KR20240008422A - 잔류물 최적화를 이용한 최적화된 펩티드 백신의 조성 및 방법 - Google Patents
잔류물 최적화를 이용한 최적화된 펩티드 백신의 조성 및 방법 Download PDFInfo
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Abstract
본원에 기술된 면역원성 조성물로서 SEQ ID NO: 19 내지 50으로 구성된 군에서 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화한다. 또한 본원에 기술된 면역원성 조성물로서 SEQ ID NO: 141 내지 272로 구성된 군에서 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화한다. 또한 본원에 기술된 면역원성 조성물로서 SEQ ID NO: 273 내지 322로 구성된 군에서 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화한다. 또한 본원에 기술된 면역원성 조성물로서 SEQ ID NO: 354 내지 458로 구성된 군에서 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화한다.
Description
본 출원은 35 U.S.C. § 119(e) 내지 미국 일련 번호: 17/243,096(출원일: 2021년 4월 28일)에 따라 혜택 및 우선권을 주장하며, 그 내용은 전체가 참조에 의해 본원에 원용된다.
본 특허 개시 내용에는 저작권 보호 대상 자료가 포함되어 있다. 저작권 소유자는 특허 문서의 팩시밀리 복제나 미국 특허청 특허 파일 또는 기록에 표시된 특허 공개에 대해 이의를 제기할 수 없으며, 그 외에는 모든 저작권 권리를 보유한다.
참조에 의한 통합
본원에 인용된 모든 특허, 특허 출원 및 출판물은 전체가 참조에 의해 본원에 원용된다. 이러한 출판물의 전체 개시 내용은 참조에 의해 이 본원에 원용된다.
서열 목록
서열 목록은 하나의 컴팩트 디스크(사본 1)에 두 개의 사본(사본 2 및 3)과 함께 제출되며(각 생성 날짜 2021년 4월 26일) 각각 "2215269_00125US1_SL.txt"라는 ASCII 형식의 229,374,097바이트 파일을 포함한다. 각 컴팩트 디스크는 매킨토시 시스템 형식으로 준비되었으며 매킨토시 운영 체제와 호환된다. 컴팩트 디스크에 포함된 자료는 특히 참조에 의해 이 본원에 원용된다.
기술 분야
본 발명은 일반적으로 펩티드 백신의 조성, 시스템 및 방법에 관한 것이다. 보다 구체적으로 본 발명은 예측한 모집단의 면역원성에 기초하여 최적화된 질병을 치료 또는 예방하기 위한 펩티드 백신을 설계하는 조성, 시스템 및 방법에 관한 것이다.
배경
펩티드 백신의 목표는 표적 펩티드를 나타내는 세포를 인식하고 관여하는 능력을 확장하도록 면역 체계를 훈련시켜 암세포나 병원체에 대한 면역 반응을 개선하는 것이다. 펩티드 백신은 또한 이미 질병에 걸린 사람에게 투여하여 원인 암, 기타 질병 또는 병원체에 대한 면역 반응을 높일 수도 있다. 또한 펩티드 백신은 면역계가 하나 이상의 펩티에 대한 치료적 내성을 갖도록 유도하기 위해 투여할 수 있다. 암, 기타 질병 또는 병원체 감염으로부터 숙주를 보호하기 위해 표시될 표적 펩티드의 예측에 기초한 펩티드 백신의 조성물, 시스템 및 방법이 필요하다.
발명의 요약
한 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 1 내지 474로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 제공한다.
일부 실시예에서, 핵산 서열은 SEQ ID NO: 1 내지 474로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 1 내지 474로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 대상체에 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 1 내지 474로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 생체내 발현을 위한 구조체 내에서 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이고, 여기서 단백질은 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 이루어진 군으로부터 선택된 돌연변이를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 췌장암, 피부암, 갑상선암, 뇌암, 결장직장암, 기관지 및 폐암, 유방암, 및 난소암로 구성된 군으로부터 선택된다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 1 내지 474로 구성된 군으로부터 선택된 3개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 1 내지 474로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 1 내지 474로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 1 내지 18로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 AKT1 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 1 내지 18로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 1 내지 18로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 1 내지 18로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 AKT1 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 19 내지 50로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 BRAF 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 19 내지 50로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 19 내지 50로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 19 내지 50로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 BRAF 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 51 내지 98로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 EGFR 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 51 내지 98로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 51 내지 98로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 51 내지 98로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 EGFR 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 99 내지 118로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 GTF2I 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 99 내지 118로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 99 내지 118로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 99 내지 118로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 GTF2I 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 119 내지 140로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 IDH1 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 119 내지 140로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 119 내지 140로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 119 내지 140로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 IDH1 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 141 내지 229로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 KRAS 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 141 내지 229로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 141 내지 229로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 141 내지 229로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 KRAS 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 230 내지 272로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 NRAS 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 230 내지 272로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 230 내지 272로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 230 내지 272로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 NRAS 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 273 내지 322로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 PIK3CA 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 273 내지 322로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 273 내지 322로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 273 내지 322로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 PIK3CA 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 323 내지 353로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 PTEN 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 323 내지 353로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 323 내지 353로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 323 내지 353로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 PTEN 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 354 내지 458로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TP53 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 354 내지 458로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 354 내지 458로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 354 내지 458로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 TP53 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 141 내지 272로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 RAS 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 141 내지 272로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 141 내지 272로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 141 내지 272로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 RAS 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 19 내지 33로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 BRAF V600E 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 19 내지 33로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 19 내지 33로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 19 내지 33로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 BRAF V600E 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 34 내지 50로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 BRAF V600M 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 34 내지 50로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 34 내지 50로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 34 내지 50로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 BRAF V600M 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 51 내지 66로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 EGFR A289V 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 51 내지 66로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 51 내지 66로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 51 내지 66로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 EGFR A289V 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 67 내지 81로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 EGFR G598V 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 67 내지 81로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 67 내지 81로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 67 내지 81로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 EGFR G598V 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 82 내지 98로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 EGFR L858R 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 82 내지 98로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 82 내지 98로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 82 내지 98로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 EGFR L858R 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 125 내지 140로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 IDH1 R132H 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 125 내지 140로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 125 내지 140로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 125 내지 140로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 IDH1 R132H 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 119 내지 124로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 IDH1 R132C 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 119 내지 124로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 119 내지 124로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 119 내지 124로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 IDH1 R132C 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 167 내지 178로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 KRAS G12D 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 167 내지 178로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 167 내지 178로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 167 내지 178로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 KRAS G12D 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 203 내지 213로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 KRAS G12V 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 203 내지 213로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 203 내지 213로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 203 내지 213로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 KRAS G12V 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 179 내지 191로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 KRAS G12R 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 179 내지 191로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 179 내지 191로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 179 내지 191로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 KRAS G12R 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 154 내지 166로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 KRAS G12C 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 154 내지 166로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 154 내지 166로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 154 내지 166로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 KRAS G12C 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 214 내지 229로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 KRAS G13D 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 214 내지 229로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 214 내지 229로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 214 내지 229로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 KRAS G13D 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 141 내지 153로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 KRAS G12A 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 141 내지 153로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 141 내지 153로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 141 내지 153로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 KRAS G12A 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 192 내지 202로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 KRAS G12S 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 192 내지 202로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 192 내지 202로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 192 내지 202로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 KRAS G12S 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 256 내지 272로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 NRAS Q61R 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 256 내지 272로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 256 내지 272로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 256 내지 272로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 NRAS Q61R 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 230 내지 238로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 NRAS Q61K 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 230 내지 238로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 230 내지 238로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 230 내지 238로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 NRAS Q61K 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 239 내지 255로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 NRAS Q61L 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 239 내지 255로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 239 내지 255로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 239 내지 255로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 NRAS Q61L 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 273 내지 285로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 PIK3CA E542K 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 273 내지 285로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 273 내지 285로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 273 내지 285로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 PIK3CA E542K 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 286 내지 293로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 PIK3CA E545K 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 286 내지 293로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 286 내지 293로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 286 내지 293로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 PIK3CA E545K 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 294 내지 309로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 PIK3CA H1047R 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 294 내지 309로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 294 내지 309로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 294 내지 309로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 PIK3CA H1047R 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 359 내지 374로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TP53 R158L 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 359 내지 374로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 359 내지 374로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 359 내지 374로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 TP53 R158L 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 375 내지 386로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TP53 R175H 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 375 내지 386로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 375 내지 386로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 375 내지 386로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 TP53 R175H 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 387 내지 401로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TP53 R248Q 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 387 내지 401로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 387 내지 401로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 387 내지 401로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 TP53 R248Q 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 422 내지 432로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TP53 R273C 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 422 내지 432로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 422 내지 432로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 422 내지 432로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 TP53 R273C 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 433 내지 446로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TP53 R273H 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 433 내지 446로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 433 내지 446로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 433 내지 446로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 TP53 R273H 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 402 내지 421로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TP53 R248W 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 402 내지 421로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 402 내지 421로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 402 내지 421로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 TP53 R248W 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 447 내지 449로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TP53 R282W 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 447 내지 449로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 447 내지 449로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 447 내지 449로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 TP53 R282W 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 450 내지 458로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TP53 Y220C 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 450 내지 458로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 450 내지 458로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 450 내지 458로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 TP53 Y220C 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 310 내지 322로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 PIK3CA R88Q 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 310 내지 322로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 310 내지 322로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 310 내지 322로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 PIK3CA R88Q 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 99 내지 118로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 GTF2I L424H 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 99 내지 118로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 99 내지 118로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 99 내지 118로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 GTF2I L424H 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 338 내지 353로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 PTEN R130Q 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 338 내지 353로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 338 내지 353로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 338 내지 353로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 PTEN R130Q 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 1 내지 18로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 AKT1 E17K 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 1 내지 18로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 1 내지 18로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 1 내지 18로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 AKT1 E17K 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 323 내지 337로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 PTEN R130G 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 323 내지 337로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 323 내지 337로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 323 내지 337로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 PTEN R130G 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 354 내지 358로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TP53 H179R 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 354 내지 358로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 354 내지 358로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 354 내지 358로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 TP53 H179R 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 168 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 179 내지 180, SEQ ID NO: 182 내지 183, SEQ ID NO: 203 내지 204, 및 SEQ ID NO: 207로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 168 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 179 내지 180, SEQ ID NO: 182 내지 183, SEQ ID NO: 203 내지 204, 및 SEQ ID NO: 207로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 생체내 발현을 위한 구조체 내에서 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 갖는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 췌장암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 168 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 179 내지 180, SEQ ID NO: 182 내지 183, SEQ ID NO: 203 내지 204, 및 SEQ ID NO: 207로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 대상체에 투여하여 췌장암를 치료하거나 예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 168 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 179 내지 180, SEQ ID NO: 182 내지 183, SEQ ID NO: 203 내지 204, 및 SEQ ID NO: 207로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 168 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 179 내지 180, SEQ ID NO: 182 내지 183, SEQ ID NO: 203 내지 204, 및 SEQ ID NO: 207로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 168 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 179 내지 180, SEQ ID NO: 182 내지 183, SEQ ID NO: 203 내지 204, 및 SEQ ID NO: 207로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이고, 여기서 단백질은 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 췌장암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 168 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 179 내지 180, SEQ ID NO: 182 내지 183, SEQ ID NO: 203 내지 204, 및 SEQ ID NO: 207로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 대상체에 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 췌장암를 치료 또는예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 168 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 179 내지 180, SEQ ID NO: 182 내지 183, SEQ ID NO: 203 내지 204, 및 SEQ ID NO: 207로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 19 내지 23, SEQ ID NO: 34 내지 40, SEQ ID NO: 230 내지 231, SEQ ID NO: 239, SEQ ID NO: 241 내지 242, 및 SEQ ID NO: 260 내지 262로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 19 내지 23, SEQ ID NO: 34 내지 40, SEQ ID NO: 230 내지 231, SEQ ID NO: 239, SEQ ID NO: 241 내지 242, 및 SEQ ID NO: 260 내지 262로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 생체내 발현을 위한 구조체 내에서 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 갖는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 피부암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 19 내지 23, SEQ ID NO: 34 내지 40, SEQ ID NO: 230 내지 231, SEQ ID NO: 239, SEQ ID NO: 241 내지 242, 및 SEQ ID NO: 260 내지 262로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 대상체에 투여하여 피부암를 치료하거나 예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 19 내지 23, SEQ ID NO: 34 내지 40, SEQ ID NO: 230 내지 231, SEQ ID NO: 239, SEQ ID NO: 241 내지 242, 및 SEQ ID NO: 260 내지 262로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 19 내지 23, SEQ ID NO: 34 내지 40, SEQ ID NO: 230 내지 231, SEQ ID NO: 239, SEQ ID NO: 241 내지 242, 및 SEQ ID NO: 260 내지 262로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 19 내지 23, SEQ ID NO: 34 내지 40, SEQ ID NO: 230 내지 231, SEQ ID NO: 239, SEQ ID NO: 241 내지 242, 및 SEQ ID NO: 260 내지 262로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이고, 여기서 단백질은 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 피부암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 19 내지 23, SEQ ID NO: 34 내지 40, SEQ ID NO: 230 내지 231, SEQ ID NO: 239, SEQ ID NO: 241 내지 242, 및 SEQ ID NO: 260 내지 262로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 대상체에 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 피부암를 치료 또는예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 19 내지 23, SEQ ID NO: 34 내지 40, SEQ ID NO: 230 내지 231, SEQ ID NO: 239, SEQ ID NO: 241 내지 242, 및 SEQ ID NO: 260 내지 262로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 19 내지 23, SEQ ID NO: 230 내지 231, 및 SEQ ID NO: 260 내지 262로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 19 내지 23, SEQ ID NO: 230 내지 231, 및 SEQ ID NO: 260 내지 262로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 생체내 발현을 위한 구조체 내에서 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 갖는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 갑상선암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 19 내지 23, SEQ ID NO: 230 내지 231, 및 SEQ ID NO: 260 내지 262로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 대상체에 투여하여 갑상선암를 치료하거나 예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 19 내지 23, SEQ ID NO: 230 내지 231, 및 SEQ ID NO: 260 내지 262로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 19 내지 23, SEQ ID NO: 230 내지 231, 및 SEQ ID NO: 260 내지 262로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 19 내지 23, SEQ ID NO: 230 내지 231, 및 SEQ ID NO: 260 내지 262로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이고, 여기서 단백질은 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 갑상선암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 19 내지 23, SEQ ID NO: 230 내지 231, 및 SEQ ID NO: 260 내지 262로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 대상체에 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 갑상선암를 치료 또는예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 19 내지 23, SEQ ID NO: 230 내지 231, 및 SEQ ID NO: 260 내지 262로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 51 내지 55, SEQ ID NO: 67 내지 70, SEQ ID NO: 72 내지 73, SEQ ID NO: 119 내지 120, SEQ ID NO: 125 내지 130, SEQ ID NO: 375, SEQ ID NO: 423, 및 SEQ ID NO: 425로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 51 내지 55, SEQ ID NO: 67 내지 70, SEQ ID NO: 72 내지 73, SEQ ID NO: 119 내지 120, SEQ ID NO: 125 내지 130, SEQ ID NO: 375, SEQ ID NO: 423, 및 SEQ ID NO: 425로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 생체내 발현을 위한 구조체 내에서 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 갖는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 뇌암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 51 내지 55, SEQ ID NO: 67 내지 70, SEQ ID NO: 72 내지 73, SEQ ID NO: 119 내지 120, SEQ ID NO: 125 내지 130, SEQ ID NO: 375, SEQ ID NO: 423, 및 SEQ ID NO: 425로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 대상체에 투여하여 뇌암를 치료하거나 예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 51 내지 55, SEQ ID NO: 67 내지 70, SEQ ID NO: 72 내지 73, SEQ ID NO: 119 내지 120, SEQ ID NO: 125 내지 130, SEQ ID NO: 375, SEQ ID NO: 423, 및 SEQ ID NO: 425로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 51 내지 55, SEQ ID NO: 67 내지 70, SEQ ID NO: 72 내지 73, SEQ ID NO: 119 내지 120, SEQ ID NO: 125 내지 130, SEQ ID NO: 375, SEQ ID NO: 423, 및 SEQ ID NO: 425로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 51 내지 55, SEQ ID NO: 67 내지 70, SEQ ID NO: 72 내지 73, SEQ ID NO: 119 내지 120, SEQ ID NO: 125 내지 130, SEQ ID NO: 375, SEQ ID NO: 423, 및 SEQ ID NO: 425로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이고, 여기서 단백질은 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 뇌암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 51 내지 55, SEQ ID NO: 67 내지 70, SEQ ID NO: 72 내지 73, SEQ ID NO: 119 내지 120, SEQ ID NO: 125 내지 130, SEQ ID NO: 375, SEQ ID NO: 423, 및 SEQ ID NO: 425로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 대상체에 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 뇌암를 치료 또는예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 51 내지 55, SEQ ID NO: 67 내지 70, SEQ ID NO: 72 내지 73, SEQ ID NO: 119 내지 120, SEQ ID NO: 125 내지 130, SEQ ID NO: 375, SEQ ID NO: 423, 및 SEQ ID NO: 425로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 20 내지 23, SEQ ID NO: 167 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 203 내지 207, SEQ ID NO: 215 내지 217, 및 SEQ ID NO: 288로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 20 내지 23, SEQ ID NO: 167 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 203 내지 207, SEQ ID NO: 215 내지 217, 및 SEQ ID NO: 288로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 생체내 발현을 위한 구조체 내에서 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 갖는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 결장직장암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 20 내지 23, SEQ ID NO: 167 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 203 내지 207, SEQ ID NO: 215 내지 217, 및 SEQ ID NO: 288로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 대상체에 투여하여 결장직장암를 치료하거나 예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 20 내지 23, SEQ ID NO: 167 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 203 내지 207, SEQ ID NO: 215 내지 217, 및 SEQ ID NO: 288로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 20 내지 23, SEQ ID NO: 167 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 203 내지 207, SEQ ID NO: 215 내지 217, 및 SEQ ID NO: 288로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 20 내지 23, SEQ ID NO: 167 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 203 내지 207, SEQ ID NO: 215 내지 217, 및 SEQ ID NO: 288로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이고, 여기서 단백질은 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 결장직장암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 20 내지 23, SEQ ID NO: 167 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 203 내지 207, SEQ ID NO: 215 내지 217, 및 SEQ ID NO: 288로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 대상체에 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 결장직장암를 치료 또는예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 20 내지 23, SEQ ID NO: 167 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 203 내지 207, SEQ ID NO: 215 내지 217, 및 SEQ ID NO: 288로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 82 내지 86, SEQ ID NO: 141 내지 144, SEQ ID NO: 154 내지 159, SEQ ID NO: 168 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 203 내지 204, SEQ ID NO: 207, SEQ ID NO: 274 내지 276, SEQ ID NO: 288, SEQ ID NO: 359, 및 SEQ ID NO: 362 내지 364로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 82 내지 86, SEQ ID NO: 141 내지 144, SEQ ID NO: 154 내지 159, SEQ ID NO: 168 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 203 내지 204, SEQ ID NO: 207, SEQ ID NO: 274 내지 276, SEQ ID NO: 288, SEQ ID NO: 359, 및 SEQ ID NO: 362 내지 364로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 생체내 발현을 위한 구조체 내에서 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 갖는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 기관지 및 폐암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 82 내지 86, SEQ ID NO: 141 내지 144, SEQ ID NO: 154 내지 159, SEQ ID NO: 168 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 203 내지 204, SEQ ID NO: 207, SEQ ID NO: 274 내지 276, SEQ ID NO: 288, SEQ ID NO: 359, 및 SEQ ID NO: 362 내지 364로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 대상체에 투여하여 기관지 및 폐암를 치료하거나 예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 82 내지 86, SEQ ID NO: 141 내지 144, SEQ ID NO: 154 내지 159, SEQ ID NO: 168 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 203 내지 204, SEQ ID NO: 207, SEQ ID NO: 274 내지 276, SEQ ID NO: 288, SEQ ID NO: 359, 및 SEQ ID NO: 362 내지 364로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 82 내지 86, SEQ ID NO: 141 내지 144, SEQ ID NO: 154 내지 159, SEQ ID NO: 168 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 203 내지 204, SEQ ID NO: 207, SEQ ID NO: 274 내지 276, SEQ ID NO: 288, SEQ ID NO: 359, 및 SEQ ID NO: 362 내지 364로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 82 내지 86, SEQ ID NO: 141 내지 144, SEQ ID NO: 154 내지 159, SEQ ID NO: 168 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 203 내지 204, SEQ ID NO: 207, SEQ ID NO: 274 내지 276, SEQ ID NO: 288, SEQ ID NO: 359, 및 SEQ ID NO: 362 내지 364로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이고, 여기서 단백질은 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 기관지 및 폐암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 82 내지 86, SEQ ID NO: 141 내지 144, SEQ ID NO: 154 내지 159, SEQ ID NO: 168 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 203 내지 204, SEQ ID NO: 207, SEQ ID NO: 274 내지 276, SEQ ID NO: 288, SEQ ID NO: 359, 및 SEQ ID NO: 362 내지 364로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 대상체에 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 기관지 및 폐암를 치료 또는예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 82 내지 86, SEQ ID NO: 141 내지 144, SEQ ID NO: 154 내지 159, SEQ ID NO: 168 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 203 내지 204, SEQ ID NO: 207, SEQ ID NO: 274 내지 276, SEQ ID NO: 288, SEQ ID NO: 359, 및 SEQ ID NO: 362 내지 364로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 273 내지 309, SEQ ID NO: 375 내지 386, 및 SEQ ID NO: 422 내지 446로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 273 내지 309, SEQ ID NO: 375 내지 386, 및 SEQ ID NO: 422 내지 446로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 생체내 발현을 위한 구조체 내에서 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 갖는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 유방암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 273 내지 309, SEQ ID NO: 375 내지 386, 및 SEQ ID NO: 422 내지 446로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 대상체에 투여하여 유방암를 치료하거나 예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 273 내지 309, SEQ ID NO: 375 내지 386, 및 SEQ ID NO: 422 내지 446로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 273 내지 309, SEQ ID NO: 375 내지 386, 및 SEQ ID NO: 422 내지 446로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 273 내지 309, SEQ ID NO: 375 내지 386, 및 SEQ ID NO: 422 내지 446로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이고, 여기서 단백질은 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 유방암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 273 내지 309, SEQ ID NO: 375 내지 386, 및 SEQ ID NO: 422 내지 446로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 대상체에 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 유방암를 치료 또는예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 273 내지 309, SEQ ID NO: 375 내지 386, 및 SEQ ID NO: 422 내지 446로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 273 내지 309, SEQ ID NO: 375 내지 386, 및 SEQ ID NO: 422 내지 446로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 273 내지 309, SEQ ID NO: 375 내지 386, 및 SEQ ID NO: 422 내지 446로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 생체내 발현을 위한 구조체 내에서 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 갖는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 난소암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 273 내지 309, SEQ ID NO: 375 내지 386, 및 SEQ ID NO: 422 내지 446로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 대상체에 투여하여 난소암를 치료하거나 예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 273 내지 309, SEQ ID NO: 375 내지 386, 및 SEQ ID NO: 422 내지 446로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 273 내지 309, SEQ ID NO: 375 내지 386, 및 SEQ ID NO: 422 내지 446로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 273 내지 309, SEQ ID NO: 375 내지 386, 및 SEQ ID NO: 422 내지 446로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이고, 여기서 단백질은 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 난소암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 273 내지 309, SEQ ID NO: 375 내지 386, 및 SEQ ID NO: 422 내지 446로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 대상체에 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 난소암를 치료 또는예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 273 내지 309, SEQ ID NO: 375 내지 386, 및 SEQ ID NO: 422 내지 446로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다.
한 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 475 내지 759로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 제공한다.
일부 실시예에서, 핵산 서열은 SEQ ID NO: 475 내지 759로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 475 내지 759로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 대상체에 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 475 내지 759로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 생체내 발현을 위한 구조체 내에서 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 II 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이고, 여기서 단백질은 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 이루어진 군으로부터 선택된 돌연변이를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 췌장암, 피부암, 갑상선암, 뇌암, 결장직장암, 기관지 및 폐암, 유방암, 및 난소암로 구성된 군으로부터 선택된다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 475 내지 759로 구성된 군으로부터 선택된 3개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 475 내지 759로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 475 내지 759로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 475 내지 483로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 AKT1 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 475 내지 483로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 475 내지 483로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 475 내지 483로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 AKT1 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 484 내지 502로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 BRAF 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 484 내지 502로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 484 내지 502로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 484 내지 502로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 BRAF 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 503 내지 527로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 EGFR 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 503 내지 527로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 503 내지 527로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 503 내지 527로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 EGFR 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 528 내지 534로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 GTF2I 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 528 내지 534로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 528 내지 534로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 528 내지 534로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 GTF2I 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 535 내지 553로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 IDH1 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 535 내지 553로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 535 내지 553로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 535 내지 553로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 IDH1 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 554 내지 615로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 KRAS 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 554 내지 615로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 554 내지 615로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 554 내지 615로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 KRAS 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 616 내지 645로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 NRAS 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 616 내지 645로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 616 내지 645로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 616 내지 645로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 NRAS 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 646 내지 675로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 PIK3CA 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 646 내지 675로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 646 내지 675로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 646 내지 675로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 PIK3CA 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 676 내지 690로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 PTEN 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 676 내지 690로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 676 내지 690로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 676 내지 690로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 PTEN 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 691 내지 758로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TP53 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 691 내지 758로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 691 내지 758로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 691 내지 758로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 TP53 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 554 내지 645로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 RAS 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 554 내지 645로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 554 내지 645로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 554 내지 645로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 RAS 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 484 내지 494로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 BRAF V600E 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 484 내지 494로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 484 내지 494로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 484 내지 494로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 BRAF V600E 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 495 내지 502로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 BRAF V600M 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 495 내지 502로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 495 내지 502로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 495 내지 502로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 BRAF V600M 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 503 내지 509로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 EGFR A289V 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 503 내지 509로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 503 내지 509로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 503 내지 509로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 EGFR A289V 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 510 내지 519로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 EGFR G598V 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 510 내지 519로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 510 내지 519로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 510 내지 519로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 EGFR G598V 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 520 내지 527로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 EGFR L858R 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 520 내지 527로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 520 내지 527로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 520 내지 527로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 EGFR L858R 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 543 내지 553로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 IDH1 R132H 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 543 내지 553로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 543 내지 553로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 543 내지 553로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 IDH1 R132H 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 535 내지 542로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 IDH1 R132C 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 535 내지 542로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 535 내지 542로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 535 내지 542로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 IDH1 R132C 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 569 내지 577로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 KRAS G12D 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 569 내지 577로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 569 내지 577로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 569 내지 577로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 KRAS G12D 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 596 내지 605로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 KRAS G12V 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 596 내지 605로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 596 내지 605로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 596 내지 605로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 KRAS G12V 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 578 내지 587로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 KRAS G12R 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 578 내지 587로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 578 내지 587로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 578 내지 587로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 KRAS G12R 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 561 내지 568로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 KRAS G12C 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 561 내지 568로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 561 내지 568로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 561 내지 568로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 KRAS G12C 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 606 내지 615로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 KRAS G13D 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 606 내지 615로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 606 내지 615로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 606 내지 615로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 KRAS G13D 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 554 내지 560로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 KRAS G12A 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 554 내지 560로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 554 내지 560로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 554 내지 560로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 KRAS G12A 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 588 내지 595로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 KRAS G12S 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 588 내지 595로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 588 내지 595로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 588 내지 595로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 KRAS G12S 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 634 내지 645로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 NRAS Q61R 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 634 내지 645로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 634 내지 645로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 634 내지 645로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 NRAS Q61R 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 616 내지 624로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 NRAS Q61K 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 616 내지 624로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 616 내지 624로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 616 내지 624로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 NRAS Q61K 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 625 내지 633로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 NRAS Q61L 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 625 내지 633로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 625 내지 633로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 625 내지 633로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 NRAS Q61L 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 646 내지 650로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 PIK3CA E542K 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 646 내지 650로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 646 내지 650로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 646 내지 650로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 PIK3CA E542K 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 651 내지 657로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 PIK3CA E545K 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 651 내지 657로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 651 내지 657로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 651 내지 657로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 PIK3CA E545K 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 658 내지 667로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 PIK3CA H1047R 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 658 내지 667로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 658 내지 667로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 658 내지 667로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 PIK3CA H1047R 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 700 내지 707로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TP53 R158L 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 700 내지 707로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 700 내지 707로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 700 내지 707로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 TP53 R158L 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 708 내지 717로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TP53 R175H 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 708 내지 717로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 708 내지 717로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 708 내지 717로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 TP53 R175H 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 718 내지 723로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TP53 R248Q 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 718 내지 723로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 718 내지 723로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 718 내지 723로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 TP53 R248Q 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 733 내지 739로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TP53 R273C 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 733 내지 739로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 733 내지 739로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 733 내지 739로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 TP53 R273C 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 740 내지 748로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TP53 R273H 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 740 내지 748로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 740 내지 748로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 740 내지 748로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 TP53 R273H 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 724 내지 732로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TP53 R248W 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 724 내지 732로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 724 내지 732로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 724 내지 732로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 TP53 R248W 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 749 내지 750로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TP53 R282W 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 749 내지 750로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 749 내지 750로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 749 내지 750로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 TP53 R282W 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 751 내지 758로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TP53 Y220C 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 751 내지 758로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 751 내지 758로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 751 내지 758로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 TP53 Y220C 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 668 내지 675로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 PIK3CA R88Q 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 668 내지 675로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 668 내지 675로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 668 내지 675로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 PIK3CA R88Q 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 528 내지 534로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 GTF2I L424H 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 528 내지 534로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 528 내지 534로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 528 내지 534로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 GTF2I L424H 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 681 내지 690로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 PTEN R130Q 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 681 내지 690로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 681 내지 690로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 681 내지 690로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 PTEN R130Q 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 475 내지 483로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 AKT1 E17K 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 475 내지 483로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 475 내지 483로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 475 내지 483로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 AKT1 E17K 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 676 내지 680로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 PTEN R130G 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 676 내지 680로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 676 내지 680로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 676 내지 680로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 PTEN R130G 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 691 내지 699로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TP53 H179R 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 691 내지 699로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 691 내지 699로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 691 내지 699로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 TP53 H179R 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 569 내지 574, SEQ ID NO: 578 내지 584, SEQ ID NO: 596 내지 599, 및 SEQ ID NO: 601 내지 603로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 569 내지 574, SEQ ID NO: 578 내지 584, SEQ ID NO: 596 내지 599, 및 SEQ ID NO: 601 내지 603로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 생체내 발현을 위한 구조체 내에서 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 II 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 갖는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 췌장암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 569 내지 574, SEQ ID NO: 578 내지 584, SEQ ID NO: 596 내지 599, 및 SEQ ID NO: 601 내지 603로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 대상체에 투여하여 췌장암를 치료하거나 예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 569 내지 574, SEQ ID NO: 578 내지 584, SEQ ID NO: 596 내지 599, 및 SEQ ID NO: 601 내지 603로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 569 내지 574, SEQ ID NO: 578 내지 584, SEQ ID NO: 596 내지 599, 및 SEQ ID NO: 601 내지 603로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 569 내지 574, SEQ ID NO: 578 내지 584, SEQ ID NO: 596 내지 599, 및 SEQ ID NO: 601 내지 603로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 HLA 클래스 II 분자에 의해 표시된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이고, 여기서 단백질은 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 췌장암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 569 내지 574, SEQ ID NO: 578 내지 584, SEQ ID NO: 596 내지 599, 및 SEQ ID NO: 601 내지 603로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 대상체에 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 췌장암를 치료 또는예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 569 내지 574, SEQ ID NO: 578 내지 584, SEQ ID NO: 596 내지 599, 및 SEQ ID NO: 601 내지 603로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 495 내지 499, SEQ ID NO: 616, SEQ ID NO: 619 내지 620, SEQ ID NO: 625 내지 628, SEQ ID NO: 634, SEQ ID NO: 637, 및 SEQ ID NO: 639 내지 640로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 495 내지 499, SEQ ID NO: 616, SEQ ID NO: 619 내지 620, SEQ ID NO: 625 내지 628, SEQ ID NO: 634, SEQ ID NO: 637, 및 SEQ ID NO: 639 내지 640로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 생체내 발현을 위한 구조체 내에서 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 II 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 갖는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 피부암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 495 내지 499, SEQ ID NO: 616, SEQ ID NO: 619 내지 620, SEQ ID NO: 625 내지 628, SEQ ID NO: 634, SEQ ID NO: 637, 및 SEQ ID NO: 639 내지 640로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 대상체에 투여하여 피부암를 치료하거나 예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 495 내지 499, SEQ ID NO: 616, SEQ ID NO: 619 내지 620, SEQ ID NO: 625 내지 628, SEQ ID NO: 634, SEQ ID NO: 637, 및 SEQ ID NO: 639 내지 640로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 495 내지 499, SEQ ID NO: 616, SEQ ID NO: 619 내지 620, SEQ ID NO: 625 내지 628, SEQ ID NO: 634, SEQ ID NO: 637, 및 SEQ ID NO: 639 내지 640로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 495 내지 499, SEQ ID NO: 616, SEQ ID NO: 619 내지 620, SEQ ID NO: 625 내지 628, SEQ ID NO: 634, SEQ ID NO: 637, 및 SEQ ID NO: 639 내지 640로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 HLA 클래스 II 분자에 의해 표시된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이고, 여기서 단백질은 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 피부암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 495 내지 499, SEQ ID NO: 616, SEQ ID NO: 619 내지 620, SEQ ID NO: 625 내지 628, SEQ ID NO: 634, SEQ ID NO: 637, 및 SEQ ID NO: 639 내지 640로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 대상체에 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 피부암를 치료 또는예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 495 내지 499, SEQ ID NO: 616, SEQ ID NO: 619 내지 620, SEQ ID NO: 625 내지 628, SEQ ID NO: 634, SEQ ID NO: 637, 및 SEQ ID NO: 639 내지 640로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 616, SEQ ID NO: 619 내지 620, SEQ ID NO: 634, SEQ ID NO: 637, 및 SEQ ID NO: 640로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 616, SEQ ID NO: 619 내지 620, SEQ ID NO: 634, SEQ ID NO: 637, 및 SEQ ID NO: 640로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 생체내 발현을 위한 구조체 내에서 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 II 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 갖는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 갑상선암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 616, SEQ ID NO: 619 내지 620, SEQ ID NO: 634, SEQ ID NO: 637, 및 SEQ ID NO: 640로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 대상체에 투여하여 갑상선암를 치료하거나 예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 616, SEQ ID NO: 619 내지 620, SEQ ID NO: 634, SEQ ID NO: 637, 및 SEQ ID NO: 640로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 616, SEQ ID NO: 619 내지 620, SEQ ID NO: 634, SEQ ID NO: 637, 및 SEQ ID NO: 640로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 616, SEQ ID NO: 619 내지 620, SEQ ID NO: 634, SEQ ID NO: 637, 및 SEQ ID NO: 640로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 HLA 클래스 II 분자에 의해 표시된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이고, 여기서 단백질은 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 갑상선암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 616, SEQ ID NO: 619 내지 620, SEQ ID NO: 634, SEQ ID NO: 637, 및 SEQ ID NO: 640로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 대상체에 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 갑상선암를 치료 또는예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 616, SEQ ID NO: 619 내지 620, SEQ ID NO: 634, SEQ ID NO: 637, 및 SEQ ID NO: 640로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 508, SEQ ID NO: 510, SEQ ID NO: 512, SEQ ID NO: 514, SEQ ID NO: 535 내지 537, SEQ ID NO: 539, SEQ ID NO: 543 내지 551, SEQ ID NO: 708, SEQ ID NO: 712, 및 SEQ ID NO: 738로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 508, SEQ ID NO: 510, SEQ ID NO: 512, SEQ ID NO: 514, SEQ ID NO: 535 내지 537, SEQ ID NO: 539, SEQ ID NO: 543 내지 551, SEQ ID NO: 708, SEQ ID NO: 712, 및 SEQ ID NO: 738로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 생체내 발현을 위한 구조체 내에서 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 II 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 갖는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 뇌암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 508, SEQ ID NO: 510, SEQ ID NO: 512, SEQ ID NO: 514, SEQ ID NO: 535 내지 537, SEQ ID NO: 539, SEQ ID NO: 543 내지 551, SEQ ID NO: 708, SEQ ID NO: 712, 및 SEQ ID NO: 738로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 대상체에 투여하여 뇌암를 치료하거나 예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 508, SEQ ID NO: 510, SEQ ID NO: 512, SEQ ID NO: 514, SEQ ID NO: 535 내지 537, SEQ ID NO: 539, SEQ ID NO: 543 내지 551, SEQ ID NO: 708, SEQ ID NO: 712, 및 SEQ ID NO: 738로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 508, SEQ ID NO: 510, SEQ ID NO: 512, SEQ ID NO: 514, SEQ ID NO: 535 내지 537, SEQ ID NO: 539, SEQ ID NO: 543 내지 551, SEQ ID NO: 708, SEQ ID NO: 712, 및 SEQ ID NO: 738로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 508, SEQ ID NO: 510, SEQ ID NO: 512, SEQ ID NO: 514, SEQ ID NO: 535 내지 537, SEQ ID NO: 539, SEQ ID NO: 543 내지 551, SEQ ID NO: 708, SEQ ID NO: 712, 및 SEQ ID NO: 738로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 HLA 클래스 II 분자에 의해 표시된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이고, 여기서 단백질은 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 뇌암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 508, SEQ ID NO: 510, SEQ ID NO: 512, SEQ ID NO: 514, SEQ ID NO: 535 내지 537, SEQ ID NO: 539, SEQ ID NO: 543 내지 551, SEQ ID NO: 708, SEQ ID NO: 712, 및 SEQ ID NO: 738로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 대상체에 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 뇌암를 치료 또는예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 508, SEQ ID NO: 510, SEQ ID NO: 512, SEQ ID NO: 514, SEQ ID NO: 535 내지 537, SEQ ID NO: 539, SEQ ID NO: 543 내지 551, SEQ ID NO: 708, SEQ ID NO: 712, 및 SEQ ID NO: 738로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 569 내지 575, SEQ ID NO: 596 내지 599, SEQ ID NO: 601 내지 604, SEQ ID NO: 606 내지 612, SEQ ID NO: 656, SEQ ID NO: 708, 및 SEQ ID NO: 712로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 569 내지 575, SEQ ID NO: 596 내지 599, SEQ ID NO: 601 내지 604, SEQ ID NO: 606 내지 612, SEQ ID NO: 656, SEQ ID NO: 708, 및 SEQ ID NO: 712로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 생체내 발현을 위한 구조체 내에서 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 II 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 갖는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 결장직장암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 569 내지 575, SEQ ID NO: 596 내지 599, SEQ ID NO: 601 내지 604, SEQ ID NO: 606 내지 612, SEQ ID NO: 656, SEQ ID NO: 708, 및 SEQ ID NO: 712로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 대상체에 투여하여 결장직장암를 치료하거나 예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 569 내지 575, SEQ ID NO: 596 내지 599, SEQ ID NO: 601 내지 604, SEQ ID NO: 606 내지 612, SEQ ID NO: 656, SEQ ID NO: 708, 및 SEQ ID NO: 712로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 569 내지 575, SEQ ID NO: 596 내지 599, SEQ ID NO: 601 내지 604, SEQ ID NO: 606 내지 612, SEQ ID NO: 656, SEQ ID NO: 708, 및 SEQ ID NO: 712로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 569 내지 575, SEQ ID NO: 596 내지 599, SEQ ID NO: 601 내지 604, SEQ ID NO: 606 내지 612, SEQ ID NO: 656, SEQ ID NO: 708, 및 SEQ ID NO: 712로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 HLA 클래스 II 분자에 의해 표시된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이고, 여기서 단백질은 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 결장직장암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 569 내지 575, SEQ ID NO: 596 내지 599, SEQ ID NO: 601 내지 604, SEQ ID NO: 606 내지 612, SEQ ID NO: 656, SEQ ID NO: 708, 및 SEQ ID NO: 712로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 대상체에 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 결장직장암를 치료 또는예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 569 내지 575, SEQ ID NO: 596 내지 599, SEQ ID NO: 601 내지 604, SEQ ID NO: 606 내지 612, SEQ ID NO: 656, SEQ ID NO: 708, 및 SEQ ID NO: 712로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 520 내지 521, SEQ ID NO: 523 내지 524, SEQ ID NO: 554 내지 556, SEQ ID NO: 558, SEQ ID NO: 561, SEQ ID NO: 563 내지 565, SEQ ID NO: 569 내지 573, SEQ ID NO: 596 내지 600, SEQ ID NO: 650, SEQ ID NO: 656, 및 SEQ ID NO: 700 내지 705로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 520 내지 521, SEQ ID NO: 523 내지 524, SEQ ID NO: 554 내지 556, SEQ ID NO: 558, SEQ ID NO: 561, SEQ ID NO: 563 내지 565, SEQ ID NO: 569 내지 573, SEQ ID NO: 596 내지 600, SEQ ID NO: 650, SEQ ID NO: 656, 및 SEQ ID NO: 700 내지 705로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 생체내 발현을 위한 구조체 내에서 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 II 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 갖는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 기관지 및 폐암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 520 내지 521, SEQ ID NO: 523 내지 524, SEQ ID NO: 554 내지 556, SEQ ID NO: 558, SEQ ID NO: 561, SEQ ID NO: 563 내지 565, SEQ ID NO: 569 내지 573, SEQ ID NO: 596 내지 600, SEQ ID NO: 650, SEQ ID NO: 656, 및 SEQ ID NO: 700 내지 705로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 대상체에 투여하여 기관지 및 폐암를 치료하거나 예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 520 내지 521, SEQ ID NO: 523 내지 524, SEQ ID NO: 554 내지 556, SEQ ID NO: 558, SEQ ID NO: 561, SEQ ID NO: 563 내지 565, SEQ ID NO: 569 내지 573, SEQ ID NO: 596 내지 600, SEQ ID NO: 650, SEQ ID NO: 656, 및 SEQ ID NO: 700 내지 705로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 520 내지 521, SEQ ID NO: 523 내지 524, SEQ ID NO: 554 내지 556, SEQ ID NO: 558, SEQ ID NO: 561, SEQ ID NO: 563 내지 565, SEQ ID NO: 569 내지 573, SEQ ID NO: 596 내지 600, SEQ ID NO: 650, SEQ ID NO: 656, 및 SEQ ID NO: 700 내지 705로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 520 내지 521, SEQ ID NO: 523 내지 524, SEQ ID NO: 554 내지 556, SEQ ID NO: 558, SEQ ID NO: 561, SEQ ID NO: 563 내지 565, SEQ ID NO: 569 내지 573, SEQ ID NO: 596 내지 600, SEQ ID NO: 650, SEQ ID NO: 656, 및 SEQ ID NO: 700 내지 705로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 HLA 클래스 II 분자에 의해 표시된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이고, 여기서 단백질은 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 기관지 및 폐암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 520 내지 521, SEQ ID NO: 523 내지 524, SEQ ID NO: 554 내지 556, SEQ ID NO: 558, SEQ ID NO: 561, SEQ ID NO: 563 내지 565, SEQ ID NO: 569 내지 573, SEQ ID NO: 596 내지 600, SEQ ID NO: 650, SEQ ID NO: 656, 및 SEQ ID NO: 700 내지 705로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 대상체에 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 기관지 및 폐암를 치료 또는예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 520 내지 521, SEQ ID NO: 523 내지 524, SEQ ID NO: 554 내지 556, SEQ ID NO: 558, SEQ ID NO: 561, SEQ ID NO: 563 내지 565, SEQ ID NO: 569 내지 573, SEQ ID NO: 596 내지 600, SEQ ID NO: 650, SEQ ID NO: 656, 및 SEQ ID NO: 700 내지 705로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 646 내지 667, SEQ ID NO: 708 내지 717, 및 SEQ ID NO: 733 내지 748로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 646 내지 667, SEQ ID NO: 708 내지 717, 및 SEQ ID NO: 733 내지 748로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 생체내 발현을 위한 구조체 내에서 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 II 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 갖는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 유방암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 646 내지 667, SEQ ID NO: 708 내지 717, 및 SEQ ID NO: 733 내지 748로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 대상체에 투여하여 유방암를 치료하거나 예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 646 내지 667, SEQ ID NO: 708 내지 717, 및 SEQ ID NO: 733 내지 748로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 646 내지 667, SEQ ID NO: 708 내지 717, 및 SEQ ID NO: 733 내지 748로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 646 내지 667, SEQ ID NO: 708 내지 717, 및 SEQ ID NO: 733 내지 748로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 HLA 클래스 II 분자에 의해 표시된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이고, 여기서 단백질은 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 유방암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 646 내지 667, SEQ ID NO: 708 내지 717, 및 SEQ ID NO: 733 내지 748로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 대상체에 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 유방암를 치료 또는예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 646 내지 667, SEQ ID NO: 708 내지 717, 및 SEQ ID NO: 733 내지 748로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 646 내지 667, SEQ ID NO: 708 내지 717, 및 SEQ ID NO: 733 내지 748로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 646 내지 667, SEQ ID NO: 708 내지 717, 및 SEQ ID NO: 733 내지 748로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 생체내 발현을 위한 구조체 내에서 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 II 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 갖는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 난소암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 646 내지 667, SEQ ID NO: 708 내지 717, 및 SEQ ID NO: 733 내지 748로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 대상체에 투여하여 난소암를 치료하거나 예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 646 내지 667, SEQ ID NO: 708 내지 717, 및 SEQ ID NO: 733 내지 748로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 646 내지 667, SEQ ID NO: 708 내지 717, 및 SEQ ID NO: 733 내지 748로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 646 내지 667, SEQ ID NO: 708 내지 717, 및 SEQ ID NO: 733 내지 748로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 HLA 클래스 II 분자에 의해 표시된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이고, 여기서 단백질은 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 난소암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 646 내지 667, SEQ ID NO: 708 내지 717, 및 SEQ ID NO: 733 내지 748로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 대상체에 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 난소암를 치료 또는예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 646 내지 667, SEQ ID NO: 708 내지 717, 및 SEQ ID NO: 733 내지 748로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다.
CT 항원 백신
한 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 28796 내지 28864, SEQ ID NO: 37110 내지 37174, SEQ ID NO: 41321 내지 41397, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49004, SEQ ID NO: 49071, SEQ ID NO: 49395, SEQ ID NO: 50632, SEQ ID NO: 50729, SEQ ID NO: 51434 내지 51510, SEQ ID NO: 55758, SEQ ID NO: 60456 내지 60527, SEQ ID NO: 68238 내지 68321, SEQ ID NO: 77091, SEQ ID NO: 77210, SEQ ID NO: 84188, SEQ ID NO: 87951, SEQ ID NO: 88144, SEQ ID NO: 95593 내지 95664, SEQ ID NO: 113808 내지 113869, SEQ ID NO: 125134 내지 125218, SEQ ID NO: 144109 내지 144188, SEQ ID NO: 162383 내지 162453, SEQ ID NO: 166444 내지 166531, SEQ ID NO: 167118, SEQ ID NO: 169740, SEQ ID NO: 173412, SEQ ID NO: 179404, 및 SEQ ID NO: 182574 내지 182654로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 제공한다.
일부 실시예에서, 핵산 서열은 SEQ ID NO: 28796 내지 28864, SEQ ID NO: 37110 내지 37174, SEQ ID NO: 41321 내지 41397, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49004, SEQ ID NO: 49071, SEQ ID NO: 49395, SEQ ID NO: 50632, SEQ ID NO: 50729, SEQ ID NO: 51434 내지 51510, SEQ ID NO: 55758, SEQ ID NO: 60456 내지 60527, SEQ ID NO: 68238 내지 68321, SEQ ID NO: 77091, SEQ ID NO: 77210, SEQ ID NO: 84188, SEQ ID NO: 87951, SEQ ID NO: 88144, SEQ ID NO: 95593 내지 95664, SEQ ID NO: 113808 내지 113869, SEQ ID NO: 125134 내지 125218, SEQ ID NO: 144109 내지 144188, SEQ ID NO: 162383 내지 162453, SEQ ID NO: 166444 내지 166531, SEQ ID NO: 167118, SEQ ID NO: 169740, SEQ ID NO: 173412, SEQ ID NO: 179404, 및 SEQ ID NO: 182574 내지 182654로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 28796 내지 28864, SEQ ID NO: 37110 내지 37174, SEQ ID NO: 41321 내지 41397, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49004, SEQ ID NO: 49071, SEQ ID NO: 49395, SEQ ID NO: 50632, SEQ ID NO: 50729, SEQ ID NO: 51434 내지 51510, SEQ ID NO: 55758, SEQ ID NO: 60456 내지 60527, SEQ ID NO: 68238 내지 68321, SEQ ID NO: 77091, SEQ ID NO: 77210, SEQ ID NO: 84188, SEQ ID NO: 87951, SEQ ID NO: 88144, SEQ ID NO: 95593 내지 95664, SEQ ID NO: 113808 내지 113869, SEQ ID NO: 125134 내지 125218, SEQ ID NO: 144109 내지 144188, SEQ ID NO: 162383 내지 162453, SEQ ID NO: 166444 내지 166531, SEQ ID NO: 167118, SEQ ID NO: 169740, SEQ ID NO: 173412, SEQ ID NO: 179404, 및 SEQ ID NO: 182574 내지 182654로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 대상체에 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 28796 내지 28864, SEQ ID NO: 37110 내지 37174, SEQ ID NO: 41321 내지 41397, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49004, SEQ ID NO: 49071, SEQ ID NO: 49395, SEQ ID NO: 50632, SEQ ID NO: 50729, SEQ ID NO: 51434 내지 51510, SEQ ID NO: 55758, SEQ ID NO: 60456 내지 60527, SEQ ID NO: 68238 내지 68321, SEQ ID NO: 77091, SEQ ID NO: 77210, SEQ ID NO: 84188, SEQ ID NO: 87951, SEQ ID NO: 88144, SEQ ID NO: 95593 내지 95664, SEQ ID NO: 113808 내지 113869, SEQ ID NO: 125134 내지 125218, SEQ ID NO: 144109 내지 144188, SEQ ID NO: 162383 내지 162453, SEQ ID NO: 166444 내지 166531, SEQ ID NO: 167118, SEQ ID NO: 169740, SEQ ID NO: 173412, SEQ ID NO: 179404, 및 SEQ ID NO: 182574 내지 182654로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 생체내 발현을 위한 구조체 내에서 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 CTG1B, KKLC1, MAGA1, MAGA3, MAGA4, MAGC1, MAGC3, MAR1, PMEL, PRAME, SSX2, TYRP1, 및 TYRP2로 구성된 군으로부터 선택된 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 췌장암, 피부암, 갑상선암, 뇌암, 결장직장암, 기관지 및 폐암, 유방암, 및 난소암로 구성된 군으로부터 선택된다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 28796 내지 28864, SEQ ID NO: 37110 내지 37174, SEQ ID NO: 41321 내지 41397, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49004, SEQ ID NO: 49071, SEQ ID NO: 49395, SEQ ID NO: 50632, SEQ ID NO: 50729, SEQ ID NO: 51434 내지 51510, SEQ ID NO: 55758, SEQ ID NO: 60456 내지 60527, SEQ ID NO: 68238 내지 68321, SEQ ID NO: 77091, SEQ ID NO: 77210, SEQ ID NO: 84188, SEQ ID NO: 87951, SEQ ID NO: 88144, SEQ ID NO: 95593 내지 95664, SEQ ID NO: 113808 내지 113869, SEQ ID NO: 125134 내지 125218, SEQ ID NO: 144109 내지 144188, SEQ ID NO: 162383 내지 162453, SEQ ID NO: 166444 내지 166531, SEQ ID NO: 167118, SEQ ID NO: 169740, SEQ ID NO: 173412, SEQ ID NO: 179404, 및 SEQ ID NO: 182574 내지 182654로 구성된 군으로부터 선택된 3개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 28796 내지 28864, SEQ ID NO: 37110 내지 37174, SEQ ID NO: 41321 내지 41397, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49004, SEQ ID NO: 49071, SEQ ID NO: 49395, SEQ ID NO: 50632, SEQ ID NO: 50729, SEQ ID NO: 51434 내지 51510, SEQ ID NO: 55758, SEQ ID NO: 60456 내지 60527, SEQ ID NO: 68238 내지 68321, SEQ ID NO: 77091, SEQ ID NO: 77210, SEQ ID NO: 84188, SEQ ID NO: 87951, SEQ ID NO: 88144, SEQ ID NO: 95593 내지 95664, SEQ ID NO: 113808 내지 113869, SEQ ID NO: 125134 내지 125218, SEQ ID NO: 144109 내지 144188, SEQ ID NO: 162383 내지 162453, SEQ ID NO: 166444 내지 166531, SEQ ID NO: 167118, SEQ ID NO: 169740, SEQ ID NO: 173412, SEQ ID NO: 179404, 및 SEQ ID NO: 182574 내지 182654로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 28796 내지 28864, SEQ ID NO: 37110 내지 37174, SEQ ID NO: 41321 내지 41397, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49004, SEQ ID NO: 49071, SEQ ID NO: 49395, SEQ ID NO: 50632, SEQ ID NO: 50729, SEQ ID NO: 51434 내지 51510, SEQ ID NO: 55758, SEQ ID NO: 60456 내지 60527, SEQ ID NO: 68238 내지 68321, SEQ ID NO: 77091, SEQ ID NO: 77210, SEQ ID NO: 84188, SEQ ID NO: 87951, SEQ ID NO: 88144, SEQ ID NO: 95593 내지 95664, SEQ ID NO: 113808 내지 113869, SEQ ID NO: 125134 내지 125218, SEQ ID NO: 144109 내지 144188, SEQ ID NO: 162383 내지 162453, SEQ ID NO: 166444 내지 166531, SEQ ID NO: 167118, SEQ ID NO: 169740, SEQ ID NO: 173412, SEQ ID NO: 179404, 및 SEQ ID NO: 182574 내지 182654로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 28796 내지 28830로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 CTG1B 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 28796 내지 28830로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 28796 내지 28830로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 28796 내지 28830로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 CTG1B 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 41321 내지 41354로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 MAGA1 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 41321 내지 41354로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 41321 내지 41354로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 41321 내지 41354로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 MAGA1 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49004, 및 SEQ ID NO: 51434 내지 51468로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 MAGA3 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49004, 및 SEQ ID NO: 51434 내지 51468로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49004, 및 SEQ ID NO: 51434 내지 51468로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49004, 및 SEQ ID NO: 51434 내지 51468로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 MAGA3 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 41352, SEQ ID NO: 41770, 및 SEQ ID NO: 60456 내지 60487로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 MAGA4 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 41352, SEQ ID NO: 41770, 및 SEQ ID NO: 60456 내지 60487로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 41352, SEQ ID NO: 41770, 및 SEQ ID NO: 60456 내지 60487로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 41352, SEQ ID NO: 41770, 및 SEQ ID NO: 60456 내지 60487로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 MAGA4 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 49395 및 SEQ ID NO: 68238 내지 68272로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 MAGC1 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 49395 및 SEQ ID NO: 68238 내지 68272로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 49395 및 SEQ ID NO: 68238 내지 68272로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 49395 및 SEQ ID NO: 68238 내지 68272로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 MAGC1 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 77091, SEQ ID NO: 77210, SEQ ID NO: 84188, SEQ ID NO: 88144, 및 SEQ ID NO: 95593 내지 95624로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 MAGC3 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 77091, SEQ ID NO: 77210, SEQ ID NO: 84188, SEQ ID NO: 88144, 및 SEQ ID NO: 95593 내지 95624로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 77091, SEQ ID NO: 77210, SEQ ID NO: 84188, SEQ ID NO: 88144, 및 SEQ ID NO: 95593 내지 95624로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 77091, SEQ ID NO: 77210, SEQ ID NO: 84188, SEQ ID NO: 88144, 및 SEQ ID NO: 95593 내지 95624로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 MAGC3 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 162383 내지 162420로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SSX2 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 162383 내지 162420로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 162383 내지 162420로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 162383 내지 162420로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 SSX2 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 144109 내지 144142로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 PRAME 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 144109 내지 144142로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 144109 내지 144142로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 144109 내지 144142로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 PRAME 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 37110 내지 37145로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 KKLC1 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 37110 내지 37145로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 37110 내지 37145로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 37110 내지 37145로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 KKLC1 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 125134 내지 125167로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 PMEL 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 125134 내지 125167로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 125134 내지 125167로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 125134 내지 125167로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 PMEL 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 166444 내지 166480로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TYRP1 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 166444 내지 166480로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 166444 내지 166480로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 166444 내지 166480로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 TYRP1 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 169740, SEQ ID NO: 173412, SEQ ID NO: 179404, 및 SEQ ID NO: 182574 내지 182606로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TYRP2 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 169740, SEQ ID NO: 173412, SEQ ID NO: 179404, 및 SEQ ID NO: 182574 내지 182606로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 169740, SEQ ID NO: 173412, SEQ ID NO: 179404, 및 SEQ ID NO: 182574 내지 182606로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 169740, SEQ ID NO: 173412, SEQ ID NO: 179404, 및 SEQ ID NO: 182574 내지 182606로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 TYRP2 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 113808 내지 113843로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 MAR1 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 113808 내지 113843로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 113808 내지 113843로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 113808 내지 113843로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 MAR1 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
한 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 28796 내지 28864, SEQ ID NO: 37110 내지 37174, SEQ ID NO: 41321 내지 41397, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49004, SEQ ID NO: 49071, SEQ ID NO: 49395, SEQ ID NO: 50632, SEQ ID NO: 50729, SEQ ID NO: 51434 내지 51510, SEQ ID NO: 55758, SEQ ID NO: 60456 내지 60527, SEQ ID NO: 68238 내지 68321, SEQ ID NO: 77091, SEQ ID NO: 77210, SEQ ID NO: 84188, SEQ ID NO: 87951, SEQ ID NO: 88144, SEQ ID NO: 95593 내지 95664, SEQ ID NO: 113808 내지 113869, SEQ ID NO: 125134 내지 125218, SEQ ID NO: 144109 내지 144188, SEQ ID NO: 162383 내지 162453, SEQ ID NO: 166444 내지 166531, SEQ ID NO: 167118, SEQ ID NO: 169740, SEQ ID NO: 173412, SEQ ID NO: 179404, 및 SEQ ID NO: 182574 내지 182654로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 제공한다.
일부 실시예에서, 핵산 서열은 SEQ ID NO: 28796 내지 28864, SEQ ID NO: 37110 내지 37174, SEQ ID NO: 41321 내지 41397, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49004, SEQ ID NO: 49071, SEQ ID NO: 49395, SEQ ID NO: 50632, SEQ ID NO: 50729, SEQ ID NO: 51434 내지 51510, SEQ ID NO: 55758, SEQ ID NO: 60456 내지 60527, SEQ ID NO: 68238 내지 68321, SEQ ID NO: 77091, SEQ ID NO: 77210, SEQ ID NO: 84188, SEQ ID NO: 87951, SEQ ID NO: 88144, SEQ ID NO: 95593 내지 95664, SEQ ID NO: 113808 내지 113869, SEQ ID NO: 125134 내지 125218, SEQ ID NO: 144109 내지 144188, SEQ ID NO: 162383 내지 162453, SEQ ID NO: 166444 내지 166531, SEQ ID NO: 167118, SEQ ID NO: 169740, SEQ ID NO: 173412, SEQ ID NO: 179404, 및 SEQ ID NO: 182574 내지 182654로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 28796 내지 28864, SEQ ID NO: 37110 내지 37174, SEQ ID NO: 41321 내지 41397, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49004, SEQ ID NO: 49071, SEQ ID NO: 49395, SEQ ID NO: 50632, SEQ ID NO: 50729, SEQ ID NO: 51434 내지 51510, SEQ ID NO: 55758, SEQ ID NO: 60456 내지 60527, SEQ ID NO: 68238 내지 68321, SEQ ID NO: 77091, SEQ ID NO: 77210, SEQ ID NO: 84188, SEQ ID NO: 87951, SEQ ID NO: 88144, SEQ ID NO: 95593 내지 95664, SEQ ID NO: 113808 내지 113869, SEQ ID NO: 125134 내지 125218, SEQ ID NO: 144109 내지 144188, SEQ ID NO: 162383 내지 162453, SEQ ID NO: 166444 내지 166531, SEQ ID NO: 167118, SEQ ID NO: 169740, SEQ ID NO: 173412, SEQ ID NO: 179404, 및 SEQ ID NO: 182574 내지 182654로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 대상체에 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 28796 내지 28864, SEQ ID NO: 37110 내지 37174, SEQ ID NO: 41321 내지 41397, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49004, SEQ ID NO: 49071, SEQ ID NO: 49395, SEQ ID NO: 50632, SEQ ID NO: 50729, SEQ ID NO: 51434 내지 51510, SEQ ID NO: 55758, SEQ ID NO: 60456 내지 60527, SEQ ID NO: 68238 내지 68321, SEQ ID NO: 77091, SEQ ID NO: 77210, SEQ ID NO: 84188, SEQ ID NO: 87951, SEQ ID NO: 88144, SEQ ID NO: 95593 내지 95664, SEQ ID NO: 113808 내지 113869, SEQ ID NO: 125134 내지 125218, SEQ ID NO: 144109 내지 144188, SEQ ID NO: 162383 내지 162453, SEQ ID NO: 166444 내지 166531, SEQ ID NO: 167118, SEQ ID NO: 169740, SEQ ID NO: 173412, SEQ ID NO: 179404, 및 SEQ ID NO: 182574 내지 182654로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 생체내 발현을 위한 구조체 내에서 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 II 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 CTG1B, KKLC1, MAGA1, MAGA3, MAGA4, MAGC1, MAGC3, MAR1, PMEL, PRAME, SSX2, TYRP1, 및 TYRP2로 구성된 군으로부터 선택된 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 췌장암, 피부암, 갑상선암, 뇌암, 결장직장암, 기관지 및 폐암, 유방암, 및 난소암로 구성된 군으로부터 선택된다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 28796 내지 28864, SEQ ID NO: 37110 내지 37174, SEQ ID NO: 41321 내지 41397, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49004, SEQ ID NO: 49071, SEQ ID NO: 49395, SEQ ID NO: 50632, SEQ ID NO: 50729, SEQ ID NO: 51434 내지 51510, SEQ ID NO: 55758, SEQ ID NO: 60456 내지 60527, SEQ ID NO: 68238 내지 68321, SEQ ID NO: 77091, SEQ ID NO: 77210, SEQ ID NO: 84188, SEQ ID NO: 87951, SEQ ID NO: 88144, SEQ ID NO: 95593 내지 95664, SEQ ID NO: 113808 내지 113869, SEQ ID NO: 125134 내지 125218, SEQ ID NO: 144109 내지 144188, SEQ ID NO: 162383 내지 162453, SEQ ID NO: 166444 내지 166531, SEQ ID NO: 167118, SEQ ID NO: 169740, SEQ ID NO: 173412, SEQ ID NO: 179404, 및 SEQ ID NO: 182574 내지 182654로 구성된 군으로부터 선택된 3개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 28796 내지 28864, SEQ ID NO: 37110 내지 37174, SEQ ID NO: 41321 내지 41397, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49004, SEQ ID NO: 49071, SEQ ID NO: 49395, SEQ ID NO: 50632, SEQ ID NO: 50729, SEQ ID NO: 51434 내지 51510, SEQ ID NO: 55758, SEQ ID NO: 60456 내지 60527, SEQ ID NO: 68238 내지 68321, SEQ ID NO: 77091, SEQ ID NO: 77210, SEQ ID NO: 84188, SEQ ID NO: 87951, SEQ ID NO: 88144, SEQ ID NO: 95593 내지 95664, SEQ ID NO: 113808 내지 113869, SEQ ID NO: 125134 내지 125218, SEQ ID NO: 144109 내지 144188, SEQ ID NO: 162383 내지 162453, SEQ ID NO: 166444 내지 166531, SEQ ID NO: 167118, SEQ ID NO: 169740, SEQ ID NO: 173412, SEQ ID NO: 179404, 및 SEQ ID NO: 182574 내지 182654로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 28796 내지 28864, SEQ ID NO: 37110 내지 37174, SEQ ID NO: 41321 내지 41397, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49004, SEQ ID NO: 49071, SEQ ID NO: 49395, SEQ ID NO: 50632, SEQ ID NO: 50729, SEQ ID NO: 51434 내지 51510, SEQ ID NO: 55758, SEQ ID NO: 60456 내지 60527, SEQ ID NO: 68238 내지 68321, SEQ ID NO: 77091, SEQ ID NO: 77210, SEQ ID NO: 84188, SEQ ID NO: 87951, SEQ ID NO: 88144, SEQ ID NO: 95593 내지 95664, SEQ ID NO: 113808 내지 113869, SEQ ID NO: 125134 내지 125218, SEQ ID NO: 144109 내지 144188, SEQ ID NO: 162383 내지 162453, SEQ ID NO: 166444 내지 166531, SEQ ID NO: 167118, SEQ ID NO: 169740, SEQ ID NO: 173412, SEQ ID NO: 179404, 및 SEQ ID NO: 182574 내지 182654로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 197897 내지 197901로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 CTG1B 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 197897 내지 197901로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 197897 내지 197901로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 197897 내지 197901로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 CTG1B 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 211901 내지 211904로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 MAGA1 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 211901 내지 211904로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 211901 내지 211904로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 211901 내지 211904로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 MAGA1 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 223623 내지 223627로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 MAGA3 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 223623 내지 223627로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 223623 내지 223627로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 223623 내지 223627로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 MAGA3 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 236016 내지 236020로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 MAGA4 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 236016 내지 236020로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 236016 내지 236020로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 236016 내지 236020로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 MAGA4 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 247059 내지 247063로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 MAGC1 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 247059 내지 247063로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 247059 내지 247063로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 247059 내지 247063로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 MAGC1 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 281350 내지 281353로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 MAGC3 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 281350 내지 281353로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 281350 내지 281353로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 281350 내지 281353로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 MAGC3 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 369027 내지 369031로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SSX2 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 369027 내지 369031로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 369027 내지 369031로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 369027 내지 369031로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 SSX2 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 342521 내지 342525로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 PRAME 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 342521 내지 342525로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 342521 내지 342525로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 342521 내지 342525로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 PRAME 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 206663 내지 206665로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 KKLC1 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 206663 내지 206665로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 206663 내지 206665로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 206663 내지 206665로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 KKLC1 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 317360 내지 317363로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 PMEL 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 317360 내지 317363로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 317360 내지 317363로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 317360 내지 317363로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 PMEL 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 373348 내지 373350로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TYRP1 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 373348 내지 373350로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 373348 내지 373350로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 373348 내지 373350로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 TYRP1 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 392434 내지 392437로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TYRP2 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 392434 내지 392437로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 392434 내지 392437로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 392434 내지 392437로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 TYRP2 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 305566 내지 305570로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 MAR1 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 305566 내지 305570로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 305566 내지 305570로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 305566 내지 305570로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 MAR1 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
자가면역질환 백신
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 34169 내지 34204로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 INS 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 34169 내지 34204로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 34169 내지 34204로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 34169 내지 34204로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 INS 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 116478 내지 116515로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 MOG 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 116478 내지 116515로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 116478 내지 116515로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 116478 내지 116515로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 MOG 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 203517 내지 203521로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 INS 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 203517 내지 203521로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 203517 내지 203521로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 203517 내지 203521로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 INS 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 307670 내지 307674로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 MOG 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 307670 내지 307674로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 307670 내지 307674로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 307670 내지 307674로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 MOG 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다음 도면은 본 발명의 예시적인 실시예를 도시한다.
도 1은 백신 최적화 방법의 순서도이다.
도 2는 시드(see) 세트 압축을 사용한 백신 최적화 방법의 순서도이다.
도 3A-3D는 돌연변이 BRAF V600E 및 BRAF V600M(도 3A); EGFR A289V, EGRF G598V 및 EGFR L858R(도 3B); KRAS G12D, KRAS G12V, KRAS G12R, KRAS G12C, KRAS G13D, KRAS G12A 및 KRAS G12S (도 3C); 그리고 PIK3CA E542K, PIK3CA E545K 및 PIK3CA H1047R(도 3D)에 대한 백신 크기별 단일 표적 MHC 클래스 I 백신의 예상 모집단 범위를 보여준다.
도 4A-4C는 돌연변이 IDH1 R132H 및 IDH1 R132C(도 4A); NRAS Q61R, NRAS Q61K 및 NRAS Q61L(도 4B); 그리고 TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R273C 및 TP53 R273H(도 4C)에 대한 백신 크기별 단일 표적 MHC 클래스 I 백신의 예상 모집단 범위를 보여준다.
도 5A-5D는 돌연변이 BRAF V600E 및 BRAF V600M(도 5A); EGFR A289V, EGRF G598V 및 EGFR L858R(도 5B); KRAS G12D, KRAS G12V, KRAS G12R, KRAS G12C, KRAS G13D, KRAS G12A 및 KRAS G12S (도 5C); 그리고 PIK3CA E542K, PIK3CA E545K 및 PIK3CA H1047R(도 5D)에 대한 백신 크기별 단일 표적 MHC 클래스 II 백신의 예상 모집단 범위를 보여준다.
도 6A-6C는 돌연변이 IDH1 R132H 및 IDH1 R132C(도 6A); NRAS Q61R, NRAS Q61K 및 NRAS Q61L(도 6B); 그리고 TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R273C 및 TP53 R273H(도 6C)에 대한 백신 크기별 단일 표적 MHC 클래스 II 백신의 예상 모집단 범위를 보여준다.
도 7은 다양한 암에 걸친 다양한 돌연변이 단백질 표적에 대한 각각의 표적 제시 확률을 보여주는 표이다.
도 8은 다중 표적 (복합) 백신 최적화 방법을 보여주는 순서도이다 .
도 9A-9D는 췌장암(도 9A), 결장직장암(도 9B), 뇌암(도 9C) 및 갑상선암(도 9D)에 대한 백신 크기별 다중 표적 (복합) MHC 클래스 I 백신의 예상 모집단 범위를 보여준다.
도 10A-10B는 기관지 및 폐암(도 10A) 및 피부암(도 10B)에 대한 백신 크기별 다중 표적 (복합) MHC 클래스 I 백신의 예상 모집단 범위를 보여준다.
도 11A-11D는 췌장암(도 11A), 결장직장암(도 11B), 뇌암(도 11C) 및 갑상선암(도 11D)에 대한 백신 크기별 다중 표적 (복합) MHC 클래스 II 백신의 예상 모집단 범위를 보여준다.
도 12A-12B는 기관지 및 폐암(도 12A) 및 피부암(도 12B)에 대한 백신 크기별 다중 표적 (복합) MHC 클래스 II 백신의 예상 모집단 범위를 보여준다.
도 13은 복합 백신 설계 절차를 위한 MERGEMULTI 함수의 파이썬 구현 예를 보여준다.
도 14는 HLA 이배체형 HLA-A 02:03, HLA-A 11:01, HLA-B55:02, HLA-B58:01, HLA-C03:02, HLA-C03:03에 대한 KRAS G12V 백신의 백신 크기별 예측 펩티드-HLA 적중을 보여준다.
도 1은 백신 최적화 방법의 순서도이다.
도 2는 시드(see) 세트 압축을 사용한 백신 최적화 방법의 순서도이다.
도 3A-3D는 돌연변이 BRAF V600E 및 BRAF V600M(도 3A); EGFR A289V, EGRF G598V 및 EGFR L858R(도 3B); KRAS G12D, KRAS G12V, KRAS G12R, KRAS G12C, KRAS G13D, KRAS G12A 및 KRAS G12S (도 3C); 그리고 PIK3CA E542K, PIK3CA E545K 및 PIK3CA H1047R(도 3D)에 대한 백신 크기별 단일 표적 MHC 클래스 I 백신의 예상 모집단 범위를 보여준다.
도 4A-4C는 돌연변이 IDH1 R132H 및 IDH1 R132C(도 4A); NRAS Q61R, NRAS Q61K 및 NRAS Q61L(도 4B); 그리고 TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R273C 및 TP53 R273H(도 4C)에 대한 백신 크기별 단일 표적 MHC 클래스 I 백신의 예상 모집단 범위를 보여준다.
도 5A-5D는 돌연변이 BRAF V600E 및 BRAF V600M(도 5A); EGFR A289V, EGRF G598V 및 EGFR L858R(도 5B); KRAS G12D, KRAS G12V, KRAS G12R, KRAS G12C, KRAS G13D, KRAS G12A 및 KRAS G12S (도 5C); 그리고 PIK3CA E542K, PIK3CA E545K 및 PIK3CA H1047R(도 5D)에 대한 백신 크기별 단일 표적 MHC 클래스 II 백신의 예상 모집단 범위를 보여준다.
