RU2008145591A - Полипептиды с активностью глюкоамилазы, и полинуклеотиды, их кодирующие - Google Patents
Полипептиды с активностью глюкоамилазы, и полинуклеотиды, их кодирующие Download PDFInfo
- Publication number
- RU2008145591A RU2008145591A RU2008145591/13A RU2008145591A RU2008145591A RU 2008145591 A RU2008145591 A RU 2008145591A RU 2008145591/13 A RU2008145591/13 A RU 2008145591/13A RU 2008145591 A RU2008145591 A RU 2008145591A RU 2008145591 A RU2008145591 A RU 2008145591A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- polypeptide
- sequence
- amylase
- alpha
- strain
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
- C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
- C12N9/2405—Glucanases
- C12N9/2408—Glucanases acting on alpha -1,4-glucosidic bonds
- C12N9/2411—Amylases
- C12N9/2428—Glucan 1,4-alpha-glucosidase (3.2.1.3), i.e. glucoamylase
Abstract
1. Полипептид с глюкоамилазной активностью, выбранный из группы, состоящей из ! (a) полипептида с аминокислотной последовательностью, которая по меньшей мере на 60% идентична аминокислотной последовательности зрелого полипептида, аминокислоты 1-558 последовательности SEQ ID NO:2; ! (b) полипептид, который кодируется нуклеотидной последовательностью, (i) которая гибридизуется по меньшей мере в условиях низкой жесткости с нуклеотидами 61-2301 последовательности SEQ ID NO:1, либо (ii) которая гибридизуется по меньшей мере в условиях низкой жесткости с последовательностью кДНК, содержащей нуклеотиды 61-1734 последовательности SEQ ID NO:3, либо (iii) комплеметарной цепью (i) или (ii); ! (c) вариант, содержащий консервативную замену, делецию и/или инсерцию одной или нескольких аминокислот в аминокислотной последовательности 1-558 последовательности SEQ ID NO:2. ! 2. Полипептид, обладающий углеводсвязывающей аффинностью, выбранный из группы, включающей ! (a) i) полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 60% идентичную аминокислотам 464-558 последовательности SEQ ID NO:2; ! (b) полипептид, кодируемый нуклеотидной последовательностью, которая гибридизуется в условиях низкой жесткости с полинуклеотидным зондом, выбранным из группы, состоящей из ! (i) комплементарной цепи нуклеотидов 1845-2301 последовательности SEQ ID NO:1; ! (ii) комплементарной цепи нуклеотидов 1450-1734 последовательности SEQ ID NO:3; ! (с) фрагмента (а) или (b), обладающего углеводсвязывающей аффинностью. ! 3. Полинуклеотид с нуклеотидной последовательностью, кодирующей полипептид по пп.1 и 2. ! 4. Конструкция нуклеиновой кислоты, содержащая полинуклеотид по п.3, функционально связанный
Claims (29)
1. Полипептид с глюкоамилазной активностью, выбранный из группы, состоящей из
(a) полипептида с аминокислотной последовательностью, которая по меньшей мере на 60% идентична аминокислотной последовательности зрелого полипептида, аминокислоты 1-558 последовательности SEQ ID NO:2;
(b) полипептид, который кодируется нуклеотидной последовательностью, (i) которая гибридизуется по меньшей мере в условиях низкой жесткости с нуклеотидами 61-2301 последовательности SEQ ID NO:1, либо (ii) которая гибридизуется по меньшей мере в условиях низкой жесткости с последовательностью кДНК, содержащей нуклеотиды 61-1734 последовательности SEQ ID NO:3, либо (iii) комплеметарной цепью (i) или (ii);
(c) вариант, содержащий консервативную замену, делецию и/или инсерцию одной или нескольких аминокислот в аминокислотной последовательности 1-558 последовательности SEQ ID NO:2.
