RU2013102241A - Способы и устройства - Google Patents

Способы и устройства Download PDF

Info

Publication number
RU2013102241A
RU2013102241A RU2013102241/10A RU2013102241A RU2013102241A RU 2013102241 A RU2013102241 A RU 2013102241A RU 2013102241/10 A RU2013102241/10 A RU 2013102241/10A RU 2013102241 A RU2013102241 A RU 2013102241A RU 2013102241 A RU2013102241 A RU 2013102241A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
nucleic acid
sampling
probe
material containing
reaction
Prior art date
Application number
RU2013102241/10A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2549694C2 (ru
Inventor
Пол Джералд ДИБЕНХЭМ
Дейвид Джон МУР
Original Assignee
ЭлДжиСи ЛИМИТЕД
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by ЭлДжиСи ЛИМИТЕД filed Critical ЭлДжиСи ЛИМИТЕД
Publication of RU2013102241A publication Critical patent/RU2013102241A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2549694C2 publication Critical patent/RU2549694C2/ru

Links

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61BDIAGNOSIS; SURGERY; IDENTIFICATION
    • A61B10/00Other methods or instruments for diagnosis, e.g. instruments for taking a cell sample, for biopsy, for vaccination diagnosis; Sex determination; Ovulation-period determination; Throat striking implements
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844Nucleic acid amplification reactions
    • C12Q1/686Polymerase chain reaction [PCR]
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6806Preparing nucleic acids for analysis, e.g. for polymerase chain reaction [PCR] assay
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844Nucleic acid amplification reactions
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844Nucleic acid amplification reactions
    • C12Q1/6848Nucleic acid amplification reactions characterised by the means for preventing contamination or increasing the specificity or sensitivity of an amplification reaction
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N1/00Sampling; Preparing specimens for investigation
    • G01N1/02Devices for withdrawing samples
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/543Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor with an insoluble carrier for immobilising immunochemicals
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N1/00Sampling; Preparing specimens for investigation
    • G01N2001/002Devices for supplying or distributing samples to an analysing apparatus
    • G01N2001/007Devices specially adapted for forensic samples, e.g. tamper-proofing, sample tracking
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N1/00Sampling; Preparing specimens for investigation
    • G01N1/02Devices for withdrawing samples
    • G01N2001/028Sampling from a surface, swabbing, vaporising

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Medical Informatics (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Heart & Thoracic Surgery (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Surgery (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
  • Saccharide Compounds (AREA)

Abstract

1. Способ амплификации нуклеиновой кислоты из высших эукариот, таких как млекопитающее или растение, который включает(a) контакт устройства для забора образцов с источником нуклеиновой кислоты из высших эукариот, таких как млекопитающее или растение, так чтобы после контакта указанный материал, содержащий нуклеиновую кислоту из высших эукариот, таких как млекопитающее или растение, налипал, по меньшей мере, на часть устройства для забора образцов, где устройство для забора образцов или его часть, на которую налипает материал, содержащий нуклеиновую кислоту, изготовлено из полимерного материала;(b) введение устройства для забора образцов или его части, на которую налип материал, содержащий нуклеиновую кислоту, в реакционный сосуд, который содержит реакционную смесь для проведения реакции амплификации нуклеиновой кислоты без какой-либо предварительной обработки материала, содержащего нуклеиновую кислоту; и(c) осуществление реакции амплификации нуклеиновой кислоты.2. Применение устройства для забора образцов для получения образца материала из высших эукариот, содержащего нуклеиновую кислоту, и для введения образца без предварительной обработки в реакционный сосуд, содержащий реакционную смесь для амплификации нуклеиновой кислоты, где устройство для забора образцов или его часть, на которую налипает материал, содержащий нуклеиновую кислоту, сделан из полимерного материала, на который материал, содержащий нуклеиновую кислоту, налипает при контакте.3. Способ по п.1, где полимерный материал выбран из любого материала из числа поликарбоната, стекла, сополимера циклического олефина, такого как Topas, акрилового �

Claims (59)