도 6A-6C는 돌연변이 IDH1 R132H 및 IDH1 R132C(도 6A); NRAS Q61R, NRAS Q61K 및 NRAS Q61L(도 6B); 그리고 TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R273C 및 TP53 R273H(도 6C)에 대한 백신 크기별 단일 표적 MHC 클래스 II 백신의 예상 모집단 범위를 보여준다.
도 7은 다양한 암에 걸친 다양한 돌연변이 단백질 표적에 대한 각각의 표적 제시 확률을 보여주는 표이다.
도 8은 다중 표적 (복합) 백신 최적화 방법을 보여주는 순서도이다 .
도 9A-9D는 췌장암(도 9A), 결장직장암(도 9B), 뇌암(도 9C) 및 갑상선암(도 9D)에 대한 백신 크기별 다중 표적 (복합) MHC 클래스 I 백신의 예상 모집단 범위를 보여준다.
도 10A-10B는 기관지 및 폐암(도 10A) 및 피부암(도 10B)에 대한 백신 크기별 다중 표적 (복합) MHC 클래스 I 백신의 예상 모집단 범위를 보여준다.
도 11A-11D는 췌장암(도 11A), 결장직장암(도 11B), 뇌암(도 11C) 및 갑상선암(도 11D)에 대한 백신 크기별 다중 표적 (복합) MHC 클래스 II 백신의 예상 모집단 범위를 보여준다.
도 12A-12B는 기관지 및 폐암(도 12A) 및 피부암(도 12B)에 대한 백신 크기별 다중 표적 (복합) MHC 클래스 II 백신의 예상 모집단 범위를 보여준다.
도 13은 복합 백신 설계 절차를 위한 MERGEMULTI 함수의 파이썬 구현 예를 보여준다.
도 14는 HLA 이배체형 HLA-A 02:03, HLA-A 11:01, HLA-B55:02, HLA-B58:01, HLA-C03:02, HLA-C03:03에 대한 KRAS G12V 백신의 백신 크기별 예측 펩티드-HLA 적중을 보여준다.
일부 실시예에서, 본 개시내용은 세포 상의 주요 조직적합성 복합체(MHC) 분자에 의해 표시되고 암 또는 병원체 질환 세포를 인식하도록 면역계를 훈련시키는 펩티드 서열을 포함하는 펩티드 백신을 제공한다. 일부 실시예에서, 본 개시내용은 자가면역 질환을 위한 항원 특이적 면역요법에서 치료적 내성을 유도하기 위해 세포 상의 주요 조직적합성 복합체(MHC) 분자에 의해 표시되는 펩티드 서열을 포함하는 펩티드 백신을 제공한다(Alhadj Ali et al., 2017, Gibson, et al. 2015). 일부 실시예에서, 펩티드 백신은 하나 이상의 펩티드로 구성된 조성물이다. 일부 실시예에서, 펩티드 백신은 하나 이상의 펩티드를 암호화하는 생체 내 발현을 위해 투여되는 mRNA 또는 DNA 구조체이다.
MHC 분자에 의한 펩티드 표시는 펩티드가 면역원성을 갖고 개체의 T 세포가 생성된 펩티드-MHC 복합체를 인식하여 T 세포 활성화, 확장 및 면역 기억을 유발하기 위해 필요하지만 충분하지는 않다. 일부 실시예에서, ELISPOT(Slota et al., 2011) 또는 면역 분석 및 면역 수용체 서열(MIRA) 분석의 조합을 사용한 항원 특이적 T 세포 수용체의 다중 식별(Klinger et al., 2015)은 MHC 분자(예: HLA 대립유전자)에 의한 펩티드 표시(예: 펩티드 결합을 필요로 하는 펩티드 면역원성)의 점수(예: 펩티드-HLA 결합 점수로 측정)에 사용된다. 일부 실시예에서, ELISPOT(Slota et al., 2011) 또는 면역 분석 및 면역 수용체 서열(MIRA) 분석의 조합을 사용한 항원 특이적 T 세포 수용체의 다중 식별(MIRA) 분석(Klinger et al., 2015)과 같은 분석의 실험 데이터는 주어진 실험 상황 또는 개인에서 펩티드 및 HLA 대립유전자에 대한 펩티드-HLA 면역원성 메트릭을 생성하는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, ELISPOT(Slota et al., 2011) 또는 면역 분석 및 면역 수용체 서열(MIRA) 분석의 조합을 사용한 항원 특이적 T 세포 수용체의 다중 식별(MIRA) 분석(Klinger et al., 2015)과 같은 분석의 실험 데이터는 MHC 분자(예: HLA 대립유전자)에 의한 펩티드 표시(예: 결합 친화성)의 점수(예: 펩티드-HLA 결합 점수로 측정) 또는 펩티드-HLA 면역원성 메트릭을 결정하기 위한 기계 학습 기반 예측과 결합될 수 있다. 일부 실시예에서, MHCflurry 또는 NetMHCpan(Reynisson et al., 2020) 계산 방법(당업계에 공지된 바와 같음)은 HLA 대립유전자에 의한 펩티드의 MHC 클래스 I 표시를 예측하는 데 사용된다(표 1 참조). 일부 실시예에서, NetMHHCIIpan 계산 방법(Reynisson et al., 2020)은 HLA 대립유전자에 의한 펩티드의 MHC 클래스 II 표시를 예측하는 데 사용된다(표 2 참조).
일부 실시예에서, MHCflurry(Odonnell et al., 2018, Odonnell et al., 2020, 전체 내용이 본원에 참조로 포함됨), NetMHCpan(Reynisson et al., 2020, 전체 내용이 본원에 참조로 포함됨) 및 NetMHCIIpan(Reynisson et al., 2020)와 같은 계산 방법은 HLA 대립유전자에 의한 펩티드의 MHC 클래스 I(MHCflurry, NetMHCpan) 또는 클래스 II(NetMHCIIpan) 표시를 예측하는 데 사용된다. 다른 실시예에서, 펩티드-HLA 결합을 결정하는 기타 방법은 국제 공개 번호 WO 2005/042698(전체 내용이 본원에 참조로 포함됨)에 개시된 바와 같이 사용된다. NetMHCpan-4.1 및 NetMHCIIpan-4.0은 펩티드-HLA 결합을 예측하기 위해 NNAlign_MA 알고리즘(Alvarez et al., 2019, 전체 내용이 본원에 참조로 포함됨)을 사용한다. NNAlign_MA는 결과적으로 NNAlign(Nielsen et al., 2009, Nielsen et al., 2017, 전체 내용이 본원에 참조로 포함됨) 신경망을 기반으로 한다. NetMHCpan-4.1(Reynisson et al., 2020)은 펩티드 서열를 설명하는 최소 180개의 입력(9 x 20 = 180 입력)이 있는 NNAlign_MA 네트워크를 사용한다. 56 및 66개의 은닉 뉴런과 2개의 출력이 있는 네트워크를 사용한다(Alvarez et al., 2019). 각 네트워크 아키텍처(56개 또는 66개 은닉 뉴런)는 5개의 서로 다른 임의 매개변수 초기화 및 5중 교차 검증으로 훈련되어 총 50개의 개별 훈련된 네트워크가 생성된다(2개 아키텍처 x 5개 초기화 x 5개 교차 검증). 이 50개의 훈련된 네트워크는 최소 10,800개의 매개변수(180개 입력 x 56개 뉴런)가 있는 25개 네트워크와 최소 11,880개 매개변수(180개 입력 x 66개 뉴런)로 구성된 25개 네트워크의 앙상블로 사용된다. 따라서 NetMHCpan-4.1에서 50개 네트워크의 앙상블은 펩티드-MHC 결합을 계산하기 위해 최소 567,000개의 산술 연산으로 평가되어야 하는 최소 567,000개의 매개변수로 구성된다. NetMHCIIpan-4.1 (Reynisson et al., 2020)은 펩티드 서열을 설명하는 최소 180개의 입력(9 x 20 = 180 입력)이 있는 NNAlign_MA 네트워크를 사용한다. 2, 10, 20, 40, 60개의 은닉 뉴런과 2개의 출력이 있는 네트워크를 사용한다(Alvarez et al., 2019). 각 네트워크 아키텍처(2, 10, 20, 40 또는 60개 은닉 뉴런)는 10개의 서로 다른 임의 매개변수 초기화 및 5중 교차 검증으로 훈련되어 총 250개의 개별 훈련된 네트워크가 생성된다(5개 아키텍처 x 10개 초기화 x 5개 교차 검증) 이 250개의 훈련된 네트워크는 최소 360개의 매개변수(180개 입력 x 2개 뉴런)가 있는 50개 네트워크, 최소 1800개 매개변수(180개 입력 x 10개 뉴런)가 있는 50개 네트워크, 최소 3600개 매개변수(180개 입력 x 20개 뉴런)가 있는 50개 네트워크, 최소 7200개의 매개변수(180개의 입력 x 40개의 뉴런) 및 최소 10,800개의 매개변수(180개의 입력 x 60개의 뉴런)가 있는 50개의 네트워크의 앙상블로 사용된다. 따라서 NetMHCIIpan-4.0에서 250개 네트워크의 앙상블은 펩티드-MHC 결합을 계산하기 위해 최소 1,188,000개의 산술 연산으로 평가되어야 하는 최소 1,188,000개의 매개변수로 구성된다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I(예: MHCflurry, NetMHCpan) 또는 클래스 II(예: NetMHCIIpan) 펩티드-HLA 결합 점수 또는 펩티드-HLA 면역원성 메트릭을 예측하기 위해 사용되는 계산 방법은 MHC 분자에 의해 결합된 펩티드의 실험적 질량 분석 관찰 데이터를 기반으로 한다. 일부 실시예에서, MHC 클래스 I(예: MHCflurry, NetMHCpan) 또는 클래스 II(예: NetMHCIIpan) 펩티드-HLA 결합 점수 또는 펩티드-HLA 면역원성 메트릭을 예측하기 위해 사용되는 계산 방법은 펩티드-MHC 결합 친화도의 실험적 관찰 데이터를 기반으로 한다. 일부 실시예에서, 펩티드-HLA 결합의 질량 분석 측정 및 T 세포 활성화의 측정을 포함하는 펩티드-MHC 결합 친화성 또는 면역원성의 실험적 관찰은 면역 에피토프 데이터베이스(IEDB)와 같은 데이터베이스에서 찾을 수 있다(Vita et al., 2018). MHCflurry 2.0 출력(Odonnell et al., 2020, 전체 내용이 본원에 참조로 포함됨)은 493,473개 펩티드-HLA 결합의 질량 분석 측정값과 219,596개의 펩티드-HLA 결합 친화도 측정값을 기반으로 한다. NetMHCpan-4.1 (Reynisson et al., 2020) 출력은 665,492개 펩티드-HLA 결합의 질량 분석 측정값과 52,402개의 펩티드-HLA 결합 친화성 측정값을 기반으로 한다. NetMHCIIpan-4.0 (Reynisson et al., 2020) 출력은 381,066개 펩티드-HLA 결합의 질량 분석 측정값과 44,861개 펩티드-HLA 결합의 친화성 측정값을 기반으로 한다.
펩티드는 MHC 분자의 홈 내에서 결합하여 T 세포 수용체가 인식할 수 있는 세포 표면으로 운반될 때 MHC 분자에 의해 표시된다. 표적 펩티드는 외래 펩티드 또는 자가 펩티드를 지칭한다. 일부 실시예에서, 건강한 개체에서 정상 프로테옴의 일부인 펩티드는 자가 펩티드이고, 정상 프로테옴의 일부가 아닌 펩티드는 외래 펩티드이다. 일부 실시예에서, 표적 펩티드는 이상 발현을 보이는 정상 프로테옴의 일부일 수 있다 (예: NY-ESO-1과 같은 암-고환 항원). 외래 펩티드는 신생항원이라고 하는 에피토프를 생성하는 종양 세포의 정상 자가 단백질 돌연변이 또는 병원성 감염에 의해 생성될 수 있다. 일부 실시예에서, 신생항원은 인간 단백질의 임의의 하위 서열이며, 여기서 하위 서열은 건강한 개체에서 나타나지 않는 하나 이상의 변경된 아미노산 또는 단백질 변형을 포함한다. 따라서, 본 개시내용에서 외래 펩티드는 표적 단백질/펩티드(또는 전장 단백질/펩티드)의 단편을 암호화하는 아미노산 서열을 의미하며, 표적 단백질/펩티드는 신생항원 단백질, 병원체 프로테옴 또는 HLA 대립유전자에 의해 결합 및 표시될 것으로 예상되는 기타 원치 않는 비자기 단백질로 구성된다.
암에서 자주 돌연변이되는 UniProt ID로 식별되는 단백질 유전자에는 AKT1_HUMAN, BRAF_HUMAN, EGFR_HUMAN, GTF2I_HUMAN, RASH_HUMAN(HRAS라고도 함), IDHC_HUMAN(IDH1이라고도 함), RASK_HUMAN(KRAS라고도 함), RASN_HUMAN(NRAS라고도 함), PIK3CA_HUMAN, PTEN_HUMAN 및 P53_HUMAN(TP53이라고도 함)이 포함된다. 야생형 아미노산의 1자 아미노산 코드, 돌연변이의 아미노산 위치 및 돌연변이 단백질에 존재하는 1자 아미노산 코드로 단백질의 과오 돌연변이를 설명한다. 예를 들어, KRAS G12D는 12번 위치의 KRAS 단백질의 글리신에서 아스파르트산(G12D)으로의 돌연변이이다. 단백질은 서로 다른 위치에 여러 돌연변이를 포함할 수 있다. 본원에서는 간결성을 위해 "_HUMAN" 접미사 없이 유전자를 지칭할 수 있다.
KRAS 유전자 돌연변이는 암에서 가장 빈번하게 변이되는 발암유전자이지만 저분자 치료제로 사용하기 매우 어려웠다. KRAS 단백질은 세포 성장을 통제하는 신호 전달 경로의 일부이며, 단백질의 점 돌연변이는 구성 경로 활성화 및 통제되지 않은 세포 성장을 유발할 수 있다. 단일 아미노산 KRAS 돌연변이는 단백질 구조에 미미한 변화를 초래하여 돌연변이 특이적 결합 포켓을 인식하고 KRAS 신호 전달을 비활성화하는 저분자 약물을 설계하기 어렵게 만든다. KRAS 발암성 돌연변이에는 12번 위치가 글리신에서 아스파르트산(G12D), 글리신에서 발린(G12V), 글리신에서 아르기닌(G12R) 또는 글리신에서 시스틴(G12C)으로의 돌연변이, 또는 13번 위치가 글리신에서 아스파르트산(G13D)으로의 돌연변이가 포함된다. 상응하는 외래 펩티드는 이러한 돌연변이들을 포함하고 있다. KRAS는 HRAS 및 NRAS를 포함하는 RAS 유전자 계열의 일원이다. KRAS, HRAS 및 NRAS는 잔기 1에서 잔기 86까지 동일한 서열을 가지고 있다. 따라서, 한 RAS 계열 일원의 돌연변이에 대해 본원에 기재된 모든 백신 및 펩티드 서열은 임의의 다른 RAS 계열 일원의 동일한 돌연변이에 대해 사용될 수 있다 (예를 들어, KRAS G12D 백신은 HRAS G12D에 대한 백신이기도 하다).
암-고환 항원과 같은 특정 자가 단백질은 암성세포에 비정상적으로 높은 수준으로 존재하므로 MHC 분자에 이러한 자가 단백질에서 유래한 펩티드를 표시하는 세포에 대해 과민성 T 세포 반응을 유도하는 백신 접종의 표적이 될 수 있다. UniProt ID에 따른 이러한 암 관련 단백질의 예로 CTG1B_HUMAN(NY-ESO-1이라고도 함), MAGA1_HUMAN, MAGA3_HUMAN, MAGA4_HUMAN, MAGC1_HUMAN, MAGC3_HUMAN, SSX2_HUMAN, PRAME_HUMAN, KKLC1_HUMAN(CT83이라고도 함), PMEL_HUMAN(gp100이라고도 함), TYRP1_HUMAN(gp75라고도 함), TYRP2_HUMAN(DCT라고도 함) 및 MAR1_HUMAN이 포함된다.
자가면역질환은 자가 단백질에 대한 면역 체계의 자가 내성 상실로 인해 발생하며 당뇨병, 다발성경화증, 자가면역뇌척수염과 같은 자가면역 질환과 관련이 있다. 자가면역 관련 자가 펩티드의 내성 유도는 내약화 프로토콜을 통한 백신 항원 전달을 이용한 항원 특이적 내성화에 의해 달성될 수 있다. 지질 나노 입자(LNP) 캡슐화(mRNA-LNP) 백신을 사용한 내성 유도 프로토콜의 예는 Krienke et al., 2021에 기술되어 있으며 전체 내용이 본원에 참조로 포함된다. 자가면역 질환 관련 단백질의 예로는 UniProt ID INS_HUMAN(인슐린이라고도 함) 및 MOG_HUMAN(미엘린-희소돌기아교세포 당단백질이라고도 함)이 있다. 당뇨병 환자는 INS_HUMAN에 대한 내성 부족으로 고통받을 수 있으며, 다발성 경화증 또는 자가면역 뇌척수염 환자는 MOG_HUMAN에 대한 내성 부족으로 고통받을 수 있다.
펩티드 백신 설계에서 나타나는 한 가지 문제는 표시할 펩티드 서열에 대해 각각 특정한 선호도를 갖는 인간 MHC 대립유전자(HLA 대립유전자)의 다양성이다. MHC 내에 있는 인간 백혈구 항원(HLA) 유전자좌는 HLA 클래스 I 및 클래스 II 분자를 암호화한다. 3개의 전통 클래스 I 유전자좌 (HLA-A, HLA-B 및 HLA-C)와 클래스 II 분자를 암호화하는 3개의 유전자좌(HLA-DR, HLA-DQ 및 HLA-DP)가 있다. 개체의 HLA 유형은 이러한 각 유전자좌에 있는 대립 유전자를 설명한다. 약 8 내지 11개 잔기 사이 길이의 펩티드는 HLA 클래스 I(또는 MHC 클래스 I) 분자에 결합할 수 있는 반면, 약 13 내지 약 25개 사이 잔기 길이의 펩티드는 HLA 클래스 II(또는 MHC 클래스 II) 분자에 결합한다(Rist et al., 2013; Chicz et al., 1992). 서로 다른 지역에서 유래한 인간 개체군은 HLA 대립유전자의 빈도가 다르며, 이러한 개체군은 HLA 유전자좌 간의 연관 불균형을 나타내어 개체군별 일배체형 빈도를 초래한다. 일부 실시예에서, 표적 집단에서의 HLA 대립형질 빈도뿐만 아니라, 견고하게 표시될 가능성이 있는 일련의 펩티드 세트를 달성하기 위해 HLA 유전자 사이의 연관 불균형을 고려하는 것을 포함하는 효과적인 백신을 제조하는 방법이 개시된다.
본 개시내용은 단일 또는 다중 표적에 대한 면역을 생성하는 백신 설계의 조성물, 시스템 및 방법을 제공한다. 일부 실시예에서, 표적은 신생항원 단백질 서열, 병원체 프로테옴, 또는 HLA 분자에 의해 결합되어 표시될 것으로 예상되는 임의의 다른 원치 않는 단백질 서열(본원에서는 HLA 대립유전자라고도 함)이다. 표적이 개체에 존재하면 다양한 HLA 대립유전자에 의해 표시되는 다중 펩티드 서열이 생성될 수 있다. 일부 실시예에서는, 선택된 자가 펩티드를 포함하는 백신을 만드는 것이 바람직할 수 있으며, 따라서 이렇게 선택된 자가 펩티드는 이러한 목적의 표적 펩티드로 간주된다.
펩티드-HLA 결합이라는 용어는 펩티드가 HLA 대립유전자에 결합하는 것으로 정의되며, 계산적으로 예측하거나, 실험적으로 관찰하거나, 실험적 관찰을 통해 계산적으로 예측할 수 있다. 펩티드-HLA 결합의 메트릭은 친화도, 백분위수 순위, 미리 결정된 임계값에서의 이진, 확률, 또는 당업계에 알려진 다른 메트릭으로 표현될 수 있다. 펩티드-HLA 면역원성 메트릭이라는 용어는 HLA 대립유전자에 의해 결합했을 때 펩티드를 인식하여 T 세포를 활성화하는 것으로 정의된다. 펩티드-HLA 면역원성 점수라는 용어는 펩티드-HLA 면역원성 메트릭의 또 다른 용어이며, 두 용어는 서로 바꿔서 사용할 수 있다. 펩티드-HLA 면역원성 메트릭은 개체마다 다를 수 있으며, 펩티드-HLA 면역원성 메트릭은 확률, 이진 지표 또는 펩티드-HLA 조합이 면역원성을 가질 가능성과 관련된 기타 메트릭으로 표현될 수 있다. 일부 실시예에서, 펩티드-HLA 면역원성은 HLA 대립유전자에 의해 결합될 때 펩티드의 인식에 기반하여 면역 내성을 유도하는 것으로 정의된다. 펩티드-HLA 면역원성 메트릭은 계산적으로 예측하거나, 실험적으로 관찰하거나, 실험 관찰을 통해 계산적으로로 예측할 수 있다. 일부 실시예에서, 펩티드-HLA 면역원성 메트릭은 펩티드-HLA 결합이 펩티드-HLA 면역원성에 필요하기 때문에 펩티드-HLA 결합에만 기초한다. 일부 실시예에서, 펩티드-HLA 면역원성 데이터 또는 펩티드-HLA 면역원성의 계산적 예측은 본원에 개시된 방법에 포함되고 펩티드 표시를 위한 점수와 결합될 수 있다. 점수를 조합하는 한 가지 방법은 질병에 걸렸거나 백신 접종을 받은 개체의 면역원성에 대해 분석한 펩티드의 면역원성 데이터를 사용하고, 계산 방법에서 표시 가능성이 가장 높을 것으로 예측되는 HLA 대립유전자를 선택하여 개체에서 이를 표시한 HLA 대립유전자에 펩티드를 할당하는 것이다. 실험적으로 분석되지 않은 펩티드의 경우 표시의 계산적 예측을 사용할 수 있다. 일부 실시예에서, 펩티드-HLA 면역원성 또는 펩티드-HLA 결합을 예측하는 상이한 계산 방법을 조합할 수 있다(Liu et al., 2020b). 주어진 펩티드 세트와 HLA 대립유전자 세트의 경우 펩티드-HLA 적중이라는 용어는 펩티드-HLA 면역원성 또는 미리 결정된 임계값에서 결합을 보이는 펩티드와 HLA 대립유전자의 고유한 조합의 수이다. 예를 들어, 펩티드-HLA 적중이 2인 경우 하나의 펩티드가 두 개의 다른 HLA 대립유전자에 의해 결합(또는 T 세포 활성화를 촉발)할 것으로 예측되고, 2개의 펩티드가 서로 다른 두 HLA 대립유전자에 의해 결합(또는 T 세포 활성화를 촉발)할 것으로 예측되거나, 2개의 펩티드가 동일한 HLA 대립유전자에 의해 결합(또는 T 세포 활성화를 촉발)할 것으로 예측된다는 것을 의미할 수 있다. 주어진 펩티드 및 HLA 빈도, HLA 일배체형 빈도 또는 HLA 이배체형 빈도에 대해 예상되는 펩티드-HLA 적중 횟수는 개체을 나타내는 각 HLA 집합의 평균 펩티드-HLA 적중 수를 발생 빈도에 따라 가중치를 부여한 값이다.
면역원성은 개체마다 다를 수 있으므로 백신 효능 확률을 높이는 한 가지 방법은 다양한 표적 펩티드 세트(예: 최소 두 개의 펩티드)를 사용하여 이들 중 일부 하위 집합이 주어진 개체에서 면역원성을 가질 가능성을 높이는 것이다. 마우스 모델을 사용한 이전 연구에 따르면 대부분의 MHC 표시 펩티드가 면역원성을 보여주었지만 이러한 면역원성은 Croft et al.(2019)에 설명된 바와 같이 개체마다 다르다. 일부 실시예에서, 실험적 펩티드-HLA 면역원성 데이터는 어떤 표적 펩티드 및 변형이 백신에서 효과적인 면역원이 될 것인지를 결정하는 데 사용된다.
펩티드 백신 설계에 대한 고려 사항은 Liu et al., Cell Systems 11, Issue 2, p. 131-146 (Liu et al., 2020) 및 (Liu et al., 2020b) 및 미국 특허 번호 11,058,751 및 미국 특허 번호 11,161,892에 요약되어 있다(전체 내용이 본원에 참조로 포함됨).
특정 표적 펩티드는 광범위한 HLA 분자에 높은 친화도로 결합하지 않을 수 있다. 표적 펩티드와 HLA 분자의 결합을 증가시키기 위해 표적 펩티드의 아미노산 조성을 변경하여 하나 이상의 앵커 잔기 또는 기타 잔기를 변경할 수 있다. 일부 실시예에서, 표적 펩티드가 HLA 분자에 의해 표시될 때 면역원성을 증가시키기 위해, 표적 펩티드의 아미노산 조성을 변경하여 하나 이상의 잔기를 변화시킬 수 있다. 앵커 잔기는 HLA 분자와 상호작용하고 HLA 분자에 대한 펩티드의 친화도에 가장 큰 영향을 미치는 아미노산이다. 아미노산 잔기가 하나 이상 변경된 펩티드를 이종 펩티드라고 한다. 일부 실시예에서, 이종 펩티드는 앵커 위치에 잔기 변형이 있는 표적 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 이종 펩티드는 비앵커 위치에 잔기 변형이 있는 표적 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 이종 펩티드는 비천연 아미노산 및 아미노산 유도체를 포함하는 잔기 변형이 있는 표적 펩티드를 포함한다. 이종 펩티드를 생성하기 위한 변형은 MHC 클래스 I 및 MHC 클래스 II 분자 모두에 대한 펩티드의 결합을 개선할 수 있으며, 필요한 변형은 펩티드 및 MHC 클래스 모두에 특이적일 수 있다. 펩티드 앵커 잔기는 MHC 분자 홈과 마주하고 있으므로 T 세포 수용체에 대한 다른 펩티드 잔기보다 덜 가시적이다. 따라서 앵커 잔기 변형이 있는 이종 펩티드는 자극된 T 세포가 비변형 펩티드에도 반응하는 T 세포 반응을 유도하는 것으로 관찰되었다. 백신에 이종 펩티드를 사용하는 경우 백신의 효과를 향상시킬 수 있다는 것이 관찰되었다(Zirlik et al., 2006). 일부 실시예에서, 이종 펩티드의 면역원성은 실험적으로 결정되고, 당업계에 공지된 바와 같이 이종클리트 펩티드의 상응하는 염기(시드라고도 함) 펩티드 또한 인식하는 T 세포를 활성화하는 능력이 결정된다(Houghton et al., 2007). 일부 실시예에서, 이종 펩티드의 면역원성 및 교차 반응성에 대한 이러한 분석은 이종 펩티드가 특정 HLA 대립유전자에 의해 표시될 때 수행된다.
하나 이상의 표적에 대한 면역을 유도하는 펩티드 백신
일부 실시예에서, 하나 이상의 표적에 대해 단일 백신 설계을 사용하여 펩티드 백신을 제형화하는 방법이 제공된다. 일부 실시예에서, 단일 표적은 특정 돌연변이를 갖는 외래 단백질(예: KRAS G12D)이다. 일부 실시예에서, 단일 표적은 자가 단백질(예: 암/고환 항원과 같은 종양 세포에서 과발현되는 단백질)이다. 일부 실시예에서, 단일 표적은 병원체 단백질(예: 바이러스 프로테옴에 포함된 단백질)이다. 일부 실시예에서, 다중 표적이 사용될 수 있다(예: KRAS G12D 및 KRAS G13D 모두).
일부 실시예에서, 방법은 Liu et al.(2020)에 기재된 바와 같이 모든 표적 프로테옴 서열(예: 전체 KRAS G12D 단백질)로부터 후보 세트를 구성하기 위해 펩티드를 추출하는 단계를 포함한다.
도 1과 2는 MHC 클래스 I 또는 MHC 클래스 II 백신 설계에 사용할 수 있는 예시적인 백신 설계 방법의 순서도를 보여준다. 후보 펩티드 세트(도 1 및 2 참조)는 입력 단백질 서열을 윈도우하여 추출한 표적 펩티드로 구성된다. 일부 실시예에서, 추출된 표적 펩티드의 아미노산 길이는 약 8 내지 약 10 사이이다(예: MHC 클래스 I 결합의 경우(Rist et al., 2013)). 일부 실시예에서, MHC 클래스 I 분자에 의해 제시된 추출된 표적 펩티드는 10개 아미노산 잔기 길이 이상, 예를 들어 11개의 잔기 길이를 가진다(Trolle et al., 2016). 일부 실시예에서, 추출된 표적 펩티드의 길이는 약 13 내지 약 25 사이이다(예: 클래스 II 결합의 경우(Chicz et al., 1992)). 일부 실시예에서, 본원에 설명된 다양한 크기 범위의 슬라이딩 윈도우가 전체 프로테옴에 걸쳐 사용된다. 일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및 클래스 II 슬라이딩 윈도우에 대한 다른 표적 펩티드 길이가 이용될 수 있다. 일부 실시예에서, 프로테아좀 절단의 전산 예측은 후보 세트에서 펩티드를 필터링 또는 선택하는 데 사용된다. 프로테아좀 절단을 예측하는 한 가지 계산 방법이 Nielsen et al.(2005)에 기술되어 있다. 일부 실시예에서, 펩티드 돌연변이율, 글리코실화, 절단 부위 또는 기타 기준을 사용하여 Liu et al.(2020)에 기재된 바와 같이 펩티드를 필터링할 수 있다. 일부 실시예에서, 펩티드는 미리 결정된 임계값 이상의 진화적 서열 변이에 기초하여 필터링될 수 있다. 진화적 서열 변이는 다른 종, 다른 병원체, 다른 병원체 균주 또는 기타 관련 유기체에 대해 계산될 수 있다. 일부 실시예에서, 제1 펩티드 세트가 후보 세트이다.
도 1-2에 도시된 바와 같이, 일부 실시예에서, 방법의 다음 단계는 Liu et al.(2020) 및 Liu et al.(2020b)에 기재된 바와 같이 고려되는 모든 HLA 대립유전자에 펩티드-HLA 결합을 위한 후보 세트의 표적 펩티드의 점수를 매기는 것을 포함한다. 일부 실시예에서, 제1 펩티드 세트는 표적 펩티드의 점수를 매긴 후의 후보 세트이다. 인간 HLA 분자, 마우스 H-2 분자, 돼지 SLA 분자 또는 예측 알고리즘을 사용할 수 있거나 개발할 수 있는 모든 종의 MHC 분자에 대해 점수를 매길 수 있다. 따라서, 상기 방법으로 비인간 종을 표적으로 하는 백신을 설계할 수 있다. 점수 메트릭에는 나노몰 단위의 HLA 대립유전자에 대한 표적 펩티드의 친화도, 용출된 리간드, 제시 및 백분위 순위 또는 기타 메트릭으로 표현할 수 있는 기타 점수가 포함될 수 있다. 후보 세트를 추가로 필터링하여 예측된 결합 코어가 관심 대상 특정 병원성 또는 신생항원 표적 잔기를 포함하지 않거나 예측 결합 코어가 앵커 위치에 표적 잔기를 포함하는 펩티드를 제외할 수 있다. 후보 세트는 또한 특정 길이, 예를 들어 MHC 클래스 I의 경우 길이 9의 표적 펩티드에 대해 필터링될 수 있다. 일부 실시예에서, 표적 펩티드의 점수는 실험 데이터 또는 실험 데이터와 전산 예측 방법의 조합으로 달성된다. 특정(펩티드, HLA) 쌍에 대한 펩티드-HLA 결합 예측을 위해 전산 모델을 사용할 수 없는 경우, 이러한 쌍의 결합 값은 점수 모델에서 사용 가능한 가장 유사한(펩티드, HLA) 쌍의 예측 기능을 포함하여 지지 쌍에 대한 평균, 중앙값, 최소 또는 최대 면역원성 값, 고정값(예: 결합 없음 표시)으로 정의하거나 가장 유사한 쌍(펩티드, HLA)의 예측 함수를 포함한 다른 기술을 사용하여 추론할 수 있다.
일부 실시예에서, 염기 세트(본원에서 시드 세트라고도 함)는 개별 펩티드-HLA 결합 또는 면역원성 기준(예: 제1 펩티드 세트)을 사용하여 점수를 매긴 후 후보 세트로부터 펩티드를 선택하여 구성된다(도 1). 일부 실시예에서, 주어진 펩티드가 다중 펩티드-HLA 점수를 가지므로, 최상의 친화성 또는 가장 높은 면역원성(예: 주어진 HLA 대립유전자에 대해 가장 강하게 결합하거나 T 세포를 가장 많이 활성화할 것으로 예측됨)을 갖는 펩티드-HLA 결합 점수 또는 펩티드-HLA 면역원성 메트릭에 기반하여 선택할 수 있다. 스코어링 절차 중에 펩티드-HLA 결합을 스코어링하는 데 사용되는 기준은 기본 세트 선정 및 백신 설계 단계에서 다양한 목표를 수용할 수 있다. 예를 들어, 펩티드-HLA 결합 친화도가 500 nM인 표적 펩티드는 질병에 걸린 개체에 의해 표시될 수 있지만 펩티드-HLA 결합 친화도가 50 nM인 표적 펩티드보다 빈도가 낮다. 백신의 조합 설계 단계에서 백신 펩티드가 발견되어 HLA 분자에 의해 표시될 확률을 높이기 위해 보다 제한된 친화성 기준(예: 제3 펩티드 세트를 선택할 때 도 1 및 2의 표적에 대한 백신)을 사용할 수 있다. 일부 실시예에서, 펩티드-HLA 면역원성 또는 펩티드-HLA 결합의 비교적 덜 제약된 임계값(예를 들어, 약 1000 nM 미만 또는 약 500 nM 미만)은 후보 펩티드-HLA 점수를 필터링하기 위한 제1 임계값(도 1 및 2의 제1 펩티드 스코어링 및 스코어링 필터링 단계)으로 사용되며 상대적으로 더 제한된 제2 임계값(예: 약 50 nM 미만)은 특정 HLA 대립 유전자의 점수에 대해 확장된 세트 펩티드-HLA 점수를 필터링하는 데 사용된다(도 1 및 2의 제2 펩티드 필터링 및 스코어링 단계). 일부 실시예에서, 백신 설계를 위해 주어진 HLA에 대한 변형된 펩티드의 미변형 펩티드가 덜 제한된 제1 임계값을 통과하지 못하는 경우 특정 펩티드-HLA 점수는 사용되지 않는다. 펩티드-HLA 점수의 이러한 필터링은 백신 내포물을 위해 면역원성이 충분하지 않은 펩티드가 항원성(제1 필터링 임계값 충족)일 수 있고, 따라서 백신에 의해 확장된 T 세포 클론형에 의해 인식될 수 있다는 관찰에 근거한다. 펩티드는 T 세포 수용체에 의해 인식되어 CD8+ T 세포 독성 또는 CD4+ 세포 활성화와 같은 반응을 일으킬 때 항원성이 된다. 항원 펩티드 유도체는 면역원성이 강해 백신에 포함될 수 있으며, 따라서 항원 펩티드를 인식하는 T 세포를 활성화하고 확장시킬 수 있다. 비변형 항원 펩티드를 인식하는 T 세포의 확장은 질병 관리에 기여하는 면역 반응을 제공할 수 있다. 일부 실시예에서, 펩티드는 펩티드-HLA 결합 친화도가 약 500 nM 미만인 제3 펩티드 세트(도 1 및 2의 표적에 대한 백신)의 잠재적 내포물에 대해 스코어링된다. 일부 실시예에서, 펩티드는 적어도 하나의 HLA 대립유전자에 대해 펩티드-HLA 결합 친화도가 약 1000 nM 미만인 염기 세트에 대해 선택된다. 대안적으로, 펩티드-HLA 면역원성 예측을 사용하여 염기 세트에 포함시킬 표적 펩티드를 검증할 수 있다. 일부 실시예에서, HLA 대립유전자에 의한 펩티드 표시 맥락에서 펩티드의 면역원성에 대한 실험적 관찰 또는 HLA 대립유전자에 대한 펩티드 결합의 실험적 관찰은 HLA 대립유전자 또는 펩티드-HLA 면역원성에 대한 결합에 대해 펩티드를 스코어링하는데 사용될 수 있다.
일부 실시예에서, 종양 세포에서 특정 HLA 대립유전자에 의한 펩티드 표시에 대한 실험적 관찰은 펩티드-HLA 결합 또는 펩티드-HLA 면역원성에 대한 펩티드를 스코어링하는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, 특정 HLA 대립유전자에 의한 펩티드 종양 세포 표시에 대한 실험적 관찰은 펩티드-HLA 결합 또는 해당 HLA 대립유전자에 대한 펩티드-HLA 면역원성에 대한 펩티드를 스코어링하는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, 펩티드 종양 세포 표시에 대한 실험적 관찰은 펩티드-HLA 결합 또는 펩티드-HLA 면역원성에 대한 펩티드와 예측된 펩티드-HLA 결합 또는 면역원성 임계값을 충족시키는 종양에 존재하는 HLA 대립유전자로부터 선택된 특정한 관찰된 펩티드에 대한 HLA 대립 유전자를 스코어링하는데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, 질량 분석법은 Bear et al.(2021) 또는 Wang et al.(2019)에 기술된 바와 같이 종양 세포에 의한 펩티드 표시를 실험적으로 결정하는 데 사용되며 이 데이터는 펩티드-HLA 결합 또는 펩티드-HLA 면역원성을 스코어링하는 데 사용된다. 일부 실시예에서, 질량 분석법은 종양 세포에 의한 펩티드 표시를 실험적으로 결정하는 데 사용되며, 이러한 실험 데이터는 백신의 하나 이상의 HLA 대립유전자에 대한 염기 세트(시드 세트) 펩티드의 포함을 검증하는 데 사용된다. 일부 실시예에서, 질량분석법은 종양 세포에 의한 펩티드 표시를 실험적으로 결정하는 데 사용되며, 이러한 실험 데이터는 펩티드가 질량분석법을 사용하여 HLA 대립유전자에 의해 표시되는 것으로 관찰되지 않는 경우 펩티드의 펩티드-HLA 결합 점수 또는 펩티드-HLA 면역원성 점수를 제외하는데 사용된다. 일부 실시예에서, 질량 분석법은 개체에서 종양 세포에 의한 펩티드 표시를 실험적으로 결정하는 데 사용되며, 이러한 실험 데이터는 개체의 하나 이상의 HLA 대립유전자에 대한 염기 세트(시드 세트) 펩티드 포함을 검증하는 데 사용된다. 일부 실시예에서, 질량 분석법은 개체에서 종양 세포에 의한 펩티드 표시를 실험적으로 결정하는 데 사용되며 이러한 실험 데이터는 펩티드가 질량분석법을 사용하여 HLA 대립유전자에 의해 표시되는 것으로 관찰되지 않는 경우 펩티드의 펩티드-HLA 결합 점수 또는 펩티드-HLA 면역원성 점수를 제외하는데 사용된다. 일부 실시예에서, HLA 대립유전자에 의한 표시 맥락에서 펩티드의 면역원성에 대한 전산 예측은 Ogishi et al.(2019) 또는 Bulik-Sullivan et al.(2019) 등의 방법과 같은 스코어링에 사용될 수 있다.
일부 실시예에서, 주어진 HLA 대립유전자에 대한 염기 세트(시드 세트)의 제1 펩티드에 대한 펩티드-HLA 점수 또는 펩티드-HLA 면역원성 점수는 제1 펩티드에 해당하는 야생형 펩티드(예를 들어, 정의된 서열 편집 거리 내에 있는 각 종의 펩티드 또는 펩티드의 돌연변이되지 않은 자연 발생 형태)가 정의된 임계값 내에서 동일한 HLA 대립유전자에 대한 펩티드-HLA 점수 또는 펩티드-HLA 면역원성 점수를 갖는 경우 제거되며 백신 설계 중에 고려되지 않는다. 임계값은 제1 펩티드와 야생형 펩티드의 점수 차이, 제1 펩티드와 야생형 펩티드의 점수 비율, 야생형 펩티드의 점수 또는 기타 메트릭을 기반으로 할 수 있다. 정의된 임계값은 지정된 값보다 크거나 작을 수 있다. 일부 실시예에서, 임계값은 야생형 펩티드가 제시될 것으로 예측되지 않도록 정의된다. 일부 실시예에서, 백신 설계 중에 제1 펩티드의 펩티드-HLA 점수 또는 펩티드-HLA 면역원성 점수가 제거되면, 동일한 HLA 대립유전자의 모든 유도체 (예: 이종 펩티드 유도체)의 펩티드-HLA 점수 또는 펩티드-HLA 면역원성 점수도 백신 설계 중에 제거되고 고려되지 않는다.
일부 실시예에서, 상기 방법은 득점 후보 세트에서 개체군의 HLA 일배체형 빈도를 사용하여 Liu et al.(2020)에 설명된 OptiVax-Robust 알고리즘을 실행하여 표적 펩티드의 염기 세트(본원에서는 시드 세트라고도 함)를 구성하는 것을 포함한다(도 2). 일부 실시예에서, HLA 이배체형 주파수가 OptiVax에 제공될 수 있다. OptiVax-Robust에는 다양한 윈도우 크기를 사용하는 슬라이딩 윈도우 접근 방식에서 발생하는 펩티드 중복을 제거하는 알고리즘이 포함되어 있지만, 다른 중복 제거 방법을 사용하여 후보 세트의 표적 펩티드 간 최소 편집 거리 제한을 적용할 수 있다. 시드 세트의 크기는 시드 세트의 표적 펩티드 수에 따라 개체군 적용 범위가 감소하는 지점에 의해 결정된다. 백신 표적 펩티드의 최소 수, 백신 표적 펩티드의 최대 수, 원하는 예상 개체군 적용 범위를 포함하는 다른 기준도 사용할 수 있다. 일부 실시예에서, 미리 결정된 개체군 적용 범위는 약 0.4 미만, 약 0.4 내지 0.5 사이, 약 0.5 내지 0.6 사이, 약 0.6 내지 0.7 사이, 약 0.7 내지 0.8 사이, 약 0.8 내지 0.9 사이, 또는 약 0.9 이상이다. 또 다른 가능한 기준은 각 개체에서 예상되는 최소 펩티드-HLA 결합 적중 수이다. 다른 실시예에서, 상기 방법은 Liu et al.(2020)에 설명된 바와 같이 OptiVax-Robust 대신에 OptiVax-Unlinked 알고리즘을 실행하는 것을 추가로 포함한다.
OptiVax-Robust 방법은 펩티드-HLA 면역원성의 이진 예측을 사용하며 이러한 이진 예측은 Liu et al.(2020b)에 설명된 대로 생성될 수 있다. OptiVax-Unlinked 방법은 표적 펩티드가 HLA 대립유전자에 결합할 확률을 사용하며 Liu et al.(2020)에 설명된 대로 생성할 수 있다. 일부 실시예에서, OptiVax-Unlinked 및 EvalVax-Unlinked는 펩티드-HLA 면역원성 확률과 함께 사용된다. 두 방법 모두 본원에 설명된 목적에 사용될 수 있으므로 "OptiVax"라는 용어는 Robust 또는 Unlinked 방법을 지칭한다. 일부 실시예에서, 실험적 분석에서 관찰된 펩티드-HLA 면역원성의 확률은 EvalVax-Unlinked 및 OptiVax-Unlinked에서 펩티드-HLA 결합의 확률로 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, 백신 설계를 위해 OptiVax에 제공된 모집단의 HLA 일배체형 또는 HLA 대립유전자 빈도는 전 세계 인구를 설명한다. 대안적인 실시예에서, 백신 설계를 위해 OptiVax에 제공되는 모집단의 HLA 일배체형 또는 HLA 대립유전자 빈도는 지리적 지역에 따라 다르다. 대안적인 실시예에서, 백신 설계를 위해 OptiVax에 제공되는 모집단의 HLA 일배체형 또는 HLA 대립유전자 빈도는 혈통에 따라 다르다. 대안적인 실시예에서, 백신 설계를 위해 OptiVax에 제공되는 모집단의 HLA 일배체형 또는 HLA 대립유전자 빈도는 인종에 따라 다르다. 대안적인 실시예에서, 백신 설계를 위해 OptiVax에 제공되는 모집단의 HLA 일배체형 또는 HLA 대립유전자 빈도는 위험의 유전적 지표, 연령, 화학 물질에 대한 노출, 알코올 사용, 만성 염증, 식이요법, 호르몬, 면역억제제, 감염원, 비만, 방사선, 햇빛 또는 담배 사용과 같은 위험 요인이 있는 개인에 따라 다르다. 대안적인 실시예에서, 백신 설계를 위해 OptiVax에 제공되는 모집단의 HLA 일배체형 또는 HLA 대립유전자 빈도는 특정 HLA 대립유전자를 가지고 있는 개인에 따라 다르다. 대안적인 실시예에서, 백신 설계를 위해 OptiVax에 제공되는 HLA 일배체형은 단일 개인를 설명하며, 개별화된 백신을 설계하는 데 사용된다.
일부 실시예에서, 표적 펩티드의 후보 세트에 OptiVax를 적용하여 생성되는 표적 펩티드의 염기(또는 시드) 세트(예: 제1 펩티드 세트)는 가능한 소형 백신 설계를 나타내는 미변형 표적 펩티드 세트를 기술한다(도 2의 시드 세트). 염기 펩티드는 염기 또는 시드 펩티드 세트(예: 제1 펩티드 세트)에 포함되는 표적 펩티드이다. 일부 실시예에서, 시드 세트(예: 제1 펩티드 세트)는 HLA 분자에 대해 예측되거나 관찰된 친화성 또는 면역원성에 의한후보 펩티드 점수 필터링에 기반한다(도 1의 시드 세트). 단, 가능한 한 광범위한 HLA 일배체형에서 표적 펩티드의 표시를 개선하기 위해, 일부 실시예는 시드(또는 염기) 세트의 변형을 포함한다. 일부 실시예에서, 실험 분석을 사용하여 변형된 시드(또는 염기) 펩티드가 염기/시드 펩티드도 인식하는 T 세포를 활성화하는 지 확인할 수 있다.
주어진 표적 펩티드에 대해 최적의 앵커 잔기 선택은 표적 펩티드에 결합하고 해당 펩티드를 표시하는 HLA 대립유전자와 HLA 대립유전자의 클래스(MHC 클래스 I 또는 클래스 II)에 따라 달라질 수 있다. 시드 펩티드 세트(예: 제1 펩티드 세트)는 MHC 클래스 I 또는 II 펩티드의 앵커 잔기 변형 펩티드를 포함함으로써 확장된 세트가 될 수 있다(도 1-2). 따라서 백신 설계의 한 가지 측면은 서로 다른 이종 펩티드가 상이하고 잠재적으로 중복되는 모집단 적용 범위를 가지게 된다는 점을 감안해 백신 포함을 위해 동일한 표적 펩티드에서 유래한 제한된 세트의 이종 펩티드를 선택하는 방법을 고려하는 것이다.
일부 실시예에서, 표적 펩티드의 각 염기 세트에 대해 가능한 모든 앵커 변형이 고려된다. 일반적으로 MHC 클래스 I 분자에 의해 결합된 펩티드에는 두 개의 앵커 잔기가 있으며, 9-mer 펩티드의 경우 일반적으로 위치 2와 9에 있다. 일부 실시예에서,
8-mer, 10-mer 및 11-mer의 앵커는 위치 2 및 n에서 발견되며, 여기서 n은 마지막 위치(각각 8, 10, 11)이다. MHC 클래스 I 분자의 경우 마지막 위치 n은 본원에서 카르복실 말단의 "C" 위치라고 한다. 일부 실시예에서, 각 앵커 위치에서 20개의 가능한 아미노산을 시도하여 최상의 이종 펩티드를 선택한다. 따라서 MHC 클래스 I 결합의 경우, 각 염기 표적 펩티드에 대해 400개(즉, 2개 위치에 20개 아미노산 = 202)에서 1개를 뺀 이종 펩티드가 생성된다. 일반적으로 MHC 클래스 II 분자에 의해 결합된 펩티드에는 4개의 앵커 잔기가 있으며 보통 9-mer 결합 코어의 위치 1, 4, 6 및 9에 있다. 따라서 MHC 클래스 I 결합의 경우, 각 염기 표적 펩티드에 대해 160,000(즉, 4개 위치에 20개 아미노산 = 204)-1개의 이종 펩티드가 있다. 일부 실시예에서, 2개 이상(MHC 클래스 I) 또는 4개(MHC 클래스 II) 위치가 앵커로 간주된다. 베이지안 최적화와 같은 기타 방법을 사용하여 최적의 앵커 잔기를 선택하여 각 시드(또는 염기) 세트 펩티드로부터 이종 펩티드를 생성할 수 있다. 최적의 앵커 잔기를 선택하는 다른 방법은 Dai et al.(2020)의 "Machine learning optimization of peptides for presentation by class II MHCs"에 나와있다(전체 내용이 본원에 참조로 포함됨). 일부 실시예에서, 앵커 위치는 펩티드를 제시하는 HLA 대립유전자에 의해 결정되며, 따라서 이종 펩티드 세트는 HLA 특이적 앵커 위치의 각 세트에 대해 가능한 모든 앵커 변형을 포함한다.
일부 실시예에서, 염기/시드 세트의 모든 표적 펩티드에 대해 가능한 모든 앵커 잔기 변형(예: MHC 클래스 I 또는 클래스 II)을 갖는 새로운 펩티드 서열이 생성되어 모든 변형을 포함하는 새로운 이종 염기 세트(도 1-2의 확장 세트)가 생성된다. 일부 실시예에서, 펩티드의 앵커 잔기 변형은 하나 이상의 펩티드 앵커 잔기 위치가 펩티드와 자가 펩티드를 구별하는 치환 돌연변이를 포함하는 경우 이종 염기 세트에 포함되지 않는다. 일부 실시예에서, 염기/시드 펩티드의 앵커 잔기 변형은 염기/시드 펩티드를 자가 펩티드와 구별하는 치환 돌연변이를 포함하지 않는 펩티드 위치의 이종 염기 세트에만 포함된다. 일부 실시예에서, 펩티드의 앵커 잔기 변형은 인접한 앵커 잔기 쌍 사이에 하나 이상의 펩티드 돌연변이가 발생하지 않는 경우 이종 염기 세트에 포함되지 않는다. 일부 실시예에서, 염기/시드 세트의 모든 표적 펩티드에 대해 선택된 앵커 위치에서 앵커 잔기 변형(예: MHC 클래스 I 또는 클래스 II)을 갖는 새로운 펩티드 서열이 생성되어 선택된 변형을 포함하는 새로운 이종 염기 세트(도 1-2의 확장 세트)가 생성된다. 일부 실시예에서, 펩티드 변형에 사용되는 앵커 잔기 위치는 백신 평가 중에 고려되는 HLA 대립유전자에 의해 결정된 앵커 잔기 위치로부터 선택된다. 일부 실시예에서, 이종 염기 세트(도 1-2의 확장 세트)는 또한 원래 시드(또는 염기) 세트(도 1-2의 시드 펩티드 세트)를 포함한다. 일부 실시예에서, 이종 염기 세트는 비앵커 잔기에서 아미노산 치환을 포함한다. 일부 실시예에서, 염기 펩티드 잔기의 변형은 T 세포 수용체에 대한 결합을 변경하여 치료 효능을 개선한다(Candia, et al. 2016). 일부 실시예에서, 이종 염기 세트는 비천연 아미노산 유사체의 아미노산 치환을 포함한다. 이종 염기 세트는 HLA 친화성, 펩티드-HLA 면역원성 또는 본원에 설명된 기타 메트릭에 대해 스코어링한다(도 1-2에 표시된 것과 같은 또 다른 펩티드 스코어링 및 점수 필터링). 일부 실시예에서, 점수 예측은 이종 펩티드 및 HLA 대립유전자의 쌍에 대해 추가로 업데이트되어, 이종 펩티드가 펩티드-HLA 결합 점수의 특정 임계값 또는 특정 펩티드-HLA 면역원성 메트릭에서 HLA 대립유전자에 의해 표시될 것으로 예측되지 않는 시드(또는 염기) 펩티드를 갖는 쌍을 제거할 수 있다. 일부 실시예에서, 특정 HLA 대립유전자에 의해 표시되는 이종 펩티드의 예측된 결합 코어가 해당 HLA 대립유전자에 대한 각 시드(또는 염기) 세트 표적 펩티드의 결합 코어와 정확히 같은 위치에 정렬되도록 하기 위해 펩티드-HLA 점수를 필터링할 수도 있다. 일부 실시예에서, 점수 예측은 HLA 대립유전자에 대해 고려되는 이종 펩티드가 해당 HLA 대립유전자에 의해 결정된 앵커 위치에서만 변형되도록 하기 위해 HLA 대립유전자에 대해 필터링된다. 스코어링은 펩티드 및 HLA 대립유전자에 대한 펩티드-HLA 면역원성 메트릭을 생성한다. 이 메트릭은 이진, 면역원성 확률 또는 펩티드-HLA 친화도 또는 퍼센트 순위와 같은 기타 면역원성 메트릭일 수 있으며, 전산 예측, 실험적 관찰 또는 전산 예측과 실험적 관찰의 조합을 기반으로 할 수 있다. 일부 실시예에서, OptiVax-Unlinked는 펩티드-HLA 면역원성의 확률을 이용한다. 일부 실시예에서, 이종 펩티드는 MIRA(Klinger et al., 2015) 또는 ELISPOT와 같은 실험 분석에 포함되어 특정 HLA 대립유전자에 대한 펩티드-HLA 면역원성 메트릭을 결정한다. 일부 실시예에서, Liu et al.(2020b)의 방법은 이종 펩티드에 대한 MIRA 데이터를 펩티드-HLA 면역원성 모델에 통합하는 데 사용할 수 있다. 일부 실시예에서, 이종 펩티드의 펩티드-HLA 면역원성 메트릭스가 실험적으로 결정되고, 이종 펩티드의 상응하는 시드(또는 염기) 펩티드 또한 인식하는 T 세포를 활성화시키는 능력은 당업계에 알려진 바와 같이 수행되어 이종 펩티드를 백신 포함에 적합하게 한다(예: Houghton et al., 2007). 일부 실시예에서, 이종 펩티드의 면역원성 및 교차 반응성에 대한 이러한 분석은 이종 펩티드가 특정 HLA 대립유전자에 의해 표시될 때 수행된다.
일부 실시예에서, 세포의 특정 HLA 대립유전자에 의한 이종 펩티드의 표시에 대한 실험적 관찰은 펩티드-HLA 결합 또는 펩티드-HLA 면역원성에 대한 펩티드를 스코어링하는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, 질량 분석법은 Bear et al.(2021) 또는 Wang et al.(2019)에 기술된 바와 같이 세포에 의한 이종 펩티드의 표시를 실험적으로 결정하는 데 사용되며 이 데이터는 펩티드-HLA 결합 또는 펩티드-HLA 면역원성을 스코어링하는 데 사용된다. 일부 실시예에서, 질량 분석법은 세포에 의한 이종 펩티드의 표시를 실험적으로 결정하는 데 사용되며, 이러한 실험 데이터는 백신에 포함하기 위한 이종 펩티드의 포함을 검증하는 데 사용된다. 일부 실시예에서, 질량분석법은 종양 세포에 의한 펩티드 표시를 실험적으로 결정하는 데 사용되며, 이러한 실험 데이터는 펩티드가 질량분석법을 사용하여 HLA 대립유전자에 의해 표시되는 것으로 관찰되지 않는 경우 펩티드의 펩티드-HLA 결합 점수 또는 펩티드-HLA 면역원성 점수를 제외하는데 사용된다. 일부 실시예에서, 질량 분석법은 개체에서 발견된 HLA 대립유전자를 가진 세포에 의한 이종 펩티드의 표시를 실험적으로 결정하는 데 사용되며, 이러한 실험 데이터는 개체에 대한 백신에 포함하기 위한 이종 펩티드의 포함을 검증하는 데 사용된다. 일부 실시예에서, 질량분석법은 개체에서 종양 세포에 의한 펩티드 표시를 실험적으로 결정하는 데 사용되며, 이러한 실험 데이터는 펩티드가 질량분석법을 사용하여 HLA 대립유전자에 의해 표시되는 것으로 관찰되지 않는 경우 펩티드의 펩티드-HLA 결합 점수 또는 펩티드-HLA 면역원성 점수를 제외하는데 사용된다. 일부 실시예에서, HLA 대립유전자에 의한 표시 맥락에서 이종 펩티드의 면역원성에 대한 전산 예측은 Ogishi et al.(2019) 또는 Bulik-Sullivan et al.(2019) 등의 방법과 같은 스코어링에 사용될 수 있다.
일부 실시예에서, 이종 염기 세트의 펩티드는 다음과 같은 경우 제거된다. (1) HLA 대립유전자의 앵커 위치 중 하나가 염기/시드 펩티드를 자가 펩티드와 구별하는 염기/시드 펩티드의 돌연변이 위치와 일치하는 경우, (2) 자가 펩티드의 펩티드-HLA 결합 또는 펩티드-HLA 면역원성이 자가 펩티드 결합 또는 면역원성에 대해 지정된 임계값보다 더 강한 경우 이는 TCR 대면 잔기를 자가 펩티드와 공유함으로써 자가 펩티드와 교차 반응할 수 있는 이종 염기 세트의 펩티드를 제거한다. 일부 실시예에서, 자가 펩티드 결합의 임계값은 약 500 nM 내지 1000 nM 사이이다.
일부 실시예에서, 이종 염기 세트의 중복 펩티드가 제거된다. 일부 실시예에서, 중복 펩티드는 펩티드-HLA 면역원성 점수 또는 펩티드-HLA 결합 점수가 스코어링된 모든 HLA에 대해 이종 염기 세트의 제2 이종 펩티드보다 면역원성이 낮은 제1 이종 펩티드이며, 여기서 제1 및 제2 이종 펩티드는 모두 동일한 염기(또는 시드) 펩티드로부터 파생된다. 일부 실시예에서, 펩티드 중복성은 HLA 대립 유전자의 펩티드-HLA 면역원성 점수 또는 펩티드-HLA 결합 점수만을 비교하여 결정되며 여기서 HLA 대립유전자의 두 펩티드 모두에 대한 펩티드-HLA 면역원성 점수 또는 펩티드-HLA 결합 점수는 주어진 임계값(예: 결합에 대해 50 nM)보다 더 큰 면역원성을 가진다. 일부 실시예에서, 중복 펩티드는 평균 펩티드-HLA 면역원성 점수 또는 펩티드-HLA 결합 점수가 이종 염기 세트 내 제2 이종 펩티드의 평균 펩티드-HLA 면역원성 점수 또는 펩티드-HLA 결합 점수보다 면역원성이 낮은 제1 이종 펩티드이며, 여기서 제1 및 제2 이종 펩티드 모두 동일한 염기(또는 시드) 펩티드에서 파생되며, 평균 점수는 HLA 대립유전자의 두 펩티드 모두에 대한 펩티드-HLA 면역원성 점수 또는 펩티드-HLA 결합 점수가 주어진 임계값(예: 결합에 대해 50 nM)보다 더 면역원성인 HLA 대립유전자에 대해 계산된다. 일부 실시예에서, 중복 펩티드는 가중 펩티드-HLA 면역원성 점수 또는 펩티드-HLA 결합 점수가 이종 염기 세트 내 제2 이종 펩티드의 가중 펩티드-HLA 면역원성 점수 또는 펩티드-HLA 결합 점수보다 면역원성이 낮은 제1 이종 펩티드이며, 여기서 제1 및 제2 이종 펩티드 모두 동일한 염기(또는 시드) 펩티드에서 파생되며, 가중치는 인간 모집단에서 HLA 대립유전자의 빈도에 의해 결정되고, 가중 점수는 HLA 대립유전자의 두 펩티드 모두에 대한 펩티드-HLA 면역원성 점수 또는 펩티드-HLA 결합 점수가 주어진 임계값(예: 결합에 대해 50 nM)보다 더 면역원성인 HLA 대립유전자에 대해 계산된다.
일부 실시예에서, 다음 단계는 이종 염기 세트(제2 펩티드 세트)를 스코어링하고 결과 점수를 필터링하여 하나 이상의 HLA 대립유전자에 대한 펩티드의 펩티드-HLA 면역원성 점수 또는 펩티드-HLA 결합 점수를 임계값과 비교하여 제2 펩티드 세트를 생성하는 것을 포함한다. 일부 실시예에서, 백신 펩티드를 발견하고 HLA 분자에 의해 표시될 확률을 증가시키기 위해 약 50 nM의 친화성 기준이 사용된다. 일부 실시예에서, 친화성 기준은 50 nM보다 더 제한적이다(즉, < 50 nM). 일부 실시예에서, 친화성 기준은 약 500 nM보다 더 제한적이다(즉, < 500 nM). 일부 실시예에서, 개별 펩티드-HLA 결합 점수 또는 면역원성 지표가 결정되며, 따라서 펩티드는 적어도 하나의 HLA 대립유전자에 대한 기준을 충족하는 한 유지될 수 있고, 기준을 충족하는 펩티드-HLA 점수만이 백신 설계에 고려된다.
일부 실시예에서, 다음 단계는 예측된 백신 성능을 최대화하는 소형 백신 펩티드 세트를 선택하기 위해 제2 펩티드 세트를 OptiVax에 입력하는 것을 포함한다(백신 성능 최적화, 도 1-2). 일부 실시예에서, 예측된 백신 성능은 예상되는 펩티드-HLA 결합 친화도의 함수이다(예: 주어진 펩티드 세트의 모든 펩티드-HLA 결합에 걸친 펩티드-HLA 결합 친화도의 분포 함수, 또는 집단 또는 개체의 HLA 대립유전자의 발생에 의해 가중치가 부여된 함수). 일부 실시예에서, 예측된 백신 성능은 백신의 예상 모집단 적용 범위이다. 일부 실시예에서, 예측된 백신 성능은 모집단 또는 개체에서 백신에 의해 생성되는 예상 펩티드-HLA 적중 수이다. 일부 실시예에서, 예측된 백신 성능은 백신에 의해 생성되는 최소 예상 펩티드-HLA 적중 수(예: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8 또는 그 이상)를 필요로 한다. 일부 실시예에서, 예측된 백신 성능은 모집단 적용 범위 및 백신에 의해 생성되는 예상 펩티드-HLA 적중 수의 함수이다. 일부 실시예에서, 예측된 백신 성능은 백신의 모든 펩티드가 2개 이상의 HLA 대립유전자(예: 3개 이상의 HLA 대립유전자)의 펩티드-HLA 면역원성에 대해 스코어링된 백신의 전체 면역원성 특성을 설명하는 메트릭이다. 일부 실시예에서, 예측된 백신 성능은 최대 펩티드-HLA 적중 수(예: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8 또는 그 이상)를 초과하는 선택된 HLA 대립유전자에 의한 면역원성 기여를 제외한다. 일부 실시예에서, 예측된 백신 성능은 최대 펩티드-HLA 적중 수(예: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8 또는 그 이상)를 초과하는 개별 HLA 이배체형에 의한 면역원성 기여를 제외한다. 일부 실시예에서, 예측된 백신 성능은 포함된 HLA 대립유전자의 분율이며, 이는 백신에 의해 생성되는 예측된 펩티드-HLA 면역원성을 갖는 최소 수의 펩티드( 예: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 또는 그 이상)를 갖는 각 개체의 HLA 대립 유전자의 예상 분율이다. 일부 실시예에서, 예측된 백신 성능은 백신에 의해 생성되는 펩티드-HLA 면역원성이 예측되는 최소 수의 펩티드(예: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 또는 그 이상)를 갖는 단일 개체에서 HLA 대립유전자의 예상 분율이다.
일부 실시예에서, 백신은 예측된 펩티드 면역원성 또는 표시에 대해 점진적으로 덜 엄격한 기준에서 이종 염기 세트(도 1-2에 도시된 바와 같이 확장 세트라고도 함)로부터 펩티드를 반복 선택하여 설계한다. 일부 실시예에서, 펩티드-HLA 점수 중 적어도 하나가 사용된 임계값에 의해 제거되지 않는 경우, 펩티드는 유지된다. 일부 실시예에서, OptiVax는 먼저 특정 펩티드 적격성 기준(예: 후보 세트의 시드 HLA-펩티드 점수는 500 nM 이상에서 적어도 하나의 MHC 분자에 결합해야 하고, 확장된 세트의 펩티드-HLA 점수는 50 nM 이상에서 적어도 하나의 MHC 분자에 결합해야 한다)으로 원하는 성능을 가진 백신을 설계하는 데 사용된다. OptiVax의 이러한 적용으로 생성된 백신은 덜 엄격한 기준(예: 후보 세트의 시드 펩티드-HLA 점수는 1000 nM 이상에서 적어도 하나의 MHC 분자에 결합해야 하고, 확장된 세트의 펩티드 HLA-점수는 100 nM 이상에서 적어도 하나의 MHC 분자에 결합해야 한다)을 가지는 백신 증강의 기반으로 사용되어 원하는 백신 성능을 더욱 개선한다. 백신 증강 방법은 Liu et al.(2020b)에 설명되어 있다(전체 내용이 본원에 참조로 포함됨). 일부 실시예에서, 여러 차례의 백신 증강이 활용될 수 있다. 일부 실시예에서, 최종적으로 증강된 백신을 선택한다.
일부 실시예에서, 원하는 예측 백신 성능을 충족하는 펩티드 세트의 선택은 OptiVax 이외의 전산 알고리즘에 의해 수행될 수 있다. 일부 실시예에서, OptiVax 대신 정수 선형 프로그래밍 또는 혼합 정수 선형프로그래밍을 사용하여 펩티드 세트를 선택한다. 펩티드 세트 선택을 위한 정수 프로그래밍 방법의 한 예가 Toussaint et al., 2008(전체 내용이 본원에 참조로 포함됨)에 기재되어 있다. 혼합 정수 선형 프로그래밍의 예제 솔버는 Toussaint et al., 2008와 결합하여 사용할 수 있는 Python-MIP이다. 백신 펩티드 선택 방법의 두 번째 예는 Liu et al.(2021)(전체 내용이 본원에 참조로 포함됨)의 "Maximum n-times Coverage for Vaccine Design"에 기재되어있다.
예측 백신 성능은 메트릭을 나타낸다. 예측된 백신 성능은 단일 수치, 복수의 수치, 임의의 수의 비수치 및 이들의 조합으로 표현할 수 있다. 값은 임의의 수학적 또는 기호 용어 및 척도(예: 명목 척도, 서수 척도, 간격 척도 또는 비율 척도)로 표현될 수 있다.
시드(또는 염기) 펩티드와 해당 시드(또는 염기) 펩티드에서 파생한 모든 변형된 펩티드는 단일 펩티드 계열을 구성한다. 일부 실시예에서, 주어진 HLA 대립유전자의 펩티드-HLA 면역원성을 기반으로 하는 백신 성능의 구성 요소에서, 동일한 펩티드 계열에 속하는 최대 수의 펩티드(예: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8 또는 그 이상)에 해당 HLA 대립유전자에 대한 전산 면역원성 크레딧이 부여된다. 펩티드 계열 면역원성에 대한 이러한 제한은 동일한 염기 펩티드의 많은 변형 버전으로 인한 크레딧을 제한한다. 일부 실시예에서, 본원에 설명된 방법은 예측된 백신 성능의 원하는 메트릭에 해당하는 EvalVax 목적 함수를 사용하여 OptiVax를 실행하기 위한 것이다. 일부 실시예에서, 모집단 적용 범위는 시드(또는 염기) 표적 펩티드에 반응하여 T 세포를 활성화시키는 하나 이상의 면역원성 펩티드를 제시하는 대상 모집단의 비율을 의미한다. 모집단 적용 범위의 메트릭은 주어진 모집단(예: 대표적인 인구 모집단)의 HLA 일배체형 빈도를 사용하여 계산된다. 일부 실시예에서, 인구 모집단의 메트릭은 모집단의 한계 HLA 빈도를 사용하여 계산된다. 모집단 적용 범위를 최대화한다는 것은 주어진 모집단(예: 대표적인 인간 모집단)에서 HLA 일배체형의 비율을 기준으로 최소 수(예: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 또는 그 이상)의 면역원성 펩티드-HLA 결합을 가지는 모집단의 가장 큰 분율을 초래하는 펩티드 세트(염기 펩티드 세트, 변형된 펩티드 세트 또는 염기 및 변형된 펩티드의 조합; 예: 제1 펩티드 세트, 제2 펩티드 세트 또는 제3 펩티드 세트)를 선택하는 것을 의미한다. 일부 실시예에서, 이 공정은 모집단 적용 범위를 개선하기 위해 상응하는 시드(또는 염기) 펩티드 및 이종 염기 펩티드에 반응하는 T 세포를 활성화시키는 이종 펩티드(본 개시내용에 기재된 바와 같이)의 OptiVax 선택을 포함한다. 일부 실시예에서, 시드(또는 염기) 표적 펩티드는 항상 최종 백신 설계에 포함된다. 일부 실시예에서, 펩티드는 임상 데이터, 동물 모델 또는 조직 배양 모델에서 면역원성이 있는 것으로 관찰된 경우에만 백신 설계(예: 제1, 제2, 및/또는 제3 펩티드 세트에 포함됨)의 후보로 간주된다.
비록 본 개시내용에서 이종 펩티드가 예시적인 실시예로 사용되지만, 이종 펩티드 대신 임의의 변형된 펩티드를 사용할 수 있다. 변형된 펩티드는 표적 염기/시드 펩티드의 하나 이상의 아미노산 치환을 갖는 펩티드이다. 아미노산 치환은 앵커 위치 또는 임의의 다른 비앵커 위치에 놓일 수 있다.
일부 실시예에서, 후보 백신 펩티드(예: 염기 펩티드 또는 변형된 펩티드)는 자가 펩티드를 인식하는 T 세포를 활성화시키는 경우(예를 들어, 이는 도 1-2에 도시된 바와 같이 펩티드 필터링 및 분류의 1차 및/또는 2차 단계에서 달성될 수 있다) 백신 포함에서 제거된다. 일부 실시예에서, 후보 백신 펩티드(예: 염기 펩티드 또는 변형된 펩티드)는 HLA 대립유전자에 의해 결합될 때 외향 아미노산이 동일한 HLA 대립유전자에 의해 제시되는 외향 자가 펩티드 잔기와 유사하면 백신 포함에서 전산적으로 제거되며, 여기서 유사성은 동일성 또는 BLOSUM 행렬(BLOSUM 행렬은 당업계에 알려져 있음)과 같은 정의된 유사성 메트릭에 의해 정의될 수 있다. 자가 펩티드를 인식하는 T 세포를 활성화하는 능력에 대한 백신 펩티드 시험은 동물 모델의 백신 접종 후 ELISPOT 또는 기타 면역원성 분석 또는 인간 조직 프로토콜을 사용하여 실험적으로 수행할 수 있다. 두 경우 모두 백신 펩티드를 나타내는 HLA 대립유전자를 가진 모델이 사용된다. 일부 실시예에서, 인간 1차 혈액 단핵 세포(PBMC)를 백신 펩티드로 자극하고, T 세포가 성장하도록 한 다음, 자가 펩티드를 사용한 T 세포 활성화를 Tapia-Calle et al.(2019) 또는 당업계에 공지된 다른 방법에 기재된 바와 같이 검정한다. 일부 실시예에서, 백신 펩티드는 T 세포가 자가-펩티드에 의해 활성화되는 경우 백신 포함에서 제외된다. 일부 실시예에서, 자가 펩티드도 인식하는 T 세포를 활성화시키는 펩티드의 능력에 대한 전산 예측이 활용될 수 있다. 이러한 예측은 펩티드-HLA 복합체의 외향 잔기와 다른 펩티드 잔기와의 상호작용에 대한 모델링을 기반으로 할 수 있다. 일부 실시예에서, 후보 펩티드(예: 염기 펩티드 또는 변형된 펩티드)의 펩티드-MHC 복합체와 자가 펩티드의 펩티드-MHC 복합체의 구조적 유사성을 기반으로 자가 펩티드를 인식하는 T 세포를 활성화할 것으로 예측되는 경우 후보 백신 펩티드(예: 염기 펩티드 또는 변형된 펩티드)는 백신 포함에서 제거되거나 교차 반응성에 대해 실험적으로 시험된다. 펩티드-MHC 구조를 예측하는 한 가지 방법은 Park et al.(2013)에 기재되어 있다.
