RU2003130370A - Реаранжированные гены ii антигена плоскоклеточных карцином - Google Patents

Реаранжированные гены ii антигена плоскоклеточных карцином Download PDF

Info

Publication number
RU2003130370A
RU2003130370A RU2003130370/13A RU2003130370A RU2003130370A RU 2003130370 A RU2003130370 A RU 2003130370A RU 2003130370/13 A RU2003130370/13 A RU 2003130370/13A RU 2003130370 A RU2003130370 A RU 2003130370A RU 2003130370 A RU2003130370 A RU 2003130370A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
scca1
scca2
fusion protein
gene
detecting
Prior art date
Application number
RU2003130370/13A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2288269C2 (ru
Inventor
Эва РЕЙЕР (SE)
Эва РЕЙЕР
Original Assignee
Канаг Диагностик Аб (Se)
Канаг Диагностик Аб
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Канаг Диагностик Аб (Se), Канаг Диагностик Аб filed Critical Канаг Диагностик Аб (Se)
Publication of RU2003130370A publication Critical patent/RU2003130370A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2288269C2 publication Critical patent/RU2288269C2/ru

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/46Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
    • C07K14/47Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
    • C07K14/4701Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals not used
    • C07K14/4731Recognins, e.g. malignin
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/81Protease inhibitors
    • C07K14/8107Endopeptidase (E.C. 3.4.21-99) inhibitors
    • C07K14/811Serine protease (E.C. 3.4.21) inhibitors
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/62DNA sequences coding for fusion proteins
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/40Fusion polypeptide containing a tag for immunodetection, or an epitope for immunisation

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)

Claims (44)

