RU2008149510A - Набор праймеров для использования при детекции дрожжей рода dekkera и дрожжей рода brettanomyces - Google Patents

Набор праймеров для использования при детекции дрожжей рода dekkera и дрожжей рода brettanomyces Download PDF

Info

Publication number
RU2008149510A
RU2008149510A RU2008149510/13A RU2008149510A RU2008149510A RU 2008149510 A RU2008149510 A RU 2008149510A RU 2008149510/13 A RU2008149510/13 A RU 2008149510/13A RU 2008149510 A RU2008149510 A RU 2008149510A RU 2008149510 A RU2008149510 A RU 2008149510A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
polynucleotide
base sequence
bases
sequence
seq
Prior art date
Application number
RU2008149510/13A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2404255C2 (ru
Inventor
Нобуюки ХАЯСИ (JP)
Нобуюки ХАЯСИ
Рицуко АРАИ (JP)
Рицуко АРАИ
Тосиказу КОМОДА (JP)
Тосиказу КОМОДА
Original Assignee
Кирин Бир Кабусики Кайся (Jp)
Кирин Бир Кабусики Кайся
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Кирин Бир Кабусики Кайся (Jp), Кирин Бир Кабусики Кайся filed Critical Кирин Бир Кабусики Кайся (Jp)
Publication of RU2008149510A publication Critical patent/RU2008149510A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2404255C2 publication Critical patent/RU2404255C2/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
    • C12Q1/6895—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for plants, fungi or algae
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/16—Primer sets for multiplex assays

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Botany (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

1. Набор праймеров для LAMP, используемый при детекции Dekkera anomala, который включает следующие полинуклеотиды: ! полинуклеотид (FIP), имеющий последовательность оснований SEQ ID NO: 1, или полинуклеотид, состоящий, по меньшей мере, из 10 оснований, который гибридизуется с полинуклеотидом, имеющим последовательность, комплементарную данной последовательности оснований (полинуклеотид 1); ! полинуклеотид (F3), имеющий последовательность оснований SEQ ID NO: 2, или полинуклеотид, состоящий, по меньшей мере, из 10 оснований, который гибридизуется с полинуклеотидом, имеющим последовательность, комплементарную данной последовательности оснований (полинуклеотид 2); ! полинуклеотид (BIP), имеющий последовательность оснований SEQ ID NO: 3, или полинуклеотид, состоящий, по меньшей мере, из 10 оснований, который гибридизуется с полинуклеотидом, имеющим последовательность, комплементарную данной последовательности оснований (полинуклеотид 3); и ! полинуклеотид (B3), имеющий последовательность оснований SEQ ID NO: 4, или полинуклеотид, состоящий, по меньшей мере, из 10 оснований, который гибридизуется с полинуклеотидом, имеющим последовательность, комплементарную данной последовательности оснований (полинуклеотид 4). ! 2. Набор праймеров по п.1, который дополнительно включает один или оба из приведенных ниже полинуклеотидов: ! полинуклеотид (LF), имеющий последовательность оснований SEQ ID NO: 5, или полинуклеотид, состоящий, по меньшей мере, из 10 оснований, который гибридизуется с полинуклеотидом, имеющим последовательность, комплементарную данной последовательности оснований (полинуклеотид 5); и ! полинуклеотид (LB), имеющий последовательность оснований SEQ ID NO: 6,

Claims (17)