2. Полипептид, обладающий углеводсвязывающей аффинностью, выбранный из группы, включающей
(a) i) полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 60% идентичную аминокислотам 464-558 последовательности SEQ ID NO:2;
(b) полипептид, кодируемый нуклеотидной последовательностью, которая гибридизуется в условиях низкой жесткости с полинуклеотидным зондом, выбранным из группы, состоящей из
(i) комплементарной цепи нуклеотидов 1845-2301 последовательности SEQ ID NO:1;
(ii) комплементарной цепи нуклеотидов 1450-1734 последовательности SEQ ID NO:3;
(с) фрагмента (а) или (b), обладающего углеводсвязывающей аффинностью.
3. Полинуклеотид с нуклеотидной последовательностью, кодирующей полипептид по пп.1 и 2.
4. Конструкция нуклеиновой кислоты, содержащая полинуклеотид по п.3, функционально связанный с одной или несколькими контролирующими последовательностями, которые направляют продукцию полипептида в экспрессирующем хозяине.
5. Рекомбинантный вектор экспрессии, содержащий конструкцию нуклеиновой кислоты по п.4.
6. Рекомбинантная клетка-хозяин, содержащая конструкцию нуклеиновой кислоты по п.4 или рекомбинантный вектор экспрессии по п.5.
7. Способ продукции полипептида по любому из пп.1 и 2, включающий
(a) культивирование клеток, которые в форме дикого типа способны продуцировать полипептид, в условиях, благоприятных для продукции полипептида; и
(b) выделение полипептида.
8. Способ продукции полипептида по любому из пп.1 и 2, включающий (а) культивирование клеток-хозяев, содержащих конструкцию нуклеиновой кислоты, содержащую нуклеотидную последовательность, кодирующую полипептид, в условиях, благоприятных для продукции полипептида; и (b) выделение полипептида.
9. Полинуклеотид, кодирующий полипептид с глюкоамилазной активностью, который выбран из группы, состоящей из
(a) полинуклеотида, кодирующего полипептид с аминокислотной последовательностью, которая по меньшей мере на 60% идентична аминокислотной последовательности зрелого полипептида с аминокислотами 1-558 последовательности SEQ ID NO:2;
(b) полинуклеотида, который по меньшей мере на 60% идентичен нуклеотидам 61-2301 последовательности SEQ ID NO:1; либо
(c) полинуклеотида, который по меньшей мере на 60% идентичен нуклеотидам 61-1734 последовательности SEQ ID NO:3;
(d) полипептида, кодируемого нуклеотидной последовательностью (i), которая гибридизуется по меньшей мере в условиях низкой жесткости с нуклеотидами 61-2301 последовательности SEQ ID NO:1, либо (ii), которая гибридизуется по меньшей мере в условиях средней жесткости с последовательностью кДНК, содержащей последовательности нуклеотидов 61-1734 последовательности SEQ ID NO:3, либо (iii) комплементарной цепью (i) или (ii).
10. Способ производства продукта ферментации из крахмалсодержащего сырья, включающий следующие этапы:
(a) разжижение крахмалсодержащего сырья;
(b) осахаривание разжиженного материала с помощью полипептида с глюкоамилазной активностью по п.1;
(c) ферментации осахаренного материала с помощью ферментирующего организма.
11. Способ производства продукта ферментации из крахмалсодержащего сырья, включающий
(a) осахаривание крахмалсодержащего сырья с помощью полипептида с глюкоамилазной активностью по п.1, при температуре ниже начальной температуры клейстеризации указанного крахмалсодержащего сырья,
(b) ферментацию с применением ферментирующего организма.
12. Способ по любому из пп.10 и 11, где крахмалсодержащее сырье представляет собой гранулярный крахмал.
13. Способ по любому из пп.10 и 11, в котором присутствует альфа-амилаза.
14. Способ по любому из пп.10 и 11, где температура во время осахаривания на этапе (а) составляет от 30°С до 75°С, предпочтительно, между 45 и 60°С.
