RU2014143720A - Автоматизированный отбор микроорганизмов и их идентификация с помощью малди - Google Patents
Автоматизированный отбор микроорганизмов и их идентификация с помощью малди Download PDFInfo
- Publication number
- RU2014143720A RU2014143720A RU2014143720A RU2014143720A RU2014143720A RU 2014143720 A RU2014143720 A RU 2014143720A RU 2014143720 A RU2014143720 A RU 2014143720A RU 2014143720 A RU2014143720 A RU 2014143720A RU 2014143720 A RU2014143720 A RU 2014143720A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- suspension
- sample
- colony
- specified
- suspension tube
- Prior art date
Links
- 244000005700 microbiome Species 0.000 title claims abstract 55
- 238000000816 matrix-assisted laser desorption--ionisation Methods 0.000 title 1
- 239000000725 suspension Substances 0.000 claims abstract 120
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract 29
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 claims abstract 5
- 230000004807 localization Effects 0.000 claims abstract 3
- 238000003795 desorption Methods 0.000 claims abstract 2
- 238000012546 transfer Methods 0.000 claims 18
- 238000009434 installation Methods 0.000 claims 9
- 238000012545 processing Methods 0.000 claims 7
- 238000005259 measurement Methods 0.000 claims 6
- 238000012360 testing method Methods 0.000 claims 5
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 claims 2
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 claims 2
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 claims 2
- 230000011664 signaling Effects 0.000 claims 2
- 230000009189 diving Effects 0.000 claims 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12M—APPARATUS FOR ENZYMOLOGY OR MICROBIOLOGY; APPARATUS FOR CULTURING MICROORGANISMS FOR PRODUCING BIOMASS, FOR GROWING CELLS OR FOR OBTAINING FERMENTATION OR METABOLIC PRODUCTS, i.e. BIOREACTORS OR FERMENTERS
- C12M1/00—Apparatus for enzymology or microbiology
- C12M1/26—Inoculator or sampler
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12M—APPARATUS FOR ENZYMOLOGY OR MICROBIOLOGY; APPARATUS FOR CULTURING MICROORGANISMS FOR PRODUCING BIOMASS, FOR GROWING CELLS OR FOR OBTAINING FERMENTATION OR METABOLIC PRODUCTS, i.e. BIOREACTORS OR FERMENTERS
- C12M23/00—Constructional details, e.g. recesses, hinges
- C12M23/02—Form or structure of the vessel
- C12M23/10—Petri dish
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12M—APPARATUS FOR ENZYMOLOGY OR MICROBIOLOGY; APPARATUS FOR CULTURING MICROORGANISMS FOR PRODUCING BIOMASS, FOR GROWING CELLS OR FOR OBTAINING FERMENTATION OR METABOLIC PRODUCTS, i.e. BIOREACTORS OR FERMENTERS
- C12M33/00—Means for introduction, transport, positioning, extraction, harvesting, peeling or sampling of biological material in or from the apparatus
- C12M33/04—Means for introduction, transport, positioning, extraction, harvesting, peeling or sampling of biological material in or from the apparatus by injection or suction, e.g. using pipettes, syringes, needles
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12M—APPARATUS FOR ENZYMOLOGY OR MICROBIOLOGY; APPARATUS FOR CULTURING MICROORGANISMS FOR PRODUCING BIOMASS, FOR GROWING CELLS OR FOR OBTAINING FERMENTATION OR METABOLIC PRODUCTS, i.e. BIOREACTORS OR FERMENTERS
- C12M41/00—Means for regulation, monitoring, measurement or control, e.g. flow regulation
- C12M41/48—Automatic or computerized control
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q3/00—Condition responsive control processes
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N1/00—Sampling; Preparing specimens for investigation
- G01N1/02—Devices for withdrawing samples
- G01N1/04—Devices for withdrawing samples in the solid state, e.g. by cutting
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N35/00—Automatic analysis not limited to methods or materials provided for in any single one of groups G01N1/00 - G01N33/00; Handling materials therefor
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N35/00—Automatic analysis not limited to methods or materials provided for in any single one of groups G01N1/00 - G01N33/00; Handling materials therefor
- G01N35/10—Devices for transferring samples or any liquids to, in, or from, the analysis apparatus, e.g. suction devices, injection devices
-
- H—ELECTRICITY
- H01—ELECTRIC ELEMENTS
- H01J—ELECTRIC DISCHARGE TUBES OR DISCHARGE LAMPS
- H01J49/00—Particle spectrometers or separator tubes
- H01J49/02—Details
- H01J49/10—Ion sources; Ion guns
- H01J49/16—Ion sources; Ion guns using surface ionisation, e.g. field-, thermionic- or photo-emission
- H01J49/161—Ion sources; Ion guns using surface ionisation, e.g. field-, thermionic- or photo-emission using photoionisation, e.g. by laser
- H01J49/164—Laser desorption/ionisation, e.g. matrix-assisted laser desorption/ionisation [MALDI]
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N15/00—Investigating characteristics of particles; Investigating permeability, pore-volume or surface-area of porous materials
- G01N15/06—Investigating concentration of particle suspensions
- G01N15/075—Investigating concentration of particle suspensions by optical means
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N1/00—Sampling; Preparing specimens for investigation
- G01N1/02—Devices for withdrawing samples
- G01N1/04—Devices for withdrawing samples in the solid state, e.g. by cutting
- G01N2001/045—Laser ablation; Microwave vaporisation
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N35/00—Automatic analysis not limited to methods or materials provided for in any single one of groups G01N1/00 - G01N33/00; Handling materials therefor
