KR20200019509A - 아세틸코에이카복실라제2 안티센스 올리고뉴클레오티드 - Google Patents

아세틸코에이카복실라제2 안티센스 올리고뉴클레오티드 Download PDF

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Abstract

본 발명은 인간 ACC2 프리-mRNA의 5' 스플라이스 위치를 표적으로 하는 펩타이드 핵산 유도체를 제공한다. 본 발명의 펩타이드 핵산 유도체는 세포 내에서 인간 ACC2 mRNA의 스플라이스 변형체의 생성을 강력하게 유도하며, 인간 ACC2 단백질에 관련된 피부 노화의 징후 또는 증상을 개선하는데 유용하다.

Description

아세틸코에이카복실라제2 안티센스 올리고뉴클레오티드 {Acetyl-CoA Carboxylase2 Antisense Oligonucleotides}
본 발명은 피부 노화 현상을 개선하는 펩타이드 핵산 유도체를 제공한다.
노화에 대한 관심이 높아지면서 피부 노화에 대한 관심도 증가하고 있다. 피부 노화는 20대 중 후반부터 시작되는 데, 피부 속 콜라겐(collagen)과 엘라스틴(elastin)의 양이 감소함에 따라 발생하며 점차 피부 탄력도 떨어지고 건조해지며 주름이 생기게 된다. 비만은 체내에 과도하게 축적된 지방으로 인한 순환 저하가 불러오는 일종의 염증 반응이라고 할 수 있는데, 피부 노화를 촉진하는 요인 중 그 영향력이 매우 크다. 혈관벽에 쌓인 지방이 혈행을 방해하여 혈액순환 악화와 호르몬 분비 저하로 이어지게 되며, 이로 인해 피부는 물론 신체 전반에 걸쳐 노화 증상이 촉진된다. 따라서 건강하고 아름다운 피부를 위해서는 그 무엇보다 비만을 경계해야 한다.
지방산(fatty acid)의 합성 및 분해는 생리적인 상황에 적절히 반응하여 잘 조절되고 있는데, 탄수화물과 에너지가 풍부하거나 지방산이 부족할 때 지방산의 합성이 최고조에 이른다. 아세틸코에이카복실라제(acetyl coenzyme A carboxylase)는 아세틸코에이로부터 말로닐코에이(malonyl coenzyme A)로의 반응을 촉매하는 비오틴(biotin) 효소로서, 이 반응은 지방산 생합성(biosynthesis)의 제1단계에서 합성속도를 규정한다.
Figure pat00001
ACC는 지방산의 대사를 조절하는 기능을 갖고 있는데, ACC가 활성화 상태일 때 생성되는 말로닐코에이는 새로운 지방산의 빌딩 블록(building block)으로 사용되며, 지방산의 아실 그룹(acyl group)의 전이를 방해하는 기전을 통하여 미토콘드리아에서 지방산의 산화를 저해한다. 인체에는 두 종류의 아세틸코에이카복실라제가 존재하는 데, 아세틸코에이카복실라제1 (ACC1, ACACA, 아세틸코에이카복실라제 알파)와 아세틸코에이카복실라제2 (ACC2, ACACB, 아세틸코에이카복실라제 베타)이다. 이 두 종류의 ACC는 서로 다른 기능을 하는 데, ACC1은 지방산의 합성을 그리고 ACC2는 지방산의 산화를 주로 조절하는 것으로 알려져 있다.
지방산의 합성 및 산화 과정에 관여하는 ACC는, 박테리아와 인간 ACC의 구조 차이를 이용한 새로운 항생제의 개발, 당뇨와 비만 등과 같은 대사증후군들의 새로운 치료제의 개발 및 지방형성과 관련된 암세포 성장 억제제 개발과 같은 여러 가능성을 제시하고 있다 [Recent Patents Cardiovasc. Drug Discov. Vol 2, 162-80 (2007); PLoS One Vol 12, e0169566 (2017)]. 그 중에서도, ACC2가 발현되지 않은 (ACC2 -/-) 쥐는 지방산이 계속 산화되어 몸에서 지방의 비율이 낮아지고, 식사량을 늘려도 몸무게가 감소하며 당뇨의 위험이 감소한다는 연구는 많은 관심을 끌고 있다 [Science Vol 291, 2613-6 (2001)]. 이러한 연구는 ACC2 저해제의 비만 및 당뇨병 치료제로서의 가능성을 제시하고 있으며, 또한 이러한 저해제를 피부에 투여할 경우 그 부위의 지방 제거 효과로 피부 비만 방지 그리고 결과적으로 피부 노화 개선 효과를 기대할 수 있다.
피부의 노화 과정에서 비만의 중요성을 감안할 때, ACC2 저해제 및 ACC2 자체의 생성에 관여하는 작용 기전에 기초한 피부 노화를 개선할 수 있는 물질의 개발은 매우 흥미롭고 필요한 과제이다.
프리 - mRNA: 유전 정보는 DNA (2-deoxyribose nucleic acid)를 통해 전달된다. DNA는 핵 안에서 프리-mRNA로 전사되는 데 포유류의 프리-mRNA는 엑손(Exon)과 인트론(Intron)으로 구성되어 있으며 아래 그림과 같이 서로 연결되어 있다.
프리 - mRNA 의 구조
Figure pat00002
프리 - mRNA 스플라이싱 (Splicing): 프리-mRNA는 아래의 그림에서 요약한 대로 “스플라이싱”이라 부르는, 인트론의 제거로부터 시작되는 일련의 과정을 통해서 mRNA로 변환된다 [Ann. Rev. Biochem. Vol 72, 291-336 (2003); Nature Rev. Mol . Cell Biol. Vol 6, 386-398 (2005); Nature Rev. Mol . Cell Biol. Vol 15, 108-121 (2014)].
Figure pat00003
작은 핵단백질 U1은 프리-mRNA의 엑손 N과 인트론 N 연결 부위에 결합하고 U2AF35은 인트론 N과 엑손 (N+1)에 결합하여 스플라이스오솜 E 복합체를 만드는 데, 따라서 엑손/인트론과 인트론/엑손 연결 부위는 초기 복합체를 만드는 데 아주 중요하다. " 스플라이스오솜 E 복합체"에 U2가 결합해서 " 스플라이스오솜 A 복합체"를 형성하고, 이 복합체에서 인트론을 제거하고 바로 옆의 엑손을 연결하는 작업이 진행된다.
리보솜(Ribosome)의 단백질 합성: 단백질은 DNA에 있는 암호에 의해 합성된다. 핵에서 DNA로부터 전사된 프리-mRNA의 인트론은 효소 작용에 의해 제거되고, 결과적으로 생성된 m-RNA는 세포질로 이동한다. 세포질에서 리보솜이라 불리는 번역 복합체가 mRNA에 붙어서 mRNA에 암호화되어 있는 유전 정보를 이용하여 단백질을 합성한다 [Biochemistry Vol 41, 4503-4510 (2002); Cancer Res. Vol 48, 2659-2668 (1988)].
안티센스 올리고뉴클레오티드 ( ASO , Antisense Oligonucleotide): DNA, mRNA 및 프리-mRNA에 염기서열 특이적으로 결합하는 올리고뉴클레오티드를 안티센스 올리고뉴클레오티드라고 한다. 만약 ASO가 세포질에서 mRNA에 강하게 결합한다면 리보솜에 의한 mRNA로부터의 단백질 합성을 저해할 수 있으며, 이 경우 ASO는 반드시 세포질 안에 있어야만 한다.
안티센스의 스플라이싱 저해: 만약 ASO가 핵에서 프리-mRNA에 강하게 결합한다면 ASO는 프리-mRNA가 mRNA로 스플라이싱되는 것을 저해 혹은 조절할 수 있으며, 이 경우 ASO는 반드시 핵 안에 있어야만 한다. 이렇게 안티센스의 스플라이싱 저해에 의해 생성된 mRNA는 ASO가 표적하였던 엑손이 결여되어 있는데, 이러한 mRNA는 접합부 변형체 또는 스플라이스 변형체(splice variant)라고 불리며 원래의 단백질보다 짧은 길이의 단백질을 생성한다.
스플라이스오솜 E 복합체의 형성을 저해하면 스플라이싱을 막을 수 있을 것이라 예상되는 데, 실제로 ASO가 (5'
Figure pat00004
3') 엑손-인트론 연결 부위 즉 5' 스플라이스 위치에 강하게 결합하면 ASO는 프리-mRNA와 U1의 결합을 막고 결과적으로 스플라이스오솜 E 복합체의 형성을 막는다. 이와 유사하게 ASO가 (5'
Figure pat00005
3') 인트론-엑손 연결 부위 즉 3' 스플라이스 위치에 강하게 결합하면 스플라이스오솜 E 복합체의 형성을 막는다. 3' 스플라이스 위치와 5' 스플라이스 위치는 다음 그림에 도시하였다.
Figure pat00006

비천연 (unnatural) 올리고뉴클레오티드: DNA 또는 RNA 올리고뉴클레오티드는 생체 내에 존재하는 뉴클리에이즈(nuclease)에 의해 쉽게 분해되므로, 치료적 용도에 한계가 있다. 지금까지 많은 유형의 비천연 올리고뉴클레오티드가 연구되고 개발되어 왔는 데 [Clin. Exp . Pharmacol . Physiol . Vol 33, 533-540 (2006)] 그 중 몇몇은 DNA와 RNA에 비교하여 긴 대사 안정성을 나타냈다. 대표적인 인공 올리고뉴클레오티드 중 몇몇의 화학 구조가 하기에 제공된다. 이들 올리고뉴클레오티드는 예상대로 DNA 또는 RNA처럼 상보적인 핵산에 결합한다.
Figure pat00007

포스포로티오에이트 올리고뉴클레오티드( PTO , Phosphorothioate Oligonucleotide): PTO는 모노머 당 골격의 포스페이트 산소 원자 중 하나가 황 원자로 치환된 DNA 유사체이다. 이러한 작은 구조적 변화는 PTO를 뉴클리에즈에 의한 분해에 비교적 잘 견디도록 만들었다 [Ann. Rev. Biochem. Vol 54, 367-402 (1985)].
