RU2693827C2 - Новые мономеры и олигомеры пептидных нуклеиновых кислот - Google Patents
Новые мономеры и олигомеры пептидных нуклеиновых кислот Download PDFInfo
- Publication number
- RU2693827C2 RU2693827C2 RU2016149427A RU2016149427A RU2693827C2 RU 2693827 C2 RU2693827 C2 RU 2693827C2 RU 2016149427 A RU2016149427 A RU 2016149427A RU 2016149427 A RU2016149427 A RU 2016149427A RU 2693827 C2 RU2693827 C2 RU 2693827C2
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- group
- atom
- formula
- tert
- general formula
- Prior art date
Links
- 108091093037 Peptide nucleic acid Proteins 0.000 title abstract description 37
- 239000000178 monomer Substances 0.000 title abstract description 29
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims abstract description 158
- -1 guaninyl Chemical group 0.000 claims abstract description 83
- 125000004435 hydrogen atom Chemical group [H]* 0.000 claims abstract description 55
- 125000004429 atom Chemical group 0.000 claims abstract description 27
- 125000001997 phenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(*)C([H])=C1[H] 0.000 claims abstract description 23
- 125000006239 protecting group Chemical group 0.000 claims abstract description 20
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims abstract description 18
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims abstract description 18
- ABLZXFCXXLZCGV-UHFFFAOYSA-N phosphonic acid group Chemical group P(O)(O)=O ABLZXFCXXLZCGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 14
- RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N thymine Chemical compound CC1=CNC(=O)NC1=O RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 14
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 claims abstract description 12
- 125000001495 ethyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 claims abstract description 12
- 125000001797 benzyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C([H])([H])* 0.000 claims abstract description 11
- 125000002496 methyl group Chemical group [H]C([H])([H])* 0.000 claims abstract description 11
- 229940113082 thymine Drugs 0.000 claims abstract description 7
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 claims abstract description 6
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 claims abstract description 4
- 125000000999 tert-butyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(*)(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 claims abstract description 4
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 claims description 39
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 claims description 37
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 claims description 36
- KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N L-lysine Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N 0.000 claims description 30
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 28
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 claims description 27
- 229960003646 lysine Drugs 0.000 claims description 27
- 235000018977 lysine Nutrition 0.000 claims description 26
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 claims description 24
- AHLPHDHHMVZTML-BYPYZUCNSA-N L-Ornithine Chemical compound NCCC[C@H](N)C(O)=O AHLPHDHHMVZTML-BYPYZUCNSA-N 0.000 claims description 24
- ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P L-argininium(2+) Chemical compound NC(=[NH2+])NCCC[C@H]([NH3+])C(O)=O ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P 0.000 claims description 24
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 24
- 235000009697 arginine Nutrition 0.000 claims description 24
- 229960003121 arginine Drugs 0.000 claims description 24
- AHLPHDHHMVZTML-UHFFFAOYSA-N Orn-delta-NH2 Natural products NCCCC(N)C(O)=O AHLPHDHHMVZTML-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 23
- 229960003104 ornithine Drugs 0.000 claims description 23
- UTJLXEIPEHZYQJ-UHFFFAOYSA-N Ornithine Natural products OC(=O)C(C)CCCN UTJLXEIPEHZYQJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 22
- HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N L-histidine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N 0.000 claims description 19
- 235000014304 histidine Nutrition 0.000 claims description 19
- 229960002885 histidine Drugs 0.000 claims description 19
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 19
- AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N L-threonine Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N 0.000 claims description 17
- QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N L-tryptophane Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N 0.000 claims description 17
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 claims description 17
- AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N Threonine Natural products CC(O)C(N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 17
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 claims description 17
- QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N Tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 17
- 229960002898 threonine Drugs 0.000 claims description 17
- 235000008521 threonine Nutrition 0.000 claims description 17
- 229960004799 tryptophan Drugs 0.000 claims description 17
- 229960004441 tyrosine Drugs 0.000 claims description 17
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 17
- 235000002374 tyrosine Nutrition 0.000 claims description 17
- MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N (2S)-2-Amino-3-hydroxypropansäure Chemical compound OC[C@H](N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N 0.000 claims description 16
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 16
- 229960001153 serine Drugs 0.000 claims description 16
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 claims description 13
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 claims description 13
- 235000006109 methionine Nutrition 0.000 claims description 13
- 229960004452 methionine Drugs 0.000 claims description 13
- DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N Asparagine Natural products OC(=O)C(N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 12
- WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N Glutamic acid Natural products OC(=O)C(N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 12
- XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N L-Cysteine Chemical compound SC[C@H](N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N 0.000 claims description 12
- ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N L-Proline Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N 0.000 claims description 12
- QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N L-alanine Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N 0.000 claims description 12
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 claims description 12
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N L-aspartic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 claims description 12
- WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N 0.000 claims description 12
- ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N L-glutamine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N 0.000 claims description 12
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 claims description 12
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 claims description 12
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N L-phenylalanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 claims description 12
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 12
- ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N Proline Natural products OC(=O)C1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 12
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 claims description 12
- 229960003767 alanine Drugs 0.000 claims description 12
- 235000009582 asparagine Nutrition 0.000 claims description 12
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 claims description 12
- 235000003704 aspartic acid Nutrition 0.000 claims description 12
- 229960005261 aspartic acid Drugs 0.000 claims description 12
- OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N beta-carboxyaspartic acid Natural products OC(=O)C(N)C(C(O)=O)C(O)=O OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 12
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 12
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 claims description 12
- 229960002433 cysteine Drugs 0.000 claims description 12
- 235000013922 glutamic acid Nutrition 0.000 claims description 12
- 229960002989 glutamic acid Drugs 0.000 claims description 12
- 239000004220 glutamic acid Substances 0.000 claims description 12
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 12
- 235000004554 glutamine Nutrition 0.000 claims description 12
- 229960002743 glutamine Drugs 0.000 claims description 12
- 235000014705 isoleucine Nutrition 0.000 claims description 12
- 229960000310 isoleucine Drugs 0.000 claims description 12
- AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N isoleucine Natural products CCC(C)C(N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 12
- 235000005772 leucine Nutrition 0.000 claims description 12
- 229960003136 leucine Drugs 0.000 claims description 12
- COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N phenylalanine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 12
- 229960005190 phenylalanine Drugs 0.000 claims description 12
- 235000008729 phenylalanine Nutrition 0.000 claims description 12
- 229960002429 proline Drugs 0.000 claims description 12
- 235000013930 proline Nutrition 0.000 claims description 12
- KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N L-valine Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N 0.000 claims description 11
- KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N Valine Natural products CC(C)C(N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 11
- 125000001918 phosphonic acid ester group Chemical group 0.000 claims description 11
- 229960004295 valine Drugs 0.000 claims description 11
- 239000004474 valine Substances 0.000 claims description 11
- 235000014393 valine Nutrition 0.000 claims description 11
- 125000001424 substituent group Chemical group 0.000 claims description 9
- 125000004172 4-methoxyphenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(OC([H])([H])[H])=C([H])C([H])=C1* 0.000 claims description 8
- 125000000113 cyclohexyl group Chemical group [H]C1([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])C1([H])[H] 0.000 claims description 7
- 150000001733 carboxylic acid esters Chemical class 0.000 claims description 5
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 claims description 5
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 claims description 4
- 125000005426 adeninyl group Chemical group N1=C(N=C2N=CNC2=C1N)* 0.000 claims description 4
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 claims description 4
- GNVMUORYQLCPJZ-UHFFFAOYSA-N carbamothioic s-acid Chemical group NC(S)=O GNVMUORYQLCPJZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 125000005931 tert-butyloxycarbonyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(OC(*)=O)(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 claims description 3
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 claims description 2
- 229910052751 metal Inorganic materials 0.000 claims description 2
- 239000002184 metal Substances 0.000 claims description 2
- 150000003008 phosphonic acid esters Chemical class 0.000 claims description 2
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract description 32
- 125000004185 ester group Chemical group 0.000 abstract description 5
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract description 5
- 229930024421 Adenine Natural products 0.000 abstract description 2
- GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N Adenine Chemical compound NC1=NC=NC2=C1N=CN2 GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 abstract description 2
- 229960000643 adenine Drugs 0.000 abstract description 2
- 229940039227 diagnostic agent Drugs 0.000 abstract description 2
- 239000000032 diagnostic agent Substances 0.000 abstract description 2
- 150000001735 carboxylic acids Chemical class 0.000 abstract 1
- YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N Dichloromethane Chemical compound ClCCl YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 47
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 45
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 36
- 125000003545 alkoxy group Chemical group 0.000 description 33
- 125000004432 carbon atom Chemical group C* 0.000 description 30
- 125000000753 cycloalkyl group Chemical group 0.000 description 26
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 25
- 125000000217 alkyl group Chemical group 0.000 description 24
- 125000003342 alkenyl group Chemical group 0.000 description 23
- 125000005119 alkyl cycloalkyl group Chemical group 0.000 description 23
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 23
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 23
- 101710187830 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B Proteins 0.000 description 22
- 125000000304 alkynyl group Chemical group 0.000 description 22
- 125000003710 aryl alkyl group Chemical group 0.000 description 22
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 22
- 125000005133 alkynyloxy group Chemical group 0.000 description 21
- 125000003118 aryl group Chemical group 0.000 description 21
- 125000000000 cycloalkoxy group Chemical group 0.000 description 21
- RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N ether Substances CCOCC RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 21
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 20
- 102100033733 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B Human genes 0.000 description 19
- 125000000392 cycloalkenyl group Chemical group 0.000 description 19
- 238000005160 1H NMR spectroscopy Methods 0.000 description 17
- XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N Ethyl acetate Chemical compound CCOC(C)=O XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 17
- 238000005481 NMR spectroscopy Methods 0.000 description 17
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 17
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 17
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 15
- 125000003302 alkenyloxy group Chemical group 0.000 description 15
- 239000003921 oil Substances 0.000 description 15
- 235000019198 oils Nutrition 0.000 description 15
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 14
- 210000003734 kidney Anatomy 0.000 description 14
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 14
- 239000000047 product Substances 0.000 description 14
- JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N Pyridine Chemical compound C1=CC=NC=C1 JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 12
- 101000648184 Homo sapiens Spermatid nuclear transition protein 1 Proteins 0.000 description 11
- 102000001708 Protein Isoforms Human genes 0.000 description 11
- 108010029485 Protein Isoforms Proteins 0.000 description 11
- 102100028899 Spermatid nuclear transition protein 1 Human genes 0.000 description 11
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 10
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 10
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 9
- 210000004072 lung Anatomy 0.000 description 9
- 238000000034 method Methods 0.000 description 9
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 9
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 9
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 9
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 9
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- CSNNHWWHGAXBCP-UHFFFAOYSA-L Magnesium sulfate Chemical compound [Mg+2].[O-][S+2]([O-])([O-])[O-] CSNNHWWHGAXBCP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 8
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N Silicium dioxide Chemical compound O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 8
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 8
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 8
- 108020004635 Complementary DNA Proteins 0.000 description 7
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 7
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 7
- 239000002158 endotoxin Substances 0.000 description 7
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 7
- 210000003205 muscle Anatomy 0.000 description 7
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 7
- 210000000952 spleen Anatomy 0.000 description 7
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 7
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 7
- CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N Acetone Chemical compound CC(C)=O CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 102000004506 Blood Proteins Human genes 0.000 description 6
- 108010017384 Blood Proteins Proteins 0.000 description 6
- ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N Triethylamine Chemical compound CCN(CC)CC ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 125000000609 carbazolyl group Chemical group C1(=CC=CC=2C3=CC=CC=C3NC12)* 0.000 description 6
- HVYWMOMLDIMFJA-DPAQBDIFSA-N cholesterol Chemical compound C1C=C2C[C@@H](O)CC[C@]2(C)[C@@H]2[C@@H]1[C@@H]1CC[C@H]([C@H](C)CCCC(C)C)[C@@]1(C)CC2 HVYWMOMLDIMFJA-DPAQBDIFSA-N 0.000 description 6
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N citric acid Chemical compound OC(=O)CC(O)(C(O)=O)CC(O)=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N cytosine Chemical compound NC=1C=CNC(=O)N=1 OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 235000019439 ethyl acetate Nutrition 0.000 description 6
- OVBPIULPVIDEAO-LBPRGKRZSA-N folic acid Chemical compound C=1N=C2NC(N)=NC(=O)C2=NC=1CNC1=CC=C(C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C=C1 OVBPIULPVIDEAO-LBPRGKRZSA-N 0.000 description 6
- UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N guanine Chemical compound O=C1NC(N)=NC2=C1N=CN2 UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 6
- VLKZOEOYAKHREP-UHFFFAOYSA-N n-Hexane Chemical compound CCCCCC VLKZOEOYAKHREP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 125000000561 purinyl group Chemical group N1=C(N=C2N=CNC2=C1)* 0.000 description 6
- 125000002098 pyridazinyl group Chemical group 0.000 description 6
- UMJSCPRVCHMLSP-UHFFFAOYSA-N pyridine Natural products COC1=CC=CN=C1 UMJSCPRVCHMLSP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 125000002943 quinolinyl group Chemical group N1=C(C=CC2=CC=CC=C12)* 0.000 description 6
- 150000003254 radicals Chemical class 0.000 description 6
- 239000000741 silica gel Substances 0.000 description 6
- 229910002027 silica gel Inorganic materials 0.000 description 6
- 229910052717 sulfur Inorganic materials 0.000 description 6
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 6
- SJRJJKPEHAURKC-UHFFFAOYSA-N N-Methylmorpholine Chemical compound CN1CCOCC1 SJRJJKPEHAURKC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 125000001584 benzyloxycarbonyl group Chemical group C(=O)(OCC1=CC=CC=C1)* 0.000 description 5
- 238000010804 cDNA synthesis Methods 0.000 description 5
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 5
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 5
- 230000006870 function Effects 0.000 description 5
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 5
- 210000001165 lymph node Anatomy 0.000 description 5
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 5
- 238000002844 melting Methods 0.000 description 5
- 230000008018 melting Effects 0.000 description 5
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 5
- 235000002639 sodium chloride Nutrition 0.000 description 5
- 125000003088 (fluoren-9-ylmethoxy)carbonyl group Chemical group 0.000 description 4
- 108010069091 Dystrophin Proteins 0.000 description 4
- 101001074035 Homo sapiens Zinc finger protein GLI2 Proteins 0.000 description 4
- 102000008100 Human Serum Albumin Human genes 0.000 description 4
- 108091006905 Human Serum Albumin Proteins 0.000 description 4
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N Hydrochloric acid Chemical compound Cl VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N Hydrogen Chemical compound [H][H] UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 101150014879 RpL13A gene Proteins 0.000 description 4
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N Uracil Chemical compound O=C1C=CNC(=O)N1 ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 102100035558 Zinc finger protein GLI2 Human genes 0.000 description 4
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 4
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 4
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 4
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 4
- 239000012043 crude product Substances 0.000 description 4
- 238000001212 derivatisation Methods 0.000 description 4
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 4
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 4
- 230000003828 downregulation Effects 0.000 description 4
- 239000000706 filtrate Substances 0.000 description 4
- 125000000623 heterocyclic group Chemical group 0.000 description 4
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 description 4
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 description 4
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 4
- 229910052943 magnesium sulfate Inorganic materials 0.000 description 4
- 235000019341 magnesium sulphate Nutrition 0.000 description 4
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 4
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 description 4
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 description 4
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 description 4
- DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N trifluoroacetic acid Substances OC(=O)C(F)(F)F DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- MGKPFALCNDRSQD-UHFFFAOYSA-N 2-(4-fluorophenyl)acetic acid Chemical group OC(=O)CC1=CC=C(F)C=C1 MGKPFALCNDRSQD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- UHOVQNZJYSORNB-UHFFFAOYSA-N Benzene Chemical compound C1=CC=CC=C1 UHOVQNZJYSORNB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 102000001039 Dystrophin Human genes 0.000 description 3
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 3
- 239000007821 HATU Substances 0.000 description 3
- 241000725303 Human immunodeficiency virus Species 0.000 description 3
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 3
- OVBPIULPVIDEAO-UHFFFAOYSA-N N-Pteroyl-L-glutaminsaeure Natural products C=1N=C2NC(N)=NC(=O)C2=NC=1CNC1=CC=C(C(=O)NC(CCC(O)=O)C(O)=O)C=C1 OVBPIULPVIDEAO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 3
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- YXFVVABEGXRONW-UHFFFAOYSA-N Toluene Chemical compound CC1=CC=CC=C1 YXFVVABEGXRONW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 3
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 3
- 125000000218 acetic acid group Chemical group C(C)(=O)* 0.000 description 3
- 239000013543 active substance Substances 0.000 description 3
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 3
- 150000001732 carboxylic acid derivatives Chemical class 0.000 description 3
- 239000003054 catalyst Substances 0.000 description 3
- 210000003855 cell nucleus Anatomy 0.000 description 3
- 235000012000 cholesterol Nutrition 0.000 description 3
- 238000001816 cooling Methods 0.000 description 3
- 125000002433 cyclopentenyl group Chemical group C1(=CCCC1)* 0.000 description 3
- 229940104302 cytosine Drugs 0.000 description 3
- 229960000304 folic acid Drugs 0.000 description 3
- 235000019152 folic acid Nutrition 0.000 description 3
- 239000011724 folic acid Substances 0.000 description 3
- BTCSSZJGUNDROE-UHFFFAOYSA-N gamma-aminobutyric acid Chemical compound NCCCC(O)=O BTCSSZJGUNDROE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229960002449 glycine Drugs 0.000 description 3
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 3
- 238000005984 hydrogenation reaction Methods 0.000 description 3
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 3
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 3
- 229940057995 liquid paraffin Drugs 0.000 description 3
- 230000014759 maintenance of location Effects 0.000 description 3
- 239000012074 organic phase Substances 0.000 description 3
- 239000001301 oxygen Substances 0.000 description 3
- 229920005862 polyol Polymers 0.000 description 3
- 150000003077 polyols Chemical class 0.000 description 3
- 150000003140 primary amides Chemical class 0.000 description 3
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 3
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 3
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 3
- 125000006413 ring segment Chemical group 0.000 description 3
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 3
- 229920006395 saturated elastomer Polymers 0.000 description 3
- CXWXQJXEFPUFDZ-UHFFFAOYSA-N tetralin Chemical compound C1=CC=C2CCCCC2=C1 CXWXQJXEFPUFDZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 235000015112 vegetable and seed oil Nutrition 0.000 description 3
- 239000008158 vegetable oil Substances 0.000 description 3
- 125000000008 (C1-C10) alkyl group Chemical group 0.000 description 2
- 125000006376 (C3-C10) cycloalkyl group Chemical group 0.000 description 2
- FZWGECJQACGGTI-UHFFFAOYSA-N 2-amino-7-methyl-1,7-dihydro-6H-purin-6-one Chemical compound NC1=NC(O)=C2N(C)C=NC2=N1 FZWGECJQACGGTI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000003903 2-propenyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])=C([H])[H] 0.000 description 2
- OIVLITBTBDPEFK-UHFFFAOYSA-N 5,6-dihydrouracil Chemical compound O=C1CCNC(=O)N1 OIVLITBTBDPEFK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- RYVNIFSIEDRLSJ-UHFFFAOYSA-N 5-(hydroxymethyl)cytosine Chemical compound NC=1NC(=O)N=CC=1CO RYVNIFSIEDRLSJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 7H-purine Chemical compound N1=CNC2=NC=NC2=C1 KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- LRFVTYWOQMYALW-UHFFFAOYSA-N 9H-xanthine Chemical compound O=C1NC(=O)NC2=C1NC=N2 LRFVTYWOQMYALW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- RZVAJINKPMORJF-UHFFFAOYSA-N Acetaminophen Chemical compound CC(=O)NC1=CC=C(O)C=C1 RZVAJINKPMORJF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- XKRFYHLGVUSROY-UHFFFAOYSA-N Argon Chemical compound [Ar] XKRFYHLGVUSROY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 208000023275 Autoimmune disease Diseases 0.000 description 2
- 125000006374 C2-C10 alkenyl group Chemical group 0.000 description 2
- 125000000041 C6-C10 aryl group Chemical group 0.000 description 2
- CURLTUGMZLYLDI-UHFFFAOYSA-N Carbon dioxide Chemical compound O=C=O CURLTUGMZLYLDI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108020004394 Complementary RNA Proteins 0.000 description 2
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ZRALSGWEFCBTJO-UHFFFAOYSA-N Guanidine Chemical compound NC(N)=N ZRALSGWEFCBTJO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000701806 Human papillomavirus Species 0.000 description 2
- DATAGRPVKZEWHA-YFKPBYRVSA-N N(5)-ethyl-L-glutamine Chemical compound CCNC(=O)CC[C@H]([NH3+])C([O-])=O DATAGRPVKZEWHA-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 2
- JGFZNNIVVJXRND-UHFFFAOYSA-N N,N-Diisopropylethylamine (DIPEA) Chemical compound CCN(C(C)C)C(C)C JGFZNNIVVJXRND-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- UFWIBTONFRDIAS-UHFFFAOYSA-N Naphthalene Chemical compound C1=CC=CC2=CC=CC=C21 UFWIBTONFRDIAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000011529 RT qPCR Methods 0.000 description 2
- UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M Sodium bicarbonate Chemical compound [Na+].OC([O-])=O UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- PPBRXRYQALVLMV-UHFFFAOYSA-N Styrene Chemical compound C=CC1=CC=CC=C1 PPBRXRYQALVLMV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108060008682 Tumor Necrosis Factor Proteins 0.000 description 2
- 102000000852 Tumor Necrosis Factor-alpha Human genes 0.000 description 2
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N acetic acid Substances CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000000654 additive Substances 0.000 description 2
- 150000003862 amino acid derivatives Chemical class 0.000 description 2
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 2
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 2
- QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N atomic oxygen Chemical compound [O] QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 2
- UCMIRNVEIXFBKS-UHFFFAOYSA-N beta-alanine Chemical compound NCCC(O)=O UCMIRNVEIXFBKS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 2
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 2
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 2
- 239000003184 complementary RNA Substances 0.000 description 2
- 229940125904 compound 1 Drugs 0.000 description 2
- 229940125782 compound 2 Drugs 0.000 description 2
- 229940126214 compound 3 Drugs 0.000 description 2
- 229940125898 compound 5 Drugs 0.000 description 2
- 125000003678 cyclohexadienyl group Chemical group C1(=CC=CCC1)* 0.000 description 2
- ZUOUZKKEUPVFJK-UHFFFAOYSA-N diphenyl Chemical compound C1=CC=CC=C1C1=CC=CC=C1 ZUOUZKKEUPVFJK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000008298 dragée Substances 0.000 description 2
- 238000009509 drug development Methods 0.000 description 2
- 239000000975 dye Substances 0.000 description 2
- 230000001819 effect on gene Effects 0.000 description 2
- 210000002472 endoplasmic reticulum Anatomy 0.000 description 2
- 239000003925 fat Substances 0.000 description 2
- 238000003818 flash chromatography Methods 0.000 description 2
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 description 2
- 229960003692 gamma aminobutyric acid Drugs 0.000 description 2
- 239000007789 gas Substances 0.000 description 2
- 150000002430 hydrocarbons Chemical group 0.000 description 2
- FDGQSTZJBFJUBT-UHFFFAOYSA-N hypoxanthine Chemical compound O=C1NC=NC2=C1NC=N2 FDGQSTZJBFJUBT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000010191 image analysis Methods 0.000 description 2
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 description 2
- PQNFLJBBNBOBRQ-UHFFFAOYSA-N indane Chemical compound C1=CC=C2CCCC2=C1 PQNFLJBBNBOBRQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 208000027866 inflammatory disease Diseases 0.000 description 2
- RLSSMJSEOOYNOY-UHFFFAOYSA-N m-cresol Chemical compound CC1=CC=CC(O)=C1 RLSSMJSEOOYNOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229940100630 metacresol Drugs 0.000 description 2
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 2
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 2
- 125000000896 monocarboxylic acid group Chemical group 0.000 description 2
- 125000000449 nitro group Chemical group [O-][N+](*)=O 0.000 description 2
- 238000010899 nucleation Methods 0.000 description 2
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 2
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 2
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 2
- 238000010647 peptide synthesis reaction Methods 0.000 description 2
- UYWQUFXKFGHYNT-UHFFFAOYSA-N phenylmethyl ester of formic acid Natural products O=COCC1=CC=CC=C1 UYWQUFXKFGHYNT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000006187 pill Substances 0.000 description 2
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 2
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 2
- 239000010948 rhodium Substances 0.000 description 2
- 239000003161 ribonuclease inhibitor Substances 0.000 description 2
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 2
- 239000007901 soft capsule Substances 0.000 description 2
- 239000012265 solid product Substances 0.000 description 2
- UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N streptomycin Chemical compound CN[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@](C=O)(O)[C@H](C)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@H]1O UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N 0.000 description 2
- 239000000829 suppository Substances 0.000 description 2
- 125000003718 tetrahydrofuranyl group Chemical group 0.000 description 2
- 229940035893 uracil Drugs 0.000 description 2
- 239000001993 wax Substances 0.000 description 2
- OGNSCSPNOLGXSM-UHFFFAOYSA-N (+/-)-DABA Natural products NCCC(N)C(O)=O OGNSCSPNOLGXSM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AJNZWRKTWQLAJK-KLHDSHLOSA-N (2r,5r)-1-[2-[(2r,5r)-2,5-dimethylphospholan-1-yl]phenyl]-2,5-dimethylphospholane Chemical compound C[C@@H]1CC[C@@H](C)P1C1=CC=CC=C1P1[C@H](C)CC[C@H]1C AJNZWRKTWQLAJK-KLHDSHLOSA-N 0.000 description 1
- MZOFCQQQCNRIBI-VMXHOPILSA-N (3s)-4-[[(2s)-1-[[(2s)-1-[[(1s)-1-carboxy-2-hydroxyethyl]amino]-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]amino]-5-(diaminomethylideneamino)-1-oxopentan-2-yl]amino]-3-[[2-[[(2s)-2,6-diaminohexanoyl]amino]acetyl]amino]-4-oxobutanoic acid Chemical group OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CCCCN MZOFCQQQCNRIBI-VMXHOPILSA-N 0.000 description 1
- ZNOREXRHKZXVPC-UHFFFAOYSA-N (4-fluorophenyl) acetate Chemical compound CC(=O)OC1=CC=C(F)C=C1 ZNOREXRHKZXVPC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DHKHKXVYLBGOIT-UHFFFAOYSA-N 1,1-Diethoxyethane Chemical compound CCOC(C)OCC DHKHKXVYLBGOIT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DHBXNPKRAUYBTH-UHFFFAOYSA-N 1,1-ethanedithiol Chemical compound CC(S)S DHBXNPKRAUYBTH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KEIFWROAQVVDBN-UHFFFAOYSA-N 1,2-dihydronaphthalene Chemical compound C1=CC=C2C=CCCC2=C1 KEIFWROAQVVDBN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RYHBNJHYFVUHQT-UHFFFAOYSA-N 1,4-Dioxane Chemical compound C1COCCO1 RYHBNJHYFVUHQT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YBYIRNPNPLQARY-UHFFFAOYSA-N 1H-indene Chemical compound C1=CC=C2CC=CC2=C1 YBYIRNPNPLQARY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PIINGYXNCHTJTF-UHFFFAOYSA-N 2-(2-azaniumylethylamino)acetate Chemical compound NCCNCC(O)=O PIINGYXNCHTJTF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- CXBXTKDUSUIBSH-UHFFFAOYSA-N 2-(6-amino-2-oxo-6-phenylmethoxycarbonyl-1h-pyrimidin-3-yl)acetic acid Chemical compound C=1C=CC=CC=1COC(=O)C1(N)NC(=O)N(CC(O)=O)C=C1 CXBXTKDUSUIBSH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FUOOLUPWFVMBKG-UHFFFAOYSA-N 2-Aminoisobutyric acid Chemical compound CC(C)(N)C(O)=O FUOOLUPWFVMBKG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000001494 2-propynyl group Chemical group [H]C#CC([H])([H])* 0.000 description 1
- ASBJGPTTYPEMLP-UHFFFAOYSA-N 3-chloroalanine Chemical compound ClCC(N)C(O)=O ASBJGPTTYPEMLP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DZQLQEYLEYWJIB-UHFFFAOYSA-N 4-aminobutanal Chemical compound NCCCC=O DZQLQEYLEYWJIB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000004217 4-methoxybenzyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(=C([H])C([H])=C1OC([H])([H])[H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 125000000339 4-pyridyl group Chemical group N1=C([H])C([H])=C([*])C([H])=C1[H] 0.000 description 1
- LDCYZAJDBXYCGN-VIFPVBQESA-N 5-hydroxy-L-tryptophan Chemical compound C1=C(O)C=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 LDCYZAJDBXYCGN-VIFPVBQESA-N 0.000 description 1
- 229940000681 5-hydroxytryptophan Drugs 0.000 description 1
- LRSASMSXMSNRBT-UHFFFAOYSA-N 5-methylcytosine Chemical compound CC1=CNC(=O)N=C1N LRSASMSXMSNRBT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010000871 Acute monocytic leukaemia Diseases 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N Alpha-Lactose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)O[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N 0.000 description 1
- USFZMSVCRYTOJT-UHFFFAOYSA-N Ammonium acetate Chemical compound N.CC(O)=O USFZMSVCRYTOJT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000005695 Ammonium acetate Substances 0.000 description 1
- 208000003174 Brain Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 125000000882 C2-C6 alkenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000003601 C2-C6 alkynyl group Chemical group 0.000 description 1
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000012422 Collagen Type I Human genes 0.000 description 1
- 108010022452 Collagen Type I Proteins 0.000 description 1
- 208000011231 Crohn disease Diseases 0.000 description 1
- DWAKXSZUASEUHH-RXMQYKEDSA-N Cucurbitine Chemical compound OC(=O)[C@@]1(N)CCNC1 DWAKXSZUASEUHH-RXMQYKEDSA-N 0.000 description 1
- FDKWRPBBCBCIGA-UWTATZPHSA-N D-Selenocysteine Natural products [Se]C[C@@H](N)C(O)=O FDKWRPBBCBCIGA-UWTATZPHSA-N 0.000 description 1
- PXXNTAGJWPJAGM-VCOUNFBDSA-N Decaline Chemical compound C=1([C@@H]2C3)C=C(OC)C(OC)=CC=1OC(C=C1)=CC=C1CCC(=O)O[C@H]3C[C@H]1N2CCCC1 PXXNTAGJWPJAGM-VCOUNFBDSA-N 0.000 description 1
- MYMOFIZGZYHOMD-UHFFFAOYSA-N Dioxygen Chemical compound O=O MYMOFIZGZYHOMD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010013801 Duchenne Muscular Dystrophy Diseases 0.000 description 1
- 206010014476 Elevated cholesterol Diseases 0.000 description 1
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 1
- 241000282326 Felis catus Species 0.000 description 1
- 108010010803 Gelatin Proteins 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 1
- 241000700721 Hepatitis B virus Species 0.000 description 1
- 101100425757 Homo sapiens TNFRSF1B gene Proteins 0.000 description 1
- 208000035150 Hypercholesterolemia Diseases 0.000 description 1
- UGQMRVRMYYASKQ-UHFFFAOYSA-N Hypoxanthine nucleoside Natural products OC1C(O)C(CO)OC1N1C(NC=NC2=O)=C2N=C1 UGQMRVRMYYASKQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100037850 Interferon gamma Human genes 0.000 description 1
- 108010074328 Interferon-gamma Proteins 0.000 description 1
- WTDRDQBEARUVNC-UHFFFAOYSA-N L-Dopa Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C(O)=C1 WTDRDQBEARUVNC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000019766 L-Lysine Nutrition 0.000 description 1
- FSBIGDSBMBYOPN-VKHMYHEASA-N L-canavanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCONC(N)=N FSBIGDSBMBYOPN-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- RHGKLRLOHDJJDR-BYPYZUCNSA-N L-citrulline Chemical compound NC(=O)NCCC[C@H]([NH3+])C([O-])=O RHGKLRLOHDJJDR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- DWPCPZJAHOETAG-IMJSIDKUSA-N L-lanthionine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CSC[C@H](N)C(O)=O DWPCPZJAHOETAG-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- ZFOMKMMPBOQKMC-KXUCPTDWSA-N L-pyrrolysine Chemical compound C[C@@H]1CC=N[C@H]1C(=O)NCCCC[C@H]([NH3+])C([O-])=O ZFOMKMMPBOQKMC-KXUCPTDWSA-N 0.000 description 1
- ZKZBPNGNEQAJSX-REOHCLBHSA-N L-selenocysteine Chemical compound [SeH]C[C@H](N)C(O)=O ZKZBPNGNEQAJSX-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N Lactose Natural products OC[C@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)C(O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N 0.000 description 1
- 240000006240 Linum usitatissimum Species 0.000 description 1
- 235000004431 Linum usitatissimum Nutrition 0.000 description 1
- 206010058467 Lung neoplasm malignant Diseases 0.000 description 1
- 241000551546 Minerva Species 0.000 description 1
- 208000035489 Monocytic Acute Leukemia Diseases 0.000 description 1
- 101100088246 Mus musculus Rpl13a gene Proteins 0.000 description 1
- 101100425758 Mus musculus Tnfrsf1b gene Proteins 0.000 description 1
- 241000204031 Mycoplasma Species 0.000 description 1
- MXNRLFUSFKVQSK-QMMMGPOBSA-O N(6),N(6),N(6)-trimethyl-L-lysine Chemical compound C[N+](C)(C)CCCC[C@H]([NH3+])C([O-])=O MXNRLFUSFKVQSK-QMMMGPOBSA-O 0.000 description 1
- GXCLVBGFBYZDAG-UHFFFAOYSA-N N-[2-(1H-indol-3-yl)ethyl]-N-methylprop-2-en-1-amine Chemical compound CN(CCC1=CNC2=C1C=CC=C2)CC=C GXCLVBGFBYZDAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- CHJJGSNFBQVOTG-UHFFFAOYSA-N N-methyl-guanidine Natural products CNC(N)=N CHJJGSNFBQVOTG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010057466 NF-kappa B Proteins 0.000 description 1
- 102000003945 NF-kappa B Human genes 0.000 description 1
- RHGKLRLOHDJJDR-UHFFFAOYSA-N Ndelta-carbamoyl-DL-ornithine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=O RHGKLRLOHDJJDR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000012902 Nervous system disease Diseases 0.000 description 1
- 208000025966 Neurological disease Diseases 0.000 description 1
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 1
- CTQNGGLPUBDAKN-UHFFFAOYSA-N O-Xylene Chemical compound CC1=CC=CC=C1C CTQNGGLPUBDAKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FSBIGDSBMBYOPN-UHFFFAOYSA-N O-guanidino-DL-homoserine Natural products OC(=O)C(N)CCON=C(N)N FSBIGDSBMBYOPN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000008589 Obesity Diseases 0.000 description 1
- 208000018737 Parkinson disease Diseases 0.000 description 1
- 229930182555 Penicillin Natural products 0.000 description 1
- JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N Penicillin G Chemical compound N([C@H]1[C@H]2SC([C@@H](N2C1=O)C(O)=O)(C)C)C(=O)CC1=CC=CC=C1 JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N 0.000 description 1
- 206010060862 Prostate cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000000236 Prostatic Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 201000004681 Psoriasis Diseases 0.000 description 1
- CZPWVGJYEJSRLH-UHFFFAOYSA-N Pyrimidine Chemical compound C1=CN=CN=C1 CZPWVGJYEJSRLH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000010802 RNA extraction kit Methods 0.000 description 1
- 239000012980 RPMI-1640 medium Substances 0.000 description 1
- 241000700159 Rattus Species 0.000 description 1
- 102000007562 Serum Albumin Human genes 0.000 description 1
- 108010071390 Serum Albumin Proteins 0.000 description 1
- 208000000453 Skin Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- CDBYLPFSWZWCQE-UHFFFAOYSA-L Sodium Carbonate Chemical class [Na+].[Na+].[O-]C([O-])=O CDBYLPFSWZWCQE-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M Sodium acetate Chemical compound [Na+].CC([O-])=O VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 229920002472 Starch Polymers 0.000 description 1
- 235000021355 Stearic acid Nutrition 0.000 description 1
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 1
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 1
- NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N Sulfur Chemical compound [S] NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GNVMUORYQLCPJZ-UHFFFAOYSA-M Thiocarbamate Chemical compound NC([S-])=O GNVMUORYQLCPJZ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 229910052770 Uranium Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 1
- 150000001242 acetic acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- IPBVNPXQWQGGJP-UHFFFAOYSA-N acetic acid phenyl ester Natural products CC(=O)OC1=CC=CC=C1 IPBVNPXQWQGGJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KXKVLQRXCPHEJC-UHFFFAOYSA-N acetic acid trimethyl ester Natural products COC(C)=O KXKVLQRXCPHEJC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000009471 action Effects 0.000 description 1
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 description 1
- 239000000443 aerosol Substances 0.000 description 1
- 150000001298 alcohols Chemical class 0.000 description 1
- 125000002877 alkyl aryl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000746 allylic group Chemical group 0.000 description 1
- 150000001370 alpha-amino acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 235000008206 alpha-amino acids Nutrition 0.000 description 1
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 description 1
- 229940043376 ammonium acetate Drugs 0.000 description 1
- 235000019257 ammonium acetate Nutrition 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- 150000008064 anhydrides Chemical class 0.000 description 1
- 239000003963 antioxidant agent Substances 0.000 description 1
- 229910052786 argon Inorganic materials 0.000 description 1
- 125000005018 aryl alkenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004350 aryl cycloalkyl group Chemical group 0.000 description 1
- 208000006673 asthma Diseases 0.000 description 1
- 125000003785 benzimidazolyl group Chemical group N1=C(NC2=C1C=CC=C2)* 0.000 description 1
- HSDAJNMJOMSNEV-UHFFFAOYSA-N benzyl chloroformate Chemical compound ClC(=O)OCC1=CC=CC=C1 HSDAJNMJOMSNEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DOABLAGDAOTKAF-UHFFFAOYSA-N benzyl n-(2-oxo-1h-pyrimidin-6-yl)carbamate Chemical compound C=1C=CC=CC=1COC(=O)NC1=CC=NC(=O)N1 DOABLAGDAOTKAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 1
- 229940000635 beta-alanine Drugs 0.000 description 1
- 150000001576 beta-amino acids Chemical class 0.000 description 1
- 239000004305 biphenyl Substances 0.000 description 1
- 235000010290 biphenyl Nutrition 0.000 description 1
- UCYRAEIHXSVXPV-UHFFFAOYSA-K bis(trifluoromethylsulfonyloxy)indiganyl trifluoromethanesulfonate Chemical compound [In+3].[O-]S(=O)(=O)C(F)(F)F.[O-]S(=O)(=O)C(F)(F)F.[O-]S(=O)(=O)C(F)(F)F UCYRAEIHXSVXPV-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 1
- 238000006664 bond formation reaction Methods 0.000 description 1
- 210000001185 bone marrow Anatomy 0.000 description 1
- 210000004556 brain Anatomy 0.000 description 1
- 239000001569 carbon dioxide Substances 0.000 description 1
- 229910002092 carbon dioxide Inorganic materials 0.000 description 1
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 1
- 239000006143 cell culture medium Substances 0.000 description 1
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 1
- 230000004663 cell proliferation Effects 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- 210000001638 cerebellum Anatomy 0.000 description 1
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 1
- 125000000068 chlorophenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 150000001841 cholesterols Chemical class 0.000 description 1
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 1
- 235000013477 citrulline Nutrition 0.000 description 1
- 229960002173 citrulline Drugs 0.000 description 1
- 210000001072 colon Anatomy 0.000 description 1
- 230000000052 comparative effect Effects 0.000 description 1
- 229940125773 compound 10 Drugs 0.000 description 1
- 230000001143 conditioned effect Effects 0.000 description 1
- DWAKXSZUASEUHH-UHFFFAOYSA-N cucurbitine Natural products OC(=O)C1(N)CCNC1 DWAKXSZUASEUHH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000004122 cyclic group Chemical group 0.000 description 1
- 150000001925 cycloalkenes Chemical class 0.000 description 1
- 125000001316 cycloalkyl alkyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000001995 cyclobutyl group Chemical group [H]C1([H])C([H])([H])C([H])(*)C1([H])[H] 0.000 description 1
- 125000001511 cyclopentyl group Chemical group [H]C1([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(*)C1([H])[H] 0.000 description 1
- 125000001559 cyclopropyl group Chemical group [H]C1([H])C([H])([H])C1([H])* 0.000 description 1
- 230000009089 cytolysis Effects 0.000 description 1
- 210000000805 cytoplasm Anatomy 0.000 description 1
- 210000000172 cytosol Anatomy 0.000 description 1
- 125000004855 decalinyl group Chemical group C1(CCCC2CCCCC12)* 0.000 description 1
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 1
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 1
- SWSQBOPZIKWTGO-UHFFFAOYSA-N dimethylaminoamidine Natural products CN(C)C(N)=N SWSQBOPZIKWTGO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MHUWZNTUIIFHAS-CLFAGFIQSA-N dioleoyl phosphatidic acid Chemical compound CCCCCCCC\C=C/CCCCCCCC(=O)OCC(COP(O)(O)=O)OC(=O)CCCCCCC\C=C/CCCCCCCC MHUWZNTUIIFHAS-CLFAGFIQSA-N 0.000 description 1
- 125000005982 diphenylmethyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C([H])(*)C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1[H] 0.000 description 1
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 1
- 238000001035 drying Methods 0.000 description 1
- 239000003480 eluent Substances 0.000 description 1
- 239000003995 emulsifying agent Substances 0.000 description 1
- 239000000839 emulsion Substances 0.000 description 1
- 210000001163 endosome Anatomy 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- 150000002148 esters Chemical class 0.000 description 1
- 125000001033 ether group Chemical group 0.000 description 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- 235000013861 fat-free Nutrition 0.000 description 1
- 239000000945 filler Substances 0.000 description 1
- 239000000796 flavoring agent Substances 0.000 description 1
- RMBPEFMHABBEKP-UHFFFAOYSA-N fluorene Chemical compound C1=CC=C2C3=C[CH]C=CC3=CC2=C1 RMBPEFMHABBEKP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000006260 foam Substances 0.000 description 1
- 150000002224 folic acids Chemical class 0.000 description 1
- 235000013355 food flavoring agent Nutrition 0.000 description 1
- 235000003599 food sweetener Nutrition 0.000 description 1
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 1
- 239000008273 gelatin Substances 0.000 description 1
- 229920000159 gelatin Polymers 0.000 description 1
- 239000007903 gelatin capsule Substances 0.000 description 1
- 235000019322 gelatine Nutrition 0.000 description 1
- 235000011852 gelatine desserts Nutrition 0.000 description 1
- 238000002523 gelfiltration Methods 0.000 description 1
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 1
- 108010010705 glutarylphenylalanine-4-nitroanilide Proteins 0.000 description 1
- 235000011187 glycerol Nutrition 0.000 description 1
- 239000008187 granular material Substances 0.000 description 1
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 1
- 239000007902 hard capsule Substances 0.000 description 1
- 210000002216 heart Anatomy 0.000 description 1
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 1
- 208000006454 hepatitis Diseases 0.000 description 1
- 231100000283 hepatitis Toxicity 0.000 description 1
- 230000003301 hydrolyzing effect Effects 0.000 description 1
- 210000002865 immune cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000005470 impregnation Methods 0.000 description 1
- 239000012535 impurity Substances 0.000 description 1
- QNXSIUBBGPHDDE-UHFFFAOYSA-N indan-1-one Chemical compound C1=CC=C2C(=O)CCC2=C1 QNXSIUBBGPHDDE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000003453 indazolyl group Chemical group N1N=C(C2=C1C=CC=C2)* 0.000 description 1
- 125000001041 indolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 230000028709 inflammatory response Effects 0.000 description 1
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 1
- 239000013067 intermediate product Substances 0.000 description 1
- 238000007912 intraperitoneal administration Methods 0.000 description 1
- 238000001990 intravenous administration Methods 0.000 description 1
- 125000000959 isobutyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])(C([H])([H])[H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 125000001449 isopropyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 125000002183 isoquinolinyl group Chemical group C1(=NC=CC2=CC=CC=C12)* 0.000 description 1
- 125000000842 isoxazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- ZLVXBBHTMQJRSX-VMGNSXQWSA-N jdtic Chemical compound C1([C@]2(C)CCN(C[C@@H]2C)C[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@@H]2NCC3=CC(O)=CC=C3C2)=CC=CC(O)=C1 ZLVXBBHTMQJRSX-VMGNSXQWSA-N 0.000 description 1
- 239000008101 lactose Substances 0.000 description 1
- 208000032839 leukemia Diseases 0.000 description 1
- 229960004502 levodopa Drugs 0.000 description 1
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 1
- 239000007791 liquid phase Substances 0.000 description 1
- 239000006193 liquid solution Substances 0.000 description 1
- 201000007270 liver cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000014018 liver neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 201000005202 lung cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000020816 lung neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 1
- 239000012139 lysis buffer Substances 0.000 description 1
- 230000013011 mating Effects 0.000 description 1
- 230000035800 maturation Effects 0.000 description 1
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 1
- AUHZEENZYGFFBQ-UHFFFAOYSA-N mesitylene Substances CC1=CC(C)=CC(C)=C1 AUHZEENZYGFFBQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000001827 mesitylenyl group Chemical group [H]C1=C(C(*)=C(C([H])=C1C([H])([H])[H])C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- DWPCPZJAHOETAG-UHFFFAOYSA-N meso-lanthionine Natural products OC(=O)C(N)CSCC(N)C(O)=O DWPCPZJAHOETAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000002503 metabolic effect Effects 0.000 description 1
- 125000006431 methyl cyclopropyl group Chemical group 0.000 description 1
- 235000013336 milk Nutrition 0.000 description 1
- 239000008267 milk Substances 0.000 description 1
- 210000004080 milk Anatomy 0.000 description 1
- 210000001616 monocyte Anatomy 0.000 description 1
- 125000002757 morpholinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 230000000877 morphologic effect Effects 0.000 description 1
- 201000006417 multiple sclerosis Diseases 0.000 description 1
- 125000004108 n-butyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- PKTSCJXWLVREKX-UHFFFAOYSA-N n-butyl-n-methylnitrous amide Chemical compound CCCCN(C)N=O PKTSCJXWLVREKX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000001280 n-hexyl group Chemical group C(CCCCC)* 0.000 description 1
- 125000000740 n-pentyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 208000018360 neuromuscular disease Diseases 0.000 description 1
- 238000006386 neutralization reaction Methods 0.000 description 1
- FEMOMIGRRWSMCU-UHFFFAOYSA-N ninhydrin Chemical compound C1=CC=C2C(=O)C(O)(O)C(=O)C2=C1 FEMOMIGRRWSMCU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000004433 nitrogen atom Chemical group N* 0.000 description 1
- 125000002868 norbornyl group Chemical group C12(CCC(CC1)C2)* 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 210000004940 nucleus Anatomy 0.000 description 1
- NIHNNTQXNPWCJQ-UHFFFAOYSA-N o-biphenylenemethane Natural products C1=CC=C2CC3=CC=CC=C3C2=C1 NIHNNTQXNPWCJQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000020824 obesity Nutrition 0.000 description 1
- QIQXTHQIDYTFRH-UHFFFAOYSA-N octadecanoic acid Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCC(O)=O QIQXTHQIDYTFRH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OQCDKBAXFALNLD-UHFFFAOYSA-N octadecanoic acid Natural products CCCCCCCC(C)CCCCCCCCC(O)=O OQCDKBAXFALNLD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000003204 osmotic effect Effects 0.000 description 1
- LDCYZAJDBXYCGN-UHFFFAOYSA-N oxitriptan Natural products C1=C(O)C=C2C(CC(N)C(O)=O)=CNC2=C1 LDCYZAJDBXYCGN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052763 palladium Inorganic materials 0.000 description 1
- 210000000496 pancreas Anatomy 0.000 description 1
- 229960005489 paracetamol Drugs 0.000 description 1
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 1
- 229940049954 penicillin Drugs 0.000 description 1
- 125000000538 pentafluorophenyl group Chemical group FC1=C(F)C(F)=C(*)C(F)=C1F 0.000 description 1
