RU2017146342A - Рекомбинантный микроорганизм для улучшенного получения химических продуктов тонкого органического синтеза - Google Patents

Рекомбинантный микроорганизм для улучшенного получения химических продуктов тонкого органического синтеза Download PDF

Info

Publication number
RU2017146342A
RU2017146342A RU2017146342A RU2017146342A RU2017146342A RU 2017146342 A RU2017146342 A RU 2017146342A RU 2017146342 A RU2017146342 A RU 2017146342A RU 2017146342 A RU2017146342 A RU 2017146342A RU 2017146342 A RU2017146342 A RU 2017146342A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
nucleic acid
acid molecule
seq
polypeptide
gene
Prior art date
Application number
RU2017146342A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2017146342A3 (ru
Inventor
Квингжао ВАНГ
Шакир Сираж РАТАНИ
Жейан ГУО
Хартвиг ШРЕДЕР
Хольгер ХАРТМАНН
Маркус ПОМПЕЙУС
Original Assignee
Басф Се
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Басф Се filed Critical Басф Се
Publication of RU2017146342A publication Critical patent/RU2017146342A/ru
Publication of RU2017146342A3 publication Critical patent/RU2017146342A3/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/195—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
    • C07K14/24—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria from Enterobacteriaceae (F), e.g. Citrobacter, Serratia, Proteus, Providencia, Morganella, Yersinia
    • C07K14/245—Escherichia (G)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
    • C12N1/20—Bacteria; Culture media therefor
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/70—Vectors or expression systems specially adapted for E. coli
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P13/00—Preparation of nitrogen-containing organic compounds
    • C12P13/04—Alpha- or beta- amino acids
    • C12P13/06—Alanine; Leucine; Isoleucine; Serine; Homoserine

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)

Claims (154)

