RU2016111682A - Модифицированный микроорганизм для улучшенного получения аланина - Google Patents
Модифицированный микроорганизм для улучшенного получения аланина Download PDFInfo
- Publication number
- RU2016111682A RU2016111682A RU2016111682A RU2016111682A RU2016111682A RU 2016111682 A RU2016111682 A RU 2016111682A RU 2016111682 A RU2016111682 A RU 2016111682A RU 2016111682 A RU2016111682 A RU 2016111682A RU 2016111682 A RU2016111682 A RU 2016111682A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- nucleic acid
- gene
- identity
- amino acid
- modified microorganism
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P13/00—Preparation of nitrogen-containing organic compounds
- C12P13/04—Alpha- or beta- amino acids
- C12P13/06—Alanine; Leucine; Isoleucine; Serine; Homoserine
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
- C12N1/20—Bacteria; Culture media therefor
- C12N1/205—Bacterial isolates
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/0004—Oxidoreductases (1.)
- C12N9/0012—Oxidoreductases (1.) acting on nitrogen containing compounds as donors (1.4, 1.5, 1.6, 1.7)
- C12N9/0014—Oxidoreductases (1.) acting on nitrogen containing compounds as donors (1.4, 1.5, 1.6, 1.7) acting on the CH-NH2 group of donors (1.4)
- C12N9/0016—Oxidoreductases (1.) acting on nitrogen containing compounds as donors (1.4, 1.5, 1.6, 1.7) acting on the CH-NH2 group of donors (1.4) with NAD or NADP as acceptor (1.4.1)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y104/00—Oxidoreductases acting on the CH-NH2 group of donors (1.4)
- C12Y104/01—Oxidoreductases acting on the CH-NH2 group of donors (1.4) with NAD+ or NADP+ as acceptor (1.4.1)
- C12Y104/01001—Alanine dehydrogenase (1.4.1.1)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12R—INDEXING SCHEME ASSOCIATED WITH SUBCLASSES C12C - C12Q, RELATING TO MICROORGANISMS
- C12R2001/00—Microorganisms ; Processes using microorganisms
- C12R2001/01—Bacteria or Actinomycetales ; using bacteria or Actinomycetales
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- Virology (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
Claims (57)
1. Модифицированный микроорганизм из семейства Pasteurellaceae, характеризующийся увеличенной экспрессией и/или увеличенной активностью фермента, кодируемого геном alaD, который кодирует аланиндегидрогеназу, ЕС 1.4.1.1,
причем увеличенная экспрессия и/или активность гена alaD по сравнению с его диким типом достигается
a) путем вставки экспрессионной конструкции, экспрессирующей ген alaD, в геном модифицированного микроорганизма,
b) путем увеличения числа копий гена alaD,
c) более сильным промотором по сравнению с диким типом гена alaD,
d) путем увеличения активности генов, повышающе регулирующих активность гена alaD, или путем уменьшения активности генов, понижающе регулирующих активность гена alaD.
2. Модифицированный микроорганизм по п. 1, содержащий 16S рДНК согласно SEQ ID NO: 1 или последовательность, которая демонстрирует идентичность последовательности, составляющую по меньшей мере 96% относительно SEQ ID NO: 1, и/или содержащий 23S рДНК согласно SEQ ID NO: 2 или последовательность, которая демонстрирует идентичность последовательности, составляющую по меньшей мере 96% относительно SEQ ID NO: 2.
3. Модифицированный микроорганизм по п. 1, причем модифицированный микроорганизм принадлежит роду Basfia.
4. Модифицированный микроорганизм по п. 3, причем модифицированный микроорганизм принадлежит виду Basfia succinicproducens.
5. Модифицированный микроорганизм по п. 4, причем дикий тип, из которого получен модифицированный микроорганизм, представляет собой штамм Basfia succiniciproducens, DD1, депонированный под номером DSM 18541 в DSMZ, Германия.
6. Модифицированный микроорганизм по п. 1 или 2, в котором ген alaD содержит нуклеиновую кислоту, выбранную из группы, состоящей из:
a) нуклеиновой кислоты, имеющей нуклеотидную последовательность SEQ ID NO: 3;
b) нуклеиновой кислоты, кодирующей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 4;
c) нуклеиновых кислот, которые являются по меньшей мере на 80% идентичными нуклеиновой кислоте согласно а) или b), причем идентичность представляет собой идентичность по всей длине нуклеиновых кислот согласно а) или b); и
d) нуклеиновых кислот, кодирующих аминокислотную последовательность, которая является по меньшей мере на 60% идентичной аминокислотной последовательности, кодируемой нуклеиновой кислотой согласно а) или b), причем идентичность представляет собой идентичность по всей длине аминокислотной последовательности, кодируемой нуклеиновыми кислотами согласно а) или b).
