JP2024517731A - 残基の最適化による最適なペプチドワクチンの組成および方法 - Google Patents
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Abstract
配列識別番号19～50からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列から成る免疫原性組成物について説明している。また、配列識別番号141 ～ 272からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列から成る免疫原性組成物についても説明している。また、配列識別番号273～ 322からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列から成る免疫原性組成物についても説明している。また、配列識別番号354～ 458からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列から成る免疫原性組成物についても説明している。
Description
本出願は、2021年4月28日に提出された米国特許出願番号：17/243,096に係る35 U.S.C. § 119(e)の利益および優先権を主張するものであり、その内容はすべて参照によりここに組み込まれるものとする。
本特許開示には、著作権保護の対象となる資料が含まれる。著作権保有者は、米国特許商標庁の特許ファイルまたは記録に記載されている特許文書のファクシミリ複製または特許開示に対して異議を唱えないが、それ以外の場合はすべての著作権を留保するものとする。
参照による組み込み
ここに引用されるすべての特許、特許出願、および出版物は、参照によりすべてここに組み込まれるものとする。ここに開示される出版物全体は、参照によりその全文を本申請書に組み込まれるものとする。
ここに引用されるすべての特許、特許出願、および出版物は、参照によりすべてここに組み込まれるものとする。ここに開示される出版物全体は、参照によりその全文を本申請書に組み込まれるものとする。
配列表
配列表は、1枚のコンパクトディスク（コピー1）とその2枚の複製（コピー2と3）で提出さるものとする。各ディスクには、それぞれ2021年4月26日に作成され、それぞれに「2215269_00125US1_SL.txt」というタイトルのASCII形式の229,374,097バイトのファイルが1つ含まれている。各コンパクトディスクは、Macintoshマシンフォーマットで作成されており、Macintoshオペレーティングシステムと互換性を持つ。コンパクトディスクに含まれる資料は、参照により本明細書に具体的に組み込まれる。
配列表は、1枚のコンパクトディスク（コピー1）とその2枚の複製（コピー2と3）で提出さるものとする。各ディスクには、それぞれ2021年4月26日に作成され、それぞれに「2215269_00125US1_SL.txt」というタイトルのASCII形式の229,374,097バイトのファイルが1つ含まれている。各コンパクトディスクは、Macintoshマシンフォーマットで作成されており、Macintoshオペレーティングシステムと互換性を持つ。コンパクトディスクに含まれる資料は、参照により本明細書に具体的に組み込まれる。
技術分野
本発明は一般に、ペプチドワクチンの組成、システム、および方法に関する。より具体的には、本発明は、予測される集団免疫原性に基づいて最適化された、疾患を治療または予防するペプチドワクチンの組成、システム、およびデザイン方法に関する。
本発明は一般に、ペプチドワクチンの組成、システム、および方法に関する。より具体的には、本発明は、予測される集団免疫原性に基づいて最適化された、疾患を治療または予防するペプチドワクチンの組成、システム、およびデザイン方法に関する。
ペプチドワクチンの目標は、標的ペプチドを提示する細胞を認識して結合する能力を拡大するように免疫系を訓練し、がん細胞または病原体に対する免疫応答を改善することである。ペプチドワクチンはまた、すでに病気に罹患している者人に投与して、原因となる癌、他の疾病、または病原体に対する免疫反応を高めることもできる。あるいは、ペプチドワクチンを投与することで、1つまたは複数のペプチドに対する治療耐性を免疫系にもたらすこともできる。宿主をがん、他の疾患、または病原体感染から保護するために提示されると予測される標的ペプチドに基づくペプチドワクチンの組成、システム、および方法が必要とされている。
一形態において、本発明は、配列識別番号: 1 から 474からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を提供する。
いくつかの実施形態では、核酸配列は、配列識別番号: 1 から 474 からなるグループから選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 1 から 474からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は被験者に投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 1 から 474 からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸配列はin vivoでの発現のために構造物として投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列のin vivo投与は、HLAクラス I 分子によって提示される1つまたは複数のペプチドを産生するように構成されている。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、そのタンパク質がAKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異を構成するタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、がんを予防するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 膵がん、皮膚がん、甲状腺がん、脳腫瘍、直腸結腸がん、気管支がんと肺がん、乳がん、卵巣がん からなるグループから選択される。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、 配列識別番号: 1 から 474からなる群から選択される少なくとも3つのアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 1 から 474からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 1 から 474からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 1 から 18からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、AKT1 タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 1 から 18からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 1 から 18からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 1 から 18からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した AKT1 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 19 から 50からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、BRAF タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 19 から 50からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 19 から 50からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 19 から 50からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した BRAF タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 51 から 98からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、EGFR タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 51 から 98からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 51 から 98からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 51 から 98からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した EGFR タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 99 から 118からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、GTF2I タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 99 から 118からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 99 から 118からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 99 から 118からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した GTF2I タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 119 から 140からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、IDH1 タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 119 から 140からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 119 から 140からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 119 から 140からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した IDH1 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 141 から 229からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、KRAS タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 141 から 229からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 141 から 229からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 141 から 229からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した KRAS タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 230 から 272からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、NRAS タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 230 から 272からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 230 から 272からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 230 から 272からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した NRAS タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 273 から 322からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、PIK3CA タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 273 から 322からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 273 から 322からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 273 から 322からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した PIK3CA タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 323 から 353からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、PTEN タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 323 から 353からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 323 から 353からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 323 から 353からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した PTEN タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 354 から 458からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TP53 タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 354 から 458からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 354 から 458からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 354 から 458からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した TP53 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 141 から 272からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、RAS タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 141 から 272からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 141 から 272からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 141 から 272からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した RAS タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 19 から 33からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、BRAF V600E タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 19 から 33からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 19 から 33からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 19 から 33からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、BRAF V600E タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 34 から 50からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、BRAF V600M タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 34 から 50からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 34 から 50からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 34 から 50からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、BRAF V600M タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 51 から 66からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、EGFR A289V タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 51 から 66からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 51 から 66からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 51 から 66からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、EGFR A289V タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 67 から 81からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、EGFR G598V タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 67 から 81からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 67 から 81からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 67 から 81からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、EGFR G598V タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 82 から 98からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、EGFR L858R タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 82 から 98からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 82 から 98からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 82 から 98からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、EGFR L858R タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 125 から 140からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、IDH1 R132H タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 125 から 140からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 125 から 140からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 125 から 140からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、IDH1 R132H タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 119 から 124からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、IDH1 R132C タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 119 から 124からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 119 から 124からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 119 から 124からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、IDH1 R132C タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 167 から 178からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、KRAS G12D タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 167 から 178からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 167 から 178からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 167 から 178からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、KRAS G12D タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 203 から 213からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、KRAS G12V タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 203 から 213からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 203 から 213からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 203 から 213からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、KRAS G12V タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 179 から 191からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、KRAS G12R タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 179 から 191からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 179 から 191からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 179 から 191からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、KRAS G12R タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 154 から 166からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、KRAS G12C タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 154 から 166からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 154 から 166からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 154 から 166からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、KRAS G12C タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 214 から 229からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、KRAS G13D タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 214 から 229からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 214 から 229からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 214 から 229からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、KRAS G13D タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 141 から 153からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、KRAS G12A タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 141 から 153からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 141 から 153からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 141 から 153からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、KRAS G12A タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 192 から 202からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、KRAS G12S タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 192 から 202からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 192 から 202からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 192 から 202からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、KRAS G12S タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 256 から 272からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、NRAS Q61R タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 256 から 272からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 256 から 272からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 256 から 272からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、NRAS Q61R タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 230 から 238からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、NRAS Q61K タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 230 から 238からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 230 から 238からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 230 から 238からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、NRAS Q61K タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 239 から 255からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、NRAS Q61L タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 239 から 255からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 239 から 255からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 239 から 255からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、NRAS Q61L タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 273 から 285からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、PIK3CA E542K タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 273 から 285からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 273 から 285からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 273 から 285からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、PIK3CA E542K タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 286 から 293からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、PIK3CA E545K タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 286 から 293からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 286 から 293からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 286 から 293からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、PIK3CA E545K タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 294 から 309からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、PIK3CA H1047R タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 294 から 309からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 294 から 309からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 294 から 309からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、PIK3CA H1047R タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 359 から 374からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TP53 R158L タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 359 から 374からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 359 から 374からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 359 から 374からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、TP53 R158L タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 375 から 386からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TP53 R175H タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 375 から 386からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 375 から 386からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 375 から 386からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、TP53 R175H タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 387 から 401からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TP53 R248Q タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 387 から 401からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 387 から 401からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 387 から 401からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、TP53 R248Q タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 422 から 432からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TP53 R273C タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 422 から 432からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 422 から 432からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 422 から 432からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、TP53 R273C タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 433 から 446からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TP53 R273H タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 433 から 446からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 433 から 446からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 433 から 446からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、TP53 R273H タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 402 から 421からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TP53 R248W タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 402 から 421からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 402 から 421からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 402 から 421からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、TP53 R248W タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 447 から 449からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TP53 R282W タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 447 から 449からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 447 から 449からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 447 から 449からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、TP53 R282W タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 450 から 458からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TP53 Y220C タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 450 から 458からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 450 から 458からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 450 から 458からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、TP53 Y220C タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 310 から 322からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、PIK3CA R88Q タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 310 から 322からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 310 から 322からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 310 から 322からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、PIK3CA R88Q タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 99 から 118からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、GTF2I L424H タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 99 から 118からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 99 から 118からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 99 から 118からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、GTF2I L424H タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 338 から 353からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、PTEN R130Q タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 338 から 353からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 338 から 353からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 338 から 353からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、PTEN R130Q タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 1 から 18からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、AKT1 E17K タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 1 から 18からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 1 から 18からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 1 から 18からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、AKT1 E17K タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 323 から 337からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、PTEN R130G タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 323 から 337からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 323 から 337からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 323 から 337からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、PTEN R130G タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 354 から 358からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TP53 H179R タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 354 から 358からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 354 から 358からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 354 から 358からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、TP53 H179R タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 168 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 179 から 180、配列識別番号: 182 から 183、配列識別番号: 203 から 204、配列識別番号: 207からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 168 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 179 から 180、配列識別番号: 182 から 183、配列識別番号: 203 から 204、配列識別番号: 207からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸配列はin vivoでの発現のために構造物として投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列のin vivo投与は、HLAクラス I 分子によって提示される1つまたは複数のペプチドを産生するように構成されている。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異のあるタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを予防するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 膵がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 168 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 179 から 180、配列識別番号: 182 から 183、配列識別番号: 203 から 204、配列識別番号: 207からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 膵がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 168 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 179 から 180、配列識別番号: 182 から 183、配列識別番号: 203 から 204、配列識別番号: 207からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 168 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 179 から 180、配列識別番号: 182 から 183、配列識別番号: 203 から 204、配列識別番号: 207からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 168 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 179 から 180、配列識別番号: 182 から 183、配列識別番号: 203 から 204、配列識別番号: 207からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、HLAクラス I 分子によって提示される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異を構成するタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 膵がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 168 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 179 から 180、配列識別番号: 182 から 183、配列識別番号: 203 から 204、配列識別番号: 207からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 膵がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 168 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 179 から 180、配列識別番号: 182 から 183、配列識別番号: 203 から 204、配列識別番号: 207からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 19 から 23、配列識別番号: 34 から 40、配列識別番号: 230 から 231、配列識別番号: 239、配列識別番号: 241 から 242、配列識別番号: 260 から 262からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 19 から 23、配列識別番号: 34 から 40、配列識別番号: 230 から 231、配列識別番号: 239、配列識別番号: 241 から 242、配列識別番号: 260 から 262からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸配列はin vivoでの発現のために構造物として投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列のin vivo投与は、HLAクラス I 分子によって提示される1つまたは複数のペプチドを産生するように構成されている。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異のあるタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを予防するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 皮膚がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 19 から 23、配列識別番号: 34 から 40、配列識別番号: 230 から 231、配列識別番号: 239、配列識別番号: 241 から 242、配列識別番号: 260 から 262からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 皮膚がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 19 から 23、配列識別番号: 34 から 40、配列識別番号: 230 から 231、配列識別番号: 239、配列識別番号: 241 から 242、配列識別番号: 260 から 262からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 19 から 23、配列識別番号: 34 から 40、配列識別番号: 230 から 231、配列識別番号: 239、配列識別番号: 241 から 242、配列識別番号: 260 から 262からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 19 から 23、配列識別番号: 34 から 40、配列識別番号: 230 から 231、配列識別番号: 239、配列識別番号: 241 から 242、配列識別番号: 260 から 262からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、HLAクラス I 分子によって提示される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異を構成するタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 皮膚がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 19 から 23、配列識別番号: 34 から 40、配列識別番号: 230 から 231、配列識別番号: 239、配列識別番号: 241 から 242、配列識別番号: 260 から 262からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 皮膚がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 19 から 23、配列識別番号: 34 から 40、配列識別番号: 230 から 231、配列識別番号: 239、配列識別番号: 241 から 242、配列識別番号: 260 から 262からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 19 から 23、配列識別番号: 230 から 231、配列識別番号: 260 から 262からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 19 から 23、配列識別番号: 230 から 231、配列識別番号: 260 から 262からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸配列はin vivoでの発現のために構造物として投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列のin vivo投与は、HLAクラス I 分子によって提示される1つまたは複数のペプチドを産生するように構成されている。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異のあるタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを予防するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 甲状腺がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 19 から 23、配列識別番号: 230 から 231、配列識別番号: 260 から 262からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 甲状腺がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 19 から 23、配列識別番号: 230 から 231、配列識別番号: 260 から 262からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 19 から 23、配列識別番号: 230 から 231、配列識別番号: 260 から 262からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 19 から 23、配列識別番号: 230 から 231、配列識別番号: 260 から 262からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、HLAクラス I 分子によって提示される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異を構成するタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 甲状腺がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 19 から 23、配列識別番号: 230 から 231、配列識別番号: 260 から 262からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 甲状腺がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 19 から 23、配列識別番号: 230 から 231、配列識別番号: 260 から 262からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 51 から 55、配列識別番号: 67 から 70、配列識別番号: 72 から 73、配列識別番号: 119 から 120、配列識別番号: 125 から 130、配列識別番号: 375、配列識別番号: 423、配列識別番号: 425からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 51 から 55、配列識別番号: 67 から 70、配列識別番号: 72 から 73、配列識別番号: 119 から 120、配列識別番号: 125 から 130、配列識別番号: 375、配列識別番号: 423、配列識別番号: 425からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸配列はin vivoでの発現のために構造物として投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列のin vivo投与は、HLAクラス I 分子によって提示される1つまたは複数のペプチドを産生するように構成されている。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異のあるタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを予防するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 脳腫瘍 である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 51 から 55、配列識別番号: 67 から 70、配列識別番号: 72 から 73、配列識別番号: 119 から 120、配列識別番号: 125 から 130、配列識別番号: 375、配列識別番号: 423、配列識別番号: 425からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 脳腫瘍を治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 51 から 55、配列識別番号: 67 から 70、配列識別番号: 72 から 73、配列識別番号: 119 から 120、配列識別番号: 125 から 130、配列識別番号: 375、配列識別番号: 423、配列識別番号: 425からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 51 から 55、配列識別番号: 67 から 70、配列識別番号: 72 から 73、配列識別番号: 119 から 120、配列識別番号: 125 から 130、配列識別番号: 375、配列識別番号: 423、配列識別番号: 425からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 51 から 55、配列識別番号: 67 から 70、配列識別番号: 72 から 73、配列識別番号: 119 から 120、配列識別番号: 125 から 130、配列識別番号: 375、配列識別番号: 423、配列識別番号: 425からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、HLAクラス I 分子によって提示される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異を構成するタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 脳腫瘍 である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 51 から 55、配列識別番号: 67 から 70、配列識別番号: 72 から 73、配列識別番号: 119 から 120、配列識別番号: 125 から 130、配列識別番号: 375、配列識別番号: 423、配列識別番号: 425からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 脳腫瘍を治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 51 から 55、配列識別番号: 67 から 70、配列識別番号: 72 から 73、配列識別番号: 119 から 120、配列識別番号: 125 から 130、配列識別番号: 375、配列識別番号: 423、配列識別番号: 425からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 20 から 23、配列識別番号: 167 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 203 から 207、配列識別番号: 215 から 217、配列識別番号: 288からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 20 から 23、配列識別番号: 167 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 203 から 207、配列識別番号: 215 から 217、配列識別番号: 288からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸配列はin vivoでの発現のために構造物として投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列のin vivo投与は、HLAクラス I 分子によって提示される1つまたは複数のペプチドを産生するように構成されている。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異のあるタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを予防するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 直腸結腸がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 20 から 23、配列識別番号: 167 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 203 から 207、配列識別番号: 215 から 217、配列識別番号: 288からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 直腸結腸がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 20 から 23、配列識別番号: 167 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 203 から 207、配列識別番号: 215 から 217、配列識別番号: 288からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 20 から 23、配列識別番号: 167 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 203 から 207、配列識別番号: 215 から 217、配列識別番号: 288からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 20 から 23、配列識別番号: 167 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 203 から 207、配列識別番号: 215 から 217、配列識別番号: 288からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、HLAクラス I 分子によって提示される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異を構成するタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 直腸結腸がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 20 から 23、配列識別番号: 167 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 203 から 207、配列識別番号: 215 から 217、配列識別番号: 288からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 直腸結腸がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 20 から 23、配列識別番号: 167 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 203 から 207、配列識別番号: 215 から 217、配列識別番号: 288からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 82 から 86、配列識別番号: 141 から 144、配列識別番号: 154 から 159、配列識別番号: 168 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 203 から 204、配列識別番号: 207、配列識別番号: 274 から 276、配列識別番号: 288、配列識別番号: 359、配列識別番号: 362 から 364からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 82 から 86、配列識別番号: 141 から 144、配列識別番号: 154 から 159、配列識別番号: 168 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 203 から 204、配列識別番号: 207、配列識別番号: 274 から 276、配列識別番号: 288、配列識別番号: 359、配列識別番号: 362 から 364からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸配列はin vivoでの発現のために構造物として投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列のin vivo投与は、HLAクラス I 分子によって提示される1つまたは複数のペプチドを産生するように構成されている。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異のあるタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを予防するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 気管支がんと肺がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 82 から 86、配列識別番号: 141 から 144、配列識別番号: 154 から 159、配列識別番号: 168 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 203 から 204、配列識別番号: 207、配列識別番号: 274 から 276、配列識別番号: 288、配列識別番号: 359、配列識別番号: 362 から 364からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 気管支がんと肺がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 82 から 86、配列識別番号: 141 から 144、配列識別番号: 154 から 159、配列識別番号: 168 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 203 から 204、配列識別番号: 207、配列識別番号: 274 から 276、配列識別番号: 288、配列識別番号: 359、配列識別番号: 362 から 364からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 82 から 86、配列識別番号: 141 から 144、配列識別番号: 154 から 159、配列識別番号: 168 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 203 から 204、配列識別番号: 207、配列識別番号: 274 から 276、配列識別番号: 288、配列識別番号: 359、配列識別番号: 362 から 364からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 82 から 86、配列識別番号: 141 から 144、配列識別番号: 154 から 159、配列識別番号: 168 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 203 から 204、配列識別番号: 207、配列識別番号: 274 から 276、配列識別番号: 288、配列識別番号: 359、配列識別番号: 362 から 364からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、HLAクラス I 分子によって提示される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異を構成するタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 気管支がんと肺がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 82 から 86、配列識別番号: 141 から 144、配列識別番号: 154 から 159、配列識別番号: 168 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 203 から 204、配列識別番号: 207、配列識別番号: 274 から 276、配列識別番号: 288、配列識別番号: 359、配列識別番号: 362 から 364からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 気管支がんと肺がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 82 から 86、配列識別番号: 141 から 144、配列識別番号: 154 から 159、配列識別番号: 168 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 203 から 204、配列識別番号: 207、配列識別番号: 274 から 276、配列識別番号: 288、配列識別番号: 359、配列識別番号: 362 から 364からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 273 から 309、配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 422 から 446からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 273 から 309、配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 422 から 446からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸配列はin vivoでの発現のために構造物として投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列のin vivo投与は、HLAクラス I 分子によって提示される1つまたは複数のペプチドを産生するように構成されている。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異のあるタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを予防するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 乳がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 273 から 309、配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 422 から 446からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 乳がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 273 から 309、配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 422 から 446からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 273 から 309、配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 422 から 446からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 273 から 309、配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 422 から 446からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、HLAクラス I 分子によって提示される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異を構成するタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 乳がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 273 から 309、配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 422 から 446からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 乳がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 273 から 309、配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 422 から 446からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 273 から 309、配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 422 から 446からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 273 から 309、配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 422 から 446からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸配列はin vivoでの発現のために構造物として投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列のin vivo投与は、HLAクラス I 分子によって提示される1つまたは複数のペプチドを産生するように構成されている。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異のあるタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを予防するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 卵巣がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 273 から 309、配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 422 から 446からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 卵巣がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 273 から 309、配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 422 から 446からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 273 から 309、配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 422 から 446からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 273 から 309、配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 422 から 446からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、HLAクラス I 分子によって提示される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異を構成するタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 卵巣がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 273 から 309、配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 422 から 446からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 卵巣がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 273 から 309、配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 422 から 446からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。
一形態において、本発明は、配列識別番号: 475 から 759からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を提供する。
いくつかの実施形態では、核酸配列は、配列識別番号: 475 から 759 からなるグループから選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 475 から 759からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は被験者に投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 475 から 759 からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸配列はin vivoでの発現のために構造物として投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列のin vivo投与は、HLAクラス II 分子によって提示される1つまたは複数のペプチドを産生するように構成されている。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、そのタンパク質がAKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異を構成するタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、がんを予防するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 膵がん、皮膚がん、甲状腺がん、脳腫瘍、直腸結腸がん、気管支がんと肺がん、乳がん、卵巣がん からなるグループから選択される。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、 配列識別番号: 475 から 759からなる群から選択される少なくとも3つのアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 475 から 759からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 475 から 759からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 475 から 483からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、AKT1 タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 475 から 483からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 475 から 483からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 475 から 483からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した AKT1 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 484 から 502からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、BRAF タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 484 から 502からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 484 から 502からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 484 から 502からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した BRAF タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 503 から 527からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、EGFR タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 503 から 527からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 503 から 527からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 503 から 527からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した EGFR タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 528 から 534からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、GTF2I タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 528 から 534からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 528 から 534からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 528 から 534からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した GTF2I タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 535 から 553からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、IDH1 タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 535 から 553からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 535 から 553からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 535 から 553からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した IDH1 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 554 から 615からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、KRAS タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 554 から 615からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 554 から 615からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 554 から 615からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した KRAS タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 616 から 645からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、NRAS タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 616 から 645からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 616 から 645からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 616 から 645からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した NRAS タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 646 から 675からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、PIK3CA タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 646 から 675からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 646 から 675からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 646 から 675からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した PIK3CA タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 676 から 690からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、PTEN タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 676 から 690からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 676 から 690からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 676 から 690からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した PTEN タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 691 から 758からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TP53 タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 691 から 758からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 691 から 758からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 691 から 758からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した TP53 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 554 から 645からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、RAS タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 554 から 645からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 554 から 645からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 554 から 645からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した RAS タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 484 から 494からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、BRAF V600E タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 484 から 494からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 484 から 494からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 484 から 494からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、BRAF V600E タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 495 から 502からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、BRAF V600M タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 495 から 502からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 495 から 502からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 495 から 502からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、BRAF V600M タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 503 から 509からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、EGFR A289V タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 503 から 509からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 503 から 509からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 503 から 509からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、EGFR A289V タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 510 から 519からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、EGFR G598V タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 510 から 519からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 510 から 519からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 510 から 519からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、EGFR G598V タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 520 から 527からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、EGFR L858R タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 520 から 527からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 520 から 527からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 520 から 527からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、EGFR L858R タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 543 から 553からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、IDH1 R132H タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 543 から 553からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 543 から 553からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 543 から 553からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、IDH1 R132H タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 535 から 542からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、IDH1 R132C タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 535 から 542からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 535 から 542からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 535 から 542からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、IDH1 R132C タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 569 から 577からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、KRAS G12D タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 569 から 577からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 569 から 577からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 569 から 577からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、KRAS G12D タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 596 から 605からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、KRAS G12V タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 596 から 605からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 596 から 605からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 596 から 605からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、KRAS G12V タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 578 から 587からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、KRAS G12R タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 578 から 587からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 578 から 587からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 578 から 587からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、KRAS G12R タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 561 から 568からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、KRAS G12C タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 561 から 568からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 561 から 568からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 561 から 568からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、KRAS G12C タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 606 から 615からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、KRAS G13D タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 606 から 615からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 606 から 615からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 606 から 615からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、KRAS G13D タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 554 から 560からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、KRAS G12A タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 554 から 560からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 554 から 560からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 554 から 560からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、KRAS G12A タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 588 から 595からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、KRAS G12S タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 588 から 595からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 588 から 595からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 588 から 595からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、KRAS G12S タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 634 から 645からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、NRAS Q61R タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 634 から 645からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 634 から 645からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 634 から 645からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、NRAS Q61R タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 616 から 624からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、NRAS Q61K タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 616 から 624からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 616 から 624からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 616 から 624からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、NRAS Q61K タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 625 から 633からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、NRAS Q61L タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 625 から 633からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 625 から 633からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 625 から 633からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、NRAS Q61L タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 646 から 650からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、PIK3CA E542K タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 646 から 650からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 646 から 650からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 646 から 650からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、PIK3CA E542K タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 651 から 657からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、PIK3CA E545K タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 651 から 657からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 651 から 657からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 651 から 657からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、PIK3CA E545K タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 658 から 667からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、PIK3CA H1047R タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 658 から 667からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 658 から 667からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 658 から 667からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、PIK3CA H1047R タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 700 から 707からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TP53 R158L タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 700 から 707からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 700 から 707からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 700 から 707からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、TP53 R158L タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 708 から 717からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TP53 R175H タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 708 から 717からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 708 から 717からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 708 から 717からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、TP53 R175H タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 718 から 723からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TP53 R248Q タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 718 から 723からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 718 から 723からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 718 から 723からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、TP53 R248Q タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 733 から 739からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TP53 R273C タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 733 から 739からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 733 から 739からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 733 から 739からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、TP53 R273C タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 740 から 748からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TP53 R273H タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 740 から 748からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 740 から 748からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 740 から 748からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、TP53 R273H タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 724 から 732からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TP53 R248W タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 724 から 732からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 724 から 732からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 724 から 732からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、TP53 R248W タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 749 から 750からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TP53 R282W タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 749 から 750からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 749 から 750からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 749 から 750からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、TP53 R282W タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 751 から 758からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TP53 Y220C タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 751 から 758からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 751 から 758からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 751 から 758からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、TP53 Y220C タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 668 から 675からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、PIK3CA R88Q タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 668 から 675からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 668 から 675からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 668 から 675からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、PIK3CA R88Q タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 528 から 534からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、GTF2I L424H タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 528 から 534からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 528 から 534からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 528 から 534からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、GTF2I L424H タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 681 から 690からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、PTEN R130Q タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 681 から 690からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 681 から 690からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 681 から 690からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、PTEN R130Q タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 475 から 483からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、AKT1 E17K タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 475 から 483からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 475 から 483からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 475 から 483からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、AKT1 E17K タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 676 から 680からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、PTEN R130G タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 676 から 680からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 676 から 680からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 676 から 680からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、PTEN R130G タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 691 から 699からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TP53 H179R タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 691 から 699からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 691 から 699からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 691 から 699からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、TP53 H179R タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 569 から 574、配列識別番号: 578 から 584、配列識別番号: 596 から 599、配列識別番号: 601 から 603からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 569 から 574、配列識別番号: 578 から 584、配列識別番号: 596 から 599、配列識別番号: 601 から 603からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸配列はin vivoでの発現のために構造物として投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列のin vivo投与は、HLAクラス II 分子によって提示される1つまたは複数のペプチドを産生するように構成されている。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異のあるタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを予防するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 膵がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 569 から 574、配列識別番号: 578 から 584、配列識別番号: 596 から 599、配列識別番号: 601 から 603からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 膵がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 569 から 574、配列識別番号: 578 から 584、配列識別番号: 596 から 599、配列識別番号: 601 から 603からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 569 から 574、配列識別番号: 578 から 584、配列識別番号: 596 から 599、配列識別番号: 601 から 603からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 569 から 574、配列識別番号: 578 から 584、配列識別番号: 596 から 599、配列識別番号: 601 から 603からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、HLAクラス II 分子によって提示される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異を構成するタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 膵がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 569 から 574、配列識別番号: 578 から 584、配列識別番号: 596 から 599、配列識別番号: 601 から 603からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 膵がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 569 から 574、配列識別番号: 578 から 584、配列識別番号: 596 から 599、配列識別番号: 601 から 603からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 495 から 499、配列識別番号: 616、配列識別番号: 619 から 620、配列識別番号: 625 から 628、配列識別番号: 634、配列識別番号: 637、配列識別番号: 639 から 640からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 495 から 499、配列識別番号: 616、配列識別番号: 619 から 620、配列識別番号: 625 から 628、配列識別番号: 634、配列識別番号: 637、配列識別番号: 639 から 640からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸配列はin vivoでの発現のために構造物として投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列のin vivo投与は、HLAクラス II 分子によって提示される1つまたは複数のペプチドを産生するように構成されている。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異のあるタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを予防するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 皮膚がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 495 から 499、配列識別番号: 616、配列識別番号: 619 から 620、配列識別番号: 625 から 628、配列識別番号: 634、配列識別番号: 637、配列識別番号: 639 から 640からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 皮膚がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 495 から 499、配列識別番号: 616、配列識別番号: 619 から 620、配列識別番号: 625 から 628、配列識別番号: 634、配列識別番号: 637、配列識別番号: 639 から 640からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 495 から 499、配列識別番号: 616、配列識別番号: 619 から 620、配列識別番号: 625 から 628、配列識別番号: 634、配列識別番号: 637、配列識別番号: 639 から 640からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 495 から 499、配列識別番号: 616、配列識別番号: 619 から 620、配列識別番号: 625 から 628、配列識別番号: 634、配列識別番号: 637、配列識別番号: 639 から 640からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、HLAクラス II 分子によって提示される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異を構成するタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 皮膚がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 495 から 499、配列識別番号: 616、配列識別番号: 619 から 620、配列識別番号: 625 から 628、配列識別番号: 634、配列識別番号: 637、配列識別番号: 639 から 640からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 皮膚がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 495 から 499、配列識別番号: 616、配列識別番号: 619 から 620、配列識別番号: 625 から 628、配列識別番号: 634、配列識別番号: 637、配列識別番号: 639 から 640からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 616、配列識別番号: 619 から 620、配列識別番号: 634、配列識別番号: 637、配列識別番号: 640からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 616、配列識別番号: 619 から 620、配列識別番号: 634、配列識別番号: 637、配列識別番号: 640からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸配列はin vivoでの発現のために構造物として投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列のin vivo投与は、HLAクラス II 分子によって提示される1つまたは複数のペプチドを産生するように構成されている。