RU2012123382A - Растения, экспрессирующие ферменты, деградирующие клеточную стенку, и векторы экспрессии - Google Patents

Растения, экспрессирующие ферменты, деградирующие клеточную стенку, и векторы экспрессии Download PDF

Info

Publication number
RU2012123382A
RU2012123382A RU2012123382/10A RU2012123382A RU2012123382A RU 2012123382 A RU2012123382 A RU 2012123382A RU 2012123382/10 A RU2012123382/10 A RU 2012123382/10A RU 2012123382 A RU2012123382 A RU 2012123382A RU 2012123382 A RU2012123382 A RU 2012123382A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
seq
transgenic plant
sequence
nucleic acid
sequence selected
Prior art date
Application number
RU2012123382/10A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2606766C2 (ru
Inventor
Р. Майкл РААБ
Олег БУГРИ
Влад САМОЙЛОВ
Нейт ЭКБОРГ
Original Assignee
Агривида, Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority claimed from US12/590,444 external-priority patent/US8420387B2/en
Application filed by Агривида, Инк. filed Critical Агривида, Инк.
Publication of RU2012123382A publication Critical patent/RU2012123382A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2606766C2 publication Critical patent/RU2606766C2/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8201—Methods for introducing genetic material into plant cells, e.g. DNA, RNA, stable or transient incorporation, tissue culture methods adapted for transformation
    • C12N15/8202—Methods for introducing genetic material into plant cells, e.g. DNA, RNA, stable or transient incorporation, tissue culture methods adapted for transformation by biological means, e.g. cell mediated or natural vector
    • C12N15/8205—Agrobacterium mediated transformation
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P19/00—Preparation of compounds containing saccharide radicals
    • C12P19/14—Preparation of compounds containing saccharide radicals produced by the action of a carbohydrase (EC 3.2.x), e.g. by alpha-amylase, e.g. by cellulase, hemicellulase
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A23—FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
    • A23K—FODDER
    • A23K10/00—Animal feeding-stuffs
    • A23K10/30—Animal feeding-stuffs from material of plant origin, e.g. roots, seeds or hay; from material of fungal origin, e.g. mushrooms
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8216—Methods for controlling, regulating or enhancing expression of transgenes in plant cells
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8242—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8242—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits
    • C12N15/8243—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine
    • C12N15/8245—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine involving modified carbohydrate or sugar alcohol metabolism, e.g. starch biosynthesis
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8242—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits
    • C12N15/8243—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine
    • C12N15/8245—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine involving modified carbohydrate or sugar alcohol metabolism, e.g. starch biosynthesis
    • C12N15/8246—Non-starch polysaccharides, e.g. cellulose, fructans, levans
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8242—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits
    • C12N15/8257—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits for the production of primary gene products, e.g. pharmaceutical products, interferon
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8261—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8261—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
    • C12N15/8287—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for fertility modification, e.g. apomixis
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14—Hydrolases (3)
    • C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
    • C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
    • C12N9/2405—Glucanases
    • C12N9/2434—Glucanases acting on beta-1,4-glucosidic bonds
    • C12N9/2437—Cellulases (3.2.1.4; 3.2.1.74; 3.2.1.91; 3.2.1.150)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14—Hydrolases (3)
    • C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
    • C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
    • C12N9/2477—Hemicellulases not provided in a preceding group
    • C12N9/248—Xylanases
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P19/00—Preparation of compounds containing saccharide radicals
    • C12P19/02—Monosaccharides
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Y—ENZYMES
    • C12Y302/00—Hydrolases acting on glycosyl compounds, i.e. glycosylases (3.2)
    • C12Y302/01—Glycosidases, i.e. enzymes hydrolysing O- and S-glycosyl compounds (3.2.1)
    • C12Y302/01004—Cellulase (3.2.1.4), i.e. endo-1,4-beta-glucanase
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Y—ENZYMES
    • C12Y302/00—Hydrolases acting on glycosyl compounds, i.e. glycosylases (3.2)
    • C12Y302/01—Glycosidases, i.e. enzymes hydrolysing O- and S-glycosyl compounds (3.2.1)
    • C12Y302/01008—Endo-1,4-beta-xylanase (3.2.1.8)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Y—ENZYMES
    • C12Y302/00—Hydrolases acting on glycosyl compounds, i.e. glycosylases (3.2)
    • C12Y302/01—Glycosidases, i.e. enzymes hydrolysing O- and S-glycosyl compounds (3.2.1)