- G01N35/10—Devices for transferring samples or any liquids to, in, or from, the analysis apparatus, e.g. suction devices, injection devices
- G01N2035/1027—General features of the devices
- G01N2035/1032—Dilution or aliquotting
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N35/00—Automatic analysis not limited to methods or materials provided for in any single one of groups G01N1/00 - G01N33/00; Handling materials therefor
- G01N35/00029—Automatic analysis not limited to methods or materials provided for in any single one of groups G01N1/00 - G01N33/00; Handling materials therefor provided with flat sample substrates, e.g. slides
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Sustainable Development (AREA)
- Immunology (AREA)
- Pathology (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Optics & Photonics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Computer Hardware Design (AREA)
- Clinical Laboratory Science (AREA)
- Plasma & Fusion (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Sampling And Sample Adjustment (AREA)
- Other Investigation Or Analysis Of Materials By Electrical Means (AREA)
- Automatic Analysis And Handling Materials Therefor (AREA)
Abstract
1. Способ локализации и отбора колонии микроорганизмов на чашке для культивирования, и идентификации микроорганизмов в указанной отобранной колонии с помощью МАЛДИ (матрично-активированная лазерная десорбция/ионизация), при этом указанный способ включает автоматизированные этапы:- локализация и отбор колонии микроорганизмов на чашке для культивирования;- получение образца указанной отобранной колонии микроорганизмов;- нанесение по меньшей мере части указанного образца отобранной колонии микроорганизмов на мишень; и- перенос указанной мишени с указанным образцом в аппарат для осуществления МАЛДИ, для идентификации указанного образца отобранной колонии микроорганизмов.2. Способ по п. 1, где этап нанесения по меньшей мере части указанного образца отобранной колонии микроорганизмов на мишень осуществляют путем непосредственного размещения указанного полученного образца отобранной колонии микроорганизмов на мишень.3. Способ по п. 1, где этап нанесения по меньшей мере части указанного образца отобранной колонии микроорганизмов на мишень осуществляют с помощью автоматизированных этапов:- перенос указанного полученного образца в суспензионную пробирку, содержащую некоторое количество суспензионной среды;- получение суспензии образца путем переноса по меньшей мере части указанного полученного образца в указанную суспензионную среду;- получение капли указанной суспензии образца; и- перенос указанной капли суспензии образца на указанную мишень.4. Способ по п. 2, дополнительно включающий автоматизированные этапы:- получение второго образца указанной отобранной колонии микроорганизмов;- перенос указанного второго обра
Claims (20)
1. Способ локализации и отбора колонии микроорганизмов на чашке для культивирования, и идентификации микроорганизмов в указанной отобранной колонии с помощью МАЛДИ (матрично-активированная лазерная десорбция/ионизация), при этом указанный способ включает автоматизированные этапы:
- локализация и отбор колонии микроорганизмов на чашке для культивирования;
- получение образца указанной отобранной колонии микроорганизмов;
- нанесение по меньшей мере части указанного образца отобранной колонии микроорганизмов на мишень; и
- перенос указанной мишени с указанным образцом в аппарат для осуществления МАЛДИ, для идентификации указанного образца отобранной колонии микроорганизмов.
2. Способ по п. 1, где этап нанесения по меньшей мере части указанного образца отобранной колонии микроорганизмов на мишень осуществляют путем непосредственного размещения указанного полученного образца отобранной колонии микроорганизмов на мишень.
3. Способ по п. 1, где этап нанесения по меньшей мере части указанного образца отобранной колонии микроорганизмов на мишень осуществляют с помощью автоматизированных этапов:
- перенос указанного полученного образца в суспензионную пробирку, содержащую некоторое количество суспензионной среды;
- получение суспензии образца путем переноса по меньшей мере части указанного полученного образца в указанную суспензионную среду;
- получение капли указанной суспензии образца; и
- перенос указанной капли суспензии образца на указанную мишень.
4. Способ по п. 2, дополнительно включающий автоматизированные этапы:
- получение второго образца указанной отобранной колонии микроорганизмов;
- перенос указанного второго образца отобранной колонии микроорганизмов и нанесение по меньшей мере части указанного второго образца отобранной колонии микроорганизмов на тестовую чашку для культивирования; и
- перенос указанной тестовой чашки для культивирования в аппарат для осуществления анализа восприимчивости к антибиотикам или другого дополнительного анализа.
5. Способ по п. 3, дополнительно включающий автоматизированные этапы:
- получение второй капли указанной суспензии образца;
- нанесение второй указанной капли суспензии образца на тестовую чашку для культивирования; и
- перенос указанной тестовой чашки для культивирования в аппарат для осуществления анализа восприимчивости к антибиотикам или другого дополнительного анализа.
6. Способ по п. 2, дополнительно включающий автоматизированный этап нанесения капли раствора матрицы МАЛДИ на часть образца, нанесенного на мишень.
7. Способ по п. 3, дополнительно включающий автоматизированный этап нанесения капли раствора матрицы МАЛДИ на указанную каплю суспензии образца, нанесенную на мишень.
8. Способ по п. 7, где указанной капле суспензии образца, нанесенной на мишень, позволяют высохнуть перед нанесением указанной капли раствора матрицы МАЛДИ.