- 229940049953 phenylacetate Drugs 0.000 description 1
- WLJVXDMOQOGPHL-UHFFFAOYSA-N phenylacetic acid Chemical compound OC(=O)CC1=CC=CC=C1 WLJVXDMOQOGPHL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052698 phosphorus Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000004962 physiological condition Effects 0.000 description 1
- 125000004193 piperazinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000005936 piperidyl group Chemical group 0.000 description 1
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 1
- 238000002953 preparative HPLC Methods 0.000 description 1
- 238000004321 preservation Methods 0.000 description 1
- 230000002265 prevention Effects 0.000 description 1
- 125000001436 propyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 210000002307 prostate Anatomy 0.000 description 1
- 230000001681 protective effect Effects 0.000 description 1
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 1
- 125000000719 pyrrolidinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 230000035484 reaction time Effects 0.000 description 1
- 238000003753 real-time PCR Methods 0.000 description 1
- 238000010839 reverse transcription Methods 0.000 description 1
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 1
- 238000012552 review Methods 0.000 description 1
- 206010039073 rheumatoid arthritis Diseases 0.000 description 1
- 238000007127 saponification reaction Methods 0.000 description 1
- 239000012047 saturated solution Substances 0.000 description 1
- 235000016491 selenocysteine Nutrition 0.000 description 1
- 229940055619 selenocysteine Drugs 0.000 description 1
- ZKZBPNGNEQAJSX-UHFFFAOYSA-N selenocysteine Natural products [SeH]CC(N)C(O)=O ZKZBPNGNEQAJSX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 1
- 210000003491 skin Anatomy 0.000 description 1
- 201000000849 skin cancer Diseases 0.000 description 1
- 210000000813 small intestine Anatomy 0.000 description 1
- 239000001632 sodium acetate Substances 0.000 description 1
- 235000017281 sodium acetate Nutrition 0.000 description 1
- 235000017557 sodium bicarbonate Nutrition 0.000 description 1
- 229910000030 sodium bicarbonate Inorganic materials 0.000 description 1
- BEOOHQFXGBMRKU-UHFFFAOYSA-N sodium cyanoborohydride Chemical compound [Na+].[B-]C#N BEOOHQFXGBMRKU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SNOOUWRIMMFWNE-UHFFFAOYSA-M sodium;6-[(3,4,5-trimethoxybenzoyl)amino]hexanoate Chemical compound [Na+].COC1=CC(C(=O)NCCCCCC([O-])=O)=CC(OC)=C1OC SNOOUWRIMMFWNE-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- HPALAKNZSZLMCH-UHFFFAOYSA-M sodium;chloride;hydrate Chemical class O.[Na+].[Cl-] HPALAKNZSZLMCH-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 238000010532 solid phase synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 208000002320 spinal muscular atrophy Diseases 0.000 description 1
- 239000007921 spray Substances 0.000 description 1
- 230000006641 stabilisation Effects 0.000 description 1
- 238000011105 stabilization Methods 0.000 description 1
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 1
- 239000010935 stainless steel Substances 0.000 description 1
- 229910001220 stainless steel Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000008107 starch Substances 0.000 description 1
- 235000019698 starch Nutrition 0.000 description 1
- 239000008117 stearic acid Substances 0.000 description 1
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 description 1
- 210000002784 stomach Anatomy 0.000 description 1
- 229960005322 streptomycin Drugs 0.000 description 1
- 210000004895 subcellular structure Anatomy 0.000 description 1
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 1
- 239000011593 sulfur Substances 0.000 description 1
- 125000004434 sulfur atom Chemical group 0.000 description 1
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 1
- 239000003765 sweetening agent Substances 0.000 description 1
- 239000006188 syrup Substances 0.000 description 1
- 235000020357 syrup Nutrition 0.000 description 1
- 238000007910 systemic administration Methods 0.000 description 1
- 239000000454 talc Substances 0.000 description 1
- 229910052623 talc Inorganic materials 0.000 description 1
- ACNRTYKOPZDRCO-UHFFFAOYSA-N tert-butyl n-(2-oxoethyl)carbamate Chemical compound CC(C)(C)OC(=O)NCC=O ACNRTYKOPZDRCO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000001412 tetrahydropyranyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000003507 tetrahydrothiofenyl group Chemical group 0.000 description 1
- ABZLKHKQJHEPAX-UHFFFAOYSA-N tetramethylrhodamine Chemical compound C=12C=CC(N(C)C)=CC2=[O+]C2=CC(N(C)C)=CC=C2C=1C1=CC=CC=C1C([O-])=O ABZLKHKQJHEPAX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000003831 tetrazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 229940026510 theanine Drugs 0.000 description 1
- 125000000335 thiazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000001544 thienyl group Chemical group 0.000 description 1
- HNKJADCVZUBCPG-UHFFFAOYSA-N thioanisole Chemical compound CSC1=CC=CC=C1 HNKJADCVZUBCPG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000001541 thymus gland Anatomy 0.000 description 1
- 230000026683 transduction Effects 0.000 description 1
- 238000010361 transduction Methods 0.000 description 1
- 125000001425 triazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- ITMCEJHCFYSIIV-UHFFFAOYSA-N triflic acid Chemical compound OS(=O)(=O)C(F)(F)F ITMCEJHCFYSIIV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000004044 trifluoroacetyl group Chemical group FC(C(=O)*)(F)F 0.000 description 1
- 125000000026 trimethylsilyl group Chemical group [H]C([H])([H])[Si]([*])(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 210000003932 urinary bladder Anatomy 0.000 description 1
- 210000002700 urine Anatomy 0.000 description 1
- PXXNTAGJWPJAGM-UHFFFAOYSA-N vertaline Natural products C1C2C=3C=C(OC)C(OC)=CC=3OC(C=C3)=CC=C3CCC(=O)OC1CC1N2CCCC1 PXXNTAGJWPJAGM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000000391 vinyl group Chemical group [H]C([*])=C([H])[H] 0.000 description 1
- 238000012800 visualization Methods 0.000 description 1
- 230000003313 weakening effect Effects 0.000 description 1
- 238000005303 weighing Methods 0.000 description 1
- 229940075420 xanthine Drugs 0.000 description 1
- 239000008096 xylene Substances 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/001—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof by chemical synthesis
- C07K14/003—Peptide-nucleic acids (PNAs)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
- C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
- C12N15/1138—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing against receptors or cell surface proteins
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P1/00—Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
- A61P1/04—Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system for ulcers, gastritis or reflux esophagitis, e.g. antacids, inhibitors of acid secretion, mucosal protectants
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P11/00—Drugs for disorders of the respiratory system
- A61P11/06—Antiasthmatics
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P19/00—Drugs for skeletal disorders
- A61P19/02—Drugs for skeletal disorders for joint disorders, e.g. arthritis, arthrosis
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P21/00—Drugs for disorders of the muscular or neuromuscular system
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P25/00—Drugs for disorders of the nervous system
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P25/00—Drugs for disorders of the nervous system
- A61P25/14—Drugs for disorders of the nervous system for treating abnormal movements, e.g. chorea, dyskinesia
- A61P25/16—Anti-Parkinson drugs
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P29/00—Non-central analgesic, antipyretic or antiinflammatory agents, e.g. antirheumatic agents; Non-steroidal antiinflammatory drugs [NSAID]
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P3/00—Drugs for disorders of the metabolism
- A61P3/04—Anorexiants; Antiobesity agents
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P3/00—Drugs for disorders of the metabolism
- A61P3/06—Antihyperlipidemics
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/12—Antivirals
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/12—Antivirals
- A61P31/14—Antivirals for RNA viruses
- A61P31/18—Antivirals for RNA viruses for HIV
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
- A61P35/02—Antineoplastic agents specific for leukemia
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
- A61P37/02—Immunomodulators
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
- A61P37/02—Immunomodulators
- A61P37/06—Immunosuppressants, e.g. drugs for graft rejection
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
- C07D473/00—Heterocyclic compounds containing purine ring systems
- C07D473/02—Heterocyclic compounds containing purine ring systems with oxygen, sulphur, or nitrogen atoms directly attached in positions 2 and 6
- C07D473/18—Heterocyclic compounds containing purine ring systems with oxygen, sulphur, or nitrogen atoms directly attached in positions 2 and 6 one oxygen and one nitrogen atom, e.g. guanine
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
- C07D473/00—Heterocyclic compounds containing purine ring systems
- C07D473/26—Heterocyclic compounds containing purine ring systems with an oxygen, sulphur, or nitrogen atom directly attached in position 2 or 6, but not in both
- C07D473/32—Nitrogen atom
- C07D473/34—Nitrogen atom attached in position 6, e.g. adenine
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
- C07D475/00—Heterocyclic compounds containing pteridine ring systems
- C07D475/02—Heterocyclic compounds containing pteridine ring systems with an oxygen atom directly attached in position 4
- C07D475/04—Heterocyclic compounds containing pteridine ring systems with an oxygen atom directly attached in position 4 with a nitrogen atom directly attached in position 2
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
- C07D519/00—Heterocyclic compounds containing more than one system of two or more relevant hetero rings condensed among themselves or condensed with a common carbocyclic ring system not provided for in groups C07D453/00 or C07D455/00
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07F—ACYCLIC, CARBOCYCLIC OR HETEROCYCLIC COMPOUNDS CONTAINING ELEMENTS OTHER THAN CARBON, HYDROGEN, HALOGEN, OXYGEN, NITROGEN, SULFUR, SELENIUM OR TELLURIUM
- C07F9/00—Compounds containing elements of Groups 5 or 15 of the Periodic Table
- C07F9/02—Phosphorus compounds
- C07F9/28—Phosphorus compounds with one or more P—C bonds
- C07F9/38—Phosphonic acids [RP(=O)(OH)2]; Thiophosphonic acids ; [RP(=X1)(X2H)2(X1, X2 are each independently O, S or Se)]
- C07F9/40—Esters thereof
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07F—ACYCLIC, CARBOCYCLIC OR HETEROCYCLIC COMPOUNDS CONTAINING ELEMENTS OTHER THAN CARBON, HYDROGEN, HALOGEN, OXYGEN, NITROGEN, SULFUR, SELENIUM OR TELLURIUM
- C07F9/00—Compounds containing elements of Groups 5 or 15 of the Periodic Table
- C07F9/02—Phosphorus compounds
- C07F9/547—Heterocyclic compounds, e.g. containing phosphorus as a ring hetero atom
- C07F9/645—Heterocyclic compounds, e.g. containing phosphorus as a ring hetero atom having two nitrogen atoms as the only ring hetero atoms
- C07F9/6509—Six-membered rings
- C07F9/6512—Six-membered rings having the nitrogen atoms in positions 1 and 3
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
- C07H19/00—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
- C07H19/02—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
- C07H19/04—Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
- C07H19/06—Pyrimidine radicals
- C07H19/073—Pyrimidine radicals with 2-deoxyribosyl as the saccharide radical
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
- C07H21/00—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
- C12N15/111—General methods applicable to biologically active non-coding nucleic acids
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
- C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/30—Chemical structure
- C12N2310/31—Chemical structure of the backbone
- C12N2310/318—Chemical structure of the backbone where the PO2 is completely replaced, e.g. MMI or formacetal
- C12N2310/3181—Peptide nucleic acid, PNA
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2320/00—Applications; Uses
- C12N2320/30—Special therapeutic applications
- C12N2320/33—Alteration of splicing
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2320/00—Applications; Uses
- C12N2320/50—Methods for regulating/modulating their activity
- C12N2320/51—Methods for regulating/modulating their activity modulating the chemical stability, e.g. nuclease-resistance
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02P—CLIMATE CHANGE MITIGATION TECHNOLOGIES IN THE PRODUCTION OR PROCESSING OF GOODS
- Y02P20/00—Technologies relating to chemical industry
- Y02P20/50—Improvements relating to the production of bulk chemicals
- Y02P20/55—Design of synthesis routes, e.g. reducing the use of auxiliary or protecting groups
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Public Health (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Immunology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Neurology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Neurosurgery (AREA)
- Oncology (AREA)
- Virology (AREA)
- Obesity (AREA)
- Diabetes (AREA)
- Orthopedic Medicine & Surgery (AREA)
- Pulmonology (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
Abstract
Изобретение относится к соединению общей формулы (I):
в которой K представляет собой активную группу эфира карбоновой кислоты или -О-RM; где RM обозначает атом Н, метальную, этильную, бензильную или трет-бутильную группу; Pr представляет собой атом Н или аминозащитную группу; # обозначает асимметричный атом С; Е представляет собой аденинильную, цитозинильную, псевдо-изоцитозинильную, гуанинильную, тиминильную, урацилильную или фенильную группу, при необходимости замещенную защитной группой для нуклеотидного основания; R1 обозначает группу общей формулы (II):
в которой R2 обозначает группу эфира фосфоновой кислоты или группу фосфоновой кислоты; R3 обозначает аминозащитную группу; m обозначает 1, 2, 3 или 4; и h обозначает 0, 1, 2 или 3; при условии что сумма m и h в общей формуле (II) находится в пределах: 2≤х≤5. Также предложены соединение формулы (VI), такое как указано в формуле изобретения, и фармацевтическая композиция. Предложенные соединения формулы (I) представляют новые мономеры для получения олигомеров пептидных нуклеиновых кислот формулы (VI), которые могут применяться в качестве диагностического средства или в антисмысловой терапии. 3 н. и 7 з.п. ф-лы, 7 ил., 8 табл., 24 пр.
Description
Настоящее изобретение относится к новым мономерам пептидных нуклеиновых кислот и олигомерам пептидных нуклеиновых кислот, которые содержат диалкиламиновую боковую цепь, замещенную группой(ами) эфира фосфоновой кислоты или группой(ами) фосфоновой кислоты, их получению, а также к вариантам их применения.
Пептидные нуклеиновые кислоты (ПНК) представляют собой синтетические аналоги ДНК/РНК, имеющие N-(2-аминоэтил)глициновую основную структуру - см. общую формулу (ПНК). В общей формуле NB обозначает нуклеотидное основание; n обозначает число звеньев ПНК (n=0-50); и F и G представляют собой заместители.
ПНК получают путем создания пептидных связей между N-ацетил-N-(2-аминоэтил)глициновыми структурными элементами (мономерами ПНК). Каждый из таких индивидуальных N-ацетил-N-(2-аминоэтил)глициновых структурных элементов представляет собой звено ПНК.
Преимущества ПНК заключаются в том, что они являются устойчивыми в физиологических условиях к гидролитическому (ферментативному) расщеплению, а также распознают комплементарные нуклеотидные последовательности (ДНК или РНК) специфическим для последовательности образом и могут связываться с ними с высокой аффинностью. Поэтому ПНК рассматриваются в качестве привлекательных соединений для биотехнологических и/или медицинских применений, например, в качестве диагностических средств, или в антисмысловой терапии.
Для успешного применения в качестве действующего вещества в антисмысловой терапии важным фактором является достаточная биодоступность в живом организме. Антисмысловое действующее вещество должно присутствовать в достаточном для оказания терапевтического действия количестве в сайте-мишени, РНК- или ДНК-мишени. Это означает, что антисмысловое действующее вещество после его введения должно проникать в достаточном количестве сначала (I) в ткань, затем (II) в клетки ткани и, наконец, (III) в клетки клеточного компартмента к РНК- или ДНК-мишени, для того, чтобы оно могло вызвать антисмысловое действие терапевтически значимого уровня.
Однако ПНК имеют недостаток, заключающийся в том, что по сравнению с ДНК они слабо растворимы в воде и лишь с трудом могут проникать через клеточные мембраны. Поэтому применение ПНК в качестве действующего вещества в антисмысловой терапии для живых организмов сильно ограничено, что продемонстрировано, например, у Beth М. и др., Antisense & Nucleic Acid Drug Development, 12, 2002, cc. 65-70 на основе исследований поглощения или биодоступности ПНК в различных органах и тканях. В своих исследованиях Beth М. С соавторами установили, что после внутрибрюшинного ведения крысам 90% ПНК снова выводилось в течение 24 ч в неизмененном виде. Лишь 2,5-4,5% пептидных нуклеиновых кислот абсорбировались почками, а во всех других исследованных органах поглощение фактически составляло даже менее 1%.
Для улучшения определенных характеристик ПНК, таких как растворимость в воде, способности связываться с комплементарной ДНК или РНК или поглощение клетками, была предложена, среди прочего, модификация РНК путем введения группы R в альфа-положение звена ПНК согласно представленной ниже общей формуле (ПНК*):
Например, в качестве группы R для модификации ПНК были предложены боковые цепи встречающихся в естественных условиях аминокислот ( и др., Tetrahedron Letters 39, 1998, сс. 4707-4710; US 5719262). Хотя в результате модификации увеличивается стерическая помеха, связывание модифицированных таким путем ПНК с комплементарной ДНК/РНК снижается лишь незначительно, что установлено на основе измерений температуры плавления гибридов ПНК/ДНК ( и др., loc. cit.).
ПНК с модифицированной лизином основной структурой (R=-(CH2)4-NH2) характеризуются улучшенной растворимостью в воде и более высокой температурой плавления гибридов ПНК/ДНК (US 5719262). Однако, недостатком таких модифицированных лизином ПНК является то, что они после поглощения клетками остаются захваченными внутри клеток во внутриклеточных эндосомах (Nielsen P., Quarterly Reviews of Biophysics 38, 4, 2005, сс. 345-350; Koppelhus U. и др., Antisense & Nucleic Acid Drug Development, 12, 2002, cc. 51-63). В результате этого модифицированные таким путем ПНК не являются доступными в достаточной степени внутри клетки для связывания с РНК и поэтому не пригодны для терапевтического применения. Как было установлено R. Corradini и др., Current Topics in Medicinal Chemistry, 11 (12), 2011, cc. 1535-1554, такие модифицированные лизином ПНК, которые описаны, например, в US 5719262, совсем не поглощаются некоторыми клетками, и даже если они поглощаются клеткой, то они часто остаются захваченными в везикулах. В клетках исследованных типов не было выявлено поглощения ядрами клеток (loc. cit., с. 1543).
Для усиления поглощения ПНК клетками были предложены ПНК с модифицированной аргинином основной структурой, так называемые пептидные нуклеиновые кислоты на основе гуанидина (GПНК):
(Zhou Р. и др., J. AM. СНЕМ. SOC. 125, 2003, сс.6878-6879). После поглощения клетками GПНК локализуются внутри клетки в эндоплазматическом ретикулуме (ER) и тем самым могут быть пригодными для связывания с мРНК самой клетки. Однако, в живых организмах после системного введения GПНК поглощаются только почками, печенью и опухолевой тканью (Thomas S. М. и др., ACS Chem. Biol.; 8 (2), 15 февраля 2013 г., сс. 345-352). Такая ограниченная биодоступность препятствует более широкому применению GПНК в качестве терапевтических средств.
В ЕР 1157031, ЕР 2041161 и у Posch W. и др., Mol Med. 18, 2012, сс. 111-122 описаны модифицированные эфиром алкилфосфоновой кислоты ПНК с R=-(CH2)n-P=O(OEt)2, (n=1, 2). Модифицированные таким путем ПНК обладают лучшей способностью проникать в клетки и более высокой растворимостью в воде по сравнению с ПНК, которые не содержат указанную модификацию. Кроме того, было продемонстрировано, что модифицированные таким путем ПНК в случае ВИЧ обладают эффективностью в отношении двух поколений вируса. Кроме того, такие модифицированные группой эфира алкилфосфоновой кислоты ПНК обладают большей биодоступностью по сравнению с GПHК. Однако модифицированные группой эфира алкилфосфоновой кислоты ПНК имеют недостаток, заключающийся в том, что их растворимость в воде зависит от последовательности нуклеотидных оснований. Так, например, в случае последовательности, которая содержит увеличенное количество гуаниновых и цитозиновых оснований, растворимость в воде таких ПНК снижена. Такая зависимая от последовательности растворимость в воде может затруднять терапевтическое применение.
Для широкого применения ПНК в качестве терапевтического средства важна комбинация нескольких различных свойств: высокая и не зависящая от последовательности растворимость в воде; высокая способность к поглощению клеткой; высокие способности к связыванию с ДНК и/или РНК; высокая биодоступность (чем выше биодоступность в различных тканях, тем больше возможностей для терапевтического применения); продолжительные времена полужизни (для достижения связывания ПНК с ДНК и/или РНК также и в клетке живого организма и обеспечения требуемого эффекта модуляции генной экспрессии); высокая способность к связыванию с белками плазмы крови для поддержания биодоступности и удлинения времени полужизни (связанные с белками плазмы крови олигомеры не фильтруются из кровотока в почки и не выделяются с мочой слишком быстро); и выраженный эффект модуляции генной экспрессии, для чего также требуются высокая способность к поглощению клеткой и внутриклеточному распределению, а также высокие способности ПНК к связыванию с ДНК и/или РНК.
Недостаток известных модифицированных ПНК заключается в том, что они обладают лишь некоторыми, но не всеми из таких важных свойств, как (I) высокая и не зависящая от последовательности растворимость в воде, (II) высокая способность к поглощению клеткой и внутриклеточному распределению, (III) высокая биодоступность и продолжительные времена полужизни в максимально возможном количестве терапевтически релевантных типов ткани, (IV) высокая способность к связыванию с белками плазмы крови и/или (V) выраженный эффект модуляции генной экспрессии, которые необходимы для широкой применимости в качестве терапевтического средства.
В основу настоящего изобретения была положена задача создать новые модифицированные мономеры ПНК; и создать новые обладающие улучшенными профилями свойств модифицированные олигомеры ПНК, которые содержат в качестве структурных элементов новые мономеры ПНК. Улучшенный профиль свойств относится к комбинации следующих свойств (I) высокая и не зависящая от последовательности растворимость в воде, (II) высокая способность к поглощению клеткой и внутриклеточному распределению, (III) высокая биодоступность и продолжительные времена полужизни в максимально возможном количестве терапевтически релевантных типов ткани, (IV) высокая способность к связыванию с белками плазмы крови и (V) выраженный эффект модуляции генной экспрессии.
Другая задача изобретения заключалась в том, чтобы разработать новые способы применения указанных выше модифицированных олигомеров ПНК, а также диагностических и терапевтических композиций, содержащих указанные модифицированные олигомеры ПНК.
Этот и другие объекты настоящего изобретения должны стать более понятными после ознакомления с представленными ниже подробным описанием и определениями.
Изобретение относится к:
[1] соединению общей формулы (I):
в которой
К представляет собой активную группу эфира карбоновой кислоты или -О-RM; где RM представляет собой атом Н, метильную, этильную, аллильную, бензильную, трет-бутильную или триметильную группу;
Pr представляет собой атом Н или аминозащитную группу;
# обозначает асимметричный атом С;
Е обозначает атом Н, фенильную группу, гетероцикл, нуклеотидное основание или нуклеотидное основание, замещенное защитной группой для нуклеотидного основания;
R1 обозначает группу, представленную общей формулой (II):
в которой
R2 обозначает группу эфира фосфоновой кислоты или группу фосфоновой кислоты;
R3 обозначает атом Н или аминозащитную группу;
m представляет собой целое число от 1 до 5; и
h представляет собой целое число от 0 до 4;
при условии, что сумма m и h в общей формуле (II) находится в пределах: 2≤х≤5.
В результате связывания группы R1 с каркасом мономерного соединения общей формулы (I) в каркасе образуется асимметричный центр (#) в точке связывания R1 и каркаса. В каждом таком асимметричном центре в каркасе (#) может иметь место либо R-конфигурация, либо S-конфигурация. В данном случае конфигурацию в указанном асимметричном центре (#) определяют согласно правилам последовательности Кана-Ингольда-Прелога при дополнительном условии, что старшинство лигандов всегда определяют следующим образом: атом азота в асимметричном центре всегда имеет старшинство 1. Атом углерода в карбоксильной группе асимметричного центра всегда имеет старшинство 2. Атом углерода в группе R1 асимметричного центра всегда имеет старшинство 3. Атом водорода в асимметричном центре всегда имеет старшинство 4.
Понятие «активная группа эфира карбоновой кислоты» обозначает производные карбоновой кислоты, известные специалисту в данной области, которые, как правило, применяют в химии пептидов для повышения реакционной связывающей способности функции карбоновой кислоты. Такие активные группы эфира карбоновой кислоты описаны, например, в: О. Marder, F. Albericio, Chimica Oggi, 2002, с. 37; Peptide Chemistry, под ред. N. Sewald, H.-D. Jakubke, изд-во Wiley-VCH Verlag, Weinheim, 2002, глава 4.3 Peptide Bond Formation, c. 197. Примерами активных групп эфира карбоновой кислоты являются галогениды карбоновой кислоты, ацилфосфониевые соли, такие как карбоксилат трис(пирролидино)фосфония (полученный путем взаимодействия с PyBroP), ангидриды, сложные тиофениловые эфиры, сложные цианометиловые эфиры, сложные нитро- и динитрофениловые эфиры, сложные пентафторфениловые эфиры, сложные хлорфениловые эфиры, сложные трихлорфениловые эфиры, сложные пентахлорфениловые эфиры, а также активные сложные эфиры, перечисленные в представленной ниже таблице
Понятие «аминозащитная группа» обозначает известные специалисту в данной области защитные группы, которые применяют в органическом синтезе аминокислот или пептидов, например, защитную трифторацетильную, оксокарбаматную, тиокарбаматную, фторенилметоксикарбонильную (Fmoc) группу, карбобензоксигруппу (Cbz), монометокситритильную (Mmt), фталоильную, трет-бутоксикарбонильную (Boc), бензгидрилоксикарбонильную (Bhoc) или аллилоксикарбонильную группу (Alloc).
Понятие «нуклеотидные основания» обозначает известные специалисту в данной области основания, способные к спариванию с встречающимися в ДНК основаниями или с встречающимися в РНК основаниями. Примеры нуклеотидных оснований включают основания с пуриновой основной структурой, например, аденин, гуанин, гипоксантин, ксантин и 7-метилгуанин; или с пиримидиновой основной структурой, например, цитозин, урацил, тимин, 5-гидроксиметилцитозин, 5-метилцитозин и 5,6-дигидроурацил; а также их аналоги и биоизостеры.
