte ďalším z predmetov predloženého vynálezu je poskytnutie hostiteľskej bunky transformovanej vyššie popísaným expresným vektorom. Hostiteľskou bunkou môže napríklad byt bakteriálna bunka, kvasinková bunka, cicavčia bunka alebo hmyzia bunka.
Ešte ďalším z predmetov predloženého vynálezu je poskytnutie spôsobu produkcie KGF fragmentu kultiváciou transformovanej hostiteľskej bunky, ako je popísané vyššie a izolácia KGF fragmentu z kultúry.
Ešte ďalším predmetom predloženého vynálezu je poskytnutie metódy stimulácie rastu epiteliálnych buniek aplikáciou KGF fragmentu na plochu, v ktorej je požadovaný rast epiteliálnych buniek a ponechanie ich vyrastenia.
Ešte ďalším z predmetov predloženého vynálezu je poskytnúť metódu na hojenie rán aplikáciou terapeutickej kompozície popísanej vyššie na plochu ošetrovanej rany a jej zahojenie.
Ešte ďalším z predmetov predloženého vynálezu je poskytnúť spôsob liečenia hyperproliferatívnej choroby epidermu aplikáciou konjugátu popísaného vyššie na ošetrovanú plochu.
Ďalšie predmety, znaky a výhody predloženého vynálezu by mali byt zrejmé odborníkom v odbore a nie je potrebné ich tu uvádzať. Predložený vynález zahrňuje varianty a modifikácie vyššie uvedeného, ktoré sú zrejmé odborníkom v odbore a ktoré podstatne nemenia charakter a aktivitu fragmentu, konjugátu, terapeutickej kompozície, vektoru, hostiteľa a spôsobu použitia.
Popis obrázkov na pripojených výkresoch
Obr. 1 predstavuje aminokyselinovú sekvenciu zrelého, ľudského KGF plnej dĺžky, začínajúci N-koncom a obsahujúci 163 aminokyselinových zvyškov a jediným N- pripojeným glykozylačným signálom pri aminokyselinových zvyškoch 14 - 16.
Obr. 2 predstavuje pAcl3 expresný vektor, do ktorého bola inzertovaná 163 aminokyselinová sekvencia KGF.
Obr. 3 ilustruje ďalšie čistenie KGF fragmentu podľa predloženého vynálezu z SFP bunečného kondicionovaného média po eluácii z Heparin Sepharosovej (HS) kolóny pomocou 1 M NaCI. Bioaktívne frakcie HS kolóny boli spojené, zriedené 5-násobne 10 mM Tris, pH 7,3 a vložené na Mono S HR5/5 katiónovýmennú FLPC.
Obr. 4 porovnáva biologickú aktivitu dlhej, t.j. fKGF136 a krátkej t.j. KGFdesl-23 f°riny KGF proti aFGF na bunkách bunečnej línie Balb/Mk.
Obr. 4 porovnáva biologickú aktivitu dlhej, t.j. fKGF^g a krátkej, t.j. KGFdesl_23 formy KGF proti bFGF na vaskulárnych endoteliálnych bunkách získaných z veľkých ciev (A:ABAE bunky) alebo kapilár (B:ACE bunky).
Prekvapujúco bolo objavené, že skrátený, neglykozylovaný KGF, tu označený ako KGF fragment alebo KGFdesl-23 ' ktorÝ deléciu zahrňujúcu prvých 23 N-koncových aminokyselinových zvyškov z rKGF163, vykazuje väčšiu biologickú aktivitu a zníženú cytotoxicitu na epiteliálnych bunkách v porovnaní s rKGF163.
V súlade s vyššie uvedeným je preferovaným vyhotovením predloženého vynálezu nový skrátený, neglykozylovaný KGF fragment, KGFdesl_23, ktorý nie je spojený s nečistotami, ktoré normálne sprevádzajú natívnu molekulu, ak je produkovaná in vivo.
Tento fragment má zjavnú molekulovú hmotnosť asi 18 kDA podlá jej migrácie v Na Dod SO4/PAGE ako jediný pík. Špecifická aktivita čisteného KGFdesl-23 Balb/Mk buniek je približne 2,5 x lo1 jednotiek na miligram (ED^q 40 pg/ml), asi 7- až 10-krát väčšia ako rKGF163 proteín alebo aFGF pri porovnaní v štúdii bunečnej proliferácie a 100 krát väčšia ako je pri bioštúdii rKGF163 skúšaním iniciácie DNA syntézy v Balb/Mk bunkách v chemicky definovanom médiu, ako je popísané v PCT patentovej prihláške č. WO 90/08771.
V ďalšom výhodnom vyhotovení predloženého vynálezu je produkovaný KGFdesl_23 rekombinantnou DNA technológiou, najmä pre komerčnú výrobu vo velkom meradle. V ďalšom výhodnom vyhotovení rekombinantné DNA molekula a expresný vektor, obsahujúce každý KGFdesl_23 alebo ich analógy v súlade s predloženým vynálezom sú vyhotovené štandardnou technológiou génovej expresie použitím metód dobre v odbore známych.
V ďalšom vyhotovení môžu byť DNA alebo vektor, obsahujúci DNA, kódujúci KGFdesl-23' exPrimované v bakteriálnom, cicavčom, kvasinkovom alebo hmyzom bunečnom expresnom systéme. Vo výhodnom vyhotovení je bakteriálny alebo kvasinkový bunečný expresný systém ideálny pre produkciu KGFdesi-23 fragmentu. V ďalšom výhodnom vyhotovení sú DNA alebo vektor exprimované v expresnom systéme hmyzích buniek.
KGF fragment podlá predloženého vynálezu môže byť použitý na identifikáciu receptor rozpoznávajúcich miest ako i na zostavenie peptidových agonistov alebo antagonistov. Naviac, vzhladom špecifickosti KGF pre keratinocyty, jeho indukovať proliferáciu vaskulámych endoteliálnych fibroblastov a jeho netoxicite je v inom výhodnom vyhotovení predloženého vynálezu KGFdesl-23 výbodne použitý na aplikáciu pri hojení rán, najmä tam, kde je žiaduce podporovať reepitelizáciu kože. Výhodné vyhotovenie využíva KGFdesl-23 v obnove corneálneho epitelu. Iné aplikácie KGFdesl-23' m°žu byt založené na jeho špecifickosti k epiteliálnym bunkám k jedinečnej neschopnosti buniek alebo nachádzajúcim sa v gastrointestinálnom trakte.
Voľba KGF fragmentu z iných rastových faktorov ako je epidermálny rastový faktor (EGF), od doštičiek odvodený faktor (PDGF) a iné FGF na hojenie kože závisí od odborníka v odbore. Iné rastové faktory napríklad indukujú fibropláziu a angiogenézu, naviac k stimulácii, buď priamo alebo nepriamo, keratinocytovej proliferácie. Pri hojení kože by takéto ďalšie aktivity mohli produkovať nežiaduce vedľajšie
V corneálnom hojení zahrňujúcom zákroky, by toto použitie iných faktorov mohlo indukovať inváziu krvných ciev do cornea, čo by mohlo viest k nežiaducej opáčite k edému. KGF, naopak, má jedinečnú špecificitu pre a nevyvoláva proliferáciu vaskulárnych endoteliálnych buniek alebo fibroblastov, a preto by mohol byt činidlom voíby pre tieto konkrétne aplikácie pri hojení rán.
účinky ako je škárovanie. buď rany alebo chirurgické cornea alebo keratinocyty
Ďalej KGF fragment podía predloženého vynálezu môže byt použitý v inom vyhotovení predloženého vynálezu, vo forme konjugátu KGF fragment/toxín. Takýto konjugát môže spomaľovať alebo ukončovať chorobný proces v takých chorobách ako je psoriasis, čo vyplýva z hyperproliferácie bazálnej vrstvy keratinocytov z epidermis. Tento konjugát by nemal ovplyvňovať ďalšie dva hlavné bunečné typy ako sú vaskulárne endoteliálne bunky a fibroblasty, prítomné v týchto tkanivách.
V ďalšom vyhotovení predloženého vynálezu môže byt konjugát KGF fragment/toxín kvôli zabráneniu proliferácie nádorových buniek, napríklad bazálnych buniek karcinómu.
Praktické vyhotovenie predloženého vynálezu bude využívať, ak nie je uvedené inak, konvenčné techniky molekulárnej biológie, mikrobiológie, rekombinantnéj DNA a imunológie, ktoré sú bežné v odbore, takéto techniky sú dobre vysvetlené v literatúre. Pozri napr. Sambrook a spol., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2. vyd. Cold Spring Harbor Laboratory Press (1989), DNA Cloning, Volumes I and II, D. N. Glover, vyd. IRL Press (1985),
Oligonucleotide Synthesis, M.J. Gait, vyd. IRL Press (1984), Nucleic Acid Hybridization, B. D. Hames and S. J. Higgins, vyd. IRL Press (1984), Transcription and Translation, B. D. Hames and S. J. Higgins, vyd. IRL Press (1984), Animal Celí Culture, R. i. Freshney, vyd. IRL Press (1986), B. Perbal, A Practical Guide to Molecular Cloning, (vydavateľ) (1984), šerie: Methods in Enzymology, Academic Press, Inc., Gene Transfer Vectors for Mammalian Cells, J. H. Miller a M.P. Calos, vyd. Cold Spring Harbor Laboratory (1987), Methods in Enzymology, zv. 154 a zv. 155, Wu a Grossman a Wu, (vyd. Mayer a Walker), (1987), Immunochemical Methods in Celí and Molecular Biology, Academic Press, Londýn, Scopes (autor?), Proteín Purification: Principles and Practice, 2. vyd., Springer-Verlag, N.Y (rok?) a Handbook of Experimental Immunology, Volumes I-IV, D.M. Weir, C. C. Blackwell vyd., (1986), Kitts a spol., Biotechniques 14: 810- 817 (1993), Munemitsu a spol., Mol. and Celí. Biol., 10: 5977 - 5982 (1987) a ďalší.
Na obr. 1 boli použité štandardné skratky pre aminokyseliny a rovnaké sú použité v tomto opise. Všetky publikácie, patenty a patentové prihlášky sú tu citované ako odkazy. Kvôli presnosti sú ďalej definované najčastejšie sa vyskytujúce výrazy.
Definície
Použitý výraz keratinocytový rastový faktor alebo KGF označuje polypeptidy, ktoré patria do rodiny štruktúrne odlišných proteínov, fibroblastových rastových faktorov, FGF, ktoré vykazujú rôzne stupne sekvenčnej homológie potvrdzujúce, že sú kódované príbuznou rodinou génov. KGF má charakteristiky popísané v tomto opise, napríklad sa viaže k FGFR-3 a je schopný stimulovať rast epiteliálnych buniek, najmä keratinocytov. KGF plnej dĺžky je tvorený 163 aminokyselinovými zvyškami.
Ako je tu použitý podľa predloženého vynálezu je KGF fragment polypeptid, ktorý je zložený z časti aminokyselinovéj sekvencie zrelého KGF plnej dĺžky. Analóg KGF fragmentu, ako je tu označovaný, zahrňuje minoritné inzercie, delécie alebo substitúcie KGF fragmentu, ktoré podstatne neovplyvňujú jeho vlastnosti. Napríklad, sú prijatelné náhrady konzervatívnych aminokyselín. Takéto náhrady sú napríklad tie, ktoré sú vykonávané v skupine aminokyselín, ktoré sú príbuzné vo svojich bočných reťazcoch. Skupiny aminokyselín sú (1) kyslé: kyselina aspartová, kyselina glutamová, (2) bázické: lyzín, arginín, histidín, (3) nepoláme: alanín, valín, leucín, izoleucín, prolín, fenylalanín, metonín, tryptofán a (4) nenabité polárne: glycín, asparagín, glutamín, cystín, serín, treonín, tyrozín. Fenylalanín, tryptofán a tyrozín sú niekedy klasifikované spolu ako skupina aromatických aminokyselín. Všeobecne sa prijíma, že konzervatívne aminokyselinové náhrady pozostávajúce z izolovanej náhrady leucínu izoleucínom alebo valínom, alebo aspartovej kyseliny kyselinou glutamovou alebo treonínu serínom alebo podobná konzervatívna náhrada aminokyseliny štruktúrne príbuznou aminokyselinou, v oblasti mimo polypeptidové aktívne miesto, nebudú mať podstatný vplyv na vlastnosti polypeptidu.
Vlastnosti | KGF |
aktivitu, ktorá je | |
najvýhodnejšie | 7 až |
epiteliálnych | buniek |
natívneho KGF | plnej |
k FGFR-3. |
fragmentu zahrňujú (i) jeho biologickú 2 až 10 krát väčšia, výhodne 2 krát, 10 krát zvýšená v stimulácii proliferácie v porovnaní s molekulou maturovaného dĺžky a (ii) jeho schopnosť viazať sa
Výraz rekombinantný polynukleotid ako je tu použitý, znamená polynukleotid polosyntetického alebo syntetického pôvodu alebo kódovaný cDNA alebo genómovou DNA (gDNA), ktorý (1) nie je spojený s celým alebo s časťou polynukleotidu, s ktorým je spojený v prírode, (2) je spojený s polynukleotidom iným ako tým, ku ktorému je pripojený v prírode, alebo (3) nevyskytuje sa v prírode.
Replikon je akýkoľvek genetický prvok, ako je plazmid, chromozóm, vírus, kozmid atď., ktorý sa správa ako autonómna jednotka polynukleotidovej replikácie v bunke, t.j. je schopný replikácie pod vlastnou kontrolou. Replikon môže obsahovať napríklad selektujúce markery.
Rekombinantný vektor je replikon, v ktorom je pripojený ďalší polynukleotidový segment, takže prináša replikáciu a/alebo expresiu pripojeného polynukleotidového segmentu.
Regulátorová sekvencia je polynukleotidová sekvencia, ktorá je nevyhnutná na reguláciu expresie kódujúcej sekvencie, ku ktorej je polynukleotidová sekvencia operabilne pripojená. Charakter takýchto regulátorových sekvencii sa odlišuje v závislosti od hostiteľskej bunky, v ktorej má byť kódujúca sekvencia exprimovaná. V prokaryotoch takéto regulátorové sekvencie všeobecne zahrňujú napríklad promótor, ribozomálne väzobné miesto a/alebo transkripčnú terminačnú sekvenciu. V eukaryotoch všeobecne takéto regulátorové sekvencie zahrňujú promótor a/alebo transkripčnú terminačnú sekvenciu. Výraz regulátorová sekvencia môže tiež zahrňovať ďalšie zložky, ktorých prítomnosť je výhodná, napríklad sekrečný leader sekvencie pre sekréciu polypeptidu, ktorý je exprimovaný.
Operabilne pripojený znamená polohu, kedy sú zložky spojené vo vztahu, ktorý im umožňuje pôsobiť ich zamýšľaným spôsobom. Napríklad regulátorová sekvencia je operabilne pripojená ku kódujúcej sekvencii, ktorá je spojená tak, že expresia kódujúca sekvenciu sa dosiahne za podmienok kompatibilných s regulátorovou sekvenciou.
Kódujúca sekvencia je polynukleotidová sekvencia, ktorá je translatovaná do polypeptidu, ak je umiestnený pod kontrolou vhodnej regulátorovéj sekvencie. Väzby kódujúce sekvencie sú všeobecne determinované translačným štart kodónom pri ich 5'-konci a translačným stop kodónom na ich 3'-konci. Kódujúca sekvencia môže zahrňovať napríklad cDNA a rekombinantné polynukleotidové sekvencie.
PCR označuje techniku polymerázovej reťazovej reakcie ako je popísaná Saikim a spol., Náture 324: 163 (1986), US patent č. 4683195 a US patent č. 4683202.
Tu použitý výraz polypeptid sa týka polyméru aminokyselín a netýka sa špecifickej dĺžky produktu. Peptidy, oligopeptidy a proteíny sú tak zahrnuté v tomto výraze. Tento výraz tiež zahrňuje translačné modifikácie polypeptidu, napríklad glykozyláciu, acetyláciu, fosforyláciu a podobne. Ďalej v tejto definícii sú napríklad zahrnuté polypeptidy so substituovanými väzbami, ako i inými modifikáciami známymi v odbore, ako prirodzene sa vyskytujúce, tak neprirodzene sa vyskytujúce.
Terminátory sú regulátorové sekvencie, ako sú polyadenylačné a transkripčné terminačné sekvencie, umiestnené 3' alebo v smere od stop kodónu kódujúcich sekvencií.
