KR20200135760A - Ssea4에 결합하는 키메라 항원 수용체 및 이의 용도 - Google Patents

Ssea4에 결합하는 키메라 항원 수용체 및 이의 용도 Download PDF

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Abstract

서열번호 3의 폴리펩타이드를 암호화하는 뉴클레오타이드 서열을 함유하는 단리된 핵산. 서열번호 3의 폴리펩타이드는 단계-특이적 배아 항원 4(SSEA4)에 특이적으로 결합한다. 상기 설명한 단리된 핵산을 포함하는 재조합 세포, 상기 단리된 핵산을 함유하는 바이러스 벡터, 및 서열번호 3의 서열을 포함하는 단리된 폴리펩타이드가 또한 개시된다. 서열번호 3의 서열을 갖고 SSEA4에 특이적으로 결합하는 단일 사슬 Fv를 포함하는 키메라 항원 수용체 (CAR)가 또한 제공된다. 더욱이, SSEA4를 발현하는 종양을 갖는 대상체의 T 세포를 CAR을 암호화하는 벡터로 시험관 내에서 형질도입하고, 형질도입된 T 세포를 확장시키고, 확장되고 형질도입된 T 세포를 대상체 내로 주입하여, 이에 의해 항-종양 T 세포 반응을 일으키는, 종양을 치료하는 방법이 개시된다.

Description

SSEA4에 결합하는 키메라 항원 수용체 및 이의 용도
화학요법(chemotherapy)과 비교하여, 표적화된 암 면역요법(immunotherapy)은 단기적 및 장기적 둘 다의 보다 양호한 효능뿐만 아니라, 더 적은 부작용의 전망을 갖는다.
예를 들어, 종양 특이적 탄수화물 항원, 예컨대 Globo H, 단계 특이적 배아 항원(stage-specific embryonic antigen) 3("SSEA3"), 및 단계-특이적 배아 항원 4("SSEA4")를 표적화하는 항암 백신은 이러한 항원에 대한 항체를 개발하도록 환자 자신의 면역계를 자극하도록 개발되어왔고, 이는 항체-의존성 세포성 세포독성, 항체-의존성 식균작용, 보체-의존성 세포 용해 뿐만 아니라, 직접적인 세포 증식 억제 및/또는 세포독성 효과로 이어진다.
이러한 접근법은 종종 종양에서 억제 환경의 결과로서 시간 경과에 따라 유효성을 상실한다. 억제 환경은 하나 또는 모든 항체, NK 세포, 대식세포 및 보체가 종양으로 진입하는 것을 차단한다.
최근에, 상기 언급된 약점을 제거하기 위해 키메라 항원 수용체("CAR")가 개발되었다. CAR은 (i) 종양 항원에 결합하는 세포외 도메인(extracellular domain) 및 (ii) T 세포에 1차 및 공동자극 신호 둘 다를 제공하는 하나 이상의 세포내 도메인을 함유한다. T 세포는 선택된 세포외 도메인을 갖는 CAR을 발현하도록 시험관 내에서 가공될 수 있다.
CAR 접근법은 효과적이지만, 심각한 부작용이 없지는 않은 것으로 입증되었다. 예를 들어, CAR을 발현하는 다수의 T 세포의 활성화가 사이토킨 방출 증후군을 유발한다. 고열, 저혈압, 저산소증을 특징으로 하는 이러한 증후군은, 다발성 장기 부전 및 심지어 죽음을 초래할 수 있다.
현재 사용되는 것보다 더 안전하고 더 효과적인 CAR-기반 종양 요법을 개발할 필요가 있다.
상기 논의된 필요를 충족시키기 위해, 서열번호 3의 폴리펩타이드를 암호화하는 뉴클레오타이드 서열을 함유하는 단리된 핵산(isolated nucleic acid)이 개시된다. 서열번호 3의 폴리펩타이드는 단계-특이적 배아 항원 4 (SSEA4)에 특이적으로 결합한다.
상기 기재된 단리된 핵산을 포함하는 재조합 세포(recombinant cell)로서, 서열번호 2의 폴리펩타이드를 발현하는 재조합 세포가 또한 개시된다.
추가로, 상기 단리된 핵산을 함유하는 바이러스 벡터가 본 발명의 범위 내에 있다. 바이러스 벡터는 렌티바이러스 벡터, 감마-레트로바이러스 벡터, 또는 아데노-연관 바이러스 벡터이다.
더욱이, 서열번호 3의 서열을 포함하는 단리된 폴리펩타이드, 다시, 단리된 폴리펩타이드는 SSEA4에 특이적으로 결합한다.
서열번호 3의 서열을 갖고 SSEA4에 특이적으로 결합하는 단일 사슬 Fv(scFv), 및 CD3ζ 또는 FcεRIγ로부터의 제1 엔도도메인(endodomain)을 포함하는 키메라 항원 수용체(CAR)가 또한 제공된다.
최종적으로, 대상체에서 종양을 치료하기 위한 방법으로서, (i) 종양을 갖는 대상체로부터 T 세포를 수득하는 단계; (ii) SSEA-4를 특이적으로 인식하는 scFv를 포함하는 CAR을 암호화하는 핵산을 함유하는 벡터로 T 세포를 시험관 내에서 형질도입하여, 이에 의해 형질도입된 T 세포가 CAR을 발현하는 단계; (iii) 시험관 내에서 형질도입된 T 세포를 확장시키는 단계; 및 (iv) 확장되고 형질도입된 T 세포를 종양을 갖는 대상체 내로 주입하여, 이에 의해 항-종양 T 세포 반응을 일으키는 단계를 포함하는 방법이 개시된다. scFv는 서열번호 3의 아미노산 서열을 갖고 종양 내의 세포는 SSEA4를 발현한다.
본 발명의 하나 이상의 실시양태의 세부사항은 하기 상세한 설명 및 도면에서 설명된다. 본 발명의 다른 특징, 목적, 및 이점은 상세한 설명으로부터 및 청구범위로부터 명백해질 것이다.
하기의 설명은 첨부된 도면을 참조한다:
도 1은 상이한 효과기(effector) 대 표적 비에서, 지시된 효과기 T 세포에 의한 표적 세포의 용해 백분율(percent lysis)의 막대 그래프이다.
도 2a는 상이한 효과기 대 표적 비에서, 지시된 효과기 T 세포를 표적 MCF-7 세포와 함께 공동 배양(coculturing)한 후 지시된 효과기 T 세포에 의해 방출된 IL-2의 양을 나타내는 막대 그래프이다.
도 2b는 상이한 효과기 대 표적 비에서, 지시된 효과기 T 세포를 표적 MCF-7 세포와 함께 공동 배양한 후 지시된 효과기 T 세포에 의해 방출된 IFN-γ의 양을 나타내는 막대 그래프이다.