Понятие «защитная группа для нуклеотидного основания» обозначает известные специалисту в данной области защитные группы, которые применяют в органическом синтезе соединений с нуклеотидными основаниями, например, ацетильную, изобутирильную, бензилоксикарбонильную, дифенилметильную, бензгидрилоксикарбонильную, анизоильную, 4-трет-бутилбензоильную, бензильную или дифенилкарбамоильную группу.
Понятие «алкил» относится к насыщенной линейной или разветвленной углеводородной группе, содержащей 1-40 атомов углерода, предпочтительно 1-20 атомов углерода, более предпочтительно 1-12 атомов углерода, и наиболее предпочтительно 1-6 атомов углерода; такой, например, как метальная, этильная, пропильная, изопропильная, н-бутильная, изобутильная, трет-бутильная, н-пентильная, н-гексильная, 2,2-диметилбутильная или н-октильная группа.
Понятия «алкенил» и «алкинил» относятся к по меньшей мере частично ненасыщенным линейным или разветвленным углеводородным группам, содержащим 2-40 атомов углерода, предпочтительно 2-20 атомов углерода, более предпочтительно 2-12 атомов углерода, и наиболее предпочтительно 2-6 атомов углерода, таким, например, как этенильная, аллильная, ацетиленильная, пропаргильная, изопренильная или гекс-2-енильная группа. Алкенильные группы предпочтительно имеют одну или две (наиболее предпочтительно одну) двойные связи или алкенильные группы имеют одну или две (наиболее предпочтительно одну) тройные связи.
Понятие «арил» или «Ar» относится к ароматической группе, которая имеет одно или несколько колец и содержит 6-14 кольцевых атомов углерода, предпочтительно 6-10 (прежде всего 6) кольцевых атомов углерода. Конкретными примерами являются бензол, нафталин или бифенил.
Понятие «аралкил» относится к группам, которые в соответствии с приведенными выше определениями содержат как арильные, так и алкильные, алкенильные, алкинильные и/или циклоалкильные группы, такие, например, как арилалкильная, арилалкенильная, арилалкинильная, арилциклоалкильная, арилциклоалкенильная, алкиларилциклоалкильная и алкиларилциклоалкенильная группы. Конкретными примерами аралкила являются толуол, ксилол, мезитилен, стирол, 1Н-инден, тетралин, дигидронафталин, инданон, фенилциклопентил, циклогексилфенил, флуорен и индан. Аралкильная группа предпочтительно содержит одну или две ароматические кольцевые системы (1 или 2 кольца) с 6-10 атомамии углерода и одну или две алкильные, алкенильные и/или алкинильные группы с 1 или 2-6 атомами углерода, и/или одну циклоалкильную группу с 5 или 6 кольцевыми атомами углерода.
Понятие «циклоалкил» относится к насыщенной или частично ненасыщенной (например, циклоалкенильной) циклической группе, которая имеет одно или несколько колец (предпочтительно 1 или 2) и содержит 3-14 кольцевых атомов углерода, предпочтительно 3-10 (в частности, 3, 4, 5, 6 или 7) кольцевых атомов углерода. Конкретными примерами циклоалкильных групп являются циклопропильная, циклобутильная, циклопентильная, спиро[4,5]деканильная, норборнильная, циклогексильная, циклопентенильная, циклогексадиенильная, декалинильная, бицикло[4.3.0]нонильная, тетралинильная, циклопентилциклогексильная или циклогекс-2-енильная группа.
Понятие «алкилциклоалкил» относится к группам, которые в соответствии с приведенными выше определениями содержат как циклоалкильные, так и алкильные, алкенильные или алкинильные группы, например, алкилциклоалкильные, циклоалкилалкильные, алкилциклоалкенильные, алкенилциклоалкильные и алкинилциклоалкильные группы. Алкилциклоалкильная группа предпочтительно содержит циклоалкильную группу, которая имеет одно или два кольца и 3-14 кольцевых атомов углерода, предпочтительно 3-10, прежде всего, 3, 4, 5, 6 или 7 кольцевых атомов углерода; и одну, две или три, предпочтительно 1 или 2 алькильную(ые), алкенильную(ые) или алкинильную(ые) группу(ы), каждая из которых содержит 1 или 2-6 атомов углерода; при этом предпочтительной является С4-C11алкилциклоалкильная группа, а наиболее предпочтительной является С4-С7алкилциклоалкильная группа. Конкретными примерами алкилциклоалкильных групп являются метилциклопропильная (С4), метилциклобутильная (С5), этилциклопропильная (С5), метилциклопентильная (С6), пропилциклопропильная (С6), этилциклопентильная (С7), метилциклогексильная (С7), этилциклопентенильная (С7) или этилциклогексадиенильная (С8) группа.
Понятия «алкоксигруппа», «алкенилоксигруппа», «алкинилоксигруппа», алкилоксиарильная группа» и «циклоалкоксигруппа» относятся к указанной выше алкильной, алкенильной, алкинильной, алкиларильной или циклоалкильной группе, которая содержит одну или несколько -О-групп. Примерами являются метоксигруппа, этоксигруппа, фуранильная, тетрагидрофуранильная, или 4-метоксибензильная группа.
Понятие «гетероцикл» относится к указанной выше циклоалкильной, арильной или аралкильной группе, в которой один или несколько, предпочтительно 1, 2 или 3 атома углерода замещены атомом кислорода, азота или серы. Примерами являются пиперидильная, пиперазинильная, морфолинильная, уротропинильная, пирролидинильная, тетрагидротиофенильная, тетрагидропиранильная, тетрагидрофурильная или 2-пиразолинильная группа. Понятие «гетероцикл» включает, например, также ароматическую группу, которая имеет одно или несколько колец и содержит 5-14 кольцевых атомов, предпочтительно 5-10, прежде всего 5 или 6 кольцевых атомов, из которых один или несколько, предпочтительно 1, 2, 3 или 4, представляют собой кольцевые атомы кислорода, азота или серы. Примерами являются 4-пиридильная, 2-имидазолильная, 3-фенилпирролильная, тиазолильная, оксазолильная, триазолильная, тетразолильная, изоксазолильная, индазолильная, индолильная, бензимидазолильная, пиридазинильная, хинолинильная, пуринильная, карбазолильная, акридинильная, пиримидильная, 2,3'-бифурильная, 3-пиразолильная и изохинолинильная группы.
Понятие «аминокислота» обозначает карбоновую кислоту, в которой один или несколько атомов водорода на атоме углерода замещены аминогруппой. Аминокислота может представлять собой, например, α-аминокислоту, такую как глицин, лейцин, изолейцин, валин, аланин, фенилаланин, тирозин, триптофан, аспарагиновая кислота, аспарагин, глутаминовая кислота, глутамин, цистеин, метионин, аргинин, лизин, пролин, серии, треонин, гистидин, селеноцистеин, пирролизин, тироксин, DOPA и L-орнитин, 5-гидрокситриптофан, лантионин, β-хлораланин, 2-метилаланин, цитруллин, канаванин, теанин, кукурбитин, β-аминокислоту, такую как β-аланин, или γ-аминокислоту, такую как γ-аминомасляная кислота (GABA).
Под объем изобретения подпадают также:
[2] Соединение, описанное в п. [1], в котором K представляет собой -O-RM и RM имеет указанное в п. [1] значение.
[3] Соединение, описанное в п. [1] или п. [2], в котором Rm представляет собой атом Н, метальную, этильную, аллильную или триметилсилильную группу.
[4] Соединение, описанное в п.п. [1]-[3], в котором Pr представляет собой аминозащитную группу.
[5] Соединение, описанное в п. [4], в котором аминозащитная группа выбрана из оксокарбаматной, тиокарбаматной защитной группы или защитной группы Mmt.
[6] Соединение, описанное в п. [4] или п. [5], в котором аминозащитная группа представляет собой защитную группу Fmoc, Boc, Cbz, Bhoc, Alloc или Mmt.
[7] Соединение, описанное в п.п. [4]-[6], в котором аминозащитная группа представляет собой защитную группу Воc или Fmoc.
[8] Соединение, описанное в п.п. [1]-[7], в котором Е представляет собой аденинильную, цитозинильную, псевдо-изоцитозинильную, гуанинильную, тиминильную, урацильную или фенильную группу, при необходимости замещенную защитной группой для нуклеотидного основания.
[9] Соединение, описанное в п. [8], в котором Е представляет собой группу, выбранную из:
где
X1-Х4 в каждом случае независимо представляют собой атом Н или защитную группу для нуклеотидного основания; и X5 в каждом случае независимо представляет собой атом Н или защитную группу Воc или Bhoc.
[10] Соединение, описанное в п. [9], в котором X1, X2 и X4 в каждом случае независимо представляют собой атом Н, ацетил (Ас), трет-бутилоксикарбонил (Воc), изобутирил (iBu-CO), бензилоксикарбонил (Cbz), (4-метоксифенил)дифенилметил (Mmt), бензгидрилоксикарбонил (Bhoc), анизоил (An) или 4-трет-бутилбензоил (tBuBz);
X5 в каждом случае независимо представляет собой атом Н или защитную группу Воc или Bhoc; и
X3 в каждом случае независимо представляет собой атом Н, бензил (Bn) или дифенилкарбамоил (Dpc).
[11] Соединение, описанное в п.п. [1]-[10], в котором Е представляет собой тиминильную, урацилильную, фенильную, N2-ацетилгуанинильную, N2-изобутирилгуанинильную, N2-бензилоксикарбонилгуанинильную, N2-(4-метоксифенил)дифенилметилгуанинильную, N2-бензгидрилоксикарбонилгуанинильную, N2-дибензгидрилоксикарбонилгуанинильную, N2-трет-бутилоксикарбонилгуанинильную, N2-ди-трет-бутилоксикарбонилгуанинильную, N6-бензилоксикарбониладенинильную, N6-(4-метоксифенил)дифенилметиладенинильную, N6-анизоиладенинильную, N6-бензгидрилоксикарбониладенинильную, N6-дибензгидрилоксикарбониладенинильную, N6-трет-бутилоксикарбониладенинильную, N6-ди-трет-бутилоксикарбониладенинильную, O6-бензгидрилгуанинильную, N2-ацетил-О6-дифенилкарбамоилгуанинильную, N2-изобутирил-O6-дифенилкарбамоилгуанинильную, N2-бензилоксикарбонил-O6-дифенилкарбамоилгуанинильную, N2-(4-Метоксифенил)дифенилметил-O6-дифенилкарбамоилгуанинильную, N2-бензгидрилоксикарбонил-О6-дифенилкарбамоилгуанинильную, N4-бензилоксикарбонилцитозинильную, N4-(4-метоксифенил)дифенилметилцитозинильную, N4-4-трет-бутилбензоилцитозинильную, N4-бензгидрилоксикарбонилцитозинильную, N4-дибензгидрилоксикарбонилцитозинильную, N4-трет-бутилоксикарбонилцитозинильную, N4-ди-трет-бутилоксикарбонилцитозинильную, N2-бензилоксикарбонил-псевдо-изоцитозинильную, N2-(4-метоксифенил)дифенилметил-псевдо-изоцитозинильную, N2-4-трет-бутилбензоил-псевдо-изоцитозинильную, N2-бензгидрилоксикарбонил-псевдо-изоцитозинильную, N2-дибензгидрилоксикарбонил-псевдо-изоцитозинильную, N2-трет-бутилоксикарбонил-псевдо-изоцитозинильную или N2-ди-трет-бутилоксикарбонил-псевдо-изоцитозинильную группу.
[12] Соединение, описанное в п.п. [1]-[11], в котором Е представляет собой тиминильную, урацильную, фенильную, N2-бензилоксикарбонилгуанинильную, N2-бензгидрилоксикарбонилгуанинильную, N2-трет-бутилоксикарбонилгуанинильную, N2-бензилоксикарбонил-O6-дифенилкарбамоилгуанинильную, N2-бензгидрилоксикарбонил-O6-дифенилкарбамоилгуанинильную, N6-бензилоксикарбониладенинильную, N6-бензгидрилоксикарбониладенинильную, N6-трет-бутилоксикарбониладенинильную, N6-ди-трет-бутилоксикарбониладенинильную, N4-бензилоксикарбонилцитозинильную, N4-бензгидрилоксикарбонилцитозинильную, N4-ди-трет-бутилоксикарбонилцитозинильную, N2-бензилоксикарбонил-псевдо-изоцитозинильную, N2-бензгидрилоксикарбонил-псевдо-изоцитозинильную или N2-трет-бутилоксикарбонил-псевдо-изоцитозинильную группу.
[13] Соединение, описанное в п.п. [1]-[12], в котором R2 представляет собой группу эфира фосфоновой кислоты формулы -P(=O)(OV)2 или -P(=O)(OV)(OH); и V каждый независимо представляет собой незамещенную С1-С7алкильную, С3-С7циклоалкильную, С4-С7алкилциклоалкильную, фенильную или бензильную группу.
[14] Соединение, описанное в п. [13], в котором каждый V независимо представляет собой метильную, этильную, циклогексильную или бензильную группу.
[15] Соединение, описанное в п. [14], в котором V в каждом случае представляет собой этильную группу.
[16] Соединение, описанное в п.п. [1]-[15], в котором R3 обозначает атом Н.
[17] Соединение, описанное в п.п. [1]-[15], в котором R3 представляет собой оксокарбаматную, тиокарбаматную защитную группу или защитную группу Mmt.
[18] Соединение, описанное в п. [17], в котором R3 представляет собой защитную группу Cbz, Alloc, Bhoc или Воc.
[19] Соединение, описанное в п.п. [1]-[18], в котором m обозначает 1, 2, 3 или 4.
[20] Соединение, описанное в п.п. [1]-[19], в котором h обозначает 0, 1, 2 или 3.
[21] Соединение, описанное в п.п. [1]-[20], в котором R1 представляет собой группу формулы -CH2-CH2-CH2-CH2-NH-CH2-CH2-P=O(OEt)2 или группу формулы -CH2-CH2-CH2-NH-CH2-CH2-P=O(OEt)2.
[22] Соединение, описанное в п.п. [1]-[15], [19] или [20], в котором R1 представляет собой группу формулы -CH2-CH2-CH2-CH2-NR3-СН2-СН2-P=O(OEt)2 или группу формулы -CH2-CH2-CH2-NR3-CH2-CH2-P=O(OEt)2; и R3 имеет значение, указанное в п. [17] или п. [18].
Предлагаемые в изобретении соединения общей формулы (I), которые описаны, например, выше в п.п. [1]-[22], можно применять для получения новых олигомерных соединений. В соответствии с этим изобретение относится также к:
[23] Соединению, содержащему по меньшей мере одно повторяющееся звено общей формулы (III):
в которой
каждый Y в каждом случае независимо представляет собой группу общей формулы (IV):
каждый Z в каждом случае независимо представляет собой группу общей формулы (V):
где
каждый Е в каждом случае независимо представляет собой атом Н, фенильную группу, гетероцикл или нуклеотидное основание;
# обозначает асимметричный атом С;
каждый R41 в каждом случае независимо представляет собой атом Н или боковую цепь аминокислоты аланина, аргинина, аспарагина, аспарагиновой кислоты, цистеина, глутамина, глутаминовой кислоты, гистидина, изолейцина, лейцина, лизина, метионина, орнитина, фенилаланина, пролина, серина, треонина, триптофана, тирозина или валина;
R11 каждый представляет собой группу -(CH2)m-NH-(CH2)h-CH2-R; в которой R12 в каждом случае представляет собой группу эфира фосфоновой кислоты или группу фосфоновой кислоты; m представляет собой целое число от 1 до 5; и h представляет собой целое число от 0 до 4; при условии, что сумма m и h находтся в пределах: 2≤х≤5;
d в каждом случае представляет собой целое число от 0 до 5;
f в каждом случае представляет собой целое число от 0 до 5;
g в каждом случае представляет собой целое число от 0 до 5;
j в каждом случае о представляет собой целое число от 0 до 5;
n представляет собой целое число от 1 до 10;
при условии, что сумма всех повторяющихся звеньев Yd, Zf, Yg и Zj в общей формуле (III) составляет ≤40 и по меньшей мере одна из переменных f или j обозначает целое число от 1 до 5.
Если повторяющееся звено, например, формулы (III), группа, например, Z или Y, или заместитель или переменная, например, Е, R11 или R41, встречается более одного раза в представленной в настоящем описании формуле, то каждое повторяющееся звено, каждую группу в повторяющемся звене и каждый заместитель или каждую переменную выбирают независимо друг от друга вне зависимости от того, указано это специально или нет. Например, в формуле (III) каждую группу Z и Y и каждую переменную Е, R11 или R41 соответственно выбирают независимо друг от друга. Иными словами, общая формула (III) включает по меньшей мере одно предлагаемое в изобретении мономерное звено Z, указанное выше или, например, определенное в п.п. [1]-[22], и в общей сложности максимум 40 звеньев Z или Z и Y.
Например, в общей формуле (III) каждую группу Y и Z и каждую переменную d, f, g и j выбирают независимо. Соответственно комбинация [Yd-Zf-Yg-Zj]n, в которой d, f, g и j=1; n=10, представляет собой, например, следующую комбинацию звеньев Y и Z: -[Y-Z-Y-Z-Y-Z-Y-Z-Y-Z-Y-Z-Y-Z-Y-Z-Y-Z-Y-Z-Y-Z-Y-Z-Y-Z-Y-Z-Y-Z-Y-Z-Y-Z-Y-Z-Y-Z-Y-Z]-, в которой суммарное количество всех звеньев Y и Z равна 40. Комбинация [Yd-Zf-Yg-Zj]n, в которой d=3, f=1, g=1 и j=3; n=3, представляет собой, например, следующую комбинацию звеньев Y и Z: -[Y-Y-Y-Z-Y-Z-Z-Z-Y-Y-Y-Z-Y-Z-Z-Z-Y-Y-Y-Z-Y-Z-Z-Z]-, в которой суммарное количество всех звеньев Y и Z равно 24.
Однако переменные d, f, g и j в соответствующих повторяющихся звеньях [Yd-Zf-Yg-Zj] могут отличаться друг от друга. Например, можно комбинировать следующие 4 повторяющихся звена [Yd-Zf-Yg-Zj]: (Y1-Z1-Y1-Z1), (Y1-Z1-Y0-Z0), (Y5-Z1-Y0-Z0), (Y1-Z1-Y1-Z1), т.е. n=4, с получением следующей комбинации групп Y и Z: -[Y-Z-Y-Z-Y-Z-Y-Y-Y-Y-Y-Z-Y-Z-Y-Z]-; суммарное количество всех групп Y и Z равно 16. Аналогичным образом можно комбинировать друг с другом, например, также следующие 3 (т.е. n=3) повторяющихся звена [Yd-Zf-Yg-Zj]: (Y5-Z1-Y1-Z1), (Y1-Z1-Y0-Z0) и (Y1-Z1-Y5-Z0) следующим образом: -[Y-Y-Y-Y-Y-Z-Y-Z-Y-Z-Y-Z-Y-Y-Y-Y-Y]-; суммарное количенство всех групп Y и Z равно 17. При этом каждую группу, содержащуюся в повторяющихся звеньях, или каждый заместитель или каждую переменную, которая встречается более одного раза в повторяющихся звеньях общей формулы (III), в каждом случае выбирают независимо из тех, которые указаны выше, вне зависимости от того, указано это специально или нет.
Кроме того, под объем изобретения подпадает:
[24] Соединение, представленное общей формулой (VI):
в которой
Е, Y, Z, d, f, g, j и n в каждом случае определяют независимо, как это указано в п. [23], при условии, что сумма всех повторяющихся звеньев Yd, Zf, Yg и Zj в общей формуле (VI) составляет ≤40 и по меньшей мере одна переменная f и j представляет собой целое число от 1 до 5;
R31 представляет собой атом Н; боковую цепь аминокислоты аланина, аргинина, аспарагина, аспарагиновой кислоты, цистеина, глутамина, глутаминовой кислоты, гистидина, изолейцина, лейцина, лизина, метионина, орнитина, фенилаланина, пролина, серина, треонина, триптофана, тирозина или валина; или группу -(CH2)m-NH-(CH2)h-CH2-R12; в которой R12 представляет собой группу эфира фосфоновой кислоты или группу фосфоновой кислоты; m представляет собой целое число от 1 до 5; и h представляет собой целое число от 0 до 4; при условии, что сумма m и h находится в пределах: 2≤х≤5;
R47 в каждом случае независимо представляет собой атом Н; боковую цепь аминокислоты аланина, аргинина, аспарагина, аспарагиновой кислоты, цистеина, глутамина, глутаминовой кислоты, гистидина, изолейцина, лейцина, лизина, метионина, орнитина, фенилаланина, пролина, серина, треонина, триптофана, тирозина или валина; группу формулы (IXb):
группу формулы (IХс):
группу формулы (IXd):
или группу формулы (IХе):
р в формулах (IXb), (IXc), (IXd) и (IXe) представляет собой число 3 или 4;
t представляет собой целое число от 0 до 10;
L представляет собой -NRDRE-NHNRDRE или -ORF; где RD, RE и RF в каждом случае независимо друг от друга представляют собой атом Н; или алкильную, алкенильную, алкинильную, арильную, аралкильную, циклоалкильную илициклоалкенильную группу, в каждом случае содержащую вплоть до 20 атомов С;
U представляет собой -NRARB; -N⊕RARBRC; -NRA(CO)RB; -NH(CO)NHRB; -NH(CO)ORB; группу формулы (VIIIa):
группу формулы (VIIIb):
группу формулы (VIIIc):
группу формулы (VIIId):
группу формулы (VIIIe):
q в формулах (VIIIb), (VIIIc), (VIIId) и (VIIIe) представляет собой число 3 или 4;
или группу общей формулы (VII):
где
В представляет собой атом Н, -NRHRI, -N⊕RHRIRJ, -NRH(CO)R1-NH(CO)NHRI, -NH(CO)ORI, фенильную группу или замещенную фенильную группу, замещенную 1-3 заместителями, выбранными из группы, которая состоит из ОН, F, Cl, Br, I и NO2;
каждый RA, RC, RH и RJ в каждом случае независимо друг от друга представляет собой атом Н, метильную группу или аминозащитную группу;
каждый RB и RI в каждом случае независимо друг от друга представляет собой атом Н; аминозащитную группу; алкильную, алкенильную, алкинильную, арильную, аралкильную, циклоалкильную, алкилциклоалкильную, циклоалкенильную группу, алкилоксигруппу, алкенилоксигруппу, алкинилоксигруппу, алкилоксиарильную группу или циклоалкилоксигруппу, в каждом случае содержащую вплоть до 40 атомов С; где в алкильной, алкенильной, алкинильной, арильной,аралкильной, циклоалкильной, алкилциклоалкильной, циклоалкенильной группе, алкилоксигруппе, алкенилоксигруппе, алкинилоксигруппе, алкилоксиарильной группе или циклоалкилоксигруппе один или несколько атом(ов) водорода в каждом случае независимо друг от друга может(ут) быть замещен(ы) группой эфира фосфоновой кислоты или группой фосфоновой кислоты, F, Cl, Br, I, -ОН, О-СН3, S-CH3, NO2, =O, NH2, -S(O2)NH-, -NHCH3, -N(CH3)2, С1-С6алкильной, C2-С6алкенильной, С2-С6алкинильной, С3-С10циклоалкильной, С6-С10арильной или С7-С12аралкильной группой;
R48 и каждый R46 в каждом случае независимо друг от друга представляют собой атом Н или боковую цепь аминокислоты аланина, аргинина, аспарагина, аспарагиновой кислоты, цистеина, глутамина, глутаминовой кислоты, гистидина, изолейцина, лейцина, лизина, метионина, орнитина, фенилаланина, пролина, серина, треонина, триптофана, тирозина или валина, или группу формулы (IXb), (IXc), (IXd) или (IXe); и
s обозначает целое число от 0 до 10.
[25] Соединение, описанное в п. [23] или п. [24], при условии, что сумма всех повторяющихся звеньев Yd, Zf, Yg и Zj в общей формуле (III) или (VI) составляет ≤30.
[26] Соединение, описанное в п.п. [23]-[25], при условии, что сумма всех повторяющихся звеньев Yd, Zf, Yg и Zj в общей формуле (III) или (VI) находится в пределах: 7≤х≤30.
[27] Соединение, описанное в п.п. [23]-[26], при условии, что отношение (сумма повторяющихся звеньев Zf и Zj):(сумма всех повторяющихся звеньев Yd, Zf, Yg и Zj) в общей формуле (III) или (VI) находится в пределах: 0,1≤х≤1,0.
[28] Соединение, описанное в п.п. [23]-[26], при условии, что отношение (сумма повторяющихся звеньев Zf и Zj):(сумма всех повторяющихся звеньев Yd, Zf, Yg и Zj) в общей формуле (III) или (VI) находится в пределах: 0,1≤х≤0,8.
[29] Соединение, описанное в п.п. [23]-[26], при условии, что отношение (сумма повторяющихся звеньев Zf и Zj):(сумма всех повторяющихся звеньев Yd, Zf, Yg и Zj) в общей формуле (III) или (VI) находится в пределах: 0,1≤х≤0,6.