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異のあるタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを予防するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 甲状腺がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 616、配列識別番号: 619 から 620、配列識別番号: 634、配列識別番号: 637、配列識別番号: 640からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 甲状腺がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 616、配列識別番号: 619 から 620、配列識別番号: 634、配列識別番号: 637、配列識別番号: 640からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 616、配列識別番号: 619 から 620、配列識別番号: 634、配列識別番号: 637、配列識別番号: 640からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 616、配列識別番号: 619 から 620、配列識別番号: 634、配列識別番号: 637、配列識別番号: 640からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、HLAクラス II 分子によって提示される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異を構成するタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 甲状腺がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 616、配列識別番号: 619 から 620、配列識別番号: 634、配列識別番号: 637、配列識別番号: 640からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 甲状腺がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 616、配列識別番号: 619 から 620、配列識別番号: 634、配列識別番号: 637、配列識別番号: 640からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 508、配列識別番号: 510、配列識別番号: 512、配列識別番号: 514、配列識別番号: 535 から 537、配列識別番号: 539、配列識別番号: 543 から 551、配列識別番号: 708、配列識別番号: 712、配列識別番号: 738からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 508、配列識別番号: 510、配列識別番号: 512、配列識別番号: 514、配列識別番号: 535 から 537、配列識別番号: 539、配列識別番号: 543 から 551、配列識別番号: 708、配列識別番号: 712、配列識別番号: 738からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸配列はin vivoでの発現のために構造物として投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列のin vivo投与は、HLAクラス II 分子によって提示される1つまたは複数のペプチドを産生するように構成されている。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異のあるタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを予防するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 脳腫瘍 である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 508、配列識別番号: 510、配列識別番号: 512、配列識別番号: 514、配列識別番号: 535 から 537、配列識別番号: 539、配列識別番号: 543 から 551、配列識別番号: 708、配列識別番号: 712、配列識別番号: 738からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 脳腫瘍を治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 508、配列識別番号: 510、配列識別番号: 512、配列識別番号: 514、配列識別番号: 535 から 537、配列識別番号: 539、配列識別番号: 543 から 551、配列識別番号: 708、配列識別番号: 712、配列識別番号: 738からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 508、配列識別番号: 510、配列識別番号: 512、配列識別番号: 514、配列識別番号: 535 から 537、配列識別番号: 539、配列識別番号: 543 から 551、配列識別番号: 708、配列識別番号: 712、配列識別番号: 738からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 508、配列識別番号: 510、配列識別番号: 512、配列識別番号: 514、配列識別番号: 535 から 537、配列識別番号: 539、配列識別番号: 543 から 551、配列識別番号: 708、配列識別番号: 712、配列識別番号: 738からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、HLAクラス II 分子によって提示される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異を構成するタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 脳腫瘍 である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 508、配列識別番号: 510、配列識別番号: 512、配列識別番号: 514、配列識別番号: 535 から 537、配列識別番号: 539、配列識別番号: 543 から 551、配列識別番号: 708、配列識別番号: 712、配列識別番号: 738からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 脳腫瘍を治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 508、配列識別番号: 510、配列識別番号: 512、配列識別番号: 514、配列識別番号: 535 から 537、配列識別番号: 539、配列識別番号: 543 から 551、配列識別番号: 708、配列識別番号: 712、配列識別番号: 738からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 569 から 575、配列識別番号: 596 から 599、配列識別番号: 601 から 604、配列識別番号: 606 から 612、配列識別番号: 656、配列識別番号: 708、配列識別番号: 712からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 569 から 575、配列識別番号: 596 から 599、配列識別番号: 601 から 604、配列識別番号: 606 から 612、配列識別番号: 656、配列識別番号: 708、配列識別番号: 712からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸配列はin vivoでの発現のために構造物として投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列のin vivo投与は、HLAクラス II 分子によって提示される1つまたは複数のペプチドを産生するように構成されている。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異のあるタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを予防するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 直腸結腸がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 569 から 575、配列識別番号: 596 から 599、配列識別番号: 601 から 604、配列識別番号: 606 から 612、配列識別番号: 656、配列識別番号: 708、配列識別番号: 712からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 直腸結腸がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 569 から 575、配列識別番号: 596 から 599、配列識別番号: 601 から 604、配列識別番号: 606 から 612、配列識別番号: 656、配列識別番号: 708、配列識別番号: 712からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 569 から 575、配列識別番号: 596 から 599、配列識別番号: 601 から 604、配列識別番号: 606 から 612、配列識別番号: 656、配列識別番号: 708、配列識別番号: 712からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 569 から 575、配列識別番号: 596 から 599、配列識別番号: 601 から 604、配列識別番号: 606 から 612、配列識別番号: 656、配列識別番号: 708、配列識別番号: 712からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、HLAクラス II 分子によって提示される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異を構成するタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 直腸結腸がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 569 から 575、配列識別番号: 596 から 599、配列識別番号: 601 から 604、配列識別番号: 606 から 612、配列識別番号: 656、配列識別番号: 708、配列識別番号: 712からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 直腸結腸がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 569 から 575、配列識別番号: 596 から 599、配列識別番号: 601 から 604、配列識別番号: 606 から 612、配列識別番号: 656、配列識別番号: 708、配列識別番号: 712からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 520 から 521、配列識別番号: 523 から 524、配列識別番号: 554 から 556、配列識別番号: 558、配列識別番号: 561、配列識別番号: 563 から 565、配列識別番号: 569 から 573、配列識別番号: 596 から 600、配列識別番号: 650、配列識別番号: 656、配列識別番号: 700 から 705からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 520 から 521、配列識別番号: 523 から 524、配列識別番号: 554 から 556、配列識別番号: 558、配列識別番号: 561、配列識別番号: 563 から 565、配列識別番号: 569 から 573、配列識別番号: 596 から 600、配列識別番号: 650、配列識別番号: 656、配列識別番号: 700 から 705からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸配列はin vivoでの発現のために構造物として投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列のin vivo投与は、HLAクラス II 分子によって提示される1つまたは複数のペプチドを産生するように構成されている。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異のあるタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを予防するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 気管支がんと肺がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 520 から 521、配列識別番号: 523 から 524、配列識別番号: 554 から 556、配列識別番号: 558、配列識別番号: 561、配列識別番号: 563 から 565、配列識別番号: 569 から 573、配列識別番号: 596 から 600、配列識別番号: 650、配列識別番号: 656、配列識別番号: 700 から 705からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 気管支がんと肺がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 520 から 521、配列識別番号: 523 から 524、配列識別番号: 554 から 556、配列識別番号: 558、配列識別番号: 561、配列識別番号: 563 から 565、配列識別番号: 569 から 573、配列識別番号: 596 から 600、配列識別番号: 650、配列識別番号: 656、配列識別番号: 700 から 705からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 520 から 521、配列識別番号: 523 から 524、配列識別番号: 554 から 556、配列識別番号: 558、配列識別番号: 561、配列識別番号: 563 から 565、配列識別番号: 569 から 573、配列識別番号: 596 から 600、配列識別番号: 650、配列識別番号: 656、配列識別番号: 700 から 705からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 520 から 521、配列識別番号: 523 から 524、配列識別番号: 554 から 556、配列識別番号: 558、配列識別番号: 561、配列識別番号: 563 から 565、配列識別番号: 569 から 573、配列識別番号: 596 から 600、配列識別番号: 650、配列識別番号: 656、配列識別番号: 700 から 705からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、HLAクラス II 分子によって提示される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異を構成するタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 気管支がんと肺がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 520 から 521、配列識別番号: 523 から 524、配列識別番号: 554 から 556、配列識別番号: 558、配列識別番号: 561、配列識別番号: 563 から 565、配列識別番号: 569 から 573、配列識別番号: 596 から 600、配列識別番号: 650、配列識別番号: 656、配列識別番号: 700 から 705からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 気管支がんと肺がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 520 から 521、配列識別番号: 523 から 524、配列識別番号: 554 から 556、配列識別番号: 558、配列識別番号: 561、配列識別番号: 563 から 565、配列識別番号: 569 から 573、配列識別番号: 596 から 600、配列識別番号: 650、配列識別番号: 656、配列識別番号: 700 から 705からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 646 から 667、配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 733 から 748からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 646 から 667、配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 733 から 748からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸配列はin vivoでの発現のために構造物として投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列のin vivo投与は、HLAクラス II 分子によって提示される1つまたは複数のペプチドを産生するように構成されている。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異のあるタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを予防するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 乳がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 646 から 667、配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 733 から 748からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 乳がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 646 から 667、配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 733 から 748からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 646 から 667、配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 733 から 748からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 646 から 667、配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 733 から 748からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、HLAクラス II 分子によって提示される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異を構成するタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 乳がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 646 から 667、配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 733 から 748からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 乳がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 646 から 667、配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 733 から 748からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 646 から 667、配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 733 から 748からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 646 から 667、配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 733 から 748からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸配列はin vivoでの発現のために構造物として投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列のin vivo投与は、HLAクラス II 分子によって提示される1つまたは複数のペプチドを産生するように構成されている。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異のあるタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを予防するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 卵巣がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 646 から 667、配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 733 から 748からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 卵巣がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 646 から 667、配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 733 から 748からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 646 から 667、配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 733 から 748からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 646 から 667、配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 733 から 748からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、HLAクラス II 分子によって提示される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異を構成するタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 卵巣がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 646 から 667、配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 733 から 748からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 卵巣がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 646 から 667、配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 733 から 748からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。
CT 抗原ワクチン
CT 抗原ワクチン
一形態において、本発明は、配列識別番号: 28796 から 28864、配列識別番号: 37110 から 37174、配列識別番号: 41321 から 41397、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49004、配列識別番号: 49071、配列識別番号: 49395、配列識別番号: 50632、配列識別番号: 50729、配列識別番号: 51434 から 51510、配列識別番号: 55758、配列識別番号: 60456 から 60527、配列識別番号: 68238 から 68321、配列識別番号: 77091、配列識別番号: 77210、配列識別番号: 84188、配列識別番号: 87951、配列識別番号: 88144、配列識別番号: 95593 から 95664、配列識別番号: 113808 から 113869、配列識別番号: 125134 から 125218、配列識別番号: 144109 から 144188、配列識別番号: 162383 から 162453、配列識別番号: 166444 から 166531、配列識別番号: 167118、配列識別番号: 169740、配列識別番号: 173412、配列識別番号: 179404、配列識別番号: 182574 から 182654からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を提供する。
いくつかの実施形態では、核酸配列は、配列識別番号: 28796 から 28864、配列識別番号: 37110 から 37174、配列識別番号: 41321 から 41397、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49004、配列識別番号: 49071、配列識別番号: 49395、配列識別番号: 50632、配列識別番号: 50729、配列識別番号: 51434 から 51510、配列識別番号: 55758、配列識別番号: 60456 から 60527、配列識別番号: 68238 から 68321、配列識別番号: 77091、配列識別番号: 77210、配列識別番号: 84188、配列識別番号: 87951、配列識別番号: 88144、配列識別番号: 95593 から 95664、配列識別番号: 113808 から 113869、配列識別番号: 125134 から 125218、配列識別番号: 144109 から 144188、配列識別番号: 162383 から 162453、配列識別番号: 166444 から 166531、配列識別番号: 167118、配列識別番号: 169740、配列識別番号: 173412、配列識別番号: 179404、配列識別番号: 182574 から 182654 からなるグループから選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 28796 から 28864、配列識別番号: 37110 から 37174、配列識別番号: 41321 から 41397、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49004、配列識別番号: 49071、配列識別番号: 49395、配列識別番号: 50632、配列識別番号: 50729、配列識別番号: 51434 から 51510、配列識別番号: 55758、配列識別番号: 60456 から 60527、配列識別番号: 68238 から 68321、配列識別番号: 77091、配列識別番号: 77210、配列識別番号: 84188、配列識別番号: 87951、配列識別番号: 88144、配列識別番号: 95593 から 95664、配列識別番号: 113808 から 113869、配列識別番号: 125134 から 125218、配列識別番号: 144109 から 144188、配列識別番号: 162383 から 162453、配列識別番号: 166444 から 166531、配列識別番号: 167118、配列識別番号: 169740、配列識別番号: 173412、配列識別番号: 179404、配列識別番号: 182574 から 182654からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は被験者に投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 28796 から 28864、配列識別番号: 37110 から 37174、配列識別番号: 41321 から 41397、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49004、配列識別番号: 49071、配列識別番号: 49395、配列識別番号: 50632、配列識別番号: 50729、配列識別番号: 51434 から 51510、配列識別番号: 55758、配列識別番号: 60456 から 60527、配列識別番号: 68238 から 68321、配列識別番号: 77091、配列識別番号: 77210、配列識別番号: 84188、配列識別番号: 87951、配列識別番号: 88144、配列識別番号: 95593 から 95664、配列識別番号: 113808 から 113869、配列識別番号: 125134 から 125218、配列識別番号: 144109 から 144188、配列識別番号: 162383 から 162453、配列識別番号: 166444 から 166531、配列識別番号: 167118、配列識別番号: 169740、配列識別番号: 173412、配列識別番号: 179404、配列識別番号: 182574 から 182654 からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸配列はin vivoでの発現のためにコンストラクトとして投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列のin vivo投与は、HLAクラス I 分子によって表示される1つまたは複数のペプチドを産生するように構成されている。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、CTG1B、KKLC1、MAGA1、MAGA3、MAGA4、MAGC1、MAGC3、MAR1、PMEL、PRAME、SSX2、TYRP1、TYRP2 からなる群から選択されるタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、がんを予防するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 膵がん、皮膚がん、甲状腺がん、脳腫瘍、直腸結腸がん、気管支がんと肺がん、乳がん、卵巣がん からなるグループから選択される。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、 配列識別番号: 28796 から 28864、配列識別番号: 37110 から 37174、配列識別番号: 41321 から 41397、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49004、配列識別番号: 49071、配列識別番号: 49395、配列識別番号: 50632、配列識別番号: 50729、配列識別番号: 51434 から 51510、配列識別番号: 55758、配列識別番号: 60456 から 60527、配列識別番号: 68238 から 68321、配列識別番号: 77091、配列識別番号: 77210、配列識別番号: 84188、配列識別番号: 87951、配列識別番号: 88144、配列識別番号: 95593 から 95664、配列識別番号: 113808 から 113869、配列識別番号: 125134 から 125218、配列識別番号: 144109 から 144188、配列識別番号: 162383 から 162453、配列識別番号: 166444 から 166531、配列識別番号: 167118、配列識別番号: 169740、配列識別番号: 173412、配列識別番号: 179404、配列識別番号: 182574 から 182654からなる群から選択される少なくとも3つのアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 28796 から 28864、配列識別番号: 37110 から 37174、配列識別番号: 41321 から 41397、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49004、配列識別番号: 49071、配列識別番号: 49395、配列識別番号: 50632、配列識別番号: 50729、配列識別番号: 51434 から 51510、配列識別番号: 55758、配列識別番号: 60456 から 60527、配列識別番号: 68238 から 68321、配列識別番号: 77091、配列識別番号: 77210、配列識別番号: 84188、配列識別番号: 87951、配列識別番号: 88144、配列識別番号: 95593 から 95664、配列識別番号: 113808 から 113869、配列識別番号: 125134 から 125218、配列識別番号: 144109 から 144188、配列識別番号: 162383 から 162453、配列識別番号: 166444 から 166531、配列識別番号: 167118、配列識別番号: 169740、配列識別番号: 173412、配列識別番号: 179404、配列識別番号: 182574 から 182654からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 28796 から 28864、配列識別番号: 37110 から 37174、配列識別番号: 41321 から 41397、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49004、配列識別番号: 49071、配列識別番号: 49395、配列識別番号: 50632、配列識別番号: 50729、配列識別番号: 51434 から 51510、配列識別番号: 55758、配列識別番号: 60456 から 60527、配列識別番号: 68238 から 68321、配列識別番号: 77091、配列識別番号: 77210、配列識別番号: 84188、配列識別番号: 87951、配列識別番号: 88144、配列識別番号: 95593 から 95664、配列識別番号: 113808 から 113869、配列識別番号: 125134 から 125218、配列識別番号: 144109 から 144188、配列識別番号: 162383 から 162453、配列識別番号: 166444 から 166531、配列識別番号: 167118、配列識別番号: 169740、配列識別番号: 173412、配列識別番号: 179404、配列識別番号: 182574 から 182654からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 28796 から 28830からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、CTG1B タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 28796 から 28830からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 28796 から 28830からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 28796 から 28830からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 CTG1B タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 41321 から 41354からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、MAGA1 タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 41321 から 41354からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 41321 から 41354からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 41321 から 41354からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 MAGA1 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49004、配列識別番号: 51434 から 51468からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、MAGA3 タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49004、配列識別番号: 51434 から 51468からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49004、配列識別番号: 51434 から 51468からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49004、配列識別番号: 51434 から 51468からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 MAGA3 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 41352、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 60456 から 60487からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、MAGA4 タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 41352、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 60456 から 60487からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 41352、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 60456 から 60487からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 41352、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 60456 から 60487からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 MAGA4 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 49395 と 配列識別番号: 68238 から 68272からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、MAGC1 タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 49395 と 配列識別番号: 68238 から 68272からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 49395 と 配列識別番号: 68238 から 68272からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 49395 と 配列識別番号: 68238 から 68272からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 MAGC1 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 77091、配列識別番号: 77210、配列識別番号: 84188、配列識別番号: 88144、配列識別番号: 95593 から 95624からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、MAGC3 タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 77091、配列識別番号: 77210、配列識別番号: 84188、配列識別番号: 88144、配列識別番号: 95593 から 95624からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 77091、配列識別番号: 77210、配列識別番号: 84188、配列識別番号: 88144、配列識別番号: 95593 から 95624からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 77091、配列識別番号: 77210、配列識別番号: 84188、配列識別番号: 88144、配列識別番号: 95593 から 95624からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 MAGC3 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 162383 から 162420からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、SSX2 タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 162383 から 162420からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 162383 から 162420からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 162383 から 162420からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 SSX2 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 144109 から 144142からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、PRAME タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 144109 から 144142からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 144109 から 144142からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 144109 から 144142からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 PRAME タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 37110 から 37145からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、KKLC1 タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 37110 から 37145からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 37110 から 37145からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 37110 から 37145からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 KKLC1 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 125134 から 125167からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、PMEL タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 125134 から 125167からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 125134 から 125167からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 125134 から 125167からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 PMEL タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 166444 から 166480からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TYRP1 タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 166444 から 166480からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 166444 から 166480からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 166444 から 166480からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 TYRP1 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 169740、配列識別番号: 173412、配列識別番号: 179404、配列識別番号: 182574 から 182606からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TYRP2 タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 169740、配列識別番号: 173412、配列識別番号: 179404、配列識別番号: 182574 から 182606からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 169740、配列識別番号: 173412、配列識別番号: 179404、配列識別番号: 182574 から 182606からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 169740、配列識別番号: 173412、配列識別番号: 179404、配列識別番号: 182574 から 182606からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 TYRP2 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 113808 から 113843からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、MAR1 タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 113808 から 113843からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 113808 から 113843からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 113808 から 113843からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 MAR1 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
一形態において、本発明は、配列識別番号: 28796 から 28864、配列識別番号: 37110 から 37174、配列識別番号: 41321 から 41397、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49004、配列識別番号: 49071、配列識別番号: 49395、配列識別番号: 50632、配列識別番号: 50729、配列識別番号: 51434 から 51510、配列識別番号: 55758、配列識別番号: 60456 から 60527、配列識別番号: 68238 から 68321、配列識別番号: 77091、配列識別番号: 77210、配列識別番号: 84188、配列識別番号: 87951、配列識別番号: 88144、配列識別番号: 95593 から 95664、配列識別番号: 113808 から 113869、配列識別番号: 125134 から 125218、配列識別番号: 144109 から 144188、配列識別番号: 162383 から 162453、配列識別番号: 166444 から 166531、配列識別番号: 167118、配列識別番号: 169740、配列識別番号: 173412、配列識別番号: 179404、配列識別番号: 182574 から 182654からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を提供する。
いくつかの実施形態では、核酸配列は、配列識別番号: 28796 から 28864、配列識別番号: 37110 から 37174、配列識別番号: 41321 から 41397、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49004、配列識別番号: 49071、配列識別番号: 49395、配列識別番号: 50632、配列識別番号: 50729、配列識別番号: 51434 から 51510、配列識別番号: 55758、配列識別番号: 60456 から 60527、配列識別番号: 68238 から 68321、配列識別番号: 77091、配列識別番号: 77210、配列識別番号: 84188、配列識別番号: 87951、配列識別番号: 88144、配列識別番号: 95593 から 95664、配列識別番号: 113808 から 113869、配列識別番号: 125134 から 125218、配列識別番号: 144109 から 144188、配列識別番号: 162383 から 162453、配列識別番号: 166444 から 166531、配列識別番号: 167118、配列識別番号: 169740、配列識別番号: 173412、配列識別番号: 179404、配列識別番号: 182574 から 182654 からなるグループから選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 28796 から 28864、配列識別番号: 37110 から 37174、配列識別番号: 41321 から 41397、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49004、配列識別番号: 49071、配列識別番号: 49395、配列識別番号: 50632、配列識別番号: 50729、配列識別番号: 51434 から 51510、配列識別番号: 55758、配列識別番号: 60456 から 60527、配列識別番号: 68238 から 68321、配列識別番号: 77091、配列識別番号: 77210、配列識別番号: 84188、配列識別番号: 87951、配列識別番号: 88144、配列識別番号: 95593 から 95664、配列識別番号: 113808 から 113869、配列識別番号: 125134 から 125218、配列識別番号: 144109 から 144188、配列識別番号: 162383 から 162453、配列識別番号: 166444 から 166531、配列識別番号: 167118、配列識別番号: 169740、配列識別番号: 173412、配列識別番号: 179404、配列識別番号: 182574 から 182654からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は被験者に投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 28796 から 28864、配列識別番号: 37110 から 37174、配列識別番号: 41321 から 41397、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49004、配列識別番号: 49071、配列識別番号: 49395、配列識別番号: 50632、配列識別番号: 50729、配列識別番号: 51434 から 51510、配列識別番号: 55758、配列識別番号: 60456 から 60527、配列識別番号: 68238 から 68321、配列識別番号: 77091、配列識別番号: 77210、配列識別番号: 84188、配列識別番号: 87951、配列識別番号: 88144、配列識別番号: 95593 から 95664、配列識別番号: 113808 から 113869、配列識別番号: 125134 から 125218、配列識別番号: 144109 から 144188、配列識別番号: 162383 から 162453、配列識別番号: 166444 から 166531、配列識別番号: 167118、配列識別番号: 169740、配列識別番号: 173412、配列識別番号: 179404、配列識別番号: 182574 から 182654 からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸配列はin vivoでの発現のためにコンストラクトとして投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列のin vivo投与は、HLAクラス II 分子によって表示される1つまたは複数のペプチドを産生するように構成されている。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、CTG1B、KKLC1、MAGA1、MAGA3、MAGA4、MAGC1、MAGC3、MAR1、PMEL、PRAME、SSX2、TYRP1、TYRP2 からなる群から選択されるタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、がんを予防するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 膵がん、皮膚がん、甲状腺がん、脳腫瘍、直腸結腸がん、気管支がんと肺がん、乳がん、卵巣がん からなるグループから選択される。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、 配列識別番号: 28796 から 28864、配列識別番号: 37110 から 37174、配列識別番号: 41321 から 41397、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49004、配列識別番号: 49071、配列識別番号: 49395、配列識別番号: 50632、配列識別番号: 50729、配列識別番号: 51434 から 51510、配列識別番号: 55758、配列識別番号: 60456 から 60527、配列識別番号: 68238 から 68321、配列識別番号: 77091、配列識別番号: 77210、配列識別番号: 84188、配列識別番号: 87951、配列識別番号: 88144、配列識別番号: 95593 から 95664、配列識別番号: 113808 から 113869、配列識別番号: 125134 から 125218、配列識別番号: 144109 から 144188、配列識別番号: 162383 から 162453、配列識別番号: 166444 から 166531、配列識別番号: 167118、配列識別番号: 169740、配列識別番号: 173412、配列識別番号: 179404、配列識別番号: 182574 から 182654からなる群から選択される少なくとも3つのアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 28796 から 28864、配列識別番号: 37110 から 37174、配列識別番号: 41321 から 41397、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49004、配列識別番号: 49071、配列識別番号: 49395、配列識別番号: 50632、配列識別番号: 50729、配列識別番号: 51434 から 51510、配列識別番号: 55758、配列識別番号: 60456 から 60527、配列識別番号: 68238 から 68321、配列識別番号: 77091、配列識別番号: 77210、配列識別番号: 84188、配列識別番号: 87951、配列識別番号: 88144、配列識別番号: 95593 から 95664、配列識別番号: 113808 から 113869、配列識別番号: 125134 から 125218、配列識別番号: 144109 から 144188、配列識別番号: 162383 から 162453、配列識別番号: 166444 から 166531、配列識別番号: 167118、配列識別番号: 169740、配列識別番号: 173412、配列識別番号: 179404、配列識別番号: 182574 から 182654からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 28796 から 28864、配列識別番号: 37110 から 37174、配列識別番号: 41321 から 41397、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49004、配列識別番号: 49071、配列識別番号: 49395、配列識別番号: 50632、配列識別番号: 50729、配列識別番号: 51434 から 51510、配列識別番号: 55758、配列識別番号: 60456 から 60527、配列識別番号: 68238 から 68321、配列識別番号: 77091、配列識別番号: 77210、配列識別番号: 84188、配列識別番号: 87951、配列識別番号: 88144、配列識別番号: 95593 から 95664、配列識別番号: 113808 から 113869、配列識別番号: 125134 から 125218、配列識別番号: 144109 から 144188、配列識別番号: 162383 から 162453、配列識別番号: 166444 から 166531、配列識別番号: 167118、配列識別番号: 169740、配列識別番号: 173412、配列識別番号: 179404、配列識別番号: 182574 から 182654からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 197897 から 197901からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、CTG1B タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 197897 から 197901からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 197897 から 197901からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 197897 から 197901からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 CTG1B タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 211901 から 211904からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、MAGA1 タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 211901 から 211904からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 211901 から 211904からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 211901 から 211904からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 MAGA1 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 223623 から 223627からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、MAGA3 タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 223623 から 223627からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 223623 から 223627からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 223623 から 223627からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 MAGA3 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 236016 から 236020からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、MAGA4 タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 236016 から 236020からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 236016 から 236020からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 236016 から 236020からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 MAGA4 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 247059 から 247063からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、MAGC1 タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 247059 から 247063からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 247059 から 247063からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 247059 から 247063からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 MAGC1 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 281350 から 281353からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、MAGC3 タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 281350 から 281353からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 281350 から 281353からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 281350 から 281353からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 MAGC3 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 369027 から 369031からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、SSX2 タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 369027 から 369031からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 369027 から 369031からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 369027 から 369031からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 SSX2 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 342521 から 342525からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、PRAME タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 342521 から 342525からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 342521 から 342525からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 342521 から 342525からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 PRAME タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 206663 から 206665からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、KKLC1 タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 206663 から 206665からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 206663 から 206665からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 206663 から 206665からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 KKLC1 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 317360 から 317363からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、PMEL タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 317360 から 317363からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 317360 から 317363からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 317360 から 317363からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 PMEL タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 373348 から 373350からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TYRP1 タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 373348 から 373350からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 373348 から 373350からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 373348 から 373350からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 TYRP1 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 392434 から 392437からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TYRP2 タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 392434 から 392437からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 392434 から 392437からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 392434 から 392437からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 TYRP2 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 305566 から 305570からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、MAR1 タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 305566 から 305570からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 305566 から 305570からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 305566 から 305570からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 MAR1 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
自己免疫疾患のワクチン
自己免疫疾患のワクチン
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 34169 から 34204からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、INS タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 34169 から 34204からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 34169 から 34204からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 34169 から 34204からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 INS タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 116478 から 116515からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、MOG タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 116478 から 116515からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 116478 から 116515からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 116478 から 116515からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 MOG タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 203517 から 203521からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、INS タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 203517 から 203521からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 203517 から 203521からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 203517 から 203521からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 INS タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 307670 から 307674からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、MOG タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 307670 から 307674からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 307670 から 307674からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 307670 から 307674からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 MOG タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
以下の図は、本発明の例示的な実施形態を示している。
いくつかの実施形態では、本開示は、細胞上の主要組織適合遺伝子複合体(MHC)分子によって提示され、がんまたは病原体疾患細胞を認識するように免疫系を訓練するペプチド配列を組み込んだペプチドワクチンを規定している。 いくつかの実施形態では、本開示は、自己免疫疾患に対する抗原特異的免疫療法において治療耐性を誘導するための、細胞上の主要組織適合遺伝子複合体(MHC)分子によって提示されるペプチド配列を組み込んだペプチドワクチンを規定している(Alhadj Ali et al., 2017、Gibson et al., 2015)。いくつかの実施形態では、ペプチドワクチンは、1つまたは複数のペプチドからなる組成物である。いくつかの実施形態において、ペプチドワクチンは、 １つまたは複数のペプチドをコードするmRNAまたはDNAコンストラクトで、in vivoで発現させるために投与される 。
ペプチドが免疫原性を示し、得られたペプチド-MHC複合体を個人のT細胞が認識してT細胞の活性化、増殖、および免疫記憶を引き起こすためには、MHC分子によるペプチド提示が必要であるが、それだけでは十分ではない。 いくつかの実施形態では、ELISPOT（Slota et al., 2011）または免疫アッセイと免疫受容体シーケンシング(MIRA)アッセイの組み合わせによる抗原特異的T細胞受容体のマルチプレックス同定(Klinger et al.、2015）を使用して、MHC分子(例：HLA対立遺伝子)によるペプチド提示(例：ペプチド結合を必要とするペプチドの免疫原性)をスコアリングする(例：ペプチド-HLA結合スコアとして測定)。 いくつかの実施形態では、ELISPOTなどのアッセイからの実験データ（Slota et al., 2011）または免疫アッセイと免疫受容体シーケンシング（MIRA）アッセイの組み合わせによる抗原特異的T細胞受容体のマルチプレックス同定（Klinger et al., 2015）を使用すると、特定の実験状況または個人におけるペプチドとHLA対立遺伝子に関するペプチド-HLA免疫原性指標を作成することができる。 いくつかの実施形態では、ELISPOTなどのアッセイからの実験データ（Slota et al., 2011）または免疫アッセイと免疫受容体シーケンシング（MIRA）アッセイの組み合わせによる抗原特異的T細胞受容体のマルチプレックス同定（Klinger et al., 2015）を機械学習ベースの予測と組み合わせて、MHC分子（例：HLA対立遺伝子）によるペプチド提示（例：結合親和性）のスコアリング（例：ペプチド-HLA結合スコアとして測定）や、ペプチド-HLA免疫原性指標の決定を行うことができる。 いくつかの実施形態では、MHCflurryまたはNetMHCpan（Reynisson et al., 2020）の計算方法（当技術分野で知られているとおり）がHLA対立遺伝子によるペプチドのMHCクラスI提示の予測に用いられている（表1を参照 ）。 いくつかの実施形態では、NetMHCiiPan計算法（Reynisson et al., 2020）を用いて、HLA対立遺伝子によるペプチドのMHCクラスII提示を予測する（表2を参照 ）。
いくつかの実施形態では、MHCflurry（Odonnell et al., 2018, Odonnell et al., 2020、参考文献により全文を本書に組み込む）、NetMHCpan（Reynisson et al., 2020、参照により全文を本書に組み込む）、および NetMHCiiPan （Reynisson et al., 2020）などの計算方法が、HLA対立遺伝子によるペプチドのMHCクラスI（MHCflurry, NetMHCpan）またはクラスII（NetMHCiPan）提示を予測するために使用される。他の実施形態では、国際特許公開物番号WO 2005/042698に開示されているように、ペプチド-HLA結合を決定する他の方法が用いられている（参照によりその全体を本書に組み込む）。NetMHCpan-4.1 と NetMHcIiPan-4.0 では、NNAlign_MA アルゴリズム（Alvarezet al., 2019、ペプチド 参照により全文を本書に組み込む）をペプチド-HLA結合の予測に使用している。NNAlign_MA はそのため、nNAlign (Nielsen et al., 2009、Nielsen et al., 2017、参照により本書に全文を組み込む）ニューラルネットワークに基づいている。 NetMHCpan-4.1（Reynisson et al., 2020）は、ペプチド配列を記述する少なくとも180の入力（9 x 20 = 180入力）を備えたNNAlign_MAネットワークを使用している。 56個と66個の隠れニューロンと2つの出力を持つネットワークが使用されている (Alvarez et al., 2019）。各ネットワークアーキテクチャ (56 個または 66 個の隠れニューロン) は、5 つの異なるランダムパラメーター初期化と 5 回の相互検証でトレーニングされ、合計で 50 個の個別のトレーニング済みネットワーク (2 つのアーキテクチャ x 5 つの初期化 x 5 つの相互検証) が得られる。これらの 50 個の学習済みネットワークは、少なくとも 10,800 個のパラメーター (180 の入力 x 56 のニューロン) を持つ 25 個のネットワークと、少なくとも 11,880 個のパラメーター (180 の入力 x 66 のニューロン) で構成される 25 個のネットワークのアンサンブルとして使用される。したがって、NetMHCpan-4.1の 50 個のネットワークのアンサンブルは、ペプチド-MHC結合を計算するために少なくとも567,000 の算術演算で評価すべき最低567,000 個のパラメーターで構成されている。 NetMHCIIpan-4.1（Reynisson et al., 2020）は、ペプチド配列を記述する少なくとも180の入力（9 x 20 = 180入力）を備えたNNAlign_MAネットワークを使用する。 2個、10個、20個、40個および6０個の隠れニューロンと2つの出力を持つネットワークが使用される（Alvarez et al., 2019）。各ネットワークアーキテクチャ（2個、10個、20個、40個、または60個の隠れニューロン）は、10回の異なるランダムパラメーター初期化と、5 回の相互検証でトレーニングされ、合計 250 個の個別のトレーニング済みネットワーク（5 つのアーキテクチャ x 10 の初期化 x 5 つの相互検証）が得られる。これらの 250 個の学習済みネットワークは、少なくとも 360 個のパラメーター (180 の入力 x 2 個のニューロン) を持つ 50 個のネットワーク、少なくとも 1800 個のパラメーター (180 の入力 x 10 個のニューロン) を持つ50 個のネットワーク、少なくとも 3,600 個のパラメーター (180 の入力 x 20 個ニューロン) を持つ 50 個のネットワーク、少なくとも 7200 個のパラメーター (180 の入力 x 40 個のニューロン) をもつ 50 個のネットワーク、および 10,800 個以上のパラメーター (180 の入力 x 60 個のニューロン) をもつ 50 個のネットワークから成るアンサンブルとして使用される。したがって、NetMHCIIpan-4.0の250個のネットワークのアンサンブルは、ペプチド-MHC結合を計算するために少なくとも1,188,00の算術演算で評価すべき最低1,118,000個のパラメーターで構成されている。
いくつかの実施形態では、MHCクラスI（例：MHCflurry、NetMHCpan）またはクラスII（例：NetMHCIIPan）のペプチド-HLA結合スコアまたはペプチド-HLA免疫原性メトリクスを予測するために使用される計算方法は、MHC分子によって結合されたペプチドの実験的質量分析観察からのデータに基づく。いくつかの実施形態では、MHCクラスI（例：MHCflurry、NetMHCpan）またはクラスII（例、NetMHCIIPan）のペプチドHLA結合スコアまたはペプチド-HLA免疫原性メトリクスのいずれかを予測するために使用される計算方法は、ペプチドMHC結合親和性の実験的観察からのデータに基づく。いくつかの実施形態では、ペプチド-HLA結合の質量分析測定およびT細胞活性化の測定を含む、ペプチド-MHC結合親和性または免疫原性の実験的観察は、免疫エピトープデータベース（IEDB）（Vita et al, 2018）などのデータベースで見つけることができる。 MHCflurry 2.0 の出力（Odonnell et al., 2020、参照により全文をここに組み込む）は、ペプチド-HLA結合の493,473回の質量分析測定と、ペプチド-HLA結合の219,596回の親和性測定に基づく。NetMHCpan-4.1のアウトプット（Reynisson et al., 2020）は、ペプチド-HLA結合の665,492回の質量分析測定と、ペプチド-HLA結合の52,402回の親和性測定に基づく。NetMHCIIpan-4.0 のアウトプット（Reynisson et al., 2020）は、ペプチド-HLA結合の381,066回の質量分析測定と、ペプチド-HLA結合の44,861回の親和性測定に基づく。
ペプチドの提示はMHC分子によるもので、ペプチドがMHC分子の溝内で結合して細胞表面に輸送され、そこでT細胞受容体によって認識されると起こる。標的ペプチドとは、外来ペプチドまたは自己ペプチドを指す。いくつかの実施形態では、健常者における正常なプロテオームの一部であるペプチドは自己ペプチドであり、正常なプロテオームの一部ではないペプチドは外来ペプチドである。いくつかの実施形態では、標的ペプチドは、異常な発現を示す正常なプロテオームの一部であり得る（例えば、NY-ESO-1などのがん精巣抗原）。外来ペプチドは、ネオ抗原と呼ばれるエピトープを生成する腫瘍細胞の正常な自己タンパク質の突然変異によって、または病原性感染によって生成される。いくつかの実施形態では、ネオ抗原はヒトタンパク質のいずれかのサブシーケンスであり、そのサブシーケンスには、健常者には現れない1つまたは複数の変化したアミノ酸またはタンパク質修飾物が含まれる。したがって、本開示において、外来ペプチドとは、標的タンパク質／ペプチド（または全長タンパク質／ペプチド）の断片、すなわち、ネオ抗原タンパク質、病原体プロテオーム、または非自己性でＨＬＡ対立遺伝子によって結合されて表示されると予測される、その他の望ましくないタンパク質から成る標的タンパク質／ペプチドをコード化するアミノ酸配列を指す。
UniProt IDによって同定され、がんにおいて頻繁に変異するタンパク質遺伝子には、AKT1_HUMAN、BRAF_HUMAN、EGFR_HUMAN、GTF2I_HUMAN、RASH_HUMAN（HRAS とも呼ばれる）、IDHC_HUMAN（IDH1とも呼ばれる）、RASK_HUMAN（KRAS とも呼ばれる）、 RASN_HUMAN （NRAS とも呼ばれる）、PIK3CA_HUMAN、PTEN_HUMAN、および P53_HUMAN（TP53 とも呼ばれる）などがある。ここでは、タンパク質のミスセンス変異を、野生型アミノ酸の1文字のアミノ酸コード、アミノ酸変異の位置、および変異したタンパク質に存在する1文字のアミノ酸コードで説明する。例えば、KRAS G12Dは、KRASタンパク質で12位がグリシンからアスパラギン酸に変わった変異（G12D）である。タンパク質には、さまざまな位置に複数の変異が含まれている場合がある。簡潔に表現するために、ここでは末尾に「_HUMAN」を付けずに遺伝子を呼ぶ場合がある。
KRAS遺伝子変異は、がんの中で最もよくある変異がん遺伝子であるが、小分子治療を使って治療することは非常に困難であった。KRASタンパク質は、細胞増殖を制御するシグナル伝達経路の一部であり、このタンパク質の点突然変異は、構成的経路の活性化や制御不能な細胞増殖を引き起こす場合がある。単一アミノ酸のKRAS変異は、タンパク質構造にわずかな変化しかもたらさないため、変異体の特異的結合ポケットを認識してKRASシグナル伝達を不活性化する小分子薬の設計は困難になる。KRASの発がん性変異には、12位のグリシンからアスパラギン酸（G12D）、グリシンからバリン（G12V）、グリシンからアルギニン（G12R）、またはグリシンからシスティンの変異（G12C）、もしくは13位のグリシンからアスパラギン酸への変異（G13D）などがある。対応する外来ペプチドにはこれらの変異が含まれる。KRASは、HRASとNRASを含むRASファミリーの遺伝子の一員である。KRAS、HRAS、およびNRASは、残基1から残基86まで同一の配列を持っている。したがって、あるRASファミリーメンバーの変異についてここに記載されたワクチンおよびペプチド配列はすべて、他のどのRASファミリーメンバーの同一の変異にも使用できる（例、KRAS G12Dワクチンは、HRAS G12Dのワクチンでもある）。
がん精巣抗原などの特定の自己タンパク質は、がん細胞に異常に高いレベルで存在するため、MHC分子上にこれらの自己タンパク質に由来するペプチドを提示する細胞に対してT細胞応答の不耐性を誘発するワクチンの標的となる可能性がある。UniProt ID別のこれらのがん関連タンパク質の例には、CTG1B_HUMAN（NY-ESO-1としても知られる）、MAGA1_HUMAN、MAGA3_HUMAN、MAGA4_HUMAN、MAGC1_HUMAN、MAGC3_HUMAN、SSX2_HUMAN、PRAME_HUMAN、KKLC1_HUMAN （CT83としても知られる）、PMEL_HUMAN （gp100としても知られる）、TYRP1_HUMAN （gp75 としても知られる）、TYRP2_HUMAN （DCT としても知られる）、および MAR1_HUMANなどがある。
自己免疫疾患は、自己タンパク質に対する自己耐性を喪失した免疫系によって引き起こされる。そのような自己耐性の喪失は、糖尿病、多発性硬化症、自己免疫性脳脊髄炎などの自己免疫疾患に関与している。自己免疫関連自己ペプチドに対する耐性の誘導は、寛容化プロトコルによるワクチン抗原の送達を用いた抗原特異的寛容化によって達成できる。脂質ナノ粒子（LNP）カプセル化（mRNA-LNP）ワクチンによる耐性を誘導するためのプロトコルの例は、Krienke、et al., 2021によって説明されており、参照により本書に全文を組み込む。自己免疫疾患関連タンパク質の例には、UniProt IDのINS_HUMAN（インスリンとしても知られる）およびMOG_HUMAN（ミエリン-オリゴデンドロサイト糖タンパク質としても知られる）が含まれる。糖尿病患者はINS_HUMANに対する耐性の喪失を、そして多発性硬化症または自己免疫性脳脊髄炎の患者は、MOG_HUMANに対する耐性の喪失を、それぞれ有している可能性がある。
ペプチドワクチンのデザインにおける課題は、ヒトMHC対立遺伝子（HLA対立遺伝子)の多様性により、表示されるペプチド配列に対してそれぞれの対立遺伝子が特定の優先傾向を持つことである。MHC内にあるヒト白血球抗原（HLA）遺伝子座は、HLAクラスIおよびクラスII分子をコード化する。3つの古典的なクラスI遺伝子座（HLA-A、HLA-B、およびHLA-C）と、クラスII分子（HLA-DR、HLA-DQ、およびHLA-DP）をコード化する3つの遺伝子座がある。個人のHLAタイプは、これらの各遺伝子座にある対立遺伝子を表す。残基の長さが約8～約11のペプチドは、HLAクラスI（またはMHCクラスI）分子に結合することができるが、長さが約13～約25残基のペプチドは、HLAクラスII（またはMHCクラスII）分子と結合する（Rist et al., 2013、Chicz et al., 1992）。異なる地域由来のヒト集団はHLA対立遺伝子の頻度が異なり、これらの集団はHLA遺伝子座間で連鎖不平衡を示し、その結果、集団固有のハプロタイプ頻度が生じる。いくつかの実施形態では、標的集団におけるHLA対立遺伝子頻度を考慮すること、およびHLA遺伝子間の連鎖不平衡を考慮して、確実に表示されそうなペプチドのセットを実現することを含む、効果的なワクチンの製造方法が開示されている。
本開示は、単一または複数の標的に免疫をもたらすワクチンのデザインの組成、システム、およびデザイン方法を規定している。いくつかの実施形態では、標的はネオ抗原タンパク質配列、病原体プロテオーム、またはHLA分子（本書ではHLA対立遺伝子とも呼ぶ）によって結合され提示されると予想される、その他の非自己で望ましくないタンパク質配列となる。標的が個体の中に存在する場合、さまざまなHLA対立遺伝子によって複数のペプチド配列が提示される可能性がある。いくつかの実施形態では、選択された自己ペプチドを含むワクチンを作製することが望ましい場合があり、したがって、これらの選択された自己ペプチドを、この目的のための標的ペプチドであると考える。
ペプチド-HLA結合という用語は、HLA対立遺伝子へのペプチドの結合と定義され、計算による予測、実験的観察、または実験的観察を使用した計算による予測のいずれかが可能である。ペプチド-HLA結合の指標は、親和性、パーセンタイル順位、所定の閾値におけるバイナリ、確率、または当技術分野で知られている他の指標として表すことができる。ペプチド-HLA免疫原性指標という用語は、HLA対立遺伝子に結合したときのペプチドの認識に基づいてT細胞に起きる活性化と定義される。ペプチド-HLA免疫原性スコアという用語は、ペプチド-HLA免疫原性指標の別名であり、これらの用語は同じ意味を持つ。ペプチド-HLAの免疫原性指標は、個人によって異なる可能性があり、ペプチド-HLAの免疫原性の指標は、確率、バイナリ指標、またはペプチドとHLAの組み合わせが免疫原性である可能性に関連するその他の指標として表すことができる。いくつかの実施形態では、ペプチド-HLA免疫原性は、HLA対立遺伝子に結合したときのペプチドの認識に基づく免疫寛容の誘導として定義される。ペプチド-HLA免疫原性指標は、計算による予測、実験的観察、または実験的観察を用いた計算による予測が可能である。いくつかの実施形態では、ペプチド-HLAの免疫原性にはペプチド-HLA結合が必要であるため、ペプチド-HLA免疫原性指標はペプチド-HLA結合のみに基づく。いくつかの実施形態では、ペプチド-HLA免疫原性データまたはペプチド-HLA免疫原性の計算予測を、本書で開示する方法におけるペプチド提示のスコアに含めて組み合わせることができる。スコアを組み合わせる1つの方法は、疾患のある個人またはワクチン接種を受けた個人の免疫原性について分析されたペプチドの免疫原性データを使用し、計算方法によって最も提示されやすいと予測されるHLA対立遺伝子を選択して、個体で提示されたHLA対立遺伝子にペプチドを割り当てることである。実験的に分析されていないペプチドについては、計算による提示の予測を使用することができる。いくつかの実施形態では、ペプチド-HLA免疫原性またはペプチド-HLA結合を予測するさまざまな計算方法を組み合わせることができる（Liu et al., 2020b）。特定のペプチドセットとHLA対立遺伝子のセットについて、ペプチド-HLAヒットという用語は、ペプチド-HLA免疫原性または所定の閾値で結合を示すペプチドとHLA対立遺伝子の特有の組み合わせの数を指す。例えば、ペプチド-HLAヒットが2であることは、次のいずれかが予測されることを意味する：1つのペプチドが2つの異なるHLA対立遺伝子に結合する（またはT細胞の活性化を引き起こす）こと、または2つのペプチドが2つの異なるHLA対立遺伝子に結合する（またはT細胞の活性化を引き起こす）こと、または2つのペプチドが同じHLA対立遺伝子に結合する（またはT細胞の活性化を引き起こす）こと。ペプチドとHLA頻度、HLAハプロタイプ頻度、またはHLAディプロタイプ頻度の特定のセットについて、期待されるペプチド-HLAヒット数は、個体を表す各セットのペプチド-HLAヒット数を、発生頻度で補正した平均値である。
免疫原性は個人によって異なる可能性があるため、ワクチンの有効率を高める1つの方法は、多様な標的ペプチドのセット（例、少なくとも2つのペプチド）を使用して、それらの一部のサブセットが特定の個人で免疫原性になる可能性を高めることである。マウスのモデルを用いた過去の研究では、ほとんどのMHC表示ペプチドは免疫原性であることが示されているが、Croft et al.（2019）が説明するように、免疫原性は個人により異なる。いくつかの実施形態では、実験的ペプチド-HLA免疫原性データを使用して、どの標的ペプチドおよびその修飾がワクチンにおいて有効な免疫原となるかを決定する。
ペプチドワクチンのデザインに関する考察は、Liu et al., Cell Systems 11, Issue 2, p. 131-146（Liu et al., 2020およびLiu et al., 2020b）、および米国特許第11,058,751号および米国特許第11,161,892号に概説されており、参照によりその全文を本書に組み込む。
特定の標的ペプチドは、幅広いHLA分子に高い親和性で結合しない場合がある。標的ペプチドのHLA分子への結合を増加させるために、それらのアミノ酸組成を変更して1つまたは複数のアンカー残基または他の残基を変化させることができる。いくつかの実施形態では、HLA分子によって提示されるときに標的ペプチドの免疫原性を高めるため、標的ペプチドのアミノ酸組成を変化させて1つまたは複数の残基を変化させることができる。アンカー残基は、HLA分子と相互作用するアミノ酸であり、HLA分子に対するペプチドの親和性に最も大きな影響を及ぼす。アミノ酸残基が1つ以上変化したペプチドは、ヘテロクリティックペプチドと呼ばれる。いくつかの実施形態では、ヘテロクリティックペプチドは、アンカー位置に残基修飾を有する標的ペプチドを含む。いくつかの実施形態では、ヘテロクリティックペプチドは、非アンカー位置に残基修飾を有する標的ペプチドを含む。いくつかの実施形態では、ヘテロクリティックペプチドは、非天然アミノ酸およびアミノ酸誘導体を含む残基修飾を有する標的ペプチドを含む。ヘテロクリティックペプチドを生成するための修飾は、MHCクラスI分子とMHCクラスII分子の両方へのペプチドの結合を改善することができ、必要な修飾はペプチドとMHCクラスの両方に特異的である可能性がある。ペプチドアンカー残基はMHC分子溝に面しているため、他のペプチド残基よりもT細胞受容体に認識されにくい。したがって、アンカー残基が修飾されたヘテロクリティックペプチドはT細胞応答を誘発し、刺激されたT細胞が未修飾ペプチドにも反応することが観察されている。 ワクチンにヘテロクリティックペプチドを使用することで、ワクチンの有効性が向上することが観察されている（Zirlik et al., 2006）。いくつかの実施形態では、当技術分野で知られているように、ヘテロクリティックペプチドの免疫原性が実験的に決定され、ヘテロクリティックペプチドの対応する塩基（シードとも呼ばれる）ペプチドも認識するT細胞を活性化するそれらの能力が特定される（(Houghton et al., 2007）。いくつかの実施形態では、ヘテロクリティックペプチドの免疫原性および交差反応性に関するこれらのアッセイは、ヘテロクリティックペプチドが特定のHLA対立遺伝子によって提示されるときに行われる。
1つまたは複数の標的に対して免疫を誘導するペプチドワクチン
1つまたは複数の標的に対して免疫を誘導するペプチドワクチン
いくつかの実施形態では、1つまたは複数の標的に対する単一のワクチンデザインを用いてペプチドワクチンを調整する方法が規定される。いくつかの実施形態では、単一標的は特定の変異を有する外来タンパク質（例、KRAS G12D）である。いくつかの実施形態では、単一標的は自己タンパク質（例、がん/精巣抗原などの腫瘍細胞において過剰発現するタンパク質）である。いくつかの実施形態では、単一標的は病原体タンパク質（例、ウイルスプロテオームに含まれるタンパク質）である。いくつかの実施形態では、複数の標的（例、KRAS G12DとKRAS G13Dの両方）を使用することができる。
いくつかの実施形態では、この方法はLiu et al.（2020）が説明するように、ペプチドを抽出してすべての標的プロテオーム配列（例、KRAS G12Dタンパク質全体）から候補セットを構築することを含む。
図1と図2は、MHCクラスIまたはMHCクラスIIのワクチンデザインに使用できる、ワクチンデザイン法実施例のフローチャートを示す。候補ペプチドセット（図1および2を参照）は、入力タンパク質配列をウィンドウ処理することによって抽出された標的ペプチドで構成されている。いくつかの実施形態では、抽出された標的ペプチドのアミノ酸長は約8～約10（例、MHCクラスI結合の場合）である（Rist et al.、2013）。いくつかの実施形態では、MHCクラスI分子によって提示される抽出された標的ペプチドは10個のアミノ酸残基よりも長く、11残基などである（Trolle et al., 2016）。いくつかの実施形態では、抽出された標的ペプチドの長さは約13～約25（例、クラスII結合の場合）である（Chicz et al., 1992）。いくつかの実施形態では、本書に記載されるさまざまなサイズ範囲のスライディングウィンドウがプロテオーム全体にわたって使用される。いくつかの実施形態では、MHCクラスIおよびクラスIIのスライディングウィンドウに対する他の標的ペプチド長を利用することができる。いくつかの実施形態では、プロテアソーム切断の計算予測を用いて、候補セット中のペプチドをフィルタリングまたは選択する。プロテアソームの切断を予測する計算方法の1つについては、Nielsen et al.（2005）が説明している。いくつかの実施形態では、Liu et al.（2020）が説明するように、ペプチド変異率、グリコシル化、切断部位、または他の基準を用いてペプチドをフィルタリングすることができる。いくつかの実施形態では、ペプチドは、所定の閾値を超える進化的配列変動に基づいてフィルタリングすることができる。進化的配列の変動は、他の種、他の病原体、他の病原体株、またはその他の関連生物に関して計算できる。いくつかの実施形態では、第1のペプチドセットが候補セットである。
図1～2に示すように、いくつかの実施形態では、この方法の次のステップには、Liu et al.（2020）およびLiu et al.（2020b）が述べるように、考えられるすべてのHLA対立遺伝子へのペプチド-HLA結合の候補セット内の標的ペプチドのスコアリングが含まれる。いくつかの実施形態では、第1ペプチドセットは、標的ペプチドをスコアリングした後の候補セットである。スコアリングは、ヒトHLA分子、マウスH-2分子、ブタSLA分子、または予測アルゴリズムが利用可能または開発可能なあらゆる種のMHC分子に対して実行できる。したがって、この方法で非ヒト種を対象としたワクチンをデザインすることができる。スコアリングマトリックスには、ナノモルでのHLA対立遺伝子に対する標的ペプチドの親和性、溶出リガンド、提示、およびパーセンタイル順位またはその他の指標として表すことができるその他のスコアが含まれる。候補セットをさらにフィルタリングして、予測される結合コアが目的の特定病原性または新抗原の標的残基を含まないペプチド、または予測される結合コアのアンカー位置に標的残基が含まれるペプチドを除外することができる。候補セットは、例えばMHCクラスIの場合は長さ9など、特定の長さの標的ペプチドについてフィルタリングすることもできる。いくつかの実施形態では、標的ペプチドのスコアリングは、実験データまたは実験データと計算予測法の組み合わせを用いて行われる。特定の（ペプチド、HLA）ペアのペプチド-HLA結合予測を行うための計算モデルが利用できない場合、そのようなペアの結合値は、サポートされているペアに対して取られた平均値、中央値、最小値、または最大値の免疫原性、固定値（結合がないことを示す値など）、またはスコアリングモデルの中で利用可能な最も類似した（ペプチド、HLA）ペアの予測関数を含む他の手法を使用して推測することができる。
いくつかの実施形態では、個々のペプチド-HLA結合または免疫原性基準（例、第1ペプチドセット）を用いてスコアリングされた候補セットからペプチドを選択することにより、塩基セット（本書ではシードセットとも呼ばれる）が構築される（図1）。いくつかの実施形態では、所与のペプチドは複数のペプチド-HLAスコアを有するので、最良の親和性または最も高い免疫原性を有する（例、既定のHLA対立遺伝子に対して最も強く結合するか、または最も活性化することが予測される）ペプチド-HLA結合スコアまたはペプチド-HLA免疫原性指標に基づいて選択することができる。スコアリング手順中にペプチド-HLA結合のスコアリングで使用される基準は、塩基セット選択およびワクチンデザイン段階におけるさまざまな目標に対応することができる。例えば、500nMのペプチド-HLA結合親和性を有する標的ペプチドは、疾患のある個人によって提示されることがあるが、50nMのペプチド-HLA結合親和性を持つ標的ペプチドよりも頻度は低くなる。ワクチンの組み合わせのデザインの段階では、HLA分子によってワクチンペプチドが発見され提示される可能性を高めるために、50nMなど、より厳密な親和性基準（例、図1と図2に示す、第3のペプチドセットを選択する場合のターゲット用ワクチン）が使用できる。いくつかの実施形態では、ペプチド-HLA免疫原性またはペプチド-HLA結合の比較的緩い閾値（例、約1000nM未満または約500nM未満）が、候補ペプチド-HLAスコアリングをフィルタリングする第1閾値（図1および図2の第1のペプチドスコアリングおよびスコアフィルタリングステップ）として使用され、比較的厳密な第2閾値（例、約50nM未満）として使用される）は、特定のHLA対立遺伝子に対し、拡張セットのペプチド-HLAスコア（図1と図2の第2のペプチドフィルタリングおよびスコアリングステップ）をフィルタリングするために使用される。いくつかの実施形態では、特定のペプチド-HLAスコアは、未修飾の対応ペプチドが第1の制約の少ない閾値を超えない場合、ワクチン設計用の所与のHLA用の改変ペプチドについては使用されない。このペプチド-HLAスコアのフィルタリングは、ワクチンに含めるのに十分な免疫原性を持たないペプチドが抗原性であり（最初のフィルタリング閾値を満たす）、したがってワクチンによって増殖したT細胞クロノタイプによって認識される可能性があるという観察結果に基づいている。ペプチドは、T細胞受容体によって認識されると抗原性を示し、CD8+T細胞の細胞毒性やCD4+細胞の活性化などの反応を引き起こす。抗原性ペプチドの誘導体は、ワクチンに含まれると強力な免疫原性を持つ可能性があるため、抗原ペプチドを認識するT細胞を活性化して増殖させる可能性がある。未修飾の抗原ペプチドを認識するT細胞の増殖により、疾患の制御に寄与する免疫応答をもたらすことができる。いくつかの実施形態では、ペプチドは、約500nM未満のペプチド-HLA結合親和性を有する第3のペプチドセット（図1および図2の対するワクチン）の潜在的な包含についてスコアリングされる。いくつかの実施形態では、少なくとも１つのHLA対立遺伝子に対して約1000nM未満のペプチド-HLA結合親和性を有するペプチドが塩基セットに選択される。あるいは、ペプチド-HLAの免疫原性の予測を用いて、塩基セットに含める標的ペプチドの適格性を判断することもできる。いくつかの実施形態では、HLA対立遺伝子による提示という文脈におけるペプチドの免疫原性の実験的観察、またはペプチドのHLA対立遺伝子への結合の実験的観察を使用して、HLA対立遺伝子に結合するペプチドまたはペプチド-HLA免疫原性をスコアリングすることができる。
いくつかの実施形態では、腫瘍細胞における特定のHLA対立遺伝子によるペプチドの提示の実験的観察を用いて、ペプチド-HLA結合またはペプチド-HLA免疫原性についてペプチドをスコアリングすることができる。いくつかの実施形態では、特定のHLA対立遺伝子による腫瘍細胞のペプチド提示の実験的観察を用いて、そのHLA対立遺伝子のペプチド-HLA結合またはペプチド-HLA免疫原性についてペプチドをスコアリングすることができる。いくつかの実施形態では、腫瘍細胞ペプチドの提示の実験的観察を用いて、ペプチド-HLA結合または免疫原性の予測閾値を満たす腫瘍に存在するHLA対立遺伝子から選択される、特定の観察されたペプチドに対するHLA対立遺伝子を用いて、ペプチド-HLA結合またはペプチド-HLA免疫原性についてペプチドをスコアリングすることができる。いくつかの実施形態では、Bear et al.（2021）またはWang et al.（2019）が述べるように、質量分析法を用いて腫瘍細胞によるペプチドの提示を実験的に決定し、これらのデータを使用して、ペプチド-HLA結合またはペプチド-HLA免疫原性を評価する。いくつかの実施形態では、質量分析法を用いて腫瘍細胞によるペプチドの提示を実験的に決定し、これらの実験データを使用して、ワクチンの1つまたは複数のHLA対立遺伝子に対する塩基セット（シードセット）ペプチドが含まれているかどうかを判定する。いくつかの実施形態では、質量分析法を用いて腫瘍細胞によるペプチドの表示を実験的に決定し、これらの実験データを使用して、ペプチドがHLA対立遺伝子によって提示されることが質量分析により観察されない場合に、ペプチド-HLA結合スコアまたはペプチド-HLA免疫原性スコアを除外する。いくつかの実施形態では、質量分析法を用いて腫瘍細胞によるペプチドの表示を実験的に決定し、これらの実験データを使用して、1つまたは複数のHLA対立遺伝子に対する塩基セット（シードセット）ペプチドが含まれているかどうかを判定する。いくつかの実施形態では、質量分析法を用いて個人の腫瘍細胞によるペプチドの表示を実験的に決定し、これらの実験データを使用して、ペプチドがHLA対立遺伝子によって提示されることが質量分析により観察されない場合に、ペプチドのペプチド-HLA結合スコアまたはペプチド-HLA免疫原性スコアを除外する。 いくつかの実施形態では、HLA対立遺伝子による提示という文脈におけるペプチドの免疫原性の計算による予測を、Ogishi et al.（2019）またはBulik-Sullivan et al.（2019）らの方法などでスコアリングに用いることができる。
いくつかの実施形態では、第1のペプチドに対応する野生型ペプチド（例えば、ペプチドの天然に存在する変異していない形態、または定義された配列の編集距離内のそれぞれの種のペプチド）が、定義された閾値内の同じHLA対立遺対子に対するペプチド-HLAスコアまたはペプチド-HLA免疫原性スコアがある場合、所与のHLA対立遺伝子の塩基セット（シードセット）内の第1ペプチドに対するペプチド-HLAスコアまたはペプチド-HLA免疫原性スコアは除去され、ワクチンデザインの際に考慮されない。閾値は、第1ペプチドと野生型ペプチドのスコアの差、第1ペプチドと野生型ペプチドのスコアの比率、野生型ペプチドのスコア、またはその他の指標に基づくことができる。定義した閾値は、指定した値より大きくても小さくても構わない。いくつかの実施形態では、野生型ペプチドが提示されることが予測されないように閾値が定義される。いくつかの実施形態では、ワクチンデザイン時に第1ペプチドについてペプチド-HLAスコアまたはペプチド-HLA免疫原性スコアが除去されると、同じHLA対立遺伝子の全ての誘導体（例、ヘテロクリティックペプチド誘導体）のペプチド-HLAスコアまたはペプチド-HLA免疫原性スコアも除去され、ワクチンデザイン時には考慮されない。
いくつかの実施形態では、この方法にはさらに、Liu et al.（2020）らが説明しているように、OptiVax-Robustアルゴリズムを実行することが含まれ、スコアリングされた候補セット上の集団のHLAハプロタイプ頻度を用いて、標的ペプチドの塩基セット （本書ではシードセットとも呼ぶ）を構築する（図2）。いくつかの実施形態では、HLAディプロタイプの頻度をOptiVaxに提供することができる。OptiVax-Robustには、さまざまなウィンドウサイズでのスライディングウィンドウアプローチから生じるペプチドの冗長性を排除するアルゴリズムが含まれているが、冗長性を除去する他の手段を使用して、候補セット内のターゲットペプチド間の最小編集距離の制約を適用することもできる。シードセットのサイズは、シードセット内のターゲットペプチド数の関数としての集団被覆率のリターンが減少するポイントによって決まる。ワクチン標的ペプチドの最小数、ワクチン標的ペプチドの最大数、および望ましい予測集団被覆率など、他の基準を使用することもできる。いくつかの実施形態では、所定の集団被覆率は約0.4未満、約0.4～0.5、約0.5～0.6、約0.6～0.7、約0.7～0.8、約0.8～0.9、または約0.9より大きい。考えられる別の基準は、各個体で予想されるペプチド-HLA結合ヒットの最小数である。別の実施形態では、この方法はさらに、Liu et al.（2020）の説明にある通り、OptiVax-Robust の代わりに OptiVax-Unlinked アルゴリズムを実行することを含む。
OptiVax-Robust法は、ペプチド-HLA免疫原性のバイナリ予測を使用し、これらのバイナリ予測はLiu et al.（2020b年）の説明のように生成できる。OptiVax-Unlinked法では、標的ペプチドがHLA対立遺伝子に結合する確率を利用し、Liu et al.（2020年）が説明するように生成できる。いくつかの実施形態では、ペプチド-HLAの免疫原性が認められる確率で、OptiVax非結合型およびEvalVax非結合型が使用される。本書で説明する目的のためにはいずれの方法も使用できるので、「OptiVax」という用語はRobust方式またはUnlinked方式のいずれかを指す。いくつかの実施形態では、実験的アッセイで観察されたペプチド-HLA免疫原性の確率を、EvalVax-非結合型およびOptiVax-非結合型におけるペプチド-HLA結合の確率として使用することができる。いくつかの実施形態では、ワクチンデザインのためにOptiVax に提供される集団のHLAハプロタイプまたはHLA対立遺伝子頻度は、世界の人口を表す。別の実施形態では、ワクチンデザインのためにOptiVaxに提供される集団のHLAハプロタイプまたはHLA対立遺伝子頻度は、地理上の地域に固有である。別の実施形態では、ワクチンデザインのためにOptiVaxに提供される集団のHLAハプロタイプまたはHLA対立遺伝子頻度は、血統に固有である。別の実施形態では、ワクチンデザインのためにOptiVaxに提供される集団のHLAハプロタイプまたはHLA対立遺伝子頻度は、人種に固有である。別の実施形態では、ワクチンデザインのためにOptiVaxに提供される集団のHLAハプロタイプまたはHLA対立遺伝子頻度は、リスクの遺伝的指標、年齢、化学物質への暴露、アルコール摂取、慢性炎症、食事、ホルモン、免疫抑制、感染因子、肥満、放射線、日光、または喫煙などの危険因子を有する個人に特有である。別の実施形態では、ワクチンデザインのためにOptiVaxに提供される集団のHLAハプロタイプまたはHLA対立遺伝子頻度は、ある種のHLA対立遺伝子を有する個人に特有である。別の実施形態では、ワクチンデザインのためにOptiVaxに提供されるHLAディプロタイプは、単一の個体を説明し、それを用いて個別化されたワクチンをデザインする。
いくつかの実施形態では、標的ペプチドの候補セットへのOptiVax適用から生じる標的ペプチドの塩基セット（またはシードセット）（例、第1ペプチドセット）は、ワクチンデザインをがコンパクトにする可能性がある未修飾標的ペプチドのセット（図2のシードセット）を表す。ペプチド塩基は、塩基またはシードペプチドセット（例 、第1ペプチドセット）に含まれる標的ペプチドである。いくつかの実施形態では、シードセット（例、第1ペプチドセット）は、HLA分子（図1のシードセット）に対する予測または観察された親和性または免疫原性によって候補ペプチドスコアをフィルタリングすることに基づいている。ただし、可能な限り広範囲のHLAハプロタイプにおける標的ペプチドの提示を改善するために、いくつかの実施形態では、シード（または塩基）セットの修飾が含まれる。いくつかの実施形態では、実験的アッセイを用いて、修飾されたシード（または塩基）ペプチドが、その塩基／シードペプチドも認識するT細胞を活性化することを確認できる。
特定の標的ペプチドについて、最適なアンカー残基の選択は、標的ペプチドに結合して提示するHLA対立遺伝子とHLA対立遺伝子のクラス（MHCクラスIまたはクラスII）に依存する場合がある。シードペプチドセット(例、第1ペプチドセット)は、MHCクラスIまたはIIペプチドのいずれかのアンカー残基修飾ペプチドを含むことによって拡張セットになることができる（図1-2）。したがって、ワクチンデザインの1つの側面は、ヘテロクリティックペプチドが異なれば、集団の適用範囲が異なり、重複する可能性があることを踏まえて、同じ標的ペプチドに由来するヘテロクリティックペプチドの限られたセットを選択してワクチンに含める方法を検討することである。
いくつかの実施形態では、標的ペプチドの各塩基セットについて考えられるすべてのアンカー修飾が考慮される。MHCクラスI分子に結しれたペプチドには通常2つのアンカー残基があり、9-mer ペプチドの場合は通常2位と9位となる。いくつかの実施形態では、8-mers、10-mers、および 11-mersのアンカーが位置2とnにあり、nは最後の位置 (それぞれ8、10、11)である。MHCクラスI分子の場合、 最後の位置nは 、本書ではカルボキシル末端の「C」位置と呼ばれる。いくつかの実施形態では、最良のヘテロクリティックペプチドを選択するために、各アンカー位置において20個の可能なアミノ酸を試みる。したがって、MHCクラスI結合では、塩基標的ペプチドごとに400（つまり、20 アミノ酸ｘ2位 = 202）から1個のヘテロクリティックペプチドを引いたものが生成される。MHCクラスII分子に結合したペプチドには通常、9-mer結合コアの1、4、6、9の位置に4つのアンカー残基がある。したがって、MHCクラスI結合では、塩基標的ペプチドごとに160,000（つまり、20 アミノ酸ｘ4位 = 204）から1個のヘテロクリティックペプチドを引いたものが生成される。いくつかの実施形態では、2つ以上（MHCクラスI）または4つ（MHCクラスII）の位置がアンカーと見なされる。ベイズ最適化を含む他の方法を使用して、最適なアンカー残基を選択し、各シード（または塩基）セットペプチドからヘテロクリティックペプチドを生成することができる。最適なアンカー残基を選択する他の方法は、Dai et al.（2020年）の「Machine learning optimization of peptides for presentation by class II MHCs」に示されており、その全文を本書に組み込む。いくつかの実施形態では、アンカー位置はペプチドを提示するHLA対立遺伝子によって決定されるため、ヘテロクリティックペプチドのセットには、HLA特異的アンカー位置の各セットについて、可能なすべてのアンカー修飾が含まれる。
いくつかの実施形態では、塩基／シードセット内のすべての標的ペプチドについて、考えられるすべてのアンカー残基修飾を伴う新しいペプチド配列（例、MHCクラスIまたはクラスII）が作成され、その結果、すべての修飾を含む新しいヘテロクライティック塩基セット（図1-2の拡張セット）が得られる。いくつかの実施形態では、ペプチドのアンカー残基位置の1つ以上が、ペプチドを自己ペプチドと区別する置換変異を含む場合、ペプチドのアンカー残基修飾はヘテロクリティック塩基セットに含まれない。いくつかの実施形態では、塩基／シードペプチドのアンカー残基修飾は、塩基／シードペプチドと自己ペプチドを区別する置換変異を含まないペプチド位置のヘテロクリティック塩背セットにのみ含まれる。いくつかの実施形態では、ペプチドのアンカー残基修飾は、ペプチドの1つまたは複数の変異がその隣接するアンカー残基ペア間で発生しない場合、ヘテロクリティック塩基セットに含まれない。いくつかの実施形態では、塩基／シードセット内のすべての標的ペプチドについて、アンカー残基修飾を伴う新しいペプチド配列（例、MHCクラスIまたはクラスII）が作成され、その結果、すべての修飾を含む新しいヘテロクライティック塩基セット（図1-2の拡張セット）が得られる。いくつかの実施形態では、ペプチドを修飾するために使用されるアンカー残基位置は、ワクチン評価中に検討されるHLA対立遺伝子によって決定されるアンカー残基位置から選択される。いくつかの実施形態では、ヘテロクライティック塩基セット（図1-2の拡張セット）には、元のシード（または塩基）セット（図1-2のシードペプチドセット）も含まれる。いくつかの実施形態では、ヘテロクリティック塩基セットには、非アンカー残基でのアミノ酸置換が含まれる。いくつかの実施形態では、塩基ペプチド残基を修飾してT細胞受容体への結合を変化させることによって治療効果を改善する（Candia et al., 2016）。いくつかの実施形態では、ヘテロクリティック塩基セットは、非天然アミノ酸類似体のアミノ酸置換を含む。ヘテロクライティック塩基セットは、HLA親和性、ペプチド-HLA免疫原性、または本書に記載されているその他の指標についてスコアリングされる（図1-2に示される過程で行う2度目のペプチドスコアリングおよびスコアフィルタリング）。いくつかの実施形態では、ヘテロクリティックペプチドとHLA対立遺伝子のペアについてスコアリング予測をさらに更新する可能性があり、これにより、ヘテロクリティックペプチドが、ペプチド-HLA結合スコアの特定の閾値または特定のペプチド-HLA免疫原性指標で、HLA対立遺伝子によって提示されると予測されないシード（または塩基）ペプチドを有するペアを排除することができる。いくつかの実施形態では、ペプチド-HLAスコアをフィルタリングして、特定のHLA対立遺伝子によって提示されるヘテロクリティックペプチドの予測結合コアが、そのHLA対立遺伝子に設定されたそれぞれのシード（または塩基）セット標的ペプチドの結合コアと正確に位置が一致するようにすることもできる。いくつかの実施形態では、スコアリング予測をHLA対立遺伝子についてフィルタリングして、そのHLA対立遺伝子について考慮されるヘテロクリティックペプチドが、そのHLA対立遺伝子によって決定されたアンカー位置でのみ修飾されるよう保証する。スコアリングにより、ペプチドとHLA対立遺伝子のペプチド-HLA免疫原性の指標が得られる。この指標は、バイナリ、免疫原性の確率、またはペプチド-HLA親和性やパーセント順位などの他の免疫原性の指標のいずれかであり、計算による予測、実験的観察、または計算による予測と実験的観察の両方の組み合わせに基づく場合がある。いくつかの実施形態では、ペプチド-HLA免疫原性の確率は、OptiVax-非結合によって利用される。いくつかの実施形態では、ヘテロクリティックペプチドは、MIRA（Klinger et al., 2015）やELISPOTなどの実験的アッセイに含まれ、特定のHLA対立遺伝子に関するペプチド-HLA免疫原性指標を決定する。いくつかの実施形態では、Liu et al.（2020年b)の方法を用いると、ヘテロクリティックペプチドのMIRAデータをペプチド-HLA免疫原性のモデルに組み込むことができる。いくつかの実施形態では、ヘテロクリティックペプチドのペプチド-HLA免疫原性指標が実験的に決定され、ヘテロクリティックペプチドと対応したシード（または塩基）ペプチドも認識するＴ細胞を活性化するその能力は、当該ヘテロクリティックペプチドをワクチンに包含する対象として認定するために当技術分野で周知の方法でに確認される（例：Houghton et al., 2007）。いくつかの実施形態では、ヘテロクリティックペプチドの免疫原性および交差反応性のこれらのアッセイは、ヘテロクリティックペプチドが特定のHLA対立遺伝子によって提示されるときに行われる。
いくつかの実施形態では、細胞における特定のHLA対立遺伝子によるヘテロクリティックペプチドの提示の実験的観察を用いて、ペプチド-HLA結合またはペプチド-HLA免疫原性についてペプチドをスコアリングすることができる。いくつかの実施形態では、Bear et al.（2021）またはWang et al.（2019）が説明するように、質量分析法を用いて細胞によるヘテロクリティックペプチドの提示を実験的に決定し、これらのデータを使用して、ペプチド-HLA結合またはペプチド-HLA免疫原性を評価する。いくつかの実施形態では、質量分析法を用いて細胞によるヘテロクリティックペプチドの提示を実験的に決定し、これらの実験データを使用して、このヘテロクリティックペプチドをワクチンに包含するかどうかを認定する。いくつかの実施形態では、質量分析法を用いて腫瘍細胞によるペプチドの提示を実験的に決定し、これらの実験データを使用して、そのペプチドがHLA対立遺伝子によって表示されることが質量分析により観察されない場合に、ペプチド-HLA結合スコアまたはペプチド-HLA免疫原性スコアを除外する。いくつかの実施形態では、質量分析法を用いて、個体に見られるHLA対立遺伝子を有する細胞によるヘテロクリティックペプチドの提示を実験的に決定し、これらの実験データを使用して、このヘテロクリティックペプチドを個体用のワクチンに包含するかどうかを認定する。いくつかの実施形態では、質量分析法を用いて腫瘍細胞によるペプチドの表示を実験的に決定し、これらの実験データを使用して、そのペプチドがHLA対立遺伝子によって提示されることが質量分析により観察されない場合に、ペプチド-HLA結合スコアまたはペプチド-HLA免疫原性スコアを除外する。 いくつかの実施形態では、HLA対立遺伝子による提示という文脈におけるペプチドの免疫原性の計算による予測を、Ogishi et al.（2019）またはBulik-Sullivan et al.（2019）らの方法でスコアリングに用いることができる。
いくつかの実施形態では、（1）HLA対立遺伝子のアンカー位置の1つが塩基/シードペプチドにおける変異の位置に対応し、それが塩基/シードペプチドを自己ペプチドと区別する変異に由来する場合、および（2）自己ペプチドのペプチド-HLA結合またはペプチド-HLA免疫原性が、自己ペプチド結合または免疫原性の特定の閾値よりも強い場合、ヘテロクリティック塩基セット中のペプチドは除去される。これにより、TCRに面する残基をセルフペプチドと共有した結果、自己ペプチドと交差反応する可能性のあるヘテロクリティック塩基セットのペプチドが除去される。いくつかの実施形態では、自己ペプチド結合の閾値は約500nM～1000nMである。
いくつかの実施形態では、ヘテロクライティック塩基セット中の冗長なペプチドが除去される。いくつかの実施形態において、冗長なペプチドは、全てのHLAに対して免疫原性が低いペプチド-HLA免疫原性スコアまたはペプチド-HLA結合スコアを有する第1のヘテロクリティックペプチドであり、ヘテロクリティック塩基セット中の第2のヘテロクリティックペプチドよりも免疫原性が低いが、ヘテロクリティック塩基セットにおいて、第1および第2のヘテロクリティックペプチドの両方は同じ塩基（またはシード）ペプチドに由来する。いくつかの実施形態では、HLA対立遺伝子の両方のペプチドのペプチド-HLA免疫原性スコアまたはペプチド-HLA結合スコアが所定の閾値（例、結合の場合は50nM）よりも免疫原性が高い場合、ペプチドの冗長性は、HLA対立遺伝子のペプチド-HLA免疫原性スコアまたはペプチド-HLA結合スコアを比較することによってのみ決定される。いくつかの実施形態では、冗長なペプチドは、平均ペプチド-HLA免疫原性スコアまたはペプチド-HLA結合スコアを有する第1ヘテロクリティックペプチドであり、ヘテロクリティック塩基セット中の第2のヘテロクリティックペプチドの平均ペプチド-HLA免疫原性スコアまたはペプチド-HLA結合スコアよりも免疫原性が低いが、ヘテロクリティック塩基セットにおいて第1および第2ヘテロクリティックペプチドの両方は、同じ塩基（またはシード）ペプチドに由来し、HLA対立遺伝子の両方のペプチドのペプチド-HLA免疫原性スコアまたはペプチド-HLA結合スコアが、所定の閾値（例、結合の場合は50 nM）よりも免疫原性が高い場合、HLA対立遺伝子の平均スコアが計算される。いくつかの実施形態では、冗長なペプチドは、補正ペプチド-HLA免疫原性スコアまたはペプチド-HLA結合スコアを有する第1ヘテロクリティックペプチドであり、ヘテロクリティック塩基セット中の第2のヘテロクリティックペプチドの補正ペプチド-HLA免疫原性スコアまたはペプチド-HLA結合スコアよりも免疫原性が低いが、ヘテロクリティック塩基セットにおいて第1および第2ヘテロクリティックペプチドの両方は、同じ塩基（またはシード）ペプチドに由来し、ヒト集団におけるHLA対立遺伝子頻度によって補正が決定される。補正されたスコアは、HLA対立遺伝子の両方のペプチドのペプチド-HLA免疫原性スコアまたはペプチド-HLA結合スコアが、所定の閾値（例、結合の場合は50 nM）の免疫原性よりも高い場合補正スコアが計算される。
いくつかの実施形態では、次のステップは、ヘテロクライティック塩基セット（第2のペプチドセット）をスコアリングし、得られたスコアをフィルタリングして、1つまたは複数のHLA対立遺伝子のペプチドのペプチド-HLA免疫原性スコアまたはペプチド-HLA結合スコアを閾値と比較することによって、第2のペプチドセットを作成することである。いくつかの実施形態では、約50nMの親和性基準を使用して、ワクチンペプチドがHLA分子によって発見され提示される確率を高める。いくつかの実施形態では、親和性基準は50nMよりも厳しい（すなわち50nM未満）。いくつかの実施形態では、親和性基準は約500nMよりも厳しい（すなわち500nM未満）。いくつかの実施形態では、個々のペプチド-HLA結合スコアまたは免疫原性指標が決定されるので、ペプチドは、少なくとも１つのHLA対立遺伝子の基準を満たす限り保持されてよく、基準を満たすペプチド-HLAスコアのみがワクチンデザインに考慮される。