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Nutrition Science (AREA)
  • Polymers & Plastics (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Botany (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Physiology (AREA)
  • Animal Husbandry (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)

Abstract

1. Трансгенное растение, включающее нуклеиновую кислоту, кодирующую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90% идентична последовательности, выбранной из SEQ ID NO:44-115.2. Трансгенное растение по п.1, где аминокислотная последовательность обладает по меньшей мере 90% идентичностью с последовательностью, выбранной из SEQ ID NO:44-45, 49-54, 57-59, 85-86, 94-96, 104-109 и 113-115.3. Трансгенное растение по п.1, где аминокислотная последовательность обладает по меньшей мере 90% идентичностью с последовательностью, выбранной из SEQ ID NO:47 и 55.4. Трансгенное растение по п.1, где аминокислотная последовательность обладает по меньшей мере 90% идентичностью с последовательностью, выбранной из SEQ ID NO:46, 48 и 56.5. Трансгенное растение по п.1, где аминокислотная последовательность обладает по меньшей мере 90% идентичностью с последовательностью, выбранной из SEQ ID NO:60-67, 70 и 75.6. Трансгенное растение по п.1, где аминокислотная последовательность обладает по меньшей мере 90% идентичностью с последовательностью, выбранной из SEQ ID NO:68-69, 71-74, 76-77 и 112.7. Трансгенное растение по п.1, где аминокислотная последовательность обладает по меньшей мере 90% идентичностью с последовательностью, выбранной из SEQ ID NO:78-84.8. Трансгенное растение по п.1, где аминокислотная последовательность обладает по меньшей мере 90% идентичностью с последовательностью, выбранной из SEQ ID NO:97-103.9. Трансгенное растение по п.1, где аминокислотная последовательность обладает по меньшей мере 90% идентичностью с последовательностью, выбранной из SEQ ID NO:87-93 и 110-111.10. Трансгенное растение по п.1, где аминокислотная последовательность обладает по меньшей мере 90% идентичностью с последовательностью, выбран

Claims (46)