1. Способ амплификации нуклеиновой кислоты из высших эукариот, таких как млекопитающее или растение, который включает
(a) контакт устройства для забора образцов с источником нуклеиновой кислоты из высших эукариот, таких как млекопитающее или растение, так чтобы после контакта указанный материал, содержащий нуклеиновую кислоту из высших эукариот, таких как млекопитающее или растение, налипал, по меньшей мере, на часть устройства для забора образцов, где устройство для забора образцов или его часть, на которую налипает материал, содержащий нуклеиновую кислоту, изготовлено из полимерного материала;
(b) введение устройства для забора образцов или его части, на которую налип материал, содержащий нуклеиновую кислоту, в реакционный сосуд, который содержит реакционную смесь для проведения реакции амплификации нуклеиновой кислоты без какой-либо предварительной обработки материала, содержащего нуклеиновую кислоту; и
(c) осуществление реакции амплификации нуклеиновой кислоты.
2. Применение устройства для забора образцов для получения образца материала из высших эукариот, содержащего нуклеиновую кислоту, и для введения образца без предварительной обработки в реакционный сосуд, содержащий реакционную смесь для амплификации нуклеиновой кислоты, где устройство для забора образцов или его часть, на которую налипает материал, содержащий нуклеиновую кислоту, сделан из полимерного материала, на который материал, содержащий нуклеиновую кислоту, налипает при контакте.
3. Способ по п.1, где полимерный материал выбран из любого материала из числа поликарбоната, стекла, сополимера циклического олефина, такого как Topas, акрилового полимера, такого как РММА, кристаллического полистирола, полипропилена, HDPE, полистирола средней ударной прочности, PVC, жидкокристаллического полимера 30%, Trans ABS, сополимера ацеталя, полиэфира, полиэтилена, нейлона, полиэфира полиуретана, блок-сополимера стирола и бутадиена, статистического сополимера полипропилена, этиленвинилацетата, силоксана, такого как PDMS, и термопластического эластомера, такого как сантопрен.
4. Способ по п.1, где источник нуклеиновых кислот из высших эукариот, таких как млекопитающее или растение, по существу, является сухим.
5. Способ амплификации нуклеиновой кислоты из источника из высших эукариот, таких как млекопитающее или растение, который включает
(а) контакт устройства для забора образцов с источником нуклеиновой кислоты из высших эукариот, таких как млекопитающее или растение, так чтобы после контакта указанный материал, содержащим нуклеиновую кислоту из высших эукариот, таких как млекопитающее или растение, налипал, по меньшей мере, на часть устройства для забора образцов, где источник нуклеиновых кислот из высших эукариот, таких как млекопитающее или растение, по существу, является сухим;
(b) введение устройства для забора образцов или его части, на которую налип материал, содержащий нуклеиновую кислоту, в реакционный сосуд, который содержит реакционную смесь для проведения реакции амплификации нуклеиновой кислоты без какой-либо предварительной обработки материала, содержащего нуклеиновую кислоту; и
(c) осуществление реакции амплификации нуклеиновой кислоты.
6. Способ по п.5, где устройство для забора образцов или его часть, на которую налипает материал, содержащий нуклеиновую кислоту, сделан из любого материала из числа стекла, поликарбоната, сополимера циклического олефина, такого как Topas, акрилового полимера, такого как РММА, кристаллического полистирола, полипропилена, HDPE, полистирола средней ударной прочности, PVC, жидкокристаллического полимера 30%, Trans ABS, сополимера ацеталя, полиэфира, полиэтилена, нейлона, полиэфира полиуретана, блок-сополимера стирола и бутадиена, статистического сополимера полипропилена, этиленвинилацетата, силоксана, такого как PDMS, и термопластического эластомера, такого как сантопрен.
7. Способ по п.1, где реакционная смесь, по существу, не содержит хаотропных агентов.
8. Способ поп.1, где реакционная смесь, по существу, не содержит агентов, лизирующих клетку.
9. Способ поп.1, где устройство для забора образцов или его часть, на которую налипает материал, содержащий нуклеиновую кислоту, обеспечивает закупорку реакционного сосуда.
10. Применение устройства для забора образцов нуклеиновой кислоты для получения нуклеиновой кислоты из источника высших эукариот, таких как млекопитающее или растение, и последующего введения источника нуклеиновой кислоты высших эукариот, таких как млекопитающее или растение, в реакционный сосуд, содержащий реакционную смесь реакции амплификации нуклеиновых кислот, без предварительной обработки, где источник нуклеиновых кислот из высших эукариот, таких как млекопитающее или растение, по существу, является сухим.
