PL210546B1 - Peptydy oraz pokrewne cząsteczki wiążące TALL-1 - Google Patents
Peptydy oraz pokrewne cząsteczki wiążące TALL-1Info
- Publication number
- PL210546B1 PL210546B1 PL369570A PL36957002A PL210546B1 PL 210546 B1 PL210546 B1 PL 210546B1 PL 369570 A PL369570 A PL 369570A PL 36957002 A PL36957002 A PL 36957002A PL 210546 B1 PL210546 B1 PL 210546B1
- Authority
- PL
- Poland
- Prior art keywords
- peptide
- seq
- tall
- amino acid
- sequence
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K7/00—Peptides having 5 to 20 amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
- C07K7/04—Linear peptides containing only normal peptide links
- C07K7/08—Linear peptides containing only normal peptide links having 12 to 20 amino acids
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
- A61K38/04—Peptides having up to 20 amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
- A61K38/10—Peptides having 12 to 20 amino acids
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P17/00—Drugs for dermatological disorders
- A61P17/02—Drugs for dermatological disorders for treating wounds, ulcers, burns, scars, keloids, or the like
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
- A61P35/02—Antineoplastic agents specific for leukemia
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
- A61P37/02—Immunomodulators
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
- A61P37/02—Immunomodulators
- A61P37/06—Immunosuppressants, e.g. drugs for graft rejection
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K1/00—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length
- C07K1/04—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length on carriers
- C07K1/047—Simultaneous synthesis of different peptide species; Peptide libraries
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/001—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof by chemical synthesis
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/46—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
- C07K14/47—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
- C07K14/4701—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals not used
- C07K14/4702—Regulators; Modulating activity
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/705—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
- C07K14/715—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants for cytokines; for lymphokines; for interferons
- C07K14/7151—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants for cytokines; for lymphokines; for interferons for tumor necrosis factor [TNF], for lymphotoxin [LT]
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IG], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/18—Immunoglobulins [IG], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
- C07K16/24—Immunoglobulins [IG], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against cytokines, lymphokines or interferons
- C07K16/241—Tumor Necrosis Factors
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
- C12N15/1034—Isolating an individual clone by screening libraries
- C12N15/1037—Screening libraries presented on the surface of microorganisms, e.g. phage display, E. coli display
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C40—COMBINATORIAL TECHNOLOGY
- C40B—COMBINATORIAL CHEMISTRY; LIBRARIES, e.g. CHEMICAL LIBRARIES
- C40B40/00—Libraries per se, e.g. arrays, mixtures
- C40B40/02—Libraries contained in or displayed by microorganisms, e.g. bacteria or animal cells; Libraries contained in or displayed by vectors, e.g. plasmids; Libraries containing only microorganisms or vectors
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
- C07K2319/30—Non-immunoglobulin-derived peptide or protein having an immunoglobulin constant or Fc region, or a fragment thereof, attached thereto
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
- C07K2319/70—Fusion polypeptide containing domain for protein-protein interaction
- C07K2319/74—Fusion polypeptide containing domain for protein-protein interaction containing a fusion for binding to a cell surface receptor
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Immunology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Public Health (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Virology (AREA)
- Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Oncology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Transplantation (AREA)
- Dermatology (AREA)
Description
Obecny wynalazek dotyczy peptydów i pokrewnych cząsteczek wiążących TALL-1, a także kwasów DNA kodujących te peptydy, wektorów ekspresji, zawierających wskazane kwasy DNA oraz komórek gospodarza, zawierających te wektory. Cząsteczki według wynalazku znajdują zastosowanie do leczenia chorób, w których pośredniczą komórki B.
Podstawy wynalazku
Po latach badań nad martwicą guzów, czynniki nekrozy nowotworów (TNFs) α i β zostały w koń cu sklonowane w roku 1984. Nast ę pne lata był y ś wiadkiem wył onienia się superrodziny cytokin TNF obejmującej ligand fas (FasL), ligand CD27 (CD27L), Hgand CD30 (CD30L), ligand CD40 (CD40L), pokrewny TNF ligand indukujący apoptozę (TRAIL, określany także, jako AGP-1), proteinę wiążącą osteoprotegerynę (ligand OPG-BP lub ligand OPG), ligand 4-lBB, LIGHT, APRIL, oraz TALL-1.
Smith i wsp. (1994), Cell 76: 959-962; Lacey i wsp. (1998), Cell 93: 165-176; Chichepotiche i wsp. (1997), J. Biol. Chem. 272: 32401-32410; Mauri i wsp. (1998), Immunity 8: 21-30; Hahne i wsp. (1998), J. Exp. Med. 188: 1185-90; Shu i wsp. (1999), J. Leukocyte Biology 65: 680-3. Rodzina ta ma wspólną strukturę, szczególnie przy końcu C. Ponadto, większość jej dotychczas poznanych członków jest eksprymowanych w przedziałach immunologicznych, aczkolwiek niektórzy jej członkowie podlegają ekspresji także w innych tkankach lub organach. Smith i wsp. (1994), Cell 76: 959-62. Wszystkie ligandy, z wyjątkiem LT-α są proteinami transmembranowymi typu II, charakteryzującymi się zachowawczym obszarem 150 aminokwasów w C-końcowej domenie pozakomórkowej. Choć ograniczona jest do jedynie 20-25% identyczności, wskazana zachowawcza domena 150 aminokwasów podlega sfałdowaniu w charakterystyczny sandwich z β-harmonijki oraz trimeryzuje. Ten zachowawczy obszar może być uwolniony proteolitycznie, z wytworzeniem rozpuszczalnej formy funkcjonalnej. Banner i wsp. (1993), Cell 73: 431-445.
Wielu członków w obrębie tej rodziny ligandów podlega ekspresji we wzbogaconych tkankach limfoidalnych i odgrywa ważną rolę w rozwijaniu i modulowaniu systemu immunologicznego. Smith i wsp. (1994). Przykładowo, TNFa jest głównie syntezowany przez makrofagi i jest ważnym mediatorem reakcji zapalnej i obrony immunologicznej. Tracey & Cerami (1994), Ann. Rev. Med. 45: 491-503. Fas-L, eksprymowany przede wszystkim w aktywowanych komórkach T, moduluje apoptozę tymocytów, w której pośredniczy TCR. Nagata, S. & Suda, T. (1995) Immunology Today 16: 39-43; Castrim I wsp. (1996), Immunity 5: 617-27. CD40L, również eksprymowany przez aktywowane komórki T dostarcza istotny sygnał dla przeżycia komórki B, proliferację oraz izotypowe przekształcenia immunoglobuliny. Noelle (1996), Immunity 4: 415-9.
Zidentyfikowano już pokrewne receptory dla większości członków rodziny ligandów TNF. Wspólną cechą tych receptorów są wielokrotne powtórzenia fragmentów bogatych w cysteinę wewnątrz ich domen zewnątrzkomórkowych oraz brak katalitycznych motywów w obszarach cytoplazmowych. Smith i wsp. (1994). Receptory sygnalizują przez bezpośrednie oddziaływania z białkami domeny śmierci (przykładowo TRADD, FADD oraz RIP) lub z proteinami TRAF (przykładowo TRAF2, TRAF3, TRAF5 oraz TRAF6), uruchamiając różnorodne i nakładające się na siebie ścieżki sygnałowe, przykładowo apoptozę, aktywację NF-kB lub aktywację JNK. Wallach i wsp. (1999), Annual Review of Immunology 17: 331-67. Te sygnałowe zdarzenia prowadzą do śmierci komórki, proliferacji, aktywacji lub różnicowania. Profil ekspresji każdego członka receptora jest inny. Przykładowo, TNFR1 podlega ekspresji w szerokiej gamie tkanek i komórek, podczas gdy występujący na powierzchni komórki receptor OPGL podlega ograniczeniu głównie do osteoklastów. Hsu i wsp. (1999) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 96: 3540-5.
Wiele grup badawczych zidentyfikowało ostatnio ligandy rodziny TNF o takiej samej lub zasadniczo podobnej sekwencji. Ligand ten określano różnymi nazwami: neutrokiną α (WO 98/18921, publikacja: 7 maja, 1998), 63954 (WO 98/27114, publikacja: 25 czerwca, 1998), TL5 (opis EP 869 180, opublikowany 7 października, 1998), NTN-2 (WO 98/55620 oraz WO 98/55621, publikacja: 10 grudnia, 1998), TNRL1-alfa (WO 9911791, publikacja: 11 marca, 1999), ligand kluczowy (WO 99/12964, publikacja: 18 marca, 1999), oraz AGP-3 (tymczasowe zgłoszenie nr US 60/119 906, dokonane 12 lutego 1999 oraz 60/166 271, dokonane 18 listopada 1999) oraz TALL-1 (WO 00/68378, publikacja: 16 listopada, 2000). Poniżej, ligandy opisane w powyższych publikacjach określa się wspólnym terminem TALL-1.
TALL-1 jest członkiem superrodziny ligandu TNF funkcjonalnie zaangażowanym w przetrwanie komórek B oraz ich proliferację. Myszy transgeniczne z nadekspresją TALL-1 mają ostry rozrost koPL 210 546 B1 mórek B oraz chorobę autoimmunologiczną podobną do tocznia. Khare i wsp. (2000) PNAS 97 (7): 3370-3375). Zarówno TACI, jak i BCMA służą jako receptory TALL-1 na powierzchni komórki. Gross i wsp. (2000), Nature 404: 995-999; Ware (2000), J. Exp. Med. 192 (11): F35-F37; Ware (2000), Nature 404: 949-950; Xia i wsp. (2000), J. Exp. Med. 192 (1): 137-143; Yu i wsp. (2000), Nature Immunology 1 (3): 252-256; Marsters i wsp. (2000), Current Biology 10: 785-788; Hatzoglou i wsp. (2000) J. of Immunology 165: 1322-1330; Shu i wsp. (2000) PNAS 97 (16): 9156-9161; Thompson i wsp. (2000) J. Exp. Med. 192 (1): 129-135; Mukhopadhyay i wsp. (1999) J. Biol. Chem. 274 (23): 15978-81; Shu i wsp. (1999) J. Leukocyte Biol. 65: 680-683; Gruss i wsp. (1995) Blood 85 (12): 3378-3404; Smith i wsp. (1994), Cell 76: 959-962; patent nr US 5 969 102, wydany 19 października 1999; WO 00/67034, publikacja: 9 listopada 2000; WO 00/40716, publikacja: 13 lipca 2000; WO 99/35170, publikacja: 15 lipca 1999. Oba receptory ulegają ekspresji na komórkach B i sygnalizują na drodze oddziaływania na proteiny TRAF. Ponadto, zarówno TACI, jak i BCMA wiążą się również do innego członka rodziny ligandu TNF - APRIL. Yu i wsp. (2000), Nature Immunology 1 (3): 252-256. Wykazano, że APRIL także indukuje proliferację komórek B.
Dotychczas nie zostały ujawnione żadne rekombinacyjne lub modyfikowane proteiny wykorzystujące peptydowe modulatory TALL-1. Rekombinacyjne i modyfikowane proteiny stanowią nową klasę środków terapeutycznych. Użyteczne modyfikacje proteinowych środków terapeutycznych obejmują połączenia z domeną „Fc” przeciwciała oraz związanie z polimerami takimi jak glikol polietylenowy (PEG) oraz dekstran. Takie modyfikacje są szczegółowo omówione w zgłoszeniu patentowym zatytułowanym „Modyfikowane peptydy, jako środki terapeutyczne” opublikowanym jako WO 00/24782.
Całkiem odmienne podejście do opracowywania środków terapeutycznych polega na poddawaniu skriningowi biblioteki peptydów. Oddziaływanie ligandu proteiny z jej receptorem często zachodzi na stosunkowo dużej powierzchni oddziaływania. Jednakże, jak to wykazano w przypadku ludzkiego hormonu wzrostu i jego receptora, kilka zaledwie kluczowych reszt na powierzchni oddziaływania przyczynia się do większej części energii wiązania. Clackson i wsp. (1995), Science 267: 383-6. W swej masie ligand proteinowy jedynie przedstawia epitopy wiążące w prawidłowej topologii lub spełnia funkcje niezwiązane z wiązaniem. Dlatego też, molekuły o tylko „peptydowej” długości (2 do 40 aminokwasów) mogą wiązać się z białkiem receptorowym danego dużego ligandu proteinowego. Takie peptydy mogą naśladować bioaktywność dużych ligandów proteinowych („peptydowi agoniści”) lub przez konkurujące wiązanie, inhibitować bioaktywność dużych ligandów proteinowych („peptydowi antagoniści”).
Peptydowe biblioteki prezentacji fagowej pojawiły się jako bardzo skuteczne narzędzie identyfikacji takich peptydowych agonistów oraz antagonistów. Patrz, przykładowo, Scott i wsp. (1990), Science 249: 386; Deylin i wsp. (1990), Science 249: 404; patent nr US 5 223 409 wydany 29 czerwca 1993; patent nr US 5 733 731 wydany 31 marca 1998; patent nr 5 498 530 wydany 12 marca 1996; patent nr 5 432 018 wydany 11 lipca 1995; patent nr US 5 338 665 wydany 16 sierpnia 1994; patent nr US 5 922 545 wydany 13 lipca 1999; WO 96/40987 publikacja: 19 grudnia 1996; oraz WO 98/15833 publikacja: 16 kwietnia 1998. W takich bibliotekach, losowe sekwencje peptydowe przedstawione są w formie fuzji z proteinami płaszcza włóknistego faga. W typowym przypadku, udostępnione peptydy są eluowane na zasadzie powinowactwa wobec unieruchomionego białka docelowego. Zatrzymane fagi mogą być wzbogacone w kolejnych cyklach oczyszczania przez powinowactwo oraz repropagację. Najlepiej wiążące peptydy można zsekwencjonować w celu identyfikacji kluczowych reszt w obrębie jednej lub więcej strukturalnie spokrewnionych rodzin peptydów. Patrz, przykładowo, Cwirla i wsp. (1997), Science 276: 1696-9, gdzie zidentyfikowano dwie różne rodziny. Sekwencje peptydowe mogą również sugerować, które reszty mogą być bezpiecznie zamienione przez skanowanie alaniną lub przez mutagenezę na poziomie DNA. Można tworzyć biblioteki mutagenezy i poddawane skriningowi celem dalszej optymalizacji sekwencji najlepiej wiążących cząsteczek. Lowman (1997), Ann. Rev. Biophvs. Biomol. Struct. 26: 401-24.
Analiza strukturalna oddziaływania proteina-proteina może również być podstawą do typowania peptydów naśladujących aktywność wiązania dużych ligandów proteinowych. W takiej analizie struktura kryształu może sugerować identyczność oraz względną orientację istotnych (krytycznych) reszt dużego ligandu proteinowego, na podstawie której można zaprojektować peptyd. Patrz, przykładowo, Takasaki i wsp. (1997), Nature Biotech. 15: 1266-70. Te metody analityczne można również wykorzystywać do badania oddziaływania pomiędzy proteiną receptorową a peptydami wybranymi na podstawie prezentacji fagowej, a uzyskane wyniki mogą sugerować dalsze modyfikacje peptydów w celu zwiększenia powinowactwa wiązania.
PL 210 546 B1
Inne sposoby konkurują z prezentacją fagową w badaniach nad peptydami. Bibliotekę peptydową można poddać fuzji do karboksylowego końca represora lac, a następnie ekspresji w E. coli. Inna metoda, oparta na wykorzystaniu E. coli pozwala na uwidocznienie na zewnętrznej błonie komórki w wyniku fuzji z lipoproteiną powiązana z peptydoglikanem (PAL). Poniżej, omówione tu metody oraz sposoby im podobne określane są zbiorczym terminem „prezentacja z E. coli”. W innej metodzie translację losowo wybranego RNA zatrzymuje się przed uwolnieniem rybosomu, w wyniku czego otrzymuje się bibliotekę polipeptydów z nadal przyłączonym odpowiadającym im RNA. Poniżej, metoda ta oraz sposoby jej podobne określane są zbiorczym terminem „prezentacja rybosomowa”. Inne metody wykorzystują peptydy przyłączone do RNA, jak przykładowo, technologia PRO-flizyjna, Phylos, Inc. Patrz, przykładowo, Roberts & Szostak (1997), Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 94: 12297-303. Poniżej, metoda ta oraz sposoby jej podobne określane są zbiorczym terminem „skrining układów RNA-peptyd”. Opracowano biblioteki peptydów przekształconych w pochodne wytworzone chemicznie, w których peptydy są unieruchomione na stabilnych materiałach nie biologicznych, takich jak pręty polietylenowe lub żywice przepuszczalne dla rozpuszczalnika. Inna biblioteka chemicznie przetworzonych peptydów wykorzystuje fotolitografię w celu skanowania peptydów unieruchomionych na płytkach szklanych. Poniżej, omówione tu metody oraz sposoby im podobne określane są zbiorczym terminem „skrining chemicznie przetworzonych peptydów”. Skrining chemicznie przetworzonych peptydów może być korzystny, ponieważ pozwala na użycie D-aminokwasów oraz innych nie występujących w naturze analogów, a także elementów nie peptydowych. Przegląd zarówno metod biologicznych, jak i chemicznych można znaleźć w Wells & Lowman (1992), Curr. Opin. Biotechnol. 3: 355-62. Stosując prezentację fagową, skrining układów RNA-peptyd oraz i inne metody opisane powyżej, można - w sferze koncepcyjnej - znaleźć peptydowe mimetyki dowolnej proteiny.
Istota wynalazku
Wynalazek dotyczy cząsteczki obejmującej sekwencję aminokwasową o wzorze:
I(f) f1f2f3Kf5Df7Lf9f10Qf12f13f14 (SEQ ID NO: 109), gdzie:
f1, f2 i f3 oznaczają, każdy niezależnie, reszty aminokwasowe lub ich brak, f5 oznacza W, Y lub F; f7 oznacza resztę aminokwasową; f9 oznacza T lub I;
f10 oznacza K, R lub H;
f12 oznacza C, obojętną resztę hydrofobową lub resztę zasadową, korzystnie W, C lub R;
f13 oznacza C, obojętną resztę hydrofobową lub jej brak; a f14 oznacza dowolną resztę aminokwasową lub jej brak;
2 3 12 13 14 z tym jednak warunkiem, że tylko jeden z f1, f2 i f3 może oznaczać C oraz że tylko jeden z f12, f13 i f14 może oznaczać C.
W powyższej cząsteczce według wynalazku, f7 korzystnie oznacza L.
W cząsteczce tej, f9 korzystnie oznacza T.
W cząsteczce tej, f10 korzystnie oznacza K.
1 2 3
W powyższej cząsteczce według wynalazku, f12 korzystnie oznacza C oraz jeden z f1, f2 i f3 oznacza C.
W cząsteczce według wynalazku f13 korzystnie oznacza V.
Korzystnie, cząsteczka według wynalazku obejmuje sekwencję aminokwasową o wzorze:
I(f') f1f2f3KWDf7Lf9KQf12f13f14 (SEQ ID NO: 125).
Korzystnie, powyższa cząsteczka obejmuje sekwencję aminokwasową wybraną z grupy obejmującej SEQ ID NO: 32, 33, 58, 60, 63, 66, 67, 69, 114, 115, 122, 123, 124, 147-150, 152-177, 179, 180 oraz 187.
Szczególnie korzystnie, powyższa cząsteczka obejmuje sekwencję aminokwasową o wzorze:
LPGCKWDLLIKQWVCDPL (SEQ ID NO: 33).
Wynalazek obejmuje także cząsteczkę o wzorze:
(X1)a - V1 - (X2)b oraz jej multimery, gdzie:
V1 oznacza domenę Fc;
PL 210 546 B1
2 1 1 1 1 X1 i X2 oznaczają, każdy niezależnie, resztę wybraną z grupy obejmującej -(L1)c-P1, -(L1)c-P1-(L2)d-P2, -(L1)c-P1-(L2)d-P2-(L3)c-P3, -(L1)c-P1-(L2)d-P2-(L3)c-P3-(L4)f-P4, gdzie jeden lub więcej niż jeden spośród P1, P2, P3 i P4, każdy niezależnie, zawiera sekwencję: f1f2f3Kf5Df7Lf9f10Qf12f13f14 (SEQ ID NO: 109, określoną jak wyżej;
L1, L2, L3 i L4 - każdy niezależnie, oznaczają linkery; zaś a, b, c, d, e oraz f - każdy niezależnie, oznaczają 0 lub 1, z tym warunkiem, że co najmniej jeden spośród indeksów a oraz b oznacza 1.
Korzystnie, powyższa cząsteczka według wynalazku jest określona wzorem:
P1-(L1)c-P2-(L2)d-V1 albo V1-(L1)c-P1-(L2)d-P2
W powyższej cząsteczce o wzorze (X1)a-V1-(X2)b, V1 korzystnie oznacza domenę IgG Fc, a korzystniej domenę IgG1 Fc.
Szczególnie korzystnie, V1 w powyższym wzorze obejmuje sekwencję SEQ ID NO: 2.
W omawianej cząsteczce według wynalazku, korzystnie f5 oznacza W;
f7 oznacza L;
f10 oznacza K; zaś f13 oznacza V.
1
W omawianej czą steczce wedł ug wynalazku, korzystnie jeden lub wię cej niż jeden spoś ród P1, P2, P3 oraz P4 - każdy niezależnie, zawiera sekwencję o wzorze:
f1f2f3KWDf7Lf9KQf12f13f14 (SEQ ID NO: 125).
Korzystnie, cząsteczka ta jest określona wzorem:
P1-(L1)c-P2-(L2)d-V1 albo V1-(L1)c-P1-(L2)d-P2
Korzystnie również, cząsteczka ta ma sekwencję aminokwasową wybraną z grupy obejmującej SEQ ID NO: 122, 123 oraz 124.
W powyższej cząsteczce o wzorze P1-(L1)c-P2-(L2)d-V1, L2 jest korzystnie większy niż 5 aminokwasów.
W szczególności, L2 jest wybrany z grupy obejmującej:
GSGSATGGSGSTASSGSGSATx1x2 (SEQ ID NO: 193) oraz
GSGSATGGSGSTASSGSGSATx1x2GSGSATGGSGSTASSGSGSATx3x4 (SEQ ID NO: 194), gdzie x1 oraz x3 - każdy niezależnie, oznacza resztę zasadową lub hydrofobową, zaś x2 oraz x4 - każdy niezależnie, oznacza resztę hydrofobową.
W powyższej cząsteczce o wzorze V1-(L1)c-P1-(L2)d-P2, L2 jest korzystnie wybrany z grupy obejmującej:
GSGSATGGSGSTASSGSGSATH
GSGSATGGSGSTASSGSGSATGM
GSGSATGGSGSTASSGSGSATGS (SEQ ID NO: 59), (SEQ ID NO: 190), (SEQ ID NO: 191) oraz
GSGSATGGSGSTASSGSGSATHMGSGSATGGSGSTASSGSGSATHM (SEQ ID NO: 192).
Wynalazek dotyczy także DNA kodującego powyższą cząsteczkę określoną wzorem (X1)a-V1-(X2)b, w którym V1 oznacza domenę IgG Fc.
Wynalazek obejmuje również wektor ekspresji zawierający DNA określony jak wyżej. Wynalazkiem objęta jest też komórka gospodarza zawierająca wektor ekspresji określony jak wyżej.
Korzystnie, komórką gospodarza według wynalazku jest komórka E. coli.
Wyżej określone cząsteczki według wynalazku przeznaczone są do stosowania w sposobie leczenia choroby autoimmunologicznej, w której pośredniczą komórki B. W szczególności, wspomnianą chorobą autoimmunologiczną, w której pośredniczą komórki B jest toczeń.
PL 210 546 B1
Wyżej określone cząsteczki według wynalazku przeznaczone są do stosowania w sposobie leczenia raka, w którym pośredniczą komórki B. W szczególności, wspomnianym rakiem, w którym pośredniczą komórki B jest chłoniak komórek B.
Obecnie zastrzegany wynalazek dotyczy środków terapeutycznych, które modulują aktywność TALL-1.
Zgodnie z obecnym ujawnieniem, modulatory TALL-1 mogą obejmować sekwencję aminokwasową Dz2Lz4 (SEQ ID NO: 108), gdzie z2 oznacza resztę aminokwasową i z4 oznacza treonyl lub izoleucyl. Takie modulatory TALL-1 obejmują cząsteczki o następujących wzorach:
I(a) a 1a2a3CDa6La8a9a10Ca12a13a14 (SEQ. ID. NO: 100), gdzie:
a1, a2, a3 oznaczają, każdy niezależnie, reszty aminokwasowe lub ich brak; a6 oznacza resztę aminokwasową; a9 oznacza resztę zasadową lub hydrofobową; a8 oznacza treonyl lub izoleucyl;
a12 oznacza obojętną resztę hydrofobową; a a13 i a14 oznaczają, każdy niezależnie, reszty aminokwasowe lub ich brak.
I(b) b 1b2b3Cb5b6Db8Lb10b11b12b13b14Cb16b17b18 (SEQ. ID. NO: 104), gdzie:
b1 i b2 oznaczają, każdy niezależnie, reszty aminokwasowe lub ich brak; b3 oznacza resztę kwasową lub amidową; b5 oznacza resztę aminokwasową;
b6 oznacza resztę aromatyczną; b8 oznacza resztę aminokwasową; b10 oznacza T lub I;
b11 oznacza resztę zasadową;
b12 i b13 oznaczają, każdy niezależnie, resztę aminokwasową;
b14 oznacza obojętną resztę hydrofobową; oraz 16 17 18 b16, b17, b18 oznaczają, każdy niezależnie, reszty aminokwasowe lub ich brak.
I(c) c 1c2c3Cc5Dc7Lc9Lc10c11c12c13c14Cc16c17c18 (SEQ. ID. NO: 105), gdzie:
c1, c2, c3 oznaczają, każdy niezależnie, reszty aminokwasowe lub ich brak; c5 oznacza resztę aminokwasową; c7 oznacza resztę aminokwasową; c9 oznacza T lub I;
c10 oznacza resztę zasadową;
c11 i c12 oznaczają, każdy niezależnie, resztę aminokwasową; c13 oznacza obojętną resztę hydrofobową; c14 oznacza resztę aminokwasową;
c16 oznacza resztę aminokwasową;
c17 oznacza obojętną resztę hydrofobową; a c18 oznacza resztę aminokwasową lub jej brak.
I(d) d 1d2d3Cd5d6d7WDd10Ld12d13d14Cd15d16d17 (SEQ. ID. NO: 106) gdzie:
d1, d2, d3 oznaczają, każdy niezależnie, reszty aminokwasowe lub ich brak; d5, d6, d7 oznaczają, każdy niezależnie, resztę aminokwasową; d10 oznacza, resztę aminokwasową;
d12 oznacza T lub I;
d13 oznacza resztę aminokwasową;
d14 oznacza resztę aminokwasową; a 16 17 18 d16, d17, d18 oznaczają, każdy niezależnie, reszty aminokwasowe lub ich brak.
PL 210 546 B1
I(e) e 1e2e3Ce5e6e7De9Le11Ke13Ce15e16e17e18 (SEQ. ID. NO: 107), gdzie:
e1, e2, e3 oznaczają, każdy niezależnie, reszty aminokwasowe lub ich brak; e5, e6, e7, e9 i e13 oznaczają, każdy niezależnie, resztę aminokwasową; e11 oznacza T lub I; a e15, e16 oraz e17 oznaczają, każdy niezależnie, reszty aminokwasowe lub ich brak.
Związki o wzorach I(a) do I(f) - powyżej, obejmują Dz2Lz4, jak również SEQ ID NO: 63 określoną poniżej. Sekwencję I(f) uzyskano jako sekwencję zgodną, w sposób opisany w przykładzie 1, poniżej. Jak wspomniano wyżej, korzystnymi związkami spośród związków objętych wzorem I(f), są związki objęte wzorem:
I(f') f1f2f3WDf7Lf9KQf12f13f14 (SEQ. ID. NO: 125).
Do związków objętych wzorem I(f') należą związki o sekwencjach SEQ ID NO: 32, 58, 60, 62, 63, 66, 67, 69, 70, 114, 115, 122, 123, 124, 147-150, 152-177, 179, 180, 187.
Związkami objętymi obecnym ujawnieniem są również związki zawierające zgodny motyw: PFPWE (SEQ. ID. NO: 110), które również wiążą TALL-1.
Ponadto, obecnie ujawnionymi związkami są także związki o wzorze:
I(g) g1g2g3Cg5PFg8Wg10Cg11g12g13 (SEQ. ID. NO. 101), gdzie:
g1, g2 oraz g3 oznaczają, każdy niezależnie, reszty aminokwasowe lub ich brak; g5 oznacza obojętną resztę hydrofobową; g8 oznacza obojętną resztę hydrofobową; g10 oznacza resztę kwasową;
g12 oraz g13 oznaczają, każdy niezależnie, resztę aminokwasową; a g14 oznacza resztę aminokwasową lub jej brak.
I(h) h1h2h3CWh6h7WGh10Ch12h13h14 (SEQ. ID. NO: 102), gdzie:
h1, h2 i h3 oznaczają, każdy niezależnie, reszty aminokwasowe lub ich brak;
h6 oznacza resztę hydrofobową;
h7 oznacza resztę hydrofobową;
h10 oznacza kwasową lub polarną resztę hydrofobową; a 12 13 14 h12, h13, h14 oznaczają, każdy niezależnie, reszty aminokwasowe lub ich brak.
I(i) i1i2i3Ci5i6i7i8i9i10Ci12i13i14 (SEQ. ID. NO: 103), gdzie oznacza resztę aminokwasową lub jej brak;
oznacza obojętną resztę hydrofobową;
3 oznacza resztę aminokwasową;
, i6, i7, i8 oznaczają, każdy niezależnie, resztę aminokwasową;
oznacza resztę kwasową ;
10 oznacza resztę aminokwasową; oraz i13 oznaczają , każ dy niezależ nie, resztę aminokwasową ; a oznacza oboję tną resztę hydrofobową .
Związki zdefiniowane przez wzory od I(g) do I(i) również wiążą TALL-1.
Ponadto, zgodnie z obecnym ujawnieniem, modulatory TALL-1 obejmują: a) domenę modulującą TALL-1 (przykładowo, sekwencję aminokwasową o wzorze od I(a) do I(i)), korzystnie sekwencję aminokwasową Dz2Lz4 lub sekwencje pochodne uzyskane metodą prezentacji fagowej, skriningu układów RNA-peptyd lub innymi technikami wymienionymi powyżej oraz b) podłoże, takie jak polimer (przykładowo PEG lub dekstran) lub domena Fc, która jest korzystnym podłożem, gdzie podłoże jest kowalencyjnie połączone z domeną modulującą TALL-1.
PL 210 546 B1
Podłoże oraz domena modulująca TALL-1 mogą być połączone przez N- lub C-koniec domeny modulującej TALL-1, jak to opisano poniżej. Korzystnym podłożem jest domena Fc, a korzystną domeną Fc jest domena IgG Fc. Takie pep-tydy związane z Fc są określane dalej terminem „ciała peptydowe.” Do korzystnych domen modulujących TALL-1 należą sekwencje aminokwasowe opisane poniżej w tablicach 1 i 2. Dalsze domeny modulujące TALL-1 mogą być generowane metodą prezentacji fagowej, skriningu układów RNA-peptyd oraz innymi, wymienionymi tu technikami.
Ponadto, obecnym ujawnieniem objęty jest także sposób wytwarzania modulatorów TALL-1, który obejmuje:
a. wybranie co najmniej jednego peptydu, który wiąże się z TALL-1; oraz
b. kowalencyjne przyłączenie wybranego peptydu do podłoża.
Korzystnym podłożem jest domena Fc. Etap (a) korzystnie prowadzi się dokonując wyboru sekwencji peptydowych z tablicy 2 poniżej lub z prezentacji fagowej, skriningu układów RNA-peptyd lub spośród sekwencji dostępnych przy użyciu innych, wymienionych tu technik.
Związki według obecnego wynalazku można wytwarzać standardowymi metodami syntezy, technikami rekombinacyjnego DNA lub dowolnymi innymi metodami wytwarzania peptydów i protein fuzyjnych. Związki według obecnego wynalazku, obejmujące części nie peptydowe można syntezować na drodze standardowych reakcji chemicznych, w połączeniu ze standardowymi reakcjami chemii peptydów, jeśli może to mieć zastosowanie.
Głównym zastosowaniem przewidzianym dla związków według obecnego wynalazku jest w pierwszym rzędzie ich użycie w charakterze środków terapeutycznych lub profilaktycznych. Peptyd związany z podłożem może posiadać aktywność porównywalną - lub nawet większą - jak naturalny ligand „naśladowany” przez ten peptyd.
Związki według obecnego wynalazku można stosować w celach terapeutycznych lub profilaktycznych po ich zmieszaniu (formulacji) z odpowiednimi farmaceutycznymi materiałami nośnikowymi, przez podawanie ich w skutecznej ilości pacjentom, takim jak człowiek (lub inny ssak) potrzebujący takiego środka. Inne, związane z tymi aspekty rozwiązania są również objęte obecnym wynalazkiem.
Liczne dalsze aspekty i korzyści płynące z obecnego wynalazku staną się zrozumiałe po przeanalizowaniu rysunków oraz szczegółowego opisu wynalazku.
Krótki opis rysunków
Figura 1 przedstawia przykładowe dimery Fc, które mogą pochodzić z przeciwciała IgG1. „Fc” na rysunku oznacza dowolną spośród odmian Fc objętych definicją „domena Fc”. „X1” oraz „X2” przedstawiają peptydy lub kombinacje linker-peptyd, zdefiniowane poniżej.
Szczególnymi dimerami są następujące dimery:
A, D: Dimery związane pojedynczym wiązaniem dwusiarczkowym. Przeciwciała IgG1 typowo posiadają dwa wiązania dwusiarczkowe w rejonie zawiasowym przeciwciała. Domena Fc na fig. 1A oraz 1D może być utworzona przez obcięcie pomiędzy obu miejscami zdolnymi do tworzenia wiązań dwusiarczkowych lub przez podstawienie reszty cysteinylowej resztą nie reaktywną (jak przykładowo alanyl). Na fig. 1A, domena Fc jest przyłączona do końca aminowego peptydów, a na fig. 1D - do końca karboksylowego.
B, E: Dimery podwójnie związane wiązaniem dwusiarczkowym. Taką domenę Fc można uzyskać przez obcięcie macierzystego przeciwciała zatrzymując obie reszty cysteinylowe w łańcuchach domeny Fc lub w wyniku ekspresji z konstruktu obejmującego sekwencję kodującą taką domenę Fc. Na fig. 1B, domena Fc jest przyłączona do końca aminowego peptydów, a na 1E - do końca karboksylowego.
C, F: Niekowalencyjne dimery. Taka domena Fc może być wytworzona w wyniku eliminacji reszt cysteinylowych albo przez obcięcie lub podstawienie. Eliminacja reszt cysteinylowych może być pożądana, gdy zależy na uniknięciu zanieczyszczeń, jakie mogą powstać w wyniku reakcji reszty cysteinylowej z resztami cysteinylowymi innych protein obecnych w komórce gospodarza. Niekowalencyjne wiązanie domen Fc jest wystarczające do utrzymania dimeru w całości. Inne dimery można wytworzyć stosując domeny Fc pochodzące z różnych rodzajów przeciwciał (przykładowo, IgG2, IgM).
Figura 2 ilustruje strukturę korzystnych związków według wynalazku, których cechą jest tandemowe powtórzenie farmakologicznie aktywnego peptydu. Fig. 2A przedstawia cząsteczkę jednołańcuchową, a może również reprezentować konstrukt DNA dla tej cząsteczki. Fig. 2B przedstawia dimer, w którym sekwencja linker-peptyd występuje w dimerze w tylko w jednym łańcuchu. Fig. 2C przedstawia dimer zawierający część peptydową w obu łańcuchach. Dimer przedstawiony na rysunku fig. 2C powstaje spontanicznie w niektórych komórkach gospodarza w wyniku ekspresji konstruktu DNA koPL 210 546 B1 dującego cząsteczkę jednołańcuchową przedstawioną na rysunku fig. 3A. W innych komórkach gospodarza komórki mogą utrzymywane w warunkach sprzyjających tworzeniu dimerów lub dimery można formować in vitro.
Figura 3 przedstawia przykładową sekwencję kwasu nukleinowego i sekwencję aminokwasową (odpowiednio SEQ ID NO: 1 i 2) ludzkiej domeny IgG1 Fc, którą można wykorzystać w obecnym wynalazku.
Figury 4A do 4F przedstawiają sekwencje nukleotydów oraz sekwencje aminokwasowe (SEQ ID NO: 3 do 27) S fragmentów od Ndel do SalI kodujących peptyd oraz linker.
Figury 5A do 5M przedstawiają sekwencję nukleotydową (SEQ ID NO: 28) wektora pAMG21-RANK-Fc, który stosowano do skonstruowania cząsteczek związanych z Fc według obecnego wynalazku.
Rysunki te identyfikują szereg cech kwasu nukleinowego, w tym:
• obszary promotora PcopB, PrepA, RNAI, APHII, luxPR oraz luxPL;
• mRNA dla APHII, luxR;
• sekwencje kodujące i sekwencje aminokwasowe białek: proteina copB, copT, repAI, repA4, APHII, luxR, RANK oraz Fc;
• miejsca wiążące dla białek copB, CRP;
• spinki T1, T2, T7 oraz spinki typu „toop”;
• miejsce operatora dla proteiny lux;
• enzymatyczne miejsca restrykcyjne dla Pf11108I, BgllL Scal, BmnI, Drdll, Dralll, BstBI, Acelll, ĄflU, PflMI, Bgll, Sfil, BstEIL, BspLullI, NspV, Bpil, EagI, Bcgl, Nsil, Bsal, Psp1406I, AatII, BsmI, Nrul, Ndel, ApaLI, Acc65, KpnI, Sall, AccI, BspEI, Ahdl, BspHI, EconI, BsrGI, BamI, Smal, SexAI, BamHI, oraz Blpl.
Figury 6A do 6B przedstawiają sekwencję DNA (SEQ ID NO: 97) wstawioną do pCFM1656 między unikalnymi miejscami restrykcyjnymi Aatll (pozycja #4364 w pCFM1656) oraz SacII (pozycja #4585 w pCFM1656) z wytworzeniem plazmidu ekspresji pAMG21 (ATCC numer dostępu 98113).
Figura 7 wykazuje, że ciało peptydowe TALL-1 (SEQ ID NO: 70) inhibituje proliferację komórek B, w której uczestniczy TALL-1. Prowadzono trzy hodowle oczyszczonych komórek B (105) pochodzących od myszy B6 na płytkach 96-studniowych ze wskazanymi ilościami zgodnego ciała peptydowego TALL-1 w obecności 10 ng/ml TALL-1 plus 2 μg/ml przeciwciała anty-IgM. Proliferację mierzono na podstawie przyswajania radioaktywnej [3H]tymidyny w ostatnich 18 h pulsu. Podane dane stanowią średnią ± odchylenie standardowe (SD) z trzech identycznych studni.
Figura 8 wykazuje, że ciała peptydowe N-końcowego dimeru tandemowego TALL-1 (SEQ ID NO: 123 i 124 w tablicy 5B, poniżej) są korzystne z punktu widzenia inhibitowania proliferacji komórek B, w której uczestniczy TALL-1. Prowadzono trzy hodowle oczyszczonych komórek B (105) pochodzących od myszy B6 na płytkach 96-studniowych ze wskazanymi ilościami ciała peptydowego TALL-1 12-3 oraz zgodnego ciała peptydowego TALL-1 (SEQ ID NO: 115 oraz 122 z tablicy 5B) lub ciał peptydowych wskazanego dimeru (SEQ ID NO: 123, 124) w obecności 10 ng/ml TALL-1 plus 2 μg/ml przeciwciała anty-IgM. Proliferację mierzono na podstawie przyswajania radioaktywnej [3H]tymidyny w ostatnich 18 h pulsu. Podane dane stanowią średnią ± odchylenie standardowe (SD) z trzech identycznych studni.
Figura 9. Ciało peptydowe AGP3 wiąże się z AGP3 z dużym powinowactwem. Stałą równowagi dysocjacji (KD) otrzymano z nieliniowej regresji krzywych konkurencji stosując homogeniczny model wiązania w jednym miejscu z użyciem podwójnej krzywej (program KinExTM). KD wynosi około 4 pM w przypadku wiązania ciała peptydowego AGP3 z AGP3 człowieka (SEQ ID NO: 123).
Figury 10A oraz 10B. Ciało peptydowe AGP3 blokuje zarówno AGP3 człowieka, jak i myszy w teście konkurencji Biacore. Rozpuszczalne ludzkie białko TACI immobilizowano na chipie B1. 1 nM rekombinacyjnego białka AGP3 człowieka (górny panel) lub 5 nM rekombinacyjnego białka AGP3 myszy (niższy panel) inkubowano ze wskazaną ilością ciała peptydowego AGP3 przed naniesieniem na całą powierzchnię receptora. Przedstawiono względną odpowiedź na wiązanie AGP3 człowieka oraz AGP3 myszy (SEQ ID NO: 123).
Figury 11A oraz 11B. Ciało peptydowe AGP3 blokowało wiązanie AGP3 do wszystkich trzech receptorów TACI, BCMA oraz BAFFR w teście konkurencji Biacore. Rekombinacyjne rozpuszczalne białka receptorów TACI, BCMA oraz BAFFR unieruchomiono na chipie CM5. 1 nM rekombinacyjnego ludzkiego AGP3 (górny panel) inkubowano ze wskazaną ilością ciała peptydowego AGP3 przed naniesieniem na całą powierzchnię każdego receptora. Zmierzono względne wiązanie AGP3. Podobnie,
PL 210 546 B1 nM rekombinacyjnego białka APRIL inkubowano ze wskazaną ilością ciała peptydowego AGP3 przed naniesieniem na całą powierzchnię każdego receptora. Ciało peptydowe nie inhibituje wiązania APRIL z wszystkimi trzema receptorami. (SEQ ID NO: 123).
Figury 12A oraz 12B. Ciało peptydowe AGP3 inhibituje wzrost poziomu immunoglobuliny w mysiej surowicy indukowany przez podanie AGP3 człowieka. Myszom Balb/c podano przez dootrzewnową iniekcję 7 dziennych dawek 1 mg/Kg białka AGP3 człowieka z: solanką, ludzką domeną Fc lub ciałem peptydowym AGP3 we wskazanych ilościach. Myszy skrwawiono w ósmym dniu. Ogólny poziom IgM oraz IgA w surowicy oznaczono stosując testy ELISA (SEQ ID NO: 123).
Figura 13. Podawanie peptydowego ciała AGP3 obniżało nasilenie zapalenia stawu w mysim modelu CIA. Samce myszy DBA/1 w wieku od ośmiu do 12 tygodni immunizowano śródskórnie u nasady ogona stosując bydlęcy kolagenem typu II (bCII) przeprowadzony w emulsję w kompletnym adiuwancie Freunda, a po 3 tygodniach od wstępnej immunizacji przyspieszano rozwój choroby stosując bCII przeprowadzony w emulsję w niekompletnym adiuwancie Freunda. Podawanie wskazanej dawki ciała peptydowego AGP3 rozpoczęto od dnia powtórnej immunizacji i kontynuowano przez 4 tygodnie.
Jak to uprzednio opisano (Khare i wsp., J. Immunol. 155: 3653-9, 1995), wszystkie cztery łapy osobno oceniano w skali 0-3 pod kątem nasilenia objawów zapalenia stawu (SEQ ID NO: 123).
Figura 14. Podawanie ciała peptydowego AGP3 inhibitowało generowanie przeciwciała antykolagenowego w mysim modelu CIA. Próbki surowicy pobrano jeden tydzień (dzień 35) po ostatnim zabiegu opisanym wyżej. Poziom przeciwciała anty-kolagen II oznaczono w surowicy stosując zestawy analityczne ELISA (SEQ ID NO: 123).
Figury 15A oraz 15B. Podawanie ciała peptydowego AGP3 opóźniało wystąpienie proteinurii i zwiększało przeżywalność dotkniętych toczniem myszy NZB/NZW. Pięciomiesięczne myszy z pronami tocznia NZBx NZBWF1 leczono przez 8 tygodni podając dootrzewnowo 3 x na tydzień PBS lub wskazane dawki białka ciała peptydowego AGP3 (SEQ ID NO: 123) lub ludzkiej domeny Fc. Zawartość białka w moczu oznaczano co miesiąc przez cały czas trwania eksperymentu stosując paski z reagentem Albustix (Bayer AG).
Figury 16A oraz 16B przedstawiają sekwencję kwasu nukleinowego oraz sekwencję aminokwasów korzystnego ciała peptydowego wiążącego-TALL-1 (SEQ ID NO: 189 oraz 123).
Szczegółowy opis wynalazku
Definicje
Określenia stosowane w niniejszym opisie mają niżej podane znaczenie chyba, że zostały odmiennie zdefiniowane w ściśle określonych przypadkach.
Definicje ogólne
Określenie „zawierający” oznacza, że związek może obejmować dodatkowe aminokwasy na jednym z dwóch lub na obu końcach N- lub C- danej sekwencji. Oczywiście, te dodatkowe aminokwasy nie powinny istotnie kolidować z aktywnością danego związku.
Ponadto, fizjologicznie akceptowalne sole związków według obecnego wynalazku są tu przewidziane. Określenie „fizjologicznie dopuszczalne sole” odnosi się do dowolnych soli, które są znane lub zostaną później odkryte jako farmaceutycznie dopuszczalne. Oto kilka specyficznych ich przykładów: octan, trifluorooctan, chlorowcowodorki, takie jak chlorowodorek i bromowodorek, siarczan, cytrynian, winian, glikolan i szczawian.
Aminokwasy
Określenie „reszta kwasowa” odnosi się do reszt aminokwasowych w postaci form D- lub L-, posiadających łańcuchy boczne zawierające grupy kwasowe. Przykładowe reszty kwasowe obejmują D oraz E.
Określenie „reszta amidowa” odnosi się do aminokwasu w postaci form D- lub L-, posiadających łańcuchy boczne zawierające pochodne amidowe grup kwasowych. Przykładowe reszty obejmują N oraz Q.
Określenie „reszta aromatyczna” odnosi się do reszt aminokwasowych w postaci form D- lub L-, posiadających łańcuchy boczne zawierające grupy aromatyczne. Przykładowe reszty aromatyczne obejmują F, Y oraz W.
Określenie „reszta zasadowa” odnosi się do reszt aminokwasowych w formie D- L-, zawierających łańcuchy boczne obejmujące grupy zasadowe. Przykładowe reszty zasadowe obejmują H, K oraz R.
PL 210 546 B1
Określenie „reszta hydrofilowa” odnosi się do reszt aminokwasowych w formie D- lub L-, zawierających łańcuchy boczne obejmujące grupy polarne. Przykładowe reszty hydrofilowe obejmują C, S, T, N oraz Q.
Określenie „reszta bezfunkcyjna” odnosi się do reszt aminokwasowych w formie D- lub L-, zawierających łańcuchy boczne w których nie występują grupy kwasowe, zasadowe lub aromatyczne. Przykładowe bezfunkcyjne reszty aminokwasowe obejmują M, G, A, V, I, L oraz norleucynę (NIe).
Określenie „obojętna reszta hydrofobowa” odnosi się do reszt aminokwasowych w formie D- lub L-, zawierających łańcuchy boczne, w których nie występują grupy zasadowe, kwasowe lub polarne. Przykładowe obojętne aminokwasowe reszty hydrofobowe obejmują A, V, L, I, P, W, M oraz F.
Określenie „polarna reszta hydrofobowa” odnosi się do reszt aminokwasowych w formie D- lub L-, zawierających łańcuchy boczne obejmujące grupy polarne. Przykładowe polarne aminokwasowe reszty hydrofobowe obejmują T, G, S, Y, C, Q oraz N.
Określenie „reszta hydrofobowa” odnosi się do reszt aminokwasowych w formie D- lub L-, zawierającej łańcuchy boczne w których nie występują grupy zasadowe lub kwasowe. Przykładowe aminokwasowe reszty hydrofobowe obejmują A, V, L, I, P, W, M, F, T, G, S, Y, C, Q oraz N.
Peptydy
Określenie „peptyd” odnosi się do cząsteczek zbudowanych z 1 do 40 aminokwasów, korzystnie molekuł o 5 do 20 aminokwasach. Przykładowe peptydy mogą zawierać domenę modulującą TALL-1 molekuły występującej w przyrodzie lub zawierają sekwencje randomizowane („losowe”).
Określenie „losowe (randomizowane)” używane przy omawianiu sekwencji peptydowych odnosi się do w pełni losowych sekwencji (przykładowo, wybranych stosując prezentację fagową lub skrining układów RNA-peptyd) oraz do sekwencji, w których jedna lub więcej reszt w cząsteczkach występujących w przyrodzie jest zastąpiona przez resztę aminokwasową nie wy stępującą w tej pozycji w molekule występującej w przyrodzie. Przykładowe metody identyfikacji sekwencji peptydowych obejmują prezentację fagową, prezentację z E. coli, prezentację rybosomową, skrining układów RNA-peptyd, chemiczny skrining i tym podobne.
Określenie „domena modulująca TALL-1” odnosi się do dowolnej sekwencji aminokwasowej, która wiąże do TALL-1 i obejmuje występujące w przyrodzie sekwencje lub sekwencje randomizowane („losowe”). Przykładowe domeny modulujące TALL-1 można zidentyfikować lub wyprowadzić z prezentacji fagowej lub innymi metodami tutaj wymienionymi.
Określenie „antagonista TALL-1” odnosi się do cząsteczki, która wiąże się z TALL-1 i podwyższa lub obniża jeden lub więcej parametrów w prowadzonych testach w przeciwieństwie do wpływu, jaki na te parametry ma natywny TALL-1 pełnej długości. Taka aktywność może być oznaczona, przykładowo, w takich testach lub próbach, jak opisane w podsekcji zatytułowanej „Biologiczna aktywność AGP-3” w sekcji Materiały i Sposoby w zgłoszeniu patentowym zatytułowanym „TNF-RELATED PROTEINS” - WO 00/47740, publikacja: 17 sierpnia 2000 r.
Podłoża i ciała peptydowe
Określenie „podłoże” odnosi się do cząsteczki, która zapobiega degradacji i/lub powoduje wzrost okresu półtrwania, redukuje toksyczność, redukuje immunogeniczność lub powoduje wzrost biologicznej aktywności proteiny terapeutycznej. Przykładowe podłoża obejmują domenę Fc (która jest korzystna), jak również polimer liniowy (przykładowo glikol polietylenowy (PEG), polilizynę, dekstran, itp.); polimer o rozgałęzionym łańcuchu (patrz, przykładowo, patenty nr US nr 4 289 872 na rzecz Denkenwalter i wsp., wydany 15 września 1981; US nr 5 229 490 na rzecz Tam, wydany 20 lipca 1993; WO 93/21259 autor: Frechet i wsp., publikacja: 28 października 1993); lipid; grupę cholesterolową (przykładowo steroid); węglowodan lub oligosacharyd (przykładowo dekstran); dowolną naturalną lub syntetyczną proteinę, polipeptyd lub peptyd, który wiąże się z receptorem ratunkowym; albuminę, obejmującą albuminę z surowicy ludzkiej (HSA), suwakową domenę (zipper domain) leucyny oraz inne takie białka i fragmenty protein. Podłoża opisano poniżej.
Określenie „natywny Fc” odnosi się do molekuły lub sekwencji obejmującej sekwencję fragmentu nie wiążącego się z antygenem, powstającego w wyniku trawienia całego przeciwciała, zarówno w postaci monomerycznej, jak i multimerycznej. Pierwotnym źródłem immunoglobulinowym natywnego Fc jest korzystnie źródło pochodzenia ludzkiego i może nim być dowolna immunoglobulina, aczkolwiek korzystnymi immunoglobulinami są IgG1 oraz IgG2. Natywne Fc są zbudowane z monomerycznych polipeptydów, które mogą być połączone w dimeryczne lub multimeryczne formy przez więzy kowalencyjne (przykładowo przez wiązania dwusiarczkowe) i niekowalencyjne. Ilość międzymolekulamych wiązań dwusiarczkowych pomiędzy monomerycznymi podjednostkami cząsteczek natywnego
PL 210 546 B1
Fc zawiera się w przedziale od 1 to 4, w zależności od klasy (przykładowo: IgG, IgA, IgE) lub podklasy (przykładowo: IgG1, IgG2, IgG3, IgA1, IgGA2). Jednym z przykładów natywnego Fc jest dimer z wiązaniami dwusiarczkowymi otrzymany z IgG trawionej papaina (patrz Ellizon i wsp. (1982), Nucleic Acids Res. 10: 4071-9). Określenie „natywny Fc” stosowane tutaj oznacza ogólnie formy monomeryczne, dimeryczne oraz multimeryczne.
Określenie „odmiana Fc” odnosi się do molekuły lub sekwencji, która jest modyfikowana z natywnego Fc, lecz ciągle obejmuje miejsce wiążące receptor ratunkowy (salvage receptor) - FcRn. Międzynarodowe zgłoszenia wynalazku WO 97/34631 (publikacja: 25 września 1997) oraz WO 96/32478 opisują przykładowe odmiany Fc, jak również oddziaływanie z receptorem ratunkowym. A więc, określenie „odmiana Fc” obejmuje molekułę lub sekwencję, którą humanizowano z nie ludzkiego natywnego Fc. Ponadto, natywny Fc zawiera miejsca, które mogą być usunięte, gdyż wprowadzają cechy strukturalne oraz biologiczną aktywność, które nie są potrzebne w cząsteczkach fuzyjnych według obecnego wynalazku. Tak więc, określenie „odmiana Fc” obejmuje molekułę lub sekwencję, w której brakuje jednego lub większej liczby miejsc lub reszt występujących w natywnym Fc, które mają wpływ lub udział w (1) tworzeniu wiązania dwusiarczkowego, (2) niekompatybilności z wybraną komórką gospodarza, (3) heterogeniczności N-końca po ekspresji w wybranej komórce gospodarza, (4) glikozylacji, (5) oddziaływaniu z komplementem, (6) wiązaniu z receptorem Fc innym niż receptor ratunkowy lub (7) cytotoksyczności komórkowej zależnej od przeciwciała (ADCC). Odmiany Fc opisano szczegółowo w dalszej części opisu.
Określenie „domena Fc” obejmuje cząsteczki i sekwencje natywnego Fc oraz odmian Fc, zdefiniowane powyżej. Jak w przypadku odmian Fc oraz natywnych Fc, określenie „domena Fc” obejmuje molekuły w monomerycznej lub multimerycznej postaci, zarówno wytrawione z całego przeciwciała, jak i otrzymane innymi środkami.
Określenie „multimer” używane w odniesieniu do domeny Fc lub molekuł zawierających domeny Fc, odnosi się do cząsteczek posiadających dwa lub więcej niż dwa polipeptydowe łańcuchy zasocjowane kowalencyjnie, niekowalencyjnie lub przez oba typy oddziaływań: kowalencyjne i niekowalencyjne. Molekuły IgG typowo tworzą dimery, IgM - pentamery, IgD - dimery, zaś IgA - monomery, dimery, trimery lub tetramery. Multimery można wytworzyć wykorzystując sekwencję i wynikającą stąd aktywność natywnej Ig stanowiącej źródło Fc lub ma drodze derywatyzacji (w sposób opisany poniżej) natywnego Fc.
Określenie „dimer” użyte w przypadku domen Fc lub molekuł zawierających domeny Fc, odnosi się do molekuł posiadających dwa łańcuchy polipeptydowe zasocjowane kowalencyjnie lub niekowalencyjnie. Tak więc, przykłady dimerów objętych zakresem obecnego wynalazku przedstawiono na rysunku fig. 1.
Określenia „derywatyzacja” oraz „pochodna” lub „przekształcone w pochodną” obejmują odpowiednio sposoby oraz końcowe związki, w których (1) związek posiada część cykliczną; przykładowo, wiązanie sieciujące pomiędzy resztami cysteinylowymi wewnątrz związku tego; (2) związek jest związany wiązaniem sieciującym lub posiada miejsce wiązania sieciującego; przykładowo, związek posiada resztę cysteinylową i dlatego tworzy dimery w wyniku tworzenia wiązań sieciujących w hodowli lub in vivo; (3) jedno lub więcej połączeń peptydylowych jest zastąpione przez nie peptydylowe połączenie; (4) N-koniec jest zastąpiony przez -NRR1, NRC(O)R1, -NRC(O)OR1, -NRS(O)2R1, -NHC(O)NHR, grupę sukcynimidową lub podstawioną, bądź nie podstawioną grupę benzyloksykarbonylo-NH-, gdzie R oraz R1 i podstawniki przy pierścieniu mają niżej podane znaczenie; (5) C-koniec jest zastąpiony przez -C(O)R2 lub -NR3R4, gdzie R2, R3 oraz R4 mają znaczenie podane poniżej oraz (6) związki, w których indywidualne reszty aminokwasowe są modyfikowane w wyniku reakcji ze środkami zdolnymi do reagowania z wybranymi łańcuchami bocznymi lub resztami końcowymi. Pochodne bliżej opisano w dalszej części.