1. Рекомбинантная молекула нуклеиновой кислоты, имеющая последовательность, выбранную из группы
(I) молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей последовательность SEQ ID NO: 3, 45, 49, 56, 57, 60 или 61, или
(II) молекулы нуклеиновой кислоты, имеющей по меньшей мере 80% идентичность с молекулой нуклеиновой кислоты SEQ ID NO: 3, 45, 49, 56, 57, 60 или 61, или
(III) молекулы нуклеиновой кислоты, гибридизующейся с комплементом молекулы нуклеиновой кислоты, имеющей SEQ ID NO: 3, 45, 49, 56, 57, 60 или 61, при строгих условиях, или
(IV) молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид SEQ ID NO: 4, 46 или 50, или
(V) молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид, имеющий по меньшей мере 60% гомологичность с полипептидом SEQ ID NO: 4, 46 или 50,
где кодон генов согласно (I) - (V), соответствующий положению 286-288 в SEQ ID NO: 45, не кодирует аминокислоту аланин и не является стоп-кодоном, или аминокислота белков, кодируемых генами согласно (I) - (V), соответствующая положению 96 в SEQ ID NO: 46, не представляет собой аланин и не представляет собой стоп-кодон, и
где кодон генов согласно (I) - (V), соответствующий положению 43-45 в SEQ ID NO: 49, не кодирует аминокислоту аланин и не является стоп-кодоном, или аминокислота белков, кодируемых генами согласно (I) - (V), соответствующая положению 15 в SEQ ID NO: 50, не представляет собой аланин и не является стоп-кодоном.
2. Рекомбинантная молекула нуклеиновой кислоты по п. 1, имеющая последовательность SEQ ID NO: 45, или ее гомологи, как определено в (II) - (V), где кодон, кодирующий аминокислоту аланин, соответствующий положению 286-288 в SEQ ID NO: 45, был замещен на кодон, кодирующий аминокислоту глутаминовая кислота или аминокислоту, родственную глутаминовой кислоте.
3. Рекомбинантная молекула нуклеиновой кислоты по п. 1, имеющая последовательность SEQ ID NO: 49, или ее гомологи, как определено в (II) - (V), где кодон, кодирующий аминокислоту аланин, соответствующий положению 43-45, был замещен на кодон, кодирующий аминокислоту треонин или аминокислоту, подобную треонину.
4. Рекомбинантная молекула аминокислоты, имеющая последовательность, выбранную из группы
(VI) молекулы аминокислоты, содержащей последовательность SEQ ID NO: 46, или
(VII) молекулы аминокислоты, имеющей по меньшей мере 60% идентичность с молекулой нуклеиновой кислоты SEQ ID NO: 46, или
где аминокислота белка согласно (VII), соответствующая положению 96 в SEQ ID NO: 46, не представляет собой аланин.
5. Рекомбинантная молекула аминокислоты, имеющая последовательность, выбранную из группы
(VI) молекулы аминокислоты, содержащей последовательность SEQ ID NO: 50, или
(VII) молекулы аминокислоты, имеющей по меньшей мере 60% идентичность с молекулой нуклеиновой кислоты SEQ ID NO: 50, или
где аминокислота белка согласно (VII), соответствующая положению 15 в SEQ ID NO: 50, не представляет собой аланин.
6. Рекомбинантная молекула аминокислоты по п. 4, где аминокислота аланин в положении, соответствующем положению 96 в SEQ ID NO 46, была замещена на глутаминовую кислоту или аминокислоту, родственную глутаминовой кислоте.
7. Рекомбинантная молекула аминокислоты по п. 5, где аминокислота аланин в положении, соответствующем положению 15 в SEQ ID NO 50, была замещена на треонин или аминокислоту, подобную треонину.
8. Рекомбинантная экспрессионная конструкция, содержащая по меньшей мере один промотор, функциональный в микроорганизме, функционально связанный с по меньшей мере одним из белков, кодирующих молекулы нуклеиновой кислоты, как определено в любом из пп. 1-3.
9. Рекомбинантный вектор, содержащий по меньшей мере одну из молекул нуклеиновых кислот, как определено в любом из пп. 1-3, или рекомбинантную экспрессионную конструкцию, как определено в п. 8.
10. Рекомбинантный микроорганизм, имеющий по меньшей мере одно из
а) уменьшенной, подавленной или исключенной активности и/или экспрессии гена brnQ или его гомолога или функционального варианта,
b) введенной, увеличенной, усиленной или измененной активности и/или экспрессии гена argP или его гомолога или функционального варианта,
c) введенной, увеличенной, усиленной или измененной активности и/или экспрессии гена gcvA или его гомолога или функционального варианта,
d) уменьшенной, подавленной или исключенной активности и/или экспрессии гена gcvB или его гомолога или функционального варианта,