상기 언급한 바와 같이, CAR-기반 종양 요법을 개발할 필요를 충족시키기 위해, 서열번호 3의 폴리펩타이드를 암호화하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 단리된 핵산이 제공된다. 서열번호 3의 폴리펩타이드는 SSEA4에 특이적으로 결합하는 scFv이다. 특정 실시예에서, 단리된 핵산은 서열번호 1의 뉴클레오타이드 서열을 갖는다.
서열번호 1의 뉴클레오타이드 서열을 갖는 단리된 핵산을 함유하는 재조합 세포가 또한 본 발명의 범위 내에 있다. 재조합 세포는 서열번호 2의 폴리펩타이드, 즉, 서열번호 3의 scFv를 포함하는 CAR 작제물(construct)을 발현한다. 재조합 세포는 T 세포, 예를 들어, CD4+ 또는 CD8+ T 세포일 수 있다. 사용될 수 있는 다른 세포는 NK, iNKT, 단핵구, 대식세포, 미세아교세포, 수지상세포, 및 호중구를 포함한다.
서열번호 3의 폴리펩타이드, 예를 들어 CAR 작제물을 암호화하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 단리된 핵산은 바이러스 벡터 내 함유될 수 있다.
예시적인 바이러스 벡터는 렌티바이러스 벡터, 감마-레트로바이러스 벡터, 및 아데노-연관 바이러스 벡터를 포함한다. 렌티바이러스 또는 감마 레트로바이러스를 기반으로 한 바이러스 벡터는 문헌 [Dai et al. 2016, J. Natl. Cancer Inst. 108:1-14 ("Dai et al."); Jin et al. 2016, EMBO Mol. Med. 8:702-711; Liechtenstein et al. 2013, Cancers 5:815-837; and Schonfeld et al. 2015, Mol. Therapy 23:330-338]에서 설명된다. 이러한 바이러스 벡터는 CAR-암호화 핵산을 T 세포 게놈 DNA로 통합시켜 CAR의 안정한 발현을 생산하기 위해 사용된다.
특정 실시예에서, 바이러스 벡터는 서열번호 1의 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 렌티바이러스 벡터이다.
대안적으로, CAR 작제물은 CAR-암호화 핵산, 예를 들어, 서열번호 1의 T 세포 내로의 트랜스포손-매개된(transposon-mediated) 게놈 통합을 용이하게 하는 서열을 함유하는 벡터 내에 포함될 수 있다. 이러한 발현 벡터의 예는 소위 "PiggyBac" 및 "슬리핑 뷰티(Sleeping Beauty)" 발현 벡터이다. 문헌 [Nakazawa et al. 2011, Mol. Ther. 19:2133-2143 and Maiti et al. 2013, J. Immunotherapy 36:112-123] 참조.
또 다른 대안에서, CAR 작제물을 함유하는 벡터는 T 세포의 게놈으로 CAR 작제물의 짧은 회문구조 반복서열 (clustered regularly interspaced short palindromic repeat; CRISPR)-매개된 삽입을 가능하게 하는 CAR 작제물에 인접하는(flanking) 게놈 핵산 서열을 또한 함유한다. CAR을 게놈 내로 삽입하기 위한 CRISPR 작제물의 예는 예를 들어, 문헌 [Miura et al. 2018, Nature Protocols13:195-215] 및 [He et al. 2016, Nucl. Acids Res. 44:1-14]에서 찾을 수 있다.
서열번호 3의 서열을 함유하는 단리된 폴리펩타이드가 추가로 개시된다. 단리된 폴리펩타이드인 scFv는, SSEA-4에 특이적으로 결합한다.
단계-특이적 배아 항원 4에 특이적으로 결합하는 scFv를 포함하는 CAR이 추가적으로 제공된다. scFv는 서열번호 3의 서열을 가질 수 있다. CAR은 CD3ζ 또는 FcεRIγ로부터의 제1 엔도도메인을 추가로 포함한다. 예시적인 CAR에서, 제1 도메인은 CD3ζ으로부터의 것이다.
CAR은 또한 제2 엔도도메인을 함유할 수 있다. 제2 엔도도메인은 CD28, CD137, CD4, OX40, 및 ICOS로부터의 엔도도메인일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다. 제2 엔도도메인이 CAR에 존재하는 경우, scFv는 제2 엔도도메인에 융합(fusing)되고 제2 엔도도메인은 제1 엔도도메인에 융합된다. CAR의 특정한 실시예는 CD137로부터의 제2 엔도도메인을 갖는다. 다른 특이적인 예에서, CAR은 서열번호 4의 아미노산 서열을 갖는다.
상기 언급한 바와 같이, 특히, 종양을 갖는 대상체로부터 T 세포를 수득하는 단계 및 SSEA4를 특이적으로 인식하는 scFv를 포함하는 CAR을 암호화하는 핵산을 함유하는 벡터로 T 세포를 시험관 내에서 형질도입하는 단계를 포함하는 종양 치료 방법이 제공된다.
T 세포를 수득하는 과정이 당해 분야에 공지되어 있다. 문헌 [예를 들면, Kaiser et al. 2015, Cancer Gene Therapy 22:72-78 ("Kaiser et al.")] 참조. T 세포는 CD4+, CD8+, 또는 NK 세포일 수 있다. 예시적인 방법에서, CD8+ 세포는 대상체로부터 수득된다.
T 세포는 상기 기재된 CAR 벡터로 시험관 내에서 형질도입된다. T 세포의 형질도입은 사용된 CAR 벡터의 유형에 따라 전기천공, 리포펙션(lipofection), 렌티바이러스 감염, 감마 레트로바이러스 감염, 또는 아데노-연관 바이러스 감염에 의해 수행될 수 있다.
더욱 구체적으로, CAR 벡터가 PiggyBac, 슬리핑 뷰티, 또는 CRISPR-기반 발현 벡터인 경우, 전기천공 또는 리포펙션을 통해 T 세포 내로 형질도입될 수 있다. CRISPR-기반 발현 벡터는 T 세포 내 의도된 게놈 삽입 부위에서 프로토스페이서(protospacer) 인접 모티프(motif)에 인접한 서열과 상보적인 가이드 RNA를 발현하는 벡터와 함께 공동 형질감염된다.
CAR 벡터가 바이러스 기반인 경우, 바이러스 입자가 제조되어 T 세포를 감염시키는데 사용된다.
종양 치료 방법은 또한 형질도입된 T 세포를 시험관 내에서 확장시키는 단계 및 확장되고 형질도입된 T 세포를 종양을 갖는 대상체 내로 주입하는 단계를 포함한다.