15. Способ по любому из пп.10 и 11, где этапы (а) и (b) проводятся последовательно или синхронно (то есть, одностадийная ферментация).
16. Способ по любому из пп.10 и 11, где глюкоамилаза присутствует в количестве от 0,001 до 10 AGU/г DS, предпочтительно, от 0,01 до 5 AGU/г DS, в частности, от 0,1 до 0,5 AGU/г DS.
17. Способ получения сиропа из крахмалсодержащего сырья, включающий
(a) разжижение крахмалсодержащего сырья, предпочтительно, в присутствии альфа-амилазы,
(b) осахаривание материала, полученного на этапе (а), с помощью глюкоамилазы по изобретению.
18. Способ по п.17, дополнительно включающий очистку, переработку и/или выделение сиропа.
19. Применение полипептида с глюкоамилазной активностью по п.1 или полипептида, обладающего углеводсвязывающей аффинностью, по п.2 для получения сиропа и/или продукта ферментации.
20. Применение по п.19, где исходным материалом является клейстеризованное и/или неклейстеризованное крахмалсодержащее сырье.
21. Применение полипептида с глюкоамилазной активностью по п.1 или полипептида, обладающего углеводсвязывающей аффинностью, по п.2 для пивоварения.
22. Композиция, содержащая полипептид с глюкоамилазной активностью по п.1 или полипептид, обладающий углеводсвязывающей аффинностью, по п.2.
23. Композиция по п.22, дополнительно содержащая альфа-амилазу.
24. Композиция по п.23, где альфа-амилаза является кислой альфа-амилазой, предпочтительно, кислой альфа-амилазой грибов.
25. Композиция по п.23 или 24, где альфа-амилаза является альфа-амилазой грибного происхождения.
26. Композиция по любому из пп.23 или 24, где альфа-амилаза получена из рода Aspergillus, предпочтительно, штамма A. niger, A. oryzae, Aspergillus awamori, либо A. kawachii, рода Rhizomucor, предпочтительно, штамма Rhizomucor puslllus, или рода Merlpilus, предпочтительно, штамма Meripilus giganteus.
27. Композиция по любому из пп.23 или 24, где альфа-амилаза является гибридной, предпочтительно, альфа-амилазой Rhizomucor pusillus с Athelia rolfsii AMG линкером и SBD; Rhizomucor pusillus альфа-амилазой с Aspergillus niger глюкоамилазным линкером и SBD; либо Aspergillus niger альфа-амилазой с Aspergillus kawachii линкером и крахмалсвязывающим доменом (SBD).
28. Композиция по любому из пп.23 или 24, дополнительно содержащая другую глюкоамилазу.
29. Композиция по п.28, где глюкоамилаза получена из рода Aspergillus, предпочтительно, штамма Aspergillus niger, Aspergillus oryzae, Aspergillus awamori, или рода Athelia, предпочтительно, штамма Athelia rolfsii, рода Talaromyces, предпочтительно, штамма Talaromyces emersonii, или штамма рода Trametes, предпочтительно, штамма Trametes cingulata; или штамма рода Rhizopus, такого как штамм Rhizopus nivius; или штамма рода Humicola, предпочтительно, штамма Humicola grisea var. thermoidea.
