KR970707298A - 미코박테리움 아비움 복합체 종의 증폭 및 검출 방법(amplification and detection of mycobacterium avium complex species) - Google Patents

미코박테리움 아비움 복합체 종의 증폭 및 검출 방법(amplification and detection of mycobacterium avium complex species)

Info

Publication number
KR970707298A
KR970707298A KR1019970702750A KR19970702750A KR970707298A KR 970707298 A KR970707298 A KR 970707298A KR 1019970702750 A KR1019970702750 A KR 1019970702750A KR 19970702750 A KR19970702750 A KR 19970702750A KR 970707298 A KR970707298 A KR 970707298A
Authority
KR
South Korea
Prior art keywords
seq
nucleic acid
amplification
target nucleic
binding sequence
Prior art date
Application number
KR1019970702750A
Other languages
English (en)
Other versions
KR100434244B1 (ko
Inventor
제임스 엘. 스크램
제임스 지. 나도우
체릴 에이치. 딘
Original Assignee
로드릭 리차드 제이.
벡톤, 디킨슨 앤드 컴퍼니
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by 로드릭 리차드 제이., 벡톤, 디킨슨 앤드 컴퍼니 filed Critical 로드릭 리차드 제이.
Publication of KR970707298A publication Critical patent/KR970707298A/ko
Application granted granted Critical
Publication of KR100434244B1 publication Critical patent/KR100434244B1/ko

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
    • C12Q1/689—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for bacteria
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H21/00—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
    • C07H21/04—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids with deoxyribosyl as saccharide radical

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Saccharide Compounds (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Solid-Sorbent Or Filter-Aiding Compositions (AREA)
  • Absorbent Articles And Supports Therefor (AREA)
  • Medicines Containing Plant Substances (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)

Abstract

본 발명은 미코박테리움 아비움 복합체 종(Amplication And Detection Of Mycobacterium avium complex species)의 dnaJ 유전자내 타겟서열을 복합체-특이적으로 증폭시키는 방법에 관한다. 또한 증폭 생성물의 검출 및/또는 존재하는 MAC 종의 동정을 위한 검정 탐침을 제공한다.

Description

미코박테리움 아비움 복합체 종의 증폭 및 검출 방법(AMPLIFICATION AND DETECTION OF MYCOBACTERIUM AVIUM COMPLEX SPECIES)
본 내용은 요부공개 건이므로 전문내용을 수록하지 않았음

Claims (17)