いくつかの実施形態では、次のステップは、第2ペプチドセットをOptiVaxに入力して、予測されるワクチン性能を最大化するコンパクトなワクチンペプチドセットを選択することである（ワクチン性能最適化、図1-2）。いくつかの実施形態において、予測されるワクチン性能は、期待されるペプチド-HLA結合親和性の関数である（例、所与のペプチドセットに対するすべてのペプチド-HLA組み合わせにわたるペプチド-HLA結合親和性の分布の関数、または集団または個体におけるHLA対立遺伝子の発生によって補正された関数）。いくつかの実施形態では、予測されるワクチンの性能は、ワクチンの予想される集団被覆率である。いくつかの実施形態では、予測されるワクチン性能は、集団または個体においてワクチンによって産生されるペプチド-HLAヒット数の期待値である。いくつかの実施形態において、予測されるワクチン性能には、ワクチンによって産生されるペプチド-HLAヒットの最小期待数（例、1、2、3、4、5、6、7、8またはそれ以上）が必要である。いくつかの実施形態では、予測されるワクチン性能は、集団被覆率と、ワクチンによって産生が期待されるペプチド-HLAヒット数の関数である。いくつかの実施形態では、予測されるワクチン性能は、ワクチンの全体的な免疫原性特性を表す指標であり、ワクチン中のすべてのペプチドが、2つ以上のHLA対立遺伝子（例、3つ以上のHLA対立遺伝子）に対するペプチド-HLA免疫原性についてスコアリングされる。いくつかの実施形態において、予測されるワクチン性能は、ペプチド-HLAヒットの最大数（例、1、2、3、4、5、6、7、8またはそれ以上）を超える数の選択されたHLA対立遺伝子による免疫原性寄与を除外する。いくつかの実施形態において、予測されるワクチン性能は、ペプチド-HLAヒットの最大数（例、1、2、3、4、5、6、7、８またはそれ以上）を超える数の個別のHLAディプロタイプの免疫原性寄与を除外する。いくつかの実施形態では、予測されるワクチン性能は、対象となるHLA対立遺伝子の割合であり、これは、ワクチンによって産生が期待されるペプチド-HLA免疫原性を持つペプチドの数が最小（例、1、2、3、4、5、6、7、8またはそれ以上）となる各個体におけるHLA対立遺伝子の予想割合である。いくつかの実施形態では、予測されるワクチン性能は、ワクチンによって産生が期待されるペプチド-HLA免疫原性を持つペプチドの数が最小（例、1、2、3、4、5、6、7、8またはそれ以上）を有する各個体におけるHLA対立遺伝子の予想割合である。
いくつかの実施形態では、ワクチンはヘテロクライティック塩基セット（図1-2に示すように拡張セットとも呼ばれる）から、予測されるペプチドの免疫原性または提示に関する基準の厳格度が徐々に低くなる 状態で反復選択することによってデザインされる。いくつかの実施形態では、ペプチドは、そのペプチド-HLAスコアのうちの少なくとも1つが、採用された閾値によって除去されない場合に保持される。いくつかの実施形態では、OptiVaxはまず、特定のペプチド認定基準を備えたワクチンをデザインするために用いられる（例えば、候補セットからのシードHLA-ペプチドスコアは500nM以上の少なくとも1つのMHC分子に結合しなければならず、拡張セットからのペプチド-HLAスコアは50nM以上の少なくとも1つのMHC分子に結合しなければならない）。次に、OptiVaxの適用により得られたワクチンを、より緩い基準（例、候補セットのシードペプチド-HLAスコアは1000 nM以上で、少なくとも1つのMHC分子に結合する必要があり、拡張セットのペプチドHLAスコアは100 nM以上で、少なくとも1つのMHC分子に結合する必要がある）でワクチン増強の基礎として使用し、所望のワクチン性能をさらに向上させる。ワクチン増強の方法はLiu et al.（2020b）に記載されており、参照によりその全文を本申請書に組み込む。いくつかの実施形態では、複数回のワクチン増強療法を利用することができる。いくつかの実施形態では、選択されたワクチンを最終的な増強ワクチンとする。
いくつかの実施形態では、所望のワクチンに予測される性能を満たすペプチドセットの選択は、OptiVax以外の計算アルゴリズムによって行うことができる。いくつかの実施形態では、OptiVaxの代わりに整数線形計画法または混合整数線形計画法を使用してペプチドセットを選択している。ペプチドセット選択のための整数プログラミング法の一例は、Toussaint et al.（2008）によって説明されており、参照によりその全文を本書に組み込む。混合整数線形計画法の解法の例はPython-MIPであり、Toussaint et al.（2008）と組み合わせて使用できる。ワクチンペプチドの選択方法の第2の例は、Liu et al.（2021）の「Maximum n-times Coverage for Vaccine Design」に記載される方法で、参照することによりその全文を本書に組み込む。
予測されるワクチン性能は指標を指す。予測されるワクチンの性能は、単一の数値、複数の数値、任意の数の非数値、およびそれらの組み合わせとして表すことができる。1つまたは複数の値は、任意の数学的または記号的な用語および任意の尺度（例、名目尺度、順序尺度、間隔尺度、または比率尺度など）で表すことができる。
シード（または塩基）ペプチドおよびそのシード（または塩基）ペプチドに由来するすべての修飾ペプチドは、単一のペプチドファミリーを構成している。いくつかの実施形態では、所与のHLA対立遺伝子に対するペプチド-HLA免疫原性に基づくワクチン性能の要素において、同じペプチドファミリーにある最大数のペプチド（例、1、2、3、4、5、6、7、8またはそれ以上）に、そのHLA対立遺伝子に対して計算された免疫原性に承認が与えられる。ペプチドファミリーの免疫原性に対するこの制限は、同じ塩基ペプチドの多くの改変バージョンによる承認を制限する。いくつかの実施形態では、本書に説明される方法には、予測されるワクチン性能の所望の測定基準に対応するEvalVax目的関数を用いてOptiVaxを実行するための方法が含まれる。いくつかの実施形態では、集団被覆率とは、シード（または塩基）標的ペプチドに応答するT細胞を活性化する1つまたは複数の免疫原性ペプチドを提示する対象集団の割合を意味する。集団被覆率の指標は、代表的なヒト集団などの特定の集団におけるHLAハプロタイプ頻度を使用して計算される。いくつかの実施形態では、集団被覆率の指標は、集団内の限界HLA頻度を用いて計算される。集団被覆率を最大化するということは、特定の集団（例、代表的なヒト集団）におけるHLAハプロタイプの割合に基づく免疫原性ペプチド-HLA結合の少なくとも最小数（ 例、1、2、3、4、5、6、7、8、またはそれ以上）を持つ集団のうち、最大の割合を占めるペプチドセット（塩基ペプチドセット、修飾ペプチドセット、または塩基と修飾ペプチドの組み合わせ。例、第1ペプチドセット、第2ペプチドセット、または第3のペプチドセット）を選択することを意味する。いくつかの実施形態では、このプロセスには、対応するシード（または塩基）ペプチドおよびヘテロクライティック塩基ペプチドに応答するT細胞を活性化して、集団被覆率を向上させるヘテロクライティックペプチド（本開示に記載の通り）をOptiVaxで選択することが含まれる。いくつかの実施形態では、シード（または塩基）標的ペプチドは、常に最終的なワクチンデザインに含まれる。いくつかの実施形態では、ペプチドは、免疫原性であることが臨床データ、動物モデル、または組織培養モデルで観察された場合にのみ、ワクチンデザインの候補（例、第１、第２、および／または第３のペプチドセットに含まれる）とみなされる。
本開示では、ヘテロクリティックペプチドが例示的な実施形態として使用されるが、ヘテロクリティックペプチドの代わりに任意の修飾ペプチドを使用することができる。修飾ペプチドは、標的塩基/シードペプチドのアミノ酸置換を1つ以上有するペプチドである。アミノ酸置換は、アンカー位置またはその他の非アンカー位置に配置することができる。
いくつかの実施形態では、候補となるワクチンペプチド（例、塩基ペプチドまたは修飾ペプチド）は、自己ペプチドを認識するT細胞を活性化する場合、ワクチンの包含物から除去される（例えば、これは、図1-2に示すように、ペプチドのフィルタリングおよびソーティングの1回目および/または2回目で達成できる）。いくつかの実施形態では、候補となるワクチンペプチド（例、塩基ペプチドまたは修飾ペプチド）は、HLA対立遺伝子によって結合される際の外向きのアミノ酸が、同じHLA対立遺伝子によって提示される外向きの自己ペプチド残基と類似している場合、計算によってワクチンの包含物から除去される。ここで、類似性は同一性またはBLOSUMマトリックスなどの定義された類似性指標によって定義することができる（当技術分野ではBLOSUMマトリックスが知られている）。自己ペプチドを認識するT細胞を活性化する能力についてのワクチンペプチドの試験は、動物モデルへのワクチン接種に続いてELISPOTやその他の免疫原性アッセイを行うか、ヒト組織プロトコルを用いて実験的に行うことができる。どちらの場合も、ワクチンペプチドを提示するHLA対立遺伝子を持つモデルが使用される。いくつかの実施形態では、ヒト単核細胞（PBMC）をワクチンペプチドで刺激し、T細胞を増殖させた後、自己ペプチドによるT細胞の活性化をTapia-Calle et al.（2019）の説明にある方法、または当技術分野で知られている他の方法でアッセイする。いくつかの実施形態では、T細胞が自己ペプチドによって活性化される場合、ワクチンペプチドはワクチンの包含から除外される。いくつかの実施形態では、自己ペプチドも認識するＴ細胞を活性化するペプチドの能力の計算予測を利用することができる。これらの予測は、ペプチド-HLA複合体の外向き残基と他のペプチド残基との相互作用のモデリングに基づいて行うことができる。いくつかの実施形態では、候補ペプチド（例、塩基ペプチドまたは修飾ペプチド）のペプチド-MHC複合体および自己ペプチドのペプチド-MHC複合体の構造的類似性に基づいて自己ペプチドも認識するＴ細胞を活性化すると予測される場合、候補ワクチンペプチド（例、塩基ペプチドまたは修飾ペプチド）は、ワクチン包含の対象から除外されるか、または交差反応性について実験的に試験される。ペプチド-MHCの構造を予測する1つの方法は、Park et al.（2013）が説明する方法である。
一部の実施形態では、候補となるヘテロクリティックワクチンペプチドが対応する特定のHLA対立遺伝子の塩基/シード標的ペプチド（2回目のペプチドスコアリングおよびスコアフィルタリング、図1-2）を認識するT細胞を活性化しない場合、候補となるヘテロクリティックワクチンペプチド（例、修飾ペプチド）およびHLA対立遺伝子のペプチド-HLA結合スコアまたはペプチド-HLA免疫原性指標は、ワクチンデザインの際に考慮対象から除外される。いくつかの実施形態では、候補となるヘテロクリティックワクチンペプチドが、所与のHLA対立遺伝子について、対応する塩基／シード標的ペプチド（ペプチドスコアリングおよびスコアフィルタリングの2回目、図1-2）を認識するT細胞を活性化しない場合、ヘテロクリティックワクチンペプチド（例、修飾ペプチド）はワクチンデザインから除外される。候補となるヘテロクリティックペプチド（例、修飾ペプチド）が、対応するシード（または塩基）標的ペプチドを認識するT細胞を同じHLA対立遺伝子に対して認識するT細胞を活性化する能力を試験することは、動物モデルへのワクチン接種に続いてELISPOTまたは他の免疫原性アッセイを行うか、またはヒト組織プロトコルを用いて実験的に行うことができる。どちらの場合も、ヘテロクリティックペプチドを提示するHLA対立遺伝子を持つモデルが使用される。いくつかの実施形態では、ヒトPBMCをヘテロクリティックペプチドで刺激し、T細胞を増殖させた後、シード（または塩基）標的ペプチドによるT細胞の活性化をTapia-Calle et al.（2019）が説明するようにアッセイするか、当技術分野で知られている他の方法を使用する。いくつかの実施形態では、対応するシード（または塩基）標的ペプチドも認識するＴ細胞を活性化するヘテロクリティックペプチドの能力の計算による予測を利用することができる。これらの予測は、ペプチド-HLA複合体の外向き残基と他のペプチド残基との相互作用のモデリングに基づいて行うことができる。いくつかの実施形態では、ヘテロクリティックペプチドのペプチド-ＨＬＡ複合体と対応するシード（または塩基）ターゲットのペプチド-HLA複合体の構造的類似性を利用して、ヘテロクリティックペプチドをワクチン包含の適格性を確認したり、ワクチン包含前に実験的免疫原性試験を要求したりする。
TCR 結合インターフェース多様性 (TCRID) は、特定のHLA対立遺伝子に関する第1ペプチドのTCR対残基の3D位置と、対応する第2ペプチドの残基位置との差の最小平均二乗偏差である。いくつかの実施形態では、最小平均二乗偏差の代わりに他の基準がTCRIDに使用される。いくつかの実施形態では、TCRに面していない残基および特定のHLA対立遺伝子からのMHC残基の位置偏差を含む他の指標がTCRIDに使用される。いくつかの実施形態では、TCRIDを使用して、特定のHLA対立遺伝子によって2つのペプチドが提示されたときに同じT細胞クロノタイプが活性化するかどうかを予測する。 いくつかの実施形態では、FlexPepDock（London et al., 2011、参照により全文を本書に組み込む）またはDINC（Antunes et al., 2018、参照によりその全文を本書に組み込む）を、HLA分子の結晶構造と併せて使用して、HLA分子が与えられたペプチドペアのTCRIDメトリックスが計算できる。いくつかの実施形態では、TCRIDは（1）特定のHLA対立遺伝子によって結合された2つの異なるペプチドの3Dペプチド-HLA構造を決定し、（2）ペプチド-HLA構造のHLAアルファヘリックスの基準系を整列させ、（3）整列したアルファヘリックスに関する2つのペプチドのTCR対向残基間の差の最小平均二乗偏差を計算することによって求められる。
いくつかの実施形態では、図1および図2の第2のペプチドスコアリングおよびスコアフィルタリングステップにより、ヘテロクリティックペプチドとそれに対応する塩基（またはシード）ペプチドとの間のHLA特異的TCRIDが第1のTCRIDの閾値を超える場合、特定のHLA対立遺伝子に対するヘテロクリティックペプチド-HLA結合または免疫原性スコアが排除される。いくつかの実施形態では、図1および図2の第2のペプチドスコアリングおよびスコアフィルタリングステップにより、ヘテロクリティックペプチドとそれに対応する変異していない自己ペプチドとの間のHLA特異的TCRIDが第2のTCRIDの閾値を下回る場合、ヘテロクリティックペプチドのすべてのペプチド-HLA結合または免疫原性スコアが排除される。いくつかの実施形態では、図1および図2の第1のスコアリングおよびスコアフィルタリングステップにより、ペプチドとそれに対応する変異していない自己ペプチドとの間のHLA特異的TCRIDが第3のTCRIDの閾値を下回る場合、候補ペプチドに対するすべてのペプチド-HLA結合または免疫原性スコアが排除される。いくつかの実施形態では、TCRID閾値はいずれも、ペプチド-HLA複合体に対するTCR分子の交差反応性を実験的に観察または計算により予測することによって決定される。
図3および4（MHCクラスI）および図5および6（MHCクラスII）は、以下の変異用にデザインされたペプチドの数が異なる、OptiVax-Robust法の選択された単一標的特異的ワクチンの予測集団被覆率を示す： BRAF V600E 、BRAF V600M、EGFR A289V、EGRF G598V、EGFR L858R、IDH1 R132H、IDH1 R132C、NRAS Q61R、NRAS Q61K、NRAS Q61L、KRAS G12D、KRAS G12V、KRAS G12R、KRAS G12C、KRAS G13D、KRAS G12A、KRAS G12S、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R273C、およびTP53 R273H。図3-6は、ワクチンのペプチド数が増えると、予測される人口被覆率も増加することを示している。図3-6に示されている集団被覆率は、ワクチンが対応するようにデザインされている特定の変異を持つ個人のものである。ペプチド数が増加すると、通常、各個体のペプチド-HLAヒットの平均数が集団内でも増加する。
OptiVaxを使用すると、HLA分子がワクチンに含まれる少なくともp個のペプチドに結合して提示すると予測される集団の割合/比率を最大化するワクチンをデザインすることができる。いくつかの実施形態では、この予測（例、スコアリング）には、少なくともp個のペプチドが免疫原性であることを直接予測する実験的免疫原性データが含まれる。 数値pがOptiVaxに入力され、OptiVaxをpの値を変えて複数回実行すると、 さまざまなペプチド数pに対して予測される最適なターゲットペプチドセットが得られる。 pの値が大きいほど、必要な集団被覆率を達成するためにより多くのペプチドが必要になるが、ワクチンの冗長性は高まる。いくつかの実施形態では、特定のヘテロクリティック塩基集合が与えられると、所与の集団被覆率を達成できない場合がある。いくつかの実施形態では、 数pはワクチンの所望の大きさの関数である 。
本書に記載した方法を用いて、MHCクラスIおよびクラスIIベースの免疫用に別々のワクチン製剤をデザインすることができる。
いくつかの実施形態では、この手順を用いて個人用のワクチンを製造する。いくつかの実施形態では、個体に存在する標的ペプチドは、個体の腫瘍RNAまたはDNAの配列を決定し、外来ペプチドを産生する変異を同定することによって決定される。この方法の1つの実施形態は、米国特許第10,738,355号に記載されており、参照によりその全文を本書に組み込む。いくつかの実施形態では、ペプチド配列決定法を用いて個体中の標的ペプチドを同定する。その一例が米国出版物第2011/0257890号に記載されている。いくつかの実施形態では、個別のワクチンに使用される標的ペプチドは、自己ペプチド、外来ペプチド、病原体ペプチド、またはそれら（自己ペプチド、外来ペプチド、または病原体ペプチド）をコードするRNAが、個体からの検体中に所定のレベルで存在する場合に選択される。本書に開示されているように、個体中の標的ペプチドは、ワクチンを製造するために用いられる。OptiVaxにはワクチンデザイン用に、個人のHLAタイプを含むディプロタイプが用意されている。別の実施形態では、ある個体のHLA型は、その個体からの１つまたは複数のHLA対立遺伝子からなるそれぞれのディプロタイプと、他の対立遺伝子の位置を評価してはならないという指示がひとつになる頻度の複数のディプロタイプに分けられる。複数のディプロタイプを使用すると、OptiVaxの目的関数により、構築されたすべてのディプロタイプに免疫原性ペプチドが提示される可能性が高くなる。これにより、ペプチド-HLA免疫原性を示す個体内の異なるHLA対立遺伝子の数を最大化するという目的が達成され、その結果、個体におけるワクチンの対立遺伝子被覆率が向上する。
図14は、MHCクラスI HLAディプロタイプ HLA-A 02:03、HLA-A 11:01、HLA-B 55:02、HLA-B 58:01、HLA-C 03:02、HLA-C03:03 を持つ単一の個人に対する10例のG12V MHCクラスIワクチンの予測ワクチン性能（ペプチド-HLAヒット数の予測)を示す。OptiVaxを使用して、このHLAディプロタイプ用のペプチド数が1～10の範囲にある10種類のG12V MHCクラスIワクチンをデザインした。図14の結果では、6つの合成ディプロタイプでOptiVaxを実行した。各ディプロタイプは等しく補正され、それぞれの個人のHLAディプロタイプからHLA対立遺伝子が1つあり、他の対立遺伝子の位置は評価対象外とマークした。図14の10種類のペプチドワクチンは、配列識別番号: 203 (LMVVGAVGV)、 配列識別番号: 208 (GAVGVGKSL)、 配列識別番号: 209 (GPVGVGKSA)、 配列識別番号: 213 (GPVGVGKSV)、 配列識別番号: 11036 (LMVVGAVGI)、 配列識別番号: 11037 (LMVVGAVGL)、 配列識別番号: 11095 (VTGAVGVGK)、 配列識別番号: 11122 (GAVGVGKSM)、 配列識別番号: 11457 (VAGAVGVGM)、 および 配列識別番号: 11737 (VVGAVGVGK)で構成されている。配列識別番号208（GAVGVGKSL）と配列識別番号11122（GAVGVGKSM）の2つのペプチドは、それぞれ50nM以下の親和性で2つのHLA対立遺伝子に結合すると予測される。
MHC クラス I ワクチンのデザイン手順
MHC クラス I ワクチンのデザイン手順
いくつかの実施形態では、MHCクラスIワクチンのデザイン手順は以下の計算ステップからなる。
いくつかの実施形態では、計算の入力は以下の通りである。
P1…n: 目的のネオ抗原または病原性標的（例：KRAS G12D、KRAS G12V、KRAS G12R、KRAS G12C、KRAS G13D）を含むペプチド配列( 長さn)。Piはi位のアミノ酸を示す。
t: P,t∈[1,…n] における標的変異の位置（例、KRAS G12D の場合は t = 12）。
s: 置換変異 s∈[true、false] は変異が置換である場合はtrue 、変異が欠失または挿入である場合、またはペプチドに変異が含まれていない場合（病原体標的など）は false とする。変異が削除または挿入である場合、 t は削除または挿入の直前の位置を示す。
τ1: ペプチド-MHCスコアリングのためのMHCによるペプチド提示の可能性の閾値（例：500 nM結合親和性）
τ2: ペプチド-MHCスコアリングのためのMHCによるペプチドの予測提示の閾値（例：50 nM結合親和性）
N: EvalVax と OptiVax 目的関数のパラメーター。対象となる個人を考慮して、集団被覆率目標の各個人の予測ヒット数の最小値を指定する。デフォルト = 1（P(n ≧ 1) の人口被覆率を計算する）。
P1…n: 目的のネオ抗原または病原性標的（例：KRAS G12D、KRAS G12V、KRAS G12R、KRAS G12C、KRAS G13D）を含むペプチド配列( 長さn)。Piはi位のアミノ酸を示す。
t: P,t∈[1,…n] における標的変異の位置（例、KRAS G12D の場合は t = 12）。
s: 置換変異 s∈[true、false] は変異が置換である場合はtrue 、変異が欠失または挿入である場合、またはペプチドに変異が含まれていない場合（病原体標的など）は false とする。変異が削除または挿入である場合、 t は削除または挿入の直前の位置を示す。
τ1: ペプチド-MHCスコアリングのためのMHCによるペプチド提示の可能性の閾値（例：500 nM結合親和性）
τ2: ペプチド-MHCスコアリングのためのMHCによるペプチドの予測提示の閾値（例：50 nM結合親和性）
いくつかの実施形態では、使用されるペプチド-HLAスコアリング関数は以下の通りである。
第2の条件 j ≠ {t - (k-1), t - 1} は、tでの変異がウィンドウ処理されたk-merペプチドのP2またはPk位置 （つまり アンカー位置）にあり、変異が置換であるペプチドを除外する。
Bのペプチドに由来するすべてのヘテロクリティックペプチド B' のセットを作成する：
次に、更新されたスコアマトリックス S'2 は、対応する塩基ペプチドが各HLAによって提示される可能性があることを条件として、ヘテロクリティックペプチドについて計算される。
ただし、各ヘテロクリティックペプチド b' ∈ B' が、塩基ペプチド b ∈ Bの変異である場合。 この条件により、hがbを示す可能性があると予測されなかった場合、 bに由来するすべてのヘテロクリティックペプチドb'はhによって提示されなくなる（たとえhがb 'を提示すると予測されていたとしても）。
いくつかの実施形態では、この手順は目的の標的ごとに独立して繰り返され、得られた独立したワクチンセットは、以下に説明するように複合ワクチンに統合することができる。
MHC クラスIIワクチンデザイン手順
MHC クラスIIワクチンデザイン手順
いくつかの実施形態では、MHCクラスIIワクチンのデザイン手順は以下の計算ステップからなる。
いくつかの実施形態では、計算の入力は以下の通りである。
P1…n: 目的のネオ抗原（例：KRAS G12D、KRAS G12V、KRAS G12R、KRAS G12C、KRAS G13D）を含むペプチド配列（長さn）。Pi はi位のアミノ酸を示す。
t: P における標的変異の位置 、t ∈ [1,…,n] （例：KRAS G12D では t = 12)）
s: 置換変異 s∈[true, false] は、変異が置換である場合はtrue 、変異が欠失または挿入である場合、またはペプチドに変異が含まれていない場合（病原体標的など）は false とする。変異が削除または挿入である場合、 t は削除または挿入の直前の位置を示す。
τ1: ペプチド-MHCスコアリングのためのMHCによるペプチド提示の可能性の閾値（例、500 nM結合親和性）
τ2: ペプチド-MHCスコアリングのためのMHCによるペプチドの予測提示の閾値（例：50 nM結合親和性）
N: EvalVax と OptiVax 目的関数のパラメーター。対象となる個人を考慮して、集団被覆率目標の各個人の予測ヒット数の最小値を指定する。デフォルト = 1 (P(n ≧ 1) の人口被覆率を計算する)。
P1…n: 目的のネオ抗原（例：KRAS G12D、KRAS G12V、KRAS G12R、KRAS G12C、KRAS G13D）を含むペプチド配列（長さn）。Pi はi位のアミノ酸を示す。
t: P における標的変異の位置 、t ∈ [1,…,n] （例：KRAS G12D では t = 12)）
s: 置換変異 s∈[true, false] は、変異が置換である場合はtrue 、変異が欠失または挿入である場合、またはペプチドに変異が含まれていない場合（病原体標的など）は false とする。変異が削除または挿入である場合、 t は削除または挿入の直前の位置を示す。
τ1: ペプチド-MHCスコアリングのためのMHCによるペプチド提示の可能性の閾値（例、500 nM結合親和性）
τ2: ペプチド-MHCスコアリングのためのMHCによるペプチドの予測提示の閾値（例：50 nM結合親和性）
いくつかの実施形態では、使用されるペプチド-HLAスコアリング関数は以下の通りである。
各（ペプチド、HLA対立遺伝子）ペア（p、 h）について、FINDCOREを使用して9-mer結合コアを特定/予測する。予測される結合コアはマトリックス Cに記録する。
次に、 Bのペプチドに由来する、すべてのヘテロクリティックペプチドB'のセットが作成される。
ここで、 アンカー修飾（b、c）は、 bに由来する20 4-1個のアンカー修飾ペプチドすべてのセットを返し 、9-mer結合コアcのP1、P4、P6、およびP9のアミノ酸に考えられるすべての修飾を加える。したがって、各塩基ペプチドbについて、 ヘテロクリティックセットB'には、スコアリングマトリックスS 2で示されるように、有効なコア位置で bを提示する可能性のあるHLA対立遺伝子について同定されたbのすべての固有なコアに修飾を加えたすべてのアンカー修飾ペプチドb'が含まれる。
各(ヘテロクリティックペプチド、HLA対立遺伝子)ペア（b'、h）について、FINDCOREを使用して9-mer結合コアを特定/予測する。予測される結合コアはマトリックス C’に記録する。
更新されたスコアマトリックス S'2 は、特定のHLAによって同じオフセットで発生するヘテロクライティックペプチドと塩基ペプチドの同定された結合コアを条件とするヘテロクリティックペプチドについて計算される。
ただし、各ヘテロクリティックペプチド b' ∈ B' が塩基ペプチド b ∈ Bの変異である場合。この条件により、 ヘテロクリティックペプチドb'の結合コアが塩基ペプチドbと同じ相対位置になり、暗黙的に、標的残基Ptが9-mer結合コア内の非アンカー位置になる（ステップ3）。
更新されたスコアマトリックス S'3 は、各HLAによって対応する塩基ペプチドが提示する可能性があることを条件として、ヘテロクリティックペプチドについて計算される。
ただし、各ヘテロクリティックペプチド b' ∈ B' が、塩基ペプチド b ∈ Bの変異である場合。 この条件により、hがbを提示すると予測されなかった場合、 bに由来するすべてのヘテロクリティックペプチドb'はhによって提示されなくなる（たとえhがb 'を提示すると予測されていたとしても）。
いくつかの実施形態では、この手順は目的の個々の標的ごとに独立して繰り返され、得られた独立したワクチンセットは、以下に説明するように複合ワクチンに統合することができる。
複数のワクチンを組み合わせる方法
複数のワクチンを組み合わせる方法
上記の方法は、1つまたは複数の個々の標的に最適化された標的ペプチドセット（例、第3のペプチドセット）を生成する。いくつかの実施形態では、複数の標的（例、KRAS G12DおよびKRAS G12Vなどの2つ以上の標的）に対するMHCクラスIおよびクラスIIベースの免疫のための、別個のワクチンをデザインする方法を規定する。
いくつかの実施形態では、がんゲノムアトラス（TCGA）などの情報源からの経験的データに基づく疾患のプレゼンテーション表を使用して、複数の標的に対する複合ペプチドワクチンを製造する方法が開示される。図7は、さまざまな変異標的（例、KRAS G12D、KRAS G12V、およびKRAS G12R）に対して提示された標的について、疾患発現タイプの確率（例、膵がん、結腸直腸がん、皮膚がん）を疾患のプレゼンテーションごとに確率で因数分解する実施形態を示す。プレゼンテーションとは、疾患の1つの形態（例、図7に示す異なる種類のがんやその適応症）によって提示される一連の固有な標的である。図7は、各プレゼンテーションについて、そのプレゼンテーションの確率と、特定のターゲットが観測される確率の例を示す。特定のプレゼンテーションには1つ以上の標的があり、それぞれに確率がある。いくつかの実施形態では、マルチターゲットワクチンのデザイン方法は、例えば図7に示すように、プレゼンテーションとそれぞれの標的確率に基づいて、疾患免疫を誘導するためにペプチドリソースを割り当てる。いくつかの実施形態では、プレゼンテーションは、異なるヒト集団または異なるリスクグループにおける標的の有病率と一致する。母集団における標的の確率は、考えられる各プレゼンテーションについて、（そのプレゼンテーションの確率）X（そのプレゼンテーション内のターゲットの確率）を合計して算出される。図7は、各標的(横列)の個々のワクチンを疾患適応症ごとの複合ワクチン(縦列)に統合するために使用される補正を示している。各数値は、各標的変異を含む症例が観察された割合を示す。データはがんゲノムアトラス（TCGA）から得た。疾患適応症について、TCGAデータは原発部位が適応症である症例のみに絞り込まれている。
いくつかの実施形態では、異なるタンパク質への変異によって生成される塩基ペプチドが同一である場合、異なるタンパク質への変異に対して同じワクチンデザインが生成される。例えば、塩基ペプチド選択のいくつかの実施形態では、HRAS Q61K、NRAS Q61K、およびKRAS Q61K；HRAS Q61L、NRAS Q61L、および KRAS Q61L；HRAS Q61R、NRAS Q61R、およびKRAS Q61Rという変異は、同じ塩基ペプチドのセットを共有しているため、同じワクチンデザインを有する。図7を参照すると、いくつかの実施形態では、2つの変異が同一の個々のワクチンデザインを有する場合、以下に説明するように、複合ワクチンに含めるために個々のワクチンデザインを補正する際（例、甲状腺がんNRAS Q61RおよびHRAS Q61Rの場合）、それらのプレゼンテーションに特異的な確率が加算される。
いくつかの実施形態では、異なるタンパク質への変異によって生成される塩基ペプチドが同一である場合、異なるタンパク質への変異に対して同じワクチンデザインが生成される。例えば、塩基ペプチド選択のいくつかの実施形態では、HRAS Q61K、NRAS Q61K、およびKRAS Q61K；HRAS Q61L、NRAS Q61L、および KRAS Q61L；HRAS Q61R、NRAS Q61R、およびKRAS Q61Rという変異は、同じ塩基ペプチドのセットを共有しているため、同じワクチンデザインを有する。図7を参照すると、いくつかの実施形態では、2つの変異が同一の個々のワクチンデザインを有する場合、以下に説明するように、複合ワクチンに含めるために個々のワクチンデザインを補正する際（例、甲状腺がんNRAS Q61RおよびHRAS Q61Rの場合）、それらのプレゼンテーションに特異的な確率が加算される。
図8について、いくつかの実施形態では、この方法にはまず各標的に対する個別のペプチドワクチンをデザインして、複数の標的に対する複合ワクチンデザインを作成することが含まれる。これにより、まず初めに一連の標的特異的なワクチンデザインが作成される。いくつかの実施形態では、サイズｋにおける各標的特異的ワクチンの限界予測性能は、 サイズｋでの予測ワクチン性能から、サイズｋ-1での予測ワクチン性能を引いたものと定義される （図3～6参照）。 ワクチンの組成は、ワクチンに使用されるペプチドの数が増えるにつれて変化する可能性があり、したがって、複合ワクチンへの寄与度を計算するには、特定のペプチドセットの代わりに、各標的特異的ワクチンの限界予測ワクチン性能が使用される。
いくつかの実施形態では、各標的特異的ワクチンサイズに対する標的特異的ワクチンデザインの補正された限界予測ワクチン性能は、図8に示すように計算される。所与の標的特異的ワクチンサイズについて、その補正予測ワクチン性能は、その予測ワクチン性能に集団における標的の確率を掛けることによって計算される（例えば、図7に示す値を用いて）。標的特異的ワクチンの限界補正予測ワクチン性能は、サイズkでの補正被覆率からサイズ(k-1)での被覆率を引いたものである (例： 図3-6を参照)。サイズ1の標的特異的ワクチンの限界補正予測ワクチン性能は、その補正予測ワクチン性能である。図8に示すように、すべてのワクチンの限界補正予測ワクチン性能を1つのリストにまとめ、組み合わせたリストを、対象となる特定のワクチンの補正限界予測ワクチン性能によって最大から最小にソートする。次に、 サイズnの混合ワクチンが、このリストの最初のn 個の要素によって決定される 。複合ワクチンのペプチドは、 サイズがnになるペプチド標的ワクチン、および 補正予測ワクチン性能の合計とソートされたリストの最初のn個の要素の合計が同じになる個々のペプチド標的ワクチンによって決定される 。これにより、サイズnの混合ワクチンの予測ワクチン性能が最大化される。
いくつかの実施形態では、複数の標的を対象とした混合ワクチンは、使用したプレゼンテーション表（例、図7を参照）に従い、記載されている疾患の全体的な予測被覆率に基づいてデザインすることができるが、これは、ワクチン性能の予測に用いられた補正を適宜調整することにより、特定の適応症および/または特定の標的に対して予測された被覆率に基づく。所望の適用範囲が決まったら、標的特異的なデザインの寄与によって複合ワクチンのペプチドが決定される。例えば、複合ワクチンにサイズkの標的特異的ワクチンが含まれている場合、 サイズkのこの標的に対するワクチンペプチドが混合ワクチンに使用される。
一実施形態の例として、図7は、変異（例、KRAS G12D、G12V、G12R）と、それぞれ異なるがん適応症（例、膵がん）における発生確率を示している。図3、4（MHCクラスI）および図5、6（MHCクラスII）は、本書に記載したワクチンの方法を使用する標的に対する標的特異的ワクチンの集団被覆率を示す。特定のワクチンサイズにおける各標的特異的ワクチンの限界集団被覆率は、そのサイズとそれより1つ小さいサイズでの被覆率の向上を示す。ペプチドを含まない場合の被覆率はゼロである。ように、各標的特異的ワクチンの限界被覆率に、その集団の標的の確率（選択された適応症（例、膵がん）対して図7に示す比率によって決定する）を掛ける。すべての標的特異的ワクチンのこれらの補正限界被覆率は、最適な標的特異的組成を決定するために分類され、得られたリストには、リストの最初のk個の要素を取り入れて、 選択された適応症に対する混合ワクチンの組成が各サイズkで記載される 。実施形態の一例として、図9、10（MHCクラスI）および図11、12（MHCクラスII）は、膵がん、皮膚がん、甲状腺がん、脳腫瘍、結腸直腸がん、および気管支・肺がんの複合ワクチンの各ワクチンサイズにおける標的特異的寄与を示している。本書に記載した複合ワクチンプロトコルの方法を使用して、図9～12の例を計算した。組み合わせたワクチンのサイズごとに、標的特異的ワクチンのさまざまな成分が、図示された適応症に使用される。表1（下）には、単独（単一標的）および複合（複数標的）のMHCクラスIワクチンデザインに存在するペプチドが含まれている。表2（下）には、単独（単一標的）MHCクラスIIワクチンデザインを組み合わせた（複数標的）MHCクラスIIワクチンデザインに存在するペプチドが含まれている。表1と表2には、図7に存在する変異に対する乳がんワクチンと卵巣がんワクチンのペプチドが含まれている。別の実施形態では、MHCクラスIワクチンおよびMHCクラスIIワクチンにおいて、変異タンパク質、特定のタンパク質変異、および表1および2の適応症について有用なヘテロクリティックペプチドが配列リストに記載されている。MHCクラスIおよびクラスIIの個別/単一標的ワクチンの任意のサブセットを組み合わせて、2つ以上の複数の標的に対するワクチンを作製することができる。
複合ワクチンのデザイン手順
複合ワクチンのデザイン手順
いくつかの実施形態では、本書に記載した手順を用いて、異なる標的に最適化された個々のコンパクトワクチンを単一の最適化された複合ワクチンに組み合わせる。
いくつかの実施形態では、手順の計算入力は以下の通りである。
ステップ2では、ワクチンの限界性能が計算され、各標的の有病率の重み付けによって補正される。各標的t（ 個別に）について、 ワクチンセットに追加されたk番目のペプチドから限界被覆率mt,k が計算される。
いくつかの実施形態では、 各ターゲットt、mt,kは（上記のステップ1で）k単位の単調的に減少する関数でなければならない。
したがって、kペプチドとの複合ワクチンは 、最適な個々の (Ct,k)-ペプチドワクチンの組み合わせとなる。 最終的なワクチンサイズkは 、ワクチンの特定の集団被覆目標によって異なる場合がある。
MHC クラス I ペプチド配列
MHC クラス I ペプチド配列
いくつかの実施形態では、ペプチドワクチン（単一標的ワクチンまたは複合多目的ワクチン）は、各ペプチドが8個以上のアミノ酸からなる約1～40個のMHCクラスIペプチドを含む。いくつかの実施形態では、MHCクラスIペプチドワクチンは、1つ以上の AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、または TP53変異タンパク質標的を対象とする。いくつかの実施形態では、MHCクラスIペプチドワクチンは、1つ以上の AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、または TP53 Y220C変異タンパク質標的を対象とする。いくつかの実施形態では、MHCクラスIペプチドワクチンは、1つ以上の 膵がん、皮膚がん、甲状腺がん、脳腫瘍、直腸結腸がん、気管支がんと肺がん、乳がん、または 卵巣がん 適応症を対象としている。
一部の実施形態では、AKT1 タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 1 から 18 と 配列識別番号: 459 を含む。いくつかの実施形態では、 AKT1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 1 から 18 または 配列識別番号: 459と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、AKT1タンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 1 から 18、配列識別番号: 459、配列識別番号: 760 から 1768、配列識別番号: 22386 から 22396を含む。いくつかの実施形態では、 AKT1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 1 から 18、配列識別番号: 459、配列識別番号: 760 から 1768、または 配列識別番号: 22386 から 22396と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、AKT1 タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 1 から 18 と 配列識別番号: 459 を含む。いくつかの実施形態では、 AKT1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 1 から 18 または 配列識別番号: 459と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、AKT1タンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 1 から 18、配列識別番号: 459、配列識別番号: 760 から 1768、配列識別番号: 22386 から 22396を含む。いくつかの実施形態では、 AKT1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 1 から 18、配列識別番号: 459、配列識別番号: 760 から 1768、または 配列識別番号: 22386 から 22396と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、BRAF タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 19 から 50 を含む。いくつかの実施形態では、 BRAFワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 19 から 50と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、BRAFタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 19 から 50、配列識別番号: 1769 から 3170、配列識別番号: 22397 から 22417を含む。いくつかの実施形態では、 BRAFワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 19 から 50、配列識別番号: 1769 から 3170、または 配列識別番号: 22397 から 22417と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、BRAF タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 19 から 50 を含む。いくつかの実施形態では、 BRAFワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 19 から 50と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、BRAFタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 19 から 50、配列識別番号: 1769 から 3170、配列識別番号: 22397 から 22417を含む。いくつかの実施形態では、 BRAFワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 19 から 50、配列識別番号: 1769 から 3170、または 配列識別番号: 22397 から 22417と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、EGFR タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 51 から 98 を含む。いくつかの実施形態では、 EGFRワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 51 から 98と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、EGFRタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 51 から 98、配列識別番号: 3171 から 5756、配列識別番号: 22418 から 22449を含む。いくつかの実施形態では、 EGFRワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 51 から 98、配列識別番号: 3171 から 5756、または 配列識別番号: 22418 から 22449と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、EGFR タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 51 から 98 を含む。いくつかの実施形態では、 EGFRワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 51 から 98と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、EGFRタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 51 から 98、配列識別番号: 3171 から 5756、配列識別番号: 22418 から 22449を含む。いくつかの実施形態では、 EGFRワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 51 から 98、配列識別番号: 3171 から 5756、または 配列識別番号: 22418 から 22449と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、GTF2I タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 99 から 118 を含む。いくつかの実施形態では、 GTF2Iワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 99 から 118と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、GTF2Iタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 99 から 118、配列識別番号: 5757 から 6498、配列識別番号: 22450 から 22466を含む。いくつかの実施形態では、 GTF2Iワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 99 から 118、配列識別番号: 5757 から 6498、または 配列識別番号: 22450 から 22466と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、GTF2I タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 99 から 118 を含む。いくつかの実施形態では、 GTF2Iワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 99 から 118と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、GTF2Iタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 99 から 118、配列識別番号: 5757 から 6498、配列識別番号: 22450 から 22466を含む。いくつかの実施形態では、 GTF2Iワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 99 から 118、配列識別番号: 5757 から 6498、または 配列識別番号: 22450 から 22466と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、IDH1 タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 119 から 140 と 配列識別番号: 460 から 461 を含む。いくつかの実施形態では、 IDH1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 119 から 140 または 配列識別番号: 460 から 461と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、IDH1タンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 119 から 140、配列識別番号: 460 から 461、配列識別番号: 6499 から 7098、配列識別番号: 22467 から 22488を含む。いくつかの実施形態では、 IDH1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 119 から 140、配列識別番号: 460 から 461、配列識別番号: 6499 から 7098、または 配列識別番号: 22467 から 22488と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、IDH1 タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 119 から 140 と 配列識別番号: 460 から 461 を含む。いくつかの実施形態では、 IDH1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 119 から 140 または 配列識別番号: 460 から 461と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、IDH1タンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 119 から 140、配列識別番号: 460 から 461、配列識別番号: 6499 から 7098、配列識別番号: 22467 から 22488を含む。いくつかの実施形態では、 IDH1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 119 から 140、配列識別番号: 460 から 461、配列識別番号: 6499 から 7098、または 配列識別番号: 22467 から 22488と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 141 から 229 と 配列識別番号: 462 から 466 を含む。いくつかの実施形態では、 KRASワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 141 から 229 または 配列識別番号: 462 から 466と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRASタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 141 から 229、配列識別番号: 462 から 466、配列識別番号: 7099 から 12814、配列識別番号: 22489 から 22558を含む。いくつかの実施形態では、 KRASワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 141 から 229、配列識別番号: 462 から 466、配列識別番号: 7099 から 12814、または 配列識別番号: 22489 から 22558と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 141 から 229 と 配列識別番号: 462 から 466 を含む。いくつかの実施形態では、 KRASワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 141 から 229 または 配列識別番号: 462 から 466と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRASタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 141 から 229、配列識別番号: 462 から 466、配列識別番号: 7099 から 12814、配列識別番号: 22489 から 22558を含む。いくつかの実施形態では、 KRASワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 141 から 229、配列識別番号: 462 から 466、配列識別番号: 7099 から 12814、または 配列識別番号: 22489 から 22558と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、NRAS タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 230 から 272 を含む。いくつかの実施形態では、 NRASワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 230 から 272と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、NRASタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 230 から 272、配列識別番号: 12815 から 14836、配列識別番号: 22559 から 22582を含む。いくつかの実施形態では、 NRASワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 230 から 272、配列識別番号: 12815 から 14836、または 配列識別番号: 22559 から 22582と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、NRAS タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 230 から 272 を含む。いくつかの実施形態では、 NRASワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 230 から 272と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、NRASタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 230 から 272、配列識別番号: 12815 から 14836、配列識別番号: 22559 から 22582を含む。いくつかの実施形態では、 NRASワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 230 から 272、配列識別番号: 12815 から 14836、または 配列識別番号: 22559 から 22582と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PIK3CA タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 273 から 322 と 配列識別番号: 467 から 468 を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CAワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 273 から 322 または 配列識別番号: 467 から 468と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PIK3CAタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 273 から 322、配列識別番号: 467 から 468、配列識別番号: 14837 から 17342、配列識別番号: 22583 から 22622を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CAワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 273 から 322、配列識別番号: 467 から 468、配列識別番号: 14837 から 17342、または 配列識別番号: 22583 から 22622と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PIK3CA タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 273 から 322 と 配列識別番号: 467 から 468 を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CAワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 273 から 322 または 配列識別番号: 467 から 468と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PIK3CAタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 273 から 322、配列識別番号: 467 から 468、配列識別番号: 14837 から 17342、配列識別番号: 22583 から 22622を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CAワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 273 から 322、配列識別番号: 467 から 468、配列識別番号: 14837 から 17342、または 配列識別番号: 22583 から 22622と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PTEN タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 323 から 353 を含む。いくつかの実施形態では、 PTENワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 323 から 353と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PTENタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 323 から 353、配列識別番号: 17343 から 18205、配列識別番号: 22623 から 22636を含む。いくつかの実施形態では、 PTENワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 323 から 353、配列識別番号: 17343 から 18205、または 配列識別番号: 22623 から 22636と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PTEN タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 323 から 353 を含む。いくつかの実施形態では、 PTENワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 323 から 353と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PTENタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 323 から 353、配列識別番号: 17343 から 18205、配列識別番号: 22623 から 22636を含む。いくつかの実施形態では、 PTENワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 323 から 353、配列識別番号: 17343 から 18205、または 配列識別番号: 22623 から 22636と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 354 から 458 と 配列識別番号: 469 から 474 を含む。いくつかの実施形態では、 TP53ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 354 から 458 または 配列識別番号: 469 から 474と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53タンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 354 から 458、配列識別番号: 469 から 474、配列識別番号: 18206 から 22385、配列識別番号: 22637 から 22727を含む。いくつかの実施形態では、 TP53ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 354 から 458、配列識別番号: 469 から 474、配列識別番号: 18206 から 22385、または 配列識別番号: 22637 から 22727と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 354 から 458 と 配列識別番号: 469 から 474 を含む。いくつかの実施形態では、 TP53ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 354 から 458 または 配列識別番号: 469 から 474と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53タンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 354 から 458、配列識別番号: 469 から 474、配列識別番号: 18206 から 22385、配列識別番号: 22637 から 22727を含む。いくつかの実施形態では、 TP53ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 354 から 458、配列識別番号: 469 から 474、配列識別番号: 18206 から 22385、または 配列識別番号: 22637 から 22727と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、RAS タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 141 から 272 と 配列識別番号: 462 から 466 を含む。いくつかの実施形態では、 RASワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 141 から 272 または 配列識別番号: 462 から 466と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、RASタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 141 から 272、配列識別番号: 462 から 466、配列識別番号: 7099 から 14836、配列識別番号: 22489 から 22582を含む。いくつかの実施形態では、 RASワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 141 から 272、配列識別番号: 462 から 466、配列識別番号: 7099 から 14836、または 配列識別番号: 22489 から 22582と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、RAS タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 141 から 272 と 配列識別番号: 462 から 466 を含む。いくつかの実施形態では、 RASワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 141 から 272 または 配列識別番号: 462 から 466と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、RASタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 141 から 272、配列識別番号: 462 から 466、配列識別番号: 7099 から 14836、配列識別番号: 22489 から 22582を含む。いくつかの実施形態では、 RASワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 141 から 272、配列識別番号: 462 から 466、配列識別番号: 7099 から 14836、または 配列識別番号: 22489 から 22582と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、BRAF V600E タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 19 から 33 を含む。いくつかの実施形態では、 BRAF V600Eワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 19 から 33と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、BRAF V600Eタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 19 から 33、配列識別番号: 1769 から 2329、配列識別番号: 22397 から 22405を含む。いくつかの実施形態では、 BRAF V600Eワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 19 から 33、配列識別番号: 1769 から 2329、または 配列識別番号: 22397 から 22405と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、BRAF V600E タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 19 から 33 を含む。いくつかの実施形態では、 BRAF V600Eワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 19 から 33と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、BRAF V600Eタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 19 から 33、配列識別番号: 1769 から 2329、配列識別番号: 22397 から 22405を含む。いくつかの実施形態では、 BRAF V600Eワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 19 から 33、配列識別番号: 1769 から 2329、または 配列識別番号: 22397 から 22405と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、BRAF V600M タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 34 から 50 を含む。いくつかの実施形態では、 BRAF V600Mワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 34 から 50と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、BRAF V600Mタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 34 から 50、配列識別番号: 2330 から 3170、配列識別番号: 22406 から 22417を含む。いくつかの実施形態では、 BRAF V600Mワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 34 から 50、配列識別番号: 2330 から 3170、または 配列識別番号: 22406 から 22417と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、BRAF V600M タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 34 から 50 を含む。いくつかの実施形態では、 BRAF V600Mワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 34 から 50と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、BRAF V600Mタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 34 から 50、配列識別番号: 2330 から 3170、配列識別番号: 22406 から 22417を含む。いくつかの実施形態では、 BRAF V600Mワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 34 から 50、配列識別番号: 2330 から 3170、または 配列識別番号: 22406 から 22417と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、EGFR A289V タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 51 から 66 を含む。いくつかの実施形態では、 EGFR A289Vワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 51 から 66と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、EGFR A289Vタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 51 から 66、配列識別番号: 3171 から 4055、配列識別番号: 22418 から 22430を含む。いくつかの実施形態では、 EGFR A289Vワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 51 から 66、配列識別番号: 3171 から 4055、または 配列識別番号: 22418 から 22430と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、EGFR A289V タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 51 から 66 を含む。いくつかの実施形態では、 EGFR A289Vワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 51 から 66と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、EGFR A289Vタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 51 から 66、配列識別番号: 3171 から 4055、配列識別番号: 22418 から 22430を含む。いくつかの実施形態では、 EGFR A289Vワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 51 から 66、配列識別番号: 3171 から 4055、または 配列識別番号: 22418 から 22430と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、EGFR G598V タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 67 から 81 を含む。いくつかの実施形態では、 EGFR G598Vワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 67 から 81と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、EGFR G598Vタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 67 から 81、配列識別番号: 4056 から 4718、配列識別番号: 22431 から 22437を含む。いくつかの実施形態では、 EGFR G598Vワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 67 から 81、配列識別番号: 4056 から 4718、または 配列識別番号: 22431 から 22437と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、EGFR G598V タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 67 から 81 を含む。いくつかの実施形態では、 EGFR G598Vワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 67 から 81と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、EGFR G598Vタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 67 から 81、配列識別番号: 4056 から 4718、配列識別番号: 22431 から 22437を含む。いくつかの実施形態では、 EGFR G598Vワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 67 から 81、配列識別番号: 4056 から 4718、または 配列識別番号: 22431 から 22437と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、EGFR L858R タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 82 から 98 を含む。いくつかの実施形態では、 EGFR L858Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 82 から 98と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、EGFR L858Rタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 82 から 98、配列識別番号: 4719 から 5756、配列識別番号: 22438 から 22449を含む。いくつかの実施形態では、 EGFR L858Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 82 から 98、配列識別番号: 4719 から 5756、または 配列識別番号: 22438 から 22449と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、EGFR L858R タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 82 から 98 を含む。いくつかの実施形態では、 EGFR L858Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 82 から 98と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、EGFR L858Rタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 82 から 98、配列識別番号: 4719 から 5756、配列識別番号: 22438 から 22449を含む。いくつかの実施形態では、 EGFR L858Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 82 から 98、配列識別番号: 4719 から 5756、または 配列識別番号: 22438 から 22449と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、IDH1 R132H タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 125 から 140 と 配列識別番号: 461 を含む。いくつかの実施形態では、 IDH1 R132Hワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 125 から 140 または 配列識別番号: 461と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、IDH1 R132Hタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 125 から 140、配列識別番号: 461、配列識別番号: 6738 から 7098、配列識別番号: 22477 から 22488を含む。いくつかの実施形態では、 IDH1 R132Hワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 125 から 140、配列識別番号: 461、配列識別番号: 6738 から 7098、または 配列識別番号: 22477 から 22488と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、IDH1 R132H タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 125 から 140 と 配列識別番号: 461 を含む。いくつかの実施形態では、 IDH1 R132Hワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 125 から 140 または 配列識別番号: 461と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、IDH1 R132Hタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 125 から 140、配列識別番号: 461、配列識別番号: 6738 から 7098、配列識別番号: 22477 から 22488を含む。いくつかの実施形態では、 IDH1 R132Hワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 125 から 140、配列識別番号: 461、配列識別番号: 6738 から 7098、または 配列識別番号: 22477 から 22488と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、IDH1 R132C タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 119 から 124 と 配列識別番号: 460 を含む。いくつかの実施形態では、 IDH1 R132Cワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 119 から 124 または 配列識別番号: 460と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、IDH1 R132Cタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 119 から 124、配列識別番号: 460、配列識別番号: 6499 から 6737、配列識別番号: 22467 から 22476を含む。いくつかの実施形態では、 IDH1 R132Cワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 119 から 124、配列識別番号: 460、配列識別番号: 6499 から 6737、または 配列識別番号: 22467 から 22476と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、IDH1 R132C タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 119 から 124 と 配列識別番号: 460 を含む。いくつかの実施形態では、 IDH1 R132Cワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 119 から 124 または 配列識別番号: 460と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、IDH1 R132Cタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 119 から 124、配列識別番号: 460、配列識別番号: 6499 から 6737、配列識別番号: 22467 から 22476を含む。いくつかの実施形態では、 IDH1 R132Cワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 119 から 124、配列識別番号: 460、配列識別番号: 6499 から 6737、または 配列識別番号: 22467 から 22476と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G12D タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 167 から 178 と 配列識別番号: 464 を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Dワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 167 から 178 または 配列識別番号: 464と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G12Dタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 167 から 178、配列識別番号: 464、配列識別番号: 8432 から 9733、配列識別番号: 22507 から 22518を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Dワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 167 から 178、配列識別番号: 464、配列識別番号: 8432 から 9733、または 配列識別番号: 22507 から 22518と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G12D タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 167 から 178 と 配列識別番号: 464 を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Dワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 167 から 178 または 配列識別番号: 464と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G12Dタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 167 から 178、配列識別番号: 464、配列識別番号: 8432 から 9733、配列識別番号: 22507 から 22518を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Dワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 167 から 178、配列識別番号: 464、配列識別番号: 8432 から 9733、または 配列識別番号: 22507 から 22518と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G12V タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 203 から 213 を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Vワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 203 から 213と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G12Vタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 203 から 213、配列識別番号: 11009 から 11744、配列識別番号: 22537 から 22546を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Vワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 203 から 213、配列識別番号: 11009 から 11744、または 配列識別番号: 22537 から 22546と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G12V タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 203 から 213 を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Vワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 203 から 213と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G12Vタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 203 から 213、配列識別番号: 11009 から 11744、配列識別番号: 22537 から 22546を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Vワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 203 から 213、配列識別番号: 11009 から 11744、または 配列識別番号: 22537 から 22546と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G12R タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 179 から 191 と 配列識別番号: 465 を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 179 から 191 または 配列識別番号: 465と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G12Rタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 179 から 191、配列識別番号: 465、配列識別番号: 9734 から 10236、配列識別番号: 22519 から 22527を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 179 から 191、配列識別番号: 465、配列識別番号: 9734 から 10236、または 配列識別番号: 22519 から 22527と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G12R タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 179 から 191 と 配列識別番号: 465 を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 179 から 191 または 配列識別番号: 465と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G12Rタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 179 から 191、配列識別番号: 465、配列識別番号: 9734 から 10236、配列識別番号: 22519 から 22527を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 179 から 191、配列識別番号: 465、配列識別番号: 9734 から 10236、または 配列識別番号: 22519 から 22527と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G12C タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 154 から 166 と 配列識別番号: 463 を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Cワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 154 から 166 または 配列識別番号: 463と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G12Cタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 154 から 166、配列識別番号: 463、配列識別番号: 7881 から 8431、配列識別番号: 22498 から 22506を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Cワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 154 から 166、配列識別番号: 463、配列識別番号: 7881 から 8431、または 配列識別番号: 22498 から 22506と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G12C タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 154 から 166 と 配列識別番号: 463 を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Cワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 154 から 166 または 配列識別番号: 463と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G12Cタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 154 から 166、配列識別番号: 463、配列識別番号: 7881 から 8431、配列識別番号: 22498 から 22506を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Cワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 154 から 166、配列識別番号: 463、配列識別番号: 7881 から 8431、または 配列識別番号: 22498 から 22506と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G13D タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 214 から 229 と 配列識別番号: 466 を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G13Dワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 214 から 229 または 配列識別番号: 466と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G13Dタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 214 から 229、配列識別番号: 466、配列識別番号: 11745 から 12814、配列識別番号: 22547 から 22558を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G13Dワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 214 から 229、配列識別番号: 466、配列識別番号: 11745 から 12814、または 配列識別番号: 22547 から 22558と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G13D タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 214 から 229 と 配列識別番号: 466 を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G13Dワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 214 から 229 または 配列識別番号: 466と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G13Dタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 214 から 229、配列識別番号: 466、配列識別番号: 11745 から 12814、配列識別番号: 22547 から 22558を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G13Dワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 214 から 229、配列識別番号: 466、配列識別番号: 11745 から 12814、または 配列識別番号: 22547 から 22558と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G12A タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 141 から 153 と 配列識別番号: 462 を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Aワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 141 から 153 または 配列識別番号: 462と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G12Aタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 141 から 153、配列識別番号: 462、配列識別番号: 7099 から 7880、配列識別番号: 22489 から 22497を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Aワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 141 から 153、配列識別番号: 462、配列識別番号: 7099 から 7880、または 配列識別番号: 22489 から 22497と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G12A タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 141 から 153 と 配列識別番号: 462 を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Aワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 141 から 153 または 配列識別番号: 462と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G12Aタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 141 から 153、配列識別番号: 462、配列識別番号: 7099 から 7880、配列識別番号: 22489 から 22497を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Aワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 141 から 153、配列識別番号: 462、配列識別番号: 7099 から 7880、または 配列識別番号: 22489 から 22497と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G12S タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 192 から 202 を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Sワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 192 から 202と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G12Sタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 192 から 202、配列識別番号: 10237 から 11008、配列識別番号: 22528 から 22536を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Sワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 192 から 202、配列識別番号: 10237 から 11008、または 配列識別番号: 22528 から 22536と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G12S タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 192 から 202 を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Sワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 192 から 202と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G12Sタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 192 から 202、配列識別番号: 10237 から 11008、配列識別番号: 22528 から 22536を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Sワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 192 から 202、配列識別番号: 10237 から 11008、または 配列識別番号: 22528 から 22536と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、NRAS Q61R タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 256 から 272 を含む。いくつかの実施形態では、 NRAS Q61Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 256 から 272と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、NRAS Q61Rタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 256 から 272、配列識別番号: 14315 から 14836、配列識別番号: 22577 から 22582を含む。いくつかの実施形態では、 NRAS Q61Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 256 から 272、配列識別番号: 14315 から 14836、または 配列識別番号: 22577 から 22582と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、NRAS Q61R タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 256 から 272 を含む。いくつかの実施形態では、 NRAS Q61Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 256 から 272と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、NRAS Q61Rタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 256 から 272、配列識別番号: 14315 から 14836、配列識別番号: 22577 から 22582を含む。いくつかの実施形態では、 NRAS Q61Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 256 から 272、配列識別番号: 14315 から 14836、または 配列識別番号: 22577 から 22582と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、NRAS Q61K タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 230 から 238 を含む。いくつかの実施形態では、 NRAS Q61Kワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 230 から 238と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、NRAS Q61Kタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 230 から 238、配列識別番号: 12815 から 13434、配列識別番号: 22559 から 22567を含む。いくつかの実施形態では、 NRAS Q61Kワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 230 から 238、配列識別番号: 12815 から 13434、または 配列識別番号: 22559 から 22567と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、NRAS Q61K タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 230 から 238 を含む。いくつかの実施形態では、 NRAS Q61Kワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 230 から 238と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、NRAS Q61Kタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 230 から 238、配列識別番号: 12815 から 13434、配列識別番号: 22559 から 22567を含む。いくつかの実施形態では、 NRAS Q61Kワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 230 から 238、配列識別番号: 12815 から 13434、または 配列識別番号: 22559 から 22567と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、NRAS Q61L タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 239 から 255 を含む。いくつかの実施形態では、 NRAS Q61Lワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 239 から 255と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、NRAS Q61Lタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 239 から 255、配列識別番号: 13435 から 14314、配列識別番号: 22568 から 22576を含む。いくつかの実施形態では、 NRAS Q61Lワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 239 から 255、配列識別番号: 13435 から 14314、または 配列識別番号: 22568 から 22576と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、NRAS Q61L タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 239 から 255 を含む。いくつかの実施形態では、 NRAS Q61Lワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 239 から 255と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、NRAS Q61Lタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 239 から 255、配列識別番号: 13435 から 14314、配列識別番号: 22568 から 22576を含む。いくつかの実施形態では、 NRAS Q61Lワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 239 から 255、配列識別番号: 13435 から 14314、または 配列識別番号: 22568 から 22576と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PIK3CA E542K タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 273 から 285 を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CA E542Kワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 273 から 285と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PIK3CA E542Kタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 273 から 285、配列識別番号: 14837 から 15625、配列識別番号: 22583 から 22592を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CA E542Kワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 273 から 285、配列識別番号: 14837 から 15625、または 配列識別番号: 22583 から 22592と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PIK3CA E542K タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 273 から 285 を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CA E542Kワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 273 から 285と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PIK3CA E542Kタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 273 から 285、配列識別番号: 14837 から 15625、配列識別番号: 22583 から 22592を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CA E542Kワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 273 から 285、配列識別番号: 14837 から 15625、または 配列識別番号: 22583 から 22592と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PIK3CA E545K タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 286 から 293 と 配列識別番号: 467 を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CA E545Kワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 286 から 293 または 配列識別番号: 467と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PIK3CA E545Kタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 286 から 293、配列識別番号: 467、配列識別番号: 15626 から 15907、配列識別番号: 22593 から 22602を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CA E545Kワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 286 から 293、配列識別番号: 467、配列識別番号: 15626 から 15907、または 配列識別番号: 22593 から 22602と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PIK3CA E545K タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 286 から 293 と 配列識別番号: 467 を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CA E545Kワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 286 から 293 または 配列識別番号: 467と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PIK3CA E545Kタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 286 から 293、配列識別番号: 467、配列識別番号: 15626 から 15907、配列識別番号: 22593 から 22602を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CA E545Kワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 286 から 293、配列識別番号: 467、配列識別番号: 15626 から 15907、または 配列識別番号: 22593 から 22602と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PIK3CA H1047R タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 294 から 309 を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CA H1047Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 294 から 309と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PIK3CA H1047Rタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 294 から 309、配列識別番号: 15908 から 16276、配列識別番号: 22603 から 22608を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CA H1047Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 294 から 309、配列識別番号: 15908 から 16276、または 配列識別番号: 22603 から 22608と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PIK3CA H1047R タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 294 から 309 を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CA H1047Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 294 から 309と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PIK3CA H1047Rタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 294 から 309、配列識別番号: 15908 から 16276、配列識別番号: 22603 から 22608を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CA H1047Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 294 から 309、配列識別番号: 15908 から 16276、または 配列識別番号: 22603 から 22608と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R158L タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 359 から 374 と 配列識別番号: 469 から 470 を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R158Lワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 359 から 374 または 配列識別番号: 469 から 470と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R158Lタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 359 から 374、配列識別番号: 469 から 470、配列識別番号: 18414 から 19404、配列識別番号: 22644 から 22657を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R158Lワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 359 から 374、配列識別番号: 469 から 470、配列識別番号: 18414 から 19404、または 配列識別番号: 22644 から 22657と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R158L タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 359 から 374 と 配列識別番号: 469 から 470 を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R158Lワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 359 から 374 または 配列識別番号: 469 から 470と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R158Lタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 359 から 374、配列識別番号: 469 から 470、配列識別番号: 18414 から 19404、配列識別番号: 22644 から 22657を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R158Lワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 359 から 374、配列識別番号: 469 から 470、配列識別番号: 18414 から 19404、または 配列識別番号: 22644 から 22657と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R175H タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 375 から 386 と 配列識別番号: 471 から 472 を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R175Hワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 375 から 386 または 配列識別番号: 471 から 472と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R175Hタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 471 から 472、配列識別番号: 19405 から 19752、配列識別番号: 22658 から 22665を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R175Hワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 471 から 472、配列識別番号: 19405 から 19752、または 配列識別番号: 22658 から 22665と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R175H タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 375 から 386 と 配列識別番号: 471 から 472 を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R175Hワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 375 から 386 または 配列識別番号: 471 から 472と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R175Hタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 471 から 472、配列識別番号: 19405 から 19752、配列識別番号: 22658 から 22665を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R175Hワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 471 から 472、配列識別番号: 19405 から 19752、または 配列識別番号: 22658 から 22665と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R248Q タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 387 から 401 を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R248Qワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 387 から 401と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R248Qタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 387 から 401、配列識別番号: 19753 から 20608、配列識別番号: 22666 から 22678を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R248Qワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 387 から 401、配列識別番号: 19753 から 20608、または 配列識別番号: 22666 から 22678と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R248Q タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 387 から 401 を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R248Qワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 387 から 401と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R248Qタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 387 から 401、配列識別番号: 19753 から 20608、配列識別番号: 22666 から 22678を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R248Qワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 387 から 401、配列識別番号: 19753 から 20608、または 配列識別番号: 22666 から 22678と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R273C タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 422 から 432 と 配列識別番号: 473 を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R273Cワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 422 から 432 または 配列識別番号: 473と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R273Cタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 422 から 432、配列識別番号: 473、配列識別番号: 21192 から 21462、配列識別番号: 22690 から 22701を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R273Cワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 422 から 432、配列識別番号: 473、配列識別番号: 21192 から 21462、または 配列識別番号: 22690 から 22701と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R273C タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 422 から 432 と 配列識別番号: 473 を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R273Cワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 422 から 432 または 配列識別番号: 473と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R273Cタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 422 から 432、配列識別番号: 473、配列識別番号: 21192 から 21462、配列識別番号: 22690 から 22701を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R273Cワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 422 から 432、配列識別番号: 473、配列識別番号: 21192 から 21462、または 配列識別番号: 22690 から 22701と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R273H タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 433 から 446 と 配列識別番号: 474 を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R273Hワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 433 から 446 または 配列識別番号: 474と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R273Hタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 433 から 446、配列識別番号: 474、配列識別番号: 21463 から 21845、配列識別番号: 22702 から 22713を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R273Hワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 433 から 446、配列識別番号: 474、配列識別番号: 21463 から 21845、または 配列識別番号: 22702 から 22713と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R273H タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 433 から 446 と 配列識別番号: 474 を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R273Hワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 433 から 446 または 配列識別番号: 474と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R273Hタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 433 から 446、配列識別番号: 474、配列識別番号: 21463 から 21845、配列識別番号: 22702 から 22713を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R273Hワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 433 から 446、配列識別番号: 474、配列識別番号: 21463 から 21845、または 配列識別番号: 22702 から 22713と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R248W タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 402 から 421 を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R248Wワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 402 から 421と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R248Wタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 402 から 421、配列識別番号: 20609 から 21191、配列識別番号: 22679 から 22689を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R248Wワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 402 から 421、配列識別番号: 20609 から 21191、または 配列識別番号: 22679 から 22689と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R248W タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 402 から 421 を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R248Wワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 402 から 421と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R248Wタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 402 から 421、配列識別番号: 20609 から 21191、配列識別番号: 22679 から 22689を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R248Wワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 402 から 421、配列識別番号: 20609 から 21191、または 配列識別番号: 22679 から 22689と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R282W タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 447 から 449 を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R282Wワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 447 から 449と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R282Wタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 447 から 449、配列識別番号: 21846 から 21940、配列識別番号: 22714 から 22720を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R282Wワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 447 から 449、配列識別番号: 21846 から 21940、または 配列識別番号: 22714 から 22720と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R282W タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 447 から 449 を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R282Wワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 447 から 449と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R282Wタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 447 から 449、配列識別番号: 21846 から 21940、配列識別番号: 22714 から 22720を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R282Wワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 447 から 449、配列識別番号: 21846 から 21940、または 配列識別番号: 22714 から 22720と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 Y220C タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 450 から 458 を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 Y220Cワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 450 から 458と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 Y220Cタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 450 から 458、配列識別番号: 21941 から 22385、配列識別番号: 22721 から 22727を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 Y220Cワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 450 から 458、配列識別番号: 21941 から 22385、または 配列識別番号: 22721 から 22727と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 Y220C タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 450 から 458 を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 Y220Cワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 450 から 458と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 Y220Cタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 450 から 458、配列識別番号: 21941 から 22385、配列識別番号: 22721 から 22727を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 Y220Cワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 450 から 458、配列識別番号: 21941 から 22385、または 配列識別番号: 22721 から 22727と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PIK3CA R88Q タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 310 から 322 と 配列識別番号: 468 を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CA R88Qワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 310 から 322 または 配列識別番号: 468と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PIK3CA R88Qタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 310 から 322、配列識別番号: 468、配列識別番号: 16277 から 17342、配列識別番号: 22609 から 22622を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CA R88Qワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 310 から 322、配列識別番号: 468、配列識別番号: 16277 から 17342、または 配列識別番号: 22609 から 22622と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PIK3CA R88Q タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 310 から 322 と 配列識別番号: 468 を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CA R88Qワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 310 から 322 または 配列識別番号: 468と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PIK3CA R88Qタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 310 から 322、配列識別番号: 468、配列識別番号: 16277 から 17342、配列識別番号: 22609 から 22622を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CA R88Qワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 310 から 322、配列識別番号: 468、配列識別番号: 16277 から 17342、または 配列識別番号: 22609 から 22622と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、GTF2I L424H タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 99 から 118 を含む。