[30] Соединение, описанное в п.п. [23]-[26], при условии, что отношение (сумма повторяющихся звеньев Zf и Zj):(сумма всех повторяющихся звеньев Yd, Zf, Yg и Zj) в общей формуле (III) или (VI) находится в пределах: 0,1≤х≤0,5.
[31] Соединение, описанное в п.п. [23]-[26], при условии, что отношение (сумма повторяющихся звеньев Zf и Zj):(сумма всех повторяющихся звеньев Yj, Zf, Yg и Zj) в общей формуле (III) или (VI) находится в пределах: 0,1≤х≤0,4.
[32] Соединение, описанное в п.п. [23]-[31], в котором каждый Е в каждом случае независимо представляет собой аденинильную, цитозинильную, псевдо-изоцитозинильную, гуанинильную, тиминильную, урацилильную или фенильную группу.
[33] Соединение, описанное в п.п. [23]-[32], в котором каждый R41 в каждом случае независимо представляет собой атом Н или боковую цепь аминокислоты лизина, орнитина, аргинина, гистидина, триптофана, тирозина, треонина или серина.
[34] Соединение, описанное в п.п. [23]-[33], в котором каждый R41 в каждом случае независимо представляет собой атом Н или боковую цепь аминокислоты лизина, орнитина или аргинина.
[35] Соединение, описанное в п.п. [23]-[34], в котором каждый R41 в каждом случае независимо представляет собой атом Н.
[36] Соединение, описанное в п.п. [23]-[34], в котором каждый R12 в каждом случае независимо представляет собой группу эфира фосфоновой кислоты формулы -P(=O)(OV)2 или -P(=O)(OV)(OH); и каждый V в каждом случае независимо представляет собой незамещенную С1-С7алкильную, С3-С7циклоалкильную, С4-С7алкилциклоалкильную, фенильную или бензильную группу.
[37] Соединение, описанное в п. [36], в котором каждый V в каждом случае независимо представляет собой метильную, этильную, циклогексильную или бензильную группу.
[38] Соединение, описанное в п. [36] или п. [37], в котором V в каждом случае представляет собой этильную группу.
[39] Соединение, описанное в п.п. [23]-[38], в котором каждый m в каждом случае независимо обозначает 1, 2, 3 или 4.
[40] Соединение, описанное в п.п. [23]-[39], в котором каждый h в каждом случае независимо обозначает 0, 1, 2 или 3.
[41] Соединение, описанное в п.п. [23]-[40], в котором каждый R11 в каждом случае представляет собой группу формулы -CH2-CH2-CH2-CH2-NH-CH2-CH2-P=O(OEt)2 или группу формулы -CH2-CH2-CH2-NH-CH2-CH2-P=O(OEt)2.
[42] Соединение, описанное в п.п. [23]-[41], в котором каждый d в каждом случае независимо обозначает 0, 1, 2, 3 или 4.
[43] Соединение, описанное в п.п. [23]-[42], в котором каждый f в каждом случае независимо обозначает 0, 1, 2, 3 или 4.
[44] Соединение, описанное в п.п. [23]-[43], в котором каждый g в каждом случае независимо обозначает 0, 1, 2, 3 или 4.
[45] Соединение, описанное в п.п. [23]-[44], в котором каждый j в каждом случае независимо обозначает 0, 1, 2, 3 или 4.
[46] Соединение, описанное в п.п. [23]-[45], в котором n=0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8.
[47] Соединение, описанное в п.п. [24]-[46], в котором R31 представляет собой атом Н, боковую цепь аминокислоты лизина, орнитина, аргинина, гистидина, триптофана, тирозина, треонина или серина, группу формулы -СН2-CH2-CH2-CH2-NH-CH2-CH2-P=O(OEt)2 или группу формулы -CH2-CH2-CH2-NH-CH2-CH2-P=O(OEt)2.
[48] Соединение, описанное в п.п. [24]-[47], в котором R31 представляет собой группу формулы -CH2-CH2-CH2-CH2-NH-CH2-CH2-P=O(OEt)2 или группу формулы -CH2-CH2-CH2-NH-CH2-CH2-P=O(OEt)2.
[49] Соединение, описанное в п.п. [24]-[47], в котором R31 представляет собой атом Н или боковую цепь аминокислоты лизина, орнитина или аргинина.
[50] Соединение, описанное в п.п. [24]-[47] или [49], в котором R31 представляет собой атом Н.
[51] Соединение, описанное в п.п. [24]-[50], в котором R47 в каждом случае независимо представляет собой атом Н; боковую цепь аминокислоты лизина, орнитина, аргинина, гистидина, триптофана, тирозина, треонина или серина; или группу формулы (IXb), (IXc), (IXd) или (IXe).
[52] Соединение, описанное в п.п. [24]-[51], в котором R47 в каждом случае независимо представляет собой атом Н или боковую цепь аминокислоты лизина, орнитина или аргинина.
[53] Соединение, описанное в п. [52], в котором R47 в каждом случае представляет собой атом Н.
[54] Соединение, описанное в п. [52], в котором R47 в каждом случае независимо представляет собой боковую цепь аминокислоты лизина, орнитина или аргинина.
[55] Соединение, описанное в п.п. [24]-[54], в котором t=0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8.
[56] Соединение, описанное в п.п. [24]-[51], в котором R47 в каждом случае независимо представляет собой атом Н; или группу формулы (IXb), (IXc), (IXd) или (IXe); и t=1, 2, 3 или 4.
[57] Соединение, описанное в п. [56], в котором R47 в каждом случае независимо представляет собой группу формулы (IXb), (IXc), (IXd) или (IXe).
[58] Соединение, описанное в п.п. [24]-[57], в котором L представляет собой -ОН, -NH2, -NHNH2, -O(С1-С10)алкильную, -O(С2-С10)алкенильную, -O(С2-C10)алкинильную, -O(С3-С10)циклоалкильную, -O(С4-С11)алкилциклоалкильную, -O(С6-С10)арильную, -O(С7-С12)аралкильную, -NH-(С1-С10)алкильную, -NH(C2-C10)алкенильную, -NH(C2-C10)циклоалкенильную, -NH(С3-С10)циклоалкильную, -NH(С6-С10)арильную или -NH(C7-С12)аралкильную группу.
[59] Соединение, описанное в п.п. [24]-[58], в котором L представляет собой -ОН, -OEt, -NH2 или -NHNH2.
[60] Соединение, описанное в п.п. [24]-[59], в котором U представляет собой -NRARB; -NRA(CO)RB; -NH(CO)NHRB или -NH(CO)ORB; RA в каждом случае представляет собой атом Н или метильную группу; и RB имеет значение, указанное в п. [24].
[61] Соединение, описанное в п. [60], в котором RB в каждом случае представляет собой атом Н, алкильную, алкенильную, алкинильную, арильную, аралкильную, циклоалкильную, алкилциклоалкильную, циклоалкенильную группу, алкилоксигруппу, алкенилоксигруппу, алкинилоксигруппу, алкилоксиарильную группу или циклоалкилоксигруппу, в каждом случае содержащую вплоть до 30 атомов С; где в алкильной, алкенильной, алкинильной, арильной, аралкильной, циклоалкильной, алкилциклоалкильной, циклоалкенильной группе, алкилоксигруппе, алкенилоксигруппе, алкинилоксигруппе, алкилоксиарильной группе или циклоалкилоксигруппе один или несколько атом(ов) водорода в каждом случае независимо может(ут) быть замещены группой эфира фосфоновой кислоты или группу фосфоновой кислоты, F, Cl, Br, I, -ОН или NO2.
[62] Соединение, описанное в п. [60], в котором RB в каждом случае представляет собой атом Н, алкильную, алкенильную, алкинильную, арильную, аралкильную, циклоалкильную, алкилциклоалкильную, циклоалкенильную группу, алкилоксигруппу, алкенилоксигруппу, алкинилоксигруппу, алкилоксиарильную группу или циклоалкилоксигруппу, в каждом случае содержащую вплоть до 20 атомов С; где в алкильной, алкенильной, алкинильной,арильной,аралкильной, циклоалкильной, алкилциклоалкильной, циклоалкенильной группе, алкилоксигруппе, алкенилоксигруппе, алкинилоксигруппе, алкилоксиарильной группе или циклоалкилоксигруппе один или несколько атом(ов) водорода в каждом случае независимо друг от друга может(ут) быть замещены группой эфира фосфоновой кислоты или группой фосфоновой кислоты, F, Cl, Br, I, -ОН или NO2.
[63] Соединение, описанное в п. [60], в котором RB в каждом случае представляет собой атом Н, алкильную, алкенильную, алкинильную, арильную, аралкильную, циклоалкильную, алкилциклоалкильную, циклоалкенильную группу, алкилоксигруппу, алкенилоксигруппу, алкинилоксигруппу, алкилоксиарильную группу или циклоалкилоксигруппу, в каждом случае содержащую вплоть до 12 атомов С; где в алкильной, алкенильной, алкинильной, арильной,а ралкильной, циклоалкильной, алкилциклоалкильной, циклоалкенильной группе, алкилоксигруппе, алкенилоксигруппе, алкинилоксигруппе, алкилоксиарильной группе или циклоалкилоксигруппе один или несколько атом(ов) водорода в каждом случае независимо друг от друга может(ут) быть замещены группой эфира фосфоновой кислоты или группой фосфоновой кислоты, F, Cl, Br, I, -ОН или NO2.
[64] Соединение, описанное в п.п. [24]-[59], в котором U представляет собой группу общей формулы (VII); В обозначает -NRHRI, -NRH(CO)RI, -NH(CO)NHRI или -NH(CO)ORI; R48 обозначает атом Н; каждый R46 в каждом случае независимо друг от друга представляет собой атом Н или боковую цепь аминокислоты аланина, аргинина, аспарагина, аспарагиновой кислоты, цистеина, глутамина, глутаминовой кислоты, гистидина, изолейцина, лейцина, лизина, метионина, орнитина, фенилаланина, пролина, серина, треонина, триптофана, тирозина или валина; и RH и RI имеют значения, указанные в п. [24].
[65] Соединение, описанное в п.п. [24]-[59], в котором U представляет собой группу общей формулы (VII); В обозначает -NRHRI, -NRH(CO)RI, -NH(CO)NHRI или -NH(CO)ORI; R48 представляет собой группу формулы (IXb)-(IXe); каждый R46 в каждом случае независимо друг от друга представляет собой атом Н или боковую цепь аминокислоты аланина, аргинина, аспарагина, аспарагиновой кислоты, цистеина, глутамина, глутаминовой кислоты, гистидина, изолейцина, лейцина, лизина, метионина, орнитина, фенилаланина, пролина, серина, треонина, триптофана, тирозина или валина; и RH и RI имеют значения, указанные в п. [24].
[66] Соединение, описанное в п. [64] или п. [65], в котором RH представляет собой атом Н или метильную группу.
[67] Соединение, описанное в п.п. [64]-[66], в котором RI представляет собой атом Н, алкильную, алкенильную, алкинильную, арильную, аралкильную, циклоалкильную, алкилциклоалкильную, циклоалкенильную группу, алкилоксигруппу, алкенилоксигруппу, алкинилоксигруппу, алкилоксиарильную группу или циклоалкилоксигруппу, в каждом случае содержащую вплоть до 30 атомов С; где в алкильной, алкенильной, алкинильной, арильной, аралкильной, циклоалкильной, алкилциклоалкильной, циклоалкенильной группе, алкилоксигруппе, алкенилоксигруппе, алкинилоксигруппе, алкилоксиарильной группе или циклоалкилоксигруппе один или несколько атом(ов) водорода в каждом случае независимо друг от друга может(ут) быть замещены группой эфира фосфоновой кислоты или группой фосфоновой кислоты, F, Cl, Br, I, -ОН или NO2.
[68] Соединение, описанное в п.п. [64]-[66], в котором RI представляет собой атом Н, алкильную, алкенильную, алкинильную, арильную, аралкильную, циклоалкильную, алкилциклоалкильную, циклоалкенильную группу, алкилоксигруппу, алкенилоксигруппу, алкинилоксигруппу, алкилоксиарильную группу или циклоалкилоксигруппу, в каждом случае содержащую вплоть до 20 атомов С; где в алкильной, алкенильной, алкинильной, арильной, аралкильной, циклоалкильной, алкилциклоалкильной, циклоалкенильной группе, алкилоксигруппе, алкенилоксигруппе, алкинилоксигруппе, алкилоксиарильной группе или циклоалкилоксигруппе один или несколько атом(ов) водорода в каждом случае независимо друг от друга может(ут) быть замещены группой эфира фосфоновой кислоты или группой фосфоновой кислоты, F, Cl, Br, I, -ОН или NO2.
[69] Соединение, описанное в п.п. [64]-[66], в котором RI представляет собой атом Н, алкильную, алкенильную, алкинильную, арильную, аралкильную, циклоалкильную, алкилциклоалкильную, циклоалкенильную группу, алкилоксигруппу, алкенилоксигруппу, алкинилоксигруппу, алкилоксиарильную группу или циклоалкилоксигруппу, в каждом случае содержащую вплоть до 12 атомов С; где в алкильной, алкенильной, алкинильной, арильной, аралкильной, циклоалкильной, алкилциклоалкильной, циклоалкенильной группе, алкилоксигруппе, алкенилоксигруппе, алкинилоксигруппе, алкилоксиарильной группе или циклоалкилоксигруппе один или несколько атом(ов) водорода в каждом случае независимо друг от друга может(ут) быть замещены группой эфира фосфоновой кислоты или группой фосфоновой кислоты, F, Cl, Br, I, -ОН или NO2.
[70] Соединение, описанное в п.п. [24]-[59], в котором U представляет собой группу общей формулы (VII); В представляет собой атом Н, фенильную группу или замещенную фенильную группу, которая замещена 1-3 заместителями, выбранными из группы, состоящей из ОН, F, Cl, Br, I и NO2; R48 обозначает атом Н; и каждый R46 в каждом случае независимо друг от друга представляет собой атом Н или боковую цепь аминокислоты аланина, аргинина, аспарагина, аспарагиновой кислоты, цистеина, глутамина, глутаминовой кислоты, гистидина, изолейцина, лейцина, лизина, метионина, орнитина, фенилаланина, пролина, серина, треонина, триптофана, тирозина или валина.
[71] Соединение, описанное в п.п. [64]-[70], в котором каждый R46 в каждом случае независимо друг от друга представляет собой атом Н или боковую цепь аминокислоты аланина, аргинина, аспарагина, аспарагиновой кислоты, цистеина, глутамина, глутаминовой кислоты, гистидина, изолейцина, лейцина, лизина, метионина, орнитина, фенилаланина, пролина, серина, треонина, триптофана, тирозина или валина.
[72] Соединение, описанное в п.п. [64]-[70], в котором каждый R46 в каждом случае независимо друг от друга представляет собой атом Н или боковую цепь аминокислоты аргинина, гистидина, лизина, метионина, орнитина, серина, треонина, триптофана или тирозина.
[73] Соединение, описанное в п.п. [64]-[72], в котором s=0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8.
[74] Соединение, описанное в п.п. [24]-[59], в котором U представляет собой группу общей формулы (VII); В представляет собой атом Н, фенильную группу или замещенную фенильную группу, которая замещена 1-3 заместителями, выбранными из группы, которая состоит из ОН, F, Cl, Br, I и NO2; R48 представляет собой атом Н; каждый R46 в каждом случае независимо друг от друга представляет собой атом Н или группу формулы (IXb)-(IXe); и s=1, 2, 3 или 4.
[75] Соединение, описанное в п. [74], в котором R46 в каждом случае независимо представляет собой группу формулы (IXb), (IXc), (IXd) или (IXe).
[76] Соединение, описанное в п.п. [24]-[59], в котором U представляет собой группу формулы (VIIIa)-(VIIIe).
[77] Соединение, описанное в п.п. [24]-[46], в котором R31 представляет собой атом Н или группу -(CH2)m-NH-(CH2)h-CH2-R12, в которой R12 представляет собой группу эфира фосфоновой кислоты формулы -P(=O)(OV)2 или P(=O)(OV)(OH); V каждый независимо обозначает метальную, этильную, циклогексильную или бензильную группу; m обозначает 1, 2, 3 или 4; и h обозначает 0, 1, 2 или 3; при условии, что сумма m и h находится в пределах: 2≤х≤5;
[78] Соединение, описанное в п. [77], в котором R47 в каждом случае независимо обозначает атом Н или боковую цепь аминокислоты лизина, орнитина или аргинина;
t=0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8;
L представляет собой ОН, OEt, NH2 или -NHNH2;
U представляет собой группу общей формулы (VII):
в которой В представляет собой атом Н, фенильную группу или замещенную фенильную групп, которая замещена 1-3 заместителями, выбранными из группы, которая состоит из ОН, F, Cl, Br, I и NO2; R48 обозначает атом Н; и
(I) каждый R46 в каждом случае независимо друг от друга представляет собой атом Н или боковую цепь аминокислоты аланина, аргинина, аспарагина, аспарагиновой кислоты, цистеина, глутамина, глутаминовой кислоты, гистидина, изолейцина, лейцина, лизина, метионина, орнитина, фенилаланина, пролина, серина, треонина, триптофана, тирозина или валина; и s обозначает 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8; или
(II) каждый R46 в каждом случае независимо друг от друга представляет собой атом Н или группу формулы (IXb)-(IXe); и s=1, 2, 3 или 4.
[79] Соединение, описанное в п.п. [24], [25] и [27]-[78], при условии, что сумма всех повторяющихся звеньев Yd, Zf, Yg и Zj в общей формуле (VI) находится в пределах: 7≤х≤25.
[80] Соединение, описанное в п.п. [24], [25] и [27]-[78], при условии, что сумма всех повторяющихся звеньев Yd, Zf, Yg и Zj в общей формуле (III) или (VI) находится в пределах: 7≤х≤22.
[81] Соединение, описанное в п.п. [77]-[80], в котором каждый R11 в каждом случае представляет собой группу формулы -CH2-CH2-CH2-CH2-NH-CH2-CH2-P=O(OEt)2 или группу формулы -CH2-CH2-CH2-NH-CH2-CH2-P=O(OEt)2.
[82] Соединение, описанное в п.п. [77]-[81], в котором каждый R31 в каждом случае представляет собой атом Н или группу формулы -СН2-СН2-СН2-CH2-NH-CH2-CH2-P=O(OEt)2 или группу формулы -CH2-CH2-CH2-NH-CH2-CH2-P=O(OEt)2.
Соединения общей формулы (III) и (VI), описанные выше в п.п. [23]-[76] или [77]-[82], содержат по меньшей мере группу Z. Следовательно, описанные в п.п. [23]-[76] или [77]-[82] соединения общей формулы (III) и (IV), предлагаемые в изобретении, имеют в сайте связывания R11 с основной структурой по меньшей мере 1 асимметричный центр (#). Предпочтительно этот асимметричный центр (#) в сайте связывания R11 с основной структурой имеет R-конфигурацию.
Если в соединениях общей формулы (III) и (VI), которые описаны в п.п. [23]-[76] или [77]-[82], присутствуют два или большее количество указанных асимметричных центров (#), то по меньшей мере 50% асимметричных центров (#), предпочтительно 66%, 70%, 75% или 80%, более предпочтительно 85%, 90% или 95%, и наиболее предпочтительно 100% могут иметь R-конфигурацию.
В альтернативном варианте в соединениях общей формулы (III) и (VI) с двумя или большим количеством асимметричных центров (#), описанные, например, в п.п. [23]-[76] или [77]-[82], по меньшей мере 50%, предпочтительно 66%, 70%, 75% или 80%, более предпочтительно 85%, 90% или 95%, и наиболее предпочтительно 100% указанных асимметричных центров (#) имеют S-конфигурацию.
Под объем изобретения подпадает также фармацевтическая композиция, которая содержит по меньшей мере одно (или большее количество) предлагаемое(ых) в изобретении олигомерное(ых) соединение(й), и необязательно по меньшей мере один носитель при необходимости в комбинации с обычными фармакологически переносимыми вспомогательными веществами и/или наполнителями, и/или по меньшей мере одним адъювантом.
Объектом изобретения является также применение предлагаемого в изобретении олигомерного соединения в качестве медикамента или лекарственного средства. Как правило, предлагаемые в изобретении соединения вводят с помощью известных и пригодных методов либо индивидуально, либо в комбинации с любыми другими терапевтическими средствами. Введение можно осуществлять, например, одним из следующих путей: орально, например, в виде драже, таблеток с покрытием, пилюль, полутвердых форм, мягких или твердых капсул, растворов, эмульсий или суспензий; парентерально, например, в виде инъекционного раствора; ректально в виде суппозиториев; путем ингаляции, например, в виде порошкообразного препарата или спрея, чрескожно или интраназально. Для приготовления таких таблеток, пилюль, полутвердых форм, таблеток с покрытием, драже и твердых желатиновых капсул можно смешивать пригодный для терапевтического применения продукт с фармакологически инертными неорганическими или органическими носителями, например, с лактозой, сахарозой, глюкозой, желатином, солодом, силикагелем, крахмалом или его производными, тальком, стеариновой кислотой или ее солями, сухим обезжиренным молоком и т.п. Для приготовления мягких капсул можно применять, например, такие носители, как растительные масла, жидкий парафин, масла животного происхождения или синтетические масла, воск, жир, полиолы. Для приготовления жидких растворов и сиропов можно применять, например, такие носители, как вода, спирты, водный соляной раствор, водные декстрозы, полиолы, глицерин, растительные масла, жидкий парафин, масла животного происхождения или синтетические масла. Для суппозиториев можно применять, например, такие носители, как растительные масла, жидкий парафин, масла животного происхождения или синтетические масла, воск, жир и полиолы. Для аэрозольных препаратов можно применять сжатые газы, пригодные для рассматриваемой цели, такие, например, как кислород, азот, фторхлоруглеводороды, фторуглеводороды, хлоруглеводороды и диоксид углерода. Фармацевтически пригодные средства могут содержать также добавки для консервации, стабилизации, эмульгаторы, подслащивающие вещества, корригенты, соли для изменения осмотического давления, буферы, добавки для капсулирования и/или антиоксиданты.
Благодаря своей способности связываться с комплементарными нуклеотидными последовательностями, предлагаемое(ую) в изобретении олигомерное соединение или фармацевтическую композицию можно применять для предупреждения и/или лечения многочисленных различных заболеваний.
Примерами таких заболеваний, которые можно предупреждать с помощью предлагаемых в изобретении олигомерных соединений, или которые можно лечить с их применением, являются, например: заболевания, вызываемые вирусами, такими, например, как вирус иммунодефицита человека (ВИЧ), вирус гепатита В и вирус гепатита С, или вирус папилломы человека (HPV); различные виды рака, такие, например, как рак кожи, рак легкого, рак печени, рак предстательной железы, лейкоз или опухоли головного мозга; редко встречающиеся нервномышечные заболевания, такие, например, как мышечная дистрофия типа Дюшенна или спинальная мышечная атрофия; воспалительные заболевания, такие, например, как астма, ревматоидный артрит, или псориаз; аутоиммунные заболевания, такие, например, как болезнь Крона или рассеянный склероз; неврологические заболевания, такие, например, как болезнь Паркинсона; или метаболические состояния, такие, например, как повышенный уровень холестерина или ожирение.
Предлагаемые в изобретении олигомерные соединения, а именно, олигомерные соединения общей формулы (III) или (VI) (которые в настоящем описании обозначают также как N-phos-олигомеры), характеризуются по сравнению с известными из ЕР 2041161 олигомерными соединениями, содержащими группы эфира алкилфосфоновой кислоты (ниже обозначены как: ЕР 2041161-олигомеры), неожиданными и улучшенными свойствами, такими, например, как значительно более высокая биодоступность, а также более продолжительное время полужизни в различных терапевтически релевантных органах. Это было выявлено, например, путем сравнительного исследования распределения в ткани, в котором мышам вводили соответствующие олигомерные соединения и измеряли их уровни в различные моменты времени в 18 терапевтически релевантных органах (см. пример 14 и фиг. 1 и фиг. 2).
Кроме того, было установлено, что предлагаемые в изобретении N-phos-олигомеры по сравнению с ЕР 2041161-олигомерами обладают более высокой способностью к связыванию с белками плазмы крови (см. пример 15); что является преимуществом с точки зрения биодоступности и удлиняет время полужизни.
Кроме того, предлагаемые в изобретении N-phos-олигомеры по сравнению с ЕР 2041161-олигомерами обладают значительно более высокой не зависящей от последовательности растворимостью в воде (см. пример 16).
Помимо этого было установлено, что предлагаемые в изобретении N-phos-олигомеры обладают более высокой способностью к связыванию с ДНК (более высокая температура плавления, см. пример 17).