11. Применение по п.10, где нуклеиновая кислота налипает на устройство для забора образцов или на его часть, причем устройство для забора образцов или его часть, на которую налипает материал, содержащий нуклеиновую кислоту, сделано из любого материала из числа поликарбоната, стекла, сополимера циклического олефина, такого как Topas, акрилового полимера, такого как РММА, кристаллического полистирола, полипропилена, HDPE, полистирола средней ударной прочности, PVC, жидкокристаллического полимера 30%, Trans ABS, сополимера ацеталя, полиэфира, полиэтилена, нейлона, полиэфира полиуретана, блок-сополимера стирола и бутадиена, статистического сополимера полипропилена, этиленвинилацетата, силоксана, такого как PDMS, и термопластического эластомера, такого как сантопрен.
12. Способ получения реакционного сосуда, содержащего реакционную смесь и материал, который содержит нуклеиновую кислоту, готового к проведению реакции амплификации нуклеиновой кислоты, который включает
(a) обеспечение закупоренного реакционного сосуда с единственной ячейкой, которая содержит реакционную смесь для проведения реакции амплификации;
(b) обеспечение устройства для забора образцов;
(c) контакт устройства для забора образцов с материалом, содержащим нуклеиновую кислоту, так чтобы после него указанный материал, содержащий нуклеиновую кислоту, налипал, по меньшей мере, на часть устройства для забора образцов;
(d) раскупоривание реакционного сосуда;
(e) помещение устройства для забора образцов или его части, на которую налип материал, содержащий нуклеиновую кислоту, в реакционный сосуд, так чтобы материал, содержащий нуклеиновую кислоту, контактировал с реакционной смесью;
(f) повторное воздухонепроницаемое закупоривание реакционного сосуда с помощью устройства для забора образцов или его части, на которую налип материал, содержащий нуклеиновую кислоту, все еще присутствующую в реакционном сосуде.
13. Способ по п.12, где несколько реакционных сосудов соединены вместе и подготавливаются одновременно.
14. Способ по п.12, где устройство для забора проб или его часть, на которую налипает материал, содержащий нуклеиновую кислоту, конструируется с учетом возможности распределения материала, содержащего нуклеиновую кислоту, между несколькими реакционными сосудами.
15. Способ по п.12 или 13, где раскупоривание реакционного сосуда (стадия (d)) проводят перед контактом устройства для забора образцов с материалом, содержащим нуклеиновую кислоту (стадия (с)).
16. Способ по п.12 или 13, где устройство для забора образцов или его часть, на которую налипает материал, содержащий нуклеиновую кислоту, обеспечивает закупоривание реакционного сосуда в стадии (f).
17. Способ по пп.12 и 13, где устройство для забора образцов или его часть, на которую налипает материал, содержащий нуклеиновую кислоту, сделан из любого материала из числа стекла, сополимера циклического олефина, такого как Topas, акрилового полимера, такого как РММА, кристаллического полистирола, полипропилена, HDPE, поликарбоната, полистирола средней ударной прочности, PVC, жидкокристаллического полимера 30%, Trans ABS, сополимера ацеталя, полиэфира, полиэтилена, нейлона, полиэфира полиуретана, блок-сополимера стирола и бутадиена, статистического сополимера полипропилена, этиленвинилацетата, силоксана, такого как PDMS, и термопластического эластомера, такого как сантопрен.
18. Способ по пп.12 и 13, где реакционная смесь, по существу, не содержит хаотропных агентов.
19. Способ по пп.12 и 13, где реакционная смесь, по существу, не содержит агентов, лизирующих клетку.
20. Способ по пп.12 и 13, где устройство для забора образцов или его часть, на которую налипает материал, содержащий нуклеиновую кислоту, помещают непосредственно в реакционный сосуд без дополнительной обработки после забора образца.
21. Способ по пп.12 и 13, где реакционная смесь предназначена для проведения любой реакции из числа полимеразной цепной реакции (ПЦР), лигазной цепной реакции (LCR), петлевой изотермической амплификации (LAMP), транскрипционно-опосредованной амплификации (ТМА), технологии сигнально-опосредованной амплификации РНК (SMART), амплификации с замещением цепи (SDA), амплификации по типу катящегося кольца (RCA), изотермической амплификации с множественным вытеснением цепи (IMDA), геликаза-зависимой амплификации (HAD), изотермической амплификации с единственным праймером (SPIA), циклической хеликаза-зависимой амплификации (CDHA) или амплификации на основе последовательности нуклеиновых кислот (NASBA).
22. Способ по пп.12 и 13, где материал, содержащий нуклеиновую кислоту, происходит из млекопитающего, такого как человек.
23. Способ по пп.12 и 13, где материал, содержащий нуклеиновую кислоту, по существу, является сухим.
24. Способ амплификации нуклеиновой кислоты, который включает приготовление реакционного сосуда по любому из пп.12-23, и осуществление реакции амплификации нуклеиновой кислоты в реакционном сосуде.
25. Способ амплификации нуклеиновой кислоты, который включает осуществление способа по любому из пп.12-23, удаление устройства для забора образцов или его части, на которую налип материал, содержащий нуклеиновую кислоту, и помещение его в дополнительный реакционный сосуд и осуществление реакции амплификации нуклеиновой кислоты в дополнительном реакционном сосуде.
26. Способ по п.25, где дополнительный реакционный сосуд готовят по п.1.