いくつかの実施形態では、 GTF2I L424Hワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 99 から 118と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、GTF2I L424Hタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 99 から 118、配列識別番号: 5757 から 6498、配列識別番号: 22450 から 22466を含む。いくつかの実施形態では、 GTF2I L424Hワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 99 から 118、配列識別番号: 5757 から 6498、または 配列識別番号: 22450 から 22466と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、GTF2I L424H タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 99 から 118 を含む。いくつかの実施形態では、 GTF2I L424Hワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 99 から 118と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、GTF2I L424Hタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 99 から 118、配列識別番号: 5757 から 6498、配列識別番号: 22450 から 22466を含む。いくつかの実施形態では、 GTF2I L424Hワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 99 から 118、配列識別番号: 5757 から 6498、または 配列識別番号: 22450 から 22466と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PTEN R130Q タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 338 から 353 を含む。いくつかの実施形態では、 PTEN R130Qワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 338 から 353と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PTEN R130Qタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 338 から 353、配列識別番号: 17869 から 18205、配列識別番号: 22630 から 22636を含む。いくつかの実施形態では、 PTEN R130Qワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 338 から 353、配列識別番号: 17869 から 18205、または 配列識別番号: 22630 から 22636と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PTEN R130Q タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 338 から 353 を含む。いくつかの実施形態では、 PTEN R130Qワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 338 から 353と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PTEN R130Qタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 338 から 353、配列識別番号: 17869 から 18205、配列識別番号: 22630 から 22636を含む。いくつかの実施形態では、 PTEN R130Qワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 338 から 353、配列識別番号: 17869 から 18205、または 配列識別番号: 22630 から 22636と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、AKT1 E17K タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 1 から 18 と 配列識別番号: 459 を含む。いくつかの実施形態では、 AKT1 E17Kワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 1 から 18 または 配列識別番号: 459と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、AKT1 E17Kタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 1 から 18、配列識別番号: 459、配列識別番号: 760 から 1768、配列識別番号: 22386 から 22396を含む。いくつかの実施形態では、 AKT1 E17Kワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 1 から 18、配列識別番号: 459、配列識別番号: 760 から 1768、または 配列識別番号: 22386 から 22396と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、AKT1 E17K タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 1 から 18 と 配列識別番号: 459 を含む。いくつかの実施形態では、 AKT1 E17Kワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 1 から 18 または 配列識別番号: 459と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、AKT1 E17Kタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 1 から 18、配列識別番号: 459、配列識別番号: 760 から 1768、配列識別番号: 22386 から 22396を含む。いくつかの実施形態では、 AKT1 E17Kワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 1 から 18、配列識別番号: 459、配列識別番号: 760 から 1768、または 配列識別番号: 22386 から 22396と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PTEN R130G タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 323 から 337 を含む。いくつかの実施形態では、 PTEN R130Gワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 323 から 337と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PTEN R130Gタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 323 から 337、配列識別番号: 17343 から 17868、配列識別番号: 22623 から 22629を含む。いくつかの実施形態では、 PTEN R130Gワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 323 から 337、配列識別番号: 17343 から 17868、または 配列識別番号: 22623 から 22629と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PTEN R130G タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 323 から 337 を含む。いくつかの実施形態では、 PTEN R130Gワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 323 から 337と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PTEN R130Gタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 323 から 337、配列識別番号: 17343 から 17868、配列識別番号: 22623 から 22629を含む。いくつかの実施形態では、 PTEN R130Gワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 323 から 337、配列識別番号: 17343 から 17868、または 配列識別番号: 22623 から 22629と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 H179R タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 354 から 358 を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 H179Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 354 から 358と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 H179Rタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 354 から 358、配列識別番号: 18206 から 18413、配列識別番号: 22637 から 22643を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 H179Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 354 から 358、配列識別番号: 18206 から 18413、または 配列識別番号: 22637 から 22643と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 H179R タンパク質の変異に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 354 から 358 を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 H179Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 354 から 358と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 H179Rタンパク質の変異に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 354 から 358、配列識別番号: 18206 から 18413、配列識別番号: 22637 から 22643を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 H179Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 354 から 358、配列識別番号: 18206 から 18413、または 配列識別番号: 22637 から 22643と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、膵がんに対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 168 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 179 から 180、配列識別番号: 182 から 183、配列識別番号: 203 から 204、配列識別番号: 207 を含む。いくつかの実施形態では、 膵がんワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 168 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 179 から 180、配列識別番号: 182 から 183、配列識別番号: 203 から 204、または 配列識別番号: 207と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、膵がんに対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 168 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 179 から 180、配列識別番号: 182 から 183、配列識別番号: 203 から 204、配列識別番号: 207 を含む。いくつかの実施形態では、 膵がんワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 168 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 179 から 180、配列識別番号: 182 から 183、配列識別番号: 203 から 204、または 配列識別番号: 207と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、皮膚がんに対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 19 から 23、配列識別番号: 34 から 40、配列識別番号: 230 から 231、配列識別番号: 239、配列識別番号: 241 から 242、配列識別番号: 260 から 262 を含む。いくつかの実施形態では、 皮膚がんワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 19 から 23、配列識別番号: 34 から 40、配列識別番号: 230 から 231、配列識別番号: 239、配列識別番号: 241 から 242、または 配列識別番号: 260 から 262と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、皮膚がんに対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 19 から 23、配列識別番号: 34 から 40、配列識別番号: 230 から 231、配列識別番号: 239、配列識別番号: 241 から 242、配列識別番号: 260 から 262 を含む。いくつかの実施形態では、 皮膚がんワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 19 から 23、配列識別番号: 34 から 40、配列識別番号: 230 から 231、配列識別番号: 239、配列識別番号: 241 から 242、または 配列識別番号: 260 から 262と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、甲状腺がんに対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 19 から 23、配列識別番号: 230 から 231、配列識別番号: 260 から 262 を含む。いくつかの実施形態では、 甲状腺がんワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 19 から 23、配列識別番号: 230 から 231、または 配列識別番号: 260 から 262と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、甲状腺がんに対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 19 から 23、配列識別番号: 230 から 231、配列識別番号: 260 から 262 を含む。いくつかの実施形態では、 甲状腺がんワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 19 から 23、配列識別番号: 230 から 231、または 配列識別番号: 260 から 262と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、脳腫瘍に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 51 から 55、配列識別番号: 67 から 70、配列識別番号: 72 から 73、配列識別番号: 119 から 120、配列識別番号: 125 から 130、配列識別番号: 375、配列識別番号: 423、配列識別番号: 425、配列識別番号: 471 から 473 を含む。いくつかの実施形態では、 脳腫瘍ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 51 から 55、配列識別番号: 67 から 70、配列識別番号: 72 から 73、配列識別番号: 119 から 120、配列識別番号: 125 から 130、配列識別番号: 375、配列識別番号: 423、配列識別番号: 425、または 配列識別番号: 471 から 473と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、脳腫瘍に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 51 から 55、配列識別番号: 67 から 70、配列識別番号: 72 から 73、配列識別番号: 119 から 120、配列識別番号: 125 から 130、配列識別番号: 375、配列識別番号: 423、配列識別番号: 425、配列識別番号: 471 から 473 を含む。いくつかの実施形態では、 脳腫瘍ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 51 から 55、配列識別番号: 67 から 70、配列識別番号: 72 から 73、配列識別番号: 119 から 120、配列識別番号: 125 から 130、配列識別番号: 375、配列識別番号: 423、配列識別番号: 425、または 配列識別番号: 471 から 473と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、直腸結腸がんに対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 20 から 23、配列識別番号: 167 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 203 から 207、配列識別番号: 215 から 217、配列識別番号: 288、配列識別番号: 467、配列識別番号: 471 から 472 を含む。いくつかの実施形態では、 直腸結腸がんワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 20 から 23、配列識別番号: 167 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 203 から 207、配列識別番号: 215 から 217、配列識別番号: 288、配列識別番号: 467、または 配列識別番号: 471 から 472と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、直腸結腸がんに対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 20 から 23、配列識別番号: 167 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 203 から 207、配列識別番号: 215 から 217、配列識別番号: 288、配列識別番号: 467、配列識別番号: 471 から 472 を含む。いくつかの実施形態では、 直腸結腸がんワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 20 から 23、配列識別番号: 167 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 203 から 207、配列識別番号: 215 から 217、配列識別番号: 288、配列識別番号: 467、または 配列識別番号: 471 から 472と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、気管支がんと肺がんに対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 82 から 86、配列識別番号: 141 から 144、配列識別番号: 154 から 159、配列識別番号: 168 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 203 から 204、配列識別番号: 207、配列識別番号: 274 から 276、配列識別番号: 288、配列識別番号: 359、配列識別番号: 362 から 364、配列識別番号: 467 を含む。いくつかの実施形態では、 気管支がんと肺がんワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 82 から 86、配列識別番号: 141 から 144、配列識別番号: 154 から 159、配列識別番号: 168 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 203 から 204、配列識別番号: 207、配列識別番号: 274 から 276、配列識別番号: 288、配列識別番号: 359、配列識別番号: 362 から 364、または 配列識別番号: 467と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、気管支がんと肺がんに対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 82 から 86、配列識別番号: 141 から 144、配列識別番号: 154 から 159、配列識別番号: 168 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 203 から 204、配列識別番号: 207、配列識別番号: 274 から 276、配列識別番号: 288、配列識別番号: 359、配列識別番号: 362 から 364、配列識別番号: 467 を含む。いくつかの実施形態では、 気管支がんと肺がんワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 82 から 86、配列識別番号: 141 から 144、配列識別番号: 154 から 159、配列識別番号: 168 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 203 から 204、配列識別番号: 207、配列識別番号: 274 から 276、配列識別番号: 288、配列識別番号: 359、配列識別番号: 362 から 364、または 配列識別番号: 467と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、乳がんに対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 273 から 309、配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 422 から 446、配列識別番号: 467、配列識別番号: 471 から 474 を含む。いくつかの実施形態では、 乳がんワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 273 から 309、配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 422 から 446、配列識別番号: 467、または 配列識別番号: 471 から 474と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、乳がんに対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 273 から 309、配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 422 から 446、配列識別番号: 467、配列識別番号: 471 から 474 を含む。いくつかの実施形態では、 乳がんワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 273 から 309、配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 422 から 446、配列識別番号: 467、または 配列識別番号: 471 から 474と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、卵巣がんに対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 273 から 309、配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 422 から 446、配列識別番号: 467、配列識別番号: 471 から 474 を含む。いくつかの実施形態では、 卵巣がんワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 273 から 309、配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 422 から 446、配列識別番号: 467、または 配列識別番号: 471 から 474と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、卵巣がんに対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 273 から 309、配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 422 から 446、配列識別番号: 467、配列識別番号: 471 から 474 を含む。いくつかの実施形態では、 卵巣がんワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 273 から 309、配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 422 から 446、配列識別番号: 467、または 配列識別番号: 471 から 474と同一のアミノ酸配列を含む。
表1は、本書に記載された以下のMHCクラスIペプチド配列を示す：それぞれの配列ID NO、配列ID NOに対応するアミノ酸配列、タンパク質標的（特定の変異を伴う）、シードアミノ酸配列（すなわち、野生型タンパク質断片のアミノ酸配列）、2位およびC位のヘテロクリティックペプチドのアミノ酸置換（もしあれば）（カルボキシル末端）など。また、本書に記載されるように、ペプチドを組み合わせたペプチドワクチンに含められる可能性のある実施形態を詳述する。いくつかの実施形態では、表１（配列識別番号: 1 から 474）に挙げたペプチドの任意の組み合わせを用いて、約2～約40個のペプチドを有する複合ペプチドワクチンを製造することができる。いくつかの実施形態では、複合ワクチン中のペプチドのいずれか（ペプチド1 から 474；配列識別番号: 1 から 474）には、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 1 から 474と同一のアミノ酸配列を含む。
MHCクラスIワクチンペプチドのその他のアミノ酸配列は、配列リスト（配列識別番号: 760 から 22727）に記載されている。いくつかの実施形態では、ここで（配列識別番号: 1 から 474 と 配列識別番号: 760 から 22727）列挙されたMHCクラス Iペプチドの任意の組み合わせを用いて、約2～約40個のペプチドを有する複合ペプチドワクチンを製造することができる。いくつかの実施形態では、複合ワクチン中のペプチド(配列識別番号: 1 から 474 と 配列識別番号: 760 から 22727)のいずれかは、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 1 から 474 または 配列識別番号: 760 から 22727と同一のアミノ酸配列を含む、または含有する。
MHC クラス II ペプチド配列
MHC クラス II ペプチド配列
いくつかの実施形態では、ペプチドワクチン（単一標的ワクチンまたは複合多目的ワクチン）は、各ペプチドが20個以上のアミノ酸からなる約1～40個のMHCクラスIIペプチドを含む。いくつかの実施形態では、MHCクラスIIペプチドワクチンは、1つ以上の AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、または TP53変異タンパク質標的を対象とする。いくつかの実施形態では、MHCクラスIIペプチドワクチンは、1つ以上の AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、または TP53 Y220C変異タンパク質標的を対象とする。いくつかの実施形態では、MHCクラスIIペプチドワクチンは、1つ以上の 膵がん、皮膚がん、甲状腺がん、脳腫瘍、直腸結腸がん、気管支がんと肺がん、乳がん、または 卵巣がん 適応症を対象としている。
いくつかの実施形態では、AKT1 タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 475 から 483 を含む。いくつかの実施形態では、 AKT1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 475 から 483と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、AKT1タンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 475 から 483、配列識別番号: 22728 から 22838、配列識別番号: 25305 から 25488を含む。いくつかの実施形態では、 AKT1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 475 から 483、配列識別番号: 22728 から 22838、または 配列識別番号: 25305 から 25488と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、AKT1 タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 475 から 483 を含む。いくつかの実施形態では、 AKT1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 475 から 483と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、AKT1タンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 475 から 483、配列識別番号: 22728 から 22838、配列識別番号: 25305 から 25488を含む。いくつかの実施形態では、 AKT1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 475 から 483、配列識別番号: 22728 から 22838、または 配列識別番号: 25305 から 25488と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、BRAF タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 484 から 502 を含む。いくつかの実施形態では、 BRAFワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 484 から 502と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、BRAFタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 484 から 502、配列識別番号: 22839 から 22966、配列識別番号: 25489 から 25616を含む。いくつかの実施形態では、 BRAFワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 484 から 502、配列識別番号: 22839 から 22966、または 配列識別番号: 25489 から 25616と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、BRAF タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 484 から 502 を含む。いくつかの実施形態では、 BRAFワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 484 から 502と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、BRAFタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 484 から 502、配列識別番号: 22839 から 22966、配列識別番号: 25489 から 25616を含む。いくつかの実施形態では、 BRAFワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 484 から 502、配列識別番号: 22839 から 22966、または 配列識別番号: 25489 から 25616と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、EGFR タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 503 から 527 を含む。いくつかの実施形態では、 EGFRワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 503 から 527と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、EGFRタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 503 から 527、配列識別番号: 22967 から 23263、配列識別番号: 25617 から 26046を含む。いくつかの実施形態では、 EGFRワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 503 から 527、配列識別番号: 22967 から 23263、または 配列識別番号: 25617 から 26046と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、EGFR タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 503 から 527 を含む。いくつかの実施形態では、 EGFRワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 503 から 527と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、EGFRタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 503 から 527、配列識別番号: 22967 から 23263、配列識別番号: 25617 から 26046を含む。いくつかの実施形態では、 EGFRワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 503 から 527、配列識別番号: 22967 から 23263、または 配列識別番号: 25617 から 26046と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、GTF2I タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 528 から 534 を含む。いくつかの実施形態では、 GTF2Iワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 528 から 534と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、GTF2Iタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 528 から 534、配列識別番号: 23264 から 23415、配列識別番号: 26047 から 26375を含む。いくつかの実施形態では、 GTF2Iワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 528 から 534、配列識別番号: 23264 から 23415、または 配列識別番号: 26047 から 26375と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、GTF2I タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 528 から 534 を含む。いくつかの実施形態では、 GTF2Iワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 528 から 534と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、GTF2Iタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 528 から 534、配列識別番号: 23264 から 23415、配列識別番号: 26047 から 26375を含む。いくつかの実施形態では、 GTF2Iワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 528 から 534、配列識別番号: 23264 から 23415、または 配列識別番号: 26047 から 26375と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、IDH1 タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 535 から 553 を含む。いくつかの実施形態では、 IDH1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 535 から 553と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、IDH1タンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 535 から 553、配列識別番号: 23416 から 23631、配列識別番号: 26376 から 26614を含む。いくつかの実施形態では、 IDH1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 535 から 553、配列識別番号: 23416 から 23631、または 配列識別番号: 26376 から 26614と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、IDH1 タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 535 から 553 を含む。いくつかの実施形態では、 IDH1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 535 から 553と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、IDH1タンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 535 から 553、配列識別番号: 23416 から 23631、配列識別番号: 26376 から 26614を含む。いくつかの実施形態では、 IDH1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 535 から 553、配列識別番号: 23416 から 23631、または 配列識別番号: 26376 から 26614と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、KRAS タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 554 から 615 と 配列識別番号: 759 を含む。いくつかの実施形態では、 KRASワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 554 から 615 または 配列識別番号: 759と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRASタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 554 から 615、配列識別番号: 759、配列識別番号: 23632 から 24129、配列識別番号: 26615 から 27328を含む。いくつかの実施形態では、 KRASワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 554 から 615、配列識別番号: 759、配列識別番号: 23632 から 24129、または 配列識別番号: 26615 から 27328と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、KRAS タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 554 から 615 と 配列識別番号: 759 を含む。いくつかの実施形態では、 KRASワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 554 から 615 または 配列識別番号: 759と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRASタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 554 から 615、配列識別番号: 759、配列識別番号: 23632 から 24129、配列識別番号: 26615 から 27328を含む。いくつかの実施形態では、 KRASワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 554 から 615、配列識別番号: 759、配列識別番号: 23632 から 24129、または 配列識別番号: 26615 から 27328と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、NRAS タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 616 から 645 を含む。いくつかの実施形態では、 NRASワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 616 から 645と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、NRASタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 616 から 645、配列識別番号: 24130 から 24347、配列識別番号: 27329 から 27557を含む。いくつかの実施形態では、 NRASワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 616 から 645、配列識別番号: 24130 から 24347、または 配列識別番号: 27329 から 27557と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、NRAS タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 616 から 645 を含む。いくつかの実施形態では、 NRASワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 616 から 645と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、NRASタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 616 から 645、配列識別番号: 24130 から 24347、配列識別番号: 27329 から 27557を含む。いくつかの実施形態では、 NRASワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 616 から 645、配列識別番号: 24130 から 24347、または 配列識別番号: 27329 から 27557と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、PIK3CA タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 646 から 675 を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CAワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 646 から 675と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PIK3CAタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 646 から 675、配列識別番号: 24348 から 24571、配列識別番号: 27558 から 27889を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CAワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 646 から 675、配列識別番号: 24348 から 24571、または 配列識別番号: 27558 から 27889と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、PIK3CA タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 646 から 675 を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CAワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 646 から 675と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PIK3CAタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 646 から 675、配列識別番号: 24348 から 24571、配列識別番号: 27558 から 27889を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CAワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 646 から 675、配列識別番号: 24348 から 24571、または 配列識別番号: 27558 から 27889と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、PTEN タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 676 から 690 を含む。いくつかの実施形態では、 PTENワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 676 から 690と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PTENタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 676 から 690、配列識別番号: 24572 から 24724、配列識別番号: 27890 から 28052を含む。いくつかの実施形態では、 PTENワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 676 から 690、配列識別番号: 24572 から 24724、または 配列識別番号: 27890 から 28052と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、PTEN タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 676 から 690 を含む。いくつかの実施形態では、 PTENワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 676 から 690と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PTENタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 676 から 690、配列識別番号: 24572 から 24724、配列識別番号: 27890 から 28052を含む。いくつかの実施形態では、 PTENワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 676 から 690、配列識別番号: 24572 から 24724、または 配列識別番号: 27890 から 28052と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、TP53 タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 691 から 758 を含む。いくつかの実施形態では、 TP53ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 691 から 758と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53タンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 691 から 758、配列識別番号: 24725 から 25304、配列識別番号: 28053 から 28795を含む。いくつかの実施形態では、 TP53ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 691 から 758、配列識別番号: 24725 から 25304、または 配列識別番号: 28053 から 28795と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、TP53 タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 691 から 758 を含む。いくつかの実施形態では、 TP53ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 691 から 758と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53タンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 691 から 758、配列識別番号: 24725 から 25304、配列識別番号: 28053 から 28795を含む。いくつかの実施形態では、 TP53ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 691 から 758、配列識別番号: 24725 から 25304、または 配列識別番号: 28053 から 28795と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、RAS タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 554 から 645 と 配列識別番号: 759 を含む。いくつかの実施形態では、 RASワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 554 から 645 または 配列識別番号: 759と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、RASタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 554 から 645、配列識別番号: 759、配列識別番号: 23632 から 24347、配列識別番号: 26615 から 27557を含む。いくつかの実施形態では、 RASワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 554 から 645、配列識別番号: 759、配列識別番号: 23632 から 24347、または 配列識別番号: 26615 から 27557と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、RAS タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 554 から 645 と 配列識別番号: 759 を含む。いくつかの実施形態では、 RASワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 554 から 645 または 配列識別番号: 759と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、RASタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 554 から 645、配列識別番号: 759、配列識別番号: 23632 から 24347、配列識別番号: 26615 から 27557を含む。いくつかの実施形態では、 RASワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 554 から 645、配列識別番号: 759、配列識別番号: 23632 から 24347、または 配列識別番号: 26615 から 27557と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、BRAF V600E タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 484 から 494 を含む。いくつかの実施形態では、 BRAF V600Eワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 484 から 494と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、BRAF V600Eタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 484 から 494、配列識別番号: 22839 から 22876、配列識別番号: 25489 から 25526を含む。いくつかの実施形態では、 BRAF V600Eワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 484 から 494、配列識別番号: 22839 から 22876、または 配列識別番号: 25489 から 25526と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、BRAF V600E タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 484 から 494 を含む。いくつかの実施形態では、 BRAF V600Eワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 484 から 494と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、BRAF V600Eタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 484 から 494、配列識別番号: 22839 から 22876、配列識別番号: 25489 から 25526を含む。いくつかの実施形態では、 BRAF V600Eワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 484 から 494、配列識別番号: 22839 から 22876、または 配列識別番号: 25489 から 25526と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、BRAF V600M タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 495 から 502 を含む。いくつかの実施形態では、 BRAF V600Mワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 495 から 502と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、BRAF V600Mタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 495 から 502、配列識別番号: 22877 から 22966、配列識別番号: 25527 から 25616を含む。いくつかの実施形態では、 BRAF V600Mワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 495 から 502、配列識別番号: 22877 から 22966、または 配列識別番号: 25527 から 25616と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、BRAF V600M タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 495 から 502 を含む。いくつかの実施形態では、 BRAF V600Mワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 495 から 502と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、BRAF V600Mタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 495 から 502、配列識別番号: 22877 から 22966、配列識別番号: 25527 から 25616を含む。いくつかの実施形態では、 BRAF V600Mワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 495 から 502、配列識別番号: 22877 から 22966、または 配列識別番号: 25527 から 25616と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、EGFR A289V タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 503 から 509 を含む。いくつかの実施形態では、 EGFR A289Vワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 503 から 509と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、EGFR A289Vタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 503 から 509、配列識別番号: 22967 から 23000、配列識別番号: 25617 から 25653を含む。いくつかの実施形態では、 EGFR A289Vワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 503 から 509、配列識別番号: 22967 から 23000、または 配列識別番号: 25617 から 25653と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、EGFR A289V タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 503 から 509 を含む。いくつかの実施形態では、 EGFR A289Vワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 503 から 509と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、EGFR A289Vタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 503 から 509、配列識別番号: 22967 から 23000、配列識別番号: 25617 から 25653を含む。いくつかの実施形態では、 EGFR A289Vワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 503 から 509、配列識別番号: 22967 から 23000、または 配列識別番号: 25617 から 25653と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、EGFR G598V タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 510 から 519 を含む。いくつかの実施形態では、 EGFR G598Vワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 510 から 519と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、EGFR G598Vタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 510 から 519、配列識別番号: 23001 から 23089、配列識別番号: 25654 から 25794を含む。いくつかの実施形態では、 EGFR G598Vワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 510 から 519、配列識別番号: 23001 から 23089、または 配列識別番号: 25654 から 25794と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、EGFR G598V タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 510 から 519 を含む。いくつかの実施形態では、 EGFR G598Vワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 510 から 519と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、EGFR G598Vタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 510 から 519、配列識別番号: 23001 から 23089、配列識別番号: 25654 から 25794を含む。いくつかの実施形態では、 EGFR G598Vワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 510 から 519、配列識別番号: 23001 から 23089、または 配列識別番号: 25654 から 25794と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、EGFR L858R タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 520 から 527 を含む。いくつかの実施形態では、 EGFR L858Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 520 から 527と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、EGFR L858Rタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 520 から 527、配列識別番号: 23090 から 23263、配列識別番号: 25795 から 26046を含む。いくつかの実施形態では、 EGFR L858Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 520 から 527、配列識別番号: 23090 から 23263、または 配列識別番号: 25795 から 26046と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、EGFR L858R タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 520 から 527 を含む。いくつかの実施形態では、 EGFR L858Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 520 から 527と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、EGFR L858Rタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 520 から 527、配列識別番号: 23090 から 23263、配列識別番号: 25795 から 26046を含む。いくつかの実施形態では、 EGFR L858Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 520 から 527、配列識別番号: 23090 から 23263、または 配列識別番号: 25795 から 26046と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、IDH1 R132H タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 543 から 553 を含む。いくつかの実施形態では、 IDH1 R132Hワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 543 から 553と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、IDH1 R132Hタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 543 から 553、配列識別番号: 23505 から 23631、配列識別番号: 26469 から 26614を含む。いくつかの実施形態では、 IDH1 R132Hワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 543 から 553、配列識別番号: 23505 から 23631、または 配列識別番号: 26469 から 26614と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、IDH1 R132H タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 543 から 553 を含む。いくつかの実施形態では、 IDH1 R132Hワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 543 から 553と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、IDH1 R132Hタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 543 から 553、配列識別番号: 23505 から 23631、配列識別番号: 26469 から 26614を含む。いくつかの実施形態では、 IDH1 R132Hワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 543 から 553、配列識別番号: 23505 から 23631、または 配列識別番号: 26469 から 26614と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、IDH1 R132C タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 535 から 542 を含む。いくつかの実施形態では、 IDH1 R132Cワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 535 から 542と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、IDH1 R132Cタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 535 から 542、配列識別番号: 23416 から 23504、配列識別番号: 26376 から 26468を含む。いくつかの実施形態では、 IDH1 R132Cワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 535 から 542、配列識別番号: 23416 から 23504、または 配列識別番号: 26376 から 26468と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、IDH1 R132C タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 535 から 542 を含む。いくつかの実施形態では、 IDH1 R132Cワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 535 から 542と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、IDH1 R132Cタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 535 から 542、配列識別番号: 23416 から 23504、配列識別番号: 26376 から 26468を含む。いくつかの実施形態では、 IDH1 R132Cワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 535 から 542、配列識別番号: 23416 から 23504、または 配列識別番号: 26376 から 26468と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、KRAS G12D タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 569 から 577 を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Dワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 569 から 577と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G12Dタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 569 から 577、配列識別番号: 23750 から 23809、配列識別番号: 26757 から 26833を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Dワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 569 から 577、配列識別番号: 23750 から 23809、または 配列識別番号: 26757 から 26833と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、KRAS G12D タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 569 から 577 を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Dワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 569 から 577と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G12Dタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 569 から 577、配列識別番号: 23750 から 23809、配列識別番号: 26757 から 26833を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Dワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 569 から 577、配列識別番号: 23750 から 23809、または 配列識別番号: 26757 から 26833と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、KRAS G12V タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 596 から 605 を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Vワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 596 から 605と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G12Vタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 596 から 605、配列識別番号: 23958 から 24025、配列識別番号: 27057 から 27148を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Vワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 596 から 605、配列識別番号: 23958 から 24025、または 配列識別番号: 27057 から 27148と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、KRAS G12V タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 596 から 605 を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Vワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 596 から 605と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G12Vタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 596 から 605、配列識別番号: 23958 から 24025、配列識別番号: 27057 から 27148を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Vワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 596 から 605、配列識別番号: 23958 から 24025、または 配列識別番号: 27057 から 27148と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、KRAS G12R タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 578 から 587 を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 578 から 587と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G12Rタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 578 から 587、配列識別番号: 23810 から 23889、配列識別番号: 26834 から 26967を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 578 から 587、配列識別番号: 23810 から 23889、または 配列識別番号: 26834 から 26967と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、KRAS G12R タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 578 から 587 を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 578 から 587と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G12Rタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 578 から 587、配列識別番号: 23810 から 23889、配列識別番号: 26834 から 26967を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 578 から 587、配列識別番号: 23810 から 23889、または 配列識別番号: 26834 から 26967と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、KRAS G12C タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 561 から 568 を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Cワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 561 から 568と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G12Cタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 561 から 568、配列識別番号: 23700 から 23749、配列識別番号: 26702 から 26756を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Cワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 561 から 568、配列識別番号: 23700 から 23749、または 配列識別番号: 26702 から 26756と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、KRAS G12C タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 561 から 568 を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Cワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 561 から 568と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G12Cタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 561 から 568、配列識別番号: 23700 から 23749、配列識別番号: 26702 から 26756を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Cワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 561 から 568、配列識別番号: 23700 から 23749、または 配列識別番号: 26702 から 26756と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、KRAS G13D タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 606 から 615 と 配列識別番号: 759 を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G13Dワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 606 から 615 または 配列識別番号: 759と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G13Dタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 606 から 615、配列識別番号: 759、配列識別番号: 24026 から 24129、配列識別番号: 27149 から 27328を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G13Dワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 606 から 615、配列識別番号: 759、配列識別番号: 24026 から 24129、または 配列識別番号: 27149 から 27328と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、KRAS G13D タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 606 から 615 と 配列識別番号: 759 を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G13Dワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 606 から 615 または 配列識別番号: 759と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G13Dタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 606 から 615、配列識別番号: 759、配列識別番号: 24026 から 24129、配列識別番号: 27149 から 27328を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G13Dワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 606 から 615、配列識別番号: 759、配列識別番号: 24026 から 24129、または 配列識別番号: 27149 から 27328と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、KRAS G12A タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 554 から 560 を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Aワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 554 から 560と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G12Aタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 554 から 560、配列識別番号: 23632 から 23699、配列識別番号: 26615 から 26701を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Aワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 554 から 560、配列識別番号: 23632 から 23699、または 配列識別番号: 26615 から 26701と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、KRAS G12A タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 554 から 560 を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Aワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 554 から 560と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G12Aタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 554 から 560、配列識別番号: 23632 から 23699、配列識別番号: 26615 から 26701を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Aワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 554 から 560、配列識別番号: 23632 から 23699、または 配列識別番号: 26615 から 26701と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、KRAS G12S タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 588 から 595 を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Sワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 588 から 595と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G12Sタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 588 から 595、配列識別番号: 23890 から 23957、配列識別番号: 26968 から 27056を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Sワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 588 から 595、配列識別番号: 23890 から 23957、または 配列識別番号: 26968 から 27056と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、KRAS G12S タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 588 から 595 を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Sワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 588 から 595と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KRAS G12Sタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 588 から 595、配列識別番号: 23890 から 23957、配列識別番号: 26968 から 27056を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Sワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 588 から 595、配列識別番号: 23890 から 23957、または 配列識別番号: 26968 から 27056と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、NRAS Q61R タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 634 から 645 を含む。いくつかの実施形態では、 NRAS Q61Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 634 から 645と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、NRAS Q61Rタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 634 から 645、配列識別番号: 24280 から 24347、配列識別番号: 27490 から 27557を含む。いくつかの実施形態では、 NRAS Q61Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 634 から 645、配列識別番号: 24280 から 24347、または 配列識別番号: 27490 から 27557と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、NRAS Q61R タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 634 から 645 を含む。いくつかの実施形態では、 NRAS Q61Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 634 から 645と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、NRAS Q61Rタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 634 から 645、配列識別番号: 24280 から 24347、配列識別番号: 27490 から 27557を含む。いくつかの実施形態では、 NRAS Q61Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 634 から 645、配列識別番号: 24280 から 24347、または 配列識別番号: 27490 から 27557と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、NRAS Q61K タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 616 から 624 を含む。いくつかの実施形態では、 NRAS Q61Kワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 616 から 624と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、NRAS Q61Kタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 616 から 624、配列識別番号: 24130 から 24194、配列識別番号: 27329 から 27396を含む。いくつかの実施形態では、 NRAS Q61Kワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 616 から 624、配列識別番号: 24130 から 24194、または 配列識別番号: 27329 から 27396と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、NRAS Q61K タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 616 から 624 を含む。いくつかの実施形態では、 NRAS Q61Kワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 616 から 624と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、NRAS Q61Kタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 616 から 624、配列識別番号: 24130 から 24194、配列識別番号: 27329 から 27396を含む。いくつかの実施形態では、 NRAS Q61Kワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 616 から 624、配列識別番号: 24130 から 24194、または 配列識別番号: 27329 から 27396と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、NRAS Q61L タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 625 から 633 を含む。いくつかの実施形態では、 NRAS Q61Lワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 625 から 633と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、NRAS Q61Lタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 625 から 633、配列識別番号: 24195 から 24279、配列識別番号: 27397 から 27489を含む。いくつかの実施形態では、 NRAS Q61Lワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 625 から 633、配列識別番号: 24195 から 24279、または 配列識別番号: 27397 から 27489と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、NRAS Q61L タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 625 から 633 を含む。いくつかの実施形態では、 NRAS Q61Lワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 625 から 633と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、NRAS Q61Lタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 625 から 633、配列識別番号: 24195 から 24279、配列識別番号: 27397 から 27489を含む。いくつかの実施形態では、 NRAS Q61Lワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 625 から 633、配列識別番号: 24195 から 24279、または 配列識別番号: 27397 から 27489と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、PIK3CA E542K タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 646 から 650 を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CA E542Kワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 646 から 650と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PIK3CA E542Kタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 646 から 650、配列識別番号: 24348 から 24362、配列識別番号: 27558 から 27572を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CA E542Kワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 646 から 650、配列識別番号: 24348 から 24362、または 配列識別番号: 27558 から 27572と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、PIK3CA E542K タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 646 から 650 を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CA E542Kワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 646 から 650と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PIK3CA E542Kタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 646 から 650、配列識別番号: 24348 から 24362、配列識別番号: 27558 から 27572を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CA E542Kワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 646 から 650、配列識別番号: 24348 から 24362、または 配列識別番号: 27558 から 27572と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、PIK3CA E545K タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 651 から 657 を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CA E545Kワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 651 から 657と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PIK3CA E545Kタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 651 から 657、配列識別番号: 24363 から 24388、配列識別番号: 27573 から 27599を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CA E545Kワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 651 から 657、配列識別番号: 24363 から 24388、または 配列識別番号: 27573 から 27599と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、PIK3CA E545K タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 651 から 657 を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CA E545Kワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 651 から 657と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PIK3CA E545Kタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 651 から 657、配列識別番号: 24363 から 24388、配列識別番号: 27573 から 27599を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CA E545Kワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 651 から 657、配列識別番号: 24363 から 24388、または 配列識別番号: 27573 から 27599と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、PIK3CA H1047R タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 658 から 667 を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CA H1047Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 658 から 667と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PIK3CA H1047Rタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 658 から 667、配列識別番号: 24389 から 24472、配列識別番号: 27600 から 27683を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CA H1047Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 658 から 667、配列識別番号: 24389 から 24472、または 配列識別番号: 27600 から 27683と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、PIK3CA H1047R タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 658 から 667 を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CA H1047Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 658 から 667と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PIK3CA H1047Rタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 658 から 667、配列識別番号: 24389 から 24472、配列識別番号: 27600 から 27683を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CA H1047Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 658 から 667、配列識別番号: 24389 から 24472、または 配列識別番号: 27600 から 27683と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、TP53 R158L タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 700 から 707 を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R158Lワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 700 から 707と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R158Lタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 700 から 707、配列識別番号: 24784 から 24927、配列識別番号: 28132 から 28372を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R158Lワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 700 から 707、配列識別番号: 24784 から 24927、または 配列識別番号: 28132 から 28372と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、TP53 R158L タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 700 から 707 を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R158Lワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 700 から 707と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R158Lタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 700 から 707、配列識別番号: 24784 から 24927、配列識別番号: 28132 から 28372を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R158Lワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 700 から 707、配列識別番号: 24784 から 24927、または 配列識別番号: 28132 から 28372と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、TP53 R175H タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 708 から 717 を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R175Hワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 708 から 717と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R175Hタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 24928 から 24954、配列識別番号: 28373 から 28410を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R175Hワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 24928 から 24954、または 配列識別番号: 28373 から 28410と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、TP53 R175H タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 708 から 717 を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R175Hワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 708 から 717と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R175Hタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 24928 から 24954、配列識別番号: 28373 から 28410を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R175Hワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 24928 から 24954、または 配列識別番号: 28373 から 28410と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、TP53 R248Q タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 718 から 723 を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R248Qワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 718 から 723と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R248Qタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 718 から 723、配列識別番号: 24955 から 25010、配列識別番号: 28411 から 28468を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R248Qワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 718 から 723、配列識別番号: 24955 から 25010、または 配列識別番号: 28411 から 28468と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、TP53 R248Q タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 718 から 723 を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R248Qワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 718 から 723と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R248Qタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 718 から 723、配列識別番号: 24955 から 25010、配列識別番号: 28411 から 28468を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R248Qワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 718 から 723、配列識別番号: 24955 から 25010、または 配列識別番号: 28411 から 28468と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、TP53 R273C タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 733 から 739 を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R273Cワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 733 から 739と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R273Cタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 733 から 739、配列識別番号: 25109 から 25117、配列識別番号: 28572 から 28580を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R273Cワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 733 から 739、配列識別番号: 25109 から 25117、または 配列識別番号: 28572 から 28580と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、TP53 R273C タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 733 から 739 を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R273Cワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 733 から 739と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R273Cタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 733 から 739、配列識別番号: 25109 から 25117、配列識別番号: 28572 から 28580を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R273Cワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 733 から 739、配列識別番号: 25109 から 25117、または 配列識別番号: 28572 から 28580と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、TP53 R273H タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 740 から 748 を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R273Hワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 740 から 748と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R273Hタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 740 から 748、配列識別番号: 25118 から 25206、配列識別番号: 28581 から 28697を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R273Hワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 740 から 748、配列識別番号: 25118 から 25206、または 配列識別番号: 28581 から 28697と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、TP53 R273H タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 740 から 748 を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R273Hワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 740 から 748と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R273Hタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 740 から 748、配列識別番号: 25118 から 25206、配列識別番号: 28581 から 28697を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R273Hワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 740 から 748、配列識別番号: 25118 から 25206、または 配列識別番号: 28581 から 28697と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、TP53 R248W タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 724 から 732 を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R248Wワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 724 から 732と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R248Wタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 724 から 732、配列識別番号: 25011 から 25108、配列識別番号: 28469 から 28571を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R248Wワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 724 から 732、配列識別番号: 25011 から 25108、または 配列識別番号: 28469 から 28571と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、TP53 R248W タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 724 から 732 を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R248Wワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 724 から 732と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R248Wタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 724 から 732、配列識別番号: 25011 から 25108、配列識別番号: 28469 から 28571を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R248Wワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 724 から 732、配列識別番号: 25011 から 25108、または 配列識別番号: 28469 から 28571と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、TP53 R282W タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 749 から 750 を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R282Wワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 749 から 750と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R282Wタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 749 から 750、配列識別番号: 25207 から 25218、配列識別番号: 28698 から 28709を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R282Wワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 749 から 750、配列識別番号: 25207 から 25218、または 配列識別番号: 28698 から 28709と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、TP53 R282W タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 749 から 750 を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R282Wワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 749 から 750と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 R282Wタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 749 から 750、配列識別番号: 25207 から 25218、配列識別番号: 28698 から 28709を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R282Wワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 749 から 750、配列識別番号: 25207 から 25218、または 配列識別番号: 28698 から 28709と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、TP53 Y220C タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 751 から 758 を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 Y220Cワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 751 から 758と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 Y220Cタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 751 から 758、配列識別番号: 25219 から 25304、配列識別番号: 28710 から 28795を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 Y220Cワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 751 から 758、配列識別番号: 25219 から 25304、または 配列識別番号: 28710 から 28795と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、TP53 Y220C タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 751 から 758 を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 Y220Cワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 751 から 758と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 Y220Cタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 751 から 758、配列識別番号: 25219 から 25304、配列識別番号: 28710 から 28795を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 Y220Cワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 751 から 758、配列識別番号: 25219 から 25304、または 配列識別番号: 28710 から 28795と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、PIK3CA R88Q タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 668 から 675 を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CA R88Qワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 668 から 675と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PIK3CA R88Qタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 668 から 675、配列識別番号: 24473 から 24571、配列識別番号: 27684 から 27889を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CA R88Qワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 668 から 675、配列識別番号: 24473 から 24571、または 配列識別番号: 27684 から 27889と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、PIK3CA R88Q タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 668 から 675 を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CA R88Qワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 668 から 675と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PIK3CA R88Qタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 668 から 675、配列識別番号: 24473 から 24571、配列識別番号: 27684 から 27889を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CA R88Qワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 668 から 675、配列識別番号: 24473 から 24571、または 配列識別番号: 27684 から 27889と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、GTF2I L424H タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 528 から 534 を含む。