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US79312806P | 2006-04-19 | 2006-04-19 | |
| US60/793,128 | 2006-04-19 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2008145591A true RU2008145591A (ru) | 2010-05-27 |
Family
ID=38625705
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2008145591/13A RU2008145591A (ru) | 2006-04-19 | 2007-04-13 | Полипептиды с активностью глюкоамилазы, и полинуклеотиды, их кодирующие |
Country Status (7)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US7871800B2 (ru) |
| EP (1) | EP2010653A4 (ru) |
| CN (1) | CN101443447A (ru) |
| CA (1) | CA2645006A1 (ru) |
| MX (1) | MX2008013100A (ru) |
| RU (1) | RU2008145591A (ru) |
| WO (1) | WO2007124285A2 (ru) |
Families Citing this family (39)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2010008841A2 (en) | 2008-06-23 | 2010-01-21 | Novozymes A/S | Processes for producing fermentation products |
| ES2534067T3 (es) * | 2009-12-01 | 2015-04-17 | Novozymes A/S | Polipéptidos que tienen actividad de glucoamilasa y polinucleótidos que codifican los mismos |
| US20120252086A1 (en) | 2009-12-22 | 2012-10-04 | Novozymes A/S | Compositions Comprising Boosting Polypeptide And Starch Degrading Enzyme And Uses Thereof |
| WO2011100161A1 (en) | 2010-02-09 | 2011-08-18 | Novozymes North America, Inc. | Addition of alpha - glucosidase and cobalt for producing fermentation products from starch |
| ES2565060T3 (es) | 2010-04-14 | 2016-03-31 | Novozymes A/S | Polipéptidos que tienen actividad de glucoamilasa y polinucleótidos que codifican los mismos |
| WO2012088303A2 (en) | 2010-12-22 | 2012-06-28 | Novozymes North America, Inc. | Processes for producing fermentation products |
| EP2766490B1 (en) | 2011-10-11 | 2017-04-12 | Novozymes North America, Inc. | Liquefaction process for producing fermentation products |
| EP2785847B1 (en) | 2011-12-02 | 2017-07-26 | Novozymes A/S | Liquefaction process with selected alpha-amylases and proteases |
| ES2935920T3 (es) | 2012-03-30 | 2023-03-13 | Novozymes North America Inc | Procesos de elaboración de productos de fermentación |
| CA2869047C (en) | 2012-03-30 | 2022-11-01 | Novozymes North America, Inc. | Processes of producing fermentation products |
| US9951364B2 (en) | 2013-09-11 | 2018-04-24 | Novozymes A/S | Processes for producing fermentation products |
| US11072786B2 (en) | 2014-04-10 | 2021-07-27 | Novozymes A/S | Alpha-amylase variants and polynucleotides encoding same |
| MY182924A (en) | 2014-06-06 | 2021-02-05 | Novozymes As | Enzyme compositions and uses thereof |
| CN108350442A (zh) | 2015-06-18 | 2018-07-31 | 诺维信公司 | 具有海藻糖酶活性的多肽及其在产生发酵产物的方法中的用途 |
| CN108699572A (zh) | 2015-12-22 | 2018-10-23 | 诺维信公司 | 使用磷脂酶c增加发酵产物得率的方法 |
| WO2018098381A1 (en) | 2016-11-23 | 2018-05-31 | Novozymes A/S | Improved yeast for ethanol production |
| MX2019014142A (es) | 2017-06-02 | 2020-02-07 | Novozymes As | Levadura mejorada para produccion de etanol. |
| MX2019014889A (es) | 2017-06-28 | 2020-02-13 | Novozymes As | Polipeptidos que tienen actividad trehalasa y polinucleotidos que los codifican. |
| MX2020001282A (es) | 2017-08-08 | 2020-03-12 | Novozymes As | Polipeptidos que tienen actividad trehalasa y uso de los mismos en proceso de produccion de productos de fermentacion. |