PTO와 DNA가 구조적으로 매우 유사함을 반영하듯이, 이들은 대부분의 동물세포에 대한 투과성이 매우 나쁘다. 그러나 DNA를 잘 투과시키는 트랜스포터(Transporter)가 많이 발현된 간 세포들의 경우, DNA와 PTO 모두 세포투과성이 좋은 편이다. 전신성으로(Systemically) 투약된 PTO는 간이나 신장에 많이 분포되는 것으로 알려져 있다 [Nucleic Acids Res. Vol 25, 3290-3296 (1997)].
PTO의 세포투과력을 높이기 위하여, 리포펙션(Lipofection) 방법이 세포 실험 수준에서 널리 사용되고 있다. 그러나 리포펙션 방법은 세포막을 변형시기고 독성을 유발하므로 장기간의 임상 사용에는 이상적이지 못하다.
과거 30년에 걸쳐, 안티센스 PTO와 PTO의 변형체들이 각종 암, 면역질환, 대사성 질환 등의 질환을 치료하기 위하여 임상적으로 평가되어 왔다 [Biochemistry Vol 41, 4503-4510 (2002); Clin . Exp . Pharmacol . Physiol . Vol 33, 533-540 (2006)]. 상당수의 이러한 안티센스 의약개발 프로그램들은 부분적으로는 PTO의 세포투과성 부족으로 성공적이지 못하였다. PTO의 세포투과력 부족을 극복하기 위해서는, 고용량의 PTO를 투약해야 한다. 그러나 PTO를 고용량 투약하면, 혈액 응고 시간이 길어지고, 컴플리먼트(Complement) 활성화, 신장 독성(Tubular Nephropathy), 쿠퍼(Kupffer) 세포 활성화, 비장 비대, 림프절 비대, 단핵식균세포(Mononuclear Cell) 침윤 등 다양한 독성이 수반된다 [Clin . Exp . Pharmacol . Physiol. Vol 33, 533-540 (2006)].
여러 안티센스 PTO들의 경우, 간이나 신장의 기여도가 큰 질환에서 임상적 약효를 나타내는 것으로 밝혀졌다. 미포메르센(Mipomersen)은 PTO 유사체로서 LDL 콜레스테롤 운반에 관여하는 apoB-100 단백질의 합성을 저해한다. 미포메르센은 일부 동맥경화 환자 군에서 약효를 나타냈는데, 이는 미포메르센이 간에 주로 분포함에 기인하는 것으로 보인다 [Circulation Vol 118, 743-753 (2008)]. ISIS-113715는 PTP1B(Protein Tyrosine Phosphatase 1B)의 합성을 저해하는 안티센스 PTO 유도체로서 제2형 당뇨 환자들에서 약효를 나타낸다고 보고되었다 [Curr . Opin . Mol . Ther . Vol 6, 331-336 (2004)].
잠금핵산 (LNA, Locked Nucleic Acid): LNA는 RNA의 리보스(Ribose) 골격이 구조적으로 제한된 핵산으로서, 핵산 결합력이 매우 강하다. 따라서, LNA는 강한 핵산 결합력을 지닌 DNA 혹은 RNA 유도체로 간주될 수 있다 [Biochemistry Vol 45, 7347-7355 (2006)].
포스포로다이아미데이트 모폴리노 올리고뉴클레오티드 ( PMO , Phosphorodiamidate Morpholino Oligonucleotide): PMO는 DNA 골격의 2-디옥시리보스(2-Deoxyribose)와 포스페이트(Phosphate)가 각각 포스포로아미데이트(Phosphoamidate)와 모폴린(Morpholine)으로 치환된 올리고뉴클레오티드이다 [Appl . Microbiol . Biotechnol . Vol 71, 575-586 (2006)]. DNA 골격이 음전하를 갖는 반면, PMO 골격은 전하가 없다. 따라서 PMO와 mRNA의 결합은 정전기적 반발이 없어, PMO와 mRNA의 결합은 DNA와 mRNA의 결합보다 강하다. 아울러 PMO는 DNA와 구조적으로 매우 다르기 때문에, DNA를 인식하는 간에 있는 트랜스포터(Hepatic Transporter)에 의해 인식되지 않는다. 따라서 PMO는 PTO와 매우 다른 조직 분포 특성을 가질 수 있으나, PMO 역시 세포막을 잘 통과하지 못한다.
펩타이드 핵산(PNA, Peptide Nucleic Acid): PNA는 N-(2-아미노에틸)글리신[Aeg, N-(2-aminoethyl)glycine]을 단위 골격으로 갖는 폴리펩티드로서 니엘슨(Nielsen) 등에 의해 발명되었다. [Science Vol 254, 1497-1500 (1991)] PNA의 화학 구조와 축약된 이름은 아래 그림에 도시되었다. DNA나 RNA와 마찬가지로, PNA 역시 상보적인 핵산과 결합한다 [Nature (London) Vol 365, 566-568 (1992)]. 상보적인 핵산에 결합할 때, PNA의 N-말단은 DNA나 RNA의 5'-말단, 그리고 C-말단은 DNA나 RNA의 3'-말단에 해당한다.
Figure pat00008

PMO 처럼 PNA 골격은 전하를 갖고 있지 않기 때문에, PNA와 RNA의 결합은 DNA와 RNA의 결합 보다 강하다. 아울러 PNA는 DNA와 구조적으로 매우 다르기 때문에, DNA를 인식하는 간에 있는 트랜스포터(Hepatic Transporter)에 의해 인식되지 않는다. 따라서 PNA는 PTO와 매우 다른 조직 분포 특성을 가질 수 있으나, PNA 역시 세포막을 잘 통과하지 못한다 [Adv . Drug Delivery Rev. Vol 55, 267-280, (2003)].
변형된 핵산염기로 세포투과성을 높인 PNA: 양이온성 지질(Cationic Lipid)이 핵산염기에 공유 결합으로 연결된 PNA는 포유류의 세포막 투과성이 매우 좋다. 변형된 핵산염기는 다음과 같이 제공된다. 이렇게 변형된 핵산염기를 갖는 시토신, 아데닌 및 구아닌은 구아닌, 티민 및 시토신과 각각 상보적으로 결합한다 [PCT Appl. No. PCT/KR2009/001256; EP2268607; US8680253].
Figure pat00009

이렇게 변형된 핵산염기를 갖는 PNA는 리포펙션(lipofection)과 비슷한 환경이 된다. 리포펙션 상황에서는 포스페이트 골격을 갖는 올리고뉴클레오티드가 리포펙타민과 같은 양이온성 지질에 둘러싸이게 되는 데, 그러한 복합체는 리포펙션으로 처리하지 않은 올리고뉴클레오티드에 비해 세포막 투과가 용이하다.
이렇게 변형된 핵산염기를 갖는 PNA는 향상된 세포투과성 외에 상보적인 핵산에 대한 결합력이 매우 강하다. 상보적인 DNA와 듀플렉스(duplex)를 형성할 때 4~5개의 변형된 핵산염기가 도입된 11~13머 (11~13-mer)의 PNA는 변형되지 않은 PNA에 비해 20oC이상 높은 Tm 값을 보인다. 또한, 이렇게 변형된 핵산염기를 갖는 PNA는 한 개의 염기 부정합(mismatch)에도 매우 민감한 데, 변형된 염기의 종류나 PNA의 순서에 따라 다르지만 약 11~22oC의 낮은 Tm 값을 보인다.
작은 간섭 RNA ( siRNA , Small Interfering RNA): 20~25개의 염기쌍으로 구성된 이중 나선의 RNA를 siRNA라한다 [Microbiol . Mol . Biol . Rev. Vol 67, 657-685 (2003)]. siRNA의 안티센스 가닥과 단백질 인자로 형성된 “RNA에 의해 유도된 사일런싱 복합체”(RISC)는 siRNA의 안티센스 가닥에 상보적인 mRNA의 일부분과 결합하여 mRNA를 절단함으로써 mRNA가 단백질을 합성하는 것을 막는다. 그러나 RISC가 항상 표적 mRNA의 상보적인 염기 서열들 전체와 결합하는 것은 아니어서 siRNA 치료법에 있어서 오프타겟 효과에 대한 문제가 제기되곤 한다. 또한, siRNA는 DNA나 RNA와 같은 골격을 갖고 있기 때문에 세포투과성이 나빠서, 적절한 제제나 물질자체의 화학적 변형을 하지 않으면 생체외 (in vitro) 또는 생체내 (in vivo) 효과가 잘 나타나지 않는다.
ACC siRNA: 21개의 염기 서열로 이루어진, ACC1 mRNA의 일부를 표적으로 하는 20 nM 농도의 ACC1 siRNA와 ACC2 mRNA의 일부를 표적으로 하는 20 nM 농도의 ACC2 siRNA의 조합을 교모세포종 암 세포주(glioblastoma cancer cell line)에 처리한 결과 ACC1과 ACC2의 mRNA와 단백질의 형성을 저해한다는 것이 보고되었다 [PLoS One Vol 12, e0169566 (2017)]. 이러한 결과는 지방생성과 관련된 암(lipogenic cancer) 전이에 관한 연구 및 항암제 개발에 도움이 될 것이다.
비만은 피부 노화를 촉진하는 요인 중 그 영향력이 매우 커서 건강하고 아름다운 피부를 위해서는 그 무엇보다 비만을 경계해야 한다. 비만과 관련하여 ACC2가 발현되지 않은 쥐에 대한 연구가 많은 관심을 받고 있는데, 항암제 개발과 관련하여 ACC1 및 ACC2의 mRNA와 단백질의 형성을 저해하는 siRNA가 발표된 바 있으나 siRNA는 제조원가가 너무 비싸서 피부 노화 개선제로 개발하기에는 제한이 있으며, 국소 투여의 효율이 낮은 문제도 있다. 따라서, ACC2의 mRNA와 단백질 형성의 저해라는 정확한 작용 기전에 기초하고 siRNA의 한계를 넘어서는, 피부 노화 개선을 위한 물질의 개발이 필요하다.
