RU2015117993A - Анализ клетки с помощью массовой цитометрии - Google Patents

Анализ клетки с помощью массовой цитометрии Download PDF

Info

Publication number
RU2015117993A
RU2015117993A RU2015117993A RU2015117993A RU2015117993A RU 2015117993 A RU2015117993 A RU 2015117993A RU 2015117993 A RU2015117993 A RU 2015117993A RU 2015117993 A RU2015117993 A RU 2015117993A RU 2015117993 A RU2015117993 A RU 2015117993A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
elementary
cells
group
suitable cell
interest
Prior art date
Application number
RU2015117993A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2636352C2 (ru
Inventor
Владимир БАРАНОВ
Original Assignee
Флуидигм Кэнада Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Флуидигм Кэнада Инк. filed Critical Флуидигм Кэнада Инк.
Publication of RU2015117993A publication Critical patent/RU2015117993A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2636352C2 publication Critical patent/RU2636352C2/ru

Links

Classifications

    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N15/00Investigating characteristics of particles; Investigating permeability, pore-volume or surface-area of porous materials
    • G01N15/10Investigating individual particles
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N1/00Sampling; Preparing specimens for investigation
    • G01N1/02Devices for withdrawing samples
    • G01N1/04Devices for withdrawing samples in the solid state, e.g. by cutting
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/483Physical analysis of biological material
    • G01N33/4833Physical analysis of biological material of solid biological material, e.g. tissue samples, cell cultures
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/569Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for microorganisms, e.g. protozoa, bacteria, viruses
    • HELECTRICITY
    • H01ELECTRIC ELEMENTS
    • H01JELECTRIC DISCHARGE TUBES OR DISCHARGE LAMPS
    • H01J49/00Particle spectrometers or separator tubes
    • H01J49/02Details
    • H01J49/04Arrangements for introducing or extracting samples to be analysed, e.g. vacuum locks; Arrangements for external adjustment of electron- or ion-optical components
    • H01J49/0409Sample holders or containers
    • H01J49/0418Sample holders or containers for laser desorption, e.g. matrix-assisted laser desorption/ionisation [MALDI] plates or surface enhanced laser desorption/ionisation [SELDI] plates
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12MAPPARATUS FOR ENZYMOLOGY OR MICROBIOLOGY; APPARATUS FOR CULTURING MICROORGANISMS FOR PRODUCING BIOMASS, FOR GROWING CELLS OR FOR OBTAINING FERMENTATION OR METABOLIC PRODUCTS, i.e. BIOREACTORS OR FERMENTERS
    • C12M1/00Apparatus for enzymology or microbiology
    • C12M1/34Measuring or testing with condition measuring or sensing means, e.g. colony counters
    • C12M1/343Mass spectrometry
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N1/00Sampling; Preparing specimens for investigation
    • G01N1/02Devices for withdrawing samples
    • G01N1/04Devices for withdrawing samples in the solid state, e.g. by cutting
    • G01N2001/045Laser ablation; Microwave vaporisation
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N15/00Investigating characteristics of particles; Investigating permeability, pore-volume or surface-area of porous materials
    • G01N15/10Investigating individual particles
    • G01N2015/1006Investigating individual particles for cytology
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N15/00Investigating characteristics of particles; Investigating permeability, pore-volume or surface-area of porous materials
    • G01N15/10Investigating individual particles
    • G01N2015/103Particle shape

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Optics & Photonics (AREA)
  • Dispersion Chemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
  • Investigating, Analyzing Materials By Fluorescence Or Luminescence (AREA)
  • Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
  • Other Investigation Or Analysis Of Materials By Electrical Means (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