1. Набор праймеров для LAMP, используемый при детекции Dekkera anomala, который включает следующие полинуклеотиды:
полинуклеотид (FIP), имеющий последовательность оснований SEQ ID NO: 1, или полинуклеотид, состоящий, по меньшей мере, из 10 оснований, который гибридизуется с полинуклеотидом, имеющим последовательность, комплементарную данной последовательности оснований (полинуклеотид 1);
полинуклеотид (F3), имеющий последовательность оснований SEQ ID NO: 2, или полинуклеотид, состоящий, по меньшей мере, из 10 оснований, который гибридизуется с полинуклеотидом, имеющим последовательность, комплементарную данной последовательности оснований (полинуклеотид 2);
полинуклеотид (BIP), имеющий последовательность оснований SEQ ID NO: 3, или полинуклеотид, состоящий, по меньшей мере, из 10 оснований, который гибридизуется с полинуклеотидом, имеющим последовательность, комплементарную данной последовательности оснований (полинуклеотид 3); и
полинуклеотид (B3), имеющий последовательность оснований SEQ ID NO: 4, или полинуклеотид, состоящий, по меньшей мере, из 10 оснований, который гибридизуется с полинуклеотидом, имеющим последовательность, комплементарную данной последовательности оснований (полинуклеотид 4).
2. Набор праймеров по п.1, который дополнительно включает один или оба из приведенных ниже полинуклеотидов:
полинуклеотид (LF), имеющий последовательность оснований SEQ ID NO: 5, или полинуклеотид, состоящий, по меньшей мере, из 10 оснований, который гибридизуется с полинуклеотидом, имеющим последовательность, комплементарную данной последовательности оснований (полинуклеотид 5); и
полинуклеотид (LB), имеющий последовательность оснований SEQ ID NO: 6, или полинуклеотид, состоящий, по меньшей мере, из 10 оснований, который гибридизуется с полинуклеотидом, имеющим последовательность, комплементарную данной последовательности оснований (полинуклеотид 6).
3. Набор праймеров для LAMP, используемый при детекции Dekkera bruxellensis, который включает следующие полинуклеотиды:
полинуклеотид (FIP), имеющий последовательность оснований SEQ ID NO: 7, или полинуклеотид, состоящий, по меньшей мере, из 10 оснований, который гибридизуется с полинуклеотидом, имеющим последовательность, комплементарную данной последовательности оснований (полинуклеотид 7);
полинуклеотид (F3), имеющий последовательность оснований SEQ ID NO: 8, или полинуклеотид, состоящий, по меньшей мере, из 10 оснований, который гибридизуется с полинуклеотидом, имеющим последовательность, комплементарную данной последовательности оснований (полинуклеотид 8);
полинуклеотид (BIP), имеющий последовательность оснований SEQ ID NO: 9, или полинуклеотид, состоящий, по меньшей мере, из 10 оснований, который гибридизуется с полинуклеотидом, имеющим последовательность, комплементарную данной последовательности оснований (полинуклеотид 9); и
полинуклеотид (B3), имеющий последовательность оснований SEQ ID NO: 10 или полинуклеотид, состоящий, по меньшей мере, из 10 оснований, который гибридизуется с полинуклеотидом, имеющим последовательность, комплементарную данной последовательности оснований (полинуклеотид 10).
4. Набор праймеров по п.3, который дополнительно включает полинуклеотид (LF), имеющий последовательность оснований SEQ ID NO: 11, или полинуклеотид, состоящий, по меньшей мере, из 10 оснований, который гибридизуется с полинуклеотидом, имеющим последовательность, комплементарную данной последовательности оснований (полинуклеотид 11).
5. Набор праймеров для LAMP, используемый при детекции Dekkera custersiana, который включает следующие полинуклеотиды:
полинуклеотид (FIP), имеющий последовательность оснований SEQ ID NO: 12, или полинуклеотид, состоящий, по меньшей мере, из 10 оснований, который гибридизуется с полинуклеотидом, имеющим последовательность, комплементарную данной последовательности оснований (полинуклеотид 12);
полинуклеотид (F3), имеющий последовательность оснований SEQ ID NO: 13, или полинуклеотид, состоящий, по меньшей мере, из 10 оснований, который гибридизуется с полинуклеотидом, имеющим последовательность, комплементарную данной последовательности оснований (полинуклеотид 13);
полинуклеотид (BIP), имеющий последовательность оснований SEQ ID NO: 14, или полинуклеотид, состоящий, по меньшей мере, из 10 оснований, который гибридизуется с полинуклеотидом, имеющим последовательность, комплементарную данной последовательности оснований (полинуклеотид 14); и
полинуклеотид (B3), имеющий последовательность оснований SEQ ID NO: 15, или полинуклеотид, состоящий, по меньшей мере, из 10 оснований, который гибридизуется с полинуклеотидом, имеющим последовательность, комплементарную данной последовательности оснований (полинуклеотид 15).