형질도입된 T 세포는 당해 분야에 공지된 방법을 사용하여 시험관 내에서 확장된다. 문헌 [Kaiser et al.] 참조. 확장된 T 세포는 이후에 1개의 배치(batch)로 또는 2개 이상의 배치로 종양을 갖는 대상체 내에 주입된다.
종양-치료 방법의 구체적인 대안에서, 방법은 바로 언급된 주입 단계 전에 수행되는 예비 조절(preconditioning) 단계를 추가로 포함한다. 예비 조절 단계는 림프구 제거(lymphodepletion)를 유도하는 약물로 대상체를 치료함으로써 달성된다. 이러한 약물의 예는 시클로포스파미드(cyclophosphamide) 및 플루다라빈(fludarabine)를 포함한다. 추가적인 약물의 예는 문헌 [Dai et al. and Han et al. 2013, J. Hematol. Oncol. 6:47-53]에서 찾을 수 있다.
종양-치료 방법에서, 형질도입된 T 세포는 CAR 이외에, 서열번호 5의 폴리펩타이드, 즉, 상피 성장 인자 수용체 t 도메인 III-IV (EGFRt)를 추가로 발현할 수 있다. 이러한 방식으로, 주입되고 확장된 T 세포는 EGFRt에 결합하는 항-상피 성장 인자 수용체 항체에 의해 생체 내에서 결실될 수 있다. 예를 들어, 세툭시맙(cetuximab)은 대상체에게 투여되어 생체 내에서 주입된 T 세포를 사멸시킨다. CAR과 EGFRt를 함께 암호화하는 예시적인 핵산은 서열번호 1의 핵산 서열을 갖는다.
상기 설명된 방법은 SSEA4를 발현하는 세포를 함유하는 종양을 치료하기 위해 사용될 수 있다. 치료될 수 있는 종양은 유방, 결장, 위장, 신장, 폐, 간, 난소, 췌장, 직장, 위, 고환, 흉선, 자궁 경부, 전립선, 방광, 피부, 비인두, 식도, 경구, 두경부, 뼈, 연골, 근육, 림프절, 골수, 또는 뇌 종양을 포함하나, 이에 제한되지 않는다.
추가의 상세한 설명 없이, 당해 분야 숙련가는, 본원의 개시내용에 기초하여, 본 개시내용을 최대한 활용할 수 있는 것으로 고려된다. 따라서, 하기의 구체적인 실시예는 단지 설명적인 것이고, 어떤 식으로든 본 개시내용의 나머지를 제한하는 것이 아닌 것으로 해석되어야한다. 본원에 인용된 모든 간행물 및 특허 문헌은 그 전문이 참고로 포함된다.
실시예
실시예 1: 항-SSEA4 CAR 작제물을 함유하는 렌티바이러스의 제조
항-SSEA4 CAR을 암호화하는 렌티바이러스 벡터의 작제
렌티바이러스 작제물을 표준 재조합 DNA 기술을 사용하여 E. coli에서 제조하였고 DNA 서열분석에 의해 검증하였다. 더욱 구체적으로, 서열번호 3의 서열을 갖는 scFv를 암호화하는 핵산을 EF-1 알파 프로모터 및 신호 펩티드 암호화 서열의 하부(downstream) 및 CD8 힌지(hinge)-암호화 서열의 상부(upstream) 렌티바이러스 플라스미드 벡터 내로 클로닝하여 CAR 카세트(cassette)를 생성하였다. CAR 카세트는 또한 CD8 막관통(transmembrane) 도메인, CD137 세포내 신호전달 도메인, CD3ζ엔도도메인, 토시아 아시그나(Thosea asigna) 자가-절단 펩타이드 T2A, 및 EGFRt 도메인 III-IV를 암호화한다. CAR 카세트는 서열번호 1의 핵산 서열을 갖는다. 렌티바이러스 플라스미드 벡터는 추가적인 서열을 함유하여 렌티바이러스 입자의 생성을 용이하게 한다.
렌티바이러스 팩키징(packaging) 및 생산
렌티바이러스의 팩키징 및 생산은 확립된 기술을 사용하여 수행되었다. 팩키징 세포, 즉, 293T 세포를, 10 cm 배양 접시 내 10 mL의 완전 배양 배지에 5 x 106 개 세포로 플레이팅(plating)하였다. 세포를 37℃에서 5% CO2로 밤새 배양(incubating)하였다. PBS에 형질감염 시약, 상기 기재된 렌티바이러스 벡터, 팩키징 벡터, 및 엔벨로프 벡터(envelope vector)를 조합함으로써 형질감염 복합체를 제조하였다. 형질감염 복합체를 팩키징 세포를 함유하는 배양 접시에 첨가하고 세포를 37℃에서 5% CO2로 6 내지 8 시간 동안 배양하였다. 배지를 교체하고 세포를 24시간 동안 배양하였다. 배양 배지를 수집하고 신선한 배지로 교체하였다. 이러한 24시간 배양 및 배지 수집을 2회 반복하였다. 수집된 모든 배지를 조합하고 0.45 μm 필터를 통과시켰다. 여액을 50,000 x g에서 2시간 동안 원심분리하여 렌티바이러스 입자를 펠렛화(pellet)하였다. 렌티바이러스 스톡(stock)을 PBS에서 현탁하고 -80℃에서 저장하였다.
렌티바이러스 적정
감염된 세포의 게놈 내로 통합된 렌티바이러스 DNA의 양을 측정하여 렌티바이러스 역가를 측정하였다. 293T 세포를 50,000개 세포/웰(cell/sell)의 밀도로 24-웰 플레이트에 플레이팅하고 밤새 배양하였다. 농축된 렌티바이러스 스톡을 폴리브렌(polybrene)과 함께 6 μg/mL의 농도로 각 웰에 첨가하였다. 플레이트를 짧게 원심분리한 다음 37℃에서 5% CO2로 72시간 동안 인큐베이터 속에 두었다. 렌티바이러스-형질도입된 세포로부터의 게놈 DNA를 상업적 키트(kit)를 사용하여 추출하였다.
실시간 정량적 PCR(RT-PCR)을 사용하여 추출된 게놈 DNA에 존재하는 렌티바이러스 DNA의 카피 수를 측정하였다. 알부민 유전자를 또한 측정하여 결과를 정규화하였다. RT-QPCR에 사용된 프라이머 및 탐침(probe)을 하기 표 1에 나타낸다.