9. Способ по п. 3, где в случае, если инструкции по обработке для отобранной колонии микроорганизмов указывают на получение суспензии образца указанной колонии микроорганизмов, способ включает этап автоматического получения суспензии образца колонии микроорганизмов, включающий автоматизированные этапы:
- подготовка первого инструмента для отбора колоний и подготовка позиционирующего устройства с держателем инструмента для отбора колоний для крепления инструмента для отбора колоний, при этом указанное позиционирующее устройство устанавливают с обеспечением возможности установки инструмента для отбора колоний в начальное положение над полученным местоположением отобранной колонии микроорганизмов на чашке для культивирования и для автоматического опускания и подъема инструмента для отбора колоний по направлению к чашке для культивирования и от нее, а также для установки инструмента для отбора колоний в положение переноса, соответственно;
- установка указанного первого инструмента для отбора колоний в указанный держатель инструмента для отбора колоний позиционирующего устройства;
- с помощью указанного позиционирующего устройства установка первого инструмента для отбора колоний в начальное положение над полученным местоположением отобранной колони микроорганизмов на чашке для культивирования, автоматическое опускание первого инструмента для отбора колоний по направлению к чашке для культивирования для контакта с микроорганизмом для сбора образца указанного микроорганизма, автоматический подъем первого инструмента для отбора колоний с указанным образцом микроорганизма в направлении от чашки для культивирования в положение переноса;
- подготовка держателя суспензионной пробирки для крепления суспензионной пробирки;
- установка суспензионной пробирки в держатель суспензионной пробирки;
- подготовка автоматического дозатора суспензионной среды для автоматического дозирования суспензионной среды в суспензионную пробирку, закрепленную в держателе суспензионной пробирки;
- с помощью автоматического дозатора автоматическая подача исходного количества суспензионной среды в суспензионную пробирку, закрепленную в держателе суспензионной пробирки;
- подготовка устройства для переноса для автоматического переноса инструмента для отбора колоний из положения переноса позиционирующего устройства в положение над суспензионной пробиркой, закрепленной в держателе для суспензионной пробирки, а также для опускания и подъема инструмента для отбора колоний в и из суспензионной среды, содержащейся в суспензионной пробирке, а также для установки инструмента для отбора колоний в положение ожидания над суспензионной пробиркой, закрепленной в держателе для суспензионной пробирки, соответственно;
- подготовка турбидиметра, производящего измерения мутности суспензионной среды, содержащейся в суспензионной пробирке, закрепленной в держателе для суспензионной пробирки;
- проведение измерения конечного значения, указывающего на измеренную мутность;
- подготовка контроллера, соединенного с позиционирующим устройством, устройством для переноса, автоматическим дозатором суспензионной среды и турбидиметром для автоматического управления движением позиционирующего устройства, движением устройства для переноса, работой автоматического дозатора суспензионной среды и работой турбидиметра, соответственно;
- при этом указанный контроллер:
а) сравнивает окончательное значение измерения с первым пороговым значением, ранее сохраненным в памяти контроллера, если оно больше, то приводит в действие автоматический дозатор суспензионной среды для подачи дополнительного количества суспензионной среды в суспензионную пробирку; и если значение равно или меньше первого порогового значения, или равно или больше второго порогового значения, ранее сохраненного в памяти контроллера, указанное первое пороговое значение равно или больше второго порогового значения, проводит сигнал о том, что суспензионную пробирку с суспензионной средой можно удалить из держателя суспензионной пробирки для дальнейшей обработки.
10. Способ по п. 9, включающий этап подготовки автоматического устройства для установки и удаления чашки для культивирования для автоматической установки и удаления чашки для культивирования, содержащей микроорганизм, на подставку и с нее, соответственно, при этом этап установки контроллера осуществляют таким образом, что его присоединяют к автоматическому устройству для установки и удаления чашки для культивирования для управления автоматическим устройством для установки и удаления чашки для культивирования, при этом этап установки чашки для культивирования, содержащей указанный микроорганизм, на подставку осуществляют автоматически под управлением контроллера.
11. Способ по п. 10, где контроллер устанавливают таким образом, что имеется возможность автоматически удалить чашку для культивирования с подставки с помощью автоматического устройства для установки и удаления чашки для культивирования только после проведения сигнала о том, что суспензионную пробирку с суспензией можно удалить из держателя суспензионной пробирки для дальнейшей обработки.
12. Способ по п. 9, включающий этап подготовки автоматического устройства для установки и удаления суспензионной пробирки для автоматической установки и удаления суспензионной пробирки в держатель суспензионной пробирки и из него, соответственно, при этом этап установки контроллера осуществляют таким образом, что его присоединяют к автоматическому устройству установки и удаления суспензионной пробирки для управления работой автоматического устройства для установки и удаления суспензионной пробирки, где этап установки суспензионной пробирки в держатель суспензионной пробирки осуществляют автоматически под контролем контроллера.
13. Способ по п. 12, где контроллер устанавливают таким образом, что держатель суспензионной пробирки автоматически удаляют из держателя суспензионной пробирки с помощью автоматического устройства для установки и удаления суспензионной пробирки только после проведения сигнала о том, что суспензионную пробирку с суспензией можно удалить из держателя суспензионной пробирки для дальнейшей обработки.
14. Способ по п. 9, включающий этап подготовки идентификационной маркировки на суспензионной пробирке и этап хранения идентификационной маркировки указанной суспензионной пробирки вместе с характеристиками суспензии с привязкой к идентификатору чашки для культивирования, с которой была получена отобранная колония микроорганизмов, в памяти компьютера центрального управления.