본 발명은 화학식 I로 대표되는 펩타이드 핵산 유도체 혹은 이의 약제학적으로 허용 가능한 염을 제공한다:
[화학식 I]
Figure pat00010
화학식 I 중에서,
n은 10과 21 사이의 정수이며;
화학식 I의 화합물은 인간의 ACC2 프리-mRNA에서 18개의 염기로 이루어진 [(5'
Figure pat00011
3') GGCCAUUUCGUCAGUAUC] 서열과 최소한 10개 이상의 상보적인 결합을 하며;
화학식 I의 화합물 전체가, 인간의 ACC2 프리-mRNA와 완전히 상보적인 결합을 하거나, 화학식 I의 화합물 전체 중 한 개 혹은 두 개의 염기 부정합을 포함한 부분적으로 상보적인 결합을 하며;
S1, S2, ……, Sn -1, Sn, T1, T2, ……, Tn -1 그리고 Tn은 수소(Hydrido), 중수소(Deuterido), 치환체가 있거나 없는 알킬(Alkyl), 그리고 치환체가 있거나 없는 아릴(Aryl) 중에서 각자 독립적으로 선택되나 꼭 이들에 한정되는 것은 아니며;
X와 Y는 수소, 중수소, 포밀[H-C(=O)-], 아미노카보닐[NH2-C(=O)-], 아미노티오카보닐[NH2-C(=S)-], 치환체가 있거나 없는 알킬, 치환체가 있거나 없는 아릴, 치환체가 있거나 없는 알킬옥시(Alkyloxy), 치환체가 있거나 없는 아릴옥시(Aryloxy), 치환체가 있거나 없는 알킬아실(Alkylacyl), 치환체가 있거나 없는 아릴아실(Arylacyl), 치환체가 있거나 없는 알킬옥시카보닐(Alkyloxycarbonyl), 치환체가 있거나 없는 아릴옥시카보닐(Aryloxycarbonyl), 치환체가 있거나 없는 알킬아미노카보닐(Alkylaminocarbonyl), 치환체가 있거나 없는 아릴아미노카보닐(Arylaminocarbonyl), 치환체가 있거나 없는 알킬아미노티오카보닐(Alkylaminothiocarbonyl), 치환체가 있거나 없는 아릴아미노티오카보닐(Arylaminothiocarbonyl), 치환체가 있거나 없는 알킬옥시티오카보닐(Alkyloxythiocarbonyl), 치환체가 있거나 없는 아릴옥시티오카보닐(Aryloxythiocarbonyl), 치환체가 있거나 없는 알킬설포닐(Alkylsulfonyl), 치환체가 있거나 없는 아릴설포닐(Arylsulfonyl), 치환체가 있거나 없는 알킬포스포닐(Alkylphosphonyl), 그리고 치환체가 있거나 없는 아릴포스포닐(Arylphosphonyl) 중에서 각자 독립적으로 선택되나 꼭 이들에 한정되는 것은 아니며;
Z는 수소, 중수소, 하이드록시(Hydroxy), 치환체가 있거나 없는 알킬옥시, 치환체가 있거나 없는 아릴옥시, 치환체가 있거나 없는 아미노, 치환체가 있거나 없는 알킬, 그리고 치환체가 있거나 없는 아릴 중에서 선택되나 꼭 이들에 한정되는 것은 아니며;
B1, B2, ……, Bn -1 그리고 Bn은 아데닌(Adenine), 티민(Thymine), 구아닌(Guanine), 시토신(Cytosine), 그리고 우라실(Uracil)을 포함하는 천연 핵산염기 및 비천연 핵산염기 중에서 각각 독립적으로 선택되며; 그리고,
B1, B2, ……, Bn -1 그리고 Bn 중 최소한 네 개는 치환체가 있거나 없는 아민이 지질성 공유결합성 링커(Linker)를 통해 핵산염기에 공유결합으로 연결된 비천연 핵산염기다.
화학식 I의 화합물은 인간의 ACC2 프리-mRNA에서 엑손 12의 스키핑(exon skipping)을 유도하여 엑손 12가 결여된 인간 ACC2 mRNA 스플라이스 변형체를 형성함으로써 인간 ACC2 프리-mRNA의 작용을 막는다.
“n은 10과 21 사이의 정수이며”의 의미는 문자 그대로 “n은 정수 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 그리고 20 중에서 선택된다"는 것이다.
화학식 I의 PNA 유도체에 포함되는 천연 핵산염기나 비천연 핵산염기의 구조는 도 1a-1c에 예시되어 있다. 본 발명에서 천연 또는 비천연 핵산염기는 도 1a-1c에서 제공된 핵산염기들로 구성되나 꼭 이들에 한정되는 것은 아니다. 제공되는 비천연 핵산염기들은 단지 핵산염기들의 다양성을 보여주기 위한 것이며, 따라서 본 발명의 범위를 한정하는 방향으로 해석하지 않아야 한다.
화학식 I의 PNA 유도체를 설명하기 위한 치환체들은 도 2a-2e에 예시되어 있다. 도 2a는 치환체가 있거나 없는 알킬의 예들을 제공하며, 도 2b는 치환체가 있거나 없는 알킬아실과 치환체가 있거나 없는 아릴아실의 예들을 예시한다. 도 2c는 치환체가 있거나 없는 알킬아미노, 치환체가 있거나 없는 아릴아미노, 치환체가 있거나 없는 아릴, 치환체가 있거나 없는 알킬 또는 아릴설포닐, 치환체가 있거나 없는 알킬 또는 아릴포스포닐의 예들을 나타낸다. 도 2d는 치환체가 있거나 없는 알킬 또는 아릴옥시카보닐, 치환체가 있거나 없는 알킬 또는 아릴아미노카보닐의 예들을 제공한다. 도 2e는 치환체가 있거나 없는 알킬 또는 아릴아미노티오카보닐, 알킬 또는 아릴옥시티오카보닐의 예들을 제공한다. 제공되는 치환체들은 단지 치환체들의 다양성을 보여주기 위한 것이며, 따라서 본 발명의 범위를 한정하는 방향으로 해석하지 않아야 한다.
이 분야의 숙련된 전문가들은 올리고뉴클레오티드가 표적 프리-mRNA에 염기서열 특이적 결합을 할 때 N-말단과 C-말단의 치환체들 보다는 올리고뉴클레오티드 서열이 더 중요하다는 것을 쉽게 인지할 것이다.
선행 기술에 예시된 바와 같이 화학식 I의 화합물은 상보적인 DNA에 강하게 결합한다 [PCT/KR2009/001256]. 화학식 I의 PNA 유도체와 상보적인 DNA나 RNA의 듀플렉스(duplex)의 Tm 값은 너무 높아서 수용액 상에서 측정하기 힘들며, 짧은 길이의 상보적인 DNA와의 Tm 값도 상당히 높다.
화학식 I의 화합물은 인간의 ACC2 프리-mRNA의 엑손 12의 5' 스플라이스 위치와 상보적으로 결합한다. [NCBI Reference Sequence: NG_ 046907] [(5'
Figure pat00012
3') GCCAUUUCGUCAGUAU]의 16머는 인간의 ACC2 프리-mRNA의 엑손 12와 인트론 12의 연결 부위에 위치하며, 8머는 엑손 12에 그리고 8머는 인트론 12에 속해 있다. 이 16머는 [(5'
Figure pat00013
3') GCCAUUUC┃gucaguau] 로 표시하기도 하는 데, 여기서 대문자는 엑손을 그리고 소문자는 인트론을 나타내며, “┃”는 연결 부분을 나타낸다. 전통적인 프리-mRNA의 표시 방법에 따르면, 인간의 ACC2 프리-mRNA의 엑손 12와 인트론 12의 연결 부위는 30머 [(5'
Figure pat00014
3') GGAAGAGGCCAUUUC┃gucaguaucuccuuc]로 표시한다.
화학식 I의 화합물은 인간의 ACC2 유전자로부터 전사된 프리-mRNA의 5' 스플라이스 위치에 강하게 결합하여 초기 스플라이스 복합체의 형성을 막음으로써 엑손 12가 결여된 (엑손 12 스키핑) 인간의 ACC2 mRNA를 생성한다.
화학식 I의 화합물은 RNA에 대한 결합력이 아주 크기 때문에, 인간의 ACC2 프리-mRNA와 한두 개의 부정합이 있어도 엑손 12 스키핑을 일으킨다. 또한, 화학식 I의 화합물은 표적 스플라이스 위치에 한두 개의 염기다형성(SNP, single nucleotide polymorphism)을 포함하는 인간의 돌연변이 ACC2 프리-mRNA에 대해서도 엑손 12 스키핑을 일으킨다.
선행 기술에 예시된 바와 같이 화학식 I의 화합물은 세포투과성이 우수하여 올리고뉴클레오티드 그 자체가 쉽게 세포에 전달된다 [PCT/KR2009/001256]. 세포에 화학식 I의 화합물을 올리고뉴클레오티드 그 자체로 투여하면 인간의 ACC2 프리-mRNA에서 엑손 12의 스키핑을 유도하여 엑손 12가 결여된 인간의 ACC2 mRNA 스플라이스 변형체를 형성한다. 화학식 I의 화합물은 특별한 제제 없이도 세포에 쉽게 전달되어 세포 안에 있는 표적 엑손의 스키핑을 강하게 유도한다. 세포에 화학식 I의 화합물을 올리고뉴클레오티드 그 자체로 투여하면 펨토몰 이하의 농도에서도 인간의 MMP-1 프리-mRNA에서 엑손 12의 스키핑을 쉽게 유도한다.