7. Модифицированный микроорганизм по п. 1 или 2, причем микроорганизм дополнительно характеризуется
a) сниженной активностью пируватформиатлиазы,
b) сниженной активностью лактатдегидрогеназы,
c) сниженной активностью фосфоенолпируваткарбоксилазы или
d) любой их комбинацией.
8. Модифицированный микроорганизм по п. 1 или 2, причем микроорганизм содержит:
a) делецию гена ldhA или по меньшей мере его части, делецию регуляторного элемента гена ldhA или по меньшей мере его части или введение по меньшей мере одной вредной мутации в ген ldhA;
b) делецию гена pflD или по меньшей мере его части, делецию регуляторного элемента гена pflD или по меньшей мере его части или введение по меньшей мере одной вредной мутации в ген pflD;
c) делецию гена pflA или по меньшей мере его части, делецию регуляторного элемента гена pflA или по меньшей мере его части или введение по меньшей мере одной вредной мутации в ген pflA;
d) делецию гена pckA или по меньшей мере его части, делецию регуляторного элемента гена pckA или по меньшей мере его части или введение по меньшей мере одной вредной мутации в ген pckA; или
e) любую их комбинацию.
9. Модифицированный микроорганизм по п. 1 или 2, в котором ген ldhA содержит нуклеиновую кислоту, выбранную из группы, состоящей из:
a) нуклеиновой кислоты, имеющей нуклеотидную последовательность SEQ ID NО:5;
b) нуклеиновой кислоты, кодирующей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6;
c) нуклеиновой кислоты, которая является по меньшей мере на 80% идентичной нуклеиновой кислоте согласно а) или b), причем идентичность представляет собой идентичность по всей длине нуклеиновых кислот согласно а) или b); и
d) нуклеиновых кислот, кодирующих аминокислотную последовательность, которая является по меньшей мере на 80% идентичной аминокислотной последовательности, кодируемой нуклеиновой кислотой согласно а) или b), причем идентичность представляет собой идентичность по всей длине аминокислотной последовательности, кодируемой нуклеиновыми кислотами согласно а) или b).
10. Модифицированный микроорганизм по п. 8,
в котором ген pflD содержит нуклеиновую кислоту, выбранную из группы, состоящей из:
a) нуклеиновой кислоты, имеющей нуклеотидную последовательность SEQ ID NO: 7;
b) нуклеиновой кислоты, кодирующей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 8;
c) нуклеиновых кислот, которые являются по меньшей мере на 80% идентичными нуклеиновой кислоте согласно а) или b), причем идентичность представляет собой идентичность по всей длине нуклеиновых кислот согласно а) или b); и
d) нуклеиновых кислот, кодирующих аминокислотную последовательность, которая является по меньшей мере на 80% идентичной аминокислотной последовательности, кодируемой нуклеиновой кислотой согласно а) или b), причем
идентичность представляет собой идентичность по всей длине аминокислотной последовательности, кодируемой нуклеиновыми кислотами согласно а) или b).
11. Модифицированный микроорганизм по п. 8,
в котором ген pflA содержит нуклеиновую кислоту, выбранную из группы, состоящей из:
a) нуклеиновой кислоты, имеющей нуклеотидную последовательность SEQ ID NO: 9;
b) нуклеиновой кислоты, кодирующей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 10;
c) нуклеиновых кислот, которые являются по меньшей мере на 80% идентичными нуклеиновой кислоте согласно а) или b), причем идентичность представляет собой идентичность по всей длине нуклеиновых кислот согласно а) или b);и
d) нуклеиновых кислот, кодирующих аминокислотную последовательность, которая является по меньшей мере на 80% идентичной аминокислотной последовательности, кодируемой нуклеиновой кислотой согласно а) или b), причем идентичность представляет собой идентичность по всей длине аминокислотной последовательности, кодируемой нуклеиновыми кислотами согласно а) или b).