いくつかの実施形態では、 GTF2I L424Hワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 528 から 534と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、GTF2I L424Hタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 528 から 534、配列識別番号: 23264 から 23415、配列識別番号: 26047 から 26375を含む。いくつかの実施形態では、 GTF2I L424Hワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 528 から 534、配列識別番号: 23264 から 23415、または 配列識別番号: 26047 から 26375と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、GTF2I L424H タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 528 から 534 を含む。いくつかの実施形態では、 GTF2I L424Hワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 528 から 534と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、GTF2I L424Hタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 528 から 534、配列識別番号: 23264 から 23415、配列識別番号: 26047 から 26375を含む。いくつかの実施形態では、 GTF2I L424Hワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 528 から 534、配列識別番号: 23264 から 23415、または 配列識別番号: 26047 から 26375と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、PTEN R130Q タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 681 から 690 を含む。いくつかの実施形態では、 PTEN R130Qワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 681 から 690と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PTEN R130Qタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 681 から 690、配列識別番号: 24659 から 24724、配列識別番号: 27980 から 28052を含む。いくつかの実施形態では、 PTEN R130Qワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 681 から 690、配列識別番号: 24659 から 24724、または 配列識別番号: 27980 から 28052と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、PTEN R130Q タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 681 から 690 を含む。いくつかの実施形態では、 PTEN R130Qワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 681 から 690と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PTEN R130Qタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 681 から 690、配列識別番号: 24659 から 24724、配列識別番号: 27980 から 28052を含む。いくつかの実施形態では、 PTEN R130Qワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 681 から 690、配列識別番号: 24659 から 24724、または 配列識別番号: 27980 から 28052と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、AKT1 E17K タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 475 から 483 を含む。いくつかの実施形態では、 AKT1 E17Kワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 475 から 483と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、AKT1 E17Kタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 475 から 483、配列識別番号: 22728 から 22838、配列識別番号: 25305 から 25488を含む。いくつかの実施形態では、 AKT1 E17Kワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 475 から 483、配列識別番号: 22728 から 22838、または 配列識別番号: 25305 から 25488と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、AKT1 E17K タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 475 から 483 を含む。いくつかの実施形態では、 AKT1 E17Kワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 475 から 483と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、AKT1 E17Kタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 475 から 483、配列識別番号: 22728 から 22838、配列識別番号: 25305 から 25488を含む。いくつかの実施形態では、 AKT1 E17Kワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 475 から 483、配列識別番号: 22728 から 22838、または 配列識別番号: 25305 から 25488と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、PTEN R130G タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 676 から 680 を含む。いくつかの実施形態では、 PTEN R130Gワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 676 から 680と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PTEN R130Gタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 676 から 680、配列識別番号: 24572 から 24658、配列識別番号: 27890 から 27979を含む。いくつかの実施形態では、 PTEN R130Gワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 676 から 680、配列識別番号: 24572 から 24658、または 配列識別番号: 27890 から 27979と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、PTEN R130G タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 676 から 680 を含む。いくつかの実施形態では、 PTEN R130Gワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 676 から 680と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PTEN R130Gタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 676 から 680、配列識別番号: 24572 から 24658、配列識別番号: 27890 から 27979を含む。いくつかの実施形態では、 PTEN R130Gワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 676 から 680、配列識別番号: 24572 から 24658、または 配列識別番号: 27890 から 27979と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、TP53 H179R タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 691 から 699 を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 H179Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 691 から 699と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 H179Rタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1以上の配列識別番号: 691 から 699、配列識別番号: 24725 から 24783、配列識別番号: 28053 から 28131を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 H179Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 691 から 699、配列識別番号: 24725 から 24783、または 配列識別番号: 28053 から 28131と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、TP53 H179R タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 691 から 699 を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 H179Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 691 から 699と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TP53 H179Rタンパク質の変異に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2以上の配列識別番号: 691 から 699、配列識別番号: 24725 から 24783、配列識別番号: 28053 から 28131を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 H179Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 691 から 699、配列識別番号: 24725 から 24783、または 配列識別番号: 28053 から 28131と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、膵がん に対するMHCクラスIIワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 569 から 574、配列識別番号: 578 から 584、配列識別番号: 596 から 599、配列識別番号: 601 から 603 を含む。いくつかの実施形態では、 膵がんワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 569 から 574、配列識別番号: 578 から 584、配列識別番号: 596 から 599、または 配列識別番号: 601 から 603と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、膵がん に対するMHCクラスIIワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 569 から 574、配列識別番号: 578 から 584、配列識別番号: 596 から 599、配列識別番号: 601 から 603 を含む。いくつかの実施形態では、 膵がんワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 569 から 574、配列識別番号: 578 から 584、配列識別番号: 596 から 599、または 配列識別番号: 601 から 603と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、皮膚がん に対するMHCクラスIIワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 495 から 499、配列識別番号: 616、配列識別番号: 619 から 620、配列識別番号: 625 から 628、配列識別番号: 634、配列識別番号: 637、配列識別番号: 639 から 640 を含む。いくつかの実施形態では、 皮膚がんワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 495 から 499、配列識別番号: 616、配列識別番号: 619 から 620、配列識別番号: 625 から 628、配列識別番号: 634、配列識別番号: 637、または 配列識別番号: 639 から 640と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、皮膚がん に対するMHCクラスIIワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 495 から 499、配列識別番号: 616、配列識別番号: 619 から 620、配列識別番号: 625 から 628、配列識別番号: 634、配列識別番号: 637、配列識別番号: 639 から 640 を含む。いくつかの実施形態では、 皮膚がんワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 495 から 499、配列識別番号: 616、配列識別番号: 619 から 620、配列識別番号: 625 から 628、配列識別番号: 634、配列識別番号: 637、または 配列識別番号: 639 から 640と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、甲状腺がん に対するMHCクラスIIワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 616、配列識別番号: 619 から 620、配列識別番号: 634、配列識別番号: 637、配列識別番号: 640 を含む。いくつかの実施形態では、 甲状腺がんワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 616、配列識別番号: 619 から 620、配列識別番号: 634、配列識別番号: 637、または 配列識別番号: 640と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、甲状腺がん に対するMHCクラスIIワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 616、配列識別番号: 619 から 620、配列識別番号: 634、配列識別番号: 637、配列識別番号: 640 を含む。いくつかの実施形態では、 甲状腺がんワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 616、配列識別番号: 619 から 620、配列識別番号: 634、配列識別番号: 637、または 配列識別番号: 640と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、脳腫瘍 に対するMHCクラスIIワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 508、配列識別番号: 510、配列識別番号: 512、配列識別番号: 514、配列識別番号: 535 から 537、配列識別番号: 539、配列識別番号: 543 から 551、配列識別番号: 708、配列識別番号: 712、配列識別番号: 738 を含む。いくつかの実施形態では、 脳腫瘍ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 508、配列識別番号: 510、配列識別番号: 512、配列識別番号: 514、配列識別番号: 535 から 537、配列識別番号: 539、配列識別番号: 543 から 551、配列識別番号: 708、配列識別番号: 712、または 配列識別番号: 738と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、脳腫瘍 に対するMHCクラスIIワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 508、配列識別番号: 510、配列識別番号: 512、配列識別番号: 514、配列識別番号: 535 から 537、配列識別番号: 539、配列識別番号: 543 から 551、配列識別番号: 708、配列識別番号: 712、配列識別番号: 738 を含む。いくつかの実施形態では、 脳腫瘍ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 508、配列識別番号: 510、配列識別番号: 512、配列識別番号: 514、配列識別番号: 535 から 537、配列識別番号: 539、配列識別番号: 543 から 551、配列識別番号: 708、配列識別番号: 712、または 配列識別番号: 738と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、直腸結腸がん に対するMHCクラスIIワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 569 から 575、配列識別番号: 596 から 599、配列識別番号: 601 から 604、配列識別番号: 606 から 612、配列識別番号: 656、配列識別番号: 708、配列識別番号: 712、配列識別番号: 759 を含む。いくつかの実施形態では、 直腸結腸がんワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 569 から 575、配列識別番号: 596 から 599、配列識別番号: 601 から 604、配列識別番号: 606 から 612、配列識別番号: 656、配列識別番号: 708、配列識別番号: 712、または 配列識別番号: 759と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、直腸結腸がん に対するMHCクラスIIワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 569 から 575、配列識別番号: 596 から 599、配列識別番号: 601 から 604、配列識別番号: 606 から 612、配列識別番号: 656、配列識別番号: 708、配列識別番号: 712、配列識別番号: 759 を含む。いくつかの実施形態では、 直腸結腸がんワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 569 から 575、配列識別番号: 596 から 599、配列識別番号: 601 から 604、配列識別番号: 606 から 612、配列識別番号: 656、配列識別番号: 708、配列識別番号: 712、または 配列識別番号: 759と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、気管支がんと肺がん に対するMHCクラスIIワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 520 から 521、配列識別番号: 523 から 524、配列識別番号: 554 から 556、配列識別番号: 558、配列識別番号: 561、配列識別番号: 563 から 565、配列識別番号: 569 から 573、配列識別番号: 596 から 600、配列識別番号: 650、配列識別番号: 656、配列識別番号: 700 から 705 を含む。いくつかの実施形態では、 気管支がんと肺がんワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 520 から 521、配列識別番号: 523 から 524、配列識別番号: 554 から 556、配列識別番号: 558、配列識別番号: 561、配列識別番号: 563 から 565、配列識別番号: 569 から 573、配列識別番号: 596 から 600、配列識別番号: 650、配列識別番号: 656、または 配列識別番号: 700 から 705と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、気管支がんと肺がん に対するMHCクラスIIワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 520 から 521、配列識別番号: 523 から 524、配列識別番号: 554 から 556、配列識別番号: 558、配列識別番号: 561、配列識別番号: 563 から 565、配列識別番号: 569 から 573、配列識別番号: 596 から 600、配列識別番号: 650、配列識別番号: 656、配列識別番号: 700 から 705 を含む。いくつかの実施形態では、 気管支がんと肺がんワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 520 から 521、配列識別番号: 523 から 524、配列識別番号: 554 から 556、配列識別番号: 558、配列識別番号: 561、配列識別番号: 563 から 565、配列識別番号: 569 から 573、配列識別番号: 596 から 600、配列識別番号: 650、配列識別番号: 656、または 配列識別番号: 700 から 705と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、乳がん に対するMHCクラスIIワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 646 から 667、配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 733 から 748 を含む。いくつかの実施形態では、 乳がんワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 646 から 667、配列識別番号: 708 から 717、または 配列識別番号: 733 から 748と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、乳がん に対するMHCクラスIIワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 646 から 667、配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 733 から 748 を含む。いくつかの実施形態では、 乳がんワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 646 から 667、配列識別番号: 708 から 717、または 配列識別番号: 733 から 748と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、卵巣がん に対するMHCクラスIIワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 646 から 667、配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 733 から 748 を含む。いくつかの実施形態では、 卵巣がんワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 646 から 667、配列識別番号: 708 から 717、または 配列識別番号: 733 から 748と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、卵巣がん に対するMHCクラスIIワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 646 から 667、配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 733 から 748 を含む。いくつかの実施形態では、 卵巣がんワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 646 から 667、配列識別番号: 708 から 717、または 配列識別番号: 733 から 748と同一のアミノ酸配列を含む。
表2は、それぞれの配列識別番号、配列識別番号に対応するアミノ酸配列、ペプチドの結合コアに対応するアミノ酸配列、タンパク質標的（特定の変異を伴う）、シードアミノ酸配列（すなわち、野生型KRASフラグメントのアミノ酸配列）、結合コアのシードアミノ酸配列、および1、4、6、および9位のヘテロクリティックペプチドのアミノ酸置換（存在する場合）を含む、本書に記載されるMHCクラスIIペプチド配列をまとめたものである。表2には、配列識別番号: 475 から 759 を含むペプチド配列が含まれている。配列識別番号: 475 から 759（表2）は組換えペプチドをエンコードする。いくつかの実施形態では、表2（配列識別番号: 475 から 759）に列挙されたペプチドの任意の組み合わせを用いて、約2～約40個のペプチドを有する単一標的（個別）または複合ペプチドワクチンを製造することができる。いくつかの実施形態では、複合ワクチン中のペプチドのいずれか（ペプチド475 から 759；配列識別番号: 475 から 759）には、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 475 から 759と同一のアミノ酸配列を含む。
MHCクラスII ワクチンペプチドのその他のアミノ酸配列は、配列リスト（配列識別番号: 22728 から 28795）に記載されている。いくつかの実施形態では、本書で（配列識別番号: 475 から 759 と 配列識別番号: 22728 から 28795）開示されたペプチドの任意の組み合わせを用いて、約2～40個のペプチドを有する複合ペプチドワクチンを製造することができる。いくつかの実施形態では、複合ワクチン中のペプチド(配列識別番号: 475 から 759 と 配列識別番号: 22728 から 28795)のいずれかは、配列識別番号: 475 から 759 または 配列識別番号: 22728 から 28795と80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％同一のアミノ酸配列を含む、または含有する。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む AKT1 タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、AKT1 タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 1 から 18、配列識別番号: 459、配列識別番号: 475 から 483、配列識別番号: 760 から 1768、配列識別番号: 22386 から 22396、配列識別番号: 22728 から 22838、配列識別番号: 25305 から 25488 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 AKT1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 1 から 18、配列識別番号: 459、配列識別番号: 475 から 483、配列識別番号: 760 から 1768、配列識別番号: 22386 から 22396、配列識別番号: 22728 から 22838、または 配列識別番号: 25305 から 25488と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む BRAF タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、BRAF タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 19 から 50、配列識別番号: 484 から 502、配列識別番号: 1769 から 3170、配列識別番号: 22397 から 22417、配列識別番号: 22839 から 22966、配列識別番号: 25489 から 25616 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 BRAFワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 19 から 50、配列識別番号: 484 から 502、配列識別番号: 1769 から 3170、配列識別番号: 22397 から 22417、配列識別番号: 22839 から 22966、または 配列識別番号: 25489 から 25616と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む EGFR タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、EGFR タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 51 から 98、配列識別番号: 503 から 527、配列識別番号: 3171 から 5756、配列識別番号: 22418 から 22449、配列識別番号: 22967 から 23263、配列識別番号: 25617 から 26046 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 EGFRワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 51 から 98、配列識別番号: 503 から 527、配列識別番号: 3171 から 5756、配列識別番号: 22418 から 22449、配列識別番号: 22967 から 23263、または 配列識別番号: 25617 から 26046と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む GTF2I タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、GTF2I タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 99 から 118、配列識別番号: 528 から 534、配列識別番号: 5757 から 6498、配列識別番号: 22450 から 22466、配列識別番号: 23264 から 23415、配列識別番号: 26047 から 26375 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 GTF2Iワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 99 から 118、配列識別番号: 528 から 534、配列識別番号: 5757 から 6498、配列識別番号: 22450 から 22466、配列識別番号: 23264 から 23415、または 配列識別番号: 26047 から 26375と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む IDH1 タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、IDH1 タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 119 から 140、配列識別番号: 460 から 461、配列識別番号: 535 から 553、配列識別番号: 6499 から 7098、配列識別番号: 22467 から 22488、配列識別番号: 23416 から 23631、配列識別番号: 26376 から 26614 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 IDH1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 119 から 140、配列識別番号: 460 から 461、配列識別番号: 535 から 553、配列識別番号: 6499 から 7098、配列識別番号: 22467 から 22488、配列識別番号: 23416 から 23631、または 配列識別番号: 26376 から 26614と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む KRAS タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、KRAS タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 141 から 229、配列識別番号: 462 から 466、配列識別番号: 554 から 615、配列識別番号: 759、配列識別番号: 7099 から 12814、配列識別番号: 22489 から 22558、配列識別番号: 23632 から 24129、配列識別番号: 26615 から 27328 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 KRASワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 141 から 229、配列識別番号: 462 から 466、配列識別番号: 554 から 615、配列識別番号: 759、配列識別番号: 7099 から 12814、配列識別番号: 22489 から 22558、配列識別番号: 23632 から 24129、または 配列識別番号: 26615 から 27328と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む NRAS タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、NRAS タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 230 から 272、配列識別番号: 616 から 645、配列識別番号: 12815 から 14836、配列識別番号: 22559 から 22582、配列識別番号: 24130 から 24347、配列識別番号: 27329 から 27557 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 NRASワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 230 から 272、配列識別番号: 616 から 645、配列識別番号: 12815 から 14836、配列識別番号: 22559 から 22582、配列識別番号: 24130 から 24347、または 配列識別番号: 27329 から 27557と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む PIK3CA タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、PIK3CA タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 273 から 322、配列識別番号: 467 から 468、配列識別番号: 646 から 675、配列識別番号: 14837 から 17342、配列識別番号: 22583 から 22622、配列識別番号: 24348 から 24571、配列識別番号: 27558 から 27889 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CAワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 273 から 322、配列識別番号: 467 から 468、配列識別番号: 646 から 675、配列識別番号: 14837 から 17342、配列識別番号: 22583 から 22622、配列識別番号: 24348 から 24571、または 配列識別番号: 27558 から 27889と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む PTEN タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、PTEN タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 323 から 353、配列識別番号: 676 から 690、配列識別番号: 17343 から 18205、配列識別番号: 22623 から 22636、配列識別番号: 24572 から 24724、配列識別番号: 27890 から 28052 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 PTENワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 323 から 353、配列識別番号: 676 から 690、配列識別番号: 17343 から 18205、配列識別番号: 22623 から 22636、配列識別番号: 24572 から 24724、または 配列識別番号: 27890 から 28052と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む TP53 タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、TP53 タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 354 から 458、配列識別番号: 469 から 474、配列識別番号: 691 から 758、配列識別番号: 18206 から 22385、配列識別番号: 22637 から 22727、配列識別番号: 24725 から 25304、配列識別番号: 28053 から 28795 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 TP53ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 354 から 458、配列識別番号: 469 から 474、配列識別番号: 691 から 758、配列識別番号: 18206 から 22385、配列識別番号: 22637 から 22727、配列識別番号: 24725 から 25304、または 配列識別番号: 28053 から 28795と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む RAS タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、RAS タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 141 から 272、配列識別番号: 462 から 466、配列識別番号: 554 から 645、配列識別番号: 759、配列識別番号: 7099 から 14836、配列識別番号: 22489 から 22582、配列識別番号: 23632 から 24347、配列識別番号: 26615 から 27557 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 RASワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 141 から 272、配列識別番号: 462 から 466、配列識別番号: 554 から 645、配列識別番号: 759、配列識別番号: 7099 から 14836、配列識別番号: 22489 から 22582、配列識別番号: 23632 から 24347、または 配列識別番号: 26615 から 27557と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む BRAF V600E タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、BRAF V600E タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 19 から 33、配列識別番号: 484 から 494、配列識別番号: 1769 から 2329、配列識別番号: 22397 から 22405、配列識別番号: 22839 から 22876、配列識別番号: 25489 から 25526 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 BRAF V600Eワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 19 から 33、配列識別番号: 484 から 494、配列識別番号: 1769 から 2329、配列識別番号: 22397 から 22405、配列識別番号: 22839 から 22876、または 配列識別番号: 25489 から 25526と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む BRAF V600M タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、BRAF V600M タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 34 から 50、配列識別番号: 495 から 502、配列識別番号: 2330 から 3170、配列識別番号: 22406 から 22417、配列識別番号: 22877 から 22966、配列識別番号: 25527 から 25616 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 BRAF V600Mワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 34 から 50、配列識別番号: 495 から 502、配列識別番号: 2330 から 3170、配列識別番号: 22406 から 22417、配列識別番号: 22877 から 22966、または 配列識別番号: 25527 から 25616と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む EGFR A289V タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、EGFR A289V タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 51 から 66、配列識別番号: 503 から 509、配列識別番号: 3171 から 4055、配列識別番号: 22418 から 22430、配列識別番号: 22967 から 23000、配列識別番号: 25617 から 25653 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 EGFR A289Vワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 51 から 66、配列識別番号: 503 から 509、配列識別番号: 3171 から 4055、配列識別番号: 22418 から 22430、配列識別番号: 22967 から 23000、または 配列識別番号: 25617 から 25653と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む EGFR G598V タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、EGFR G598V タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 67 から 81、配列識別番号: 510 から 519、配列識別番号: 4056 から 4718、配列識別番号: 22431 から 22437、配列識別番号: 23001 から 23089、配列識別番号: 25654 から 25794 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 EGFR G598Vワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 67 から 81、配列識別番号: 510 から 519、配列識別番号: 4056 から 4718、配列識別番号: 22431 から 22437、配列識別番号: 23001 から 23089、または 配列識別番号: 25654 から 25794と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む EGFR L858R タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、EGFR L858R タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 82 から 98、配列識別番号: 520 から 527、配列識別番号: 4719 から 5756、配列識別番号: 22438 から 22449、配列識別番号: 23090 から 23263、配列識別番号: 25795 から 26046 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 EGFR L858Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 82 から 98、配列識別番号: 520 から 527、配列識別番号: 4719 から 5756、配列識別番号: 22438 から 22449、配列識別番号: 23090 から 23263、または 配列識別番号: 25795 から 26046と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む IDH1 R132H タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、IDH1 R132H タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 125 から 140、配列識別番号: 461、配列識別番号: 543 から 553、配列識別番号: 6738 から 7098、配列識別番号: 22477 から 22488、配列識別番号: 23505 から 23631、配列識別番号: 26469 から 26614 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 IDH1 R132Hワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 125 から 140、配列識別番号: 461、配列識別番号: 543 から 553、配列識別番号: 6738 から 7098、配列識別番号: 22477 から 22488、配列識別番号: 23505 から 23631、または 配列識別番号: 26469 から 26614と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む IDH1 R132C タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、IDH1 R132C タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 119 から 124、配列識別番号: 460、配列識別番号: 535 から 542、配列識別番号: 6499 から 6737、配列識別番号: 22467 から 22476、配列識別番号: 23416 から 23504、配列識別番号: 26376 から 26468 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 IDH1 R132Cワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 119 から 124、配列識別番号: 460、配列識別番号: 535 から 542、配列識別番号: 6499 から 6737、配列識別番号: 22467 から 22476、配列識別番号: 23416 から 23504、または 配列識別番号: 26376 から 26468と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む KRAS G12D タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、KRAS G12D タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 167 から 178、配列識別番号: 464、配列識別番号: 569 から 577、配列識別番号: 8432 から 9733、配列識別番号: 22507 から 22518、配列識別番号: 23750 から 23809、配列識別番号: 26757 から 26833 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Dワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 167 から 178、配列識別番号: 464、配列識別番号: 569 から 577、配列識別番号: 8432 から 9733、配列識別番号: 22507 から 22518、配列識別番号: 23750 から 23809、または 配列識別番号: 26757 から 26833と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む KRAS G12V タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、KRAS G12V タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 203 から 213、配列識別番号: 596 から 605、配列識別番号: 11009 から 11744、配列識別番号: 22537 から 22546、配列識別番号: 23958 から 24025、配列識別番号: 27057 から 27148 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Vワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 203 から 213、配列識別番号: 596 から 605、配列識別番号: 11009 から 11744、配列識別番号: 22537 から 22546、配列識別番号: 23958 から 24025、または 配列識別番号: 27057 から 27148と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む KRAS G12R タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、KRAS G12R タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 179 から 191、配列識別番号: 465、配列識別番号: 578 から 587、配列識別番号: 9734 から 10236、配列識別番号: 22519 から 22527、配列識別番号: 23810 から 23889、配列識別番号: 26834 から 26967 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 179 から 191、配列識別番号: 465、配列識別番号: 578 から 587、配列識別番号: 9734 から 10236、配列識別番号: 22519 から 22527、配列識別番号: 23810 から 23889、または 配列識別番号: 26834 から 26967と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む KRAS G12C タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、KRAS G12C タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 154 から 166、配列識別番号: 463、配列識別番号: 561 から 568、配列識別番号: 7881 から 8431、配列識別番号: 22498 から 22506、配列識別番号: 23700 から 23749、配列識別番号: 26702 から 26756 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Cワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 154 から 166、配列識別番号: 463、配列識別番号: 561 から 568、配列識別番号: 7881 から 8431、配列識別番号: 22498 から 22506、配列識別番号: 23700 から 23749、または 配列識別番号: 26702 から 26756と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む KRAS G13D タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、KRAS G13D タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 214 から 229、配列識別番号: 466、配列識別番号: 606 から 615、配列識別番号: 759、配列識別番号: 11745 から 12814、配列識別番号: 22547 から 22558、配列識別番号: 24026 から 24129、配列識別番号: 27149 から 27328 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G13Dワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 214 から 229、配列識別番号: 466、配列識別番号: 606 から 615、配列識別番号: 759、配列識別番号: 11745 から 12814、配列識別番号: 22547 から 22558、配列識別番号: 24026 から 24129、または 配列識別番号: 27149 から 27328と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む KRAS G12A タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、KRAS G12A タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 141 から 153、配列識別番号: 462、配列識別番号: 554 から 560、配列識別番号: 7099 から 7880、配列識別番号: 22489 から 22497、配列識別番号: 23632 から 23699、配列識別番号: 26615 から 26701 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Aワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 141 から 153、配列識別番号: 462、配列識別番号: 554 から 560、配列識別番号: 7099 から 7880、配列識別番号: 22489 から 22497、配列識別番号: 23632 から 23699、または 配列識別番号: 26615 から 26701と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む KRAS G12S タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、KRAS G12S タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 192 から 202、配列識別番号: 588 から 595、配列識別番号: 10237 から 11008、配列識別番号: 22528 から 22536、配列識別番号: 23890 から 23957、配列識別番号: 26968 から 27056 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 KRAS G12Sワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 192 から 202、配列識別番号: 588 から 595、配列識別番号: 10237 から 11008、配列識別番号: 22528 から 22536、配列識別番号: 23890 から 23957、または 配列識別番号: 26968 から 27056と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む NRAS Q61R タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、NRAS Q61R タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 256 から 272、配列識別番号: 634 から 645、配列識別番号: 14315 から 14836、配列識別番号: 22577 から 22582、配列識別番号: 24280 から 24347、配列識別番号: 27490 から 27557 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 NRAS Q61Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 256 から 272、配列識別番号: 634 から 645、配列識別番号: 14315 から 14836、配列識別番号: 22577 から 22582、配列識別番号: 24280 から 24347、または 配列識別番号: 27490 から 27557と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む NRAS Q61K タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、NRAS Q61K タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 230 から 238、配列識別番号: 616 から 624、配列識別番号: 12815 から 13434、配列識別番号: 22559 から 22567、配列識別番号: 24130 から 24194、配列識別番号: 27329 から 27396 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 NRAS Q61Kワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 230 から 238、配列識別番号: 616 から 624、配列識別番号: 12815 から 13434、配列識別番号: 22559 から 22567、配列識別番号: 24130 から 24194、または 配列識別番号: 27329 から 27396と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む NRAS Q61L タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、NRAS Q61L タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 239 から 255、配列識別番号: 625 から 633、配列識別番号: 13435 から 14314、配列識別番号: 22568 から 22576、配列識別番号: 24195 から 24279、配列識別番号: 27397 から 27489 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 NRAS Q61Lワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 239 から 255、配列識別番号: 625 から 633、配列識別番号: 13435 から 14314、配列識別番号: 22568 から 22576、配列識別番号: 24195 から 24279、または 配列識別番号: 27397 から 27489と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む PIK3CA E542K タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、PIK3CA E542K タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 273 から 285、配列識別番号: 646 から 650、配列識別番号: 14837 から 15625、配列識別番号: 22583 から 22592、配列識別番号: 24348 から 24362、配列識別番号: 27558 から 27572 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CA E542Kワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 273 から 285、配列識別番号: 646 から 650、配列識別番号: 14837 から 15625、配列識別番号: 22583 から 22592、配列識別番号: 24348 から 24362、または 配列識別番号: 27558 から 27572と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む PIK3CA E545K タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、PIK3CA E545K タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 286 から 293、配列識別番号: 467、配列識別番号: 651 から 657、配列識別番号: 15626 から 15907、配列識別番号: 22593 から 22602、配列識別番号: 24363 から 24388、配列識別番号: 27573 から 27599 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CA E545Kワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 286 から 293、配列識別番号: 467、配列識別番号: 651 から 657、配列識別番号: 15626 から 15907、配列識別番号: 22593 から 22602、配列識別番号: 24363 から 24388、または 配列識別番号: 27573 から 27599と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む PIK3CA H1047R タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、PIK3CA H1047R タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 294 から 309、配列識別番号: 658 から 667、配列識別番号: 15908 から 16276、配列識別番号: 22603 から 22608、配列識別番号: 24389 から 24472、配列識別番号: 27600 から 27683 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CA H1047Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 294 から 309、配列識別番号: 658 から 667、配列識別番号: 15908 から 16276、配列識別番号: 22603 から 22608、配列識別番号: 24389 から 24472、または 配列識別番号: 27600 から 27683と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む TP53 R158L タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、TP53 R158L タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 359 から 374、配列識別番号: 469 から 470、配列識別番号: 700 から 707、配列識別番号: 18414 から 19404、配列識別番号: 22644 から 22657、配列識別番号: 24784 から 24927、配列識別番号: 28132 から 28372 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R158Lワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 359 から 374、配列識別番号: 469 から 470、配列識別番号: 700 から 707、配列識別番号: 18414 から 19404、配列識別番号: 22644 から 22657、配列識別番号: 24784 から 24927、または 配列識別番号: 28132 から 28372と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む TP53 R175H タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、TP53 R175H タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 471 から 472、配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 19405 から 19752、配列識別番号: 22658 から 22665、配列識別番号: 24928 から 24954、配列識別番号: 28373 から 28410 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R175Hワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 471 から 472、配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 19405 から 19752、配列識別番号: 22658 から 22665、配列識別番号: 24928 から 24954、または 配列識別番号: 28373 から 28410と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む TP53 R248Q タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、TP53 R248Q タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 387 から 401、配列識別番号: 718 から 723、配列識別番号: 19753 から 20608、配列識別番号: 22666 から 22678、配列識別番号: 24955 から 25010、配列識別番号: 28411 から 28468 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R248Qワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 387 から 401、配列識別番号: 718 から 723、配列識別番号: 19753 から 20608、配列識別番号: 22666 から 22678、配列識別番号: 24955 から 25010、または 配列識別番号: 28411 から 28468と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む TP53 R273C タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、TP53 R273C タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 422 から 432、配列識別番号: 473、配列識別番号: 733 から 739、配列識別番号: 21192 から 21462、配列識別番号: 22690 から 22701、配列識別番号: 25109 から 25117、配列識別番号: 28572 から 28580 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R273Cワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 422 から 432、配列識別番号: 473、配列識別番号: 733 から 739、配列識別番号: 21192 から 21462、配列識別番号: 22690 から 22701、配列識別番号: 25109 から 25117、または 配列識別番号: 28572 から 28580と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む TP53 R273H タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、TP53 R273H タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 433 から 446、配列識別番号: 474、配列識別番号: 740 から 748、配列識別番号: 21463 から 21845、配列識別番号: 22702 から 22713、配列識別番号: 25118 から 25206、配列識別番号: 28581 から 28697 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R273Hワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 433 から 446、配列識別番号: 474、配列識別番号: 740 から 748、配列識別番号: 21463 から 21845、配列識別番号: 22702 から 22713、配列識別番号: 25118 から 25206、または 配列識別番号: 28581 から 28697と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む TP53 R248W タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、TP53 R248W タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 402 から 421、配列識別番号: 724 から 732、配列識別番号: 20609 から 21191、配列識別番号: 22679 から 22689、配列識別番号: 25011 から 25108、配列識別番号: 28469 から 28571 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R248Wワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 402 から 421、配列識別番号: 724 から 732、配列識別番号: 20609 から 21191、配列識別番号: 22679 から 22689、配列識別番号: 25011 から 25108、または 配列識別番号: 28469 から 28571と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む TP53 R282W タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、TP53 R282W タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 447 から 449、配列識別番号: 749 から 750、配列識別番号: 21846 から 21940、配列識別番号: 22714 から 22720、配列識別番号: 25207 から 25218、配列識別番号: 28698 から 28709 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 R282Wワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 447 から 449、配列識別番号: 749 から 750、配列識別番号: 21846 から 21940、配列識別番号: 22714 から 22720、配列識別番号: 25207 から 25218、または 配列識別番号: 28698 から 28709と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む TP53 Y220C タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、TP53 Y220C タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 450 から 458、配列識別番号: 751 から 758、配列識別番号: 21941 から 22385、配列識別番号: 22721 から 22727、配列識別番号: 25219 から 25304、配列識別番号: 28710 から 28795 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 Y220Cワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 450 から 458、配列識別番号: 751 から 758、配列識別番号: 21941 から 22385、配列識別番号: 22721 から 22727、配列識別番号: 25219 から 25304、または 配列識別番号: 28710 から 28795と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む PIK3CA R88Q タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、PIK3CA R88Q タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 310 から 322、配列識別番号: 468、配列識別番号: 668 から 675、配列識別番号: 16277 から 17342、配列識別番号: 22609 から 22622、配列識別番号: 24473 から 24571、配列識別番号: 27684 から 27889 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 PIK3CA R88Qワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 310 から 322、配列識別番号: 468、配列識別番号: 668 から 675、配列識別番号: 16277 から 17342、配列識別番号: 22609 から 22622、配列識別番号: 24473 から 24571、または 配列識別番号: 27684 から 27889と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む GTF2I L424H タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、GTF2I L424H タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 99 から 118、配列識別番号: 528 から 534、配列識別番号: 5757 から 6498、配列識別番号: 22450 から 22466、配列識別番号: 23264 から 23415、配列識別番号: 26047 から 26375 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 GTF2I L424Hワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 99 から 118、配列識別番号: 528 から 534、配列識別番号: 5757 から 6498、配列識別番号: 22450 から 22466、配列識別番号: 23264 から 23415、または 配列識別番号: 26047 から 26375と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む PTEN R130Q タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、PTEN R130Q タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 338 から 353、配列識別番号: 681 から 690、配列識別番号: 17869 から 18205、配列識別番号: 22630 から 22636、配列識別番号: 24659 から 24724、配列識別番号: 27980 から 28052 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 PTEN R130Qワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 338 から 353、配列識別番号: 681 から 690、配列識別番号: 17869 から 18205、配列識別番号: 22630 から 22636、配列識別番号: 24659 から 24724、または 配列識別番号: 27980 から 28052と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む AKT1 E17K タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、AKT1 E17K タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 1 から 18、配列識別番号: 459、配列識別番号: 475 から 483、配列識別番号: 760 から 1768、配列識別番号: 22386 から 22396、配列識別番号: 22728 から 22838、配列識別番号: 25305 から 25488 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 AKT1 E17Kワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 1 から 18、配列識別番号: 459、配列識別番号: 475 から 483、配列識別番号: 760 から 1768、配列識別番号: 22386 から 22396、配列識別番号: 22728 から 22838、または 配列識別番号: 25305 から 25488と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む PTEN R130G タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、PTEN R130G タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 323 から 337、配列識別番号: 676 から 680、配列識別番号: 17343 から 17868、配列識別番号: 22623 から 22629、配列識別番号: 24572 から 24658、配列識別番号: 27890 から 27979 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 PTEN R130Gワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 323 から 337、配列識別番号: 676 から 680、配列識別番号: 17343 から 17868、配列識別番号: 22623 から 22629、配列識別番号: 24572 から 24658、または 配列識別番号: 27890 から 27979と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む TP53 H179R タンパク質の変異に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、TP53 H179R タンパク質における変異用ワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 354 から 358、配列識別番号: 691 から 699、配列識別番号: 18206 から 18413、配列識別番号: 22637 から 22643、配列識別番号: 24725 から 24783、配列識別番号: 28053 から 28131 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 TP53 H179Rワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 354 から 358、配列識別番号: 691 から 699、配列識別番号: 18206 から 18413、配列識別番号: 22637 から 22643、配列識別番号: 24725 から 24783、または 配列識別番号: 28053 から 28131と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、本書に開示されているMHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチド（配列番号：1 から 28795）の任意の組み合わせを使用して、約2～40個のペプチドを含む単一ターゲット（個体）または複合ペプチドワクチンを製造することができる。いくつかの実施形態では、複合ワクチン中のペプチドのいずれか（ペプチド1 から 28795；配列番号：1 から 28795）には、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％いずれかの配列番号：1 から 28795と同一のアミノ酸配列を含む。
CT 抗原ワクチン
MHC クラス I ペプチド配列
CT 抗原ワクチン
MHC クラス I ペプチド配列
いくつかの実施形態では、ペプチドワクチン（単一標的ワクチンまたは複合多目的ワクチン）は、各ペプチドが8個以上のアミノ酸からなる約1～40個のMHCクラスIペプチドを含む。いくつかの実施形態では、MHCクラスIペプチドワクチンは、1つ以上の CTG1B、KKLC1、MAGA1、MAGA3、MAGA4、MAGC1、MAGC3、MAR1、PMEL、PRAME、SSX2、TYRP1、または TYRP2タンパク質標的を対象とする。いくつかの実施形態では、MHCクラスIペプチドワクチンは、1つ以上の 膵がん、皮膚がん、甲状腺がん、脳腫瘍、直腸結腸がん、気管支がんと肺がん、乳がん、または 卵巣がん 適応症を対象としている。
一部の実施形態では、CTG1B タンパク質に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 28796 から 28864 を含む。いくつかの実施形態では、 CTG1Bワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 28796 から 28864と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、CTG1B タンパク質に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 28796 から 34168 を含む。いくつかの実施形態では、 CTG1Bワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 28796 から 34168と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、CTG1B タンパク質に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 28796 から 28864 を含む。いくつかの実施形態では、 CTG1Bワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 28796 から 28864と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、CTG1B タンパク質に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 28796 から 34168 を含む。いくつかの実施形態では、 CTG1Bワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 28796 から 34168と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAGA1 タンパク質に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 41321 から 41397 を含む。いくつかの実施形態では、 MAGA1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 41321 から 41397と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAGA1 タンパク質に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 41321 から 51433 を含む。いくつかの実施形態では、 MAGA1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 41321 から 51433と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAGA1 タンパク質に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 41321 から 41397 を含む。いくつかの実施形態では、 MAGA1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 41321 から 41397と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAGA1 タンパク質に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 41321 から 51433 を含む。いくつかの実施形態では、 MAGA1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 41321 から 51433と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAGA3 タンパク質に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 41383、配列識別番号: 41396、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49004、配列識別番号: 51434 から 51510 を含む。いくつかの実施形態では、 MAGA3ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 41383、配列識別番号: 41396、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49004、または 配列識別番号: 51434 から 51510と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAGA3 タンパク質に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 41351 から 41352、配列識別番号: 41383、配列識別番号: 41396、配列識別番号: 41410、配列識別番号: 41414、配列識別番号: 41435、配列識別番号: 41450、配列識別番号: 41463、配列識別番号: 41478、配列識別番号: 41489、配列識別番号: 41495、配列識別番号: 41503、配列識別番号: 41513、配列識別番号: 41520、配列識別番号: 41535、配列識別番号: 41541、配列識別番号: 41545、配列識別番号: 41577、配列識別番号: 41588、配列識別番号: 41598、配列識別番号: 41605、配列識別番号: 41617、配列識別番号: 41620、配列識別番号: 41622、配列識別番号: 41627、配列識別番号: 41630、配列識別番号: 41638、配列識別番号: 41647、配列識別番号: 41673、配列識別番号: 41696、配列識別番号: 41703、配列識別番号: 41708、配列識別番号: 41728、配列識別番号: 41732 から 41733、配列識別番号: 41749、配列識別番号: 41760、配列識別番号: 41766、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 41788、配列識別番号: 41791、配列識別番号: 41809、配列識別番号: 41813、配列識別番号: 41817、配列識別番号: 41829、配列識別番号: 41847 から 41848、配列識別番号: 41853、配列識別番号: 41859、配列識別番号: 41889、配列識別番号: 41894、配列識別番号: 41897、配列識別番号: 41909、配列識別番号: 41923、配列識別番号: 41934、配列識別番号: 41939、配列識別番号: 41953 から 41954、配列識別番号: 41959、配列識別番号: 41967、配列識別番号: 41970、配列識別番号: 41976、配列識別番号: 41984 から 41985、配列識別番号: 42007、配列識別番号: 42017、配列識別番号: 42034、配列識別番号: 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一部の実施形態では、MAGA3 タンパク質に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 41383、配列識別番号: 41396、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49004、配列識別番号: 51434 から 51510 を含む。いくつかの実施形態では、 MAGA3ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 41383、配列識別番号: 41396、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49004、または 配列識別番号: 51434 から 51510と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAGA3 タンパク質に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 41351 から 41352、配列識別番号: 41383、配列識別番号: 41396、配列識別番号: 41410、配列識別番号: 41414、配列識別番号: 41435、配列識別番号: 41450、配列識別番号: 41463、配列識別番号: 41478、配列識別番号: 41489、配列識別番号: 41495、配列識別番号: 41503、配列識別番号: 41513、配列識別番号: 41520、配列識別番号: 41535、配列識別番号: 41541、配列識別番号: 41545、配列識別番号: 41577、配列識別番号: 41588、配列識別番号: 41598、配列識別番号: 41605、配列識別番号: 41617、配列識別番号: 41620、配列識別番号: 41622、配列識別番号: 41627、配列識別番号: 41630、配列識別番号: 41638、配列識別番号: 41647、配列識別番号: 41673、配列識別番号: 41696、配列識別番号: 41703、配列識別番号: 41708、配列識別番号: 41728、配列識別番号: 41732 から 41733、配列識別番号: 41749、配列識別番号: 41760、配列識別番号: 41766、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 41788、配列識別番号: 41791、配列識別番号: 41809、配列識別番号: 41813、配列識別番号: 41817、配列識別番号: 41829、配列識別番号: 41847 から 41848、配列識別番号: 41853、配列識別番号: 41859、配列識別番号: 41889、配列識別番号: 41894、配列識別番号: 41897、配列識別番号: 41909、配列識別番号: 41923、配列識別番号: 41934、配列識別番号: 41939、配列識別番号: 41953 から 41954、配列識別番号: 41959、配列識別番号: 41967、配列識別番号: 41970、配列識別番号: 41976、配列識別番号: 41984 から 41985、配列識別番号: 42007、配列識別番号: 42017、配列識別番号: 42034、配列識別番号: 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一部の実施形態では、MAGA4 タンパク質に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 41352、配列識別番号: 41357 から 41358、配列識別番号: 41377、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49071、配列識別番号: 50632、配列識別番号: 50729、配列識別番号: 55758、配列識別番号: 60456 から 60527 を含む。いくつかの実施形態では、 MAGA4ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 41352、配列識別番号: 41357 から 41358、配列識別番号: 41377、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49071、配列識別番号: 50632、配列識別番号: 50729、配列識別番号: 55758、または 配列識別番号: 60456 から 60527と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAGA4 タンパク質に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 41345、配列識別番号: 41347、配列識別番号: 41352、配列識別番号: 41357 から 41358、配列識別番号: 41366、配列識別番号: 41377、配列識別番号: 41382、配列識別番号: 41392、配列識別番号: 41396、配列識別番号: 41398、配列識別番号: 41406、配列識別番号: 41411、配列識別番号: 41414、配列識別番号: 41433、配列識別番号: 41436、配列識別番号: 41445、配列識別番号: 41449、配列識別番号: 41455、配列識別番号: 41478、配列識別番号: 41487、配列識別番号: 41495 から 41496、配列識別番号: 41503、配列識別番号: 41515、配列識別番号: 41520、配列識別番号: 41529、配列識別番号: 41549、配列識別番号: 41553、配列識別番号: 41562、配列識別番号: 41569、配列識別番号: 41574、配列識別番号: 41576、配列識別番号: 41579、配列識別番号: 41587 から 41588、配列識別番号: 41605、配列識別番号: 41617、配列識別番号: 41620、配列識別番号: 41634、配列識別番号: 41650、配列識別番号: 41665、配列識別番号: 41670、配列識別番号: 41672、配列識別番号: 41696、配列識別番号: 41703、配列識別番号: 41709、配列識別番号: 41725、配列識別番号: 41732 から 41733、配列識別番号: 41748、配列識別番号: 41760、配列識別番号: 41766、配列識別番号: 41768、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 41779、配列識別番号: 41791、配列識別番号: 41797、配列識別番号: 41813、配列識別番号: 41819、配列識別番号: 41825、配列識別番号: 41829、配列識別番号: 41846 から 41847、配列識別番号: 41853、配列識別番号: 41876、配列識別番号: 41889、配列識別番号: 41892、配列識別番号: 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一部の実施形態では、MAGA4 タンパク質に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 41352、配列識別番号: 41357 から 41358、配列識別番号: 41377、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49071、配列識別番号: 50632、配列識別番号: 50729、配列識別番号: 55758、配列識別番号: 60456 から 60527 を含む。いくつかの実施形態では、 MAGA4ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 41352、配列識別番号: 41357 から 41358、配列識別番号: 41377、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49071、配列識別番号: 50632、配列識別番号: 50729、配列識別番号: 55758、または 配列識別番号: 60456 から 60527と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAGA4 タンパク質に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 41345、配列識別番号: 41347、配列識別番号: 41352、配列識別番号: 41357 から 41358、配列識別番号: 41366、配列識別番号: 41377、配列識別番号: 41382、配列識別番号: 41392、配列識別番号: 41396、配列識別番号: 41398、配列識別番号: 41406、配列識別番号: 41411、配列識別番号: 41414、配列識別番号: 41433、配列識別番号: 41436、配列識別番号: 41445、配列識別番号: 41449、配列識別番号: 41455、配列識別番号: 41478、配列識別番号: 41487、配列識別番号: 41495 から 41496、配列識別番号: 41503、配列識別番号: 41515、配列識別番号: 41520、配列識別番号: 41529、配列識別番号: 41549、配列識別番号: 41553、配列識別番号: 41562、配列識別番号: 41569、配列識別番号: 41574、配列識別番号: 41576、配列識別番号: 41579、配列識別番号: 41587 から 41588、配列識別番号: 41605、配列識別番号: 41617、配列識別番号: 41620、配列識別番号: 41634、配列識別番号: 41650、配列識別番号: 41665、配列識別番号: 41670、配列識別番号: 41672、配列識別番号: 41696、配列識別番号: 41703、配列識別番号: 41709、配列識別番号: 41725、配列識別番号: 41732 から 41733、配列識別番号: 41748、配列識別番号: 41760、配列識別番号: 41766、配列識別番号: 41768、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 41779、配列識別番号: 41791、配列識別番号: 41797、配列識別番号: 41813、配列識別番号: 41819、配列識別番号: 41825、配列識別番号: 41829、配列識別番号: 41846 から 41847、配列識別番号: 41853、配列識別番号: 41876、配列識別番号: 41889、配列識別番号: 41892、配列識別番号: 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一部の実施形態では、MAGC1 タンパク質に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 49395、配列識別番号: 50632、配列識別番号: 68238 から 68321 を含む。いくつかの実施形態では、 MAGC1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 49395、配列識別番号: 50632、または 配列識別番号: 68238 から 68321と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAGC1 タンパク質に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 41352、配列識別番号: 41478、配列識別番号: 41495、配列識別番号: 41725、配列識別番号: 41847、配列識別番号: 42129、配列識別番号: 42135、配列識別番号: 42168、配列識別番号: 42170、配列識別番号: 42195、配列識別番号: 42218、配列識別番号: 42229、配列識別番号: 42458、配列識別番号: 42545、配列識別番号: 42628、配列識別番号: 42653、配列識別番号: 42685、配列識別番号: 42703、配列識別番号: 42872、配列識別番号: 43008、配列識別番号: 43046、配列識別番号: 43083、配列識別番号: 43333、配列識別番号: 43429、配列識別番号: 43564、配列識別番号: 43780、配列識別番号: 43836、配列識別番号: 43881、配列識別番号: 43898、配列識別番号: 43932、配列識別番号: 44048、配列識別番号: 44181、配列識別番号: 44328、配列識別番号: 44456、配列識別番号: 44523、配列識別番号: 44566、配列識別番号: 44773、配列識別番号: 44877、配列識別番号: 45197、配列識別番号: 45385、配列識別番号: 45450、配列識別番号: 45556、配列識別番号: 45580、配列識別番号: 45584、配列識別番号: 45599、配列識別番号: 45765、配列識別番号: 45829、配列識別番号: 45894、配列識別番号: 45915、配列識別番号: 46273、配列識別番号: 46400、配列識別番号: 46421、配列識別番号: 46457、配列識別番号: 46459、配列識別番号: 46484、配列識別番号: 46666、配列識別番号: 46678、配列識別番号: 46689、配列識別番号: 46981、配列識別番号: 46991、配列識別番号: 46993、配列識別番号: 47047、配列識別番号: 47151、配列識別番号: 47324、配列識別番号: 47432、配列識別番号: 47592、配列識別番号: 47673、配列識別番号: 47895、配列識別番号: 47960、配列識別番号: 47964、配列識別番号: 47979、配列識別番号: 47984、配列識別番号: 48034、配列識別番号: 48113、配列識別番号: 48118、配列識別番号: 48300、配列識別番号: 48436、配列識別番号: 48461 から 48462、配列識別番号: 48469、配列識別番号: 48574、配列識別番号: 48680、配列識別番号: 48796、配列識別番号: 48832、配列識別番号: 48838、配列識別番号: 48845、配列識別番号: 48877、配列識別番号: 48947、配列識別番号: 49019、配列識別番号: 49111、配列識別番号: 49176、配列識別番号: 49263、配列識別番号: 49395、配列識別番号: 49462、配列識別番号: 49557、配列識別番号: 49823、配列識別番号: 49883、配列識別番号: 50062、配列識別番号: 50167、配列識別番号: 50305、配列識別番号: 50394、配列識別番号: 50401、配列識別番号: 50423、配列識別番号: 50428、配列識別番号: 50443、配列識別番号: 50450、配列識別番号: 50564、配列識別番号: 50574、配列識別番号: 50632、配列識別番号: 50678、配列識別番号: 68238 から 95592 を含む。いくつかの実施形態では、 MAGC1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 41352、配列識別番号: 41478、配列識別番号: 41495、配列識別番号: 41725、配列識別番号: 41847、配列識別番号: 42129、配列識別番号: 42135、配列識別番号: 42168、配列識別番号: 42170、配列識別番号: 42195、配列識別番号: 42218、配列識別番号: 42229、配列識別番号: 42458、配列識別番号: 42545、配列識別番号: 42628、配列識別番号: 42653、配列識別番号: 42685、配列識別番号: 42703、配列識別番号: 42872、配列識別番号: 43008、配列識別番号: 43046、配列識別番号: 43083、配列識別番号: 43333、配列識別番号: 43429、配列識別番号: 43564、配列識別番号: 43780、配列識別番号: 43836、配列識別番号: 43881、配列識別番号: 43898、配列識別番号: 43932、配列識別番号: 44048、配列識別番号: 44181、配列識別番号: 44328、配列識別番号: 44456、配列識別番号: 44523、配列識別番号: 44566、配列識別番号: 44773、配列識別番号: 44877、配列識別番号: 45197、配列識別番号: 45385、配列識別番号: 45450、配列識別番号: 45556、配列識別番号: 45580、配列識別番号: 45584、配列識別番号: 45599、配列識別番号: 45765、配列識別番号: 45829、配列識別番号: 45894、配列識別番号: 45915、配列識別番号: 46273、配列識別番号: 46400、配列識別番号: 46421、配列識別番号: 46457、配列識別番号: 46459、配列識別番号: 46484、配列識別番号: 46666、配列識別番号: 46678、配列識別番号: 46689、配列識別番号: 46981、配列識別番号: 46991、配列識別番号: 46993、配列識別番号: 47047、配列識別番号: 47151、配列識別番号: 47324、配列識別番号: 47432、配列識別番号: 47592、配列識別番号: 47673、配列識別番号: 47895、配列識別番号: 47960、配列識別番号: 47964、配列識別番号: 47979、配列識別番号: 47984、配列識別番号: 48034、配列識別番号: 48113、配列識別番号: 48118、配列識別番号: 48300、配列識別番号: 48436、配列識別番号: 48461 から 48462、配列識別番号: 48469、配列識別番号: 48574、配列識別番号: 48680、配列識別番号: 48796、配列識別番号: 48832、配列識別番号: 48838、配列識別番号: 48845、配列識別番号: 48877、配列識別番号: 48947、配列識別番号: 49019、配列識別番号: 49111、配列識別番号: 49176、配列識別番号: 49263、配列識別番号: 49395、配列識別番号: 49462、配列識別番号: 49557、配列識別番号: 49823、配列識別番号: 49883、配列識別番号: 50062、配列識別番号: 50167、配列識別番号: 50305、配列識別番号: 50394、配列識別番号: 50401、配列識別番号: 50423、配列識別番号: 50428、配列識別番号: 50443、配列識別番号: 50450、配列識別番号: 50564、配列識別番号: 50574、配列識別番号: 50632、配列識別番号: 50678、または 配列識別番号: 68238 から 95592と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAGC1 タンパク質に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 49395、配列識別番号: 50632、配列識別番号: 68238 から 68321 を含む。いくつかの実施形態では、 MAGC1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 49395、配列識別番号: 50632、または 配列識別番号: 68238 から 68321と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAGC1 タンパク質に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 41352、配列識別番号: 41478、配列識別番号: 41495、配列識別番号: 41725、配列識別番号: 41847、配列識別番号: 42129、配列識別番号: 42135、配列識別番号: 42168、配列識別番号: 42170、配列識別番号: 42195、配列識別番号: 42218、配列識別番号: 42229、配列識別番号: 42458、配列識別番号: 42545、配列識別番号: 42628、配列識別番号: 42653、配列識別番号: 42685、配列識別番号: 42703、配列識別番号: 42872、配列識別番号: 43008、配列識別番号: 43046、配列識別番号: 43083、配列識別番号: 43333、配列識別番号: 43429、配列識別番号: 43564、配列識別番号: 43780、配列識別番号: 43836、配列識別番号: 43881、配列識別番号: 43898、配列識別番号: 43932、配列識別番号: 44048、配列識別番号: 44181、配列識別番号: 44328、配列識別番号: 44456、配列識別番号: 44523、配列識別番号: 44566、配列識別番号: 44773、配列識別番号: 44877、配列識別番号: 45197、配列識別番号: 45385、配列識別番号: 45450、配列識別番号: 45556、配列識別番号: 45580、配列識別番号: 45584、配列識別番号: 45599、配列識別番号: 45765、配列識別番号: 45829、配列識別番号: 45894、配列識別番号: 45915、配列識別番号: 46273、配列識別番号: 46400、配列識別番号: 46421、配列識別番号: 46457、配列識別番号: 46459、配列識別番号: 46484、配列識別番号: 46666、配列識別番号: 46678、配列識別番号: 46689、配列識別番号: 46981、配列識別番号: 46991、配列識別番号: 46993、配列識別番号: 47047、配列識別番号: 47151、配列識別番号: 47324、配列識別番号: 47432、配列識別番号: 47592、配列識別番号: 47673、配列識別番号: 47895、配列識別番号: 47960、配列識別番号: 47964、配列識別番号: 47979、配列識別番号: 47984、配列識別番号: 48034、配列識別番号: 48113、配列識別番号: 48118、配列識別番号: 48300、配列識別番号: 48436、配列識別番号: 48461 から 48462、配列識別番号: 48469、配列識別番号: 48574、配列識別番号: 48680、配列識別番号: 48796、配列識別番号: 48832、配列識別番号: 48838、配列識別番号: 48845、配列識別番号: 48877、配列識別番号: 48947、配列識別番号: 49019、配列識別番号: 49111、配列識別番号: 49176、配列識別番号: 49263、配列識別番号: 49395、配列識別番号: 49462、配列識別番号: 49557、配列識別番号: 49823、配列識別番号: 49883、配列識別番号: 50062、配列識別番号: 50167、配列識別番号: 50305、配列識別番号: 50394、配列識別番号: 50401、配列識別番号: 50423、配列識別番号: 50428、配列識別番号: 50443、配列識別番号: 50450、配列識別番号: 50564、配列識別番号: 50574、配列識別番号: 50632、配列識別番号: 50678、配列識別番号: 68238 から 95592 を含む。いくつかの実施形態では、 MAGC1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 41352、配列識別番号: 41478、配列識別番号: 41495、配列識別番号: 41725、配列識別番号: 41847、配列識別番号: 42129、配列識別番号: 42135、配列識別番号: 42168、配列識別番号: 42170、配列識別番号: 42195、配列識別番号: 42218、配列識別番号: 42229、配列識別番号: 42458、配列識別番号: 42545、配列識別番号: 42628、配列識別番号: 42653、配列識別番号: 42685、配列識別番号: 42703、配列識別番号: 42872、配列識別番号: 43008、配列識別番号: 43046、配列識別番号: 43083、配列識別番号: 43333、配列識別番号: 43429、配列識別番号: 43564、配列識別番号: 43780、配列識別番号: 43836、配列識別番号: 43881、配列識別番号: 43898、配列識別番号: 43932、配列識別番号: 44048、配列識別番号: 44181、配列識別番号: 44328、配列識別番号: 44456、配列識別番号: 44523、配列識別番号: 44566、配列識別番号: 44773、配列識別番号: 44877、配列識別番号: 45197、配列識別番号: 45385、配列識別番号: 45450、配列識別番号: 45556、配列識別番号: 45580、配列識別番号: 45584、配列識別番号: 45599、配列識別番号: 45765、配列識別番号: 45829、配列識別番号: 45894、配列識別番号: 45915、配列識別番号: 46273、配列識別番号: 46400、配列識別番号: 46421、配列識別番号: 46457、配列識別番号: 46459、配列識別番号: 46484、配列識別番号: 46666、配列識別番号: 46678、配列識別番号: 46689、配列識別番号: 46981、配列識別番号: 46991、配列識別番号: 46993、配列識別番号: 47047、配列識別番号: 47151、配列識別番号: 47324、配列識別番号: 47432、配列識別番号: 47592、配列識別番号: 47673、配列識別番号: 47895、配列識別番号: 47960、配列識別番号: 47964、配列識別番号: 47979、配列識別番号: 47984、配列識別番号: 48034、配列識別番号: 48113、配列識別番号: 48118、配列識別番号: 48300、配列識別番号: 48436、配列識別番号: 48461 から 48462、配列識別番号: 48469、配列識別番号: 48574、配列識別番号: 48680、配列識別番号: 48796、配列識別番号: 48832、配列識別番号: 48838、配列識別番号: 48845、配列識別番号: 48877、配列識別番号: 48947、配列識別番号: 49019、配列識別番号: 49111、配列識別番号: 49176、配列識別番号: 49263、配列識別番号: 49395、配列識別番号: 49462、配列識別番号: 49557、配列識別番号: 49823、配列識別番号: 49883、配列識別番号: 50062、配列識別番号: 50167、配列識別番号: 50305、配列識別番号: 50394、配列識別番号: 50401、配列識別番号: 50423、配列識別番号: 50428、配列識別番号: 50443、配列識別番号: 50450、配列識別番号: 50564、配列識別番号: 50574、配列識別番号: 50632、配列識別番号: 50678、または 配列識別番号: 68238 から 95592と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAGC3 タンパク質に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 68285、配列識別番号: 68290、配列識別番号: 68305、配列識別番号: 77091、配列識別番号: 77210、配列識別番号: 84188、配列識別番号: 87951、配列識別番号: 88144、配列識別番号: 95593 から 95664 を含む。