일부 실시예에서, 후보 이종 백신 펩티드(예: 변형된 펩티드) 및 HLA 대립유전자의 펩티드-HLA 결합 점수 또는 펩티드-HLA 면역원성 메트릭은 후보 이종 백신 펩티드가 주어진 HLA 대립유전자에 대해 상응하는 염기/시드 표적 펩티드를 인식하는 T 세포를 활성화하지 않는 경우 백신 설계 시 고려 대상에서 제외된다(펩티드 스코어링 및 스코어링 필터링의 2차 라운드, 도1-2). 일부 실시예에서, 후보 이종 백신 펩티드가 주어진 HLA 대립유전자에 대해 상응하는 염기/시드 표적 펩티드를 인식하는 T 세포를 활성화하지 않는 경우, 이종 백신 펩티드(예: 변형된 펩티드) 는 백신 설계에서 제외된다(펩티드 스코어링 및 스코어 필터링 2차 라운드, 도 1-2). 동일한 HLA 대립유전자에 대해 상응하는 시드(또는 염기) 표적 펩티드를 인식하는 T 세포를 활성화하는 능력에 대해 후보 이종 펩티드(예: 변형된 펩티드)를 시험하는 것은 동물 모델의 백신 접종 후 ELISPOT 또는 기타 면역원성 분석 또는 인간 조직 프로토콜을 사용하여 실험적으로 수행할 수 있다. 두 경우 모두 이종 펩티드를 나타내는 HLA 대립유전자를 가진 모델이 사용된다. 일부 실시예에서, 인간 PBMC를 이종 펩티드로 자극하고, T 세포를 성장시킨 다음, 시드(또는 염기) 표적 펩티드를 사용한 T 세포 활성화를 Tapia-Calle et al.(2019)에 기재된 바와 같이 또는 당업계에 알려진 다른 방법을 사용하여 분석한다. 일부 실시예에서, 상응하는 시드(또는 염기) 표적 펩티드도 인식하는 T 세포를 활성화시키는 이종 펩티드의 능력에 대한 전산 예측이 활용될 수 있다. 이러한 예측은 펩티드-HLA 복합체의 외향 잔기와 다른 펩티드 잔기와의 상호작용에 대한 모델링을 기반으로 할 수 있다. 일부 실시예에서, 이종 펩티드의 펩티드-HLA 복합체와 상응하는 시드(또는 염기) 표적의 펩티드-HLA 복합체의 구조적 유사성은 이종 펩티드를 백신 포함에 적합하게 하거나 백신 포함 전에 실험적 면역원성 시험을 요구하는 데 사용된다.
TCRID(TCR 인터페이스 다이버전스)는 특정 HLA 대립 유전자에 대해 제1 펩티드의 TCR 직면 잔기의 3D 위치와 제2 펩티드의 해당 잔기 위치 간의 차이의 최소 평균 제곱 편차이다. 일부 실시예에서, TCRID에 대해 최소 제곱 평균 편차 대신 다른 메트릭이 사용된다. 일부 실시예에서, TCRID에 대해 특정 HLA 대립유전자로부터의 비-TCR 직면 잔기 및 MHC 잔기의 위치 편차를 포함하는 다른 메트릭이 사용된다. 일부 실시예에서, TCRID는 주어진 HLA 대립유전자에 의해 표시될 때 2개의 펩티드가 동일한 T 세포 클론형을 활성화하는지 여부를 예측하는데 사용된다. 일부 실시예에서, HLA 분자의 결정 구조와 함께 FlexPepDock(London et al., 2011, 전체 내용이 본원에 참조로 포함됨) 또는 DINC(Antunes et al., 2018, 전체 내용이 본원에 참조로 포함됨)을 사용하여 HLA 분자가 주어진 펩티드 쌍에 대한 TCRID 메트릭을 계산할 수 있다. 일부 실시예에서, TCRID는 (1) 특정 HLA 대립유전자에 의해 결합된 2개의 상이한 펩티드의 3D 펩티드-HLA 구조를 결정하고, (2) 펩티드-HLA 구조의 HLA 알파 나선을 정렬하고, (3) 정렬된 알파 나선 프레임에 대해 두 펩티드의 TCR 직면 잔기 간의 차이의 최소 평균 제곱 편차를 통해 계산된다.
일부 실시예에서, 도 1 및 2의 제2 펩티드 스코어링 및 스코어 필터링 단계는 이종 펩티드와 그것이 파생된 상응하는 염기(또는 시드) 펩티드 사이의 HLA 특이적 TCRID가 제1 TCRID 임계값을 초과할 때 특정 HLA 대립유전자의 이종 펩티드에 대한 펩티드-HLA 결합 또는 면역원성 점수를 제거한다. 일부 실시예에서, 도 1 및 2의 제2 펩티드 스코어링 및 스코어 필터링 단계는 이종 펩티드와 그것이 파생된 상응하는 돌연변이되지 않은 펩티드 사이의 HLA 특이적 TCRID가 제2 TCRID 임계값 미만일 때 이종 펩티드에 대한 모든 펩티드-HLA 결합 또는 면역원성 점수를 제거한다. 일부 실시예에서, 도 1 및 2의 제1 펩티드 스코어링 및 스코어 필터링 단계는 펩티드와 이에 상응하는 돌연변이되지 않은 자체 펩티드 사이 HLA 특이적 TCRID가 제3 TCRID 임계값 미만일 때 후보 펩티드에 대한 모든 펩티드-HLA 결합 또는 면역원성 점수를 제거한다. 일부 실시예에서, 임의의 TCRID 임계값은 펩티드-HLA 복합체에 대한 TCR 분자의 교차 반응성을 실험적으로 관찰 또는 계산적으로 예측함으로써 결정된다.
도 3 및 4(MHC 클래스 I)와 도 5 및 6(MHC 클래스 II)은 BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGRF G598V, EGFR L858R, IDH1 R132H, IDH1 R132C, NRAS Q61R, NRAS Q61K, NRAS Q61L, KRAS G12D, KRAS G12V, KRAS G12R, KRAS G12C, KRAS G13D, KRAS G12A, KRAS G12S, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R273C 및 TP53 R273H 돌연변이를 위해 설계된 펩티드 수를 달리하여 OptiVax-Robust에서 선택한 단일 표적 특이적 백신의 예상 모집단 적용 범위를 보여준다. 도 3-6은 백신에 대한 펩티드 수가 증가함에 따라 예측되는 모집단 적용 범위가 증가한다는 것을 보여준다. 도 3-6에 표시된 모집단 적용 범위는 백신이 적용하도록 설계된 특정 돌연변이를 가진 개체이다. 또한 펩티드 수가 증가하면 일반적으로 각 개체의 평균 펩티드-HLA 적중 수가 모집단에서 증가한다.
OptiVax는 HLA 분자가 백신에서 최소 p개의 펩티드에 결합하고 표시될 것으로 예측되는 모집단의 분율/비율을 최대화하는 백신을 설계하는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, 이러한 예측(예: 스코어링)은 적어도 p개 펩티드가 면역원성일 것이라고 직접 예측하기 위한 실험적 면역원성 데이터를 포함한다. OptiVax에 숫자 p를 입력하고, OptiVax를 다양한 p 값으로 여러 번 실행하여 다양한 펩티드 수 p에 대해 예측된 최적의 표적 펩티드 세트를 얻을 수 있다. p 값이 클수록 백신의 중복성이 높아지지만 펩티드를 더 많이 소모하여 원하는 모집단 범위를 달성할 수 있다. 일부 실시예에서, 특정 이종 염기 세트가 주어진 모집단 범위를 달성하는 것이 불가능할 수 있다. 일부 실시예에서, p 값은 원하는 크기의 백신의 함수이다.
본원에 기술된 방법은 MHC 클래스 I 및 클래스 II 기반 면역을 위한 별도의 백신 제형을 설계하는 데 사용될 수 있다.
일부 실시예에서, 이 절차는 개체를 위한 백신을 만드는 데 사용된다. 일부 실시예에서, 개체에 존재하는 표적 펩티드는 개체의 종양 RNA 또는 DNA를 시퀀싱하고 외래 펩티드를 생성하는 돌연변이를 식별하여 결정된다. 이 방법의 한 가지 실시예는 미국 특허 번호 10,738,355에 기술되어 있으며, 전체 내용이 본원에 참조로 포함되어 있다. 일부 실시예에서, 펩티드 시퀀싱 방법은 개체의 표적 펩티드를 식별하는 데 사용된다. 이에 대한 한 가지 실시예는 미국 간행물 번호 2011/0257890에 기술되어 있다. 일부 실시예에서, 개체의 백신에 사용되는 표적 펩티드는 개체의 검체에서 관찰되는 자가 펩티드, 외래 펩티드, 병원체 펩티드, 또는 자가 펩티드, 외래 펩티드, 병원체 펩티드를 암호화하는 RNA가 미리 정해진 수준으로 존재할 때 선택된다. 개체의 표적 펩티드는 본원에 개시된 바와 같이 백신을 구성하는 데 사용된다. 백신 설계를 위해 OptiVax에는 개체의 HLA 유형을 포함하는 이배체형이 제공된다. 대안적인 실시예에서, 개체의 HLA 유형은 총 1이 되는 빈도를 갖는 다중 이배체형으로 분리되며, 여기서 각 이배체형은 개체의 하나 이상의 HLA 대립유전자와 다른 대립유전자 위치를 평가해서는 안 된다는 표기법을 포함한다. 다중 이배체형을 사용하는 경우 OptiVax의 목적 함수가 구성된 모든 이베채형에 의해 면역원성 펩티드가 표시될 가능성을 증가시킨다다. 이는 펩티드-HLA 면역원성을 나타내는 개체에서 별개의 HLA 대립유전자의 수를 최대화하여 개체 내 백신의 대립형질 범위를 향상시키는 목표를 달성한다.
도 14는 MHC 클래스 I HLA 이배체형 HLA-A02:03, HLA-A11:01, HLA-B55:02, HLA-B58:01, HLA-C03:02, HLA-C03:03을 가지는 단일 개체에 대한 10가지 예시 G12V MHC 클래스 I 백신의 예측 백신 성능(예측된 펩티드-HLA 적중 횟수)을 보여준다. OptiVax는 이 HLA 이배체형에 대해 펩티드 수가 1에서 10에 범위인 10개의 G12V MHC 클래스 I 백신을 설계하는 데 사용되었다. 도 14의 결과를 위해 OptiVax를 각각 동일한 가중치를 부여한 6개의 합성 이배채형으로 실행했으며, 각 개체의 HLA 이배체형에 하나의 HLA 대립유전자가 있고, 다른 대립유전자 위치는 평가되지 않은 것으로 표시된다. 도 14에서 10개 펩티드 백신은 SEQ ID NO: 203(LMVVGAVGV), SEQ ID NO: 208(GAVGVGKSL), SEQ ID NO: 209(GPVGVGKSA), SEQ ID NO: 213(GPVGVGKSV), SEQ ID NO: 11036(LMVVGAVGI), SEQ ID NO: 11037(LMVVGAVGL), SEQ ID NO: 11095(VTGAVGVGK), SEQ ID NO: 11122(GAVGVGKSM), SEQ ID NO: 11457(VAGAVGVGM) 및 SEQ ID NO: 11737(VVGAVGVGK)으로 구성된다. SEQ ID NO: 208(GAVGVGKSL) 및 SEQ ID NO: 11122(GAVGVGKSM)의 2개의 펩티드는 각각 50 nM 이하의 친화도로 2개의 HLA 대립유전자에 결합하는 것으로 예측된다.
MHC 클래스 I 백신 설계 절차
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 백신 설계 절차는 다음과 같은 계산 단계로 구성된다.
일부 실시예에서, 계산을 위한 입력은 다음과 같다.
: 관심 신생항원 또는 병원성 표적(예: KRAS G12D, KRAS G12V, KRAS G12R, KRAS G12C, KRAS G13D)을 포함하는 펩티드 서열(길이 n). 는 위치 i의 아미노산을 나타낸다.
t: P에서 표적 돌연변이의 위치 (예: KRAS G12D의 경우 t = 12).
s: 치환 돌연변이 는 돌연변이가 치환인 경우 true이고, 돌연변이가 삭제 또는 삽입이거나 펩티드에 돌연변이가 포함되어 있지 않은 경우(예: 병원체 표적) false이다. 돌연변이가 삭제 또는 삽입인 경우 t는 삭제 또는 삽입 직전의 위치를 나타낸다.
: 펩티드-MHC 스코어링에 대한 MHC의 펩티드 잠재적 제시 임계값(예: 500 nM 결합 친화도)
: 펩티드-MHC 스코어링에 대한 MHC의 펩티드 예측 표시 임계값(예: 50 nM 결합 친화도)
: HLA 대립유전자 세트(HLA-A, HLA-B, HLA-C 유전자좌의 경우)
F : : 모집단 일배체형 빈도(OptiVax 최적화 및 적용 범위 평가).
N: EvalVax 및 OptiVax 목적 함수의 매개변수. 적용되는 개체를 고려하기 위해 모집단 적용 범위 목표에 대해 예측되는 개인당 최소 적중 횟수를 지정한다. 기본값 = 1 (P(n ≥ 1) 모집단 범위 계산).
일부 실시예에서, 사용되는 펩티드-HLA 스코어링 함수는 다음과 같다.
ScorePotential : : (펩티드, HLA 대립유전자) 쌍을 펩티드-HLA 표시 예측에 매핑하는 스코어링 함수. 예측 친화도 ≤ τ1이면 1을 반환하고, 그렇지 않으면 0을 반환한다. 옵션에는 MHCflurry, NetMHCpan, PUFFIN, 앙상블이 포함되거나 면역원성 데이터에 대해 보정된 모델을 포함하여 대체 메트릭 또는 소프트웨어를 사용할 수 있다.
SCOREDISPLAY : : (펩티드, HLA 대립유전자) 쌍을 펩티드-HLA 표시 예측에 매핑하는 스코어링 함수. 예측 친화도 ≤ τ2면 1을 반환하고, 그렇지 않으면 0을 반환한다. 옵션에는 MHCflurry, NetMHCpan, PUFFIN, 앙상블이 포함되거나 면역원성 데이터에 대해 보정된 모델을 포함하여 대체 메트릭 또는 소프트웨어를 사용할 수 있다.
다음으로, 시드 단백질 서열(P)에서 단백질 서열에 걸친 윈도우형 천연 펩티드 세트 P가 구성된다. 는 첨자가 정의된 시드 단백질 P의 범위 내에 있는 경우에만 세트 구성원을 생성한다. 일부 실시예에서, 8-mer, 9-mer, 10-mer 및 11-mer가 생성되지만, 이 절차는 임의의 원하는 윈도우 길이와 결합된 결과 펩티드 세트로 수행될 수 있다. 일부 실시예에서는 9-mer만 생성된다.
두 번째 조건 j {t-(k-1), t-1}은 t에서의 돌연변이가 윈도우가 있는 k-mer 펩티드의 위치 P2 또는 Pk(즉, 앵커 위치)에 있고 돌연변이가 치환인 경우 펩티드를 제외한다.
정의된 펩티드 세트를 사용한 MHC 클래스 I 백신 설계 절차
다음으로, P의 각 펩티드 서열은 (임계값 τ1 = 500 nM)을 사용하여 잠재적 제시에 대해 모든 HLA 대립유전자에 대해 스코어링되며 행렬 S에 결과를 저장한다.
참고로 S는 이진 행렬이며, 여기서 1은 HLA가 잠재적으로 펩티드를 제시할 것으로 예측되고 0은 잠재적으로 제시되지 않음을 나타낸다.
펩티드의 염기 세트 정의
:
따라서 B는 적어도 1개의 HLA에 의해 잠재적으로 제시될 것으로 예측되는 천연 펩티드를 포함한다.
B 의 펩티드에서 파생된 모든 이종 펩티드 B' 세트를 생성한다:
여기서 ANCHOR-MODIFIED(b)는 b에서 파생된 모든 399개의 앵커 변형 펩티드 세트를 반환한다(P2 및 P9에서 아미노산에 대한 모든 가능한 변형 포함).
다음으로, B'의 모든 이종 후보 펩티드(예: 변형된 펩티드)는 SCOREDISPLAY(임계값 τ2 = 50 nM)를 사용하여 예측된 표시에 대해 모든 HLA 대립유전자에 대해 스코어링되고 결과를 이진 |B'| Х |H| 행렬 에 저장한다.
다음으로, 업데이트된 스코어링 행렬 는 각 HLA에 의한 해당 염기 펩티드의 잠재적 제시에 따라 조절된 이종 펩티드에 대해 계산된다.
여기서 각 이종 펩티드 b' ∈ B'는 염기 펩티드 b ∈ B의 돌연변이이다. 이 조건은 h가 b를 잠재적으로 제시하는 것으로 예측되지 않은 경우 b에서파생된 모든 이종 펩티드 b'가 h에 의해 표시되지 않도록 한다(h가 b'를 표시할 것으로 예측되더라도).
일부 실시예에서 OptiVax-Robust는 기본 펩티드와 이종 펩티드의 합집합 (각각 B 및 B'에 대한 해당 스코어링 행렬 S 및 포함)으로부터 최종 펩티드 세트(예: 제3 펩티드 세트)를 설계하는 데 사용된다. OptiVax는 m개의 세트 를 출력한다. 여기서 m은 OptiVax에서 요청한 가장 큰 백신 크기이다. 는 OptiVax가 출력하는 백신 펩티드의 긴밀 집합(k개 펩티드 포함)을 나타낸다. 가 반드시 의 확대 집합인 것은 아니라는 사실에 유의한다. 대체 실시예에서, OptiVax는 스코어링 행렬을 사용하여 B'의 펩티드로 염기 세트 B를 보강하는 데 사용할 수 있으며, 이때 스코어링 행렬 은 OptiVax 반환 세트가 , 최종 백신 세트 는 펩티드 로 구성된다.
일부 실시예에서, 이 절차는 각 관심 표적에 대해 독립적으로 반복되며, 생성된 독립 백신 세트는 아래에 설명된 바와 같이 복합 백신에 병합될 수 있다.
MHC 클래스 II 백신 설계 절차
일부 실시예에서, MHC 클래스 II 백신 설계 절차는 다음 계산 단계로 구성된다.
일부 실시예에서, 계산을 위한 입력은 다음과 같다.
: 관심 신생항원(예: KRAS G12D, KRAS G12V, KRAS G12R, KRAS G12C, KRAS G13D)을 포함하는 펩티드 서열(길이 n). P i 는 위치 i의 아미노산을 나타낸다.
t: P에서 표적 돌연변이의 위치, t∈[1,...,n](예: KRAS G12D의 경우 t = 12).
s: 치환 돌연변이 는 돌연변이가 치환인 경우 true이고, 돌연변이가 삭제 또는 삽입이거나 펩티드에 돌연변이가 포함되어 있지 않은 경우(예: 병원체 표적) false이다. 돌연변이가 삭제 또는 삽입인 경우 t는 삭제 또는 삽입 직전의 위치를 나타낸다.
: 펩티드-MHC 스코어링에 대한 MHC의 펩티드 잠재적 제시 임계값(예: 500 nM 결합 친화도)
: 펩티드-MHC 스코어링에 대한 MHC의 펩티드 예측 표시 임계값(예: 50 nM 결합 친화도)
: HLA 대립유전자 세트(HLA-DR, HLA-DQ, HLA-DP 유전자좌의 경우)
F: : 모집단 일배체형 빈도(OptiVax 최적화 및 적용 범위 평가).
N: EvalVax 및 OptiVax 목적 함수의 매개변수. 적용되는 개체을 고려하기 위해 모집단 적용 범위 목표에 대해 예측되는 개인당 최소 적중 횟수를 지정한다. 기본값 = 1 (P(n ≥ 1) 모집단 범위 계산).
일부 실시예에서, 사용되는 펩티드-HLA 스코어링 함수는 다음과 같다.
SCOREPOTENTIAL : : (펩티드, HLA 대립유전자) 쌍을 HLA 표시 예측에 매핑하는 스코어링 함수. 예측 친화도 ≤ τ1이면 1을 반환하고, 그렇지 않으면 0을 반환한다. 옵션에는 NetMHCIIpan, PUFFIN, 앙상블이 포함되거나 면역원성 데이터에 대해 보정된 모델을 포함하여 대체 메트릭 또는 소프트웨어를 사용할 수 있다.
SCOREDISPLAY : : (펩티드, HLA 대립유전자) 쌍을 펩티드-HLA 표시 예측에 매핑하는 스코어링 함수. 예측 친화도 ≤ τ2면 1을 반환하고, 그렇지 않으면 0을 반환한다. 옵션에는 NetMHCIIpan, PUFFIN, 앙상블이 포함되거나 면역원성 데이터에 대해 보정된 모델을 포함하여 대체 메트릭 또는 소프트웨어를 사용할 수 있다.
FindCore : : (펩티드, HLA 대립유전자) 쌍을 9-mer 결합 코어의 예측에 매핑하는 함수. 코어는 코어가 시작되는 펩티드에 대한 오프셋 위치(인덱스)로 지정될 수 있다.
다음으로, 시드 단백질 서열(P)로부터 단백질 서열에 걸친 펩티드 세트 가 구성된다. 는 첨자가 정의된 시드 단백질 P의 범위 내에 있는 경우에만 세트 구성원을 생성한다. 여기서는 표적 돌연변이에 걸쳐 있는 길이가 13~25인 모든 윈도우 펩티드를 추출하며 이 절차는 원하는 윈도우 길이(예: 15-mer만)를 사용하여 수행할 수 있다.
여기서 는 길이k의 모든 슬라이딩 윈도우를 포함하며, 이 윈도우들은 결합되어 을 형성한다. 여기서(MHC 클래스 I와 달리) 결합 코어 또는 앵커 잔기 위치에 따라 어떠한 펩티드도 제외되지 않는다는 점에 유의한다(MHC 클래스 II의 경우, 필터링은 본 개시내용에 설명된 바와 같이 수행된다).
정의된 펩티드 세트를 사용한 MHC 클래스 II 백신 설계 절차
다음으로, 의 각 펩티드 서열은 (임계값 τ1 = 500 nM)을 사용하여 잠재적 제시에 대해 모든 HLA 대립유전자에 대해 스코어링되며 ||×| | 행렬 S 1에 결과를 저장한다.
참고로 S 1은 이진 행렬이며, 여기서 1은 HLA가 잠재적으로 펩티드를 제시할 것으로 예측되고 0은 잠재적으로 제시되지 않음을 나타낸다.
각 (펩티드, HLA 대립유전자) 쌍(p, h)에 대해 FINDCORE를 사용하여 9-mer 결합 코어를 식별/예측한다. 예측된 결합 코어는 행렬 C에 기록된다.
다음으로 (s)가 아니면 S 2[p, h] = S 1[p, h], 그렇지 않으면 업데이트된 스코어링 행렬 S 2를 의 천연 펩티드에 대해 계산한다.
여기서 P t 는 관심 표적 잔기(예: KRAS G12D의 돌연변이 부위)이다. 이 조건은 표적 잔기가 S 2에서 점수가 0이 아닌 모든 쌍(펩티드, HLA 대립유전자)에 대해 비앵커 위치에서 결합 코어 내에 들어가도록 하고 결합 코어가 펩티드당 대립유전자에 따라 달라질 수 있도록 한다(특정 펩티드의 결합 코어는 펩티드를 나타내는 HLA 대립유전자에 따라 다를 수 있음). 따라서 각 쌍 (p, h)에 대해 예측된 결합 코어 C[p, h]가 앵커 위치(9-mer 코어의 P1, P4, P6 또는 P9)에서 표적 잔기 P t 를지정하거나 P t 가 결합 코어 내에 포함되어 있지 않은 경우 S 2[p, h] = 0이다. 다른 실시예에서, P t 는 비앵커 위치에서 코어 외부 또는 코어 내부에 위치할 수 있다. 일부 실시예에서, P t 는 코어 내부 및/또는 외부의 특정 위치에만 있을 수 있다. 일부 실시예에서, C에서 결합 코어 예측은 예측 신뢰도를 수반한다. 일부 실시예에서, 예측된 코어 C[p, h]의 신뢰도가 원하는 임계값(예: 0.5, 0.6, 0.7, 0.8 또는 0.9) 미만이면 S 2[p, h] = 0이다.
다음으로 OptiVax-Robust를 펩티드 및 스코어링 행렬 로 실행해 펩티드 의 비중복 염기 세트를 식별한다. (다른 실시예에서, B는 비중복 염기 세트를 식별하는 대신 전체 세트 로 선택될 수 있다.)
다음으로, 모든 이종 펩티드 세트 B ' 는 B의 펩티드에서 파생하여 생성된다.
여기서 ANCHOR-MODIFIED(b,c)는 9-mer 결합 코어 c의 P1, P4, P6 및 P9에서 아미노산에 대한 모든 가능한 변형과 함께 b에서 파생된 모든 204 - 1개의 앵커 변형 펩티드 세트를 반환한다. 따라서, 각 염기 펩티드 b에 대해, 이종 세트 B'는 스코어링 행렬 S 2로 표시되는 유효 코어 위치가 있는 b를 잠재적으로 제시하는 임의의 HLA 대립유전자에 대해 식별된 b의 모든 고유 코어에 대한 변형이 있는 모든 앵커-변형 펩티드 b'를 포함한다.
다음으로, B'의 모든 이종 후보 펩티드(예:변형된 펩티드)는 SCOREDISPLAY(임계값 τ2 = 50 nM)를 사용하여 예측된 표시에 대해 모든 HLA 대립유전자에 대해 스코어링되고 결과를 이진 |B'| × || 행렬 에 저장한다.
각 (이종 펩티드, HLA 대립유전자) 쌍 (b',h)에 대해 FindCore를 사용하여
9-mer 결합 코어를 식별/예측한다. 예측된 결합 코어는 행렬 C'에기록된다.
업데이트된 스코어링 행렬 은 특정 HLA에 의해 동일한 오프셋에서 발생하는 이종 및 염기 펩티드의 확인된 결합 코어에 조건화된 이종 펩티드에 대해 계산된다.
여기서 각 이종 펩티드 b' ∈ B'는 염기 펩티드 b ∈ B의 돌연변이이다. 이 조건은 이종 펩티드 b'의 결합 코어가 염기 펩티드 b와 동일한 상대적 위치에 있도록 하고, 암시적으로 표적 잔기 P t 가 여전히 9-mer 결합 코어 내의 비앵커 위치에 있도록 한다(3단계).
업데이트된 스코어링 행렬 는 각 HLA에 의한 해당 염기 펩티드의 잠재적 제시에 따라 조절된 이종 펩티드에 대해 계산된다.
여기서 각 이종 펩티드 b' ∈ B'는 염기 펩티드 b ∈ B의 돌연변이이다. 이 조건은 h가 b를 표시할 것으로 예측되지 않은 경우 b에서파생된 모든 이종 펩티드 b'가 h에 의해 표시되지 않도록 한다(h가 b'를 표시할 것으로 예측되더라도).
OptiVax-Robust는 기본 펩티드와 이종 펩티드의 합집합 B ∈ B'(각각 B 및 B'에 대한 해당 스코어링 행렬 및 포함)으로부터 최종 펩티드 세트(예: 제3 펩티드 세트)를 설계하는 데 사용된다. OptiVax는 m개의 세트 를 출력한다. 여기서 m은 OptiVax에서 요청한 가장 큰 백신 크기이다. 는 OptiVax가 출력하는 백신 펩티드의 긴밀 집합(k개 펩티드 포함)을 나타낸다. 가 반드시 상위 집합이 아니라는 점에 주의한다. (대체 실시예에서, OptiVax는 스코어링 행렬을 사용하여 B'의 펩티드로 염기 세트 B를 보강하는 데 사용할 수 있으며, 이때 스코어링 행렬 은 OptiVax 반환 세트가 , 최종 백신 세트 는 펩티드로 구성된다.)
일부 실시예에서, 이 절차는 각 단일 관심 표적에 대해 독립적으로 반복되며, 생성된 독립 백신 세트는 아래에 설명된 바와 같이 복합 백신에 병합될 수 있다.
여러 백신을 결합하는 방법
위에서 설명한 방법은 하나 이상의 개별 표적에 대해 최적화된 표적 펩티드 세트(예: 제3 펩티드 세트)를 생성한다. 일부 실시예에서, 다중 표적(예: KRAS G12D 및 KRAS G12V와 같은 2개 이상의 표적)의 MHC 클래스 I 및 클래스 II 기반 면역을 위한 별도의 백신을 설계하는 방법이 제공된다.
일부 실시예에서, 다중 표적의 복합 펩티드 백신을 생성하는 방법은 TCGA(Cancer Genome Atlas)와 같은 출처의 경험적 데이터에 기초한 질병의 제시 표를 사용하여 개시된다. 도 7은 다양한 돌연변이 표적(예: KRAS G12D, KRAS G12V 및 KRAS G12R)에 대해 제시된 표적의 확률별로 질병 발현형 확률(예: 췌장암, 결장직장, 피부암)을 인자화하는 일 실시예를 나타낸다. 제시는 한 가지 형태의 질병(예: 도 7과 같이 뚜렷한 유형의 암 또는 암 적응증)에 의해 제시되는 고유한 표적 세트이다. 도 7은 각 제시에 대해 해당 제시의 확률과 주어진 목표가 관찰될 확률의 예를 보여준다. 주어진 제시에 대해 각각 확률이 있는 하나 이상의 표적이 있을 수 있다. 일부 실시예에서, 다중 표적 백신 설계 방법은 예를 들어 도 7에 도시된 바와 같이 제시 및 각 표적 확률을 기반으로 질병 면역을 유도하기 위한 펩티드 자원을 할당한다. 일부 실시예에서, 제시는 상이한 인간 모집단 또는 상이한 위험 그룹에서의 표적의 유병률에 상응한다. 모집단에서 표적의 확률은 가능한 각 제시에 대해 해당 제시의 확률과 해당제시의 표적 확률을 합산하여 계산한다. 도 7은 각 표적(행)에 대한 개별 백신을 각 질병 적응증(열)에 대한 복합 백신으로 병합하는 데 사용되는 가중치를 보여준다. 값은 각 표적 돌연변이를 포함하는 사례의 관찰된 비율을 나타낸다. 데이터는 TCGA(The Cancer Genome Atlas)에서 얻는다. 각 질병 적응증에 대해 TCGA 데이터는 Primary Site가 적응증인 사례로 필터링된다.
일부 실시예에서, 상이한 단백질에 대한 돌연변이에 의해 생성된 염기 펩티드가 동일할 때 상이한 단백질에 대한 돌연변이에 대해 동일한 백신 설계가 생성된다. 예를 들어, 염기 펩티드 선택의 일부 실시예에서, 다음 돌연변이는 동일한 염기 펩티드 세트를 공유하기 때문에 백신 설계가 동일하다: HRAS Q61K, NRAS Q61K, and KRAS Q61K; HRAS Q61L, NRAS Q61L, and KRAS Q61L; HRAS Q61R, NRAS Q61R 및 KRAS Q61R. 도 7을 참조하는 경우 두 돌연변이가 동일한 개별 백신 설계를 갖는 일부 실시예에서, 아래에 설명된 바와 같이 복합 백신에 포함하기 위한 개별 백신 설계에 가중치를 부여할 때 이들의 제시 특정 확률이 추가된다(예를 들어, 갑상선암 NRAS Q61R 및 HRAS Q61R의 경우).
도 8을 참조하는 경우 일부 실시예에서, 방법은 먼저 각 표적에 대한 개별 펩티드 백신을 설계하여 다중 표적에 대한 조합 백신 설계를 생성하는 단계를 포함한다. 그 결과 처음에는 표적별 백신 설계 세트가 생성된다. 일부 실시예에서, 크기 k에서 각 표적 특이적 백신의 한계 예측 백신 성능은 크기 k에서 예측된 백신 성능에서 크기 k-1에서 예측된 백신 성능을 뺀 값으로 정의된다(도 3-6 참조). 백신에 사용되는 펩티드의 수가 증가하면 백신의 구성이 변할 수 있으므로, 복합 백신에 대한 기여도를 계산하기 위해 특정 펩티드 세트 대신 각 표적 특이적 백신의 한계 예측 백신 성능이 사용된다.
일부 실시예에서, 각 표적 특이적 백신 크기에 대한 표적 특이적 백신 설계의 가중 한계 예측 백신 성능은 도 8에 도시된 바와 같이 계산된다. 주어진 표적 백신 크기에 대해 가중 예측 백신 성능은 예측된 백신 성능과 모집단 내 표적의 확률을 곱하여 계산한다(예: 도 7에서 도시된 바와 같은 값 사용). 표적 특이적 백신에 대한 한계 가중치 예측 백신 성능은 크기 k에서의 가중치 적용 범위에서 크기 k-1의 범위를 뺀 값이다(예: 도 3~6 참조). 크기 1의 표적 특이적 백신의 한계 가중 예측 백신 성능은 가중 예측 백신 성능이다. 모든 백신의 한계 가중 예측 백신 성능을 단일 목록으로 결합하고, 결합된 목록은 도 8과 같이 표적 특이적 백신의 가중 한계 예측 백신 성능에 따라 가장 큰 것부터 가장 작은 것까지 정렬된다. 크기 n의 복합 백신은 이 목록의 처음 n개 요소에 의해 결정된다. 복합 백신의 펩티드는 크기가 n에 더해지고 가중 예측 백신 성능의 합이 정렬된 목록의 처음 n개 요소와 동일한 합계가 되는 개별 펩티드 표적 백신에 의해 결정된다. 이는 크기 n의 복합 백신의 예측 백신 성능을 최대화한다.
일부 실시예에서, 복합 다중 표적 백신은 사용된 제시 표(예를 들어, 도 7 참조)에 따라 설명된 질병에 대한 전체 예측 적용 범위, 특정 적응증에 대한 예측 적용 범위 및/또는 예측된 백신 성능에 사용되는 가중치를 적절히 조정함으로써 특정 표적에 대한 예측 적용 범위에 따라 설계될 수 있다. 원하는 적용 범위 수준이 선택되면, 표적 특이적 설계의 기여도에 따라 복합 백신의 펩티드가 결정된다. 예를 들어, 복합 백신에 크기 k의 표적 특이적 백신을 포함하는 경우, 크기 k의 이 표적에 대한 백신 펩티드가 복합 백신에 사용된다.
일 실시예의 예로서, 도 7은 돌연변이(예: KRAS G12D, G12V 및 G12R) 및 상이한 암 적응증(예: 췌장암)을 가진 개인에서 발생할 각 확률을 나타낸다. 도 3 및 4(MHC 클래스 I)와 도 5 및 6(MHC 클래스 II)은 본원에 설명된 백신 방법을 사용하여 표적에 대한 표적 특이적 백신의 모집단 범위를 보여준다. 주어진 백신 크기에서 각 표적 특이적 백신의 한계 모집단 적용 범위는 해당 크기 및 해당 크기-1의 적용 범위의 개선이다. 펩티드가 없는 적용 범위는 0이다. 선택된 적응증(예: 췌장암)에 대해 각 표적 특이적 백신의 한계 범위는 도 7에 도시된 비율에 의해 결정된 모집단 내 표적의 확률로 곱한다. 모든 표적 특이적 백신의 이러한 가중 한계 적용 범위는 최적의 표적 특이적 구성을 결정하기 위해 분류되며, 결과 목록은 목록의 처음 k개 요소를 취하여 각 크기 k에서 선택된 적응증에 대한 복합 백신의 구성을 설명한다. 일 실시예로서, 도 9 및 10(MHC 클래스 I)과 도 11 및 12(MHC 클래스 II)는 췌장암, 피부암, 갑상선암, 뇌암, 결장직장암, 기관지 및 폐암의 복합 백신에 대한 각 백신 크기에서의 표적 특이적 기여도를 나타낸다. 본원에 설명된 복합 백신 프로토콜의 방법을 사용하여 도 9~12의 예를 계산했다. 각 복합 백신 크기에서 표적 특이적 백신의 다양한 구성 요소가 도에 표시된 적응증에 사용된다. 표 1(아래)에는 독립(단일 표적) 및 복합(다중 표적) MHC 클래스 I 백신 설계에 존재하는 펩티드가 포함되어 있다. 표 2(아래)에는 독립(단일 표적) MHC 클래스 II 백신 설계 결합(다중 표적) MHC 클래스 II 백신 설계에 존재하는 펩티드가 포함되어 있다. 표 1과 2에는 도 7에 존재하는 돌연변이에 대한 유방암 및 난소암 백신의 펩티드가 포함되어 있다. 대체 실시예의 경우, 서열 목록은 표 1 및 2의 돌연변이 단백질, 특정 단백질 돌연변이 및 적응증에 대한 MHC 클래스 I 백신 및 MHC 클래스 II 백신에 유용한 이종 펩티드를 제공한다. MHC 클래스 I 및 클래스 II에 대한 개별/단일 표적 백신의 모든 하위 집합을 결합하여 둘 이상의 다중 표적에 대한 백신을 만들 수 있다.
복합 백신 설계 절차
일부 실시예에서, 여기에 설명된 절차는 상이한 표적에 최적화된 개별 소형 백신을 하나의 최적화된 복합 백신으로 결합하는 데 사용된다.
일부 실시예에서, 절차를 위한 계산 입력은 다음과 같다.
: 관심 대상 신생항원 또는 병원성 표적 세트(예: KRAS G12D, KRAS G12V,
KRAS G12R)
: 각 표적에 대해 개별적으로 최적화된 백신 세트. 는 표적 에 대한 정확하게 k개의 펩티드의 최적 백신 세트를 나타낸다(예: 위에서 설명한 절차에 따라 계산). 가 반드시 의 상위 집합이 아닐 수 있다는 사실에 유의한다.
W: : 각 표적 를 특정 관심 제시(예: 췌장암, 예를 들어 Exhibit A, 표 1 참조)에서 t의 확률 또는 가중치로 매핑하는 표적 가중치 함수.
POPULATIONCOVERAGE: : 펩티드 세트를 모집단 범위에 매핑하는 함수(예: EvalVax). 이 함수는 HLA 일배체형 빈도 및 개인당 최소 펩티드-HLA 적중 수 N(본원에서는 EvalVax-Robust를 사용하여 적용 범위를 P(n ≥ 1)로 계산한다)을 비롯한 추가 매개변수를 입력으로 사용할 수도 있다.
1단계에서 각 표적 t(개별적으로)에 대해 1~m(1~m개 펩티드; m은 계산에 사용된 가장 큰 백신 크기) 크기의 최적화된 백신을 세트 로 계산한다. 여기서 k는 백신의 크기를 나타낸다. 그런 다음 각 백신 크기에 대한 백신 성능을 계산한다. 각 표적 t(개별적으로) 및 백신 크기(펩티드 수) k에 대해 가중치가 적용되지 않은 모집단 적용 범위 는 다음과 같이 계산된다.
일부 실시예에서, 각 표적 t에 대해, c t,k 는 일반적으로 k 값이 증가하면 단조롭게 증가하고 아래로 오목하게 된다(각 추가 펩티드는 적용 범위를 증가시키지만 반환은 감소된다).
2단계에서 백신 한계 성능을 계산하고 각 표적의 유병률 가중치를 기준으로 가중치를 부여한다. 각 표적 t(개별적으로)에 대해 한계 적용 범위 m t,k 는 백신 세트에 추가된 k번째 펩티드로 계산된다.
일부 실시예에서, 각 표적에 대해 t, m t,k 는 k에서 단조롭게 감소하는 함수여야 한다(위의 1단계에 의해).
가중치가 적용된 한계 모집단 적용 범위 는 W에서 각 대상의 가중치를 사용하여 계산된다.
가중치가 적용된 한계 모집단 적용 범위는 제시에서 표적의 유병률에 의해 가중치가 부여된 백신에서 k번째 펩티드의 유효 한계 적용 범위를 제공한다(제시에서 표적의 확률/가중치를 곱하여).
3단계에서는 모든 표적에 대해 가중치가 적용된 백신 성능을 병합하여 각 펩티드 수에서 복합 백신 설계를 생성한다. 개별 백신은 가중 한계 모집단 적용 범위 목록 에서 호출하는 MERGEMULTI 절차를 통해 복합 백신으로 결합된다. 도 13은 MERGEMULTI 함수의 파이썬 구현 예를 보여준다. 이 절차는 여러 정렬된(내림차순) 목록을 입력으로 가져와 정렬된(내림차순) 단일 목록으로 병합한다. M은 MERGEMULTI의 출력을 나타내며, 여기서 각 요소 M k 는 복합 백신의 k번째 펩티드의 한계 가중치 적용 범위와 공급원(표적)을 모두 포함한다. 복합 백신에는 다양한 표적의 펩티드가 포함되어 있다. 특히, k개의 펩티드를 포함하는 복합 백신은 표적 t의 펩티드 를 포함한다. 및 (C t,k 는 전체 표적에서 복합 백신의 k 펩티드의 분포를 나타낸다.)
4단계에서 원하는 성능을 가진 백신을 선택한다. 최종 백신 크기 k는 백신의 특정 모집단 범위 표적에 따라 달라질 수 있다. 복합 백신 M k 의 한계 가중 적용 범위 값을 k에 대해 누적하여 k개 펩티드를 포함하는 복합 백신의 전체 유효(표적 가중) 모집단 적용 범위 를 얻을 수 있다(제시에서 표적의 확률/가중치 및 HLA 표시를 기반으로 한 펩티드의 예상 모집단 범위를 모두 고려).
5단계에서 최종 백신 크기 k에 대해 표적 적용 범위에 해당하는 백신 펩티드를 검색한다. 최종 백신 크기 k에 대한 최적의 복합 백신 세트 는 다음과 같이 정의된다.
따라서 k개의 펩티드를 갖는 복합 백신은 최적의 개별 (C t, k )-펩티드 백신의 조합이다. 최종 백신 크기 k는 백신의 특정 모집단 범위 표적에 따라 달라질 수 있다.
MHC 클래스 I 펩티드 서열
일부 실시예에서, 펩티드 백신(단일 표적 또는 복합 다중 표적 백신)은 약 1 내지 40개의 MHC 클래스 I 펩티드를 포함하며, 각 펩티드는 8개 이상의 아미노산으로 구성된다. 일부 실시예에서, MHC 클래스 I 펩티드 백신은 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN 또는 TP53 돌연변이 단백질 표적 중 하나 이상을 대상으로 한다. 일부 실시예에서, MHC 클래스 I 펩티드 백신은 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W 또는 TP53 Y220C 돌연변이 단백질 표적 중 하나 이상을 대상으로 한다. 일부 실시예에서, MHC 클래스 I 펩티드 백신은 췌장암, 피부암, 갑상선암, 뇌암, 결장직장암, 기관지 및 폐암, 유방암 또는 난소암 적응증 중 하나 이상을 대상으로 한다.
일부 실시예에서, AKT1 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 1 내지 18 및 SEQ ID NO: 459를 포함한다. 일부 실시예에서, AKT1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 1 내지 18 또는 SEQ ID NO: 459와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, AKT1 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 1 내지 18, SEQ ID NO: 459, SEQ ID NO: 760 내지 1768, 및 SEQ ID NO: 22386 내지 22396를 포함한다. 일부 실시예에서, AKT1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 1 내지 18, SEQ ID NO: 459, SEQ ID NO: 760 내지 1768 또는 SEQ ID NO: 22386 내지 22396와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, AKT1 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 1 내지 18 및 SEQ ID NO: 459를 포함한다. 일부 실시예에서, AKT1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 1 내지 18 또는 SEQ ID NO: 459와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, AKT1 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 1 내지 18, SEQ ID NO: 459, SEQ ID NO: 760 내지 1768, 및 SEQ ID NO: 22386 내지 22396를 포함한다. 일부 실시예에서, AKT1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 1 내지 18, SEQ ID NO: 459, SEQ ID NO: 760 내지 1768 또는 SEQ ID NO: 22386 내지 22396와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, BRAF 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 19 내지 50를 포함한다. 일부 실시예에서, BRAF 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 19 내지 50와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, BRAF 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 19 내지 50, SEQ ID NO: 1769 내지 3170, 및 SEQ ID NO: 22397 내지 22417를 포함한다. 일부 실시예에서, BRAF 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 19 내지 50, SEQ ID NO: 1769 내지 3170 또는 SEQ ID NO: 22397 내지 22417와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, BRAF 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 19 내지 50를 포함한다. 일부 실시예에서, BRAF 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 19 내지 50와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, BRAF 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 19 내지 50, SEQ ID NO: 1769 내지 3170, 및 SEQ ID NO: 22397 내지 22417를 포함한다. 일부 실시예에서, BRAF 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 19 내지 50, SEQ ID NO: 1769 내지 3170 또는 SEQ ID NO: 22397 내지 22417와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, EGFR 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 51 내지 98를 포함한다. 일부 실시예에서, EGFR 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 51 내지 98와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, EGFR 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 51 내지 98, SEQ ID NO: 3171 내지 5756, 및 SEQ ID NO: 22418 내지 22449를 포함한다. 일부 실시예에서, EGFR 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 51 내지 98, SEQ ID NO: 3171 내지 5756 또는 SEQ ID NO: 22418 내지 22449와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, EGFR 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 51 내지 98를 포함한다. 일부 실시예에서, EGFR 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 51 내지 98와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, EGFR 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 51 내지 98, SEQ ID NO: 3171 내지 5756, 및 SEQ ID NO: 22418 내지 22449를 포함한다. 일부 실시예에서, EGFR 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 51 내지 98, SEQ ID NO: 3171 내지 5756 또는 SEQ ID NO: 22418 내지 22449와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, GTF2I 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 99 내지 118를 포함한다. 일부 실시예에서, GTF2I 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 99 내지 118와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, GTF2I 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 99 내지 118, SEQ ID NO: 5757 내지 6498, 및 SEQ ID NO: 22450 내지 22466를 포함한다. 일부 실시예에서, GTF2I 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 99 내지 118, SEQ ID NO: 5757 내지 6498 또는 SEQ ID NO: 22450 내지 22466와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, GTF2I 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 99 내지 118를 포함한다. 일부 실시예에서, GTF2I 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 99 내지 118와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, GTF2I 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 99 내지 118, SEQ ID NO: 5757 내지 6498, 및 SEQ ID NO: 22450 내지 22466를 포함한다. 일부 실시예에서, GTF2I 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 99 내지 118, SEQ ID NO: 5757 내지 6498 또는 SEQ ID NO: 22450 내지 22466와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, IDH1 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 119 내지 140 및 SEQ ID NO: 460 내지 461를 포함한다. 일부 실시예에서, IDH1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 119 내지 140 또는 SEQ ID NO: 460 내지 461와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, IDH1 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 119 내지 140, SEQ ID NO: 460 내지 461, SEQ ID NO: 6499 내지 7098, 및 SEQ ID NO: 22467 내지 22488를 포함한다. 일부 실시예에서, IDH1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 119 내지 140, SEQ ID NO: 460 내지 461, SEQ ID NO: 6499 내지 7098 또는 SEQ ID NO: 22467 내지 22488와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, IDH1 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 119 내지 140 및 SEQ ID NO: 460 내지 461를 포함한다. 일부 실시예에서, IDH1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 119 내지 140 또는 SEQ ID NO: 460 내지 461와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, IDH1 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 119 내지 140, SEQ ID NO: 460 내지 461, SEQ ID NO: 6499 내지 7098, 및 SEQ ID NO: 22467 내지 22488를 포함한다. 일부 실시예에서, IDH1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 119 내지 140, SEQ ID NO: 460 내지 461, SEQ ID NO: 6499 내지 7098 또는 SEQ ID NO: 22467 내지 22488와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 141 내지 229 및 SEQ ID NO: 462 내지 466를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 141 내지 229 또는 SEQ ID NO: 462 내지 466와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 141 내지 229, SEQ ID NO: 462 내지 466, SEQ ID NO: 7099 내지 12814, 및 SEQ ID NO: 22489 내지 22558를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 141 내지 229, SEQ ID NO: 462 내지 466, SEQ ID NO: 7099 내지 12814 또는 SEQ ID NO: 22489 내지 22558와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 141 내지 229 및 SEQ ID NO: 462 내지 466를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 141 내지 229 또는 SEQ ID NO: 462 내지 466와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 141 내지 229, SEQ ID NO: 462 내지 466, SEQ ID NO: 7099 내지 12814, 및 SEQ ID NO: 22489 내지 22558를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 141 내지 229, SEQ ID NO: 462 내지 466, SEQ ID NO: 7099 내지 12814 또는 SEQ ID NO: 22489 내지 22558와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, NRAS 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 230 내지 272를 포함한다. 일부 실시예에서, NRAS 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 230 내지 272와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, NRAS 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 230 내지 272, SEQ ID NO: 12815 내지 14836, 및 SEQ ID NO: 22559 내지 22582를 포함한다. 일부 실시예에서, NRAS 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 230 내지 272, SEQ ID NO: 12815 내지 14836 또는 SEQ ID NO: 22559 내지 22582와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, NRAS 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 230 내지 272를 포함한다. 일부 실시예에서, NRAS 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 230 내지 272와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, NRAS 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 230 내지 272, SEQ ID NO: 12815 내지 14836, 및 SEQ ID NO: 22559 내지 22582를 포함한다. 일부 실시예에서, NRAS 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 230 내지 272, SEQ ID NO: 12815 내지 14836 또는 SEQ ID NO: 22559 내지 22582와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PIK3CA 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 273 내지 322 및 SEQ ID NO: 467 내지 468를 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 273 내지 322 또는 SEQ ID NO: 467 내지 468와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PIK3CA 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 273 내지 322, SEQ ID NO: 467 내지 468, SEQ ID NO: 14837 내지 17342, 및 SEQ ID NO: 22583 내지 22622를 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 273 내지 322, SEQ ID NO: 467 내지 468, SEQ ID NO: 14837 내지 17342 또는 SEQ ID NO: 22583 내지 22622와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PIK3CA 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 273 내지 322 및 SEQ ID NO: 467 내지 468를 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 273 내지 322 또는 SEQ ID NO: 467 내지 468와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PIK3CA 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 273 내지 322, SEQ ID NO: 467 내지 468, SEQ ID NO: 14837 내지 17342, 및 SEQ ID NO: 22583 내지 22622를 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 273 내지 322, SEQ ID NO: 467 내지 468, SEQ ID NO: 14837 내지 17342 또는 SEQ ID NO: 22583 내지 22622와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PTEN 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 323 내지 353를 포함한다. 일부 실시예에서, PTEN 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 323 내지 353와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PTEN 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 323 내지 353, SEQ ID NO: 17343 내지 18205, 및 SEQ ID NO: 22623 내지 22636를 포함한다. 일부 실시예에서, PTEN 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 323 내지 353, SEQ ID NO: 17343 내지 18205 또는 SEQ ID NO: 22623 내지 22636와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PTEN 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 323 내지 353를 포함한다. 일부 실시예에서, PTEN 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 323 내지 353와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PTEN 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 323 내지 353, SEQ ID NO: 17343 내지 18205, 및 SEQ ID NO: 22623 내지 22636를 포함한다. 일부 실시예에서, PTEN 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 323 내지 353, SEQ ID NO: 17343 내지 18205 또는 SEQ ID NO: 22623 내지 22636와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 354 내지 458 및 SEQ ID NO: 469 내지 474를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 354 내지 458 또는 SEQ ID NO: 469 내지 474와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 354 내지 458, SEQ ID NO: 469 내지 474, SEQ ID NO: 18206 내지 22385, 및 SEQ ID NO: 22637 내지 22727를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 354 내지 458, SEQ ID NO: 469 내지 474, SEQ ID NO: 18206 내지 22385 또는 SEQ ID NO: 22637 내지 22727와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 354 내지 458 및 SEQ ID NO: 469 내지 474를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 354 내지 458 또는 SEQ ID NO: 469 내지 474와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 354 내지 458, SEQ ID NO: 469 내지 474, SEQ ID NO: 18206 내지 22385, 및 SEQ ID NO: 22637 내지 22727를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 354 내지 458, SEQ ID NO: 469 내지 474, SEQ ID NO: 18206 내지 22385 또는 SEQ ID NO: 22637 내지 22727와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, RAS 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 141 내지 272 및 SEQ ID NO: 462 내지 466를 포함한다. 일부 실시예에서, RAS 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 141 내지 272 또는 SEQ ID NO: 462 내지 466와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, RAS 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 141 내지 272, SEQ ID NO: 462 내지 466, SEQ ID NO: 7099 내지 14836, 및 SEQ ID NO: 22489 내지 22582를 포함한다. 일부 실시예에서, RAS 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 141 내지 272, SEQ ID NO: 462 내지 466, SEQ ID NO: 7099 내지 14836 또는 SEQ ID NO: 22489 내지 22582와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, RAS 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 141 내지 272 및 SEQ ID NO: 462 내지 466를 포함한다. 일부 실시예에서, RAS 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 141 내지 272 또는 SEQ ID NO: 462 내지 466와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, RAS 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 141 내지 272, SEQ ID NO: 462 내지 466, SEQ ID NO: 7099 내지 14836, 및 SEQ ID NO: 22489 내지 22582를 포함한다. 일부 실시예에서, RAS 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 141 내지 272, SEQ ID NO: 462 내지 466, SEQ ID NO: 7099 내지 14836 또는 SEQ ID NO: 22489 내지 22582와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, BRAF V600E 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 19 내지 33를 포함한다. 일부 실시예에서, BRAF V600E 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 19 내지 33와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, BRAF V600E 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 19 내지 33, SEQ ID NO: 1769 내지 2329, 및 SEQ ID NO: 22397 내지 22405를 포함한다. 일부 실시예에서, BRAF V600E 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 19 내지 33, SEQ ID NO: 1769 내지 2329 또는 SEQ ID NO: 22397 내지 22405와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, BRAF V600E 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 19 내지 33를 포함한다. 일부 실시예에서, BRAF V600E 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 19 내지 33와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, BRAF V600E 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 19 내지 33, SEQ ID NO: 1769 내지 2329, 및 SEQ ID NO: 22397 내지 22405를 포함한다. 일부 실시예에서, BRAF V600E 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 19 내지 33, SEQ ID NO: 1769 내지 2329 또는 SEQ ID NO: 22397 내지 22405와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, BRAF V600M 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 34 내지 50를 포함한다. 일부 실시예에서, BRAF V600M 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 34 내지 50와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, BRAF V600M 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 34 내지 50, SEQ ID NO: 2330 내지 3170, 및 SEQ ID NO: 22406 내지 22417를 포함한다. 일부 실시예에서, BRAF V600M 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 34 내지 50, SEQ ID NO: 2330 내지 3170 또는 SEQ ID NO: 22406 내지 22417와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, BRAF V600M 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 34 내지 50를 포함한다. 일부 실시예에서, BRAF V600M 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 34 내지 50와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, BRAF V600M 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 34 내지 50, SEQ ID NO: 2330 내지 3170, 및 SEQ ID NO: 22406 내지 22417를 포함한다. 일부 실시예에서, BRAF V600M 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 34 내지 50, SEQ ID NO: 2330 내지 3170 또는 SEQ ID NO: 22406 내지 22417와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, EGFR A289V 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 51 내지 66를 포함한다. 일부 실시예에서, EGFR A289V 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 51 내지 66와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, EGFR A289V 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 51 내지 66, SEQ ID NO: 3171 내지 4055, 및 SEQ ID NO: 22418 내지 22430를 포함한다. 일부 실시예에서, EGFR A289V 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 51 내지 66, SEQ ID NO: 3171 내지 4055 또는 SEQ ID NO: 22418 내지 22430와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, EGFR A289V 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 51 내지 66를 포함한다. 일부 실시예에서, EGFR A289V 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 51 내지 66와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, EGFR A289V 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 51 내지 66, SEQ ID NO: 3171 내지 4055, 및 SEQ ID NO: 22418 내지 22430를 포함한다. 일부 실시예에서, EGFR A289V 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 51 내지 66, SEQ ID NO: 3171 내지 4055 또는 SEQ ID NO: 22418 내지 22430와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, EGFR G598V 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 67 내지 81를 포함한다. 일부 실시예에서, EGFR G598V 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 67 내지 81와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, EGFR G598V 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 67 내지 81, SEQ ID NO: 4056 내지 4718, 및 SEQ ID NO: 22431 내지 22437를 포함한다. 일부 실시예에서, EGFR G598V 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 67 내지 81, SEQ ID NO: 4056 내지 4718 또는 SEQ ID NO: 22431 내지 22437와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, EGFR G598V 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 67 내지 81를 포함한다. 일부 실시예에서, EGFR G598V 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 67 내지 81와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, EGFR G598V 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 67 내지 81, SEQ ID NO: 4056 내지 4718, 및 SEQ ID NO: 22431 내지 22437를 포함한다. 일부 실시예에서, EGFR G598V 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 67 내지 81, SEQ ID NO: 4056 내지 4718 또는 SEQ ID NO: 22431 내지 22437와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, EGFR L858R 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 82 내지 98를 포함한다. 일부 실시예에서, EGFR L858R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 82 내지 98와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, EGFR L858R 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 82 내지 98, SEQ ID NO: 4719 내지 5756, 및 SEQ ID NO: 22438 내지 22449를 포함한다. 일부 실시예에서, EGFR L858R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 82 내지 98, SEQ ID NO: 4719 내지 5756 또는 SEQ ID NO: 22438 내지 22449와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, EGFR L858R 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 82 내지 98를 포함한다. 일부 실시예에서, EGFR L858R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 82 내지 98와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, EGFR L858R 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 82 내지 98, SEQ ID NO: 4719 내지 5756, 및 SEQ ID NO: 22438 내지 22449를 포함한다. 일부 실시예에서, EGFR L858R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 82 내지 98, SEQ ID NO: 4719 내지 5756 또는 SEQ ID NO: 22438 내지 22449와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, IDH1 R132H 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 125 내지 140 및 SEQ ID NO: 461를 포함한다. 일부 실시예에서, IDH1 R132H 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 125 내지 140 또는 SEQ ID NO: 461와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, IDH1 R132H 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 125 내지 140, SEQ ID NO: 461, SEQ ID NO: 6738 내지 7098, 및 SEQ ID NO: 22477 내지 22488를 포함한다. 일부 실시예에서, IDH1 R132H 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 125 내지 140, SEQ ID NO: 461, SEQ ID NO: 6738 내지 7098 또는 SEQ ID NO: 22477 내지 22488와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, IDH1 R132H 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 125 내지 140 및 SEQ ID NO: 461를 포함한다. 일부 실시예에서, IDH1 R132H 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 125 내지 140 또는 SEQ ID NO: 461와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, IDH1 R132H 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 125 내지 140, SEQ ID NO: 461, SEQ ID NO: 6738 내지 7098, 및 SEQ ID NO: 22477 내지 22488를 포함한다. 일부 실시예에서, IDH1 R132H 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 125 내지 140, SEQ ID NO: 461, SEQ ID NO: 6738 내지 7098 또는 SEQ ID NO: 22477 내지 22488와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, IDH1 R132C 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 119 내지 124 및 SEQ ID NO: 460를 포함한다. 일부 실시예에서, IDH1 R132C 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 119 내지 124 또는 SEQ ID NO: 460와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, IDH1 R132C 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 119 내지 124, SEQ ID NO: 460, SEQ ID NO: 6499 내지 6737, 및 SEQ ID NO: 22467 내지 22476를 포함한다. 일부 실시예에서, IDH1 R132C 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 119 내지 124, SEQ ID NO: 460, SEQ ID NO: 6499 내지 6737 또는 SEQ ID NO: 22467 내지 22476와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, IDH1 R132C 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 119 내지 124 및 SEQ ID NO: 460를 포함한다. 일부 실시예에서, IDH1 R132C 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 119 내지 124 또는 SEQ ID NO: 460와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, IDH1 R132C 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 119 내지 124, SEQ ID NO: 460, SEQ ID NO: 6499 내지 6737, 및 SEQ ID NO: 22467 내지 22476를 포함한다. 일부 실시예에서, IDH1 R132C 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 119 내지 124, SEQ ID NO: 460, SEQ ID NO: 6499 내지 6737 또는 SEQ ID NO: 22467 내지 22476와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12D 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 167 내지 178 및 SEQ ID NO: 464를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12D 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 167 내지 178 또는 SEQ ID NO: 464와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12D 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 167 내지 178, SEQ ID NO: 464, SEQ ID NO: 8432 내지 9733, 및 SEQ ID NO: 22507 내지 22518를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12D 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 167 내지 178, SEQ ID NO: 464, SEQ ID NO: 8432 내지 9733 또는 SEQ ID NO: 22507 내지 22518와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12D 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 167 내지 178 및 SEQ ID NO: 464를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12D 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 167 내지 178 또는 SEQ ID NO: 464와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12D 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 167 내지 178, SEQ ID NO: 464, SEQ ID NO: 8432 내지 9733, 및 SEQ ID NO: 22507 내지 22518를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12D 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 167 내지 178, SEQ ID NO: 464, SEQ ID NO: 8432 내지 9733 또는 SEQ ID NO: 22507 내지 22518와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12V 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 203 내지 213를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12V 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 203 내지 213와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12V 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 203 내지 213, SEQ ID NO: 11009 내지 11744, 및 SEQ ID NO: 22537 내지 22546를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12V 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 203 내지 213, SEQ ID NO: 11009 내지 11744 또는 SEQ ID NO: 22537 내지 22546와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12V 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 203 내지 213를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12V 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 203 내지 213와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12V 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 203 내지 213, SEQ ID NO: 11009 내지 11744, 및 SEQ ID NO: 22537 내지 22546를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12V 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 203 내지 213, SEQ ID NO: 11009 내지 11744 또는 SEQ ID NO: 22537 내지 22546와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12R 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 179 내지 191 및 SEQ ID NO: 465를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 179 내지 191 또는 SEQ ID NO: 465와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12R 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 179 내지 191, SEQ ID NO: 465, SEQ ID NO: 9734 내지 10236, 및 SEQ ID NO: 22519 내지 22527를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 179 내지 191, SEQ ID NO: 465, SEQ ID NO: 9734 내지 10236 또는 SEQ ID NO: 22519 내지 22527와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12R 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 179 내지 191 및 SEQ ID NO: 465를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 179 내지 191 또는 SEQ ID NO: 465와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12R 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 179 내지 191, SEQ ID NO: 465, SEQ ID NO: 9734 내지 10236, 및 SEQ ID NO: 22519 내지 22527를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 179 내지 191, SEQ ID NO: 465, SEQ ID NO: 9734 내지 10236 또는 SEQ ID NO: 22519 내지 22527와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12C 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 154 내지 166 및 SEQ ID NO: 463를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12C 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 154 내지 166 또는 SEQ ID NO: 463와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12C 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 154 내지 166, SEQ ID NO: 463, SEQ ID NO: 7881 내지 8431, 및 SEQ ID NO: 22498 내지 22506를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12C 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 154 내지 166, SEQ ID NO: 463, SEQ ID NO: 7881 내지 8431 또는 SEQ ID NO: 22498 내지 22506와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12C 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 154 내지 166 및 SEQ ID NO: 463를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12C 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 154 내지 166 또는 SEQ ID NO: 463와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12C 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 154 내지 166, SEQ ID NO: 463, SEQ ID NO: 7881 내지 8431, 및 SEQ ID NO: 22498 내지 22506를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12C 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 154 내지 166, SEQ ID NO: 463, SEQ ID NO: 7881 내지 8431 또는 SEQ ID NO: 22498 내지 22506와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G13D 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 214 내지 229 및 SEQ ID NO: 466를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G13D 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 214 내지 229 또는 SEQ ID NO: 466와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G13D 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 214 내지 229, SEQ ID NO: 466, SEQ ID NO: 11745 내지 12814, 및 SEQ ID NO: 22547 내지 22558를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G13D 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 214 내지 229, SEQ ID NO: 466, SEQ ID NO: 11745 내지 12814 또는 SEQ ID NO: 22547 내지 22558와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G13D 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 214 내지 229 및 SEQ ID NO: 466를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G13D 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 214 내지 229 또는 SEQ ID NO: 466와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G13D 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 214 내지 229, SEQ ID NO: 466, SEQ ID NO: 11745 내지 12814, 및 SEQ ID NO: 22547 내지 22558를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G13D 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 214 내지 229, SEQ ID NO: 466, SEQ ID NO: 11745 내지 12814 또는 SEQ ID NO: 22547 내지 22558와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12A 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 141 내지 153 및 SEQ ID NO: 462를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12A 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 141 내지 153 또는 SEQ ID NO: 462와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12A 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 141 내지 153, SEQ ID NO: 462, SEQ ID NO: 7099 내지 7880, 및 SEQ ID NO: 22489 내지 22497를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12A 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 141 내지 153, SEQ ID NO: 462, SEQ ID NO: 7099 내지 7880 또는 SEQ ID NO: 22489 내지 22497와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12A 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 141 내지 153 및 SEQ ID NO: 462를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12A 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 141 내지 153 또는 SEQ ID NO: 462와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12A 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 141 내지 153, SEQ ID NO: 462, SEQ ID NO: 7099 내지 7880, 및 SEQ ID NO: 22489 내지 22497를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12A 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 141 내지 153, SEQ ID NO: 462, SEQ ID NO: 7099 내지 7880 또는 SEQ ID NO: 22489 내지 22497와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12S 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 192 내지 202를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12S 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 192 내지 202와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12S 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 192 내지 202, SEQ ID NO: 10237 내지 11008, 및 SEQ ID NO: 22528 내지 22536를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12S 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 192 내지 202, SEQ ID NO: 10237 내지 11008 또는 SEQ ID NO: 22528 내지 22536와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12S 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 192 내지 202를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12S 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 192 내지 202와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12S 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 192 내지 202, SEQ ID NO: 10237 내지 11008, 및 SEQ ID NO: 22528 내지 22536를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12S 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 192 내지 202, SEQ ID NO: 10237 내지 11008 또는 SEQ ID NO: 22528 내지 22536와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, NRAS Q61R 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 256 내지 272를 포함한다. 일부 실시예에서, NRAS Q61R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 256 내지 272와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, NRAS Q61R 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 256 내지 272, SEQ ID NO: 14315 내지 14836, 및 SEQ ID NO: 22577 내지 22582를 포함한다. 일부 실시예에서, NRAS Q61R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 256 내지 272, SEQ ID NO: 14315 내지 14836 또는 SEQ ID NO: 22577 내지 22582와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, NRAS Q61R 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 256 내지 272를 포함한다. 일부 실시예에서, NRAS Q61R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 256 내지 272와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, NRAS Q61R 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 256 내지 272, SEQ ID NO: 14315 내지 14836, 및 SEQ ID NO: 22577 내지 22582를 포함한다. 일부 실시예에서, NRAS Q61R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 256 내지 272, SEQ ID NO: 14315 내지 14836 또는 SEQ ID NO: 22577 내지 22582와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, NRAS Q61K 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 230 내지 238를 포함한다. 일부 실시예에서, NRAS Q61K 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 230 내지 238와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, NRAS Q61K 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 230 내지 238, SEQ ID NO: 12815 내지 13434, 및 SEQ ID NO: 22559 내지 22567를 포함한다. 일부 실시예에서, NRAS Q61K 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 230 내지 238, SEQ ID NO: 12815 내지 13434 또는 SEQ ID NO: 22559 내지 22567와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, NRAS Q61K 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 230 내지 238를 포함한다. 일부 실시예에서, NRAS Q61K 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 230 내지 238와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, NRAS Q61K 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 230 내지 238, SEQ ID NO: 12815 내지 13434, 및 SEQ ID NO: 22559 내지 22567를 포함한다. 일부 실시예에서, NRAS Q61K 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 230 내지 238, SEQ ID NO: 12815 내지 13434 또는 SEQ ID NO: 22559 내지 22567와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, NRAS Q61L 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 239 내지 255를 포함한다. 일부 실시예에서, NRAS Q61L 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 239 내지 255와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, NRAS Q61L 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 239 내지 255, SEQ ID NO: 13435 내지 14314, 및 SEQ ID NO: 22568 내지 22576를 포함한다. 일부 실시예에서, NRAS Q61L 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 239 내지 255, SEQ ID NO: 13435 내지 14314 또는 SEQ ID NO: 22568 내지 22576와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, NRAS Q61L 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 239 내지 255를 포함한다. 일부 실시예에서, NRAS Q61L 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 239 내지 255와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, NRAS Q61L 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 239 내지 255, SEQ ID NO: 13435 내지 14314, 및 SEQ ID NO: 22568 내지 22576를 포함한다. 일부 실시예에서, NRAS Q61L 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 239 내지 255, SEQ ID NO: 13435 내지 14314 또는 SEQ ID NO: 22568 내지 22576와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PIK3CA E542K 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 273 내지 285를 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA E542K 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 273 내지 285와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PIK3CA E542K 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 273 내지 285, SEQ ID NO: 14837 내지 15625, 및 SEQ ID NO: 22583 내지 22592를 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA E542K 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 273 내지 285, SEQ ID NO: 14837 내지 15625 또는 SEQ ID NO: 22583 내지 22592와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PIK3CA E542K 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 273 내지 285를 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA E542K 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 273 내지 285와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PIK3CA E542K 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 273 내지 285, SEQ ID NO: 14837 내지 15625, 및 SEQ ID NO: 22583 내지 22592를 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA E542K 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 273 내지 285, SEQ ID NO: 14837 내지 15625 또는 SEQ ID NO: 22583 내지 22592와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PIK3CA E545K 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 286 내지 293 및 SEQ ID NO: 467를 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA E545K 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 286 내지 293 또는 SEQ ID NO: 467와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PIK3CA E545K 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 286 내지 293, SEQ ID NO: 467, SEQ ID NO: 15626 내지 15907, 및 SEQ ID NO: 22593 내지 22602를 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA E545K 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 286 내지 293, SEQ ID NO: 467, SEQ ID NO: 15626 내지 15907 또는 SEQ ID NO: 22593 내지 22602와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PIK3CA E545K 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 286 내지 293 및 SEQ ID NO: 467를 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA E545K 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 286 내지 293 또는 SEQ ID NO: 467와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PIK3CA E545K 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 286 내지 293, SEQ ID NO: 467, SEQ ID NO: 15626 내지 15907, 및 SEQ ID NO: 22593 내지 22602를 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA E545K 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 286 내지 293, SEQ ID NO: 467, SEQ ID NO: 15626 내지 15907 또는 SEQ ID NO: 22593 내지 22602와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PIK3CA H1047R 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 294 내지 309를 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA H1047R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 294 내지 309와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PIK3CA H1047R 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 294 내지 309, SEQ ID NO: 15908 내지 16276, 및 SEQ ID NO: 22603 내지 22608를 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA H1047R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 294 내지 309, SEQ ID NO: 15908 내지 16276 또는 SEQ ID NO: 22603 내지 22608와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PIK3CA H1047R 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 294 내지 309를 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA H1047R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 294 내지 309와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PIK3CA H1047R 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 294 내지 309, SEQ ID NO: 15908 내지 16276, 및 SEQ ID NO: 22603 내지 22608를 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA H1047R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 294 내지 309, SEQ ID NO: 15908 내지 16276 또는 SEQ ID NO: 22603 내지 22608와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R158L 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 359 내지 374 및 SEQ ID NO: 469 내지 470를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R158L 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 359 내지 374 또는 SEQ ID NO: 469 내지 470와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R158L 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 359 내지 374, SEQ ID NO: 469 내지 470, SEQ ID NO: 18414 내지 19404, 및 SEQ ID NO: 22644 내지 22657를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R158L 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 359 내지 374, SEQ ID NO: 469 내지 470, SEQ ID NO: 18414 내지 19404 또는 SEQ ID NO: 22644 내지 22657와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R158L 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 359 내지 374 및 SEQ ID NO: 469 내지 470를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R158L 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 359 내지 374 또는 SEQ ID NO: 469 내지 470와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R158L 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 359 내지 374, SEQ ID NO: 469 내지 470, SEQ ID NO: 18414 내지 19404, 및 SEQ ID NO: 22644 내지 22657를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R158L 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 359 내지 374, SEQ ID NO: 469 내지 470, SEQ ID NO: 18414 내지 19404 또는 SEQ ID NO: 22644 내지 22657와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R175H 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 375 내지 386 및 SEQ ID NO: 471 내지 472를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R175H 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 375 내지 386 또는 SEQ ID NO: 471 내지 472와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R175H 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 375 내지 386, SEQ ID NO: 471 내지 472, SEQ ID NO: 19405 내지 19752, 및 SEQ ID NO: 22658 내지 22665를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R175H 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 375 내지 386, SEQ ID NO: 471 내지 472, SEQ ID NO: 19405 내지 19752 또는 SEQ ID NO: 22658 내지 22665와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R175H 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 375 내지 386 및 SEQ ID NO: 471 내지 472를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R175H 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 375 내지 386 또는 SEQ ID NO: 471 내지 472와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R175H 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 375 내지 386, SEQ ID NO: 471 내지 472, SEQ ID NO: 19405 내지 19752, 및 SEQ ID NO: 22658 내지 22665를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R175H 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 375 내지 386, SEQ ID NO: 471 내지 472, SEQ ID NO: 19405 내지 19752 또는 SEQ ID NO: 22658 내지 22665와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R248Q 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 387 내지 401를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R248Q 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 387 내지 401와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R248Q 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 387 내지 401, SEQ ID NO: 19753 내지 20608, 및 SEQ ID NO: 22666 내지 22678를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R248Q 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 387 내지 401, SEQ ID NO: 19753 내지 20608 또는 SEQ ID NO: 22666 내지 22678와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R248Q 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 387 내지 401를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R248Q 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 387 내지 401와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R248Q 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 387 내지 401, SEQ ID NO: 19753 내지 20608, 및 SEQ ID NO: 22666 내지 22678를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R248Q 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 387 내지 401, SEQ ID NO: 19753 내지 20608 또는 SEQ ID NO: 22666 내지 22678와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R273C 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 422 내지 432 및 SEQ ID NO: 473를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R273C 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 422 내지 432 또는 SEQ ID NO: 473와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R273C 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 422 내지 432, SEQ ID NO: 473, SEQ ID NO: 21192 내지 21462, 및 SEQ ID NO: 22690 내지 22701를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R273C 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 422 내지 432, SEQ ID NO: 473, SEQ ID NO: 21192 내지 21462 또는 SEQ ID NO: 22690 내지 22701와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R273C 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 422 내지 432 및 SEQ ID NO: 473를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R273C 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 422 내지 432 또는 SEQ ID NO: 473와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R273C 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 422 내지 432, SEQ ID NO: 473, SEQ ID NO: 21192 내지 21462, 및 SEQ ID NO: 22690 내지 22701를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R273C 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 422 내지 432, SEQ ID NO: 473, SEQ ID NO: 21192 내지 21462 또는 SEQ ID NO: 22690 내지 22701와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R273H 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 433 내지 446 및 SEQ ID NO: 474를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R273H 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 433 내지 446 또는 SEQ ID NO: 474와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R273H 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 433 내지 446, SEQ ID NO: 474, SEQ ID NO: 21463 내지 21845, 및 SEQ ID NO: 22702 내지 22713를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R273H 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 433 내지 446, SEQ ID NO: 474, SEQ ID NO: 21463 내지 21845 또는 SEQ ID NO: 22702 내지 22713와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R273H 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 433 내지 446 및 SEQ ID NO: 474를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R273H 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 433 내지 446 또는 SEQ ID NO: 474와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R273H 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 433 내지 446, SEQ ID NO: 474, SEQ ID NO: 21463 내지 21845, 및 SEQ ID NO: 22702 내지 22713를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R273H 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 433 내지 446, SEQ ID NO: 474, SEQ ID NO: 21463 내지 21845 또는 SEQ ID NO: 22702 내지 22713와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R248W 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 402 내지 421를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R248W 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 402 내지 421와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R248W 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 402 내지 421, SEQ ID NO: 20609 내지 21191, 및 SEQ ID NO: 22679 내지 22689를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R248W 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 402 내지 421, SEQ ID NO: 20609 내지 21191 또는 SEQ ID NO: 22679 내지 22689와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R248W 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 402 내지 421를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R248W 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 402 내지 421와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R248W 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 402 내지 421, SEQ ID NO: 20609 내지 21191, 및 SEQ ID NO: 22679 내지 22689를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R248W 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 402 내지 421, SEQ ID NO: 20609 내지 21191 또는 SEQ ID NO: 22679 내지 22689와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R282W 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 447 내지 449를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R282W 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 447 내지 449와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R282W 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 447 내지 449, SEQ ID NO: 21846 내지 21940, 및 SEQ ID NO: 22714 내지 22720를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R282W 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 447 내지 449, SEQ ID NO: 21846 내지 21940 또는 SEQ ID NO: 22714 내지 22720와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R282W 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 447 내지 449를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R282W 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 447 내지 449와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R282W 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 447 내지 449, SEQ ID NO: 21846 내지 21940, 및 SEQ ID NO: 22714 내지 22720를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R282W 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 447 내지 449, SEQ ID NO: 21846 내지 21940 또는 SEQ ID NO: 22714 내지 22720와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 Y220C 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 450 내지 458를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 Y220C 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 450 내지 458와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 Y220C 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 450 내지 458, SEQ ID NO: 21941 내지 22385, 및 SEQ ID NO: 22721 내지 22727를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 Y220C 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 450 내지 458, SEQ ID NO: 21941 내지 22385 또는 SEQ ID NO: 22721 내지 22727와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 Y220C 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 450 내지 458를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 Y220C 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 450 내지 458와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 Y220C 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 450 내지 458, SEQ ID NO: 21941 내지 22385, 및 SEQ ID NO: 22721 내지 22727를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 Y220C 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 450 내지 458, SEQ ID NO: 21941 내지 22385 또는 SEQ ID NO: 22721 내지 22727와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PIK3CA R88Q 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 310 내지 322 및 SEQ ID NO: 468를 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA R88Q 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 310 내지 322 또는 SEQ ID NO: 468와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PIK3CA R88Q 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 310 내지 322, SEQ ID NO: 468, SEQ ID NO: 16277 내지 17342, 및 SEQ ID NO: 22609 내지 22622를 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA R88Q 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 310 내지 322, SEQ ID NO: 468, SEQ ID NO: 16277 내지 17342 또는 SEQ ID NO: 22609 내지 22622와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PIK3CA R88Q 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 310 내지 322 및 SEQ ID NO: 468를 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA R88Q 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 310 내지 322 또는 SEQ ID NO: 468와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PIK3CA R88Q 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 310 내지 322, SEQ ID NO: 468, SEQ ID NO: 16277 내지 17342, 및 SEQ ID NO: 22609 내지 22622를 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA R88Q 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 310 내지 322, SEQ ID NO: 468, SEQ ID NO: 16277 내지 17342 또는 SEQ ID NO: 22609 내지 22622와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, GTF2I L424H 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 99 내지 118를 포함한다. 일부 실시예에서, GTF2I L424H 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 99 내지 118와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, GTF2I L424H 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 99 내지 118, SEQ ID NO: 5757 내지 6498, 및 SEQ ID NO: 22450 내지 22466를 포함한다. 일부 실시예에서, GTF2I L424H 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 99 내지 118, SEQ ID NO: 5757 내지 6498 또는 SEQ ID NO: 22450 내지 22466와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, GTF2I L424H 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 99 내지 118를 포함한다. 일부 실시예에서, GTF2I L424H 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 99 내지 118와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, GTF2I L424H 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 99 내지 118, SEQ ID NO: 5757 내지 6498, 및 SEQ ID NO: 22450 내지 22466를 포함한다. 일부 실시예에서, GTF2I L424H 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 99 내지 118, SEQ ID NO: 5757 내지 6498 또는 SEQ ID NO: 22450 내지 22466와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PTEN R130Q 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 338 내지 353를 포함한다. 일부 실시예에서, PTEN R130Q 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 338 내지 353와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PTEN R130Q 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 338 내지 353, SEQ ID NO: 17869 내지 18205, 및 SEQ ID NO: 22630 내지 22636를 포함한다. 일부 실시예에서, PTEN R130Q 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 338 내지 353, SEQ ID NO: 17869 내지 18205 또는 SEQ ID NO: 22630 내지 22636와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PTEN R130Q 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 338 내지 353를 포함한다. 일부 실시예에서, PTEN R130Q 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 338 내지 353와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PTEN R130Q 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 338 내지 353, SEQ ID NO: 17869 내지 18205, 및 SEQ ID NO: 22630 내지 22636를 포함한다. 일부 실시예에서, PTEN R130Q 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 338 내지 353, SEQ ID NO: 17869 내지 18205 또는 SEQ ID NO: 22630 내지 22636와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, AKT1 E17K 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 1 내지 18 및 SEQ ID NO: 459를 포함한다. 일부 실시예에서, AKT1 E17K 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 1 내지 18 또는 SEQ ID NO: 459와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, AKT1 E17K 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 1 내지 18, SEQ ID NO: 459, SEQ ID NO: 760 내지 1768, 및 SEQ ID NO: 22386 내지 22396를 포함한다. 일부 실시예에서, AKT1 E17K 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 1 내지 18, SEQ ID NO: 459, SEQ ID NO: 760 내지 1768 또는 SEQ ID NO: 22386 내지 22396와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, AKT1 E17K 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 1 내지 18 및 SEQ ID NO: 459를 포함한다. 일부 실시예에서, AKT1 E17K 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 1 내지 18 또는 SEQ ID NO: 459와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, AKT1 E17K 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 1 내지 18, SEQ ID NO: 459, SEQ ID NO: 760 내지 1768, 및 SEQ ID NO: 22386 내지 22396를 포함한다. 일부 실시예에서, AKT1 E17K 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 1 내지 18, SEQ ID NO: 459, SEQ ID NO: 760 내지 1768 또는 SEQ ID NO: 22386 내지 22396와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PTEN R130G 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 323 내지 337를 포함한다. 일부 실시예에서, PTEN R130G 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 323 내지 337와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PTEN R130G 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 323 내지 337, SEQ ID NO: 17343 내지 17868, 및 SEQ ID NO: 22623 내지 22629를 포함한다. 일부 실시예에서, PTEN R130G 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 323 내지 337, SEQ ID NO: 17343 내지 17868 또는 SEQ ID NO: 22623 내지 22629와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PTEN R130G 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 323 내지 337를 포함한다. 일부 실시예에서, PTEN R130G 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 323 내지 337와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PTEN R130G 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 323 내지 337, SEQ ID NO: 17343 내지 17868, 및 SEQ ID NO: 22623 내지 22629를 포함한다. 일부 실시예에서, PTEN R130G 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 323 내지 337, SEQ ID NO: 17343 내지 17868 또는 SEQ ID NO: 22623 내지 22629와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 H179R 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 354 내지 358를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 H179R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 354 내지 358와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 H179R 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 354 내지 358, SEQ ID NO: 18206 내지 18413, 및 SEQ ID NO: 22637 내지 22643를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 H179R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 354 내지 358, SEQ ID NO: 18206 내지 18413 또는 SEQ ID NO: 22637 내지 22643와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 H179R 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 354 내지 358를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 H179R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 354 내지 358와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 H179R 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 354 내지 358, SEQ ID NO: 18206 내지 18413, 및 SEQ ID NO: 22637 내지 22643를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 H179R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 354 내지 358, SEQ ID NO: 18206 내지 18413 또는 SEQ ID NO: 22637 내지 22643와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, 췌장암에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열 백신은 하나 이상의 SEQ ID NO: 168 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 179 내지 180, SEQ ID NO: 182 내지 183, SEQ ID NO: 203 내지 204, 및 SEQ ID NO: 207를 포함한다. 일부 실시예에서, 췌장암 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 168 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 179 내지 180, SEQ ID NO: 182 내지 183, SEQ ID NO: 203 내지 204 또는 SEQ ID NO: 207와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, 췌장암에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열 백신은 2개 이상의 SEQ ID NO: 168 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 179 내지 180, SEQ ID NO: 182 내지 183, SEQ ID NO: 203 내지 204, 및 SEQ ID NO: 207를 포함한다. 일부 실시예에서, 췌장암 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 168 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 179 내지 180, SEQ ID NO: 182 내지 183, SEQ ID NO: 203 내지 204 또는 SEQ ID NO: 207와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, 피부암에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열 백신은 하나 이상의 SEQ ID NO: 19 내지 23, SEQ ID NO: 34 내지 40, SEQ ID NO: 230 내지 231, SEQ ID NO: 239, SEQ ID NO: 241 내지 242, 및 SEQ ID NO: 260 내지 262를 포함한다. 일부 실시예에서, 피부암 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 19 내지 23, SEQ ID NO: 34 내지 40, SEQ ID NO: 230 내지 231, SEQ ID NO: 239, SEQ ID NO: 241 내지 242 또는 SEQ ID NO: 260 내지 262와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, 피부암에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열 백신은 2개 이상의 SEQ ID NO: 19 내지 23, SEQ ID NO: 34 내지 40, SEQ ID NO: 230 내지 231, SEQ ID NO: 239, SEQ ID NO: 241 내지 242, 및 SEQ ID NO: 260 내지 262를 포함한다. 일부 실시예에서, 피부암 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 19 내지 23, SEQ ID NO: 34 내지 40, SEQ ID NO: 230 내지 231, SEQ ID NO: 239, SEQ ID NO: 241 내지 242 또는 SEQ ID NO: 260 내지 262와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, 갑상선암에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열 백신은 하나 이상의 SEQ ID NO: 19 내지 23, SEQ ID NO: 230 내지 231, 및 SEQ ID NO: 260 내지 262를 포함한다. 일부 실시예에서, 갑상선암 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 19 내지 23, SEQ ID NO: 230 내지 231 또는 SEQ ID NO: 260 내지 262와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, 갑상선암에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열 백신은 2개 이상의 SEQ ID NO: 19 내지 23, SEQ ID NO: 230 내지 231, 및 SEQ ID NO: 260 내지 262를 포함한다. 일부 실시예에서, 갑상선암 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 19 내지 23, SEQ ID NO: 230 내지 231 또는 SEQ ID NO: 260 내지 262와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, 뇌암에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열 백신은 하나 이상의 SEQ ID NO: 51 내지 55, SEQ ID NO: 67 내지 70, SEQ ID NO: 72 내지 73, SEQ ID NO: 119 내지 120, SEQ ID NO: 125 내지 130, SEQ ID NO: 375, SEQ ID NO: 423, SEQ ID NO: 425, 및 SEQ ID NO: 471 내지 473를 포함한다. 일부 실시예에서, 뇌암 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 51 내지 55, SEQ ID NO: 67 내지 70, SEQ ID NO: 72 내지 73, SEQ ID NO: 119 내지 120, SEQ ID NO: 125 내지 130, SEQ ID NO: 375, SEQ ID NO: 423, SEQ ID NO: 425 또는 SEQ ID NO: 471 내지 473와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, 뇌암에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열 백신은 2개 이상의 SEQ ID NO: 51 내지 55, SEQ ID NO: 67 내지 70, SEQ ID NO: 72 내지 73, SEQ ID NO: 119 내지 120, SEQ ID NO: 125 내지 130, SEQ ID NO: 375, SEQ ID NO: 423, SEQ ID NO: 425, 및 SEQ ID NO: 471 내지 473를 포함한다. 일부 실시예에서, 뇌암 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 51 내지 55, SEQ ID NO: 67 내지 70, SEQ ID NO: 72 내지 73, SEQ ID NO: 119 내지 120, SEQ ID NO: 125 내지 130, SEQ ID NO: 375, SEQ ID NO: 423, SEQ ID NO: 425 또는 SEQ ID NO: 471 내지 473와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, 결장직장암에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열 백신은 하나 이상의 SEQ ID NO: 20 내지 23, SEQ ID NO: 167 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 203 내지 207, SEQ ID NO: 215 내지 217, SEQ ID NO: 288, SEQ ID NO: 467, 및 SEQ ID NO: 471 내지 472를 포함한다. 일부 실시예에서, 결장직장암 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 20 내지 23, SEQ ID NO: 167 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 203 내지 207, SEQ ID NO: 215 내지 217, SEQ ID NO: 288, SEQ ID NO: 467 또는 SEQ ID NO: 471 내지 472와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, 결장직장암에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열 백신은 2개 이상의 SEQ ID NO: 20 내지 23, SEQ ID NO: 167 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 203 내지 207, SEQ ID NO: 215 내지 217, SEQ ID NO: 288, SEQ ID NO: 467, 및 SEQ ID NO: 471 내지 472를 포함한다. 일부 실시예에서, 결장직장암 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 20 내지 23, SEQ ID NO: 167 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 203 내지 207, SEQ ID NO: 215 내지 217, SEQ ID NO: 288, SEQ ID NO: 467 또는 SEQ ID NO: 471 내지 472와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, 기관지 및 폐암에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열 백신은 하나 이상의 SEQ ID NO: 82 내지 86, SEQ ID NO: 141 내지 144, SEQ ID NO: 154 내지 159, SEQ ID NO: 168 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 203 내지 204, SEQ ID NO: 207, SEQ ID NO: 274 내지 276, SEQ ID NO: 288, SEQ ID NO: 359, SEQ ID NO: 362 내지 364, 및 SEQ ID NO: 467를 포함한다. 일부 실시예에서, 기관지 및 폐암 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 82 내지 86, SEQ ID NO: 141 내지 144, SEQ ID NO: 154 내지 159, SEQ ID NO: 168 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 203 내지 204, SEQ ID NO: 207, SEQ ID NO: 274 내지 276, SEQ ID NO: 288, SEQ ID NO: 359, SEQ ID NO: 362 내지 364 또는 SEQ ID NO: 467와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, 기관지 및 폐암에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열 백신은 2개 이상의 SEQ ID NO: 82 내지 86, SEQ ID NO: 141 내지 144, SEQ ID NO: 154 내지 159, SEQ ID NO: 168 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 203 내지 204, SEQ ID NO: 207, SEQ ID NO: 274 내지 276, SEQ ID NO: 288, SEQ ID NO: 359, SEQ ID NO: 362 내지 364, 및 SEQ ID NO: 467를 포함한다. 일부 실시예에서, 기관지 및 폐암 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 82 내지 86, SEQ ID NO: 141 내지 144, SEQ ID NO: 154 내지 159, SEQ ID NO: 168 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 203 내지 204, SEQ ID NO: 207, SEQ ID NO: 274 내지 276, SEQ ID NO: 288, SEQ ID NO: 359, SEQ ID NO: 362 내지 364 또는 SEQ ID NO: 467와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, 유방암에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열 백신은 하나 이상의 SEQ ID NO: 273 내지 309, SEQ ID NO: 375 내지 386, SEQ ID NO: 422 내지 446, SEQ ID NO: 467, 및 SEQ ID NO: 471 내지 474를 포함한다. 일부 실시예에서, 유방암 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 273 내지 309, SEQ ID NO: 375 내지 386, SEQ ID NO: 422 내지 446, SEQ ID NO: 467 또는 SEQ ID NO: 471 내지 474와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, 유방암에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열 백신은 2개 이상의 SEQ ID NO: 273 내지 309, SEQ ID NO: 375 내지 386, SEQ ID NO: 422 내지 446, SEQ ID NO: 467, 및 SEQ ID NO: 471 내지 474를 포함한다. 일부 실시예에서, 유방암 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 273 내지 309, SEQ ID NO: 375 내지 386, SEQ ID NO: 422 내지 446, SEQ ID NO: 467 또는 SEQ ID NO: 471 내지 474와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, 난소암에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열 백신은 하나 이상의 SEQ ID NO: 273 내지 309, SEQ ID NO: 375 내지 386, SEQ ID NO: 422 내지 446, SEQ ID NO: 467, 및 SEQ ID NO: 471 내지 474를 포함한다. 일부 실시예에서, 난소암 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 273 내지 309, SEQ ID NO: 375 내지 386, SEQ ID NO: 422 내지 446, SEQ ID NO: 467 또는 SEQ ID NO: 471 내지 474와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, 난소암에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열 백신은 2개 이상의 SEQ ID NO: 273 내지 309, SEQ ID NO: 375 내지 386, SEQ ID NO: 422 내지 446, SEQ ID NO: 467, 및 SEQ ID NO: 471 내지 474를 포함한다. 일부 실시예에서, 난소암 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 273 내지 309, SEQ ID NO: 375 내지 386, SEQ ID NO: 422 내지 446, SEQ ID NO: 467 또는 SEQ ID NO: 471 내지 474와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
표 1은 각각의 SEQ ID NO, SEQ ID NO에 상응하는 아미노산 서열, 단백질 표적(특정 돌연변이를 포함), 시드 아미노산 서열(즉 야생형 단백질 단편의 아미노산 서열), 위치 2 및 C(카르복실 말단)의 이종 펩티드의 아미노산 치환(있는 경우), 펩티드가 본원에 기술된 복합 펩티드 백신에 포함될 수 있는 구체예의 상술을 포함해 본원에 기술된 MHC 클래스 I 펩티드 서열을 보여준다. 일부 실시예에서, 표 1(SEQ ID NO: 1 내지 474)에 열거된 펩티드의 임의의 조합을 사용하여 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 복합 펩티드 백신을 만들 수 있다. 일부 실시예에서, 복합 백신의 펩티드 중 임의의 하나(펩티드 1 내지 474; SEQ ID NO: 1 내지 474)는 SEQ ID NO: 1 내지 474와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
MHC 클래스 I 백신 펩티드의 추가 아미노산 서열은 서열 목록(SEQ ID NO: 760 내지 22727)에 제공된다. 일부 실시예에서, 본원(SEQ ID NO: 1 내지 474 및 SEQ ID NO: 760 내지 22727)에 개시된 MHC 클래스 I 펩티드의 임의의 조합을 사용하여 약 2개 내지 40개의 펩티드를 갖는 복합 펩티드 백신을 만들 수 있다. 일부 실시예에서, 복합 백신의 펩티드 중 임의의 하나(SEQ ID NO: 1 내지 474 및 SEQ ID NO: 760 내지 22727)는 임의의 SEQ ID NO: 1 내지 474 또는 SEQ ID NO: 760 내지 22727와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
MHC 클래스 II 펩티드 서열
일부 실시예에서, 펩티드 백신(단일 표적 또는 복합 다중 표적 백신)은 약 1 내지 40개의 MHC 클래스 II 펩티드를 포함하며, 각 펩티드는 20개 이상의 아미노산으로 구성된다. 일부 실시예에서, MHC 클래스 II 펩티드 백신은 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN 또는 TP53 돌연변이 단백질 표적 중 하나 이상을 대상으로 한다. 일부 실시예에서, MHC 클래스 II 펩티드 백신은 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W 또는 TP53 Y220C 돌연변이 단백질 표적 중 하나 이상을 대상으로 한다. 일부 실시예에서, MHC 클래스 II 펩티드 백신은 췌장암, 피부암, 갑상선암, 뇌암, 결장직장암, 기관지 및 폐암, 유방암 또는 난소암 적응증 중 하나 이상을 대상으로 한다.