1. Слитый транскрипт, состоящий из гомологичного кроссовера между двумя различными генами, с более чем 80% гомологией последовательности в определенных районах, в частности, районах кроссовера.
2. Слитый транскрипт по п.1, где эти два гена являются генами SCCA1 и SCCA2.
3. Полноразмерный белок слитого транскрипта между SCCA1 и SCCA2, имеющий переключаемые петли реактивных сайтов в сравнении с основным промотором.
4. По существу полноразмерный белок слитого транскрипта между SCCA1 и SCCA2, имеющий переключаемые петли реактивных сайтов в сравнении с основным промотором.
5. Слитый белок по п.4, кодируемый одним или несколькими из экзонов 2-7 гена SCCA1, слитыми с экзоном 8 гена SCCA2.
6. Слитый белок по п.3, кодируемый экзонами 2-7 гена SCCA1, слитыми с экзоном 8 гена SCCA2.
7. Слитый белок по п.4, кодируемый одним или несколькими из экзонов 2-7 гена SCCA2, слитыми с экзоном 8 гена SCCA1.
8. Слитый белок по п.3, кодируемый экзонами 2-7 гена SCCA2, слитыми с экзоном 8 гена SCCA1.
9. Слитый белок по п.5, где белковая последовательность представляет собой
MNSLSEANTK FMFDLFQQFR KSKENNIFYS PISITSALGM VLLGAKDNTA QQIKKVLHFD QVTENTTGKA ATYHVDRSGN VHHQFQKLLTE FNKSTDAYE LKIANKLFGE KTYLFLQEYL DAIKKFYQTS VESVDFANAP EESRKKINSW VESQTNEKIK LIPEGNIGS NTTLVLVNAI YFKGQWEKKF NKEDTKEEKF WPNKNTYKSI QMMRQYTSFH FASLEDVQAK VLEIPYKGKD LSMIVLLPNE IDGLQKLEEK LTAEKLMEWT SLQNMRETCV DLHLPRFKME ESYDLKDTLR TMGMVNIFNG DADLSGMTWS HGLSVSKVLH KAFVEVTEEG VEAAAATAVV VVELSSPSTN EEFCCNHPFL FFIRQNKTNS ILFYGRFSSP.
10. Последовательность ДНК, кодирующая слитый белок SCCA1/SCCA2.
11. Последовательность ДНК, содержащая нуклеотидную последовательность экзонов 2-7 SCCA1, слитую с нуклеотидной последовательностью экзона 8 SCCA2.
12. Последовательность ДНК по п.11, где нуклеотидная последовательность представляет собой
ATGAATTCAC TCAGTGAAGC CAACACCAAG TTCATGTTCG ACCTGTTCCA ACAGTTCAGA AAATCAAAAG AGAACAACAT CTTCTATTCC CCTATCAGCA TCACATCAGC ATTAGGGATG GTCCTCTTAG GAGCCAAAGA CAACACTGCA CAACAGATTA AGAAGGTTCT TCACTTTGAT CAAGTCACAG AGAACACCAC AGGAAAAGCT GCAACATATC ATGTTGATAG GTCAGGAAAT GTTCATCACC AGTTTCAAAA GCTTCTGACT GAATTCAACA AATCCACTGA TGCATATGAG CTGAAGATCG CCAACAAGCT CTTCGGAGAA AAAACGTATC TATTTTTACA GGAATATTTA GATGCCATCA AGAAATTTTA CCAGACCAGT GTGGAATCTG TTGATTTTGC AAATGCTCCA GAAGAAAGTC GAAAGAAGAT TAACTCCTGG GTGGAAAGTC AAACGAATGA AAAAATTAAA AACCTAATTC CTGAAGGTAA TATTGGCAGC AATACCACAT TGGTTCTTGT GAACGCAATC TATTTCAAAG GGCAGTGGGA GAAGAAATTT AATAAAGAAG ATACTAAAGA GGAAAAATTT TGGCCAAACA AGAATACATA CAAGTCCATA CAGATGATGA GGCAATACAC ATCTTTTCAT TTTGCCTCGC TGGAGGATGT ACAGGCCAAG GTCCTGGAAA TACCATACAA AGGCAAAGAT CTAAGCATGA TTGTGTTGCT GCCAAATGAA ATCGATGGTC TCCAGAAGCT TGAAGAGAAA CTCACTGCTG AGAAATTGAT GGAATGGACA AGTTTGCAGA ATATGAGAGA GACATGTGTC GATTTACACT TACCTCGGTT CAAAATGGAA GAGAGCTATG ACCTCAAGGA CACGTTGAGA ACCATGGGAA TGGTGAATAT CTTCAATGGG GATGCAGACC TCTCAGGCAT GACCTGGAGC CACGGTCTCT CAGTATCTAA AGTCCTACAC AAGGCCTTTG TGGAGGTCAC TGAGGAGGGA GTGGAAGCTG CAGCTGCCAC CGCTGTAGTA GTAGTCGAAT TATCATCTCC TTCAACTAAT GAAGAGTTCT GTTGTAATCA CCCTTTCCTA TTCTTCATAA GGCAAAATAA GACCAACAGC ATCCTCTTCT ATGGCAGATT CTCATCCCCA.
13. Плазмида, содержащая нуклеотидную последовательность, соответствующую одному или нескольким из экзонов 2-7 гена SCCA1, слитую с экзоном 8 гена SCCA2.
14. Плазмида, содержащая нуклеотидную последовательность, соответствующую экзонам 2-7 гена SCCA1, слитую с нуклеотидной последовательностью экзона 8 гена SCCA2.
15. Плазмида, содержащая нуклеотидную последовательность, соответствующую одному или нескольким из экзонов 2-7 гена SCCA2, слитую с экзоном 8 гена SCCA1.
16. Плазмида, содержащая нуклеотидную последовательность, соответствующую экзонам 2-7 гена SCCA2, слитую с экзоном 8 гена SCCA1.
17. Плазмида по пп.13-14, содержащая нуклеотидную последовательность по п.12, депонированная в ЕСАСС под депозитным номером 01031315.
18. Система экспрессии белка для получения слитого белка SCCA1/SCCA2.
19. Рекомбинантные бактерии, содержащие плазмиду по пп.13-17.
20. Рекомбинантные бактерии, содержащие плазмиду по п.14.
21. Рекомбинантная E. coli, содержащая плазмиду по п.13.
22. Рекомбинантная E. coli, содержащая плазмиду по п.14.
23. Способ детектирования реаранжировки генов, образующей слитый белок SCCA1/SCCA2, с использованием клонирования кДНК и анализа секвенирования опухолевой ДНК.
24. Способ детектирования реаранжировки генов, образующей слитый белок SCCA2/SCCA1, с использованием клонирования кДНК и анализа секвенирования опухолевой ДНК.
25. Способ детектирования реаранжировки генов, образующей слитый белок SCCA1/SCCA2, с использованием Саузерн-блоттинг-технологии, применяемой на опухолевой ДНК.
26. Способ детектирования реаранжировки генов, образующей слитый белок SCCA2/SCCA1, с использованием Саузерн-блоттинг-технологии, применяемой на опухолевой ДНК.
27. Способ детектирования реаранжировки генов, образующей слитый белок SCCA1/SCCA2, с использованием технологии ПЦР-анализа.
28. Способ детектирования реаранжировки генов, образующей слитый белок SCCA2/SCCA1, с использованием технологии ПЦР-анализа.
29. Способ детектирования реаранжировки генов, образующей слитый белок SCCA1/SCCA2, с использованием технологии секвенирования аминокислот.
30. Способ детектирования реаранжировки генов, образующей слитый белок SCCA2/SCCA1, с использованием технологии секвенирования аминокислот.
31. Способ детектирования слитого белка SCCA1/SCCA2 с использованием Вестерн-блоттинга.
32. Способ детектирования слитого белка SCCA2/SCCA1 с использованием Вестерн-блоттинга.
33. Моноклональное антитело, специфическое в отношении слитого белка SCCA1/SCCA2.
34. Моноклональное антитело, специфическое в отношении слитого белка SCCA2/SCCA1.
35. Поликлональное антитело, специфическое в отношении слитого белка SCCA1/SCCA2.
36. Поликлональное антитело, специфическое в отношении слитого белка SCCA2/SCCA1.
37. Иммуноанализ с использованием моноклонального антитела или поликлонального антитела, специфического в отношении слитого белка SCCA1/SCCA2, для детектирования присутствия и определения концентрации слитого белка SCCA1/SCCA2.
38. Иммуноанализ с использованием моноклонального антитела или поликлонального антитела, специфического в отношении слитого белка SCCA2/SCCA1, для детектирования присутствия и определения концентрации слитого белка SCCA2/SCCA1.
39. Способ диагностики присутствия или отсутствия плоскоклеточной карциномы детектированием слитого белка SCCA1/SCCA2 в пробе человека.
40. Способ диагностики присутствия или отсутствия плоскоклеточной карциномы детектированием слитого белка SCCA2/SCCA1 в пробе человека.
41. Способ по пп.39 и 40, где слитый белок используют в гистохимическом анализе.
42. Набор, содержащий антитело к слитому белку SCCA1/SCCA2, для использования в определении присутствия или отсутствия плоскоклеточной карциномы (SCC).
43. Набор, содержащий антитело к слитому белку SCCA2/SCCA1, для использования в определении присутствия или отсутствия плоскоклеточной карциномы (SCC).
44. Набор по пп.42-43, отличающийся тем, что он дополнительно содержит антитела, родственные SCCA1 и/или SCCA2.
RU2003130370/13A 2001-03-15 2002-03-15 Слитый транскрипт реаранжированных генов scca1 и scca2, кодирующая его последовательность днк и экспрессирующая плазмида (варианты) RU2288269C2 (ru)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
SE0100938A SE521652C2 (sv) 2001-03-15 2001-03-15 En skivepitelcellcancerrelaterad fusionsgen och motsvarande fusionsprotein
SE0100938-0 2001-03-15