Rekombinantné hostiteľské bunky, hostiteľské bunky, bunky, bunečné kultúry a iné výrazy znamenajú napríklad mikroorganizmy, hmyzie bunky a cicavčie bunky, ktoré môžu byt alebo boli použité ako príjemcovia na zavedenie rekombinantného vektoru alebo inej transferovej DNA a zahrňujú predkov bunky, ktorá bola transformovaná. Takíto predkovia zahrňujú tie, ktoré musia byt nevyhnutne zhodné v morfologickom alebo genomickom alebo celkovom DNA komplemente ako pôvodný rodič a ktoré môžu byt produkované ako výsledok prirodzenej, acidentálnej alebo deliberačnej mutácie. Príklady takýchto hostiteľských buniek zahrňujú bunky vaječníkov čínskeho škrečka (CHO) a opičích ľadvín (COS).
Tu použitý výraz mikroorganizmus zahrňuje prokaryotické a eukaryotické mikrobiálne druhy ako sú baktérie a pliesne, kde posledne uvedené zahrňujú kvasinky a vláknité pliesne.
Transformácia ako je tu použitá, označuje prenesenie exogénneho polypeptidu do hostiteľskej bunky vrátane spôsobu použitého na prenesenie, ktorým môže napríklad byt infekcia, priamy príjem, transdukcia, F-mating, mikroinjekcia alebo elektroporácia. Exogénny polynukleotid môže byt udržiavaný ako neintegrovaný vektor, napríklad plazmid alebo alternatívne môže byt integrovaný do hostiteľovho genómu.
Čistený a izolovaný v súvislosti s polypeptidom alebo nukleotidovou sekvenciou znamená, že uvedená molekula je prítomná za v podstate neprítomnosti iných biologických makromolekúl rovnakého druhu alebo typu. Výraz znamená, že je prítomných aspoň 75 hmôt., výhodnejšie aspoň 95 % hmôt. hmôt. biologických makromolekúl čistený ako je tu použitý % hmôt., výhodne aspoň 85 % a najvýhodnejšie aspoň 98 % rovnakého typu, alebo môžu rovnako byt prítomné voda, pufre a iné malé molekuly, najmä molekuly, majúce molekulovú hmotnost menšiu ako 1 000.
Farmaceutický prijateľným nosičom je mienený akýkoívek nosič, ktorý môže byt použitý odborníkmi v odbore na podanie človeku, ktorý sám nevyvoláva akékoľvek nežiaduce vedlajšie účinky ako je produkcia protilátok, horúčku, atď. Vhodné nosiče sú typické veľké, pomaly metabolizujúce makromolekuly, ktorými môžu byt proteín, polysacharid, polymliečna kyselina, polyglykolová kyselina, polymérna aminokyselina, aminokyselinové kopolyméry alebo inaktívne vírusové častice. Iné nosiče môžu byt tie, ktoré sú známe odborníkom v odbore. Výhodne nosič obsahuje tyroglobulín.
Terapeutický prípravok typicky bude obsahovať farmaceutický prijateľné nosiče ako je voda, salinický roztok, glycerol, etanol atď. Ďalej môžu byt v takýchto prípravkoch prítomné pomocné zložky ako sú zmáčacie alebo emulgačné činidlá, pH pufrujúce zložky a podobne.
Terapeuticky účinným množstvom je tu mienené množstvo, ktoré je účinné na dosiahnutie požadovaného výsledku. Toto množstvo sa mení v závislosti od zdravotného a fyzického stavu liečeného jednotlivca, schopnosti imunitného systému jednotlivca syntetizovať protilátky na stupni požadovanej ochrany, prípravku, hodnotenia situácie ošetrujúcim lekárom a iných relevantných faktorov. Predpokladá sa, že množstvo bude spadať do relatívne širokého rozmedzia, ktoré je možné stanoviť rutinnými pokusmi.
Neočakávane sa zistilo, že ak je KGF exprimovaný v hmyzích bunkách Spodoptera frugiperda (SF9), pri infekcii rekombinantným bakulovírusom Autographa californica, obsahujúcim cDNA, kódujúcu KGF163, tieto produkujú KGF fragment, ktorému chýba prvých domény,
KGF23 aminokyselinových zvyškov KGF
KGF
163
140
163 N-koncovej obsahujúcej jediné glykozylačné miesto, naviac ku Skrátený a neglykozylovaný KGF fragment KGFjesl_23 alebo na rozdiel od natívnej dlhej formy identifikovanej ako KGF163 7_ až 10-krát zvýšenú potenciu u cieľových buniek.
Špecifickosť cieľových buniek pre KGFjesl_23 íe nezmenená. Ďalej, pri vysokých koncentráciách KGF fragmentu nie je pozorovaný na rozdiel od kgfiô3 žiaden toxický účinok. Tieto pozorovania potvrdzujú, že na rozdiel od toho, čo bolo popísané v PCT prihláške č. WO 90/08771, špecifičnosť KGF pre cieľové bunky nie je daná jeho N-koncovou doménou. Ďalej predložený vynález ukazuje, že N-koncovo zoslabená verzia KGF v skutočnosti predstavuje zlepšenú verziu KGF s vyššou biologickou aktivitou a zníženou cytotoxicitou pre terapeutickú aplikáciu.
Veľké množstvo KGF fragmentu môže byť produkované rekombinantnými DNA technikami, čo je výhodné oproti alternatívnemu spôsobu izolácie a čistenie KGF z prírodných zdrojov a štiepenia prvých 23 aminokyselinových zvyškov z ich N-konca. KGF produkovaný rekombinantnými technikami umožňuje, aby bol KGF izolovaný za neprítomnosti kontaminujúcich molekúl, ktoré sú normálne prítomné v bunkách. V skutočnosti KGF kompozície úplne zbavené akýchkoľvek stôp ľudských proteínových kontaminantov môžu byt ľahko produkované napríklad v bakteriálnych bunkách, kvasinkových bunkách a hmyzích bunkách. Pri použití rekombinantných DNA techník môžu byť tiež produkované miestne riadenou metagenézou.
Akýkoľvek promótor, ktorý by mohol umožniť expresiu KGF fragmentu v požadovanom hostiteľovi, môže byť použitý v predloženom vynáleze. Napríklad v E. coli môže byt použitá regulátorová sekvencia lac operónu. Inými príkladom je kvasinkový alkohol dehydrogenáza (ADH) promótor, ktorý má sekvenciu proti smeru aktivátora (upsteam activator sequence UAS), ktorá moduluj e aktivitu ADH promótora. Ďalej môžu byt tiež použité určité vírusové enhancery. Takéto enhancery nielen amplifikujú, ale tiež regulujú expresiu v cicavčích bunkách. Tieto enhancery môžu byt inkorporované do cicavčích promótorových sekvencií, ktoré budú aktivované iba za prítomnosti induktora ako je hormónový alebo enzýmový substrát, ako je popísané v Sassone-Corsi a Borelli, Trends Genet., 2: 215 (1986), Maniatis a spol., Science 236: 1237 (1987). Promótory, ktoré môžu byt použité v predloženom vynáleze, tiež zahrňujú bakulovírusový polyhedrón hybridný promótor a plO promótor.
Príklady terminačných sekvencií, ktoré môžu byt použité v predloženom vynáleze, sú Saccharomyces cerevisiae alfa - faktor terminátor a bakulovírus terminátor. Ďalej môžu tiež byt použité virálne terminátory, ktoré sú operabilné v určitej hostiteľskej bunke. Napríklad SV40 terminátor je funkčný v bunkách vaječníka čínskeho škrečka (CHO).
natívneho KGF. uvedená na obr.
Pri vytváraní skrátených proteínov sú niektoré KGF preferované pri praktickom vyhotovení vynálezu. Jedným je neglykozylovaný KGF, napríklad skrátením 23 aminokyselín cDNA, kódujúca preferovaný skrátený KGF, je 1. Iné druhy KGF fragmentov existujú alebo môžu byt vytvorené rutinnými metódami. V uvedenej sekvencií sa môže objaviť pre skrátený proteín štiepiace miesto označené zátvorkou (a), čo poskytne proteín majúci molekulovú hmotnosť asi 18 000 Da. Použitím sekvenčných dát na obr. 1, ako i uvedených charakteristík skráteného KGF, môže odborník v odbore získať iné DNA sekvencie, kódujúce skrátený KGF. Napríklad môže byt štrukturálny gén spracovaný menením jednotlivých, nukleotidov, pri zachovaní správnych aminokyselín, alebo menením nukleotidov tak, že sa modifikujú aminokyseliny, bez straty biologickej aktivity. Nukleotidy môžu byt nahradené, inzertované alebo deletované známymi technikami, zahrňujúcimi napríklad in vitro mutagenézu a primérovú reparáciu. Štrukturálny gén môže byt skrátený na svojom 3'-konci a/alebo na svojom 5'-konci a udržať si svoju biologickú aktivitu.
KGF fragment kódujúca sekvencia môže byť konštruovaná syntézou DNA sekvencie, kódujúcej KGF fragment alebo zmenou existujúcej alebo natívnej KGF kódujúcej sekvencie na produkciu požadovanej sekvencie. Natívne KGF kódujúce sekvencie alebo polypeptid sú tie, ktoré sa objavujú v prírode. Aminokyselinová sekvencia natívneho KGF je uvedená na obr. X. Syntetický KGF fragment môže byt vyrobený na báze známej aminokyselinovej sekvencie KGF použitím kodónov preferovaných zvolenou hostiteľskou bunkou ako odporúča Urdea a spol., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 80: 7461 (1983). Alternatívne môže byt požadovaný KGF fragment kódujúca sekvencia klonovaná z knižníc nukleových kyselín za použitia sond na báze nukleokyselinovej sekvencie uvedenej na obr. X. Techniky na produkciu a sondovanie knižníc nukleokyselinových sekvencii sú popísané napr. v práci Sambrooka a spol., Molecular Cloning: A Laboratory Manual (New York, Cold Spring Harbor Laboratory, 1989). Iné rekombinantné techniky ako je miestne špecifická mutagenéza, PCR, enzymatické štiepenie a ligácia, môžu byť tiež použité na konštrukciu analógov a derivátov kódujúcej sekvencie KGF fragmentu. Natívna KGF polypeptid kódujúca sekvencia môže byť ľahko modifikovateľná na vytvorenie iných tried KGF polypeptidov.
Napríklad môžu byt vytvorené analógy KGF fragmentu konzervatívnymi aminokyselinovými substitúciami, ktoré nezhoršujú aktivitu KGF fragmentu. Predložený vynález ďalej zahrňuje podskupinu analógov KGF fragmentu zvaných muteíny, v ktorých sú nesulfidové väzby prítomných cysteínov v KGF fragmente substituované, všeobecne serínmi. Tieto mutácie musia byť stabilné v širšom teplotnom rozmedzí ako nemodifikovaný KGF fragment. Muteíny môžu tiež obsahovať aminokyselinové delécie v porovnaní s natívnym KGF fragmentom. Muteíny si budú udržiavať aspoň 20 %, výhodne aspoň 50 % a najvýhodnejšie aspoň 80 % aktivity natívneho KGF fragmentu. Kódujúce sekvencie muteínov môžu byť konštruované in vitro mutagenézou kódujúcej sekvencie natívneho KGF fragmentu.
Fragmenty sa odlišujú od natívnej KGF molekuly amino a/alebo karboxyl terminálnymi aminokyselinovými deléciami. Počet aminokyselín, ktoré sú skrátené, nie je podstatný, pokiaľ KGF fragment neobsahuje N-terminálne glykozylačné miesto a udržiava si aspoň 20 % KGF aktivity natívnej KGF molekuly. Kódujúce sekvencie takýchto fragmentov môžu byť ľahko konštruované odštiepením neočakávaných nukleotidov od natívnej KGF kódujúcej sekvencie alebo ich variantov.
Expresný vektor podľa predloženého vynálezu obsahuje promótor, ktorý je operabilný v hostiteľskej bunke a je operatívne pripojený ku kódujúcej sekvencii KGF fragmentu alebo analógu. Expresný vektor môže prípadne obsahovať signálnu sekvenciu pre sekréciu, terminátor selektujúci marker, počiatok replikácie a sekvencie homológne k hostiteľským bunečným sekvenciám. Tieto ďalšie prvky môžu byt obsiahnuté kvôli optimalizácii expresie.
Môžu tiež byť použité funkčne neprirodzené promótory, napríklad syntetické promótory založené na zhodných sekvenciách rozdielnych promótorov. Tiež účinnými promótormi môžu byt hybridné promótory, ktoré obsahujú regulátorový región spojený s heterológnym expresným iniciačným regiónom. Príklady hybridných promótorov sú E. coli lac operátor spojený s E. coli tac transkripčným aktivačným regiónom;
dehydrogenázová (ADH) regulátorová kvasinkovému glyceraldehyd-3-fosfát-dehydrogenázovému (GAPDH) transkripčnému aktivačnému regiónu, ako je popísané v US patentoch č. 4876197 a 4880734, zahrnuté tu ako odkaz;
a cytomegalovírus (CMV) enhancer napojený k promótoru opičieho vírusu SV40.
kvasinková alkoholová sekvencia napojená ku
Kódujúca sekvencia pre KGF fragment alebo analóg podľa predloženého vynálezu môže byt tiež napojená v čítacom rámci k signálnej sekvencii. Signálna sekvencia typicky kóduje aminokyselinovú sekvenciu pre sekréciu, zahrňujúcu hydrofóbne aminokyseliny, ktoré riadia KGF fragment alebo analóg k bunečnej membráne. Vo výhodnom vyhotovení je miesto upravenia umiestnené medzi signálnu sekvenciu a KGF fragment, aby umožnilo štiepenie medzi signálnou sekvenciou a KGF fragmentom buď in vivo alebo in vitro. Vhodné signálne sekvencie sú tie, ktoré sú odvodené od génov pre proteíny sekretované endogénnymi hostitelskými bunkami, ako je gén kvasinkovej invertázy popísaný v EP č. 12873 a japonskom patente č. 62,096,086, gén A-faktora ako je popísaný v US patente č. 4588684 a interferónová signálna sekvencia ako je popísaná v EP 60057.
Preferovanou triedou sekrečných leadrov na použitie v predloženom vynáleze pre kvasinkovú expresiu je skrátená kvasinková alfa-faktor sekvencia, ktorá obsahuje aspoň časť pre signálnej sekvencie a pro región. Alfa - faktor leaderové sekvencie, ktoré môžu tu byt použité, zahrňujú pre-pro alfa faktor leader plnej dĺžky, majúci asi 83 aminokyselinových zvyškov, ako i skrátené alfa-faktor leadery, typicky asi 25 až asi 50 aminokyselinových zvyškov, ako je popísané v US patentoch č. 4546083 a 4870008 (a US pat. prihláške xxxx) a európskom patente č. EP 324274, zahrnutom tu ako odkaz. Ďalšie leadery využívajúce alfa-faktorový leader fragment, ktoré tu môžu byt použité, zahrňujú hybridné alfa-faktorové leadery vyrobené s presekvenciou od prvej kvasinkovej signálnej sekvencie, ale pro-regiónom z druhého kvasinkového alfa-faktora (pozri napr. PCT WO 89/02463).
f) Expresné systémy
KGF fragmenty a ich analógy môžu byt exprimované rekombinantnými technikami, kedy sa DNA sekvencie, kódujúce KGF fragment alebo analóg, operabilne napoja do vektora v správnom čítacom rámci a orientácii, ako sú tieto známe odborníkom v odbore. Ak sa produkuje genetický konštrukt, obsahujúci KGF fragment, je preferovaným východiskovým materiálom cDNA, kódujúca KGF fragment. Typicky bude skrátený KGF gén inzertovaný v smere od promótora a bude nasledovaný terminačnou sekvenciou, hoci KGF fragment môže byt produkovaný ako hybridný proteín, ktorý môže byt štiepený, ak je to žiaduce. Všeobecne budú použité sekvencie špecifické pre hostiteľskú bunku, zlepšujúce produkčný výťažok skráteného KGF a skrátených KGF polypeptidových derivátov a vhodné kontrolné sekvencie, ako sú enhancerové sekvencie, polyadenylačné sekvencie a ribozómové väzobné miesta budú pridané k expresnému vektoru. Keď je vhodná kódujúca sekvencia izolovaná, môže byt exprimovaná vo veľa rôznych expresných systémoch; ako ich príklady môžu byt použité cicavčie bunky, bakulovírusy, baktérie a kvasinky. Tieto sú tu diskutované ďalej.
i) Cicavčie systémy
Cicavčie expresné systémy sú v odbore známe. Cicavčí promótor je akákoľvek DNA sekvencia schopná väzby cicavčej RNA smere (3') od kódujúcej mRNA. Promótor bude mat je zvyčajne umiestnený polymerázy a iniciácie transkripcie v sekvencie (napr. štrukturálny gén) do transkripčný iniciačný región, ktorý blízko k 5' kódujúcej sekvencie a TATA box, zvyčajne umiestnený 25 - 30 bázových párov (bp) proti smeru od miesta začiatku transkripcie. TATA box je považovaný za riadiacu RNA polymerázu II tak, aby začala RNA syntéza na správnom mieste. Cicavčí promótor bude tiež obsahovať protismerový promótorový prvok, typicky umiestnený v 100 až 200 bp proti smeru od TATA boxu. Protiprúdový promótorový prvok|determinuje rýchlosť, ktorou začne transkripcia a môže pôsobiť v inej orientácii (Sambrook a spol. (1989) Expression of Cloned Genes in Mammalian Cells. In Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2. vyd. J.).