いくつかの実施形態では、 MAGC3ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 68285、配列識別番号: 68290、配列識別番号: 68305、配列識別番号: 77091、配列識別番号: 77210、配列識別番号: 84188、配列識別番号: 87951、配列識別番号: 88144、または 配列識別番号: 95593 から 95664と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAGC3 タンパク質に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 41647、配列識別番号: 50668、配列識別番号: 50905、配列識別番号: 51039 から 51040、配列識別番号: 68257、配列識別番号: 68285、配列識別番号: 68288、配列識別番号: 68290、配列識別番号: 68305、配列識別番号: 68389、配列識別番号: 68419、配列識別番号: 68470、配列識別番号: 68510、配列識別番号: 68519、配列識別番号: 68592、配列識別番号: 68603、配列識別番号: 68684、配列識別番号: 68688、配列識別番号: 68747、配列識別番号: 68760、配列識別番号: 68778、配列識別番号: 68786、配列識別番号: 68855、配列識別番号: 68898、配列識別番号: 68900、配列識別番号: 68927、配列識別番号: 68961、配列識別番号: 69026、配列識別番号: 69041、配列識別番号: 69047、配列識別番号: 69148、配列識別番号: 69173、配列識別番号: 69180、配列識別番号: 69192、配列識別番号: 69227、配列識別番号: 69311、配列識別番号: 69330、配列識別番号: 69333、配列識別番号: 69346、配列識別番号: 69356、配列識別番号: 69393、配列識別番号: 69421、配列識別番号: 69437、配列識別番号: 69451、配列識別番号: 69500、配列識別番号: 69505、配列識別番号: 69517、配列識別番号: 69540、配列識別番号: 69559、配列識別番号: 69571、配列識別番号: 69586、配列識別番号: 69589、配列識別番号: 69591、配列識別番号: 69619、配列識別番号: 69631、配列識別番号: 69633、配列識別番号: 69644、配列識別番号: 69649、配列識別番号: 69747、配列識別番号: 69764、配列識別番号: 69767、配列識別番号: 69790、配列識別番号: 69832、配列識別番号: 69836、配列識別番号: 69882、配列識別番号: 69999、配列識別番号: 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一部の実施形態では、MAGC3 タンパク質に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 68285、配列識別番号: 68290、配列識別番号: 68305、配列識別番号: 77091、配列識別番号: 77210、配列識別番号: 84188、配列識別番号: 87951、配列識別番号: 88144、配列識別番号: 95593 から 95664 を含む。いくつかの実施形態では、 MAGC3ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 68285、配列識別番号: 68290、配列識別番号: 68305、配列識別番号: 77091、配列識別番号: 77210、配列識別番号: 84188、配列識別番号: 87951、配列識別番号: 88144、または 配列識別番号: 95593 から 95664と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAGC3 タンパク質に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 41647、配列識別番号: 50668、配列識別番号: 50905、配列識別番号: 51039 から 51040、配列識別番号: 68257、配列識別番号: 68285、配列識別番号: 68288、配列識別番号: 68290、配列識別番号: 68305、配列識別番号: 68389、配列識別番号: 68419、配列識別番号: 68470、配列識別番号: 68510、配列識別番号: 68519、配列識別番号: 68592、配列識別番号: 68603、配列識別番号: 68684、配列識別番号: 68688、配列識別番号: 68747、配列識別番号: 68760、配列識別番号: 68778、配列識別番号: 68786、配列識別番号: 68855、配列識別番号: 68898、配列識別番号: 68900、配列識別番号: 68927、配列識別番号: 68961、配列識別番号: 69026、配列識別番号: 69041、配列識別番号: 69047、配列識別番号: 69148、配列識別番号: 69173、配列識別番号: 69180、配列識別番号: 69192、配列識別番号: 69227、配列識別番号: 69311、配列識別番号: 69330、配列識別番号: 69333、配列識別番号: 69346、配列識別番号: 69356、配列識別番号: 69393、配列識別番号: 69421、配列識別番号: 69437、配列識別番号: 69451、配列識別番号: 69500、配列識別番号: 69505、配列識別番号: 69517、配列識別番号: 69540、配列識別番号: 69559、配列識別番号: 69571、配列識別番号: 69586、配列識別番号: 69589、配列識別番号: 69591、配列識別番号: 69619、配列識別番号: 69631、配列識別番号: 69633、配列識別番号: 69644、配列識別番号: 69649、配列識別番号: 69747、配列識別番号: 69764、配列識別番号: 69767、配列識別番号: 69790、配列識別番号: 69832、配列識別番号: 69836、配列識別番号: 69882、配列識別番号: 69999、配列識別番号: 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一部の実施形態では、SSX2 タンパク質に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 162383 から 162453 を含む。いくつかの実施形態では、 SSX2ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 162383 から 162453と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、SSX2 タンパク質に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 162383 から 166443 を含む。いくつかの実施形態では、 SSX2ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 162383 から 166443と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、SSX2 タンパク質に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 162383 から 162453 を含む。いくつかの実施形態では、 SSX2ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 162383 から 162453と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、SSX2 タンパク質に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 162383 から 166443 を含む。いくつかの実施形態では、 SSX2ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 162383 から 166443と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PRAME タンパク質に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 144109 から 144188 を含む。いくつかの実施形態では、 PRAMEワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 144109 から 144188と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PRAME タンパク質に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 144109 から 162382 を含む。いくつかの実施形態では、 PRAMEワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 144109 から 162382と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PRAME タンパク質に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 144109 から 144188 を含む。いくつかの実施形態では、 PRAMEワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 144109 から 144188と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PRAME タンパク質に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 144109 から 162382 を含む。いくつかの実施形態では、 PRAMEワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 144109 から 162382と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KKLC1 タンパク質に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 37110 から 37174 を含む。いくつかの実施形態では、 KKLC1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 37110 から 37174と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KKLC1 タンパク質に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 37110 から 41320 を含む。いくつかの実施形態では、 KKLC1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 37110 から 41320と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KKLC1 タンパク質に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 37110 から 37174 を含む。いくつかの実施形態では、 KKLC1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 37110 から 37174と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KKLC1 タンパク質に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 37110 から 41320 を含む。いくつかの実施形態では、 KKLC1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 37110 から 41320と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PMEL タンパク質に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 125134 から 125218 を含む。いくつかの実施形態では、 PMELワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 125134 から 125218と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PMEL タンパク質に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 125134 から 144108 を含む。いくつかの実施形態では、 PMELワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 125134 から 144108と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PMEL タンパク質に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 125134 から 125218 を含む。いくつかの実施形態では、 PMELワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 125134 から 125218と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PMEL タンパク質に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 125134 から 144108 を含む。いくつかの実施形態では、 PMELワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 125134 から 144108と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TYRP1 タンパク質に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 166444 から 166531 を含む。いくつかの実施形態では、 TYRP1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 166444 から 166531と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TYRP1 タンパク質に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 166444 から 182573 を含む。いくつかの実施形態では、 TYRP1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 166444 から 182573と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TYRP1 タンパク質に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 166444 から 166531 を含む。いくつかの実施形態では、 TYRP1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 166444 から 166531と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TYRP1 タンパク質に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 166444 から 182573 を含む。いくつかの実施形態では、 TYRP1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 166444 から 182573と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TYRP2 タンパク質に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 166476、配列識別番号: 167118、配列識別番号: 169740、配列識別番号: 173412、配列識別番号: 179404、配列識別番号: 182574 から 182654 を含む。いくつかの実施形態では、 TYRP2ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 166476、配列識別番号: 167118、配列識別番号: 169740、配列識別番号: 173412、配列識別番号: 179404、または 配列識別番号: 182574 から 182654と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TYRP2 タンパク質に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 166476 から 166477、配列識別番号: 166486、配列識別番号: 166513、配列識別番号: 166591、配列識別番号: 166606、配列識別番号: 166629、配列識別番号: 166641、配列識別番号: 166667、配列識別番号: 166678 から 166679、配列識別番号: 166795、配列識別番号: 166799、配列識別番号: 166834、配列識別番号: 166854、配列識別番号: 166909、配列識別番号: 166912、配列識別番号: 166942、配列識別番号: 166991 から 166992、配列識別番号: 167062、配列識別番号: 167067、配列識別番号: 167073 から 167074、配列識別番号: 167106、配列識別番号: 167118、配列識別番号: 167151、配列識別番号: 167177、配列識別番号: 167241、配列識別番号: 167271、配列識別番号: 167395、配列識別番号: 167491、配列識別番号: 167505、配列識別番号: 167687、配列識別番号: 167736、配列識別番号: 167740、配列識別番号: 167743、配列識別番号: 167755、配列識別番号: 167810、配列識別番号: 167831、配列識別番号: 167837、配列識別番号: 167844、配列識別番号: 167847 から 167848、配列識別番号: 167859、配列識別番号: 167880、配列識別番号: 167891、配列識別番号: 167897、配列識別番号: 167933、配列識別番号: 168094、配列識別番号: 168111 から 168112、配列識別番号: 168132、配列識別番号: 168144、配列識別番号: 168167、配列識別番号: 168211、配列識別番号: 168252、配列識別番号: 168268、配列識別番号: 168343、配列識別番号: 168354、配列識別番号: 168376、配列識別番号: 168396、配列識別番号: 168410、配列識別番号: 168423、配列識別番号: 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一部の実施形態では、TYRP2 タンパク質に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 166476、配列識別番号: 167118、配列識別番号: 169740、配列識別番号: 173412、配列識別番号: 179404、配列識別番号: 182574 から 182654 を含む。いくつかの実施形態では、 TYRP2ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 166476、配列識別番号: 167118、配列識別番号: 169740、配列識別番号: 173412、配列識別番号: 179404、または 配列識別番号: 182574 から 182654と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TYRP2 タンパク質に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 166476 から 166477、配列識別番号: 166486、配列識別番号: 166513、配列識別番号: 166591、配列識別番号: 166606、配列識別番号: 166629、配列識別番号: 166641、配列識別番号: 166667、配列識別番号: 166678 から 166679、配列識別番号: 166795、配列識別番号: 166799、配列識別番号: 166834、配列識別番号: 166854、配列識別番号: 166909、配列識別番号: 166912、配列識別番号: 166942、配列識別番号: 166991 から 166992、配列識別番号: 167062、配列識別番号: 167067、配列識別番号: 167073 から 167074、配列識別番号: 167106、配列識別番号: 167118、配列識別番号: 167151、配列識別番号: 167177、配列識別番号: 167241、配列識別番号: 167271、配列識別番号: 167395、配列識別番号: 167491、配列識別番号: 167505、配列識別番号: 167687、配列識別番号: 167736、配列識別番号: 167740、配列識別番号: 167743、配列識別番号: 167755、配列識別番号: 167810、配列識別番号: 167831、配列識別番号: 167837、配列識別番号: 167844、配列識別番号: 167847 から 167848、配列識別番号: 167859、配列識別番号: 167880、配列識別番号: 167891、配列識別番号: 167897、配列識別番号: 167933、配列識別番号: 168094、配列識別番号: 168111 から 168112、配列識別番号: 168132、配列識別番号: 168144、配列識別番号: 168167、配列識別番号: 168211、配列識別番号: 168252、配列識別番号: 168268、配列識別番号: 168343、配列識別番号: 168354、配列識別番号: 168376、配列識別番号: 168396、配列識別番号: 168410、配列識別番号: 168423、配列識別番号: 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一部の実施形態では、MAR1 タンパク質に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 113808 から 113869 を含む。いくつかの実施形態では、 MAR1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 113808 から 113869と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAR1 タンパク質に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 113808 から 116477 を含む。いくつかの実施形態では、 MAR1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 113808 から 116477と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAR1 タンパク質に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 113808 から 113869 を含む。いくつかの実施形態では、 MAR1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 113808 から 113869と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAR1 タンパク質に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 113808 から 116477 を含む。いくつかの実施形態では、 MAR1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 113808 から 116477と同一のアミノ酸配列を含む。
MHCクラスIワクチンペプチドのその他のアミノ酸配列は、配列リスト（配列識別番号: 760 から 22727、配列識別番号: 28865 から 34168、配列識別番号: 37175 から 41320、配列識別番号: 41345、配列識別番号: 41347、配列識別番号: 41351 から 41352、配列識別番号: 41366、配列識別番号: 41382、配列識別番号: 41392、配列識別番号: 41396、配列識別番号: 41398 から 51433、配列識別番号: 51511 から 60455、配列識別番号: 60528 から 68237、配列識別番号: 68257、配列識別番号: 68288、配列識別番号: 68322 から 95592、配列識別番号: 95665 から 113807、配列識別番号: 113870 から 116477、配列識別番号: 125219 から 144108、配列識別番号: 144189 から 162382、配列識別番号: 162454 から 166443、配列識別番号: 166477、配列識別番号: 166486、配列識別番号: 166513、配列識別番号: 166532 から 182573、配列識別番号: 182655 から 197896）に記載されている。いくつかの実施形態では、ここで（配列識別番号: 1 から 474、配列識別番号: 760 から 22727、配列識別番号: 28796 から 34168、配列識別番号: 37110 から 116477、配列識別番号: 125134 から 197896）列挙されたMHCクラス Iペプチドの任意の組み合わせを用いて、約2～約40個のペプチドを有する複合ペプチドワクチンを製造することができる。いくつかの実施形態では、複合ワクチン中のペプチド(配列識別番号: 1 から 474、配列識別番号: 760 から 22727、配列識別番号: 28796 から 34168、配列識別番号: 37110 から 116477、配列識別番号: 125134 から 197896)のいずれかは、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 1 から 474、配列識別番号: 760 から 22727、配列識別番号: 28796 から 34168、配列識別番号: 37110 から 116477、または 配列識別番号: 125134 から 197896と同一のアミノ酸配列を含む、または含有する。
MHC クラス II ペプチド配列
MHC クラス II ペプチド配列
いくつかの実施形態では、ペプチドワクチン（単一標的ワクチンまたは複合多目的ワクチン）は、各ペプチドが20個以上のアミノ酸からなる約1～40個のMHCクラスIIペプチドを含む。いくつかの実施形態では、MHCクラスIペプチドワクチンは、1つ以上の CTG1B、KKLC1、MAGA1、MAGA3、MAGA4、MAGC1、MAGC3、MAR1、PMEL、PRAME、SSX2、TYRP1、または TYRP2タンパク質標的を対象とする。いくつかの実施形態では、MHCクラスIIペプチドワクチンは、1つ以上の 膵がん、皮膚がん、甲状腺がん、脳腫瘍、直腸結腸がん、気管支がんと肺がん、乳がん、または 卵巣がん 適応症を対象としている。
一部の実施形態では、CTG1B タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 197897 から 197910 を含む。いくつかの実施形態では、 CTG1Bワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 197897 から 197910と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、CTG1B タンパク質に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 197897 から 203516 を含む。いくつかの実施形態では、 CTG1Bワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 197897 から 203516と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、CTG1B タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 197897 から 197910 を含む。いくつかの実施形態では、 CTG1Bワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 197897 から 197910と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、CTG1B タンパク質に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 197897 から 203516 を含む。いくつかの実施形態では、 CTG1Bワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 197897 から 203516と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAGA1 タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 211901 から 211917 を含む。いくつかの実施形態では、 MAGA1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 211901 から 211917と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAGA1 タンパク質に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 211901 から 223622 を含む。いくつかの実施形態では、 MAGA1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 211901 から 223622と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAGA1 タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 211901 から 211917 を含む。いくつかの実施形態では、 MAGA1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 211901 から 211917と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAGA1 タンパク質に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 211901 から 223622 を含む。いくつかの実施形態では、 MAGA1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 211901 から 223622と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAGA3 タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 223623 から 223640 を含む。いくつかの実施形態では、 MAGA3ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 223623 から 223640と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAGA3 タンパク質に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 212187 から 212190、配列識別番号: 212668 から 212673、配列識別番号: 212836 から 212837、配列識別番号: 213320 から 213323、配列識別番号: 213359、配列識別番号: 213380 から 213382、配列識別番号: 213391 から 213395、配列識別番号: 213432、配列識別番号: 214285 から 214290、配列識別番号: 215204 から 215205、配列識別番号: 215677 から 215682、配列識別番号: 216240、配列識別番号: 216385、配列識別番号: 216393、配列識別番号: 216397、配列識別番号: 217119 から 217137、配列識別番号: 217185、配列識別番号: 217187、配列識別番号: 217190、配列識別番号: 217659 から 217660、配列識別番号: 219238 から 219245、配列識別番号: 219322 から 219323、配列識別番号: 219380 から 219386、配列識別番号: 219432 から 219446、配列識別番号: 219545 から 219546、配列識別番号: 219774、配列識別番号: 219777、配列識別番号: 220091、配列識別番号: 221996 から 222005、配列識別番号: 223185、配列識別番号: 223187、配列識別番号: 223251、配列識別番号: 223253、配列識別番号: 223258、配列識別番号: 223261、配列識別番号: 223264、配列識別番号: 223268、配列識別番号: 223272、配列識別番号: 223274、配列識別番号: 223277、配列識別番号: 223623 から 236015 を含む。いくつかの実施形態では、 MAGA3ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 212187 から 212190、配列識別番号: 212668 から 212673、配列識別番号: 212836 から 212837、配列識別番号: 213320 から 213323、配列識別番号: 213359、配列識別番号: 213380 から 213382、配列識別番号: 213391 から 213395、配列識別番号: 213432、配列識別番号: 214285 から 214290、配列識別番号: 215204 から 215205、配列識別番号: 215677 から 215682、配列識別番号: 216240、配列識別番号: 216385、配列識別番号: 216393、配列識別番号: 216397、配列識別番号: 217119 から 217137、配列識別番号: 217185、配列識別番号: 217187、配列識別番号: 217190、配列識別番号: 217659 から 217660、配列識別番号: 219238 から 219245、配列識別番号: 219322 から 219323、配列識別番号: 219380 から 219386、配列識別番号: 219432 から 219446、配列識別番号: 219545 から 219546、配列識別番号: 219774、配列識別番号: 219777、配列識別番号: 220091、配列識別番号: 221996 から 222005、配列識別番号: 223185、配列識別番号: 223187、配列識別番号: 223251、配列識別番号: 223253、配列識別番号: 223258、配列識別番号: 223261、配列識別番号: 223264、配列識別番号: 223268、配列識別番号: 223272、配列識別番号: 223274、配列識別番号: 223277、または 配列識別番号: 223623 から 236015と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAGA3 タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 223623 から 223640 を含む。いくつかの実施形態では、 MAGA3ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 223623 から 223640と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAGA3 タンパク質に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 212187 から 212190、配列識別番号: 212668 から 212673、配列識別番号: 212836 から 212837、配列識別番号: 213320 から 213323、配列識別番号: 213359、配列識別番号: 213380 から 213382、配列識別番号: 213391 から 213395、配列識別番号: 213432、配列識別番号: 214285 から 214290、配列識別番号: 215204 から 215205、配列識別番号: 215677 から 215682、配列識別番号: 216240、配列識別番号: 216385、配列識別番号: 216393、配列識別番号: 216397、配列識別番号: 217119 から 217137、配列識別番号: 217185、配列識別番号: 217187、配列識別番号: 217190、配列識別番号: 217659 から 217660、配列識別番号: 219238 から 219245、配列識別番号: 219322 から 219323、配列識別番号: 219380 から 219386、配列識別番号: 219432 から 219446、配列識別番号: 219545 から 219546、配列識別番号: 219774、配列識別番号: 219777、配列識別番号: 220091、配列識別番号: 221996 から 222005、配列識別番号: 223185、配列識別番号: 223187、配列識別番号: 223251、配列識別番号: 223253、配列識別番号: 223258、配列識別番号: 223261、配列識別番号: 223264、配列識別番号: 223268、配列識別番号: 223272、配列識別番号: 223274、配列識別番号: 223277、配列識別番号: 223623 から 236015 を含む。いくつかの実施形態では、 MAGA3ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 212187 から 212190、配列識別番号: 212668 から 212673、配列識別番号: 212836 から 212837、配列識別番号: 213320 から 213323、配列識別番号: 213359、配列識別番号: 213380 から 213382、配列識別番号: 213391 から 213395、配列識別番号: 213432、配列識別番号: 214285 から 214290、配列識別番号: 215204 から 215205、配列識別番号: 215677 から 215682、配列識別番号: 216240、配列識別番号: 216385、配列識別番号: 216393、配列識別番号: 216397、配列識別番号: 217119 から 217137、配列識別番号: 217185、配列識別番号: 217187、配列識別番号: 217190、配列識別番号: 217659 から 217660、配列識別番号: 219238 から 219245、配列識別番号: 219322 から 219323、配列識別番号: 219380 から 219386、配列識別番号: 219432 から 219446、配列識別番号: 219545 から 219546、配列識別番号: 219774、配列識別番号: 219777、配列識別番号: 220091、配列識別番号: 221996 から 222005、配列識別番号: 223185、配列識別番号: 223187、配列識別番号: 223251、配列識別番号: 223253、配列識別番号: 223258、配列識別番号: 223261、配列識別番号: 223264、配列識別番号: 223268、配列識別番号: 223272、配列識別番号: 223274、配列識別番号: 223277、または 配列識別番号: 223623 から 236015と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAGA4 タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 236016 から 236033 を含む。いくつかの実施形態では、 MAGA4ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 236016 から 236033と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAGA4 タンパク質に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 211911、配列識別番号: 212086 から 212095、配列識別番号: 212435 から 212440、配列識別番号: 212681 から 212684、配列識別番号: 212858 から 212860、配列識別番号: 213516 から 213517、配列識別番号: 213529 から 213531、配列識別番号: 213602 から 213611、配列識別番号: 213719 から 213720、配列識別番号: 213899、配列識別番号: 214004 から 214012、配列識別番号: 214607、配列識別番号: 214647 から 214649、配列識別番号: 214672 から 214679、配列識別番号: 214774 から 214775、配列識別番号: 214777、配列識別番号: 214779、配列識別番号: 214782、配列識別番号: 215373 から 215415、配列識別番号: 215494、配列識別番号: 215497、配列識別番号: 215679、配列識別番号: 216244、配列識別番号: 216246、配列識別番号: 216383 から 216401、配列識別番号: 217184 から 217192、配列識別番号: 217200、配列識別番号: 217362、配列識別番号: 217708 から 217712、配列識別番号: 217719、配列識別番号: 219238、配列識別番号: 219742 から 219744、配列識別番号: 219747、配列識別番号: 219749、配列識別番号: 219751、配列識別番号: 219773 から 219781、配列識別番号: 219994 から 220030、配列識別番号: 220318 から 220319、配列識別番号: 220327、配列識別番号: 220670、配列識別番号: 220815、配列識別番号: 220820、配列識別番号: 221197 から 221234、配列識別番号: 221998、配列識別番号: 222000、配列識別番号: 223092、配列識別番号: 223095、配列識別番号: 223097、配列識別番号: 223099、配列識別番号: 223119、配列識別番号: 223121、配列識別番号: 223184 から 223190、配列識別番号: 223250 から 223283、配列識別番号: 223319、配列識別番号: 230922、配列識別番号: 232805 から 232806、配列識別番号: 232846、配列識別番号: 236016 から 247058 を含む。いくつかの実施形態では、 MAGA4ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 211911、配列識別番号: 212086 から 212095、配列識別番号: 212435 から 212440、配列識別番号: 212681 から 212684、配列識別番号: 212858 から 212860、配列識別番号: 213516 から 213517、配列識別番号: 213529 から 213531、配列識別番号: 213602 から 213611、配列識別番号: 213719 から 213720、配列識別番号: 213899、配列識別番号: 214004 から 214012、配列識別番号: 214607、配列識別番号: 214647 から 214649、配列識別番号: 214672 から 214679、配列識別番号: 214774 から 214775、配列識別番号: 214777、配列識別番号: 214779、配列識別番号: 214782、配列識別番号: 215373 から 215415、配列識別番号: 215494、配列識別番号: 215497、配列識別番号: 215679、配列識別番号: 216244、配列識別番号: 216246、配列識別番号: 216383 から 216401、配列識別番号: 217184 から 217192、配列識別番号: 217200、配列識別番号: 217362、配列識別番号: 217708 から 217712、配列識別番号: 217719、配列識別番号: 219238、配列識別番号: 219742 から 219744、配列識別番号: 219747、配列識別番号: 219749、配列識別番号: 219751、配列識別番号: 219773 から 219781、配列識別番号: 219994 から 220030、配列識別番号: 220318 から 220319、配列識別番号: 220327、配列識別番号: 220670、配列識別番号: 220815、配列識別番号: 220820、配列識別番号: 221197 から 221234、配列識別番号: 221998、配列識別番号: 222000、配列識別番号: 223092、配列識別番号: 223095、配列識別番号: 223097、配列識別番号: 223099、配列識別番号: 223119、配列識別番号: 223121、配列識別番号: 223184 から 223190、配列識別番号: 223250 から 223283、配列識別番号: 223319、配列識別番号: 230922、配列識別番号: 232805 から 232806、配列識別番号: 232846、または 配列識別番号: 236016 から 247058と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAGA4 タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 236016 から 236033 を含む。いくつかの実施形態では、 MAGA4ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 236016 から 236033と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAGA4 タンパク質に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 211911、配列識別番号: 212086 から 212095、配列識別番号: 212435 から 212440、配列識別番号: 212681 から 212684、配列識別番号: 212858 から 212860、配列識別番号: 213516 から 213517、配列識別番号: 213529 から 213531、配列識別番号: 213602 から 213611、配列識別番号: 213719 から 213720、配列識別番号: 213899、配列識別番号: 214004 から 214012、配列識別番号: 214607、配列識別番号: 214647 から 214649、配列識別番号: 214672 から 214679、配列識別番号: 214774 から 214775、配列識別番号: 214777、配列識別番号: 214779、配列識別番号: 214782、配列識別番号: 215373 から 215415、配列識別番号: 215494、配列識別番号: 215497、配列識別番号: 215679、配列識別番号: 216244、配列識別番号: 216246、配列識別番号: 216383 から 216401、配列識別番号: 217184 から 217192、配列識別番号: 217200、配列識別番号: 217362、配列識別番号: 217708 から 217712、配列識別番号: 217719、配列識別番号: 219238、配列識別番号: 219742 から 219744、配列識別番号: 219747、配列識別番号: 219749、配列識別番号: 219751、配列識別番号: 219773 から 219781、配列識別番号: 219994 から 220030、配列識別番号: 220318 から 220319、配列識別番号: 220327、配列識別番号: 220670、配列識別番号: 220815、配列識別番号: 220820、配列識別番号: 221197 から 221234、配列識別番号: 221998、配列識別番号: 222000、配列識別番号: 223092、配列識別番号: 223095、配列識別番号: 223097、配列識別番号: 223099、配列識別番号: 223119、配列識別番号: 223121、配列識別番号: 223184 から 223190、配列識別番号: 223250 から 223283、配列識別番号: 223319、配列識別番号: 230922、配列識別番号: 232805 から 232806、配列識別番号: 232846、配列識別番号: 236016 から 247058 を含む。いくつかの実施形態では、 MAGA4ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 211911、配列識別番号: 212086 から 212095、配列識別番号: 212435 から 212440、配列識別番号: 212681 から 212684、配列識別番号: 212858 から 212860、配列識別番号: 213516 から 213517、配列識別番号: 213529 から 213531、配列識別番号: 213602 から 213611、配列識別番号: 213719 から 213720、配列識別番号: 213899、配列識別番号: 214004 から 214012、配列識別番号: 214607、配列識別番号: 214647 から 214649、配列識別番号: 214672 から 214679、配列識別番号: 214774 から 214775、配列識別番号: 214777、配列識別番号: 214779、配列識別番号: 214782、配列識別番号: 215373 から 215415、配列識別番号: 215494、配列識別番号: 215497、配列識別番号: 215679、配列識別番号: 216244、配列識別番号: 216246、配列識別番号: 216383 から 216401、配列識別番号: 217184 から 217192、配列識別番号: 217200、配列識別番号: 217362、配列識別番号: 217708 から 217712、配列識別番号: 217719、配列識別番号: 219238、配列識別番号: 219742 から 219744、配列識別番号: 219747、配列識別番号: 219749、配列識別番号: 219751、配列識別番号: 219773 から 219781、配列識別番号: 219994 から 220030、配列識別番号: 220318 から 220319、配列識別番号: 220327、配列識別番号: 220670、配列識別番号: 220815、配列識別番号: 220820、配列識別番号: 221197 から 221234、配列識別番号: 221998、配列識別番号: 222000、配列識別番号: 223092、配列識別番号: 223095、配列識別番号: 223097、配列識別番号: 223099、配列識別番号: 223119、配列識別番号: 223121、配列識別番号: 223184 から 223190、配列識別番号: 223250 から 223283、配列識別番号: 223319、配列識別番号: 230922、配列識別番号: 232805 から 232806、配列識別番号: 232846、または 配列識別番号: 236016 から 247058と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAGC1 タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 247059 から 247093 を含む。いくつかの実施形態では、 MAGC1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 247059 から 247093と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAGC1 タンパク質に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 247059 から 281349 を含む。いくつかの実施形態では、 MAGC1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 247059 から 281349と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAGC1 タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 247059 から 247093 を含む。いくつかの実施形態では、 MAGC1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 247059 から 247093と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAGC1 タンパク質に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 247059 から 281349 を含む。いくつかの実施形態では、 MAGC1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 247059 から 281349と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAGC3 タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 281350 から 281378 を含む。いくつかの実施形態では、 MAGC3ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 281350 から 281378と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAGC3 タンパク質に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 217120、配列識別番号: 247270、配列識別番号: 248009、配列識別番号: 248159 から 248160、配列識別番号: 248735 から 248738、配列識別番号: 249358 から 249362、配列識別番号: 249690 から 249691、配列識別番号: 252562 から 252564、配列識別番号: 252836 から 252837、配列識別番号: 256214、配列識別番号: 256221、配列識別番号: 256226、配列識別番号: 256229、配列識別番号: 256235、配列識別番号: 256705、配列識別番号: 257337、配列識別番号: 257341、配列識別番号: 257345、配列識別番号: 257995、配列識別番号: 258292、配列識別番号: 258295、配列識別番号: 258614 から 258616、配列識別番号: 259467、配列識別番号: 259471、配列識別番号: 259474、配列識別番号: 260118、配列識別番号: 260122、配列識別番号: 260126、配列識別番号: 260131、配列識別番号: 260138、配列識別番号: 260145、配列識別番号: 260153、配列識別番号: 260367 から 260384、配列識別番号: 260407、配列識別番号: 260412、配列識別番号: 261788、配列識別番号: 261790、配列識別番号: 261792 から 261793、配列識別番号: 261795、配列識別番号: 261798、配列識別番号: 261800、配列識別番号: 261803、配列識別番号: 261805、配列識別番号: 261809、配列識別番号: 261811、配列識別番号: 261814、配列識別番号: 261816、配列識別番号: 261821、配列識別番号: 261823、配列識別番号: 261830、配列識別番号: 261832、配列識別番号: 261837、配列識別番号: 261839、配列識別番号: 262119、配列識別番号: 262122、配列識別番号: 262261 から 262285、配列識別番号: 262313、配列識別番号: 262318、配列識別番号: 263471 から 263474、配列識別番号: 263494、配列識別番号: 263498、配列識別番号: 266653 から 266654、配列識別番号: 269139、配列識別番号: 269143、配列識別番号: 269149、配列識別番号: 269156、配列識別番号: 269169、配列識別番号: 270516 から 270517、配列識別番号: 270519 から 270520、配列識別番号: 270523 から 270524、配列識別番号: 270527 から 270528、配列識別番号: 272016、配列識別番号: 272020、配列識別番号: 272214 から 272222、配列識別番号: 272243、配列識別番号: 272248、配列識別番号: 272896、配列識別番号: 273018 から 273020、配列識別番号: 278350 から 278351、配列識別番号: 278355、配列識別番号: 278358 から 278359、配列識別番号: 278361 から 278362、配列識別番号: 278364、配列識別番号: 278367、配列識別番号: 278369、配列識別番号: 278371、配列識別番号: 278373、配列識別番号: 278375、配列識別番号: 278377、配列識別番号: 278383、配列識別番号: 278385、配列識別番号: 278388、配列識別番号: 278390、配列識別番号: 278394、配列識別番号: 278396、配列識別番号: 281013 から 281014、配列識別番号: 281018、配列識別番号: 281022、配列識別番号: 281026、配列識別番号: 281031、配列識別番号: 281037 から 281038、配列識別番号: 281044 から 281045、配列識別番号: 281052 から 281053、配列識別番号: 281151 から 281152、配列識別番号: 281155、配列識別番号: 281159、配列識別番号: 281162 から 281163、配列識別番号: 281165 から 281166、配列識別番号: 281169、配列識別番号: 281171、配列識別番号: 281174、配列識別番号: 281176、配列識別番号: 281179、配列識別番号: 281181、配列識別番号: 281184、配列識別番号: 281186、配列識別番号: 281190、配列識別番号: 281192、配列識別番号: 281197、配列識別番号: 281199、配列識別番号: 281350 から 305565 を含む。いくつかの実施形態では、 MAGC3ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 217120、配列識別番号: 247270、配列識別番号: 248009、配列識別番号: 248159 から 248160、配列識別番号: 248735 から 248738、配列識別番号: 249358 から 249362、配列識別番号: 249690 から 249691、配列識別番号: 252562 から 252564、配列識別番号: 252836 から 252837、配列識別番号: 256214、配列識別番号: 256221、配列識別番号: 256226、配列識別番号: 256229、配列識別番号: 256235、配列識別番号: 256705、配列識別番号: 257337、配列識別番号: 257341、配列識別番号: 257345、配列識別番号: 257995、配列識別番号: 258292、配列識別番号: 258295、配列識別番号: 258614 から 258616、配列識別番号: 259467、配列識別番号: 259471、配列識別番号: 259474、配列識別番号: 260118、配列識別番号: 260122、配列識別番号: 260126、配列識別番号: 260131、配列識別番号: 260138、配列識別番号: 260145、配列識別番号: 260153、配列識別番号: 260367 から 260384、配列識別番号: 260407、配列識別番号: 260412、配列識別番号: 261788、配列識別番号: 261790、配列識別番号: 261792 から 261793、配列識別番号: 261795、配列識別番号: 261798、配列識別番号: 261800、配列識別番号: 261803、配列識別番号: 261805、配列識別番号: 261809、配列識別番号: 261811、配列識別番号: 261814、配列識別番号: 261816、配列識別番号: 261821、配列識別番号: 261823、配列識別番号: 261830、配列識別番号: 261832、配列識別番号: 261837、配列識別番号: 261839、配列識別番号: 262119、配列識別番号: 262122、配列識別番号: 262261 から 262285、配列識別番号: 262313、配列識別番号: 262318、配列識別番号: 263471 から 263474、配列識別番号: 263494、配列識別番号: 263498、配列識別番号: 266653 から 266654、配列識別番号: 269139、配列識別番号: 269143、配列識別番号: 269149、配列識別番号: 269156、配列識別番号: 269169、配列識別番号: 270516 から 270517、配列識別番号: 270519 から 270520、配列識別番号: 270523 から 270524、配列識別番号: 270527 から 270528、配列識別番号: 272016、配列識別番号: 272020、配列識別番号: 272214 から 272222、配列識別番号: 272243、配列識別番号: 272248、配列識別番号: 272896、配列識別番号: 273018 から 273020、配列識別番号: 278350 から 278351、配列識別番号: 278355、配列識別番号: 278358 から 278359、配列識別番号: 278361 から 278362、配列識別番号: 278364、配列識別番号: 278367、配列識別番号: 278369、配列識別番号: 278371、配列識別番号: 278373、配列識別番号: 278375、配列識別番号: 278377、配列識別番号: 278383、配列識別番号: 278385、配列識別番号: 278388、配列識別番号: 278390、配列識別番号: 278394、配列識別番号: 278396、配列識別番号: 281013 から 281014、配列識別番号: 281018、配列識別番号: 281022、配列識別番号: 281026、配列識別番号: 281031、配列識別番号: 281037 から 281038、配列識別番号: 281044 から 281045、配列識別番号: 281052 から 281053、配列識別番号: 281151 から 281152、配列識別番号: 281155、配列識別番号: 281159、配列識別番号: 281162 から 281163、配列識別番号: 281165 から 281166、配列識別番号: 281169、配列識別番号: 281171、配列識別番号: 281174、配列識別番号: 281176、配列識別番号: 281179、配列識別番号: 281181、配列識別番号: 281184、配列識別番号: 281186、配列識別番号: 281190、配列識別番号: 281192、配列識別番号: 281197、配列識別番号: 281199、または 配列識別番号: 281350 から 305565と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAGC3 タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 281350 から 281378 を含む。いくつかの実施形態では、 MAGC3ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 281350 から 281378と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAGC3 タンパク質に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 217120、配列識別番号: 247270、配列識別番号: 248009、配列識別番号: 248159 から 248160、配列識別番号: 248735 から 248738、配列識別番号: 249358 から 249362、配列識別番号: 249690 から 249691、配列識別番号: 252562 から 252564、配列識別番号: 252836 から 252837、配列識別番号: 256214、配列識別番号: 256221、配列識別番号: 256226、配列識別番号: 256229、配列識別番号: 256235、配列識別番号: 256705、配列識別番号: 257337、配列識別番号: 257341、配列識別番号: 257345、配列識別番号: 257995、配列識別番号: 258292、配列識別番号: 258295、配列識別番号: 258614 から 258616、配列識別番号: 259467、配列識別番号: 259471、配列識別番号: 259474、配列識別番号: 260118、配列識別番号: 260122、配列識別番号: 260126、配列識別番号: 260131、配列識別番号: 260138、配列識別番号: 260145、配列識別番号: 260153、配列識別番号: 260367 から 260384、配列識別番号: 260407、配列識別番号: 260412、配列識別番号: 261788、配列識別番号: 261790、配列識別番号: 261792 から 261793、配列識別番号: 261795、配列識別番号: 261798、配列識別番号: 261800、配列識別番号: 261803、配列識別番号: 261805、配列識別番号: 261809、配列識別番号: 261811、配列識別番号: 261814、配列識別番号: 261816、配列識別番号: 261821、配列識別番号: 261823、配列識別番号: 261830、配列識別番号: 261832、配列識別番号: 261837、配列識別番号: 261839、配列識別番号: 262119、配列識別番号: 262122、配列識別番号: 262261 から 262285、配列識別番号: 262313、配列識別番号: 262318、配列識別番号: 263471 から 263474、配列識別番号: 263494、配列識別番号: 263498、配列識別番号: 266653 から 266654、配列識別番号: 269139、配列識別番号: 269143、配列識別番号: 269149、配列識別番号: 269156、配列識別番号: 269169、配列識別番号: 270516 から 270517、配列識別番号: 270519 から 270520、配列識別番号: 270523 から 270524、配列識別番号: 270527 から 270528、配列識別番号: 272016、配列識別番号: 272020、配列識別番号: 272214 から 272222、配列識別番号: 272243、配列識別番号: 272248、配列識別番号: 272896、配列識別番号: 273018 から 273020、配列識別番号: 278350 から 278351、配列識別番号: 278355、配列識別番号: 278358 から 278359、配列識別番号: 278361 から 278362、配列識別番号: 278364、配列識別番号: 278367、配列識別番号: 278369、配列識別番号: 278371、配列識別番号: 278373、配列識別番号: 278375、配列識別番号: 278377、配列識別番号: 278383、配列識別番号: 278385、配列識別番号: 278388、配列識別番号: 278390、配列識別番号: 278394、配列識別番号: 278396、配列識別番号: 281013 から 281014、配列識別番号: 281018、配列識別番号: 281022、配列識別番号: 281026、配列識別番号: 281031、配列識別番号: 281037 から 281038、配列識別番号: 281044 から 281045、配列識別番号: 281052 から 281053、配列識別番号: 281151 から 281152、配列識別番号: 281155、配列識別番号: 281159、配列識別番号: 281162 から 281163、配列識別番号: 281165 から 281166、配列識別番号: 281169、配列識別番号: 281171、配列識別番号: 281174、配列識別番号: 281176、配列識別番号: 281179、配列識別番号: 281181、配列識別番号: 281184、配列識別番号: 281186、配列識別番号: 281190、配列識別番号: 281192、配列識別番号: 281197、配列識別番号: 281199、配列識別番号: 281350 から 305565 を含む。いくつかの実施形態では、 MAGC3ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 217120、配列識別番号: 247270、配列識別番号: 248009、配列識別番号: 248159 から 248160、配列識別番号: 248735 から 248738、配列識別番号: 249358 から 249362、配列識別番号: 249690 から 249691、配列識別番号: 252562 から 252564、配列識別番号: 252836 から 252837、配列識別番号: 256214、配列識別番号: 256221、配列識別番号: 256226、配列識別番号: 256229、配列識別番号: 256235、配列識別番号: 256705、配列識別番号: 257337、配列識別番号: 257341、配列識別番号: 257345、配列識別番号: 257995、配列識別番号: 258292、配列識別番号: 258295、配列識別番号: 258614 から 258616、配列識別番号: 259467、配列識別番号: 259471、配列識別番号: 259474、配列識別番号: 260118、配列識別番号: 260122、配列識別番号: 260126、配列識別番号: 260131、配列識別番号: 260138、配列識別番号: 260145、配列識別番号: 260153、配列識別番号: 260367 から 260384、配列識別番号: 260407、配列識別番号: 260412、配列識別番号: 261788、配列識別番号: 261790、配列識別番号: 261792 から 261793、配列識別番号: 261795、配列識別番号: 261798、配列識別番号: 261800、配列識別番号: 261803、配列識別番号: 261805、配列識別番号: 261809、配列識別番号: 261811、配列識別番号: 261814、配列識別番号: 261816、配列識別番号: 261821、配列識別番号: 261823、配列識別番号: 261830、配列識別番号: 261832、配列識別番号: 261837、配列識別番号: 261839、配列識別番号: 262119、配列識別番号: 262122、配列識別番号: 262261 から 262285、配列識別番号: 262313、配列識別番号: 262318、配列識別番号: 263471 から 263474、配列識別番号: 263494、配列識別番号: 263498、配列識別番号: 266653 から 266654、配列識別番号: 269139、配列識別番号: 269143、配列識別番号: 269149、配列識別番号: 269156、配列識別番号: 269169、配列識別番号: 270516 から 270517、配列識別番号: 270519 から 270520、配列識別番号: 270523 から 270524、配列識別番号: 270527 から 270528、配列識別番号: 272016、配列識別番号: 272020、配列識別番号: 272214 から 272222、配列識別番号: 272243、配列識別番号: 272248、配列識別番号: 272896、配列識別番号: 273018 から 273020、配列識別番号: 278350 から 278351、配列識別番号: 278355、配列識別番号: 278358 から 278359、配列識別番号: 278361 から 278362、配列識別番号: 278364、配列識別番号: 278367、配列識別番号: 278369、配列識別番号: 278371、配列識別番号: 278373、配列識別番号: 278375、配列識別番号: 278377、配列識別番号: 278383、配列識別番号: 278385、配列識別番号: 278388、配列識別番号: 278390、配列識別番号: 278394、配列識別番号: 278396、配列識別番号: 281013 から 281014、配列識別番号: 281018、配列識別番号: 281022、配列識別番号: 281026、配列識別番号: 281031、配列識別番号: 281037 から 281038、配列識別番号: 281044 から 281045、配列識別番号: 281052 から 281053、配列識別番号: 281151 から 281152、配列識別番号: 281155、配列識別番号: 281159、配列識別番号: 281162 から 281163、配列識別番号: 281165 から 281166、配列識別番号: 281169、配列識別番号: 281171、配列識別番号: 281174、配列識別番号: 281176、配列識別番号: 281179、配列識別番号: 281181、配列識別番号: 281184、配列識別番号: 281186、配列識別番号: 281190、配列識別番号: 281192、配列識別番号: 281197、配列識別番号: 281199、または 配列識別番号: 281350 から 305565と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、SSX2 タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 369027 から 369036 を含む。いくつかの実施形態では、 SSX2ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 369027 から 369036と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、SSX2 タンパク質に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 369027 から 373347 を含む。いくつかの実施形態では、 SSX2ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 369027 から 373347と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、SSX2 タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 369027 から 369036 を含む。いくつかの実施形態では、 SSX2ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 369027 から 369036と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、SSX2 タンパク質に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 369027 から 373347 を含む。いくつかの実施形態では、 SSX2ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 369027 から 373347と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PRAME タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 342521 から 342555 を含む。いくつかの実施形態では、 PRAMEワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 342521 から 342555と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PRAME タンパク質に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 342521 から 369026 を含む。いくつかの実施形態では、 PRAMEワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 342521 から 369026と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PRAME タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 342521 から 342555 を含む。いくつかの実施形態では、 PRAMEワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 342521 から 342555と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PRAME タンパク質に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 342521 から 369026 を含む。いくつかの実施形態では、 PRAMEワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 342521 から 369026と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KKLC1 タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 206663 から 206675 を含む。いくつかの実施形態では、 KKLC1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 206663 から 206675と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KKLC1 タンパク質に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 206663 から 211900 を含む。いくつかの実施形態では、 KKLC1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 206663 から 211900と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KKLC1 タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 206663 から 206675 を含む。いくつかの実施形態では、 KKLC1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 206663 から 206675と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、KKLC1 タンパク質に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 206663 から 211900 を含む。いくつかの実施形態では、 KKLC1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 206663 から 211900と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PMEL タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 317360 から 317390 を含む。いくつかの実施形態では、 PMELワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 317360 から 317390と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PMEL タンパク質に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 317360 から 342520 を含む。いくつかの実施形態では、 PMELワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 317360 から 342520と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PMEL タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 317360 から 317390 を含む。いくつかの実施形態では、 PMELワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 317360 から 317390と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、PMEL タンパク質に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 317360 から 342520 を含む。いくつかの実施形態では、 PMELワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 317360 から 342520と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TYRP1 タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 373348 から 373373 を含む。いくつかの実施形態では、 TYRP1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 373348 から 373373と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TYRP1 タンパク質に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 373348 から 392433 を含む。いくつかの実施形態では、 TYRP1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 373348 から 392433と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TYRP1 タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 373348 から 373373 を含む。いくつかの実施形態では、 TYRP1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 373348 から 373373と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TYRP1 タンパク質に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 373348 から 392433 を含む。いくつかの実施形態では、 TYRP1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 373348 から 392433と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TYRP2 タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 392434 から 392455 を含む。いくつかの実施形態では、 TYRP2ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 392434 から 392455と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TYRP2 タンパク質に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 379327、配列識別番号: 379329、配列識別番号: 379332、配列識別番号: 379334、配列識別番号: 379770、配列識別番号: 381531、配列識別番号: 382109、配列識別番号: 383301、配列識別番号: 383305、配列識別番号: 383310、配列識別番号: 386111、配列識別番号: 387057、配列識別番号: 387062、配列識別番号: 392434 から 410309 を含む。いくつかの実施形態では、 TYRP2ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 379327、配列識別番号: 379329、配列識別番号: 379332、配列識別番号: 379334、配列識別番号: 379770、配列識別番号: 381531、配列識別番号: 382109、配列識別番号: 383301、配列識別番号: 383305、配列識別番号: 383310、配列識別番号: 386111、配列識別番号: 387057、配列識別番号: 387062、または 配列識別番号: 392434 から 410309と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TYRP2 タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 392434 から 392455 を含む。いくつかの実施形態では、 TYRP2ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 392434 から 392455と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、TYRP2 タンパク質に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 379327、配列識別番号: 379329、配列識別番号: 379332、配列識別番号: 379334、配列識別番号: 379770、配列識別番号: 381531、配列識別番号: 382109、配列識別番号: 383301、配列識別番号: 383305、配列識別番号: 383310、配列識別番号: 386111、配列識別番号: 387057、配列識別番号: 387062、配列識別番号: 392434 から 410309 を含む。いくつかの実施形態では、 TYRP2ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 379327、配列識別番号: 379329、配列識別番号: 379332、配列識別番号: 379334、配列識別番号: 379770、配列識別番号: 381531、配列識別番号: 382109、配列識別番号: 383301、配列識別番号: 383305、配列識別番号: 383310、配列識別番号: 386111、配列識別番号: 387057、配列識別番号: 387062、または 配列識別番号: 392434 から 410309と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAR1 タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 305566 から 305571 を含む。いくつかの実施形態では、 MAR1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 305566 から 305571と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAR1 タンパク質に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 305566 から 307669 を含む。いくつかの実施形態では、 MAR1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 305566 から 307669と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAR1 タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 305566 から 305571 を含む。いくつかの実施形態では、 MAR1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 305566 から 305571と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MAR1 タンパク質に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 305566 から 307669 を含む。いくつかの実施形態では、 MAR1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 305566 から 307669と同一のアミノ酸配列を含む。
MHCクラスII ワクチンペプチドのその他のアミノ酸配列は、配列リスト（配列識別番号: 22728 から 28795、配列識別番号: 197911 から 203516、配列識別番号: 206676 から 211900、配列識別番号: 211911、配列識別番号: 211918 から 223622、配列識別番号: 223641 から 236015、配列識別番号: 236034 から 247058、配列識別番号: 247094 から 281349、配列識別番号: 281379 から 305565、配列識別番号: 305572 から 307669、配列識別番号: 317391 から 342520、配列識別番号: 342556 から 369026、配列識別番号: 369037 から 373347、配列識別番号: 373374 から 392433、配列識別番号: 392456 から 410309）に記載されている。いくつかの実施形態では、本書で（配列識別番号: 475 から 759、配列識別番号: 22728 から 28795、配列識別番号: 197897 から 203516、配列識別番号: 206663 から 307669、配列識別番号: 317360 から 410309）開示されたペプチドの任意の組み合わせを用いて、約2～40個のペプチドを有する複合ペプチドワクチンを製造することができる。いくつかの実施形態では、複合ワクチン中のペプチド(配列識別番号: 475 から 759、配列識別番号: 22728 から 28795、配列識別番号: 197897 から 203516、配列識別番号: 206663 から 307669、配列識別番号: 317360 から 410309)のいずれかは、配列識別番号: 475 から 759、配列識別番号: 22728 から 28795、配列識別番号: 197897 から 203516、配列識別番号: 206663 から 307669、または 配列識別番号: 317360 から 410309と80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％同一のアミノ酸配列を含む、または含有する。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む CTG1B タンパク質に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、CTG1B タンパク質におけるワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 28796 から 34168 と 配列識別番号: 197897 から 203516 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 CTG1Bワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 28796 から 34168 または 配列識別番号: 197897 から 203516と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む MAGA1 タンパク質に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、MAGA1 タンパク質におけるワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 41321 から 51433 と 配列識別番号: 211901 から 223622 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 MAGA1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 41321 から 51433 または 配列識別番号: 211901 から 223622と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む MAGA3 タンパク質に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、MAGA3 タンパク質におけるワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 41351 から 41352、配列識別番号: 41383、配列識別番号: 41396、配列識別番号: 41410、配列識別番号: 41414、配列識別番号: 41435、配列識別番号: 41450、配列識別番号: 41463、配列識別番号: 41478、配列識別番号: 41489、配列識別番号: 41495、配列識別番号: 41503、配列識別番号: 41513、配列識別番号: 41520、配列識別番号: 41535、配列識別番号: 41541、配列識別番号: 41545、配列識別番号: 41577、配列識別番号: 41588、配列識別番号: 41598、配列識別番号: 41605、配列識別番号: 41617、配列識別番号: 41620、配列識別番号: 41622、配列識別番号: 41627、配列識別番号: 41630、配列識別番号: 41638、配列識別番号: 41647、配列識別番号: 41673、配列識別番号: 41696、配列識別番号: 41703、配列識別番号: 41708、配列識別番号: 41728、配列識別番号: 41732 から 41733、配列識別番号: 41749、配列識別番号: 41760、配列識別番号: 41766、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 41788、配列識別番号: 41791、配列識別番号: 41809、配列識別番号: 41813、配列識別番号: 41817、配列識別番号: 41829、配列識別番号: 41847 から 41848、配列識別番号: 41853、配列識別番号: 41859、配列識別番号: 41889、配列識別番号: 41894、配列識別番号: 41897、配列識別番号: 41909、配列識別番号: 41923、配列識別番号: 41934、配列識別番号: 41939、配列識別番号: 41953 から 41954、配列識別番号: 41959、配列識別番号: 41967、配列識別番号: 41970、配列識別番号: 41976、配列識別番号: 41984 から 41985、配列識別番号: 42007、配列識別番号: 42017、配列識別番号: 42034、配列識別番号: 42044、配列識別番号: 42046、配列識別番号: 42048、配列識別番号: 42056、配列識別番号: 42067、配列識別番号: 42080、配列識別番号: 42088、配列識別番号: 42091、配列識別番号: 42119 から 42120、配列識別番号: 42129、配列識別番号: 42135、配列識別番号: 42140 から 42141、配列識別番号: 42155、配列識別番号: 42158、配列識別番号: 42164、配列識別番号: 42170、配列識別番号: 42174、配列識別番号: 42186、配列識別番号: 42209、配列識別番号: 42218、配列識別番号: 42224、配列識別番号: 42229、配列識別番号: 42232、配列識別番号: 42235、配列識別番号: 42237 から 42238、配列識別番号: 42265、配列識別番号: 42272、配列識別番号: 42278、配列識別番号: 42293、配列識別番号: 42314、配列識別番号: 42336 から 42337、配列識別番号: 42339、配列識別番号: 42372 から 42373、配列識別番号: 42376、配列識別番号: 42382、配列識別番号: 42386、配列識別番号: 42408、配列識別番号: 42414、配列識別番号: 42423、配列識別番号: 42429、配列識別番号: 42447 から 42448、配列識別番号: 42461、配列識別番号: 42466、配列識別番号: 42475、配列識別番号: 42513、配列識別番号: 42540、配列識別番号: 42545、配列識別番号: 42550、配列識別番号: 42553、配列識別番号: 42567 から 42568、配列識別番号: 42580、配列識別番号: 42585、配列識別番号: 42605、配列識別番号: 42612、配列識別番号: 42627、配列識別番号: 42675、配列識別番号: 42680、配列識別番号: 42685、配列識別番号: 42690、配列識別番号: 42702、配列識別番号: 42711、配列識別番号: 42719、配列識別番号: 42738、配列識別番号: 42743、配列識別番号: 42750、配列識別番号: 42755、配列識別番号: 42777、配列識別番号: 42788、配列識別番号: 42793、配列識別番号: 42851、配列識別番号: 42858、配列識別番号: 42866、配列識別番号: 42903、配列識別番号: 42927、配列識別番号: 42936 から 42937、配列識別番号: 42940 から 42941、配列識別番号: 42957、配列識別番号: 42962、配列識別番号: 42966、配列識別番号: 42968、配列識別番号: 42986、配列識別番号: 43002、配列識別番号: 43013、配列識別番号: 43037、配列識別番号: 43052、配列識別番号: 43055 から 43056、配列識別番号: 43063 から 43064、配列識別番号: 43096、配列識別番号: 43133、配列識別番号: 43138、配列識別番号: 43156、配列識別番号: 43161、配列識別番号: 43186、配列識別番号: 43199、配列識別番号: 43205、配列識別番号: 43245、配列識別番号: 43251、配列識別番号: 43275、配列識別番号: 43312、配列識別番号: 43327、配列識別番号: 43333、配列識別番号: 43339、配列識別番号: 43342、配列識別番号: 43348、配列識別番号: 43365、配列識別番号: 43371、配列識別番号: 43400、配列識別番号: 43440、配列識別番号: 43451、配列識別番号: 43462、配列識別番号: 43467、配列識別番号: 43487、配列識別番号: 43498 から 43499、配列識別番号: 43507、配列識別番号: 43522、配列識別番号: 43529、配列識別番号: 43533、配列識別番号: 43545、配列識別番号: 43558、配列識別番号: 43560、配列識別番号: 43583、配列識別番号: 43597、配列識別番号: 43599、配列識別番号: 43610、配列識別番号: 43614、配列識別番号: 43627、配列識別番号: 43697、配列識別番号: 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一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む MAGA4 タンパク質に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、MAGA4 タンパク質におけるワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 41345、配列識別番号: 41347、配列識別番号: 41352、配列識別番号: 41357 から 41358、配列識別番号: 41366、配列識別番号: 41377、配列識別番号: 41382、配列識別番号: 41392、配列識別番号: 41396、配列識別番号: 41398、配列識別番号: 41406、配列識別番号: 41411、配列識別番号: 41414、配列識別番号: 41433、配列識別番号: 41436、配列識別番号: 41445、配列識別番号: 41449、配列識別番号: 41455、配列識別番号: 41478、配列識別番号: 41487、配列識別番号: 41495 から 41496、配列識別番号: 41503、配列識別番号: 41515、配列識別番号: 41520、配列識別番号: 41529、配列識別番号: 41549、配列識別番号: 41553、配列識別番号: 41562、配列識別番号: 41569、配列識別番号: 41574、配列識別番号: 41576、配列識別番号: 41579、配列識別番号: 41587 から 41588、配列識別番号: 41605、配列識別番号: 41617、配列識別番号: 41620、配列識別番号: 41634、配列識別番号: 41650、配列識別番号: 41665、配列識別番号: 41670、配列識別番号: 41672、配列識別番号: 41696、配列識別番号: 41703、配列識別番号: 41709、配列識別番号: 41725、配列識別番号: 41732 から 41733、配列識別番号: 41748、配列識別番号: 41760、配列識別番号: 41766、配列識別番号: 41768、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 41779、配列識別番号: 41791、配列識別番号: 41797、配列識別番号: 41813、配列識別番号: 41819、配列識別番号: 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一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む MAGC1 タンパク質に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、MAGC1 タンパク質におけるワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 41352、配列識別番号: 41478、配列識別番号: 41495、配列識別番号: 41725、配列識別番号: 41847、配列識別番号: 42129、配列識別番号: 42135、配列識別番号: 42168、配列識別番号: 42170、配列識別番号: 42195、配列識別番号: 42218、配列識別番号: 42229、配列識別番号: 42458、配列識別番号: 42545、配列識別番号: 42628、配列識別番号: 42653、配列識別番号: 42685、配列識別番号: 42703、配列識別番号: 42872、配列識別番号: 43008、配列識別番号: 43046、配列識別番号: 43083、配列識別番号: 43333、配列識別番号: 43429、配列識別番号: 43564、配列識別番号: 43780、配列識別番号: 43836、配列識別番号: 43881、配列識別番号: 43898、配列識別番号: 43932、配列識別番号: 44048、配列識別番号: 44181、配列識別番号: 44328、配列識別番号: 44456、配列識別番号: 44523、配列識別番号: 44566、配列識別番号: 44773、配列識別番号: 44877、配列識別番号: 45197、配列識別番号: 45385、配列識別番号: 45450、配列識別番号: 45556、配列識別番号: 45580、配列識別番号: 45584、配列識別番号: 45599、配列識別番号: 45765、配列識別番号: 45829、配列識別番号: 45894、配列識別番号: 45915、配列識別番号: 46273、配列識別番号: 46400、配列識別番号: 46421、配列識別番号: 46457、配列識別番号: 46459、配列識別番号: 46484、配列識別番号: 46666、配列識別番号: 46678、配列識別番号: 46689、配列識別番号: 46981、配列識別番号: 46991、配列識別番号: 46993、配列識別番号: 47047、配列識別番号: 47151、配列識別番号: 47324、配列識別番号: 47432、配列識別番号: 47592、配列識別番号: 47673、配列識別番号: 47895、配列識別番号: 47960、配列識別番号: 47964、配列識別番号: 47979、配列識別番号: 47984、配列識別番号: 48034、配列識別番号: 48113、配列識別番号: 48118、配列識別番号: 48300、配列識別番号: 48436、配列識別番号: 48461 から 48462、配列識別番号: 48469、配列識別番号: 48574、配列識別番号: 48680、配列識別番号: 48796、配列識別番号: 48832、配列識別番号: 48838、配列識別番号: 48845、配列識別番号: 48877、配列識別番号: 48947、配列識別番号: 49019、配列識別番号: 49111、配列識別番号: 49176、配列識別番号: 49263、配列識別番号: 49395、配列識別番号: 49462、配列識別番号: 49557、配列識別番号: 49823、配列識別番号: 49883、配列識別番号: 50062、配列識別番号: 50167、配列識別番号: 50305、配列識別番号: 50394、配列識別番号: 50401、配列識別番号: 50423、配列識別番号: 50428、配列識別番号: 50443、配列識別番号: 50450、配列識別番号: 50564、配列識別番号: 50574、配列識別番号: 50632、配列識別番号: 50678、配列識別番号: 68238 から 95592、配列識別番号: 247059 から 281349 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 MAGC1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 41352、配列識別番号: 41478、配列識別番号: 41495、配列識別番号: 41725、配列識別番号: 41847、配列識別番号: 42129、配列識別番号: 42135、配列識別番号: 42168、配列識別番号: 42170、配列識別番号: 42195、配列識別番号: 42218、配列識別番号: 42229、配列識別番号: 42458、配列識別番号: 42545、配列識別番号: 42628、配列識別番号: 42653、配列識別番号: 42685、配列識別番号: 42703、配列識別番号: 42872、配列識別番号: 43008、配列識別番号: 43046、配列識別番号: 43083、配列識別番号: 43333、配列識別番号: 43429、配列識別番号: 43564、配列識別番号: 43780、配列識別番号: 43836、配列識別番号: 43881、配列識別番号: 43898、配列識別番号: 43932、配列識別番号: 44048、配列識別番号: 44181、配列識別番号: 44328、配列識別番号: 44456、配列識別番号: 44523、配列識別番号: 44566、配列識別番号: 44773、配列識別番号: 44877、配列識別番号: 45197、配列識別番号: 45385、配列識別番号: 45450、配列識別番号: 45556、配列識別番号: 45580、配列識別番号: 45584、配列識別番号: 45599、配列識別番号: 45765、配列識別番号: 45829、配列識別番号: 45894、配列識別番号: 45915、配列識別番号: 46273、配列識別番号: 46400、配列識別番号: 46421、配列識別番号: 46457、配列識別番号: 46459、配列識別番号: 46484、配列識別番号: 46666、配列識別番号: 46678、配列識別番号: 46689、配列識別番号: 46981、配列識別番号: 46991、配列識別番号: 46993、配列識別番号: 47047、配列識別番号: 47151、配列識別番号: 47324、配列識別番号: 47432、配列識別番号: 47592、配列識別番号: 47673、配列識別番号: 47895、配列識別番号: 47960、配列識別番号: 47964、配列識別番号: 47979、配列識別番号: 47984、配列識別番号: 48034、配列識別番号: 48113、配列識別番号: 48118、配列識別番号: 48300、配列識別番号: 48436、配列識別番号: 48461 から 48462、配列識別番号: 48469、配列識別番号: 48574、配列識別番号: 48680、配列識別番号: 48796、配列識別番号: 48832、配列識別番号: 48838、配列識別番号: 48845、配列識別番号: 48877、配列識別番号: 48947、配列識別番号: 49019、配列識別番号: 49111、配列識別番号: 49176、配列識別番号: 49263、配列識別番号: 49395、配列識別番号: 49462、配列識別番号: 49557、配列識別番号: 49823、配列識別番号: 49883、配列識別番号: 50062、配列識別番号: 50167、配列識別番号: 50305、配列識別番号: 50394、配列識別番号: 50401、配列識別番号: 50423、配列識別番号: 50428、配列識別番号: 50443、配列識別番号: 50450、配列識別番号: 50564、配列識別番号: 50574、配列識別番号: 50632、配列識別番号: 50678、配列識別番号: 68238 から 95592、または 配列識別番号: 247059 から 281349と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む MAGC3 タンパク質に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、MAGC3 タンパク質におけるワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 41647、配列識別番号: 50668、配列識別番号: 50905、配列識別番号: 51039 から 51040、配列識別番号: 68257、配列識別番号: 68285、配列識別番号: 68288、配列識別番号: 68290、配列識別番号: 68305、配列識別番号: 68389、配列識別番号: 68419、配列識別番号: 68470、配列識別番号: 68510、配列識別番号: 68519、配列識別番号: 68592、配列識別番号: 68603、配列識別番号: 68684、配列識別番号: 68688、配列識別番号: 68747、配列識別番号: 68760、配列識別番号: 68778、配列識別番号: 68786、配列識別番号: 68855、配列識別番号: 68898、配列識別番号: 68900、配列識別番号: 68927、配列識別番号: 68961、配列識別番号: 69026、配列識別番号: 69041、配列識別番号: 69047、配列識別番号: 69148、配列識別番号: 69173、配列識別番号: 69180、配列識別番号: 69192、配列識別番号: 69227、配列識別番号: 69311、配列識別番号: 69330、配列識別番号: 69333、配列識別番号: 69346、配列識別番号: 69356、配列識別番号: 69393、配列識別番号: 69421、配列識別番号: 69437、配列識別番号: 69451、配列識別番号: 69500、配列識別番号: 69505、配列識別番号: 69517、配列識別番号: 69540、配列識別番号: 69559、配列識別番号: 69571、配列識別番号: 69586、配列識別番号: 69589、配列識別番号: 69591、配列識別番号: 69619、配列識別番号: 69631、配列識別番号: 69633、配列識別番号: 69644、配列識別番号: 69649、配列識別番号: 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一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む SSX2 タンパク質に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、SSX2 タンパク質におけるワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 162383 から 166443 と 配列識別番号: 369027 から 373347 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 SSX2ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 162383 から 166443 または 配列識別番号: 369027 から 373347と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む PRAME タンパク質に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、PRAME タンパク質におけるワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 144109 から 162382 と 配列識別番号: 342521 から 369026 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 PRAMEワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 144109 から 162382 または 配列識別番号: 342521 から 369026と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む KKLC1 タンパク質に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、KKLC1 タンパク質におけるワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 37110 から 41320 と 配列識別番号: 206663 から 211900 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 KKLC1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 37110 から 41320 または 配列識別番号: 206663 から 211900と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む PMEL タンパク質に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、PMEL タンパク質におけるワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 125134 から 144108 と 配列識別番号: 317360 から 342520 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 PMELワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 125134 から 144108 または 配列識別番号: 317360 から 342520と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む TYRP1 タンパク質に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、TYRP1 タンパク質におけるワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 166444 から 182573 と 配列識別番号: 373348 から 392433 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 TYRP1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 166444 から 182573 または 配列識別番号: 373348 から 392433と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む TYRP2 タンパク質に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、TYRP2 タンパク質におけるワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 166476 から 166477、配列識別番号: 166486、配列識別番号: 166513、配列識別番号: 166591、配列識別番号: 166606、配列識別番号: 166629、配列識別番号: 166641、配列識別番号: 166667、配列識別番号: 166678 から 166679、配列識別番号: 166795、配列識別番号: 166799、配列識別番号: 166834、配列識別番号: 166854、配列識別番号: 166909、配列識別番号: 166912、配列識別番号: 166942、配列識別番号: 166991 から 166992、配列識別番号: 167062、配列識別番号: 167067、配列識別番号: 167073 から 167074、配列識別番号: 167106、配列識別番号: 167118、配列識別番号: 167151、配列識別番号: 167177、配列識別番号: 167241、配列識別番号: 167271、配列識別番号: 167395、配列識別番号: 167491、配列識別番号: 167505、配列識別番号: 167687、配列識別番号: 167736、配列識別番号: 167740、配列識別番号: 167743、配列識別番号: 167755、配列識別番号: 167810、配列識別番号: 167831、配列識別番号: 167837、配列識別番号: 167844、配列識別番号: 167847 から 167848、配列識別番号: 167859、配列識別番号: 167880、配列識別番号: 167891、配列識別番号: 167897、配列識別番号: 167933、配列識別番号: 168094、配列識別番号: 168111 から 168112、配列識別番号: 168132、配列識別番号: 168144、配列識別番号: 168167、配列識別番号: 168211、配列識別番号: 168252、配列識別番号: 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一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む MAR1 タンパク質に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、MAR1 タンパク質におけるワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 113808 から 116477 と 配列識別番号: 305566 から 307669 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 MAR1ワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 113808 から 116477 または 配列識別番号: 305566 から 307669と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、本書に開示されているMHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチド（配列番号：1 から 34168、37110 から 116477、125134 から 203516、206663 から 307669、または 317360 から 410309）の任意の組み合わせを使用して、約2～40個のペプチドを含む単一ターゲット（個体）または複合ペプチドワクチンを製造することができる。いくつかの実施形態では、複合ワクチン中のペプチドのいずれか（ペプチド1 から 34168、37110 から 116477、125134 から 203516、206663 から 307669、または 317360 から 410309；配列番号：1 から 34168、37110 から 116477、125134 から 203516、206663 から 307669、または 317360 から 410309）には、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％いずれかの配列番号：1 から 34168、37110 から 116477、125134 から 203516、206663 から 307669、または 317360 から 410309と同一のアミノ酸配列を含む。
自己免疫疾患のワクチン
MHC クラス I ペプチド配列
自己免疫疾患のワクチン
MHC クラス I ペプチド配列
一部の実施形態では、INS タンパク質に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 34169 から 34224 を含む。いくつかの実施形態では、 INSワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 34169 から 34224と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、INS タンパク質に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 34169 から 37109 を含む。いくつかの実施形態では、 INSワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 34169 から 37109と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、INS タンパク質に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 34169 から 34224 を含む。いくつかの実施形態では、 INSワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 34169 から 34224と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、INS タンパク質に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 34169 から 37109 を含む。いくつかの実施形態では、 INSワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 34169 から 37109と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MOG タンパク質に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 116478 から 116563 を含む。いくつかの実施形態では、 MOGワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 116478 から 116563と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MOG タンパク質に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 116478 から 125133 を含む。いくつかの実施形態では、 MOGワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 116478 から 125133と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MOG タンパク質に対するMHCクラスIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 116478 から 116563 を含む。いくつかの実施形態では、 MOGワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 116478 から 116563と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MOG タンパク質に対するMHCクラス I ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 116478 から 125133 を含む。いくつかの実施形態では、 MOGワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 116478 から 125133と同一のアミノ酸配列を含む。
MHC クラス II ペプチド配列
MHC クラス II ペプチド配列
一部の実施形態では、INS タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 203517 から 203524 を含む。いくつかの実施形態では、 INSワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 203517 から 203524と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、INS タンパク質に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 203517 から 206662 を含む。いくつかの実施形態では、 INSワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 203517 から 206662と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、INS タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 203517 から 203524 を含む。いくつかの実施形態では、 INSワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 203517 から 203524と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、INS タンパク質に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 203517 から 206662 を含む。いくつかの実施形態では、 INSワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 203517 から 206662と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MOG タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 307670 から 307685 を含む。いくつかの実施形態では、 MOGワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 307670 から 307685と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MOG タンパク質に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、1 以上の 配列識別番号: 307670 から 317359 を含む。いくつかの実施形態では、 MOGワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 307670 から 317359と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MOG タンパク質の変異に対するMHCクラスIIペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 307670 から 307685 を含む。いくつかの実施形態では、 MOGワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 307670 から 307685と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MOG タンパク質に対するMHCクラス II ペプチドワクチンのアミノ酸配列は、2 以上の 配列識別番号: 307670 から 317359 を含む。いくつかの実施形態では、 MOGワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 307670 から 317359と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む INS タンパク質に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、INS タンパク質におけるワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 34169 から 37109 と 配列識別番号: 203517 から 206662 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 INSワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 34169 から 37109 または 配列識別番号: 203517 から 206662と同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、MHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチドのアミノ酸配列を使用して、約2～約40個のペプチドを含む MOG タンパク質に対する単一ターゲット（個別）または複合ペプチドワクチンを作製することができる。いくつかの実施形態では、MOG タンパク質におけるワクチン中のペプチドのいずれかが 配列識別番号: 116478 から 125133 と 配列識別番号: 307670 から 317359 のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、 MOGワクチン中のペプチドのいずれかには、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99％配列識別番号: 116478 から 125133 または 配列識別番号: 307670 から 317359と同一のアミノ酸配列を含む。