| WO2019055455A1 (en) | 2017-09-15 | 2019-03-21 | Novozymes A/S | MIXTURES OF ENZYMES AND METHODS FOR IMPROVING THE NUTRITIONAL QUALITY OF ANIMAL FEED |
| BR112020007814A2 (pt) | 2017-10-23 | 2020-10-20 | Novozymes A/S | processos para reduzir e/ou prevenir um aumento nos níveis de ácido lático em um sistema de fermentação de biocombustível e para produção de um produto de fermentação a partir de um material contendo amido, e, uso de um polipeptídeo, ou uma composição enzimática |
| US20230183385A1 (en) * | 2017-12-22 | 2023-06-15 | Novozymes A/S | Wheat Milling Process and GH8 Xylanases |
| US20220348967A1 (en) | 2018-01-29 | 2022-11-03 | Novozymes A/S | Microorganisms With Improved Nitrogen Utilization For Ethanol Production |
| EP3752626A1 (en) | 2018-02-15 | 2020-12-23 | Novozymes A/S | Improved yeast for ethanol production |
| MX2020012754A (es) | 2018-05-31 | 2021-02-26 | Novozymes As | Procesos para mejorar el crecimiento y la productividad de la levadura. |
| MX2021000893A (es) | 2018-07-25 | 2021-03-31 | Novozymes As | Levadura que expresa enzimas para la producción de etanol. |
| AU2019359187A1 (en) | 2018-10-08 | 2021-04-29 | Novozymes A/S | Enzyme-expressing yeast for ethanol production |
| WO2020160126A1 (en) | 2019-01-31 | 2020-08-06 | Novozymes A/S | Polypeptides having xylanase activity and use thereof for improving the nutritional quality of animal feed |
| US20220186266A1 (en) | 2019-04-02 | 2022-06-16 | Novozymes A/S | Process For Producing A Fermentation Product |
| CN114466594A (zh) | 2019-07-09 | 2022-05-10 | 杜邦营养生物科学有限公司 | 脂肪包衣的微粒状酶组合物 |
| EP4004029A1 (en) | 2019-07-26 | 2022-06-01 | Novozymes A/S | Microorganisms with improved nitrogen transport for ethanol production |
| CN114127124A (zh) | 2019-08-06 | 2022-03-01 | 诺维信公司 | 用于提高酶表达的融合蛋白 |
| CN110628648B (zh) * | 2019-08-07 | 2022-04-22 | 中国科学院成都生物研究所 | 一种产液化型淀粉酶的根毛霉菌及应用 |
| WO2021046073A1 (en) | 2019-09-05 | 2021-03-11 | Dupont Nutrition Biosciences Aps | Feed composition |
| BR112022011271A2 (pt) | 2019-12-10 | 2022-09-06 | Novozymes As | Célula hospedeira recombinante, composição, métodos para produzir um derivado de uma célula e um produto de fermentação, e, uso de uma célula hospedeira recombinante |
| AR120775A1 (es) | 2019-12-16 | 2022-03-16 | Novozymes As | Procesos para obtener productos de fermentación |
| EP4352241A1 (en) | 2021-06-07 | 2024-04-17 | Novozymes A/S | Engineered microorganism for improved ethanol fermentation |
| AU2022349014A1 (en) | 2021-09-27 | 2024-04-04 | International N&H Denmark Aps | Feed additive compositions and methods for using the same |
| WO2023225510A1 (en) | 2022-05-17 | 2023-11-23 | Dupont Nutrition Biosciences Aps | Feed additive comprising enzyme combinations |
Family Cites Families (7)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| NO840200L (no) | 1983-01-28 | 1984-07-30 | Cefus Corp | Glukoamylase cdna. |
| US4727046A (en) | 1986-07-16 | 1988-02-23 | Fairchild Semiconductor Corporation | Method of fabricating high performance BiCMOS structures having poly emitters and silicided bases |
| CA2312836A1 (en) | 1997-12-02 | 1999-06-10 | Vermund Rust Christensen | Processes for the production of man-made vitreous fibres |
| WO2000075296A1 (en) | 1999-06-02 | 2000-12-14 | Novozymes A/S | Novel glucoamylase |
