RU2003130370A - Реаранжированные гены ii антигена плоскоклеточных карцином - Google Patents
Реаранжированные гены ii антигена плоскоклеточных карцином Download PDFInfo
- Publication number
- RU2003130370A RU2003130370A RU2003130370/13A RU2003130370A RU2003130370A RU 2003130370 A RU2003130370 A RU 2003130370A RU 2003130370/13 A RU2003130370/13 A RU 2003130370/13A RU 2003130370 A RU2003130370 A RU 2003130370A RU 2003130370 A RU2003130370 A RU 2003130370A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- scca1
- scca2
- fusion protein
- gene
- detecting
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/46—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
- C07K14/47—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
- C07K14/4701—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals not used
- C07K14/4731—Recognins, e.g. malignin
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/81—Protease inhibitors
- C07K14/8107—Endopeptidase (E.C. 3.4.21-99) inhibitors
- C07K14/811—Serine protease (E.C. 3.4.21) inhibitors
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
- C12N15/62—DNA sequences coding for fusion proteins
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
- C07K2319/40—Fusion polypeptide containing a tag for immunodetection, or an epitope for immunisation
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Oncology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Toxicology (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Public Health (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
Claims (44)
1. Слитый транскрипт, состоящий из гомологичного кроссовера между двумя различными генами, с более чем 80% гомологией последовательности в определенных районах, в частности, районах кроссовера.
2. Слитый транскрипт по п.1, где эти два гена являются генами SCCA1 и SCCA2.
3. Полноразмерный белок слитого транскрипта между SCCA1 и SCCA2, имеющий переключаемые петли реактивных сайтов в сравнении с основным промотором.
4. По существу полноразмерный белок слитого транскрипта между SCCA1 и SCCA2, имеющий переключаемые петли реактивных сайтов в сравнении с основным промотором.
5. Слитый белок по п.4, кодируемый одним или несколькими из экзонов 2-7 гена SCCA1, слитыми с экзоном 8 гена SCCA2.
6. Слитый белок по п.3, кодируемый экзонами 2-7 гена SCCA1, слитыми с экзоном 8 гена SCCA2.
7. Слитый белок по п.4, кодируемый одним или несколькими из экзонов 2-7 гена SCCA2, слитыми с экзоном 8 гена SCCA1.
8. Слитый белок по п.3, кодируемый экзонами 2-7 гена SCCA2, слитыми с экзоном 8 гена SCCA1.
9. Слитый белок по п.5, где белковая последовательность представляет собой
MNSLSEANTK FMFDLFQQFR KSKENNIFYS PISITSALGM VLLGAKDNTA QQIKKVLHFD QVTENTTGKA ATYHVDRSGN VHHQFQKLLTE FNKSTDAYE LKIANKLFGE KTYLFLQEYL DAIKKFYQTS VESVDFANAP EESRKKINSW VESQTNEKIK LIPEGNIGS NTTLVLVNAI YFKGQWEKKF NKEDTKEEKF WPNKNTYKSI QMMRQYTSFH FASLEDVQAK VLEIPYKGKD LSMIVLLPNE IDGLQKLEEK LTAEKLMEWT SLQNMRETCV DLHLPRFKME ESYDLKDTLR TMGMVNIFNG DADLSGMTWS HGLSVSKVLH KAFVEVTEEG VEAAAATAVV VVELSSPSTN EEFCCNHPFL FFIRQNKTNS ILFYGRFSSP.
10. Последовательность ДНК, кодирующая слитый белок SCCA1/SCCA2.
11. Последовательность ДНК, содержащая нуклеотидную последовательность экзонов 2-7 SCCA1, слитую с нуклеотидной последовательностью экзона 8 SCCA2.
