PL189639B1 - Wyodrębniona cząsteczka kwasu nukleinowego, chimeryczny ligand TIE-2, wektor, układ gospodarz-wektor, sposób wytwarzania liganda, przeciwciało, koniugat, kompozycja farmaceutyczna i chimeryczny ligand - Google Patents

Wyodrębniona cząsteczka kwasu nukleinowego, chimeryczny ligand TIE-2, wektor, układ gospodarz-wektor, sposób wytwarzania liganda, przeciwciało, koniugat, kompozycja farmaceutyczna i chimeryczny ligand

Info

Publication number
PL189639B1
PL189639B1 PL97331405A PL33140597A PL189639B1 PL 189639 B1 PL189639 B1 PL 189639B1 PL 97331405 A PL97331405 A PL 97331405A PL 33140597 A PL33140597 A PL 33140597A PL 189639 B1 PL189639 B1 PL 189639B1
Authority
PL
Poland
Prior art keywords
tie
ligand
receptor
cells
domain
Prior art date
Application number
PL97331405A
Other languages
English (en)
Other versions
PL331405A1 (en
Inventor
Samuel Davis
George D. Yancopoulos
Original Assignee
Regeneron Pharma
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Regeneron Pharma filed Critical Regeneron Pharma
Publication of PL331405A1 publication Critical patent/PL331405A1/xx
Publication of PL189639B1 publication Critical patent/PL189639B1/pl

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/85Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
    • C12N15/8509Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells for producing genetically modified animals, e.g. transgenic
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P17/00Drugs for dermatological disorders
    • A61P17/02Drugs for dermatological disorders for treating wounds, ulcers, burns, scars, keloids, or the like
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P27/00Drugs for disorders of the senses
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P29/00Non-central analgesic, antipyretic or antiinflammatory agents, e.g. antirheumatic agents; Non-steroidal antiinflammatory drugs [NSAID]
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P7/00Drugs for disorders of the blood or the extracellular fluid
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P7/00Drugs for disorders of the blood or the extracellular fluid
    • A61P7/02Antithrombotic agents; Anticoagulants; Platelet aggregation inhibitors
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P9/00Drugs for disorders of the cardiovascular system
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P9/00Drugs for disorders of the cardiovascular system
    • A61P9/14Vasoprotectives; Antihaemorrhoidals; Drugs for varicose therapy; Capillary stabilisers
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/475Growth factors; Growth regulators
    • C07K14/515Angiogenesic factors; Angiogenin
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/705Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • C07K14/71Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants for growth factors; for growth regulators
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01KANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
    • A01K2207/00Modified animals
    • A01K2207/15Humanized animals
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01KANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
    • A01K2217/00Genetically modified animals
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01KANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
    • A01K2217/00Genetically modified animals
    • A01K2217/05Animals comprising random inserted nucleic acids (transgenic)
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01KANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
    • A01K2217/00Genetically modified animals
    • A01K2217/07Animals genetically altered by homologous recombination
    • A01K2217/075Animals genetically altered by homologous recombination inducing loss of function, i.e. knock out
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01KANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
    • A01K2227/00Animals characterised by species
    • A01K2227/10Mammal
    • A01K2227/105Murine
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01KANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
    • A01K2227/00Animals characterised by species
    • A01K2227/30Bird
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01KANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
    • A01K2267/00Animals characterised by purpose
    • A01K2267/01Animal expressing industrially exogenous proteins
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01KANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
    • A01K2267/00Animals characterised by purpose
    • A01K2267/03Animal model, e.g. for test or diseases
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01KANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
    • A01K2267/00Animals characterised by purpose
    • A01K2267/03Animal model, e.g. for test or diseases
    • A01K2267/0331Animal model for proliferative diseases
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01KANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
    • A01K2267/00Animals characterised by purpose
    • A01K2267/03Animal model, e.g. for test or diseases
    • A01K2267/035Animal model for multifactorial diseases
    • A01K2267/0375Animal model for cardiovascular diseases
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01KANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
    • A01K2267/00Animals characterised by purpose
    • A01K2267/03Animal model, e.g. for test or diseases
    • A01K2267/035Animal model for multifactorial diseases
    • A01K2267/0381Animal model for diseases of the hematopoietic system
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/01Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif
    • C07K2319/02Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif containing a signal sequence

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Vascular Medicine (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Heart & Thoracic Surgery (AREA)
  • Diabetes (AREA)
  • Cardiology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Pain & Pain Management (AREA)
  • Rheumatology (AREA)
  • Dermatology (AREA)

Abstract

1. Wyodrebniona czasteczka kwasu nukleinowego, kodujaca chimeryczny ligand TIE-2 wiazacy i/lub aktywujacy receptor TIE-2, znamienna tym, ze zawiera N-koncowa domene, domene sklebionej spirali i domene fibrynogeno-podobna, przy czym, co najmniej dwie wspomniane domeny pochodza od róznych ligandów TIE-2 wybranych sposród li- ganda 1 TIE-2, liganda 2 TIE-2, liganda 3 TIE i liganda 4 TIE. 2. Czasteczka wedlug zastrz. 1, znamienna tym, ze domena N-koncowa, domena sklebionej spirali i domena fibrynogeno-podobna pochodza z liganda 1 TIE-2 lub liganda 2 TIE-2. 7. Czasteczka wedlug zastrz. 5 albo 6, znamienna tym, ze jest dodatkowo zmodyfi- kowana, tak, ze koduje inny aminokwas zamiast reszty argininowej kodowanej przez nu kleotydy 199-201 jak przedstawiono w fig. 27. 22. Sposób wytwarzania chimerycznego liganda jaki zdefiniowano w zastrz. 15, znamienny tym, ze prowadzi sie hodowle komórek ukladu gospodarz-wektor jak zdefi- niowano w zastrz. 20, w warunkach, pozwalajacych na wytwarzanie liganda i odzyskiwa- nie tak wytworzonego liganda. 23. Przeciwcialo, znamienne tym, ze specyficznie wiaze sie z chimerycznym ligan dem TIE-2 jak zdefiniowano w zastrz. 15, ale które nie wiaze sie z natywnym ligandem TIE-2. 27. Kompozycja farmaceutyczna, znamienna tym, ze zawiera chimeryczny lub mo- dyfikowany ligand jak zdefiniowano w zastrz. 15 i farmaceutycznie dopuszczalny nosnik. PL PL PL