Cicavčie virálne gény sú často vysoko exprimované a majú široký hostiteľský rozsah; preto sekvencie, kódujúce cicavčie virálne gény, poskytujú najmä vhodné promótorové sekvence. Príklady zahrňujú SV40 skorý promótor, promótor vírusu nádoru myšej mliečnej žľazy LTR, adenovírus hlavný oneskorený promótor (Ad MLP) a promótor herpes simplex vírusu.. Ďalej sekvencie odvodené od nevirálnych génov ako je myší metaloteionénový gén, poskytujú tiež vhodné promótorové sekvencie. Expresia môže byť buď konštitutívna alebo regulovaná (inducibilná), v závislosti od promótora môže byť indukovaná glukokortikoidmi v bunkách, odpovedajúcich na hormón.
Prítomnosť enhancerového prvku (enhancera), kombinovaného s promótorovými prvkami popísanými vyššie, budú typicky zvyšovať expresné hladiny. Enhancer je regulátorová DNA sekvencia, ktorá môže stimulovať transkripciu až 1 000-krát, ak je napojená k homológnym alebo heterológnym promótorom, so syntézou začínajúcou pri normálnom RNA štart mieste. Enhancery sú tiež aktívne, ak sú umiestnené proti smeru alebo po smere od miesta začiatku transkripcie, buď v normálnej alebo obrátenej orientácii alebo vo vzdialenosti väčšej ako 1 000 nukleotidov od promótora (Maniatis a spol. (1987), Science 236: 1237, Alberts a spol. (1989), Molecular Biology of the Celí, 2. vyd.)). Najmä môžu byt použité enhancerové prvky odvodené od .vírusu, pretože typicky majú širší hostitelský rozsah. Príklady zahrňujú SV40 skorý génový enhancer (Dijkema a spol. (1985), EMBO J. 4: 761) a enhancer/ promótory odvodené z dlhých terminálnych opakovaní (long terminál repeat - LTR) vírusu Rousovho sarkómu (Gorman a spol. (1982b), Proc. Natl. Acad. Sci. 79, 6777) a z ludského cytomegalovírusu (Boshart a spol. (1985), Celí 41: 521). Ďalej sú niektoré enhancery regulovatelné a stávajú sa aktívne iba za prítomnosti induktora, ako je hormón alebo kovový ión (Sassone-Corsi a Borelli (1986), Trends Genet. 2: 215, Maniatis a spol. (1987), Science 236: 1237).
DNA molekula môže byt exprimovaná extracelulárne v cicavčích bunkách. Promótorová sekvencia môže byt priamo spojená s DNA molekulou a v tomto prípade bude prvou aminokyselinou pri N-konci rekombinantného proteínu metionín, ktorý je kódovaný ATG štart kodónom. Ak je to žiaduce, môže byt N-koniec odštiepený z proteínu in vitro inkubáciou brómkyánom.
Alternatívne môžu byť tiež cudzie proteiny sekretované z bunky do rastového média vytvorením chimérnych DNA molekúl, ktoré kódujú fúzny proteín, obsahujúci leader sekventný fragment, ktorý poskytuje sekréciu cudzieho proteínu v cicavčích bunkách. Výhodne sú tu opracovávané miesta kódované medzi leader fragmentom a cudzím génom, ktoré môžu byť štiepené buď in vivo alebo in vitro. Leader sekvenčný fragment typicky kóduje signálny peptid, obsahujúci hydrofóbne aminokyseliny, ktoré riadia sekréciu proteínu z bunky. Adenovírus tripartitný leader je príkladom leader sekvencie, ktorá poskytuje sekréciu cudzieho proteínu v cicavčích bunkách.
Typicky transkripčné terminačné a polyadenylačné sekvencie rozoznávané cicavčími bunkami sú regulátorové regióny umiestnené 3' k translačnému stop kodónu a tak, spolu s promótorovými prvkami, lemujú kódujúcu sekvenciu. 3' koniec zrelého mRNA je vytvorený miestne špecifickým posttranskripčným štiepením a polyadenyláciou (Birnstiel a spol. (1985), Celí 41: 349,
Proudfoot a Whitelaw (1988), Termination and 3' end processing of eukaryotic RNA. In Transcription and Splicing a D. M. Glover), Proudfoot (1989), Trends
105). Tieto sekvencie riadia transkripciu mRNA, ktorá môže byt translatovaná do polypeptidu, kódovaného DNA. Príklady transkripčných signálov terminátor/polyadenylácia zahrňujú tie, ktoré sú odvodené z SV40 (Sambrook a spol. (1989), Expression of Cloned Genes in Cultured Mammalian Cells. In Molecular Cloning: A Laboratory Manual).
(vyd. E. D. Hámes Biochem. Sci. 14:
Niektoré gény môžu byt exprimované oveía účinnejšie, keď sú prítomné intróny (nazývané tiež intervenčné sekvencie). Niektoré cDNA boli však účinne exprimované z vektorov, ktorým chýbajú signály pre strih (tiež nazývané strihové donorové a akceptorové miesta) (pozri napr. Gothing a Sambrook (1981), Náture 293: 620). Intróny sú intervenčné nekódujúce sekvencie v kódujúcej sekvencii, ktorá obsahuje strihové donorové a akceptorové miesta. Sú odstránené spôsobom nazvaným zostrih, po polyadenylácii primárneho transkriptu (Nevins (1983), Annu. Rev. Biochem. 52:
441, Green (1986), Annu. Rev. Genet. 20: (1986), Annu. rev. Biochem., 55: 1119, (1988), RNA Splicing v Transcription and Hames a D. M. Glover)).
671, Padget a spol. Krainer a Maniatis Splicing (vyd. B. D.
pre replikáciu vyžadujú plazmidy, obsahujúce
Typicky vyššie uvedené zložky, obsahujúce promótor, polyadenylačný signál a transkripčné terminačné sekvencie sa zavedú do expresných konštruktov. Enhancery, intróny s funkčnými strihovými donorovými a akceptorovými miestami a leader sekvencie môžu byt tiež obsiahnuté v expresnom konstrukte, ak je to žiaduce. Expresné konštrukty sú často udržiavané v replikone, ako je extrachromozornáIny element (napr. plazmidy), schopnom stabilného udržiavania v hostiteľovi, ako sú cicavčie bunky alebo baktérie. Cicavčie replikačné systémy zahrňujú tie, ktoré sú odvodené od živočíšnych vírusov, ktoré trans-pôsobiace faktory. Napríklad replikačné systémy papovavírusov ako je SV40 (Gluzman (1981), Celí 23: 175) alebo polyomavírus, replikujú extrémne vysoký počet kópií za prítomnosti vhodného virálneho T antigénu. Ďalšie príklady cicavčích replikonov zahrňujú tie, ktoré sú odvodené od hovädzieho papillomavírusu a Epstein-Barrovej vírusu. Ďalej môže replikon mat dva replikačné systémy a je tak umožnené, aby bol udržiavaný napríklad v cicavčích bunkách pre expresiu a v prokaryotickom hostiteľovi na klonovanie a amplifikáciu. Príklady takýchto cicavčích bakteriálnych vektorov zahrňujú pMT2 (Kaufman a spol. (1989), (Mol. Celí. Biol. 9: 946 a pHEBO (Shimizu a spol. (1986), Mol. Celí. Biol., 6: 1074).
Použitý transformačný proces závisí od hostiteľa, ktorý má byť transformovaný. Spôsoby zavedenia heterológnych polynukleotidov do cicavčích buniek sú známe v odbore a zahrňujú dextránom sprostredkovanú transfekciu, zrážanie fosforečnanom vápenatým, polybrénom sprostredkovanú transfekciu, protoplastovú fúziu, elektroporáciu, enkapsuláciu polynukleotidu(ov) do lipozómov a priame mikroinjektovanie DNA do jadra.
Cicavčie bunečné línie dostupné ako hostitelia pre expresiu sú známe v odbore a zahrňujú veľa imortalizovaných bunečných línií dostupných od American Type Culture Collection (ATCC), zahrňujúce, ale neobmedzujúce sa na ne, bunky vaječníkov čínskeho škrečka (CHO), HeLa bunky, bunky ľadvín novorodencov škrečka (BHK), bunky opičích ľadvín (COS), ľudskej hepatocelulárnej karcinómovej bunky (napr. Hep G2) a veľa iných bunečných línií.
ii) Bakulovírusové systémy
Polynukleotid kódujúci KGF môže byť inzertovaný do vhodného expresného vektora, napríklad hmyzieho bunečného expresného vektora a operabilne pripojený ku kontrolným prvkom v tom istom vektore. Vektorová konštrukcia využíva techniky, ktoré sú známe v odbore. Hlavne, na účely predloženého vynálezu, je konštruovaný bakulovírusový expresný vektor v podstate podlá Kittsa a spol., BioTechniques 14: 810 - 817 (1993).
Stručne, najprv sa skonštruuje KGF expresná kazeta inzerciou tu vektora, obsahujúceho homológna k časti ako bakulovírusová hoihológnej kgf163 kódujúcej sekvencie do transfer polynukleotidovú sekvenciu, ktorá je bakulovírusového genómu (označená sekvencia a je s ňou schopná
Bakulovírusová sekvencia obsahuje aspoň polynukleotidovú sekvenciu, ako je popísaná ďalej sekvencia sa inzertuje do transfer vektora takým lemuje obidva konce bakulovírusovéj sekvencie.
rekombinácie.
podstatnú
KGF kódujúca spôsobom, že
Transfer vektor, obsahujúci KGF kódujúcu sekvenciu je transferovaný do hostiteľských buniek spolu s mutantom prirodzeného typu bakulovírusu, ktorému chýba podstatná polynukleotidová sekvencia nevyhnutná na produkciu funkčného vírusu. Z tohto hľadiska môže byt funkčný vírus produkovaný v hostiteľských bunkách po transfekcii, ak sa mutantný bakulovírus rekombinuje s KGF expresnou kazetou.
Funkčný bakulovírus produkovaný týmto spôsobom má tak inkorporovanú KGF expresnú kazetu a je vhodný na transfekciu do
- 23 nových hostiteľských buniek na produkciu rekombinantného KGF a rekombinantného KGFdesl_23- Alternatívne môže byt tento spôsob vykonaný s KGFdesl-23 kódujúcou sekvenciou namiesto KGFig3 kódujúcej sekvencie. Všeobecne zahrňujú zložky expresného systému transfer vektor, zvyčajne bakteriálny plazmid, ktorý obsahuje ako fragment bakulovírusového genómu, tak zvyčajné reštrikčné miesto pre inzerciu heterológneho génu alebo génov, ktoré sú exprimované; prirodzený typ bakulovírusu sa sekvenciou homológnou k bakulovírus - špecifickému fragmentu v transfer vektore (táto umožňuje homológnu rekombináciu heterológneho génu do bakulovírusového genómu), a vhodné hmyzie hostiteľské bunky a rastové média.
Po inzercii skrátenej KGF DNA sekvencie do transfer vektora sú vektor a genóm prirodzeného typu vektora transfektované do hmyzej hostiteľskej bunky, kde prebehne rekombinácia vektora a vírusového genómu. Vzniknutý rekombinantný vírus je exprimovaný a rekombinantné plaky sú identifikované a čistené. Materiály a spôsoby na expresné systémy bakulovírus/hmyzia bunka sú komerčne dostupné vo forme gitu od, inter alia, Invitrogen, San Diego CA (MaxBac git). Tieto techniky sú všeobecne známe odborníkom v odbore a sú popísané v práci Summersa a Smitha, Texas Agricultural Experiment Station Bulletin No. 1555 (1987) (ďalej tu Summers a Smith), ktorá je tu zahrnutá ako odkaz.
Pred inzerciou skrátenej KGF DNA sekvencie do bakulovírusového genómu sú vyššie uvedené zložky, zahrňujúce promótor, leader (ak je to žiaduce), žiadanú kódujúcu sekvenciu a transkripčnú terminačnú sekvenciu, typicky zostavené do medziproduktového prenášajúceho konštruktu (transfer vektor). Tento konštrukt môže obsahovať, jediný gén a operatívne pripojené regulátorové elementy; viac génov, ktoré sú každý operatívne pripojené k regulátorovým prvkom; alebo viac génov, regulovaných rovnakou sadou regulátorových prvkov. Medziproduktové prenášajúce konštrukty sú často udržiavané v replikone, ako je extrachromozomálny element (napr. plazmidy) schopný stabilného udržania v hostiteľovi ako je baktéria. Replikon bude mať replikačný systém, ktorý mu umožňuje byt zachovaný vo vhodnom hostiteľovi na klonovanie a amplifikáciu.
V súčasnosti je najbežnejšie používaný transfer vektorom na zavedenie cudzích génov do AcNPV pAc373. Je rovnako možné zostaviť vela iných vektorov, ako bude zrejmé odborníkom v odbore. Tieto napríklad zahrňujú pVL985 (ktorý mení polyhedrín štart kodón z ATG na ATT a ktorý zavádza BamHI klonovacie miesto 32 bázových párov po smere expresie od ATT, pozri Luckow a Summers, Virology (1989) 17: 31).
Plazmid zvyčajne tiež obsahuje polyhedrín polyadenylačný signál (Miller a spol. (1988), Ann. Rev. Microbiol., 42: 1, 77) a gén prokaryotickej ampicilínovej rezistencie (amp) a počiatok replikácie selekcie a propagácie v E. coli.
Bakulovírus transfer vektory zvyčajne obsahujú bakulovírusový promótor. Bakulovírusový promótor je akákoľvek DNA sekvencia schopná viazat bakulovírus RNA polymerázu a iniciovat proti smeru expresie (5' k 3') transkripciu kódujúcej sekvencie (napr. štrukturálneho génu) do mRNA. Promótor bude mat transkripčný iniciačný región, ktorý je zvyčajne umiestnený v blízkosti 5' konca kódujúcej sekvencie. Tento transkripčný iniciačný región typicky obsahuje RNA polymerázové väzobné miesto a transkripčné počiatočné miesto. Bakulovírus transfer vektor môže tiež mat druhú doménu nazvanú enhancer, ktorá, ak je prítomná, je zvyčajne vzdialená od štrukturálneho génu. Expresia môže byt buď regulovaná alebo konštitutívna.
Štrukturálne gény, v poslednej dobe hojne, transkribované vo virálnom infekčnom cykle, poskytujú obzvlášt vhodné promótorové sekvencie. Príklady zahrňujú sekvencie odvodené od génu, kódujúceho virálny polyhedrón proteín, Friesen a spol. (1986), The Regulation of Baculovirus Gene Expression, v The Molecular Biology of Baculoviruses (vyd. Walter Doerfler), EPO č. 127839 a 155476) a génu kódujúceho plO proteín Vlak a spol. ,(1988), J. Gen. Virol. 69: 765.
DNA, kódujúca vhodné signálne sekvencie, môže byť odvodená od génov pre sekréciu hmyzích alebo bakulovírusových proteínov, ako je bakulovírus polyhedrin gen (Carbonell a spol. (1988), Gene, 73: 409). Alternatívne, pretože signály procicavčej bunečnej posttranslačnej modifikácie (ako je signálne peptidová štiepenie, proteolytické štiepenie a fosforylácia) zdajú sa byť rozoznávané hmyzími bunkami a signály vyžadované na sekréciu a akumuláciu v jadre sa zdajú byť konzervované medzi invertebrálnymi bunkami a vertebrálnymi bunkami, môžu byt tiež použité pre sekréciu v hmyze leadermi nehmyzieho pôvodu, ako sú tie, ktoré sú odvodené od génov, kódujúcich ludský α-interferón, Maeda a spol. (1985), Náture 315: 592, ludský gastrín uvoľňujúci peptid, Labacq - Verheyden a spol. (1988), Molec. Celí. Biol., 8: 3129, ludský IL-2, Smith a spol., (1985), Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 82, 8404, myšou IL-3 (Miyajima a spol., (1987), Gene, 58: 273 a ľudskú glukocerebrodizázu, Martin a spol. (1988), DNA, 7: 99.