1. Трансгенное растение, включающее нуклеиновую кислоту, кодирующую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90% идентична последовательности, выбранной из SEQ ID NO:44-115.
2. Трансгенное растение по п.1, где аминокислотная последовательность обладает по меньшей мере 90% идентичностью с последовательностью, выбранной из SEQ ID NO:44-45, 49-54, 57-59, 85-86, 94-96, 104-109 и 113-115.
3. Трансгенное растение по п.1, где аминокислотная последовательность обладает по меньшей мере 90% идентичностью с последовательностью, выбранной из SEQ ID NO:47 и 55.
4. Трансгенное растение по п.1, где аминокислотная последовательность обладает по меньшей мере 90% идентичностью с последовательностью, выбранной из SEQ ID NO:46, 48 и 56.
5. Трансгенное растение по п.1, где аминокислотная последовательность обладает по меньшей мере 90% идентичностью с последовательностью, выбранной из SEQ ID NO:60-67, 70 и 75.
6. Трансгенное растение по п.1, где аминокислотная последовательность обладает по меньшей мере 90% идентичностью с последовательностью, выбранной из SEQ ID NO:68-69, 71-74, 76-77 и 112.
7. Трансгенное растение по п.1, где аминокислотная последовательность обладает по меньшей мере 90% идентичностью с последовательностью, выбранной из SEQ ID NO:78-84.
8. Трансгенное растение по п.1, где аминокислотная последовательность обладает по меньшей мере 90% идентичностью с последовательностью, выбранной из SEQ ID NO:97-103.
9. Трансгенное растение по п.1, где аминокислотная последовательность обладает по меньшей мере 90% идентичностью с последовательностью, выбранной из SEQ ID NO:87-93 и 110-111.
10. Трансгенное растение по п.1, где аминокислотная последовательность обладает по меньшей мере 90% идентичностью с последовательностью, выбранной из SEQ ID NO:44, 45, 49 и 54.
11. Трансгенное растение по п.1, где аминокислотная последовательность обладает по меньшей мере 90% идентичностью с последовательностью, выбранной из SEQ ID NO:45, 87, 104-106 и 113.
12. Трансгенное растение по п.1, где аминокислотная последовательность обладает по меньшей мере 90% идентичностью с последовательностью, выбранной из SEQ ID NO:50-53, 57-59, 94-96, 104-109 и 113-115.
13. Трансгенное растение по п.1, где аминокислотная последовательность обладает по меньшей мере 95% идентичностью с последовательностью, выбранной из SEQ ID NO:44-115.
14. Трансгенное растение по п.1, где аминокислотная последовательность обладает 100% идентичностью с последовательностью, выбранной из SEQ ID NO:44-115.
15. Трансгенное растение по п.1, где трансгенное растение представляет собой одно из кукурузы, проса, мискантуса, сахарного тростника или сорго.
16. Трансгенное растение по п.15, где трансгенное растение представляет собой кукурузу.
17. Трансгенное растение по п.15, где трансгенное растение представляет собой просо.
18. Трансгенное растение, полученное с помощью трансформации, опосредованной Agrobacterium, используя плазмиду с нуклеотидной последовательностью, которая по меньшей мере на 90% идентична любой последовательности SEQ ID NO:188-283.
19. Трансгенное растение, полученное с помощью трансформации, опосредованной Agrobacterium, используя плазмиду с нуклеотидной последовательностью, которая по меньшей мере на 90% идентична последовательности SEQ ID NO:207.
20. Трансгенное растение, включающее первую нуклеиновую кислоту, которая способна гибридизоваться в условиях умеренной жесткости со второй нуклеиновой кислотой, состоящей из нуклеотидной последовательности, выбранной из SEQ ID NO:116-187 или комплементарной ей последовательности.
21. Трансгенное растение по п.20, где первая нуклеиновая кислота способна гибридизоваться в условиях высокой жесткости со второй нуклеиновой кислотой, состоящей из нуклеотидной последовательности, выбранной из SEQ ID NO:116-187 или комплементарной ей последовательности.
22. Трансгенное растение по пп.20 или 21, где трансгенное растение представляет собой одно из кукурузы, проса, мискантуса, сахарного тростника или сорго.
23. Трансгенное растение по пп.20 или 21, где трансгенное растение представляет собой кукурузу.
24. Трансгенное растение по пп.20 или 21, где трансгенное растение представляет собой просо.
25. Трансгенное растение, полученное с помощью трансформации, опосредованной Agrobacterium, используя плазмиду с первой нуклеиновой кислотой, способной гибридизоваться в условиях высокой жесткости со второй нуклеиновой кислотой, состоящей из любой последовательности SEQ ID NO:116-187.
26. Вектор, включающий первую нуклеиновую кислоту, способную гибридизоваться в условиях высокой жесткости со второй нуклеиновой кислотой, состоящей из любой последовательности SEQ ID NO:116-187.
27. Вектор, включающий нуклеиновую кислоту, имеющую последовательность, которая по меньшей мере на 90% идентична эталонной последовательности, выбранной из SEQ ID NO:188-283.
28. Вектор по п.27, где нуклеиновая кислота имеет последовательность, которая по меньшей мере на 90% идентична эталонной последовательности согласно SEQ ID NO:207.
29. Способ переработки растительной биомассы, включающий:
предварительную обработку растения или его части путем смешения растения или его части с жидкостью с образованием смеси, имеющей отношение жидкости к твердому веществу, меньшее или равное 15, и обеспечение условий для поддержания смеси при температуре, меньшей или равной 100°C; и