Określenie „ciało peptydowe” i „ciała peptydowe” odnosi się do molekuł zawierających domenę Fc i co najmniej jeden peptyd. Takie ciała peptydowe mogą być multimerami lub dimerami, bądź ich fragmentami i mogą być zderywatyzowane. W obecnym wynalazku, molekuły o wzorach II do VI wskazanych poniżej są ciałami peptydowymi, gdy V1 oznacza domenę Fc.
Budowa związków
Część ogólna
Obecni twórcy zidentyfikowali sekwencje zdolne do wiązania z TALL-1 oraz do modulowania aktywności biologicznej TALL-1. Sekwencje te mogą być modyfikowane technikami omówionymi wyPL 210 546 B1 żej, w wyniku czego jeden lub więcej niż jeden aminokwas może być zmieniony przy zachowaniu lub nawet poprawie powinowactwa do wiązania danego peptydu.
W czą steczkach wytwarzanych zgodnie z obecnym wynalazkiem peptyd ten (peptydy) można przyłączyć do podłoża N-końcem lub C-końcem. Dowolne spośród tych peptydów mogą być połączone tandemowo (to znaczy sekwencyjnie, jeden za drugim) poprzez linker lub bez linkerów. Tak więc, cząsteczki podłoże-peptyd według obecnego wynalazku mogą być opisane następującym wzorem II:
(X1)a - V1 - (X2)b (wzór II) gdzie:
V1 oznacza podłoże (korzystnie domenę Fc);
2 1 1 1 1
X1 i X2 oznaczają, każdy niezależnie, resztę wybraną z grupy obejmującej -(L1)c-P1, -(L1)c-P1-(L2)d-P2, -(L1)c-P1-(L2)d-P2-(L3)c-P3, -(L1)c-P1-(L2)d-P2-(L3)c-P3-(L4)f-P4;
P1, P2, P3 oraz P4, oznaczają, każdy niezależnie, sekwencje domen modulujących TALL-1, jak sekwencje o wzorach I(a) do I(i);
L1, L2, L3 oraz L4 oznaczają, każdy niezależnie, linkery, zaś a, b, c, d, e oraz f oznaczają, każdy niezależnie, 0 lub 1, z tym warunkiem, że co najmniej jeden z symboli a oraz b oznacza 1.
A więc, związek II obejmuje korzystne związki o wzorach III do VI:
X1 - V1 (wzór III) i ich multimery, gdzie V1 oznacza domenę Fc przyłączoną do C-końca A1;
V1 - X1 (wzór IV) i ich multimery, gdzie V1 oznacza domenę Fc przyłączoną do N-końca A1;
V1 - (L1)c - P1 (wzór V) i ich multimery, gdzie V1 oznacza domenę Fc przyłączoną do N-końca -(L1)c-P1; oraz
V1 - (L1)e - P1 - (L2)d - P2 (wzór VI) i ich multimery, gdzie V1 oznacza domenę Fc przyłączoną do N-końca -L1-P1-L2-P2.
Peptydy
Peptydy według obecnego wynalazku są przydatne jako peptydy modulujące TALL-1 lub jako domeny modulujące TALL-1 w cząsteczkach o wzorach II do VI. Zgodnie z wynalazkiem, cząsteczki zawierające te sekwencje peptydowe można wytwarzać znanymi metodami.
Korzystne sekwencje peptydowe mają wyżej podane wzory I, w których podstawniki mają niżej podane znaczenie.
T a b l i c a 1
Korzystne podstawniki peptydowe
| 1 | 2 |
| Wzór I(a) | a8 oznacza T; a9 oznacza resztę zasadową (najkorzystniej K); a a12 oznacza obojętną resztę hydrofobową (najkorzystniej F). |
| Wzór I(b) | b3 oznacza D, Q lub E; b6 oznacza W lub Y; 10 b oznacza T; b11 oznacza K lub R; a b14 oznacza V lub L. |
| Wzór I(c) | 9 c9 oznacza T; c10 oznacza K lub R; c13 oznacza a I, L lub V; a c17 oznacza A lub L. |
| Wzór I(d) | d12 oznacza T. |
| Wzór I(e) | e11 oznacza T. |
PL 210 546 B1 cd tablicy 1
| 1 | 2 |
| Wzór I(f) | f9 oznacza T; f10 oznacza K; a f13 oznacza V. |
| Wzór I(g) | g5 oznacza W; 8 g oznacza P; 10 g oznacza E; a 13 g13 oznacza resztę zasadową. |
| Wzór I(h) | h1 oznacza G; h6 oznacza A; h7 oznacza obojętną resztę hydrofobową; a h10 oznacza resztę kwasową. |
| Wzór I(i) | i2 oznacza W; a i14 oznacza W. |
Korzystne sekwencje peptydowe przedstawiono poniżej w tablicy 2.
T a b l i c a 2
Korzystne domeny modulowane TALL-1
| Sekwencja | SEQ ID NO: |
| 1 | 2 |
| PGTCFPFPWECTHA | 29 |
| WGACWPFPWECFKE | 30 |
| VPFCDLLTKHCFEA | 31 |
| GSRCKYKWDVLTKQCFHH | 32 |
| LPGCKWDLLIKQWVCDPL | 33 |
| SADCYFDILTKSDYCTSS | 34 |
| SDDCMYDQLTRMFICSNL | 35 |
| DLNCKYDELTYKEWCQFN | 36 |
| FHDCKYDLLTRQMVCHGL | 37 |
| RNHCFWDHLLKQDICPSP | 38 |
| ANQCWWDSLTKKNVCEFF | 39 |
| YKGRQMWDILTRSWWSL | 126 |
| QDVGLWWDILTRAWM PN I | 127 |
| QNAQRVWDLLIRTWVYPQ | 128 |
| GWNEAWWDELTKIWVLEQ | 129 |
| RITCDTWDSLIKKCVPQS | 130 |
| GAIMQFWDSLTKTWLRQS | 131 |
| WLHSGWWDPLTKHWLQKV | 132 |
| SEWFFWFDPLTRAQLKFR | 133 |
| GVWFWWFDPLTKQWTQAG | 134 |
| MQCKGYYDILTKWCVTNG | 135 |
| LWSKEVWDILTKSWVSQA | 136 |
| KAAGWWFDWLTKYWYPAP | 137 |
PL 210 546 B1 cd tablicy 2
| 1 | 2 |
| AYQTWFWDSLTRLWLSTT | 138 |
| SGQHFWWDLLTRSWTPST | 139 |
| LGVGQKWDPLTKQWVSRG | 140 |
| VGKMCQWDPLIKRTVCVG | 141 |
| CRQGAKFDLLTKQCLLGR | 142 |
| GQAIRHWDVLTKQWVDSQ | 143 |
| RGPCGSWDLLTKHCLDSQ | 144 |
| WQWKQQWDLLTKQMVWVG | 145 |
| PITICRKDLLTKQWCLD | 146 |
| KTCNGKWDLLTKQCLQQA | 147 |
| KCLKGKWDLLTKQCVTEV | 148 |
| RCWNGKWDLLTKQCIHPW | 149 |
| NRDMRKWDPLIKQWIVRP | 150 |
| QAAAATWDLLTKQWLVPP | 151 |
| PEGGPKWDPLTKQFLPPV | 152 |
| QTPQKKWDLLTKQWFTRN | 153 |
| IGSPCKWDLLTKQMICQT | 154 |
| CTAAGKWDLLTKQCIQEK | 155 |
| VSQCMKWDLLTKQCLQGW | 156 |
| VWGTWKWDLLTKQYLPPQ | 157 |
| GWWEMKWDLLTKQWYRPQ | 158 |
| TAQVSKWDLLTKQWLPLA | 159 |
| QLWGTKWDLLTKQYIQIM | 160 |
| WATSQKWDLLTKQWVQNM | 161 |
| QRQCAKWDLLTKQCVLFY | 162 |
| KTTDCKWDLLTKQRICQV | 163 |
| LLCQGKWDLLTKQCLKLR | 164 |
| LMWFWKWDLLTKQLVPTF | 165 |
| QTWAWKWDLLTKQWIGPM | 166 |
| NKELLKWDLLTKQCRGRS | 167 |
| GQKDLKWDLLTKQYVRQS | 168 |
| PKPCQKWDLLTKQCLGSV | 169 |
| GOIGWKWDLLTKQWIQTR | 170 |
| VWLDWKWDLLTKQWIHPQ | 171 |
| QEWEYKWDLLTKQWGWLR | 172 |
| HWDSWKWDLLTKQWWQA | 173 |
| TRPLQKWDLLTKQWLRVG | 174 |
| SDOWQKWDLLTKQWFWDV | 175 |
PL 210 546 B1 cd tablicy 2
| 1 | 2 |
| QQTFMKWDLLTKQWIRRH | 176 |
| QGECRKWDLLTKQCFPGQ | 177 |
| GQMGWRWDPLIKMCLGPS | 178 |
| QLDGCKWDLLTKQKVCIP | 179 |
| HGYWQKWDLLTKQWVSSE | 180 |
| HQGQCGWDLLTRIYLPCH | 181 |
| LHKACKWDLLTKQCWPMQ | 182 |
| GPPGSVWDLLTKIWIQTG | 183 |
| ITQDWRFDTLTRLWLPLR | 184 |
| QGGFAAWDVLTKMWITVP | 185 |
| GHGTPWWDALTRIWILGY | 186 |
| VWPWQKWDLLTKQFVFQD | 187 |
| WQWSWKWDLLTRQYISSS | 188 |
| NQTLWKWDLLTKQFITYM | 60 |
| PVYQGWWDTLTKLYIWDG | 61 |
| WLDGGWRDPLIKRSVQLG | 62 |
| GHQQFKWDLLTKQWVQSN | 63 |
| ORVGQFWDVLTKMFITGS | 64 |
| QAQGWSYDALIKTWIRWP | 65 |
| GWMHWKWDPLTKQALPWM | 66 |
| GHPTYKWDLLTKQWILQM | 67 |
| WNNWSLWDPLTKLWLQQN | 68 |
| WQWGWKWDLLTKQWVQQQ | 69 |
| GQMGWRWDPLTKMWLGTS | 70 |
Zauważono, że znane receptory TALL-1 wykazują pewną homologiczność sekwencji z korzystnymi peptydami:
12-3 LPGCKWDLLIKOWVCDPL
BAFFR MRRGPRSLRGRDAPVPTPCVPTECYDLLVRKCVDCRLL
TACI TICNHQSQRTCAAFCRSLSCRKEQGKFYDHLLRDCISCASI
BCMA FVSPSQEIRGRFRRMLQMAGQCSQNEYFDSLLHACIPCQLRC (odpowiednio, SEQ ID NO: 33, 195, 196 oraz 197).
Dowolny peptyd zawierający resztę cysteiny Iową można połączyć wiązaniem sieciującym z innym peptydem zawierającym resztę Cys, z których dowolny lub obydwa mogą być połączone z podłożem. Dowolny peptyd zawierający więcej niż jedną resztę Cys może również tworzyć wewnątrzpeptydowe wiązanie dwusiarczkowe. Każdy z tych peptydów może być zderywatyzowany w sposób niżej opisany.
Dodatkowe użyteczne sekwencje peptydów mogą być wynikiem konserwatywnych (zachowawczych) i/lub niekonserwatywnych (niezachowawczych) modyfikacji sekwencji aminokwasowych podanych w tablicy 2.
Konserwatywne (zachowawcze) modyfikacje mogą dawać peptydy zawierające funkcjonalne i chemiczne właściwości podobne do własności peptydów, które poddano takim modyfikacjom. W przeciwieństwie do tego, zasadnicze modyfikacje funkcjonalnych i/lub chemicznych charakterystyk peptydów można uzyskać w wyniku doboru podstawień w sekwencji aminokwasowej, które dają zaPL 210 546 B1 sadniczo różny wpływ na zachowanie (a) struktury szkieletu cząsteczki w obszarze podstawiania, przykładowo konformacji w formie arkusza lub helisy, (b) ładunku lub hydrofobowości cząsteczki w danym miejscu lub (c) rozmiarów (wielkości) cząsteczki.
Przykładowo, „konserwatywne podstawienie aminokwasu” może obejmować podstawienie natywnej reszty aminokwasowej resztą nie natywną taką, że ma jedynie niewielki wpływ lub nie ma żadnego wpływu na polarność lub ładunek reszty aminokwasowej w tej pozycji. Ponadto, dowolna natywna reszta w polipeptydzie może również być podstawiona alaniną, jak uprzednio opisano w odniesieniu do „mutagenezy skanowania alaniną” (patrz, przykładowo, Mac-Lennan i wsp., 1998, Acta Physiol. Scand. Suppl. 643: 55-67; Sasaki i wsp., 1998, Adv. Biophys. 35: 1-24, gdzie omówiono mutagenezę skanowania alaniną).
Biegli w sztuce mogą ustalić pożądane podstawienia aminokwasowe (zarówno konserwatywne, jak też nie konserwatywne), gdy takie podstawniki okażą się pożądane. Przykładowo, podstawienia aminokwasowe można wykorzystać do identyfikacji ważnych reszt sekwencji peptydu lub w celu zwiększenia lub obniżenia powinowactwa peptydu lub cząsteczek podłoże-peptyd (patrz poprzednie wzory). Przykładowe podstawienia aminokwasowe podano w tablicy 3.
T a b l i c a 3
Podstawienia aminokwasowe
| Oryginalne reszty | Przykładowe podstawienia | Korzystne podstawienia |
| Ala (A) | Val, Leu, Ile | Val |
| Arg (R) | Lys, Gin, Asn | Lys |
| Asn(N) | Gin | Gin |
| Asp(D) | Glu | Glu |
| Cys (C) | Ser, Ala | Ser |
| Gin (Q) | Asn | Asn |
| Glu (E) | Asp | Asp |
| Gly (G) | Pro, Ala | Ala |
| His (H) | Asn, Gin, Lys, Arg | Arg |
| Ile (I) | Leu, Val, Met, Ala, Phe, norleucyna | Leu |
| Leu (L) | norleucyna, Ile, Val, Met, Ala, Phe | Ile |
| Lys (K) | Arg, kwas 1,4-diaminobutyrowy, Gin, Asn | Arg |
| Met (M) | Leu, Phe, Ile | Leu |
| Phe (F) | Leu, Val, Ile, Ala, Tyr | Leu |
| Pro (P) | Ala | Gly |
| Ser (S) | Thr, Ala, Cys | Thr |
| Thr (T) | Ser | Ser |
| Trp (W) | Tyr, Phe | Tyr |
| Tyr (Y) | Trp, Phe, Thr, Ser | Phe |
| Val (V) | Ile, Met, Leu, Phe, Ala, norleucyna | Leu |
W pewnych wykonaniach, konserwatywne podstawienia aminokwasowe również obejmują nie występujące naturalnie reszty aminokwasowe, które typowo są raczej wprowadzane w toku chemicznej syntezy peptydów niż w wyniku syntez w systemach biologicznych.
Jak zauważono we wcześniejszej sekcji „Definicje”, reszty pochodzenia naturalnego mogą być podzielone na klasy w oparciu o wspólne właściwości łańcuchów bocznych, które mogą być użyteczne przy modyfikowaniu sekwencji. Przykładowo, nie zachowawcze podstawienia mogą obejmować wy18
PL 210 546 B1 mianę członu przynależnego do jednej z tych klas na człon z innej klasy. Tak podstawione reszty mogą być wprowadzone do obszarów peptydów homologicznych z nieludzkimi ortologami lub do nie homologicznych obszarów danej cząsteczki. Ponadto, można również wprowadzać modyfikacje stosując P lub G w celu wpływania na orientację łańcucha.
Przy wprowadzaniu takich modyfikacji, można brać pod uwagę hydropatyczny współczynnik aminokwasów. Każdemu aminokwasowi przypisano współczynniki hydropatyczny na podstawie właściwej mu charakterystyki hydrofobowości i ładunku, a mianowicie: izoleucyna (+4,5), walina (+4,2), leucyna (+3,8), fenyloalanina (+2,8), cysteina/cystyna (+2,5), metionina (+1,9), alanina (+1,8), glicyna (-0,4), treonina (-0,7), seryna (-0,8), tryptofan (-0,9), tyrozyna (-1,3), prolina (-1,6), histydyna (-3,2), kwas glutaminowy (-3,5), glutamina (-3,5), kwas asparaginowy (-3,5), asparagina (-3,5), lizyna (-3,9) oraz arginina (-4,5).
W tej dziedzinie docenia się wagę współczynnika (indeksu) hydropatycznego aminokwasów przy potwierdzaniu interaktywnego biologicznego działania białka. Kyte i wsp., J. Mol. Biol., 157: 105-131 (1982). Wiadomo, że pewne aminokwasy mogą być podstawione za inne aminokwasy posiadające podobny współczynnik hydropatyczny lub wynik, a mimo to zachowana jest podobna aktywność biologiczna. Przy dokonywaniu zmian w oparciu o indeks hydropatyczny, korzystne są podstawienia aminokwasów o współczynnikach hydropatycznych ± 2, a zwłaszcza ± 1, a jeszcze korzystniej ± 0,5.
W tej dziedzinie wiadomo również, że podstawienie podobnych aminokwasów może być wykonane skutecznie w oparciu o hydrofilowość. Największa lokalna przeciętna hydrofilowość białka, na którą wpływa hydrofilowość sąsiednich aminokwasów, koreluje z jego immunogenicznością i antygenicznością, to znaczy z biologicznymi własnościami proteiny.
Resztom aminokwasowym przypisano następujące wartości hydrofilowości: arginina (+3,0), lizyna (+3,0), asparaginian (+3,0 ± 1), glutaminian (+3,0 ± 1), seryna (+0,3), asparagina (+0,2), glutamina (+0,2), glicyna (0), treonina (-0,4), prolina (-0,5 ± 1), alanina (-0,5), histydyna (-0,5), cysteina (-1,0), metionina (-1,3), walina (-1,5), leucyna (-1,8), izoleucyna (-1,8), tyrozyna (-2,3), fenyloalanina (-2,5), tryptofan (-3,4). Przy dokonywaniu zmian w oparciu o podobne wartości hydrofilowości, korzystne są podstawienia aminokwasów o wartościach ± 2, a zwłaszcza ± 1, a jeszcze korzystniej ± 0,5. Można również zidentyfikować epitopy z pierwszorzędowych sekwencji aminokwasowych na podstawie hydrofilowości. Te regiony określane są również terminem „epitopowe regiony rdzeniowe”.
Biegli w sztuce będą mogli określić odpowiednie warianty polipeptydu określonego wcześniej podanymi sekwencjami stosując dobrze znane techniki. W celu identyfikacji odpowiednich obszarów molekuł, które mogą być zmienione bez zniszczenia aktywności, biegły w sztuce może wytypować obszary uważane za nieistotne z punktu widzenia aktywności. Przykładowo, kiedy znane są podobne polipeptydy o podobnej aktywności pochodzące z tego samego gatunku lub od innych gatunków, biegły w sztuce może porównać sekwencję aminokwasową peptydu z podobnymi peptydami. Po takim porównaniu można zidentyfikować reszty i części cząsteczek, które występują w podobnych polipeptydach. Zostanie dostrzeżone, że zmiany w obszarach peptydu, które nie stanowią obszarów zachowawczych w stosunku do tych podobnych peptydów, powinny - z mniejszym prawdopodobieństwem - wpływać na aktywność biologiczną i/lub strukturę danego peptydu. Biegły w sztuce powinien również wiedzieć, że nawet w relatywnie zachowawczych regionach, można podstawić chemicznie podobne aminokwasy za reszty występujące w przyrodzie, z zachowaniem aktywności (konserwatywne podstawienia reszt aminokwasowych). Tak więc, nawet obszary, które mogą być ważne dla aktywności biologicznej lub struktury mogą podlegać konserwatywnym podstawieniom aminokwasów bez zniszczenia aktywności biologicznej lub bez niekorzystnego wpływu na strukturę peptydu.
Ponadto, biegły w sztuce może dokonać przeglądu badań nad związkami funkcji i struktury, identyfikując w podobnych peptydach reszty ważne dla aktywności biologicznej lub dla struktury. W świetle takiego porównania, można przewidzieć wagę reszt aminokwasowych w peptydzie, odpowiadających resztom aminokwasowym ważnym z punktu widzenia aktywności lub budowy podobnych peptydów. Biegły w sztuce może dokonać wyboru i wskazać chemicznie podobne podstawienia aminokwasowe dla takich dających się przewidzieć, ważnych reszt aminokwasowych (modyfikowanych) peptydów.
Biegły w sztuce może również przeprowadzić analizę trójwymiarowej struktury oraz sekwencji aminokwasowej w porównaniu z trójwymiarową strukturą podobnych polipeptydów. W świetle uzyskanych informacji biegły w sztuce może przewidzieć ustawienie reszt aminokwasowych peptydu względem jego trójwymiarowej struktury. Biegły w sztuce może dokonać wyboru niedokonywania radykalnych zmian w odniesieniu do reszt aminokwasowych, co do których można przewidywać, że występuPL 210 546 B1 ją na powierzchni proteiny, ponieważ takie reszty mogą być zaangażowane w ważne oddziaływaniami z innymi molekułami. Ponadto, biegły w sztuce może generować testowe odmiany zawierające pojedyncze podstawienie aminokwasowe przy każdej wybranej reszcie aminokwasowej. Odmiany mogą być następnie poddane skriningowi przy użyciu prób na aktywność znanych biegłym w sztuce. Takie dane mogłyby być użyte do gromadzenia informacji o odpowiednich wariantach. Przykładowo, gdyby się okazało, że zmiana przy określonej reszcie aminokwasowej powoduje zniszczenie, niepożądane obniżenie lub nieodpowiednią aktywność, odmian z taką zmianą należałoby unikać. Innymi słowy, w oparciu o informacje zebrane na podstawie takich rutynowych eksperymentów, biegły w sztuce może z łatwością ustalić aminokwasy, przy których należy unikać dalszych podstawień zarówno występujących samodzielnie, jak i w kombinacji z innymi mutacjami.
Wiele naukowych publikacji poświęcono przewidywaniu drugorzędowej struktury. Patrz: Moult J., Curr. Op. in Biotech., 7 (4): 422-427 (1996), Chou i wsp., Biochemistry. 13 (2): 222-245 (1974); Chou i wsp., Biochemistry. 113 (2): 211-222 (1974); Chou i wsp., Adv. Enzymol. Relat. Areas Mol. Biol., 47: 45-148 (1978); Chou i wsp., Ann. Rev. Blochem., 47: 251-276 oraz Chou i wsp., Biophys. J., 26: 367-384 (1979). Ponadto, obecnie dostępne są programy komputerowo wspomagające przewidywanie drugorzędowej struktury. Jedna z metod przewidywania drugorzędowej struktury oparta jest o modelowanie homologii. Przykładowo, dwa polipeptydy lub proteiny, które w stopniu większym niż 30% wykazują identyczność sekwencję, albo podobieństwo w stopniu większym niż w 40%, mają często podobne topologie strukturalne. Obserwowany ostatnio rozwój baz danych dotyczących struktury białek (PDB) zapewnia zwiększoną przewidywalność struktury drugorzędowej, łącznie z ilością potencjalnych fałdowań w obrębie struktury polipeptydu lub białka. Patrz Holm i wsp., Nucl. Acid. Res., 27 (1): 244-247 (1999). Zasugerowano (Brenner i wsp., Curr. Op. Struct. Biol., 7 (3): 369-376 (1997)), że jest ograniczona ilość fałd w danym polipeptydzie lub proteinie oraz że jeśli krytyczna ilość struktur zostanie rozwiązana przewidywania struktury zyskają dramatycznie na dokładności.
Dodatkowe metody przewidywania drugorzędowej struktury obejmują „tkanie (threading)” (Jones, D., Curr. Opin. Struct. Biol., 7 (3): 377-87 (1997); Sippl i wsp., Structure, 4 (1): 15-9 (1996)), „analiza profilowa (profile analysis)” (Bowie i wsp., Science, 253: 164-170 (1991); Gribskov i wsp., Meth. Enzym., 183: 146-159 (1990); Gribskov i wsp., Proc. Nat. Acad. Sci., 84 (13): 4355-8 (1987)), oraz „ewolucyjne łączenie (evolutionary linkage)” (patrz Home, jak wyżej, oraz Brenner, jak wyżej).
Podłoża
Zgodnie z obecnym wynalazkiem wymagana jest obecność co najmniej jednego podłoża (V1) przyłączonego do peptydu, do jego N-końca lub C-końca lub do łańcucha bocznego jednej z reszt aminokwasowych. Można stosować również wiele podłoży, mogą przykładowo podłoża Fc być przyłączone do każdego końca lub podłoże Fc - przy jednym końcu, a grupa PEG przy drugim końcu lub przy łańcuchu bocznym. Do przykładowych podłoży należą:
• domena Fc;
• inne proteiny, polipeptydy lub peptydy zdolne do wiązania z receptorem ratunkowym (salvage receptor);
• albumina ludzkiej surowicy (HSA);
• suwakowa domena leucynowa (leucine zipper - LZ);
• glikol polietylenowy (PEG), w tym PEG o wymiarach 5 kD, 20 kD, oraz 30 kD oraz inne polimery;
• dekstran;
oraz inne cząsteczki, o których powszechnie wiadomo, że wydłużają okres półtrwania oraz zapewniają ochronę przed degradacją proteolityczną i usuwaniem z organizmu.
Korzystnym podłożem jest domena Fc. Domena Fc może być przyłączona w wyniku fuzji do końców N lub C peptydów, bądź do obu końców N i C. Fuzja do N-końca jest korzystna.
Jak wskazano wyżej, zgodnie z obecnym wynalazkiem odmiany Fc są odpowiednimi podłożami. Możliwa jest ekstensywna modyfikacja natywnego Fc z wytworzeniem odmiany Fc zgodnie z obecnym wynalazkiem, pod warunkiem zachowania zdolności wiązania do receptora ratunkowego; patrz, przykładowo WO 97/34631 oraz WO 96/32478. W takich odmianach Fc, można usunąć jedno lub więcej miejsc właściwych natywnemu Fc, zapewniających cechy strukturalnie lub funkcjonalną aktywność, zbędne w przypadku cząsteczek fuzyjnych według obecnego wynalazku. Można usuwać te miejsca przez, przykładowo, podstawienie lub usunięcie reszt, wstawienie reszt do miejsca lub obcięcie części obejmującej dane miejsce. Wstawionymi lub podstawionymi resztami mogą być również zmienione aminokwasy, takie jak peptydomimetyki lub D-aminokwasy.
PL 210 546 B1
Odmiany Fc mogą być również pożądane dla wielu powodów, z których kilka opisano poniżej. Przykładowe odmiany Fc obejmują cząsteczki oraz sekwencje w których:
1. Usunięte zostały miejsca zaangażowane w tworzenie wiązań (mostków) dwusiarczkowych. Takie usunięcie pozwala uniknąć reakcji z innymi proteinami zawierającymi cysteinę występującymi w komórce gospodarza, stosowanej do wytwarzania cząsteczek według obecnego wynalazku. W tym celu, segment zawierający cysteinę przy N-końcu może być obcięty lub reszty cysteinowe mogą być usunięte lub podstawione przez inne reszty aminokwasowe (przykładowo alanyl, seryl). W szczególności, można obciąć N-końcowy 20-aminokwasowy segment w sekwencji SEQ ID NO: 2 lub usunąć, bądź podstawić reszty cysteinowe w pozycjach 7 i 10 w sekwencji SEQ ID NO: 2. Nawet, gdy reszty cysteinowe zostaną usunięte, jednołańcuchowa domena Fc może nadal wytworzyć dimeryczną domenę Fc, spojoną nie kowalencyjnie.
2. Natywna domena Fc została zmodyfikowana tak, by poprawić kompatybilność z wybraną komórką gospodarza. Przykładowo, można usunąć sekwencję PA przy N-końcu typowej natywnej domeny Fc, rozpoznawaną przez trawiący enzym w E. coli, taki jak iminopeptydaza prolinowa. Można również dodać resztę metioninową przy N-końcu, zwłaszcza gdy cząsteczka podlega rekombinacyjnej ekspresji w komórce bakteryjnej takiej jak E. coli. Domena Fc w sekwencji SEQ ID NO: 2 stanowi jedną z takich odmian Fc.
3. Część N-końca natywnego Fc została usunięta w celu zapobieżenia N-końcowej heterogeniczności podczas ekspresji w wybranej komórce gospodarza. W tym celu, dowolna spośród pierwszych 20 reszt aminokwasowych przy N-końcu może być usunięta, zwłaszcza reszty w pozycjach 1, 2, 3, 4 oraz 5.
4. Jedno lub więcej miejsc glikozylacji zostało usunięte. Reszty, które w typowych warunkach ulegają glikozylacji (przykładowo asparagina) mogą być odpowiedzialne za odpowiedź cytolityczną. Takie reszty mogą być usunięte lub podstawione nieglikozylowanymi resztami (przykładowo alaniną).
5. Miejsca biorące udział w interakcjach z komplementem, takie jak miejsce wiążące Clq zostały usunięte. Przykładowo, można usunąć lub podstawić sekwencję EKK ludzkiego IgG1. Dobór komplementu może nie być korzystny dla molekuł według obecnego wynalazku i można tego uniknąć stosując opisaną odmianę Fc.
6. Miejsca mające wpływ na wiązanie z receptorami Fc innymi niż receptor ratunkowy. Natywna domena Fc może zawierać miejsca do oddziaływań z pewnymi białymi krwinkami, zbędne w przypadku cząsteczek fuzyjnych według obecnego wynalazku i mogą być zatem usunięte.
7. Usunięte zostało miejsce ADCC. Miejsca ADCC są znane; patrz, przykładowo, Molec. Immunol. 29 (5): 633-9 (1992) w związku z miejscami ADCC w IgG1. Miejsca te także są zbędne w przypadku molekuł fuzyjnych według obecnego wynalazku, mogą zatem być usunięte.
8. Gdy natywna domena Fc pochodzi z przeciwciała nie ludzkiego, domena Fc może być poddana humanizacji. Typowo w celu humanizacji natywnego Fc można podstawić wybrane reszty w innej niż ludzka natywna domena Fc resztami, które normalnie występują w natywnej ludzkiej domenie Fc. Techniki humanizacji przeciwciała są dobrze znane biegłym w sztuce.
Korzystne odmiany Fc obejmują następujące sekwencje: w SEQ ID NO: 2 (rysunek fig. 3), leucyna w pozycji 15 może być podstawiona glutaminianem, glutaminian w pozycji 99 - alaniną, a lizyny w pozycjach 101 i 103 - alaninami. Ponadto, jedna lub więcej niż jedna spośród reszt tyrozynowych może być zastąpiona resztami fenyalaninowymi.
Alternatywnymi podłożami mogłyby być białko, polipeptyd, peptyd, przeciwciało, fragment przeciwciała lub mała molekuła (przykładowo związek peptydomimetyczny) zdolna do wiązania z receptorem ratunkowym. Przykładowo, można użyć w charakterze podłoża polipeptyd opisany w patencie nr US 5 739 277 wydanym 14 kwietnia 1998 na rzecz Presta i wsp. Peptydy mogłyby również być wybrane przez prezentację fagową lub skrining układów RNA-peptyd pod kątem wiązania do receptora ratunkowego FcRn. Takie związki wiążące się z receptorem ratunkowym są również objęte terminem „podłoże” i leżą w zakresie obecnego wynalazku. Takie podłoża powinny być wybrane w celu zwiększenia okresu półtrwania (przykładowo, dzięki unikaniu sekwencji rozpoznawanych przez proteazy) i obniżenia immunogeniczności (przykładowo dzięki uprzywilejowaniu nie immunogenicznych sekwencji, jak to stwierdzono w przypadku humanizacji przeciwciał).
Jak zauważono powyżej, jako V1 można także stosować podłoża polimerowe. Obecnie dostępne są różne środki do przyłączania chemicznych ugrupowań przydatnych w charakterze podłoża, patrz, przykładowo publikacja nr WO 96/11953, dokonana zgodnie z układem o współpracy patentowej (PCT), zatytułowana „Kompozycje zawierające N-końcowo, chemicznie modyfikowane białka oraz
PL 210 546 B1 sposoby” („N-Terminally Chemically Modified Protein Compositions and Methods”). Ta publikacja PCT ujawnia, poza innymi zagadnieniami, selektywne przyłączanie rozpuszczonych w wodzie polimerów do N-końców białek.
Korzystnym podłożem polimerowym jest glikol polietylenowy (PEG). Grupa PEG może mieć dowobią dogodną masę cząsteczkową i może mieć charakter liniowy lub rozgałęziony. Korzystny przedział wartości masy cząsteczkowej PEG zawiera się w granicach od około 2 kilodaltonów („kD”) do około 100 kD, korzystniej od około 5 kD do około 50 kD, najkorzystniej od około 5 kD do około 10 kD. Grupy PEG będą zasadniczo przyłączane do związków według obecnego wynalazku na drodze acylowania lub redukcyjnego alkilowania z udziałem reaktywnej grupy obecnej w reszcie PEG (przykładowo grupy aldehydowej, aminowej, tiolowej lub estrowej) oraz reaktywnej grupy obecnej w związku według wynalazku (przykładowo grupy aldehydowej, aminowej lub estrowej).
Strategia przydatna przy PEGylowaniu syntetycznych peptydów polega na łączeniu - przez tworzenie skoniugowanego połączenia w roztworze, peptydu i PEG, z których każdy posiada specjalną grupę funkcyjną zdolną do reakcji z grupą obecną w drugim reagencie. Takie peptydy można z łatwością wytworzyć znaną metodą syntezy w fazie stałej. Takie peptydy są „wstępnie aktywowane” przez wprowadzenie odpowiedniej grupy funkcyjnej w określone miejsce. Prekursory poddaje się oczyszczeniu i ustala się ich pełną charakterystykę przed poddaniem reakcji z resztą PEG. Ligowanie peptydu z użyciem PEG zwykle zachodzi w fazie wodnej i może być z łatwością monitorowane stosując analityczną chromatografię HPLC z odwróconymi fazami. PEGylowane peptydy można z łatwością oczyszczać stosując preparatywną chromatografię HPLC i scharakteryzować wykorzystując analityczną chromatografię HPLC, analizę aminokwasów i laserową desorpcyjną spektrometrię masową.
Polimery polisacharydowe są innym rodzajem rozpuszczalnych w wodzie polimerów, które można stosować w celu modyfikacji białek. Dekstrany są polimerami polisacharydowymi zbudowanymi z poszczególnych podjednostek glukozy, połączonych w przeważającej mierze wiązaniami α1-6. Sam dekstran cechuje się szerokim wachlarzem wartości masy cząsteczkowej i łatwo dostępne są jego formy o masie cząsteczkowej od około 1 kD do około 70 kD. Dekstran jest odpowiednim polimerem rozpuszczalnym w wodzie do stosowania w obecnym wynalazku jako podłoże samodzielnie lub w połączeniu z innym podłożem (przykładowo Fc). Patrz, przykładowo, WO 96/11953 oraz WO 96/05309. Opisano już stosowanie dekstranu w połączeniu z immunoglobulinami terapeutycznymi lub diagnostycznymi; patrz, przykładowo publikacja nr EP 0 315 456. Gdy dekstran jest stosowany jako podłoże zgodnie z obecnym wynalazkiem, korzystnie jest to dekstran o masie około 1 kD do około 20 kD.
Linkery
Grupa „linkera” jest grupą opcjonalną. Gdy jest obecna, jej budowa chemiczna nie ma charakteru krytycznego, ponieważ służy ona przede wszystkim jako element dystansujący. Korzystnie, linker jest zbudowany z aminokwasów połączonych wiązaniami peptydowymi. A więc, w korzystnych wykonaniach, linker zbudowany jest z 1 do 30 aminokwasów połączonych wiązaniami peptydowymi, przy czym aminokwasy są wybrane spośród 20 występujących w przyrodzie aminokwasów. Niektóre z tych aminokwasów mogą być glikozylowane, co jest w pełni zrozumiałe dla znawców tej dziedziny. W korzystniejszym wykonaniu, każdy z 1 do 20 aminokwasów jest wybrany z grupy obejmującej: glicynę, alaninę, prolinę, asparaginę, glutaminian, i lizynę. Jeszcze korzystniej, linker zbudowany jest w większości z aminokwasów wolnych od zawad sferycznych, takich jak glicyna and alanina. Tak więc, korzystnymi linkerami są poliglicyny (szczególnie (Gly)4, (Gly)5, poli(Gly-Ala) oraz polialaniny. Innymi szczególnymi przykładami linkerów są:
(Gly)3Lys(Gly)4 (Gly)3AsnGlySer(Gly)2 (Gly)3Cys(Gly)4
GlyProAsnGlyGly (SEQ ID NO: 40), (SEQ ID NO: 41), (SEQ ID NO: 42), (SEQ ID NO: 43).
Dla wyjaśnienia powyższej nomenklatury, przykładowo: (Gly)3Lys(Gly)4 oznacza Gly-Gly-Gly-Lys-Gly-Gly-Gly-Gly (SEQ ID NO: 40). Kombinacje Gly oraz Ala są również korzystne. Przedstawione tutaj linkery są jedynie przykładami; linkery wchodzące w zakres obecnego wynalazku mogą być dużo dłuższe i mogą obejmować także inne reszty.
Korzystnymi linkerami są linkery aminokwasowe obejmujące więcej niż 5 aminokwasów, przy czym odpowiednie linkery zawierają do około 500 aminokwasów wybranych spośród aminokwasów,
PL 210 546 B1 takich jak: glicyna, alanina, prolina, asparagina, glutaminian, lizyna, treonina, seryna lub asparaginian. Najkorzystniejsze są linkery od około 20 do 50 aminokwasów. Jedną grupę korzystnych linkerów stanowią linkery o wzorze:
GSGSATGGSGSTASSGSGSATx1x2 (SEQ ID NO: 193) oraz
GSGSATGGSGSTASSGSGSATx1x2GSGSATGGSGSTASSGSGSATx3x4(SEQ ID NO: 194) gdzie x1 oraz x2 oznaczają, każdy niezależnie, resztę zasadową lub hydrofobową a x3 oraz x4 oznaczają, każdy niezależnie, reszty hydrofobowe. Szczególnie korzystnymi linkerami są:
GSGSATGGSGSTASSGSGSATHM (SEQ ID NO: 59),
GSGSATGGSGSTASSGSGSATGM (SEQ ID NO: 190),
GSGSATGGSGSTASSGSGSATGS (SEQ ID NO: 191), oraz
GSGSATGGSGSTASSGSGSATHMGSGSATGGSGSTASSGSGSATHM (SEQ ID NO: 192).
Nie peptydowe linkery są również możliwe. Przykładowo, mogłyby być wykorzystane linkery alkilowe takie jak -NH-(CH2)s-C(O)-, gdzie s = 2-20. Te linkery alkilowe mogą być dodatkowo podstawione przez dowolną grupę nie stanowiącą zawady sterycznej, taką jak niższy alkil (przykładowo C1-C6) niższy acyl, chlorowiec (przykładowo Cl, Br), CN, NH2, fenyl i tp. Przykładem nie peptydowego linkera jest linker PEG o wzorze VII
w którym n przyjmuje taką wartość, że linker posiada masę cząsteczkową od 100 do 5000 kD, korzystnie 100 do 500 kD. Linkery peptydowe mogą być zmieniane, z wytworzeniem pochodnej, w ten sam sposób jak opisano powyżej.
Pochodne
Obecni wynalazcy uwzględnili również derywatyzację związków według wynalazku w części peptydowej i/lub części stanowiącej podłoże. Takie pochodne mogę poprawiać rozpuszczalność związków, absorpcję, okres biologicznego półrozpadu i temu podobne. Wprowadzane w ten sposób ugrupowania mogą alternatywnie eliminować lub osłabiać wszelkie niepożądane efekty uboczne tych związków i odgrywać tym podobne role. Przykładowe pochodne obejmują związki, w których:
1. Cały związek lub pewna jego część ma budowę cykliczną. Przykładowo, część peptydu może być modyfikowana tak, że zawiera dwie lub więcej niż dwie reszty Cys (przykładowo, w linkerze), które mogą cyklizować przez utworzenie wiązania dwusiarczkowego.
2. Związek jest połączony wiązaniem sieciującym lub zmodyfikowany tak, że jest zdolny utworzyć wiązanie sieciujące między różnymi cząsteczkami. Przykładowo, część peptydowa może być modyfikowana tak, aby zawierała jedną resztę Cys i skutkiem tego mogła utworzyć międzycząsteczkowe wiązanie dwusiarczkowe z drugą podobną cząsteczką. Związek może również być związany wiązaniem sieciującym utworzonym przez jego C-koniec, jak w cząsteczce o wzorze VIII, przedstawionej poniżej:
PL 210 546 B1
We wzorze VIII, każdy fragment „V1” może typowo reprezentować jednoniciowe domeny Fc.
3. Jedno lub więcej niż jedno peptydylowe [-C(O)NR-] połączenie (wiązanie) jest zastąpione przez połączenie nie peptydylowe. Przykładami nie peptydylowych połączeń są: -CH2-karbaminian [-CH2-OC(O)NR-], fosfonian, -CH2-sulfonamid [-CH2-S(O)2NR-], mocznik [-NHC(O)NH-], -CH2-drugorzędowa amina oraz alkilowany peptyd [-C(O)NR6-, gdzie R6 oznacza niższy alkil].
4. N-koniec jest zderywatyzowany. W typowym przypadku, N-koniec może być zacylowany lub zmodyfikowany do podstawionej aminy. Przykłady pochodnych N-końcowych grup obejmują: -NRR1 (inne niż -NH2), -NRC(O)R1, -NRC(O)OR1, -NRS(O)2R1, -NHC(O)NHR,1 imid kwasu bursztynowego, lub benzyloksykarbonylo-NH-(CBZ-NH-), gdzie R oraz R1 oznaczają, każdy niezależnie, wodór lub niższy alkil i gdzie pierścień fenylowy może być podstawiony przez 1 do 3 podstawników wybranych z grupy obejmującej: C1-C4 alkil, C1-C4 alkoksy, chloro oraz bromo.
5. Wolny C-koniec jest zderywatyzowany. W typowym przypadku C-koniec jest zestryfikowany lub zamidowany. Przykłady grup pochodnych grup C-końcowych obejmują, przykładowo, -C(O)R2, gdzie R2 oznacza niższą grupę alkoksy lub -NR3R4, gdzie R3 oraz R4 oznaczają, każdy niezależnie, wodór lub C1-C8 alkil (korzystnie C1-C4 alkil).
6. Wiązanie dwusiarczkowe jest zastąpione innym, korzystnie bardziej stabilnym, ugrupowaniem zdolnym do tworzenia wiązań sieciujących (przykładowo alkilenem). Patrz, przykładowo, Bhatnagar i wsp. (1996), J. Med. Chem. 39: 3814-9; Alberts i wsp. (1993) Thirteenth Am. Pep. Svmp., 357-9.
7. Jedna lub więcej niż jedna pojedyncza reszta aminokwasowa jest zmodyfikowana. Znane są różne środki derywatyzujące, zdolne do reakcji z wybranymi łańcuchami bocznymi lub grupami końcowymi, jak szczegółowo opisano poniżej.
Reszty lizynylowe i końcowe grupy aminowe mogą być poddane reakcji z bezwodnikiem bursztynowym lub bezwodnikami innych kwasów karboksylowych, które odwracają ładunek reszt lizynylowych. Iime stosowne reagenty do derywatyzowania reszt zawierających grupy alfa-aminowe obejmują imidoestry takie jak metylopikolinoimidan; fosforan pirydoksalu; pirydoksal; chloroborowodorek; kwas trinitrobenzenosulfonowy; O-metyloizomocznik; 2,4 pentanodion; a także reakcja z glioksalanem katalizowana przez transaminazę.
Reszty arginylowe mogą być modyfikowane na drodze reakcji z dowolnym znanym reagentem lub z kombinacją konwencjonalnych reagentów, do których zalicza się fenyloglioksal, 2,3-butanodion, 1,2-cykloheksanodion oraz ninhydrynę. Derywatyzacja reszt arginylowych wymaga prowadzenia reakcji w środowisku alkalicznym z uwagi na dużą wartość pKa guanidynowej grupy funkcyjnej. Ponadto, reagenty te mogą reagować z grupami lizyny, jak również grupą epsilon-aminową argininy.
Obszernie badano specyficzne modyfikacje reszt tyrozylowych, ze szczegóbiym uwzględnieniem wprowadzania spektralnych znaczników do reszt tyrozylowych na drodze reakcji z aromatycznymi związkami dwuazoniowymi lub z tetranitrometanem. Najpowszechniej, N-acetyloimidizol oraz tetranitrometan są stosowane do otrzymywania, odpowiednio, układów O-acetylotyrozylowych i 3-nitropochodnych.
Grupy karboksylowe z łańcuchów bocznych (aspartyl lub glutamyl) mogą być selektywnie modyfikowane na drodze reakcji z karbodiimidami (R'-N=C=N-R'), takimi jak 1-cykloheksylo-3-(2-morfolinylo-(4-etylo)karbodiimid lub 1-etylo-3-(4-azonia-4,4-dimetylopentylo)karbodiimid. Ponadto, reszty aspartylowa i glutamylowa mogą być przekształcone w reszty asparaginylowe i glutaminylowe na drodze reakcji z jonami amonowymi.
Reszty glutaminylową i asparaginylową można zdeaminować do odpowiednich reszt glutamylowej i aspartylowej. Alternatywnie, reszty te są deaminowane w średnio kwaśnych warunkach. Każda z postaci tych reszt jest objęta zakresem obecnego wynalazku.
Reszty cysteinylowe mogą być zastąpione przez reszty aminokwasowe lub inne ugrupowania, bądź to w celu eliminowania możliwości tworzenia wiązań dwusiarczkowych lub odwrotnie - w celu stabilizowania wiązań sieciujących. Patrz, przykładowo, Bhatnagar i wsp. (1996), J. Med. Chem. 39: 3814-9.
Derywatyzacja przy użyciu środków dwufunkcyjnych jest użyteczna w celu utworzenia wiązania sieciującego między peptydami lub ich funkcjonalnymi pochodnymi i nierozpuszczalnymi w wodzie matrycami lub innymi makromolekularnymi nośnikami. Powszechnie wykorzystywane środki sieciujące obejmują, przykładowo: 1,1-bis(diazoacetylo)-2-fenyloetan, aldehyd glutarowy, estry N-hydroksybursztynoimidowe, przykładowo estry kwasu 4-azydosalicylowego, homobifunkcyjne imidoestry, obejmujące estry dibursztynoimidylowe takie, jak 3,3'-ditiobis(bursztynoimidylopropionian) oraz bifunkcyjne imidy kwasu maleinowego, takie jak bis-N-maleimido-1,8-oktan. Środki derywatyzujące, takie jak me24
PL 210 546 B1 tylo-3-[(p-azydofenylo)ditio]propioimidan prowadzą do wytworzenia związków pośrednich ulegających fotoaktywacji, zdolnych do sieciowania w obecności światła. Alternatywnie, reaktywne matryce nierozpuszczalne w wodzie takie jak węglowodany aktywowane bromkiem dwucyjanu oraz reaktywne substraty opisane w patentach US nr 3 969 287; US nr 3 691 016; US nr 4 195 128; US nr 4 247 642; US nr 4 229 537 oraz US nr 4 330 440 wykorzystuje się do związania i unieruchomienia białek.
Grupy węglowodanowe (oligosacharydy) można dogodnie przyłączać do miejsc znanych jako miejsca glikozylacji w białkach. Ogólnie, połączenia oligosacharydów przez atom tlenu występują w przypadku reszt serynowych (Ser) lub treoninowych (Thr), podczas gdy połączenia oligosacharydów przez atom azotu występują w przypadku reszt asparaginowych (Asn), gdy są one częścią sekwencji Asn-X-Ser/Thr, gdzie X może być dowobym aminokwasem z wyjątkiem proliny. Korzystnie, X oznacza jeden z 19 występujących w przyrodzie aminokwasów innych niż prolina. Stwierdzono, że struktury N-połączonych oraz O-połączonych oligosacharydów i reszty cukrowe w każdym rodzaju są różne. Jednym rodzajem cukru spotykanym powszechnie w obu typach jest kwas N-acetyloneuraminowy (określany jako kwas sialowy). Kwas sialowy jest zwykle końcową resztą na oligosacharydach połączonych przez atom azotu oraz przez atom tlenu, a dzięki swemu negatywnemu ładunkowi, może nadawać właściwości kwasowe związkowi zglikozylowanemu. Takie miejsce(a) można wstawiać do linkerów związków według obecnego wynalazku i korzystnie glikozylacja następuje przez komórki podczas rekombinacyjnego wytwarzania związków polipeptydowych (przykładowo w komórkach ssaków takich jak CHO, BHK, COS). Jednakże, takie miejsca można dodatkowo glikozylować znanymi metodami syntetycznymi lub znanymi metodami semisyntetycznymi.
Inne możliwe modyfikacje obejmują hydroksylację proliny oraz lizyny, fosforylację grup hydroksylowych reszt serylowych lub treonylowych, utlenianie atomu siarki w Cys, metylowanie grup alfaaminowych w łańcuchach bocznych lizyny, argininy oraz histydyny. Creighton, Proteins: Structure and Molecule Properties (W. H. Freeman & Co., San Francisco), pp. 79-86 (1983).
Związki według wynalazku mogą być także zmieniane na poziomie DNA. Sekwencja DNA jakiejkolwiek części związku może być zmieniona na kodony bardziej kompatybilne z wybraną komórką gospodarza. W przypadku E. coli, która jest korzystną komórką gospodarza, znane są zoptymalizowane kodony. Kodony mogą być podstawione w celu eliminacji miejsc restrykcyjnych lub w celu włączenia uśpionych miejsc restrykcyjnych, które mogą wspomagać przetwarzanie DNA w wybranej komórce gospodarza. Sekwencje DNA podłoża, linkera oraz peptydu można zmodyfikować tak, aby obejmowały one dowolną spośród wymienionych wyżej zmian sekwencji.
Sposoby wytwarzania
Związki według obecnego wynalazku w znacznej mierze można wytworzyć w transformowanych komórkach gospodarza przy użyciu technik rekombinacyjnych DNA. Aby to zrealizować, przygotowuje się rekombinacyjną cząsteczkę DNA kodującą dany peptyd. Sposoby wytwarzania takich molekuł DNA są znane w stanie techniki. Przykładowo, sekwencje kodujące peptydy mogłyby być wycięte z DNA przy użyciu właściwych enzymów restrykcyjnych. Alternatywnie, cząsteczkę DNA można zsyntezować przy użyciu technik syntezy chemicznej, takich jak metoda fosforamidonowa. Można także wykorzystywać kombinacje tych technik.
Wynalazkiem objęty jest również wektor do ekspresji peptydów w odpowiednim gospodarzu. Wektor zawiera cząsteczkę DNA, kodującą peptydy operacyjnie połączone z właściwymi sekwencjami kontroli ekspresji. Dobrze znane są sposoby realizacji takiego powiązania operacyjnego przed albo po wstawieniu molekuły DNA do wektora. Sekwencje kontroli ekspresji obejmują promotory, aktywatory, czynniki usprawniające, operatory, rybosomowe miejsca wiążące, sygnały startowe, sygnały stopujące, sygnały nakładkowe, sygnały poliadenylacji oraz inne sygnały obejmujące kontrolę transkrypcji i translacji.
Otrzymany wektor z zawartą w nim cząsteczką DNA stosuje się w celu transformowania odpowiedniego gospodarza. Transformację taką można prowadzić stosując metody dobrze znane w stanie techniki.
Przy realizacji obecnego wynalazku można wykorzystać dowolną z dużej ilości dostępnych i dobrze znanych komórek gospodarzy. Wyselekcjonowanie szczególnego gospodarza zależy od wielu czynników znanych w stanie techniki. Obejmują one, przykładowo, kompatybilność z wybranym wektorem ekspresji, toksyczność peptydów kodowanych przez molekułę DNA, toksyczność peptydów kodowanych przez daną cząsteczkę DNA, szybkość transformacji, łatwość wyodrębniania uzyskanych peptydów, charakterystyki ekspresji, bezpieczeństwo biologiczne i koszty. Równowagi tych czynników należy szukać rozumiejąc, że nie wszystkie komórki gospodarza mogą być równie efektywne dla eksPL 210 546 B1 presji danej szczególnej sekwencji DNA. W ramach tych ogólnych wytycznych, użyteczne komórki gospodarza spośród drobnoustrojów obejmują: bakterie (takie jak gatunku E. coli), komórki drożdży (takich jak gatunku Sacharomyces) i innych grzybów, owadów, roślin, ssaków (włącznie z człowiekiem) w hodowli, bądź inne znane w tej dziedzinie komórki gospodarzy.
Następnie, prowadzi się hodowlę transformowanego gospodarza i oczyszczanie. Komórki gospodarza można hodować w konwencjonalnych warunkach fermentacji tak, aby następowała ekspresja pożądanych związków. Takie warunki fermentacji są dobrze znane w stanie techniki. W końcu, peptydy oczyszcza się z hodowli metodami dobrze znanymi w stanie techniki.
Obecne związki można również wytwarzać metodami syntetycznymi. Przykładowo, mogą być stosowane techniki syntezy w fazie stałej. Odpowiednie techniki są dobrze znane w stanie techniki i obejmują metody opisane w: Merrifield (1973), Chem. Polipeptyds. str. 335-61 (Katsoyannis & Panayotis ed.); Merrifield (1963), J. Arn. Chem. Soc. 85: 2149; Davis i wsp. (1985), Biochem. Intl. 10: 394-414; Stewart i Young (1969), Solid Fase Peptvd Synthesis: w patencie nr US 3 941 763; Finn I wsp. (1976), The Proteins (wydanie trzecie) 2: 105-253; oraz Erickson i wsp. (1976), The Proteins (wydanie trzecie) 2: 257-527. Synteza w fazie stałej jest korzystną techniką wytwarzania pojedynczych peptydów, gdyż jest ona najbardziej efektywna pod względem kosztów wytwarzania małych peptydów.
Związki, które obejmują zderywatyzowane peptydy lub które zawierają nie peptydowe grupy można otrzymywać na drodze syntezy dobrze znanymi technikami chemii organicznej.
Zastosowanie obecnych związków
Związki według obecnego wynalazku mogą być szczególnie przydatne w leczeniu chorób autoimmunologicznych, w których pośredniczą komórki B. W szczególności, związki według obecnego wynalazku mogą być przydatne w leczeniu, zapobieganiu, łagodzeniu, diagnozowaniu lub prognozowaniu stanów obejmujących toczeń, w tym ogólnoustrojowy toczeń rumieniowaty (SLE), a także choroby i stany towarzyszące toczniowi. Inne korzystne wskazania obejmują raki, w których pośredniczą komórki B, w tym chłoniaka komórek B.
Związki według obecnego wynalazku mogą również być stosowane w stanach zapalnych stawów. Stany zapalne stawów oraz przewlekłe choroby stawów dotykają i czynią kalekami, w zróżnicowanym stopniu, miliony ludzi na świecie. Reumatoidalne zapalenie stawów jest chorobą połączeń stawowych, w których chrząstka i kość ulegają powolnej erozji pod wypływem proliferującej, inwazyjnej tkanki łącznej, tak zwanej łuszczki, która pochodzi z błony mazi stawowej. Choroba może dotyczyć struktur okołostawowych, takich jak torebki, otoczki ścięgien i ścięgna, jak również tkanek pozastawowych, takich jak tkanka podskórna, tkanki układu sercowo-naczyniowego, płuc, śledziony, węzłów chłonnych, mięśni szkieletowych, układu nerwowego (centralnego i obwodowego) oraz oczu (Silberberg (1985), Anderson's Pathology, Kissane (ed.), 11: 1828). Osteoartroza stanowi powszechną chorobę zwyrodnieniową stawów, charakteryzującą się zwyrodnieniowymi zmianami w chrząstkach stawowych oraz odpowiedzią w formie proliferacji kości i chrząstki wokół zaatakowanego stawu. Zwyrodnieniowa choroba stawów jest aktywnym procesem zachodzącym z mediacją komórkową, który może stanowić nieprawidłową odpowiedź chondrocytów na bodźce kataboliczne i anaboliczne. Zgodnie z doniesieniami, we wczesnych fazach osteoartrozy występują zmiany w niektórych molekułach matrycy chrząstek stawowych (Thonar i wsp. (1993), Rheumatic disease clinics of North America, Moskowitz (ed.), 19: 635-657 oraz Shinmei i wsp. (1992), Arthritis Rheum., 35: 1304-1308). Panuje przekonanie, że TALL-1, TALL-1R i ich modulatory są użyteczne w leczeniu tych stanów i stanów z nimi związanych.