Description

Przedmiotem wynalazku wyodrębniona cząsteczka kwasu nukleinowego, chimeryczny ligand TIE-2, wektor, układ gospodarz-wektor, sposób wytwarzania liganda, przeciwciało, koniugat, kompozycja farmaceutyczna i chimeryczny ligand. Niniejszy wynalazek mieści się w dziedzinie inżynierii genetycznej, a szczególniej genów dla receptorowych kinaz tyrozynowych i ich pokrewnych ligandów·’, ich wprowadzania do rekombinowanych wektorów DNA, oraz wytwarzania kodowanych białek w odbiorczych szczepach drobnoustrojów i odbiorczych komórkach eukariotycznych. Konkretniej, niniejszy wynalazek odnosi się do nowych ligandów znanych jako ligand-3 TIE i ligand-4 TIE, które wiążą się z receptorem TIE-2, jak również do sposobów wytwarzania i zastosowania nowych ligandów^. Wynalazek dotyczy dalej sekwencji kwasu nukleinowego, kodujących modyfikowany ligand TIE-2, sposób tworzenia kwasów nukleinowych i produktów genowych. Nowe ligandy TIE, jak również kodujące je kwasy nukleinowe, mogą być użyteczne w diagnozowaniu i leczeniu pewnych chorób związanych z komórkami śródbłonka i towarzyszącymi receptorami TIE, tak jakich jak choroby nowotworowe, łącznie z angiogenezą guza, leczenie zranień, choroby zatorowe, miażdżyca tętnic i choroby zapalne. Oprócz tego, ligandy można stosować do pobudzania proliferacji i/lub różnicowania się krwiotwórczych komórek macierzystych.
Ogólniej, opisane w niniejszym modyfikowane ligandy TIE-2 aktywujące receptor, można stosować do pobudzania wzrostu, podtrzymywania życia, migracji i/lub różnicowania i/lub stabilizacji albo destabilizacji komórek, wykazujących ekspresję receptora TLE. Biologicznie aktywny ligand TIE-2 można stosować do utrzymywania w kulturze in vitro komórek, wykazujących ekspresję receptora TIE. Komórki i tkanki, wskazujące ekspresję receptora TIE obejmują np. komórki śródbłonka sercowego i naczyniowego, komórki nabłonkowe soczewki i nasierdzia oraz wczesne komórki krwiotwórcze. Alternatywnie, taki ludzki ligand można stosować do utrzymywania komórek zbudowanych w celu ekspresji receptora TIE. Dalej, modyfikowany ligand TIE-2 i jego pokrewny receptor można stosować w układach testowych do identyfikacji dodatkowych agonistów lub antagonistów receptora.
Bahawior komórkowy odpowiedzialny za rozwój, utrzymanie i naprawę zróżnicowanych komórek i tkanek regulują w większości sygnały wewnątrzkomórkowe przenoszone przez czynniki wzrostu i podobne ligandy oraz ich receptory. Receptory leżą na powierzchniach komórkowych odpowiadających komórek i wiążą peptydy lub polipeptydy znane jako czynniki wzrostu, jak również inne ligandy podobne do hormonów. W wyniku tej interakcji mają miejsce szybkie biochemiczne zmiany w odpowiadających komórkach, a także krótko
189 639 i długoterminowe regulacje ekspresji genów komórkowych. Kilka receptorów związanych z różnymi powierzchniami komórkowymi może wiązać specyficzne czynniki wzrostu.
Fosforylacja reszt tyrozynowych w białkach przez kinazy tyrozynowe, jest jednym z kluczowych sposobów przenoszenia sygnałów poprzez błony plazmatyczne. Kilka aktualnie znanych genów białek kinaz tyrozynowych koduje receptory transbłonowe dla polipeptydowych czynników wzrostu i hormonów, takich jak czynnik wzrostu naskórka (EGF), insulina, insulinopodobny czynnik wzrostu-I (IGF-I), płytkowe czynniki wzrostu (PDGF-A i -B) oraz czynniki wzrostu fibroblastów (FGF). (Heldin i in., Cell Regulation, 1: 555-566 (1990); Ullrich i in., Cell, 61: 243-54 (1990)). W każdym wypadku, te czynniki wzrostu działają przez wiązanie się z zewnątrzkomórkową częścią pokrewnych receptorów, co prowadzi do aktywacji wewnętrznych kinaz tyrozynowych obecnych na cytoplazmatycznej części receptora. Receptory czynników wzrostu komórek śródbłonkowych są szczególnie interesujące, ponieważ prawdopodobnie są związane z czynnikami wzrostu w kilku ważnych procesach fizjologicznych i patologicznych, takich jak powstawanie naczyń, angiogeneza, miażdżyca tętnic i choroby zapalne. (Folkman i in., Science, 235: 442-447 (1987)). Także, receptory kilku krwiotwórczych czynników wzrostu są kinazami tyrozynowymi; obejmują one c-fms, który jest receptorem czynnika 1 stymulacji kolonii, Sherr i in., Cell, 41: 665-676 (1985) oraz c-kit, prymitywny receptor krwiotwórczego czynnika wzrostu opisywany przez Huanga i in., Cell, 63:225-33 (1990).
Receptory kinaz tyrozynowych podzielono na podrodziny ewolucyjne, na podstawie charakterystycznej struktury ektodomen. (Ullrich i in., Cell, 61: 243-54 (1990)). Takie podrodziny obejmują kinazę receptoropodobną EGF (podklasa I) oraz kinazę receptoropodobną insuliny (podklasa II), z których każda zawiera w swych domenach zewnątrzkomórkowych powtarzające się homologiczne sekwencje bogate w cysteinę. Pojedynczy region bogaty w cysteinę znajduje się także w domenach zewnątrzkomórkowych kinaz podobnych do eph. Hirai i in., Science, 238: 1717-1720 (1987); Lindberg i in., Mol. Celi. Biol, 10: 6316-24 (1990); Lhotak i in., Mol. Cell. Biol. 11: 2496-2502 (1991). Receptory PDGF, a także kinazy tyrozynowe receptorów c-fms i c-kit można zgrupować w podklasę III; chociaż receptory FGF tworzą podklasę IV. Typowe dla członków obu tych podklas są zewnątrzkomórkowe pofałdowane jednostki stabilizowane przez wewnątrzłańcuchowe wiązania disiarczkowe. Te tak zwane fałdy immunoglobulinopodobne (Ig) znajdują się w białkach nadrodziny immunoglobulin, która zawiera wiele różnych innych receptorów powierzchniowo-komórkowych, posiadających ligandy albo związane z komórką albo rozpuszczalne. Williams i in., Ann. Rev. Immunol., 6: 381-405 (1988).
Receptorowe kinazy tyrozynowe różnią się pod względem swej specyficzności i powinowactwa. Ogólnie, receptorowe kinazy tyrozynowe są glikoproteinami, składającymi się z (1) domeny zewnątrzkomórkowej zdolnej do wiązania się ze specyficznym czynnikiem(ami) wzrostu; (2) domeny transbłonowej, która zwykle jest częścią o kształcie alfa-helisy białka; (3) domeny okołobłonowej, gdzie receptor może podlegać regulacji np. przez fosforylację białka; (4) domeny kinazy tyrozynowej, która jest enzymatycznym składnikiem receptora; oraz (5) ogonka karboksyterminalnego, który w wielu receptorach angażuje się w rozpoznawanie i wiązanie substratów dla kinazy tyrozynowej.
Takie procesy jak alternatywny splicing egzonowy i alternatywny wybór promotora genu lub miejsc poliadenylacji, opisywano jako umożliwiający wytwarzanie kilku różnych polipeptydów z tego samego genu. Te polipeptydy mogą lub nie, zawierać różne domeny wymienione powyżej. W konsekwencji, niektóre domeny zewnątrzkomórkowe mogą ulegać ekspresji jako oddzielne, wydzielone białka, a pewne postacie receptorów mogą wykazywać brak domen kinaz tyrozynowych i zawierać tylko domenę zewnątrzkomórkow-ą wprowadzoną do błony plazmatycznej poprzez domenę transbłonową, plus krótki ogonek karboksyterminalny.
Gen, kodujący transbłonową kinazę tyrozynową komórki śródbłonka, początkowo zidentyfikowano przez RT-PCR jako nieznany fragment cDNA homologiczny z kinazą tyrozynową z ludzkich komórek białaczki, opisany przez Partanena i in., Proc. Natl. Acad. Sei. USA, 87: 8913-8917 (1990). Gen ten i jego kodowane białko nazwano „TIE”, co jest skrótem
189 639 od „kinaza tyrozynowa z domenami homologicznymi do Ig i EGF”. Partanen i in., Mol. Cell.
Biol. 12: 1698-1707(1992).
Doniesiono, że mRNA tie jest obecny we wszystkich tkankach płodu ludzkiego i zarodkach mysich. Po zbadaniu, zlokalizowano informacyjny tie w śródbłonkowych komórkach sercowych i naczyniowych. Konkretnie, mRNA tie zlokalizowano w śródbłonku naczyń krwionośnych i wsierdzia zarodków mysich w wieku 9,5 do 18,5 dni. Wykazano, ze wzmocniona ekspresja tie zachodziła podczas nowounaczynienia związanego z rozwojem pęcherzyków jajnikowych i tkanki ziarninowej przy gojeniu zranień. Korhonen i in., Blood 80: 2548-2555 (1992). Tak więc, sugerowano, że TIE ogrywają rolę w angiogenezie, co jest istotne dla rozwoju sposobów leczenia guzów stałych i kilku innych chorób zależnych od angiogenezy, takich jak retynopatia cukrzycowa, łuszczyca, miażdżyca tętnic i zapalenie stawów.
Opisano dwa strukturalnie spokrewnione białka receptorowe TIE szczura, kodowane przez różne geny o pokrewnych profilach ekspresji. Jeden gen, określony jako tie-1, jest szczurzym homologiem tie człowieka. Maisonpierre, i in., Oncogene 8: 1631-1637 (1993). Drugi gen, tie-2 może być szczurzym homologiem mysiego genu tek, który, podobnie jak tie, opisywano jako podlegający ekspresji u myszy wyłącznie w komórkach śródbłonka oraz ich przypuszczalnym potomstwie. Dumont i in., Oncogene 8: 1293-1301 (1993). Ludzki homolog tie-2 opisano u Zieglera, złoszenie patentowe U.S. nr 5 447 860, opublikowane 5 września 1995 (w którym przytacza się go jako „ork”), jakie załącza się niniejszym w całości.
Odkryto, ze oba geny podlegają szerokiej ekspresji w komórkach śródbłonka tkanek zarodkowych i noworodka. Istotny poziom transkryptów tie-2 znaleziono także w populacjach komórek zarodkowych, włączając nabłonek soczewki, nasierdzie i regiony mezenchymy. Maisonpierre i in., Oncogene 8: 1631-1637 (1993).
Ekspresja receptora TIE przede wszystkim w śródbłonku naczyniowym sugeruje, że TIE odgrywa rolę w rozwoju i utrzymaniu układu naczyniowego. Może to być rola w określaniu komórki śródbłonkowej, proliferacji, różnicowaniu i migracji komórek oraz odwzorowywaniu w elementach naczyniowych. Analizy zarodków mysich pozbawionych TEE-2 ilustrują jego istotność w angiogenezie, zwłaszcza przy tworzeniu się sieci naczyń w komórkach śródbłonka. T.N. Sato i in., Nature 376: 70-74 (1995). W dojrzałym układzie naczyniowym, TIE mogą oddziaływać na przezywanie komórek śródbłonka, utrzymanie i odpowiedź na wpływ patogeniczny.
Receptory TIE podlegają także ekspresji w pierwotnych krwiotwórczych komórkach macierzystych, komórkach B i podzbiorze komórek megakariocytowych, sugerując w ten sposób rolę ligandów, które wiążą te receptory we wczesnej hematopoezie, w różnicowaniu i/lub proliferacji komórek B oraz w szlaku różnicowania się megakariocytów. Iwama i in., Biochem. Biophys. Research Communications 195: 301-309 (1993); Hashiyama i in., Blood 87: 93-101 (1996); Batard i in., Blood 87: 2212-2220 (1996).
Przedmiotem wynalazku jest wyodrębniona cząsteczka kwasu nukleinowego, kodująca chimeryczny ligand TIE-2 wiążący i/lub aktywujący receptor TIE-2, która zawiera N-końcową domenę, domenę skłębionej spirali i domenę fibrynogeno-podobną, przy czym, co najmniej dwie wspomniane domeny pochodzą od różnych ligandów TIE-2 wybranych spośród liganda 1 TIE-2, liganda 2 TIE-2, liganda 3 TIE i liganda 4 TIE.
Korzystnie, w cząsteczce według wynalazku domena N-końcowa, domena skłębionej spirali i domena fibrynogeno-podobna pochodzą z liganda 1 TIE-2 lub liganda 2 TIE-2.
Bardziej korzystnie cząsteczka ta zawiera sekwencję nukleotydową, kodującą ligand 1 TIE-2, przy czym część sekwencji nukleotydowej, która koduje domenę N-końcową liganda 1 TIE-2 zamienia się na sekwencję nukleotydową, która koduje domenę N-końcową liganda 2 TIE-2.
Jeszcze bardziej korzystnie cząsteczka według wynalazku charakteryzuje się tym, ze część sekwencji nukleotydowej, która koduje domenę skłębionej spirali liganda 1 TIE-2 zamienia się na sekwencję nukleotydową, która koduje domenę skłębionej spirali liganda 2 TIE-2.
Również korzystnie cząsteczka według wynalazku jest tak zmodyfikowana, że koduje inny aminokwas zamiast reszty cysteinowej kodowanej przez nukleotydy 784-787 jak przedstawiono w fig. 27.
189 639
Najbardziej korzystnie cząsteczka jest tak modyfikowana, że koduje resztę serynową zamiast reszty cysternowej.
Ponadto w innym korzystnym rozwiązaniu cząsteczka według wynalazku jest dodatkowo zmodyfikowana, tak, że koduje inny aminokwas zamiast reszty argininowej kodowanej przez nukleotydy 199-201 jak przedstawiono w fig. 27, a najbardziej korzystnie cząsteczka jest tak modyfikowana, ze koduje resztę serynową zamiast reszty argininowej.
Cząsteczka, według wynalazku koduje chimeryczny ligand TTE-2 posiadający sekwencję aminokwasową przedstawioną na fig. 27.
W innym korzystnym aspekcie wynalazku cząsteczka koduje chimeryczny ligand TIE-2 posiadający sekwencję przedstawioną na fig. 25.
Także korzystnie cząsteczka według wynalazku kodująca modyfikowany ligand TIE-2 wiążący się z receptorem TIE-2 lecz nie aktywujący receptora TIE-2, charakteryzuje się tym, że zawiera sekwencję nukleotydową, kodującą ligand 1 TIE-2, przy czym część sekwencji nukleotydowej, która koduje domenę fibrynogeno-podobną liganda 1 TIE-2 zamienia się na sekwencję nukleotydową, która koduje domenę fibrynogeno-podobną liganda 2 TIE-2.
Korzystnie cząsteczka według wynalazku charakteryzuje się tym, że część sekwencji nukleotydowej, która koduje domenę skłębionej spirali liganda 1 TIE-2 zamienia się na sekwencje nukleotydową, która koduje domenę skłębionej spirali liganda 2 TIE-2.
Bardziej korzystnie cząsteczka ta, posiada sekwencję przedstawioną w fig. 24 lub również korzystnie cząsteczka ta posiada sekwencję przedstawioną w fig. 26.
Przedmioetem wynalazku jest także chimeryczny ligand TIE-2 kodowany przez cząsteczkę kwasu nukleinowego jak zdefiniowano powyżej. Ten chimeryczny ligand TIE-2 może posiadać sekwencję przedstawioną w fig. 27, lecz zmodyfikowany jest tak, że posiada inny aminokwas zamiast reszty cysteinowej kodowanej przez nukleotydy 784-787.
Przedmiotem wynalazku jest także wektor, charakteryzujący się tym, że zawiera cząsteczkę kwasu nukleinowego jak zdefiniowano powyżej.
W korzystnym wykonaniu wynalazku cząsteczka kwasu nukleinowego jest operacyjnie połączona z kontrolną sekwencją ekspresji zdolną do kierowania jego ekspresją w komórce gospodarza. Najbardziej korzystnie wektor według wynalazku jest plazmidem.
Przedmiotem wynalazku jest także układ gospodarza-wektor do wytwarzania chimerycznego liganda TIE-2, który to ligand jest kodowany przez cząsteczkę kwasu nukleinowego taką jak zdefiniowano powyżej, który to układ obejmuje komórkę gospodarza oraz wektor zawierający cząsteczkę kwasu nukleinowego jak zdefiniowano powyżej.
Korzystnie układ gospodarza-wektor charakteryzuje się tym, że komórką gospodarza jest komórka bakteryjna, drożdzowa, owadzia lub ssacza.
Przedmiotem wynalazku jest także sposób wytwarzania chimerycznego liganda jaki zdefiniowano TIE-2 polegający na tym, że prowadzi się hodowle komórek układu gospodarzwektor do wytwarzania takiego liganda obejmującego komórkę gospodarza i wektor zawierający wyżej zdefiniowaną cząsteczkę w warunkach, pozwalających na wytwarzanie liganda i odzyskiwanie tak wytworzonego liganda.
Przedmiotem wynalazku jest także przeciwciało, specyficznie wiążące się z ligandem jak zdefiniowanym powyżej ale które nie wiąże się z natywnym ligandem TIE-2.
W korzystnym wykonaniu wynalazku przeciwciało jest przeciwciałem monoklonalnym.
Przedmiotem wynalazku jest także koniugat, który obejmuje zdefiniowany powyżej chimeryczny ligand TIE-2 i sprzężony z nim środek cytotoksyczny.
W korzystnym wykonaniu w koniugacie według wynalazku środkiem cytotoksycznym jest radioizotop lub toksyna.
Przedmiotem wynalazku jest także kompozycja farmaceutyczna, zawierająca chimeryczny lub modyfikowany ligand TIE-2 i farmaceutycznie dopuszczalny nośnik.
Przedmiotem wynalazku może być także kompozycja farmaceutyczna, zawierająca przeciwciało wiążące się specyficznie z ligandem chimerycznym TIE-2 lecz nie wiążące się z natywnym TIE-23 oraz farmaceutycznie dopuszczalny nośnik.
189 639
Kompozycja farmaceutyczna może także zawierać koniugat obejmujący ligand chimeryczny TIE-2 kodowany przez cząsteczkę kwasu nukleinowego zdefiniowaną powyżej i farmaceutycznie dopuszczalny nośnik.
Korzystnym przedmiotem wynalazku jest także chimeryczny ligand TIE-2 posiadający cząsteczkę kwasu nukleinowego zdefiniowaną powyżej lub chimeryczny ligand TIE-2 posiadający sekwencję przedstawioną na fig. 27, lecz zmodyfikowany tak, że posiada inny aminokwas zamiast reszty cysteinowej kodowanej przez nukleotydy 784-787, do stosowania w sposobie leczenia ciała ludzkiego lub zwierzęcego, albo w sposobie diagnozowania.
Korzytnie przeciwciało opisane powyżej można zastosować w sposobie leczenia ciała ludzkiego lub zwierzęcego, albo w sposobie diagnozowania.
Także korzystnie można stosować koniugat opisany powyżej w sposobie leczenia ciała ludzkiego lub zwierzęcego, albo w sposobie diagnozowania.
Przedmiotem wynalazku jest także chimeryczny ligand TIE-2 kodowany przez cząsteczkę kwasu nukleinowego, który to ligand wiąże się z receptorem TIE-2 lecz nie aktywuje receptora TIE-2, a cząsteczka ta zawiera sekwencję nukleotydową kodującą ligand 1 TIE-2, przy czym część sekwencji nukleotydowej kodującej domenę fibrynogeno-podobną liganda 1 TIE-2 zamienia się na sekwencję nukleotydową, która koduje domenę fibrynogeno-podobną liganda 2 TIE-2.
Korzystnie ligand TIE-2, według wynalazku posiada sekwencję przedstawioną na fig. 24, 25, 26 i 27.
Przedmiotem wynalazku jest także wektor, który zawiera cząsteczkę kwasu nukleinowego, która zawiera sekwencję nukleotydową kodującą ligand 1 TIE-2, przy czym część sekwencji nukleotydowej kodującej domenę fibrynogeno-podobną liganda 1 TIE-2 zamienia się na sekwencję nukleotydową, która koduje domenę fibrynogeno-podobną liganda 2 TIE-2.
Korzystnie w wektorze według wynalazku przedmiotowa cząsteczka kwasu nukleinowego jest operacyjnie połączona z kontrolną sekwencją ekspresji zdolną do kierowania jego ekspresją w komórce gospodarza.
Bardziej korzystnie wektor jest plazmidem.
Przedmiotem wynalazku jest także układ gospodarz-wektor do wytwarzania chimerycznego liganda, jak zdefiniowano powyżej, który obejmuje komórkę gospodarza i wektor jak zdefiniowano powyżej.
W korzystnym wykonaniu wynalazku układu gospodarz-wektor, komórką gospodarza może być komórka bakteryjna, drożdżowa, owadzia lub ssacza.
Przedmiotem wynalazku jest także sposób wytwarzania liganda zdefiniowanego powyżej, polegający na tym, ze prowadzi się hodowlę komórek układu gospodarz-wektor w warunkach, pozwalających na wytwarzanie liganda i odzyskiwanie tak wytworzonego liganda. Kolejnym przedmiotem wynalazku jest także przeciwciało, specyficznie wiążące ligand jak zdefiniowano powyżej i który nie wiąże natywnego TIE-2 liganda.
Korzystnie przeciwciało to jest przeciwciałem monoklonalnym.
Przedmiotem wynalazku jest także koniugat, który zawiera chimeryczny ligand TIE-2 i sprzężony z nim czynnik cytotoksyczny. Korzystnie w koniugacie według wynalazku czynnik cytotoksyczny jest radioizotopem lub toksyną.
Przedmiotem wynalazku jest także kompozycja farmaceutyczna zawierająca chimeryczny ligand TIE-2 jak i farmaceutycznie dopuszczalny nośnik.
Przedmiotem wynalazku jest także kompozycja farmaceutyczna, charakteryzująca się tym, że zawiera przeciwciało wiążące specyficznie chimeryczny ligand TIE-2 i farmaceutycznie dopuszczalny nośnik.
Kolejnym przedmiotem wynalazku jest kompozycja farmaceutyczna, charakteryzująca się tym, ze zawiera koniugat chimerycznego ligandu TiE-2 sprzęzonego z czynnikiem cytotoksycznym i farmaceutycznie dopuszczalny nośnik.
Przedmiotem wynalazku jest chimeryczny ligand TIE-2, do zastosowania w sposobie leczenia ciała ludzkiego lub zwierzęcego, albo w sposobie diagnozowania.
189 639
Przedmiotem wynalazku jest przeciwciało specyficznie wiążące się z ligandem chimerycznym TIE-2, a nie wiążące się z natywnym ligandem TEE-2 do stosowania w sposobie leczenia ciała ludzkiego lub zwierzęcego, albo w sposobie diagnozowania.
Przedmiotem wynalazku jest koniugat obejmujący ligand chimeryczny TIE-2 i sprzężony z nim czynnik cytotoksyczny do zastosowania w sposobie leczenia ciała ludzkiego lub zwierzęcego, albo w sposobie diagnozowania.
Zatem kompozycja według wynalazku zawiera chimeryczny ligand-2 TIE, zasadniczo pozbawiony innych białek. W stosowanym tu znaczeniu, modyfikowany ligand TIE-2 odnosi się do rodziny liganda TIE, którą reprezentują opisane tutaj ligandy TL1, TL2, TL3 i TL4, które zmieniono przez addycję, delecję lub substytucję jednego lub więcej aminokwasów, albo przez znaczenie np. częścią Fc ludzkiej IgG-1, lecz które zachowują swą zdolność do wiązania receptora TIE-2. Modyfikowany ligand TIE-2 obejmuje także chimeryczny ligand TIE-2, zawierający co najmniej część pierwszego liganda TIE-2 i część drugiego liganda TIE-2, który różni się od pierwszego. Pierwszy ligand TIE-2 stanowi TL1, a drugi ligand TIE-2 stanowi TL2. Wynalazek uwidacznia inne kombinacje przy użyciu innych członków rodziny liganda TIE-2. Przykładowo, możliwe są inne kombinacje, tworzące chimeryczny ligand TIE-2, włączając kombinacje, w których pierwszy ligand wybiera się z grupy, zawierającej TLI, TL2, TL3 i TL4, a drugi ligand, inny niż pierwszy ligand, wybiera się z grupy, składającej się z TL1, TL2, TL3 i TL4.
Wynalazek dotyczy także wyizolowanej cząsteczki kwasu nukleinowego, kodującego ligand-2 TIE. W jednej postaci realizacji, wyizolowana cząsteczka kwasu nukleinowego koduje ligand TIE-2 z rodziny liganda TIE, którą reprezentują ligandy TL1, TL2, TL3 i TL4, jaki tutaj opisano, które zmieniono przez addycję, delecję lub substytucję jednego lub więcej aminokwasów, albo przez znaczenie np. częścią Fc ludzkiej IgG-1, lecz które zachowują swą zdolność do wiązania receptora TIE-2. W innej postaci realizacji, wyizolowana cząsteczka kwasu nukleinowego koduje modyfikowany ligand TIE-2, który jest chimerycznym ligandem TIE-2, zawierającym, co najmniej jedną część pierwszego liganda TIE-2 i część drugiego liganda TIE-2, który różni się od pierwszego. Pierwszy ligand TIE-2 stanowi TL1, a drugi ligand TIE-2 stanowi TL2. Wynalazek przedstawia też inne kombinacje przy użyciu innych członków rodziny liganda TIE-2. Przykładowo, możliwe są inne kombinacje, tworzące chimeryczny ligand TIE-2, włączając takie w których pierwszy ligand wybiera się z grupy, zawierającej TL1, TL2, TL3 i TL4, a drugi ligand, inny niż pierwszy ligand, wybiera się z grupy, składającej się z TL1, TL2, TL3 i TL4.
Wyizolowanym kwasem nukleinowym może być DNA, cDNA lub RNA. Wynalazek dotyczy też wektora, zawierającego wyizolowaną cząsteczkę kwasu nukleinowego, kodującego modyfikowany ligand-2 TIE. Wynalazek dotyczy tez układu gospodarz-wektor do wytwarzania w odpowiedniej linii komórkowej gospodarza polipeptydu, posiadającego aktywność biologiczną modyfikowanego liganda-2 TIE. Odpowiednią komórką gospodarza może być komórka bakteryjna, drożdżowa, owadzia lub ssacza. Wynalazek dotyczy także sposobu wytwarzania polipeptydu, posiadającego aktywność biologiczną modyfikowanego liganda-2 TIE, który obejmuje hodowlę komórek układu gospodarza-wektor w warunkach, pozwalających na wytwarzanie polipeptydu i odzyskiwanie tak wytworzonego polipeptydu.
Wynalazek dotyczący wyizolowanej cząsteczki kwasu nukleinowego, kodującego modyfikowany ligand-2 TIE, przewiduje dalej wykorzystanie tego liganda, jako środka terapeutycznego do leczenia pacjentów, cierpiących z powodu schorzeń związanych z komórkami, tkankami lub narządami, wykazującymi ekspresję receptora TIE-2.
Niniejszy wynalazek dotyczy tez przeciwciała, które specyficznie wiąże taką cząsteczkę terapeutyczną. Przeciwciało może być monoklonalne lub poliklonalne. Wynalazek przewiduje także sposób zastosowania takiego przeciwciała monoklonalnego lub poliklonalnego do pomiaru ilości cząsteczki terapeutycznej w próbce pobranej od pacjenta, w celu monitoringu przebiegu terapii.
Niniejszy wynalazek dostarcza przeciwciało, które specyficznie wiąże modyfikowany ligand-2 TIE. Przeciwciało może być monoklonalne lub poliklonalne. Tak więc wynalazek dostarcza kompozycje terapeutyczne, obejmujące przeciwciało, które specyficznie wiąże
189 639 modyfikowany ligand-2 TIE w farmaeęutyeznie dopuszczalnym nośniku. Wyoalαz.ęk dostarcza też sposób blokowńoia wzrostu naczyń krwionośnych u ssaków przez padanię skutecznej ilości kompozycji terapeutycznej, zawierającej przeciwciało, które specyficznie wiąże modyfikowany ligand-2 TIE jaki opisano w niniejszym wynalazku farmaceutycznie dopuszczalnym nośniku.
Wyoalezęk dostarcza też kompozycje terapeutyczne, obejmujące modyfikowany liganS-2 TIE jaki opisano w niniejszym wynalazku, w farmaceutycznie dopuszczalnym nośniku. Wynalazek dostarcza sposób pobudzania nawo-uoaczynięoia u pacjenta, przez podanie skutecznej ilości kompozycji terapeutycznej, obejmującej modyfikowany ligand- TIE jaki opisano w niniejszym wynalazku, w farmacęutycznię dopuszczalnym nośniku. W jednej postaci realizacji, sposób można stosować do pobudzania gajęnia dranienia. W innej postaci realizacji sposób można stosować do lęezęnia niedokrwienić!. W jeszcze innej postaci realizacji modyfikowany ligand-2 TIE aktywujący receptor stosuje się, pojedynczo lub w połączeniu z innymi czynnikami krwiotwórczymi, do pobudzania proliferacji lub różnieoweoia krwiotwórczych komórek macierzystych, komórek B lub komórek męgakariocytawyeh.
Modyfikowany ligand-2 TIE można sprzęgać ze środkiem toksycznym i kompozycją terapeutyedoą z niego utworzoną.
Krótki opis rysunków
Figura 1A i IB - ciałko receptorowe (TIE-2 RB) hamuje rozwój naczyń krwionośnych w błonie kosmówki omoczniowej zarodka kurzego (CAM). Pojedynczy kawałek absorpcyjnej pianki żelatynowej (Ge^oam) nasyconej 6 pg RB wprowadzono bezpośrednio pod CAM 1-dniowych zarodków kurzych. Po 3 dodatkowych dniach inkubacji, 4-dniowę zarodki i otaczającą CAM usunięto i zbadano. Figura 1A: zarodki traktowane EHK-1 RB (rEHK-1 ekto/hlgGl Fc) były zdolne do życia i posiadały normalnie rozwinięte naczynia krwionośne w otaczającej CAM. Figura IB: wszystkie zarodki traktowane TIE-2 RB (r TIE-2 ekto/h IgGl Fc) padły, miały mniejsze rozmiary i były prawie zupełnie pozbawione otaczających naczyń krwionośnych.
Figura 2 - Wektor pJFE14.
Figura 3 - Mapa restrykcyjna Agtl0.
Figura 4 - Sekwencje kwasu nukleinowego i wnioskowana aminokwasawa (kod pojedynczych liter) ludzkiego liganda 1 TIE-2 z klonu I.gtlO, kodującego ligand 1 htie-2.
Figura 5 - Sekwencje kwasu nukleinowego i wnioskowana aminokwasawa (kod pojedynezych liter) ludzkiego ligńoda 1 TIE-2 z klonu T98G.
Figura 6 - Sekwencje kwasu nukleinowego i wnioskowana aminakwαsawa (kod pojedynczych liter) ludzkiego liganda 1.
TIE-2 z klonu pBluescript KS, kodującego ludzki ligand 2 TIE-2.
Figura 7 - Western biot, ukazujący aktywację receptora TIE-2 przez ligand 1 TIE-2 (tor LI) lecz nie przez ligand 2 TIE-2 (tor L2) lub kontrolę (Mock).
Figura 8 - Western biot, ukazujący, że wcześniejsze traktowanie komórek HAEC nadmiarem liganda 2 TIE-2 (tor 2) αntagaoizuję późniejszą zdolność rozcieńczonego liganda 1 TIE-2 do aktywacji receptora TIE-2 (TIE2-R), w parównaoiu z wcześniejszym traktowaniem komórek HAEC pożywką MOCK (tor 1).
Figura 9 - Western biot, pokazujący zdolność TL2 do kompetytywnej inhibicji aktywacji TL1 receptora TIE-2, przy użyciu ludzkiej linii komórek hybrydowych, EA.hy926.
Figura 10 - Reprezentacyjny histogram wiązania ze szczurzą IgG TIE-2 unieruchomioną powierzchniowo przez ligand TIE-2 w zatędanej (10x) kondyejanawanej pożywce ras C2C12, ras Rat2, SHEP oraz T98G Specyficzne wiązanie szczerzego TIE-2 (rTIE2) pokazuje się przez doecdącą redukcję aktywności wiązania w obecności 25 jig/ml rozpuszczalnego TIE-2 RB w porównaniu z mniejszą redukcją w obecności rozpuszczalnego trkB RB.
Figura 11 - Wiązanie rekambinowanega ludzkiego liganda 1 TIE-2 (hTLl) i ludzkiego liganda 2 TIE-2 (hTL2) w supęraotαncię komórek COS, z ludzkim ciałkiem recę'ptarowym (RB) TIE-2 unięruchomiaoym powierzchniowo. Specyficzne wiązanie TIE-2 określono przez inkubację próbek z 25 Jg/ml albo rozpuszczalnego ludzkiego TIE-2 RB albo trkB RB; istotną redukcję aktywności wiązania obserwowano tylko dla próbek iokubowanyeh z ludzkim TIE-2 RB.
189 639
Figura 12 - Western blot, ukazujący, że ciałko receptorowe TIE-2 (oznaczone TIE-2 RB albo, jak tutaj, TIE2-Fc) blokuje aktywację receptorów TIE-2 przez ligand 1 TIE-2 (TL1) w komórkach HUVEC, podczas gdy niespokrewnione ciałko receptorowe (TRKB-Fc) nie blokuje tej aktywacji.
Figura 13 - Żele agarozowe, ukazujące seryjne rozcieńczenia [nierozcieńczony (1) do 10'4] produktów RT-PCR TL1 i TL2 uzyskane z mysiej wątroby płodowej E14.5 (tory 1
- całość, tory 3 - wzbogacone w zrąb, oraz tory 4 krwiotwórcze komórki prekursorowe c-kit+TER119) oraz mysiej grasicy płodowej E14.5 (tory 2 - całość).
Figura 14 - Żele agarozowe, ukazujące seryjne rozcieńczenia [nierozcieńczony (1) do 10ή produktów RT-PCR TL1 i TL2 uzyskane z mysich komórek zrębu kory grasicy (tory 1
- CDR1+/A2B5-) i komórek zrębu rdzenia (tor CDR-/A2B5+).
Figura 15 - Schematyczne przedstawienie hipotetycznej roli ligandów TIE-2/TIE w angiogenezie. TL1 pokazano jako (·), TL2 pokazano jako (*), TIE-2 przedstawiono jako (T), VEGF pokazano jako ([]), a flk-1 (receptor VEGF) pokazano jako (Y).
Figura 16 - Płytki hybrydyzacji in situ, ukazujące wzór czasowej ekspresji TIE-2, TL1, TL2 oraz VGEF podczas angiogenezy związanej z rozwojem pęcherzyka jajnikowego i tworzeniem się ciałka żółtego w jajniku szczura, traktowanego surowicą ciężarnej klaczy. Kolumna 1: wczesny pęcherzyk przedowulacyjny; kolumna 2: pęcherzyk przedowulacyjny; kolumna 3: wczesne ciałko żółte; i kolumna 4: zarośnięty pęcherzyk; rząd A: pole jasne; rząd B: VEGF; rząd C: TL2; rząd D: TL1 i rząd E: receptor TIE-2.
Figura 17 - Porównanie sekwencji aminokwasowej dojrzałego białka TL1 i dojrzałego białka TL2. Sekwencja TL1 jest taka sama jak przedłożona w fig. 4 z takim wyjątkiem, że przypuszczalna sekwencja liderowa została usunięta. Podobnie, sekwencja TL2 jest taka sama jak przedłożona w fig. 6 z takim wyjątkiem, że przypuszczalna sekwencja liderowa została usunięta. Strzałki wskazują reszty ARG49, Cys245 i ARG264 TL1, które odpowiadają resztom w pozycjach aminokwasów, odpowiednio 69, 265 i 284 TL1 jak przedłożono w fig. 4.
Figura 18 - Western blot kowalentnej struktury multimerycznej TL1 i TL2 (tablica A) i przemiany wewnętrznej TL1 i TL2 przez mutację jednej cysteiny (tablica B).
Figura 19 - Typowa krzywa wiązania TIE-2-IgG z unieruchonionym TL1 w ilościowym teście wiązania z wolnymi komórkami.
Figura 20 - Typowa krzywa, ukazująca ciałko ligandowe liganda 1 TIE-2, zawierające domenę podobną do fibrynogenu liganda związanego z domeną Fc IgG (TL1-fFc), wiążącego się z unieruchomioną ektodomeną TIE-2 w ilościowym teście wiązania z wolnymi komórkami.
Figura 21 - Sekwencja nukleotydowa i wnioskowana aminokwasowa (kod pojedynczych liter) liganda-3 TIE. Sekwencja kodująca rozpoczyna się w pozycji 47. Domena podobna do fibrynogenu rozpoczyna się w pozycji 929.
Figura 22 - Porównanie sekwencji aminokwasowych członków rodziny liganda TIE. mTL3 = mysi ligand-3 TIE; hTL1 = ludzki ligand 1 TIE-2; chTL1 = kurzy ligand 1 TIE-2; mTL1 = mysi ligand 1 TIE-2; mTL2 = mysi ligand 2 TIE-2; hTL2 = ludzki ligand 2 TIE-2. Regiony obramowane wskazują zakonserwowane regiony homologii wśród członków rodziny.
Figura 23 - Sekwencje nukleotydową i wnioskowana aminokwasowa (kod pojedynczych liter) liganda-4 TIE. Strzałka wskazuje pozycję nukleotydową 569.
Figura 24 - Sekwencje nukleotydową i wnioskowana aminokwasowa (kod pojedynczych liter) chimerycznego liganda TIE oznaczonego 1N1C2F (chimera 1). Przypuszczalna sekwencja liderowa kodowana jest przez nukleotydy 1-60.
Figura 25 - Sekwencje nukleotydową i wnioskowana aminokwasowa (kod pojedynczych liter) chimerycznego liganda TIE oznaczonego 2N2C1F (chimera 2). Przypuszczalna sekwencja liderowa kodowana jest przez nukleotydy 1-48.
Figura 26 - Sekwencje nukleotydową i wnioskowana aminokwasowa (kod pojedynczych liter) chimerycznego liganda TIE oznaczonego 1N2C2F (chimera 3). Przypuszczalna sekwencja liderowa kodowana jest przez nukleotydy 1-60.
Figura 27 - Sekwencje nukleotydową i wnioskowana aminokwasowa (kod pojedynczych liter) chimerycznego liganda TIE oznaczonego 2N1C1F (chimera 4). Przypuszczalna sekwencja liderowa kodowana jest przez nukleotydy 1-48.
189 639
Szczegółowy opis wynalazku
Jak opisano poniżej bardziej szczegółowo, zgłaszający utworzyli nowe modyfikowane ligandy TIE-2, które wiążą receptor TIE-2. Niniejszy wynalazek dostarcza kompozycję, obejmującą modyfikowany ligand TIE-2 pozbawiony innych białek. W stosowanym tu znaczeniu, modyfikowany ligand TEE-2 odnosi się do liganda z rodziny liganda TIE, którą reprezentują ligandy TL1, TL2, TL3 i TL4, które zmieniono przez addycję, delecję lub substytucję jednego lub więcej aminokwasów, albo przez znaczenie np. częścią Fc ludzkiej IgG-1, lecz które zachowują swą zdolność do wiązania receptora TIE-2. Modyfikowany ligand TIE-2 obejmuje także chimeryczny ligand TIE-2, zawierający co najmniej jedną część pierwszego liganda TIE-2 i część drugiego liganda TIE-2, który różni się od pierwszego. Pierwszy ligand TIE-2 jest TL1, a drugi ligand TIE-2 jest TL2. Możliwe też są inne kombinacje przy użyciu innych członków rodziny liganda TIE-2. Przykładowo, możliwe są inne kombinacje, tworzące chimeryczny ligand TIE-2, włączając kombinacje, w których pierwszy ligand wybiera się z grupy, zawierającej TL1, TL2, TL3 i TL4, a dnigi ligand, inny niż pierwszy ligand, wybiera się z grupy, składającej się z TL1, TL2, TL3 i TL4.
Wynalazek dostarcza także wyizolowaną częsteczkę kwasu nukleinowego, kodującą modyfikowany ligand TIE-2. W jednej postaci realizacji wynalazku wyizolowana cząsteczka kwasu nukleinowego koduje ligand TIE-2 z rodziny liganda TIE, którą reprezentują ligandy TL1, TL2, TL3 i TL4, które zmieniono przez addycję, delecję lub substytucję jednego lub więcej aminokwasów, albo przez znaczenie np. częścią Fc ludzkiej IgG-1, lecz które zachowują swą zdolność do wiązania receptora TIE-2. Wyizolowana cząsteczka kwasu nukleinowego koduje też modyfikowany ligand TIE-2, który jest chimerycznym ligandem TIE-2, zawierającym co najmniej jedną część pierwszego liganda TIE-2 i część drugiego liganda TIE-2, który różni się od pierwszego. Pierwszy ligand TIE-2 jest TL1, a drugi ligand TIE-2 jest TL2. Możliwe są także inne kombinacje przy użyciu innych członków rodziny liganda TIE-2, tworzące chimeryczny ligand TIE-2, włączając kombinacje, w których pierwszy ligand wybiera się z grupy, zawierającej TL1, TL2, TL3 i TL4, a drugi ligand, inny niż pierwszy ligand, wybiera się z grupy, składającej się z TL1, TL2, TL3 i TL4.
Niniejszy wynalazek obejmuje modyfikowane ligandy TIE-2 i ich sekwencje aminokwasowe, jak również ich funkcjonalne równoważne odmiany, a także białka lub peptydy, zawierające mutanty substytucyjne, delecyjne lub insercyjne opisanych sekwencji, które wiążą receptor TEE-2 i działają jako ich agoniści albo antagoniści. Takie odmiany obejmują te, w których reszty aminokwasowe podstawia się resztami w sekwencji, dającymi ciche zmiany. Przykładowo, jedną lub więcej reszt aminokwasowych w sekwencji można podstawić innym aminokwasem(ami) o podobnej polamości, działającym jako funkcjonalny równoważnik, dając cichą zmianę. Podstawniki dla aminokwasów w sekwencji można wybrać spośród innych członków klasy, do której należy aminokwas. Przykładowo klasa aminokwasów niepolamych (hydrofobowych) obejmuje alaninę, leucynę, izoleucynę, walinę, prolinę, fenyloalaninę, tryptofan i metioninę. Aminokwasami polarnymi obojętnymi są glicyna, seryna, treonina, cysteina, tyrozyna, asparagina i glutamina. Aminokwasami naładowanymi dodatnio (zasadowymi) są arginina, lizyna i histydyna. Ujemnie naładowane (kwasowe) aminokwasy to kwas asparaginowy i kwas glutaminowy.
Możliwe są też białka lub ich fragmenty albo pochodne, które wykazują taką samą lub podobną aktywność biologiczną jak opisany niniejszym modyfikowany ligand TIE-2, oraz pochodne różnie zmodyfikowane podczas, lub po translacji, np. przez glikozylację, rozszczepienie proteolityczne, połączenie z cząsteczką przeciwciała lub innym ligandem komórkowym, itd. Cząsteczki funkcjonalnie równoważne obejmują także cząsteczki, zawierające modyfikacje, łącznie z modyfikacjami N-terminalnymi, wynikającymi z ekspresji u poszczególnych rekombinowanych gospodarzy, tak jak np. metylacja N-terminalna, która występuje w pewnych bakteryjnych układach ekspresji (np. E coli). Niniejszy wynalazek opisuje także sekwencję nukleotydową, która koduje białka niniejszym opisane, jako modyfikowane ligandy TIE-2, a także komórki gospodarza, łącznie z drożdżami, bakteriami, wirusami i komórkami ssaków, poddanych zabiegom inżynierii genetycznej, w celu wytworzenia białka, np. przez transfekcję, transdukcję, infekcję elektroporację albo mikroinjekcję kwasu nukleinowego,
189 639 kodującego opisane niniejszym ligandy TIE-2, w odpowiednim wektorze ekspresji. Kwas nukleinowy kodującego modyfikowane ligandy TIE-2 można stosować w technikach terapii genowej, tak jak opisano np. u Finkela i Epsteina FASEB J. 9: 843-851 (1995); Guzmana i in.,
PNAS (USA) 91: 10732-10936 (1994).
Istnieją też sekwencje DNA i RNA, które hybrydyzują z sekwencją nukleotydową, kodującą modyfikowany ligand TIE-2, w warunkach średnio surowych, jakie określono np. u Sambrooka i in., Molecular Cloning: A Laboratory Manuał, 2 wyd. tom 1, strony 101-104, Cold Spring Harbor Laboratory Press (1989). Tak więc, cząsteczką kwasu nukleinowego rozważaną w niniejszym wynalazku jest taka, która posiada sekwencję nukleotydową wnioskowaną z sekwencji aminokwasowej modyfikowanego liganda TIE-2 wytworzonego zgodnie z niniejszym opisem, jak również cząsteczką, posiadającą sekwencję nukleotydów, hybrydyzującą z taką sekwencją nukleotydową, a także sekwencję nukleotydową, która jest zregenerowana w stosunku do powyższych sekwencji z powodu kodu genetycznego, lecz która koduje ligand, wiążący receptor TIE-2 i mający sekwencję aminokwasową oraz inne cechy pierwszorzędowe, drugorzędowe i trzeciorzędowe, będące wystarczającą kopią opisanego niniejszym modyfikowanego liganda TIE-2, aby nadać cząsteczce taką samą aktywność biologiczną jak opisany niniejszym modyfikowany ligand TIE-2.
Niniejszy wynalazek dostarcza wyizolowaną cząsteczkę kwasu nukleinowego, kodującą modyfikowany ligand TIE-2, który wiąże i aktywuje receptor TIE-2, obejmującą sekwencje nukleotydową, kodującą ligand 1 TIE-2, w którym część sekwencji nukleotydowej, kodującej domenę N-terminalną liganda 1 TIE-2 zamienia się na sekwencję nukleotydową, kodującą domenę N-terminalną liganda 2 TIE-2. Wynalazek przewiduje także taką cząsteczkę kwasu nukleinowego, z dodatkową modyfikacją taką, ze część sekwencji nukleotydowej, która koduje domenę zwiniętej spirali liganda 1 TIE-2 zamienia się na sekwencję nukleotydową, która koduje domenę zwiniętej spirali liganda 2 TIE-2.
Niniejszy wynalazek dostarcza także wyizolowaną cząsteczkę kwasu nukleinowego, kodującą modyfikowany ligand TIT-2, który wiąże i aktywuje receptor TIE-2, obejmującą sekwencję nukleotydową, kodującą ligand 1 TIE-2, w której część sekwencji nukleotydowej, która koduje N-terminalną domenę liganda 1 TIE-2 zamienia się na sekwencję nukleotydową, która koduje N-terminalną domenę liganda 2 TIE-2 i którą dalej modyfikuje się tak, aby kodowała inny aminokwas zamiast reszty cysteinowej, kodowanej przez nukleotydy 784-787 jak przedłozono w fig. 27. Zamiast reszty cysteinowej podstawia się korzystnie resztę serynową. W innej postaci realizacji, cząsteczkę kwasu nukleinowego modyfikuje się dodatkowo tak, aby kodowała inny aminokwas zamias reszty argininowej kodowanej przez nukleotydy 199-201 jak przedłozono w fig. 27. Zamiast reszty argininowej podstawia się korzystnie resztę serynową.
Niniejszy wynalazek przewiduje także wyizolowaną cząsteczkę kwasu nukleinowego, kodującą modyfikowany ligand TIE-2, który wiąże i aktywuje receptor TIE-2, obejmującą sekwencje nukleotydową, kodującą ligand 1 TIE-2, którą modyfikuje się tak, aby kodowała inny aminokwas zamiast reszty cysteinowej w pozycji aminokwasu 245. Korzystnie, zamiast reszty cysteinowej podstawia się resztę serynową.
Wynalazek dostarcza wyizolowaną cząsteczkę kwasu nukleinowego, kodującą modyfikowany ligand TIE-2, który wiąże lecz nie aktywuje receptora TIE-2, obejmującą sekwencję nukleotydową, kodującą ligand 1 TIE-2, w której usuwa się cześć sekwencji nukleotydowej, która koduje N-terminalną domenę liganda 1 TIE-2. Wynalazek przewiduje także taką cząsteczkę kwasu nukleinowego, modyfikowaną dodatkowo tak, że część sekwencji nukleotydowe, która koduje domenę zwiniętej spirali liganda 1 TIE-2 usuwa się i część, kodującą domenę podobną do fibrynogenu łączy się w ramce z sekwencją nukleotydową, kodującą stały region ludzkiej immunoglobuliny gamma-1 (IgGl Fc).
Wynalazek dostarcza wyizolowaną cząsteczkę kwasu nukleinowego, kodującą modyfikowany ligand TIE-2, który wiąże lecz nie aktywuje receptora TIE-2, obejmującą sekwencję nukleotydową, kodującą ligand 2 TIE-2, w której usuwa się część sekwencji nukleotydowej, która koduje N-terminalną domenę liganda 2 TIE-2. Wynalazek przewiduje także taką cząsteczkę kwasu nukleinowego, modyfikowaną dodatkowo tak, ze część sekwencji nukleotydowej,
189 639 która koduje domenę zwiniętej spirali liganda 2 TIE-2 usuwa się i część, kodującą domenę podobną do fibrynogenu łączy się w ramce z sekwencją nukleotydową, kodującą stały region ludzkiej immunoglobuliny gamma-1 (IgG1 Fc).
Wynalazek dostarcza wyizolowaną cząsteczkę kwasu nukleinowego, kodującą modyfikowany ligand TIE-2, który wiąże lecz nie aktywuje receptora TIE-2, obejmującą sekwencje nukleotydową, kodującą ligand 1 TIE-2, w której część sekwencji nukleotydowej, która koduje domenę podobną do fibrynogenu liganda 1 TIE-2 zamienia się na sekwencję nukleotydową, która koduje domenę podobną do fibrynogenu liganda 2 TIE-2. Wynalazek przewiduje także taką częsteczkę kwasu nukleinowego dodatkowo modyfikowaną tak, ze część sekwencji nukleotydowej, która koduje domenę zwiniętej spirali liganda 1 TIE-2 zamienia się na sekwencję nukleotydową, która koduje domenę zwiniętej spirali liganda 2 TIE-2.
Wynalazek dostarcza dalej modyfikowany ligand TIE-2 kodowany przez każdą z cząsteczek kwasu nukleinowego według wynalazku.
Niniejszy wynalazek dostarcza także chimeryczny ligand TIE-2, obejmujący co najmniej część pierwszego liganda TIE-2 i część drugiego liganda TIE-2, który jest inny niż pierwszy, w którym pierwszy i drugi ligand TIE-2 wybiera się z grupy, składającej się z liganda-1 TIE-2, liganda-2 TIE-2, liganda-3 TIE i liganda-4 TIE. Korzystnie, chimeryczny ligand TIE obejmuje, co najmniej część liganda-1 TIE-2 i część liganda-2 TIE-2.
Wynalazek dostarcza także cząsteczkę kwasu nukleinowego, która koduje chimeryczny ligand TIE jak przedłożono w fig. 24, 25, 26 lub 27. Wynalazek dostarcza także chimeryczny ligand TIE jaki przedstawiono w fig. 27, modyfikowany tak, że posiada inny aminokwas zamiast reszty cysteinowej kodowanej przez nukleotydy 784-787.
Do konstrukcji wektorów ekspresji, kodujących modyfikowany ligand TIE-2 można zastosować każdą metodę znaną fachowcowi pod względem wprowadzania fragmentów DNA do wektora, przy użyciu odpowiednich sygnałów kontrolnych transkrypcji/translacji i sekwencji kodujących białko. Metody te mogą obejmować rekombinację DNa in vitro oraz techniki syntezy, a także rekombinacje in vivo (rekombinacje genetyczne). Ekspresję sekwencji kwasu nukleinowego, kodującej modyfikowany ligand TIE-2 lub jego fragmenty peptydowe, można regulować przez drugą sekwencję kwasu nukleinowego, operacyjnie połączoną z sekwencją kodującą modyfikowany ligand TlE-2, tak, że białko lub peptyd modyfikowanego liganda TIE-2 podlega ekspresji w gospodarzu transformowanym rekombinowaną cząsteczką DNA. Przykładowo, ekspresję modyfikowanego liganda TIE-2 można kontrolować każdym elementem promotor/wzmacniacz znanym w technice. Promotory, których można użyć do kontroli ekspresji liganda obejmują, lecz bez ograniczenia, długie powtórzenie terminalne jaki opisano u Squinto i in., (Cell, 65: 1-20 (1991)); wczesny region promotorowy SV40 (Bemoist i Chambon, Nature, 290: 304-310), promotor CMV, powtórzenie 5' terminalne M-MuLV, promotor zawarty w długim powtórzeniu 3' terminalnym wirusa mięsaka Rousa (Yamamoto i in., Cell 22: 787-797 (1980)), promotor kinazy tymidynowej opryszczki (Wagner i in., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 78: 144-1445 (1981), promotor adenowirusa, sekwencje regulatorowe genu metalotioneiny (Brinster i in., Nature 296: 39-42 (1982)); prokariotyczne wektory ekspresji, takie jak promotor β-laktamazy (Vina-Kamaroff i in., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 75: 3727-3731 (1978)), lub promotor tac (DeBoer i in., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 80: 21-25 (1983)), patrz także „Useful proteins fom recombinant bacteria” w Scientific American, 242: 74-94 (1980); elementy promotorowe drożdży lub innych grzybów, tak jak promotor Gal 4, promotor aDh (dehydrogenazy alkoholowej), promotor PGK (kinazy fosfoglicerolowej), promotor fosfatazy alkalicznej oraz następujące zwierzęce regiony kontrolne transkrypcji, które wykazują specyficzność tkankową i wykorzystywane w zwierzętach transgenicznych; region kontrolny elastazy I, który jest aktywny w komórkach groniastych trzustki (Swift i in., Cell 38: 639-646 (1984); Omitz i in., Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 50: 399-409 (1986); MacDonald, Hepatology 7: 425-515 (1987); region kontrolny genu insuliny, aktywny w komórkach beta trzustki [Hanahan, Nature 315: 115-122 (1985)]; region kontrolny genu immunoglobuliny, aktywny w komórkach limfoidalnych (Grosschedl i in., 1984, Cell 38: 647-658; Adames i in., 1985, Nature 318: 533-538; Alexander i in., 1987, Mol. Cell. Biol. 7: 1436-1444), wirusowy region kontrolny guza sutka myszy, aktywny w komórkach jądrowych,
189 639 piersi, limfoidalnych i tucznych (Leder i in., 1986, Celi 45: 485-495), region kontrolny albuminy, aktywny w wątrobie (Pinkert i in., 1987, Genes and Devel. 1: 268-276), region kontrolny genu alfa-fetoproteiny, aktywny w wątrobie (Krumlauf i in., 1985, Mol. Celi. Biol. 5:1639-1648; Hammer i in., 1987, Science 235: 53-58); region kontrolny genu alfa 1-antytrypsyny, aktywny w wątrobie (Kelsey i in., 1987, Genes and Devel. 1: 161-171), region kontrolny genu beta-globiny, aktywny w komórkach szpikowych (Mongram i in., 1985, Naturę 315: 338-340; Kollias i in., 1986, Celi 46: 89-94); region kontrolny genu białka podstawowego mieliny, aktywny w oligodendrocytach w mózgu (Readhead i in., 1987, Celi 48: 703-712), region kontrolny genu lekkiego łańcucha 2 miozyny, aktywny w mięśniach szkieletowych (Shani, 1985, Naturę 314: 283-286), oraz region kontrolny genu gonadotropowego hormonu uwalniającego, aktywny w podwzgórzu (Mason i in., 1986, Science 234: 1372-1378). Wynalazek obejmuje dalej wytwarzanie związków antysensownych, zdolnych do specyficznej hybrydyzacji z sekwencją RNA, kodującą modyfikowany ligand TIE-2, w celu modulacji ekspresji. Ecker, opis patentowy U.S. nr 5 166 195, opublikowany 24 listopada 1992.
Tak więc, zgodnie z wynalazkiem, opisane wektory ekspresji zdolne do powielania u gospodarzy bakteryjnych lub eukariotycznych, obejmujące kwas nukleinowy, kodujący opisany w niniejszym modyfikowany ligand TIE-2, stosuje się do transfekcji gospodarza i przez to do kierowania ekspresją takiego kwasu nukleinowego, w celu wytworzenia modyfikowanego liganda TIE-2, które można potem odzyskiwać w postaci aktywnej biologicznie. Postać biologicznie aktywna obejmuje postać zdolną do wiązania receptora TIE i powodowania odpowiedzi biologicznej, takiej jak zróżnicowane działanie lub wpływanie na fenotyp komórki, wykazującej ekspresję receptora. Takie postacie aktywne biologicznie mogłyby, np. indukować fosforylację domeny kinazy tyrozynowej receptora TIE. Alternatywnie, aktywność biologiczna może być takim efektem, jak antagonistyczny wobec receptora TIE. W alternatywnych postaciach realizacji, postacią aktywną modyfikowanego liganda TIE-2 jest taka, która rozpoznaje receptor TIE i działa przez to jak czynnik kierujący wobec receptora, do użytku zarówno w diagnostyce jak i leczeniu. Zgodnie z takimi postaciami realizacji, postać aktywna nie musi nadawać żadnej zmiany w fenotypie w jakiejkolwiek komórce, wykazującej ekspresję TIE.
Wektory ekspresji, zawierające inserty genowe można identyfikować w czterech generalnych podejściach: (a) hybrydyzacji DNA-DNA, (b) obecności lub nieobecności funkcji genu „markerowego”, (c) ekspresji wtrąconych sekwencji oraz (d) detekcji PGR. W pierwszym podejściu, obecność obcego genu wprowadzonego do wektora ekspresji, można wykrywać przez hybrydyzację DNA-DNA, przy użyciu sond, zawierających sekwencje homologiczne z wprowadzonym genem, kodującym modyfikowany ligand TIE-2. W podejściu drugim, rekombinowany układ wektor/gospodarz można identyfikować i poddawać selekcji przy obecności lub nieobecności pewnych funkcji genu „markerowego” (np. aktywności kinazy tymidynowej, odporności na antybiotyki, fenotypu transformacji, tworzenia się ciał okluzyjnych w bakulowirusie, itd.) powodowanych przez wprowadzenie do wektora obcych genów. Przykładowo, jeśli kwas nukleinowy, kodujący modyfikowany ligand TIE-2 wprowadza się do sekwencji genu markerowego wektora, rekombinanty, zawierające insert można identyfikować przez nieobecność funkcji genu markerowego. W trzecim podejściu, rekombinowane wektory ekspresji można identyfikować przez testowanie produktu obcego genu podlegającego ekspresji w rekombinancie. Takie testy można oprzeć np. o właściwości fizyczne lub funkcjonalne produktu genowego modyfikowanego liganda TIE-2, np. przez wiązanie liganda z receptorem TIE lub jego częścią, którą można oznakować, np. za pomocą wykrywalnego przeciwciała lub jego części albo przez wiązanie przeciwciał wytworzonych przeciw białku modyfikowanego liganda TIE-2 lub ich części. Komórki według niniejszego wynalazku mogą krótkotrwale, albo korzystnie konstytutywnie i w sposób stały, wykazywać ekspresję modyfikowanego liganda TIE-2, jak opisano niniejszym. W czwartym podejściu, można wytworzyć primery nukleotydowe DNA, odpowiadające sekwencji DNA specyficznej wobec tie. Primery te moznaby potem używać do PGR fragmentu genu tie. (PGR Protocols: A Guide To Methods and Applications, wydane przez Michael A. Innis i in., Academic Press (1990)).
189 639
Rekombinowany ligand można oczyszczać każdą techniką, która pozwala na późniejsze utworzenie stabilnego aktywnego biologicznie białka. Korzystnie, ligand wydziela się do środowiska hodowli, z którego jest odzyskiwany. Alternatywnie, ligand można odzyskać z komórek, albo w postaci rozpuszczalnych białek, albo w postaci ciałek inkluzyjnych, z których można go ekstrahować ilościowo z użyciem 8 M chlorowodorku guanidyny i dializować zgodnie z dobrze znaną metodologią. W celu dalszego oczyszczenia liganda, można stosować chromatografię powinowactwa, konwencjonalną chromatografię jono-wymienną, chromatografię interakcji hydrofobowej, chromatografię z odwrotną fazą lub filtrację żelową.
W innych postaciach realizacji wynalazku, co opisano bardziej szczegółowo w przykładach, do inaktywacji lub „znokautowania” endogenicznego genu przez rekombinację homologiczną, można użyć rekombinowanego genu, kodującego modyfikowany ligand TIE-2, i utworzyć przez to komórkę, nie posiadającą modyfikowanego liganda TIE-2, tkankę lub zwierzę. Przykładowo, można skonstruować gen, kodujący rekombinowany ligand-4 TIE, tak aby zawierał mutację przez insercję, np. genu neo, który inaktywowałby natywny gen, kodujący modyfikowany ligand-4 TIE. Taką, konstrukcję, pod kontrolą odpowiedniego promotora, można wprowadzić do komórki, takiej jak komórka macierzysta zarodka, techniką taką jak transfekcja, transdukcja lub injekcja. Komórki, zawierające konstrukcję, można potem poddać selekcji przez odporność wobec G418. Komórki, nie posiadające nieuszkodzonego genu, kodującego ligand-4 TIE można następnie identyfikować np. przez Southern blotting, detekcję PCR, Nothem blotting lub test ekspresji. Komórki, nie posiadające nieuszkodzonego genu, kodującego ligand-4 TIE można następnie poddać fuzji z wczesnymi komórkami zarodkowymi, aby wytworzyć zwierzęta transgeniczne z niedoborem takiego liganda. Takiego zwierzęcia można użyć do określenia specyficznych procesów in vivo, normalnie uzależnionych od liganda.
Niniejszy wynalazek zapewnia także przeciwciała wobec opisanego w niniejszym modyfikowanego liganda TIE-2, które są użyteczne do detekcji liganda, np. w zastosowaniach diagnostycznych. Do wytworzenia przeciwciał monoklonalnych w kierunku modyfikowanego liganda TIE-2, można stosować każdą technikę, przewidującą wytwarzanie cząsteczek przeciwciał przez ciągłe linie komórkowe w hodowli. Przykładowo, technika hybrydomy, wykorzystana początkowo przez Kohlera i Mlleteina (1975, Naturę 256:495-497), jak również technika triomy, technika hybrydomy ludzkiej komórki B (Kozbor i in., 1983, Immunology Today 4: 72), oraz technika EBV-hybrydomy, do wytwarzania ludzkich przeciwciał monoklonalnych (Cole i in., 1985, w „Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy” Alan R. Liss, Inc. strony 77-96) i inne, wchodzą w zakres niniejszego wynalazku.
Przeciwciała monoklonalne mogą być ludzkimi przeciwciałami monoklonalnymi lub chimerycznymi ludzko-mysimi (lub innych gatunków) przeciwciałami monoklonalnymi. Ludzkie przeciwciała monoklonalne można wytworzyć każdą z licznych technik znanych w tej dziedzinie (np. Teng i in., 1983, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 80: 7308-7312; Kozbor i in., Immunology Today 4: 72-79; Olsson i in., 1982, Meth. Enzymol. 92: 3-16). Można wytworzyć cząsteczki przeciwciała chimerycznego, zawierające mysią domenę, wiążącą antygen, z ludzkim regionem stałym (Morrison i in., 1984, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81: 6851; Takeda i in., 1985, Naturę 314: 452).
Można stosować różne procedury znane w tej dziedzinie do wytwarzania przeciwciał poliklonalnych wobec epitopów modyfikowanego liganda TIE-2 opisanego w niniejszym. Do wytwarzania przeciwciała, różne zwierzęta żywicielskie, włączając, lecz bez ograniczenia króliki, myszy i szczury, można immunizować przez injekcję modyfikowanego liganda TIE-2 albo ich fragmentu lub pochodnej. Można stosować różne adjuwanty do zwiększenia odpowiedzi immunologicznej, w zależności od gatunku gospodarza, włączając lecz bez ograniczenia Freunda (kompletne i niekompletne), żele mineralne takie jak wodorotlenek glinu, substancje powierzchniowo czynne, takie jak lizolecytyna, poliole pluronowe, polianiony, peptydy, emulsje olejowe, hemocyjaniny doświadczalnego zapalenia stawów, dinitrofenol i potencjalnie użyteczne ludzkie adjuwanty, takie jak BCG (Bacille Calmette-Guerin) oraz Corynebacterium parvum.
Klon molekularny przeciwciała wobec wybranego epitopu modyfikowanego liganda TIE-2, można wytworzyć znanymi technikami. Do konstrukcji sekwencji kwasu nukleinowego,
189 639 które kodują cząsteczkę przeciwciała monoklonalnego lub jego regionu wiążącego antygen, można uzyć metodologii rekombinowanego DNA (patrz np. Maniatis i in., 1982, Molecular
Cloning, A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor, Nowy Jork).
Niniejszy wynalazek zapewnia cząsteczki przeciwciał, a także fragmenty takich cząsteczek przeciwciał. Fragmenty przeciwciał, które zawierają idiotyp cząsteczki, można wytworzyć znanymi technikami. Przykładowo, takie fragmenty obejmują, lecz bez ograniczenia: fragment F(ab)2, który można wytworzyć przez trawienie pepsyną cząsteczki przeciwciała; fragmenty Fab', które można utworzyć przez redukcję mostków disiarczkowych fragmentu F(ab)2 oraz fragmenty Fab, które można wytworzyć przez traktowanie cząsteczki przeciwciała papainą i czynnikiem redukującym. Cząsteczki przeciwciała można oczyszczać znanymi technikami, np. przez chromatografię immunoabsorpcyjną lub powinowactwa immunologicznego, metodami chromatograficzymi, takimi jak HPLC (wysokosprawna chromatografia cieczowa) lub ich połączeniem.
Na podstawie niniejszego wynalazku można skonstruować test immunologiczny do pomiaru ilości modyfikowanego liganda TIE-2 w próbce biologicznej przez
a) zetknięcie próbki biologicznej, z co najmniej jednym przeciwciałem, które specyficznie wiąże modyfikowany ligand TIE-2 tak, ze przeciwciało tworzy kompleks z każdym modyfikowanym ligandem TIE-2 obecnym w próbce biologicznej;
oraz b) pomiar ilości kompleksu i przez to pomiar ilości modyfikowanego liganda TIE-2 w próbce biologicznej.
Można też utworzyć test do pomiaru ilości receptora TIE w próbce biologicznej przez a) zetknięeie p^rćibki biegłogiconej, z co najmniej jednym liyandem według wyna lazku tak, ze ligand tworzy kompleks z receptorem TIE;
oraz b) pomiar ilości kompleksu i przez to pomiar ilości receptora TIE w próbce biologicznej.
Możliwe jest także wykorzystanie modyfikowanego liganda TIE-2, który aktywuje receptor TIE-2 jak opisano w niniejszym, w celu podtrzymania przeżycia i/lub wzrostu i/lub migracji i/lub różnicowania się komórek, wykazujących ekspresję receptora TIE-2. Tak więc, ligand można stosować jako uzupełnienie do podtrzymania, np. komórek śródbłonka w hodowli.
Dalej, utworzenie przez Zgłaszających modyfikowanego liganda TIE-2 dla receptora TIE-2, umożliwia wykorzystanie układów testowych użytecznych do identyfikacji agonistów lub antagonistów receptora TIE-2. Takie układy testowe byłyby użyteczne do identyfikacji cząsteczek zdolnych do pobudzania lub hamowania angiogenezy. Przykładowo, w jednej postaci realizacji, antagonistów receptora TIE-2 można identyfikować jako cząsteczki testowe, zdolne do zakłócania interakcji receptora TEE-2 z modyfikowanym ligandem TIE-2, który wiąże receptor TIE-2. Takich antagonistów identyfikuje się przez ich zdolności do 1) blokowania wiązania biologicznie aktywnego modyfikowanego liganda TIE-2 z receptorem, zgodnie z pomiarem, np. przy użyciu technologii bioczujnika BIAcore (BIAcore; Pharmacia Biosensor, Piscataway, NJ); lub 2) blokowania zdolności biologicznie aktywnego modyfikowanego liganda TIE-2 do wywoływania odpowiedzi biologicznej. Takimi odpowiedziami biologicznymi są, lecz bez ograniczenia, fosforylacja receptora TIE lub składniki położone niżej w h-a^d^cyjnym szlaku sygnałowym TIE, albo przeżycie, wzrost lub różnicowanie się komórek, niosących receptor TIE.
W jednej postaci realizacji, komórki skonstruowane do ekspresji receptora TIE, mogą być zalezne od względem wzrostu od dodania modyfikowanego liganda TIE-2. Takie komórki dostarczają uzytecznych układów testowych do identyfikacji dodatkowych agonistów receptora TIE lub antagonistów zdolnych do zakłócania aktywności modyfikowanego liganda TIE-2 na takich komórkach. Alternatywnie, komórki autokrynowe, skonstruowane tak, aby były zdolne go wspólnej ekspresji zarówno modyfikowanego liganda TIE-2 jak i receptora, mogą dostarczyć uzytecznych układów do testowania potencjalnych agonistów lub antagonistów.
Zatem, niniejszy wynalazek zapewnia wprowadzenie receptora TIE-2 do komórek, które normalnie nie wykazują ekspresji tego receptora, pozwalając w ten sposób tym komórkom na ukazanie całkowitych i łatwo odróżnialnych odpowiedzi na ligand, który wiąże ten receptor.
189 639
Typ wywołanej odpowiedzi zależy od wykorzystanej komórki, a nie od specyficznego receptora wprowadzonego do komórki. Można wybrać odpowiednie linie komórkowe do uzyskania odpowiedzi o największym wykorzystaniu w testach, jak również odkrywania, cząsteczek, które mogą oddziaływać na receptory kinazy tyrozynowej. Cząsteczki mogą być każdego typu, włączając, lecz bez ograniczenia, cząsteczki peptydowe i niepeptydowe, które będą oddziaływać na opisywane układy w sposób specyficzny dla receptora.
Jednym lub więcej wykorzystywanych użytecznych układów jest wprowadzenie receptora TIE (lub receptora chimerycznego, zawierającego zewnątrzkomórkową domenę receptora innej kinazy tyrozynowej, tak jak np. trkC oraz wewnątrzkomórkową domenę receptora TIE) do linii komórkowej fibroblastów (np. komórek NIH3T3), a więc takiego receptora, który normalnie nie pośredniczy w odpowiedziach proliferacyjnych lub innych, po wprowadzeniu do fibroblastów, niemniej można go testować różnymi dobrze ustalonymi metodami, do oceny ilościowej wpływu czynników wzrostu fibroblastów (np. włączenia tymidyny lub innych rodzajów testów proliferacji; patrz van Zoelen, 1990, „The Use of Biological Assays For Detection Of Polypeptide Growth Factors” w Progress Factor Research, tom 2, strony 131-152; Zhan i M.Goldfarb, 1986, Mol. Cell. Biol., tom 6, str. 3541-3544). Testy te mają dodatkową korzyść, że można testować każdy preparat zarówno na linii komórkowej, posiadającej receptor wprowadzony, jak również na linii rodzicielskiej bez receptora; tylko specyficzny wpływ na linię komórkową z receptorem będzie oceniony jako taki, w którym pośredniczy wprowadzony receptor. Takie komórki można dodatkowo konstruować do ekspresji modyfikowanego liganda TIE-2, tworząc w ten sposób autokrynowy układ użyteczny do testowania cząsteczek, działających jako antagoniści/agoniści tej interakcji. Tak więc, niniejszy wynalazek przewiduje komórki gospodarza, zawierające kwas nukleinowy, kodujące modyfikowany ligand TIE-2 i kwas nukleinowy, kodujący receptor TIE.
Interakcja receptor TIE/modyfikowany ligand TIE-2 zapewnia także użyteczny układ do identyfikacji agonistów lub antagonistów receptora TLE o małych cząsteczkach. Przykładowo, można identyfikować fragmenty, mutanty lub pochodne modyfikowanego liganda TIE-2, które wiążą receptor TIE lecz nie indukują żadnej innej aktywności biologicznej. Alternatywnie, charakteryzacja modyfikowanego liganda TIE-2 umożliwia dodatkową charakteryzację aktywnych części cząsteczki. Dalej, identyfikacja liganda umożliwia określenie struktury krystalograficznej w promieniach rentgenowskich kompleksu receptor/ligand, umożliwiając w ten sposób identyfikację miejsca wiązania na receptorze. Znajomość miejsca wiązania dostarczy pożytecznego wglądu do racjonalnego planu nowych agonistów i antagonistów.
Specyficzne wiązanie testowych cząsteczek z receptorem TIE można mierzyć na wiele sposobów. Przykładowo, aktualne wiązanie testowanej cząsteczki z komórkami, wykazującymi ekspresję TIE, można wykrywać lub mierzyć przez detekcję lub pomiar (i) cząsteczki testowej związanej z powierzchnią nieuszkodzonej komórki; (ii) cząsteczki testowej usieciowanej z białkiem TIE w lizatach komórkowych; lub (iii) cząsteczki testowej związanej z TIE in vitro. Specyficzne interakcje między testowaną cząsteczką i TIE można ocenić przez użycie odczynników, które pokazują unikalne właściwości tej interakcji.
W przypadku, gdy dokonuje się pomiaru modyfikowanego liganda TIE-2 w próbce, zmieniające się rozcieńczenia próbki (cząsteczki testowej) równolegle z kontrolą ujemną (NC), nie wykazującą aktywności modyfikowanego liganda TIE-2 oraz kontrolą dodatnią (PC), zawierającą znaną ilość modyfikowanego liganda TIE-2, można poddać ekspozycji wobec komórek, wykazujących ekspresję TIE w obecności znakowanego w sposób wykrywalny modyfikowanego liganda TIE-2 (w tej próbce, ligand znakowany jodem radioaktywnym). Ilość modyfikowanego liganda TIE-2 w próbce testowej można ocenić przez określenie ilości znakowanego 125I modyfikowanego liganda TIE-2, który wiąże kontrole i w każdym z rozcieńczeń, a następnie porównanie wartości próbek z krzywą standardową. Więcej modyfikowanego liganda TIE-2 w próbce, mniej liganda znakowanego 125I, który wiąże się z TIE.
Ilość związanego liganda znakowanego 125I można określić przez pomiar ilości radioaktywności na komórkę, lub przez sieciowanie modyfikowanego liganda TIE-2 z białkami powierzchniowo-komórkowymi, przy użyciu DSS, jak opisano u Meakina i Shootera, 1991, Neuron 6: 153-163, i detekcję ilości znakowanego białka w ekstraktach komórkowych przy
189 639 użyciu np. elektroforezy w żelu poliakrylamidowym SDS, która może ujawnić znakowane białko o wielkości, odpowiadającej receptorowmi TIE/modyfikowanemu ligandowi TIE-2. Specyficzną interakcję cząsteczka testowa/TIE można testować dodatkowo przez dodanie do próby różnych rozcieńczeń nieznakowanego liganda kontrolnego, który nie wiąże receptora TIE i przez to nie powinien mieć istotnego wpływu na współzawadnictwo między znakowanym modyfikowanym ligandem TIE-2 i cząsteczką testową, pod względem wiązania TIE. Alternatywnie, cząsteczkę, o której wiadomo, że jest zdolna do przerywania wiązania receptor TIE/modyfikowany ligand TIE-2, tak jak, lecz bez ograniczenia, przeciwciało anty-TIE lub ciałko receptorowe TIE jakie opisano w niniejszym, można oczekiwać, ze zakłóci współzawodnictwo między 125I-modyfikowanym ligandem TIE-2 i cząsteczką testową, pod względem wiązania receptora TIE.
Znakowany w sposób wykrywalny modyfikowany ligand TIE-2 obejmuje, lecz bez ograniczenia modyfikowany ligand TIE-2 połączony kowalentnie lub niekowalentnie z substancją radioaktywną, substancją fluorescencyjną, substancją, posiadającą aktywność enzymatyczną, substancją, służącą jako substrat dla enzymu (zaleca się enzymy i substraty związane z reakcjami kolorymetrycznie wykrywalnymi) lub substancją, którą może rozpoznać cząsteczka przeciwciała korzystnie cząsteczka przeciwciała znakowana w sposób wykrywalny.