프라이머 서열 (형광 표지) 서열번호
LTR Fa TGACAGCCGCCTAGCATTTC 6
LTR Ra GCTCGATATCAGCAGTTCTTGAAG 7
LTR Probea CACGTGGCCCGAGAGCTGCATC
(5'-FAM-BHQ1-3')		 8
ALB Fb GCTGTCATCTCTTGTGGGCTGT 9
ALB Rb ACTCATGGGAGCTGCTGGTTC 10
ALB Probeb CCTGTCATGCCCACACAAATCTCTCC
(5'-FAM-BHQ1-3')		 11
a LTR = 긴 말단 반복(long terminal repeat). 이 프라이머는 렌티바이러스 서열을 특이적으로 증폭시킨다.
b ALB = 알부민. 이 프라이머는 알부민 유전자를 특이적으로 증폭시킨다.
상기 기재된 RT-QPCR 프라이머를 사용하여 알부민 또는 LTR 유전자 서열을 보유하는 플라스미드 DNA의 공지된 양을 증폭시킴으로써 표준 곡선을 작제하였다. 게놈 DNA 내 렌티바이러스 DNA의 카피 수를 LTR 서열의 양을 알부민 서열의 양으로 나눈 비로 계산하였다.
이후 렌티바이러스 역가를 하기 식을 사용하여 계산하였다:
렌티바이러스 역가 =
Figure pct00001
예시적인 렌티바이러스 제제는 2.6 x 108 개 형질도입 단위/mL를 함유하였다.
실시예 2: 항-SSEA4 CAR T 세포의 제조
항-SSEA4 CAR을 발현하는 T 세포를 확립된 기술을 사용하여 제조하였다. 첫 째로, 말초 혈액 단핵 세포(PBMC)를 표준 혈액 분리 튜브를 사용하여 전혈(whole blood)로부터 단리하고 세포를 완전 배양 배지에 세포를 재현탁시켰다. T 세포를 표준 자기 비드 분리 기술을 사용하여 PBMC로부터 단리하였다.
단리된 T 세포를 조직 배양 플레이트 내로 분배하고 200 IU/mL IL2, 10 ng/mL IL7, 5 ng/mL IL15, 및 5 ng/mL IL21로 보충된 성장 배지를 첨가하여 세포 밀도가 0.5 x 106 내지 1 x 106 개 세포/mL가 되도록 하였다. 플레이트를 37℃에서 5% CO2로 3일 동안 배양시켰다. 실시예 1에서 상기 기재된 바와 같이 생성된 렌티바이러스 제제를 T 세포에 첨가하고, 폴리브렌을 6 μg/ml의 최종 농도로 또한 첨가하였다. 플레이트를 800 x g로 1시간 동안 실온에서 원심분리하고, 이후 37℃에서 5% CO2로 5일 동안 배양하였다. 5일의 배양 동안, T 세포를 0.5 x 106개 세포/mL의 세포 밀도로 유지시켰다. 항-SSEA4 CAR을 발현하는 T 세포의 백분율을 EGFR 도메인 III-IV에 대한 항체를 사용하는 형광-활성화 세포 분류에 의해 측정하였다.
예시적인 제조에서, T 세포의 45.7%가 항-SSEA4 CAR을 발현하였다.
실시예 3: 항-SSEA4 CAR T 효과기 세포에 의한 MCF-7 표적 세포의 용해
표적 세포를 용해하는 항-SSEA4 CAR T 세포의 능력을 공동 배양 분석에 의해 평가하였다. SSEA4를 발현하는, MCF-7 유방암 세포를 표적 세포로 사용하였다. 5 x 105 개 세포/mL의 100 μL의 MCF-7 표적 세포를 96-웰 플레이트의 각 웰에 옮기고 37℃에서 5% CO2로 밤새 배양하였다. 효과기 세포, 즉, 항-SSEA4 CAR T 세포, 비형질도입된 T 세포, 및 음성 대조군 렌티바이러스로 형질도입된 T 세포를 무혈청 RPMI1640 배지에 각각 현탁시켰다. 96 웰 플레이트로부터의 배양 배지를 제거하고 표적 세포를 PBS로 1회 세척하였다. T 세포를 1:1, 2:1, 5:1 및 10:1의 효과기 대 표적(E/T) 비로 별도의 웰에 첨가하였다. 각 웰에서 배지의 최종 용적을 RPMI1640을 사용하여 100 μL/웰로 조정하였다. 공동 배양물을 37℃에서 5% CO2로 6시간 동안 배양하였다.
상업용 키트(CytoTox 96® non-radioactive cytotoxicity assay; 미국 위스콘신주 프로메가(Promega) 소재)를 사용하여 용해 중 이러한 세포로부터 방출된 락테이트 디히드로게네이스(LDH)의 수준을 측정함으로써 표적 MCF-7 세포의 용해를 측정하였다. 공동 배양한 후, 96-웰 플레이트를 1200 x g로 5분 동안 실온에서 원심분리하고, 각 웰로부터 50μL의 상청액을 새로운 96 웰 플레이트로 옮겼다. 각 상청액에서 LDH 수준을 제조업자에 의해 지시된 대로 측정하였다. 표적 세포만 함유하는 특정 웰은 원심분리 단계 전 용해 완충제로 처리하였다. 이 웰로부터의 상청액을 사용하여 MCF-7 세포에 의해 방출된 LDH의 최대량을 측정하였다. 결과는 도 1에 나타낸다.
데이터는 비형질도입된 T 세포 및 빈(empty) 렌티바이러스 형질도입된 T 세포와 비교하여, 모든 E/T 비에서 항-SSEA4 CAR-T 세포가 유의하게 더 많은 표적 MCF-7 세포를 용해시켰다는 것을 보여준다.
실시예 4: 항-SSEA4 CAR-T 세포에 의한 사이토카인 방출
상기 기재된 CAR-T 세포를 10% FBS로 보충된 RPMI1640 배지에서 상이한 E/T 비로 24시간 동안 96-웰 플레이트에서 37℃에서 5% CO2로 표적 세포주 MCF7와 함께 공동 배양하였다. CAR-T 세포에 의한 사이토카인 방출을 측정하기 위해 배양 배지를 수확(harvesting)하였다. 요약하면, 96-웰 플레이트를 1200 x g로 5분 동안 실온에서 원심분리하고, 이후 각 웰로부터 50μL의 상청액을 새로운 96 웰 플레이트로 옮겼다. 사이토카인 IL-2 및 IFN-γ의 농도를 제조업자의 설명서에 따라 상업용 ELISA 키트를 사용하여 측정하였다. 결과는 도 2a 및 도 2b에 나타낸다. 데이터는 SSEA4-특이적 CAR-T 세포가 표적 종양 세포에 관여한 후 IL-2 및 IFN-γ 둘 다를 강력하게 분비하고 이 분비 수준은 비형질도입된 T 세포 또는 CAR 작제물이 결여된 렌티바이러스로 형질도입된 T 세포보다 유의하게 크다는 것을 나타낸다.