Związki według obecnego wynalazku mogą być również być przydatne w leczeniu szeregu innych chorób i zaburzeń chorobowych, wśród których należy wymienić następujące stany:
• ostre zapalenie trzustki, • ALS, • choroba Alzheimera, • astma, • arterioskleroza, • autoimmunologiczna anemia hemolityczna, • rak, w szczególności nowotwory związane z komórkami B, • kacheksja /anoreksja, • syndrom chronicznego zmęczenia, • marskość (przykładowo pierwotna marskość żółciowa), • cukrzyca (przykładowo cukrzyca insulinowa),
PL 210 546 B1 • gorączka, • zapalenie kłębuszkowe nerek, w tym zapalenie kłębuszkowe nerek związane z IgA oraz pierwotne zapalenie kłębuszkowe nerek, • syndrom Goodpasture'a, • syndrom Guillaina-Barre'a, • choroba odrzucenia przeszczepu, • zapalenie tarczycy Hashimoto, • szok krwotoczny, • przeczulica słuchowa, • zapalenie jelita, • stany zapalne stawów, w tym osteoartroza, łuszczycowe zapalenie stawów oraz reumatoidalne zapalenie stawów, • stany zapalne wynikające z wyczerpania, zwichnięcia, uszkodzenia chrząstki, urazu, operacji ortopedycznej, infekcji lub innych procesów chorobowych, • cukrzyca zależna od insuliny, • uszkodzenie z niedokrwieniem, łącznie z niedokrwieniem mózgu (przykładowo uszkodzenie mózgu na skutek urazu, epilepsji, wylewu lub udaru, z których każde może prowadzić do neurodegeneracji), • przeuczenie, • choroby płuc (przykładowo ARDS), • szpiczak rozsiany, • stwardnienie rozsiane, • ciężka miastenia, • białaczki mielogenniczne (przykładowo AML i CML) oraz inne, • miopatie (przykładowo metabolizm białka mięśni, zwłaszcza w sepsie), • neurotoksyczność (przykładowo wywołana przez HIV), • osteoporoza, • ból, • choroba Parkinsona, • pęcherzyca, • zapalenie wielomięśniowe/zapalenie skórno-mięśniowe, • zapalenie płuc, obejmujące autoimmunologiczne zapalenie płuc, • poród przedwczesny, • łuszczyca, • choroba Reitera, • defekt reperfuzyjny, • szok septyczny, • efekty uboczne towarzyszące radioterapii, • syndrom Sjogrena, • zaburzenie snu, • przejściowa choroba stawu żuchwowego, • trombocytopenia, wraz z idiopatyczną trombocytopenią oraz autoimmunologiczną trombocytopenią noworodków, • rak w fazie przerzutów, • zapalenie błony naczyniowej gałki ocznej oraz • zapalenie naczyń.
Związki według obecnego wynalazku mogą być podawane samodzielnie lub w połączeniu z terapeutycznie skuteczną ilością innych środków farmaceutycznych, obejmujących środki znieczulające, leki przeciwreumatyczne modyfikujące przebieg choroby (DMARD), nie sterydowe leki przeciwzapalne (NSAID) oraz dowolne modulatory immunologiczne i/lub modulatory stanów zapalnych. A więc, łącznie ze związkami według obecnego wynalazku mogą być podawane następujące środki:
• modulatory innych członków rodziny TNF/receptora TNF, obejmującej antagonisty TNF, takie jak etanercept (Enbrel™), sTNF-RI, onercept, D2E7 i Remicade™, • modulatory czynnika wzrostu nerwu (NGF),
PL 210 546 B1 • inhibitory IL-1, obejmują ce molekuł y IL-lra, takie jak anakinra i ostatnio odkryte czą steczki podobne do IL-lra, takie jak IL-lHyl oraz IL-lHy2; cząsteczki-„pułapki” IL-1 opisane w patencie nr US 5 844 099, wydanym 1 grudnia, 1998; przeciwciała IL-1; rozpuszczalny receptor IL-1 i tym podobne, • inhibitory IL-6 (przykładowo przeciwciała do IL-6), • inhibitory IL-8 (przykładowo przeciwciała do IL-8), • inhibitory IL-18 (przykładowo proteina wiążąca IL-18, rozpuszczony receptor IL-18 lub przeciwciała IL-18), • modulatory enzymu konwertują cego interleukinę -1 (ICE), • insulinopodobne czynniki wzrostu (IGF-1, IGF-2) i ich modulatory, • transformujący czynnik wzrostu -β (TGF-β), członkowie rodziny TGF-β oraz modulatory TGF-β, • czynniki wzrostu fibroblastów od FGF-1 do FGF-10 oraz modulatory FGF, • osteoprotegeryna (OPG), analogi OPG, czynniki osteoochronne oraz przeciwciała do ligandu OPG (OPG-L), • środki anaboliczne kości, takie jak hormon przytarczyc (PTH), fragmenty PTH i cząsteczki zawierające fragmenty PTH (przykładowo PTH (l-34)-Fc), • antagoniści PAF, • czynnik wzrostu keratynocytu (KGF), cząsteczki pokrewne KGF (przykładowo KGF-2) oraz modulatory KGF, • inhibitory COX-2, takie jak Celebrex™ oraz Vioxx™, • analogi prostaglandyny (przykładowo, prostaglandyny serii E), • modulatory matrycy metaloproteinazy (MMP), • modulatory syntazy tlenku azotu (NOS) obejmujące modulatory indukowalnej syntazy NOS, • modulatory receptora glukokortykoidu, • modulatory receptora glutaminianu, • modulatory poziomów lipopolisacharydów (LPS), • środki przeciwrakowe, obejmujące inhibitory onkogenów (przykładowo fos, jun) oraz interferony, • noradrenalina oraz jej modulatory i mimetyki.
Kompozycje farmaceutyczne
Część ogólna
Obecny wynalazek zapewnia również sposoby stosowania farmaceutycznych kompozycji związków według wynalazku. Takie farmaceutyczne kompozycje można podawać przez iniekcję lub doustnie, dopłucnie, donosowo, podskórnie lub innymi drogami podawania. Generalnie, obecny wynalazek obejmuje kompozycje farmaceutyczne zawierające skuteczne ilości związku według wynalazku oraz farmaceutycznie dopuszczalne rozcieńczalniki, środki konserwujące, solubilizujące, emulsyfikatory, adiuwanty i/lub nośniki. Takie kompozycje zawierają rozcieńczalniki o różnej zawartości buforów (przykładowo Tris-HCl, octan, fosforan), różnym pH oraz sile jonowej; dodatki, takie jak detergenty i środki solubilizujące (przykładowo Tween 80, Polisorbate 80), antyutleniacze (przykładowo kwas askorbinowy, metabisiarczyn sodu), środki konserwujące (przykładowo Thimersol, alkohol benzylowy) oraz substancje „objętościowe” (przykładowo laktozę, mannitol); a także uwzględniają włączenie materiału czynnego do preparatów drobnoziarnistych ze związków polimerycznych, takich jak kwas polimlekowy, kwas poliglikolowy i tp. lub do lipozomów. Można również wykorzystać kwas hialuronowy i w ten sposób uzyskać efekt przedłużonej obecności leku w organizmie. Takie kompozycje mają wpływ na stan fizyczny, stabilność, szybkość uwalniania in vivo oraz szybkość usuwania z organizmu in vivo obecnych białek i pochodnych. Patrz, przykładowo, publikacja Remington's Pharmaceutical Sciences, wydanie 18 (1990, Mack Publishing Co., Easton, PA 18042) strony 1435-1712. Kompozycje mogą być wytwarzane w postaci ciekłej lub mogą być w postaci suchego proszku, takiego jak postać zliofilizowana. Uwzględniono także implantowalne formulacje o przedłużonym uwalnianiu, takie jak preparaty śródskórne.
Formy do podawania doustnego
Dla obecnych kompozycji właściwe są formy nadające się do podawania doustnego w postaci stałej, które opisano ogólnie w rozdziale 89 w publikacji Remington's Pharmaceutical Sciences (1990), wydanie 18, Mack Publishing Co. Easton PA 18042. Formy do podawania w postaci stałej obejmują tabletki, kapsułki, pigułki, pastylki lub opłatki. Można również wykorzystać otoczki lipozomalne lub proteinoidowe przy formułowania obecnych kompozycji (jak, przykładowo, proteinoidowe mikrosfery opisane w patencie nr US 4 925 673). Można wykorzystywać otoczkowanie lipozomami, a lipozomy mogą być derywatyzowane przy użyciu różnych polimerów (przykładowo patent nr US 5 013 556).
PL 210 546 B1
Opis możliwych form do podawania leków w postaci stałej podano w rozdziale 10 pracy Marshalla, K., Modern Pharmaceutics (1979), w edycji G. S. Banker i C. T. Rhodes. Generalnie, forma galeniczna będzie obejmować związki według wynalazku oraz składniki obojętne, zapewniające ochronę przed środowiskiem żołądka i uwalnianie biologicznie aktywnego materiału w jelitach.
Szczególną uwagę poświęcono stałym postaciom do doustnego podawania związków według wynalazku. Jeżeli to konieczne, związki można chemicznie zmodyfikować, aby doustne podawanie było skuteczne. Generalnie, uwzględniono modyfikację chemiczną polegającą na przyłączeniu do cząsteczki obecnego związku co najmniej jednej innej reszty, pozwalającą na (a) inhibitowanie proteolizy oraz (b) przenikanie do strumienia krwi z żołądka lub jelit. Pożądany jest również ogólny wzrost stabilności związku i wydłużenia czasu cyrkulacji w organizmie. Cząsteczki przydatne zgodnie z obecnym wynalazkiem w charakterze podłoża przyłączanego kowalentnie do obecnych związków mogą również być wykorzystywane w obecnie omawianym celu. Przykłady takich ugrupowań obejmują: PEG, kopolimery glikolu etylenowego i glikolu propylenowego, karboksymetylocelulozę, dekstran, alkohol poliwinylowy, poliwinylopirolidon oraz poliprolinę. Patrz, przykładowo, Abuchowski i Davis, Soluble Polimer-Enzvme Adducts. Enzymes as Drugs (1981), Hocenberg i Roberts, ed., Wiley-Interscience, New York, NY, str. 367-83; Newmark i wsp. (1982), J. Appl. Biochem. 4: 185-9. Innymi polimerami, które mogą być użyte, są poli-1,3-dioksolan i poli-1,3,6-tioksokan. Do celów wykorzystania farmaceutycznego w wyżej omówionym zakresie korzystne są reszty PEG.
W przypadku form do podawania doustnego można również stosować sól zmodyfikowanego aminokwasu alifatycznego, takiego jak sól sodowa kwasu N-(8-[2-hydroksybenzoilo]amino)kaprylowego (SNAC), jako nośnik zwiększający wchłanianie terapeutycznych związków według wynalazku. Kliniczną skuteczność heparyny w kompozycji z SN AC wykazano w fazie II badań klinicznych prowadzonych przez Emisphere Technologies. Patrz, patent nr US 5 792 451 „Oral drug delivery composition and methods”.
Związki według obecnego wynalazku można włączać do finalnych form jako preparaty drobnocząsteczkowe w postaci granulek lub płatków o wymiarach cząstek około 1 mm. Do podawania w postaci kapsułek można przygotować te materiały w postaci proszku, lekko sprasowanych rdzeni, a nawet tabletek. Środek leczniczy można przeprowadzić w finalną postać przez sprasowanie.
Można dodać także środki barwiące oraz smakowo-zapachowe. Przykładowo, obecne białko (lub pochodna) może być włączone w kompozycję (przykładowo przez zamknięcie w lipozomie lub mikrosferze), a następnie w tej formie dodane do produktu jadabiego takiego jak napój schłodzony zawierający środki barwiące i smakowo-zapachowe.
Można rozcieńczać lub zwiększać objętość kompozycji związku według wynalazku przez dodanie materiału obojętnego. Rozcieńczalniki takie mogłyby obejmować węglowodany, zwłaszcza mannitol, α-laktozę, bezwodną laktozę, celulozę, sacharozę modyfikowane dekstrany i skrobię. Pewne nieorganiczne sole można także wykorzystywać jako wypełniacze. Zalicza się do nich trójfosforan wapnia, węglan magnezu i chlorek sodu. Mogą to również być handlowo dostępne rozcieńczalniki Fast-Flo, Emdex, STA-Rx 1500, Emcompress i Avicell.
Dezintegranty mogą stanowić składnik środka leczniczego w postaci stałej. Materiały stosowane jako dezintegranty obejmują, lecz nie wyłącznie, skrobię, łącznie z handlowo dostępnym preparatem dezintegrującym opartym na skrobii - Explotab, sodowy glikolan skrobiowy, Amberlite, sól sodową karboksymetylocelulozy, ultramylopektynę, alginian sodu, żelatynę, skórkę pomarańczową, karboksymetylocelulozę w postaci kwasowej, naturalną gąbkę oraz bentonit. Inną grupę środków dezintegrujących stanowią nierozpuszczalne żywice kationowymienne. Jako substancje dezintegrujące oraz wiążące mogą być stosowane także sproszkowane gumy, do których zalicza się sproszkowane gumy takie jak agar, guma Karaya lub guma tragakantowa. Kwas alginowy oraz jego sól sodowa są także przydatne jako dezintegranty.
Lepiszcza mogą być stosowane, aby zlepić środek leczniczy w całość i uformować twardą tabletkę. Właściwymi materiałami z produktów naturalnych są guma akacjowa, tragakantowa, skrobia i żelatyna. Inne materiały do tego celu obejmują metylocelulozę (MC), etylocelulozę (EC) oraz karboksymetylocelulozę (CMC). Poliwinylopirolidon (PVP) oraz hydroksypropylmetylocelulozę (HPMC) można stosować w postaci roztworów alkoholowych, aby wytworzyć zgranulowany środek leczniczy.
Środek zmniejszający tarcie może także stanowić składnik środka leczniczego, w celu zapobiegania przywierania masy do urządzeń podczas wytwarzania form galenicznych. Na ścianach dysz, w celu oddzielenia ich od środka leczniczego można przy formulacji stosować środki smarujące, które mogą obejmować - lecz nie wyłącznie: kwas stearynowy oraz jego sole magnezową i wapniową, poliPL 210 546 B1 tetrafluoroetylen (PTFE), ciekłą parafinę, oleje roślinne i woski. Można również stosować rozpuszczalne środki smarujące takie jak siarczan sodowo-laurylowy, siarczan magnezowo-laurylowy, glikol polietylenowy o różnych masach cząsteczkowych, Carbowax 4000 i 6000.
Można także dodawać środki poślizgowe, które mogą poprawić przepływ (własności sypne) leku podczas formulacji i wspomagać zmianę postaci podczas sprasowywania. Środki takie obejmują skrobię, talk, pirogeniczną krzemionkę oraz uwodniony krzemoglinian.
W celu ułatwienia rozpuszczania związku aktywnego według obecnego wynalazku w środowisku wodnym można dodać środek powierzchniowo czynny jako środek zwilżający. Środki powierzchniowo czynne mogą obejmować detergenty anionowe takie jak siarczan sodowo-laurylowy, sulfobursztynian dioktylo-sodowy i sulfonian dioktylo-sodowy. Można stosować detergenty kationowe, takie jak chlorek benzalkoniowy lub chlorek benzetoniowy. Lista potencjalnych niejonowych detergentów, które można włączyć do kompozycji jako środki powierzchniowoczynne obejmuje: lauromacrogol 400, stearynian polioksylu 40, pohoksyetylen z uwodornionym olejem rącznikowym 10, 50 oraz 60, monostearynian gliceryny, polisorbat 40, 60, 65 oraz 80, estry sacharozy i kwasów tłuszczowych, metylocelulozę oraz karboksymetylocelulozę. Te środki powierzchniowoczynne mogą kompozycji zawierającej obecne białko lub pochodną występować samodzielnie albo w postaci mieszanin o różnych proporcjach.
Do kompozycji można wprowadzać także dodatki zwiększające wchłanianie związku aktywnego. Dodatkami potencjalnie mającymi te właściwości są, przykładowo, kwasy tłuszczowe, kwas oleinowy, kwas linolowy oraz kwas linolenowy.
Pożądana może być forma leku o kontrolowanym uwalnianiu. Związki według obecnego wynalazku mogą być osadzone w obojętnej matrycy, która umożliwia uwalnianie albo przez dyfuzję albo dzięki mechanizmom wymywania, przykładowo w gumy. Matryce ulegające powolnej degeneracji mogą być również wykorzystywane przy wytwarzaniu tej formy leku - formulacji. Przykładowo są to alginiany, polisacharydy, Inna postać zdolna do kontrolowanego uwalniania związków według obecnego wynalazku oparta jest na systemie terapeutycznym Oros (Alza Corp.), co oznacza, że lekarstwo jest otoczone półprzepuszczalną membraną, która pozwala na przenikanie do środka wody i wypieranie stamtąd lekarstwa przez jeden mały otwór, na zasadzie osmozy. Niektóre powłoki jelitowe również zapewniają efekt powolnego uwalniania.
Wykorzystywać można także inne powleczenia. Obejmują one różnorodne cukry, które można nanosić w powlekarce. Środek leczniczy może mieć również postać tabletki powleczonej cienką błoną, do wykonania której można użyć materiałów, które z kolei można podzielić na dwie grupy. Pierwsza zawiera materiały niejelitowe i obejmuje metylocelulozę, etylocelulozę, hydroksyetylocelulozę, metylohydroksyetylocelulozę, hydroksypropylocelulozę, hydroksypropylometylocelulozę, sól sodową karboksymetylocelulozy, prowidon oraz glikole polietylenowe. Druga grupa obejmuje materiały jelitowe, którymi są zwykłe estry kwasu ftalowego.
W celu uzyskania optymalnego powleczenia można stosować mieszanki materiałów. Nanoszenie powłoki w formie błonki można prowadzić w powlekarce talerzowej lub w złożu fluidalnym lub stosując powlekanie ciśnieniowe.
Formy do podawania dopłucnego
Uwzględniono tu również podawanie dopłucne obecnego białka (lub jego pocłiodnych). Proteina (lub pochodna) dostarczona do płuc ssaków podczas inhalacji przenika przez nabłonkowe wyścielenie płuc do krwioobiegu, (inne doniesienia na ten temat obejmują Adjei i wsp., Farma. Res. (1990) 7: 565-9; Adjei i wsp. (1990), Intematl. J. Farmaceutics 63: 135-44 (octan leuprolidu); Braquet i wsp. (1989), J. Cardiovasc. Farmacol. 13 (suplement 5): str.143-146 (endotelina-1); Hubbard i wsp. (1989), Annals Int. Med. 3: 206-12 (a1-antytrypsyna); Smith i wsp. (1989), J. Clin. Invest. 84: 1145-6 (a1-proteinaza); Oswein i wsp. (March 1990), „Aerosolization of Proteins”, Proc. Svmp. Resp. Drug Delivery II, Keystone, Colorado (rekombinacyjny ludzki hormon wzrostu); Debs i wsp. (1988), J. Immunol. 140: 3482-8 (interferon-γ oraz TNF-α) oraz Platz i wsp., patent nr US 5 284 656 (czynnik stymulujący kolonie granulocytów).
Rozważano odnośnie praktycznego wykorzystania obecnego wynalazku stosowanie szerokiego wachlarza mechanicznych urządzeń przeznaczonych do dopłucnego podawania środków leczniczych. Urządzenia te obejmują - lecz nie wyłącznie: nebulizery, inhalatory z dozownikami oraz inhalatory proszkowe, z których wszystkie są dobrze znane biegłym w sztuce. Niektórymi szczególnymi przykładami handlowo dostępnych urządzeń nadających się do wykorzystania w praktycznych realizacjach obecnego wynalazku są: nebulizer Ultravent, produkowany przez Mallinckrodt, Inc., St. Louis, Missouri; nebulizer Acorn II, produkowany przez Marquest Medical Products, Englewood, Colorado; inhala30
PL 210 546 B1 tor z dozownikiem typu Ventolin, produkowany przez Glaxo Inc., Research Triangle Park, North Carolina oraz inhalator proszkowy Spinhaler, produkowany przez Fizons Corp., Bedford, Massachusetts.
Wszystkie tego rodzaju urządzenia wymagają stosowania preparatów odpowiednich do uwalniania związków według obecnego wynalazku. Zazwyczaj, każdy preparat dostosowany jest do określonego typu stosowanego urządzenia i może obejmować wykorzystanie odpowiedniego materiału zapewniającego lotność i odpowiednie rozproszenie, obok rozcieńczalników, substancji pomocniczych i/lub nośników użytecznych w leczeniu.
Związek według obecnego wynalazku powinien najkorzystniej być przetworzony w postać drobnoziarnistą o wymiarach cząstek mniejszych niż 10 μm, najkorzystniej 0,5 do 5 μm, w celu najbardziej efektywnego podawania do dalekich obszarów płuc.
Farmaceutycznie akceptowalne nośniki obejmują węglowodany, takie jak trehaloza, mannitol, ksylitol, sacharoza, laktoza i sorbitol. Inne składniki do stosowania w preparatach mogą obejmować DPPC, DOPE, DSPC oraz DOPC. Mogą być stosowane naturalne lub syntetyczne środki powierzchniowoczynne. Można stosować PEG (nawet niezależnie od jego wykorzystania do derywatyzacji obecnego białka lub analoga). Można stosować też dekstrany, takie jak cyklodekstran. Sole żółciowe oraz inne środki wspomagające (enhancery) mogą być także wykorzystywane. Odpowiednim dodatkiem może też być celuloza lub pochodne celulozy. Mogą być stosowane aminokwasy, przykładowo w celu buforowania.
Uwzględniono również stosowanie lipozomów, mikrokapsułek lub mikrosfer, kompleksów inkluzyjnych lub innych rodzajów nośników.
Preparaty odpowiednie do stosowania w nebulizerze dyszowym lub też ultradźwiękowym, typowo obejmować będą związek według obecnego wynalazku rozpuszczony w wodzie w stężeniu od około 0,1 do 25 mg biologicznie czynnego białka na 1 ml roztworu. Preparat taki może również zawierać bufor i prosty cukier (przykładowo w celu stabilizacji proteiny i regulowania ciśnienia osmotycznego). Preparat do podawania w postaci mgły przy użyciu nebulizera może również zawierać środek powierzchniowo czynny, w celu zmniejszenia lub przeciwdziałania indukowanej powierzchniowej agregacji białka, powodowanej przez rozpylanie roztworu podczas tworzenia aerozolu.
Formulacja do stosowania urządzenia do inhalacji z dozownikiem będzie - generalnie - obejmować subtelnie rozdrobniony proszek zawierający związek według obecnego wynalazku zawieszony w ośrodku rozpraszającym, zapewniającym lotność, dzięki użyciu środka powierzchniowo czynnego. Ośrodkiem rozpraszającym zapewniającym lotność może być dowolny znany materiał stosowany w tym celu, taki jak węglowodór podstawiony chlorem i fluorem całkowicie lub częściowo, to jest chlorofluorowęglowodór, fluorowęglowodór albo węglowodór, w tym trichlorofluorometan, dichlorodifluorometan, dichlorotetrafluoroetanol oraz 1,1,1,2-tetrafluoroetan lub ich mieszaniny. Odpowiednie środki powierzchniowo czynne obejmują trioleinian sorbitanu oraz lecytynę sojową. Jako środek powierzchniowo czynny może być również stosowany kwas oleinowy.
Preparaty do podawania przy użyciu inhalatora proszkowego zawierają subtelnie rozdrobniony suchy proszek zawierający związek według obecnego wynalazku i mogą również zawierać środek zwiększający objętość i masę taki jak laktoza, sorbitol, sacharoza, mannitol, trehaloza lub ksylitol w ilościach, które ułatwiają dyspergowanie proszku z urządzenia, przykładowo od 50 do 90% wagowych w przeliczeniu na masę preparatu.
Formy do podawania donorowego
Uwzględniono również podawanie donosowe związków według obecnego wynalazku. Dostarczanie donosowe pozwala wprowadzać białko aktywne do krwioobiegu bezpośrednio po podaniu donosowo środka leczniczego, bez konieczności wprowadzania tego środka do płuc. Preparaty do podawania donosowego zawierają dekstran lub cyklodekstran. Uwzględniono także podawanie oparte na transporcie przez inne błony śluzowe,
Dawkowanie
Reżim dawkowania w leczeniu wyżej określonych stanów musi być określony przez lekarza prowadzącego, z uwzględnieniem różnych czynników, które modyfikują działanie leków, jak przykładowo wiek, stan, masa ciała, płeć i dieta pacjenta, ostrość infekcji, czas podawania i inne czynniki kliniczne. Generalnie, dzienna dawka powinna zawierać się w przedziale 0,1-1000 mikrogramów związku według obecnego wynalazku, na każdy kilogram masy ciała, korzystnie 0,1-150 mikrogramów na kilogram.
PL 210 546 B1
Szczególnie korzystne przykłady wykonania
Wynalazcy obecni określili korzystne struktury dla korzystnych peptydów wymienionych poniżej w tablicy 4. Symbol „Λ” oznacza dowolny linker opisany wyżej lub może po prostu reprezentować normalne wiązanie peptydowe (to znaczy, gdy nie ma żadnego linkera). Powtórzenia tandemowe i linkery wyodrębniono dla jasności przez użycie myślników.
T a b l i c a 4
Korzystne przykłady wykonania
| Sekwencja/struktura | SEQ. ID. NO: |
| LPGCKWDLLIKQWVCDPL^-V1 | 44 |
| V1^-LPGCKWDLLIKQWVCDPL | 45 |
| LPGCKWDLLIKQWVCDPL^-LPGCKWDLLIKQWVCDPL^-V1 | 46 |
| V1^-LPGCKWDLLIKQWVCDPL^-LPGCKWDLLIKQWVCDPL | 47 |
| SADCYFDILTKSDVCTSS^-V1 | 48 |
| V1^-SADCYFDILTKSDVCTSS | 49 |
| SADCYFDILTKSDVTSS^-SADCYFDILTKSDVTSS^-V1 | 50 |
| V^-SADCYFDILTKSDVTSS^-SADCYFDILTKSDVTSS | 51 |
| FHDCKWDLLTKQWVCHGL^-V1 | 52 |
| V1^-FHDCKWDLLTKQWVCHGL | 53 |
| FHDCKWDLLTKQWVCHGL^-FHDCKWDLLTKQWVCHGL^-V | 54 |
| V1-A-FHDCKWDLLTKQWVCHGL-A-FHDCKWDLLTKQWVCHGL | 55 |
„V1” oznacza domenę Fc jak to zdefiniowano uprzednio. Poza wskazanymi w tablicy 4, obecni wynalazcy uwzględniali heterodimery, w których każda nić dimeru Fc jest połączona z inną sekwencją peptydową; przykładowo takie, w których każda domena Fc jest połączona z inną sekwencją wybraną z tablicy 2.
Wszystkie związki według obecnego wynalazku można wytworzyć metodami opisanymi w publikacji nr WO 99/25044.
Wynalazek zostanie obecnie dodatkowo objaśniony w następujących przykładach realizacji, które stanowią raczej ilustrację niż ograniczenie zakresu wynalazku.
P r z y k ł a d 1. Peptydy
Prezentacja fagowa peptydów
1. Wytwarzanie perełek magnetycznych
A. unieruchomienie Fc-TALL-1 na perełkach magnetycznych
Rekombinacyjną proteinę Fc-TALL-1 immobilizowano na perełkach Dynabeads z białkiem A (Dynal) w stężeniu 8 μg Fc-TALL-1 na 100 μl perełek w formie dostarczonej przez wytwórcę. Odciągając perełki na jedną stronę probówki przy użyciu magnesu oraz odpipetowując płyn przemyto je dwukrotnie stosując solankę w buforze fosforanowym (PBS) i ponownie przeprowadzono w zawiesinę w PBS. Białko Fc-TALL-1 dodano w powyższym stężeniu do przemytych perełek i inkubowano z rotacją przez 1 godzinę w temperaturze pokojowej. Perełki z powłoką Fc-TALL-1 następnie zablokowano przez dodanie albuminy z surowicy bydlęcej (BSA) do końcowego 1% stężenia i inkubowano z rotacją przez noc w temperaturze 4°C. Otrzymane perełki z powłoką Fc-TALL-1 przemyto następnie dwukrotnie przy użyciu PBST (PBS z 0,05% Tween-20) przed poddaniem procedurom selekcji.
B. Wytwarzanie perełek do selekcji negatywnej
Dodatkowe perełki wytworzono również do selekcji negatywnych. Dla każdych warunków panoramowania, 250 μl próbki perełek w postaci dostarczonej przez wytwórcę poddano powyższej procedurze (sekcja 1A) z wyjątkiem tego, że pominięto etap inkubacji z Fc-TALL-1. W ostatnim etapie przemywania perełki podzielono na pięć 50 μl części.
PL 210 546 B1
2. Selekcja fagów wiążących TALL-1
A. Strategia ogólna
Dwie biblioteki włóknistych fagów TN8-IX (5 x 109 niezależnych transformantów) oraz TN12-I (1,4 x 109 niezależnych transformantów) (Dyax Corp.), użyto do wybrania faga wiążącego TALL-1. Każdą bibliotekę poddano albo eluowaniu przy pH 2 lub „eluowaniu perełkowemu” (sekcja 2E). Stąd wynika, że w projekcie dotyczącym TALL-1 wykorzystano cztery różne warunki panoramowania (TN8-IX przy użyciu metody eluowania przy pH 2, TN8-IX przy użyciu metody perełkowego eluowania, TN12-I przy użyciu metody eluowania przy pH 2 oraz TN12-I przy użyciu perełkowej metody eluowania). Przeprowadzono trzy cykle selekcji w każdych warunkach.
B. Negatywna selekcja
Dla każdych warunków panoramowania pobrano próbki około 100 losowych ekwiwalentów biblioteki (5 x 1011 pfu dla TN8-IX oraz 1,4 x 1011 pfu dla TN12-I) z bazowej biblioteki rozcieńczono do objętości 300 μl przy użyciu PBST. Po odebraniu cieczy z ostatniego przemycia pierwszej 50 μl próbki perełek wytworzonych dla prowadzenia selekcji negatywnych (sekcja 1B), do perełek dodano powyższe 300 μl rozcieńczonej bazowej biblioteki. Tak otrzymaną mieszaninę inkubowano obracając przez 10 minut w temperaturze pokojowej. Sklarowane fagi znad osadu oddzielono przy użyciu magnezu dodano do drugiej 50 μl próbki w celu wykonania drugiego etapu negatywnej selekcji. W ten sposób zrealizowano pięć etapów negatywnej selekcji.
C. Selekcja przy użyciu perełek powleczonych proteiną Fc-TALL-1
Sklarowane fagi po ostatnim etapie negatywnej selekcji (sekcja 1B) dodano do perełek powleczonych Fc-TALL-1 po ostatnim etapie przemywania (sekcja 1A). Mieszaninę tę inkubowano obracając przez dwie godziny w temperaturze pokojowej, co pozwoliło na związanie specyficznego faga z docelowa proteiną. Po usunięciu sklarowanej cieczy znad osadu, perełki przemyto siedmiokrotnie przy użyciu PBST.
D. Eluowanie związanego faga przy pH 2
Po ostatnim etapie przemywania (sekcja 2C), związane fagi eluowano z magnetycznych perełek przez dodanie 200 μl CBST (50 mM cytrynianu sodu, 150 mM chlorku sodu, 0,05% Tween-20, pH 2). Po 5 minutowej inkubacji w temperaturze pokojowej, ciecz zawierającą wymyte fagi oddzielono i przeniesiono do innej probówki. Etap eluowania powtórzono ponownie dodając 200 μl CBST i inkubując przez 5 minut. Ciecze z obu etapów eluowania połączono i dodano 100 μl 2 M roztworu Tris (pH 8) w celu neutralizacji pH. Dodano 1 ml 500 μl roztworu soli Min A Sahs (60 mM K2HPO4, 33 mM KH2PO4, 7,6 mM (NH4)SO4 i 1,7 mM cytrynian sodu) doprowadzając końcową objętość do 1 ml.
E. Eluowanie perełkowe
Po oddzieleniu cieczy z ostatniego przemycia (sekcja 2C), do perełek dodano 1 ml roztworu soli Min A Salts. Tę mieszaninę perełek dodano bezpośrednio do stężonej próbki bakterii w celu zainfekowania (sekcje 3A oraz 3B).
3. Amplifikacja
A. Wytwarzanie komórek do powleczenia
Świeżą hodowlę E. coli. (XL-1 Blue MRF') poddano wzrostowi do OD600 = 0,5 w pożywce LB zawierającej 12,5 μg/ml tetracykliny. Dla każdych z warunków panoramowania, 20 ml tej hodowli ochłodzono lodem i odwirowano. Placek z bakterii ponownie rozproszono w 1 ml roztworu soli Min A Salts.
B. Transdukcja
Każdą mieszaninę z różnych metod eluowania (sekcje 2D oraz 2E) dodano do stężonej próbki bakterii (sekcja 3A) i inkubowano w temperaturze 37°C przez 15 minut. Do każdej z mieszanin dodano ml pożywki NZCYM (2 x NZCYM, 50 μg/ml ampicyliny) i inkubowano w temperaturze pokojowej przez 15 minut. Otrzymane 4 ml roztworu naniesiono na dużą płytkę agarową NZCYM zawierającą 50 μg/ml ampicyliny i inkubowano przez noc w temperaturze 37 °C.
C. Zebranie fagów
Każdą z mieszanin bakteria/fag, którą poddano wzrostowi przez noc na dużej płytce agarowej NZCYM (sekcja 3B) zeskrobano do 35 ml pożywki LB, a płytkę agarową dodatkowo przemyto dodatkową porcją 35 ml pożywki LB. Otrzymaną mieszaninę bakteria/fagi w pożywce LB odwirowano, aby oddzielić bakterie w formie zbitego osadu. 50 ml sklarowanej cieczy fagowej przeniesiono do świeżej probówki, dodano 12,5 ml roztworu PEG (20% PEG 8000, 3,5M octan amonu) i inkubowano na lodzie przez 2 godziny w celu wytrącenia fagów. Wytrącone fagi odwirowano i ponownie rozproszono w 6 ml
PL 210 546 B1 buforu do suspendowania fagów (250 mM NaCl, 100 mM Tris pH 8, 1 mM EDTA). Następnie, ten roztwór oczyszczono przez odwirowanie, usunięto pozostałe bakterie i wytrącono drugi raz fagi przez dodanie 1,5 ml roztworu PEG. Po odwirowaniu, zbitą masę fagów ponownie przeprowadzono w zawiesinę w 400 μl PBS. Roztwór ten poddano końcowemu odwirowaniu w celu oddzielenia pozostałych szczątków bakterii. Końcowy preparat fagowy oznaczono w standardowej próbie tworzenia płytki (Molecular Cloning, Maniatis i wsp., wydanie 3).
4. Dwie dalsze rundy selekcji i amplifikacii
W drugiej rundzie, zamplifikowane fagi (1010 pfu) z pierwszej rundy (sekcja 3C) zastosowano jako wsad fagów przy prowadzenia dalszych etapów selekcji i amplifikacji (sekcje 2 i 3). Z kolei, zaplifi10 kowane fagi (1010 pfu) z przeprowadzonej drugiej rundy użyto jako wsad fagów w celu przeprowadzenia trzeciej rundy selekcji i amplifikacji (sekcje 2 i 3).
Po etapach eluowania (sekcja 2D oraz 2E) trzeciej rundy, małą frakcję wymytego faga osadzono stosując standardową próbę tworzenia płytki (sekcja 3C). Wybrano indywidualne płytki i umieszczono na płytkach do mikrooznaczeń o 96 wgłębieniach zawierających 100 μl buforu TE w każdym wgłębieniu. Te wzorcowe płytki inkubowano w temperaturze 37°C przez 1 godzinę, co pozwoliło na wyeluowanie fagów do buforu TE.
5. Analiza klonalna (testy ELISA dla fagów i sekwencjonowanie)
Klony fagów analizowano stosując testy ELISA dla fagów oraz i metody oznaczania sekwencji. Sekwencje sklasyfikowano w oparciu o łączne wyniki z tych dwóch prób.
A. Test ELISA dla fagów
Prowadzono wzrost hodowli An XL-1 Blue MRP' do osiągnięcia OD600 o wartości 0,5. 30 μl próbki tej hodowli wprowadzono do każdego wgłębienia płytki do mikrooznaczeń o 96 wgłębieniach. Do każdego wgłębienia dodano 10 μl wyeluowanego faga (sekcja 4) i dopuszczono infekowanie bakterii przez 15 minut w temperaturze pokojowej.
Do każdego wgłębienia dodano 130 μl pożywki LB zawierającej 12,5 μg/ml tetracykliny oraz 50 μg/ml ampicyliny. Następnie całą płytkę do mikrooznaczeń inkubowano przez noc w temperaturze 37°C. Rekombinacyjne białko TALL-1 (1 μg/ml w PBS) pozostawiono do osadzenia na płytkach Maxisorp o 96 wgłębieniach przez noc w temperaturze 4°C. Jako kontrolę przygotowano oddzielną płytkę Maxisorp powleczoną proteiną rekombinacyjnego Fc-Trail, w takim samym stężeniu molowym jak białko TALL-1.
Następnego dnia, usunięto ciecze z powleczonych białkami płytek Maxisorp i każde wgłębienie zablokowano przy użyciu 300 μl 2% roztworu BSA w temperaturze 37°C w ciągu 1 godziny. Roztwór BSA usunięto i wgłębienia przemyto trzykrotnie roztworem PBST.
Po ostatnim przemyciu do każdego wgłębienia płytek Maxisorp pokrytych białkami dodano 50 μl PBST. Każdą z prowadzonych przez noc 50 μl hodowli uzyskanych na tej płytce do mikrooznaczeń o 96 wgłębieniach przeniesiono do odpowiednich wgłębień płytek powleczonych TALL-1, jak również kontrolnych płytek pokrytych Fc-Trail.
Mieszaniny o objętości 100 μl z tych dwóch rodzajów płytek inkubowano przez 1 godzinę w temperaturze pokojowej. Ciecz usunięto z płytek Maxisorp i wgłębienia przemyto pięć razy stosując PBST. Skoniugowane z HRP przeciwciało anty-M13 (Farmacia) rozcieńczono do stężenia 1:7,500 i 100 μl tego rozcieńczonego roztworu dodano do każdego wgłębienia płytek Maxisorp i inkubowano przez 1 godzinę w temperaturze pokojowej.
Ciecz ponownie usunięto i wgłębienia przemyto siedem razy stosując PBST. Do każdego wgłębienia dodano 100 μl substratu tetrametylobenzydyny (TMB) (Sigma) w celu wywołania barwnej reakcji i reakcję tę zatrzymano stosując 50 μl 5 N roztworu H2SO4. Wartość OD450 odczytano na czytniku płytek (Molecular Devices).
A. Sekwencjonowanie klonów faga
Dla każdego klonu faga wytworzono wzorzec sekwencjonowania metodą PCR. Następującą parę oligonukleotydów stosowano do amplifikacji fragmentów około 500 nukleotydowych:
primer #1(5'-CGGCGCAACTATCGGTATCAAGCTG-3') (SEQ ID NO: 56), oraz primer #2 (5' -CATGTACCGTAACACTGAGTTTCGTC- 3') (SEQ ID NO: 57).
Następującą mieszankę przygotowano dla każdego klonu.
PL 210 546 B1
| Reagenty | Objętość ^L)/probówkę |
| dH2O | 26,25 |
| 50% gliceryna | 10 |
| 10B PCR Bufor (bez MgCfe) | 5 |
| 25 mM MgCl2 | 4 |
| 10 mM mieszanki dNTP | 1 |
| 100 μM primera 1 | 0,25 |
| 100 μM primera 2 | 0,25 |
| Polimeraza Taq | 0,25 |
| Fag w TE (sekcja 4) | 3 |
| Końcowa objętość reakcji | 50 |
W termocyklerze (GeneAmp PCR System 9700, Applied Biosystems) zrealizowano następujący program: temperatura 94°C przez 5 minut; [temperatura 94°C przez 30 sekund, 55°C przez 30 sekund, 72°C przez 45 sekund.] x 30 cykli; temperatura 72°C przez 7 minut; chłodzenie do temperatury do 4°C.
Produkt PCR sprawdzano prowadząc każdą reakcję PCR w 5 μl na 1% żelu agarozowym.
Produkt PCR w pozostałych 45 μl z każdej reakcji poddano oczyszczeniu przy użyciu zestawu QIAquick Muhiwell PCR Purification kit (Qiagen), zgodnie z zaleceniami wytwórcy.
Otrzymany produkt poddano następnie sekwencjonowaniu przy użyciu urządzenia ABI 377 Sequencer (Perkin-Elmer) zgodnie z protokołem zalecanym przez producenta.
6. Przegląd sekwencji i oznaczenie zgodnych sekwencji
A. Przegląd sekwencji
Sekwencje peptydowe, które uzyskano przez translację zmiennych sekwencji nukleotydowych (sekcja 5B) skorelowano z danymi ELISA.
Klony wykazywały wysoką wartość OD450 we wgłębieniach płytki pokrytej TALL-1 oraz niską wartość OD450 we wgłębieniach płytki pokrytej Fc-Trail uznano za ważniejsze.
Sekwencje, które wystąpiły wielokrotnie również uznano za ważne.
W oparciu o te kryteria wybrano sekwencje kandydackie do dalszych analiz w charakterze peptydu lub ciał peptydowych.
Odpowiednio pięć i dziewięć kandydackich sekwencji peptydowych wybrano spośród bibliotek TN-8-IX oraz TN12-I.
B. Oznaczenie zgodnej sekwencji
Większość sekwencji wybranych z biblioteki TN12-I zawiera bardzo konserwatywny motyw
DBL.
Motyw ten obserwowano również w sekwencjach wybranych także z biblioteki TN8-IB. Inny motyw, PFPWE (SEQ ID NO: 110) również obserwowano w sekwencjach otrzymanych z biblioteki TN8-IB.
Zgodny peptyd, FHDCKWDLLTKOWVCHGL (SEQ ID NO: 58), zaprojektowano w oparciu o motyw DBL.
Ponieważ peptydy otrzymane z biblioteki TN12-I były najbardziej aktywne, w oparciu o powyższe kryteria rankingowe (sekcja 5A) wyróżniono 26 najlepszych sekwencji peptydowych przez motyw DBL.
Podkreśloną „sekwencję rdzenia” aminokwasowego otrzymano przez oznaczenie aminokwasów występujących najczęściej w każdej pozycji.
Dwie cysteiny przyległe do sekwencji rdzenia były stałymi aminokwasami w bibliotece TN12-I.
Pozostała część sekwencji aminokwasowej w tym zgodnym peptydzie została wzięta z jednego z kandydackich peptydów -TALL-1-12-10 (tablica 2, SEQ ID NO: 37).
Peptyd oraz ciało peptydowe wyprowadzone z tej zgodnej sekwencji były najbardziej aktywne w próbach na proliferację komórek B.
PL 210 546 B1
P r z y k ł a d 2. Ciała peptydowe
Skonstruowano zestaw 12 ciał peptydowych inhibitujących TALL-1 (tablica 5), w których monomer każdego peptydu poddano fuzji w ramce z regionem Fc ludzkiej IgG1.
Każde ciało peptydowe inhibitujące TALL-1 skonstruowano przez wygrzewanie par oligonukleotydów przedstawionych w tablicy 6 w celu utworzenia dupleksu kodującego dany peptyd i linker zawierający 5 reszt glicynowych i jedną resztę walinową jako fragment od Ndel do SalI.
Te dupleksy cząsteczki ligowano do wektora (pAMG21-RANK-Fc, tu opisanego) zawierającego ludzki gen Fc, wytrawiony także przy użyciu Ndel oraz SalI.
Otrzymane mieszaniny ligacyjne transformowano na drodze elektroporezy do komórej E. coli, szczep 2596 (GM221, opisany tutaj).
Klony poddano skriningowi pod kątem zdolności do wytwarzania rekombinacyjnego produktu białkowego oraz posiadania fuzji genowej o poprawnej sekwencji nukleotydowej.
Wybrano pojedynczy taki klon dla każdego ciała peptydowego.
Sekwencje nukleotydów i sekwencje aminokwasowe białek fuzyjnych przedstawiono na rysunkach od fig. 4A do 4F.
T a b l i c a 5
Sekwencje peptydowe i oligonukleotydy stosowane do generowania ciał peptydowych inhibitujących TALL-1
| Ciało peptydowe (C.P.) | SEQ ID NO (C.P.) | Sekwencja peptydu | Oligonukleotyd sensowny | Oligonukleotyd antysensowny |
| TALL-I-8-1-a | 29 | PGTCFPFPWECTHA | 2517-24 | 2517-25 |
| TALL-I-8-2-a | 30 | WGACWPFPWECFKE | 2517-26 | 2517-27 |
| TALL-I-8-4-a | 31 | YPFCDLLTKHCFEA | 2517-28 | 2517-29 |
| TALL-I-12-4-a | 32 | GSRCKYKWDVLTKQCFHH | 2517-30 | 2517-31 |
| TALL-I-12-3-a | 33 | LPGCKWDLLIKQWVCDPL | 2517-32 | 2517-33 |
| TALL-l-12-5-a | 34 | SADCYFDILTKSDYCTSS | 2517-34 | 2517-35 |
| TALL-l-12-8-a | 35 | SDDCMYDQLTRMFICSNL | 2517-36 | 2517-37 |
| TALL-l-12-9-a | 36 | DLNCKYDELTYKEWCQFN | 2521-92 | 2521-93 |
| TALL-l-12-10-a | 37 | FHDCKYDLLTRQMVCHGL | 2521-94 | 2521-95 |
| TALL-l-12-11-a | 38 | RNHCFWDHLLKQDICPSP | 2521-96 | 2521-97 |
| TALL-l-12-14-a | 39 | ANQCWWDSLTKKNVCEFF | 2521-98 | 2521-99 |
| Zgodny TALL-I | 58 | FHDCKWDLLTKQWVCHGL | 2551-48 | 2551-49 |
PL 210 546 B1
T a b l i c a 5B
Ciała peptydowe inhibitujące TALL-1
| Ciało peptydowe | SEQ ID NO (C.p.) | Sekwencja peptydu |
| TALL-l-8-l-a | 111 | MPGTCFPFPW ECTHAGGGGG VDKTHTCPPC PAPELLGGPS VFLFPPKPKD TLMISRTPEV TCVWDVSHE DPEVKFNWYV DGVEVHNAKT KPREEQYNST YRWSVLTVL HQDWLNGKEY KCKVSNKALP APIEKTISKA KGQPREPQVY TLPPSRDELT KNQVSLTCLV KGFYPSDIAV EWESNGQPEN NYKTTPPVLD SDGSFFLYSK LTVDKSRWQQ GNVFSCSVMH EALHNHYTQK SLSLSPGK |
| TALL-l-8-2-a | 112 | MWGACWPFPW ECFKEGGGGG VDKTHTCPPC PAPELLGGPS VFLFPPKPKD TLMISRTPEV TCVWDVSHE DPEVKFNWYV DGVEVHNAKT KPREEQYNST YRWSVLTVL HQDWLNGKEY KCKVSNKALP APIEKTISKA KGQPREPQVY TLPPSRDELT KNQVSLTCLV KGFYPSDIAV EWESNGQPEN NYKTTPPVLD SDGSFFLYSK LTVDKSRWQQ GNVFSCSVMH EALHNHYTQK SLSLSPGK |
| TALL-l-8-4-a | 113 | MVPFCDLLTK HCFEAGGGGG VDKTHTCPPC PAPELLGGPS VFLFPPKPKD TLMISRTPEV TCVWDVSHE DPEVKFNWYV DGVEVHNAKT KPREEQYNST YRWSVLTVL HQDWLNGKEY KCKVSNKALP APIEKTISKA KGQPREPQVY TLPPSRDELT KNQVSLTCLV KGFYPSDIAV EWESNGQPEN NYKTTPPVLD SDGSFFLYSK LTVDKSRWQQ GNVFSCSVMH EALHNHYTQK SLSLSPGK |
| TALL-l-12-4-a | 114 | MGSRCKYKWD VLTKQCFHHG GGGGVDKTHT CPPCPAPELL GGPSVFLFPP KPKDTLMISR TPEVTCVWD VSHEDPEVKF NWYVDGVEVH NAKTKPREEQ YNSTYRWSV LTVLHQDWLN GKEYKCKVSN KALPAPIEKT ISKAKGQPRE PQVYTLPPSR DELTKNQVSL TCLVKGFYPS DIAVEWESNG QPENNYKTTP PVLDSDGSFF LYSKLTVDKS RWQQGNVFSC SYMHEALHNH YTQKSLSLSP GK |
PL 210 546 B1
| Ciało peptydowe | SEQ ID NO (C.P.) | Sekwencja peptydu |
| TALL-l-12-3-a | 115 | MLPGCKWDLL IKQWVCDPLG GGGGVDKTHT CPPCPAPELL GGPSVFLFPP KPKDTLMISR TPEVTCVWD VSHEDPEVKF NWYVDGVEVH NAKTKPREEQ YNSTYRWSV LTVLHQDWLN GKEYKCKVSN KALPAPIEKT ISKAKGQPRE PQVYTLPPSR DELTKNQVSL TCLVKGFYPS DIAVEWESNG QPENNYKTTP PVLDSDGSFF LYSKLTVDKS RWQQGNVFSC SVMHEALHNH YTQKSLSLSP GK |
| TALL-l-12-5-a | 116 | MSADCYFDIL TKSDVCTSSG GGGG VDKTHT CPPCPAPELL GGPSVFLFPP KPKDTLMISR TPEVTCWVD VSHEDPEVKF NWYVDGVEVH NAKTKPREEQ YNSTYRWSV LTVLHQDWLN GKEYKCKVSN KALPAPIEKT ISKAKGQPRE PQVYTLPPSR DELTKNQVSL TCLVKGFYPS DIAVEWESNG QPENNYKTTP PVLDSDGSFF LYSKLTVDKS RWQQGNVFSC SVMHEALHNH YTQKSLSLSP GK |
| TALL-l-12-8-a | 117 | MSDDCMYDQL TRMFICSNLG GGGGVDKTHT CPPCPAPELL GGPSVFLFPP KPKDTLMISR TPEVTCVWD VSHEDPEVKF NWYVDGVEVH NAKTKPREEQ YNSTYRWSV LTVLHQDWLN GKEYKCKVSN KALPAPIEKT ISKAKGQPRE PQVYTLPPSR DELTKNQVSL TCLVKGFYPS DIAVEWESNG QPENNYKTTP PVLDSDGSFF LYSKLTVDKS RWQQGNVFSC SVMHEALHNH YTQKSLSLSP GK |
| TAI,L-l-12-9-a | 118 | MDLNCKYDEL TYKEWCQFNG GGGGVDKTHT CPPCPAPELL GGPSVFLFPP KPKDTLMISR TPEVTCVWD VSHEDPEVKF NWYVDGVEVH NAKTKPREEQ YNSTYRWSV LTVLHQDWLN GKEYKCKVSN KALPAPIEKT ISKAKGQPRE PQVYTLPPSR DELTKNQVSL TCLVKGFYPS DIAVEWESNG QPENNYKTTP PVLDSDGSFF LYSKLTVDKS RWQQGNVFSC SVMHEALHNH YTQKSLSLSP GK |
| TALL-l-12-10-a | 119 | MFHDCKYDLL TRQMVCHGLG GGGGYDKTHT CPPCPAPELL GGPSVFLFPP KPKDTLMISR TPEVTCVWD VSHEDPEVKF NWYVDGVEVH NAKTKPREEQ YNSTYRWSV LTVLHQDWLN GKEYKCKVSN KALPAPIEKT ISKAKGQPRE PQVYTLPPSR DELTKNQVSL TCLVKGFYPS DIAVEWESNG QPENNYKTTP PVLDSDGSFF LYSKLTVDKS RWQQGNVFSC SVMHEALHNH YTQKSLSLSP GK |
PL 210 546 B1
| Ciało peptydowe | SEQ ID NO (C.P.) | Sekwencja peptydu |
| TALL-l-12-ll-a | 120 | MRNHCFWDHL LEQDICPSPG GGGGVDKTHT CPPCPAPELL GGPSVFLFPP EPKDTLMISR TPEVTCVWD VSHEDPEVKF NWYVDGVEVH NAKTKPREEQ YNSTYRWSV LTVLHQDWLN GKEYKCKVSN KALPAPIEKT ISKAKGQPRE PQVYTLPPSR DELTKNQVSL TCLVKGFYPS DIAVEWESNG QPENNYKTTP PVLDSDGSFF LYSKLTVDKS RWQQGNVFSC SVMHEALHNH YTQKSLSLSP GK |
| TALL-1 -12- 14-a | 121 | MANQCWWDSL TKKNVCEFFG GGGGVDKTHT CPPCPAPELL GGPSVFLFPP KPKDTLMISR TPEVTCVWD VSHEDPEVKF NWYVDGVEVH NAKTKPREEQ YNSTYRWSV LTVLHQDWLN GKEYKCKVSN KALPAPIEKT ISKAKGQPRE PQVYTLPPSR DELTKNQVSL TCLVKGFYPS DIAVEWESNG QPENNYKTTP PVLDSDGSFF LYSKLTVDKS RWQQGNVFSC SVMHEALHNH YTQKSLSLSP GK |
| zgodny TALL-1 | 122 | MFHDCKWDLL TKQWVCHGLG GGGGVDKTHT CPPCPAPELL GGPSVFLFPP KPKDTLMISR TPEVTCVWD VSHEDPEVKF NWYVDGVEVH NAKTKPREEQ YNSTYRWSV LTVLHQDWLN GKEYKCKVSN KALPAPIEKT ISKAKGQPRE PQVYTLPPSR DELTKNQVSL TCLVKGFYPS DIAVEWESNG QPENNYKTTP PVLDSDGSFF LYSKLTVDKS RWQQGNVFSC SVMHEALHNH YTQKSLSLSP GK |
| Dimer tandemowy TALL-1 12-3 | 123 | MLPGCKWDLL IKQWVCDPLG SGSATGGSGS TASSGSGSAT HMLPGCKWDL LIKQWVCDPL GGGGGVDKTH TCPPCPAPEL LGGPSVFLFP PKPKDTLMIS RTPEVTCVW DVSHEDPEVK FNWYVDGVEV HNAKTKPREE QYNSTYRWS VLTVLHQDWL NGKEYKCKVS NKALPAPIEK TISKAKGQPR EPQVYTLPPS RDELTKNQVS LTCLVKGFYP SDIAVEWESN GQPENNYKTT PPVLDSDGSF FLYSKLTVDK SRWQQGNVFS CSVMHEALHN HYTQKSLSLS PGK |
| zgodny dimer tandemowy TALL-1 | 124 | MFHDCKWDLL TKQWVCHGLG SGSATGGSGS TASSGSGSAT HMFHDCKWDL LTKQWVCHGL GGGGGVDKTH TCPPCPAPEL LGGPSVFLFP PKPKDTLMIS RTPEVTCVW DVSHEDPEVK FNWYVDGVEV HNAKTKPREE QYNSTYRWS VLTVLHQDWL NGKEYKCKVS NKALPAPIEK TISKAKGQPR EPQVYTLPPS RDELTKNQVS LTCLVKGFYP SDIAVEWESN GQPENNYKTT PPVLDSDGSF FLYSKLTVDK SRWQQGNVFS CSVMHEALHN HYTQKSLSLS PGK |
PL 210 546 B1
T a b l i c a 6
Sekwencje oligonukleotydów stosowanych w konstruowaniu ciał peptydowych
| Nr identyfikacyjny oligonukleotydu | SEQ ID NO: | Sekwencja |
| 1 | 2 | 3 |
| 2517-24 | 71 | TAT GCC GGG TAC TTG TTT CCC GTT CCC GTG GGA ATG CAC TCA CGC TGG TGG AGG CGG TGG GG |
| 2517-25 | 72 | TCG ACC CCA CCG CCT CCT GGA GCG TGA GTG CAT TCC CAC GGG AAG CCG AAA CAA GTA CCC GGC A |
| 2517-26 | 73 | TAT GTG GGG TGC TTG TTG GCC GTT CCC GTG GGA ATG TTT CAA AGA AGG TGG AGG CGG TGG GG |
| 2517-27 | 74 | TCG ACC CCA CCG CCT CCA CCT TCT TTG AAA CAT TCC CACGGG AAC GGC CAA CAAGCA CCC CAC A |
| 2517-28 | 75 | TAT GGT TCC GTT CTG TGA CCT GCT GAC TAA ACA CTG TTT CGA AGC TGG TGG AGG CGG TGG GG |
| 2517-29 | 76 | TCG ACC CCA CCG CCT CCA CCA GCT TCG AAA CAG TGT TTA GTC AGC AGG TCA CAGAAC GGA ACC A |
| 2517-30 | 77 | TAT GGG TTC TCG TTG TAA ATA CAA ATG GGA CGT TCT GAC TAA ACA GTG TTT CCA CCA CGG TGG AGG CGG TGG GG |
| 2517-31 | 78 | TCG ACC CCA CCG CCT CCA CCG TGG TGG AAA CAC TGT TTA GTC AGA ACG TCC CAT TTG TAT TTA CAA CGA GAA CCC A |
| 2517-32 | 79 | TAT GCT GCC GGG TTG TAA ATG GGA CCT GCT GAT CAA ACA GTG GGT TTG TGA CCC GCT GGG TGG AGG CGG TGG GG |
| 2517-33 | 80 | TCG ACC CCA CCG CCT CCA CCC AGC GGG TCA CAA ACC CAC TGT TTG ATC AGC AGG TCC CAT TTA CAA CCC GGC AGC A |
| 2517-34 | 81 | TAT GTC TGC TGA CTG TTA CTT CGA CAT CCT GAC TAA ATC TGA CGT TTG TAC TTC TTC TGG TGG AGG CGG TGG GG |
| 2517-35 | 82 | TCG ACC CCA CCG CCT CCA CCA GAA GAA GTA CAA ACG TCA GAT TTA GTC AGG ATG TCG AAG TAA CAG TCA GCA GAC A |
| 2517-36 | 83 | TAT GTC TGA CGA CTG TAT GTA CGA CCA GCT GAC TCG TAT GTT CAT CTG TTC TAA CCT GGG TGG AGG CGG TGG GG |
| 2517-37 | 84 | TCG ACC CCA CCG CCT CCA CCC AGG TTA GAA CAG ATG AAC ATA CGA GTC AGC TGG TCG TAC ATA CAG TCG TCA GAC A |
| 2521-92 | 85 | TAT GGA CCT GAA CTG TAA ATA CGA CGA ACT GAC TTA CAA AGA ATG GTG TCA GTT CAA CGG TGG AGG CGG TGG GG |
| 2521-93 | 86 | TCG ACC CCA CCG CCT CCA CCG TTG AAC TGA CAC CAT TCT TTG TAA GTC AGTTCG TCG TAT TTA CAG TTC AGG TCC A |
| 2521-94 | 87 | TAT GTT CCA CGA CTG TAA ATA CGA CCT GCT GAC TCG TCA GAT GGT TTG TCA CGG TCT GGG TGG AGG CGG TGG GG |
| 2521-95 | 88 | TCG ACC CCA CCG CCT CCA CCC AGA CCG TGA CAA ACC ATC TGA CGA GTC AGC AGG TCG TAT TTA CAG TCG TGG AAC A |
| 2521-96 | 89 | TAT GCG TAA CCA CTG TTT CTG GGA CCA CCT GCT GAA ACA GGA CAT CTG TCC GTC TCC GGG TGG AGG CGG TGG GG |
| 2521-97 | 90 | TCG ACC CCA CCG CCT CCA CCC GGA GAC GGA CAG ATG TCC TGT TTC AGC AGG TGG TCC CAG AAA CAG TGG TTA CGC A |
| 2521-98 | 91 | TAT GGC TAA CCA GTG TTG GTG GGA CTC TCT GCT GAA AAA AAA CGT TTG TGA ATT CTT CGG TGG AGG CGG TGG GG |
| 2521-99 | 92 | TCG ACC CCA CCG CCT CCA CCG AAG AAT TCA CAA ACG TTT TTT TTC AGC AGA GAG TCC CAC CAA CAC TGG TTA GCC A |
PL 210 546 B1 cd tablicy 6
| 1 | 2 | 3 |
| 2551-48 | 93 | TAT GTT CCA CGA CTG CAA ATG GGA CCT GCT GAC CAA ACA GTG GGT TTG CCA CGG TCT GGG TGG AGG CGG TGG GG |
| 2551-49 | 94 | TCG ACC CCA CCG CCT CCA CCC AGA CCG TGG CAA ACC CAC TGT TTG GTC AGC AGG TCC CAT TTG CAG TCG TGG AAC A |
Wektor pAMG21-RANK-Fc pAMG21. Plazmid ekspresji pAMG21 (ATCC numer dostępu 98113) może być wyprowadzony z wektora ekspresji pCFM1656 (ATCC #69576) będącego własnością firmy Amgen, który z kolei może być wyprowadzony z systemu wektorów ekspresji należącego do firmy Amgen opisanego w patencie nr US 4 710 473. Plazmid pCFM1656 można wyprowadzić z wcześniej opisanego plazmidu pCFM836 (patent nr US 4 710 473), poprzez:
• zniszczenie dwóch endogennych miejsc restrykcyjnych Ndel przez końcowe wypełnienie enzymem polimerazy T4, a następnie ligację tępego końca;
• zastąpienie sekwencji DNA między unikalnymi miejscami restrykcyjnymi Aatll oraz Clal zawierającej syntetyczny promotor PL podobnym fragmentem otrzymanym z pCFM636 (patent nr US 4 710 473) obejmującym ten promotor PL (patrz SEQ ID NO: 95, poniżej); oraz • podstawienie małej sekwencji DNA między unikalnymi miejscami restrykcyjnymi Clal oraz KpnI oligonukleotydem posiadającym sekwencję SEQ ID NO: 96.