1. Способ клеточного анализа с помощью массовой цитометрии, содержащий:обеспечение группы клеток (18), маркированных более чем одним отличающимся элементарным маркером (Tn);выбор подходящей клетки (20) в группе клеток (18) путем идентификации локализации подходящей клетки (20), имеющей интересующее свойство;запись локализации (22) подходящей клетки (20) согласно ее положению внутри группы клеток (18);направление по меньшей мере одного лазерного импульса (24) на подходящую клетку (20) в записанной локализации (22) и генерирование дискретного шлейфа (26) для каждого из по меньшей мере одного лазерного импульса (24), причем каждый дискретный шлейф (26) содержит более одного отличающегося элементарного маркера (Tn);введение каждого дискретного шлейфа (26) в индуктивно сопряженную плазму (14) и генерирование групп элементарных ионов (28), соответствующих каждому из более чем одного отличающихся элементарных маркеров (Tn);обнаружение каждой из групп элементарных ионов (28) одновременно для каждого дискретного шлейфа (26) с помощью массовой цитометрии; икорреляцию обнаруженных элементарных ионов (28) с интересующим свойством.2. Способ по п. 1, в котором обеспечение группы клеток (18), маркированных более чем одним отличающимся элементарным маркером (Tn), содержит маркировку группы клеток (18) более чем одним сопряженным с элементом антителом, причем каждое из более, чем одного сопряженных с элементом антител содержит один или более отличающийся элементарный маркер (Tn).3. Способ по п. 2, в котором один или более отличающийся элементарный маркер (Tn) выбирается из группы, содержащий переходные металлы.4. Способ по п. 3, в котором корреляция обнаруженных элементарных ионов (28) с интересующим свойством содержитгенерирование

Claims (20)

1. Способ клеточного анализа с помощью массовой цитометрии, содержащий:
обеспечение группы клеток (18), маркированных более чем одним отличающимся элементарным маркером (Tn);
выбор подходящей клетки (20) в группе клеток (18) путем идентификации локализации подходящей клетки (20), имеющей интересующее свойство;
запись локализации (22) подходящей клетки (20) согласно ее положению внутри группы клеток (18);
направление по меньшей мере одного лазерного импульса (24) на подходящую клетку (20) в записанной локализации (22) и генерирование дискретного шлейфа (26) для каждого из по меньшей мере одного лазерного импульса (24), причем каждый дискретный шлейф (26) содержит более одного отличающегося элементарного маркера (Tn);
введение каждого дискретного шлейфа (26) в индуктивно сопряженную плазму (14) и генерирование групп элементарных ионов (28), соответствующих каждому из более чем одного отличающихся элементарных маркеров (Tn);
обнаружение каждой из групп элементарных ионов (28) одновременно для каждого дискретного шлейфа (26) с помощью массовой цитометрии; и
корреляцию обнаруженных элементарных ионов (28) с интересующим свойством.
2. Способ по п. 1, в котором обеспечение группы клеток (18), маркированных более чем одним отличающимся элементарным маркером (Tn), содержит маркировку группы клеток (18) более чем одним сопряженным с элементом антителом, причем каждое из более, чем одного сопряженных с элементом антител содержит один или более отличающийся элементарный маркер (Tn).
3. Способ по п. 2, в котором один или более отличающийся элементарный маркер (Tn) выбирается из группы, содержащий переходные металлы.
4. Способ по п. 3, в котором корреляция обнаруженных элементарных ионов (28) с интересующим свойством содержит
генерирование данных (30) элементарного маркера из обнаруженных элементарных ионов (24) и запись данных элементарного маркера для интересующего свойства.