27. Способ по п.1, где образец, содержащий нуклеиновую кислоту, представляет собой любые клетки, такие как клетки кожи, высушенная кровь, высушенная семенная жидкость, высушенная слюна или клеточный материал, депонированный на поверхности посредством касания.
28. Набор реактивов, включающий (а) закупоренный реакционный сосуд, который содержит реакционную смесь для проведения реакции амплификации нуклеиновой кислоты, и (b) устройство для забора образцов, по меньшей мере, на часть которого может налипнуть материал, содержащий нуклеиновую кислоту, после контакта с указанным материалом, где устройство для забора образцов или его часть, на которую налипает материал, содержащий нуклеиновую кислоту, может быть введено в реакционный сосуд, а реакция амплификации нуклеиновой кислоты может быть осуществлена в сосуде в присутствии устройства для забора образцов или его части, на которую налип материал, содержащий нуклеиновую кислоту.
29. Набор реактивов по п.28, включающий несколько реакционных сосудов, соединенных вместе.
30. Набор реактивов по п.28 или 29, где устройство для забора образцов или его часть, на которую может налипнуть материал, содержащий нуклеиновую кислоту, конструируется с учетом возможности распределения материала, содержащего нуклеиновую кислоту, между несколькими реакционными сосудами.
31. Набор реактивов по п.28 или 29, где устройство для забора образцов или его часть, на которую может налипнуть материал, содержащий нуклеиновую кислоту, обеспечивает закупоривание реакционного сосуда после удаления исходного затвора.
32. Набор реактивов по п.28 или 29, где устройство для забора образцов или его часть, на которую может налипнуть материал, содержащий нуклеиновую кислоту, сделан из любого материала из числа поликарбоната, стекла, сополимера циклического олефина, такого как Topas, акрилового полимера, такого как РММА, кристаллического полистирола, полипропилена, HDPE, полистирола средней ударной прочности, PVC, жидкокристаллического полимера 30%, Trans ABS, сополимера ацеталя, полиэфира, полиэтилена, нейлона, полиэфира полиуретана, блок-сополимера стирола и бутадиена, статистического сополимера полипропилена, этиленвинилацетата, силоксана, такого как PDMS, и термопластического эластомера, такого как сантопрен.
33. Набор реактивов по п.28 или 29, где реакционная смесь, присутствующая в реакционном сосуде, определяется по любому из пп.18, 19 или 21.
34. Способ конструкции носителя данных, который записывает генотип, ассоциированный с нуклеиновой кислотой из материала, содержащего нуклеиновую кислоту, причем способ включает проведение способа по любому из пп.1, 5 или 24, определение генотипа нуклеиновой кислоты в материале, содержащем нуклеиновую кислоту, и запись генотипа на носитель данных.
35. Устройство для забора нуклеиновой кислоты, включающее зонд для удержания образца нуклеиновой кислоты; и манипулятор, который присоединяется к зонду с учетом возможности маневрирования зондом, причем зонд способен отделяться от манипулятора, где зонд включает несколько элементов зонда, которые способны перемещаться друг относительно друга между сближенной и взаимно удаленной конфигурациями, причем каждый элемент зонда имеет наконечник, который, в момент когда элементы зонда перемещаются в сближенную конфигурацию, объединяется с другими наконечниками, образуя составной наконечник, который способен контактировать с нуклеиновой кислотой с целью доставки ее образца.
36. Устройство по п.35, где образованный составной наконечник имеет несколько контактов с нуклеиновой кислотой, соответствующих количеству прикрепленных наконечников, так что при контакте нуклеиновой кислоты с составным наконечником каждый из контактов нуклеиновой кислоты имеет, как правило, одинаковое количество нуклеиновой кислоты.
37. Устройство по п.35 или 36, где манипулятор имеет активатор элемента зонда для вызова избирательного движения элементов зонда между сближенной и взаимно удаленной конфигурациями.
38. Устройство по п.36, где манипулятор имеет удлиненный корпус; а активатор элемента зонда способен двигаться вдоль корпуса для того, чтобы вызвать избирательное движение элементов зонда сближенной и взаимно удаленной конфигурациями.
39. Устройство по п.38, где корпус является пустотелым, а активатор элемента зонда по существу расположен в нем и способен перемещаться во внутреннем пространстве корпуса.
40. Устройство по п.39, где корпус имеет сквозное отверстие, образованное в нем; а активатор элемента зонда способен контактировать посредством сквозного отверстия с целью его движения внутри стержня.
41. Устройство по п.37, где манипулятор имеет вращаемый элемент, который функционально связан с активатором элемента зонда, так что вращение вращаемого элемента вызывает передвижение активатором элементов зонда между сближенной и взаимно удаленной конфигурациями.