12. Модифицированный микроорганизм по п. 8, в котором ген pckA содержит:
a) нуклеиновую кислоту, имеющую нуклеотидную последовательность SEQ ID NO: 11;
b) нуклеиновую кислоту, кодирующую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 12;
c) нуклеиновую кислоту, которая является по меньшей мере на 80% идентичной нуклеиновой кислоте согласно а) или b), причем идентичность представляет собой идентичность по всей длине нуклеиновых кислот согласно а) или b); и
d) нуклеиновые кислоты, кодирующие аминокислотную последовательность, которая является по меньшей мере на 80% идентичной аминокислотной последовательности, кодируемой нуклеиновой кислотой согласно а) или b), причем идентичность представляет собой идентичность по всей длине аминокислотной последовательности, кодируемой нуклеиновыми кислотами согласно а) или b).
13. Способ получения аланина, включающий:
I) культивирование модифицированного микроорганизма по любому одному из пп. 1-12 при подходящих условиях культивирования в культуральной среде с обеспечением для модифицированного микроорганизма возможности продуцировать аланин, тем самым получая ферментативный бульон, содержащий аланин;
II) извлечение аланина из ферментативного бульона, полученного на стадии способа I).
14. Способ по п. 13, в котором культуральная среда в качестве ассимилируемого источника углерода содержит глюкозу, сахарозу, ксилозу, арабинозу и/или глицерин.
15. Способ по п. 13, в котором культивирование модифицированного микроорганизма проводят при анаэробных или микораэробных условиях.
16. Способ по любому одному из пп. 13-15, где способ дополнительно включает стадию:
превращение аланина, содержащегося в ферментативном бульоне, полученном на стадии способа I), или превращение извлеченного аланина, полученного на стадии способа II), во вторичный органический продукт, отличающийся от аланина, по меньшей мере одной химической реакцией.
17. Применение модифицированного микроорганизма по любому одному из пп. 1-12 для ферментативного получения аланина.
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
EP13182425.2 | 2013-08-30 | ||
EP13182425 | 2013-08-30 | ||
PCT/IB2014/063950 WO2015028915A1 (en) | 2013-08-30 | 2014-08-18 | Modified microorganism for improved production of alanine |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2016111682A true RU2016111682A (ru) | 2017-10-05 |
Family
ID=49036529
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2016111682A RU2016111682A (ru) | 2013-08-30 | 2014-08-18 | Модифицированный микроорганизм для улучшенного получения аланина |
Country Status (10)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US20160304917A1 (ru) |
EP (1) | EP3039121A4 (ru) |
JP (1) | JP2016529901A (ru) |
KR (1) | KR20160043973A (ru) |
CN (1) | CN105593361A (ru) |
BR (1) | BR112016002105A2 (ru) |
CA (1) | CA2920814A1 (ru) |
MX (1) | MX2016002651A (ru) |
RU (1) | RU2016111682A (ru) |
WO (1) | WO2015028915A1 (ru) |
Families Citing this family (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US10047364B2 (en) | 2013-09-25 | 2018-08-14 | Basf Se | Recombinant microorganism for improved production of fine chemicals |
MY193287A (en) | 2013-12-13 | 2022-09-30 | Basf Se | Recombinant microorganism for improved production of fine chemicals |
RU2017146342A (ru) | 2015-06-04 | 2019-07-10 | Басф Се | Рекомбинантный микроорганизм для улучшенного получения химических продуктов тонкого органического синтеза |
MY189932A (en) | 2015-06-12 | 2022-03-22 | Basf Se | Recombinant microorganism for improved production of alanine |
CN107937361B (zh) * | 2018-01-15 | 2019-02-12 | 金华利家园生物工程有限公司 | 一种丙氨酸脱氢酶突变体及其应用 |
CN110305823B (zh) * | 2018-11-16 | 2021-05-04 | 江南大学 | 采用乳酸生产l-丙氨酸的方法及菌株 |
EP3960879A1 (en) * | 2020-09-01 | 2022-03-02 | Metabolic Explorer | Microorganism and method for the improved production of alanine |
Family Cites Families (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2008119009A2 (en) * | 2007-03-27 | 2008-10-02 | University Of Florida Research Foundation, Inc. | Materials and methods for efficient alanine production |