Rekombinantný polypeptid alebo polyproteín môže byť exprimovaný intracelulárne alebo, ak je exprimovaný so správnymi regulátorovými sekvenciami, môže byť sekretovaný. Dobrá intracelulárna expresia nefúzovaných cudzích proteínov zvyčajne vyžaduje heterológne gény, ktoré ideálne majú krátku leader sekvenciu, obsahujúcu vhodné translačné iniciačné signály predchádzajúce ATG štart signálu. Ak je to žiaduce, môže byt metionín na N-konci odštiepený zo zrelého proteínu in vitro inkubáciou brómkyánom.
Alternatívne, rekombinantné polyproteíny alebo proteíny, ktoré nie sú prirodzene sekretované, môžu byt sekretované z hmyzej bunky vytvorením chimérnych DNA molekúl, ktoré kódujú fúzny proteín, obsahujúci leader sekvenčný fragment, ktorý poskytuje sekréciu cudzieho proteínu v hmyze. Leader sekvenčný fragment typicky kóduje signálny peptid, obsahujúci hydrofóbne aminokyseliny, ktoré riadia translokáciu proteínu do endoplazmického retikula.
Po inzercii skrátenej KGF DNA sekvencie a/alebo génu, kódujúceho prekurzor expresného produktu, je hmyzia hostiteľská bunka ko-transformovaná s heterológnou DNA transfer vektora a genómovou DNA prirodzeného typu bakulovírusu - obyčajne ko-transfekciou. Promótorová a transkripčná terminačná sekvencia konštruktu bude typicky obsahovať 2 - 5 kb sekciu bakulovírusového genómu. Spôsoby zavedenia heterológnej DNA do požadovaného miesta bakulovírusu sú známe v odbore. (Pozri Summers a Smith supra, Ju a spol., Mol. Celí. Biol. (1983), 3: 2156 a Luckow a Summer (1989)). Napríklad inzercia do génu ako je polyhedrín gén, môže byť vykonaná homológnou dvojitou cross-over rekombináciou; inzercia môže tiež byť do miesta reštrikčného enzýmu zapracovaného do požadovaného bakulovírusového génu, Miller a spol. (1989)), Bioessays, 4: 91. DNA sekvencia, ak je klonovaná namiesto polyhedrínového génu v expresnom vektore, je lemovaná ako 5', tak 3' polyhedrín - špecifickými sekvenciami a je umiestnená po smere expresie polyhedrínového promótora.
Novo vytvorený bakulovírus expresný vektor je následne umiestnený do infekčného rekombinantného bakulovírusu. Homológna rekombinácia prebieha pri malej frekvencii (medzi asi 1 % a asi 5 %); to znamená, že podstatná časť vírusu produkovaného po kotransfekcii je ešte štandardného typu. Preto je potrebná metóda na identifikáciu rekombinantných vírusov. Výhodou expresného systému je vizuálny screening, umožňujúci rozlíšenie rekombinantných vírusov. Polyhedrín proteín, ktorý je produkovaný natívnym vírusom, je produkovaný vo veľmi vysokých hladinách v jadre infikovaných buniek po vírusovej infekcii. Akumulovaný polyhedrín proteín vytvára oklúzne telieska, ktoré tiež obsahujú uzatvorené častice. Tieto oklúzne telieska až do veľkosti 15 gm, sú vysoko odrážajúce, a preto sú jasne trblietavého vzhľadu, ktorý je ľahko vizualizovaný pod svetelným mikroskopom. Bunky infikované rekombinantnými vírusmi nemajú oklúzne telieska. Kvôli rozlíšeniu rekombinantného vírusu od prirodzeného vírusu sa transfekčný supernatant plakuje na monovrstvu hmyzích buniek technikami, ktoré sú odborníkom v odbore známe. Totiž, plaky sa screenujú pod svetelným mikroskopom na prítomnosť (indikujúcu prírodný typ vírusu) alebo neprítomnosť (indikujúcu rekombinantný vírus) oklúznych teliesok, Current Protocols in Microbiology, č. 2 (Ausubel a spol.) vyd. 16.8. (dod. 10, 1990), Summers a Smith, supra, Miller a spol. (1980).
Rekombinantný bakulovírus expresné infekciu do niektorých hmyzích buniek, rekombinantné bakulovírusy pre, inter vektory boli vyvinuté na Napríklad boli vyvinuté alia: Aedes aegypti,
Autographa californica, Spodoptera frugiperda WO 89/046699, Carbonell
Bombyx mori, Drosophila melanogaster, a Trichoplusia ni (PCT č. pub. a spol. (1985), J. Virol., 56: 153,
Wright (1986), Náture 321: 718, Smith a spol. (1983), Mol. Celí. Biol., 3: 2156 a pozri všeobecne Fraser a spol. (1989), In Vitro Celí. Dev. Biol., 25: 225).
Bunky a bunečné média sú komerčne dostupné ako pre priamu, tak fúznu expresiu heterológnych polypeptidov v bakulovírus/ expresnom systéme; technológia bunečnej kultúry je všeobecne odborníkom v odbore dobre známa - pozri napr. Summers a Smith, supra.
Modifikované hmyzie bunky môžu potom rásť vo vhodnom živnom médiu, ktoré umožňuje stabilné zachovanie plazmidu(ov) prítomných v modifikovanom hmyzom hostiteľovi. Ak je génový expresný produkt pod indukčnou kontrolou, hostiteľ môže rásť vo vysokej hustote a indukovať expresiu. Alternatívne, ak je expresia konštitutívna, produkt bude kontinuálne exprimovaný do média a. živné médium musí plynulé cirkulovať pri odstraňovaní požadovaného produktu a doplňovaní vyčerpaných živín. Produkt môže byť čistený takými technikami ako je chromatografia, napr. HPLC, afinitná chromátografia, iónovýmenná chromatografia, atď.; elektroforéza, odstreďovanie s hustotným gradientom, extrakcia rozpúšťadlami a podobne. Ak je to vhodné, produkt môže byt ďalej čistený podľa požiadaviek tak, že sa odstránia v podstate akékoľvek hmyzie proteíny, ktoré sú tiež sekretované do média alebo sú výsledkom lýzie hmyzích buniek tak, že sa poskytne produkt, ktorý je aspoň v podstate zbavený zlomov hostiteľských buniek, napr. proteínov, lipidov a polysacharidov.
Za účelom získania expresie skráteného KGF, sa rekombinantné hostiteľské bunky, získané z transformantov, inkubujú za podmienok, ktoré umožňujú expresiou rekombinantné skrátenie KGF kódujúcej sekvencie. Tieto podmienky sa budú menit v závislosti od zvolenej hostiteľskej bunky. Podmienky bude však ľahké stanoviť odborníkom na základe toho, čo je v odbore známe.
iii) Bakteriálne systémy
Bakteriálne expresné techniky sú známe v odbore. Bakteriálny promótor je akákoľvek DNA sekvencia schopná väzby bakteriálnej RNA polymerázy a iniciácie transkripcie po smere expresie (3) kódujúcej sekvencie (napr. štruktúrneho génu) do mRNA. Promótor bude mať transkripčný iniciačný región, ktorý je zvyčajne umiestnený blízko 5' konca kódujúcej sekvencie. Transkripčný iniciačný región typicky zahrňuje RNA polymerázové väzobné miesto a transkripčné iniciačné miesto. Bakteriálny promótor môže tiež mat druhú doménu zvanú operátor, ktorá môže presahovať pripojené RNA polymerázové väzobné miesto, pri ktorom začína RNA syntéza. Operátor umožňuje negatívne regulovanú (indukovatelnú) transkripciu, pretože gén represor proteínu môže viazať operátor, a tým inhibovať transkripciu špecifického génu. Konštitutívna expresia môže prebiehať za neprítomnosti negatívnych regulátorových prvkov ako je operátor. Naviac, pozitívna regulácia môže byt dosiahnutá gén aktivátor proteínovou väzobnou sekvenciou, ktorá, ak je prítomná, je zvyčajne blízko (5') k RNA
Príkladom gén aktivátor proteín (CAP - catabolite počiatku transkripcie lac polymerázovej väzobnej sekvencií. proteínu je katabolitový aktivátor activator protein), ktorý napomáha operónu v Escherichia coli (E. coli) (Raibaud a spol. (1984), Annu. Rev. Genet., 18: 173). Regulovaná expresia môže byt preto ako pozitívna, tak negatívna, čím sa zvyšuje alebo redukuje transkripcia.
Sekvencie, kódujúce metabolickú dráhu enzýmov, poskytujú obzvlášť vhodné promótorové sekvencie. Príklady zahrňujú promótorové sekvencie odvodené z enzýmov, metaboližujúcich cukor ako je galaktóza, laktóza (lac) (Chang a spol. (1977), Náture
198: 1056) maltóza sekvencie odvodené z
Ďalšie príklady zahrňujú promótorové biosyntetických enzýmov ako je tryptofán (trp) (Goeddel a spol. (1980) Nuc. Acids Res., 8: 4057, Yelverton a spol. (1981), Nucl. Acids Res., 9: 731, US 4738921, EPO pub. č. 036776 a 121775). g-Laotamasa (bla) promótorový systém (Weissmann (1981) The Cloning of Interferon and Other Mistakes. V Interferon 3 (vyd. I. Gresser) (bakteriofág lambda PL ) Simatake a spol. (1981), Náture 292: 128) a T5 (US 4689406) promótorové systémy poskytujú tiež vhodné promótorové sekvencie.
Ďalej môžu syntetické promótory, ktoré sa nevyskytujú v prírode, tiež pôsobiť ako bakteriálne promótory. Napríklad transkripčné aktivačné Isekvencie jedného bakteriálneho alebo bakteriofágového promótora môžu byť spojené s operónovými sekvenciami iného bakteriálneho alebo bakteriofágového promótora, za vytvorenia syntetického hybridného promótora (US patent č. 4551433). Napríklad tac promótor je hybrid trp - lac promótora, obsahujúci ako trp promótorovu, tak lac operónovú sekvenciu, ktorá je regulovaná lac represorom (Amann a spol., (1983), Gene 25: 167, de Boer a spol. (1983), Proc. Natl. Acad. Sci., 80: 21). Naviac môže bakteriálny promótor obsahovať prirodzene sa vyskytujúce promótory nebakteriálneho pôvodu, ktoré majú schopnosť sa viazať k bakteriálnej RNA polymeráze a iniciovať transkripciu. Prirodzene sa vyskytujúci promótor nebakteriálneho pôvodu môže byť tiež kondenzovaný s kompatibilnou RNA polymerázou kvôli získaniu vysokých hladín expresie rovnakých génov v prokaryotoch. Systém bakteriofágová T7 RNA polymeráza/promótor je príkladom kondenzovaného promótorového systému (Studier a spol. (1986), J. Mol. Biol., 113, Tábor a spol. (1985), Proc. Natl. Acad. Sci., 82: 1074). Naviac môže hybridný promótor tiež obsahovať bakteriofágový promótor a E. coli operátor región (EPO pub. č. 267851).
Naviac k funkčnej promótorovej sekvencii je tiež účinné ribozóm väzobné miesto na expresiu cudzích génov v prokaryotoch. V E. coli je ribozómové väzobné miesto nazvané Shine - Dalgarno (SD) sekvencie a obsahuje iniciačný kodón (ATG) a sekvenciu 3 - 9 nukleotidov dĺžky umiestnenú proti smeru expresie od iniciačného kodónu (Shine a spol. (1975), Náture 254: 34). SD sekvencia je považovaná za promótujúcu väzbu mRNA k ribozómu párovaním báz medzi SD sekvenciou a 3' a E. coli 16S rRNA (steitz a spol. (1979), Genetic Signals and Nucleotide Sequences in Messenger RNA v Biological Regulation and Development, Gene Expression (vyd. R. F. Goldberger)). Pre expresiu eukaryotických génov a prokaryotických génov so slabým ribozóm - väzobným miestom (Sambrook a spol. (1989), Expression of Cloned Genes in Escherichia coli v Molecular Cloning: A Laboratory Manual.
DNA molekula môže byť exprimovaná intracelulárne. Promótorová sekvencia môže byť priamo spojená s DNA molekulou a v tomto prípade bude vždy prvou aminokyselinou na N-konci metionín, ktorý kóduje ATG štart kodón. Ak je to žiaduce, môže byť metionín na N-konci odštiepený z proteínu in vitro inkubáciou s brómkyánom alebo in vivo alebo in vitro inkubáciou s bakteriálnou metionín N-koncovou peptidázou (EPO pub. č. 219237).
Alternatívou pre riadenú expresiu sú fúzne proteíny. Typicky DNA sekvencia, kódujúca N-koncovú časť endogénneho bakteriálneho proteínu alebo iného stabilného proteínu, je fúzovaná k 5' koncu heterologných kódujúcich sekvencii. Pri expresii tento konštrukt bude poskytovať fúziu dvoch aminokyselinových sekvencii. Napríklad bakteriofág lambda bunečný gén môže byť pripojený k 5' koncu cudzieho génu a exprimovaný v baktérii. Výsledný fúzny proteín si výhodne udržiava miesto pri opracovávajúci enzým (faktor Xa) na štiepenie bakteriofágového proteínu z cudzieho génu (Nagai a spol. (1984), Náture 309: 810). Fúzne proteíny môžu tiež byť vyrobené so sekvenciami z lacZ/Jia a spol. (1987), Gene 60: 197), trpE (Alien a spol. (1987), J. Biotechnol. 5: 93, Makoff a spol. (1989), J. Gen. Microbiol. 135: 11) a Chey (EPO pub. č. 324647) génov. DNA sekvencia pri spojení dvoch aminokyselinových sekvencii môže alebo nemusí kódovať miesto štiepenia. Iným príkladom je ubiquitín fúzny proteín. Takýto fúzny proteín sa vyrobí s ubiquitínovým regiónom, ktorý si výhodne zachováva miesto pre opracovávajúci enzým (napr. ubiquitín špecifickú opracovávajúcu proteázu) na štiepenie ubiquitínu z cudzieho proteínu. Touto metódou môže byť izolovaný natívny cudzí proteín (Miller a spol. (1989) Bio/Technology 7: 698) .
Alternatívne cudzie proteíny môžu byť tiež sekretované z buniek vytvorením chimérnych DNA molekúl, ktoré kódujú fúzny proteín, obsahujúci signálny peptidový sekvenčný fragment, ktorý poskytuje sekréciu cudzieho proteínu v baktérii (US 4336336). Signálny sekvenčný fragment typicky kóduje signálny peptid obsahujúci hydrofóbne aminokyseliny, ktoré riadia sekréciu proteínu z bunky. Proteín je buď sekretovaný do rastového média (gram - pozitívne baktérie) alebo do periplazmického priestoru, umiestneného medzi vnútornou a vonkajšou membránou bunky (gram - negatívne baktérie). Výhodne sú tu také miesta na úpravu, ktoré môžu byť štiepené buď in vivo alebo in vitro, zakódované medzi signálny peptidový fragment a cudzí gén.
DNA kódujúca vhodná signálna sekvencia môže byť odvodená z génov pre sekretované bakteriálne proteíny, ako je E. coli vonkajší membránový proteínový gén (ompA) (Masiu a spol. (1983) v Experimental Manipulation of Gene Expression, Ghrayeb a spol. (1984) EMBO J. 2: 2437) a E. coli alkalická fosfatáza signálnej sekvencie (phoA) (Oka a spol. (1985) Proc. Natl. Acad. Sci. 82: 7212). Ako ďalší príklad môže byt použitá signálna sekvencia alfa-amyláza génov z rôznych Bacilus kmeňov na sekretovanie heterológnych proteínov z B. subtilis (Palva a spol. (1982), Proc. Natl. Acad. Sci. USA 79: 5582, EPO pub. č. 244042).