일부 실시예에서, AKT1 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 475 내지 483를 포함한다. 일부 실시예에서, AKT1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 475 내지 483와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, AKT1 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 475 내지 483, SEQ ID NO: 22728 내지 22838, 및 SEQ ID NO: 25305 내지 25488를 포함한다. 일부 실시예에서, AKT1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 475 내지 483, SEQ ID NO: 22728 내지 22838 또는 SEQ ID NO: 25305 내지 25488와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, AKT1 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 475 내지 483를 포함한다. 일부 실시예에서, AKT1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 475 내지 483와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, AKT1 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 475 내지 483, SEQ ID NO: 22728 내지 22838, 및 SEQ ID NO: 25305 내지 25488를 포함한다. 일부 실시예에서, AKT1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 475 내지 483, SEQ ID NO: 22728 내지 22838 또는 SEQ ID NO: 25305 내지 25488와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, BRAF 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 484 내지 502를 포함한다. 일부 실시예에서, BRAF 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 484 내지 502와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, BRAF 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 484 내지 502, SEQ ID NO: 22839 내지 22966, 및 SEQ ID NO: 25489 내지 25616를 포함한다. 일부 실시예에서, BRAF 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 484 내지 502, SEQ ID NO: 22839 내지 22966 또는 SEQ ID NO: 25489 내지 25616와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, BRAF 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 484 내지 502를 포함한다. 일부 실시예에서, BRAF 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 484 내지 502와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, BRAF 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 484 내지 502, SEQ ID NO: 22839 내지 22966, 및 SEQ ID NO: 25489 내지 25616를 포함한다. 일부 실시예에서, BRAF 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 484 내지 502, SEQ ID NO: 22839 내지 22966 또는 SEQ ID NO: 25489 내지 25616와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, EGFR 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 503 내지 527를 포함한다. 일부 실시예에서, EGFR 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 503 내지 527와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, EGFR 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 503 내지 527, SEQ ID NO: 22967 내지 23263, 및 SEQ ID NO: 25617 내지 26046를 포함한다. 일부 실시예에서, EGFR 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 503 내지 527, SEQ ID NO: 22967 내지 23263 또는 SEQ ID NO: 25617 내지 26046와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, EGFR 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 503 내지 527를 포함한다. 일부 실시예에서, EGFR 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 503 내지 527와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, EGFR 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 503 내지 527, SEQ ID NO: 22967 내지 23263, 및 SEQ ID NO: 25617 내지 26046를 포함한다. 일부 실시예에서, EGFR 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 503 내지 527, SEQ ID NO: 22967 내지 23263 또는 SEQ ID NO: 25617 내지 26046와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, GTF2I 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 528 내지 534를 포함한다. 일부 실시예에서, GTF2I 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 528 내지 534와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, GTF2I 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 528 내지 534, SEQ ID NO: 23264 내지 23415, 및 SEQ ID NO: 26047 내지 26375를 포함한다. 일부 실시예에서, GTF2I 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 528 내지 534, SEQ ID NO: 23264 내지 23415 또는 SEQ ID NO: 26047 내지 26375와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, GTF2I 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 528 내지 534를 포함한다. 일부 실시예에서, GTF2I 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 528 내지 534와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, GTF2I 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 528 내지 534, SEQ ID NO: 23264 내지 23415, 및 SEQ ID NO: 26047 내지 26375를 포함한다. 일부 실시예에서, GTF2I 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 528 내지 534, SEQ ID NO: 23264 내지 23415 또는 SEQ ID NO: 26047 내지 26375와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, IDH1 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 535 내지 553를 포함한다. 일부 실시예에서, IDH1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 535 내지 553와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, IDH1 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 535 내지 553, SEQ ID NO: 23416 내지 23631, 및 SEQ ID NO: 26376 내지 26614를 포함한다. 일부 실시예에서, IDH1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 535 내지 553, SEQ ID NO: 23416 내지 23631 또는 SEQ ID NO: 26376 내지 26614와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, IDH1 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 535 내지 553를 포함한다. 일부 실시예에서, IDH1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 535 내지 553와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, IDH1 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 535 내지 553, SEQ ID NO: 23416 내지 23631, 및 SEQ ID NO: 26376 내지 26614를 포함한다. 일부 실시예에서, IDH1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 535 내지 553, SEQ ID NO: 23416 내지 23631 또는 SEQ ID NO: 26376 내지 26614와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 554 내지 615 및 SEQ ID NO: 759를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 554 내지 615 또는 SEQ ID NO: 759와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 554 내지 615, SEQ ID NO: 759, SEQ ID NO: 23632 내지 24129, 및 SEQ ID NO: 26615 내지 27328를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 554 내지 615, SEQ ID NO: 759, SEQ ID NO: 23632 내지 24129 또는 SEQ ID NO: 26615 내지 27328와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 554 내지 615 및 SEQ ID NO: 759를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 554 내지 615 또는 SEQ ID NO: 759와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 554 내지 615, SEQ ID NO: 759, SEQ ID NO: 23632 내지 24129, 및 SEQ ID NO: 26615 내지 27328를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 554 내지 615, SEQ ID NO: 759, SEQ ID NO: 23632 내지 24129 또는 SEQ ID NO: 26615 내지 27328와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, NRAS 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 616 내지 645를 포함한다. 일부 실시예에서, NRAS 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 616 내지 645와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, NRAS 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 616 내지 645, SEQ ID NO: 24130 내지 24347, 및 SEQ ID NO: 27329 내지 27557를 포함한다. 일부 실시예에서, NRAS 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 616 내지 645, SEQ ID NO: 24130 내지 24347 또는 SEQ ID NO: 27329 내지 27557와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, NRAS 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 616 내지 645를 포함한다. 일부 실시예에서, NRAS 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 616 내지 645와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, NRAS 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 616 내지 645, SEQ ID NO: 24130 내지 24347, 및 SEQ ID NO: 27329 내지 27557를 포함한다. 일부 실시예에서, NRAS 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 616 내지 645, SEQ ID NO: 24130 내지 24347 또는 SEQ ID NO: 27329 내지 27557와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PIK3CA 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 646 내지 675를 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 646 내지 675와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PIK3CA 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 646 내지 675, SEQ ID NO: 24348 내지 24571, 및 SEQ ID NO: 27558 내지 27889를 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 646 내지 675, SEQ ID NO: 24348 내지 24571 또는 SEQ ID NO: 27558 내지 27889와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PIK3CA 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 646 내지 675를 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 646 내지 675와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PIK3CA 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 646 내지 675, SEQ ID NO: 24348 내지 24571, 및 SEQ ID NO: 27558 내지 27889를 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 646 내지 675, SEQ ID NO: 24348 내지 24571 또는 SEQ ID NO: 27558 내지 27889와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PTEN 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 676 내지 690를 포함한다. 일부 실시예에서, PTEN 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 676 내지 690와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PTEN 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 676 내지 690, SEQ ID NO: 24572 내지 24724, 및 SEQ ID NO: 27890 내지 28052를 포함한다. 일부 실시예에서, PTEN 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 676 내지 690, SEQ ID NO: 24572 내지 24724 또는 SEQ ID NO: 27890 내지 28052와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PTEN 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 676 내지 690를 포함한다. 일부 실시예에서, PTEN 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 676 내지 690와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PTEN 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 676 내지 690, SEQ ID NO: 24572 내지 24724, 및 SEQ ID NO: 27890 내지 28052를 포함한다. 일부 실시예에서, PTEN 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 676 내지 690, SEQ ID NO: 24572 내지 24724 또는 SEQ ID NO: 27890 내지 28052와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 691 내지 758를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 691 내지 758와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 691 내지 758, SEQ ID NO: 24725 내지 25304, 및 SEQ ID NO: 28053 내지 28795를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 691 내지 758, SEQ ID NO: 24725 내지 25304 또는 SEQ ID NO: 28053 내지 28795와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 691 내지 758를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 691 내지 758와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 691 내지 758, SEQ ID NO: 24725 내지 25304, 및 SEQ ID NO: 28053 내지 28795를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 691 내지 758, SEQ ID NO: 24725 내지 25304 또는 SEQ ID NO: 28053 내지 28795와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, RAS 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 554 내지 645 및 SEQ ID NO: 759를 포함한다. 일부 실시예에서, RAS 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 554 내지 645 또는 SEQ ID NO: 759와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, RAS 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 554 내지 645, SEQ ID NO: 759, SEQ ID NO: 23632 내지 24347, 및 SEQ ID NO: 26615 내지 27557를 포함한다. 일부 실시예에서, RAS 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 554 내지 645, SEQ ID NO: 759, SEQ ID NO: 23632 내지 24347 또는 SEQ ID NO: 26615 내지 27557와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, RAS 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 554 내지 645 및 SEQ ID NO: 759를 포함한다. 일부 실시예에서, RAS 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 554 내지 645 또는 SEQ ID NO: 759와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, RAS 단백질 내 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 554 내지 645, SEQ ID NO: 759, SEQ ID NO: 23632 내지 24347, 및 SEQ ID NO: 26615 내지 27557를 포함한다. 일부 실시예에서, RAS 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 554 내지 645, SEQ ID NO: 759, SEQ ID NO: 23632 내지 24347 또는 SEQ ID NO: 26615 내지 27557와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, BRAF V600E 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 484 내지 494를 포함한다. 일부 실시예에서, BRAF V600E 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 484 내지 494와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, BRAF V600E 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 484 내지 494, SEQ ID NO: 22839 내지 22876, 및 SEQ ID NO: 25489 내지 25526를 포함한다. 일부 실시예에서, BRAF V600E 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 484 내지 494, SEQ ID NO: 22839 내지 22876 또는 SEQ ID NO: 25489 내지 25526와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, BRAF V600E 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 484 내지 494를 포함한다. 일부 실시예에서, BRAF V600E 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 484 내지 494와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, BRAF V600E 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 484 내지 494, SEQ ID NO: 22839 내지 22876, 및 SEQ ID NO: 25489 내지 25526를 포함한다. 일부 실시예에서, BRAF V600E 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 484 내지 494, SEQ ID NO: 22839 내지 22876 또는 SEQ ID NO: 25489 내지 25526와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, BRAF V600M 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 495 내지 502를 포함한다. 일부 실시예에서, BRAF V600M 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 495 내지 502와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, BRAF V600M 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 495 내지 502, SEQ ID NO: 22877 내지 22966, 및 SEQ ID NO: 25527 내지 25616를 포함한다. 일부 실시예에서, BRAF V600M 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 495 내지 502, SEQ ID NO: 22877 내지 22966 또는 SEQ ID NO: 25527 내지 25616와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, BRAF V600M 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 495 내지 502를 포함한다. 일부 실시예에서, BRAF V600M 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 495 내지 502와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, BRAF V600M 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 495 내지 502, SEQ ID NO: 22877 내지 22966, 및 SEQ ID NO: 25527 내지 25616를 포함한다. 일부 실시예에서, BRAF V600M 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 495 내지 502, SEQ ID NO: 22877 내지 22966 또는 SEQ ID NO: 25527 내지 25616와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, EGFR A289V 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 503 내지 509를 포함한다. 일부 실시예에서, EGFR A289V 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 503 내지 509와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, EGFR A289V 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 503 내지 509, SEQ ID NO: 22967 내지 23000, 및 SEQ ID NO: 25617 내지 25653를 포함한다. 일부 실시예에서, EGFR A289V 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 503 내지 509, SEQ ID NO: 22967 내지 23000 또는 SEQ ID NO: 25617 내지 25653와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, EGFR A289V 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 503 내지 509를 포함한다. 일부 실시예에서, EGFR A289V 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 503 내지 509와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, EGFR A289V 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 503 내지 509, SEQ ID NO: 22967 내지 23000, 및 SEQ ID NO: 25617 내지 25653를 포함한다. 일부 실시예에서, EGFR A289V 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 503 내지 509, SEQ ID NO: 22967 내지 23000 또는 SEQ ID NO: 25617 내지 25653와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, EGFR G598V 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 510 내지 519를 포함한다. 일부 실시예에서, EGFR G598V 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 510 내지 519와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, EGFR G598V 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 510 내지 519, SEQ ID NO: 23001 내지 23089, 및 SEQ ID NO: 25654 내지 25794를 포함한다. 일부 실시예에서, EGFR G598V 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 510 내지 519, SEQ ID NO: 23001 내지 23089 또는 SEQ ID NO: 25654 내지 25794와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, EGFR G598V 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 510 내지 519를 포함한다. 일부 실시예에서, EGFR G598V 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 510 내지 519와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, EGFR G598V 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 510 내지 519, SEQ ID NO: 23001 내지 23089, 및 SEQ ID NO: 25654 내지 25794를 포함한다. 일부 실시예에서, EGFR G598V 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 510 내지 519, SEQ ID NO: 23001 내지 23089 또는 SEQ ID NO: 25654 내지 25794와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, EGFR L858R 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 520 내지 527를 포함한다. 일부 실시예에서, EGFR L858R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 520 내지 527와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, EGFR L858R 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 520 내지 527, SEQ ID NO: 23090 내지 23263, 및 SEQ ID NO: 25795 내지 26046를 포함한다. 일부 실시예에서, EGFR L858R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 520 내지 527, SEQ ID NO: 23090 내지 23263 또는 SEQ ID NO: 25795 내지 26046와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, EGFR L858R 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 520 내지 527를 포함한다. 일부 실시예에서, EGFR L858R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 520 내지 527와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, EGFR L858R 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 520 내지 527, SEQ ID NO: 23090 내지 23263, 및 SEQ ID NO: 25795 내지 26046를 포함한다. 일부 실시예에서, EGFR L858R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 520 내지 527, SEQ ID NO: 23090 내지 23263 또는 SEQ ID NO: 25795 내지 26046와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, IDH1 R132H 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 543 내지 553를 포함한다. 일부 실시예에서, IDH1 R132H 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 543 내지 553와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, IDH1 R132H 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 543 내지 553, SEQ ID NO: 23505 내지 23631, 및 SEQ ID NO: 26469 내지 26614를 포함한다. 일부 실시예에서, IDH1 R132H 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 543 내지 553, SEQ ID NO: 23505 내지 23631 또는 SEQ ID NO: 26469 내지 26614와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, IDH1 R132H 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 543 내지 553를 포함한다. 일부 실시예에서, IDH1 R132H 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 543 내지 553와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, IDH1 R132H 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 543 내지 553, SEQ ID NO: 23505 내지 23631, 및 SEQ ID NO: 26469 내지 26614를 포함한다. 일부 실시예에서, IDH1 R132H 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 543 내지 553, SEQ ID NO: 23505 내지 23631 또는 SEQ ID NO: 26469 내지 26614와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, IDH1 R132C 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 535 내지 542를 포함한다. 일부 실시예에서, IDH1 R132C 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 535 내지 542와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, IDH1 R132C 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 535 내지 542, SEQ ID NO: 23416 내지 23504, 및 SEQ ID NO: 26376 내지 26468를 포함한다. 일부 실시예에서, IDH1 R132C 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 535 내지 542, SEQ ID NO: 23416 내지 23504 또는 SEQ ID NO: 26376 내지 26468와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, IDH1 R132C 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 535 내지 542를 포함한다. 일부 실시예에서, IDH1 R132C 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 535 내지 542와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, IDH1 R132C 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 535 내지 542, SEQ ID NO: 23416 내지 23504, 및 SEQ ID NO: 26376 내지 26468를 포함한다. 일부 실시예에서, IDH1 R132C 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 535 내지 542, SEQ ID NO: 23416 내지 23504 또는 SEQ ID NO: 26376 내지 26468와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12D 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 569 내지 577를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12D 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 569 내지 577와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12D 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 569 내지 577, SEQ ID NO: 23750 내지 23809, 및 SEQ ID NO: 26757 내지 26833를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12D 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 569 내지 577, SEQ ID NO: 23750 내지 23809 또는 SEQ ID NO: 26757 내지 26833와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12D 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 569 내지 577를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12D 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 569 내지 577와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12D 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 569 내지 577, SEQ ID NO: 23750 내지 23809, 및 SEQ ID NO: 26757 내지 26833를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12D 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 569 내지 577, SEQ ID NO: 23750 내지 23809 또는 SEQ ID NO: 26757 내지 26833와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12V 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 596 내지 605를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12V 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 596 내지 605와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12V 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 596 내지 605, SEQ ID NO: 23958 내지 24025, 및 SEQ ID NO: 27057 내지 27148를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12V 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 596 내지 605, SEQ ID NO: 23958 내지 24025 또는 SEQ ID NO: 27057 내지 27148와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12V 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 596 내지 605를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12V 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 596 내지 605와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12V 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 596 내지 605, SEQ ID NO: 23958 내지 24025, 및 SEQ ID NO: 27057 내지 27148를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12V 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 596 내지 605, SEQ ID NO: 23958 내지 24025 또는 SEQ ID NO: 27057 내지 27148와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12R 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 578 내지 587를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 578 내지 587와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12R 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 578 내지 587, SEQ ID NO: 23810 내지 23889, 및 SEQ ID NO: 26834 내지 26967를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 578 내지 587, SEQ ID NO: 23810 내지 23889 또는 SEQ ID NO: 26834 내지 26967와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12R 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 578 내지 587를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 578 내지 587와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12R 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 578 내지 587, SEQ ID NO: 23810 내지 23889, 및 SEQ ID NO: 26834 내지 26967를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 578 내지 587, SEQ ID NO: 23810 내지 23889 또는 SEQ ID NO: 26834 내지 26967와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12C 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 561 내지 568를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12C 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 561 내지 568와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12C 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 561 내지 568, SEQ ID NO: 23700 내지 23749, 및 SEQ ID NO: 26702 내지 26756를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12C 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 561 내지 568, SEQ ID NO: 23700 내지 23749 또는 SEQ ID NO: 26702 내지 26756와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12C 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 561 내지 568를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12C 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 561 내지 568와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12C 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 561 내지 568, SEQ ID NO: 23700 내지 23749, 및 SEQ ID NO: 26702 내지 26756를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12C 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 561 내지 568, SEQ ID NO: 23700 내지 23749 또는 SEQ ID NO: 26702 내지 26756와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G13D 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 606 내지 615 및 SEQ ID NO: 759를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G13D 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 606 내지 615 또는 SEQ ID NO: 759와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G13D 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 606 내지 615, SEQ ID NO: 759, SEQ ID NO: 24026 내지 24129, 및 SEQ ID NO: 27149 내지 27328를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G13D 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 606 내지 615, SEQ ID NO: 759, SEQ ID NO: 24026 내지 24129 또는 SEQ ID NO: 27149 내지 27328와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G13D 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 606 내지 615 및 SEQ ID NO: 759를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G13D 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 606 내지 615 또는 SEQ ID NO: 759와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G13D 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 606 내지 615, SEQ ID NO: 759, SEQ ID NO: 24026 내지 24129, 및 SEQ ID NO: 27149 내지 27328를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G13D 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 606 내지 615, SEQ ID NO: 759, SEQ ID NO: 24026 내지 24129 또는 SEQ ID NO: 27149 내지 27328와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12A 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 554 내지 560를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12A 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 554 내지 560와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12A 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 554 내지 560, SEQ ID NO: 23632 내지 23699, 및 SEQ ID NO: 26615 내지 26701를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12A 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 554 내지 560, SEQ ID NO: 23632 내지 23699 또는 SEQ ID NO: 26615 내지 26701와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12A 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 554 내지 560를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12A 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 554 내지 560와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12A 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 554 내지 560, SEQ ID NO: 23632 내지 23699, 및 SEQ ID NO: 26615 내지 26701를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12A 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 554 내지 560, SEQ ID NO: 23632 내지 23699 또는 SEQ ID NO: 26615 내지 26701와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12S 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 588 내지 595를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12S 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 588 내지 595와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12S 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 588 내지 595, SEQ ID NO: 23890 내지 23957, 및 SEQ ID NO: 26968 내지 27056를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12S 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 588 내지 595, SEQ ID NO: 23890 내지 23957 또는 SEQ ID NO: 26968 내지 27056와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12S 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 588 내지 595를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12S 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 588 내지 595와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KRAS G12S 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 588 내지 595, SEQ ID NO: 23890 내지 23957, 및 SEQ ID NO: 26968 내지 27056를 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12S 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 588 내지 595, SEQ ID NO: 23890 내지 23957 또는 SEQ ID NO: 26968 내지 27056와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, NRAS Q61R 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 634 내지 645를 포함한다. 일부 실시예에서, NRAS Q61R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 634 내지 645와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, NRAS Q61R 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 634 내지 645, SEQ ID NO: 24280 내지 24347, 및 SEQ ID NO: 27490 내지 27557를 포함한다. 일부 실시예에서, NRAS Q61R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 634 내지 645, SEQ ID NO: 24280 내지 24347 또는 SEQ ID NO: 27490 내지 27557와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, NRAS Q61R 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 634 내지 645를 포함한다. 일부 실시예에서, NRAS Q61R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 634 내지 645와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, NRAS Q61R 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 634 내지 645, SEQ ID NO: 24280 내지 24347, 및 SEQ ID NO: 27490 내지 27557를 포함한다. 일부 실시예에서, NRAS Q61R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 634 내지 645, SEQ ID NO: 24280 내지 24347 또는 SEQ ID NO: 27490 내지 27557와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, NRAS Q61K 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 616 내지 624를 포함한다. 일부 실시예에서, NRAS Q61K 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 616 내지 624와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, NRAS Q61K 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 616 내지 624, SEQ ID NO: 24130 내지 24194, 및 SEQ ID NO: 27329 내지 27396를 포함한다. 일부 실시예에서, NRAS Q61K 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 616 내지 624, SEQ ID NO: 24130 내지 24194 또는 SEQ ID NO: 27329 내지 27396와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, NRAS Q61K 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 616 내지 624를 포함한다. 일부 실시예에서, NRAS Q61K 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 616 내지 624와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, NRAS Q61K 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 616 내지 624, SEQ ID NO: 24130 내지 24194, 및 SEQ ID NO: 27329 내지 27396를 포함한다. 일부 실시예에서, NRAS Q61K 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 616 내지 624, SEQ ID NO: 24130 내지 24194 또는 SEQ ID NO: 27329 내지 27396와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, NRAS Q61L 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 625 내지 633를 포함한다. 일부 실시예에서, NRAS Q61L 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 625 내지 633와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, NRAS Q61L 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 625 내지 633, SEQ ID NO: 24195 내지 24279, 및 SEQ ID NO: 27397 내지 27489를 포함한다. 일부 실시예에서, NRAS Q61L 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 625 내지 633, SEQ ID NO: 24195 내지 24279 또는 SEQ ID NO: 27397 내지 27489와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, NRAS Q61L 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 625 내지 633를 포함한다. 일부 실시예에서, NRAS Q61L 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 625 내지 633와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, NRAS Q61L 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 625 내지 633, SEQ ID NO: 24195 내지 24279, 및 SEQ ID NO: 27397 내지 27489를 포함한다. 일부 실시예에서, NRAS Q61L 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 625 내지 633, SEQ ID NO: 24195 내지 24279 또는 SEQ ID NO: 27397 내지 27489와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PIK3CA E542K 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 646 내지 650를 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA E542K 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 646 내지 650와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PIK3CA E542K 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 646 내지 650, SEQ ID NO: 24348 내지 24362, 및 SEQ ID NO: 27558 내지 27572를 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA E542K 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 646 내지 650, SEQ ID NO: 24348 내지 24362 또는 SEQ ID NO: 27558 내지 27572와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PIK3CA E542K 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 646 내지 650를 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA E542K 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 646 내지 650와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PIK3CA E542K 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 646 내지 650, SEQ ID NO: 24348 내지 24362, 및 SEQ ID NO: 27558 내지 27572를 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA E542K 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 646 내지 650, SEQ ID NO: 24348 내지 24362 또는 SEQ ID NO: 27558 내지 27572와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PIK3CA E545K 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 651 내지 657를 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA E545K 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 651 내지 657와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PIK3CA E545K 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 651 내지 657, SEQ ID NO: 24363 내지 24388, 및 SEQ ID NO: 27573 내지 27599를 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA E545K 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 651 내지 657, SEQ ID NO: 24363 내지 24388 또는 SEQ ID NO: 27573 내지 27599와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PIK3CA E545K 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 651 내지 657를 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA E545K 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 651 내지 657와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PIK3CA E545K 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 651 내지 657, SEQ ID NO: 24363 내지 24388, 및 SEQ ID NO: 27573 내지 27599를 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA E545K 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 651 내지 657, SEQ ID NO: 24363 내지 24388 또는 SEQ ID NO: 27573 내지 27599와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PIK3CA H1047R 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 658 내지 667를 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA H1047R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 658 내지 667와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PIK3CA H1047R 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 658 내지 667, SEQ ID NO: 24389 내지 24472, 및 SEQ ID NO: 27600 내지 27683를 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA H1047R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 658 내지 667, SEQ ID NO: 24389 내지 24472 또는 SEQ ID NO: 27600 내지 27683와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PIK3CA H1047R 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 658 내지 667를 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA H1047R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 658 내지 667와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PIK3CA H1047R 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 658 내지 667, SEQ ID NO: 24389 내지 24472, 및 SEQ ID NO: 27600 내지 27683를 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA H1047R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 658 내지 667, SEQ ID NO: 24389 내지 24472 또는 SEQ ID NO: 27600 내지 27683와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R158L 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 700 내지 707를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R158L 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 700 내지 707와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R158L 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 700 내지 707, SEQ ID NO: 24784 내지 24927, 및 SEQ ID NO: 28132 내지 28372를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R158L 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 700 내지 707, SEQ ID NO: 24784 내지 24927 또는 SEQ ID NO: 28132 내지 28372와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R158L 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 700 내지 707를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R158L 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 700 내지 707와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R158L 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 700 내지 707, SEQ ID NO: 24784 내지 24927, 및 SEQ ID NO: 28132 내지 28372를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R158L 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 700 내지 707, SEQ ID NO: 24784 내지 24927 또는 SEQ ID NO: 28132 내지 28372와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R175H 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 708 내지 717를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R175H 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 708 내지 717와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R175H 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 708 내지 717, SEQ ID NO: 24928 내지 24954, 및 SEQ ID NO: 28373 내지 28410를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R175H 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 708 내지 717, SEQ ID NO: 24928 내지 24954 또는 SEQ ID NO: 28373 내지 28410와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R175H 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 708 내지 717를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R175H 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 708 내지 717와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R175H 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 708 내지 717, SEQ ID NO: 24928 내지 24954, 및 SEQ ID NO: 28373 내지 28410를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R175H 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 708 내지 717, SEQ ID NO: 24928 내지 24954 또는 SEQ ID NO: 28373 내지 28410와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R248Q 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 718 내지 723를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R248Q 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 718 내지 723와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R248Q 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 718 내지 723, SEQ ID NO: 24955 내지 25010, 및 SEQ ID NO: 28411 내지 28468를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R248Q 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 718 내지 723, SEQ ID NO: 24955 내지 25010 또는 SEQ ID NO: 28411 내지 28468와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R248Q 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 718 내지 723를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R248Q 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 718 내지 723와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R248Q 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 718 내지 723, SEQ ID NO: 24955 내지 25010, 및 SEQ ID NO: 28411 내지 28468를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R248Q 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 718 내지 723, SEQ ID NO: 24955 내지 25010 또는 SEQ ID NO: 28411 내지 28468와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R273C 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 733 내지 739를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R273C 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 733 내지 739와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R273C 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 733 내지 739, SEQ ID NO: 25109 내지 25117, 및 SEQ ID NO: 28572 내지 28580를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R273C 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 733 내지 739, SEQ ID NO: 25109 내지 25117 또는 SEQ ID NO: 28572 내지 28580와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R273C 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 733 내지 739를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R273C 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 733 내지 739와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R273C 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 733 내지 739, SEQ ID NO: 25109 내지 25117, 및 SEQ ID NO: 28572 내지 28580를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R273C 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 733 내지 739, SEQ ID NO: 25109 내지 25117 또는 SEQ ID NO: 28572 내지 28580와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R273H 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 740 내지 748를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R273H 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 740 내지 748와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R273H 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 740 내지 748, SEQ ID NO: 25118 내지 25206, 및 SEQ ID NO: 28581 내지 28697를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R273H 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 740 내지 748, SEQ ID NO: 25118 내지 25206 또는 SEQ ID NO: 28581 내지 28697와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R273H 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 740 내지 748를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R273H 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 740 내지 748와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R273H 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 740 내지 748, SEQ ID NO: 25118 내지 25206, 및 SEQ ID NO: 28581 내지 28697를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R273H 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 740 내지 748, SEQ ID NO: 25118 내지 25206 또는 SEQ ID NO: 28581 내지 28697와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R248W 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 724 내지 732를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R248W 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 724 내지 732와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R248W 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 724 내지 732, SEQ ID NO: 25011 내지 25108, 및 SEQ ID NO: 28469 내지 28571를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R248W 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 724 내지 732, SEQ ID NO: 25011 내지 25108 또는 SEQ ID NO: 28469 내지 28571와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R248W 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 724 내지 732를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R248W 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 724 내지 732와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R248W 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 724 내지 732, SEQ ID NO: 25011 내지 25108, 및 SEQ ID NO: 28469 내지 28571를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R248W 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 724 내지 732, SEQ ID NO: 25011 내지 25108 또는 SEQ ID NO: 28469 내지 28571와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R282W 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 749 내지 750를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R282W 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 749 내지 750와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R282W 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 749 내지 750, SEQ ID NO: 25207 내지 25218, 및 SEQ ID NO: 28698 내지 28709를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R282W 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 749 내지 750, SEQ ID NO: 25207 내지 25218 또는 SEQ ID NO: 28698 내지 28709와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R282W 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 749 내지 750를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R282W 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 749 내지 750와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 R282W 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 749 내지 750, SEQ ID NO: 25207 내지 25218, 및 SEQ ID NO: 28698 내지 28709를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R282W 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 749 내지 750, SEQ ID NO: 25207 내지 25218 또는 SEQ ID NO: 28698 내지 28709와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 Y220C 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 751 내지 758를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 Y220C 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 751 내지 758와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 Y220C 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 751 내지 758, SEQ ID NO: 25219 내지 25304, 및 SEQ ID NO: 28710 내지 28795를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 Y220C 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 751 내지 758, SEQ ID NO: 25219 내지 25304 또는 SEQ ID NO: 28710 내지 28795와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 Y220C 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 751 내지 758를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 Y220C 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 751 내지 758와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 Y220C 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 751 내지 758, SEQ ID NO: 25219 내지 25304, 및 SEQ ID NO: 28710 내지 28795를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 Y220C 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 751 내지 758, SEQ ID NO: 25219 내지 25304 또는 SEQ ID NO: 28710 내지 28795와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PIK3CA R88Q 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 668 내지 675를 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA R88Q 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 668 내지 675와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PIK3CA R88Q 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 668 내지 675, SEQ ID NO: 24473 내지 24571, 및 SEQ ID NO: 27684 내지 27889를 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA R88Q 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 668 내지 675, SEQ ID NO: 24473 내지 24571 또는 SEQ ID NO: 27684 내지 27889와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PIK3CA R88Q 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 668 내지 675를 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA R88Q 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 668 내지 675와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PIK3CA R88Q 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 668 내지 675, SEQ ID NO: 24473 내지 24571, 및 SEQ ID NO: 27684 내지 27889를 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA R88Q 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 668 내지 675, SEQ ID NO: 24473 내지 24571 또는 SEQ ID NO: 27684 내지 27889와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, GTF2I L424H 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 528 내지 534를 포함한다. 일부 실시예에서, GTF2I L424H 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 528 내지 534와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, GTF2I L424H 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 528 내지 534, SEQ ID NO: 23264 내지 23415, 및 SEQ ID NO: 26047 내지 26375를 포함한다. 일부 실시예에서, GTF2I L424H 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 528 내지 534, SEQ ID NO: 23264 내지 23415 또는 SEQ ID NO: 26047 내지 26375와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, GTF2I L424H 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 528 내지 534를 포함한다. 일부 실시예에서, GTF2I L424H 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 528 내지 534와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, GTF2I L424H 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 528 내지 534, SEQ ID NO: 23264 내지 23415, 및 SEQ ID NO: 26047 내지 26375를 포함한다. 일부 실시예에서, GTF2I L424H 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 528 내지 534, SEQ ID NO: 23264 내지 23415 또는 SEQ ID NO: 26047 내지 26375와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PTEN R130Q 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 681 내지 690를 포함한다. 일부 실시예에서, PTEN R130Q 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 681 내지 690와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PTEN R130Q 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 681 내지 690, SEQ ID NO: 24659 내지 24724, 및 SEQ ID NO: 27980 내지 28052를 포함한다. 일부 실시예에서, PTEN R130Q 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 681 내지 690, SEQ ID NO: 24659 내지 24724 또는 SEQ ID NO: 27980 내지 28052와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PTEN R130Q 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 681 내지 690를 포함한다. 일부 실시예에서, PTEN R130Q 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 681 내지 690와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PTEN R130Q 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 681 내지 690, SEQ ID NO: 24659 내지 24724, 및 SEQ ID NO: 27980 내지 28052를 포함한다. 일부 실시예에서, PTEN R130Q 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 681 내지 690, SEQ ID NO: 24659 내지 24724 또는 SEQ ID NO: 27980 내지 28052와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, AKT1 E17K 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 475 내지 483를 포함한다. 일부 실시예에서, AKT1 E17K 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 475 내지 483와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, AKT1 E17K 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 475 내지 483, SEQ ID NO: 22728 내지 22838, 및 SEQ ID NO: 25305 내지 25488를 포함한다. 일부 실시예에서, AKT1 E17K 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 475 내지 483, SEQ ID NO: 22728 내지 22838 또는 SEQ ID NO: 25305 내지 25488와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, AKT1 E17K 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 475 내지 483를 포함한다. 일부 실시예에서, AKT1 E17K 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 475 내지 483와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, AKT1 E17K 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 475 내지 483, SEQ ID NO: 22728 내지 22838, 및 SEQ ID NO: 25305 내지 25488를 포함한다. 일부 실시예에서, AKT1 E17K 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 475 내지 483, SEQ ID NO: 22728 내지 22838 또는 SEQ ID NO: 25305 내지 25488와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PTEN R130G 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 676 내지 680를 포함한다. 일부 실시예에서, PTEN R130G 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 676 내지 680와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PTEN R130G 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 676 내지 680, SEQ ID NO: 24572 내지 24658, 및 SEQ ID NO: 27890 내지 27979를 포함한다. 일부 실시예에서, PTEN R130G 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 676 내지 680, SEQ ID NO: 24572 내지 24658 또는 SEQ ID NO: 27890 내지 27979와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PTEN R130G 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 676 내지 680를 포함한다. 일부 실시예에서, PTEN R130G 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 676 내지 680와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PTEN R130G 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 676 내지 680, SEQ ID NO: 24572 내지 24658, 및 SEQ ID NO: 27890 내지 27979를 포함한다. 일부 실시예에서, PTEN R130G 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 676 내지 680, SEQ ID NO: 24572 내지 24658 또는 SEQ ID NO: 27890 내지 27979와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 H179R 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 691 내지 699를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 H179R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 691 내지 699와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 H179R 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 691 내지 699, SEQ ID NO: 24725 내지 24783, 및 SEQ ID NO: 28053 내지 28131를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 H179R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 691 내지 699, SEQ ID NO: 24725 내지 24783 또는 SEQ ID NO: 28053 내지 28131와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 H179R 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 691 내지 699를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 H179R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 691 내지 699와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TP53 H179R 단백질 돌연변이에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 691 내지 699, SEQ ID NO: 24725 내지 24783, 및 SEQ ID NO: 28053 내지 28131를 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 H179R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 691 내지 699, SEQ ID NO: 24725 내지 24783 또는 SEQ ID NO: 28053 내지 28131와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, 췌장암에 대한 MHC 클래스 II 백신의 아미노산 서열 백신은 하나 이상의 SEQ ID NO: 569 내지 574, SEQ ID NO: 578 내지 584, SEQ ID NO: 596 내지 599, 및 SEQ ID NO: 601 내지 603를 포함한다. 일부 실시예에서, 췌장암 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 569 내지 574, SEQ ID NO: 578 내지 584, SEQ ID NO: 596 내지 599 또는 SEQ ID NO: 601 내지 603와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, 췌장암에 대한 MHC 클래스 II 백신의 아미노산 서열 백신은 2개 이상의 SEQ ID NO: 569 내지 574, SEQ ID NO: 578 내지 584, SEQ ID NO: 596 내지 599, 및 SEQ ID NO: 601 내지 603를 포함한다. 일부 실시예에서, 췌장암 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 569 내지 574, SEQ ID NO: 578 내지 584, SEQ ID NO: 596 내지 599 또는 SEQ ID NO: 601 내지 603와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, 피부암에 대한 MHC 클래스 II 백신의 아미노산 서열 백신은 하나 이상의 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 495 내지 499, SEQ ID NO: 616, SEQ ID NO: 619 내지 620, SEQ ID NO: 625 내지 628, SEQ ID NO: 634, SEQ ID NO: 637, 및 SEQ ID NO: 639 내지 640를 포함한다. 일부 실시예에서, 피부암 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 495 내지 499, SEQ ID NO: 616, SEQ ID NO: 619 내지 620, SEQ ID NO: 625 내지 628, SEQ ID NO: 634, SEQ ID NO: 637 또는 SEQ ID NO: 639 내지 640와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, 피부암에 대한 MHC 클래스 II 백신의 아미노산 서열 백신은 2개 이상의 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 495 내지 499, SEQ ID NO: 616, SEQ ID NO: 619 내지 620, SEQ ID NO: 625 내지 628, SEQ ID NO: 634, SEQ ID NO: 637, 및 SEQ ID NO: 639 내지 640를 포함한다. 일부 실시예에서, 피부암 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 495 내지 499, SEQ ID NO: 616, SEQ ID NO: 619 내지 620, SEQ ID NO: 625 내지 628, SEQ ID NO: 634, SEQ ID NO: 637 또는 SEQ ID NO: 639 내지 640와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, 갑상선암에 대한 MHC 클래스 II 백신의 아미노산 서열 백신은 하나 이상의 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 616, SEQ ID NO: 619 내지 620, SEQ ID NO: 634, SEQ ID NO: 637, 및 SEQ ID NO: 640를 포함한다. 일부 실시예에서, 갑상선암 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 616, SEQ ID NO: 619 내지 620, SEQ ID NO: 634, SEQ ID NO: 637 또는 SEQ ID NO: 640와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, 갑상선암에 대한 MHC 클래스 II 백신의 아미노산 서열 백신은 2개 이상의 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 616, SEQ ID NO: 619 내지 620, SEQ ID NO: 634, SEQ ID NO: 637, 및 SEQ ID NO: 640를 포함한다. 일부 실시예에서, 갑상선암 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 616, SEQ ID NO: 619 내지 620, SEQ ID NO: 634, SEQ ID NO: 637 또는 SEQ ID NO: 640와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, 뇌암에 대한 MHC 클래스 II 백신의 아미노산 서열 백신은 하나 이상의 SEQ ID NO: 508, SEQ ID NO: 510, SEQ ID NO: 512, SEQ ID NO: 514, SEQ ID NO: 535 내지 537, SEQ ID NO: 539, SEQ ID NO: 543 내지 551, SEQ ID NO: 708, SEQ ID NO: 712, 및 SEQ ID NO: 738를 포함한다. 일부 실시예에서, 뇌암 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 508, SEQ ID NO: 510, SEQ ID NO: 512, SEQ ID NO: 514, SEQ ID NO: 535 내지 537, SEQ ID NO: 539, SEQ ID NO: 543 내지 551, SEQ ID NO: 708, SEQ ID NO: 712 또는 SEQ ID NO: 738와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, 뇌암에 대한 MHC 클래스 II 백신의 아미노산 서열 백신은 2개 이상의 SEQ ID NO: 508, SEQ ID NO: 510, SEQ ID NO: 512, SEQ ID NO: 514, SEQ ID NO: 535 내지 537, SEQ ID NO: 539, SEQ ID NO: 543 내지 551, SEQ ID NO: 708, SEQ ID NO: 712, 및 SEQ ID NO: 738를 포함한다. 일부 실시예에서, 뇌암 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 508, SEQ ID NO: 510, SEQ ID NO: 512, SEQ ID NO: 514, SEQ ID NO: 535 내지 537, SEQ ID NO: 539, SEQ ID NO: 543 내지 551, SEQ ID NO: 708, SEQ ID NO: 712 또는 SEQ ID NO: 738와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, 결장직장암에 대한 MHC 클래스 II 백신의 아미노산 서열 백신은 하나 이상의 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 569 내지 575, SEQ ID NO: 596 내지 599, SEQ ID NO: 601 내지 604, SEQ ID NO: 606 내지 612, SEQ ID NO: 656, SEQ ID NO: 708, SEQ ID NO: 712, 및 SEQ ID NO: 759를 포함한다. 일부 실시예에서, 결장직장암 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 569 내지 575, SEQ ID NO: 596 내지 599, SEQ ID NO: 601 내지 604, SEQ ID NO: 606 내지 612, SEQ ID NO: 656, SEQ ID NO: 708, SEQ ID NO: 712 또는 SEQ ID NO: 759와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, 결장직장암에 대한 MHC 클래스 II 백신의 아미노산 서열 백신은 2개 이상의 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 569 내지 575, SEQ ID NO: 596 내지 599, SEQ ID NO: 601 내지 604, SEQ ID NO: 606 내지 612, SEQ ID NO: 656, SEQ ID NO: 708, SEQ ID NO: 712, 및 SEQ ID NO: 759를 포함한다. 일부 실시예에서, 결장직장암 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 569 내지 575, SEQ ID NO: 596 내지 599, SEQ ID NO: 601 내지 604, SEQ ID NO: 606 내지 612, SEQ ID NO: 656, SEQ ID NO: 708, SEQ ID NO: 712 또는 SEQ ID NO: 759와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, 기관지 및 폐암에 대한 MHC 클래스 II 백신의 아미노산 서열 백신은 하나 이상의 SEQ ID NO: 520 내지 521, SEQ ID NO: 523 내지 524, SEQ ID NO: 554 내지 556, SEQ ID NO: 558, SEQ ID NO: 561, SEQ ID NO: 563 내지 565, SEQ ID NO: 569 내지 573, SEQ ID NO: 596 내지 600, SEQ ID NO: 650, SEQ ID NO: 656, 및 SEQ ID NO: 700 내지 705를 포함한다. 일부 실시예에서, 기관지 및 폐암 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 520 내지 521, SEQ ID NO: 523 내지 524, SEQ ID NO: 554 내지 556, SEQ ID NO: 558, SEQ ID NO: 561, SEQ ID NO: 563 내지 565, SEQ ID NO: 569 내지 573, SEQ ID NO: 596 내지 600, SEQ ID NO: 650, SEQ ID NO: 656 또는 SEQ ID NO: 700 내지 705와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, 기관지 및 폐암에 대한 MHC 클래스 II 백신의 아미노산 서열 백신은 2개 이상의 SEQ ID NO: 520 내지 521, SEQ ID NO: 523 내지 524, SEQ ID NO: 554 내지 556, SEQ ID NO: 558, SEQ ID NO: 561, SEQ ID NO: 563 내지 565, SEQ ID NO: 569 내지 573, SEQ ID NO: 596 내지 600, SEQ ID NO: 650, SEQ ID NO: 656, 및 SEQ ID NO: 700 내지 705를 포함한다. 일부 실시예에서, 기관지 및 폐암 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 520 내지 521, SEQ ID NO: 523 내지 524, SEQ ID NO: 554 내지 556, SEQ ID NO: 558, SEQ ID NO: 561, SEQ ID NO: 563 내지 565, SEQ ID NO: 569 내지 573, SEQ ID NO: 596 내지 600, SEQ ID NO: 650, SEQ ID NO: 656 또는 SEQ ID NO: 700 내지 705와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, 유방암에 대한 MHC 클래스 II 백신의 아미노산 서열 백신은 하나 이상의 SEQ ID NO: 646 내지 667, SEQ ID NO: 708 내지 717, 및 SEQ ID NO: 733 내지 748를 포함한다. 일부 실시예에서, 유방암 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 646 내지 667, SEQ ID NO: 708 내지 717 또는 SEQ ID NO: 733 내지 748와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, 유방암에 대한 MHC 클래스 II 백신의 아미노산 서열 백신은 2개 이상의 SEQ ID NO: 646 내지 667, SEQ ID NO: 708 내지 717, 및 SEQ ID NO: 733 내지 748를 포함한다. 일부 실시예에서, 유방암 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 646 내지 667, SEQ ID NO: 708 내지 717 또는 SEQ ID NO: 733 내지 748와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, 난소암에 대한 MHC 클래스 II 백신의 아미노산 서열 백신은 하나 이상의 SEQ ID NO: 646 내지 667, SEQ ID NO: 708 내지 717, 및 SEQ ID NO: 733 내지 748를 포함한다. 일부 실시예에서, 난소암 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 646 내지 667, SEQ ID NO: 708 내지 717 또는 SEQ ID NO: 733 내지 748와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, 난소암에 대한 MHC 클래스 II 백신의 아미노산 서열 백신은 2개 이상의 SEQ ID NO: 646 내지 667, SEQ ID NO: 708 내지 717, 및 SEQ ID NO: 733 내지 748를 포함한다. 일부 실시예에서, 난소암 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 646 내지 667, SEQ ID NO: 708 내지 717 또는 SEQ ID NO: 733 내지 748와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
표 2는 각각의 SEQ ID NO, SEQ ID NO에 해당하는 아미노산 서열, 펩티드의 결합 코어에 해당하는 아미노산 서열, 단백질 표적(특정 돌연변이 포함), 시드 아미노산 서열(즉, 야생형 KRAS 단편의 아미노산 서열), 바인딩 코어의 시드 아미노산 서열, 위치 1, 4, 6 및 9에서 이종에 대한 아미노산 치환(있는 경우)을 포함해 본원에 기술된 MHC 클래스 II 펩티드 서열을 요약한다. 표 2는 SEQ ID NO: 475 내지 759를 포함하는 펩티드 서열을 포함한다. SEQ ID NO: 475 내지 759(표 2)는 재조합 펩티드를 암호화한다. 일부 실시예에서, 표 2(SEQ ID NO: 475 내지 759)에 열거된 펩티드의 임의의 조합을 사용하여 단일 표적(개별) 또는 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 복합 펩티드 백신을 만들 수 있다. 일부 실시예에서, 복합 백신의 펩티드 중 임의의 하나(펩티드 475 내지 759; SEQ ID NO: 475 내지 759)는 SEQ ID NO: 475 내지 759와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