  1. 서열1, 서열 2 및 서열 3의 타켓 결합서열로 이루어진 그룹에서 선택된 타겟 결합서열을 포함하는 증폭 프라이머.
  2. 서열 1, 서열 2 서열3으로 이루어진 그룹에서 선택된 제1항의 증폭 프라이머.
  3. 서열 4, 서열 5 또는 서열 6으로 이루어진 올리고누클레오티드.
  4. 서열 7, 서열 8, 서열 9, 서열 10, 서열 11 또는 서열 12으로 이루어진 올리고누클레오티드.
  5. 검출 가능한 표지로 표지된 제4항의 올리고누클레오티드.
  6. a)서열 1의 타겟 결합 서열을 포함하는 제1증폭 프라이머 및 서열 2의 타겟 결합 서열을 포함하는 제2증폭 프라이머 또는 서열 3의 타겟 결합 서열을 타겟 핵산에 잡종화시키는 단계; b) 잡종화된 제1 및 제2증폭 프라이머가 타겟 핵산상에서 연장된 증폭 반응내에서 타겟 핵산을 증폭시키는 단계를 포함하는복합체의 타겟 핵산을 복합체-특이 증폭(complex-specific amplification)시키는 방법.
  7. 제6항에 있어서, 검출 가능한 표지가 부착된 서열 9, 서열 10, 서열11 또는 서열 12로 이루어진 검출 탐침에 잡종화시켜 증폭된 타겟 핵산을 검출하는 것을 추가로 포함하는 방
  8. 제7항에 있어서, 상기 증폭된 타겟 핵산을 검출하기 위하여 리간드로 표지된 서열 7 또는 서열 8로 이루어진 포획 탐침(capture probe)에 잡종화시켜 포획하는 방법.
  9. 제6항에 있어서, 상기 제1 및 제2증폭 프라이머가 인지 부위의 절반이 개질(hemimodified) 경우 인지부위에 닉(nick)을 형성시키는 제한 엔도누클라아제의 인지 부위를 추가로 포함하는 방법.
  10. 제9항에 있어서, 제2증폭 프라이머가 서열 2의 타겟 결합 서열을 포함하고 서열 5로 이루어진 제1범퍼 프라이머(bumper primer) 및 서열 6으로 이루어진 제2범퍼 프라이머 연장(extension) 됨에 따라 잡종화된 제1 및 제2증폭 프라이머가 타겟 핵산으로부터 치환되는 방법.
  11. 제9항에 있어서, 제2증폭 프라이머가 서열 3의 타겟 결합 서열을 포함하고 서열 4로 이루어진 제1범퍼 프라이머 및 서열 5로 이루어진 제2범퍼 프라이머가 연장됨에 따라 잡종화된 제1 및 제2증폭 프라이머가 타겟 핵산으로부터 치환되는 방법.
  12. 제6항에 있어서, 서열 1의 타겟 결합 서열로 이루어진 제1증폭 프라이머 및 서열 2의 타겟 결합 서열로 이루어진 제2증폭 프라이머 또는 서열 3의 타겟 결합 서열, 및 타겟 핵산이 중합 효소 사슬 반응(Polymerase Chain Reaction)으로 증폭되는 방법.
  13. a) 서열 1로 이루어진 제1증폭 프라이머 및 서열 2 및 서열 3으로 이루어진 제2증폭 프라이머를 타겟 핵산에 잡종화시키는 단계; 및 b) 상기 타겟 핵산을 사슬 치환 증폭(Strand Displacement Amplification) 방법에 의하여 증폭시키는 단계를 포함하는복합체의 타겟 핵산을 복합체-특이 증폭시키는 방법.
  14. 제13항에 있어서, 검출 가능한 표지부가 부착된 서열 9, 서열 10, 서열 11, 또는 서열 12로 이루어진 검출 탐치(detector probe)에 잡종화시켜 상기 증폭된 타겟 핵산을 검출시키는 것을 추가로 포함하는 방법.
  15. 제14항에 있어서, 증폭된 타겟 핵산을 검출하기 위하여 리간드로 표지된 서열 7 또는 서열 8로 이루어진 포획 탐침에 잡종화시켜 증폭된 타겟 핵산을 포획하는 방법.
  16. 제13항에 있어서, 서열 5로 이루어진 제1범퍼 프라이머 및 서열 6으로 이루어진 제2범퍼 프라이머를 연장시켜 서열 2로 이루어진 제2증폭 프라이머 및 잡종화된 제1 및 제2증폭 프라이머를 타겟 핵산으로부터 치환시키는 방법.
  17. 제13항에 있어서, 서열 3로 이루어진 제2증폭 프라이머 및 잡종화된 제1 및 제2증폭 프라이머를 성열 4로 이루어진 제1범퍼 프라이머 및 서열 5로 이루어진 제2범퍼 프라이머를 연장시켜 타겟 핵산으로부터 치환시키는 방법.
    ※ 참고사항 : 최초출원 내용에 의하여 공개하는 것임.
KR1019970702750A 1995-08-28 1996-07-30 미코박테리움아비움복합체종의증폭및검출방법 KR100434244B1 (ko)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US08/520,194 1995-08-28
US08/520,194 US5681705A (en) 1995-08-28 1995-08-28 Amplification and detection of mycobacterium avium complex species

Publications (2)

Publication Number Publication Date
KR970707298A true KR970707298A (ko) 1997-12-01
KR100434244B1 KR100434244B1 (ko) 2004-11-20

Family

ID=24071559

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
KR1019970702750A KR100434244B1 (ko) 1995-08-28 1996-07-30 미코박테리움아비움복합체종의증폭및검출방법

Country Status (12)

Country Link
US (1) US5681705A (ko)
EP (1) EP0787210B1 (ko)
JP (2) JP3134940B2 (ko)
KR (1) KR100434244B1 (ko)
AT (1) ATE238433T1 (ko)
AU (1) AU710387B2 (ko)
BR (1) BR9606602A (ko)
CA (1) CA2203545C (ko)
DE (1) DE69627625T2 (ko)
FI (1) FI971802A (ko)
TW (1) TW349123B (ko)
WO (1) WO1997008340A1 (ko)