предоставление одного или нескольких ферментов для ферментативного гидролиза лигноцеллюлозного материала.
30. Способ по п.29, где растение представляет собой трансгенное растение,
включающее нуклеиновую кислоту, кодирующую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90% идентична последовательности, выбранной из SEQ ID NO:44-115;
полученное с помощью трансформации, опосредованной Agrobacterium, используя плазмиду с нуклеотидной последовательностью, которая по меньшей мере на 90% идентична одной из последовательностей SEQ ID NO:188-283;
включающее первую нуклеиновую кислоту, которая способна гибридизоваться в условиях средней жесткости со второй нуклеиновой кислотой, состоящей из нуклеотидной последовательности, выбранной из SEQ ID NO:116-187 или их комплементарной последовательности;
включающее первую нуклеиновую кислоту, которая способна гибридизоваться в условиях высокой жесткости со второй нуклеиновой кислотой, состоящей из нуклеотидной последовательности, выбранной из SEQ ID NO:116-187 или их комплементарной последовательности; или
полученное с помощью трансформации, опосредованной Agrobacterium, используя плазмиду, имеющую первую нуклеиновую кислоту, способную гибридизоваться в условиях высокой жесткости со второй нуклеиновой кислотой, состоящей из любой последовательности SEQ ID NO:116-187.
31. Способ по п.30, дополнительно предусматривающий наличие трансгенного растения или его части,
включающего нуклеиновую кислоту, кодирующую аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90% идентична последовательности, выбранной из SEQ ID NO:44-115;
полученного с помощью трансформации, опосредованной Agrobacterium, используя плазмиду с нуклеотидной последовательностью, которая по меньшей мере на 90% идентична одной из последовательностей SEQ ID NO:188-283;
включающего первую нуклеиновую кислоту, которая способна гибридизоваться в условиях средней жесткости со второй нуклеиновой кислотой, состоящей из нуклеотидной последовательности, выбранной из SEQ ID NO:116-187 или их комплементарной последовательности;
включающего первую нуклеиновую кислоту, которая способна гибридизоваться в условиях высокой жесткости со второй нуклеиновой кислотой, состоящей из нуклеотидной последовательности, выбранной из SEQ ID NO:116-187 или их комплементарной последовательности; или
полученного с помощью трансформации, опосредованной Agrobacterium, используя плазмиду, имеющую первую нуклеиновую кислоту, способную гибридизоваться в условиях высокой жесткости со второй нуклеиновой кислотой, состоящей из любой последовательности SEQ ID NO:116-187.
32. Способ по любому из пп.29-31, где отношение жидкости к твердому веществу выбрано из величины, меньшей или равной 20, 19, 18, 17, 16, 15, 14, 13, 12, 11, 10, 9, 8, 7, 6, 5, 4, 3, 2 или 1.
33. Способ по любому из пп.29-31, где отношение жидкости к твердому веществу равно 8 или менее.
34. Способ по любому из пп.29-31, где стадия предварительной обработки включает поддержание температуры, меньшей или равной 100°C в течение по меньшей мере четырех часов.
35. Способ по любому из пп.29-31, где температура, меньшая или равная 100°C, составляет от 40°C до 90°C.
36. Способ по любому из пп.29-31, где жидкость представляет собой воду.
37. Способ по любому из пп.29-31, где жидкость включает воду, бисульфит аммония и карбонат аммония.
38. Способ по п.37, где бисульфит аммония находится в концентрации 8%-38% в расчете на масс./масс. с растением или его частью.
39. Способ по п.37 или 38, где карбонат аммония имеет pH 7,6-8,5 и концентрацию 4%-19% в расчете на масс./масс. с растением или его частью.
40. Способ по любому из пп.29-31, где стадия предоставления одного или нескольких ферментов включает предоставление по меньшей мере одного из эндоглюканазы, β-глюкозидазы и целлобиогидролазы.
41. Способ по п.40, где стадия предоставления одного или нескольких ферментов включает предоставление ксиланазы.
42. Способ по любому из пп.29-31, где стадия предоставления одного или нескольких ферментов включает предоставление ксиланазы.
43. Способ по любому из пп.29-31, где отношение жидкости к твердому веществу выбрано из величины, меньшей или равной 20, 19, 18, 17, 16, 15, 14, 13, 12, 11, 10, 9, 8, 7, 6, 5, 4, 3, 2 или 1; где стадия предварительной обработки включает поддержание температуры, меньшей или равной 100°C в течение по меньшей мере четырех часов; где жидкость представляет собой по меньшей мере одну из следующих жидкостей: i) воду или ii) воду, бисульфит аммония и карбонат аммония.
44. Способ по п.42, где отношение жидкости к твердому веществу равно 8 или менее; где бисульфит аммония находится в концентрации 8%-38% в расчете на масс./масс. с растением или его частью; где карбонат аммония имеет pH 7,6-8,5 и концентрацию 4%-19% в расчете на масс./масс. с растением или его частью.
45. Способ по п.44, где стадия предоставления одного или нескольких ферментов включает предоставление по меньшей мере одного из эндоглюканазы, β-глюкозидазы и целлобиогидролазы.
46. Способ по п.45, где стадия предоставления одного или нескольких ферментов включает предоставление ксиланазы.
RU2012123382A 2009-11-06 2010-11-05 Растения, экспрессирующие ферменты, деградирующие клеточную стенку, и векторы экспрессии RU2606766C2 (ru)