6. Набор праймеров по п.5, который дополнительно включает полинуклеотид (LB), имеющий последовательность оснований SEQ ID NO: 16, или полинуклеотид, состоящий, по меньшей мере, из 10 оснований, который гибридизуется с полинуклеотидом, имеющим последовательность, комплементарную данной последовательности оснований (полинуклеотид 16).
7. Набор праймеров для LAMP, используемый при детекции Brettanomyces naardenensis, который включает следующие полинуклеотиды:
полинуклеотид (FIP), имеющий последовательность оснований SEQ ID NO: 17, или полинуклеотид, состоящий, по меньшей мере, из 10 оснований, который гибридизуется с полинуклеотидом, имеющим последовательность, комплементарную данной последовательности оснований (полинуклеотид 17);
полинуклеотид (F3), имеющий последовательность оснований SEQ ID NO: 18, или полинуклеотид, состоящий, по меньшей мере, из 10 оснований, который гибридизуется с полинуклеотидом, имеющим последовательность, комплементарную данной последовательности оснований (полинуклеотид 18);
полинуклеотид (BIP), имеющий последовательность оснований SEQ ID NO: 19, или полинуклеотид, состоящий, по меньшей мере, из 10 оснований, который гибридизуется с полинуклеотидом, имеющим последовательность, комплементарную данной последовательности оснований (полинуклеотид 19); и
полинуклеотид (B3), имеющий последовательность оснований SEQ ID NO: 20, или полинуклеотид, состоящий, по меньшей мере, из 10 оснований, который гибридизуется с полинуклеотидом, имеющим последовательность, комплементарную данной последовательности оснований (полинуклеотид 20).
8. Набор праймеров по п.7, который дополнительно включает полинуклеотид (LF), имеющий последовательность оснований SEQ ID NO: 21, или полинуклеотид, состоящий, по меньшей мере, из 10 оснований, который гибридизуется с полинуклеотидом, имеющим последовательность, комплементарную данной последовательности оснований (полинуклеотид 21).
9. Набор праймеров по любому из пп.1-8, где полинуклеотид, состоящий, по меньшей мере, из 10 оснований, гибридизующийся с полинуклеотидом, имеющим последовательность, комплементарную любой из последовательностей оснований SEQ ID NO: 1-21, включает, по меньшей мере, 10 последовательных нуклеотидов в соответствующей последовательности оснований.
10. Набор праймеров по любому из пп.1-8, где полинуклеотид, состоящий, по меньшей мере, из 10 оснований, гибридизующийся с полинуклеотидом, имеющим последовательность, комплементарную любой из последовательностей оснований SEQ ID NO: 1-21, обладает, по меньшей мере, 90% идентичностью с соответствующей последовательностью оснований.
11. Набор праймеров по любому из пп.1-8, где полинуклеотид, состоящий, по меньшей мере, из 10 оснований, гибридизующийся с полинуклеотидом, имеющим последовательность комплементарную любой из последовательностей оснований SEQ ID NO: 1-21, представляет собой полинуклеотид, который состоит из последовательности модифицированных оснований, в которую введены одна или несколько мутаций, применительно к соответствующей последовательности оснований, и который гибридизуется с полинуклеотидом, имеющим последовательность, комплементарную соответствующей последовательности оснований.
12. Способ детекции Dekkera anomala, который включает проведение реакции амплификации нуклеиновой кислоты по LAMP-методу c использованием набора праймеров по п.1 или 2.
13. Способ детекции Dekkera bruxellensis, который включает проведение реакции амплификации нуклеиновой кислоты по LAMP-методу c использованием набора праймеров по п.3 или 4.
14. Способ детекции Dekkera custersiana, который включает проведение реакции амплификации нуклеиновой кислоты по LAMP-методу c использованием набора праймеров по п.5 или 6.
15. Способ детекции Brettanomyces naardenensis, который включает проведение реакции амплификации нуклеиновой кислоты по LAMP-методу c использованием набора праймеров по п.7 или 8.
16. Набор для детекции дрожжей рода Dekkera и/или дрожжей рода Brettanomyces, который включает набор праймеров, выбранный из группы, состоящей из набора праймеров по п.1 или 2, набора праймеров по п.3 или 4, набора праймеров по п.5 или 6, набора праймеров по п.7 или 8 и сочетания указанных наборов праймеров.
17. Набор, используемый при контроле качества спиртовых напитков и/или безалкогольных напитков, который включает набор праймеров, выбранный из группы, состоящей из набора праймеров по п.1 или 2, набора праймеров по п.3 или 4, набора праймеров по п.5 или 6, набора праймеров по п.7 или 8, и сочетания указанных наборов праймеров.
RU2008149510/10A 2006-05-16 2007-03-14 Набор праймеров для использования при детекции дрожжей рода dekkera и дрожжей рода brettanomyces RU2404255C2 (ru)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2006136810 2006-05-16
JP2006-136810 2006-05-16