Families Citing this family (19)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP0920532B1 (en) * 1995-12-22 2004-11-24 Dade Behring Marburg GmbH Detection of differences in nucleic acids
US5667994A (en) * 1996-02-28 1997-09-16 Becton, Dickinson And Company Amplification and detection of mycobacterium avium complex species
US6465638B2 (en) * 1997-06-25 2002-10-15 Ortho-Clinical Diagnostics, Inc. Multiplexed PCR assay for detecting disseminated Mycobacterium avium complex infection
US20020025519A1 (en) * 1999-06-17 2002-02-28 David J. Wright Methods and oligonucleotides for detecting nucleic acid sequence variations
US20030165913A1 (en) * 1999-06-17 2003-09-04 Sha-Sha Wang Methods for detecting nucleic acid sequence variations
US6232104B1 (en) 1999-08-17 2001-05-15 Dade Behring Inc. Detection of differences in nucleic acids by inhibition of spontaneous DNA branch migration
WO2001066797A2 (en) 2000-03-03 2001-09-13 The Government Of The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services Multiplex hybridization system for identification of pathogenic mycobacterium and method of use
EP2011871A4 (en) 2006-05-02 2010-01-27 Wako Pure Chem Ind Ltd PRIMER AND PROBE FOR THE DETECTION OF MYCOBACTERIUM INTRACELLULARE AND METHOD FOR THE DETECTION OF MYCOBACTERIUM INTRACELLULARE USING THE PRIMER AND THE PROBE
CN101563455B (zh) 2006-12-18 2013-08-21 和光纯药工业株式会社 鸟分枝杆菌检测用引物和探针、以及使用它们检测鸟分枝杆菌的方法
DE102007015775A1 (de) 2007-03-30 2008-10-09 Justus-Liebig-Universität Giessen Verfahren zum Nachweis von Paratuberkolose
JP5286996B2 (ja) * 2007-07-13 2013-09-11 東洋紡株式会社 抗酸菌属細菌の検出用オリゴヌクレオチドおよびその用途
JP5286998B2 (ja) * 2007-07-13 2013-09-11 東洋紡株式会社 抗酸菌属細菌の菌種同定用オリゴヌクレオチドおよびその用途
JP5286997B2 (ja) * 2007-07-13 2013-09-11 東洋紡株式会社 抗酸菌属細菌の検出用オリゴヌクレオチドおよびその用途
JP5286995B2 (ja) * 2007-07-13 2013-09-11 東洋紡株式会社 抗酸菌属細菌の検出用オリゴヌクレオチドおよびその用途
WO2009011277A1 (ja) * 2007-07-13 2009-01-22 Toyo Boseki Kabushiki Kaisha 抗酸菌属細菌の検出および同定用オリゴヌクレオチド、およびその用途
US9689031B2 (en) 2007-07-14 2017-06-27 Ionian Technologies, Inc. Nicking and extension amplification reaction for the exponential amplification of nucleic acids
ES2650066T3 (es) 2008-05-28 2018-01-16 Wako Pure Chemical Industries, Ltd. Cebador y sonda para la detección de Mycobacterium intracellulare, y método para la detección de Mycobacterium intracellulare empleando el cebador o la sonda
US9352312B2 (en) 2011-09-23 2016-05-31 Alere Switzerland Gmbh System and apparatus for reactions
KR102531590B1 (ko) * 2019-07-16 2023-05-11 고려대학교 산학협력단 절단효소 인식부위의 미러링 결합에 의한 표적핵산의 검출 방법 및 핵산 검출용 조성물

Family Cites Families (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
FR2683227B1 (fr) * 1991-10-31 1994-03-04 Pasteur Institut Sequences nucleotidiques hybridant avec les souches bacteriennes du complexe mycobacterium avium-intracellulare, leur utilisation comme amorces oligonucleotidiques et sondes nucleiques.
JP3360736B2 (ja) * 1992-03-10 2002-12-24 株式会社ヤトロン ミコバクテリア属微生物を特異的に認識するプローブ及びミコバクテリア属微生物の検出方法
FR2694754B1 (fr) * 1992-08-12 1994-09-16 Bio Merieux Fragments d'ADN de mycobactéries, amorces d'amplification, sondes d'hybridation, réactifs et procédé de détection de détection de mycobactéries.
US5314801A (en) * 1992-11-06 1994-05-24 Becton, Dickinson And Company Probes to Mycobacterium avium, Mycobacterium intracellulare, and Mycobacterium paratuberculosis
CA2119188A1 (en) * 1993-04-05 1994-10-06 Patricia A. Spears Detection and identification of mycobacteria
US6136529A (en) * 1993-09-03 2000-10-24 Gen-Probe Incorporated Nucleic acid probes to Mycobacterium avium complex