12. Последовательность ДНК по п.11, где нуклеотидная последовательность представляет собой
ATGAATTCAC TCAGTGAAGC CAACACCAAG TTCATGTTCG ACCTGTTCCA ACAGTTCAGA AAATCAAAAG AGAACAACAT CTTCTATTCC CCTATCAGCA TCACATCAGC ATTAGGGATG GTCCTCTTAG GAGCCAAAGA CAACACTGCA CAACAGATTA AGAAGGTTCT TCACTTTGAT CAAGTCACAG AGAACACCAC AGGAAAAGCT GCAACATATC ATGTTGATAG GTCAGGAAAT GTTCATCACC AGTTTCAAAA GCTTCTGACT GAATTCAACA AATCCACTGA TGCATATGAG CTGAAGATCG CCAACAAGCT CTTCGGAGAA AAAACGTATC TATTTTTACA GGAATATTTA GATGCCATCA AGAAATTTTA CCAGACCAGT GTGGAATCTG TTGATTTTGC AAATGCTCCA GAAGAAAGTC GAAAGAAGAT TAACTCCTGG GTGGAAAGTC AAACGAATGA AAAAATTAAA AACCTAATTC CTGAAGGTAA TATTGGCAGC AATACCACAT TGGTTCTTGT GAACGCAATC TATTTCAAAG GGCAGTGGGA GAAGAAATTT AATAAAGAAG ATACTAAAGA GGAAAAATTT TGGCCAAACA AGAATACATA CAAGTCCATA CAGATGATGA GGCAATACAC ATCTTTTCAT TTTGCCTCGC TGGAGGATGT ACAGGCCAAG GTCCTGGAAA TACCATACAA AGGCAAAGAT CTAAGCATGA TTGTGTTGCT GCCAAATGAA ATCGATGGTC TCCAGAAGCT TGAAGAGAAA CTCACTGCTG AGAAATTGAT GGAATGGACA AGTTTGCAGA ATATGAGAGA GACATGTGTC GATTTACACT TACCTCGGTT CAAAATGGAA GAGAGCTATG ACCTCAAGGA CACGTTGAGA ACCATGGGAA TGGTGAATAT CTTCAATGGG GATGCAGACC TCTCAGGCAT GACCTGGAGC CACGGTCTCT CAGTATCTAA AGTCCTACAC AAGGCCTTTG TGGAGGTCAC TGAGGAGGGA GTGGAAGCTG CAGCTGCCAC CGCTGTAGTA GTAGTCGAAT TATCATCTCC TTCAACTAAT GAAGAGTTCT GTTGTAATCA CCCTTTCCTA TTCTTCATAA GGCAAAATAA GACCAACAGC ATCCTCTTCT ATGGCAGATT CTCATCCCCA.
13. Плазмида, содержащая нуклеотидную последовательность, соответствующую одному или нескольким из экзонов 2-7 гена SCCA1, слитую с экзоном 8 гена SCCA2.
14. Плазмида, содержащая нуклеотидную последовательность, соответствующую экзонам 2-7 гена SCCA1, слитую с нуклеотидной последовательностью экзона 8 гена SCCA2.
15. Плазмида, содержащая нуклеотидную последовательность, соответствующую одному или нескольким из экзонов 2-7 гена SCCA2, слитую с экзоном 8 гена SCCA1.
16. Плазмида, содержащая нуклеотидную последовательность, соответствующую экзонам 2-7 гена SCCA2, слитую с экзоном 8 гена SCCA1.
17. Плазмида по пп.13-14, содержащая нуклеотидную последовательность по п.12, депонированная в ЕСАСС под депозитным номером 01031315.
18. Система экспрессии белка для получения слитого белка SCCA1/SCCA2.
19. Рекомбинантные бактерии, содержащие плазмиду по пп.13-17.
20. Рекомбинантные бактерии, содержащие плазмиду по п.14.
21. Рекомбинантная E. coli, содержащая плазмиду по п.13.
22. Рекомбинантная E. coli, содержащая плазмиду по п.14.
23. Способ детектирования реаранжировки генов, образующей слитый белок SCCA1/SCCA2, с использованием клонирования кДНК и анализа секвенирования опухолевой ДНК.
24. Способ детектирования реаранжировки генов, образующей слитый белок SCCA2/SCCA1, с использованием клонирования кДНК и анализа секвенирования опухолевой ДНК.