e) (I) молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей последовательность SEQ ID NO: 49, или
(II) молекулы нуклеиновой кислоты, имеющей по меньшей мере 80% идентичность с молекулой нуклеиновой кислоты SEQ ID NO: 49, или
(III) молекулы нуклеиновой кислоты, гибридизующейся с комплементом молекулы нуклеиновой кислоты, имеющей SEQ ID NO: 49, при строгих условиях, или
(IV) молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид SEQ ID NO: 50, или
(V) молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид, имеющий по меньшей мере 60% гомологичность с полипептидом SEQ ID NO: 50,
где кодон генов согласно (I) - (V), соответствующий положению 43-45 в SEQ ID NO: 49, не кодирует аминокислоту аланин и не является стоп-кодоном, или аминокислота белков, кодируемых генами согласно (I) - (V), соответствующая положению 15 в SEQ ID NO: 50, не представляет собой аланин и не представляет собой стоп-кодон.
11. Рекомбинантный микроорганизм по п. 10, где ген brnQ выбирают из группы
(i) молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей последовательность SEQ ID NO: 1, или
(ii) молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей по меньшей мере 80% идентичность с молекулой нуклеиновой кислоты SEQ ID NO: 1, или
(iii) молекулы нуклеиновой кислоты, гибридизующейся с комплементом молекулы нуклеиновой кислоты, имеющей SEQ ID NO: 1, при строгих условиях, или
(iv) молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид SEQ ID NO: 2, или
(v) молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид, имеющий по меньшей мере 60% гомологичность с полипептидом SEQ ID NO: 2.
12. Рекомбинантный микроорганизм по п. 10, где ген argP выбирают из группы
(i) молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей последовательность SEQ ID NO: 45, или
(ii) молекулы нуклеиновой кислоты, имеющей по меньшей мере 80% идентичность с молекулой нуклеиновой кислоты SEQ ID NO: 45, или
(iii) молекулы нуклеиновой кислоты, гибридизующейся с комплементом молекулы нуклеиновой кислоты, имеющей SEQ ID NO: 45, при строгих условиях, или
(iv) молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид SEQ ID NO: 46, или
(v) молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид, имеющий по меньшей мере 60% гомологичность с полипептидом SEQ ID NO: 46.
13. Рекомбинантный микроорганизм по п. 10, где ген gcvA выбирают из группы
(i) молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей последовательность SEQ ID NO: 53, или
(ii) молекулы нуклеиновой кислоты, имеющей по меньшей мере 80% идентичность с молекулой нуклеиновой кислоты SEQ ID NO: 53, или
(iii) молекулы нуклеиновой кислоты, гибридизующейся с комплементом молекулы нуклеиновой кислоты, имеющей SEQ ID NO: 53, при строгих условиях, или
(iv) молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид SEQ ID NO: 54, или
(v) молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид, имеющий по меньшей мере 60% гомологичность с полипептидом SEQ ID NO: 54.
14. Рекомбинантный микроорганизм по п. 10, где ген gcvB выбирают из группы
(i) молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей последовательность SEQ ID NO: 58, или
(ii) молекулы нуклеиновой кислоты, имеющей по меньшей мере 80% идентичность с молекулой нуклеиновой кислоты SEQ ID NO: 58, или
(iii) молекулы нуклеиновой кислоты, гибридизующейся с комплементом молекулы нуклеиновой кислоты, имеющей SEQ ID NO: 58, при строгих условиях.
15. Рекомбинантный микроорганизм, содержащий по меньшей мере одну из рекомбинантных молекул нуклеиновой кислоты, как определено в любом из пп. 1-3, или рекомбинантную экспрессионную конструкцию по п. 8 или рекомбинантный вектор по п. 9.
16. Рекомбинантный микроорганизм по пп. 10-15, дополнительно содержащий введенную, увеличенную или усиленную активность и/или экспрессию гена alaD.
17. Рекомбинантный микроорганизм по пп. 10-15, дополнительно содержащий уменьшенную, подавленную или исключенную активность и/или экспрессию гена pflB.
18. Рекомбинантный микроорганизм по любому из пп. 10-15, дополнительно содержащий уменьшенную, подавленную или исключенную активность и/или экспрессию гена adhE.
19. Рекомбинантный микроорганизм по любому из пп. 10-15, дополнительно содержащий уменьшенную, подавленную или исключенную активность и/или экспрессию гена ldhA.
20. Рекомбинантный микроорганизм по любому из пп. 10-15, дополнительно содержащий уменьшенную, подавленную или исключенную активность и/или экспрессию гена pta.
