KR20240023185A - 대장암의 검출 키트 또는 디바이스 및 검출 방법 - Google Patents

대장암의 검출 키트 또는 디바이스 및 검출 방법 Download PDF

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도레이 카부시키가이샤
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Abstract

대장암의 검출용 키트 또는 디바이스, 및 검출 방법을 제공한다. 피험체의 검체 중의 miRNA과 특이적으로 결합가능한 핵산을 포함하는 대장암 검출용 키트 또는 디바이스, 및 그 miRNA를 in vitro에서 측정하는 것을 포함하는 대장암을 검출하는 방법.

Description

대장암의 검출 키트 또는 디바이스 및 검출 방법{COLORECTAL CANCER DETECTION KIT OR DEVICE, AND DETECTION METHOD}
본 발명은 피험체에 있어서 대장암에의 이환의 유무의 검사를 위해 사용되는 특정 miRNA와 특이적으로 결합가능한 핵산을 포함하는 대장암의 검출용 키트 또는 디바이스, 및 상기 핵산을 이용하여 상기 miRNA의 발현량을 측정하는 것을 포함하는 대장암의 검출 방법에 관한 것이다.
대장은 소화 흡수된 나머지의 장 내용물을 모아 수분을 흡수하면서 대변으로 하는 장기이다. 대장은 맹장으로부터 시작되고, 이어서 상행결장, 횡행결장, 하행결장, S상결장, 직장, 항문관으로 연결되어 있다. 국립연구개발법인국립 고쿠리츠간켄큐센터 암 대책정보센터가 개시하는 2011년 일본 국내에 있어서의 부위별 암의 통계에 의하면 대장암 이환자수는 112,772명, 즉 일본인의 약 14명에 1명이 대장암에 이환되게 되고, 이환수가 제 2 위인 암 부위이다. 또한, 대장암에 의한 사망수는 남녀 합쳐서 45,744명에 달하고, 사망수가 제 3 위인 암 부위이다. 또한, 미국에서는 약 20명에 1명의 비율로 대장암이 발생한다고 하고, 미국의 2014년의 추정 대장암 이환자수는 96,830명에도 달하고, 그 중 약 40,000명이 사망한다고 한다(비특허문헌 1).
대장암의 진행도는 비특허문헌 2에 정해져 있으며, 종양의 넓어짐(Tis, T1~T4), 림프절 전이(N0, N1a~c, N2a~b), 원격 전이(M0, M1a~b)의 정도에 따라 스테이지 0(Tis/N0/M0), 스테이지 I(T1~T2/N0/M0), 스테이지 II(T3~T4/N0/M0), 스테이지 IIA(T3/N0/M0), 스테이지 IIB(T4a/N0/M0), 스테이지 IIC(T4b/N0/M0), 스테이지 III(N1~2/M0), 스테이지 IIIA(T1~2/N1/M0 및 T1/N2a/M0), 스테이지 IIIB(T3~T4a/N1/M0 및 T2~T3/N2a/M0 및 T1~T2/N2b/M0), 스테이지 IIIC(T4a/N2a/M0 및 T3~T4a/N2b/M0 및 T4b/N1~2/M0), 스테이지 IVA(M1a), 스테이지 IVB(M1b)로 분류된다.
대장암의 생존율은 진행도에 따라 다르고, 비특허문헌 1에는 결장암과 직장암으로 나누어 하기의 통계값이 보고되어 있다. 결장암의 5년 상대 생존율은 스테이지 I가 74%, 스테이지 IIA가 67%, 스테이지 IIB가 59%, 스테이지 IIC가 37%, 스테이지 IIIA가 73%, 스테이지 IIIB가 46%, 스테이지 IIIC가 28%, 스테이지 IV가 6%로 보고되어 있다. 또한, 직장암의 5년 상대 생존율은 스테이지 I가 74%, 스테이지 IIA가 65%, 스테이지 IIB가 52%, 스테이지 IIC가 32%, 스테이지 IIIA가 74%, 스테이지 IIIB가 45%, 스테이지 IIIC가 33%, 스테이지 IV가 6%로 보고되어 있다. 이상으로부터 진행도가 낮은 대장암은 생존율이 높다. 따라서, 대장암을 조기에 발견, 치료할 수 있으면 생존율의 향상에 크게 기여한다.
대장암의 치료는 주로 개복 수술이나 복강경 수술이며, 수술 후에 항암제 치료나 방사선 치료도 병용되는 경우가 많다(비특허문헌 1). 특히 조기의 대장암에서는 개복하지 않고 치료를 할 수 있는 내시경 수술을 적응할 수 있는 경우가 있다.
비특허문헌 1에 기재되어 있는 바와 같이 대장암의 검사에는 변 잠혈 검사나 내시경 검사가 널리 보급되어 있다. 특히 변 잠혈 검사는 저렴하며 또한 비침습적이며, 자택에서 실시가능한 점에서 미국 암 협회는 변 잠혈 검사를 매년 수진하는 것을 추장하고 있다. 또한, 암이 있는 부위나 넓어짐을 조사하기 위해서 대장 내시경 검사에 추가하여 주장 조영 검사, CT 검사나 MRI 검사 등의 화상 검사도 실시된다. 또한, 이미 대장암이 진단되고 있는 환자에 대하여 예후 관찰 및 치료 효과 관찰을 목적으로 해서 CEA나 CA19-9 등의 혈액 종양 마커 검사가 실시되는 경우도 있다(비특허문헌 1).
연구 단계이지만 특허문헌 1~4에 나타내는 바와 같이 혈액을 비롯한 생체 샘플 중의 마이크로RNA(miRNA)의 발현량, 또는 miRNA의 발현량과 다른 단백질 마커의 발현량을 조합함으로써 대장암을 검출한다는 보고가 있다.
특허문헌 1에는 대장암 조직 중의 hsa-miR-92a-2-5p, hsa-miR-128-2-5p, hsa-miR-24-3p를 이용하여 대장암이나 다른 암을 검출하는 방법이 나타내어져 있다.
특허문헌 2에는 혈장 중의 hsa-miR-1233-5p나 hsa-miR-1225-3p를 이용하여 대장암을 검출하는 방법이 나타내어져 있다.
특허문헌 3에는 대장 조직이나 변 중의 hsa-miR-1231, hsa-miR-423-5p, hsa-miR-1268a 등 복수의 miRNA를 이용하여 대장암을 검출하는 방법이 나타내어져 있다.
특허문헌 4에는 조직 중의 hsa-miR-150-3p나 miR-92a-2-5p 등을 이용하여 대장암을 검출하는 방법이 나타내어져 있다.
국제공개 제 2007/081740호 미국특허출원공개 제 2013/102487호 명세서 미국특허출원공개 제 2012/088687호 명세서 일본특허공표 2009-531019호 공보
American Cancer Society 「Colorectal Cancer」, 2013년 감수, p.5~6, 17~28, 33~, 45~54, 67~71 Sobin, L. 등, 「TNM Classification of Malignant Tumours 제 7 판」 2010년, p.94-99 Allison, JE. 등, 1996년, The NeW England Journal of Medicine, 제 334(3)권, p.155-9 Palmqvist，R. 등, 2007년, Diseases of colon and rectum, 제 46(11)권, p.1538-44
본 발명의 과제는 신규한 대장암 종양 마커를 찾아내고, 상기 마커에 특이적으로 결합가능한 핵산을 이용하여 대장암을 효과적으로 검출할 수 있는 방법을 제공하는 것이다. 대장암의 1차 검사로서 현재 널리 보급되고 있는 변 잠혈 검사는 치질 등의 암이 아닌 이유로 출혈되고 있는 경우이어도 양성으로 판정되어버리는 한편, 출혈되고 있지 않는 조기의 대장암은 검출할 수 없어 90% 이상의 대장 이상(암을 포함함)을 놓친다는 보고도 있다(비특허문헌 1). 구체적인 변 잠혈 검사의 감도는 사용하는 검사 키트에 따라 37%~79.4%로 크게 다르고, 또한 특이도는 86.7%~97.7%가 된다(비특허문헌 3). 또한, 대장 내시경 검사는 검사 정밀도가 높은 것이 알려져 있지만 전처치나 진정제의 필요성, 비교적 가격이 높은 점 등으로부터 1차 스크리닝에는 적용하기 어렵다(비특허문헌 1). 또한, CEA나 CA19-9 등의 혈중 종양 마커는 대장암 이외의 암에서도 상승하는 경우가 있기 때문에 대장암의 유무를 판정할 수는 없다고 말해지고 있다. 다른 암을 잘못해서 대장암으로 진단해버리면 적절한 치료의 기회를 놓치거나, 잘못된 의료를 적용함으로써 환자에게 불필요한 경제적, 체력적 부담을 강요하게 된다. 그 때문에 CEA나 CA19-9는 이미 대장암으로 진단된 환자의 예후 관찰 및 치료 효과 관찰에 사용이 한정되어 있는 경우가 많다(비특허문헌 1). 어떤 보고에 의하면 CEA 검사의 특이도는 99%인 한편 감도는 12% 밖에 안되어 대장암 스크리닝 검사로서의 종양 마커 측정의 의의는 부족하다고 되어 있다(비특허문헌 4).
또한, 연구 단계이지만 혈액을 비롯한 생체 샘플 중의 마이크로RNA(miRNA)의 발현량을 이용하여 대장암을 판별한다는 보고가 하기와 같이 있지만 모두 실용화에 도달해 있지 않다.
특허문헌 1에는 대장암 조직 중의 hsa-miR-92a-2-5p, hsa-miR-128-2-5p, hsa-miR-24-3p를 이용하여 대장암이나 다른 암을 검출하는 방법이 나타내어져 있다. 그러나 본 검출 방법은 외과수술에 의해 대장암의 조직 검체를 입수할 필요가 있으며, 이 공정은 환자에게 주는 육체적 부담이 무겁기 때문에 검사 방법으로서는 바람직하지 않다. 또한, 본 검출 방법은 구체적인 정밀도, 감도, 특이도 등의 대장암의 검출 성능에 대한 기재가 없기 때문에 산업적 실용성이 부족하다.
특허문헌 3에는 대장 조직이나 대변 중의 hsa-miR-1231, hsa-miR-423-5p, hsa-miR-1268a 등 복수의 miRNA를 이용하여 대장암을 검출하는 방법이 나타내어져 있다. 그러나, 대장암 조직을 입수하기 위해 외과수술을 행하는 것은 환자에게 주는 육체적 부담이 무겁기 때문에 검사 방법으로서는 바람직하지 않다. 또한, 대변 검체는 채취가 비침습적이지만 피검 물질이 대변 중에 불균일하게 존재하는 경우가 있어 검사 결과에 불균일을 생기게 하기 쉽다는 과제가 있다.
특허문헌 4에는 조직 중의 hsa-miR-150-3p나 miR-92a-2-5p 등을 이용하여 대장암을 검출하는 방법이 나타내어져 있지만 정밀도, 감도, 특이도 등의 검출 성능 에 대한 기재가 없고, 또한 구체적인 혈액을 사용한 대장암의 판별 방법이 기재되어 있지 않기 때문에 산업적 실용성이 부족하다. 또한, 상기 miRNA 마커는 독립된 검체군에서 검증되고 있지 않기 때문에 신뢰성이 부족하다.
이렇게, 대장암의 검출에 있어서 기존의 종양 마커는 그 성능이 낮거나, 또한 연구 단계의 마커에 대해서는 성능이나 검출의 방법이 구체적으로 나타내어져 있지 않기 때문에 이들을 이용한 경우에는 건상체를 대장암 환자로 오검출하는 것에 의한 불필요한 추가 검사의 실시나, 대장암 환자를 간과하는 것에 의한 치료 기회의 일실이 일어날 가능성이 있다. 또한, 수십개~수백개로 이루어지는 miRNA를 측정하는 것은 검사 비용을 증대시키기 때문에 건강진단과 같은 대규모의 스크리닝에는 사용하기 어렵다. 또한, 종양 마커를 측정하기 위해서 대장 조직을 채취하는 것은 환자에게 주는 침습성이 높아 바람직하지 않기 때문에 저침습으로 채취할 수 있는 혈액으로부터의 검출이 가능하며, 대장암 환자를 대장암 환자로, 건상체를 건상체로 올바르게 판별할 수 있는 정밀도가 높은 대장암 마커가 요구된다. 대장암은 조기에 발견하여 치료함으로써 생존율을 대폭 향상시킬 수 있다. 또한, 대장암을 조기에 발견할 수 있으면 개복하지 않고 치료하는 내시경 수술이 적응가능해지는 점에서 진행도가 낮은 대장암에서도 검출할 수 있는 감도가 높은 대장암 마커가 갈망되고 있다.
본 발명자들은 상기 과제를 해결하기 위해 예의 검토한 결과, 저침습으로 채취할 수 있는 혈액으로부터 대장암의 검출 마커에 사용가능한 복수개의 유전자를 찾아내고, 이것에 특이적으로 결합가능한 핵산을 사용함으로써 대장암을 유의하게 검출할 수 있는 것을 찾아내어 본 발명을 완성하기에 이르렀다.
<발명의 개요>
즉, 본 발명은 이하의 특징을 갖는다.
(1) 대장암 마커인 miR-6726-5p, miR-4257, miR-6787-5p, miR-6780b-5p, miR-3131, miR-7108-5p, miR-1343-3p, miR-1247-3p, miR-4651, miR-6757-5p, miR-3679-5p, miR-7641, miR-6746-5p, miR-8072, miR-6741-5p, miR-1908-5p, miR-6857-5p, miR-4746-3p, miR-744-5p, miR-4792, miR-564, miR-6791-5p, miR-6825-5p, miR-6826-5p, miR-4665-3p, miR-4467, miR-3188, miR-6125, miR-6756-5p, miR-1228-3p, miR-8063, miR-8069, miR-6875-5p, miR-3185, miR-4433b-3p, miR-6887-5p, miR-128-1-5p, miR-6724-5p, miR-1914-3p, miR-1225-5p, miR-4419b, miR-7110-5p, miR-187-5p, miR-3184-5p, miR-204-3p, miR-5572, miR-6729-5p, miR-615-5p, miR-6749-5p, miR-6515-3p, miR-3937, miR-6840-3p, miR-6893-5p, miR-4728-5p, miR-6717-5p, miR-7113-3p, miR-4665-5p, miR-642b-3p, miR-7109-5p, miR-6842-5p, miR-4442, miR-4433-3p, miR-4707-5p, miR-6126, miR-4449, miR-4706, miR-1913, miR-602, miR-939-5p, miR-4695-5p, miR-711, miR-6816-5p, miR-4632-5p, miR-6721-5p, miR-7847-3p, miR-6132, miR-887-3p, miR-3679-3p, miR-6784-5p, miR-1249, miR-937-5p, miR-5195-3p, miR-6732-5p, miR-4417, miR-4281, miR-4734, miR-6766-3p, miR-663a, miR-4513, miR-6781-5p, miR-1227-5p, miR-6845-5p, miR-6798-5p, miR-3620-5p, miR-1915-5p, miR-4294, miR-642a-3p, miR-371a-5p, miR-940, miR-4450, miR-4723-5p, miR-1469, miR-6861-5p, miR-7975, miR-6879-5p, miR-6802-5p, miR-1268b, miR-663b, miR-125a-3p, miR-2861, miR-6088, miR-4758-5p, miR-296-3p, miR-6738-5p, miR-671-5p, miR-4454, miR-4516, miR-7845-5p, miR-4741, miR-92b-5p, miR-6795-5p, miR-6805-3p, miR-4725-3p, miR-6782-5p, miR-4688, miR-6850-5p, miR-6777-5p, miR-6785-5p, miR-7106-5p, miR-3663-3p, miR-6131, miR-1915-3p, miR-4532, miR-6820-5p, miR-4689, miR-4638-5p, miR-3656, miR-3621, miR-6769b-5p, miR-149-3p, miR-23b-3p, miR-3135b, miR-6848-5p, miR-6769a-5p, miR-4327, miR-6765-3p, miR-6716-5p, miR-6877-5p, miR-6727-5p, miR-4534, miR-614, miR-1202, miR-575, miR-6870-5p, miR-6722-3p, miR-7977, miR-4649-5p, miR-4675, miR-6075, miR-6779-5p, miR-4271, miR-3196, miR-6803-5p, miR-6789-5p, miR-4648, miR-4508, miR-4749-5p, miR-4505, miR-5698, miR-1199-5p, miR-4763-3p, miR-6836-3p, miR-3195, miR-718, miR-3178, miR-638, miR-4497, miR-6085, miR-6752-5p 및 miR-135a-3p로 이루어지는 군으로부터 선택되는 적어도 1개 이상의 폴리뉴클레오티드와 특이적으로 결합가능한 핵산을 포함하는 대장암의 검출용 키트.
(2) miR-6726-5p가 hsa-miR-6726-5p이며, miR-4257이 hsa-miR-4257이며, miR-6787-5p가 hsa-miR-6787-5p이며, miR-6780b-5p가 hsa-miR-6780b-5p이며, miR-3131이 hsa-miR-3131이며, miR-7108-5p가 hsa-miR-7108-5p이며, miR-1343-3p가 hsa-miR-1343-3p이며, miR-1247-3p가 hsa-miR-1247-3p이며, miR-4651이 hsa-miR-4651이며, miR-6757-5p가 hsa-miR-6757-5p이며, miR-3679-5p가 hsa-miR-3679-5p이며, miR-7641이 hsa-miR-7641이며, miR-6746-5p가 hsa-miR-6746-5p이며, miR-8072가 hsa-miR-8072이며, miR-6741-5p가 hsa-miR-6741-5p이며, miR-1908-5p가 hsa-miR-1908-5p이며, miR-6857-5p가 hsa-miR-6857-5p이며, miR-4746-3p가 hsa-miR-4746-3p이며, miR-744-5p가 hsa-miR-744-5p이며, miR-4792가 hsa-miR-4792이며, miR-564가 hsa-miR-564이며, miR-6791-5p가 hsa-miR-6791-5p이며, miR-6825-5p가 hsa-miR-6825-5p이며, miR-6826-5p가 hsa-miR-6826-5p이며, miR-4665-3p가 hsa-miR-4665-3p이며, miR-4467이 hsa-miR-4467이며, miR-3188이 hsa-miR-3188이며, miR-6125가 hsa-miR-6125이며, miR-6756-5p가 hsa-miR-6756-5p이며, miR-1228-3p가 hsa-miR-1228-3p이며, miR-8063이 hsa-miR-8063이며, miR-8069가 hsa-miR-8069이며, miR-6875-5p가 hsa-miR-6875-5p이며, miR-3185가 hsa-miR-3185이며, miR-4433b-3p가 hsa-miR-4433b-3p이며, miR-6887-5p가 hsa-miR-6887-5p이며, miR-128-1-5p가 hsa-miR-128-1-5p이며, miR-6724-5p가 hsa-miR-6724-5p이며, miR-1914-3p가 hsa-miR-1914-3p이며, miR-1225-5p가 hsa-miR-1225-5p이며, miR-4419b가 hsa-miR-4419b이며, miR-7110-5p가 hsa-miR-7110-5p이며, miR-187-5p가 hsa-miR-187-5p이며, miR-3184-5p가 hsa-miR-3184-5p이며, miR-204-3p가 hsa-miR-204-3p이며, miR-5572가 hsa-miR-5572이며, miR-6729-5p가 hsa-miR-6729-5p이며, miR-615-5p가 hsa-miR-615-5p이며, miR-6749-5p가 hsa-miR-6749-5p이며, miR-6515-3p가 hsa-miR-6515-3p이며, miR-3937이 hsa-miR-3937이며, miR-6840-3p가 hsa-miR-6840-3p이며, miR-6893-5p가 hsa-miR-6893-5p이며, miR-4728-5p가 hsa-miR-4728-5p이며, miR-6717-5p가 hsa-miR-6717-5p이며, miR-7113-3p가 hsa-miR-7113-3p이며, miR-4665-5p가 hsa-miR-4665-5p이며, miR-642b-3p가 hsa-miR-642b-3p이며, miR-7109-5p가 hsa-miR-7109-5p이며, miR-6842-5p가 hsa-miR-6842-5p이며, miR-4442가 hsa-miR-4442이며, miR-4433-3p가 hsa-miR-4433-3p이며, miR-4707-5p가 hsa-miR-4707-5p이며, miR-6126이 hsa-miR-6126이며, miR-4449가 hsa-miR-4449이며, miR-4706이 hsa-miR-4706이며, miR-1913이 hsa-miR-1913이며, miR-602가 hsa-miR-602이며, miR-939-5p가 hsa-miR-939-5p이며, miR-4695-5p가 hsa-miR-4695-5p이며, miR-711이 hsa-miR-711이며, miR-6816-5p가 hsa-miR-6816-5p이며, miR-4632-5p가 hsa-miR-4632-5p이며, miR-6721-5p가 hsa-miR-6721-5p이며, miR-7847-3p가 hsa-miR-7847-3p이며, miR-6132가 hsa-miR-6132이며, miR-887-3p가 hsa-miR-887-3p이며, miR-3679-3p가 hsa-miR-3679-3p이며, miR-6784-5p가 hsa-miR-6784-5p이며, miR-1249가 hsa-miR-1249이며, miR-937-5p가 hsa-miR-937-5p이며, miR-5195-3p가 hsa-miR-5195-3p이며, miR-6732-5p가 hsa-miR-6732-5p이며, miR-4417이 hsa-miR-4417이며, miR-4281이 hsa-miR-4281이며, miR-4734가 hsa-miR-4734이며, miR-6766-3p가 hsa-miR-6766-3p이며, miR-663a가 hsa-miR-663a이며, miR-4513이 hsa-miR-4513이며, miR-6781-5p가 hsa-miR-6781-5p이며, miR-1227-5p가 hsa-miR-1227-5p이며, miR-6845-5p가 hsa-miR-6845-5p이며, miR-6798-5p가 hsa-miR-6798-5p이며, miR-3620-5p가 hsa-miR-3620-5p이며, miR-1915-5p가 hsa-miR-1915-5p이며, miR-4294가 hsa-miR-4294이며, miR-642a-3p가 hsa-miR-642a-3p이며, miR-371a-5p가 hsa-miR-371a-5p이며, miR-940이 hsa-miR-940이며, miR-4450이 hsa-miR-4450이며, miR-4723-5p가 hsa-miR-4723-5p이며, miR-1469가 hsa-miR-1469이며, miR-6861-5p가 hsa-miR-6861-5p이며, miR-7975가 hsa-miR-7975이며, miR-6879-5p가 hsa-miR-6879-5p이며, miR-6802-5p가 hsa-miR-6802-5p이며, miR-1268b가 hsa-miR-1268b이며, miR-663b가 hsa-miR-663b이며, miR-125a-3p가 hsa-miR-125a-3p이며, miR-2861이 hsa-miR-2861이며, miR-6088이 hsa-miR-6088이며, miR-4758-5p가 hsa-miR-4758-5p이며, miR-296-3p가 hsa-miR-296-3p이며, miR-6738-5p가 hsa-miR-6738-5p이며, miR-671-5p가 hsa-miR-671-5p이며, miR-4454가 hsa-miR-4454이며, miR-4516이 hsa-miR-4516이며, miR-7845-5p가 hsa-miR-7845-5p이며, miR-4741이 hsa-miR-4741이며, miR-92b-5p가 hsa-miR-92b-5p이며, miR-6795-5p가 hsa-miR-6795-5p이며, miR-6805-3p가 hsa-miR-6805-3p이며, miR-4725-3p가 hsa-miR-4725-3p이며, miR-6782-5p가 hsa-miR-6782-5p이며, miR-4688이 hsa-miR-4688이며, miR-6850-5p가 hsa-miR-6850-5p이며, miR-6777-5p가 hsa-miR-6777-5p이며, miR-6785-5p가 hsa-miR-6785-5p이며, miR-7106-5p가 hsa-miR-7106-5p이며, miR-3663-3p가 hsa-miR-3663-3p이며, miR-6131이 hsa-miR-6131이며, miR-1915-3p가 hsa-miR-1915-3p이며, miR-4532가 hsa-miR-4532이며, miR-6820-5p가 hsa-miR-6820-5p이며, miR-4689가 hsa-miR-4689이며, miR-4638-5p가 hsa-miR-4638-5p이며, miR-3656이 hsa-miR-3656이며, miR-3621이 hsa-miR-3621이며, miR-6769b-5p가 hsa-miR-6769b-5p이며, miR-149-3p가 hsa-miR-149-3p이며, miR-23b-3p가 hsa-miR-23b-3p이며, miR-3135b가 hsa-miR-3135b이며, miR-6848-5p가 hsa-miR-6848-5p이며, miR-6769a-5p가 hsa-miR-6769a-5p이며, miR-4327이 hsa-miR-4327이며, miR-6765-3p가 hsa-miR-6765-3p이며, miR-6716-5p가 hsa-miR-6716-5p이며, miR-6877-5p가 hsa-miR-6877-5p이며, miR-6727-5p가 hsa-miR-6727-5p이며, miR-4534가 hsa-miR-4534이며, miR-614가 hsa-miR-614이며, miR-1202가 hsa-miR-1202이며, miR-575가 hsa-miR-575이며, miR-6870-5p가 hsa-miR-6870-5p이며, miR-6722-3p가 hsa-miR-6722-3p이며, miR-7977이 hsa-miR-7977이며, miR-4649-5p가 hsa-miR-4649-5p이며, miR-4675가 hsa-miR-4675이며, miR-6075가 hsa-miR-6075이며, miR-6779-5p가 hsa-miR-6779-5p이며, miR-4271이 hsa-miR-4271이며, miR-3196이 hsa-miR-3196이며, miR-6803-5p가 hsa-miR-6803-5p이며, miR-6789-5p가 hsa-miR-6789-5p이며, miR-4648이 hsa-miR-4648이며, miR-4508이 hsa-miR-4508이며, miR-4749-5p가 hsa-miR-4749-5p이며, miR-4505가 hsa-miR-4505이며, miR-5698이 hsa-miR-5698이며, miR-1199-5p가 hsa-miR-1199-5p이며, miR-4763-3p가 hsa-miR-4763-3p이며, miR-6836-3p가 hsa-miR-6836-3p이며, miR-3195가 hsa-miR-3195이며, miR-718이 hsa-miR-718이며, miR-3178이 hsa-miR-3178이며, miR-638이 hsa-miR-638이며, miR-4497이 hsa-miR-4497이며, miR-6085가 hsa-miR-6085이며, miR-6752-5p가 hsa-miR-6752-5p이며, 또한 miR-135a-3p가 hsa-miR-135a-3p인 (1)에 기재된 키트.
(3) 상기 핵산이 하기 (a)~(e)에 나타내는 폴리뉴클레오티드:
(a) 서열번호 1~171 및 606~614 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편,
(b) 서열번호 1~171 및 606~614 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드,
(c) 서열번호 1~171 및 606~614 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열에 상보적인 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편,
(d) 서열번호 1~171 및 606~614 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열에 상보적인 염기 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 및
(e) 상기 (a)~(d) 중 어느 하나의 폴리뉴클레오티드와 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드로 이루어지는 군으로부터 선택되는 폴리뉴클레오티드인 (1) 또는 (2)에 기재된 키트.
(4) 상기 키트가, 별도의 대장암 마커인 miR-1231, miR-1233-5p, miR-150-3p, miR-1225-3p, miR-92a-2-5p, miR-423-5p, miR-1268a, miR-128-2-5p 및 miR-24-3p로 이루어지는 군으로부터 선택되는 적어도 1개 이상의 폴리뉴클레오티드와 특이적으로 결합가능한 핵산을 더 포함하는 (1) 내지 (3) 중 어느 하나에 기재된 키트.
(5) miR-1231이 hsa-miR-1231이며, miR-1233-5p가 hsa-miR-1233-5p이며, miR-150-3p가 hsa-miR-150-3p이며, miR-1225-3p가 hsa-miR-1225-3p이며, miR-92a-2-5p가 hsa-miR-92a-2-5p이며, miR-423-5p가 hsa-miR-423-5p이며, miR-1268a가 hsa-miR-1268a이며, miR-128-2-5p가 hsa-miR-128-2-5p이며, 또한 miR-24-3p가 hsa-miR-24-3p인 (4)에 기재된 키트.
(6) 상기 핵산이 하기 (f)~(j)에 나타내는 폴리뉴클레오티드:
(f) 서열번호 172~180 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편,
(g) 서열번호 172~180 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드,
(h) 서열번호 172~180 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열에 상보적인 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편,
(i) 서열번호 172~180 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열에 상보적인 염기 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 및
(j) 상기 (f)~(i) 중 어느 하나의 폴리뉴클레오티드와 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드로 이루어지는 군으로부터 선택되는 폴리뉴클레오티드인 (4) 또는 (5)에 기재된 키트.
(7) 상기 키트가, 별도의 대장암 마커인 miR-4697-5p, miR-3197, miR-675-5p, miR-4486, miR-7107-5p, miR-23a-3p, miR-4667-5p, miR-451a, miR-3940-5p, miR-8059, miR-6813-5p, miR-4492, miR-4476 및 miR-6090으로 이루어지는 군으로부터 선택되는 적어도 1개 이상의 폴리뉴클레오티드와 특이적으로 결합가능한 핵산을 더 포함하는 (1) 내지 (6) 중 어느 하나에 기재된 키트.
(8) miR-4697-5p가 hsa-miR-4697-5p이며, miR-3197이 hsa-miR-3197이며, miR-675-5p가 hsa-miR-675-5p이며, miR-4486이 hsa-miR-4486이며, miR-7107-5p가 hsa-miR-7107-5p이며, miR-23a-3p가 hsa-miR-23a-3p이며, miR-4667-5p가 hsa-miR-4667-5p이며, miR-451a가 hsa-miR-451a이며, miR-3940-5p가 hsa-miR-3940-5p이며, miR-8059가 hsa-miR-8059이며, miR-6813-5p가 hsa-miR-6813-5p이며, miR-4492가 hsa-miR-4492이며, miR-4476이 hsa-miR-4476이며, 또한 miR-6090이 hsa-miR-6090인 (7)에 기재된 키트.
(9) 상기 핵산이 하기 (k)~(o)에 나타내는 폴리뉴클레오티드:
(k) 서열번호 181~194 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편,
(l) 서열번호 181~194 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드,
(m) 서열번호 181~194 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열에 상보적인 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편,
(n) 서열번호 181~194 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열에 상보적인 염기 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 및
(o) 상기 (k)~(n) 중 어느 하나의 폴리뉴클레오티드와 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드로 이루어지는 군으로부터 선택되는 폴리뉴클레오티드인 (7) 또는 (8)에 기재된 키트.
(10) 상기 키트가, (1) 또는 (2)에 기재된 모든 대장암 마커로 이루어지는 군으로부터 선택되는 적어도 2개 이상의 폴리뉴클레오티드 각각과 특이적으로 결합가능한 적어도 2개 이상의 핵산을 포함하는 (1) 내지 (9) 중 어느 하나에 기재된 키트.
(11) 대장암 마커인 miR-6726-5p, miR-4257, miR-6787-5p, miR-6780b-5p, miR-3131, miR-7108-5p, miR-1343-3p, miR-1247-3p, miR-4651, miR-6757-5p, miR-3679-5p, miR-7641, miR-6746-5p, miR-8072, miR-6741-5p, miR-1908-5p, miR-6857-5p, miR-4746-3p, miR-744-5p, miR-4792, miR-564, miR-6791-5p, miR-6825-5p, miR-6826-5p, miR-4665-3p, miR-4467, miR-3188, miR-6125, miR-6756-5p, miR-1228-3p, miR-8063, miR-8069, miR-6875-5p, miR-3185, miR-4433b-3p, miR-6887-5p, miR-128-1-5p, miR-6724-5p, miR-1914-3p, miR-1225-5p, miR-4419b, miR-7110-5p, miR-187-5p, miR-3184-5p, miR-204-3p, miR-5572, miR-6729-5p, miR-615-5p, miR-6749-5p, miR-6515-3p, miR-3937, miR-6840-3p, miR-6893-5p, miR-4728-5p, miR-6717-5p, miR-7113-3p, miR-4665-5p, miR-642b-3p, miR-7109-5p, miR-6842-5p, miR-4442, miR-4433-3p, miR-4707-5p, miR-6126, miR-4449, miR-4706, miR-1913, miR-602, miR-939-5p, miR-4695-5p, miR-711, miR-6816-5p, miR-4632-5p, miR-6721-5p, miR-7847-3p, miR-6132, miR-887-3p, miR-3679-3p, miR-6784-5p, miR-1249, miR-937-5p, miR-5195-3p, miR-6732-5p, miR-4417, miR-4281, miR-4734, miR-6766-3p, miR-663a, miR-4513, miR-6781-5p, miR-1227-5p, miR-6845-5p, miR-6798-5p, miR-3620-5p, miR-1915-5p, miR-4294, miR-642a-3p, miR-371a-5p, miR-940, miR-4450, miR-4723-5p, miR-1469, miR-6861-5p, miR-7975, miR-6879-5p, miR-6802-5p, miR-1268b, miR-663b, miR-125a-3p, miR-2861, miR-6088, miR-4758-5p, miR-296-3p, miR-6738-5p, miR-671-5p, miR-4454, miR-4516, miR-7845-5p, miR-4741, miR-92b-5p, miR-6795-5p, miR-6805-3p, miR-4725-3p, miR-6782-5p, miR-4688, miR-6850-5p, miR-6777-5p, miR-6785-5p, miR-7106-5p, miR-3663-3p, miR-6131, miR-1915-3p, miR-4532, miR-6820-5p, miR-4689, miR-4638-5p, miR-3656, miR-3621, miR-6769b-5p, miR-149-3p, miR-23b-3p, miR-3135b, miR-6848-5p, miR-6769a-5p, miR-4327, miR-6765-3p, miR-6716-5p, miR-6877-5p, miR-6727-5p, miR-4534, miR-614, miR-1202, miR-575, miR-6870-5p, miR-6722-3p, miR-7977, miR-4649-5p, miR-4675, miR-6075, miR-6779-5p, miR-4271, miR-3196, miR-6803-5p, miR-6789-5p, miR-4648, miR-4508, miR-4749-5p, miR-4505, miR-5698, miR-1199-5p, miR-4763-3p, miR-6836-3p, miR-3195, miR-718, miR-3178, miR-638, miR-4497, miR-6085, miR-6752-5p 및 miR-135a-3p로 이루어지는 군으로부터 선택되는 적어도 1개 이상의 폴리뉴클레오티드와 특이적으로 결합가능한 핵산을 포함하는 대장암의 검출용 디바이스.
(12) miR-6726-5p가 hsa-miR-6726-5p이며, miR-4257이 hsa-miR-4257이며, miR-6787-5p가 hsa-miR-6787-5p이며, miR-6780b-5p가 hsa-miR-6780b-5p이며, miR-3131이 hsa-miR-3131이며, miR-7108-5p가 hsa-miR-7108-5p이며, miR-1343-3p가 hsa-miR-1343-3p이며, miR-1247-3p가 hsa-miR-1247-3p이며, miR-4651이 hsa-miR-4651이며, miR-6757-5p가 hsa-miR-6757-5p이며, miR-3679-5p가 hsa-miR-3679-5p이며, miR-7641이 hsa-miR-7641이며, miR-6746-5p가 hsa-miR-6746-5p이며, miR-8072가 hsa-miR-8072이며, miR-6741-5p가 hsa-miR-6741-5p이며, miR-1908-5p가 hsa-miR-1908-5p이며, miR-6857-5p가 hsa-miR-6857-5p이며, miR-4746-3p가 hsa-miR-4746-3p이며, miR-744-5p가 hsa-miR-744-5p이며, miR-4792가 hsa-miR-4792이며, miR-564가 hsa-miR-564이며, miR-6791-5p가 hsa-miR-6791-5p이며, miR-6825-5p가 hsa-miR-6825-5p이며, miR-6826-5p가 hsa-miR-6826-5p이며, miR-4665-3p가 hsa-miR-4665-3p이며, miR-4467이 hsa-miR-4467이며, miR-3188이 hsa-miR-3188이며, miR-6125가 hsa-miR-6125이며, miR-6756-5p가 hsa-miR-6756-5p이며, miR-1228-3p가 hsa-miR-1228-3p이며, miR-8063이 hsa-miR-8063이며, miR-8069가 hsa-miR-8069이며, miR-6875-5p가 hsa-miR-6875-5p이며, miR-3185가 hsa-miR-3185이며, miR-4433b-3p가 hsa-miR-4433b-3p이며, miR-6887-5p가 hsa-miR-6887-5p이며, miR-128-1-5p가 hsa-miR-128-1-5p이며, miR-6724-5p가 hsa-miR-6724-5p이며, miR-1914-3p가 hsa-miR-1914-3p이며, miR-1225-5p가 hsa-miR-1225-5p이며, miR-4419b가 hsa-miR-4419b이며, miR-7110-5p가 hsa-miR-7110-5p이며, miR-187-5p가 hsa-miR-187-5p이며, miR-3184-5p가 hsa-miR-3184-5p이며, miR-204-3p가 hsa-miR-204-3p이며, miR-5572가 hsa-miR-5572이며, miR-6729-5p가 hsa-miR-6729-5p이며, miR-615-5p가 hsa-miR-615-5p이며, miR-6749-5p가 hsa-miR-6749-5p이며, miR-6515-3p가 hsa-miR-6515-3p이며, miR-3937이 hsa-miR-3937이며, miR-6840-3p가 hsa-miR-6840-3p이며, miR-6893-5p가 hsa-miR-6893-5p이며, miR-4728-5p가 hsa-miR-4728-5p이며, miR-6717-5p가 hsa-miR-6717-5p이며, miR-7113-3p가 hsa-miR-7113-3p이며, miR-4665-5p가 hsa-miR-4665-5p이며, miR-642b-3p가 hsa-miR-642b-3p이며, miR-7109-5p가 hsa-miR-7109-5p이며, miR-6842-5p가 hsa-miR-6842-5p이며, miR-4442가 hsa-miR-4442이며, miR-4433-3p가 hsa-miR-4433-3p이며, miR-4707-5p가 hsa-miR-4707-5p이며, miR-6126이 hsa-miR-6126이며, miR-4449가 hsa-miR-4449이며, miR-4706이 hsa-miR-4706이며, miR-1913이 hsa-miR-1913이며, miR-602가 hsa-miR-602이며, miR-939-5p가 hsa-miR-939-5p이며, miR-4695-5p가 hsa-miR-4695-5p이며, miR-711이 hsa-miR-711이며, miR-6816-5p가 hsa-miR-6816-5p이며, miR-4632-5p가 hsa-miR-4632-5p이며, miR-6721-5p가 hsa-miR-6721-5p이며, miR-7847-3p가 hsa-miR-7847-3p이며, miR-6132가 hsa-miR-6132이며, miR-887-3p가 hsa-miR-887-3p이며, miR-3679-3p가 hsa-miR-3679-3p이며, miR-6784-5p가 hsa-miR-6784-5p이며, miR-1249가 hsa-miR-1249이며, miR-937-5p가 hsa-miR-937-5p이며, miR-5195-3p가 hsa-miR-5195-3p이며, miR-6732-5p가 hsa-miR-6732-5p이며, miR-4417이 hsa-miR-4417이며, miR-4281이 hsa-miR-4281이며, miR-4734가 hsa-miR-4734이며, miR-6766-3p가 hsa-miR-6766-3p이며, miR-663a가 hsa-miR-663a이며, miR-4513이 hsa-miR-4513이며, miR-6781-5p가 hsa-miR-6781-5p이며, miR-1227-5p가 hsa-miR-1227-5p이며, miR-6845-5p가 hsa-miR-6845-5p이며, miR-6798-5p가 hsa-miR-6798-5p이며, miR-3620-5p가 hsa-miR-3620-5p이며, miR-1915-5p가 hsa-miR-1915-5p이며, miR-4294가 hsa-miR-4294이며, miR-642a-3p가 hsa-miR-642a-3p이며, miR-371a-5p가 hsa-miR-371a-5p이며, miR-940이 hsa-miR-940이며, miR-4450이 hsa-miR-4450이며, miR-4723-5p가 hsa-miR-4723-5p이며, miR-1469가 hsa-miR-1469이며, miR-6861-5p가 hsa-miR-6861-5p이며, miR-7975가 hsa-miR-7975이며, miR-6879-5p가 hsa-miR-6879-5p이며, miR-6802-5p가 hsa-miR-6802-5p이며, miR-1268b가 hsa-miR-1268b이며, miR-663b가 hsa-miR-663b이며, miR-125a-3p가 hsa-miR-125a-3p이며, miR-2861이 hsa-miR-2861이며, miR-6088이 hsa-miR-6088이며, miR-4758-5p가 hsa-miR-4758-5p이며, miR-296-3p가 hsa-miR-296-3p이며, miR-6738-5p가 hsa-miR-6738-5p이며, miR-671-5p가 hsa-miR-671-5p이며, miR-4454가 hsa-miR-4454이며, miR-4516이 hsa-miR-4516이며, miR-7845-5p가 hsa-miR-7845-5p이며, miR-4741이 hsa-miR-4741이며, miR-92b-5p가 hsa-miR-92b-5p이며, miR-6795-5p가 hsa-miR-6795-5p이며, miR-6805-3p가 hsa-miR-6805-3p이며, miR-4725-3p가 hsa-miR-4725-3p이며, miR-6782-5p가 hsa-miR-6782-5p이며, miR-4688이 hsa-miR-4688이며, miR-6850-5p가 hsa-miR-6850-5p이며, miR-6777-5p가 hsa-miR-6777-5p이며, miR-6785-5p가 hsa-miR-6785-5p이며, miR-7106-5p가 hsa-miR-7106-5p이며, miR-3663-3p가 hsa-miR-3663-3p이며, miR-6131이 hsa-miR-6131이며, miR-1915-3p가 hsa-miR-1915-3p이며, miR-4532가 hsa-miR-4532이며, miR-6820-5p가 hsa-miR-6820-5p이며, miR-4689가 hsa-miR-4689이며, miR-4638-5p가 hsa-miR-4638-5p이며, miR-3656이 hsa-miR-3656이며, miR-3621이 hsa-miR-3621이며, miR-6769b-5p가 hsa-miR-6769b-5p이며, miR-149-3p가 hsa-miR-149-3p이며, miR-23b-3p가 hsa-miR-23b-3p이며, miR-3135b가 hsa-miR-3135b이며, miR-6848-5p가 hsa-miR-6848-5p이며, miR-6769a-5p가 hsa-miR-6769a-5p이며, miR-4327이 hsa-miR-4327이며, miR-6765-3p가 hsa-miR-6765-3p이며, miR-6716-5p가 hsa-miR-6716-5p이며, miR-6877-5p가 hsa-miR-6877-5p이며, miR-6727-5p가 hsa-miR-6727-5p이며, miR-4534가 hsa-miR-4534이며, miR-614가 hsa-miR-614이며, miR-1202가 hsa-miR-1202이며, miR-575가 hsa-miR-575이며, miR-6870-5p가 hsa-miR-6870-5p이며, miR-6722-3p가 hsa-miR-6722-3p이며, miR-7977이 hsa-miR-7977이며, miR-4649-5p가 hsa-miR-4649-5p이며, miR-4675가 hsa-miR-4675이며, miR-6075가 hsa-miR-6075이며, miR-6779-5p가 hsa-miR-6779-5p이며, miR-4271이 hsa-miR-4271이며, miR-3196이 hsa-miR-3196이며, miR-6803-5p가 hsa-miR-6803-5p이며, miR-6789-5p가 hsa-miR-6789-5p이며, miR-4648이 hsa-miR-4648이며, miR-4508이 hsa-miR-4508이며, miR-4749-5p가 hsa-miR-4749-5p이며, miR-4505가 hsa-miR-4505이며, miR-5698이 hsa-miR-5698이며, miR-1199-5p가 hsa-miR-1199-5p이며, miR-4763-3p가 hsa-miR-4763-3p이며, miR-6836-3p가 hsa-miR-6836-3p이며, miR-3195가 hsa-miR-3195이며, miR-718이 hsa-miR-718이며, miR-3178이 hsa-miR-3178이며, miR-638이 hsa-miR-638이며, miR-4497이 hsa-miR-4497이며, miR-6085가 hsa-miR-6085이며, miR-6752-5p가 hsa-miR-6752-5p이며, 또한 miR-135a-3p가 hsa-miR-135a-3p인 (11)에 기재된 디바이스.