기타 실시양태
본 명세서에 개시된 모든 특징들은 임의의 조합으로 조합될 수 있다. 본 명세서에 개시된 각각의 특징은 동일하거나, 동등하거나, 유사한 목적을 제공하는 대안적인 특징으로 대체될 수 있다. 달리 명시되지 않는 한, 개시된 각각의 특징은 일반적인 일련의 동등하거나 유사한 특징의 예일 뿐이다.
상기 설명으로부터, 당해 분야 숙련가는 본 발명의 본질적인 특징을 쉽게 확인할 수 있고, 본 발명의 사상 및 범위를 벗어나지 않으면서, 본 발명의 다양한 변경 및 수정을 행하여 다양한 용도 및 조건에 적응시킬 수 있다. 따라서, 기타 실시양태도 다음의 청구범위의 범위 내에 있다.
SEQUENCE LISTING <110> CHEN, LAN, BO <120> CHIMERIC ANTIGEN RECEPTORS THAT BIND TO SSEA4 AND USES THEREOF <130> IPA200392-US <150> US 15/926,382 <151> 2018-03-20 <160> 11 <170> PatentIn version 3.5 <210> 1 <211> 3972 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic construct <220> <221> CDS <222> (1354)..(3972) <400> 1 gagtaattca tacaaaagga ctcgcccctg ccttggggaa tcccagggac cgtcgttaaa 60 ctcccactaa cgtagaaccc agagatcgct gcgttcccgc cccctcaccc gcccgctctc 120 gtcatcactg aggtggagaa gagcatgcgt gaggctccgg tgcccgtcag tgggcagagc 180 gcacatcgcc cacagtcccc gagaagttgg ggggaggggt cggcaattga accggtgcct 240 agagaaggtg gcgcggggta aactgggaaa gtgatgtcgt gtactggctc cgcctttttc 300 ccgagggtgg gggagaaccg tatataagtg cagtagtcgc cgtgaacgtt ctttttcgca 360 acgggtttgc cgccagaaca caggtaagtg ccgtgtgtgg ttcccgcggg cctggcctct 420 ttacgggtta tggcccttgc gtgccttgaa ttacttccac gcccctggct gcagtacgtg 480 attcttgatc ccgagcttcg ggttggaagt gggtgggaga gttcgaggcc ttgcgcttaa 540 ggagcccctt cgcctcgtgc ttgagttgag 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225 230 ttc gct gtc tac tac tgc ttc caa ggc agc ggc ttc cct ctg aca ttt 2094 Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Phe Gln Gly Ser Gly Phe Pro Leu Thr Phe 235 240 245 gga cag ggc acc aag gtg gaa atc aag acc act acc cca gca ccg agg 2142 Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg 250 255 260 cca ccc acc ccg gct cct acc atc gcc tcc cag cct ctg tcc ctg cgt 2190 Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg 265 270 275 ccg gag gca tgt aga ccc gca gct ggt ggg gcc gtg cat acc cgg ggt 2238 Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly 280 285 290 295 ctt gac ttc gcc tgc gat atc tac att tgg gcc cct ctg gct ggt act 2286 Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr 300 305 310 tgc ggg gtc ctg ctg ctt tca ctc gtg atc act ctt tac tgt atc tac 2334 Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Ile Tyr 315 320 325 att tgg gcc cct ctg gct ggt act tgc ggg gtc ctg ctg ctt tca ctc 2382 Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu 330 335 340 gtg atc act ctt tac tgt aag cgc ggt cgg aag aag ctg ctg tac atc 2430 Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile 345 350 355 ttt aag caa ccc ttc atg agg cct gtg cag act act caa gag gag gac 2478 Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp 360 365 370 375 ggc tgt tca tgc cgg ttc cca gag gag gag gaa ggc ggc tgc gaa ctg 2526 Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu 380 385 390 cgc gtg aaa ttc agc cgc agc gca gat gct cca gcc tac aag cag ggg 2574 Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Lys Gln Gly 395 400 405 cag aac cag ctc tac aac gaa ctc aat ctt ggt cgg aga gag gag tac 2622 Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr 410 415 420 gac gtg ctg gac aag cgg aga gga cgg gac cca gaa atg ggc ggg aag 2670 Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys 425 430 435 ccg cgc aga aag aat ccc caa gag ggc ctg tac aac gag ctc caa aag 2718 Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys 440 445 450 455 gat aag atg gca gaa gcc tat agc gag att ggt atg aaa ggg gaa cgc 2766 Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg 460 465 470 aga aga ggc aaa ggc cac gac gga ctg tac cag gga ctc agc acc gcc 2814 Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala 475 480 485 acc aag gac acc tat gac gct ctt cac atg cag gcc ctg ccg cct cgg 2862 Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg 490 495 500 gag ggc aga ggc agc ctg ctg aca tgt ggc gac gtg gaa gag aac cct 2910 Glu Gly Arg Gly Ser Leu Leu Thr Cys Gly Asp Val Glu Glu Asn Pro 505 510 515 ggc ccc atg tgg ctg cag agc ctg ctg ctc ttg ggc act gtg gcc tgc 2958 Gly Pro Met Trp Leu Gln Ser Leu Leu Leu Leu Gly Thr Val Ala Cys 520 525 530 535 agc atc tct cgc aaa gtg tgt aac gga ata ggt att ggt gaa ttt aaa 3006 Ser Ile Ser Arg Lys Val Cys Asn Gly Ile Gly Ile Gly Glu Phe Lys 540 545 550 gac tca ctc tcc ata aat gct acg aat att aaa cac ttc aaa aac tgc 3054 Asp Ser Leu Ser Ile Asn Ala Thr Asn Ile Lys His Phe Lys Asn Cys 555 560 565 acc tcc atc agt ggc gat ctc cac atc ctg ccg gtg gca ttt agg ggt 3102 Thr Ser Ile Ser Gly Asp Leu His Ile Leu Pro Val Ala Phe Arg Gly 570 575 580 gac tcc ttc aca cat act cct cct ctg gat cca cag gaa ctg gat att 3150 Asp Ser Phe Thr His Thr Pro Pro Leu Asp Pro Gln Glu Leu Asp Ile 585 590 595 ctg aaa acc gta aag gaa atc aca ggg ttt ttg ctg att cag gct tgg 3198 Leu Lys Thr Val Lys Glu Ile Thr Gly Phe Leu Leu Ile Gln Ala Trp 600 605 610 615 cct gaa aac agg acg gac ctc cat gcc ttt gag aac cta gaa atc ata 3246 Pro Glu Asn Arg Thr Asp Leu His Ala Phe Glu Asn Leu Glu Ile Ile 620 625 630 cgc ggc agg acc aag caa cat ggt cag ttt tct ctt gca gtc gtc agc 3294 Arg Gly Arg Thr Lys Gln His Gly Gln Phe Ser Leu Ala Val Val Ser 635 640 645 ctg aac ata aca tcc ttg gga tta cgc tcc ctc aag gag ata agt gat 3342 Leu Asn Ile Thr Ser Leu Gly Leu Arg Ser Leu Lys Glu Ile Ser Asp 650 655 660 gga gat gtg ata att tca gga aac aaa aat ttg tgc tat gca aat aca 3390 Gly Asp Val Ile Ile Ser Gly Asn Lys Asn Leu Cys Tyr Ala Asn Thr 665 670 675 ata aac tgg aaa aaa ctg ttt ggg acc tcc ggt cag aaa acc aaa att 3438 Ile Asn Trp Lys Lys Leu Phe Gly Thr Ser Gly Gln Lys Thr Lys Ile 680 685 690 695 ata agc aac aga ggt gaa aac agc tgc aag gcc aca ggc cag gtc tgc 3486 Ile Ser Asn Arg Gly Glu Asn Ser Cys Lys Ala Thr Gly Gln Val Cys 700 705 710 cat gcc ttg tgc tcc ccc gag ggc tgc tgg ggc ccg gag ccc agg gac 3534 His Ala Leu Cys Ser Pro Glu Gly Cys Trp Gly Pro Glu Pro Arg Asp 715 720 725 tgc gtc tct tgc cgg aat gtc agc cga ggc agg gaa tgc gtg gac aag 3582 Cys Val Ser Cys Arg Asn Val Ser Arg Gly Arg Glu Cys Val Asp Lys 730 735 740 