15. Способ по п. 2, где в случае, если инструкции по обработке для отобранной колонии микроорганизмов указывают на непосредственное нанесение указанного полученного образца отобранной колонии микроорганизмов на указанную мишень, способ включает следующие автоматизированные этапы:
- подготовка первого инструмента для отбора колоний и подготовка позиционирующего устройства с держателем инструмента для отбора колоний для закрепления инструмента для отбора колоний, указанное позиционирующее устройство устанавливают для установки инструмента для отбора колоний в начальное положение над полученным местоположением отобранной колонии микроорганизмов на чашке для культивирования и для автоматического опускания и подъема инструмента для отбора колоний по направлению к чашке для культивирования и от нее, и для установки инструмента для отбора колоний в положение переноса, соответственно;
- установка указанного первого инструмента для отбора колоний в указанный держатель инструмента для отбора колоний позиционирующего устройства;
- с помощью указанного позиционирующего устройства установка первого инструмента для отбора колоний в начальное положение над полученным местоположением отобранной колонии микроорганизмов на чашке для культивирования, автоматическое опускание первого инструмента для отбора колоний по направлению к чашке для культивирования для контакта с микроорганизмом для сбора образца указанного микроорганизма, автоматический подъем первого инструмента для отбора колоний с указанным образцом микроорганизма в направлении от чашки для культивирования в положение переноса;
- подготовка держателя мишени для закрепления мишени, при этом указанная мишень имеет множество точек нанесения;
- установка мишени в держатель мишени;
- подготовка устройства для переноса для автоматического переноса инструмента для отбора колоний из положения переноса позиционирующего устройства в положение над одной из точек нанесения мишени, и для опускания инструмента для отбора колоний таким образом, что образец колонии микроорганизмов, присутствующий на инструменте для отбора колоний вступает в контакт с мишенью, передвижение инструмента для отбора колоний в плоскости, параллельной плоскости мишени, таким образом, что образец колонии микроорганизмов наносится на точку нанесения, более конкретно, покрывая не более чем около половины одной из точек нанесения мишени; и
- подъем указанного инструмента для отбора колоний от мишени.
16. Способ по п. 15, включающий этап подготовки идентификационной маркировки на мишень и возможно подготовка идентификационной маркировки на точки нанесения указанной мишени, а также этап хранения идентификационной маркировки указанных мишени и точек нанесения вместе с характеристиками суспензии с привязкой к идентификатору чашки для культивирования, с которой была получена отобранная колония микроорганизмов в памяти указанного компьютера центрального управления.
17. Способ автоматического получения суспензии образца микроорганизмов по п. 9, где способ включает подготовку автоматического устройства для установки и удаления суспензионной пробирки для автоматической установки и удаления суспензионной пробирки в держатель суспензионной пробирки и из него, соответственно, при этом этап установки контроллера осуществляют таким образом, что его присоединяют к автоматическому устройству для установки и удаления суспензионной пробирки для управления работой автоматического устройства для установки и удаления суспензионной пробирки, при этом этап установки суспензионной пробирки в держатель суспензионной пробирки осуществляют автоматически под управлением контроллера.
18. Способ автоматического получения суспензии образца микроорганизмов по п. 17, где контроллер устанавливают таким образом, что держатель суспензионной пробирки автоматически удаляют из держателя суспензионной пробирки с помощью автоматического устройства для установки и удаления суспензионной пробирки только после проведения сигнала о том, что суспензионную пробирку с суспензией можно удалить из держателя суспензионной пробирки для дальнейшей обработки.
19. Аппарат для автоматического получения суспензии образца микроорганизмов для осуществления способа или этапа способа для автоматического получения суспензии образца микроорганизмов по п. 9, при этом указанный аппарат включает:
- подставку для чашки для культивирования, содержащую указанный микроорганизм;
- первый и дополнительный инструмент для отбора колоний и позиционирующее устройство с держателем инструмента для отбора колоний для закрепления инструмента для отбора колоний, при этом указанное позиционирующее устройство устанавливают для установки инструмента для отбора колоний в начальное положение над чашкой для культивирования и для автоматического опускания и подъема инструмента для отбора колоний по направлению к чашке для культивирования и от нее, а также для установки инструмента для отбора колоний в положение переноса, соответственно;