(13) 상기 핵산이 하기 (a)~(e)에 나타내는 폴리뉴클레오티드:
(a) 서열번호 1~171 및 606~614 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편,
(b) 서열번호 1~171 및 606~614 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드,
(c) 서열번호 1~171 및 606~614 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열에 상보적인 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편,
(d) 서열번호 1~171 및 606~614 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열에 상보적인 염기 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 및
(e) 상기 (a)~(d) 중 어느 하나의 폴리뉴클레오티드와 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드로 이루어지는 군으로부터 선택되는 폴리뉴클레오티드인 (11) 또는 (12)에 기재된 디바이스.
(14) 상기 디바이스가, 별도의 대장암 마커인 miR-1231, miR-1233-5p, miR-150-3p, miR-1225-3p, miR-92a-2-5p, miR-423-5p, miR-1268a, miR-128-2-5p 및 miR-24-3p로 이루어지는 군으로부터 선택되는 적어도 1개 이상의 폴리뉴클레오티드와 특이적으로 결합가능한 핵산을 더 포함하는 (11) 내지 (13) 중 어느 하나에 기재된 디바이스.
(15) miR-1231이 hsa-miR-1231이며, miR-1233-5p가 hsa-miR-1233-5p이며, miR-150-3p가 hsa-miR-150-3p이며, miR-1225-3p가 hsa-miR-1225-3p이며, miR-92a-2-5p가 hsa-miR-92a-2-5p이며, miR-423-5p가 hsa-miR-423-5p이며, miR-1268a가 hsa-miR-1268a이며, miR-128-2-5p가 hsa-miR-128-2-5p이며, 또한 miR-24-3p가 hsa-miR-24-3p인 (14)에 기재된 디바이스.
(16) 상기 핵산은 하기 (f)~(j)에 나타내는 폴리뉴클레오티드:
(f) 서열번호 172~180 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편,
(g) 서열번호 172~180 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드,
(h) 서열번호 172~180 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열에 상보적인 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편,
(i) 서열번호 172~180 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열에 상보적인 염기 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 및
(j) 상기 (f)~(i) 중 어느 하나의 폴리뉴클레오티드와 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드로 이루어지는 군으로부터 선택되는 폴리뉴클레오티드인 (14) 또는 (15)에 기재된 디바이스.
(17) 상기 디바이스가, 별도의 대장암 마커인 miR-4697-5p, miR-3197, miR-675-5p, miR-4486, miR-7107-5p, miR-23a-3p, miR-4667-5p, miR-451a, miR-3940-5p, miR-8059, miR-6813-5p, miR-4492, miR-4476 및 miR-6090으로 이루어지는 군으로부터 선택되는 적어도 1개 이상의 폴리뉴클레오티드와 특이적으로 결합가능한 핵산을 더 포함하는 (11) 내지 (16) 중 어느 하나에 기재된 디바이스.
(18) miR-4697-5p가 hsa-miR-4697-5p이며, miR-3197이 hsa-miR-3197이며, miR-675-5p가 hsa-miR-675-5p이며, miR-4486이 hsa-miR-4486이며, miR-7107-5p가 hsa-miR-7107-5p이며, miR-23a-3p가 hsa-miR-23a-3p이며, miR-4667-5p가 hsa-miR-4667-5p이며, miR-451a가 hsa-miR-451a이며, miR-3940-5p가 hsa-miR-3940-5p이며, miR-8059가 hsa-miR-8059이며, miR-6813-5p가 hsa-miR-6813-5p이며, miR-4492가 hsa-miR-4492이며, miR-4476이 hsa-miR-4476이며, 또한 miR-6090이 hsa-miR-6090인 (17)에 기재된 디바이스.
(19) 상기 핵산이 하기 (k)~(o)에 나타내는 폴리뉴클레오티드:
(k) 서열번호 181~194 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편,
(l) 서열번호 181~194 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드,
(m) 서열번호 181~194 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열에 상보적인 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편,
(n) 서열번호 181~194 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열에 상보적인 염기 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 및
(o) 상기 (k)~(n) 중 어느 하나의 폴리뉴클레오티드와 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드로 이루어지는 군으로부터 선택되는 폴리뉴클레오티드인 (17) 또는 (18)에 기재된 디바이스.
(20) 상기 디바이스가 하이브리다이제이션 기술에 의한 측정을 위한 디바이스인 (11) 내지 (19) 중 어느 하나에 기재된 디바이스.
(21) 상기 하이브리다이제이션 기술이 핵산 어레이 기술인 (20)에 기재된 디바이스.
(22) 상기 디바이스가, (11) 또는 (12)에 기재된 모든 대장암 마커로부터 선택되는 적어도 2개 이상의 폴리뉴클레오티드 각각과 특이적으로 결합가능한 적어도 2개 이상의 핵산을 포함하는 (11) 내지 (21) 중 어느 하나에 기재된 디바이스.
(23) (1) 내지 (10) 중 어느 하나에 기재된 키트 또는 (11) 내지 (22) 중 어느 하나에 기재된 디바이스를 사용하여 피험체의 검체에 있어서의 표적 핵산의 발현량을 측정하고, 그 측정된 발현량과, 마찬가지로 측정된 건상체의 대조 발현량을 이용하여 피험체가 대장암에 이환되어 있는 것, 또는 대장암에 이환되어 있지 않은 것을 in vitro에서 평가하는 것을 포함하는 대장암의 검출 방법.
(24) 상기 피험체가 인간인 (23)에 기재된 방법.
(25) 상기 검체는 혈액, 혈청 또는 혈장인 (23) 또는 (24)에 기재된 방법.
<용어의 정의>
본 명세서 중에서 사용하는 용어는 이하의 정의를 갖는다.
뉴클레오티드, 폴리뉴클레오티드, DNA, RNA 등의 약호에 의한 표시는 「염기 서열 또는 아미노산 서열을 포함하는 명세서 등의 작성을 위한 가이드라인」(일본국특허청 편) 및 해당기술분야에 있어서의 관용을 따르는 것으로 한다.
본 명세서에 있어서 「폴리뉴클레오티드」란 RNA, DNA, 및 RNA/DNA(키메라) 모두 포함하는 핵산에 대해 사용된다. 또한, 상기 DNA에는 cDNA, 게놈 DNA, 및 합성 DNA 모두가 포함된다. 또한, 상기 RNA에는 total RNA, mRNA, rRNA, miRNA, siRNA, snoRNA, snRNA, 비코딩(non-coding) RNA 및 합성 RNA 모두가 포함된다. 본 명세서에 있어서 「합성 DNA」 및 「합성 RNA」는 소정의 염기 서열(천연형 서열 또는 비천연형 서열 중 어느 것이어도 좋다)에 의거하여 예를 들면, 자동 핵산 합성기를 사용하여 인공적으로 제작된 DNA 및 RNA를 말한다. 본 명세서에 있어서 「비천연형 서열」은 광의의 의미로 사용하는 것을 의도하고 있고, 천연형 서열과 다른, 예를 들면 1개 이상의 뉴클레오티드의 치환, 결실, 삽입 및/또는 부가를 포함하는 서열(즉, 변이 서열), 1개 이상의 수식 뉴클레오티드를 포함하는 서열(즉, 수식 서열) 등을 포함한다. 또한, 본 명세서에서는 폴리뉴클레오티드는 핵산과 호환적으로 사용된다.
본 명세서에 있어서 「단편」이란 폴리뉴클레오티드의 연속된 일부분의 염기 서열을 갖는 폴리뉴클레오티드이며, 15 염기 이상, 바람직하게는 17 염기 이상, 보다 바람직하게는 19 염기 이상의 길이를 갖는 것이 바람직하다.
본 명세서에 있어서 「유전자」란 RNA, 및 2본쇄 DNA뿐만 아니라 그것을 구성하는 정쇄(正鎖)(또는 센스쇄) 또는 상보쇄(또는 안티센스쇄) 등의 각 1본쇄 DNA를 포함하는 것을 의도하여 사용된다. 또한, 그 길이에 의해 특별히 제한되는 것은 아니다.
따라서, 본 명세서에 있어서 「유전자」는 특별히 언급되지 않는 한, 인간 게놈 DNA를 포함하는 2본쇄 DNA, 1본쇄 DNA(정쇄), cDNA를 포함하는 상기 정쇄와 상보적인 서열을 갖는 1본쇄 DNA(상보쇄), 마이크로RNA(miRNA), 및 이들의 단편, 및 전사 산물 모두 포함한다. 또한, 상기 「유전자」는 특정 염기 서열(또는 서열번호)로 나타내어지는 「유전자」뿐만 아니라 이들에 의해 코딩되는 RNA와 생물학적 기능이 동등한 RNA, 예를 들면 동족체(즉, 호몰로그 또는 오솔로그), 유전자 다형 등의 변이체, 및 유도체를 코딩하는 「핵산」을 포함한다. 이러한 동족체, 변이체 또는 유도체를 코딩하는 「핵산」으로서는 구체적으로는 후에 기재한 스트린젠트한 조건 하에서 서열번호 1~635 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열, 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열의 상보 서열과 하이브리다이징하는 염기 서열을 갖는 「핵산」을 들 수 있다. 또한, 「유전자」는 기능 영역의 차이를 묻는 것이 아니라 예를 들면 발현 제어 영역, 코드 영역, 엑손 또는 인트론을 포함할 수 있다. 또한, 「유전자」는 세포에 포함되어 있어도 좋고, 세포외로 방출되어서 단독으로 존재하고 있어도 좋고, 또한 엑소좀이라고 불리는 소포에 내포된 상태에 있어도 좋다.
본 명세서에 있어서 「엑소좀」(별칭 「엑소좀」)이란 세포로부터 분비되는 지질 이중막으로 싸인 소포이다. 엑소좀은 다포 엔도좀으로부터 유래되고, 세포외 환경으로 방출될 때에 RNA, DNA 등의 「유전자」나 단백질 등의 생체 물질을 내부에 포함하는 경우가 있다. 엑소좀은 혈액, 혈청, 혈장, 림프액 등의 체액에 포함되는 것이 알려져 있다.
본 명세서에 있어서 「전사 산물」이란 유전자의 DNA 서열을 주형으로 해서 합성된 RNA의 것을 말한다. RNA 폴리메라아제가 유전자의 상류에 있는 프로모터라고 불리는 부위에 결합하고, DNA의 염기 서열에 상보적이 되도록 3' 말단에 리보뉴클레오티드를 결합시켜 가는 형태로 RNA가 합성된다. 이 RNA에는 유전자 그 자체뿐만 아니라 발현 제어 영역, 코드 영역, 엑손 또는 인트론을 비롯한 전사 개시점으로부터 폴리 A 서열의 말단에 이를 때까지의 전체 서열이 포함된다.
또한, 본 명세서에 있어서 「마이크로RNA(miRNA)」는 특별히 언급되지 않는 한, 헤어핀 모양 구조의 RNA 전구체로서 전사되고, RNase III 절단 활성을 갖는 dsRNA 절단 효소에 의해 절단되고, RISC라고 칭하는 단백질 복합체에 편입되고, mRNA의 번역 억제에 관여하는 15~25 염기의 비코딩 RNA를 의도해서 사용한다. 또한, 본 명세서에서 사용하는 「miRNA」는 특정 염기 서열(또는 서열번호)로 나타내어지는 「miRNA」뿐만 아니라 상기 「miRNA」의 전구체(pre-miRNA, pri-miRNA), 및 이들과 생물학적 기능이 동등한 miRNA, 예를 들면 동족체(즉, 호몰로그 또는 오솔로그), 유전자 다형 등의 변이체, 및 유도체도 포함한다. 이러한 전구체, 동족체, 변이체 또는 유도체로서는 구체적으로는 miRBase release 20(http://WWW.mirbase.org/)에 의해 동정할 수 있고, 후에 기재한 스트린젠트한 조건 하에서 서열번호 1~635 중 어느 하나로 나타내어지는 어느 하나의 특정 염기 서열의 상보 서열과 하이브리다이징하는 염기 서열을 갖는 「miRNA」를 들 수 있다. 또한, 본 명세서에서 사용하는 「miRNA」는 miR 유전자의 유전자 산물이어도 좋고, 그러한 유전자 산물은 성숙 miRNA(예를 들면, 상기한 바와 같은 mRNA의 번역 억제에 관여하는 15~25 염기, 또는 19~25 염기의 비코딩 RNA) 또는 miRNA 전구체(예를 들면, 상기한 바와 같은 pre-miRNA 또는 pri-miRNA)를 포함한다.
본 명세서에 있어서 「프로브」란 유전자의 발현에 의해 생긴 RNA 또는 그것으로부터 유래되는 폴리뉴클레오티드를 특이적으로 검출하기 위해 사용되는 폴리뉴클레오티드 및/또는 그것에 상보적인 폴리뉴클레오티드를 포함한다.
본 명세서에 있어서 「프라이머」란 유전자의 발현에 의해 생긴 RNA 또는 그것으로부터 유래되는 폴리뉴클레오티드를 특이적으로 인식하고, 증폭되는 폴리뉴클레오티드 및/또는 그것에 상보적인 폴리뉴클레오티드를 포함한다.
여기서, 상보적인 폴리뉴클레오티드(상보쇄, 역쇄)란 서열번호 1~635 중 어느 하나에 의해 정의되는 염기 서열, 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 전장 서열, 또는 그 부분 서열(여기서는 편의상 이것을 정쇄라고 부른다)에 대하여 A:T(U), G:C라고 하는 염기쌍 관계에 의거하여 염기적으로 상보적인 관계에 있는 폴리뉴클레오티드를 의미한다. 단, 이러한 상보쇄는 대상으로 하는 정쇄의 염기 서열과 완전하게 상보 서열을 형성하는 경우에 한하지 않고 대상으로 하는 정쇄와 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징할 수 있는 정도의 상보 관계를 갖는 것이어도 좋다.
본 명세서에 있어서 「스트린젠트한 조건」이란 핵산 프로브가 다른 서열에 대한 보다 큰 정도(예를 들면, 백그라운드 측정값의 평균＋백그라운드 측정값의 표준 오차×2 이상의 측정값)로 그 표적 서열에 대하여 하이브리다이징하는 조건을 말한다. 스트린젠트한 조건은 서열 의존성이며, 하이브리다이제이션이 행해지는 환경에 따라 다르다. 하이브리다이제이션 및/또는 세정 조건의 스트린전시를 제어함으로써 핵산 프로브에 대하여 100% 상보적인 표적 서열이 동정될 수 있다. 「스트린젠트한 조건」의 구체예는 후술한다.
본 명세서에 있어서 「Tm값」이란 폴리뉴클레오티드의 2본쇄 부분이 1본쇄로 변성되고, 2본쇄와 1본쇄가 1:1의 비로 존재하는 온도를 의미한다.
본 명세서에 있어서 「변이체」란 핵산의 경우, 다형성, 돌연변이 등에 기인한 천연의 변이체, 또는 서열번호 1~194 및 606~614 중 어느 하나의 염기 서열, 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열, 또는 그 부분 서열에 있어서 1 또는 2 이상의 염기의 결실, 치환, 부가 또는 삽입을 포함하는 변이체, 또는 상기 염기 서열 각각은 그 부분 서열과 약 90% 이상, 약 95% 이상, 약 97% 이상, 약 98% 이상, 약 99% 이상의 % 동일성을 나타내는 변이체, 또는 상기 염기 서열 또는 그 부분 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드 또는 올리고뉴클레오티드와 상기 정의의 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 핵산을 의미한다.
본 명세서에 있어서 「수개」란 약 10, 9, 8, 7, 6, 5, 4, 3 또는 2개의 정수를 의미한다.
본 명세서에 있어서 변이체는 부위 특이적 돌연변이 유발법, PCR법을 이용한 돌연변이 도입법 등의 주지의 기술을 이용하여 제작가능하다.
본 명세서에 있어서 「% 동일성」은 상기 BLAST나 FASTA에 의한 단백질 또는 유전자의 검색 시스템을 이용해서 갭을 도입하여, 또는 갭을 도입하지 않고 결정할 수 있다(Zheng Zhang 등, 2000년, J. Comput. Biol., 7권, p203-214; Altschul, S.F. 등, 1990년, Journal of Molecular Biology, 제 215권, p403-410; Pearson, W.R. 등, 1988년, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 제85권, p2444-2448).
본 명세서에 있어서 「유도체」란 수식 핵산, 비한정적으로 예를 들면 형광단 등에 의한 라벨화 유도체, 수식 뉴클레오티드(예를 들면 할로겐, 메틸 등의 알킬, 메톡시 등의 알콕시, 티오, 카르복시메틸 등의 기를 포함하는 뉴클레오티드 및 염기의 재구성, 이중결합의 포화, 탈아미노화, 산소 분자의 황 분자로의 치환 등을 받은 뉴클레오티드 등)를 포함하는 유도체, PNA(peptide nucleic acid; Nielsen, P.E. 등, 1991년, Science, 254권, p1497-500), LNA(locked nucleic acid; Obika, S. 등, 1998년, Tetrahedron Lett., 39권, p5401-5404) 등을 포함하는 것을 의미한다.
본 명세서에 있어서 상기 대장암 마커인 miRNA로부터 선택되는 폴리뉴클레오티드와 특이적으로 결합가능한 「핵산」은 합성 또는 조제된 핵산이며, 구체적으로는 「핵산 프로브」 또는 「프라이머」를 포함하고, 피험체 중의 대장암의 존재의 유무를 검출하기 위해서, 또는 대장암의 이환의 유무, 이환의 정도, 대장암의 개선의 유무나 개선의 정도, 대장암의 치료에 대한 감수성을 진단하기 위해서, 또는 대장암의 예방, 개선 또는 치료에 유용한 후보 물질을 스크리닝하기 위해서 직접 또는 간접적으로 이용된다. 이들에는 대장암의 이환에 관련해서 생체 내, 특히 혈액, 뇨 등의 체액 등의 검체에 있어서 서열번호 1~635 중 어느 하나로 나타내어지는 전사 산물 또는 그 cDNA 합성 핵산을 특이적으로 인식하여 결합할 수 있는 뉴클레오티드, 올리고뉴클레오티드 및 폴리뉴클레오티드를 포함한다. 이들의 뉴클레오티드, 올리고뉴클레오티드 및 폴리뉴클레오티드는 상기 성질에 의거하여 생체 내, 조직이나 세포 내 등에서 발현된 상기 유전자를 검출하기 위한 프로브로서, 또한 생체 내에서 발현된 상기 유전자를 증폭하기 위한 프라이머로서 유효하게 이용할 수 있다.
본 명세서에 있어서 「특이적으로 결합가능한」이란 본 발명에서 사용하는 핵산 프로브 또는 프라이머가 특정 표적 핵산과 결합하고, 다른 핵산과 실질적으로 결합할 수 없는 것을 의미한다.
본 명세서에서 사용하는 「검출」이라는 용어는 검사, 측정, 검출 또는 판정 지원이라는 용어로 치환할 수 있다. 또한, 본 명세서에 있어서 「평가」라는 용어는 검사 결과 또는 측정 결과에 의거하여 진단 또는 평가를 지원하는 것을 포함하는 의미에서 사용된다.
본 명세서에서 사용되는 「피험체」는 인간, 침팬지를 포함하는 영장류, 개, 고양이 등의 애완동물 동물, 소, 말, 양, 염소 등의 가축동물, 마우스, 랫 등의 설치류 등의 포유동물을 의미한다. 또한, 「건상체」도 또한 이러한 포유동물이며, 검출하려고 하는 암에 이환되어 있지 않은 동물을 의미한다.
본 명세서에서 사용되는 「P」 또는 「P값」이란 통계학적 검정에 있어서 귀무가설 하에서 실제로 데이터로부터 계산된 통계량보다 극단적인 통계량이 관측되는 확률을 나타낸다. 따라서, 「P」 또는 「P값」이 작을수록 비교 대상 간에 유의차가 있다고 간주할 수 있다.
본 명세서에 있어서 「감도」는 (진양성의 수)/(진양성의 수＋위음성의 수)의 값을 의미한다. 감도가 높으면 대장암을 조기에 발견하는 것이 가능해지고, 완전한 암부의 절제나 재발률의 저하로 이어진다.
본 명세서에 있어서 「특이도」는 (진음성의 수)/(진음성의 수＋위양성의 수)를 의미한다. 특이도가 높으면 건상체를 대장암 환자로 오판별하는 것에 의한 불필요한 추가 검사의 실시를 막고, 환자의 부담의 경감이나 의료비의 삭감으로 이어진다.
본 명세서에 있어서 「정밀도」는 (진양성의 수＋진음성의 수)/(전체 증례수)의 값을 의미한다. 정밀도는 전체 검체에 대한 판별 결과가 올바른 비율을 나타내고 있고, 검출 성능을 평가하는 제 1 지표가 된다.
본 명세서에 있어서 판정, 검출 또는 진단의 대상이 되는 「검체」란 대장암의 발생, 대장암의 진행, 및 대장암에 대한 치료 효과의 발휘에 따라 본 발명의 유전자가 발현 변화되는 조직 및 생체 재료를 가리킨다. 구체적으로는 대장 조직 및 그 주변의 맥관, 림프절 및 장기, 또한 전이가 의심되는 장기, 피부, 및 혈액, 뇨, 타액, 땀, 조직 침출액 등의 체액, 혈액으로부터 조제된 혈청, 혈장, 그 외, 변, 모발 등을 가리킨다. 또한 이들로부터 추출된 생체 시료, 구체적으로는 RNA나 miRNA 등의 유전자를 가리킨다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6726-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6726-5p」라고 하는 용어는 서열번호 1에 기재된 hsa-miR-6726-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027353)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6726-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6726-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6726」(miRBase Accession No. MI0022571, 서열번호 195)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4257 유전자」 또는 「hsa-miR-4257」이라는 용어는 서열번호 2에 기재된 hsa-miR-4257 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0016878)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4257 유전자는 Goff LA 등, 2009년, PLoS One, 4권, e7192에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4257」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4257」(miRBase Accession No. MI0015856, 서열번호 196)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6787-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6787-5p」라고 하는 용어는 서열번호 3에 기재된 hsa-miR-6787-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027474)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6787-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6787-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6787」(miRBase Accession No. MI0022632, 서열번호197)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6780b-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6780b-5p」라는 용어는 서열번호 4에 기재된 hsa-miR-6780b-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027572)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6780b-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6780b-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6780b」(miRBase Accession No. MI0022681, 서열번호 198)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-3131 유전자」 또는 「hsa-miR-3131」이라는 용어는 서열번호 5에 기재된 hsa-miR-3131 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0014996)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-3131 유전자는 Stark MS 등, 2010년, PLoS One, 5권, e9685에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-3131」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-3131」(miRBase Accession No. MI0014151, 서열번호 199)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-7108-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-7108-5p」라는 용어는 서열번호 6에 기재된 hsa-miR-7108-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0028113)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-7108-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-7108-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-7108」(miRBase Accession No. MI0022959, 서열번호 200)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1343-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-1343-3p」라는 용어는 서열번호 7에 기재된 hsa-miR-1343-3p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0019776)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1343-3p 유전자는 Persson H 등, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1343-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1343」(miRBase Accession No. MI0017320, 서열번호 201)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1247-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-1247-3p」라는 용어는 서열번호 8에 기재된 hsa-miR-1247-3p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0022721)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1247-3p 유전자는 Morin RD 등, 2008년, Genome Res, 18권, p610-621에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1247-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1247」(miRBase Accession No. MI0006382, 서열번호 202)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4651 유전자」 또는 「hsa-miR-4651」이라는 용어는 서열번호 9에 기재된 hsa-miR-4651 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0019715)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4651 유전자는 Persson H 등, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4651」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4651」(miRBase Accession No. MI0017279, 서열번호 203)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6757-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6757-5p」라는 용어는 서열번호 10에 기재된 hsa-miR-6757-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027414)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6757-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6757-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6757」(miRBase Accession No. MI0022602, 서열번호 204)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-3679-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-3679-5p」라는 용어는 서열번호 11에 기재된 hsa-miR-3679-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0018104)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-3679-5p 유전자는 Creighton CJ 등, 2010년, PLoS One, 5권, e9637에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-3679-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-3679」(miRBase Accession No. MI0016080, 서열번호 205)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-7641 유전자」 또는 「hsa-miR-7641」이라는 용어는 서열번호 12에 기재된 hsa-miR-7641 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0029782)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-7641 유전자는 Yoo JK 등, 2013년, Arch Pharm Res, 36권, p353-358에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-7641」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-7641-1」, 「hsa-mir-7641-2」(miRBase Accession No. MI0024975, MI0024976, 서열번호 206, 207)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6746-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6746-5p」라는 용어는 서열번호 13에 기재된 hsa-miR-6746-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027392)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6746-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6746-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6746」(miRBase Accession No. MI0022591, 서열번호 208)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-8072 유전자」 또는 「hsa-miR-8072」라하는 용어는 서열번호 14에 기재된 hsa-miR-8072 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0030999)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-8072 유전자는 Wang HJ 등, 2013년, Shock, 39권, p480-487에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-8072」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-8072」(miRBase Accession No. MI0025908, 서열번호 209)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6741-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6741-5p」라는 용어는 서열번호 15에 기재된 hsa-miR-6741-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027383)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6741-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6741-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6741」(miRBase Accession No. MI0022586, 서열번호 210)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1908-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-1908-5p」라는 용어는 서열번호 16에 기재된 hsa-miR-1908-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0007881)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1908-5p 유전자는 Bar M 등, 2008년, Stem Cells, 26권, p2496-2505에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1908-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1908」(miRBase Accession No. MI0008329, 서열번호 211)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6857-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6857-5p」라는 용어는 서열번호 17에 기재된 hsa-miR-6857-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027614)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6857-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한 「hsa-miR-6857-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6857」(miRBase Accession No. MI0022703, 서열번호 212)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4746-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-4746-3p」라는 용어는 서열번호 18에 기재된 hsa-miR-4746-3p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0019881)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4746-3p 유전자는 Persson H 등, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4746-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4746」(miRBase Accession No. MI0017385, 서열번호 213)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-744-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-744-5p」라는 용어는 서열번호 19에 기재된 hsa-miR-744-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0004945)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-744-5p 유전자는 Berezikov E 등, 2006년, Genome Res, 16권, p1289-1298에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-744-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-744」(miRBase Accession No. MI0005559, 서열번호 214)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4792 유전자」 또는 「hsa-miR-4792」라는 용어는 서열번호 20에 기재된 hsa-miR-4792 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0019964)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4792 유전자는 Persson H 등, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4792」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4792」(miRBase Accession No. MI0017439, 서열번호 215)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-564 유전자」 또는 「hsa-miR-564」라는 용어는 서열번호 21에 기재된 hsa-miR-564 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0003228)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-564 유전자는 Cummins JM 등, 2006년, Proc Natl Acad Sci U S A, 103권, p3687-3692에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-564」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-564」(miRBase Accession No. MI0003570, 서열번호 216)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6791-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6791-5p」라는 용어는 서열번호 22에 기재된 hsa-miR-6791-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027482)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6791-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6791-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6791」(miRBase Accession No. MI0022636, 서열번호 217)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6825-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6825-5p」라는 용어는 서열번호 23에 기재된 hsa-miR-6825-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027550)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6825-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6825-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6825」(miRBase Accession No. MI0022670, 서열번호 218)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6826-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6826-5p」라는 용어는 서열번호 24에 기재된 hsa-miR-6826-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027552)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6826-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6826-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6826」(miRBase Accession No. MI0022671, 서열번호 219)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4665-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-4665-3p」라는 용어는 서열번호 25에 기재된 hsa-miR-4665-3p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0019740)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4665-3p 유전자는 Persson H 등, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4665-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4665」(miRBase Accession No. MI0017295, 서열번호 220)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4467 유전자」 또는 「hsa-miR-4467」이라는 용어는 서열번호 26에 기재된 hsa-miR-4467 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0018994)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4467 유전자는 Jima DD 등, 2010년, Blood, 116권, e118-e127에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한 「hsa-miR-4467」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4467」(miRBase Accession No. MI0016818, 서열번호 221)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-3188 유전자」 또는 「hsa-miR-3188」이라는 용어는 서열번호 27에 기재된 hsa-miR-3188 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0015070)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-3188 유전자는 Stark MS 등, 2010년, PLoS One, 5권, e9685에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-3188」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-3188」(miRBase Accession No. MI0014232, 서열번호 222)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6125 유전자」 또는 「hsa-miR-6125」라는 용어는 서열번호 28에 기재된 hsa-miR-6125 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0024598)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6125 유전자는 Smith JL 등, 2012년, J Virol, 86권, p5278-5287에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6125」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6125」(miRBase Accession No. MI0021259, 서열번호 223)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6756-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6756-5p」라는 용어는 서열번호 29에 기재된 hsa-miR-6756-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027412)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6756-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6756-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6756」(miRBase Accession No. MI0022601, 서열번호 224)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1228-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-1228-3p」라는 용어는 서열번호 30에 기재된 hsa-miR-1228-3p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0005583)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1228-3p 유전자는 Berezikov E 등, 2007년, Mol Cell, 28권, p328-336에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1228-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1228」(miRBase Accession No. MI0006318, 서열번호 225)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-8063 유전자」 또는 「hsa-miR-8063」이라는 용어는 서열번호 31에 기재된 hsa-miR-8063 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0030990)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-8063 유전자는 Wang HJ 등, 2013년, Shock, 39권, p480-487에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-8063」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-8063」(miRBase Accession No. MI0025899, 서열번호 226)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-8069 유전자」 또는 「hsa-miR-8069」라는 용어는 서열번호 32에 기재된 hsa-miR-8069 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0030996)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-8069 유전자는 Wang HJ 등, 2013년, Shock, 39권, p480-487에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-8069」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-8069」(miRBase Accession No. MI0025905, 서열번호 227)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6875-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6875-5p」라는 용어는 서열번호 33에 기재된 hsa-miR-6875-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027650)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6875-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6875-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6875」(miRBase Accession No. MI0022722, 서열번호 228)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-3185 유전자」 또는 「hsa-miR-3185」라는 용어는 서열번호 34에 기재된 hsa-miR-3185 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0015065)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-3185 유전자는 Stark MS 등, 2010년, PLoS One, 5권, e9685에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-3185」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-3185」(miRBase Accession No. MI0014227, 서열번호 229)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4433b-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-4433b-3p」라는 용어는 서열번호 35에 기재된 hsa-miR-4433b-3p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0030414)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4433b-3p 유전자는 Ple H 등, 2012년, PLoS One, 7권, e50746에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4433b-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4433b」(miRBase Accession No. MI0025511, 서열번호 230)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6887-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6887-5p」라는 용어는 서열번호 36에 기재된 hsa-miR-6887-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027674)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6887-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6887-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6887」(miRBase Accession No. MI0022734, 서열번호 231)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-128-1-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-128-1-5p」라는 용어는 서열번호 37에 기재된 hsa-miR-128-1-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0026477)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-128-1-5p 유전자는 Lagos-Quintana M 등, 2002년, Curr Biol, 12권, p735-739에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-128-1-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-128-1」(miRBase Accession No. MI0000447, 서열번호 232)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6724-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6724-5p」라는 용어는 서열번호 38에 기재된 hsa-miR-6724-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0025856)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6724-5p 유전자는 Li Y 등, 2012년, Gene, 497권, p330-335에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6724-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6724」(miRBase Accession No. MI0022559, 서열번호 233)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1914-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-1914-3p」라는 용어는 서열번호 39에 기재된 hsa-miR-1914-3p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0007890)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1914-3p 유전자는 Bar M 등, 2008년, Stem Cells, 26권, p2496-2505에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1914-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1914」(miRBase Accession No. MI0008335, 서열번호 234)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1225-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-1225-5p」라는 용어는 서열번호 40에 기재된 hsa-miR-1225-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0005572)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1225-5p 유전자는 Berezikov E 등, 2007년, Mol Cell, 28권, p328-336에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1225-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1225」(miRBase Accession No. MI0006311, 서열번호 235)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4419b 유전자」 또는 「hsa-miR-4419b」라는 용어는 서열번호 41에 기재된 hsa-miR-4419b 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0019034)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4419b 유전자는 Jima DD 등, 2010년, Blood, 116권, e118-e127에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4419b」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4419b」(miRBase Accession No. MI0016861, 서열번호 236)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-7110-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-7110-5p」라는 용어는 서열번호 42에 기재된 hsa-miR-7110-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0028117)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-7110-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-7110-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-7110」(miRBase Accession No. MI0022961, 서열번호 237)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-187-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-187-5p」라는 용어는 서열번호 43에 기재된 hsa-miR-187-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0004561)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-187-5p 유전자는 Lim LP 등, 2003년, Science, 299권, p1540에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-187-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-187」(miRBase Accession No. MI0000274, 서열번호 238)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-3184-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-3184-5p」라는 용어는 서열번호 44에 기재된 hsa-miR-3184-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0015064)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-3184-5p 유전자는 Stark MS 등, 2010년, PLoS One, 5권, e9685에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-3184-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-3184」(miRBase Accession No. MI0014226, 서열번호 239)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-204-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-204-3p」라는 용어는 서열번호 45에 기재된 hsa-miR-204-3p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0022693)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-204-3p 유전자는 Lim LP 등, 2003년, Science, 299권, p1540에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-204-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-204」(miRBase Accession No. MI0000284, 서열번호 240)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-5572 유전자」 또는 「hsa-miR-5572」라는 용어는 서열번호 46에 기재된 hsa-miR-5572 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0022260)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-5572 유전자는 Tandon M 등, 2012년, Oral Dis, 18권, p127-131에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-5572」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-5572」(miRBase Accession No. MI0019117, 서열번호 241)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6729-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6729-5p」라는 용어는 서열번호 47에 기재된 hsa-miR-6729-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027359)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6729-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6729-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6729」(miRBase Accession No. MI0022574, 서열번호 242)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-615-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-615-5p」라는 용어는 서열번호 48에 기재된 hsa-miR-615-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0004804)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-615-5p 유전자는 Cummins JM 등, 2006년, Proc Natl Acad Sci U S A, 103권, p3687-3692에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-615-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-615」(miRBase Accession No. MI0003628, 서열번호 243)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6749-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6749-5p」라는 용어는 서열번호 49에 기재된 hsa-miR-6749-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027398)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6749-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6749-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6749」(miRBase Accession No. MI0022594, 서열번호 244)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6515-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-6515-3p」라는 용어는 서열번호 50에 기재된 hsa-miR-6515-3p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0025487)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6515-3p 유전자는 Joyce CE 등, 2011년, Hum Mol Genet, 20권, p4025-4040에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6515-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6515」(miRBase Accession No. MI0022227, 서열번호 245)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-3937 유전자」 또는 「hsa-miR-3937」이라는 용어는 서열번호 51에 기재된 hsa-miR-3937 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0018352)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-3937 유전자는 Liao JY 등, 2010년, PLoS One, 5권, e10563에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-3937」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-3937」(miRBase Accession No. MI0016593, 서열번호 246)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6840-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-6840-3p」라는 용어는 서열번호 52에 기재된 hsa-miR-6840-3p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027583)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6840-3p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6840-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6840」(miRBase Accession No. MI0022686, 서열번호 247)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6893-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6893-5p」라는 용어는 서열번호 53에 기재된 hsa-miR-6893-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027686)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6893-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6893-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6893」(miRBase Accession No. MI0022740, 서열번호 248)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4728-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-4728-5p」라는 용어는 서열번호 54에 기재된 hsa-miR-4728-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0019849)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4728-5p 유전자는 Persson H 등, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4728-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4728」(miRBase Accession No. MI0017365, 서열번호 249)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6717-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6717-5p」라는 용어는 서열번호 55에 기재된 hsa-miR-6717-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0025846)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6717-5p 유전자는 Li Y 등, 2012년, Gene, 497권, p330-335에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6717-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6717」(miRBase Accession No. MI0022551, 서열번호 250)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-7113-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-7113-3p」라는 용어는 서열번호 56에 기재된 hsa-miR-7113-3p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0028124)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-7113-3p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-7113-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-7113」(miRBase Accession No. MI0022964, 서열번호 251)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4665-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-4665-5p」라는 용어는 서열번호 57에 기재된 hsa-miR-4665-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0019739)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4665-5p 유전자는 Persson H 등, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4665-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4665」(miRBase Accession No. MI0017295, 서열번호 220)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-642b-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-642b-3p」라는 용어는 서열번호 58에 기재된 hsa-miR-642b-3p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0018444)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-642b-3p 유전자는 Witten D 등, 2010년, BMC Biol, 8권, p58에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-642b-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-642b」(miRBase Accession No. MI0016685, 서열번호 252)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-7109-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-7109-5p」라는 용어는 서열번호 59에 기재된 hsa-miR-7109-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0028115)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-7109-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-7109-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-7109」(miRBase Accession No. MI0022960, 서열번호 253)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6842-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6842-5p」라는 용어는 서열번호 60에 기재된 hsa-miR-6842-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027586)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6842-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6842-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6842」(miRBase Accession No. MI0022688, 서열번호 254)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4442 유전자」 또는 「hsa-miR-4442」라는 용어는 서열번호 61에 기재된 hsa-miR-4442 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0018960)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4442 유전자는 Jima DD 등, 2010년, Blood, 116권, e118-e127에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4442」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4442」(miRBase Accession No. MI0016785, 서열번호 255)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4433-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-4433-3p」라는 용어는 서열번호 62에 기재된 hsa-miR-4433-3p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0018949)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4433-3p 유전자는 Jima DD 등, 2010년, Blood, 116권, e118-e127에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4433-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4433」(miRBase Accession No. MI0016773, 서열번호 256)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4707-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-4707-5p」라는 용어는 서열번호 63에 기재된 hsa-miR-4707-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0019807)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4707-5p 유전자는 Persson H 등, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4707-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4707」(miRBase Accession No. MI0017340, 서열번호 257)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6126 유전자」 또는 「hsa-miR-6126」이라는 용어는 서열번호 64에 기재된 hsa-miR-6126 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0024599)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6126 유전자는 Smith JL 등, 2012년, J Virol, 86권, p5278-5287에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6126」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6126」(miRBase Accession No. MI0021260, 서열번호 258)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4449 유전자」 또는 「hsa-miR-4449」라는 용어는 서열번호 65에 기재된 hsa-miR-4449 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0018968)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4449 유전자는 Jima DD 등, 2010년, Blood, 116권, e118-e127에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4449」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4449」(miRBase Accession No. MI0016792, 서열번호 259)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4706 유전자」 또는 「hsa-miR-4706」이라는 용어는 서열번호 66에 기재된 hsa-miR-4706 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0019806)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4706 유전자는 Persson H 등, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4706」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4706」(miRBase Accession No. MI0017339, 서열번호 260)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1913 유전자」 또는 「hsa-miR-1913」이라는 용어는 서열번호 67에 기재된 hsa-miR-1913 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0007888)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1913 유전자는 Bar M 등, 2008년, Stem Cells, 26권, p2496-2505에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한 「hsa-miR-1913」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1913」(miRBase Accession No. MI0008334, 서열번호 261)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-602 유전자」 또는 「hsa-miR-602」라는 용어는 서열번호 68에 기재된 hsa-miR-602 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0003270)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-602 유전자는 Cummins JM 등, 2006년, Proc Natl Acad Sci U S A, 103권, p3687-3692에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-602」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-602」(miRBase Accession No. MI0003615, 서열번호 262)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-939-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-939-5p」라는 용어는 서열번호 69에 기재된 hsa-miR-939-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0004982)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-939-5p 유전자는 Lui WO 등, 2007년, Cancer Res, 67권, p6031-6043에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-939-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-939」(miRBase Accession No. MI0005761, 서열번호 263)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4695-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-4695-5p」라는 용어는 서열번호 70에 기재된 hsa-miR-4695-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0019788)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4695-5p 유전자는 Persson H 등, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한 「hsa-miR-4695-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4695」(miRBase Accession No. MI0017328, 서열번호 264)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-711 유전자」 또는 「hsa-miR-711」이라는 용어는 서열번호 71에 기재된 hsa-miR-711 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0012734)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-711 유전자는 Artzi S 등, 2008년, BMC Bioinformatics, 9권, p39에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-711」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-711」(miRBase Accession No. MI0012488, 서열번호 265)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6816-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6816-5p」라는 용어는 서열번호 72에 기재된 hsa-miR-6816-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027532)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6816-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6816-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6816」(miRBase Accession No. MI0022661, 서열번호 266)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4632-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-4632-5p」라는 용어는 서열번호 73에 기재된 hsa-miR-4632-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0022977)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4632-5p 유전자는 Persson H 등, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4632-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4632」(miRBase Accession No. MI0017259, 서열번호 267)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6721-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6721-5p」라는 용어는 서열번호 74에 기재된 hsa-miR-6721-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0025852)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6721-5p 유전자는 Li Y 등, 2012년, Gene, 497권, p330-335에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6721-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6721」(miRBase Accession No. MI0022556, 서열번호 268)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-7847-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-7847-3p」라는 용어는 서열번호 75에 기재된 hsa-miR-7847-3p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0030422)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-7847-3p 유전자는 Ple H 등, 2012년, PLoS One, 7권, e50746에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-7847-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-7847」(miRBase Accession No. MI 0025517, 서열번호 269)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6132 유전자」 또는 「hsa-miR-6132」라는 용어는 서열번호 76에 기재된 hsa-miR-6132 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0024616)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6132 유전자는 Dannemann M 등, 2012년, Genome Biol Evol, 4권, p552-564에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6132」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6132」(miRBase Accession No. MI0021277, 서열번호 270)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-887-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-887-3p」라는 용어는 서열번호 77에 기재된 hsa-miR-887-3p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0004951)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-887-3p 유전자는 Berezikov E 등, 2006년, Genome Res, 16권, p1289-1298에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-887-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-887」(miRBase Accession No. MI0005562, 서열번호 271)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-3679-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-3679-3p」라는 용어는 서열번호 78에 기재된 hsa-miR-3679-3p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0018105)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-3679-3p 유전자는 Creighton CJ 등, 2010년, PLoS One, 5권, e9637에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-3679-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-3679」(miRBase Accession No. MI0016080, 서열번호 205)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6784-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6784-5p」라는 용어는 서열번호 79에 기재된 hsa-miR-6784-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027468)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6784-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6784-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6784」(miRBase Accession No. MI0022629, 서열번호 272)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1249 유전자」 또는 「hsa-miR-1249」라는 용어는 서열번호 80에 기재된 hsa-miR-1249 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0005901)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1249 유전자는 Morin RD 등, 2008년, Genome Res, 18권, p610-621에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1249」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1249」(miRBase Accession No. MI0006384, 서열번호 273)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-937-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-937-5p」라는 용어는 서열번호 81에 기재된 hsa-miR-937-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0022938)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-937-5p 유전자는 Lui WO 등, 2007년, Cancer Res, 67권, p6031-6043에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-937-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-937」(miRBase Accession No. MI0005759, 서열번호 274)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-5195-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-5195-3p」라는 용어는 서열번호 82에 기재된 hsa-miR-5195-3p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0021127)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-5195-3p 유전자는 Schotte D 등, 2011년, Leukemia, 25권, p1389-1399에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-5195-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-5195」(miRBase Accession No. MI0018174, 서열번호 275)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6732-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6732-5p」라는 용어는 서열번호 83에 기재된 hsa-miR-6732-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027365)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6732-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6732-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6732」(miRBase Accession No. MI 0022577, 서열번호 276)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4417 유전자」 또는 「hsa-miR-4417」이라는 용어는 서열번호 84에 기재된 hsa-miR-4417 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0018929)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4417 유전자는 Jima DD 등, 2010년, Blood, 116권, e118-e127에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4417」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4417」(miRBase Accession No. MI0016753, 서열번호 277)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4281 유전자」 또는 「hsa-miR-4281」이라는 용어는 서열번호 85에 기재된 hsa-miR-4281 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0016907)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4281 유전자는 Goff LA 등, 2009년, PLoS One, 4권, e7192에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4281」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4281」(miRBase Accession No. MI0015885, 서열번호 278)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4734 유전자」 또는 「hsa-miR-4734」라는 용어는 서열번호 86에 기재된 hsa-miR-4734 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0019859)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4734 유전자는 Persson H 등, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4734」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4734」(miRBase Accession No. MI0017371, 서열번호 279)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6766-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-6766-3p」라는 용어는 서열번호 87에 기재된 hsa-miR-6766-3p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027433)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6766-3p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6766-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6766」(miRBase Accession No. MI0022611, 서열번호 280)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-663a 유전자」 또는 「hsa-miR-663a」라는 용어는 서열번호 88에 기재된 hsa-miR-663a 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0003326)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-663a 유전자는 Cummins JM 등, 2006년, Proc Natl Acad Sci U S A, 103권, p3687-3692에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-663a」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-663a」(miRBase Accession No. MI0003672, 서열번호 281)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4513 유전자」 또는 「hsa-miR-4513」이라는 용어는 서열번호 89에 기재된 hsa-miR-4513 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0019050)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4513 유전자는 Jima DD 등, 2010년, Blood, 116권, e118-e127에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4513」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4513」(miRBase Accession No. MI0016879, 서열번호 282)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6781-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6781-5p」라는 용어는 서열번호 90에 기재된 hsa-miR-6781-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027462)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6781-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6781-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6781」(miRBase Accession No. MI0022626, 서열번호 283)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1227-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-1227-5p」라는 용어는 서열번호 91에 기재된 hsa-miR-1227-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0022941)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1227-5p 유전자는 Berezikov E 등, 2007년, Mol Cell, 28권, p328-336에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1227-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1227」(miRBase Accession No. MI0006316, 서열번호 284)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6845-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6845-5p」라는 용어는 서열번호 92에 기재된 hsa-miR-6845-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027590)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6845-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6845-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6845」(miRBase Accession No. MI0022691, 서열번호 285)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6798-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6798-5p」라는 용어는 서열번호 93에 기재된 hsa-miR-6798-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027496)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6798-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6798-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6798」(miRBase Accession No. MI0022643, 서열번호 286)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-3620-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-3620-5p」라는 용어는 서열번호 94에 기재된 hsa-miR-3620-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0022967)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-3620-5p 유전자는 Witten D 등, 2010년, BMC