화학식 I의 화합물의 우수한 세포투과성으로 인하여 올리고뉴클레오티드 그 자체를 국소적(Topically)으로 투여하여도 엑손 12의 스키핑을 쉽게 유도한다. 화학식 I의 화합물은 원하는 생물학적 또는 치료상의 효과를 위해 피부를 통해 표적 조직으로 전달하기 위한 제제가 필요하지 않다. 물과 조용매에 녹인 화학식 I의 화합물을 피코몰 이하의 농도로 피부에 투여하여도 원하는 생물학적 또는 치료상의 효과를 나타낸다. 본 발명의 화합물은 피부에 치료 효과를 나타내기 위해 과도하거나 침략적인 제제가 필요 없기는 하지만, 피부 크림이나 로션을 만들기 위해 화장품 구성물(ingredients)이나 보조제(adjuvants)를 제제에 사용할 수 있다. 그러한 피부 크림이나 로션은 피부 노화를 개선하기 위해 유용하게 사용될 수 있다.
화학식 I의 화합물은 원하는 생물학적 또는 치료상의 효과를 위해 1 아토몰(1 aM)에서 1 나노몰(1 nM)의 농도로 피부를 통해 투여할 수 있는데, 그 농도는 대상자의 증상이나 투여 일정에 따라 변할 수 있다.
화학식 I의 화합물은 다양한 투약 형태, 예를 들면 비제한적으로 주사제, 비강 스프레이(nasal spray), 경피 흡수(transdermal) 제형 등으로 제형화할 수 있다. 또한 화학식 I의 화합물은 치료학적으로 효과적인 용량으로 대상(subject)에게 투여할 수 있고, 투여 용량은 적응증, 투약 경로, 투약 스케쥴, 대상자의 상태 등에 따라 다양하다.
화학식 I의 화합물은 약제학적으로 허용 가능한 산이나 염기와 같이 사용될 수 있는데, 약제학적으로 허용 가능한 산이나 염기는 수산화 나트륨(Sodium Hydroxide), 수산화 칼륨(Potassium Hydroxide), 염산(Hydrochloric Acid), 황산(Sulfuric Acid), 메탄설폰산 (Methanesulfonic Acid), 구연산(Citric Acid), 트리플루오로아세트산(Trifluoroacetic Acid) 등을 포함하나 꼭 이들에 한정되는 것은 아니다.
화학식 I의 화합물은 약제학적으로 허용 가능한 보조제(Adjuvant)와 함께 투약될 수 있는데, 이러한 보조제는 구연산, 염산, 주석산 (Tartaric Acid), 스테아린산, 폴리프로필렌글리콜 (Polypropyleneglycol), 폴리에틸렌글리콜 (Polyethyleneglycol), 에탄올, 이소프로판올 (Isopropanol), 중탄산나트륨 (Sodium Bicarbonate), 증류수, 방부제 (Preservative) 등을 포함하나 이들에 한정되는 것은 아니다.
본 발명의 바람직한 PNA 유도체는 다음과 같은 조건을 갖는 화학식 I의 PNA 유도체와 이들의 약제학적으로 허용 가능한 염을 포함한다:
화학식 I 중에서,
n은 10과 21 사이의 정수이며;
화학식 I의 화합물은 인간의 ACC2 프리-mRNA에서 18개의 염기로 이루어진 [(5'
Figure pat00015
3') GGCCAUUUCGUCAGUAUC] 서열과 최소한 10개 이상의 상보적인 결합을 하며;
화학식 I의 화합물 전체가, 인간의 ACC2 프리-mRNA와 완전히 상보적인 결합을 하거나, 화학식 I의 화합물 전체 중 한 개 혹은 두 개의 염기 부정합을 포함한 부분적으로 상보적인 결합을 하며;
S1, S2, ……, Sn -1, Sn, T1, T2, ……, Tn -1 그리고 Tn은 수소, 중수소 중에서 각자 독립적으로 선택되나 꼭 이들에 한정되는 것은 아니며;
X와 Y는 수소, 중수소, 포밀, 아미노카보닐, 아미노티오카보닐, 치환체가 있거나 없는 알킬, 치환체가 있거나 없는 아릴, 치환체가 있거나 없는 알킬옥시, 치환체가 있거나 없는 아릴옥시, 치환체가 있거나 없는 알킬아실, 치환체가 있거나 없는 아릴아실, 치환체가 있거나 없는 알킬옥시카보닐, 치환체가 있거나 없는 아릴옥시카보닐, 치환체가 있거나 없는 알킬아미노카보닐, 치환체가 있거나 없는 아릴아미노카보닐, 치환체가 있거나 없는 알킬아미노티오카보닐, 치환체가 있거나 없는 아릴아미노티오카보닐, 치환체가 있거나 없는 알킬옥시티오카보닐, 치환체가 있거나 없는 아릴옥시티오카보닐, 치환체가 있거나 없는 알킬설포닐, 치환체가 있거나 없는 아릴설포닐, 치환체가 있거나 없는 알킬포스포닐 그리고 치환체가 있거나 없는 아릴포스포닐 중에서 각자 독립적으로 선택되나 꼭 이들에 한정되는 것은 아니며;
Z는 수소, 하이드록시, 치환체가 있거나 없는 알킬옥시, 치환체가 있거나 없는 아릴옥시, 치환체가 있거나 없는 아미노 중에서 선택되나 꼭 이들에 한정되는 것은 아니며;
B1, B2, ……, Bn -1 그리고 Bn은 아데닌, 티민, 구아닌, 시토신, 그리고 우라실을 포함하는 천연 핵산염기 및 비천연 핵산염기 중에서 각각 독립적으로 선택되며; 그리고,
B1, B2, ……, Bn -1 그리고 Bn 중 최소한 네 개는 화학식 II, 화학식 III, 또는 화학식 IV로 대표되는 비천연 핵산염기다.
Figure pat00016
[화학식 II]
Figure pat00017
[화학식 III]
Figure pat00018
[화학식 IV]
화학식 II, III 및 IV 중에서,
R1, R2, R3, R4, R5 그리고 R6는 수소 또는 치환체가 있거나 없는 알킬 중에서 각자 독립적으로 선택되며; 그리고,
L1, L2 그리고 L3는 화학식 V로 대표되는 공유결합성 링커이며, 염기성 아민과 핵산염기 부위를 연결시켜 준다:
Figure pat00019
[화학식 V]
화학식 V 중에서,
Q1과 Qm은 치환체가 있거나 없는 메틸렌(methylene: -CH2-, -CH(치환체)- 또는 -C(치환체)2-]이고, Qm은 염기성 아민에 연결되며;
Q2, Q3, … 그리고 Qm -1은 치환체가 있거나 없는 메틸렌, 산소(-O-), 황(-S-), 치환체가 있거나 없는 아미노 [-N(H)- 또는 -N(치환체)-] 중에서 각자 독립적으로 선택되며; 그리고,
m 은 1과 15 사이의 정수이다.
본 발명의 더 바람직한 PNA 유도체는 다음과 같은 조건을 갖는 화학식 I의 PNA 유도체와 이들의 약제학적으로 허용 가능한 염을 포함한다:
화학식 I 중에서,
n은 11과 16 사이의 정수이며;
화학식 I의 화합물은 인간의 ACC2 프리-mRNA에서 18개의 염기로 이루어진 [(5'
Figure pat00020
3') GGCCAUUUCGUCAGUAUC] 서열과 최소한 10개 이상의 상보적인 결합을 하며;
화학식 I의 화합물 전체가, 인간의 ACC2 프리-mRNA와 완전히 상보적인 결합을 하며;
S1, S2, ……, Sn -1, Sn, T1, T2, ……, Tn -1 그리고 Tn은 수소이며;
X와 Y는 수소, 치환체가 있거나 없는 알킬아실, 치환체가 있거나 없는 알킬옥시카보닐 중에서 각자 독립적으로 선택되며;
Z는 치환체가 있거나 없는 아미노이며;
B1, B2, ……, Bn -1 그리고 Bn은 아데닌, 티민, 구아닌, 시토신, 그리고 우라실을 포함하는 천연 핵산염기 및 비천연 핵산염기 중에서 각각 독립적으로 선택되며; 그리고,
B1, B2, ……, Bn -1 그리고 Bn 중 최소한 다섯 개는 화학식 II, 화학식 III, 또는 화학식 IV로 대표되는 비천연 핵산염기이며;
R1, R2, R3, R4, R5 그리고 R6는 수소이며;
Q1과 Qm은 메틸렌이고, Qm은 염기성 아민에 연결되며;
Q2, Q3,
Figure pat00021
, 그리고 Qm -1은 메틸렌, 산소 중에서 각자 독립적으로 선택되며; 그리고,
m 은 1과 9 사이의 정수이다.
본 발명의 더욱더 바람직한 PNA 유도체는 다음과 같은 조건을 갖는 화학식 I의 PNA 유도체와 이들의 약제학적으로 허용 가능한 염을 포함한다:
화학식 I 중에서,
n은 11과 16 사이의 정수이며;
화학식 I의 화합물은 인간의 ACC2 프리-mRNA에서 18개의 염기로 이루어진 [(5'
Figure pat00022
3') GGCCAUUUCGUCAGUAUC] 서열과 최소한 10개 이상의 상보적인 결합을 하며;
화학식 I의 화합물 전체가, 인간의 ACC2 프리-mRNA와 완전히 상보적인 결합을 하며;
S1, S2, ……, Sn -1, Sn, T1, T2, ……, Tn -1 그리고 Tn은 수소이며;
X는 수소이며;
Y는 치환체가 있거나 없는 알킬옥시카보닐이며;
Z는 치환체가 있거나 없는 아미노이며;
B1, B2, ……, Bn -1 그리고 Bn은 아데닌, 티민, 구아닌, 시토신, 그리고 우라실을 포함하는 천연 핵산염기 및 비천연 핵산염기 중에서 각각 독립적으로 선택되며; 그리고,
B1, B2, ……, Bn -1 그리고 Bn 중 최소한 다섯 개는 화학식 II, 화학식 III, 또는 화학식 IV로 대표되는 비천연 핵산염기이며;
R1, R2, R3, R4, R5 그리고 R6는 수소이며;
L1은 -(CH2)2-O-(CH2)2-, -CH2-O-(CH2)2-, -CH2-O-(CH2)3-, -CH2-O-(CH2)4-, 혹은 -CH2-O-(CH2)5- 이며; 그리고,
L2와 L3는 -(CH2)2-O-(CH2)2-, -(CH2)3-O-(CH2)2-, -(CH2)2-O-(CH2)3-, -(CH2)2-, -(CH2)3-, -(CH2)4-, -(CH2)5-, -(CH2)6-, -(CH2)7-, 그리고 -(CH2)8- 중에서 각자 독립적으로 선택된다.