21. Рекомбинантный микроорганизм по любому из пп. 10-15, дополнительно содержащий уменьшенную, подавленную или исключенную активность и/или экспрессию гена ackA.
22. Рекомбинантный микроорганизм по любому из пп. 10-15, дополнительно содержащий уменьшенную, подавленную или исключенную активность и/или экспрессию гена frdA.
23. Рекомбинантный микроорганизм по любому из пп. 10-15, дополнительно содержащий уменьшенную, подавленную или исключенную активность и/или экспрессию гена dadX.
24. Рекомбинантный микроорганизм по любому из пп. 10-15, дополнительно содержащий введенную, увеличенную или усиленную активность и/или экспрессию гена ygaW.
25. Рекомбинантный микроорганизм по любому из пп. 10-15, дополнительно содержащий введенную, увеличенную или усиленную активность и/или экспрессию гена zipA.
26. Рекомбинантный микроорганизм по любому из пп. 10-15, дополнительно содержащий введенную, увеличенную или усиленную активность и/или экспрессию гена lpd.
27. Рекомбинантный микроорганизм по п. 16, где ген alaD выбирают из группы, состоящей из
(ЕЕ) молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей последовательность SEQ ID NO: 15, или
(FF) молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей по меньшей мере 80% идентичность с молекулой нуклеиновой кислоты SEQ ID NO: 15, или
(GG) молекулы нуклеиновой кислоты, гибридизующейся с комплементом молекулы нуклеиновой кислоты, имеющей SEQ ID NO: 15, при строгих условиях, или
(НН) молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид SEQ ID NO: 16, или
(II) молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид, имеющий по меньшей мере 60% гомологичность с полипептидом SEQ ID NO: 16.
28. Рекомбинантный микроорганизм по п. 16, где ген alaD функционально связан с промотором, имеющим SEQ ID NO 115 или 116, или
(I) молекулой нуклеиновой кислоты, имеющей по меньшей мере 80% идентичность с молекулой нуклеиновой кислоты SEQ ID NO: 115 или 116, или
(II) молекулой нуклеиновой кислоты, гибридизующейся с молекулой, имеющей SEQ ID NO: 115 или 116 при умеренно жестких условиях, или
(III) фрагментом из по меньшей мере 10 нуклеотидов молекулы нуклеиновой кислоты, имеющей SEQ ID NO: 115.
29. Рекомбинантный микроорганизм по п. 17, где ген pflB выбирают из группы, состоящей из
(A) молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей последовательность SEQ ID NO: 5, или
(B) молекулы нуклеиновой кислоты, имеющей по меньшей мере 80% идентичность с молекулой нуклеиновой кислоты SEQ ID NO: 5, или
(C) молекулы нуклеиновой кислоты, гибридизующейся с комплементом молекулы нуклеиновой кислоты, имеющей SEQ ID NO: 5, при строгих условиях, или
(D) молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид SEQ ID NO: 6, или
(E) молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид, имеющий по меньшей мере 60% гомологичность с полипептидом SEQ ID NO: 6.
30. Рекомбинантный микроорганизм по п. 18, где ген adhE выбирают из группы, состоящей из
(F) молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей последовательность SEQ ID NO: 7, или
(G) молекулы нуклеиновой кислоты, имеющей по меньшей мере 80% идентичность с молекулой нуклеиновой кислоты SEQ ID NO: 7, или
(H) молекулы нуклеиновой кислоты, гибридизующейся с комплементом молекулы нуклеиновой кислоты, имеющей SEQ ID NO: 7 при строгих условиях, или
(I) молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид SEQ ID NO: 8, или
(J) молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид, имеющий по меньшей мере 60% гомологичность с полипептидом SEQ ID NO: 8.
31. Рекомбинантный микроорганизм по п. 19, где ген ldhA выбирают из группы, состоящей из
(K) молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей последовательность SEQ ID NO: 9, или
(L) молекулы нуклеиновой кислоты, имеющей по меньшей мере 80% идентичность с молекулой нуклеиновой кислоты SEQ ID NO: 9, или
(М) молекулы нуклеиновой кислоты, гибридизующейся с комплементом молекулы нуклеиновой кислоты, имеющей SEQ ID NO: 9, при строгих условиях, или
(N) молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид SEQ ID NO: 10, или
(О) молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид, имеющий по меньшей мере 60% гомологичность с полипептидом SEQ ID NO: 10.
32. Рекомбинантный микроорганизм по п. 20, где ген pta выбирают из группы, состоящей из
(Р) молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей последовательность SEQ ID NO: 11, или