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2003130370A true RU2003130370A (ru) 2005-01-20
RU2288269C2 RU2288269C2 (ru) 2006-11-27

Family

ID=20283412

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2003130370/13A RU2288269C2 (ru) 2001-03-15 2002-03-15 Слитый транскрипт реаранжированных генов scca1 и scca2, кодирующая его последовательность днк и экспрессирующая плазмида (варианты)

Country Status (13)

Country Link
US (2) US20070218463A1 (ru)
EP (1) EP1368476B1 (ru)
JP (1) JP4436044B2 (ru)
AT (1) ATE409229T1 (ru)
AU (1) AU2002243139B2 (ru)
BR (1) BRPI0208021B8 (ru)
CA (1) CA2440028C (ru)
DE (1) DE60229043D1 (ru)
ES (1) ES2315349T3 (ru)
MX (1) MXPA03007949A (ru)
RU (1) RU2288269C2 (ru)
SE (1) SE521652C2 (ru)
WO (1) WO2002074904A2 (ru)

Families Citing this family (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
SE0202702L (sv) * 2002-09-10 2004-05-10 Canag Diagnostics Ab Immunotest för specifik bestämning av SCCA isoformer
BRPI0410979A (pt) 2003-09-18 2006-07-04 Axys Pharm Inc composto, composição farmacêutica, e, métodos para tratar uma doença em um animal mediada pela catepsina s e para tratar um paciente submetido a uma terapia
DE10360456A1 (de) * 2003-12-22 2005-07-28 Vaecgene Biotech Gmbh Tumorantigene und deren Verwendung
NZ561681A (en) 2005-03-21 2011-01-28 Virobay Inc Alpha ketoamide compounds as cysteine protease inhibitors
JP5215167B2 (ja) 2005-03-22 2013-06-19 ビロベイ,インコーポレイティド システインプロテアーゼ阻害剤としてのスルホニル基含有化合物
DK2079683T3 (en) 2006-10-04 2015-04-27 Virobay Inc Difluoro-containing compounds as cysteine protease inhibitors
US7893112B2 (en) 2006-10-04 2011-02-22 Virobay, Inc. Di-fluoro containing compounds as cysteine protease inhibitors
US8324417B2 (en) 2009-08-19 2012-12-04 Virobay, Inc. Process for the preparation of (S)-2-amino-5-cyclopropyl-4,4-difluoropentanoic acid and alkyl esters and acid salts thereof
CN112280746A (zh) * 2020-10-29 2021-01-29 杭州华葵金配生物科技有限公司 一种细胞癌抗原杂交瘤细胞株及其单克隆抗体的应用方法