- держатель суспензионной пробирки для закрепления суспензионной пробирки;
- автоматический дозатор суспензионной среды для автоматического дозирования суспензионной среды в суспензионную пробирку, закрепленную в держателе суспензионной пробирки;
- устройство для переноса для автоматического переноса инструмента для отбора колоний из положения переноса позиционирующего устройства в положение над суспензионной пробиркой, закрепленной в держателе для суспензионной пробирки, а также для опускания и подъема инструмента для отбора колоний в и из суспензионной среды, содержащейся в суспензионной пробирке, а также для установки инструмента для отбора колоний в положение ожидания над суспензионной пробиркой, закрепленной в держателе суспензионной пробирки, соответственно;
- турбидиметр для осуществления измерения мутности суспензионной среды, содержащейся в суспензионной пробирке, закрепленной в держателе суспензионной пробирки и для проведения измерения конечного значения, указывающего на измеренную мутность;
- контроллер, соединенный с позиционирующим устройством, устройством для переноса, автоматическим дозатором суспензионной среды и турбидиметром для автоматического управления движением позиционирующего устройства, движением устройства для переноса, работой автоматического дозатора суспензионной среды и работой турбидиметра, соответственно;
- указанный контроллер устанавливают для:
a) определения, является ли окончательное значение измерения больше первого порогового значения, ранее сохраненного в памяти контроллера, если да, то контроллер устанавливают для выполнения этапа b); или является ли окончательное значение измерения равным или меньше первого порогового значения, или равным или больше второго порогового значения, ранее сохраненного в памяти контроллера, является ли указанное первое пороговое значение равным или больше второго порогового значения, и если да, то контроллер устанавливают для выполнения этапа c); или является ли окончательное значение измерения меньше второго порогового значения, если да, то контроллер устанавливают для выполнения этапа d);
b) контролирования автоматического дозатора суспензионной среды для подачи дополнительного количества суспензионной среды в суспензионную пробирку;
c) проведения сигнала о том, что суспензионную пробирку с суспензионной средой можно удалить из держателя суспензионной пробирки для дальнейшей обработки; или
d) установки указанного дополнительного инструмента для отбора колоний в держатель инструмента для отбора колоний позиционирующего устройства; с помощью указанного позиционирующего устройства установка дополнительного инструмента для отбора колоний в начальное положение над чашкой для культивирования, автоматическое опускание дополнительного инструмента для отбора колоний по направлению к чашке для культивирования для контакта с микроорганизмом для сбора дополнительного образца указанного микроорганизма, автоматический подъем дополнительного инструмента для отбора колоний с указанным образцом микроорганизма в направлении от чашки для культивирования в положение переноса; с помощью указанного устройства для переноса автоматический перенос указанного дополнительного инструмента для отбора колоний с дополнительным образцом микроорганизма из положения переноса позиционирующего устройства в положение над суспензионной пробиркой, закрепленной в держателе суспензионной пробирки, опускание указанного дополнительного инструмента для отбора колоний с дополнительным образцом микроорганизма в суспензионную среду, содержащуюся в суспензионной пробирке, так, что образец погружается в суспензию; измерение мутности суспензионной среды, содержащейся в суспензионной пробирке, закрепленной в держателе суспензионной пробирки, с помощью турбидиметра и проведение дополнительного измерения конечного значения, указывающего на измеренную мутность; и осуществление этапа a).
20. Аппарат для автоматического получения суспензии образца микроорганизмов по п. 19, где контроллер устанавливают для управления работой турбидиметра таким образом, чтобы этап измерения мутности суспензионной среды, содержащейся в суспензионной пробирке, расположенной в держателе суспензионной пробирки, с помощью турбидиметра начинался раньше, чем инструмент для отбора колоний погружается в суспензионную среду, содержащуюся в суспензионной пробирке.
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US201261618003P | 2012-03-30 | 2012-03-30 | |
| US61/618,003 | 2012-03-30 | ||
| PCT/NL2013/050239 WO2013147610A2 (en) | 2012-03-30 | 2013-04-02 | Automated selection of microorganisms and identification using maldi |
Publications (3)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2014143720A true RU2014143720A (ru) | 2016-05-27 |
| RU2639777C2 RU2639777C2 (ru) | 2017-12-22 |