(Q) молекулы нуклеиновой кислоты, имеющей по меньшей мере 80% идентичность с молекулой нуклеиновой кислоты SEQ ID NO: 11, или
(R) молекулы нуклеиновой кислоты, гибридизующейся с комплементом молекулы нуклеиновой кислоты, имеющей SEQ ID NO: 11, при строгих условиях, или
(S) молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид SEQ ID NO: 12, или
(Т) молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид, имеющий по меньшей мере 60% гомологичность с полипептидом SEQ ID NO: 12.
33. Рекомбинантный микроорганизм по п. 21, где ген ackA выбирают из группы, состоящей из
(U) молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей последовательность SEQ ID NO: 120, или
(V) молекулы нуклеиновой кислоты, имеющей по меньшей мере 80% идентичность с молекулой нуклеиновой кислоты SEQ ID NO: 120, или
(W) молекулы нуклеиновой кислоты, гибридизующейся с комплементом молекулы нуклеиновой кислоты, имеющей SEQ ID NO: 120, при строгих условиях, или
(X) молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид SEQ ID NO: 121, или
(Y) молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид, имеющий по меньшей мере 60% гомологичность с полипептидом SEQ ID NO: 121.
34. Рекомбинантный микроорганизм по п. 22, где ген frdA выбирают из группы, состоящей из
(Z) молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей последовательность SEQ ID NO: 13, или
(АА) молекулы нуклеиновой кислоты, имеющей по меньшей мере 80% идентичность с молекулой нуклеиновой кислоты SEQ ID NO: 13, или
(ВВ) молекулы нуклеиновой кислоты, гибридизующейся с комплементом молекулы нуклеиновой кислоты, имеющей SEQ ID NO: 13, при строгих условиях, или
(СС) молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид SEQ ID NO: 14, или
(DD) молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид, имеющий по меньшей мере 60% гомологичность с полипептидом SEQ ID NO: 14.
35. Рекомбинантный микроорганизм по п. 23, где ген dadX выбирают из группы, состоящей из
(JJ) молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей последовательность SEQ ID NO: 118, или
(KK) молекулы нуклеиновой кислоты, имеющей по меньшей мере 80% идентичность с молекулой нуклеиновой кислоты SEQ ID NO: 118, или
(LL) молекулы нуклеиновой кислоты, гибридизующейся с комплементом молекулы нуклеиновой кислоты, имеющей SEQ ID NO: 118, при строгих условиях, или
(ММ) молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид SEQ ID NO: 119, или
(NN) молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид, имеющий по меньшей мере 60% гомологичность с полипептидом SEQ ID NO: 119.
36. Рекомбинантный микроорганизм по п. 24, где ген ygaW выбирают из группы, состоящей из
(ОО) молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей последовательность SEQ ID NO: 109, или
(РР) молекулы нуклеиновой кислоты, имеющей по меньшей мере 80% идентичность с молекулой нуклеиновой кислоты SEQ ID NO: 109, или
(QQ) молекулы нуклеиновой кислоты, гибридизующейся с комплементом молекулы нуклеиновой кислоты, имеющей SEQ ID NO: 109, при строгих условиях, или
(RR) молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид SEQ ID NO: 110, или
(SS) молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид, имеющий по меньшей мере 60% гомологичность с полипептидом SEQ ID NO: 110.
37. Рекомбинантный микроорганизм по п. 25, где ген zipA выбирают из группы, состоящей из
(ТТ) молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей последовательность SEQ ID NO: 111, или
(UU) молекулы нуклеиновой кислоты, имеющей по меньшей мере 80% идентичность с молекулой нуклеиновой кислоты SEQ ID NO: 111, или
(VV) молекулы нуклеиновой кислоты, гибридизующейся с комплементом молекулы нуклеиновой кислоты, имеющей SEQ ID NO: 111, при строгих условиях, или
(WW) молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид SEQ ID NO: 112, или
(XX) молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид, имеющий по меньшей мере 60% гомологичность с полипептидом SEQ ID NO: 112.
38. Рекомбинантный микроорганизм по п. 26, где ген lpd выбирают из группы, состоящей из
(YY) молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей последовательность SEQ ID NO: 113, или
(ZZ) молекулы нуклеиновой кислоты, имеющей по меньшей мере 80% идентичность с молекулой нуклеиновой кислоты SEQ ID NO: 113, или
(AAA) молекулы нуклеиновой кислоты, гибридизующейся с комплементом молекулы нуклеиновой кислоты, имеющей SEQ ID NO: 113, при строгих условиях, или