mRNAワクチンおよびDNAワクチン
いくつかの実施形態では、ワクチンペプチドはmRNAまたはDNA分子としてコードされ、 当技術分野で知られているようにin vivoでの発現のために投与される 。 mRNAによるワクチンの送達の一例は Kranz et a.;.（2016）で説明されており、参照により本書に組み込む。いくつかの実施形態では、本書に全文を組み込む Sahin et al.（2017）に見られるように、ワクチンペプチドは複数のmRNAまたはDNA分子にコードされている。一実施形態では、コンストラクトは以下の30種類のペプチドからなる：本書で説明される手順によって最適化された、10ペプチドのMHCクラスI複合膵がんワクチン（標的：KRAS G12D、KRAS G12V、KRAS G12R）および20ペプチドのMHCクラスII複合膵がんワクチン（標的：KRAS G12D、KRAS G12V、KRAS G12R）。ペプチドの先頭のN末端に分泌シグナル配列が追加され、その後にMHCクラスI輸送信号（MITD）が続く（Kreiter et al., 2008、Sahin et al., 2017）。MITDは、HLAクラスIおよびクラスIIの発現経路に抗原を誘導することが示されている（Kreiter et al., 2008）。ここでは、Sahin et al.（2017）の非免疫原性グリシン/セリンリンカーを使用して、各MHCクラスのすべてのペプチドを単一のコンストラクトに構築するが、Kreiter et al.（2008）の立証したのと同じ分泌シグナルとMITDシグナルを持つ単一のペプチドを含む個々のコンストラクトを構築することも、妥当性が高いとされる。
いくつかの実施形態では、mRNAワクチンによってコードされるアミノ酸配列は、配列識別番号: 410310を含む。下線のついたアミノ酸は、シグナルペプチド（またはリーダー）配列に相当する。太字のアミノ酸は、MHCクラスI（長さが8～11アミノ酸、10個のペプチド）とMHCクラスII（長さが13～25個のアミノ酸、20個のペプチド）のペプチド配列に相当する。イタリック体のアミノ酸は輸送信号に相当する。
いくつかの実施形態では、ワクチンはmRNAワクチンで、配列識別番号: 410310からなるアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、mRNAワクチンの核酸配列は、配列識別番号: 410310と同一のアミノ酸配列80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または 99% をコードする。
いくつかの実施形態では、ワクチンはDNAワクチンで、配列識別番号: 410310からなるアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、DNAワクチンの核酸配列は、配列識別番号: 410310と同一のアミノ酸配列80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または 99% をコードする。
いくつかの実施形態では、本書に開示されている1つまたは複数のMHCクラスIおよび/またはMHCクラスIIペプチド（配列識別番号：1～410310）を1つまたは複数のmRNAまたはDNA分子にコードし、in vivoで発現させるために投与することができる。いくつかの実施形態では、約2～約40のペプチド配列が、１つまたは複数のmRNAコンストラクトにコードされている。いくつかの実施形態では、約2～約40のペプチド配列が、１つまたは複数のDNAコンストラクト（すなわち、１つまたは複数の配列ID番号：1～410310を含むアミノ酸配列をコードする核酸）にコードされる。いくつかの実施形態では、mRNAワクチンのアミノ酸配列、またはDNAワクチンの核酸配列は、配列識別番号1～410310と同一のアミノ酸配列80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または 99% をコードする。
対象分野の非限定的な実施形態
対象分野の非限定的な実施形態
一形態において、本発明は、配列識別番号: 1 から 474からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を提供する。
いくつかの実施形態では、核酸配列は、配列識別番号: 1 から 474 からなるグループから選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 1 から 474からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は被験者に投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 1 から 474 からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸配列はin vivoでの発現のために構造物として投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列のin vivo投与は、HLAクラス I 分子によって提示される1つまたは複数のペプチドを産生するように構成されている。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、そのタンパク質がAKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異を構成するタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、がんを予防するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 膵がん、皮膚がん、甲状腺がん、脳腫瘍、直腸結腸がん、気管支がんと肺がん、乳がん、卵巣がん からなるグループから選択される。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、 配列識別番号: 1 から 474からなる群から選択される少なくとも3つのアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 1 から 474からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 1 から 474からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 1 から 18からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、AKT1 タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 1 から 18からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 1 から 18からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 1 から 18からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した AKT1 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 19 から 50からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、BRAF タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 19 から 50からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 19 から 50からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 19 から 50からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した BRAF タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 51 から 98からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、EGFR タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 51 から 98からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 51 から 98からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 51 から 98からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した EGFR タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 99 から 118からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、GTF2I タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 99 から 118からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 99 から 118からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 99 から 118からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した GTF2I タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 119 から 140からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、IDH1 タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 119 から 140からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 119 から 140からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 119 から 140からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した IDH1 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 141 から 229からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、KRAS タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 141 から 229からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 141 から 229からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 141 から 229からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した KRAS タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 230 から 272からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、NRAS タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 230 から 272からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 230 から 272からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 230 から 272からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した NRAS タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 273 から 322からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、PIK3CA タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 273 から 322からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 273 から 322からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 273 から 322からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した PIK3CA タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 323 から 353からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、PTEN タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 323 から 353からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 323 から 353からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 323 から 353からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した PTEN タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 354 から 458からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TP53 タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 354 から 458からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 354 から 458からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 354 から 458からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した TP53 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 141 から 272からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、RAS タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 141 から 272からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 141 から 272からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 141 から 272からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した RAS タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 19 から 33からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、BRAF V600E タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 19 から 33からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 19 から 33からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 19 から 33からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、BRAF V600E タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 34 から 50からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、BRAF V600M タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 34 から 50からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 34 から 50からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 34 から 50からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、BRAF V600M タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 51 から 66からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、EGFR A289V タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 51 から 66からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 51 から 66からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 51 から 66からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、EGFR A289V タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 67 から 81からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、EGFR G598V タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 67 から 81からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 67 から 81からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 67 から 81からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、EGFR G598V タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 82 から 98からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、EGFR L858R タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 82 から 98からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 82 から 98からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 82 から 98からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、EGFR L858R タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 125 から 140からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、IDH1 R132H タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 125 から 140からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 125 から 140からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 125 から 140からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、IDH1 R132H タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 119 から 124からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、IDH1 R132C タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 119 から 124からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 119 から 124からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 119 から 124からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、IDH1 R132C タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 167 から 178からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、KRAS G12D タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 167 から 178からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 167 から 178からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 167 から 178からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、KRAS G12D タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 203 から 213からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、KRAS G12V タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 203 から 213からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 203 から 213からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 203 から 213からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、KRAS G12V タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 179 から 191からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、KRAS G12R タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 179 から 191からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 179 から 191からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 179 から 191からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、KRAS G12R タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 154 から 166からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、KRAS G12C タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 154 から 166からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 154 から 166からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 154 から 166からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、KRAS G12C タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 214 から 229からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、KRAS G13D タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 214 から 229からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 214 から 229からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 214 から 229からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、KRAS G13D タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 141 から 153からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、KRAS G12A タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 141 から 153からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 141 から 153からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 141 から 153からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、KRAS G12A タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 192 から 202からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、KRAS G12S タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 192 から 202からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 192 から 202からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 192 から 202からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、KRAS G12S タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 256 から 272からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、NRAS Q61R タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 256 から 272からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 256 から 272からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 256 から 272からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、NRAS Q61R タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 230 から 238からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、NRAS Q61K タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 230 から 238からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 230 から 238からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 230 から 238からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、NRAS Q61K タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 239 から 255からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、NRAS Q61L タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 239 から 255からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 239 から 255からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 239 から 255からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、NRAS Q61L タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 273 から 285からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、PIK3CA E542K タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 273 から 285からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 273 から 285からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 273 から 285からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、PIK3CA E542K タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 286 から 293からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、PIK3CA E545K タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 286 から 293からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 286 から 293からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 286 から 293からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、PIK3CA E545K タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 294 から 309からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、PIK3CA H1047R タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 294 から 309からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 294 から 309からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 294 から 309からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、PIK3CA H1047R タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 359 から 374からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TP53 R158L タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 359 から 374からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 359 から 374からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 359 から 374からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、TP53 R158L タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 375 から 386からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TP53 R175H タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 375 から 386からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 375 から 386からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 375 から 386からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、TP53 R175H タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 387 から 401からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TP53 R248Q タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 387 から 401からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 387 から 401からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 387 から 401からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、TP53 R248Q タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 422 から 432からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TP53 R273C タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 422 から 432からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 422 から 432からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 422 から 432からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、TP53 R273C タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 433 から 446からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TP53 R273H タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 433 から 446からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 433 から 446からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 433 から 446からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、TP53 R273H タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 402 から 421からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TP53 R248W タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 402 から 421からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 402 から 421からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 402 から 421からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、TP53 R248W タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 447 から 449からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TP53 R282W タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 447 から 449からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 447 から 449からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 447 から 449からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、TP53 R282W タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 450 から 458からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TP53 Y220C タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 450 から 458からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 450 から 458からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 450 から 458からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、TP53 Y220C タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 310 から 322からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、PIK3CA R88Q タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 310 から 322からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 310 から 322からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 310 から 322からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、PIK3CA R88Q タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 99 から 118からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、GTF2I L424H タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 99 から 118からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 99 から 118からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 99 から 118からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、GTF2I L424H タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 338 から 353からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、PTEN R130Q タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 338 から 353からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 338 から 353からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 338 から 353からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、PTEN R130Q タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 1 から 18からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、AKT1 E17K タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 1 から 18からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 1 から 18からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 1 から 18からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、AKT1 E17K タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 323 から 337からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、PTEN R130G タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 323 から 337からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 323 から 337からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 323 から 337からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、PTEN R130G タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 354 から 358からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TP53 H179R タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 354 から 358からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 354 から 358からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 354 から 358からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、TP53 H179R タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 168 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 179 から 180、配列識別番号: 182 から 183、配列識別番号: 203 から 204、配列識別番号: 207からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 168 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 179 から 180、配列識別番号: 182 から 183、配列識別番号: 203 から 204、配列識別番号: 207からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸配列はin vivoでの発現のために構造物として投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列のin vivo投与は、HLAクラス I 分子によって提示される1つまたは複数のペプチドを産生するように構成されている。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異のあるタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを予防するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 膵がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 168 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 179 から 180、配列識別番号: 182 から 183、配列識別番号: 203 から 204、配列識別番号: 207からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 膵がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 168 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 179 から 180、配列識別番号: 182 から 183、配列識別番号: 203 から 204、配列識別番号: 207からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 168 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 179 から 180、配列識別番号: 182 から 183、配列識別番号: 203 から 204、配列識別番号: 207からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 168 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 179 から 180、配列識別番号: 182 から 183、配列識別番号: 203 から 204、配列識別番号: 207からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、HLAクラス I 分子によって提示される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異を構成するタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 膵がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 168 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 179 から 180、配列識別番号: 182 から 183、配列識別番号: 203 から 204、配列識別番号: 207からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 膵がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 168 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 179 から 180、配列識別番号: 182 から 183、配列識別番号: 203 から 204、配列識別番号: 207からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 19 から 23、配列識別番号: 34 から 40、配列識別番号: 230 から 231、配列識別番号: 239、配列識別番号: 241 から 242、配列識別番号: 260 から 262からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 19 から 23、配列識別番号: 34 から 40、配列識別番号: 230 から 231、配列識別番号: 239、配列識別番号: 241 から 242、配列識別番号: 260 から 262からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸配列はin vivoでの発現のために構造物として投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列のin vivo投与は、HLAクラス I 分子によって提示される1つまたは複数のペプチドを産生するように構成されている。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異のあるタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを予防するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 皮膚がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 19 から 23、配列識別番号: 34 から 40、配列識別番号: 230 から 231、配列識別番号: 239、配列識別番号: 241 から 242、配列識別番号: 260 から 262からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 皮膚がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 19 から 23、配列識別番号: 34 から 40、配列識別番号: 230 から 231、配列識別番号: 239、配列識別番号: 241 から 242、配列識別番号: 260 から 262からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 19 から 23、配列識別番号: 34 から 40、配列識別番号: 230 から 231、配列識別番号: 239、配列識別番号: 241 から 242、配列識別番号: 260 から 262からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 19 から 23、配列識別番号: 34 から 40、配列識別番号: 230 から 231、配列識別番号: 239、配列識別番号: 241 から 242、配列識別番号: 260 から 262からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、HLAクラス I 分子によって提示される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異を構成するタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 皮膚がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 19 から 23、配列識別番号: 34 から 40、配列識別番号: 230 から 231、配列識別番号: 239、配列識別番号: 241 から 242、配列識別番号: 260 から 262からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 皮膚がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 19 から 23、配列識別番号: 34 から 40、配列識別番号: 230 から 231、配列識別番号: 239、配列識別番号: 241 から 242、配列識別番号: 260 から 262からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 19 から 23、配列識別番号: 230 から 231、配列識別番号: 260 から 262からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 19 から 23、配列識別番号: 230 から 231、配列識別番号: 260 から 262からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸配列はin vivoでの発現のために構造物として投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列のin vivo投与は、HLAクラス I 分子によって提示される1つまたは複数のペプチドを産生するように構成されている。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異のあるタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを予防するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 甲状腺がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 19 から 23、配列識別番号: 230 から 231、配列識別番号: 260 から 262からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 甲状腺がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 19 から 23、配列識別番号: 230 から 231、配列識別番号: 260 から 262からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 19 から 23、配列識別番号: 230 から 231、配列識別番号: 260 から 262からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 19 から 23、配列識別番号: 230 から 231、配列識別番号: 260 から 262からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、HLAクラス I 分子によって提示される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異を構成するタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 甲状腺がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 19 から 23、配列識別番号: 230 から 231、配列識別番号: 260 から 262からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 甲状腺がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 19 から 23、配列識別番号: 230 から 231、配列識別番号: 260 から 262からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 51 から 55、配列識別番号: 67 から 70、配列識別番号: 72 から 73、配列識別番号: 119 から 120、配列識別番号: 125 から 130、配列識別番号: 375、配列識別番号: 423、配列識別番号: 425からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 51 から 55、配列識別番号: 67 から 70、配列識別番号: 72 から 73、配列識別番号: 119 から 120、配列識別番号: 125 から 130、配列識別番号: 375、配列識別番号: 423、配列識別番号: 425からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸配列はin vivoでの発現のために構造物として投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列のin vivo投与は、HLAクラス I 分子によって提示される1つまたは複数のペプチドを産生するように構成されている。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異のあるタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを予防するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 脳腫瘍 である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 51 から 55、配列識別番号: 67 から 70、配列識別番号: 72 から 73、配列識別番号: 119 から 120、配列識別番号: 125 から 130、配列識別番号: 375、配列識別番号: 423、配列識別番号: 425からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 脳腫瘍を治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 51 から 55、配列識別番号: 67 から 70、配列識別番号: 72 から 73、配列識別番号: 119 から 120、配列識別番号: 125 から 130、配列識別番号: 375、配列識別番号: 423、配列識別番号: 425からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 51 から 55、配列識別番号: 67 から 70、配列識別番号: 72 から 73、配列識別番号: 119 から 120、配列識別番号: 125 から 130、配列識別番号: 375、配列識別番号: 423、配列識別番号: 425からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 51 から 55、配列識別番号: 67 から 70、配列識別番号: 72 から 73、配列識別番号: 119 から 120、配列識別番号: 125 から 130、配列識別番号: 375、配列識別番号: 423、配列識別番号: 425からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、HLAクラス I 分子によって提示される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異を構成するタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 脳腫瘍 である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 51 から 55、配列識別番号: 67 から 70、配列識別番号: 72 から 73、配列識別番号: 119 から 120、配列識別番号: 125 から 130、配列識別番号: 375、配列識別番号: 423、配列識別番号: 425からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 脳腫瘍を治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 51 から 55、配列識別番号: 67 から 70、配列識別番号: 72 から 73、配列識別番号: 119 から 120、配列識別番号: 125 から 130、配列識別番号: 375、配列識別番号: 423、配列識別番号: 425からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 20 から 23、配列識別番号: 167 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 203 から 207、配列識別番号: 215 から 217、配列識別番号: 288からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 20 から 23、配列識別番号: 167 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 203 から 207、配列識別番号: 215 から 217、配列識別番号: 288からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸配列はin vivoでの発現のために構造物として投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列のin vivo投与は、HLAクラス I 分子によって提示される1つまたは複数のペプチドを産生するように構成されている。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異のあるタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを予防するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 直腸結腸がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 20 から 23、配列識別番号: 167 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 203 から 207、配列識別番号: 215 から 217、配列識別番号: 288からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 直腸結腸がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 20 から 23、配列識別番号: 167 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 203 から 207、配列識別番号: 215 から 217、配列識別番号: 288からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 20 から 23、配列識別番号: 167 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 203 から 207、配列識別番号: 215 から 217、配列識別番号: 288からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 20 から 23、配列識別番号: 167 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 203 から 207、配列識別番号: 215 から 217、配列識別番号: 288からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、HLAクラス I 分子によって提示される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異を構成するタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 直腸結腸がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 20 から 23、配列識別番号: 167 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 203 から 207、配列識別番号: 215 から 217、配列識別番号: 288からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 直腸結腸がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 20 から 23、配列識別番号: 167 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 203 から 207、配列識別番号: 215 から 217、配列識別番号: 288からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 82 から 86、配列識別番号: 141 から 144、配列識別番号: 154 から 159、配列識別番号: 168 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 203 から 204、配列識別番号: 207、配列識別番号: 274 から 276、配列識別番号: 288、配列識別番号: 359、配列識別番号: 362 から 364からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 82 から 86、配列識別番号: 141 から 144、配列識別番号: 154 から 159、配列識別番号: 168 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 203 から 204、配列識別番号: 207、配列識別番号: 274 から 276、配列識別番号: 288、配列識別番号: 359、配列識別番号: 362 から 364からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸配列はin vivoでの発現のために構造物として投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列のin vivo投与は、HLAクラス I 分子によって提示される1つまたは複数のペプチドを産生するように構成されている。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異のあるタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを予防するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 気管支がんと肺がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 82 から 86、配列識別番号: 141 から 144、配列識別番号: 154 から 159、配列識別番号: 168 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 203 から 204、配列識別番号: 207、配列識別番号: 274 から 276、配列識別番号: 288、配列識別番号: 359、配列識別番号: 362 から 364からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 気管支がんと肺がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 82 から 86、配列識別番号: 141 から 144、配列識別番号: 154 から 159、配列識別番号: 168 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 203 から 204、配列識別番号: 207、配列識別番号: 274 から 276、配列識別番号: 288、配列識別番号: 359、配列識別番号: 362 から 364からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 82 から 86、配列識別番号: 141 から 144、配列識別番号: 154 から 159、配列識別番号: 168 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 203 から 204、配列識別番号: 207、配列識別番号: 274 から 276、配列識別番号: 288、配列識別番号: 359、配列識別番号: 362 から 364からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 82 から 86、配列識別番号: 141 から 144、配列識別番号: 154 から 159、配列識別番号: 168 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 203 から 204、配列識別番号: 207、配列識別番号: 274 から 276、配列識別番号: 288、配列識別番号: 359、配列識別番号: 362 から 364からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、HLAクラス I 分子によって提示される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異を構成するタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 気管支がんと肺がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 82 から 86、配列識別番号: 141 から 144、配列識別番号: 154 から 159、配列識別番号: 168 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 203 から 204、配列識別番号: 207、配列識別番号: 274 から 276、配列識別番号: 288、配列識別番号: 359、配列識別番号: 362 から 364からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 気管支がんと肺がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 82 から 86、配列識別番号: 141 から 144、配列識別番号: 154 から 159、配列識別番号: 168 から 169、配列識別番号: 171、配列識別番号: 203 から 204、配列識別番号: 207、配列識別番号: 274 から 276、配列識別番号: 288、配列識別番号: 359、配列識別番号: 362 から 364からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 273 から 309、配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 422 から 446からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 273 から 309、配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 422 から 446からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸配列はin vivoでの発現のために構造物として投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列のin vivo投与は、HLAクラス I 分子によって提示される1つまたは複数のペプチドを産生するように構成されている。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異のあるタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを予防するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 乳がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 273 から 309、配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 422 から 446からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 乳がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 273 から 309、配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 422 から 446からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 273 から 309、配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 422 から 446からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 273 から 309、配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 422 から 446からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、HLAクラス I 分子によって提示される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異を構成するタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 乳がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 273 から 309、配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 422 から 446からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 乳がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 273 から 309、配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 422 から 446からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 273 から 309、配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 422 から 446からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 273 から 309、配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 422 から 446からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸配列はin vivoでの発現のために構造物として投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列のin vivo投与は、HLAクラス I 分子によって提示される1つまたは複数のペプチドを産生するように構成されている。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異のあるタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを予防するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 卵巣がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 273 から 309、配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 422 から 446からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 卵巣がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 273 から 309、配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 422 から 446からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 273 から 309、配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 422 から 446からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 273 から 309、配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 422 から 446からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、HLAクラス I 分子によって提示される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異を構成するタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 卵巣がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 273 から 309、配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 422 から 446からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 卵巣がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 273 から 309、配列識別番号: 375 から 386、配列識別番号: 422 から 446からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。
一形態において、本発明は、配列識別番号: 475 から 759からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を提供する。
いくつかの実施形態では、核酸配列は、配列識別番号: 475 から 759 からなるグループから選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 475 から 759からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は被験者に投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 475 から 759 からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸配列はin vivoでの発現のために構造物として投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列のin vivo投与は、HLAクラス II 分子によって提示される1つまたは複数のペプチドを産生するように構成されている。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、そのタンパク質がAKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異を構成するタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、がんを予防するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 膵がん、皮膚がん、甲状腺がん、脳腫瘍、直腸結腸がん、気管支がんと肺がん、乳がん、卵巣がん からなるグループから選択される。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、 配列識別番号: 475 から 759からなる群から選択される少なくとも3つのアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 475 から 759からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 475 から 759からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 475 から 483からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、AKT1 タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 475 から 483からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 475 から 483からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 475 から 483からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した AKT1 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 484 から 502からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、BRAF タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 484 から 502からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 484 から 502からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 484 から 502からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した BRAF タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 503 から 527からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、EGFR タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 503 から 527からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 503 から 527からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 503 から 527からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した EGFR タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 528 から 534からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、GTF2I タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 528 から 534からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 528 から 534からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 528 から 534からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した GTF2I タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 535 から 553からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、IDH1 タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 535 から 553からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 535 から 553からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 535 から 553からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した IDH1 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 554 から 615からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、KRAS タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 554 から 615からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 554 から 615からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 554 から 615からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した KRAS タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 616 から 645からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、NRAS タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 616 から 645からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 616 から 645からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 616 から 645からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した NRAS タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 646 から 675からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、PIK3CA タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 646 から 675からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 646 から 675からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 646 から 675からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した PIK3CA タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 676 から 690からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、PTEN タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 676 から 690からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 676 から 690からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 676 から 690からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した PTEN タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 691 から 758からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TP53 タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 691 から 758からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 691 から 758からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 691 から 758からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した TP53 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 554 から 645からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、RAS タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 554 から 645からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 554 から 645からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 554 から 645からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、変異した RAS タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 484 から 494からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、BRAF V600E タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 484 から 494からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 484 から 494からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 484 から 494からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、BRAF V600E タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 495 から 502からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、BRAF V600M タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 495 から 502からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 495 から 502からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 495 から 502からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、BRAF V600M タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 503 から 509からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、EGFR A289V タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 503 から 509からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 503 から 509からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 503 から 509からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、EGFR A289V タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 510 から 519からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、EGFR G598V タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 510 から 519からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 510 から 519からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 510 から 519からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、EGFR G598V タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 520 から 527からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、EGFR L858R タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 520 から 527からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 520 から 527からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 520 から 527からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、EGFR L858R タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 543 から 553からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、IDH1 R132H タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 543 から 553からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 543 から 553からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 543 から 553からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、IDH1 R132H タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 535 から 542からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、IDH1 R132C タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 535 から 542からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 535 から 542からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 535 から 542からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、IDH1 R132C タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 569 から 577からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、KRAS G12D タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 569 から 577からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 569 から 577からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 569 から 577からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、KRAS G12D タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 596 から 605からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、KRAS G12V タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 596 から 605からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 596 から 605からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 596 から 605からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、KRAS G12V タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 578 から 587からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、KRAS G12R タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 578 から 587からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 578 から 587からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 578 から 587からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、KRAS G12R タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 561 から 568からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、KRAS G12C タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 561 から 568からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 561 から 568からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 561 から 568からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、KRAS G12C タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 606 から 615からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、KRAS G13D タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 606 から 615からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 606 から 615からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 606 から 615からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、KRAS G13D タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 554 から 560からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、KRAS G12A タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 554 から 560からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 554 から 560からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 554 から 560からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、KRAS G12A タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 588 から 595からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、KRAS G12S タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 588 から 595からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 588 から 595からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 588 から 595からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、KRAS G12S タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 634 から 645からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、NRAS Q61R タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 634 から 645からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 634 から 645からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 634 から 645からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、NRAS Q61R タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 616 から 624からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、NRAS Q61K タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 616 から 624からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 616 から 624からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 616 から 624からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、NRAS Q61K タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 625 から 633からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、NRAS Q61L タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 625 から 633からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 625 から 633からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 625 から 633からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、NRAS Q61L タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 646 から 650からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、PIK3CA E542K タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 646 から 650からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 646 から 650からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 646 から 650からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、PIK3CA E542K タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 651 から 657からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、PIK3CA E545K タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 651 から 657からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 651 から 657からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 651 から 657からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、PIK3CA E545K タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 658 から 667からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、PIK3CA H1047R タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 658 から 667からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 658 から 667からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 658 から 667からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、PIK3CA H1047R タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 700 から 707からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TP53 R158L タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 700 から 707からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 700 から 707からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 700 から 707からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、TP53 R158L タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 708 から 717からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TP53 R175H タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 708 から 717からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 708 から 717からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 708 から 717からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、TP53 R175H タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 718 から 723からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TP53 R248Q タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 718 から 723からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 718 から 723からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 718 から 723からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、TP53 R248Q タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 733 から 739からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TP53 R273C タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 733 から 739からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 733 から 739からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 733 から 739からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、TP53 R273C タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 740 から 748からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TP53 R273H タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 740 から 748からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 740 から 748からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 740 から 748からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、TP53 R273H タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 724 から 732からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TP53 R248W タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 724 から 732からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 724 から 732からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 724 から 732からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、TP53 R248W タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 749 から 750からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TP53 R282W タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 749 から 750からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 749 から 750からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 749 から 750からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、TP53 R282W タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 751 から 758からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TP53 Y220C タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 751 から 758からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 751 から 758からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 751 から 758からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、TP53 Y220C タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 668 から 675からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、PIK3CA R88Q タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 668 から 675からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 668 から 675からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 668 から 675からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、PIK3CA R88Q タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 528 から 534からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、GTF2I L424H タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 528 から 534からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 528 から 534からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 528 から 534からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、GTF2I L424H タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 681 から 690からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、PTEN R130Q タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 681 から 690からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 681 から 690からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 681 から 690からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、PTEN R130Q タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 475 から 483からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、AKT1 E17K タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 475 から 483からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 475 から 483からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 475 から 483からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、AKT1 E17K タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 676 から 680からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、PTEN R130G タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 676 から 680からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 676 から 680からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 676 から 680からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、PTEN R130G タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 691 から 699からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TP53 H179R タンパク質変異に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 691 から 699からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 691 から 699からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 691 から 699からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、TP53 H179R タンパク質変異に由来するペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 569 から 574、配列識別番号: 578 から 584、配列識別番号: 596 から 599、配列識別番号: 601 から 603からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 569 から 574、配列識別番号: 578 から 584、配列識別番号: 596 から 599、配列識別番号: 601 から 603からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸配列はin vivoでの発現のために構造物として投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列のin vivo投与は、HLAクラス II 分子によって提示される1つまたは複数のペプチドを産生するように構成されている。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異のあるタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを予防するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 膵がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 569 から 574、配列識別番号: 578 から 584、配列識別番号: 596 から 599、配列識別番号: 601 から 603からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 膵がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 569 から 574、配列識別番号: 578 から 584、配列識別番号: 596 から 599、配列識別番号: 601 から 603からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 569 から 574、配列識別番号: 578 から 584、配列識別番号: 596 から 599、配列識別番号: 601 から 603からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 569 から 574、配列識別番号: 578 から 584、配列識別番号: 596 から 599、配列識別番号: 601 から 603からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、HLAクラス II 分子によって提示される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異を構成するタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 膵がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 569 から 574、配列識別番号: 578 から 584、配列識別番号: 596 から 599、配列識別番号: 601 から 603からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 膵がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 569 から 574、配列識別番号: 578 から 584、配列識別番号: 596 から 599、配列識別番号: 601 から 603からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 495 から 499、配列識別番号: 616、配列識別番号: 619 から 620、配列識別番号: 625 から 628、配列識別番号: 634、配列識別番号: 637、配列識別番号: 639 から 640からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 495 から 499、配列識別番号: 616、配列識別番号: 619 から 620、配列識別番号: 625 から 628、配列識別番号: 634、配列識別番号: 637、配列識別番号: 639 から 640からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸配列はin vivoでの発現のために構造物として投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列のin vivo投与は、HLAクラス II 分子によって提示される1つまたは複数のペプチドを産生するように構成されている。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異のあるタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを予防するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 皮膚がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 495 から 499、配列識別番号: 616、配列識別番号: 619 から 620、配列識別番号: 625 から 628、配列識別番号: 634、配列識別番号: 637、配列識別番号: 639 から 640からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 皮膚がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 495 から 499、配列識別番号: 616、配列識別番号: 619 から 620、配列識別番号: 625 から 628、配列識別番号: 634、配列識別番号: 637、配列識別番号: 639 から 640からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 495 から 499、配列識別番号: 616、配列識別番号: 619 から 620、配列識別番号: 625 から 628、配列識別番号: 634、配列識別番号: 637、配列識別番号: 639 から 640からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 495 から 499、配列識別番号: 616、配列識別番号: 619 から 620、配列識別番号: 625 から 628、配列識別番号: 634、配列識別番号: 637、配列識別番号: 639 から 640からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、HLAクラス II 分子によって提示される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異を構成するタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 皮膚がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 495 から 499、配列識別番号: 616、配列識別番号: 619 から 620、配列識別番号: 625 から 628、配列識別番号: 634、配列識別番号: 637、配列識別番号: 639 から 640からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 皮膚がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 495 から 499、配列識別番号: 616、配列識別番号: 619 から 620、配列識別番号: 625 から 628、配列識別番号: 634、配列識別番号: 637、配列識別番号: 639 から 640からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 616、配列識別番号: 619 から 620、配列識別番号: 634、配列識別番号: 637、配列識別番号: 640からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 616、配列識別番号: 619 から 620、配列識別番号: 634、配列識別番号: 637、配列識別番号: 640からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸配列はin vivoでの発現のために構造物として投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列のin vivo投与は、HLAクラス II 分子によって提示される1つまたは複数のペプチドを産生するように構成されている。