Biol, 8권, p58에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-3620-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-3620」(miRBase Accession No. MI0016011, 서열번호 287)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1915-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-1915-5p」라는 용어는 서열번호 95에 기재된 hsa-miR-1915-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0007891)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1915-5p 유전자는 Bar M 등, 2008년, Stem Cells, 26권, p2496-2505에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1915-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1915」(miRBase Accession No. MI0008336, 서열번호 288)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4294 유전자」 또는 「hsa-miR-4294」라는 용어는 서열번호 96에 기재된 hsa-miR-4294 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0016849)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4294 유전자는 Goff LA 등, 2009년, PLoS One, 4권, e7192에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4294」는, 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4294」(miRBase Accession No. MI0015827, 서열번호 289)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-642a-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-642a-3p」라는 용어는 서열번호 97에 기재된 hsa-miR-642a-3p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0020924)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-642a-3p 유전자는 Cummins JM 등, 2006년, Proc Natl Acad Sci U S A, 103권, p3687-3692에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-642a-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-642a」(miRBase Accession No. MI0003657, 서열번호 290)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-371a-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-371a-5p」라는 용어는 서열번호 98에 기재된 hsa-miR-371a-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0004687)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-371a-5p 유전자는 Suh MR 등, 2004년, Dev Biol, 270권, p488-498에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-371a-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-371a」(miRBase Accession No. MI0000779, 서열번호 291)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-940 유전자」 또는 「hsa-miR-940」이라는 용어는 서열번호 99에 기재된 hsa-miR-940 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0004983)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-940 유전자는 Lui WO 등, 2007년, Cancer Res, 67권, p6031-6043에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-940」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-940」(miRBase Accession No. MI0005762, 서열번호 292)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4450 유전자」 또는 「hsa-miR-4450」이라는 용어는 서열번호 100에 기재된 hsa-miR-4450 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0018971)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4450 유전자는 Jima DD 등, 2010년, Blood, 116권, e118-e127에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4450」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4450」(miRBase Accession No. MI0016795, 서열번호 293)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4723-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-4723-5p」라는 용어는 서열번호 101에 기재된 hsa-miR-4723-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0019838)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4723-5p 유전자는 Persson H 등, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4723-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4723」(miRBase Accession No. MI0017359, 서열번호 294)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1469 유전자」 또는 「hsa-miR-1469」라는 용어는 서열번호 102에 기재된 hsa-miR-1469 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0007347)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1469 유전자는 Kawaji H 등, 2008년, BMC Genomics, 9권, p157에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1469」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1469」(miRBase Accession No. MI0007074, 서열번호 295)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6861-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6861-5p」라는 용어는 서열번호 103에 기재된 hsa-miR-6861-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027623)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6861-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6861-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6861」(miRBase Accession No. MI0022708, 서열번호 296)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-7975 유전자」 또는 「hsa-miR-7975」라는 용어는 서열번호 104에 기재된 hsa-miR-7975 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0031178)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-7975 유전자는 Velthut-Meikas A 등, 2013년, Mol Endocrinol, 온라인판에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-7975」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-7975」(miRBase Accession No. MI0025751, 서열번호 297)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6879-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6879-5p」라는 용어는 서열번호 105에 기재된 hsa-miR-6879-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027658)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6879-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6879-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6879」(miRBase Accession No. MI0022726, 서열번호 298)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6802-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6802-5p」라는 용어는 서열번호 106에 기재된 hsa-miR-6802-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027504)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6802-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6802-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6802」(miRBase Accession No. MI0022647, 서열번호 299)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1268b 유전자」 또는 「hsa-miR-1268b」라는 용어는 서열번호 107에 기재된 hsa-miR-1268b 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0018925)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1268b 유전자는 Jima DD 등, 2010년, Blood, 116권, e118-e127에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1268b」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1268b」(miRBase Accession No. MI0016748, 서열번호 300)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-663b 유전자」 또는 「hsa-miR-663b」라는 용어는 서열번호 108에 기재된 hsa-miR-663b 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0005867)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-663b 유전자는 Takada S 등, 2008년, Leukemia, 22권, p1274-1278에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-663b」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-663b」(miRBase Accession No. MI0006336, 서열번호 301)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-125a-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-125a-3p」라는 용어는 서열번호 109에 기재된 hsa-miR-125a-3p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0004602)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-125a-3p 유전자는 Lagos-Quintana M 등, 2002년, Curr Biol, 12권, p735-739에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-125a-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-125a」(miRBase Accession No. MI0000469, 서열번호 302)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-2861 유전자」 또는 「hsa-miR-2861」이라는 용어는 서열번호 110에 기재된 hsa-miR-2861 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0013802)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-2861 유전자는 Li H 등, 2009년, J Clin Invest, 119권, p3666-3677에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-2861」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-2861」(miRBase Accession No. MI0013006, 서열번호 303)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6088 유전자」 또는 「hsa-miR-6088」이라는 용어는 서열번호 111에 기재된 hsa-miR-6088 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0023713)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6088 유전자는 Yoo JK 등, 2012년, Stem Cells Dev, 21권, p2049-2057에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6088」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6088」(miRBase Accession No. MI0020365, 서열번호 304)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4758-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-4758-5p」라는 용어는 서열번호 112에 기재된 hsa-miR-4758-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0019903)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4758-5p 유전자는 Persson H 등, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4758-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4758」(miRBase Accession No. MI0017399, 서열번호 305)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-296-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-296-3p」라는 용어는 서열번호 113에 기재된 hsa-miR-296-3p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0004679)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-296-3p 유전자는 Houbaviy HB 등, 2003년, Dev Cell, 5권, p351-358에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-296-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-296」(miRBase Accession No. MI0000747, 서열번호 306)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6738-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6738-5p」라는 용어는 서열번호 114에 기재된 hsa-miR-6738-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027377)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6738-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6738-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6738」(miRBase Accession No. MI0022583, 서열번호 307)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-671-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-671-5p」라는 용어는 서열번호 115에 기재된 hsa-miR-671-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0003880)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-671-5p 유전자는 Berezikov E 등, 2006년, Genome Res, 16권, p1289-1298에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-671-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-671」(miRBase Accession No. MI0003760, 서열번호 308)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4454 유전자」 또는 「hsa-miR-4454」라는 용어는 서열번호 116에 기재된 hsa-miR-4454 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0018976)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4454 유전자는 Jima DD 등, 2010년, Blood, 116권, e118-e127에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4454」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4454」(miRBase Accession No. MI0016800, 서열번호 309)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4516 유전자」 또는 「hsa-miR-4516」이라는 용어는 서열번호 117에 기재된 hsa-miR-4516 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0019053)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4516 유전자는 Jima DD 등, 2010년, Blood, 116권, e118-e127에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4516」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4516」(miRBase Accession No. MI0016882, 서열번호 310)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-7845-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-7845-5p」라는 용어는 서열번호 118에 기재된 hsa-miR-7845-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0030420)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-7845-5p 유전자는 Ple H 등, 2012년, PLoS One, 7권, e50746에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-7845-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-7845」(miRBase Accession No. MI0025515, 서열번호 311)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4741 유전자」 또는 「hsa-miR-4741」이라는 용어는 서열번호 119에 기재된 hsa-miR-4741 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0019871)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4741 유전자는 Persson H 등, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4741」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4741」(miRBase Accession No. MI0017379, 서열번호 312)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-92b-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-92b-5p」라는 용어는 서열번호 120에 기재된 hsa-miR-92b-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0004792)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-92b-5p 유전자는 Cummins JM 등, 2006년, Proc Natl Acad Sci U S A, 103권, p3687-3692에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-92b-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-92b」(miRBase Accession No. MI0003560, 서열번호 313)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6795-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6795-5p」라는 용어는 서열번호 121에 기재된 hsa-miR-6795-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027490)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6795-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6795-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6795」(miRBase Accession No. MI0022640, 서열번호 314)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6805-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-6805-3p」라는 용어는 서열번호 122에 기재된 hsa-miR-6805-3p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027511)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6805-3p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6805-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6805」(miRBase Accession No. MI0022650, 서열번호 315)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4725-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-4725-3p」라는 용어는 서열번호 123에 기재된 hsa-miR-4725-3p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0019844)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4725-3p 유전자는 Persson H 등, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4725-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4725」(miRBase Accession No. MI0017362, 서열번호 316)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6782-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6782-5p」라는 용어는 서열번호 124에 기재된 hsa-miR-6782-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027464)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6782-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6782-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6782」(miRBase Accession No. MI0022627, 서열번호 317)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4688 유전자」 또는 「hsa-miR-4688」이라는 용어는 서열번호 125에 기재된 hsa-miR-4688 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0019777)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4688 유전자는 Persson H 등, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4688」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4688」(miRBase Accession No. MI0017321, 서열번호 318)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6850-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6850-5p」라는 용어는 서열번호 126에 기재된 hsa-miR-6850-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027600)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6850-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6850-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6850」(miRBase Accession No. MI0022696, 서열번호 319)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6777-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6777-5p」라는 용어는 서열번호 127에 기재된 hsa-miR-6777-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027454)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6777-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6777-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6777」(miRBase Accession No. MI0022622, 서열번호 320)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6785-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6785-5p」라는 용어는 서열번호 128에 기재된 hsa-miR-6785-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027470)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6785-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6785-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6785」(miRBase Accession No. MI0022630, 서열번호 321)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-7106-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-7106-5p」라는 용어는 서열번호 129에 기재된 hsa-miR-7106-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0028109)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-7106-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-7106-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-7106」(miRBase Accession No. MI0022957, 서열번호 322)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-3663-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-3663-3p」라는 용어는 서열번호 130에 기재된 hsa-miR-3663-3p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0018085)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-3663-3p 유전자는 Liao JY 등, 2010년, PLoS One, 5권, e10563에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-3663-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-3663」(miRBase Accession No. MI0016064, 서열번호 323)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6131 유전자」 또는 「hsa-miR-6131」이라는 용어는 서열번호 131에 기재된 hsa-miR-6131 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0024615)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6131 유전자는 Dannemann M 등, 2012년, Genome Biol Evol, 4권, p552-564에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6131」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6131」(miRBase Accession No. MI0021276, 서열번호 324)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1915-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-1915-3p」라는 용어는 서열번호 132에 기재된 hsa-miR-1915-3p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0007892)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1915-3p 유전자는 Bar M 등, 2008년, Stem Cells, 26권, p2496-2505에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1915-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1915」(miRBase Accession No. MI0008336, 서열번호 288)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4532 유전자」 또는 「hsa-miR-4532」라는 용어는 서열번호 133에 기재된 hsa-miR-4532 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0019071)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4532 유전자는 Jima DD 등, 2010년, Blood, 116권, e118-e127에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4532」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4532」(miRBase Accession No. MI0016899, 서열번호 325)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6820-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6820-5p」라는 용어는 서열번호 134에 기재된 hsa-miR-6820-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027540)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6820-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6820-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6820」(miRBase Accession No. MI0022665, 서열번호 326)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4689 유전자」 또는 「hsa-miR-4689」라는 용어는 서열번호 135에 기재된 hsa-miR-4689 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0019778)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4689 유전자는 Persson H 등, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4689」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4689」(miRBase Accession No. MI0017322, 서열번호 327)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4638-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-4638-5p」라는 용어는 서열번호 136에 기재된 hsa-miR-4638-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0019695)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4638-5p 유전자는 Persson H 등, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4638-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4638」 (miRBase Accession No. MI0017265, 서열번호 328)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-3656 유전자」 또는 「hsa-miR-3656」이라는 용어는 서열번호 137에 기재된 hsa-miR-3656 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0018076)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-3656 유전자는 Meiri E 등, 2010년, Nucleic Acids Res, 38권, p6234-6246에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-3656」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-3656」(miRBase Accession No. MI0016056, 서열번호 329)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-3621 유전자」 또는 「hsa-miR-3621」이라는 용어는 서열번호 138에 기재된 hsa-miR-3621 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0018002)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-3621 유전자는 Witten D 등, 2010년, BMC Biol, 8권, p58에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-3621」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-3621」(miRBase Accession No. MI0016012, 서열번호 330)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6769b-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6769b-5p」라는 용어는 서열번호 139에 기재된 hsa-miR-6769b-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027620)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6769b-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6769b-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6769b」(miRBase Accession No. MI0022706, 서열번호 331)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-149-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-149-3p」라는 용어는 서열번호 140에 기재된 hsa-miR-149-3p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0004609)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-149-3p 유전자는 Lagos-Quintana M 등, 2002년, Curr Biol, 12권, p735-739에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-149-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-149」(miRBase Accession No. MI0000478, 서열번호 332)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-23b-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-23b-3p」라는 용어는, 서열번호 141에 기재된 hsa-miR-23b-3p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0000418)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-23b-3p 유전자는 Lagos-Quintana M 등, 2002년, Curr Biol, 12권, p735-739에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-23b-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-23b」(miRBase Accession No. MI0000439, 서열번호 333)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-3135b 유전자」 또는 「hsa-miR-3135b」라는 용어는 서열번호 142에 기재된 hsa-miR-3135b 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0018985)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-3135b 유전자는 Jima DD 등, 2010년, Blood, 116권, e118-e127에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-3135b」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-3135b」(miRBase Accession No. MI0016809, 서열번호 334)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6848-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6848-5p」라는 용어는 서열번호 143에 기재된 hsa-miR-6848-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027596)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6848-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6848-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6848」(miRBase Accession No. MI0022694, 서열번호 335)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6769a-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6769a-5p」라는 용어는 서열번호 144에 기재된 hsa-miR-6769a-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027438)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6769a-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6769a-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6769a」(miRBase Accession No. MI0022614, 서열번호 336)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4327 유전자」 또는 「hsa-miR-4327」이라는 용어는 서열번호 145에 기재된 hsa-miR-4327 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0016889)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4327 유전자는 Goff LA 등, 2009년, PLoS One, 4권, e7192에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4327」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4327」(miRBase Accession No. MI0015867, 서열번호 337)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6765-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-6765-3p」라는 용어는 서열번호 146에 기재된 hsa-miR-6765-3p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027431)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6765-3p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6765-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6765」(miRBase Accession No. MI0022610, 서열번호 338)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6716-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6716-5p」라는 용어는 서열번호 147에 기재된 hsa-miR-6716-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0025844)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6716-5p 유전자는 Li Y 등, 2012년, Gene, 497권, p330-335에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6716-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6716」 (miRBase Accession No. MI0022550, 서열번호 339)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6877-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6877-5p」라는 용어는 서열번호 148에 기재된 hsa-miR-6877-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027654)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6877-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6877-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6877」(miRBase Accession No. MI0022724, 서열번호 340)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6727-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6727-5p」라는 용어는 서열번호 149에 기재된 hsa-miR-6727-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027355)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6727-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6727-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6727」(miRBase Accession No. MI0022572, 서열번호 341)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4534 유전자」 또는 「hsa-miR-4534」라는 용어는 서열번호 150에 기재된 hsa-miR-4534 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0019073)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4534 유전자는 Jima DD 등, 2010년, Blood, 116권, e118-e127에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4534」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4534」(miRBase Accession No. MI0016901, 서열번호 342)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-614 유전자」 또는 「hsa-miR-614」라는 용어는 서열번호 151에 기재된 hsa-miR-614 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0003282)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-614 유전자는 Cummins JM 등, 2006년, Proc Natl Acad Sci U S A, 103권, p3687-3692에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-614」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-614」(miRBase Accession No. MI0003627, 서열번호 343)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1202 유전자」 또는 「hsa-miR-1202」라는 용어는 서열번호 152에 기재된 hsa-miR-1202 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0005865)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1202 유전자는 Marton S 등, 2008년, Leukemia, 22권, p330-338에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1202」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1202」(miRBase Accession No. MI0006334, 서열번호 344)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-575 유전자」 또는 「hsa-miR-575」라는 용어는 서열번호 153에 기재된 hsa-miR-575 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0003240)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-575 유전자는 Cummins JM 등, 2006년, Proc Natl Acad Sci U S A, 103권, p3687-3692에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-575」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-575」(miRBase Accession No. MI0003582, 서열번호 345)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6870-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6870-5p」라는 용어는 서열번호 154에 기재된 hsa-miR-6870-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027640)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6870-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6870-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6870」(miRBase Accession No. MI0022717, 서열번호 346)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6722-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-6722-3p」라는 용어는 서열번호 155에 기재된 hsa-miR-6722-3p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0025854)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6722-3p 유전자는 Li Y 등, 2012년, Gene, 497권, p330-335에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6722-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6722」(miRBase Accession No. MI0022557, 서열번호 347)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-7977 유전자」 또는 「hsa-miR-7977」이라는 용어는 서열번호 156에 기재된 hsa-miR-7977 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0031180)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-7977 유전자는 Velthut-Meikas A 등, 2013년, Mol Endocrinol, 온라인판에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-7977」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-7977」(miRBase Accession No. MI0025753, 서열번호 348)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4649-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-4649-5p」라는 용어는 서열번호 157에 기재된 hsa-miR-4649-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0019711)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4649-5p 유전자는 Persson H 등, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한. 「hsa-miR-4649-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4649」(miRBase Accession No. MI0017276, 서열번호 349)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4675 유전자」 또는 「hsa-miR-4675」라는 용어는 서열번호 158에 기재된 hsa-miR-4675 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0019757)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4675 유전자는 Persson H 등, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4675」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4675」(miRBase Accession No. MI0017306, 서열번호 350)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6075 유전자」 또는 「hsa-miR-6075」라는 용어는 서열번호 159에 기재된 hsa-miR-6075 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0023700)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6075 유전자는 Voellenkle C 등, 2012년, RNA, 18권, p472-484에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6075」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6075」(miRBase Accession No. MI0020352, 서열번호 351)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6779-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6779-5p」라는 용어는 서열번호 160에 기재된 hsa-miR-6779-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027458)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6779-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6779-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6779」(miRBase Accession No. MI0022624, 서열번호 352)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4271 유전자」 또는 「hsa-miR-4271」이라는 용어는 서열번호 161에 기재된 hsa-miR-4271 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0016901)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4271 유전자는 Goff LA 등, 2009년, PLoS One, 4권, e7192에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4271」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4271」(miRBase Accession No. MI0015879, 서열번호 353)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-3196 유전자」 또는 「hsa-miR-3196」이라는 용어는 서열번호 162에 기재된 hsa-miR-3196 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0015080)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-3196 유전자는 Stark MS 등, 2010년, PLoS One, 5권, e9685에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-3196」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-3196」(miRBase Accession No. MI0014241, 서열번호 354)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6803-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6803-5p」라는 용어는 서열번호 163에 기재된 hsa-miR-6803-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027506)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6803-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6803-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6803」(miRBase Accession No. MI0022648, 서열번호 355)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6789-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6789-5p」라는 용어는 서열번호 164에 기재된 hsa-miR-6789-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027478)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6789-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6789-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6789」(miRBase Accession No. MI0022634, 서열번호 356)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4648 유전자」 또는 「hsa-miR-4648」이라는 용어는 서열번호 165에 기재된 hsa-miR-4648 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0019710)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4648 유전자는 Persson H 등, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4648」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4648」(miRBase Accession No. MI0017275, 서열번호 357)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4508 유전자」 또는 「hsa-miR-4508」이라는 용어는 서열번호 166에 기재된 hsa-miR-4508 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0019045)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4508 유전자는 Jima DD 등, 2010년, Blood, 116권, e118-e127에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4508」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4508」(miRBase Accession No. MI0016872, 서열번호 358)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4749-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-4749-5p」라는 용어는 서열번호 167에 기재된 hsa-miR-4749-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0019885)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4749-5p 유전자는 Persson H 등, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4749-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4749」(miRBase Accession No. MI0017388, 서열번호 359)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4505 유전자」 또는 「hsa-miR-4505」라는 용어는 서열번호 168에 기재된 hsa-miR-4505 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0019041)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4505 유전자는 Jima DD 등, 2010년, Blood, 116권, e118-e127에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4505」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4505」(miRBase Accession No. MI0016868, 서열번호 360)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-5698 유전자」 또는 「hsa-miR-5698」이라는 용어는 서열번호 169에 기재된 hsa-miR-5698 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0022491)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-5698 유전자는 Watahiki A 등, 2011년, PLoS One, 6권, e24950에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-5698」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-5698」(miRBase Accession No. MI0019305, 서열번호 361)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1199-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-1199-5p」라는 용어는 서열번호 170에 기재된 hsa-miR-1199-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0031119)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1199-5p 유전자는 Salvi A 등, 2013년, Int J Oncol, 42권, p391-402에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1199-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1199」(miRBase Accession No. MI0020340, 서열번호 362)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4763-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-4763-3p」라는 용어는 서열번호 171에 기재된 hsa-miR-4763-3p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0019913)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4763-3p 유전자는 Persson H 등, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4763-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4763」(miRBase Accession No. MI0017404, 서열번호 363)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1231 유전자」 또는 「hsa-miR-1231」이라는 용어는 서열번호 172에 기재된 hsa-miR-1231 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0005586)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1231 유전자는 Berezikov E 등, 2007년, Mol Cell, 28권, p328-336에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1231」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1231」(miRBase Accession No. MI0006321, 서열번호 364)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1233-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-1233-5p」라는 용어는 서열번호 173에 기재된 hsa-miR-1233-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0022943)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1233-5p 유전자는 Berezikov E 등, 2007년, Mol Cell, 28권, p328-336에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1233-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1233-1, hsa-mir-1233-2」(miRBase Accession No. MI0006323, MI0015973, 서열번호 365, 366)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-150-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-150-3p」라는 용어는 서열번호 174에 기재된 hsa-miR-150-3p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0004610)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-150-3p 유전자는 Lagos-Quintana M 등, 2002년, Curr Biol, 12권, p735-739에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-150-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-150」(miRBase Accession No. MI0000479, 서열번호 367)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1225-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-1225-3p」라는 용어는 서열번호 175에 기재된 hsa-miR-1225-3p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0005573)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1225-3p 유전자는 Berezikov E 등, 2007년, Mol Cell, 28권, p328-336에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1225-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1225」(miRBase Accession No. MI0006311, 서열번호 235)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-92a-2-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-92a-2-5p」라는 용어는 서열번호 176에 기재된 hsa-miR-92a-2-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0004508)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-92a-2-5p 유전자는 Mourelatos Z 등, 2002년, Genes Dev, 16권, p720-728에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-92a-2-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-92a-2」(miRBase Accession No. MI0000094, 서열번호 368)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-423-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-423-5p」라는 용어는 서열번호 177에 기재된 hsa-miR-423-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0004748)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-423-5p 유전자는 Kasashima K 등, 2004년, Biochem Biophys Res Commun, 322권, p403-410에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-423-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-423」(miRBase Accession No. MI0001445, 서열번호 369)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-1268a 유전자」 또는 「hsa-miR-1268a」라는 용어는 서열번호 178에 기재된 hsa-miR-1268a 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0005922)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-1268a 유전자는 Morin RD 등, 2008년, Genome Res, 18권, p610-621에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-1268a」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-1268a」(miRBase Accession No. MI0006405, 서열번호 370)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-128-2-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-128-2-5p」라는 용어는 서열번호 179에 기재된 hsa-miR-128-2-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0031095)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-128-2-5p 유전자는 Lagos-Quintana M 등, 2002년, Curr Biol, 12권, p735-739에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-128-2-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-128-2」(miRBase Accession No. MI0000727, 서열번호 371)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-24-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-24-3p」라는 용어는 서열번호 180에 기재된 hsa-miR-24-3p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0000080)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-24-3p 유전자는 Lagos-Quintana M 등, 2001년, Science, 294권, p853-858에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-24-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-24-1, hsa-mir-24-2」(miRBase Accession No. MI0000080, MI0000081, 서열번호 372, 373)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4697-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-4697-5p」라는 용어는 서열번호 181에 기재된 hsa-miR-4697-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0019791)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4697-5p 유전자는 Persson H 등, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4697-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4697」(miRBase Accession No. MI0017330, 서열번호 374)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-3197 유전자」 또는 「hsa-miR-3197」이라는 용어는 서열번호 182에 기재된 hsa-miR-3197 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0015082)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-3197 유전자는 Stark MS 등, 2010년, PLoS One, 5권, e9685에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-3197」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-3197」(miRBase Accession No. MI0014245, 서열번호 375)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-675-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-675-5p」라는 용어는 서열번호 183에 기재된 hsa-miR-675-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0004284)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-675-5p 유전자는 Cai X 등, 2007년, RNA, 13권, p313-316에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-675-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-675」(miRBase Accession No. MI0005416, 서열번호 376)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4486 유전자」 또는 「hsa-miR-4486」이라는 용어는 서열번호 184에 기재된 hsa-miR-4486 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0019020)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4486 유전자는 Jima DD 등, 2010년, Blood, 116권, e118-e127에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4486」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4486」(miRBase Accession No. MI0016847, 서열번호 377)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-7107-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-7107-5p」라는 용어는 서열번호 185에 기재된 hsa-miR-7107-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0028111)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-7107-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-7107-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-7107」(miRBase Accession No. MI0022958, 서열번호 378)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-23a-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-23a-3p」라는 용어는 서열번호 186에 기재된 hsa-miR-23a-3p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0000078)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-23a-3p 유전자는 Lagos-Quintana M 등, 2001년, Science, 294권, p853-858에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-23a-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-23a」(miRBase Accession No. MI0000079, 서열번호 379)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4667-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-4667-5p」라는 용어는 서열번호 187에 기재된 hsa-miR-4667-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0019743)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4667-5p 유전자는 Persson H 등, 2011년, Cancer Res, 71권, p78-86에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4667-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4667」(miRBase Accession No. MI0017297, 서열번호 380)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-451a 유전자」 또는 「hsa-miR-451a」라는 용어는 서열번호 188에 기재된 hsa-miR-451a 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0001631)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-451a 유전자는 Altuvia Y 등, 2005년, Nucleic Acids Res, 33권, p2697-2706에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-451a」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-451a」(miRBase Accession No. MI0001729, 서열번호 381)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-3940-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-3940-5p」라는 용어는 서열번호 189에 기재된 hsa-miR-3940-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0019229)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-3940-5p 유전자는 Liao JY 등, 2010년, PLoS One, 5권, e10563에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-3940-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-3940」(miRBase Accession No. MI0016597, 서열번호 382)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-8059 유전자」 또는 「hsa-miR-8059」라는 용어는 서열번호 190에 기재된 hsa-miR-8059 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0030986)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-8059 유전자는 Wang HJ 등, 2013년, Shock, 39권, p480-487에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-8059」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-8059」(miRBase Accession No. MI0025895, 서열번호 383)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6813-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6813-5p」라는 용어는 서열번호 191에 기재된 hsa-miR-6813-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027526)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6813-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6813-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6813」(miRBase Accession No. MI0022658, 서열번호 384)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4492 유전자」 또는 「hsa-miR-4492」라는 용어는 서열번호 192에 기재된 hsa-miR-4492 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0019027)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4492 유전자는 Jima DD 등, 2010년, Blood, 116권, e118-e127에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4492」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4492」(miRBase Accession No. MI0016854, 서열번호 385)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4476 유전자」 또는 「hsa-miR-4476」이라는 용어는 서열번호 193에 기재된 hsa-miR-4476 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0019003)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-4476 유전자는 Jima DD 등, 2010년, Blood, 116권, e118-e127에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4476」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4476」(miRBase Accession No. MI0016828, 서열번호 386)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6090 유전자」 또는 「hsa-miR-6090」이라는 용어는 서열번호 194에 기재된 hsa-miR-6090 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0023715)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등을 포함한다. hsa-miR-6090 유전자는 Yoo JK 등, 2012년, Stem Cells Dev, 21권, p2049-2057에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6090」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6090」(miRBase Accession No. MI0020367, 서열번호 387)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6836-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-6836-3p」라는 용어는 서열번호 606에 기재된 hsa-miR-6836-3p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027575)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등이 포함된다. hsa-miR-6836-3p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6836-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6836」(miRBase Accession No. MI0022682, 서열번호 615)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-3195 유전자」 또는 「hsa-miR-3195」라는 용어는 서열번호 607에 기재된 hsa-miR-3195 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0015079)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등이 포함된다. hsa-miR-3195 유전자는 Stark MS 등, 2010년, PLoS One, 5권, e9685에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-3195」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-3195」(miRBase Accession No. MI0014240, 서열번호 616)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-718 유전자」 또는 「hsa-miR-718」이라는 용어는 서열번호 608에 기재된 hsa-miR-718 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0012735)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등이 포함된다. hsa-miR-718 유전자는 Artzi S 등, 2008년, BMC Bioinformatics, 9권, p39에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-718」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-718」(miRBase Accession No. MI0012489, 서열번호 617)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-3178 유전자」 또는 「hsa-miR-3178」이라는 용어는 서열번호 609에 기재된 hsa-miR-3178 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0015055)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등이 포함된다. hsa-miR-3178 유전자는 Stark MS 등, 2010년, PLoS One, 5권, e9685에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-3178」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-3178」(miRBase Accession No. MI0014212, 서열번호 618)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-638 유전자」 또는 「hsa-miR-638」이라는 용어는 서열번호 610에 기재된 hsa-miR-638 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0003308)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등이 포함된다. hsa-miR-638 유전자는 Cummins JM 등, 2006년, Proc Natl Acad Sci U S A, 103권, p3687-3692에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-638」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-638」(miRBase Accession No. MI0003653, 서열번호 619)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-4497 유전자」 또는 「hsa-miR-4497」이라는 용어는 서열번호 611에 기재된 hsa-miR-4497 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0019032)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등이 포함된다. hsa-miR-4497 유전자는 Jima DD 등, 2010년, Blood, 116권, e118-e127에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-4497」은 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-4497」(miRBase Accession No. MI0016859, 서열번호 620)이 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6085 유전자」 또는 「hsa-miR-6085」라는 용어는 서열번호 612에 기재된 hsa-miR-6085 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0023710)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등이 포함된다. hsa-miR-6085 유전자는 Voellenkle C 등, 2012년, RNA, 18권, p472-484에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6085」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6085」(miRBase Accession No. MI0020362, 서열번호 621)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-6752-5p 유전자」 또는 「hsa-miR-6752-5p」라는 용어는 서열번호 613에 기재된 hsa-miR-6752-5p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0027404)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등이 포함된다. hsa-miR-6752-5p 유전자는 Ladewig E 등, 2012년, Genome Res, 22권, p1634-1645에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-6752-5p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-6752」(miRBase Accession No. MI0022597, 서열번호 622)가 알려져 있다.
본 명세서에서 사용되는 「hsa-miR-135a-3p 유전자」 또는 「hsa-miR-135a-3p」라는 용어는 서열번호 614에 기재된 hsa-miR-135a-3p 유전자(miRBase Accession No. MIMAT0004595)나 그 외 생물종 호몰로그 또는 오솔로그 등이 포함된다. hsa-miR-135a-3p 유전자는 Lagos-Quintana M 등, 2002년, Curr Biol, 12권, p735-739에 기재되는 방법에 의해 얻을 수 있다. 또한, 「hsa-miR-135a-3p」는 그 전구체로서 헤어핀 모양 구조를 취하는 「hsa-mir-135a」(miRBase Accession No. MI0000452, 서열번호 623)가 알려져 있다.
또한, 성숙형의 miRNA는 헤어핀 모양 구조를 취하는 RNA 전구체로부터 성숙형 miRNA로서 절출될 때에 서열의 전후 1~수염기가 짧게, 또는 길게 절출되는 경우나, 염기의 치환이 생겨 변이체가 되는 경우가 있고, isomiR이라고 칭해진다(Morin RD. 등, 2008년, Genome Res., 제18권, p.610-621). miRBase Release 20에서는 서열번호 1~194 및 606~614 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열 외에 수많은 isomiR이라고 불리는 서열번호 388~605 및 624~635 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열의 변이체 및 단편도 나타내어져 있다. 이들의 변이체도 또한 서열번호 1~194 및 606~614 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열을 갖는 miRNA로서 얻을 수 있다. 즉, 본 발명의 서열번호 5, 7, 8, 9, 11, 16, 19, 20, 21, 26, 27, 28, 30, 34, 37, 38, 39, 41, 43, 45, 46, 48, 50, 54, 55, 57, 58, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 69, 70, 71, 73, 74, 76, 77, 78, 80, 81, 82, 84, 85, 86, 88, 89, 94, 95, 97, 98, 99, 100, 101, 104, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 115, 116, 117, 119, 120, 123, 125, 131, 132, 133, 135, 136, 137, 140, 141, 142, 147, 151, 152, 157, 161, 162, 165, 166, 167, 168, 169, 171, 173, 174, 176, 177, 178, 179, 180, 182, 183, 184, 186, 187, 188, 189, 192, 193, 607, 608, 609, 610, 611 및 614로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 변이체 중 예를 들면 miRBase Release 20에 등록되어 있는 가장 긴 변이체로서 각각 서열번호 388, 390, 392, 394, 396, 398, 400, 402, 404, 406, 408, 410, 412, 414, 416, 418, 420, 422, 424, 426, 428, 430, 432, 434, 436, 438, 440, 442, 444, 446, 448, 450, 452, 454, 456, 458, 460, 462, 464, 466, 468, 470, 472, 474, 476, 478, 480, 482, 484, 486, 488, 490, 492, 494, 496, 498, 500, 502, 504, 506, 508, 510, 512, 514, 516, 518, 520, 522, 524, 526, 528, 530, 532, 534, 536, 538, 540, 542, 544, 546, 548, 550, 552, 554, 556, 558, 560, 562, 564, 566, 568, 570, 572, 574, 576, 578, 580, 582, 584, 586, 588, 590, 592, 594, 596, 598, 600, 602, 604, 624, 626, 628, 630, 632 및 634로 나타내어지는 폴리뉴클레오티드를 들 수 있다. 또한, 본 발명의 서열번호 5, 7, 8, 9, 11, 16, 19, 20, 21, 26, 27, 28, 30, 34, 37, 38, 39, 41, 43, 45, 46, 48, 50, 54, 55, 57, 58, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 69, 70, 71, 73, 74, 76, 77, 78, 80, 81, 82, 84, 85, 86, 88, 89, 94, 95, 97, 98, 99, 100, 101, 104, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 115, 116, 117, 119, 120, 123, 125, 131, 132, 133, 135, 136, 137, 140, 141, 142, 147, 151, 152, 157, 161, 162, 165, 166, 167, 168, 169, 171, 173, 174, 176, 177, 178, 179, 180, 182, 183, 184, 186, 187, 188, 189, 192, 193, 607, 608, 609, 610, 611 및 614로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 변이체 중 예를 들면 miRBASE Release 20에 등록되어 있는 가장 긴 변이체로서 각각 서열번호 389, 391, 393, 395, 397, 399, 401, 403, 405, 407, 409, 411, 413, 415, 417, 419, 421, 423, 425, 427, 429, 431, 433, 435, 437, 439, 441, 443, 445, 447, 449, 451, 453, 455, 457, 459, 461, 463, 465, 467, 469, 471, 473, 475, 477, 479, 481, 483, 485, 487, 489, 491, 493, 495, 497, 499, 501, 503, 505, 507, 509, 511, 513, 515, 517, 519, 521, 523, 525, 527, 529, 531, 533, 535, 537, 539, 541, 543, 545, 547, 549, 551, 553, 555, 557, 559, 561, 563, 565, 567, 569, 571, 573, 575, 577, 579, 581, 583, 585, 587, 589, 591, 593, 595, 597, 599, 601, 603, 605, 625, 627, 629, 631, 633 및 635로 나타내어지는 서열의 폴리뉴클레오티드를 들 수 있다. 또한, 이들의 변이체 및 단편 이외에도 miRBase에 등록된 서열번호 1~194 및 606~614의 수많은 isomiR인 폴리뉴클레오티드를 들 수 있다. 또한, 서열번호 1~194 및 606~614 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드의 예로서는 각각 전구체인 서열번호 195~387 및 615~623 중 어느 하나로 나타내어지는 폴리뉴클레오티드를 들 수 있다.