Предлагаемые в изобретении N-phos-олигомеры характеризуются также неожиданно значительно более сильным воздействием на модуляцию генной экспрессии по сравнению с ЕР 2041161-олигомерами. Более сильное воздействие на модуляцию генной экспрессии проявляется, например, в понижающей регуляции NFkB в клетках HeLa (см. пример 18), а также в модуляции сайта сплайсинга гена TNFR2 в клетках ТНР1 (см. пример 19).
Сравнение эффективности предлагаемого в изобретении N-phos-олигомера с ЕР 2041161 -олигомером и US 5719262-олигомером в отношении модуляции сайта сплайсинга мишени TNFR2 в клетках ТНР1 подтвердило, что предлагаемые в изобретении N-phos-олигомеры оказывают значительно большее действие на модуляцию генной экспрессии. US 5719262-олигомер оказался практически неэффективным, что согласуется с полученными R. Corradini с соавторами (Current Topics in Medicinal Chemistry, 11 (12), 2011, cc. 1535-1554) данными о том, что для US 5719262-олигомеров характерна выраженная тенденция к накоплению в клетках в везикулах и поэтому они не находятся в достаточном для оказания антисмыслового действия количестве в области-мишени, т.е. в мРНК в цитозоле или ядре (см. пример 21 и фиг. 3).
Выраженное воздействие N-phos-олигомеров на модуляцию генной экспрессии также и в живом организме продемонстрировано также на примере модуляции сайта сплайсинга гена TNFR2 в селезенке и в лимфатических узлах мышей (см. пример 20). Для различных предлагаемых в изобретении N-phos-олигомеров оказалось возможным выявить более сильное действие также и в легких (см. пример 22 и фиг. 4, а также пример 23 и фиг. 5), почках (см. пример 23 и фиг. 5, а также пример 24 и фиг. 6), печени (см. пример 23 и фиг. 5) и в мышцах (см. пример 25 и фиг. 7). Например, в почках мыши для предлагаемых в изобретении N-phos-олигомеров продемонстрировано более сильное вплоть до 12,6 раз воздействие на модуляцию сайта сплайсинга гена TNFR2 по сравнению с воздействием ЕР 2041161-олигомеров (см. пример 24 и фиг. 6). В мышцах мышей оказалось возможным выявить более сильное воздействие предлагаемых в изобретении N-phos-олигомеров на модуляцию генной экспрессии гена дистрофина (пропуск экзона 23) (см. пример 25 и фиг. 7).
Мишени NF-каппаВ и TNFR2 играют важную роль в пути трансдукции сигнала TNF-α в иммунных клетках. Важными органами иммунной системы являются селезенка и лимфатические узлы. Таким образом, предлагаемые в изобретении соединения (N-phos-олигомеры) пригодны для терапевтического применения при опосредуемых иммунной системой заболеваниях, таких, например, как воспалительные заболевания, аутоиммунные заболевания или рак.
Предлагаемые в изобретении мономеры общей формулы (I) можно получать с помощью реакций, известных специалисту в данной области. Например, предлагаемый в изобретении мономер общей формулы (I), в котором асимметричный центр (#) имеет R-конфигурацию и R3 представляет собой защитную группу Cbz, можно получать согласно следующей схеме синтеза (более подробное описание представлено в примерах 1-10):
Для получения предлагаемого в изобретении мономера общей формулы (I) (в настоящем описании обозначен также как N-phos-мономер) с S-конфигурацией в асимметричном центре (#) в процессе гидрирования вместо катализатора (R,R)-Me-DuPhos-Rh(I)(OD)2Otf применяют катализатор (S,S)-Me-DuPhos-Rh(I)(COD)2OTf.
Предлагаемые в изобретении олигомерные соединения общей формулы (III) или (VI), можно получать, например, с помощью описанных в литературе методов путем осуществления известным способом реакции с использованием предлагаемых в изобретении мономеров общей формулы (I), или при необходимости других мономеров ПНК или аминокислот (см., например, L. Christensen, R. Fitzpatrick, В. Gildea, K.Н. Petersen, H.F. Hansen, Т. Koch, M. Egholm, О. Buchardt, P.E. Nielsen, J. Coull, R.H. Berg, J. Pept. Sci. 3, 1995, cc. 175-183; T. Koch, H.F. Hansen, P. Andersen, T. Larsen, H.G. Batz, K. Otteson, J. Pept. Res. 49, 1997, cc. 80-88; F. Bergmann, W. Bannwarth, S. Tam, Tetrahedron Lett. 36, 1995, cc. 6823-6826). После завершения твердофазного синтеза защитные группы отщепляют, в результате чего получают предлагаемые в изобретении олигомерные соединения, например, соединения общей формулы (IV).
Описание чертежей
На чертежах показано:
на фиг. 1 - биодоступность меченного 3Н N-phos-олигомера, предлагаемого в изобретении, а также меченного 3Н ЕР 2041161-олигомера в различных тканях в течение 14-дневного периода времени. Как продемонстрировано на чертеже, биодоступность меченного 3Н N-phos-олигомера во всех тканях была выше биодоступности меченного 3Н ЕР 2041161-олигомера в течение 14-дневного периода времени в 1,7-4,6 раза;
на фиг. 2 - время полужизни меченного 3Н N-phos-олигомера, предлагаемого в изобретении, а также меченного 3Н ЕР 2041161-олигомера в течение 14-дневного периода времени. На фиг. 2 продемонстрировано, что время полужизни меченного 3Н N-phos-олигомера превышает время полужизни меченного 3Н ЕР 2041161-олигомера в течение 14-дневного периода времени в большинстве тканей, а в селезенке даже в 2 раза;
на фиг. 3 - сравнение эффективности предлагаемого в изобретении N-phos-олигомера, ЕР 2041161-олигомера и US 5719262-олигомера в отношении модуляции сайта сплайсинга мишени TNFR2 (пропуск экзона 7) в клетках ТНР1. На фиг. 3 продемонстрировано, что N-phos-олигомер оказывает в 2,6 раза более сильное воздействие на модуляцию сайта сплайсинга мишени TNFR2 в клетках ТНР1 по сравнению с ЕР 2041161-олигомером, в то время как модуляция мишени TNFR2 в клетках ТНР1 US 5719262-олигомером практически равна нулю;
на фиг. 4 - воздействие предлагаемых в изобретении N-phos-олигомеров с различными радикалами U на модуляцию сайта сплайсинга мишени TNFR2 (пропуск экзона 7) в легких мышей. На фиг. 4 продемонстрировано, что при применении предлагаемых в изобретении N-phos-олигомеров формулы (VI), содержащих радикал U общей формулы VII и группу формулы IXc (дериватизация холестерином) или IXd (дериватизация фолиевой кислотой) в качестве R46, повышает воздействие на генную экспрессию при модуляции сайта сплайсинга в 560 раз (дериватизация холестерином) или в 378 раз (дериватизация фолиевой кислотой) по сравнению с ЗФР, применяемым в качестве отрицательного контроля;
на фиг. 5 - воздействие предлагаемых в изобретении N-phos-олигомеров N-Phos 23-1, N-Phos 23-2, N-Phos 23-3 и N-Phos 23-4 на модуляцию сайта сплайсинга мишени TNFR2 (пропуск экзона 7) в почках, печени и легких мышей. Предлагаемые в изобретении N-Phos-олигомеры N-Phos 23-1, N-Phos 23-2, N-Phos 23-3 и N-Phos 23-4 различались нуклеотидной последовательностью, радикалом U, а также количеством и положением групп общей формулы (IV) и (V) в общей формуле (VI). На фиг. 5 продемонстрировано, что предлагаемые в изобретении N-Phos-олигомеры N-Phos 23-1, N-Phos 23-2, N-Phos 23-3 и N-Phos 23-4 в различных мышиных тканях (почки, печень и легкие) оказывают очень сильное воздействие на генную экспрессию изоформы мРНК без экзона 7. Например, в почках воздействие N-Phos 23-1 в 1983 раза превышало воздействие ЗФР, применяемого в качестве отрицательного контроля;
на фиг. 6 - сравнение эффективности предлагаемых в изобретении N-Phos-олигомеров и ЕР 2041161-олигомеров в отношении модуляции сайта сплайсинга мишени TNFR2 (пропуск экзона 7) в почках мышей. Протестированные олигомеры отличались друг от друга, во-первых, суммой всех повторяющихся звеньев Yd, Zf, Yg и Zj (15 или 14), и, во-вторых, количеством и положением групп общей формулы (IV) и (V). На фиг. 6 продемонстрировано, что воздействие N-Phos-олигомеров на генную экспрессию изоформы мРНК без экзона 7 при непосредственном сравнении с ЕР 2041161-олигомерами было в 12,6 или 6,7 раз сильнее;
на фиг. 7 - воздействие in vivo предлагаемых в изобретении N-Phos-олигомеров, содержащих 20 структурных элементов (сумма всех повторяющихся звеньев Yd, Zf, Yg и Zj общей формулы (VI) равна 19) на модуляцию сайта сплайсинга мишени дистрофина (пропуск экзона 23) в мышце мышей линии mdx. На фиг. 7 продемонстрировано, что предлагаемый в изобретении N-Phos-олигомер даже по данным кратковременного эксперимента в течение 15 дней с осуществлением только 3 инъекций в мышцу оказывал в 9 раз более сильное воздействие на генную экспрессию изоформы мРНК без экзона 23 по сравнению с обработанной ЗФР контрольной группой.
Примеры
Пример 1: Получение соединения 1
Описание: 66,52 г (200 ммолей) метилового эфира 2-N-Cbz-амино-2-(диметоксифосфорил)уксусной кислоты в 300 мл метанола смешивали с 2,13 г Pd/C 10% (соответствует 1 мол. % Pd) и перемешивали при давлении водорода 2 бара в течение 24 ч при комнатной температуре. Катализатор отфильтровывали через целит и затем из фильтрата выпаривали растворитель. В результате получали продукт в виде масла светло-желтого цвета, которое при выстаивании превращалось в воскоподобное твердое вещество.
Выход: 39 г, 99%. 1Н-ЯМР (ДМСО-d6): 4,01 (d, 1Н), 3,66-3,73 (m, 9Н), 2,4-2,5 (s, br, 2Н). 31Р-ЯМР (ДМСО-d6): 23,6 част./млн.
Пример 2: Получение соединения 2
Описание: 39 г (198 ммолей, 1 экв.) соединения 1 растворяли в 1000 мл дихлорметана. Затем добавляли 56,178 г (257 ммолей, 1,3 экв.) Вос2О и 16,1 мл (198 ммолей, 1 экв.) пиридина. Смесь перемешивали в течение 48 ч при комнатной температуре. Растворитель удаляли на роторном испарителе, остаток вносили в уксусный эфир и промывали 5%-ным раствором лимонной кислоты, насыщенным раствором карбоната натрия и насыщенным соляным раствором. Затем сушили с использованием сульфата магния и упаривали. Оставшийся продукт очищали с помощью экспресс-хроматографии (силикагель, гексан / уксусный эфир, 1:5). В результате получали продукт в виде масла желтого цвета.
Выход: 43,5 г (146 ммолей, 74%). 1H-ЯМР (CDCl3): 5,35 (d, br, 1H), 4,88 (dd, 1H), 3,80-3,86 (m, 9H), 1,46 (s, 9H). 31Р-ЯМР (CDCl3): 20.1 част./млн.
Пример 3: Получение соединения 3
Описание: 50 г (319 ммолей, 1 экв.) диэтилацеталя 4-аминобутиральдегида растворяли при комнатной температуре в 200 мл ТГФ и 51,5 мл (372 ммоля, 1,2 экв.) триэтиламина, затем по каплям добавляли 75,99 г (310 ммолей, 1 экв.) диэтил-2-бромметилфосфоната. Затем раствор нагревали до 70°C и перемешивали при этой температуре в течение 24 ч. Растворитель удаляли на роторном испарителе. Остаток интенсивно перемешивали с простым эфиром и отфильтровывали. Оставшийся при этом твердый продукт еще дважды экстрагировали с помощью простого эфира. Полученные с помощью простого эфира фильтраты объединяли и упаривали. В результате получали продукт в виде масла желтого цвета, которое применяли в следующей реакции без дополнительной очистки.
1Н-ЯМР (ДМСО-d6): 4,45 (t, 1Н); 3,98 (m, 4Н); 3,54 и 3,42 (2m, 2×2Н); 2,5-2,8 (m, 4Н); 1,90 (m, 2Н); 1,25-1,60 (m, 4Н); 1,22 (t, 6Н); 1,10 (2t, 6Н). 31Р-ЯМР (ДМСО-d6): 30 част./млн.
Полученный на первой стадии промежуточный продукт растворяли в 400 мл ТГФ, смешивали с 85,94 мл (620 ммолей, 2 экв.) триэтиламина и охлаждали до 0°C. Затем добавляли по каплям 66,11 мл (465 ммолей, 1,5 экв.) бензилхлорформиата, прекращали охлаждение и осуществляли перемешивание в течение ночи при комнатной температуре. Затем реакционную смесь нейтрализовали с помощью 1М соляной кислоты и выпаривали растворитель. Остаток перемешивали с простым эфиром и выдерживали в течение ночи в холодильнике. Осадившийся при этом твердый продукт отделяли и еще дважды тщательно промывали простым эфиром. Эфирные растворы объединяли и упаривали. Остаток очищали с помощью хроматографии на силикагелевой колонке. При этом сначала элюировали все примеси с использованием смеси гексан : уксусный эфир, 2:1, а затем продукт с использованием уксусного эфира.
Выход: 85,752 г (60,2%) бесцветного вязкого масла. 1Н-ЯМР (ДМСО-d6): 7,34 (m, 5Н); 5,07 (s, 2Н); 4,44 (m, 1Н); 3,94 (m, 4Н); 3,6-3,2 (m, 8Н); 2,02 (m, 2Н); 1,46 (m, 4Н); 1,19 (m, 6Н); 1,09 (m, 6Н). 31Р-ЯМР (ДМСО-d6): 28,93 и 28,57 част./млн.
Пример 4: Получение соединения 4
Описание: 80 г соединения 3 в 1000 мл ацетона перемешивали с 0,98 г (1,74 ммоля, 1 мол. %) трифлата индия (III) при комнатной температуре. Мониторинг прохождения реакции осуществляли с помощью ЖХВР (RP18, метанол / вода 80:20). Периодически растворитель выпаривали и заменяли свежим ацетоном. Это осуществляли до тех пор, пока реакция не завершалась более чем на 95%. Затем растворитель выпаривали. Субстанцию, представляющую собой масло желтого цвета, кратковременно сушили в глубоком вакууме и сразу же применяли на следующей стадии.
1Н-ЯМР (ДМСО-d6): 9,62 (d, 1Н); 7,36 (m, 5Н); 5,07 (s, 2Н); 3,94 (m, 4Н); 3,37 и 3,24 (2m, 4Н); 2,41 (m, 2Н), 2,04 (m, 2Н); 1,73 (m, 2Н); 1,22 (t, 6Н). 31Р-ЯМР (ДМСО-d6): 29,51, 29,14 част./млн
Пример 5: Получение соединения 5
Описание: В атмосфере аргона охлаждали до -70°C 29,438 г соединения 2 в 350 мл ТГФ, затем по каплям добавляли 12,96 мл (103 ммоля, 1,04 экв.) N,N,N'N'-тетраметилгуанидина. После перемешивания в течение 10 мин при -70°C по каплям добавляли 38,170 г (99,04 ммоля, 1 экв.) соединения 4 в 60 мл ТГФ. Перемешивание продолжали еще в течение 1 ч при -70°C, затем продукту давали медленно нагреться до комнатной температуры и перемешивали в течение ночи.
Растворитель выпаривали. Остаток растворяли примерно в 400 мл уксусного эфира, промывали дважды 5%-ным раствором лимонной кислоты и один раз насыщенным раствором NaCl, сушили с использованием сульфата магния и упаривали. В результате получали продукт в виде масла желтого цвета.
Выход: 53,228 г, 95,6 ммолей, 96,5%. 1H-ЯМР (CDCl3): 7,33 (s, 5Н); 6,48 (t, 1Н); 5,13 (s, 2H); 4,08 (m, 4H); 3,81 и 3,76 (2s, все 3Н); 3,49 (m, 2Н); 3,30 (t, 2Н); 2,21 (m, 2Н); 2,04 (m, 2Н); 1,71 (m, 2Н); 1,48 и 1,46 (2s, все 9Н); 1,28 (m, 6Н). 31Р-ЯМР (CDCl3): 29,72 и 29.15 част./млн.
Пример 6: Получение соединения 6
Описание: В реакционном сосуде аппарата Парра для гидрирования растворяли в атмосфере аргона 450 мг (0,96 ммоля, 1 мол. %) трифторметансульфоната бис(1,5-циклооктадиенил)родия (I) и 306 мг (0,96 ммоля, 1 мол. %) (-)-1,2-бис-[(2R,5R)-2,5-диметилфосфолано]бензола примерно в 50 мл метанола, затем добавляли 53,228 г (96 ммолей) соединения 5, растворенного в 250 мл метанола. Сосуд устанавливали в аппарат для гидрирования, трижды вакуумировали и заполняли водородом. Наконец, устанавливали давление водорода на уровне 4,5-5 бар и сосуд перемешивали в течение 24 ч.
Выпускали избыток водорода, сосуд вынимали и реакционный раствор фильтровали через целит. Фильтрат упаривали и сушили в вакууме. В результате получали продукт в виде масла светло-коричневого цвета.
Выход: 53,712 г, 96 ммолей, количественый. 1H-ЯМР (CDCl3): 7,35 (m, 5Н); 6,48 и 6,35 (2m, все 1Н); 5,13 (s, 2Н); 4,27 (m, 1Н); 4,07 (m, 4Н); 3,73 (s, 3Н); 3,48 (m, 2Н); 3,27 (m, 2Н); 2,25-1,95 (m, 4Н); 1,75-1,55 (m, 4Н); 1,45 (s, 9Н); 1,28 (m, 6Н). 31Р-ЯМР (CDCl3): 29,78 и 29.23 част./млн.
Пример 7: Получение соединения 7
Описание: К 53,94 г (96,6 ммоля) соединения 6 в 120 мл ТГФ добавляли по каплям 240 мл 4М раствора HCl в диоксане. Затем осуществляли перемешивание при комнатной температуре. Мониторинг протекания реакции осуществляли с помощью ЖХВР (метанол / вода 70:30). Через 2-3 ч завершалось отщепление Boc. Растворитель выпаривали и остаток промывали простым диэтиловым эфиром и сушили. В результате получали продукт в виде вязкого масла желтого цвета.
Выход: 47,83 г, количественный. 1Н-ЯМР (ДМСО-d6): 8,64 (s, br, 2Н); 7,36 (m, 5Н); 5,07 (s, 2Н); 3,97 (m, 5Н); 3,73 (s, 3Н); 3,38 (m, 2Н); 3,22 (m, 2Н); 2,04 (m, 2Н); 1,80 (m, 2Н); 1,48-1,35 (m, 4Н); 1,22 (m, 6Н). 31Р-ЯМР (ДМСО-d6): 29,012 и 28,62 част./млн.
Пример 8: Получение соединения 8
Описание: 16,65 г (29,8 ммоля, 1 экв.) соединения 7 в 100 мл метанола охлаждали до 0°C и смешивали с 5,414 г (66 ммолей, 2,2 экв.) ацетата натрия. Затем добавляли по каплям 5,218 г (32,8 ммоля, 1,1 экв.) N-Boc-аминоацетальдегида в 150 мл метанола. Перемешивание продолжали в течение 1 ч при 0°C, затем порциями добавляли 2,074 г (33 ммоля, 1,1 экв.) цианборогидрида натрия. После ослабления образования газа охлаждающую баню удаляли и осуществляли перемешивание в течение ночи при комнатной температуре.
Растворитель удаляли на роторном испарителе, остаток растворяли в уксусном эфире и промывали раствором бикарбоната натрия (полунасыщенным), а также насыщенным раствором хлорида натрия. Органическую фазу сушили с использованием сульфата магния, упаривали и сушили в вакууме. Неочищенный продукт очищали на силикагелевой колонке (дихлорметан/метанол, 5 об. %). В результате получали продукт в виде вязкого масла желтого цвета.
Выход: 15,379 г (25,6 ммоля, 86%). 1H-ЯМР (ДМСО-d6): 7,36 (m, 5Н); 6,69 (m, 1H); 5,06 (s, 2Н); 4,02 (m, 4Н); 3,4-3,15 (3m, все 7Н); 2,95 (m, 1Н); 2,38 (m, 1Н); 2,01 (m, 2Н); 1,60-1,30 (m, 6Н); 1,38 (s, 9Н); 1,20 (m, 6Н). 31Р-ЯМР (ДМСО-d6): 29,00 и 28.60 част./млн.
Пример 9: Получение соединения 9
Е=Cbz-A, Cbz-C, Cbz-G, Т
Описание: 20,25 ммоля (1,5 экв.) производных уксусной кислоты (N6-Cbz-аденин-9-ил-уксусная кислота, N4-Cbz-цитозин-1-ил-уксусная кислота, N2-Cbz-гуанин-9-ил-уксусная кислота или тимидин-1-ил-уксусная кислота) в 70 мл ацетонитрила, 20 мл пиридина и 4,5 мл (40,5 ммоля, 3 экв.) N-метилморфолина охлаждали до 0°C и смешивали с 7,186 г (18,9 ммоля, 1,4 экв.) HATU. Охлаждение прекращали и осуществляли перемешивание в течение 10 мин при комнатной температуре. Затем смесь медленно добавляли к 8,1 г (13,5 ммоля, 1 экв.) соединения 8, растворенного в 50 мл ацетонитрила. Осуществляли перемешивание в течение 1 ч при комнатной температуре, затем в течение ночи при 40°C.
Смесь снова охлаждали до комнатной температуры и разбавляли с помощью 20 мл воды. После перемешивания в течение 30 мин растворитель выпаривали. Затем остаток еще два раза упаривали с дихлорметаном для возможно большего удаления пиридина. Затем остаток снова растворяли в дихлорметане и выдерживали в течение ночи в холодильнике. Осадившийся при этом твердый продукт отфильтровывали, фильтрат упаривали и очищали с помощью экспресс-хроматографии (силикагель, 2-5% метанола в дихлорметане), в результате чего получали продукт в виде пены светло-желтого цвета.
Соединение 9, Е=Cbz-A:
Выход: 62%. 1H-ЯМР (ДМСО-d6): 10,65 (s, 1H); 8,59 (s, 1Н); 8,35 и 8,29 (2s, все 1Н); 1,47-7,24 (m, 10Н); 6,90 и 6,72 (2m, все 1Н); 5,42-5,00 (m, 6Н); 3,92 (m, 5Н); 3,56 и 3,49 (2s, все 3Н); 3,50-2,95 (m, 8Н); 2,12-1,30 (m, 8Н); 1,38 и 1,35 (2s, все 9Н); 1,16 (m, 6Н); 31Р-ЯМР (ДМСО-d6): 29,52 и 29,16 част./млн.
Соединение 9, Е=Cbz-C:
Выход: 59%. 1H-ЯМР (ДМСО-d6): 10,77 (s, br, 1Н); 7,94 (d, 1H), 7,42-7,33 (m, 10H); 7,01 (d, 1H); 6,91 и 6,80 (2m, все 1H); 5,19 (s, 2H); 5,07 (s, 2H); 4,80-4,6 (m, 2H); 4,36 (m, 1H); 3,94 (m, 4H); 3,7 и 3,59 (2s, все 3Н); 3,5-2,8 (m, 8H); 2,05-1,3 (m, 8H); 1,38 и 1,37 (2s, все 9H); 1,19 (m, 6H). 31Р-ЯМР (ДМСО-d6): 29,02 и 28,63 част./млн.
Соединение 9, Е=Cbz-G:
Выход: 77,5%. 1H-ЯМР (ДМСО-d6): 11,33 (s, br, 2Н); 7,85 (s, 1H); 7,45-7,30 (m, 10 H); 6,99 и 6,81 (2m, все 1Н); 5,26 (s, 2H); 5,06 (m, 4H); 4,58 и 4,31 (2m, все 1Н); 3,934 (m, 4H); 3,56 (s, 3Н); 3,31-3,19 (m, 8H); 2,21-1,30 (m, 8H); 1,36 и 1,35 (2s, все 9Н); 1,19 (m, 6Н). 31Р-ЯМР (ДМСО-d6): 28,98 и 28,59 част./млн.
Соединение 9, Е=Т:
Выход: 78% 1Н-ЯМР (ДМСО-d6): 11,26 (s, br, 1Н); 7,35 (m, 6H); 6,90 и 6,79 (2m, все 1H); 5,07 (s, 2H); 4,63-4,49 (m, 2H); 4,31 (m, 1H); 3,94 (m, 4H); 3,70 и 3,58 (2s, все 3Н); 3,46-3,12 (m, 8H); 2,11-1,30 (m, 8H); 1,76 (s, 3H); 1,38 и 1,35 (2s, все 9H); 1,19 (m, 6H). 31Р-ЯМР (ДМСО-d6): 29,61 и 29,25 част./млн.