25. Способ детектирования реаранжировки генов, образующей слитый белок SCCA1/SCCA2, с использованием Саузерн-блоттинг-технологии, применяемой на опухолевой ДНК.
26. Способ детектирования реаранжировки генов, образующей слитый белок SCCA2/SCCA1, с использованием Саузерн-блоттинг-технологии, применяемой на опухолевой ДНК.
27. Способ детектирования реаранжировки генов, образующей слитый белок SCCA1/SCCA2, с использованием технологии ПЦР-анализа.
28. Способ детектирования реаранжировки генов, образующей слитый белок SCCA2/SCCA1, с использованием технологии ПЦР-анализа.
29. Способ детектирования реаранжировки генов, образующей слитый белок SCCA1/SCCA2, с использованием технологии секвенирования аминокислот.
30. Способ детектирования реаранжировки генов, образующей слитый белок SCCA2/SCCA1, с использованием технологии секвенирования аминокислот.
31. Способ детектирования слитого белка SCCA1/SCCA2 с использованием Вестерн-блоттинга.
32. Способ детектирования слитого белка SCCA2/SCCA1 с использованием Вестерн-блоттинга.
33. Моноклональное антитело, специфическое в отношении слитого белка SCCA1/SCCA2.
34. Моноклональное антитело, специфическое в отношении слитого белка SCCA2/SCCA1.
35. Поликлональное антитело, специфическое в отношении слитого белка SCCA1/SCCA2.
36. Поликлональное антитело, специфическое в отношении слитого белка SCCA2/SCCA1.
37. Иммуноанализ с использованием моноклонального антитела или поликлонального антитела, специфического в отношении слитого белка SCCA1/SCCA2, для детектирования присутствия и определения концентрации слитого белка SCCA1/SCCA2.
38. Иммуноанализ с использованием моноклонального антитела или поликлонального антитела, специфического в отношении слитого белка SCCA2/SCCA1, для детектирования присутствия и определения концентрации слитого белка SCCA2/SCCA1.
39. Способ диагностики присутствия или отсутствия плоскоклеточной карциномы детектированием слитого белка SCCA1/SCCA2 в пробе человека.
40. Способ диагностики присутствия или отсутствия плоскоклеточной карциномы детектированием слитого белка SCCA2/SCCA1 в пробе человека.
41. Способ по пп.39 и 40, где слитый белок используют в гистохимическом анализе.
42. Набор, содержащий антитело к слитому белку SCCA1/SCCA2, для использования в определении присутствия или отсутствия плоскоклеточной карциномы (SCC).
43. Набор, содержащий антитело к слитому белку SCCA2/SCCA1, для использования в определении присутствия или отсутствия плоскоклеточной карциномы (SCC).
44. Набор по пп.42-43, отличающийся тем, что он дополнительно содержит антитела, родственные SCCA1 и/или SCCA2.
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
SE0100938A SE521652C2 (sv) | 2001-03-15 | 2001-03-15 | En skivepitelcellcancerrelaterad fusionsgen och motsvarande fusionsprotein |
SE0100938-0 | 2001-03-15 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2003130370A true RU2003130370A (ru) | 2005-01-20 |
RU2288269C2 RU2288269C2 (ru) | 2006-11-27 |
Family
ID=20283412
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2003130370/13A RU2288269C2 (ru) | 2001-03-15 | 2002-03-15 | Слитый транскрипт реаранжированных генов scca1 и scca2, кодирующая его последовательность днк и экспрессирующая плазмида (варианты) |