5. Способ по п. 4, в котором группа клеток (18) содержит более чем одну подгруппу клеток, каждая из которых промаркирована более чем одним отличающимся элементарным маркером (Tn).
6. Способ по п. 5, дополнительно содержащий идентификацию более чем одной подгрупп клеток в соответствии с интересующим свойством.
7. Способ по п. 6, в котором интересующее свойство идентифицируется с помощью одного или более из флюоресценции, фосфоресценции, отражения, поглощения, распознавания формы, физической особенности или их комбинации.
8. Способ по п. 4, дополнительно содержащий представление локализации (22) подходящей клетки (20) в двухмерном пространстве внутри группы клеток (18).
9. Способ по п. 4, дополнительно содержащий представление локализации (22) подходящей клетки (20) в трехмерном пространстве внутри группы клеток (18).
10. Способ по п. 8 или 9, дополнительно содержащий приготовление группы клеток (18) с интересующим свойством.
11. Способ по п. 10, в котором интересующее свойство идентифицируется с помощью одного или более из флюоресценции, фосфоресценции, отражения, поглощения, распознавания формы, физической особенности или их комбинации.
12. Способ по п. 10, в котором подходящая клетка (20) идентифицируется с помощью флуоресцентного излучения.
13. Способ по п. 12, в котором группа клеток (18) представляет собой образец ткани.
14. Система для клеточного анализа с использованием элементарных маркеров, содержащая:
по меньшей мере одно опрашивающее устройство (19), выполненное с возможностью идентификации локализации (22) подходящей клетки (20);
хранилище (21) данных, имеющее формат для записи
локализации (22) подходящей клетки (20);
систему лазерной абляции (23), взаимодействующую с хранилищем (21) данных, выполненную с возможностью направления по меньшей мере одного лазерного импульса (24) на локализацию (22) подходящей клетки (20); и
массовый цитометр (16), соединенный с системой (23) лазерной абляции, выполненный с возможностью обнаружения элементарного маркера, связанного с подходящей клеткой (20).
15. Система по п. 14, в которой по меньшей мере одно опрашивающее устройство (19) выполнено с возможностью идентификации локализации (22) подходящей клетки, имеющей интересующее свойство, а хранилище (21) данных дополнительно отформатировано для записи интересующего свойства.
16. Система по п. 15, дополнительно содержащая систему (34) управления, выполненную с возможностью взаимодействия системы (23) лазерной абляции с хранилищем (21) данных.
17. Система по п. 16, в которой система (34) управления выполнена с возможностью получать доступ к хранилищу (21) данных и направлять по меньшей мере один лазерный импульс (24) на локализацию (22) подходящей клетки.
18. Система по п. 15, в которой по меньшей мере одно опрашивающее устройство (19) выбирается из оптического микроскопа, флуоресцентного микроскопа, электронного микроскопа, конфокального микроскопа, а также любой их комбинации.
19. Система по п. 14, в которой хранилище (21) данных содержит формат, выбранный из алфавитно-цифрового, эмиссионного изображения, штрих-кода, радиочастотной идентификации (RFID), а также любой их комбинации.
20. Система по п. 14, в которой массовый цитометр (16) содержит детектор ионов и полный путь, определяемый между локализацией подходящей клетки и детектором ионов, и выполненный с возможностью обеспечения полного времени задержки от 20 до 200 мс.
RU2015117993A 2012-10-26 2013-10-22 Способ и система для клеточного анализа с помощью массовой цитометрии RU2636352C2 (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201261719087P 2012-10-26 2012-10-26
US61/719,087 2012-10-26
PCT/CA2013/050798 WO2014063247A1 (en) 2012-10-26 2013-10-22 Cell analysis by mass cytometry