Пример 10: Получение соединения 10: Е=Cbz-A, Cbz-C, Cbz-G, Т
Описание: 2,31 ммоля соединения 9 (Е=Cbz-A, Cbz-C, Cbz-G или Т) охлаждали в 12 мл смеси вода / метанол, 1:1, до 0°, затем по каплям добавляли 12 мл 2н. раствора NaOH. Осуществляли перемешивание в течение 15 мин при 0°C, затем при комнатной температуре до завершения омыления по данным DC-контроля (силикагель, 10% метанола в дихлорметане) (продолжительность: примерно 1 ч). Затем осуществляли разбавление с использованием небольшого количества воды и удаляли путем кратковременного центрифугирования любые присутствующие нерастворившиеся субстанции. Прозрачный раствор разбавляли водой до объема примерно 300 мл и снова охлаждали до 0°C. Значение рН доводили до 2,5 с помощью 1М раствора HCl, в результате чего выпадал осадок в виде твердого вещества белого цвета. Раствор экстрагировали дихлорметаном (примерно 5 раз) до тех пор, пока продукт не переставал переходить в органическую фазу (DC-контроль). Объединенные органические фазы сушили с использованием сульфата магния, упаривали и сушили в вакууме. В результате получали продукт в виде твердого вещества светло-желтого цвета.
Соединение 10, Е=Cbz-A:
Выход: 72%. 1Н-ЯМР (ДМСО-d6): 10,68 (s, br, 1Н); 8,59 (s, br, 1H); 8,35 и 8,29 (2s, br, все 1H); 7,49-7,33 (m, 10 H); 6,98 и 6,85 (2m, все 1H); 5,35-5,04 (m 6H); 4,62 и 4,22 (2m, все 1H,); 3,93 (m, 4H,); 3,50-2,85 (m, 8H); 2,20-1,30 (m, 8H); 1,39 и 1,36 (2s, все 9H); 1,17 (m, 6H). 31Р-ЯМР (ДМСО-d6): 29,55 и 29,19 част./млн.
Соединение 10, Е=Cbz-C:
Выход: 59%. 1H-ЯМР (ДМСО-d6): 7,95 (d, 1Н); 7,42-7,28 (m, 10Н); 7,01 (d, 1H); 6,90 и 6,85 (2m, все 1Н); 5,19 (s, 2Н); 5,07 (s, 2Н); 4,81-4,65 (m, 2Н); 4,33 (m, 1Н); 3,933 (m, 4Н); 3,45-3,15 (m, 8Н); 2,15-1,30 (m, 8Н); 1,38 и 1,35 (2s, все 9Н); 1,20 (m, 6Н). 31Р-ЯМР (ДМСО-d6): 29,03 и 28,66 част./млн.
Соединение 10, Е=Cbz-G:
Выход: 62%. 1Н-ЯМР (ДМСО-d6): 11,43 (s, br, 1Н); 11,33 (s, br, 1H); 7,85 (s, 1H); 7,44-7,31 (m, 10H); 6,97 и 6,81 (2m, все 1H); 5,24 (s, 2H); 5,10-5,00 (m, 4H); 4,51 и 4,28 (2m, все 1H); 3,91 (m, 4H); 3,52-3,08 (m, 8H); 2,12-1,28 (m, 8H); 1,36 и 1,34 (2s, все 9H); 1,15 (m, 6H). 31Р-ЯМР (ДМСО-d6): 29,61 и 29,21 част./млн.
Соединение 10, Е=Cbz-T:
Выход: 72%. 1Н-ЯМР (ДМСО-d6): 11,27 (s, br, 1Н); 7,35 (m, 6H); 6,88 (m, 1H); 5,07 (s, 2H); 4,65-4,48 (m, 2H); 4,37 и 4,38 (2m, все 1H); 3,94 (m, 4H); 3,45-3,17 (m, 8H); 2,11-1,30 (m, 8h); 1,75 (s, 3H); 1,38 и 1,36 (2s, все 9H); 1,19 (m, 6H). 31Р-ЯМР (ДМСО-d6): 29,64 и 29,26 част./млн.
Пример 11: Получение предлагаемых в изобретении олигомерных соединений общей формулы (III) или (VI)
Путем последовательного связывания соответствующих соединений общей формулы (I) с мономерными звеньями, выбранными из группы, которая состоит из N-ацетил-N-(2-аминоэтил)глициновых структурных элементов, аминокислот, производных аминокислот и группы B-CH(R48)СООН, с помощью твердофазного пептидного синтеза получали предлагаемые в изобретении олигомерные соединения.
Для простоты представления звеньев Z общей формулы (V) в олигомерных соединениях общей формулы (IV) применяли, например, следующие сокращения: TR, CR, GR, AR, PR, TS, CS, GS, AS и PS. При этом T, С, G, А и P (фенил) в каждом случае обозначает нуклеотидное основание соответствующего мономерного звена, а верхние индексы R или S обозначают R- или S-конфигурацию в асимметричном центре (#) звена Z общей формулы (V).
Мономеры, состоящие из N-ацетил-N-(2-аминоэтил)глициновых структурных элементов, сокращенно обозначали аналогично вышеописанным мономерам общей формулы (V) с тем различием, что вместо заглавных букв для нуклеотидного основания и верхних индексов для конфигурации (например, AR) использовали соответствующие строчные буквы. Например, мономер с С в качестве нуклеотидного основания сокращенно обозначали как с.
Пример 12: Олигомерные соединения общей формулы (III) или (VI) с 4-фторфенилацетатным заместителем в качестве группы B-CH(R48)СООН:
Для получения предлагаемых в изобретении соединений с помощью твердофазного пептидного синтеза применяли следующий протокол синтеза:
Стадия 1: Предварительная пропитка 10 мг смолы (смола МВНА, фирма Novabiochem, с низкой загрузкой, составляющей примерно 0,5-06 ммоля/г) в дихлорметане в течение 3 ч.
Стадия 2: Начало цикла синтеза: 4-кратная промывка дихлорметаном.
Стадия 3: Нейтрализация смолы: 3-кратная промывка дихлорметаном/DIPEA (5%).
Стадия 4: 5-кратная промывка дихлорметаном.
Стадия 5: 5-кратная промывка NMP.
Стадия 6: Предварительная активация в течение 1 мин 4 эквивалентов соответствующим образом защищенного соединения (соединение общей формулы (I)/мономер ПНК/аминокислота/производное аминокислоты) 3,8 эквивалентами HATU 9 эквивалентами NMM в смеси NMP / пиридин (2:1).
Стадия 7: Взаимодействие активированного защищенного соединения (соединение общей формулы (I)/мономер ПНК/аминокислота/производное аминокислоты) с твердой фазой (1-е сочетание; продолжительность: 60 мин).
Стадия 8: 4-кратная промывка NMP.
Стадия 9: Повторение стадий 6-8 (2-е сочетание).
Стадия 10: Проверка эффективности сочетания с использованием нингидрина (тест Кайзера; если результат теста Кайзера положительный, то следует повторять стадии 6-8 с использованием соответствующим образом защищенного соединения (соединение общей формулы (I)/мономер ПНК/аминокислота/производное аминокислоты).
Стадия 11: После получения отрицательного результата теста Кайзера: 1-кратное кэпирование в течение 10 мин с использованием раствора Ac2O / NMP / пиридин (1:25:25).
Стадия 12: 5-кратная промывка NMP.
Стадия 13: Замена растворителя на дихлорметан: 5-кратная промывка ДХМ.
Стадия 14: Отщепление Boc путем реакции с ТФК / мета-крезолом (95:5). Продолжительность реакции: 2× каждый раз по 3 мин.
Стадия 15: 5-кратная промывка ДХМ.
Стадия 16: Замена растворителя на NMP. 5-кратная промывка NMP.
Стадия 17: Повторение цикла синтеза (стадии 6-16) до сочетания с последним соответствующим образом защищенным соединением (соединение общей формулы (I)/мономер ПНК/аминокислота/производное аминокислоты). Затем при необходимости повторение цикла синтеза (стадии 6-16) до сочетания с последним соответствующим образом защищенным соединением (соединение общей формулы (I)/мономер ПНК/аминокислота/производное аминокислоты).
Стадия 18: 5-кратная промывка дихлорметаном.
Стадия 19: Отщепление Boc путем реакции с ТФК / мета-крезолом (95:5). Продолжительность реакции: 2×, каждый раз по 3 мин.
Стадия 20: 5-кратная промывка дихлорметаном.
Стадия 21: 5-кратная промывка NMP.
Стадия 22: Предварительная активация в течение 1 мин 6 эквивалентов 4-фторфенилуксусной кислоты с использованием 5,7 эквивалента HATU 13 эквивалентов NMM в смеси NMP / пиридин (2:1).
Стадия 23: Взаимодействие активированной 4-фторфенилуксусной кислоты с твердой фазой (продолжительность: 60 мин).
Стадия 24: 4-кратная промывка NMP.
Стадия 25: Повторение при необходимости стадий 23-24 (2-е сочетание).
Стадия 26: 5-кратная промывка дихлорметаном.
Стадия 27: для сушки: 5-кратная промывка простым диэтиловым эфиром.
Получали соединения общей формулы (III) или (VI), которые связаны на С-конце со смолой.
Отщепление предлагаемого в изобретении соединения общей формулы (III) или (VI) от смолы:
Смолу с предлагаемым в изобретении соединением встряхивали в растворе, содержащем трифторуксусную кислоту, трифторметансульфоновую кислоту, тиоанизол и этандитиол (85/12,5/1,7/0,8, об./об./об./об.) в течение 2 ч. Жидкую фазу отфильтровывали и неочищенный продукт осаждали путем добавления холодного простого эфира. Неочищенный продукт обессоливали с помощью гель-фильтрации. Неочищенный продукт очищали с помощью препаративной ЖХВР на RP-C18-колонке с использованием смеси метанол/вода. В результате получали предлагаемое в изобретении соединение в виде бесцветного твердого вещества с выходом примерно 50%. Массу предлагаемого в изобретении соединения характеризовали с помощью ЖХВР-ESI.
Пример 13: Примеры полученных соединений общей формулы (III) или (VI)
Путем осуществления общей процедуры синтеза, описанной в примере 12, получали олигомерные соединения общей формулы (III) или общей формулы (VI), которые сокращенно обозначали следующим образом:
Например, если получали предлагаемое в изобретении олигомерное соединение, состоящее из мономеров общей формулы (I) с асимметричным центром с R-конфигурацией, а также других мономеров ПНК и аминокислоты L-лизина (сокращение: LysL), и на последней стадии осуществляли кэпирование α-аминофункции лизина ацетилом, и затем отщепляли от смолы олигомерное соединение в виде первичного амида, то его сокращенно обозначали как Ас-LysL-cCRgGRgGRtcgcaGRcTRgGR-NH2.
Например, если получали предлагаемое в изобретении олигомерное соединение, состоящее из мономеров общей формулы (I) с асимметричным центром с S-конфигурацией, а также других мономеров ПНК и аминокислоты глицина (сокращение: Gly), и на последней стадии осуществляли кэпирование α-аминофункции глицина фенилацетатом (сокращение: Рас), и затем отщепляли от смолы олигомерное соединение в виде первичного амида, то его сокращенно обозначали как Pac-Gly-agcccTSaacTSgcacTSTSccaTS-NH2.
Например, если получали предлагаемое в изобретении олигомерное соединение, состоящее из мономеров общей формулы (I) с асимметричным центром с R-конфигурацией, а также других мономеров ПНК и аминокислоты D-лизина (сокращение: LysD), и на последней стадии осуществляли кэпирование α-аминофункции лизина 4-фторфенилацетатом (сокращение: FluPac), и затем отщепляли от смолы олигомерное соединение в виде первичного амида, и после этого еще ε-аминофункцию лизина конъюгировали с флуоресцентным красителем ATTO647, то его сокращенно обозначали как FluPac-LysD (ATTO647)-cCRgGRgGRtcgcaGRcTRgGR-NH2.
Примерами других флуоресцентных красителей являются АТТО, MegaRed, Alexa, BODIPY и TAMRA.
Ниже представлены примеры полученных предлагаемых в изобретении соединений общей формулы (IV):
MN обозначает радикал 4-гидрокси-3-нитрофенилацетат
Пример 14: Улучшенная биодоступность и более продолжительное время полужизни в различных органах/тканях
Меченный 3Н N-Phos-олигомер и меченный 3Н ЕР 2041161-олигомер растворяли в каждом случае в ЗФР (рН 7,1) и вводили посредством внутривенной болюсной инъекции мышам в концентрации 10 мг/кг. В различные моменты времени (через 20 мин, 1,5, 3, 6, 24 ч, 2 дня, 4 дня, 8 дней и 14 дней) у мышей брали образцы крови, а также изымали 18 различных органов/тканей (почки, печень, селезенку, костный мозг, лимфатические узлы, легкие, толстую кишку, тонкую кишку, поджелудочную железу, мочевой пузырь, сердце, тимус, желудок, мышцу, большой мозг, мозжечок, предстательную железу и кожу) и измеряли концентрацию 3Н в соответствующей ткани. Фармакокинетический анализ осуществляли с помощью валидированного профессионального программного обеспечения WinNonlin, версия 4.0.1 (фирма Pharsight Corporation, Маунтин Вью, США). Оценивали в зависимости от времени радиоактивность в соответствующих органах/тканях (среднее значение, полученное для трех животных на одну область, из которой брали образец) без допустимых компартментов для расчета биодоступности (которую выражали в виде площади под кривой) и времени полужизни в органах/тканях.
Было установлено, что биодоступность меченного 3Н N-Phos-олигомера на протяжении 14-дневного периода во всех тканях была больше, чем биодоступность меченного 3Н ЕР 2041161-олигомера в 1,7-4,6 раза. Результаты представлены на фиг. 1.
Кроме того, было установлено, что время полужизни меченного 3Н N-Phos-олигомера на протяжении 14-дневного периода было больше, чем время полужизни меченного 3Н ЕР 2041161-олигомера в большинстве тканей, а в селезенке даже превышала ее в 2 раза. Результаты представлены на фиг. 2.
Пример 15: Повышенное связывание с белками плазмы
Связывание с человеческим сывороточным альбумином оценивали на 5 см колонке для ЖХВР фирмы Chromtech (4,0×50 мм, 5 мкм). На этой колонке иммобилизовали человеческий сывороточный альбумин, так что на основе времен удерживания можно определять аффинность связывания с человеческим сывороточным альбумином. В качестве элюента применяли 30% изопроп./ацетат-аммонийный буфер (рН 7).
Константу аффинности рассчитывали согласно инструкциям производителя по следующей формуле:
k'=(tr-tm)/tm,
tr обозначает время удерживания внесенного образца,
tm обозначает время удерживания ацетаминофена
На основе полученного значения рассчитывали связывание Р (в %) с человеческим сывороточным альбумином:
Р=100(k'/(k'+1))
Более высокое значение свидетельствует о более предпочтительном распределении in vivo. В представленной ниже таблице продемонстрировано значительно более сильное по сравнению с ЕР 2041161-олигомером связывание N-Phos-олигомера с сывороточным альбумином.
aN-Phos-олигомер: R1 обозначает -CH2-CH2-CH2-CH2-NH-CH2-CH2-P=O(OEt)2
bEP 2041161-олигомер: R1 обозначает -CH2-CH2-CH2-P=O(OEt)2
Пример 16: Повышенная и не зависящая от последовательности растворимость в воде
Отвешивали определенное количество N-Phos-олигомеров и ЕР 2041161-олигомеров и добавляли ЗФР (рН 7,2) в таком количестве, чтобы получить раствор с теоретической концентрацией 100 мкМ. Затем измеряли величины ОП полученных растворов. После этого сравнивали друг с другом величины ОП N-Phos-олигомеров и ЕР 2041161-олигомеров, при этом более высокая величина ОП соответствовала большему количеству растворенных молекул и следовательно более высокой растворимости. В то время как для ЕР 2041161-олигомеров, последовательность которых содержала большее количество гуаниновых и цитозиновых оснований, не удавалось получать 100 мкМ раствор в ЗФР, в котором олигомерные соединения были бы полностью растворены, N-Phos-олигомеры при приготовлении 100 мкМ раствора, напротив, полностью растворялись в ЗФР. В представленной ниже таблице продемонстрировано, что независимо от последовательности растворимость в воде N-Phos-олигомеров оказалась неожиданно значительно выше, чем ЕР 2041161-олигомеров.
aN-Phos-олигомеры: R1 обозначает -CH2-CH2-CH2-CH2-NH-CH2-CH2-P=O(OEt)2
bEP 2041161-олигомеры: R1 обозначает -CH2-CH2-CH2-P=O(OEt)2
cm обозначает навеску [мг]
величина ОПd обозначает измеренную величину ОП после приготовления раствора в ЗФР с теоретической концентрацией 100 мкМ.
Пример 17: Сильное связывание с комплементарной ДНК
N-Phos-олигомер или ЕР 2041161-олигомер и олигомер с комплементарной ДНК-последовательностью растворяли в эквимолярном соотношении в не содержащем магния и кальция физиологическом ЗФР-буфере. Раствор разводили таким образом, чтобы по данным измерений с помощью УФ-спектрофотометра величина ОП была равна 0,8. С помощью нагревательной бани находящиеся в спектрофотометре кюветы постепенно нагревали с шагом 1°C от комнатной температуры до 95°C. После каждого шага увеличения температуры на 1°C определяли величину ОП. Температуру плавления определяли по точке излома полученной кривой.
В представленной ниже таблице продемонстрировано, что N-Phos-олигомер обладал более высокой температурой плавления, чем соответствующий ЕР 2041161-олигомер. Таким образом, N-Phos-олигомер образовывал более стабильную связь с олигомером, имеющим комплементарную ДНК-последовательность.
aN-Phos-олигомер: R1 обозначает -CH2-CH2-CH2-CH2-NH-CH2-CH2-P=O(OEt)2)
bEP 2041161-олигомер: R1 обозначает -CH2-CH2-CH2-P=O(OEt)2)
Пример 18: Понижающая регуляция NFkB в клетках HeLa
После культивирования клеток HeLa в течение 2 дней (полученных из DSMZ), высеянных в 384-луночные планшеты Greiner μClear 384w с плотностью 800 клеток/лунку, добавляли растворенные в ЗФР N-Phos-олигомеры или ЕР 2041161-олигомеры до получения в каждом случае конечных концентраций 0,5, 2,5 и 10 мкМ в полной среде. В день 5 после посева клеток добавляли свежую полную среду из расчета 20 мкл/лунку. В день 7 осуществляли замену на минимальную среду с 0,1% FCS. В день 8 в среду (0,1% FCS, без антибиотиков) добавляли 10 нг/мл TNFα (фирма Peprotech) для стимуляции клеток, через 30 мин клетки фиксировали (4% PFA) для морфологического анализа и для визуализации наиболее важных субклеточных структур, таких как клеточное ядро и цитоплазма, окрашивали соответствующими красителями и антителами. Обработку изображений осуществляли с помощью автоматизированного микроскопа ImageXPress Micro (фирма MDC). Анализ изображений осуществляли визуально с использованием программного обеспечения (фирма MDC) и затем количественно с помощью программного обеспечения для автоматизированного анализа изображений Definiens XD (фирма Definiens) с применением специфических алгоритмов. Таким путем с применением окрашивания красителем Хёхста определяли количество клеточных ядер, которое служило в качестве показателя уровня клеточной пролиферации и тем самым понижающей регуляции NFkB олигомерными соединениями. В представленной ниже таблице продемонстрировано, что воздействие N-Phos-олигомеров на генную экспрессию вследствие усиления понижающей регуляции NFkB повышалось по сравнению с ЕР 2041161-олигомерами, поскольку количество клеточных ядер было более низким, прежде всего при концентрациях 2,5 мкМ и 10 мкМ.
aN-Phos-олигомеры: R1 обозначает -CH2-CH2-CH2-CH2-NH-CH2-CH2-P=O(OEt)2
bEP 2041161-олигомеры: R1 обозначает -CH2-CH2-CH2-P=O(OEt)2
Пример 19: Более сильная модуляция сайта сплайсинга мишени TNFR2 (пропуск экзона 7) в клетках ТНР1
Тесты по оценке эффективности олигомерных соединений проводили на культуре клеток ТНР1, полученной из АТСС (АТСС TIB-202®™). ТНР1 представляет собой клеточную линию человеческих моноцитов, полученную из организма пациентов с острым моноцитарным лейкозом. Культуры клеток ТНР1 выращивали (в среде RPMI 1640 с 10% FCS) без добавления антибиотиков. Периодически проводили тесты на микоплазму (с использованием набора Venor GeM фирмы Minerva).
В день 1 клетки ТНР1 с добавлением РМА вносили из расчета 13000 клеток/лунку в обработанные коллагеном типа I 384-луночные планшеты фирмы Greiner (Greiner Kollagen I 384W Platten, №781956) с помощью многоканального диспенсера. На этой стадии клетки обрабатывали полной средой, содержащей 10% сыворотки и пенициллин/стрептомицин. После посева добавляли РМА (фирма Sigma, № Р8139) в концентрации 100 нМ. В день 4 после замены культуральной среды добавляли олигомеры в концентрациях 0,2, 2 и 20 мкМ. В день 6 клетки кондиционировали путем добавления INFg ТНР1 В концентрации 100 ед./мл (фирма Peprotech) и затем IFN-γ в течение 24 ч. В день 7 после замены среды для клеточной культуры добавляли 5 мкг LPS (фирма Sigma) в так называемой минимальной среде (0,1% FCS) и осуществляли стимулирование культуры в течение 24 ч. В день 8 клетки ТНР1 лизировали в буфере для лизиса Stratec S (№7061311700) и лизат помещали на хранение при -80°C. В день 9 с использованием наборов для экстракции РНК RNA Stratec InviTrap (№7061300400) осуществляли экстракцию клеток и помещали на хранение при -80°C для дальнейшего анализа.
ОТ-реакцию проводили с помощью набора для кДНК LifeTech High Capacity (№4368813) с использованием ингибитора РНКазы (№ N8080119). qПЦР проводили в реакционном объеме 11 мкл с применением мастер-смеси для qПЦР Bioline SensiMix Sybr (№ QT605-20) с использованием специфических праймеров для мРНК человеческих изоформ TNFR2, содержащих и не содержащих экзон 7.
qПЦР-реакции проводили с помощью системы ABI PRISM 7900НТ. Полученные в результате ОТ-qПЦР данные проверяли вручную с использованием кривых амплификации для каждой лунки. Относительные количества мРНК гена-мишени стандартизовали относительно количества мРНК референс-гена Rpl13a.
Для каждой протестированной концентрации олигомерных соединений определяли отношение (выраженное в процентах) уровня экспрессии индуцированной изоформы TNFR2 без экзона 7 к уровню экспрессии изоформы TFNR2 с экзоном 7, в каждом случае определенного относительно уровня экспрессии референс-гена Rpl13a. Эквипотентную действующую концентрацию, ЕС50, рассчитывали на основе аппроксимации данных, полученных для индивидуальных концентраций, кривой с помощью статистического метода наилучшей подгонки (квадратичная подгонка) с использованием программы Excel-Add-ins XLfit.5 (IDBS).