42. Устройство по п.37, где каждый элемент зонда включает упруго деформируемый, удлиненный элемент, имеющий на одном конце указанный наконечник; где удлиненные элементы расположены в одной связке вдоль друг друга со своими наконечниками на одном конце связки; где каждый элемент зонда изогнут так, чтобы наконечники отклонялись друг от друга; и где активатор элемента зонда имеет оболочку, которая окружает связку способна передвигаться вдоль элементов связки, и где оболочка при приближении к наконечникам вызывает схождение наконечников в направлении, противоположном упругой деформации элементов зонда, в результате чего образуется составной наконечник, а перемещение оболочки от наконечников вдоль связки позволяет наконечникам отклоняться друг от друга из-за их изогнутой формы и способности к упругой деформации.
43. Устройство по п.42, включающее один или несколько высвобождаемых фиксаторов для сохранения оболочки в определенном положении.
44. Устройство по п.37, включающее упруго деформируемый лист, служащий основанием для нескольких элементов зонда, каждый из которых имеет свободный конец, включающий наконечник, где лист способен к преобразованию между конфигурацией, в которой части наконечников отдалены друг от друга, и деформированной конфигурацией, в которой элементы зонда сближаются так, что наконечники образуют композитный наконечник.
45. Устройство по п.35, дополнительно включающее приемник, имеющий закупориваемое отверстие для контакта одного или нескольких реактивов и образца нуклеиновой кислоты; функциональную часть манипулятора, которая обуславливает или обеспечивает вставку зонда через отверстие для помещения образца в приемник.
46. Устройство по п.45, зонд которого имеет закупоривающее устройство, которое при помещении образца в приемник закрывает приемник от выхода или входа материала, содержащего нуклеиновую кислоту.
47. Устройство по п.46, где закупоривающее устройство представляет собой или включает непроницаемый для жидкостей затвор, который присоединен к зонду или является составной частью зонда.
48. Устройство по п.46, включающее закупоривающее устройство, которое присоединено к нескольким зондам или является их составной частью.
49. Устройство по любому из пп.45-48, где закупоривающее устройство и манипулятор избирательно могут быть отделены друг от друга.
50. Устройство по п.35, где манипулятор включает источник, удерживающий несколько зондов так, чтобы они были отделены от окружающей среды; и распределяющий механизм для последовательного представления зондов так, чтобы привести, по меньшей мере, часть из них в контакт с нуклеиновой кислотой.
51. Устройство по п.50, где источник представляет собой или включает сосуд, содержащий один или несколько зондов, причем сосуд имеет отверстие, через которое указанный зонд может выдвигаться при функционировании распределяющего механизма.
52. Устройство по п.51, где выдвигающийся зонд закрывает отверстие сосуда при распределении.
53. Устройство по п.35, где манипулятор имеет один или несколько эжекторов для извлечения, по меньшей мере, одного указанного зонда из манипулятора при его отделении от зонда, причем каждый эжектор функционирует из места на манипуляторе, которое отдалено от извлекаемого зонда.
54. Устройство по п.53, включающее несколько зондов и общий эжектор для извлечения более чем одного зонда из манипулятора.
55. Устройство по п.53, включающее несколько зондов и соответствующее множество эжекторов, причем указанный эжектор способен извлекать указанный зонд.
56. Устройство по п.35, где каждый зонд может быть сконфигурирован для образования наконечника, который можно применять для контакта с нуклеиновой кислотой с целью введения ее образца в приемник при функционировании манипулятора.
57. Устройство по п.56, где, по меньшей мере, один наконечник сделан из полимерного материала или включает полимерный материал, на который налипает ДНК или материал, содержащий нуклеиновую кислоту высших эукариот.
58. Устройство по п.56, где полимерный материал выбран из списка, включающего поликарбонат, стекло, сополимер циклического олефина, такого как Topas, акриловый полимер, такой как РММА, кристаллический полистирол, полипропилен, HDPE, полистирол средней ударной прочности, PVC, жидкий кристаллический полимер 30%, Trans ABS, сополимер ацеталя, полиэфир, полиэфиримид, полиэтилен, нейлон, полиэфир полиуретана, блок-сополимер стирола и бутадиена, статистический сополимер полипропилена, этиленвинилацетат, силоксан, такой как PDMS, и термопластический эластомер, такой как сантопрен.
59. Способ или применение или набор реактивов или устройство по любому из предыдущих пунктов, где устройство для забора образцов или его часть, на которую налипает материал, содержащий нуклеиновую кислоту, обрабатывается так, чтобы оно было ДНК-стерильным, или зонд для удержания указанного образца нуклеиновой кислоты обрабатывается так, чтобы он был ДНК-стерильным.
RU2013102241/10A 2010-06-18 2011-06-17 Пцр способ, использующий полимерный материал в качестве носителя RU2549694C2 (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
GB1010237.4 2010-06-18
GB201010237A GB201010237D0 (en) 2010-06-18 2010-06-18 Methods and apparatuses
PCT/GB2011/051133 WO2011158037A2 (en) 2010-06-18 2011-06-17 Methods and apparatuses