SEQ ID NO: 95:
AatII
5' CTAATTCCGCTCTCACCTACCAAACAATGCCCCCCTGCAAAAAATAAATTCATAT3 ' TGCAGATTAAGGCGAGAGTGGATGGTTTGTTACGGGGGGACGTTTTTTATTTAAGTATA-AAAAAACATACAGATAACCATCTGCGGTGATAAATTATCTCTGGCGGTGTTGACATAAA_ TTTTTTGTATGTCTATTGGTAGACGCCACTATTTAATAGAGACCGCCACAACTGTATTT-TACCACTGGCGGTGATACTGAGCACAT 3'
-ATGGTGACCGCCACTATGACTCGTGTAGC 5'
Ciał
SEQ ID NO: 96:
' CGATTTGATTCTAGAAGGAGGAATAACATATGGTTAACGCGTTGGAATTCGGTAC 3'
3' TAAACTAAGATCTTCCTCCTTATTGTATACCAATTGCGCAACCTTAAGC 5'
Ciał KpnI
Plazmid ekspresji pAMG21 można następnie otrzymać z pCFM1656 przez wykonanie serii zmian par zasad w wybranych miejscach metodą mutagenezy oligonukleotydów w zachodzących na siebie reakcjach PCR nakładanie mutagenezy oligonukleotydowej oraz podstawienia sekwencji DNA. Wychodząc z miejsca Bglll (w plazmidzie para zasad # 180) bezpośrednio 5' w stosunku do promotora PcopB replikacji plazmidu i kierując się ku genom replikacji plazmidu zmiany par zasad (pz) są zgodne z tym, co zawiera tablica 7, poniżej.
T a b l i c a 7
Zmiany par zasad prowadzące do powstania pAMG21
| pAMG21 pz # | pz w pCFM1656 | pz zmienione w pAMG21 na |
| 1 | 2 | 3 |
| # 204 | T/A | C/G |
| # 428 | A/T | G/C |
| # 509 | G/C | A/T |
PL 210 546 B1 cd tablicy 7
| 1 | 2 | 3 |
| # 617 | - | wstawienie 2 pz G/C |
| # 679 | G/C | T/A |
| # 980 | T/A | C/G |
| # 994 | G/C | A/T |
| #1004 | A/T | C/G |
| # 1007 | C/G | T/A |
| # 1028 | A/T | T/A |
| # 1047 | C/G | T/A |
| #1178 | G/C | T/A |
| # 1466 | G/C | T/A |
| # 2028 | G/C | delecja |
| # 2187 | C/G | T/A |
| # 2480 | A/T | T/A |
| # 2499-2502 | AGTG | GTCA |
| TCAC | CAGT | |
| # 2642 | TCCGAGC AGGCTCG | delecja 7 pz |
| # 3435 | G/C | A/T |
| # 3446 | G/C | A/T |
| # 3643 | A/T | A/T |
Sekwencja DNA między unikalnymi miejscami restrykcyjnymi Aatll (pozycja # 4364 w PC-FM1656) oraz SacII (pozycja # 4585 w pCFM1656) jest podstawiona następującą sekwencją DNA (SEQ ID NO: 97):
[Aatll lepki koniec] 5' GCGTAACGTATGCATGGTCTCC(pozycja #4358 w pAMG21) 3' TGCACGCATTGCATACGTACCAGAGG- CCATGCGAGAGTAGGGAACTGCCAGGCATCAAATAAAACGAAAGGCTCAGTCGAAAGACT -GGTACGCTCTCATCCCTTGACGGTCCGTAGTTTATTTTGCTTTCCGAGTCAGCTTTCTGA-gggcctttcgttttatctgttgtttgtcggtgaacgctctcctgagtaggacaaatccgc
-CCCGGAAAGCAAAATAGACAACAAACAGCCACTTGCGAGAGGACTCATCCTGTTTAGGCG-CGGGAGCGGATTTGAACGTTGCGAAGCAACGGCCCGGAGGGTGGCGGGCAGGACGCCCGC
-gccctcgcctaaacttgcaacgcttcgttgccgggcctcccaccgcccgtcctgcgggcg-CATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCGT-GTATTTGACGGTCCGTAGTTTAATTCGTCTTCCGGTAGGACTGCCTACCGGAAAAACGCAAatll
-TTCTACAAACTCTTTTGTTTATTTTTCTAAATACATTCAAATATGGACGTCGTACTTAAC-aagatgtttgagaaaacaaataaaaagatttatgtaagtttatacctgcagcatgaattg- TTTTAAAGTATGGGCAATCAATTGCTCCTGTTAAAATTGCTTTAGAAATACTTTGGCAGC -AAAATTTCATACCCGTTAGTTAACGAGGACAATTTTAACGAAATCTTTATGAAACCGTCG-ggtttgttgtattgagtttcatttgcgcattggttaaatggaaagtgaccgtgcgcttac -CCAAACAACATAACTCAAAGTAAACGCGTAACCAATTTACCTTTCACTGGCACGCGAATG- TACAGCCTAATATTTTTGAAATATCCCAAGAGCTTTTTCCTTCGCATGCCCACGCTAAAC -ATGTCGGATTATAAAAACTTTATAGGGTTCTCGAAAAAGGAAGCGTACGGGTGCGATTTGATTCTTTTTCTCTTTTGGTTAAATCGTTGTTTGATTTATTATTTGCTATATTTATTTTTC TAAGAAAAAGAGAAAACCAATTTAGC AACAAACTAAATAATAAACGATATAAATAAAAAG gataattatcaactagagaaggaacaattaatggtatgttcatacacgcatgtaaaaata·
CTATTAATAGTTGATCTCTTCCTTGTTAATTACCATACAAGTATGTGCGTACATTTTTAT
PL 210 546 B1
AACTATCTATATAGTTGTCTTTCTCTGAATGTGCAAAACTAAGCATTCCGAAGCCATTAT
TTGATAGATATATCAACAGAAAGAGACTTACACGTTTTGATTCGTAAGGCTTCGGTAATA
TAGCAGTATGAATAGGGAAACTAAACCCAGTGATAAGACCTGATGATTTCGCTTCTTTAA
ATCGTCATACTTATCCCTTTGATTTGGGTCACTATTCTGGACTACTAAAGCGAAGAAATT
TTACATTTGGAGATTTTTTATTTACAGCATTGTTTTCAAATATATTCCAATTAATCGGTG
AATGTAAACCTCTAAAAAATAAATGTCGTAACAAAAGTTTATATAAGGTTAATTAGCCAC
AATGATTGGAGTTAGAATAATCTACTATAGGATCATATTTTATTAAATTAGCGTCATCAT TTACTAACCTCAATCTTATTAGATGATATCCTAGTATAAAATAATTTAATCGCAGTAGTA
AATATTGCCTCCATTTTTTAGGGTAATTATCCAGAATTGAAATATCAGATTTAACCATAG
TTATAACGGAGGTAAAAAATCCCATTAATAGGTCTTAACTTTATAGTCTAAATTGGTATC
AATGAGGATAAATGATCGCGAGTAAATAATATTCACAATGTACCATTTTAGTCATATCAG
TTACTCCTATTTACTAGCGCTCATTTATTATAAGTGTTACATGGTAAAATCAGTATAGTC
ATAAGCATTGATTAATATCATTATTGCTTCTACAGGCTTTAATTTTATTAATTATTCTGTTATTCGTAACTAATTATAGTAATAACGAAGATGTCCGAAATTAAAATAATTAATAAGACAAAGTGTCGTCGGCATTTATGTCTTTCATACCCATCTCTTTATCCTTACCTATTGTTTGTCTTCACAGCAGCCGTAAATACAGAAAGTATGGGTAGAGAAATAGGAATGGATAACAAACAG-GCAAGTTTTGCGTGTTATATATCATTAAAACGGTAATAGATTGACATTTGATTCTAATAA-CGTTCAAAACGCACAATATATAGTAATTTTGCCATTATCTAACTGTAAACTAAGATTATT-ATTGGATTTTTGTCACACTATTATATCGCTTGAAATACAATTGTTTAACATAAGTACCTG-TAACCTAAAAACAGTGTGATAATATAGCGAACTTTATGTTAACAAATTGTATTCATGGAC-TAGGATCGTACAGGTTTACGCAAGAAAATGGTTTGTTATAGTCGATTAATCGATTTGATT-ATCCTAGCATGTCCAAATGCGTTCTTTTACCAAACAATATCAGCTAATTAGCTAAACTAA-CTAGATTTGTTTTAACTAATTAAAGGAGGAATAACATATGGTTAACGCGTTGGAATTCGA-GATCTAAACAAAATTGATTAATTTCCTCCTTATTGTATACCAATTGCGCAACCTTAAGCTSacII
-GCTCACTAGTGTCGACCTGCAGGGTACCATGGAAGCTTACTCGAGGATCCGCGGAAAGAA-CGAGTGATCACAGCTGGACGTCCCATGGTACCTTCGAATGAGCTCCTAGGCGCCTTTCTT-GAAGAAGAAGAAGAAAGCCCGAAAGGAAGCTGAGTTGGCTGCTGCCACCGCTGAGCAATA-CTTCTTCTTCTTCTTTCGGGCTTTCCTTCGACTCAACCGACGACGGTGGCGACTCGTTAT-ACTAGCATAACCCCTTGGGGCCTCTAAACGGGTCTTGAGGGGTTTTTTGCTGAAAGGAGG-TGATCGTATTGGGGAACCCCGGAGATTTGCCCAGAACTCCCCAAAAAACGACTTTCCTCC-AACCGCTCTTCACGCTCTTCACGC 3' [SacII lepki koniec]
-TTGGCGAGAAGTGCGAGAAGTG 51 (pozycja #5904 w pAMG21)
Podczas ligowania lepkich końców tej sekwencji podstawionego DNA części na zewnątrz w stosunku do miejsc Aatll oraz SacII są niszczone. W podstawionej sekwencji DNA są unikalne miejsca Aatll oraz SacII.
Gen kodujący ludzki RANK w fuzji przez N-koniec z Fc ligowano do pAMG21 jako fragment od Ndel do BamHI uzyskując szczep # 4125 należący do firmy Amgen. Ten konstrukt zmodyfikowano, aby wstawić kodon waliny w miejscu połączenia RANK i Fc. Sąsiadujące ze sobą kodony waliny i kwasu asparaginowego tworzą unikalne miejsce SalI. Pozwala to na fuzję peptydów przez N-koniec Fc3 między unikalnymi miejscami Ndel i SalI. Sekwencję RANK usuwa się po wprowadzeniu nowego fragmentu Ndel-SalI. Sekwencję wektora przedstawiono na rysunku fig. 5A do 5M.
PL 210 546 B1
GM221 (Amgen # 2596)
Szczep gospodarza należący do firmy Amgen # 2596 jest szczepem E. coli K-12 wyprowadzonym z należącego do firmy Amgen szczepu # 393, który jest wyprowadzony z E. coli W1485, otrzymanego z E. coli Genetic Stock Center, Yale University, New Haven, Connecticut (CGSC szczep 6159). Został on zmodyfikowany tak, aby obejmował wrażliwy na temperaturę represor lambda cI857s7 we wczesnym obszarze ebg oraz represor laclQ w późnym obszarze ebg (68 minut). Obecność tych dwóch represorów pozwala na wykorzystywanie tego gospodarza w różnorodnych układach ekspresji, jednakże oba te represory nie mają znaczenia przy ekspresji z IuxPR. Nie transformowany gospodarz nie ma jakiejkolwiek odporności na antybiotyki.
Miejsce wiązania rybosomu w genie cI857s7 zmodyfikowano, aby objęło uwydatnione RBS (miejsce wiązania rybosomu). Wprowadzono je do operonu ebg między pozycje nukleotydowe 1170 oraz 1411, według numeracji przyjętej w przypadku o numerze dostępu w Genbank w M64441Gb_Ba z delecją leżącej między nimi sekwencji ebg. Sekwencja insertu jest przedstawiona poniżej, gdzie małymi literami zapisano sekwencje ebg na flankach insertu (SEQ ID NO: 98):
ttattttcgtGCGGCCGCACCATTATCACCGCCAGAGGTAAACTAGTCAACACGCACGGTGTTAGATAT
TTATCCCTTGCGGTGATAGATTGAGCACATCGATTTGATTCTAGAAGGAGGGATAATATATGAG
CACAAAAAAGAAACCATTAACACAAGAGCAGCTTGAGGACGCACGTCGCCTTAAAGCAATTTAT
GAAAAAAAGAAAAATGAACTTGGCTTATCCCAGGAATCTGTCGCAGACAAGATGGGGATGGGGC
AGTCAGGCGTTGGTGCTTTATTTAATGGCATCAATGCATTAAATGCTTATAACGCCGCATTGCT
TACAAAAATTCTCAAAGTTAGCGTTGAAGAATTTAGCCCTTCAATCGCCAGAGAATCTACGAGA
TGTATGAAGCGGTTAGTATGCAGCCGTCACTTAGAAGTGAGTATGAGTACCCTGTTTTTTCTCA
TGTTCAGGCAGGGATGTTCTCACCTAAGCTTAGAACCTTTACCAAAGGTGATGCGGAGAGATGG
GTAAGCACAACCAAAAAAGCCAGTGATTCTGCATTCTGGCTTGAGGTTGAAGGTAATTCCATGA
CCGCACCAACAGGCTCCAAGCCAAGCTTTCCTGACGGAATGTTAATTCTCGTTGACCCTGAGCA
GGCTGTTGAGCCAGGTGATTTCTGCATAGCCAGACTTGGGGGTGATGAGTTTACCTTCAAGAAA
CTGATCAGGGATAGCGGTCAGGTGTTTTTACAACCACTAAACCCACAGTACCCAATGATCCCAT
GCAATGAGAGTTGTTCCGTTGTGGGGAAAGTTATCGCTAGTCAGTGGCCTGAAGAGACGTTTGG
CTGATAGACTAGTGGATCCACTAGTgtttctgccc
Konstrukt ten dostarczono do chromosomu stosując fag rekombinacyjny o nazwie MMebgcI857s7 enhancedRBS # 4 w F'tet/393. Po rekombinacji i rozdziale, w komórce pozostaje wyłącznie chromosomalny insert opisany powyżej. Nadano mu nową nazwę F'tet/GM101. F'tet/GM101 został następnie zmodyfikowany przez dostarczenie konstruktu laclQ do operonu ebg pomiędzy pozycje nukleotydowe 2493 i 2937 według numeracji przyjętej w przypadku o numerze dostępu w Genbank M64441Gb_Ba z delecją leżącej między nimi sekwencji ebg. Sekwencja insertu jest przedstawiona poniżej, gdzie małymi literami zaznaczono sekwencje ebg na flankach insertu (SEQ ID NO: 99):
ggcggaaaccGACGTCCATCGAATGGTGCAAAACCTTTCGCGGTATGGCATGATAGCGCCCGGAAGA
GAGTCAATTCAGGGTGGTGAATGTGAAACCAGTAACGTTATACGATGTCGCAGAGTATGCCGGT
GTCTCTTATCAGACCGTTTCCCGCGTGGTGAACCAGGCCAGCCACGTTTCTGCGAAAACGCGGG
AAAAAGTCGAAGCGGCGATGGCGGAGCTGAATTACATTCCCAACCGCGTGGCACAACAACTGGC
GGGCAAACAGTCGCTCCTGATTGGCGTTGCCACCTCCAGTCTGGCCCTGCACGCGCCGTCGCAA
ATTGTCGCGGCGATTAAATCTCGCGCCGATCAACTGGGTGCCAGCGTGGTGGTGTCGATGGTAG
AACGAAGCGGCGTCGAAGCCTGTAAAGCGGCGGTGCACAATCTTCTCGCGCAACGCGTCAGTGG
GCTGATCATTAACTATCCGCTGGATGACCAGGATGCCATTGCTGTGGAAGCTGCCTGCACTAAT
GTTCCGGCGTTATTTCTTGATGTCTCTGACCAGACACCCATCAACAGTATTATTTTCTCCCATG
AAGACGGTACGCGACTGGGCGTGGAGCATCTGGTCGCATTGGGTCACCAGCAAATCGCGCTGTT
AGCGGGCCCATTAAGTTCTGTCTCGGCGCGTCTGCGTCTGGCTGGCTGGCATAAATATCTCACT
CGCAATCAAATTCAGCCGATAGCGGAACGGGAAGGCGACTGGAGTGCCATGTCCGGTTTTCAAC
AAACCATGCAAATGCTGAATGAGGGCATCGTTCCCACTGCGATGCTGGTTGCCAACGATCAGAT
GGCGCTGGGCGCAATGCGCGCCATTACCGAGTCCGGGCTGCGCGTTGGTGCGGATATCTCGGTA
GTGGGATACGACGATACCGAAGACAGCTCATGTTATATCCCGCCGTTAACCACCATCAAACAGG
ATTTTCGCCTGCTGGGGCAAACCAGCGTGGACCGCTTGCTGCAACTCTCTCAGGGCCAGGCGGT
GAAGGGCAATCAGCTGTTGCCCGTCTCACTGGTGAAAAGAAAAACCACCCTGGCGCCCAATACG
CAAACCGCCTCTCCCCGCGCGTTGGCCGATTCATTAATGCAGCTGGCACGACAGGTTTCCCGAC
TGGAAAGCGGACAGTAAGGTACCATAGGATCCaggcacagga
PL 210 546 B1
Konstrukt ten dostarczono do chromosomu stosując fag rekombinacyjny o nazwie AGebg-LacIQ #5 w F'tet/GM101. Po rekombinacji i rozdzieleniu w komórce pozostaje wyłącznie cliromosomalny insert opisany powyżej. Nadano mu nową nazwę F'tet/GM221. Episom F'tet został zakonserwowany przy użyciu oranżu akrydynowego w stężeniu 25 μg/ml w LB. Tak przetworzony szczep został zidentyfikowany jako wrażliwy na tetracyklinę i zachowany jako GM221.
Ekspresja w E. coli
Prowadzono hodowle wszystkich konstruktów fuzyjnych pAMG21-Fc w E. coli GM221 w temperaturze 37°C w pożywce Luria Broth. Indukcję ekspresji produktu genowego z promotora luxPR uzyskano po dodaniu syntetycznego autoinduktora: laktonu N-(3-oksoheksanoylo)-DL-homoseryny do pożywki hodowlanej w ilości zapewniającej końcowe stężenie 20 ng/ml. Hodowle inkubowano w temperaturze 37°C przez dalsze 3 godziny. Po upływie 3 godzin, hodowle bakteryjne badano pod mikroskopem na obecność ciał inkluzyjnych, a następnie zebrano je przez odwirowanie. Refrakcyjne ciała inkluzyjne obserwowano w indukowanych hodowlach, co wskazuje, że fuzje Fc były najchętniej produkowane w nierozpuszczalnych frakcjach w E. coli. Zbrylone komórki bezpośrednio poddano lizie na drodze ponownego przeprowadzenia ich w zawiesinę w próbce buforu Laenimli'ego zawierającego 10% β-merkaptoetanolu i analizowano metodą SDS-PAGE. W każdym przypadku, na żelu SDS PAGE obserwowano pasmo intensywnie wybarwione odczynnikiem Coomassie, o odpowiedniej masie cząsteczkowej.
P r z y k ł a d 3. Ciało peptydowe TALL-1 inhibituje proliferację komórek B, w której pośredniczy TALL-1
Mysie limfocyty B wyodrębniono ze śledzion C57BL/6 na drodze selekcji negatywnej (MACS CD43 (Ly-48) Microbeads, Miltenyi Biotech, Auburn, CA). Prowadzono trzy równoległe hodowle oczyszczonych komórek B (105) w środowisku MEM (10% termicznie inaktywowanego FCS, 5 x 10-5 M 2-merkaptoetanolu, 100 U/ml penicyliny, 100 μg/ml streptomycyny) na płytkach do hodowli tkankowych o 96-zagłębieniach z płaskim dnem stosując 10 ng/ml białka TALL-1 oraz 2 μg/ml koziego F(ab')2 antymysiej IgM (Jackson ImmunoResearch Laboratory, West Grove, Pennsylvania) oraz wskazane ilości rekombinacyjnego ciała peptydowego TALL-1 przez okres 4 dni w temperaturze 37°C, 5%) CO2. Oznaczono proliferację metodą przyłączenia znaczonej radioaktywnie 3[H] tymidyny po 18 godzinach inkubowania.
P r z y k ł a d 4. Ciało peptydowe TALL-1 blokuje wiązanie TALL-1 z jego receptorami
Ludzkim AGP3 (znanym także jako TALL-1, Khare i wsp., Proc. Natl. Acad. Sci. 97: 3370-3375, 2000) wstępnie powleczono Reacti-Gel 6x (Pierce) i zablokowano BSA. Próbki 100 pM i 40 pM ciała peptydowego AGP3 inkubowano z dodatkiem ludzkiego AGP3 we wskazanych stężeniach w temperaturze pokojowej przez 8 godzin przez wprowadzeniem ich na perełki pokryte ludzkim AGP3. Ilości związanego z perełkami ciała peptydowego oznaczono ilościowo stosując fluorescencyjnie (Cy5) znaczone kozie przeciwciało przeciw ludzkiemu białku Fc (Jackson Immuno Research). Sygnał wiązania jest proporcjonalny do stężenia wolnego ciała peptydowego w stanie równowagi wiązania. Równanie stałej równowagi (KD) uzyskano w wyniku nieliniowej regresji krzywych konkurencji stosując model z podwójną krzywą dla jednomiejscowego homogenicznego wiązania (KinEx™ software). KD dla wiązania ciała peptydowego AGP3 (SEQ ID NO: 123) z ludzkim AGP3 (rysunek fig. 9) wynosi 4 pM.
Zastosowano próbę neutralizacji BIAcore, aby ustalić czy to ciało peptydowe AGP3 może neutralizować wiązanie mysiego AGP-3, podobnie jak ludzkiego AGP3. Wszystkie eksperymenty przeprowadzano stosując BIAcore 3000 w temperaturze pokojowej. Ludzkie białko TACI-Fc (Xia et al, J. Exp. Med. 192, 137-144, 2000) zostało unieruchomione na chipie B1 stosując 10 mM octan o pH 4,0 do poziomu 2900 RU. Ślepy przepływ komórek wykorzystano jako kontrolę tła. Stosując przepływ zbuforowanej solanki PBS (bez wapnia ani magnezu) zawierającej 0,005% P2O, 1 nM roztwór rekombinacyjnego ludzkiego AGP3 (w takim samym buforze z dodatkiem 0,1 mg/ml BSA) inkubowano bez dodatków oraz z dodatkiem wskazanych różnych ilości ciała peptydowego AGP3 (oś x) przed naniesieniem na powierzchnię receptora. Regenerację prowadzono stosując 8 mM glicyny o pH 1,5 przez 1 minutę, 25 mM kwas 3-cykloheksylamino]-1-propanosulfonowy (CAPS) o pH 10,5, 1 M NaCl przez 1 minutę. W celu oznaczenia wiązania mysiego AGP3, ludzki znaczony histydyną TAGI unieruchomiono do poziomu 1000 RU w wyżej podanym buforze. 5 nM rekombinacyjny mysi AGP3 (w tym buforze z dodatkiem 0,1 mg/ml BSA) inkubowano bez dodatku oraz z dodatkiem różnych ilości - wskazanych na rysunku fig. 11 - ciała peptydowego AGP3 (oś x) przed naniesieniem na powierzchnię receptora. Regenerację prowadzono stosując 10 mM HCl o pH 2, dwa razy po 30 sekund. Mierzono (oś y) względne wiązanie zarówno ludzkiego, jak i mysiego białka AGP3 w obecności i bez obecności ciała
PL 210 546 B1 peptydowego AGP3 (SEQ ID NO: 123). Oznaczono względną odpowiedź na wiązanie jako (RU-RU ślepej próby/RUo-RU ślepej próby). Ciało peptydowe AGP3 (SEQ ID NO: 123) inhibitowało wiązanie zarówno ludzkiego, jak i mysiego białka AGP3 do ich receptora TACI (rysunek fig. 10A i 10B).
W celu zbadania, czy to ciało peptydowe AGP3 blokuje wiązanie AGP3 ze wszystkimi trzema receptorami (TACI, BCMA oraz BAFFR), rekombinacyjne rozpuszczalne białka receptorów TACI, BCMA oraz BAFFR unieruchomiono na chipie CM5. Stosując 10 mM octan o pH4, ludzki TACI-Fc unieruchomiono do 6300 RU, ludzki BCMA-Fc - do 5000 RU, a BAFFR-Fc - do 6000 RU. 1 nM rekombinacyjne ludzkie AGP3 (w przepływającym buforze zawierającym 0,1 mg/ml BSA oraz 0,1 mg/ml heparyny) lub 1 nM rekombinacyjne białko APRIL (Yu, i wsp., Nat. Immunol., 1: 252-256, 2000) inkubowano wraz ze wskazanymi ilościami ciała peptydowego AGP3 przed naniesieniem na wszystkie powierzchnię receptora. Regenerację w doświadczeniu z AGP3 prowadzono stosując 8 mM glicyny o pH 1,5 przez 1 minutę, a następnie 25 mM CAPS o pH 10,5, 1M NaCl przez 1 minutę. Regenerację w doświadczeniu z APRIL prowadzono stosując 8 mM glicyny o pH 2 przez jedną minutę, a następnie 25 mM CAPS o pH 10,5, 1 M NaCl przez jedną minutę. Zmierzono względne wiązanie AGP3 lub APRIL. Ciało peptydowe AGP3 (SEQ ID NO: 123) blokowało wiązanie AGP3 ze wszystkimi trzema receptorami (rysunek fig. 11 A). Ciało peptydowe AGP3 nie miało wpływu na wiązanie APRIL z tymi receptorami (rysunek fig. 11B).
P r z y k ł a d 5. Ciało peptydowe AGP3 blokuje proliferację komórek B, w której pośredniczy
AGP3
Wyodrębniono mysie limfocyty B ze śledzion C57BL/6 w wyniku negatywnej selekcji. (MACS CD43 (Ly-48) Microbeads, Miltenyi Biotech, Aubum, CA). Prowadzono trzy równoległe hodowle oczyszczonych komórek B (105) w minimalnej pożywce podstawowej (MEM), z dodatkiem 10% inaktywowanej termicznie cielęcej surowicy płodowej (FCS), 5 x 10+5 M 2-merkaptoetanolu, 100 U/ml penicyliny, 100 μg/ml streptomycyny w płytkach do hodowli tkankowych o 96-zagłębieniach z płaskim dnem stosując 10 ng/ml białka AGP3 (TALL-1) oraz 2 μg/mL koziego F(ab')2 antymysiej IgM (Jackson ImmunoResearch Laboratory, West Grove, Pennsylvania) ze wskazaniem ilości rekombinacyjnego ciała peptydowego AGP3 (SEQ ID NO: 123) przez okres 4 dni w temperaturze 37°C, 5% CO2. Proliferację oznaczono metodą przyłączenia znaczonej radioaktywnie 3[H] tymidyny po 18 godzinach inkubowania.
P r z y k ł a d 6. Wpływ ciała peptydowego AGP3 na produkcję Ig stymulowaną przez ciało peptydowe AGP3 u myszy
Myszy (Balb/c płci żeńskiej w wieku 9-14 tygodni i o masie ciała 19-21 gramów) zakupiono w firmie Charles River Laboratories, Wilmington, MA. Myszom (n = 10) podawano dootrzewnowo raz dziennie 1 mg/Kg ludzkiego AGP3 przez pięć kolejnych dni, a następnie 5 mg/Kg lub 0,5 mg/Kg ciała peptydowego AGP3 (SEQ ID NO: 123), bądź solanki lub 5 mg/Kg ludzkiego białka Fc. Inne myszy pozostawiono bez leczenia. Myszy uśmiercono szóstego dnia w celu zmierzenia poziomu IgM oraz IgA w surowicy, dokonując tych pomiarów metodą ELISA. Zwięźle, płytki powleczono przeciwciałami wyłapującymi, specyficznie IgM lub IgA (Southern Biotechnology Associates, Birmingham, AL), a następnie zablokowano, po czym dodano wzorzec w różnych rozcieńczeniach (IgM z firmy Calbiochem, San Diego, CA oraz IgA z firmy Southern Biotechnology Associates) lub badane próbki. Wychwyconą Ig uwolniono stosując biotynylowane przeciwciała specyficzne wobec IgM lub IgA (Southern Biotechnology Associates), peroksydazę sprzężoną z neutrawidyną peroksydazy (Pierce, Rockford, IL) oraz substrat peroksydazy do mikrostudni z tetrametylobenzydyną (TMB) (KPL, Gaithersburg, MD). Gęstości optyczne oznaczono ilościowo przy użyciu czytnika Thermomax ELISA (Molecular Devices, Menlo Park, CA).
Stymulowany ludzkim białkiem AGP3 wzrost poziomów IgM oraz IgA w surowicy był blokowany przy użyciu 5 mg/Kg ciała peptydowego anty-AGP3 (SEQ ID NO: 123), a przy 0,5 mg/Kg (rysunek fig. 12A oraz 12B) - nie był blokowany.
P r z y k ł a d 7. Ciało peptydowe AGP3 obniżało ilość komórek B śledziony u myszy
Myszom (jak wyżej, n = 7) podawano dootrzewnowo przez siedem kolejnych dni 5 mg/Kg lub 1,5 mg/Kg, lub 0,5 mg/Kg ciała peptydowego AGP3 (SEQ ID NO: 123), bądź też solankę lub 5 mg/Kg ludzkiego białka Fc. Myszy uśmiercono ósmego dnia w celu policzenia ilości komórek B w śledzionie. Śledziony zebrano, umieszczono w solance i delikatnie rozerwano prowadząc ręczną homogenizację, otrzymując zawiesinę komórek. Zliczono wszystkie komórki stosując licznik HIE (Teclmicon, Tarrytown, NY). Udział procentowy komórek B wyliczono stosując podwójne immunofluorescencyjne wybarwianie oraz cytometrię przepływową stosując przeciwciała wobec CD3 i B220 skoniugowane, od46
PL 210 546 B1 powiednio, z izotiocyjanianem fluoresceiny (FITC) oraz fikoerytryną (PE) (FarMingen, San Diego, CA) i analizator FACScan (Becton and Dickinson, Mountain View, CA). Komórki B zidentyfikowano jako będące komórkami CD3-B220+. We wszystkich dawkach, ciało peptydowe AGP3 (SEQ ID NO: 123) obniżało ilość komórek B śledziony w sposób zależny od dawki (rysunek fig. 12A oraz 12B) (SEQ ID NO: 123).
T a b l i c a 8
Ciało peptydowe AGP3 obniża ilość komórek B u zwykłych myszy
| n = 7 | Dawka (1/dzień x 7) | Komórki B śledziony (1x10) | SD | t test |
| Solanka | 51,3 | 9,6 | ||
| Fc | 5 mg/Kg | 45,5 | 7,1 | |
| Ciało peptydowe | 5 mg/Kg | 20,1 | 3,8 | 1,37856E-05 |
| 1,5 mg/Kg | 22,6 | 6,9 | 5,10194E-05 | |
| 0,5 mg/Kg | 25,8 | 3,6 | 0,000111409 |
P r z y k ł a d 8. Ciało peptydowe AGP3 obniżało nasilenie zapalenia stawów w mysim modelu CIA
Myszy DBA/1 w wieku od 8 do 12 tygodni (otrzymane z Jackson Laboratories, Bar Harbor, ME) immunizowano bydlęcym kolagenem typu II (bCII) (kupionym od University of Utah), przeprowadzonym w emulsję w kompletnym adiuwancie Freunda (Difco), wstrzykiwanym podskórnie w nasadę ogona. Za każdym razem wstrzykiwano 100 μg bCII w 100 pi. 3 tygodnie po wstępnej immunizacji przyspieszano rozwój choroby stosując bCII przeprowadzony w emulsję w niekompletnym adiuwancie Freunda. Leczenie rozpoczęto od dnia powtórnej immunizacji i kontynuowano przez 4 tygodnie. Myszy badano odnotowując rozwój zapalenia stawów. Jak uprzednio opisano (Khare i wsp., J. Immunol. 155: 3653-9, 1995), wszystkie cztery łapy oceniano indywidualnie stosując skalę od 0 do 3. Zatem, łączna ocena nasilenia objawów zapalenia stawów mogła się zmieniać od 0 do 12 w przypadku każdego zwierzęcia. Leczenie ciałem peptydowym AGP3 (SEQ ID NO: 123) wyraźnie obniżało nasilenie objawów zapalenia stawów (rysunek fig. 13).
Próbki surowicy pobrano jeden tydzień po ostatnim podaniu badanego środka leczniczego (dzień 35) w celu oznaczenia poziom przeciwciał antykolagen. Wysoko wiążące płytki ELISA (Immulon, Nunc) pokryto 50 μl roztworu bydlęcego CII w buforze węglanowym, o stężeniu 4 μg/ml i pokryte płytki przechowywano przez noc w chłodzie, w lodówce. Płytki przemyto trzykrotnie zimną wodą. Użyto 75 μl roztworu blokującego o składzie PBS/0,05% Tween 20/1% BSA przez godzinę do zablokowania niespecyficznego wiązania. Próbki rozcieńczono (buforem blokującym) przy użyciu płytek do rozcieńczeń, w stosunku 1:25, 1:100, 1:400 oraz 1:1600, a następnie 25 μl tych próbek dodano do każdego wgłębienia na płytce ELISA, aby końcowe rozcieńczenia wynosiły 100, 400, 1600 oraz 6400 przy ostatecznej objętości 100 μl/wgłębienie. Po inkubowaniu w temperaturze pokojowej przez 3 godziny, płytki ponownie przemyto trzykrotnie. Dodano po 100 μl wtórnego przeciwciała rozcieńczonego w buforze blokującym (szczurze przeciwciało antymysia IgM, IgG2a, IgG2b, IgG1, IgG3-HRP) do każdego wgłębienia i płytki inkubowano przez co najmniej 2 godziny. Następnie, płytki przemyto czterokrotnie. Dodano 100 μl roztworu TMB (Sigma) do każdego wgłębienia i reakcję zatrzymano stosując 50 μl 25% kwasu siarkowego. Płytki odczytano stosując czytnik płytek ELISA przy 450 nm. OD porównano ze standardowym zbiorem danych wyrażonych w jednostkach/ml. Podawanie ciała peptydowego AGP3 (SEQ ID NO: 123) obniżało poziom przeciwciał antykolagen II IgG1, IgG3, IgG2a oraz IgG2b w surowicy w porównaniu z grupami kontrolnymi otrzymującymi PBS lub Fc (fig. 14).
P r z y k ł a d 9. Leczenie tocznia NZB/NZW u myszy ciałem peptydowym AGP3
Myszom ze skłonnością do tocznia NZBx NZBWF1, w wieku pięciu miesięcy podawano dootrzewnowo 3 x tydzień przez 8 tygodni PBS lub wskazane dawki ciała peptydowego AGP3, bądź ludzkiego białka Fc. Przed leczeniem wstępnie sprawdzono u zwierząt zawartość białka w moczu stosując paski z odczynnikiem Albustix (Bayer AG). Myszy, u których stwierdzono ponad 100 mg/dl białka w moczu nie zostały objęte badaniami. Białko w moczu oznaczano co miesiąc przez cały przez czas trwania eksperymentu. Podawanie ciała peptydowego AGP3 (SEQ ID NO: 123) opóźniało wystąpienie proteinurii oraz zwiększało przeżywalność (rysunek fig. 15A i 15B).
PL 210 546 B1
Lista Sekwencji <110> AMGEN INC.
<120> PEPTYDY ORAZ POKREWNE CZĄSTECZKI WIĄŻĄCE TALL-1 <130> A-743 (PCT) <140> PCT/US02/15273 <141> 2002-05-13 <150> US 60/290,196 <151> 2001-05-11 <160> 197 <170> Patentln version 3.2 <210> 1 <211> 684 <212> DNA <213> Homo sapiens <220>
<221> CDS <222> (1)..(684) <400> 1
| atg gac aaa | act Thr | cac aca | tgt Cys | cca Pro | cct Pro | tgt Cys 10 | cca Pro | gct Ala | ccg Pro | gaa Glu | ctc Leu 15 | ctg Leu | 48 | |||
| Met Asp 1 | Lys | His 5 | Thr | |||||||||||||
| ggg | gga | ccg | tca | gtc | ttc | ctc | ttc | ccc | cca | aaa | ccc | aag | gac | acc | ctc | 96 |
| Gly | Gly | Pro | Ser | Val | Phe | Leu | Phe | Pro | Pro | Lys | Pro | Lys | Asp | Thr | Leu | |
| 20 | 25 | 30 | ||||||||||||||
| atg | atc | tcc | cgg | acc | cct | gag | gtc | aca | tgc | gtg | gtg | gtg | gac | gtg | agc | 144 |
| Met | Ile | Ser | Arg | Thr | Pro | Glu | Val | Thr | Cys | Val | Val | Val | Asp | Val | Ser | |
| 35 | 40 | 45 | ||||||||||||||
| cac | gaa | gac | cct | gag | gtc | aag | ttc | aac | tgg | tac | gtg | gac | ggc | gtg | gag | 192 |
| His | Glu | Asp | Pro | Glu | Val | Lys | Phe | Asn | Trp | Tyr | Val | Asp | Gly | Val | Glu | |
| 50 | 55 | 60 | ||||||||||||||
| gtg | cat | aat | gcc | aag | aca | aag | ccg | cgg | gag | gag | cag | tac | aac | agc | acg | 240 |
| Val | His | Asn | Ala | Lys | Thr | Lys | Pro | Arg | Glu | Glu | Gin | Tyr | Asn | Ser | Thr | |
| 65 | 70 | 75 | 80 | |||||||||||||
| tac | cgt | gtg | gtc | agc | gtc | ctc | acc | gtc | ctg | cac | cag | gac | tgg | ctg | aat | 288 |
| Tyr | Arg | Val | Val | Ser | Val | Leu | Thr | Val | Leu | His | Gin | Asp | Trp | Leu | Asn | |
| 85 | 90 | 95 | ||||||||||||||
| ggc | aag | gag | tac | aag | tgc | aag | gtc | tcc | aac | aaa | gcc | ctc | cca | gcc | ccc | 336 |
| Gly | Lys | Glu | Tyr | Lys | Cys | Lys | Val | Ser | Asn | Lys | Ala | Leu | Pro | Ala | Pro | |
| 100 | 105 | 110 | ||||||||||||||
| atc | gag | aaa | acc | atc | tcc | aaa | gcc | aaa | ggg | cag | ccc | ega | gaa | cca | cag | 384 |
| Ile | Glu | Lys | Thr | Ile | Ser | Lys | Ala | Lys | Gly | Gin | Pro | Arg | Glu | Pro | Gin | |
| 115 | 120 | 125 |
PL 210 546 B1
| gtg Val | tac Tyr 130 | acc Thr | ctg Leu | ccc Pro | cca Pro | tcc Ser 135 | cgg Arg | gat Asp | gag Glu | ctg Leu | acc Thr 140 | aag Lys | aac Asn | cag Gin | gtc Val | 432 |
| agc | ctg | acc | tgc | ctg | gtc | aaa | ggc | ttc | tat | ccc | agc | gac | atc | gcc | gtg | 480 |
| Ser | Leu | Thr | Cys | Leu | Val | Lys | Gly | Phe | Tyr | Pro | Ser | Asp | Ile | Ala | Val | |
| 145 | 150 | 155 | 160 | |||||||||||||
| gag | tgg | gag | agc | aat | ggg | cag | ccg | gag | aac | aac | tac | aag | acc | acg | cct | 528 |
| Glu | Trp | Glu | Ser | Asn | Gly | Gin | Pro | Glu | Asn | Asn | Tyr | Lys | Thr | Thr | Pro | |
| 165 | 170 | 175 | ||||||||||||||
| ccc | gtg | ctg | gac | tcc | gac | ggc | tcc | ttc | ttc | ctc | tac | agc | aag | ctc | acc | 576 |
| Pro | Val | Leu | Asp | Ser | Asp | Gly | Ser | Phe | Phe | Leu | Tyr | Ser | Lys | Leu | Thr | |
| 180 | 185 | 190 | ||||||||||||||
| gtg | gac | aag | agc | agg | tgg | cag | cag | ggg | aac | gtc | ttc | tca | tgc | tcc | gtg | 624 |
| Val | Asp | Lys | Ser | Arg | Trp | Gin | Gin | Gly | Asn | Val | Phe | Ser | Cys | Ser | Val | |
| 195 | 200 | 205 | ||||||||||||||
| atg | cat | gag | gct | ctg | cac | aac | cac | tac | acg | cag | aag | agc | ctc | tcc | ctg | 672 |
| Met | His | Glu | Ala | Leu | His | Asn | His | Tyr | Thr | Gin | Lys | Ser | Leu | Ser | Leu | |
| 210 | 215 | 220 | ||||||||||||||
| tct | ccg | ggt | aaa | 684 | ||||||||||||
| Ser | Pro | Gly | Lys |
225 <210> 2 <211> 228 <212> PRT
| <213> Homo | sapiens | ||||||||||||||
| <400> 2 Met Asp 1 | > Lys | Thr | His 5 | Thr | Cys | Pro | Pro | Cys 10 | Pro | Ala | Pro | Glu | Leu 15 | Leu | |
| Gly | Gly | Pro | Ser 20 | Val | Phe | Leu | Phe | Pro 25 | Pro | Lys | Pro | Lys | Asp 30 | Thr | Leu |
| Met | Ile | Ser 35 | Arg | Thr | Pro | Glu | Val 40 | Thr | Cys | Val | Val | Val 45 | Asp | Val | Ser |
| His | Glu 50 | Asp | Pro | Glu | Val | Lys 55 | Phe | Asn | Trp | Tyr | Val 60 | Asp | Gly | Val | Glu |
| Val 65 | His | Asn | Ala | Lys | Thr 70 | Lys | Pro | Arg | Glu | Glu 75 | Gin | Tyr | Asn | Ser | Thr 80 |
| Tyr | Arg | Val | Val | Ser 85 | Val | Leu | Thr | Val | Leu 90 | His | Gin | Asp | Trp | Leu 95 | Asn |
| Gly | Lys | Glu | Tyr | Lys | Cys | Lys | Val | Ser | Asn | Lys | Ala | Leu | Pro | Ala | Pro |
100 105 110
PL 210 546 B1
Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gin Pro Arg Glu Pro Gin 115 120 125
Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Asp Glu Leu Thr Lys Asn Gin Val 130 135 140
Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val
145 150 155 160
Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gin Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro
165 170 175
Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr 180 185 190
Val Asp Lys Ser Arg Trp Gin Gin Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val 195 200 205
Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gin Lys Ser Leu Ser Leu 210 215 220
Ser Pro 225
Gly Lys <210> 3 <211> 62 <212> DNA <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Fragmenty Ndel do Sali <220>
<221> CDS <222> (2) .. (61) <400> 3 t atg ccg ggt act tgt ttc ccg ttc ccg tgg gaa tgc act cac gct ggt Met Pro Gly Thr Cys Phe Pro Phe Pro Trp Glu Cys Thr His Ala Gly 15 10 15 gga ggc ggt ggg g Gly Gly Gly Gly <210> 4 <211> 20 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Konstrukt Syntetyczny
PL 210 546 B1 <400> 4
Met Pro Gly Thr Cys Phe Pro Phe Pro Trp Glu Cys Thr His Ala Gly 15 10 15
Gly Gly Gly Gly 20
| <210> <211> <212> <213> | 5 62 DNA Sekwencja sztuczna |
| <220> | |
| <223> | Fragmenty Ndel do i |
| <220> | |
| <221> | CDS |
| <222> | (2) . . (61) |
| <400> | 5 |
| t atg | tgg ggt gct tgt tgg |
| Met | Trp Gly Ala Cys Trp |
| 1 | 5 |
| gga ggc ggt ggg g |
Gly Gly Gly Gly 20 <210> 6 <211> 20 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223>
Konstrukt Syntetyczny <400> 6
Met Trp Gly Ala Cys Trp Pro Phe Pro Trp Glu Cys Phe Lys Glu Gly 15 10 15
Gly Gly Gly Gly 20
| <210> | 7 |
| <211> | 62 |
| <212> | DNA |
| <213> | Sekwencja sztuczna |
| <220> | |
| <223> | Fragmenty Ndel do Salls |
| <220> | |
| <221> | CDS |
| <222> | (2) . . (61) |
PL 210 546 B1 <400> 7 t atg gtt ccg ttc tgt gac ctg ctg act aaa cac tgt ttc gaa get ggt Met Val Pro Phe Cys Asp Leu Leu Thr Lys His Cys Phe Glu Ala Gly 15 10 15 gga ggc ggt ggg g Gly Gly Gly Gly <210> 8 <211> 20 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Konstrukt Syntetyczny <400> 8
Met Val Pro Phe Cys Asp Leu Leu Thr Lys His Cys Phe Glu Ala Gly 15 10 15
Gly Gly Gly Gly 20
| <210> <211> <212> <213> | 9 74 DNA Sekwencja sztuczna |
| <220> | |
| <223> | Fragmenty Ndel do |
| <220> | |
| <221> | CDS |
| <222> | (2)..(73) |
| <400> | 9 |
| t atg | ggt tct cgt tgt aaa |
| Met | Gly Ser Arg Cys Lys |
ttc cac cac ggt gga ggc ggt ggg g Phe His His Gly Gly Gly Gly Gly
| <210> <211> <212> <213> | 10 24 PRT Sekwencja | sztuczna |
| <220> <223> | Konstrukt | Syntetyczny |
PL 210 546 B1 <400> 10
Met Gly Ser Arg Cys Lys Tyr Lys Trp Asp Val Leu Thr Lys Gin Cys 15 10 15
Phe His His Gly Gly Gly Gly Gly 20
| <210> <211> <212> <213> | 11 74 DNA Sekwencja sztuczna |
| <220> | |
| <223> | Fragmenty Ndel do ; |
| <220> | |
| <221> | CDS |
| <222> | (2) . . (73) |
| <400> | 11 |
| t atg | ctg ccg ggt tgt aaa |
| Met | Leu Pro Gly Cys Lys |
gac ccg ctg ggt gga ggc ggt ggg g Asp Pro Leu Gly Gly Gly Gly Gly <210> 12 <211> 24 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Konstrukt Syntetyczny <400> 12
Met Leu Pro Gly Cys Lys Trp Asp Leu Leu Ile Lys Gin Trp Val Cys 15 10 15
Asp Pro Leu Gly Gly Gly Gly Gly 20
| <210> | 13 |
| <211> | 74 |
| <212> | DNA |
| <213> | Sekwencja sztuczna |
| <220> | |
| <223> | Fragmenty Ndel do Salls |
| <220> | |
| <221> | CDS |
| <222> | (2)..(73) |
PL 210 546 B1 <400> 13 t atg tet gct gac tgt tac ttc gac atc ctg act aaa tet gac gtt tgt Met Ser Ala Asp Cys Tyr Phe Asp Ile Leu Thr Lys Ser Asp Val Cys 15 10 15 act tet tet ggt gga ggc ggt ggg g Thr Ser Ser Gly Gly Gly Gly Gly <210>
<211>
<212>
<213>
<220>
<223>
PRT
Sekwencja sztuczna
Konstrukt Syntetyczny <400> 14
Met Ser Ala Asp Cys Tyr Phe Asp Ile Leu Thr Lys Ser Asp Val Cys 15 10 15
Thr Ser Ser Gly Gly Gly Gly Gly 20
| <210> <211> <212> <213> | 15 74 DNA Sekwencja sztuczna |
| <220> | |
| <223> | Fragmenty Ndel do ! |
| <220> | |
| <221> | CDS |
| <222> | (2)..(73) |
| <400> | 15 |
| t atg | tet gac gac tgt atg |
| Met | Ser Asp Asp Cys Met |
tet aac ctg ggt gga ggc ggt ggg g Ser Asn Leu Gly Gly Gly Gly Gly <210> 16 <211> 24 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223>
Konstrukt Syntetyczny <400> 16
Met Ser Asp Asp Cys Met Tyr Asp Gin Leu Thr Arg Met Phe Ile Cys 15 10 15
PL 210 546 B1
Ser Asn Leu Gly Gly Gly Gly Gly 20
| <210> | 17 | ||
| <211> | 76 | ||
| <212> | DNA | ||
| <213> | Sekwencja | sztuczna | |
| <220> | |||
| <223> | Fragmenty | Ndel | do : |
| <220> | |||
| <221> | CDS | ||
| <222> | (2) . . (73) | ||
| <400> | 17 | ||
| t atg | gac ctg aac | ; tgt | aaa |
| Met | Asp Leu Asn | , Cys | Lys |
cag ttc aac ggg gtg gag gcg gtg ggg Gin Phe Asn Gly Val Glu Ala Val
| <210> | 18 |
| <211> | 24 |
| <212> | PRT |
| <213> | Sekwenc ja s z tuczna |
| <220> | |
| <223> | Konstrukt Syntetyczny |
| <400> | 18 |
| Met Asp | i Leu Asn Cys Lys Tyr , |
| 1 | 5 |
| Gin Phe | i Asn Gly Val Glu Ala ' |
| <210> | 19 |
| <211> | 74 |
| <212> | DNA |
| <213> | Sekwencja sztuczna |
| <220> | |
| <223> | Fragmenty Ndel do Salls |
| <220> | |
| <221> | CDS |
| <222> | (2) . . (73) |
PL 210 546 B1 <400> 19 t atg ttc cac gac tgt aaa tac gac ctg ctg act cgt cag atg gtt tgt Met Phe His Asp Cys Lys Tyr Asp Leu Leu Thr Arg Gin Met Val Cys 15 10 15 cac ggt ctg ggt gga ggc ggt ggg g His Gly Leu Gly Gly Gly Gly Gly <210> 20 <211> 24 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Konstrukt Syntetyczny <400> 20
Met Phe His Asp Cys Lys Tyr Asp Leu Leu Thr Arg Gin Met Val Cys 15 10 15
His Gly Leu Gly Gly Gly Gly Gly 20
| <210> | 21 | |
| <211> | 74 | |
| <212> | DNA | |
| <213> | Sekwencja sztuczna | |
| <220> | ||
| <223> | Fragmenty Ndel | do |
| <220> | ||
| <221> | CDS | |
| <222> | (2)..(73) | |
| <400> | 21 | |
| t atg | cgt aac cac tgt | ttc |
| Met | Arg Asn His Cys | Phe |
ccg tct ccg ggt gga ggc ggt ggg g Pro Ser Pro Gly Gly Gly Gly Gly <210> 22 <211> 24 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Konstrukt Syntetyczny
PL 210 546 B1 <400> 22
Met Arg Asn His Cys Phe Trp Asp His Leu Leu Lys Gin Asp Ile Cys 15 10 15
Pro Ser Pro Gly Gly Gly Gly Gly 20 <210> 23 <211> 74 <212> DNA <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Fragmenty Ndel do Salls <220>
<221> CDS <222> (2)..(73) <400> 23 t atg gct aac cag tgt tgg tgg gac tct ctg ctg aaa aaa aac gtt tgt Met Ala Asn Gin Cys Trp Trp Asp Ser Leu Leu Lys Lys Asn Val Cys 15 10 15 gaa ttc ttc ggt gga ggc ggt ggg g
Glu Phe Phe Gly Gly Gly Gly Gly 20 <210> 24 <211> 24 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Konstrukt Syntetyczny <400> 24
Met Ala Asn Gin Cys Trp Trp Asp Ser Leu Leu Lys Lys Asn Val Cys 15 10 15
Glu Phe Phe Gly Gly Gly Gly Gly 20
| <210> | 25 |
| <211> | 74 |
| <212> | DNA |
| <213> | Sekwencja sztuczna |
| <220> | |
| <223> | Fragmenty Ndel do Salls |
| <220> | |
| <221> | CDS |
| <222> | (2) . . (73) |
PL 210 546 B1 <400> 25 t atg ttc cac gac tgc aaa tgg gac ctg ctg acc aaa cag tgg gtt tgc Met Phe His Asp Cys Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Trp Val Cys 15 10 15 cac ggt ctg ggt gga ggc ggt ggg g His Gly Leu Gly Gly Gly Gly Gly <210> 26 <211> 24 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Konstrukt Syntetyczny <400> 26
Met Phe His Asp Cys Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Trp Val Cys 15 10 15
His Gly Leu Gly Gly Gly Gly Gly 20 <210> 27 <211> 7285 <212> DNA <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> wektor pAMG21-Rank-Fc <400> 27
| gatcagcagt | ccccggaaca | tcgtagctga | cgccttcgcg | ttgctcagtt | gtccaacccc | 60 |
| ggaaacggga | aaaagcaagt | tttccccgct | cccggcgttt | caataactga | aaaccatact | 120 |
| atttcacagt | ttaaatcaca | ttaaacgaca | gtaatccccg | ttgatttgtg | cgccaacaca | 180 |
| gatcttcgtc | acaattctca | agtcgctgat | ttcaaaaaac | tgtagtatce | tctgcgaaac | 240 |
| gatccctgtt | tgagtattga | ggaggcgaga | tgtogcagac | agaaaatgca | gtgacttcct | 300 |
| cattgagtca | aaagcggttt | gtgcgcagag | gtaagcctat | gactgactct | gagaaacaaa | 360 |
| tggccgttgt | tgcaagaaaa | cgtcttacac | acaaagagat | aaaagttttt | gtcaaaaatc | 420 |
| ctctgaagga | tctcatggtt | gagtactgcg | agagagaggg | gataacacag | gctcagttcg | 480 |
| ttgagaaaat | catcaaagat | gaactgcaaa | gactggatat | actaaagtaa | agactttact | 540 |
| ttgtggcgta | gcatgctaga | ttactgatcg | tttaaggaat | tttgtggctg | gccacgccgt | 600 |
| aaggtggcaa | ggaactggtt | ctgatgtgga | tttacaggag | ccagaaaagc | aaaaaccccg | 660 |
PL 210 546 B1
| ataatcttct | tcaacttttg | cgagtacgaa | aagattaccg | gggcccactt | aaaccgtata | 720 |
| gccaacaatt | cagctatgcg | gggagtatag | ttatatgccc | ggaaaagttc | aagacttctt | 780 |
| tctgtgctcg | ctccttctgc | gcattgtaag | tgcaggatgg | tgtgactgat | cttcaccaaa | 840 |
| cgtattaccg | ccaggtaaag | aacccgaatc | cggtgtttac | accccgtgaa | ggtgcaggaa | 900 |
| cgctgaagtt | ctgcgaaaaa | ctgatggaaa | aggcggtggg | cttcacttcc | cgttttgatt | 960 |
| tcgccattca | tgtggcgcac | gcccgttcgc | gtgatctgcg | tcgccgtatg | ccaccagtgc | 1020 |
| tgcgtcgtcg | ggctattgat | gcgctcttgc | aggggctgtg | tttccactat | gacccgctgg | 1080 |
| ccaaccgcgt | ccagtgctcc | atcaccacgc | tggccattga | gtgcggactg | gcgacggagt | 1140 |
| ctgctgccgg | aaaactctcc | atcacccgtg | ccacccgtgc | cctgacgttc | ctgtcagagc | 1200 |
| tgggactgat | tacctaccag | acggaatatg | acccgcttat | cgggtgctac | attccgaccg | 1260 |
| atatcacgtt | cacatctgca | ctgtttgctg | ccctcgatgt | atcagaggag | gcagtggccg | 1320 |
| ccgcgcgccg | cagccgtgtg | gtatgggaaa | acaaacaacg | caaaaagcag | gggctggata | 1380 |
| ccctgggcat | ggatgaactg | atagcgaaag | cctggcgttt | tgttcgtgag | cgttttcgca | 1440 |
| gttatcagac | agagcttaag | tcccgtggaa | taaagcgtgc | ccgtgcgcgt | cgtgatgcgg | 1500 |
| acagggaacg | tcaggatatt | gtcaccctgg | tgaaacggca | gctgacgcgc | gaaatcgcgg | 1560 |
| aagggcgctt | cactgccaat | cgtgaggcgg | taaaacgcga | agttgagcgt | cgtgtgaagg | 1620 |
| agcgcatgat | tctgtcacgt | aaccgtaatt | acagccggct | ggccacagct | tccccctgaa | 1680 |
| agtgacctcc | tctgaataat | ccggcctgcg | ccggaggctt | ccgcacgtct | gaagcccgac | 1740 |
| agcgcacaaa | aaatcagcac | cacatacaaa | aaacaacctc | atcatccagc | ttctggtgca | 1800 |
| tccggccccc | cctgttttcg | atacaaaaca | cgcctcacag | acggggaatt | ttgcttatcc | 1860 |
| acattaaact | gcaagggact | tccccataag | gttacaaccg | ttcatgtcat | aaagcgccat | 1920 |
| ccgccagcgt | tacagggtgc | aatgtatctt | ttaaacacct | gtttatatct | cctttaaact | 1980 |
| acttaattac | attcatttaa | aaagaaaacc | tattcactgc | ctgtccttgg | acagacagat | 2040 |
| atgcacctcc | caccgcaagc | ggcgggcccc | taccggagcc | gctttagtta | caacactcag | 2100 |
| acacaaccac | cagaaaaacc | ccggtccagc | gcagaactga | aaccacaaag | cccctccctc | 2160 |
| ataactgaaa | agcggccccg | ccccggtccg | aagggccgga | acagagtcgc | ttttaattat | 2220 |
| gaatgttgta | actacttcat | catcgctgtc | agtcttctcg | ctggaagttc | tcagtacacg | 2280 |
| ctcgtaagcg | gccctgacgg | occgctaacg | cggagatacg | ccccgacttc | gggtaaaccc | 2340 |
| tcgtcgggac | cactccgacc | gcgcacagaa | gctctctcat | ggctgaaagc | gggtatggtc | 2400 |
PL 210 546 B1
| tggcagggct | ggggatgggt | aaggtgaaat | ctatcaatca | gtaccggctt | acgccgggct | 2460 |
| tcggcggttt | tactcctgtt | tca ta ta tga | aacaacaggt | caccgccttc | catgccgctg | 2520 |
| atgcggcata | tcctggtaac | gatatctgaa | ttgttataca | tgtgtatata | cg tgg taa tg | 2580 |
| acaaaaatag | gacaagttaa | aaatttacag | gcgatgcaat | gattcaaaca | cgtaatcaat | 2640 |
| atcgggggtg | ggcgaagaac | tccagcatga | gatccccgcg | ctggaggatc | atccagccgg | 2700 |
| cgtcccggaa | aacgattccg | aagcccaacc | tttcatagaa | ggcggcggtg | gaatcgaaat | 2760 |
| ctcgtgatgg | caggttgggc | gtcgcttggt | cggtcatttc | gaaccccaga | gtcccgctca | 2820 |
| gaagaactcg | tcaagaaggc | gatagaaggc | gatgcgctgc | gaatcgggag | cggcgatacc | 2880 |
| gtaaagcacg | aggaagcggt | cagcccattc | gccgccaagc | tcttcagcaa | tatcacgggt | 2940 |
| agccaacgct | atgtcctgat | agcggtccgc | cacacccagc | cggccacagt | cgatgaatcc | 3000 |
| agaaaagcgg | ccattttcca | ccatgatatt | cggcaagcag | gcatcgccat | gagtcacgac | 3060 |
| gagatcctcg | ccgtcgggca | tgcgcgcctt | gagcctggcg | aacagttcgg | ctggcgcgag | 3120 |
| cccctgatgc | tcttcgtcca | gatcatcctg | atcgacaaga | ccggcttcca | tccgagtacg | 3180 |
| tgctcgctcg | atgcgatgtt | tcgcttggtg | gtcgaatggg | caggtagccg | gatcaagcgt | 3240 |