Typicky sú transkripčné terminačné sekvencie rozpoznávané baktériami umiestnené 3' k translačnému stop kodónu, a tak spolu s promótorom lemujú kódujúce sekvencie. Tieto sekvencie riadia transkripciu mRNA, ktorá môže byt translatovaná do polypeptidu kódovaného mRNA, ktorá môže byť translatovaná do polypeptidu kódovaného DNA. Transkripčné terminačné sekvencie často zahrňujú DNA sekvencie o asi 50 . nukleotidoch, schopné tvorby kmeňových slučkových štruktúr, ktoré napomáhajú terminačnej transkripcii. Príklady zahrňujú transkripčné terminačné sekvencie odvodené od génov so silnými promótormi, ako je trp gén v E. coli ako i iné biosyntetické gény.
Typicky, vyššie uvedené zložky, zahrňujúce promótor, signálnu sekvenciu (ak je žiaduca), kódujúcu požadovanú sekvenciu a transkripčnú terminačnú sekvenciu, tvoria expresné konštrukty. Expresné konštrukty sú často udržiavané v replikone ako je extrachromozomálny element (napr. plazmidy), schopný stabilného zachovania v hostiteľovi, ako je baktéria. Replikon bude mat replikačný systém, ktorý umožňuje, aby bol zachovaný v prokaryotickom hostiteľovi na expresiu alebo na klonovanie a amplifikáciu. Ďalej môže byť replikon plazmid s buď vysokým alebo nízkym počtom kópií. Plazmid s vysokým počtom kópií bude všeobecne mať počet kópií v rozmedzí od asi 5 do asi 2 000 a typicky 10 až asi 150. Hostiteľ, obsahujúci plazmid s vysokým počtom kópií bude výhodne obsahovať aspoň asi 10 a výhodnejšie aspoň asi 20 plazmidov. Môže byt zvolený vektor ako s vysokým počtom kópií, tak s nízkym počtom kópií v závislosti od účinku vektora a cudzieho proteínu na hostiteľa.
Alternatívne môžu byt expresné konštrukty integrované do bakteriálneho genómu s integračným vektorom. Integračné vektory typicky obsahujú aspoň jednu sekvenciu homológnu k bakteriálnemu chromozómu, ktorá umožňuje vektoru sa integrovať. Integrácia sa zdá byt výsledkom rekombinácií medzi homológnou DNA vo vektore a bakteriálnom chromozóme. Napríklad integračné vektory konštruované s DNA z rôznych Bacillus kmeňov integrujú do Bacillus chromozómu (EPO pub. č. 127328). Integrujúce vektory môžu tiež obsahovať bakteriofágové alebo transpozónové sekvencie.
Typicky môžu extrachromozomálne a integračné expresné konštrukty obsahovať selektovateľné markery kvôli umožneniu selekcie bakteriálnych kmeňov, ktoré boli transformované. Selektovateľné markery môžu byt exprimované v bakteriálnom hostiteľovi a môžu zahrňovať gény, ktoré udeľujú baktérii rezistenciu k liekom ako je ampicilín, chloramfenikol, erytromycín, kanamycín, (neomycín) a tetracyklín (Davies a spol. (1978), Annu. Rev. Microbiol., 32: 469). Selektovateľné markery môžu tiež obsahovať biosyntetické gény ako sú gény v dráhach biosyntézy histidínu, tryptofánu a leucínu.
Alternatívne môžu niektoré z vyššie popísaných zložiek spolu vstupovať do transformačného vektoru. Transformačné vektory typicky obsahujú selektovateľný marker, ktorý je buď udržiavaný v replikone alebo vypestovaný v integračnom vektore ako je popísané vyššie.
Expresné a transformačné replikony alebo integračné transformáciu do expresné vektory substilis (Palva a
5582, EPO pub. č. 036259 coli (Shimatake (1985), Gene 40:
113, EPO pub. č.
(Powell a spol.
vektory, buď extrachromozomálne vektory, boli vyvinuté pre mnohých baktérií. Napríklad boli inter alia vyvinuté pre nasledujúce baktérie: Bacillus spol. (1982), Proc. Natl. Acad. Sci. USA 79:
a 063953, PCT WO 84/04541), Escherichia a spol. (1981), Náture 292: 128, Amann a spol. 183, Studier a spol. (1986), J. Mol. Biol. 189: 036776, 136829 a 136907), Streptococcus cremoris (1988), Appl. Environ. Microbiol., 54: 655),
Streptococcus lividans (Powell a spol. (1988), Appl. Environ. Microbiol., 54: 655), Streptomyces lividans (US 4745056).
Spôsoby zavedenia exogénnej DNA do bakteriálnych hostiteľov sú v odbore dobre známe a typicky zahrňujú buď transformáciu baktérií ošetrených CaCl2 alebo inými činidlami, ako sú divalentné katióny a DMSO. DNA môže byt tiež zvedená do bakteriálnych buniek elektroporáciou. Transformačné postupy sa zvyčajne menia podľa transformovaných bakteriálnych druhov. Pozri napr. (Masson a spol. (1989), FEMS Microbiol. Lett., 60: 273, Palva a spol., (1982), Proc. Natl. Acad. Sci. USA 79: 5582, EPO pub. č. 036259 a 063953, PCT pub.č. WO 84/04541, Bacillus), (Miller a spol. (1988), Proc. Natl. Acad. Sci., 85: 856, Wang a spol. (1990), J. Bacteriol., 172: 949, Campylobacter), (Cohen a spol. (1973), Proc. Natl. Acad. Sci., 69: 2110, Dower a spol. (1988), Nucleic Acids Res., 16: 6127, Kushner (1978), An Improved Method for Transformation of Escherichia coli with ColEl-Derived Plasmids. V Genetic Engineering: Proceedings of the International Symposium on Genetic Engineering (vyd. H. W. Boyer a S. Micosia), Mandel a spol. (1970), J. Mol. Biol., 53: 159, Takeo (1988), Biochim. Biophys. Acta, 949: 318, Escherichia), (Chassy a spol. (1987) FEMS Microbiol. Lett., 44: 173 Lactobacillus), (Fiedler
1988), Anál. Biochem. 170: 38, Pseudomonas), (Augustín
Lett., 66: 203, Staphylococcus), Bacteriol., 144: 698, Harlander
Streptococcus lactis by a spol.
a spol. (1990), FEMS Microbiol. (Barany a spol. (1980), J. (1987), Transformation of
Electroporation, v.: Streptococcal Genetics (vyd. J. Ferretti a R. Curtis III), Perry a spol. (1981), Infec. Immun., 32: 1295, (1988), Appl. Environ. Microbiol.
54: 665,
Powell a spol.
Somkuti a spol. (1987), Proc. 4 th Env. 412, Streptococcus).
Cong. Biotechnology, 1:
iv) Kvasinková expresia
Kvasinkové expresné systémy sú odborníkom v odbore dobre známe. Kvasinkový promótor je akákoľvek DNA sekvencia schopná viazať kvasinkovú RNA polymerázu a iniciovať po smere (3') transkripciu kódujúcej sekvencie (napr. štrukturálny gén) do nRNA. Promótor bude mat transkripčný iniciačný región, ktorý je zvyčajne umiestnený blízko 5' konca kódujúcej sekvencie. Tento transkripčný iniciačný región typicky obsahuje RNA polymerázové väzobné miesto (TATA box) a transkripčné iniciačné miesto. Kvasinkový promótor môže mat tiež druhú doménu nazvanú protismerová aktivátorová sekvencia (upstream activator sequence - UAS), ktorá, ak je prítomná, je zvyčajne distálna k štrukturálnemu génu. UAS umožňuje regulovanú (indukovateľnú) expresiu. Konštitutívna expresia sa objavuje za neprítomnosti UAS. Regulovaná expresia môže byť buď pozitívna alebo negatívna, čím sa buď zvyšuje alebo redukuje transkripcia.
Kvasinka je fermentujúci organizmus s aktívnou metabolickou dráhou, preto sekvencie, kódujúce enzýmy v metabolickej dráhe, poskytujú obzvlášť vhodné promótorové sekvencie. Príklady zahrňujú alkohol dehydrogenázu (ADH) (EPO pub.č. 284044), enolázu, glukóza-6-fosfát glyceraldehyd-3-fosfát-dehydrogenázu (GAP hexokinázu, fosforruktokinázu, 3-fosfoglycerát kinázu (PyK) (EPO pub. č. 329203). Kvasinkový PHO5 gén, kódujúci kyslú fosfatázu, poskytuje tiež vhodné promótorové sekvencie (Myanohara a spol. (1983), Proc. Natl. Acad. Sci. USA 80: 1).
izomerazu, alebo GAPDH), mutázu a pyruvát
Ďalej syntetické promótory, ktoré sa nevyskytujú v prírode, tiež pôsobia ako kvasinkové promótory. Napríklad UAS sekvencie jedného kvasinkového promótora môžu byt spojené s transkripčným aktivačným regiónom iného kvasinkového promótora, vytvorí sa tak syntetický hybridný promótor. Príklady takýchto hybridných promótorov zahrňujú ADH regulátorovú sekvenciu napojenú ku GAP transkripčnému aktivačnému regiónu (US 4876197 a US 4880734). Iné príklady hybridných promótorov zahrňujú promótory, ktoré obsahujú regulátorové sekvencie buď ADH2, GAL4, GAL10 alebo PHO5 gény spojené s transkripčným aktivačným regiónom glykolytického enzýmu ako je GAP alebo PyK (EPO pub. č. 164556). Ďalej môže kvasinkový promótor zahrňovať prirodzene sa vyskytujúce promótory nekvasinkového pôvodu, ktoré majú schopnosť viazať kvasinkovú RNA polymerázu a iniciujú transkripciu. Príklady takýchto promótorov zahrňujú, inter alia, (Cohen a spol. (1980), Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77: 1078, Henikoff a spol. (1981), Náture 283: 835, Hollenberg a spol. (1981), Curr. Topics Microbiol. Immunol., 96: 119, Hollenberg a spol. (1979), The Expression of Bacterial Antibiotic Resistance Genes in the Yeast Saccharomyces cerevisiae, v: Plasmids of Medical, Environmental and Commercial Importance (vyd. K. N. Timmis a A. Puhler), Mercerau - Puigalon a spol. (1980), Gene 11: 163, Panthier a spol. (1980), Cur. Genet., 2: 109).
DNA molekula môže byt exprimovaná intracelulárne v kvasinke.
Promótorová sekvencia môže byť priamo spojená s DNA molekulou a v tomto prípade prvá aminokyselina na N-konci rekombinantného proteínu vždy bude metionín, ktorý je kódovaný ATG štart kodónom. Ak je to žiaduce, metionín na N-konci môže byť odštiepený z proteínu in vitro inkubáciou s brómkyánom.
Fúzne proteíny poskytujú alternatívu pre kvasinkové expresné systémy, ako cicavčie, bakulovírusové a bakteriálne systémy. Typicky, DNA sekvencia, kódujúca N-koncovú časť endogénneho stabilného proteínu, je kódujúcej sekvencie. Pri poskytovať fúziu dvoch kvasinkového proteínu fúzovaná k 5' koncu expresii bude tento alebo iného heterológnej konštrukt aminokyselinových sekvencii. Napríklad gén kvasinkovej alebo ludskej superoxid dizmutázy (SOD) môže byť pripojený k 5' koncu cudzieho génu a exprimovaný v kvasinke. DNA sekvencia v spojení dvoch aminokyselinových sekvencii môže alebo nemusí kódovať štiepiteľné miesto. Pozri napr. EPO pub. č. 196056. ďalším príkladom je ubiquitínový fúzny proteín. Takýto fúzny proteín je pripravený s ubiquitínovým regiónom, ktorý si výhodne udržiava miesto pre upravujúci enzým (napr. ubiquitín - špecificky upravujúcu proteázu) na odštiepenie ubiquitínu z cudzieho proteínu. Touto metódou tak môže byt izolovaný natívny cudzí proteín (pozri napr. PCT publ. č. WO 88/024066).
Alternatívne môžu byť tiež cudzie proteíny sekretované z bunky do rastového média vytvorením chimérnych DNA molekúl, ktoré kódujú fúzny proteín, obsahujúci leader sekvenčný fragment, ktorý poskytuje sekréciu cudzieho proteínu v kvasinke. Výhodne sú tu upravujúce miesta kódované medzi leader fragmentom a cudzím génom, ktoré budú štiepené buď in vivo alebo in vitro. Leader sekvenčný fragment typicky kóduje signálny peptid, obsahujúci hydrofóbne aminokyseliny, ktorý riadi sekréciu proteínu z bunky.
DNA, kódujúce vhodné signálne sekvencie, môžu byť odvodené z génov pre sekréciu kvasinkových proteínov, ako je kvasinkový invertázový gén (EPO pub.č. 012873, JPO pub. č. 62,096,086) a A-faktorový gén (US 4588684). Alternatívne existujú leadery nekvasinkového pôvodu, ako je interferón leader, ktoré tiež poskytujú sekréciu v kvasinke (EPO pub. č. 060057).
Preferovanou triedou sekrečných leaderov sú tie, ktoré využívajú fragment génu kvasinkového alfa faktora, ktorý obsahuje pre signálnu sekvenciu a pro región. Typy alfa faktorových fragmentov, ktoré môžu byt použité, zahrňujúce plnú dĺžku pre-pro alfa faktorového leadera (asi 83 aminokyselinových zvyškov), ako i skrátené alfa - faktorové leadery (typicky asi 25 až asi 50 aminokyselinových zvyškov) (US 4546083 a US a 4870008, EPO pub.č. 324274). Ďalšie leadery, využívajúce alfa - faktorový leader fragment, ktoré poskytujú sekréciu, zahrňujú hybridné alfa faktor leadery vyrobené s presekvenciou prvej kvasinky, ale s pro - regiónom druhého kvasinkového alfa faktora. Pozri napr. PCT pub. č. WO 89/02463.
Typicky sú transkripčné terminačné sekvencie rozpoznávané kvasinkou regulátorové regióny umiestnené 3' k translačnému stop kodónu, a tak spolu s promótorom lemujú kódujúcu sekvenciu. Tieto sekvencie riadia transkripciu mRNA, ktorá môže byt translatovaná do polypeptidu, kódovaného DNA. Príklady transkripčnéj terminačnej sekvencie a iných kvasinkou rozpoznávaných terminačných sekvencií, ako sú napríklad tie, ktoré kódujú glykolytické enzýmy.
Typicky vyššie popísané zložky, obsahujúce promótor, leader (ak je požadovaný), požadovanú kódujúcu sekvenciu a transkripčnú terminačnú sekvenciu, spoločne vstupujú do expresných konštruktov. Expresné konštrukty sú často udržiavané v replikone, ako je extrachromozomálny element (napr. plazmidy), schopnom stabilného uchovania v hostiteíovi, ako je kvasinka alebo baktéria. Replikon môže mat dva replikačné systémy, ktoré umožňujú, aby bol uchovaný, napríklad v kvasinke na expresiu a v prokaryotickom hostiteíovi na klonovanie a amplifikáciu. Príklady takýchto kvasinka - baktéria shuttle vektorov zahrňujú YEp24 (Botsein a spol. (1979), Gene 8: 17 -24), pCl/1 (Brake a spol. (Brake a spol. (1984), Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81:
4642 - 4646) a YRpl7 (Stinchcomb a spol. (1982), J. Mol. Biol., 158: 157). Naviac môže byt replikon plazmid s buď vysokým alebo nízkym počtom kópií. Vysokokópiový plazmid bude všeobecne mat počet kópií v rozmedzí od asi 5 do asi 200 a typicky asi 10 až asi 150. Hostite!, obsahujúci vysokokópiový plazmid, bude všeobecne mat aspoň asi 10 a výhodnejšie aspoň asi 20. Vstup vysoko alebo nízkokópiového vektora môže byt zvolený, v závislosti od účinku vektoru a cudzieho proteínu na hostiteľa. Pozri Brake a spol., supra.
Alternatívne môžu expresné konštrukty byt integrované do kvasinkového genómu s integračným vektorom. Integračné vektory typicky obsahujú aspoň jednu sekvenciu homológnu ku kvasinkovému chromozómu, ktorý umožňuje vektoru integrovať a výhodne obsahuje dve homológne sekvencie lemujúce expresný konštrukt. Integrácia sa zdá byť výsledkom rekombinácie medzi homológnou DNA vo vektore a kvasinkového chromozónu (Orr - Weaver a spol. (1983), Methods in Enzymol., 101: 228 - 245). Integračný vektor môže byť riadený k špecifickému miestu v kvasinke výberom vhodnej homológnej sekvencie kvôli zahrnutiu do vektora. Pozri Orr - Weaver a spol., supra. Integrovať môže jeden alebo viacero expresných konštruktov, čo ovplyvňuje hladiny produkovaného rekombinantného proteínu (Rine a spol. (1983), Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 80: 6750). Chromozomálne sekvencie zahrnuté vo vektore, sa môžu objavovať ako jediný segment vo vektore, ktorý vedie k integrácii celého vektora, alebo dva segmenty homológne k pripojeným segmentom v chromozóme a lemujúce expresný konštrukt vo vektore, ktorý môže viesť k stabilnej integrácii iba expresného konštruktu.