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2013102241A true RU2013102241A (ru) 2014-07-27
RU2549694C2 RU2549694C2 (ru) 2015-04-27

Family

ID=42471855

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2013102241/10A RU2549694C2 (ru) 2010-06-18 2011-06-17 Пцр способ, использующий полимерный материал в качестве носителя

Country Status (15)

Country Link
US (1) US9139871B2 (ru)
EP (1) EP2582843B1 (ru)
JP (1) JP5766284B2 (ru)
CN (1) CN103069008B (ru)
AU (1) AU2011266792B2 (ru)
BR (1) BR112012032369A2 (ru)
CA (1) CA2802911A1 (ru)
ES (1) ES2578263T3 (ru)
GB (2) GB201010237D0 (ru)
HK (1) HK1171476A1 (ru)
MX (1) MX340926B (ru)
NZ (2) NZ700170A (ru)
RU (1) RU2549694C2 (ru)
WO (1) WO2011158037A2 (ru)
ZA (1) ZA201209615B (ru)

Families Citing this family (19)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
NZ711257A (en) 2009-02-03 2017-05-26 Netbio Inc Nucleic acid purification
GB201201464D0 (en) * 2012-01-27 2012-03-14 Secr Defence Analytical method
CN102605100B (zh) * 2012-02-22 2014-08-20 山东省农业科学院畜牧兽医研究所 环介导等温扩增禽传染性支气管炎病毒的引物、检测试剂盒及检测方法
KR101943623B1 (ko) * 2013-03-13 2019-01-30 주식회사 씨젠 멜팅 피크 분석을 이용한 타겟 핵산서열의 정량
JP6337323B2 (ja) * 2014-01-21 2018-06-06 森永乳業株式会社 検体採取具、その製造方法、検体の採取方法、および検出方法
WO2016060793A1 (en) * 2014-10-14 2016-04-21 Becton, Dickinson And Company Blood sample management using open cell foam
JP6886965B2 (ja) * 2015-08-11 2021-06-16 ステム アーツ プロジェクツ, エルエルシー 携帯型核酸抽出器具及びその使用方法
CN108430336A (zh) * 2015-11-11 2018-08-21 格拉茨医科大学 循环细胞、蛋白质和核酸的体内收集和局部定量以及特征分析
US10391498B2 (en) * 2015-12-11 2019-08-27 Spartan Bioscience Inc. Systems and methods for nucleic acid amplification
NZ720675A (en) 2016-05-31 2017-07-28 Crime Scene Solutions Ltd Improved collection and storage apparatus
WO2017210748A1 (en) * 2016-06-10 2017-12-14 Flinders University Of South Australia Nucleic acid collection device and method
WO2018025856A1 (ja) * 2016-08-02 2018-02-08 学校法人武庫川学院 簡便な遺伝子検査法およびコピー数計測法ならびにその支援技術
RU178938U1 (ru) * 2017-06-20 2018-04-23 Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Амурская государственная медицинская академия" Министерства здравоохранения Российской Федерации Устройство для подготовки цитологического мазка биологических жидкостей к проведению экспресс-анализа клеточного состава
CN107807144A (zh) * 2017-10-24 2018-03-16 唐山开滦化工科技有限公司 一种共聚甲醛分子中链段分布的测定方法
CN108796118B (zh) * 2018-06-26 2021-11-16 福建省农业科学院植物保护研究所 一种马铃薯早疫病菌环介导扩增检测引物及其检测方法
JP6652673B1 (ja) * 2019-06-07 2020-02-26 日本板硝子株式会社 反応処理容器
US11465143B2 (en) 2019-06-07 2022-10-11 Nippon Sheet Glass Company, Limited Reaction processing vessel
CN111549024B (zh) * 2020-05-09 2023-06-30 浙江省中药研究所有限公司 一种核酸提取试纸条及其使用方法
RU2770918C1 (ru) * 2021-06-07 2022-04-25 Федеральное Государственное Казенное Образовательное Учреждение Высшего Образования «Санкт-Петербургская Академия Следственного Комитета Российской Федерации» Способ изъятия биологических следов со снега и устройство для его реализации