| atgcagccgc | cgcattgcat | cagccatgat | ggatactttc | tcggcaggag | caaggtgaga | 3300 |
| tgacaggaga | tcctgccccg | gcacttcgcc | caatagcagc | cagtcccttc | ccgcttcagt | 3360 |
| gacaacgtcg | agcacagctg | cgcaaggaac | gcccgtcgtg | gccagccacg | atagccgcgc | 3420 |
| tgcctcgtcc | tgcaattcat | tcaggacacc | ggacaggtcg | gtcttgacaa | aaagaaccgg | 3480 |
| gcgcccctgc | gctgacagcc | ggaacacggc | ggcatcagag | cagccgattg | tctgttgtgc | 3540 |
| ccagtcatag | ccgaatagcc | tctccaccca | agcggccgga | gaacctgcgt | gcaatccatc | 3600 |
| ttgttcaatc | atgcgaaacg | atcctcatcc | tgtctcttga | tctgatcttg | atcccctgcg | 3660 |
| ccatcagatc | cttggcggca | agaaagccat | ccagtttact | ttgcagggct | tcccaacctt | 3720 |
| accagagggc | gccccagctg | gcaattccgg | ttcgcttgct | gtccataaaa | ccgcccagtc | 3780 |
| tagctatcgc | catgtaagcc | cactgcaagc | tacctgcttt | ctctttgcgc | ttgcgttttc | 3840 |
| ccttgtccag | atagcccagt | agctgacatt | catccggggt | cagcaccgtt | tctgcggact | 3900 |
| ggctttctac | gtgttccgct | tcctttagca | gcccttgcgc | cctgagtgct | tgcggcagcg | 3960 |
| tgaagctaca | tatatgtgat | ccgggcaaat | cgctgaatat | tccttttgtc | tccgaccatc | 4020 |
| aggcacctga | gtcgctgtct | ttttcgtgac | attcagttcg | ctgcgctcac | ggctctggca | 4080 |
| gtgaatgggg | gtaaatggca | ctacaggcgc | cttttatgga | ttcatgcaag | gaaactaccc | 4140 |
PL 210 546 B1
| ataatacaag | aaaagcccgt | cacgggcttc | tcagggcgtt | ttatggcggg | tctgctatgt | 4200 |
| ggtgctatct | gactttttgc | tgttcagcag | ttcctgccct | ctgattttcc | agtctgacca | 4260 |
| cttcggatta | tcccgtgaca | ggtcattcag | actggctaat | gcacccagta | aggcagcggt | 4320 |
| atcatcaaca | ggcttacccg | tcttactgtc | gaagacgtgc | gtaacgtatg | catggtctcc | 4380 |
| ccatgcgaga | gtagggaact | gccaggcatc | aaataaaacg | aaaggctcag | tcgaaagact | 4440 |
| gggcctttcg | ttttatctgt | tgtttgtcgg | tgaacgctct | cctgagtagg | acaaatccgc | 4500 |
| cgggagcgga | tttgaacgtt | gcgaagcaac | ggcccggagg | gtggcgggca | ggacgcccgc | 4560 |
| cataaactgc | caggcatcaa | attaagcaga | aggccatcct | gacggatggc | ctttttgcgt | 4620 |
| ttctacaaac | tcttttgttt | atttttctaa | atacattcaa | atatggacgt | cgtacttaac | 4680 |
| ttttaaagta | tgggcaatca | attgctcctg | ttaaaattgc | tttagaaata | ctttggcagc | 4740 |
| ggtttgttgt | attgagtttc | atttgcgcat | tggttaaatg | gaaagtgacc | gtgcgcttac | 4800 |
| tacagoctaa | tatttttgaa | atatcccaag | agctttttcc | ttcgcatgcc | cacgctaaac | 4860 |
| attctttttc | tcttttggtt | aaatcgttgt | ttgatttatt | atttgctata | tttatttttc | 4920 |
| gataattatc | aactagagaa | ggaacaatta | atggtatgtt | catacacgca | tgtaaaaata | 4980 |
| aactatctat | atagttgtct | ttctctgaat | gtgcaaaact | aagcattccg | aagccattat | 5040 |
| tagcagtatg | aatagggaaa | ctaaacccag | tgataagacc | tgatgatttc | gcttctttaa | 5100 |
| ttacatttgg | agatttttta | tttacagcat | tgttttcaaa | tatattccaa | ttaatcggtg | 5160 |
| aatgattgga | gttagaataa | tctactatag | gatcatattt | tattaaatta | gcgtcatcat | 5220 |
| aatattgcct | ccatttttta | gggtaattat | ccagaattga | aatatcagat | ttaaccatag | 5280 |
| aatgaggata | aatgatcgcg | agtaaataat | attcacaatg | taccatttta | gtcatatcag | 5340 |
| ataagcattg | attaatatca | ttattgcttc | tacaggcttt | aattttatta | attattctgt | 5400 |
| aagtgtcgtc | ggcatttatg | tctttcatac | ccatctcttt | atccttacct | attgtttgtc | 5460 |
| gcaagttttg | cgtgttatat | atcattaaaa | cggtaataga | ttgacatttg | attctaataa | 5520 |
| attggatttt | tgtcacacta | ttatatcgct | tgaaatacaa | ttgtttaaca | taagtacctg | 5580 |
| taggatcgta | caggtttacg | caagaaaatg | gtttgttata | gtcgattaat | cgatttgatt | 5640 |
| ctagatttgt | tttaactaat | taaaggagga | ataacatatg | atcgctccac | catgcaccag | 5700 |
| tgagaagcat | tatgagcatc | tgggacggtg | ctgtaacaaa | tgtgaaccag | gaaagtacat | 5760 |
| gtcttctaaa | tgcactacta | cctctgacag | tgtatgtctg | ccctgtggcc | cggatgaata | 5820 |
| cttggatagc | tggaatgaag | aagataaatg | cttgctgcat | aaagtttgtg | atacaggcaa | 5880 |
PL 210 546 B1
| ggccctggtg | gccgtggtcg | ccggcaacag | tacgaccccc | cggcgctgcg | cgtgcacggc | 5940 |
| tgggtaccac | tggagccagg | actgcgagtg | ctgccgccgc | aacaccgagt | gcgcgccggg | 6000 |
| cctgggcgcc | cagcacccgt | tgcagctcaa | caaggacaca | gtgtgcaaac | cttgccttgc | 6060 |
| aggctacttc | tctgatgcct | tttcctccac | ggacaaatgc | agaccctgga | ccaactgtac | 6120 |
| cttccttgga | aagagagtag | aacatcatgg | gacagagaaa | tccgatgtgg | tttgcagttc | 6180 |
| ttctctgcca | gctagaaaac | caccaaatga | accccatgtt | tacgtcgaca | aaactcacac | 6240 |
| atgtccacct | tgtccagctc | cggaactcct | ggggggaccg | tcagtcttcc | tcttcccccc | 6300 |
| aaaacccaag | gacaccctca | tgatctcccg | gacccctgag | gtcacatgcg | tggtggtgga | 6360 |
| cgtgagccac | gaagaccctg | aggtcaagtt | caactggtac | gtggacggcg | tggaggtgca | 6420 |
| taatgccaag | acaaagccgc | gggaggagca | gtacaacagc | acgtaccgtg | tggtcagcgt | 6480 |
| cctcaccgtc | ctgcaccagg | actggctgaa | tggcaaggag | tacaagtgca | aggtctccaa | 6540 |
| caaagccctc | ccagccccca | tcgagaaaac | catctccaaa | gccaaagggc | agccccgaga | 6600 |
| accacaggtg | tacaccctgc | ccccatcccg | gga tgagc tg | accaagaacc | aggtcagcct | 6660 |
| gacctgcctg | gtcaaaggct | tctatcccag | cgacatcgcc | gtggagtggg | agagcaatgg | 6720 |
| gcagccggag | aacaactaca | agaccacgcc | tcccgtgctg | gactccgacg | gctccttctt | 6780 |
| cctctacagc | aagctcaccg | tggacaagag | caggtggcag | caggggaacg | tcttctcatg | 6840 |
| ctccgtgatg | catgaggctc | tgcacaacca | ctacacgcag | aagagcctct | ccctgtctcc | 6900 |
| gggtaaataa | tggatccgcg | gaaagaagaa | gaagaagaag | aaagcccgaa | aggaagctga | 6960 |
| gttggctgct | gccaccgctg | agcaataact | agcataaccc | cttggggcct | ctaaacgggt | 7020 |
| cttgaggggt | tttttgctga | aaggaggaac | cgctcttcac | gctcttcacg | cggataaata | 7080 |
| agtaacgatc | cggtccagta | atgacctcag | aactccatct | ggatttgttc | agaacgctcg | 7140 |
| gttgccgccg | ggcgtttttt | attggtgaga | atcgcagcaa | cttgtcgcgc | caatcgagcc | 7200 |
| atgtcgtcgt | caacgacccc | ccattcaaga | acagcaagca | gcattgagaa | ctttggaatc | 7260 |
| cagtccctct | tccacctgct | gac cg | 7285 |
<210> 28 <211> 7285
| <212> | PRT |
| <213> | Sekwencja sztuczna |
| <220> | |
| <223> | wektor pAMG21-Rank |
PL 210 546 B1 <220>
<221> inne cechy <223> Xaa (Ροζ .1,2,3,15,16,17) oznaczają niezależnie reszty aminokwasowe lub ich brak,
Xaa (Poz.5,6,7,9,13) oznaczają niezależnie reszty aminokwasowe, <400> 28
| Gly 1 | Ala | Thr | Cys | Ala 5 | Gly | Cys | Ala | Gly | Thr 10 | Cys | Cys | Cys | Cys | Gly 15 | Gly |
| Ala | Ala | Cys | Ala 20 | Thr | Cys | Gly | Thr | Ala 25 | Gly | Cys | Thr | Gly | Ala 30 | Cys | Gly |
| Cys | Cys | Thr 35 | Thr | Cys | Gly | Cys | Gly 40 | Thr | Thr | Gly | Cys | Thr 45 | Cys | Ala | Gly |
| Thr | Thr 50 | Gly | Thr | Cys | Cys | Ala 55 | Ala | Cys | Cys | Cys | Cys 60 | Gly | Gly | Ala | Ala |
| Ala 65 | Cys | Gly | Gly | Gly | Ala 70 | Ala | Ala | Ala | Ala | Gly 75 | Cys | Ala | Ala | Gly | Thr 80 |
| Thr | Thr | Thr | Cys | Cys 85 | Cys | Cys | Gly | Cys | Thr 90 | Cys | Cys | Cys | Gly | Gly 95 | Cys |
| Gly | Thr | Thr | Thr 100 | Cys | Ala | Ala | Thr | Ala 105 | Ala | Cys | Thr | Gly | Ala 110 | Ala | Ala |
| Ala | Cys | Cys 115 | Ala | Thr | Ala | Cys | Thr 120 | Ala | Thr | Thr | Thr | Cys 125 | Ala | Cys | Ala |
| Gly | Thr 130 | Thr | Thr | Ala | Ala | Ala 135 | Thr | Cys | Ala | Cys | Ala 140 | Thr | Thr | Ala | Ala |
| Ala 145 | Cys | Gly | Ala | Cys | Ala 150 | Gly | Thr | Ala | Ala | Thr 155 | Cys | Cys | Cys | Cys | Gly 160 |
| Thr | Thr | Gly | Ala | Thr 165 | Thr | Thr | Gly | Thr | Gly 170 | Cys | Gly | Cys | Cys | Ala 175 | Ala |
| Cys | Ala | Cys | Ala 180 | Gly | Ala | Thr | Cys | Thr 185 | Thr | Cys | Gly | Thr | Cys 190 | Ala | Cys |
| Ala | Ala | Thr 195 | Thr | Cys | Thr | Cys | Ala 200 | Ala | Gly | Thr | Cys | Gly 205 | Cys | Thr | Gly |
| Ala | Thr 210 | Thr | Thr | Cys | Ala | Ala 215 | Ala | Ala | Ala | Ala | Cys 220 | Thr | Gly | Thr | Ala |
| Gly 225 | Thr | Ala | Thr | Cys | Cys 230 | Thr | Cys | Thr | Gly | Cys 235 | Gly | Ala | Ala | Ala | Cys 240 |
| Gly | Ala | Thr | Cys | Cys 245 | Cys | Thr | Gly | Thr | Thr 250 | Thr | Gly | Ala | Gly | Thr 255 | Ala |
| Thr | Thr | Gly | Ala | Gly | Gly | Ala | Gly | Gly | Cys | Gly | Ala | Gly | Ala | Thr | Gly |
260 265 270
PL 210 546 B1
| Thr | Cys | Gly 275 | Cys | Ala | Gly | Ala | Cys 280 | Ala | Gly | Ala | Ala | Ala 285 | Ala | Thr | Gly |
| Cys | Ala 290 | Gly | Thr | Gly | Ala | Cys 295 | Thr | Thr | Cys | Cys | Thr 300 | Cys | Ala | Thr | Thr |
| Gly 305 | Ala | Gly | Thr | Cys | Ala 310 | Ala | Ala | Ala | Gly | Cys 315 | Gly | Gly | Thr | Thr | Thr 320 |
| Gly | Thr | Gly | Cys | Gly 325 | Cys | Ala | Gly | Ala | Gly 330 | Gly | Thr | Ala | Ala | Gly 335 | Cys |
| Cys | Thr | Ala | Thr 340 | Gly | Ala | Cys | Thr | Gly 345 | Ala | Cys | Thr | Cys | Thr 350 | Gly | Ala |
| Gly | Ala | Ala 355 | Ala | Cys | Ala | Ala | Ala 360 | Thr | Gly | Gly | Cys | Cys 365 | Gly | Thr | Thr |
| Gly | Thr 370 | Thr | Gly | Cys | Ala | Ala 375 | Gly | Ala | Ala | Ala | Ala 380 | Cys | Gly | Thr | Cys |
| Thr 385 | Thr | Ala | Cys | Ala | Cys 390 | Ala | Cys | Ala | Ala | Ala 395 | Gly | Ala | Gly | Ala | Thr 400 |
| Ala | Ala | Ala | Ala | Gly 405 | Thr | Thr | Thr | Thr | Thr 410 | Gly | Thr | Cys | Ala | Ala 415 | Ala |
| Ala | Ala | Thr | Cys 420 | Cys | Thr | Cys | Thr | Gly 425 | Ala | Ala | Gly | Gly | Ala 430 | Thr | Cys |
| Thr | Cys | Ala 435 | Thr | Gly | Gly | Thr | Thr 440 | Gly | Ala | Gly | Thr | Ala 445 | Cys | Thr | Gly |
| Cys | Gly 450 | Ala | Gly | Ala | Gly | Ala 455 | Gly | Ala | Gly | Gly | Gly 460 | Gly | Ala | Thr | Ala |
| Ala 465 | Cys | Ala | Cys | Ala | Gly 470 | Gly | Cys | Thr | Cys | Ala 475 | Gly | Thr | Thr | Cys | Gly 480 |
| Thr | Thr | Gly | Ala | Gly 485 | Ala | Ala | Ala | Ala | Thr 490 | Cys | Ala | Thr | Cys | Ala 495 | Ala |
| Ala | Gly | Ala | Thr 500 | Gly | Ala | Ala | Cys | Thr 505 | Gly | Cys | Ala | Ala | Ala 510 | Gly | Ala |
| Cys | Thr | Gly 515 | Gly | Ala | Thr | Ala | Thr 520 | Ala | Cys | Thr | Ala | Ala 525 | Ala | Gly | Thr |
| Ala | Ala 530 | Ala | Gly | Ala | Cys | Thr 535 | Thr | Thr | Ala | Cys | Thr 540 | Thr | Thr | Gly | Thr |
| Gly 545 | Gly | Cys | Gly | Thr | Ala 550 | Gly | Cys | Ala | Thr | Gly 555 | Cys | Thr | Ala | Gly | Ala 560 |
| Thr | Thr | Ala | Cys | Thr 565 | Gly | Ala | Thr | Cys | Gly 570 | Thr | Thr | Thr | Ala | Ala 575 | Gly |
PL 210 546 B1
Gly Ala Ala Thr Thr Thr Thr Gly Thr Gly Gly Cys Thr Gly Gly Cys 580 585 590
Cys Ala Cys Gly Cys Cys Gly Thr Ala Ala Gly Gly Thr Gly Gly Cys 595 600 605
Ala Ala Gly Gly Ala Ala Cys Thr Gly Gly Thr Thr Cys Thr Gly Ala 610 615 620
Thr Gly Thr Gly Gly Ala Thr Thr Thr Ala Cys Ala Gly Gly Ala Gly
625 630 635 640
Cys Cys Ala Gly Ala Ala Ala Ala Gly Cys Ala Ala Ala Ala Ala Cys
645 650 655
Cys Cys Cys Gly Ala Thr Ala Ala Thr Cys Thr Thr Cys Thr Thr Cys 660 665 670
Ala Ala Cys Thr Thr Thr Thr Gly Cys Gly Ala Gly Thr Ala Cys Gly 675 680 685
Ala Ala Ala Ala Gly Ala Thr Thr Ala Cys Cys Gly Gly Gly Gly Cys 690 695 700
Cys Cys Ala Cys Thr Thr Ala Ala Ala Cys Cys Gly Thr Ala Thr Ala 705 710 715 720
Gly Cys Cys Ala Ala Cys Ala Ala Thr Thr Cys Ala Gly Cys Thr Ala 725 730 735
Thr Gly Cys Gly Gly Gly Gly Ala Gly Thr Ala Thr Ala Gly Thr Thr 740 745 750
Ala Thr Ala Thr Gly Cys Cys Cys Gly Gly Ala Ala Ala Ala Gly Thr 755 760 765
Thr Cys Ala Ala Gly Ala Cys Thr Thr Cys Thr Thr Thr Cys Thr Gly 770 775 780
Thr Gly Cys Thr Cys Gly Cys Thr Cys Cys Thr Thr Cys Thr Gly Cys
785 790 795 800
Gly Cys Ala Thr Thr Gly Thr Ala Ala Gly Thr Gly Cys Ala Gly Gly
805 810 815
Ala Thr Gly Gly Thr Gly Thr Gly Ala Cys Thr Gly Ala Thr Cys Thr 820 825 830
Thr Cys Ala Cys Cys Ala Ala Ala Cys Gly Thr Ala Thr Thr Ala Cys 835 840 845
Cys Gly Cys Cys Ala Gly Gly Thr Ala Ala Ala Gly Ala Ala Cys Cys 850 855 860
PL 210 546 B1
| Cys 865 | Gly | Ala | Ala | Thr | Cys 870 | Cys | Gly | Gly | Thr | Gly 875 | Thr | Thr | Thr | Ala | Cys 880 |
| Ala | Cys | Cys | Cys | Cys 885 | Gly | Thr | Gly | Ala | Ala 890 | Gly | Gly | Thr | Gly | Cys 895 | Ala |
| Gly | Gly | Ala | Ala 900 | Cys | Gly | Cys | Thr | Gly 905 | Ala | Ala | Gly | Thr | Thr 910 | Cys | Thr |
| Gly | Cys | Gly 915 | Ala | Ala | Ala | Ala | Ala 920 | Cys | Thr | Gly | Ala | Thr 925 | Gly | Gly | Ala |
| Ala | Ala 930 | Ala | Gly | Gly | Cys | Gly 935 | Gly | Thr | Gly | Gly | Gly 940 | Cys | Thr | Thr | Cys |
| Ala 945 | Cys | Thr | Thr | Cys | Cys 950 | Cys | Gly | Thr | Thr | Thr 955 | Thr | Gly | Ala | Thr | Thr 960 |
| Thr | Cys | Gly | Cys | Cys 965 | Ala | Thr | Thr | Cys | Ala 970 | Thr | Gly | Thr | Gly | Gly 975 | Cys |
| Gly | Cys | Ala | Cys 980 | Gly | Cys | Cys | Cys | Gly 985 | Thr | Thr | Cys | Gly | Cys 990 | Gly | Thr |
| Gly | Ala | Thr | Cys | Thr | Gly | Cys | Gly | Thr | Cys | Gly | Cys | Cys | Gly | Thr | Ala |
995 1000 1005
| Thr | Gly 1010 | Cys | Cys | Ala | Cys | Cys 1015 | Ala | Gly | Thr | Gly | Cys 1020 | Thr | Gly | Cys |
| Gly | Thr 1025 | Cys | Gly | Thr | Cys | Gly 1030 | Gly | Gly | Cys | Thr | Ala 1035 | Thr | Thr | Gly |
| Ala | Thr 1040 | Gly | Cys | Gly | Cys | Thr 1045 | Cys | Thr | Thr | Gly | Cys 1050 | Ala | Gly | Gly |
| Gly | Gly 1055 | Cys | Thr | Gly | Thr | Gly 1060 | Thr | Thr | Thr | Cys | Cys 1065 | Ala | Cys | Thr |
| Ala | Thr 1070 | Gly | Ala | Cys | Cys | Cys 1075 | Gly | Cys | Thr | Gly | Gly 1080 | Cys | Cys | Ala |
| Ala | Cys 1085 | Cys | Gly | Cys | Gly | Thr 1090 | Cys | Cys | Ala | Gly | Thr 1095 | Gly | Cys | Thr |
| Cys | Cys 1100 | Ala | Thr | Cys | Ala | Cys 1105 | Cys | Ala | Cys | Gly | Cys 1110 | Thr | Gly | Gly |
| Cys | Cys 1115 | Ala | Thr | Thr | Gly | Ala 1120 | Gly | Thr | Gly | Cys | Gly 1125 | Gly | Ala | Cys |
| Thr | Gly 1130 | Gly | Cys | Gly | Ala | Cys 1135 | Gly | Gly | Ala | Gly | Thr 1140 | Cys | Thr | Gly |
| Cys | Thr 1145 | Gly | Cys | Cys | Gly | Gly 1150 | Ala | Ala | Ala | Ala | Cys 1155 | Thr | Cys | Thr |
PL 210 546 B1
| Cys | Cys 1160 | Ala | Thr | Cys | Ala | Cys 1165 | Cys | Cys | Gly | Thr | Gly 1170 | Cys | Cys | Ala |
| Cys | Cys 1175 | Cys | Gly | Thr | Gly | Cys 1180 | Cys | Cys | Thr | Gly | Ala 1185 | Cys | Gly | Thr |
| Thr | Cys 1190 | Cys | Thr | Gly | Thr | Cys 1195 | Ala | Gly | Ala | Gly | Cys 1200 | Thr | Gly | Gly |
| Gly | Ala 1205 | Cys | Thr | Gly | Ala | Thr 1210 | Thr | Ala | Cys | Cys | Thr 1215 | Ala | Cys | Cys |
| Ala | Gly 1220 | Ala | Cys | Gly | Gly | Ala 1225 | Ala | Thr | Ala | Thr | Gly 1230 | Ala | Cys | Cys |
| Cys | Gly 1235 | Cys | Thr | Thr | Ala | Thr 1240 | Cys | Gly | Gly | Gly | Thr 1245 | Gly | Cys | Thr |
| Ala | Cys 1250 | Ala | Thr | Thr | Cys | Cys 1255 | Gly | Ala | Cys | Cys | Gly 1260 | Ala | Thr | Ala |
| Thr | Cys 1265 | Ala | Cys | Gly | Thr | Thr 1270 | Cys | Ala | Cys | Ala | Thr 1275 | Cys | Thr | Gly |
| Cys | Ala 1280 | Cys | Thr | Gly | Thr | Thr 1285 | Thr | Gly | Cys | Thr | Gly 1290 | Cys | Cys | Cys |
| Thr | Cys 1295 | Gly | Ala | Thr | Gly | Thr 1300 | Ala | Thr | Cys | Ala | Gly 1305 | Ala | Gly | Gly |
| Ala | Gly 1310 | Gly | Cys | Ala | Gly | Thr 1315 | Gly | Gly | Cys | Cys | Gly 1320 | Cys | Cys | Gly |
| Cys | Gly 1325 | Cys | Gly | Cys | Cys | Gly 1330 | Cys | Ala | Gly | Cys | Cys 1335 | Gly | Thr | Gly |
| Thr | Gly 1340 | Gly | Thr | Ala | Thr | Gly 1345 | Gly | Gly | Ala | Ala | Ala 1350 | Ala | Cys | Ala |
| Ala | Ala 1355 | Cys | Ala | Ala | Cys | Gly 1360 | Cys | Ala | Ala | Ala | Ala 1365 | Ala | Gly | Cys |
| AJ a | Gly 1370 | Gly | Gly | Gly | Cys | Thr 1375 | Gly | Gly | Ala | Thr | Ala 1380 | Cys | Cys | Cys |
| Thr | Gly 1385 | Gly | Gly | Cys | Ala | Thr 1390 | Gly | Gly | Ala | Thr | Gly 1395 | Ala | Ala | Cys |
| Thr | Gly 1400 | Ala | Thr | Ala | Gly | Cys 1405 | Gly | Ala | Ala | Ala | Gly 1410 | Cys | Cys | Thr |
| Gly | Gly 1415 | Cys | Gly | Thr | Thr | Thr 1420 | Thr | Gly | Thr | Thr | Cys 1425 | Gly | Thr | Gly |
| Ala | Gly 1430 | Cys | Gly | Thr | Thr | Thr 1435 | Thr | Cys | Gly | Cys | Ala 1440 | Gly | Thr | Thr |
PL 210 546 B1
| Ala | Thr 1445 | Cys | Ala | Gly | Ala | Cys 1450 | Ala | Gly | Ala | Gly | Cys 1455 | Thr | Thr | Ala |
| Ala | Gly 1460 | Thr | Cys | Cys | Cys | Gly 1465 | Thr | Gly | Gly | Ala | Ala 1470 | Thr | Ala | Ala |
| Ala | Gly 1475 | Cys | Gly | Thr | Gly | Cys 1480 | Cys | Cys | Gly | Thr | Gly 1485 | Cys | Gly | Cys |
| Gly | Thr 1490 | Cys | Gly | Thr | Gly | Ala 1495 | Thr | Gly | Cys | Gly | Gly 1500 | Ala | Cys | Ala |
| Gly | Gly 1505 | Gly | Ala | Ala | Cys | Gly 1510 | Thr | Cys | Ala | Gly | Gly 1515 | Ala | Thr | Ala |
| Thr | Thr 1520 | Gly | Thr | Cys | Ala | Cys 1525 | Cys | Cys | Thr | Gly | Gly 1530 | Thr | Gly | Ala |
| Ala | Ala 1535 | Cys | Gly | Gly | Cys | Ala 1540 | Gly | Cys | Thr | Gly | Ala 1545 | Cys | Gly | Cys |
| Gly | Cys 1550 | Gly | Ala | Ala | Ala | Thr 1555 | Cys | Gly | Cys | Gly | Gly 1560 | Ala | Ala | Gly |
| Gly | Gly 1565 | Cys | Gly | Cys | Thr | Thr 1570 | Cys | Ala | Cys | Thr | Gly 1575 | Cys | Cys | Ala |
| Ala | Thr 1580 | Cys | Gly | Thr | Gly | Ala 1585 | Gly | Gly | Cys | Gly | Gly 1590 | Thr | Ala | Ala |
| Ala | Ala 1595 | Cys | Gly | Cys | Gly | Ala 1600 | Ala | Gly | Thr | Thr | Gly 1605 | Ala | Gly | Cys |
| Gly | Thr 1610 | Cys | Gly | Thr | Gly | Thr 1615 | Gly | Ala | Ala | Gly | Gly 1620 | Ala | Gly | Cys |
| Gly | Cys 1625 | Ala | Thr | Gly | Ala | Thr 1630 | Thr | Cys | Thr | Gly | Thr 1635 | Cys | Ala | Cys |
| Gly | Thr 1640 | Ala | Ala | Cys | Cys | Gly 1645 | Thr | Ala | Ala | Thr | Thr 1650 | Ala | Cys | Ala |
| Gly | Cys 1655 | Cys | Gly | Gly | Cys | Thr 1660 | Gly | Gly | Cys | Cys | Ala 1665 | Cys | Ala | Gly |
| Cys | Thr 1670 | Thr | Cys | Cys | Cys | Cys 1675 | Cys | Thr | Gly | Ala | Ala 1680 | Ala | Gly | Thr |
| Gly | Ala 1685 | Cys | Cys | Thr | Cys | Cys 1690 | Thr | Cys | Thr | Gly | Ala 1695 | Ala | Thr | Ala |
| Ala | Thr 1700 | Cys | Cys | Gly | Gly | Cys 1705 | Cys | Thr | Gly | Cys | Gly 1710 | Cys | Cys | Gly |
| Gly | Ala 1715 | Gly | Gly | Cys | Thr | Thr 1720 | Cys | Cys | Gly | Cys | Ala 1725 | Cys | Gly | Thr |
PL 210 546 B1
| Cys | Thr 1730 | Gly | Ala | Ala | Gly | Cys 1735 | Cys | Cys | Gly | Ala | Cys 1740 | Ala | Gly | Cys |
| Gly | Cys 1745 | Ala | Cys | Ala | Ala | Ala 1750 | Ala | Ala | Ala | Thr | Cys 1755 | Ala | Gly | Cys |
| Ala | Cys 1760 | Cys | Ala | Cys | Ala | Thr 1765 | Ala | Cys | Ala | Ala | Ala 1770 | Ala | Ala | Ala |
| Cys | Ala 1775 | Ala | Cys | Cys | Thr | Cys 1780 | Ala | Thr | Cys | Ala | Thr 1785 | Cys | Cys | Ala |
| Gly | Cys 1790 | Thr | Thr | Cys | Thr | Gly 1795 | Gly | Thr | Gly | Cys | Ala 1800 | Thr | Cys | Cys |
| Gly | Gly 1805 | Cys | Cys | Cys | Cys | Cys 1810 | Cys | Cys | Thr | Gly | Thr 1815 | Thr | Thr | Thr |
| Cys | Gly 1820 | Ala | Thr | Ala | Cys | Ala 1825 | Ala | Ala | Ala | Cys | Ala 1830 | Cys | Gly | Cys |
| Cys | Thr 1835 | Cys | Ala | Cys | Ala | Gly 1840 | Ala | Cys | Gly | Gly | Gly 1845 | Gly | Ala | Ala |
| Thr | Thr 1850 | Thr | Thr | Gly | Cys | Thr 1855 | Thr | Ala | Thr | Cys | Cys 1860 | Ala | Cys | Ala |
| Thr | Thr 1865 | Ala | Ala | Ala | Cys | Thr 1870 | Gly | Cys | Ala | Ala | Gly 1875 | Gly | Gly | Ala |
| Cys | Thr 1880 | Thr | Cys | Cys | Cys | Cys 1885 | Ala | Thr | Ala | Ala | Gly 1890 | Gly | Thr | Thr |
| Ala | Cys 1895 | Ala | Ala | Cys | Cys | Gly 1900 | Thr | Thr | Cys | Ala | Thr 1905 | Gly | Thr | Cys |
| Ala | Thr 1910 | Ala | Ala | Ala | Gly | Cys 1915 | Gly | Cys | Cys | Ala | Thr 1920 | Cys | Cys | Gly |
| Cys | Cys 1925 | Ala | Gly | Cys | Gly | Thr 1930 | Thr | Ala | Cys | Ala | Gly 1935 | Gly | Gly | Thr |
| Gly | Cys 1940 | Ala | Ala | Thr | Gly | Thr 1945 | Ala | Thr | Cys | Thr | Thr 1950 | Thr | Thr | Ala |
| Ala | Ala 1955 | Cys | Ala | Cys | Cys | Thr 1960 | Gly | Thr | Thr | Thr | Ala 1965 | Thr | Ala | Thr |
| Cys | Thr 1970 | Cys | Cys | Thr | Thr | Thr 1975 | Ala | Ala | Ala | Cys | Thr 1980 | Ala | Cys | Thr |
| Thr | Ala 1985 | Ala | Thr | Thr | Ala | Cys 1990 | Ala | Thr | Thr | Cys | Ala 1995 | Thr | Thr | Thr |
| Ala | Ala 2000 | Ala | Ala | Ala | Gly | Ala 2005 | Ala | Ala | Ala | Cys | Cys 2010 | Thr | Ala | Thr |
PL 210 546 B1
| Thr | Cys 2015 | Ala | Cys | Thr | Gly | Cys 2020 | Cys | Thr | Gly | Thr | Cys 2025 | Cys | Thr | Thr |
| Gly | Gly 2030 | Ala | Cys | Ala | Gly | Ala 2035 | Cys | Ala | Gly | Ala | Thr 2040 | Ala | Thr | Gly |
| Cys | Ala 2045 | Cys | Cys | Thr | Cys | Cys 2050 | Cys | Ala | Cys | Cys | Gly 2055 | Cys | Ala | Ala |
| Gly | Cys 2060 | Gly | Gly | Cys | Gly | Gly 2065 | Gly | Cys | Cys | Cys | Cys 2070 | Thr | Ala | Cys |
| Cys | Gly 2075 | Gly | Ala | Gly | Cys | Cys 2080 | Gly | Cys | Thr | Thr | Thr 2085 | Ala | Gly | Thr |
| Thr | Ala 2090 | Cys | Ala | Ala | Cys | Ala 2095 | Cys | Thr | Cys | Ala | Gly 2100 | Ala | Cys | Ala |
| Cys | Ala 2105 | Ala | Cys | Cys | Ala | Cys 2110 | Cys | Ala | Gly | Ala | Ala 2115 | Ala | Ala | Ala |
| Cys | Cys 2120 | Cys | Cys | Gly | Gly | Thr 2125 | Cys | Cys | Ala | Gly | Cys 2130 | Gly | Cys | Ala |
| Gly | Ala 2135 | Ala | Cys | Thr | Gly | Ala 2140 | Ala | Ala | Cys | Cys | Ala 2145 | Cys | Ala | Ala |
| Ala | Gly 2150 | Cys | Cys | Cys | Cys | Thr 2155 | Cys | Cys | Cys | Thr | Cys 2160 | Ala | Thr | Ala |
| Ala | Cys 2165 | Thr | Gly | Ala | Ala | Ala 2170 | Ala | Gly | Cys | Gly | Gly 2175 | Cys | Cys | Cys |
| Cys | Gly 2180 | Cys | Cys | Cys | Cys | Gly 2185 | Gly | Thr | Cys | Cys | Gly 2190 | Ala | Ala | Gly |
| Gly | Gly 2195 | Cys | Cys | Gly | Gly | Ala 2200 | Ala | Cys | Ala | Gly | Ala 2205 | Gly | Thr | Cys |
| Gly | Cys 2210 | Thr | Thr | Thr | Thr | Ala 2215 | Ala | Thr | Thr | Ala | Thr 2220 | Gly | Ala | Ala |
| Thr | Gly 2225 | Thr | Thr | Gly | Thr | Ala 2230 | Ala | Cys | Thr | Ala | Cys 2235 | Thr | Thr | Cys |
| Ala | Thr 2240 | Cys | Ala | Thr | Cys | Gly 2245 | Cys | Thr | Gly | Thr | Cys 2250 | Ala | Gly | Thr |
| Cys | Thr 2255 | Thr | Cys | Thr | Cys | Gly 2260 | Cys | Thr | Gly | Gly | Ala 2265 | Ala | Gly | Thr |
| Thr | Cys 2270 | Thr | Cys | Ala | Gly | Thr 2275 | Ala | Cys | Ala | Cys | Gly 2280 | Cys | Thr | Cys |
| Gly | Thr 2285 | Ala | Ala | Gly | Cys | Gly 2290 | Gly | Cys | Cys | Cys | Thr 2295 | Gly | Ala | Cys |
PL 210 546 B1
| Gly | Gly 2300 | Cys | Cys | Cys | Gly | Cys 2305 | Thr | Ala | Ala | Cys | Gly 2310 | Cys | Gly | Gly |
| Ala | Gly 2315 | Ala | Thr | Ala | Cys | Gly 2320 | Cys | Cys | Cys | Cys | Gly 2325 | Ala | Cys | Thr |
| Thr | Cys 2330 | Gly | Gly | Gly | Thr | Ala 2335 | Ala | Ala | Cys | Cys | Cys 2340 | Thr | Cys | Gly |
| Thr | Cys 2345 | Gly | Gly | Gly | Ala | Cys 2350 | Cys | Ala | Cys | Thr | Cys 2355 | Cys | Gly | Ala |
| Cys | Cys 2360 | Gly | Cys | Gly | Cys | Ala 2365 | Cys | Ala | Gly | Ala | Ala 2370 | Gly | Cys | Thr |
| Cys | Thr 2375 | Cys | Thr | Cys | Ala | Thr 2380 | Gly | Gly | Cys | Thr | Gly 2385 | Ala | Ala | Ala |
| Gly | Cys 2390 | Gly | Gly | Gly | Thr | Ala 2395 | Thr | Gly | Gly | Thr | Cys 2400 | Thr | Gly | Gly |
| Cys | Ala 2405 | Gly | Gly | Gly | Cys | Thr 2410 | Gly | Gly | Gly | Gly | Ala 2415 | Thr | Gly | Gly |
| Gly | Thr 2420 | Ala | Ala | Gly | Gly | Thr 2425 | Gly | Ala | Ala | Ala | Thr 2430 | Cys | Thr | Ala |
| Thr | Cys 2435 | Ala | Ala | Thr | Cys | Ala 2440 | Gly | Thr | Ala | Cys | Cys 2445 | Gly | Gly | Cys |
| Thr | Thr 2450 | Ala | Cys | Gly | Cys | Cys 2455 | Gly | Gly | Gly | Cys | Thr 2460 | Thr | Cys | Gly |
| Gly | Cys 2465 | Gly | Gly | Thr | Thr | Thr 2470 | Thr | Ala | Cys | Thr | Cys 2475 | Cys | Thr | Gly |
| Thr | Thr 2480 | Thr | Cys | Ala | Thr | Ala 2485 | Thr | Ala | Thr | Gly | Ala 2490 | Ala | Ala | Cys |
| Ala | Ala 2495 | Cys | Ala | Gly | Gly | Thr 2500 | Cys | Ala | Cys | Cys | Gly 2505 | Cys | Cys | Thr |
| Thr | Cys 2510 | Cys | Ala | Thr | Gly | Cys 2515 | Cys | Gly | Cys | Thr | Gly 2520 | Ala | Thr | Gly |
| Cys | Gly 2525 | Gly | Cys | Ala | Thr | Ala 2530 | Thr | Cys | Cys | Thr | Gly 2535 | Gly | Thr | Ala |
| Ala | Cys 2540 | Gly | Ala | Thr | Ala | Thr 2545 | Cys | Thr | Gly | Ala | Ala 2550 | Thr | Thr | Gly |
| Thr | Thr 2555 | Ala | Thr | Ala | Cys | Ala 2560 | Thr | Gly | Thr | Gly | Thr 2565 | Ala | Thr | Ala |
| Thr | Ala 2570 | Cys | Gly | Thr | Gly | Gly 2575 | Thr | Ala | Ala | Thr | Gly 2580 | Ala | Cys | Ala |
PL 210 546 B1
| Ala | Ala 2585 | Ala | Ala | Thr | Ala | Gly 2590 | Gly | Ala | Cys | Ala | Ala 2595 | Gly | Thr | Thr |
| Ala | Ala 2600 | Ala | Ala | Ala | Thr | Thr 2605 | Thr | Ala | Cys | Ala | Gly 2610 | Gly | Cys | Gly |
| Ala | Thr 2615 | Gly | Cys | Ala | Ala | Thr 2620 | Gly | Ala | Thr | Thr | Cys 2625 | Ala | Ala | Ala |
| Cys | Ala 2630 | Cys | Gly | Thr | Ala | Ala 2635 | Thr | Cys | Ala | Ala | Thr 2640 | Ala | Thr | Cys |
| Gly | Gly 2645 | Gly | Gly | Gly | Thr | Gly 2650 | Gly | Gly | Cys | Gly | Ala 2655 | Ala | Gly | Ala |
| Ala | Cys 2660 | Thr | Cys | Cys | Ala | Gly 2665 | Cys | Ala | Thr | Gly | Ala 2670 | Gly | Ala | Thr |
| Cys | Cys 2675 | Cys | Cys | Gly | Cys | Gly 2680 | Cys | Thr | Gly | Gly | Ala 2685 | Gly | Gly | Ala |
| Thr | Cys 2690 | Ala | Thr | Cys | Cys | Ala 2695 | Gly | Cys | Cys | Gly | Gly 2700 | Cys | Gly | Thr |
| Cys | Cys 2705 | Cys | Gly | Gly | Ala | Ala 2710 | Ala | Ala | Cys | Gly | Ala 2715 | Thr | Thr | Cys |
| Cys | Gly 2720 | Ala | Ala | Gly | Cys | Cys 2725 | Cys | Ala | Ala | Cys | Cys 2730 | Thr | Thr | Thr |
| Cys | Ala 2735 | Thr | Ala | Gly | Ala | Ala 2740 | Gly | Gly | Cys | Gly | Gly 2745 | Cys | Gly | Gly |
| Thr | Gly 2750 | Gly | Ala | Ala | Thr | Cys 2755 | Gly | Ala | Ala | Ala | Thr 2760 | Cys | Thr | Cys |
| Gly | Thr 2765 | Gly | Ala | Thr | Gly | Gly 2770 | Cys | Ala | Gly | Gly | Thr 2775 | Thr | Gly | Gly |
| Gly | Cys 2780 | Gly | Thr | Cys | Gly | Cys 2785 | Thr | Thr | Gly | Gly | Thr 2790 | Cys | Gly | Gly |
| Thr | Cys 2795 | Ala | Thr | Thr | Thr | Cys 2800 | Gly | Ala | Ala | Cys | Cys 2805 | Cys | Cys | Ala |
| Gly | Ala 2810 | Gly | Thr | Cys | Cys | Cys 2815 | Gly | Cys | Thr | Cys | Ala 2820 | Gly | Ala | Ala |
| Gly | Ala 2825 | Ala | Cys | Thr | Cys | Gly 2830 | Thr | Cys | Ala | Ala | Gly 2835 | Ala | Ala | Gly |
| Gly | Cys 2840 | Gly | Ala | Thr | Ala | Gly 2845 | Ala | Ala | Gly | Gly | Cys 2850 | Gly | Ala | Thr |
| Gly | Cys 2855 | Gly | Cys | Thr | Gly | Cys 2860 | Gly | Ala | Ala | Thr | Cys 2865 | Gly | Gly | Gly |
PL 210 546 B1
| Ala | Gly 2870 | Cys | Gly | Gly | Cys | Gly 2875 | Ala | Thr | Ala | Cys | Cys 2880 | Gly | Thr | Ala |
| Ala | Ala 2885 | Gly | Cys | Ala | Cys | Gly 2890 | Ala | Gly | Gly | Ala | Ala 2895 | Gly | Cys | Gly |
| Gly | Thr 2900 | Cys | Ala | Gly | Cys | Cys 2905 | Cys | Ala | Thr | Thr | Cys 2910 | Gly | Cys | Cys |
| Gly | Cys 2915 | Cys | Ala | Ala | Gly | Cys 2920 | Thr | Cys | Thr | Thr | Cys 2925 | Ala | Gly | Cys |
| Ala | Ala 2930 | Thr | Ala | Thr | Cys | Ala 2935 | Cys | Gly | Gly | Gly | Thr 2940 | Ala | Gly | Cys |
| Cys | Ala 2945 | Ala | Cys | Gly | Cys | Thr 2950 | Ala | Thr | Gly | Thr | Cys 2955 | Cys | Thr | Gly |
| Ala | Thr 2960 | Ala | Gly | Cys | Gly | Gly 2965 | Thr | Cys | Cys | Gly | Cys 2970 | Cys | Ala | Cys |
| Ala | Cys 2975 | Cys | Cys | Ala | Gly | Cys 2980 | Cys | Gly | Gly | Cys | Cys 2985 | Ala | Cys | Ala |
| Gly | Thr 2990 | Cys | Gly | Ala | Thr | Gly 2995 | Ala | Ala | Thr | Cys | Cys 3000 | Ala | Gly | Ala |
| Ala | Ala 3005 | Ala | Gly | Cys | Gly | Gly 3010 | Cys | Cys | Ala | Thr | Thr 3015 | Thr | Thr | Cys |
| Cys | Ala 3020 | Cys | Cys | Ala | Thr | Gly 3025 | Ala | Thr | Ala | Thr | Thr 3030 | Cys | Gly | Gly |
| Cys | Ala 3035 | Ala | Gly | Cys | Ala | Gly 3040 | Gly | Cys | Ala | Thr | Cys 3045 | Gly | Cys | Cys |
| Ala | Thr 3050 | Gly | Ala | Gly | Thr | Cys 3055 | Ala | Cys | Gly | Ala | Cys 3060 | Gly | Ala | Gly |
| Ala | Thr 3065 | Cys | Cys | Thr | Cys | Gly 3070 | Cys | Cys | Gly | Thr | Cys 3075 | Gly | Gly | Gly |
| Cys | Ala 3080 | Thr | Gly | Cys | Gly | Cys 3085 | Gly | Cys | Cys | Thr | Thr 3090 | Gly | Ala | Gly |
| Cys | Cys 3095 | Thr | Gly | Gly | Cys | Gly 3100 | Ala | Ala | Cys | Ala | Gly 3105 | Thr | Thr | Cys |
| Gly | Gly 3110 | Cys | Thr | Gly | Gly | Cys 3115 | Gly | Cys | Gly | Ala | Gly 3120 | Cys | Cys | Cys |
| Cys | Thr 3125 | Gly | Ala | Thr | Gly | Cys 3130 | Thr | Cys | Thr | Thr | Cys 3135 | Gly | Thr | Cys |
| Cys | Ala 3140 | Gly | Ala | Thr | Cys | Ala 3145 | Thr | Cys | Cys | Thr | Gly 3150 | Ala | Thr | Cys |
PL 210 546 B1
| Gly | Ala 3155 | Cys | Ala | Ala | Gly | Ala 3160 | Cys | Cys | Gly | Gly | Cys 3165 | Thr | Thr | Cys |
| Cys | Ala 3170 | Thr | Cys | Cys | Gly | Ala 3175 | Gly | Thr | Ala | Cys | Gly 3180 | Thr | Gly | Cys |
| Thr | Cys 3185 | Gly | Cys | Thr | Cys | Gly 3190 | Ala | Thr | Gly | Cys | Gly 3195 | Ala | Thr | Gly |
| Thr | Thr 3200 | Thr | Cys | Gly | Cys | Thr 3205 | Thr | Gly | Gly | Thr | Gly 3210 | Gly | Thr | Cys |
| Gly | Ala 3215 | Ala | Thr | Gly | Gly | Gly 3220 | Cys | Ala | Gly | Gly | Thr 3225 | Ala | Gly | Cys |
| Cys | Gly 3230 | Gly | Ala | Thr | Cys | Ala 3235 | Ala | Gly | Cys | Gly | Thr 3240 | Ala | Thr | Gly |
| Cys | Ala 3245 | Gly | Cys | Cys | Gly | Cys 3250 | Cys | Gly | Cys | Ala | Thr 3255 | Thr | Gly | Cys |
| Ala | Thr 3260 | Cys | Ala | Gly | Cys | Cys 3265 | Ala | Thr | Gly | Ala | Thr 3270 | Gly | Gly | Ala |
| Thr | Ala 3275 | Cys | Thr | Thr | Thr | Cys 3280 | Thr | Cys | Gly | Gly | Cys 3285 | Ala | Gly | Gly |
| Ala | Gly 3290 | Cys | Ala | Ala | Gly | Gly 3295 | Thr | Gly | Ala | Gly | Ala 3300 | Thr | Gly | Ala |
| Cys | Ala 3305 | Gly | Gly | Ala | Gly | Ala 3310 | Thr | Cys | Cys | Thr | Gly 3315 | Cys | Cys | Cys |
| Cys | Gly 3320 | Gly | Cys | Ala | Cys | Thr 3325 | Thr | Cys | Gly | Cys | Cys 3330 | Cys | Ala | Ala |
| Thr | Ala 3335 | Gly | Cys | Ala | Gly | Cys 3340 | Cys | Ala | Gly | Thr | Cys 3345 | Cys | Cys | Thr |
| Thr | Cys 3350 | Cys | Cys | Gly | Cys | Thr 3355 | Thr | Cys | Ala | Gly | Thr 3360 | Gly | Ala | Cys |
| Ala | Ala 3365 | Cys | Gly | Thr | Cys | Gly 3370 | Ala | Gly | Cys | Ala | Cys 3375 | Ala | Gly | Cys |
| Thr | Gly 3380 | Cys | Gly | Cys | Ala | Ala 3385 | Gly | Gly | Ala | Ala | Cys 3390 | Gly | Cys | Cys |
| Cys | Gly 3395 | Thr | Cys | Gly | Thr | Gly 3400 | Gly | Cys | Cys | Ala | Gly 3405 | Cys | Cys | Ala |
| Cys | Gly 3410 | Ala | Thr | Ala | Gly | Cys 3415 | Cys | Gly | Cys | Gly | Cys 3420 | Thr | Gly | Cys |
| Cys | Thr 3425 | Cys | Gly | Thr | Cys | Cys 3430 | Thr | Gly | Cys | Ala | Ala 3435 | Thr | Thr | Cys |
PL 210 546 B1
| Ala | Thr 3440 | Thr | Cys | Ala | Gly | Gly 3445 | Ala | Cys | Ala | Cys | Cys 3450 | Gly | Gly | Ala |
| Cys | Ala 3455 | Gly | Gly | Thr | Cys | Gly 3460 | Gly | Thr | Cys | Thr | Thr 3465 | Gly | Ala | Cys |
| Ala | Ala 3470 | Ala | Ala | Ala | Gly | Ala 3475 | Ala | Cys | Cys | Gly | Gly 3480 | Gly | Cys | Gly |
| Cys | Cys 3485 | Cys | Cys | Thr | Gly | Cys 3490 | Gly | Cys | Thr | Gly | Ala 3495 | Cys | Ala | Gly |
| Cys | Cys 3500 | Gly | Gly | Ala | Ala | Cys 3505 | Ala | Cys | Gly | Gly | Cys 3510 | Gly | Gly | Cys |
| Ala | Thr 3515 | Cys | Ala | Gly | Ala | Gly 3520 | Cys | Ala | Gly | Cys | Cys 3525 | Gly | Ala | Thr |
| Thr | Gly 3530 | Thr | Cys | Thr | Gly | Thr 3535 | Thr | Gly | Thr | Gly | Cys 3540 | Cys | Cys | Ala |
| Gly | Thr 3545 | Cys | Ala | Thr | Ala | Gly 3550 | Cys | Cys | Gly | Ala | Ala 3555 | Thr | Ala | Gly |
| Cys | Cys 3560 | Thr | Cys | Thr | Cys | Cys 3565 | Ala | Cys | Cys | Cys | Ala 3570 | Ala | Gly | Cys |
| Gly | Gly 3575 | Cys | Cys | Gly | Gly | Ala 3580 | Gly | Ala | Ala | Cys | Cys 3585 | Thr | Gly | Cys |
| Gly | Thr 3590 | Gly | Cys | Ala | Ala | Thr 3595 | Cys | Cys | Ala | Thr | Cys 3600 | Thr | Thr | Gly |
| Thr | Thr 3605 | Cys | Ala | Ala | Thr | Cys 3610 | Ala | Thr | Gly | Cys | Gly 3615 | Ala | Ala | Ala |
| Cys | Gly 3620 | Ala | Thr | Cys | Cys | Thr 3625 | Cys | Ala | Thr | Cys | Cys 3630 | Thr | Gly | Thr |
| Cys | Thr 3635 | Cys | Thr | Thr | Gly | Ala 3640 | Thr | Cys | Thr | Gly | Ala 3645 | Thr | Cys | Thr |
| Thr | Gly 3650 | Ala | Thr | Cys | Cys | Cys 3655 | Cys | Thr | Gly | Cys | Gly 3660 | Cys | Cys | Ala |
| Thr | Cys 3665 | Ala | Gly | Ala | Thr | Cys 3670 | Cys | Thr | Thr | Gly | Gly 3675 | Cys | Gly | Gly |
| Cys | Ala 3680 | Ala | Gly | Ala | Ala | Ala 3685 | Gly | Cys | Cys | Ala | Thr 3690 | Cys | Cys | Ala |
| Gly | Thr 3695 | Thr | Thr | Ala | Cys | Thr 3700 | Thr | Thr | Gly | Cys | Ala 3705 | Gly | Gly | Gly |
| Cys | Thr 3710 | Thr | Cys | Cys | Cys | Ala 3715 | Ala | Cys | Cys | Thr | Thr 3720 | Ala | Cys | Cys |
PL 210 546 B1
| Ala | Gly 3725 | Ala | Gly | Gly | Gly | Cys 3730 | Gly | Cys | Cys | Cys | Cys 3735 | Ala | Gly | Cys |
| Thr | Gly 3740 | Gly | Cys | Ala | Ala | Thr 3745 | Thr | Cys | Cys | Gly | Gly 3750 | Thr | Thr | Cys |
| Gly | Cys 3755 | Thr | Thr | Gly | Cys | Thr 3760 | Gly | Thr | Cys | Cys | Ala 3765 | Thr | Ala | Ala |
| Ala | Ala 3770 | Cys | Cys | Gly | Cys | Cys 3775 | Cys | Ala | Gly | Thr | Cys 3780 | Thr | Ala | Gly |
| Cys | Thr 3785 | Ala | Thr | Cys | Gly | Cys 3790 | Cys | Ala | Thr | Gly | Thr 3795 | Ala | Ala | Gly |
| Cys | Cys 3800 | Cys | Ala | Cys | Thr | Gly 3805 | Cys | Ala | Ala | Gly | Cys 3810 | Thr | Ala | Cys |
| Cys | Thr 3815 | Gly | Cys | Thr | Thr | Thr 3820 | Cys | Thr | Cys | Thr | Thr 3825 | Thr | Gly | Cys |
| Gly | Cys 3830 | Thr | Thr | Gly | Cys | Gly 3835 | Thr | Thr | Thr | Thr | Cys 3840 | Cys | Cys | Thr |
| Thr | Gly 3845 | Thr | Cys | Cys | Ala | Gly 3850 | Ala | Thr | Ala | Gly | Cys 3855 | Cys | Cys | Ala |
| Gly | Thr 3860 | Ala | Gly | Cys | Thr | Gly 3865 | Ala | Cys | Ala | Thr | Thr 3870 | Cys | Ala | Thr |
| Cys | Cys 3875 | Gly | Gly | Gly | Gly | Thr 3880 | Cys | Ala | Gly | Cys | Ala 3885 | Cys | Cys | Gly |
| Thr | Thr 3890 | Thr | Cys | Thr | Gly | Cys 3895 | Gly | Gly | Ala | Cys | Thr 3900 | Gly | Gly | Cys |
| Thr | Thr 3905 | Thr | Cys | Thr | Ala | Cys 3910 | Gly | Thr | Gly | Thr | Thr 3915 | Cys | Cys | Gly |
| Cys | Thr 3920 | Thr | Cys | Cys | Thr | Thr 3925 | Thr | Ala | Gly | Cys | Ala 3930 | Gly | Cys | Cys |
| Cys | Thr 3935 | Thr | Gly | Cys | Gly | Cys 3940 | Cys | Cys | Thr | Gly | Ala 3945 | Gly | Thr | Gly |
| Cys | Thr 3950 | Thr | Gly | Cys | Gly | Gly 3955 | Cys | Ala | Gly | Cys | Gly 3960 | Thr | Gly | Ala |
| Ala | Gly 3965 | Cys | Thr | Ala | Cys | Ala 3970 | Thr | Ala | Thr | Ala | Thr 3975 | Gly | Thr | Gly |
| Ala | Thr 3980 | Cys | Cys | Gly | Gly | Gly 3985 | Cys | Ala | Ala | Ala | Thr 3990 | Cys | Gly | Cys |
| Thr | Gly 3995 | Ala | Ala | Thr | Ala | Thr 4000 | Thr | Cys | Cys | Thr | Thr 4005 | Thr | Thr | Gly |
PL 210 546 B1
| Thr | Cys 4010 | Thr | Cys | Cys | Gly | Ala 4015 | Cys | Cys | Ala | Thr | Cys 4020 | Ala | Gly | Gly |
| Cys | Ala 4025 | Cys | Cys | Thr | Gly | Ala 4030 | Gly | Thr | Cys | Gly | Cys 4035 | Thr | Gly | Thr |
| Cys | Thr 4040 | Thr | Thr | Thr | Thr | Cys 4045 | Gly | Thr | Gly | Ala | Cys 4050 | Ala | Thr | Thr |
| Cys | Ala 4055 | Gly | Thr | Thr | Cys | Gly 4060 | Cys | Thr | Gly | Cys | Gly 4065 | Cys | Thr | Cys |
| Ala | Cys 4070 | Gly | Gly | Cys | Thr | Cys 4075 | Thr | Gly | Gly | Cys | Ala 4080 | Gly | Thr | Gly |
| Ala | Ala 4085 | Thr | Gly | Gly | Gly | Gly 4090 | Gly | Thr | Ala | Ala | Ala 4095 | Thr | Gly | Gly |
| Cys | Ala 4100 | Cys | Thr | Ala | Cys | Ala 4105 | Gly | Gly | Cys | Gly | Cys 4110 | Cys | Thr | Thr |
| Thr | Thr 4115 | Ala | Thr | Gly | Gly | Ala 4120 | Thr | Thr | Cys | Ala | Thr 4125 | Gly | Cys | Ala |
| Ala | Gly 4130 | Gly | Ala | Ala | Ala | Cys 4135 | Thr | Ala | Cys | Cys | Cys 4140 | Ala | Thr | Ala |
| Ala | Thr 4145 | Ala | Cys | Ala | Ala | Gly 4150 | Ala | Ala | Ala | Ala | Gly 4155 | Cys | Cys | Cys |
| Gly | Thr 4160 | Cys | Ala | Cys | Gly | Gly 4165 | Gly | Cys | Thr | Thr | Cys 4170 | Thr | Cys | Ala |
| Gly | Gly 4175 | Gly | Cys | Gly | Thr | Thr 4180 | Thr | Thr | Ala | Thr | Gly 4185 | Gly | Cys | Gly |
| Gly | Gly 4190 | Thr | Cys | Thr | Gly | Cys 4195 | Thr | Ala | Thr | Gly | Thr 4200 | Gly | Gly | Thr |
| Gly | Cys 4205 | Thr | Ala | Thr | Cys | Thr 4210 | Gly | Ala | Cys | Thr | Thr 4215 | Thr | Thr | Thr |
| Gly | Cys 4220 | Thr | Gly | Thr | Thr | Cys 4225 | Ala | Gly | Cys | Ala | Gly 4230 | Thr | Thr | Cys |
| Cys | Thr 4235 | Gly | Cys | Cys | Cys | Thr 4240 | Cys | Thr | Gly | Ala | Thr 4245 | Thr | Thr | Thr |
| Cys | Cys 4250 | Ala | Gly | Thr | Cys | Thr 4255 | Gly | Ala | Cys | Cys | Ala 4260 | Cys | Thr | Thr |
| Cys | Gly 4265 | Gly | Ala | Thr | Thr | Ala 4270 | Thr | Cys | Cys | Cys | Gly 4275 | Thr | Gly | Ala |
| Cys | Ala 4280 | Gly | Gly | Thr | Cys | Ala 4285 | Thr | Thr | Cys | Ala | Gly 4290 | Ala | Cys | Thr |
PL 210 546 B1
| Gly | Gly 4295 | Cys | Thr | Ala | Ala | Thr 4300 | Gly | Cys | Ala | Cys | Cys 4305 | Cys | Ala | Gly |
| Thr | Ala 4310 | Ala | Gly | Gly | Cys | Ala 4315 | Gly | Cys | Gly | Gly | Thr 4320 | Ala | Thr | Cys |
| Ala | Thr 4325 | Cys | Ala | Ala | Cys | Ala 4330 | Gly | Gly | Cys | Thr | Thr 4335 | Ala | Cys | Cys |
| Cys | Gly 4340 | Thr | Cys | Thr | Thr | Ala 4345 | Cys | Thr | Gly | Thr | Cys 4350 | Gly | Ala | Ala |
| Gly | Ala 4355 | Cys | Gly | Thr | Gly | Cys 4360 | Gly | Thr | Ala | Ala | Cys 4365 | Gly | Thr | Ala |
| Thr | Gly 4370 | Cys | Ala | Thr | Gly | Gly 4375 | Thr | Cys | Thr | Cys | Cys 4380 | Cys | Cys | Ala |
| Thr | Gly 4385 | Cys | Gly | Ala | Gly | Ala 4390 | Gly | Thr | Ala | Gly | Gly 4395 | Gly | Ala | Ala |
| Cys | Thr 4400 | Gly | Cys | Cys | Ala | Gly 4405 | Gly | Cys | Ala | Thr | Cys 4410 | Ala | Ala | Ala |
| Thr | Ala 4415 | Ala | Ala | Ala | Cys | Gly 4420 | Ala | Ala | Ala | Gly | Gly 4425 | Cys | Thr | Cys |
| Ala | Gly 4430 | Thr | Cys | Gly | Ala | Ala 4435 | Ala | Gly | Ala | Cys | Thr 4440 | Gly | Gly | Gly |
| Cys | Cys 4445 | Thr | Thr | Thr | Cys | Gly 4450 | Thr | Thr | Thr | Thr | Ala 4455 | Thr | Cys | Thr |
| Gly | Thr 4460 | Thr | Gly | Thr | Thr | Thr 4465 | Gly | Thr | Cys | Gly | Gly 4470 | Thr | Gly | Ala |
| Ala | Cys 4475 | Gly | Cys | Thr | Cys | Thr 4480 | Cys | Cys | Thr | Gly | Ala 4485 | Gly | Thr | Ala |
| Gly | Gly 4490 | Ala | Cys | Ala | Ala | Ala 4495 | Thr | Cys | Cys | Gly | Cys 4500 | Cys | Gly | Gly |
| Gly | Ala 4505 | Gly | Cys | Gly | Gly | Ala 4510 | Thr | Thr | Thr | Gly | Ala 4515 | Ala | Cys | Gly |
| Thr | Thr 4520 | Gly | Cys | Gly | Ala | Ala 4525 | Gly | Cys | Ala | Ala | Cys 4530 | Gly | Gly | Cys |
| Cys | Cys 4535 | Gly | Gly | Ala | Gly | Gly 4540 | Gly | Thr | Gly | Gly | Cys 4545 | Gly | Gly | Gly |
| Cys | Ala 4550 | Gly | Gly | Ala | Cys | Gly 4555 | Cys | Cys | Cys | Gly | Cys 4560 | Cys | Ala | Thr |
| Ala | Ala 4565 | Ala | Cys | Thr | Gly | Cys 4570 | Cys | Ala | Gly | Gly | Cys 4575 | Ala | Thr | Cys |
PL 210 546 B1
| Ala | Ala 4580 | Ala | Thr | Thr | Ala | Ala 4585 | Gly | Cys | Ala | Gly | Ala 4590 | Ala | Gly | Gly |
| Cys | Cys 4595 | Ala | Thr | Cys | Cys | Thr 4600 | Gly | Ala | Cys | Gly | Gly 4605 | Ala | Thr | Gly |
| Gly | Cys 4610 | Cys | Thr | Thr | Thr | Thr 4615 | Thr | Gly | Cys | Gly | Thr 4620 | Thr | Thr | Cys |
| Thr | Ala 4625 | Cys | Ala | Ala | Ala | Cys 4630 | Thr | Cys | Thr | Thr | Thr 4635 | Thr | Gly | Thr |
| Thr | Thr 4640 | Ala | Thr | Thr | Thr | Thr 4645 | Thr | Cys | Thr | Ala | Ala 4650 | Ala | Thr | Ala |
| Cys | Ala 4655 | Thr | Thr | Cys | Ala | Ala 4660 | Ala | Thr | Ala | Thr | Gly 4665 | Gly | Ala | Cys |
| Gly | Thr 4670 | Cys | Gly | Thr | Ala | Cys 4675 | Thr | Thr | Ala | Ala | Cys 4680 | Thr | Thr | Thr |
| Thr | Ala 4685 | Ala | Ala | Gly | Thr | Ala 4690 | Thr | Gly | Gly | Gly | Cys 4695 | Ala | Ala | Thr |
| Cys | Ala 4700 | Ala | Thr | Thr | Gly | Cys 4705 | Thr | Cys | Cys | Thr | Gly 4710 | Thr | Thr | Ala |
| Ala | Ala 4715 | Ala | Thr | Thr | Gly | Cys 4720 | Thr | Thr | Thr | Ala | Gly 4725 | Ala | Ala | Ala |
| Thr | Ala 4730 | Cys | Thr | Thr | Thr | Gly 4735 | Gly | Cys | Ala | Gly | Cys 4740 | Gly | Gly | Thr |
| Thr | Thr 4745 | Gly | Thr | Thr | Gly | Thr 4750 | Ala | Thr | Thr | Gly | Ala 4755 | Gly | Thr | Thr |
| Thr | Cys 4760 | Ala | Thr | Thr | Thr | Gly 4765 | Cys | Gly | Cys | Ala | Thr 4770 | Thr | Gly | Gly |
| Thr | Thr 4775 | Ala | Ala | Ala | Thr | Gly 4780 | Gly | Ala | Ala | Ala | Gly 4785 | Thr | Gly | Ala |
| Cys | Cys 4790 | Gly | Thr | Gly | Cys | Gly 4795 | Cys | Thr | Thr | Ala | Cys 4800 | Thr | Ala | Cys |
| Ala | Gly 4805 | Cys | Cys | Thr | Ala | Ala 4810 | Thr | Ala | Thr | Thr | Thr 4815 | Thr | Thr | Gly |
| Ala | Ala 4820 | Ala | Thr | Ala | Thr | Cys 4825 | Cys | Cys | Ala | Ala | Gly 4830 | Ala | Gly | Cys |
| Thr | Thr 4835 | Thr | Thr | Thr | Cys | Cys 4840 | Thr | Thr | Cys | Gly | Cys 4845 | Ala | Thr | Gly |
| Cys | Cys 4850 | Cys | Ala | Cys | Gly | Cys 4855 | Thr | Ala | Ala | Ala | Cys 4860 | Ala | Thr | Thr |
PL 210 546 B1