서열번호 1~635로 나타내어지는 유전자의 명칭과 miRBase Accession No.(등록번호)를 표 1에 기재했다.
[표 1]
본 명세서는 본원의 우선권의 기초인 일본국특허출원 2014-122686호, 2015-070182호의 명세서 및/또는 도면에 기재되는 내용을 포함한다.
(발명의 효과)
본 발명에 의해 대장암을 용이하게 또한 높은 정밀도로 검출하는 것이 가능하게 되었다.
예를 들면, 저침습적으로 채취할 수 있는 환자의 혈액, 혈청 및 또는 혈장 중의 수개의 miRNA 발현량의 측정값을 지표로 하여 용이하게 환자가 대장암인지 아닌지를 검출할 수 있다.
도 1은 전구체인 서열번호 205로 나타내어지는 hsa-mir-3679로부터 생성되는 서열번호 11로 나타내어지는 hsa-miR-3679-5p, 및 서열번호 78로 나타내어지는 hsa-miR-3679-3p의 염기 서열의 관계를 나타낸다.
도 2는 좌측 도면: 학습 검체군으로서 선택된 건상체(100명)와 대장암 환자(34명)의 hsa-miR-6726-5p(서열번호 1)의 발현량 측정값을 종축으로 하여 각각 나타낸 것이다. 도면 중의 수평선은 피셔의 판별 분석에 의해 최적화된 양쪽 군을 판별하는 역치(9.43)를 나타낸다. 우측 도면: 테스트 검체군으로서 선택된 건상체(50명)와 대장암 환자(16명)의 hsa-miR-6726-5p(서열번호 1)의 발현량 측정값을 종축으로 하여 각각 나타낸 것이다. 도면 중의 수평선은 학습 검체군에서 설정한 양쪽 군을 판별하는 역치(9.43)를 나타낸다.
도 3은 좌측 도면: 학습 검체군으로서 선택된 건상체(100명, ○)와 대장암 환자(34명, △)의 hsa-miR-6726-5p(서열번호 1)의 발현량 측정값을 횡축으로 하고, hsa-miR-4257(서열번호 2)의 발현량 측정값을 종축으로 하여 각각 나타낸 것이다. 도면 중의 선은 피셔의 판별 분석에 의해 최적화된 양쪽 군을 판별하는 판별 함수(0=1.26x＋y―18.06)를 나타낸다. 우측 도면: 테스트 검체군으로서 선택된 건상체(50명, ○)와 대장암 환자(16명, △)의 hsa-miR-6726-5p(서열번호 1)의 발현량 측정값을 횡축으로 하고, hsa-miR-4257(서열번호 2)의 발현량 측정값을 종축으로 하여 각각 나타낸 것이다. 도면 중의 선은 학습 검체군에서 설정한 양쪽 군을 판별하는 역치(0=1.26x＋y―18.06)를 나타낸다.
도 4는 상측 도면: 학습 검체군으로서 선택된 대장암 환자 34명, 건상체 103명, 췌장암 환자 69명, 담도암 환자 66명, 위암 환자 30명, 식도암 환자 33명, 간암 환자 32명, 및 췌담도 양성 질환 환자 15명의 hsa-miR-3131(서열번호 5), hsa-miR-204-3p(서열번호 45), hsa-miR-4665-5p(서열번호 57), hsa-miR-7847-3p(서열번호 75), hsa-miR-3196(서열번호 162), hsa-miR-3195(서열번호 607)의 발현량 측정값으로부터 피셔의 판별 분석을 이용하여 판별식을 작성하고(1.49×hsa-miR-3131―0.23×hsa-miR-7847-3p―1.13×hsa-miR-3196＋1.11×hsa-miR-3195＋2.25×hsa-miR-4665-5p―1.00×hsa-miR-204-3p―11.16), 그 판별식으로부터 얻어진 판별 득점을 종축으로 하고, 검체군을 횡축으로 하여 나타낸 것이다. 도면 중의 점선은 판별 득점이 0이 되는 양쪽 군을 판별하는 판별 경계를 나타낸다. 하측 도면: 테스트 검체군으로서 선택된 대장암 환자 16명, 건상체 47명, 췌장암 환자 30명, 담도암 환자 33명, 위암 환자 20명, 식도암 환자 17명, 간암 환자 20명, 및 췌담도 양성 질환 환자 6명의 hsa-miR-3131(서열번호 5), hsa-miR-204-3p(서열번호 45), hsa-miR-4665-5p(서열번호 57), hsa-miR-7847-3p(서열번호 75), hsa-miR-3196(서열번호 162), hsa-miR-3195(서열번호 607)의 발현량 측정값에 대하여 학습 검체군에서 작성한 그 판별식으로부터 얻어진 판별 득점을 종축으로 하고, 검체군을 횡축으로 하여 나타낸 것이다. 도면 중의 점선은 판별 득점이 0이 되는 양쪽 군을 판별하는 판별 경계를 나타낸다.
이하에 본 발명을 더 구체적으로 설명한다.
1.대장암의 표적 핵산
본 발명의 상기 정의의 대장암 검출용의 핵산 프로브 또는 프라이머를 사용하여 대장암 또는 대장암 세포의 존재 및/또는 부존재를 검출하기 위한 대장암 마커로서의 주요한 표적 핵산에는 hsa-miR-6726-5p, hsa-miR-4257, hsa-miR-6787-5p, hsa-miR-6780b-5p, hsa-miR-3131, hsa-miR-7108-5p, hsa-miR-1343-3p, hsa-miR-1247-3p, hsa-miR-4651, hsa-miR-6757-5p, hsa-miR-3679-5p, hsa-miR-7641, hsa-miR-6746-5p, hsa-miR-8072, hsa-miR-6741-5p, hsa-miR-1908-5p, hsa-miR-6857-5p, hsa-miR-4746-3p, hsa-miR-744-5p, hsa-miR-4792, hsa-miR-564, hsa-miR-6791-5p, hsa-miR-6825-5p, hsa-miR-6826-5p, hsa-miR-4665-3p, hsa-miR-4467, hsa-miR-3188, hsa-miR-6125, hsa-miR-6756-5p, hsa-miR-1228-3p, hsa-miR-8063, hsa-miR-8069, hsa-miR-6875-5p, hsa-miR-3185, hsa-miR-4433b-3p, hsa-miR-6887-5p, hsa-miR-128-1-5p, hsa-miR-6724-5p, hsa-miR-1914-3p, hsa-miR-1225-5p, hsa-miR-4419b, hsa-miR-7110-5p, hsa-miR-187-5p, hsa-miR-3184-5p, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-5572, hsa-miR-6729-5p, hsa-miR-615-5p, hsa-miR-6749-5p, hsa-miR-6515-3p, hsa-miR-3937, hsa-miR-6840-3p, hsa-miR-6893-5p, hsa-miR-4728-5p, hsa-miR-6717-5p, hsa-miR-7113-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-642b-3p, hsa-miR-7109-5p, hsa-miR-6842-5p, hsa-miR-4442, hsa-miR-4433-3p, hsa-miR-4707-5p, hsa-miR-6126, hsa-miR-4449, hsa-miR-4706, hsa-miR-1913, hsa-miR-602, hsa-miR-939-5p, hsa-miR-4695-5p, hsa-miR-711, hsa-miR-6816-5p, hsa-miR-4632-5p, hsa-miR-6721-5p, hsa-miR-7847-3p, hsa-miR-6132, hsa-miR-887-3p, hsa-miR-3679-3p, hsa-miR-6784-5p, hsa-miR-1249, hsa-miR-937-5p, hsa-miR-5195-3p, hsa-miR-6732-5p, hsa-miR-4417, hsa-miR-4281, hsa-miR-4734, hsa-miR-6766-3p, hsa-miR-663a, hsa-miR-4513, hsa-miR-6781-5p, hsa-miR-1227-5p, hsa-miR-6845-5p, hsa-miR-6798-5p, hsa-miR-3620-5p, hsa-miR-1915-5p, hsa-miR-4294, hsa-miR-642a-3p, hsa-miR-371a-5p, hsa-miR-940, hsa-miR-4450, hsa-miR-4723-5p, hsa-miR-1469, hsa-miR-6861-5p, hsa-miR-7975, hsa-miR-6879-5p, hsa-miR-6802-5p, hsa-miR-1268b, hsa-miR-663b, hsa-miR-125a-3p, hsa-miR-2861, hsa-miR-6088, hsa-miR-4758-5p, hsa-miR-296-3p, hsa-miR-6738-5p, hsa-miR-671-5p, hsa-miR-4454, hsa-miR-4516, hsa-miR-7845-5p, hsa-miR-4741, hsa-miR-92b-5p, hsa-miR-6795-5p, hsa-miR-6805-3p, hsa-miR-4725-3p, hsa-miR-6782-5p, hsa-miR-4688, hsa-miR-6850-5p, hsa-miR-6777-5p, hsa-miR-6785-5p, hsa-miR-7106-5p, hsa-miR-3663-3p, hsa-miR-6131, hsa-miR-1915-3p, hsa-miR-4532, hsa-miR-6820-5p, hsa-miR-4689, hsa-miR-4638-5p, hsa-miR-3656, hsa-miR-3621, hsa-miR-6769b-5p, hsa-miR-149-3p, hsa-miR-23b-3p, hsa-miR-3135b, hsa-miR-6848-5p, hsa-miR-6769a-5p, hsa-miR-4327, hsa-miR-6765-3p, hsa-miR-6716-5p, hsa-miR-6877-5p, hsa-miR-6727-5p, hsa-miR-4534, hsa-miR-614, hsa-miR-1202, hsa-miR-575, hsa-miR-6870-5p, hsa-miR-6722-3p, hsa-miR-7977, hsa-miR-4649-5p, hsa-miR-4675, hsa-miR-6075, hsa-miR-6779-5p, hsa-miR-4271, hsa-miR-3196, hsa-miR-6803-5p, hsa-miR-6789-5p, hsa-miR-4648, hsa-miR-4508, hsa-miR-4749-5p, hsa-miR-4505, hsa-miR-5698, hsa-miR-1199-5p, hsa-miR-4763-3p, hsa-miR-6836-3p, hsa-miR-3195, hsa-miR-718, hsa-miR-3178, hsa-miR-638, hsa-miR-4497, hsa-miR-6085, hsa-miR-6752-5p 및 hsa-miR-135a-3p로 이루어지는 군으로부터 선택되는 적어도 1개 이상의 miRNA를 사용할 수 있다. 또한, 이들의 miRNA와 조합할 수 있는 다른 대장암 마커, 즉 hsa-miR-1231, hsa-miR-1233-5p, hsa-miR-150-3p, hsa-miR-1225-3p, hsa-miR-92a-2-5p, hsa-miR-423-5p, hsa-miR-1268a, hsa-miR-128-2-5p 및 hsa-miR-24-3p로 이루어지는 군으로부터 선택되는 적어도 1개 이상의 miRNA도 표적 핵산으로서 바람직하게 사용할 수 있다. 또한, 이들의 miRNA와 조합할 수 있는 다른 대장암 마커, 즉 hsa-miR-4697-5p, hsa-miR-3197, hsa-miR-675-5p, hsa-miR-4486, hsa-miR-7107-5p, hsa-miR-23a-3p, hsa-miR-4667-5p, hsa-miR-451a, hsa-miR-3940-5p, hsa-miR-8059, hsa-miR-6813-5p, hsa-miR-4492, hsa-miR-4476 및 hsa-miR-6090으로 이루어지는 군으로부터 선택되는 적어도 1개 이상의 miRNA도 표적 핵산으로서 바람직하게 사용할 수 있다.
상기의 miRNA에는 예를 들면, 서열번호 1~194 및 606~614 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열을 포함하는 인간 유전자(즉, 각각 hsa-miR-6726-5p, hsa-miR-4257, hsa-miR-6787-5p, hsa-miR-6780b-5p, hsa-miR-3131, hsa-miR-7108-5p, hsa-miR-1343-3p, hsa-miR-1247-3p, hsa-miR-4651, hsa-miR-6757-5p, hsa-miR-3679-5p, hsa-miR-7641, hsa-miR-6746-5p, hsa-miR-8072, hsa-miR-6741-5p, hsa-miR-1908-5p, hsa-miR-6857-5p, hsa-miR-4746-3p, hsa-miR-744-5p, hsa-miR-4792, hsa-miR-564, hsa-miR-6791-5p, hsa-miR-6825-5p, hsa-miR-6826-5p, hsa-miR-4665-3p, hsa-miR-4467, hsa-miR-3188, hsa-miR-6125, hsa-miR-6756-5p, hsa-miR-1228-3p, hsa-miR-8063, hsa-miR-8069, hsa-miR-6875-5p, hsa-miR-3185, hsa-miR-4433b-3p, hsa-miR-6887-5p, hsa-miR-128-1-5p, hsa-miR-6724-5p, hsa-miR-1914-3p, hsa-miR-1225-5p, hsa-miR-4419b, hsa-miR-7110-5p, hsa-miR-187-5p, hsa-miR-3184-5p, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-5572, hsa-miR-6729-5p, hsa-miR-615-5p, hsa-miR-6749-5p, hsa-miR-6515-3p, hsa-miR-3937, hsa-miR-6840-3p, hsa-miR-6893-5p, hsa-miR-4728-5p, hsa-miR-6717-5p, hsa-miR-7113-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-642b-3p, hsa-miR-7109-5p, hsa-miR-6842-5p, hsa-miR-4442, hsa-miR-4433-3p, hsa-miR-4707-5p, hsa-miR-6126, hsa-miR-4449, hsa-miR-4706, hsa-miR-1913, hsa-miR-602, hsa-miR-939-5p, hsa-miR-4695-5p, hsa-miR-711, hsa-miR-6816-5p, hsa-miR-4632-5p, hsa-miR-6721-5p, hsa-miR-7847-3p, hsa-miR-6132, hsa-miR-887-3p, hsa-miR-3679-3p, hsa-miR-6784-5p, hsa-miR-1249, hsa-miR-937-5p, hsa-miR-5195-3p, hsa-miR-6732-5p, hsa-miR-4417, hsa-miR-4281, hsa-miR-4734, hsa-miR-6766-3p, hsa-miR-663a, hsa-miR-4513, hsa-miR-6781-5p, hsa-miR-1227-5p, hsa-miR-6845-5p, hsa-miR-6798-5p, hsa-miR-3620-5p, hsa-miR-1915-5p, hsa-miR-4294, hsa-miR-642a-3p, hsa-miR-371a-5p, hsa-miR-940, hsa-miR-4450, hsa-miR-4723-5p, hsa-miR-1469, hsa-miR-6861-5p, hsa-miR-7975, hsa-miR-6879-5p, hsa-miR-6802-5p, hsa-miR-1268b, hsa-miR-663b, hsa-miR-125a-3p, hsa-miR-2861, hsa-miR-6088, hsa-miR-4758-5p, hsa-miR-296-3p, hsa-miR-6738-5p, hsa-miR-671-5p, hsa-miR-4454, hsa-miR-4516, hsa-miR-7845-5p, hsa-miR-4741, hsa-miR-92b-5p, hsa-miR-6795-5p, hsa-miR-6805-3p, hsa-miR-4725-3p, hsa-miR-6782-5p, hsa-miR-4688, hsa-miR-6850-5p, hsa-miR-6777-5p, hsa-miR-6785-5p, hsa-miR-7106-5p, hsa-miR-3663-3p, hsa-miR-6131, hsa-miR-1915-3p, hsa-miR-4532, hsa-miR-6820-5p, hsa-miR-4689, hsa-miR-4638-5p, hsa-miR-3656, hsa-miR-3621, hsa-miR-6769b-5p, hsa-miR-149-3p, hsa-miR-23b-3p, hsa-miR-3135b, hsa-miR-6848-5p, hsa-miR-6769a-5p, hsa-miR-4327, hsa-miR-6765-3p, hsa-miR-6716-5p, hsa-miR-6877-5p, hsa-miR-6727-5p, hsa-miR-4534, hsa-miR-614, hsa-miR-1202, hsa-miR-575, hsa-miR-6870-5p, hsa-miR-6722-3p, hsa-miR-7977, hsa-miR-4649-5p, hsa-miR-4675, hsa-miR-6075, hsa-miR-6779-5p, hsa-miR-4271, hsa-miR-3196, hsa-miR-6803-5p, hsa-miR-6789-5p, hsa-miR-4648, hsa-miR-4508, hsa-miR-4749-5p, hsa-miR-4505, hsa-miR-5698, hsa-miR-1199-5p, hsa-miR-4763-3p, hsa-miR-1231, hsa-miR-1233-5p, hsa-miR-150-3p, hsa-miR-1225-3p, hsa-miR-92a-2-5p, hsa-miR-423-5p, hsa-miR-1268a, hsa-miR-128-2-5p, hsa-miR-24-3p, hsa-miR-4697-5p, hsa-miR-3197, hsa-miR-675-5p, hsa-miR-4486, hsa-miR-7107-5p, hsa-miR-23a-3p, hsa-miR-4667-5p, hsa-miR-451a, hsa-miR-3940-5p, hsa-miR-8059, hsa-miR-6813-5p, hsa-miR-4492, hsa-miR-4476, hsa-miR-6090, hsa-miR-6836-3p, hsa-miR-3195, hsa-miR-718, hsa-miR-3178, hsa-miR-638, hsa-miR-4497, hsa-miR-6085, hsa-miR-6752-5p 및 hsa-miR-135a-3p), 그 동족체, 그 전사 산물, 및 그 변이체 또는 유도체가 포함된다. 여기서, 유전자, 동족체, 전사 산물, 변이체 및 유도체는 상기 정의대로이다.
바람직한 표적 핵산은 서열번호 1~635 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열을 포함하는 인간 유전자, 또는 그 전사 산물이며, 보다 바람직하게는 상기 전사 산물, 즉 miRNA, 그 전구체 RNA인 pri-miRNA 또는 pre-miRNA이다.
제 1 표적 유전자는 hsa-miR-6726-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 2 표적 유전자는 hsa-miR-4257 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 3 표적 유전자는 hsa-miR-6787-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 4 표적 유전자는 hsa-miR-6780b-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 5 표적 유전자는 hsa-miR-3131 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 6 표적 유전자는 hsa-miR-7108-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 7 표적 유전자는 hsa-miR-1343-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 8 표적 유전자는 hsa-miR-1247-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 9 표적 유전자는 hsa-miR-4651 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 10 표적 유전자는 hsa-miR-6757-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 11 표적 유전자는 hsa-miR-3679-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 12 표적 유전자는 hsa-miR-7641 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 13 표적 유전자는 hsa-miR-6746-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 14 표적 유전자는 hsa-miR-8072 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 15 표적 유전자는 hsa-miR-6741-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 16 표적 유전자는 hsa-miR-1908-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 17 표적 유전자는 hsa-miR-6857-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 18 표적 유전자는 hsa-miR-4746-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 19 표적 유전자는 hsa-miR-744-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 20 표적 유전자는 hsa-miR-4792 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 21 표적 유전자는 hsa-miR-564 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 22 표적 유전자는 hsa-miR-6791-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 23 표적 유전자는 hsa-miR-6825-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 24 표적 유전자는 hsa-miR-6826-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 25 표적 유전자는 hsa-miR-4665-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 26 표적 유전자는 hsa-miR-4467 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 27 표적 유전자는 hsa-miR-3188 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 28 표적 유전자는 hsa-miR-6125 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 29 표적 유전자는 hsa-miR-6756-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 30 표적 유전자는 hsa-miR-1228-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 31 표적 유전자는 hsa-miR-8063 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 32 표적 유전자는 hsa-miR-8069 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 33 표적 유전자는 hsa-miR-6875-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 34 표적 유전자는 hsa-miR-3185 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 35 표적 유전자는 hsa-miR-4433b-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 36 표적 유전자는 hsa-miR-6887-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 37 표적 유전자는 hsa-miR-128-1-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 38 표적 유전자는 hsa-miR-6724-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 39 표적 유전자는 hsa-miR-1914-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 40 표적 유전자는 hsa-miR-1225-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 41 표적 유전자는 hsa-miR-4419b 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 42 표적 유전자는 hsa-miR-7110-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 43 표적 유전자는 hsa-miR-187-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 44 표적 유전자는 hsa-miR-3184-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 45 표적 유전자는 hsa-miR-204-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 46 표적 유전자는 hsa-miR-5572 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 47 표적 유전자는 hsa-miR-6729-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 48 표적 유전자는 hsa-miR-615-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 49 표적 유전자는 hsa-miR-6749-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 50 표적 유전자는 hsa-miR-6515-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 51 표적 유전자는 hsa-miR-3937 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 52 표적 유전자는 hsa-miR-6840-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 53 표적 유전자는 hsa-miR-6893-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 54 표적 유전자는 hsa-miR-4728-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 55 표적 유전자는 hsa-miR-6717-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 56 표적 유전자는 hsa-miR-7113-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 57 표적 유전자는 hsa-miR-4665-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 58 표적 유전자는 hsa-miR-642b-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 59 표적 유전자는 hsa-miR-7109-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 60 표적 유전자는 hsa-miR-6842-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 61 표적 유전자는 hsa-miR-4442 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 62 표적 유전자는 hsa-miR-4433-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 63 표적 유전자는 hsa-miR-4707-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 64 표적 유전자는 hsa-miR-6126 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 65 표적 유전자는 hsa-miR-4449 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 66 표적 유전자는 hsa-miR-4706 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 67 표적 유전자는 hsa-miR-1913 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 68 표적 유전자는 hsa-miR-602 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 69 표적 유전자는 hsa-miR-939-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 70 표적 유전자는 hsa-miR-4695-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 71 표적 유전자는 hsa-miR-711 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 72 표적 유전자는 hsa-miR-6816-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 73 표적 유전자는 hsa-miR-4632-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 74 표적 유전자는 hsa-miR-6721-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 75 표적 유전자는 hsa-miR-7847-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 76 표적 유전자는 hsa-miR-6132 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 77 표적 유전자는 hsa-miR-887-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 78 표적 유전자는 hsa-miR-3679-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 79 표적 유전자는 hsa-miR-6784-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 80 표적 유전자는 hsa-miR-1249 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 81 표적 유전자는 hsa-miR-937-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 82 표적 유전자는 hsa-miR-5195-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 83 표적 유전자는 hsa-miR-6732-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 84 표적 유전자는 hsa-miR-4417 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 85 표적 유전자는 hsa-miR-4281 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 86 표적 유전자는 hsa-miR-4734 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 87 표적 유전자는 hsa-miR-6766-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 88 표적 유전자는 hsa-miR-663a 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 89 표적 유전자는 hsa-miR-4513 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 90 표적 유전자는 hsa-miR-6781-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 91 표적 유전자는 hsa-miR-1227-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 92 표적 유전자는 hsa-miR-6845-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 93 표적 유전자는 hsa-miR-6798-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 94 표적 유전자는 hsa-miR-3620-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 95 표적 유전자는 hsa-miR-1915-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 96 표적 유전자는 hsa-miR-4294 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 97 표적 유전자는 hsa-miR-642a-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 98 표적 유전자는 hsa-miR-371a-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 99 표적 유전자는 hsa-miR-940 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 100 표적 유전자는 hsa-miR-4450 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 101 표적 유전자는 hsa-miR-4723-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 102 표적 유전자는 hsa-miR-1469 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 103 표적 유전자는 hsa-miR-6861-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 104 표적 유전자는 hsa-miR-7975 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 105 표적 유전자는 hsa-miR-6879-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 106 표적 유전자는 hsa-miR-6802-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 107 표적 유전자는 hsa-miR-1268b 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 108 표적 유전자는 hsa-miR-663b 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 109 표적 유전자는 hsa-miR-125a-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 110 표적 유전자는 hsa-miR-2861 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 111 표적 유전자는 hsa-miR-6088 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 112 표적 유전자는 hsa-miR-4758-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 113 표적 유전자는 hsa-miR-296-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 114 표적 유전자는 hsa-miR-6738-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 115 표적 유전자는 hsa-miR-671-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 116 표적 유전자는 hsa-miR-4454 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 117 표적 유전자는 hsa-miR-4516 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 118 표적 유전자는 hsa-miR-7845-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 119 표적 유전자는 hsa-miR-4741 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 120 표적 유전자는 hsa-miR-92b-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 121 표적 유전자는 hsa-miR-6795-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 122 표적 유전자는 hsa-miR-6805-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 123 표적 유전자는 hsa-miR-4725-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 124 표적 유전자는 hsa-miR-6782-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 125 표적 유전자는 hsa-miR-4688 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 126 표적 유전자는 hsa-miR-6850-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 127 표적 유전자는 hsa-miR-6777-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 128 표적 유전자는 hsa-miR-6785-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 129 표적 유전자는 hsa-miR-7106-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 130 표적 유전자는 hsa-miR-3663-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 131 표적 유전자는 hsa-miR-6131 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 132 표적 유전자는 hsa-miR-1915-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 133 표적 유전자는 hsa-miR-4532 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 134 표적 유전자는 hsa-miR-6820-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 135 표적 유전자는 hsa-miR-4689 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 136 표적 유전자는 hsa-miR-4638-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 137 표적 유전자는 hsa-miR-3656 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 138 표적 유전자는 hsa-miR-3621 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 139 표적 유전자는 hsa-miR-6769b-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 140 표적 유전자는 hsa-miR-149-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 141 표적 유전자는 hsa-miR-23b-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 142 표적 유전자는 hsa-miR-3135b 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 143 표적 유전자는 hsa-miR-6848-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 144 표적 유전자는 hsa-miR-6769a-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 145 표적 유전자는 hsa-miR-4327 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 146 표적 유전자는 hsa-miR-6765-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 147 표적 유전자는 hsa-miR-6716-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 148 표적 유전자는 hsa-miR-6877-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 149 표적 유전자는 hsa-miR-6727-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 150 표적 유전자는 hsa-miR-4534 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 151 표적 유전자는 hsa-miR-614 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 152 표적 유전자는 hsa-miR-1202 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 153 표적 유전자는 hsa-miR-575 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 154 표적 유전자는 hsa-miR-6870-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 155 표적 유전자는 hsa-miR-6722-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 156 표적 유전자는 hsa-miR-7977 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 157 표적 유전자는 hsa-miR-4649-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 158 표적 유전자는 hsa-miR-4675 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 159 표적 유전자는 hsa-miR-6075 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 160 표적 유전자는 hsa-miR-6779-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 161 표적 유전자는 hsa-miR-4271 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 162 표적 유전자는 hsa-miR-3196 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 163 표적 유전자는 hsa-miR-6803-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 164 표적 유전자는 hsa-miR-6789-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 165 표적 유전자는 hsa-miR-4648 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 166 표적 유전자는 hsa-miR-4508 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 167 표적 유전자는 hsa-miR-4749-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 168 표적 유전자는 hsa-miR-4505 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 169 표적 유전자는 hsa-miR-5698 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 170 표적 유전자는 hsa-miR-1199-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 171 표적 유전자는 hsa-miR-4763-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 172 표적 유전자는 hsa-miR-1231 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고가 알려져 있다(특허문헌 3).
제 173 표적 유전자는 hsa-miR-1233-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고가 알려져 있다(특허문헌 2).
제 174 표적 유전자는 hsa-miR-150-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고가 알려져 있다(특허문헌 4).
제 175 표적 유전자는 hsa-miR-1225-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고가 알려져 있다(특허문헌 2).
제 176 표적 유전자는 hsa-miR-92a-2-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고가 알려져 있다(특허문헌 1 및 특허문헌 4).
제 177 표적 유전자는 hsa-miR-423-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고가 알려져 있다(특허문헌 3).
제 178 표적 유전자는 hsa-miR-1268a 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고가 알려져 있다(특허문헌 3).
제 179 표적 유전자는 hsa-miR-128-2-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고가 알려져 있다(특허문헌 1).
제 180 표적 유전자는 hsa-miR-24-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고가 알려져 있다(특허문헌 1).
제 181 표적 유전자는 hsa-miR-4697-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 182 표적 유전자는 hsa-miR-3197 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 183 표적 유전자는 hsa-miR-675-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 184 표적 유전자는 hsa-miR-4486 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 185 표적 유전자는 hsa-miR-7107-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 186 표적 유전자는 hsa-miR-23a-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고가 있다(특허문헌 2).
제 187 표적 유전자는 hsa-miR-4667-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 188 표적 유전자는 hsa-miR-451a 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 189 표적 유전자는 hsa-miR-3940-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 190 표적 유전자는 hsa-miR-8059 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 191 표적 유전자는 hsa-miR-6813-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 192 표적 유전자는 hsa-miR-4492 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 193 표적 유전자는 hsa-miR-4476 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 194 표적 유전자는 hsa-miR-6090 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 본 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 195 표적 유전자는 hsa-miR-6836-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 196 표적 유전자는 hsa-miR-3195 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 197 표적 유전자는 hsa-miR-718 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 198 표적 유전자는 hsa-miR-3178 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 199 표적 유전자는 hsa-miR-638 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 200 표적 유전자는 hsa-miR-4497 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 201 표적 유전자는 hsa-miR-6085 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 202 표적 유전자는 hsa-miR-6752-5p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
제 203 표적 유전자는 hsa-miR-135a-3p 유전자, 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 또는 그들의 변이체 또는 유도체이다. 지금까지 유전자 또는 그 전사 산물의 발현의 변화가 대장암의 마커가 될 수 있다는 보고는 알려져 있지 않다.
2. 대장암의 검출용의 핵산 프로브 또는 프라이머
본 발명에 있어서는 상기 대장암 마커로서의 표적 핵산에 특이적으로 결합가능한 핵산을 대장암을 검출 또는 진단하기 위한 핵산, 예를 들면 핵산 프로브 또는 프라이머로서 사용할 수 있다.
본 발명에 있어서 대장암을 검출하기 위한, 또는 대장암을 진단하기 위해 사용가능한 핵산 프로브 또는 프라이머는 상기 대장암 마커로서의 표적 핵산, 예를 들면 인간 유래의 hsa-miR-6726-5p, hsa-miR-4257, hsa-miR-6787-5p, hsa-miR-6780b-5p, hsa-miR-3131, hsa-miR-7108-5p, hsa-miR-1343-3p, hsa-miR-1247-3p, hsa-miR-4651, hsa-miR-6757-5p, hsa-miR-3679-5p, hsa-miR-7641, hsa-miR-6746-5p, hsa-miR-8072, hsa-miR-6741-5p, hsa-miR-1908-5p, hsa-miR-6857-5p, hsa-miR-4746-3p, hsa-miR-744-5p, hsa-miR-4792, hsa-miR-564, hsa-miR-6791-5p, hsa-miR-6825-5p, hsa-miR-6826-5p, hsa-miR-4665-3p, hsa-miR-4467, hsa-miR-3188, hsa-miR-6125, hsa-miR-6756-5p, hsa-miR-1228-3p, hsa-miR-8063, hsa-miR-8069, hsa-miR-6875-5p, hsa-miR-3185, hsa-miR-4433b-3p, hsa-miR-6887-5p, hsa-miR-128-1-5p, hsa-miR-6724-5p, hsa-miR-1914-3p, hsa-miR-1225-5p, hsa-miR-4419b, hsa-miR-7110-5p, hsa-miR-187-5p, hsa-miR-3184-5p, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-5572, hsa-miR-6729-5p, hsa-miR-615-5p, hsa-miR-6749-5p, hsa-miR-6515-3p, hsa-miR-3937, hsa-miR-6840-3p, hsa-miR-6893-5p, hsa-miR-4728-5p, hsa-miR-6717-5p, hsa-miR-7113-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-642b-3p, hsa-miR-7109-5p, hsa-miR-6842-5p, hsa-miR-4442, hsa-miR-4433-3p, hsa-miR-4707-5p, hsa-miR-6126, hsa-miR-4449, hsa-miR-4706, hsa-miR-1913, hsa-miR-602, hsa-miR-939-5p, hsa-miR-4695-5p, hsa-miR-711, hsa-miR-6816-5p, hsa-miR-4632-5p, hsa-miR-6721-5p, hsa-miR-7847-3p, hsa-miR-6132, hsa-miR-887-3p, hsa-miR-3679-3p, hsa-miR-6784-5p, hsa-miR-1249, hsa-miR-937-5p, hsa-miR-5195-3p, hsa-miR-6732-5p, hsa-miR-4417, hsa-miR-4281, hsa-miR-4734, hsa-miR-6766-3p, hsa-miR-663a, hsa-miR-4513, hsa-miR-6781-5p, hsa-miR-1227-5p, hsa-miR-6845-5p, hsa-miR-6798-5p, hsa-miR-3620-5p, hsa-miR-1915-5p, hsa-miR-4294, hsa-miR-642a-3p, hsa-miR-371a-5p, hsa-miR-940, hsa-miR-4450, hsa-miR-4723-5p, hsa-miR-1469, hsa-miR-6861-5p, hsa-miR-7975, hsa-miR-6879-5p, hsa-miR-6802-5p, hsa-miR-1268b, hsa-miR-663b, hsa-miR-125a-3p, hsa-miR-2861, hsa-miR-6088, hsa-miR-4758-5p, hsa-miR-296-3p, hsa-miR-6738-5p, hsa-miR-671-5p, hsa-miR-4454, hsa-miR-4516, hsa-miR-7845-5p, hsa-miR-4741, hsa-miR-92b-5p, hsa-miR-6795-5p, hsa-miR-6805-3p, hsa-miR-4725-3p, hsa-miR-6782-5p, hsa-miR-4688, hsa-miR-6850-5p, hsa-miR-6777-5p, hsa-miR-6785-5p, hsa-miR-7106-5p, hsa-miR-3663-3p, hsa-miR-6131, hsa-miR-1915-3p, hsa-miR-4532, hsa-miR-6820-5p, hsa-miR-4689, hsa-miR-4638-5p, hsa-miR-3656, hsa-miR-3621, hsa-miR-6769b-5p, hsa-miR-149-3p, hsa-miR-23b-3p, hsa-miR-3135b, hsa-miR-6848-5p, hsa-miR-6769a-5p, hsa-miR-4327, hsa-miR-6765-3p, hsa-miR-6716-5p, hsa-miR-6877-5p, hsa-miR-6727-5p, hsa-miR-4534, hsa-miR-614, hsa-miR-1202, hsa-miR-575, hsa-miR-6870-5p, hsa-miR-6722-3p, hsa-miR-7977, hsa-miR-4649-5p, hsa-miR-4675, hsa-miR-6075, hsa-miR-6779-5p, hsa-miR-4271, hsa-miR-3196, hsa-miR-6803-5p, hsa-miR-6789-5p, hsa-miR-4648, hsa-miR-4508, hsa-miR-4749-5p, hsa-miR-4505, hsa-miR-5698, hsa-miR-1199-5p, hsa-miR-4763-3p, hsa-miR-6836-3p, hsa-miR-3195, hsa-miR-718, hsa-miR-3178, hsa-miR-638, hsa-miR-4497, hsa-miR-6085, hsa-miR-6752-5p 또는 hsa-miR-135a-3p 또는 그들의 조합, 또는 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 그들의 변이체 또는 유도체, 및 그들과 경우에 따라 조합할 수 있는 hsa-miR-1231, hsa-miR-1233-5p, hsa-miR-150-3p, hsa-miR-1225-3p, hsa-miR-92a-2-5p, hsa-miR-423-5p, hsa-miR-1268a, hsa-miR-128-2-5p 또는 hsa-miR-24-3p, 또는 그들의 조합, 또는 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 그들의 변이체 또는 유도체, 및 그들과 경우에 따라 조합할 수 있는 hsa-miR-4697-5p, hsa-miR-3197, hsa-miR-675-5p, hsa-miR-4486, hsa-miR-7107-5p, hsa-miR-23a-3p, hsa-miR-4667-5p, hsa-miR-451a, hsa-miR-3940-5p, hsa-miR-8059, hsa-miR-6813-5p, hsa-miR-4492, hsa-miR-4476 또는 hsa-miR-6090, 또는 그들의 조합, 또는 그들의 동족체, 그들의 전사 산물, 그들의 변이체 또는 유도체의 존재, 발현량 또는 존재량을 정성적 및/또는 정량적으로 측정하는 것을 가능하게 한다.
상기 표적 핵산은 건상체와 비교하여 대장암에 이환된 피험체에 있어서 그 표적 핵산의 종류에 따라 그들의 발현량이 증가하는 것도 있으면, 또는 저하하는 것도 있다(이하, 「증가/저하」라고 칭한다). 그 때문에 본 발명의 핵산은 대장암의 이환이 의심되는 피험체(예를 들면, 인간) 유래의 체액과 건상체 유래의 체액에 대해서 상기 표적 핵산의 발현량을 측정하고, 그들을 비교하여 대장암을 검출하기 위해 유효하게 사용할 수 있다.
본 발명에서 사용가능한 핵산 프로브 또는 프라이머는 서열번호 1~171 및 606~614 중 적어도 1개로 나타내어지는 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드와 특이적으로 결합가능한 핵산 프로브, 또는 서열번호 1~171 및 606~614 중 적어도 1개로 나타내어지는 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 증폭하기 위한 프라이머이다.
본 발명에서 사용가능한 핵산 프로브 또는 프라이머는 또한 서열번호 172~180 중 적어도 1개로 나타내어지는 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드와 특이적으로 결합가능한 핵산 프로브, 또는 서열번호 172~180 중 적어도 1개로 나타내어지는 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 증폭하기 위한 프라이머를 포함할 수 있다.
본 발명에서 사용가능한 핵산 프로브 또는 프라이머는 또한 서열번호 181~194 중 적어도 1개로 나타내어지는 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드와 특이적으로 결합가능한 핵산 프로브, 또는 서열번호 181~194 중 적어도 1개로 나타내어지는 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 증폭하기 위한 프라이머를 더 포함할 수 있다.
구체적으로는 상기 핵산 프로브 또는 프라이머는 서열번호 1~635 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열, 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드군 및 그 상보적 폴리뉴클레오티드군, 상기 염기 서열에 상보적인 염기 서열로 이루어지는 DNA와 스트린젠트한 조건(후술)에서 각각 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드군 및 그 상보적 폴리뉴클레오티드군, 및 그들의 폴리뉴클레오티드군의 염기 서열에 있어서 15 이상, 바람직하게는 17 이상의 연속된 염기를 포함하는 폴리뉴클레오티드군으로부터 선택된 1개 또는 복수의 폴리뉴클레오티드의 조합을 포함한다. 이들의 폴리뉴클레오티드는 표적 핵산인 상기 대장암 마커를 검출하기 위한 핵산 프로브 및 프라이머로서 사용할 수 있다.
또한, 구체적으로는 본 발명에서 사용가능한 핵산 프로브 또는 프라이머의 예는 이하의 폴리뉴클레오티드 (a)~(e)로 이루어지는 군으로부터 선택되는 1개 또는 복수의 폴리뉴클레오티드이다.
(a) 서열번호 1~171 및 606~614 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열, 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열 로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편,
(b) 서열번호 1~171 및 606~614 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드,
(c) 서열번호 1~171 및 606~614 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열, 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열에 상보적인 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편,
(d) 서열번호 1~171 및 606~614 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열, 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열에 상보적인 염기 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 및
(e) 상기 (a)~(d) 중 어느 하나의 폴리뉴클레오티드와 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드.
본 발명에서 사용가능한 핵산 프로브 또는 프라이머는 또한 상기 폴리뉴클레오티드 (a)~(e)로부터 선택되는 적어도 1개 이상의 폴리뉴클레오티드 외에 하기 (f)~(j)에 나타내는 폴리뉴클레오티드로 이루어지는 군으로부터 선택되는 폴리뉴클레오티드를 포함할 수 있다.
(f) 서열번호 172~180 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편,
(g) 서열번호 172~180 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드,
(h) 서열번호 172~180 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열, 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열에 상보적인 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편,
(i) 서열번호 172~180 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열, 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열에 상보적인 염기 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 및
(j) 상기 (f)~(i) 중 어느 하나의 폴리뉴클레오티드와 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드.
본 발명에서 사용가능한 핵산 프로브 또는 프라이머는 또한 상기 폴리뉴클레오티드 (a)~(j)로부터 선택되는 적어도 1개 이상의 폴리뉴클레오티드 외에 하기 (k)~(o)에 나타내는 폴리뉴클레오티드로 이루어지는 군으로부터 선택되는 폴리뉴클레오티드를 포함할 수 있다.
(k) 서열번호 181~194 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편,
(l) 서열번호 181~194 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드,
(m) 서열번호 181~194 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열, 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열에 상보적인 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편,
(n) 서열번호 181~194 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열, 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열에 상보적인 염기 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 및
(o) 상기 (k)~(n) 중 어느 하나의 폴리뉴클레오티드와 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드.
상기 폴리뉴클레오티드에 있어서 「15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편」은 각 폴리뉴클레오티드의 염기 서열에 있어서 예를 들면, 연속되는 15로부터 서열의 전체 염기수 미만, 17로부터 서열의 전체 염기수 미만, 19로부터 서열의 전체 염기수 미만 등의 범위의 염기수를 포함할 수 있지만, 이들에 한정되지 않는 것으로 한다.
본 발명에서 사용되는 상기 폴리뉴클레오티드류 또는 그 단편류는 모두 DNA이어도 좋고 RNA이어도 좋다.
본 발명에서 사용가능한 상기 폴리뉴클레오티드는 DNA 재조합 기술, PCR법, DNA/RNA 자동 합성기에 의한 방법 등의 일반적인 기술을 사용하여 제작할 수 있다.
DNA 재조합 기술 및 PCR법은 예를 들면, Ausubel 등, Current Protocols in Molecular Biology, John Willey ＆ Sons, US(1993); Sambrook 등, Molecular Cloning A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, US(1989) 등에 기재되는 기술을 사용할 수 있다.