(ВВВ) молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид SEQ ID NO: 114, или
(ССС) молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид, имеющий по меньшей мере 60% гомологичность с полипептидом SEQ ID NO: 114.
39. Рекомбинантный микроорганизм по любому из пп. 10-15, где микроорганизм выбирают из рода группы, состоящей из Corynebacterium, Bacillus, Erwinia, Escherichia, Pantoea, Streptomyces, Zymomonas, Rhodococcus и Saccharomyces.
40. Композиция, содержащая один или более рекомбинантных микроорганизмов по любому из пп. 10-39.
41. Композиция по п. 40, дополнительно содержащая среду или источник углерода.
42. Способ получения рекомбинантного микроорганизма с увеличенным выходом по пирувату, сукцинату, аспартату, малату, лактату, валину, лейцину и/или аланину, который включает следующие стадии:
(I) введение по меньшей мере одной из молекул нуклеиновой кислоты, как определено в любом из пп. 1-3, или по меньшей мере одной из молекул аминокислоты, как определено в любом из пп. 4-7, или экспрессионной конструкции по п. 8 или вектора по п. 9 в микроорганизм; и
(II) получение рекомбинантного микроорганизма с увеличенным выходом по пирувату, сукцинату, аспартату, малату, лактату, валину, лейцину и/или аланину по сравнению с эталонным микроорганизмом, не содержащим по меньшей мере одну из молекул нуклеиновой кислоты, как определено в любом из пп. 1-3, или по меньшей мере одну из молекул аминокислоты, как определено в любом из пп. 4-7, или экспрессионную конструкцию по п. 8 или вектор по п. 9.
43. Способ по п. 42, в котором рекомбинантный микроорганизм, применяемый в указанном способе, дополнительно содержит увеличенную или усиленную активность и/или экспрессию по меньшей мере одного гена, как определено в пп. 16, 24-28 и 36-38, и/или уменьшенную, подавленную или исключенную активность и/или экспрессию по меньшей мере одного гена, как определено в любом из пп. 17-23 и 29-35.
44. Способ по любому из пп. 42 или 43, в котором микроорганизм выбирают из рода группы, состоящей из Corynebacterium, Bacillus, Erwinia, Escherichia, Pantoea, Streptomyces, Zymomonas, Rhodococcus и Saccharomyces.
45. Способ получения пирувата, сукцината, аспартата, малата, лактата, валина, лейцина и/или аланина, включающий культивирование одного или более рекомбинантного микроорганизма по любому из пп. 10-39 в условиях, которые позволяют получение пирувата, сукцината, аспартата, малата, лактата, валина, лейцина и/или аланина.
46. Способ по п. 45, в котором микроорганизм культивируют в среде, содержащей от 0.5% до 30% (мас./об.) сахара.
47. Способ по п. 45, в котором выход пирувата, сукцината, аспартата, малата, лактата, валина, лейцина и/или аланина составляет по меньшей мере 80%.
48. Способ по любому из пп. 45-47, в котором хиральная чистота L-аланина составляет по меньшей мере 95%.
49. Способ культивирования или выращивания генетически модифицированного микроорганизма, включающий инокуляцию культуральной среды одним или более генетически модифицированными микроорганизмами по любому из пп. 10-39 и культивирование или выращивание указанного генетически модифицированного микроорганизма в культуральной среде.
50. Применение рекомбинантной молекулы нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-3, рекомбинантной молекулы аминокислоты по любому из пп. 4-7, рекомбинантной экспрессионной конструкции по п. 8, рекомбинантного вектора по п. 9, рекомбинантного микроорганизма по любому из пп. 10-39 или композиции по любому из пп. 40 или 41 для ферментативного получения пирувата, сукцината, аспартата, малата, лактата, валина, лейцина и/или аланина.
51. Способ ферментативного получения пирувата, сукцината, аспартата, малата, лактата, валина, лейцина и/или аланина, включающий стадии
I) выращивание микроорганизма по любому из пп. 10-39 в ферментере, и
II) выделение пирувата, сукцината, аспартата, малата, лактата, валина, лейцина и/или аланина из ферментативного бульона, полученного на стадии I).
RU2017146342A 2015-06-04 2016-06-02 Рекомбинантный микроорганизм для улучшенного получения химических продуктов тонкого органического синтеза RU2017146342A (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201562171036P 2015-06-04 2015-06-04
US62/171,036 2015-06-04
PCT/EP2016/062457 WO2016193351A2 (en) 2015-06-04 2016-06-02 Recombinant microorganism for improved production of fine chemicals