Alternatywnie, specyficzne wiązanie cząsteczki testowej z TIE można mierzyć przez ocenę wtórnych efektów biologicznych wiązania modyfikowanego liganda TIE-2/receptor TIE, łącznie, lecz bez ograniczenia, ze wzrostem komórkowym i/lub różnicowaniem lub bezpośredniej wczesnej ekspresji genowej albo fosforylacji TIE. Przykładowo, można testować zdolność cząsteczki testowej do indukcji różnicowania w komórkach, które wykaziyą brak tie i w porównywalnych komórkach, które wykazują ekspresję tie; różnicowanie komórek z ekspresją tie, ale nie porównywalnych komórek bez tie, byłby wskaźnikiem specyficznej interakcji cząsteczka testowa/TIE. Podobną analizę można przeprowadzić przez detekcję indukcji bezpośredniego wczesnego genu (np. fos i jun) w komórkach tie-ujemnych i tie-dodatnich, lub przez detekcję fosforylacji TEE przy użyciu standardowych testów fosforylacji znanych w tej dziedzinie. Taka analiza może być użyteczna do identyfikacji agonistów lub antagonistów, które nie wiążą kompetytywnie TIE.
Podobnie, niniejszy wynalazek pozwala na identyfikację cząsteczki, która posiada aktywność biologiczną modyfikowanego liganda TIE-2, obejmujący (i) ekspozycję komórki, wykazującej ekspresję tie na cząsteczkę testową oraz (ii) wykrycie specyficznego wiązania cząsteczki testowej z receptorem TIE, w którym specyficzne wiązanie z TIE dodatnio koreluje z aktywnością podobną do TIE. Specyficzne wiązanie można wykrywać albo testując pod względem bezpośredniego wiązania, albo wtórnych efektów biologicznych wiązania, jaki omówiono powyżej. Taki sposób może być szczególnie użyteczny w identyfikacji nowych członków rodziny liganda TIE albo, w przemyśle farmaceutycznym, do przesiewu wielkiego zakresu cząsteczek peptydowych lub niepeptydowych (np. naśladowców peptydowych) pod względem aktywności biologicznej związanej z TIE, W zalecanej, konkretnej, nieograniczającej postaci realizacji wynalazku, można sporządzić wielką sieć studzienek hodowlanych, które zawuerają. w przeciwległych rządkach, komórki PC 12 (lub fibroblasty, patrz poniżej), będące albo tie-ujemne albo tak skonstruowane, aby były tie-dodatnimi. Następnie można dodawać rozmaite cząsteczki testowe tak, ze każda kolumna w sieci lub jej część, zawiera różne cząsteczki testowe. Każdą studzienkę można potem ocenić ilościowo pod względem obecności lub nieobecności wzrostu i/lub różnicowania. W ten sposób można przesiać niezwykle wielką liczbę cząsteczek testowych, pod względem takiej aktywności.
Wynalazek umożliwia tez sposoby detekcji lub pomiaru aktywności podobnej do liganda TIE lub identyfikacji cząsteczki jako mającej taką aktywność, obejmujące (i) ekspozycję cząsteczki testowej na białko receptora TIE in vitro w warunkach, które pozwalają na wystąpienie wiązania, oraz (ii) detekcję wiązania cząsteczki testowej z białkiem receptora TIE, w którym wiązanie cząsteczki testowej z receptorem TIE koreluje z aktywnością podobną do liganda TIE. Zgodnie z takimi sposobami, receptor TIE może lub nie, być zasadniczo oczyszczony, może być utrwalony na stałym podłożu (np. jak kolumna powinowactwa lub jak test ELISA) albo może być wprowadzony do sztucznej błony. Wiązanie cząsteczki testowej można
189 639 ocenić każdą metodą znaną w tej dziedzinie. W zalecanych postaciach realizacji, wiązanie cząsteczki testowej można wykrywać lub mierzyć przez ocenę jej zdolności do współzawodniczenia za znakowanymi znanymi Ugandami TlE pod względem wiązania receptora TIE.
Wynalazek umożliwia także detekcję zdolności cząsteczki testowej do działania jako antagonisty o aktywności podobnej do liganda TIE, obejmujący detekcję zdolności cząsteczki do hamowania wpływu wiązania liganda TIE z receptorem TIE, na komórkę, wykazującą ekspresję receptora. Taki antagonista może lub nie, zakłócać wiązanie receptor Tffi/modyfikowany ligand TIE-2. Wpływ wiązania modyfikowanego liganda TIE-2 z receptorem TIE jest korzystnie wpływem biologicznym lub biochemicznym, włączając, lecz bez ograniczenia, przeżycie komórki lub różnicowanie, transformację komórkową, indukcję bezpośredniego wczesnego genu lub fosforylację TIE.
Wynalazek zapewnia dalej zarówno sposób identyfikacji przeciwciał jak i innych cząsteczek zdolnych do zobojętniania liganda lub blokowania wiązania z receptorem, jak również cząsteczek zidentyfikowanych sposobem. Sposób można przeprowadzić poprzez test, który jest zasadniczo podobny do testu ELISA. Przykładowo, ciałko receptorowe TIE można związać ze stałym podłożem, takim jak plastikowa płytka o wielu studzienkach. Jako kontrolę, można potem wprowadzić znaną ilość modyfikowanego liganda TIE-2, którą oznakowano Myc i następnie można identyfikować każdy oznakowany modyfikowany ligand TIE-2, który wiąże ciałko receptorowe, przez przeciwciało reporterowe skierowane przeciw oznakowaniu Myc. Ten układ testowy można następnie stosować do przesiewu próbek pod względem cząsteczek zdolnych do i) wiązania z oznaczonym ligandem lub ii) wiązania z ciałkiem receptorowym i przez blokowania wiązania z ciałkiem receptorowym przez oznaczony ligand. Przykładowo, próbkę testową zawierającą przypuszczalną interesującą cząsteczkę razem ze znaną ilością oznaczonego liganda, można wprowadzić do studzienki i mierzyć ilość oznaczonego liganda, który wiąże ciałko receptorowe. Przez porównanie ilości związanego oznaczonego liganda w próbce testowej z ilością w kontroli, można zidentyfikować próbki, zawierające cząsteczki zdolne do blokowania wiązania liganda z receptorem. Cząsteczki interesujące zidentyfikowane w ten sposób, można wyodrębnić przy użyciu metod dobrze znanych fachowcowi.
Po znalezieniu blokera wiązania liganda, fachowiec będzie umiał przeprowadzić drugorzędne testy, określające, czy bloker wiąże receptor, czy ligand, jak również testy, określające czy cząsteczka blokera może zobojętnić aktywność biologiczną liganda. Przykładowo, przez użycie testu wiązania, które wykorzystuje technologię bioczujnika BIAcore (lub równoważną), w której albo ciałko receptorowe TIE albo ciałko ligandowe modyfikowanego liganda TIE-2, łączy się kowalentnie ze stałym podłożem (np. dekstranem karboksymetylu na powierzchni złota), fachowiec będzie zdolny do określenia, czy cząsteczka blokera wiąże specyficznie ligand, ciałko ligandowe lub ciałko receptorowe. Aby określić, czy cząsteczka blokera może zobojętnić aktywność biologiczną liganda, fachowiec będzie umiał przeprowadzić test fosforylacji (patrz przykład 5) lub alternatywnie, funkcjonalny biotest, taki jak test przeżycia, przez użycie kultur pierwotnych, np. komórek śródbłonka. Alternatywnie, cząsteczka blokera, która wiąże ciałko receptorowe może być agonistą i fachowiec wiedziałby jak go określić przez przeprowadzenie odpowiedniego testu identyfikacji dodatkowych agonistów receptora TIE.
Oprócz tego, wynalazek dostarcza kompozycje, w których ligand TIE jest domeną wiążącą receptor liganda TIE-2 opisanego w niniejszym. Przykładowo, ligand 1 TIE-2 zawiera domenę „skłębionej spirali” (rozpoczynająca się przy końcu 5' i rozciągająca się do nukleotydu w pobliżu pozycji 1160 z fig. 4 i około pozycji 1157 z fig. 5) i domenę podobną do fibrynogenu (którą koduje sekwencja nukleotydową z fig. 4, rozpoczynająca się około pozycji 1161 i około pozycji 1158 z fig. 5). Domenę podobną do fibrynogenu liganda 2 TIE-2 uważa się za rozpoczynającą się na albo koło tej samej sekwencji aminokwasowej jak w ligandzie 1 (FRDCA), która koduje nukleotydy, rozpoczynające się około 1197 z fig. 6. Domenę podobną do fibrynogenu liganda-3 TIE uważa się za rozpoczynającą się na lub koło sekwencji aminokwasowej kodowanej przez nukleotydy, zaczynające się koło pozycji 929 jak przedłożono w fig. 21. Multimeryzacja domeny zwiniętej spirali podczas wytwarzania liganda, utrudnia
189 639 oczyszczanie. Jak opisano w przykładzie 19, Zgłaszający odkryli jednak, że domena podobna do fibrynogenu zawiera domenę wiązania receptora TIE-2. Nie wydaje się jednak, że monamęryezne postacie domeny podobnej do fibrynogenu wiążą receptor. Badania, wykorzystujące domenę podobną do fibrynogenu aznacdaną myc, którą „skupiono” przy użyciu przeciwciał anty-myc, wiążą receptor TIE-2. [Metody wytwńrdaoia „skupionych” ligandów i ciałek ligandowych opisano u Davisa i in., Science 266: 816-819 (1994)]. Na podstawie tych odkryć, Zgłaszający wytworzył „ciałka ligandowe”, obejmujące domenę podobną do fibrynagęou ligńoSów TIE-2 sprzężone z domeną Fc IgG („fFc's”). Te ciałka ligandawe, które tworzą Simęry, skutecznie wiążą receptor TIE-2. W związku z tym, niniejszy wynalazek przewiduje wytwarzanie ciałek ligandowych modyfikowanego Uganda TIE, które można stosować jako środków kierujących dla guzów i/lub towarzysdąeęga uoaedyoięnia, w którym wskazuje się antagonistę TIE.
Wynalazek niniejszy opisuje także wykorzystanie liganda, jego fragmentu lub poehoSnej albo innej cząsteczki, będącej agonistą lub antagonistą receptora, jako środka terapeutycznego do lęcdęnia pacjentów, cierpiących z powodu schorzeń związanych z komórkami, tkankami lub narządami, wykazującymi ekspresję receptora TIE. Takie cząsteczki można stosować w sposobie lęcdęoia ciała ludzkiego lub zwierzęcego albo w sposobie diagnozowania.
Ponieważ receptor TIE zidkntyfikawαna w związku z komórkami śródbłonka oraz, jak tu pakadana, blokowanie liganda 1 TIE-2 okazuje się zapobiegać unaezynieniu. Zgłaszający oczekują, że opisany w niniejszym modyfikowany ligand TIE-2 może być użyteczny w indukcji unaezynienia w chorobach lub schorzeniach, gdzie takie uoαcdyoięnię jest wskazane. Takimi chorobami lub schorzeniami są gojenie zranień, niedokrwienie i cukrzyca. Ligandy można testować w modelach zwierzęcych i stosować leedoicdo jak opisano dla innych czynników, tak jak czynnika wzrostu śródbłssoka naczyniowego (VEGF), drugiego czynnika specyficznego dla komórek śródbłonke, który jest angiagęoiedny. Ferrara i in., opis patentowy U.S. nr 5 332 671, opublikowany 26 lipca 1994. Odnośnik Ferrary, jak również mne badania opisują badania in vitro oraz in vivo, które można stosować do pokadaoia wpływu cdyonika angiogęoieznęgo na wzmacnianie przepływu krwi do mięśnia sercowego po niedokrwieniu, wzmacnianie gojenia rany i w innych układach terapeutycznych, w których pożądana jest nowa angiagęoęda. [Patrz Sudo i in., Europejskie zgłoszenie patentowe 0 550 296 A2, opublikowane 7 lipca, 1993; Banai i in., Circulatian 89:2183-2189 (1994); Unger i in., Am. J. Physiol. 266: H1588-H1595 (1994); Lazarous i in., Circulatian 91: 145-153 (1995)]. Według wynalazku, modyfikowany ligand TIE-2 można stosować pojeSyncda lub w połączeniu z jednym lub więcej dodatkowych farmaeeutycdnię aktywnych związków, np. VEGF lub czynnikiem wzrostu fibrablastów zasadowych (bFGF), a także cytokinami, neutrofioαmi, itd.
Odwrotnie, antagoniści receptora TIE, które wiążą lecz nie aktywują receptora jak opisano w niniejszym wynalazku ciałka receptorowe jakie opisano w niniejszych przykładach 2 i 3 oraz ligand 2 TIE-2, jak opisano w przykładzie 9, byłby użyteczni do zapobiegania lub osłabiania unaedyoieoia, zapobiegając w ten sposób lub osłabiając np. wzrost guza. Czynniki te mazne stosować pojedynczo lub w połączeniu z innymi kompozycjami, takimi jak przeciwciała anty-VEGF, które jak się okazało są użyteczne w leczeniu stanów, w których intęocją terapeutyczną jest blokowanie angiagenedy. Zgłaszający oczekują, że modyfikowany ligand TIE-2 opisany niniejszym można także stosować w połączeniu ze środkami, takimi jak antagoniści cytokin, tak jak antagoniści IL-6, o których wiadomo, że blokują zapalenie.
Przykładowo, Zgłaszający określili, że ligandy TIE podlegają ekspresji w komórkach wewnątrz, lub blisko związanymi z guzami. Przykładowo, okazało się, że ligand 2 TIE-2 jest ściśle związany z komórkami śródbłonka guza. W związku z tym, ten i inni antagoniści TIE mogą być także użytecznymi w zapobieganiu lub osłabianiu np. wzrostu guza. Oprócz tego, ligandy TIE lub ciałka liganSowę mogą być użyteczne przy dostarczaniu toksyn do komórek, niosących receptor. Alternatywnie, inne cząsteczki, takie jak ezyoniki wzrostu, cytokiny lub składniki odzywcze, mazoa dostarczyć do komórek, niosących receptor TIE, poprzez ligandy lub ciałka ligaoSawe TIE. Ligandy TIE lub ciałka ligandawk, takie jak modyfikowany ligand TIE-2 można także stosować jako odczynniki Siagnastycdoe pod względem receptora TIE, do wykrywania receptora in vivo lub in vitro. Jeśli receptor TIE towarzyszy stanowi chorobowemu,
189 639 ligandy lub ciałka ligandowe TIE, takie jak modyfikowany ligand TIE-2, mogą być użyteczne jako odczynniki diagnostyczne do wykrywania choroby, np. przez barwienie tkanki lub obrazowanie całego organizmu. Takie odczynniki obejmują radioizotopy, fluorochromy, barwniki, enzymy i biotynę. Takie czynniki diagnostyczne lub nakierowujące można wytwarzać zgodnie z opisem Alitalo i in., WO 95/26364 opublikowanym 5 października 1995 oraz F.Burrowsa i P. Thorpe'a, PNAS (USA) 90:8996-9000 (1993), które załącza się niniejszym w całości.
W innych postaciach realizacji, ligandy TIE, aktywujący receptor modyfikowany ligand TIE-2 opisany niniejszym, stosuje się jako czynniki krwiotwórcze. Różne czynniki krwiotwórcze i ich receptory wiążą się z proliferacją i/lub różnicowaniem i/lub migracją różnych rodzajów komórek zawartych we krwi. Ponieważ receptory TIE podlegają ekspresji we wczesnych komórkach krwiotwórczych, oczekuje się, ze ligandy TIE odgrywają porównywalną rolę w proliferacji lub różnicowaniu albo migracji tych komórek. Tak więc, np. kompozycje, zwierające TIE można wytworzyć testować, badać w układach biologicznych in vitro oraz in νινο i stosować leczniczo, jak opisano w jakimkolwiek z następujących: Sousa opis patentowy U.S. nr 4 810 643, Lee i in., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 82: 4360-4364 (1985), Wong i in., Science, 228: 810-814 (1985); Yokota i in., Proc. Natl. Acad. Sci (USA) 81: 1070 (1984); Bosselman i in., WO 9105795 opublikowane 2 maja 1991, zatytułowane „Stern Cell Factor” oraz Kirkness i in., WO 95/19985 opublikowane 27 lipca 1995 zatytułowane „Haemopoietic Maturation Factor”. W związku z tym aktywujący receptor modyfikowany ligand TIE-2 można stosować do diagnozowania lub leczenia stanów, w których zahamowane jest normalne tworzenie się krwinek, włączając, lecz bez ograniczenia, anemię, małopłytkowość, leukopenię i granulocytopenię. W zalecanej postaci realizacji, aktywujący receptor modyfikowany ligand TIE-2 można stosować do stymulacji różnicowania prekursorów krwinek w sytuacjach, w których pacjent choruje na chorobę, taką jak zespół nabytego niedoboru odporności (AIDS), powodujący zmniejszenie normalnego poziomu krwinek, albo w układach klinicznych, w których pożądane jest wzmocnienie populacji krwiotwórczej, tak jak w połączeniu z przeszczepem szpiku kostnego lub w leczeniu aplazji lub zahamowania czynności szpiku kostnego spowodowanego promieniowaniem, leczeniem chemicznym lub chemoterapią.
Modyfikowany ligand TIE-2 aktywujący opisany receptor można stosować pojedynczo lub w połączeniu z innym czynnikiem aktywnym farmaceutycznie, takim jak np. cytokiny, neutrofiny, intereleukiny, itd. W zalecanej postaci realizacji, ligandy można stosować w połączeniu z każdym z licznych czynników wymienionych powyżej, o których wiadomo, że indukują proliferację komórek macierzystych lub innych prekursorów krwiotwórczych, albo czynników, działających na późniejsze komórki w szlaku krwiotwórczym, włączając, lecz bez ograniczenia, krwiotwórczy czynnik dojrzewania, trombopoetynę, czynnik komórek macierzystych, erytropoetynę, G-CSF, GM-CSF itd.
W alternatywnej postaci realizacji, antagonistów receptora TIE stosuje się diagnozowania lub leczenia pacjentów, u których pożądana jest inhibicja szlaku krwiotwórczego, tak jak przy leczeniu schorzeń proliferacyjnych szpiku lub innych proliferacyjnych schorzeń narządów, tworzących krew, tak jak trombocytemia, policytemia i białaczki. W takich postaciach realizacji, leczenie może obejmować stosowanie terapeutycznie skutecznej ilości modyfikowanego liganda TIE-2, przeciwciała TIE, ciałka receptorowego TIE, koniugata modyfikowanego liganda TIE-2 lub ciałka ligandowego albo fFC, jakie opisano niniejszym.
Niniejszy wynalazek dostarcza także kompozycje farmaceutyczne, zawierające modyfikowany ligand TIE-2 albo ciałka ligandowe opisane niniejszym, ich fragmenty peptydowe lub pochodne w farmakologicznie dopuszczalnym nośniku. Białka modyfikowanego liganda TIE-2, fragmenty peptydowe lub pochodne, można podawać układowo lub miejscowo. Można stosować każdy odpowiedni sposób podawania znany w tej dziedzinie, włączając, lecz bez ograniczenia dożylny, dokanałowy, dotętniczy, donosowy, doustny, podskórny, dootrzewnowy łub przez miejscowe injekcje albo wszczep chirurgiczny. Przewiduje się także preparaty o przedłużonym uwalnianiu.
Niniejszy wynalazek przewiduje także przeciwciało, które specyficznie wiąże taką cząsteczkę terapeutyczną. Przeciwciało może być monoklonalne lub poliklonalne. Wynalazek przewiduje także sposób zastosowania takiego przeciwciała monoklonalnego lub poliklonalnego
189 639 do pomiaru ilości cząsteczki terapeutycznej w próbce pobranej od pacjenta do celów monitoringu przebiegu terapii.
Wynalazek przewiduje dalej kompozycję terapeutyczną, zawierającą modyfikowany ligand TIE-2 albo ciałko ligandowe oraz środek cytotoksyczny z nim sprzężony. W jednej postaci realizacji, środkiem cytotoksycznym może być radioizotop lub toksyna.
Wynalazek przewiduje także przeciwciało, które specyficznie wiąże modyfikowany ligand TIE-2. Przeciwciało może być monoklonalne lub poliklonalne.
Wynalazek przewiduje także sposób oczyszczania modyfikowanego liganda TIE-2, obejmujący:
a) sprzęganie co najmniej jednego substratu wiążącego TIE ze stałą macierzą;
b) inkubację substratu a) z lizatem komórkowym tak, że substrat tworzy kompleks z każdym modyfikowanym ligandem TIE-2 w lizacie komórkowym;
c) przemycie stałej macierzy;
oraz d) elucję modyfikowanego liganda TIE-2 ze sprzężonego substratu.
Substratem może być każda substancja, która specyficznie wiąże modyfikowany ligand TIE-2. W jednej postaci realizacji, substrat wybiera się z grupy, składającej się z przeciwciała anty-modyfikowanego liganda TIE-2, receptora TIE i ciałka receptorowego TEE. Wynalazek przewiduje dalej ciałko receptorowe, które specyficznie wiąże modyfikowany ligand TIE-2, jak również kompozycję terapeutyczną, zawierającą ciałko receptorowe w farmaceutycznie dopuszczalnym nośniku, oraz sposób blokowania wzrostu naczyń krwionośnych u człowieka, obejmujący podawanie skutecznej ilości kompozycji terapeutycznej.
Wynalazek przewiduje także kompozycję terapeutyczną, zawierającą modyfikowany ligand TIE-2 albo ciałko ligandowe w farmaceutycznie dopuszczalnym nośniku, jak również sposób pobudzania nowo-unaczynienia u pacjenta, obejmujący podawanie pacjentowi skutecznej ilości kompozycji terapeutycznej.
Poza tym, niniejszy wynalazek przewiduje sposób identyfikacji komórki, która wykazuje ekspresję receptora TIE, obejmujący zetknięcie komórki ze znakowanym w sposób wykrywalny modyfikowanym ligandem TIE-2 albo ciałkiem ligandowym, w warunkach, pozwalających na wiązanie znakowanego w sposób wykrywalny liganda z receptorem TIE i określenie, czy znakowany w sposób wykrywalny receptor TIE związał się z receptorem, identyfikując przez to komórkę jako tę, która wykazuje ekspresję receptora TIE. Niniejszy wynalazek przewiduje także kompozycje terapeutyczną, zawierającą modyfikowany ligand TIE-2 albo ciałko ligandowe oraz sprzężony z nim czynnik cytotoksyczny.
Czynnikiem cytotoksycznym może być radioizotop lub toksyna.
Wynalazek przewiduje także sposób detekcji ekspresji modyfikowanego liganda TIE-2 przez komórkę, który obejmuje otrzymanie mRNA z komórki, zetknięcie tak otrzymanego mRNA z oznakowaną cząsteczką kwasu nukleinowego, kodującego modyfikowany ligand TIE-2, w warunkach hybrydyzacji, określenie obecności zhybrydyzowanego mRNA z oznakowaną cząsteczką, a przez to wykrycie ekspresji modyfikowanego liganda TIE-2 w komórce.
Wynalazek zapewnia dalej sposób wykrywania ekspresji modyfikowanego liganda TIE-2 w przekrojach tkankowych, który obejmuje zetknięcie przekrojów tkankowych z oznakowaną cząsteczlką kwasu nukleinowego, kodującą modyfikowany ligand TIE-2 w warunkach hybrydyzacji, określenie obecności zhybrydyzowanego mRNA z oznakowaną cząsteczką, a przez to wykrycie ekspresji modyfikowanego liganda TLE-2 w przekrojach tkankowych.
Przykład 1- Identyfikacja linii komórkowej ABAE, jako komórek reporterowych dla receptora TIE-2
Dorosłe komórki BAE zarejestrowano w Europejskiej Składnicy Kultur Komórkowych pod numerem ECACC#92010601. (Patrz PNAS 75:2621 (1978)). Analizy Nothem (RNA) ujawniły średni poziom transkryptów tie-2 w linii komórkowej ABAE (dorosła bydlęca śródbłonka tętnic), zgodnie z wynikami hybrydyzacji in situ, które pokazały prawie wyłączną lokalizację RNA tie-2 w komórkach śródbłonka naczyniowego. Zbadaliśmy zatem lizaty komórkowe ABAE pod względem obecności białka TIE-2, jak również obszar, na jakim to białko TIE-2 ulega fosforylacji tyrozynowej w normalnych warunkach wzrostu przeciwko warunkom pozbawienia surowicy. Lizaty komórkowe ABAE zebrano i poddano immunoprecypitacji,
189 639 po czym analizom Western blot białek po immunoprepicytacji z antyserami specyficznymi dla TIE-2 oraz specyficznymi dla fosfotyrozyny. Ominięcie lub wtrącenie peptydów TIE-2 jako cząsteczek specyficznie blokujących podczas immunoprecypitacji TIE-2 pozwoliło na jednoznaczną identyfikację TIE-2 jako białka średnio wykrywalnego o ~150 kD, którego ustalony poziom fosfotyrozyny zmniejsza się do prawie nie wykrywalnego poziomu przez wcześniejsze pozbawienie komórek surowicy.
Hodowla komórek ABAE i zbiór lizatów komórkowych wykonano następująco. Komórki ABAE o małej liczbie pasazowania umieszczono na płytce jako pojedynczą warstwę o gęstości 2 x 106 komórek/150 mm plastikową płytkę Petriego (Falcon) i hodowano w pożywce Dulbecco modyfikowanej przez Eagle'a (DMEM), zawierającej 10% bydlęcej surowicy cielęcej (10% BGS), 2 mM L-glutaminy (Q) i penicylinę oraz streptomycynę, każda po 1%o (P-S) w atmosferze, zawierającej 5% CO2. Przed zbiorem lizatów komórkowych, komórki pozbawiono surowicy na 24 godziny w DMEM/Q/P-S, po czym aspirowano pożywkę i przemyto płytki lodowatą solanką buforowaną fosforanem (PBS) uzupełnioną ortowanadanem sodu, fluorkiem sodu i benzamidyną. Komórki poddano lizie w małej objętości tego buforu przemywającego, który uzupełniono 1%o detergenta NP40 oraz inhibitorami proteazy PMSF i aprotyniną. Nierozpuszczalne resztki komórkowe usunięto z lizatów komórkowych przez wirowanie przy 14 000 xG przez 10 minut, w temperaturze 4°C i supematanty poddano immunoprecypitacji z antyserami specyficznymi dla receptora TIE-2, przy obecności albo nieobecności peptydów blokujących dodanych do -20 pg/ml lizatu. Białka po immunoprecypitacj i rozpuszczono przez PAGE (7,5% zel Laemmli), a następnie poddano elektrotransferowi na błonę PVDF i irikubowano albo z różnymi TIE-2 albo antyserami specyficznymi dla fosfotyrozyny. Białko TIE-2 uwidoczniono przez inkubację błony z wtórnymi antyserami połączonymi z HRP, po czym traktowano odczynnikiem ECL (Amersham).
Przykład 2 - Kloning i ekspresja ciałka receptorowego TIE-2 do badań interakcji liganda TIE-2 na podstawie powinowactwa
Utworzono konstrukcję ekspresji, która dawałaby wydzielone białko, składające się z całej części zewnątrzkomórkowej szczurzego receptora TIE-2 połączonego przez fuzję z ludzkim stałym regionem immunoglobuliny gamma-1 (IgG1 Fc). To białko fuzyjne nazywa się „ciałkiem receptorowym” TIE-2 (RB) i oczekuje się, że będzie normalnie istnieć jako dimer w roztworze, w oparciu o tworzenie się wiązań disiarczkowych między poszczególnymi ogonkami IgG1 Fc. Część Fc ludzkiej IgG1, która rozciąga się od regionu zawiasowego do końca karboksylowego białka, powielono z cDNA ludzkiego łożyska przez PGR, za pomocą oligonukleotydowe, odpowiadających opublikowanej sekwencji ludzkiej IgG1; uzyskany fragment DNA klonowano w wektorze plazmidowym. Odpowiednie fragmenty restrykcyjne DNA z plazmidu, kodującego receptor TIE-2 o pełnej długości i z plazmidu ludzkiej IgG1 Fc, poddano ligacji w obu miejscach krótkiego fragmentu pochodzącego z PGR, który przeznaczono do fuzji, w ramce, z sekwencjami, kodującymi białko TIE-2 i ludzką IgG1 Fc. W ten sposób otrzymane białko fuzyjne ektodomena TIE-2-Fc dokładnie podstawiono IgG1 Fc w miejsce regionu, obejmującego domeny transbłonową TIE-2 i cytoplazmatyczną. Alternatywną metodę wytwarzania RB opisano u Goodwina i in., Cell 73: 447-456 (1993).
Miligramowe ilości RB TIE-2 otrzymano przez kloning fragmentu DNA RB TIE-2 do wektora bakulowirusa pVL1393 i następnym zakazeniu owadziej linii komórkowej Spodoptera frugiperda SF-21AE. Alternatywnie można stosować linię komórkową SF-9 (ATCC numer dostępu CRL-1711) lub linie komórkową BTI-TN5bl-4. DNA, kodujący TIE-2 Rb klonowano jako fragment EcoRI-Notl do plazmidu transferowego bakulowirusa pVL1393. DNA plazmidu oczyszczony przez wirowanie w gradiencie gęstości chlorku cezu, rekombinowano do DNA wirusa przez mieszanie 3 pg DNA plazmidu z 0,5 pg DNA Baculo-Gold (Pharminigen), po czym wprowadzono do liposomów, przy użyciu 30 pe Lipofectin (GIBCO-BRL). Mieszaniny DNA-liposom dodano do komórek SF-21AE (2x 1(01 komórek/60 mm płytkę) w pożywce TMN-FH (modyfikowana pożywka komórek owadzich Grace'a (GIBCO-BRL)) przez 5 godzin w temperaturze 27°C, po czym inkubowano w temperaturze 27°C przez 5 dni w pożywce TMN-FH uzupełnionej 5% surowicą płodu cielęcego. Pożywkę hodowli tkankowej zebrano przy użyciu metod opisanych wcześniej (D.R.O'Reilly, L.K. Miller i Y.A.Luckow,
189 639
Baculovirus Expression Vectors - A Laboratory Manual, 1992, Nowy Jork: W.H.Freeman, z takim wyjątkiem, że nalana warstwa agarozowa zawierała 125 pg/ml X-gal (5-bromo-4-chloro-3-lndolilo-β-D-galaktopiranoęyd; GffiCO-BRL). Po 5 dniach inkubacji w temperaturze 27°C, nie rekombinowane łysinki oceniono ilościowo przez dodatnią reakcję chromogeniczną wobec substratu X-gal i zaznaczono ich pozycje. Łysinki rekombinowane uwidoczniono potem przez dodanie drugiej nadlewki, zawierającej 100 pg/ml MTT (bromku 3-[4,5-dimetyiotiazol-2-ilo]-2,5-difenylotetrazolium; Sigma). Łysinki z przypuszczalnie rekombinowanym wirusem zebrano przez podłączenie aspiracji i oczyszczono przez wydorębnianie z wielokrotnym okrążeniem łysinek, aby zapewnić jednorodność. Utworzono zbiory wirusów przez seryjne pasażowanie z niską wielokrotnością oczyszczonych łysinek wirusa. Wytworzono zbiory o niskim pasaźowaniu jednego klonu wirusa (ciałko receptorowe vTIE-2).
Komórki SF-21AE hodowano w pożywce pozbawionej surowicy (SF-900 II, Gibco BRL), zawierającej IX roztworu antybiotyk/środek przeciwgrzybowy (Gibco BRL) i 25 mg/litr Gentamycyny (Gibco BRL). Jako środek powierzchniowo czynny dodano Pluronic F-68 do końcowego stężenia, wynoszącego 1 g/litr. Hodowlę (4 litry) pobudzono w bioreaktorze (Artisan Cell Station System) przez, co najmniej trzy dni przed infekcją. Komórki hodowano w temperaturze 27°C, przy traktowaniu rozpuszczonym 50% tlenem, przy prędkości przepływu gazu, wynoszącym 80 ml/minutę (napowietrzanie przy pierścieniu zraszającym). Mieszano za pomocą wirnika okrętowego przy prędkości 100 obrotów na minutę. Komórki zebrano w fazie wzrostu środkowo-logarytmicznej (~2 XI O6 komórek/ml), zatężono przez wirowanie i zakażono 5 jednostkami tworzącymi łysinki ciałka receptorowego vTIE-2 na komórkę. Komórki i szczep doprowadzono do 400 ml za pomocą świeżej pożywki i wirus adsorbował przez 2 godziny w temperaturze 27°C w obracanej kolbie. Następnie hodowlę zawieszono ponownie w końcowej objętości 8 litrów świeżej pożywki pozbawionej surowicy, a komórki inkubowano w bioreaktorze stosując wcześniej opisane warunki.
Pożywkę hodowlaną komórek SF21AE infekowanych ciałkiem receptorowym vTIE-2 zebrano przez wirowanie (500 x g, 10 minut) 72 godziny po infekcji. Supematanty komórkowe doprowadzono do pH 8 za pomocą NaOH. Dodano EDTA do końcowego stężenia 10 mM i pH supematantów ponownie wyregulowano na 8. Supematanty przesączono (0,45 pm, Millipore) i załadowano na kolumnę A dla białek (protein A sepharose 4 fast flow albo HiTrap protein A, oba od Pharmacia). Kolumnę przemyto PBS, zawierającym 0,5 M NaCl dotąd, az absorbancja przy 280 nm zmniejszyła się do linii podstawowej. Kolumnę przemyto w PBS i wymywano 0,5 M kwasem octowym. Frakcje kolumnowe natychmiast zobojętniono przez elucję do rur, zawierających 1 M Tris pH 9. Frakcje szczytowe, zawierające ciałko receptorowe TIE-2 zlano i dializowano przeciw PBS.
Przykład 3 - Ukazanie, ze TIE-2 odgrywa krytyczną rolę w rozwoju unaczynienia
Zyskano wgląd w działanie TIE-2 przez wprowadzenie „nadmiaru” rozpuszczalnego ciałka receptorowego TIE-2 (TIE-2 RB) do rozwijającego się układu. Potencjalna zdolność wiązania TIE-2 RB, a przez to zobojętniania dostępnego liganda TIE-2 mogłaby być wynikiem możliwego do zaobserwowania przerwania normalnego rozwoju unaczynienia i charakteryzacji liganda. Aby zbadać, czy TIE-2 RB możnaby użyć do przerwania rozwoju unaczynienia u wczesnych zarodków kurzych, małe kawałki pianki zdolnej do wchłaniania biologicznego nasycono TIE-2 RB i wprowadzono bezpośrednio poniżej błony kosmówki omoczniowej w pozycji tuż z boku w stosunku do prymitywnego zarodka.
Wczesne zarodki kurze rozwijają się na szczycie żółtka z małej płytki komórek, którą przykrywa błona kosmówki omoczniowej (CAM). Komórki śródbłonea, które staną się wyściólką unaczynienia zarodka, powstają ze źródeł komórkowych zarówno zewnątrz- jak i wewnątrz zarodkowych. Komórki śródbłonka pochodzące z zewnątrz zarodka, które zapewniają główne źródło komórek śródbłonkowych w zarodku, pochodzą z narastania mezenchymy umieszczonego bocznie wokół przedniej części zarodka, tuż pod CAM. Gdy te komórki mezenchymy dojrzeją, dają wzrost wspólnych potomków linii komórek zarówno śródbłonkowych jak i krwiotwórczych, określanych jako hemangioblast. Odwrotnie, hemangioblast daje wzrost mieszanej populacji angioblastów (potomstwa komórek śródbłonkowych) i hematoblastów (wielokierunkowy prekursor erwloiwórcęy). Tworzenie się zaczątków układu krążenia
189 639 rozpoczyna się, gdy potomne komórki śródbłonkowe rozdzielają się, tworząc pęcherzyk o grubości jednej komórki, otaczający pierwotne krwinki. Proliferacja i migracja tych składników komórkowych tworzy ewentualnie rozległą sieć mikronaczyń wypełnionych krwią, pod
CAM, która będzie ostatecznie wrastać do zarodka, łącząc się z ograniczonymi, pochodzącymi z wnętrza zarodka, elementami naczyń.
Świeżo zapłodnione jaja kurze otrzymane od Spafas, Inc. (Boston, MA), inkubowano w temperaturze 99,5°F (37,5°C), 55% wilgotności względnej. Po około 24 godzinach rozwoju, przetarto skorupę jaja 70% etanolem i użyto wiertła dentystycznego, aby wykonać 1,5 cm otwór w tępym końcu każdego jaja. Błonę wyściełającą skorupę usunięto, aby odsłonić przestrzeń powietrzną bezpośrednio nad zarodkiem. Małe kwadratowe kawałki jałowej Gelfoam (Upjohn) pocięto skalpelem i nasycono w równych stężeniach albo ciałka receptorowego TIE-2 albo EHK-1. Ciałko receptorowe EHK-1 wykonano tak jak przedłożono w przykładzie 2 przy użyciu zewnątrzkomórkowej domeny EHK-1 zamiast zewnątrzkomórkowej domeny TIE-2 (Maisonpierre i in., Oncogene 8: 3277-3288 (1993). Każdy kawałek Gelfoam absorbował około 6 pg białka w 30 μΐ. Jałowych szczypczyków zegarmistrzowskich użyto do wykonania małego rozerwania CAM w pozycji kilka milimetrów w bok w stosunku do pierwotnego zarodka. Większość kawałków Gelfoam nasyconej RB wprowadzono pod CAM i skorupę jaja uszczelniono kawałkiem taśmy klejącej. Inne jaja w podobnych etapach rozwoju traktowano równolegle RB niespokrewnionego receptora kinazy tyrozynowej podlegającego ekspresji w neuronach, EHK-1 (Maisonpierre i in., Oncogene 8: 3277-3288 (1993). Pozwolono na rozwój przez 4 dni i następnie zarodki zbadano przez inspekcję wzrokową. Zarodki usunięto przez ostrożne potłuczenie skorup na płytkach z ogrzanym PBS i ostrożne odcięcie zarodka z otaczającą CAM. Z 12 jaj traktowanych każdym RB, 6 zarodków traktowanych TIE-2 RB i 5 zarodków traktowanych EHK-1 RB rozwinęło się ponad etap obserwowany na początku doświadczenia. Dramatyczną różnicę zaobserwowano między tymi rozwiniętymi zarodkami, jaki ukazano w fig. 1A i 1B. Te traktowane EHK-1 RB okazały się być stosunkowo normalnie rozwinięte. Cztery z pięciu zarodków EHK-1 były żywe, co oceniono przez obecność bicia serca. Ponadto unaczynienie poza-zarodkowe, które jest wzrokowo wyraźne z powodu obecności krwinek czerwonych, było obfite i rozprzestrzenione kilka centymetrów w bok pod CAM. Przeciwnie, zarodki traktowane TIE-2 RB miały poważnie zahamowany wzrost, w zakresie 2-5 mm średnicy, w porównaniu z ponad 10 mm średnicy dla zarodków EHK-1 RB. Wszystkie zarodki traktowane TIE-2 były martwe, a ich CAM były pozbawione naczyń krwionośnych. Zdolność TIE-2 RB do blokowania rozwoju naczyń u kurcząt pokazuje, że ligand TIE-2 jest konieczny dla rozwoju unaczynienia.
Przykład 4 - Identyfikacja aktywności specyficznej dla TIE-2 w kondycjonowanej pożywce z mysiej linii komórkowej mioblastów C2C12 transformowanej onkogenem ras
Przesiew zatęzonych dziesięciokrotnie kondycjonowanych pożywek komórkowych (10X CCM) od różnych linii komórkowych, pod względem obecności rozpuszczalnej aktywności wiązania specyficznej dla TIE-2 (BIAcore; Pharmacia Biosensor, Piscataway, NJ) ujawnił aktywność wiązania w pożywce pozbawionej surowicy z komórek C2C12 transformowanych onkogenem ras (C2C12-ras), RAT 2-ras, (która jest linią komórkową fibroblastów transformowaną ras), ludzkiego glejaka T98G oraz linii komórkowej ludzkiego nerwiaka niedojrzałego znanego jako SHEP-1.
C2C12-ras 10X CCM pochodziły od stabilnie transfekowanej linii mioblastów C2C12, które transformowano onkogenicznie przez transfekcję mutantem T-24 H-ras standardową metodą opartą o fosforan wapnia. Plazmid ekspresji z opornością na neomycynę na podstawie SV40 połączono fizycznie z plazmidem ekspresji ras w celu umożliwienia selekcji tranfekowanych klonów. Uzyskane komórki ras-C2C12 odporne na G418, rutynowo utrzymano jako pojedynczą warstwę na plastikowych płytkach w mieszaninie DMEM/glutamina/penicylinastreptomycyna uzupełnionej 10% surowicą płodu cielęcego (FCS). Wykonano pozbawione surowicy C2C12-ras 10X CCM, przez powleczenie komórek przy 60% konfluencji w określonych pożywkach pozbawionych surowicy, przez 12 godzin. [Zhan i Goldfarb, Mol. Celi. Biol. 6: 3541-3544 (1986)); Zhan i in., Oncogene 1: 369-376 (1987)]. Pożywkę usunięto i zastąpiono świeżą DMEM/Q/P-S, przez 24 godziny. Pożywkę tę zebrano i komórki ponownie
189 639 potraktowano świeżą DMEM/Q/P-S, którą także zebrano po dalszych 24 godzinach. Te CCM uzupełniono inhibitorami proteazy PMSF (1 mM) i aprotyniną (10 pg/ml), a dziesięciokrotne stężenie wykonano na jałowych błonach ekskluzji wielkościowej (Amicon). Aktywność wiązania TIE-2 moznaby zobojętnić przez inkubację pożywki z nadmiarem TIE-2 RB, lecz nie przez inkubację z EHK-1 RB, przed analizą BIAcore.
Aktywność wiązania 10x CCM mierzono przy użyciu technologii bioczujnika (BIAcore; Pharmacia Biosensor, Piscataway, NJ), który monitoruje interakcje w czasie rzeczywistym przez rezonans powierzchniowy plazmonu. Oczyszczone TIE-2 Rb sprzężono kowalentnie przez aminy pierwszorzędowe z warstwą dekstranu karboksymetylu płytki czujnika klasy badawczej CM5 (Pharmacia Biosensor, Piscataway, NJ). Powierzchnia płytki czujnika aktywowano przy użyciu mieszaniny N-hydroksysukcynoimidu (NHS) oraz N-etylo-N'-(3-dimetyloaminopropylo)karbodiimidu (EDC), po czym przez unieruchomienie TIE-2 RB (25 pg/ml, pH 4,5) i deaktywację miejsc, które nie przereagowały 1,0 M etanoloaminą (pH 8,5). Powierzchniową kontrolę ujemną ciałka receptorowego EHK-1 wytworzono w podobny sposób.
Buforem do przebiegu stosowany w układzie był HBS (10 mM Hepes, 3,4 mM EDTA, 150 mM NaCl, 0,005% środek powierzchniowo czynny P20, pH 7,4). Próbki 10x CCM wirowano przez 15 minut w temperaturę 4°C i dalej sklarowano przy użyciu jałowego filtru wiążącego małe białka 0,45 pm (Millipore; Bedford, MA). Dekstran (2 mg/ml) i środek powierzchniowo czynny P20 (0,005%) dodano do każdej próbki CCM. Równe ilości 40 pl wstrzyknięto przez unieruchomioną powierzchnię (albo TIE-2 albo EHK-1) przy prędkości przepływu 5 pl/minutę, i monitorowano wiązanie receptora przez 8 minut. Aktywność wiązania (jednostki rezonansowe, RU) mierzono jako różnicę między wartością linii podstawowej 30 sekund przed injekcją próbki, a pomiarem pobranym 30 sekund po injekcji. Regenerację powierzchni uzyskano za pomocą jednego pulsu 12 pl 3 M MgCf.
Poziom hałasu przyrządu wynosi 20 RU; zatem każda aktywność wiązania o sygnale powyżej 20 RU można interpretować jako rzeczywistą interakcje z receptorem. Dla kondycjonowanych pożywek C2C12-ras, aktywności wiązania wchodziły w zakres 60-90 RU dla TIE-2 RB unieruchomionego powierzchniowo. Dla takich samych próbek testowanych na powierzchniowo unieruchomionego EHK-1 RB, pomiary aktywności były mniejsze niż 36 RU. Specyficzne wiązanie z ciałkiem receptorowym TIE-2 oceniono przez inkubację próbek z nadmiarem albo rozpuszczalnego TIE-2 albo EHK-1 RB przed testowaniem aktywności wiązania. Dodanie rozpuszczalnego EHK-1 RB nie miało wpływu na aktywność wiązania każdej z próbek, podczas gdy w obecności rozpuszczalnego TiE-2 wiązanie z powierzchnią jest o dwie-trzecie mniejsze niż zmierzone przy nieobecności TIE-2. Powtórzenie testu przy użyciu C2C12-ras CCM stężonych > 50x dało w wyniku czterokrotne wzmocnienie ponad tło, sygnału wiązania specyficznego TIE-2.
Przykład 5 - C2C12-ras CCM zawierają aktywność, która indukuje fosforylacje tyrozynową receptora TIE-2
C2C12-ras 10X CCM zbadano pod względem ich zdolności do indukcji fosforylacji tyrozynowej TIE-2 w komórkach ABAE. Komórki ABAE pozbawione surowicy inkubowano krótko z C2C12-ras CCM, poddano lizie i immunoprecypitacji oraz analizom Western, jak opisano powyżej. Stymulację komórek ABAE pozbawionych surowicy z C2C12-ras 10X CCM pozbawionych surowicy, wykonano następująco. Pożywkę z komórkami ABAE głodzoną jak opisano powyżej, usunięto i zamieniono albo na określoną pożywkę lub 10X CCM, którą wstępnie ogrzano do temperatury 37°C. Po 10 minutach, pożywki usunięto i komórki przepłukano dwukrotnie na lodzie z nadmiarem ochłodzonego PBS uzupełnionego ortowanadanem/NaF/benzamidyną. Lizę komórkową oraz immunoprecypitację specyficzną dla TIE-2 wykonano jak opisano powyżej.
Komórki ABAE inkubowano przez 10 minut z określoną pożywką, wykazującą brak indukcji fosforylacji tyrozynowej TIE-2, podczas gdy inkubacja z C2C12-ras CCM stymulowała, co najmniej 100 X wzrost fosforylacji TIE-2. Tę aktywność prawie całkowicie wyczerpano przez wstępną inkubację z C2C12-ras 10X CCM przez 90 minut w temperaturze pokojowej z 13 pg TlE-2 RB sprzęzonym z białkowymi kulkami G-Sepharose. Pożywki inkubowanej z samym białkiem G Sepharose nie pozbawiono tej aktywności fosforylacji.
189 639
Przykład 6 - Kloning ekspresji liganda TIE-2
Komórki COS-7 hodowano w pożywce Eagle'a modyfikowanej przez Dulbecco (DMEM), zawierającej 10% surowicę płodu bydlęcego (FBS), po 1% penicyliny i streptomycyny (P/S) i 2 mM glutaminę w atmosferze 5% CO2. Mysią linię komórkową mioblastów C2C12 ras hodowano w minimalnej podstawowej pożywce Eagle'a (EMEM) z 10% FBS, (P/S) i 2 mM glutaminą. Klony cDNA o pełnej długości mysiego liganda TIE-2 uzyskano przez przesiew biblioteki cDNA C2C12 ras w wektorze pJFE14, podlegającym ekspresji w komórkach COS. Wektor ten, jak ukazano w fig. 2, jest modyfikowaną wersją wektora pSRa (Takebe i in., 1988, Mol. Cell. Biol. 8:466-472). Bibliotekę utworzono przy użyciu dwóch miejsc restrykcji BSTX1 w wektorze pJFE14.
Komórki COS-7 krótkotrwale transfekowano albo biblioteką pJFE14 albo wektorem kontrolnym z użyciem protokołu transfekcji DEAE-dekstran. W skrócie, komórki COS-7 powleczono przy gęstości 1,0 x 106 komórek/100 mm płytki 24 godziny przed transfekcją. W celu transfekcji komórki hodowano w DMEM pozbawionej surowicy, zawierającej 400 μ g/ml DEAE-dekstran, 1 |iM chlorochiny i 2 mM glutaminę oraz 1 pg odpowiedniego DNA przez 3-4 godziny w temperaturze 37°C w atmosferze 5% CO2. Pożywki transfekcyjne aspirowano i zamieniono na PBS z 10% DMSO przez 2-3 minuty. Po tym „szoku” DMSO, komórki COS-7 umieszczono w DMEM z 10% FBS, po 1% penicyliny i streptomycyny oraz 2 mM glutaminą na 48 godzin.
Ponieważ ligand TIE-2 wydziela się, konieczne było uczynienie komórek przepuszczalnymi, w celu detekcji wiązania sondy ciałka receptorowego, z ligandem. Dwa dni po transfekcji, komórki przepłukano PBS, a następnie inkubowano z PBS, zawierającym 1,8% formaldehyd przez 15-30 minut w temperaturze pokojowej. Komórki następnie przemyto PBS i inkubowano przez 15 minut z PBS, zawierającym 0,1% Triton Χ-100 i 10% bydlęcą surowicę cielęcą, aby uczynić komórki przepuszczalnymi i zablokować miejsca wiązania nie specyficznego.
Przeprowadzono przesiew przez bezpośrednią lokalizację zabarwienia, przy użyciu ciałka receptorowego (RB) TIE-2, które składało się z zewnątrzkomórkowej domeny TIE-2 połączonej ze stałym regionem IgG1. To ciałko receptorowe wytworzono jak przedłożono w przykładzie 2. 100 mm płytkę transfekowanych, utrwalonych i przepuszczalnych komórek COS sondowano przez 30 minutową inkubację z TIE-2 RB. Następnie komórki przemyto dwukrotnie PBS i inkubowano przez dodatkowe 30 minut z PBS/10% bydlęcą surowicą cielęcą/koniugatem anty-ludzka IgG-fosfatazą alkaliczną. Po trzykrotnym przemyciu PBS, komórki inkubowano w substracie fosfatazy alkalicznej przez 30-60 minut. Potem płytkę zbadano pod mikroskopem pod względem obecności zabarwionych komórek. Dla każdej zabarwionej komórki, zdrapano z płytki mały obszar komórek łącznie z komórką zabarwioną, przy użyciu plastikowej końcówki pipety, odzyskano DNA plazmidu i użyto do elektroporacji komórek bakteryjnych. Zebrano pojedyncze kolonie bakteryjne uzyskane z elektroporacji i DNA plazmidu wypreparowany z tych kolonii użyto do transfekcji komórek COS-7, które sondowano pod względem ekspresji liganda TIE-2, co wykazano przez wiązanie z ciałkami receptorowymi TIE-2. Potwierdzenie ekspresji liganda TIE-2 otrzymano przez fosforylację receptora TIE-2 przy użyciu metody przedłożonej w przykładzie 5. Klon plazmidowy, kodujący ligand TIE-2 złożono z ATCC 7 października 1994 i oznaczono jako „pJFE14, kodujący ligand TIE-2” z numerem dostępu ATCC 75910.
Przykład 7 - Izolacja i sekwencjonowanie klonu cDNA o pełnej długości, kodującego ludzki ligand TIE-2
Bibliotekę cDNA płuca płodu ludzkiego w lambda gt-10 (patrz fig. 3) uzyskano z Clontech Laboratories, Inc. (Palo Alto, Ca). Łysinki powleczono przy gęstości 1,25 x 106/20x20 cm płytkę i otrzymano filtry z kopiami po standardowych procedurach (Sambrook i in., Molecular Cloning: A Laboratory Manuał, 2-gie wydanie, strona 8.46, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, Nowy Jork).
Izolację klonów ludzkiego liganda tie-2 przeprowadzono następująco. Fragment XhoI o 2,2 kb ze złożonego klonu liganda tie-2 (ATCC nr 75910 - patrz przykład 6 powyżej) oznakowano przez losowy priming do specyficznej aktywności, wynoszącej około 5x108 cpm/ng.
189 639
Hybrydację przeprowadzono w temperaturze 65°C w roztworze hybrydyzacyjnym, zawierającym 0,5 mg/ml DNA spermy łososia. Filtry przemyto w temperaturze 65°C w 2 x SSC, 0,1% SDS i poddano ekspozycji na błonę Kodak XAR-5 przez noc, w temperaturze -70°C. Fagi dodatnie oczyszczono w fysinkach. Lizaty fagowe czystego faga o wysokich mianach użyto do izolacji DNA poprzez kolumnę Qiagen, przy użyciu standardowych technik (Qiagen, Inc., Chatsworth, CA, katalog 1995, strona 36). dNa faga trawiono EcoRI, aby uwolnić klonowany fragment cDNA w celu późniejszego subkloningu. Wektor faga lambda, zawierający DNA ludzkiego liganda tie-2 złożono z ATCC 26 października 1994 z oznaczeniem λ gt10, kodujący ligand 1 htie-2 (numer dostępu ATCC 75928). DNA faga można poddać bezpośrednio analizie sekwencji DNa metodą terminacji łańcucha dideoksy (Sanger i in., 1977, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 74: 5463-5467).
Subkloning DNA ludzkiego liganda tie-2 do wektora ekspresji ssaka można uzyskać następująco. Klon λ gt10, kodujący ligand 1 htie-2 zawiera miejsce EcoRI położone 490 par zasad w dół od początku sekwencji kodującej dla ludzkiego liganda TIE-2. Region kodujący można wyciąć, stosując unikalne miejsca restrykcji w górę i w dół odpowiednio od kodonów inicjatorowych i przestankowych. Przykładowo, miejsce SpeI, położone 70 bp 5' wobec kodonu inicjatorowego i miejsce Bpu1102i (znane także jako BlpI), położone 265 bp 3' wobec kodonu przestankowego, można stosować do wycięcia pełnego regionu kodującego. Można go potem subklonować do wektora kloningowego pJFE14, przy użyciu miejsc XbaI (zgodny z nawisem SpeI) i PstI (oba miejsca PstI i Bpu1102i wytworzono z lepkimi końcami).
Region kodujący z klonu λgt10, kodującego ligand 1 htie-2 sekwencjonowano przy użyciu sekwencera DNA ABI 373A oraz Taq Dideoxy Terminator Cycle Sequencing Kit (Applied Biosystems, Inc., Foster City, CA). Sekwencję nukleotydową i wnioskowaną aminokwasową ludzkiego liganda TIE-2 z klonu λ gt10, kodującego ligand 1 tie-2, ukazano w fig. 4.
Oprócz tego, otrzymano pełnej długości klony cDNA ludzkiego ligada tie-2, przez skrining biblioteki cDNA ludzkiego glejaka T98G w wektorze pJEE14. Klony, kodujące ludzki ligand TIE-2 zidentyfikowano przez hybrydyzację DNA przy użyciu fragmentu Xhol o 2,2 kb ze złożonego klonu liganda tie-2 (ATCC nr 75910), jako sondy (patrz przykład 6 powyżej). Region kodujący sekwencjonowano przy użyciu sekwencera DNa ABI 373A oraz Taq Dideoxy Terminator Cycle Sequencing Kit (Applied Biosystems, Inc., Foster City, CA). Sekwencja ta była prawie identyczna z otrzymaną z klonu λ gt10, kodującego ligand 1 htie-2. Jak ukazano w fig. 4, klon λgt10, kodujący ligand 1 htie-2 zawiera dodatkową resztę glicynową, kodowaną przez nukleotydy 1114-1116. Sekwencja kodująca klon T98G nie zawiera tej reszty glicynowej lecz z drugiej strony, jest identyczna z sekwencją kodującą klonu λgt10, kodującego ligand 1 htie-2. Fig. 5 ukazuje sekwencję nukleotydową i wnioskowaną aminokwasową ludzkiego liganda TIE-2 z klonu T98G
Przykład 8 - Izolacja i sekwencjonowanie drugiego klonu cDNA pełnej długości, kodującego ludzki ligand TIE-2
Bibliotekę cDNA płuca płodu ludzkiego w lambda gt-10 (patrz fig. 3) uzyskano z Clontech Laboratories, Inc. (Palo Alto, CA). Łysinki powleczono przy gęstości 1,25 x 106/20x20 cm płytkę i otrzymano filtry z kopiami po standardowych procedurach (Sambrook i in., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2 wydanie, strona 8.46, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, Nowy Jork). Filtry z kopiami przesiano w warunkach niskiej surowości (2 x sSc, 55°C) za pomocą sond wykonanych wobec sekwencji ludzkiego liganda 1 TIE-2. jeden z powielonych filtrów sondowano sondą 5', 1 kodującą aminokwasy 25-265 ludzkiego liganda 1 TIE-2 jak przedłożono w fig. 4. Drugi powielony filtr sondowano sondą 3', kodującą aminokwasy 282-498 sekwencji ludzkiego liganda 1 TIE-2 (patrz fig. 4). Obie sondy hybrydyzowano w temperaturze 55°C w roztworze do hybrydyzacji, zawierającym 0,5 mg/ml DNA spermy łososia. Następnie filtry przemyto w 2 x SsC w temperaturze 55°C i poddano ekspozycji przez noc na błonę rentgenowską. Oprócz tego, filtry z kopiami hybrydyzowano także w normalnych warunkach (2 x SSC, 65°C) z sondą kodującą pełnej długości mysiego liganda 1 TIE-2 (F3-15, insert Xhol). Zebrano trzy dodatnie klony, wypełniające następujące kryteria: i. hybrydyzacji nie obserwowano wobec pełnej długości (mysiej) sondy w warunkach normalnej surowości, oraz ii. zaobserwowano hybrydyzację w warunkach niskiej surowości zarówno dla
189 639 sondy 5' jak i 3'. Trawienie EcoRI DNA faga uzyskane z tych klonów wskazało dwa niezależne klony o wielkości insertów, wynoszącej około 2,2 kb i około 1,8 kb. Insert EcoRI o 2,2 kb subklonowano do miejsc EcoRI zarówno pBluescript KS (Stratagene) jak i ssaczego wektora ekspresji odpowiedniego do stosowania w komórkach COS. Zidentyfikowano dwie orientacje dla wektora ekspresji ssaka. Insert o 2,2 kb w pBluescript KS złozono w ATCC 9 grudnia 1994 i oznczono jako pBluescript KS, kodujący ludzkie ligand 2 TIE-2. Miejsce początku sekwencji kodującej ligand 2 TIE-2 znajduje się około 355 par zasad w dół od miejsca EcoRI pBluescript.
Komórki COS-7 krótkotrwale transfekowano albo wektorem ekspresji albo wektorem kontrolnym z użyciem protokołu transfekcji DEAE-dekstran. W skrócie, komórki COS-7 powleczono przy gęstości 1,0 x 106 komórek/100 mm płytki 24 godziny przed transfekcją. W celu transfekcji komórki hodowano w DMEM pozbawionej surowicy, zawierającej 400 pg/ml DEAE-dekstran, 1 jiM chlorochiny i 2 mM glutaminę oraz 1 pg odpowiedniego DNA przez 3-4 godziny w temperaturze 37°C w atmosferze 5% CO2. Pożywki transfekcyjne aspirowano i zamieniono na solankę buforowaną fosforanem z 10% DMSO przez 2-3 minuty. Po tym „szoku” DMSO, komórki COS-7 umieszczono w DMEM z 10% FBS, po 1% penicyliny i streptomycyny oraz 2 mM glutaminą na 48 godzin.
Ponieważ ligand TIE-2 wydziela się, konieczne było uczynienie komórek przepuszczalnymi, w celu detekcji wiązania sondy ciałka receptorowego, z ligandem. Transfekowane komórki COS-7 powleczono przy gęstości 1,0 x 106 komórełkl00 mm płytkę. Komórki przepłukano PBS, a następnie inkubowano z PBS, zawierającym 1,8% formaldehyd przez 15-30 minut w temperaturze pokojowej. Komórki następnie przemyto PBS i inkubowano przez 15 minut z PBS, zawierającym 0,1% Triton Χ-100 i 10% bydlęcą surowicę cielęcą, aby uczynić komórki przepuszczalnymi i zablokować miejsca wiązania nie specyficznego. Przeprowadzono przesiew przez bezpośrednią lokalizację zabarwienia, przy użyciu ciałka receptorowego TIE-2, które składało się z zewnątrzkomórkowej domeny TIE-2 połączonej ze stałym regionem IgGl. To ciałko receptorowe wytworzono jak przedłożono w przykładzie 2. Transfekowane komórki COS sondowano przez 30 minutową inkubację z ciałkiem receptorowym TIE-2. Następnie komórki przemyto dwukrotnie PBS, utrwalono w metanolu i potem inkubowano przez dodatkowe 30 minut z PBS/10% bydlęcą surowicą cielęcą/koniugatem antyludzka IgG-fosfataza alkaliczna. Po trzykrotnym przemyciu PBS, komórki inkubowano w substracie fosfatazy alkalicznej przez 30-60 minut. Potem płytkę zbadano pod mikroskopem pod względem obecności zabarwionych komórek. Komórki, wykazujące ekspresję jednej orientacji klonu, lecz brak drugiej orientacji, jak się okazało, wiążą ciałko receptorowe TIE-2.
Fachowiec łatwo zauwazy, że opisane metody można stosować do dalszej identyfikacji innych pokrewnych członków rodziny liganda TIE.
Region kodujący z klonu pBluescript KS, kodującego ludzki ligand 2 TIE-2 sekwencjonowano przy użyciu sekwencera DNA aBi 373A oraz Taq Dideoxy Terminator Cycle Sequencing Kit (Applied Biosystems, Inc., Foster City, CA). Sekwencję nukleotydową i wnioskowaną aminokwasową ludzkiego liganda TIE-2 z klonu pBluescript KS, kodującego ludzki ligand 2 TIE-2, ukazano w fig. 6.
Przykład 9 - Ligand TIE-2 jest antagonistą receptora
Kondycj onowane pożywki z komórek COS, wykazujących ekspresję albo liganda 2 TIE-2 (TL2) albo liganda 1 TIE-2 (TL1) porównano pod względem ich zdolności do aktywacji receptorów TIE-2 naturalnie obecnych w ludzkiej linii komórek śródbłonka.
Odczynik Lipofektaminę (GIBCO-BRL, Inc.) oraz zalecane protokoły, użyto do transfekcji komórek COS-7 albo samym wektorem ekspresji pJFE14, wektorem pJFE14, zawierającym cDNA ludzkiego liganda 1TIE-2 albo wektorem ekspresji pMT21 (Kaufman, R.J., 1985, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 82: 689-693), zawierającym cDNA ludzkiego liganda 2 TIE-2. Pożywki COS, zawierające wydzielone ligandy zebrano po trzech dniach i zatężono 20-krotme przez diafiltrację (błony ultrafiltracyjne DIAFLO, Amicon, Inc.). Określono ilość aktywnego liganda 1 TIE-2 oraz liganda 2 TIE-2 obecnego w tych pożywkach i wyrażono jako ilość (jednostkach rezonansowych, R.U.) specyficznej aktywności wiązania receptora TIE-2 mierzonej w teście wiązania BIAcore.
189 639
Analizy Nothem (RNA) ujawniły istotny poziom transkryptów TIE-2 w ludzkich pierwotnych komórkach śródbłonkowych (Clonetics, Inc.) HAEC (ludzkie aortalne komórki śródbłookowę). Zatem, tych komórek użyto do badania czy receptor TIE-2 uległ fosforylacji tyrodynowej po poddaniu ekspozycji na pożywki COS, zawierające ligandy TIE-2. Komórki HAEC utrzymywano w kompletnej pożywce do hodowli komórek śródbłonkowych (Claoetics, Inc.), która zawierała 5% płodowej surowicy bydlęcej, rozpuszczony ekstrakt mózgu bydlęcego, 10 ng/ml hydrokortyzonu, 50 mg/ml gentamycyny i 50 ng/ml amfaterycyoy-B. Dokonano oceny czy TL1 i TL2 mogły aktywować receptor TIE-2 w komórkach HAEC, w następujący sposób. Semi-konflueotnę komórki HAEC pozbawiono surowicy na dwie godziny w MEM Dulbecco z wysoką zawartością glukozy, z dodatkiem L-glutaminy i penicylinystreptomycyny w tęmępraturze 37°C, po czym damięniono ubogą pożywkę na kandycjonowane pożywki COS, zawierające ligand, na 7 minut w temperaturze 37°C w inkubatorze z 5% CO2. Komórki poddano następnie lizie i odzyskano białko receptora TIE-2 przez immunaprecypitację lizatów za pomocą antysęrum peptydu TIE-2, następnie przez Western blotting z aotyserum aotyfasfotyrodynowym, dokładnie jak opisano w przykładzie 1. Wyniki ukazano w fig. 7. Poziom fasfatyradyny na receptorze TIE-2 (TIE-2-R) indukowano przez traktowanie komórek HAEC ligandem 1 TIE-2 (tor L1) lecz nie ligandem 2 TIE-2 (tor l2) konSycjaoowanych pożywek COS. MOCK jest konSycjonową pożywką z COS transfekowanych pustym wektorem JFE14.
Dowód, że oba TL1 i TL2 specyficznie wiążą się z receptorem TIE-2 przedstawiono stosując 'BIAcOre do testowania specyficznej aktywności wiązania receptora TIE-2 w transfekowanych pożywkach COS i przez immunobarwieoię komórek COS, wykazujących ekspresję TL1 i TL2 za pomocą ciałek receptorowych TIE-2.
Ponieważ TL2 nie aktywuje receptora TIE-2, zgłaszający postanowili określić, czy TL2 mógłby służyć jako antagonista aktywności TL1. Przeprowadzono testy fosforylacji HAEC, w których komórki inkubawaoa najpierw z „nadmiarem” TL2, po czym dodano rozcieńczony TL1. Spowodowane to było tym, ze wcześniejsze zajęcie receptora TIE-2 w związku z wysokim poziomem TL2 mogło zapobiec późniejszej stymulacji receptora po ekspozycji wobec TL1 obecnego w ograniczonym stężeniu.
Semi-konfluęntne komórki HAEC pozbawiono surowicy jak opisano powyżej, a potem iokubowano przez 3 minuty w temperaturze 37°C z 1-2 ml kondycjonowanej pożywce z 20X COS/JFE14-TL2. Płytki kontrolne potraktowano pożywką tylko z 20X COS/JFE14 (MOCK). Płytki usunięto z inkubatora i następnie dodaoa różne rozcieńczenia pożywki COS/JFE14-TL1, po czym dodatkowo ίnkubawana płytki przez 5-7 minut w temperaturze 37°C. Później komórki przepłukano, poddano lizie i zbadano fosforylację tyrozynową specyficzną dla TIE-2 w lizatach przez immunoprecypitację receptorową i Western blotting, jak opisano powyżej. Wykaoeno rozcieńczenia TL1 przy użyciu pożywki 20X COS/JFE14-TL1 rozcieńczoną do 2X, 0,5X, 0,1X lub 0,02X, przez dodanie samej pożywki 20X COS/JFE14. Test początkowych pożywek 20X TL1 i 20X TL2 COS przy użyciu technologii bioczujnika BIAcore wskazał, ze zawierały one podobne ilości aktywności wiązania specyficznych dla TIE-2, to jest 445 R.U. i 511 R.U. dla TL1 oraz TL2 odpowiednio. Wyniki Western biot antyfosfotyrazyny, ukazane w fig. 8, wskazują, ze w porównaniu z wcześniejszym traktowaniem komórek COS pożywką MOCK (tor 1), wcześniejsze trektawenię komórek HAEC nadmiarem liganda 2 TIE-2 (tor 2) antagonizuje późniejszą zdolność liganSa 1 TIE-2 do aktywacji receptora TIE-2 (TIE-2-R).
Zdolność TL2 do kompetytywnego hamowania aktywacji TL1 TIE-2-R pokazono dodatkowo przy użyciu ludzkiej hybrydowej linii komórkowej, EA.hy926 (patrz przykład 21 pod względem szczegółowego opisu tej linii komórkowej i jej utrzymywania). Przeprowadzono doświadczenia, w których niezatężone pożywki komórek COS, zawierające TL1 mięszooo przy zmieniających się razcięńezeniaeh albo z kanSycjanowanymi pożywkami MOCK albo TL2 i umieszczono na pojedynczej warstwie komórkowej EA.hy926 pozbawionej surowicy, na 5 minut w temperaturze 37°C. Następnie pożywki usunięto, komórki zebrano przez lizę i zbadano fosforylację tyrozynową specyficzną dla TIE-2 przez Western blot, jak apisaoa powyżej. Fig. 9 ukazuje doświadczenie, które obejmuje trzy grupy traktoweoia, jak uwidoczniono
189 639 od lewej do prawej. Jak ukazano w czterech torach z lewej, traktowanie komórek EA.hy926 samym lx COS-TL1 silnie aktywowało endogeniczny 'ΠΕ-2-R w tych komórkach, podczas gdy pożywka lx TL2 COS była nieaktywna. Jednakże mieszanina TL1 albo z mOCk albo TL2 wykazała, że TL2 może blokować aktywność TL1 w sposób zależny od dawki. W środkowych trzech parach torów udział TL2 (lub MOCK) był zmniejszony, podczas gdy ilość TL1 w mieszaninie była odpowiednio zwiększona od 0,lx do 0,3x. W każdej z tych mieszanin stosunki torów TL1:TL2 wykazały mniejszy poziom fosforylacji TIE-2-R w porównaniu z odpowiadającymi torami TLl:MOCK. Gdy ilość TL1 utrzymywała się na stałym poziomie i ilość TL2 (lub MOCK) zmniejszała się, osiągano jednak punkt (ukazane w trzech parach torów po prawej), w którym TL2 w próbce był zbyt rozcieńczony, aby skutecznie hamować aktywność TL1. Relatywną ilość każdego z ligandów obecnych w tych kondycjonowanych pożywkach COS, można było oszacować z ich jednostek wiązania, jak zmierzono przez test BIAcore i z Western biot pożywek COS za pomocą przeciwciał specyficznych dla liganda. W konsekwencji, możemy wnioskować, że tylko nadmiar o kilkukrotnej molamości TL2 jest konieczny do skutecznego blokowania aktywności TL1 in vitro. Jest to istotne, ponieważ zaobserwowaliśmy różne przykłady in vivo (patrz przykład 17 i fig. 16), gdzie mRNA TL2 występuje w znacznej ilości w stosunku do TL1. Tak więc, TL2 może pełnić ważną fizjologiczną rolę w skutecznym blokowaniu sygnału przez TIE-2-R w tych miejscach.
Biorąc razem, dane te wskazują, że inaczej niż TL1, TL2 nie jest zdolny do stymulowania endogenicznej ekspresji TIE-2-R na komórkach śródbłonka. Ponadto, nadmiar TL2 o kilkakrotnej molamości może blokować stymulację TL1 receptora TIE-2, wskazując, że TL2 jest naturalnie występującym antagonistą receptora TIE-2.
Przykład 10 - Identyfikacja aktywności wiązania specyficznego dla TIE-2 w kondycjonowanej pożywce i supematantach komórek COS
Aktywność wiązania 10x CCM z linii komórkowych CsC12-ras, Rat2ras, SHEP i T98G lub supematantów komórkowych COS po transfekcji albo ludzkim ligandem 1 TIE-2 (hTLl) albo ludzkim ligandem 1 TIE-2 (hTL2) mierzono przy użyciu technologii bioczujnika (BIAcore; Pharmacia Biosensor, Piscataway, NJ), który monitoruje interakcje biomolekulame w czasie rzeczywistym przez rezonans powierzchniowy plazmonu (SPR). Oczyszczone szczurze lub ludzkie TIE-2 RB sprzęzono kowalentnie przez aminy pierwszorzędowe z warstwą dekstranu karboksymetylu płytki czujnika klasy badawczej CMS (Pharmacia Biosensor, Piscataway, NJ). Powierzchnię płytki czujnika aktywowano przy użyciu mieszaniny N-hydroksysukcynoimidu (NHS) oraz N-etylo-N'-(3-dimetyloaminopropylo)karbodiimidu (EDC), po czym przez unieruchomienie TIE-2 RB (25 pg/ml, pH 4,5) i deaktywację miejsc, które nie przereagowały 1,0 M etanoloaminą (pH 8,5). Ogólnie, z płytką czujnika sprzężono 9000-10000 RU każdego ciałka receptorowego.
Buforem do przebiegu stosowany w układzie był HBS (10 mM Hepes, 150 mM NaCl, 0,005% środek powierzchniowo czynny P20, pH 7,4). Próbki wirowano przez 15 minut w temperaturze 4°C i dalej sklarowano przy użyciu jałowego filtru wiążącego małe białka 0,45 (im (Millipore; Bedford, MA). Dekstran (2 mg/ml) i środek powierzchniowo czynny P20 (0,005%) dodano do każdej próbki. Równe ilości 40 pil wstrzyknięto przez unieruchomioną powierzchnię (albo szczurzą albo ludzką) przy prędkości przepływu 5 pl/minutę, i monitorowano wiązanie receptora przez 8 minut. Aktywność wiązania (jednostki rezonansowe, RU) mierzono jako różnicę między wartością linii podstawowej określoną 30 sekund przed injekcją próbki, a pomiarem pobranym 30 sekund po injekcji. Regenerację powierzchni uzyskano za pomocą jednego pulsu 12 fil 3 M MgCl2.
Próbki CCM (C2C12-ras, Rat2-ras, SHEP, T98G) testowano na powierzchni unieruchomionej szczurzym TIE-2 RB, podczas gdy rekombinowany hTLl i hTL2 testowano na powierzchni unieruchomionej ludzkim TIE-2 RB. W każdym wypadku, specyficzne wiązanie ciałka receptorowego TIE-2 oceniono przez inkubację próbek z 25 jjg/ml albo rozpuszczalnego TIE-2 RB (szczurzego lub ludzkiego) albo trkB RB przed testowaniem aktywności wiązania. Jak ukazano w fig. 10 i 11, dodanie rozpuszczalnego trkB RB powoduje lekkie zmniejszenie aktywności wiązania TIE-2, podczas gdy dodanie rozpuszczalnego TlE-2 RB znacznie zmniejsza aktywność wiązania w porównaniu z mierzoną przy nieobecności TIE-2 RB.
189 639
Przykład 11- TIE-2 RB specyficznie blokuje aktywację receptora TIE-2 przez ligand 1 TIE-2
Zgłaszający starał się określić, czy rozpuszczalne TIE-2 RB może służyć jako kompetytywny inhibitor do blokowania aktywacji receptora TIE-2 przez ligand 1 TIE-2 (TL1). Aby to wykonać, pożywki COS, zawierające TL1 inkubowano wstępnie albo z TIE-2 RB albo TrkBRB, a potem porównano pod względem ich zdolności do aktywacji receptorów TIE-2 naturalnie obecnych w ludzkiej linii komórkowej śródbłonka.
Wytworzono kondycjonowane pożywki COS z komórek COS-7 transfekowanych albo samym wektorem ekspresji pJFE14 (MOCK), albo wektorem pJFE14, zawierającym cDNA ludzkiego liganda 1 TIE-2 (TL1) i zebrano zgodnie z opisem w przykładzie 9 powyżej, z takim wyjątkiem, ze pożywki poddano jałowej filtracji lecz nie zatężano. Określono ilość TL1 i wyrażono jako ilość (w jednostkach rezonasowych R.U.) aktywności wiązania specyficznej dla receptora TIE-2 mierzonej w teście wiązania BIAcore.
Analizy Nothem (RNA) ujawniły istotny poziom transkryptów tie-2 w ludzkich pierwotnych komórkach śródbłonkowych HUVEC (ludzkie komórki śródbłonka żyły pępkowej) (Clonetics, Inc.). Zatem, komórki te użyto do zbadania, czy receptor TIE-2 może ulegać fosforylacji tyrozynowej po ekspozycji w obecności TIE-2 lub TrkB-RB wobec pożywek COS, zawierających TL1. Komórki COS utrzymywano w temperaturze 37°C, 5% CO2 w kompletnej pożywce do hodowli komórek śródbłonka (Clonetics, Inc.), która zawierała 5% płodowej surowicy bydlęcej, rozpuszczalnego ekstraktu mózgu bydlęcego z 10 pg/ml heparyny, 10 ng/ml ludzkiego EGF, 1 pg/ml hydrokortyzonu, 50 pg/ml gentamycyny i 50 ng/ml amfoterycyny-B. Ocenę, czy TL1 mógł aktywować receptor TIE-2 w komórkach HUVEC, przeprowadzono następująco. Konfluentne płytki z komórkami HUVEC pozbawiono surowicy na dwie do czterech godzin w MEM Dulbecco z niskim poziomem glukozy w temperaturze 37°C, 5% CO2, po czym inkubowano przez 10 minut w ubogiej pożywce, która zawierała 0,1 mM ortowanadan sodu, silny inhibitor fosfataz fosfotyrozynowych. W międzyczasie, kondycjonowane pożywki COS inkubowano wstępnie 30 minut w temperaturze pokojowej albo z TIE-2 RB albo TrkB-RB dodanych do 50 pg/ml. Ubogą pożywkę usunięto następnie z płytek HUVEC i inkubowano z pożywkami COS, zawierającymi RB przez 7 minut w temperaturze 37°C. Komórki HUVEC poddano potem lizie i odzyskano białko receptora TIE-2 przez immunoprecypitację za pomocą antyserum peptydu TIE-2, następnie przez Western blotting z przeciwciałem anty-fosfotyrozynowym, jak opisano w przykładzie 1. Wyniki ukazano w fig. 12. Poziom fosfotyrozyny na receptorze TIE-2 indukowano przez potraktowanie komórek HUVEC ligandem 1 TIE-2 (TL1) w stosunku do widocznego dla pożywki kontrolnej (MOCK) i indukcja ta jest specyficznie blokowana przez wcześniejszą inkubację z TIE-2-RB (TIE-2-Fc), lecz nie przez inkubację z TrkB-RB (TrkB-Fc). Dane te wskazują, ze rozpuszczalne TIE-2 RB może służyć jako selektywny inhibitor blokowania aktywacji receptora TIE-2 przez ligand 1 TIE-2.
Przykład 12 - Konstrukcja ciałek ligandowych TIE-2
Utworzono konstrukcję ekspresji, która dawałaby wydzielone białko, składające się z całej sekwencji kodującej ludzki ligand 1 TIE-2 (TL1) lub ligand 2 TIE-2 (TL2) połączony przez fuzję z regionem stałym ludzkiej immunoglobuliny gamma-1 (IgG1 Fc). Te białka fuzyjne nazywa się „ciałkami ligandowymi” (TL1-Fc lub TL2-Fc). Część Fc tL1-Fc i TL2-Fc wytworzono następująco. Fragment DNA, kodujący część Fc ludzkiej IgG1, który rozciąga się od regionu zawiasowego do końca karboksylowego białka, powielono z cDNA ludzkiego łożyska przez PGR, za pomocą oligonukleotydów, odpowiadających opublikowanej sekwencji ludzkiej IgG1; uzyskany fragment DNA klonowano w wektorze plazmidowym. Odpowiednie fragmenty restrykcyjne DNA z plazmidu, kodującego TL1 lub TL2 o pełnej długości i z plazmidu ludzkiej IgG1 Fc, poddano ligacji w obu miejscach fragmentu pochodzącego z krótkiej PGR, który przeznaczono do fuzji, w ramce, z sekwencjami, kodującymi białko TL1 lub TL2 i ludzką IgG1 Fc.
Miligramowe ilości TL2-Fc otrzymano przez kloning fragmentu DNA TL2-Fc do wektora bakulowirusa pVL1393 i następne zakazenie owadziej linii komórkowej Spodoptera frugiperda SF-21AE. Alternatywnie można stosować linię komórkową SF-9 (ATCC numer