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2015117993A true RU2015117993A (ru) 2016-12-20
RU2636352C2 RU2636352C2 (ru) 2017-11-22

Family

ID=50543817

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2015117993A RU2636352C2 (ru) 2012-10-26 2013-10-22 Способ и система для клеточного анализа с помощью массовой цитометрии

Country Status (9)

Country Link
US (5) US9261503B2 (ru)
EP (3) EP2912433B1 (ru)
JP (1) JP6419703B2 (ru)
CN (1) CN104838250B (ru)
CA (1) CA2888308C (ru)
HK (1) HK1214364A1 (ru)
RU (1) RU2636352C2 (ru)
SG (1) SG11201503038RA (ru)
WO (1) WO2014063247A1 (ru)

Families Citing this family (18)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP2912433B1 (en) 2012-10-26 2019-03-20 Fluidigm Canada Inc. Cell analysis by mass cytometry
KR20150134373A (ko) 2013-03-22 2015-12-01 에테하 취리히 레이저 어블레이션 셀
WO2016105418A1 (en) * 2014-12-24 2016-06-30 Fluidigm Canada Inc. Methods and systems for correlating results of optical and mass cytometry
WO2016103501A1 (ja) * 2014-12-26 2016-06-30 国立大学法人東京大学 解析装置、解析方法、解析プログラム、細胞の製造方法、および細胞
JP6757730B2 (ja) 2014-12-31 2020-09-23 フリューダイム カナダ インコーポレイテッド マスサイトメトリーによる分析用の構造化生体試料
CN104897530B (zh) * 2015-06-17 2018-03-30 哈尔滨工业大学 一种基于光子时域滤波技术的喷注雾化全场测量装置及方法
CN114350752A (zh) 2015-07-17 2022-04-15 纳米线科技公司 在横切面组织的用户定义区域中的基因表达的同时定量
KR102545430B1 (ko) 2015-07-17 2023-06-19 나노스트링 테크놀로지스, 인크. 절편화된 조직의 사용자-한정된 영역에서의 복수의 단백질의 동시적인 정량화
JP6527594B2 (ja) * 2015-12-01 2019-06-05 株式会社日立ハイテクノロジーズ 細胞解析デバイス、装置およびそれを用いた細胞解析方法
CN107505252A (zh) * 2017-08-14 2017-12-22 浙江普罗亭健康科技有限公司 一种用于质谱流式细胞技术的新型Barcoding 89Y试剂
CN107796748B (zh) * 2017-09-28 2020-06-26 上海交通大学 一种用于单细胞质谱流式细胞术的检测方法
SG11202007501SA (en) 2018-02-12 2020-09-29 Nanostring Technologies Inc Biomolecular probes and methods of detecting gene and protein expression
FR3078777B1 (fr) 2018-03-07 2020-11-13 Alain Rousseau Procede d’analyse d’un echantillon biologique contenant des cellules biologiques, et appareil d’analyse pour la mise en œuvre du procede d’analyse
JP2023507585A (ja) * 2019-12-20 2023-02-24 スタンダード バイオツールズ カナダ インコーポレイテッド イメージングマスサイトメトリー用プラズマおよびサンプリングジオメトリー
CN111982789B (zh) * 2020-08-21 2022-02-08 中国科学院生态环境研究中心 基于单细胞富集和单细胞质谱的金属离子及金属纳米颗粒的高通量检测方法
CN116964433A (zh) 2020-10-07 2023-10-27 贝克顿·迪金森公司 基于模型化和最小化溢出扩散的流式细胞术面板设计方法以及用于实践该方法的系统
AU2021372349A1 (en) * 2020-10-29 2023-04-20 Ambergen, Inc. Novel photocleavable mass-tags for multiplexed mass spectrometric imaging of tissues using biomolecular probes
US20230243735A1 (en) * 2022-01-31 2023-08-03 Becton, Dickinson And Company Methods and Systems for Identifying a Fluorochrome Panel

Family Cites Families (19)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5885840A (en) * 1997-02-10 1999-03-23 Compucyte Corp. Multiple assays of cell specimens
US7135296B2 (en) 2000-12-28 2006-11-14 Mds Inc. Elemental analysis of tagged biologically active materials
US7479630B2 (en) * 2004-03-25 2009-01-20 Bandura Dmitry R Method and apparatus for flow cytometry linked with elemental analysis
WO2005095942A1 (ja) * 2004-03-30 2005-10-13 Riken レーザーアブレーションを用いた生体試料の分析方法およびその装置
US20070190560A1 (en) * 2006-02-13 2007-08-16 Olga Ornatsky Element-tagged olignucleotide gene expression analysis
JP2010509748A (ja) * 2006-03-07 2010-03-25 アプライド バイオシステムズ, エルエルシー 質量分析のためにイオンを生成するための方法および装置
JP4943504B2 (ja) * 2006-06-02 2012-05-30 ファイザー・プロダクツ・インク 循環腫瘍細胞アッセイ
WO2008060713A2 (en) * 2006-06-22 2008-05-22 Massachusetts Institute Of Technology Flow cytometry methods and immunodiagnostics with mass sensitive readout
JP4891671B2 (ja) * 2006-06-30 2012-03-07 大日本印刷株式会社 測光機能付きカメラおよびカメラ用光学素子
US20080176332A1 (en) * 2006-09-29 2008-07-24 The Regents Of The University Of California Systems and methods for identifying and disrupting cellular organelles
EP2092294B1 (en) 2006-11-02 2015-06-03 Mitchell A. Winnik Particles containing detectable elemental code
US8003312B2 (en) 2007-02-16 2011-08-23 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Multiplex cellular assays using detectable cell barcodes
US20100129290A1 (en) * 2008-11-26 2010-05-27 I.S.T. Corporation Smart contrast agent and detection method for detecting transition metal ions
DE102009016512B4 (de) * 2009-04-08 2011-05-12 Forschungszentrum Jülich GmbH Verfahren und Vorrichtung zur Durchführung einer quantitativen ortsaufgelösten Lokal- und Verteilungsanalyse chemischer Elemente und in-situ Charakterisierung der ablatierten Oberflächenregionen
WO2011006156A2 (en) 2009-07-10 2011-01-13 University Of Florida Research Foundation, Inc. Method and apparatus to laser ablation-laser induced breakdown spectroscopy
DE112011100631B4 (de) * 2010-04-13 2019-10-10 International Business Machines Corporation System und Verfahren für die Veränderung und/oder das Glätten von Gewebe durch Laserabtragung
US20120077714A1 (en) 2010-09-20 2012-03-29 Nolan Garry P Mass Spectrometry Based Particle Separation
US8679858B2 (en) * 2011-01-11 2014-03-25 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Lanthanide mass dots: nanoparticle isotope tags
EP2912433B1 (en) 2012-10-26 2019-03-20 Fluidigm Canada Inc. Cell analysis by mass cytometry