서열번호 1~194 및 606~614로 나타내어지는 인간 유래의 hsa-miR-6726-5p, hsa-miR-4257, hsa-miR-6787-5p, hsa-miR-6780b-5p, hsa-miR-3131, hsa-miR-7108-5p, hsa-miR-1343-3p, hsa-miR-1247-3p, hsa-miR-4651, hsa-miR-6757-5p, hsa-miR-3679-5p, hsa-miR-7641, hsa-miR-6746-5p, hsa-miR-8072, hsa-miR-6741-5p, hsa-miR-1908-5p, hsa-miR-6857-5p, hsa-miR-4746-3p, hsa-miR-744-5p, hsa-miR-4792, hsa-miR-564, hsa-miR-6791-5p, hsa-miR-6825-5p, hsa-miR-6826-5p, hsa-miR-4665-3p, hsa-miR-4467, hsa-miR-3188, hsa-miR-6125, hsa-miR-6756-5p, hsa-miR-1228-3p, hsa-miR-8063, hsa-miR-8069, hsa-miR-6875-5p, hsa-miR-3185, hsa-miR-4433b-3p, hsa-miR-6887-5p, hsa-miR-128-1-5p, hsa-miR-6724-5p, hsa-miR-1914-3p, hsa-miR-1225-5p, hsa-miR-4419b, hsa-miR-7110-5p, hsa-miR-187-5p, hsa-miR-3184-5p, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-5572, hsa-miR-6729-5p, hsa-miR-615-5p, hsa-miR-6749-5p, hsa-miR-6515-3p, hsa-miR-3937, hsa-miR-6840-3p, hsa-miR-6893-5p, hsa-miR-4728-5p, hsa-miR-6717-5p, hsa-miR-7113-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-642b-3p, hsa-miR-7109-5p, hsa-miR-6842-5p, hsa-miR-4442, hsa-miR-4433-3p, hsa-miR-4707-5p, hsa-miR-6126, hsa-miR-4449, hsa-miR-4706, hsa-miR-1913, hsa-miR-602, hsa-miR-939-5p, hsa-miR-4695-5p, hsa-miR-711, hsa-miR-6816-5p, hsa-miR-4632-5p, hsa-miR-6721-5p, hsa-miR-7847-3p, hsa-miR-6132, hsa-miR-887-3p, hsa-miR-3679-3p, hsa-miR-6784-5p, hsa-miR-1249, hsa-miR-937-5p, hsa-miR-5195-3p, hsa-miR-6732-5p, hsa-miR-4417, hsa-miR-4281, hsa-miR-4734, hsa-miR-6766-3p, hsa-miR-663a, hsa-miR-4513, hsa-miR-6781-5p, hsa-miR-1227-5p, hsa-miR-6845-5p, hsa-miR-6798-5p, hsa-miR-3620-5p, hsa-miR-1915-5p, hsa-miR-4294, hsa-miR-642a-3p, hsa-miR-371a-5p, hsa-miR-940, hsa-miR-4450, hsa-miR-4723-5p, hsa-miR-1469, hsa-miR-6861-5p, hsa-miR-7975, hsa-miR-6879-5p, hsa-miR-6802-5p, hsa-miR-1268b, hsa-miR-663b, hsa-miR-125a-3p, hsa-miR-2861, hsa-miR-6088, hsa-miR-4758-5p, hsa-miR-296-3p, hsa-miR-6738-5p, hsa-miR-671-5p, hsa-miR-4454, hsa-miR-4516, hsa-miR-7845-5p, hsa-miR-4741, hsa-miR-92b-5p, hsa-miR-6795-5p, hsa-miR-6805-3p, hsa-miR-4725-3p, hsa-miR-6782-5p, hsa-miR-4688, hsa-miR-6850-5p, hsa-miR-6777-5p, hsa-miR-6785-5p, hsa-miR-7106-5p, hsa-miR-3663-3p, hsa-miR-6131, hsa-miR-1915-3p, hsa-miR-4532, hsa-miR-6820-5p, hsa-miR-4689, hsa-miR-4638-5p, hsa-miR-3656, hsa-miR-3621, hsa-miR-6769b-5p, hsa-miR-149-3p, hsa-miR-23b-3p, hsa-miR-3135b, hsa-miR-6848-5p, hsa-miR-6769a-5p, hsa-miR-4327, hsa-miR-6765-3p, hsa-miR-6716-5p, hsa-miR-6877-5p, hsa-miR-6727-5p, hsa-miR-4534, hsa-miR-614, hsa-miR-1202, hsa-miR-575, hsa-miR-6870-5p, hsa-miR-6722-3p, hsa-miR-7977, hsa-miR-4649-5p, hsa-miR-4675, hsa-miR-6075, hsa-miR-6779-5p, hsa-miR-4271, hsa-miR-3196, hsa-miR-6803-5p, hsa-miR-6789-5p, hsa-miR-4648, hsa-miR-4508, hsa-miR-4749-5p, hsa-miR-4505, hsa-miR-5698, hsa-miR-1199-5p, hsa-miR-4763-3p, hsa-miR-1231, hsa-miR-1233-5p, hsa-miR-150-3p, hsa-miR-1225-3p, hsa-miR-92a-2-5p, hsa-miR-423-5p, hsa-miR-1268a, hsa-miR-128-2-5p, hsa-miR-24-3p, hsa-miR-4697-5p, hsa-miR-3197, hsa-miR-675-5p, hsa-miR-4486, hsa-miR-7107-5p, hsa-miR-23a-3p, hsa-miR-4667-5p, hsa-miR-451a, hsa-miR-3940-5p, hsa-miR-8059, hsa-miR-6813-5p, hsa-miR-4492, hsa-miR-4476, hsa-miR-6090, hsa-miR-6836-3p, hsa-miR-3195, hsa-miR-718, hsa-miR-3178, hsa-miR-638, hsa-miR-4497, hsa-miR-6085, hsa-miR-6752-5p 및 hsa-miR-135a-3p는 공지이며, 상술한 바와 같이 그 취득 방법도 알려져 있다. 이 때문에 이 유전자를 클로닝함으로써 본 발명에서 사용가능한 핵산 프로브 또는 프라이머로서의 폴리뉴클레오티드를 제작할 수 있다.
그러한 핵산 프로브 또는 프라이머는 DNA 자동 합성 장치를 사용하여 화학적으로 합성할 수 있다. 이 합성에는 일반적으로 포스포아미다이트법이 사용되고, 이 방법에 의해 약 100 염기까지의 1본쇄 DNA를 자동 합성할 수 있다. DNA 자동 합성 장치는 예를 들면, Polygen사, ABI사, Applied BioSystems사 등으로부터 시판되고 있다.
또는, 본 발명의 폴리뉴클레오티드는 cDNA 클로닝법에 의해 제작할 수도 있다. cDNA 클로닝 기술은 예를 들면, microRNA Cloning Kit Wako 등을 이용할 수 있다.
여기서, 서열번호 1~194 및 606~614 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 검출하기 위한 핵산 프로브 및 프라이머의 서열은 miRNA 또는 그 전구체로서는 생체 내에 존재하고 있지 않다. 예를 들면, 서열번호 11 및 서열번호 78로 나타내어지는 염기 서열은 서열번호 205로 나타내어지는 전구체로부터 생성되지만 이 전구체는 도 1에 나타내는 바와 같은 헤어핀 모양 구조를 갖고 있고, 서열번호 11 및 서열번호 78로 나타내어지는 염기 서열은 서로 미스매치 서열을 갖고 있다. 마찬가지로, 서열번호 11 또는 서열번호 78로 나타내어지는 염기 서열에 대한 완전하게 상보적인 염기 서열이 생체 내에서 자연히 생성되는 경우는 없다. 이 때문에 서열번호 1~194 및 606~614 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열을 검출하기 위한 핵산 프로브 및 프라이머는 생체 내에 존재하지 않는 인공적인 염기 서열을 갖게 된다.
3. 대장암 검출용 키트 또는 디바이스
본 발명은 또한 대장암 마커인 표적 핵산을 측정하기 위한 본 발명에 있어서 핵산 프로브 또는 프라이머로서 사용가능한 폴리뉴클레오티드(이것에는 변이체, 단편, 또는 유도체를 포함할 수 있다. 이하, 검출용 폴리뉴클레오티드라고 칭하는 경우가 있다)의 하나 또는 복수를 포함하는 대장암 검출용 키트 또는 디바이스를 제공한다.
본 발명에 있어서의 대장암 마커인 표적 핵산은 바람직하게는 이하의 군 1로부터 선택된다:
miR-6726-5p, miR-4257, miR-6787-5p, miR-6780b-5p, miR-3131, miR-7108-5p, miR-1343-3p, miR-1247-3p, miR-4651, miR-6757-5p, miR-3679-5p, miR-7641, miR-6746-5p, miR-8072, miR-6741-5p, miR-1908-5p, miR-6857-5p, miR-4746-3p, miR-744-5p, miR-4792, miR-564, miR-6791-5p, miR-6825-5p, miR-6826-5p, miR-4665-3p, miR-4467, miR-3188, miR-6125, miR-6756-5p, miR-1228-3p, miR-8063, miR-8069, miR-6875-5p, miR-3185, miR-4433b-3p, miR-6887-5p, miR-128-1-5p, miR-6724-5p, miR-1914-3p, miR-1225-5p, miR-4419b, miR-7110-5p, miR-187-5p, miR-3184-5p, miR-204-3p, miR-5572, miR-6729-5p, miR-615-5p, miR-6749-5p, miR-6515-3p, miR-3937, miR-6840-3p, miR-6893-5p, miR-4728-5p, miR-6717-5p, miR-7113-3p, miR-4665-5p, miR-642b-3p, miR-7109-5p, miR-6842-5p, miR-4442, miR-4433-3p, miR-4707-5p, miR-6126, miR-4449, miR-4706, miR-1913, miR-602, miR-939-5p, miR-4695-5p, miR-711, miR-6816-5p, miR-4632-5p, miR-6721-5p, miR-7847-3p, miR-6132, miR-887-3p, miR-3679-3p, miR-6784-5p, miR-1249, miR-937-5p, miR-5195-3p, miR-6732-5p, miR-4417, miR-4281, miR-4734, miR-6766-3p, miR-663a, miR-4513, miR-6781-5p, miR-1227-5p, miR-6845-5p, miR-6798-5p, miR-3620-5p, miR-1915-5p, miR-4294, miR-642a-3p, miR-371a-5p, miR-940, miR-4450, miR-4723-5p, miR-1469, miR-6861-5p, miR-7975, miR-6879-5p, miR-6802-5p, miR-1268b, miR-663b, miR-125a-3p, miR-2861, miR-6088, miR-4758-5p, miR-296-3p, miR-6738-5p, miR-671-5p, miR-4454, miR-4516, miR-7845-5p, miR-4741, miR-92b-5p, miR-6795-5p, miR-6805-3p, miR-4725-3p, miR-6782-5p, miR-4688, miR-6850-5p, miR-6777-5p, miR-6785-5p, miR-7106-5p, miR-3663-3p, miR-6131, miR-1915-3p, miR-4532, miR-6820-5p, miR-4689, miR-4638-5p, miR-3656, miR-3621, miR-6769b-5p, miR-149-3p, miR-23b-3p, miR-3135b, miR-6848-5p, miR-6769a-5p, miR-4327, miR-6765-3p, miR-6716-5p, miR-6877-5p, miR-6727-5p, miR-4534, miR-614, miR-1202, miR-575, miR-6870-5p, miR-6722-3p, miR-7977, miR-4649-5p, miR-4675, miR-6075, miR-6779-5p, miR-4271, miR-3196, miR-6803-5p, miR-6789-5p, miR-4648, miR-4508, miR-4749-5p, miR-4505, miR-5698, miR-1199-5p, miR-4763-3p, miR-6836-3p, miR-3195, miR-718, miR-3178, miR-638, miR-4497, miR-6085, miR-6752-5p 및 miR-135a-3p.
경우에 따라 측정에 사용할 수 있는 추가의 표적 핵산은 이하의 군 2로부터 선택된다: miR-1231, miR-1233-5p, miR-150-3p, miR-1225-3p, miR-92a-2-5p, miR-423-5p, miR-1268a, miR-128-2-5p 및 miR-24-3p.
경우에 따라 측정에 더 사용할 수 있는 추가의 표적 핵산은 이하의 군 3으로부터 선택된다: miR-4697-5p, miR-3197, miR-675-5p, miR-4486, miR-7107-5p, miR-23a-3p, miR-4667-5p, miR-451a, miR-3940-5p, miR-8059, miR-6813-5p, miR-4492, miR-4476,및 miR-6090.
본 발명의 키트 또는 디바이스는 상기 대장암 마커인 표적 핵산과 특이적으로 결합가능한 핵산, 바람직하게는 상기 2에 기재된 핵산 프로브 또는 프라이머, 구체적으로는 상기 2에 기재된 폴리뉴클레오티드류로부터 선택되는 1개 또는 복수의 폴리뉴클레오티드 또는 그 변이체 등을 포함한다.
구체적으로는 본 발명의 키트 또는 디바이스는 서열번호 1~171 및 606~614 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열, 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열을 포함하는(또는, 이루어지는) 폴리뉴클레오티드, 그 상보적 서열을 포함하는(또는, 이루어지는) 폴리뉴클레오티드, 그들의 폴리뉴클레오티드와 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드, 또는 그들의 폴리뉴클레오티드 서열의 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 변이체 또는 단편을 적어도 1개 이상 포함할 수 있다.
본 발명의 키트 또는 디바이스는 또한, 서열번호 172~180 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열, 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열을 포함하는(또는, 이루어지는) 폴리뉴클레오티드, 그 상보적 서열을 포함하는(또는, 이루어지는) 폴리뉴클레오티드, 그들의 폴리뉴클레오티드와 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드, 또는 그들의 폴리뉴클레오티드 서열의 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 변이체 또는 단편을 1개 이상 포함할 수 있다.
본 발명의 키트 또는 디바이스는 또한, 서열번호 181~194 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열, 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열을 포함하는 (또는, 이루어지는) 폴리뉴클레오티드, 그 상보적 서열을 포함하는(또는, 이루어지는) 폴리뉴클레오티드, 그들의 폴리뉴클레오티드와 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드, 또는 그들의 폴리뉴클레오티드 서열의 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 변이체 또는 단편을 1개 이상 포함할 수 있다.
본 발명의 키트 또는 디바이스에 포함할 수 있는 단편은 예를 들면, 하기 (1)~(3)으로 이루어지는 군으로부터 선택되는 1개 이상, 바람직하게는 2개 이상의 폴리뉴클레오티드이다.
(1) 서열번호 1~171 및 606~614 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열 또는 그 상보적 서열에 있어서 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 폴리뉴클레오티드.
(2) 서열번호 172~180 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열 또는 그 상보적 서열에 있어서 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 폴리뉴클레오티드.
(3) 서열번호 181~194 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열 또는 그 상보적 서열에 있어서 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 폴리뉴클레오티드.
바람직한 실시형태에서는 상기 폴리뉴클레오티드가 서열번호 1~171 및 606~614 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열, 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그들의 폴리뉴클레오티드와 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드, 또는 그들의 15 이상, 바람직하게는 17 이상, 보다 바람직하게는 19 이상의 연속된 염기를 포함하는 변이체이다.
또한, 바람직한 실시형태에서는 상기 폴리뉴클레오티드가 서열번호 172~180 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열, 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그들의 폴리뉴클레오티드와 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드, 또는 그것들의 15 이상, 바람직하게는 17 이상, 보다 바람직하게는 19 이상의 연속된 염기를 포함하는 변이체이다.
또한, 바람직한 실시형태에서는 상기 폴리뉴클레오티드가 서열번호 181~194 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열, 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그들의 폴리뉴클레오티드와 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드, 또는 그것들의 15 이상, 바람직하게는 17 이상, 보다 바람직하게는 19 이상의 연속된 염기를 포함하는 변이체이다.
바람직한 실시형태에서는 상기 단편은 15 이상, 바람직하게는 17 이상, 보다 바람직하게는 19 이상의 연속된 염기를 포함하는 폴리뉴클레오티드일 수 있다.
본 발명에 있어서 폴리뉴클레오티드의 단편의 사이즈는 각 폴리뉴클레오티드의 염기 서열에 있어서 예를 들면, 연속되는 15로부터 서열의 전체 염기수 미만, 17로부터 서열의 전체 염기수 미만, 19로부터 서열의 전체 염기수 미만 등의 범위의 염기수이다.
본 발명의 키트 또는 디바이스를 구성하는 상기 폴리뉴클레오티드의 조합으로서는 구체적으로는 표 1에 나타내어지는 서열번호(표 중의 miRNA 마커에 대응하는 서열번호 1~194 및 606~614)에 나타내어지는 염기 서열로 이루어지는 상기 폴리뉴클레오티드를 1개, 2개, 3개, 4개, 5개, 6개, 7개, 8개, 9개, 10개 또는 그 이상의 개수를 조합한 경우를 들 수 있지만 그들은 어디까지나 예시이며, 다른 여러가지 가능한 조합의 전부가 본 발명에 포함되는 것으로 한다.
예를 들면, 본 발명에 있어서 대장암과 건상체를 판별하기 위한 키트 또는 디바이스를 구성하는 상기 조합으로서는 표 1에 나타내어지는 서열번호로 나타내어지는 염기 서열로 이루어지는 상기 폴리뉴클레오티드를 2개 이상 조합하는 것이 바람직하고, 통상으로는 2개의 조합으로 충분한 성능을 얻을 수 있다.
구체적으로 대장암과 건상체를 판별하기 위한 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 2개의 조합으로서 서열번호 1~194 및 606~614로 나타내어지는 염기 서열로 이루어지는 상기 폴리뉴클레오티드로 구성되는 2개의 조합 중 신규로 발견된 서열번호 1~171로 나타내어지는 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 이상 포함하는 조합이 바람직하다. 더욱 구체적으로는 서열번호 1~194 및 606~614로 나타내어지는 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합 중 서열번호 5, 15, 24, 32, 38, 45, 55, 64, 96, 97, 162로 나타내어지는 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 조합이 보다 바람직하다.
또한, 대장암을 건상체뿐만 아니라 다른 암으로도 판별할 수 있는 암종특이성이 있는 폴리뉴클레오티드의 조합으로서 예를 들면 서열번호 5, 13, 15, 24, 32, 38, 41, 45, 55, 57, 64, 72, 75, 77, 96, 97, 115, 162, 163, 173, 189, 606, 607, 608, 609, 610, 611, 612, 613 및 614의 폴리뉴클레오티드로 이루어지는 군(이후, 본 군을 「암종특이성 폴리뉴클레오티드군 1」이라고 한다)으로부터 선택되는 적어도 1개의 폴리뉴클레오티드와 그 외의 서열번호의 폴리뉴클레오티드의 복수개의 조합이 바람직하다.
또한, 대장암을 건상체뿐만 아니라 다른 암으로도 판별할 수 있는 암 종 특이성이 있는 폴리뉴클레오티드의 조합으로서 암종특이성 폴리뉴클레오티드군 1로부터 선택되는 복수개의 폴리뉴클레오티드의 조합이 보다 바람직하다.
또한, 대장암을 건상체뿐만 아니라 다른 암으로도 판별할 수 있는 암종특이성이 있는 폴리뉴클레오티드의 조합으로서 암종특이성 폴리뉴클레오티드군 1로부터 선택되는 복수개의 폴리뉴클레오티드의 조합 중 암종특이성 폴리뉴클레오티드군 1에 포함되는 서열번호 5, 45, 57, 96 및 606의 폴리뉴클레오티드로 이루어지는 군(이후, 본 군을 「암종특이성 폴리뉴클레오티드군 2」라고 한다)으로부터 선택되는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 이상 포함하는 조합이 보다 바람직하다.
상기 암종특이성이 있는 폴리뉴클레오티드의 조합의 개수로서는 1개, 2개, 3개, 4개, 5개, 6개, 7개, 8개, 9개, 10개 또는 그 이상의 개수를 조합이 가능하지만 보다 바람직하게는 6개 이상의 조합이며, 통상으로는 5개 또는 6개의 조합으로 충분한 성능을 얻을 수 있다.
이하에 비한정적으로 서열번호 5로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드와 암종특이성 폴리뉴클레오티드군 1로부터 선택되는 4개 또는 5개의 폴리뉴클레오티드의 서열번호로 나타내어지는 서열번호로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합을 예시한다.
(1) 서열번호 5, 45, 57, 75, 607(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-7847-3p, hsa-miR-3195)의 조합
(2) 서열번호 5, 45, 96, 606, 607(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4294, hsa-miR-6836-3p, hsa-miR-3195)의 조합
(3) 서열번호 5, 45, 57, 97, 115, 607(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-642a-3p, hsa-miR-671-5p, hsa-miR-3195)의 조합
(4) 서열번호 5, 45, 57, 97, 162, 607(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-642a-3p, hsa-miR-3196, hsa-miR-3195)의 조합
(5) 서열번호 5, 45, 57, 162, 607, 613(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-3196, hsa-miR-3195, hsa-miR-6752-5p)의 조합
(6) 서열번호 5, 45, 57, 97, 607, 612(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-642a-3p, hsa-miR-3195, hsa-miR-6085)의 조합
(7) 서열번호 5, 13, 45, 57, 606, 607(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-6746-5p, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-6836-3p, hsa-miR-3195)의 조합
(8) 서열번호 5, 45, 96, 189, 606, 608(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4294, hsa-miR-3940-5p, hsa-miR-6836-3p, hsa-miR-718)의 조합
(9) 서열번호 5, 45, 57, 96, 189, 606(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-4294, hsa-miR-3940-5p, hsa-miR-6836-3p)의 조합
(10) 서열번호 5, 24, 45, 57, 96, 608(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-6826-5p, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-4294, hsa-miR-718)의 조합
(11) 서열번호 5, 45, 57, 162, 607, 610(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-3196, hsa-miR-3195, hsa-miR-638)의 조합
(12) 서열번호 5, 45, 57, 189, 606, 607(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-3940-5p, hsa-miR-6836-3p, hsa-miR-3195)의 조합
또한, 비한정적으로 서열번호 45로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드와 암종특이성 폴리뉴클레오티드군 1로부터 선택되는 4개 또는 5개의 폴리뉴클레오티드의 서열번호로 나타내어지는 서열번호로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합을 예시한다.
(1) 서열번호 5, 45, 96, 606, 607(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4294, hsa-miR-6836-3p, hsa-miR-3195)의 조합
(2) 서열번호 5, 45, 57, 75, 607(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-7847-3p, hsa-miR-3195)의 조합
(3) 서열번호 5, 45, 57, 75, 606, 607(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-7847-3p, hsa-miR-6836-3p, hsa-miR-3195)의 조합
(4) 서열번호 5, 45, 57, 77, 607, 613(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-887-3p, hsa-miR-3195, hsa-miR-6752-5p)의 조합
(5) 서열번호 5, 45, 57, 97, 606, 607(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-642a-3p, hsa-miR-6836-3p, hsa-miR-3195)의 조합
(6) 서열번호 5, 45, 57, 75, 77, 607(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-7847-3p, hsa-miR-887-3p, hsa-miR-3195)의 조합
(7) 서열번호 5, 32, 45, 57, 96, 606(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-8069, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-4294, hsa-miR-6836-3p)의 조합
(8) 서열번호 5, 24, 45, 57, 96, 606(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-6826-5p, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-4294, hsa-miR-6836-3p)의 조합
(9) 서열번호 5, 45, 57, 96, 162, 606(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-4294, hsa-miR-3196, hsa-miR-6836-3p)의 조합
(10) 서열번호 5, 15, 45, 75, 96, 606(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-6741-5p, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-7847-3p, hsa-miR-4294, hsa-miR-6836-3p)의 조합
(11) 서열번호 5, 32, 45, 57, 162, 607(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-8069, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-3196, hsa-miR-3195)의 조합
(12) 서열번호 38, 45, 96, 606, 608, 611(마커: hsa-miR-6724-5p, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4294, hsa-miR-6836-3p, hsa-miR-718, hsa-miR-4497)의 조합
또한, 비한정적으로 서열번호 57로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드와 암종특이성 폴리뉴클레오티드군 1로부터 선택되는 4개 또는 5개의 폴리뉴클레오티드의 서열번호로 나타내어지는 서열번호로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합을 예시한다.
(1) 서열번호 24, 41, 57, 45, 96(마커: hsa-miR-6826-5p, hsa-miR-4419b, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4294)의 조합
(2) 서열번호 5, 45, 57, 607, 612(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-3195, hsa-miR-6085)의 조합
(3) 서열번호 5, 45, 57, 606, 607, 608(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-6836-3p, hsa-miR-3195, hsa-miR-718)의 조합
(4) 서열번호 5, 13, 45, 57, 75, 607(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-6746-5p, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-7847-3p, hsa-miR-3195)의 조합
(5) 서열번호 5, 45, 57, 64, 75, 607(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-6126, hsa-miR-7847-3p, hsa-miR-3195)의 조합
(6) 서열번호 5, 45, 55, 57, 607, 613(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-6717-5p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-3195, hsa-miR-6752-5p)의 조합
(7) 서열번호 5, 45, 55, 57, 75, 607(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-6717-5p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-7847-3p, hsa-miR-3195)의 조합
(8) 서열번호 5, 38, 45, 57, 96, 607(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-6724-5p, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-4294, hsa-miR-3195)의 조합
(9) 서열번호 5, 45, 57, 75, 162, 607(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-7847-3p, hsa-miR-3196, hsa-miR-3195)의 조합
(10) 서열번호 5, 45, 57, 75, 162, 609(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-7847-3p, hsa-miR-3196, hsa-miR-3178)의 조합
(11) 서열번호 5, 45, 57, 64, 96, 607(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-6126, hsa-miR-4294, hsa-miR-3195)의 조합
(12) 서열번호 57, 64, 96, 606, 608, 611(마커: hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-6126, hsa-miR-4294, hsa-miR-6836-3p, hsa-miR-718, hsa-miR-4497)의 조합
또한, 비한정적으로 서열번호 96으로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드와 암종특이성 폴리뉴클레오티드군 1로부터 선택되는 4개 또는 5개의 폴리뉴클레오티드의 서열번호로 나타내어지는 서열번호로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합을 예시한다.
(1) 서열번호 38, 96, 606, 608, 611(마커: hsa-miR-6724-5p, hsa-miR-4294, hsa-miR-6836-3p, hsa-miR-718, hsa-miR-4497)의 조합
(2) 서열번호 5, 45, 57, 96, 607(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-4294, hsa-miR-3195)의 조합
(3) 서열번호 38, 72, 96, 606, 608, 611(마커: hsa-miR-6724-5p, hsa-miR-6816-5p, hsa-miR-4294, hsa-miR-6836-3p, hsa-miR-718, hsa-miR-4497)의 조합
(4) 서열번호 32, 38, 96, 606, 608, 611(마커: hsa-miR-8069, hsa-miR-6724-5p, hsa-miR-4294, hsa-miR-6836-3p, hsa-miR-718, hsa-miR-4497)의 조합
(5) 서열번호 38, 96, 163, 606, 608, 611(마커: hsa-miR-6724-5p, hsa-miR-4294, hsa-miR-6803-5p, hsa-miR-6836-3p, hsa-miR-718, hsa-miR-4497)의 조합
(6) 서열번호 64, 72, 96, 162, 609, 611(마커: hsa-miR-6126, hsa-miR-6816-5p, hsa-miR-4294, hsa-miR-3196, hsa-miR-3178, hsa-miR-4497)의 조합
(7) 서열번호 38, 64, 96, 163, 606, 608(마커: hsa-miR-6724-5p, hsa-miR-6126, hsa-miR-4294, hsa-miR-6803-5p, hsa-miR-6836-3p, hsa-miR-718)의 조합
(8) 서열번호 5, 45, 57, 75, 96, 606(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-7847-3p, hsa-miR-4294, hsa-miR-6836-3p)의 조합
(9) 서열번호 5, 15, 45, 57, 96, 606(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-6741-5p, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-4294, hsa-miR-6836-3p)의 조합
(10) 서열번호 5, 41, 45, 57, 96, 606(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-4419b, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-4294, hsa-miR-6836-3p)의 조합
(11) 서열번호 5, 41, 45, 96, 189, 606(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-4419b, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4294, hsa-miR-3940-5p, hsa-miR-6836-3p)의 조합
(12) 서열번호 5, 45, 75, 96, 189, 606(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-7847-3p, hsa-miR-4294, hsa-miR-3940-5p, hsa-miR-6836-3p)의 조합
또한, 비한정적으로 서열번호 606으로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드와 암종특이성 폴리뉴클레오티드군 1로부터 선택되는 3개의 폴리뉴클레오티드의 서열번호로 나타내어지는 서열번호로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 조합을 예시한다.
(1) 서열번호 5, 24, 45, 96, 189, 606(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-6826-5p, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4294, hsa-miR-3940-5p, hsa-miR-6836-3p)의 조합
(2) 서열번호 5, 15, 45, 96, 189, 606(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-6741-5p, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4294, hsa-miR-3940-5p, hsa-miR-6836-3p)의 조합
(3) 서열번호 5, 45, 96, 189, 606, 613(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4294, hsa-miR-3940-5p, hsa-miR-6836-3p, hsa-miR-6752-5p)의 조합
(4) 서열번호 5, 45, 72, 96, 189, 606(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-6816-5p, hsa-miR-4294, hsa-miR-3940-5p, hsa-miR-6836-3p)의 조합
(5) 서열번호 5, 15, 32, 45, 96, 606(마커: hsa-miR-3131, hsa-miR-6741-5p, hsa-miR-8069, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-4294, hsa-miR-6836-3p)의 조합
본 발명의 키트 또는 디바이스에는 위에서 설명한 본 발명에 있어서의 폴리뉴클레오티드(이것에는 변이체, 단편 또는 유도체를 포함할 수 있다)에 추가하여 대장암 검출을 가능하게 하는 기지의 폴리뉴클레오티드 또는 장래 발견될 수 있는 폴리뉴클레오티드도 포함시킬 수 있다.
본 발명의 키트에는 위에서 설명한 본 발명에 있어서의 폴리뉴클레오티드에 추가하여 CEA나 CA19-9 등의 공지의 대장암 검사용 마커를 측정하기 위한 항체도 포함시킬 수 있다.
본 발명의 키트에 포함되는 상기 폴리뉴클레오티드는 개별로 또는 임의로 조합하여 다른 용기에 포장될 수 있다.
본 발명의 키트에는 체액, 세포 또는 조직으로부터 핵산(예를 들면, total RNA)을 추출하기 위한 키트, 표지용 형광 물질, 핵산 증폭용 효소 및 배지, 사용 설명서 등을 포함시킬 수 있다.
본 발명의 디바이스는 위에서 설명한 본 발명에 있어서의 폴리뉴클레오티드 등의 핵산이 예를 들면, 고상에 결합 또는 부착된 암 마커 측정을 위한 디바이스이다. 고상의 재질의 예는 플라스틱, 종이, 유리, 실리콘 등이며, 가공의 하기 쉬움으로부터 바람직한 고상의 재질은 플라스틱이다. 고상의 형상은 임의이며, 예를 들면 사각형, 환형, 단책형, 필름형 등이다. 본 발명의 디바이스에는 예를 들면 하이브리다이제이션 기술에 의한 측정을 위한 디바이스가 포함되고, 구체적으로는 블로팅 디바이스, 핵산 어레이(예를 들면, 마이크로어레이, DNA칩, RNA칩 등) 등이 예시된다.
핵산 어레이 기술은 필요에 따라 L 리신 코트나 아미노기, 카르복실기 등의 관능기 도입 등의 표면 처리가 실시된 고상의 표면에 스폿터 또는 어레이어라고 불리는 고밀도 분주기를 사용하여 핵산을 스폿팅하는 방법, 노즐보다 미소한 액적을 압전 소자 등에 의해 분사하는 잉크젯을 이용하여 핵산을 고상에 분무하는 방법, 고상 상에서 순차 뉴클레오티드 합성을 행하는 방법 등의 방법을 이용하여 상기 핵산을 1개씩 결합 또는 부착시킴으로써 칩 등의 어레이를 제작하고, 이 어레이 를 사용하여 하이브리다이제이션을 이용해서 표적 핵산을 측정하는 기술이다.
본 발명의 키트 또는 디바이스는 상기 군 1의 대장암 마커인 miRNA 중 적어도 1개 이상, 바람직하게는 적어도 2개 이상, 더욱 바람직하게는 적어도 3개 이상, 가장 바람직하게는 적어도 5개 이상으로부터 전부의 폴리뉴클레오티드 각각과 특이적으로 결합가능한 핵산을 포함한다. 본 발명의 키트 또는 디바이스는 또한 경우에 따라 상기 군 2의 대장암 마커인 miRNA 중 적어도 1개 이상, 바람직하게는 적어도 2개 이상, 더욱 바람직하게는 적어도 3개 이상, 가장 바람직하게는 적어도 5개 이상으로부터 전부의 폴리뉴클레오티드 각각과 특이적으로 결합가능한 핵산을 포함할 수 있다. 본 발명의 키트 또는 디바이스는 또한 경우에 따라 상기 군 3의 대장암 마커인 miRNA 중 적어도 1개 이상, 바람직하게는 적어도 2개 이상, 더욱 바람직하게는 적어도 3개 이상, 가장 바람직하게는 적어도 5개 이상으로부터 전부의 폴리뉴클레오티드 각각과 특이적으로 결합가능한 핵산을 포함할 수 있다.
본 발명의 키트 또는 디바이스는 하기 4의 대장암의 검출을 위해 사용할 수 있다.
4. 대장암의 검출 방법
본 발명은 또한 상기 3에서 설명한 본 발명의 키트 또는 디바이스(본 발명에서 사용가능한 상기 핵산을 포함한다)를 이용하여 검체 중의 이하의 군: miR-6726-5p, miR-4257, miR-6787-5p, miR-6780b-5p, miR-3131, miR-7108-5p, miR-1343-3p, miR-1247-3p, miR-4651, miR-6757-5p, miR-3679-5p, miR-7641, miR-6746-5p, miR-8072, miR-6741-5p, miR-1908-5p, miR-6857-5p, miR-4746-3p, miR-744-5p, miR-4792, miR-564, miR-6791-5p, miR-6825-5p, miR-6826-5p, miR-4665-3p, miR-4467, miR-3188, miR-6125, miR-6756-5p, miR-1228-3p, miR-8063, miR-8069, miR-6875-5p, miR-3185, miR-4433b-3p, miR-6887-5p, miR-128-1-5p, miR-6724-5p, miR-1914-3p, miR-1225-5p, miR-4419b, miR-7110-5p, miR-187-5p, miR-3184-5p, miR-204-3p, miR-5572, miR-6729-5p, miR-615-5p, miR-6749-5p, miR-6515-3p, miR-3937, miR-6840-3p, miR-6893-5p, miR-4728-5p, miR-6717-5p, miR-7113-3p, miR-4665-5p, miR-642b-3p, miR-7109-5p, miR-6842-5p, miR-4442, miR-4433-3p, miR-4707-5p, miR-6126, miR-4449, miR-4706, miR-1913, miR-602, miR-939-5p, miR-4695-5p, miR-711, miR-6816-5p, miR-4632-5p, miR-6721-5p, miR-7847-3p, miR-6132, miR-887-3p, miR-3679-3p, miR-6784-5p, miR-1249, miR-937-5p, miR-5195-3p, miR-6732-5p, miR-4417, miR-4281, miR-4734, miR-6766-3p, miR-663a, miR-4513, miR-6781-5p, miR-1227-5p, miR-6845-5p, miR-6798-5p, miR-3620-5p, miR-1915-5p, miR-4294, miR-642a-3p, miR-371a-5p, miR-940, miR-4450, miR-4723-5p, miR-1469, miR-6861-5p, miR-7975, miR-6879-5p, miR-6802-5p, miR-1268b, miR-663b, miR-125a-3p, miR-2861, miR-6088, miR-4758-5p, miR-296-3p, miR-6738-5p, miR-671-5p, miR-4454, miR-4516, miR-7845-5p, miR-4741, miR-92b-5p, miR-6795-5p, miR-6805-3p, miR-4725-3p, miR-6782-5p, miR-4688, miR-6850-5p, miR-6777-5p, miR-6785-5p, miR-7106-5p, miR-3663-3p, miR-6131, miR-1915-3p, miR-4532, miR-6820-5p, miR-4689, miR-4638-5p, miR-3656, miR-3621, miR-6769b-5p, miR-149-3p, miR-23b-3p, miR-3135b, miR-6848-5p, miR-6769a-5p, miR-4327, miR-6765-3p, miR-6716-5p, miR-6877-5p, miR-6727-5p, miR-4534, miR-614, miR-1202, miR-575, miR-6870-5p, miR-6722-3p, miR-7977, miR-4649-5p, miR-4675, miR-6075, miR-6779-5p, miR-4271, miR-3196, miR-6803-5p, miR-6789-5p, miR-4648, miR-4508, miR-4749-5p, miR-4505, miR-5698, miR-1199-5p, miR-4763-3p, miR-6836-3p, miR-3195, miR-718, miR-3178, miR-638, miR-4497, miR-6085, miR-6752-5p 및 miR-135a-3p로부터 선택되는 대장암 유래의 유전자의 발현량, 및 경우에 따라 이하의 군: miR-1231, miR-1233-5p, miR-150-3p, miR-1225-3p, miR-92a-2-5p, miR-423-5p, miR-1268a, miR-128-2-5p 및 miR-24-3p로부터 선택되는 대장암 유래의 유전자의 발현량, 및 경우에 따라 이하의 군: miR-4697-5p, miR-3197, miR-675-5p, miR-4486, miR-7107-5p, miR-23a-3p, miR-4667-5p, miR-451a, miR-3940-5p, miR-8059, miR-6813-5p, miR-4492, miR-4476, 및 miR-6090으로부터 선택되는 대장암 유래의 유전자의 발현량 중 1개 이상으로 나타내어지는 대장암 유래의 유전자의 발현량을 in vitro에서 측정하고, 또한 대장암의 이환이 의심되는 피험체와, 건상체(비대장암 환자를 포함한다)로부터 채취한 혈액, 혈청, 혈장 등의 검체에 대해서 검체 중의 상기 유전자의 발현량과 건상체의 대조 발현량을 이용하여 예를 들면, 양 발현량을 비교하여 상기 검체 중의 표적 핵산의 발현량에 통계학적으로 유의하게 차가 있는 경우, 피험체가 대장암에 이환되어 있다고 평가하는 것을 포함하는 대장암의 검출 방법을 제공한다.
본 발명의 상기 방법은 저침습적으로 감도 및 특이도가 높은 암의 조기 진단을 가능하게 하고, 이것에 의해 조기 치료 및 예후의 개선을 가져오고, 또한 질병증오의 모니터나 외과적, 방사선 요법적, 및 화학 요법적인 치료의 유효성의 모니터를 가능하게 한다.
본 발명의 혈액, 혈청, 혈장 등의 검체로부터 대장암 유래의 유전자를 추출하는 방법에서는 3D-Gene(등록상표) RNA extraction reagent from liquid sample kit(TORAY INDUSTRIES, INC.) 중의 RNA 추출용 시약을 첨가하여 조제하는 것이 특히 바람직하지만 일반적인 산성 페놀법(Acid Guanidinium―Phenol―Chloroform(AGPC)법)을 사용해도 좋고, Trizol(등록상표)(Life Technologies사)을 사용해도 좋고, Trizol(life technologies사)이나 Isogen(NIPPON GENE CO., LTD.) 등의 산성 페놀을 포함하는 RNA 추출용 시약을 첨가하여 조제해도 좋다. 또한, miRNeasy(등록상표) Mini Kit(Qiagen사) 등의 키트를 이용할 수 있지만 이들의 방법에 한정되지 않는다.
본 발명은 또한 본 발명의 키트 또는 디바이스의 피험체 유래의 검체 중의 대장암 유래의 miRNA 유전자의 발현 산물의 in vitro에서의 검출을 위한 사용을 제공한다.
본 발명의 상기 방법에 있어서 상기 키트 또는 디바이스는 위에서 설명한 바와 같은 본 발명에서 사용가능한 폴리뉴클레오티드를 단일로 또는 모든 가능한 조합으로 포함하는 것이 사용된다.
본 발명의 대장암의 검출 또는 (유전자)진단에 있어서 본 발명의 키트 또는 디바이스에 포함되는 폴리뉴클레오티드는 프로브 또는 프라이머로서 사용할 수 있다. 프라이머로서 사용하는 경우에는 Life Technologies사의 TaqMan(등록상표) MicroRNA Assays, Qiagen사의 miScript PCR System 등을 이용할 수 있지만 이들 의 방법에 한정되지 않는다.
본 발명의 키트 또는 디바이스에 포함되는 폴리뉴클레오티드는 노던 블로팅법, 서던 블로팅법, in situ 하이브리다이제이션법, 노던 하이브리다이제이션법, 서던 하이브리다이제이션법 등의 하이브리다이제이션 기술, 정량 RT-PCR법 등의 정량 증폭 기술 등의 특정 유전자를 특이적으로 검출하는 공지의 방법에 있어서 정법에 따라 프라이머 또는 프로브로서 이용할 수 있다. 측정 대상 검체로서는 사용하는 검출 방법의 종류에 따라 피험체의 혈액, 혈청, 혈장, 뇨 등의 체액을 채취한다. 또는, 그러한 체액 상기의 방법에 의해 조제한 total RNA를 사용해도 좋고, 또한 상기 RNA를 기초로 해서 조제되는 cDNA를 포함하는 각종 폴리뉴클레오티드를 사용해도 좋다.