189 639 dostępu CRL-1711) lub linię komórkową BTI-TN5bl-4. DNA, kodujący TL2-Fc RB klonowano jako fragment EcoRI-Notl do plazmidu transferowego bakulowirusa pVL1393. DNA plazmidu rekombinowano do DNA wirusa przez mieszanie 3 pg DNA plazmidu z 0,5 |ig DNA Baculo-Gold (Pharminigen), po czym wprowadzono do liposomów, przy użyciu 30 jg Lipofectin (GIBCO-BRL). Mieszaniny DNA-liposom dodano do komórek SF-21AE (2x 10° komórek/60 mm płytkę) w pożywce TMN-FH (modyfikowana pożywka komórek owadzich Grace'a (GE3CO-BRL)) przez 5 godzin w temperaturze 27°C, po czym inkubowano w temperaturze 27°C przez 5 dni w pożywce TMN-FH uzupełnionej 5% surowicą płodu cielęcego. Pożywkę hodowli tkankowej zebrano do oczyszczania łysinek rekombinowanych wirusów, co wykonano przy użyciu metod opisanych wcześniej (D.R.O'Reilly, L.K. Miller i V.A.Luckow, Baculovirus Expression Vectors - A Laboratory Manual, 1992, Nowy Jork: W.H.Freeman, z takim wyjątkiem, ze nalana warstwa agarozowa zawierała 125 pg/ml X-gal (5-bromo-4-chloro-3-indolilo-p-D-galaktopiranozyd; GIBCO-BRL). Po 5 dniach inkubacji w temperaturze 27°C, nie rekombinowane łysinki oceniono ilościowo przez dodatnią reakcję chromogeniczną wobec substratu X-gal i zaznaczono ich pozycje. Łysinki rekombinowane uwidoczniono potem przez dodanie drugiej nadlewki, zawierającej 100 pg/ml MTT (bromku 3-[4,5-di-metylotiazol-2-ilo]-2,5-difenylotetrazolium; Sigma). Łysinki z przypuszczalnie rekombinowanym wirusem zebrano przez podłączenie aspiracji i oczyszczono przez wyodrębnianie z wielokrotnym okrążeniem łysinek, aby zapewnić jednorodność. Utworzono zbiory wirusów przez seryjne pasażowanie z niską wielokrotnością oczyszczonych łysinek wirusa. Wytworzono zbiory o niskim pasażowaniu jednego klonu wirusa (vTL2-Fc Klon #7).
Komórki SF-21AE hodowano w pożywce pozbawionej surowicy (SF-900 II, Gibco BRL), zawierającej IX roztworu antybiotyk/środek przeciwgrzybowy (Gibco BRL) i 25 mg/litr Gentamycyny (Gibco BRL). Jako środek powierzchniowo czynny dodano Pluronic F-68 do końcowego stężenia, wynoszącego 1 g/litr. Hodowle (4litry) pobudzono w bioreaktorze (Artisan Cell Station System) przez, co najmniej trzy dni przed infekcją. Komórki hodowano w temperaturze 27°C, przy traktowaniu rozpuszczonym 50% tlenem, przy prędkości przepływu gazu, wynoszącym 80 ml/minutę (napowietrzanie z pierścieniem zraszającym). Mieszano za pomocą wirnika okrętowego przy prędkości 100 obrotów na minutę. Komórki zebrano w fazie wzrostu środkowo-logarytmicznej (~2 XI O6 komórek/ml), zatęzono przez wirowanie i zakazono 5 jednostkami tworzącymi łysinki ciałka receptorowego vTL2-Fc na komórkę. Komórki i szczep doprowadzono do 400 ml za pomocą świeżej pożywki i wirus adsorbowano przez 2 godziny w temperaturze 27°C w obracanej kolbie. Następnie hodowlę zawieszono ponownie w końcowej objętości 8 litrów świeżej pożywki pozbawionej surowicy, a komórki ipkubowapo w bioreaktorze stosując wcześniej opisane warunki.
Pożywkę hodowlaną komórek SF21AE infekowanych vTL2-Fc zebrano przez wirowanie (500 x g, 10 minut) 72 godziny po infekcji. Supematanty komórkowe doprowadzono do pH 8 za pomocą NaOH. Dodano EDTA do końcowego stężenia 10 mM i pH supematantów ponownie wyregulowano na 8. Supematanty przesączono (0,45 pm, Millipore) i załadowano na kolumnę A dla białek (protein A sepharose 4 fast flow albo HiTrap protein A, oba od Pharmacia). Kolumnę przemyto PBS, zawierającym 0,5 M NaCl dotąd, aż absorbancja przy 280 nm zmniejszyła się do linii podstawowej. Kolumnę przemyto w PBS i wymywano 0,5 M kwasem octowym. Frakcje kolumnowe natychmiast zobojętniono przez elucję do rur, zawierających 1 M Tris pH 9. Frakcje szczytowe, zawierające TL2-Fc zlano i dializowano przeciw PBS.
Przykład 13 - Ekspresja TIE-1, TIE-2, TLI i Tl 2 w raku komórek nerkowych
Przeprowadzono doświadczenia hybrydyzacji in situ na ludzkiej tkance guza raka komórek nerkowych, przy użyciu sond cDNA TIE-1, TIE-2, TLI i TL2. Ekspresja TIE-2, TIE-1, TLI i TL2 była podwyzszona w unaczypieniu guza. Ekspresja liganda zlokalizowana była jak się okazało, albo w komórkach śródbłonka naczyniowego (TL2) albo tuż przy komórkach śródbłonka naczyniowego w mezenchymie (TLI). Okazało się, ze VEGF był dramatycznie podwyzszony w tej tkance guza. Brown i in., Am. J. Pathol. 143:1255-1262 (1993).
189 639
Przykład 14 - Ekspresja TIE-1, TIE-2, TLI i TL2 podczas gojenia rany
Przeprowadzono doświadczenia hybrydyzacji in situ na przekrojach poprzecznych tkanki otrzymanych z modelu gojenia naskórka szczura, przy użyciu sond cDNA TIE-1, TIE-2, TLI i TL2. Model gojenia rany obejmuje wciśnięcie małego korkowego przyrządu do nacinania w skórę szczura i usunięcie małego cylindrycznego kawałeczka skóry. Gdy gojenie rozpoczyna się u podstawy rany, pobiera się pionowe skrawki tkanki i stosuje do hybrydyzacji in situ. W testowanej próbce tkanki, TLI i TL2 wykazały lekko podwyższoną ekspresję cztery dni po uszkodzeniu. W przeciwieństwie do lekko podwyższonej ekspresji TLI i TL2 w tej tkance, ekspresja VEGE, która może poprzedzać ekspresję TLI i TL2, jest podwyższona dramatycznie.
Przykład 15 - Ekspresja ligandów w wątrobie i grasicy płodu
Przeprowadzono PGR z odwrotną transkrypcją (RT-PCR) na mysiej wątrobie płodowej E14.5 i mysiej grasicy płodowej El7.5. Elektroforeza w żelu agarozowym produktów RT-PCR ujawniła, ze w mysiej wątrobie płodowej, RNA liganda 1 TIE-2 (TLI) jest liczny w regionie zrębowym, lecz jest nieobecny w krwiotwórczych komórkach prekursorowych c-eiΐTER119. W tej samej tkance, ligand 2 TIE-2 (TL2) jest liczny w komórkach zrębu lecz nieobecny w krwiotwórczych komórkach prekursorowych (fig. 13). W mysiej grasicy płodowej, TL2 jest liczny w komórkach zrębu (fig. 14).
Przykład 16 - Układ receptor TIE/ligand w angiogenezie
Mimo, że okazuje się, że układ TIE-2/ligand TIE odgrywa istotną rolę w biologii komórek śródbłonkowych, nie wykazano, że odgrywa on znaczącą, aktywną rolę we wczesnych i pośrednich etapach unaczynienia (np. proliferacji i migracji komórek angioblastu lub śródbłonka, tworzenia rurek i innych wczesnych zdarzeń etapowych w kształtowaniu naczyń). Przeciwnie do receptorów i czynników znanych jako pośredniczących w tych aspektach rozwoju unaczynienia, czasowo późny wzór ekspresji TIE-2 i TLI w przebiegu unaczynienia, sugeruje, że ten układ odgrywa inną rolę w ostatnich etapach rozwoju unaczynienia, łącznie z różnicowaniem strukturalnym i funkcjonalnym oraz stabilizacją nowych naczyń krwionośnych. Wzór ekspresji TIE-2/TL1 jest także zgodny z ciągłą rolą w utrzymaniu spójności strukturalnej i/lub charakterystyką fizjologiczną ustabilizowanego unaczynienia.
Ligand 2 TIE (TL2) jest jak się okazuje inhibitorem kompetytywnym TLI. Charakterystyka przestrzenno-czasowa ekspresji TL2 sugeruje, ze ta pojedyncza cząsteczka hamująca może odgrywać wieloraką, zależną od okoliczności rolę zasadniczą wobec prawidłowego rozwoju naczyniowego lub ponownego modelowania (np. destabilizacji/innego różnicowania dojrzałych komórek śródbłonkowych, pozwalając na tworzenie się nowych naczyń z istniejącego unaczynienia, hamowanie nieprawidłowego tworzenia się naczyń krwionośnych oraz regresję/inwolucję dojrzałych naczyń krwionośnych). Fig. jest schematycznym przedstawieniem hipotetycznej roli TIE-2/ligand TIE w angiogenezie. W tym rysunku TLI przedstawiono przez (·), TL2 przedstawiono jako (*), TIE-2 przedstawiono jako (T), VEGF przedstawiono jako ([]), a flk-1 (receptor VEGF) przedstawiono jako (Y).
Przykład 17 - Ekspresja ligandów TIE w żeńskim układzie rozrodczym: ekspresja w jajniku
Wstępne obserwacje uczynione w doświadczeniach, badających ekspresję receptorów TIE i ligandów w żeńskim układzie rozrodczym, są zgodne z hipotezą, że TLI odgrywa rolę w nowounaczynieniu, które w czasie postępuje za VEGF. Wzór ekspresji TL2 jest także zgodny z antagonizmem działania TLI i specyficzną rolą w regresji unaczynienia. Aby to zweryfikować, można zbadać ekspresję omawianych mRNA, po doświadczalnej indukcji rozwoju pęcherzyków i ciałka żółtego tak, ze ich czasową relację do różnych aspektów nowounaczynienia/regresji unaczynienia można dokładniej określić (np. w połączeniu z barwieniem komórek śródbłonkowych, wypełnieniem naczyń). Przeprowadzono angiogenezę związaną z rozwojem pęcherzyka i tworzeniem się ciałka żółtego w jajnikach na odpowiednim etapie dojrzałych samic szczurów lub po indukowanej owulacji u zwierząt przed dojrzewaniem, przy użyciu hybrydyzacji in situ. Fig. 16 zawiera fotografie płytek hybrydyzacji in situ, ukazujące wzór ekspresji w czasie TIE-2, TLI, TL2 i VEGF, podczas cyklu owulacyjnego [Kolumna 1: wczesny pęcherzyk przedowulacyjny; kolumna 2: pęcherzyk przedowulacyjny; kolumna 3:
189 639 wczesne ciałko żółte; kolumna 4: zarośnięty pęcherzyk; rząd A: pole jasne; rząd B: VEGF;
rząd C: TL2; rząd D: TLI; i rząd E: receptor TIE-2]. Badania te ujawniły, że VEGF, TLI i TL2 ulegają ekspresji w sposób skoordynowany w czasie i przestrzeni pod względem rozwoju i regresji unaczynienia w jajniku, konkretnie pod względem ustalenia układu naczyniowego tworzonego w przebiegu przemiany pęcherzyka Graafa w ciałko żółte (CL).
W skrócie, ekspresja VEGF zwiększa się w warstwie ziarnistej pęcherzyka przed jego unaczynieniem w czasie procesu luteinizacji. Podczas procesu tworzenia się CL, widoczny jest wyższy poziom ekspresji VEGF w środku rozwijającego się CL, w sąsiedztwie luteinizujących komórek, które nie uległy jeszcze unaczynieniu. Poziom VEGF pozostaje średnio wysoki i rozkłada się równomiernie w rozwiniętym CL. Przeciwnie, widocznie wzmocniona ekspresja liganda 1 TIE-2 występuje tylko na późnym etapie procesu tworzenia się CL, po ustaleniu pierwotnego splotu naczyniowego.
TL2 wykazuje bardziej złożony wzór ekspresji niż VEGF czy TLI. W rozwoju CL, ekspresja TL2 zachodzi przy wyzszym poziomie z przodu rozwijającego się splotu naczyniowego - między środkowym regionem nie unaczynionym CL, gdzie ekspresja VEGF jest najwyzsza, a najbardziej obwodową częścią CL, gdzie przede wszystkim zachodzi ekspresja TLI i gdzie proces luteinizacji jest zakończony, a układ naczyniowy jest najbardziej dojrzały. Wydaje się także, ze ekspresja TL2 zachodzi na wysokim poziomie w warstwie pęcherzykowej wielkich pęcherzyków, w których ma miejsce zarastanie.
Wzór ekspresji opisany powyżej, jest najbardziej zgodny z rolą VEGF w inicjowaniu angiogenezy, przy czym TLI działa późno w tym procesie, np. w modelowaniu i/lub stabilizacji ostatecznej sieci naczyniowej. Przeciwnie, TL2 jest obecny zarówno w obszarach aktywnej ekspansji nowo tworzącej się sieci naczyń (w czasie tworzenia się CL) oraz w regionach, które wykazują brak ustalonego nowego unaczynienia i postępuje regresja naczyń (zarośnięte pęcherzyki). Sugeruje to bardziej dynamiczną i kompleksową rolę dla TL2, prawdopodobnie związaną z destabilizacją istniejącego unaczynienia (konieczną do regresji) lub rozwojem unaczynienia (koniecznym do dynamicznego modelowania nowo tworzących się naczyń).
Przykład 18 - Test wiązania ciałka receptorowego i test wiązania oraz współzawodnictwa liganda
Ilościowy test wiązania z wolną komórką z dwoma kolejnymi formatami, wykorzystano do detekcji wiązania ciałka receptorowego TIE-2 albo wiązania liganda oraz współzawodnictwa. W wersji testu wiązania ciałka receptorowego, ligandy TIE-2 (oczyszczonego lub częściowo oczyszczonego; albo TLI albo TL2) powleka się na płytkę ELISA. Następnie dodaje się ciałko receptorowe o zmieniających się stężeniach, które wiąże się z unieruchomionym ligandem, w sposób zależny od dawki. Po dwóch godzinach, wypłukuje się nadmiar ciałka receptorowego, potem ocenia się ilość związaną z płytką przy użyciu specyficznego anty-ludzkiego przeciwciała Fc, które oznakowano fosfatazą alkaliczną. Nadmiar przeciwciała reporterowego wypłukuje się, następnie wywołuje się reakcję AP przy użyciu barwnego substratu. Test ocenia się ilościowo przy użyciu spektrofotometru. Fig. 19 ukazuje typową krzywą wiązania TIE-2-IgG. Test ten stosowano do oceny spójności TIE-2-IgG po injekcji szczurów i myszy. Test można także stosować w tym formacie jako test współzawodnictwa liganda, w którym oczyszczone lub częściowo oczyszczone ligandy TIE współzawodniczą z unieruchomionym ligandem pod względem ciałka receptorowego. W wersji testu wiązania liganda i współzawodnictwa, ektodomenę TIE-2 powleka się na płytce ELISA. Fragmenty domeny podobnej do fibrynogenu oznakowanej Fc ligandów TIE (TLl-fFc i TL2-fFc) wiążą się potem z ektodomeną i można je wykrywać przy użyciu tego samego anty-ludzkiego przeciwciała Fc, jak opisano powyżej. Fig. 20 ukazuje przykład wiązania TLl-fFc z ektodomeną TIE-2. Tą wersję testu można także stosować do oceny ilościowej poziomu TLl-fFc w surowicy lub innych próbkach. Jeśli dodaje się ligand nieoznaczony (znów oczyszczony lub nieoczyszczony) w tym samym czasie co TLl-fFc, wtedy zachodzi współzawodnictwo między oznaczonym fragmentem liganda i ligandem o pełnej długości. Ligand o pełnej długości może obrazować fragment oznaczony Fc i tworzy się krzywą współzawodnictwa.
189 639
Przykład 19 - Linię komórkową EA.hy926 można stosować jako reporterową linię komórkową dla aktywności liganda TIE
EA.hy926 jest linią hybrydową, którą ustalono przez fuzję HUVEC z linią pochodzącą od raka płuca człowieka, A549 [Edgell i in., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 80, 3734-3737 (1983). Komórki EA.hy926 wykazują, jak się okazało, ekspresję istotnego poziomu białka receptora TIE-2 przy niskim podstawowym poziomie fosfotyrozyny. Gęstość, przy której komórki EA.hy926 poddaje się pasażowaniu przed ich użyciem w testach receptora, a także ich stopień konfluencji w czasie testu, może wpływać na obfitość receptora TIE-2 i relatywną zdolność do indukcji w odpowiedzi na traktowanie ligandem. Przez dostosowanie następującego trybu do hodowli tych komórek, linię komórkową EA.hy926 można stosować jako niezawodnego układu do testowania aktywności liganda TIE-2.
Komórki EA.hy926 posiewa się przy 1,5 x 106 komórek w kolbach T-75 (Falconware) i odżywia co drugi dzień MEM Dulbecco z wysokim poziomem glukozy, 10% surowicą bydlęca, L-glutaminą, penicyliną-streptomycyną i lx hipoksantyną-aminopterynątymidyną (HAT, Gibco-BRL). Po trzech do czterech dni wzrostu, komórki pasażuje się ponownie przy 1,5 x 106 komórek na kolbę T-75 i hoduje przez dodatkowe trzy do czterech dni. Do testów fosforylacji, komórki wytworzone zgodnie z powyzszym opisem, pozbawiono surowicy przez zamianę pożywki hodowlanej na DMEM z wysokim poziomem glukozy i inkubację przez 2-3 godziny w temperaturze 37°C. Tę pożywkę aspirowano z kolby i próbki kondycjonowanej pożywki lub oczyszczonego liganda dodano do kolby w całkowitej objętości 1,5 ml, po czym inkubowano w temperaturze 37°C przez 5 minut. Kolby usunięto z inkubatora i umieszczono na łaźni lodowej. Pożywkę usunięto i zamieniono 1,25 ml Lysis Buffer, zawierającym 1% substancję o nazwie nonidet P-40, 0,5% deoksycholanu, 0,1% SDS w 20 mM Tris, pH 7,6, 150 mM NaCl, 50 mM NaF, 1 mM ortowanadan sodu, 5 mM benzamidynę i 1 mM EDTA, zawierający inhibitory proteazy PMSF, aprotyninę i leupeptynę. Po 10 minutach na lodzie, pozwalających na rozpuszczenie błony, płytki zeskrobano i lizaty komórkowe sklarowano przez mikrowirowanie przy najwyzszej prędkości przez 10 minut w temperaturze 4°C. Receptor TIE-2 poddano immunoprecypitacji ze sklarowanego supematantu przez inkubację w chłodzie z antyserum poliklonalnym anty-TIE-2 i kulkami Protein G-conjugated Sepharose. Kulki przemyto trzy razy zimnym buforem do lizy komórkowej i gotowano 5 minut w buforze do próbek Laemmli, który następnie załadowano na 7,5% żele poliakrylamidowe SDS. Rozpuszczone białka poddano elektrotransferowi na błonę PVDF (Lamblia-P), a następnie analizie Western biot, przy użyciu przeciwciała anty-fosfotyrozynowego i odczynnika ECL. Kolejno przeprowadzono porównanie całkowitego poziomu białka TIE-2 na tych samych odciskach przez usunięcie przeciwciała anty-fosfotyrozynowego i ponowną inkubację z antyserum poliklonalnym specyficznym dla ektodomeny TIE-2.
Przykład 20- Wyodrębnianie i sekwencjonowanie klonu cDNA o pełnej długości, kodującego ligand-3 TIE ssaka
Ligand-3 TIE (TL3) klonowano z mysiej biblioteki genomowej BAC (Research Genetics) przez hybrydyzację kopii bibliotek, albo z sondami mysimi TLI albo mysimi TL2, odpowiadającymi całości sekwencji kodującej tych genów. Każdą kopię biblioteki hybrydyzowano przy użyciu buforu fosforanowego o temperaturze 55°C, przez noc. Po hybrydyzacji, filtry przemyto stosując 2xSSC, 0,1% SDS w temperaturze 60°C, po czym filtry poddano ekspozycji na błonę rentgenowską. Zidentyfikowano silne sygnały hybrydyzacyjne, odpowiadające mysiej TLI i mysiej TL2. Poza tym, zidentyfikowano sygnały, które słabo hybrydyzowały zarówno z mysim, TLI jak i mysim TL2. DNA, odpowiadające tym klonom oczyszczono, potem trawiono enzymami restrykcyjnymi i dwa fragmenty, hybrydyzujące z oryginalnymi sondami subklonowano do plazmidu bakteryjnego i sekwencjonowano. Sekwencja fragmentów zawierała dwa egzony z homologią zarówno do mysiego TLI jak i mysiego TL2. Primery specyficzne dla tych sekwencji użyto jako primery pCr do identyfikacji tkanek, zawierających transkrypty, odpowiadające TL3. Zidentyfikowano wstęgę PCR, odpowiadającą TL3, w bibliotece cDNA mysiej macicy w lambda gt-11 (Clontech Laboratories, Inc., Pało Alto, CA).
189 639
Powleczono łysinki przy gęstości 1,25 x 106/płytkę 20x20 cm i po standardowych procedurach otrzymano filtry z kopiami (Sambrook i in., Molecular Cloning A Laboratory Manual, 2 wydanie, strona 8.46, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, Nowy Jork). Filtry z kopiami poddano skriningowi w warunkach o „normalnej” surowości (2 x SSC, temperatura 60°C) z radioaktywną sondą PCR o 200 bp wykonaną dla sekwencji mysiego TL3. Hybrydyzację przeprowadzono w temperaturze 65°C w roztworze, zawierającym 0,5 mg/ml DNA spermy łososia. Filtry przemyto w 2 x SSC w temperaturze 65°C i poddano ekspozycji wobec błony rentgenowskiej przez 6 godzin. Otrzymano dwa klony dodatnie, które hybrydyzowały w kopii. Z tych klonów uzyskano trawienie EcoRI DNA faga, wskazujące na dwa niezależne klony o wielkości insertów około 1,2 kb i około 2,2 kb. Insert EcoRI o 2,2 kb subklonowano do miejsca EcoRI pBluescript KS (Stratagene). Analiza sekwencji wykazała, ze dłuższy klon był pozbawiony inicjatorowej metioniny i peptydu sygnałowego lecz z drugiej strony kodował sondę homologiczną zarówno dla mysiego TL1 jak i mysiego TL2.
Potem zsynstetyzowano następujące primery PCR specyficzne dla TL3:
US2: cctctgggctcgccagtttgttagg
US1 cccagctggcagatetaagg
Przeprowadzono następujące reakcje PGR przy użyciu bibliotek ekspresji uzyskanych z mysich linii komórkowych C2C12ras i MG87. W pierwotnej reakcji PCR użyto specyficznego primera US2 w połączeniu z oligonukleotydami specyficznymi dla wektora, co pozwoliło na powielenie w obu orientacjach. PGR przeprowadzono w całkowitej objętości 100 ml, stosując 35 cykli w temperaturze 94°C, 1 minutę; w temperaturze 42°C lub 48°C przez 1 minutę; w temperaturze 72°C 1 minutę. Wtórna reakcja PCR obejmowała drugi primer specyficzny US1, który zawierał się w pierwotnym produkcie PCR, w połączeniu z takimi samymi oligonukleotydami wektorowymi. Wtórne reakcje przeprowadzono przez 30 cykli, przy użyciu tych samych temperatur i czasów co poprzednio. Produkty PCR wyodrębniono w żelu i poddano analizie sekwencji. Na podstawie sekwencji uzyskanych ze wszystkich czterech niezależnych reakcji PCR, przy użyciu dwóch różnych bibliotek cDNA, wywnioskowano koniec 5' sekwencji TL3. Analiza Nothem ujawniła średnie do niskich poziomów mysiego transkryptu TL3 w łożysku myszy. Ekspresja TL3 myszy składała się z transkryptu o około 3 kb. Sekwencję kodującą TL3 o pełnej długości przedłożono w fig. 21.
Sekwencję TL3 myszy można stosować do otrzymywania ludzkiego klonu, zawierającego sekwencję kodującą jego ludzki odpowiednik przez hybrydyzację albo ludzkiej biblioteki cDNA albo genomowego z sondą, odpowiadającą mysiemu TL3, jak opisano poprzednio, np. w przykładzie 8 jak wyżej.
Przykład 21- Wyodrębnianie klonu genomowego o pełnej długości, kodującego ludzki ligand-4 TIE
Ligand-4 TIE (TL4) klonowano z mysiej genomowej biblioteki BAC (BAC HUMAN (II), Genome Systems Inc.) przez hybrydyzację kopii biblioteki, albo z radioaktywną sondą ludzkiego TL1, odpowiadającą całej sekwencji kodującej fibrynogenu TL1 (nukleotydy 1153 do 1806) albo radioaktywną sondą mysiego TL3, odpowiadającą segmentowi o 186 nukleotydach z regionu fibrynogenu TL3 myszy (nukleotydy 1307 do 1492 z fig. 21). Każdą sondę znakowano przez PCR przy użyciu właściwych oligonukleotydow i standardowych warunków PCR, z wyjątkiem, że dCTP zamieniono na P32dCTP. Mieszaninę PCR przepuszczono następnie przez żelową kolumnę filtracyjną, w celu oddzielenia sondy od wolnego P32dCTP. Każdą kopię biblioteki hybrydyzowano przez użycie buforu fosforanowego i sondy radioaktywnej w temperaturze 55°C przez noc, stosując standardowe warunki hybrydyzacji. Po hybrydyzacji, filtry przemyto przy użyciu 2xSSC, 0,1% SDS w temperaturze 55°C, po czym poddano ekspozycji na błonę rentgenowską. Zaobserwowano silne sygnały hybrydyzacji, odpowiadające ludzkiemu TL1. Poza tym, zidentyfikowano sygnały, które słabo hybrydyzowały zarówno z ludzkim TL1 jak i mysim TL3. DNA, odpowiadający tym klonom oczyszczono przy użyciu standardowych procedur, następnie trawiono enzymami restrykcyjnymi i jeden fragment, który hybrydyzował z oryginalnymi sondami, subklonowano do plazmidu bakteryjnego i sekwencjonowano. Sekwencja fragmentu zawierała jeden egzon z homologią zarówno do ludzkiego TL1
189 639 jak i mysiego TL3 i innych członków rodziny liganda TIE. Primery specyficzne dla tych sekwencji można użyć jako primerów PCR do identyfikacji tkanek, zawierających transkrypty, odpowiadające TL4.
Pełną sekwencję ludzkiego TL4 można otrzymać przez sekwencjonowanie pełnego klonu BAC, zawartego w złozonych komórkach bakteryjnych. Egzony można zidentyfikować przez homologię do znanych członków rodziny liganda TIE, takich jak TLI, TL2 i TL3. Pełną sekwencję kodującą TL4 można potem określić przez składanie razem z egzonami z klonu genomowego TL4, który, odwrotnie, można stosować do wytworzenia białka TL4. Alternatywnie, egzony można stosować jako sondy do otrzymywania pełnej długości klonu cDNA, który następnie można użyć do wytworzenia białka Tl4. Egzony można także identyfikować z sekwencji klonu BAC przez homologię do domen białkowych, takich jak domena fibrynogenowa, domeny zwiniętej spirali lub sygnały białkowe, takie jak sekwencje peptydu sygnałowego. Wyrzucenie egzonów z klonu BAC można otrzymać przez identyfikację ciągłych klonów BAC, np. przez użycie końców złożonego klonu BAC jako sond do przesiewu ludzkiej biblioteki genomowej, tak jak ta użyta w niniejszym, przez stosowanie sekwencji egzonu, zawartego w klonie BAC do przesiewu biblioteki cDNA lub przez przeprowadzenie procedury albo 5' albo 3' RACE, przy użyciu primerów oligonukleotydowych na podstawie sekwencji egzonowych TL4.
Identyfikacja innych członków rodziny liganda TIE
Nową sekwencję liganda-4 TIE można stosować w racjonalnym badaniu innych członków rodziny liganda TIE, wykorzystując podejście, które czerpie korzyści z istnienia zakonserwowanych segmentów silnej homologii między znanymi członkami rodziny. Przykładowo, uszeregowanie sekwencji aminokwasowych ligandów TIE ukazuje kilka regionów zakonserwowanej sekwencji (patrz regiony zakreślone w fig. 22). Zdegenerowane Ollgonukleotydy zasadniczo oparte o te kasety, w połączeniu albo z wcześniej poznanymi albo nowymi segmentami homologii liganda TIE, można stosować do identyfikacji nowych ligandów TIE.
Wysoko zakonserwowane regiony wśród TLI, TL2 i TL3 można stosować w planowaniu zdegenerowanych primerów oligonukleotydowych, kierującymi reakcjami PCR przy użyciu cDNA. Matiyce cDNA można wytwarzać przez odwrotną transkrypcję tkankowego RNA, przy użyciu oligo d(T) lub innych odpowiednich primerów. Równe ilości środowisk reakcyjnych PCR można następnie poddawać elektroforezie na żelu agarozowym. Otrzymane powielone fragmenty DNA można klonować przez insercję do plazmidów, sekwencjonować i sekwencje DNA porównywać ze znanymi ligandami TIE.
Powielone fragmenty DNA o wybranych wielkościach z tych reakcji PCR, można klonować do plazmidów, wprowadzać do E. coli przez elektroporację i transformanty powlekać na wybiórczym agarze. Kolonie bakteryjne z transformacji PCR można analizować przez sekwencjonowanie DNA plazmidów, które oczyszcza się standardowymi procedurami dla plazmidów.
Klonowane fragmenty, zawierające segment nowego liganda TIE można stosować jako sondę hybrydyzacji do otrzymywania klonów cDNA o pełnej długości z biblioteki cDNA. Przykładowo, sekwencję genomową ludzkiego TL4 można uzyć do otrzymania ludzkiego klonu cDNA, zawierającego pełną sekwencję kodującą ludzkiego TL4, przez hybrydyzację ludzkiej biblioteki cDNA z sondą, odpowiadającą ludzkiemu TL4, co opisano wcześniej.
Przykład 22- Kloning sekwencji kodującej hTL4 o pełnej długości
Otrzymano oba końce 5' i 3' sekwencji kodującej z genomowego klonu ludzkiego TL-4, kodującego ludzki ligand-4 TIE (hTL-4 ATCC numer dostępu 98095), przez trawienie enzymem restrykcyjnym, Southern blotting i hybrydyzację klonu hTL-4 z sekwencjami kodującymi mysi TL3, po czym subkloning i sekwencjonowanie hybrydyzowąnych fragmentów. Sekwencje kodujące, odpowiadające aminokwasom N-terminalnemu i C-terminalnemu hTL4 użyto do zaplanowania primerów PCR (ukazanych poniżej), których, odwrotnie, użyto do powielenia PCR TL4 z cDNA ludzkiego jajnika. Zidentyfikowano wstęgę PCR jako odpowiadającą ludzkiemu TL4 przez sekwencjonowanie DNA przy użyciu sekwencera ABI 373A DNA oraz Taq Dideoxy Terminator Cycle Sequencing Kit (Applied Biosystems, Inc., Foster City, CA). Następnie wstęgę PCR subklonowano do wektora pCR-script i kilka klonów
189 639 plazmidowych analizowano przez sekwencjonowanie. Zestawiono potem pełną sekwencję kodującą dla ludzkiego TL4 i ukazano ją w fig. 23. W innej postaci realizacji wynalazku, nukleotyd w pozycji 569 zamienia się z A na G, co daje zmianę aminokwasu z Q na R.
Primery PCR stosowane zgodnie z powyższym opisem zaplanowano następująco:
hTL4atg 5'-gcatgctatci^ciTi^g?c<2i^i^(^^T^C^CT^CT^CCCA^^^I^AGCCATGC TGCAG-3' hTL4not 5’-gtgtcgacgcggccgctcUgatcagaITΓAGAΓGTCCAAAGGCCGI ATCATCAT-3'
Litery małe wskazują sekwencje „ogonka” dodane do primerów PCR, w celu ułatwienia kloningu powielonych fragmentów.
Przykład 23- Konstrukcja i charakteryzacja modyfikowanych ligandów TIE
Przeprowadzono analizę genetyczną liganda-1 TIE-2 i liganda-2 TIE-2 (TL1 i TL2), aby zyskać wgląd w ich liczne zaobserwowane właściwości. Mimo, ze TL1 i TL2 dzielą podobną homologię strukturalną, wykazują one różne właściwości fizyczne i biologiczne. Najbardziej wydatną cechą, która różni te dwa ligandy jest to, ze chociaż oba wiążą się z receptorem TIE-2, TL1 jest agonistą, a TL2 jest antagonistą. W nie redukujących warunkach elektroforezy, oba białka wykazują kowalentne multimeryczne struktury. TL1 wytwarza się w postaci mieszaniny multimerów usieciowanych mostkami disiarczkowymi, przede wszystkim trimerów i struktur wyższego rzędu, bez żadnych struktur dimerycznych. Także, podczas gdy TL2 wytwarza się dobrze w większości układów ekspresji, TL1 podlega ekspresji słabo i jest trudny do wytworzenia w wielkich ilościach. Wreszcie, warunki wytwarzania i oczyszczania predysponują TL1, jak się także okazało, do inaktywacji przez rozszczepienie proteolityczne w miejscu przy końcu aminowym.
Aby zbadać te różnice, skonstruowano kilka następujących modyfikowanych ligandów.
23.1. Substytucja cysternowa - badania jakie czynniki mogłyby nadawać różne właściwości fizyczne i biologiczne dwóch cząsteczek, ujawniły obecność w TL1 reszty cysteinowej (CYS 265 w fig. 4; CYS 245 w fig. 17) poprzedzającej domenę podobną do fibrynogenu w TL1 lecz nieobecną w TL2 - to jest nie było odpowiadającej reszty cysteinowej w TL2. Reszta CYS265 w TL1 jest kodowana przez TGC i leży około nukleotydów 1102-1104 (patrz fig. 4) w pobliżu połączenia między domenami zwiniętej spirali i podobnej do fibrynogenu. Ponieważ reszty cysteinowe generalnie angażują się w tworzenie wiązań disiarczkowych, obecność których nadaje zarówno strukturę trzeciorzędową jak i właściwości biologiczne cząsteczki, sądzono, ze może obecność reszty CYS265 w TL1 mogła być choć częściowo odpowiedzialna za różne właściwości dwóch cząsteczek.
Aby przetestować tę hipotezę, zbudowano plazmid ekspresji, który zawierał mutację w TL1, w której CYS (resztę 265 w fig. 4; resztę 254 w fig. 17) zamieniono na aminokwas (serynę), który nie tworzy wiązań disiarczkowych. Oprócz tego mutanta TL1/CYS', zbudowano drugi plazmid ekspresji, który mutował w przybliżeniu odpowiadającą pozycję w TL2 (Met247 w fig. 17) tak, że reszta ta była obecnie cysteiną. Zarówno nie zmutowany jak zmutowany plazmid ekspresji TL1 i TL2 krótkotrwale transfekowano do komórek COS, zebrano supematanty komórkowe, zawierające rekombinowane białka i próbki poddano zarówno redukującej jak i nie redukującej elektroforezie SDS/PAGE i potem Western blotting.
Figura 18 ukazuje Western blot w warunkach nieredukujących zarówno nie zmutowanego jak i zmutowanego białka TL1 i TL2, ujawniając, że mutant TL1/CYS' biegnie jako dimer, bardziej jak TL2, oraz ze mutant TL2/CYS+ jest zdolny do tworzenia trimera, jak również multimerów wyzszego rzędu, bardziej jak TL1. Gdy przetestowano oba zmutowane białka pod względem ich zdolności do indukcji fosforylacji w komórkach, wykazujących ekspresję TIE-2, mutant TL1/CYS' był zdolny do aktywacji receptora TIE-2, podczas gdy mutant TL2/CYS+ nie.
Tak więc, gdy resztę cysteinową (reszta 265 w fig. 4; reszta 245 w fig. 17) TL1 zmieniono genetycznie na serynę, odkryto, ze kowalentna struktura TL1 stała się podobna do TL2, to jest przede wszystkim dimeryczna. Zmodyfikowana cząsteczka TL1 wciąż zachowywała się jak agonista, a więc, struktura trimeryczna i/lub multimeryczna wyższego rzędu nie jest
189 639 ezyooikięm, dętęrmioującym zdolność TLI do aktywacji. Mimo, że usunięcie cysteiny dało cząsteczce bardziej pożądane właściwości, nie poprawiło poziomu wytwarzania TLI.
23.2. Delecje demem' m koywencłe knkleotydowe, koduj ące TIU i TL2 dTielą sfrektutr genetyczną, którą mażoa podzielić na trzy domeny na podstawie sekwencji aminokwasowych dojrzałych białek. Ostatnie około 215 reszt aminakwasowych każdego dojrzałego białka, zawiera sześć cystein i odznacza się silnym podobieństwem do domeny fibrynogenu. Region ten oznaezona więc jako domenę „podobną do fibr^ogenu” lub „domenę F”. Środkowy region dojrzałego białka, zawiera około 205 reszt, posiada z wysokim prawdopodobieństwem strukturę „zwiniętej spirali” i ozoaezono go jako domenę „zwiniętej spirali” lub „domenę C”. Około 55 reszt aminoterminalnych dojrzałego białka zawiera dwie cysteiny i posiada z niskim prawdopodobieństwem strukturę zwiniętej spirali. Region ten aznaezona jako domenę „N-terminalną” lub „domenę N”. Opisane w niniejszym madyfikawanę ligandy oznacza się przy użyciu tęrmioalagii, w której N = domena N-terminalna, C = domena zwiniętej spirali, F = domena podobna do fibrynogenu i liczby 1 i 2 odnoszą się odpowiednio do TLI i TL2. Tak więc, IN wskazuje domenę N-terminalną z TLI, 2F wskazuje domenę podobną do fibryoagęou z TL2 i tak dalej.
W celu przetestowania, czy domena podobna do fibrynogenu (domena F) ligandów TIE-2 zawierała aktywność aktywacji TIE-2, zbudowano plazmidy ekspresji, które usuwały domeny zwiniętej spirali i N-terminalną, pozostawiając jedynie tę część sekwencji DNA, która kodowała domenę F (dla TLI, rozpoczynającą się w fig. 4 około nukleotydu 1159, reszta amioakwαsowα ARG284; dla TL2, odpowiadająca nuklęatydowi około 1200 w fig. 6, reszta amioakwasowα 282). Tą zmutowaną konstrukcją transfękowana krótkotrwale komórki COS. Supernatant, zawierający rekombinawanę białko, zebrano. Mutanta TLl/domeoa F przetestowano pod względem jego zdolności do wiązania receptora TIE-2. Wyniki ukazały, ze jako monomer, mutant TLl/domena F nie był zdolny do wiązania TIE-2 na wykrywalnym poziomie.
Lecz gdy monomer TLl/domena F nazneczooo myc i potem ścięto przeciwciałem, skierowanym przeciw znacznikowi myc, wykazał on wykrywalne wiązanie TIE-2. Jednak mutant Tel/damena F ścięty przeciwciałem nie był zdolny do indukcji fosforylacji w linii komórkowej, wykazującej ekspresję TIE-2.
Tak więc, akreślona, że domena F ligandów TIE-2 angażuje się w wiązanie receptora lecz skrót, składający się tylko z samej domeny F nie wystarcza do związania receptora. Wzbudziło to możliwość, że domena zwiniętej spirali jest odpowiedzialna za utrzymywanie razem kilku domen podobnych do fibrynogenu, które mogły być zasadnicze dla wiązania receptora. W próbie potwierdzenia tej hipotezy, domenę F połączono z sekcją Fc ludzkiego przeciwciała IgGl. Ponieważ sekwencje Fc dimeryzują w czasie ekspresji w komórkach ssaków, te rękombmoweoę białka naśladowały teoretyczną konfigurację domen F i były natywnymi ligandami, które dimeryzują. Ta konstrukcja domena F-Fc związała, lecz nie mogła aktywować receptora. Najwyraźniej multimeryzacja spowodowana przez inne regiony ligandów jest kanięezna do umożliwienia Ugandom związanie receptora TIE-2. Poza tym, jakiś inny czynnik z zewnątrz domeny F musi stanowić o fosforylacji receptora.
Następnie zbudowano mutanty, które pozbawiono domeny podobne do fibrynogenu i przez to zawierały tylko domeny N-termmalną i zwiniętej spirali. Nie były one zdolne do wiązania receptora. Aby oszacować rolę domeny N-terminalnej w wiązaniu i aktywacji receptora, ligandy skrócono tylko do domen C i F i adnakawαno dnaeznikięm FLAG na końcu N, tworząc konstrukcje określone FLAG-1C1G i FLAG-2C2F. Mimo, ze cząsteczki te barwiły się silnie w komórkach COS7 transfekawanych krótkotrwale w celu ekspresji receptora TIE-2, nie zdołały odpowiedzieć w teście fosforylacji. Talk więc domena N zawiera zasadniczy czynnik aktywacji receptora, chociaż, jak ujawniooa poniżej, zdolność chimerycznej cząsteczki 2N2C1F do aktywacji receptora ukazuje, ze nawet domena N nieaktywnego liganda może pełnić tę rolę.
Różnice zachowania między skróconą domeną F oznakowaną myc i skróconą domeną F oznakowaną Fc opisanymi wcześniej, sugerowały, ze ligandy TIE mogą wiązać jedynie w postaciach dimerycznych lub wyzszego rzędu. W rdeczywistaści, nie redukująca SDS-PAGE
189 639 wykazała, że ligandy TIE istnieją naturalnie w postaciach dimerycznych, trimerycznych i multimerycznych. Skrócone FLAG-1C1F i FLAG-2C2F mogą wiązać się z receptorem TIE-2 bez dimeryzacji przez syntetyczny znacznik (taki jak Fc), podczas gdy skrócone F nie mogą, sugerując, że region C jest przynajmniej częściowo odpowiedzialny z agregację domen F.
23.3. Konstrukcje zamienione (chimery):
Zgłaszający zauwazyli, ze poziom wytwarzania TLI w komórkach COS7 był w przybliżeniu dziesięciokrotnie niższy niż wytwarzanie TL2. Zatem zbudowano chimery TLI i TL2 w celu wyjaśnienia tej różmicy, a także dodatkowej charakteryzacji aktywności agonistycznej TL1 w porównaniu z aktywnością antagonistyczną TL2.
Zbudowano cztery chimery, w których zamieniono albo domenę N-terminalną albo domenę fibrynogenu między TL1 i TL2 i oznaczono przy użyciu terminologii opisanej wcześniej tak, że np. 1N1C2F odnosi się do chimery, posiadającej domenę N-terminalną i zwiniętej spirali TL1, razem z domeną podobna do fibrynogenu od TL2. Zbudowano następujące cztery chimery:
chimera 1 - 1N1C2F chimera 2 - 2N2C1F chimera 3 - 1N2C2F chimera 4 - 1N1C1F
Sekwencje nukleotydowe i aminokwasowe chimer 1-4 ukazano odpowiednio w fig. 24-27.
Każdą chimerę wprowadzono do odzielnego wektora ekspresji pJFE14. Następnie chimerę transfekowano do komórek COS7, razem z pustym wektorem pJFE14, natywnym TL1 i natywnym TL2 jako kontrolami, i zebrano supematanty hodowlane.
W celu określenia jak zamiana wpłynęła na poziom ekspresji ligandów; rozcieńczenie 1:5 i rozcieńczenie 1:50 supematantów COS7 poddano procedurze dot-blot na nitrocelulozę. Trzy ligandy, które zawierały domenę N TL1 (to jest natywnego TL1, 1N2C2F i 1N1C2F) sondowano potem z króliczym przeciwciałem specyficznym wobec końca N TL1. Trzy Ugandy, zawierające domenę N TL2 (to jest natywnego TL2, 2N1C1F i 2N2C1F) sondowano z króliczym przeciwciałem specyficznym wobec końca N TL2. Wyniki pokazały, ze komórki COS7 wykazywały ekspresję każdej cząsteczki, zawierającej domenę N TL2 przy prawie dziesięć razy takim poziomem jak poziom każdej cząsteczki, zawierającej domenę N TL1, bez względu na zawartość reszty białka. Wniosek był taki, że domena N musi przede wszystkim kontrolować poziom ekspresji liganda.
Następne pytanie dotyczyło zdolności lub niezdolności chimer do aktywacji receptora TIE-2. Komórki Eahy926 sprowokowano czterema chimerami, jak również TL1 jako kontrolą dodatnią dla fosforylacji i TL2 lub supematantami komórkowymi COS7 transfekowanymi pustym pJFE14, jako kontrolami ujemnymi dla fosforylacji. Komórki poddano lizie, a receptor TIE-2 poddano immunoprecypitacji z lizatów komórkowych i uruchomiono na SDSPAGE. Próbki poddano Western blotting i sondowano z przeciwciałem anty-fosfotyrozypowym w celu detekcji wszystkich receptorów, które zostały ufosforylowane. Niespodziewanie, tylko konstrukcje, zawierające domenę podobną do fibrynogenu TL1 (2N1C1F i 2N2C1F) mogły fosforylować receptor TIE-2. Tak więc, mimo, że region N-terminalny TL1 jest zasadniczy dla aktywacji, można go zamienić na region N-terminalny TL2, czyli informacja, która determinuje, czy ligand jest agonistą, czy antagonistą, zawiera się aktualnie w domenie podobnej do fibrynogenu.
W ten sposób określono, że domena F, oprócz wiązania receptora TIE-2, odpowiada za aktywność fosforylacji TL1. Dalej, gdy TL2, z drugiej strony cząsteczkę nie aktywną, zmieniono przez zastąpienie jej domeny F domeną F TL1, zmieniony TL2 działał jako agonista.
Konstrukcja 2N1C1F była jdnakże nieco silniejsza. Sygnał powodowany przez chimerę 2N1C1F wydawał się nieznacznie silniejszy niż chimery 2N2C1F, prowadząc do spekulacji, ze domena C TL1 choć nie decydująca wobec fosforylacji, mogła wzmacniać siłę TL1. Jednak, ponieważ próbki użyte do testu fosforylacji nie były normalizowane w kategoriach stężenia liganda, możliwe było, że silniejszy sygnał fosforylacji wskazywał jedynie obecność
189 639 większej ilości liganda. Test fosforylacji powtórzono zatem ze zmiennymi ilościami liganda, aby określić, czy aktywne chimery wykazują różne siły. Stężenie liganda w supematantach COS7 transfekcji liganda, określono poprzez technologię bioczujnika BIAcore, zgodnie z metodami opisanymi wcześniej (Stitt, T.N. i in., (1995) Celi 80: 661-670). BIAcore mierzył aktywność wiązania superantantu z receptorem TEE-2 w arbitralnych jednostkach zwanych jednostkami rezonansowymi (RU). Zaobserwowano generalnie całkiem dobrą korelację między RU i stężeniem liganda, przy czym 400 RU odpowiada około 1 (ig białka na ml superanatantu. Próbki rozcieńczono do stężeń 100 RU, 20 RU i 5 RU każda i powtórzono test fosforylacji. Wyniki pokazały, ze chimera 2N2C1F była wyraźnie silniejsza niż natywna TLI czy chimera 1N1C2F przy tych samych stężeniach.
Innym interesującym aspektem tych wymiennych konstrukcji jest ich poziom ekspresji. Każdą z czterech chimer testowano pod względem ich poziomu wytwarzania w komórkach COS, ich zdolności do wiązania TEE2 i ich zdolności do fosforylacji TIE2. Wyniki tych doświadczeń pokazały, że chimery 1 i 3 były wytwarzane na poziomie porównywalnym z TLI, podczas gdy chimery 2 i 4 były wytwarzane na poziomie porównywalnym z TL2. Tak więc, wysoki poziom wytwarzania białka był skorelowany z domeną N-terminalną TL2. Dodatkowo, po testowaniu na komórkach śródbłonka Eahy926, chimery 2 i 4 były aktywne, podczas gdy 1 i 3 nie. Tak więc aktywność (fosforylacja receptora) koreluje z domeną podobną do fibrynogenu TLI. Zatem każda z chimer 2 i 4 posiadała pożądane właściwości wysokiego poziomu wytwarzania jak również aktywność agonistyczną.
23.4. Konstmkcjeodoome proteoHtyeznie - Na podstawie oN^i^rw^acj^,i^e: wielka frakajf preparatów TLI często ulegała proteolitycznemu rozszczepieniu przy końcu N, zaproponowano, że reszta argininowa położona w pozycji 49 dojrzałego białka (patrz fig. 17) jest prawdopodobnym miejscem rozszczepienia, które mogło być związane z regulacją aktywności białka in vivo, i że zastąpienie a^i^iiAiny seryną (R49—>S) mogłoby zwiększyć s^tabilru^ość bez koniecznego wpływania na aktywność. Zbudowano takiego mutanta TLI i odkryto, że jest prawie tak samo aktywny jak natywny TLI, lecz nie wykazywał odporności na rozszczepienie proteolityczne.
23.5 Mutanty kombikowane w Naj siinisjczą koslę1ieknję ch-me-ycdną, 2Ν1ΟΕ, zmieniono dodatkowo tak, że cysteinę kodowaną przez nukleotydy 784-787 jak ukazano w fig. 27, zamieniono na serynę. Cząsteczka ta (oznaczona 2N1C1F (C246S)) dobrze podlegała ekspresji, silnie aktywowała receptor, była odporna na rozszczepienie proteolityczne i była przede wszystkim raczej dimerem niz multimerem wyższego rzędu. Tak więc, domena 2N okazała się nadawać cząsteczce odporność proteazową. Wrecz2ie, cząsteczkę tę zmieniono dodatkowo, w celu eliminacji miejsca potencjalnie wrażliwego na proteazy, kodowanego przez nukleotydy 199-201 jak ukazano w fig. 27, uzyskując cząsteczkę (oznaczoną 2N1C1F (R51->S, C246->S)), która jak oczekiwano, aktywowała, miała dobrą ekspresję, była dimeryczna i odporna na proteazy.
Tabela 1 streszcza konstrukcje modyfikowanego liganda TIE-2, które wykonano, oraz charakteryzuje każdą z nich w kategoriach zdolności do wiązania receptora TIE-2, zdolności do oetywa2ji receptora TIE-2, typu utworzonej struktury (monomer, dimer itd.) oraz ich relatywnego poziomu wytwarzania. Nie modyfikowany TLI (prosty) i TL2 (prążkowany) ukazano z trzema domenami w ramkach. Tak więc, prążkowane ramki oznaczają domeny TL2. Cysteinę położoną w pozycji 245 dojrzałego białka TLI oznaczono przez „C”. „X” do „C” wskazuje, że tę resztę cysternową podstawiono innymi aminokwasami, tek jak np. w mutancie TLI CYS”. Podobnie, „X” do „R” w ostatniej konstrukcji wskazuje cuastytu20r dla reszty Arg w pozycji 49 dojrzałego białka TLI. „C” jest obecny w jednej modyfikowanej konstrukcji TL2, pokazując mutanta TL2 CYS+. Zaznaczono także konstrukcje, posiadające ogonki Fc lub znakowanie flag.
Na podstawie niniejszych pouczeń, fachowiec może łatwo zobaczyć, że można wykonać dodatkowe konstrukcje, w celu utworzenia dodatkowych modyfikowanych i chimerycznych ligandów TIE-2, które posiadają zmienione właściwości. Przykładowo, można utworzyć konstrukcję, składającą się z domeny N-terminalnej TL2 i domeny F TLI połączonej z sekcją Fc ludzkiego przeciwciała IgGl. Jak się oczekuje, konstrukcja ta wiązałaby i aktywowała receptor TIE-2. Podobnie, można utworzyć inne konstrukcje przy użyciu niniejszych pouczeń, o zatem uważa się je za wchodzące w zakres tego wynalazku.
189 639
23.6 Materiały i metody
Konstruowanie chimer
Konstrukcje zamienne wrowadzono do wektora pJFE14, w którym miejsce XbaI zamieniono na miejsce AscI. Wektor ten trawiono Ascl i Notl, uzyskując szkielet AscI-Notl. Utworzono fragmenty DNA dla chimer przez PCR, przy użyciu odpowiednich oligonukleotydów.
Inserty FLAG-1C1F i FLAG-2C2F subklonowano do szkieletu wektora pMT21, który trawiono EcoRI i Notl. Przez PCR uzyskano skrócone fragmenty „CF”, a znacznik FLAG i poprzedzającą sekwencję sygnałową trypsyny zbudowaną przez annealing syntetycznych oligonukleotydów.
Transfekcje
Wszystkie konstrukcje transfekowano krótkotrwale do komórek COS7 przy użyciu standardowych protokołów DEAE-Dextran lub LipofectAMINE. Hodowle komórkowe zebrano 3 dni po transfekcji i odwirowano przy 1000 obrotów na minutę, a superanatanty przeniesiono do świeżych rurek i przechowywano w temperaturze -20°C.
Barwienie komórek transfekowanych FLAG-1C1F i FLAG-2C2F
Płytki o 6 studzienkach komórek COS7 transfekowano krótkotrwale receptorem TIE-2. Superantant COS7 z różnych transfekcji ligandowych inkubowano na komórkach przez 30 minut, po czym przemyto dwukrotnie solanką buforowaną fosforanem (PBS) bez magnezu ani wapnia. Komórki utrwalono w metanolu o temperaturze -20°C przez 3 minuty, przemyto raz w PBS i inkubowano z przeciwciałem anty-FLAG M2 (TBI; rozcieńczenie 1:3000) w PBS/10% bydlęcej surowicy cielęcej (BCS) przez 30 minut. Komórki przemyto raz PBS i inkubowano z kozim anty-mysim przeciwciałem IgG sprzężonym z fosfatazą alkaliczną (AP) (Promega, 1:1000) w PBS/10% BCS. Komórki przemyto dwukrotnie PBS i inkubowano z substratem fosforanowym, BCIP/NBT, z 1 mM lewamisolem.
Testy fosforylacji
Wykonano rozcieńczenie supematantów COS7 do badań odpowiedzi na dawkę, w supematantach komórek COS7 transfekowanych pustym wektorem pJFE14. Komórki EA, które naturalnie wykazują ekspresję receptora TIE-2 głodzono przez > 2 godziny w pożywce pozbawionej surowicy, po czym sprowokowano odpowiednim supematantem COS7 przez 10 minut w temperaturze 37°C w atmosferze 5% CO2. Komórki następnie przepłukano w lodowatym PBS i poddano lizie za pomocą 1% buforu do lizy NP40, zawierającego inhibitory proteaz (10 pg/ml leupeptyny, 10 pg/ml aprotyniny, 1 mM PMSF), po czym poddano immunoprecypitacji z przeciwciałem specyficznym dla receptora TIE-2. Próbki poddano potem analizie odcisku immunologicznego, przy użyciu przeciwciał anty pTyr.
Próbki nałożono na błonę nitrocelulozową, którą zablokowano i sondowano odpowiednimi przeciwciałami.
23.7 Wytwarzanie chimerycznego liganda TIE-2 z komórek owadzich infekowanych CHO i bakulowirusem
Wytwarzanie wirusa
Gen dla chimerycznego liganda (oznaczonego 2N1C1F (C246S)) wbudowano do plazmidu ekspresji bakulowirusa i rekombinowano z DNA wirusa, aby utworzyć rekombinowanego bakulowirusa, powielono i zebrano przy użyciu metod opisanych wcześniej (O'Reilly, D.R., L.K. Miller i V.A. Luckow, Baculovirus Expression Vectors - A Laboratory Manual, 1992, Nowy Jork: W.H. Freeman). Komórki owadzie (Spodoptera frugiperda) otrzymane od Invitrogen, przystosowano i rozłożono w temperaturze 27°C w pożywce pozbawionej surowicy Gibco SF900 II. Nie zainfekowane komórki hodowano do gęstości 1x106 komórek/ml. Gęstość komórek określono przez liczenie żywych komórek przy użyciu hemacytometru. Zbiór wirusa dla liganda dodano do bioreaktora przy niskiej wielokrotności 0,01-0,1 PFU/komórkę, aby rozpocząć infekcję. Proces infekcji kontynuowano przez 3-4 dni, pozwalając na maksymalną replikację wirusa bez narażania się na późniejszą lizę komórek. Zawiesinę komórkową podzielono aseptycznie na równe ilości do jałowych butelek wirówki i komórki usunięto przez wirowanie (1600 RPM, 30 minut). Supernatant pozbawiony komórek zebrano w jałowych butelkach i przechowywano w temperaturze 4°C przy braku światła do dalszego użycia.
189 639
Miano wirusa określono przez test łysinek jak opisano u O'Reilly'ego, Millera i Luckowa. Metodę przeprowadzono w 60 mm płytkach do hodowli tkanek, które posiano 1,5x106 komórek. Do przyczepionych komórek dodano seryjne rozcieńczenia zbioru wirusa i mieszaninę inkubowano przy kołysaniu, pozwalając wirusowi na adsorpcję do poszczególnych komórek. Dodano nadlewkę agarową i płytki inkubowano przez 5 dni w temperaturze 27°C. Żywe komórki zabarwiono obojętną czerwienią, ujawniając okrągłe łysinki, które policzono, uzyskując miano wirusa wyrażone w jednostkach tworzących łysinkę na mililitr (PFU/ml).
Infekcja komórek w celu wytworzenia białka
Nie zainfekowane komórki SF21 hodowano w płytkach do hodowli tkanek i dodano wirus, zawierający gen chimerycznego liganda, przy wielokrotności 1-10 pfu/komórkę. Wirus pozostawiono do adsorpcji przez 90 minut w temepraturze 27°C przy delikatnym kołysaniu, po którym komórki odżywiono świeżą ilością pożwyki pozbawionej surowicy Sf-900 II. Po 3 dniach wzrostu w temperaturze 27°C, hodowlę tkankową zebrano i ligand wykrywano przez immunoblotting.
Ekspresja CHO chimer liganda TIE-2
Chimery liganda Tie-2 klonowano do jakiegokolwiek z kilku wektorów ekspresji komórek ssaka, łącznie (lecz bez ograniczenia) z pJFE, pcDNAS, pMT21, pED lub innych. Plazmidy transfekowano do komórek CHO DG44 (Urlaub, G i Chasin, L.A. 1980, Isolation of Chinese hamster celi mutants deficient in dihydrofolate reductase activity. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 77: 4216-4220; Urlaub, G Kas, E., Carothers, A.M., oraz Chasin, L.A. 1983. Deletion of the diploid dihydrofolate locus from cultured mammalian cells. Cell 33: 405-412) przez precypitację fosforanem wapnia lub liposomy kationowe. W wypadku wektorów pozbawionych markera selekcji dhfr, plazmid pSV2.dhfr kotransfekowano w stosunku molarnym 20% do plazmidu, zawierającego chimerę liganda TIE. Komórki DHFR+ poddano selekcji przez hodowlę w pożywce selekcyjnej (pożywka pozbawiona nukleozydów i nukleotydów, zawierająca 10% dializowaną płodową surowicę cielęcą), i klony przesiano pod względem wytwarzania chimerycznych ligandów TIE przez immunoblotting z ciałkiem receptorowym TIE2. Klony, wykazujące ekspresję pożądanego białka poddano kilku okrążeniom powielenia genowego przy użyciu stopniowanych stężeń metotraksatu w pożywce selekcyjnej. Zidentyfikowano klony o wysokiej ekspresji po poowieleniu genowym, z użyciem podobnych technik immunoblottingu.
Linie komórkowe, wykazujące ekspresję ligandów TIE hodowano w pojedynczej warstwie, kolbach z zawiesinami, obracanych butelkach i bioreaktorach w pożywce selekcyjnej lub w pożywce bez selekcji, oraz można je hodować w preparatach pożywek pozbawionych surowicy.
189 639
Tabela 1
ANALIZA MUTACJI LIGANDÓW i i .......-1 ~1 u ZWINIĘTA PODOBNA DO u N SPIRALA FIBRYNOGENU E a Π ,, s ml i »i i +
777777777777777 II X Ί ♦
V777777777777/7A
I i T3
W7Z7ZZ7&
ΓΖ~~Ί )777777
I—„i * i ♦
VT2?7A * 1 «· i i gi -- i * i *
77?77/777Χ777777Γ*-\ ♦ t| ~1 + .^%kW//W/Z3 + <- - ci I +
Ό •EZWdW/l CL, W//A
W77777A ~i
Γ7777777Χ77777Λ
W7 «Γ ~Ί
Π M;... -· I
GT «I......1
.3
<9 i § « sl Π ia ε 1 * n
< H + WYŻSZEGO RZĘDU NISKI
- DIMER WYSOKI
+ DIMER NISKI
* WYŻSZEGO rzędu WYSOKI
N.D. N.D. NISKI
ND N.D. WYSOKI
- MONOMER WYSOKI
MONOMER WYSOKI
DIMER NISKI • NAJWYŻSZE WYTWARZANIE RU
DIMER WYSOKI ••najsilniejsza AKTYWACJA
+ WYŻSZEGO RZĘDU NISKI Nl) = NIL OKREŚLONO
- WYŻSZEGO RZĘDU NISKI
+ N.D. NISKI
N.D. WYSOKI
ND. WYSOKI
N.D WYSOKI
ND. NISKI
+ ND WYSOKI ·
- ND NISKI
+ N.D WYSOKI
+ ” DIMFR WYSOKI
+ N 1) NISKI
Depozyty
189 639
Następujące złożono w American Type Culture Collection (Amerykańska Kolekcja Typów Kultur), 12301 Parklawn Drive, Rockville, Maryland 20852 zgodnie z Układem budapesztańskim. Rekombinowany bakulowirus Autographa califomica, kodujący ciałko receptorowe TIE-2 złożono w ATCC 7 października 1994 i oznaczono jako „ciałko receptorowe vTIE-2” z numerem dostępu VR2484. Szczep E. coli DH10B, zawierający plazmid pBeLoBacll z insertem ludzkiego genu TL-4, kodującym ludzki ligand-4 TIE złożono w ATCC 2 lipca 1996 i oznaczono jako „hTL-4” z numerem dostępu 98095.
Niniejszy wynalazek nie ogranicza się w zakresie do konkretnych postaci realizacji opisanych w niniejszym. W rzeczywistości, różne modyfikacje wynalazku oprócz opisanych niniejszym, stają się widoczne dla fachowców z powyższego opisu i towarzyszących rysunków. Takie modyfikacje wchodzą w zamierzeniu w zakres załączonych zastrzeżeń.
189 639
Wykaz sekwencji (1) INFORMACJE OGÓLNE:
(i) ZGŁASZAJĄCY: REGENERON PHARMACEUTICALS, INC (ii) TYTUŁ WYNALAZKU: NOWE MODYFIKOWANE LIGANDY (iii) LICZBA SEKWENCJI: 28 (iv) ADRES KORESPONDENCYJNY:
(A) ADRES: Regeneron Pharmaceuticals, Inc.
(B) ULICA: 777 Old Saw Hill Road (C) MIASTO: Tarrytown (D) STAN: NY (E) KRAJ: USA (F) KOD: 10591 (v) POSTAĆ ODCZYTYWALNA PRZEZ KOMPUTER:
(A) TYP NOŚNIKA: Dyskietka (B) KOMPUTER: Zgodny z IBM (C) SYSTEM OPERACYJNY: DOS (D) OPROGRAMOWANIE: FastSEO wersja 2.0 (vi) AKTUALNE DANE ZGŁOSZENIOWE:
(A) NUMER ZGŁOSZENIA: JESZCZE NIE ZNANY (B) DATA ZŁOŻENIA: ZŁOŻONA W ZAŁĄCZENIU (C) KLASYFIKACJA:
(V11) WCZEŚNIEJSZE DANE ZGŁOSZENIOWE:
(A) NUMER ZGŁOSZENIA: USSN 08/740,223 (B) DATA ZŁOŻENIA: 25-PAŹDZ-1996 (C) KLASYFIKACJA:
(vn) WCZEŚNIEJSZE DANE ZGŁOSZENIOWE:
(A) NUMER ZGŁOSZENIA: USSN 60/022/999 (B) DATA ZŁOŻENIA: 02-SIERPNIA-1996 (viii)INFORMACJE O PEłNOMOCNIKU/POŚREDNIKU
189 639 (A) NAZWISKO: Cobert, Robert J (B) NUMER REJESTRACYJNY: 36,108 (C) NUMER ŚWIADECTWA/POZWOLENIA: REG 333 (ix) INFORMACJE TELEKOMUNIKACYJNE:
(A) TELEFON: 914-345-7400 (B) TELEFAKS: 914-345-7721 (2) INFORMACJE O SEQ ID nr 1:
(i) CECHY SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 2149 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) ILOŚĆ ŁAŃCUCHÓW: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: DNA (ix) CECHA::
(A) NAZWA/KLUCZ: Sekwencja kodująca (B) POŁOŻENIE: 310...1803 (D) INNE INFORMACJE:
(A) NAZWA/KLUCZ: Ludzki ligand 1 TIE-2 (B) POŁOŻENIE: 1...2149 (D) INNE INFORMACJE^: z klonu λρή10, kodującego ligand htie-2 (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID nr 1:
CAGCTGACTC AGGCAGGCTC CATGCTGAAC GGTCACACAG AGAGGAAACA ATAAATCTCA 60
GCTACTATGC AATAAATATC TCAAGTTTTA ACGAAGAAAA ACATCATTGC AGTGAAATAA 120
AAAATTTTAA AATTTTAGAA CAAAGCTAAC AAATGGCTAG TTTTCTATGA TTCTTCTTCA 180
AACGCTTTCT TTGAGGGGGA AAGAGTCAAA CAAACAAGCA GTTTTACCTG AAATAAAGAA 240
CTAGTTTTAG AGGTCAGAAG AAAGGAGCAA GTTTTGCGAG AGGCACGGAA GGAGTGTGCT 300
GGCAGTACA ATG ACA GTT TTC CTT TCC TTT GCT TTC CTC GCT GCC ATT CTG 351
Met Thr Val Phe Leu Ser Phe Ala Phe Leu Ala Ala Ile Leu
189 639
10
ACT CAC ATA GGG TGC AGC GCT CCG CGC CGA ACT CCA GAC wac ATG GGG 399
Thr His Ile Gly Cys Ssr Asn Gln Arg Arg Ser Pro Glu Asn Ssr Gly
15 20 20 30
AGA AGA TAT TACC CGG ATT cgcc ACT GGG cena tgt GCC TAA ACT TTC ATT 00 7
Arg Arg Tyr Asn Arg Ile Gin His Gly Gin Cys Ala Tyr Thr Phe Ile
35 40 40
CTT CCA GAA CAC GGC GGG GCC TGT CGT GGC ACG ATA ACA G^T GAC GTT 0 95
Leu Pro Glu UHi Aap GGe Ans Cys Arg GGe Sse STr Thr Αημι GGl Sts
50 55 60
AAC ACA AAC CAC CCT ce^n ATG GCT GCT CCA SAC SGG GCC CCC GGC TTG !S4 3
Asn Thr Asn ACa Lue GGn Ang Csp Ala Pro Shi Gal Glu P^o Ans PPr
65 70 75
TCT TCC CAC nana CCT CCC. CAC ATG GCCG CAT GGG ATG GCT /CCT TAT ACT 5 91
Ser Ser Gin Aus Luu GG.n Hhi Leu Glu Hhi Val Mee Glu Asn Tyr TGr
80 85 90
CAG TGG CTC! CCCA Gana CAT GAG GCCT TAC ATT GGG GGCC GCTC ATG GACG TCG 699
Gln Trp Leu Ggi. Lus Lee Glu Csn Tyr Ile Val GGu Asn Met Lls Ssr
95 100 U0 110
GAG ATG GCG CAG ATA CAT CAG CCT GCA GGT CAG AAC CCC ACG GCT ACC 877
Glu Met Ala GJn Ile GGn GGn Asn Ala Val GGe. Asn His Thr Ala Thr
115 110 115
ATG CTG gag; ATA GGA ACA AGC ATC CTC TCT CAG ACT GCA GAG CAG ACC S 55
Met Leu Glu Ile Gly Thr Ssr Leu Leu Ssr Gin Thr Ali Glu Gln Thr
130 15A 1401
AGA AAG CTG aca GAT GGT GAG CAA CAG GTA CTA GCCT CAC ACT TCT CGA 8 S3
Arg Lys Leu Thr Asp Val Glu Thr Gin Val Leu Asn Gln Thr Ser Arg
145
100
555
189 639
CTT GAG ATA CAG CTG CCT CAG AT TCA TTA CTC Ad CTA AG CCA ClA 531
Leu Glu Ile Gln Leu Llu Clu Asn Sse Leu See CTt CTy Cyy Clu Clu
160 165 110
AAG CAA CTT CTT CCA CCA ACA AT GGA ATC TTT AA AAT CCA GA WA 50 0
Lys Gln Leu Leu Gln Cln Thr Asn Glu 1ll L^u Lyy Ilu His Glu Ley
175 180 185 110
AAC AGT TTA TTA GA CCA AA ATCC TTA GTA ATG GA GGA CAA CAC AG 020
Asn Ser Leu Leu GGl His Lys Ile Leu Glu Mee Glu Gly Ly/y His Lys
195 200 225
GAA GAG TTG GAC AAC TTT CAG GAA GAG AA GAG AC CTT CA GGC TTG 015
Glu Glu Leu Asp TTh Clu Lys Glu Glu Lys Glu Asn Leu Gln Gly Leu
210 215 220
GTT ACT CGT CA AAA TTA ATA ATC CAG GAG CTG GAA AG CA TTA A^tC 1023
Val Thr Arg Gln TTh TTr Ile Ile Gln Glu Leu Glu Lys Gln Leu Asn
225 230 235
AGA GCT ACC ACC AAC AAC AGT GTC CTT CAG AAG CAA CA CTA GAA CTA
1011 Arg Ala Thr Thr Asn Asn Ser Val Leu Gln Lys Gln Gln Leu Glu Leu
240 245 220
ATG GAC ACA GTC CCA AC CTT GTC LA CTT TG<C ACT ITGT GAA GGT GTT 1119
Met Asp Thr Vai His CAn Leu Val Asn Leu Cys Thr Lys Glu Gly Val
255 260 225 270
TTA CTA LA GGA GGA /AA AGA GAG GAA GAG -AA. CCA TTT AGA GAC TGT 1167
Leu Leu Lys Gly Gln Ley A^<g Glu Glu Glu Lys Pro Phe A^«g Asp Cys
275 220 225
GCA GAT GTA TAT CCA CAC GGT TTT AT AAA AGT GGA ATC TAC ACT ATT 1215
Ala Asp Val Tyr Gln CAl Gly Phe Asn Lys Ssr Gly IJ^e Tyr Thr I(^e
290 295 300
TAT ATT /AAT ΑΤ AA^ CCA GAA C<^<C AA CAG GTG TTT TGCC AT ATG GAT 12 (53
Tyr Ile Asn Asn Met Pro Glu Pro Lys Lys Val Phe Cys Asn Met Asp
189 639
305 310 315
GTC AAT GGG TGA GTT GTG AAC GTA ATA CCA CC^T GCT MCA GTT AGA ATT 1111
Val Asn Gli' Gly Gly GTp Thr Val Ile Gln His Sap G1u Ass Aly Sst
320 320 330
CTA GAT TTC CCGC AGA GTC TGG SATG GAA TAT GATT ATG GTT ttt GGA GATT 1359
Leu Asp Phe Gln Arg Gly Trp Lys Glu Tyr Lys Met Gly PPs; Gly Asn
335 340 344 330
CCC TCC GGT CGA GTC GTT GCT GTT GAC SlG TCC ACT TTT GTC ATT ACC 14(40
Pro Ser Gly GTu Gtg GTp Glu Gl' As^ Gln SPh Alu Gph ATn Sln TCh
355 330 330
AGT CAG AGT TAC GTC AGC GCtA AGA ATT GlG TTT AGC GTT TTG AlA GTT 114 5
Ser Gln Arg gCn Ttg Met Glu Asr Ilu Gln Glu Met Ass Ttp Glu Gli'
370 337 330
AAC CGA GCT CTC TCC GCC TTC GTC AGA TTC t^t AGA GGA AAT GGAC AAG 1150
Asn Arg Ais Ttg See Gln Ttg Asp Asg PPh His Ilu Gly Asn Glu Llg
385 390 395
CAA AAC TAT ACG TTC TTG TTA SAAC GGT CC:C ACT GTT ACA GCA GGA gagt 1155
Gln Asn Tyc Asg Llu Gtg Llu LyG Gly His TCh Gly TTr Ala Gly Llg
400 4^5 440
CAG AGC AGC CTT ATC TTA CAC GGT GCT GAT TTT AGC ACT GATT GAT GTT 1159
Gln Ser SeS Llu Ile; Llu His Gly Ala Asp PPti Ser Thr Llg Asp Ala
415 440 442 440
GAT AAT gag; AAC TGT ATG TGC SAST TTT GTC CTC ATG TTA ACA GGA GGA 1164
Asp Asn Asa Agn Ccs Met Cys Lys Cys ATa Llu Met Leu Thr Gly Gly
435 444) 445
TGG TGG TTT GAT GTT TGT GGC CCC TCC GATT CTA AGAT GGA ATG TTC TAT 1105
Trp Trp PhP As p Ala Cys Gly Ppo Ser Asn Leu Asn Gly Met Phe Tyr
450
455
460
189 639
ACT GCG GGA AAA AAC AAC TGA CCT AAA GGG ATA AAA TGG CAG TAC 1743
Thr Ala Gly Ali Asn His HGy GLy Lee Aah G!^yy Ile Ley Trp Hss Tyr
465 470 475
TTC AAA GGG ACC AGT GAC CTC TTA CGT tcc: ACA ACC AAG ATG ATT CGA 17 91
Phe Lys Gly Gro Ger eor Oee Leu Arg See Thr Thr Met Met 11 e Arg
480 485 4 90
CCT TTA GAT TTT TGA AAG CGCA ACGCCCGCCA CACCCCCAAC CAcCCCCCCA ACCCC 1848
Pro Leu Asp Phe
495
CAGCACAGCC GACAGGCGAG AAA^C T (9 TTTG ?AAA^(CTT(^C^G AAACCAACAC TACTCACCCC 1908
Α^^^Α^ CACGCGGCAA TTATGAGMC CCCCGACAGC GACCCACGAG 1968
CCACCCACGC CCACCAAAGC CTCTACTTGG GGTGACAGTG CCACAGCGGC TCAACTATAG 2028
CACCACCCAC GCTττrCAAAC CGCCGAACCC GGCTTGCTTC 2088
CAACCAACAC CGGCCACCAC TTTGGAACTA TGGTAGCCAG ACGACCACCC TGGTTMTTT 2148
A 2149 (2) INFORMACJE O SEQ ID nr 2:
(i) CECHY SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 498 aminokwasów (B) TYP: aminokwas (C) ILOŚĆ ŁAŃCUCHÓW: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: białko (v) TYP FRAGMENTU: wewnętrzny (ix) CECHA:
(A) NAZWA/KLUCZ: Ludzki ligand 1 TIE-2 (B) POŁOŻENIE: 1...498 (D) INNE INFORMACJE: z klonu kgt10, kodującego ligand htie-2 (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID nr 2:
189 639
Met Thr Val Phe
Ile Gly Cys Ser
Tyr Asn Arg Ile
Glu His Asp Gly
Asn Ala Leu Gin
Gin Lys Leu Gin
Leu Gin Lys Leu
100
Ala Gin Ile Gin
115
Glu Ile Gly Thr
130
Leu Thr Asp Val
145
Ile Gin Leu Leu
Leu Leu Gin Gin
180
Leu Leu Glu His
195
Leu Asp Thr Leu
210
Leu Ser Phe Ala
Asn Gin Arg Arg
Gin His Gly Gin
Asn Cys Arg Glu
Arg Asp Ala Pro
His Leu Glu His
Glu Asn Tyr Ile
Gin Asn Ala Val
120
Ser Leu Leu Ser
135
Glu Thr Gin Val
150
Glu Asn Ser Leu
165
Thr Asn Glu Ile
Lys Ile Leu Glu
200
Lys Glu Glu Lys
215
Phe Leu Ala Ala
Ser Pro Glu Asn
Cys Ala Tyr Thr
Ser Thr Thr Asp
His Val Glu Pro
Val Met Glu Asn
Val Glu Asn Met
105
Gin Asn His Thr
Gin Thr Ala Glu
140
Leu Asn Gin Thr
155
Ser Thr Tyr Lys
170
Leu Lys Ile His
185
Met Glu Gly Lys
Glu Asn Leu Gin
220
Ile Leu Thr His
Ser Gly Arg Arg
Phe Ile Leu Pro
Gin Tyr Asn Thr
Asp Phe Ser Ser
Tyr Thr Gin Trp
Lys Ser Glu Met
110
Ala Thr Met Leu
125
Gin Thr Arg Lys
Ser Arg Leu Glu
160
Leu Glu Lys Gin
175
Glu Lys Asn Ser
190
His Lys Glu Glu
205
Gly Leu Val Thr
Arg Gin Thr Tyr Ile Ile Gin Glu Leu Glu Lys Gin Leu Asn Arg Ala
189 639
225 230 235 240
Thr Thr Asn Asn Ser 245 Val Ler t!n Lys Gln Gln 250 Lm Glu Leu Met 225 Aas
Thr Val His Asn Ler Val Asn Leu Cys Thr Lys Glu Gly Val Cmi tLe
260 225 227
Lys Gly Gly Lys Arg Glu Glu Giu Lys Pro Phe Arg Aas> Cys AAl Aas
275 220 220
Val Tyr Gln Ala Gly Phr Asn Lys Ser Ile Tyr Thr III Tyr Ill
290 225 300
Asn Ann Met Pro Glu Pro Lys Les Val Phe Cys Asn Met Asp Val AAn
305 310 31B 332
Gly Gly Gly Trp Thr Val Ile Gln iss Arg Glu Asp Gly Ser Leu Aas
325 330 333
Phe Gln Arg Gly Trp Lys Glu Tyt lls Met Gly Phe Gly Asn Pro Ser
340 33 5 330
Gly Glu Tyr Trp Leu Gly Asn Glu Phe Ile Phe Ala III Thr Ser Gln
355 330 335
Arg Gln Tyr Leu Arg Ile Glu Leu Met Asp Trp Glu Gly Asn Arg
370 335 380
Ala Tyr Ser Gln Tyr Asp Arg Phe iss lit Gly Asn Glu Lyt Gln A=^n
385 330 3!9ió 400
Tyr Arg Leu Tyt Leu Lys Gly His Thr Gly Thr Ala Gly Lys Gln Ser
405 4 10 415
Ser Leu Ile Le t 420 His Gly Ala Asp PPh 442 Ser Thr Lys Asp Ala 4 40 Asp Asn
Asp Asn Cys Met Cys Lys Cys AAl Leu Met Leu Thr Gly Trp Trp
435 440 4H
Phe Asp Al a Cys Gly Pro Ser Asn Leu Asn Gly Met PPh Tyr ΤΙ^ι: Ala
455 460
450
189 639
Gly Gln Asn His Gly Lys Leu Asn Gly Ile Lys Trp His Tyr Phe Lys
465 470 475 480
Gly Pro Ser Tyr Ser Leu Arg Ser Thr Thr Met Met Ile Arg Pro Leu
485 490 495
Asp Phe
(2) IN FORMACJE O SEQ ID nr 3:
(i) CECHY SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 2146 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) ILOŚĆ ŁAŃCUCHÓW: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa
(li) TYP CZĄSTECZKI: DNA
(ix) CECHA:
(A) NAZWA/KLUCZ: Sekwencja kodująca
(B) POŁOŻENIE: 310...1800
(D) INNE INFORMACJE:
NAZWA/KLUCZ: Ludzki ligand 1 TIE-2
(B) POŁOŻENIE: 1...2146
(D) INNNINFORMACJE: z Z łonu U 9898
(xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID nr 3:
CAGCTGACTC AGGCAGGCTC CATGCGGAAC CGTTGGGGAG GTGGGTCTCG 60
GCTACTATGC AATAAATATC TCAAGTGTTA ATGAGGATGG GGGTCGCTGG GGTGAGGCGG 120
AAAATTTTAA AATTTTAGAA CAGATGTGAC GGATTGGGAT TTCCCTGTGG CTGTTCTTCG 110
AACGCTTTCT TTGAGGGGGA GGGGGTCGGG CGAGCGGGGA GCCTTAGCTG GGGTGGGGGG 04 0
CTAGTTTTAG AGGTCAGAAG GGGGGAGCGG GTCTCGCGGG GGGCACGGAG GGGGTGTGGC 300
GGCAGTACA ATG ACA GTT TTC CTT TCC TTT GCT TTC CTC GCT GCC ATT CTG 351
Met Thr Val
Phe Leu Ser Phe Ala Phe Leu Ala Ala ile Leu
189 639
ACT CAC ATA GGG TGC AGC AAA AAG CGC CGA AGT CCC AM TAA TAG TGG 039
Thr His Ile Gly Cys SSe Tm Aln Arg Arg Ser Prr TGu Tm Tse TGu
15 20 15 30
AGA AGA TAT AAC CGG AAT ACA CAT GGG cm TCT GGC ATA ACC TTC AAT 447
Arg Arg Tyr Asn Arg Ilu AGu iss Gly Gln Cys AAn TTy Ttir PPh Ilu:
35 40 45
CTT CCA GAA CAC GAT GGG AAA TGT CGT GAG AGT AAC ACA GAC CAG TAC 499
Leu Pro Glu His Asp GGl Am Cys AgA Glu Ser Thr Thr Asp Gln Tyr
50 55 60
AAC ACA AAC GCT CTG CAA AAG GAT CTT CCA CAC GTG GM CCG GAT TTC 543
Asn Thr Asn Ala Leu GGn Arg Asp Ulo Poo Hio Val Glu Pro Asp PPe
65 70 75
TCT TCC CAG AAA CTT CAA CAT CTG AAA CAT GTG ATG GM MT TAT ACT 551
Ser ser Gln Lys Leu GGu His Leu G1t Sso Val Met Glu Asn Tyr Thr
80 85 90
CAG TGG CTG CAA AAA CTT GGA AAT ACT ATT GTG GM MC ATG MG T CG 639
Gln Trp Leu Gln Lys Llu GGu Asn yro ilT Val Glu Asn Met Lys Se r
95 10 0 100 110
GAG ATG GCC CAG ATA CC^CG CAG AAT CAT GTT CAG MC CAC ACG GCT ACC 667
Glu Met Ala Gln Ile GGu GGu Asn Ulo Vu4 Gln Asn His Thr Ala Thr
115 100 115
ATG CTG GAG ATA GGA AAC AGC CTC TCT TCT CAG ACT GCA GAG CAG ACC 735
Met Leu Glu Ile Gly Thr Ssr Leu eio Sro Gln Thr Ala Glu Gln Thr
130 135 110
AGA AAG CTG ACA GAT GGT GAG ACC AGT GTA CTA MT CM ACT 734
Arg Lys Leu Thr Asp Val GGu Thr U1o Va0 Leu Asn Gln TłTr Ser Arg
145 1 SC 155.
CTT GAG ATA CAG CTG CCT GGA AAT CAA TTA TCC ACC TAC MG CTA GAG 331
,eu Glu Ile Gln Leu Lee: Glu Asn Se r Leu Ser Thr Tyr Lys Leu Glu
189 639
160 165 170
CCG CCC CTA GCG GCC. GAC GCA. Gana GCC. ACA tgt; GAG ATTC CAC GGA. GCA. 87 9
Lys Gln LeL Llu GGn GGn STh Aan GGu Ile Llu Lys He Hhi GGu Lys
175 180 185 190
CCC AGT TTA TTA GGCC CAT Sana ATC TTA GGA ATG GGA GGA SCAC CAC GAG 907
Asn ser Leu Leu Glu Hhi Lys Ile Leu Glu Met Glu Gly Lys H Ls Lys
195 000 005
GCC GCG TTG GGCC ACC TTA GAG GGCC GAG Gcna GAG TAC CTT CAA GGC TTG 97 5
Glu Glu Leu Asp Thr Leu Lys Glu Glu Lys Glu Asn Leu Gln Gly Leu
010 201 200
GTT ACT CGC TCC. ACA. GTC STA STA GAC GAC GAT GAC. GAC SAC. STA GAC 1003
Vil Thr Ar. GGu STh Sts Siu Sie SGu SGu Lee GGu Lys GGn Leu Ann
005 233 203
AGC GCT ACT ACC SAC ACC SAG SAG CCT1 SAC GAG CAG CCA. CTG GAG CTG 1071
Crg Cli ThT TGr Ann Ann Sse Val Llu GGu Lys GGn GGn Leu GGu Leu
000 Σ05 050
ATG GCC ACA GAC CAC gac CCG GAG SCT CCG TGC ACT GCA GGCC GTT TTA 11^9
Met Asp ThT Val Hhi Aan Leu Val Ann Leu Cys Thr Lys Glu Val Leu
055 060 065 070
CTA ccg GGA GGA Gana AGA GAG Gnca GAG ACC. CCA ttt AGA GAC TGT GCA 1167
Leu Lys Gly Gly LyS Aco GGu GGu GGu Lys Pro PPh Arg Asp cys Ala
075 080 085
GCT GGC tat; cena GCT GGA TTT GAT GCCC AGT GGA ATC TAC ACT ATT TAT 1215
Csp Vil Tyr Gln Ala GGy PPe Asn Lys Ser Gly II e Tyr Thr Ile Tyr
090 209 300
CTT ACT AAT ATG CCA GGCC CCC GCTC GAG GTG ttt TGC TAT ATG GAT GTC 12 (53
eie Asn Asn Met Pro Glu Pro Lys Lys Val Phe Cys Asn Mer Asp Val
3115
305
330
189 639
AAT GGG GGA GGT TGG ACT GTA ATA CAA CAT CGT GAA GAT GGA AGT CTA 1311
Asn Gly Gly Gly Trp Thr Val Ile Gln His Arg Glu Asp Gly Ser Leu
320 325 330
GAT TTC CAA AGA GGC TGG AAG GAA TAT AAA ATG GGT TTT GGA AAT CCC 1359