본 발명의 PNA 유도체 중 특별히 관심이 있는 것으로서 그 구체적인 예는, 다음 식의 PNA 유도체들 (이하, 순서대로 ASO 1, 2, 3, 4, 5 및 6으로 각각 지칭함)과 이의 약제학적으로 허용 가능한 염을 포함한다:
Fethoc-CTG(6)-ACG(6)-AA(5)A-TG(6)G-C(1O2)C-NH2;
Fethoc-TA(5)C(1O2)-TGA(5)-CGA(5)-AA(5)T-G(6)GC(1O2)-C-NH2;
Fethoc-TA(5)C-TG(5)A-C(1O2)GA(5)-AA(5)T-G(5)G-NH2;
Fethoc-AC(1O2)T-GA(5)C-GA(5)A-A(5)TG(5)-GC(1O2)-NH2;
Fethoc-CTG(6)-AC(1O2)G-A(5)AA(5)-TG(6)G-NH2; 및
Fethoc-CTG(6)-AC(1O2)G-A(5)AA(5)-TG(6)G-C(1O2)C-NH2
상기 PNA 유도체의 식들에서,
A, T, G, 그리고 C는 각각 천연 핵산염기인 아데닌, 티민, 구아닌, 그리고 시토신을 포함하는 PNA 모노머(monomer)이며;
C(pOq), A(p)와 G(p)는 각각 화학식 VI, 화학식 VII과 화학식 VIII로 대표되는, 비천연 핵산염기로 변형된 시토신, 아데닌과 구아닌을 포함하는 PNA 모노머이다;
Figure pat00023
[화학식 VI]
Figure pat00024
[화학식 VII]
Figure pat00025
[화학식 VIII]
화학식 VI, 화학식 VII 및 화학식 VIII에서,
p와 q는 정수인데, 상기 식의 PNA 유도체 중 ASO 4를 예로 들어 설명하면, p가 1 또는 5에 해당되고 q가 2에 해당되는 것이며; 그리고,
약자인 "Fethoc-"는 "[2-(9-플루오레닐)에틸-1-옥시]카보닐", 즉 "[2-(9-fluorenyl)ethyl-1-oxy]carbonyl"을 의미한다.
PNA 모노머인 A, G, T, C, C(pOq), A(p), G(p)의 화학적 구조는 도 3에 명확하게 제공된다. 선행 기술에서 상술한 바와 같이 [PCT/KR2009/001256], C(pOq)는 구아닌과 상보적인 결합을 하기 때문에 “변형 시토신” PNA 모노머로 인식된다. 마찬가지로 A(p)는 티민과 상보적인 결합을 하기 때문에 “변형 아데닌” PNA 모노머로, G(p)는 시토신과 상보적인 결합을 하기 때문에 “변형 구아닌” PNA 모노머로 인식된다. 또한 화학 구조의 명확한 제시를 위해 14머 PNA 유도체인 "(N
Figure pat00026
C) CTG(6)-ACG(6)-AA(5)A-TG(6)G-C(1O2)C-NH2" ASO 1 의 구조가 도 4에 제공된다.
ASO 1은 "(5'
Figure pat00027
3') CTG-ACG-AAA-TGG-CC" 서열을 갖는 DNA와 동일하게 프리-mRNA와 상보적 결합을 한다. 이 14머 PNA는 인간 ACC2 프리-mRNA의 엑손 12와 인트론 12 결합 부분 중에서도 굵게 밑줄친 부분에 상보적으로 결합한다: [(5'
Figure pat00028
3') GGAAGA GGCCAUUUC gucag uaucuccuuc]
본 발명은 또한, 본 발명의 펩타이드 핵산 유도체 혹은 이의 약제학적으로 허용 가능한 염을 투여하는 것을 포함하는, 인간 ACC2 유전자의 전사에 관련된 징후 또는 증상을 개선하기 위한 사용 방법을 제공한다.
본 발명은 또한, 본 발명의 펩타이드 핵산 유도체 혹은 이의 약제학적으로 허용 가능한 염을 투여하는 것을 포함하는, 피부 노화를 개선하기 위한 사용 방법을 제공한다.
본 발명은 또한, 본 발명의 펩타이드 핵산 유도체 혹은 이의 약제학적으로 허용 가능한 염을 포함하는, 인간 ACC2 유전자 전사 관련 징후 또는 증상 개선용 약학 조성물을 제공한다.
본 발명은 또한, 본 발명의 펩타이드 핵산 유도체 혹은 이의 약제학적으로 허용 가능한 염을 포함하는, 인간 ACC2 유전자 전사 관련 징후 또는 증상 개선용 화장품을 제공한다.
본 발명은 또한, 본 발명의 펩타이드 핵산 유도체 혹은 이의 약제학적으로 허용 가능한 염을 포함하는, 피부 노화 개선용 약학 조성물을 제공한다.
본 발명은 또한, 본 발명의 펩타이드 핵산 유도체 혹은 이의 약제학적으로 허용 가능한 염을 포함하는, 피부 노화 개선용 화장품을 제공한다.
본 발명에 따르는 화학식 I의 PNA 유도체 혹은 이의 약제학적으로 허용 가능한 염을 투여함으로써 인간 ACC2 유전자의 전사에 관련된 징후 또는 증상을 개선할 수 있다.
또한 본 발명에 따르는 화학식 I의 PNA 유도체 혹은 이의 약제학적으로 허용 가능한 염을 투여하여 함으로써 피부 노화를 개선할 수 있다.
도 1a-1c. 화학식 I PNA 유도체의 천연 및 비천연 핵산염기의 예.
도 2a-2e. 화학식 I PNA 유도체의 치환체의 예.
도 3. 천연 및 변형 핵산염기를 갖는 PNA 모노머의 화학 구조.
도 4. PNA 유도체 14머 "ASO 1"의 화학 구조
도 5. 본 발명에서 PNA 유도체의 합성에 사용된 Fmoc 보호기가 붙은 PNA 모노머의 화학적 구조.
도 6a-6b. "ASO 1"의 정제 전후의 C18-역상 HPLC 크로마토그램.
도 7. C18-역상 HPLC로 정제한 "ASO 1"의 ESI-TOF 매스 스팩트럼.
도 8. 골격근 세포(C2C12)에서의 “ASO 1”에 의한 ACC2의 엑손 스키핑
도 9. C2C12에서의 “ASO 1”에 의한 ACC2 mRNA 감소 qPCR 결과
도 10. C2C12에서의 “ASO 6”에 의한 ACC2 mRNA 감소 qPCR 결과
도 11. C2C12에서의 “ASO 5”에 의한 ACC2 mRNA 감소 qPCR 결과
PNA 올리고머를 합성하는 일반적인 방법
변형된 핵산염기를 가진 PNA 모노머들은 선행 기술 [PCT/KR 2009/001256]에서 공개된 방법이나 이를 약간 변형하여 합성하였다. 변형된 핵산염기를 가진 Fmoc[{(9-fluorenyl)methoxy}carbonyl]으로 보호된 PNA 모노머들과 천연 핵산염기를 가진 Fmoc으로 보호된 PNA 모노머들을 사용하여 [반응식 1]과 같이 선행 기술 [US6,133,444; WO96/40685]에 공개된 방법이나 이를 약간 변형하여 화학식 I의 PNA 올리고머를 고체상으로 합성하였다. 합성에 사용된 고체상은 PCAS 바이오마트릭스사 (PCAS BioMatrix Inc., Quebec, Canada)에서 구매한 H-링크 아미드-캠마트릭스 (H-Rink Amide-ChemMatrix) 레진을 주로 사용하였다. 이렇게 합성된 PNA 올리고머는 MALDI-TOF MS로 동정되었고 C18-역상(Reverse Phase) HPLC를 이용하여 분리 및 분석되었다. (증류수/아세토니트릴 또는 증류수/메탄올, 0.1% TFA) [도 6a-6b]는 “ASO 1”을 HPLC 정제하기 전과 후의 HPLC 크로마토그램이고 [도 7]은 HPLC로 정제한 “ASO 1”에 대한 ESI/TOF/MS 스펙트럼으로서, 본 발명의 PNA 올리고머들에 대한 설명을 목적으로 제공되었으며 본 발명의 범위를 한정하기 위함이 아니다.
[반응식 1]은 고체상 합성의 전형적인 과정을 도식화 하였는데 각각의 반응 과정은 다음과 같이 간략히 제공한다.
[H-링크-캠마트릭스 레진의 활성화] 레진의 아민에 Fmoc 보호기가 붙어있지 않을 경우에 해당되며, 0.01 mmol (약 20 mg 레진)과 1.5 mL 20% 피페리딘/디메틸포름아미드(DMF)가 혼합된 현탁액을 리브라 튜브에서 20분간 보텍싱 (vortexing)후 DeFmoc 용액을 여과해서 제거한다. 레진을 1.5 mL 메틸렌클로라이드(MC), 1.5 mL DMF, 1.5 mL MC, 1.5 mL DMF, 그리고 1.5 mL MC로 각각 30초간 세척하고 나면, 레진의 아민은 Fmoc으로 보호된 PNA 모노머와 반응할 준비가 완료된다.