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2008149510A true RU2008149510A (ru) 2010-06-27
RU2404255C2 RU2404255C2 (ru) 2010-11-20

Family

ID=38693691

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2008149510/10A RU2404255C2 (ru) 2006-05-16 2007-03-14 Набор праймеров для использования при детекции дрожжей рода dekkera и дрожжей рода brettanomyces

Country Status (7)

Country Link
US (1) US20100047781A1 (ru)
EP (1) EP2020448A4 (ru)
JP (1) JPWO2007132589A1 (ru)
CN (1) CN101490278A (ru)
AU (1) AU2007251096A1 (ru)
RU (1) RU2404255C2 (ru)
WO (1) WO2007132589A1 (ru)

Families Citing this family (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
BRPI1106599A2 (pt) * 2011-09-26 2015-09-01 Brasil Pesquisa Agropec Oligonucleotídeos, uso, método e kit para detecção de contaminação de amostras por leveduras
FR3042507B1 (fr) * 2015-10-20 2017-12-15 Univ Bordeaux Procede d'analyse d'un echantillon pour la presence de levures de l'espece brettanomyces bruxellensis resistantes aux sulfites et kit pour sa mise en œuvre
CN106071554B (zh) * 2016-06-24 2019-08-20 江南大学 一种功能性银杏发酵饮料的制备方法
CN106434954A (zh) * 2016-10-27 2017-02-22 上海出入境检验检疫局动植物与食品检验检疫技术中心 一种用于布鲁塞尔酒香酵母快速检测试剂盒
RU2769572C1 (ru) * 2021-05-14 2022-04-04 Общество с ограниченной ответственностью «Система-БиоТех» Тест-система для выявления специфических нуклеотидных последовательностей, характерных для выявляемых микроорганизмов или вирусов, способ применения тест-системы (варианты)