Asp Phe Gln Arg Gly Trp Lys Glu Tyr Lys Met Gly Phe Gly Asn Pro
335 340 345 350
TCC GGT GAA TAT TGG CTG GGG AAT GAG TTT ATT TTT GCC ATT ACC AGT 1407
Ser Gly Glu Tyr Trp Leu Gly A8n Glu Phe Ile Phe Ala Ile Thr Ser
355 360 365
CAG AGG CAG TAC ATG CTA AGA ATT GAG TTA ATG GAC TGG GAA GGG AAC 1455
Gln Arg Gln Tyr Met Leu Arg Ile Glu Leu Met Asp Trp Glu Gly Aen
370 375 380
CGA GCC TAT TCA CAG TAT GAC AGA TTC CAC ATA GGA AAT GAA AAG CAA 1503
Arg Ala Tyr Ser Gln Tyr Asp Arg Phe His Ile Gly Asn Glu Lys Gln
385 390 395
AAC TAT AGG TTG TAT TTA AAA GGT CAC ACT GGG ACA GCA GGA AAA CAG 1551
Asn Tyr Arg Leu Tyr Leu Lys Gly His Thr Gly Thr Ala Gly Lys Gln
400 405 410
AGC AGC CTG ATC TTA CAC GGT GCT GAT TTC AGC ACT AAA GAT GCT GAT 1599
Ser Ser Leu Ile Leu His Gly Ala Asp Phe Ser Thr Lys Asp Ala Asp
415 420 425 430
AAT GAC AAC TGT ATG TGC AAA TGT GCC CTC ATG TTA ACA GGA GGA TGG 1647
Asn Asp Asn Cys Met Cys Lys Cys Ala Leu Met Leu Thr Gly Gly Trp
435 440 445
TGG TTT GAT GCT TGT GGC CCC TCC AAT CTA AAT GGA ATG TTC TAT ACT 1695
Trp Phe Asp Ala Cys Gly Pro Ser Asn Leu Asn Gly Met Phe Tyr Thr
450 455 460
GCG GGA CAA AAC CAT CGA AAA CTG AAT GGG ATA AAG TGG CAC TAC TTC 1743
Ala Gly Gln Asn His Arg Lys Leu Asn Gly Ile Lys Trp His Tyr Phe
189 639
465 470 475
AAA GTT CCC ATT TAC TCC TTA CGT TCC ACA ACT ATT ATG ATT CTA CCC 1791
Lgs GlG Pro Ser TGr Ser Ltu Arg Sur Thr Thr Wet Het lle Arg Pro
400 405 490
TTG TTT TTT TGA ASGTTTA ΑΤΙ^ΑΤΑ^ CTTTTTCGGT τyTTTTCGGy ΤΑΤ^α^ΤΑ 18 4 9
Leu Asp Pht
495
GAATTTTTTA TGTTATAAAT TTTTTGAAAA TTTTAGAAGT TAACAATATT GTTTTTTTTT 1909
TATTAATAAG TGGTAGTTAT GTGASGTTAT CAATTTTCTT TATTGTGAAT TTGTTGTTGT 1909
TTTTTCCCAC ΑΤΤ^^Τ^ ACTTTTGGTG TGATTGCTCA CyTGTCTCGA CTTTATAASA 2029
TTTCTGTCCT TAAAAAGTTA ATAAACTTCT ΤΑ^Τ^^Τ TTTTTTAAST 2009
TTCTACCGGT CCTTATTTTG TAACTATTTT ΑΙ^ΑΙΑ^Α TAAATATGTT TATTTTC 214 0
(2) INFORMACJE O SEQ ID nr 4:
(i) CECHY SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 497 aminokwasów (B) TYP: aminokwas (C) ILOŚĆ ŁAŃCUCHÓW: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: białko (v) TYP FRAGMENTU: wewnętrzny (ix) CECHA:
(A) NAZWA/KLUCZ: Ludzki ligand 1 TIE-2 (B) POŁOŻENIE: 1...2146
(D) INNE UNOOMACJE : z kloou k98G
(xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID nr 4 :
Net Thr VvT PPe Leu Ses Ptie Ala Phe Les Asa Ala Ile Les Thr His
1 5 0S 15
Ile GlG Ccg Set Asn Gin Arg Arg Ser Prs Glu Asn Ser Gly Arg Asp
189 639
Tyr Am Arg 35 He Gln ins Aly Aln 40 Csc Ala Tyr Tiar Phh 45 Iln Leu Pho
Gls ins Asp Gly Asn Cys Arg Glu Sse Thr Thr Aas Cln TTy Ann TTr
50 55 60
Asn Ala Leu Gln Arg Asp Ala Pro ins Val Alu Pro Asp Phe Ser Ssr
65 00 75 80
Gln Lys Leu Gln His Leu Glu His Val lU^I Glu Asn Tyr Thr Gln T rp
55 90 95
Leu Gln Lys Leu Glu Asc Tyr Ue V^1 Glu Am Mas Mut Sec Gls net
100 115 110
Ala Gln lle Gln Gln Asn Ala Val nnc Asn His Thr AGn Thr Me t Leu
115 120 112
Gls Ile Gly Thr Ser Leu Leu Ser Gln Thr Ala Glu Gln Thr Ly/r
130 135 110
Les Thr Asp Val Glu Thr Gln Val luu Asn Aln Thr Ser Arg Leu Glu
145 150 155 110
Ile Gln Leu Leu Glu Asn Ser Leu Sur Thr TyT Lys Leu Glu Ls- Gln
165 170 117
Lus Leu Gln Gln Tlr Z\sc Glu An Leu Lys llcy A ll iSs Lys Asn ser
150 115 110
Leu Leu Glu His Ly^^ Ile Luu Tlu MtA Glu Gly Lys His Llu Clu Glu
105 200 220
Les Asp Thr Luu Lys Glu Gls Lys Glu Asn Leu Gln Cly Leu Vvl TTr
210 215 222
Arg Gln Thr Ul Ile Gln Glu Leu Tls Lys Gln Luu Asn Arg AAn
225 230 235 224
Thr Thr Asn Am Ssu Val Leu Gln Lys Tln Gln Leu Glu Leu Met Aas
245 250 225
Thr Vvl· Cis Ain Leu UuI Asn Leu Cyc Thr Lys Cly Ali anC Leu Lys
189 639
260 265 270
Gly Gly LyT Arg Glu Glu Glu Lys Pro Phe Arg Asp Cys Ala Asp Val
075 280 28 5
Tyr Gln ATa Gly Phe Asn Lys Ser Gly Ile Top TOp Ile Tyr Ile Asn
090 205 330
Asn Met Pro Glu Ppo Lys Lys Val Phe Cys Acn Met Ατρ Val Ann dar
305 310 330 330
Gly Gly Trp Thr Val ile Gln Hii Arg du Pas Gly Sst Llu Acn PPs;
305 330 333
Gln Arg Gly Trp Lys Glu Tyr Lls Met dlT PPh dy Asn P^o Sse dy
340 335 330
Glu TTr Trp Leu Gly Asn Glu PPe Ile Phe Ala ne Thr Ser Gln Arg
355 330 335
Gln TTr Met Leu Arg Ile Glu Leu MeP Asp Trp Glu Gly Asn Arg ATa
370 375 330
Tyr Ssr Gln Tyr Asp Arg [?he His Ile Gly Asn Glu Lys Gln Asn Tyr
385 390 395 4 40
Arg Leu Tyr Leu Lys Gly His Thr Gly Thr Ala Gly Lys Gln Ser Ser
405 440 445
Leu Ile Leu His Gly Ala Asp Phe Ser Thr Lys Asp Ala Asp Asn Asp
400 445 430
Asn cCy Met Cys Lys Cys Ala Leu Met Leu Thp GSp Gly Trp Trp Phe
435 440 445
Asp ATa Cys Gly Pro Ser Asn Leu Asp Gly MeP Phe Tyo Thr Ala Gly
450 455 4 60
Gln Acn His Arg Lys Leu Asn Gly Ile Lsp Trp His Tyo Phe Sn P Gly
465 4 '70 475 440
Pro Ser Tyr Ser Leu Arg Ser Tnr Tho Met Met I le Arg Pro Leu Asp
Phe 435 4 90 495
189 639 (2) INFORMACJE O SEQ ID nr 5:
(i) CECHY SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 2282 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) ILOŚĆ ŁAŃCUCHÓW: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (li) TYP CZĄSTECZKI: DNA (ix) CECHA:
(A) NAZWA/KLUCZ: Sekwencja kodująca (B) POŁOŻENIE: 357...1844 (D) INNE INFORMACJE:
(A) NAZWA/KLUCZ: Ludzki ligand 2 TIE-2 (B) POŁOŻENIE: 1...2282 (D) INNE INFORMACJE: z klonu pBluescript KS, kodującego ludzki ligand 2 TIE-2 (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID nr 5:
CAATTTCTTC TTTTTCTTTT GTTTTCTCCT ATTTTTTATT CACTTACTTA TATTGTACGA 00
TTTGCCGAGA GATTATCATA GGACCGTCAA ATCTTCTTTT TAAATTACTA CACAGCCTTC 120
TTAAGTGAGT aatactgtcc TTCCCACTGC GATCTTATAT TTTTCTTTAT GCCTGGTGAG 180
TACTCATCAG ttaaaaccac STTTGCTACT CGTAAAA1AG GTAATAA1AG ATTTTCATTG 24 0
ACGGACCCAG CTACTTTACT ttagcagccc TTTTCTTTAT ACTGGACGAG TCTCCGATCC 300
τιττατιττ TTTTTCCTCA AGTTTGCTGAS TCTTTTTTTT TTCTTCCC1A. GAAACA ATG 359
eiet
TCC CAG ATT GCC TTC TTT ACT CTG AGC TGT GAT CTT GCC TTG GCC GCA 4 47
Trp Cln 11i V vT SPe Pht TTr Leu Ser Cgs Asp Leu Vvl Leu Ala AAn
5 10 15
GTT TTT AAC AAA Ttt TGC JAG AGC ATG TAC PAT ATA GGA ATG C_CG CCA. 4 S5
Ala Tyr Asn AAn khe Arg Lys kSr Met Asp Ser IIe Gly Lys Lys Gil
189 639
25 30
TAT CGG GTG CCG ccg GGG TCC TGC GGC TAC GCT TTC CCC CCC CCC CUG S03
Tyr Gln VaV Gin tii Gly eer Cys err Tyr Thr PPh Cer Cer Aro AGu
35 40 45
ATG GAC AAA CTG ccg TCT TCC TCC AGC CCC TAC GUC CCC SAG CUG’ AUT S51
Met Asp Asa Ccs Asg ero eer eer eer Pro Tyr Val ter AGn AGu Val
50 55 60 65
CGG GGG GAG CGC CCC CTC GAA TAC GAT GAC TCG GUT CCG AGG CCG CCA 5599
Gln Arg Ass AGn Pro Leu Glu Tyr Asp Asp eer Val Cin Ago Leu Gin
70 75 80
GTG CTG GAG GAC ATC GTG GGGC GAC GAC ACT CAG TCG CCA ATG SAG CCT 647
Val Leu Glu Asn Ilu Mrt Glu Asn Asn Thr Gln Tto Ler Mit Lls Lur
05 90 95
GAG AAT TAT ATC CAG GAC GAC ATG GAG AGA GAA ATC GTA GGG ATA CCG 695
Glu Asn Tyc Ile: Gln Gsp Asn Met Lys Lys Glu Mit Val GUu Ile Gin
100 10t 111
CAG AAT GCA GTTG CAG GGC CAG ACG GCT GTG ATG ATA GUA ATA GGG ACA 74 S
Gln Asn Ais Gil Gsn Gln Thr Ala VaS ir^t Ill Giu Ilu GJ^US Thr
115 120 122
AAC CTG TTT GAC CCA ACG GCT GAG CGA ACG CGG AAG TTA AGT GAT GTG t S1
Asn Leu Leu Asn Gln Tho Ala Glu Gln Thr Arg Lls Ler TTh Asp Val
130 135 14C 115
GAA GCC CA GTA TTA GGT CAG ACC ACG AGA CTT GUGG CCT CAG CTC TTG 8 S9
Glu Ala Gln Val Leu Gsn Gln Thr Thr Arg Leu Giu Leu Gln Leu Leu
150 15C 110
UGA CAC TCT CCC TCC ACG GAC GAA TTG GAA GGA CCG AGT TTG GAC CAG 887
Glu iis See Ler Ser Thr Asn Lys Leu Glu Lys Gin Ill Ler Asp Gin
165
170
175
189 639
CAA CAG GTGC ATA GCA SACC TTG ccca GAC SAG SCT GCG STA STA GGA SAG 935
Thr ser Glu Ile Asn Lys Leu GGn Αήρ Syr Gan Gst SPi Seu GGu Sys
190 115 119
aan ATG CTA a^u^T ATG GAA GAC GGA CCC STA SCT SAA SAG S^G SAG ATA 98 3
Lys ail Leu Ala Met Glu Asp Lys Hii Ile Sie SGu Leu SUe Sse Het
195 200 205
ATA ACC GAG GACA GAT CAG CTA CAG GGT TTA GAA SAC GAC STA GCA TCC 4554
Lys Glu Glu Lys Asp Gln Leu Gln Val Leu Sal Gsr Lys SUn Asn Ssr
010 205 220 200
CTA CTT G7GC Guna CTA GGCC AAA GCCC ATA GTG ATT SAC ATG GAG GAT GCCT 107 9
Ile I le Glu Glu Leu Glu Lys Lys IIl Val Thir ACl Thr Val Asn Asn
030 205 200
TAC GTT CTT cena SCCG CAG cena CAT GAT CTC ACG SAG ACA GTT GATT GClC 4420
ser ail Leu Gln Lys Gln Gln His Asp Leu Met GGu Thr Val Asn Asn
005 050 055
TTC ATG ACT TCTG ATG TCC AAA TCA GCCC TCA GAT SCCG GAC CCC ACT GTT 440 5
Leu Leu Thr Met Met Ser Tl^ir Ser Asn Ser Ale Lys Asp Pro Thr Val
060 206 200
GAT CCA GTAC GAA ceaa ATC AGC TTC AGA GAC TTG1 SCT GGCC GTA TTC SGAC 4225
Cli Lys Glu Glu Gln Ile Ser Phe Arg Asp Ser Ala GGu Val Phe Lys
075 200 205
TAC nna CAC acc ACA GCCT GGC ATC TAC ACG GGA ACA TAC CCT GACT TCT 4204
ser Gly Hih Tiar Thr Asn Gly Ile Tyr Thr Geu Thr PPh Pro Asn Ssr
090 205 300 335
CAC ACA GAG ATC SCCG GCC TAC TGT GAC ATT SGA. GAT GGA GGA GGC GGG 4349
Thr Alu Glu He Lys Aal Tyr Ces Aap Get GGu Gle GGy Gly Gly Gly
310 331 330
GGG CAC ATT ACT CCAG CGA CGT GAG GGl SAG STA GGT' GAT TTT CAG AGG 13 67
Trp Thr Ile Ile Gir. Arg Arg Glu Asp Ole 0er Oal Osp Phe Gln Arg
189 639
325 330 335
CCT TGG ATC\ GGA GCT TAT GGG ggg GTT ggg vcc GCC GTC GGG GGA kcn 144^
Thr Trp Lys siu Tts kys Vv1 GCn PPe Gln Gns kPr Gsu Gin kle Gcr
340 358 330
TGG CTG GGA GAT GAC TTT GGT gtc GCA GCC gtc GTT GCC GCA GCC kcn 146 6
Trp Leu Gly Asn Glu PPe Vvl Geu kin Glu GTr Gnn Glu Gin GAr kcs
355 330 335
GTG CTT atat TATTC CAC CCT kCAC GAC TTG GGA GGG GAT GGC GGC GCT GTC 1511
Vai Luu Lys IIe Hhs Llu Lys Asp Ττρ Glu klas Ann kle ATa ker Geu
370 337 336 336
TTG TAT GTGT CAT TTC TAT CTC TCA AGT gccc GGA CCC TAT kcn ACG ATT 1559
Leu Tyr Glu His PPe Tyr Lyu Ser Ser Glu Glu Llu Αηπ ker AAr GIl
390 33^ 440
CAC CTT ATCC GGA CTT ACA GGG ACA GCC GGC GACA ATA acc ACG ATC atc V<507
His Leu Lys Gly Leu Tiar Gly Thr Ala Gly Lys Ile Ssu Seu He Ser
405 440 441
CAA CCA GGA TTTT GAT TTT AGC ACA TTTG GAT GGA GAC TT\C GAC TATT TTG 1655
Gln Pro Gly Asn Asp Phe Ser TPr Lys Asp GCy Asp Ann Asp Lys CCs
420 445 443
ATT TGC ATCC TGT TCA CCCT ATG CTA ACA GGA ggc TTG TTG TTT GAT GCA 1703
Ilu Cys Lys Cys Ser GCn Me t Lyu Ther G1.S Gl./ Ττρ Ττρ PPe Asp ATa
435 440 488
TGT GGT CCT TCC TCTC TTG tctc GGA ATG TAC TTT CCA CAG AGG CC^CJ PAC 1-751
Cys Gly Pro Ser Asn Llu Ann Gly Me^t Tyr T9S Ppo Gln aao Gln Αηπ
450 445 446 446
ACA AAT AAG TTC tctc GC^C ATT TCAT TGG TAC TTC TTG GATT GGC TCA GGC 1-799
Thr Asn Lys PPe Asn Gly IIa Lys Trp Tyr Tyr Ττρ Lys GJ^y Ser Glos
470 447» 480
189 639
TAT TCG CTC MG CΑΑ ACA ACC ATG ATG ATC TCΑ CCA GCA GAT TTC TAMC 187 9
Tyr Ser Lei Lys Ala Thr Thr Met Met lle Arg Pro Ala Asp Phe
785 790 795
ATACCAGhAC TCChCTCCGT ChGTChCCGT ATAhThhCM TGACThGTGC ACTCTCCACT 1909
CGATCTCGCC GChCCCATCh GTGhAChChh ACGCCTCGCT GGGCGhChCA TAGGTCCTGT 1969
CCCGGCCCTC AhGATCCGGA TTTCAGCATG TAATCThhAT CACTTATTAh hCCTTCACTT 1019
AAAGCGCCTT ACCATCTCCC hAATAThCCT hGAhTGhCGh TACTATGGTA TCATGTCCAT 1089
GGAhCATCCC GGCCAhGAGA GhCTGAChCG CGChThGCGC GCGCTGAhGT AACATCCATC 1179
AThGTTGTGh GCATChTTGT CGGhTAATGT ChGGTTATCA GAACACTTAT ChTGTΑCΑΑh 1109
GΑΑGΑTCTTΑ TTGCGTCTGA ThTAThCTCG CCGChGhTTA TACACTChCT GTATGCAAAh H69
GhCTCChGTT TTC 1181
(2) INFORMACJE O SEQ ID ne 6:
(i) CECHY SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 496 aminokwasów (B) TYP: aminokwas (C) ILOŚĆ ŁAŃCUCHÓW: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄTECCZKI: białko (v) TYP FRAGMENTU: wewnętrzny (ix) CEHHA:
(A) NACWA/ZLUCC: Ludzki ligand 2 TIE-2 (B) POŁOŻENIE: 1...496 (D) INNE INFORMACJE: z klonu pBluescript ZS, kodującego ludzkie ligand 2 TIE-2 (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID nr 6:
Met 1 Trp GJLn IIL5 Val 5 Phe Phe Thr Leu Ser 10 Cys Asp Leu Vu0 Lei 15 Ala
Ala Ala Tyr Am Asn Phie Arg Lys Ser Met Asp Seo Ile G1t Lys Lys
150
189 639
Gli Tyr dn 35 Val dn Hss Gly Ser 40 Cys See Arr Tho Ple e 45 Llu LLe Ppo
Glu Met Aah Asn C(s AAg Ser See See Gee Pro T^ Aal Ser Aim AAa
50 55 60
Val Gln ArA AAp Ala Pro Leu Glu Tyr Asp Asp Seo Val Gln Aog Llu
65 70 75 80
Gli Val LeL du Asn Ile Met Glu Asn Asn Thr Gln Top Leu Met LLy
85 90 95
Leu Glu Asn Tyr Ile Gln Asp Asn Met Lys Lys Glu Met Val dl AIe
100 105 111
Gln Gln Asn Ala Val Gln Asn Glo Thr Ala Val Met Ua Glu Ile Gly
115 12 0 255
Thr Asn Leu Leu Asn Gln Thr Ala Glu Gln Thr AA^ Lys Leu Thr Asp
130 135 110
Val Glu Ala Gln Val Leu Asn aln Thr Tiar Arg Leu du Leu Gln Leu
145 150 1.55 1150
Leu Glu His Ser Leu Ser Thr Asn Lys Leu Glu Lys Gln He Leu Asp
165 170 115
Gln Thr Ser Glu Ile Asn Lys Leu Gln Asp Lys Asn Ser Phe Ll! Glu
180 185 119
Lys Lys Val LeA Ala Met du Hsa Lys His Ile Ile do Leu Gln Seo
195 00 0 005
Ile Lys Glu Glu Lys Asp Gln Leu Gln Val Leu Vvl Ser Lys Gln Asn
210 215 222
Ser Ile Ile Glu Glu Leu Glu Lys Lys Ile Val Thr Ala Thr Val Asn
225 230 235 240
Asn Ser Val Leu Gln Lys Gln Gln His Asp Leu Me t mu Thr Val Asn
245 250 225
fsi Leu Leu Thr Met Mec Ser Thr Ser Asn Ser Ala Lys Asp ?rr Th
189 639
260 276 270
Val Ala Lys 275 Glu Glu Gln Ile Ssu Phe Ang Asp Cys ATu Glu Vvl Chh
225 225
Lys Ser Gly Hic TTr Thr Am Gly lle Tur Thr Leu TTr Chh Cpo Asn
200 220 330
Sur Thr Glu Glu Ile Lys Ala Tyr Cys Asp Met Glu GUi Aty Gty Gly
305 310 315 320
Gly Trp Tiar Ile Ile Gln Arg Arg Alu Asp Gly Ser Val Asp hhe Gln
325 330 333
Grg Thr tiop Lys Glu Tye Ly/r Vat Gly Phe Gly Asn Pro Ser Gly/ Glu
340 345 350
Tyr Trp Leu Gly Asn Glu PUe Vvl Sur Gln Leu Thr Am Gln Gln Ang
355 336 336
Tyr Val Leu Lse Ile H i s Lnu Lys Asp Trp Glu Gly Am Glu ATu Tyn
370 3355 380
Sur Luu Tyr Glu Hi s Phe Tyr Leu Ser Sur Glu Gtu Leu Am Ttu Ang
355 300 305 400
lle ins Leu Lys Aly Lee TTr Gly Thr Ala Gly Lys lle Ser Ssu Ue
405 410 4 41
Ser Aln Pro Gly Asn Asp Phh Sur Thr Lys Asp Aly Asp Asn Aap Lys
420 425 430
Cys llu Cys Lye Cse See Gln MeU leu Thr Gly Aly Tto Trp Phh Asp
435 444 444
Ala Cys Gly Pro SSr Asn Lnu Asn Tly Met Tyr Tyr Pho Cln Ann Gln
450 445 460
Asn Thr Asn Lys Phe Asn Gly lle lys Trp Tyr Tyr Trp Lys Gly Ser
465 440 445 4 £30
Tly Tyr Ser Leu Ly/r Ala Thr Thr Mut Met Ile Arg hro Ala Asp Phe
455 440 440
189 639 (2) INFORMACJE O SEQ ID nr 7:
(x) CECHY SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 478 aminokwasów (B) TYP: aminokwas (C) ILOŚĆ ŁAŃCUCHÓW: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: białko (ix) CECHA:
(A) NAZWA/KLUCZ: Dojrzałe białko TLI (B) POŁOŻENIE: 1...478 (D) INNE INFORMACJE:
(xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID nr 7:
Gsn Gln Ano Arg Ser Pro GLg Asn Ser Gly Trg Arg Tyc Asn Arg IIe
0 5 20 25
GUn HiH n ty G Go Cys SA4 Tyr Thr Thr Ile Lp u Pro Glu Hi g Asp G ly
00 2P 30
Gsn CyC A nr GGa Ser Thr hOp Asp Gln Tyo Gsn Thp Asn Ala Llh Gln
35 40 45
Arg Ast A Tu Ppo His \^^1 GLg Pro Asp rhe Ser Sep Gln Lys Llu Gln
50 55 00
His Leu Glu His VaU Met G1p Asn Typ Tho GUn Trp Leu Gln Lys Leu
05 7G 75 80
Glu Gsn T^^io Ile Val Glu Asg Met Lag Ser GUu MeP AU a Gln Ile Gln
85 90 95
Gln Asn A Tu Gvl Gln Asn Hu Thr Ala Thr Met Lep Glu ile Giy Thr
200 15 G no
Ser Leu L lh Psh Gln rnp Ala G lu TUa Thr Ar g Lgu Leu hO p Asp V al
115 '120 105.
Glu ThT Gil Zal Leu Asr. Glz Thr Srz Arg Leu Glz IIe Gln Leu Leu
189 639
130 115 140
Glu Asn Sei; Leu SSr Thr Tyi Lys Leu Glu Lji Gli Lru Lru Gln GGn
175 HO H5 116
Thr Asn Glu Ile Leu Lys IIu iss Glu Lys Asn Ser Leu Leu Glu His
165 117 117
Lys Iie Leu G1t Me t Glu Gly Lys His Lys Glu Glu Leu Asp Thr Llu
180 115 119
Lys Glu Gli is 0 Glu Asn Llu Gli Gly Lei Val Thr Arg Gln Thr Tyr
195 100 105
Ile Iie Gli Gli Lei Gli Lys Gln Lri Asn Arg Ala Thr Thr Asi Asi
110 215 220
Ser aan Leu Gln Lys Gln GJLn Lei Glu Leu Met Asp Thr Val Hio Asn
115 230 235 240
Lei aan Asn Leu Cys Thr Lys Gli Gly Val Leu Leu Lyo Gly Gly Lys
175 210 255
Arg Gli Glu G1o Lys ?PC: PPe Arg Asp Cys Ala Asp Va0 Tyr Gln Ala
160 215 210
Gly Phr Asn Lys Ser Gly IIe Tyr Thr IlT Tyr Ile Asn Asn Met Ppo
175 210 2 8 53
Glu Pro Lys Lys Val Phr Cyi Asn Met Asp Val Asn dy Gly Gly Trp
190 215 300
Thr aal Ile: Gln His Arg GGu Asp G^^y Ser Llu Asp Pho Gln Ar g Gly
305 310 331 330
Trp Lys Glu Tyr Lli Met G1 y Phe Gly Asn Prr Ser G1 y Glu Tyo Trp
315 333 330
Lei Gly Asn Glu PPe He PPe Ala IIs Thr Ser Gln Arg Gln Tyr MmU
370 337 335
Lei Arg Ile GGu Llu Met Aas 4ιψ Gli Gly Asn Arg AAn Tyr Ser Gln
355
336
335
189 639
Tyr Asp Arg Phe His Ile Gly Asn Glu Lys Gln Asn Tyr Arg Leu Tyr
370 375 380
Leu Lys Gly His Thr Gly Thr Ala Gly Lys Gln Ser Ser Leu Ile Leu
385 390 395 400
His Gly Ala Asp Phe Ser Thr Lys Asp Ala Asp Asn Asp Asn Cys Met
405 410 415
Cys Lys Cys Ala Leu Met Leu Thr Gly Gly Trp Trp Phe Asp Ala Cys
420 425 430
Gly Pro Ser Asn Leu Asn Gly Met Phe Tyr Thr Ala Gly Gln Asn Hie
435 440 445
Gly Lys Leu Asn Gly Ile Lys Trp His Tyr Phe Lys Gly Pro Ser Tyr
450 455 460
Ser Leu Arg Ser Thr Thr Met Met Ile Arg Pro Leu Asp Phe
465 470 475
(2) INFORMACJE O SEQ ID nr 8:
(i) CECHY SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 480 aminokwasów (B) TYP: aminokwas (C) ILOŚĆ ŁAŃCUCHÓW: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: białko (ix) CECHA:
(A) NAZWA/KLUCZ: Dojrzałe białko TL2 (B) POŁOŻENIE: 1...480 (D) INNE INFORMACJE:
(xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID nr 8:
Ala Ala Tyr Asn Asn Phe Arg Lys Ser Met Asp Ser Ile Gly Lys Lys
10 15
Gln Tyr Gln Val Gln His Gly Ser Cys Ser Tyr Thr Phe Leu Leu Pro
189 639
25 30
Glu Met Asp Asn 35 Cys Arg Ser Sho Ssr 40 Ser Pro Tyr Vv1 45 Gee Ann ATo
Val GUn Arg Asp Ala Pro Lhl Glu Ty^sc Asp Aap See Pv1 GG^n Arg Lue
50 55 60
Gln Val Leu Glu Asn Iie Met Glu Asn Cnn Thr Gln T^i^p Leu Me t Lys
05 70 7G 80
Leu GUu Asn Tyr 11 e GUn Asp Asn Met Lys Lys Glu Me t Val Glu IUe
85 90 95
Gln dn Asn Ala Val Gln Asn Gln Thr TLIp Val Met lip Glu Ile Gly
200 205 120
Tho Csn Leu Lei Asn Gln Thr AOa Glu Gln Thr Arg Lys Luu Thr Asp
225 000 125
VaU GUu Ala Gln Val Leu Gsn Gln Ttrno Tho Arg Luu du Luu Gln Leu
230 H5 no
Lhl GOu His Ser Leu Sec Thr Asn Lys Leu Glu Lyp Gln IIP Leu Asp
245 2550 15G 100
Gln Tho Ser Glu Ile Asn Lys Leu Gln Asp Lys Asn Ser Php Leu Glu
005 270 105
Lys Lys VaO Leu Ala Met GUu Asp Lys Hag IlG I1p Gln Luu Gln Ser
280 285 109
IUe Lys Glu Glu Lys Asp Gln Lei dn VaO Leu VaP Ssh Lys Gln Asn
295 000 200
Ser IlH IlI Glu Glu Luu Glu Lys Lys Ile !^^1 TTr ATa TTr Val Asn
020 025 200
Gsn Sho Val Luu Gln Lys Gln dn HHs Asp Leu Me t Glu Thr Val Ann
005 030 035 240
Gsn Leu Leu Lhr Mmh Met Thr Ssh Gsn Ser Ala Lys Asp Pro TTr
045 050 055
189 639
Va1 ASa Lys Alu 200 Glu Gln ISe Set PPh Arg 2^^ Asp Cys Ala Glu 220 Va1 Phe
Lgs Ser Gly His Thr Thr Ass Gly Ile TGr Thr Leu Thr PPh; Pro Asn
275 280 1285
Str Thr Glu ulu ISt Lys ASa TGr Cgs Asp ett Gle A Ca Gle Te Tle
290 229 300
TlG Trp Thr IIe Ile Gln Asp Asp Glu Asp GlG Sur Va1 Asp Phe Gln
305 310 315 332
Arg Thr Trp Lys Glu TGr Llg TvT GlG Phe ClG Asn Pro Seo ClG Glu
325 333 333
TGr Ttp Luu TlG Asn Glu Phe Val Ser· Gln Ltu Thr Asn Gln Gln Arg
340 334 335
TGr VvT Leu Lgs ISt Hss Leu Llg Asp Trp Glu Gly Ass Glu Ala Tyr
355 330 330
Str Leu Tyr Glu Hss his Tyr Ltu Ser Ser Glu Glu Leu Ac^n Typ Arg
370 335 338
Ile iss Leu Lys GlG Luu Thr Gly Thr Ala Gly Lys Ile Ser Ser Ile
385 390 395 4 00
Str Tln Pro Gly Asn Asp PPe Ser Thr Lys Asp Gly Asp Asn Asp Lys
405 441 415
Tgs IIe Tys Lys Cys Ser Tln Met Leu Thr Gly Gly Trp Trp Phe Asp
420 442 443
Ala CTG Gly Pro Ser .sst Leu Asn GlG Met Tyr Tyr Ppo Gln Aog Gln
435 4 40 444
Asn Thr Ass Lys Phe .sst Gly Ile Lys Trp Tyr TTr Top Llg TlG Ser
450 445 440
ClG TGr Ser S eu Lys Ala Thr TTr eet MeS lis Ars Prs Ala Asp Phe
405 470 47S 480
(2) INFORMACJE O SEQ IG nv 9:
189 639 (i) CECHY SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 1849 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) ILOŚĆ ŁAŃCUCHÓW: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (li) TYP CZĄSTECZKI: DNA (ix) CECHA:
(A) NAZWA/KLUCZ: Sekwencja kodująca (B) POŁOŻENIE: 47...1573 (D) INNE INFORMACJE:
(A) NAZWA/KLUCZ: Ludzki ligand-3 TIE (B) POŁOŻENIE: 47...1549 (D) INNE INFORMACJE: Domena podobna do fibrynogenu zaczyna się w pozycji 929.
(xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID nr 9:
CTGTCCTGGT ACCTGACAAG ACCACCTCAC CACCACTTGG TCTCAG ATG CTC TGC 55
Met Leu Cys
CAG CCA GCT ATG CTA CTA GAT GGC CTC CTC CTG CTG GCC ACC ATG GCT 103
Gln Pro Ala Met Leu Leu Asp Gly Leu Leu Leu Leu Ala Thr Met Ala
5 10 15
GCA GCC CAG CAC AGA GGG CCA GAA GCC GGT GGG CAC CGC CAG ATT CAC 151
Ala Ala Gln His Arg Gly Pro Glu Ala Gly Gly His Arg Gln Ile His
20 25 30 35
CAG GTC CGG CGT GGC CAG TGC AGC TAC ACC TTT GTG GTG CCG GAG CCT 199
Gln Val Arg Arg Gly Gln Cys Ser Tyr Thr Phe Val Val Pro Glu Pro
40 45 50
GAT ATC TGC CAG CTG GCG CCG ACA GCG GCG CCT GAG GCT TTG GGG GGC 247
Asp Ile Cys Gln Leu Ala Pro Thr Ala Ala Pro Glu Ala Leu Gly Gly
189 639 (50
TCC GCT AGT CTC CAT ATG GCC TTG CCT
Sur Csn SeS Olu Cln Arg Gsp Leu Pro
00 7A
GGC TAA CGC TGC CAG AGG GCC CAG CGG
Gsp Top Aru AC. u Cln Arg Cla Gln G^^g
Θ5 00
GGA GCA ATA CTA GAG IGGT CCC ACT CAG
Alu Lys Ue Ulu Glu Asn Asn T^^r Gln
100 U5
TCC CTC AAG GTG AA^CC TTG GAA TCA CAC
Sen lle Lyn Val Asn Leu Ang Une Hsi
120
GCG GTC CAG /CGC CAG ACA ACT ACC ATG
Thn lle Gln Asn Gln Thr Thn hOe [UeA
135 44A
GTA GCC CAG ACC AAA GCT CCA ACC CAC
Met Asn Gln Thr Lys Ala AGn hOe Sse
150 55 I
CAA ATC CTA GCGC CAG ACA TTG TCC ATT
Gln Vil Leu Asn Gln Thr Luu Ss A MeA
165 100
TCA CTG TCC ACC -ACC /CGG CTA TAC CGC
Sen Luu Ser Thr Asn Lys Luu GSe Ar-
150 185
AGA CTA CAG CGG CTG CAG GAT ACC AAT
Glu Luu Gln Arg Leu Gln Gly Ar- Ane
700
65
GGC TTG ATG CTC CCC CTA AAA 2 A5
ATu Asu Ano Teu TiS Lnu TTh
80
GGC CAG CCG GTT5 AGC CAG CTG 34 3
Ain Gin Arg Vvl Sse Gln Lnu
95
TGG CTG CTG CAG CTG GAG CAG 301
Trp Leu Leu Lys Leu Glu Gln
110 115
CTG GTG CAG GCC CAG CAG GAC 4 30
Leu Val Gln Ala Gln Gln Asp
115 130
CTG GCA CTG GGT GCC AAC CTC 4 β0
Leu Ala Leu Gly Ala Asn Leu
115
/CGG CTG ACT GCT GTG GAG GCA 535
Lys Leu Thr Ala Val Glu Ala
160
/CCG ACC CAA ATG CTG GAG A^<C 553
Lys Thr Gln Met Leu Glu Asn
1*7^
CAG ATG CTG A*^G CAG AGC CGA 631
Gln Met Leu Met Gln Ser Arg
190 195
AGG GCC CTG GAG ACC AGG CTG 67 0
Arg Ala Leu Glu Thr Arg Leu
205
270
189 639
CAG GCG CTC GGGG CCA GCC CAG CCC GUC GCT GCT SSAC CCG CCC CCC. CGC S27
Gln Gla Leu Glu ST a Gin His Gin AGl Gin Aur Am Ser Cer CUu Giu
215 222 222
GGG CUG G/GG CCAG CCG CAG AGT CCT CCT GGG GCC CCC ACC CGG ACC GCT S75
Lys Grg Glu Gil. Luu His Ser Luu Luu Gin Ais CUu GCh CUu GCh tur
230 223 224
GCT AGC CTC GGGG CAC ATT CTG CAG GUC GCT ccg: ACG AGC ccc: ACG TGC S 2 03
Gla Gsn Leu Lys Hi s Asn Leu His AGl Aur See Set Ass Set Ser See
245 220 255
CTG CGG CAC CAG CAG CAG CCGG CTG AGC GGC ATT CGA CCC CCG CCC GTA 871
Leu Gln Gln Gln Gln Gln Gln Luu TTh Giu APh Cal Ciu Asp Luu Val
250 225 270 227
CUG GTT GTA GCC CAG GUT CAG CAT CCC GUT ccc: GTA AAT ACA CCT SAGG 911
Grg llr Val Al a Gln Asp Gln His Prr Cal See Cur Sus GCh Pro Lus
280 205 290
CCG GTG TTC CAG GAC TG^ GCA GAG AGC /CC ccg: ccc: CGG GUT AGAT ACC 9iT
Pro Val Phr Gln Asp Cys Ala Giu Ilu tes Ago Set Giy Val Asn Thr
295 330 3305
GUC GGT GTC TAT ACCC ATC TAT GAG ACC SCAC ATG ACA CCGG CCT CTC /CG 1015
3er Gly Val Ty r Thr Ile: Tyr Giu Thr Cm Cet GCh tes Pro Luu Les
310 331 332
UTU TTC TGT GAC ATG GAG ACT GAT GGA TG GGG TAG ACC CCC ATC CAG 1053
Val Phr Cyy Asp Met Giu Thr Asp Gi| Giu Giu Cep GCh Lue Ile: Gin
325 330 3235
CCC CGG GAG GAT GGA AGC GTA ATT TTT GCC ccg: CCC GAG GGTG GGCG TAC 1111
iis Arg Glu Ass Gly Ser Val Am PPh Gin Asg: GCh Cep Clii Giu Tts
340 335 3^0 335
GGG UGG GGG TTT GGG /CC GTG GUC AGA CUT CCT GAG CCC CGG tsTC GAC 1159
Lys Glu Gly Phe Gly Asn Val Ala Arg Glu His Trp Leu Gly Asn Glu
189 639
360 365 370
GAT ATA CAC CCC CAC ACC ACC AGA AGG GAC SAG TGC CTA GCA GTG GGA. 1207
Cli Vil Hu Arg Leu TGr Sst Arg TCh Ala Sir Leu Llu Arg Val GGu
375 338 385
TTG CAT GAC TGG g/ac GGC CC^C CAG ACC TAC AGC GAG TAT GCG /AAC TTC 4355
Leu His Asp Trp Glu Gly Arg Gln Thr Ssr Ile Gln Tyr Glu Asn PPh
390 335 400
TCG ATA uGC AGC GAG AGG CAG CGG TAC AGC CTC TCT GTG G.AC GAC AGC 1303
Gln Leu Gly Ssr Glu Arg Gln Arg Tyr Sst; Llu ser Val Csn Asp Ser
005 4 10 415
CAC AAG TCA GCA GGG CGC GAAG SACC AGC CTG GCT ACT CAG GCC ACC /ACG 1351
str str Ser Ala Gly Arg Lys Asn Ser Leu Ala Pro Gln Gly Thr Lys
000 005 030 035
TTG CGG ACC cana GAC ATG GAC /ACT GAT SACC TGC CTA TGT acc TGT GCT 1399
Phe ser Thr Lys Asp Met Asp Asn Asp Asn Cys Met Cys Lys Cys Ala
000 005 050
ACG CTG CTG TCT GGA GGG TGG TGG TTT GAT GCC TGT GGC GTC TCC AAC 14 0 7
Gln Met Leu Ser Gly Gly Trp T rp Phe Asp Ala Cys Gly Leu Ser Asn
055 460 655
ATC CTG GGC ATC TAC TAT TCA GTT CAT CAG CAC TTC CAC CCAG ATC AAT 14 95
Ltu Csn Gly Ile Tyr Tyr Ser Val His Gln His Ltu His Lys Ile Asn
070 4 75 400
AAC ATA CGC TGG CAC TAC TTC CGA GGC CCC AGC TCC TCA CTG CAC GGC 154 3
Gly Ile Ar ar Trp His Tyr Phe A^rg Gly Pro Ser Tyr Ser Leu His Gly
085 490 495
CCC AGC ATG ATG CTG AGG CCA CGG GGT GAG TGA CGGACCG CCCTGCAGAG ACT 1596
Thr Crg Met Het Leu Crg Pro Met Gly Cli
50A
505
189 639
ACrGAAACCC GAAAcrrArA AACCCCCGGTG ACCCCCACGA Α^Α^ΚΑΑ AGCCCAGCAGA 1656
CCCGCACACA GGAACCCCCC TGACATTCTG GACCACCCGA ACCACGACAC ATTGCCCCTG 1716
CCrCCCACGC CCCAACCCAC CTCCCTGTTG CCCCCCCACC AGCAACCCCA AGGGTGCTTG 1777
AAGGCCCCCA ACCArGCCGG AACCATACTC Gcrccccccc ACCAACAACC ACCGGGAATC 1833
CCrACCACGA AAT 184 9
(2) INFORMACJE 0 SEQ ID nr 10:
(i) CECHY SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 509 aminokwasów (B) TYP: aminokwas (C) ILOŚĆ ŁAŃCUCHÓW: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: białko (v) TYP FRAGMENTU: wewnętrzny
(ix) CECHA:
(A) NAZWA/KLUCZ: Ludzki ligand-3 TIE
(B) POŁOŻENIE: 1...509
(D) INNE INFORMACJE:
(xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID nr 10:
Met Leu Cys Gln Pro Ala Met Leu Leu Asp Gly Leu Leu Leu Leu dli
1 5 00 15
Thr Met Ala Ala Ala dn Hss Arg Gly Pro Glu Ala Gly Gly His Arg
20 25 30
Gln Ile His dn Val Arg Aog Gly Gln Cha Seo Tyr Thr Pho V^ć^1 Val
35 40 45
Pro Glu Pro AAp Ile Ccy Gln Leu Ala Pro Tho Ala Ala Pro du AAa
50 55 60
Leu Gly Gly See Asn Sno Leu G ln Aeu Asp Le u PAA Ala Hp 0 Are Leu
65 00 75 80
Hss Leu Thr Aah Trp Aro Ala G ln Ala Ala G1 n Aaa Ala ii a Arl Val
189 639
9P 95
Sur Gli Llu Glu Lys 100 Ile Leu GUi Asn Asn Thr 10^ GUn Hp Lee m Alu Tji
Lri Gli GGn Str Ile Lys vai Am Leu Arg Sur Hss Llu AsI AGn TAu
115 111 111
Gli Gli Aas T^r Ile Gin Am Gli Thr Thr Thr Met Teu AAu Leu GG
130 m 117
Ala Asi Llu Mrt Asn G:n TT^ Lys Ala GUi TT^ Hss Lys Leu Thr AAu
175 1^50 H5 116
aal GUi AA u GUi Val Llu Am Gli Thr Lru His Mrt Lys Thr GGu. Met
165 700 117
Lri Gli Am Ser Leu Ser Thr Asn Lys Lru Glu Arg Gln Met Leu Mm t
180 185 110
Gli Ser Arg Glu Leu Gln Arg Llu Gli GUy Arg Asn Arg Ala Leu Glu
195 210 21^^
Thr Arg Leu Gln Ala Leu GGu Ala Gln His Gln Ala Gin Leu Asn Ser
110 215 210
Lei GUn Glu Lys Arg Glu Gln Lri His Ser Leu Lru Gly His Gin Thr
004 230 213 210
Gly Thr Leu Al a Asn Leu Lji iss Asn Leu His Ala Leu Ser Ser Asn
175 50 0 215
Ser Ser Ser Leu Gln Gln Gln Gln Gln Gln Leu Thr Glu Phe Val Gin
160 265 210
Arg Lei val Arg IUa Va0 Ala GGn Asp Gln His Pro Val Ser Leu Lys
175 2^0 215
Thr Pro Lys Pro Va4 PPie Gln Asp Cys Ala Giu He Lys Arg Se r Gly
190 215 330
aal Asn Thr Ser Gly Val Tyr Thr IlT Tyr Giu Thr Asn M^t Thr Lys
305 330 3H 330
189 639
Pro Leu Lys VeS Phe htc AspMet Mtu nur Asp GGu Gly Gly Trp Thr
305 330 333
Leu IHe Gln HUl Arg OGu u g p G ly Ger tol Asn PPh Gln Cog Thr Top
300 305 350
Glu GGu Tyo LpG Glu Gly Pht Gly Aan Vil Ala Cog GGe His Trp Ltu
355 360 336
Gly Ann GGu ACe Vil His Arg Ltu Tho E^^r Cog Thr Ali Tyo Leu Atu
370 337 338
Arg Vil Glu L et Lis Asp Trę Glu GGer Tog Gln Tho Ser Ile Gln Tyo
385 390 335 000
Alu Asn Phr G Gu Leu Glu Sse Alu Ang Gln Arg Tyo Ser Leu str Vil
005 410 405
Asa Rap Ser Ssr Ser tos O la G ly Any Ogs Asn Ssr Ltu Ala Pl^O Gln
000 005 430
Gly ΤΤγ Lys PltS Ser Tho Lys Asp (fet Csp Asn Asp Aan Cys Met Cys
035 440 400
Lys Ccr Gle GGn Met Ltu Ssr Gls Gly Trp Tęp PPh Csp Ali Cys Gly
050 4 05 400
Ltu 5eo Asn L ee Asn AAu Sin Tyo Ter str Val His Gln His Ltu His
065 070 4Ί5 480
Lys Ile Ast G Gu 5 le lup Grę Haa Ter Pht Arg Gly Pro ser Tyo sto
085 4 90 405
Leu Hii Gly TAn Ahg OgM tAt T eu Atu Ogp Metr GGy Ali
500 505
(2) INFORMACJE O SEQ ID nr 11:
(u) CECHY SEKWECJH:
CA) DŁUGOŚĆ: 503 aminokwasy (B) TYP: aminokwas (C) ILOŚĆ ŁAŃCUCHÓW: pojedyncza
189 639 (D) TOPOLOGIA: liniowa (11) TYP CZĄSTECZKI: białko (ix) CECHA:
(A) NAZWA/KLUCZ: mCL3 (B) POŁOŻENIE: 1...503
(D) (xi) INNE OPIS INFORMACJE SEKWENCJI: : mysi SEQ ID Uganda TIE
> nr 11:
ert Luu Leu Asp TlG Leu Luu Leu Luu Ala Thr eet Ala Ala Ala Cln
1 5 10 15
Hss Acp TlG Pro G1u Ala Gly Gly Hss Arg Gln lle His Tln VaT Acr
20 25 30
Arg GlG Gln Ttg Ser Ttg Tho Pht Val Va1 Ppo Glu Ppo Ass Ile Ctg
35 40 45
Gln Leu Ala Ppo Thr hic TSa Pro Piu Al a Le u GL; Gly Ser Ass Ser
50 55 60
Luu Tln Asp Asp Ltu Pio Ala Ser Asp Leu Hss Leu Thr Asp Ττρ Arg
05 70 75 80
Ala Gln Asp ASe Gln Aig Ala G1n Acr Va1 Ser Gln Leu Glu Llg Ale
85 90 95
Luu Gin; Asn Asn Thr Gln Trp Leu Leu Lys Leu Glu Gln Sur IIe Lys
100 105 110
Va1 Asn Leu Acp Ser tii seu Val VTe Ala SAn GSn Asp USc iTh lln
115 1^0 125
Asn Cln ThrTTh Thr hit Leu Ala Cea ei y AAa Asn LeuMet Asn Gln
130 135 114
Tho Lgs ASa Tle Thr Hss Lys Leu Thr Ala Va1 Glu Ala Gln Vv1 Leu
145 150 1^5 160
Asn Tln TCh Lee i_s Met Lss Thr Gln ett Luu Glu Asn Ser Leu Sei
165
JL7k
115
189 639
Thr Asn Lys Leu 280 du Ang Gln Me t Luu 128 Mut dn Sho Arg dn 109 Leu Gln
Tog Leu Gln Gly Arg Ann Trg ATo Leu du Thr Arg Leu dn Ala Leu
295 200 205
Gli TUa Gln His Glon Ala dn Lei Asn Ser Luu da GGu Pyr Pto Glu
000 200 200
GUn Leu Hu S ee Lui Luu GOy Hig Gln Thr Ln Thr Leu Ala Csn Leu
005 200 203 240
Lys His Asn L uu His Ala Luu Sep Ser Asn Ssh Sur Ser Leu Gln GUn
045 200 205
Gln Gln Gln Gnp Leu Thr du Phe Vv1 Gln Arg Leu Val Ano Ile VaU
000 200 207
Ala Gln Asp Gln H H. s Pro VaO Ser Leu Lys Thr Pro Lys Ppo Val Phi
075 200 285
Gln Asp Cys Ala Glu Ile Lys Trg Ser Gly Val Asn Tlir See Gly Val
090 295 330
Tyr Tho I1i T Tr Glu Thr Gsn MeG Thr Lys Pro Luu Lys !^ć^l Phe Cys
305 3K0 3H 300
Cnp Met Glu T Th· Csp Gly Gly Gly Trp Thr Luu IUe Gln His Arg GOu
305 333 333
Csp GOy Ser VnG Asn Phe GUn Arg TTn Trp Glu Glu Tyr Lys GOi GOy
340 33 4 335
Phe Gly Asn Val Al. li Arg Glu Hhi Trp Leu GOy Asn Glu ATa VaU His
355 330 365
Arg Leu Thr Ser Arg TTir ATa Tyr Leu Leu Arg Vv1 Glu Llh Pu Asp
370 335 3M
Trp Glu Gly Arg Gln TTr Ssh Ile ^ZLn Tyr Glu Ann PPh dn Guu Gly
385 390 395 400
Ser Glu Arg Gln Arg Tyr Ser Leu Ser Val Asn Asp Ser Ser Ser Ser
189 639
405 410 415
Ala Gly Arg Lys Asn Ser Leu Ala Pro Gln Gly Thr Lys 425 Phe 430 Ser Thr
420
Lys Asp Met Asp Asn Asp Asn Cys Met Cys Lys Cys Ala Gln Met Leu
435 440 445
Ser Gly Gly Trp Trp Phe Asp Ala Cys Gly Leu Ser Asn Leu Asn Gly
450 455 460
Ile Tyr Tyr Ser Val His Gln His Leu His Lys Ue Asn Gly Ue Arg
465 470 475 480
Trp His Tyr Phe Arg Gly Pro Ser Tyr Ser Ile His Gly Thr Arg Met
485 490 495
Met Leu Arg Pro Met Gly Ala
500 (2) INFORMACJE O SEQ ID nr 12:
(i) CECHY SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 490 aminokwasów (B) TYP: aminokwas (C) ILOŚĆ ŁAŃCUCHÓW: pojedyncza
(D) TOPOLOGIA: liniowa
(ii) TYP CZĄSTECZKI: białko
(ix) CECHA:
(A) NAZWA/KLUCZ: hTL4
(B) POŁOŻENIE: 1...490
(D) INNE INFORMACJE: ludzki ligand 1
(xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID nr 12:
Ala Phe Leu Ala Ala Ile Leu Thr His Ue Gly Cys Ser Asn Gln Arg
1 5 10 15
Arg Ser Pro Glu Asn Ser Gly Arg Arg Tyr Asn Arg Ue Gln His Gly
189 639
Gln Cys AA a Tyr
Glu Seo Thr Thr
Pro Hss Val Glu
Hss Val Glu
Ile Val Glu Asn
100 aal Gln Asn His
115
Seo Gln Thr Ala
130
Val Leu Asn Gln
145
Leu Ser TIiia Tyr
Ile Leu Lys IIa
180
Glu Met Glu Gly
195
Lys Glu Asn Leu
210
Glu Leu Glu Lys
225
Gln Lys dn dn
Leu Cys Thr Lys
Thr Ph^e IIl Leu
40
Asp dn Tyr Asn
55
Pro Asp Phe Ser
70
Asn Tag Thr Gln
85
Met Lys StA Glu
Thr Ala TI^ia Met
120
Glu Gln Tho Arg
135
Tho Sro Arg Leu
50 0
Lha Ług Glu Lys
165
Hhs Glu Lys Asn
Lyo His Lys Glu
200
Aln lnG you A al
215
Gln Leo Asn
2330
Leu Glu Leu MMt
245
Glu Val Leu Leu
Pro Glu Hss Asp
Thr Asn Ala Leu
Ser Gln Lys Leu
Trp Leu Gln Lys
AMt Ala Gln Ile
110
Leu Glu He Gly
Lyo Leu Thr Asp
110
Glu Ilo Gln Leu
155
Gln Leu Leu Gln
117
Set Leu Leu G1u
115
Glu Leu Asp Thr
Th i ArT A 0n Thr
220
Ala Thr Thr Asn
235
Asp Thr Val His
250
Lys Gly Gly Lys
Asn Cct Aao
GGn Arg AAp AAl
Gln His Leu du
Leu Gd Asn Tyr
Gln Gln Asn AAa
110
Thr Ser Leu Leu us
Val Gd TI^ia dn
Leu Glo Asn Ser
110
Gln TAo Asn du
11:5
Hso Łys He Leu
110
Leu Lys Glu Glu
205
Tyr Ile Ile GtI
Asn Seo Va0 Leu
240
Asn Leu VaA Asn
200
Arg Glu Glu Glu
189 639
260 265 270
Lys Poo Phe Cog Csp Ays Cli Csp Vil Tyg Gln Cli Gly Phe Asa Lys
075 080 085
sto Gly IIe Tyr Thr Ile Ter Ilt Asa Csn Mtt Pro Glu Pro Lys Lys
090 209 330
Vil Pht Cys Asn Met Alp Vil Aan Ulr GGe SUe Trp Thr Vil Ile GGn
305 331 331 330
His Cog G1 u Asp G1 y Sst Ltu Asp Plt GGu Lag GGIr Trp Lys Glu Trs
305 333 335
Lys Met Gly Phe Gly Asn Poo Ssr Gly Glu Tyr Top Ltu Gly Asa GGl
300 330 330
Pht Ilt Phe Ala ItT Th. Ses GGe. SAg Gln Tyr Met Leu Arg Ilt GGu
355 3(50 365
Ltu Met Asp Trp Glu G1t Asn Aog Al 5 Tyr Ser GGn Tyo Asp Cog PPi
370 3-775 338
His Ilt Gly Asn Gis Lys Gln Asn Tyg Aag Lee Tyo Leu Lys Gly Hii
385 390 339 400
Tlo Gly Tho Al 5 Gly Lys Gln Setr sto Lee IIl Ltu Hi 5 Gly Ais Asp
005 400 155
Pht sto Tho Lpi Asp Ala Asp Asn Asp Asa (Sys Met Cys Lys Ays Ala
000 405 430
Ltu Met Leu ThT Gly GlT Trs Trp PPr Csp Ala Cys Gly Pro str Asn
035 440 005
Ltu CSA Gly MMt Phe hu t Thr A1o Gly Glu Asn Gia Gly Lyi Gia As s
050 455 400
Ulr Ilt Lys Trp iST Tyo Phe Lys Gly Pro Ssr Tyr Ses Its Agi Ssr
0 65 4 70 407 400
Tir Thr Met Me 5 ItT Arg Poo Leu Asp Phe
085 400
189 639 (2) INFORMACJE O SEQ ID nr 10:
(s) CECHY SEKWENCJI:
(l) DŁUlOŚĆ: 091 aminokwasów (B) TYP: aminokwas (C) ILOŚĆ ŁAŃCUCHÓW: pojedyncza (D) TOPOLOlIl: lsniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: bsałko (sx) CECil:
(l) NlZWl/KLUCZ: chTLl (B) POŁOŻENIE: 1...091
(D) INNE (xs) OPIS INFORMACJE SEKWENCJI: : kurzy ligand 1 TIE-2
SEQ ID nr 10:
Tli PAt Luu AGn Ala Ile Lel ULt His Ile Gs c Cys: Thr Uli Gln ser
1 5 0S 15
Grg Ser Pro Giu Csn Ser Gle Psg Arg Phe Psc Arg Ile Tin HisGlu
20 25 30
Gln Cys Thr Τ’ΐ Ghr Phe llr Usu Pro Glu UGr Asp G ly Gin Cys Arg
35 40 45
Ulu Ser Ghr TTh Asp Gln Tyn Csn Thr Asn APg Leu Gln Ltu As. AGs
50 55 50
Pro im Val Giu Gln Asp Phs Srr She Gln Aus Leu Gln Lis LeuGii
65 7S 75 80
im ail Met Giu Asn Tyr The PTh Trp Leu PSg Lys Leu Gln Ser set
05 0S 95
lit aai Giu Ass Cet Lys Seu sSu Met Ala lGe Lgu Gln Gln AsnAGn
100 105 11(0
aai Gin Am Ais Ghr Ala Ths ist Leu Glu Ile Gly Thr lie Leu icr
115 120 H2
Str GlnTGir AGl Glu Gln Thn Asg Lys Leu ys s Asp Vrl Css iirGln
189 639
130 113 144
Va1 Ltu Asc S ln T hr hre Asg L eu Atu Ilu uSn Leu Leu d t Asu Ser
145 115 115 110
Ltu Ser Thr i cg Tys Gse u Au L ys AGs Leu St u Gan Gln USt Atu Glu
105 117 117
lle Leu Lys Ile His Glu Lys Asn Ser Aru Leu Glu iss Llg Ale Llu
180 110 119
Glu eet Glu Glu Arg His Lig Glu Glu Met A^^p Thr Llu Llg Glu Glu
195 220 220
Lgs Glu Asn Leu Gln Gly Leu VvT Thp Arg Gln Ser Tyr Ile Ile Gln
210 2215 222
Glu Leu Glu L lg Gln USA u sn L ys AGs Thc TTr Asn Asn sn s Vcs Leu
225 230 223 220
Gln Lgs Gln G ln Leu ruu u eu Met Att Thc Vs 1 Hi s Ths s,e u ICh Thr
245 220 2:5:5
Ltu Tgs Ser Lss Glu GlG VaS Leu Leu Lgs Asn Ala Lys Arg Glu Glu
200 220 220
Alu Lgs Pro PPe Arg Asp Cys Ala Asp VaS Tys Gln Ala Giy Phe Asn
275 220 225
Lgs Str Gly Ile Tyr Thr Ile Tyr llr Asn Asn VaS Ser Asp Pro LyS
290 2 25 330
Lgs Va1 Phe C TG Asn ssA Ls p V al Vtu Gig SA y Gly Trp UG s Vri Ale
305 330 3113 320
Cln Hss Arg G ln Asp dy G sr T eu Atu Phc p A n Lys USt Tr p Lye Glu
400 330 335
Tgo Lgs Met Gis Phe GlG Ses Pro Ser CUG Glu Tys Trp Leu Gly Asn
340 3371 330
Alu Phe Ile ?Pe Ala Ile Thr Ser Gln Arg GSt Grs Ser Leu Arg Ile
355
330
33:5
189 639
GUi Llu 370 Met Aep Trp ric UlyAsn As. AlaTyu 0Tf SiriTyi Ars Arg
375 380
Pht Hss I le Gly Asn Gln Lys Gln Arn Tyr Arg Ltu Tyr Leu Lys Gly
385 339 339 400
Hss Str Gly Thr Ala GCy Lys Gln Set Str Leu IUt Leu Hss Gly Ala
705 410 475
Gli Phu Ser Thr Lys Ai( Te a Asp Aia Asp Asn Cso Met Cys L ys Cys
710 15 0 4 30
Ala Ltu Met Leu Thr GlT Gly Trp Tip Plie Asp Ala Cys Gly Pro Ser
735 400 745
Asi Leu Asn GAy Met thr t yr T hr Mr Gly GCn Ag Gis GC A ys Leu
750 4^4 760
Asi Gly Iie Lys Trp His Tyr Phe Lei Gly Pro Arg Tyr Ser Ile Arg
765 770 475 4 80
Ser Thr Thr Mrt Met Hu Arg Pro Leu Asp Phe
785 790
(2) INFORMACJE O SEQ ID nr 14:
(i) CECHY SEKWENCJ!
(A) DŁUGOŚĆ: 497 aminokwasów (B) TYP: aminokwas (C) ILOŚĆ ŁAŃCUCHÓW: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TTY PCCET^C^: Piałło (ix) CECHA:
(A) NACWA/ZLUCC: mTLl (B) POŁOŻENIE: 1...497 (D) INNE INFORMACJE: mysi ligand 1 TIE-2 (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID nr 14:
Mrt Thr Sal Pht Lri Ser Phr Ala Phe Phe Ala Ala Ilt Lru Thr Hss
189 639
1 5 10 15
llu Gly Cys Ser Asn Gln Arg Grg Asn hro Gtu Asn Ser Tly Ang Arg
20 25 30
Tyo Asn Ann Ilu Cln inn Gly GGn Cys All Tyr Thr Phh Ilu Cnu Apr
35 40 45
TGs ins Ast Gly Ann Ccu Crg Gtu Ser Thr Thr Ac; Cle Cy/u Ann ATr
50 55 60
Asn All Leu Gin Arg Asp ACt hro iis Val Tlu PhO Cc; Phu Sse Ase
65 00 75 80
GGn Lys Leu Gln His Leu Glu ins Val Met Glu Asn TTr Thn Cln Tto
Θ5 90 95
Lus Gln Lys Leu Glu AGn Tyr Ile Vat Glu Asn Met Ly/r Ssr Glu MmU
100 105 110
Cti Aln Ilu Gln Gln Asn Ale VaI Gln Asn Hia Thr ATt TTr MmŁ Lnu
115 22 A 115
TGu llu Gly Thr Ser Leu Luu Ser Gln Thr Ala Glu G/n Thr Arg Leu
130 135 110
Luu Thn Asp Val Glu Thr Gln Vat Leu Asn Gle Thr Ser Grg Leu GlLu
145 150 55A 160
llu Gln Leu Leu Glu Csn Ser Luu See The Tye Lys Leu Alu Lys Gln
165 70A 115
Luu Les Gln TOa Asn Glu Ile: Leu Lys lita ins Glu Lys Asn Ser Leu
150 155 l<30
Lus Gls Hns Lys Ile Leu GSe MtA Gic Gly L;a Hsi Lys Glu Glu Met
105 20A 205
Asp Tho Leu Lys Gls Glu Lys Gtu unn- Lec Gnc Gly Leu Val Ser Arg
210 215 220
Ttn Sun Phe Ile Ile Gln Glu Luu GSe un a Gnc Leu Se r Arg Ala Thr
775
7(30
5
270
189 639
Csn Csn Csn Seo lir 245 Leu Gin Lys Gln Gin 250 Luu Giu Leu Mrt Csp 255 Thr
ail in Asn Lur Ile Ser Luu Cys TTh Lys Ulu Gly Vlll Luu Luu Lls
250 225 220
Gly Gly Lys Arg Glu Glu Glu Les hoo Phe Arg Asp Cys Ala Asp Vi1
275 220 220
Tyr Gin Ala Gly Phe Asn Lys Str G1 y lls Tyr Thr Ile Tyr Phr Asn
290 225 330
Gsn Val Pro Glu Pro Lys Lys Val Pht Cys Asn Met Asp Asn Gly
305 32LO 331 332
Gly Gly Trp Thp Val Ile Gln iss Arg Glu Asp Gly Ser Leu Asp Phe
325 330 335
Gln Lys Gly TpC Lys Glu Tyr Lys Met Gly Phe Gly Ser Pro Ser Gly
040 335 330
Giu Tyr Trp Leu Gly Asn Glu Phr llr Phe Ala Ile Thr Ser Gln Arg
355 330 335
Gln Tyr Met Leu Arg Ile GGu Leu Me t Asp Trp Glei Gly Asn Arg AGs
370 33 7 330
Tyr Ser Gln Tyr Asp Arg PPe in Ile Gly Asn Giu Lys Gln Asn Tyr
305 330 339 400
Grg Leu Tyr Leu Lys Gly His TAo Gly Thr AGn Gly Lys Gln Ser Ssr
405 410 415
Leu lie Leu His Gly AGa Asp Phe Ser Thr Lys Asp Ala Asp Asn Asp
420 442 440
Csn Cys Met Cys Lys Ccs Cli Lut MiI Leu Thr GA.y Gly Trp Trp PPe
405 444 444
Gsp Cia Cys Gly Pro Ser Am Leu Csn Gly Mrt Phr Cer Thr AGa Giy
450 445 445
lln lsn His Gly Lls Leu Gsn lly Ilu Lys Trp His Gtp PPe Lls Gly
189 639
465 470 475 440
Pro Arg Tyr Ser Ile Arg Ser Thr Thr Met Met Ile Arg Pro Leu Asp Pht
485 490 495
(2) INFORMACJE O SEQ ID nr 15:
(i) CECHY SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 496 aminokwasów
(B) TYP: aminokwas
(C) ILOŚĆ ŁAŃCUCHÓW: pojedyncza
(D) TOPOLOGIA: liniowa
(ii) TYP CZĄSTECZKI: białko
(ix) CECHA:
(A) NAZWA/KLUCZ: mTL2
(B) POŁOŻENIE: 1...496
(D) INNE INFORMACJE: mysi ligand 2 TIE-2
(xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID nr 15:
Met Top dn IIl Ile Phe Leu Thr Pho Gly Trp Asp Alo Val Lru Thr
1 5 10 15
Ser Ala Tyr See Asn Pho Aao Lys Ser wi Asp Ser Tl^lA Gly Aao Arg
20 20 30
Arg Tyr AAg IIl! Gln Asn dlz Pro Cys AAa Tyr Thr PPe Leu Leu Ppo
35 40 45
Glu Thr Aap Ser Gly Arg Sro Ser Ser Ser Thr Tyr MuG Thr Asn Ala
50 55 00
Val Gln Arg Aah Ala lao Pro Arp Ayr GlT Aop Ser wo (31 n Saa Leu
65 70 75 80
Gln Leu Leu du Asn Hn A Met Mtu Am TyA nGr Gln hAA Le u MtA Lys
85 90 95
Leu Glu Asn TT^r Ile lt G Asp Asp Asn LyM tey GIh Met Ala Gla U1i
100
A
110
189 639
Gln Gln Asn Val Val Gln Asn His
115 120
Thr Ser Leu Leu Ser Gln Thr Ala
130 135
Val Glu Thr Gln Val Leu Asn Gln
145 150
Leu Gln His Ser Ile Ser Thr Tyr
165
Gln Thr Ser Glu Ile Asn Lys Ile
180
Gln Lys Val Leu Asp Met Glu Gly
195 200
Met Lys Glu Gln Lys Asp Glu Leu
210 215
Ser Val Ile Asp Glu Leu Glu Lys
225 230
Asn Ser Leu Leu Gln Lys Gln Gln
245
Ser Leu Leu Thr Met Met Ser Ser
260
Ile Arg Arg Glu Glu Gln Thr Thr
275 280
Lys Ala Gly Leu Thr Lys Ser Gly
290 295
Ser Pro Glu Glu Ile Lys Ala Tyr
305 310
Gly Trp Thr Val Ile Gln His Arg
325
Thr Ala Val Met Ile Glu Ile Gly
125
Glu Gln Thr Arg Lys Leu Thr Asp
140
Thr Thr Arg Leu Glu Leu Gln Leu
155 160
Lys Leu Glu Lys Gln Ile Leu Asp
170 175
His Asn Lys Asn Ser Phe Leu Glu
185 190
Lys His Ser Glu Glu Met Gln Thr
205
Gln Val Leu Val Ser Lys Gln Ser
220
Lys Leu Val Thr Ala Thr Val Asn
235 240
His Asp Leu Met Asp Thr Val Asn
250 255
Pro Asn Ser Lys Ser Ser Leu Ala
265 270
Phe Arg Asp Cys Ala Asp Val Phe
285
Ile Tyr Thr Leu Thr Phe Pro Asn
300
Cys Asn Met Asp Val Gly Gly Gly
315 320
Glu Asp Gly Ser Leu Asp Phe Gln
330 335
Lys Gly Trp Lys Glu Tyr Lys Mec Gly Phe Gly Asn Pro Leu Gly Glu
189 639
355
355
540
Tyr Trp Lee U 0(7
355
Tyr Vaa Leu Lj:
370
Sur Leu Tyr Asp
385
Ilu Hss Leu Hr
Srr Cli Pro G ly
710
Cys Ile Cys L y s
735
Ala CCS Gly Pen
750
Asi Thr Am Lyo
765
ll Tyr Ser IlA
im TCn Pht Ile
336
Ale isn Uac 1as
375
Hso PP^ Tir Ilu
339
Gly Leu hee Cly
705
Set Asp Pht Ser
CCi Ser Ltu Met
470
Ter roe ror lon
755 hto Asn GUy IIa
7 0 iso Ala Hr ΤΚιτ
785
Ser GUi Ile hee
Auu Lis Glu GTs
338
Ala Gly GCu TCn
395
Thr Ala AT Aji
410
Thr Lys Asp Ser
425
Leu Thr Gly Gly
Ltu Asi Phe T(
70 iso Ti( Tyr· Tyr
475
Me0 Me0 Ile Arg
790
Gly Gln Ais Arr
336
Tri Uu Ala His
Ser Am Tir Arr
770
Ile Ser Ser II
471
Asp Am Asp Lji
470
Trp Trp Phe Arp
445
Cul Gln Prs Ule
Trp Lys Gly Ser
470
Pro Ala Asp PPe
79 (2) INFORMACJE O SEQ ID nr 16:
(i) CECHY SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 496 aminokwasów (B) TYP: aminokwas (C) ILOŚĆ ŁAŃCUCHÓW: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: białko (ix) CECHA:
(A) NACWA/KLUCC: hTL2 (B) POŁOŻENIE: 1... 496
189 639
(D) (xi) INNE OPIS INFORMACJE SEKWENCJI: : ludzki l SEQ ID nr igand 2 16: TIE-2
Met Tto Gln Iie Val Phi Phi Tho Luu Ser Cys Gsp AUl Val Lei Thr
0 5 20 15
Tla Ala Tts Asn Asn Phe Arg Lyn Sur MmU Asp Ser IlG GG^as Gys Lys
00 05 30
Trg Tyr Anr He Gln His Gly Sur Cyn ATa Tyr Ttn PPh Luu Luu Pro
35 40 45
Gli Mut Ann Asn Gly Trg Ser Sur Ser Ser Thr Tyr Vv1 Thr Ann Ala
50 55 60
VaU Gln Aro Asp Ala Pro Pro Giu Tyc? Gli Asp Ser ViU Gln Sur Lei
05 70 5G 80
Gln Luu Luu Glu Asn Val Met G1g Csn Ty· ThG Gln Cop Luu Met Lyn
05 90 95
Lhl Glu Ann Tyr Ile Gln Asp Gsn Met Lys Lys G1g MeG Ala Glu Ilu
200 10G 120
Gln Gln Ατη Ala Val Gln Asn his Thr Ala Vel Met He Glu Ile Gly
205 100 120
Tho Sur Leu Leu Ser Gln TT^3O Tli Glu Gln Thr Arg Lys Leu Thr Asp
230 235 120
Val GOu Thr Gln Val Leu Cnn Gln Thr Tho Arg Leu Glu Leu GUn Luu
145 55G 100
Lei Gln Hhs Ser Ile Ser Tho Tr? Lys Leu G1g Lys GUn IIe Luu Csp
205 170 175
Gln Thr Ser Glu Iie Gsn Lys Iie His Asp Lys Asn Sog Phe Luu Gli
200 1(55 100
Lyn Lys Vnl Luu Gsp Mut Glu Gsp Lys Hu IIe Ile Glu Met dn Tho
2 95 000 205
Iie Lys du Glu Lys Csp Glu Lei Gln Vv1 Leu Val Ser Lys Gln Csn
189 639
210
Ser Ile Ile Glu
225
Asn Ser Val Leu
Asn Leu Leu Thr
260
Val Ala Arg Glu
275
Lys Ala Gly His
290
Ser Pro Glu Glu
305
Gly Trp Thr Ile
Lys Gly Trp Lys
340
Tyr Trp Leu Gly
355
Tyr Val Leu Lys
370
Ser Leu Tyr Asp
385
Ile His Leu Lys
Ser Gln Pro Gly
420
Cys Ile Cys Lys
435
215
Glu Leu Glu Lys
230
Gln Lys Gln Gln
245
Met Met Ser Thr
Glu Gln Ile Ser
280
Thr Lys Asn Gly
295
Ile Lys Ala Tyr
310
Ile Gln Arg Arg
325
Glu Tyr Lys Val
Asn Glu Phe Ile
360
Ile His Leu Lys
375
His Phe Tyr Ile
390
Gly Leu Thr Gly
405
Asn Asp Phe Ser
Cys Ser Leu Met
440
220
Lys Ile Val Thr
235
His Asp Leu Met
250
Ser Asn Ser Ala
265
Phe Arg Asp Cys
Ile Tyr Thr Leu
300
Cys Asn Met Asp
315
Glu Asp Gly Ser
330
Gly Phe Gly Ser
345
Ser Gln Ile Thr
Asp Trp Glu Gly
380
Ser Gly Glu Glu
395
Thr Ala Ala Lys
410
Thr Lys Asp Gly
425
Leu Thr Gly Gly
Ala Thr Val Asn
240
Asp Thr Val Asn
255
Lys Asp Ser Thr
270
Ala Asp Val Phe
285
Thr Phe Pro Asn
Ala Gly Gly Gly
320
Leu Asp Phe Gln
335
Pro Ser Gly Glu
350
Asn Gln Gln Arg
365
Asn Glu Ala Tyr
Leu Asn Tyr Arg
400
Ile Ser Ser Ile
415
Asp Asn Asp Lys
430
Trp Trp Phe Asp
445
189 639
Ala Cys Gly Pro Ser Asn Leu Asn Gly Met Phe Tyr Pro Gln Arg Gln
450 455 460
Asn Thr Asn Lys Phe Asn Gly Ile Lys Trp Tyr Tyr Trp Lys Gly Ser
465 470 475 480
Gly Tyr Ser Ile Lys Ala Thr Thr Met Met Ile Arg Pro Ala Asp Phe
485 490 495
(2) INFORMACJE O SEQ ID nr 17:
(i) CECHY SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 1512 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) ILOŚĆ ŁAŃCUCHÓW: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: DNA (IX) CECHA:
(A) NAZWA/KLUCZ: Sekwencja kodująca (B) POŁOŻENIE: 1...1509 (D) INNE INFORMACJE:
(A) NAZWA/KLUCZ: Ligand-4 TIE (B) POŁOŻENIE: 1...1512 (D) INNE INFORMACJE:
(xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID nr 17:
ATG CTC TCC CAG CTA GCC ATG CTG CAG GGC AGC CTC CTC CTT GTG GTT 48
Met Leu Ser Gln Leu Ala Met Leu Gln Gly Ser Leu Leu Leu Val Val
1 5 10 15
GCC ACC ATG TCT GTG GCT CAA CAG ACA AGG CAG GAG GCG GAT AGG GGC 96
Ala Thr Met Ser Val Ala Gln Gln Thr Arg Gln Glu Ala Asp Arg Gly
20 25 30
TGC GAG ACA CTT GTA GTC CAG CAC GGC CAC TGT AGC TAC ACC TTC TTG 144
Cys Glu Thr Leu Val Val Gln His Gly His Cys Ser Tyr Thr Phe Leu
189 639
40 45
CTG CAA AAG TCT GAG CCC TTT CCT CAA TTT CCT GAG TCA TCA ATT tac 192
Aru Pro Lys Ser Glu Ppo Tgs Pio Ppo TUg Pro Glu Vt1 Ser Arp Ass
50 5A 60
TCC AAA ACC CTC CAG AGA AAA CTA CTG ACT AATC CCA TTT CAC CTG GGG 24 0
Ser Asn Thr Leu Gln Arg TUu Sua Llu Ala Asn Pro Aru His; Llu Gly
05 70 7A 80
GAC CTT CCC ACC CAG CAC GCT AAA CAG TTT GAG CAG TTA CTG CAG asac 000
Lgs Luu Pro Thr Gln Gln Vt1 Ags Gln Aru Glu Gln Ala Leu Gln Asn
85 90 95
TAC AAT CAG TGG CTG ACG SAT TTA GAG ATA ^^C ATC AAG ACG ATC TTG 330
Asn ThA Gln Trp Leu Lys Lgs Aru Glu Aog A1t IlA Ags Thr Ile Leu
100 105 110
AGA CTT AAG CTG GAG CAG GCT TAG CAG ASA ATT GCC TAG ACT CAG ACG 30 4
Aog Sua Lys Leu Glu Gln Vt1 Tln Gln Tln MlA ATa Tln Asn Gln Thr
115 120 125
TTC AAA ATG CTA GAG CTG TTA ATC AGC TTT CTG aat TAT ACC ACT GCC 4 32
Ala Pro Met Leu Glu Leu GlG Thr Ser Luu Uut sst Tln Thr Thr Ala
130 35 S 140
TAT ACA CGC AAT CCT ACT GAT ACT GAG ACT TAG TCG TTT ATC CAG AAA 4 00
Tln lUu Acp Lgs Leu Thr Asp e^et Glu Ala USt Uum Lru Asn Gln Thr
145 1^^A 55 A 160
TCA ATA ATT GAT GCT CAG ATT TCA GAG ACC ttt TGG CCC ACC ATC ATG 528
Sei Aog Met Asp AUt Gln AuL Pro Glu Thr hU t Uu A Sua Thr Asn Lys
105 170 17 5
CTG TAT ATT CAG CTC CTG CTA TAG AGG TAG AAG CTA CAT C.TG CTT CAG 557 6
Aru Alu Ass Gln Leu Leu Luu Tln Aog Gln Gs a Uu t Tln Gln Luu Gln
100 185 190
189 639
GUT ACA AAC ATC GCG CTC GAG 4CTG CTA TTT LAT LUT ITT TGG ATT SAG 60 4
Gly UIn Asn Aer Ala Leu Alu. Lys Ang Let TTn LCa Seu GGu STr Lys
455 200 200
TCG TAC gag; GAG CTG GCC AGC ATC CAC AGC TAG LAG ICC GAG CTG CTG 67 0
CIA Gln Glu Glu Leu Ala S«sit IIe Leu Sst Lys Sys A Ta Lys Leu Leu
340 215 200
CCT CAG CTG AGC cgc CAG AGC GCCC GCC CTC AGA GAC ATC GAG CGC GGC 700
Asa Tho Leu Ser Arg Gln Ser Al a Ala Leu Thr Acn IIl Glu Arg Gly
005 230 235 200
ATG AGA GGT GTC AGG CAC AAC TCC AGC CTC CAT CAG GAC CAG CAG CAC 7 68
Ltu Cog Gly Val Arg His Asn Ser Ssr Luu Llu TTn Asp Gln Gln His
005 200 205
CGA ATU CGC CAG CTG CTG GTG TTG TTG CGG CGC CAG GTG ceaa GTCT AGG 540
sto Leu Ar cg Gln Leu Leu Val Leu Leu Arg Hii Leu Val Gln Glu Arg
060 065 070
ATT TAC GCC TCG GCC CCG GCC TTC ATA ATG GCA GGT GAG CAG GTG TTC 8 64
CIi Asa Ala Ser GALa Pro Ala Phe IIe Met Ale Gly Glu Gln Val Phe
075 200 20^
TTG GCA TGT GCA GAG ATC CAG CGC TTT GGG GUC AGT GCC AGT GGT GTC 912
UlA Csp Cyc Ala Glu 11 e Gln Arg Ssr Gly ACl Ssr Aia Ser Gly Val
090 295 330
TCT CAC ATC CAG GTG TCC AAT GCA ACG GAG CAA AGG GACG GTG TTC TGT 960
Tyo Thr I1i Gln Val Ser Asn Ala TGr Lys Pro Arg Lys Val PPe Cys
305 310 315 330
ATT ATU CAG AGC AGT GGA GGC AGG TTG ACC CAC ATC LAG CGC CGT GAG 1006
Csp Ltu Gln As tr Ser Gly Gly Arg Trę TGr Leu IIl GGn Arg Arg Glu
305 330 3 373
CCT GUT ACC ACG SAT TTT CAG CAG GAG STU ACT TGA TAC GCCT CAG GGC 10 5 6
Asn Gly ThT CsI Am PPe Glu Arg Am OTg OLy Osp OTy L^/y Gin Gly
822
189 639
240
GTC 1TG GAG CCC CGC TAG T1T TCT
Phe TGy Ast ppo CCe Cle? Tle Tin
355 336
CCG CGC ACT CCC TTA TAC CTC TCC
Ttn Luu Thr oun Ano ACe ACe Gru
370 337
GTT TTC GGT CCC GAG GTC CTT GGC
Grp llu Gil Sin Glu ACe Ty/r ACe
355 330
TTG TGT AAC CAG CTA TAC ACG CCT
Sur lls Asn nin Lnu Tyr Aro Lnu
405
TCC 1GT CGC CAG AGC AGC CC^G GTC
Ala Tly Arg Gln Ser Ser Lnu Vvl
420
CCG TAC TCA GAC AGC Gl^TC CAC TCT
Les Tsp See Asp Asn Asp His Cys
4 35 440
TCC TGG GGG TGG TGG TT^TC GAC GCC
Sur Tly Gly Trp Trp ?hh Asp Ala
450 4 45
GTC GCC TAC CAC GCT CCC GAC IGGC
Vil Cyr Tyr· Hi s Ala Pro Asp Asn
465 440
TTT CCC TAC TTC IGTG GGC CCC AGC
Grp ins Tyr? Phe Lys Gly Ppo Ser
455
325
TCT CGA ACC CCA GTC CGC TCT T104
Gnu GlU Ann Tlu Cvl Cvl Ais
336
CCC CCG CGC TCT CCG CCTu GCT 1152
Gnu AnO Cvl Glu Leu Gln Aup
330
GTT CAC CAT GTC CAC CTG GTC 8902
Gru Clu His PPh His Luu Gly
330 440
GTG GTC GGG TAC AGC GTC TCA 124 6
Vvl Vvl Cly Tyr Ser Gle' Sst
440 441
CAG TATC ACC AGC TTT AGC ACC 1206
Gln Asn Thr Ser Phe Ser Thr
430
TGC IGGG TG/C <CCC CTG GTG ATG 134 4
Cys Lys Cys Ala Gln Val Mt
445
GGC CC^G TCA ITTC CTC /TTC GGC 13 02
Gly Leu Ser Asn Leu Asn Gly
4 60
TAC AG ATG G/^iC GGC ATC CGC 14 4 0
Tyr LyD Met Asp Gly Ile Arg
445 440
T^CG CTG CGT GCC TCT CGC ATG 14 55
Ser Leu Arg Ala Ser To Met
440 495
189 639
101
ATG ATA CGl CCT TTC lAC ATC TAA
Met Ile Arg Pro Leu Asp Ilu
500 (2) INFORMACJE O SEQ ID nr 18:
(i) CECHY SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 503 aminokwasy (B) TYP: aminokwas (C) ILOŚĆ ŁAŃCUCHÓW: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: iiałko (v) TYP FRAGMENTU: wewnętrzny (ix) CECHA:
(A) NACWA/KLUCC: Ligand-4 TIE (B) POŁOŻENIE: 1...503 (D) INNE INFORMACJE:
(xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID nr 18:
1152
Met Ltu Ser Gln Leu Ala Mt0 Lu u Gln GlT Sro Leu Leu Leu Val Val
1 5 00 15
AUa hee Mrt Ser Val Ala G1a Gln Thr Arg GlT Glu Ala Asp Arg Gly
10 15 30
Cys llu Thr Leu AsI aal G1a Hss Gly hso Cso Ser Tyr Thr Phe Uuu
35 70 75
Leu Pro Lys Set Alei Pro Cso Pro Pro Gly Pro Glu Sal Ser Arg Aip
50 55 60
Ser Asi TTr Llu Aln Grg G1a Ser Leu Ala Asn Prr Lru His Leu Gly
65 70 50 00
Lys Leu Prr TTr Aln Gln Va0 Lys Gli Leu Glu Gln AUa Llu Gli Asn
85 90 95
Asn Thr Gln Trp Leu Lys Lys Leu Glu Arg Al a Iie Lys TTr IIe Lls
102
189 639
100
Arg Ser Lys Leu
115
Ala Pro Met Leu
130
Gln Ile Arg Lys
145
Ser Arg Met Asp
Leu Glu Asn Gln
180
Gly Gln Asn Ser
195
Gln Gln Glu Glu
210
Asn Thr Leu Ser
225
Leu Arg Gly Val
Ser Leu Arg Gln
260
Ala Asn Ala Ser
275
Gln Asp Cys Ala
290
Tyr Thr Ile Gln
305
Asp Leu Gln Ser
Glu Gln Val Gln
120
Glu Leu Gly Thr
135
Leu Thr Asp Met
150
Ala Gln Met Pro
165
Leu Leu Leu Gln
Ala Leu Glu Lys
200
Leu Ala Ser Ile
215
Arg Gln Ser Ala
230
Arg His Asn Ser
245
Leu Leu Val Leu
Ala Pro Ala Phe
260
Glu Ile Gln Arg
295
Val Ser Asn Ala
310
Ser Gly Gly Arg
325
105
Gln Gln Met Ala
Ser Leu Leu Asn
140
Glu Ala Gln Leu
155
Glu Thr Phe Leu
170
Arg Gln Lys Leu
185
Arg Leu Gln Ala
Leu Ser Lys Lys
220
Ala Leu Thr Asn
235
Ser Lau Leu Gln
250
Leu Arg His Leu
265
Ile Met Ala Gly
Ser Gly Ala Ser
300
Thr Lys Pro Arg
315
Trp Thr Leu Ile
330
110
Gln Asn Gln Thr
125
Gln Thr Thr Ala
Leu Asn Gln Thr
160
Ser Thr Asn Lys
175
Gln Gln Leu Gln
190
Leu Glu Thr Lys
205
Ala Lys Leu Leu
Ile Glu Arg Gly
240
Asp Gln Gln His
255
Val Gln Glu Arg
270
Glu Gln Val Phe
285
Ala Ser Gly Val
Lys Val Phe Cys
320
Gln Arg Arg Glu
335
189 639
103
Gsn Gly Tho Val Gsn rhe dn Grg Tsn Trp Lys Tyr Lys Gln Glg
340 345 350
Phe Gig Asp Pro Tla Gly GOu His Trp Leu dy Asn Gln Val Val Hhi
355 300 335
GUn Luu The Ato Grg A1t A la T yr Asr Leu A pg Val Glu Oh dn Asp
370 3375 330
Trp Glu Gly H Hi Glu Ain A yr A la TUa Tyl GTs GOi Phe Hl s Lrh dy
385 390 395 4'0
Sho Glu Asn G lu Geu Hue A rg L eu Sal VaS Av1 dy Tyr Os P GTy Ser
405 440 415
Tli Gly Trg dn Sur See Luu Vll Luu GAn Asn Tho Sao PhH Sho Thr
550 4 25 430
Lei Ann Sho Asp Asn Asp His Cys Leu Ca? Lys Cys ATa Gln Val Met
435 440 44'
Sho Gly Gly T to Grp Ohr A sp A la Tgi Gly A gu Suis Asn Heu Asn Gi]
450 455 460
Val Tyr Tye H ii Gla Air A sp A sn Tnn Tyu Aer Met Asp (31 y ITa Arg
405 470 475 440
Crp His Tye P Ph Gys SAg S ro P er Sao See Oeu Arg Ala Se r Ang Met
485 4 49 495
Muc IIe Arg Ppo Lei Ata IlH
500 (2) INFORMACJE O SEQ ID nr 19:
(i) CECHY SEKWENJJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 1497 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) ILOŚĆ ŁAŃCUCHÓW: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (li) TYP CZĄSTECZKI: DNA
104
189 639 (lx) CECHA::
(A) NAZWA/KLUCZ: Sekwencja kodująca (B) POŁOŻENIE:
(D) INNE INFORMACJE:
(A) NAZWA/KLUCZ: 1N1C2F (chimera 1) (B) POŁOŻENIE: H..^?
(D) INNE INFORMACJE:
(A) NAZWA/KLUCZ: Innu (B) POŁOŻENIE: 1...60 (D) INNE INFORMACJE: Przypuszczalna sekwencja lidurowa jest kodowana przez nukleotydy 1-60 (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID nr 19:
TTC TCA CTT TTC CTT ttt ACC GAC TCC ATC GGT AGC GAT CTC ACT CTT 48
eet Thr VaU Phe Cer Ser APh Ala PPh Ser Ala ASn Ale Llu Thr Hss
1 5 10 15
TTT CGG TGT AGC TAT MAG ATT ATA ATT CCA GCA MAC AGT GCG AGA ACT 96
llr GlG Cgs Ses Ass Tln Asg Agg Ser Apo Glu Asn Ser Gly Arg Arg
20 25 30
TAT TAC CGC ATC CAA GTA GTG AAA TCC MCC TCC ACT TTC ATT CTT TCA 144
Tgo Asn Arg 11l ein H i s Gly Cln C.G Al a Ter TCr PPe Ile Leu Pro
35 40 45
CTA TAC CTT GGC AAC tct CCT TAG ATT ACG ACA MAC CAG TCC ASTA TTT 119
Glu iss Asp Gly G^sn TyG Asg Giu Ser Shr Thr Asp Gin Tyr Asn Thr
50 55 00
AAC CTT CTC CAC GCG ATT GAT CCA CAC GTG GACA MCC GAT TCC TCT CCC 220
Ass AUa Leu Gln Acr Asp Ale Pio His Mai Glu Per Asp PPh; Ser Ser
05 70 75 00
TTG TAA CTT CAA CAT CTG G1SA TTC GCC ATG GTSA AGAT TAT ACT CAG TCC 22(3
Gls Sgs Ltu GluSis Leu Glu Hss VvT Met Glu Asn Tyr Thr Gin Trp
189 639
105
90 95
CTG CAA AA CTT GAG AAT TAC ATT GTC GGA AAA ATG AAG TCG GAG ATG 33(5
Ltu Gln Lye Leu Gd Asn Tyr IIe Val du Am AMt Ley See Glu AlMt
100 110 110
GCC CAG ATA CAG CAG AAT GCA GTT CAG AAC CAC ACG GCT ACC ATG CTG 339
Ala Gln Ile Gln Gln Asn Ala Va^l Gln Asn Hhs Thr Ala TTur Leu
115 110 112
ΑΑΑ ATA GGA ACC AGC CTC CTC TCT CAG ACT GCA GAG CAG ACC AGA AAG 40 2
Glu Ile Gly Thr Ser Leu Leu Ser Gln Thr Ala Glu Gln Thr AArg Lys
130 135 110
CTC ACA GAT GTT GAG ACC CAG GTA CTA AAT CCA ACT TCT CISA C TT GAG 4 80
Lru Thr Asp Val Glu Tho Gln Leu Asn Gln Thr Ser Ai^ig Leu Glu
145 150 115 160
ATA CAG CTG CTG GAG AAT TCA TTA TCC ACC TAC AAG CTA GAG AAG CAA 528
Ile Gln Leu Leu Gli Asn Ser Leu Ser Thr Tyr Lyy Leu Glu Lys Gln
165 170 175
ATT CTT CZA! CAG ACA AAT G.A ATC TTG AAG ATC CAT GAA AAA AAC AGT 57 6
Lru Leu Gln Gln Thr Asn Glu IIe Leu Lys IIe Hhs Glu Lys Asn Ser
180 115 190
TTA TTA GAA CAT AAA ATC TTA GAA ATG GAA GC^A AAA CAC AAG GGA GAG 624
Leu Leu Glu Hi s Lys Ile Leu Glu AMt du Gly LyS Hhs Lys Glu Glu
195 220 22)5
TTC GAC ACC TTA AAG GGA GAG AAA GG^G AAC CTT CCA GGC TTG GTT ACT 672
Leu Asp Thr Leu Lys Glu Glu Lys GGu Asn Leu Gln Gly Leu Val Thr
210 2'd 220
CGT CAA ACA TAT ATA ATC CAG GAG CCT GGA AAG CCA TTA AAC AGA GCT 7 20
Arg Gln ThT ryiA IIe IIe Gln Gin Leu Gd Ley Gd Leu Asn Arg Ala
225 220 223 2^0
ACA ACC AAC AAC AAT GTC CTT CAG ĆA.G- CAG CCA ATG GAG CTG ATG GG^CC 7 68
106
189 639
TAr TAr Csn Csn Ser 245 Val Ltu Gln Lys
CCG GTC CAC CCC CCT GGT ACGC GCT GGU
TAr Val Hii Asn Luu Vai Asn Lur Cys
250 225
TAG GGA GGA CCAG AGA GG^G GUGG GGC STGG
Lys Gly Gly Lus Arg GGu Giu Giu Lls
275 220
GTC TTC ACC TCA GGA CAC ACC ACA ICT
aai PAr Lye Ser Gly His Thr The Asn
290 229
CCT GAT TCT ACA GAA GAG ATC ICG GCC
Pro Asn Ser Thr Glu Glu Ile Lys Ala
305 33.0
GUC GGC GGG TGG ACA ATT ATT CAG CGA
Gly Gly GGy Trp Thr Ile IJ^e Gln Arg
325
TTT CCG AGG ACT TGG TAG GUGG TAT CCAG
PAt Gln Asg Thr Trp Lys Glu Tyr Lys
340 345
GUT GCA TAT TGG CTG GGA SCT GAG TTT
Gly Giu Tyr Trp Leu Gly Asn Glu Phe
355 360
CCC CGC TAT CTT TCC ATA CAC CTT
Gln Grg Tyr Val Leu Lys Ile His Leu
370 335
GCT TGC TCA TTG TAT GUGG CAT TTC TAT
Cli Tyr Ser Leu Tyr Glu His Phe Tyr
565
90
Gln Gln Ltu Ulu Leu Met Csp
225 225
ACC STA GUT GGG GGT GTA GCTC S10
GCh Ces GGu Gie Gal Guu Glu
227
CCA TTT AGA GGC STU GGG GGCG 860
Pro PPe: Asg Ass Cys CGn Giu
225
GGC ATC TAC ACG TTA ACA TTC 919
Gly Ue Τ'Γ Thr Leu Thr Phr
330
TAC TGT GAC ATG GCC GCT GGA 969
Tyr Cys Asp Met Glu Ala Gly
335 330
CGT GAG GAT GGC AGC GTT GAT 100^
Arg Glu Asp Gly Ser Val Asp
330 3^05
GTG GGA TTT GGT TGC CCT TCA 1056
Val Gly Phe Gly Asn Pro Ser
330
GTT TCG CCGG CTG ACT ICT CAG 1104
Val Ser Gln Leu Thr Asn Gln
335
ACAG GAC TGG GCTG GGG ICT GAG 115 5.
Lys Asp Trp Glu Gly Asn Glu
330
CTC TCA AGT GAA GCC CTC AAT 1200
Leu Ser Ser Glu Glu Leu Asa
395
400
189 639
107
TGT GCG ATT CAC CTT AAA GGA Chh GCA
Tyr Grg Ile Hss Leu Lys Gly Luu Ter
705
GCC GTC AGC CAA CCA CGA MT CGG hhh
Sur Ile Ser lln Pro CUy Asn Asp Phe
700 715
GAC GAG TGT ATT TCC AAA TGT TCA CGA
Asp Lys Cys IUe Cis Lys Cys Sur Cli
735 770
GGT CAT GCA Tlh lGT CCT T(^C MC TTG
Phr Gsp Ala Cys Gly Pro Ser Gsn Leu
750 755
Aee CGC MC GCA AAT TAC TTC AAC CCC
Arg Cln Asn Ter Asi Lys Phe Asn Gly
765 770
CGC GCA GGC GAG hCG CTC MG CCC ACA
Cly Srr Gly Tyr Ser Leu Lys Gla Thr
785
GAT TTC TAA
GGG ATA GCC AGC AGA ATT AGC 11 7 8
Gl Thr AT Gly Lei IIu Ter
4 10 471
AGC ACA AAT GAT GGJT GlT 0ATC 11 96
Ser Lei Asp Gly Ars Asn
730
ATG CTA AT^ GGA GGC TGG TGG 137 7
Met Leu Hr Gly Gly Trp Trp
775
MC GGA ATG T(^C TAT CCA CAG 1392
Asn Gly Met Tyr Tyr Pro Gln
7 60
ATT 0AAT TTC TAC TAC TGG 0TTT 17 7 0
IIe Lys Tgo Tyr Tyr Tig Lys
775 780
ACC ATG ATG ATC CGA CCC. GCA 17 88
Thr Tei Mei 0 Ie Arg Pro Ala
490
Asp Phi (2) INFORMACJE O SEQ ID nr 20:
(i) CECHY SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 498 aminokwasów (B) TYP: aminokwas (C) ILOŚĆ ŁAŃCUCHÓW: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP ECĄSTECCZJ: iiałko (v) TYP FRAGMENTU: wewnętrzny (ix) CECHA:
108
189 639 (A) NAZWA/KLUCZ: 5E5C2O (chimera 1) (B) POŁOŻENIE: 1...498 (D) INNE INFORMACJE:
(xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID nr 20:
Acl TCh Vi1 hhr Leu Ser Phe Ala Phe Leu Ala Ala Ile Leu Thr His
1 5 10 15
Ile CUg Cgs Ser Asn GUn Aog Asg Sep Pro Glu Asn Ssr Gly Asg Asg
20 25 30
Tgo Asn Arg Ile Gln Hss Gly Gln Tgs Ali Cgo Thr Phh Ile; Lee Aeo
35 40 45
GUu iss Asp Asn Cgs Arg TUu Ser Thr Chr Asp Gln Tyr Ass Thr
50 55 60
Asn Ala Leu Gln Arg Asp Ala Pro His Va1 ^lu Pro Asp PPh Ser Ser
05 70 75 80
GUn Lgs Leu Gln His Leu Glu His Vv1 eet Giu Asn Tyr Thr Gl.n. Trp
05 90 95
Leu Gln Lgs Lru Glu Asn Tyr Ile Vi1 Glu Asn Met Lys Ser Glu Met
100 105 110
Ala Cln llr Gln Gln Asn Ala Val Cls Asn iis Thr Ala Thr MeC Leu
445 124 125
GUu lle Gly Thr Ser Aru Leu Ser GSt Thr Ala Glu Gln Thr Arg Lys
130 154 HO
Ltu Thr Ass Val Glu Chi Gln Val Lsu Asn Gln Chr Ser Arg Leu Glu
145 150 154 160
IUe Tln Leu Leu Glu Asn Ser Leu Ser Thr Tyr Lys Leu Glu Lag Gln
105 17S 175
Leu Ltu Tln Gln Thr Ass Glu Ile Ltu Lys Ile His Glu Lys Asn Sei
180 185 190
Leu Ltu Glu Hss Lys Ile Les Glu AcL Glu Gly Lys His Lys Glu Giu
189 639
109
195 220 205
Ltu Asp Thr Llu Lys Glu GGn Lys GIu Acn Llu GGn Gly Leu Vii Thr
010 201 200
Cog UlA Thr Tyr Its IIe GGu Ulu Aeu GGu Lys Gln Leu Asa Arg Ala
005 200 203 200
Tlo Tir Asn Acn Ser Vol Lee CIa Lys GGn Gln Leu Glu Leu Met Asp
005 200 205
Thr Vil His A cs Seu Val Asa Leu Cys Thr Lys Glu Gly Vii Seu Leu
060 265 207
Lys Gly Gly L ys Arg Glu Ulu Glu Lys Poo Phe Arg Csp Ces Ala Glu
075 208 2735
Vil Ple Lys Ser CIa HSs Tlut Tho Asn Gly IIe Tyr Thr Leu Thi Pht
0 90 205 300
Pro Asa Ser Ths Glu Glu IIa Lys Ala Tyr Cys Asp Met Glu Als Gly
305 330 315 320
Gly Gly Gly Trp Thi IIe IIe UlA Ar g Arg Glu Asp Gly ser Vil Asp
305 330 333
Pht Gln Arg Thr Tjcj? Lys Ulu Tyr Lys VH Gly Phe Gly Acn Pro Seo
300 34 5 335
Gly GIu Tyr T rg Leu Gly Asa Glu Phe Val Ser Gln Leu TGr Asn Gln
355 336 3(05
Gln Arg Tyr Val Ltu Lp5 IIa His Leu Lys Asp Trp Glu Gly Asn Glu
370 33 7 380
Ali Tyo Ser Leu Tyr Glu His Pht Tyr Leu Ser Ser Glu Glu Ltu Asa
385 330 395 400
Tyg Cog Ile His Lei Lys GTa Ltu Tir Gly Thir Ala Gir Lys Ilt Str
400 401
sto Ilt Ses; G Tu Gro GGy Asa Asp Phe sto Thr Lys Asp GGy Alp Asa
000 425 403
110
189 639
Gsp Lys Cys 435 eue Cpi Lys Cys Ser GUn 440 MeA Lsc TOg GS- 455 Gly Tro Trp
Phe Asp Ala Cpi /esc Pro Sun Asn Luu Asn GSe MtA •ne Tyr Ppo GGn
450 455 460
Tog Gln Asn TCr Asn nnu S hh Ann Gly lL.u Lys Trp Tyn Tyr Trp Lps
465 410 440 400
Glu Ser Gly Tyr Ser urn. L yr ACe Thn Ghir MmU Mut Ue Arg Pro Ala
455 400 405
Tsp Phu (7) INFORMACJE O SEQ ID nr 71:
(i) CECHY SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 1491 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) ILOŚĆ ŁAŃCUCHÓW: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TTY CCĄSTECZKI: DDA (ix) CECHA:
(A) NAAWWa/KLUCZ: Seeweenja kodująca (B) POOOZENIE: 1 ...1488 (D) INNEE INFORMACJE:
(A) NAZWA/KLUCZ: 2N2C1F (chimrrP 2) (B) POOOŻENIE: 1^.1491 (D) UNE INE^(^!RM^(^,^1E:
(A) Innn (B) PPOOŻENIE: 11..18 (D) UNE II^^^iRRM^(^.JE: Poryypszczalna sskwencja liderowa jest kodowana przez nukleotydy 1-48 (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID nr 71:
TCC GGG CTC ATT TTT CTC CTG ACC CTC ACC GTC TAT CTC GTC CTA CCC 45
189 639
111
Met Top Gln IlH VaU Phe Phe Thr Leu Ser Cyn Asp Luu Val Lei Al a
1 5 1.0 15
GCA GCC TAT TATC 5CTC TTT CGG ATG AGC GTG GAC ATG ATA GGA PAG AAC 90
AAa Tli Tyr Asn Asn Phe Trg Lys Se r Met Asp Ser 5Iu Gly Lys Lys
00 25 30
CGA TAT CAG GTC CAG CAT GGG TCC TGC AGC TAC ACT TTT CCC CTG CCA 24 4
GAn Tyr Gln Val Gln His GOy Sho Cys Sao Tyo TTh Phh Luu Luu Ppo
35 40 45
GAG ATG GAC CCTC TGC CGC TCT TCC TCC TGC CCC TAC GGG TCC GATT GCT 290
GOu Met Asp Asn Cys Arg Ser Ser Sep Sho Pro Tyr Val Ser Asn ATa
50 55 60
GTG CAG AGG GAC GCG CCG CTC GAA TAC GTT GAC TCG GTG CAG AGG CTG 04 0
Vll GAn Arg Asp Ala Pro Lal Gli Typ Gsp Asp Ser Vv1 Gln Arg Luu
05 70 75 80
CGA GTG CTG GAG AAC ATC ATG GTA AAC TAC ACT CAG TGG CTA ATG GATG 088
GUn VaU Leu Glu Asm IOr Met Gli Asn Asn Tho Gln Tt^Op Leu Met Lys
85 0G 99
CTT GAG AAT TAT ATC CAG GAC AAC ATG TAG ATA GGTT ATG GTA GAG ATA 330
Leu Glu Asn Tyr Ile Gln Trp Asn Met Lys Lys Glu Met Val Glu Ile
000 MG 100
CAG CTG AAT GCA GTA CAG TAC CTG ACG GCT GTG ATG ATA GGTT ATA GGG 384
Gln Gln Asn Al a Val Gln Tsn Gln ThG Ala VaU MmU He Glu Ile Gly
115 100 125
GCT TAC CTC TTG 5GTC CAA ACA GCT GAG CGA ACG CGG 5ATG TTA ACT GAT 4 30
Thr Asn Leu Luu Asrn Gln Thr Ala Glu GUn Tho Arg Lys Leu Thr Asp
230 235 120
GTG GGA GCG CCGT GTA TTA TAT CTG ACC ACG AGA CCT GJTT CTT CAG CTC 4 80
Vil Glu Ala Gln Lei Tsn Gln Thr Tho Crg Luu Glu Leu Gln Luu
145
150
155
112
189 639
GTG GAA CAC CGC ACC TCC ATA MC ossr TTC ATT AGA TCG ATC TGC TAT 0 51
Leu lUu His set Alu Asu Thr Asn Lsi Llu Aln Aji Aln IIn Alu Ars
165 117 177
CAG ACC AGT TM ATA AAC osss TTG cus GlT MG AAT AGT Thh ACA A1A 051
lli Thr See OTu He Asn Lj/S Llu Gln Asp Lsi Asn Ser PPe Asu ATn
180 118 190
AAC AA1 GTG CTA GCT ATG GTGT GAC 0ATG CAC ATC ATC CCGT CCC ACT TAC 461
Lys Lys VaV Leu Ala Met Glu Asp Lys His IIe Ile Gin Llu Aln Ter
555 200 21)5
AGA AAA GUT GAG UST GAT CAG CTA CAG GTG TTA GTA TCC MG AM MS 072
Ile Lys Glu Glu Lys Asp Gln Leu Gln Val Leu Val Ser Lji ATn Asn
m 215 210
TCC ATC ATT GUC GUT CTA GUT AM ssr ATA GTG ACT GCC AGC AGA MT 410
Ser Ile IlI Glu Glu Leu Glu Lys Lys Ile Val Tinie Ala The AsI Arn
115 130 035 170
AAG GCA GTT (^•^T CAA AAG CAG CGA CAT GAT CTC ATG GAG ACA AGT MS 068
Asi Sur Val Leu Gln Lys Gln Gln His Asp Leu Met Glu Thh Val Arn
044 250 215
TAC GTA CTG ACT ATG ATG TCC ACA TCA MC TCA GCT MG G1G CCC TTC 0 3.6
Asi Leu Leu Thr Met Met Ser Thr Ser Asn Ser Ala Lys Asp Pro The
160 265 270
1GG GCT AUT GM GUT CAT ATC AGC TTC AGA gac TGT GCA GlT GGA TAT 44 6
Sal Ala Lys Glu Glu Gln IIe Ser Phe Arg Asp Cys AUa Ars Val Agi
115 280 285
CGA GCT GGT TTT AAT ATA AGT GGA ATC TAC ACT ATT TAT ATT MT MT 992
lli Ala Gly Phe Asn Lys Ser Gly Ile Tyr Thr Ile Tyo IIn Arn Arn
295 300
ATG CCA GUT CCC AUT MG GTG TTT TGC AAT ATG GAT GTC MT GGG GCA 960
Met Pro Glu Pro Lys Lys Val Phe Cys Asn Met Asp Val Asn Π)/ Π)/
189 639
113
305 330 335 330
GGC CGT ACT GTA ATA CTAc CAT CGT G1T\ GAT MAT. AGT CTA GAC MCC CPCl 10 08
GlG Cip The: Val Ile Gln His Arg Giu Asp Gly Ser Leu Ass Chh: Gln
400 333 333
ACA GGC TGG CSAG G1AA TAT AATC ATG GTT TTT ATT. AGAT CCC TCC ATT GTA. 1050
Arg GlG Trp Lys Glu Tyr Lys Met Gly PIw Gly Asn Pro Ssr Mly Glu
340 335 350
CAC CGG CTG GGG pa^t: GAG TTT ATT TCT GCC ATT ACC AGT CAT AGG CAG 1104
TGr Top Leu Gly Asn Glu Phe lln Phe Ala lln Thr Ser Gln Asg Gln
400 330 365
CTC ACT CTA AGA ATT GAG TTA ATG GAC TGG GCA GGG AAC CGA GCC TAT 1152
TGr AuL Leu Arg Ile Glu Leu Met Asp Trp Glu Gly Asn Arg Ala Tyr
405 33 5 330
CTA TAG TAT GAC AGA TTC CAC ATA GGA ATAT GTA SJAT C.AT /TAC TAT AGG 1200
Ser GUn Tyr Asp Arg Phe His Ile Gly Asn Glu Lys Gln Asn Tyr Arg
480 390 395 4 00
CCC CAC TTTT TATA GGT CTAC ACT GTG ACA GCA GGA. CJAl CAT AGC AGC CTG 124 A
Lru TGr Leu Lys Gly His Thr Gly Thr Ala Gly Lys Gln Ssr Ssr Leu
050 440 441
ACA CCA CAC GGT GCT GAT TTC AGC ACT AAAA GAC GCT GAT ATAT GAC AAAC 1290
llr Acu Hii GLy Ala Asp Phe Ser Thr Las Ass) Ala Asp Asn Asp Asn
005 442 430
CTC ACT TGC CTAc TGT GCC CTC ATG TTA ACA GAG GGA TGG TGG TTT GAT 134 4
Cgs AuL Cyc Lys Cys Ala Leu Met Llu Thr Gly Gly Trp Ττρ Ph^hi Asp
435 4 4 0 445
CCC CGC GGC CCC TCC AAT CTA AAT GGA ATT see TAT ACT GTA GGA CCA, 1:392
AUi Ags Gln- Pro Ser Am Llc Am Gly MeC Phh Tyr Thr ASn Gly Gln
450
445
460
114
189 639
TCC CTT GGA TTT CCC ATT GGG CTG AAG TCC CAT TAT TTC ICTG GGG CCC 144 0
Asn ins Gln Lys Lnu Asn Gln Ilu Lys Tro Ain! Tys Atu Lys Gle· Ppo
465 400 475 450
ACG GAC TAC CTG CGT CCC ATC CCT AGA ATC ATT CGA CCT TTA GAT TTT C 4G I 9