tgc aac ctt ctg gag ggt gag cca agg gag ttt gtg gag aac tct gag 3630 Cys Asn Leu Leu Glu Gly Glu Pro Arg Glu Phe Val Glu Asn Ser Glu 745 750 755 tgc ata cag tgc cac cca gag tgc ctg cct cag gcc atg aac atc acc 3678 Cys Ile Gln Cys His Pro Glu Cys Leu Pro Gln Ala Met Asn Ile Thr 760 765 770 775 tgc aca gga cgg gga cca gac aac tgt atc cag tgt gcc cac tac att 3726 Cys Thr Gly Arg Gly Pro Asp Asn Cys Ile Gln Cys Ala His Tyr Ile 780 785 790 gac ggc ccc cac tgc gtc aag acc tgc ccg gca gga gtc atg gga gaa 3774 Asp Gly Pro His Cys Val Lys Thr Cys Pro Ala Gly Val Met Gly Glu 795 800 805 aac aac acc ctg gtc tgg aag tac gca gac gcc ggc cat gtg tgc cac 3822 Asn Asn Thr Leu Val Trp Lys Tyr Ala Asp Ala Gly His Val Cys His 810 815 820 ctg tgc cat cca aac tgc acc tac gga tgc act ggg cca ggt ctt gaa 3870 Leu Cys His Pro Asn Cys Thr Tyr Gly Cys Thr Gly Pro Gly Leu Glu 825 830 835 ggc tgt cca acg aat ggg cct aag atc ccg tcc atc gcc act ggg atg 3918 Gly Cys Pro Thr Asn Gly Pro Lys Ile Pro Ser Ile Ala Thr Gly Met 840 845 850 855 gtg ggg gcc ctc ctc ttg ctg ctg gtg gtg gcc ctg ggg atc ggc ctc 3966 Val Gly Ala Leu Leu Leu Leu Leu Val Val Ala Leu Gly Ile Gly Leu 860 865 870 ttc atg 3972 Phe Met <210> 2 <211> 873 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Construct <400> 2 Met Ala Leu Pro Val Thr Ala Leu Leu Leu Pro Leu Ala Leu Leu Leu 1 5 10 15 His Ala Ala Arg Pro Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys 20 25 30 Pro Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Phe Ser Leu 35 40 45 Thr Ser Tyr Gly Val Asp Trp Val Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu 50 55 60 Glu Trp Ile Gly Val Ile Trp Gly Gly Gly Ser Thr Asn Tyr Asn Ser 65 70 75 80 Ala Leu Met Ser Arg Leu Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Ser Gln 85 90 95 Val Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr 100 105 110 Tyr Cys Ala Lys His Glu Val Leu Arg Gly Tyr Ala Leu Asp Tyr Trp 115 120 125 Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly 130 135 140 Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Leu Thr Gln Ser Pro Ala Thr 145 150 155 160 Leu Ser Leu Ser Pro Gly Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Ser Ala Ser 165 170 175 Pro Ser Val Ser Tyr Met His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala 180 185 190 Pro Arg Leu Leu Ile Tyr Asp Thr Tyr Lys Leu Ala Ser Gly Ile Pro 195 200 205 Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile 210 215 220 Ser Ser Leu Glu Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Phe Gln Gly 225 230 235 240 Ser Gly Phe Pro Leu Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys 245 250 255 Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala 260 265 270 Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly 275 280 285 Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile 290 295 300 Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val 305 310 315 320 Ile Thr Leu Tyr Cys Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys 325 330 335 Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly 340 345 350 Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro Val 355 360 365 Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu 370 375 380 Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp 385 390 395 400 Ala Pro Ala Tyr Lys Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn 405 410 415 Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg 420 425 430 Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly 435 440 445 Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu 450 455 460 Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu 465 470 475 480 Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His 485 490 495 Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg Glu Gly Arg Gly Ser Leu Leu Thr Cys 500 505 510 Gly Asp Val Glu Glu Asn Pro Gly Pro Met Trp Leu Gln Ser Leu Leu 515 520 525 Leu Leu Gly Thr Val Ala Cys Ser Ile Ser Arg Lys Val Cys Asn Gly 530 535 540 Ile Gly Ile Gly Glu Phe Lys Asp Ser Leu Ser Ile Asn Ala Thr Asn 545 550 555 560 Ile Lys His Phe Lys Asn Cys Thr Ser Ile Ser Gly Asp Leu His Ile 565 570 575 Leu Pro Val Ala Phe Arg Gly Asp Ser Phe Thr His Thr Pro Pro Leu 580 585 590 Asp Pro Gln Glu Leu Asp Ile Leu Lys Thr Val Lys Glu Ile Thr Gly 595 600 605 Phe Leu Leu Ile Gln Ala Trp Pro Glu Asn Arg Thr Asp Leu His Ala 610 615 620 Phe Glu Asn Leu Glu Ile Ile Arg Gly Arg Thr Lys Gln His Gly Gln 625 630 635 640 Phe Ser Leu Ala Val Val Ser Leu Asn Ile Thr Ser Leu Gly Leu Arg 645 650 655 Ser Leu Lys Glu Ile Ser Asp Gly Asp Val Ile Ile Ser Gly Asn Lys 660 665 670 Asn Leu Cys Tyr Ala Asn Thr Ile Asn Trp Lys Lys Leu Phe Gly Thr 675 680 685 Ser Gly Gln Lys Thr Lys Ile Ile Ser Asn Arg Gly Glu Asn Ser Cys 690 695 700 Lys Ala Thr Gly Gln Val Cys His Ala Leu Cys Ser Pro Glu Gly Cys 705 710 715 720 Trp Gly Pro Glu Pro Arg Asp Cys Val Ser Cys Arg Asn Val Ser Arg 725 730 735 Gly Arg Glu Cys Val Asp Lys Cys Asn Leu Leu Glu Gly Glu Pro Arg 740 745 750 Glu Phe Val Glu Asn Ser Glu Cys Ile Gln Cys His Pro Glu Cys Leu 755 760 765 Pro Gln Ala Met Asn Ile Thr Cys Thr Gly Arg Gly Pro Asp Asn Cys 770 775 780 Ile Gln Cys Ala His Tyr Ile Asp Gly Pro His Cys Val Lys Thr Cys 785 790 795 800 Pro Ala Gly Val Met Gly Glu Asn Asn Thr Leu Val Trp Lys Tyr Ala 805 810 815 Asp Ala Gly His Val Cys His Leu Cys His Pro Asn Cys Thr Tyr Gly 820 825 830 Cys Thr Gly Pro Gly Leu Glu Gly Cys Pro Thr Asn Gly Pro Lys Ile 835 840 845 Pro Ser Ile Ala Thr Gly Met Val Gly Ala Leu Leu Leu Leu Leu Val 850 855 860 Val Ala Leu Gly Ile Gly Leu Phe Met 865 870 <210> 3 <211> 235 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> single chain Fv <400> 3 Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu Thr Leu 1 5 10 15 Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Phe Ser Leu Thr Ser Tyr Gly Val 20 25 30 Asp Trp Val Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile Gly Val 35 40 45 Ile Trp Gly Gly Gly Ser Thr Asn Tyr Asn Ser Ala Leu Met Ser Arg 50 55 60 