| EP1633874A2 (en) | 2003-06-13 | 2006-03-15 | Novozymes A/S | Method for producing glucoamylases and their uses |
| EP1745122A4 (en) | 2004-01-16 | 2010-11-03 | Novozymes North America Inc | PROCESSES FOR PRODUCING FERMENTATION PRODUCT |
| MX2007007030A (es) * | 2004-12-22 | 2007-08-14 | Novozymes As | Enzimas para procesamiento de almidon. |
-
2007
- 2007-04-13 US US12/529,582 patent/US7871800B2/en not_active Expired - Fee Related
- 2007-04-13 MX MX2008013100A patent/MX2008013100A/es not_active Application Discontinuation
- 2007-04-13 CN CNA200780014185XA patent/CN101443447A/zh active Pending
- 2007-04-13 WO PCT/US2007/066618 patent/WO2007124285A2/en active Application Filing
- 2007-04-13 CA CA002645006A patent/CA2645006A1/en not_active Abandoned
- 2007-04-13 EP EP07760635A patent/EP2010653A4/en not_active Withdrawn
- 2007-04-13 RU RU2008145591/13A patent/RU2008145591A/ru not_active Application Discontinuation
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| WO2007124285A2 (en) | 2007-11-01 |
| EP2010653A4 (en) | 2010-03-03 |
| US7871800B2 (en) | 2011-01-18 |
| CA2645006A1 (en) | 2007-11-01 |
| US20100120108A1 (en) | 2010-05-13 |
| EP2010653A2 (en) | 2009-01-07 |
| CN101443447A (zh) | 2009-05-27 |
| WO2007124285A3 (en) | 2009-02-19 |
| MX2008013100A (es) | 2008-10-27 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2008145591A (ru) | Полипептиды с активностью глюкоамилазы, и полинуклеотиды, их кодирующие | |
| Amore et al. | Potential of fungi as category I Consolidated BioProcessing organisms for cellulosic ethanol production | |
| CN104169417B (zh) | 具有葡糖淀粉酶活性的多肽及其编码多核苷酸 | |
| EP2291526B1 (en) | Saccharification enzyme composition with Bacillus subtilis alpha-amylase | |
| DK2118276T3 (en) | STARCH HYDROLYSIS BY USING PHYTASE WITH ALPHA-amylase | |
| DK2816109T3 (en) | GLUCOAMYLASE VARIABLES WITH CHANGED PROPERTIES | |
| JP5594898B2 (ja) | 性質が変えられたグルコアミラーゼ変異種 | |
| WO2012001139A1 (en) | Variants of glucoamylase | |
| CN102712915B (zh) | 具有改良比活和/或热稳定性的葡糖淀粉酶的组合变体 | |
| CN103215239A (zh) | 杂交酶 | |
| WO2008097620A1 (en) | Starch hydrolysis using phytase with an alpha amylase | |
| CN108239609B (zh) | 重组酵母及其应用 | |
| RU2012133453A (ru) | Альфа-амилазы | |
| WO2011011796A9 (en) | Methods and compositions for improving sugar transport, mixed sugar fermentation, and production of biofuels | |
| CN106148209B (zh) | 新的二元有机酸生产菌株及其制备和应用 | |
| RU2008143371A (ru) | Способ получения сусла | |
| JP2015526090A (ja) | グルコアミラーゼ活性を有する変異体 | |
| WO2006066582A1 (en) | Fermentation product processes | |
| EP2561083A1 (en) | Neutral ph saccharification and fermentation | |
| FI3720955T3 (fi) | Alfa-amylaasivariantteja ja niitä koodaavia polynukleotideja | |
| CN103695323B (zh) | 一种稳定、高产α-转移葡萄糖苷酶的菌株 | |
| CN102994476B (zh) | 一种糖化酶 | |
| CN103614354A (zh) | 一种糖化酶及其重组表达菌株 | |
| WO2009008756A4 (en) | DNA SEQUENCE ENCODING A SPECIFIC L-ARABINOSE TRANSPORTER, A cDNA MOLECULE, A PLASMID COMPRISING THE SAID DNA SEQUENCE, HOST CELL TRANSFORMED WITH SUCH PLASMID AND APPLICATION THEREOF | |
| CN102392036A (zh) | β-1,4-内切甘露聚糖酶(Tvi Man5A)基因的克隆及重组酶的制备 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| FA93 | Acknowledgement of application withdrawn (no request for examination) |
Effective date: 20100701 |