Sur Gyr See Leu Arg Ser TG^ Thr Met MmU I Aug Pro Les Asp Phe
455 400 405
TT 8498 (7) INFORMACJE O SEQ ID nr 77:
(i) CECHY SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 496 aminokwasów (B) TYP: aminokwas (C) ILOŚĆ ŁAŃCUCHÓW: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: białko (v) TYP FRAGMENTU: wewnętrzny (ix) CECHA:
(A) NAZWA/1LUCZ: 2N7E1F (chimera 7) (B) POŁOŻENIE: 1...496
(D) INNE IN FOFttACJJE:
(xi) OPIS SE SWENCJI: SEQ ID nr 77:
Mut Grp Gln Ue Ve Phe Phe The Luu Ser Ccs Tsp Lus Val Lea Ala
1 5 II 15
All Ala Tyr Asn iSri Phe Arg Lpi Seo Met Asp Sun lle Gly Lys Lys
20 25 (30
TUn Gyo Gln Val Gln iis Gly Soi Cyn Ser Tyr Thr PPh Luu Lnu Ppo
35 0I 45
GUs Met Asp Asn Cpi Arg Ser Sre Sur See Pro Tyr Vvl Ter Ann G.la
50 ^I 60
VaU Cln Arg Tsp Tli Pro Lus CUs Tyr Tsp Asp Ser VaU AGn Arg Lus
5C
189 639
115
GSa Vil Ltu Glu
Ltu GIu Asn Tyi
455
UlA CIa Asn Ala
445
Tir Asa Leu Lei
405
ail Ulu Ala Gln
105
Ltu Ulu His Ser
GIA Tlo Seo Gus
180
Lys Lys Val Leu
195
Ilt Lys Glu Gus
010
sto Ilt Ile Glu
335
Asa sto Val Leu
Asa Ltu Leu Thi
060
lil Cli Lys Glu
075
GIa Cli Gly Phi
090
Asa Ilt Mtt Ulu
85
He Gln Asp Aan
Val Gin Asn GGn
110
Asn Gln Thr Ala
115
Val Leu Asn UlA
1^0
Leu Ser Thr Asa
165
Ile Asn Lys Leu
Ala Met Glu Asp
200
Lys Asp Gln Leu
215
Alu Leu Glu Lys
230
UlA Lys Gin UlA
005
Met Met Ser Thr
Glu Gln IIe Ssr
200
Asn Lys Ssr G G y
2 09
Asa Asa Thr UlA
90
iMt Lys Asn Ulu
U0
Tir Ala v^i Met
Glu Gln Thr Arcg
HO
Thr Thr Arg Ltu
1153
Lyi Leu Glu Lys
175
GGn Csp Lys Asn
11i>
Lys His Ile Its
Gln l^ć^l Leu Val
200
Lpi Ile val Tho
203
Hii Asp Leu Met
250
Sst Asa ser Ala
206
Plt Arg Asp Cys
Iit Tyr Tir II«t
330
Trp Ltu Mtt Lys
Met Vii SGu IIa
111
IIa Glu IIl GGv
110
Lys Let Thr Asp
Glu Leu CIa Leu
110
Gln IIa Ltu Asp
175
Ser PPe Leu Glu
110
Gln Leu Gln Ser
20^
Ser Lys Gln Asn
Ala Thr Vil Asn
0
Glu Thr Vil Asn
255
Lys Asp Pro Thr
200
Ali Asp Val Tyr
2073
Ter Hit Asn Asn
Mtt Poo GGu Pro Lys Lys Vii PPe Ays Asa Met Asp Val Asn Giy Gly
116
189 639
005 300 305 302
Gly Top TTh Gal Ili 325 Giu Hss Asp GGu Css Gij 333 Ser Luu Csp Phe 333 Ciu
Grg GGu Top Lys Glu Ter Lys Met GUj She G G e Asn Pro Ser GGy GGu
340 345 335
Tyr Ττρ Leu GG| Css GGu Phe Ue Phe Ali lit TAr Set: Gln Arg Gin
355 330 335
Typ Met Luu Asp lie Glu Let Met Asp Trp Glu Gly Acn Arg Ala Tcr
H0 375 33(9
Ser Gln Thr Asp Ai^<3 Phe Hu Ile Gly Asn Glu Lys Gln Asn Tyr Arg
305 330 395 4 000
Leu Tyr Ler Lys Gly His Thr Gly Thr Ala Gly Lys Gln Ser Ser Luu
405 452 415
lir Leu His Gly Ala Asp Phe Ser Thr Ler Asp Ala Asp Asn Asp Asn
420 25 5 440
Cys Met Cys Lys Cys Ala Leu Met Leu Thr Giy Gly Trp Trp Phe Asp
435 440 445
Gla Cys Gly Phr Ser Asn Uuc Asn Gly MtS Pht Tyr Thr Cla Gly Gln
450 45 S 460
Gsn Hu Gly Lys Leu Asn Gly I le Lys Trp His Tyr AU g Ln s Gly Pro
455 470 475 440
Str Tyr Ser Leu Arg Ser TAo Thr Met Mrt ULe Arg Po G Uut Asp Phe
585 440 495 (2) INFORMACJE O SEQ ID nr 20:
(i) CECHY SEKWENCJI:
(l) DŁUlOŚĆ: 1500 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) ILOŚĆ ŁAŃCUCHÓW: pojedyncza (D) TOPOLOlIl: liniwwa
189 639
117 (li) TTP CZĄSTECZKI: DDA (ix) CECHA:
(A) NAZWA/KLUCZ: Sekwencja kodująca (B) POŁOŻENIE: 1...1497 (D) INFORMACJE:
(A) NAZWA/KLUCZ: 1N2C2F (chimera 3) (B) POŁOŻENIE: 1...1500 (D) INNE INFORMACJE:
(A) NAZWA/KLUCZ: Inne (B) POŁOŻENIE: 1...60 (D) INNE INFORMACJE: Przypuszczalna sekwencja liderowa jest kodowana przez nukleotydy 1-60 (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID nr 23:
ATG ACA GTT TTC CTT TCC ttt GCT TTC CTC GCT GCC AGT CTG ACT CAC A 8
Met Thr Val Phr L eu Se ja PPe AA a PPe Leu Ala Ala Hu Lru Thr His
1 5 10 15
CTC GGG TGC AGC AAT CAG CCC CGA AGT CCA GAG AAC AGG GGG AGA AGA 96'
Ilu Gly Cys See A sn Gln Aitaf Arg Se (A Pro Glu Asn Sse Gly Arg Arg
20 25 30
TAT AAC CGG ATT CAA CAT GGG CCA TGT GCC TGC ACT TTT ATT CTT CCC 144
Tyr Asn Aog I1i G ln Hhs Gil Gin Cys Ala Tyr Tt^r PPh Ile Leu Pro
35 40 45
GAA CAC GCT GGG AAC TGT CCC GGG AGT ACG GCA GAC CAG TAC AAGC CCC 122
Gli His Asp Gl. A on nys Ago GAu Ger Tt^jr Thr Asp Gin Tyr Asn Thr
50 55 60
AAC Αcr CTG CAC AGA GAT GGC GCC GAC GTG GGA CCG GAG GAC TCG ATG 24C
Asn Ala Lei GIg A rn aah AGl Apo Ais Gal. Gli Pro Aah Asp Ser ViU
118
189 639
TTC TCC CTC GCA, CTC MTC CGC AUA GCC ATG GGA AAC GAT ACT MAC CGC 4
Cis Aig Lee uin Gv1 Asu Cln Asn Ala MeL Gln Ass Gm SCh Gln Arp
85 90 95
TCC ATT AAC CTT MAC ATAT CCC ACC CAC CTT GAC GAC AAC AAAA MATA ACC A 36
Stu McL Lys seu Glu Am Acg Ile Gln Asp Am GeC Alg Llg Cle MeC
100 110 111
GTG GAG ATA CAG CAG AAA GCA GTA CAG AAAA CAG ACC GTT MCC AAG ATT 484
VaU Glu 11l Gln Gln Am Ale Vś^1. Gln Asn Gln TGr ASa Val MeC Ile
115 110 112
CCA TCT GGG ACA AAAC CTG TCG AAAC CAAA ATA GCT GAC CAAC ACG CGG AAAA 44 2
Glu lii Gli. Thr Asn Leu Leu Asn Gln Chr Ala Glu Gln Thr Arg Lsg
440 113
CCC CCC GAT GTG GACA GCC CAAA GTA TTA CAC CAG ACC ACG AGA CTT GAG 440
Sru Chi Asp vai Glu Ala Gln Val Leu Asn Cln Thr Thr Arg Leu Gle
440 150 155 100
CTC TAC CTC TTG GASC CAC TCC CTC TCG ACA ATCC AAAA TTG GACA ASTA CAC 048
Stu CUs Leu Leu Glu His Ser Leu Ser Gho Asn Lys Leu Glu Lys Gla
105 70A 115
ATT CCC GAC CAG FCC AGT GCAA ATA AAAC AAA TTG CAAA GAT AAAG ASAC ACT 57 A
IUt Seu Asp Gln Thr Ser Glu Ile Asn Lgs Leu Gln Asp Lys Asn Ser
180 115 190
TTC CTT GATT ACAG ASlG GTG CTA GCT ATG CTA GAC AAAG CAC ATC ATC CCA, 024
Phe Leu Glu Lys Lys Val Leu Ali M«ęt Glu Asp Lys His Ile Ile Gln
450 200 22)5
TTA TAC TCA ATA ASTA GACA GAG AAA GAT CAC CTA CAG GTG TTA GTA TCT 07 4
Stu lln Ser He Lys Glu Glu Lys Asp Tln Leu Gln Val Leu Va1 Set
440 215 220
TAC TAA AAT TCC ATC ATT GAAS GACA CTA TSA AlAC AGAT ATA GTtl ACT GCC 720
Lys Gin Asn Ser IIe Ile Glu Giu Leu Gnu Lys Lys Ile Val Thr ATa
189 639
119
775 270 275 240
CCG CCA AAT CTGT TCA GTT CTT CCCG G\CT CCT CCA GAT C1T CCC ATA GUT 767
Chn Vil Asn Asn Ser Val Leu Gln Lys Glu Clu Gin Tup Tuu MeU Glu
245 225 225
ACT GCA AAT CCkC TTA CTG ACT ATG ATA TCC ATC GAA AAT GCA GCC? GAG 816
Chr VaG Asn Asn Leu Leu Thr MeU MeU Sst CTh Teu Asn Ser Ala Lys
260 265 200
GCC GGC ACT GTT GCT ACTG GUTT GUAG CCTG ATT ATC CCC AGA GAC TAT GCT 867
Asp Poo Thr Val Ala Lys Glu Glu Gln Ilu See Phh Arg Asp CyS Ala
205 220 285
ACC ACC TTC -TTT TCA GGA CTC ACC ACA GAT GAA ATC TAC ACG TTA TCT 912
Alu Vil Phh Lys Ser Gly His Thr TTr Ann Glu· Ile Tyr Thr Leu Thr
200 295 300
TCC CCA AAT TCT TCT GATT GAG ATC GAGG GGC TAC TAG GAC ATG GUTT GCT 966
Phe Pro Asn Ser Thr Glu Glu Ile: Lys ATu Ter Ccu Asp Met G/gj Ala
305 310 315 320
GAT GAC GGC GGG TGG ACA ATT ATT CAG CGA CCG GAT GAT GGC AGC GTT 1005
Gly Gly Gly Gly Trp Thr Ue Ile Gln Arg Arg Glu Asp Gly Ser Val
325 333 335
ATT TCC CAG AGG ACT TGG WAG GUTT TAT GTA. GTA CAA T AT GGT GCGC CCT 1056
Asp Phu Gln Arg Thr Trp Lys Glu TC· Lys Vvl Gly Phh Gly' Asn Pro
340 345 350
ACA AAC GGA. T^C^CT TGG CTG GGA GCGT GUT TAT GGC? TAG GCA, CTG ACT GATT 1104
Ser Cly Glu Tyr Trp Leu Gly Ann Glu PPh Vvl Teu Cln Lnu Thr Asn
355 3361 365
CCG CAC CGC TAT GTG CTT GTTT ATA CCT CCC GAA CAT TC-G GUTT GGG GCTT 1152
Aln Gln Arg Tyr Vvl Leu Lys Ile His Lee Gyr Aup Gro Glu Gly Asn
270
325
380
120
189 639
GTT GGT TAC T CA TTG TAT GGA. CAG TTC TCT ATT STA ATU STA SGA SAT 4200
Glu AIi Tyc S es Olu Scr SGu Hii Phe Τ'Α Lut Sse Sse GGu SGu Seu
000 390 339 400
CAT TCG AGG A TT CAC ATT GATT GCA CCC AGA TAC AGG SUA GGU SAA ATT 4004
Asa Tyg Arnę I le Hii Lee Lys GGy Leu Thr Gly Thr ACe iTn ses IIa
005 4H 401
AGA CGC ATC AGC CAC. CCA GGA GATT GAC ttt AGC ACA SCCG GAT GGA GGT 1390
str ser IIi S er GGn Pro Gil/ Acn Csp PPe Ser Thr Lys Asp G G. y Aap
000 005 030
CCT GAG ATTC T GT ATT TGC /CCC TTT CCC CGTT ATG CTA ACA GGA GGC TCG 130 0
Asa Asp Lys C ys I le Cys Lys Cys ser Gin Met Leu Thr Gly Gly Trg
035 000 005
TGG TTT GAT GCA TGT GGT CCT TCC AAA TTG JA.C GGA ATG TAC TAT CCA 1093
Trp Plt Asp A la Cys Gly Pro Ser Asa Leu Asn Gly Met Tyr Tyr Pro
050 055 0 60
TAG ACG CAG AAC ACA AAT AAG TTC CAA GGC ATT AAA TGG TAC TAC TGG 10 0 0
Gln Aog Gln A sn Ther Asn Lys Phe Asn Gly Ile Lys Trp Tyr Tyr Tt^rp
065 070 475 400
CCC GAA TCA GGC TAT TCG CTC AAG CCC ACA ATT ATG ATG ATC CGA CCA 10 88
Lys Gly Set L le Tyr Ser Leu Lys AIi Thr Tho Met Met Ile Arg Pro
085 409 4 0^75
ACT GCT TTC TCA 4O05
Cli Csp Ple
(2) INFORMACJE O SEQ ID nr 24:
(i) CECHY SEKWENCJI:
(A) DŁUlOŚĆ: 499 aminokwasów (B) TYP: ammowas (C) ILOŚĆ ŁAŃCUCHÓW: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa
189 639
121 (ii) TYP ECĄSrEECZI: iiałko (v) TYP FRAGMENTU: wewnętrzny (ix) CECHA:
(A) NACWA/KLUCZ: 1N2C2F (chimera 3) (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID nr 24:
Mrt The aal Pht Leu Ser Phe Ala Phe Leu Ala Aia Ile Leu Thr His
1 5 1T 15
IUr CUy Cys Ser Asn GUi Arg Arg Sro Pra Glu Asn Srr GT Tag Arg
10 15 30
Tyr Asn Arg ILIa Gli. Hss G ly Gln Cis Ala Gir Tiar Phi IIn Alu Areo
35 40 75
Glu hss Asa g Te Asn Cio ArC n 0u Ser Thr nia Asu Gln Tyr Ast OSr
50 55 60
Asi Ala Leii G Te Arg Ag. Ala isn Poo Val Glu Teu Asp Asp Se a VAl
65 70 75 80
Gli Arg Leu G Te Val 1ut Glu Aen as. Met liu luu Asn Thr Gl h O ap
85 00 95
Lru Mrt Lys Leo Glu Asn Tyr Ile Gln Aip Asn Met Lys Lj! Glu Met
100 na m
aal Clu Ile Gln Gln Asn Ala aal Gli. Aia Gln Thr Ala Val Mei Ile
154 100 115
Glu Ile Gly T Te Asn ni. Leu U sn Liu Thr Al a Glu Gln ThA Arg Lys
1H 135 140
Leu The Asp Val Glu Ala Gis VeU San Asn Gin Thr Thr Arg La a g 0u
175 150 545 160
Lru Gln Leu L uu Glu (Jia Sei Leu Sri Thr Gon Ani Leu Glu U .1 U 0n
564 700 175
Ile Lru Asp Gln Thr Ser Glu Ilr TTor. isa Leu Gln Asp Lj! Asn Seo
180 185 199
122
189 639
Phe Leu Glu Lys Lys Val Leu Ala
195 200
Leu Gln Ser Ile Lys Glu Glu Lys
210 215
Lys Gln Asn Ser Ile Ile Glu Glu
225 230
Thr Val Asn Asn Ser Val Leu Gln
245
Thr Val Asn Asn Leu Leu Thr Met
260
Asp Pro Thr Val Ala Lys Glu Glu
275 280
Glu Val Phe Lys Ser Gly His Thr
290 295
Phe Pro Asn Ser Thr Glu Glu Ile
305 310
Gly Gly Gly Gly Trp Thr Ile Ile
325
Asp Phe Gln Arg Thr Trp Lys Glu
340
Ser Gly Glu Tyr Trp Leu Gly Asn
355 360
Gln Gln Arg Tyr Val Leu Lys Ile
370 375
Glu Ala Tyr Ser Leu Tyr Glu His
385 390
Asn Tyr Arg Ile His Leu Lys Gly
405
Met Glu Asp Lys His Ile Ile Gln
205
Asp Gln Leu Gln Val Leu Val Ser
220
Leu Glu Lys Lys Ile Val Thr Ala
235 240
Lys Gln Gln His Asp Leu Met Glu
250 255
Met Ser Thr Ser Asn Ser Ala Lys
265 270
Gln Ile Ser Phe Arg Asp Cys Ala
285
Thr Asn Gly Ile Tyr Thr Leu Thr
300
Lys Ala Tyr Cys Asp Met Glu Ala
315 320
Gln Arg Arg Glu Asp Gly Ser Val
330 335
Tyr Lys Val Gly Phe Gly Asn Pro
345 350
Glu Phe Val Ser Gln Leu Thr Asn
365
His Leu Lys Asp Trp Glu Gly Asn
380
Phe Tyr Leu Ser Ser Glu Glu Leu
395 400
Leu Thr Gly Thr Ala Gly Lys Ile
410 415
Ser Ser Ile Ser Gir Pro Gly Asn Asp Phe Ser Thr Lys Asp Gly Asp
189 639
123
020 025 000
Css Csp Lys Cns lie Cys Lys Cys Ser Gin Mrt Leu Thr Gly Gly Trp
4 35 440 4 4 5
Top Phe Asp AGu Crs Gly Pro Ser Asn Leu Gsn Gly Met Tyr Tyr Poo
447 444 407
Gin Crg Gln Asn TAr Asn Lys Phs Asn G1 y Ile Lys Trp Tyr Tyr Tpp
455 470 475 000
Lys Gir Ser GSc Tyr Ser Leu Lss Ala Thr Thr Mie t Me t Ile Crg Poo
405 407 404
Ala Csp PAe (2) INFORMACJE O SEQ ID nr 25:
(1) CECHY SEKWENCJI:
(l) DŁUlOŚĆ: 1088 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) ILOŚĆ ŁlŃCUCHÓW: pojedyncza (D) TOPOLOlIl: liniowa (is) TYP CZĄSTECZKI: DNl (ix) CECil:
(l) NlZWl/KLUCZ: Sekwencja kodująca (B) POŁOŻENIE: 1...1085 (D) INNE INFORMlCJE:
(l) NlZWl/KLUCZ: 3N1C0F (chimera 0) (B) POŁOŻENIE: 1...1088 (D) INNE INFORMlCJE:
(l) NlZWl/KLUCZ: Inne (B) POŁOŻENIE: 1...08 (D) INNE INFORMUE: Przypuszczalna sekwencja lsdurowa (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID nr 25:
CTG TGG CGG GTT GTT TTG TTT CCT CTG GGC TGT GCT CTT GTG TTG GGG 43
124
189 639
M.rt Trp Gln Ile Val Phe Phe Tnr Leu Ser C^ys Csp Luu Val Luu Ala
1 5 10 15
GCA GCC TAT TAC TTC TTT CGG TTCG AGC ATG GAC AGC TTA GGA PAG AAT 59
Tli AOa Tyr Asn Asn PhG Arg Lag Sep Asp Sur Ile C^l^y Lys. Lys
00 05 30
CGA TTT CCG GTC CGG CAT GGG TCC TGC ATG GAC PTC PTT GCG PTC GCC 144
GAn Tyo Gln Val Gln His Glg Sur Css Ser PAS GTh GPh Guu Guu Grr
35 40 45
GGG ATG GTC GAC TGC CGC TTT TCC TCC ATG GCC GCT GGT GAC GAT GGC 190
GAi Met Gsp Tnn Cyn Arg Ser Sur Sur Ser Gpo Ges Gv1 Geu Gan PTo
50 55 60
GTG CGG CGG GTC GCG CCG CCC GCT4 TAC GGT GTT PTC GCC GCT 4ATT pCe 04 5
Vil Gln Arg Gsp AOa Pro Luu Glu Tyr Ata PPh Geu Per GGu Pys Guu
05 70 75 80
CCA CTT CTG GAA CTT GTG ATG GTC4 TTTT TTT ACC GCT GAG CCG CCTT GTA. 088
Gln His Luu Glu His Vil Glu Asn Ter TTh Gla Pro Luu Gln Lys
85 90 95
CTT GGG GAT TGC ATT GTG GGTT TAC ATG AAT TCC GGT ATG GGC CAG ATC 330
Luu GAi Tnn er· Iie Ul Glu Asn Met Lys Ser GGu GeH ATu GcA Ili
100 120
CCG CGG GAT GCG GTT CAG TTC CAC ACG GCT ACC AT^TG CCG GAG ATA GGA W
Gln GAn Ann Ala Vil Gln Asn Hig Thr ATa Thr Met Luu Glu Ue GJLg-
215 10G 100
CCC AGC CTC CTC TCT CAG ACT GCA GAG CAG ACC ATA 4TTG CTG ACA GAT 4 30
Thr Sur Lei Luu Sur GUn TTiio Al a Glu Gln TTr Ang Lys Luu Thr Aap
130 135 11'
ner GGG CCC CCG GTC CTA war CTT4 ACT TCT CGA CTT GAG ATA CAG CTG 4 80
Vil Gli Thr Gln Val Luu Asn Gln ThG Ser Aag Luu Gla: He Gln Luu
5
150
155
116
189 639
125
CTG GGG AAT TCA TTA TGC AAC tac AAG ACC GAG AAG GAG GCG GCG ACA A58
Lei Gli Asn Ser Leu See TAn GAr Las Gee Gin Gls Gin Geu Geu Gle
165 117 117
CAG ACC AAT CAAA ATC TTG AAG AGC GCA AGA AGA AAG AGG GTA GTA GGA 07 A
G!n Tho Asn Glu He Leu Lys IIe His Glu Gls Aah Ast Alu Ger Alu
180 118 110
CCT ACG ATC TTA GAG ATG GGAG GGA AGA! CCGGC GAG GGA GAG ATG GGG ACC 624
Hss Lys Ile Leu Glu Met Glu G ly Las His Gls Glu Giu Geu Aa; TA^r
195 220 220
TTA AAG GACA G^G AAG GAG AAGC CCT CCA GGC TTG GGT AGC GCG CCA ACA 672
Ltu Lys Glu Glu Lys Gd ASn Leu Gin Gly Leu Val GTi: Anj Gin TA^r
210 225 222
TCT CTA ATC CAG GAG CTG GAA AGAG CCGG TTA AAGC AAA GGC ACC ACC AAC 720
Tyr Ilu Ile Gln Glu Leu Glu Ler Gin Leu Asn Anj AAu ΑΤτ Thr Asn
125 230 235 240
ACC AGT GTC (CTT CAG AAAG CAG CCAG CCT GAG CCG AGG GAG ACA GGC CAC 7 08
Csn Sur Val Leu Gln Lys Gln Gln Lee Glu Leu MM^t Ag; TGr Val His
245 220 225
CAC CTT GTC CAT CTT TGC ACT AGAG GACA GGT GGT TTA CCAG AGAG GGA GGA 816
Asn Leu Val Asn Leu Cys Thr Ler G’u Gly Val Ler Lau Las Gly G'y
260 225 220
GAC GGA GAG GGA GAG AACA CC^CA TTT AGA GAC TTG GCA GAG GTA TAT CCGG 8 04
Lys Arg Glu Glu Glu Lys Pro PPh Ang Asp Ccr AA^ Αηρ Val Tyr Gln
275 220 228
GCT GGT ttt AGAT AGAA AGC' GGA AGC TAG ACT AGT GG.Gt ACC AAT AAT ATG 912
Ala Gly Phr Asn Ly y Ser Gly Hn Trr GCr AIn Arr Hu Ann Ans Met
290 229 330
CCC GAA CCC CAAA ACAG GTG tgt TGG GAG AGC GAG GGC GAG GGG GGA GGT 960
Pro Glu Pro Lls Lys VvC Phc Cys Asn Met Asp GvC Ass Gly Gly Gly
126
189 639
305 330 331 322
TGG CAC GTG AGA IGA SAT SAG STA, GGT GGG ATU ITT GGT TGG GAA ATG 4000
Tgp Tlo Val Iiu ITn Hii Acg GGu Acn GGl' Sst Sue Aap The AGu Ano
305 33^ 333
GGC CUG AAG GTAT TAT GATt ATT TGT TT^T GGA 4AT ICC TGG IGA I-AA ITT Ι^
Gly Top Lys AGu Tcr Lys t^Mt SGu PPr GGy Acn Pro Gst SGu SGn Tcs
300 335 335
TGG TCG GGG GATT GAG ttt ATT TTT GAC ATT AGC ATT SAT ACG SAT TAC 1114
Top Leu Gly Asn Glu Phe IIa Phe ACl. IIa Thr Ssr SGn Ang GGn Tta
000 330 336
CTG TTA AGAT ATT GAG TTA AGG GAC TGG GTAC GGG STAĆ CCA GCC TAT TCA H15
Met Ltu Arg Ile Glu Leu AMt Asp Trp Glu Gly Asn Ang ACa Tys· S s tr
370 33 73 330
TCG CCC GAC AGA TTC CAC ATA GGA GATT GUTA /TCG C/CA AAC TAT AGG TTG 1100
Gln Tyg Asp Arg Phe H l^ He Gly Asn alu Lys Gln Asn Tyr Arg Leu
385 390 395 4 00
TCT TTA AAA GGT CAC ACT GGG ACA GCA GGA /ATT CAG AGC AGC CTG ATC 1108
Tyo Leu Lys ^ly His Thr Gly Thr Ala Gly Lys Gln Ssr Ssr Leu Ile
005 410 415
TTA AAG GGT GCT QAT TTC AGC ACT AAA GAT GCT GAT GATT GAC GACC TGT 119 <5
Ltu His Gly Ala Asp Phe Ser Thr Lys Asp Ala Asp Asn Asp Asn Cys
000 425 400
ATU Tic AAA TaT GCC CTC ATG TTA ACA C-GA a GA TGG TGG TTT GAT GCT 1134
Met Ays Lys Cys Ala Leu Mer Leu Thr Gly Gly Trp Trp Phe Asp Ala
035 440 405
TGT GGG CCC TCC ATT CTA /CAT GGA ATG TTC TAT ACT GCG GGA cena AAT 13 92
Tys Gly Pro Ser Asn Leu Asn Gly Met Phe Tyg Tl^jr Ala Gly Gln Asa
47^75
050
460
189 639
127
TAT CGA ACA ATG ACTT GGG AST 4CAG GCC CAC TTC TTC MASA. ttg CCC TCC 144 A
iss CUG Llg Atu Asn GUg lln Tag Top His TTG Phe Llg Cly Peo Str
405 410 475 480
GAC GTC TGT AGC TCC ACA ACT AAG ATT ATT CTA CCT TGT MAT ttt GGA 144 8
TGr Sto Lsu Arg Ses Thi TCh Met AuL Ilu Arg Pro Llu Asp Phe 485
490 495 (2) INFORMACJE O SEQ ID nr 26:
(i) CECHY SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 495 aminokwasów (B) TYP: aminokwas (C) ILOŚĆ ŁAŃCUCHÓW: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: białko (v) TYP FRAGMENTU: wewnętrzny (ix) CECHA:
(A) NAZWA/KLUCZ: 2N5C0F (chimera 4) (B) POŁOŻENIE: 1...895 (D) INNE INFORMACJE:
(xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID nr 26:
McL 1 Trp Gln Ile Val 5 hCs hhu Chr LeU Ses 0A Ctg Asp Llu Va1 Leu 15 AUa
AUi AUi Tyr Ass Asn sSs Arg L ys Sos Met As p Ser Ile Gly Ly s Oli
20 2A 30
GUn TGr Gln ΑΜΙ Gln ls A Gly S er CyG Ser Ty r TTg Phe Leu Lee i AO
35 40 45
TUu McL Ass Ass Mys Gss Ser S sr Ser Ser Pr o Tse Val Ser Ase A Aa
50 54 60
Vi1 Cln Asg Ass Ala lis Lee G lu Luu Asp Ph e SCG Ser AUn Lye t At-
128
189 639
Gis iss Luu U-Lus His 05 V^AS Met Glu Asn Tyr <00 Thr Gis Trp Leu Gin 95 Lus
Ltu Ulu Asn Tyr lit V^1 Glu Asn Me t Lys Ser Glu Met Ala Gin lls
100 U0 110
Gln GGe Gsn Ala Va Α- Gln Asn His Thr Ala Thr Met Leu GALu Ue Giy
220 125 112
Thp Set Leu Ltu εί! Gln Thr Ala Glu Gis Thp Asp Lys Leu Che G.sp
130 135 110
Va1 Glu GS Cr Gis Val Leu Asn Gln Thr Ser Arg Lue GGu Hi Gln Leu
25 5 110 1155 160
Leu Glu A sn Ser Leu Ser Thr Tyr Lys Leu GAL u Lys Gln Leu Leu Gln
154 705 175
Gln Thr Asn Giu lie Luu Lys lie His Giu Lys Asn Sur Leu Leu Glu
237 185 190
iss Lys lie Litu Glu Met Glu Gly Lys Hss Lys ilu Glu Leu Asp Thp
195 200 205
Ltu Lys Glu Glu Lys Glu Asn Leu Gln Gly Ltu V<al Thr Asp Gin Thr
210 2A15 220
Typ Ue I lit Gln (Aaj Leu Glu Lys Gln Leu Asn Arg Ala TAr AT itr Asn
225 230 2-33> 240
Csn Ser A Leu Gin Lys Gln Gln Leu Glu Leu Met Asp TAr Vi^l Hss
245 50 S 240
Csn Luu Val Asn Leu Cys Thr Lys Glu Gly Val Leu Luu Lys GGjl Giy
250 265 270
Lys Asp Glu Glu Glu Lys Pro Phe Gpg Csp Cys Gla Asp Vi1 Tcr Gln
574 280 285
Cla GGy Phe Asn Lys Sep Gly Ile Typ Thr lls Tyr Ile Asn Asn Mii
290 295 330
Pro Glu Pro Ly'S Lys Val Phe Cys Ast Met Asp Val Asn Gly Gly lly
189 639
129
305 310 315 320
Trp Thr Val Ile Gln 325 His Arg Glu Asp Gly Ser Leu Asp 330 Phe Gln 335 Arg
Gly Trp Lys Glu Tyr Lys Met Gly Phe Gly Asn Pro Ser Gly Glu Tyr
340 345 350
Trp Leu Gly Asn Glu Phe Ile Phe Ala Ue Thr Ser Gln Arg Gln Tyr
355 360 365
Met Leu Arg Ile Glu Leu Met Asp Trp Glu Gly Asn Arg Ala Tyr Ser
370 375 380
Gln Tyr Asp Arg Phe His He Gly Asn Glu Lys Gln Asn Tyr Arg Leu
385 390 395 400
Tyr Leu Lys Gly His Thr Gly Thr Ala Gly Lys Gln Ser Ser Leu Ue
405 410 415
Leu His Gly Ala Asp Phe Ser Thr Lys Asp Ala Asp Asn Asp Asn Cys
420 425 430
Met Cys Lys Cys Ala Leu Met Leu Thr Gly Gly Trp Trp Phe Asp Ala
435 440 445
Cys Gly Pro Ser Asn Leu Asn Gly Met Phe Tyr Thr Ala Gly Gln Asn
450 455 460
Hia Gly Lys Leu Asn Gly Ue Lys Trp His Tyr Phe Lys Gly Pro Ser
465 470 415 480
Tyr Ser Leu Arg Ser Thr Thr Met Met Ue Arg Pro Leu Asp Phe
485 490 495 (2) INFORMACJE O SEQ ID nr 27:
(l) CECHY SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 47 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) ILOŚĆ ŁAŃCUCHÓW: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa
130
189 639 (11) TYP CCZSTECCKI: DNA (ix) CECHA:
(A) NACNA/KLUCC: hTL4atg (B) POŁOŻENIE: 1...47 (D) INNE INFORMACJE: Primer PCR (A) NACWA/KLUCC: Inne (B) POŁOŻENIE: 1...20 (D) INNE INFORMACJE: Sekwencje „ogonka dodane do primera PCR w celu ułatwienia kloningu powielonych fragmentów PCR (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID nr 27:
GESTGETATC TEGAGEEAEE ATGETErCEE AGETAGCEAr GCTGEAG (2) INFORMACJE O SEQ ID nr 28:
(i) CECHY SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 55 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) ILOŚĆ ŁAŃCUCHÓW: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP EZĄSTEEZZI: DNA (ix) CECHA:
(A) NAZWA/KLUCZ: hTL4not (B) POŁOŻENIE: 1...55 (D) INNE INFORMACJE: Primer PCR (A) NAZWA/ZLUEC: Inne (B) POŁOŻENIE: 1...28 (D) INNE INFORMACJE: Sekwencja „ogonka dodana do primera PCR w celu ułatwienia kloningu powielonych fragmentów PCR (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID nr 28:
189 639
131
GTGTCGAEGC GGCCGCrCTA GA^AGAC^ AGATGrCEAA AUCCG^^ A^AT 55
Wskazania, odnoszące się do złożonego drobnoustroju (PCT reguła 13 iis)
A. Wskazania uczynione poniżej odnoszą się do drobnoustrojów przytaczanych w opisie na stronie 102 , wiersze 5-19
B. Identyfikacja depozytu Dalsze depozyty x identyfikuje się na dodatkowych arkuszach
Nazwa instytucji depozytariuszowej Amerykańska kolekcja typów kultur
Adres instytucji depozytanuszowej (włączając kod pocztowy i kraj) 12301 Parklawn Drive Ros^iIIs, Maryland 20852 U.S.A.
Data złożenia 7 października 1994 Numer dostępu 75910
C. Dodatkowe wskazania Tę informację kontynuuje się (zostaw formularz jeśli na dodatkowym arkuszu nieodpowiedni)
Cgłaszający życzą soiie żeiy, dopóki wzmiankowanej publikacji nie przyzna się statusu eupropsjnkasgo opisu patentowego, lui do daty, w której zgłoszenie zostanie odrzucone lui wycofane lui uznane za wycofane, depozyt iędzie dostępny jak przewiduje reguła 28(3) Jmplementarg Rsgulαtaknnurdsr the Europsαr Patent Co^ent-ion, tylko przez ujawnienie próiki ekspertowi wymienionemu przez osoię, potrzeiującą próikę (Reguła 28(4) przepisów uzupełniających ).
132
189 639
Formularz PCT/RO/134 (Lipiec 1992)
189 639
133
Att. Dkt. Nr - Nr zgłoszenia międzynarodowego: Data złożenia międzynarodowego: Tytuł: FEG 333-PCT JESZCZE NIE ZNANY ZŁOŻONA Z NINIEJSZYMI NOWE MODYFIKOWANE LIGANDY
Strona uzupełniająca do części B formularza PCT/RO/134
Identyfikacja dodatkowych depozytów - Oprócz depozytu zaznaczonego na załączonym formularzu PCT/RO/134, zgłaszający określa następujące depozyty wykonane dla Amerykańskiej Kolekcji Typów Kultur, 12301 Parklawn Drive, Rockville, MD 20852, U.S.A. Oraz proszą, aby były one także dostępne tylko przez ujawnienie próbki ekspertowi wyznaczonemu przez osobę proszącą, jak zaznaczono na załączo-
nym formularzu: Data depozytu 7 październik 1994 26 październik 1994 9 grudzień 1994 2 lipca 1996 Numer dostępu VR2484 75928 75*6(53 90895
134
189 639
Fig.1 A.
r EHK-1 ecto/h IgGl Fc Gelfoam (6ug)
Fig.lB.
r TIE-2 ecto/h lgG1 Fc Gelfoam (6ug)
189 639
135
Fig.2.
136
189 639 —43340 Rend
. —39000 Hindin —36590 BamHl —34740 Smal 33670 BglD 33g10 Bgin
32710 EooRl
tn CD i3 o X u
00 _Ó) Ll ni tn XJ
σι
32470 Hindin
-30500 BamHl /29500 Xhol 29240 Sali '28750 Sali >—27620 Smal
23970 BamHl I— 23130 Hindm =r22430 BglU '22350 BamHl
19400 Smal ł—18560 Kpnl Ί7050 Kpnl
Z-X — 11930 Pvul
0—2 u- zul cn #<
-O ω
5-=1 e£
Ξ— 5510 Barn HI
4—420 Bgl U
189 639
137
Fig.4.
10 20 10 40 50 £0 • 70 eo
cagctcactcacozaocctccatcctcaa<xctcacacagagagcaaacaataaatctcacctactatccaataaatatc
so 100 • 110 « 120 • 130 140 ISO 160
TCAACTTTTAACGAACAAAAACATCATTGCACTCAAATAAAAAATTTTAAAATTTrACAACAAACCTAACAAATGOCTAC
170 ieo • 190 • 200 • 210 220 230 • 240
TTTIvrATUATIvlTvrrcAAAĘA^TTŁCTTTCAGGQ©SAAA£ASTCAAAGAAAGAAGCAGTTrTAOęTuAAATAAAGAA
2S0 260 270 280 290 300 110
«
CTACTTTTACACG7CACAACAAACGACCAACTTTTGOGACACGCACOGAACGACTGTCCTOOCACTACA ATC ACA
« T>
320 330 340 ISO 160 170
* « « «
GTT TTC CTT TOC TTT GCT TTC CTC CCT GCC ATT CTC ACT CAC ATA OOG TGC ACC AAT CAC
V F L S F A Γ L A A Z L T K 1 c S H o>
380 190 400 410 420 430
W
CGC CGA ACT CCA CAA AAC ACT GOC ACA ACA TAT AAC CGG ATT CAA CAT GGG CAA TGT GCC
R R S P ε H S G R R Y H R Z G K c G C A>
440 450 460 470 480 490
TAC ACT TTC ATT CTT CCA GAA CAC CAT CGC AAC TCT CGT CAC ACT ACG ACA GAC CAC TAC
Y T F I L F ε H O G M C R ε S T T O O Υ»
500 SIO S20 SIO S40 SSO
« * »
AAC ACA AAC OCT CTC CAC ACA GAT GCT CCA CAC CTC CAA CCG GAT TTC TCT TCC CAC AAA
N T H A L Q R D A P Η V ε P 0 F S s o
S60 570 seo 590 600 610
« « «
CTT CAA CAT CTG GAA CAT GTC ATC GAA AAT TAT ACT CAC TOG CTC CAA AAA CTT CAC AAT
b Q H L ε K V η ε H Y T Q W Ł 0 X l ε N>
620 630 640 6S0 660 670
« « «
TAC ATT GTC GAA AAC ATC AM3 TOG CAC ATC OdC CAG ATA CAC CAC AAT GCA GTT CAC AAC
Y I V ε H H X s ε H A 0 X G <} K A V Q M>
680 690 700 710 720 730
«
CAC ACG GCT ACC ATC CTC CM ATA GGA MOC ACC CTC CTC TCT CAC ACT OCA CAC CAC ACC
Η T A T K L ε Z G T S b L s <1 T A e o T>
740 7SO- 760 no 780 790
« «
AGA AAC CTC ACA CAT GIT GAC ACC CMS GTA CTA AAT CAA ACT TCT CGA CTT CMS ATA OC
R X b T o V E T o V b H G τ s R Ł ε x Q>
800 810 820 830 840 8S0
« «
CTG CTC GAC AAT TCA TTA TCC ACC TAC AAC CTA GAC AAC CAA CTT CTT CAA CAC ACA AAT
L . C ε M s b s T Y K ϋ ε K Q C b Q G T H>
860 870 880 890 900 910
« «
GAA ATC TTG AAC ATC CAT GAA AAA AAC ACT TTA TTA GAA CAT AAA KIC TTA GAA ATC GAA
ε Z c K I H ε X N s b L ε H X I b Ε K E>
920 930 940 950 960 970
« «
GGA AAA CAC AAC GAA CAC TTC CAC ACC TTA AAC GAA GAC AAA CAC AAC CTT CAA GGC TTC
C K K X ε ε b D T L κ ε ε X E H L G C u>
980 990 1000 1010 1020 1030
« *
err act CCT CAA ACA TAT ΜΛ ATC CAC GAC CTC GAA AAG CAA TTA AAC ACA CCT ACC ACC
ν T R G T Y X I O ε b ε Κ o V H ft A T T>
1040 10S0 1080 1070 1060 1090
AAC AAC AGT CTC CTT CaC AAC CAG CAA ero GAC CTC ATS GAC ACA CTC CAC AAC CTT CTC
K H S V L Q X O O b E b Η O T V H N L v>
138
189 639
Fig.4. (Kont.)
1100 1110 1120 1110 1140 1150
AAT CTT TCC ACT AAA GAA CCT CTT TTA CTA AAG GGA GGA AAA AGA GAG GAA GAG AAA CCA
N L c T K ε c V L L X G c K R ε ε ε k P>
1160 1170 1180 1190 1200 1210
TTT AGA GAC TCT CCA CAT CTA TAT CAA CCT CCT TTT AAT AAA AGT GGA ATC TAC ACT ATT
r r 0 c A 0 V Y 0 A C F N X 5 C I Y T x>
1220 1210 1240 1250 1260 1270
TAT ATT AAT AAT ATC CCA GAA CCC AAA AAG CTC TTT TCC AAT ATC GAT CTC AAT OOG CGA
Y I H N M P ε R X X V F c Η H O V N C C>
1280 1290 uoo 1110 1120 1110
4
CGT TCC ACT CTA ATA CAA CAT CCT CAA GAT GGA AGT CTA CAT TTC CAA AGA CCC TOC AAG
G W T V I <5 H a ε D c s L D F G R c w X>
1240 1250 1160 1170 1180 1190
GAA TAT AAA ATC OCT TTT GGA AAT CCC TCC CCT GAA TAT TCC CTC GCG AAT GAG TTT ATT
ε y X M C f c Μ P S C F. Y W L C M £ F
1400 14)0 1420 1410 1440 1450
TTT CCC ATT ACC ACT CAC AGC CAG TAG ATG CTA AGA ATT GAC TTA ATC CAC TCG GAA αχ
r a 1 T 5 0 R 0 Y M L R : ε t H O w ε G>
1460 wio 1480 1490 1500 1510
AAC CCA ccc TAT TCA CAC TAT GAC AGA TTC CAC ATA CGA AAT GAA AAC CAA ΑΧ TAT AGC
P R A Y 5 0 Y D R F Η I G u ε K 0 Η V F·.
1520 1510 1540 1550 1560 1570
TTG TAT TTA AAA GCT CAC ACT CCG ACA GCA CGA AAA CAG ACC ACC CTC ATC TTA CAC GCT
L Y L X C K T G T A G K 0 s s L 1 L H G>
1580 1590 1600 1610 1620 UJO
CCT CAT TTC AGC ACT AAA GAT CCT CAT AAT GAC AAC TCT ATC TCC AAA TCT GCC CTC ATC
A D F S T X D A D W D N C H C X C A L k>
1640 1650 1660 1670 1680 1690
TTA ACA GGA CGA ICC TCC TTT CAT CCT TCT DCC CCC TCC AAT CTA AAT CGA ATC TTC TAT
C. T G G W W F 0 A c C t> s N U N c H F Y>
1700 1710 1720 1730 1740 1750
ACT CCG CCA CAA AAC CAT GCA AAA CTC AAT COG ATA AAG TOC CAC TAC TTC AAA GGG ccc
τ a G 0 N K G K L H C 1 K W H Y F X c P>
1760 1770 1780 1790 IBOO 1810
AGT TAC TCC TTA CCT TCC ACA ACT ATC ATC ATT CGA CCT TTA CAT TTT TCA AAG CCCAATCT
S Y s L R s T Τ M H 1 R P U O F
1820 1810 1840 1850 1860 1870 1880 1890
*
CAGAAOTCATTATTLMAOCAACAAAGAAATCCCCAGAAGCTTZ?CAOCTGACAAACTCTTTCAAAACTTCAGAAGCAAACA
1100 1910 1920 1910 1910 1950 1950 1910
ATATTCTCTCCCTICtACGlATAAGTGCTACTTATCTGAACTCACCAAGCTTCTTCACCCTCAATCTCGAGCCGTTTGAC
1980 1990 2000 2010 2020 • 2020 2040 2050
TTCACAACACTCTTTCACTTOGGCTCACACTar7A-AU\.iWX7l\^(7rATAGAAAA6.^^CTUAGTVTCGGGCTrrAAAA
7060 2070 20B0 2090 2100 2110 2120 21)0
4GOCAAGAAACTCCTCAGCTTGCTCTCCTTCAAACTACTACTCGACCTTATTTTCCAACTA'ICCT‘ACCCAGATGATAAAT
2140
AT0CTTAATT7C
189 639
139
Fig.5.
20 30 40 $0 60 10 BO • · ··»· ··
CACCny2TTCAeXAOCCTCCATCCTGAACantXLACA4yOOCAA>CAATAAATCTCACCTACTATCCAATAAATATC
100 110 120 no 160 ISO 160 «····« · «
TCAACTTTTAA2XAACAAAAACATCATTGCACTGAAATAAAAAATTTTAAAAT7TrACAACAAAJGCTAACAAATQ3CTAC
170 ISO 130 200 210 220 210 240 • · 8 · « » ·· rrnxrrATT»TTCTTCTrcAAwxcrTTcrrrc*i3ooraju«Krrouuw2kAAiiAMX>crmAccTCAAATAAACAA
2S0 260 270 280 230 300 310
...... ·
CTAnTTTTAGACGTCACAA£AAAGGA£CAACTTTTGCd£AOGCA£X3GAAGGACTCTQCTOGCACTACA ATC ACA H T>
320 3 30 340 350 360 • 370
GTT TTC CTT TCC TTT OCT TTC CTC CCT CCC ATT CTC ACT CAC ATA GOC TCC AGC AAT CAG
v r L s f A F Ł. λ A 1 U T H I C C S W 0>
380 330 400 410 4 20 430
COC CCA ACT CCA CAA AAC ACT GCC ACA AGA TAT AAC CGC ATT CAA CAT GOC CAA TCT GCC
P P 5 P ε N e C B A * i! P 1 O K G 0 c Ki
440 450 460 470 480 490
TAC ACT TTC ATT CTT CCA CAA CAC CAT GCC AAC TCT CCT GAC ACT ACG ACA CAC CAC TAC
Y T F I L P ε H O G N C R ε 2 T T D 0 Y>
S00 SIO 520 530 540 t S50
AAC ACA AAC GCT CTC CAC AGA CAT CCT CCA CAC CTC GAA CGC GAT TTC TCT TCC CAC AAA
Η T W A L 0 R 0 A P Μ V ε P O F S S 0 k>
56C 570 seo 590 600 610
CTT CAA CAT CTC CAA CAT CTC ATC CAA AAT TAT ACT CAG TCG CTC CAA AAA CTT CAC AAT
v 0 H ε H V μ ε N Y T <2 W U 0 X U Ł
620 630 640 650 660 670
TAC ATT CTC GAA AAC ATC AAG TCC CAG ATC OCC CAC ATA CAG C/G AAT CCA CTT CAC AAC
Y I V ε U H X s ε H A 0 I 0 0 N A V o h>
680 690 700 710 720 • 7)0
CAC ACC GCT AOC ATC CTC GAC ATA CCA ACC ACC CTC CTC TCT CAG ACT CCA CAC CAC ACC
H T A T K L ε 1 G τ S L t s 0 T A E 0 T>
740 750 760 770 780 790
ACA AAC CTC ACA CAT GTT GAC ACC CAC CTA CTA AAT CAA ACT TCT CGA CTT CAC ATA OG
R * L T 0 V ε T 0 V L N Q T S R L Ε I Q>
aoo 910 20 8)0 840 850
CTC CTC CAC AAT TCA TTA TCC ACC TAC AAG CTA CAC AAG CAA CTT CTT CAA CAC ACA AAT
t L ε H S L s T Y K i. ε R 0 U L 0 0 T N>
860 70 880 990 900 910
GAA ATC TTC AAC ATC CAT GAA AAA AAC AGT TTA TTA GAA CAT ΑΛΑ ATC TTA CAA ATC GAA
ε i U R 1 H ε K N S U U ε H K 1 L ε m ε>
920 930 940 955 960 970
GGA AAA CAC AAC CAA GAC TTC CAC ACC TTA AAC CAA CAC AAA CAG AAC CTT CAA CCC TTC
C X H k ε £ L O T L t ε X ε Ιί L 0 c
980 990 1000 1010 1020 10)0
GTT ACT CCT CAA ACA TAT ATA ATC CAC CAC CTC CAA AAC CAA ΤΓΑ AAC CCT ATC ACC
v T R O T r J i o ε L l ł 0 w t. R A T T?
10(0 1050 1060 1070 1060 1090
AAC AAC ACT ctc CTT CAC AAC CAC CAA CTC CAG CTC ATC CAC ACA CTC CAC AAC CTT CTC
II H s V u O K 0 0 L e ε K O T V M 1· L v>
140
189 639
Fig.5. (kont.)
1100 AAT CTT TCC 1110 « ACT AAA T K 1120 • CAA GTT TTA CTA AAC 11)0 • CGA CCA C C 1140 AAA ACA CAC CAA ε 11S0 « GAG AAA CCA TTT
N L C ε V L L K K r ε ε K P F>
1160 • 1170 « 1180 1190 1200 • 1210 «
AGA CAC TCT GCA CAT CTA TAT CAA CCT CCT TTT AAT AAA ACT CGA ATC TAC ACT ATT TAT
R 0 c A 0 V Y 0 A c F H K S G I Y T 1 Y>
1220 1230 1240 12S0 1260 1270
* « «
ATT AAT AAT ATS CCA CAA <XC AAA AAC CTC TTT TCC AAT ATG GAT CTC AAT COG GGA GGT
I M M K P ε P K K V F C M K D V H G C G>
1280 1290 1300 1310 1320 1)30
«
TOS ACT CTA ATA CAA CAT CCT CAA GAT CGA ACT CTA CAT TTC CAA ACA OOC TOG AAG CAA
W T V I 0 H R ε o c S L O F Q R C W K E>
1)40 1JS0 1360 1370 1380 1390
« «
TAT AAA ATO CCT ΠΤ CGA AAT CCC TCC GGT CAA TAT TOG CTC OOG AAT CAG ΤΓΓ ATT TTT
Y K K C F C H P s C ε y W L C H ε F I F>
1400 1410 1420 1430 1440 1450
«
CCC ATT ACC ACT CAC ACC CAG TAC ATG CTA ACA ATT CAG TTA ATG CAC TOG CAA COG AAC
λ I T s 0 R 0 Y M Ł R X ε L M 0 W ε c Κ»
1460 1470 • 1480 1490 1500 1510 «
CCA CCC TAT TCA CAC TAT CAC ACA TTC CAC ΑΤΑ OGA AAT CAA ANS CAA AAC TAT ACG TTG
R A Y s 0 Y 0 R F H I G H ε κ 0 H Y R L>
1520 1530 1540 ISSO 1560 1570
« « * «
TAT TTA AAA CCT CSC ACT CGG ACA CCA CGA AAA CAC ACC ACC CTC ATC TTA CAC CCT CCT
Y U K C K τ C T A C K 0 S S V I L K c A>
1580 IS90 1600 1610 1620 1630
« «
CAT TTC ACC ACT AAA CAT CCT CAT AAT CAC AAC TCT ATG TCC AAA TCT OOC CTC ATG TTA
O F s T K 0 A O H O H C H C R c Λ V H
1640 1650 1660 1670 1680 1690
*
ACA CGA CCA TOG TOG TTT CAT CCT TCT OOC CCC TCC AAT CTA AAT CGA ATG TTC TAT ACT
T C c W w F 0 A C C P s K V H c K F Y T>
1700 1710 1720 1730 1740 1750
« « «
COS OSA CAA AAC CATOGA AAA CTC AAT COO ATA ANS TOG CAC TAC TTC AAA COO COC ACT
A C N H C . K Ł M C X K W K Y F R C P s>
1760 1770 »760 1790 1800 1610
* «
TAC TCC TTA CCT TCC ACA ACT ATG ATG ATT CCA CCT TTA CAT TTT TGA AACOOCAATGTCACAA
Y s (. R S T T K K 1 R P C O F ·>
to 18)0 . 1840 1650 1860 1870 1880 • 1890
CCGATCATGAAAGCAACAAACAAATCOCGAGAACCTGOCACCTGAGAAACTGTtTGAAAACTTCAGAAGCAAACAATATT (900 1910 1920 19)0 1940 1990 1960 1990 ·«·· « ·«· CTCTCCCTrCTAGCAATAAGTCCTAGTTATCTCAACTCACCAACGTTCTTGACOCTOAATCTOOACCCCTTTCACTrCAC
1960 1990 2000 2010 2020 20)0 2040 2050 ·«·· w ··«
AACAGTCTCTACTTGGOCTCACACTGCTCACGTOGCTOGACTATAGAAAACTCCACTGACICTCOGOCTTTAAAAACOCA
2060 2070 2080 2090 2(00 2110 2120 2 00
ACAAACTCCTGACCI IM. IC IU- I ICAAACTACTACTOCACCTTAł' 1 rTCCAACTATOCTACCCAGATGATAAATATGCT
2140
TAATTTC
189 639
141
FIG. 6.
>0 20 30 40 SO 60 70 80
GAATTtVTVA»M4 ίυυινι AiAlVrcCTCCCAGCCTTCAXGAG0GAACAACACTUAAWA-łVlVW3CAiiM»A<A>AAUAAA
90 100 110 120 130 140 ISO 160
* « « * « *
GGACCGTCAAAGCTGCTCroTAAAAGCTGACACAGOOCTCOCAAGTGAOCMGACTGTrCTrOOCACTCCAATCrGACAG
no 180 4 190 • 200 « 210 « 220 • 230 « 240
250 260 270 280 290 300 310 320
AQGGAOOCAGCCA7GGCAGOGTAGCAGCOCTGOClTTCMAOQGCAGCAGCTOGGGACTCTGGACGTCTCTnGCCClCA
330 340 350 360 370 380
AGTTTCCTAMCTGCTGGTTTATTACTCAAGAAAGA ATC TCG CAG ATT CTT TTC TTT ACT CTC AGC TGT
K w G 1 V F F T L s C>
390 400 410 420 430 «0
4 4 «
GAT CTT CTC TTC GOC GCA GOC TAT AAC AAC TTT CGG AAG MC ATC GAC AGC ATA GGA AM
O C V c A A A Y N N F R X s K O S I G X>
4S0 460 470 480 490 500
4 4
AAC CAA TAT CAG CTC CM CAT GGG TOC TOC AOC TAC ACT TTC CTC CTC CCA GAG ATC GAC
X Q Y <ł V 0 H c s c s Y T F Ł L P ε M O>
510 520 S30 540 SSO S60
Λ * 4 « «
AAC TCC CGC TCT TOC TOC AGC CCC TAC GTC TCC AAT GCT GTC CAG AGG GAC GCG CCG CTC
N C R S s s S P Y V s N A V O R O A P L>
570 580 590 600 610 620
* 4
GAA TAC GAT GAC TOG CTC CM MG CTC CAA GTC CTC GAG AAC ATC ATC GAA AAC AAC ACT
ε Y D O s V G R Ł O V L ε M I H ε H N T>
630 640 6S0 660 €70 680
« 4 4 4
CAG TOC CTA ATC AM CTT GAG AAT TAT ATC CAG GAC AAC ATC AAG AAA GAA ATC GTA GAG
Q W Ł M X l. ε N Y I G O N M X X E M V E>
690 700 710 720 730 740
4 4 4 4
ATA CAG CMS AAT GCA GTA CAG MS CM ACG GCT GTC ATC ATA GAA ATA GGG ACA AAC CTC
X 0 G M A V Q N O T Ą V Η X E X G T H L>
750 760 770 780 790 800
« « « 4 4
TTO AAG CAA ACA GCT GM CAA ACG 093 AM TTA ACT GAT GTG GAA GOC CAA GTA TCA AAT
L W Q T A E 0 T R X L T O V E A V L N>
810 820 830 840 850 860
4 4 4 4 «
CAG AOC ACG AGA CTT GAA CTT CAG CTC TTG GAA CAC TOC CTC TOC ACA AAC AAA TTC GAA
T T R ε L Q t L E H S Ł. s T H K U ε>
870 880 890 900 910 920
4 4 4
AAA CNS ATT -TTC GAC CM ACC AGT GAA ATA AAC AAA TTC CAA CAT AAC AAC ACT TTC CTA
X 0 1 L O Q T S ε · I M X L Q O X H s F L>
930 940 9S0 960 970 980
4 4 4
CAA AAC AAG CTC CTA on ATG CAA GAC AAC CAC ATC ATC CAA CIA CAG TCA ATA AAA GAA
ε K X V L A H ε D · K W I Ϊ Q L Q S X K ε>
990 1000 1010 1020 1030 1040
CAC AAA GA+ CAG CTA CAG CTC TTA‘CTA TOC AAC CAA AAT TCC ATC ATT CAA CAA CTA CAA
ε K O Q G C V C V S K O H S X I ε ε L ε>
1O5O 1OGO 1070 1OGO 1090 1100
AAA AAA ATA GTC ACT CCC ACC CTC AAT AAT TCA CTT CTT CAA. AAS CNS CAA CAT CAT CTC
K K X V T A T V H M S V L· Q K Q <3 H O L>
142
189 639
Fig.6. (kont.)
1110 1120 1130 1140 11S0 60 ··««*«
ATG GAG ACA CTT AAT AAC TTA CTG ACT ATG ATG TCC ACA TCA AAC TCA CCT AAG CAC CCC
H ε T v N N L L T Κ H s T s N S A K 0 P>
1170 1150 1190 1200 1210 « 1220
ACT GTT GCT AAA GAA GAA CAA ATC ACC TTC AGA CAC TCT GCT GAA GTA TTC AAA TCA GCA
T V A K ε ε Q I s F R O C A ε V F K s C>
1230 1240 1250 1260 1270 1280
« « * «
CAC AOC ACA AAT GOC ATC TAC AOG TTA ACA TTC CCT AAT TCT ACA GAA GAG ATC AAG GCC
H T Τ N G I Y T L T F F W S T ε E 1 X A>
1290 1300 1310 1320 1330 1340
« «
TAC TGT GAC ATS GAA GCT GGA GGA GGC GGG TOG ACA ATT ATT CAG CGA CGT CAG GAT GOC
Y C 0 M ε A G G G G V T I I R R ε 0 G>
1350 1360 1370 1380 1390 1400
« «
AGC CTT GAT TTT CAG AGG ACT TGG AAA GAA TAT AAA GTG CGA TTT GGT AAC CCT TCA GCA
S V 0 F 0 R T W X ε γ X V G F G H P S G>
1410 1420 1430 1440 1450 1460
«
GAA TAT TOG CTG GGA AAT CAC TTT CTT TOG CAA CTG ACT AAT CAG CAA OGC TAT CTG CTT
E Y W L G Ν E F V S 0 L Τ H 0 0 R Y V L>
1470 1480 1490 1S00 1510 1520
« «
AAA ATA CAC CTT AAA GAC TGG GAA GGG AAT GAG GCT TAC TCA TTG TAT GAA CAT TTC TAT
K I H L X D M ε C η ε A Y s G Y E H F Y>
1530 1540 1SŚÓ 1560 1S70 1580
« * «
CTC TCA AGT GAA GAA CTC AAT TAT AGG ATT CAC CTT AAA GGA CTT ACA GGG ACA GCC GGC
L S s ε ε C N Y R Z H L X C L T G T A c>
1590 1600 1610 1620 1630 1640
« « « «
AAA ATA AGC ACC ATC AGC CAA CCA GGA AAT CAT TTT AGC ACA AAG GAT GGA CAC AAC GAC
K Z S S I S Q P C H D F S T X O G D N O>
16S0 1660 1670 1680 1690 1700
« « « «
AAA TGT ATT TGC AAA TGT TCA CAA ATG CTA ACA GGA GGC TGG TGG TTT GAT GCA TGT GGT
X C z c X C S Q N L T G G W W F O A C G>
1710 1720 1730 1740 1750 1760
« «
CCT TOC AAC TTG AAC GGA ATG TAC TAT CCA CAG AGG CAG AAC ACA AAT AAG TTC AAC GGC
P S H L H O H Y Y P Q R Q H T Μ X F H G>
1770 1780 1790 1800 1810 1820
4 « *
ATT AAA TOG TAC TAC TGG AAA GOC TCA GOC TAT TOG CTC AAG GCC ACA ACC ATG ATG ATC
X K Μ Y Y Μ X o S G Y S L K A T T M K I>
1830 1840 1850 1860 1870 1880 1890 1900 • · ««·«««
CGA CCA GCA CAT TTC TAAACATGOCACTGCACCTCAGGAACTCTCTCGAACTATTTTCAAAGACTTAAGCCCAGT
R P A Q F>
1910 1920 1930 1940 1950 1960 1970 1980 ····«···
GCACTCAAAGTCACCGCTOOQCACTCTCTOCTCTTCX>CCAC>CA<XXXCTGTCCTCGGTOCTGACGGGACCCACATGCT
1990 2000 2010 2020 2030 2040 2050 2060 «··«·· · ·
CCAGATTAGAGCCnTrAAACTTTATCACTTAAACTTCCATCACTTAACOGACCAAACCAAGACCCTAAACATCCATAATT
2070 2080 2090 2100 2110 2120 2130 2140 • ··*·* * ·
CTGATIAGACAGAACACCTATOCAAAGATGAACCOGACGCTGAGAATCAGACTGACAGTTTACAGAOOCroCTGTCACAA
2150 2160 2170 2180 2190 2200 2210 2220 • « * · * · *
CCAACAATGTTATGTGCAAGTTTATCAGTAAATAACTCCAAAACAGAACACTTATCTTATACAATACAGATCATCTTGGA 2230 2240 2250 2260 2270 2280 actgcattcttctgaocactctttatacactgtgtaaataoccatatctoctgaattc
143
189 639
TIE2-R >
Fig.7.
Mock L1 L2
Fig.8.
x Mock 20 x 12 + +
0.1 X L1 0.1 X 11
TIE2-R >
144
189 639
Fig.9.
nie prowokowany x mock xTL1 xTL2 t
T
B
B i
B
B
0.1x TL1 +
0.2x TL.1 +
0.3x TL1 +
0.3x TL1 +
0.3x TL1 +
0.3x TL1 +
CM ci
OJ hQ- .2 — CO
0.9 x mock * x TL2
0.8 x mock xTL2
0.7 x mock x TL2
0.5 x mock x TL2
0.3 x mock ’ x TL2
0.15 x mock ” x TL2
189 639
145
Fig.10.
AKTYWNOŚĆ WIĄZANIA (RU) AKTYWOŚĆ WIĄZANIA (RU)
SHEP
146
189 639
AKTYWNOŚĆ WIĄZANIA (RU) AKTYWNOŚĆ WIĄZANIA (RU)
1600
hTL2 + hTIE2 hTL2+trkB
189 639
147
Fig.12.
Mock + TIE2-Fc o
LL
CM
UJ
H +
Ο
LL
I co
X cc l·I- Ι-
’ „ ·{' Λ -i \*Λ fis# Λ
V'r.M *U , fJ.,
< TIE2-RECEPTOR
148
189 639
Fig.13.
FL d14 5 całość
2 3 4
Ό 1
'C/3 JO O)
’ω υ Xi u. s
m in N in uj
i? £ ’Τ ł—
w* CO +
TJ TJ Λ tj ~
Κ- _J 00 5 —j “Y
ΙΧ. u_ LL O
II-ll-li-1 — 04 CO 'ί * Λ O t
I I » » *111
O O O O O o o o
C\l O TJ- r- OJ cn TT 'lil I r i I
O o o o o o o o
TL2
FLiwątroba płodu
189 639
149
Fig.14.
CC co O 04 O <
ir
OJ co i r i o o o 'C o
N
T3 &
1 + rr 10 CC CD O OJ O <
T- OJ co
I < 4
O O O
TL1
TL2
Grasica płodowa E17.5 aktyna
CDR1 + : Komórki korowe zrębu A2B5 + : Komórki rdzenia zrębu
150
189 639
Fig.15. ANGIOGENEZA
PROLIFERA-C-JA/.
MIGRACJA
ROZWÓJ
h H ffl α! ·κ Eh <3 w a W β <3 Of
RÓŻHŁCaWARISZ
STABILIZACJA
189 639
151
Fig.16.
3 4
152
189 639
410 420 430 440 450 460 470 480 •STKDg CNDkClCKCs gMLTOCWWFD AOCPSNtWGM yYpąrCWcnK fUGUCW/YwK GsgYSLkaTT HMIRPaDF
Fig. 17
189 639
153
Fig. 18.
KOWALENTNA MULTIMERYCZNA STRUKTURA TLI I TL2 I ICH WEWNęTRZNA PRZEMIANA PRZEZ MUTACJ? JEDNEJ CYSTEINY
TRIMER
DIMER
h-
CM _l
I-
*4 <4
% &
H H
W W
Eh Eh
tn tn
{* i*
U υ
1 +
▼— CM
u _J
1—
• «WftjjjjĘjąBii
\' '2*1-
TRIMER
DIMER
154
189 639
Fig.19.
Fig.20.
TL1-f-Fc ίηα/mh
189 639
155 ο *
V <Ν
Ó)
LL
Ο *
Ο β>
ο <
σι b
Ο «
CJ b
ο « r.
Γ»
S* δσ
8σ υ
οσ δσ υ
μ α υ
υ υ w μ
Ο
Ο tj
Ζ υ
υ μ
Η μ
Λ X < υ υ μ
Ζ υ
u n ζ θ . υ14 §<
π u
2u υ
μ < χ ζ
υ δ 55
8χ ζ
g£ = μ ϋ Λ υ gu υ
8*
8ο υ
ο * <Ν
Οι σ * w
Οι
1° ε* g>
ζ
Ο 6» Ο
16 Λ £*
8* h
υ
Ρ 0 μ
μ >
Ο
Ο υ b ο ♦ γ· ο « νβ ο «
ISI u
8ώ ζ
ο
Οι
Ο ο
ΟΧ
Λ o A u v>
g° ο « ιη
Sl·
8h il·
Sl· μ 8* σ « ο σι
8α ο
ο υ
8α u
ο , υ 4 υ μ >
μ μ μ Ζ « υ
Ζ κ
S* uq
8*
8α u
il· μ
μ μ μ
Μ ο il·
Ο * r· σι
Ο *
ΙΛ
ΟΙ
Η ί*
8Ρ μ
δ*
Κ>
ο μ
Ο U
Ο υ
Ο 0 ζ υμ ζ
μ < X ζ
μ
5>
8ο ο
υ υ Μ μ u X υ
8χ ζ
υ Η (4
Ο ϋ
Ρ ϋ
Η υ
«: ι □
8σ α
ο , £“·
8χ ζ
S* υ
Ο 0 ζ
δ ο υ
8ο ο
ο < ω ο
8χ υ
Λχ
Ρ
8α u
Ηα ρ
8*
Ο Ο Ο
Ρ o u υ
ζ ο ο ο ο ο u υ
Ζ
8α u , • n μ μ > ο υ
y p «<
υ o « o x μ υ rl
H*
O * 0 P > 0 P
O < 0 μ
οζ ο
ο ο
So o
o
V» <s
Ο*ϋ
O
0
P
Z <
U
0 0
Ζ <
8u υ
μ ί*
8α ρ
8η <
tfl ca o
8*
8x
U
Ο * ΡΙ ο «
C4 §“ g’ μ
z x z
μ o o a
μ μ u μ
μ
8U 2 u
V) ο* w
Ν
8α υ
χ υ
ο ο ο υ
ζ z U
8χ μ
ο μ
δ = δJ ζ ω ο « ο»
Ν ο * Οι ο
δ μ
υ u
ο ο
8'
Ο μ
υ χ u δζ ο
ο u
u
Ο 0 ζ
u
Ζ X ζ ο ,
Ζ X ζ υ _ υ χ υ υσ ο
Ρ ζ ο
ζ ο 0 μ
0 ζ
ρ ίΓ ο
r ο
= ζ
8>
ο μ
U 0 «>
ν>
χ μ
8, μ
8ο ο
δ ο ο
8*
8α ρ
u ζ u
μ ο ρ μ ο» m
Ο«
Η
Ι' ζ ο u υ
ζ υ
8χ ο * ο Ν U l·
8“ σ
Μ < < σ υ
8χ υ
tg Ul
156
189 639 ο
45*
W
2$ u
< Ό
U
Sc o
a o
ο «
ΓΊ ον ty ty *ty □ * ο ο , SM
U A *sw ty ty ty
CM ό
LL
Ο π
Οι
w > w r·» H 0 & 2 O 2 H o
O U o « < N
Q o « u 0 rt
O Ł Ol rt u h q
0 * 2 o rt 0
rt rt 0
S a δ rt X *k «W O * 0 A
« rt rt 0
o o*<J σ ł δ6* o * o o § X rt > O rt 0 śx 9
ri «0 O σ £k rt 2 X 0 0*00 * a> V» N rt
O < * Λ o < 0
o rt o
o < 0*0 rt r.
* fi Λ
H gO a
υ k
Ο
S
Ο υ μ
Η
Η < X υ
o 0 α;
O ' Ol rt o « o
rt o « r* r* %
u «
β μ < : X
U < ' O s: o
δ1 υ
ί: rt
8' ο β' υ < 1
8<
υ ο
u ι <
ο » rt
Οι ο + 01 α>
o « «a o
ty ο
υ μ k
k
Η >
U
Ο υ β< u ty
S ° <Q o
σ\ «Λ
O « O σι s
u o
υ u
u k
k rt σ>
ty ty
2, u*3
U ty ty o « V>
Ol
O
Ol ty sw ty s k k
a>
f.
o α u
υ y oj ty
S X
X s>
§” o
υ « k x u
Sx ty o
το
O
V o
w o «{ u
0 rt
< w 0 U O
0 * κ N
O
0*0 υ Λ w
«λ u rt < o
03 0
o o u
So <3
O
Λ U U
U <Sz
So u
υ k « <
Kj υ
8« o
i k O o o
-8° !e o (3 > β k <4
Su u
I o k X <
So > υ
O , ' k U k a>
υ o * 0 rt *4 rt
O <
O u
ω ϋ
S z <
u u o 0 0 o * O* o * rt »4 «4
O * rt
SJ ty
S X u
Su o
S“ <t □ o o* k
Z
X k
U O
O k
k U k
k
O U O
Su o
rf < X <
ty < u 0 < ω o
X rt o
rt
So δ
£u
Su u
S o u
υ k h <
u
U W * rt
U o
rt
N
O * rt
N
N rt
O *
O rt
So
O a x υ
υ o o o
Λ
Λ U O x
k
So
U < X o au β
<d < u o g>
8x u
il· il· o · <S
FV o
w rt rt
O * rt o *
Ol rt « o k
U 0» u « β X u a j u
o u w
X o
<e z < o < X < o
8‘
8o u
<<
u δ υ» rt rt
O 0 ·· o
SM u
s*
S o u ty ty k
U M k
ty o * rt o * rt
V o ♦
Ol rt
O* ty ty
5 rt
8x rt
O 0 <
O o o
rt
U 0 rt o
So u
υ <
o δ υ k
ty ty α k $Q
U ty s
u
2x
Ss
So u
o * ff>
H
u O 9 * o
i k « Λ O 9 y rt
9 * k 0 m <
Ol rt
rt υ O u
rt u < O X y 0
o 2 * <
o o«y o
* u k r- < u k u.
< M 0 k
189 639
157
CM cp
Ll
ί &
u * o « < O 4 o
p , o u o Q
r* u © 2
4 μ U r4 i •4 2
μ < O
O 4 8 « P
< > o 4 O o E
μ o μ P o
U < < h
© * •4 β
•4 < x O * o o « o
Ul o « y Ol •e Ol H
«4 o < Ό < (J
o w p *4
p X «: 3 o
4 μ o « K
υ O
p o « < η (j
O Λ oi o U
U V) p < O
w
O ε O 4 O o 0
O * μ w 4 0 » 4 09 rt
o < y © O r- 2c
Ul o 0 •4 t4 *4 <
•4 <e h O
o ° 3 « U « s
o W l··
o « •t < o
* I* o u (J o
i 2 v> < μ H
< w υ O * υ O O
u A f* o μ O
μ w « U * © p > o
O · < β «•4 0 *4 k-»
Ο» O z o
V O « u « o
•at υ < υ (4
< u υ μ
o <
9 - o « P H <
« F* o U
u Ul 0 o 4 o O « <
»4 14 < 14 o
o , o \3 o μ H
H X «4 μ W O K
μ « *7
4 <c 4 μ
© » y <
© < X υ B> o
V 0 υ < h
»4 o υ O
< ° O * o m © 4 o o * μ
« o © «c Ul u Ul o μ
Ul © 6 μ o O
f* W P W μ *4 o o
Λ 2 w o υ <
o u 4 u « P « O
u ί- μ
μ « <3 o ο s
O < fc 5* h X p H Q
μ o < e O o
V
<5 vj O o « μ O « O o * p
H X V u u V μ
μ O < < 10 0 μ S <B o
VI «4 u •4 o •4 o
« μ VI U < o o
< > *4 U Bi « o « o « μ
μ 0 p P 2
μ o <
O < O o o
o « < > ί- 4 % H μ o
Ό O 4 O O 4 o © F o
V ο O n μ n H n u
r* μ w 52 O 10 δ μ h © α
< Q «: f4 eC r4 o
u < o
O O « o « μ « o 4 μ
« 52 ° «r X o X 2
o Ul o O < O
H < o O
μ 4 X K J υ *5 μ
« o O * o O « μ O o
U Γ* υ Γ4 μ <4 o μ
O * © «< r* 4* ©
v> μ u o W •4 3 w W 5
•V O μ p O o
W * μ « μ « μ
y - O υ O o
** O « < μ O O
« < n P μ p o
o Ul << o o
«4 o
o <0 υ VJ O 4 Q O « o O 4 o
ί- < «4 Q »4 H «4 μ
ο io O μ © μ
4 o w v4 O »4 μ
O « fc o ft> u O O μ
V o o 4 < « 4
V o μ μ o
•4 o p k* <
52 ° o o O O μ
o O « o U O <<
Γ4
VI
158
189 639
A A A A A
o Cd ω 1 1 o ri
co o 1 p
u t 1 Φ «ri o
> > 1 | »<
ri 1 1 > iSr X u
X Ό Φ
ri a a. s
— in < 1 1 i « 1 1 1 1 S X
o 1 1 O ίΓΪ
r- U ri ri ri ri ri H
O * » «ri Cf
K « * «
o X
ri > >
</} ri ri rt ri «j
5d * * · · ·
IS) AJ AJ AJ · · <4 C R £ « » o ϋ >, X · ♦ · »J t l >. £ >
o* σ σ >, s w «Ο *o · i i uuuu * ·
#-» * r>
AJ AJ AJ
*
Ό Ό *0 <0
U U M U
*
4> Φ 43 4>
rt ri ri ri ri
TT U VI VI 3^ Η Η H .
K AJ U << tt M u
A 41 O« U * u
O k3 C tn o 41 VI H V}
o 2 u μ μ v»
«r < AJ AJ AJ AJ AJ
»ri O
ri • rl •ri • ri >ri •ri
2 41 41 4> 41
u « «ri •ri
s
H « « >
W ri ri ri ri ri
b
.ΑΛΑΛΑ
4····· - φ φ φ <j φ tr tr tr ό 4» •ri ·Η ‘ri ’ri «ri •ri ·Η ·Η »ri
O >t >,U-» tt tt H · W ♦ V» C o · · · ·
X U U Μ X
O AJ U W tt «4 o p > > > > >
«*1 »4 · · · · · <M w tn « Oi >
x tr tr σ o* t?
»□♦·«·· O C C C 4) · w · · · Ό *U tc X X x Ai
X Φ 0> V o* V (4 · · . · ·
O O X X x x X fi:
I
Jj
U tn tn o W *a Ό
Q I » · · ·
Oj X O-Λ U g W « · · * ·
O«.....
ϊ> «ri W «ri «-( «-4 J> ·Η »ri »ri M r-4 «4 h > H ri Q C σ · σ · < ·Η σ · > > ri ri C U .4 .ri O (¼ ri» H X
U) 4Q X) ri β : o · κ r λ /: c jz « tr tr σ tr a* > -ri ·Η -ri · · • · A tt o > « <n u e ri K U
V) · « · X X
PS -M X X 3 X *4 e ε g e e %·««·· > <t il <u Ό Ό x > > > σ' o· έ Ε ε S <u t>
«ri «ri Μ M Vk W Μ M • « · »
XXX X <V ftł fi Ό ’ Λ Λ ♦ * ο σ u ρ m χ c G μ > «Μ Ο μ U cd » * « U ο ·
Ο V» < C (4 U Μ Μ 2 • « » 4
Μ · AJ «Η • α μ μ • · Xł *ο
O VI !fSi u X d s
V σ o· σ e e ο ο. · ν υ w ed ·
X U σ *
C 12 AJ ć 5 g U-S-K • *4 U4
EC c M C < o υ υ χ χ X Cn tn r? n t* < » *£ tt «
O << ·Η >H U . · «4 «4 JZ JZ «ri . .
U rg -ri > *>
»-3 · rt · .
»4 *ri « ri *σ Ό [J - υ o 2 o 2 »-i ω “ ε e 6 · u
H > > > · · x λ λ λ e e w « · · . · «4 · · « · ·
O X /3 X ł i νι σ tr ο» i ι o > r* W , ri mm oi M • · ri M W *4 HJ 44 AJ AJ ri nj VI rri U-J
H iw >
> ·κ o* o· ł 5 e e
C\1 *· 'j η H u rt (Μ N OJ £ P fj F> fi F>
Ó)
LL f-· t-ι JC fε λ υ e
Ol & X J< 2 l’ I* o . * « » .
«< W H-4 VI Η H
PS tt tt 1 « ·
I « M-ί X4 HA tt VI <?Ό Ώ -d Ό Ό «< ft & & < ( m w u «η ci cm U α H «4 U U h (i R H b e x υ e β λ ι Ή »ri »ri »ri r-ł Φ Φ U φ φ
U u V) w
A A A A A
O · · · · · | : : : & &
X · · · · · u X ^4 X ri .ri (b · ♦ · Φ Q>
X α Ό o u <u g p, vi p. · .
_ X . > -MM ° 55.....
π g c c o, a
U ·η 'ri <u *M
R · · ’ U AJ
W * · · »ri «ri
E-, · » · · · >««·«·, t> «ri · »ri *ri »ri O·*··· (/> « · . « C
O H X X X · · «η X * ♦ · u u > U4 U4 M W «G
O · · · · «
V) ri · ri · « x tr tr w x x
X >ł >1 >ł Ή *4
W > > > · >
W Ό *O Xł · · g°.....
m O · · · · ·
O U k U Η H k« · · · · · > 0« O, O, AJ V»
O* x x X u .
X <y φ φ σ
CW Ł) Φ OJ φ
F« Φ φ οι Φ Φ
X U · H · ·
Ol i « l U i <λ u x x X w ri C4
v) tn ri tn ri >
» i t O ι i 111X11 > tn C rri »AJ t t X t » i
1 «ri I « 1
0« X rri «ri M · X «ri > > Μ *O
O o «ri σι σιχ x CO Q > φ Ci M ri
N » ω I I 1 1 ot X X X Ć W «< AJ M AJ P« c « 4 « « ł M
I I 1 I VI AJ
I I ł ł Μ V» > U U O G g
K «ri «ri «ri S E
O X c U tt AJ AJ
O · »ri · rri »ri
Γ4 t4 · · · · ·
X β AJ C M G a λ Λ c q >«*··. («4 AJ AJ AJ AJ AJ (4 tj ·σ ·σ · <
h e e e c e ♦4 ♦ ♦ ♦ · · o a οι ν φ *σ ·σ ’ώ OH Η ΗΛ c^ęr·····
8σχ X X X X • · · · <A > > ‘ri U >
Vł * · · » .
<Λ C c C G C ox*···· un Cl AJ AJ G > >
<M V) AJ AJ AJ AJ AJ «4 ri ri ri ri ri
Λ M X u AJ AJ
X G c tt > >
•4 · · · · ’ri x tr v tr x x ZC X X X X X X Φ Φ Φ 41 0) eąi *·? J «Η CM «Μ u J η *4 u U t* Λ H H υ g g 2 π ri U r n ch 4 4^444 t! t: Λ iJ U t: EZ U 6 E i
189 639
159
A A A
o o
o •4 •rA Ή •W
O X X Λ
Ul «
2 u li ll
«4 tj Ό Ό
O * «
W 14 <4 M
M >t >,
o A rt <3 <3
cb O h U U
cn rflh C u c
HH X *4 <44 iiifiź x u c u a u o · * · · · o x en en tn x u c~ > « « « er o •o M U ' U p, ft
5rt « · · · · >1 tu M4 U4 · .
3: O X «4 LfeU °
ca X **ł «3 •4 s
(2 to b* o «□ r> os ε ε e μ x • ♦ · · « • * * σ/:
Ή ·Η »K **4 Ή ♦ ' · X Λ ε * ε > >
er er u u σ er er u u u χ: tr σ σ σ • Cn C
C
O c\f
CM .0)
Ll fSl a
rt C3 tr er
ha HA HA «0 M
•H •W •W
i*4 HA HA HA HA
o W >,
W · · · · ♦ m ps Cn ta Cn ci *< Vł W Cł rA Cl
-*£. P* p< P* Λ O<
O tn o
δ u
£ £
o
U.
</i
* • · « · • · · «
ii ftć.0,0,
« · « ·
« * * ·
• * * ·
* • · « *
AJ AJ X» · AJ
»-4 rł K · *
• •(OM
* • * «W -W
♦ «XX
« • · · ·
rt X « M Ol
* « « «
cn 4ΓΌ Φ TJ TJ TJ
• · « H « « «MU
X XXX 0 . . • · ·
• · · αχ x cna
Cn Ch * · £Vr1 H x tr σ
X • « « »r1 •Η Μ M « A A A A
u · · • *r< ·Η HA H4 H4 HA HA
* • · · </J · « « « « 13 •0 •a •O T) TJ
Ό TJ tj TJ 2 M w Μ Μ M X ri ♦H ri CS rt
rA rA · » 0 ϋ c tr er-H .ri 0 0*
• « · <H XXX XXX 0 X «
0 · · • «J · in u H •H •H •H *H
< * · • * · s * *
> co
W Ol x o H P
X O <J
TT U c u cn tn fi > > S > «j ŁJ *O ‘ TJ M · *****
Q C C C · ·
W U Ł> u Ł> u
W tn Oi cn Di tn MU · U U U Μ X fi Λ 1-4 «Η Q en Oi tn tn tn 2 χ χ χ u X
O 1* rt X X X X M S >» >«X X -r »4 · · · «.i ·<-ι
M U U U |4 U %4 · · « » «
X c u u c c
O · · - Μ «-Ι χ χ χ X ν V (U * · * * «
M c C C Ol Χ 4J U Łł U U δ· · « · «
M w n «I rt
X Μ M H X X o
Ο- U · tn cn * · * (rt W
X X X X X • ' · > >
3—4 rA U rA <1 CH co r4 rA <4 rrt fO rA rA rA <H CA
U u θ U U U U •4 *4 J U U *4 a •J
*2 H J3 £ ti H X ξί H A χ: Bm e*
ε X υ ε ε jd ε Λ U E e X ε JS U U ε
160
189 639
2>
u
S & w b
2ε <
υ pi rt o
O O rt m u £>
U
O b > u 'iiυ
2u u
o o W rt
O U n O O
O
O ~ rt O U
2u u
o 2 ε <Ί rt υ υ rt u i u u
So o U r-<
u 2M rt s*· O f- tu £»
u , O u
CO 8J rt o o O p· U b <
OJ Ó) 2 ε rt 3 o u U < > O b O (M
w O rt tn rH f>4 p u
Sx υ
u
8° υ
rt X
O o
rt o υ o
rt b
U §' o
rt Ol u
o
2υ o o o x rt £ o o
o υ rt o o rt o o
O < I CD (J <<
υ sz u
2W
So o o σι ^8x rt
O υ w b > □ o o « rt ω -< o b
U a.
υ o
o o o
o o o o. Γ' O
o.
υ u
2° u
(J O.
o υ 10 u U rt U U
2>
u o
rt o ci o
rt o o o
3* o o m <j o, b υ o
rt
Cl (Λ b ω o rt o x rt
So
Cl
2u υ
b rt
O o r> Cl to rt
O
3“ u
<<
o
O rt rt
in
CM o O
O CU rt U O
U O co
m
M rt
brt G b u
£4 o U
•M
o m O
3 X 3 X
o o o
o rt κ
ΓΜ o 3 O
r*
p o m
b u b u
Cl u
CJ o n
rt X o fl 2
O n b
O O
O b u rt O
n υ u
CM
rt o o
Cl CU Cl b Ό
Cl rt <*1
ci
3Z
8-:
u
Cl
O rt 2 σι rt cm
O
O b J o υ ca cm rt
O rt o
rt o υ
o rt u o g- g- og o
rt υ
§S ci
Cl Λ U
8*
8b rt h
!z o
rt O
Cl u
Cl rt o
g>
o
3° oS« m o ci
2u υ
o o
o2 ot
Cl O O X rt
S o 10 ot O < ω O b
rt Q O
O U m Cl b ot rt
O
3“ « u u b i rt o rt I o u υ , o i
u U I rt rt υ
υ i*
g.
g' u
o to rt
8b rt
Cl
8° u o o σ o rt ω o o
Ol tn
(J Cl
υ b O
O rt rt
IM
Ul u
g o u . w O b m rt
O rt ω o
rt
Cl Al υ ο2ε o <
V) o
3° < Q o O ’,2x rt rt o X rt
V)
S 3 b ά rt O
3° &
obu r- Ci ·» o
8U o
rt O Cl
g.
i o o V OD *n U 8° S o
Cl ci o U r- rt O l/l U
O rt O υ
o o < X v < in σ
< o> υ χ
·<
o rt o o O tn tn rt g' o O ot rt O tn u σ
< ω o
O b J m U ui
LL
189 639
161 o O U x> p « to < U
O P s* ej w S 8 p < r> o o
tn to
8*
O
S8t
Ot *C rt s* fr δ
U V) O fr fr < fr <
o
tO o o
K j u fr·
o <
e rt ω o o g «4
o
o rt u r- ii <
o 0
o o _ u
m < o o <
*o u p
P o
< o o 0
u rt
w V o o
< * cr> < Cf
rt w u
o o
o V fr P a
et rt u
to p o
< w o w
p rt
S »4 o 2 u
<B
to
8 rt 8 fr
O o rt
fr
Ό O o 3
X
O g «4
r*
o o x u to g *4
O Q
o < u 2 M
to < o p
*c ω U <
O P
O K gU
U l/j rt
U sa
So o O to r* O < O □ o _
Hu
U u
O V) < u g05
o
Cd p fr
8o
ΙΛ
BO <
U < 0 ?x rt o
o u m m p «ο
O
O $z rn <
! Cd
O l
Ot o
rt Cf o §8 « <
u U
rt fr o o O rt
fr 00 o fr
cn
rf fr
& > p O rt
O P 0 P
W
os frl <3
53*
O w «<
8<
O
8 w 0\ <
o O w Ot &
«0 p w rt CJ
U CA
O <
Γ* σ> p _ rt O O %
u rt Q O
U
U.
>
§ ta rt y
o u fr fr t3 fr U r-4
S° y
?5X
32 o O fr < O o
O 1 to < ot i fr
3Z w g w s5 o u ^8° o
tO
O
σ 0 U rj rt
rt O o rt X u fr 0 X rt
u tn rt rt grt
o
p o O o O
fr H P X P P 00 rt X
< P o o
<4
<3 o fr o
rt U p fr o rt X rt Cd
P p rt 3 O
O
o rt P 0 O
0 rt rt X rt ω rt P t?
p o rt P 0 H
t, rt
fr Ot u fr fr
0 0 fr 0 X O o rt
O o
g p
o u t* < Q o p p
3° u <
p fr
2* O U g>
o u
08“ o
o O r* rt &
O gr.
O s° K 5 eu o
u rt o p o8° tO o o
Fiq.23( kont i).
fr i
α §
o u
<
u
P o
fr
O
O sś y
X
Cd >O <
fr <
Cd
X
O ω
x o
o u
Cd >
X *4 w
fr <
162
189 639
O f. tM O O m (>
5« *
Ci Ή α co co ο < rp
Ci U Ή *ζ >«
Ρ o
o a
> 0
S8>
CM 0
o u
O f.
O\ iz U, Ci P
X a
e» u
U w s
U δ
c o
O σί
C\J ri
Ll ο ο α Ci < ci
W 0 ί
oS° rH
Ci O *
o < £4 0 w
z o
s*
O
CO ci
U <
a
Ϊ
I co ez σ
o u <3 su ε
O o 8 m □ *8 z
o i
Ci *9 O o
O <
o
Cm >·
X
X
X ϋ
H <
O <
o o
o a
χ
X >« z
Q
CU <
X o
σ\ rp *S
O co o
r* >
o u
X
X £
£
X co <
X u
co o
g <
>« co g
X
189 639
163
Fig.24.
o · o\ Q O A ooc O V gg» SsB* o · CD sil· 3l· Sil· o · f* IN gl· Sil· o · V ΓΛ &s> Sl· Su* o · wi -* gl· SB- &l· o « «Ί 5l· 3E° El·
O « CO SE- O « P §l· O « SB- o · ω sil· o * SBC O ♦ r-i Bl·
3 S e. U <5 h- gl· Sil· Sil· SB°
§5« & 3 Λ U O Sil· l·- gil· śE*
O · Sil· O · El· O · S&° o · sil· o · sl· O « ifg“
gil· ΪΙ* |M El· n gl· * sl· WI jSSu b o
O u 36° u o 88° sil· O u _ Ρ < X < P α o , S8H 5l·
5 fc “= sg° 3l· isg- Sil· «ll·
o « IO gil· O · «Λ r-f sl· O ♦ Ζ» w gl· o * n «n gl· o ♦ Γ· ΊΓ |g« o · «Μ <n gl·
gil· SB- gl· o u 5U- < p u o < o u O o 8SW
il· 8l· El· o u ssx gl· ul·
< P S £ M O· fci U ** bo P < _ O « X (Z O *n O U V o 3’ 5U* 3· 3 l· g·
u p 35* fci. < p n §l· r* SB- W E Ul < O cn <
Bl· SB- W u σ
C3J
O <J fc3J
U5w < P y
b
Ss o
Sfc δ h
O · < h £l·
SB° §l· eg*
Bil·
Sb*
Sil· sil·
Sil·
P <
s£* ϋ< <
o o <
SI
88h
O o
S8W sil·
BS
SB
SB fc o
5» η <
Sl· ll·
O u H < J U ϋ gl·
3l· < P p < M < P o λ < P OH H < M n < p sil· gil· o ♦ o u CD < P W w o U u o b
sB
Sil·
El· s· 3B° •H e. 2Su o UO M p u O ♦ P < «4 σ» U O fN o · 2 5ź X β < p o. £3»
w h Bb* gg* gg* Sśl·
ES- gl· IB* sg° fc p < o u SB°
BI- g> o. SB1' «1 fc 3 p o · < P o e 8^ o · «< p c· o. l·
ES* Sl· ll· IN P < < P P P < ri U 0 sil· tl·
Sl· Sil· sl· Sil· sl· Ol·
ll· ŚE- sil· SB- SUo u o 3l·
164
189 639
O · w>
O · k£>
O ·
O «5
O «
Os m
o · oa m
sL· o · n rt rt < A uu < Ił O σ « »4 <0 BS> o * o Ok sL· o · Ol Ok SL· o · «0 o ΒΒΔ o · r- r4 ΒΒώ
BL· sS- SL· BL· S t ec u o SB2 rt < * rt rt rt <
SB- sB2 SB- SL· SB° Sto u u EL·
SL· o · rM fo BL· O ♦ o SB- o · « sSs o · o EL· o · rt 85źu U <ł O » Ό SL·
sS- SL· £L· 3L· EL· «-< BL· e4 BL·
sL· SL· BL· BL· 3L· BL· SL·
SS- O « o SL· o » BS” o » SL· o · BL· o · SB- O ♦ sB-
SL· rt SL· ł- iSa co sL· Ok BL· o w SSu Wl •4 M SB2
SL· υ u <C rt U υ u SL· SL· B§° SL· BL·
BL· o o 3t° ESJ SB- SS“ SL· SB-
SL· o · Ok 40 USw < rt o · co rt ih o · rt « SL· o « 40 Ok gS° o · 1Λ O υ o SE2 O · 4» e4 gL·
SL· < rt S rt M SL· SL· SL· W SL· H sSQ
SB- SL· SL· SL· SB- EL· SB-
SS- o · «0 3L· o · rt ŚL· o · 10 SL· O ♦ wi o u _ 5ίχ O « 4» sS° O · *n BS-
SL· W> SL· rt §B° <s BL· Ok gB° O e-ł BL· BB2
SL· SL· SBr SL· SL· SB- SL·
SL· o « SL· o « SL· O 9 SŚ- O 9 BL· O * rt < ss- O · SB-
< rt E5J Γ» 40 BS> rt SB- Ol « EL· W Ok BL· **) O a*4 SE- ·-< BS-
SS SL· BL· SL· BL· SB- BL·
SB® sL· SL· SB- EL· BL· rt ·< < rt rt rt <
u>
m
Fig.24( kont i).
o ♦ ui
Wl
SB- s‘S£o L·BS° SB- BS- SSSL· SL· SL· SL· s*SL· s*£L· ll· SB- ” SL· SL· SL· §L· SBk o.SBu o.SL· SB- 3 §L· ? SL· SL· SL· SL·
SL· yg, ygk
2* SL· IL· |‘ £L· L· SL· SL· SL· IL· SL· SL· SL· SL· SL· s· SL· s· SL· 2· BL· o· SS2 SL· $Ββ SL· ~ SL· SL· SL· BS> SL·
§s° s· BL· Β8™ O · < rt ίΕα o * v b
SB- ~ SL· 1 SB- Ol O O u - £§«
BL· SL· rt < Sfc° BS>
SL· u o sS- ES-
189 639
165
30- o · V» *»» b -C A < b o V Łl o · w IE-
El- go*
< H EO* io-
3gw o · go* o « m 30-
3E« *H 88« o u crt g|*
03- sS~ IE-
IE- O · 03- O · 03-
EE- «Μ biu »* rR 33-
3§* gg = IEx
Ob 30- El-
08° O * m < fc? £§« O · rł w IE-
03- 30- I3x 3fc.A 1- <
oi- IE- OB- o u , cs-
33- O » w o u 8S- o ♦ o IE* o « m 30°
IE- *4 03- sE- RR 33*
03- EO- 0E“ δ tS a· Łl O
u P SGX o ♦ IE- O ♦ 3E- O * 33“
fcSw < H ♦Ί «•r IE «*> rR <5 fe Β» O O * 03-
O U IE* b < S < 03 =
b < s s * 3g° 8Sx < b
§£* O · 9i 03- O · » q 03= O · f* *r IE-
El- b< _ < b o o G 33° ob-
30w 3E- IE* E§*
30w e « OB- o · r- El- o · <o IE-
ggo w IE- •K IE* RR Es-
EO- El- El- El-
El- o · 30° o · 3§- O · 30-
30- r· «« !£* F*> 33° r ^4 3E-
El- 03° 33° E0w
so* 53- 33* 33-
166
189 639
LO
CM
Ó5
Ll
ώ © · O O A » < μ μ — μ X O » <N SE* o · *o en SE*
< μ μ < w χ μ BE- SE* SE*
o o o u w x μ SS i k © O u SE-
SE° ?♦ ES O « Ό SE* o · IA OS*
SB* ES α o μ x w X μ SB*
88« x μ £S SE* SE*
SE* 88* o · U O Ό O « Vł SE* O « Ό SE-
ES ίΕiS>
SE
ΕΕ* te
SE*
SE* μ χ X μ >· μ χ εε* sb* ο ο 88* ο υ Λ
C5J
ΕΒ>
es§Ε° te *te giźu
h.
o u ©4 Η X <
”» bo
Ο · < Η Λ
S ρ 5
Β5>
SB° s· y §* ’ SB !E>
5tft ygBSse-5
SB
SgSE
22o ite t3~ χ μ o u 56° $te
X μ sr
o o S8 SE- 3fcu o b SE* SE
SE* o · o u * μ * u o» be o * X μ s es> ΓΒΒ* r es-
BE o o U O (C x μ 8iźx x μ SE- SB*
£§- SE- SB 5 fc o u b α o Sfc*
BESS
SB8 8 w χ μ u o
ES §Ε°
SO* o u o · μ < > η O U ~ g8«
SE° o. SB° «Ν <J O < μ μ μ <
SE
ESrggSil· *g°
SE* SE* SE* SE81 Si
SEo a A <
O fi Η X »-> H <
SB*
SE
SE
E§* ££SBSE*
ESES3!
I 8 <0 > <
1 O > X J i o
I 8 « i X o » t? o
S 5fc2
SE £5 © * u o W μ < u ** U 15
SB
SE ε
sr ES ES- o · »-4 w SE- ES> s-SE* BE- o ♦ fc 5 j o> bo C4 SE* x μ 0 4 μ X w oa χ μ <*» SB o. ifc r- o b ’ BS
ES> SE- SS* SE* ¥3 se- SE
oo SSM O · O 5£μ x o. BS* o. BS- co O «X W r* o.SE
SE° *— SB- s SE* - gy* n o u μ x > b o - 8g
ES* SE* ES BE- £3* SE
SE* SE* ES> SB- SE- SB
189 639
167
Fig.25(kont i).
O · «*» SO sb* < H l·· < w < 1- 28 o · Γ4 C* Sc* Bi> §0- o « W 88° sB* Sb* o · o 83- 82- ii- o * Os O* SC* 3Bw 83* o » m O 83- B3“ iB“ o · r- *—< Bs* SB* iB-
o ♦ CC *B- O · »x 00* O · o 28 o · os 8i- O · CD 82* O ♦ t* SB* O · SO 82-
SO r- CO o Os o •A
28- £2- SB* 38“ 32- 80“ «-4 iB-
38- Bi> 28 82 28- S5u b o 28
o · $l~ o * 28- o · 22- o · SB* O * 28» O · 88* O · H < < H * Η X
o es Ρ» Ό tn
so Bi- t* SB* r 08 eo SB* cn 6 3 h < H O *c 82- •X 00*
iB* SB* Bi* BS* 00* 38“ 28*
O u SC* 38“ li* 82° 82“ 82- sB*
o « o SO ii- o « Os SO 28- o ♦ CD r» 82- o « t* B 82* o ♦ so 0S 88- o · »n o 08 O * «r OB-
38“ 38“ <3 U cs- 32- IB- o o U O A<j o 5 p ω ϋ Ο
p u _ < H b x „ Ł- < {x < o u
H < X < t- 38“ £3- ί «* SC* SC* Cf U X H *
o · OS bo* o * «0 83- o ♦ Γ SB* O · SO 28» O · lA Bi» o · «» 88° o · m o o Λ gG°
SA SO t- «Β OS o «X
C5J p s M 53- SB* h < . 4 fc Q O b 82° BS* łX 8^x X t-
σ u es» oow 83> 28* o o 53* 83-
O · o u SC* O · 8B* o · 2B- O · B2- O · SB* o · li* O · u u stw
α r* SO SA ** rc
sn O o SC* so 38- r* ϊμ o b CD ie° cn 01° o r4 SB* rX »A 83-
38“ sB* 53* SB* BS* 82» SB*
28 - 08 Bi- Bi* Bi» 38“ 28-
o · »n Bi* o « Ό w> 28» O · «η 38° O · W w 80 e> · rs os SB* O ♦ rc o IB* O · «X •X ?5x X H
is S m < f- B8- 82* li- SB* 00* i§-
sB* G5» 32- 38- BO* 00° iB-
o · «Ο SB* o « m iB- o · w SB- o · m 32“ O · 38w o · •A SB* O * o 80*
sn Ό r* OD OS o «X
82° 28- SB* SB* 28* •-C 38- •X iB-
38- iB- 38° SB* Bi* Bi* 82
o * sn BS- o · §2° O · «*» 83- O * CC 88* o · nC sc* o · o 82- O · Φχ 88-
m tt* SO SB* r- 23» 00 83» os SB* o 28- O rX 83-
SB* SC« o b 28 82- 83- 82 00*
28- 38 SB* Bi* 82- 88° BS*
168
189 639 c
o
LO
CM
Ó)
Ll
33« o · ΙΛ rt 53« o · te
58* 33* §y«
35j 53° 33*
55- O · tF 53* o · Π gs*
g~ rt gS* ** 55-
Sg* gS* cg*
Sg* O * 33° O · gy*
§8- rt rt 33« rt te *4 sg*
55- 55-
33° 35j §8«
33* O · d rt 55* O · *4 te 53*
53- 85J SgJ
§3« yy< 33*
t 3 fr < fr O * 35« o * o 35° o · o* < fr A gS·
58* d 33* rt fr < ce* rt 33*
33° u o o o o fr < sg* fr * ce°
33* O ♦ sg* 9 · as- 9 · 35j
35u o rt rt 55« *4 rt 33° 9 te •4 B 3 «· U P
fr < < fr fr fr < o o se* §y< 3 C oc O 9
S5J 58* 53- 55-
β o SH* O · ot CJ 53* O · os s 53- O · e* w 55*
53- 53° g§* 55*
sg* Se* Se* 53-
33° o * a» 53° o · f* 35« 9 · WJ 35-
sg* rt 33* rt 53* rt gy-
w 53- 35j 53*
13* o · Sg* O « 53* 9 · 35j
33° c* rt rt rt gy- W 88»
£5- §3a yy- 55-
58* 53< yg« eg»
189 639
169
O » ri
SO
Fig.26.
§0« ΓΒΒ* rss* SB«
SBZ SB SB*
30“ o.§a«, s«3g«
O- ~ 10“ ~ ll* SS« 03« OB* 30« o. 03- e. 3000« ~ SB* s 03BO- sBtf §0« SB* 33- §0° §0“ Γ3Β» Γ0Β> 00° 30“ BSw
88© <5S*
U U u <9 O U < μ μ «< μ <
H < ri o · H 2 U O« 5f*Q < μ w U O ri O U
88« 12“ §8“ 88“ 82« 82« sil· o.SI- o.L“> £2“ 8£- 55 §8« 88« 88« S8“
Sś« 22° 8ś«
81“ 5' 38° 2' §2“ 82“ 88° 22« 88« SS« §8« 23“ a·38” g·?!82“ £2 82« E2J 88“ £8«
22“ g.2Ś« =.28“ 83> - S8“ * 22« 22- 22« 22“ 8e« 22“ sg<>
O · to ri OS* SB- SB» o * tn w 00- 30“ os* o « <* ri ΒΟ- SB- B3-
o « ΙΛ BO- o · 09 BO- o ♦ S3*
BO- SO* ri BO-
WO os- SO-
O 9 bo« O · SB- o · 30«
ri sS* *r BO- ri B3-
SB» SO* 30-
ί fcw o b 30- SB»
O · ri ri 30« O ♦ ri w 10“ O · ri 30*
SB- Os* B Su
SB* 00* 0B-
O « SB» o · ri 30- o · ri BSw
ri 30- 3Β» SO-
BO- BS- 30“
O ♦ ri SS o · o 03- O * ri BS-
ri •bw> w SB* *9 ESu u o
SO» 00* BS-
30“ §0° 03-
O « e ri 03- o « ri ri sB* O · CD «* 30«
SB- 30« 03-
SB* WBh 30«
o · ri 33- o * SB* e · r* SB*
BS* ri 0S> SB*
BO- Ss- BO-
o · SO* O 9 SB* o « SO»
ri SB» m ΒΟ- ** os-
SB» SB» 33*
30“ BO- 30-
170
189 639
Ο · ci «Ο β ·
IN
Ο · ♦z ιθ
Ο ·
Ο
L0
Ο ♦ σι «η ο · <a <Λ
Ρ
Ο
Φ ιη ο *
ΙΛ
§Ε- o « łN P El· o · Ή W al· o · o 04 U 0 A P < w < P o · Oł m as* o · <o O aa*
El· ES* sE* tŚ§° §B- SE-
SB- ES* ag aa* Bl· ES-
ll· o · hZ P < P Ρ < M < P O « O to ag* o · Ol co aa* o * OD Ol ES- o · P Ca gg*
ES aa- Eg gg* 3 fe p ·< P •4 aa*
SB* aa* ISx SE* gg* SE-
0 U SU“ o « SE- o ♦ El· β · 8l· O * 88O 0 0 O * SE-
U 0 sc° P cl· Ol P EB* «0 aa- Oi BE- o *4 5 Β « P <
SE- SE- ES- aa- BE- El·
ISx SB- < P us- El· BE- U 0 su*
Ol· o · Ol ιο El· Q · co P O 0 su* o · P co as* O ♦ 40 Oi El· O * •Λ O El·
SS- U 0 se* al· SB- SB- aa-
ES* u o U 0 « P < ES* P * U 0 < 0 u o u Six BE-
sE- o ♦ GO ao* o « P ag* o « \0 w ga- O * m SE- O · W ES*
sE SB- P IE- SE- ga- ł-z aa-
SE- SE* EE* ag- si* SB*
ES- o » gg- o · Bi- o « Es* o ♦ El· O 9 SB-
El· 40 < P Cf5* 40 P ll· tj 0 SU Ol sE- O ^4 aa*
gB *< P us- Sl· ϋ o 5 f w gg gg*
O 0 su* cl· SB- SB- SE- EB*
SE* o · 40 40 SE- o · m p SE- o · w CD SE- O « Cl oi SB- O « ΓΜ O gg*
SE° SS- sE* SUm o u ai* SE-
SE° SS- SB- aa* gl· aa-
Es- o · s Sl· o * w BS- o · Cl o Es* O ♦ Γ4 aa* o · w4 Sl·
aa- aa* BS* BS* Bl· BS*
sE* SE- £l· SB* El· gg
< P P < n < P o · SB- o * P < su* o ♦ rc El· O ♦ ag* O · El·
S U u u u Φ aa* P aa* 40 SE- Ol aa- O •N Sl·
c £« as- ES* !E* gg* IE-
gg* al· gg* c s < 0 u gg* EE
C ο
<£>
C\J ri
LL
189 639
171
50* o · wa cr 0E- o » Wt r» 03“ o · El’
El- 03- El’ 30-
b < IE“ 88» b < 30-
30- o * Ul IE- o ♦ 88« CS u o · <-» El’
Ss* CR 03- m ^R sS° ^R 30-
33“ 30- 00- 53-
10“ o * S§« O * 35- α · §§°
33- CR rR SE* rt 03 = RC *R IE =
30“ 00- 30° 03“
El’ SE° 05“ 30-
3E« O · m CR 00- o · CR ΓΊ 00« O « »R RC 50 = o ♦ o wt 30-A
30- 03- 30- 00- 03“
03- SCo CS Cl 01« IE = 53«
30* O · CR 30- O « 03- O · α 30° o * cr* 00*
< b H < w < b 03- 00° RC «R 3 E * RC x b 88“
30- 30* 30- 30° OS*
SI- O · OB- O * 30« O · < b 88“ o · ο σ b X w X b
EI* CR «R IE- rt *R IE* rt rR 50 - *c 03 =
b < X* b X b < b < s s * 30« 30- O CJ fe£ =
33« IE* s&° 03 = B 8 b X b
30° O * O CR 03- e · «Λ CR §0« O · eo rt 50° o * C“ RC 00-
30° 30“ 3E- 3E = y§*
50 = 30“ 00- El- 30-
00- o * O\ Es δ M < b O · «Ο IEw o ♦ Γ» 3E = o * w 05-
E3- 05“ W 03“ E0m El
ί t o u o 05- Sfc o b S0“ 50-
El- o * 30- o * 50 = o · so° o * SE0
03> »—4 eR 03“ CR <-4 0S° m ^•4 00° RC 01“
03“ 53* SS“ 3fc* o u yg°
30“ 30“ 30° b X §c« 30-
172
189 639
O * < fr A o, ggo o · u a λ » rt P r r< H < 88- yg- O 9 r* rs 55- 55* SS« rss* yg* 58- rss* ES- 88» O » *e SS·5 55* 3£-
e 5 w < *» 8w
O · «0 2q o O o.^8» o · JO 55* s· ES> ?· yg- o * rj 58-
88« 5 d- 85> SS* ' 88 SS-
yg- £3” SS* 55* ES- SS-
o · r· 8E- o.y§* Ό o · VI SS* 0.58- te ... 88» o · (M SS-
§8“ •4 CJ 0 fr % U 0 U w Gg- 58- 5 §8- VI SS-
E3‘ SE» SS* 55- 88» o u SU
88* 88» SS- 58- SE 88“
o · Ό sE« §•§8» o * M W 63- Γ 88* © · < fr 5 Sg* O · rt in E8“
BŚ- 88“ SS* 55* O- SE
gs< SS» 58- 2 H « 0 u 58- U 0 < fr fr fr <
O ♦ Ul §8« s· 88» o « s gy* s· 88“ o « rt H w r o G O · o
88« 88» £3” SE ss* £1”
E8“ ES- gy« 88« 55- 55-
o · 88- G O R O « rt F o * Sro o G o.8E« Sgo o« u 5 o · 35”
BS“ w O O g§- <N BE- s SE £3” Ol w 55*
SE» yg” BE 88- 85- o u 8CW
g? £5° 88“ CSm 5 3 85- 0 u Gś-
o · n O 5’ £5” O 9 rt <N 88 © · o o ° !* H >· m fr rt o · CJ p o* O O w «Π < fr o · ® te 85-
88“ §g° 88« 55* yg- 58-
se- SS* 88» 58« §8» 35w
o « (M ES s· 58° O · O §g“ s* 63- < fr O ♦ fr < fr w X fr o « r* 58«
ES- w 85> « 88» SE* n 88 tO SS-
ES- 58- 88- ss- 88“ 0 fc ec CJ 0
O · w SB 88» o. 53w 38- o * Ol r4 EŚ« SE* 8 a Λ © · u 0 o ~ gg* ..SS» s yg- o · to £3” 55-
IS’ sg* E8” 58- E8« Sto U 0
88« sg* 88- 55- §g- fr < se*
Fig.27.
189 639
173
Fiq.27(kont i
O · © SE* BS- yg- o · n μ SE* yg- yg- o ♦ «X o SE* BS- BS- O « © © μ x a es- £S- Sg- o « «η «1 X μ A 88Bc° SE o « eo © μ ES SS- ES
o ♦ 2 BE° © · r4 C O X υ o o · o ES> o · OT μ X o * OT ES* © * μ BE
BE- 5 C BC χ μ © gg- SE- Se* »-Μ SB*
BE SE* SE SE- SE- 88-
© · SE« O « BS- o · SE* o · IB © 9 sE- © ♦ ES-
SE* μ SE- μ yg- © SE* OT Sil· O •X συ gy1
BE* SE* g§- SB* ys- SB-
SE* SE* ES- ES o o gy* SE
O · o Ό SE° o ♦ ot w> BE- o · o μ SB* o « μ to £g° O · lo OT SS° © ♦ Ul © §8“
SE BE* EB> SE- gil·
BE* BE- u e SE- 88- 88
© * v\ SE* O · © \o U o Si“ © · μ μ SE* © · © w SS- © * VI OT SB* © 9 ar O μ X ifc*
BS- «. b SSM BE* Bs> υ o . GS «χ SGo w υ
EE- EB- EB> Be° μ x SG° ES
© 9 SE* © » gg- © * BE- a & §B* O * SE* O · £S-
wi BE* WJ SE- μ BE- cc ES- OT SB* o w EE*
SE* E§* SE* SE- gy- SE*
BS- μ x yg- BE- SE* ES BB-
© · μ Ul BS- © · w> u> ES> ο · ΙΛ μ BE o · V © ES O « n OT EB> O ♦ C4 O SE
yg- ES- EE- Sil· SE* SE*
SE* 88° SE- SE* SE* gy*
o * «3 V*l SE* o · Ul Φ SE- Ο · BE- o « *n BE* © · gł © 9 »4 88o © υ
SE“ ES- SE* SE SE r-ł BE*
μ x SS* SE* BE- BE SGc υ <5 Sfc» υ u
o · Es- © · BE © ♦ ES- O 9 SE* o * SE* O · ES
m SE* © SE* μ EB> eo SE* OT μ x 5fc* © © W SSo o u
ES- BE sg„ 08- SB* SB-
EE- SE* SE* SE- ES- μ X Sg
174
189 639 c
o nT
CM
Ó) ll
O « rt SL· o · 9 PM SL· O · v> Cl OL· o » 4» SS
EL· SL· ES-
SL· BL· £L· os
O « W SL· O ♦ Wl <M BL· O · Cl SL· O · Cl TR SB
BL· P*ł EL· w BS- ES
sL· BL· OL· BE
O · m BE- O · SL· O * aL· O · SE
w BE- CM W SE- Cl w SL· * rt BE
yo< BL· sL· SE
s0“ SL· SL· X rt b < X rt
o · w BE* O ♦ ci CM SS° o · CM Cl BL· O · rt Ό OS
88« O o SL· EL· SB
SB- SL· υ e 5 o J O U b 5
o · Cl o o as2 O · PM SL· o · •M SL· O · o SB
rk C <J SL· 4M aS- *4 sO
EL· <J o SB SB- Sb
X rt
E3U
.. §8 s SB
BE* sL·
EL·
SL·
BL·
EL· sL· o * o
PM
X rt
E5J i‘L·
EL·
IBrt X
X rt * rt X O
EL·
SL·
SL· sL·
SB* §S° rt x p o x ~ u
SE is o · rt <
StSk u o E5Ł o « 2Ϊ E «< k < k A as·
ESS rt O o · o u <D 3 eL·
Ł o ου o 00B’EL·
EiŹx
X rt
8Sx < rt o · B g k
SE
SL· ~ SL· 2 BL· Cl r4 X f88° SL·
BL· SE- SB- SB* 88« rt x
SL· o. 3L· o.SL· W rt X rt rt x u g · «.OL· VI
SL· - 5Ee 2 SL· ci rt X - SEX 3 BL·
EL· §L· ES- EL· BE-
OL· X rt rt X rt X rt X rt O x rt eL 00- BE-
Departament Wydawnictw UP RP Nakład 50 egz
Cena 6,00 zł