MHC 클래스 II 백신 펩티드의 추가 아미노산 서열은 서열 목록(SEQ ID NO: 22728 내지 28795)에 제공된다. 일부 실시예에서, 본원(SEQ ID NO: 475 내지 759 및 SEQ ID NO: 22728 내지 28795)에 개시된 MHC 클래스 II 펩티드의 임의의 조합을 사용하여 약 2개 내지 40개의 펩티드를 갖는 복합 펩티드 백신을 만들 수 있다. 일부 실시예에서, 복합 백신의 펩티드 중 임의의 하나(SEQ ID NO: 475 내지 759 및 SEQ ID NO: 22728 내지 28795)는 임의의 SEQ ID NO: 475 내지 759 또는 SEQ ID NO: 22728 내지 28795와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 AKT1 단백질 내 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, AKT1 단백질 내 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 1 내지 18, SEQ ID NO: 459, SEQ ID NO: 475 내지 483, SEQ ID NO: 760 내지 1768, SEQ ID NO: 22386 내지 22396, SEQ ID NO: 22728 내지 22838, 및 SEQ ID NO: 25305 내지 25488 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, AKT1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 1 내지 18, SEQ ID NO: 459, SEQ ID NO: 475 내지 483, SEQ ID NO: 760 내지 1768, SEQ ID NO: 22386 내지 22396, SEQ ID NO: 22728 내지 22838 또는 SEQ ID NO: 25305 내지 25488와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 BRAF 단백질 내 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, BRAF 단백질 내 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 19 내지 50, SEQ ID NO: 484 내지 502, SEQ ID NO: 1769 내지 3170, SEQ ID NO: 22397 내지 22417, SEQ ID NO: 22839 내지 22966, 및 SEQ ID NO: 25489 내지 25616 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, BRAF 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 19 내지 50, SEQ ID NO: 484 내지 502, SEQ ID NO: 1769 내지 3170, SEQ ID NO: 22397 내지 22417, SEQ ID NO: 22839 내지 22966 또는 SEQ ID NO: 25489 내지 25616와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 EGFR 단백질 내 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, EGFR 단백질 내 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 51 내지 98, SEQ ID NO: 503 내지 527, SEQ ID NO: 3171 내지 5756, SEQ ID NO: 22418 내지 22449, SEQ ID NO: 22967 내지 23263, 및 SEQ ID NO: 25617 내지 26046 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, EGFR 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 51 내지 98, SEQ ID NO: 503 내지 527, SEQ ID NO: 3171 내지 5756, SEQ ID NO: 22418 내지 22449, SEQ ID NO: 22967 내지 23263 또는 SEQ ID NO: 25617 내지 26046와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 GTF2I 단백질 내 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, GTF2I 단백질 내 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 99 내지 118, SEQ ID NO: 528 내지 534, SEQ ID NO: 5757 내지 6498, SEQ ID NO: 22450 내지 22466, SEQ ID NO: 23264 내지 23415, 및 SEQ ID NO: 26047 내지 26375 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, GTF2I 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 99 내지 118, SEQ ID NO: 528 내지 534, SEQ ID NO: 5757 내지 6498, SEQ ID NO: 22450 내지 22466, SEQ ID NO: 23264 내지 23415 또는 SEQ ID NO: 26047 내지 26375와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 IDH1 단백질 내 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, IDH1 단백질 내 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 119 내지 140, SEQ ID NO: 460 내지 461, SEQ ID NO: 535 내지 553, SEQ ID NO: 6499 내지 7098, SEQ ID NO: 22467 내지 22488, SEQ ID NO: 23416 내지 23631, 및 SEQ ID NO: 26376 내지 26614 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, IDH1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 119 내지 140, SEQ ID NO: 460 내지 461, SEQ ID NO: 535 내지 553, SEQ ID NO: 6499 내지 7098, SEQ ID NO: 22467 내지 22488, SEQ ID NO: 23416 내지 23631 또는 SEQ ID NO: 26376 내지 26614와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 KRAS 단백질 내 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, KRAS 단백질 내 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 141 내지 229, SEQ ID NO: 462 내지 466, SEQ ID NO: 554 내지 615, SEQ ID NO: 759, SEQ ID NO: 7099 내지 12814, SEQ ID NO: 22489 내지 22558, SEQ ID NO: 23632 내지 24129, 및 SEQ ID NO: 26615 내지 27328 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 141 내지 229, SEQ ID NO: 462 내지 466, SEQ ID NO: 554 내지 615, SEQ ID NO: 759, SEQ ID NO: 7099 내지 12814, SEQ ID NO: 22489 내지 22558, SEQ ID NO: 23632 내지 24129 또는 SEQ ID NO: 26615 내지 27328와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 NRAS 단백질 내 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, NRAS 단백질 내 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 230 내지 272, SEQ ID NO: 616 내지 645, SEQ ID NO: 12815 내지 14836, SEQ ID NO: 22559 내지 22582, SEQ ID NO: 24130 내지 24347, 및 SEQ ID NO: 27329 내지 27557 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, NRAS 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 230 내지 272, SEQ ID NO: 616 내지 645, SEQ ID NO: 12815 내지 14836, SEQ ID NO: 22559 내지 22582, SEQ ID NO: 24130 내지 24347 또는 SEQ ID NO: 27329 내지 27557와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 PIK3CA 단백질 내 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, PIK3CA 단백질 내 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 273 내지 322, SEQ ID NO: 467 내지 468, SEQ ID NO: 646 내지 675, SEQ ID NO: 14837 내지 17342, SEQ ID NO: 22583 내지 22622, SEQ ID NO: 24348 내지 24571, 및 SEQ ID NO: 27558 내지 27889 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 273 내지 322, SEQ ID NO: 467 내지 468, SEQ ID NO: 646 내지 675, SEQ ID NO: 14837 내지 17342, SEQ ID NO: 22583 내지 22622, SEQ ID NO: 24348 내지 24571 또는 SEQ ID NO: 27558 내지 27889와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 PTEN 단백질 내 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, PTEN 단백질 내 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 323 내지 353, SEQ ID NO: 676 내지 690, SEQ ID NO: 17343 내지 18205, SEQ ID NO: 22623 내지 22636, SEQ ID NO: 24572 내지 24724, 및 SEQ ID NO: 27890 내지 28052 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, PTEN 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 323 내지 353, SEQ ID NO: 676 내지 690, SEQ ID NO: 17343 내지 18205, SEQ ID NO: 22623 내지 22636, SEQ ID NO: 24572 내지 24724 또는 SEQ ID NO: 27890 내지 28052와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 TP53 단백질 내 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, TP53 단백질 내 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 354 내지 458, SEQ ID NO: 469 내지 474, SEQ ID NO: 691 내지 758, SEQ ID NO: 18206 내지 22385, SEQ ID NO: 22637 내지 22727, SEQ ID NO: 24725 내지 25304, 및 SEQ ID NO: 28053 내지 28795 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 354 내지 458, SEQ ID NO: 469 내지 474, SEQ ID NO: 691 내지 758, SEQ ID NO: 18206 내지 22385, SEQ ID NO: 22637 내지 22727, SEQ ID NO: 24725 내지 25304 또는 SEQ ID NO: 28053 내지 28795와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 RAS 단백질 내 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, RAS 단백질 내 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 141 내지 272, SEQ ID NO: 462 내지 466, SEQ ID NO: 554 내지 645, SEQ ID NO: 759, SEQ ID NO: 7099 내지 14836, SEQ ID NO: 22489 내지 22582, SEQ ID NO: 23632 내지 24347, 및 SEQ ID NO: 26615 내지 27557 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, RAS 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 141 내지 272, SEQ ID NO: 462 내지 466, SEQ ID NO: 554 내지 645, SEQ ID NO: 759, SEQ ID NO: 7099 내지 14836, SEQ ID NO: 22489 내지 22582, SEQ ID NO: 23632 내지 24347 또는 SEQ ID NO: 26615 내지 27557와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 BRAF V600E 단백질 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, BRAF V600E 단백질 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 19 내지 33, SEQ ID NO: 484 내지 494, SEQ ID NO: 1769 내지 2329, SEQ ID NO: 22397 내지 22405, SEQ ID NO: 22839 내지 22876, 및 SEQ ID NO: 25489 내지 25526 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, BRAF V600E 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 19 내지 33, SEQ ID NO: 484 내지 494, SEQ ID NO: 1769 내지 2329, SEQ ID NO: 22397 내지 22405, SEQ ID NO: 22839 내지 22876 또는 SEQ ID NO: 25489 내지 25526와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 BRAF V600M 단백질 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, BRAF V600M 단백질 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 34 내지 50, SEQ ID NO: 495 내지 502, SEQ ID NO: 2330 내지 3170, SEQ ID NO: 22406 내지 22417, SEQ ID NO: 22877 내지 22966, 및 SEQ ID NO: 25527 내지 25616 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, BRAF V600M 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 34 내지 50, SEQ ID NO: 495 내지 502, SEQ ID NO: 2330 내지 3170, SEQ ID NO: 22406 내지 22417, SEQ ID NO: 22877 내지 22966 또는 SEQ ID NO: 25527 내지 25616와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 EGFR A289V 단백질 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, EGFR A289V 단백질 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 51 내지 66, SEQ ID NO: 503 내지 509, SEQ ID NO: 3171 내지 4055, SEQ ID NO: 22418 내지 22430, SEQ ID NO: 22967 내지 23000, 및 SEQ ID NO: 25617 내지 25653 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, EGFR A289V 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 51 내지 66, SEQ ID NO: 503 내지 509, SEQ ID NO: 3171 내지 4055, SEQ ID NO: 22418 내지 22430, SEQ ID NO: 22967 내지 23000 또는 SEQ ID NO: 25617 내지 25653와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 EGFR G598V 단백질 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, EGFR G598V 단백질 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 67 내지 81, SEQ ID NO: 510 내지 519, SEQ ID NO: 4056 내지 4718, SEQ ID NO: 22431 내지 22437, SEQ ID NO: 23001 내지 23089, 및 SEQ ID NO: 25654 내지 25794 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, EGFR G598V 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 67 내지 81, SEQ ID NO: 510 내지 519, SEQ ID NO: 4056 내지 4718, SEQ ID NO: 22431 내지 22437, SEQ ID NO: 23001 내지 23089 또는 SEQ ID NO: 25654 내지 25794와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 EGFR L858R 단백질 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, EGFR L858R 단백질 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 82 내지 98, SEQ ID NO: 520 내지 527, SEQ ID NO: 4719 내지 5756, SEQ ID NO: 22438 내지 22449, SEQ ID NO: 23090 내지 23263, 및 SEQ ID NO: 25795 내지 26046 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, EGFR L858R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 82 내지 98, SEQ ID NO: 520 내지 527, SEQ ID NO: 4719 내지 5756, SEQ ID NO: 22438 내지 22449, SEQ ID NO: 23090 내지 23263 또는 SEQ ID NO: 25795 내지 26046와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 IDH1 R132H 단백질 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, IDH1 R132H 단백질 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 125 내지 140, SEQ ID NO: 461, SEQ ID NO: 543 내지 553, SEQ ID NO: 6738 내지 7098, SEQ ID NO: 22477 내지 22488, SEQ ID NO: 23505 내지 23631, 및 SEQ ID NO: 26469 내지 26614 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, IDH1 R132H 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 125 내지 140, SEQ ID NO: 461, SEQ ID NO: 543 내지 553, SEQ ID NO: 6738 내지 7098, SEQ ID NO: 22477 내지 22488, SEQ ID NO: 23505 내지 23631 또는 SEQ ID NO: 26469 내지 26614와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 IDH1 R132C 단백질 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, IDH1 R132C 단백질 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 119 내지 124, SEQ ID NO: 460, SEQ ID NO: 535 내지 542, SEQ ID NO: 6499 내지 6737, SEQ ID NO: 22467 내지 22476, SEQ ID NO: 23416 내지 23504, 및 SEQ ID NO: 26376 내지 26468 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, IDH1 R132C 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 119 내지 124, SEQ ID NO: 460, SEQ ID NO: 535 내지 542, SEQ ID NO: 6499 내지 6737, SEQ ID NO: 22467 내지 22476, SEQ ID NO: 23416 내지 23504 또는 SEQ ID NO: 26376 내지 26468와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 KRAS G12D 단백질 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, KRAS G12D 단백질 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 167 내지 178, SEQ ID NO: 464, SEQ ID NO: 569 내지 577, SEQ ID NO: 8432 내지 9733, SEQ ID NO: 22507 내지 22518, SEQ ID NO: 23750 내지 23809, 및 SEQ ID NO: 26757 내지 26833 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12D 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 167 내지 178, SEQ ID NO: 464, SEQ ID NO: 569 내지 577, SEQ ID NO: 8432 내지 9733, SEQ ID NO: 22507 내지 22518, SEQ ID NO: 23750 내지 23809 또는 SEQ ID NO: 26757 내지 26833와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 KRAS G12V 단백질 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, KRAS G12V 단백질 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 203 내지 213, SEQ ID NO: 596 내지 605, SEQ ID NO: 11009 내지 11744, SEQ ID NO: 22537 내지 22546, SEQ ID NO: 23958 내지 24025, 및 SEQ ID NO: 27057 내지 27148 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12V 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 203 내지 213, SEQ ID NO: 596 내지 605, SEQ ID NO: 11009 내지 11744, SEQ ID NO: 22537 내지 22546, SEQ ID NO: 23958 내지 24025 또는 SEQ ID NO: 27057 내지 27148와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 KRAS G12R 단백질 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, KRAS G12R 단백질 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 179 내지 191, SEQ ID NO: 465, SEQ ID NO: 578 내지 587, SEQ ID NO: 9734 내지 10236, SEQ ID NO: 22519 내지 22527, SEQ ID NO: 23810 내지 23889, 및 SEQ ID NO: 26834 내지 26967 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 179 내지 191, SEQ ID NO: 465, SEQ ID NO: 578 내지 587, SEQ ID NO: 9734 내지 10236, SEQ ID NO: 22519 내지 22527, SEQ ID NO: 23810 내지 23889 또는 SEQ ID NO: 26834 내지 26967와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 KRAS G12C 단백질 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, KRAS G12C 단백질 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 154 내지 166, SEQ ID NO: 463, SEQ ID NO: 561 내지 568, SEQ ID NO: 7881 내지 8431, SEQ ID NO: 22498 내지 22506, SEQ ID NO: 23700 내지 23749, 및 SEQ ID NO: 26702 내지 26756 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12C 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 154 내지 166, SEQ ID NO: 463, SEQ ID NO: 561 내지 568, SEQ ID NO: 7881 내지 8431, SEQ ID NO: 22498 내지 22506, SEQ ID NO: 23700 내지 23749 또는 SEQ ID NO: 26702 내지 26756와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 KRAS G13D 단백질 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, KRAS G13D 단백질 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 214 내지 229, SEQ ID NO: 466, SEQ ID NO: 606 내지 615, SEQ ID NO: 759, SEQ ID NO: 11745 내지 12814, SEQ ID NO: 22547 내지 22558, SEQ ID NO: 24026 내지 24129, 및 SEQ ID NO: 27149 내지 27328 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G13D 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 214 내지 229, SEQ ID NO: 466, SEQ ID NO: 606 내지 615, SEQ ID NO: 759, SEQ ID NO: 11745 내지 12814, SEQ ID NO: 22547 내지 22558, SEQ ID NO: 24026 내지 24129 또는 SEQ ID NO: 27149 내지 27328와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 KRAS G12A 단백질 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, KRAS G12A 단백질 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 141 내지 153, SEQ ID NO: 462, SEQ ID NO: 554 내지 560, SEQ ID NO: 7099 내지 7880, SEQ ID NO: 22489 내지 22497, SEQ ID NO: 23632 내지 23699, 및 SEQ ID NO: 26615 내지 26701 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12A 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 141 내지 153, SEQ ID NO: 462, SEQ ID NO: 554 내지 560, SEQ ID NO: 7099 내지 7880, SEQ ID NO: 22489 내지 22497, SEQ ID NO: 23632 내지 23699 또는 SEQ ID NO: 26615 내지 26701와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 KRAS G12S 단백질 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, KRAS G12S 단백질 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 192 내지 202, SEQ ID NO: 588 내지 595, SEQ ID NO: 10237 내지 11008, SEQ ID NO: 22528 내지 22536, SEQ ID NO: 23890 내지 23957, 및 SEQ ID NO: 26968 내지 27056 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, KRAS G12S 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 192 내지 202, SEQ ID NO: 588 내지 595, SEQ ID NO: 10237 내지 11008, SEQ ID NO: 22528 내지 22536, SEQ ID NO: 23890 내지 23957 또는 SEQ ID NO: 26968 내지 27056와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 NRAS Q61R 단백질 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, NRAS Q61R 단백질 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 256 내지 272, SEQ ID NO: 634 내지 645, SEQ ID NO: 14315 내지 14836, SEQ ID NO: 22577 내지 22582, SEQ ID NO: 24280 내지 24347, 및 SEQ ID NO: 27490 내지 27557 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, NRAS Q61R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 256 내지 272, SEQ ID NO: 634 내지 645, SEQ ID NO: 14315 내지 14836, SEQ ID NO: 22577 내지 22582, SEQ ID NO: 24280 내지 24347 또는 SEQ ID NO: 27490 내지 27557와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 NRAS Q61K 단백질 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, NRAS Q61K 단백질 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 230 내지 238, SEQ ID NO: 616 내지 624, SEQ ID NO: 12815 내지 13434, SEQ ID NO: 22559 내지 22567, SEQ ID NO: 24130 내지 24194, 및 SEQ ID NO: 27329 내지 27396 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, NRAS Q61K 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 230 내지 238, SEQ ID NO: 616 내지 624, SEQ ID NO: 12815 내지 13434, SEQ ID NO: 22559 내지 22567, SEQ ID NO: 24130 내지 24194 또는 SEQ ID NO: 27329 내지 27396와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 NRAS Q61L 단백질 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, NRAS Q61L 단백질 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 239 내지 255, SEQ ID NO: 625 내지 633, SEQ ID NO: 13435 내지 14314, SEQ ID NO: 22568 내지 22576, SEQ ID NO: 24195 내지 24279, 및 SEQ ID NO: 27397 내지 27489 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, NRAS Q61L 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 239 내지 255, SEQ ID NO: 625 내지 633, SEQ ID NO: 13435 내지 14314, SEQ ID NO: 22568 내지 22576, SEQ ID NO: 24195 내지 24279 또는 SEQ ID NO: 27397 내지 27489와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 PIK3CA E542K 단백질 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, PIK3CA E542K 단백질 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 273 내지 285, SEQ ID NO: 646 내지 650, SEQ ID NO: 14837 내지 15625, SEQ ID NO: 22583 내지 22592, SEQ ID NO: 24348 내지 24362, 및 SEQ ID NO: 27558 내지 27572 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA E542K 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 273 내지 285, SEQ ID NO: 646 내지 650, SEQ ID NO: 14837 내지 15625, SEQ ID NO: 22583 내지 22592, SEQ ID NO: 24348 내지 24362 또는 SEQ ID NO: 27558 내지 27572와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 PIK3CA E545K 단백질 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, PIK3CA E545K 단백질 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 286 내지 293, SEQ ID NO: 467, SEQ ID NO: 651 내지 657, SEQ ID NO: 15626 내지 15907, SEQ ID NO: 22593 내지 22602, SEQ ID NO: 24363 내지 24388, 및 SEQ ID NO: 27573 내지 27599 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA E545K 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 286 내지 293, SEQ ID NO: 467, SEQ ID NO: 651 내지 657, SEQ ID NO: 15626 내지 15907, SEQ ID NO: 22593 내지 22602, SEQ ID NO: 24363 내지 24388 또는 SEQ ID NO: 27573 내지 27599와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 PIK3CA H1047R 단백질 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, PIK3CA H1047R 단백질 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 294 내지 309, SEQ ID NO: 658 내지 667, SEQ ID NO: 15908 내지 16276, SEQ ID NO: 22603 내지 22608, SEQ ID NO: 24389 내지 24472, 및 SEQ ID NO: 27600 내지 27683 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA H1047R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 294 내지 309, SEQ ID NO: 658 내지 667, SEQ ID NO: 15908 내지 16276, SEQ ID NO: 22603 내지 22608, SEQ ID NO: 24389 내지 24472 또는 SEQ ID NO: 27600 내지 27683와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 TP53 R158L 단백질 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, TP53 R158L 단백질 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 359 내지 374, SEQ ID NO: 469 내지 470, SEQ ID NO: 700 내지 707, SEQ ID NO: 18414 내지 19404, SEQ ID NO: 22644 내지 22657, SEQ ID NO: 24784 내지 24927, 및 SEQ ID NO: 28132 내지 28372 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R158L 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 359 내지 374, SEQ ID NO: 469 내지 470, SEQ ID NO: 700 내지 707, SEQ ID NO: 18414 내지 19404, SEQ ID NO: 22644 내지 22657, SEQ ID NO: 24784 내지 24927 또는 SEQ ID NO: 28132 내지 28372와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 TP53 R175H 단백질 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, TP53 R175H 단백질 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 375 내지 386, SEQ ID NO: 471 내지 472, SEQ ID NO: 708 내지 717, SEQ ID NO: 19405 내지 19752, SEQ ID NO: 22658 내지 22665, SEQ ID NO: 24928 내지 24954, 및 SEQ ID NO: 28373 내지 28410 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R175H 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 375 내지 386, SEQ ID NO: 471 내지 472, SEQ ID NO: 708 내지 717, SEQ ID NO: 19405 내지 19752, SEQ ID NO: 22658 내지 22665, SEQ ID NO: 24928 내지 24954 또는 SEQ ID NO: 28373 내지 28410와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 TP53 R248Q 단백질 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, TP53 R248Q 단백질 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 387 내지 401, SEQ ID NO: 718 내지 723, SEQ ID NO: 19753 내지 20608, SEQ ID NO: 22666 내지 22678, SEQ ID NO: 24955 내지 25010, 및 SEQ ID NO: 28411 내지 28468 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R248Q 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 387 내지 401, SEQ ID NO: 718 내지 723, SEQ ID NO: 19753 내지 20608, SEQ ID NO: 22666 내지 22678, SEQ ID NO: 24955 내지 25010 또는 SEQ ID NO: 28411 내지 28468와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 TP53 R273C 단백질 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, TP53 R273C 단백질 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 422 내지 432, SEQ ID NO: 473, SEQ ID NO: 733 내지 739, SEQ ID NO: 21192 내지 21462, SEQ ID NO: 22690 내지 22701, SEQ ID NO: 25109 내지 25117, 및 SEQ ID NO: 28572 내지 28580 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R273C 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 422 내지 432, SEQ ID NO: 473, SEQ ID NO: 733 내지 739, SEQ ID NO: 21192 내지 21462, SEQ ID NO: 22690 내지 22701, SEQ ID NO: 25109 내지 25117 또는 SEQ ID NO: 28572 내지 28580와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 TP53 R273H 단백질 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, TP53 R273H 단백질 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 433 내지 446, SEQ ID NO: 474, SEQ ID NO: 740 내지 748, SEQ ID NO: 21463 내지 21845, SEQ ID NO: 22702 내지 22713, SEQ ID NO: 25118 내지 25206, 및 SEQ ID NO: 28581 내지 28697 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R273H 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 433 내지 446, SEQ ID NO: 474, SEQ ID NO: 740 내지 748, SEQ ID NO: 21463 내지 21845, SEQ ID NO: 22702 내지 22713, SEQ ID NO: 25118 내지 25206 또는 SEQ ID NO: 28581 내지 28697와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 TP53 R248W 단백질 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, TP53 R248W 단백질 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 402 내지 421, SEQ ID NO: 724 내지 732, SEQ ID NO: 20609 내지 21191, SEQ ID NO: 22679 내지 22689, SEQ ID NO: 25011 내지 25108, 및 SEQ ID NO: 28469 내지 28571 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R248W 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 402 내지 421, SEQ ID NO: 724 내지 732, SEQ ID NO: 20609 내지 21191, SEQ ID NO: 22679 내지 22689, SEQ ID NO: 25011 내지 25108 또는 SEQ ID NO: 28469 내지 28571와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 TP53 R282W 단백질 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, TP53 R282W 단백질 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 447 내지 449, SEQ ID NO: 749 내지 750, SEQ ID NO: 21846 내지 21940, SEQ ID NO: 22714 내지 22720, SEQ ID NO: 25207 내지 25218, 및 SEQ ID NO: 28698 내지 28709 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 R282W 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 447 내지 449, SEQ ID NO: 749 내지 750, SEQ ID NO: 21846 내지 21940, SEQ ID NO: 22714 내지 22720, SEQ ID NO: 25207 내지 25218 또는 SEQ ID NO: 28698 내지 28709와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 TP53 Y220C 단백질 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, TP53 Y220C 단백질 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 450 내지 458, SEQ ID NO: 751 내지 758, SEQ ID NO: 21941 내지 22385, SEQ ID NO: 22721 내지 22727, SEQ ID NO: 25219 내지 25304, 및 SEQ ID NO: 28710 내지 28795 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 Y220C 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 450 내지 458, SEQ ID NO: 751 내지 758, SEQ ID NO: 21941 내지 22385, SEQ ID NO: 22721 내지 22727, SEQ ID NO: 25219 내지 25304 또는 SEQ ID NO: 28710 내지 28795와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 PIK3CA R88Q 단백질 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, PIK3CA R88Q 단백질 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 310 내지 322, SEQ ID NO: 468, SEQ ID NO: 668 내지 675, SEQ ID NO: 16277 내지 17342, SEQ ID NO: 22609 내지 22622, SEQ ID NO: 24473 내지 24571, 및 SEQ ID NO: 27684 내지 27889 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, PIK3CA R88Q 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 310 내지 322, SEQ ID NO: 468, SEQ ID NO: 668 내지 675, SEQ ID NO: 16277 내지 17342, SEQ ID NO: 22609 내지 22622, SEQ ID NO: 24473 내지 24571 또는 SEQ ID NO: 27684 내지 27889와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 GTF2I L424H 단백질 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, GTF2I L424H 단백질 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 99 내지 118, SEQ ID NO: 528 내지 534, SEQ ID NO: 5757 내지 6498, SEQ ID NO: 22450 내지 22466, SEQ ID NO: 23264 내지 23415, 및 SEQ ID NO: 26047 내지 26375 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, GTF2I L424H 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 99 내지 118, SEQ ID NO: 528 내지 534, SEQ ID NO: 5757 내지 6498, SEQ ID NO: 22450 내지 22466, SEQ ID NO: 23264 내지 23415 또는 SEQ ID NO: 26047 내지 26375와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 PTEN R130Q 단백질 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, PTEN R130Q 단백질 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 338 내지 353, SEQ ID NO: 681 내지 690, SEQ ID NO: 17869 내지 18205, SEQ ID NO: 22630 내지 22636, SEQ ID NO: 24659 내지 24724, 및 SEQ ID NO: 27980 내지 28052 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, PTEN R130Q 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 338 내지 353, SEQ ID NO: 681 내지 690, SEQ ID NO: 17869 내지 18205, SEQ ID NO: 22630 내지 22636, SEQ ID NO: 24659 내지 24724 또는 SEQ ID NO: 27980 내지 28052와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 AKT1 E17K 단백질 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, AKT1 E17K 단백질 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 1 내지 18, SEQ ID NO: 459, SEQ ID NO: 475 내지 483, SEQ ID NO: 760 내지 1768, SEQ ID NO: 22386 내지 22396, SEQ ID NO: 22728 내지 22838, 및 SEQ ID NO: 25305 내지 25488 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, AKT1 E17K 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 1 내지 18, SEQ ID NO: 459, SEQ ID NO: 475 내지 483, SEQ ID NO: 760 내지 1768, SEQ ID NO: 22386 내지 22396, SEQ ID NO: 22728 내지 22838 또는 SEQ ID NO: 25305 내지 25488와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 PTEN R130G 단백질 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, PTEN R130G 단백질 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 323 내지 337, SEQ ID NO: 676 내지 680, SEQ ID NO: 17343 내지 17868, SEQ ID NO: 22623 내지 22629, SEQ ID NO: 24572 내지 24658, 및 SEQ ID NO: 27890 내지 27979 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, PTEN R130G 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 323 내지 337, SEQ ID NO: 676 내지 680, SEQ ID NO: 17343 내지 17868, SEQ ID NO: 22623 내지 22629, SEQ ID NO: 24572 내지 24658 또는 SEQ ID NO: 27890 내지 27979와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 TP53 H179R 단백질 돌연변이에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, TP53 H179R 단백질 돌연변이에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 354 내지 358, SEQ ID NO: 691 내지 699, SEQ ID NO: 18206 내지 18413, SEQ ID NO: 22637 내지 22643, SEQ ID NO: 24725 내지 24783, 및 SEQ ID NO: 28053 내지 28131 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, TP53 H179R 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 354 내지 358, SEQ ID NO: 691 내지 699, SEQ ID NO: 18206 내지 18413, SEQ ID NO: 22637 내지 22643, SEQ ID NO: 24725 내지 24783 또는 SEQ ID NO: 28053 내지 28131와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, 본원에 개시된 MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 임의의 조합(SEQ ID NO: 1 내지 28795)은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 단일 표적(개별) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, 복합 백신의 펩티드 중 임의의 하나(펩티드 1 내지 28795; SEQ ID NO: 1 내지 28795)는 SEQ ID NO: 1 내지 28795와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
CT 항원 백신
MHC 클래스 I 펩티드 서열
일부 실시예에서, 펩티드 백신(단일 표적 또는 복합 다중 표적 백신)은 약 1 내지 40개의 MHC 클래스 I 펩티드를 포함하며, 각 펩티드는 8개 이상의 아미노산으로 구성된다. 일부 실시예에서, MHC 클래스 I 펩티드 백신은 CTG1B, KKLC1, MAGA1, MAGA3, MAGA4, MAGC1, MAGC3, MAR1, PMEL, PRAME, SSX2, TYRP1 또는 TYRP2 단백질 표적 중 하나 이상을 대상으로 한다. 일부 실시예에서, MHC 클래스 I 펩티드 백신은 췌장암, 피부암, 갑상선암, 뇌암, 결장직장암, 기관지 및 폐암, 유방암 또는 난소암 적응증 중 하나 이상을 대상으로 한다.
일부 실시예에서, CTG1B 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 28796 내지 28864를 포함한다. 일부 실시예에서, CTG1B 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 28796 내지 28864와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, CTG1B 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 28796 내지 34168를 포함한다. 일부 실시예에서, CTG1B 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 28796 내지 34168와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, CTG1B 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 28796 내지 28864를 포함한다. 일부 실시예에서, CTG1B 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 28796 내지 28864와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, CTG1B 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 28796 내지 34168를 포함한다. 일부 실시예에서, CTG1B 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 28796 내지 34168와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAGA1 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 41321 내지 41397를 포함한다. 일부 실시예에서, MAGA1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 41321 내지 41397와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAGA1 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 41321 내지 51433를 포함한다. 일부 실시예에서, MAGA1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 41321 내지 51433와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAGA1 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 41321 내지 41397를 포함한다. 일부 실시예에서, MAGA1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 41321 내지 41397와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAGA1 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 41321 내지 51433를 포함한다. 일부 실시예에서, MAGA1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 41321 내지 51433와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAGA3 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 41383, SEQ ID NO: 41396, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49004, 및 SEQ ID NO: 51434 내지 51510를 포함한다. 일부 실시예에서, MAGA3 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 41383, SEQ ID NO: 41396, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49004 또는 SEQ ID NO: 51434 내지 51510와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAGA3 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 41351 내지 41352, SEQ ID NO: 41383, SEQ ID NO: 41396, SEQ ID NO: 41410, SEQ ID NO: 41414, SEQ ID NO: 41435, SEQ ID NO: 41450, SEQ ID NO: 41463, SEQ ID NO: 41478, SEQ ID NO: 41489, SEQ ID NO: 41495, SEQ ID NO: 41503, SEQ ID NO: 41513, SEQ ID NO: 41520, SEQ ID NO: 41535, SEQ ID NO: 41541, SEQ ID NO: 41545, SEQ ID NO: 41577, SEQ ID NO: 41588, SEQ ID NO: 41598, SEQ ID NO: 41605, SEQ ID NO: 41617, SEQ ID NO: 41620, SEQ ID NO: 41622, SEQ ID NO: 41627, SEQ ID NO: 41630, SEQ ID NO: 41638, SEQ ID NO: 41647, SEQ ID NO: 41673, SEQ ID NO: 41696, SEQ ID NO: 41703, SEQ ID NO: 41708, SEQ ID NO: 41728, SEQ ID NO: 41732 내지 41733, SEQ ID NO: 41749, SEQ ID NO: 41760, SEQ ID NO: 41766, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 41788, SEQ ID NO: 41791, SEQ ID NO: 41809, SEQ ID NO: 41813, SEQ ID NO: 41817, SEQ ID NO: 41829, SEQ ID NO: 41847 내지 41848, SEQ ID NO: 41853, SEQ ID NO: 41859, SEQ ID NO: 41889, SEQ ID NO: 41894, SEQ ID NO: 41897, SEQ ID NO: 41909, SEQ ID NO: 41923, SEQ ID NO: 41934, SEQ ID NO: 41939, SEQ ID NO: 41953 내지 41954, SEQ ID NO: 41959, SEQ ID NO: 41967, SEQ ID NO: 41970, SEQ ID NO: 41976, SEQ ID NO: 41984 내지 41985, SEQ ID NO: 42007, SEQ ID NO: 42017, SEQ ID NO: 42034, SEQ ID NO: 42044, SEQ ID NO: 42046, SEQ ID NO: 42048, SEQ ID NO: 42056, SEQ ID NO: 42067, SEQ ID NO: 42080, SEQ ID NO: 42088, SEQ ID NO: 42091, SEQ ID NO: 42119 내지 42120, SEQ ID NO: 42129, SEQ ID NO: 42135, SEQ ID NO: 42140 내지 42141, SEQ ID NO: 42155, SEQ ID NO: 42158, SEQ ID NO: 42164, SEQ ID NO: 42170, SEQ ID NO: 42174, SEQ ID NO: 42186, SEQ ID NO: 42209, SEQ ID NO: 42218, SEQ ID NO: 42224, SEQ ID NO: 42229, SEQ ID NO: 42232, SEQ ID NO: 42235, SEQ ID NO: 42237 내지 42238, SEQ ID NO: 42265, SEQ ID NO: 42272, SEQ ID NO: 42278, SEQ ID NO: 42293, SEQ ID NO: 42314, SEQ ID NO: 42336 내지 42337, SEQ ID NO: 42339, SEQ ID NO: 42372 내지 42373, SEQ ID NO: 42376, SEQ ID NO: 42382, SEQ ID NO: 42386, SEQ ID NO: 42408, SEQ ID NO: 42414, SEQ ID NO: 42423, SEQ ID NO: 42429, SEQ ID NO: 42447 내지 42448, SEQ ID NO: 42461, SEQ ID NO: 42466, SEQ ID NO: 42475, SEQ ID NO: 42513, SEQ ID NO: 42540, SEQ ID NO: 42545, SEQ ID NO: 42550, SEQ ID NO: 42553, SEQ ID NO: 42567 내지 42568, SEQ ID NO: 42580, SEQ ID NO: 42585, SEQ ID NO: 42605, SEQ ID NO: 42612, SEQ ID NO: 42627, SEQ ID NO: 42675, SEQ ID NO: 42680, SEQ ID NO: 42685, SEQ ID NO: 42690, SEQ ID NO: 42702, SEQ ID NO: 42711, SEQ ID NO: 42719, SEQ ID NO: 42738, SEQ ID NO: 42743, SEQ ID NO: 42750, SEQ ID NO: 42755, SEQ ID NO: 42777, SEQ ID NO: 42788, SEQ ID NO: 42793, SEQ ID NO: 42851, SEQ ID NO: 42858, SEQ ID NO: 42866, SEQ ID NO: 42903, SEQ ID NO: 42927, SEQ ID NO: 42936 내지 42937, SEQ ID NO: 42940 내지 42941, SEQ ID NO: 42957, SEQ ID NO: 42962, SEQ ID NO: 42966, SEQ ID NO: 42968, SEQ ID NO: 42986, SEQ ID NO: 43002, SEQ ID NO: 43013, SEQ ID NO: 43037, SEQ ID NO: 43052, SEQ ID NO: 43055 내지 43056, SEQ ID NO: 43063 내지 43064, SEQ ID NO: 43096, SEQ ID NO: 43133, SEQ ID NO: 43138, SEQ ID NO: 43156, SEQ ID NO: 43161, SEQ ID NO: 43186, SEQ ID NO: 43199, SEQ ID NO: 43205, SEQ ID NO: 43245, SEQ ID NO: 43251, SEQ ID NO: 43275, SEQ ID NO: 43312, SEQ ID NO: 43327, SEQ ID NO: 43333, SEQ ID NO: 43339, SEQ ID NO: 43342, SEQ ID NO: 43348, SEQ ID NO: 43365, SEQ ID NO: 43371, SEQ ID NO: 43400, SEQ ID NO: 43440, SEQ ID NO: 43451, SEQ ID NO: 43462, SEQ ID NO: 43467, SEQ ID NO: 43487, SEQ ID NO: 43498 내지 43499, SEQ ID NO: 43507, SEQ ID NO: 43522, SEQ ID NO: 43529, SEQ ID NO: 43533, SEQ ID NO: 43545, SEQ ID NO: 43558, SEQ ID NO: 43560, SEQ ID NO: 43583, SEQ ID NO: 43597, SEQ ID NO: 43599, SEQ ID NO: 43610, SEQ ID NO: 43614, SEQ ID NO: 43627, SEQ ID NO: 43697, SEQ ID NO: 43715, SEQ ID NO: 43718, SEQ ID NO: 43768, SEQ ID NO: 43777, SEQ ID NO: 43825 내지 43826, SEQ ID NO: 43836, SEQ ID NO: 43840, SEQ ID NO: 43856, SEQ ID NO: 43860, SEQ ID NO: 43870, SEQ ID NO: 43878, SEQ ID NO: 43881 내지 43882, SEQ ID NO: 43905, SEQ ID NO: 43922, SEQ ID NO: 43930, SEQ ID NO: 43943, SEQ ID NO: 43953, SEQ ID NO: 43958, SEQ ID NO: 43979, SEQ 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ID NO: 50709, SEQ ID NO: 50711, SEQ ID NO: 50729, SEQ ID NO: 50731, SEQ ID NO: 50741, SEQ ID NO: 50743, SEQ ID NO: 50748, SEQ ID NO: 50762, SEQ ID NO: 50765, SEQ ID NO: 50767, SEQ ID NO: 50800, SEQ ID NO: 50803, SEQ ID NO: 50807, SEQ ID NO: 50841, SEQ ID NO: 50865, SEQ ID NO: 50872, SEQ ID NO: 50905, SEQ ID NO: 50955 내지 50956, SEQ ID NO: 50975 내지 50977, SEQ ID NO: 50986, SEQ ID NO: 51021, SEQ ID NO: 51039 내지 51040, SEQ ID NO: 51066 내지 51068, SEQ ID NO: 51084, SEQ ID NO: 51099 내지 51100, SEQ ID NO: 51165 내지 51167, SEQ ID NO: 51169, SEQ ID NO: 51190, SEQ ID NO: 51194 내지 51198, SEQ ID NO: 51267 내지 51270, SEQ ID NO: 51281 내지 51282, SEQ ID NO: 51324, SEQ ID NO: 51349, SEQ ID NO: 51379, SEQ ID NO: 51413 내지 51415, SEQ ID NO: 51420 내지 51421 또는 SEQ ID NO: 51434 내지 60455와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAGA3 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 41383, SEQ ID NO: 41396, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49004, 및 SEQ ID NO: 51434 내지 51510를 포함한다. 일부 실시예에서, MAGA3 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 41383, SEQ ID NO: 41396, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49004 또는 SEQ ID NO: 51434 내지 51510와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAGA3 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 41351 내지 41352, SEQ ID NO: 41383, SEQ ID NO: 41396, SEQ ID NO: 41410, SEQ ID NO: 41414, SEQ ID NO: 41435, SEQ ID NO: 41450, SEQ ID NO: 41463, SEQ ID NO: 41478, SEQ ID NO: 41489, SEQ ID NO: 41495, SEQ ID NO: 41503, SEQ ID NO: 41513, SEQ ID NO: 41520, SEQ ID NO: 41535, SEQ ID NO: 41541, SEQ ID NO: 41545, SEQ ID NO: 41577, SEQ ID NO: 41588, SEQ ID NO: 41598, SEQ ID NO: 41605, SEQ ID NO: 41617, SEQ ID NO: 41620, SEQ ID NO: 41622, SEQ ID NO: 41627, SEQ ID NO: 41630, SEQ ID NO: 41638, SEQ ID NO: 41647, SEQ ID NO: 41673, SEQ ID NO: 41696, SEQ ID NO: 41703, SEQ ID NO: 41708, SEQ ID NO: 41728, SEQ ID NO: 41732 내지 41733, SEQ ID NO: 41749, SEQ ID NO: 41760, SEQ ID NO: 41766, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 41788, SEQ ID NO: 41791, SEQ ID NO: 41809, SEQ ID NO: 41813, SEQ ID NO: 41817, SEQ ID NO: 41829, SEQ ID NO: 41847 내지 41848, SEQ ID NO: 41853, SEQ ID NO: 41859, SEQ ID NO: 41889, SEQ ID NO: 41894, SEQ ID NO: 41897, SEQ ID NO: 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일부 실시예에서, MAGA4 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 41352, SEQ ID NO: 41357 내지 41358, SEQ ID NO: 41377, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49071, SEQ ID NO: 50632, SEQ ID NO: 50729, SEQ ID NO: 55758, 및 SEQ ID NO: 60456 내지 60527를 포함한다. 일부 실시예에서, MAGA4 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 41352, SEQ ID NO: 41357 내지 41358, SEQ ID NO: 41377, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49071, SEQ ID NO: 50632, SEQ ID NO: 50729, SEQ ID NO: 55758 또는 SEQ ID NO: 60456 내지 60527와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAGA4 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 41345, SEQ ID NO: 41347, SEQ ID NO: 41352, SEQ ID NO: 41357 내지 41358, SEQ ID NO: 41366, SEQ ID NO: 41377, SEQ ID NO: 41382, SEQ ID NO: 41392, SEQ ID NO: 41396, SEQ ID NO: 41398, SEQ ID NO: 41406, SEQ ID NO: 41411, SEQ ID NO: 41414, SEQ ID NO: 41433, SEQ ID NO: 41436, SEQ ID NO: 41445, SEQ ID NO: 41449, SEQ ID NO: 41455, SEQ ID NO: 41478, SEQ ID NO: 41487, SEQ ID NO: 41495 내지 41496, SEQ ID NO: 41503, SEQ ID NO: 41515, SEQ ID NO: 41520, SEQ ID NO: 41529, SEQ ID NO: 41549, SEQ ID NO: 41553, SEQ ID NO: 41562, SEQ ID NO: 41569, SEQ ID NO: 41574, SEQ ID NO: 41576, SEQ ID NO: 41579, SEQ ID NO: 41587 내지 41588, SEQ ID NO: 41605, SEQ ID NO: 41617, SEQ ID NO: 41620, SEQ ID NO: 41634, SEQ ID NO: 41650, SEQ ID NO: 41665, SEQ ID NO: 41670, SEQ ID NO: 41672, SEQ ID NO: 41696, SEQ ID NO: 41703, SEQ ID NO: 41709, SEQ ID NO: 41725, SEQ ID NO: 41732 내지 41733, SEQ ID NO: 41748, SEQ ID NO: 41760, SEQ ID NO: 41766, SEQ ID NO: 41768, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 41779, SEQ ID NO: 41791, SEQ ID NO: 41797, SEQ ID NO: 41813, SEQ ID NO: 41819, SEQ ID NO: 41825, SEQ ID NO: 41829, SEQ ID NO: 41846 내지 41847, SEQ ID NO: 41853, SEQ ID NO: 41876, SEQ ID NO: 41889, SEQ ID NO: 41892, SEQ ID NO: 41897, SEQ ID NO: 41906 내지 41907, SEQ ID NO: 41912, SEQ ID NO: 41924, SEQ ID NO: 41940, SEQ ID NO: 41953, SEQ ID NO: 41956, SEQ ID NO: 41967, SEQ ID NO: 41970, SEQ ID NO: 41976, SEQ ID NO: 41985, SEQ ID NO: 41990, SEQ ID NO: 42014, SEQ ID NO: 42017, SEQ ID NO: 42026, SEQ ID NO: 42034, SEQ ID NO: 42037, SEQ ID NO: 42046, SEQ ID NO: 42048, SEQ ID NO: 42056 내지 42057, SEQ ID NO: 42080, SEQ ID NO: 42088, SEQ ID NO: 42091, SEQ ID NO: 42102, SEQ ID NO: 42106, SEQ ID NO: 42115, SEQ ID NO: 42120, SEQ ID NO: 42129, SEQ ID NO: 42135, SEQ ID NO: 42138, SEQ ID NO: 42151, SEQ ID NO: 42158, SEQ ID NO: 42163 내지 42164, SEQ ID NO: 42167 내지 42168, SEQ ID NO: 42170, SEQ ID NO: 42186, SEQ ID NO: 42192, SEQ ID NO: 42195, SEQ ID NO: 42198, SEQ ID NO: 42204, SEQ ID NO: 42209, SEQ ID NO: 42218, SEQ ID NO: 42221, SEQ ID NO: 42224, SEQ ID NO: 42229, SEQ ID NO: 42240, SEQ ID NO: 42263, SEQ ID NO: 42265, SEQ ID NO: 42270, SEQ ID NO: 42316, SEQ ID NO: 42336 내지 42337, SEQ ID NO: 42339, SEQ ID NO: 42351, SEQ ID NO: 42354, SEQ ID NO: 42372, SEQ ID NO: 42378, SEQ ID NO: 42385 내지 42386, SEQ ID NO: 42394, SEQ ID NO: 42405, SEQ ID NO: 42409, SEQ ID NO: 42417, SEQ ID NO: 42423, SEQ ID NO: 42439, SEQ ID NO: 42447, SEQ ID NO: 42453, SEQ ID NO: 42458, SEQ ID NO: 42460 내지 42461, SEQ ID NO: 42466, SEQ ID NO: 42472 내지 42473, SEQ ID NO: 42519 내지 42520, SEQ ID NO: 42525, SEQ ID NO: 42528, SEQ ID NO: 42540, SEQ ID NO: 42545, SEQ ID NO: 42550, SEQ ID NO: 42563 내지 42564, SEQ ID NO: 42580, SEQ ID NO: 42605, SEQ ID NO: 42609, SEQ ID NO: 42612 내지 42613, SEQ ID NO: 42615, SEQ ID NO: 42628, SEQ ID NO: 42637, SEQ ID NO: 42648, SEQ ID NO: 42653, SEQ ID NO: 42675, SEQ ID NO: 42680, SEQ ID NO: 42685, SEQ ID NO: 42696, SEQ ID NO: 42703, SEQ ID NO: 42719, SEQ ID NO: 42735, SEQ ID 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일부 실시예에서, MAGA4 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 41352, SEQ ID NO: 41357 내지 41358, SEQ ID NO: 41377, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49071, SEQ ID NO: 50632, SEQ ID NO: 50729, SEQ ID NO: 55758, 및 SEQ ID NO: 60456 내지 60527를 포함한다. 일부 실시예에서, MAGA4 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 41352, SEQ ID NO: 41357 내지 41358, SEQ ID NO: 41377, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49071, SEQ ID NO: 50632, SEQ ID NO: 50729, SEQ ID NO: 55758 또는 SEQ ID NO: 60456 내지 60527와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAGA4 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 41345, SEQ ID NO: 41347, SEQ ID NO: 41352, SEQ ID NO: 41357 내지 41358, SEQ ID NO: 41366, SEQ ID NO: 41377, SEQ ID NO: 41382, SEQ ID NO: 41392, SEQ ID NO: 41396, SEQ ID NO: 41398, SEQ ID NO: 41406, SEQ ID NO: 41411, SEQ ID NO: 41414, SEQ ID NO: 41433, SEQ ID NO: 41436, SEQ ID NO: 41445, SEQ ID NO: 41449, SEQ ID NO: 41455, SEQ ID NO: 41478, SEQ ID NO: 41487, SEQ ID NO: 41495 내지 41496, SEQ ID NO: 41503, SEQ ID NO: 41515, SEQ ID NO: 41520, SEQ ID NO: 41529, SEQ ID NO: 41549, SEQ ID NO: 41553, SEQ ID NO: 41562, SEQ ID NO: 41569, SEQ ID NO: 41574, SEQ ID NO: 41576, SEQ ID NO: 41579, SEQ ID NO: 41587 내지 41588, SEQ ID NO: 41605, SEQ ID NO: 41617, SEQ ID NO: 41620, SEQ ID NO: 41634, SEQ ID NO: 41650, SEQ ID NO: 41665, SEQ ID NO: 41670, SEQ ID NO: 41672, SEQ ID NO: 41696, SEQ ID NO: 41703, SEQ ID NO: 41709, SEQ ID NO: 41725, SEQ ID NO: 41732 내지 41733, SEQ ID NO: 41748, SEQ ID NO: 41760, SEQ ID NO: 41766, SEQ ID NO: 41768, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 41779, SEQ ID NO: 41791, SEQ ID NO: 41797, SEQ ID NO: 41813, SEQ ID NO: 41819, SEQ ID NO: 41825, SEQ ID NO: 41829, SEQ ID NO: 41846 내지 41847, SEQ ID NO: 41853, SEQ ID NO: 41876, SEQ ID NO: 41889, SEQ ID NO: 41892, SEQ ID NO: 41897, SEQ ID NO: 41906 내지 41907, SEQ ID NO: 41912, SEQ ID NO: 41924, SEQ ID NO: 41940, SEQ ID NO: 41953, SEQ ID NO: 41956, SEQ ID NO: 41967, SEQ ID NO: 41970, SEQ ID NO: 41976, SEQ ID NO: 41985, SEQ ID NO: 41990, SEQ ID NO: 42014, SEQ ID NO: 42017, SEQ ID NO: 42026, SEQ ID NO: 42034, SEQ ID NO: 42037, SEQ ID NO: 42046, SEQ ID NO: 42048, SEQ ID NO: 42056 내지 42057, SEQ ID NO: 42080, SEQ ID NO: 42088, SEQ ID NO: 42091, SEQ ID NO: 42102, SEQ ID NO: 42106, SEQ ID NO: 42115, SEQ ID NO: 42120, SEQ ID NO: 42129, SEQ ID NO: 42135, SEQ ID NO: 42138, SEQ ID NO: 42151, SEQ ID NO: 42158, SEQ ID NO: 42163 내지 42164, SEQ ID NO: 42167 내지 42168, SEQ ID NO: 42170, SEQ ID NO: 42186, SEQ ID NO: 42192, SEQ ID NO: 42195, SEQ ID NO: 42198, SEQ ID NO: 42204, SEQ ID NO: 42209, SEQ ID NO: 42218, SEQ ID NO: 42221, SEQ ID NO: 42224, SEQ ID NO: 42229, SEQ ID NO: 42240, SEQ ID NO: 42263, SEQ ID NO: 42265, SEQ ID NO: 42270, SEQ ID NO: 42316, SEQ ID NO: 42336 내지 42337, SEQ ID NO: 42339, SEQ ID NO: 42351, SEQ ID NO: 42354, SEQ ID NO: 42372, SEQ ID NO: 42378, SEQ ID NO: 42385 내지 42386, SEQ ID NO: 42394, SEQ ID NO: 42405, SEQ ID NO: 42409, SEQ ID NO: 42417, SEQ ID NO: 42423, SEQ ID NO: 42439, SEQ ID NO: 42447, SEQ ID NO: 42453, SEQ ID NO: 42458, SEQ ID NO: 42460 내지 42461, SEQ ID NO: 42466, SEQ ID NO: 42472 내지 42473, SEQ ID NO: 42519 내지 42520, SEQ ID NO: 42525, SEQ ID NO: 42528, SEQ ID NO: 42540, SEQ ID NO: 42545, SEQ ID NO: 42550, SEQ ID NO: 42563 내지 42564, SEQ ID NO: 42580, SEQ ID NO: 42605, SEQ ID NO: 42609, SEQ ID NO: 42612 내지 42613, SEQ ID NO: 42615, SEQ ID NO: 42628, SEQ ID NO: 42637, SEQ ID NO: 42648, SEQ ID NO: 42653, SEQ ID NO: 42675, SEQ ID NO: 42680, SEQ ID NO: 42685, SEQ ID NO: 42696, SEQ ID NO: 42703, SEQ ID NO: 42719, SEQ ID NO: 42735, SEQ ID 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SEQ ID NO: 43362, SEQ ID NO: 43365, SEQ ID NO: 43384, SEQ ID NO: 43389, SEQ ID NO: 43395, SEQ ID NO: 43401, SEQ ID NO: 43429, SEQ ID NO: 43432, SEQ ID NO: 43440, SEQ ID NO: 43451 내지 43453, SEQ ID NO: 43462, SEQ ID NO: 43464, SEQ ID NO: 43467, SEQ ID NO: 43479, SEQ ID NO: 43482, SEQ ID NO: 43496, SEQ ID NO: 43511, SEQ ID NO: 43513, SEQ ID NO: 43517, SEQ ID NO: 43545, SEQ ID NO: 43564, SEQ ID NO: 43573, SEQ ID NO: 43585, SEQ ID NO: 43587, SEQ ID NO: 43591, SEQ ID NO: 43611, SEQ ID NO: 43632, SEQ ID NO: 43636, SEQ ID NO: 43641, SEQ ID NO: 43643, SEQ ID NO: 43651, SEQ ID NO: 43669, SEQ ID NO: 43688, SEQ ID NO: 43696, SEQ ID NO: 43700, SEQ ID NO: 43703, SEQ ID NO: 43707, SEQ ID NO: 43718, SEQ ID NO: 43760, SEQ ID NO: 43763, SEQ ID NO: 43768, SEQ ID NO: 43777, SEQ ID NO: 43780, SEQ ID NO: 43787, SEQ ID NO: 43801, SEQ ID NO: 43808, SEQ ID NO: 43810, SEQ ID NO: 43825, SEQ ID NO: 43827, SEQ ID NO: 43836, SEQ ID NO: 43860, SEQ ID NO: 43867, SEQ ID NO: 43881 내지 43882, SEQ ID NO: 43884, SEQ ID NO: 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55814, SEQ ID NO: 55875, SEQ ID NO: 55879, SEQ ID NO: 55886, SEQ ID NO: 55911, SEQ ID NO: 55986, SEQ ID NO: 56043, SEQ ID NO: 56052, SEQ ID NO: 56175, SEQ ID NO: 56240, SEQ ID NO: 56277, SEQ ID NO: 56352, SEQ ID NO: 56418, SEQ ID NO: 56435, SEQ ID NO: 56521, SEQ ID NO: 56593, SEQ ID NO: 56609, SEQ ID NO: 56629, SEQ ID NO: 56649 내지 56650, SEQ ID NO: 56793, SEQ ID NO: 56836, SEQ ID NO: 56852, SEQ ID NO: 56902, SEQ ID NO: 57155, SEQ ID NO: 57157, SEQ ID NO: 57265, SEQ ID NO: 57278, SEQ ID NO: 57323, SEQ ID NO: 57472, SEQ ID NO: 57535, SEQ ID NO: 57550, SEQ ID NO: 57561, SEQ ID NO: 57568, SEQ ID NO: 57639, SEQ ID NO: 57655, SEQ ID NO: 57790, SEQ ID NO: 57811, SEQ ID NO: 57904, SEQ ID NO: 57944, SEQ ID NO: 58040, SEQ ID NO: 58064, SEQ ID NO: 58075, SEQ ID NO: 58145, SEQ ID NO: 58199, SEQ ID NO: 58223, SEQ ID NO: 58226, SEQ ID NO: 58309, SEQ ID NO: 58349, SEQ ID NO: 58395, SEQ ID NO: 58411, SEQ ID NO: 58433, SEQ ID NO: 58547, SEQ ID NO: 58589, SEQ ID NO: 58679, SEQ ID NO: 58683 내지 58684, SEQ ID NO: 58815, SEQ ID NO: 58823, SEQ ID NO: 58855, SEQ ID NO: 58932, SEQ ID NO: 59223, SEQ ID NO: 59246, SEQ ID NO: 59248, SEQ ID NO: 59530, SEQ ID NO: 59622, SEQ ID NO: 59755, SEQ ID NO: 59757, SEQ ID NO: 59775, SEQ ID NO: 59816, SEQ ID NO: 59821, SEQ ID NO: 59828, SEQ ID NO: 59856, SEQ ID NO: 59871, SEQ ID NO: 59873, SEQ ID NO: 59875, SEQ ID NO: 59960, SEQ ID NO: 59967, SEQ ID NO: 60005, SEQ ID NO: 60046 내지 60047, SEQ ID NO: 60081, SEQ ID NO: 60224, SEQ ID NO: 60228, SEQ ID NO: 60276, SEQ ID NO: 60289, SEQ ID NO: 60292, SEQ ID NO: 60422 내지 60423, SEQ ID NO: 60444 또는 SEQ ID NO: 60456 내지 68237와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAGC1 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 49395, SEQ ID NO: 50632, 및 SEQ ID NO: 68238 내지 68321를 포함한다. 일부 실시예에서, MAGC1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 49395, SEQ ID NO: 50632 또는 SEQ ID NO: 68238 내지 68321와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAGC1 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 41352, SEQ ID NO: 41478, SEQ ID NO: 41495, SEQ ID NO: 41725, SEQ ID NO: 41847, SEQ ID NO: 42129, SEQ ID NO: 42135, SEQ ID NO: 42168, SEQ ID NO: 42170, SEQ ID NO: 42195, SEQ ID NO: 42218, SEQ ID NO: 42229, SEQ ID NO: 42458, SEQ ID NO: 42545, SEQ ID NO: 42628, SEQ ID NO: 42653, SEQ ID NO: 42685, SEQ ID NO: 42703, SEQ ID NO: 42872, SEQ ID NO: 43008, SEQ ID NO: 43046, SEQ ID NO: 43083, SEQ ID NO: 43333, SEQ ID NO: 43429, SEQ ID NO: 43564, SEQ ID NO: 43780, SEQ ID NO: 43836, SEQ ID NO: 43881, SEQ ID NO: 43898, SEQ ID NO: 43932, SEQ ID NO: 44048, SEQ ID NO: 44181, SEQ ID NO: 44328, SEQ ID NO: 44456, SEQ ID NO: 44523, SEQ ID NO: 44566, SEQ ID NO: 44773, SEQ ID NO: 44877, SEQ ID NO: 45197, SEQ ID NO: 45385, SEQ ID NO: 45450, SEQ ID NO: 45556, SEQ ID NO: 45580, SEQ ID NO: 45584, SEQ ID NO: 45599, SEQ ID NO: 45765, SEQ ID NO: 45829, SEQ ID NO: 45894, SEQ ID NO: 45915, SEQ ID NO: 46273, SEQ ID NO: 46400, SEQ ID NO: 46421, SEQ ID NO: 46457, SEQ ID NO: 46459, SEQ ID NO: 46484, SEQ ID NO: 46666, SEQ ID NO: 46678, SEQ ID NO: 46689, SEQ ID NO: 46981, SEQ ID NO: 46991, SEQ ID NO: 46993, SEQ ID NO: 47047, SEQ ID NO: 47151, SEQ ID NO: 47324, SEQ ID NO: 47432, SEQ ID NO: 47592, SEQ ID NO: 47673, SEQ ID NO: 47895, SEQ ID NO: 47960, SEQ ID NO: 47964, SEQ ID NO: 47979, SEQ ID NO: 47984, SEQ ID NO: 48034, SEQ ID NO: 48113, SEQ ID NO: 48118, SEQ ID NO: 48300, SEQ ID NO: 48436, SEQ ID NO: 48461 내지 48462, SEQ ID NO: 48469, SEQ ID NO: 48574, SEQ ID NO: 48680, SEQ ID NO: 48796, SEQ ID NO: 48832, SEQ ID NO: 48838, SEQ ID NO: 48845, SEQ ID NO: 48877, SEQ ID NO: 48947, SEQ ID NO: 49019, SEQ ID NO: 49111, SEQ ID NO: 49176, SEQ ID NO: 49263, SEQ ID NO: 49395, SEQ ID NO: 49462, SEQ ID NO: 49557, SEQ ID NO: 49823, SEQ ID NO: 49883, SEQ ID NO: 50062, SEQ ID NO: 50167, SEQ ID NO: 50305, SEQ ID NO: 50394, SEQ ID NO: 50401, SEQ ID NO: 50423, SEQ ID NO: 50428, SEQ ID NO: 50443, SEQ ID NO: 50450, SEQ ID NO: 50564, SEQ ID NO: 50574, SEQ ID NO: 50632, SEQ ID NO: 50678, 및 SEQ ID NO: 68238 내지 95592를 포함한다. 일부 실시예에서, MAGC1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 41352, SEQ ID NO: 41478, SEQ ID NO: 41495, SEQ ID NO: 41725, SEQ ID NO: 41847, SEQ ID NO: 42129, SEQ ID NO: 42135, SEQ ID NO: 42168, SEQ ID NO: 42170, SEQ ID NO: 42195, SEQ ID NO: 42218, SEQ ID NO: 42229, SEQ ID NO: 42458, SEQ ID NO: 42545, SEQ ID NO: 42628, SEQ ID NO: 42653, SEQ ID NO: 42685, SEQ ID NO: 42703, SEQ ID NO: 42872, SEQ ID NO: 43008, SEQ ID NO: 43046, SEQ ID NO: 43083, SEQ ID NO: 43333, SEQ ID NO: 43429, SEQ ID NO: 43564, SEQ ID NO: 43780, SEQ ID NO: 43836, SEQ ID NO: 43881, SEQ ID NO: 43898, SEQ ID NO: 43932, SEQ ID NO: 44048, SEQ ID NO: 44181, SEQ ID NO: 44328, SEQ ID NO: 44456, SEQ ID NO: 44523, SEQ ID NO: 44566, SEQ ID NO: 44773, SEQ ID NO: 44877, SEQ ID NO: 45197, SEQ ID NO: 45385, SEQ ID NO: 45450, SEQ ID NO: 45556, SEQ ID NO: 45580, SEQ ID NO: 45584, SEQ ID NO: 45599, SEQ ID NO: 45765, SEQ ID NO: 45829, SEQ ID NO: 45894, SEQ ID NO: 45915, SEQ ID NO: 46273, SEQ ID NO: 46400, SEQ ID NO: 46421, SEQ ID NO: 46457, SEQ ID NO: 46459, SEQ ID NO: 46484, SEQ ID NO: 46666, SEQ ID NO: 46678, SEQ ID NO: 46689, SEQ ID NO: 46981, SEQ ID NO: 46991, SEQ ID NO: 46993, SEQ ID NO: 47047, SEQ ID NO: 47151, SEQ ID NO: 47324, SEQ ID NO: 47432, SEQ ID NO: 47592, SEQ ID NO: 47673, SEQ ID NO: 47895, SEQ ID NO: 47960, SEQ ID NO: 47964, SEQ ID NO: 47979, SEQ ID NO: 47984, SEQ ID NO: 48034, SEQ ID NO: 48113, SEQ ID NO: 48118, SEQ ID NO: 48300, SEQ ID NO: 48436, SEQ ID NO: 48461 내지 48462, SEQ ID NO: 48469, SEQ ID NO: 48574, SEQ ID NO: 48680, SEQ ID NO: 48796, SEQ ID NO: 48832, SEQ ID NO: 48838, SEQ ID NO: 48845, SEQ ID NO: 48877, SEQ ID NO: 48947, SEQ ID NO: 49019, SEQ ID NO: 49111, SEQ ID NO: 49176, SEQ ID NO: 49263, SEQ ID NO: 49395, SEQ ID NO: 49462, SEQ ID NO: 49557, SEQ ID NO: 49823, SEQ ID NO: 49883, SEQ ID NO: 50062, SEQ ID NO: 50167, SEQ ID NO: 50305, SEQ ID NO: 50394, SEQ ID NO: 50401, SEQ ID NO: 50423, SEQ ID NO: 50428, SEQ ID NO: 50443, SEQ ID NO: 50450, SEQ ID NO: 50564, SEQ ID NO: 50574, SEQ ID NO: 50632, SEQ ID NO: 50678 또는 SEQ ID NO: 68238 내지 95592와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAGC1 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 49395, SEQ ID NO: 50632, 및 SEQ ID NO: 68238 내지 68321를 포함한다. 일부 실시예에서, MAGC1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 49395, SEQ ID NO: 50632 또는 SEQ ID NO: 68238 내지 68321와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAGC1 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 41352, SEQ ID NO: 41478, SEQ ID NO: 41495, SEQ ID NO: 41725, SEQ ID NO: 41847, SEQ ID NO: 42129, SEQ ID NO: 42135, SEQ ID NO: 42168, SEQ ID NO: 42170, SEQ ID NO: 42195, SEQ ID NO: 42218, SEQ ID NO: 42229, SEQ ID NO: 42458, SEQ ID NO: 42545, SEQ ID NO: 42628, SEQ ID NO: 42653, SEQ ID NO: 42685, SEQ ID NO: 42703, SEQ ID NO: 42872, SEQ ID NO: 43008, SEQ ID NO: 43046, SEQ ID NO: 43083, SEQ ID NO: 43333, SEQ ID NO: 43429, SEQ ID NO: 43564, SEQ ID NO: 43780, SEQ ID NO: 43836, SEQ ID NO: 43881, SEQ ID NO: 43898, SEQ ID NO: 43932, SEQ ID NO: 44048, SEQ ID NO: 44181, SEQ ID NO: 44328, SEQ ID NO: 44456, SEQ ID NO: 44523, SEQ ID NO: 44566, SEQ ID NO: 44773, SEQ ID NO: 44877, SEQ ID NO: 45197, SEQ ID NO: 45385, SEQ ID NO: 45450, SEQ ID NO: 45556, SEQ ID NO: 45580, SEQ ID NO: 45584, SEQ ID NO: 45599, SEQ ID NO: 45765, SEQ ID NO: 45829, SEQ ID NO: 45894, SEQ ID NO: 45915, SEQ ID NO: 46273, SEQ ID NO: 46400, SEQ ID NO: 46421, SEQ ID NO: 46457, SEQ ID NO: 46459, SEQ ID NO: 46484, SEQ ID NO: 46666, SEQ ID NO: 46678, SEQ ID NO: 46689, SEQ ID NO: 46981, SEQ ID NO: 46991, SEQ ID NO: 46993, SEQ ID NO: 47047, SEQ ID NO: 47151, SEQ ID NO: 47324, SEQ ID NO: 47432, SEQ ID NO: 47592, SEQ ID NO: 47673, SEQ ID NO: 47895, SEQ ID NO: 47960, SEQ ID NO: 47964, SEQ ID NO: 47979, SEQ ID NO: 47984, SEQ ID NO: 48034, SEQ ID NO: 48113, SEQ ID NO: 48118, SEQ ID NO: 48300, SEQ ID NO: 48436, SEQ ID NO: 48461 내지 48462, SEQ ID NO: 48469, SEQ ID NO: 48574, SEQ ID NO: 48680, SEQ ID NO: 48796, SEQ ID NO: 48832, SEQ ID NO: 48838, SEQ ID NO: 48845, SEQ ID NO: 48877, SEQ ID NO: 48947, SEQ ID NO: 49019, SEQ ID NO: 49111, SEQ ID NO: 49176, SEQ ID NO: 49263, SEQ ID NO: 49395, SEQ ID NO: 49462, SEQ ID NO: 49557, SEQ ID NO: 49823, SEQ ID NO: 49883, SEQ ID NO: 50062, SEQ ID NO: 50167, SEQ ID NO: 50305, SEQ ID NO: 50394, SEQ ID NO: 50401, SEQ ID NO: 50423, SEQ ID NO: 50428, SEQ ID NO: 50443, SEQ ID NO: 50450, SEQ ID NO: 50564, SEQ ID NO: 50574, SEQ ID NO: 50632, SEQ ID NO: 50678, 및 SEQ ID NO: 68238 내지 95592를 포함한다. 일부 실시예에서, MAGC1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 41352, SEQ ID NO: 41478, SEQ ID NO: 41495, SEQ ID NO: 41725, SEQ ID NO: 41847, SEQ ID NO: 42129, SEQ ID NO: 42135, SEQ ID NO: 42168, SEQ ID NO: 42170, SEQ ID NO: 42195, SEQ ID NO: 42218, SEQ ID NO: 42229, SEQ ID NO: 42458, SEQ ID NO: 42545, SEQ ID NO: 42628, SEQ ID NO: 42653, SEQ ID NO: 42685, SEQ ID NO: 42703, SEQ ID NO: 42872, SEQ ID NO: 43008, SEQ ID NO: 43046, SEQ ID NO: 43083, SEQ ID NO: 43333, SEQ ID NO: 43429, SEQ ID NO: 43564, SEQ ID NO: 43780, SEQ ID NO: 43836, SEQ ID NO: 43881, SEQ ID NO: 43898, SEQ ID NO: 43932, SEQ ID NO: 44048, SEQ ID NO: 44181, SEQ ID NO: 44328, SEQ ID NO: 44456, SEQ ID NO: 44523, SEQ ID NO: 44566, SEQ ID NO: 44773, SEQ ID NO: 44877, SEQ ID NO: 45197, SEQ ID NO: 45385, SEQ ID NO: 45450, SEQ ID NO: 45556, SEQ ID NO: 45580, SEQ ID NO: 45584, SEQ ID NO: 45599, SEQ ID NO: 45765, SEQ ID NO: 45829, SEQ ID NO: 45894, SEQ ID NO: 45915, SEQ ID NO: 46273, SEQ ID NO: 46400, SEQ ID NO: 46421, SEQ ID NO: 46457, SEQ ID NO: 46459, SEQ ID NO: 46484, SEQ ID NO: 46666, SEQ ID NO: 46678, SEQ ID NO: 46689, SEQ ID NO: 46981, SEQ ID NO: 46991, SEQ ID NO: 46993, SEQ ID NO: 47047, SEQ ID NO: 47151, SEQ ID NO: 47324, SEQ ID NO: 47432, SEQ ID NO: 47592, SEQ ID NO: 47673, SEQ ID NO: 47895, SEQ ID NO: 47960, SEQ ID NO: 47964, SEQ ID NO: 47979, SEQ ID NO: 47984, SEQ ID NO: 48034, SEQ ID NO: 48113, SEQ ID NO: 48118, SEQ ID NO: 48300, SEQ ID NO: 48436, SEQ ID NO: 48461 내지 48462, SEQ ID NO: 48469, SEQ ID NO: 48574, SEQ ID NO: 48680, SEQ ID NO: 48796, SEQ ID NO: 48832, SEQ ID NO: 48838, SEQ ID NO: 48845, SEQ ID NO: 48877, SEQ ID NO: 48947, SEQ ID NO: 49019, SEQ ID NO: 49111, SEQ ID NO: 49176, SEQ ID NO: 49263, SEQ ID NO: 49395, SEQ ID NO: 49462, SEQ ID NO: 49557, SEQ ID NO: 49823, SEQ ID NO: 49883, SEQ ID NO: 50062, SEQ ID NO: 50167, SEQ ID NO: 50305, SEQ ID NO: 50394, SEQ ID NO: 50401, SEQ ID NO: 50423, SEQ ID NO: 50428, SEQ ID NO: 50443, SEQ ID NO: 50450, SEQ ID NO: 50564, SEQ ID NO: 50574, SEQ ID NO: 50632, SEQ ID NO: 50678 또는 SEQ ID NO: 68238 내지 95592와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAGC3 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 68285, SEQ ID NO: 68290, SEQ ID NO: 68305, SEQ ID NO: 77091, SEQ ID NO: 77210, SEQ ID NO: 84188, SEQ ID NO: 87951, SEQ ID NO: 88144, 및 SEQ ID NO: 95593 내지 95664를 포함한다. 일부 실시예에서, MAGC3 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 68285, SEQ ID NO: 68290, SEQ ID NO: 68305, SEQ ID NO: 77091, SEQ ID NO: 77210, SEQ ID NO: 84188, SEQ ID NO: 87951, SEQ ID NO: 88144 또는 SEQ ID NO: 95593 내지 95664와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAGC3 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 41647, SEQ ID NO: 50668, SEQ ID NO: 50905, SEQ ID NO: 51039 내지 51040, SEQ ID NO: 68257, SEQ ID NO: 68285, SEQ ID NO: 68288, SEQ ID NO: 68290, SEQ ID NO: 68305, SEQ ID NO: 68389, SEQ ID NO: 68419, SEQ ID NO: 68470, SEQ ID NO: 68510, SEQ ID NO: 68519, SEQ ID NO: 68592, SEQ ID NO: 68603, SEQ ID NO: 68684, SEQ ID NO: 68688, SEQ ID NO: 68747, SEQ ID NO: 68760, SEQ ID NO: 68778, SEQ ID NO: 68786, SEQ ID NO: 68855, SEQ ID NO: 68898, SEQ ID NO: 68900, SEQ ID NO: 68927, SEQ ID NO: 68961, SEQ ID NO: 69026, SEQ ID NO: 69041, SEQ ID NO: 69047, SEQ ID NO: 69148, SEQ ID NO: 69173, SEQ ID NO: 69180, SEQ ID NO: 69192, SEQ ID NO: 69227, SEQ ID NO: 69311, SEQ ID NO: 69330, SEQ ID NO: 69333, SEQ ID NO: 69346, SEQ ID NO: 69356, SEQ ID NO: 69393, SEQ ID NO: 69421, SEQ ID NO: 69437, SEQ ID NO: 69451, SEQ ID NO: 69500, SEQ ID NO: 69505, SEQ ID NO: 69517, SEQ ID NO: 69540, SEQ ID NO: 69559, SEQ ID NO: 69571, SEQ ID NO: 69586, SEQ ID NO: 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일부 실시예에서, MAGC3 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 68285, SEQ ID NO: 68290, SEQ ID NO: 68305, SEQ ID NO: 77091, SEQ ID NO: 77210, SEQ ID NO: 84188, SEQ ID NO: 87951, SEQ ID NO: 88144, 및 SEQ ID NO: 95593 내지 95664를 포함한다. 일부 실시예에서, MAGC3 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 68285, SEQ ID NO: 68290, SEQ ID NO: 68305, SEQ ID NO: 77091, SEQ ID NO: 77210, SEQ ID NO: 84188, SEQ ID NO: 87951, SEQ ID NO: 88144 또는 SEQ ID NO: 95593 내지 95664와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAGC3 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 41647, SEQ ID NO: 50668, SEQ ID NO: 50905, SEQ ID NO: 51039 내지 51040, SEQ ID NO: 68257, SEQ ID NO: 68285, SEQ ID NO: 68288, SEQ ID NO: 68290, SEQ ID NO: 68305, SEQ ID NO: 68389, SEQ ID NO: 68419, SEQ ID NO: 68470, SEQ ID NO: 68510, SEQ ID NO: 68519, SEQ ID NO: 68592, SEQ ID NO: 68603, SEQ ID NO: 68684, SEQ ID NO: 68688, SEQ ID NO: 68747, SEQ ID NO: 68760, SEQ ID NO: 68778, SEQ ID NO: 68786, SEQ ID NO: 68855, SEQ ID NO: 68898, SEQ ID NO: 68900, SEQ ID NO: 68927, SEQ ID NO: 68961, SEQ ID NO: 69026, SEQ ID NO: 69041, SEQ ID NO: 69047, SEQ ID NO: 69148, SEQ ID NO: 69173, SEQ ID NO: 69180, SEQ ID NO: 69192, SEQ ID NO: 69227, SEQ ID NO: 69311, SEQ ID NO: 69330, SEQ ID NO: 69333, SEQ ID NO: 69346, SEQ ID NO: 69356, SEQ ID NO: 69393, SEQ ID NO: 69421, SEQ ID NO: 69437, SEQ ID NO: 69451, SEQ ID NO: 69500, SEQ ID NO: 69505, SEQ ID NO: 69517, SEQ ID NO: 69540, SEQ ID NO: 69559, SEQ ID NO: 69571, SEQ ID NO: 69586, SEQ ID NO: 69589, SEQ ID NO: 69591, SEQ ID NO: 69619, SEQ ID NO: 69631, SEQ ID NO: 69633, SEQ ID NO: 69644, SEQ ID NO: 69649, SEQ ID NO: 69747, SEQ ID NO: 69764, SEQ ID NO: 69767, SEQ ID NO: 69790, SEQ ID NO: 69832, SEQ ID NO: 69836, SEQ ID NO: 69882, SEQ ID NO: 69999, SEQ ID NO: 70012, SEQ ID NO: 70036, SEQ ID NO: 70050, SEQ ID NO: 70066, SEQ ID NO: 70069, SEQ ID NO: 70109, SEQ ID NO: 70159, SEQ ID NO: 70165, SEQ ID NO: 70175, SEQ ID NO: 70177, SEQ ID NO: 70188, SEQ ID NO: 70284, SEQ ID NO: 70323, SEQ ID NO: 70326, SEQ ID NO: 70428, SEQ ID NO: 70455, SEQ ID NO: 70570, SEQ ID NO: 70606, SEQ ID NO: 70635, SEQ ID NO: 70676, SEQ ID NO: 70692, SEQ ID NO: 70716, SEQ ID NO: 70728, SEQ ID NO: 70735, SEQ ID NO: 70750, SEQ ID NO: 70764, SEQ ID NO: 70770, SEQ ID NO: 70806, SEQ ID NO: 70968, SEQ ID NO: 70997, SEQ ID NO: 71049, SEQ ID NO: 71075, SEQ ID NO: 71090, SEQ ID NO: 71117, SEQ ID NO: 71151, SEQ ID NO: 71176, SEQ ID NO: 71193, SEQ ID NO: 71203, SEQ ID NO: 71239, SEQ ID NO: 71247, SEQ ID NO: 71249, SEQ 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ID NO: 92918, SEQ ID NO: 92920, SEQ ID NO: 93004, SEQ ID NO: 93036, SEQ ID NO: 93042, SEQ ID NO: 93071, SEQ ID NO: 93089, SEQ ID NO: 93136, SEQ ID NO: 93180, SEQ ID NO: 93251, SEQ ID NO: 93325, SEQ ID NO: 93335, SEQ ID NO: 93344, SEQ ID NO: 93356, SEQ ID NO: 93382, SEQ ID NO: 93408, SEQ ID NO: 93420, SEQ ID NO: 93503, SEQ ID NO: 93537, SEQ ID NO: 93617, SEQ ID NO: 93658, SEQ ID NO: 93697, SEQ ID NO: 93710, SEQ ID NO: 93877, SEQ ID NO: 93885, SEQ ID NO: 93888, SEQ ID NO: 93893, SEQ ID NO: 93903, SEQ ID NO: 93912, SEQ ID NO: 93926, SEQ ID NO: 93933, SEQ ID NO: 93982, SEQ ID NO: 93987, SEQ ID NO: 94000, SEQ ID NO: 94054, SEQ ID NO: 94058, SEQ ID NO: 94087, SEQ ID NO: 94090, SEQ ID NO: 94102, SEQ ID NO: 94143, SEQ ID NO: 94269, SEQ ID NO: 94367, SEQ ID NO: 94465, SEQ ID NO: 94477, SEQ ID NO: 94525, SEQ ID NO: 94587 또는 SEQ ID NO: 95593 내지 113807와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, SSX2 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 162383 내지 162453를 포함한다. 일부 실시예에서, SSX2 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 162383 내지 162453와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, SSX2 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 162383 내지 166443를 포함한다. 일부 실시예에서, SSX2 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 162383 내지 166443와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, SSX2 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 162383 내지 162453를 포함한다. 일부 실시예에서, SSX2 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 162383 내지 162453와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, SSX2 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 162383 내지 166443를 포함한다. 일부 실시예에서, SSX2 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 162383 내지 166443와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PRAME 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 144109 내지 144188를 포함한다. 일부 실시예에서, PRAME 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 144109 내지 144188와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PRAME 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 144109 내지 162382를 포함한다. 일부 실시예에서, PRAME 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 144109 내지 162382와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PRAME 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 144109 내지 144188를 포함한다. 일부 실시예에서, PRAME 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 144109 내지 144188와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PRAME 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 144109 내지 162382를 포함한다. 일부 실시예에서, PRAME 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 144109 내지 162382와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KKLC1 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 37110 내지 37174를 포함한다. 일부 실시예에서, KKLC1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 37110 내지 37174와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KKLC1 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 37110 내지 41320를 포함한다. 일부 실시예에서, KKLC1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 37110 내지 41320와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KKLC1 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 37110 내지 37174를 포함한다. 일부 실시예에서, KKLC1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 37110 내지 37174와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KKLC1 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 37110 내지 41320를 포함한다. 일부 실시예에서, KKLC1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 37110 내지 41320와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PMEL 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 125134 내지 125218를 포함한다. 일부 실시예에서, PMEL 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 125134 내지 125218와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PMEL 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 125134 내지 144108를 포함한다. 일부 실시예에서, PMEL 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 125134 내지 144108와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PMEL 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 125134 내지 125218를 포함한다. 일부 실시예에서, PMEL 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 125134 내지 125218와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PMEL 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 125134 내지 144108를 포함한다. 일부 실시예에서, PMEL 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 125134 내지 144108와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TYRP1 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 166444 내지 166531를 포함한다. 일부 실시예에서, TYRP1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 166444 내지 166531와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TYRP1 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 166444 내지 182573를 포함한다. 일부 실시예에서, TYRP1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 166444 내지 182573와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TYRP1 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 166444 내지 166531를 포함한다. 일부 실시예에서, TYRP1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 166444 내지 166531와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TYRP1 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 166444 내지 182573를 포함한다. 일부 실시예에서, TYRP1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 166444 내지 182573와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TYRP2 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 166476, SEQ ID NO: 167118, SEQ ID NO: 169740, SEQ ID NO: 173412, SEQ ID NO: 179404, 및 SEQ ID NO: 182574 내지 182654를 포함한다. 일부 실시예에서, TYRP2 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 166476, SEQ ID NO: 167118, SEQ ID NO: 169740, SEQ ID NO: 173412, SEQ ID NO: 179404 또는 SEQ ID NO: 182574 내지 182654와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TYRP2 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 166476 내지 166477, SEQ ID NO: 166486, SEQ ID NO: 166513, SEQ ID NO: 166591, SEQ ID NO: 166606, SEQ ID NO: 166629, SEQ ID NO: 166641, SEQ ID NO: 166667, SEQ ID NO: 166678 내지 166679, SEQ ID NO: 166795, SEQ ID NO: 166799, SEQ ID NO: 166834, SEQ ID NO: 166854, SEQ ID NO: 166909, SEQ ID NO: 166912, SEQ ID NO: 166942, SEQ ID NO: 166991 내지 166992, SEQ ID NO: 167062, SEQ ID NO: 167067, SEQ ID NO: 167073 내지 167074, SEQ ID NO: 167106, SEQ ID NO: 167118, SEQ ID NO: 167151, SEQ ID NO: 167177, SEQ ID NO: 167241, SEQ ID NO: 167271, SEQ ID NO: 167395, SEQ ID NO: 167491, SEQ ID NO: 167505, SEQ ID NO: 167687, SEQ ID NO: 167736, SEQ ID NO: 167740, SEQ ID NO: 167743, SEQ ID NO: 167755, SEQ ID NO: 167810, SEQ ID NO: 167831, SEQ ID NO: 167837, SEQ ID NO: 167844, SEQ ID NO: 167847 내지 167848, SEQ ID NO: 167859, SEQ ID NO: 167880, SEQ ID NO: 167891, SEQ ID NO: 167897, SEQ ID NO: 167933, SEQ ID NO: 168094, SEQ ID NO: 168111 내지 168112, SEQ ID 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ID NO: 182471 또는 SEQ ID NO: 182574 내지 197896와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TYRP2 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 166476, SEQ ID NO: 167118, SEQ ID NO: 169740, SEQ ID NO: 173412, SEQ ID NO: 179404, 및 SEQ ID NO: 182574 내지 182654를 포함한다. 일부 실시예에서, TYRP2 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 166476, SEQ ID NO: 167118, SEQ ID NO: 169740, SEQ ID NO: 173412, SEQ ID NO: 179404 또는 SEQ ID NO: 182574 내지 182654와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TYRP2 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 166476 내지 166477, SEQ ID NO: 166486, SEQ ID NO: 166513, SEQ ID NO: 166591, SEQ ID NO: 166606, SEQ ID NO: 166629, SEQ ID NO: 166641, SEQ ID NO: 166667, SEQ ID NO: 166678 내지 166679, SEQ ID NO: 166795, SEQ ID NO: 166799, SEQ ID NO: 166834, SEQ ID NO: 166854, SEQ ID NO: 166909, SEQ ID NO: 166912, SEQ ID NO: 166942, SEQ ID NO: 166991 내지 166992, SEQ ID NO: 167062, SEQ ID NO: 167067, SEQ ID NO: 167073 내지 167074, SEQ ID NO: 167106, SEQ ID NO: 167118, SEQ ID NO: 167151, SEQ ID NO: 167177, SEQ ID NO: 167241, SEQ ID NO: 167271, SEQ ID NO: 167395, SEQ ID NO: 167491, SEQ ID NO: 167505, SEQ ID NO: 167687, SEQ ID NO: 167736, SEQ ID NO: 167740, SEQ ID NO: 167743, SEQ ID NO: 167755, SEQ ID NO: 167810, SEQ ID NO: 167831, SEQ ID NO: 167837, SEQ ID NO: 167844, SEQ ID NO: 167847 내지 167848, SEQ ID NO: 167859, SEQ ID NO: 167880, SEQ ID NO: 167891, SEQ ID NO: 167897, SEQ ID NO: 167933, SEQ ID NO: 168094, SEQ ID NO: 168111 내지 168112, SEQ ID 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ID NO: 182471 또는 SEQ ID NO: 182574 내지 197896와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAR1 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 113808 내지 113869를 포함한다. 일부 실시예에서, MAR1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 113808 내지 113869와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAR1 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 113808 내지 116477를 포함한다. 일부 실시예에서, MAR1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 113808 내지 116477와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAR1 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 113808 내지 113869를 포함한다. 일부 실시예에서, MAR1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 113808 내지 113869와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAR1 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 113808 내지 116477를 포함한다. 일부 실시예에서, MAR1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 113808 내지 116477와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
MHC 클래스 I 백신 펩티드의 추가 아미노산 서열은 서열 목록(SEQ ID NO: 760 내지 22727, SEQ ID NO: 28865 내지 34168, SEQ ID NO: 37175 내지 41320, SEQ ID NO: 41345, SEQ ID NO: 41347, SEQ ID NO: 41351 내지 41352, SEQ ID NO: 41366, SEQ ID NO: 41382, SEQ ID NO: 41392, SEQ ID NO: 41396, SEQ ID NO: 41398 내지 51433, SEQ ID NO: 51511 내지 60455, SEQ ID NO: 60528 내지 68237, SEQ ID NO: 68257, SEQ ID NO: 68288, SEQ ID NO: 68322 내지 95592, SEQ ID NO: 95665 내지 113807, SEQ ID NO: 113870 내지 116477, SEQ ID NO: 125219 내지 144108, SEQ ID NO: 144189 내지 162382, SEQ ID NO: 162454 내지 166443, SEQ ID NO: 166477, SEQ ID NO: 166486, SEQ ID NO: 166513, SEQ ID NO: 166532 내지 182573, 및 SEQ ID NO: 182655 내지 197896)에 제공된다. 일부 실시예에서, 본원(SEQ ID NO: 1 내지 474, SEQ ID NO: 760 내지 22727, SEQ ID NO: 28796 내지 34168, SEQ ID NO: 37110 내지 116477, 및 SEQ ID NO: 125134 내지 197896)에 개시된 MHC 클래스 I 펩티드의 임의의 조합을 사용하여 약 2개 내지 40개의 펩티드를 갖는 복합 펩티드 백신을 만들 수 있다. 일부 실시예에서, 복합 백신의 펩티드 중 임의의 하나(SEQ ID NO: 1 내지 474, SEQ ID NO: 760 내지 22727, SEQ ID NO: 28796 내지 34168, SEQ ID NO: 37110 내지 116477, 및 SEQ ID NO: 125134 내지 197896)는 임의의 SEQ ID NO: 1 내지 474, SEQ ID NO: 760 내지 22727, SEQ ID NO: 28796 내지 34168, SEQ ID NO: 37110 내지 116477 또는 SEQ ID NO: 125134 내지 197896와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
MHC 클래스 II 펩티드 서열
일부 실시예에서, 펩티드 백신(단일 표적 또는 복합 다중 표적 백신)은 약 1 내지 40개의 MHC 클래스 II 펩티드를 포함하며, 각 펩티드는 20개 이상의 아미노산으로 구성된다. 일부 실시예에서, MHC 클래스 II 펩티드 백신은 CTG1B, KKLC1, MAGA1, MAGA3, MAGA4, MAGC1, MAGC3, MAR1, PMEL, PRAME, SSX2, TYRP1 또는 TYRP2 단백질 표적 중 하나 이상을 대상으로 한다. 일부 실시예에서, MHC 클래스 II 펩티드 백신은 췌장암, 피부암, 갑상선암, 뇌암, 결장직장암, 기관지 및 폐암, 유방암 또는 난소암 적응증 중 하나 이상을 대상으로 한다.