| Cys | Thr 4865 | Thr | Thr | Thr | Thr | Cys 4870 | Thr | Cys | Thr | Thr | Thr 4875 | Thr | Gly | Gly |
| Thr | Thr 4880 | Ala | Ala | Ala | Thr | Cys 4885 | Gly | Thr | Thr | Gly | Thr 4890 | Thr | Thr | Gly |
| Ala | Thr 4895 | Thr | Thr | Ala | Thr | Thr 4900 | Ala | Thr | Thr | Thr | Gly 4905 | Cys | Thr | Ala |
| Thr | Ala 4910 | Thr | Thr | Thr | Ala | Thr 4915 | Thr | Thr | Thr | Thr | Cys 4920 | Gly | Ala | Thr |
| Ala | Ala 4925 | Thr | Thr | Ala | Thr | Cys 4930 | Ala | Ala | Cys | Thr | Ala 4935 | Gly | Ala | Gly |
| Ala | Ala 4940 | Gly | Gly | Ala | Ala | Cys 4945 | Ala | Ala | Thr | Thr | Ala 4950 | Ala | Thr | Gly |
| Gly | Thr 4955 | Ala | Thr | Gly | Thr | Thr 4960 | Cys | Ala | Thr | Ala | Cys 4965 | Ala | Cys | Gly |
| Cys | Ala 4970 | Thr | Gly | Thr | Ala | Ala 4975 | Ala | Ala | Ala | Thr | Ala 4980 | Ala | Ala | Cys |
| Thr | Ala 4985 | Thr | Cys | Thr | Ala | Thr 4990 | Ala | Thr | Ala | Gly | Thr 4995 | Thr | Gly | Thr |
| Cys | Thr 5000 | Thr | Thr | Cys | Thr | Cys 5005 | Thr | Gly | Ala | Ala | Thr 5010 | Gly | Thr | Gly |
| Cys | Ala 5015 | Ala | Ala | Ala | Cys | Thr 5020 | Ala | Ala | Gly | Cys | Ala 5025 | Thr | Thr | Cys |
| Cys | Gly 5030 | Ala | Ala | Gly | Cys | Cys 5035 | Ala | Thr | Thr | Ala | Thr 5040 | Thr | Ala | Gly |
| Cys | Ala 5045 | Gly | Thr | Ala | Thr | Gly 5050 | Ala | Ala | Thr | Ala | Gly 5055 | Gly | Gly | Ala |
| Ala | Ala 5060 | Cys | Thr | Ala | Ala | Ala 5065 | Cys | Cys | Cys | Ala | Gly 5070 | Thr | Gly | Ala |
| Thr | Ala 5075 | Ala | Gly | Ala | Cys | Cys 5080 | Thr | Gly | Ala | Thr | Gly 5085 | Ala | Thr | Thr |
| Thr | Cys 5090 | Gly | Cys | Thr | Thr | Cys 5095 | Thr | Thr | Thr | Ala | Ala 5100 | Thr | Thr | Ala |
| Cys | Ala 5105 | Thr | Thr | Thr | Gly | Gly 5110 | Ala | Gly | Ala | Thr | Thr 5115 | Thr | Thr | Thr |
| Thr | Ala 5120 | Thr | Thr | Thr | Ala | Cys 5125 | Ala | Gly | Cys | Ala | Thr 5130 | Thr | Gly | Thr |
| Thr | Thr 5135 | Thr | Cys | Ala | Ala | Ala 5140 | Thr | Ala | Thr | Ala | Thr 5145 | Thr | Cys | Cys |
PL 210 546 B1
| Ala | Ala 5150 | Thr | Thr | Ala | Ala | Thr 5155 | Cys | Gly | Gly | Thr | Gly 5160 | Ala | Ala | Thr |
| Gly | Ala 5165 | Thr | Thr | Gly | Gly | Ala 5170 | Gly | Thr | Thr | Ala | Gly 5175 | Ala | Ala | Thr |
| Ala | Ala 5180 | Thr | Cys | Thr | Ala | Cys 5185 | Thr | Ala | Thr | Ala | Gly 5190 | Gly | Ala | Thr |
| Cys | Ala 5195 | Thr | Ala | Thr | Thr | Thr 5200 | Thr | Ala | Thr | Thr | Ala 5205 | Ala | Ala | Thr |
| Thr | Ala 5210 | Gly | Cys | Gly | Thr | Cys 5215 | Ala | Thr | Cys | Ala | Thr 5220 | Ala | Ala | Thr |
| Ala | Thr 5225 | Thr | Gly | Cys | Cys | Thr 5230 | Cys | Cys | Ala | Thr | Thr 5235 | Thr | Thr | Thr |
| Thr | Ala 5240 | Gly | Gly | Gly | Thr | Ala 5245 | Ala | Thr | Thr | Ala | Thr 5250 | Cys | Cys | Ala |
| Gly | Ala 5255 | Ala | Thr | Thr | Gly | Ala 5260 | Ala | Ala | Thr | Ala | Thr 5265 | Cys | Ala | Gly |
| Ala | Thr 5270 | Thr | Thr | Ala | Ala | Cys 5275 | Cys | Ala | Thr | Ala | Gly 5280 | Ala | Ala | Thr |
| Gly | Ala 5285 | Gly | Gly | Ala | Thr | Ala 5290 | Ala | Ala | Thr | Gly | Ala 5295 | Thr | Cys | Gly |
| Cys | Gly 5300 | Ala | Gly | Thr | Ala | Ala 5305 | Ala | Thr | Ala | Ala | Thr 5310 | Ala | Thr | Thr |
| Cys | Ala 5315 | Cys | Ala | Ala | Thr | Gly 5320 | Thr | Ala | Cys | Cys | Ala 5325 | Thr | Thr | Thr |
| Thr | Ala 5330 | Gly | Thr | Cys | Ala | Thr 5335 | Ala | Thr | Cys | Ala | Gly 5340 | Ala | Thr | Ala |
| Ala | Gly 5345 | Cys | Ala | Thr | Thr | Gly 5350 | Ala | Thr | Thr | Ala | Ala 5355 | Thr | Ala | Thr |
| Cys | Ala 5360 | Thr | Thr | Ala | Thr | Thr 5365 | Gly | Cys | Thr | Thr | Cys 5370 | Thr | Ala | Cys |
| Ala | Gly 5375 | Gly | Cys | Thr | Thr | Thr 5380 | Ala | Ala | Thr | Thr | Thr 5385 | Thr | Ala | Thr |
| Thr | Ala 5390 | Ala | Thr | Thr | Ala | Thr 5395 | Thr | Cys | Thr | Gly | Thr 5400 | Ala | Ala | Gly |
| Thr | Gly 5405 | Thr | Cys | Gly | Thr | Cys 5410 | Gly | Gly | Cys | Ala | Thr 5415 | Thr | Thr | Ala |
| Thr | Gly 5420 | Thr | Cys | Thr | Thr | Thr 5425 | Cys | Ala | Thr | Ala | Cys 5430 | Cys | Cys | Ala |
PL 210 546 B1
| Thr | Cys 5435 | Thr | Cys | Thr | Thr | Thr 5440 | Ala | Thr | Cys | Cys | Thr 5445 | Thr | Ala | Cys |
| Cys | Thr 5450 | Ala | Thr | Thr | Gly | Thr 5455 | Thr | Thr | Gly | Thr | Cys 5460 | Gly | Cys | Ala |
| Ala | Gly 5465 | Thr | Thr | Thr | Thr | Gly 5470 | Cys | Gly | Thr | Gly | Thr 5475 | Thr | Ala | Thr |
| Ala | Thr 5480 | Ala | Thr | Cys | Ala | Thr 5485 | Thr | Ala | Ala | Ala | Ala 5490 | Cys | Gly | Gly |
| Thr | Ala 5495 | Ala | Thr | Ala | Gly | Ala 5500 | Thr | Thr | Gly | Ala | Cys 5505 | Ala | Thr | Thr |
| Thr | Gly 5510 | Ala | Thr | Thr | Cys | Thr 5515 | Ala | Ala | Thr | Ala | Ala 5520 | Ala | Thr | Thr |
| Gly | Gly 5525 | Ala | Thr | Thr | Thr | Thr 5530 | Thr | Gly | Thr | Cys | Ala 5535 | Cys | Ala | Cys |
| Thr | Ala 5540 | Thr | Thr | Ala | Thr | Ala 5545 | Thr | Cys | Gly | Cys | Thr 5550 | Thr | Gly | Ala |
| Ala | Ala 5555 | Thr | Ala | Cys | Ala | Ala 5560 | Thr | Thr | Gly | Thr | Thr 5565 | Thr | Ala | Ala |
| Cys | Ala 5570 | Thr | Ala | Ala | Gly | Thr 5575 | Ala | Cys | Cys | Thr | Gly 5580 | Thr | Ala | Gly |
| Gly | Ala 5585 | Thr | Cys | Gly | Thr | Ala 5590 | Cys | Ala | Gly | Gly | Thr 5595 | Thr | Thr | Ala |
| Cys | Gly 5600 | Cys | Ala | Ala | Gly | Ala 5605 | Ala | Ala | Ala | Thr | Gly 5610 | Gly | Thr | Thr |
| Thr | Gly 5615 | Thr | Thr | Ala | Thr | Ala 5620 | Gly | Thr | Cys | Gly | Ala 5625 | Thr | Thr | Ala |
| Ala | Thr 5630 | Cys | Gly | Ala | Thr | Thr 5635 | Thr | Gly | Ala | Thr | Thr 5640 | Cys | Thr | Ala |
| Gly | Ala 5645 | Thr | Thr | Thr | Gly | Thr 5650 | Thr | Thr | Thr | Ala | Ala 5655 | Cys | Thr | Ala |
| Ala | Thr 5660 | Thr | Ala | Ala | Ala | Gly 5665 | Gly | Ala | Gly | Gly | Ala 5670 | Ala | Thr | Ala |
| Ala | Cys 5675 | Ala | Thr | Ala | Thr | Gly 5680 | Ala | Thr | Cys | Gly | Cys 5685 | Thr | Cys | Cys |
| Ala | Cys 5690 | Cys | Ala | Thr | Gly | Cys 5695 | Ala | Cys | Cys | Ala | Gly 5700 | Thr | Gly | Ala |
| Gly | Ala 5705 | Ala | Gly | Cys | Ala | Thr 5710 | Thr | Ala | Thr | Gly | Ala 5715 | Gly | Cys | Ala |
PL 210 546 B1
| Thr | Cys 5720 | Thr | Gly | Gly | Gly | Ala 5725 | Cys | Gly | Gly | Thr | Gly 5730 | Cys | Thr | Gly |
| Thr | Ala 5735 | Ala | Cys | Ala | Ala | Ala 5740 | Thr | Gly | Thr | Gly | Ala 5745 | Ala | Cys | Cys |
| Ala | Gly 5750 | Gly | Ala | Ala | Ala | Gly 5755 | Thr | Ala | Cys | Ala | Thr 5760 | Gly | Thr | Cys |
| Thr | Thr 5765 | Cys | Thr | Ala | Ala | Ala 5770 | Thr | Gly | Cys | Ala | Cys 5775 | Thr | Ala | Cys |
| Thr | Ala 5780 | Cys | Cys | Thr | Cys | Thr 5785 | Gly | Ala | Cys | Ala | Gly 5790 | Thr | Gly | Thr |
| Ala | Thr 5795 | Gly | Thr | Cys | Thr | Gly 5800 | Cys | Cys | Cys | Thr | Gly 5805 | Thr | Gly | Gly |
| Cys | Cys 5810 | Cys | Gly | Gly | Ala | Thr 5815 | Gly | Ala | Ala | Thr | Ala 5820 | Cys | Thr | Thr |
| Gly | Gly 5825 | Ala | Thr | Ala | Gly | Cys 5830 | Thr | Gly | Gly | Ala | Ala 5835 | Thr | Gly | Ala |
| Ala | Gly 5840 | Ala | Ala | Gly | Ala | Thr 5845 | Ala | Ala | Ala | Thr | Gly 5850 | Cys | Thr | Thr |
| Gly | Cys 5855 | Thr | Gly | Cys | Ala | Thr 5860 | Ala | Ala | Ala | Gly | Thr 5865 | Thr | Thr | Gly |
| Thr | Gly 5870 | Ala | Thr | Ala | Cys | Ala 5875 | Gly | Gly | Cys | Ala | Ala 5880 | Gly | Gly | Cys |
| Cys | Cys 5885 | Thr | Gly | Gly | Thr | Gly 5890 | Gly | Cys | Cys | Gly | Thr 5895 | Gly | Gly | Thr |
| Cys | Gly 5900 | Cys | Cys | Gly | Gly | Cys 5905 | Ala | Ala | Cys | Ala | Gly 5910 | Thr | Ala | Cys |
| Gly | Ala 5915 | Cys | Cys | Cys | Cys | Cys 5920 | Cys | Gly | Gly | Cys | Gly 5925 | Cys | Thr | Gly |
| Cys | Gly 5930 | Cys | Gly | Thr | Gly | Cys 5935 | Ala | Cys | Gly | Gly | Cys 5940 | Thr | Gly | Gly |
| Gly | Thr 5945 | Ala | Cys | Cys | Ala | Cys 5950 | Thr | Gly | Gly | Ala | Gly 5955 | Cys | Cys | Ala |
| Gly | Gly 5960 | Ala | Cys | Thr | Gly | Cys 5965 | Gly | Ala | Gly | Thr | Gly 5970 | Cys | Thr | Gly |
| Cys | Cys 5975 | Gly | Cys | Cys | Gly | Cys 5980 | Ala | Ala | Cys | Ala | Cys 5985 | Cys | Gly | Ala |
| Gly | Thr 5990 | Gly | Cys | Gly | Cys | Gly 5995 | Cys | Cys | Gly | Gly | Gly 6000 | Cys | Cys | Thr |
PL 210 546 B1
| Gly | Gly 6005 | Gly | Cys | Gly | Cys | Cys 6010 | Cys | Ala | Gly | Cys | Ala 6015 | Cys | Cys | Cys |
| Gly | Thr 6020 | Thr | Gly | Cys | Ala | Gly 6025 | Cys | Thr | Cys | Ala | Ala 6030 | Cys | Ala | Ala |
| Gly | Gly 6035 | Ala | Cys | Ala | Cys | Ala 6040 | Gly | Thr | Gly | Thr | Gly 6045 | Cys | Ala | Ala |
| Ala | Cys 6050 | Cys | Thr | Thr | Gly | Cys 6055 | Cys | Thr | Thr | Gly | Cys 6060 | Ala | Gly | Gly |
| Cys | Thr 6065 | Ala | Cys | Thr | Thr | Cys 6070 | Thr | Cys | Thr | Gly | Ala 6075 | Thr | Gly | Cys |
| Cys | Thr 6080 | Thr | Thr | Thr | Cys | Cys 6085 | Thr | Cys | Cys | Ala | Cys 6090 | Gly | Gly | Ala |
| Cys | Ala 6095 | Ala | Ala | Thr | Gly | Cys 6100 | Ala | Gly | Ala | Cys | Cys 6105 | Cys | Thr | Gly |
| Gly | Ala 6110 | Cys | Cys | Ala | Ala | Cys 6115 | Thr | Gly | Thr | Ala | Cys 6120 | Cys | Thr | Thr |
| Cys | Cys 6125 | Thr | Thr | Gly | Gly | Ala 6130 | Ala | Ala | Gly | Ala | Gly 6135 | Ala | Gly | Thr |
| Ala | Gly 6140 | Ala | Ala | Cys | Ala | Thr 6145 | Cys | Ala | Thr | Gly | Gly 6150 | Gly | Ala | Cys |
| Ala | Gly 6155 | Ala | Gly | Ala | Ala | Ala 6160 | Thr | Cys | Cys | Gly | Ala 6165 | Thr | Gly | Thr |
| Gly | Gly 6170 | Thr | Thr | Thr | Gly | Cys 6175 | Ala | Gly | Thr | Thr | Cys 6180 | Thr | Thr | Cys |
| Thr | Cys 6185 | Thr | Gly | Cys | Cys | Ala 6190 | Gly | Cys | Thr | Ala | Gly 6195 | Ala | Ala | Ala |
| Ala | Cys 6200 | Cys | Ala | Cys | Cys | Ala 6205 | Ala | Ala | Thr | Gly | Ala 6210 | Ala | Cys | Cys |
| Cys | Cys 6215 | Ala | Thr | Gly | Thr | Thr 6220 | Thr | Ala | Cys | Gly | Thr 6225 | Cys | Gly | Ala |
| Cys | Ala 6230 | Ala | Ala | Ala | Cys | Thr 6235 | Cys | Ala | Cys | Ala | Cys 6240 | Ala | Thr | Gly |
| Thr | Cys 6245 | Cys | Ala | Cys | Cys | Thr 6250 | Thr | Gly | Thr | Cys | Cys 6255 | Ala | Gly | Cys |
| Thr | Cys 6260 | Cys | Gly | Gly | Ala | Ala 6265 | Cys | Thr | Cys | Cys | Thr 6270 | Gly | Gly | Gly |
| Gly | Gly 6275 | Gly | Ala | Cys | Cys | Gly 6280 | Thr | Cys | Ala | Gly | Thr 6285 | Cys | Thr | Thr |
PL 210 546 B1
| Cys | Cys 6290 | Thr | Cys | Thr | Thr | Cys 6295 | Cys | Cys | Cys | Cys | Cys 6300 | Ala | Ala | Ala |
| Ala | Cys 6305 | Cys | Cys | Ala | Ala | Gly 6310 | Gly | Ala | Cys | Ala | Cys 6315 | Cys | Cys | Thr |
| Cys | Ala 6320 | Thr | Gly | Ala | Thr | Cys 6325 | Thr | Cys | Cys | Cys | Gly 6330 | Gly | Ala | Cys |
| Cys | Cys 6335 | Cys | Thr | Gly | Ala | Gly 6340 | Gly | Thr | Cys | Ala | Cys 6345 | Ala | Thr | Gly |
| Cys | Gly 6350 | Thr | Gly | Gly | Thr | Gly 6355 | Gly | Thr | Gly | Gly | Ala 6360 | Cys | Gly | Thr |
| Gly | Ala 6365 | Gly | Cys | Cys | Ala | Cys 6370 | Gly | Ala | Ala | Gly | Ala 6375 | Cys | Cys | Cys |
| Thr | Gly 6380 | Ala | Gly | Gly | Thr | Cys 6385 | Ala | Ala | Gly | Thr | Thr 6390 | Cys | Ala | Ala |
| Cys | Thr 6395 | Gly | Gly | Thr | Ala | Cys 6400 | Gly | Thr | Gly | Gly | Ala 6405 | Cys | Gly | Gly |
| Cys | Gly 6410 | Thr | Gly | Gly | Ala | Gly 6415 | Gly | Thr | Gly | Cys | Ala 6420 | Thr | Ala | Ala |
| Thr | Gly 6425 | Cys | Cys | Ala | Ala | Gly 6430 | Ala | Cys | Ala | Ala | Ala 6435 | Gly | Cys | Cys |
| Gly | Cys 6440 | Gly | Gly | Gly | Ala | Gly 6445 | Gly | Ala | Gly | Cys | Ala 6450 | Gly | Thr | Ala |
| Cys | Ala 6455 | Ala | Cys | Ala | Gly | Cys 6460 | Ala | Cys | Gly | Thr | Ala 6465 | Cys | Cys | Gly |
| Thr | Gly 6470 | Thr | Gly | Gly | Thr | Cys 6475 | Ala | Gly | Cys | Gly | Thr 6480 | Cys | Cys | Thr |
| Cys | Ala 6485 | Cys | Cys | Gly | Thr | Cys 6490 | Cys | Thr | Gly | Cys | Ala 6495 | Cys | Cys | Ala |
| Gly | Gly 6500 | Ala | Cys | Thr | Gly | Gly 6505 | Cys | Thr | Gly | Ala | Ala 6510 | Thr | Gly | Gly |
| Cys | Ala 6515 | Ala | Gly | Gly | Ala | Gly 6520 | Thr | Ala | Cys | Ala | Ala 6525 | Gly | Thr | Gly |
| Cys | Ala 6530 | Ala | Gly | Gly | Thr | Cys 6535 | Thr | Cys | Cys | Ala | Ala 6540 | Cys | Ala | Ala |
| Ala | Gly 6545 | Cys | Cys | Cys | Thr | Cys 6550 | Cys | Cys | Ala | Gly | Cys 6555 | Cys | Cys | Cys |
| Cys | Ala 6560 | Thr | Cys | Gly | Ala | Gly 6565 | Ala | Ala | Ala | Ala | Cys 6570 | Cys | Ala | Thr |
PL 210 546 B1
| Cys | Thr 6575 | Cys | Cys | Ala | Ala | Ala 6580 | Gly | Cys | Cys | Ala | Ala 6585 | Ala | Gly | Gly |
| Gly | Cys 6590 | Ala | Gly | Cys | Cys | Cys 6595 | Cys | Gly | Ala | Gly | Ala 6600 | Ala | Cys | Cys |
| Ala | Cys 6605 | Ala | Gly | Gly | Thr | Gly 6610 | Thr | Ala | Cys | Ala | Cys 6615 | Cys | Cys | Thr |
| Gly | Cys 6620 | Cys | Cys | Cys | Cys | Ala 6625 | Thr | Cys | Cys | Cys | Gly 6630 | Gly | Gly | Ala |
| Thr | Gly 6635 | Ala | Gly | Cys | Thr | Gly 6640 | Ala | Cys | Cys | Ala | Ala 6645 | Gly | Ala | Ala |
| Cys | Cys 6650 | Ala | Gly | Gly | Thr | Cys 6655 | Ala | Gly | Cys | Cys | Thr 6660 | Gly | Ala | Cys |
| Cys | Thr 6665 | Gly | Cys | Cys | Thr | Gly 6670 | Gly | Thr | Cys | Ala | Ala 6675 | Ala | Gly | Gly |
| Cys | Thr 6680 | Thr | Cys | Thr | Ala | Thr 6685 | Cys | Cys | Cys | Ala | Gly 6690 | Cys | Gly | Ala |
| Cys | Ala 6695 | Thr | Cys | Gly | Cys | Cys 6700 | Gly | Thr | Gly | Gly | Ala 6705 | Gly | Thr | Gly |
| Gly | Gly 6710 | Ala | Gly | Ala | Gly | Cys 6715 | Ala | Ala | Thr | Gly | Gly 6720 | Gly | Cys | Ala |
| Gly | Cys 6725 | Cys | Gly | Gly | Ala | Gly 6730 | Ala | Ala | Cys | Ala | Ala 6735 | Cys | Thr | Ala |
| Cys | Ala 6740 | Ala | Gly | Ala | Cys | Cys 6745 | Ala | Cys | Gly | Cys | Cys 6750 | Thr | Cys | Cys |
| Cys | Gly 6755 | Thr | Gly | Cys | Thr | Gly 6760 | Gly | Ala | Cys | Thr | Cys 6765 | Cys | Gly | Ala |
| Cys | Gly 6770 | Gly | Cys | Thr | Cys | Cys 6775 | Thr | Thr | Cys | Thr | Thr 6780 | Cys | Cys | Thr |
| Cys | Thr 6785 | Ala | Cys | Ala | Gly | Cys 6790 | Ala | Ala | Gly | Cys | Thr 6795 | Cys | Ala | Cys |
| Cys | Gly 6800 | Thr | Gly | Gly | Ala | Cys 6805 | Ala | Ala | Gly | Ala | Gly 6810 | Cys | Ala | Gly |
| Gly | Thr 6815 | Gly | Gly | Cys | Ala | Gly 6820 | Cys | Ala | Gly | Gly | Gly 6825 | Gly | Ala | Ala |
| Cys | Gly 6830 | Thr | Cys | Thr | Thr | Cys 6835 | Thr | Cys | Ala | Thr | Gly 6840 | Cys | Thr | Cys |
| Cys | Gly 6845 | Thr | Gly | Ala | Thr | Gly 6850 | Cys | Ala | Thr | Gly | Ala 6855 | Gly | Gly | Cys |
PL 210 546 B1
| Thr | Cys 6860 | Thr | Gly | Cys | Ala | Cys 6865 | Ala | Ala | Cys | Cys | Ala 6870 | Cys | Thr | Ala |
| Cys | Ala 6875 | Cys | Gly | Cys | Ala | Gly 6880 | Ala | Ala | Gly | Ala | Gly 6885 | Cys | Cys | Thr |
| Cys | Thr 6890 | Cys | Cys | Cys | Thr | Gly 6895 | Thr | Cys | Thr | Cys | Cys 6900 | Gly | Gly | Gly |
| Thr | Ala 6905 | Ala | Ala | Thr | Ala | Ala 6910 | Thr | Gly | Gly | Ala | Thr 6915 | Cys | Cys | Gly |
| Cys | Gly 6920 | Gly | Ala | Ala | Ala | Gly 6925 | Ala | Ala | Gly | Ala | Ala 6930 | Gly | Ala | Ala |
| Gly | Ala 6935 | Ala | Gly | Ala | Ala | Gly 6940 | Ala | Ala | Ala | Gly | Cys 6945 | Cys | Cys | Gly |
| Ala | Ala 6950 | Ala | Gly | Gly | Ala | Ala 6955 | Gly | Cys | Thr | Gly | Ala 6960 | Gly | Thr | Thr |
| Gly | Gly 6965 | Cys | Thr | Gly | Cys | Thr 6970 | Gly | Cys | Cys | Ala | Cys 6975 | Cys | Gly | Cys |
| Thr | Gly 6980 | Ala | Gly | Cys | Ala | Ala 6985 | Thr | Ala | Ala | Cys | Thr 6990 | Ala | Gly | Cys |
| Ala | Thr 6995 | Ala | Ala | Cys | Cys | Cys 7000 | Cys | Thr | Thr | Gly | Gly 7005 | Gly | Gly | Cys |
| Cys | Thr 7010 | Cys | Thr | Ala | Ala | Ala 7015 | Cys | Gly | Gly | Gly | Thr 7020 | Cys | Thr | Thr |
| Gly | Ala 7025 | Gly | Gly | Gly | Gly | Thr 7030 | Thr | Thr | Thr | Thr | Thr 7035 | Gly | Cys | Thr |
| Gly | Ala 7040 | Ala | Ala | Gly | Gly | Ala 7045 | Gly | Gly | Ala | Ala | Cys 7050 | Cys | Gly | Cys |
| Thr | Cys 7055 | Thr | Thr | Cys | Ala | Cys 7060 | Gly | Cys | Thr | Cys | Thr 7065 | Thr | Cys | Ala |
| Cys | Gly 7070 | Cys | Gly | Gly | Ala | Thr 7075 | Ala | Ala | Ala | Thr | Ala 7080 | Ala | Gly | Thr |
| Ala | Ala 7085 | Cys | Gly | Ala | Thr | Cys 7090 | Cys | Gly | Gly | Thr | Cys 7095 | Cys | Ala | Gly |
| Thr | Ala 7100 | Ala | Thr | Gly | Ala | Cys 7105 | Cys | Thr | Cys | Ala | Gly 7110 | Ala | Ala | Cys |
| Thr | Cys 7115 | Cys | Ala | Thr | Cys | Thr 7120 | Gly | Gly | Ala | Thr | Thr 7125 | Thr | Gly | Thr |
| Thr | Cys 7130 | Ala | Gly | Ala | Ala | Cys 7135 | Gly | Cys | Thr | Cys | Gly 7140 | Gly | Thr | Thr |
PL 210 546 B1
| Gly | Cys 7145 | Cys | Gly | Cys | Cys | Gly 7150 | Gly | Gly | Cys | Gly | Thr 7155 | Thr | Thr | Thr |
| Thr | Thr 7160 | Ala | Thr | Thr | Gly | Gly 7165 | Thr | Gly | Ala | Gly | Ala 7170 | Ala | Thr | Cys |
| Gly | Cys 7175 | Ala | Gly | Cys | Ala | Ala 7180 | Cys | Thr | Thr | Gly | Thr 7185 | Cys | Gly | Cys |
| Gly | Cys 7190 | Cys | Ala | Ala | Thr | Cys 7195 | Gly | Ala | Gly | Cys | Cys 7200 | Ala | Thr | Gly |
| Thr | Cys 7205 | Gly | Thr | Cys | Gly | Thr 7210 | Cys | Ala | Ala | Cys | Gly 7215 | Ala | Cys | Cys |
| Cys | Cys 7220 | Cys | Cys | Ala | Thr | Thr 7225 | Cys | Ala | Ala | Gly | Ala 7230 | Ala | Cys | Ala |
| Gly | Cys 7235 | Ala | Ala | Gly | Cys | Ala 7240 | Gly | Cys | Ala | Thr | Thr 7245 | Gly | Ala | Gly |
| Ala | Ala 7250 | Cys | Thr | Thr | Thr | Gly 7255 | Gly | Ala | Ala | Thr | Cys 7260 | Cys | Ala | Gly |
| Thr | Cys 7265 | Cys | Cys | Thr | Cys | Thr 7270 | Thr | Cys | Cys | Ala | Cys 7275 | Cys | Thr | Gly |
| Cys | Thr | Gly | Ala | Cys | Cys | Gly |
7280 7285
| <210> <211> <212> <213> | 29 14 PRT Sekwencja | sztuczna |
| <220> | ||
| <223> | Korzystne | domeny modulujące TALL-1 |
| <400> | 29 | |
| Pro Gly Thr Cys : | Phe Pro Phe Pro Trp Glu Cys |
10
Thr His Ala <210> 30 <211> 14 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 30
Trp Gly Ala Cys Trp Pro Phe Pro Trp Glu Cys Phe Lys Glu 15 10
PL 210 546 B1 <210> 31 <211> 14 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 31
Val Pro Phe Cys Asp Leu Leu Thr Lys His Cys Phe Glu Ala 15 10 <210> 32 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 32
Gly Ser Arg Cys Lys Tyr Lys Trp Asp Val Leu Thr Lys Gin Cys Phe 15 10 15
His His <210> 33 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 33
Leu Pro Gly Cys Lys Trp Asp Leu Leu Ile Lys Gin Trp Val Cys Asp 15 10 15
Pro Leu <210> 34 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 34
Ser Ala Asp Cys Tyr Phe Asp Ile Leu Thr Lys Ser Asp Val Cys Thr 15 10 15
Ser Ser
PL 210 546 B1 <210> 35 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 35
Ser Asp Asp Cys Met Tyr Asp Gin Leu Thr Arg Met Phe Ile Cys Ser 15 10 15
Asn Leu <210> 36 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 36
Asp Leu Asn Cys Lys Tyr Asp Glu Leu Thr Tyr Lys Glu Trp Cys Gin 15 10 15
Phe Asn <210> 37 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 37
Phe His Asp Cys Lys Tyr Asp Leu Leu Thr Arg Gin Met Val Cys His 15 10 15
Gly Leu <210> 38 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 38
Arg Asn His Cys Phe Trp Asp His Leu Leu Lys Gin Asp Ile Cys Pro 15 10 15
Ser Pro
PL 210 546 B1 <210> 39 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 39
Ala Asn Gin Cys Trp Trp Asp Ser Leu Thr Lys Lys Asn Val Cys Glu 15 10 15
Phe Phe
| <210> <211> <212> <213> | 40 8 DNA Sekwencja sztuczna |
| <220> <223> | Linkery poliglicynowe |
| <400> 40 gggkgggg | |
| <210> <211> <212> <213> | 41 8 DNA Sekwencja sztuczna |
| <220> <223> | Linkery poliglicynowe |
| <220> <221> <222> <223> | inne cechy (4) . . (4> N oznacza asparginę |
| <400> | 41 |
| gggngsgg | |
| <210> <211> <212> <213> | 42 8 DNA Sekwencja sztuczna |
| <220> <223> | Linkery poliglicynowe |
| <400> | 42 |
| gggcgggg | |
| <210> | 43 |
PL 210 546 B1 <211> 5 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Linkery poliglicynowe <400> 43
Gly Pro Asn Gly Gly
| 1 | 5 |
| <210> | 44 |
| <211> | 19 |
| <212> | PRT |
| <213> | Sekwencja sztuczna |
| <220> | |
| <223> | Wiązanie peptydowe |
| <220> | |
| <221> | inne cechy |
| <222> | (19) . . (19) |
| <223> | Xaa = wiązanie peptydowe domena Fc przyłączona w pozycji 19 do C-końca |
| <400> | 44 |
Leu Pro Gly Cys Lys Trp Asp Leu Leu Ile Lys Gin Trp Val Cys Asp 15 10 15
Pro Leu Xaa <210> 45 <211> 19 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Wiązanie peptydowe <220>
<221> inne cechy <222> (1)..(1) <223> Xaa = wiązanie peptydowe domena Fc domain przyłączona w pozycji 1 do N-końca <400> 45
Xaa Leu Pro Gly Cys Lys Trp Asp Leu Leu Ile Lys Gin Trp Val Cys 15 10 15
Asp Pro Leu <210> 46 <211> 38 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna
PL 210 546 B1
| <220> | |
| <223> | Wiązanie peptydowe |
| <220> | |
| <221> | inne cechy |
| <222> | (19)..(19) |
| <223> | Xaa = wiązanie peptydowe |
| <220> | |
| <221> | inne cechy |
| <222> | (38) . . (38) |
| <223> | Xaa = wiązanie peptydowe domena Fc przyłączona w pozycji 38 do C-końca |
| <400> | 46 |
| Leu 1 | Pro | Gly | Cys | Lys 5 | Trp | Asp | Leu | Leu | Ile 10 | Lys | Gin | Trp | Val | Cys 15 | Asp |
| Pro | Leu | Xaa | Leu | Pro | Gly | Cys | Lys | Trp | Asp | Leu | Leu | Ile | Lys | Gin | Trp |
25 30
Val Cys Asp Pro Leu Xaa 35 <210> 47 <211> 38 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Wiązanie peptydowe <220>
<221> inne cechy <222> (1)..(1) <223> Xaa = wiązanie peptydowe domena Fc przyłączona w pozycji 1 do N-końca <220>
<221> inne cechy <222> (20) . . (20) <223> Xaa = wiązanie peptydowe <400> 47
| Xaa 1 | Leu | Pro | Gly | Cys 5 | Lys | Trp | Asp | Leu | Leu 10 | Ile | Lys | Gin | Trp | Val 15 | Cys |
| Asp | Pro | Leu | Xaa 20 | Leu | Pro | Gly | Cys | Lys 25 | Trp | Asp | Leu | Leu | Ile 30 | Lys | Gin |
| Trp | Val | Cys | Asp | Pro | Leu |
PL 210 546 B1
| <210> | 48 |
| <211> | 19 |
| <212> | PRT |
| <213> | Sekwencja sztuczna |
| <220> | |
| <223> | Wiązanie peptydowe |
| <220> | |
| <221> | inne cechy |
| <222> | (19) . . (19) |
| <223> | Xaa = wiązanie peptydowe domena Fc przyłączona w pozycji 19 do C-końca |
| <400> | 48 |
Ser Ala Asp Cys Tyr Phe Asp Ile Leu Thr Lys Ser Asp Val Cys Thr 15 10 15
Ser Ser Xaa
| <210> <211> <212> <213> | 49 19 PRT Sekwencja sztuczna |
| <220> <223> | Wiązanie peptydowe |
| <220> <221> <222> <223> | inne cechy (1) - · (1) Xaa = wiązanie peptydowe Domena Fc przyłączona w pozycji 1 do |
| <400> | 49 |
Xaa Ser Ala Asp Cys Tyr Phe Asp Ile Leu Thr Lys Ser Asp Val Cys 15 10 15
| Thr Ser Ser | |
| <210> | 50 |
| <211> | 36 |
| <212> | PRT |
| <213> | Sekwencja sztuczna |
| <220> | |
| <223> | Wiązanie peptydowe |
| <220> | |
| <221> | inne cechy |
| <222> | (18) . . (18) |
| <223> | Xaa = wiązanie peptydowe |
| <220> | |
| <221> | inne cechy |
| <222> | (36)..(36) |
PL 210 546 B1 <223> Xaa = wiązanie peptydowe
Domena Fc przyłączona w pozycji 36 do C-końca <400> 50
| Ser | Ala | Asp | Cys | Tyr | Phe | Asp | Ile | Leu | Thr | Lys | Ser | Asp | Val | Thr | Ser |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Ser | Xaa | Ser | Ala | Asp | Cys | Tyr | Phe | Asp | Ile | Leu | Thr | Lys | Ser | Asp | Val |
25 30
Thr Ser Ser Xaa 35 <210> 51 <211> 36 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Wiązanie peptydowe <220>
<221> inne cechy <222> (1) . . (1) <223> Xaa = wiązanie peptydowe
Domena Fc przyłączona w pozycji 1 do N-końca <220>
<221> inne cechy <222> (19)..(19) <223> Xaa = wiązanie peptydowe <400> 51
| Xaa 1 | Ser | Ala | Asp Cys Tyr 5 | Phe Asp | Ile Leu 10 | Thr | Lys | Ser Asp | Val 15 | Thr | ||||
| Ser | Ser | Xaa | Ser | Ala Asp | Cys | Tyr | Phe | Asp | Ile | Leu | Thr | Lys | Ser | Asp |
| 20 | 25 | 30 |
Val Thr Ser Ser 35
| <210> | 52 |
| <211> | 19 |
| <212> | PRT |
| <213> | Sekwencja sztuczna |
| <220> | |
| <223> <220> | Wiązanie peptydowe |
| <221> | inne cechy |
| <222> | (19) · (19) |
| <223> | Xaa = wiązanie peptydowe Domena Fc przyłączona w pozycji 19 do C-końca |
PL 210 546 B1 <400> 52
Phe His Asp Cys Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Trp Val Cys His 15 10 15
Gly Leu Xaa
| <210> <211> <212> <213> | 53 19 PRT Sekwencja sztuczna |
| <220> <223> | Wiązanie peptydowe |
| <220> <221> <222> <223> | inne cechy (1) . · (1) Xaa = wiązanie peptydowe Domena Fc przyłączona w pozycji 1 do |
| <400> | 53 |
Xaa Phe His Asp Cys Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Trp Val Cys 15 10 15
His Gly Leu
| <210> <211> <212> <213> | 54 38 PRT Sekwencja sztuczna |
| <220> <223> | Wiązanie peptydowe |
| <220> <221> <222> <223> | inne cechy (19) · · (19) Xaa = wiązanie peptydowe |
| <220> <221> <222> <223> | inne cechy (38) . . (38) Xaa = wiązanie peptydowe Domena Fc przyłączona w pozycji 38 do C-końca |
| <400> | 54 |
| Phe 1 | His | Asp Cys | Lys 5 | Trp | Asp | Leu Leu | Thr 10 | Lys | Gin Trp Val | Cys 15 | His | ||||
| Gly | Leu | Xaa | Phe | His | Asp | Cys | Lys | Trp | Asp | Leu | Leu | Thr | Lys | Gin | Trp |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Val | Cys | His | Gly | Leu | Xaa | ||||||||||
| 35 |
PL 210 546 B1 <210> 55 <211> 38 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Wiązanie peptydowe <220>
<221> inne cechy <222> (1)..(1) <223> Xaa = wiązanie peptydowe
Domena Fc przyłączona w pozycji 1 do N-końca <220>
<221> inne cechy <222> (20)..(20) <223> Xaa = wiązanie peptydowe <400> 55
| Xaa 1 | Phe | His | Asp | Cys 5 | Lys | Trp | Asp |
| His | Gly | Leu | Xaa 20 | Phe | His | Asp | Cys |
| Trp | Val | Cys | His | Gly | Leu |
Leu Thr Lys Gin Trp Val Cys 10 15
Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin 30 <210> 56 <211> 25 <212> DNA <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Oligonukleotyd <400> 56 cggcgcaact atcggtatca agctg <210> 57 <211> 26 <212> DNA <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Oligonukleotyd <400> 57 catgtaccgt aacactgagt ttcgtc <210> 58 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna
PL 210 546 B1 <220>
<223> Peptyd zgodny <400> 58
Phe His Asp Cys Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Trp Val Cys His 15 10 15
Gly Leu <210> 59 <211> 23 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystna sekwencja linkera <400> 59
Gly Ser Gly Ser Ala Thr Gly Gly Ser Gly Ser Thr Ala Ser Ser Gly 15 10 15
Ser Gly Ser Ala Thr His Met 20 <210> 60 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 60
Asn Gin Thr Leu Trp Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Phe Ile Thr 15 10 15
Tyr Met <210> 61 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 61
Pro Val Tyr Gin Gly Trp Trp Asp Thr Leu Thr Lys Leu Tyr Ile Trp 15 10 15
Asp Gly
PL 210 546 B1 <210> 62 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 62
Trp Leu Asp Gly Gly Trp Arg Asp Pro Leu Ile Lys Arg Ser Val Gin 15 10 15
Leu Gly <210> 63 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 63
Gly His Gin Gin Phe Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Trp Val Gin 15 10 15
Ser Asn <210> 64 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 64
Gin Arg Val Gly Gin Phe Trp Asp Val Leu Thr Lys Met Phe Ile Thr 1 5 10 15
Gly Ser <210> 65 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 65
Gin Ala Gin Gly Trp Ser Tyr Asp Ala Leu Ile Lys Thr Trp Ile Arg 1 5 10 15
Trp Pro
PL 210 546 B1 <210>
<211>
<212>
PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 66
Gly Trp Met His Trp Lys Trp Asp Pro Leu Thr Lys Gin Ala Leu Pro 15 10 15
Trp Met <210> 67 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 67
Gly His Pro Thr Tyr Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Trp Ile Leu 15 10 15
Gin Met <210>
<211>
<212>
PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 68
Trp Asn Asn Trp Ser Leu Trp Asp Pro Leu Thr Lys Leu Trp Leu Gin 15 10 15
Gin Asn <210> 69 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1
100
PL 210 546 B1 <400> 69
Trp Gin Trp Gly Trp Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Trp Val Gin 15 10 15
Gin Gin <210> 70 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 70
Gly Gin Met Gly Trp Arg Trp Asp Pro Leu Thr Lys Met Trp Leu Gly 15 10 15
Thr Ser
<210> 73 <211> 62 <212> DNA <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Oligonukleotydy
PL 210 546 B1
101
| <400> tatgtg gg | 73 | ||||
| gggt gcttgttggc cgttcccgtg ggaatgtttc aaagaaggtg gaggcggtgg | 60 62 | ||||
| <210> | 74 | ||||
| <211> | 64 | ||||
| <212> | DNA | ||||
| <213> | Sekwencja sztuczna | ||||
| <220> <223> | Oligonukleotydy | ||||
| <400> | 74 | ||||
| tcgaccccac cgcctccacc ttctttgaaa | cattcccacg | ggaacggcca | acaagcaccc | 60 | |
| caca | 64 | ||||
| <210> | 75 | ||||
| <211> | 62 | ||||
| <212> | DNA | ||||
| <213> | Sekwencja sztuczna | ||||
| <220> <223> | Oligonukleotydy | ||||
| <400> | 75 | ||||
| tatggttccg ttctgtgacc tgctgactaa | acactgtttc | gaagctggtg | gaggcggtgg | 60 | |
| gg | 62 | ||||
| <210> | 76 | ||||
| <211> | 64 | ||||
| <212> | DNA | ||||
| <213> | Sekwencja sztuczna | ||||
| <220> <223> | Oligonukleotydy | ||||
| <400> | 76 | ||||
| tcgaccccac cgcctccacc agcttcgaaa | cagtgtttag | tcagcaggtc | acagaacgga | 60 | |
| acca | 64 | ||||
| <210> | 77 | ||||
| <211> | 74 | ||||
| <212> | DNA | ||||
| <213> | Sekwencja sztuczna | ||||
| <220> <223> | Oligonukleotydy | ||||
| <400> | 77 | ||||
| tatgggttct cgttgtaaat acaaatggga | cgttctgact | aaacagtgtt | tccaccacgg | 60 |
102
PL 210 546 B1 tggaggcggt gggg <210> 78 <211> 76 <212> DNA <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Oligonukleotydy <400> 78 tcgaccccac cgcctccacc gtggtggaaa cactgtttag tcagaacgtc ccatttgtat ttacaacgag aaccca <210> 79 <211> 74 <212> DNA <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Oligonukleotydy <400> 79 tatgctgccg ggttgtaaat gggacctgct gatcaaacag tgggtttgtg acccgctggg tggaggcggt gggg <210>
<211>
<212> DNA <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Oligonukleotydy <400> 80 tcgaccccac cgcctccacc cagcgggtca caaacccact gtttgatcag caggtcccat ttacaacccg gcagca <210>
<211>
<212> DNA <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Oligonukleotydy <400> 81 tatgtctgct gactgttact tcgacatcct gactaaatct gacgtttgta cttcttctgg tggaggcggt gggg
PL 210 546 B1
103 <210> 82 <211> 76 <212> DNA <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Oligonukleotydy <400> 82 tcgaccccac cgcctccacc agaagaagta caaacgtcag atttagtcag gatgtcgaag taacagtcag cagaca <210> 83 <211> 74 <212> DNA <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Oligonukleotydy <400> 83 tatgtctgac gactgtatgt acgaccagct gactcgtatg ttcatctgtt ctaacctggg tggaggcggt gggg <210> 84 <211> 76 <212> DNA <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Oligonukleotydy <400> 84 tcgaccccac cgcctccacc caggttagaa cagatgaaca tacgagtcag ctggtcgtac atacagtcgt cagaca <210> 85 <211> 74 <212> DNA <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Oligonukleotydy <400> 85 tatggacctg aactgtaaat acgacgaact gacttacaaa gaatggtgtc agttcaacgg tggaggcggt gggg
104
PL 210 546 B1 <210> 86 <211> 76 <212> DNA <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Oligonukleotydy <400> 86 tcgaccccac cgcctccacc gttgaactga caccattett tgtaagtcag ttcgtcgtat ttacagttca ggtcca <210> 87 <211> 74 <212> DNA <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Oligonukleotydy <400> 87 tatgttccac gactgtaaat acgacctgct gactcgtcag atggtttgtc acggtctggg tggaggcggt gggg <210>
<211>
<212> DNA <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Oligonukleotydy <400> 88 tcgaccccac cgcctccacc cagaccgtga caaaccatct gacgagtcag caggtcgtat 60 ttacagtcgt ggaaca 76 <210>
<211>
<212>
DNA <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Oligonukleotydy <400> 89 tatgcgtaac cactgtttct gggaccacct gctgaaacag gacatctgtc cgtctccggg tggaggcggt gggg
PL 210 546 B1
105 <210> 90 <211> 76 <212> DNA <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Oligonukleotydy <400> 90 tcgaccccac cgcctccacc cggagacgga cagatgtcct gtttcagcag gtggtcccag 60 aaacagtggt tacgca 76 <210> 91 <211> 74 <212> DNA <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Oligonukleotydy <400> 91 tatggctaac cagtgttggt gggactctct gctgaaaaaa aacgtttgtg aattcttcgg tggaggcggt gggg <210> 92 <211> 76 <212> DNA <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Oligonukleotydy <400> 92 tcgaccccac cgcctccacc gaagaattca caaacgtttt ttttcagcag agagtcccac caacactggt tagcca <210> 93 <211> 74 <212> DNA <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Oligonukleotydy <400> 93 tatgttccac gactgcaaat gggacctgct gaccaaacag tgggtttgcc acggtctggg tggaggcggt gggg
106
PL 210 546 B1 <210> 94 <211> 76 <212> DNA <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Oligonukleotydy <400> 94 tcgaccocac cgcctccacc cagaccgtgg caaacccact gtttggtcag caggtcccat ttgcagtcgt ggaaca <210> 95 <211> 141 <212> DNA <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> wektor pAMG21-Rank-Fc <400> 95 ctaattccgc tctcacctac caaacaatgc ccccctgcaa aaaataaatt catataaaaa 60 acatacagat aaccatctgc ggtgataaat tatctctggc ggtgttgaca taaataccac 120 tggcggtgat actgagcaca t 141 <210> 96 <211> 55 <212> DNA <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> wektor pAMG21-Rank-Fc <400> 96 cgatttgatt ctagaaggag gaataacata tggttaaogc gttggaattc ggtac <210> 97 <211> 1546 <212> DNA <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> pAMG21 <400> 97
| tgcatggtct | ccccatgcga | gagtagggaa | ctgccaggca | tcaaataaaa | 60 |
| agtcgaaaga | ctgggccttt | ogttttatct | gttgtttgtc | ggtgaacgct | 120 |
| ggacaaatcc | gccgggagcg | gatttgaacg | ttgcgaagca | acggcccgga | 180 |
| caggacgccc | gccataaact | gccaggcatc | aaattaagca | gaaggccatc | 240 |
PL 210 546 B1
107
| ctgacggatg | gcctttttgc | gtttctacaa | actcttttgt | ttatttttct | aaatacattc | 300 |
| aaatatggac | gtcgtactta | acttttaaag | tatgggcaat | caattgctcc | tgttaaaatt | 360 |
| gctttagaaa | tactttggca | gcggtttgtt | gtattgagtt | tcatttgcgc | attggttaaa | 420 |
| tggaaagtga | ccgtgcgctt | actacagcct | aatatttttg | aaatatccca | agagcttttt | 480 |
| ccttcgcatg | cccacgctaa | acattctttt | tctcttttgg | ttaaatcgtt | gtttgattta | 540 |
| ttatttgcta | tatttatttt | tcgataatta | tcaactagag | aaggaacaat | taatggtatg | 600 |
| ttcatacacg | catgtaaaaa | taaactatct | atatagttgt | ctttctctga | atgtgcaaaa | 660 |
| ctaagcattc | cgaagccatt | attagcagta | tgaataggga | aactaaaocc | agtgataaga | 720 |
| cctgatgatt | tcgcttcttt | aattacattt | ggagattttt | tatttacagc | attgttttca | 780 |
| aatatattcc | aattaatcgg | tgaatgattg | gagttagaat | aatctactat | aggatcatat | 840 |
| tttattaaat | tagcgtcatc | ataatattgc | ctccattttt | tagggtaatt | atccagaatt | 900 |
| gaaatatcag | atttaaccat | agaatgagga | taaatgatcg | cgagtaaata | atattcacaa | 960 |
| tgtaccattt | tagtcatatc | agataagcat | tgattaatat | cattattgct | tctacaggct | 1020 |
| ttaattttat | taattattct | gtaagtgtcg | tcggcattta | tgtctttcat | acccatctct | 1080 |
| ttatccttac | ctattgtttg | tcgcaagttt | tgcgtgttat | atatcattaa | aacggtaata | 1140 |
| gattgacatt | tgattctaat | aaattggatt | tttgtcacac | tattatatcg | cttgaaatac | 1200 |
| aattgtttaa | cataagtacc | tgtaggatcg | tacaggttta | cgcaagaaaa | tggtttgtta | 1260 |
| tagtcgatta | atcgatttga | ttctagattt | gttttaacta | attaaaggag | gaataacata | 1320 |
| tggttaacgc | gttggaattc | gagctcacta | gtgtcgacct | gcagggtacc | atggaagctt | 1380 |
| actcgaggat | ccgcggaaag | aagaagaaga | agaagaaagc | ccgaaaggaa | gctgagttgg | 1440 |
| ctgctgccac | cgctgagcaa | taactagcat | aaccccttgg | ggcctctaaa | cgggtcttga | 1500 |
| ggggtttttt | gctgaaagga | ggaaccgctc | ttcacgctct | tcacgc | 1546 |
<210> 98 <211> 872 <212> DNA <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> GM221 <400> 98 ttattttcgt gcggccgcac cattatcacc gccagaggta aactagtcaa cacgcacggt 60 gttagatatt tatcccttgc ggtgatagat tgagcacatc gatttgattc tagaaggagg 120
108
PL 210 546 B1
| gataatatat | gagcacaaaa | aagaaaccat | taacacaaga | gcagcttgag | gacgcacgtc | 180 |
| gccttaaagc | aatttatgaa | aaaaagaaaa | atgaacttgg | cttatcccag | gaatctgtcg | 240 |
| cagacaagat | ggggatgggg | cagtcaggcg | ttggtgcttt | atttaatggc | atcaatgcat | 300 |
| taaatgctta | taacgccgca | ttgcttacaa | aaattctcaa | agttagcgtt | gaagaattta | 360 |
| gcccttcaat | cgccagagaa | tctacgagat | gtatgaagcg | gttagtatgc | agccgtcact | 420 |
| tagaagtgag | tatgagtacc | ctgttttttc | tcatgttcag | gcagggatgt | tctcacctaa | 480 |
| gcttagaacc | tttaccaaag | gtgatgcgga | gagatgggta | agcacaacca | aaaaagccag | 540 |
| tgattctgca | ttctggćttg | aggttgaagg | taattccatg | accgcaccaa | caggctccaa | 600 |
| gccaagcttt | cctgacggaa | tgttaattct | cgttgaccct | gagcaggctg | ttgagccagg | 660 |
| tgatttctgc | atagccagac | ttgggggtga | tgagtttacc | ttcaagaaac | tgatcaggga | 720 |
| tagcggtcag | gtgtttttac | aaccactaaa | cccacagtac | ccaatgatcc | catgcaatga | 780 |
| gagttgttcc | gttgtgggga | aagttatcgc | tagtcagtgg | cctgaagaga | cgtttggctg | 840 |
| atagactagt | ggatccacta | gtgtttctgc | cc | 872 |
<210> 99 <211> 1197 <212> DNA <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> (34221 <400> 99
| ggcggaaacc | gacgtccatc | gaatggtgca | aaacctttcg | cggtatggca | tgatagcgcc | 60 |
| cggaagagag | tcaattcagg | gtggtgaatg | tgaaaccagt | aacgttatac | gatgtcgcag | 120 |
| agtatgccgg | tgtctcttat | cagaccgttt | cccgcgtggt | gaaccaggcc | agccacgttt | 180 |
| ctgcgaaaac | gcgggaaaaa | gtcgaagcgg | cgatggcgga | gctgaattac | attcccaacc | 240 |
| gcgtggcaca | acaactggcg | ggcaaacagt | cgctcctgat | tggcgttgcc | acctccagtc | 300 |
| tggccctgca | cgcgccgtcg | caaattgtcg | cggcgattaa | atctcgcgcc | gatcaactgg | 360 |
| gtgccagcgt | ggtggtgtcg | atggtagaac | gaagcggcgt | cgaagcctgt | aaagcggcgg | 420 |
| tgcacaatct | tctcgcgcaa | cgcgtcagtg | ggctgatcat | taactatccg | ctggatgacc | 480 |
| aggatgccat | tgctgtggaa | gctgcctgca | ctaatgttcc | ggcgttattt | cttgatgtct | 540 |
| ctgaccagac | acccatcaac | agtattattt | tctcccatga | agacggtacg | cgactgggcg | 600 |
| tggagcatct | ggtcgcattg | ggtcaccagc | aaatcgcgct | gttagcgggc | ccattaagtt | 660 |
PL 210 546 B1
109
| ctgtctcggc | gcgtctgcgt | ctggctggct | ggcataaata | tctcactcgc | aatcaaattc | 720 |
| agccgatagc | ggaacgggaa | ggcgactgga | gtgccatgtc | cggttttcaa | caaaccatgc | 780 |
| aaatgctgaa | tgagggcatc | gttcccactg | cgatgctggt | tgccaacgat | cagatggcgc | 840 |
| tgggcgcaat | gcgcgccatt | accgagtccg | ggctgcgcgt | tggtgcggat | atctcggtag | 900 |
| tgggatacga | cgataccgaa | gacagctcat | gttatatccc | gccgttaacc | accatcaaac | 960 |
| aggattttcg | cctgctgggg | caaaccagcg | tggaccgctt | gctgcaactc | tctcagggcc | 1020 |
| aggcggtgaa | gggcaatcag | ctgttgcccg | tctcactggt | gaaaagaaaa | accaccctgg | 1080 |
| cgcccaatac | gcaaaccgcc | tctccccgcg | cgttggccga | ttcattaatg | cagctggcac | 1140 |
| gacaggtttc | ccgactggaa | agcggacagt | aaggtaccat | aggatccagg | cacagga | 1197 |
| <210> <211> <212> <213> | 100 14 PRT Sekwencja sztuczna |
| <220> | |
| <223> | Moduladory TALL-1 |
| <220> | |
| <221> | inne cechy |
| <222> | (1, 2, 3, 13) . . (14) |
| <223> | Xaa (Poz. . 1,2,3,13,14) oznaczają lkażdy niezależnie aminokwasowe lub ich brak; |
| <220> | |
| <221> | inne cechy |
| <222> | (6) . . (6) |
| <223> | Xaa (Poz.6) oznacza resztę aminokwasową; |
| <220> | |
| <221> | inne cechy |
| <222> | (8) . . (8) |
| <223> | Xaa (Poz.8) oznacza treonyl lub izoleucyl; |
| <220> | |
| <221> | inne cechy |
| <222> | (9) . . (9) |
| <223> | Xaa (Poz. 9) oznacza resztę zasadową lub hydrofobową; |
| <220> | |
| <221> | inne cechy |
| <222> | (10) . . (10) |
| <223> | Xaa (Poz. 10) oznacza resztę aminokwasową; |
| <220> | |
| <221> | inne cechy |
| <222> | (12)..(12) |
| <223> | Xaa (Poz. 12) oznacza resztę obojętną lub hydrofobową; |
110
PL 210 546 B1 <400> 100
Xaa Xaa Xaa Cys Asp Xaa Leu Xaa Xaa Xaa Cys Xaa Xaa Xaa
| 1 | 5 | 10 |
| <210> | 101 | |
| <211> | 14 | |
| <212> | PRT | |
| <213> | Sekwencja sztuczna | |
| <220> <223> | Moduładory TALL-1 | |
| <220> <221> | inne cechy | |
| <222> | (1, 2, 3, 12 i)..(13) | |
| <223> | Xaa (Poz.1,2,3,12,13) ich brak; | oznaczają niezależnie reszty aminokwasowe lub |
| <220> <221> | inne cechy | |
| <222> | (5 i) . . (8) | |
| <223> | Xaa (Poz.5,8) oznacza | resztę obojętną lub hydrofobową; |
| <220> <221> | inne cechy | |
| <222> | (10) . . (10) | |
| <223> | Xaa (Poz.10) oznacza | resztę kwasową; |
| <220> <221> | inne cechy | |
| <222> | (14) . . (14) | |
| <223> | Xaa (Poz. 14) oznacza | resztę aminokwasową lub jej brak. |
| <400> | 101 | |
| Xaa Xaa Xaa Cys Xaa Pro Phe | Xaa Trp Xaa Cys Xaa Xaa Xaa |
10 <210> 102 <211> 14 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Modulador TALL-1 <220>
<221> inne cechy <222> (1, 2, 3, 12, 13 i)..(14) <223> Xaa (Poz. 1,2,3,12,13,14) oznaczają niezależnie reszty aminokwasowe lub ich brak;
PL 210 546 B1
111 <220>
<221> inne cechy <222> (6 i)..(7) <223> Xaa (Ροζ. 6,7) oznacza resztę hydrofobową;
<220>
<221> inne cechy <222> (10)..(10) <223> Xaa (Poz. 10) oznacza resztę kwasową lub polarną hydrofobową.