Typicky extrachromozomálne a integračné expresné konštrukty môžu obsahovať selektujúce markery na umožnenie výberu kvasinkových kmeňov, ktoré boli transformované. Selektovateľné markery môžu zahrňovať biosyntetické gény, ktoré môžu byť exprimované v kvasinkovom hostiteľovi, ako je gén ADE2, HIS4, LEU2, TRPÍ a ALG7 a G418 rezistencie, ktoré udeľujú rezistenciu v kvasinkách k tunicarmycínu a G418. Naviac, vhodný selektujúci marker môže tiež poskytnúť kvasinku so schopnosťou rásť za prítomnosti toxických zlúčenín, ako je kov. Napríklad prítomnosť CUIP umožňuje kvasinkám rásť za prítomnosti iónov medi (Butt a spol. (1987), Microbiol. Rev., 51: 351).
Alternatívne môžu niektoré z vyššie popísaných zložiek spolu vstupovať do transformačných vektorov. Transformačné vektory typicky obsahujú selektujúci marker, ktorý je buď udržiavaný v replikone alebo vyvinutý v integračnom vektore, ako je popísané vyššie.
Expresné a transformačné vektory, buď extrachromozomálne replikony alebo integračné vektory, boli vyvinuté pre transformáciu do mnohých kvasiniek. Napríklad boli vyvinuté expresné vektory pre, inter alia, nasledujúce kvasinky: Candida albicans (Kurtz a spol. (1986), Mol. Celí. Biol., 6: 142), Candida maltosa (Kunze a spol. (1985), J. Basic Microbiol., 25: 141), Hansenula polymorpha (Gleeson a spol. (1986), J. Gen. Microbiol., 132: 3459, Roggemkamp a spol. (1986), Mol. Gen. Genet., 202: 302), Kluyveromyces fragilis (Das a spol. (1984), J. Bacteriol., 158: 1165), Kluyveromyces lactis (De Louvencourt a spol. (1983), J. Bacteriol., 154: 737, Van den Berg a spol. (1990), Bio/Technology 8: 135), Pichia guillerimondií (Kunze a spol. (1985), J. Basic Microbiol., 25: 141), Pichia pastoris (Cregg a spol. (1985), Mol. Celí. Biol., 5: 3376, US 4837148 a US 4929555), Saccharomyces cerevisiae (Hinnen a spol. (1978), Proc. Natl. Acad. Sci. USA 75: 1929, Ito a spol. (1983), J. Bacteriol., 153: 163), Schizosaccharomyces pombe (Beach a Nurse (1981), Náture 300: 706) a Yarrowia lipolytica (Davidow a spol. (1985), Curr. Genet., 10: 380 - 471, Gaillardin a spol. (1985), Curr. Genet. 10: 49).
Spôsoby zavedenia exogénnej DNA do kvasinkových hostitelov sú v odbore známe a typicky zahrňujú transformáciu sferoplastov alebo intaktných kvasinkových buniek spracovaných s alkalickými katiónmi. Transformačné postupy sa zvyčajne menia s transformovanými kvasinkovými druhmi. Pozri napr. (Kurtz a spol. (1986), Mol. J. Basic Microbiol., J. Gen. Microbiol., Gen. Genet., 202:
Bacteriol., 158:
Bacteriol., 154: Bio/Technology, 8 Mol. Celí. Biol.
Celí. Biol., 6: 142, Kunze a spol. (1985), 25: 141, Candida), (Gleeson a spol. (1986), 132: 3459, Roggenkamp a spol. (1986), Mol. Hanseluna), (Das a spol. (1984), J.
Louvencourt a spol. (1983), J.
(1990) , (1985) , (1985), J. Basic
302,
1165, De
1165, Van den Berg a spol.
135, Kluyveromyces), Cregg a spol.
5: 3376, Kunze a spol.
Microbiol., 25: 141, US 4837148 a US 4929555, Pichia), (Hinnen a spol. (1978), Proc. Natl. Acad. Sci. USA 75, 1929, Ito a spol. (1983), J. Bacteriol., 153: 163, Saccharomyces), (Beach a Nurse (1981), Náture 300: 706, Schizosaccharomyces), (Davidow a spol. (1985), Curr. Genet. 10: 39, Gaillardin a spol. (1985), Curr. Genet., 10: 49, Yarrowia).
V predloženom vynáleze môžu byť v expresnom vektore obsiahnuté selektujúce markery, počiatok replikácie a homológne sekvencie hostiteľských buniek. Selektujúci marker môže byt použitý na prehľadanie hostiteľských buniek ktoré potenciálne obsahujú expresný vektor. Takéto markery zahrňujú tie, ktoré robia hostiteľskú bunku rezistentnou k liekom ako je ampicilín, chloramfenikol, erytromycín, enomycín a tetracyklín. Markery môžu tiež zahrňovať biosyntetické gény ako sú gény v dráhach histidínu, tryptofánu a leucínu, ktoré sú vyžadované pre rast v hostiteľskej bunke. Ak je použitá napríklad leu(-) hostiteľská bunka ako príjemca v transformácii expresným vektorom a leucín je neprítomný v médiu, budú prežívať iba bunky, ktoré nesú plazmid s leu(+) génom.
V predloženom vynáleze môže byť inkorporovaný do expresného vektora kvôli replikácie v hostiteľskej bunke. Takýto zahrňuje tie, ktoré umožňujú, aby začiatok replikácie umožneniu autonómnej počiatok replikácie expresný vektor bol reprodukovaný vo vysokom počte kópií za.prítomnosti vhodných proteínov v bunke, napríklad 2 gm a autonómne sa replikujúcej sekvencie, ktoré sú účinné v kvasinke, a počiatok replikácie virálneho T-antigénu, ktorý je účinný v COS-7 bunkách.
Pre účel predloženého vynálezu môžu byt expresné vektory buď integrované do genómu hostiteľskej bunky alebo zostávajú v bunke autonómne. Kvôli integrácii do hostiteľského genómu môže expresný vektor obsahovať polynukleotidové sekvencie, ktoré sú homológne so sekvenciami v genóme hostiteľskej bunky. Homológne sekvencie nevyhnutne nemusia byť pripojené k expresnému vektoru. Napríklad môžu expresné vektory byť integrované do CHO genómu cez nepripojený gén dihydrofolát reduktázy. V kvasinke je preferované, keď homológna sekvencia lemuje expresnú kazetu. Obzvlášť výhodné homológne sekvencie kvasinkového genómu podlá predloženého vynálezu sú tie, ktoré sú popísané v PCT WO 90/01800 a sekvencie HIS4 génu, popísané v Genbank, prír. číslo J01331.
Voľba promótora, terminátora a iných prípadných prvkov expresného vektoru bude tiež závisieť od zvolenej hostiteľskej bunky ako je známe odborníkom v odbore.
Predložený vynález nie je závislý od vybranej hostiteľskej bunky. V odbore je známych vela hostitelov pre expresiu a sú dostupné z American Type Culture Collection (ATCC).
Napríklad bakteriálni hostitelia vhodní pre expresiu KGF fragmentu alebo analógu zahrňujú: Campylobacter, Bacillus, Escherichia, Lactobacillus, Pseudomonas, Staphylococcus a Streptococcus. Môžu byt použití kvasinkoví hostitelia z nasledujúcich rodov: Candida, Hansenula, Kluyveromyces, Pichia, Saccharomyces, Schizosaccharomyces a Yarowia. Imortalizované cicavčie bunky, ktoré môžu byt použité ako hostitelia, zahrňujú CHO bunky, HeLa bunky, bunky ľadvín mláďata škrečka (BKB), bunky opičích ľadvín (COS) a bunky ľudského hepatocelulárneho karcinómu, napr. Hep G2. Na expresiu KGF fragmentu alebo jeho analógu je vhodných vela hmyzích bunečných hostitelov, ktorí zahrňujú: Aedes aegypti, Autographa californica, Bombyx mori, Drosophila melanogaster a Spodoptera frugiperda ako sú popísané v PCT WO 89/046699, Carbonell a spol., J. Virol., 56: 153 (1985), Wright, Náture 321: 718 (1986), Smith a spol., Mol. Celí. Biol., 3: 2156 (1983) a všeobecne Fraser a spol. in vitro Celí. Dev. Biol., 25: 225 (1989).
Expresný vektor, obsahujúci KGF fragment alebo jeho analóg, sa inzertuje do hostiteľskej bunky. Na inzertovanie expresných vektorov do hostiteľskej bunky môžu byť použité akékoľvek transformačné techniky, ktoré sú známe v odbore. Napríklad transformácia bakteriálnych hostiteľov typicky zahrňuje prvé upravenie baktérie buď s CaCl2 alebo inými činidlami, ako sú divalentné katióny a DMSO a umožnenie zavedenia exogénnej DNA do ošetrených bakteriálnych buniek. DNA môže byť tiež zavedená do bakteriálnych buniek elektroporáciou alebo virálnou infekciou. Transformačné postupy pre bakteriálneho hostiteľa, ktoré môžu byť
použité, zahrňujú | tie, | ktoré sú | popísané v | Masson | a spol. |
(1989), FEMS Microbiol. | Lett., 60: | 273, Palva a | spol., | (1982), | |
Proc. Natl. Acad. | Sci | . USA 79: | 5582, EPO | pub. č. | 036259 |
a 063953, PCT pub. | č. | WO 84/04541 | , Bacillus), | (Miller | a spol. |
(1988), Proc. Natl. | Acad | . Sci., 85: | 856, Wang a | spol. (1990) , J. | |
Bacteriol., 172: | 949, | Campylobacter), (Cohen | a spol. | (1973), | |
Proc. Natl. Acad. | Sci. , | 69: 2110, | Dower a spol. | (1988) , | Nucleic |
Acids Res., 16: 6127, Kushner, An Improved Method for Transformation of Escherichia coli with ColEl - Derived Plasmids. V Genetic Engineering: Proceedings of the International Symposium on Genetic Engineering (vyd. H. W. Boyer a S. Nicosia) (1978), Mandel a spol. (1970), J. Mol. Biol., 53: 159, Takéto (1988), Biochim. Biophys. Acta, 949: 318, Escherichia), (Chassy a spol. (1987) FEMS Microbiol. Lett., 44: 173 Lactobacillus), (Fiedler a spol. (1988), Anál. Biochem., 170: 38, Pseudomonas), (Augustín a spol. (1990) FEMS Microbiol. Lett., 66: 203, Staphylococcus), (Bary a spol. (1980), J. Bacteriol., 144: 698, Harlander (1987), Transformation of Streptococcus lactis by Electroporation, v: Streptococcal Genetics (vyd. J. Ferretti a R. Curtis III), Perry a spol., Infec. Immun., 32: 1295 (1981), Powell a spol., Appl. Environ. Microbiol., 54: 665 (1988), Somkuti a spol., Proc. 4 th Evr. Cong. Biotechnology, 1: 412 (1987), Streptococcus).
Transformačné metódy pre kvasinkových hostiteľov sú dobre známe v odbore a typicky zahrňujú transformáciu buď sferoblastov alebo intaktných kvasinkových buniek spracovaných s alkalickými katiónmi. Kvasinkové bunky môžu byt tiež transformované elektroporáciou ako je popísané v Methods in Enzymology, diel 194, 1991, Guide to Yeast Genetics and Molecular Biology. Podľa predloženého vynálezu sa použitý transformačný postup mení podľa transformovaných kvasinkových druhov a zahrňuje tie, ktoré sú popísané v Kurtz a spol. (1986), Mol. Celí. Biol. 6: 142), Candida maltosa (Kunze a spol. (1985)), J. Basic Microbiol., 25: 141), Hansenula polymorpha (Gleeson a spol. (1986), J. Gen. Microbiol., 132: 3459, Roggemkamp a spol. (1986), Mol. Gen. Genet., 202: 302), Kluyveromyces fragilis (Das a spol. (1984), J. Bacteriol., 158: 1165), Kluyveromyces lactis (De Louvencourt a spol. (1983), J. Bacteriol., 154: 737, Van den Berg a spol. (1990), Bio/Technology, 8: 135), Pichia guillerimondii (Kunze a spol. (1985), J. Basic Microbiol., 25: 141), Pichia pastoris (Cregg a spol. (1985), Mol. Celí. Biol., 5: 3376, US 4837148 a US 4929555), Saccharomyces cerevisiae (Hinnen a spol. (1978), Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 75: 1929, Ito a spol. (1983), J. Bacteriol., 153: 163), Schizosaccharomyces pombe (each a Nurse (1981), Náture 300: 706) a Yarrowia lipolytica (Davidow a spol. (1985), Curr. Genet., 10: 380 - 471, Gaillardin a spol. (1985), Curr. Genet., 10: 49).
Spôsoby zavedenia exogénnej DNA do kvasinkových hostiteľov sú v odbore známe a typicky zahrňujú transformáciu sferoplastov alebo intaktných kvasinkových buniek spracovaných s alkalickými katiónmi. Transformačné postupy sa zvyčajne menia s transformovanými kvasinkovými druhmi a zahrňujú tie, ktoré sú popísané v práci Kurtz a spol. (1986), Mol. Celí. Biol., 6: 142, Kunze a spol. (1985), J. Basic Microbiol., 25: 141, Candida, Gleeson a spol. (1986), J. Gen. Microbiol., 132: 3459, Roggenkamp a spol. (1986), Mol. Gen. Genet., 202: 302, Hansenula, Das a spol., (1984), J. Bacteriol., 158: 1165, De Louvencourt a spol. (1983), J. Bacteriol., 154: 1165, Van den Berg a spol. (1990), Bio/Technology, 8: 135, Kluyveromyces, Cregg a spol. (1985), Mol.
- 44 Celí. Biol., 5: 3376, Kunze a spol. (1985), J. Basic Microbiol., 25: 141, US 4837148 a US 4929555, Pichia, Hinnen a spol. (1978),
Proc. Natl. Acad. Bacteriol., 153:
Náture 300: 706, Curr. Genet., 10:
10: 49, Yarrowia.
Sci. USA, 75: 1929, Ito a 163, Saccharomyces, (Beach Schizosaccharomyces, Davidow spol. (1983), j. a Nurse (1981) , a spol. (1985),
39, Gaillardin a spol. (1985), Curr. Genet.,
Spôsoby zavedenia heterológnych polypeptidov do cicavčích buniek sú známe v odbore a zahrňujú, napríklad vírusovú infekciu, dextránom sprostredkovanú transfekciu, zrážanie fosforečnanom vápenatým, polybrénom sprostredkovanú transfekciu, protoplastovú fúziu, elektroporáciu, enkapsuláciu polynukleotidu(ov) v lipozómoch a priame mikroinjektovanie DNA do jadra.
Spôsoby na zavedenie heterológnej DNA do bakulovírusového vektoru a na transformáciu tiež v odbore známe ako je Celí. Biol., 3: 2156 (1983) 31 (1989). Napríklad môže byť vírusu na vytvorenie expresného hmyzích hostiteľských buniek sú popísané v Smith a spol., Mol. a Lucklow a Summers, Virology, 17:
KGF fragment DNA inzertovaná do polyhedrón génu homológnou dvojitou cross-over rekombináciou. Inzercia môže byť tiež vykonaná zapracovaním miesta pre reštrikčný enzým do požadovaného bakulovírusového génu, ako popisuje Miller a spol., Bioessays, 4: 91 (1989). DNA sekvencia KGF fragmentu, ak je klonovaná namiesto polyhedrón génu v expresnom vektore, je lemovaná ako 5', tak 3' polyhedrón - špecifickými sekvenciami a je umiestnená v zmesi polyhedrónového promótora.