Applications Claiming Priority (7)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US28063509P 2009-11-06 2009-11-06
US12/590,444 2009-11-06
US61/280,635 2009-11-06
US12/590,444 US8420387B2 (en) 2009-11-06 2009-11-06 Intein-modified enzymes, their production and industrial applications
US39858910P 2010-06-28 2010-06-28
US61/398,589 2010-06-28
PCT/US2010/055746 WO2011057159A1 (en) 2009-11-06 2010-11-05 Plants expressing cell wall degrading enzymes and expression vectors

Related Child Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2016147539A Division RU2658779C1 (ru) 2009-11-06 2010-11-05 Растения, экспрессирующие ферменты, деградирующие клеточную стенку, и векторы экспрессии

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2012123382A true RU2012123382A (ru) 2013-12-20
RU2606766C2 RU2606766C2 (ru) 2017-01-10

Family

ID=43970385

Family Applications (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2012123382A RU2606766C2 (ru) 2009-11-06 2010-11-05 Растения, экспрессирующие ферменты, деградирующие клеточную стенку, и векторы экспрессии
RU2016147539A RU2658779C1 (ru) 2009-11-06 2010-11-05 Растения, экспрессирующие ферменты, деградирующие клеточную стенку, и векторы экспрессии

Family Applications After (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2016147539A RU2658779C1 (ru) 2009-11-06 2010-11-05 Растения, экспрессирующие ферменты, деградирующие клеточную стенку, и векторы экспрессии

Country Status (6)

Country Link
US (1) US20210254115A1 (ru)
CN (3) CN102711446B (ru)
BR (1) BR112012010742B8 (ru)
RU (2) RU2606766C2 (ru)
UA (1) UA117654C2 (ru)
WO (1) WO2011057159A1 (ru)