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異のあるタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを予防するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 甲状腺がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 616、配列識別番号: 619 から 620、配列識別番号: 634、配列識別番号: 637、配列識別番号: 640からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 甲状腺がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 616、配列識別番号: 619 から 620、配列識別番号: 634、配列識別番号: 637、配列識別番号: 640からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 616、配列識別番号: 619 から 620、配列識別番号: 634、配列識別番号: 637、配列識別番号: 640からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 616、配列識別番号: 619 から 620、配列識別番号: 634、配列識別番号: 637、配列識別番号: 640からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、HLAクラス II 分子によって提示される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異を構成するタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 甲状腺がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 616、配列識別番号: 619 から 620、配列識別番号: 634、配列識別番号: 637、配列識別番号: 640からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 甲状腺がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 616、配列識別番号: 619 から 620、配列識別番号: 634、配列識別番号: 637、配列識別番号: 640からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 508、配列識別番号: 510、配列識別番号: 512、配列識別番号: 514、配列識別番号: 535 から 537、配列識別番号: 539、配列識別番号: 543 から 551、配列識別番号: 708、配列識別番号: 712、配列識別番号: 738からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 508、配列識別番号: 510、配列識別番号: 512、配列識別番号: 514、配列識別番号: 535 から 537、配列識別番号: 539、配列識別番号: 543 から 551、配列識別番号: 708、配列識別番号: 712、配列識別番号: 738からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸配列はin vivoでの発現のために構造物として投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列のin vivo投与は、HLAクラス II 分子によって提示される1つまたは複数のペプチドを産生するように構成されている。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異のあるタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを予防するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 脳腫瘍 である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 508、配列識別番号: 510、配列識別番号: 512、配列識別番号: 514、配列識別番号: 535 から 537、配列識別番号: 539、配列識別番号: 543 から 551、配列識別番号: 708、配列識別番号: 712、配列識別番号: 738からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 脳腫瘍を治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 508、配列識別番号: 510、配列識別番号: 512、配列識別番号: 514、配列識別番号: 535 から 537、配列識別番号: 539、配列識別番号: 543 から 551、配列識別番号: 708、配列識別番号: 712、配列識別番号: 738からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 508、配列識別番号: 510、配列識別番号: 512、配列識別番号: 514、配列識別番号: 535 から 537、配列識別番号: 539、配列識別番号: 543 から 551、配列識別番号: 708、配列識別番号: 712、配列識別番号: 738からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 508、配列識別番号: 510、配列識別番号: 512、配列識別番号: 514、配列識別番号: 535 から 537、配列識別番号: 539、配列識別番号: 543 から 551、配列識別番号: 708、配列識別番号: 712、配列識別番号: 738からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、HLAクラス II 分子によって提示される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異を構成するタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 脳腫瘍 である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 508、配列識別番号: 510、配列識別番号: 512、配列識別番号: 514、配列識別番号: 535 から 537、配列識別番号: 539、配列識別番号: 543 から 551、配列識別番号: 708、配列識別番号: 712、配列識別番号: 738からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 脳腫瘍を治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 508、配列識別番号: 510、配列識別番号: 512、配列識別番号: 514、配列識別番号: 535 から 537、配列識別番号: 539、配列識別番号: 543 から 551、配列識別番号: 708、配列識別番号: 712、配列識別番号: 738からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 569 から 575、配列識別番号: 596 から 599、配列識別番号: 601 から 604、配列識別番号: 606 から 612、配列識別番号: 656、配列識別番号: 708、配列識別番号: 712からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 569 から 575、配列識別番号: 596 から 599、配列識別番号: 601 から 604、配列識別番号: 606 から 612、配列識別番号: 656、配列識別番号: 708、配列識別番号: 712からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸配列はin vivoでの発現のために構造物として投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列のin vivo投与は、HLAクラス II 分子によって提示される1つまたは複数のペプチドを産生するように構成されている。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異のあるタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを予防するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 直腸結腸がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 569 から 575、配列識別番号: 596 から 599、配列識別番号: 601 から 604、配列識別番号: 606 から 612、配列識別番号: 656、配列識別番号: 708、配列識別番号: 712からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 直腸結腸がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 569 から 575、配列識別番号: 596 から 599、配列識別番号: 601 から 604、配列識別番号: 606 から 612、配列識別番号: 656、配列識別番号: 708、配列識別番号: 712からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 569 から 575、配列識別番号: 596 から 599、配列識別番号: 601 から 604、配列識別番号: 606 から 612、配列識別番号: 656、配列識別番号: 708、配列識別番号: 712からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 569 から 575、配列識別番号: 596 から 599、配列識別番号: 601 から 604、配列識別番号: 606 から 612、配列識別番号: 656、配列識別番号: 708、配列識別番号: 712からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、HLAクラス II 分子によって提示される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異を構成するタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 直腸結腸がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 569 から 575、配列識別番号: 596 から 599、配列識別番号: 601 から 604、配列識別番号: 606 から 612、配列識別番号: 656、配列識別番号: 708、配列識別番号: 712からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 直腸結腸がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 484 から 485、配列識別番号: 488 から 489、配列識別番号: 569 から 575、配列識別番号: 596 から 599、配列識別番号: 601 から 604、配列識別番号: 606 から 612、配列識別番号: 656、配列識別番号: 708、配列識別番号: 712からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 520 から 521、配列識別番号: 523 から 524、配列識別番号: 554 から 556、配列識別番号: 558、配列識別番号: 561、配列識別番号: 563 から 565、配列識別番号: 569 から 573、配列識別番号: 596 から 600、配列識別番号: 650、配列識別番号: 656、配列識別番号: 700 から 705からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 520 から 521、配列識別番号: 523 から 524、配列識別番号: 554 から 556、配列識別番号: 558、配列識別番号: 561、配列識別番号: 563 から 565、配列識別番号: 569 から 573、配列識別番号: 596 から 600、配列識別番号: 650、配列識別番号: 656、配列識別番号: 700 から 705からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸配列はin vivoでの発現のために構造物として投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列のin vivo投与は、HLAクラス II 分子によって提示される1つまたは複数のペプチドを産生するように構成されている。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異のあるタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを予防するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 気管支がんと肺がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 520 から 521、配列識別番号: 523 から 524、配列識別番号: 554 から 556、配列識別番号: 558、配列識別番号: 561、配列識別番号: 563 から 565、配列識別番号: 569 から 573、配列識別番号: 596 から 600、配列識別番号: 650、配列識別番号: 656、配列識別番号: 700 から 705からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 気管支がんと肺がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 520 から 521、配列識別番号: 523 から 524、配列識別番号: 554 から 556、配列識別番号: 558、配列識別番号: 561、配列識別番号: 563 から 565、配列識別番号: 569 から 573、配列識別番号: 596 から 600、配列識別番号: 650、配列識別番号: 656、配列識別番号: 700 から 705からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 520 から 521、配列識別番号: 523 から 524、配列識別番号: 554 から 556、配列識別番号: 558、配列識別番号: 561、配列識別番号: 563 から 565、配列識別番号: 569 から 573、配列識別番号: 596 から 600、配列識別番号: 650、配列識別番号: 656、配列識別番号: 700 から 705からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 520 から 521、配列識別番号: 523 から 524、配列識別番号: 554 から 556、配列識別番号: 558、配列識別番号: 561、配列識別番号: 563 から 565、配列識別番号: 569 から 573、配列識別番号: 596 から 600、配列識別番号: 650、配列識別番号: 656、配列識別番号: 700 から 705からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、HLAクラス II 分子によって提示される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異を構成するタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 気管支がんと肺がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 520 から 521、配列識別番号: 523 から 524、配列識別番号: 554 から 556、配列識別番号: 558、配列識別番号: 561、配列識別番号: 563 から 565、配列識別番号: 569 から 573、配列識別番号: 596 から 600、配列識別番号: 650、配列識別番号: 656、配列識別番号: 700 から 705からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 気管支がんと肺がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 520 から 521、配列識別番号: 523 から 524、配列識別番号: 554 から 556、配列識別番号: 558、配列識別番号: 561、配列識別番号: 563 から 565、配列識別番号: 569 から 573、配列識別番号: 596 から 600、配列識別番号: 650、配列識別番号: 656、配列識別番号: 700 から 705からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 646 から 667、配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 733 から 748からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 646 から 667、配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 733 から 748からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸配列はin vivoでの発現のために構造物として投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列のin vivo投与は、HLAクラス II 分子によって提示される1つまたは複数のペプチドを産生するように構成されている。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異のあるタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを予防するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 乳がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 646 から 667、配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 733 から 748からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 乳がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 646 から 667、配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 733 から 748からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 646 から 667、配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 733 から 748からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 646 から 667、配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 733 から 748からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、HLAクラス II 分子によって提示される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異を構成するタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 乳がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 646 から 667、配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 733 から 748からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 乳がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 646 から 667、配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 733 から 748からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 646 から 667、配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 733 から 748からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 646 から 667、配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 733 から 748からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸配列はin vivoでの発現のために構造物として投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列のin vivo投与は、HLAクラス II 分子によって提示される1つまたは複数のペプチドを産生するように構成されている。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異のあるタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを予防するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 卵巣がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 646 から 667、配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 733 から 748からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 卵巣がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 646 から 667、配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 733 から 748からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 646 から 667、配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 733 から 748からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 646 から 667、配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 733 から 748からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、HLAクラス II 分子によって提示される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1、BRAF、EGFR、GTF2I、HRAS、IDH1、KRAS、NRAS、PIK3CA、PTEN、TP53 からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物中のペプチドは、AKT1 E17K、BRAF V600E、BRAF V600M、EGFR A289V、EGFR G598V、EGFR L858R、GTF2I L424H、IDH1 R132C、IDH1 R132H、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、KRAS G13D、NRAS Q61K、NRAS Q61L、NRAS Q61R、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、PIK3CA R88Q、PTEN R130G、PTEN R130Q、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、TP53 Y220C からなる群から選択される変異を構成するタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 卵巣がん である。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 646 から 667、配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 733 から 748からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を被験者に投与することで 卵巣がんを治療または予防する方法を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 646 から 667、配列識別番号: 708 から 717、配列識別番号: 733 から 748からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。
CT 抗原ワクチン
CT 抗原ワクチン
一形態において、本発明は、配列識別番号: 28796 から 28864、配列識別番号: 37110 から 37174、配列識別番号: 41321 から 41397、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49004、配列識別番号: 49071、配列識別番号: 49395、配列識別番号: 50632、配列識別番号: 50729、配列識別番号: 51434 から 51510、配列識別番号: 55758、配列識別番号: 60456 から 60527、配列識別番号: 68238 から 68321、配列識別番号: 77091、配列識別番号: 77210、配列識別番号: 84188、配列識別番号: 87951、配列識別番号: 88144、配列識別番号: 95593 から 95664、配列識別番号: 113808 から 113869、配列識別番号: 125134 から 125218、配列識別番号: 144109 から 144188、配列識別番号: 162383 から 162453、配列識別番号: 166444 から 166531、配列識別番号: 167118、配列識別番号: 169740、配列識別番号: 173412、配列識別番号: 179404、配列識別番号: 182574 から 182654からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を提供する。
いくつかの実施形態では、核酸配列は、配列識別番号: 28796 から 28864、配列識別番号: 37110 から 37174、配列識別番号: 41321 から 41397、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49004、配列識別番号: 49071、配列識別番号: 49395、配列識別番号: 50632、配列識別番号: 50729、配列識別番号: 51434 から 51510、配列識別番号: 55758、配列識別番号: 60456 から 60527、配列識別番号: 68238 から 68321、配列識別番号: 77091、配列識別番号: 77210、配列識別番号: 84188、配列識別番号: 87951、配列識別番号: 88144、配列識別番号: 95593 から 95664、配列識別番号: 113808 から 113869、配列識別番号: 125134 から 125218、配列識別番号: 144109 から 144188、配列識別番号: 162383 から 162453、配列識別番号: 166444 から 166531、配列識別番号: 167118、配列識別番号: 169740、配列識別番号: 173412、配列識別番号: 179404、配列識別番号: 182574 から 182654 からなるグループから選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 28796 から 28864、配列識別番号: 37110 から 37174、配列識別番号: 41321 から 41397、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49004、配列識別番号: 49071、配列識別番号: 49395、配列識別番号: 50632、配列識別番号: 50729、配列識別番号: 51434 から 51510、配列識別番号: 55758、配列識別番号: 60456 から 60527、配列識別番号: 68238 から 68321、配列識別番号: 77091、配列識別番号: 77210、配列識別番号: 84188、配列識別番号: 87951、配列識別番号: 88144、配列識別番号: 95593 から 95664、配列識別番号: 113808 から 113869、配列識別番号: 125134 から 125218、配列識別番号: 144109 から 144188、配列識別番号: 162383 から 162453、配列識別番号: 166444 から 166531、配列識別番号: 167118、配列識別番号: 169740、配列識別番号: 173412、配列識別番号: 179404、配列識別番号: 182574 から 182654からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は被験者に投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 28796 から 28864、配列識別番号: 37110 から 37174、配列識別番号: 41321 から 41397、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49004、配列識別番号: 49071、配列識別番号: 49395、配列識別番号: 50632、配列識別番号: 50729、配列識別番号: 51434 から 51510、配列識別番号: 55758、配列識別番号: 60456 から 60527、配列識別番号: 68238 から 68321、配列識別番号: 77091、配列識別番号: 77210、配列識別番号: 84188、配列識別番号: 87951、配列識別番号: 88144、配列識別番号: 95593 から 95664、配列識別番号: 113808 から 113869、配列識別番号: 125134 から 125218、配列識別番号: 144109 から 144188、配列識別番号: 162383 から 162453、配列識別番号: 166444 から 166531、配列識別番号: 167118、配列識別番号: 169740、配列識別番号: 173412、配列識別番号: 179404、配列識別番号: 182574 から 182654 からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸配列はin vivoでの発現のためにコンストラクトとして投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列のin vivo投与は、HLAクラス I 分子によって表示される1つまたは複数のペプチドを産生するように構成されている。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、CTG1B、KKLC1、MAGA1、MAGA3、MAGA4、MAGC1、MAGC3、MAR1、PMEL、PRAME、SSX2、TYRP1、TYRP2 からなる群から選択されるタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、がんを予防するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 膵がん、皮膚がん、甲状腺がん、脳腫瘍、直腸結腸がん、気管支がんと肺がん、乳がん、卵巣がん からなるグループから選択される。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、 配列識別番号: 28796 から 28864、配列識別番号: 37110 から 37174、配列識別番号: 41321 から 41397、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49004、配列識別番号: 49071、配列識別番号: 49395、配列識別番号: 50632、配列識別番号: 50729、配列識別番号: 51434 から 51510、配列識別番号: 55758、配列識別番号: 60456 から 60527、配列識別番号: 68238 から 68321、配列識別番号: 77091、配列識別番号: 77210、配列識別番号: 84188、配列識別番号: 87951、配列識別番号: 88144、配列識別番号: 95593 から 95664、配列識別番号: 113808 から 113869、配列識別番号: 125134 から 125218、配列識別番号: 144109 から 144188、配列識別番号: 162383 から 162453、配列識別番号: 166444 から 166531、配列識別番号: 167118、配列識別番号: 169740、配列識別番号: 173412、配列識別番号: 179404、配列識別番号: 182574 から 182654からなる群から選択される少なくとも3つのアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 28796 から 28864、配列識別番号: 37110 から 37174、配列識別番号: 41321 から 41397、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49004、配列識別番号: 49071、配列識別番号: 49395、配列識別番号: 50632、配列識別番号: 50729、配列識別番号: 51434 から 51510、配列識別番号: 55758、配列識別番号: 60456 から 60527、配列識別番号: 68238 から 68321、配列識別番号: 77091、配列識別番号: 77210、配列識別番号: 84188、配列識別番号: 87951、配列識別番号: 88144、配列識別番号: 95593 から 95664、配列識別番号: 113808 から 113869、配列識別番号: 125134 から 125218、配列識別番号: 144109 から 144188、配列識別番号: 162383 から 162453、配列識別番号: 166444 から 166531、配列識別番号: 167118、配列識別番号: 169740、配列識別番号: 173412、配列識別番号: 179404、配列識別番号: 182574 から 182654からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 28796 から 28864、配列識別番号: 37110 から 37174、配列識別番号: 41321 から 41397、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49004、配列識別番号: 49071、配列識別番号: 49395、配列識別番号: 50632、配列識別番号: 50729、配列識別番号: 51434 から 51510、配列識別番号: 55758、配列識別番号: 60456 から 60527、配列識別番号: 68238 から 68321、配列識別番号: 77091、配列識別番号: 77210、配列識別番号: 84188、配列識別番号: 87951、配列識別番号: 88144、配列識別番号: 95593 から 95664、配列識別番号: 113808 から 113869、配列識別番号: 125134 から 125218、配列識別番号: 144109 から 144188、配列識別番号: 162383 から 162453、配列識別番号: 166444 から 166531、配列識別番号: 167118、配列識別番号: 169740、配列識別番号: 173412、配列識別番号: 179404、配列識別番号: 182574 から 182654からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 28796 から 28830からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、CTG1B タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 28796 から 28830からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 28796 から 28830からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 28796 から 28830からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 CTG1B タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 41321 から 41354からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、MAGA1 タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 41321 から 41354からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 41321 から 41354からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 41321 から 41354からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 MAGA1 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49004、配列識別番号: 51434 から 51468からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、MAGA3 タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49004、配列識別番号: 51434 から 51468からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49004、配列識別番号: 51434 から 51468からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49004、配列識別番号: 51434 から 51468からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 MAGA3 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 41352、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 60456 から 60487からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、MAGA4 タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 41352、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 60456 から 60487からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 41352、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 60456 から 60487からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 41352、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 60456 から 60487からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 MAGA4 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 49395 と 配列識別番号: 68238 から 68272からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、MAGC1 タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 49395 と 配列識別番号: 68238 から 68272からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 49395 と 配列識別番号: 68238 から 68272からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 49395 と 配列識別番号: 68238 から 68272からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 MAGC1 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 77091、配列識別番号: 77210、配列識別番号: 84188、配列識別番号: 88144、配列識別番号: 95593 から 95624からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、MAGC3 タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 77091、配列識別番号: 77210、配列識別番号: 84188、配列識別番号: 88144、配列識別番号: 95593 から 95624からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 77091、配列識別番号: 77210、配列識別番号: 84188、配列識別番号: 88144、配列識別番号: 95593 から 95624からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 77091、配列識別番号: 77210、配列識別番号: 84188、配列識別番号: 88144、配列識別番号: 95593 から 95624からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 MAGC3 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 162383 から 162420からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、SSX2 タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 162383 から 162420からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 162383 から 162420からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 162383 から 162420からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 SSX2 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 144109 から 144142からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、PRAME タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 144109 から 144142からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 144109 から 144142からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 144109 から 144142からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 PRAME タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 37110 から 37145からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、KKLC1 タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 37110 から 37145からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 37110 から 37145からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 37110 から 37145からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 KKLC1 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 125134 から 125167からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、PMEL タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 125134 から 125167からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 125134 から 125167からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 125134 から 125167からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 PMEL タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 166444 から 166480からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TYRP1 タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 166444 から 166480からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 166444 から 166480からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 166444 から 166480からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 TYRP1 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 169740、配列識別番号: 173412、配列識別番号: 179404、配列識別番号: 182574 から 182606からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TYRP2 タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 169740、配列識別番号: 173412、配列識別番号: 179404、配列識別番号: 182574 から 182606からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 169740、配列識別番号: 173412、配列識別番号: 179404、配列識別番号: 182574 から 182606からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 169740、配列識別番号: 173412、配列識別番号: 179404、配列識別番号: 182574 から 182606からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 TYRP2 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 113808 から 113843からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、MAR1 タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 113808 から 113843からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 113808 から 113843からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 113808 から 113843からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 MAR1 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
一形態において、本発明は、配列識別番号: 28796 から 28864、配列識別番号: 37110 から 37174、配列識別番号: 41321 から 41397、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49004、配列識別番号: 49071、配列識別番号: 49395、配列識別番号: 50632、配列識別番号: 50729、配列識別番号: 51434 から 51510、配列識別番号: 55758、配列識別番号: 60456 から 60527、配列識別番号: 68238 から 68321、配列識別番号: 77091、配列識別番号: 77210、配列識別番号: 84188、配列識別番号: 87951、配列識別番号: 88144、配列識別番号: 95593 から 95664、配列識別番号: 113808 から 113869、配列識別番号: 125134 から 125218、配列識別番号: 144109 から 144188、配列識別番号: 162383 から 162453、配列識別番号: 166444 から 166531、配列識別番号: 167118、配列識別番号: 169740、配列識別番号: 173412、配列識別番号: 179404、配列識別番号: 182574 から 182654からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を提供する。
いくつかの実施形態では、核酸配列は、配列識別番号: 28796 から 28864、配列識別番号: 37110 から 37174、配列識別番号: 41321 から 41397、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49004、配列識別番号: 49071、配列識別番号: 49395、配列識別番号: 50632、配列識別番号: 50729、配列識別番号: 51434 から 51510、配列識別番号: 55758、配列識別番号: 60456 から 60527、配列識別番号: 68238 から 68321、配列識別番号: 77091、配列識別番号: 77210、配列識別番号: 84188、配列識別番号: 87951、配列識別番号: 88144、配列識別番号: 95593 から 95664、配列識別番号: 113808 から 113869、配列識別番号: 125134 から 125218、配列識別番号: 144109 から 144188、配列識別番号: 162383 から 162453、配列識別番号: 166444 から 166531、配列識別番号: 167118、配列識別番号: 169740、配列識別番号: 173412、配列識別番号: 179404、配列識別番号: 182574 から 182654 からなるグループから選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 28796 から 28864、配列識別番号: 37110 から 37174、配列識別番号: 41321 から 41397、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49004、配列識別番号: 49071、配列識別番号: 49395、配列識別番号: 50632、配列識別番号: 50729、配列識別番号: 51434 から 51510、配列識別番号: 55758、配列識別番号: 60456 から 60527、配列識別番号: 68238 から 68321、配列識別番号: 77091、配列識別番号: 77210、配列識別番号: 84188、配列識別番号: 87951、配列識別番号: 88144、配列識別番号: 95593 から 95664、配列識別番号: 113808 から 113869、配列識別番号: 125134 から 125218、配列識別番号: 144109 から 144188、配列識別番号: 162383 から 162453、配列識別番号: 166444 から 166531、配列識別番号: 167118、配列識別番号: 169740、配列識別番号: 173412、配列識別番号: 179404、配列識別番号: 182574 から 182654からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は被験者に投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 28796 から 28864、配列識別番号: 37110 から 37174、配列識別番号: 41321 から 41397、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49004、配列識別番号: 49071、配列識別番号: 49395、配列識別番号: 50632、配列識別番号: 50729、配列識別番号: 51434 から 51510、配列識別番号: 55758、配列識別番号: 60456 から 60527、配列識別番号: 68238 から 68321、配列識別番号: 77091、配列識別番号: 77210、配列識別番号: 84188、配列識別番号: 87951、配列識別番号: 88144、配列識別番号: 95593 から 95664、配列識別番号: 113808 から 113869、配列識別番号: 125134 から 125218、配列識別番号: 144109 から 144188、配列識別番号: 162383 から 162453、配列識別番号: 166444 から 166531、配列識別番号: 167118、配列識別番号: 169740、配列識別番号: 173412、配列識別番号: 179404、配列識別番号: 182574 から 182654 からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸配列はin vivoでの発現のためにコンストラクトとして投与される。いくつかの実施形態では、核酸配列のin vivo投与は、HLAクラス II 分子によって表示される1つまたは複数のペプチドを産生するように構成されている。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、CTG1B、KKLC1、MAGA1、MAGA3、MAGA4、MAGC1、MAGC3、MAR1、PMEL、PRAME、SSX2、TYRP1、TYRP2 からなる群から選択されるタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、がんを予防するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、がんを治療するために被験者に有効量で投与される。いくつかの実施形態では、がんは 膵がん、皮膚がん、甲状腺がん、脳腫瘍、直腸結腸がん、気管支がんと肺がん、乳がん、卵巣がん からなるグループから選択される。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、 配列識別番号: 28796 から 28864、配列識別番号: 37110 から 37174、配列識別番号: 41321 から 41397、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49004、配列識別番号: 49071、配列識別番号: 49395、配列識別番号: 50632、配列識別番号: 50729、配列識別番号: 51434 から 51510、配列識別番号: 55758、配列識別番号: 60456 から 60527、配列識別番号: 68238 から 68321、配列識別番号: 77091、配列識別番号: 77210、配列識別番号: 84188、配列識別番号: 87951、配列識別番号: 88144、配列識別番号: 95593 から 95664、配列識別番号: 113808 から 113869、配列識別番号: 125134 から 125218、配列識別番号: 144109 から 144188、配列識別番号: 162383 から 162453、配列識別番号: 166444 から 166531、配列識別番号: 167118、配列識別番号: 169740、配列識別番号: 173412、配列識別番号: 179404、配列識別番号: 182574 から 182654からなる群から選択される少なくとも3つのアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 28796 から 28864、配列識別番号: 37110 から 37174、配列識別番号: 41321 から 41397、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49004、配列識別番号: 49071、配列識別番号: 49395、配列識別番号: 50632、配列識別番号: 50729、配列識別番号: 51434 から 51510、配列識別番号: 55758、配列識別番号: 60456 から 60527、配列識別番号: 68238 から 68321、配列識別番号: 77091、配列識別番号: 77210、配列識別番号: 84188、配列識別番号: 87951、配列識別番号: 88144、配列識別番号: 95593 から 95664、配列識別番号: 113808 から 113869、配列識別番号: 125134 から 125218、配列識別番号: 144109 から 144188、配列識別番号: 162383 から 162453、配列識別番号: 166444 から 166531、配列識別番号: 167118、配列識別番号: 169740、配列識別番号: 173412、配列識別番号: 179404、配列識別番号: 182574 から 182654からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 28796 から 28864、配列識別番号: 37110 から 37174、配列識別番号: 41321 から 41397、配列識別番号: 41770、配列識別番号: 49004、配列識別番号: 49071、配列識別番号: 49395、配列識別番号: 50632、配列識別番号: 50729、配列識別番号: 51434 から 51510、配列識別番号: 55758、配列識別番号: 60456 から 60527、配列識別番号: 68238 から 68321、配列識別番号: 77091、配列識別番号: 77210、配列識別番号: 84188、配列識別番号: 87951、配列識別番号: 88144、配列識別番号: 95593 から 95664、配列識別番号: 113808 から 113869、配列識別番号: 125134 から 125218、配列識別番号: 144109 から 144188、配列識別番号: 162383 から 162453、配列識別番号: 166444 から 166531、配列識別番号: 167118、配列識別番号: 169740、配列識別番号: 173412、配列識別番号: 179404、配列識別番号: 182574 から 182654からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 197897 から 197901からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、CTG1B タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 197897 から 197901からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 197897 から 197901からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 197897 から 197901からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 CTG1B タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 211901 から 211904からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、MAGA1 タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 211901 から 211904からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 211901 から 211904からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 211901 から 211904からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 MAGA1 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 223623 から 223627からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、MAGA3 タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 223623 から 223627からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 223623 から 223627からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 223623 から 223627からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 MAGA3 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 236016 から 236020からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、MAGA4 タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 236016 から 236020からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 236016 から 236020からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 236016 から 236020からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 MAGA4 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 247059 から 247063からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、MAGC1 タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 247059 から 247063からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 247059 から 247063からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 247059 から 247063からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 MAGC1 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 281350 から 281353からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、MAGC3 タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 281350 から 281353からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 281350 から 281353からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 281350 から 281353からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 MAGC3 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 369027 から 369031からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、SSX2 タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 369027 から 369031からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 369027 から 369031からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 369027 から 369031からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 SSX2 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 342521 から 342525からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、PRAME タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 342521 から 342525からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 342521 から 342525からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 342521 から 342525からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 PRAME タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 206663 から 206665からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、KKLC1 タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 206663 から 206665からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 206663 から 206665からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 206663 から 206665からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 KKLC1 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 317360 から 317363からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、PMEL タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 317360 から 317363からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 317360 から 317363からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 317360 から 317363からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 PMEL タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 373348 から 373350からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TYRP1 タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 373348 から 373350からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 373348 から 373350からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 373348 から 373350からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 TYRP1 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 392434 から 392437からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、TYRP2 タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 392434 から 392437からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 392434 から 392437からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 392434 から 392437からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 TYRP2 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 305566 から 305570からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、MAR1 タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 305566 から 305570からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 305566 から 305570からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 305566 から 305570からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 MAR1 タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
自己免疫疾患のワクチン
自己免疫疾患のワクチン
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 34169 から 34204からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、INS タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 34169 から 34204からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 34169 から 34204からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 34169 から 34204からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 INS タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 116478 から 116515からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、MOG タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 116478 から 116515からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 116478 から 116515からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 116478 から 116515からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 MOG タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 203517 から 203521からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、INS タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 203517 から 203521からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 203517 から 203521からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 203517 から 203521からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 INS タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
別の形態では、本発明は、 配列識別番号: 307670 から 307674からなる群から選択される1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、MOG タンパク質に由来する1つまたは複数のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、免疫原性組成物は、配列識別番号: 307670 から 307674からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
別の形態では、本発明は、配列識別番号: 307670 から 307674からなる群から選択される1つまたは複数のペプチドを含む免疫原性ペプチド組成物を規定する。
いくつかの実施形態では、免疫原性ペプチド組成物は、 配列識別番号: 307670 から 307674からなるグループから選択される2つ以上のペプチドを含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のペプチドは、 MOG タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである。
組成物
組成物
いくつかの実施形態では、ペプチドワクチンは、本開示の１つまたは複数のペプチドを含み、薬学的に許容されるキャリアを含む医薬組成物で投与される。いくつかの実施形態では、本開示に記載されるように、ペプチドワクチンは、第3のペプチドセットから構成される。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、スプレー、エアロゾル、ゲル、溶液、エマルション、脂質ナノ粒子、ナノ粒子、または懸濁液の形態である。
この組成物は、薬学的に許容されるキャリアを用いて被験者に投与されることが好ましい。一般的に、いくつかの実施形態では、薬学的に許容される適切な量の塩を製剤に使用するが、このような塩はいくつかの実施形態で、等張な製剤を等張にするために使用される可能性がある。
特定の実施形態では、ペプチドは、本書に記載されたペプチドのいずれか、および薬学的に許容されるキャリアを含む免疫原性組成物として規定される。特定の実施形態では、免疫原性組成物はさらにアジュバントを含む。特定の実施形態では、当技術分野に従事する者に周知されるように、ペプチドは他の分子と結合してその有効性を高める。例えば、抗原提示細胞上の細胞表面タンパク質を認識する抗体にペプチドを結合させることで、ワクチンの有効性を高めることができる。ペプチド送達の有効性を高めるためのそのような方法の1つが、Woodham et al.（2018）で説明されている。自己免疫疾患の治療に関する特定の実施形態では、当該ペプチドは、当技術分野で周知されるように、耐性を誘導するように設計された組成物およびプロトコルで投与される。 免疫寛容化のためにペプチドを使用する方法として、Alhadj Ali et al.（2017）とGibson et al.（2015）に説明される例がある。
いくつかの実施形態では、薬学的に許容されるキャリアは、生理食塩水、リンガー液、デキストロース溶液、およびそれらの組み合わせからなる群から選択される。当技術分野で周知されている、その他の適切で薬学的に許容可能なキャリアが考えられる。適切なキャリアとその製剤については、Remington's Pharmaceutical Sciences（2005年、Mack Publishing Co.）に説明されている。溶液のpHは約5～約8であることが好ましく、約7～約7.5であればなお好ましい。製剤は凍結乾燥粉末を含んでもよい。その他のキャリアとしては、固体疎水性ポリマーの半透性マトリックスなどの徐放性製剤が挙げられる。これらのマトリックスは、例えば、フィルム、リポソーム、微粒子などの成形品の形をしている。当技術分野に精通する者には明かであるように、例えば、投与経路および投与されるペプチドの濃度によっては、特定のキャリアの方がより好ましいとされる場合がある。
本書で使用される医薬的に許容されるキャリアという語句は、対象となる医薬品をある臓器または身体の一部から別の臓器または身体の一部に運搬または輸送することに関与する、液体または固体の充填剤、希釈剤、賦形剤、溶媒またはカプセル化材料などの薬学的に許容される材料、組成物、または媒体を意味する。各キャリアは、製剤の他の成分と相溶性があり、患者に害を及ぼすことはないという意味で許容範囲内にある。薬学的に許容されるキャリアとして役立つ物質の例として以下のものがある：ラクトース、グルコース、スクロースなどの糖、コーンスターチやポテトスターチなどのデンプン、セルロースおよびその誘導体（カルボキシメチルセルロースナトリウム、エチルセルロース、酢酸セルロースなど）、粉末トラガカンス、麦芽、ゼラチン、タルク、カカオバターと座薬（ワックス）などの賦形剤、落花油、綿実油、サフラワー油、ゴマ油、オリーブ油、コーン油、大豆油などの油、ブチレングリコールなどのグリコール、グリセリン、ソルビトール、マンニトール、ポリエチレングリコールなどのポリオール、オレイン酸エチルやラウリン酸エチルなどのエステル、寒天、水酸化マグネシウムや水酸化アルミニウムなどの緩衝剤、アルギン酸、パイロジェンフリー水、等張性食塩水、リンガー液、エチルアルコール、リン酸緩衝液、および医薬品製剤に使用されるその他の非毒性の適合物質。キャリアという用語は、天然または合成の有機または無機成分を指し、有効成分を組み合わせて適用を容易にする。また、医薬組成物の成分は、所望の医薬効率を実質的に損なうような相互作用がないような方法で、本発明の化合物と互いに混合させることもできる。組成物には、等張剤、防腐剤、界面活性剤、および二価カチオン（好ましくは亜鉛）などの追加の薬剤を含んでもよい。
組成物には、賦形剤やペプチド組成物の安定化剤（例、緩衝剤、還元剤、バルクタンパク質、グリシンやプラリンなどのアミノ酸、炭水化物など）も含まれる場合がある。ペプチド組成物の製剤化に有用なバルクタンパク質として、アルブミンが挙げられる。ペプチドの製剤化に有用な代表的な炭水化物には、スクロース、マンニトール、ラクトース、トレハロース、またはグルコースが含まれるが、これらに限定されない。
界面活性剤は、組成物に含まれるペプチドまたはタンパク質の可溶性および不溶性の凝集および/または沈殿を防ぐためにも使用できる。適切な界面活性剤には、トリオレイン酸ソルビタン、大豆レシチン、およびオレイン酸が含まれるが、これらに限定されない。特定の場合においては、エタノールなどの溶媒を使用する溶液エアロゾルが好ましい。したがって、ペプチドを含む製剤には、エアロゾルを形成する際に溶液を霧化することによってペプチドの表面誘導凝集を低減または防止できる、界面活性剤を含めることもできる。ポリオキシエチレン脂肪酸エステルやアルコール、ポリオキシエチレンソルビトール脂肪酸エステルなど、さまざまな従来の界面活性剤が使用できる。量は通常、製剤の0.001～4重量％の範囲である。いくつかの実施形態において、本開示で使用される界面活性剤は、ポリオキシエチレンソルビタンモノオレエート、ポリソルベート80、ポリソルベート20である。当技術分野で周知されているその他の薬剤を組成物に含めることもできる。
いくつかの実施形態では、医薬組成物および投薬形態には、活性成分の崩壊速度を低下させるか、組成物の性質が変化する速度を低下させる1つまたは複数の化合物も含む。いわゆる安定剤または防腐剤には、アミノ酸、酸化防止剤、pH緩衝剤、または塩緩衝剤など（これらに限定されない）を含めてよい。抗酸化物質の非限定的な例としては、ブチルヒドロキシアニソール（BHA）、アスコルビン酸とその誘導体、トコフェロールとその誘導体、ブチルヒドロキシアニソール、システインなどがある。防腐剤の非限定的な例としては、p-ヒドロキシ安息香酸メチルまたはプロピル、塩化ベンザルコニウムなどのパラベンなどがある。アミノ酸のその他の非限定的な例には、グリシンまたはプロリンなどがある。
本発明はまた、プロリンまたはグリシンなどのアミノ酸を使用して、二価カチオンの有無にかかわらず、中性pHまたは中性pH以下のペプチドを含む液体溶液を使用して安定化（熱的または機械的に誘発される可溶性または不溶性凝集および/または阻害薬タンパク質の沈殿を防止または最小化すること）を図り、室温で安定した、または医薬品に好ましい、透明またはほぼ透明の溶液を作製する方法についても説明している。
一実施形態では、組成物は単体的または複合的な投薬形態の医薬組成物である。本発明の単体的または複合的な投与形態の医薬組成物は、予防または治療に有効な量の単一または複数の組成物（例、本発明の化合物、または他の予防または治療薬）、一般的に1つまたは複数の媒体、キャリア、または賦形剤、安定化剤、および／または防腐剤を含む。媒体、キャリア、賦形剤、安定化剤および防腐剤は、薬学的に許容範囲内であることが好ましい。
いくつかの実施形態では、医薬組成物および投薬形態には、無水医薬組成物および剤型を含む。本発明の無水医薬組成物および剤型は、無水または低含水成分および低水分または低湿度条件を用いて調製することができる。ラクトースと第一級または第二級アミンを含む少なくとも一つの活性成分を含む医薬組成物および剤形は、製造、包装、および／または保管中の水分および／または湿度との実質的な接触が予想される場合には無水物であることが好ましい。無水医薬組成物は、その無水性が維持されるように調製および保存する必要がある。したがって、無水組成物は、適切な調合キットに含めることができるよう、水への暴露を防止することが知られている材料を用いて包装されることが好ましい。適切な包装の例としては、密閉フォイル、プラスチック、単位用量容器（例、バイアル）、ブリスターパック、およストリップパックなどが含まれるが、これらに限定されない。
適切な媒体は製薬技術に熟練した者には周知であるが、適切な媒体の非限定的な例として、グルコース、スクロース、デンプン、ラクトース、ゼラチン、米、シリカゲル、グリセロール、タルク、塩化ナトリウム、乾燥脱脂乳、プロピレングリコール、水、ステアリン酸ナトリウム、エタノール、および当技術分野で周知されている類似の物質が挙げられる。生理食塩水、デキストロース水およびグリセロール水溶液も液体媒体として使用できる。特定の媒体が医薬組成物または剤形に組み込むのに適しているかどうかは、剤形が患者に投与される方法および剤形中の特定の活性成分などを含む（これらに限定されない）、当技術分野で周知されるさまざまな要因に依存する。医薬品媒体は、石油、動物、植物または合成由来の水および油（ピーナッツ油、大豆油、鉱油、ゴマ油とその類似品）などの無菌液体でもよい。
本発明はまた、医薬組成物を、量を示すアンプルや小袋などの密閉容器に包装できることも規定している。一実施形態では、医薬組成物は乾燥した滅菌凍結乾燥粉末として、患者の下気道への投与に適した送達装置に供給することができる。医薬組成物は、必要に応じて、活性成分を含む１つまたは複数の単位剤形を収めることができる、パックまたはディスペンサー装置に入れて提供することができる。パックは、例えば、ブリスターパックのような金属またはプラスチックホイルを含むことができる。パックまたはディスペンサー装置には、投与説明書を添付することができる。
これらの製剤または組成物を調製する方法には、本発明の化合物をキャリア、および必要に応じて1つ以上の補助成分と結合させる段階が含まれる。一般に、製剤は、本発明の化合物を液体キャリア、または細かく分割された固体キャリア、あるいはその両方に均一かつ密接に結合させ、その後、必要に応じて生成物を成形することによって調製される。
投与に適した本発明の製剤は、粉末、顆粒、または水性または非水性液体の溶液または懸濁液として、または水中油または油中水性液体エマルションとして、またはエリキシル剤またはシロップとして、またはトローチとして（ゼラチンおよびグリセリン、またはスクロースおよびアカシアなどの不活性ベースを使用する）および／またはうがい薬などとして、それぞれが所定の量の本発明の化合物（例、ペプチド）を有効成分として含む。
本書中の液体組成物は、そのまま送達装置と共に使用するか、あるいは、例えば噴霧乾燥法などによって調製される薬学的に許容されるペプチド含有製剤の調製に使用することもできる。医薬品投与用の噴霧凍結乾燥ペプチド／タンパク質の方法は、Maa et al., Curr Pharm. Biotechnol., 2001, 1, 283-302 に開示されており、本書に組み込まれている。別の実施形態では、本書の液体溶液は凍結噴霧乾燥され、噴霧乾燥された生成物は、分散性ペプチド含有粉末として回収され、治療的に有効であるとして個人に投与される。
本発明の化合物および医薬組成物は、併用療法に用いることができる。すなわち、化合物および医薬組成物は、1つまたは複数の他の所望の治療または医療処置と同時、またはその前後に投与することができる（例えば、ペプチドワクチンは、化学療法、放射線療法、医薬品、および/または別の治療など、他の治療との併用療法で使用できる）。併用療法において用いられる特定の治療法（治療法または手技）の組み合わせでは、所望の治療法および/または手技と、達成すべき望ましい治療効果との適合性が考慮される。また、用いられる治療法が、同じ疾患に対して所望の効果を達成し得ることが望ましい（例えば、本発明の化合物は、他の治療薬または予防薬と同時に投与することができる）。
本発明はまた、本発明の医薬組成物の成分の1つ以上を充填した、1つまたは複数の容器を含む医薬品パックまたはキットも規定する。当該容器には、医薬品または生物製剤の製造、使用、または販売を規制する政府機関が規定する形式の通知を添付することができ、当該通知には、ヒトへの投与を目的とした製造、使用、または販売に関与した当局の承認が反映されているものとする。
本発明は、がんまたは他の疾患の治療に適したペプチドを含む剤形を規定する。剤形は、 例えば、スプレー、エアロゾル、ナノ粒子、リポソーム、または当技術分野の技術者に周知されている他の形態で製剤化することができる。 「Remington's Pharmaceutical Sciences」、「Remington: The Science and Practice of Pharmacy supra」、「 Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems」（Howard C., Ansel et al., Lippincott Williams & Wilkins; 7th edition (Oct. 1, 1999）などを参照。
一般に、疾患の急性治療に使用される剤形には、同じ疾患の慢性治療に使用される剤形よりも、構成する有効成分が1つまたは複数多く含まれている場合がある。さらに、予防的および治療的に有効な剤形は、さまざまな条件によって異なる場合がある。例えば、治療に有効な剤形には、がんやその他の疾患の治療を目的とする場合に適切な免疫原性作用を持つペプチドを含めることができる。一方で、異なる有効用量は、本発明のペプチドを癌または他の疾患／病態に対する予防薬（例、ワクチン）として使用しようとする場合、 適切な免疫原性作用を有するペプチドを含有してもよい。本発明が包含する特定の剤形は、これらの方法やその他の方法によって異なり、本発明の技術分野に熟練した者は容易に見分けることができる。これについては、 例えば以下を参照：Remington's Pharmaceutical Science (2005、Mack Publishing Co.)、The Science and Practice of Pharmacy by Gennaro, Lippincott Williams & Wilkins; 20th edition (2003)、Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems by Howard C. Ansel et al., Lippincott Williams & Wilkins; 7th edition (Oct. 1, 1999)、およびEncyclopedia of Pharmaceutical Technology, edited by Swarbrick, J. & Boylan, J.C., Marcel Dekker Inc., New York, 1988。参照によりその全文を本書に組み込む。
医薬組成物または剤形のpHを調整して、1つまたは複数の有効成分の送達および/または安定性を改善することもできる。同様に、溶媒キャリアの極性、イオン強度、または強度を調整して送達率を向上させることができる。ステアリン酸塩などの化合物を医薬組成物または剤形に添加して、１つまたは複数の活性成分の親水性または親油性を有利に変化させて送達を改善することもできる。この点で、ステアリン酸塩は、製剤の脂質媒体として、あるいは乳化剤や界面活性剤として、および送達促進剤や浸透促進剤としても機能する。有効成分のさまざまな塩、水和物、または溶媒和物を使用して、結果として得られる組成物の特性をさらに調整できる。
免疫化に適した組成物を生み出す技術を用いることで、適切なキャリアとアジュバントを用いて組成物を調製することができる。組成物は、例えば、ミョウバン、ポリIC、MF-59、スクアレン系アジュバント、または免疫化に適したリポソーム系アジュバントなどを含むが、これらに限定されないアジュバントを含むことができる。
いくつかの実施形態では、組成物および方法は、宿主の免疫寛容性および誘導された抗体の放出のメカニズムを調節できる任意の適切な薬剤または免疫調節を含む。特定の実施形態において、免疫調節薬は、例えば腫瘍ネオ抗原（すなわち、腫瘍特異性抗原 [TSA]）に対する抗体を含む免疫応答を誘導するために、被験者の免疫応答の一過性調節に十分な量で適時に投与される。
発現系
発現系
ある形態では、本発明は、本発明のペプチドのいずれかを、本書に記載されるペプチドのいずれかを含む培地中で発現する細胞株の培養を規定する。
当技術分野では、組換えタンパク質／ペプチドを産生するための種々な発現系が知られており、これには原核生物（例、細菌）、植物、昆虫、酵母、および哺乳類の発現系が含まれる。目的の分子を産生するために、適切な細胞株を、本発明のペプチドのコード配列を含む核酸で形質転換、形質導入、またはトランスフェクトすることができる。このような核酸配列を含む発現ベクターは、宿主細胞におけるヌクレオチド配列の発現を可能にする方法で少なくとも１つの調節配列に結合することができ、当技術分野で知られている方法を介して導入することができる。発現ベクターのデザインが、トランスフェクトされる宿主細胞の選択および／または発現を希望するタンパク質の種類および／または量などの要因に依存し得ることを、本技術分野の実施者は理解している。非コードDNA領域のプロモーター領域の上流または下流に見られる配列であるエンハンサー領域も、発現を最適化する上で重要であることは、当技術分野では周知されている。必要に応じて、プラスミドDNAの導入に原核生物の宿主を利用する場合など、ウイルス源からの複製起点を利用することができる。しかし、真核生物では、染色体統合がDNA複製の一般的なメカニズムである。哺乳類細胞の安定したトランスフェクションでは、ごく一部の細胞で導入されたDNAをゲノムに組み込むことができる。使用される発現ベクターとトランスフェクション法は、統合イベントの成功に寄与する要因となる可能性がある。目的のタンパク質を安定的に増幅および発現させるためには、目的のタンパク質をコードするDNAを含むベクターを真核細胞（例、哺乳類細胞）のゲノムに安定的に組み込むことで、トランスフェクトされた遺伝子が安定して発現される。目的のタンパク質をコードする遺伝子を安定的に発現するクローンを同定して選択するために、選択可能なマーカー（例、抗生物質や薬剤に対する耐性）をコードする遺伝子を対象の遺伝子と共に宿主細胞に導入することができる。目的の遺伝子を含む細胞は、薬物選択（選択可能なマーカー遺伝子を組み込んだ細胞が薬剤の存在下で生存する）によって同定できる。選択可能なマーカーの遺伝子を組み込んでいない細胞は死滅する。その後、生存している細胞をスクリーニングして、目的のタンパク質分子が産生されるかどうか調べることができる。
挿入された配列の発現を調節する、または核酸を所望の特定の方法で修飾および処理する、宿主細胞株を選択することもできる。このような修飾（例、グリコシル化やその他の翻訳後修飾など）およびペプチド／タンパク質産物の処理（例、切断）は、ペプチド／タンパク質の機能にとって重要な場合がある。さまざまな宿主細胞株には、タンパク質や遺伝子産物の翻訳後処理と修飾のための、特徴的かつ特異的なメカニズムがある。そのため、適切な宿主系または細胞株を選択することで、発現した標的タンパク質の正しい修飾と処理を確実に行うことができる。こうして、一次転写産物の適切な処理、グリコシル化、および遺伝子産物のリン酸化のための細胞機構を有する真核生物の宿主細胞を使用することができる。
培養される宿主細胞に関して、さまざまな培養パラメーターが使用できる。哺乳類細胞の適切な培養条件は、当技術分野では周知されている（Cleveland WL et al., J. lmunol Methods, 1983, 56 (2): 221-234）、あるいは熟練した実施者が決定することもできる（例えば、『Animal Cell Culture: A Practical Approach』2nd Ed., Rickwood, D. and Hames, B. D., eds. [Oxford University Press: New York, 1992] を参照）。細胞培養条件は、選択した宿主細胞の種類によって異なる。媒体は市販のものを使用することができる。
本発明のペプチドは、ポリペプチド（本発明のペプチドを発現する発現コンストラクトでトランスフェクトされたものを含む）を発現する任意のヒトまたはヒト以外の細胞から精製することができる。タンパク質の回収、単離、精製では、細胞培養培地または細胞溶解物を遠心分離して粒子状の細胞や細胞破片を除去する。所望のポリペプチド分子は、適切な精製技術により、汚染の原因となる可溶性タンパク質およびポリペプチドから単離または精製される。タンパク質の非限定的な精製方法には、サイズ排除クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィー、エタノール沈殿、逆相HPLC、シリカなどの樹脂または陽イオン交換樹脂（例、DEAE）でのクロマトグラフィー、クロマトフォーカシング、SDS-PAGE、硫酸アンモニウム沈殿、Sephadex G-75などを用いたゲルろ過、免疫グロブリン汚染物質を除去するためのプロテインAセファロースクロマトグラフィーなどがある。プロテアーゼ阻害薬（例、PMSFまたはプロテイナーゼK）などその他の添加剤を使用して、精製中のタンパク質分解を阻害することができる。また、例えば、イオン交換ソフトゲルクロマトグラフィーや、陽イオン交換樹脂または陰イオン交換樹脂を使用するHPLCなど、炭水化物を選択できる精製手順を使用して、より酸性度の高い画分を収集することもできる。
治療の方法
治療の方法
一実施形態では、本書に開示される主題は、疾患の悪化を防止したり病気を治療するために、がんの診断後に開始される予防的治療に関するものである。一実施形態において、本書に開示される対象は、がんのリスクがあると考えられる被験者、または過去にがん（または他の疾患）と診断されたことがある被験者の予防に関連するものである。一実施形態では、当該被験者には、本書に記載されたペプチドワクチンまたはその医薬組成物を投与することができる。本発明は、本書に記載されたシステムおよび方法によって産生されるいずれかのペプチドの使用を想定している。一実施形態では、本書に記載されたペプチドワクチンは、注射器または当技術分野で知られている他の適切な方法を介して皮下投与することができる。
本書に開示される化合物または化合物の組み合わせ、または医薬組成物は、任意の適切な手段によって細胞、哺乳動物、またはヒトに投与することができる。限定されない投与方法の例としては、とりわけ(a)カプセル、錠剤、顆粒、スプレー、シロップ、またはその他の同様の形態での投与を含む経口経路による投与、(b)眼内、鼻内、耳内、直腸、膣、尿道、経粘膜、口腔内または経皮などの非経口経路による投与が挙げられ、これには、水性懸濁液、油性製剤など、または点滴、スプレー、座薬、塗布剤、軟膏などとしての投与が含まれる。(c) 以下を含む注射による皮下注射、腹腔内注射、静脈注射、筋肉注射、経皮投与、眼内注射、嚢内注射、髄腔内投与、胸腔内投与など（輸液ポンプ送達を含む）、(d)腎部または心臓部位への直接注射などによる局所投与、 例えば、デポ移植による投与、(e) 局所投与、本書に開示されている化合物または化合物の組み合わせを生体組織と接触させるのに当該分野の技術者が適当と認める場合、(f) エアロゾル化、噴霧化、および粉末化製剤を含む吸入による投与、および(g) 移植による投与。
本発明の技術分野に精通した者には明かなように、 投与すべき有効なin vivo用量および特定の投与方法は 、年齢、体重、および治療を受ける種、ならびに本書に開示されている化合物または化合物の組み合わせが用いられる特定の用途に応じて異なる。有効用量レベル、すなわち所望の結果を達成するのに必要な用量レベルの決定は、当業者が日常的な薬理学的方法を用いて行うことができる。通常、製品のヒトへの臨床応用は、より低い用量レベルで開始され、目的の効果が得られるまで用量レベルを上げていく。あるいは、 許容できるin vitro研究を用い 、確立された薬理学的方法を使用して、本方法により同定された組成物の有用な用量および投与経路を確立することもできる。 in vivo研究で得られた有効な動物への投与量は、当技術分野で知られている変換方法を使用して、適切なヒト用量に変換することができる（例、A simple practice guide for dose conversion between animals and human. Nair AB, Jacob S. Journal of basic and clinical pharmacy. 2016 Mar;7(2):27 を参照）。
予防方法
予防方法
いくつかの実施形態では、本発明の方法を用いて調製されたペプチドは、がん（例、腫瘍ネオ抗原）に対する免疫応答を促進するワクチンとして使用することができる。いくつかの実施形態において、本発明は、免疫応答を誘導するための組成物および方法、例えば、腫瘍ネオ抗原に対する抗体の誘導を規定する。いくつかの実施形態では、抗体は広域中和抗体である。いくつかの実施形態では、本発明の方法を用いて調製されたペプチドは、病原体に対する免疫応答を促進するためのワクチンとして使用することができる。いくつかの実施形態では、本発明の方法を用いて調製されたペプチドは、自己免疫疾患治療薬として免疫寛容を促進するために使用することができる。
本書に開示される組成、システム、および方法は、その範囲が本書に記載された特定の実施形態に限定されるものではない。事実、本発明の技術分野に精通した者にとっては、前述の他にもさまざまな構成、システム、および方法があることは明らかである。
Claims (67)
- 配列識別番号141から147、150から161、163から164、168から177、180から185、187から190、192から206、208から209、および211から272からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物。
- 免疫原性組成物が被験者に投与される請求項1の免疫原性組成物。
- 核酸配列が生体内で発現するためのコンストラクトとして投与される請求項1の免疫原性組成物。
- 核酸配列のin vivo投与により、HLAクラスI分子によって示される1つまたは複数のペプチドが、被験者において発現される請求項3の免疫原性組成物。
- 2つ以上のアミノ酸配列のそれぞれが、変異したRASタンパク質の修飾または未修飾フラグメントである請求項4の免疫原性組成物。
- 変異したRASタンパク質は変異したKRASタンパク質であり、変異したKRASタンパク質はKRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、およびKRAS G13Dからなるグループから選択される請求項5の免疫原性組成物。
- 2つ以上のアミノ酸配列が被験者において発現される変異RASタンパク質に基づいて選択され、かつ免疫原性組成物ががんを治療するために被験者に有効量で投与され、かつがんが被験者において発現する変異したRASタンパク質と関連している請求項5の免疫原性組成物。
- 2つ以上のアミノ酸配列が、被験者が属するリスクグループにおける変異したRASタンパク質の有病率に基づいて選択され、当該免疫原性組成物が、被験者のがんに対する免疫応答を促進するため、または被験者のがんを治療するために有効量で被験者に投与され、かつがんが変異したRASタンパク質と関連している請求項5の免疫原性組成物。
- 次の配列識別番号からなる群から選択される少なくとも2つのアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物：配列識別番号:154、配列識別番号:155、配列識別番号:156、配列識別番号:157、配列識別番号:159、配列識別番号:160、配列識別番号:161、配列識別番号:163、配列識別番号:164、 配列識別番号:7882、配列識別番号:7884、配列識別番号:7887、配列識別番号:7888、配列識別番号:7894、配列識別番号:7898、配列識別番号:7899、配列識別番号:7900、配列識別番号:7901、配列識別番号:7904、配列識別番号:7905、配列識別番号:7906、配列識別番号:7920、配列識別番号:7921、配列識別番号:7926、配列識別番号:7932、配列識別番号:7933、配列識別番号:7934、配列識別番号:7936、配列識別番号:7937、配列識別番号:7940、配列識別番号:7950、配列識別番号:7951、配列識別番号:7953、配列識別番号:7954、配列識別番号:7970、配列識別番号:7972、配列識別番号:7976、配列識別番号:7982、配列識別番号:8139、配列識別番号:8267、配列識別番号:8269、配列識別番号:8272、配列識別番号:8277、配列識別番号:8296、配列識別番号:8422。
- 核酸配列がin vivoでの核酸配列の発現を可能にするよう構成されている請求項9の免疫原性組成物。
- 核酸配列がHLAクラスI分子によって提示される核酸配列によってコードされる1つまたは複数のペプチドの生体内での発現を可能にするように構成されている請求項10の免疫原性組成物。
- 核酸配列が、核酸配列によってコードされる少なくとも2つのペプチドのin vivoでの発現を可能にするよう構成され、少なくとも2つのペプチドのうちの第1のペプチドは、第1の複数のHLAクラスI対立遺伝子によって提示され、少なくとも2つのペプチドのうちの第2のペプチドは、第2の複数のHLAクラスI対立遺伝子によって提示され、第1の複数のHLAクラスI対立遺伝子と第2の複数のHLAクラスI対立遺伝子とが、少なくとも1つのHLAクラスI対立遺伝子によって異なる、請求項10の免疫原性組成物。
- 少なくとも2つのアミノ酸配列のそれぞれが、KRAS G12C変異を含むKRASタンパク質の断片のヘテロクリティック修飾を含む請求項11の免疫原性組成物。
- 2つ以上のアミノ酸配列が、被験者において発現するKRAS G12C変異に基づいて選択される請求項13の免疫原性組成物。
- 次の配列識別番号からなる群から選択される少なくとも2つのアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む請求項9の免疫原性組成物：配列識別番号:154、配列識別番号:155、配列識別番号:156、配列識別番号:158、配列識別番号:159、配列識別番号:160、配列識別番号:162、配列識別番号:163、配列識別番号:164、配列識別番号:165、配列識別番号:7900、配列識別番号:7901、配列識別番号:7904、配列識別番号:7905、配列識別番号:7906、配列識別番号:7921、配列識別番号:7933、配列識別番号:7950、配列識別番号:7951、配列識別番号:7976、配列識別番号:8080、配列識別番号:8272、配列識別番号:8296、および配列識別番号:8422。
- 次の配列識別番号からなる群から選択される少なくとも2つのアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物:配列識別番号:203、 配列識別番号:204、 配列識別番号:205、 配列識別番号:206、 配列識別番号:208、 配列識別番号:209、 配列識別番号:211、 配列識別番号:213、 配列識別番号:11018、 配列識別番号:11021、 配列識別番号:11024、 配列識別番号:11029、 配列識別番号:11030、 配列識別番号:11031、 配列識別番号:11032、 配列識別番号:11035、 配列識別番号:11036、 配列識別番号:11037、 配列識別番号:11040、 配列識別番号:11041、 配列識別番号:11043、 配列識別番号:11044、 配列識別番号:11046、 配列識別番号:11052、 配列識別番号:11053、 配列識別番号:11054、 配列識別番号:11062、 配列識別番号:11064、 配列識別番号:11070、 配列識別番号:11071、 配列識別番号:11072、 配列識別番号:11073、 配列識別番号:11076、 配列識別番号:11077、 配列識別番号:11078、 配列識別番号:11079、 配列識別番号:11080、 配列識別番号:11091、 配列識別番号:11092、 配列識別番号:11094、 配列識別番号:11096、 配列識別番号:11097、 配列識別番号:11098、 配列識別番号:11102、 配列識別番号:11104、 配列識別番号:11106、 配列識別番号:11108、 配列識別番号:11116、 配列識別番号:11118、 配列識別番号:11122、 配列識別番号:11128、 配列識別番号:11130、 配列識別番号:11193、 配列識別番号:11203、 配列識別番号:11206、 配列識別番号:11212、 配列識別番号:11220、 配列識別番号:11227、 配列識別番号:11274、 配列識別番号:11283、 配列識別番号:11305、 配列識別番号:11306、 配列識別番号:11310、 配列識別番号:11311、 配列識別番号:11315、 配列識別番号:11324、 配列識別番号:11333、 配列識別番号:11342、 配列識別番号:11343、 配列識別番号:11352、 配列識別番号:11447、 配列識別番号:11453、 配列識別番号:11456、 配列識別番号:11457、 配列識別番号:11461、 配列識別番号:11465、 配列識別番号:11468、 配列識別番号:11469、 配列識別番号:11474、 配列識別番号:11585、 配列識別番号:11617、 配列識別番号:11672、 配列識別番号:11701、 配列識別番号:11723、 および配列識別番号:11734
- 核酸配列がin vivoでの核酸配列の発現を可能にするように構成されている請求項16の免疫原性組成物。
- 核酸配列が、HLAクラスI分子によって提示される核酸配列によってコードされる１つまたは複数のペプチドのin vivoでの発現を可能にするよう構成されている、請求項17の免疫原性組成物。
- 核酸配列が、核酸配列によってコードされる少なくとも2つのペプチドのin vivoでの発現を可能にするよう構成され、少なくとも2つのペプチドのうちの第1のペプチドは、第1の複数のHLAクラスI対立遺伝子によって提示され、少なくとも2つのペプチドのうちの第2のペプチドは、第2の複数のHLAクラスI対立遺伝子によって提示され、第1の複数のHLAクラスI対立遺伝子と第2の複数のHLAクラスI対立遺伝子とが、少なくとも1つのHLAクラスI対立遺伝子によって異なる請求項16の免疫原性組成物。
- 少なくとも2つのアミノ酸配列のそれぞれが、KRAS G12V変異を含むKRASタンパク質の断片のヘテロクリティック修飾を含む請求項18の免疫原性組成物。
- 2つ以上のアミノ酸配列が、被験者において発現するKRAS G12V変異に基づいて選択される、請求項20の免疫原性組成物。
- 次の配列識別番号からなる群から選択される少なくとも2つのアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む請求項16の免疫原性組成物：配列識別番号:203、配列識別番号:204、配列識別番号:205、配列識別番号:208、配列識別番号:210、配列ID番号:11018、配列識別番号:11036、配列識別番号:11037、配列識別番号:11043、配列識別番号:11044、配列識別番号:11046、配列識別番号:11054、配列識別番号:11076、配列識別番号:11078、配列識別番号:11080、配列識別番号:11098、配列識別番号:11118、配列識別番号:11122、配列識別番号:11128、配列識別番号:11130、配列識別番号:11310、配列識別番号:11447、配列識別番号:11468、配列識別番号:11469、および配列識別番号:11474。
- 次の配列識別番号からなる群から選択される少なくとも2つのアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む請求項19の免疫原性組成物：配列識別番号:203、配列識別番号:204、配列識別番号:205、配列識別番号:208、配列識別番号:210、配列ID番号:11018、配列識別番号:11036、配列識別番号:11037、配列識別番号:11043、配列識別番号:11044、配列識別番号:11046、配列識別番号:11054、配列識別番号:11076、配列識別番号:11078、配列識別番号:11080、配列識別番号:11098、配列識別番号:11118、配列識別番号:11122、配列識別番号:11128、配列識別番号:11130、配列識別番号:11310、配列識別番号:11447、配列識別番号:11468、配列識別番号:11469、および配列識別番号:11474。
- 次の配列識別番号からなる群から選択される少なくとも2つのアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物：配列識別番号:180、配列識別番号:181、配列識別番号:182、配列識別番号:183、配列識別番号:184、配列識別番号:185、配列識別番号:187、配列識別番号:188、配列識別番号:189、配列識別番号:190、配列識別番号:9760、配列識別番号:9768、配列識別番号:9771、配列識別番号:9772、配列識別番号:9775、配列識別番号:9776、配列識別番号:9779、配列識別番号:9780、配列識別番号:9784、配列識別番号:9785、配列識別番号:9786、SEQ 配列識別番号:9795、配列識別番号:9799、配列識別番号:9800、配列識別番号:9844、配列識別番号:9872、配列識別番号:9875、配列識別番号:9877、配列識別番号:9878、配列識別番号:9885、配列識別番号:9907、配列識別番号:9914、配列識別番号:9920、配列識別番号:9927、配列識別番号:9933、配列識別番号:9940、配列識別番号:10072、配列識別番号:10075、配列識別番号:10076、配列識別番号:10079、配列識別番号:10103、配列識別番号:10192、配列識別番号:10227。
- 核酸配列がin vivoでの核酸配列の発現を可能にするよう構成されている請求項24の免疫原性組成物。
- 核酸配列が、HLAクラスI分子によって示される核酸配列によってコードされる1つまたは複数のペプチドの生体内での発現を可能にするように構成されている請求項25の免疫原性組成物。
- 核酸配列が、その核酸配列によってコードされる少なくとも2つのペプチドのin vivoでの発現を可能にするよう構成され、少なくとも2つのペプチドのうちの第1のペプチドは、第1の複数のHLAクラスI対立遺伝子によって提示され、少なくとも2つのペプチドのうちの第2のペプチドは、第2の複数のHLAクラスI対立遺伝子によって提示され、第1の複数のHLAクラスI対立遺伝子と第2の複数のHLAクラスI対立遺伝子とが、少なくとも1つのHLAクラスI対立遺伝子によって異なる請求項25の免疫原性組成物。
- 少なくとも2つのアミノ酸配列のそれぞれが、KRAS G12R変異を含むKRASタンパク質の断片のヘテロクリティック修飾を含む請求項26の免疫原性組成物。
- 2つ以上のアミノ酸配列が被験者において発現するKRAS G12R変異に基づいて選択される、請求項28の免疫原性組成物。
- 次の配列識別番号からなる群から選択される少なくとも2つのアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む請求項24の免疫原性組成物：配列識別番号:180、配列識別番号:181、配列識別番号:182、配列識別番号:183、配列識別番号:184、配列識別番号:185、配列識別番号:187、配列識別番号:188、番号:189、配列識別番号:190、配列識別番号:9760、配列識別番号:9768、配列識別番号:9772、配列識別番号:9775、配列識別番号:9779、配列識別番号:9785、配列識別番号:9786、配列識別番号:9799、配列識別番号:9800、配列識別番号:9878、配列識別番号:9885、配列識別番号:10076、配列識別番号:10103、配列識別番号:10227。
- 次の配列識別番号からなる群から選択される少なくとも2つのアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む免疫原性組成物：配列識別番号:168、配列識別番号:169、配列識別番号:170、配列識別番号:171、配列識別番号:172、配列識別番号:173、配列識別番号:174、配列識別番号:175、配列識別番号:176、配列識別番号:177、配列識別番号:8439、配列識別番号:8447、配列識別番号:8449、配列識別番号:8450、配列識別番号:8453、配列識別番号:8454、配列識別番号:8458、配列識別番号:8464、配列識別番号:8465、配列識別番号:8467、配列識別番号:8468、配列識別番号:8472、配列識別番号:8475、配列識別番号:8498、配列識別番号:8504、配列識別番号:8510、配列識別番号:8513、配列識別番号:8514、配列識別番号:8518、配列識別番号:8524、配列識別番号:8526、配列識別番号:8529、配列識別番号:8534、配列識別番号:8536、配列識別番号:8554、配列識別番号:8605、配列識別番号:8630、配列識別番号:8631、配列識別番号:8667、配列識別番号:8669、配列識別番号:8671、配列識別番号:8672、配列識別番号:8675、配列識別番号:8704、配列識別番号:8705、配列識別番号:8707、配列識別番号:8708、配列識別番号:8710、配列識別番号:8731、配列識別番号:8733、配列識別番号:8734、配列識別番号:8736、配列識別番号:8764、配列識別番号:8828、配列識別番号:8831、配列識別番号:8841、配列識別番号:8847、配列識別番号:8849、配列識別番号:8851、配列識別番号:8852、配列識別番号:8855、配列識別番号:8863、配列識別番号:8878、配列識別番号:8880、配列識別番号:8882、配列識別番号:8883、配列識別番号:8886、配列識別番号:8898、配列識別番号:8909、配列識別番号:8911、配列識別番号:8913、配列識別番号:8914、配列識別番号:8917、配列識別番号:8958、配列識別番号:8959、配列識別番号:9059、配列識別番号:9066、配列識別番号:9067、配列識別番号:9070、配列識別番号:9072、配列識別番号:9073、配列識別番号:9075、配列識別番号:9076、配列識別番号:9083、配列識別番号:9085、配列識別番号:9086、配列識別番号:9103、配列識別番号:9106、配列識別番号:9107、配列識別番号:9112、配列識別番号:9221、配列識別番号:9222、配列識別番号:9279、配列識別番号:9280、配列識別番号:9282、配列識別番号:9286、配列識別番号:9287、配列識別番号:9293、配列識別番号:9336、配列識別番号:9340、配列識別番号:9341、配列識別番号:9345、配列識別番号:9368、配列識別番号:9371、配列識別番号:9375、配列識別番号:9376、配列識別番号:9381、配列識別番号:9393、配列識別番号:9412、配列識別番号:9425、配列識別番号:9458、配列識別番号:9481、配列識別番号:9486、配列識別番号:9491、配列識別番号:9538、配列識別番号:9543、配列識別番号:9544、配列識別番号:9546、配列識別番号:9550、配列識別番号:9551、配列識別番号:9558、配列識別番号:9587、配列識別番号:9591、配列識別番号:9592、配列識別番号:9594、配列識別番号:9598、海ID番号:9599、配列識別番号:9606、配列識別番号:9626、配列識別番号:9633、配列識別番号:9637、配列識別番号:9642、配列識別番号:9643、配列識別番号:9645、配列識別番号:9649、配列識別番号:9650、配列識別番号:9657、配列識別番号:9698、配列識別番号:9721。
- 核酸配列がin vivoでの核酸配列の発現を可能にするよう構成されている請求項31の免疫原性組成物。
- 核酸配列が、HLAクラスI分子によって示される核酸配列によってコードされる1つまたは複数のペプチドのin vivoでの発現を可能にするように構成されている請求項32の免疫原性組成物。
- 核酸配列が核酸配列によってコードされる少なくとも2つのペプチドのin vivoでの発現を可能にするよう構成され、少なくとも2つのペプチドのうちの第1のペプチドは、第1の複数のHLAクラスI対立遺伝子によって提示表示され、少なくとも2つのペプチドのうちの第2のペプチドは、第2の複数のHLAクラスI対立遺伝子によって提示され、第1の複数のHLAクラスI対立遺伝子と第2の複数のHLAクラスI対立遺伝子とが、少なくとも1つのHLAクラスI対立遺伝子によって異なる請求項32の免疫原性組成物。
- 少なくとも2つのアミノ酸配列のそれぞれが、KRAS G12D変異を含むKRASタンパク質の断片のヘテロクリティック修飾を含む請求項32の免疫原性組成物。
- 2つ以上のアミノ酸配列が被験者において発現するKRAS G12D変異に基づいて選択される請求項35の免疫原性組成物。
- 次の配列識別番号からなる群から選択される少なくとも2つのアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む請求項31の免疫原性組成物：配列識別番号:168、配列識別番号:169、配列識別番号:170、配列識別番号:171、配列識別番号:172、配列識別番号:173、配列識別番号:174、配列識別番号:175、配列識別番号:176、配列識別番号:8439、配列識別番号:8449、配列識別番号:8450、配列識別番号:8453、配列識別番号:8454、配列識別番号:8458、配列識別番号:8465、配列識別番号:8529、配列識別番号:8851、配列識別番号:8882、配列識別番号:9059、配列識別番号:9067、配列識別番号:9106、配列識別番号:9642、配列識別番号:9698、配列識別番号:9721。
- 次の配列識別番号からなる群から選択される少なくとも2つのアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む請求項34の免疫原性組成物：配列識別番号:168、配列識別番号:169、配列識別番号:170、配列識別番号:171、配列識別番号:172、配列識別番号:173、配列識別番号:174、配列識別番号:175、配列識別番号:176、配列識別番号:8439、配列識別番号:8449、配列識別番号:8450、配列識別番号:8453、配列識別番号:8454、配列識別番号:8458、配列識別番号:8465、配列識別番号:8529、配列識別番号:8851、配列識別番号:8882、配列識別番号:9059、配列識別番号:9067、配列識別番号:9106、配列識別番号:9642、配列識別番号:9698、配列識別番号:9721。
- 配列識別番号:19～50からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列から成る免疫原性組成物。
- 免疫原性組成物が被験者に投与される請求項39の免疫原性組成物。
- 核酸配列がin vivoで発現するためのコンストラクトとして投与される請求項39の免疫原性組成物。
- 核酸配列のin vivo投与が、HLAクラスI分子によって示される1つまたは複数のペプチドを産生するよう構成されている請求項41の免疫原性組成物。
- 1つまたは複数のペプチドが、変異したBRAFタンパク質の修飾フラグメントまたは未修飾フラグメントである請求項42の免疫原性組成物。
- 変異したBRAFタンパク質がBRAF V600EまたはBRAF V600Mである請求項43の免疫原性組成物。
- 免疫原性組成物が、がんを予防または治療するために被験者に有効量で投与される請求項39の免疫原性組成物。
- がんが、結腸直腸がん、皮膚がん、および甲状腺がんからなる群から選択される請求項45の免疫原性組成物。
- 配列識別番号141～272からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列から成る免疫原性組成物。
- 免疫原性組成物が被験者に投与されるものである請求項47の免疫原性組成物。
- 核酸配列がin vivoで発現するためのコンストラクトとして投与される請求項47の免疫原性組成物。
- 核酸配列のin vivo投与が、HLAクラスI分子によって示される1つまたは複数のペプチドを産生するよう構成されている請求項49の免疫原性組成物。
- 1つまたは複数のペプチドが、変異KRASタンパク質、変異NRASタンパク質、および変異HRASタンパク質からなる群から選択される変異タンパク質の修飾または未修飾フラグメントである請求項50の免疫原性組成物。
- 変異KRASタンパク質が、KRAS G12A、KRAS G12C、KRAS G12D、KRAS G12R、KRAS G12S、KRAS G12V、およびKRAS G13Dからなる群から選択される請求項51の免疫原性組成物。
- 変異NRASタンパク質が、NRAS Q61K、NRAS Q61L、およびNRAS Q61Rからなる群から選択される請求項51の免疫原性組成物。
- 免疫原性組成物が、がんを予防または治療するために被験者に有効量で投与されるものである請求項47の免疫原性組成物。
- 配列識別番号273～322からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列から成る免疫原性組成物。
- 核酸配列がin vivoで発現するためのコンストラクトとして投与される請求項55の免疫原性組成物。
- 核酸配列のin vivo投与が、HLAクラスI分子によって示される1つまたは複数のペプチドを産生するよう構成されている請求項56の免疫原性組成物。
- 1つまたは複数のペプチドは、変異したPIK3CAタンパク質の修飾フラグメントまたは未修飾フラグメントである請求項57の免疫原性組成物。
- 変異したPIK3CAタンパク質が、PIK3CA E542K、PIK3CA E545K、PIK3CA H1047R、およびPIK3CA R88Qからなる群から選択される請求項58の免疫原性組成物。免疫原性組成物が、がんの予防または治療のために被験者に有効量で投与される請求項17の免疫原性組成物。
- がんが、気管支がんおよび肺がん、結腸直腸がん、および乳がんからなる群から選択される、請求項59の免疫原性組成物。
- 配列識別番号354～458からなる群から選択される2つ以上のアミノ酸配列をコードする核酸配列から成る免疫原性組成物。
- 核酸配列がin vivoで発現するためのコンストラクトとして投与される請求項61の免疫原性組成物。
- 核酸配列のin vivo投与が、HLAクラスI分子によって示される1つまたは複数のペプチドを産生するよう構成されている請求項62の免疫原性組成物。
- 1つまたは複数のペプチドが、変異したTP53タンパク質の修飾フラグメントまたは未修飾フラグメントである請求項63の免疫原性組成物。
- 変異したTP53タンパク質が、TP53 H179R、TP53 R158L、TP53 R175H、TP53 R248Q、TP53 R248W、TP53 R273C、TP53 R273H、TP53 R282W、およびTP53 Y220Cからなるグループから選択される請求項64の免疫原性組成物。
- 免疫原性組成物が、がんを予防または治療するために被験者に有効量で投与される請求項55の免疫原性組成物。
- がんが、脳腫瘍、気管支がんおよび肺がん、結腸直腸がん、乳がん、および卵巣がんからなる群から選択される、請求項66の免疫原性組成物。
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