Vo vyhotovení predloženého vynálezu môže byt novo formovaný bakulovírus expresný vektor následne vložený do infekčného rekombinantného bakulovírusu. V bakulovírusovom expresnom systéme sa objavuje homológna rekombinácia málo často, medzi asi 1 % a asi 5 %. Preto zvyčajne väčšina vírusu produkuje po transfekcii ešte prirodzený typ vírusu. Rekombinantné vírusy však môžu byt identifikované známymi metódami. Napríklad natívny vírus produkuje polyhedrón proteín vo veľmi vysokých hladinách v jadre infikovaných buniek počas neskorého štádia vírusovej infekcie. Akumulovaný polyhedrón protein tvorí oklúzne telieska, ktoré tiež obsahujú zapuzdrené vírusové častice. Tieto oklúzne telieska majúce veľkosť až 15 μπι, majú vysokú odrazivosť, čo ich robí veľmi jasnými, a preto sú ľahko vizualizované pod svetelným mikroskopom. Bunky infikované rekombinantnými vírusmi nemajú oklúzne telieska. Rekombinantný vírus a prirodzený vírus môžu byt rozlíšené umiestnením na platni, transfekciou supernatantu alebo jeho riedením do monovrstvy hmyzích buniek štandardnými technikami. Plaky môžu potom byť screenované pod svetelným mikroskopom na prítomnosť indikujúcu prirodzený typ vírusu, alebo neprítomnosť, indikujúcu rekombinantný vírus, oklúznych teliesok ako je popísané v Current Protocols in Microbiology, zv. 2 (Ausubel a spol. vyd. 16.8., dod. 10.1990).
Imunoskúšky a skúšky aktivity, ktoré sú známe v odbore, môžu byt použité na stanovenie, či transformované hostiteľské bunky exprimujú požadovaný KGF fragment. Napríklad imunofluorescencia môže byť vykonaná na transformovanom hostiteľovi bez oddelenia KGF fragmentov z bunečnej membrány. V tejto skúške sú hostiteľské bunky najprv fixované do pevného nosiča, ako sú mikroskopické rezy alebo mikrotitračná jamka. Potom sú hostiteľské bunky vystavené anti-KGF protilátke. Výhodne, kvôli zvýšeniu citlivosti skúšky, sú fixované bunky vystavené druhej protilátke, ktoré je značená a viaže sa k anti-KGF protilátke. Napríklad môže byť sekundárna protilátka značená fluorescentným markerom. Hostiteľské bunky, ktoré exprimujú KGF fragmenty, budú fluorescenčné značené a môžu byť vizualizované pod mikroskopom.
Príklady vyhotovenia vynálezu
Príklad 1
Ľudská KGF cDNA bola inzertovaná do bakulovírusového expresného systému klonovaním cDNA do pAcC13Pst/not 1 expresného vektoru, ako je uvedené na obr. 1. Tento plazmid bol odvodený z pAcCIZ, ako popísal Munemitsu a spol., Mol. Celí. Biol., 10:
5977 - 5982 (1990 ) .
PCR oligonukleotidové priméry boli vytvorené pre skrátený 19 kd KGF na báze dostupných N-terminálnych aminokyselinových sekvencii KGF popísaných v práci Finch a spol., Science, 2: 752 - 755 (1989). Lemujúce reštrikčné miesta (PstI a Nôti) boli inkorporované do primérov kvôli uľahčeniu subklonovania do pAcC13 expresného vektora, derivátu pVL941 transfer vektoru, ako popisuje Luckow a spol,. Virology, 170: 31 - 39 (1989) a Quiliam a spol., Mol. Celí. Biol., 10: 2900102908 (1990). Tento expresný vektor bol konštruovaný inzerciou KGF - kódujúceho fragmentu do Pstl/NotI polylinkerového miesta pAcC13. KFG cDNA kóduje zrelú upravenú formu KGF, ktorá bola zložená zo 163 aminokyselinových zvyškov, s potenciálnym N-glykozylačným miestom u zvyškov 14 až 16.
Príprava kondičného média
Spodoptera frugiperda, Sf9 hmyzej bunky boli infikované bakulovírusom, Autographa californica, obsahujúcim cDNA pre KGF1-163' Po zriedení x 10x) buniek/ml, boli bunky kultivované po 48 až 72 hod. v Excell - 400 za neprítomnosti sérového doplnku, antibiotík alebo fungicídov. Kvapalina z kultúry bola zhromaždená a odstredená pri 10 000 x g po 30 min. kvôli odstráneniu plávajúcich buniek a iných bunečných zvyškov. Kondičné médium bolo potom filtrované 0,8 μ - filtrom (Millipore) a približne 5 litrov tohto média bolo koncentrované na 200 ml za použitia Filtron kazetového systému (Omega membrána), majúceho deliacu schopnosť 3 kDa.mol. hmotnosti.
Po koncentrácii bolo kondicionované médium z transfektovaných Sf9 buniek oddelené odstreďovaním pri 10 000 x g po 20 minút a médium bolo čistené nasledujúcou heparín Sepharose (HS) afinitnou chromatografiou. V jednom vyhotovení vynálezu bol približne 1 liter Sf9 bunečného kondicionovaného média ultra - filtrovaný za získania 200 ml ultrafiltračného retentátu za použitia Omega membrány (Filtron), majúcej deliacu schopnosť 3-kDa.
HSAC a Mono S katiónovýmenná chromatografia
Supernatant bol upravený na pH 7,2. 30 ml vzorka bola vložená na heparín Sepharose živicu, ktorá bola ekvilibrovaná v 10 mM Tris-HCl pH 7,3, 150 mM NaCl. Živica bola premývaná intenzívne ekvilibračným pufrom až do navrátenia absorbancie na základnú hodnotu a potom postupne eluovaná zvyšujúcimi sa NaCl koncentráciami od 0,45 M do IM a 2 M NaCl. Z frakcií boli odobrané podiely na použitie v bunečných proliferačných štúdiách a 1 M NaCl frakcie s najvyššou bioaktivitou boli spojené. Spojené frakcie boli zriedené päťnásobne s 10 mM Tris pH 7,2 (konečná koncentrácia soli 0,2 M NaCl) a vzorka bola aplikovaná so Super slučkou na Mono S kolónu pripojenú k FPLC systému (Pharmacia, Piscataway, NJ). Eluácia bola vykonaná s lineárnym gradientom (10 mM Tris pH 7,3, 0,2 M NaCl až 10 mM Tris pH 7,3, 1 M NaCl). Po testovaní frakcií na bioaktivitu boli aktívne frakcie spojené.
Retentát bol upravený na pH 7,3 a vložený na HS kolónu, obsahujúcu lôžko približne s objemom 30 ml. Kolóna bola ponechaná pretekať približne 2 hodiny pri 4 “C. Kolóna bola premytá 150 ml ekvilibračného pufra, obsahujúceho 10 mM Tris-HCl a 0,15 M NaCl pri pH 7,3. Zadržaný proteín bol eluovaný 0,45 NaCl a 1 M NaCl. Prietoková rýchlosť počas eluácie bola upravená na približne 90 ml/h a boli odoberané frakcie s velkostou 3 ml.
Bioaktívne 1 M NaCl chromatografie boli spojené a priamo vnesené na Mono S frakcie zo stupňov HS afinitnej a zriedené 5-krát 10 mM Tris pH 7,3 HR 5/5 kolónu (Pharmacia). Zadržané proteíny boli eluované za použitia 0,2 M NaCl až 1 M NaCl gradientu. Bioskúška aktívnej frakcie bola vykonaná použitím Balb - Mk bunečnej línie. Bola vykonaná SDS PAGE analýza frakciou bioaktívneho proteínu izolovaných Mono S katiónovýmennou chromatografiou. Frakcie 37 - 39 a frakcie 41 - 42 boli spojené a 10 ml podiely boli pridané k SDS a 10 mM DTT. Vzorky boli tepelne denaturované a elektroforézované v 12 % polyakrylamidovom géli, ktorý bol následne vyfarbený striebrom. Bola pozorovaná podobná migrácia u vzoriek, ktoré prešli ako redukčným prostredím, tak prostredím neredukčným. 25 kDa bola zjavná molekulová hmotnosť, proteínu získaného z frakcií 37 - 39 a 18 kDa bola zjavná molekulová hmotnosť proteínu obsiahnutého vo frakciách 41 - 42.
Chromatogram HS bioaktívnej frakcie ukazuje profil Balb/Mk bioaktivity, pokrývajúcej frakcie 31 až 47 demonštrujúcej prítomnosť 12 molekulových druhov, jednej eluujúcej pri 0,55 M NaCl a druhej eluujúcej pri 0,6M NaCl.
Stanovenie KGF aktivity
Prítomnosť KGF aktivity v získaných frakciách bola hodnotená schopnosťou frakcií promótovať rast BALB/C-Mk buniek. Za tým účelom boli 10 μΐ frakcie zriedené 1 ml 0,2 % želatíny vo fosfátom pufrovánom salinickom roztoku (PBS) a 10 μΐ zriedených frakcií bolo testovaných na rast stimulujúcu aktivitu BALB/C-Mk buniek vysiatych na 12 jamkové platne (cluster plate), obsahujúce n
každa 22 mm jamky, v množstve 5 x 10 buniek na jamku. Všetka aktivita KGF bola zadržaná v kolóne a bola eluovaná IM NaCl.
KGF bioaktívne frakcie eluované z HS kolóny IM NaCl boli ďalej čistené katiónovýmennou FPLC stĺpcovou chromatografiou. Tieto frakcie boli spojené, zriedené 5-násobne 10 mM Tris na pH
7,3 a priamo vložené na Mono S HR 5/5 kolónu od fy Pharmacia.
Proteín zadržaný v Mono S HR 5/5 kolóne bol eluovaný gradientom 2,2M NaCl až IM NaCl. Bioaktivita frakcií bola hodnotená ako je popísané vyššie, za použitia BALB/C-Mk buniek. Obr. 3 ilustruje aktivitný profil, pokrývajúci frakcie 31 až 47.
V mitogenickej štúdii bolo 104 ABAE a 5 x 103 buniek na
O jamku vysiate na 12 jamkové cluster platne v hustote 5 x 10 buniek na jamku v 1 ml DMEM doplnenom 10 % teíacím sérom a antibiotikami, ako je popísané Bohlenom a spol., EMBO 4: 1951
- 1956 (1985) a Gospodarowiczom a spol., J. Celí. Physiol., 127: 121 - 136 (1986).a Bellostou a spol., J. Celí. Biol., 121: 705
- 713 (1993). Po šiestich hodinách inkubácie boli sady vždy troch jamôk tryptinizované a bunky boli zrátané kvôli stanoveniu účinnosti upravenia na platni. Mikrolitrové podiely vhodného riedenia každej vzorky potom boli pridané do uvedených troch jamôk v miskách v deň 0., 2. a 4. Po 5-tom dni v kultúre boli platne tryptinizované a stanovené bunečné hustoty pomocou Coulter čítača (Coulter Electronics, Hialeh, FL).
Prídavky KGF alebo bázického KGF boli vykonané v deň 0. a každý ďalší deň v uvedenej koncentrácii. Po 5 dňoch v kultúre boli bunky tryptinizované a konečná bunečná hustota bola stanovená pomocou Coulter čítača.
Elektroforéza (NaDodS04)
Polyakrylamidové gély boli pripravené s NaDodS04 postupom podlá Lammeliho a spol., Náture, 227: 680 - 685 (1970). Vzorky boli varené 3 minúty za prítomnosti 10 mM DTT a elektroforézované v 12 % polyakrylamidovom géli. Gély boli fixované a vyfarbené striebrom za použitia činidiel a protokolu od BioRad a ako je diskutované v práci Merrila a spol., Science, 211: 1437 - 1438. Vhodné markery molekulovej hmotnosti boli od BioRad.
Skúška bunečnej proliferácie
Mitogenická aktivita kolónových frakcií a čistených vzoriek bola stanovená za použitia Balb/Mk buniek ako cieľových buniek. Zásobné kultúry rástli a boli udržiavané s nízkym obsahom vápnika modifikovanom Eagle médiu, doplnenom 10 % FCS, 50 ^g/ml gentamicínu, 0,25 μg/ml fungizónu a 10 ng/ml aFGF ako popísal Gospodarowicz a spol., J. Celí. Physiol, 142: 325 - 333. Pre mitogenickú skúšku, boli bunky vysiate do 12 jamkových cluster platní v hustote 5 x 103 až 104 buniek na jamku v 1 ml MEM s nízkym obsahom vápnika, doplnenom 10 % FCS podľa Gospodarowicza a spol. Prídavky vzoriek a konečné stanovenie bunečnej hustoty boli vykonané po 5 dňoch v kultúre, ako popísal Gospodarowicz a spol.
Mitogenická aktivita konečného testovaná na dospelých hovädzích bunkách (ABAE - adult bovine čisteného materiálu bola aortických endoteliálnych aortic endothelial cells) a kapilárnych bunkách získaných z adrenálneho kortexu (ACE bunky) ako popísal Gospodarowicz a spol., Proc. Natl. Acad. Sci., 73: 412 - 4124 (1976). Zásobné kultúry boli udržiavané za prítomnosti DMEM doplneného 10 % CS, 50 μg/ml gentamicínu a 0,25 μg/ml fungizónu pasážovaním na slabo gelovaných miskách tkanivovej kultúry pri pomere delenia 1 : 10.
Použitím štandardnej metódy dobre v odbore známej bola stanovená jednoznačná aminokyselinová sekvencia pre polohu 1 až 20 od NH2 konca KGFdesl_23 ako nasledujúca:
S1YDM5EGGDIRVRRLFXRTQ
Predložený vynález tiež zahrňuje DNA segmenty, kódujúce KGFdesi-23 a kratšiu formu KGF s chýbajúcou nekonzervovanou NH2 koncovou charakteristikou KGF163 proti iným členom KGF rodiny.
Proteínové mikrosekvencovanie
Dve nominálne 100 pikomólové vzorky KGF163 a KGFaesi-23 b°li analyzované Edmanovou degradáciou a AA analýzou po odstreďovaní adsorpciou k polyvinylidéndifluoridu (PVDF, Applied Biosystems Biospin). Vzorky boli vložené do proteínového sekvenátora v plynnej fáze Applied Biosystems 477A. Bolo vykonaných dvadsať cyklov za použitia štandardného softwaru a chemikálií dodávaných Applied Biosystems a identifikácie PTH aminokyselín boli vykonané na automatizovanej on-line HPLC kolóne (model 120A, Applied Biosystems).
Claims (18)
1. Keratinocytový rastový faktorový fragment obsahujúci časť aminokyselinovej sekvencie zrelého keratinocytového faktora plnej dĺžky, kde čast vykazuje aspoň dvojnásobné zvýšenie mitogenickej aktivity v porovnaní so zrelým, rekombinantným keratinocytovým faktorom plnej dĺžky a nemá sekvenciu, obsahujúcu prvé aminokyselinové zvyšky z N-konca zrelého keratinocytového faktora plnej dĺžky.
2. Fragment keratinocytového rastového faktoru podía nároku 1, kde fragment vykazuje sedemnásobné zvýšenie mitogenickej aktivity v porovnaní so zrelým rekombinantným keratinocytovým rastovým faktorom plnej dĺžky.
3. Fragment keratinocytového rastového faktoru podía nároku 1, kde fragment vykazuje desaťnásobné zvýšenie mitogenickej aktivity v porovnaní so zrelým rekombinantným keratinocytovým rastovým faktorom plnej dĺžky.
4. Fragment keratinocytového rastového faktoru podía nároku 1, kde fragment vykazuje zníženie cytotoxicity v porovnaní so zrelým rekombinantným keratinocytovým rastovým faktorom plnej dĺžky.
5. Konjugát, obsahujúci:
a) fragment keratinocytového rastového faktoru, ktorý obsahuje časť aminokyselinovej sekvencie zrelého keratinocytového rastového faktoru plnej dĺžky, kde časť vykazuje aspoň dvojnásobné zvýšenie mitogenickej aktivity v porovnaní so zrelým keratinocytovým rastovým faktorom plnej dĺžky a nemá sekvenciu obsahujúcu prvých 23 - N-koncových aminokyselinových zvyškov zrelého, keratinocytového rastového faktoru plnej dĺžky a
b) toxínovú molekulu.
6. Konjugát podlá nároku 5, kde toxínová molekula je vybraná zo skupiny, zahrňujúcej ricín A, diftéria toxín a saporín.
7. Konjugát podlá nároku 5, kde fragment vykazuje sedemnásobné zvýšenie mitogenickej aktivity v porovnaní so zrelým rekombinantným keratinocytovým rastovým faktorom plnej dĺžky.
8. Konjugát podlá nároku 5, kde fragment vykazuje desaťnásobné zvýšenie mitogenickej aktivity v porovnaní so zrelým rekombinantným keratinocytovým rastovým faktorom plnej dĺžky.