| RU2639777C9 RU2639777C9 (ru) | 2018-02-16 |
Family
ID=48142905
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2014143720A RU2639777C9 (ru) | 2012-03-30 | 2013-04-02 | Автоматизированный отбор микроорганизмов и их идентификация с помощью малди |
Country Status (11)
| Country | Link |
|---|---|
| US (6) | US9556495B2 (ru) |
| EP (3) | EP3792635A1 (ru) |
| JP (5) | JP6321622B2 (ru) |
| CN (2) | CN104364659B (ru) |
| AU (2) | AU2013240662B2 (ru) |
| BR (1) | BR112014024474B8 (ru) |
| CA (2) | CA2868555C (ru) |
| ES (2) | ES2642340T3 (ru) |
| RU (1) | RU2639777C9 (ru) |
| SG (1) | SG11201406166SA (ru) |
| WO (1) | WO2013147610A2 (ru) |
Families Citing this family (28)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| ES2642340T3 (es) | 2012-03-30 | 2017-11-16 | Bd Kiestra B.V. | Selección automática de microorganismos e identificación usando MALDI |
| US9939379B2 (en) * | 2012-10-15 | 2018-04-10 | Pharmaseq, Inc. | Compact analyzer for acquiring characteristics of small tabs placed in a vessel |
| US10072927B2 (en) * | 2016-01-07 | 2018-09-11 | Rarecyte, Inc. | Detecting a substrate |
| US11054346B2 (en) | 2013-04-11 | 2021-07-06 | Rarecyte, Inc. | Detecting a substrate |
| US11133866B2 (en) | 2014-02-25 | 2021-09-28 | Pharmaseq, Inc. | All optical identification and sensor system with power on discovery |
| JP6469977B2 (ja) * | 2014-07-09 | 2019-02-13 | オリンパス株式会社 | 標本観察装置および標本観察方法 |
| JP6665163B2 (ja) | 2014-08-18 | 2020-03-13 | ベクトン・ディキンソン・アンド・カンパニーＢｅｃｔｏｎ， Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ Ａｎｄ Ｃｏｍｐａｎｙ | Ｍａｌｄｉ用の試料調製方法およびそのための自動化システム |
| BR112017021460A2 (pt) * | 2015-04-08 | 2018-07-03 | Becton Dickinson Co | método e aparelhagem para coleta de crescimento microbiológico a partir de uma superfície semi-sólida |
| EP3286732A2 (en) * | 2015-04-23 | 2018-02-28 | BD Kiestra B.V. | Method and system for automatically counting microbial colonies |
| RU2718086C2 (ru) | 2015-05-28 | 2020-03-30 | БД КИЕСТРА Би.Ви. | Автоматизированный способ и система для получения и приготовления образца микроорганизма как для идентификации, так и для тестов на чувствительность к антибиотикам |
| CZ307243B6 (cs) * | 2015-12-01 | 2018-04-25 | Univerzita Karlova v Praze, Lékařská fakulta v Plzni | Způsob vlhké depozice mikrobiální kultury na pevný povrch určený k taxonomické identifikaci kultur pomocí desorpčně-ionizačních technik hmotnostní spektrometrie |
| US10882258B1 (en) | 2016-01-22 | 2021-01-05 | Pharmaseq, Inc. | Microchip affixing probe and method of use |
| AU2017355449B2 (en) | 2016-11-04 | 2023-03-09 | Becton, Dickinson And Company | System and method for selecting colonies |
| US11322262B2 (en) | 2016-11-10 | 2022-05-03 | Becton, Dickinson And Company | System and method for consulting on culture plate readings |
| JP7030806B2 (ja) | 2016-11-10 | 2022-03-07 | ベクトン・ディキンソン・アンド・カンパニー | 培地プロトコルをモニタするためのタイムラインシステム |
| AU2016431213B2 (en) * | 2016-11-30 | 2023-10-05 | Bruker Daltonics GmbH & Co. KG | Preparing live microbial samples and microorganisms for subsequent mass-specrometric measurement and evaluation |
| AU2018254604B2 (en) | 2017-04-20 | 2021-05-27 | Biomerieux, Inc. | Method, apparatus, and computer program product for controlling components of a detection device |
| CN107410223B (zh) * | 2017-08-28 | 2023-04-07 | 南京农业大学 | 一种可用于磁场处理的小型昆虫生理行为节律自动监测收样装置 |
| BR112020026623A2 (pt) | 2018-06-25 | 2021-03-30 | Bd Kiestra B.V. | Método para inoculação direta de um caldo a partir de uma suspensão fonte |
| CN109321429B (zh) * | 2018-09-28 | 2020-09-08 | 农业部沼气科学研究所 | 一种自动挑菌仪及微生物筛选方法 |
| CA3122938A1 (en) * | 2018-12-20 | 2020-06-25 | Bd Kiestra B.V. | A system and method for monitoring bacterial growth of bacterial colonies and predicting colony biomass |
| CN110988107B (zh) * | 2019-12-17 | 2020-09-01 | 山东省分析测试中心 | 一种结晶温度可控的升华-再结晶型质谱成像基质沉淀装置和方法 |
| CN115398826A (zh) | 2020-02-14 | 2022-11-25 | P芯片知识产权控股公司 | 光触发的应答器 |
| CN111607501A (zh) * | 2020-06-05 | 2020-09-01 | 重庆工商大学 | 一种蔬菜叶片微生物采集装置 |
| US20220085992A1 (en) | 2020-09-17 | 2022-03-17 | P-Chip Ip Holdings Inc. | Devices, systems, and methods using microtransponders |
| GB2605850B (en) * | 2021-07-06 | 2023-04-26 | Cellularorigins Ltd | Bioprocessing system |
| WO2023221211A1 (zh) * | 2022-05-19 | 2023-11-23 | 厦门元谱生物科技有限公司 | 一种直涂装置及应用该直涂装置的微生物直涂点样仪 |
| CN114813906A (zh) * | 2022-05-19 | 2022-07-29 | 厦门元谱生物科技有限公司 | 一种微生物直涂点样仪 |
Family Cites Families (57)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US2315329A (en) | 1938-11-04 | 1943-03-30 | Corning Glass Works | Method of making composite glass articles |
| BE857893A (fr) | 1977-08-18 | 1978-02-20 | Acec | Perfectionnements aux engins blindes a propulsion par chenilles |
| US4617265A (en) * | 1984-09-19 | 1986-10-14 | Board Of Regents, University Of Texas System | Colony blot assay for enterotoxigenic bacteria |