일부 실시예에서, CTG1B 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 197897 내지 197910를 포함한다. 일부 실시예에서, CTG1B 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 197897 내지 197910와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, CTG1B 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 197897 내지 203516를 포함한다. 일부 실시예에서, CTG1B 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 197897 내지 203516와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, CTG1B 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 197897 내지 197910를 포함한다. 일부 실시예에서, CTG1B 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 197897 내지 197910와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, CTG1B 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 197897 내지 203516를 포함한다. 일부 실시예에서, CTG1B 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 197897 내지 203516와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAGA1 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 211901 내지 211917를 포함한다. 일부 실시예에서, MAGA1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 211901 내지 211917와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAGA1 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 211901 내지 223622를 포함한다. 일부 실시예에서, MAGA1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 211901 내지 223622와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAGA1 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 211901 내지 211917를 포함한다. 일부 실시예에서, MAGA1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 211901 내지 211917와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAGA1 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 211901 내지 223622를 포함한다. 일부 실시예에서, MAGA1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 211901 내지 223622와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAGA3 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 223623 내지 223640를 포함한다. 일부 실시예에서, MAGA3 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 223623 내지 223640와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAGA3 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 212187 내지 212190, SEQ ID NO: 212668 내지 212673, SEQ ID NO: 212836 내지 212837, SEQ ID NO: 213320 내지 213323, SEQ ID NO: 213359, SEQ ID NO: 213380 내지 213382, SEQ ID NO: 213391 내지 213395, SEQ ID NO: 213432, SEQ ID NO: 214285 내지 214290, SEQ ID NO: 215204 내지 215205, SEQ ID NO: 215677 내지 215682, SEQ ID NO: 216240, SEQ ID NO: 216385, SEQ ID NO: 216393, SEQ ID NO: 216397, SEQ ID NO: 217119 내지 217137, SEQ ID NO: 217185, SEQ ID NO: 217187, SEQ ID NO: 217190, SEQ ID NO: 217659 내지 217660, SEQ ID NO: 219238 내지 219245, SEQ ID NO: 219322 내지 219323, SEQ ID NO: 219380 내지 219386, SEQ ID NO: 219432 내지 219446, SEQ ID NO: 219545 내지 219546, SEQ ID NO: 219774, SEQ ID NO: 219777, SEQ ID NO: 220091, SEQ ID NO: 221996 내지 222005, SEQ ID NO: 223185, SEQ ID NO: 223187, SEQ ID NO: 223251, SEQ ID NO: 223253, SEQ ID NO: 223258, SEQ ID NO: 223261, SEQ ID NO: 223264, SEQ ID NO: 223268, SEQ ID NO: 223272, SEQ ID NO: 223274, SEQ ID NO: 223277, 및 SEQ ID NO: 223623 내지 236015를 포함한다. 일부 실시예에서, MAGA3 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 212187 내지 212190, SEQ ID NO: 212668 내지 212673, SEQ ID NO: 212836 내지 212837, SEQ ID NO: 213320 내지 213323, SEQ ID NO: 213359, SEQ ID NO: 213380 내지 213382, SEQ ID NO: 213391 내지 213395, SEQ ID NO: 213432, SEQ ID NO: 214285 내지 214290, SEQ ID NO: 215204 내지 215205, SEQ ID NO: 215677 내지 215682, SEQ ID NO: 216240, SEQ ID NO: 216385, SEQ ID NO: 216393, SEQ ID NO: 216397, SEQ ID NO: 217119 내지 217137, SEQ ID NO: 217185, SEQ ID NO: 217187, SEQ ID NO: 217190, SEQ ID NO: 217659 내지 217660, SEQ ID NO: 219238 내지 219245, SEQ ID NO: 219322 내지 219323, SEQ ID NO: 219380 내지 219386, SEQ ID NO: 219432 내지 219446, SEQ ID NO: 219545 내지 219546, SEQ ID NO: 219774, SEQ ID NO: 219777, SEQ ID NO: 220091, SEQ ID NO: 221996 내지 222005, SEQ ID NO: 223185, SEQ ID NO: 223187, SEQ ID NO: 223251, SEQ ID NO: 223253, SEQ ID NO: 223258, SEQ ID NO: 223261, SEQ ID NO: 223264, SEQ ID NO: 223268, SEQ ID NO: 223272, SEQ ID NO: 223274, SEQ ID NO: 223277 또는 SEQ ID NO: 223623 내지 236015와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAGA3 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 223623 내지 223640를 포함한다. 일부 실시예에서, MAGA3 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 223623 내지 223640와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAGA3 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 212187 내지 212190, SEQ ID NO: 212668 내지 212673, SEQ ID NO: 212836 내지 212837, SEQ ID NO: 213320 내지 213323, SEQ ID NO: 213359, SEQ ID NO: 213380 내지 213382, SEQ ID NO: 213391 내지 213395, SEQ ID NO: 213432, SEQ ID NO: 214285 내지 214290, SEQ ID NO: 215204 내지 215205, SEQ ID NO: 215677 내지 215682, SEQ ID NO: 216240, SEQ ID NO: 216385, SEQ ID NO: 216393, SEQ ID NO: 216397, SEQ ID NO: 217119 내지 217137, SEQ ID NO: 217185, SEQ ID NO: 217187, SEQ ID NO: 217190, SEQ ID NO: 217659 내지 217660, SEQ ID NO: 219238 내지 219245, SEQ ID NO: 219322 내지 219323, SEQ ID NO: 219380 내지 219386, SEQ ID NO: 219432 내지 219446, SEQ ID NO: 219545 내지 219546, SEQ ID NO: 219774, SEQ ID NO: 219777, SEQ ID NO: 220091, SEQ ID NO: 221996 내지 222005, SEQ ID NO: 223185, SEQ ID NO: 223187, SEQ ID NO: 223251, SEQ ID NO: 223253, SEQ ID NO: 223258, SEQ ID NO: 223261, SEQ ID NO: 223264, SEQ ID NO: 223268, SEQ ID NO: 223272, SEQ ID NO: 223274, SEQ ID NO: 223277, 및 SEQ ID NO: 223623 내지 236015를 포함한다. 일부 실시예에서, MAGA3 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 212187 내지 212190, SEQ ID NO: 212668 내지 212673, SEQ ID NO: 212836 내지 212837, SEQ ID NO: 213320 내지 213323, SEQ ID NO: 213359, SEQ ID NO: 213380 내지 213382, SEQ ID NO: 213391 내지 213395, SEQ ID NO: 213432, SEQ ID NO: 214285 내지 214290, SEQ ID NO: 215204 내지 215205, SEQ ID NO: 215677 내지 215682, SEQ ID NO: 216240, SEQ ID NO: 216385, SEQ ID NO: 216393, SEQ ID NO: 216397, SEQ ID NO: 217119 내지 217137, SEQ ID NO: 217185, SEQ ID NO: 217187, SEQ ID NO: 217190, SEQ ID NO: 217659 내지 217660, SEQ ID NO: 219238 내지 219245, SEQ ID NO: 219322 내지 219323, SEQ ID NO: 219380 내지 219386, SEQ ID NO: 219432 내지 219446, SEQ ID NO: 219545 내지 219546, SEQ ID NO: 219774, SEQ ID NO: 219777, SEQ ID NO: 220091, SEQ ID NO: 221996 내지 222005, SEQ ID NO: 223185, SEQ ID NO: 223187, SEQ ID NO: 223251, SEQ ID NO: 223253, SEQ ID NO: 223258, SEQ ID NO: 223261, SEQ ID NO: 223264, SEQ ID NO: 223268, SEQ ID NO: 223272, SEQ ID NO: 223274, SEQ ID NO: 223277 또는 SEQ ID NO: 223623 내지 236015와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAGA4 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 236016 내지 236033를 포함한다. 일부 실시예에서, MAGA4 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 236016 내지 236033와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAGA4 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 211911, SEQ ID NO: 212086 내지 212095, SEQ ID NO: 212435 내지 212440, SEQ ID NO: 212681 내지 212684, SEQ ID NO: 212858 내지 212860, SEQ ID NO: 213516 내지 213517, SEQ ID NO: 213529 내지 213531, SEQ ID NO: 213602 내지 213611, SEQ ID NO: 213719 내지 213720, SEQ ID NO: 213899, SEQ ID NO: 214004 내지 214012, SEQ ID NO: 214607, SEQ ID NO: 214647 내지 214649, SEQ ID NO: 214672 내지 214679, SEQ ID NO: 214774 내지 214775, SEQ ID NO: 214777, SEQ ID NO: 214779, SEQ ID NO: 214782, SEQ ID NO: 215373 내지 215415, SEQ ID NO: 215494, SEQ ID NO: 215497, SEQ ID NO: 215679, SEQ ID NO: 216244, SEQ ID NO: 216246, SEQ ID NO: 216383 내지 216401, SEQ ID NO: 217184 내지 217192, SEQ ID NO: 217200, SEQ ID NO: 217362, SEQ ID NO: 217708 내지 217712, SEQ ID NO: 217719, SEQ ID NO: 219238, SEQ ID NO: 219742 내지 219744, SEQ ID NO: 219747, SEQ ID NO: 219749, SEQ ID NO: 219751, SEQ ID NO: 219773 내지 219781, SEQ ID NO: 219994 내지 220030, SEQ ID NO: 220318 내지 220319, SEQ ID NO: 220327, SEQ ID NO: 220670, SEQ ID NO: 220815, SEQ ID NO: 220820, SEQ ID NO: 221197 내지 221234, SEQ ID NO: 221998, SEQ ID NO: 222000, SEQ ID NO: 223092, SEQ ID NO: 223095, SEQ ID NO: 223097, SEQ ID NO: 223099, SEQ ID NO: 223119, SEQ ID NO: 223121, SEQ ID NO: 223184 내지 223190, SEQ ID NO: 223250 내지 223283, SEQ ID NO: 223319, SEQ ID NO: 230922, SEQ ID NO: 232805 내지 232806, SEQ ID NO: 232846, 및 SEQ ID NO: 236016 내지 247058를 포함한다. 일부 실시예에서, MAGA4 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 211911, SEQ ID NO: 212086 내지 212095, SEQ ID NO: 212435 내지 212440, SEQ ID NO: 212681 내지 212684, SEQ ID NO: 212858 내지 212860, SEQ ID NO: 213516 내지 213517, SEQ ID NO: 213529 내지 213531, SEQ ID NO: 213602 내지 213611, SEQ ID NO: 213719 내지 213720, SEQ ID NO: 213899, SEQ ID NO: 214004 내지 214012, SEQ ID NO: 214607, SEQ ID NO: 214647 내지 214649, SEQ ID NO: 214672 내지 214679, SEQ ID NO: 214774 내지 214775, SEQ ID NO: 214777, SEQ ID NO: 214779, SEQ ID NO: 214782, SEQ ID NO: 215373 내지 215415, SEQ ID NO: 215494, SEQ ID NO: 215497, SEQ ID NO: 215679, SEQ ID NO: 216244, SEQ ID NO: 216246, SEQ ID NO: 216383 내지 216401, SEQ ID NO: 217184 내지 217192, SEQ ID NO: 217200, SEQ ID NO: 217362, SEQ ID NO: 217708 내지 217712, SEQ ID NO: 217719, SEQ ID NO: 219238, SEQ ID NO: 219742 내지 219744, SEQ ID NO: 219747, SEQ ID NO: 219749, SEQ ID NO: 219751, SEQ ID NO: 219773 내지 219781, SEQ ID NO: 219994 내지 220030, SEQ ID NO: 220318 내지 220319, SEQ ID NO: 220327, SEQ ID NO: 220670, SEQ ID NO: 220815, SEQ ID NO: 220820, SEQ ID NO: 221197 내지 221234, SEQ ID NO: 221998, SEQ ID NO: 222000, SEQ ID NO: 223092, SEQ ID NO: 223095, SEQ ID NO: 223097, SEQ ID NO: 223099, SEQ ID NO: 223119, SEQ ID NO: 223121, SEQ ID NO: 223184 내지 223190, SEQ ID NO: 223250 내지 223283, SEQ ID NO: 223319, SEQ ID NO: 230922, SEQ ID NO: 232805 내지 232806, SEQ ID NO: 232846 또는 SEQ ID NO: 236016 내지 247058와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAGA4 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 236016 내지 236033를 포함한다. 일부 실시예에서, MAGA4 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 236016 내지 236033와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAGA4 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 211911, SEQ ID NO: 212086 내지 212095, SEQ ID NO: 212435 내지 212440, SEQ ID NO: 212681 내지 212684, SEQ ID NO: 212858 내지 212860, SEQ ID NO: 213516 내지 213517, SEQ ID NO: 213529 내지 213531, SEQ ID NO: 213602 내지 213611, SEQ ID NO: 213719 내지 213720, SEQ ID NO: 213899, SEQ ID NO: 214004 내지 214012, SEQ ID NO: 214607, SEQ ID NO: 214647 내지 214649, SEQ ID NO: 214672 내지 214679, SEQ ID NO: 214774 내지 214775, SEQ ID NO: 214777, SEQ ID NO: 214779, SEQ ID NO: 214782, SEQ ID NO: 215373 내지 215415, SEQ ID NO: 215494, SEQ ID NO: 215497, SEQ ID NO: 215679, SEQ ID NO: 216244, SEQ ID NO: 216246, SEQ ID NO: 216383 내지 216401, SEQ ID NO: 217184 내지 217192, SEQ ID NO: 217200, SEQ ID NO: 217362, SEQ ID NO: 217708 내지 217712, SEQ ID NO: 217719, SEQ ID NO: 219238, SEQ ID NO: 219742 내지 219744, SEQ ID NO: 219747, SEQ ID NO: 219749, SEQ ID NO: 219751, SEQ ID NO: 219773 내지 219781, SEQ ID NO: 219994 내지 220030, SEQ ID NO: 220318 내지 220319, SEQ ID NO: 220327, SEQ ID NO: 220670, SEQ ID NO: 220815, SEQ ID NO: 220820, SEQ ID NO: 221197 내지 221234, SEQ ID NO: 221998, SEQ ID NO: 222000, SEQ ID NO: 223092, SEQ ID NO: 223095, SEQ ID NO: 223097, SEQ ID NO: 223099, SEQ ID NO: 223119, SEQ ID NO: 223121, SEQ ID NO: 223184 내지 223190, SEQ ID NO: 223250 내지 223283, SEQ ID NO: 223319, SEQ ID NO: 230922, SEQ ID NO: 232805 내지 232806, SEQ ID NO: 232846, 및 SEQ ID NO: 236016 내지 247058를 포함한다. 일부 실시예에서, MAGA4 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 211911, SEQ ID NO: 212086 내지 212095, SEQ ID NO: 212435 내지 212440, SEQ ID NO: 212681 내지 212684, SEQ ID NO: 212858 내지 212860, SEQ ID NO: 213516 내지 213517, SEQ ID NO: 213529 내지 213531, SEQ ID NO: 213602 내지 213611, SEQ ID NO: 213719 내지 213720, SEQ ID NO: 213899, SEQ ID NO: 214004 내지 214012, SEQ ID NO: 214607, SEQ ID NO: 214647 내지 214649, SEQ ID NO: 214672 내지 214679, SEQ ID NO: 214774 내지 214775, SEQ ID NO: 214777, SEQ ID NO: 214779, SEQ ID NO: 214782, SEQ ID NO: 215373 내지 215415, SEQ ID NO: 215494, SEQ ID NO: 215497, SEQ ID NO: 215679, SEQ ID NO: 216244, SEQ ID NO: 216246, SEQ ID NO: 216383 내지 216401, SEQ ID NO: 217184 내지 217192, SEQ ID NO: 217200, SEQ ID NO: 217362, SEQ ID NO: 217708 내지 217712, SEQ ID NO: 217719, SEQ ID NO: 219238, SEQ ID NO: 219742 내지 219744, SEQ ID NO: 219747, SEQ ID NO: 219749, SEQ ID NO: 219751, SEQ ID NO: 219773 내지 219781, SEQ ID NO: 219994 내지 220030, SEQ ID NO: 220318 내지 220319, SEQ ID NO: 220327, SEQ ID NO: 220670, SEQ ID NO: 220815, SEQ ID NO: 220820, SEQ ID NO: 221197 내지 221234, SEQ ID NO: 221998, SEQ ID NO: 222000, SEQ ID NO: 223092, SEQ ID NO: 223095, SEQ ID NO: 223097, SEQ ID NO: 223099, SEQ ID NO: 223119, SEQ ID NO: 223121, SEQ ID NO: 223184 내지 223190, SEQ ID NO: 223250 내지 223283, SEQ ID NO: 223319, SEQ ID NO: 230922, SEQ ID NO: 232805 내지 232806, SEQ ID NO: 232846 또는 SEQ ID NO: 236016 내지 247058와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAGC1 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 247059 내지 247093를 포함한다. 일부 실시예에서, MAGC1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 247059 내지 247093와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAGC1 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 247059 내지 281349를 포함한다. 일부 실시예에서, MAGC1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 247059 내지 281349와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAGC1 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 247059 내지 247093를 포함한다. 일부 실시예에서, MAGC1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 247059 내지 247093와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAGC1 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 247059 내지 281349를 포함한다. 일부 실시예에서, MAGC1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 247059 내지 281349와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAGC3 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 281350 내지 281378를 포함한다. 일부 실시예에서, MAGC3 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 281350 내지 281378와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAGC3 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 217120, SEQ ID NO: 247270, SEQ ID NO: 248009, SEQ ID NO: 248159 내지 248160, SEQ ID NO: 248735 내지 248738, SEQ ID NO: 249358 내지 249362, SEQ ID NO: 249690 내지 249691, SEQ ID NO: 252562 내지 252564, SEQ ID NO: 252836 내지 252837, SEQ ID NO: 256214, SEQ ID NO: 256221, SEQ ID NO: 256226, SEQ ID NO: 256229, SEQ ID NO: 256235, SEQ ID NO: 256705, SEQ ID NO: 257337, SEQ ID NO: 257341, SEQ ID NO: 257345, SEQ ID NO: 257995, SEQ ID NO: 258292, SEQ ID NO: 258295, SEQ ID NO: 258614 내지 258616, SEQ ID NO: 259467, SEQ ID NO: 259471, SEQ ID NO: 259474, SEQ ID NO: 260118, SEQ ID NO: 260122, SEQ ID NO: 260126, SEQ ID NO: 260131, SEQ ID NO: 260138, SEQ ID NO: 260145, SEQ ID NO: 260153, SEQ ID NO: 260367 내지 260384, SEQ ID NO: 260407, SEQ ID NO: 260412, SEQ ID NO: 261788, SEQ ID NO: 261790, SEQ ID NO: 261792 내지 261793, SEQ ID NO: 261795, SEQ ID NO: 261798, SEQ ID NO: 261800, SEQ ID NO: 261803, SEQ ID NO: 261805, SEQ ID NO: 261809, SEQ ID NO: 261811, SEQ ID NO: 261814, SEQ ID NO: 261816, SEQ ID NO: 261821, SEQ ID NO: 261823, SEQ ID NO: 261830, SEQ ID NO: 261832, SEQ ID NO: 261837, SEQ ID NO: 261839, SEQ ID NO: 262119, SEQ ID NO: 262122, SEQ ID NO: 262261 내지 262285, SEQ ID NO: 262313, SEQ ID NO: 262318, SEQ ID NO: 263471 내지 263474, SEQ ID NO: 263494, SEQ ID NO: 263498, SEQ ID NO: 266653 내지 266654, SEQ ID NO: 269139, SEQ ID NO: 269143, SEQ ID NO: 269149, SEQ ID NO: 269156, SEQ ID NO: 269169, SEQ ID NO: 270516 내지 270517, SEQ ID NO: 270519 내지 270520, SEQ ID NO: 270523 내지 270524, SEQ ID NO: 270527 내지 270528, SEQ ID NO: 272016, SEQ ID NO: 272020, SEQ ID NO: 272214 내지 272222, SEQ ID NO: 272243, SEQ ID NO: 272248, SEQ ID NO: 272896, SEQ ID NO: 273018 내지 273020, SEQ ID NO: 278350 내지 278351, SEQ ID NO: 278355, SEQ ID NO: 278358 내지 278359, SEQ ID NO: 278361 내지 278362, SEQ ID NO: 278364, SEQ ID NO: 278367, SEQ ID NO: 278369, SEQ ID NO: 278371, SEQ ID NO: 278373, SEQ ID NO: 278375, SEQ ID NO: 278377, SEQ ID NO: 278383, SEQ ID NO: 278385, SEQ ID NO: 278388, SEQ ID NO: 278390, SEQ ID NO: 278394, SEQ ID NO: 278396, SEQ ID NO: 281013 내지 281014, SEQ ID NO: 281018, SEQ ID NO: 281022, SEQ ID NO: 281026, SEQ ID NO: 281031, SEQ ID NO: 281037 내지 281038, SEQ ID NO: 281044 내지 281045, SEQ ID NO: 281052 내지 281053, SEQ ID NO: 281151 내지 281152, SEQ ID NO: 281155, SEQ ID NO: 281159, SEQ ID NO: 281162 내지 281163, SEQ ID NO: 281165 내지 281166, SEQ ID NO: 281169, SEQ ID NO: 281171, SEQ ID NO: 281174, SEQ ID NO: 281176, SEQ ID NO: 281179, SEQ ID NO: 281181, SEQ ID NO: 281184, SEQ ID NO: 281186, SEQ ID NO: 281190, SEQ ID NO: 281192, SEQ ID NO: 281197, SEQ ID NO: 281199, 및 SEQ ID NO: 281350 내지 305565를 포함한다. 일부 실시예에서, MAGC3 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 217120, SEQ ID NO: 247270, SEQ ID NO: 248009, SEQ ID NO: 248159 내지 248160, SEQ ID NO: 248735 내지 248738, SEQ ID NO: 249358 내지 249362, SEQ ID NO: 249690 내지 249691, SEQ ID NO: 252562 내지 252564, SEQ ID NO: 252836 내지 252837, SEQ ID NO: 256214, SEQ ID NO: 256221, SEQ ID NO: 256226, SEQ ID NO: 256229, SEQ ID NO: 256235, SEQ ID NO: 256705, SEQ ID NO: 257337, SEQ ID NO: 257341, SEQ ID NO: 257345, SEQ ID NO: 257995, SEQ ID NO: 258292, SEQ ID NO: 258295, SEQ ID NO: 258614 내지 258616, SEQ ID NO: 259467, SEQ ID NO: 259471, SEQ ID NO: 259474, SEQ ID NO: 260118, SEQ ID NO: 260122, SEQ ID NO: 260126, SEQ ID NO: 260131, SEQ ID NO: 260138, SEQ ID NO: 260145, SEQ ID NO: 260153, SEQ ID NO: 260367 내지 260384, SEQ ID NO: 260407, SEQ ID NO: 260412, SEQ ID NO: 261788, SEQ ID NO: 261790, SEQ ID NO: 261792 내지 261793, SEQ ID NO: 261795, SEQ ID NO: 261798, SEQ ID NO: 261800, SEQ ID NO: 261803, SEQ ID NO: 261805, SEQ ID NO: 261809, SEQ ID NO: 261811, SEQ ID NO: 261814, SEQ ID NO: 261816, SEQ ID NO: 261821, SEQ ID NO: 261823, SEQ ID NO: 261830, SEQ ID NO: 261832, SEQ ID NO: 261837, SEQ ID NO: 261839, SEQ ID NO: 262119, SEQ ID NO: 262122, SEQ ID NO: 262261 내지 262285, SEQ ID NO: 262313, SEQ ID NO: 262318, SEQ ID NO: 263471 내지 263474, SEQ ID NO: 263494, SEQ ID NO: 263498, SEQ ID NO: 266653 내지 266654, SEQ ID NO: 269139, SEQ ID NO: 269143, SEQ ID NO: 269149, SEQ ID NO: 269156, SEQ ID NO: 269169, SEQ ID NO: 270516 내지 270517, SEQ ID NO: 270519 내지 270520, SEQ ID NO: 270523 내지 270524, SEQ ID NO: 270527 내지 270528, SEQ ID NO: 272016, SEQ ID NO: 272020, SEQ ID NO: 272214 내지 272222, SEQ ID NO: 272243, SEQ ID NO: 272248, SEQ ID NO: 272896, SEQ ID NO: 273018 내지 273020, SEQ ID NO: 278350 내지 278351, SEQ ID NO: 278355, SEQ ID NO: 278358 내지 278359, SEQ ID NO: 278361 내지 278362, SEQ ID NO: 278364, SEQ ID NO: 278367, SEQ ID NO: 278369, SEQ ID NO: 278371, SEQ ID NO: 278373, SEQ ID NO: 278375, SEQ ID NO: 278377, SEQ ID NO: 278383, SEQ ID NO: 278385, SEQ ID NO: 278388, SEQ ID NO: 278390, SEQ ID NO: 278394, SEQ ID NO: 278396, SEQ ID NO: 281013 내지 281014, SEQ ID NO: 281018, SEQ ID NO: 281022, SEQ ID NO: 281026, SEQ ID NO: 281031, SEQ ID NO: 281037 내지 281038, SEQ ID NO: 281044 내지 281045, SEQ ID NO: 281052 내지 281053, SEQ ID NO: 281151 내지 281152, SEQ ID NO: 281155, SEQ ID NO: 281159, SEQ ID NO: 281162 내지 281163, SEQ ID NO: 281165 내지 281166, SEQ ID NO: 281169, SEQ ID NO: 281171, SEQ ID NO: 281174, SEQ ID NO: 281176, SEQ ID NO: 281179, SEQ ID NO: 281181, SEQ ID NO: 281184, SEQ ID NO: 281186, SEQ ID NO: 281190, SEQ ID NO: 281192, SEQ ID NO: 281197, SEQ ID NO: 281199 또는 SEQ ID NO: 281350 내지 305565와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAGC3 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 281350 내지 281378를 포함한다. 일부 실시예에서, MAGC3 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 281350 내지 281378와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAGC3 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 217120, SEQ ID NO: 247270, SEQ ID NO: 248009, SEQ ID NO: 248159 내지 248160, SEQ ID NO: 248735 내지 248738, SEQ ID NO: 249358 내지 249362, SEQ ID NO: 249690 내지 249691, SEQ ID NO: 252562 내지 252564, SEQ ID NO: 252836 내지 252837, SEQ ID NO: 256214, SEQ ID NO: 256221, SEQ ID NO: 256226, SEQ ID NO: 256229, SEQ ID NO: 256235, SEQ ID NO: 256705, SEQ ID NO: 257337, SEQ ID NO: 257341, SEQ ID NO: 257345, SEQ ID NO: 257995, SEQ ID NO: 258292, SEQ ID NO: 258295, SEQ ID NO: 258614 내지 258616, SEQ ID NO: 259467, SEQ ID NO: 259471, SEQ ID NO: 259474, SEQ ID NO: 260118, SEQ ID NO: 260122, SEQ ID NO: 260126, SEQ ID NO: 260131, SEQ ID NO: 260138, SEQ ID NO: 260145, SEQ ID NO: 260153, SEQ ID NO: 260367 내지 260384, SEQ ID NO: 260407, SEQ ID NO: 260412, SEQ ID NO: 261788, SEQ ID NO: 261790, SEQ ID NO: 261792 내지 261793, SEQ ID NO: 261795, SEQ ID NO: 261798, SEQ ID NO: 261800, SEQ ID NO: 261803, SEQ ID NO: 261805, SEQ ID NO: 261809, SEQ ID NO: 261811, SEQ ID NO: 261814, SEQ ID NO: 261816, SEQ ID NO: 261821, SEQ ID NO: 261823, SEQ ID NO: 261830, SEQ ID NO: 261832, SEQ ID NO: 261837, SEQ ID NO: 261839, SEQ ID NO: 262119, SEQ ID NO: 262122, SEQ ID NO: 262261 내지 262285, SEQ ID NO: 262313, SEQ ID NO: 262318, SEQ ID NO: 263471 내지 263474, SEQ ID NO: 263494, SEQ ID NO: 263498, SEQ ID NO: 266653 내지 266654, SEQ ID NO: 269139, SEQ ID NO: 269143, SEQ ID NO: 269149, SEQ ID NO: 269156, SEQ ID NO: 269169, SEQ ID NO: 270516 내지 270517, SEQ ID NO: 270519 내지 270520, SEQ ID NO: 270523 내지 270524, SEQ ID NO: 270527 내지 270528, SEQ ID NO: 272016, SEQ ID NO: 272020, SEQ ID NO: 272214 내지 272222, SEQ ID NO: 272243, SEQ ID NO: 272248, SEQ ID NO: 272896, SEQ ID NO: 273018 내지 273020, SEQ ID NO: 278350 내지 278351, SEQ ID NO: 278355, SEQ ID NO: 278358 내지 278359, SEQ ID NO: 278361 내지 278362, SEQ ID NO: 278364, SEQ ID NO: 278367, SEQ ID NO: 278369, SEQ ID NO: 278371, SEQ ID NO: 278373, SEQ ID NO: 278375, SEQ ID NO: 278377, SEQ ID NO: 278383, SEQ ID NO: 278385, SEQ ID NO: 278388, SEQ ID NO: 278390, SEQ ID NO: 278394, SEQ ID NO: 278396, SEQ ID NO: 281013 내지 281014, SEQ ID NO: 281018, SEQ ID NO: 281022, SEQ ID NO: 281026, SEQ ID NO: 281031, SEQ ID NO: 281037 내지 281038, SEQ ID NO: 281044 내지 281045, SEQ ID NO: 281052 내지 281053, SEQ ID NO: 281151 내지 281152, SEQ ID NO: 281155, SEQ ID NO: 281159, SEQ ID NO: 281162 내지 281163, SEQ ID NO: 281165 내지 281166, SEQ ID NO: 281169, SEQ ID NO: 281171, SEQ ID NO: 281174, SEQ ID NO: 281176, SEQ ID NO: 281179, SEQ ID NO: 281181, SEQ ID NO: 281184, SEQ ID NO: 281186, SEQ ID NO: 281190, SEQ ID NO: 281192, SEQ ID NO: 281197, SEQ ID NO: 281199, 및 SEQ ID NO: 281350 내지 305565를 포함한다. 일부 실시예에서, MAGC3 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 217120, SEQ ID NO: 247270, SEQ ID NO: 248009, SEQ ID NO: 248159 내지 248160, SEQ ID NO: 248735 내지 248738, SEQ ID NO: 249358 내지 249362, SEQ ID NO: 249690 내지 249691, SEQ ID NO: 252562 내지 252564, SEQ ID NO: 252836 내지 252837, SEQ ID NO: 256214, SEQ ID NO: 256221, SEQ ID NO: 256226, SEQ ID NO: 256229, SEQ ID NO: 256235, SEQ ID NO: 256705, SEQ ID NO: 257337, SEQ ID NO: 257341, SEQ ID NO: 257345, SEQ ID NO: 257995, SEQ ID NO: 258292, SEQ ID NO: 258295, SEQ ID NO: 258614 내지 258616, SEQ ID NO: 259467, SEQ ID NO: 259471, SEQ ID NO: 259474, SEQ ID NO: 260118, SEQ ID NO: 260122, SEQ ID NO: 260126, SEQ ID NO: 260131, SEQ ID NO: 260138, SEQ ID NO: 260145, SEQ ID NO: 260153, SEQ ID NO: 260367 내지 260384, SEQ ID NO: 260407, SEQ ID NO: 260412, SEQ ID NO: 261788, SEQ ID NO: 261790, SEQ ID NO: 261792 내지 261793, SEQ ID NO: 261795, SEQ ID NO: 261798, SEQ ID NO: 261800, SEQ ID NO: 261803, SEQ ID NO: 261805, SEQ ID NO: 261809, SEQ ID NO: 261811, SEQ ID NO: 261814, SEQ ID NO: 261816, SEQ ID NO: 261821, SEQ ID NO: 261823, SEQ ID NO: 261830, SEQ ID NO: 261832, SEQ ID NO: 261837, SEQ ID NO: 261839, SEQ ID NO: 262119, SEQ ID NO: 262122, SEQ ID NO: 262261 내지 262285, SEQ ID NO: 262313, SEQ ID NO: 262318, SEQ ID NO: 263471 내지 263474, SEQ ID NO: 263494, SEQ ID NO: 263498, SEQ ID NO: 266653 내지 266654, SEQ ID NO: 269139, SEQ ID NO: 269143, SEQ ID NO: 269149, SEQ ID NO: 269156, SEQ ID NO: 269169, SEQ ID NO: 270516 내지 270517, SEQ ID NO: 270519 내지 270520, SEQ ID NO: 270523 내지 270524, SEQ ID NO: 270527 내지 270528, SEQ ID NO: 272016, SEQ ID NO: 272020, SEQ ID NO: 272214 내지 272222, SEQ ID NO: 272243, SEQ ID NO: 272248, SEQ ID NO: 272896, SEQ ID NO: 273018 내지 273020, SEQ ID NO: 278350 내지 278351, SEQ ID NO: 278355, SEQ ID NO: 278358 내지 278359, SEQ ID NO: 278361 내지 278362, SEQ ID NO: 278364, SEQ ID NO: 278367, SEQ ID NO: 278369, SEQ ID NO: 278371, SEQ ID NO: 278373, SEQ ID NO: 278375, SEQ ID NO: 278377, SEQ ID NO: 278383, SEQ ID NO: 278385, SEQ ID NO: 278388, SEQ ID NO: 278390, SEQ ID NO: 278394, SEQ ID NO: 278396, SEQ ID NO: 281013 내지 281014, SEQ ID NO: 281018, SEQ ID NO: 281022, SEQ ID NO: 281026, SEQ ID NO: 281031, SEQ ID NO: 281037 내지 281038, SEQ ID NO: 281044 내지 281045, SEQ ID NO: 281052 내지 281053, SEQ ID NO: 281151 내지 281152, SEQ ID NO: 281155, SEQ ID NO: 281159, SEQ ID NO: 281162 내지 281163, SEQ ID NO: 281165 내지 281166, SEQ ID NO: 281169, SEQ ID NO: 281171, SEQ ID NO: 281174, SEQ ID NO: 281176, SEQ ID NO: 281179, SEQ ID NO: 281181, SEQ ID NO: 281184, SEQ ID NO: 281186, SEQ ID NO: 281190, SEQ ID NO: 281192, SEQ ID NO: 281197, SEQ ID NO: 281199 또는 SEQ ID NO: 281350 내지 305565와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, SSX2 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 369027 내지 369036를 포함한다. 일부 실시예에서, SSX2 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 369027 내지 369036와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, SSX2 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 369027 내지 373347를 포함한다. 일부 실시예에서, SSX2 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 369027 내지 373347와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, SSX2 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 369027 내지 369036를 포함한다. 일부 실시예에서, SSX2 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 369027 내지 369036와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, SSX2 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 369027 내지 373347를 포함한다. 일부 실시예에서, SSX2 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 369027 내지 373347와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PRAME 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 342521 내지 342555를 포함한다. 일부 실시예에서, PRAME 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 342521 내지 342555와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PRAME 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 342521 내지 369026를 포함한다. 일부 실시예에서, PRAME 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 342521 내지 369026와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PRAME 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 342521 내지 342555를 포함한다. 일부 실시예에서, PRAME 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 342521 내지 342555와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PRAME 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 342521 내지 369026를 포함한다. 일부 실시예에서, PRAME 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 342521 내지 369026와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KKLC1 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 206663 내지 206675를 포함한다. 일부 실시예에서, KKLC1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 206663 내지 206675와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KKLC1 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 206663 내지 211900를 포함한다. 일부 실시예에서, KKLC1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 206663 내지 211900와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KKLC1 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 206663 내지 206675를 포함한다. 일부 실시예에서, KKLC1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 206663 내지 206675와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, KKLC1 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 206663 내지 211900를 포함한다. 일부 실시예에서, KKLC1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 206663 내지 211900와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PMEL 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 317360 내지 317390를 포함한다. 일부 실시예에서, PMEL 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 317360 내지 317390와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PMEL 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 317360 내지 342520를 포함한다. 일부 실시예에서, PMEL 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 317360 내지 342520와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PMEL 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 317360 내지 317390를 포함한다. 일부 실시예에서, PMEL 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 317360 내지 317390와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, PMEL 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 317360 내지 342520를 포함한다. 일부 실시예에서, PMEL 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 317360 내지 342520와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TYRP1 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 373348 내지 373373를 포함한다. 일부 실시예에서, TYRP1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 373348 내지 373373와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TYRP1 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 373348 내지 392433를 포함한다. 일부 실시예에서, TYRP1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 373348 내지 392433와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TYRP1 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 373348 내지 373373를 포함한다. 일부 실시예에서, TYRP1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 373348 내지 373373와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TYRP1 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 373348 내지 392433를 포함한다. 일부 실시예에서, TYRP1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 373348 내지 392433와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TYRP2 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 392434 내지 392455를 포함한다. 일부 실시예에서, TYRP2 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 392434 내지 392455와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TYRP2 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 379327, SEQ ID NO: 379329, SEQ ID NO: 379332, SEQ ID NO: 379334, SEQ ID NO: 379770, SEQ ID NO: 381531, SEQ ID NO: 382109, SEQ ID NO: 383301, SEQ ID NO: 383305, SEQ ID NO: 383310, SEQ ID NO: 386111, SEQ ID NO: 387057, SEQ ID NO: 387062, 및 SEQ ID NO: 392434 내지 410309를 포함한다. 일부 실시예에서, TYRP2 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 379327, SEQ ID NO: 379329, SEQ ID NO: 379332, SEQ ID NO: 379334, SEQ ID NO: 379770, SEQ ID NO: 381531, SEQ ID NO: 382109, SEQ ID NO: 383301, SEQ ID NO: 383305, SEQ ID NO: 383310, SEQ ID NO: 386111, SEQ ID NO: 387057, SEQ ID NO: 387062 또는 SEQ ID NO: 392434 내지 410309와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TYRP2 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 392434 내지 392455를 포함한다. 일부 실시예에서, TYRP2 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 392434 내지 392455와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, TYRP2 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 379327, SEQ ID NO: 379329, SEQ ID NO: 379332, SEQ ID NO: 379334, SEQ ID NO: 379770, SEQ ID NO: 381531, SEQ ID NO: 382109, SEQ ID NO: 383301, SEQ ID NO: 383305, SEQ ID NO: 383310, SEQ ID NO: 386111, SEQ ID NO: 387057, SEQ ID NO: 387062, 및 SEQ ID NO: 392434 내지 410309를 포함한다. 일부 실시예에서, TYRP2 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 379327, SEQ ID NO: 379329, SEQ ID NO: 379332, SEQ ID NO: 379334, SEQ ID NO: 379770, SEQ ID NO: 381531, SEQ ID NO: 382109, SEQ ID NO: 383301, SEQ ID NO: 383305, SEQ ID NO: 383310, SEQ ID NO: 386111, SEQ ID NO: 387057, SEQ ID NO: 387062 또는 SEQ ID NO: 392434 내지 410309와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAR1 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 305566 내지 305571를 포함한다. 일부 실시예에서, MAR1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 305566 내지 305571와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAR1 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 305566 내지 307669를 포함한다. 일부 실시예에서, MAR1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 305566 내지 307669와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAR1 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 305566 내지 305571를 포함한다. 일부 실시예에서, MAR1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 305566 내지 305571와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MAR1 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 305566 내지 307669를 포함한다. 일부 실시예에서, MAR1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 305566 내지 307669와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
MHC 클래스 II 백신 펩티드의 추가 아미노산 서열은 서열 목록(SEQ ID NO: 22728 내지 28795, SEQ ID NO: 197911 내지 203516, SEQ ID NO: 206676 내지 211900, SEQ ID NO: 211911, SEQ ID NO: 211918 내지 223622, SEQ ID NO: 223641 내지 236015, SEQ ID NO: 236034 내지 247058, SEQ ID NO: 247094 내지 281349, SEQ ID NO: 281379 내지 305565, SEQ ID NO: 305572 내지 307669, SEQ ID NO: 317391 내지 342520, SEQ ID NO: 342556 내지 369026, SEQ ID NO: 369037 내지 373347, SEQ ID NO: 373374 내지 392433, 및 SEQ ID NO: 392456 내지 410309)에 제공된다. 일부 실시예에서, 본원(SEQ ID NO: 475 내지 759, SEQ ID NO: 22728 내지 28795, SEQ ID NO: 197897 내지 203516, SEQ ID NO: 206663 내지 307669, 및 SEQ ID NO: 317360 내지 410309)에 개시된 MHC 클래스 II 펩티드의 임의의 조합을 사용하여 약 2개 내지 40개의 펩티드를 갖는 복합 펩티드 백신을 만들 수 있다. 일부 실시예에서, 복합 백신의 펩티드 중 임의의 하나(SEQ ID NO: 475 내지 759, SEQ ID NO: 22728 내지 28795, SEQ ID NO: 197897 내지 203516, SEQ ID NO: 206663 내지 307669, 및 SEQ ID NO: 317360 내지 410309)는 임의의 SEQ ID NO: 475 내지 759, SEQ ID NO: 22728 내지 28795, SEQ ID NO: 197897 내지 203516, SEQ ID NO: 206663 내지 307669 또는 SEQ ID NO: 317360 내지 410309와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 CTG1B 단백질에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, CTG1B 단백질에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 28796 내지 34168 및 SEQ ID NO: 197897 내지 203516 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, CTG1B 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 28796 내지 34168 또는 SEQ ID NO: 197897 내지 203516와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 MAGA1 단백질에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, MAGA1 단백질에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 41321 내지 51433 및 SEQ ID NO: 211901 내지 223622 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, MAGA1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 41321 내지 51433 또는 SEQ ID NO: 211901 내지 223622와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 MAGA3 단백질에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, MAGA3 단백질에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 41351 내지 41352, SEQ ID NO: 41383, SEQ ID NO: 41396, SEQ ID NO: 41410, SEQ ID NO: 41414, SEQ ID NO: 41435, SEQ ID NO: 41450, SEQ ID NO: 41463, SEQ ID NO: 41478, SEQ ID NO: 41489, SEQ ID NO: 41495, SEQ ID NO: 41503, SEQ ID NO: 41513, SEQ ID NO: 41520, SEQ ID NO: 41535, SEQ ID NO: 41541, SEQ ID NO: 41545, SEQ ID NO: 41577, SEQ ID NO: 41588, SEQ ID NO: 41598, SEQ ID NO: 41605, SEQ ID NO: 41617, SEQ ID NO: 41620, SEQ ID NO: 41622, SEQ ID NO: 41627, SEQ ID NO: 41630, SEQ ID NO: 41638, SEQ ID NO: 41647, SEQ ID NO: 41673, SEQ ID NO: 41696, SEQ ID NO: 41703, SEQ ID NO: 41708, SEQ ID NO: 41728, SEQ ID NO: 41732 내지 41733, SEQ ID NO: 41749, SEQ ID NO: 41760, SEQ ID NO: 41766, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 41788, SEQ ID NO: 41791, SEQ ID NO: 41809, SEQ ID NO: 41813, SEQ ID NO: 41817, SEQ ID NO: 41829, SEQ ID NO: 41847 내지 41848, SEQ ID NO: 41853, SEQ ID NO: 41859, SEQ ID NO: 41889, SEQ ID NO: 41894, SEQ ID NO: 41897, SEQ ID NO: 41909, SEQ ID NO: 41923, SEQ ID NO: 41934, SEQ ID NO: 41939, SEQ ID NO: 41953 내지 41954, SEQ ID NO: 41959, SEQ ID NO: 41967, SEQ ID NO: 41970, SEQ ID NO: 41976, SEQ ID NO: 41984 내지 41985, SEQ ID NO: 42007, SEQ ID NO: 42017, SEQ ID NO: 42034, SEQ ID NO: 42044, SEQ ID NO: 42046, SEQ ID NO: 42048, SEQ ID NO: 42056, SEQ ID NO: 42067, SEQ ID NO: 42080, SEQ ID NO: 42088, SEQ ID NO: 42091, SEQ ID NO: 42119 내지 42120, SEQ ID NO: 42129, SEQ ID NO: 42135, SEQ ID NO: 42140 내지 42141, SEQ ID NO: 42155, SEQ ID NO: 42158, SEQ ID NO: 42164, SEQ ID NO: 42170, SEQ ID NO: 42174, SEQ ID NO: 42186, SEQ ID NO: 42209, SEQ ID NO: 42218, SEQ ID NO: 42224, SEQ ID NO: 42229, SEQ ID NO: 42232, SEQ ID NO: 42235, SEQ ID NO: 42237 내지 42238, SEQ ID NO: 42265, SEQ ID NO: 42272, SEQ ID NO: 42278, SEQ ID NO: 42293, SEQ ID NO: 42314, SEQ ID NO: 42336 내지 42337, SEQ ID NO: 42339, SEQ ID NO: 42372 내지 42373, SEQ ID NO: 42376, SEQ ID NO: 42382, SEQ ID NO: 42386, SEQ ID NO: 42408, SEQ ID NO: 42414, SEQ ID NO: 42423, SEQ ID NO: 42429, SEQ ID NO: 42447 내지 42448, SEQ ID NO: 42461, SEQ ID NO: 42466, SEQ ID NO: 42475, SEQ ID NO: 42513, SEQ ID NO: 42540, SEQ ID NO: 42545, SEQ ID NO: 42550, SEQ ID NO: 42553, SEQ ID NO: 42567 내지 42568, SEQ ID NO: 42580, SEQ ID NO: 42585, SEQ ID NO: 42605, SEQ ID NO: 42612, SEQ ID NO: 42627, SEQ ID NO: 42675, SEQ ID NO: 42680, SEQ ID NO: 42685, SEQ ID NO: 42690, SEQ ID NO: 42702, SEQ ID NO: 42711, SEQ ID NO: 42719, SEQ ID NO: 42738, SEQ ID NO: 42743, SEQ ID NO: 42750, SEQ ID NO: 42755, SEQ ID NO: 42777, SEQ ID NO: 42788, SEQ ID NO: 42793, SEQ ID NO: 42851, SEQ ID NO: 42858, SEQ ID NO: 42866, SEQ ID NO: 42903, SEQ ID NO: 42927, SEQ ID NO: 42936 내지 42937, SEQ ID NO: 42940 내지 42941, SEQ ID NO: 42957, SEQ ID NO: 42962, SEQ ID NO: 42966, SEQ ID NO: 42968, SEQ ID NO: 42986, SEQ ID NO: 43002, SEQ ID NO: 43013, SEQ ID NO: 43037, SEQ ID NO: 43052, SEQ ID NO: 43055 내지 43056, SEQ ID NO: 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ID NO: 43922, SEQ ID NO: 43930, SEQ ID NO: 43943, SEQ ID NO: 43953, SEQ ID NO: 43958, SEQ ID NO: 43979, SEQ ID NO: 43986, SEQ ID NO: 44002, SEQ ID NO: 44033, SEQ ID NO: 44037, SEQ ID NO: 44048, SEQ ID NO: 44050, SEQ ID NO: 44052, SEQ ID NO: 44080 내지 44081, SEQ ID NO: 44093 내지 44094, SEQ ID NO: 44114 내지 44115, SEQ ID NO: 44120, SEQ ID NO: 44142, SEQ ID NO: 44152, SEQ ID NO: 44164 내지 44166, SEQ ID NO: 44181, SEQ ID NO: 44222, SEQ ID NO: 44244, SEQ ID NO: 44246, SEQ ID NO: 44255, SEQ ID NO: 44261, SEQ ID NO: 44276, SEQ ID NO: 44286 내지 44287, SEQ ID NO: 44296, SEQ ID NO: 44315, SEQ ID NO: 44322, SEQ ID NO: 44324, SEQ ID NO: 44328, SEQ ID NO: 44332, SEQ ID NO: 44339, SEQ ID NO: 44401, SEQ ID NO: 44413, SEQ ID NO: 44435, SEQ ID NO: 44452, SEQ ID NO: 44454, SEQ ID NO: 44463, SEQ ID NO: 44467, SEQ ID NO: 44485, SEQ ID NO: 44504, SEQ ID NO: 44512, SEQ ID NO: 44523, SEQ ID NO: 44526 내지 44527, SEQ ID NO: 44536, SEQ ID NO: 44564, SEQ ID NO: 44605, SEQ ID NO: 44607, SEQ ID NO: 44612, SEQ ID NO: 44629, SEQ ID NO: 44635 내지 44636, SEQ ID NO: 44647, SEQ ID NO: 44650, SEQ ID NO: 44674, SEQ ID NO: 44691, SEQ ID NO: 44696, SEQ ID NO: 44702, SEQ ID NO: 44710, SEQ ID NO: 44713, SEQ ID NO: 44715, SEQ ID NO: 44722, SEQ ID NO: 44730, SEQ ID NO: 44733, SEQ ID NO: 44755, SEQ ID NO: 44770, SEQ ID NO: 44773, SEQ ID NO: 44781, SEQ ID NO: 44783, SEQ ID NO: 44797, SEQ ID NO: 44805, SEQ ID NO: 44822, SEQ ID NO: 44828, SEQ ID NO: 44830, SEQ ID NO: 44832, SEQ ID NO: 44850, SEQ ID NO: 44852, SEQ ID NO: 44854, SEQ ID NO: 44860, SEQ ID NO: 44866, SEQ ID NO: 44898, SEQ ID NO: 44900, SEQ ID NO: 44907, SEQ ID NO: 44933, SEQ ID NO: 44947, SEQ ID NO: 44986, SEQ ID NO: 45003, SEQ ID NO: 45007, SEQ ID NO: 45009, SEQ ID NO: 45012, SEQ ID NO: 45016, SEQ ID NO: 45018, SEQ ID NO: 45027, SEQ ID NO: 45031, SEQ ID NO: 45036, SEQ ID NO: 45044, SEQ ID NO: 45060, SEQ ID NO: 45071, SEQ ID NO: 45077, SEQ ID NO: 45095, SEQ ID NO: 45126, SEQ ID NO: 45132, SEQ ID NO: 45135, SEQ ID NO: 45139, SEQ ID NO: 45143, SEQ ID NO: 45159, SEQ ID NO: 45177, SEQ ID NO: 45197, SEQ ID NO: 45200, SEQ ID NO: 45219, SEQ ID NO: 45228, SEQ ID NO: 45323, SEQ ID NO: 45329, SEQ ID NO: 45351, SEQ ID NO: 45378, SEQ ID NO: 45380, SEQ ID NO: 45389, SEQ ID NO: 45413, SEQ ID NO: 45417, SEQ ID NO: 45438, SEQ ID NO: 45455, SEQ ID NO: 45457, SEQ ID NO: 45467, SEQ ID NO: 45478, SEQ ID NO: 45530, SEQ ID NO: 45562, SEQ ID NO: 45565, SEQ ID NO: 45583 내지 45584, SEQ ID NO: 45595 내지 45596, SEQ ID NO: 45608, SEQ ID NO: 45612, SEQ ID NO: 45616, SEQ ID NO: 45627, SEQ ID NO: 45653, SEQ ID NO: 45666 내지 45667, SEQ ID NO: 45680, SEQ ID NO: 45697, SEQ ID NO: 45705, SEQ ID NO: 45710, SEQ ID NO: 45722, SEQ ID NO: 45736, SEQ ID NO: 45742, SEQ ID NO: 45746, SEQ ID NO: 45765, SEQ ID NO: 45808, SEQ ID NO: 45830, SEQ ID NO: 45840 내지 45841, SEQ ID NO: 45896, SEQ ID NO: 45904 내지 45905, SEQ ID NO: 45913, SEQ ID NO: 45915, SEQ ID NO: 45940 내지 45943, SEQ ID NO: 45945, SEQ ID NO: 45958 내지 45959, SEQ ID NO: 45977, SEQ ID NO: 45983, SEQ ID NO: 45992, SEQ ID NO: 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백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 41351 내지 41352, SEQ ID NO: 41383, SEQ ID NO: 41396, SEQ ID NO: 41410, SEQ ID NO: 41414, SEQ ID NO: 41435, SEQ ID NO: 41450, SEQ ID NO: 41463, SEQ ID NO: 41478, SEQ ID NO: 41489, SEQ ID NO: 41495, SEQ ID NO: 41503, SEQ ID NO: 41513, SEQ ID NO: 41520, SEQ ID NO: 41535, SEQ ID NO: 41541, SEQ ID NO: 41545, SEQ ID NO: 41577, SEQ ID NO: 41588, SEQ ID NO: 41598, SEQ ID NO: 41605, SEQ ID NO: 41617, SEQ ID NO: 41620, SEQ ID NO: 41622, SEQ ID NO: 41627, SEQ ID NO: 41630, SEQ ID NO: 41638, SEQ ID NO: 41647, SEQ ID NO: 41673, SEQ ID NO: 41696, SEQ ID NO: 41703, SEQ ID NO: 41708, SEQ ID NO: 41728, SEQ ID NO: 41732 내지 41733, SEQ ID NO: 41749, SEQ ID NO: 41760, SEQ ID NO: 41766, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 41788, SEQ ID NO: 41791, SEQ ID NO: 41809, SEQ ID NO: 41813, SEQ ID NO: 41817, SEQ ID NO: 41829, SEQ ID NO: 41847 내지 41848, SEQ ID NO: 41853, SEQ ID NO: 41859, SEQ ID NO: 41889, SEQ ID NO: 41894, SEQ ID NO: 41897, SEQ ID NO: 41909, SEQ ID NO: 41923, SEQ ID NO: 41934, 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일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 MAGA4 단백질에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, MAGA4 단백질에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 41345, SEQ ID NO: 41347, SEQ ID NO: 41352, SEQ ID NO: 41357 내지 41358, SEQ ID NO: 41366, SEQ ID NO: 41377, SEQ ID NO: 41382, SEQ ID NO: 41392, SEQ ID NO: 41396, SEQ ID NO: 41398, SEQ ID NO: 41406, SEQ ID NO: 41411, SEQ ID NO: 41414, SEQ ID NO: 41433, SEQ ID NO: 41436, SEQ ID NO: 41445, SEQ ID NO: 41449, SEQ ID NO: 41455, SEQ ID NO: 41478, SEQ ID NO: 41487, SEQ ID NO: 41495 내지 41496, SEQ ID NO: 41503, SEQ ID NO: 41515, SEQ ID NO: 41520, SEQ ID NO: 41529, SEQ ID NO: 41549, SEQ ID NO: 41553, SEQ ID NO: 41562, SEQ ID NO: 41569, SEQ ID NO: 41574, SEQ ID NO: 41576, SEQ ID NO: 41579, SEQ ID NO: 41587 내지 41588, SEQ ID NO: 41605, SEQ ID NO: 41617, SEQ ID NO: 41620, SEQ ID NO: 41634, SEQ ID NO: 41650, SEQ ID NO: 41665, SEQ ID NO: 41670, SEQ ID NO: 41672, SEQ ID NO: 41696, SEQ ID NO: 41703, SEQ ID NO: 41709, SEQ ID NO: 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60292, SEQ ID NO: 60422 내지 60423, SEQ ID NO: 60444, SEQ ID NO: 60456 내지 68237, SEQ ID NO: 211911, SEQ ID NO: 212086 내지 212095, SEQ ID NO: 212435 내지 212440, SEQ ID NO: 212681 내지 212684, SEQ ID NO: 212858 내지 212860, SEQ ID NO: 213516 내지 213517, SEQ ID NO: 213529 내지 213531, SEQ ID NO: 213602 내지 213611, SEQ ID NO: 213719 내지 213720, SEQ ID NO: 213899, SEQ ID NO: 214004 내지 214012, SEQ ID NO: 214607, SEQ ID NO: 214647 내지 214649, SEQ ID NO: 214672 내지 214679, SEQ ID NO: 214774 내지 214775, SEQ ID NO: 214777, SEQ ID NO: 214779, SEQ ID NO: 214782, SEQ ID NO: 215373 내지 215415, SEQ ID NO: 215494, SEQ ID NO: 215497, SEQ ID NO: 215679, SEQ ID NO: 216244, SEQ ID NO: 216246, SEQ ID NO: 216383 내지 216401, SEQ ID NO: 217184 내지 217192, SEQ ID NO: 217200, SEQ ID NO: 217362, SEQ ID NO: 217708 내지 217712, SEQ ID NO: 217719, SEQ ID NO: 219238, SEQ ID NO: 219742 내지 219744, SEQ ID NO: 219747, SEQ ID NO: 219749, SEQ ID NO: 219751, SEQ ID NO: 219773 내지 219781, SEQ ID NO: 219994 내지 220030, SEQ ID NO: 220318 내지 220319, SEQ ID NO: 220327, SEQ ID NO: 220670, SEQ ID NO: 220815, SEQ ID NO: 220820, SEQ ID NO: 221197 내지 221234, SEQ ID NO: 221998, SEQ ID NO: 222000, SEQ ID NO: 223092, SEQ ID NO: 223095, SEQ ID NO: 223097, SEQ ID NO: 223099, SEQ ID NO: 223119, SEQ ID NO: 223121, SEQ ID NO: 223184 내지 223190, SEQ ID NO: 223250 내지 223283, SEQ ID NO: 223319, SEQ ID NO: 230922, SEQ ID NO: 232805 내지 232806, SEQ ID NO: 232846 또는 SEQ ID NO: 236016 내지 247058와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 MAGC1 단백질에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, MAGC1 단백질에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 41352, SEQ ID NO: 41478, SEQ ID NO: 41495, SEQ ID NO: 41725, SEQ ID NO: 41847, SEQ ID NO: 42129, SEQ ID NO: 42135, SEQ ID NO: 42168, SEQ ID NO: 42170, SEQ ID NO: 42195, SEQ ID NO: 42218, SEQ ID NO: 42229, SEQ ID NO: 42458, SEQ ID NO: 42545, SEQ ID NO: 42628, SEQ ID NO: 42653, SEQ ID NO: 42685, SEQ ID NO: 42703, SEQ ID NO: 42872, SEQ ID NO: 43008, SEQ ID NO: 43046, SEQ ID NO: 43083, SEQ ID NO: 43333, SEQ ID NO: 43429, SEQ ID NO: 43564, SEQ ID NO: 43780, SEQ ID NO: 43836, SEQ ID NO: 43881, SEQ ID NO: 43898, SEQ ID NO: 43932, SEQ ID NO: 44048, SEQ ID NO: 44181, SEQ ID NO: 44328, SEQ ID NO: 44456, SEQ ID NO: 44523, SEQ ID NO: 44566, SEQ ID NO: 44773, SEQ ID NO: 44877, SEQ ID NO: 45197, SEQ ID NO: 45385, SEQ ID NO: 45450, SEQ ID NO: 45556, SEQ ID NO: 45580, SEQ ID NO: 45584, SEQ ID NO: 45599, SEQ ID NO: 45765, SEQ ID NO: 45829, SEQ ID NO: 45894, SEQ ID NO: 45915, SEQ ID NO: 46273, SEQ ID NO: 46400, SEQ ID NO: 46421, SEQ ID NO: 46457, SEQ ID NO: 46459, SEQ ID NO: 46484, SEQ ID NO: 46666, SEQ ID NO: 46678, SEQ ID NO: 46689, SEQ ID NO: 46981, SEQ ID NO: 46991, SEQ ID NO: 46993, SEQ ID NO: 47047, SEQ ID NO: 47151, SEQ ID NO: 47324, SEQ ID NO: 47432, SEQ ID NO: 47592, SEQ ID NO: 47673, SEQ ID NO: 47895, SEQ ID NO: 47960, SEQ ID NO: 47964, SEQ ID NO: 47979, SEQ ID NO: 47984, SEQ ID NO: 48034, SEQ ID NO: 48113, SEQ ID NO: 48118, SEQ ID NO: 48300, SEQ ID NO: 48436, SEQ ID NO: 48461 내지 48462, SEQ ID NO: 48469, SEQ ID NO: 48574, SEQ ID NO: 48680, SEQ ID NO: 48796, SEQ ID NO: 48832, SEQ ID NO: 48838, SEQ ID NO: 48845, SEQ ID NO: 48877, SEQ ID NO: 48947, SEQ ID NO: 49019, SEQ ID NO: 49111, SEQ ID NO: 49176, SEQ ID NO: 49263, SEQ ID NO: 49395, SEQ ID NO: 49462, SEQ ID NO: 49557, SEQ ID NO: 49823, SEQ ID NO: 49883, SEQ ID NO: 50062, SEQ ID NO: 50167, SEQ ID NO: 50305, SEQ ID NO: 50394, SEQ ID NO: 50401, SEQ ID NO: 50423, SEQ ID NO: 50428, SEQ ID NO: 50443, SEQ ID NO: 50450, SEQ ID NO: 50564, SEQ ID NO: 50574, SEQ ID NO: 50632, SEQ ID NO: 50678, SEQ ID NO: 68238 내지 95592, 및 SEQ ID NO: 247059 내지 281349 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, MAGC1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 41352, SEQ ID NO: 41478, SEQ ID NO: 41495, SEQ ID NO: 41725, SEQ ID NO: 41847, SEQ ID NO: 42129, SEQ ID NO: 42135, SEQ ID NO: 42168, SEQ ID NO: 42170, SEQ ID NO: 42195, SEQ ID NO: 42218, SEQ ID NO: 42229, SEQ ID NO: 42458, SEQ ID NO: 42545, SEQ ID NO: 42628, SEQ ID NO: 42653, SEQ ID NO: 42685, SEQ ID NO: 42703, SEQ ID NO: 42872, SEQ ID NO: 43008, SEQ ID NO: 43046, SEQ ID NO: 43083, SEQ ID NO: 43333, SEQ ID NO: 43429, SEQ ID NO: 43564, SEQ ID NO: 43780, SEQ ID NO: 43836, SEQ ID NO: 43881, SEQ ID NO: 43898, SEQ ID NO: 43932, SEQ ID NO: 44048, SEQ ID NO: 44181, SEQ ID NO: 44328, SEQ ID NO: 44456, SEQ ID NO: 44523, SEQ ID NO: 44566, SEQ ID NO: 44773, SEQ ID NO: 44877, SEQ ID NO: 45197, SEQ ID NO: 45385, SEQ ID NO: 45450, SEQ ID NO: 45556, SEQ ID NO: 45580, SEQ ID NO: 45584, SEQ ID NO: 45599, SEQ ID NO: 45765, SEQ ID NO: 45829, SEQ ID NO: 45894, SEQ ID NO: 45915, SEQ ID NO: 46273, SEQ ID NO: 46400, SEQ ID NO: 46421, SEQ ID NO: 46457, SEQ ID NO: 46459, SEQ ID NO: 46484, SEQ ID NO: 46666, SEQ ID NO: 46678, SEQ ID NO: 46689, SEQ ID NO: 46981, SEQ ID NO: 46991, SEQ ID NO: 46993, SEQ ID NO: 47047, SEQ ID NO: 47151, SEQ ID NO: 47324, SEQ ID NO: 47432, SEQ ID NO: 47592, SEQ ID NO: 47673, SEQ ID NO: 47895, SEQ ID NO: 47960, SEQ ID NO: 47964, SEQ ID NO: 47979, SEQ ID NO: 47984, SEQ ID NO: 48034, SEQ ID NO: 48113, SEQ ID NO: 48118, SEQ ID NO: 48300, SEQ ID NO: 48436, SEQ ID NO: 48461 내지 48462, SEQ ID NO: 48469, SEQ ID NO: 48574, SEQ ID NO: 48680, SEQ ID NO: 48796, SEQ ID NO: 48832, SEQ ID NO: 48838, SEQ ID NO: 48845, SEQ ID NO: 48877, SEQ ID NO: 48947, SEQ ID NO: 49019, SEQ ID NO: 49111, SEQ ID NO: 49176, SEQ ID NO: 49263, SEQ ID NO: 49395, SEQ ID NO: 49462, SEQ ID NO: 49557, SEQ ID NO: 49823, SEQ ID NO: 49883, SEQ ID NO: 50062, SEQ ID NO: 50167, SEQ ID NO: 50305, SEQ ID NO: 50394, SEQ ID NO: 50401, SEQ ID NO: 50423, SEQ ID NO: 50428, SEQ ID NO: 50443, SEQ ID NO: 50450, SEQ ID NO: 50564, SEQ ID NO: 50574, SEQ ID NO: 50632, SEQ ID NO: 50678, SEQ ID NO: 68238 내지 95592 또는 SEQ ID NO: 247059 내지 281349와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 MAGC3 단백질에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, MAGC3 단백질에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 41647, SEQ ID NO: 50668, SEQ ID NO: 50905, SEQ ID NO: 51039 내지 51040, SEQ ID NO: 68257, SEQ ID NO: 68285, SEQ ID NO: 68288, SEQ ID NO: 68290, SEQ ID NO: 68305, SEQ ID NO: 68389, SEQ ID NO: 68419, SEQ ID NO: 68470, SEQ ID NO: 68510, SEQ ID NO: 68519, SEQ ID NO: 68592, SEQ ID NO: 68603, SEQ ID NO: 68684, SEQ ID NO: 68688, SEQ ID NO: 68747, SEQ ID NO: 68760, SEQ ID NO: 68778, SEQ ID NO: 68786, SEQ ID NO: 68855, SEQ ID NO: 68898, SEQ ID NO: 68900, SEQ ID NO: 68927, SEQ ID NO: 68961, SEQ ID NO: 69026, SEQ ID NO: 69041, SEQ ID NO: 69047, SEQ ID NO: 69148, SEQ ID NO: 69173, SEQ ID NO: 69180, SEQ ID NO: 69192, SEQ ID NO: 69227, SEQ ID NO: 69311, SEQ ID NO: 69330, SEQ ID NO: 69333, SEQ ID NO: 69346, SEQ ID NO: 69356, SEQ ID NO: 69393, SEQ ID NO: 69421, SEQ ID NO: 69437, SEQ ID NO: 69451, SEQ ID NO: 69500, SEQ ID NO: 69505, SEQ ID NO: 69517, SEQ ID NO: 69540, SEQ ID NO: 69559, SEQ ID NO: 69571, SEQ ID NO: 69586, SEQ ID NO: 69589, SEQ ID NO: 69591, SEQ ID NO: 69619, SEQ ID NO: 69631, SEQ ID NO: 69633, SEQ ID NO: 69644, SEQ ID NO: 69649, SEQ ID NO: 69747, SEQ ID NO: 69764, SEQ ID NO: 69767, SEQ ID NO: 69790, SEQ ID NO: 69832, SEQ ID NO: 69836, SEQ ID NO: 69882, SEQ ID NO: 69999, SEQ ID NO: 70012, SEQ ID NO: 70036, SEQ ID NO: 70050, SEQ ID NO: 70066, SEQ ID NO: 70069, SEQ ID NO: 70109, SEQ ID NO: 70159, SEQ ID NO: 70165, SEQ ID NO: 70175, SEQ ID NO: 70177, SEQ ID NO: 70188, SEQ ID NO: 70284, SEQ ID NO: 70323, SEQ ID NO: 70326, SEQ ID NO: 70428, SEQ ID NO: 70455, SEQ ID NO: 70570, SEQ ID NO: 70606, SEQ ID NO: 70635, SEQ ID NO: 70676, SEQ ID NO: 70692, SEQ ID NO: 70716, SEQ ID NO: 70728, SEQ ID NO: 70735, SEQ ID NO: 70750, SEQ ID NO: 70764, SEQ ID NO: 70770, SEQ ID NO: 70806, SEQ ID NO: 70968, SEQ ID NO: 70997, SEQ ID NO: 71049, SEQ ID NO: 71075, SEQ ID NO: 71090, SEQ ID NO: 71117, SEQ ID NO: 71151, SEQ 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NO: 281181, SEQ ID NO: 281184, SEQ ID NO: 281186, SEQ ID NO: 281190, SEQ ID NO: 281192, SEQ ID NO: 281197, SEQ ID NO: 281199 또는 SEQ ID NO: 281350 내지 305565와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 SSX2 단백질에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, SSX2 단백질에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 162383 내지 166443 및 SEQ ID NO: 369027 내지 373347 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, SSX2 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 162383 내지 166443 또는 SEQ ID NO: 369027 내지 373347와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 PRAME 단백질에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, PRAME 단백질에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 144109 내지 162382 및 SEQ ID NO: 342521 내지 369026 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, PRAME 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 144109 내지 162382 또는 SEQ ID NO: 342521 내지 369026와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 KKLC1 단백질에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, KKLC1 단백질에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 37110 내지 41320 및 SEQ ID NO: 206663 내지 211900 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, KKLC1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 37110 내지 41320 또는 SEQ ID NO: 206663 내지 211900와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 PMEL 단백질에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, PMEL 단백질에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 125134 내지 144108 및 SEQ ID NO: 317360 내지 342520 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, PMEL 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 125134 내지 144108 또는 SEQ ID NO: 317360 내지 342520와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 TYRP1 단백질에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, TYRP1 단백질에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 166444 내지 182573 및 SEQ ID NO: 373348 내지 392433 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, TYRP1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 166444 내지 182573 또는 SEQ ID NO: 373348 내지 392433와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 TYRP2 단백질에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, TYRP2 단백질에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 166476 내지 166477, SEQ ID NO: 166486, SEQ ID NO: 166513, SEQ ID NO: 166591, SEQ ID NO: 166606, SEQ ID NO: 166629, SEQ ID NO: 166641, SEQ ID NO: 166667, SEQ ID NO: 166678 내지 166679, SEQ ID NO: 166795, SEQ ID NO: 166799, SEQ ID NO: 166834, SEQ ID NO: 166854, SEQ ID NO: 166909, SEQ ID NO: 166912, SEQ ID NO: 166942, SEQ ID NO: 166991 내지 166992, SEQ ID NO: 167062, SEQ ID NO: 167067, SEQ ID NO: 167073 내지 167074, SEQ ID NO: 167106, SEQ ID NO: 167118, SEQ ID NO: 167151, SEQ ID NO: 167177, SEQ ID NO: 167241, SEQ ID NO: 167271, SEQ ID NO: 167395, SEQ ID NO: 167491, SEQ ID NO: 167505, SEQ ID NO: 167687, SEQ ID NO: 167736, SEQ ID NO: 167740, SEQ ID NO: 167743, SEQ ID NO: 167755, SEQ ID NO: 167810, SEQ ID NO: 167831, SEQ ID NO: 167837, SEQ ID NO: 167844, SEQ ID NO: 167847 내지 167848, SEQ ID NO: 167859, SEQ ID NO: 167880, SEQ 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176355, SEQ ID NO: 176369, SEQ ID NO: 176379, SEQ ID NO: 176452, SEQ ID NO: 176466, SEQ ID NO: 176503, SEQ ID NO: 176548, SEQ ID NO: 176560, SEQ ID NO: 176611, SEQ ID NO: 176621, SEQ ID NO: 176639, SEQ ID NO: 176693, SEQ ID NO: 176700, SEQ ID NO: 176713, SEQ ID NO: 176764, SEQ ID NO: 176795 내지 176796, SEQ ID NO: 176806, SEQ ID NO: 176815, SEQ ID NO: 176953, SEQ ID NO: 176958, SEQ ID NO: 176969, SEQ ID NO: 176980, SEQ ID NO: 176991, SEQ ID NO: 177016, SEQ ID NO: 177033, SEQ ID NO: 177044, SEQ ID NO: 177061, SEQ ID NO: 177065, SEQ ID NO: 177080, SEQ ID NO: 177088, SEQ ID NO: 177102, SEQ ID NO: 177119, SEQ ID NO: 177343, SEQ ID NO: 177358, SEQ ID NO: 177390, SEQ ID NO: 177430, SEQ ID NO: 177437, SEQ ID NO: 177465, SEQ ID NO: 177482 내지 177483, SEQ ID NO: 177492, SEQ ID NO: 177495, SEQ ID NO: 177522, SEQ ID NO: 177585, SEQ ID NO: 177604, SEQ ID NO: 177611, SEQ ID NO: 177664, SEQ ID NO: 177669, SEQ ID NO: 177701, SEQ ID NO: 177707, SEQ ID NO: 177710, SEQ ID NO: 177712, SEQ ID NO: 177714, SEQ ID NO: 177734, SEQ ID NO: 177808, SEQ ID NO: 177841, SEQ ID NO: 177848, SEQ ID NO: 177892, SEQ ID NO: 177918, SEQ ID NO: 177958, SEQ ID NO: 177989 내지 177990, SEQ ID NO: 178023, SEQ ID NO: 178032, SEQ ID NO: 178035, SEQ ID NO: 178039, SEQ ID NO: 178122, SEQ ID NO: 178161, SEQ ID NO: 178195, SEQ ID NO: 178208, SEQ ID NO: 178244, SEQ ID NO: 178272, SEQ ID NO: 178293, SEQ ID NO: 178310, SEQ ID NO: 178338, SEQ ID NO: 178353, SEQ ID NO: 178385, SEQ ID NO: 178399, SEQ ID NO: 178477, SEQ ID NO: 178519, SEQ ID NO: 178568, SEQ ID NO: 178587, SEQ ID NO: 178600, SEQ ID NO: 178612, SEQ ID NO: 178615, SEQ ID NO: 178651, SEQ ID NO: 178726, SEQ ID NO: 178740, SEQ ID NO: 178743, SEQ ID NO: 178750, SEQ ID NO: 178821, SEQ ID NO: 178886, SEQ ID NO: 178895, SEQ ID NO: 178911, SEQ ID NO: 178942, SEQ ID NO: 178946, SEQ ID NO: 178948, SEQ ID NO: 178966, SEQ ID NO: 179020, SEQ ID NO: 179031, SEQ ID NO: 179034, SEQ ID NO: 179130, SEQ ID NO: 179134, SEQ ID NO: 179151, SEQ ID NO: 179154, SEQ ID NO: 179224, SEQ ID NO: 179257, SEQ ID NO: 179387, SEQ ID NO: 179404, SEQ ID NO: 179444, SEQ ID NO: 179455, SEQ ID NO: 179462, SEQ ID NO: 179483, SEQ ID NO: 179544, SEQ ID NO: 179586, SEQ ID NO: 179600, SEQ ID NO: 179612, SEQ ID NO: 179619, SEQ ID NO: 179632, SEQ ID NO: 179677, SEQ ID NO: 179695, SEQ ID NO: 179697, SEQ ID NO: 179760, SEQ ID NO: 179863, SEQ ID NO: 179898, SEQ ID NO: 179904, SEQ ID NO: 179934, SEQ ID NO: 179957, SEQ ID NO: 179981, SEQ ID NO: 180013, SEQ ID NO: 180019, SEQ ID NO: 180036, SEQ ID NO: 180077, SEQ ID NO: 180086, SEQ ID NO: 180167, SEQ ID NO: 180257, SEQ ID NO: 180259, SEQ ID NO: 180271, SEQ ID NO: 180291, SEQ ID NO: 180327, SEQ ID NO: 180348, SEQ ID NO: 180378, SEQ ID NO: 180396, SEQ ID NO: 180430, SEQ ID NO: 180452, SEQ ID NO: 180458, SEQ ID NO: 180481, SEQ ID NO: 180489, SEQ ID NO: 180492, SEQ ID NO: 180528, SEQ ID NO: 180551, SEQ ID NO: 180567, SEQ ID NO: 180577, SEQ ID NO: 180597, SEQ ID NO: 180622, SEQ ID NO: 180683, SEQ ID NO: 180694, SEQ ID NO: 180720 내지 180721, SEQ ID NO: 180772, SEQ ID NO: 180799, SEQ ID NO: 180823, SEQ ID NO: 180843, SEQ ID NO: 180848, SEQ ID NO: 180858, SEQ ID NO: 180866, SEQ ID NO: 180879, SEQ ID NO: 180977, SEQ ID NO: 181032 내지 181033, SEQ ID NO: 181173, SEQ ID NO: 181204, SEQ ID NO: 181259, SEQ ID NO: 181406, SEQ ID NO: 181630, SEQ ID NO: 181685, SEQ ID NO: 181792, SEQ ID NO: 181963, SEQ ID NO: 181984, SEQ ID NO: 182157 내지 182159, SEQ ID NO: 182471, SEQ ID NO: 182574 내지 197896, SEQ ID NO: 379327, SEQ ID NO: 379329, SEQ ID NO: 379332, SEQ ID NO: 379334, SEQ ID NO: 379770, SEQ ID NO: 381531, SEQ ID NO: 382109, SEQ ID NO: 383301, SEQ ID NO: 383305, SEQ ID NO: 383310, SEQ ID NO: 386111, SEQ ID NO: 387057, SEQ ID NO: 387062 또는 SEQ ID NO: 392434 내지 410309와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 MAR1 단백질에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, MAR1 단백질에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 113808 내지 116477 및 SEQ ID NO: 305566 내지 307669 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, MAR1 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 113808 내지 116477 또는 SEQ ID NO: 305566 내지 307669와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, 본원에 개시된 MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 임의의 조합(SEQ ID NO: 1 내지 34168, 37110 내지 116477, 125134 내지 203516, 206663 내지 307669 또는 317360 내지 410309)은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 단일 표적(개별) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, 복합 백신의 펩티드 중 임의의 하나(펩티드 1 내지 34168, 37110 내지 116477, 125134 내지 203516, 206663 내지 307669 또는 317360 내지 410309; SEQ ID NO: 1 내지 34168, 37110 내지 116477, 125134 내지 203516, 206663 내지 307669 또는 317360 내지 410309)는 SEQ ID NO: 1 내지 34168, 37110 내지 116477, 125134 내지 203516, 206663 내지 307669 또는 317360 내지 410309와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
자가면역질환 백신
MHC 클래스 I 펩티드 서열
일부 실시예에서, INS 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 34169 내지 34224를 포함한다. 일부 실시예에서, INS 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 34169 내지 34224와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, INS 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 34169 내지 37109를 포함한다. 일부 실시예에서, INS 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 34169 내지 37109와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, INS 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 34169 내지 34224를 포함한다. 일부 실시예에서, INS 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 34169 내지 34224와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, INS 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 34169 내지 37109를 포함한다. 일부 실시예에서, INS 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 34169 내지 37109와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MOG 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 116478 내지 116563를 포함한다. 일부 실시예에서, MOG 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 116478 내지 116563와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MOG 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 116478 내지 125133를 포함한다. 일부 실시예에서, MOG 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 116478 내지 125133와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MOG 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 116478 내지 116563를 포함한다. 일부 실시예에서, MOG 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 116478 내지 116563와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MOG 단백질에 대한 MHC 클래스 I 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 116478 내지 125133를 포함한다. 일부 실시예에서, MOG 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 116478 내지 125133와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
MHC 클래스 II 펩티드 서열
일부 실시예에서, INS 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 203517 내지 203524를 포함한다. 일부 실시예에서, INS 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 203517 내지 203524와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, INS 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 203517 내지 206662를 포함한다. 일부 실시예에서, INS 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 203517 내지 206662와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, INS 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 203517 내지 203524를 포함한다. 일부 실시예에서, INS 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 203517 내지 203524와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, INS 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 203517 내지 206662를 포함한다. 일부 실시예에서, INS 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 203517 내지 206662와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MOG 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 307670 내지 307685를 포함한다. 일부 실시예에서, MOG 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 307670 내지 307685와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MOG 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 하나 이상의 SEQ ID NO: 307670 내지 317359를 포함한다. 일부 실시예에서, MOG 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 307670 내지 317359와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MOG 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 307670 내지 307685를 포함한다. 일부 실시예에서, MOG 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 307670 내지 307685와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MOG 단백질에 대한 MHC 클래스 II 펩티드 백신의 아미노산 서열은 2개 이상의 SEQ ID NO: 307670 내지 317359를 포함한다. 일부 실시예에서, MOG 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 307670 내지 317359와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 INS 단백질에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, INS 단백질에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 34169 내지 37109 및 SEQ ID NO: 203517 내지 206662 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, INS 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 34169 내지 37109 또는 SEQ ID NO: 203517 내지 206662와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시예에서, MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드의 아미노산 서열은 약 2 내지 40개의 펩티드를 갖는 MOG 단백질에 대한 단일 표적(개체) 또는 복합 펩티드 백신을 만드는 데 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, MOG 단백질에 대한 백신에서 임의의 한 개 펩티드는 SEQ ID NO: 116478 내지 125133 및 SEQ ID NO: 307670 내지 317359 중 하나 이상을 포함한다. 일부 실시예에서, MOG 백신의 펩티드 중 임의의 하나는 SEQ ID NO: 116478 내지 125133 또는 SEQ ID NO: 307670 내지 317359와 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
표 1. 예시 백신 펩티드(MHC 클래스 I)
표 2. 예시 백신 펩티드(MHC 클래스 II)
mRNA 및 DNA 백신
일부 실시예에서, 백신 펩티드는 mRNA 또는 DNA 분자로 암호화되고, 당업계에 알려진 바와 같이 생체 내 발현을 위해 투여된다. mRNA에 의한 백신 전달의 한 예는 Kranz et al.(2016)(전체 내용이 본원에 참조로 포함됨)에 제시되어 있다. 일부 실시예에서, 백신 펩티드는 Sahin et. al.(2017)(전체 내용이 본원에 참조로 포함됨)에 기재된 바와 같이 하나 이상의 mRNA 또는 DNA 분자에서 암호화된다. 일 실시예에서, 구조체는 본원에 설명된 절차에 의해 최적화된 10-펩티드 MHC 클래스 I 복합 췌장암 백신을 비롯한 30개의 펩티드(표적: KRAS G12D, KRAS G12V, KRAS G12R)와 20-펩티드 MHC 클래스 II 복합 췌장암 백신(표적: KRAS G12D, KRAS G12V, KRAS G12R)을 포함한다. 펩티드 앞에는 N-말단에 분비 신호 서열이 추가되고 그 뒤에 MHC 클래스 I 트래피킹 신호(MITD)가 뒤따른다(Kreiter et al., 2008; Sahin et al., 2017). MITD는 항원을 HLA 클래스 I 및 클래스 II 제시를 위한 경로로 우회하는 것으로 나타났다(Kreiter et al., 2008). 본원에서 저자는 각 MHC 클래스의 모든 펩티드를 Sahin et al.(2017)의 비면역원성 글리신/세린 링커를 사용하여 단일 구조로 결합하지만, Kreiter et al.(2008)에 기재된 바와 같이 분비 및 MITD 신호가 동일한 단일 펩티드를 포함하는 개별 구조를 구성하는 것 또한 타당하다.