본 발명의 키트 또는 디바이스는 대장암의 진단 또는 이환의 유무의 검출을 위해 유용하다. 구체적으로는 상기 키트 또는 디바이스를 사용한 대장암의 검출은 대장암의 이환이 의심되는 피험체로부터 혈액, 혈청, 혈장, 뇨 등의 검체를 이용하여 상기 키트 또는 디바이스에 포함되는 핵산 프로브 또는 프라이머에서 검출되는 유전자의 발현량을 in vitro에서 검출함으로써 행할 수 있다. 대장암의 이환이 의심되는 피험체의 혈액, 혈청, 혈장, 뇨 등의 검체 중의 서열번호 1~171 및 606~614 중 적어도 1개 이상으로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열, 및 경우에 따라 서열번호 172~180 중 1개 이상으로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열, 및 경우에 따라 서열번호 181~194 중 1개 이상으로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드(그 변이체, 단편 또는 유도체를 포함한다)에 의해 측정되는 표적 miRNA 마커의 발현량이 건상체의 혈액, 혈청, 또는 혈장, 뇨 등의 검체 중의 그들의 발현량과 비교하여 통계학적으로 유의하게 차가 있는 경우, 상기 피험체는 대장암에 이환되어 있다고 평가할 수 있다.
본 발명의 방법은 변 잠혈, 직장진, 대장 내시경 검사에 추가하여 주장 조영 검사, CT 검사, MRI 검사, 골 신티그램 검사 등의 화상 진단법과 조합할 수 있다. 본 발명의 방법은 대장암을 특이적으로 검출하는 것이 가능하며, 대장암 이외의 암으로부터 실질적으로 식별할 수 있다.
본 발명의 키트 또는 디바이스를 이용한 검체 중에 대장암 유래의 유전자의 발현 산물이 포함되지 않는 것, 또는 대장암 유래의 유전자의 발현 산물이 포함되는 것의 검출 방법은 피험체의 혈액, 혈청, 혈장, 뇨 등의 체액을 채취해서 거기에 포함되는 표적 유전자의 발현량을 본 발명의 폴리뉴클레오티드군으로부터 선택된 단수 또는 복수의 폴리뉴클레오티드(변이체, 단편 또는 유도체를 포함한다)를 이용하여 측정함으로써 대장암의 유무를 평가하는 또는 대장암을 검출하는 것을 포함한다. 또한, 본 발명의 대장암의 검출 방법을 이용하여 예를 들면, 대장암 환자에 있어서 그 질환의 개선을 위해 치료약을 투여한 경우에 있어서의 상기 질환의 개선의 유무 또는 개선의 정도를 평가 또는 진단할 수도 있다.
본 발명의 방법은 예를 들면, 이하의 (a), (b) 및 (c)의 스텝:
(a) 피험체 유래의 검체를 in vitro에서 본 발명의 키트 또는 디바이스 중의 폴리뉴클레오티드와 접촉시키는 스텝,
(b) 검체 중의 표적 핵산의 발현량을 상기 폴리뉴클레오티드를 핵산 프로브 또는 프라이머로서 사용하여 측정하는 스텝,
(c) (b)의 결과를 바탕으로 상기 피험체 중의 대장암(세포)의 존재 또는 부존재를 평가하는 스텝을 포함할 수 있다.
구체적으로는 본 발명은 miR-6726-5p, miR-4257, miR-6787-5p, miR-6780b-5p, miR-3131, miR-7108-5p, miR-1343-3p, miR-1247-3p, miR-4651, miR-6757-5p, miR-3679-5p, miR-7641, miR-6746-5p, miR-8072, miR-6741-5p, miR-1908-5p, miR-6857-5p, miR-4746-3p, miR-744-5p, miR-4792, miR-564, miR-6791-5p, miR-6825-5p, miR-6826-5p, miR-4665-3p, miR-4467, miR-3188, miR-6125, miR-6756-5p, miR-1228-3p, miR-8063, miR-8069, miR-6875-5p, miR-3185, miR-4433b-3p, miR-6887-5p, miR-128-1-5p, miR-6724-5p, miR-1914-3p, miR-1225-5p, miR-4419b, miR-7110-5p, miR-187-5p, miR-3184-5p, miR-204-3p, miR-5572, miR-6729-5p, miR-615-5p, miR-6749-5p, miR-6515-3p, miR-3937, miR-6840-3p, miR-6893-5p, miR-4728-5p, miR-6717-5p, miR-7113-3p, miR-4665-5p, miR-642b-3p, miR-7109-5p, miR-6842-5p, miR-4442, miR-4433-3p, miR-4707-5p, miR-6126, miR-4449, miR-4706, miR-1913, miR-602, miR-939-5p, miR-4695-5p, miR-711, miR-6816-5p, miR-4632-5p, miR-6721-5p, miR-7847-3p, miR-6132, miR-887-3p, miR-3679-3p, miR-6784-5p, miR-1249, miR-937-5p, miR-5195-3p, miR-6732-5p, miR-4417, miR-4281, miR-4734, miR-6766-3p, miR-663a, miR-4513, miR-6781-5p, miR-1227-5p, miR-6845-5p, miR-6798-5p, miR-3620-5p, miR-1915-5p, miR-4294, miR-642a-3p, miR-371a-5p, miR-940, miR-4450, miR-4723-5p, miR-1469, miR-6861-5p, miR-7975, miR-6879-5p, miR-6802-5p, miR-1268b, miR-663b, miR-125a-3p, miR-2861, miR-6088, miR-4758-5p, miR-296-3p, miR-6738-5p, miR-671-5p, miR-4454, miR-4516, miR-7845-5p, miR-4741, miR-92b-5p, miR-6795-5p, miR-6805-3p, miR-4725-3p, miR-6782-5p, miR-4688, miR-6850-5p, miR-6777-5p, miR-6785-5p, miR-7106-5p, miR-3663-3p, miR-6131, miR-1915-3p, miR-4532, miR-6820-5p, miR-4689, miR-4638-5p, miR-3656, miR-3621, miR-6769b-5p, miR-149-3p, miR-23b-3p, miR-3135b, miR-6848-5p, miR-6769a-5p, miR-4327, miR-6765-3p, miR-6716-5p, miR-6877-5p, miR-6727-5p, miR-4534, miR-614, miR-1202, miR-575, miR-6870-5p, miR-6722-3p, miR-7977, miR-4649-5p, miR-4675, miR-6075, miR-6779-5p, miR-4271, miR-3196, miR-6803-5p, miR-6789-5p, miR-4648, miR-4508, miR-4749-5p, miR-4505, miR-5698, miR-1199-5p 및 miR-4763-3p, miR-6836-3p, miR-3195, miR-718, miR-3178, miR-638, miR-4497, miR-6085, miR-6752-5p 및 miR-135a-3p로 이루어지는 군으로부터 선택되는 적어도 1개 이상, 바람직하게는 적어도 2개 이상의 폴리뉴클레오티드와 특이적으로 결합가능한 핵산을 이용하여 피험체의 검체에 있어서의 표적 핵산의 발현량을 측정하고, 그 측정된 발현량과, 마찬가지로 측정된 건상체의 대조 발현량을 이용하여 피험체가 대장암에 이환되어 있는 것, 또는 대장암에 이환되어 있지 않은 것을 in vitro에서 평가하는 것을 포함하는 대장암의 검출 방법을 제공한다.
본 명세서에 있어서 「평가」한다란 의사에 의한 판정이 아니라 in vitro에서의 검사에 의한 결과에 의거한 평가 지원이다.
상기와 같이 본 발명의 바람직한 실시형태의 방법에 있어서 표적 핵산은 구체적으로 miR-6726-5p가 hsa-miR-6726-5p이며, miR-4257이 hsa-miR-4257이며, miR-6787-5p가 hsa-miR-6787-5p이며, miR-6780b-5p가 hsa-miR-6780b-5p이며, miR-3131이 hsa-miR-3131이며, miR-7108-5p가 hsa-miR-7108-5p이며, miR-1343-3p가 hsa-miR-1343-3p이며, miR-1247-3p가 hsa-miR-1247-3p이며, miR-4651이 hsa-miR-4651이며, miR-6757-5p가 hsa-miR-6757-5p이며, miR-3679-5p가 hsa-miR-3679-5p이며, miR-7641이 hsa-miR-7641이며, miR-6746-5p가 hsa-miR-6746-5p이며, miR-8072가 hsa-miR-8072이며, miR-6741-5p가 hsa-miR-6741-5p이며, miR-1908-5p가 hsa-miR-1908-5p이며, miR-6857-5p가 hsa-miR-6857-5p이며, miR-4746-3p가 hsa-miR-4746-3p이며, miR-744-5p가 hsa-miR-744-5p이며, miR-4792가 hsa-miR-4792이며, miR-564가 hsa-miR-564이며, miR-6791-5p가 hsa-miR-6791-5p이며, miR-6825-5p가 hsa-miR-6825-5p이며, miR-6826-5p가 hsa-miR-6826-5p이며, miR-4665-3p가 hsa-miR-4665-3p이며, miR-4467이 hsa-miR-4467이며, miR-3188이 hsa-miR-3188이며, miR-6125가 hsa-miR-6125이며, miR-6756-5p가 hsa-miR-6756-5p이며, miR-1228-3p가 hsa-miR-1228-3p이며, miR-8063이 hsa-miR-8063이며, miR-8069가 hsa-miR-8069이며, miR-6875-5p가 hsa-miR-6875-5p이며, miR-3185가 hsa-miR-3185이며, miR-4433b-3p가 hsa-miR-4433b-3p이며, miR-6887-5p가 hsa-miR-6887-5p이며, miR-128-1-5p가 hsa-miR-128-1-5p이며, miR-6724-5p가 hsa-miR-6724-5p이며, miR-1914-3p가 hsa-miR-1914-3p이며, miR-1225-5p가 hsa-miR-1225-5p이며, miR-4419b가 hsa-miR-4419b이며, miR-7110-5p가 hsa-miR-7110-5p이며, miR-187-5p가 hsa-miR-187-5p이며, miR-3184-5p가 hsa-miR-3184-5p이며, miR-204-3p가 hsa-miR-204-3p이며, miR-5572가 hsa-miR-5572이며, miR-6729-5p가 hsa-miR-6729-5p이며, miR-615-5p가 hsa-miR-615-5p이며, miR-6749-5p가 hsa-miR-6749-5p이며, miR-6515-3p가 hsa-miR-6515-3p이며, miR-3937이 hsa-miR-3937이며, miR-6840-3p가 hsa-miR-6840-3p이며, miR-6893-5p가 hsa-miR-6893-5p이며, miR-4728-5p가 hsa-miR-4728-5p이며, miR-6717-5p가 hsa-miR-6717-5p이며, miR-7113-3p가 hsa-miR-7113-3p이며, miR-4665-5p가 hsa-miR-4665-5p이며, miR-642b-3p가 hsa-miR-642b-3p이며, miR-7109-5p가 hsa-miR-7109-5p이며, miR-6842-5p가 hsa-miR-6842-5p이며, miR-4442가 hsa-miR-4442이며, miR-4433-3p가 hsa-miR-4433-3p이며, miR-4707-5p가 hsa-miR-4707-5p이며, miR-6126이 hsa-miR-6126이며, miR-4449가 hsa-miR-4449이며, miR-4706이 hsa-miR-4706이며, miR-1913이 hsa-miR-1913이며, miR-602가 hsa-miR-602이며, miR-939-5p가 hsa-miR-939-5p이며, miR-4695-5p가 hsa-miR-4695-5p이며, miR-711이 hsa-miR-711이며, miR-6816-5p가 hsa-miR-6816-5p이며, miR-4632-5p가 hsa-miR-4632-5p이며, miR-6721-5p가 hsa-miR-6721-5p이며, miR-7847-3p가 hsa-miR-7847-3p이며, miR-6132가 hsa-miR-6132이며, miR-887-3p가 hsa-miR-887-3p이며, miR-3679-3p가 hsa-miR-3679-3p이며, miR-6784-5p가 hsa-miR-6784-5p이며, miR-1249가 hsa-miR-1249이며, miR-937-5p가 hsa-miR-937-5p이며, miR-5195-3p가 hsa-miR-5195-3p이며, miR-6732-5p가 hsa-miR-6732-5p이며, miR-4417이 hsa-miR-4417이며, miR-4281이 hsa-miR-4281이며, miR-4734가 hsa-miR-4734이며, miR-6766-3p가 hsa-miR-6766-3p이며, miR-663a가 hsa-miR-663a이며, miR-4513이 hsa-miR-4513이며, miR-6781-5p가 hsa-miR-6781-5p이며, miR-1227-5p가 hsa-miR-1227-5p이며, miR-6845-5p가 hsa-miR-6845-5p이며, miR-6798-5p가 hsa-miR-6798-5p이며, miR-3620-5p가 hsa-miR-3620-5p이며, miR-1915-5p가 hsa-miR-1915-5p이며, miR-4294가 hsa-miR-4294이며, miR-642a-3p가 hsa-miR-642a-3p이며, miR-371a-5p가 hsa-miR-371a-5p이며, miR-940이 hsa-miR-940이며, miR-4450이 hsa-miR-4450이며, miR-4723-5p가 hsa-miR-4723-5p이며, miR-1469가 hsa-miR-1469이며, miR-6861-5p가 hsa-miR-6861-5p이며, miR-7975가 hsa-miR-7975이며, miR-6879-5p가 hsa-miR-6879-5p이며, miR-6802-5p가 hsa-miR-6802-5p이며, miR-1268b가 hsa-miR-1268b이며, miR-663b가 hsa-miR-663b이며, miR-125a-3p가 hsa-miR-125a-3p이며, miR-2861이 hsa-miR-2861이며, miR-6088이 hsa-miR-6088이며, miR-4758-5p가 hsa-miR-4758-5p이며, miR-296-3p가 hsa-miR-296-3p이며, miR-6738-5p가 hsa-miR-6738-5p이며, miR-671-5p가 hsa-miR-671-5p이며, miR-4454가 hsa-miR-4454이며, miR-4516이 hsa-miR-4516이며, miR-7845-5p가 hsa-miR-7845-5p이며, miR-4741이 hsa-miR-4741이며, miR-92b-5p가 hsa-miR-92b-5p이며, miR-6795-5p가 hsa-miR-6795-5p이며, miR-6805-3p가 hsa-miR-6805-3p이며, miR-4725-3p가 hsa-miR-4725-3p이며, miR-6782-5p가 hsa-miR-6782-5p이며, miR-4688이 hsa-miR-4688이며, miR-6850-5p가 hsa-miR-6850-5p이며, miR-6777-5p가 hsa-miR-6777-5p이며, miR-6785-5p가 hsa-miR-6785-5p이며, miR-7106-5p가 hsa-miR-7106-5p이며, miR-3663-3p가 hsa-miR-3663-3p이며, miR-6131이 hsa-miR-6131이며, miR-1915-3p가 hsa-miR-1915-3p이며, miR-4532가 hsa-miR-4532이며, miR-6820-5p가 hsa-miR-6820-5p이며, miR-4689가 hsa-miR-4689이며, miR-4638-5p가 hsa-miR-4638-5p이며, miR-3656이 hsa-miR-3656이며, miR-3621이 hsa-miR-3621이며, miR-6769b-5p가 hsa-miR-6769b-5p이며, miR-149-3p가 hsa-miR-149-3p이며, miR-23b-3p가 hsa-miR-23b-3p이며, miR-3135b가 hsa-miR-3135b이며, miR-6848-5p가 hsa-miR-6848-5p이며, miR-6769a-5p가 hsa-miR-6769a-5p이며, miR-4327이 hsa-miR-4327이며, miR-6765-3p가 hsa-miR-6765-3p이며, miR-6716-5p가 hsa-miR-6716-5p이며, miR-6877-5p가 hsa-miR-6877-5p이며, miR-6727-5p가 hsa-miR-6727-5p이며, miR-4534가 hsa-miR-4534이며, miR-614가 hsa-miR-614이며, miR-1202가 hsa-miR-1202이며, miR-575가 hsa-miR-575이며, miR-6870-5p가 hsa-miR-6870-5p이며, miR-6722-3p가 hsa-miR-6722-3p이며, miR-7977이 hsa-miR-7977이며, miR-4649-5p가 hsa-miR-4649-5p이며, miR-4675가 hsa-miR-4675이며, miR-6075가 hsa-miR-6075이며, miR-6779-5p가 hsa-miR-6779-5p이며, miR-4271이 hsa-miR-4271이며, miR-3196이 hsa-miR-3196이며, miR-6803-5p가 hsa-miR-6803-5p이며, miR-6789-5p가 hsa-miR-6789-5p이며, miR-4648이 hsa-miR-4648이며, miR-4508이 hsa-miR-4508이며, miR-4749-5p가 hsa-miR-4749-5p이며, miR-4505가 hsa-miR-4505이며, miR-5698이 hsa-miR-5698이며, miR-1199-5p가 hsa-miR-1199-5p이며, miR-4763-3p가 hsa-miR-4763-3p, miR-6836-3p가 hsa-miR-6836-3p이며, miR-3195가 hsa-miR-3195이며, miR-718이 hsa-miR-718이며, miR-3178이 hsa-miR-3178이며, miR-638이 hsa-miR-638이며, miR-4497이 hsa-miR-4497이며, miR-6085가 hsa-miR-6085이며, miR-6752-5p가 hsa-miR-6752-5p이며, 또한 miR-135a-3p가 hsa-miR-135a-3p이다.
또한, 본 발명의 방법의 바람직한 실시형태에 있어서 구체적으로는 핵산(구체적으로는, 프로브 또는 프라이머)이 하기 (a)~(e)에 나타내는 폴리뉴클레오티드:
(a) 서열번호 1~171 및 606~614 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열, 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편,
(b) 서열번호 1~171 및 606~614 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드,
(c) 서열번호 1~171 및 606~614 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열, 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열에 상보적인 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편,
(d) 서열번호 1~171 및 606~614 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열, 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열에 상보적인 염기 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 및
(e) 상기 (a)~(d) 중 어느 하나의 폴리뉴클레오티드와 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드로 이루어지는 군으로부터 선택된다.
본 발명의 방법에서는 또한 miR-1231, miR-1233-5p, miR-150-3p, miR-1225-3p, miR-92a-2-5p, miR-423-5p, miR-1268a, miR-128-2-5p 및 miR-24-3p로 이루어지는 군으로부터 선택되는 적어도 1개 이상의 폴리뉴클레오티드와 특이적으로 결합가능한 핵산을 사용할 수 있다.
그러한 핵산은 구체적으로는 miR-1231이 hsa-miR-1231이며, miR-1233-5p가 hsa-miR-1233-5p이며, miR-150-3p가 hsa-miR-150-3p이며, miR-1225-3p가 hsa-miR-1225-3p이며, miR-92a-2-5p가 hsa-miR-92a-2-5p이며, miR-423-5p가 hsa-miR-423-5p이며, miR-1268a가 hsa-miR-1268a이며, miR-128-2-5p가 hsa-miR-128-2-5p이며, 또한 miR-24-3p가 hsa-miR-24-3p이다.
또한, 바람직한 실시형태에서는 구체적으로는 그러한 핵산은 하기 (f)~(j)에 나타내는 폴리뉴클레오티드:
(f) 서열번호 172~180 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열, 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편,
(g) 서열번호 172~180 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드,
(h) 서열번호 172~180 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열, 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열에 상보적인 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편,
(i) 서열번호 172~180 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열, 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열에 상보적인 염기 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 및
(j) 상기(f)~(i)중 어느 하나의 폴리뉴클레오티드와 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드로 이루어지는 군으로부터 선택된다.
본 발명의 방법에 있어서의 핵산에서는 또한 miR-4697-5p, miR-3197, miR-675-5p, miR-4486, miR-7107-5p, miR-23a-3p, miR-4667-5p, miR-451a, miR-3940-5p, miR-8059, miR-6813-5p, miR-4492, miR-4476 및 miR-6090으로 이루어지는 군으로부터 선택되는 적어도 1개 이상의 폴리뉴클레오티드와 특이적으로 결합가능한 핵산을 사용할 수 있다.
그러한 핵산은 구체적으로는 miR-4697-5p가 hsa-miR-4697-5p이며, miR-3197이 hsa-miR-3197이며, miR-675-5p가 hsa-miR-675-5p이며, miR-4486이 hsa-miR-4486이며, miR-7107-5p가 hsa-miR-7107-5p이며, miR-23a-3p가 hsa-miR-23a-3p이며, miR-4667-5p가 hsa-miR-4667-5p이며, miR-451a가 hsa-miR-451a이며, miR-3940-5p가 hsa-miR-3940-5p이며, miR-8059이 hsa-miR-8059이며, miR-6813-5p가 hsa-miR-6813-5p이며, miR-4492가 hsa-miR-4492이며, miR-4476이 hsa-miR-4476이며, 및 miR-6090이 hsa-miR-6090이다.
또한, 바람직한 실시형태에서는 구체적으로는 그러한 핵산은 하기 (k)~(o)에 나타내는 폴리뉴클레오티드:
(k) 서열번호 181~194 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열, 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편,
(l) 서열번호 181~194 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드,
(m) 서열번호 181~194 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열, 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열에 상보적인 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편,
(n) 서열번호 181~194 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열, 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열에 상보적인 염기 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 및
(o) 상기 (k)~(n) 중 어느 하나의 폴리뉴클레오티드와 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드로 이루어지는 군으로부터 선택되는 폴리뉴클레오티드이다.
본 발명 방법에서 사용되는 검체로서는 피험체의 생체 조직(바람직하게는 대장 조직), 혈액, 혈청, 혈장, 뇨 등의 체액 등으로부터 조제되는 검체를 들 수 있다. 구체적으로는 상기 조직으로부터 조제되는 RNA 함유 검체, 그것으로부터 또한 조제되는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 검체, 혈액, 혈청, 혈장, 뇨 등의 체액, 피험체의 생체 조직의 일부 또는 전부를 바이옵시 등에서 채취하거나, 수술에 의해 적출한 생체 조직 등이며, 이들로부터 측정을 위한 검체를 조제할 수 있다.
본 명세서에서 피험체란 포유동물, 예를 들면 비한정적으로 인간, 원숭이, 마우스, 래트 등을 가리키고, 바람직하게는 인간이다.
본 발명의 방법은 측정 대상으로서 사용하는 검체의 종류에 따라 스텝을 변경할 수 있다.
측정 대상물로서 RNA를 이용하는 경우, 대장암(세포)의 검출은 예를 들면 하기 스텝 (a), (b) 및 (c):
(a) 피험체의 검체로부터 조제된 RNA 또는 그것으로부터 전사된 상보적 폴리뉴클레오티드(cDNA)를 본 발명의 키트 또는 디바이스 중의 폴리뉴클레오티드와 결합시키는 스텝,
(b) 상기 폴리뉴클레오티드에 결합된 검체 유래의 RNA 또는 상기 RNA로부터 합성된 cDNA를 상기 폴리뉴클레오티드를 핵산 프로브로서 사용하는 하이브리다이제이션에 의해, 또는 상기 폴리뉴클레오티드를 프라이머로서 사용하는 정량 RT-PCR에 의해 측정하는 스텝,
(c) 상기 (b)의 측정 결과에 의거하여 대장암(유래의 유전자의 발현)의 존재 또는 부존재를 평가하는 스텝을 포함할 수 있다.
본 발명에 의해 대장암(유래의 유전자의 발현)을 in vitro에서 검출, 검사, 평가 또는 진단하기 위해 예를 들면 각종 하이브리다이제이션법을 사용할 수 있다. 이러한 하이브리다이제이션법에는 예를 들면 노던 블로팅법, 서던 블로팅법, RT-PCR법, DNA칩 해석법, in situ 하이브리다이제이션법, 노던 하이브리다이제이션법, 서던 하이브리다이제이션법 등을 사용할 수 있다.
노던 블로팅법을 이용하는 경우는 본 발명에서 사용가능한 상기 핵산 프로브를 사용함으로써 RNA 중의 각 유전자 발현의 유무나 그 발현량을 검출, 측정할 수 있다. 구체적으로는 핵산 프로브(상보쇄)를 방사성 동위원소(32P, 33P, 35S 등)나 형광 물질 등으로 표지하고, 그것을 상법에 따라서 나일론 멤브레인 등에 트랜스퍼한 피검자의 생체 조직 유래의 RNA와 하이브리다이징시킨 후, 형성된 DNA/RNA 2중쇄의 표지물(방사성 동위원소 또는 형광 물질)로부터 유래되는 시그널을 방사선 검출기(BAS-1800II(후지샤신필름 가부시키가이샤) 등을 예시할 수 있다) 또는 형광 검출기(STORM 865(GE 헬스케어사) 등을 예시할 수 있다)로 검출, 측정하는 방법을 예시할 수 있다.
정량 RT-PCR법을 이용하는 경우에는 본 발명에서 사용가능한 상기 프라이머를 사용함으로써 RNA 중의 유전자 발현의 유무나 그 발현량을 검출, 측정할 수 있다. 구체적으로는 피검체의 생체 조직 유래의 RNA로부터 상법에 따라 cDNA를 조제하고, 이것을 주형으로 해서 표적의 각 유전자의 영역이 증폭될 수 있도록 본 발명의 1쌍의 프라이머(상기 cDNA에 결합하는 정쇄와 역쇄로 이루어지는)를 cDNA와 하이브리다이징시켜서 상법에 의해 PCR법을 행하고, 얻어진 2본쇄 DNA를 검출하는 방법을 예시할 수 있다. 또한, 2본쇄 DNA의 검출법으로서는 상기 PCR을 미리 방사성 동위원소나 형광 물질로 표지해 둔 프라이머를 이용하여 행하는 방법, PCR 산물을 아가로오스 겔로 전기 영동하고, 에티듐 브로마이드 등으로 2본쇄 DNA를 염색해서 검출하는 방법, 생산된 2본쇄 DNA를 상법에 따라 나일론 멤브레인 등에 트랜스퍼시키고, 표지한 핵산 프로브와 하이브리다이징시켜서 검출하는 방법을 포함할 수 있다.
핵산 어레이 해석을 이용하는 경우는 본 발명의 핵산 프로브(1본쇄 또는 2본쇄)를 기판(고상)에 부착한 RNA칩 또는 DNA칩을 사용한다. 핵산 프로브를 부착한 영역을 프로브 스폿, 핵산 프로브를 부착하고 있지 않은 영역을 블랭크 스폿으로 칭한다. 유전자군을 기판에 고상화한 것에는 일반적으로 핵산 칩, 핵산 어레이, 마이크로어레이 등이라는 명칭이 있으며, DNA 또는 RNA 어레이에는 DNA 또는 RNA 매크로어레이와 DNA 또는 RNA 마이크로어레이가 포함되지만, 본 명세서에서는 칩이라고 한 경우, 그들 모두를 포함하는 것으로 한다. DNA칩으로서는 3D-Gene(등록상표) Human miRNA Oligo chip(TORAY INDUSTRIES, INC.)을 사용할 수 있지만 이것에 한정되지 않는다.
DNA칩의 측정은 한정되지 않지만, 예를 들면 핵산 프로브의 표지물로부터 유래되는 시그널을 화상 검출기(Typhoon 9410(GE 헬스케어사), 3D-Gene(등록상표) 스캐너(TORAY INDUSTRIES, INC.) 등을 예시할 수 있다)로 검출, 측정하는 방법을 예시할 수 있다.
본 명세서 중에서 사용하는 「스트린젠트한 조건」이란 상술한 바와 같이 핵산 프로브가 다른 서열에 대한 보다 큰 정도(예를 들면. 백그라운드 측정값의 평균＋백그라운드 측정값의 표준오차×2 이상의 측정값)로 그 표적 서열에 대하여 하이브리다이징하는 조건이다.
스트린젠트한 조건은 하이브리다이제이션과 그 후의 세정의 조건에 의해 규정된다. 그 하이브리다이제이션의 조건은 한정되지 않지만, 예를 들면 30℃~60℃에서 SSC, 계면활성제, 포름아미드, 덱스트란황산염, 블로킹제 등을 포함하는 용액 중에서 1~24시간의 조건으로 한다. 여기서, 1×SSC는 150mM 염화나트륨 및 15mM 시트르산 나트륨을 포함하는 수용액(pH 7.0)이며, 계면활성제는 SDS(도데실 황산나트륨), Triton, 또는 TWeen 등을 포함한다. 하이브리다이제이션 조건으로서는 보다 바람직하게는 3~10×SSC, 0.1~1% SDS를 포함한다. 스트린젠트한 조건을 규정하는 또 하나의 조건인 하이브리다이제이션 후의 세정 조건으로서는 예를 들면 30℃의 0.5×SSC와 0.1% SDS를 포함하는 용액, 및 30℃의 0.2×SSC와 0.1% SDS를 포함하는 용액, 및 30℃의 0.05×SSC 용액에 의한 연속된 세정 등의 조건을 들 수 있다. 상보쇄는 이러한 조건에서 세정해도 대상으로 하는 정쇄와 하이브리다이즈 상태를 유지하는 것이 바람직하다. 구체적으로는 이러한 상보쇄로서 대상의 정쇄의 염기 서열과 완전하게 상보적인 관계에 있는 염기 서열로 이루어지는 쇄, 및 상기 쇄와 적어도 80%, 바람직하게는 적어도 85%, 보다 바람직하게는 적어도 90% 또는 적어도 95%, 예를 들면 적어도 98% 또는 적어도 99%의 동일성을 갖는 염기 서열로 이루어지는 쇄를 예시할 수 있다.
이들의 하이브리다이제이션에 있어서의 「스트린젠트한 조건」의 다른 예에 대해서는 예를 들면 Sambrook, J. & Russel, D. 저, Molecular Cloning, A LABORATORY MANUAL, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2001년 1월 15일 발행의 제 1 권 7.42~7.45, 제 2 권 8.9~8.17 등에 기재되어 있고, 본 발명에 있어서 이용할 수 있다.
본 발명의 키트 중의 폴리뉴클레오티드 단편을 프라이머로서 PCR를 실시할 때의 조건의 예로서는 예를 들면 10mM Tris-HCL(pH 8.3), 50mM KCL, 1~2mM MgCl2 등의 조성의 PCR 버퍼를 사용하고, 상기 프라이머의 서열로부터 계산된 Tm값＋5~10℃에 있어서 15초부터 1분 정도 처리하는 것 등을 들 수 있다. 이러한 Tm값의 계산 방법으로서 Tm값=2×(아데닌 잔기수＋티민 잔기수)＋4×(구아닌 잔기수＋시토신 잔기수) 등을 들 수 있다.
또한, 졍량 PT-PCR법을 사용하는 경우에는 TaqMan(등록상표) MicroRNA Assays(Life Technologies사): LNA(등록상표)-based MicroRNA PCR(Exiqon사): Ncode(등록상표) miRNA qRT-PCT 키트(invitrogen사) 등의 miRNA를 정량적으로 측정하기 위해 특별히 고안된 시판의 측정용 키트를 사용해도 좋다.
유전자 발현량의 산출에는 한정되지 않지만, 예를 들면 Statistical analysis of gene expression microarray data(Speed T. 저, Chapman and Hall/CRC), 및 A beginner's guide Microarray gene expression data analysis(Causton H.C. 등 저, BlackWell publishing) 등에 기재된 통계학적 처리를 본 발명에 있어서 이용할 수 있다. 예를 들면, DNA칩 상의 블랭크 스폿의 측정값의 평균값에 블랭크 스폿의 측정값의 표준편차의 2배, 바람직하게는 3배, 보다 바람직하게는 6배를 가산하고, 그 값 이상의 시그널값을 갖는 프로브 스폿을 검출 스폿으로 간주할 수 있다. 또한, 블랭크 스폿의 측정값의 평균값을 백그라운드로 간주하고 프로브 스폿의 측정값으로부터 감산하여 유전자 발현량으로 할 수 있다. 유전자 발현량의 결손값에 대해서는 해석 대상으로부터 제외하거나, 바람직하게는 각 DNA칩에 있어서의 유전자 발현량의 최소값으로 치환하거나, 보다 바람직하게는 유전자 발현량의 최소값의 대수값으로부터 0.1을 감산한 값으로 치환할 수 있다. 또한, 저 시그널의 유전자를 제거하기 위해서 측정 샘플수의 20% 이상, 바람직하게는 50% 이상, 보다 바람직하게는 80% 이상에 있어서 2의 6승, 바람직하게는 2의 8승, 보다 바람직하게는 2의 10승 이상의 유전자 발현량을 갖는 유전자만을 해석 대상으로 해서 선택할 수 있다. 유전자 발현량의 정규화(노멀라이제이션)로서는 한정되지 않지만, 예를 들면 global normalization이나 quantile normalization(Bolstad, B.M. 등, 2003년, Bioinformatics, 19권, p185-193) 등을 들 수 있다.
본 발명은 또한 본 발명의 검출용 폴리뉴클레오티드, 키트, 디바이스(예를 들면, 칩), 또는 그들의 조합을 이용하여 피험체 유래의 검체 중의 표적 유전자 또는 유전자의 발현량을 측정하고, 대장암 환자 유래의 검체와 건상체 유래의 검체의 유전자 발현량을 교사 샘플로서 판별식(판별 함수)을 작성하고, 검체가 대장암 유래의 유전자를 포함하는 것 및/또는 포함하지 않는 것을 결정 또는 평가하는 방법을 제공한다.
즉, 본 발명은 또한 본 발명의 검출용 폴리뉴클레오티드, 키트, 디바이스 (예를 들면, 칩), 또는 그들의 조합을 이용하여 검체가 대장암 유래의 유전자를 포함하는 것/또는 대장암 유래의 유전자를 포함하지 않는 것을 결정 또는 평가하는 것이 기지의 복수의 검체 중의 표적 유전자(표적 핵산)의 발현량을 in vitro에서 측정하는 제 1 스텝, 상기 제 1 스텝에서 얻어진 상기 표적 유전자의 발현량의 측정값을 교사 샘플로 한 판별식을 작성하는 제 2 스텝, 피험체 유래의 검체 중의 상기 표적 유전자의 발현량을 제 1 스텝과 마찬가지로 in vitro에서 측정하는 제 3 스텝, 상기 제 2 스텝에서 얻어진 판별식에 제 3 스텝에서 얻어진 상기 표적 유전자의 발현량의 측정값을 대입하고, 상기 판별식으로부터 얻어진 결과에 의거하여 검체가 대장암 유래의 유전자를 포함하는 것/또는 대장암 유래의 유전자를 포함하지 않는 것을 결정 또는 평가하는 제 4 스텝을 포함하고, 여기서 상기 표적 유전자가 상기 폴리뉴클레오티드, 키트 또는 디바이스(예를 들면, 칩)에 포함되는 검출용 폴리뉴클레오티드에 의해 검출가능한 것인 방법을 제공한다. 여기서, 피셔의 판별 분석, 마할라노비스 거리에 의한 비선형 판별 분석, 뉴럴 네트워크, Support Vector Machine(SVM) 등을 이용하여 판별식을 작성할 수 있지만 이들에 한정되지 않는다.
선형 판별 분석은 군 분류의 경계가 직선 또는 초평면인 경우, 식 1을 판별식으로서 이용하여 군의 소속을 판별하는 방법이다. 여기서, x는 설명 변수, w는 설명 변수의 계수, w0은 정수항으로 한다.
판별식에서 얻어진 값을 판별 득점이라고 부르고, 새롭게 주어진 데이터 세트의 측정값을 설명 변수로서 상기 판별식에 대입하고, 판별 득점의 부호로 군 분류를 판별할 수 있다.
선형 판별 분석의 일종인 피셔의 판별 분석은 클래스 판별을 행하는데 적당한 차원을 선택하기 위한 차원 삭감법이며, 합성 변수의 분산에 착안하여 동일한 라벨을 갖는 데이터의 분산을 최소화함으로써 식별력이 높은 합성 변수를 구성한다 (Venables, W. N. 등 저, Modern Applied Statistics With S. Fourth edition. Springer., 2002년). 피셔의 판별 분석에서는 식 2를 최대로 하는 사영방향 w를 구한다. 여기서, μ는 입력의 평균, ng는 클래스 g에 속하는 데이터 수, μg은 클래스 g에 속하는 데이터의 입력의 평균으로 한다. 분자·분모는 각각 데이터를 벡터 w의 방향으로 사영했을 때의 클래스 간 분산, 클래스 내 분산이 되어 있고, 이 비를 최대화함으로써 판별식 계수 Wi를 구한다(카나모리 타카후미 등 저, 「패턴 인식」, KYORITSU SHUPPAN CO., LTD.(2009년), Richard O. 등 저, Pattern Classification Second Edition., Wiley-Interscience, 2000년).
마할라노비스 거리는 데이터의 상관을 고려한 식 3으로 산출되고, 각 군으로부터의 마할라노비스 거리가 가까운 군을 소속군으로서 판별하는 비선형 판별 분석으로서 사용할 수 있다. 여기서, μ는 각 군의 중심 벡터, S-1은 그 군의 분산 공분산 행렬의 역행렬이다. 중심 벡터는 설명 변수 x로부터 산출되고, 평균 벡터나 중앙값 벡터 등을 사용할 수 있다.
SVM이란 V. Vapnik가 고안한 판별 분석법이다(The Nature of Statistical Leaning Theory, Springer, 1995년). 분류해야 할 군 분류가 기지의 데이터 세트의 특정 데이터 항목을 설명 변수, 분류해야 할 군 분류를 목적 변수로 하여 상기 데이터 세트를 기지의 군 분류로 올바르게 분류하기 위한 초평면이라고 불리는 경계면을 결정하고, 상기 경계면을 이용하여 데이터를 분류하는 판별식을 결정한다. 그리고 상기 판별식은 새롭게 주어지는 데이터 세트의 측정값을 설명 변수로서 상기 판별식에 대입함으로써 군 분류를 판별할 수 있다. 또한, 이 때의 판별 결과는 분류해야 할 군이어도 좋고, 분류해야 할 군으로 분류될 수 있는 확률이어도 좋고, 초평면으로부터의 거리이어도 좋다. SVM에서는 비선형인 문제에 대응하기 위한 방법으로서 특징 벡터를 고차원으로 비선형 변환하고, 그 공간에서 선형의 식별을 행하는 방법이 알려져 있다. 비선형으로 사상(寫像)된 공간에서의 2개의 요소의 내적이 각각의 것의 공간에서의 입력만으로 표현되는 바와 같은 식의 것을 커널이라고 부르고, 커널의 일례로서 리니어 커널, RBF(Radial Basis Function) 커널, 가우시안 커널을 들 수 있다. 커널에 의해 고차원으로 사상되면서 실제로는 사상된 공간에서의 특징의 계산을 피해 커널의 계산만으로 최적의 판별식, 즉 판별식을 구성할 수 있다(예를 들면, 아소 히데키 등 저, 통계과학의 프론티어 6 「패턴 인식과 학습의 통계학 새로운 개념과 방법」, Iwanami Shoten, Publishers(2004년), Nello Cristianini 등 저, SVM 입문, KYORITSU SHUPPAN CO., LTD.(2008년)).
SVM법의 일종인 C-support vector classification(C-SVC)은 2군의 설명 변수로 학습을 행하여 초평면을 작성하고, 미지의 데이터 세트가 어느 쪽의 군으로 분류되는를 판별한다(C. Cortes 등, 1995년, Machine Learning, 20권, p273-297).
본 발명 의 방법에서 사용가능한 C-SVC의 판별식의 산출예를 이하에 나타낸다. 우선 전체 피험체를 대장암 환자와 건상체의 2군으로 군 분류한다. 피험체가 대장암 환자이거나 건상체라고 판단하기 위해서는 예를 들면, 대장 조직 검사를 사용할 수 있다.
이어서, 분류된 2군의 혈청 유래의 검체의 망라적 유전자 발현량으로 이루어지는 데이터 세트(이하, 학습 검체군)를 준비하고, 상기 2군 사이에서 유전자 발현량에 명확한 차가 보여지는 유전자를 설명 변수, 상기 군 분류를 목적 변수(예를 들면, -1과 +1)로 한 C-SVC에 의한 판별식을 결정한다. 식 4눈 최적화되는 목적 함수이며, 여기서 e는 모든 입력 벡터, y는 목적 변수, a는 Lagrange 미정 승수 벡터, Q는 양의 정부호 행렬, C는 제약 조건을 조정하는 파라미터를 나타낸다.
식 5는 최종적으로 얻어진 판별식이며, 판별식에 의해 얻어진 값의 부호로 소속되는 군을 결정할 수 있다. 여기서, x는 서포트 벡터, y는 군의 소속을 나타내는 레이블, a는 대응하는 계수, b는 정수항, K은 커널 함수이다.
커널 함수로서는 예를 들면 식 6으로 정의되는 RBF 커널을 사용할 수 있다. 여기서, x는 서포트 벡터, γ는 초평면의 복잡함을 조정하는 커널 파라미터를 나타낸다.
이들 외에도 피험체 유래의 검체가 대장암 유래의 표적 유전자의 발현을 포함하는 것 및/또는 포함하지 않는 것을 결정 또는 평가하거나, 또는 그 발현량을 건상체 유래의 대조와 비교하여 평가하는 방법으로서 뉴럴 네트워크, k-근방법, 결정트리, 로지스틱 회귀 분석 등의 방법을 선택할 수 있다.
본 발명의 방법은 예를 들면, 하기 스텝 (a), (b) 및 (c):
(a) 대장암 환자 유래의 대장암 유래 유전자를 포함하는 조직 및/또는 건상체 유래의 대장암 유래 유전자를 포함하지 않는 조직인 것이 이미 알려져 있는 검체 중의 표적 유전자의 발현량을 본 발명에 의한 검출용 폴리뉴클레오티드, 키트 또는 디바이스(예를 들면, DNA칩)를 이용하여 측정하는 스텝,
(b) (a)에서 측정된 발현량의 측정값으로부터 상기 식 1~3, 5 및 6의 판별식을 작성하는 스텝,
(c) 피험체 유래의 검체 중의 상기 표적 유전자의 발현량을 본 발명에 의한 검출용 폴리뉴클레오티드, 키트 또는 디바이스(예를 들면, DNA칩)를 이용하여 측정하고, (b)에서 작성한 판별식에 측정값을 대입해서 얻어진 결과에 의거하여 검체가 대장암 유래의 표적 유전자를 포함하는 것 및/또는 포함하지 않는 것을 결정 또는 평가하거나, 또는 그 발현량을 건상체 유래의 대조와 비교하여 평가하는 스텝을 포함할 수 있다. 여기서, 식 1~3, 5 및 6의 식 중의 x는 설명 변수이며, 상기 2절에 기재된 폴리뉴클레오티드류로부터 선택되는 폴리뉴클레오티드 또는 그 단편 등을 측정함으로써 얻어지는 값을 포함하고, 구체적으로는 본 발명의 대장암 환자와 건상체를 판별하기 위한 설명 변수는 예를 들면, 하기 (1)~(3)으로부터 선택되는 유전자 발현량이다.