| US5432085A (en) * | 1992-11-10 | 1995-07-11 | Warren; Richard J. | Cell feeder/harvester assembly |
| US20030027216A1 (en) * | 2001-07-02 | 2003-02-06 | Kiernan Urban A. | Analysis of proteins from biological fluids using mass spectrometric immunoassay |
| US5808300A (en) * | 1996-05-10 | 1998-09-15 | Board Of Regents, The University Of Texas System | Method and apparatus for imaging biological samples with MALDI MS |
| DE19628178C1 (de) * | 1996-07-12 | 1997-09-18 | Bruker Franzen Analytik Gmbh | Verfahren zum Beladen von Probenträgern für Massenspektrometer |
| CZ294729B6 (cs) | 1996-08-13 | 2005-03-16 | Biovision Ag | Způsob in vitro zjišťování stavu organismu stanovením peptidů |
| US6111096A (en) * | 1997-10-31 | 2000-08-29 | Bbi Bioseq, Inc. | Nucleic acid isolation and purification |
| JP2000157257A (ja) * | 1998-11-24 | 2000-06-13 | Microtech Nition:Kk | 微量生体試料の捕捉及び塗布方法並びに生体試料用コロニーピッキング装置 |
| JP2000171360A (ja) * | 1998-12-09 | 2000-06-23 | Jt Science:Kk | コロニ―採取方法および装置 |
| DE10013513A1 (de) * | 1999-03-30 | 2000-10-19 | Inst Mikrotechnik Mainz Gmbh | Vorrichtung zum Transfer und Dosieren von fluiden Proben |
| US20020155445A1 (en) * | 1999-12-16 | 2002-10-24 | Jarvik Jonathan W. | Methods and products for peptide based DNA sequence identification and analysis |
| US6787764B2 (en) * | 2000-02-18 | 2004-09-07 | Bruker Daltonics, Inc. | Method and apparatus for automating a matrix-assisted laser desorption/ionization (MALDI) mass spectrometer |
| US7166441B2 (en) * | 2002-03-12 | 2007-01-23 | Perseptive Biosystems Inc. | Method and apparatus for the identification and quantification of biomolecules |
| ATE368861T1 (de) * | 2002-10-25 | 2007-08-15 | Sense Proteomic Ltd | Neuartige verwendungen von durch ble-gene kodierten proteinen und antibiotika aus der bleomycin-familie |
| US20040185521A1 (en) * | 2003-03-20 | 2004-09-23 | Shigeru Yoshida | Microorganism sampling method and microorganism sampling device |
| JP4255730B2 (ja) * | 2003-04-04 | 2009-04-15 | 旭化成ケミカルズ株式会社 | 生体触媒を用いたカルボン酸アンモニウムの製造方法 |
| US20040267181A1 (en) | 2003-06-26 | 2004-12-30 | Asd | Swab sample collection and recovery device |
| US7776584B2 (en) | 2003-08-01 | 2010-08-17 | Genetix Limited | Animal cell colony picking apparatus and method |
| CA2536166A1 (en) * | 2003-08-21 | 2005-03-03 | Global Technologies (Nz) Ltd | Sampling device |
| DE102004020885B4 (de) * | 2004-04-26 | 2011-03-10 | BIOMéRIEUX, INC. | Verfahren und Vorrichtung zur Aufnahme von Zellmaterial und Ablage desselben |
| CN1950923A (zh) * | 2004-04-27 | 2007-04-18 | 皇家飞利浦电子股份有限公司 | 在分析分析物中使用金刚石和其他材料的复合物或合成物 |
| US20090131524A1 (en) * | 2005-06-07 | 2009-05-21 | Buck Institute | Sialic acid abc transporters in prokaryotes therapeutic targets |
| US7435951B2 (en) * | 2005-06-08 | 2008-10-14 | Agilent Technologies, Inc. | Ion source sample plate illumination system |
| CA2622439A1 (en) * | 2005-09-15 | 2007-03-29 | Microphage Incorporated | Method and apparatus for identification of microorganisms using bacteriophage |
| US7901624B2 (en) * | 2006-09-26 | 2011-03-08 | Becton, Dickinson And Company | Device for automatically adjusting the bacterial inoculum level of a sample |
| EP1942194A1 (en) * | 2007-01-08 | 2008-07-09 | Université René Descartes | Method for identifying a germ isolated from a clinical sample |
| EP2099896B1 (en) * | 2007-01-12 | 2019-09-04 | Autobio Diagnostics Co., Ltd. | Method and apparatus for inoculating and streaking a medium in a plate |
| WO2008118959A1 (en) * | 2007-03-26 | 2008-10-02 | The University Of Chicago | Immunoassays and characterization of biomolecular interactions using self- assembled monolayers |
| KR101571706B1 (ko) | 2007-08-31 | 2015-11-25 | 니끼 쇼꾸바이 카세이 가부시키가이샤 | 하드 코팅막부 기재 및 하드 코팅막 형성용 도포액 |
| US7978258B2 (en) * | 2007-08-31 | 2011-07-12 | Historx, Inc. | Automatic exposure time selection for imaging tissue |
| JP4408957B2 (ja) | 2007-09-27 | 2010-02-03 | 聡 井川 | 殺菌方法および装置 |
| US9121005B2 (en) * | 2007-11-05 | 2015-09-01 | Bd Kiestra B.V. | Methods and apparatus for handling microbial samples |
| DE102007058516B4 (de) * | 2007-11-23 | 2017-08-10 | Bruker Daltonik Gmbh | Identifizierung von Erregern in Körperflüssigkeiten |
| US8216782B2 (en) * | 2008-03-14 | 2012-07-10 | Cedars-Sinai Medical Center | PTTG1 as a biomarker for cancer treatment |
| US8417011B2 (en) | 2008-09-18 | 2013-04-09 | Molecular Devices (New Milton) Ltd. | Colony detection |
| US20100227414A1 (en) * | 2009-03-05 | 2010-09-09 | Trex Enterprises Corp. | Affinity capture mass spectroscopy with a porous silicon biosensor |
| US9490113B2 (en) * | 2009-04-07 | 2016-11-08 | The George Washington University | Tailored nanopost arrays (NAPA) for laser desorption ionization in mass spectrometry |
| US8224581B1 (en) * | 2009-06-18 | 2012-07-17 | The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Army | Methods for detection and identification of cell type |