Family Cites Families (10)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
ATE306560T1 (de) * 1994-06-24 2005-10-15 Innogenetics Nv Gleichzeitiger nachweis, identifizierung und differenzierung von eubakterien unter verwendung eines hybridisierungs-assays
US5763169A (en) * 1995-01-13 1998-06-09 Chiron Diagnostics Corporation Nucleic acid probes for the detection and identification of fungi
US5707802A (en) * 1995-01-13 1998-01-13 Ciba Corning Diagnostics Corp. Nucleic acid probes for the detection and identification of fungi
US5961693A (en) * 1997-04-10 1999-10-05 Electric Power Research Institute, Incorporated Electrostatic separator for separating solid particles from a gas stream
JP4425354B2 (ja) * 1997-05-02 2010-03-03 ザ ガバメント オブ ザ ユナイテッド ステイツ オブ アメリカ アズ リプレゼンティッド バイ ザ セクレタリー オブ ザ デパートメント オブ ヘルス アンド ヒューマン サービシーズ Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ種および他の糸状菌を検出するための核酸
ES2320814T3 (es) 1998-11-09 2009-05-28 Eiken Kagaku Kabushiki Kaisha Procedimiento de sintesis de acido nucleico.
WO2000077259A1 (en) 1999-06-15 2000-12-21 Boston Probes, Inc. Probes, probe sets, methods and kits pertaining to the detection, identification and/or enumeration of yeast; particularly in wine
JP2002345499A (ja) * 2001-05-29 2002-12-03 Eiken Chem Co Ltd 核酸配列を検出する方法及びその方法に使用するキット
WO2005093059A1 (ja) 2004-03-25 2005-10-06 Sapporo Breweries Limited 酵母、乳酸菌及び偏性嫌気性菌検出・識別のためのプライマー及びプライマーセット並びにそれらを用いた検出・識別方法
JP2006061134A (ja) * 2004-08-24 2006-03-09 Hideyo Yamaguchi 結核菌検出のためのプライマーおよび検出同定法

Also Published As

Publication number Publication date
EP2020448A1 (en) 2009-02-04
RU2404255C2 (ru) 2010-11-20
AU2007251096A1 (en) 2007-11-22
CN101490278A (zh) 2009-07-22
US20100047781A1 (en) 2010-02-25
WO2007132589A1 (ja) 2007-11-22
JPWO2007132589A1 (ja) 2009-09-24
EP2020448A4 (en) 2010-08-04

Similar Documents

Publication Publication Date Title
AR085952A2 (es) Polinucleotidos cebadores
EP2322930A2 (en) Sequences for detection and identification of methicillin-resistant Staphylococcus Aureus (MRSA) of MREJ type xiv
JP2003524416A5 (ru)
RU2010116772A (ru) Полинуклеотидные праймеры
RU2008149510A (ru) Набор праймеров для использования при детекции дрожжей рода dekkera и дрожжей рода brettanomyces
WO2006106316A3 (en) Polynucleotide primers
EP2090653A4 (en) PROCESS FOR DETECTION OF APPLE MOSAIC VIRUS, PRIMER'S TEST FOR PROOF AND KIT FOR PROOF
CN103981278B (zh) 利用Tem-PCR技术检测多种致病菌的PCR检测通用引物对
JP2011519275A5 (ru)
WO2002097096A3 (en) Nucleotide sequences which code for the metd gene
JP6057460B2 (ja) デングウイルスアッセイ
WO2015190107A1 (ja) ビブリオ・パラヘモリティカスの検出方法、及びビブリオ・パラヘモリティカス検出用担体
CN110512012B (zh) 一组基于特异性靶标鉴定单核细胞增生李斯特氏菌血清型的多重pcr引物及其应用
CN111893198A (zh) 用于银白色葡萄球菌鉴定的特异性分子靶标、检测引物组及其快速检测方法
WO2002046447A3 (en) Methods for identifying nucleotides at defined positions in target nucleic acids
RU2005100511A (ru) Идентификация олигонуклеотидов для захвата, выявления и количественного определения нуклеиновой кислоты вируса гепатита а
CN105452488B (zh) 用于检测hev核酸的组合物和方法
KR101531296B1 (ko) Streptococcus iniae의 병원성 판별용 유전자 마커 및 펩티드핵산을 이용한 병원성 결정 마커 검사키트
CN112654721A (zh) 用于检测b群链球菌核酸的组合物和方法
WO2011042901A8 (en) Brucella phage polynucleotides and uses thereof
WO2023069026A2 (en) A method for detection of point mutations in target nucleic acid using loop-mediated isothermal amplification
JP2005501565A5 (ru)
JP2010115122A5 (ru)
ES2929033T3 (es) Un método para la detección de Legionella
JP2010004878A5 (ru)

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20120315