<400> 102
Xaa Xaa Xaa Cys Trp Xaa Xaa Trp Gly Xaa Cys Xaa Xaa Xaa
10 <210> 103 <211> 14 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Modulador TALL-1 <220>
<221> inne cechy <222> (1) . . (1) <223> Xaa (Ροζ. 1) oznacza resztę aminokwasową lub jej brak;
<220>
<221> inne cechy <222> (2 i)..(14) <223> Xaa (Poz. 2,14) oznacza obojętną resztę hydrofobową;
<220>
<221> inne cechy <222> (3 i)..(10) <223> Xaa (Poz. 3,10) oznacza resztę kwasową;
<220>
<221> inne cechy <222> (5, 6, 7, 8, 12 i)..(13) <223> Xaa (Poz. 5,6,7,8,12,13) oznaczają niezależnie reszty aainokwasowe;
<220>
<221> inne cechy <222> (9)..(9) <223> Xaa (Poz. 9) oznacza resztę kwasową;
<400> 103
Xaa Xaa Xaa Cys Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Cys Xaa Xaa Xaa
10 <210> 104 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna
112
PL 210 546 B1 <220>
<223> Modulador TALL-1 <220>
<221> inne cechy <222> (1, 2, 12, 13, 16, 17 i)..(18) <223> Xaa (Ροζ. 1,2,12,13,16,17,18) oznaczają niezależnie reszty aminokwasowe lub ich brak;
<220>
| <221> <222> <223> | inne cechy | ||
| (3) . Xaa | • (3) (Poz. 3) oznacza | resztę kwasową lub amidową; | |
| <220> | |||
| <221> | inne | cechy | |
| <222> | (5 i) . . (8) | ||
| <223> | Xaa | (Poz. 5,8) oznacza resztę aminokwasową; | |
| <220> | |||
| <221> | inne | cechy | |
| <222> | (6) . | (5) | |
| <223> | Xaa | (Poz. 6) oznacza | resztę aromatyczną; |
| <220> | |||
| <221> | inne | cechy | |
| <222> | (10) | • · (10) | |
| <223> | Xaa | (Poz. 10) oznacza T lub I; | |
| <220> | |||
| <221> | inne | cechy | |
| <222> | (11) | • · dl) | |
| <223> | Xaa | (Poz. 11) oznacza resztę zasadową; | |
| <220> | |||
| <221> | inne | cechy | |
| <222> | (14) | . · (14) | |
| <223> | Xaa | (Poz. 14) oznacza | i obojętną resztę hydrofobową. |
| <400> | 104 | ||
| Xaa Xaa Xaa | Cys Xaa Xaa Asp | Xaa Leu Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Cys Xaa | |
| 1 | 5 | 10 15 | |
| Xaa Xaa |
| <210> | 105 |
| <211> | 18 |
| <212> | PRT |
| <213> | Sekwencja sztuczna |
| <220> | |
| <223> | Modulador TALL-1 |
| <220> | |
| <221> | inne cechy |
| <222> | (1, 2 i) . . (3) |
PL 210 546 B1
113 <223> Xaa (Ροζ. 1,2,3) oznaczają niezależnie reszty aminokwasowe lub ich brak;
<220>
<221> inne cechy <222> (5, 7, 14 i)..(16) <223> Xaa (Poz. 5,7,14,16) oznacza resztę aminokwasową;
<220>
<221> inne cechy <222> (9)..(9) <223> Xaa (Poz. 9) oznacza T lub I;
<220>
<221> inne cechy <222> (10)..(10) <223> Xaa (Poz. 10) oznacza resztę zasadową;
<220>
<221> inne cechy <222> (11 i) . . (12) <223> Xaa (Poz. 11,12) oznaczają niezależnie reszty aminokwasowe;
<220>
<221> inne cechy <222> (13 i) .. (17) <223> Xaa (Poz. 13,17) oznacza obojętną resztę hydrofobową;
<220>
<221> inne cechy <222> (18)..(18) <223> Xaa (Poz. 18) oznacza resztę aminokwasową lub jej brak.
<400> 105
Xaa Xaa Xaa Cys Xaa Asp Xaa Leu Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Cys Xaa 15 10 15
Xaa Xaa <210> 106 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Modulador TALL-1 <220>
<221> inne cechy <222> (1, 2, 3, 16, 17 i) . . (18) <223> Xaa (Poz. 1,2,3,16,17,18) oznaczają niezależnie reszty aminokwasowe lub ich brak;
<220>
<221> inne cechy <222> (5, 6, 7, 10 i) . . (14) <223> Xaa (Poz. 5,6,7,10,14) oznaczają niezależnie reszty aminokwasowe.
114
PL 210 546 B1
| <220> <221> <222> <223> | inne cechy | 12) | oznacza T lub I; | |||
| (12) Xaa | •·(12) (Poz . | |||||
| <220> <221> | inne | cechy | ||||
| <222> | (13) | •(13) | ||||
| <223> | Xaa | (Poz. | 13) | oznacza resztę | ! aminokwasową; | |
| <400> | 106 | |||||
| Xaa Xaa Xaa | Cys Xaa Xaa Xaa Trp Asp | Xaa Leu Xaa Xaa | Xaa Cys Xaa | |||
| 1 | 5 | 10 | 15 | |||
| Xaa Xaa |
<210> 107 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Modulador TALL-1 <220>
<221> inne cechy <222> (1,2,3,15,16,17)..(18) <223> Xaa (Ροζ. 1,2,3,15,16,17,18) oznaczają niezależnie reszty aminokwasowe lub ich brak ;
<220>
<221> inne cechy <222> (5, 6, 7, 9 i)..(13) <223> Xaa (Poz. 5,6,7,9 13) oznaczają niezależnie reszty aminokwasowe <220>
<221> inne cechy <222> (11)..(11) <223> Xaa (Poz. 11) oznacza T lub I;
<400> 107
Xaa Xaa Xaa Cys Xaa Xaa Xaa Asp Xaa Leu Xaa Lys Xaa Cys Xaa Xaa 15 10 15
Xaa Xaa
| <210> <211> <212> <213> | 108 4 PRT Sekwencja | sztuczna |
| <220> | ||
| <223> | Modulador | TALL-1 |
PL 210 546 B1
115 <220>
<221> inne cechy <222> (2)..(2) <223> X w (Ροζ. 2) oznacza resztę aminokwasowa;
<220>
<221> inne cechy <222> (4)..(4) <223> X w (Poz. 4) oznacza treonyl lub izoleucyl <400> 108
Asp Xaa Leu Xaa
| <210> | 109 |
| <211> | 14 |
| <212> | PRT |
| <213> | Sekwencja sztuczna |
| <220> | |
| <223> | Modulador TALL-1 |
| <220> | |
| <221> | inne cechy |
| <222> | (1, 2 i) . . (3) |
| <223> | X w (Ροζ. 1, 2, 3) oznaczają niezależnie reszty aminokwasowe lub ich brak; (przy czym jedna z grup XI, X2 i X3 oznacza korzystnie C gdy jedna z grup Χ12, Χ13 i Χ14 oznacza C); |
<220>
<221> inne cechy
116
PL 210 546 B1 <222> (13)..(13) <223> X w (Ροζ. t 13) oznacza C, obojętną resztę hydrofobową lub jej brak (korzystnie V);
<220>
<221> inne cechy <222> (14) . . (14) <223> X w (Poz. 14) oznacza dowolną resztę aminokwasową lub jej brak.
<400> 109
Xaa Xaa Xaa Lys Xaa Asp Xaa Leu Xaa Xaa Gin Xaa Xaa Xaa
10 <210> 110 <211> 5 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Modulador TALL-1 <400> 110
Pro Phe Pro Trp Glu 1 5
| <210> | 111 | |
| <211> | 248 | |
| <212> | PRT | |
| <213> | Sekwencja sztuczna | |
| <220> <223> | Ciała peptydowe inhibitujące | TALL-1 |
| <400> | 111 | |
| Met Pro Gly Thr Cys Phe Pro Phe Pro | Trp Glu Cys Thr His Ala Gly |
Ala
Pro
Val
Val
Gin
Gin
PL 210 546 B1
117
Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala 115 120 125
Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gin Pro 130 135 140
Arg Glu Pro Gin Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Asp Glu Leu Thr
145 150 155 160
Lys Asn Gin Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser
165 170 175
Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gin Pro Glu Asn Asn Tyr 180 185 190
Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr 195 200 205
Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gin Gin Gly Asn Val Phe 210 215 220
Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gin Lys 225 230 235 240
Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys 245 <210> 112 <211> 248 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Ciała peptydowe inhibitujące TALL-1 <400> 112
Met Trp Gly Ala Cys Trp Pro Phe Pro Trp Glu Cys Phe Lys Glu Gly 15 10 15
Gly Gly Gly Gly Val Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala 20 25 30
Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro 35 40 45
Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val 50 55 60
Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val
70 75 80
Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gin
90 95
Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gin 100 105 110
118
PL 210 546 B1
| Asp | Trp | Leu 115 | Asn | Gly | Lys | Glu | Tyr 120 | Lys | Cys | Lys | Val | Ser 125 | Asn | Lys | Ala |
| Leu | Pro 130 | Ala | Pro | Ile | Glu | Lys 135 | Thr | Ile | Ser | Lys | Ala 140 | Lys | Gly | Gin | Pro |
| Arg 145 | Glu | Pro | Gin | Val | Tyr 150 | Thr | Leu | Pro | Pro | Ser 155 | Arg | Asp | Glu | Leu | Thr 160 |
| Lys | Asn | Gin | Val | Ser 165 | Leu | Thr | Cys | Leu | Val 170 | Lys | Gly | Phe | Tyr | Pro 175 | Ser |
| Asp | Ile | Ala | Val 180 | Glu | Trp | Glu | Ser | Asn 185 | Gly | Gin | Pro | Glu | Asn 190 | Asn | Tyr |
| Lys | Thr | Thr 195 | Pro | Pro | Val | Leu | Asp 200 | Ser | Asp | Gly | Ser | Phe 205 | Phe | Leu | Tyr |
| Ser | Lys 210 | Leu | Thr | Val | Asp | Lys 215 | Ser | Arg | Trp | Gin | Gin 220 | Gly | Asn | Val | Phe |
| Ser 225 | Cys | Ser | Val | Met | His 230 | Glu | Ala | Leu | His | Asn 235 | His | Tyr | Thr | Gin | Lys 240 |
| Ser | Leu | Ser | Leu | Ser | Pro | Gly | Lys |
245 <210> 113 <211> 248 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Ciała peptydowe inhibitujące TALL-1 <400> 113
| Met 1 | Val | Pro | Phe | Cys 5 | Asp | Leu | Leu | Thr | Lys 10 | His | Cys | Phe | Glu | Ala 15 | Gly |
| Gly | Gly | Gly | Gly 20 | Val | Asp | Lys | Thr | His 25 | Thr | Cys | Pro | Pro | Cys 30 | Pro | Ala |
| Pro | Glu | Leu 35 | Leu | Gly | Gly | Pro | Ser 40 | Val | Phe | Leu | Phe | Pro 45 | Pro | Lys | Pro |
| Lys | Asp 50 | Thr | Leu | Met | Ile | Ser 55 | Arg | Thr | Pro | Glu | Val 60 | Thr | Cys | Val | Val |
| Val 65 | Asp | Val | Ser | His | Glu 70 | Asp | Pro | Glu | Val | Lys 75 | Phe | Asn | Trp | Tyr | Val 80 |
| Asp | Gly | Val | Glu | Val 85 | His | Asn | Ala | Lys | Thr 90 | Lys | Pro | Arg | Glu | Glu 95 | Gin |
| Tyr | Asn | Ser | Thr 100 | Tyr | Arg | Val | Val | Ser 105 | Val | Leu | Thr | Val | Leu 110 | His | Gin |
PL 210 546 B1
119
| Asp | Trp | Leu | Asn | Gly | Lys | Glu | Tyr | Lys | Cys | Lys | Val | Ser | Asn | Lys | Ala |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Leu | Pro | Ala | Pro | Ile | Glu | Lys | Thr | Ile | Ser | Lys | Ala | Lys | Gly | Gin | Pro |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Arg | Glu | Pro | Gin | Val | Tyr | Thr | Leu | Pro | Pro | Ser | Arg | Asp | Glu | Leu | Thr |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Lys | Asn | Gin | Val | Ser | Leu | Thr | Cys | Leu | Val | Lys | Gly | Phe | Tyr | Pro | Ser |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Asp | Ile | Ala | Val | Glu | Trp | Glu | Ser | Asn | Gly | Gin | Pro | Glu | Asn | Asn | Tyr |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Lys | Thr | Thr | Pro | Pro | Val | Leu | Asp | Ser | Asp | Gly | Ser | Phe | Phe | Leu | Tyr |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Ser | Lys | Leu | Thr | Val | Asp | Lys | Ser | Arg | Trp | Gin | Gin | Gly | Asn | Val | Phe |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Ser | Cys | Ser | Val | Met | His | Glu | Ala | Leu | His | Asn | His | Tyr | Thr | Gin | Lys |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Ser | Leu | Ser | Leu | Ser | Pro | Gly | Lys |
245 <210> 114 <211> 252
| <212> 1 <213> ! | PRT Sekwencja sztuczna |
| <220> <223> Ciała peptydowe inhibitujące TALL-1 <400> 114 | |
| Met Gly 1 | Ser Arg Cys Lys Tyr Lys Trp Asp Val Leu Thr Lys Gin Cys 5 10 15 |
| Phe Hi s | His Gly Gly Gly Gly Gly Val Asp Lys Thr His Thr Cys Pro 20 25 30 |
| Pro Cys | Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe 35 40 45 |
| Pro Pro 50 | Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val 55 60 |
| Thr Cys 65 | Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe 70 75 80 |
| Asn Trp | Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro 85 90 95 |
| Arg Glu | Glu Gin Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr 100 105 110 |
120
PL 210 546 B1
| Val | Leu His 115 | Gin | Asp | Trp | Leu Asn 120 | Gly | Lys | Glu | Tyr | Lys 125 | Cys | Lys | Val | ||
| Ser | Asn | Lys | Ala | Leu | Pro | Ala | Pro | Ile | Glu | Lys | Thr | Ile | Ser | Lys | Ala |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Lys | Gly | Gin | Pro | Arg | Glu | Pro | Gin | Val | Tyr | Thr | Leu | Pro | Pro | Ser | Arg |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Asp | Glu | Leu | Thr | Lys | Asn | Gin | Val | Ser | Leu | Thr | Cys | Leu | Val | Lys | Gly |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Phe | Tyr | Pro | Ser | Asp | Ile | Ala | Val | Glu | Trp | Glu | Ser | Asn | Gly | Gin | Pro |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Glu | Asn | Asn | Tyr | Lys | Thr | Thr | Pro | Pro | Val | Leu | Asp | Ser | Asp | Gly | Ser |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Phe | Phe | Leu | Tyr | Ser | Lys | Leu | Thr | Val | Asp | Lys | Ser | Arg | Trp | Gin | Gin |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Gly | Asn | Val | Phe | Ser | Cys | Ser | Val | Met | His | Glu | Ala | Leu | His | Asn | His |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Tyr | Thr | Gin | Lys | Ser | Leu | Ser | Leu | Ser | Pro | Gly | Lys |
245 250 <210> 115 <211> 252 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
| <223> Ciała | peptydowe inhibitujące TALL-1 |
| <400> 115 | |
| Met Leu Pro 1 | Gly Cys Lys Trp Asp Leu Leu Ile Lys Gin Trp Val Cys 5 10 15 |
| Asp Pro Leu | Gly Gly Gly Gly Gly Val Asp Lys Thr His Thr Cys Pro 20 25 30 |
| Pro Cys Pro 35 | Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe 40 45 |
| Pro Pro Lys 50 | Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val 55 60 |
| Thr Cys Val 65 | Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe 70 75 80 |
| Asn Trp Tyr | Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro 85 90 95 |
| Arg Glu Glu | Gin Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr 100 105 110 |
PL 210 546 B1
121
| Val | Leu | His 115 | Gin | Asp | Trp | Leu | Asn 120 | Gly | Lys | Glu | Tyr | Lys 125 | Cys | Lys Val | |
| Ser | Asn | Lys | Ala | Leu | Pro | Ala | Pro | Ile | Glu | Lys | Thr | Ile | Ser | Lys | Ala |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Lys | Gly | Gin | Pro | Arg | Glu | Pro | Gin | Val | Tyr | Thr | Leu | Pro | Pro | Ser | Arg |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Asp | Glu | Leu | Thr | Lys | Asn | Gin | Val | Ser | Leu | Thr | Cys | Leu | Val | Lys | Gly |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Phe | Tyr | Pro | Ser | Asp | Ile | Ala | Val | Glu | Trp | Glu | Ser | Asn | Gly | Gin | Pro |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Glu | Asn | Asn | Tyr | Lys | Thr | Thr | Pro | Pro | Val | Leu | Asp | Ser | Asp | Gly | Ser |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Phe | Phe | Leu | Tyr | Ser | Lys | Leu | Thr | Val | Asp | Lys | Ser | Arg | Trp | Gin | Gin |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Gly | Asn | Val | Phe | Ser | Cys | Ser | Val | Met | His | Glu | Ala | Leu | His | Asn | His |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Tyr | Thr | Gin | Lys | Ser | Leu | Ser | Leu | Ser | Pro | Gly | Lys |
245 250 <210> 116 <211> 252 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
| <223> Ciała | peptydowe inhibitujące TALL-1 |
| <400> 116 | |
| Met Ser Ala 1 | Asp Cys Tyr Phe Asp Ile Leu Thr Lys Ser Asp Val Cys 5 10 15 |
| Thr Ser Ser | Gly Gly Gly Gly Gly Val Asp Lys Thr His Thr Cys Pro 20 25 30 |
| Pro Cys Pro 35 | Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe 40 45 |
| Pro Pro Lys 50 | Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val 55 60 |
| Thr Cys Val 65 | Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe 70 75 80 |
| Asn Trp Tyr | Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro 85 90 95 |
| Arg Glu Glu | Gin Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr 100 105 110 |
122
PL 210 546 B1
| Val | Leu | His 115 | Gin | Asp | Trp | Leu | Asn 120 | Gly | Lys | Glu | Tyr | Lys 125 | Cys | Lys | Val |
| Ser | Asn 130 | Lys | Ala | Leu | Pro | Ala 135 | Pro | Ile | Glu | Lys | Thr 140 | Ile | Ser | Lys | Ala |
| Lys 145 | Gly | Gin | Pro | Arg | Glu 150 | Pro | Gin | Val | Tyr | Thr 155 | Leu | Pro | Pro | Ser | Arg 160 |
| Asp | Glu | Leu | Thr | Lys 165 | Asn | Gin | Val | Ser | Leu 170 | Thr | Cys | Leu | Val | Lys 175 | Gly |
| Phe | Tyr | Pro | Ser 180 | Asp | Ile | Ala | Val | Glu 185 | Trp | Glu | Ser | Asn | Gly 190 | Gin | Pro |
| Glu | Asn | Asn 195 | Tyr | Lys | Thr | Thr | Pro 200 | Pro | Val | Leu | Asp | Ser 205 | Asp | Gly | Ser |
| Phe | Phe 210 | Leu | Tyr | Ser | Lys | Leu 215 | Thr | Val | Asp | Lys | Ser 220 | Arg | Trp | Gin | Gin |
| Gly 225 | Asn | Val | Phe | Ser | Cys 230 | Ser | Val | Met | His | Glu 235 | Ala | Leu | His | Asn | His 240 |
| Tyr | Thr | Gin | Lys | Ser | Leu | Ser | Leu | Ser | Pro | Gly | Lys |
245 250 <210> 117 <211> 252 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
| <223> Ciała | peptydowe inhibitujące TALL-1 |
| <400> 117 | |
| Met Ser Asp 1 | Asp Cys Met Tyr Asp Gin Leu Thr Arg Met Phe Ile Cys 5 10 15 |
| Ser Asn Leu | Gly Gly Gly Gly Gly Val Asp Lys Thr His Thr Cys Pro 20 25 30 |
| Pro Cys Pro 35 | Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe 40 45 |
| Pro Pro Lys 50 | Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val 55 60 |
| Thr Cys Val 65 | Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe 70 75 80 |
| Asn Trp Tyr | Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro 85 90 95 |
| Arg Glu Glu | Gin Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr 100 105 110 |
PL 210 546 B1
123
| Val | Leu | His 115 | Gin | Asp | Trp | Leu | Asn 120 | Gly | Lys | Glu | Tyr | Lys 125 | Cys | Lys | Val |
| Ser | Asn 130 | Lys | Ala | Leu | Pro | Ala 135 | Pro | Ile | Glu | Lys | Thr 140 | Ile | Ser | Lys | Ala |
| Lys 145 | Gly | Gin | Pro | Arg | Glu 150 | Pro | Gin | Val | Tyr | Thr 155 | Leu | Pro | Pro | Ser | Arg 160 |
| Asp | Glu | Leu | Thr | Lys 165 | Asn | Gin | Val | Ser | Leu 170 | Thr | Cys | Leu | Val | Lys 175 | Gly |
| Phe | Tyr | Pro | Ser 180 | Asp | Ile | Ala | Val | Glu 185 | Trp | Glu | Ser | Asn | Gly 190 | Gin | Pro |
| Glu | Asn | Asn 195 | Tyr | Lys | Thr | Thr | Pro 200 | Pro | Val | Leu | Asp | Ser 205 | Asp | Gly | Ser |
| Phe | Phe 210 | Leu | Tyr | Ser | Lys | Leu 215 | Thr | Val | Asp | Lys | Ser 220 | Arg | Trp | Gin | Gin |
| Gly 225 | Asn | Val | Phe | Ser | Cys 230 | Ser | Val | Met | His | Glu 235 | Ala | Leu | His | Asn | His 240 |
| Tyr | Thr | Gin | Lys | Ser | Leu | Ser | Leu | Ser | Pro | Gly | Lys |
245 250 <210> 118 <211> 252 <212> PRT
| <213> | Sekwencji | i sztuczna |
| <220> <223> Ciała peptydowe inhibitujące TALL-1 <400> 118 | ||
| Met Asp 1 | Leu Asn | Cys Lys Tyr Asp Glu Leu Thr Tyr Lys Glu Trp Cys 5 10 15 |
| Gin Phe | Asn Gly 20 | Gly Gly Gly Gly Val Asp Lys Thr His Thr Cys Pro 25 30 |
| Pro Cys | Pro Ala 35 | Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe 40 45 |
| Pro Pro 50 | Lys Pro | Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val 55 60 |
| Thr Cys 65 | Val Val | Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe 70 75 80 |
| Asn Trp | Tyr Val | Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro 85 90 95 |
| Arg Glu | Glu Gin 100 | Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr 105 110 |
124
PL 210 546 B1
| Val | Leu | His | Gin | Asp | Trp | Leu | Asn | Gly | Lys | Glu | Tyr | Lys | Cys | Lys | Val |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Ser | Asn | Lys | Ala | Leu | Pro | Ala | Pro | Ile | Glu | Lys | Thr | Ile | Ser | Lys | Ala |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Lys | Gly | Gin | Pro | Arg | Glu | Pro | Gin | Val | Tyr | Thr | Leu | Pro | Pro | Ser | Arg |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Asp | Glu | Leu | Thr | Lys | Asn | Gin | Val | Ser | Leu | Thr | Cys | Leu | Val | Lys | Gly |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Phe | Tyr | Pro | Ser | Asp | Ile | Ala | Val | Glu | Trp | Glu | Ser | Asn | Gly | Gin | Pro |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Glu | Asn | Asn | Tyr | Lys | Thr | Thr | Pro | Pro | Val | Leu | Asp | Ser | Asp | Gly | Ser |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Phe | Phe | Leu | Tyr | Ser | Lys | Leu | Thr | Val | Asp | Lys | Ser | Arg | Trp | Gin | Gin |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Gly | Asn | Val | Phe | Ser | Cys | Ser | Val | Met | His | Glu | Ala | Leu | His | Asn | His |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Tyr | Thr | Gin | Lys | Ser | Leu | Ser | Leu | Ser | Pro | Gly | Lys | ||||
| 245 | 250 |
| <210> | 119 | |
| <211> | 252 | |
| <212> | PRT | |
| <213> | Sekwencja sztuczna | |
| <220> | ||
| <223> | Ciała peptydowe inhibitujące | TALL-1 |
| <400> | 119 | |
| Met Phe His Asp Cys Lys Tyr Asp Leu | Leu Thr Arg Gin Met Val Cys |
10 15
His Gly Leu Gly Gly Gly Gly Gly Val Asp Lys Thr His Thr Cys Pro 20 25 30
Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe 35 40 45
Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val 50 55 60
Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe
70 75 80
Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro
90 95
Arg Glu Glu Gin Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr 100 105 110
PL 210 546 B1
125
Val Leu His Gin Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val 115 120 125
Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala 130 135 140
Lys Gly Gin Pro Arg Glu Pro Gin Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg
145 150 155 160
Asp Glu Leu Thr Lys Asn Gin Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly
165 170 175
Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gin Pro 180 185 190
Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser 195 200 205
Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gin Gin 210 215 220
Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His 225 230 235 240
Tyr Thr Gin Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys 245 250 <210> 120 <211> 252 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Ciała peptydowe inhibitujące TALL-1
| <400> 120 | |||||||||||||||
| Met 1 | Arg | Asn | His | Cys 5 | Phe | Trp | Asp | His | Leu 10 | Leu | Lys | Gin | Asp | Ile 15 | Cys |
| Pro | Ser | Pro | Gly 20 | Gly | Gly | Gly | Gly | Val 25 | Asp | Lys | Thr | His | Thr 30 | Cys | Pro |
| Pro | Cys | Pro 35 | Ala | Pro | Glu | Leu | Leu 40 | Gly | Gly | Pro | Ser | Val 45 | Phe | Leu | Phe |
| Pro | Pro 50 | Lys | Pro | Lys | Asp | Thr 55 | Leu | Met | Ile | Ser | Arg 60 | Thr | Pro | Glu | Val |
| Thr 65 | Cys | Val | Val | Val | Asp 70 | Val | Ser | His | Glu | Asp 75 | Pro | Glu | Val | Lys | Phe 80 |
| Asn | Trp | Tyr | Val | Asp 85 | Gly | Val | Glu | Val | His 90 | Asn | Ala | Lys | Thr | Lys 95 | Pro |
| Arg | Glu | Glu | Gin 100 | Tyr | Asn | Ser | Thr | Tyr 105 | Arg | Val | Val | Ser | Val 110 | Leu | Thr |
126
PL 210 546 B1
| Val | Leu | His 115 | Gin | Asp | Trp | Leu | Asn 120 | Gly | Lys | Glu | Tyr | Lys 125 | Cys | Lys | Val |
| Ser | Asn 130 | Lys | Ala | Leu | Pro | Ala 135 | Pro | Ile | Glu | Lys | Thr 140 | Ile | Ser | Lys | Ala |
| Lys 145 | Gly | Gin | Pro | Arg | Glu 150 | Pro | Gin | Val | Tyr | Thr 155 | Leu | Pro | Pro | Ser | Arg 160 |
| Asp | Glu | Leu | Thr | Lys 165 | Asn | Gin | Val | Ser | Leu 170 | Thr | Cys | Leu | Val | Lys 175 | Gly |
| Phe | Tyr | Pro | Ser 180 | Asp | Ile | Ala | Val | Glu 185 | Trp | Glu | Ser | Asn | Gly 190 | Gin | Pro |
| Glu | Asn | Asn 195 | Tyr | Lys | Thr | Thr | Pro 200 | Pro | Val | Leu | Asp | Ser 205 | Asp | Gly | Ser |
| Phe | Phe 210 | Leu | Tyr | Ser | Lys | Leu 215 | Thr | Val | Asp | Lys | Ser 220 | Arg | Trp | Gin | Gin |
| Gly 225 | Asn | Val | Phe | Ser | Cys 230 | Ser | Val | Met | His | Glu 235 | Ala | Leu | His | Asn | His 240 |
| Tyr | Thr | Gin | Lys | Ser | Leu | Ser | Leu | Ser | Pro | Gly | Lys |
245 250 <210> 121 <211> 252 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
| <223> ( | Diała peptydowe inhibitujące | TALL-1 |
| <400> : | 121 | |
| Met Ala 1 | Asn Gin Cys Trp Trp Asp Ser 5 | Leu Thr Lys Lys Asn Val Cys 10 15 |
| Glu Phe | Phe Gly Gly Gly Gly Gly Val 20 25 | Asp Lys Thr His Thr Cys Pro 30 |
| Pro Cys | Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly 35 40 | Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe 45 |
| Pro Pro 50 | Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met 55 | Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val 60 |
| Thr Cys 65 | Val Val Val Asp Val Ser His 70 | Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe 75 80 |
| Asn Trp | Tyr Val Asp Gly Val Glu Val 85 | His Asn Ala Lys Thr Lys Pro 90 95 |
| Arg Glu | Glu Gin Tyr Asn Ser Thr Tyr 100 105 | Arg Val Val Ser Val Leu Thr 110 |
PL 210 546 B1
127
| Val | Leu | His 115 | Gin | Asp | Trp | Leu | Asn 120 | Gly | Lys | Glu | Tyr | Lys 125 | Cys | Lys | Val |
| Ser | Asn 130 | Lys | Ala | Leu | Pro | Ala 135 | Pro | Ile | Glu | Lys | Thr 140 | Ile | Ser | Lys | Ala |
| Lys 145 | Gly | Gin | Pro | Arg | Glu 150 | Pro | Gin | Val | Tyr | Thr 155 | Leu | Pro | Pro | Ser | Arg 160 |
| Asp | Glu | Leu | Thr | Lys 165 | Asn | Gin | Val | Ser | Leu 170 | Thr | Cys | Leu | Val | Lys 175 | Gly |
| Phe | Tyr | Pro | Ser 180 | Asp | Ile | Ala | Val | Glu 185 | Trp | Glu | Ser | Asn | Gly 190 | Gin | Pro |
| Glu | Asn | Asn 195 | Tyr | Lys | Thr | Thr | Pro 200 | Pro | Val | Leu | Asp | Ser 205 | Asp | Gly | Ser |
| Phe | Phe 210 | Leu | Tyr | Ser | Lys | Leu 215 | Thr | Val | Asp | Lys | Ser 220 | Arg | Trp | Gin | Gin |
| Gly 225 | Asn | Val | Phe | Ser | Cys 230 | Ser | Val | Met | His | Glu 235 | Ala | Leu | His | Asn | His 240 |
| Tyr | Thr | Gin | Lys | Ser | Leu | Ser | Leu | Ser | Pro | Gly | Lys |
245 250 <210> 122 <211> 252 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
| <223> ( | Oiała peptydowe inhibitujące | TALL-1 |
| <4oo> : | 122 | |
| Met Phe 1 | His Asp Cys Lys Trp Asp Leu 5 | Leu Thr Lys Gin Trp Val Cys 10 15 |
| His Gly | Leu Gly Gly Gly Gly Gly Val 20 25 | Asp Lys Thr His Thr Cys Pro 30 |
| Pro Cys | Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly 35 40 | Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe 45 |
| Pro Pro 50 | Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met 55 | Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val 60 |
| Thr Cys 65 | Val Val Val Asp Val Ser His 70 | Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe 75 80 |
| Asn Trp | Tyr Val Asp Gly Val Glu Val 85 | His Asn Ala Lys Thr Lys Pro 90 95 |
| Arg Glu | Glu Gin Tyr Asn Ser Thr Tyr 100 105 | Arg Val Val Ser Val Leu Thr 110 |
128
PL 210 546 B1
Val Leu His Gin Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val 115 120 125
Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala 130 135 140
Lys Gly Gin Pro Arg Glu Pro Gin Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg
145 150 155 160
Asp Glu Leu Thr Lys Asn Gin Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly
165 170 175
Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gin Pro 180 185 190
Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser 195 200 205
Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gin Gin 210 215 220
Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His 225 230 235 240
Tyr Thr Gin Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys 245 250 <210> 123 <211> 293 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Ciała peptydowe inhibitujące TALL-1 <400> 123
Met Leu Pro Gly Cys Lys Trp Asp 1 5
Asp Pro Leu Gly Ser Gly Ser Ala 20
Ser Ser Gly Ser Gly Ser Ala Thr 35 40
Asp Leu Leu Ile Lys Gin Trp Val 50 55
Gly Val Asp Lys Thr His Thr Cys 65 70
Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu 85
Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu 100
Leu Leu Ile Lys Gin Trp Val Cys 10 15
Thr Gly Gly Ser Gly Ser Thr Ala 25 30
His Met Leu Pro Gly Cys Lys Trp 45
Cys Asp Pro Leu Gly Gly Gly Gly 60
Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu 75 80
Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr 90 95
Val Thr Cys Val Val Val Asp Val 105 110
PL 210 546 B1
129
| Ser | His | Glu 115 | Asp | Pro | Glu | Val | Lys 120 | Phe | Asn | Trp | Tyr | Val 125 | Asp | Gly | Val |
| Glu | Val 130 | His | Asn | Ala | Lys | Thr 135 | Lys | Pro | Arg | Glu | Glu 140 | Gin | Tyr | Asn | Ser |
| Thr 145 | Tyr | Arg | Val | Val | Ser 150 | Val | Leu | Thr | Val | Leu 155 | His | Gin | Asp | Trp | Leu 160 |
| Asn | Gly | Lys | Glu | Tyr 165 | Lys | Cys | Lys | Val | Ser 170 | Asn | Lys | Ala | Leu | Pro 175 | Ala |
| Pro | Ile | Glu | Lys 180 | Thr | Ile | Ser | Lys | Ala 185 | Lys | Gly | Gin | Pro | Arg 190 | Glu | Pro |
| Gin | Val | Tyr 195 | Thr | Leu | Pro | Pro | Ser 200 | Arg | Asp | Glu | Leu | Thr 205 | Lys | Asn | Gin |
| Val | Ser 210 | Leu | Thr | Cys | Leu | Val 215 | Lys | Gly | Phe | Tyr | Pro 220 | Ser | Asp | Ile | Ala |
| Val 225 | Glu | Trp | Glu | Ser | Asn 230 | Gly | Gin | Pro | Glu | Asn 235 | Asn | Tyr | Lys | Thr | Thr 240 |
| Pro | Pro | Val | Leu | Asp 245 | Ser | Asp | Gly | Ser | Phe 250 | Phe | Leu | Tyr | Ser | Lys 255 | Leu |
| Thr | Val | Asp | Lys 260 | Ser | Arg | Trp | Gin | Gin 265 | Gly | Asn | Val | Phe | Ser 270 | Cys | Ser |
| Val | Met | His 275 | Glu | Ala | Leu | His | Asn 280 | His | Tyr | Thr | Gin | Lys 285 | Ser | Leu | Ser |
| Leu | Ser | Pro | Gly | Lys |
290
| <210> | 124 | |
| <211> | 293 | |
| <212> | PRT | |
| <213> | Sekwencja sztuczna | |
| <220> | ||
| <223> | Ciała peptydowe inhibitujące | TALL-1 |
| <400> | 124 | |
| Met Phe His Asp Cys Lys Trp Asp Leu | Leu Thr Lys Gin Trp Val Cys |
10 15
His Gly Leu Gly Ser Gly Ser Ala Thr Gly Gly Ser Gly Ser Thr Ala 20 25 30
Ser Ser Gly Ser Gly Ser Ala Thr His Met Phe His Asp Cys Lys Trp 35 40 45
Asp Leu Leu Thr Lys Gin Trp Val Cys His Gly Leu Gly Gly Gly Gly 50 55 60
130
PL 210 546 B1
PL 210 546 B1
131
| <223> | X w czym Χ12 , | (Poz . jedna Χ13 i | 1, 2, 3) oznaczają reszty aminokwasowe lub ich brak (przy z grup XI, X2 i X3 korzystnie oznacza C gdy jedna z reszt Χ14 oznacza C); |
| <220> | |||
| <221> | inne | cechy | |
| <222> | (7) . | . (7) | |
| <223> | X w | (Poz . | 7) oznacza resztę aminokwasową (korzystnie L); |
| <220> | |||
| <221> | inne | cechy | |
| <222> | (9) . | • (9) | |
| <223> | X w | (Poz. | 9) oznacza T lub I (korzystnie T); |
| <220> | |||
| <221> | inne | cechy | |
| <222> | (12) | (12) | |
| <223> | X w | (Poz . | 12) oznacza C, obojętną resztę hydrofobowa lub resztę |
| zasadową (korzystnie W, C, or R); | |||
| <220> | |||
| <221> | inne | cechy | |
| <222> | (13) | .·(13) | |
| <223> | X w | (Poz. | 13) is C, oznacza C, obojętną resztę hydrofobowa lub jej |
| brak | (korzystnie V) ; | ||
| <220> | |||
| <221> | inne | cechy | |
| <222> | (14) | - (14) | |
| <223> | X w | (Poz . | 14) oznacza dowolną resztę aminokwasową lub jej brak. |
| <400> | 125 |
Xaa Xaa Xaa Lys Trp Asp Xaa Leu Xaa Lys Gin Xaa Xaa Xaa 15 10 <210> 126 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 126
Tyr Lys Gly Arg Gin Met Trp Asp Ile Leu Thr Arg Ser Trp Val Val 15 10 15
Ser Leu <210> 127 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna
132
PL 210 546 B1 <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 127
Gin Asp Val Gly Leu Trp Trp Asp Ile Leu Thr Arg Ala Trp Met Pro 15 10 15
Asn Ile <210> 128 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 128
Gin Asn Ala Gin Arg Val Trp Asp Leu Leu Ile Arg Thr Trp Val Tyr 15 10 15
Pro Gin <210> 129 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 129
Gly Trp Asn Glu Ala Trp Trp Asp Glu Leu Thr Lys Ile Trp Val Leu 15 10 15
Glu Gin <210> 130 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 130
Arg Ile Thr Cys Asp Thr Trp Asp Ser Leu Ile Lys Lys Cys Val Pro 15 10 15
Gin Ser
PL 210 546 B1
133 <210> 131 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 131
| Gly Ala 1 Gin Ser | Ile Met Gin Phe 5 | Trp Asp | Ser | Leu Thr Lys 10 | Thr | Trp | Leu 15 | Arg |
| <210> | 132 | |||||||
| <211> | 18 | |||||||
| <212> | PRT | |||||||
| <213> | Sekwencja sztuczna | |||||||
| <220> | ||||||||
| <223> | Korzystne domeny | modulujące ' | TALL-1 | |||||
| <400> | 132 | |||||||
| Trp Leu | His Ser Gly Trp | Trp Asp | Pro | Leu Thr Lys | His | Trp | Leu | Gin |
| 1 | 5 | 10 | 15 | |||||
| Lys Val |
| <210> | 133 | ||
| <211> | 18 | ||
| <212> | PRT | ||
| <213> | Sekwencja sztuczna | ||
| <220> | |||
| <223> | Korzystne domeny modulujące | TALL-1 | |
| <400> | 133 | ||
| Ser Glu Trp Phe Phe Trp Phe Asp Pro | Leu Thr Arg Ala | Gin Leu Lys | |
| 1 | 5 | 10 | 15 |
| Phe Arg |
| <210> | 134 | |||
| <211> | 18 | |||
| <212> | PRT | |||
| <213> | Sekwencja sztuczna | |||
| <220> <223> | Korzystne domeny modulujące | TALL- | •1 | |
| <400> | 134 | |||
| Gly Val | . Trp Phe Trp Trp Phe Asp Pro | Leu | Thr Lys Gin | Trp Thr Gin |
| 1 | 5 | 10 | 15 |
134
PL 210 546 B1
Ala Gly <210> 135 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 135
Met Gin Cys Lys Gly Tyr Tyr Asp Ile Leu Thr Lys Trp Cys Val Thr 15 10 15
Asn Gly <210> 136 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 136
Leu Trp Ser Lys Glu Val Trp Asp Ile Leu Thr Lys Ser Trp Val Ser 15 10 15
Gin Ala <210> 137 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 137
Lys Ala Ala Gly Trp Trp Phe Asp Trp Leu Thr Lys Val Trp Val Pro 15 10 15
Ala Pro <210> 138 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna
PL 210 546 B1
135 <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 138
Ala Tyr Gin Thr Trp Phe Trp Asp Ser Leu Thr Arg Leu Trp Leu Ser 15 10 15
Thr Thr <210> 139 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 139
Ser Gly Gin His Phe Trp Trp Asp Leu Leu Thr Arg Ser Trp Thr Pro 15 10 15
Ser Thr <210> 140 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 140
Leu Gly Val Gly Gin Lys Trp Asp Pro Leu Thr Lys Gin Trp Val Ser 15 10 15
Arg Gly <210> 141 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 141
Val Gly Lys Met Cys Gin Trp Asp Pro Leu Ile Lys Arg Thr Val Cys 15 10 15
Val Gly
136
PL 210 546 B1 <210> 142 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 142
Cys Arg Gin Gly Ala Lys Phe Asp Leu Leu Thr Lys Gin Cys Leu Leu 15 10 15
Gly Arg <210> 143 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 143
Gly Gin Ala Ile Arg His Trp Asp Val Leu Thr Lys Gin Trp Val Asp 15 10 15
Ser Gin <210> 144 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 144
Arg Gly Pro Cys Gly Ser Trp Asp Leu Leu Thr Lys His Cys Leu Asp 15 10 15
Ser Gin <210> 145 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 145
Trp Gin Trp Lys Gin Gin Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Met Val Trp 15 10 15
PL 210 546 B1
137
Val Gly <210> 146 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 146
Pro Ile Thr Ile Cys Arg Lys Asp Leu Leu Thr Lys Gin Val Val Cys 15 10 15
Leu Asp <210> 147 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 147
Lys Thr Cys Asn Gly Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Cys Leu Gin 15 10 15
Gin Ala <210> 148 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 148
Lys Cys Leu Lys Gly Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Cys Val Thr 15 10 15
Glu Val <210> 149 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna
138
PL 210 546 B1 <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 149
Arg Cys Trp Asn Gly Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Cys Ile His 15 10 15
Pro Trp <210> 150 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 150
Asn Arg Asp Met Arg Lys Trp Asp Pro Leu Ile Lys Gin Trp Ile Val 15 10 15
Arg Pro <210> 151 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 151
Gin Ala Ala Ala Ala Thr Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Trp Leu Val 15 10 15
Pro Pro <210> 152 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 152
Pro Glu Gly Gly Pro Lys Trp Asp Pro Leu Thr Lys Gin Phe Leu Pro 15 10 15
Pro Val
PL 210 546 B1
139 <210> 153 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 153
Gin Thr Pro Gin Lys Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Trp Phe Thr 15 10 15
Arg Asn <210> 154 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 154
Ile Gly Ser Pro Cys Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Met Ile Cys 15 10 15
Gin Thr <210> 155 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 155
Cys Thr Ala Ala Gly Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Cys Ile Gin 15 10 15
Glu Lys <210> 156 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 156
Val Ser Gin Cys Met Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Cys Leu Gin 15 10 15
140
PL 210 546 B1
Gly Trp <210> 157 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 157
Val Trp Gly Thr Trp Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Tyr Leu Pro 15 10 15
Pro Gin <210> 158 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 158
Gly Trp Trp Glu Met Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Trp Tyr Arg 15 10 15
Pro Gin <210> 159 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 159
Thr Ala Gin Val Ser Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Trp Leu Pro 15 10 15
Leu Ala <210> 160 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1
PL 210 546 B1
141 <400> 160
Gin Leu Trp Gly Thr Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Tyr Ile Gin 15 10 15
Ile Met <210> 161 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 161
Trp Ala Thr Ser Gin Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Trp Val Gin 15 10 15
Asn Met <210> 162 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 162
Gin Arg Gin Cys Ala Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Cys Val Leu 15 10 15
Phe Tyr <210> 163 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 163
Lys Thr Thr Asp Cys Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Arg Ile Cys 15 10 15
Gin Val <210> 164 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna
142
PL 210 546 B1 <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 164
Leu Leu Cys Gin Gly Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Cys Leu Lys 15 10 15
Leu Arg <210> 165 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 165
Leu Met Trp Phe Trp Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Leu Val Pro 15 10 15
Thr Phe <210> 166 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 166
Gin Thr Trp Ala Trp Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Trp Ile Gly 15 10 15
Pro Met <210> 167 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 167
Asn Lys Glu Leu Leu Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Cys Arg Gly 15 10 15
Arg Ser
PL 210 546 B1
143 <210> 168 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 168
Gly Gin Lys Asp Leu Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Tyr Val Arg 15 10 15
Gin Ser <210> 169 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 169
Pro Lys Pro Cys Gin Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Cys Leu Gly 15 10 15
Ser Val <210> 170 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 170
Gly Gin Ile Gly Trp Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Trp Ile Gin 15 10 15
Thr Arg <210> 171 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 171
Val Trp Leu Asp Trp Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Trp Ile His 15 10 15
Pro Gin
144
PL 210 546 B1 <210> 172 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 172
Gin Glu Trp Glu Tyr Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Trp Gly Trp 15 10 15
Leu Arg <210> 173 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 173
His Trp Asp Ser Trp Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Trp Val Val 15 10 15
Gin Ala <210> 174 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 174
Thr Arg Pro Leu Gin Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Trp Leu Arg 15 10 15
Val Gly <210> 175 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 175
Ser Asp Gin Trp Gin Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Trp Phe Trp 15 10 15
PL 210 546 B1
145
Asp Val <210> 176 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 176
Gin Gin Thr Phe Met Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Trp Ile Arg 15 10 15
Arg His <210> 177 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 177
Gin Gly Glu Cys Arg Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Cys Phe Pro 1 5 10 15
Gly Gin <210> 178 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 178
Gly Gin Met Gly Trp Arg Trp Asp Pro Leu Ile Lys Met Cys Leu Gly 1 5 10 15
Pro Ser <210> 179 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1
146
PL 210 546 B1 <400> 179
Gin Leu Asp Gly Cys Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Lys Val Cys 15 10 15
Ile Pro <210> 180 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 180
His Gly Tyr Trp Gin Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Trp Val Ser 15 10 15
Ser Glu <210> 181 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 181
His Gin Gly Gin Cys Gly Trp Asp Leu Leu Thr Arg Ile Tyr Leu Pro 15 10 15
Cys His <210> 182 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 182
Leu His Lys Ala Cys Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Cys Trp Pro 15 10 15
Met Gin <210> 183 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna
PL 210 546 B1
147 <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 183
Gly Pro Pro Gly Ser Val Trp Asp Leu Leu Thr Lys Ile Trp Ile Gin 15 10 15
Thr Gly <210> 184 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 184
Ile Thr Gin Asp Trp Arg Phe Asp Thr Leu Thr Arg Leu Trp Leu Pro 15 10 15
Leu Arg <210> 185 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 185
Gin Gly Gly Phe Ala Ala Trp Asp Val Leu Thr Lys Met Trp Ile Thr 15 10 15
Val Pro <210> 186 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 186
Gly His Gly Thr Pro Trp Trp Asp Ala Leu Thr Arg Ile Trp Ile Leu 15 10 15
Gly Val
148
PL 210 546 B1 <210> 187 <211> 18 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 187
Val Trp Pro Trp Gin Lys Trp Asp Leu Leu Thr Lys Gin Phe Val Phe 15 10 15
Gin Asp <210> 188 <211> 19 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystne domeny modulujące TALL-1 <400> 188
Trp Gin Gin Trp Ser Trp Lys Trp Asp Leu Leu Thr Arg Gin Tyr Ile 15 10 15
Ser Ser Ser <210> 189 <211> 882 <212> DNA <213> Sekwencja sztuczna
<220>
<223> TALL-1 12-3 dimer tandemowy <400> 189 atgcttccag gctgcaagtg ggatcttctt attaagcaat gggtatgcga tccacttgga 60 tccggttctg ctactggtgg ttccggctcc accgcaagct ctggttcagg cagtgcgact 120 catatgctgc cgggttgtaa atgggacctg ctgatcaaac agtgggtttg tgacccgctg 180 ggtggaggcg gtggggtcga caaaactcac acatgtccac cttgtccagc tccggaactc 240 ctggggggac cgtcagtctt cctcttcccc ccaaaaccca aggacaccot catgatctcc 300 cggacccctg aggtcacatg cgtggtggtg gacgtgagcc acgaagacco tgaggtcaag 360 ttcaactggt acgtggacgg cgtggaggtg cataatgcca agacaaagcc gcgggaggag 420 cagtacaaca gcacgtaccg tgtggtcagc gtcctcaccg tcctgcacca ggactggctg 480 aatggcaagg agtacaagtg caaggtctcc aacaaagccc tcccagcccc catcgagaaa 540 accatctoca aagccaaagg gcagccccga gaaccacagg tgtacaccct gcccccatcc 600
PL 210 546 B1
149
| cgggatgagc | tgaccaagaa | ccaggtcagc | ctgacctgcc | tggtcaaagg | cttctatccc | 660 |
| agcgacatcg | ccgtggagtg | ggagagcaat | gggcagccgg | agaacaacta | caagaccacg | 720 |
| cctcccgtgc | tggactccga | cggctccttc | ttcctctaca | gcaagctcac | cgtggacaag | 780 |
| agcaggtggc | agcaggggaa | cgtcttctca | tgctccgtga | tgcatgaggc | tctgcacaac | 840 |
| cactacacgc | agaagagcct | ctccctgtct | ccgggtaaat | aa | 882 |
<210> 190 <211> 23 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystny linker <400> 190
Gly Ser Gly Ser Ala Thr Gly Gly Ser Gly Ser Thr Ala Ser Ser Gly 15 10 15
Ser Gly Ser Ala Thr Gly Met 20
| <210> <211> <212> <213> | 191 23 PRT Sekwencja sztuczna |
| <220> | |
| <223> | Korzystny linker |
| <400> | 191 |
| Gly Ser | Gly Ser Ala Thr Gly |
| 1 | 5 |
| Ser Gly | Ser Ala Thr Gly Ser |
| 20 |
<210> 192 <211> 46 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystny linker <400> 192
Gly Ser Gly Ser Ala Thr Gly Gly Ser Gly Ser Thr Ala Ser Ser Gly 15 10 15
150
PL 210 546 B1
| Ser | Gly | Ser | Ala 20 | Thr | His | Met | Gly | Ser 25 | Gly | Ser | Ala | Thr | Gly Gly Ser 30 |
| Gly | Ser | Thr | Ala | Ser | Ser | Gly | Ser | Gly | Ser | Ala | Thr | His | Met |
| 35 | 40 | 45 |
<210> 193 <211> 23 <212> PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystny linker <220>
<221> inne cechy <222> (22)..(23) <223> X w (Ροζ. 22) oznacza niezależnie resztę zasadową lub hydrofobową. X w (Poz. 23) oznacza niezależnie resztę hydrofobową.