| US9109194B2 (en) * | 2009-11-05 | 2015-08-18 | Hitachi High-Technologies Corporation | Device for harvesting bacterial colony and method therefor |
| JP5411662B2 (ja) | 2009-11-13 | 2014-02-12 | 株式会社日立ハイテクノロジーズ | 微生物菌液調整装置 |
| JP5618810B2 (ja) * | 2010-05-11 | 2014-11-05 | 株式会社日立ハイテクノロジーズ | 釣菌装置および釣菌方法 |
| US9180448B2 (en) * | 2010-07-06 | 2015-11-10 | Becton, Dickinson And Company | Method and apparatus for identification of bacteria |
| FR2962446B1 (fr) * | 2010-07-08 | 2012-07-27 | Biomerieux Sa | Procede de prelevement et/ou depot d'un echantillon de matiere biologique et dispositif mettant en oeuvre un tel procede |
| JP4938117B2 (ja) | 2010-08-16 | 2012-05-23 | 株式会社エヌ・ティ・ティ・ドコモ | シグナリング方法、基地局装置、移動端末装置及び無線通信システム |
| JP5313218B2 (ja) * | 2010-09-30 | 2013-10-09 | 株式会社日立ハイテクノロジーズ | 細菌検査システム |
| DE102010052976A1 (de) | 2010-11-30 | 2012-05-31 | Bruker Daltonik Gmbh | Unterstützung der händischen Präparation von Proben auf einem Probenträger für eine Ionisierung mit matrix-unterstützter Laserdesorption |
| DE102010052975A1 (de) * | 2010-11-30 | 2012-05-31 | Bruker Daltonik Gmbh | Verfahren und Probenträger für die Unterstützung der händischen Präparation von Proben für eine Ionisierung mit matrix-unterstützter Laserdesorption |
| DE102010054581A1 (de) * | 2010-12-15 | 2012-06-21 | Bruker Daltonik Gmbh | Probenpräparation für die Ionisierung mit matrixunterstützter Laserdesorption |
| EP2518136B1 (en) * | 2011-04-29 | 2017-06-21 | BD Kiestra B.V. | Disc dispensing device, tubular container for use in such a disc dispensing device and method of dispensing discs |
| JP2014523914A (ja) * | 2011-07-18 | 2014-09-18 | プレジデント・アンド・フェロウズ・オブ・ハーバード・カレッジ | 操作された微生物標的化分子およびその使用 |
| FR2982367B1 (fr) * | 2011-11-08 | 2013-12-27 | Biomerieux Sa | Procede de detection de l'hemolysine delta de staphylococcus aureus par spectrometrie de masse directement a partir d'une population bacterienne |
| ES2642340T3 (es) | 2012-03-30 | 2017-11-16 | Bd Kiestra B.V. | Selección automática de microorganismos e identificación usando MALDI |
| DE102012011647B4 (de) * | 2012-06-08 | 2020-07-02 | Bruker Daltonik Gmbh | Analyse von Mikroben aus Mikrokolonien mittels MALDI-Massenspektrometrie |
| DE102012011648B4 (de) * | 2012-06-08 | 2018-06-14 | Bruker Daltonik Gmbh | Analyse von Mikroben aus Mikrokolonien mittels MALDI-Massenspektrometrie |
| DE102012016830B4 (de) * | 2012-08-24 | 2021-08-26 | Bruker Daltonics GmbH & Co. KG | Präparationsvorrichtung für massenspektrometrische Proben |
-
2013
- 2013-04-02 ES ES13717580.8T patent/ES2642340T3/es active Active
- 2013-04-02 CN CN201380027317.8A patent/CN104364659B/zh active Active
- 2013-04-02 RU RU2014143720A patent/RU2639777C9/ru active
- 2013-04-02 ES ES17182362T patent/ES2821376T3/es active Active
- 2013-04-02 EP EP20186311.5A patent/EP3792635A1/en active Pending
- 2013-04-02 EP EP13717580.8A patent/EP2831598B1/en active Active
- 2013-04-02 CN CN201710417821.9A patent/CN107238725B/zh active Active
- 2013-04-02 WO PCT/NL2013/050239 patent/WO2013147610A2/en active Application Filing
- 2013-04-02 BR BR112014024474A patent/BR112014024474B8/pt active IP Right Grant
- 2013-04-02 CA CA2868555A patent/CA2868555C/en active Active
- 2013-04-02 EP EP17182362.8A patent/EP3267206B1/en active Active
- 2013-04-02 CA CA3003387A patent/CA3003387C/en active Active
- 2013-04-02 US US14/388,430 patent/US9556495B2/en active Active
- 2013-04-02 SG SG11201406166SA patent/SG11201406166SA/en unknown
- 2013-04-02 AU AU2013240662A patent/AU2013240662B2/en active Active
- 2013-04-02 JP JP2015503148A patent/JP6321622B2/ja active Active
-
2016
- 2016-12-19 US US15/383,573 patent/US9753045B2/en active Active
-
2017
- 2017-07-28 US US15/663,540 patent/US10073105B2/en active Active
-
2018
- 2018-02-26 AU AU2018201376A patent/AU2018201376B2/en active Active
- 2018-04-05 JP JP2018073211A patent/JP6849629B2/ja active Active
- 2018-08-08 US US16/058,414 patent/US10495655B2/en active Active
-
2019
- 2019-10-30 US US16/668,656 patent/US10859588B2/en active Active
-
2020
- 2020-11-10 US US17/094,178 patent/US11609239B2/en active Active
-
2021
- 2021-03-04 JP JP2021034607A patent/JP7277498B2/ja active Active
-
2023
- 2023-05-08 JP JP2023076854A patent/JP2023116445A/ja active Pending
-
2024
- 2024-05-08 JP JP2024075997A patent/JP2024105451A/ja active Pending
Also Published As
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2014143720A (ru) | Автоматизированный отбор микроорганизмов и их идентификация с помощью малди | |
| JP2015518142A5 (ru) | ||
| CN108535169B (zh) | 一种细胞内pH值检测方法 | |
| CN104458872A (zh) | 一种测量水中重金属离子的装置 | |
| CN209542392U (zh) | 一种可实时监控的耐黄变试验机 | |
| CN220912995U (zh) | 一种动物养殖场环境微生物检测装置 | |
| CN220568608U (zh) | 一种锂电池隔膜浸润性检测装置 | |
| CN101984347B (zh) | 全自动膏药软化点测定装置 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| TH4A | Reissue of patent specification |