[반응식 1]
Figure pat00029

[Fmoc 제거(DeFmoc)] 레진의 아민에 Fmoc 보호기가 붙어있을 경우에 해당되며, 0.01 mmol (약 20 mg 레진)과 1.5 mL 20% 피페리딘/DMF가 혼합된 현탁액을 리브라 튜브에서 7분간 보텍싱 후 DeFmoc 용액을 여과해서 제거한다. 레진을 1.5 mL MC, 1.5 mL DMF, 1.5 mL MC, 1.5 mL DMF, 그리고 1.5 mL MC로 각각 30초간 세척하고 나면, 레진의 아민은 Fmoc으로 보호된 PNA 모노머와 반응할 준비가 완료된다.
[Fmoc-PNA 모노머와의 커플링(Coupling)] 레진의 아민은 다음과 같은 방법으로 Fmoc-PNA 모노머와 커플링된다. 0.04 mmol PNA monomer, 0.05 mmol HBTU, 그리고 0.1 mmol DIEA 등을 1 mL 무수 DMF에 녹인 후, 2분 후에 그 용액을 레진에 가한다. 레진 현탁액을 1 시간 동안 보텍싱 후 용액은 여과해서 제거하고, 레진은 1.5 mL MC, 1.5 mL DMF, 1.5 mL MC, 1.5 mL DMF 그리고 1.5 mL MC로 각각 30초간 세척한다. 본 발명에서 PNA 유도체의 합성에 사용된 Fmoc으로 보호된 PNA 모노머의 화학적 구조는 도 5에 제공된다. 도 5에 제공된 변형 염기를 갖는 Fmoc으로 보호된 PNA 모노머들은 본 발명의 내용을 설명하기 위하여 제공되었으며 본 발명의 범위를 한정하기 위함이 아니다.
[캡핑(Capping)] 커플링 반응 후에 반응하지 않은 아민은 1.5 mL 캡핑 용액(capping solution, 5% 아세틱안하이드라이드와 6% 2,6-루티딘의 DMF 용액)에서 5분간 반응을 통하여 캡핑(capping)된다. 캡핑 용액을 여과하여 제거한 후 레진은 1.5 mL MC, 1.5 mL DMF, 그리고 1.5 mL MC로 각각 30초간 세척한다.
[N-말단에 "Fethoc"기 도입] 레진의 N-말단 아민은 다음과 같은 방법으로 "Fethoc-OSu"와 반응하여 "Fethoc"기가 도입 된다. 0.1 mmol Fethoc-OSu와 0.1 mmol DIEA를 1 mL 무수 DMF에 녹인 후, 그 용액을 레진에 가한다. 레진 현탁액을 1 시간 동안 보텍싱 후 용액은 여과해서 제거하고, 레진은 1.5 mL MC, 1.5 mL DMF, 그리고 1.5 mL MC로 각각 30초간 세척한다. 본 발명에서 PNA 유도체의 합성에 사용된 "Fethoc-OSu"의 [CAS No. 179337-69-0, C20H17NO5, MW 351.36] 화학적 구조는 다음과 같다.
Figure pat00030
[레진으로부터 분리] 레진에 결합되어있는 PNA 올리고머는 1.5 mL 분리 용액(cleavage solution, 2.5% 트리이소프로필실란과 2.5% 물의 트리플루오로아세틱산 용액)에서 3 시간 동안 반응하여 레진으로부터 분리된다. 레진을 여과하여 제거하고 여과액을 저압에서 농축한다. 잔사를 에테르(diethylether)로 처리하여 얻은 고체를 여과하여 수득한 다음, 역상 HPLC로 정제한다.
[HPLC 분석 및 정제] 레진으로부터 분리된 PNA 유도체의 조생성물(crude product)은 0.1% TFA가 포함된 물/아세토니트릴이나 물/메탄올을 용리제로 사용하여 C18-역상 HPLC로 정제한다. 도 6a와 6b는 "ASO 1"의 정제 전과 후의 C18-역상 HPLC 크로마토그램의 예시이다.
화학식 I의 PNA 유도체에 대한 합성 예
인간 ACC2 프리-mRNA 엑손 12의 5' 스플라이스 위치에 상보적으로 결합하는 PNA 유도체를 위의 방법에 부분적인 수정을 통하여 합성하였다. 인간 ACC2 프리-mRNA를 표적으로 하는 이러한 PNA 유도체는 본 발명의 내용을 설명하기 위하여 제공되었으며 본 발명의 범위를 한정하기 위함이 아니다.
인간 ACC2 프리-mRNA 엑손 12의 5' 스플라이스 위치에 상보적으로 결합하는 PNA 유도체와 매스 구조 분석 데이타.
PNA
유도체
PNA 서열 (N→C) Exact Mass, m/z
theor.a obs.b
ASO 1 Fethoc-CTG(6)-ACG(6)-AA(5)A-TG(6)G-C(1O2)C-NH2 4549.07 4549.08
ASO 2 Fethoc-TA(5)C(1O2)-TGA(5)-CGA(5)-AA(5)T-G(6)GC(1O2)-C-NH2 5289.43 5289.38
ASO 3 Fethoc-TA(5)C-TG(5)A-C(1O2)GA(5)-AA(5)T-G(5)G-NH2 4661.14 4661.18
ASO 4 Fethoc-AC(1O2)T-GA(5)C-GA(5)A-A(5)TG(5)-GC(1O2)-NH2 4658.11 4658.10
ASO 5 Fethoc-CTG(6)-AC(1O2)G-A(5)AA(5)-TG(6)G-NH2 4047.86 4047.87
ASO 6 Fethoc-CTG(6)-AC(1O2)G-A(5)AA(5)-TG(6)G-C(1O2)C-NH2 4647.12 4647.12
a)이론치 값, b)관측 값.
표 1은 인간 ACC2 유전자로부터 [NCBI Reference Sequence: NG_ 046907] 전사된 인간 ACC2 프리-mRNA 엑손 12의 5' 스플라이스 위치에 상보적으로 결합하는 PNA 유도체와 매스 구조 분석 데이터를 제공한다. 표 1의 ASO는 본 발명의 내용을 설명하기 위하여 제공되었으며 본 발명의 범위를 한정하기 위함이 아니다.
"ASO 1"은 인간 ACC2 프리-mRNA의 엑손 12와 인트론 12 결합 부분 중에서도 다음의 굵게 밑줄친 부분에 상보적으로 결합하는 14머 PNA이다:
[(5'
Figure pat00031
3') GGAAGA GGCCAUUUC gucag uaucuccuuc]
"ASO 1"은 인간 ACC2 프리-mRNA의 엑손 12와 9머, 그리고 인트론 12와 5머의 상보적인 결합을 한다.
ASO ”와 상보적인 DNA와의 결합력(Binding Affinity)
화학식 I PNA 유도체들의 N-말단이나 C-말단이 표적인 상보적인 10머 DNA들과의 결합력을 측정하였다. 결합력은 PNA와 상보적인 10머 DNA 이중나선의 Tm 값으로 평가하였다. PNA와 전체 길이의 상보적인 DNA 이중나선의 Tm 값은 너무 높아서 측정하기 어려운데, 이는 완충용액이 Tm 측정 중에 끓을 수 있기 때문이다. 따라서 10머 길이의 DNA와의 Tm 값을 측정하여 전체 길이의 결합력을 예측하였다.
Tm은 UV/Vis 분광 광도계(spectrophotometer)를 이용하여 다음과 같이 측정하였다. 15 mL 폴리프로필렌 팔콘 튜브(falcon tube)에서 4 마이크로몰(μM) PNA 올리고머와 4 마이크로몰(μM)의 상보적인 10머 DNA를 완충 용액(pH 7.16, 10mM 소듐 포스페이트, 100mM NaCl)에 섞은 후, 90oC에서 수분간 인큐베이션하고 상온으로 서서히 냉각시켰다. 이 용액을 3mL 석영 큐벳 (Quartz Cuvette)에 옮기고 잘 봉인한 후 애질런트(Agilent) 8453 UV/가시광선 분광 광도계에 장착하였다. 큐벳의 온도를 분당 0.5 혹은 1.0oC 속도로 올리면서 260nm에서 흡광도 변화를 측정하고 흡광도 변화율이 가장 큰 온도, 즉, 변곡점을 PNA 올리고머와 10머 DNA 사이의 Tm 값으로 정하였다. Tm 측정에 사용된 DNA는 대전의 (주)바이오니아(www.bioneer.com, 대한민국 대전직할시)로부터 구매하여 별도의 정제 없이 사용되었다.
화학식 I PNA 유도체들의 Tm 값들은 상당히 높게 나타났는 데, 그 결과들은 표 2에 요약되었다.
PNA 유도체들과 N-말단이나 C-말단이 표적인 상보적인 10머 DNA들과의 Tm 값.
PNA Tm 값, oC
N-말단 10머 DNA C-말단 10머 DNA
ASO 1 72.80 79.60
ASO 2 82.99 82.01
ASO 3 76.03 78.99
ASO 4 80.01 82.01
예를 들면, “ASO 1”은 PNA에서 밑 줄 및 굵게 표시된 [(N → C) Fethoc- CTG(6)-ACG(6)-AA(5)A-T G(6)G-C(1O2)C-NH2] N-말단이 표적인 상보적인 10머 DNA와 72.80 oC의 Tm 값이 측정되었다. 반면에, “ASO 1”은 PNA에서 밑줄 및 굵게 표시된 [(N → C) Fethoc-CTG(6)-A CG (6)-AA(5)A- TG(6)G-C(1 O2 )C -NH2] C-말단이 표적인 상보적인 10머 DNA와 79.60 oC의 Tm 값이 측정되었다.
화학식 I PNA 유도체의 생물학적 활성에 대한 예
골격근 세포인 C2C12에서 실시간 정량적 연쇄 중합반응 (Real-Time quantitative Polymerase Chain Reaction, RT-qPCR) 등을 이용하여 화학식 I PNA 유도체의 ACC2 안티센스(antisense) 효능을 평가하였다. 이러한 안티센스 효능 평가 예들은 본 발명의 내용을 설명하기 위하여 제공되었으며 본 발명의 범위를 한정하기 위함은 아니다.