Family Cites Families (33)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US627226A (en) 1899-06-20 farquharson
US5496562A (en) 1988-10-05 1996-03-05 Flinders Technologies Pty Ltd Solid medium and method for DNA storage
US5807527A (en) 1991-05-29 1998-09-15 Flinders Technologies Pty. Ltd. Solid medium and method for DNA storage
NL8900725A (nl) 1989-03-23 1990-10-16 Az Univ Amsterdam Werkwijze en combinatie van middelen voor het isoleren van nucleinezuur.
US6103192A (en) 1997-04-14 2000-08-15 Genetec Corporation Immobilizing and processing specimens on matrix materials for the identification of nucleic acid sequences
DE19746874A1 (de) 1997-10-23 1999-04-29 Qiagen Gmbh Verfahren zur Isolierung und Reinigung von Nukleinsäuren an hydrophoben Oberflächen - insbesondere unter Verwendung hydrophober Membranen
BR9814604A (pt) 1997-12-31 2000-10-17 Qiagen Genomics Inc "ponteiras em fase sólida e seus usos"
AU6048199A (en) 1999-03-11 2000-09-28 Whatman, Inc. Solid medium and process for the storage and rapid purification of nucleic acid
CA2379503A1 (en) 1999-08-20 2001-03-01 Promega Corporation Simultaneous isolation and quantitation of dna
DK1715063T3 (da) 2000-03-29 2011-05-16 Lgc Ltd Hydridiseringsbeacon og fremgangsmåde til hurtig sekvensdetektion og distinktion
US6428962B1 (en) 2001-02-12 2002-08-06 Dna Analysis, Inc. Nucleic acid collection barrier method and apparatus
WO2002078847A1 (fr) 2001-03-28 2002-10-10 Hitachi, Ltd. Instrument et procede permettant de recuperer de l'acide nucleique
US7041257B2 (en) 2001-09-25 2006-05-09 Cytonome, Inc. Microfabricated two-pin liquid sample dispensing system
DE60316660T3 (de) 2002-01-08 2016-01-28 Roche Diagnostics Gmbh Verwendung eines silikamaterials bei der amplifikation
US20040152085A1 (en) 2003-02-04 2004-08-05 Veridian Systems Division Surface for collection and/or purification of nucleic acids
GB0322983D0 (en) * 2003-10-01 2003-11-05 Isohelix Limitd Sampling kits, devices and uses thereof
US6991898B2 (en) 2003-10-20 2006-01-31 Kimberly-Clark Worldwide, Inc. Diagnostic test device and method of using same
CA2552686A1 (en) 2003-11-12 2005-05-26 Trustees Of Boston University Isolation of nucleic acid from mouth epithelial cells
US20050136477A1 (en) 2003-11-17 2005-06-23 Hashem Akhavan-Tafti Methods for isolating nucleic acids from biological and cellular materials
US20050106602A1 (en) 2003-11-17 2005-05-19 Hashem Akhavan-Tafti Simplified methods for isolating nucleic acids from cellular materials
GB0514889D0 (en) 2005-07-20 2005-08-24 Lgc Ltd Oligonucleotides
RU2321638C2 (ru) * 2006-05-23 2008-04-10 Закрытое акционерное общество "Молекулярно-медицинские технологии" Способ изготовления многофункционального мультичипа, мультичип для последовательного или параллельного скрининга биополимеров, способ анализа биополимеров и набор для осуществления способа
JP4729711B2 (ja) 2006-07-06 2011-07-20 国立大学法人群馬大学 デオキシリボ核酸複合体を固定化したシリコーン構造体の製造方法
EP1878497A1 (en) 2006-07-14 2008-01-16 Roche Diagnostics GmbH Disposable for analyzing a liquid sample by nucleic acid amplification
US20080070282A1 (en) 2006-08-21 2008-03-20 Samsung Electronics Co., Ltd. Method and device for obtaining or amplifying nucleic acid from a cell using a nonplanar solid substrate
US20080058676A1 (en) 2006-09-06 2008-03-06 Yong Peter A K Retractable segmented bio-molecular collector swab system
US7521213B2 (en) 2006-12-01 2009-04-21 Quest Diagnostics Investments Incorporated Sample processing for nucleic acid amplification
JP2007244389A (ja) 2007-04-16 2007-09-27 Sumitomo Precision Prod Co Ltd 核酸増幅基板
AU2008315791B2 (en) 2007-10-22 2014-04-10 Lgc Limited Oligonucleotides and uses thereof
US20090260458A1 (en) 2008-04-17 2009-10-22 Victor Joseph High throughput dispenser
US8226906B2 (en) 2008-09-08 2012-07-24 Zygem Corporation Limited Sample collection device suitable for low-volume extraction
DE102009012221A1 (de) 2009-03-07 2010-09-09 Daimler Ag Fahrberechtigungssystem für einen Elektroantrieb
WO2011116481A1 (en) * 2010-03-25 2011-09-29 Dna Genotek Inc. Sample collection tool