Country Status (13)
Country | Link |
---|---|
US (2) | US20070218463A1 (ru) |
EP (1) | EP1368476B1 (ru) |
JP (1) | JP4436044B2 (ru) |
AT (1) | ATE409229T1 (ru) |
AU (1) | AU2002243139B2 (ru) |
BR (1) | BRPI0208021B8 (ru) |
CA (1) | CA2440028C (ru) |
DE (1) | DE60229043D1 (ru) |
ES (1) | ES2315349T3 (ru) |
MX (1) | MXPA03007949A (ru) |
RU (1) | RU2288269C2 (ru) |
SE (1) | SE521652C2 (ru) |
WO (1) | WO2002074904A2 (ru) |
Families Citing this family (9)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
SE0202702L (sv) * | 2002-09-10 | 2004-05-10 | Canag Diagnostics Ab | Immunotest för specifik bestämning av SCCA isoformer |
BRPI0410979A (pt) | 2003-09-18 | 2006-07-04 | Axys Pharm Inc | composto, composição farmacêutica, e, métodos para tratar uma doença em um animal mediada pela catepsina s e para tratar um paciente submetido a uma terapia |
DE10360456A1 (de) * | 2003-12-22 | 2005-07-28 | Vaecgene Biotech Gmbh | Tumorantigene und deren Verwendung |
NZ561681A (en) | 2005-03-21 | 2011-01-28 | Virobay Inc | Alpha ketoamide compounds as cysteine protease inhibitors |
JP5215167B2 (ja) | 2005-03-22 | 2013-06-19 | ビロベイ,インコーポレイティド | システインプロテアーゼ阻害剤としてのスルホニル基含有化合物 |
DK2079683T3 (en) | 2006-10-04 | 2015-04-27 | Virobay Inc | Difluoro-containing compounds as cysteine protease inhibitors |
US7893112B2 (en) | 2006-10-04 | 2011-02-22 | Virobay, Inc. | Di-fluoro containing compounds as cysteine protease inhibitors |
US8324417B2 (en) | 2009-08-19 | 2012-12-04 | Virobay, Inc. | Process for the preparation of (S)-2-amino-5-cyclopropyl-4,4-difluoropentanoic acid and alkyl esters and acid salts thereof |
CN112280746A (zh) * | 2020-10-29 | 2021-01-29 | 杭州华葵金配生物科技有限公司 | 一种细胞癌抗原杂交瘤细胞株及其单克隆抗体的应用方法 |
Family Cites Families (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CA2044421C (en) * | 1990-11-27 | 2005-06-21 | Thomas Hyatt Duffy | Squamous cell carcinoma-like immunoreactive antigen from human female urine |
DE19742725A1 (de) * | 1997-09-26 | 1999-04-01 | Abts Harry Frank Dr | Hurpin/PI13: Ein neuer, UV-reprimierbarer, Serin Protease Inhibitor aus der Familie der Ovalbumin-Serpine |
WO2001002603A1 (en) * | 1999-06-30 | 2001-01-11 | Jakob Stenman | Diagnostic method for squamous cell carcinoma |
-
2001
- 2001-03-15 SE SE0100938A patent/SE521652C2/sv not_active IP Right Cessation
-
2002
- 2002-03-15 RU RU2003130370/13A patent/RU2288269C2/ru active
- 2002-03-15 BR BRPI0208021 patent/BRPI0208021B8/pt not_active IP Right Cessation
- 2002-03-15 AT AT02708878T patent/ATE409229T1/de not_active IP Right Cessation
- 2002-03-15 MX MXPA03007949A patent/MXPA03007949A/es active IP Right Grant
- 2002-03-15 JP JP2002573898A patent/JP4436044B2/ja not_active Expired - Lifetime
- 2002-03-15 DE DE60229043T patent/DE60229043D1/de not_active Expired - Lifetime
- 2002-03-15 AU AU2002243139A patent/AU2002243139B2/en not_active Expired
- 2002-03-15 CA CA2440028A patent/CA2440028C/en not_active Expired - Lifetime
- 2002-03-15 ES ES02708878T patent/ES2315349T3/es not_active Expired - Lifetime
- 2002-03-15 EP EP02708878A patent/EP1368476B1/en not_active Expired - Lifetime
- 2002-03-15 WO PCT/SE2002/000512 patent/WO2002074904A2/en active Application Filing