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2017146342A true RU2017146342A (ru) 2019-07-10
RU2017146342A3 RU2017146342A3 (ru) 2020-07-17

Family

ID=56119472

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2017146342A RU2017146342A (ru) 2015-06-04 2016-06-02 Рекомбинантный микроорганизм для улучшенного получения химических продуктов тонкого органического синтеза

Country Status (11)

Country Link
US (1) US10519474B2 (ru)
EP (1) EP3303372A2 (ru)
JP (1) JP7071124B2 (ru)
KR (1) KR20180011313A (ru)
CN (1) CN108350040B (ru)
BR (1) BR112017025923A2 (ru)
CA (1) CA2988415A1 (ru)
MX (1) MX2017015668A (ru)
PH (1) PH12017502215A1 (ru)
RU (1) RU2017146342A (ru)
WO (1) WO2016193351A2 (ru)

Families Citing this family (10)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US11952581B2 (en) 2003-08-01 2024-04-09 Basf Plant Science Gmbh Process for the production of polyunsaturated fatty acids in transgenic organisms
MX347962B (es) 2003-08-01 2017-05-19 Basf Plant Science Gmbh * Metodo para la produccion de acidos grasos poli-insaturados en organismos transgenicos.
AR059376A1 (es) 2006-02-21 2008-03-26 Basf Plant Science Gmbh Procedimiento para la produccion de acidos grasos poliinsaturados
KR20180011313A (ko) 2015-06-04 2018-01-31 바스프 에스이 정제 화학약품의 개선된 제조를 위한 재조합 미생물
RU2018100807A (ru) 2015-06-12 2019-07-12 Басф Се Рекомбинантный микроорганизм для улучшенного получения аланина
KR20180084135A (ko) 2015-12-02 2018-07-24 바스프 에스이 감소된 clr2 활성을 갖는 사상 진균에서 단백질을 생산하는 방법
CN108291191A (zh) 2015-12-02 2018-07-17 巴斯夫欧洲公司 在具有降低的clr1活性的丝状真菌中生产蛋白质的方法
WO2018209398A1 (en) * 2017-05-17 2018-11-22 Microbio Pty Ltd Biomarkers and uses thereof
CN108660142A (zh) * 2018-05-28 2018-10-16 河北大学 一种高产l-丙氨酸的基因及其工程菌的构建方法
KR102306010B1 (ko) 2021-04-07 2021-09-27 씨제이제일제당 (주) 신규한 분지쇄아미노산 투과효소 변이체 및 이를 이용한 l-발린 생산 방법

Family Cites Families (26)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE3853683T2 (de) 1987-10-07 1995-08-31 Univ Washington Verfahren zur erhaltung eines erwünschten rekombinanten gens in einer genetischen zellpopulation.
US5019509A (en) 1988-04-20 1991-05-28 Genetics Institute, Inc. Method and compositions for the production of l-alanine and derivatives thereof
DE4319935A1 (de) 1993-06-16 1994-12-22 Basf Ag Verwendung von Glycin-N,N-diessigsäure-Derivaten als Komplexbildner für Erdalkali- und Schwermetallionen
WO1995015972A1 (en) 1993-12-09 1995-06-15 Thomas Jefferson University Compounds and methods for site-directed mutations in eukaryotic cells
US6555732B1 (en) 1998-09-14 2003-04-29 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Rac-like genes and methods of use
RU2268305C2 (ru) 2003-12-18 2006-01-20 Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт "Аджиномото-Генетика" (ЗАО АГРИ) Способ получения l-аминокислот с использованием бактерий с оптимизированным уровнем генной экспрессии
DE102004003411A1 (de) 2004-01-23 2005-09-01 Degussa Ag Verfahren zur Herstellung von L-Aminosäuren unter Verwendung von Stämmen der Familie Enterobacteriaceae
JP4836440B2 (ja) * 2004-03-10 2011-12-14 センター・フォー・ディーエヌエイ・フィンガープリンティング・アンド・ダイアグノスティックス 微生物を用いたアルギニン産生の方法
WO2007120198A2 (en) 2005-11-08 2007-10-25 University Of Florida Research Foundation, Inc. Materials and methods for improved microbial production of organic compounds
EP2055771A3 (en) * 2006-03-23 2009-07-08 Ajinomoto Co., Inc. A method for producing an L-amino acid using bacterium of the Enterobacteriaceae family with attenuated expression of a gene coding for small RNA
JP2010110217A (ja) 2007-02-22 2010-05-20 Ajinomoto Co Inc Ｌ−アミノ酸生産菌及びｌ−アミノ酸の製造法
WO2008119009A2 (en) 2007-03-27 2008-10-02 University Of Florida Research Foundation, Inc. Materials and methods for efficient alanine production
US20100317084A1 (en) 2007-05-10 2010-12-16 The Arizona Board Of Regents For And On Behalf Of Arizona State University Recombinant bacteria comprising vectors for expression of nucleic acid sequences encoding antigens
RU2392322C2 (ru) 2007-08-14 2010-06-20 Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт Аджиномото-Генетика" (ЗАО АГРИ) СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ L-ТРЕОНИНА С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ БАКТЕРИИ, ПРИНАДЛЕЖАЩЕЙ К РОДУ Escherichia, В КОТОРОЙ ИНАКТИВИРОВАН ГЕН yahN
RU2007147436A (ru) * 2007-12-21 2009-06-27 Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт Аджиномото-Генетика" (ЗАО АГРИ) (RU) Бактерия-продуцент (2s,3r,4s)-4-гидрокси-l-изолейцина и способ продукции (2s,3r,4s)-4-гидрокси-l-изолейцина
US7915011B2 (en) * 2009-03-05 2011-03-29 E.I. Du Pont De Nemours And Company Host cell modifications that improve peptide production and downstream processing
MX2013012811A (es) 2011-05-03 2014-02-10 Basf Se Procedimiento para preparar una sal trialcalinometalica cristalina de l-mgda.
JP2013000064A (ja) 2011-06-17 2013-01-07 Tohoku Univ 組換え微生物、当該組換え微生物を用いたアラニンの製造方法
ES2800341T3 (es) 2012-07-11 2020-12-29 Adisseo France Sas Método para la preparación de 2,4-dihidroxibutirato
CA2920814A1 (en) 2013-08-30 2015-03-05 Basf Se Modified microorganism for improved production of alanine
CN105683378B (zh) 2013-09-25 2021-06-29 巴斯夫欧洲公司 用于精细化学品的改进生产的重组微生物
CN113481217A (zh) * 2013-12-13 2021-10-08 巴斯夫欧洲公司 用于精细化学品的改进生产的重组微生物
CA2942990A1 (en) 2014-03-19 2015-09-24 Basf Se The use of glycerol with limited feed of carbohydrates for fermentation
WO2016063172A1 (en) 2014-10-24 2016-04-28 Koninklijke Philips N.V. Determining if airway clearance is required during respiratory therapy
KR20180011313A (ko) 2015-06-04 2018-01-31 바스프 에스이 정제 화학약품의 개선된 제조를 위한 재조합 미생물
RU2018100807A (ru) * 2015-06-12 2019-07-12 Басф Се Рекомбинантный микроорганизм для улучшенного получения аланина