(1) 서열번호 1~171 및 606~614 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열에 있어서 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 DNA 중 어느 하나에 의해 측정되는 대장암 환자 또는 건상체의 혈청에 있어서의 유전자 발현량.
(2) 서열번호 172~180 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열에 있어서 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 DNA 중 어느 하나에 의해 측정되는 대장암 환자 또는 건상체의 혈청에 있어서의 유전자 발현량.
(3) 서열번호 181~194 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열에 있어서 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 DNA 중 어느 하나에 의해 측정되는 대장암 환자 또는 건상체의 혈청에 있어서의 유전자 발현량.
이상에 나타내는 바와 같이 피험체 유래의 검체가 대장암 유래의 유전자를 포함하는 것 및/또는 포함하지 않는 것을 결정 또는 평가하는 방법으로서 판별식의 작성에는 학습 검체군으로부터 작성한 판별식이 필요하며, 상기 판별식의 판별 정밀도를 높이기 위해서는 학습 검체군 중의 2군 사이에 명확한 차가 있는 유전자를 판별식에 사용하는 것이 필요하다.
또한, 판별식의 설명 변수에 사용하는 유전자의 결정은 다음과 같이 행하는 것이 바람직하다. 우선, 학습 검체군인 대장암 환자군의 망라적 유전자 발현량과 건상체군의 망라적 유전자 발현량을 데이터 세트로 하고, 파라메트릭 해석인 t 검정의 P값, 논파라메트릭 해석인 Mann-Whitney의 U 검정의 P값, 또는 Wilcoxon 검정의 P값 등을 이용하여 상기 2군 사이에서 있어서의 각 유전자의 발현량의 차의 크기를 구한다.
검정에 의해 얻어진 P값의 위험률(유의수준)이 예를 들면 5%, 1% 또는 0.01%보다 작은 경우에 통계학적으로 유의한 것으로 간주할 수 있다.
검정을 반복하여 행하는 것에 기인하는 제 1 종의 과오의 확률의 증대를 보정하기 위해서 공지의 방법, 예를 들면 본페로니, 홀름 등의 방법에 의해 보정할 수 있다(예를 들면, 나가타 야스시 등 저, 「통계적 다중비교법의 기초」, scientist사 (2007년)). 본페로니 보정을 예시하면, 예를 들면 검정에 의해 얻어진 P값을 검정의 반복 횟수, 즉 해석에 사용하는 유전자수로 곱하고, 소망의 유의수준과 비교함으로써 검정 전체에서의 제 1 종 과오가 생기는 확률을 억제할 수 있다.
또한, 검정이 아니라 대장암 환자군의 유전자 발현량과 건상체군의 유전자 발현량 사이에서 각각의 유전자 발현량의 중앙값의 발현비의 절대값(Fold change)을 산출하고, 판별식의 설명 변수에 사용하는 유전자를 선택해도 좋다. 또한, 대장암 환자군과 건상체군의 유전자 발현량을 이용하여 ROC 곡선을 작성하고, AUROC값을 기준으로 해서 판별식의 설명 변수에 사용하는 유전자를 선택해도 좋다.
이어서, 여기서 구한 유전자 발현량의 차가 큰 임의의 수의 유전자를 이용하여 상기 여러가지 방법으로 산출할 수 있는 판별식을 작성한다. 최대의 판별 정밀도를 얻는 판별식을 구축하는 방법으로서 예를 들면, P값의 유의수준을 만족한 유전자의 모든 조합으로 판별식을 구축하는 방법이나, 판별식을 작성하기 위해서 사용하는 유전자를 유전자 발현량의 차가 큰 순서로 하나씩 늘리면서 반복하여 평가하는 방법 등이 있다(Furey TS. 등, 2000년, Bioinformatics., 16권, p906-14). 이 판별식에 대하여 별도의 독립의 대장암 환자 또는 건상체의 유전자 발현량을 설명 변수에 대입하여 이 독립의 대장암 환자 또는 건상체에 대해서 소속되는 군의 판별 결과를 산출한다. 즉, 발견된 진단용 유전자 세트 및 진단용 유전자 세트를 이용하여 구축한 판별식을 독립의 검체군에서 평가함으로써 보다 보편적인 대장암을 검출할 수 있는 진단용 유전자 세트 및 대장암을 판별하는 방법을 찾아낼 수 있다.
또한, 상기 판별식의 판별 성능(범화성)의 평가에는 Split-sample법을 사용하는 것이 바람직하다. 즉, 데이터 세트를 학습 검체군과 테스트 검체군으로 분할하고, 학습 검체군에서 통계학적 검정에 의한 유전자의 선택과 판별식 작성을 행하고, 그 판별식으로 테스트 검체군을 판별한 결과와 테스트 검체군이 소속되는 진정한 군을 이용하여 정밀도·감도·특이도를 산출하고, 판별 성능을 평가한다. 한편, 데이터 세트를 분할하지 않고 전체 검체를 이용하여 통계학적 검정에 의한 유전자의 선택과 판별식 작성을 행하고, 신규로 준비한 검체를 상기 판별식으로 판별해서 정밀도·감도·특이도를 산출하고, 판별 성능을 평가할 수도 있다.
본 발명은 대장암의 진단 및 치료에 유용한 검출용 또는 질환 진단용 폴리뉴클레오티드, 상기 폴리뉴클레오티드를 사용한 대장암의 검출 방법, 및 상기 폴리뉴클레오티드를 포함하는 대장암의 검출 키트 및 디바이스를 제공한다. 특히, 기존의 종양 마커 CEA에 의한 대장암 진단법을 초월하는 정밀도를 나타내는 진단용 유전자의 선정과 판별식의 작성을 실시하기 위해서 본 발명의 방법에 있어서 예를 들면, CEA에 의해 음성으로 판단되었음에도 불구하고 조영제를 사용한 컴퓨터 단층 촬영 등의 정밀 검사에 의해 최종적으로 대장암이 존재하는 것이 명확해진 환자 유래의 혈청 중의 발현 유전자와, 대장암이 존재하지 않는 환자 유래의 혈청 중의 발현 유전자를 비교함으로써 CEA를 초월하는 정밀도를 나타내는 진단용 유전자 세트 및 판별식을 구축할 수 있다.
예를 들면, 위에 기재된 바와 같은 서열번호 1~171 및 606~614 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열에 의거하는 1 또는 2 이상의 상기 폴리뉴클레오티드, 및 경우에 따라 서열번호 172~180 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열에 의거하는 1 또는 2 이상의 상기 폴리뉴클레오티드, 및 경우에 따라 서열번호 181~194 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열에 의거하는 1 또는 2 이상의 상기 폴리뉴클레오티드로부터의 임의의 조합을 진단용 유전자 세트로 한다. 또한, 조직 진단의 진단 결과가 클래스 I의 대장암 환자 유래의 검체와, 클래스 II의 건상체 유래의 검체에 있어서의 상기 진단용 유전자 세트의 발현량을 이용하여 판별식을 구축한다. 그 결과, 미지의 검체의 그 진단용 유전자 세트의 발현량을 측정함으로써 미지의 검체가 대장암 유래 유전자를 포함하는 것 또는 대장암 유래 유전자를 포함하지 않는 것을 최고 100%의 정밀도로 분별할 수 있다.
(실시예)
본 발명을 이하의 실시예에 의해 더욱 구체적으로 설명한다. 그러나, 본 발명의 범위는 이 실시예에 의해 제한되지 않는 것으로 한다.
[참고예 1]
<대장암 환자와 건상체의 검체의 채취>
인폼드 컨센트를 얻은 건상체 100명과 대장암 이외의 원발암이 인정되고 있지 않은 대장암 환자 34명(스테이지 I이 15례, 스테이지 IIA가 6례, 스테이지 IIIA가 4례, 스테이지 IIIB가 6례, 스테이지 IIIC가 2례, 스테이지 IV가 1례)으로부터베노젝트 II 진공 채혈관 VP-AS109K 60(TERUMO CORPORATION)을 이용하여 각각 혈청을 채취하여 학습 검체군으로 했다. 마찬가지로, 인폼드 컨센트를 얻은 건상체 50명과 대장암 이외의 원발암이 인정되고 있지 않은 대장암 환자 16명(스테이지 I이 3례, 스테이지 IIA가 4례, 스테이지 IIB가 1례, 스테이지 IIIB가 2례, 스테이지IIIC가 2례, 스테이지 IV가 4례)으로부터 베노젝트 II 진공 채혈관 VP-AS109K 60(TERUMO CORPORATION)을 이용하여 각각 혈청을 채취하여 테스트 검체군으로 했다.
<total RNA의 추출>
검체로서 상기 학습 검체군, 테스트 검체군 합쳐서 건상체 150명과 대장암 환자 50명의 합계 200명으로부터 각각 얻어진 혈청 300μL로부터 3D-Gene(등록상표) RNA extraction reagent from liquid sample kit(TORAY INDUSTRIES, INC.) 중의 RNA 추출용 시약을 이용하여 동사의 정해진 프로토콜에 따라서 total RNA를 얻었다.
<유전자 발현량의 측정>
검체로서 상기 학습 검체군, 테스트 검체군 모두 건상체 150명과 대장암 환자 50명의 합계 200명의 혈청으로부터 얻은 total RNA에 대하여 3D-Gene(등록상표) miRNA Labeling kit(TORAY INDUSTRIES, INC.)를 이용하여 동사가 규정한 프로토콜(ver 2.20)에 의거하여 miRNA를 형광 표지했다. 올리고 DNA칩으로서 miRBase release 20에 등록되어 있는 miRNA 중에서 2,555종의 miRNA와 상보적인 배열을 갖는 프로브를 탑재한 3D-Gene(등록상표) Human miRNA Oligo chip(TORAY INDUSTRIES, INC.)을 사용하고, 동사가 정하는 프로토콜에 의거하여 스트린젠트한 조건에서 total RNA 중의 miRNA와 DNA칩 상의 프로브의 하이브리다이제이션 및 하이브리다이제이션 후의 세정을 행했다. DNA칩을 3D-Gene(등록상표) Scanner(TORAY INDUSTRIES, INC.)을 이용하여 스캔하고, 화상을 취득해서 3D-Gene(등록상표) Extraction(TORAY INDUSTRIES, INC.)에 의해 형광 강도를 수치화했다. 수치화된 형광 강도를 밑이 2인 대수값으로 변환해서 유전자 발현량으로 하고, 블랭크값의 감산을 행하고, 결손값은 각 DNA칩에 있어서의 유전자 발현량의 최소값의 대수값으로부터 0.1을 감산한 값으로 치환했다. 그 결과, 대장암 환자 50명의 혈청 및 건상체 150명의 혈청에 대한 망라적인 miRNA의 유전자 발현량을 얻었다. 수치화된 miRNA의 유전자 발현량을 사용한 계산 및 통계 해석은 R언어 3.0.2(R Development Core Team(2013). R:A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing, URL http://WWW.R-project.org/) 및 MASS패키지 7.3-30(Venables, W.N. & Ripley, B.D.(2002) Modern Applied Statistics With S. Fourth Edition. Springer, NeW York. ISBN 0-387-95457-0)을 사용해서 실시했다.
[참고예2]
<대장암 이외의 암의 검체의 채취>
인폼드 컨센트를 얻은 다른 장기에 암이 확인되고 있지 않은 췌장암 환자 69명, 담도암 환자 66명, 위암 환자 30명, 식도암 환자 33명, 간암 환자 32명, 및 췌담도 양성 질환 환자 15명으로부터 베노젝트 II 진공 채혈관 VP-AS109K60(TERUMO CORPORATION)을 이용하여 각각 혈청을 채취하고, 참고예 1의 대장암 환자 34명과 건상체 103명 모두 학습 검체군으로 했다. 마찬가지로, 인폼드 컨센트를 얻은 다른 장기에 암이 확인되고 있지 않은 췌장암 환자 30명, 담도암 환자 33명, 위암 환자 20명, 식도암 환자 17명, 간암 환자 20명, 및 췌담도 양성 질환 환자 6명으로부터 베노젝트 II 진공 채혈관 VP-AS109K60(TERUMO CORPORATION)을 이용하여 각각 혈청을 채취하고, 참고예 1의 대장 이외의 장기에 암이 확인되고 있지 않은 대장암 환자 16명, 건상체 47명 모두 테스트 검체군으로 했다. 이후의 조작은 참고예 1과 마찬가지로 행했다.
[실시예 1]
<학습 검체군의 검체를 사용한 유전자 마커의 선정과 테스트 검체군의 검체를 사용한 단독의 유전자 마커의 대장암 판별 성능의 평가 방법>
본 실시예에서는 학습 검체군으로부터 대장암을 건상체로 판별하기 위한 유전자 마커를 선정하고, 학습 검체군과는 독립된 테스트 검체군의 검체에 있어서 선정한 유전자 마커에 대해서 각각 단독으로의 대장암 판별 성능을 평가하는 방법을 검토했다.
구체적으로는 우선 상기 참고예에서 얻은 학습 검체군과 테스트 검체군의 miRNA 발현량을 합쳐 quantile normalization으로 정규화했다.
이어서 학습 검체군을 이용하여 진단용 유전자의 선정을 행했다. 여기서, 보다 신뢰성이 높은 진단 마커를 획득하기 위해서 학습 검체군의 대장암 환자군 또는 학습 검체군의 건상체군 중 어느 하나에 있어서 50% 이상의 검체에서 2의 6승 이상의 유전자 발현량을 갖는 유전자만을 선택했다. 또한 대장암 환자군과 건상체군을 판별하기 위한 통계적 유의성이 있는 유전자로서 각각의 유전자 발현량에 대해서 등분산을 가정한 양측 t검정에서 얻어진 P값을 본페로니 보정하고, p＜0.01을 만족하는 유전자를 판별식의 설명 변수에 사용하는 유전자 마커로서 획득하고, 표 2에 기재했다.
이렇게 해서 hsa-miR-6726-5p, hsa-miR-4257, hsa-miR-6787-5p, hsa-miR-6780b-5p, hsa-miR-3131, hsa-miR-7108-5p, hsa-miR-1343-3p, hsa-miR-1247-3p, hsa-miR-4651, hsa-miR-6757-5p, hsa-miR-3679-5p, hsa-miR-7641, hsa-miR-6746-5p, hsa-miR-8072, hsa-miR-6741-5p, hsa-miR-1908-5p, hsa-miR-6857-5p, hsa-miR-4746-3p, hsa-miR-744-5p, hsa-miR-4792, hsa-miR-564, hsa-miR-6791-5p, hsa-miR-6825-5p, hsa-miR-6826-5p, hsa-miR-4665-3p, hsa-miR-4467, hsa-miR-3188, hsa-miR-6125, hsa-miR-6756-5p, hsa-miR-1228-3p, hsa-miR-8063, hsa-miR-8069, hsa-miR-6875-5p, hsa-miR-3185, hsa-miR-4433b-3p, hsa-miR-6887-5p, hsa-miR-128-1-5p, hsa-miR-6724-5p, hsa-miR-1914-3p, hsa-miR-1225-5p, hsa-miR-4419b, hsa-miR-7110-5p, hsa-miR-187-5p, hsa-miR-3184-5p, hsa-miR-204-3p, hsa-miR-5572, hsa-miR-6729-5p, hsa-miR-615-5p, hsa-miR-6749-5p, hsa-miR-6515-3p, hsa-miR-3937, hsa-miR-6840-3p, hsa-miR-6893-5p, hsa-miR-4728-5p, hsa-miR-6717-5p, hsa-miR-7113-3p, hsa-miR-4665-5p, hsa-miR-642b-3p, hsa-miR-7109-5p, hsa-miR-6842-5p, hsa-miR-4442, hsa-miR-4433-3p, hsa-miR-4707-5p, hsa-miR-6126, hsa-miR-4449, hsa-miR-4706, hsa-miR-1913, hsa-miR-602, hsa-miR-939-5p, hsa-miR-4695-5p, hsa-miR-711, hsa-miR-6816-5p, hsa-miR-4632-5p, hsa-miR-6721-5p, hsa-miR-7847-3p, hsa-miR-6132, hsa-miR-887-3p, hsa-miR-3679-3p, hsa-miR-6784-5p, hsa-miR-1249, hsa-miR-937-5p, hsa-miR-5195-3p, hsa-miR-6732-5p, hsa-miR-4417, hsa-miR-4281, hsa-miR-4734, hsa-miR-6766-3p, hsa-miR-663a, hsa-miR-4513, hsa-miR-6781-5p, hsa-miR-1227-5p, hsa-miR-6845-5p, hsa-miR-6798-5p, hsa-miR-3620-5p, hsa-miR-1915-5p, hsa-miR-4294, hsa-miR-642a-3p, hsa-miR-371a-5p, hsa-miR-940, hsa-miR-4450, hsa-miR-4723-5p, hsa-miR-1469, hsa-miR-6861-5p, hsa-miR-7975, hsa-miR-6879-5p, hsa-miR-6802-5p, hsa-miR-1268b, hsa-miR-663b, hsa-miR-125a-3p, hsa-miR-2861, hsa-miR-6088, hsa-miR-4758-5p, hsa-miR-296-3p, hsa-miR-6738-5p, hsa-miR-671-5p, hsa-miR-4454, hsa-miR-4516, hsa-miR-7845-5p, hsa-miR-4741, hsa-miR-92b-5p, hsa-miR-6795-5p, hsa-miR-6805-3p, hsa-miR-4725-3p, hsa-miR-6782-5p, hsa-miR-4688, hsa-miR-6850-5p, hsa-miR-6777-5p, hsa-miR-6785-5p, hsa-miR-7106-5p, hsa-miR-3663-3p, hsa-miR-6131, hsa-miR-1915-3p, hsa-miR-4532, hsa-miR-6820-5p, hsa-miR-4689, hsa-miR-4638-5p, hsa-miR-3656, hsa-miR-3621, hsa-miR-6769b-5p, hsa-miR-149-3p, hsa-miR-23b-3p, hsa-miR-3135b, hsa-miR-6848-5p, hsa-miR-6769a-5p, hsa-miR-4327, hsa-miR-6765-3p, hsa-miR-6716-5p, hsa-miR-6877-5p, hsa-miR-6727-5p, hsa-miR-4534, hsa-miR-614, hsa-miR-1202, hsa-miR-575, hsa-miR-6870-5p, hsa-miR-6722-3p, hsa-miR-7977, hsa-miR-4649-5p, hsa-miR-4675, hsa-miR-6075, hsa-miR-6779-5p, hsa-miR-4271, hsa-miR-3196, hsa-miR-6803-5p, hsa-miR-6789-5p, hsa-miR-4648, hsa-miR-4508, hsa-miR-4749-5p, hsa-miR-4505, hsa-miR-5698, hsa-miR-1199-5p 및 hsa-miR-4763-3p, hsa-miR-1231, hsa-miR-1233-5p, hsa-miR-150-3p, hsa-miR-1225-3p, hsa-miR-92a-2-5p, hsa-miR-423-5p, hsa-miR-1268a, hsa-miR-128-2-5p 및 hsa-miR-24-3p 유전자가 이들에 관련되는 서열번호 1~180의 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 발견했다.
이 중 대장암의 유무를 검사하는 마커로서 신규로 발견된 유전자는 서열번호 1~171로 나타내어지는 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드이다.
또한, 이들의 유전자의 발현량을 지표로서 피셔의 판별 분석에 의해 대장암의 유무를 판별하는 판별식을 작성했다. 즉, 학습 검체군에 있어서 발견된 서열번호 1~180 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 식 2에 입력해서 판별식을 작성하고, 산출한 정밀도·감도·특이도를 표 3에 나타냈다. 또한, 그 때의 판별식 계수와 정수항을 표 4에 나타냈다.
상기에서 작성한 판별식을 이용하여 테스트 검체군에 있어서의 정밀도·감도·특이도를 산출하고, 선정된 폴리뉴클레오티드의 판별 성능을 독립된 검체에서 검증했다(표 3). 예를 들면 서열번호 1로 나타내어지는 염기 서열의 발현량 측정값을 학습 검체군의 건상체(100명)와 대장암 환자(34명)에서 비교한 경우, 건상체군에 대하여 대장암 환자군의 유전자 발현량의 측정값이 유의하게 낮은 것이 나타내어지고(도 2 좌측 참조), 또한, 이 결과는 테스트 검체군의 건상체(50명)와 대장암 환자(16명)에서도 재현할 수 있었다(도 2 우측 참조). 마찬가지로 서열번호 2~180으로 나타내어지는 다른 폴리뉴클레오티드에 있어서도 건상체군에 대하여 대장암 환자군의 유전자 발현량의 측정값이 유의하게 낮은(-) 또는 높은(+) 결과(표 2)가 얻어지고, 이들의 결과는 테스트 검체군에서 검증할 수 있었다. 또한, 예를 들면 이 서열번호 1로 나타내어지는 염기 서열에 관한 것이며, 학습 검체군에서 설정한 양쪽 군을 판별하는 역치(9.43)를 사용해서 테스트 검체군에 있어서의 대장암 검출의 적중률을 산출한 결과, 진양성 16례, 진음성 50례, 위양성 0례, 위음성 0례이며, 이들의 값으로부터 검출 성능으로서 정밀도 100%, 감도 100%, 특이도 100%가 얻어졌다. 이렇게 해서, 서열번호 1~180으로 나타내어지는 모든 폴리뉴클레오티드의 검출 성능을 산출하고, 표 3에 기재했다.
예를 들면 서열번호 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 49, 50, 51, 52, 53, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 65, 66, 67, 68, 69, 71, 72, 73, 74, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 83, 84, 86, 87, 88, 90, 92, 93, 95, 96, 97, 99, 100, 101, 102, 107, 109, 110, 111, 113, 114, 115, 118, 120, 122, 124, 126, 134, 136, 142, 153, 172, 173 및 175로 나타내어지는 염기 서열로 이루어지는 110개의 폴리뉴클레오티드는, 테스트 검체군에 있어서 각각 감도 100%, 100%, 100%, 75%, 93.8%, 75%, 87.5%, 75%, 93.8%, 68.8%, 81.2%, 100%, 75%, 50%, 75%, 75%, 68.8%, 75%, 81.2%, 81.2%, 75%, 62.5%, 75%, 56.2%, 75%, 68.8%, 56.2%, 62.5%, 68.8%, 75%, 68.8%, 68.8%, 56.2%, 68.8%, 62.5%, 68.8%, 62.5%, 50%, 56.2%, 56.2%, 56.2%, 75%, 50%, 68.8%, 68.8%, 68.8%, 50%, 56.2%, 62.5%, 62.5%, 50%, 62.5%, 68.8%, 56.2%, 56.2%, 43.8%, 75%, 62.5%, 62.5%, 56.2%, 62.5%, 62.5%, 56.2%, 62.5%, 56.2%, 56.2%, 56.2%, 56.2%, 43.8%, 43.8%, 50%, 68.8%, 56.2%, 62.5%, 62.5%, 43.8%, 62.5%, 56.2%, 62.5%, 62.5%, 50%, 56.2%, 43.8%, 50%, 43.8%, 50%, 43.8%, 56.2%, 43.8%, 50%, 50%, 50%, 50%, 50%, 50%, 43.8%, 50%, 43.8%, 50%, 50%, 50%, 43.8%, 43.8%, 50%, 43.8%, 43.8%, 50%, 81.2%, 68.8% 및 56.2%를 나타냈다(표 3). 여기서, 후술의 비교예로부터 테스트 검체군에 있어서의 기존 마커 CEA의 감도는 43.75%이었던 점에서(표 5-1, 5-2), 테스트 검체군에 있어서 서열번호 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 49, 50, 51, 52, 53, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 65, 66, 67, 68, 69, 71, 72, 73, 74, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 83, 84, 86, 87, 88, 90, 92, 93, 95, 96, 97, 99, 100, 101, 102, 107, 109, 110, 111, 113, 114, 115, 118, 120, 122, 124, 126, 134, 136, 142, 153, 172, 173 및 175로 나타내어지는 염기 서열로 이루어지는 110개의 폴리뉴클레오티드는 단독으로 CEA를 상회하는 감도로 대장암을 판별하는 것을 증명할 수 있었다.
또한, 예를 들면 서열번호 1, 2, 3, 10, 14, 17, 21, 23, 32, 36, 47, 59, 65, 101로 나타내어지는 염기 서열로로 이루어지는 14개의 폴리뉴클레오티드는 테스트 검체군에 포함되어 있었던 스테이지 1의 대장암 3검체를 모두 올바르게 대장암으로 판별할 수 있었다 따라서 이들의 폴리뉴클레오티드는 조기의 대장암도 검출할 수 있어 대장암의 조기 진단에 공헌한다.
또한, 예를 들면 서열번호 1, 2, 3, 5, 7, 10, 14, 39, 46, 73, 81, 148로 나타내어지는 염기 서열로 이루어지는 12개의 폴리뉴클레오티드는 변 잠혈 검사에서는 검출하기 어렵다고 여겨지는 대장 상부의 암, 즉 테스트 검체군에 있어서의 맹장암 1례나 상행결장암 3례를 모두 올바르게 대장암으로 판별할 수 있었다. 따라서 이들의 폴리뉴클레오티드는 대장암이 발생된 부위에 한정되지 않고 대장암을 검출할 수 있다.
[실시예 2]
<테스트 검체군 검체를 사용한 복수의 유전자 마커의 조합에 의한 대장암 판별 성능의 평가 방법>
본 실시예에서는 실시예 1에서 선정된 유전자 마커를 조합하여 대장암 판별 성능을 평가하는 방법을 검토했다. 구체적으로는 실시예 1에 있어서 선택된 서열번호 1~180으로 나타내어지는 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드 중 신규로 발견된 서열번호 1~171로 나타내어지는 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드 중 어느 하나의 발현량 측정값을 적어도 1개 이상 포함하는 2개의 폴리뉴클레오티드의 조합 16,074종류에 대해 피셔의 판별 분석을 행하고, 대장암의 존재의 유무를 판별하는 판별식을 구축했다. 이어서, 상기에서 작성한 판별식을 이용하여 테스트 검체군에 있어서의 정밀도·감도·특이도를 산출하고, 선정된 폴리뉴클레오티드의 판별 성능을 독립된 검체에서 검증했다.
예를 들면, 서열번호 1과 서열번호 2로 나타내어지는 염기 서열의 발현량 측정값을 학습 검체군의 건상체(100명)와 대장암 환자(34명)에서 비교한 경우, 건상체군과 대장암 환자군의 유전자 발현량의 측정값이 유의하게 분리되는 산포도가 얻어지고(도 3 좌측 참조), 또한 이 결과는 테스트 검체군의 건상체(50명)와 대장암 환자(16명)에서도 재현할 수 있었다(도 3 우측 참조). 마찬가지로, 서열번호 1~180으로 나타내어지는 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드 중 신규로 발견된 서열번호 1~171로 나타내어지는 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드 중 어느 하나의 발현량 측정값을 적어도 1개 이상 포함하는 2개의 다른 조합에 있어서도 건상체군과 대장암 환자군의 유전자 발현량의 측정값을 유의하게 분리하는 산포도가 얻어지고, 이들의 결과는 테스트 검체군에서 검증을 할 수 있었다. 또한, 예를 들면 이 서열번호 1과 서열번호 2로 나타내어지는 염기 서열에 관한 것이며, 학습 검체군에서 설정한 양쪽 군을 판별하는 함수(0=1.26x＋y―18.06)를 사용해서 대장암 검출의 적중률을 산출한 결과, 진양성 16례, 진음성 50례, 위양성 0례, 위음성 0례이며, 이들의 값으로부터 검출 성능으로서 정밀도 100%, 감도 100%, 특이도 100%가 얻어졌다. 이렇게 해서, 서열번호 1~180으로 나타내어지는 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드 중 신규로 발견된 서열번호 1~171로 나타내어지는 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드 중 어느 하나의 발현량 측정값을 적어도 1개 이상 포함하는 2개의 조합 전체 종류의 검출 성능을 산출했다. 이 중 예로서 서열번호 1로 나타내어지는 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 발현량 측정값을 포함하는 조합 179종류와 그 검출 성능에 대해서 표 6에 기재했다. 예를 들면, 서열번호 1과 서열번호 2, 서열번호 1과 서열번호 3, 서열번호 1과 서열번호 4, 및 서열번호 1과 서열번호 5로 나타내어지는 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 발현량 측정값의 조합에 대해서는 모두 테스트 검체군에 있어서 감도 100%를 나타냈다(표 6). 또한, 예로서 서열번호 1 이외의 염기 서열로 이루어지는 2개의 폴리뉴클레오티드의 조합을 표 7에 기재했다. 예를 들면, 구체적인 2개의 폴리뉴클레오티드의 조합으로서 서열번호 5와 6, 서열번호 5와 11, 서열번호 5와 38, 서열번호 15와 16, 서열번호 15와 21, 서열번호 15와 64, 서열번호 24와 25, 서열번호 24와 30, 서열번호 24와 32, 서열번호 2와 32, 서열번호 32와 36, 서열번호 15와 32, 서열번호 3과 38, 서열번호 38과 39, 서열번호 38과 64, 서열번호 3과 45, 서열번호 45와 58, 서열번호 45와 64, 서열번호 2와 55, 서열번호 6과 55, 서열번호 55와 64, 서열번호 2와 64, 서열번호 4와 64, 서열번호 2와 96, 서열번호 과 96, 서열번호 96과 97, 서열번호 2와 97, 서열번호 3과 97, 서열번호 5와 97, 서열번호 2와 162, 서열번호 3과 162, 서열번호 5와 162로 나타내어지는 조합은 학습 검체군 및 검증 검체군의 양 검체군에 있어서 대장암 환자와 건상체를 판별하는 정밀도 75% 이상을 나타냈다. 이렇게 기존 마커인 CEA의 감도(표 5-2로부터 43.8%)를 상회하는 2개의 폴리뉴클레오티드의 발현량 측정값의 조합은 테스트 검체군에서 14,598종류 얻어지고, 이 조합에는 실시예 1에서 얻어진 표 2에 기재된 염기 서열 1~180의 전부가 적어도 1회는 사용되었다. 즉, 서열번호 1~180으로 나타내어지는 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드는 2개 조합하여 사용한 경우도 기존 마커보다 우수한 성능으로 대장암의 판별을 가능하게 하는 것을 증명할 수 있었다.
서열번호 1~180으로 나타내어지는 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 발현량 측정값을 3개, 4개, 5개, 6개, 7개, 8개, 9개, 10개 또는 그 이상의 개수를 조합함으로써 더 우수한 감도로 대장암을 검출하는 마커가 얻어진다. 예를 들면, 실시예 1에서 선택된 서열번호 1~180으로 나타내어지는 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드 중 신규로 발견된 서열번호 1~171로 나타내어지는 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드에 대하여 테스트 검체군에 있어서의 건상체군과 대장암군 사이에서 측정된 발현량 값을 얻고, 군 간의 차의 통계적 유의성을 나타내는 Student's의 t-test에 의한 P값의 내림차순으로 전체 폴리뉴클레오티드를 순위 부여하고(P값이 가장 낮은 것이 1위가 된다), 상위의 폴리뉴클레오티드로부터 1개씩 조합에 추가함으로써 1개로부터 복수개의 폴리뉴클레오티드의 조합의 대장암 검출 감도를 평가했다. 즉, 이 평가에 있어서의 폴리뉴클레오티드의 조합의 순서는 서열번호로 나타내면 표 2에 나타내는 서열번호 171로부터 170, 169로 거슬러 올라간 순이 된다. 그 결과, 테스트 검체군에 있어서의 감도는 1개의 폴리뉴클레오티드(서열번호 171)에서 12.5%, 2개의 폴리뉴클레오티드(서열번호 170 및 171)에서 18.8%, 4개의 폴리뉴클레오티드(서열번호 168~171)에서 25.0%, 5개의 폴리뉴클레오티드(서열번호 167~171)에서 31.2%, 7개의 폴리뉴클레오티드(서열번호165~171)에서 37.5%, 10개의 폴리뉴클레오티드(서열번호 162~171)에서 87.5%, 20개의 폴리뉴클레오티드(서열번호 152~171)에서 100%, 30개의 폴리뉴클레오티드(서열번호 142~171)에서 100%, 80개의 폴리뉴클레오티드(서열번호 92~171)에서 100%, 170개의 폴리뉴클레오티드(서열번호 2~171)에서 100%, 171개의 폴리뉴클레오티드(서열번호 1~171)에서 100%이었다.
즉, 단독의 폴리뉴클레오티드, 또는 보다 소수의 폴리뉴클레오티드보다 복수의 폴리뉴클레오티드를 조합한 경우의 쪽이 높은 대장암 판별 성능을 얻는 것이 가능한 것이 나타내어졌다. 여기서, 복수의 폴리뉴클레오티드의 조합은 상기한 바와 같이 통계적 유의차의 순서로 조합하는 경우에 한하지 않고, 어떤 복수개의 폴리뉴클레오티드의 조합을 이용해도 대장암의 검출에 사용할 수 있다.
이들의 결과로부터 서열번호 1~180으로 나타내어지는 염기 서열로 이루어지는 모든 폴리뉴클레오티드는 우수한 대장암의 검출용 마커인 것으로 간주할 수 있다.
[표 2]
[표 3]
[표 4]
[표 5-1]
[표 5-2]
[표 6]
[표 7]
[실시예 3]
<전체 검체를 사용한 경우의 유전자 마커의 선정과 채취된 유전자 마커의 대장암 판별 성능의 평가 방법>
본 실시예에서는 상기 실시예 1 및 실시예 2에서 사용한 학습 검체군 및 테스트 검체군의 검체를 통합하고 전체 검체를 이용하여 유전자 마커의 선정, 및 그 대장암 판별 성능 평가를 행했다.
구체적으로는 상기 참고예에서 얻은 대장암 환자 50명의 혈청 및 건상체 150명의 혈청에 대한 miRNA 발현량에 대하여 quantile normalization으로 정규화했다. 보다 신뢰성이 높은 진단 마커를 획득하기 위해서 유전자 마커의 선정에서는 대장암 환자군 또는 건상체군 중 어느 하나에 있어서 50% 이상의 검체에서 2의 6승 이상의 유전자 발현량을 갖는 유전자만을 선택했다. 또한 대장암 환자군과 건상체군을 판별하기 위한 통계적 유의성을 얻기 위해서 각각의 유전자 발현량에 대해서 등분산을 가정한 양측 t검정에서 얻어진 P값을 본페로니 보정하고, p＜0.01을 만족하는 유전자를 판별식의 설명 변수에 사용하는 유전자 마커로서 선택하여 표 8에 기재했다. 이렇게 해서 표 2에 기재한 유전자에 추가하여 hsa-miR-4697-5p, hsa-miR-3197, hsa-miR-675-5p, hsa-miR-4486, hsa-miR-7107-5p, hsa-miR-23a-3p, hsa-miR-4667-5p, hsa-miR-451a, hsa-miR-3940-5p, hsa-miR-8059, hsa-miR-6813-5p, hsa-miR-4492, hsa-miR-4476 및 hsa-miR-6090 유전자, 이들에 관련되는 서열번호 181~194의 염기 서열을 발견했다. 서열번호 1~180의 염기 서열과 마찬가지로 서열번호 181~194로 나타내어지는 폴리뉴클레오티드에 있어서도 건상체군에 대하여 대장암 환자군의 유전자 측정값이 유의하게 낮은(-) 또는 높은(+) 결과(표 8)가 얻어지고, 이들의 결과는 테스트 검체군에서 검증을 할 수 있었다. 따라서, 표 8에 기재한 유전자 발현량의 측정값을 단독 또는 표 2에 기재된 유전자 발현량의 측정값과 조합하여 사용함으로써 실시예 1 및 실시예 2에 기재한 방법으로 신규로 얻은 검체를 판별할 수 있다.
[표 8]
[실시예 4]
<테스트 검체군 검체를 사용한 복수의 유전자 마커의 조합에 의한 대장암 특이적인 판별 성능의 평가 방법>
본 실시예에서는 실시예 1에서 선정된 유전자 마커를 사용해서 참고예 2에 기재한 검체군의 학습 검체군을 대상으로 하여 실시예 1에 기재된 방법과 동일한 방법으로 대장암 환자와 건강체, 췌장암 환자, 담도암 환자, 위암 환자, 식도암 환자, 간암 환자 및 췌담도 양성 질환 환자로 이루어지는 대조군의 혈청 중의 miRNA의 유전자 발현량의 비교를 행하여 진단용 유전자를 선택했다. 그 결과, 선택된 서열번호 606~614로 나타내어지는 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 더 조합하여 대장암 특이적인 판별 성능을 평가하는 방법을 검토했다.
구체적으로는 우선 상기 참고예 2에서 얻은 학습 검체군과 테스트 검체군의 miRNA 발현량을 합쳐 quantile normalization으로 정규화했다. 이어서, 서열번호 1~171, 606~614로 나타내어지는 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드 중 어느 하나의 발현량 측정값을 적어도 1개 이상 포함하는 1~6개의 조합에 대하여 피셔의 판별 분석을 행하고, 대장암의 존재의 유무를 판별하는 판별식을 구축했다. 이어서, 대장암 환자군을 양성 검체군, 반면에 건상체군, 췌장암 환자군, 담도암 환자군, 위암 환자군, 식도암 환자군, 간암 환자군 및 췌담도 양성 질환 환자군을 음성 검체군으로 해서 상기에서 작성한 판별식을 이용하여 테스트 검체군에 있어서의 정밀도·감도·특이도를 산출하고, 선정된 폴리뉴클레오티드의 판별 성능을 독립된 검체에서 검증했다.
상기 서열번호(표 1의 miRNA 마커에 대응하는 서열번호 1~194 및 606~614)로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드의 대부분이 대장암의 존재의 유무의 판별에 있어서 비교적 높은 정밀도, 감도, 특이도를 제공할 수 있고 또한 대장암을 그 외의 암으로부터 특이적으로 식별가능했다. 표적 마커와 특이적으로 결합가능한 폴리뉴클레오티드로서 예를 들면 서열번호 5, 13, 15, 24, 32, 38, 41, 45, 55, 57, 64, 72, 75, 77, 96, 97, 115, 162, 163, 173, 189, 606, 607, 608, 609, 610, 611, 612, 613 및 614로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드로 이루어지는 군(암종특이성 폴리뉴클레오티드군 1)으로부터 선택되는 복수개의 폴리뉴클레오티드의 조합 중 암종특이성 폴리뉴클레오티드군 1에 포함되는 서열번호 5, 45, 57, 96 및 606으로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드로 이루어지는 군(암종특이성 폴리뉴클레오티드군 2)으로부터 선택되는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 이상 포함하는 조합에 있어서 고정밀도로 대장암을 그 외의 암으로부터 특이적으로 식별가능했다.
상기 암종특이성이 있는 폴리뉴클레오티드의 조합의 개수로서는 1개, 2개, 3개, 4개, 5개, 6개, 7개, 8개, 9개, 10개 또는 그 이상의 개수를 조합이 가능하지만 6개 이상의 조합에 있어서 판별 정밀도 90% 이상을 나타낼 수 있었다.
구체적으로는 서열번호 5로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 이용하여 측정한 경우의 판별 정밀도를 표 9-1에 나타낸다. 서열번호 5로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 1개의 조합을 이용하여 측정한 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 90.1%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 87.6%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 5로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 2개의 조합을 이용하여 측정한 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 91.7%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 88.8%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 5로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 3개의 조합을 이용하여 측정한 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 94.0%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 91.2%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 5로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 4개의 조합을 이용하여 측정한 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 95.6%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 93.6%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 5로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 5개의 조합을 이용하여 측정한 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 96.4%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 94.8%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 5로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 6개의 조합을 이용하여 측정한 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 96.9%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 94.7%를 나타냈다.
또한 서열번호 45로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 이용하여 측정한 경우의 판별 정밀도를 표 9-2에 나타낸다. 서열번호 45로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 1개의 조합을 이용하여 측정한 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 56.7%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 55.4%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 45로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 2개의 조합을 이용하여 측정한 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 90.7%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 88.4%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 45로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 3개의 조합을 이용하여 측정한 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 94.0%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 89.6%를 나타냈다. 또한,예를 들면 서열번호 45로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 4개의 조합을 이용하여 측정한 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 95.2%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 91.6%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 45로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 5개의 조합을 이용하여 측정한 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 96.4%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 94.4%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 45로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 6개의 조합을 이용하여 측정한 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 97.6%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 92.6%를 나타냈다.
또한, 서열번호 57로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드을 이용하여 측정한 경우의 판별 정밀도를 표 9-3에 나타낸다. 서열번호 57로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 1개의 조합을 이용하여 측정한 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 60.2%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 60.6%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 57로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 2개의 조합을 이용하여 측정한 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 86.7%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 83.7%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 57로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 3개의 조합을 이용하여 측정한 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 92.4%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 90.0%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 57로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 4개의 조합을 이용하여 측정한 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 95.2%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 91.2%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 57로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 5개의 조합을 이용하여 측정한 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 96.2%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 94.8%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 57로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 6개의 조합을 이용하여 측정한 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 96.9%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 93.6%를 나타냈다.
또한, 서열번호 96으로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 이용하여 측정한 경우의 판별 정밀도를 표 9-4에 나타낸다. 서열번호 96으로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 1개의 조합을 이용하여 측정한 경우, 학습 검체군에 있어서 최고여서 정밀도 57.9%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 59.4%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 96으로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 2개의 조합을 이용하여 측정한 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 85.9%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 83.7%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 96으로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 3개의 조합을 이용하여 측정한 경우, 학습 검체군에 있어서 최고여서 정밀도 92.6%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 90.4%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 96으로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 4개의 조합을 이용하여 측정한 경우, 학습 검체군에 있어서 최고여서 정밀도 94.4%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 91.2%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 96으로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 5개의 조합을 이용하여 측정한 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 96.0%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 94.0%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 96로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 6개의 조합을 이용하여 측정한 경우, 학습 검체군에 있어서 최고여서 정밀도 96.3%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 93.6%를 나타냈다.