-
2003
- 2003-09-12 US US10/661,742 patent/US20070218463A1/en not_active Abandoned
-
2009
- 2009-09-02 US US12/552,557 patent/US8288518B2/en not_active Expired - Lifetime
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
SE521652C2 (sv) | 2003-11-25 |
ES2315349T3 (es) | 2009-04-01 |
EP1368476B1 (en) | 2008-09-24 |
AU2002243139B2 (en) | 2007-02-01 |
MXPA03007949A (es) | 2004-10-15 |
US20070218463A1 (en) | 2007-09-20 |
JP4436044B2 (ja) | 2010-03-24 |
WO2002074904A3 (en) | 2002-11-14 |
SE0100938D0 (sv) | 2001-03-15 |
JP2004529634A (ja) | 2004-09-30 |
BR0208021A (pt) | 2004-02-25 |
WO2002074904A2 (en) | 2002-09-26 |
CA2440028A1 (en) | 2002-09-26 |
CA2440028C (en) | 2013-06-18 |
US20100062514A1 (en) | 2010-03-11 |
BRPI0208021B8 (pt) | 2021-05-25 |
ATE409229T1 (de) | 2008-10-15 |
BRPI0208021B1 (pt) | 2018-12-04 |
RU2288269C2 (ru) | 2006-11-27 |
DE60229043D1 (de) | 2008-11-06 |
US8288518B2 (en) | 2012-10-16 |
EP1368476A2 (en) | 2003-12-10 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Goodrich et al. | Drosophila TAFII40 interacts with both a VP16 activation domain and the basal transcription factor TFIIB | |
Wang et al. | The XPB and XPD DNA helicases are components of the p53-mediated apoptosis pathway. | |
Dallas et al. | Characterization of monoclonal antibodies raised against p300: both p300 and CBP are present in intracellular TBP complexes | |
Frost et al. | DNA sequence of the F traALE region that includes the gene for F pilin | |
RU2003130370A (ru) | Реаранжированные гены ii антигена плоскоклеточных карцином | |
AU2009201708A1 (en) | Nuclear matrix protein alterations associated with colon cancer and colon metastasis to the liver, and uses thereof | |
CA2153507A1 (en) | A fas ligand, a fragment thereof and dna encoding the same | |
JP6300913B2 (ja) | Trail細胞膜透過性ペプチド様突然変異体 | |
CN110218732B (zh) | 一种非洲猪瘟病毒串联基因、共表达载体、构建方法及应用 | |
Sampson et al. | Translation initiation controls the relative rates of expression of the bacteriophage lambda late genes. | |
JP3091870B2 (ja) | 肝細胞の癌の癌遺伝子 | |
Bagchi et al. | Purification and characterization of chicken ovalbumin gene upstream promoter transcription factor from homologous oviduct cells | |
KR101347288B1 (ko) | 융합 폴리펩타이드 hpv 항원을 이용한 hpv 항체 스크리닝 키트 | |
CN116574182B (zh) | 一种抗人Ki-67抗体及其制备方法和用途 | |
US20090175871A1 (en) | Method for demonstrating presence or absence of markers associated with the presence and/or the chemosensitivity of tumors | |
CA2498524C (en) | Immunoassays for specific determination of scca isoforms | |
WO2015163745A1 (ko) | 바코드 이동 분석을 위한 이중 리포터 시스템을 보유한 효모 균주 | |
AU2002243139A1 (en) | Rearranged squamous cell carcinoma antigen genes II | |
Ishioka et al. | Oligomerization is not essential for growth suppression by p53 in p53-deficient osteosarcoma Saos-2 cells | |
KR100963302B1 (ko) | 대장균 유래 ptsL 프로모터를 함유하는 재조합벡터 및이를 이용한 외래 단백질의 제조방법 | |
CN113214373B (zh) | 新包虫病抗原Murinoglobulin-2蛋白 | |
US20040176577A1 (en) | Immunoassays for specific determination of SCCA isoforms | |
CN116622849B (zh) | circ0337-122aa的检测试剂作为食管鳞癌预后试剂的应用 | |
CN116082512B (zh) | 针对CDKN1A_p21CIP1蛋白的单克隆抗体及其制备方法和应用 | |
JPS63501953A (ja) | 毛管内皮細胞プロテア−ゼ合成、dna合成および遊走を促進することの出来るヒト胎盤血管形成誘導因子 |