Also Published As

Publication number Publication date
JP2018517413A (ja) 2018-07-05
CA2988415A1 (en) 2016-12-08
MX2017015668A (es) 2018-08-15
US20180148748A1 (en) 2018-05-31
EP3303372A2 (en) 2018-04-11
JP7071124B2 (ja) 2022-05-18
WO2016193351A3 (en) 2017-01-12
PH12017502215A1 (en) 2018-07-02
WO2016193351A2 (en) 2016-12-08
CN108350040A (zh) 2018-07-31
CN108350040B (zh) 2022-03-25
RU2017146342A3 (ru) 2020-07-17
BR112017025923A2 (pt) 2018-08-14
KR20180011313A (ko) 2018-01-31
US10519474B2 (en) 2019-12-31

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2017146342A (ru) Рекомбинантный микроорганизм для улучшенного получения химических продуктов тонкого органического синтеза
RU2016115777A (ru) Рекомбинантный микроорганизм для улучшенного получения химических веществ тонкого органического синтеза
RU2017136561A (ru) Рекомбинантный микроорганизм для улучшенного получения химических продуктов тонкого органического синтеза
RU2459871C2 (ru) Способ ферментативного получения 2-гидрокси-2-метилкарбоновых кислот
RU2018100807A (ru) Рекомбинантный микроорганизм для улучшенного получения аланина
CN105899664A (zh) 用于精细化学品的改进生产的重组微生物
JP2019519242A5 (ru)
AU780433B2 (en) Novel enzymes which dehydrate glycerol
US10435720B2 (en) Recombinant microorganism having enhanced D(-) 2,3-butanediol producing ability and method for producing D(-) 2,3-butanediol using the same
CN110106206B (zh) 一种提高l-赖氨酸产量及稳定性的谷氨酸棒状杆菌构建方法
EP2977444B1 (en) Recombinant microorganism with increased productivity of 2,3-butanediol, and method for producing 2,3-butanediol using same
RU2016111682A (ru) Модифицированный микроорганизм для улучшенного получения аланина
US20150211028A1 (en) Production of 1,3-Propanediol in Cyanobacteria
CN112204146A (zh) 具有受抑制的乙醇产生途径的耐酸酵母及使用其生产乳酸的方法
US11136596B2 (en) Long-chain dibasic acid with low content of hydroxyl acid impurity and production method thereof
US10053716B2 (en) 4-amino cinnamic acid production method using enzyme
JP2015530121A5 (ru)
CN109456987A (zh) 高产l-亮氨酸的相关基因及工程菌构建方法与应用
KR101781294B1 (ko) 글리세롤을 탄소원으로 이용하는 고생장성 대장균
US10006008B2 (en) Recombinant microorganism having enhanced ability to produce 2,3-butanediol and method for producing 2,3-butanediol using same
US9222110B2 (en) Microorganism and method for lactic acid production
CN107810266B (zh) 二醇生成用重组微生物
EP4317442A1 (en) Recombinant microorganism for producing 2,3-butanediol with reduced by-product production and method for producing 2,3-butanediol by using same
KR102253701B1 (ko) 하이브리드형 해당 경로
CN111334445B (zh) 长链二元酸生产菌株及其制备方法和应用

Legal Events

Date Code Title Description
FA92 Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted)

Effective date: 20210114