В представленной ниже таблице продемонстрировано, что для N-Phos-олигомеров величины ЕС50, характеризующие модуляцию сайта сплайсинга TNFR2, были значительно более низкими по сравнению ЕР 2041161-олигомерами.
aN-Phos-олигомеры: R1 обозначает -CH2-CH2-CH2-CH2-NH-CH2-CH2-P=O(OEt)2
bEP 2041161-олигомеры: R1 обозначает -CH2-CH2-CH2-P=O(OEt)2
Пример 20: Модуляция сайта сплайсинга мишени TNFR2 (пропуск экзона 7) у мышей
Мышам в группах обработки, каждая из которых состояла из 5 мышей линии BalB/С (фирма Jackson Labs), вводили в дни 1, 3 и 5 внутривенно либо N-Phos-олигомер из расчета 50 мг/кг, либо ЗФР в таком же объеме. В день 8 осуществляли стимуляцию воспалительной реакции с помощью 15 мг/кг LPS (фенол-LPS Е. coli, серотип ∅127: В8, фирма Sigma, каталожный номер L3129, с уровнем эндотоксина не менее 500000 EU (эндотоксиновых единиц/мг)). Через 3 ч после LPS-стимуляции животных умерщвляли и брали образцы из селезенки и мезентерических лимфатических узлов примерно по 30 мг каждый и сразу замораживали в жидком азоте. Образцы ткани хранили при -80°C в холодильнике до дальнейшей обработки. Для экстракции РНК фрагменты ткани массой немного меньше 30 мг (после удаления избытка ткани с помощью скальпеля) сразу переносили в пробирку, содержащую 300 мкл реагента QIAzol и гранулы из нержавеющей стали (фирма Qiagen, каталожный номер 69989) для лизиса. Экстракцию РНК из образцов ткани осуществляли с использованием набора для ткани Qiagen RNeasy 96 Universal (фирма Qiagen, №74881) согласно протоколу производителя. Полученную РНК помещали на хранение при -80°C до дальнейшей обработки. При проведении qПЦР-анализа для ОТ-реакции использовали набор для обратной транскрипции кДНК High Capacity cDNA Reverse Transkription с ингибитором РНКазы фирмы Invitrogen (каталожный номер 4374966) согласно протоколу производителя. Реакционные смеси для qПЦР приготавливали, применяя мастер-смесь Bioline SensiMix SYBR (№ QT605-20) в реакционном объеме 11 мкл, с использованием идентификации на основе SybrGreen и предварительно валидированных специфических в отношении транскриптов пар праймеров в трех повторностях. ПЦР-реакции в реальном времени проводили с использованием системы ABI PRISM 7900НТ. Данные, полученные в результате OT-qПЦР, проверяли вручную и количество мРНК-мишени стандартизовали относительно количества мРНК референс-гена Rpl13a. Уровень экспрессии мРНК-мишени, изоформы мРНК гена TNFR2 мыши без экзона 7, определяли в виде медианы 5 медиан результатов проведенных в трех повторностях измерений на образцах селезенки или мезентерических лимфатических узлов, стандартизованных в каждом случае относительно уровня гена Rpl13a мыши из тест-группы, состоящей из 5 мышей.
aN-Phos-олигомеры: R1 обозначает -CH2-CH2-CH2-CH2-NH-CH2-CH2-P=O(OEt)2
Пример 21: Сравнение эффективности предлагаемого в изобретении N-Phos-олигомера, ЕР 2041161-олигомера и US 5719262-олигомера в отношении модуляции сайта сплайсинга мишени TNFR2 (пропуск экзона 7) в клетках ТНР1
Эксперимент проводили согласно процедуре, описанной в примере 19. Результаты представлены в приведенной ниже таблице и на фиг. 3.
N-Phos-олигомер, предлагаемый в изобретении, обладал по сравнению с ЕР 2041161-олигомером в 2,6 раза более сильным воздействием в отношении модуляции сайта сплайсинга мишени TNFR2 в клетках ТНР1, в то время как модуляция мишени TNFR2 в клетках ТНР1 при использовании US 5719262-олигомера практически отсутствовала.
aN-Phos-олигомер: R1 обозначает -CH2-CH2-CH2-CH2-NH-CH2-CH2-P=O(OEt)2
bEP 2041161-олигомер: R1 обозначает -CH2-CH2-CH2-P=O(OEt)2
cUS 5719262-олигомер: R1 обозначает -CH2-CH2-CH2-CH2-NH2
Пример 22: Воздействие предлагаемых в изобретении N-Phos-олигомеров с различными радикалами U на модуляцию сайта сплайсинга TNFR2-мишени (пропуск экзона 7) в легких мышей
Эксперимент проводили согласно процедуре, описанной в примере 20.
Протестированные N-Phos-олигомеры, предлагаемые в изобретении, формулы (VI) с радикалом U общей формулы VII и группой формулы IXc (производное холестерина) или IXd (производное фолиевой кислоты) в качестве R46 оказывали сильное воздействие на генную экспрессию при модуляции сайта сплайсинга TNFR2-мишени у мышей.
Например, в легких воздействие при использовании производного холестерина было в 560 раз больше, а при использовании производного фолиевой кислоты было в 378 раз больше, чем в случае ЗФР, применяемого в качестве отрицательного контроля. Результаты представлены на фиг. 4.
Пример 23: Воздействие предлагаемых в изобретении N-Phos-олигомеров общей формулы (VI), имеющих различные нуклеотидные последовательности, радикалы U, а также различия в количестве и положении групп общих формул (IV) и (V) на модуляцию сайта сплайсинга TNFR2-мишени (пропус экзона 7) в почках, печени и легких мышей
Эксперимент проводили с использованием предлагаемых в изобретении N-Phos-олигомеров N-Phos 23-1, N-Phos 23-2, N-Phos-23-4 (см. фиг. 5). Эксперимент осуществляли согласно процедуре, описанной в примере 20.
Все протестированные N-Phos-олигомеры, предлагаемые в изобретении, оказывали в различных мышиных тканях (почки, печень и легкие) очень сильные воздействия на генную экспрессию изоформы мРНК без экзона 7. Например, в почках воздействие N-Phos 23-1 было в 1983 раза выше, чем ЗФР, применяемого в качестве отрицательного контроля. Результаты представлены на фиг. 5.
Пример 24: Сравнение эффективности предлагаемых в изобретении N-Phos-олигомеров и ЕР 2041161-олигомеров в отношении модуляции сайта сплайсинга TNFR2-мишени (пропуск экзона 7) в почках мышей
Тестировали 2 варианта N-Phos-олигомеров (вариант 1: сумма всех повторяющихся звеньев Yd, Zf, Yg и Zj общей формулы (VI) равна 15 или 14; вариант 2: количество и положение групп общей формулы (IV) и (V) соответствовали общей формуле (VI)) и соответствующие варианты ЕР 2041161-олигомеров. Протестированные варианты представлены на фиг. 6. Эксперимент проводили согласно процедуре, описанной в примере 20, с тем различием, что в рассматриваемом эксперименте животных умерщвляли уже через 2 ч после стимуляции LPS.
Воздействие N-Phos-олигомеров на генную экспрессию изоформы мРНК без экзона 7 при непосредственном сравнении с ЕР 2041161-олигомерами оказалось в 12,6 или 6,7 раза сильнее. Результаты представлены на фиг. 6.
Пример 25: Воздействие in vivo предлагаемого в изобретении N-Phos-олигомера с 20 структурными элементами на модуляцию сайта сплайсинга гена дистрофина-мишени (пропуск экзона 23) в мышце мышей линии mdx
Эксперимент проводили с использованием предлагаемого в изобретении N-Phos-олигомера с 20 структурными элементами (сумма всех повторяющихся звеньев Yd, Zf, Yg и Zj общей формулы (VI) равна 19). Протестированые соединения представлены на фиг. 7. Этот эксперимент проводили согласно процедуре, описанной в примере 20, с тем различием, что в этом эксперименте использовали мышей линии C57BL/10ScSn-Dmdmdx/J (фирма Jackson Labs), животных не стимулировали LPS и умерщвляли в день 15. Уровень экспрессии мРНК-мишени, изоформы мРНК гена дистрофина мышей без экзона 23, определяли как медиану 5 медиан результатов проведенного в трех повторностях измерения в мышце, стандартизованного относительно уровня Rpl13a.
Предлагаемый в изобретении N-Phos-олигомер с 20 структурными элементами оказывал в мышце в 9 раз более сильное воздействие in vivo на генную экспрессию изоформы мРНК без экзона 23 по сравнению с контрольной группой, обработанной ЗФР. Результат представлен на фиг. 7.
SEQUENCE LISTING
<110> Ugisense AG
<120> Neue Peptid-Nukleinsaeuren-Monomere und -Oligomere
<130> 21474-PCT
<140> PCT/EP2015/000998
<141> 2015-05-15
<150> DE102014007158.8
<151> 2014-05-16
<160> 1
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 16
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> DNA Oligomer for thermal stability (Tm) measurements of PNAs
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(16)
<223> DNA Oligomer for thermal stability (Tm) measurements of PNAs
<400> 1
tttctttcta ggactg 16
Claims (61)
1. Соединения общей формулы (I):
в которой
K представляет собой активную группу эфира карбоновой кислоты или -О-RM; где RM обозначает атом Н, метальную, этильную, бензильную или трет-бутильную группу;
Pr представляет собой атом Н или аминозащитную группу;
# обозначает асимметричный атом С;
Е представляет собой аденинильную, цитозинильную, псевдо-изоцитозинильную, гуанинильную, тиминильную, урацилильную или фенильную группу, при необходимости замещенную защитной группой для нуклеотидного основания;
R1 обозначает группу общей формулы (II):
в которой
R2 обозначает группу эфира фосфоновой кислоты или группу фосфоновой кислоты;
R3 обозначает аминозащитную группу;
m обозначает 1, 2, 3 или 4; и
h обозначает 0, 1, 2 или 3;
при условии, что сумма m и h в общей формуле (II) находится в пределах: 2≤х≤5.
2. Соединение по п. 1, в котором Е представляет собой тиминильную, урацилильную, фенильную, N2-ацетилгуанинильную, N2-изобутирилгуанинильную, N2-бензилоксикарбонилгуанинильную, N2-(4-метоксифенил)дифенилметилгуанинильную, N2-бензгидрилоксикарбонилгуанинильную, N2-дибензгидрилоксикарбонилгуанинильную, N2-трет-бутилоксикарбонилгуанинильную, N2-ди-трет-бутилоксикарбонилгуанинильную, N6-бензилоксикарбониладенинильную, N6-(4-метоксифенил)дифенилметиладенинильную, N6-анизоиладенинильную, N6-бензгидрилоксикарбониладенинильную, N6-дибензгидрилоксикарбониладенинильную, N6-трет-бутилоксикарбониладенинильную, N6-ди-трет-бутилоксикарбониладенинильную, O6-бензилгуанинильную, N2-ацетил-O6-дифенилкарбамоилгуанинильную, N2-изобутирил-O6-дифенилкарбамоилгуанинильную, N2-бензилоксикарбонил-О6-дифенилкарбамоилгуанинильную, N2-(4-метоксифенил)дифенилметил-O6-дифенилкарбамоилгуанинильную, N2-бензгидрилоксикарбонил-O6-дифенилкарбамоилгуанинильную, N4-бензилоксикарбонилцитозинильную, N4-(4-метоксифенил)дифенилметилцитозинильную, N4-4-трет-бутилбензоилцитозинильную, N4-бензгидрилоксикарбонилцитозинильную, N4-дибензгидрилоксикарбонилцитозинильную, N4-трет-бутилоксикарбонилцитозинильную, N4-ди-трет-бутилоксикарбонилцитозинильную, N2-бензилоксикарбонил-псевдо-изоцитозинильную, N2-(4-метоксифенил)дифенилметил-псевдо-изоцитозинильную, N2-4-трет-бутилбензоил-псевдо-изоцитозинильную, N2-бензгидрилоксикарбонил-псевдо-изоцитозинильную, N2-ди-бензгидрилоксикарбонил-псевдо-изоцитозинильную, N2-трет-бутилоксикарбонил-псевдо-изоцитозинильную или N2-ди-трет-бутилоксикарбонил-псевдо-изоцитозинильную группу.
3. Соединение по п. 2, в котором Е представляет собой тиминильную, урацилильную, фенильную, N2-бензилоксикарбонилгуанинильную, N2-бензгидрилоксикарбонилгуанинильную, N2-трет-бутилоксикарбонилгуанинильную, N2-бензилоксикарбонил-O6-дифенилкарбамоилгуанинильную, N2-бензгидрилоксикарбонил-О6-дифенилкарбамоилгуанинильную, N6-бензилоксикарбониладенинильную, N6-бензгидрилоксикарбониладенинильную, N6-трет-бутилоксикарбониладенинильную, N6-ди-трет-бутилоксикарбониладенинильную, N4-бензилоксикарбонилцитозинильную, N4-бензгидрилоксикарбонилцитозинильную, N4-ди-трет-бутилоксикарбонилцитозинильную, N2-бензилоксикарбонил-псевдо-изоцитозинильную, N2-бензгидрилоакикарбонил-псевдо-изоцитозинильную или N2-трет-бутилоксикарбонил-псевдо-изоцитозинильную группу.
4. Соединение по одному из пп. 1-3, в котором R2 обозначает группу эфира фосфоновой кислоты формулы -P(=O)(OV)2 или -P(=O)(OV)(OH); и V каждый независимо представляет собой метильную, этильную, циклогексильную или бензильную группу.
5. Соединение по одному из пп. 1-4, в котором R3 представляет собой оксокарбаматную, тиокарбаматную защитную группу или монометокситритильную защитную группу.
6. Соединение общей формулы (VI):
в которой
каждый Y в каждом случае независимо представляет собой группу общей формулы (IV):
каждый Z в каждом случае независимо представляет собой группу общей формулы (V):
где
каждый Е в каждом случае независимо представляет собой аденинильную, цитозинильную, псевдо-изоцитозинильную, гуанинильную, тиминильную, урацилильную или фенильную группу;
# обозначает асимметричный атом С;
каждый R41 в каждом случае представляет собой атом Н;
R11 каждый представляет собой группу -(CH2)m-NH-(CH2)h-CH2-R12;
в которой R12 в каждом случае независимо представляет собой группу эфира фосфоновой кислоты формулы -P(=O)(OV)2 или -P(=O)(OV)(OH); и каждый V в каждом случае независимо представляет собой метальную, этильную, циклогексильную или бензильную группу;
m в каждом случае независимо обозначает 1, 2, 3 или 4 и h в каждом случае независимо обозначает 0, 1, 2 или 3; при условии, что сумма m и h находится в пределах: 2≤х≤5;
d в каждом случае независимо обозначает 0, 1, 2, 3 или 4;
f в каждом случае независимо обозначает 0, 1, 2, 3 или 4;
g в каждом случае независимо обозначает 0, 1, 2, 3 или 4;
j в каждом случае независимо обозначает 0, 1, 2, 3 или 4;
n=0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8;
при условии, что сумма всех повторяющихся звеньев Yd, Zf, Yg и Zj в общей формуле (VI) находится в пределах: 7≤х≤30; и по меньшей мере одна переменная f или j представляет собой целое число от 1 до 5;
при условии, что отношение (сумма повторяющихся звеньев Zf и Zj):(сумма всех повторяющихся звеньев Yd, Zf, Yg и Zj) в общей формул (VI) находится в пределах: 0,1≤х≤0,5;
R31 представляет собой атом Н; боковую цепь аминокислоты аланина, аргинина, аспарагина, аспарагиновой кислоты, цистеина, глутамина, глутаминовой кислоты, гистидина, изолейцина, лейцина, лизина, метионина, орнитина, фенилаланина, пролина, гистидина, серина, треонина, триптофана, тирозина или валина; или группу -(CH2)m-NH-(CH2)h-CH2-R12; в которой R12 обозначает группу эфира фосфоновой кислоты или группу фосфоновой кислоты; m представляет собой целое число от 1 до 5; и h представляет собой целое число от 0 до 4; при условии, что сумма m и h находится в пределах: 2≤х≤5;
R47 в каждом случае независимо обозначает атом Н; или боковую цепь аминокислоты лизина, орнитина или аргинина;
t=0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8;
L представляет собой ОН, OEt, NH2 или -NHNH2;
U представляет собой группу общей формулы (VII):
в которой В представляет собой атом Н, фенильную группу или замещенную фенильную группу, замещенную 1-3 заместителями, выбранными из группы, которая состоит из ОН, F, Cl, Br, I и NO2; R48 обозначает атом Н; и
(I) каждый R46 в каждом случае независимо друг от друга представляет собой атом Н или боковую цепь аминокислоты аланина, аргинина, аспарагина, аспарагиновой кислоты, цистеина, глутамина, глутаминовой кислоты, гистидина, изолейцина, лейцина, лизина, метионина, орнитина, фенилаланина, пролина, гистидина, серина, треонина, триптофана, тирозина или валина; и s обозначает 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8; или
(II) каждый R46 каждый раз независимо друг от друга представляет собой атом Н или группу формулы (IXb):
группу формулы (IXc):
группу формулы (IXd):
или группу формулы (IXe):
р в формулах (IXb), (IXc), (IXd) и (IXe) представляет собой число 3 или 4; и s=1, 2, 3 или 4.
7. Соединение по п. 6, в котором каждый R11 в каждом случае представляет собой группу формулы -CH2-CH2-CH2-CH2-NH-CH2-CH2-P=O(OEt)2 или группу формулы -CH2-CH2-CH2-NH-CH2-CH2-P=O(OEt)2.
8. Соединение по п. 6 или 7, в котором каждый R31 представляет собой атом Н, боковую цепь аминокислоты лизина, орнитина, аргинина, гистидина, триптофана, тирозина, треонина или серина, группу формулы -СН2-СН2-СН2-CH2-NH-CH2-CH2-P=O(OEt)2 или группу формулы -CH2-CH2-CH2-NH-CH2-CH2-P=O(OEt)2.
9. Соединение по одному из пп. 6-8, предназначенное для применения в качестве диагностического средства или в антисмысловой терапии.
10. Фармацевтическая композиция для применения в качестве диагностического средства или в антисмысловой терапии, содержащая по меньшей мере одно соединение по одному из пп. 6-8 и необязательно по меньшей мере один носитель и/или по меньшей мере один адъювант.
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
DE102014007158.8A DE102014007158A1 (de) | 2014-05-16 | 2014-05-16 | Neue Peptid-Nukleinsäuren-Monomere und -Oligomere |
DE102014007158.8 | 2014-05-16 | ||
PCT/EP2015/000998 WO2015172889A1 (de) | 2014-05-16 | 2015-05-15 | Peptid-nukleinsäuren-monomere und -oligomere |
Publications (3)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2016149427A RU2016149427A (ru) | 2018-06-20 |
RU2016149427A3 RU2016149427A3 (ru) | 2018-12-05 |
RU2693827C2 true RU2693827C2 (ru) | 2019-07-05 |
Family
ID=53267289
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2016149427A RU2693827C2 (ru) | 2014-05-16 | 2015-05-15 | Новые мономеры и олигомеры пептидных нуклеиновых кислот |
Country Status (13)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US20170166900A1 (ru) |
EP (1) | EP3143038B8 (ru) |
JP (1) | JP6546272B2 (ru) |
KR (1) | KR102515760B1 (ru) |
CN (1) | CN107074911B (ru) |
AU (1) | AU2015258476B2 (ru) |
CA (1) | CA2949185C (ru) |
DE (1) | DE102014007158A1 (ru) |
DK (1) | DK3143038T3 (ru) |
ES (1) | ES2683186T3 (ru) |
PL (1) | PL3143038T3 (ru) |
RU (1) | RU2693827C2 (ru) |
WO (1) | WO2015172889A1 (ru) |
Families Citing this family (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP7060216B2 (ja) * | 2016-11-16 | 2022-04-26 | アカデミシュ ジーケンハウス ライデン ハー.オー.デー.エン. ルムク | 多様な選択された臓器又は組織をターゲティングするための物質 |
JP2020511550A (ja) * | 2017-03-23 | 2020-04-16 | トゥルーコード ジーン リペアー, インコーポレイテッド | 直交保護エステル部分を有するペプチド核酸(pna)モノマー |
GB202109880D0 (en) * | 2018-12-13 | 2021-08-25 | Neubase Therapeutics Inc | PNA Oligomers and related methods |
TW202042822A (zh) * | 2019-01-22 | 2020-12-01 | 美商科羅生物公司 | Rna編輯之寡核苷酸及其用途 |
KR102403904B1 (ko) * | 2019-12-24 | 2022-06-02 | 주식회사 시선바이오머티리얼스 | 용액공정상 pna 올리고머의 제조방법 |
Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2154638C2 (ru) * | 1994-11-02 | 2000-08-20 | Ай-Си-Эн ФАРМАСЬЮТИКАЛЗ | Нуклеиновые кислоты, модифицированные аминокислотами |
WO2000052038A1 (de) * | 1999-03-03 | 2000-09-08 | Ugichem Gmbh | Mit phosphonsäureester-, phosphonsäure- oder carbaboran-funktionen substituierte oligomere und die entsprechenden pna-monomere |
WO2008009470A1 (de) * | 2006-07-21 | 2008-01-24 | Ugichem Gmbh | Chirale mit phosphonsäureester- oder phosphonsäure- substituierte verbindungen |
WO2008049583A2 (de) * | 2006-10-24 | 2008-05-02 | Ugichem Gesellschaft für Organische Chemie mbH | Verfahren zur selektiven lokalisierung von wirkstoffen an und in mitochondrien und entsprechende wirkstoffe |
Family Cites Families (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5719262A (en) * | 1993-11-22 | 1998-02-17 | Buchardt, Deceased; Ole | Peptide nucleic acids having amino acid side chains |
DE69734783T2 (de) * | 1996-07-24 | 2006-08-17 | Buchardt, Dorte | Peptidnukleinsäuren mit erhöhter bindungsaffinität, sequenzspezifität und löslichkeit |
JP2001501975A (ja) * | 1997-05-28 | 2001-02-13 | ペーター・エー・ニールセン | 亢進した細胞取り込みを有する結合ペプチド核酸 |
-
2014
- 2014-05-16 DE DE102014007158.8A patent/DE102014007158A1/de not_active Withdrawn
-
2015
- 2015-05-15 CA CA2949185A patent/CA2949185C/en active Active
- 2015-05-15 WO PCT/EP2015/000998 patent/WO2015172889A1/de active Application Filing
- 2015-05-15 US US15/311,704 patent/US20170166900A1/en active Pending
- 2015-05-15 AU AU2015258476A patent/AU2015258476B2/en active Active
- 2015-05-15 RU RU2016149427A patent/RU2693827C2/ru active
- 2015-05-15 CN CN201580038548.8A patent/CN107074911B/zh active Active
- 2015-05-15 DK DK15724512.7T patent/DK3143038T3/en active
- 2015-05-15 KR KR1020167035152A patent/KR102515760B1/ko active IP Right Grant
- 2015-05-15 ES ES15724512.7T patent/ES2683186T3/es active Active
- 2015-05-15 JP JP2017512102A patent/JP6546272B2/ja active Active
- 2015-05-15 EP EP15724512.7A patent/EP3143038B8/de active Active
- 2015-05-15 PL PL15724512T patent/PL3143038T3/pl unknown
Patent Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2154638C2 (ru) * | 1994-11-02 | 2000-08-20 | Ай-Си-Эн ФАРМАСЬЮТИКАЛЗ | Нуклеиновые кислоты, модифицированные аминокислотами |
WO2000052038A1 (de) * | 1999-03-03 | 2000-09-08 | Ugichem Gmbh | Mit phosphonsäureester-, phosphonsäure- oder carbaboran-funktionen substituierte oligomere und die entsprechenden pna-monomere |
WO2008009470A1 (de) * | 2006-07-21 | 2008-01-24 | Ugichem Gmbh | Chirale mit phosphonsäureester- oder phosphonsäure- substituierte verbindungen |
WO2008049583A2 (de) * | 2006-10-24 | 2008-05-02 | Ugichem Gesellschaft für Organische Chemie mbH | Verfahren zur selektiven lokalisierung von wirkstoffen an und in mitochondrien und entsprechende wirkstoffe |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CA2949185C (en) | 2023-03-14 |
DK3143038T3 (en) | 2018-11-26 |
JP2017518363A (ja) | 2017-07-06 |
EP3143038A1 (de) | 2017-03-22 |
KR20170002649A (ko) | 2017-01-06 |
DE102014007158A1 (de) | 2015-11-19 |
ES2683186T3 (es) | 2018-09-25 |
RU2016149427A3 (ru) | 2018-12-05 |
AU2015258476B2 (en) | 2018-12-20 |
EP3143038B8 (de) | 2018-09-12 |
US20170166900A1 (en) | 2017-06-15 |
WO2015172889A1 (de) | 2015-11-19 |
EP3143038B1 (de) | 2018-08-01 |
CN107074911A (zh) | 2017-08-18 |
RU2016149427A (ru) | 2018-06-20 |
AU2015258476A1 (en) | 2016-12-01 |
PL3143038T3 (pl) | 2019-01-31 |
CA2949185A1 (en) | 2015-11-19 |
CN107074911B (zh) | 2020-11-03 |
KR102515760B1 (ko) | 2023-03-29 |
JP6546272B2 (ja) | 2019-07-17 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
RU2693827C2 (ru) | Новые мономеры и олигомеры пептидных нуклеиновых кислот | |
JP3210672B2 (ja) | 新規ペプチド核酸 | |
US20030207804A1 (en) | Modified peptide nucleic acids | |
AU2017361784B2 (en) | Substances for targeting various selected organs or tissues | |
WO2018056871A1 (ru) | Аналоги олигонуклеотидов как средства коррекции сплайсинга для лечения мышечной дистрофии дюшена | |
US9951093B2 (en) | Chiral compounds substituted with phosphonic acid ester functions or phosphonic acid functions | |
EP4083208A1 (en) | Antisense nucleic acid that induces skipping of exon 50 | |
DK2079757T3 (en) | Method for selectively placing active substances on and in metochondria and corresponding active substances | |
AU2021226089A1 (en) | Antisense nucleic acid inducing skipping of exon 51 | |
US6872809B2 (en) | Nucleoside derivatives | |
US20160016989A1 (en) | Synthetic Polymers Containing Amino Acid Side Chains | |
US20030162739A1 (en) | Antisense molecules and method of controlling expression of gene function by using the same | |
JPH01226899A (ja) | 新規ペプチド | |
JP2003219874A (ja) | Rnaに選択的に結合するペプチド核酸をアンチセンスオリゴヌクレオチドとして用いる方法、及び該ペプチド核酸の製造方法 |