9. Terapeutická kompozícia, vyznačujúca sa tým, že obsahuje:
a) fragment keratinocytového rastového faktoru, ktorý obsahuje časť aminokyselinovej sekvencie zrelého keratinocytového rastového faktoru plnej dĺžky, kde časť vykazuje aspoň 2-násobné zvýšenie mitogenickej aktivity v porovnaní so zrelým keratinocytovým rastovým faktorom plnej dĺžky a nemá sekvenciu, obsahujúcu prvých 23 - N-koncových aminokyselinových zvyškov zrelého keratinocytového rastového faktora plnej dĺžky a
b) farmaceutický prijateľný nosič.
10. DNA molekula, obsahujúca nukleotidovú sekvenciu, ktorá kóduje fragment keratinocytového rastového faktoru podlá nároku
1.
11. DNA molekula, obsahujúca nukleotidovú sekvenciu, ktorá kóduje fragment keratinocytového rastového faktoru podlá nároku
2.
12. DNA molekula, obsahujúca nukleotidovú sekvenciu, ktorá kóduje fragment keratinocytového rastového faktoru podľa nároku
3.
13. Expresný vektor, obsahujúci DNA molekulu podľa nároku 10 a regulátorovú sekvenciu pre expresiu DNA molekuly.
14. Expresný vektor podľa nároku 13, kde vektorom je bakulovírus.
15. Hostiteľská bunka transformovaná expresným vektorom podľa nároku 13.
16. Hostiteľská bunka podľa nároku 15, kde bunka je vybraná zo skupiny, zahrňujúcej bakteriálnu bunku, kvasinkovú bunku, cicavčiu bunku a hmyziu bunku.
17. Spôsob prípravy fragmentu keratinocytového faktoru, vyznačujúci sa tým, že zahrňuje stupne kultivácie hostiteľskej bunky podľa nároku 15 a izoláciu fragmentu keratinocytového rastového faktoru z kultúry.
18. Spôsob hojenia rán, vyznačujúci sa tým, že zahrňuje aplikáciu terapeutickej kompozície podľa nároku 9 na plochu rany, ktorá má byt hojená a ponechanie rany, aby sa zahojila.
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US8642793A | 1993-06-29 | 1993-06-29 | |
PCT/US1994/004694 WO1995001434A1 (en) | 1993-06-29 | 1994-04-28 | A truncated keratinocyte growth factor (kgf) having increased biological activity |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
SK153295A3 true SK153295A3 (en) | 1996-11-06 |
Family
ID=22198501
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
SK1532-95A SK153295A3 (en) | 1993-06-29 | 1994-04-28 | A truncated keratinocyte growth factor (kgf) having increased biological activity |
Country Status (25)
Country | Link |
---|---|
US (7) | US5677278A (sk) |
EP (2) | EP1493812A3 (sk) |
JP (4) | JP3570516B2 (sk) |
KR (1) | KR960703433A (sk) |
CN (1) | CN1129955A (sk) |
AT (1) | ATE278777T1 (sk) |
AU (1) | AU681405B2 (sk) |
BG (1) | BG100236A (sk) |
BR (1) | BR9407035A (sk) |
CA (1) | CA2166278A1 (sk) |
CZ (1) | CZ343795A3 (sk) |
DE (2) | DE122006000005I2 (sk) |
DK (1) | DK0706563T3 (sk) |
ES (1) | ES2227527T3 (sk) |
FI (1) | FI956203A (sk) |
FR (1) | FR06C0004I2 (sk) |
HU (1) | HUT73453A (sk) |
LU (1) | LU91215I2 (sk) |
NL (1) | NL300217I2 (sk) |
NO (1) | NO955189D0 (sk) |
NZ (1) | NZ266622A (sk) |
PL (1) | PL312257A1 (sk) |
PT (1) | PT706563E (sk) |
SK (1) | SK153295A3 (sk) |
WO (1) | WO1995001434A1 (sk) |
Families Citing this family (42)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP1016716A3 (en) * | 1989-01-31 | 2000-07-12 | RUBIN, Jeffrey S | Dna encoding a growth factor specific for epithelial cells |
US7026291B1 (en) | 1989-01-31 | 2006-04-11 | The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services | Epithelial cell specific growth factor, keratinocyte growth factor (KGF) |
US5965530A (en) * | 1993-03-26 | 1999-10-12 | Amgen Inc. | Therapeutic uses of keratinocyte growth factor |
CA2166278A1 (en) * | 1993-06-29 | 1995-01-12 | Denis J. Gospodarowicz | A truncated keratinocyte growth factor (kgf) having increased biological activity |
US7084119B2 (en) * | 1993-06-29 | 2006-08-01 | Chiron Corporation | Truncated keratinocyte growth factor (KGF) having increased biological activity |
AU745815B2 (en) * | 1994-10-13 | 2002-04-11 | Biovitrum Ab (Publ) | Analogs of keratinocyte growth factor, nucleic acids encoding such analogs, processes of making and methods of using |
WO1996011949A2 (en) * | 1994-10-13 | 1996-04-25 | Amgen Inc. | Analogs of keratinocyte growth factor |
EP0785949B1 (en) * | 1994-10-13 | 2003-05-02 | Amgen Inc. | Method for purifying keratinocyte growth factors |
US6008328A (en) * | 1994-10-13 | 1999-12-28 | Amgen Inc. | Method for purifying keratinocyte growth factors |
US6693077B1 (en) | 1995-02-14 | 2004-02-17 | Human Genome Sciences, Inc. | Keratinocyte growth factor-2 |
US7232667B2 (en) | 1995-02-14 | 2007-06-19 | Human Genome Sciences, Inc. | Keratinocyte growth factor-2 polynucleotides |
US6077692A (en) | 1995-02-14 | 2000-06-20 | Human Genome Sciences, Inc. | Keratinocyte growth factor-2 |
ES2224178T3 (es) | 1995-10-11 | 2005-03-01 | Chiron Corporation | Cobinacion de pdgf, kgf,igf e igfbp para la cicatrizacion de heridas. |
US6692961B1 (en) | 1996-10-11 | 2004-02-17 | Invitrogen Corporation | Defined systems for epithelial cell culture and use thereof |
US20030144202A1 (en) * | 1996-10-15 | 2003-07-31 | Amgen Inc. | Uses of keratinocyte growth factor-2 |
EP1473366A1 (en) * | 1996-10-15 | 2004-11-03 | Amgen Inc. | Keratinocyte growth factor-2 products |
CA2269077C (en) * | 1996-10-15 | 2004-04-06 | Amgen Inc. | Keratinocyte growth factor-2 products |
US6743422B1 (en) | 1996-10-15 | 2004-06-01 | Amgen, Inc. | Keratinocyte growth factor-2 products |
CA2294569A1 (en) * | 1997-06-19 | 1998-12-23 | Genetics Institute, Inc. | Secreted proteins and polynucleotides encoding them |
US20080233086A1 (en) * | 1997-09-05 | 2008-09-25 | Canbiocin Inc. | Expression Vectors for Treating Bacterial Infections |
US6869927B1 (en) | 1997-12-22 | 2005-03-22 | Human Genome Sciences, Inc. | Keratinocyte growth factor-2 formulations |
US6238888B1 (en) | 1997-12-22 | 2001-05-29 | Human Genone Sciences, Inc. | Keratinocyte growth factor-2 formulations |
EP1054900A4 (en) * | 1998-02-13 | 2004-12-22 | Human Genome Sciences Inc | THERAPEUTIC USE OF THE KERATINOCTENT GROWTH FACTOR-2 |
DE19934510B4 (de) * | 1999-07-22 | 2009-04-16 | Vermicon Ag | Verfahren zum Nachweis von Mikroorganismen |
US6485937B1 (en) | 1999-10-15 | 2002-11-26 | The Rockefeller University | System for rapid generation of recombinant baculovirus-based expression vectors for silkworm larvae |
DE10024334B4 (de) * | 2000-05-17 | 2006-06-01 | Medigene Ag | Verfahren zum Einbringen von Nukleinsäure in eine Zelle (Transfektion) mittels Calciumphosphat |
JP4262979B2 (ja) | 2000-11-21 | 2009-05-13 | ザ・テキサス・エイ・アンド・エム・ユニバーシテイ・システム | Fgfアフィニティークロマトグラフィー |
US20030186904A1 (en) * | 2001-01-08 | 2003-10-02 | Human Genome Sciences, Inc. | Keratinocyte growth factor-2 |
ES2309167T3 (es) | 2001-02-19 | 2008-12-16 | Merck Patent Gmbh | Metodo para identificar epitotes de celulas t y metodo para preparar moleculas con inmunogenicidad reducida. |
PL374269A1 (en) | 2001-08-21 | 2005-10-03 | Chiron Corporation | Kgf polypeptide compositions |
US7202066B2 (en) * | 2002-01-29 | 2007-04-10 | Carrington Laboratories, Inc. | Combination of a growth factor and a protease enzyme |
GB0426394D0 (en) | 2004-12-01 | 2005-01-05 | Health Prot Agency | Fusion proteins |
MX2007006822A (es) * | 2004-12-15 | 2007-07-24 | Amgen Inc | Formulaciones terapeuticas para el factor de crecimiento de queratinocitos. |
US20060183712A1 (en) * | 2005-02-17 | 2006-08-17 | The Texas A&M University System | Affinity purified heparin/heparan sulfate for controlling the biological activity of the FGF receptor |
JP5215865B2 (ja) * | 2005-11-22 | 2013-06-19 | ノバルティス ヴァクシンズ アンド ダイアグノスティクス インコーポレイテッド | ノロウイルス抗原およびサポウイルス抗原 |
GB0611405D0 (en) * | 2006-06-09 | 2006-07-19 | Univ Belfast | FKBP-L: A novel inhibitor of angiogenesis |
US20080119433A1 (en) * | 2006-07-06 | 2008-05-22 | Aaron Thomas Tabor | Compositions and Methods for Genetic Modification of Cells Having Cosmetic Function to Enhance Cosmetic Appearance |
KR101021197B1 (ko) * | 2008-04-11 | 2011-03-11 | (주)케어젠 | 성장인자―미미킹 펩타이드 및 그의 용도 |
CN102471769A (zh) | 2009-07-17 | 2012-05-23 | 亚伦·T.·塔波尔 | 用于具有美容功能的细胞的遗传修饰以提高美容外观的方法和组合物 |
RU2016117275A (ru) | 2013-11-01 | 2017-12-04 | Сфериум Биомед С.Л. | Тельца включения для трансдермальной доставки терапевтических и косметических средств |
EP4395806A1 (en) | 2021-08-30 | 2024-07-10 | Unichem Laboratories Ltd | Protein compositions for the treatment of inflammatory diseases |
KR20230070596A (ko) * | 2021-11-15 | 2023-05-23 | (주)피앤피바이오팜 | 안정성이 증가된 인간 각질세포 성장인자1 변이체 및 이의 용도 |
Family Cites Families (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP1016716A3 (en) | 1989-01-31 | 2000-07-12 | RUBIN, Jeffrey S | Dna encoding a growth factor specific for epithelial cells |
US5194596A (en) * | 1989-07-27 | 1993-03-16 | California Biotechnology Inc. | Production of vascular endothelial cell growth factor |
US5350836A (en) * | 1989-10-12 | 1994-09-27 | Ohio University | Growth hormone antagonists |
US5965530A (en) | 1993-03-26 | 1999-10-12 | Amgen Inc. | Therapeutic uses of keratinocyte growth factor |
CA2166278A1 (en) | 1993-06-29 | 1995-01-12 | Denis J. Gospodarowicz | A truncated keratinocyte growth factor (kgf) having increased biological activity |
WO1996011949A2 (en) | 1994-10-13 | 1996-04-25 | Amgen Inc. | Analogs of keratinocyte growth factor |
ES2196088T3 (es) | 1994-10-13 | 2003-12-16 | Amgen Inc | Analogos del factor de crecimiento de los queratinocitos. |
-
1994
- 1994-04-28 CA CA002166278A patent/CA2166278A1/en not_active Abandoned
- 1994-04-28 BR BR9407035A patent/BR9407035A/pt not_active Application Discontinuation
- 1994-04-28 AU AU68208/94A patent/AU681405B2/en not_active Ceased
- 1994-04-28 JP JP50346495A patent/JP3570516B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 1994-04-28 EP EP04023638A patent/EP1493812A3/en not_active Ceased
- 1994-04-28 EP EP94916597A patent/EP0706563B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1994-04-28 HU HU9503857A patent/HUT73453A/hu unknown
- 1994-04-28 WO PCT/US1994/004694 patent/WO1995001434A1/en active IP Right Grant
- 1994-04-28 DE DE1994634053 patent/DE122006000005I2/de active Active
- 1994-04-28 CN CN94193193A patent/CN1129955A/zh active Pending
- 1994-04-28 AT AT94916597T patent/ATE278777T1/de active
- 1994-04-28 DE DE69434053T patent/DE69434053T2/de not_active Expired - Lifetime
- 1994-04-28 PT PT94916597T patent/PT706563E/pt unknown
- 1994-04-28 DK DK94916597T patent/DK0706563T3/da active
- 1994-04-28 KR KR1019950705997A patent/KR960703433A/ko not_active Application Discontinuation
- 1994-04-28 NZ NZ266622A patent/NZ266622A/en unknown
- 1994-04-28 PL PL94312257A patent/PL312257A1/xx unknown
- 1994-04-28 ES ES94916597T patent/ES2227527T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1994-04-28 SK SK1532-95A patent/SK153295A3/sk unknown
- 1994-04-28 CZ CZ953437A patent/CZ343795A3/cs unknown
-
1995
- 1995-03-27 US US08/410,941 patent/US5677278A/en not_active Expired - Lifetime
- 1995-06-06 US US08/468,546 patent/US5773586A/en not_active Expired - Lifetime
- 1995-06-06 US US08/467,937 patent/US5863767A/en not_active Expired - Lifetime
- 1995-06-06 US US08/468,547 patent/US5843883A/en not_active Expired - Lifetime
- 1995-12-20 BG BG100236A patent/BG100236A/xx unknown
- 1995-12-20 NO NO955189A patent/NO955189D0/no unknown
- 1995-12-22 FI FI956203A patent/FI956203A/fi unknown
-
1998
- 1998-05-08 US US09/074,950 patent/US6074848A/en not_active Expired - Lifetime
-
2000
- 2000-05-16 US US09/573,068 patent/US6677301B1/en not_active Expired - Fee Related
-
2004
- 2004-02-10 JP JP2004034289A patent/JP2004166709A/ja not_active Withdrawn
-
2005
- 2005-11-17 JP JP2005333438A patent/JP2006075173A/ja not_active Withdrawn
-
2006
- 2006-01-26 NL NL300217C patent/NL300217I2/nl unknown
- 2006-01-27 LU LU91215C patent/LU91215I2/en unknown
- 2006-01-31 FR FR06C0004C patent/FR06C0004I2/fr active Active
-
2007
- 2007-06-11 US US11/811,560 patent/US20090093400A1/en not_active Abandoned
-
2008
- 2008-11-26 JP JP2008301630A patent/JP4662569B2/ja not_active Expired - Lifetime
Also Published As
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
SK153295A3 (en) | A truncated keratinocyte growth factor (kgf) having increased biological activity | |
AU7350000A (en) | Fibroblast growth factor-like polypeptides | |
JPH06505631A (ja) | 巨核球刺激因子 | |
JP2008148711A (ja) | 細胞分裂促進活性を有する短縮型インスリン様成長因子結合タンパク質 | |
US20050136058A1 (en) | Insulin-like growth factor binding protein (IGFBP-5) | |
JPH10500300A (ja) | 単球走化性蛋白質−4 | |
IE913035A1 (en) | Genetic material encoding new insulin-like growth factor¹binding protein (igfbp-5) | |
AU719526B2 (en) | New form of amphiregulin, methods for producing and using the same and compositions comprising the same | |
JPH11511117A (ja) | 細胞表面局在化ドメインを有するキメラmcpおよびdafタンパク質 | |
IE913032A1 (en) | New insulin-like growth factor binding protein (igfbp-4) | |
US7247452B2 (en) | Truncated keratinocyte growth factor (KGF) having increased biological activity | |
JPH08333394A (ja) | ラット肥満遺伝子、その遺伝子産物およびその製造法 | |
JPH11506919A (ja) | 繊維芽細胞増殖因子15 | |
JP3534434B2 (ja) | トロンボモジュリン類発現用シグナルペプチド | |
JP2553425B2 (ja) | トロンビン結合性物質及びその製造法 |