또한, 서열번호 606로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 이용하여 측정한 경우의 판별 정밀도를 표 9-5에 나타낸다. 서열번호 606으로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 1개의 조합을 이용하여 측정한 경우, 학습 검체군에 있어서 최고여서 정밀도 59.4%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 58.6%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 606으로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 2개의 조합을 이용하여 측정한 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 86.6%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 82.9%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 606으로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 3개의 조합을 이용하여 측정한 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 92.6%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 91.2%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 606으로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 4개의 조합을 이용하여 측정한 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 94.8%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 90.0%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 606으로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 5개의 조합을 이용하여 측정한 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 96.0%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 93.6%를 나타냈다. 또한, 예를 들면 서열번호 606으로 나타내어지는 염기 서열 또는 그 상보적 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드를 적어도 1개 포함하는 6개의 조합을 이용하여 측정한 경우, 학습 검체군에 있어서 최고로 정밀도 95.3%, 테스트 검체군에 있어서 정밀도 93.6%를 나타냈다.
또한, 서열번호 5, 45, 57, 75, 162, 607로 나타내어지는 염기 서열의 발현량 측정값을 이용하여 학습 검체군의 대장암 환자 34명, 건상체 103명, 췌장암 환자 69명, 담도암 환자 66명, 위암 환자 30명, 식도암 환자 33명, 간암 환자 32명,및 췌담도 양성 질환 환자 15명을 비교한 경우, 학습 검체군에서는 대장암 환자군과 그 외의 군의 판별 득점이 유의하게 분리되는 산포도가 얻어지고(도 4 상측 도면 참조), 또한 이 결과는 테스트 검체군에서도 재현을 할 수 있었다(도 4 하측 도면 참조).
[표 9-1]
[표 9-2]
[표 9-3]
[표 9-4]
[표 9-5]
[비교예 1]
<기존 혈중 종양 마커의 대장암 판별 성능>
상기 참고예에서 얻은 학습 검체군과 테스트 검체군에 대하여 기존의 종양 마커 CEA의 혈중 농도를 측정했다. 이들의 종양 마커는 원칙, 비특허문헌 4에 기재되는 기준값(CEA는 5ng/mL)보다 혈중 농도가 높으면 암의 의심이 있다고 여겨진다. 따라서, 각 검체마다 CEA의 혈중 농도가 기준값을 초과하고 있는지 아닌지를 확인하고, 그 결과가 대장암 환자를 암으로 판정하고 있는지 보고 정하여 학습 검체군 및 테스트 검체군에 있어서의 각 기존 마커의 감도를 산출했다. 이 결과를 표 5-1, 5-2에 나타냈다. CEA의 감도는 학습 검체군에 있어서 26.5%, 테스트 검체군에 있어서는 43.8%밖에 안 되어 대장암의 검출에는 유용하지 않은 것을 알 수 있었다(표 5-1, 5-2).
한편, 상기 실시예 1 및 실시예 2의 표 3 및 표 6에 나타낸 바와 같이 서열번호 1~180으로 나타내어지는 염기 서열로 되는 모든 폴리뉴클레오티드는 기존의 대장암 마커 이상의 감도를 나타내는 1개 또는 2개의 조합이 존재하고, 우수한 진단 마커라고 말할 수 있다.
이상의 실시예, 비교예에 나타내는 바와 같이 본 발명의 키트 등 및 방법에 의하면 기존의 종양 마커보다 대장암을 감도 좋게 검출할 수 있으므로 대장암을 조기에 발견하여 치료하는 것이 가능해지고, 그 결과, 생존율의 향상이나, 환자에게 부담이 적은 내시경 수술이라는 치료 선택지의 제공도 가능해진다.
본 발명에 의해 간이하고 또한 저렴한 방법으로 대장암을 효과적으로 검출할 수 있기 때문에 대장암의 조기 발견, 진단 및 치료가 가능해진다. 또한, 본 발명의 방법에 의해 환자 혈액을 이용하여 대장암을 저침습적으로 검출할 수 있기 때문에 대장암을 간편하고 또한 신속하게 검출하는 것이 가능해진다.
본 명세서에서 인용한 모든 간행물, 특허 및 특허출원을 그대로 참고로 하여 본 명세서에 있어서 도입하는 것으로 한다.
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National Cancer Center <120> Kit and method for detecting colon cancer <130> PH-6235-PCT <150> JP 2014-122686 <151> 2014-06-13 <150> JP 2015-070182 <151> 2015-03-30 <160> 635 <170> PatentIn version 3.5 <210> 1 <211> 21 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 1 cgggagcugg ggucugcagg u 21 <210> 2 <211> 18 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 2 ccagaggugg ggacugag 18 <210> 3 <211> 22 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 3 uggcgggggu agagcuggcu gc 22 <210> 4 <211> 23 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 4 uggggaaggc uuggcaggga aga 23 <210> 5 <211> 23 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 5 ucgaggacug guggaagggc cuu 23 <210> 6 <211> 21 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 6 guguggccgg caggcgggug g 21 <210> 7 <211> 22 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 7 cuccuggggc ccgcacucuc gc 22 <210> 8 <211> 24 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 8 ccccgggaac gucgagacug gagc 24 <210> 9 <211> 20 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 9 cggggugggu gaggucgggc 20 <210> 10 <211> 22 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 10 uagggauggg 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uccgccccgg cccccgcccc 80 <210> 212 <211> 93 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 212 gcuuguuggg gauuggguca ggccaguguu caagggcccc uccucuagua cucccuguuu 60 guguucugcc acugacugag cuucucccca cag 93 <210> 213 <211> 71 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 213 gugucugugc cggucccagg agaaccugca gaggcaucgg gucagcggug cuccugcggg 60 ccgacacuca c 71 <210> 214 <211> 98 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 214 uugggcaagg ugcggggcua gggcuaacag cagucuuacu gaagguuucc uggaaaccac 60 gcacaugcug uugccacuaa ccucaaccuu acucgguc 98 <210> 215 <211> 74 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 215 gcagcccggu gagcgcucgc uggccuggca gugcgucgga agaacagggc ggguggggcc 60 gcgcacaucu cugc 74 <210> 216 <211> 94 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 216 cgggcagcgg gugccaggca cggugucagc aggcaacaug gccgagaggc cggggccucc 60 gggcggcgcc guguccgcga ccgcguaccc ugac 94 <210> 217 <211> 67 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 217 ccagaccccu ggggcugggc aggcggaaag aggucugaac ugccucugcc uccuuggucu 60 ccggcag 67 <210> 218 <211> 66 <212> RNA <213> Homo 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gagaaugggg ggacagaugg agaggacaca ggcuggcacu gagguccccu ccacuuuccu 60 ccuag 65 <210> 232 <211> 82 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 232 ugagcuguug gauucggggc cguagcacug ucugagaggu uuacauuucu cacagugaac 60 cggucucuuu uucagcugcu uc 82 <210> 233 <211> 92 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 233 cgcugcgcuu cugggcccgc ggcgggcgug gggcugcccg ggccggucga ccagcgcgcc 60 guagcucccg aggcccgagc cgcgacccgc gg 92 <210> 234 <211> 80 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 234 cgugugagcc cgcccugugc ccggcccacu ucugcuuccu cuuagcgcag gagggguccc 60 gcacugggag gggcccucac 80 <210> 235 <211> 90 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 235 guggguacgg cccagugggg gggagaggga cacgcccugg gcucugccca gggugcagcc 60 ggacugacug agccccugug ccgcccccag 90 <210> 236 <211> 68 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 236 cucaggcuca guggugcaug cuuauagucc cagccacucu ggaggcugaa ggaagauggc 60 uugagccu 68 <210> 237 <211> 86 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 237 ggggcugggg guguggggag agagagugca cagccagcuc agggauuaaa gcucuuucuc 60 ucucucucuc ucccacuucc cugcag 86 <210> 238 <211> 109 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 238 ggucgggcuc accaugacac agugugagac cucgggcuac aacacaggac ccgggcgcug 60 cucugacccc ucgugucuug uguugcagcc ggagggacgc agguccgca 109 <210> 239 <211> 75 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 239 aagcaagacu gaggggccuc agaccgagcu uuuggaaaau agaaaagucu cgcucucugc 60 cccucagccu aacuu 75 <210> 240 <211> 110 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 240 ggcuacaguc uuucuucaug ugacucgugg acuucccuuu gucauccuau gccugagaau 60 auaugaagga ggcugggaag gcaaagggac guucaauugu caucacuggc 110 <210> 241 <211> 137 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 241 agccagacaa gagggucaug gggagucacu gucaacccag agcaggcacu gccccugcga 60 ccagccuggg gcaucgguug gggugcaggg gucugcuggu gaugcuuucc aucucuuugc 120 uuuguccuga uuguagc 137 <210> 242 <211> 65 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 242 gagggugggc gagggcggcu gagcggcucc aucccccggc cugcucaucc cccucgcccu 60 cucag 65 <210> 243 <211> 96 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 243 cucgggaggg gcgggagggg gguccccggu gcucggaucu cgagggugcu uauuguucgg 60 uccgagccug ggucucccuc uuccccccaa cccccc 96 <210> 244 <211> 69 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 244 ggcccucggg ccugggguug ggggagcucu guccugucuc acucauugcu ccuccccugc 60 cuggcccag 69 <210> 245 <211> 57 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 245 cauuggaggg uguggaagac aucugggcca acucugaucu cuucaucuac cccccag 57 <210> 246 <211> 106 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 246 agaagaaugc ccaaccagcc cucaguugcu acaguucccu guuguuucag cucgacaaca 60 acaggcggcu guagcaaugg ggggcuggau gggcaucuca augugc 106 <210> 247 <211> 71 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 247 ugaccacccc cgggcaaaga ccugcagauc cccuguuaga gacgggccca ggacuuugug 60 cggggugccc a 71 <210> 248 <211> 69 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 248 ccgggcaggc agguguaggg uggagcccac uguggcuccu gacucagccc ugcugccuuc 60 accugccag 69 <210> 249 <211> 67 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 249 gugggagggg agaggcagca agcacacagg gccugggacu agcaugcuga ccucccuccu 60 gccccag 67 <210> 250 <211> 73 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 250 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cacag 85 <210> 331 <211> 62 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 331 cuuccuggug gguggggagg agaagugccg uccucaugag ccccucucug ucccacccau 60 ag 62 <210> 332 <211> 89 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 332 gccggcgccc gagcucuggc uccgugucuu cacucccgug cuuguccgag gagggaggga 60 gggacggggg cugugcuggg gcagcugga 89 <210> 333 <211> 97 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 333 cucaggugcu cuggcugcuu ggguuccugg caugcugauu ugugacuuaa gauuaaaauc 60 acauugccag ggauuaccac gcaaccacga ccuuggc 97 <210> 334 <211> 68 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 334 ugcccaggcu ggagcgagug caguggugca gucaguccua gcucacugca gccucgaacu 60 ccugggcu 68 <210> 335 <211> 70 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 335 gucccugggg gcugggaugg gccauggugu gcucugaucc cccugugguc ucuuggcccc 60 caggaacucc 70 <210> 336 <211> 73 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 336 aggccaggug gguauggagg agcccucaua uggcaguugg cgagggccca gugagccccu 60 cucugcucuc cag 73 <210> 337 <211> 85 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 337 ggccugggua ggcuugcaug ggggacuggg aagagaccau gaacagguua guccagggag 60 uucucaucaa gccuuuacuc aguag 85 <210> 338 <211> 87 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 338 gugaggcggg gccaggaggg uguguggcgu gggugcugcg gggccgucag ggugccugcg 60 ggacgcucac cuggcuggcc cgcccag 87 <210> 339 <211> 80 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 339 gagaggccaa gaccuuggga auggggguaa gggccuucug agcccagguc cgaacucucc 60 auuccucugc agagcgcucu 80 <210> 340 <211> 64 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 340 aguucagggc cgaagggugg aagcugcugg ugcucaucuc agccucugcc cuuggccucc 60 ccag 64 <210> 341 <211> 65 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 341 gggugcucgg ggcaggcggc ugggagcggc ccucacauug auggcuccug ccaccuccuc 60 cgcag 65 <210> 342 <211> 60 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 342 ugugaaugac ccccuuccag agccaaaauc accagggaug gaggaggggu cuuggguacu 60 <210> 343 <211> 90 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 343 ucuaagaaac gcaguggucu cugaagccug caggggcagg ccagcccugc acugaacgcc 60 uguucuugcc agguggcaga agguugcugc 90 <210> 344 <211> 83 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 344 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<213> Homo sapiens <400> 358 aggacccagc ggggcugggc gcgcggagca gcgcugggug cagcgccugc gccggcagcu 60 gcaagggccg 70 <210> 359 <211> 61 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 359 ccugcgggga caggccaggg caucuaggcu gugcacagug acgccccucc ugcccccaca 60 g 61 <210> 360 <211> 73 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 360 ggaggcuggg cugggacgga cacccggccu ccacuuucug uggcagguac cuccuccaug 60 ucggcccgcc uug 73 <210> 361 <211> 72 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 361 cugugcaccu gggggagugc agugauugug gaaugcaaag ucccacaauc acuguacucc 60 ccaggugcac ag 72 <210> 362 <211> 119 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 362 agccugcgcc ggagccgggg ccugagcccg ggccgcgcag gccgugaacu cgucgagcug 60 cgcgugcggc cggugcucaa ccugccgggu ccuggccccg cgcucccgcg cgcccugga 119 <210> 363 <211> 92 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 363 ccugucccuc cugcccugcg ccugcccagc ccuccugcuc uggugacuga ggaccgccag 60 gcaggggcug gugcugggcg gggggcggcg gg 92 <210> 364 <211> 92 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 364 gucagugucu gggcggacag cugcaggaaa gggaagacca aggcuugcug ucuguccagu 60 cugccacccu acccugucug uucuugccac ag 92 <210> 365 <211> 82 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 365 gugaguggga ggccagggca cggcaggggg agcugcaggg cuaugggagg ggccccagcg 60 ucugagcccu guccucccgc ag 82 <210> 366 <211> 82 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 366 gugaguggga ggccagggca cggcaggggg agcugcaggg cuaugggagg ggccccagcg 60 ucugagcccu guccucccgc ag 82 <210> 367 <211> 84 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 367 cuccccaugg cccugucucc caacccuugu accagugcug ggcucagacc cugguacagg 60 ccugggggac agggaccugg ggac 84 <210> 368 <211> 75 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 368 ucaucccugg guggggauuu guugcauuac uuguguucua uauaaaguau ugcacuuguc 60 ccggccugug gaaga 75 <210> 369 <211> 94 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 369 auaaaggaag uuaggcugag gggcagagag cgagacuuuu cuauuuucca aaagcucggu 60 cugaggcccc ucagucuugc uuccuaaccc gcgc 94 <210> 370 <211> 52 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 370 uagccgggcg uggugguggg ggccuguggu cccagcuacu uuggaggcug ag 52 <210> 371 <211> 84 <212> RNA <213> 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uggccccucu ccccag 56 <210> 385 <211> 80 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 385 cugcagcgug cuucuccagg ccccgcgcgc ggacagacac acggacaagu cccgccaggg 60 gcugggcgcg cgccagccgg 80 <210> 386 <211> 70 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 386 aaaagccugu cccuaagucc cucccagccu uccagaguug gugccaggaa ggauuuaggg 60 acaggcuuug 70 <210> 387 <211> 60 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 387 cgcugggucc gcgcgcccug ggccgggcga uguccgcuug ggggagcgag gggcggggcg 60 <210> 388 <211> 24 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 388 ucgaggacug guggaagggc cuuu 24 <210> 389 <211> 16 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 389 ucgaggacug guggaa 16 <210> 390 <211> 23 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 390 cuccuggggc ccgcacucuc gcu 23 <210> 391 <211> 18 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 391 cuccuggggc ccgcacuc 18 <210> 392 <211> 22 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 392 ccgggaacgu cgagacugga gc 22 <210> 393 <211> 15 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 393 cgggaacguc gagac 15 <210> 394 <211> 23 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 394 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gguaagggcc u 21 <210> 551 <211> 15 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 551 cuucugagcc caggu 15 <210> 552 <211> 17 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 552 ugcaggggca ggccagc 17 <210> 553 <211> 17 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 553 ugcaggggca ggccagc 17 <210> 554 <211> 16 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 554 agcugcagug ggggag 16 <210> 555 <211> 15 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 555 gcugcagugg gggag 15 <210> 556 <211> 15 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 556 ucugggcgag gggug 15 <210> 557 <211> 15 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 557 ucugggcgag gggug 15 <210> 558 <211> 16 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 558 ugggggggaa gaaaag 16 <210> 559 <211> 16 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 559 ugggggggaa gaaaag 16 <210> 560 <211> 17 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 560 gcggggcggc aggggcc 17 <210> 561 <211> 15 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 561 gggggcgggg cggca 15 <210> 562 <211> 22 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 562 ugugggacug caaaugggag cu 22 <210> 563 <211> 22 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 563 ugugggacug caaaugggag cu 22 <210> 564 <211> 18 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 564 cagcggggcu gggcgcgc 18 <210> 565 <211> 15 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 565 cagcggggcu gggcg 15 <210> 566 <211> 24 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 566 cugcggggac aggccagggc aucu 24 <210> 567 <211> 20 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 567 cugcggggac aggccagggc 20 <210> 568 <211> 30 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 568 gcugggcugg gacggacacc cggccuccac 30 <210> 569 <211> 19 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 569 gaggcugggc ugggacgga 19 <210> 570 <211> 24 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 570 ugggggagug cagugauugu ggaa 24 <210> 571 <211> 19 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 571 ugggggagug cagugauug 19 <210> 572 <211> 24 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 572 aggcaggggc uggugcuggg cggg 24 <210> 573 <211> 15 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 573 gggcgggggg cggcg 15 <210> 574 <211> 19 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 574 agugggaggc cagggcacg 19 <210> 575 <211> 15 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 575 agggggagcu gcagg 15 <210> 576 <211> 24 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 576 cugguacagg ccugggggac aggg 24 <210> 577 <211> 18 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 577 cugguacagg ccuggggg 18 <210> 578 <211> 25 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 578 ggguggggau uuguugcauu acuug 25 <210> 579 <211> 20 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 579 ggguggggau uuguugcauu 20 <210> 580 <211> 30 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 580 ugaggggcag agagcgagac uuuucuauuu 30 <210> 581 <211> 15 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 581 ugaggggcag agagc 15 <210> 582 <211> 21 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 582 gccgggcgug gugguggggg c 21 <210> 583 <211> 15 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 583 uagccgggcg uggug 15 <210> 584 <211> 23 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 584 gggggccgau acacuguacg aga 23 <210> 585 <211> 20 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 585 gggggccgau acacuguacg 20 <210> 586 <211> 24 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 586 acuggcucag uucagcagga acag 24 <210> 587 <211> 15 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 587 uggcucaguu cagca 15 <210> 588 <211> 23 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 588 ggaggcgcag gcucggaaag gcg 23 <210> 589 <211> 15 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 589 gcaggcucgg aaagg 15 <210> 590 <211> 23 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 590 uggugcggag agggcccaca gug 23 <210> 591 <211> 15 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 591 gggucuggug cggag 15 <210> 592 <211> 19 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 592 gcugggcgag gcuggcauc 19 <210> 593 <211> 17 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 593 gcugggcgag gcuggca 17 <210> 594 <211> 27 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 594 aucacauugc cagggauuuc caaccga 27 <210> 595 <211> 15 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 595 aaucacauug ccagg 15 <210> 596 <211> 24 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 596 ugacugggga gcagaaggag aacc 24 <210> 597 <211> 15 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 597 gacuggggag cagaa 15 <210> 598 <211> 27 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 598 aaaccguuac cauuacugag uuuagua 27 <210> 599 <211> 15 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 599 gaaaccguua ccauu 15 <210> 600 <211> 19 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 600 guggguuggg gcgggcucu 19 <210> 601 <211> 19 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 601 guggguuggg gcgggcucu 19 <210> 602 <211> 17 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 602 aggggcuggg cgcgcgc 17 <210> 603 <211> 15 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 603 caggggcugg gcgcg 15 <210> 604 <211> 25 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 604 caggaaggau uuagggacag gcuuu 25 <210> 605 <211> 19 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 605 caggaaggau uuagggaca 19 <210> 606 <211> 21 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 606 augccucccc cggccccgca g 21 <210> 607 <211> 17 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 607 cgcgccgggc ccggguu 17 <210> 608 <211> 21 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 608 cuuccgcccc gccgggcguc g 21 <210> 609 <211> 17 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 609 ggggcgcggc cggaucg 17 <210> 610 <211> 25 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 610 agggaucgcg ggcggguggc ggccu 25 <210> 611 <211> 17 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 611 cuccgggacg gcugggc 17 <210> 612 <211> 19 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 612 aaggggcugg gggagcaca 19 <210> 613 <211> 22 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 613 ggggggugug gagccagggg gc 22 <210> 614 <211> 22 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 614 uauagggauu ggagccgugg cg 22 <210> 615 <211> 63 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 615 ggcuccgcag ggcccuggcg caggcaucca gacagcgggc gaaugccucc cccggccccg 60 cag 63 <210> 616 <211> 84 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 616 ccgcagccgc cgcgccgggc ccggguuggc cgcugacccc cgcggggccc ccggcggccg 60 gggcgggggc gggggcugcc ccgg 84 <210> 617 <211> 70 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 617 ggccgcggcg cgcaagaugg cggcgggccc gggcaccgcc ccuuccgccc cgccgggcgu 60 cgcacgaggc 70 <210> 618 <211> 84 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 618 gaggcugggc ggggcgcggc cggaucgguc gagagcgucc uggcugauga cggucucccg 60 ugcccacgcc ccaaacgcag ucuc 84 <210> 619 <211> 100 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 619 gugagcgggc gcggcaggga ucgcgggcgg guggcggccu agggcgcgga gggcggaccg 60 ggaauggcgc gccgugcgcc gccggcguaa cugcggcgcu 100 <210> 620 <211> 89 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 620 accuccggga cggcugggcg ccggcggccg ggagauccgc gcuuccugaa ucccggccgg 60 cccgcccggc gcccguccgc ccgcggguc 89 <210> 621 <211> 110 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 621 gucuaccagg ugugggccca gcuuuacaua guucaugcug aggccgggau uucaugcaga 60 aaacugguug caaaaggugc ugaaggggcu gggggagcac aagggagaag 110 <210> 622 <211> 71 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 622 auggaggggg guguggagcc agggggccca ggucuacagc uucuccccgc ucccugcccc 60 cauacuccca g 71 <210> 623 <211> 90 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 623 aggccucgcu guucucuaug gcuuuuuauu ccuaugugau ucuacugcuc acucauauag 60 ggauuggagc cguggcgcac ggcggggaca 90 <210> 624 <211> 17 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 624 ggggcggggg cgggggc 17 <210> 625 <211> 15 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 625 cgcgccgggc ccggg 15 <210> 626 <211> 15 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 626 ggcggcgggc ccggg 15 <210> 627 <211> 15 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 627 ggcggcgggc ccggg 15 <210> 628 <211> 24 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 628 gaucggucga gagcguccug gcug 24 <210> 629 <211> 15 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 629 gcugggcggg gcgcg 15 <210> 630 <211> 16 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 630 ggcgcggagg gcggac 16 <210> 631 <211> 15 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 631 ggcgcggagg gcgga 15 <210> 632 <211> 17 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 632 ccuccgggac ggcuggg 17 <210> 633 <211> 15 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 633 cuccgggacg gcugg 15 <210> 634 <211> 22 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 634 auauagggau uggagccgug gc 22 <210> 635 <211> 20 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 635 auauagggau uggagccgug 20

Claims (18)

  1. 대장암 마커인 miR-887-3p의 폴리뉴클레오티드와 특이적으로 결합가능한 핵산을 포함하는, 대장암의 검출용 키트.
  2. 제 1 항에 있어서,
    상기 핵산이 하기 (a)~(e)에 나타내는 폴리뉴클레오티드:
    (a) 서열번호 77로 나타내어지는 염기 서열 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편,
    (b) 서열번호 77로 나타내어지는 염기 서열 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 또는 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편,
    (c) 서열번호 77로 나타내어지는 염기 서열 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열에 상보적인 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편,
    (d) 서열번호 77로 나타내어지는 염기 서열 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열에 상보적인 염기 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 또는 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편, 및
    (e) 상기 (a)~(d) 중 어느 하나의 폴리뉴클레오티드 또는 그 단편과 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드로 이루어지는 군으로부터 선택되는 1개 이상의 폴리뉴클레오티드인, 키트.
  3. 제 1 항에 있어서,
    상기 키트가, 별도의 대장암 마커인 miR-4257, miR-6787-5p, miR-6780b-5p, miR-3131, miR-7108-5p, miR-1343-3p, miR-1247-3p, miR-4651, miR-6757-5p, miR-3679-5p, miR-7641, miR-6746-5p, miR-8072, miR-6741-5p, miR-1908-5p, miR-6857-5p, miR-4746-3p, miR-744-5p, miR-4792, miR-564, miR-6791-5p, miR-6825-5p, miR-6826-5p, miR-4665-3p, miR-4467, miR-3188, miR-6125, miR-6756-5p, miR-1228-3p, miR-8063, miR-8069, miR-6875-5p, miR-3185, miR-4433b-3p, miR-6887-5p, miR-128-1-5p, miR-6724-5p, miR-1914-3p, miR-1225-5p, miR-4419b, miR-7110-5p, miR-187-5p, miR-3184-5p, miR-204-3p, miR-5572, miR-6729-5p, miR-615-5p, miR-6749-5p, miR-6515-3p, miR-6840-3p, miR-6893-5p, miR-4728-5p, miR-6717-5p, miR-7113-3p, miR-4665-5p, miR-642b-3p, miR-7109-5p, miR-6842-5p, miR-4442, miR-4433-3p, miR-4707-5p, miR-6126, miR-4449, miR-4706, miR-1913, miR-602, miR-939-5p, miR-4695-5p, miR-711, miR-6816-5p, miR-4632-5p, miR-6721-5p, miR-7847-3p, miR-6132, miR-3679-3p, miR-6784-5p, miR-1249, miR-937-5p, miR-5195-3p, miR-6732-5p, miR-4417, miR-4281, miR-4734, miR-6766-3p, miR-663a, miR-4513, miR-6781-5p, miR-1227-5p, miR-6845-5p, miR-6798-5p, miR-3620-5p, miR-1915-5p, miR-4294, miR-642a-3p, miR-371a-5p, miR-940, miR-4450, miR-4723-5p, miR-1469, miR-6861-5p, miR-7975, miR-6879-5p, miR-6802-5p, miR-1268b, miR-663b, miR-125a-3p, miR-2861, miR-6088, miR-4758-5p, miR-296-3p, miR-6738-5p, miR-671-5p, miR-4454, miR-4516, miR-7845-5p, miR-4741, miR-92b-5p, miR-6795-5p, miR-6805-3p, miR-4725-3p, miR-6782-5p, miR-4688, miR-6850-5p, miR-6777-5p, miR-6785-5p, miR-7106-5p, miR-3663-3p, miR-6131, miR-1915-3p, miR-4532, miR-6820-5p, miR-4689, miR-4638-5p, miR-3656, miR-3621, miR-6769b-5p, miR-149-3p, miR-23b-3p, miR-6848-5p, miR-6769a-5p, miR-4327, miR-6765-3p, miR-6716-5p, miR-6877-5p, miR-6727-5p, miR-4534, miR-614, miR-1202, miR-575, miR-6870-5p, miR-6722-3p, miR-7977, miR-4649-5p, miR-4675, miR-6075, miR-6779-5p, miR-4271, miR-3196, miR-6803-5p, miR-6789-5p, miR-4648, miR-4508, miR-4749-5p, miR-4505, miR-5698, miR-1199-5p, miR-4763-3p, miR-6836-3p, miR-3195, miR-718, miR-3178, miR-638, miR-4497, miR-6085, miR-6752-5p, miR-135a-3p, miR-1231, miR-1233-5p, miR-150-3p, miR-1225-3p, miR-92a-2-5p, miR-423-5p, miR-1268a, miR-128-2-5p, miR-24-3p, miR-4697-5p, miR-3197, miR-675-5p, miR-4486, miR-7107-5p, miR-23a-3p, miR-4667-5p, miR-451a, miR-3940-5p, miR-8059, miR-6813-5p, miR-4492, miR-4476 및 miR-6090으로 이루어지는 군으로부터 선택되는 1개 이상의 폴리뉴클레오티드와 특이적으로 결합가능한 1개 이상의 핵산을 더 포함하는, 키트.
  4. 제 3 항에 있어서,
    상기 핵산이 하기 (f)~(j)에 나타내는 폴리뉴클레오티드:
    (f) 서열번호 2~50, 52~76, 78~141, 143~194, 및 606~614 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편,
    (g) 서열번호 2~50, 52~76, 78~141, 143~194, 및 606~614 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 또는 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편,
    (h) 서열번호 2~50, 52~76, 78~141, 143~194, 및 606~614 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열에 상보적인 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편,
    (i) 서열번호 2~50, 52~76, 78~141, 143~194, 및 606~614 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열에 상보적인 염기 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 또는 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편, 및
    (j) 상기 (f)~(i) 중 어느 하나의 폴리뉴클레오티드 또는 그 단편과 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드
    로 이루어지는 군으로부터 선택되는 1개 이상의 폴리뉴클레오티드인, 키트.
  5. 대장암 마커인 miR-887-3p의 폴리뉴클레오티드와 특이적으로 결합가능한 1개 이상의 핵산을 포함하는, 대장암의 검출용 디바이스.
  6. 제 5 항에 있어서,
    상기 핵산이 하기 (a)~(e)에 나타내는 폴리뉴클레오티드:
    (a) 서열번호 77로 나타내어지는 염기 서열 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편,
    (b) 서열번호 77로 나타내어지는 염기 서열 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 또는 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편,
    (c) 서열번호 77로 나타내어지는 염기 서열 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열에 상보적인 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편,
    (d) 서열번호 77로 나타내어지는 염기 서열 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열에 상보적인 염기 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 또는 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편, 및
    (e) 상기 (a)~(d) 중 어느 하나의 폴리뉴클레오티드 또는 그 단편과 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드로 이루어지는 군으로부터 선택되는 1개 이상의 폴리뉴클레오티드인, 디바이스.
  7. 상기 디바이스가, 별도의 대장암 마커인 miR-4257, miR-6787-5p, miR-6780b-5p, miR-3131, miR-7108-5p, miR-1343-3p, miR-1247-3p, miR-4651, miR-6757-5p, miR-3679-5p, miR-7641, miR-6746-5p, miR-8072, miR-6741-5p, miR-1908-5p, miR-6857-5p, miR-4746-3p, miR-744-5p, miR-4792, miR-564, miR-6791-5p, miR-6825-5p, miR-6826-5p, miR-4665-3p, miR-4467, miR-3188, miR-6125, miR-6756-5p, miR-1228-3p, miR-8063, miR-8069, miR-6875-5p, miR-3185, miR-4433b-3p, miR-6887-5p, miR-128-1-5p, miR-6724-5p, miR-1914-3p, miR-1225-5p, miR-4419b, miR-7110-5p, miR-187-5p, miR-3184-5p, miR-204-3p, miR-5572, miR-6729-5p, miR-615-5p, miR-6749-5p, miR-6515-3p, miR-6840-3p, miR-6893-5p, miR-4728-5p, miR-6717-5p, miR-7113-3p, miR-4665-5p, miR-642b-3p, miR-7109-5p, miR-6842-5p, miR-4442, miR-4433-3p, miR-4707-5p, miR-6126, miR-4449, miR-4706, miR-1913, miR-602, miR-939-5p, miR-4695-5p, miR-711, miR-6816-5p, miR-4632-5p, miR-6721-5p, miR-7847-3p, miR-6132, miR-3679-3p, miR-6784-5p, miR-1249, miR-937-5p, miR-5195-3p, miR-6732-5p, miR-4417, miR-4281, miR-4734, miR-6766-3p, miR-663a, miR-4513, miR-6781-5p, miR-1227-5p, miR-6845-5p, miR-6798-5p, miR-3620-5p, miR-1915-5p, miR-4294, miR-642a-3p, miR-371a-5p, miR-940, miR-4450, miR-4723-5p, miR-1469, miR-6861-5p, miR-7975, miR-6879-5p, miR-6802-5p, miR-1268b, miR-663b, miR-125a-3p, miR-2861, miR-6088, miR-4758-5p, miR-296-3p, miR-6738-5p, miR-671-5p, miR-4454, miR-4516, miR-7845-5p, miR-4741, miR-92b-5p, miR-6795-5p, miR-6805-3p, miR-4725-3p, miR-6782-5p, miR-4688, miR-6850-5p, miR-6777-5p, miR-6785-5p, miR-7106-5p, miR-3663-3p, miR-6131, miR-1915-3p, miR-4532, miR-6820-5p, miR-4689, miR-4638-5p, miR-3656, miR-3621, miR-6769b-5p, miR-149-3p, miR-23b-3p, miR-6848-5p, miR-6769a-5p, miR-4327, miR-6765-3p, miR-6716-5p, miR-6877-5p, miR-6727-5p, miR-4534, miR-614, miR-1202, miR-575, miR-6870-5p, miR-6722-3p, miR-7977, miR-4649-5p, miR-4675, miR-6075, miR-6779-5p, miR-4271, miR-3196, miR-6803-5p, miR-6789-5p, miR-4648, miR-4508, miR-4749-5p, miR-4505, miR-5698, miR-1199-5p, miR-4763-3p, miR-6836-3p, miR-3195, miR-718, miR-3178, miR-638, miR-4497, miR-6085, miR-6752-5p, miR-135a-3p, miR-1231, miR-1233-5p, miR-150-3p, miR-1225-3p, miR-92a-2-5p, miR-423-5p, miR-1268a, miR-128-2-5p, miR-24-3p, miR-4697-5p, miR-3197, miR-675-5p, miR-4486, miR-7107-5p, miR-23a-3p, miR-4667-5p, miR-451a, miR-3940-5p, miR-8059, miR-6813-5p, miR-4492, miR-4476 및 miR-6090으로 이루어지는 군으로부터 선택되는 1개 이상의 폴리뉴클레오티드와 특이적으로 결합가능한 1개 이상의 핵산을 더 포함하는, 디바이스.
  8. 제 7 항에 있어서,
    상기 핵산이 하기 (f)~(j)에 나타내는 폴리뉴클레오티드:
    (f) 서열번호 2~50, 52~76, 78~141, 143~194, 및 606~614 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편,
    (g) 서열번호 2~50, 52~76, 78~141, 143~194, 및 606~614 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 또는 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편,
    (h) 서열번호 2~50, 52~76, 78~141, 143~194, 및 606~614 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열에 상보적인 염기 서열로 이루어지는 폴리뉴클레오티드, 그 변이체, 그 유도체, 또는 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편,
    (i) 서열번호 2~50, 52~76, 78~141, 143~194, 및 606~614 중 어느 하나로 나타내어지는 염기 서열 또는 상기 염기 서열에 있어서 u가 t인 염기 서열에 상보적인 염기 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 또는 15 이상의 연속된 염기를 포함하는 그 단편, 및
    (j) 상기 (f)~(i) 중 어느 하나의 폴리뉴클레오티드 또는 그 단편과 스트린젠트한 조건에서 하이브리다이징하는 폴리뉴클레오티드
    로 이루어지는 군으로부터 선택되는 1개 이상의 폴리뉴클레오티드인, 디바이스.
  9. 제 5 항 내지 제 8 항 중 어느 한 항에 있어서,
    상기 디바이스가 하이브리다이제이션 기술에 의한 측정을 위한 디바이스인, 디바이스.
  10. 제 9 항에 있어서,
    상기 하이브리다이제이션 기술이 핵산 어레이 기술인, 디바이스.
  11. 제 1 항 내지 제 4 항 중 어느 한 항에 기재된 키트 또는 제 5 항 내지 제 8 항 중 어느 한 항에 기재된 디바이스를 사용하여 피험체의 검체에 있어서의 표적 핵산의 발현량을 측정하고, 그 측정된 발현량과, 마찬가지로 측정된 건상체의 대조 발현량을 비교하여 피험체에 있어서의 대장암의 검출을 위한 정보를 제공하는 방법.
  12. 제 11 항에 있어서,
    상기 피험체가 인간인, 방법.
  13. 제 11 항에 있어서,
    상기 검체가 혈액, 혈청 또는 혈장인, 방법.
  14. 제 1 항 내지 제 4 항 중 어느 한 항에 기재된 키트 또는 제 5 항 내지 제 8 항 중 어느 한 항에 기재된 디바이스를 사용하여 피험체의 검체에 있어서의 표적 유전자의 발현량을 측정하고, 대장암을 갖는 것이 기지인 피험체 유래의 검체의 유전자 발현량과 건상체 유래의 검체의 유전자 발현량을 교사 샘플로 하여 작성된, 또한 대장암과 건상을 구별적으로 판별하는 것이 가능한 판별식에 상기 피험체 유래의 검체 중의 표적 유전자의 발현량을 대입하고, 그것에 의해 대장암의 존재 또는 부존재를 평가하는 것을 포함하는, 피험체에 있어서의 대장암의 검출을 위한 정보를 제공하는 방법.
  15. 제 14 항에 있어서,
    상기 피험체가 인간인, 방법.
  16. 제 14 항에 있어서,
    상기 검체가 혈액, 혈청 또는 혈장인, 방법.
  17. 표적 유전자로서 miR-887-3p의 폴리뉴클레오티드를 사용하여, 피험체의 검체에 있어서의 표적 유전자의 발현량을 측정하고, 그 측정된 발현량과, 마찬가지로 측정된 건상체의 대조 발현량을 비교하여, 피험체에 있어서의 대장암의 검출을 위한 정보를 제공하는 방법.
  18. 제 17 항에 있어서,
    표적 유전자로서, miR-4257, miR-6787-5p, miR-6780b-5p, miR-3131, miR-7108-5p, miR-1343-3p, miR-1247-3p, miR-4651, miR-6757-5p, miR-3679-5p, miR-7641, miR-6746-5p, miR-8072, miR-6741-5p, miR-1908-5p, miR-6857-5p, miR-4746-3p, miR-744-5p, miR-4792, miR-564, miR-6791-5p, miR-6825-5p, miR-6826-5p, miR-4665-3p, miR-4467, miR-3188, miR-6125, miR-6756-5p, miR-1228-3p, miR-8063, miR-8069, miR-6875-5p, miR-3185, miR-4433b-3p, miR-6887-5p, miR-128-1-5p, miR-6724-5p, miR-1914-3p, miR-1225-5p, miR-4419b, miR-7110-5p, miR-187-5p, miR-3184-5p, miR-204-3p, miR-5572, miR-6729-5p, miR-615-5p, miR-6749-5p, miR-6515-3p, miR-6840-3p, miR-6893-5p, miR-4728-5p, miR-6717-5p, miR-7113-3p, miR-4665-5p, miR-642b-3p, miR-7109-5p, miR-6842-5p, miR-4442, miR-4433-3p, miR-4707-5p, miR-6126, miR-4449, miR-4706, miR-1913, miR-602, miR-939-5p, miR-4695-5p, miR-711, miR-6816-5p, miR-4632-5p, miR-6721-5p, miR-7847-3p, miR-6132, miR-3679-3p, miR-6784-5p, miR-1249, miR-937-5p, miR-5195-3p, miR-6732-5p, miR-4417, miR-4281, miR-4734, miR-6766-3p, miR-663a, miR-4513, miR-6781-5p, miR-1227-5p, miR-6845-5p, miR-6798-5p, miR-3620-5p, miR-1915-5p, miR-4294, miR-642a-3p, miR-371a-5p, miR-940, miR-4450, miR-4723-5p, miR-1469, miR-6861-5p, miR-7975, miR-6879-5p, miR-6802-5p, miR-1268b, miR-663b, miR-125a-3p, miR-2861, miR-6088, miR-4758-5p, miR-296-3p, miR-6738-5p, miR-671-5p, miR-4454, miR-4516, miR-7845-5p, miR-4741, miR-92b-5p, miR-6795-5p, miR-6805-3p, miR-4725-3p, miR-6782-5p, miR-4688, miR-6850-5p, miR-6777-5p, miR-6785-5p, miR-7106-5p, miR-3663-3p, miR-6131, miR-1915-3p, miR-4532, miR-6820-5p, miR-4689, miR-4638-5p, miR-3656, miR-3621, miR-6769b-5p, miR-149-3p, miR-23b-3p, miR-6848-5p, miR-6769a-5p, miR-4327, miR-6765-3p, miR-6716-5p, miR-6877-5p, miR-6727-5p, miR-4534, miR-614, miR-1202, miR-575, miR-6870-5p, miR-6722-3p, miR-7977, miR-4649-5p, miR-4675, miR-6075, miR-6779-5p, miR-4271, miR-3196, miR-6803-5p, miR-6789-5p, miR-4648, miR-4508, miR-4749-5p, miR-4505, miR-5698, miR-1199-5p, miR-4763-3p, miR-6836-3p, miR-3195, miR-718, miR-3178, miR-638, miR-4497, miR-6085, miR-6752-5p, miR-135a-3p, miR-1233-5p, miR-150-3p, miR-1225-3p, miR-92a-2-5p, miR-423-5p, miR-1268a, miR-128-2-5p, miR-24-3p, miR-4697-5p, miR-3197, miR-675-5p, miR-4486, miR-7107-5p, miR-23a-3p, miR-4667-5p, miR-451a, miR-3940-5p, miR-8059, miR-6813-5p, miR-4492, miR-4476 및 miR-6090으로 이루어지는 군으로부터 선택되는 적어도 1개의 폴리뉴클레오티드를 더 사용하는, 대장암의 검출을 위한 정보를 제공하는 방법.
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