Also Published As

Publication number Publication date
GB2485955A (en) 2012-05-30
WO2011158037A2 (en) 2011-12-22
RU2549694C2 (ru) 2015-04-27
EP2582843A2 (en) 2013-04-24
GB201205470D0 (en) 2012-05-09
CN103069008A (zh) 2013-04-24
GB2485955B (en) 2013-04-24
WO2011158037A3 (en) 2012-03-29
NZ604683A (en) 2014-10-31
MX340926B (es) 2016-08-01
AU2011266792A1 (en) 2013-01-10
AU2011266792B2 (en) 2014-11-06
CA2802911A1 (en) 2011-12-22
JP2013528393A (ja) 2013-07-11
CN103069008B (zh) 2016-01-20
ES2578263T3 (es) 2016-07-22
JP5766284B2 (ja) 2015-08-19
MX2012015025A (es) 2013-04-03
ZA201209615B (en) 2014-05-28
US9139871B2 (en) 2015-09-22
EP2582843B1 (en) 2016-03-30
GB201010237D0 (en) 2010-07-21
US20130157315A1 (en) 2013-06-20
BR112012032369A2 (pt) 2016-10-04
NZ700170A (en) 2016-01-29
HK1171476A1 (en) 2013-03-28

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2013102241A (ru) Способы и устройства
JP2013528393A5 (ru)
Choi et al. based sample-to-answer molecular diagnostic platform for point-of-care diagnostics
EP3009510B1 (en) Rapid nucleic acid extraction method and apparatus
EP3789503B1 (en) Method of amplifying nucleic acids
CN101457204A (zh) 自动化遗传物质处理系统及方法
EP3387107B1 (en) Tube sealing system and methods for nucleic acid amplification
EP3980349A1 (en) Sample collection methods and devices
JP2018099109A (ja) マルチウェルプレート用蓋部材及びマルチウェルプレート
JP2019520825A (ja) 磁性粒子を用いたハイスループット微生物学適用高分解能システム、キット、装置および方法
CN106190769B (zh) 一种物料分存式混合装置
CN211142050U (zh) 一种微量细胞核酸提取与扩增系统
Yanagihara et al. Direct PCR amplification of the 16S rRNA gene from single microbial cells isolated from an Antarctic iceberg using laser microdissection microscopy
CN206666512U (zh) 一种pcr实验操作实验盘
EP3630355B1 (en) Modified sample processing tubule
US20180345275A1 (en) Customizable Sample Processing Device
CN110724633A (zh) 一种微量细胞核酸提取与扩增系统及工艺
CN204661651U (zh) 一种物料分存式混合装置
CN202220171U (zh) 猪黑素皮质素受体4基因检测试剂盒
Zengerle et al. Microfluidic solutions for miniaturization, integration, automation and parallelization of tests on commercially available instruments
Vitha et al. High Throughput Processing of DNA Samples on FTA Paper for PCR Analysis
Brisbin et al. Single-cell RNA extraction and cDNA library preparation from challenging marine protists (eg Acantharea)
CN117019248A (zh) 一种微孔芯片与单细胞分析方法
Behr Sampling of Cells after Biopsy for aCGH
Kit Rapidly purify genomic DNA for diverse applications

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20190618