일부 실시예에서, mRNA 백신에 의해 암호화된 아미노산 서열은 서열번호: 410310을 포함한다. 밑줄로 표시된 아미노산은 신호 펩티드(또는 리더) 서열에 해당한다. 굵은 글씨체로 표시된 아미노산은 MHC 클래스 I(8~11개 아미노산 길이, 10개 펩티드) 및 MHC 클래스 II(13~25개 아미노산 길이, 20개 펩티드) 펩티드 서열에 해당한다. 기울임꼴로 표시된 아미노산은 트래피킹 신호에 해당한다.
MRVTAPRTLILLLSGALALTETWAGSGGSGGGGSGGLMVVGADGVGGSGGGGSGGLTVVGADGVGGSGGGGSGGVVVGADGVGRGGSGGGGSGGGPRGVGKSAVGGSGGGGSGGLLVVGARGVGGSGGGGSGGVMGARGVGKGGSGGGGSGGVVVGARGVGRGGSGGGGSGGLMVVGAVGVGGSGGGGSGGLTVVGAVGVGGSGGGGSGGVTVGAVGVGKGGSGGGGSGGEYKFVVFGSDGAGKSGGSGGGGSGGEYKFVVIGNDGAGKSALTIQLIQNGGSGGGGSGGEYKFVVLGADGAGKSGGSGGGGSGGMTEYKFVVSGADGIGKSALTGGSGGGGSGGMTEYKFVVYGSDGIGKSALTGGSGGGGSGGMTEYKIVVMGIDGAGKSALTGGSGGGGSGGTEYKFVVIGNRGLGKGGSGGGGSGGTEYKFVVTGFRGLGKSALTIGGSGGGGSGGTEYKIVVAGARGSGKGGSGGGGSGGTEYKLVVIGTRGAGKSALTIGGSGGGGSGGTEYRLVSVFARSVGKSALTIGGSGGGGSGGTEYKFVVIGRRGSGKGGSGGGGSGGTEYKLVVLGMRGYGKGGSGGGGSGGEYKFVVIGRVGHGKSGGSGGGGSGGEYKFVVLGTVGHGKSGGSGGGGSGGEYKFVVYGNVGVGKSGGSGGGGSGGEYKIVVAGNVGIGKSGGSGGGGSGGEYKFVVNGAVGVGKSGGSGGGGSGGEYKIVVMGNVGYGKSGGSGGGGSGGEYKLVVLGRVGHGKSGGSLGGGGSGIVGIVAGLAVLAVVVIGAVVATVMCRRKSSGGKGGSYSQAASSDSAQGSDVSLTA(SEQ ID NO: 410310).
일부 실시예에서, 백신은 SEQ ID NO: 410310으로 구성된 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 mRNA 백신이다. 일부 실시예에서, mRNA 백신의 핵산 서열은 SEQ ID NO: 410310과 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 암호화한다.
일부 실시예에서, 백신은 SEQ ID NO: 410310으로 구성된 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 DNA 백신이다. 일부 실시예에서, DNA 백신의 핵산 서열은 SEQ ID NO: 410310과 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 암호화한다.
일부 실시예에서, 본원에 개시된 하나 이상의 MHC 클래스 I 및/또는 MHC 클래스 II 펩티드(SEQ ID NO: 1 내지 410310)는 하나 이상의 mRNA 또는 DNA 분자에서 암호화되어 생체 내 발현을 위해 투여될 수 있다. 일부 실시예에서, 약 2 내지 약 40개의 펩티드 서열이 하나 이상의 mRNA 구조체에 암호화된다. 일부 실시예에서, 약 2 내지 약 40개의 펩티드 서열이 하나 이상의 DNA 구조체(즉 SEQ ID NO: 1 내지 410310 중 하나 이상을 포함하는 아미노산 서열을 암호화하는 핵산)에서 암호화된다. 일부 실시예에서, mRNA 백신의 아미노산 서열 또는 DNA 백신의 핵산 서열은 임의의 SEQ ID NO: 1 내지 410310과 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 암호화한다.
해당 주제의 비제한적 실시예
한 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 1 내지 474로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 제공한다.
일부 실시예에서, 핵산 서열은 SEQ ID NO: 1 내지 474로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 1 내지 474로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 대상체에 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 1 내지 474로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 생체내 발현을 위한 구조체 내에서 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이고, 여기서 단백질은 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 이루어진 군으로부터 선택된 돌연변이를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 췌장암, 피부암, 갑상선암, 뇌암, 결장직장암, 기관지 및 폐암, 유방암, 및 난소암로 구성된 군으로부터 선택된다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 1 내지 474로 구성된 군으로부터 선택된 3개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 1 내지 474로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 1 내지 474로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 1 내지 18로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 AKT1 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 1 내지 18로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 1 내지 18로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 1 내지 18로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 AKT1 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 19 내지 50로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 BRAF 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 19 내지 50로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 19 내지 50로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 19 내지 50로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 BRAF 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 51 내지 98로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 EGFR 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 51 내지 98로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 51 내지 98로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 51 내지 98로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 EGFR 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 99 내지 118로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 GTF2I 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 99 내지 118로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 99 내지 118로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 99 내지 118로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 GTF2I 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 119 내지 140로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 IDH1 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 119 내지 140로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 119 내지 140로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 119 내지 140로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 IDH1 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 141 내지 229로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 KRAS 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 141 내지 229로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 141 내지 229로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 141 내지 229로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 KRAS 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 230 내지 272로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 NRAS 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 230 내지 272로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 230 내지 272로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 230 내지 272로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 NRAS 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 273 내지 322로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 PIK3CA 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 273 내지 322로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 273 내지 322로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 273 내지 322로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 PIK3CA 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 323 내지 353로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 PTEN 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 323 내지 353로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 323 내지 353로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 323 내지 353로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 PTEN 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 354 내지 458로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TP53 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 354 내지 458로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 354 내지 458로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 354 내지 458로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 TP53 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 141 내지 272로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 RAS 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 141 내지 272로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 141 내지 272로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 141 내지 272로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 RAS 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 19 내지 33로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 BRAF V600E 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 19 내지 33로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 19 내지 33로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 19 내지 33로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 BRAF V600E 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 34 내지 50로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 BRAF V600M 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 34 내지 50로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 34 내지 50로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 34 내지 50로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 BRAF V600M 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 51 내지 66로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 EGFR A289V 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 51 내지 66로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 51 내지 66로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 51 내지 66로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 EGFR A289V 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 67 내지 81로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 EGFR G598V 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 67 내지 81로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 67 내지 81로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 67 내지 81로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 EGFR G598V 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 82 내지 98로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 EGFR L858R 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 82 내지 98로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 82 내지 98로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 82 내지 98로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 EGFR L858R 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 125 내지 140로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 IDH1 R132H 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 125 내지 140로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 125 내지 140로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 125 내지 140로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 IDH1 R132H 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 119 내지 124로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 IDH1 R132C 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 119 내지 124로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 119 내지 124로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 119 내지 124로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 IDH1 R132C 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 167 내지 178로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 KRAS G12D 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 167 내지 178로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 167 내지 178로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 167 내지 178로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 KRAS G12D 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 203 내지 213로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 KRAS G12V 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 203 내지 213로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 203 내지 213로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 203 내지 213로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 KRAS G12V 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 179 내지 191로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 KRAS G12R 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 179 내지 191로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 179 내지 191로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 179 내지 191로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 KRAS G12R 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 154 내지 166로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 KRAS G12C 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 154 내지 166로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 154 내지 166로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 154 내지 166로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 KRAS G12C 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 214 내지 229로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 KRAS G13D 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 214 내지 229로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 214 내지 229로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 214 내지 229로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 KRAS G13D 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 141 내지 153로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 KRAS G12A 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 141 내지 153로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 141 내지 153로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 141 내지 153로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 KRAS G12A 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 192 내지 202로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 KRAS G12S 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 192 내지 202로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 192 내지 202로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 192 내지 202로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 KRAS G12S 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 256 내지 272로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 NRAS Q61R 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 256 내지 272로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 256 내지 272로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 256 내지 272로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 NRAS Q61R 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 230 내지 238로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 NRAS Q61K 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 230 내지 238로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 230 내지 238로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 230 내지 238로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 NRAS Q61K 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 239 내지 255로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 NRAS Q61L 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 239 내지 255로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 239 내지 255로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 239 내지 255로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 NRAS Q61L 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 273 내지 285로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 PIK3CA E542K 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 273 내지 285로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 273 내지 285로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 273 내지 285로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 PIK3CA E542K 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 286 내지 293로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 PIK3CA E545K 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 286 내지 293로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 286 내지 293로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 286 내지 293로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 PIK3CA E545K 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 294 내지 309로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 PIK3CA H1047R 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 294 내지 309로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 294 내지 309로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 294 내지 309로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 PIK3CA H1047R 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 359 내지 374로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TP53 R158L 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 359 내지 374로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 359 내지 374로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 359 내지 374로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 TP53 R158L 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 375 내지 386로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TP53 R175H 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 375 내지 386로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 375 내지 386로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 375 내지 386로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 TP53 R175H 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 387 내지 401로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TP53 R248Q 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 387 내지 401로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 387 내지 401로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 387 내지 401로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 TP53 R248Q 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 422 내지 432로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TP53 R273C 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 422 내지 432로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 422 내지 432로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 422 내지 432로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 TP53 R273C 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 433 내지 446로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TP53 R273H 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 433 내지 446로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 433 내지 446로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 433 내지 446로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 TP53 R273H 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 402 내지 421로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TP53 R248W 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 402 내지 421로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 402 내지 421로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 402 내지 421로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 TP53 R248W 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 447 내지 449로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TP53 R282W 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 447 내지 449로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 447 내지 449로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 447 내지 449로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 TP53 R282W 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 450 내지 458로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TP53 Y220C 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 450 내지 458로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 450 내지 458로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 450 내지 458로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 TP53 Y220C 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 310 내지 322로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 PIK3CA R88Q 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 310 내지 322로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 310 내지 322로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 310 내지 322로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 PIK3CA R88Q 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 99 내지 118로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 GTF2I L424H 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 99 내지 118로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 99 내지 118로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 99 내지 118로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 GTF2I L424H 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 338 내지 353로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 PTEN R130Q 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 338 내지 353로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 338 내지 353로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 338 내지 353로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 PTEN R130Q 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 1 내지 18로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 AKT1 E17K 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 1 내지 18로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 1 내지 18로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 1 내지 18로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 AKT1 E17K 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 323 내지 337로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 PTEN R130G 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 323 내지 337로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 323 내지 337로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 323 내지 337로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 PTEN R130G 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 354 내지 358로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TP53 H179R 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 354 내지 358로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 354 내지 358로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 354 내지 358로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 TP53 H179R 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 168 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 179 내지 180, SEQ ID NO: 182 내지 183, SEQ ID NO: 203 내지 204, 및 SEQ ID NO: 207로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 168 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 179 내지 180, SEQ ID NO: 182 내지 183, SEQ ID NO: 203 내지 204, 및 SEQ ID NO: 207로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 생체내 발현을 위한 구조체 내에서 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 갖는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 췌장암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 168 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 179 내지 180, SEQ ID NO: 182 내지 183, SEQ ID NO: 203 내지 204, 및 SEQ ID NO: 207로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 대상체에 투여하여 췌장암를 치료하거나 예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 168 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 179 내지 180, SEQ ID NO: 182 내지 183, SEQ ID NO: 203 내지 204, 및 SEQ ID NO: 207로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 168 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 179 내지 180, SEQ ID NO: 182 내지 183, SEQ ID NO: 203 내지 204, 및 SEQ ID NO: 207로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 168 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 179 내지 180, SEQ ID NO: 182 내지 183, SEQ ID NO: 203 내지 204, 및 SEQ ID NO: 207로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이고, 여기서 단백질은 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 췌장암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 168 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 179 내지 180, SEQ ID NO: 182 내지 183, SEQ ID NO: 203 내지 204, 및 SEQ ID NO: 207로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 대상체에 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 췌장암를 치료 또는예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 168 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 179 내지 180, SEQ ID NO: 182 내지 183, SEQ ID NO: 203 내지 204, 및 SEQ ID NO: 207로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 19 내지 23, SEQ ID NO: 34 내지 40, SEQ ID NO: 230 내지 231, SEQ ID NO: 239, SEQ ID NO: 241 내지 242, 및 SEQ ID NO: 260 내지 262로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 19 내지 23, SEQ ID NO: 34 내지 40, SEQ ID NO: 230 내지 231, SEQ ID NO: 239, SEQ ID NO: 241 내지 242, 및 SEQ ID NO: 260 내지 262로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 생체내 발현을 위한 구조체 내에서 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 갖는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 피부암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 19 내지 23, SEQ ID NO: 34 내지 40, SEQ ID NO: 230 내지 231, SEQ ID NO: 239, SEQ ID NO: 241 내지 242, 및 SEQ ID NO: 260 내지 262로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 대상체에 투여하여 피부암를 치료하거나 예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 19 내지 23, SEQ ID NO: 34 내지 40, SEQ ID NO: 230 내지 231, SEQ ID NO: 239, SEQ ID NO: 241 내지 242, 및 SEQ ID NO: 260 내지 262로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 19 내지 23, SEQ ID NO: 34 내지 40, SEQ ID NO: 230 내지 231, SEQ ID NO: 239, SEQ ID NO: 241 내지 242, 및 SEQ ID NO: 260 내지 262로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 19 내지 23, SEQ ID NO: 34 내지 40, SEQ ID NO: 230 내지 231, SEQ ID NO: 239, SEQ ID NO: 241 내지 242, 및 SEQ ID NO: 260 내지 262로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이고, 여기서 단백질은 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 피부암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 19 내지 23, SEQ ID NO: 34 내지 40, SEQ ID NO: 230 내지 231, SEQ ID NO: 239, SEQ ID NO: 241 내지 242, 및 SEQ ID NO: 260 내지 262로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 대상체에 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 피부암를 치료 또는예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 19 내지 23, SEQ ID NO: 34 내지 40, SEQ ID NO: 230 내지 231, SEQ ID NO: 239, SEQ ID NO: 241 내지 242, 및 SEQ ID NO: 260 내지 262로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 19 내지 23, SEQ ID NO: 230 내지 231, 및 SEQ ID NO: 260 내지 262로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 19 내지 23, SEQ ID NO: 230 내지 231, 및 SEQ ID NO: 260 내지 262로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 생체내 발현을 위한 구조체 내에서 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 갖는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 갑상선암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 19 내지 23, SEQ ID NO: 230 내지 231, 및 SEQ ID NO: 260 내지 262로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 대상체에 투여하여 갑상선암를 치료하거나 예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 19 내지 23, SEQ ID NO: 230 내지 231, 및 SEQ ID NO: 260 내지 262로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 19 내지 23, SEQ ID NO: 230 내지 231, 및 SEQ ID NO: 260 내지 262로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 19 내지 23, SEQ ID NO: 230 내지 231, 및 SEQ ID NO: 260 내지 262로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이고, 여기서 단백질은 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 갑상선암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 19 내지 23, SEQ ID NO: 230 내지 231, 및 SEQ ID NO: 260 내지 262로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 대상체에 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 갑상선암를 치료 또는예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 19 내지 23, SEQ ID NO: 230 내지 231, 및 SEQ ID NO: 260 내지 262로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 51 내지 55, SEQ ID NO: 67 내지 70, SEQ ID NO: 72 내지 73, SEQ ID NO: 119 내지 120, SEQ ID NO: 125 내지 130, SEQ ID NO: 375, SEQ ID NO: 423, 및 SEQ ID NO: 425로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 51 내지 55, SEQ ID NO: 67 내지 70, SEQ ID NO: 72 내지 73, SEQ ID NO: 119 내지 120, SEQ ID NO: 125 내지 130, SEQ ID NO: 375, SEQ ID NO: 423, 및 SEQ ID NO: 425로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 생체내 발현을 위한 구조체 내에서 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 갖는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 뇌암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 51 내지 55, SEQ ID NO: 67 내지 70, SEQ ID NO: 72 내지 73, SEQ ID NO: 119 내지 120, SEQ ID NO: 125 내지 130, SEQ ID NO: 375, SEQ ID NO: 423, 및 SEQ ID NO: 425로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 대상체에 투여하여 뇌암를 치료하거나 예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 51 내지 55, SEQ ID NO: 67 내지 70, SEQ ID NO: 72 내지 73, SEQ ID NO: 119 내지 120, SEQ ID NO: 125 내지 130, SEQ ID NO: 375, SEQ ID NO: 423, 및 SEQ ID NO: 425로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 51 내지 55, SEQ ID NO: 67 내지 70, SEQ ID NO: 72 내지 73, SEQ ID NO: 119 내지 120, SEQ ID NO: 125 내지 130, SEQ ID NO: 375, SEQ ID NO: 423, 및 SEQ ID NO: 425로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 51 내지 55, SEQ ID NO: 67 내지 70, SEQ ID NO: 72 내지 73, SEQ ID NO: 119 내지 120, SEQ ID NO: 125 내지 130, SEQ ID NO: 375, SEQ ID NO: 423, 및 SEQ ID NO: 425로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이고, 여기서 단백질은 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 뇌암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 51 내지 55, SEQ ID NO: 67 내지 70, SEQ ID NO: 72 내지 73, SEQ ID NO: 119 내지 120, SEQ ID NO: 125 내지 130, SEQ ID NO: 375, SEQ ID NO: 423, 및 SEQ ID NO: 425로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 대상체에 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 뇌암를 치료 또는예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 51 내지 55, SEQ ID NO: 67 내지 70, SEQ ID NO: 72 내지 73, SEQ ID NO: 119 내지 120, SEQ ID NO: 125 내지 130, SEQ ID NO: 375, SEQ ID NO: 423, 및 SEQ ID NO: 425로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 20 내지 23, SEQ ID NO: 167 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 203 내지 207, SEQ ID NO: 215 내지 217, 및 SEQ ID NO: 288로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 20 내지 23, SEQ ID NO: 167 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 203 내지 207, SEQ ID NO: 215 내지 217, 및 SEQ ID NO: 288로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 생체내 발현을 위한 구조체 내에서 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 갖는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 결장직장암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 20 내지 23, SEQ ID NO: 167 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 203 내지 207, SEQ ID NO: 215 내지 217, 및 SEQ ID NO: 288로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 대상체에 투여하여 결장직장암를 치료하거나 예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 20 내지 23, SEQ ID NO: 167 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 203 내지 207, SEQ ID NO: 215 내지 217, 및 SEQ ID NO: 288로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 20 내지 23, SEQ ID NO: 167 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 203 내지 207, SEQ ID NO: 215 내지 217, 및 SEQ ID NO: 288로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 20 내지 23, SEQ ID NO: 167 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 203 내지 207, SEQ ID NO: 215 내지 217, 및 SEQ ID NO: 288로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이고, 여기서 단백질은 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 결장직장암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 20 내지 23, SEQ ID NO: 167 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 203 내지 207, SEQ ID NO: 215 내지 217, 및 SEQ ID NO: 288로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 대상체에 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 결장직장암를 치료 또는예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 20 내지 23, SEQ ID NO: 167 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 203 내지 207, SEQ ID NO: 215 내지 217, 및 SEQ ID NO: 288로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 82 내지 86, SEQ ID NO: 141 내지 144, SEQ ID NO: 154 내지 159, SEQ ID NO: 168 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 203 내지 204, SEQ ID NO: 207, SEQ ID NO: 274 내지 276, SEQ ID NO: 288, SEQ ID NO: 359, 및 SEQ ID NO: 362 내지 364로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 82 내지 86, SEQ ID NO: 141 내지 144, SEQ ID NO: 154 내지 159, SEQ ID NO: 168 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 203 내지 204, SEQ ID NO: 207, SEQ ID NO: 274 내지 276, SEQ ID NO: 288, SEQ ID NO: 359, 및 SEQ ID NO: 362 내지 364로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 생체내 발현을 위한 구조체 내에서 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 갖는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 기관지 및 폐암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 82 내지 86, SEQ ID NO: 141 내지 144, SEQ ID NO: 154 내지 159, SEQ ID NO: 168 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 203 내지 204, SEQ ID NO: 207, SEQ ID NO: 274 내지 276, SEQ ID NO: 288, SEQ ID NO: 359, 및 SEQ ID NO: 362 내지 364로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 대상체에 투여하여 기관지 및 폐암를 치료하거나 예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 82 내지 86, SEQ ID NO: 141 내지 144, SEQ ID NO: 154 내지 159, SEQ ID NO: 168 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 203 내지 204, SEQ ID NO: 207, SEQ ID NO: 274 내지 276, SEQ ID NO: 288, SEQ ID NO: 359, 및 SEQ ID NO: 362 내지 364로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 82 내지 86, SEQ ID NO: 141 내지 144, SEQ ID NO: 154 내지 159, SEQ ID NO: 168 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 203 내지 204, SEQ ID NO: 207, SEQ ID NO: 274 내지 276, SEQ ID NO: 288, SEQ ID NO: 359, 및 SEQ ID NO: 362 내지 364로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 82 내지 86, SEQ ID NO: 141 내지 144, SEQ ID NO: 154 내지 159, SEQ ID NO: 168 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 203 내지 204, SEQ ID NO: 207, SEQ ID NO: 274 내지 276, SEQ ID NO: 288, SEQ ID NO: 359, 및 SEQ ID NO: 362 내지 364로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이고, 여기서 단백질은 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 기관지 및 폐암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 82 내지 86, SEQ ID NO: 141 내지 144, SEQ ID NO: 154 내지 159, SEQ ID NO: 168 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 203 내지 204, SEQ ID NO: 207, SEQ ID NO: 274 내지 276, SEQ ID NO: 288, SEQ ID NO: 359, 및 SEQ ID NO: 362 내지 364로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 대상체에 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 기관지 및 폐암를 치료 또는예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 82 내지 86, SEQ ID NO: 141 내지 144, SEQ ID NO: 154 내지 159, SEQ ID NO: 168 내지 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 203 내지 204, SEQ ID NO: 207, SEQ ID NO: 274 내지 276, SEQ ID NO: 288, SEQ ID NO: 359, 및 SEQ ID NO: 362 내지 364로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 273 내지 309, SEQ ID NO: 375 내지 386, 및 SEQ ID NO: 422 내지 446로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 273 내지 309, SEQ ID NO: 375 내지 386, 및 SEQ ID NO: 422 내지 446로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 생체내 발현을 위한 구조체 내에서 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 갖는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 유방암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 273 내지 309, SEQ ID NO: 375 내지 386, 및 SEQ ID NO: 422 내지 446로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 대상체에 투여하여 유방암를 치료하거나 예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 273 내지 309, SEQ ID NO: 375 내지 386, 및 SEQ ID NO: 422 내지 446로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 273 내지 309, SEQ ID NO: 375 내지 386, 및 SEQ ID NO: 422 내지 446로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 273 내지 309, SEQ ID NO: 375 내지 386, 및 SEQ ID NO: 422 내지 446로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이고, 여기서 단백질은 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 유방암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 273 내지 309, SEQ ID NO: 375 내지 386, 및 SEQ ID NO: 422 내지 446로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 대상체에 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 유방암를 치료 또는예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 273 내지 309, SEQ ID NO: 375 내지 386, 및 SEQ ID NO: 422 내지 446로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 273 내지 309, SEQ ID NO: 375 내지 386, 및 SEQ ID NO: 422 내지 446로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 273 내지 309, SEQ ID NO: 375 내지 386, 및 SEQ ID NO: 422 내지 446로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 생체내 발현을 위한 구조체 내에서 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 갖는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 난소암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 273 내지 309, SEQ ID NO: 375 내지 386, 및 SEQ ID NO: 422 내지 446로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 대상체에 투여하여 난소암를 치료하거나 예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 273 내지 309, SEQ ID NO: 375 내지 386, 및 SEQ ID NO: 422 내지 446로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 273 내지 309, SEQ ID NO: 375 내지 386, 및 SEQ ID NO: 422 내지 446로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 273 내지 309, SEQ ID NO: 375 내지 386, 및 SEQ ID NO: 422 내지 446로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이고, 여기서 단백질은 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 난소암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 273 내지 309, SEQ ID NO: 375 내지 386, 및 SEQ ID NO: 422 내지 446로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 대상체에 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 난소암를 치료 또는예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 273 내지 309, SEQ ID NO: 375 내지 386, 및 SEQ ID NO: 422 내지 446로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다.
한 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 475 내지 759로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 제공한다.
일부 실시예에서, 핵산 서열은 SEQ ID NO: 475 내지 759로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 475 내지 759로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 대상체에 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 475 내지 759로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 생체내 발현을 위한 구조체 내에서 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 II 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이고, 여기서 단백질은 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 이루어진 군으로부터 선택된 돌연변이를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 췌장암, 피부암, 갑상선암, 뇌암, 결장직장암, 기관지 및 폐암, 유방암, 및 난소암로 구성된 군으로부터 선택된다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 475 내지 759로 구성된 군으로부터 선택된 3개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 475 내지 759로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 475 내지 759로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 475 내지 483로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 AKT1 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 475 내지 483로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 475 내지 483로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 475 내지 483로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 AKT1 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 484 내지 502로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 BRAF 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 484 내지 502로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 484 내지 502로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 484 내지 502로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 BRAF 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 503 내지 527로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 EGFR 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 503 내지 527로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 503 내지 527로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 503 내지 527로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 EGFR 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 528 내지 534로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 GTF2I 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 528 내지 534로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 528 내지 534로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 528 내지 534로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 GTF2I 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 535 내지 553로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 IDH1 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 535 내지 553로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 535 내지 553로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 535 내지 553로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 IDH1 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 554 내지 615로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 KRAS 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 554 내지 615로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 554 내지 615로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 554 내지 615로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 KRAS 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 616 내지 645로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 NRAS 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 616 내지 645로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 616 내지 645로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 616 내지 645로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 NRAS 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 646 내지 675로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 PIK3CA 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 646 내지 675로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 646 내지 675로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 646 내지 675로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 PIK3CA 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 676 내지 690로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 PTEN 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 676 내지 690로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 676 내지 690로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 676 내지 690로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 PTEN 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 691 내지 758로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TP53 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 691 내지 758로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 691 내지 758로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 691 내지 758로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 TP53 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 554 내지 645로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 RAS 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 554 내지 645로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 554 내지 645로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 554 내지 645로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이 RAS 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 484 내지 494로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 BRAF V600E 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 484 내지 494로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 484 내지 494로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 484 내지 494로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 BRAF V600E 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 495 내지 502로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 BRAF V600M 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 495 내지 502로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 495 내지 502로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 495 내지 502로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 BRAF V600M 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 503 내지 509로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 EGFR A289V 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 503 내지 509로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 503 내지 509로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 503 내지 509로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 EGFR A289V 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 510 내지 519로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 EGFR G598V 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 510 내지 519로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 510 내지 519로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 510 내지 519로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 EGFR G598V 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 520 내지 527로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 EGFR L858R 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 520 내지 527로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 520 내지 527로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 520 내지 527로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 EGFR L858R 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 543 내지 553로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 IDH1 R132H 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 543 내지 553로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 543 내지 553로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 543 내지 553로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 IDH1 R132H 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 535 내지 542로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 IDH1 R132C 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 535 내지 542로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 535 내지 542로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 535 내지 542로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 IDH1 R132C 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 569 내지 577로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 KRAS G12D 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 569 내지 577로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 569 내지 577로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 569 내지 577로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 KRAS G12D 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 596 내지 605로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 KRAS G12V 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 596 내지 605로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 596 내지 605로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 596 내지 605로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 KRAS G12V 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 578 내지 587로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 KRAS G12R 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 578 내지 587로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 578 내지 587로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 578 내지 587로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 KRAS G12R 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 561 내지 568로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 KRAS G12C 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 561 내지 568로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 561 내지 568로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 561 내지 568로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 KRAS G12C 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 606 내지 615로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 KRAS G13D 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 606 내지 615로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 606 내지 615로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 606 내지 615로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 KRAS G13D 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 554 내지 560로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 KRAS G12A 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 554 내지 560로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 554 내지 560로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 554 내지 560로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 KRAS G12A 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 588 내지 595로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 KRAS G12S 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 588 내지 595로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 588 내지 595로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 588 내지 595로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 KRAS G12S 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 634 내지 645로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 NRAS Q61R 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 634 내지 645로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 634 내지 645로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 634 내지 645로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 NRAS Q61R 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 616 내지 624로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 NRAS Q61K 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 616 내지 624로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 616 내지 624로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 616 내지 624로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 NRAS Q61K 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 625 내지 633로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 NRAS Q61L 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 625 내지 633로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 625 내지 633로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 625 내지 633로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 NRAS Q61L 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 646 내지 650로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 PIK3CA E542K 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 646 내지 650로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 646 내지 650로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 646 내지 650로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 PIK3CA E542K 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 651 내지 657로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 PIK3CA E545K 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 651 내지 657로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 651 내지 657로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 651 내지 657로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 PIK3CA E545K 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 658 내지 667로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 PIK3CA H1047R 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 658 내지 667로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 658 내지 667로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 658 내지 667로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 PIK3CA H1047R 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 700 내지 707로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TP53 R158L 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 700 내지 707로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 700 내지 707로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 700 내지 707로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 TP53 R158L 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 708 내지 717로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TP53 R175H 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 708 내지 717로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 708 내지 717로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 708 내지 717로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 TP53 R175H 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 718 내지 723로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TP53 R248Q 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 718 내지 723로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 718 내지 723로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 718 내지 723로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 TP53 R248Q 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 733 내지 739로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TP53 R273C 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 733 내지 739로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 733 내지 739로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 733 내지 739로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 TP53 R273C 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 740 내지 748로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TP53 R273H 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 740 내지 748로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 740 내지 748로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 740 내지 748로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 TP53 R273H 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 724 내지 732로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TP53 R248W 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 724 내지 732로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 724 내지 732로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 724 내지 732로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 TP53 R248W 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 749 내지 750로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TP53 R282W 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 749 내지 750로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 749 내지 750로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 749 내지 750로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 TP53 R282W 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 751 내지 758로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TP53 Y220C 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 751 내지 758로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 751 내지 758로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 751 내지 758로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 TP53 Y220C 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 668 내지 675로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 PIK3CA R88Q 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 668 내지 675로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 668 내지 675로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 668 내지 675로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 PIK3CA R88Q 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 528 내지 534로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 GTF2I L424H 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 528 내지 534로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 528 내지 534로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 528 내지 534로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 GTF2I L424H 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 681 내지 690로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 PTEN R130Q 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 681 내지 690로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 681 내지 690로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 681 내지 690로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 PTEN R130Q 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 475 내지 483로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 AKT1 E17K 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 475 내지 483로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 475 내지 483로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 475 내지 483로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 AKT1 E17K 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 676 내지 680로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 PTEN R130G 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 676 내지 680로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 676 내지 680로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 676 내지 680로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 PTEN R130G 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 691 내지 699로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TP53 H179R 단백질 돌연변이로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 691 내지 699로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 691 내지 699로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 691 내지 699로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 TP53 H179R 단백질 돌연변이로부터 유래된 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 569 내지 574, SEQ ID NO: 578 내지 584, SEQ ID NO: 596 내지 599, 및 SEQ ID NO: 601 내지 603로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 569 내지 574, SEQ ID NO: 578 내지 584, SEQ ID NO: 596 내지 599, 및 SEQ ID NO: 601 내지 603로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 생체내 발현을 위한 구조체 내에서 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 II 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 갖는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 췌장암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 569 내지 574, SEQ ID NO: 578 내지 584, SEQ ID NO: 596 내지 599, 및 SEQ ID NO: 601 내지 603로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 대상체에 투여하여 췌장암를 치료하거나 예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 569 내지 574, SEQ ID NO: 578 내지 584, SEQ ID NO: 596 내지 599, 및 SEQ ID NO: 601 내지 603로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 569 내지 574, SEQ ID NO: 578 내지 584, SEQ ID NO: 596 내지 599, 및 SEQ ID NO: 601 내지 603로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 569 내지 574, SEQ ID NO: 578 내지 584, SEQ ID NO: 596 내지 599, 및 SEQ ID NO: 601 내지 603로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 HLA 클래스 II 분자에 의해 표시된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이고, 여기서 단백질은 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 췌장암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 569 내지 574, SEQ ID NO: 578 내지 584, SEQ ID NO: 596 내지 599, 및 SEQ ID NO: 601 내지 603로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 대상체에 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 췌장암를 치료 또는예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 569 내지 574, SEQ ID NO: 578 내지 584, SEQ ID NO: 596 내지 599, 및 SEQ ID NO: 601 내지 603로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 495 내지 499, SEQ ID NO: 616, SEQ ID NO: 619 내지 620, SEQ ID NO: 625 내지 628, SEQ ID NO: 634, SEQ ID NO: 637, 및 SEQ ID NO: 639 내지 640로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 495 내지 499, SEQ ID NO: 616, SEQ ID NO: 619 내지 620, SEQ ID NO: 625 내지 628, SEQ ID NO: 634, SEQ ID NO: 637, 및 SEQ ID NO: 639 내지 640로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 생체내 발현을 위한 구조체 내에서 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 II 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 갖는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 피부암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 495 내지 499, SEQ ID NO: 616, SEQ ID NO: 619 내지 620, SEQ ID NO: 625 내지 628, SEQ ID NO: 634, SEQ ID NO: 637, 및 SEQ ID NO: 639 내지 640로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 대상체에 투여하여 피부암를 치료하거나 예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 495 내지 499, SEQ ID NO: 616, SEQ ID NO: 619 내지 620, SEQ ID NO: 625 내지 628, SEQ ID NO: 634, SEQ ID NO: 637, 및 SEQ ID NO: 639 내지 640로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 495 내지 499, SEQ ID NO: 616, SEQ ID NO: 619 내지 620, SEQ ID NO: 625 내지 628, SEQ ID NO: 634, SEQ ID NO: 637, 및 SEQ ID NO: 639 내지 640로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 495 내지 499, SEQ ID NO: 616, SEQ ID NO: 619 내지 620, SEQ ID NO: 625 내지 628, SEQ ID NO: 634, SEQ ID NO: 637, 및 SEQ ID NO: 639 내지 640로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 HLA 클래스 II 분자에 의해 표시된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이고, 여기서 단백질은 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 피부암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 495 내지 499, SEQ ID NO: 616, SEQ ID NO: 619 내지 620, SEQ ID NO: 625 내지 628, SEQ ID NO: 634, SEQ ID NO: 637, 및 SEQ ID NO: 639 내지 640로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 대상체에 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 피부암를 치료 또는예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 495 내지 499, SEQ ID NO: 616, SEQ ID NO: 619 내지 620, SEQ ID NO: 625 내지 628, SEQ ID NO: 634, SEQ ID NO: 637, 및 SEQ ID NO: 639 내지 640로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 616, SEQ ID NO: 619 내지 620, SEQ ID NO: 634, SEQ ID NO: 637, 및 SEQ ID NO: 640로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 616, SEQ ID NO: 619 내지 620, SEQ ID NO: 634, SEQ ID NO: 637, 및 SEQ ID NO: 640로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 생체내 발현을 위한 구조체 내에서 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 II 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 갖는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 갑상선암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 616, SEQ ID NO: 619 내지 620, SEQ ID NO: 634, SEQ ID NO: 637, 및 SEQ ID NO: 640로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 대상체에 투여하여 갑상선암를 치료하거나 예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 616, SEQ ID NO: 619 내지 620, SEQ ID NO: 634, SEQ ID NO: 637, 및 SEQ ID NO: 640로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 616, SEQ ID NO: 619 내지 620, SEQ ID NO: 634, SEQ ID NO: 637, 및 SEQ ID NO: 640로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 616, SEQ ID NO: 619 내지 620, SEQ ID NO: 634, SEQ ID NO: 637, 및 SEQ ID NO: 640로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 HLA 클래스 II 분자에 의해 표시된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이고, 여기서 단백질은 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 갑상선암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 616, SEQ ID NO: 619 내지 620, SEQ ID NO: 634, SEQ ID NO: 637, 및 SEQ ID NO: 640로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 대상체에 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 갑상선암를 치료 또는예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 616, SEQ ID NO: 619 내지 620, SEQ ID NO: 634, SEQ ID NO: 637, 및 SEQ ID NO: 640로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 508, SEQ ID NO: 510, SEQ ID NO: 512, SEQ ID NO: 514, SEQ ID NO: 535 내지 537, SEQ ID NO: 539, SEQ ID NO: 543 내지 551, SEQ ID NO: 708, SEQ ID NO: 712, 및 SEQ ID NO: 738로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 508, SEQ ID NO: 510, SEQ ID NO: 512, SEQ ID NO: 514, SEQ ID NO: 535 내지 537, SEQ ID NO: 539, SEQ ID NO: 543 내지 551, SEQ ID NO: 708, SEQ ID NO: 712, 및 SEQ ID NO: 738로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 생체내 발현을 위한 구조체 내에서 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 II 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 갖는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 뇌암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 508, SEQ ID NO: 510, SEQ ID NO: 512, SEQ ID NO: 514, SEQ ID NO: 535 내지 537, SEQ ID NO: 539, SEQ ID NO: 543 내지 551, SEQ ID NO: 708, SEQ ID NO: 712, 및 SEQ ID NO: 738로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 대상체에 투여하여 뇌암를 치료하거나 예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 508, SEQ ID NO: 510, SEQ ID NO: 512, SEQ ID NO: 514, SEQ ID NO: 535 내지 537, SEQ ID NO: 539, SEQ ID NO: 543 내지 551, SEQ ID NO: 708, SEQ ID NO: 712, 및 SEQ ID NO: 738로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 508, SEQ ID NO: 510, SEQ ID NO: 512, SEQ ID NO: 514, SEQ ID NO: 535 내지 537, SEQ ID NO: 539, SEQ ID NO: 543 내지 551, SEQ ID NO: 708, SEQ ID NO: 712, 및 SEQ ID NO: 738로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 508, SEQ ID NO: 510, SEQ ID NO: 512, SEQ ID NO: 514, SEQ ID NO: 535 내지 537, SEQ ID NO: 539, SEQ ID NO: 543 내지 551, SEQ ID NO: 708, SEQ ID NO: 712, 및 SEQ ID NO: 738로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 HLA 클래스 II 분자에 의해 표시된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이고, 여기서 단백질은 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 뇌암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 508, SEQ ID NO: 510, SEQ ID NO: 512, SEQ ID NO: 514, SEQ ID NO: 535 내지 537, SEQ ID NO: 539, SEQ ID NO: 543 내지 551, SEQ ID NO: 708, SEQ ID NO: 712, 및 SEQ ID NO: 738로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 대상체에 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 뇌암를 치료 또는예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 508, SEQ ID NO: 510, SEQ ID NO: 512, SEQ ID NO: 514, SEQ ID NO: 535 내지 537, SEQ ID NO: 539, SEQ ID NO: 543 내지 551, SEQ ID NO: 708, SEQ ID NO: 712, 및 SEQ ID NO: 738로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 569 내지 575, SEQ ID NO: 596 내지 599, SEQ ID NO: 601 내지 604, SEQ ID NO: 606 내지 612, SEQ ID NO: 656, SEQ ID NO: 708, 및 SEQ ID NO: 712로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 569 내지 575, SEQ ID NO: 596 내지 599, SEQ ID NO: 601 내지 604, SEQ ID NO: 606 내지 612, SEQ ID NO: 656, SEQ ID NO: 708, 및 SEQ ID NO: 712로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 생체내 발현을 위한 구조체 내에서 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 II 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 갖는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 결장직장암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 569 내지 575, SEQ ID NO: 596 내지 599, SEQ ID NO: 601 내지 604, SEQ ID NO: 606 내지 612, SEQ ID NO: 656, SEQ ID NO: 708, 및 SEQ ID NO: 712로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 대상체에 투여하여 결장직장암를 치료하거나 예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 569 내지 575, SEQ ID NO: 596 내지 599, SEQ ID NO: 601 내지 604, SEQ ID NO: 606 내지 612, SEQ ID NO: 656, SEQ ID NO: 708, 및 SEQ ID NO: 712로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 569 내지 575, SEQ ID NO: 596 내지 599, SEQ ID NO: 601 내지 604, SEQ ID NO: 606 내지 612, SEQ ID NO: 656, SEQ ID NO: 708, 및 SEQ ID NO: 712로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 569 내지 575, SEQ ID NO: 596 내지 599, SEQ ID NO: 601 내지 604, SEQ ID NO: 606 내지 612, SEQ ID NO: 656, SEQ ID NO: 708, 및 SEQ ID NO: 712로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 HLA 클래스 II 분자에 의해 표시된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이고, 여기서 단백질은 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 결장직장암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 569 내지 575, SEQ ID NO: 596 내지 599, SEQ ID NO: 601 내지 604, SEQ ID NO: 606 내지 612, SEQ ID NO: 656, SEQ ID NO: 708, 및 SEQ ID NO: 712로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 대상체에 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 결장직장암를 치료 또는예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 484 내지 485, SEQ ID NO: 488 내지 489, SEQ ID NO: 569 내지 575, SEQ ID NO: 596 내지 599, SEQ ID NO: 601 내지 604, SEQ ID NO: 606 내지 612, SEQ ID NO: 656, SEQ ID NO: 708, 및 SEQ ID NO: 712로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 520 내지 521, SEQ ID NO: 523 내지 524, SEQ ID NO: 554 내지 556, SEQ ID NO: 558, SEQ ID NO: 561, SEQ ID NO: 563 내지 565, SEQ ID NO: 569 내지 573, SEQ ID NO: 596 내지 600, SEQ ID NO: 650, SEQ ID NO: 656, 및 SEQ ID NO: 700 내지 705로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 520 내지 521, SEQ ID NO: 523 내지 524, SEQ ID NO: 554 내지 556, SEQ ID NO: 558, SEQ ID NO: 561, SEQ ID NO: 563 내지 565, SEQ ID NO: 569 내지 573, SEQ ID NO: 596 내지 600, SEQ ID NO: 650, SEQ ID NO: 656, 및 SEQ ID NO: 700 내지 705로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 생체내 발현을 위한 구조체 내에서 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 II 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 갖는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 기관지 및 폐암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 520 내지 521, SEQ ID NO: 523 내지 524, SEQ ID NO: 554 내지 556, SEQ ID NO: 558, SEQ ID NO: 561, SEQ ID NO: 563 내지 565, SEQ ID NO: 569 내지 573, SEQ ID NO: 596 내지 600, SEQ ID NO: 650, SEQ ID NO: 656, 및 SEQ ID NO: 700 내지 705로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 대상체에 투여하여 기관지 및 폐암를 치료하거나 예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 520 내지 521, SEQ ID NO: 523 내지 524, SEQ ID NO: 554 내지 556, SEQ ID NO: 558, SEQ ID NO: 561, SEQ ID NO: 563 내지 565, SEQ ID NO: 569 내지 573, SEQ ID NO: 596 내지 600, SEQ ID NO: 650, SEQ ID NO: 656, 및 SEQ ID NO: 700 내지 705로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 520 내지 521, SEQ ID NO: 523 내지 524, SEQ ID NO: 554 내지 556, SEQ ID NO: 558, SEQ ID NO: 561, SEQ ID NO: 563 내지 565, SEQ ID NO: 569 내지 573, SEQ ID NO: 596 내지 600, SEQ ID NO: 650, SEQ ID NO: 656, 및 SEQ ID NO: 700 내지 705로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 520 내지 521, SEQ ID NO: 523 내지 524, SEQ ID NO: 554 내지 556, SEQ ID NO: 558, SEQ ID NO: 561, SEQ ID NO: 563 내지 565, SEQ ID NO: 569 내지 573, SEQ ID NO: 596 내지 600, SEQ ID NO: 650, SEQ ID NO: 656, 및 SEQ ID NO: 700 내지 705로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 HLA 클래스 II 분자에 의해 표시된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이고, 여기서 단백질은 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 기관지 및 폐암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 520 내지 521, SEQ ID NO: 523 내지 524, SEQ ID NO: 554 내지 556, SEQ ID NO: 558, SEQ ID NO: 561, SEQ ID NO: 563 내지 565, SEQ ID NO: 569 내지 573, SEQ ID NO: 596 내지 600, SEQ ID NO: 650, SEQ ID NO: 656, 및 SEQ ID NO: 700 내지 705로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 대상체에 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 기관지 및 폐암를 치료 또는예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 520 내지 521, SEQ ID NO: 523 내지 524, SEQ ID NO: 554 내지 556, SEQ ID NO: 558, SEQ ID NO: 561, SEQ ID NO: 563 내지 565, SEQ ID NO: 569 내지 573, SEQ ID NO: 596 내지 600, SEQ ID NO: 650, SEQ ID NO: 656, 및 SEQ ID NO: 700 내지 705로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 646 내지 667, SEQ ID NO: 708 내지 717, 및 SEQ ID NO: 733 내지 748로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 646 내지 667, SEQ ID NO: 708 내지 717, 및 SEQ ID NO: 733 내지 748로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 생체내 발현을 위한 구조체 내에서 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 II 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 갖는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 유방암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 646 내지 667, SEQ ID NO: 708 내지 717, 및 SEQ ID NO: 733 내지 748로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 대상체에 투여하여 유방암를 치료하거나 예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 646 내지 667, SEQ ID NO: 708 내지 717, 및 SEQ ID NO: 733 내지 748로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 646 내지 667, SEQ ID NO: 708 내지 717, 및 SEQ ID NO: 733 내지 748로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 646 내지 667, SEQ ID NO: 708 내지 717, 및 SEQ ID NO: 733 내지 748로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 HLA 클래스 II 분자에 의해 표시된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이고, 여기서 단백질은 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 유방암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 646 내지 667, SEQ ID NO: 708 내지 717, 및 SEQ ID NO: 733 내지 748로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 대상체에 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 유방암를 치료 또는예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 646 내지 667, SEQ ID NO: 708 내지 717, 및 SEQ ID NO: 733 내지 748로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 646 내지 667, SEQ ID NO: 708 내지 717, 및 SEQ ID NO: 733 내지 748로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 646 내지 667, SEQ ID NO: 708 내지 717, 및 SEQ ID NO: 733 내지 748로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 생체내 발현을 위한 구조체 내에서 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 II 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 갖는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 난소암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 646 내지 667, SEQ ID NO: 708 내지 717, 및 SEQ ID NO: 733 내지 748로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 대상체에 투여하여 난소암를 치료하거나 예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 646 내지 667, SEQ ID NO: 708 내지 717, 및 SEQ ID NO: 733 내지 748로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 646 내지 667, SEQ ID NO: 708 내지 717, 및 SEQ ID NO: 733 내지 748로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 646 내지 667, SEQ ID NO: 708 내지 717, 및 SEQ ID NO: 733 내지 748로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 HLA 클래스 II 분자에 의해 표시된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 AKT1, BRAF, EGFR, GTF2I, HRAS, IDH1, KRAS, NRAS, PIK3CA, PTEN, 및 TP53로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물 내의 펩티드는 단백질의 변형 또는 비변형 단편이고, 여기서 단백질은 AKT1 E17K, BRAF V600E, BRAF V600M, EGFR A289V, EGFR G598V, EGFR L858R, GTF2I L424H, IDH1 R132C, IDH1 R132H, KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, KRAS G13D, NRAS Q61K, NRAS Q61L, NRAS Q61R, PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R, PIK3CA R88Q, PTEN R130G, PTEN R130Q, TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W, 및 TP53 Y220C로 구성된 군으로부터 선택된 돌연변이를 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 난소암이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 646 내지 667, SEQ ID NO: 708 내지 717, 및 SEQ ID NO: 733 내지 748로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 대상체에 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 난소암를 치료 또는예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 646 내지 667, SEQ ID NO: 708 내지 717, 및 SEQ ID NO: 733 내지 748로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다.
CT 항원 백신
한 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 28796 내지 28864, SEQ ID NO: 37110 내지 37174, SEQ ID NO: 41321 내지 41397, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49004, SEQ ID NO: 49071, SEQ ID NO: 49395, SEQ ID NO: 50632, SEQ ID NO: 50729, SEQ ID NO: 51434 내지 51510, SEQ ID NO: 55758, SEQ ID NO: 60456 내지 60527, SEQ ID NO: 68238 내지 68321, SEQ ID NO: 77091, SEQ ID NO: 77210, SEQ ID NO: 84188, SEQ ID NO: 87951, SEQ ID NO: 88144, SEQ ID NO: 95593 내지 95664, SEQ ID NO: 113808 내지 113869, SEQ ID NO: 125134 내지 125218, SEQ ID NO: 144109 내지 144188, SEQ ID NO: 162383 내지 162453, SEQ ID NO: 166444 내지 166531, SEQ ID NO: 167118, SEQ ID NO: 169740, SEQ ID NO: 173412, SEQ ID NO: 179404, 및 SEQ ID NO: 182574 내지 182654로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 제공한다.