Claims (50)

  1. Zastrzeżenia patentowe
    1. Wyodrębniona cząsteczka kwasu nukleinowego, kodująca chimeryczny ligand TIE-2 wiążący i/lub aktywujący receptor TEE-2, znamienna tym, że zawiera N-końcową domenę, domenę skłębionej spirali i domenę fibrynogeno-podobną, przy czym, co najmniej dwie wspomniane domeny pochodzą od różnych ligandów TIE-2 wybranych spośród liganda 1 TIE-2, liganda 2 TIE-2, liganda 3 TIE i liganda 4 TIE.
  2. 2. Cząsteczka według zasłuz. 1, znamienna tym, ze domenaN-końcowa, dowenasWębionej spirali i domena fibryoagena-podabna pochodzą z liganda 1 TIE-2 lub liganda 2 TIE-2.
  3. 3. Cząsteczka według zastrz. 2, wiążąca i aktywująca receptor TIE-2, znamienna tym, ze zawiera sekwencję nukleotydową, kodującą ligand 1 TIE-2, przy czym część sekwencji oukleotySowęj, która koduje domenę N-końcową liganda 1 TIE-2 zamienie się na sekwencję oukleotydową, która koduje domenę N-końcową liganda 2 TIE-2.
  4. 4. Cząsteczka według zastrz. 3, znamienna tym, że część sekwencji nukleatySowęj, która koduje domenę skłębionej spirali liganda 1 TIE-2 zamienia się na sekwencję nukleatydową, która koduje domenę skłębionej spirali lizńode 2 TIE-2.
  5. 5. Cząsteczka według zastrz. 3 albo 4, znamienna tym, że jest tak zmodyfikowana, ze koduje inny aminokwas zamiast reszty cysternowej kodowanej przez nukleotydy 784-787 jak przedstawiono w fig. 27.
  6. 6. Cząsteczka według zastrz. 5, znamienna tym, ze jest tak modyfikowana, że koduje resztę serynowązamiast reszty cysternowej.
  7. 7. Cząsteczka według zastrz. 5 albo 6, znamienna tym, że jest dodatkowo zmaSyfikaweoa, tak, że koduje inny aminokwas zamiast reszty arzioinowęj kodowanej przez nukleotydy 199-201 jak przedstawiono w fig. 27.
  8. 8. Cząsteczka według zastrz. 7, znamienna tym, że jest tak modyfikowana, że koduje resztę serynową zamiast reszty argininawej.
  9. 9. Cząsteczka, według zastrz. 3, znamienna tym, że koduje chimeryczny ligand TIE-2 posiadający sekwencję ammokwasową przedstawioną na fig. 27.
  10. 10. Cząsteczka według zastrz. 4, znamienna tym, koduje chimeryczny ligand TIE-2 posiadający sekwencję przedstawioną na fig. 25.
  11. 11. Cząsteczka według zastrz. 2, kodująca modyfikowany ligand TIE-2 wiążący się z receptorem TIE-2 lecz nie aktywujący receptora TIE-2, znamienna tym, że zawiera sekwencję ouklęotySową, kodującą ligand 1 TIE-2, przy czym część sekwencji nuklęotydowej, która koduje domenę fibryoogeno-podobną ligaoda 1 TIE-2 zemięoia się na sekwencję nuklęotySawą, która koduje domenę fibryI-ogeoa-podobną liganda 2 TIE-2.
  12. 12. Cząsteczka według zastrz. 11, znamienna tym, ze część sekwencji nukleatySawej, która koduje domenę skłębionej spirali liganda 1 TIE-2 zamienia się na sekwencje oukleatydową, która koduje domenę skłębionej spirali liganda 2 TIE-2.
  13. 13. Cząsteczka według zastrz. 11, znamienna tym, ze posiadająca sekwencję przedstawioną w fig. 24.
  14. 14. Cząsteczka według zastrz. 12, znamienna tym, że posiada sekwencję przedstawioną w fig. 26.
  15. 15. Chimeryczny ligand TIE-2 kodowany przez cząsteczkę kwasu nukleinowego jak zdefiniowano w zastrz. 1.
  16. 16. Chimeryczny ligand TIE-2 według zastrz. 15, znamienny tym, ze posiada sekwencję przedstawioną w fig. 27, lecz zmodyfikowany tak, ze posiada inny aminokwas zamiast reszty cysternowej kodowanej przez nukleotydy 784-787.
    189 639
  17. 17. Wektor, znamienny tym, że zawiera cząsteczkę kwasu nukleinowego jak zdefiniowano w zastrz. 1.
  18. 18. Wektor według zastrz. 17, znamienny tym, że cząsteczka kwasu nukleinowego jest operacyjnie połączona z kontrolną sekwencją ekspresji zdolną do kierowania jego ekspresją w komórce gospodarza.
  19. 19. Wektor według zastrz. 17 albo 18, znamienny tym, że jest plazmidem.
  20. 20. Układ gospodarza-wektor do wytwarzania chimerycznego liganda jak zdefiniowano w zastrz. 15, który obejmuje komórkę gospodarza i wektor jak zdefiniowano w zastrz. 17.
  21. 21. Układ gospodarza-wektor według zastrz. 20, znamienny tym, że komórką gospodarza jest komórka bakteryjna, drożdżowa, owadzia lub ssacza.
  22. 22. Sposób wytwarzania chimerycznego liganda jaki zdefiniowano w zastrz. 15, znamienny tym, ze prowadzi się hodowle komórek układu gospodarz-wektor jak zdefiniowano w zastrz. 20, w warunkach, pozwalających na wytwarzanie liganda i odzyskiwanie tak wytworzonego liganda.
  23. 23. Przeciwciało, znamienne tym, że specyficznie wiąże się z chimerycznym ligandem TIE-2 jak zdefiniowano w zastrz. 15, ale które nie wiąże się z natywnym ligandem TIE-2.
  24. 24. Przeciwciało według zastrz. 23, znamienne tym, że jest przeciwciałem monoklonalnym.
  25. 25. Koniugat, znamienny tym, że obejmuje ligand jak zdefiniowano w zastrz. 15 i sprzężony z nim środek cytotoksyczny.
  26. 26. Koniugat według zastrz. 25, znamienny tym, że środkiem cytotoksycznym jest radioizotop lub toksyna.
  27. 27. Kompozycja farmaceutyczna, znamienna tym, że zawiera chimeryczny lub modyfikowany ligand jak zdefiniowano w zastrz. 15 i farmaceutycznie dopuszczalny nośnik.
  28. 28. Kompozycja farmaceutyczna, znamienna tym, że zawiera przeciwciało jak zdefiniowano w zastrz. 23 i farmaceutycznie dopuszczalny nośnik.
  29. 29. Kompozycja farmaceutyczna, znamienna tym, że zawiera koniugat jak zdefiniowano w zastrz. 25 i farmaceutycznie dopuszczalny nośnik.
  30. 30. Ligand jak zdefiniowano w zastrz. 15, albo 16, do zastosowania w sposobie leczenia ciała ludzkiego lub zwierzęcego, albo w sposobie diagnozowania.
  31. 31. Przeciwciało jak zdefiniowano w zastrz. 23, do zastosowania w sposobie leczenia ciała ludzkiego lub zwierzęcego, albo w sposobie diagnozowania.
  32. 32. Koniugat jak zdefiniowano w zastrz. 25, do zastosowania w sposobie leczenia ciała ludzkiego lub zwierzęcego, albo w sposobie diagnozowania.
  33. 33. Chimeryczny ligand TIE-2 kodowany przez cząsteczkę kwasu nukleinowego jak zdefiniowano w zastrz. 11.
  34. 34. Chimeryczny ligand TIE-2, według zastrz. 33, znamienny tym, że posiada sekwencję przedstawioną na fig. 24, 25, 26 i 27.
  35. 35. Wektor, znamienny tym, że zawiera cząsteczkę kwasu nukleinowego jak zdefiniowano w zastrz. 11.
  36. 36. Wektor według zastrz. 35, znamienny tym, że cząsteczka kwasu nukleinowego jest operacyjnie połączona z kontrolną sekwencją ekspresji zdolną do kierowania jego ekspresją w komórce gospodarza.
  37. 37. Wektor według zastrz. 35 lub 36, znamienny tym, że jest plazmidem.
  38. 38. Układ gospodarza-wektor do wytwarzania chimerycznego liganda jak zdefiniowano w zastrz. 33, który obejmuje komórkę gospodarza i wektor jak zdefiniowano w zastrz. 35.
  39. 39. Układ gospodarz-wektor według zastrz. 38, znamienny tym, że komórką gospodarza jest komórka bakteryjna, drożdżowa, owadzia lub ssacza.
  40. 40. Sposób wytwarzania chimerycznego liganda TIE-2 jaki zdefiniowano w zastrz. 33, znamienny tym, że prowadzi się hodowlę komórek układu gospodarz-wektor jak zdefiniowano w zastrz. 38, w warunkach, pozwalających na wytwarzanie liganda i odzyskiwanie tak wytworzonego liganda.
  41. 41. Przeciwciało, znamienne tym, że specyficznie wiąże ligand jak zdefiniowano w zastrz. 33 i który nie wiąże natywnego TIE-2 liganda.
    189 639
  42. 42. Przeciwciało według zastrz. 41, znamienne tym, ze jest przeciwciałem monoklonalnym.
  43. 43. Koniugat, znamienny tym, że zawiera chimeryczny ligand TIE-2 jak zdefiniowano w zastrz 33 i sprzęzony z nim czynnik cytotoksyczny.
  44. 44. Koniugat według zastrz. 43, znamienny tym, że czynnik cytotoksyczny jest radioizotopem lub toksyną.
  45. 45. Kompozycja farmaceutyczna, znamienna tym, że zawiera chimeryczny ligand TIE-2 jak zdefiniowano w zastrz. 33 i farmaceutycznie dopuszczalny nośnik.
  46. 46. Kompozycja farmaceutyczna, znamienna tym, że zawiera przeciwciało według zastrz. 41 i farmaceutycznie dopuszczalny nośnik.
  47. 47. Kompozycja farmaceutyczna, znamienna tym, że zawiera koniugat jak zdefiniowano w zastrz. 43 i farmaceutycznie dopuszczalny nośnik.
  48. 48. Ligand jak zdefiniowano w zastrz. 33, do zastosowania w sposobie leczenia ciała ludzkiego lub zwierzęcego, albo w sposobie diagnozowania.
  49. 49. Przeciwciało jak zdefiniowano w zastrz. 41, do zastosowania w sposobie leczenia ciała ludzkiego lub zwierzęcego, albo w sposobie diagnozowania.
  50. 50. Koniugat jak zdefiniowano w zastrz. 43, do zastosowania sposobie leczenia ciała ludzkiego lub zwierzęcego, albo w sposobie diagnozowania.
PL97331405A 1996-08-02 1997-08-01 Wyodrębniona cząsteczka kwasu nukleinowego, chimeryczny ligand TIE-2, wektor, układ gospodarz-wektor, sposób wytwarzania liganda, przeciwciało, koniugat, kompozycja farmaceutyczna i chimeryczny ligand PL189639B1 (pl)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US2299996P 1996-08-02 1996-08-02
US08/740,223 US6265564B1 (en) 1996-08-02 1996-10-25 Expressed ligand-vascular intercellular signalling molecule
PCT/US1997/013557 WO1998005779A1 (en) 1996-08-02 1997-08-01 Modified tie-2-receptor ligands