Also Published As

Publication number Publication date
BR9606602A (pt) 1997-09-30
TW349123B (en) 1999-01-01
WO1997008340A1 (en) 1997-03-06
JPH09511658A (ja) 1997-11-25
AU6715696A (en) 1997-03-19
JP3134940B2 (ja) 2001-02-13
AU710387B2 (en) 1999-09-16
DE69627625T2 (de) 2003-10-16
CA2203545C (en) 2000-12-05
FI971802A0 (fi) 1997-04-28
DE69627625D1 (de) 2003-05-28
EP0787210A1 (en) 1997-08-06
CA2203545A1 (en) 1997-03-06
US5681705A (en) 1997-10-28
FI971802A (fi) 1997-04-28
EP0787210B1 (en) 2003-04-23
KR100434244B1 (ko) 2004-11-20
JP2001103986A (ja) 2001-04-17
ATE238433T1 (de) 2003-05-15

Similar Documents

Publication Publication Date Title
KR970707298A (ko) 미코박테리움 아비움 복합체 종의 증폭 및 검출 방법(amplification and detection of mycobacterium avium complex species)
CA2399733A1 (en) Nucleic acid detection methods using universal priming
KR100226297B1 (ko) 유기상 내로의 추출에 의한 소수성 증폭생성물의 검출방법
NZ506333A (en) An assay for detecting and quantifying the presence of particular nucleic acid (DNA or RNA) sequences
ZA907706B (en) Biotin-labelled dna by polymerase chain reaction and detection thereof
EP1707642A3 (de) Verfahren zum Nachweis von Cytosin-Methylierungen
CA2425747A1 (en) Solid support assay systems and methods utilizing non-standard bases
KR910006497A (ko) 프라이머 3' 말단에서의 프라이머-표적 오합(mismatch)을 극복한 진단 및 증폭방법
KR930010192A (ko) 에이치엘에이(hla) 제i형 디엠에이(dna) 타이핑 방법 및 시약
EP0459533A3 (en) Probe groups for the detection of nucleotide variations and genetic polymorphisms
CA2308599A1 (en) Dna polymorphism identity determination using flow cytometry
KR950702999A (ko) 핵산 서열 증폭 방법(nucleic acid sequence amplification)
WO1997041260A3 (en) Subtractive amplification
EP0857221A1 (en) Optimally fluorescent oligonucleotides
EP1061135A3 (en) Methods and oligonucleotides for detecting nucleic acid sequence variations
PL307341A1 (en) Method of as well as reagent and kit for detecting and amplifying a sequence of nucleic acids
HK1068651A1 (en) Detection system
KR920006510A (ko) 사람 유두종 바이러스의 증폭 및 검출을 위한 타입-특이 탐침, pcr프라이머 및 lcr탐침으로서 유용한 뉴클레오타이드 서열, 및 관련된 키트 및 방법
KR930004477A (ko) 미코박테리아 프라이머 및 탐침
WO2004003136A3 (en) Methods of detecting sequence differences
JP2006521799A5 (ko)
KR940009336A (ko) 슈퍼옥사이드 디스뮤타제(sod)족으로부터 기원한 올리고뉴클레오타이드
KR960705060A (ko) 미코박테리움 아비움 콤플렉스에 대한 핵산 프로브(Nucleic Acid Probes to Mycobacterium Avium Complex)
WO2008032058A2 (en) Method for sequencing a polynucleotide
KR970065730A (ko) 후 증폭 인큐베이팅 (post amplification incubation) 단계를 이용한 타겟 핵산의 증폭 및 검출 방법

Legal Events

Date Code Title Description
A201 Request for examination
E902 Notification of reason for refusal
E701 Decision to grant or registration of patent right
GRNT Written decision to grant
G170 Re-publication after modification of scope of protection [patent]
FPAY Annual fee payment

Payment date: 20100514

Year of fee payment: 7

LAPS Lapse due to unpaid annual fee