US8574875B2 (en) * | 2007-08-17 | 2013-11-05 | Basf Se | Bacterial strain and process for the fermentative production of organic acids |
CA2751280C (en) * | 2009-02-16 | 2019-03-12 | Basf Se | Novel microbial succinic acid producers and purification of succinic acid |
CN101974476A (zh) * | 2010-08-31 | 2011-02-16 | 安徽华恒生物工程有限公司 | 一种高产l-丙氨酸的xz-a26菌株及构建方法与应用 |
CN103045528B (zh) * | 2012-12-28 | 2014-05-07 | 安徽华恒生物工程有限公司 | 生产dl-丙氨酸的工程菌及利用该工程菌生产dl-丙氨酸的方法 |
-
2014
- 2014-08-18 CN CN201480047262.1A patent/CN105593361A/zh active Pending
- 2014-08-18 WO PCT/IB2014/063950 patent/WO2015028915A1/en active Application Filing
- 2014-08-18 BR BR112016002105A patent/BR112016002105A2/pt not_active Application Discontinuation
- 2014-08-18 US US14/914,855 patent/US20160304917A1/en not_active Abandoned
- 2014-08-18 RU RU2016111682A patent/RU2016111682A/ru not_active Application Discontinuation
- 2014-08-18 EP EP14839975.1A patent/EP3039121A4/en not_active Withdrawn
- 2014-08-18 CA CA2920814A patent/CA2920814A1/en not_active Abandoned
- 2014-08-18 JP JP2016537409A patent/JP2016529901A/ja active Pending
- 2014-08-18 KR KR1020167004780A patent/KR20160043973A/ko not_active Application Discontinuation
- 2014-08-18 MX MX2016002651A patent/MX2016002651A/es unknown
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
BR112016002105A2 (pt) | 2017-08-29 |
EP3039121A1 (en) | 2016-07-06 |
KR20160043973A (ko) | 2016-04-22 |
MX2016002651A (es) | 2016-09-23 |
JP2016529901A (ja) | 2016-09-29 |
WO2015028915A1 (en) | 2015-03-05 |
CN105593361A (zh) | 2016-05-18 |
CA2920814A1 (en) | 2015-03-05 |
EP3039121A4 (en) | 2017-05-03 |
US20160304917A1 (en) | 2016-10-20 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
RU2016111682A (ru) | Модифицированный микроорганизм для улучшенного получения аланина | |
US9023632B2 (en) | Microbial succinic acid producers and purification of succinic acid | |
EP2054502B1 (en) | Novel engineered microorganism producing homo-succinic acid and method for preparing succinic acid using the same | |
US10443078B2 (en) | Pichia kudriavzevii NG7 microorganism and uses thereof | |
US20150010968A1 (en) | Biological alkene oxidation | |
KR101616171B1 (ko) | 유기산 제조에서의 모나스쿠스의 용도 | |
RU2017146342A (ru) | Рекомбинантный микроорганизм для улучшенного получения химических продуктов тонкого органического синтеза | |
RU2017136561A (ru) | Рекомбинантный микроорганизм для улучшенного получения химических продуктов тонкого органического синтеза | |
US10287571B2 (en) | Genetically modified microorganism for improved production of fine chemicals on sucrose | |
KR101103839B1 (ko) | 순수 숙신산 생성 변이균주 및 이를 이용한 숙신산제조방법 | |
US9932609B2 (en) | Recombinant microorganism having enhanced 1,3-propanediol producing ability and method for producing 1,3-propanediol using the same | |
EP3591062A1 (en) | Long-chain dibasic acid with low content of hydroxyl acid impurity and production method thereof | |
JP6580051B2 (ja) | コハク酸生産のための改善された微生物 | |
EP3102672A1 (en) | Modified microorganism for improved production of fine chemicals on sucrose | |
JP2015228804A (ja) | 2,3−ブタンジオール生産能を有する微生物およびそれを用いた2,3−ブタンジオールの製造方法、1,3−ブタジエンの製造方法 | |
CN105593368B (zh) | 2,3-丁二醇的生成能力得到增加的重组微生物及利用其的2,3-丁二醇的生产方法 | |
CN113840909A (zh) | 从气态底物发酵生产2-苯乙醇 | |
US11279955B2 (en) | Process for producing an organic compound | |
US10087425B2 (en) | Chimeric enzymes for conversion of lignin-derived chemicals | |
WO2016030373A1 (en) | Modified microorganism for improved production of fine chemicals on sucrose | |
WO2019122144A1 (en) | Modified microorganism for improved production of succinate | |
CN112368392A (zh) | 用于由非生物合成料流合成碳产物的方法 | |
CN117693588A (zh) | 用于改进乙二醇的生物产生的微生物和方法 | |
KR20180068819A (ko) | 클로스트리디움 아세토부티리쿰 ATCC 824 유래 FeFe-수소화효소 유전자를 포함하는 셔틀벡터 | |
CN107190029A (zh) | 使用新型酶的d型乳酸的制备 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
FA93 | Acknowledgement of application withdrawn (no request for examination) |
Effective date: 20170821 |