일부 실시예에서, 핵산 서열은 SEQ ID NO: 28796 내지 28864, SEQ ID NO: 37110 내지 37174, SEQ ID NO: 41321 내지 41397, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49004, SEQ ID NO: 49071, SEQ ID NO: 49395, SEQ ID NO: 50632, SEQ ID NO: 50729, SEQ ID NO: 51434 내지 51510, SEQ ID NO: 55758, SEQ ID NO: 60456 내지 60527, SEQ ID NO: 68238 내지 68321, SEQ ID NO: 77091, SEQ ID NO: 77210, SEQ ID NO: 84188, SEQ ID NO: 87951, SEQ ID NO: 88144, SEQ ID NO: 95593 내지 95664, SEQ ID NO: 113808 내지 113869, SEQ ID NO: 125134 내지 125218, SEQ ID NO: 144109 내지 144188, SEQ ID NO: 162383 내지 162453, SEQ ID NO: 166444 내지 166531, SEQ ID NO: 167118, SEQ ID NO: 169740, SEQ ID NO: 173412, SEQ ID NO: 179404, 및 SEQ ID NO: 182574 내지 182654로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 28796 내지 28864, SEQ ID NO: 37110 내지 37174, SEQ ID NO: 41321 내지 41397, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49004, SEQ ID NO: 49071, SEQ ID NO: 49395, SEQ ID NO: 50632, SEQ ID NO: 50729, SEQ ID NO: 51434 내지 51510, SEQ ID NO: 55758, SEQ ID NO: 60456 내지 60527, SEQ ID NO: 68238 내지 68321, SEQ ID NO: 77091, SEQ ID NO: 77210, SEQ ID NO: 84188, SEQ ID NO: 87951, SEQ ID NO: 88144, SEQ ID NO: 95593 내지 95664, SEQ ID NO: 113808 내지 113869, SEQ ID NO: 125134 내지 125218, SEQ ID NO: 144109 내지 144188, SEQ ID NO: 162383 내지 162453, SEQ ID NO: 166444 내지 166531, SEQ ID NO: 167118, SEQ ID NO: 169740, SEQ ID NO: 173412, SEQ ID NO: 179404, 및 SEQ ID NO: 182574 내지 182654로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 대상체에 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 28796 내지 28864, SEQ ID NO: 37110 내지 37174, SEQ ID NO: 41321 내지 41397, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49004, SEQ ID NO: 49071, SEQ ID NO: 49395, SEQ ID NO: 50632, SEQ ID NO: 50729, SEQ ID NO: 51434 내지 51510, SEQ ID NO: 55758, SEQ ID NO: 60456 내지 60527, SEQ ID NO: 68238 내지 68321, SEQ ID NO: 77091, SEQ ID NO: 77210, SEQ ID NO: 84188, SEQ ID NO: 87951, SEQ ID NO: 88144, SEQ ID NO: 95593 내지 95664, SEQ ID NO: 113808 내지 113869, SEQ ID NO: 125134 내지 125218, SEQ ID NO: 144109 내지 144188, SEQ ID NO: 162383 내지 162453, SEQ ID NO: 166444 내지 166531, SEQ ID NO: 167118, SEQ ID NO: 169740, SEQ ID NO: 173412, SEQ ID NO: 179404, 및 SEQ ID NO: 182574 내지 182654로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 생체내 발현을 위한 구조체 내에서 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 CTG1B, KKLC1, MAGA1, MAGA3, MAGA4, MAGC1, MAGC3, MAR1, PMEL, PRAME, SSX2, TYRP1, 및 TYRP2로 구성된 군으로부터 선택된 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 췌장암, 피부암, 갑상선암, 뇌암, 결장직장암, 기관지 및 폐암, 유방암, 및 난소암로 구성된 군으로부터 선택된다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 28796 내지 28864, SEQ ID NO: 37110 내지 37174, SEQ ID NO: 41321 내지 41397, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49004, SEQ ID NO: 49071, SEQ ID NO: 49395, SEQ ID NO: 50632, SEQ ID NO: 50729, SEQ ID NO: 51434 내지 51510, SEQ ID NO: 55758, SEQ ID NO: 60456 내지 60527, SEQ ID NO: 68238 내지 68321, SEQ ID NO: 77091, SEQ ID NO: 77210, SEQ ID NO: 84188, SEQ ID NO: 87951, SEQ ID NO: 88144, SEQ ID NO: 95593 내지 95664, SEQ ID NO: 113808 내지 113869, SEQ ID NO: 125134 내지 125218, SEQ ID NO: 144109 내지 144188, SEQ ID NO: 162383 내지 162453, SEQ ID NO: 166444 내지 166531, SEQ ID NO: 167118, SEQ ID NO: 169740, SEQ ID NO: 173412, SEQ ID NO: 179404, 및 SEQ ID NO: 182574 내지 182654로 구성된 군으로부터 선택된 3개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 28796 내지 28864, SEQ ID NO: 37110 내지 37174, SEQ ID NO: 41321 내지 41397, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49004, SEQ ID NO: 49071, SEQ ID NO: 49395, SEQ ID NO: 50632, SEQ ID NO: 50729, SEQ ID NO: 51434 내지 51510, SEQ ID NO: 55758, SEQ ID NO: 60456 내지 60527, SEQ ID NO: 68238 내지 68321, SEQ ID NO: 77091, SEQ ID NO: 77210, SEQ ID NO: 84188, SEQ ID NO: 87951, SEQ ID NO: 88144, SEQ ID NO: 95593 내지 95664, SEQ ID NO: 113808 내지 113869, SEQ ID NO: 125134 내지 125218, SEQ ID NO: 144109 내지 144188, SEQ ID NO: 162383 내지 162453, SEQ ID NO: 166444 내지 166531, SEQ ID NO: 167118, SEQ ID NO: 169740, SEQ ID NO: 173412, SEQ ID NO: 179404, 및 SEQ ID NO: 182574 내지 182654로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 28796 내지 28864, SEQ ID NO: 37110 내지 37174, SEQ ID NO: 41321 내지 41397, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49004, SEQ ID NO: 49071, SEQ ID NO: 49395, SEQ ID NO: 50632, SEQ ID NO: 50729, SEQ ID NO: 51434 내지 51510, SEQ ID NO: 55758, SEQ ID NO: 60456 내지 60527, SEQ ID NO: 68238 내지 68321, SEQ ID NO: 77091, SEQ ID NO: 77210, SEQ ID NO: 84188, SEQ ID NO: 87951, SEQ ID NO: 88144, SEQ ID NO: 95593 내지 95664, SEQ ID NO: 113808 내지 113869, SEQ ID NO: 125134 내지 125218, SEQ ID NO: 144109 내지 144188, SEQ ID NO: 162383 내지 162453, SEQ ID NO: 166444 내지 166531, SEQ ID NO: 167118, SEQ ID NO: 169740, SEQ ID NO: 173412, SEQ ID NO: 179404, 및 SEQ ID NO: 182574 내지 182654로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 28796 내지 28830로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 CTG1B 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 28796 내지 28830로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 28796 내지 28830로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 28796 내지 28830로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 CTG1B 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 41321 내지 41354로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 MAGA1 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 41321 내지 41354로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 41321 내지 41354로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 41321 내지 41354로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 MAGA1 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49004, 및 SEQ ID NO: 51434 내지 51468로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 MAGA3 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49004, 및 SEQ ID NO: 51434 내지 51468로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49004, 및 SEQ ID NO: 51434 내지 51468로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49004, 및 SEQ ID NO: 51434 내지 51468로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 MAGA3 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 41352, SEQ ID NO: 41770, 및 SEQ ID NO: 60456 내지 60487로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 MAGA4 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 41352, SEQ ID NO: 41770, 및 SEQ ID NO: 60456 내지 60487로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 41352, SEQ ID NO: 41770, 및 SEQ ID NO: 60456 내지 60487로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 41352, SEQ ID NO: 41770, 및 SEQ ID NO: 60456 내지 60487로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 MAGA4 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 49395 및 SEQ ID NO: 68238 내지 68272로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 MAGC1 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 49395 및 SEQ ID NO: 68238 내지 68272로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 49395 및 SEQ ID NO: 68238 내지 68272로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 49395 및 SEQ ID NO: 68238 내지 68272로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 MAGC1 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 77091, SEQ ID NO: 77210, SEQ ID NO: 84188, SEQ ID NO: 88144, 및 SEQ ID NO: 95593 내지 95624로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 MAGC3 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 77091, SEQ ID NO: 77210, SEQ ID NO: 84188, SEQ ID NO: 88144, 및 SEQ ID NO: 95593 내지 95624로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 77091, SEQ ID NO: 77210, SEQ ID NO: 84188, SEQ ID NO: 88144, 및 SEQ ID NO: 95593 내지 95624로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 77091, SEQ ID NO: 77210, SEQ ID NO: 84188, SEQ ID NO: 88144, 및 SEQ ID NO: 95593 내지 95624로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 MAGC3 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 162383 내지 162420로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SSX2 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 162383 내지 162420로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 162383 내지 162420로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 162383 내지 162420로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 SSX2 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 144109 내지 144142로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 PRAME 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 144109 내지 144142로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 144109 내지 144142로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 144109 내지 144142로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 PRAME 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 37110 내지 37145로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 KKLC1 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 37110 내지 37145로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 37110 내지 37145로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 37110 내지 37145로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 KKLC1 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 125134 내지 125167로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 PMEL 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 125134 내지 125167로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 125134 내지 125167로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 125134 내지 125167로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 PMEL 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 166444 내지 166480로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TYRP1 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 166444 내지 166480로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 166444 내지 166480로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 166444 내지 166480로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 TYRP1 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 169740, SEQ ID NO: 173412, SEQ ID NO: 179404, 및 SEQ ID NO: 182574 내지 182606로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TYRP2 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 169740, SEQ ID NO: 173412, SEQ ID NO: 179404, 및 SEQ ID NO: 182574 내지 182606로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 169740, SEQ ID NO: 173412, SEQ ID NO: 179404, 및 SEQ ID NO: 182574 내지 182606로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 169740, SEQ ID NO: 173412, SEQ ID NO: 179404, 및 SEQ ID NO: 182574 내지 182606로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 TYRP2 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 113808 내지 113843로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 MAR1 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 113808 내지 113843로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 113808 내지 113843로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 113808 내지 113843로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 MAR1 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
한 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 28796 내지 28864, SEQ ID NO: 37110 내지 37174, SEQ ID NO: 41321 내지 41397, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49004, SEQ ID NO: 49071, SEQ ID NO: 49395, SEQ ID NO: 50632, SEQ ID NO: 50729, SEQ ID NO: 51434 내지 51510, SEQ ID NO: 55758, SEQ ID NO: 60456 내지 60527, SEQ ID NO: 68238 내지 68321, SEQ ID NO: 77091, SEQ ID NO: 77210, SEQ ID NO: 84188, SEQ ID NO: 87951, SEQ ID NO: 88144, SEQ ID NO: 95593 내지 95664, SEQ ID NO: 113808 내지 113869, SEQ ID NO: 125134 내지 125218, SEQ ID NO: 144109 내지 144188, SEQ ID NO: 162383 내지 162453, SEQ ID NO: 166444 내지 166531, SEQ ID NO: 167118, SEQ ID NO: 169740, SEQ ID NO: 173412, SEQ ID NO: 179404, 및 SEQ ID NO: 182574 내지 182654로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 제공한다.
일부 실시예에서, 핵산 서열은 SEQ ID NO: 28796 내지 28864, SEQ ID NO: 37110 내지 37174, SEQ ID NO: 41321 내지 41397, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49004, SEQ ID NO: 49071, SEQ ID NO: 49395, SEQ ID NO: 50632, SEQ ID NO: 50729, SEQ ID NO: 51434 내지 51510, SEQ ID NO: 55758, SEQ ID NO: 60456 내지 60527, SEQ ID NO: 68238 내지 68321, SEQ ID NO: 77091, SEQ ID NO: 77210, SEQ ID NO: 84188, SEQ ID NO: 87951, SEQ ID NO: 88144, SEQ ID NO: 95593 내지 95664, SEQ ID NO: 113808 내지 113869, SEQ ID NO: 125134 내지 125218, SEQ ID NO: 144109 내지 144188, SEQ ID NO: 162383 내지 162453, SEQ ID NO: 166444 내지 166531, SEQ ID NO: 167118, SEQ ID NO: 169740, SEQ ID NO: 173412, SEQ ID NO: 179404, 및 SEQ ID NO: 182574 내지 182654로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 28796 내지 28864, SEQ ID NO: 37110 내지 37174, SEQ ID NO: 41321 내지 41397, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49004, SEQ ID NO: 49071, SEQ ID NO: 49395, SEQ ID NO: 50632, SEQ ID NO: 50729, SEQ ID NO: 51434 내지 51510, SEQ ID NO: 55758, SEQ ID NO: 60456 내지 60527, SEQ ID NO: 68238 내지 68321, SEQ ID NO: 77091, SEQ ID NO: 77210, SEQ ID NO: 84188, SEQ ID NO: 87951, SEQ ID NO: 88144, SEQ ID NO: 95593 내지 95664, SEQ ID NO: 113808 내지 113869, SEQ ID NO: 125134 내지 125218, SEQ ID NO: 144109 내지 144188, SEQ ID NO: 162383 내지 162453, SEQ ID NO: 166444 내지 166531, SEQ ID NO: 167118, SEQ ID NO: 169740, SEQ ID NO: 173412, SEQ ID NO: 179404, 및 SEQ ID NO: 182574 내지 182654로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 대상체에 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 28796 내지 28864, SEQ ID NO: 37110 내지 37174, SEQ ID NO: 41321 내지 41397, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49004, SEQ ID NO: 49071, SEQ ID NO: 49395, SEQ ID NO: 50632, SEQ ID NO: 50729, SEQ ID NO: 51434 내지 51510, SEQ ID NO: 55758, SEQ ID NO: 60456 내지 60527, SEQ ID NO: 68238 내지 68321, SEQ ID NO: 77091, SEQ ID NO: 77210, SEQ ID NO: 84188, SEQ ID NO: 87951, SEQ ID NO: 88144, SEQ ID NO: 95593 내지 95664, SEQ ID NO: 113808 내지 113869, SEQ ID NO: 125134 내지 125218, SEQ ID NO: 144109 내지 144188, SEQ ID NO: 162383 내지 162453, SEQ ID NO: 166444 내지 166531, SEQ ID NO: 167118, SEQ ID NO: 169740, SEQ ID NO: 173412, SEQ ID NO: 179404, 및 SEQ ID NO: 182574 내지 182654로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 핵산 서열은 생체내 발현을 위한 구조체 내에서 투여된다. 일부 실시예에서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 II 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 CTG1B, KKLC1, MAGA1, MAGA3, MAGA4, MAGC1, MAGC3, MAR1, PMEL, PRAME, SSX2, TYRP1, 및 TYRP2로 구성된 군으로부터 선택된 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 암을 예방하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여된다. 일부 실시예에서, 암은 췌장암, 피부암, 갑상선암, 뇌암, 결장직장암, 기관지 및 폐암, 유방암, 및 난소암로 구성된 군으로부터 선택된다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 28796 내지 28864, SEQ ID NO: 37110 내지 37174, SEQ ID NO: 41321 내지 41397, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49004, SEQ ID NO: 49071, SEQ ID NO: 49395, SEQ ID NO: 50632, SEQ ID NO: 50729, SEQ ID NO: 51434 내지 51510, SEQ ID NO: 55758, SEQ ID NO: 60456 내지 60527, SEQ ID NO: 68238 내지 68321, SEQ ID NO: 77091, SEQ ID NO: 77210, SEQ ID NO: 84188, SEQ ID NO: 87951, SEQ ID NO: 88144, SEQ ID NO: 95593 내지 95664, SEQ ID NO: 113808 내지 113869, SEQ ID NO: 125134 내지 125218, SEQ ID NO: 144109 내지 144188, SEQ ID NO: 162383 내지 162453, SEQ ID NO: 166444 내지 166531, SEQ ID NO: 167118, SEQ ID NO: 169740, SEQ ID NO: 173412, SEQ ID NO: 179404, 및 SEQ ID NO: 182574 내지 182654로 구성된 군으로부터 선택된 3개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 28796 내지 28864, SEQ ID NO: 37110 내지 37174, SEQ ID NO: 41321 내지 41397, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49004, SEQ ID NO: 49071, SEQ ID NO: 49395, SEQ ID NO: 50632, SEQ ID NO: 50729, SEQ ID NO: 51434 내지 51510, SEQ ID NO: 55758, SEQ ID NO: 60456 내지 60527, SEQ ID NO: 68238 내지 68321, SEQ ID NO: 77091, SEQ ID NO: 77210, SEQ ID NO: 84188, SEQ ID NO: 87951, SEQ ID NO: 88144, SEQ ID NO: 95593 내지 95664, SEQ ID NO: 113808 내지 113869, SEQ ID NO: 125134 내지 125218, SEQ ID NO: 144109 내지 144188, SEQ ID NO: 162383 내지 162453, SEQ ID NO: 166444 내지 166531, SEQ ID NO: 167118, SEQ ID NO: 169740, SEQ ID NO: 173412, SEQ ID NO: 179404, 및 SEQ ID NO: 182574 내지 182654로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 28796 내지 28864, SEQ ID NO: 37110 내지 37174, SEQ ID NO: 41321 내지 41397, SEQ ID NO: 41770, SEQ ID NO: 49004, SEQ ID NO: 49071, SEQ ID NO: 49395, SEQ ID NO: 50632, SEQ ID NO: 50729, SEQ ID NO: 51434 내지 51510, SEQ ID NO: 55758, SEQ ID NO: 60456 내지 60527, SEQ ID NO: 68238 내지 68321, SEQ ID NO: 77091, SEQ ID NO: 77210, SEQ ID NO: 84188, SEQ ID NO: 87951, SEQ ID NO: 88144, SEQ ID NO: 95593 내지 95664, SEQ ID NO: 113808 내지 113869, SEQ ID NO: 125134 내지 125218, SEQ ID NO: 144109 내지 144188, SEQ ID NO: 162383 내지 162453, SEQ ID NO: 166444 내지 166531, SEQ ID NO: 167118, SEQ ID NO: 169740, SEQ ID NO: 173412, SEQ ID NO: 179404, 및 SEQ ID NO: 182574 내지 182654로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 197897 내지 197901로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 CTG1B 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 197897 내지 197901로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 197897 내지 197901로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 197897 내지 197901로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 CTG1B 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 211901 내지 211904로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 MAGA1 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 211901 내지 211904로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 211901 내지 211904로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 211901 내지 211904로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 MAGA1 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 223623 내지 223627로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 MAGA3 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 223623 내지 223627로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 223623 내지 223627로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 223623 내지 223627로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 MAGA3 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 236016 내지 236020로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 MAGA4 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 236016 내지 236020로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 236016 내지 236020로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 236016 내지 236020로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 MAGA4 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 247059 내지 247063로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 MAGC1 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 247059 내지 247063로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 247059 내지 247063로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 247059 내지 247063로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 MAGC1 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 281350 내지 281353로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 MAGC3 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 281350 내지 281353로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 281350 내지 281353로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 281350 내지 281353로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 MAGC3 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 369027 내지 369031로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SSX2 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 369027 내지 369031로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 369027 내지 369031로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 369027 내지 369031로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 SSX2 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 342521 내지 342525로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 PRAME 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 342521 내지 342525로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 342521 내지 342525로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 342521 내지 342525로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 PRAME 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 206663 내지 206665로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 KKLC1 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 206663 내지 206665로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 206663 내지 206665로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 206663 내지 206665로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 KKLC1 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 317360 내지 317363로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 PMEL 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 317360 내지 317363로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 317360 내지 317363로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 317360 내지 317363로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 PMEL 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 373348 내지 373350로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TYRP1 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 373348 내지 373350로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 373348 내지 373350로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 373348 내지 373350로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 TYRP1 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 392434 내지 392437로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 TYRP2 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 392434 내지 392437로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 392434 내지 392437로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 392434 내지 392437로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 TYRP2 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 305566 내지 305570로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 MAR1 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 305566 내지 305570로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 305566 내지 305570로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 305566 내지 305570로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 MAR1 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
자가면역질환 백신
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 34169 내지 34204로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 INS 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 34169 내지 34204로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 34169 내지 34204로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 34169 내지 34204로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 INS 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 116478 내지 116515로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 MOG 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 116478 내지 116515로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 116478 내지 116515로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 116478 내지 116515로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 MOG 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 203517 내지 203521로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 INS 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 203517 내지 203521로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 203517 내지 203521로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 203517 내지 203521로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 INS 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 307670 내지 307674로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 MOG 단백질로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시예에서, 면역원성 조성물은 SEQ ID NO: 307670 내지 307674로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함한다.
다른 양태에서, 본 발명은 SEQ ID NO: 307670 내지 307674로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 펩티드를 포함하는 면역원성 펩티드 조성물을 제공한다.
일부 실시예에서, 면역원성 펩티드 조성물은 SEQ ID NO: 307670 내지 307674로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 펩티드를 포함한다. 일부 실시예에서, 하나 이상의 펩티드는 MOG 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
구성
일부 실시예에서, 펩티드 백신은 본 개시내용의 하나 이상의 펩티드를 포함하고 제약상 허용되는 담체를 포함하는 약학 조성물로 투여된다. 일부 실시예에서, 펩티드 백신은 본 개시내용에 기재된 바와 같이 제3 펩티드 세트로 구성된다. 일부 실시예에서, 약학 조성물은 스프레이, 에어로졸, 겔, 용액, 에멀젼, 지질 나노입자, 나노입자 또는 현탁액의 형태이다.
상기 조성물은 약학적으로 허용되는 담체를 사용해 피험체에 투여하는 것이 바람직하다. 통상적으로, 일부 실시예에서 적절한 양의 약학적으로 허용되는 염이 제제에 사용되며, 일부 실시예에서 제제를 등장성으로 만들 수 있다.
특정 실시예에서, 펩티드는 본원에 기재된 임의의 한 펩티드 및 약학적으로 허용되는 담체를 포함하는 면역원성 조성물로 제공된다. 특정 실시예에서, 면역원성 조성물은 보조제를 추가로 포함한다. 특정 실시예에서, 펩티드는 당업계에 알려진 바와 같이 다른 분자와 접합되어 그 효과를 증가시킨다. 예를 들어, 펩티드는 항원 제시 세포의 세포 표면 단백질을 인식하는 항체에 결합되어 백신 효과를 높일 수 있다. 펩티드 전달의 효과를 높이는 방법 중 하나가 Woodham, et al.(2018)에 기재되어 있다. 자가면역 질환의 치료의 특정 실시예에서, 펩티드는 당업계에 알려진 바와 같이 내성을 유도하도록 설계된 조성물 및 프로토콜과 함께 전달된다. 면역 내성을 위해 펩티드를 사용하는 방법의 예는 Alhadj Ali, et al.(2017) 및 Gibson, et al.(2015)에 기재되어 있다.
일부 실시예에서, 약학적으로 허용 가능한 담체는 식염수, 링거 용액, 포도당 용액 및 이들의 조합으로 구성된 군으로부터 선택된다. 당업계에 알려진 다른 적합한 약학적으로 허용되는 담체가 고려된다. 적합한 담체와 그 제형은 Remington의 Pharmaceutical Sciences, 2005, Mack Publishing Co.에 설명되어 있다. 용액의 pH는 약 5 내지 약 8이 바람직하며, 보다 바람직한 것은 약 7 내지 약 7.5이다. 제제는 또한 동결건조된 분말을 포함할 수 있다. 추가 담체에는 고체 소수성 중합체의 반투과성 매트릭스와 같은 지속 방출 제제가 포함되며, 이러한 매트릭스는 예를 들어 필름, 리포좀 또는 마이크로입자와 같은 성형품 형태이다. 이 분야에 숙련된 사람에게는, 예를 들어 투여되는 펩티드의 투여 경로 및 농도에 따라 특정 담체가 더 선호될 수 있다는 것이 명백할 것이다.
본원에서 사용된 약학적으로 허용 가능한 담체라는 용어는 대상 약제를 신체의 한 기관 또는 일부에서 다른 기관 또는 신체의 일부로 운반하는 데 관여하는 액체 또는 고체 충전제, 희석제, 부형제, 용매 또는 캡슐화 물질과 같은 약학적으로 허용되는 물질, 조성물 또는 매개체를 의미한다. 각 담체는 제제의 다른 성분과 호환되고 환자에게 해롭지 않다는 점에서 허용된다. 약학적으로 허용되는 담체로 작용할 수 있는 물질의 예는 유당, 포도당 및 자당과 같은 당, 옥수수 전분 및 감자 전분과 같은 전분, 셀룰로오스 및 그 유도체(예: 나트륨 카르복시메틸 셀룰로오스, 에틸 셀룰로오스 및 셀룰로오스 아세테이트), 분말 트라가칸스, 맥아, 젤라틴, 활석, 부형제, 코코아 버터 및 좌약 왁스와 같은 부형제, 땅콩 오일, 면실유, 홍화유, 참기름, 올리브유, 옥수수 오일 및 대두유와 같은 오일, 부틸렌 글리콜과 같은 글리콜, 글리세린, 소르비톨, 만니톨 및 폴리에틸렌 글리콜과 같은 폴리올, 에틸 올레이트 및 에틸 라우레이트와 같은 에스테르, 한천, 수산화 마그네슘 및 수산화 알루미늄과 같은 완충제, 알긴산, 무발열수, 등소성 식염수, 링거 용액, 에틸 알코올, 인산염 완충 용액 및 제약 제제에 사용되는 기타 무독성 호환 물질이 포함된다. 담체라는 용어는 유기 또는 무기 성분(천연 또는 합성)을 나타내며, 활성 성분과 결합하여 적용을 용이하게 한다. 또한, 제약 조성물의 성분은 원하는 약제학적 효율을 실질적으로 손상시킬 수 있는 상호작용이 없는 방식으로 본 발명의 화합물과 서로 혼합될 수 있다. 조성물은 또한 등가제, 방부제, 계면활성제, 2가 양이온, 바람직하게는 아연과 같은 추가 제제를 포함할 수 있다.
상기 조성물은 또한 완충제, 환원제, 벌크 단백질, 아미노산(예: 글리신 또는 프랄린) 또는 탄수화물과 같은 펩티드 조성물의 안정화제 또는 부형제를 포함할 수 있다. 펩티드 조성물을 제조하는데 유용한 벌크 단백질은 알부민을 포함한다. 펩티드 제제에 유용한 전형적인 탄수화물에는 자당, 만니톨, 락토오스, 트레할로스 또는 포도당이 포함되지만 이에 국한되지 않는다.
계면활성제는 또한 조성물에 포함된 펩티드 또는 단백질의 가용성 및 불용성 응집 및/또는 침전을 방지하는 데 사용될 수 있다. 적합한 계면활성제는 소르비탄 트리올레에이트, 대두 레시틴 및 올레산을 포함하나 이에 국한되지 않는다. 경우에 따라 에어로졸 용액에 대해 에탄올과 같은 용제를 사용하는 것이 선호된다. 따라서, 펩티드를 포함하는 제제는 또한 에어로졸을 형성할 때 용액의 원자화에 의해 펩티드의 표면 유도 응집을 감소시키거나 방지할 수 있는 계면활성제를 포함할 수 있다. 폴리옥시에틸렌 지방산 에스테르 및 알코올, 폴리옥시에틸렌 소르비톨 지방산 에스테르와 같은 다양한 기존 계면 활성제를 사용할 수 있다. 양은 일반적으로 제제의 중량 기준으로 0.001% ~ 4% 사이이다. 일부 실시예에서, 본 개시내용에 사용된 계면활성제는 폴리옥시에틸렌 소르비탄 모노올레에이트, 폴리소르베이트 80, 폴리소르베이트 20이다. 또한 당업계에 알려진 추가 약제가 조성물에 포함될 수 있다.
일부 실시예에서, 약학적 조성물 및 제형은 활성 성분이 분해되는 속도를 감소시키거나 조성물의 특성이 변하는 하나 이상의 화합물을 추가로 포함한다. 소위 안정제 또는 방부제에는 아미노산, 항산화제, pH 완충제 또는 염분 완충제가 포함될 수 있지만 이에 국한되지 않는다. 항산화제의 비제한적 예로는 부틸화 하이드록시 아니솔(BHA), 아스코르브산 및 그 유도체, 토코페롤 및 그 유도체, 부틸화 하이드록시 아니솔 및 시스테인이 있다. 방부제의 비제한적인 예로는 메틸 또는 프로필 p-하이드록시벤조에이트 및 벤잘코늄 클로라이드와 같은 파라벤이 있다. 아미노산의 추가적인 비제한적인 예로는 글리신 또는 프롤린이 있다.
본 발명은 또한 실온에서 안정하거나 약학 투여에 선호되는 투명하거나 거의 투명한 용액을 생성하는 2가 양이온을 포함하거나 포함하지 않는 프롤린 또는 글리신을 포함하는 아미노산을 사용해 중성 pH 또는 중성 pH 미만에서 펩티드를 함유하는 액체 용액의 안정화(열적으로 또는 기계적으로 유도된 용해성 또는 불용성 응집 및/또는 억제제 단백질의 침전을 방지하거나 최소화)를 교시한다
일 실시예에서, 조성물은 단일 단위 또는 다중 단위 투여 형태의 약학적 조성물이다. 본 발명의 단일 단위 또는 다중 단위 투여 형태의 약제학적 조성물에는 예방적 또는 치료적 유효량의 하나 이상의 조성물 (예를 들어, 본 발명의 화합물 또는 다른 예방적 또는 치료제), 통상적으로 하나 이상의 매개체, 담체 또는 부형제, 안정화제 및/또는 보존제가 포함된다. 바람직하게는 매개체, 담체, 부형제, 안정화제 및 방부제가 약제학적으로 허용된다.
일부 실시예에서, 제약 조성물 및 제형은 무수 제약 조성물 및 제형을 포함한다. 본 발명의 무수 제약 조성물 및 제형은 무수 또는 저수분 함유 성분 및 저수분 또는 저습도 조건을 사용하여 제조할 수 있다. 유당과 1차 또는 2차 아민을 포함하는 하나 이상의 활성 성분을 포함하는 제약 조성물 및 제형은 제조, 포장 및/또는 보관 중에 수분 및/또는 습도와의 실질적인 접촉이 예상되는 경우 무수물인 것이 바람직하다. 무수 제약 조성물은 무수 성질이 유지되도록 제조하고 보관해야 한다. 따라서, 무수 조성물은 적합한 처방 키트에 포함시킬 수 있도록 물에 대한 노출을 방지하는 것으로 알려진 물질을 사용하여 포장하는 것이 바람직하다. 적합한 포장의 예로는 밀폐 포일, 플라스틱, 단위 용량 용기(예:바이알), 블리스터 팩 및 스트립 팩이 포함되며 이에 국한되지 않는다.
적합한 매개체는 약학 분야의 전문가들에게 잘 알려져 있으며, 적합한 매개체의 비제한적인 예로는 포도당, 자당, 전분, 유당, 젤라틴, 쌀, 실리카겔, 글리세롤, 활석, 염화나트륨, 건조 탈지유, 프로필렌 글리콜, 물, 스테아린산 나트륨, 에탄올 및 당업계에서 잘 알려진 유사 물질이 있다.식염수 용액과 포도당 및 글리세롤 수용액도 액체 매개체로 사용할 수 있다. 특정 매개체가 약제학적 조성물 또는 제형에 혼입하기에 적합한지 여부는 제형이 환자에게 투여되는 방식 및 제형의 특정 활성 성분을 포함하나 이에 국한되지 않는 당업계에 잘 알려진 다양한 인자에 따라 좌우된다. 약제학적 매개체는 물 및 석유, 동물성, 식물성 또는 합성 기원의 것을 포함하는 오일, 예를 들어 땅콩유, 대두유, 광유, 참기름 등과 같은 멸균 액체일 수 있다.
본 발명은 또한 약제학적 조성물을 양을 나타내는 앰플 또는 포와 같은 밀폐 용기에 포장할 수 있다고 규정한다. 일 실시예에서, 약제학적 조성물은 환자의 하부 기도에 투여하기에 적합한 전달 장치에서 건식 멸균된 동결건조 분말로서 공급될 수 있다. 원하는 경우 약제학적 조성물은 활성 성분을 함유하는 하나 이상의 단위 제형을 포함할 수 있는 팩 또는 디스펜서 장치에 제공될 수 있다. 팩은 예를 들어 블리스터 팩과 같은 금속 또는 플라스틱 호일로 구성될 수 있다. 팩 또는 디스펜서 장치에는 투여 지침이 함께 제공될 수 있다.
이러한 제제나 조성물의 제조 방법은 본 발명의 화합물을 담체 및 선택적으로 하나 이상의 보조 성분과 결합시키는 단계를 포함한다. 일반적으로, 제제는 본 발명의 화합물을 액체 담체 또는 미분된 고체 담체 또는 둘 다와 균일하고 밀접하게 결합시킨 다음, 필요하다면 제품을 성형함으로써 제조된다.
투여에 적합한 본 발명의 제제는 분말, 과립 형태, 또는 수성 또는 비수성 액체의 용액 또는 현탁액, 수중유 또는 유중수 액체 에멀젼, 엘릭서 또는 시럽, 또는 캔디형 알약(젤라틴 및 글리세린 또는 자당 및 아카시아와 같은 불활성 염기 사용) 및/또는 구강 청정제 등으로서, 각각 미리 정해진 양의 본 발명의 화합물(예: 펩티드)을 유효 성분으로 함유한다.
본원의 액체 조성물은 전달 장치와 함께 그대로 사용될 수 있으며, 또는 예를 들어 분무 건조 방법으로 제조되는 펩티드를 포함하는 약제학적으로 허용 가능한 제형의 제조에 사용될 수 있다. 제약학적 투여를 위한 펩티드/단백질의 분무 동결 건조 방법은 Maa et al., Curr. Pharm. Biotechnol., 2001, 1, 283-302에 기재되어 있으며 본원에 포함된다. 또 다른 실시예에서, 본원의 액체 용액은 동결 분무 건조되고 분무 건조된 생성물은 개인에게 투여될 때 치료학적으로 효과적인 분산성 펩티드 함유 분말로서 수집된다.
본 발명의 화합물 및 약제학적 조성물은 병용 요법에 사용될 수 있다. 즉 화합물 및 약학적 조성물은 하나 이상의 다른 원하는 치료제 또는 의학적 시술과 동시에, 그 이전 또는 이후에 투여될 수 있다(예를 들어, 펩티드 백신은 화학요법, 방사선, 약제학적 제제와 같은 다른 치료법과 병용하여 및/또는 다른 치료법으로 사용될 수 있다). 병용 요법에 사용하기 위한 특정 치료법(치료제 또는 시술)의 조합은 원하는 치료제 및/또는 시술의 호환성과 달성하려는 원하는 치료 효과를 고려한다. 또한 사용된 치료법이 동일한 질환에 대해 원하는 효과를 달성할 수 있다는 것도 이해될 것이다(예를 들어, 본 발명의 화합물은 다른 치료제 또는 예방약과 동시에 투여될 수 있다).
본 발명은 또한 본 발명의 약학적 조성물의 성분 중 하나 이상이 채워진 하나 이상의 용기를 포함하는 약학적 팩 또는 키트를 제공한다. 이러한 용기에 의약품 또는 생물학적 제제의 제조, 사용 또는 판매를 규제하는 정부 기관이 정한 양식으로 인체 투여를 위한 제조, 사용 또는 판매 기관의 승인이 반영된 안내문을 선택적으로 첨부할 수 있다.
본 발명은 암 또는 다른 질병을 치료하는데 적합한 펩티드를 포함하는 제형을 제공한다. 제형은 예를 들어스프레이, 에어로졸, 나노입자, 리포좀, 또는 당업계의 기술자에게 알려진 다른 형태로 제형화될 수 있다. 예를 들어 Remington의 Pharmaceutical Sciences, Remington: The Science and Practice of Pharmacy supra; Howard C., Ansel et al.의 Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems, Lippincott Williams & Wilkins; 7판(1999년 10월 1일)을 참조한다.
일반적으로, 질병의 급성 치료에 사용되는 제형은 동일한 질환의 만성 치료에 사용되는 제형보다 더 많은 양의 하나 이상의 활성 성분을 함유할 수 있다. 또한, 예방적 및 치료적으로 효과적인 제형은 조건에 따라 달라질 수 있다. 예를 들어, 치료적으로 효과적인 제형은 암 또는 다른 질병을 치료하고자 할 때 적절한 면역원성 작용을 갖는 펩티드를 함유할 수 있다. 한편, 상이한 유효 용량은 본 발명의 펩티드를 암 또는 다른 질병/상태의 예방제(예: 백신)로서 사용하고자 하는 경우 적절한 면역원성 작용을 갖는 펩티드를 함유할 수 있다. 이러한 방법과 본 발명에 포함된 특정 제형의 기타 방법은 서로 다를 수 있으며 당업계의 전문가에게 명백하다. 예를 들어, Remington의 Pharmaceutical Sciences, 2005, Mack Publishing Co., Remington: The Science and Practice of Pharmacy by Gennaro, Lippincott Williams & Wilkins, 20판(2003), Howard C. Ansel et al.의 Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems, Lippincott Williams & Wilkins; 7판(1999년 10월 1일), Encyclopedia of Pharmaceutical Technology, Swarbrick, J. & J.C. Boylan편집, Marcel Dekker, Inc., New York, 1988을 참조한다(전체 내용에 본원에 참조로 포함됨).
제약학적 조성물 또는 투여 형태의 pH는 또한 하나 이상의 활성 성분의 전달 및/또는 안정성을 개선하기 위해 조정될 수 있다. 마찬가지로 용매 담체의 극성, 이온 강도 또는 장성을 조정하여 전달을 개선할 수 있다. 또한 스테아레이트와 같은 화합물을 제약학적 조성물 또는 제형에 첨가하여 하나 이상의 활성 성분의 친수성 또는 친유성을 유리하게 변경하여 전달을 개선할 수 있다. 이와 관련하여, 스테아레이트는 또한 제형의 지질 전달체, 유화제 또는 계면활성제, 전달 증강제 또는 침투 촉진제로서 작용할 수 있다. 활성 성분의 다양한 염, 수화물 또는 용매화물을 사용하여 생성된 조성물의 특성을 추가로 조정할 수 있다.
면역화에 적합한 조성물을 생성하는 기술을 사용하여 적절한 담체 및 보조제와 함께 조성물을 제조할 수 있다. 조성물은 예를 들어, 면역화에 적합한 명반, 폴리 IC,
MF-59, 스쿠알렌계 보조제 또는 리포솜계 보조제와 같은 보조제를 포함할 수 있으나 이에 국한되지 않는다.
일부 실시예에서, 조성물 및 방법은 유도된 항체의 방출 및 숙주 면역 관용의 기전을 조절할 수 있는 임의의 적합한 제제 또는 면역 조절을 포함한다. 특정 실시예에서, 면역 조절제는 예를 들어 종양 신생항원(즉, 종양 특이적 항원(TSA))에 대한 항체를 포함하는 면역 반응을 유도하기 위해 대상체의 면역 반응의 일시적인 조절에 충분한 양으로 한 번 투여된다.
발현 시스템
특정 양태에서, 본 발명은 본원에 기술된 펩티드를 포함하는 배양 배지에서 본 발명의 펩티드 중 어느 하나를 발현하는 세포주를 배양하는 것을 제공한다.
재조합 단백질/펩티드를 생성하기 위한 다양한 발현 시스템이 당업계에 알려져 있으며, 여기에는 원핵생물(예:박테리아), 식물, 곤충, 효모 및 포유류 발현 시스템이 포함된다. 적합한 세포주는 본 발명의 펩티드에 대한 암호화 서열을 포함하는 핵산으로 형질전환, 형질도입 또는 형질감염되어 관심 분자를 생성할 수 있다. 숙주 세포에서 뉴클레오티드 서열의 발현을 허용하는 방식으로 적어도 하나의 조절 서열에 연결될 수 있는 이러한 핵산 서열을 함유하는 발현 벡터는 당업계에 알려진 방법을 통해 도입될 수 있다. 당업자는 발현 벡터를 설계하는 것이 형질감염될 숙주 세포의 선택 및/또는 발현될 원하는 단백질의 유형 및/또는 양과 같은 인자에 의존할 수 있다는 것을 이해한다. 비암호화 DNA 영역에서 프로모터 영역의 상류 또는 하류에서 발견되는 서열인 인핸서 영역은 또한 발현 최적화에 중요한 것으로 당업계에 알려져 있다. 필요한 경우, 플라스미드 DNA의 도입을 위해 원핵생물 숙주를 활용하는 경우와 같이 바이러스 원천의 복제 기점을 사용할 수 있다. 그러나 진핵 생물에서 염색체 통합은 DNA 복제의 일반적인 기전이다. 포유류 세포의 안정적인 형질감염을 위해 세포의 작은 부분이 도입된 DNA를 게놈에 통합할 수 있다. 사용된 발현 벡터 및 형질감염 방법은 성공적인 통합 이벤트에 기여하는 요인이 될 수 있다. 원하는 단백질의 안정적인 증폭 및 발현을 위해 관심 단백질을 암호화하는 DNA를 포함하는 벡터를 진핵 세포(예: 포유동물 세포)의 게놈에 안정적으로 통합하여 형질감염된 유전자가 안정적으로 발현되도록 한다. 관심 단백질을 암호화하는 유전자를 안정적으로 발현하는 클론을 확인하고 선별하기 위해 선택 가능한 마커(예: 항생제 또는 약물에 대한 내성)를 암호화하는 유전자를 관심 유전자와 함께 숙주 세포에 도입할 수 있다. 관심 유전자를 포함하는 세포는 약물 선택에 의해 식별될 수 있으며, 선택 가능한 마커 유전자를 포함하는 세포는 약물의 존재 하에서도 생존한다. 선택 가능한 마커의 유전자를 통합하지 않은 세포는 사멸된다. 그런 다음 원하는 단백질 분자를 생성하기 위해 생존하는 세포를 선별할 수 있다.
삽입된 서열의 발현을 조절하거나 원하는 특정 방식으로 핵산을 변형 및 처리하는 숙주 세포 균주도 선택할 수 있다. 펩티드/단백질 제품의 이러한 변형(예: 글리코실화 및 기타 번역 후 변형) 및 처리(예: 절단)는 펩티드/단백질의 기능에 중요할 수 있다. 다양한 숙주 세포 균주는 단백질 및 유전자 산물의 번역 후 처리 및 변형을 위한 특징적이고 구체적인 기전을 가지고 있다. 따라서 적절한 숙주 시스템 또는 세포주를 선택하여 발현된 표적 단백질의 올바른 변형 및 처리를 보장할 수 있다. 따라서, 유전자 생성물의 1차 전사체, 글리코실화 및 인산화의 적절한 처리를 위한 세포 기구를 보유한 진핵 숙주 세포를 사용할 수 있다.
배양되는 숙주 세포에 대해 다양한 배양 파라미터를 사용할 수 있다. 포유류 세포의 적절한 배양 조건은 당업계에 잘 알려져 있거나(Cleveland WL, et al., J lmmunol 방법, 1983, 56(2): 221-234) 숙련된 기술자가 결정할 수 있다(예를 들어 Animal Cell Culture: A Practical Approach 제2판, Rickwood, D. and Hames, B. D., eds. (Oxford University Press: New York, 1992) 참조). 세포 배양 조건은 선택한 숙주 세포의 유형에 따라 달라질 수 있다. 상업적으로 이용 가능한 매체를 활용할 수 있다.
본 발명의 펩티드는 본 발명의 펩티드를 발현하는 발현 구조체로 형질감염된 것을 포함하여, 폴리펩티드를 발현하는 임의의 인간 또는 비인간 세포로부터 정제될 수 있다. 단백질 회수, 분리 및/또는 정제를 위해 세포 배양 배지 또는 세포 용해물을 원심분리하여 미립자 세포 및 세포 잔해를 제거한다. 원하는 폴리펩티드 분자는 적절한 정제 기술로 가용성 단백질 및 폴리펩티드를 오염시키지 않고 분리 또는 정제된다. 단백질의 비제한적 정제 방법에은 크기 배제 크로마토그래피, 친화성 크로마토그래피, 이온 교환 크로마토그래피, 에탄올 침전, 역상 HPLC, 실리카, 또는 DEAE와 같은 양이온 교환 수지에 대한 크로마토그래피, 크로마토포커싱, SDS-PAGE, 황산암모늄 침전, 예를 들어 Sephadex G-75, Sepharose를 사용한 겔 여과, 면역글로불린 오염물질 제거를 위한 단백질 A 세파로스 크로마토그래피 등이 있다. 프로테아제 억제제(예: PMSF 또는 프로테이나제 K)와 같은 다른 첨가제를 사용하여 정제 중에 단백질 분해 분해를 억제할 수 있다. 탄수화물을 선택할 수 있는 정제 절차도 사용할 수 있다(예: 더 많은 산성 분획이 수집되는 양이온 또는 음이온 교환 수지를 사용한 이온 교환 소프트 젤 크로마토그래피 또는 HPLC).
치료 방법
일 실시예에서, 본원에 개시된 주제는 암의 악화를 방지하거나 질병을 치료하는 것을 방지하기 위해 암 진단 후 시작되는 예방적 치료에 관한 것이다. 일 실시예에서, 본원에 개시된 주제는 암에 걸릴 위험이 있다고 여겨지거나 이전에 암(또는 다른 질병)으로 진단된 적이 있는 대상체의 예방에 관한 것이다. 일 실시예에서, 상기 대상체는 본원에 기술된 펩티드 백신 또는 이의 약제학적 조성물을 투여받을 수 있다. 본 발명은 본원에 기술된 시스템 및 방법에 의해 생산된 임의의 펩티드를 사용하는 것을 고려한다. 일 실시예에서, 본 명세서에 기재된 펩티드 백신은 주사기 또는 당업계에 알려진 임의의 다른 적절한 방법을 통해 피하로 투여될 수 있다.
본원에 개시된 화합물 또는 화합물의 조합 또는 약제학적 조성물은 임의의 적절한 수단에 의해 세포, 포유동물 또는 인간에게 투여될 수 있다. 투여 방법의 비제한적 예는 특별히 (a) 캡슐, 정제, 과립, 스프레이, 시럽 또는 기타 이러한 형태의 투여를 포함하는 경구 경로를 통한 투여 (b) 안구내, 비강내, 귀내, 직장, 질, 요도내, 경점막, 협측 또는 경피와 같은 비경구 경로를 통한 투여, 여기에는 수성 현탁액, 유성 제제 등 또는 드립, 스프레이, 좌약, 고약, 연고 등으로서의 투여가 포함된다 (c) 피하, 복강내, 정맥내, 근육내, 진피내, 안와내, 피막내, 척수내, 흉골내 등을 포함하는 주사를 통한 투여(주입 펌프 전달 포함) (d) 신장 또는 심장 부위에 직접 주사( 예: 데포 이식)를 통한 국소 투여 (e) 본원에 개시된 화합물 또는 화합물의 조합을 살아있는 조직과 접촉시키기 위해 당업자가 적절하다고 간주하는 국소 투여 (f) 에어로졸, 분무 및 분말 제제를 포함한 흡입을 통한 투여 및 (g) 이식을 통한 투여가 있다.
당업계의 숙련자라면 쉽게 알 수 있는 바와 같이, 투여되는 유효 생체 내 용량 및 특정 투여 방식은 연령, 체중 및 치료되는 종, 그리고 본원에 개시된 화합물 또는 화합물의 조합을 사용하는 특정 용도에 따라 달라진다. 유효 용량 수준, 즉 원하는 결과를 달성하는 데 필요한 용량 수준의 결정은 당업자의 숙련자가 통상적인 약리학적 방법을 사용하여 수행할 수 있다. 통상적으로 제품의 인체 임상 적용은 더 낮은 용량 수준에서 시작되며 원하는 효과가 달성될 때까지 용량 수준을 증가시킨다. 대안적으로, 허용되는 생체 내 연구를 사용하여 확립된 약리학적 방법을 통해 본 방법에 의해 확인된 조성물의 유용한 용량 및 투여 경로를 확립할 수 있다. 생체 내 연구에서 유효 동물 투여량은 당업계에 알려진 전환 방법을 사용하여 적절한 인체 투여량으로 전환할 수 있다(예를 들어, Nair AB, Jacob S. A simple practice guide for dose conversion between animals and human. Journal of basic and clinical pharmacy. 2016년 3월;7(2):27 참조)
예방 방법
일부 실시예에서, 본 발명의 방법을 사용하여 제조된 펩티드는 암에 대한 면역 반응(예: 종양 신생항원에 대한)을 촉진시키는 백신으로 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, 본 발명은 면역 반응 유도, 예를 들어 종양 신생항원에 대한 항체 유도를 위한 조성물 및 방법을 제공한다. 일부 실시예에서, 항체는 광범위하게 중화 항체이다. 일부 실시예에서, 본 발명의 방법을 사용하여 제조된 펩티드는 병원체에 대한 면역 반응을 촉진하기 위한 백신으로 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, 본 발명의 방법을 사용하여 제조된 펩티드는 자가면역 질환 치료제로서 면역 내성을 증진시키는 데 사용될 수 있다.
본원에 개시된 조성물, 시스템 및 방법은 본원에 기술된 특정 실시예에만 범위가 한정되지 않는다. 실제로, 기술된 것에 더하여, 조성물, 시스템 및 방법의 다양한 변형은 상기 기술의 당업자에게는 명백하다.
Claims (67)
- SEQ ID NO 141 내지 147, 150 내지 161, 163 내지 164, 168 내지 177, 180 내지 185, 187 내지 190, 192 내지 206, 208 내지 209 및 211 내지 272로 구성된 군으로부터 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물.
- 청구항 1의 면역원성 조성물로서, 면역원성 조성물은 대상체에게 투여된다.
- 청구항 1의 면역원성 조성물로서, 핵산 서열은 생체 내 발현을 위한 구조체 내에 투여된다.
- 청구항 3의 면역원성 조성물로서, 핵산 서열의 생체 내 투여로 인해 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드가 대상체에서 발현되도록 한다.
- 청구항 4의 면역원성 조성물로서, 2개 이상의 아미노산 서열 각각 돌연변이된 RAS 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
- 청구항 5의 면역원성 조성물로서, 돌연변이된 RAS 단백질은 돌연변이된 KRAS 단백질이고, 돌연변이된 KRAS 단백질은 KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V, 및 KRAS G13D로 이루어진 군으로부터 선택된다.
- 청구항 5의 면역원성 조성물로서, 2개 이상의 아미노산 서열은 대상체에서 발현되는 돌연변이된 RAS 단백질에 기초하여 선택되고, 면역원성 조성물은 암을 치료하기 위해 대상체에 유효량으로 투여되며, 암은 대상체에서 발현되는 돌연변이 RAS 단백질과 연관되어 있다.
- 청구항 5의 면역원성 조성물로서, 2개 이상의 아미노산 서열은 대상체가 속한 위험군에서 돌연변이된 RAS 단백질의 유병률에 기초하여 선택되고, 면역원성 조성물은 암에 대한 면역 반응을 촉진하거나 대상체의 암을 치료하기 위해 대상체에게 유효량으로 투여되며, 암은 돌연변이된 RAS 단백질과 연관되어 있다.
- SEQ ID NO: 154, SEQ ID NO: 155, SEQ ID NO: 156, SEQ ID NO: 157, SEQ ID NO: 159, SEQ ID NO: 160, SEQ ID NO: 161, SEQ ID NO: 163, SEQ ID NO: 164, SEQ ID NO: 7882, SEQ ID NO: 7884, SEQ ID NO: 7887, SEQ ID NO: 7888, SEQ ID NO: 7894, SEQ ID NO: 7898, SEQ ID NO: 7899, SEQ ID NO: 7900, SEQ ID NO: 7901, SEQ ID NO: 7904, SEQ ID NO: 7905, SEQ ID NO: 7906, SEQ ID NO: 7920, SEQ ID NO: 7921, SEQ ID NO: 7926, SEQ ID NO: 7932, SEQ ID NO: 7933, SEQ ID NO: 7934, SEQ ID NO: 7936, SEQ ID NO: 7937, SEQ ID NO: 7940, SEQ ID NO: 7950, SEQ ID NO: 7951, SEQ ID NO: 7953, SEQ ID NO: 7954, SEQ ID NO: 7970, SEQ ID NO: 7972, SEQ ID NO: 7976, SEQ ID NO: 7982, SEQ ID NO: 8139, SEQ ID NO: 8267, SEQ ID NO: 8269, SEQ ID NO: 8272, SEQ ID NO: 8277, SEQ ID NO: 8296 및 SEQ ID NO: 8422로 구성된 군에서 선택된 적어도 2개의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물.
- 청구항 9의 면역원성 조성물로서, 핵산 서열은 핵산 서열의 생체 내 발현을 허용하도록 구성된다.
- 청구항 10의 면역원성 조성물로서, 핵산 서열은 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시되는 핵산 서열에 의해 암호화된 하나 이상의 펩티드의 생체 내 발현을 허용하도록 구성된다.
- 청구항 10의 면역원성 조성물로서, 핵산 서열은 핵산 서열에 의해 암호화된 적어도 두 개의 펩티드를 생체 내에서 발현시킬 수 있도록 구성되고, 적어도 2개의 펩티드 중 제1 펩티드는 HLA 클래스 I 대립유전자의 제1 다수에 의해 표시되고, 적어도 2개의 펩티드의 제2 펩티드는 HLA 클래스 I 대립유전자의 제2 다수에 의해 표시되며, HLA 클래스 I 대립유전자의 제1 다수와 HLA 클래스 I 대립유전자의 제2 다수는 적어도 하나의 HLA 클래스 I 대립유전자와 상이하다.
- 청구항 11의 면역원성 조성물로서, 적어도 2개 이상의 아미노산 서열이 각각 KRAS G12C 돌연변이를 포함하는 KRAS 단백질 단편의 이종 변형을 포함한다.
- 청구항 13의 면역원성 조성물로서, 2개 이상의 아미노산 서열은 대상체에서 발현되는 KRAS G12C 돌연변이에 기초하여 선택된다.
- 청구항 9의 면역원성 조성물로서, 핵산 서열은 SEQ ID NO: 154, SEQ ID NO: 155, SEQ ID NO: 156, SEQ ID NO: 158, SEQ ID NO: 159, SEQ ID NO: 160, SEQ ID NO: 162, SEQ ID NO: 163, SEQ ID NO: 164, SEQ ID NO: 165, SEQ ID NO: 7900, SEQ ID NO: 7901, SEQ ID NO: 7904, SEQ ID NO: 7905, SEQ ID NO: 7906, SEQ ID NO: 7921, SEQ ID NO: 7933, SEQ ID NO: 7950, SEQ ID NO: 7951, SEQ ID NO: 7976, SEQ ID NO: 8080, SEQ ID NO: 8272, SEQ ID NO: 8296, 및 SEQ ID NO: 8422로 구성된 군에서 선택되는 적어도 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화한다.
- SEQ ID NO: 203, SEQ ID NO: 204, SEQ ID NO: 205, SEQ ID NO: 206, SEQ ID NO: 208, SEQ ID NO: 209, SEQ ID NO: 211, SEQ ID NO: 213, SEQ ID NO: 11018, SEQ ID NO: 11021, SEQ ID NO: 11024, SEQ ID NO: 11029, SEQ ID NO: 11030, SEQ ID NO: 11031, SEQ ID NO: 11032, SEQ ID NO: 11035, SEQ ID NO: 11036, SEQ ID NO: 11037, SEQ ID NO: 11040, SEQ ID NO: 11041, SEQ ID NO: 11043, SEQ ID NO: 11044, SEQ ID NO: 11046, SEQ ID NO: 11052, SEQ ID NO: 11053, SEQ ID NO: 11054, SEQ ID NO: 11062, SEQ ID NO: 11064, SEQ ID NO: 11070, SEQ ID NO: 11071, SEQ ID NO: 11072, SEQ ID NO: 11073, SEQ ID NO: 11076, SEQ ID NO: 11077, SEQ ID NO: 11078, SEQ ID NO: 11079, SEQ ID NO: 11080, SEQ ID NO: 11091, SEQ ID NO: 11092, SEQ ID NO: 11094, SEQ ID NO: 11096, SEQ ID NO: 11097, SEQ ID NO: 11098, SEQ ID NO: 11102, SEQ ID NO: 11104, SEQ ID NO: 11106, SEQ ID NO: 11108, SEQ ID NO: 11116, SEQ ID NO: 11118, SEQ ID NO: 11122, SEQ ID NO: 11128, SEQ ID NO: 11130, SEQ ID NO: 11193, SEQ ID NO: 11203, SEQ ID NO: 11206, SEQ ID NO: 11212, SEQ ID NO: 11220, SEQ ID NO: 11227, SEQ ID NO: 11274, SEQ ID NO: 11283, SEQ ID NO: 11305, SEQ ID NO: 11306, SEQ ID NO: 11310, SEQ ID NO: 11311, SEQ ID NO: 11315, SEQ ID NO: 11324, SEQ ID NO: 11333, SEQ ID NO: 11342, SEQ ID NO: 11343, SEQ ID NO: 11352, SEQ ID NO: 11447, SEQ ID NO: 11453, SEQ ID NO: 11456, SEQ ID NO: 11457, SEQ ID NO: 11461, SEQ ID NO: 11465, SEQ ID NO: 11468, SEQ ID NO: 11469, SEQ ID NO: 11474, SEQ ID NO: 11585, SEQ ID NO: 11617, SEQ ID NO: 11672, SEQ ID NO: 11701, SEQ ID NO: 11723 및 SEQ ID NO: 11734로 구성된 군에서 선택된 적어도 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물.
- 청구항 16의 면역원성 조성물로서, 핵산 서열은 핵산 서열의 생체 내 발현을 허용하도록 구성된다.
- 청구항 17의 면역원성 조성물로서, 핵산 서열은 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시되는 핵산 서열에 의해 암호화된 하나 이상의 펩티드의 생체 내 발현을 허용하도록 구성된다.
- 청구항 16의 면역원성 조성물로서, 핵산 서열은 핵산 서열에 의해 암호화된 적어도 두 개의 펩티드를 생체 내에서 발현시킬 수 있도록 구성되고, 적어도 2개의 펩티드 중 제1 펩티드는 HLA 클래스 I 대립유전자의 제1 다수에 의해 표시되고, 적어도 2개의 펩티드의 제2 펩티드는 HLA 클래스 I 대립유전자의 제2 다수에 의해 표시되며, HLA 클래스 I 대립유전자의 제1 다수와 HLA 클래스 I 대립유전자의 제2 다수는 적어도 하나의 HLA 클래스 I 대립유전자와 상이하다.
- 청구항 18의 면역원성 조성물로서, 적어도 2개 이상의 아미노산 서열이 각각 KRAS G12V 돌연변이를 포함하는 KRAS 단백질 단편의 이종 변형을 포함한다.
- 청구항 20의 면역원성 조성물로서, 2개 이상의 아미노산 서열은 대상체에서 발현되는 KRAS G12V 돌연변이에 기초하여 선택된다.
- 청구항 16의 면역원성 조성물로서, 핵산 서열은 SEQ ID NO: 203, SEQ ID NO: 204, SEQ ID NO: 205, SEQ ID NO: 208, SEQ ID NO: 210, SEQ ID NO: 11018, SEQ ID NO: 11036, SEQ ID NO: 11037, SEQ ID NO: 11043, SEQ ID NO: 11044, SEQ ID NO: 11046, SEQ ID NO: 11054, SEQ ID NO: 11076, SEQ ID NO: 11078, SEQ ID NO: 11080, SEQ ID NO: 11098, SEQ ID NO: 11118, SEQ ID NO: 11122, SEQ ID NO: 11128, SEQ ID NO: 11130, SEQ ID NO: 11310, SEQ ID NO: 11447, SEQ ID NO: 11468, SEQ ID NO: 11469, 및 SEQ ID NO: 11474으로 구성된 군에서 선택된 적어도 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화한다.
- 청구항 19의 면역원성 조성물로서, 핵산 서열은 SEQ ID NO: 203, SEQ ID NO: 204, SEQ ID NO: 205, SEQ ID NO: 208, SEQ ID NO: 210, SEQ ID NO: 11018, SEQ ID NO: 11036, SEQ ID NO: 11037, SEQ ID NO: 11043, SEQ ID NO: 11044, SEQ ID NO: 11046, SEQ ID NO: 11054, SEQ ID NO: 11076, SEQ ID NO: 11078, SEQ ID NO: 11080, SEQ ID NO: 11098, SEQ ID NO: 11118, SEQ ID NO: 11122, SEQ ID NO: 11128, SEQ ID NO: 11130, SEQ ID NO: 11310, SEQ ID NO: 11447, SEQ ID NO: 11468, SEQ ID NO: 11469, 및 SEQ ID NO: 11474으로 구성된 군에서 선택된 적어도 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화한다.
- SEQ ID NO: 180, SEQ ID NO: 181, SEQ ID NO: 182, SEQ ID NO: 183, SEQ ID NO: 184, SEQ ID NO: 185, SEQ ID NO: 187, SEQ ID NO: 188, SEQ ID NO: 189, SEQ ID NO: 190, SEQ ID NO: 9760, SEQ ID NO: 9768, SEQ ID NO: 9771, SEQ ID NO: 9772, SEQ ID NO: 9775, SEQ ID NO: 9776, SEQ ID NO: 9779, SEQ ID NO: 9780, SEQ ID NO: 9784, SEQ ID NO: 9785, SEQ ID NO: 9786, SEQ ID NO: 9795, SEQ ID NO: 9799, SEQ ID NO: 9800, SEQ ID NO: 9844, SEQ ID NO: 9872, SEQ ID NO: 9875, SEQ ID NO: 9877, SEQ ID NO: 9878, SEQ ID NO: 9885, SEQ ID NO: 9907, SEQ ID NO: 9914, SEQ ID NO: 9920, SEQ ID NO: 9927, SEQ ID NO: 9933, SEQ ID NO: 9940, SEQ ID NO: 10072, SEQ ID NO: 10075, SEQ ID NO: 10076, SEQ ID NO: 10079, SEQ ID NO: 10103, SEQ ID NO: 10192, 및 SEQ ID NO: 10227으로 구성된 군에서 선택된 적어도 2개의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물.
- 청구항 24의 면역원성 조성물로서, 핵산 서열은 핵산 서열의 생체 내 발현을 허용하도록 구성된다.
- 청구항 25의 면역원성 조성물로서, 핵산 서열은 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시되는 핵산 서열에 의해 암호화된 하나 이상의 펩티드의 생체 내 발현을 허용하도록 구성된다.
- 청구항 25의 면역원성 조성물로서, 핵산 서열은 핵산 서열에 의해 암호화된 적어도 두 개의 펩티드를 생체 내에서 발현시킬 수 있도록 구성되고, 적어도 2개의 펩티드 중 제1 펩티드는 HLA 클래스 I 대립유전자의 제1 다수에 의해 표시되고, 적어도 2개의 펩티드의 제2 펩티드는 HLA 클래스 I 대립유전자의 제2 다수에 의해 표시되며, HLA 클래스 I 대립유전자의 제1 다수와 HLA 클래스 I 대립유전자의 제2 다수는 적어도 하나의 HLA 클래스 I 대립유전자와 상이하다.
- 청구항 26의 면역원성 조성물로서, 적어도 2개 이상의 아미노산 서열이 각각 KRAS G12R 돌연변이를 포함하는 KRAS 단백질 단편의 이종 변형을 포함한다.
- 청구항 28의 면역원성 조성물로서, 2개 이상의 아미노산 서열은 대상체에서 발현되는 KRAS G12R 돌연변이에 기초하여 선택된다.
- 청구항 24의 면역원성 조성물로서, 핵산 서열은 SEQ ID NO: 180, SEQ ID NO: 181, SEQ ID NO: 182, SEQ ID NO: 183, SEQ ID NO: 184, SEQ ID NO: 185, SEQ ID NO: 187, SEQ ID NO: 188, SEQ ID NO: 189, SEQ ID NO: 190, SEQ ID NO: 9760, SEQ ID NO: 9768, SEQ ID NO: 9772, SEQ ID NO: 9775, SEQ ID NO: 9779, SEQ ID NO: 9785, SEQ ID NO: 9786, SEQ ID NO: 9799, SEQ ID NO: 9800, SEQ ID NO: 9878, SEQ ID NO: 9885, SEQ ID NO: 10076, SEQ ID NO: 10103, 및 SEQ ID NO: 10227으로 이루어진 군에서 선택된 적어도 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화한다.
- SEQ ID NO: 168, SEQ ID NO: 169, SEQ ID NO: 170, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 172, SEQ ID NO: 173, SEQ ID NO: 174, SEQ ID NO: 175, SEQ ID NO: 176, SEQ ID NO: 177, SEQ ID NO: 8439, SEQ ID NO: 8447, SEQ ID NO: 8449, SEQ ID NO: 8450, SEQ ID NO: 8453, SEQ ID NO: 8454, SEQ ID NO: 8458, SEQ ID NO: 8464, SEQ ID NO: 8465, SEQ ID NO: 8467, SEQ ID NO: 8468, SEQ ID NO: 8472, SEQ ID NO: 8475, SEQ ID NO: 8498, SEQ ID NO: 8504, SEQ ID NO: 8510, SEQ ID NO: 8513, SEQ ID NO: 8514, SEQ ID NO: 8518, SEQ ID NO: 8524, SEQ ID NO: 8526, SEQ ID NO: 8529, SEQ ID NO: 8534, SEQ ID NO: 8536, SEQ ID NO: 8554, SEQ ID NO: 8605, SEQ ID NO: 8630, SEQ ID NO: 8631, SEQ ID NO: 8667, SEQ ID NO: 8669, SEQ ID NO: 8671, SEQ ID NO: 8672, SEQ ID NO: 8675, SEQ ID NO: 8704, SEQ ID NO: 8705, SEQ ID NO: 8707, SEQ ID NO: 8708, SEQ ID NO: 8710, SEQ ID NO: 8731, SEQ ID NO: 8733, SEQ ID NO: 8734, SEQ ID NO: 8736, SEQ ID NO: 8764, SEQ ID NO: 8828, SEQ ID NO: 8831, SEQ ID NO: 8841, SEQ ID NO: 8847, SEQ ID NO: 8849, SEQ ID NO: 8851, SEQ ID NO: 8852, SEQ ID NO: 8855, SEQ ID NO: 8863, SEQ ID NO: 8878, SEQ ID NO: 8880, SEQ ID NO: 8882, SEQ ID NO: 8883, SEQ ID NO: 8886, SEQ ID NO: 8898, SEQ ID NO: 8909, SEQ ID NO: 8911, SEQ ID NO: 8913, SEQ ID NO: 8914, SEQ ID NO: 8917, SEQ ID NO: 8958, SEQ ID NO: 8959, SEQ ID NO: 9059, SEQ ID NO: 9066, SEQ ID NO: 9067, SEQ ID NO: 9070, SEQ ID NO: 9072, SEQ ID NO: 9073, SEQ ID NO: 9075, SEQ ID NO: 9076, SEQ ID NO: 9083, SEQ ID NO: 9085, SEQ ID NO: 9086, SEQ ID NO: 9103, SEQ ID NO: 9106, SEQ ID NO: 9107, SEQ ID NO: 9112, SEQ ID NO: 9221, SEQ ID NO: 9222, SEQ ID NO: 9279, SEQ ID NO: 9280, SEQ ID NO: 9282, SEQ ID NO: 9286, SEQ ID NO: 9287, SEQ ID NO: 9293, SEQ ID NO: 9336, SEQ ID NO: 9340, SEQ ID NO: 9341, SEQ ID NO: 9345, SEQ ID NO: 9368, SEQ ID NO: 9371, SEQ ID NO: 9375, SEQ ID NO: 9376, SEQ ID NO: 9381, SEQ ID NO: 9393, SEQ ID NO: 9412, SEQ ID NO: 9425, SEQ ID NO: 9458, SEQ ID NO: 9481, SEQ ID NO: 9486, SEQ ID NO: 9491, SEQ ID NO: 9538, SEQ ID NO: 9543, SEQ ID NO: 9544, SEQ ID NO: 9546, SEQ ID NO: 9550, SEQ ID NO: 9551, SEQ ID NO: 9558, SEQ ID NO: 9587, SEQ ID NO: 9591, SEQ ID NO: 9592, SEQ ID NO: 9594, SEQ ID NO: 9598, SEQ ID NO: 9599, SEQ ID NO: 9606, SEQ ID NO: 9626, SEQ ID NO: 9633, SEQ ID NO: 9637, SEQ ID NO: 9642, SEQ ID NO: 9643, SEQ ID NO: 9645, SEQ ID NO: 9649, SEQ ID NO: 9650, SEQ ID NO: 9657, SEQ ID NO: 9698, 및 SEQ ID NO: 9721로 구성된 군에서 선택된 적어도 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물.
- 청구항 31의 면역원성 조성물로서, 핵산 서열은 핵산 서열의 생체 내 발현을 허용하도록 구성된다.
- 청구항 32의 면역원성 조성물로서, 핵산 서열은 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시되는 핵산 서열에 의해 암호화된 하나 이상의 펩티드의 생체 내 발현을 허용하도록 구성된다.
- 청구항 32의 면역원성 조성물로서, 핵산 서열은 핵산 서열에 의해 암호화된 적어도 두 개의 펩티드를 생체 내에서 발현시킬 수 있도록 구성되고, 적어도 2개의 펩티드 중 제1 펩티드는 HLA 클래스 I 대립유전자의 제1 다수에 의해 표시되고, 적어도 2개의 펩티드의 제2 펩티드는 HLA 클래스 I 대립유전자의 제2 다수에 의해 표시되며, HLA 클래스 I 대립유전자의 제1 다수와 HLA 클래스 I 대립유전자의 제2 다수는 적어도 하나의 HLA 클래스 I 대립유전자와 상이하다.
- 청구항 32의 면역원성 조성물로서, 적어도 2개 이상의 아미노산 서열이 각각 KRAS G12D 돌연변이를 포함하는 KRAS 단백질 단편의 이종 변형을 포함한다.
- 청구항 35의 면역원성 조성물로서, 2개 이상의 아미노산 서열은 대상체에서 발현되는 KRAS G12D 돌연변이에 기초하여 선택된다.
- 청구항 31의 면역원성 조성물로서, 핵산 서열은 SEQ ID NO: 168, SEQ ID NO: 169, SEQ ID NO: 170, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 172, SEQ ID NO: 173, SEQ ID NO: 174, SEQ ID NO: 175, SEQ ID NO: 176, SEQ ID NO: 8439, SEQ ID NO: 8449, SEQ ID NO: 8450, SEQ ID NO: 8453, SEQ ID NO: 8454, SEQ ID NO: 8458, SEQ ID NO: 8465, SEQ ID NO: 8529, SEQ ID NO: 8851, SEQ ID NO: 8882, SEQ ID NO: 9059, SEQ ID NO: 9067, SEQ ID NO: 9106, SEQ ID NO: 9642, SEQ ID NO: 9698, 및 SEQ ID NO: 9721로 구성된 군에서 선택되는 적어도 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화한다.
- 청구항 34의 면역원성 조성물로서, 핵산 서열은 SEQ ID NO: 168, SEQ ID NO: 169, SEQ ID NO: 170, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 172, SEQ ID NO: 173, SEQ ID NO: 174, SEQ ID NO: 175, SEQ ID NO: 176, SEQ ID NO: 8439, SEQ ID NO: 8449, SEQ ID NO: 8450, SEQ ID NO: 8453, SEQ ID NO: 8454, SEQ ID NO: 8458, SEQ ID NO: 8465, SEQ ID NO: 8529, SEQ ID NO: 8851, SEQ ID NO: 8882, SEQ ID NO: 9059, SEQ ID NO: 9067, SEQ ID NO: 9106, SEQ ID NO: 9642, SEQ ID NO: 9698, 및 SEQ ID NO: 9721로 구성된 군에서 선택되는 적어도 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화한다.
- SEQ ID NO: 19 내지 50으로 구성된 군에서 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물.
- 청구항 39의 면역원성 조성물로서, 면역원성 조성물은 대상체에게 투여된다.
- 청구항 39의 면역원성 조성물로서, 핵산 서열은 생체 내 발현을 위한 구조체 내에 투여된다.
- 청구항 41의 면역원성 조성물로서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다.
- 청구항 42의 면역원성 조성물로서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이된 BRAF 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
- 청구항 43의 면역원성 조성물로서, 돌연변이된 BRAF 단백질은 BRAF V600E 또는 BRAF V600M이다.
- 청구항 39의 면역원성 조성물로서, 면역원성 조성물은 암을 예방하거나 치료하기 위해 대상체에게 유효량으로 투여된다.
- 청구항 45의 면역원성 조성물로서, 상기 암은 결장직장암, 피부암 및 갑상선암으로 구성된 군에서 선택된다.
- SEQ ID NO: 141 내지 272로 구성된 군에서 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물.
- 청구항 47의 면역원성 조성물로서, 면역원성 조성물은 대상체에게 투여된다.
- 청구항 47의 면역원성 조성물로서, 핵산 서열은 생체 내 발현을 위한 구조체 내에 투여된다.
- 청구항 49의 면역원성 조성물로서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다.
- 청구항 50의 면역원성 조성물로서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이된 KRAS 단백질, 돌연변이된 NRAS 단백질 및 돌연변이된 HRAS 단백질로 구성된 군에서 선택된 돌연변이 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
- 청구항 51의 면역원성 조성물로서, 돌연변이된 RAS 단백질은 KRAS G12A, KRAS G12C, KRAS G12D, KRAS G12R, KRAS G12S, KRAS G12V 및 KRAS G13D로 구성된 군에서 선택된다.
- 청구항 51의 면역원성 조성물로서, 돌연변이된 NRAS 단백질은 NRAS Q61K, NRAS Q61L 및 NRAS Q61R로 구성된 군에서 선택된다.
- 청구항 47의 면역원성 조성물로서, 면역원성 조성물은 암을 예방하거나 치료하기 위해 대상체에게 유효량으로 투여된다.
- SEQ ID NO: 273 내지 322로 구성된 군에서 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물.
- 청구항 55의 면역원성 조성물로서, 핵산 서열은 생체 내 발현을 위한 구조체 내에 투여된다.
- 청구항 56의 면역원성 조성물로서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다.
- 청구항 57의 면역원성 조성물로서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이된 PIK3CA 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
- 청구항 58의 면역원성 조성물로서, 돌연변이된 PIK3CA 단백질은 PIK3CA E542K, PIK3CA E545K, PIK3CA H1047R 및 PIK3CA R88Q로 구성된 군에서 선택된다. 청구항 17항의 면역원성 조성물로서, 면역원성 조성물은 암을 예방하거나 치료하기 위해 대상체에게 유효량으로 투여된다.
- 청구항 59의 면역원성 조성물로서, 상기 암은 기관지 및 폐암, 결장직장암 및 유방암으로 구성된 군에서 선택된다.
- SEQ ID NO: 354 내지 458로 구성된 군에서 선택된 2개 이상의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열을 포함하는 면역원성 조성물.
- 청구항 61의 면역원성 조성물로서, 핵산 서열은 생체 내 발현을 위한 구조체 내에 투여된다.
- 청구항 62의 면역원성 조성물로서, 핵산 서열의 생체 내 투여는 HLA 클래스 I 분자에 의해 표시되는 하나 이상의 펩티드를 생성하도록 구성된다.
- 청구항 63의 면역원성 조성물로서, 하나 이상의 펩티드는 돌연변이된 TP53 단백질의 변형 또는 비변형 단편이다.
- 청구항 64의 면역원성 조성물로서, 돌연변이된 TP53 단백질은 TP53 H179R, TP53 R158L, TP53 R175H, TP53 R248Q, TP53 R248W, TP53 R273C, TP53 R273H, TP53 R282W 및 TP53 Y220C로 구성된 군에서 선택된다.
- 청구항 55의 면역원성 조성물로서, 면역원성 조성물은 암을 예방하거나 치료하기 위해 대상체에게 유효량으로 투여된다.
- 청구항 66의 면역원성 조성물로서, 상기 암은 뇌암, 기관지 및 폐암, 결장직장암, 유방암 및 난소암으로 이루어진 군에서 선택된다.
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