Family Cites Families (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CA2044421C (en) * 1990-11-27 2005-06-21 Thomas Hyatt Duffy Squamous cell carcinoma-like immunoreactive antigen from human female urine
DE19742725A1 (de) * 1997-09-26 1999-04-01 Abts Harry Frank Dr Hurpin/PI13: Ein neuer, UV-reprimierbarer, Serin Protease Inhibitor aus der Familie der Ovalbumin-Serpine
WO2001002603A1 (en) * 1999-06-30 2001-01-11 Jakob Stenman Diagnostic method for squamous cell carcinoma

Also Published As

Publication number Publication date
SE521652C2 (sv) 2003-11-25
ES2315349T3 (es) 2009-04-01
EP1368476B1 (en) 2008-09-24
AU2002243139B2 (en) 2007-02-01
MXPA03007949A (es) 2004-10-15
US20070218463A1 (en) 2007-09-20
JP4436044B2 (ja) 2010-03-24
WO2002074904A3 (en) 2002-11-14
SE0100938D0 (sv) 2001-03-15
JP2004529634A (ja) 2004-09-30
BR0208021A (pt) 2004-02-25
WO2002074904A2 (en) 2002-09-26
CA2440028A1 (en) 2002-09-26
CA2440028C (en) 2013-06-18
US20100062514A1 (en) 2010-03-11
BRPI0208021B8 (pt) 2021-05-25
ATE409229T1 (de) 2008-10-15
BRPI0208021B1 (pt) 2018-12-04
RU2288269C2 (ru) 2006-11-27
DE60229043D1 (de) 2008-11-06
US8288518B2 (en) 2012-10-16
EP1368476A2 (en) 2003-12-10

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Goodrich et al. Drosophila TAFII40 interacts with both a VP16 activation domain and the basal transcription factor TFIIB
Wang et al. The XPB and XPD DNA helicases are components of the p53-mediated apoptosis pathway.
Dallas et al. Characterization of monoclonal antibodies raised against p300: both p300 and CBP are present in intracellular TBP complexes
Frost et al. DNA sequence of the F traALE region that includes the gene for F pilin
RU2003130370A (ru) Реаранжированные гены ii антигена плоскоклеточных карцином
AU2009201708A1 (en) Nuclear matrix protein alterations associated with colon cancer and colon metastasis to the liver, and uses thereof
CA2153507A1 (en) A fas ligand, a fragment thereof and dna encoding the same
JP6300913B2 (ja) Trail細胞膜透過性ペプチド様突然変異体
CN110218732B (zh) 一种非洲猪瘟病毒串联基因、共表达载体、构建方法及应用
Sampson et al. Translation initiation controls the relative rates of expression of the bacteriophage lambda late genes.
JP3091870B2 (ja) 肝細胞の癌の癌遺伝子
Bagchi et al. Purification and characterization of chicken ovalbumin gene upstream promoter transcription factor from homologous oviduct cells
KR101347288B1 (ko) 융합 폴리펩타이드 hpv 항원을 이용한 hpv 항체 스크리닝 키트
CN116574182B (zh) 一种抗人Ki-67抗体及其制备方法和用途
US20090175871A1 (en) Method for demonstrating presence or absence of markers associated with the presence and/or the chemosensitivity of tumors
CA2498524C (en) Immunoassays for specific determination of scca isoforms
WO2015163745A1 (ko) 바코드 이동 분석을 위한 이중 리포터 시스템을 보유한 효모 균주
AU2002243139A1 (en) Rearranged squamous cell carcinoma antigen genes II
Ishioka et al. Oligomerization is not essential for growth suppression by p53 in p53-deficient osteosarcoma Saos-2 cells
KR100963302B1 (ko) 대장균 유래 ptsL 프로모터를 함유하는 재조합벡터 및이를 이용한 외래 단백질의 제조방법
CN113214373B (zh) 新包虫病抗原Murinoglobulin-2蛋白
US20040176577A1 (en) Immunoassays for specific determination of SCCA isoforms
CN116622849B (zh) circ0337-122aa的检测试剂作为食管鳞癌预后试剂的应用
CN116082512B (zh) 针对CDKN1A_p21CIP1蛋白的单克隆抗体及其制备方法和应用
JPS63501953A (ja) 毛管内皮細胞プロテア−ゼ合成、dna合成および遊走を促進することの出来るヒト胎盤血管形成誘導因子