Families Citing this family (13)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US10443068B2 (en) 2010-06-25 2019-10-15 Agrivida, Inc. Plants with engineered endogenous genes
US9598700B2 (en) 2010-06-25 2017-03-21 Agrivida, Inc. Methods and compositions for processing biomass with elevated levels of starch
ES2610923T3 (es) 2011-03-07 2017-05-04 Agrivida, Inc. Pretratamiento consolidado e hidrólisis de biomasa vegetal que expresa enzimas de degradación de pared celular
WO2013173563A1 (en) 2012-05-17 2013-11-21 Shell Oil Company Process for producing volatile organic compounds from biomass material
JP2015519896A (ja) 2012-05-17 2015-07-16 シエル・インターナシヨネイル・リサーチ・マーチヤツピイ・ベー・ウイＳｈｅｌｌ Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌｅ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｍａａｔｓｃｈａｐｐｉｊ Ｂｅｓｌｏｔｅｎｖｅｎｎｏｏｔｓｈａｐ 動物飼料製品及びその製造方法
CA2873298C (en) 2012-05-17 2016-04-26 Corey William RADTKE Process for producing volatile organic compounds from biomass material
WO2014078588A1 (en) * 2012-11-14 2014-05-22 Agrivida, Inc. Methods and compositions for processing biomass with elevated levels of starch
WO2016073610A1 (en) * 2014-11-07 2016-05-12 Novozymes A/S Xylanase based bleach boosting
TW201617451A (zh) * 2014-11-11 2016-05-16 陶氏農業科學公司 合成雙向植物啓動子
CN111172160B (zh) * 2015-08-03 2022-05-24 华中农业大学 水稻绿色组织特异表达合成启动子gssp2及其应用
CN109880837B (zh) * 2019-03-07 2022-02-11 郑州大学 一种降解烟草秸秆木质素的方法
CN112779279B (zh) * 2019-11-08 2022-07-12 中国科学院成都生物研究所 一种包含pOsGluB-4启动子的种子特异性干扰载体及其应用
WO2023225459A2 (en) 2022-05-14 2023-11-23 Novozymes A/S Compositions and methods for preventing, treating, supressing and/or eliminating phytopathogenic infestations and infections

Family Cites Families (16)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO1997036995A2 (en) * 1996-03-29 1997-10-09 Pacific Enzymes Limited A xylanase
US6521435B1 (en) * 1999-08-30 2003-02-18 The United States Of America As Represented By The Secretary Of Agriculture Nucleic acid sequences encoding cell wall-degrading enzymes and use to engineer resistance to Fusarium and other pathogens
CN1230530C (zh) * 2000-07-19 2005-12-07 诺和酶股份有限公司 细胞壁降解酶变体
RU2291901C2 (ru) * 2000-09-21 2007-01-20 Басф Акциенгезелльшафт Полипептид и композиция, обладающие активностью ксиланазы, применение полипептида, полинуклеотид, кодирующий полипептид, вектор экспрессии, содержащий полинуклеотид, способ получения полинуклеотида, способ обработки растительного или ксилансодержащего материала
WO2002034926A2 (en) * 2000-10-20 2002-05-02 Michigan State University Transgenic plants containing ligninase and cellulase which degrade lignin and cellulose to fermentable sugars
US20070192900A1 (en) * 2006-02-14 2007-08-16 Board Of Trustees Of Michigan State University Production of beta-glucosidase, hemicellulase and ligninase in E1 and FLC-cellulase-transgenic plants
DE10145969A1 (de) * 2001-09-18 2003-04-10 Maltagen Forschung Gmbh Verfahren zum Herstellen eines Markerimpfstoffs gegen ein Säugervirus
RS20060506A (en) * 2004-03-08 2008-04-04 Syngenta Participations Ag., Self-processing plants and plant parts
EP1752533A1 (en) * 2005-08-12 2007-02-14 Institut National de la Recherche Agronomique Fusion proteins between plant cell-wall degrading enzymes, and their uses
US20070079396A1 (en) * 2005-10-03 2007-04-05 Malvar Thomas M Transgenic plant seed with increased lysine
US8043839B2 (en) * 2006-02-14 2011-10-25 Verenium Corporation Xylanases, nucleic acids encoding them and methods for making and using them
CN100365099C (zh) * 2006-02-27 2008-01-30 淮北市辉克药业有限公司 全新的生物质生产液体燃料技术
JP2009528033A (ja) * 2006-02-27 2009-08-06 イーデンスペース システムズ コーポレイション 改善されたバイオ燃料原料のためのエネルギー作物
US20110053195A1 (en) * 2006-06-16 2011-03-03 Syngenta Participations Ag Catalytically inactive proteins and method for recovery of enzymes from plant-derived materials
CN101668418B (zh) * 2007-02-28 2013-03-20 日本烟草产业株式会社 包括用含3,6-二氯-2-甲氧基苯甲酸的共存培养基培养植物组织的共存步骤的提高植物转化效率的方法
CN101200734A (zh) * 2007-11-23 2008-06-18 河南天冠企业集团有限公司 膨化法预处理植物纤维生产燃料酒精的方法