Also Published As

Publication number Publication date
US20140120550A1 (en) 2014-05-01
US20190094121A1 (en) 2019-03-28
US20160131635A1 (en) 2016-05-12
US9261503B2 (en) 2016-02-16
US9435787B2 (en) 2016-09-06
US10107734B2 (en) 2018-10-23
CN104838250B (zh) 2017-07-07
JP2016503288A (ja) 2016-02-04
RU2636352C2 (ru) 2017-11-22
WO2014063247A1 (en) 2014-05-01
EP3572788B1 (en) 2022-03-16
SG11201503038RA (en) 2015-05-28
EP2912433B1 (en) 2019-03-20
JP6419703B2 (ja) 2018-11-07
HK1214364A1 (zh) 2016-07-22
EP4075478A1 (en) 2022-10-19
CA2888308C (en) 2021-01-19
CN104838250A (zh) 2015-08-12
EP2912433A1 (en) 2015-09-02
US20190353576A1 (en) 2019-11-21
CA2888308A1 (en) 2014-05-01
US20170089821A1 (en) 2017-03-30
EP3572788A1 (en) 2019-11-27
EP2912433A4 (en) 2016-06-22

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2015117993A (ru) Анализ клетки с помощью массовой цитометрии
RU2633311C2 (ru) Анализ образца с помощью массовой цитометрии
US10458897B2 (en) Method for identifying biological particles using stacks of defocused holographic images
CN110446803A (zh) 自动收集指定数目的细胞
CN101278829A (zh) 便携式在体流式细胞仪
CN102414716A (zh) 显微剖切方法和信息处理系统
WO2016090356A1 (en) Mass cytometry imaging
CN104641222A (zh) 用于发光显微成像的双向扫描
JP2009192539A5 (ru)
CN103411936A (zh) 一种三维纳米分辨定位方法及装置
Vorobjev et al. Quantitative functional morphology by imaging flow cytometry
US11971343B2 (en) Dual excitation beams for irradiating a sample in a flow stream and methods for using same
US20210325292A1 (en) Systems for light detection array multiplexing and methods for same
Chia et al. Imaging and quantitation techniques for tracking cargo along endosome-to-Golgi transport pathways
CN104880469B (zh) 核聚变靶室及其原位在线检测装置和分析装置
Wozniewski Differential cross section measurements in the H→ ττ decay channel with CMS data of proton-proton collisions at the Large Hadron Collider at CERN
US11927522B2 (en) Methods for identifying saturated data signals in cell sorting and systems for same
JP2023524474A (ja) 独特な表現型を指標選別するための方法及び同システム
Blom et al. Nanoscopy—imaging life at the nanoscale: a Nobel Prize achievement with a bright future
Barak Charged Higgs boson searches with ATLAS
Scientific 2.1 Materials and equipment
Zoref et al. Point Spread Function Engineering for 3D Imaging in High-Throughput Microscopy
ATLAS MDT Collaboration Upgrade of the ATLAS MDT Readout and Trigger for the HL-LHC
KR20230136832A (ko) 딥 러닝 알고리즘을 이용한 이미지 기반의 미세유체 세포 분류기 및 미세유체 세포 분류 방법
Gandini et al. The LHCb Experiment at the LHC