실시예 1. C2C12 에서 중첩 PCR (Nested PCR )을 이용한 “ ASO 1”의 엑손 스키핑 유도 효능평가.
ASO 1에 의한 엑손 스키핑 유도를 아래와 같은 실험 과정을 통해 평가하였다.
[세포배양 & ASO 처리] C2C12 (Cat. No. CRL-1772, ATCC)를 둘 베코 변형 이글 배지 (Dulbecco Modified Eagle Medium: DMEM) (Cat. No. 12-604F, Lonza)에 10% 소 혈청 (Fetal Bovine Serum) (Cat. No. 10099-41, GIBCO)과 1% 페니실린/스트렙토마이신 (Cat. No. 15140-122, GIBCO)를 첨가하여 사용하였고, 37oC, 5% CO2 조건에서 세포 배양하였다. C2C12 세포를 60 mm 배양접시에 2×105개 접종하고 24시간 배양하여 안정화시킨 후, “ASO 1”을 100 zM에서 1 fM 사이의 농도로 5 시간 처리하였다.
[RNA분리 및 중첩 PCR] ASO가 처리된 세포를 수확한 후 알니지 미니 킷트 (RNeasy Mini kit) (Qiagen, Cat. No. 714106)의 실험방법에 따라 RNA를 분리하였으며, cDNA는 200ng의 RNA를 대상으로 슈퍼스크립트 III 원스텝 RT-PCR 시스템 (SuperScriptTM III One-Step RT-PCR System) (Cat. No. 12574-018, Invitrogen)를 사용하여 제조하였다. PCR 튜브에 200ng의 RNA와 25 마이크로리터(μL) 2X 반응 혼합 완충액 (Reaction Mix buffer), 슈퍼스크립트 IIITM RT/플래티넘 Taq 믹스(SuperScript IIITM RT/Platinum Taq Mix) 2 마이크로리터를 첨가하고 엑손 9 포워드 프라이머 (Exon 9 Forward Primer) 10 마이크로몰 (5'-TTTTCCGACAAGTGCAGAG-3')과 엑손 15 리버스 프라이머 (Exon 15 Reverse Primer) 10 마이크로몰 (5'-AACGTCCACAATGTTCAG-3')을 각각 1 마이크로리터를 추가로 넣은 후 총 50 마이크로리터가 되게 오토 클레이브 된 증류수 (Autoclaved distilled Water)를 최종 포함시킨 후 혼합한다. 혼합된 PCR 튜브를 60 oC에 30분간 반응시킨 다음에 94 oC에서 2분을 추가 반응시킨 후, PCR 과정을 94 oC에서 15 초, 50 oC에서 30 초, 68 oC에서 1분 동안 총 30회 반응 시켜 1차 중합효소 반응 산물을 생산한다. 생산한 반응 산물의 1 마이크로리터와 엑손 10 포워드 프라이머 (Exon 10 Forward Primer) 10 마이크로몰 (5’-GAG TAC TTA TAC AGC CAG G-3’)와 엑손 14 리버스 프라이머 (Exon 14 Reverse Primer) 10 마이크로몰 (5’-TTC TGA ACA TCG CGT CTG-3’)를 각각 1 마이크로리터씩 추가하고 파이로호스트스타트 태크 폴리머라제 킷트 (PyroHostStart Taq Polymerase Kit) (Cat. No. K-2611-FCG)에서 제시한 실험 방법에 따라 95 oC에서 2분 동안 1차 반응을 한 후 95 oC에서 30 초, 47 oC에서 1 분, 72 oC에서 20초동안 중합효소 반응을 수행하였다.
[엑손 스키핑 산물 확인 전기영동] 중합효소 반응이 완료된 산물 10 마이크로리터을 2% 아가로스겔 (Agarose Gel)에 전기영동(electrophoresis)하여 ASO처리 시료에서 확인된 밴드를 추출하여 생거 시퀀싱 (Sanger Sequencing)을 통해 엑손 스키핑 시퀀스를 동정하였다.
[ASO 1에 의해 유도된 엑손 스키핑] 도 8과 같이, ASO 1을 처리하였을 시, 0.1 aM 과 1 fM 사이에서 농도 의존적으로 엑손 스키핑이 유도되는 것을 확인하였다.
실시예 2. C2C12 에서 실시간 qPCR (Real-Time qPCR )을 이용한 “ ASO 1”의 ACC2 mRNA 억제 효과 평가.
ASO 1에 의한 ACC2 mRNA 변화를 아래와 같은 실험 과정을 통해 평가 하였다.
[세포배양 & ASO 처리] C2C12 (Cat. No. CRL-1772, ATCC)를 둘 베코 변형 이글 배지 (DMEM) (Cat. No. 12-604F, Lonza)에 10% 소 혈청 (Fetal Bovine Serum) (Cat. No. 10099-41, GIBCO)과 1% 페니실린/스트렙토마이신 (Cat. No. 15140-122, GIBCO)를 첨가하여 사용하였고, 37oC, 5% CO2 조건에서 세포 배양하였다. C2C12 세포를 60 mm 배양접시에 2×105개 접종하고 24시간 배양하여 안정화 시킨 후, “ASO 1”을 100 zM에서 1 fM 사이의 농도로 24 시간 처리하였다.
[RNA분리 및 cDNA 합성] ASO가 처리된 세포를 수확한 후 알니지 미니 킷트 (Qiagen, Cat. No. 714106)의 실험방법에 따라 RNA를 분리하였으며, cDNA는 400ng의 RNA를 대상으로 프라임스크립트TM 제1 가닥 cDNA 합성키트 (PrimeScriptTM 1st strand cDNA Synthesis Kit) (Cat. No. 6110A, Takara)를 사용하여 제조하였다. PCR 튜브에 400ng의 RNA와 1 마이크로리터 의 랜덤 헥사머(random hexamer) 그리고 1 마이크로리터 dNTP (10 mM)를 넣고 DEPC 수 (water)를 총 10 마이크로리터가 되게 하여 65oC에서 5분간 반응하였다. 여기에 프라임스크립트 알티에이즈(PrimeScript RTase) 반응 혼합물 10 마이크로리터를 추가로 첨가하여 30oC에서 10분간 반응한 후 42oC에서 60분 반응시켜 cDNA를 합성하였다.
[정량적 실시간 PCR (Quantitative Real-Time PCR)] 합성된 cDNA를 이용하여 ACC2 mRNA 발현율을 확인하기 위해 타크만 프로브 (Taqman probe)를 이용한 실시간 qPCR을 진행하였다. PCR 튜브에 cDNA, 타크만 프로브 (Thermo, Mm01204651), IQ 슈퍼믹스 (IQ supermix) (BioRad, Cat. No. 170-8862) 및 핵산가수분해효소가 없는 물(Nuclease free water)을 혼합하여 반응액을 제조하였다. 반응액을 제조한 다음에 CFX96 터치 실시간 시스템 (CFX96 Touch Real-Time system, BioRad)을 이용하여 95oC 에서 3분 동안 1차 변성 (primary denaturation) 한 후 변성, 풀림(annealing), 중합(polymerization)을 각각 95oC에서 10초, 60oC에 서 30초로 총 50 사이클 (cycle)을 수행하였고, 매 사이클 이 끝난 후 형광강도를 측정하였다. PCR 결과는 각 결과별 용융 곡선 (melting curve)로 검증하였다. 각 유전자의 역치 주기 (threshold cycle: Ct)값을 GAPDH의 Ct값으로 표준화한 후, Ct값의 변화량을 비교하여 분석하였다.
[ASO에 의한 ACC2 mRNA의 감소효과] 도 9과 같이, ASO 1을 처리하였을 시, 100 zM과 1 fM 사이에서 농도 의존적으로 ACC2 mRNA가 감소하였고, 특히 1 fM에서, "ASO 1"를 처리하지 않은 대조군 (con)과 비교하여 통계적으로 유의성을 보이는 30% 감소효과가 나타났다 (통계적 유의성은 student t-test를 통해 검증함).
실시예 3. C2C12 에서 실시간 qPCR을 이용한 “ ASO 6”의 ACC2 mRNA 억제 효과 평가.
ASO 6에 의한 ACC2 mRNA 변화를 아래와 같은 실험 과정을 통해 평가 하였다.
[세포배양 & ASO 처리] C2C12 (Cat. No. CRL-1772, ATCC)를 둘 베코 변형 이글 배지 (DMEM) (Cat. No. 12-604F, Lonza) 에 10% 소 혈청 (Fetal Bovine Serum) (Cat. No. 10099-41, GIBCO)과 1% 페니실린/스트렙토마이신 (Cat. No. 15140-122, GIBCO)를 첨가하여 사용하였고, 37oC, 5% CO2 조건에서 세포 배양하였다. C2C12 세포를 60 mm 배양접시에 2×105개 접종하고 24시간 배양하여 안정화 시킨 후, “ASO 6”을 100 zM에서 1 fM 사이의 농도로 24 시간 처리하였다.
[RNA분리 및 cDNA 합성] ASO가 처리된 세포를 수확한 후 알니지 미니 킷트 (Qiagen, Cat. No. 714106)의 실험방법에 따라 RNA를 분리하였으며, cDNA는 400ng의 RNA를 대상으로 프라임스크립트TM 제1 가닥 cDNA 합성키트 (Cat. No. 6110A, Takara)를 사용하여 제조하였다. PCR 튜브에 400ng의 RNA와 1 마이크로리터 의 랜덤 헥사머(random hexamer) 그리고 1 마이크로리터 dNTP (10 mM)를 넣고 DEPC 수 (water)를 총 10 마이크로리터가 되게 하여 65oC에서 5분간 반응하였다. 여기에 프라임스크립트 알티에이즈 반응 혼합물 10 마이크로리터를 추가로 첨가하여 30oC에서 10분간 반응한 후 42oC에서 60분 반응시켜 cDNA를 합성하였다.