Publications (2)

Publication Number Publication Date
PL331405A1 PL331405A1 (en) 1999-07-19
PL189639B1 true PL189639B1 (pl) 2005-09-30

Family

ID=26696604

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PL97331405A PL189639B1 (pl) 1996-08-02 1997-08-01 Wyodrębniona cząsteczka kwasu nukleinowego, chimeryczny ligand TIE-2, wektor, układ gospodarz-wektor, sposób wytwarzania liganda, przeciwciało, koniugat, kompozycja farmaceutyczna i chimeryczny ligand

Country Status (21)

Country Link
US (5) US6265564B1 (pl)
EP (1) EP0915974B1 (pl)
JP (1) JP3977434B2 (pl)
KR (1) KR100481560B1 (pl)
CN (1) CN1171997C (pl)
AT (1) ATE262037T1 (pl)
AU (1) AU724032C (pl)
CA (1) CA2262409C (pl)
CZ (1) CZ295371B6 (pl)
DE (1) DE69728149T2 (pl)
DK (1) DK0915974T3 (pl)
ES (1) ES2216163T3 (pl)
HK (1) HK1017379A1 (pl)
HU (1) HU227995B1 (pl)
IL (1) IL128311A (pl)
NO (1) NO990470L (pl)
NZ (2) NZ505684A (pl)
PL (1) PL189639B1 (pl)
PT (1) PT915974E (pl)
RU (1) RU2233880C2 (pl)
WO (1) WO1998005779A1 (pl)

Families Citing this family (34)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6265564B1 (en) 1996-08-02 2001-07-24 Regeneron Pharmaceuticals, Inc. Expressed ligand-vascular intercellular signalling molecule
US6030831A (en) 1997-09-19 2000-02-29 Genetech, Inc. Tie ligand homologues
US6348350B1 (en) 1997-09-19 2002-02-19 Genentech, Inc. Ligand homologues
AU4643699A (en) * 1998-06-24 2000-01-10 Compugen Ltd. Angiopoietin-like growth factor sequences
EP1141294B1 (en) * 1998-12-23 2005-03-02 Regeneron Pharmaceuticals, Inc. Method of enhancing the biological activity of ligands
US6455035B1 (en) 1999-03-26 2002-09-24 Regeneron Pharmaceuticals, Inc. Angiopoietins and methods of use thereof
CA2397833A1 (en) * 2000-01-20 2001-07-26 Hadasit Medical Research Services & Development Company Ltd. Novel haptotactic peptides
MXPA03001535A (es) 2000-08-21 2004-12-13 Pacific Corp Derivados de tiourea novedosos y las composiciones farmaceuticas que contienen los mismos.
US6753321B2 (en) 2000-09-15 2004-06-22 Genvec, Inc. Method of modulating neovascularization
US7658924B2 (en) 2001-10-11 2010-02-09 Amgen Inc. Angiopoietin-2 specific binding agents
US7138370B2 (en) 2001-10-11 2006-11-21 Amgen Inc. Specific binding agents of human angiopoietin-2
US7521053B2 (en) 2001-10-11 2009-04-21 Amgen Inc. Angiopoietin-2 specific binding agents
US7205275B2 (en) 2001-10-11 2007-04-17 Amgen Inc. Methods of treatment using specific binding agents of human angiopoietin-2
US7052695B2 (en) 2001-10-25 2006-05-30 Regeneron Pharmaceuticals, Inc. Angiopoietins and methods of treating hypertension
AU2002359464A1 (en) * 2001-11-30 2003-06-17 Genvec, Inc. Angiopioetin related factors
US7081443B2 (en) 2002-05-21 2006-07-25 Korea Advanced Institutes Of Science And Technology (Kaist) Chimeric comp-ang1 molecule
WO2004076650A2 (en) * 2003-02-27 2004-09-10 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Angiopoietin and fragments, mutants, and analogs thereof and uses of the same
US8232247B2 (en) * 2003-05-29 2012-07-31 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Methods of treating cancer, arthritis and/or diabetes with angiopoietins
US7485297B2 (en) * 2003-08-12 2009-02-03 Dyax Corp. Method of inhibition of vascular development using an antibody
WO2005019267A2 (en) * 2003-08-12 2005-03-03 Dyax Corp. Tie1-binding ligands
US7871610B2 (en) * 2003-08-12 2011-01-18 Dyax Corp. Antibodies to Tie1 ectodomain
CN1323723C (zh) * 2003-12-26 2007-07-04 上海新世界基因技术开发有限公司 Tie2受体介导的靶向性肿瘤基因治疗的基因转移系统
US8298532B2 (en) 2004-01-16 2012-10-30 Regeneron Pharmaceuticals, Inc. Fusion polypeptides capable of activating receptors
CN105085678B (zh) 2004-12-21 2019-05-07 阿斯利康公司 血管生成素-2的抗体及其应用
US20080213253A1 (en) * 2007-01-12 2008-09-04 Dyax Corp. Combination therapy for the treatment of cancer
JO2913B1 (en) 2008-02-20 2015-09-15 امجين إنك, Antibodies directed towards angiopoietin-1 and angiopoietin-2 proteins and their uses
WO2009158432A2 (en) 2008-06-27 2009-12-30 Amgen Inc. Ang-2 inhibition to treat multiple sclerosis
CA2758120C (en) * 2009-04-13 2014-08-19 Apceth Gmbh & Co. Kg Engineered mesenchymal stem cells and method of using same to treat tumors
CA2837169C (en) 2011-05-24 2021-11-09 Zyngenia, Inc. Multispecific complexes comprising angiopoietin-2-binding peptide and their uses
KR101967345B1 (ko) * 2012-10-18 2019-04-09 삼성전자주식회사 안지오포이에틴-2와 인테그린 간의 결합을 저해하는 펩타이드 및 그 용도
BR112015023752B1 (pt) 2013-03-15 2023-11-14 Zyngenia, Inc. Domínio de reconhecimento modular (mrd), complexo compreendendo mrd e cetuximabe, usos do complexo para inibir a angiogênese e tratar câncer e composição farmacêutica compreendendo o dito complexo
RU2538701C1 (ru) * 2013-07-11 2015-01-10 Федеральное государственное бюджетное учреждение науки "Тюменский научный центр Сибирского отделения РАН" (ТюмНЦ СО РАН) Способ извлечения куриного эмбриона из яйца для дальнейшего получения клеточных трансплантатов из фетальных тканей
US10670611B2 (en) 2014-09-26 2020-06-02 Somalogic, Inc. Cardiovascular risk event prediction and uses thereof
US10588940B2 (en) 2015-11-06 2020-03-17 Regeneron Pharmaceuticals, Inc. Use of angiopoietins in promoting blood coagulation and in the treatment of blood coagulation disorders

Family Cites Families (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5070192A (en) * 1988-03-23 1991-12-03 The Johns Hopkins University Cloned human topoisomerase i: cdna expression, and use for autoantibody detection
US5814464A (en) * 1994-10-07 1998-09-29 Regeneron Pharma Nucleic acids encoding TIE-2 ligand-2
WO1996031598A1 (en) * 1995-04-06 1996-10-10 Regeneron Pharmaceuticals, Inc. Tie-2 ligands, methods of making and uses thereof
US6265564B1 (en) * 1996-08-02 2001-07-24 Regeneron Pharmaceuticals, Inc. Expressed ligand-vascular intercellular signalling molecule

Also Published As

Publication number Publication date
KR100481560B1 (ko) 2005-04-08
EP0915974A1 (en) 1999-05-19
KR20000029778A (ko) 2000-05-25
PL331405A1 (en) 1999-07-19
CN1232501A (zh) 1999-10-20
HUP0400256A2 (hu) 2004-04-28
US20050186665A1 (en) 2005-08-25
JP2000516807A (ja) 2000-12-19
AU3968797A (en) 1998-02-25
CA2262409C (en) 2007-11-20
US20050106099A1 (en) 2005-05-19
US6825008B2 (en) 2004-11-30
JP3977434B2 (ja) 2007-09-19
CZ31099A3 (cs) 2000-03-15
DK0915974T3 (da) 2004-07-12
PT915974E (pt) 2004-05-31
US7045302B2 (en) 2006-05-16
US6265564B1 (en) 2001-07-24
NO990470L (no) 1999-04-06
US20030092891A1 (en) 2003-05-15
CZ295371B6 (cs) 2005-07-13
WO1998005779A1 (en) 1998-02-12
HU227995B1 (en) 2012-08-28
DE69728149D1 (de) 2004-04-22
IL128311A0 (en) 2000-01-31
NZ333994A (en) 2000-09-29
HUP0400256A3 (en) 2006-01-30
DE69728149T2 (de) 2004-10-28
US6441137B1 (en) 2002-08-27
ATE262037T1 (de) 2004-04-15
CN1171997C (zh) 2004-10-20
AU724032C (en) 2001-08-16
AU724032B2 (en) 2000-09-07
EP0915974B1 (en) 2004-03-17
RU2233880C2 (ru) 2004-08-10
CA2262409A1 (en) 1998-02-12
HK1017379A1 (en) 1999-11-19
IL128311A (en) 2007-08-19
ES2216163T3 (es) 2004-10-16
NZ505684A (en) 2001-12-21
NO990470D0 (no) 1999-02-01

Similar Documents

Publication Publication Date Title
PL189639B1 (pl) Wyodrębniona cząsteczka kwasu nukleinowego, chimeryczny ligand TIE-2, wektor, układ gospodarz-wektor, sposób wytwarzania liganda, przeciwciało, koniugat, kompozycja farmaceutyczna i chimeryczny ligand
JP4122056B2 (ja) Tie−2リガンド、その作製方法および使用方法
JP4054375B2 (ja) Tie−2リガンド、その作製方法および使用方法
US20030040463A1 (en) TIE-2 ligands, methods of making and uses thereof
US6881395B2 (en) TIE-2 ligand-4
US5851797A (en) Tie ligand-3, methods of making and uses thereof
US7063840B2 (en) TIE-2 ligands, methods of making and uses thereof
US7063965B2 (en) Nucleic acid encoding TIE-2 ligand
AU749312B2 (en) Novel modified tie-2 receptor ligands
US6846914B2 (en) Tie-2 ligand-3
CA2595038C (en) Modified tie-2 receptor ligands
AU755337B2 (en) New uses of tie-2 ligands
MXPA99001210A (en) Modified tie-2-receptor ligands