Leu Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Ser Gln Val Ser Leu Lys Leu 65 70 75 80 Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Lys His 85 90 95 Glu Val Leu Arg Gly Tyr Ala Leu Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu 100 105 110 Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly 115 120 125 Gly Gly Gly Ser Leu Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro 130 135 140 Gly Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Ser Ala Ser Pro Ser Val Ser Tyr 145 150 155 160 Met His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile 165 170 175 Tyr Asp Thr Tyr Lys Leu Ala Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly 180 185 190 Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Glu Pro 195 200 205 Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Phe Gln Gly Ser Gly Phe Pro Leu 210 215 220 Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys 225 230 235 <210> 4 <211> 490 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic polypeptide <400> 4 Met Ala Leu Pro Val Thr Ala Leu Leu Leu Pro Leu Ala Leu Leu Leu 1 5 10 15 His Ala Ala Arg Pro Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys 20 25 30 Pro Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Phe Ser Leu 35 40 45 Thr Ser Tyr Gly Val Asp Trp Val Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu 50 55 60 Glu Trp Ile Gly Val Ile Trp Gly Gly Gly Ser Thr Asn Tyr Asn Ser 65 70 75 80 Ala Leu Met Ser Arg Leu Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Ser Gln 85 90 95 Val Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr 100 105 110 Tyr Cys Ala Lys His Glu Val Leu Arg Gly Tyr Ala Leu Asp Tyr Trp 115 120 125 Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly 130 135 140 Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Leu Thr Gln Ser Pro Ala Thr 145 150 155 160 Leu Ser Leu Ser Pro Gly Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Ser Ala Ser 165 170 175 Pro Ser Val Ser Tyr Met His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala 180 185 190 Pro Arg Leu Leu Ile Tyr Asp Thr Tyr Lys Leu Ala Ser Gly Ile Pro 195 200 205 Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile 210 215 220 Ser Ser Leu Glu Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Phe Gln Gly 225 230 235 240 Ser Gly Phe Pro Leu Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys 245 250 255 Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala 260 265 270 Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly 275 280 285 Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Lys Arg Gly 290 295 300 Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro Val 305 310 315 320 Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu 325 330 335 Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp 340 345 350 Ala Pro Ala Tyr Lys Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn 355 360 365 Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg 370 375 380 Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly 385 390 395 400 Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu 405 410 415 Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu 420 425 430 Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His 435 440 445 Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg Glu Gly Arg Gly Ser Leu Leu Thr Cys 450 455 460 Gly Asp Val Glu Glu Asn Pro Gly Pro Met Trp Leu Gln Ser Leu Leu 465 470 475 480 Leu Leu Gly Thr Val Ala Cys Ser Ile Ser 485 490 <210> 5 <211> 352 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic ploypeptide <400> 5 Met Trp Leu Gln Ser Leu Leu Leu Leu Gly Thr Val Ala Cys Ser Ile 1 5 10 15 Ser Arg Lys Val Cys Asn Gly Ile Gly Ile Gly Glu Phe Lys Asp Ser 20 25 30 Leu Ser Ile Asn Ala Thr Asn Ile Lys His Phe Lys Asn Cys Thr Ser 35 40 45 Ile Ser Gly Asp Leu His Ile Leu Pro Val Ala Phe Arg Gly Asp Ser 50 55 60 Phe Thr His Thr Pro Pro Leu Asp Pro Gln Glu Leu Asp Ile Leu Lys 65 70 75 80 Thr Val Lys Glu Ile Thr Gly Phe Leu Leu Ile Gln Ala Trp Pro Glu 85 90 95 Asn Arg Thr Asp Leu His Ala Phe Glu Asn Leu Glu Ile Ile Arg Gly 100 105 110 Arg Thr Lys Gln His Gly Gln Phe Ser Leu Ala Val Val Ser Leu Asn 115 120 125 Ile Thr Ser Leu Gly Leu Arg Ser Leu Lys Glu Ile Ser Asp Gly Asp 130 135 140 Val Ile Ile Ser Gly Asn Lys Asn Leu Cys Tyr Ala Asn Thr Ile Asn 145 150 155 160 Trp Lys Lys Leu Phe Gly Thr Ser Gly Gln Lys Thr Lys Ile Ile Ser 165 170 175 Asn Arg Gly Glu Asn Ser Cys Lys Ala Thr Gly Gln Val Cys His Ala 180 185 190 Leu Cys Ser Pro Glu Gly Cys Trp Gly Pro Glu Pro Arg Asp Cys Val 195 200 205 Ser Cys Arg Asn Val Ser Arg Gly Arg Glu Cys Val Asp Lys Cys Asn 210 215 220 Leu Leu Glu Gly Glu Pro Arg Glu Phe Val Glu Asn Ser Glu Cys Ile 225 230 235 240 Gln Cys His Pro Glu Cys Leu Pro Gln Ala Met Asn Ile Thr Cys Thr 245 250 255 Gly Arg Gly Pro Asp Asn Cys Ile Gln Cys Ala His Tyr Ile Asp Gly 260 265 270 Pro His Cys Val Lys Thr Cys Pro Ala Gly Val Met Gly Glu Asn Asn 275 280 285 Thr Leu Val Trp Lys Tyr Ala Asp Ala Gly His Val Cys His Leu Cys 290 295 300 His Pro Asn Cys Thr Tyr Gly Cys Thr Gly Pro Gly Leu Glu Gly Cys 305 310 315 320 Pro Thr Asn Gly Pro Lys Ile Pro Ser Ile Ala Thr Gly Met Val Gly 325 330 335 Ala Leu Leu Leu Leu Leu Val Val Ala Leu Gly Ile Gly Leu Phe Met 340 345 350 <210> 6 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic primer <400> 6 tgacagccgc ctagcatttc 20 <210> 7 <211> 24 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic primer <400> 7 gctcgatatc agcagttctt gaag 24 <210> 8 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic probe <400> 8 cacgtggccc gagagctgca tc 22 <210> 9 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic primer <400> 9 gctgtcatct cttgtgggct gt 22 <210> 10 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic primer <400> 10 actcatggga gctgctggtt c 21 <210> 11 <211> 26 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic probe <400> 11 cctgtcatgc ccacacaaat ctctcc 26

Claims (20)

  1. 서열번호 3의 폴리펩타이드를 암호화하는 뉴클레오타이드를 포함하는, 단리된 핵산(isolated nucleic acid).