<400> 193
Gly Ser Gly Ser Ala Thr Gly Gly Ser Gly Ser Thr Ala Ser Ser Gly 1 5 10 15
Ser Gly Ser Ala Thr Xaa Xaa 20 <210>
<211>
<212>
194
PRT <213> Sekwencja sztuczna <220>
<223> Korzystny linker <220>
<221> inne cechy <222> (22, 23, 45 i) . . (46) <223> X w (Poz. 22) i w (Poz. 45) oznaczają niezależnie resztę zasadową lub hydrofobową, a X w (Poz. 23) i (Poz. 46) oznaczają niezależnie resztę hydrofobową
| <400> : | 194 | |||||
| Gly | Ser | Gly | Ser | Ala | Thr | Gly |
| 1 | 5 | |||||
| Ser | Gly | Ser | Ala | Thr | Xaa | Xaa |
| 20 | ||||||
| Gly | Ser | Thr | Ala | Ser | Ser | Gly |
| 35 |
PL 210 546 B1
151 <210> 195 <211> 38 <212> PRT <213> ludzka <400> 195
| Met 1 Thr Val | Arg Arg Pro Cys | Gly Pro | Arg Ser Leu Arg Gly Arg Asp Ala | Pro Val | Pro Cys | ||||||||
| Val 20 Arg | 5 Pro Leu | Thr Glu Leu | 10 | Leu | Val | Arg 30 | 15 Lys | ||||||
| Cys | Tyr 25 | Asp Leu | |||||||||||
| Asp | Cys 35 | ||||||||||||
| <210> | 196 | ||||||||||||
| <211> | 41 | ||||||||||||
| <212> | PRT | ||||||||||||
| <213> | ludzka | ||||||||||||
| <400> | 196 | ||||||||||||
| Thr | Ile | Cys | Asn | His | Gin Ser | Gin | Arg | Thr Cys | Ala | Ala | Phe | Cys | Arg |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||
| Ser | Leu | Ser | Cys | Arg | Lys Glu | Gin | Gly | Lys Phe | Tyr | Asp | His | Leu | Leu |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||
| Arg | Asp | Cys | Ile | Ser | Cys Ala | Ser | Ile | ||||||
| 35 | 40 | ||||||||||||
| <210> | 197 | ||||||||||||
| <211> | 42 | ||||||||||||
| <212> | PRT | ||||||||||||
| <213> | ludzka | ||||||||||||
| <400> | 197 | ||||||||||||
| Phe | Val | Ser | Pro | Ser | Gin Glu | Ile | Arg | Gly Arg | Phe | Arg | Arg | Met | Leu |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||
| Gin | Met | . Ala | Gly | Gin | Cys Ser | Gin | Asn | Glu Tyr | Phe | Asp | Ser | Leu | Leu |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||
| His | Ala | . Cys | Ile | Pro | Cys Gin | Leu | Arg | Cys | |||||
| 35 | 40 | ||||||||||||
| Zastrzeżenia patentowe |
1. Cząsteczka obejmująca sekwencję aminokwasową o wzorze I(f):
Claims (16)
1. Cząsteczka obejmująca sekwencję aminokwasową o wzorze I(f): f1f2f3Kf5Df7Lf9f10Qf12f13f14 (SEQ ID NO: 109), gdzie:
f1, f2 i f3 oznaczają, każdy niezależnie, reszty aminokwasowe lub ich brak, f5 oznacza W, Y lub F; f7 oznacza resztę aminokwasową; f9 oznacza T lub I;
f10 oznacza K, R lub H;
152
PL 210 546 B1 f12 oznacza C, obojętną resztę hydrofobową lub resztę zasadową, korzystnie W, C lub R;
f13 oznacza C, obojętną resztę hydrofobową lub jej brak; a f14 oznacza dowolną resztę aminokwasową lub jej brak;
z tym jednak warunkiem, że tylko jeden z f1, f2 i f3 może oznaczać C oraz że tylko jeden z f12, f13 i f14 może oznaczać C.
2. Cząsteczka według zastrz. 1, znamienna tym, ż e f7 oznacza L.
3. Cząsteczka według zastrz. 1, znamienna tym, ż e f9 oznacza T.
4. Cząsteczka według zastrz. 1, znamienna tym, ż e f10 oznacza K.
5. Cząsteczka według zastrz. 1, znamienna tym, ż e f12 oznacza C oraz jeden z f1, f2 i f3 oznacza C.
6. Cząsteczka według zastrz. 1, znamienna tym, ż e f13 oznacza V.
7. Czą steczka wedł ug zastrz. 1, znamienna tym, ż e obejmuje sekwencję aminokwasową o wzorze I(f'):
f1f2f3KWDf7Lf9KQf12f13f14 (SEQ ID NO: 125).
8. Czą steczka wedł ug zastrz. 7, znamienna tym, ż e obejmuje sekwencję aminokwasową wybraną z grupy obejmującej SEQ ID NO: 32, 33, 58, 60, 63, 66, 67, 69, 114, 115, 122, 123, 124, 147-150, 152-177, 179, 180 oraz 187.
9. Cząsteczka według zastrz. 8, znamienna tym, że obejmuje sekwencję aminokwasową o wzorze:
LPGCKWDLLIKQWVCDPL (SEQ ID NO: 33).
10. Cząsteczka o wzorze:
(X1)a - V1 - (X2)b oraz jej multimery, gdzie:
V1 oznacza domenę Fc;
1 2 1 1 1 1
X1 i X2 oznaczają, każdy niezależnie, resztę wybraną z grupy obejmującej -(L1)c-P1, -(L1)c-P1-(L2)d-P2, -(L1)c-P1-(L2)d-P2-(L3)c-P3, -(L1)c-P1-(L2)d-P2-(L3)c-P3-(L4)f-P4, gdzie jeden lub więcej niż jeden spośród P1, P2, P3 i P4, każdy niezależnie, zawiera sekwencję: f1f2f3Kf5Df7Lf9f10Qf12f13f14 (SEQ ID NO: 109określoną jak w zastrz. 1;
L1, L2, L3 i L4 - każdy niezależnie, oznaczają linkery; zaś a, b, c, d, e oraz f - każ dy niezależ nie, oznaczają 0 lub 1, z tym warunkiem, ż e co najmniej jeden spośród indeksów a oraz b oznacza 1.
11. Cząsteczka według zastrz. 10, znamienna tym, że jest określona wzorem:
P1-(L1)c-P2-(L2)d-V1.
12. Cząsteczka według zastrz. 10, znamienna tym, że jest określona wzorem:
V1-(L1)c-P1-(L2)d-P2.
13. Cząsteczka według zastrz. 10, znamienna tym, że V1 oznacza domenę IgG Fc.
14. Cząsteczka według zastrz. 10, znamienna tym, że V1 oznacza domenę IgG1 Fc.
15. Cząsteczka według zastrz. 10, znamienna tym, że V1 obejmuje sekwencję SEQ ID NO: 2.
16. Cząsteczka według zastrz. 10, znamienna tym, że: f5 oznacza W;
f7 oznacza L; f10 oznacza K; zaś f13 oznacza V.
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US29019601P | 2001-05-11 | 2001-05-11 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| PL369570A1 PL369570A1 (pl) | 2005-05-02 |
| PL210546B1 true PL210546B1 (pl) | 2012-01-31 |
Family
ID=23114926
Family Applications (2)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| PL39331702A PL393317A1 (pl) | 2001-05-11 | 2002-05-13 | Peptydy oraz pokrewne cząsteczki wiążące TALL-1 |
| PL369570A PL210546B1 (pl) | 2001-05-11 | 2002-05-13 | Peptydy oraz pokrewne cząsteczki wiążące TALL-1 |
Family Applications Before (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| PL39331702A PL393317A1 (pl) | 2001-05-11 | 2002-05-13 | Peptydy oraz pokrewne cząsteczki wiążące TALL-1 |
Country Status (30)
| Country | Link |
|---|---|
| US (5) | US7259137B2 (pl) |
| EP (4) | EP2845864A3 (pl) |
| JP (1) | JP4516719B2 (pl) |
| KR (1) | KR100902687B1 (pl) |
| CN (3) | CN1970078A (pl) |
| AT (2) | ATE549354T1 (pl) |
| AU (1) | AU2002342669C1 (pl) |
| BG (1) | BG66270B1 (pl) |
| BR (1) | BR0209546A (pl) |
| CA (1) | CA2446189C (pl) |
| CY (1) | CY1107131T1 (pl) |
| CZ (1) | CZ304592B6 (pl) |
| DE (1) | DE60222882T2 (pl) |
| DK (1) | DK1385882T3 (pl) |
| EA (1) | EA010435B1 (pl) |
| EE (1) | EE05294B1 (pl) |
| ES (3) | ES2527471T3 (pl) |
| HK (1) | HK1207390A1 (pl) |
| HU (1) | HU229910B1 (pl) |
| IL (2) | IL158719A0 (pl) |
| MX (1) | MXPA03010210A (pl) |
| NO (1) | NO331785B1 (pl) |
| NZ (2) | NZ529267A (pl) |
| PL (2) | PL393317A1 (pl) |
| PT (1) | PT1385882E (pl) |
| RS (1) | RS51708B (pl) |
| SI (1) | SI1385882T1 (pl) |
| SK (1) | SK288175B6 (pl) |
| WO (1) | WO2002092620A2 (pl) |
| ZA (1) | ZA200308513B (pl) |
Families Citing this family (145)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US8212004B2 (en) * | 1999-03-02 | 2012-07-03 | Human Genome Sciences, Inc. | Neutrokine-alpha fusion proteins |
| US6812327B1 (en) * | 1996-10-25 | 2004-11-02 | Human Genome Sciences, Inc. | Neutrokine-alpha polypeptides |
| US7879328B2 (en) | 2000-06-16 | 2011-02-01 | Human Genome Sciences, Inc. | Antibodies that immunospecifically bind to B lymphocyte stimulator |
| DE60143798D1 (de) | 2000-06-16 | 2011-02-17 | Cambridge Antibody Tech | Immunspezifisch bindende antikörper gegen blys |
| EP2267015A3 (en) | 2000-08-18 | 2011-04-20 | Human Genome Sciences, Inc. | Binding polypeptides for B lymphocyte stimulator protein (BLyS) |
| WO2002016411A2 (en) | 2000-08-18 | 2002-02-28 | Human Genome Sciences, Inc. | Binding polypeptides and methods based thereon |
| UA83458C2 (uk) | 2000-09-18 | 2008-07-25 | Байоджен Айдек Ма Інк. | Виділений поліпептид baff-r (рецептор фактора активації в-клітин сімейства tnf) |
| JP4516719B2 (ja) * | 2001-05-11 | 2010-08-04 | アムジエン・インコーポレーテツド | Tall−1と結合するペプチド及び関連分子 |
| US7112410B1 (en) | 2001-08-29 | 2006-09-26 | Human Genome Sciences, Inc. | Human tumor necrosis factor TR21 and methods based thereon |
| MXPA05007019A (es) | 2002-12-30 | 2005-08-18 | Amgen Inc | Terapia de combinacion con factores co-estimuladores. |
| EP1608730B1 (en) | 2003-03-28 | 2013-11-06 | Biogen Idec MA Inc. | Truncated baff receptors |
| AU2004256042A1 (en) | 2003-06-05 | 2005-01-20 | Genentech, Inc. | BlyS antagonists and uses thereof |
| US7605120B2 (en) * | 2003-10-22 | 2009-10-20 | Amgen Inc. | Antagonists of the brandykinin B1 receptor |
| AU2004315198A1 (en) | 2004-01-29 | 2005-08-18 | Genentech, Inc. | Variants of the extracellular domain of BCMA and uses thereof |
| US20070004658A1 (en) * | 2004-06-21 | 2007-01-04 | Nick Vandeghinste | Method and means for treatment of osteoarthritis |
| CN101103045B (zh) | 2004-09-24 | 2015-11-25 | 安姆根有限公司 | 修饰的Fc分子 |
| CN100378122C (zh) * | 2004-12-03 | 2008-04-02 | 中国人民解放军第三军医大学 | B淋巴细胞刺激因子抑制肽及其制备方法 |
| EP1902320B1 (en) | 2005-05-20 | 2010-03-10 | Genentech, Inc. | Pretreatment of a biological sample from an autoimmune disease subject |
| ES2776657T3 (es) | 2005-06-14 | 2020-07-31 | Amgen Inc | Formulaciones de proteínas autotamponantes |
| US8008453B2 (en) | 2005-08-12 | 2011-08-30 | Amgen Inc. | Modified Fc molecules |
| US9168286B2 (en) | 2005-10-13 | 2015-10-27 | Human Genome Sciences, Inc. | Methods and compositions for use in treatment of patients with autoantibody positive disease |
| NZ597082A (en) | 2005-10-13 | 2013-11-29 | Human Genome Sciences Inc | Methods and Compositions for Use in Treatment of Patients with Autoantibody Positive Diseases |
| MY149159A (en) | 2005-11-15 | 2013-07-31 | Hoffmann La Roche | Method for treating joint damage |
| AU2006318539B2 (en) | 2005-11-23 | 2012-09-13 | Genentech, Inc. | Methods and compositions related to B cell assays |
| US8211649B2 (en) | 2006-03-31 | 2012-07-03 | Human Genome Sciences, Inc. | Methods of diagnosing and prognosing hodgkin's lymphoma |
| JO3324B1 (ar) | 2006-04-21 | 2019-03-13 | Amgen Inc | مركبات علاجية مجففة بالتبريد تتعلق بالعصارة الهضمية |
| US7981425B2 (en) | 2006-06-19 | 2011-07-19 | Amgen Inc. | Thrombopoietic compounds |
| US20090252703A1 (en) * | 2006-10-19 | 2009-10-08 | Gegg Jr Colin V | Use of alcohol co-solvents to improve pegylation reaction yields |
| JP5591691B2 (ja) | 2007-05-22 | 2014-09-17 | アムジエン・インコーポレーテツド | 生物活性を有する融合タンパク質を作製するための組成物及び方法 |
| EP2197421A1 (en) * | 2007-08-31 | 2010-06-23 | Amgen, Inc | Solid-state protein formulation |
| WO2009043049A2 (en) * | 2007-09-27 | 2009-04-02 | Amgen Inc. | Pharmaceutical formulations |
| WO2009064838A1 (en) | 2007-11-15 | 2009-05-22 | Amgen, Inc. | Aqueous formulation of erythropoiesis stimulating protein stablised by antioxidants for parenteral administration |
| WO2010075249A2 (en) | 2008-12-22 | 2010-07-01 | Genentech, Inc. | A method for treating rheumatoid arthritis with b-cell antagonists |
| WO2010093993A2 (en) * | 2009-02-12 | 2010-08-19 | Human Genome Sciences, Inc. | Use of b lymphocyte stimulator protein antagonists to promote transplantation tolerance |
| WO2010108154A2 (en) | 2009-03-20 | 2010-09-23 | Amgen Inc. | Selective and potent peptide inhibitors of kv1.3 |
| PE20120591A1 (es) | 2009-04-02 | 2012-05-23 | Roche Glycart Ag | Anticuerpos multiespecificos que comprenden anticuerpos de longitud completa y fragmentos fab de cadena sencilla |
| CN102597268B (zh) | 2009-09-03 | 2017-09-22 | 弗·哈夫曼-拉罗切有限公司 | 用于治疗、诊断和监控类风湿性关节炎的方法 |
| WO2011034605A2 (en) | 2009-09-16 | 2011-03-24 | Genentech, Inc. | Coiled coil and/or tether containing protein complexes and uses thereof |
| MX344382B (es) | 2009-10-23 | 2016-12-14 | Amgen Inc * | Adaptador de vial y sistema. |
| AR080793A1 (es) | 2010-03-26 | 2012-05-09 | Roche Glycart Ag | Anticuerpos biespecificos |
| US9637557B2 (en) | 2010-04-23 | 2017-05-02 | Genentech, Inc. | Production of heteromultimeric proteins |
| HUE026173T2 (en) | 2010-06-07 | 2016-05-30 | Amgen Inc | pharmaceutical Pump |
| CN104474546A (zh) | 2010-08-13 | 2015-04-01 | 弗·哈夫曼-拉罗切有限公司 | 用于疾病治疗的针对IL-1β和IL-18的抗体 |
| RU2013110875A (ru) | 2010-08-24 | 2014-09-27 | Ф.Хоффманн-Ля Рош Аг | БИСПЕЦИФИЧЕСКИЕ АНТИТЕЛА, СОДЕРЖАЩИЕ СТАБИЛИЗИРОВАННЫЙ ДИСУЛЬФИДОМ ФРАГМЕНТ Fv |
| CN103339145A (zh) | 2010-09-22 | 2013-10-02 | 安姆根有限公司 | 运载体免疫球蛋白及其用途 |
| JP5766296B2 (ja) | 2010-12-23 | 2015-08-19 | エフ.ホフマン−ラ ロシュ アーゲーF. Hoffmann−La Roche Aktiengesellschaft | ポリペプチド−ポリヌクレオチド複合体、およびエフェクター成分の標的化された送達におけるその使用 |
| CN103649117B (zh) | 2011-02-04 | 2016-09-14 | 霍夫曼-拉罗奇有限公司 | Fc变体及其生成方法 |
| US10689447B2 (en) | 2011-02-04 | 2020-06-23 | Genentech, Inc. | Fc variants and methods for their production |
| RU2013140975A (ru) | 2011-02-28 | 2015-04-10 | Дженентек, Инк. | Биологические маркеры и способы прогнозирования восприимчивости к антагонистам в-клеток |
| AU2012236573B2 (en) | 2011-03-31 | 2016-06-02 | Amgen Inc. | Vial adapter and system |
| TR201905991T4 (tr) | 2011-04-20 | 2019-05-21 | Amgen Inc | Oto enjektör aparatı. |
| DE202012012998U1 (de) | 2011-08-31 | 2014-06-13 | Daniel Elias | Bioaktive, regenerative Mischung zur Herstellung eines Ergänzungsnahrungsmittels |
| CN104093744A (zh) | 2011-10-11 | 2014-10-08 | 弗·哈夫曼-拉罗切有限公司 | 双特异性抗体的改进的组装 |
| EP3045188B1 (en) | 2011-10-14 | 2020-12-23 | Amgen Inc. | Injector and method of assembly |
| AR091305A1 (es) | 2012-01-31 | 2015-01-28 | Genentech Inc | ANTICUERPOS ANTI-IgE Y SUS METODOS DE USO |
| MX2014009565A (es) | 2012-02-10 | 2014-11-10 | Genentech Inc | Anticuerpos monocatenarios y otros heteromultimeros. |
| JP6254146B2 (ja) | 2012-03-27 | 2017-12-27 | エヌジーエム バイオファーマシューティカルス,インコーポレーテッド | 代謝障害を治療するための組成物および方法 |
| JP6203838B2 (ja) | 2012-06-27 | 2017-09-27 | エフ.ホフマン−ラ ロシュ アーゲーF. Hoffmann−La Roche Aktiengesellschaft | 少なくとも2つの異なる結合実体を含む、テーラーメイドの高度に選択的かつ多重特異的なターゲティング実体を選択および作製するための方法、ならびにその使用 |
| RU2015100656A (ru) | 2012-06-27 | 2016-08-20 | Ф. Хоффманн-Ля Рош Аг | Способ получения конъюгатов fc-фрагмента антитела, включающих по меньшей мере одну связывающую группировку, которая специфически связывается с мишенью, и их применения |
| EP2922590B1 (en) | 2012-11-21 | 2020-02-05 | Amgen Inc. | Drug delivery device |
| US9161966B2 (en) | 2013-01-30 | 2015-10-20 | Ngm Biopharmaceuticals, Inc. | GDF15 mutein polypeptides |
| KR101993714B1 (ko) | 2013-01-30 | 2019-06-28 | 엔지엠 바이오파마슈티컬스, 아이엔씨. | 대사 장애를 치료하는데 이용하기 위한 조성물과 방법 |
| US9458246B2 (en) | 2013-03-13 | 2016-10-04 | Amgen Inc. | Proteins specific for BAFF and B7RP1 |
| PH12022550138A1 (en) | 2013-03-13 | 2023-03-06 | Amgen Inc | Proteins specific for baff and b7rp1 and uses thereof |
| SG11201507417RA (en) | 2013-03-15 | 2015-10-29 | Amgen Inc | Body contour adaptable autoinjector device |
| TWI614041B (zh) | 2013-03-15 | 2018-02-11 | 安美基公司 | 用於注射器之匣盒 |
| US10092703B2 (en) | 2013-03-15 | 2018-10-09 | Amgen Inc. | Drug cassette, autoinjector, and autoinjector system |
| EP2976117B1 (en) | 2013-03-22 | 2020-12-30 | Amgen Inc. | Injector and method of assembly |
| EP3058003B8 (en) | 2013-10-17 | 2020-08-26 | Alcon Inc. | Crosslinkable polyacetal for contact lenses |
| CA2920894C (en) | 2013-10-24 | 2023-03-14 | Amgen Inc. | Injector and method of assembly |
| EP3957345B1 (en) | 2013-10-24 | 2025-12-10 | Amgen Inc. | Drug delivery system with temperature-sensitive control |
| US10994112B2 (en) | 2014-02-05 | 2021-05-04 | Amgen Inc. | Drug delivery system with electromagnetic field generator |
| HUE063273T2 (hu) | 2014-05-06 | 2024-01-28 | Hoffmann La Roche | Heteromultimer fehérjék elõállítása emlõssejtek felhasználásával |
| MX388536B (es) | 2014-05-07 | 2025-03-20 | Amgen Inc | Autoinyector con elementos reductores del shock. |
| CN106470717B (zh) | 2014-06-03 | 2020-09-11 | 安姆根有限公司 | 药物递送系统和使用方法 |
| UA123432C2 (uk) | 2014-07-30 | 2021-04-07 | Нджм Біофармасьютікалз, Інк. | Димер та спосіб його застосування для лікування метаболічних розладів |
| AU2015332557B2 (en) | 2014-10-14 | 2020-05-14 | Amgen Inc. | Drug injection device with visual and audio indicators |
| MD20170035A2 (ro) | 2014-10-31 | 2017-09-30 | Ngm Biopharmaceuticals Inc | Compoziţii şi metode de utilizare pentru tratamentul tulburărilor metabolice |
| WO2016087416A1 (en) | 2014-12-03 | 2016-06-09 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Multispecific antibodies |
| EP3848072A1 (en) | 2014-12-19 | 2021-07-14 | Amgen Inc. | Drug delivery device with proximity sensor |
| ES2785311T3 (es) | 2014-12-19 | 2020-10-06 | Amgen Inc | Dispositivo de administración de fármacos con botón móvil o campo de interfaz de usuario |
| CA3069716C (en) | 2015-02-17 | 2021-11-09 | Amgen Inc. | Drug delivery device with vacuum assisted securement and/or feedback |
| EP3261690B1 (en) | 2015-02-27 | 2021-12-15 | Amgen Inc. | Drug delivery device having a needle guard mechanism with a tunable threshold of resistance to needle guard movement |
| MA42613A (fr) | 2015-08-13 | 2018-06-20 | Amgen Inc | Filtration en profondeur chargée de protéines de liaison à un antigène |
| WO2017039786A1 (en) | 2015-09-02 | 2017-03-09 | Amgen Inc. | Syringe assembly adapter for a syringe |
| WO2017100501A1 (en) | 2015-12-09 | 2017-06-15 | Amgen Inc. | Auto-injector with signaling cap |
| US11154661B2 (en) | 2016-01-06 | 2021-10-26 | Amgen Inc. | Auto-injector with signaling electronics |
| WO2017160799A1 (en) | 2016-03-15 | 2017-09-21 | Amgen Inc. | Reducing probability of glass breakage in drug delivery devices |
| CN117986363A (zh) | 2016-03-31 | 2024-05-07 | 恩格姆生物制药公司 | 结合蛋白及其使用方法 |
| WO2017189089A1 (en) | 2016-04-29 | 2017-11-02 | Amgen Inc. | Drug delivery device with messaging label |
| US11389588B2 (en) | 2016-05-02 | 2022-07-19 | Amgen Inc. | Syringe adapter and guide for filling an on-body injector |
| AU2017263558B2 (en) | 2016-05-13 | 2022-12-22 | Amgen Inc. | Vial sleeve assembly |
| EP3458988B1 (en) | 2016-05-16 | 2023-10-18 | Amgen Inc. | Data encryption in medical devices with limited computational capability |
| WO2017209899A1 (en) | 2016-06-03 | 2017-12-07 | Amgen Inc. | Impact testing apparatuses and methods for drug delivery devices |
| WO2018004842A1 (en) | 2016-07-01 | 2018-01-04 | Amgen Inc. | Drug delivery device having minimized risk of component fracture upon impact events |
| US20190328965A1 (en) | 2016-08-17 | 2019-10-31 | Amgen Inc. | Drug delivery device with placement detection |
| WO2018081234A1 (en) | 2016-10-25 | 2018-05-03 | Amgen Inc. | On-body injector |
| JP2020503976A (ja) | 2017-01-17 | 2020-02-06 | アムジエン・インコーポレーテツド | 注入デバイスならびに関連する使用および組立方法 |
| EP3582829A1 (en) | 2017-02-17 | 2019-12-25 | Amgen Inc. | Insertion mechanism for drug delivery device |
| MX2019009625A (es) | 2017-02-17 | 2019-10-09 | Amgen Inc | Dispositivo de administracion de farmacos con trayectoria de flujo de fluido esteril y metodo relacionado de ensamblaje. |
| EP3592403B1 (en) | 2017-03-06 | 2025-08-20 | Amgen Inc. | Drug delivery device with activation prevention feature |
| CA3052482A1 (en) | 2017-03-07 | 2018-09-13 | Amgen Inc. | Needle insertion by overpressure |
| AU2018230486B2 (en) | 2017-03-09 | 2023-05-11 | Amgen Inc. | Insertion mechanism for drug delivery device |
| CN118743804A (zh) | 2017-03-28 | 2024-10-08 | 美国安进公司 | 柱塞杆和注射器组件系统以及方法 |
| EP3632933A4 (en) | 2017-06-01 | 2021-03-03 | Seoul National University R & DB Foundation | Novel anti-cd40 antibodies and use thereof |
| AU2018280054B2 (en) | 2017-06-08 | 2023-07-13 | Amgen Inc. | Syringe assembly for a drug delivery device and method of assembly |
| CA3066399A1 (en) | 2017-06-08 | 2018-12-13 | Amgen Inc. | Torque driven drug delivery device |
| AU2018288604B2 (en) | 2017-06-22 | 2023-12-21 | Amgen Inc. | Device activation impact/shock reduction |
| MA49461A (fr) | 2017-06-23 | 2020-04-29 | Amgen Inc | Dispositif électronique d'administration de médicament comprenant un bouchon activé par un ensemble commutateur |
| MA49562A (fr) | 2017-07-14 | 2020-05-20 | Amgen Inc | Système d'insertion-rétractation d'aiguille présentant un système à ressort en double torsion |
| US11672733B2 (en) | 2017-07-21 | 2023-06-13 | Amgen Inc. | Gas permeable sealing member for drug container and methods of assembly |
| JP2020528296A (ja) | 2017-07-25 | 2020-09-24 | アムジエン・インコーポレーテツド | ギヤモジュールを有する薬物送達デバイス及び関連する組立方法 |
| US11484648B2 (en) | 2017-07-25 | 2022-11-01 | Amgen Inc. | Drug delivery device with container access system and related method of assembly |
| WO2019032482A2 (en) | 2017-08-09 | 2019-02-14 | Amgen Inc. | HYDRAULIC-PNEUMATIC PRESSURE CHAMBER DELIVERY SYSTEM |
| WO2019036181A1 (en) | 2017-08-18 | 2019-02-21 | Amgen Inc. | BODY INJECTOR WITH STERILE ADHESIVE PATCH |
| US11103636B2 (en) | 2017-08-22 | 2021-08-31 | Amgen Inc. | Needle insertion mechanism for drug delivery device |
| ES2939292T3 (es) | 2017-10-04 | 2023-04-20 | Amgen Inc | Adaptador de flujo para dispositivo de administración de fármacos |
| EP4257164A3 (en) | 2017-10-06 | 2024-01-17 | Amgen Inc. | Drug delivery device with interlock assembly and related method of assembly |
| EP3694578B1 (en) | 2017-10-09 | 2025-09-24 | Amgen Inc. | Drug delivery device with drive assembly and related method of assembly |
| MA50528A (fr) | 2017-11-03 | 2020-09-09 | Amgen Inc | Systèmes et approches pour stériliser un dispositif d'administration de médicament |
| US12053618B2 (en) | 2017-11-06 | 2024-08-06 | Amgen Inc. | Fill-finish assemblies and related methods |
| WO2019089178A1 (en) | 2017-11-06 | 2019-05-09 | Amgen Inc. | Drug delivery device with placement and flow sensing |
| IL319987A (en) | 2017-11-10 | 2025-06-01 | Amgen Inc | Plungers for drug delivery devices |
| JP7747438B2 (ja) | 2017-11-16 | 2025-10-01 | アムジエン・インコーポレーテツド | 失速及び終点検出を有するオートインジェクタ |
| SG11202003004RA (en) | 2017-11-16 | 2020-04-29 | Amgen Inc | Door latch mechanism for drug delivery device |
| US10835685B2 (en) | 2018-05-30 | 2020-11-17 | Amgen Inc. | Thermal spring release mechanism for a drug delivery device |
| US11083840B2 (en) | 2018-06-01 | 2021-08-10 | Amgen Inc. | Modular fluid path assemblies for drug delivery devices |
| US12115360B2 (en) | 2018-07-24 | 2024-10-15 | Amgen Inc. | Hybrid drug delivery devices with grip portion |
| US12042645B2 (en) | 2018-07-24 | 2024-07-23 | Amgen Inc. | Delivery devices for administering drugs |
| MX2021000749A (es) | 2018-07-24 | 2021-03-29 | Amgen Inc | Dispositivos de suministro para administrar farmacos. |
| US12303677B2 (en) | 2018-07-24 | 2025-05-20 | Amgen Inc. | Hybrid drug delivery devices with optional grip portion and related method of preparation |
| EP3829692A1 (en) | 2018-07-31 | 2021-06-09 | Amgen Inc. | Fluid path assembly for a drug delivery device |
| US20210346601A1 (en) | 2018-09-24 | 2021-11-11 | Amgen Inc. | Interventional dosing systems and methods |
| EP3856283A1 (en) | 2018-09-28 | 2021-08-04 | Amgen Inc. | Muscle wire escapement activation assembly for a drug delivery device |
| AU2019352616B2 (en) | 2018-10-02 | 2024-10-10 | Amgen Inc. | Injection systems for drug delivery with internal force transmission |
| US12151089B2 (en) | 2018-10-05 | 2024-11-26 | Amgen Inc. | Drug delivery device having dose indicator |
| SG11202103800RA (en) | 2018-10-15 | 2021-05-28 | Amgen Inc | Drug delivery device having damping mechanism |
| JP2022504805A (ja) | 2018-10-15 | 2022-01-13 | アムジエン・インコーポレーテツド | 薬物送達デバイスのプラットフォーム式組み立てプロセス |
| US11213620B2 (en) | 2018-11-01 | 2022-01-04 | Amgen Inc. | Drug delivery devices with partial drug delivery member retraction |
| TWI831847B (zh) | 2018-11-01 | 2024-02-11 | 美商安進公司 | 部分針頭縮回之藥物遞送裝置及其操作方法 |
| AU2019370159B2 (en) | 2018-11-01 | 2025-05-29 | Amgen Inc. | Drug delivery devices with partial drug delivery member retraction |
| JP7510952B2 (ja) | 2019-04-24 | 2024-07-04 | アムジエン・インコーポレーテツド | シリンジ滅菌確認アセンブリ及び方法 |
| JP7608439B2 (ja) | 2019-08-23 | 2025-01-06 | アムジエン・インコーポレーテツド | 構成可能な針シールド係合構成要素を備えた薬物送達デバイス及び関連方法 |
| CA3217207A1 (en) | 2021-05-21 | 2022-11-24 | Amgen Inc. | Method of optimizing a filling recipe for a drug container |
| WO2026030152A1 (en) | 2024-07-29 | 2026-02-05 | Amgen Inc. | System and method for assessing transferability of a fill recipe |
Family Cites Families (67)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US3691016A (en) | 1970-04-17 | 1972-09-12 | Monsanto Co | Process for the preparation of insoluble enzymes |
| CA1023287A (en) | 1972-12-08 | 1977-12-27 | Boehringer Mannheim G.M.B.H. | Process for the preparation of carrier-bound proteins |
| US3941763A (en) | 1975-03-28 | 1976-03-02 | American Home Products Corporation | PGlu-D-Met-Trp-Ser-Tyr-D-Ala-Leu-Arg-Pro-Gly-NH2 and intermediates |
| US4195128A (en) | 1976-05-03 | 1980-03-25 | Bayer Aktiengesellschaft | Polymeric carrier bound ligands |
| US4330440A (en) | 1977-02-08 | 1982-05-18 | Development Finance Corporation Of New Zealand | Activated matrix and method of activation |
| CA1093991A (en) | 1977-02-17 | 1981-01-20 | Hideo Hirohara | Enzyme immobilization with pullulan gel |
| US4229537A (en) | 1978-02-09 | 1980-10-21 | New York University | Preparation of trichloro-s-triazine activated supports for coupling ligands |
| US4289872A (en) | 1979-04-06 | 1981-09-15 | Allied Corporation | Macromolecular highly branched homogeneous compound based on lysine units |
| US4816567A (en) | 1983-04-08 | 1989-03-28 | Genentech, Inc. | Recombinant immunoglobin preparations |
| US4710473A (en) | 1983-08-10 | 1987-12-01 | Amgen, Inc. | DNA plasmids |
| US4496689A (en) * | 1983-12-27 | 1985-01-29 | Miles Laboratories, Inc. | Covalently attached complex of alpha-1-proteinase inhibitor with a water soluble polymer |
| NL8720442A (nl) | 1986-08-18 | 1989-04-03 | Clinical Technologies Ass | Afgeefsystemen voor farmacologische agentia. |
| US5229490A (en) | 1987-05-06 | 1993-07-20 | The Rockefeller University | Multiple antigen peptide system |
| DE3889853D1 (de) | 1987-11-05 | 1994-07-07 | Hybritech Inc | Polysaccharidmodifizierte Immunglobuline mit reduziertem immunogenem Potential oder verbesserter Pharmakokinetik. |
| US6018026A (en) | 1988-01-22 | 2000-01-25 | Zymogenetics, Inc. | Biologically active dimerized and multimerized polypeptide fusions |
| US5223409A (en) | 1988-09-02 | 1993-06-29 | Protein Engineering Corp. | Directed evolution of novel binding proteins |
| US5225538A (en) | 1989-02-23 | 1993-07-06 | Genentech, Inc. | Lymphocyte homing receptor/immunoglobulin fusion proteins |
| US5116964A (en) | 1989-02-23 | 1992-05-26 | Genentech, Inc. | Hybrid immunoglobulins |
| US5013556A (en) | 1989-10-20 | 1991-05-07 | Liposome Technology, Inc. | Liposomes with enhanced circulation time |
| US5723286A (en) | 1990-06-20 | 1998-03-03 | Affymax Technologies N.V. | Peptide library and screening systems |
| AU643141B2 (en) | 1991-03-15 | 1993-11-04 | Amgen, Inc. | Pulmonary administration of granulocyte colony stimulating factor |
| US5270170A (en) | 1991-10-16 | 1993-12-14 | Affymax Technologies N.V. | Peptide library and screening method |
| US5733731A (en) | 1991-10-16 | 1998-03-31 | Affymax Technologies N.V. | Peptide library and screening method |
| DE69312700T2 (de) | 1992-04-14 | 1998-02-19 | Cornell Res Foundation Inc | Makromoleküle auf basis von dendritischen polymeren und verfahren zur herstellung |
| US5792451A (en) | 1994-03-02 | 1998-08-11 | Emisphere Technologies, Inc. | Oral drug delivery compositions and methods |
| US5417972A (en) * | 1993-08-02 | 1995-05-23 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Method of killing B-cells in a complement independent and an ADCC independent manner using antibodies which specifically bind CDIM |
| US5470952A (en) | 1993-10-20 | 1995-11-28 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | CNTF and IL-6 antagonists |
| US5922545A (en) | 1993-10-29 | 1999-07-13 | Affymax Technologies N.V. | In vitro peptide and antibody display libraries |
| US6309853B1 (en) | 1994-08-17 | 2001-10-30 | The Rockfeller University | Modulators of body weight, corresponding nucleic acids and proteins, and diagnostic and therapeutic uses thereof |
| DE4435919C1 (de) | 1994-10-07 | 1995-12-07 | Deutsches Krebsforsch | Zinkfinger-DNA, -Protein und ihre Verwendung |
| US5824784A (en) | 1994-10-12 | 1998-10-20 | Amgen Inc. | N-terminally chemically modified protein compositions and methods |
| US6096871A (en) | 1995-04-14 | 2000-08-01 | Genentech, Inc. | Polypeptides altered to contain an epitope from the Fc region of an IgG molecule for increased half-life |
| US5739277A (en) | 1995-04-14 | 1998-04-14 | Genentech Inc. | Altered polypeptides with increased half-life |
| US6127977A (en) | 1996-11-08 | 2000-10-03 | Cohen; Nathan | Microstrip patch antenna with fractal structure |
| AU728657B2 (en) | 1996-03-18 | 2001-01-18 | Board Of Regents, The University Of Texas System | Immunoglobulin-like domains with increased half-lives |
| DK0934526T3 (da) | 1996-10-08 | 2003-05-05 | Bisys B V U | Fremgangsmåder og midler til udvælgelse af peptider og proteiner, der har specifik affinitet til et mål |
| EP0939804B2 (en) | 1996-10-25 | 2011-06-15 | Human Genome Sciences, Inc. | NEUTROKINE alpha |
| US6812327B1 (en) | 1996-10-25 | 2004-11-02 | Human Genome Sciences, Inc. | Neutrokine-alpha polypeptides |
| AU5705898A (en) | 1996-12-17 | 1998-07-15 | Schering Corporation | Mammalian cell surface antigens; related reagents |
| US5969102A (en) | 1997-03-03 | 1999-10-19 | St. Jude Children's Research Hospital | Lymphocyte surface receptor that binds CAML, nucleic acids encoding the same and methods of use thereof |
| CA2232743A1 (en) | 1997-04-02 | 1998-10-02 | Smithkline Beecham Corporation | A tnf homologue, tl5 |
| WO1998055620A1 (en) | 1997-06-06 | 1998-12-10 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Ntn-2 member of tnf ligand family |
| JP2002517977A (ja) | 1997-06-06 | 2002-06-18 | リジェネロン ファーマシューティカルズ,インコーポレイテッド | Tnfリガンドファミリーのntn−2メンバー |
| AU9376498A (en) | 1997-09-05 | 1999-03-22 | University Of Washington | Tumor necrosis factor family receptors and ligands, encoding nucleic acids and related binding agents |
| AU9315298A (en) | 1997-09-12 | 1999-03-29 | Apotech S.A. | Kay - a novel immune system protein |
| AU2212299A (en) | 1998-01-05 | 1999-07-26 | Genentech Inc. | Compositions and methods for the treatment of tumor |
| WO1999062951A1 (en) * | 1998-06-04 | 1999-12-09 | Shanghai Second Medical University | A human zinc finger protein gene (bmzf3) |
| US6660843B1 (en) | 1998-10-23 | 2003-12-09 | Amgen Inc. | Modified peptides as therapeutic agents |
| SK288176B6 (sk) | 1999-01-07 | 2014-04-02 | Zymogenetics, Inc. | Farmaceutický prostriedok obsahujúci fúzny proteín, izolovaná molekula polynukleotidu, expresný vektor, kultivovaná bunka, spôsob prípravy polypeptidu a izolovaný polypeptid |
| MXPA01007464A (es) | 1999-01-25 | 2003-06-06 | Apoxis Sa | Baff, inhibidores del mismo y su uso en la modulacion de la respuesta de celula b. |
| US20030095967A1 (en) | 1999-01-25 | 2003-05-22 | Mackay Fabienne | BAFF, inhibitors thereof and their use in the modulation of B-cell response and treatment of autoimmune disorders |
| AU2880400A (en) | 1999-02-12 | 2000-08-29 | Amgen, Inc. | Tnf-related proteins |
| US20030022233A1 (en) | 1999-04-30 | 2003-01-30 | Raymond G. Goodwin | Methods of use of the taci/taci-l interaction |
| WO2000068378A1 (en) | 1999-05-06 | 2000-11-16 | National Jewish Medical And Research Center | Tall-1 nucleic acid molecules, proteins, receptors and methods of use thereof |
| WO2001002440A1 (en) | 1999-07-02 | 2001-01-11 | Genentech, Inc. | Fusion peptides comprising a peptide ligand domain and a multimerization domain |
| EP1254227A2 (en) | 2000-02-11 | 2002-11-06 | Amgen Inc. | Fusion receptor from tnf family |
| WO2002016411A2 (en) * | 2000-08-18 | 2002-02-28 | Human Genome Sciences, Inc. | Binding polypeptides and methods based thereon |
| EP2267015A3 (en) | 2000-08-18 | 2011-04-20 | Human Genome Sciences, Inc. | Binding polypeptides for B lymphocyte stimulator protein (BLyS) |
| JP4516719B2 (ja) * | 2001-05-11 | 2010-08-04 | アムジエン・インコーポレーテツド | Tall−1と結合するペプチド及び関連分子 |
| AR035119A1 (es) | 2001-08-16 | 2004-04-14 | Lilly Co Eli | Anticuerpos humanos antagonistas anti-htnfsf13b |
| MXPA05007019A (es) * | 2002-12-30 | 2005-08-18 | Amgen Inc | Terapia de combinacion con factores co-estimuladores. |
| CA2572765C (en) * | 2004-07-08 | 2013-05-21 | Amgen Inc. | Compound having improved bioefficiency when administered in a multidose regimen |
| US8008453B2 (en) * | 2005-08-12 | 2011-08-30 | Amgen Inc. | Modified Fc molecules |
| KR101104556B1 (ko) | 2006-12-05 | 2012-01-11 | 가부시키가이샤 고베 세이코쇼 | 인쇄판용 고강도 알루미늄 합금판 |
| US9458246B2 (en) * | 2013-03-13 | 2016-10-04 | Amgen Inc. | Proteins specific for BAFF and B7RP1 |
| PH12022550138A1 (en) * | 2013-03-13 | 2023-03-06 | Amgen Inc | Proteins specific for baff and b7rp1 and uses thereof |
| JP7184157B2 (ja) | 2019-02-27 | 2022-12-06 | 株式会社村田製作所 | コネクタ、コネクタセット |
-
2002
- 2002-05-13 JP JP2002589503A patent/JP4516719B2/ja not_active Expired - Lifetime
- 2002-05-13 ES ES07019762.9T patent/ES2527471T3/es not_active Expired - Lifetime
- 2002-05-13 PT PT02769739T patent/PT1385882E/pt unknown
- 2002-05-13 NZ NZ529267A patent/NZ529267A/en not_active IP Right Cessation
- 2002-05-13 SK SK1489-2003A patent/SK288175B6/sk not_active IP Right Cessation
- 2002-05-13 DK DK02769739T patent/DK1385882T3/da active
- 2002-05-13 IL IL15871902A patent/IL158719A0/xx unknown
- 2002-05-13 CN CNA2006101537137A patent/CN1970078A/zh active Pending
- 2002-05-13 ES ES10178373T patent/ES2387546T3/es not_active Expired - Lifetime
- 2002-05-13 EA EA200301241A patent/EA010435B1/ru not_active IP Right Cessation
- 2002-05-13 PL PL39331702A patent/PL393317A1/pl unknown
- 2002-05-13 CN CNA2006101537090A patent/CN1970077A/zh active Pending
- 2002-05-13 CZ CZ2003-3291A patent/CZ304592B6/cs not_active IP Right Cessation
- 2002-05-13 SI SI200230645T patent/SI1385882T1/sl unknown
- 2002-05-13 BR BR0209546-7A patent/BR0209546A/pt not_active Application Discontinuation
- 2002-05-13 RS YU95203A patent/RS51708B/sr unknown
- 2002-05-13 PL PL369570A patent/PL210546B1/pl unknown
- 2002-05-13 HU HU0700125A patent/HU229910B1/hu not_active IP Right Cessation
- 2002-05-13 AT AT10178373T patent/ATE549354T1/de active
- 2002-05-13 AT AT02769739T patent/ATE375361T1/de active
- 2002-05-13 MX MXPA03010210A patent/MXPA03010210A/es active IP Right Grant
- 2002-05-13 EP EP14180109.2A patent/EP2845864A3/en not_active Withdrawn
- 2002-05-13 EE EEP200300552A patent/EE05294B1/xx not_active IP Right Cessation
- 2002-05-13 EP EP20070019762 patent/EP1921088B1/en not_active Expired - Lifetime
- 2002-05-13 WO PCT/US2002/015273 patent/WO2002092620A2/en not_active Ceased
- 2002-05-13 ES ES02769739T patent/ES2295404T3/es not_active Expired - Lifetime
- 2002-05-13 NZ NZ542878A patent/NZ542878A/en not_active IP Right Cessation
- 2002-05-13 EP EP20100178373 patent/EP2292655B1/en not_active Expired - Lifetime
- 2002-05-13 KR KR1020037014672A patent/KR100902687B1/ko not_active Expired - Fee Related
- 2002-05-13 CA CA2446189A patent/CA2446189C/en not_active Expired - Fee Related
- 2002-05-13 DE DE60222882T patent/DE60222882T2/de not_active Expired - Lifetime
- 2002-05-13 EP EP02769739A patent/EP1385882B9/en not_active Expired - Lifetime
- 2002-05-13 AU AU2002342669A patent/AU2002342669C1/en not_active Ceased
- 2002-05-13 CN CNB028140095A patent/CN100448891C/zh not_active Expired - Fee Related
- 2002-05-13 US US10/145,206 patent/US7259137B2/en not_active Expired - Lifetime
-
2003
- 2003-10-31 ZA ZA200308513A patent/ZA200308513B/en unknown
- 2003-11-02 IL IL158719A patent/IL158719A/en not_active IP Right Cessation
- 2003-11-10 NO NO20034980A patent/NO331785B1/no not_active IP Right Cessation
- 2003-11-12 BG BG108349A patent/BG66270B1/bg unknown
-
2005
- 2005-11-10 US US11/272,521 patent/US7737111B2/en not_active Expired - Fee Related
-
2008
- 2008-01-09 CY CY081100030T patent/CY1107131T1/el unknown
-
2010
- 2010-05-26 US US12/788,137 patent/US8507426B2/en not_active Expired - Fee Related
-
2013
- 2013-07-09 US US13/938,141 patent/US9139645B2/en not_active Expired - Fee Related
-
2015
- 2015-08-21 HK HK15108146.9A patent/HK1207390A1/en unknown
- 2015-09-21 US US14/860,381 patent/US20160176926A1/en not_active Abandoned
Also Published As
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| KR100902687B1 (ko) | Tall - 1 - 결합 조성물 | |
| JP2004533249A5 (pl) | ||
| AU2002342669A1 (en) | Peptides and related molecules that bind to TALL-1 | |
| HK1059269B (en) | Peptides and related molecules that bind to tall-1 | |
| HK1151545B (en) | Peptides and related molecules that bind to tall-1 |