Also Published As

Publication number Publication date
RU2658779C1 (ru) 2018-06-22
CN107723309A (zh) 2018-02-23
CN103966279A (zh) 2014-08-06
UA117654C2 (uk) 2018-09-10
BR112012010742B1 (pt) 2020-05-26
US20210254115A1 (en) 2021-08-19
CN107723309B (zh) 2022-02-01
WO2011057159A1 (en) 2011-05-12
CN102711446A (zh) 2012-10-03
RU2606766C2 (ru) 2017-01-10
BR112012010742A2 (pt) 2018-09-04
BR112012010742B8 (pt) 2020-09-01
CN103966279B (zh) 2018-07-13
CN102711446B (zh) 2017-06-30

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2012123382A (ru) Растения, экспрессирующие ферменты, деградирующие клеточную стенку, и векторы экспрессии
Geiser et al. Activating intrinsic carbohydrate-active enzymes of the smut fungus Ustilago maydis for the degradation of plant cell wall components
Liu et al. Diversity of cellulolytic microorganisms and microbial cellulases
ES2564541T3 (es) Hidrólisis eficiente de una lignocelulosa con producción integrada de enzimas
DK2744899T3 (en) PROCEDURE FOR PREPARING CELLULASES FROM A FILAMENT'S FUNGI ADAPTED TO A SLOW VOLUMETRIC OXYGEN TRANSFER COFFEE EFFICIENCY CLASS
CA2709485A1 (en) Polypeptides having cellulolytic enhancing activity and polynucleotides encoding same
Tutt et al. Suitability of various plant species for bioethanol production.
CA2623908A1 (en) Methods for enhancing the degradation or conversion of cellulosic material
Zhang et al. Homology analysis of 35 β-glucosidases in Oenococcus oeni and biochemical characterization of a novel β-glucosidase BGL0224
AL Rocha et al. Characterization of the cellulolytic secretome of Trichoderma harzianum during growth on sugarcane bagasse and analysis of the activity boosting effects of swollenin
CN113234695A (zh) Gh61多肽变体以及编码其的多核苷酸
BR112016012371B1 (pt) Célula bacteriana recombinante para a produção de uma amina graxa, cultura de células e método de produção de uma amina graxa
Li et al. Expression and characterization of a novel lytic polysaccharide monooxygenase, PdLPMO9A, from the edible fungus Pleurotus djamor and its synergistic interactions with cellulase in corn straw biomass saccharification
Datta Recent strategies to overexpress and engineer cellulases for biomass degradation
Sanjaya et al. In silico characterization of the GH5-cellulase family from uncultured microorganisms: physicochemical and structural studies
Woon et al. Cloning, production and characterization of a glycoside hydrolase family 7 enzyme from the gut microbiota of the termite Coptotermes curvignathus
Srivastava et al. Application of thermostable cellulase in bioethanol production from lignocellulosic waste
EP3315609A1 (en) Cellulolytic compositions comprising monooxygenase polysaccharide enzymes with improved activity
Wang et al. Omics applications to biofuel research
CN105018444A (zh) 一种腐质霉来源的高温酸性β-葡萄糖苷酶HiBgl3C及其基因和应用
CN105754973B (zh) 一种β-葡萄糖苷酶的突变体W233D及其应用
Balan et al. The saccharification step: Trichoderma reesei cellulase hyper producer strains
de Barcelos et al. Microorganisms for cellulase production: Availability, diversity, and efficiency
Meussen Developing a role for Rhizopus oryzae in the biobased economy by aiming at ethanol and cyanophycin coproduction
Marchwicka Influence of pH and Cellic® CTec2 enzymes dose on the glucose yield after enzymatic hydrolysis of cellulose at 45° C

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20191106