  2. 제1항에 있어서, 뉴클레오타이드 서열이 서열번호 1인, 단리된 핵산.
  3. 제2항의 단리된 핵산을 포함하는 재조합 세포로서, 서열번호 2의 폴리펩타이드를 발현하는, 재조합 세포(recombinant cell).
  4. 제3항에 있어서, 세포가 T 세포인, 재조합 세포.
  5. 제1항의 단리된 핵산을 포함하는 바이러스 벡터로서, 바이러스 벡터가 렌티바이러스 벡터, 감마-레트로바이러스 벡터, 또는 아데노-연관 바이러스 벡터인, 바이러스 벡터.
  6. 제5항에 있어서, 뉴클레오타이드 서열이 서열번호 1인, 바이러스 벡터.
  7. 서열번호 3의 서열을 포함하는 단리된 폴리펩타이드로서, 단계-특이적 배아 항원 4에 특이적으로 결합하는, 단리된 폴리펩타이드.
  8. 단계-특이적 배아 항원 4에 특이적으로 결합하는 단일 사슬 Fv(scFv), 및 CD3ζ 또는 FcεRIγ로부터의 제1 엔도도메인(endodomain)을 포함하고, 여기서 scFv가 서열번호 3의 서열을 갖는 것인, 키메라 항원 수용체.
  9. 제8항에 있어서, CD28, CD137, CD4, OX40, 또는 ICOS로부터의 제2 엔도도메인을 추가로 포함하고, 여기서 scFv가 제2 엔도도메인에 융합(fusing)되고 제2 엔도도메인이 제1 엔도도메인에 융합되는 것인, 키메라 항원 수용체.
  10. 제9항에 있어서, 서열번호 4의 서열을 갖는, 키메라 항원 수용체.
  11. 종양을 갖는 대상체로부터 T 세포를 수득하는 단계;
    단계-특이적 배아 항원 4(SSEA4)를 특이적으로 인식하는 scFv를 포함하는 키메라 항원 수용체(CAR)를 암호화하는 핵산을 함유하는 벡터로 T 세포를 시험관 내에서 형질도입하여, 이에 의해 형질도입된 T 세포가 CAR을 발현하는 단계;
    형질도입된 T 세포를 시험관 내에서 확장시키는 단계; 및
    확장되고 형질도입된 T 세포를 종양을 갖는 대상체 내로 주입하여, 이에 의해 항-종양 T 세포 반응을 일으키는 단계를 포함하여, 대상체에서 종양을 치료하는 방법으로서,
    여기서 scFv가 서열번호 3의 아미노산 서열을 갖고 종양 내의 세포가 SSEA4를 발현하는, 방법.
  12. 제11항에 있어서, CAR이 서열번호 4의 아미노산 서열을 갖는, 방법.
  13. 제12항에 있어서, 벡터가 렌티바이러스, 감마 레트로바이러스, 또는 아데노-연관 바이러스인, 방법.
  14. 제13항에 있어서, 종양이 유방, 결장, 위장, 신장, 폐, 간, 난소, 췌장, 직장, 위, 고환, 흉선, 자궁 경부, 전립선, 방광, 피부, 비인두, 식도, 경구, 두경부, 뼈, 연골, 근육, 림프절, 골수, 또는 뇌 종양인, 방법.
  15. 제11항에 있어서, 형질도입된 T 세포가 서열번호 5의 폴리펩타이드를 추가로 발현하여, 주입된 확장된 T 세포가 항-표피 성장 인자 수용체 항체에 의해 생체 내에서 결실될 수 있는, 방법.
  16. 제15항에 있어서, CAR이 서열번호 4의 아미노산 서열을 갖는, 방법.
  17. 제16항에 있어서, 핵산이 서열번호 1의 서열을 갖는, 방법.
  18. 제15항에 있어서, 종양이 유방, 결장, 위장, 신장, 폐, 간, 난소, 췌장, 직장, 위, 고환, 흉선, 자궁 경부, 전립선, 방광, 피부, 비인두, 식도, 경구, 두경부, 뼈, 연골, 근육, 림프절, 골수, 또는 뇌 종양인, 방법.
  19. 제16항에 있어서, 종양이 유방, 결장, 위장, 신장, 폐, 간, 난소, 췌장, 직장, 위, 고환, 흉선, 자궁 경부, 전립선, 방광, 피부, 비인두, 식도, 경구, 두경부, 뼈, 연골, 근육, 림프절, 골수, 또는 뇌 종양인, 방법.
  20. 제17항에 있어서, 종양이 유방, 결장, 위장, 신장, 폐, 간, 난소, 췌장, 직장, 위, 고환, 흉선, 자궁 경부, 전립선, 방광, 피부, 비인두, 식도, 경구, 두경부, 뼈, 연골, 근육, 림프절, 골수, 또는 뇌 종양인, 방법.
KR1020207014038A 2018-03-20 2019-03-19 Ssea4에 결합하는 키메라 항원 수용체 및 이의 용도 KR20200135760A (ko)

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