[정량적 실시간 PCR] 합성된 cDNA를 이용하여 ACC2 mRNA 발현율을 확인하기 위해 타크만 프로브를 이용한 실시간 qPCR을 진행하였다. PCR 튜브에 cDNA, 타크만 프로브(Thermo, Mm01204651), IQ 슈퍼믹스 (BioRad, Cat. No. 170-8862) 및 핵산가수분해효소가 없는 물을 혼합하여 반응액을 제조하였다. 반응액을 제조한 다음에 CFX96 터치 실시간 시스템 (BioRad)을 이용하여 95oC 에서 3분 동안 1차 변성 한 후 변성, 풀림(annealing), 중합(polymerization)을 각각 95oC에서 10초, 60oC에 서 30초로 총 50 사이클을 수행하였고, 매 사이클 이 끝난 후 형광강도를 측정하였다. PCR 결과는 각 결과별 용융 곡선으로 검증하였다. 각 유전자의 역치 주기 (Ct)값을 GAPDH의 Ct값으로 표준화한 후, Ct값의 변화량을 비교하여 분석하였다.
[ASO에 의한 ACC2 mRNA의 감소효과] 도 10과 같이, ASO 6를 처리하였을 시, 100 zM과 1 fM 사이에서 농도 의존적으로 ACC2 mRNA가 감소하였고, ASO 6를 처리하지 않은 대조군 (con)과 비교하여, 1 aM에서는 30 %, 1 fM에서는 50%의 통계적으로 유의성을 보이는 감소효과 나타났다 (통계적 유의성은 student t-test를 통해 검증함).
실시예 4. C2C12 에서 실시간 qPCR을 이용한 “ ASO 5”의 ACC2 mRNA 억제 효과 평가.
ASO 5에 의한 ACC2 mRNA 변화를 아래와 같은 실험 과정을 통해 평가하였다.
[세포배양 & ASO 처리] C2C12 (Cat. No. CRL-1772, ATCC)를 둘 베코 변형 이글 배지 (DMEM) (Cat. No. 12-604F, Lonza)에 10% 소 혈청 (Fetal Bovine Serum) (Cat. No. 10099-41, GIBCO)과 1% 페니실린/스트렙토마이신 (Cat. No. 15140-122, GIBCO)를 첨가하여 사용하였고, 37oC, 5% CO2 조건에서 세포 배양하였다. C2C12 세포를 60 mm 배양접시에 2×105개 접종하고 24시간 배양하여 안정화 시킨 후, “ASO 5”를 100 zM에서 1 fM 사이의 농도로 24 시간 처리하였다.
[RNA분리 및 cDNA 합성] ASO가 처리된 세포를 수확한 후 알니지 미니 킷트 (Qiagen, Cat. No. 714106)의 실험방법에 따라 RNA를 분리하였으며, cDNA는 400ng의 RNA를 대상으로 프라임스크립트TM 제1 가닥 cDNA 합성키트 (Cat. No. 6110A, Takara)를 사용하여 제조하였다. PCR 튜브에 400ng의 RNA와 1 마이크로리터 의 랜덤 헥사머(random hexamer) 그리고 1 마이크로리터 dNTP (10 mM)를 넣고 DEPC 수 (water)를 총 10 마이크로리터가 되게 하여 65oC에서 5분간 반응하였다. 여기에 프라임스크립트 알티에이즈 반응 혼합물 10 마이크로리터를 추가로 첨가하여 30oC에서 10분간 반응한 후 42oC에서 60분 반응시켜 cDNA를 합성하였다.
[정량적 실시간 PCR] 합성된 cDNA를 이용하여 ACC2 mRNA 발현율을 확인하기 위해 타크만 프로브를 이용한 실시간 qPCR을 진행하였다. PCR 튜브에 cDNA, 타크만 프로브(Thermo, Mm01204651), IQ 슈퍼믹스 (BioRad, Cat. No. 170-8862) 및 핵산가수분해효소가 없는 물을 혼합하여 반응액을 제조하였다. 반응액을 제조한 다음에 CFX96 터치 실시간 시스템 (BioRad)을 이용하여 95oC 에서 3분 동안 1차 변성 한 후 변성, 풀림(annealing), 중합(polymerization)을 각각 95oC에서 10초, 60oC에 서 30초로 총 50 사이클을 수행하였고, 매 사이클 이 끝난 후 형광강도를 측정하였다. PCR 결과는 각 결과별 용융 곡선으로 검증하였다. 각 유전자의 역치 주기 (Ct)값을 GAPDH의 Ct값으로 표준화한 후, Ct값의 변화량을 비교하여 분석하였다.
[ASO에 의한 ACC2 mRNA의 감소효과] 도 11과 같이, ASO 5를 처리하였을 시, 100 zM과 1 fM 사이에서 농도 의존적으로 ACC2 mRNA가 감소하였고, ASO 5를 처리하지 않은 대조군 (con)과 비교하여, 1 aM에서는 30 %, 1 fM에서는 42%의 통계적으로 유의성을 보이는 감소효과가 나타났다 (통계적 유의성은 student t-test를 통해 검증함).
실시예 5. 화학식 I의 화합물을 포함하는 바디 로션 제조
화학식 I의 화합물을 포함하는 바디 로션 조성물의 예 (단위: w/w%)
파트 No. 한글 성분명 기준량
A 1 폴리글리세릴-3메칠글루코오스디스테아레이트 0.700
2 글리세릴스테아레이트 0.300
3 세테아릴알코올 1.000
4 시어버터 1.000
5 카프릴릭/카프릭트라이글리세라이드 3.000
6 디카프릴릴카보네이트 4.000
7 다이메치콘 0.500
8 에틸헥실글리세린 0.300
B 9 글리세린 5.000
10 프로판다이올 5.000
11 1,2-헥산다이올 0.300
12 알지닌 0.160
13 정제수 62.110
C 14 소듐아크릴레이트/소듐아크릴로일다이메틸타우레이트코폴리머 0.300
15 카보머 0.200
16 잔탄검 0.030
17 정제수 13.000
D 18 향료 0.100
19 올리고머 [ACC2 1000fM + POLYSORBATE 80 0.1%] 3.000
합계 100.000
1. A파트를 비이커에 계량 후 용해한다(80oC).
2. B파트를 또 다른 비이커에 계량 후 용해한다(80oC).
3. A와 B를 혼합하여 호모게나이저를 사용하여 유화한다(80oC, 3,600rpm, 5분).
4. C파트를 계량하여 완전히 분산한 후 50메쉬로 여과한 다음 3의 유화된 제형에 투입하여 호모게나이저로 혼합한다(80oC, 3,600rpm, 5분).
5. 35oC까지 냉각한 후 D파트를 4의 유화된 제형에 투입하여 호모게나이저로 혼합한다(25oC, 2,500rpm, 3분).
6. 균일분산과 완전 탈포를 확인 후 작업을 종결한다.
실시예 6. 화학식 I의 화합물을 포함하는 페이스 크림 제조
화학식 I의 화합물을 포함하는 페이스 크림 조성물의 예 (단위: w/w%)
파트 No. 한글 성분명 기준량
A 1 카프릴릭/카프릭트라이글리세라이드 2.000
2 글리세릴스테아레이트/ PEG-10스테아레이트 10.000
3 세테아릴알코올 2.000
4 에틸헥실글리세린 0.300
B 10 글리세린 5.000
11 1,2-헥산다이올 0.300
12 정제수 78.900
C 14 하이드록시에틸아크릴레이트/소듐아크릴로일다이메틸타우레이트코폴리머 1.000
D 19 올리고머[ACC2 1000fM + POLYSORBATE 80 0.1%] 0.500
합계 100.000
1. A파트를 비이커에 계량 후 용해한다(80oC).
2. B파트를 또 다른 비이커에 계량 후 용해한다(80oC).
3. A와 B를 혼합하여 호모게나이저를 사용하여 유화한다 (80oC, 3,600rpm, 5분).
4. C파트를 계량하여 3의 유화한 제형에 넣고 완전 분산한다 (80oC, 3,600rpm, 5분).
5. 35oC까지 냉각한 후 D파트를 넣고 교반 한다 (35oC, 3,600rpm, 3분).
6. 균일 분산 및 완전 탈포 확인 후 작업을 종료한다 (25oC).

Claims (11)

  1. 화학식 I로 대표되는 펩타이드 핵산 유도체 혹은 이의 약제학적으로 허용 가능한 염:
    [화학식 I]
    Figure pat00032

    화학식 I 중에서,
    n은 10과 21 사이의 정수이며;
    화학식 I의 화합물은 인간의 ACC2 프리-mRNA에서 18개의 염기로 이루어진 [(5'
    Figure pat00033
    3') GGCCAUUUCGUCAGUAUC] 서열과 최소한 10개 이상의 상보적인 결합을 하며;
    화학식 I의 화합물 전체가, 인간의 ACC2 프리-mRNA와 완전히 상보적인 결합을 하거나, 화학식 I의 화합물 전체 중 한 개 혹은 두 개의 염기 부정합을 포함한 부분적으로 상보적인 결합을 하며;
    S1, S2, ……, Sn -1, Sn, T1, T2, ……, Tn -1 그리고 Tn은 수소, 중수소, 치환체가 있거나 없는 알킬, 그리고 치환체가 있거나 없는 아릴 중에서 각자 독립적으로 선택되며;
    X와 Y는 수소, 중수소, 포밀, 아미노카보닐, 아미노티오카보닐, 치환체가 있거나 없는 알킬, 치환체가 있거나 없는 아릴, 치환체가 있거나 없는 알킬옥시, 치환체가 있거나 없는 아릴옥시, 치환체가 있거나 없는 알킬아실, 치환체가 있거나 없는 아릴아실, 치환체가 있거나 없는 알킬옥시카보닐, 치환체가 있거나 없는 아릴옥시카보닐, 치환체가 있거나 없는 알킬아미노카보닐, 치환체가 있거나 없는 아릴아미노카보닐, 치환체가 있거나 없는 알킬아미노티오카보닐, 치환체가 있거나 없는 아릴아미노티오카보닐, 치환체가 있거나 없는 알킬옥시티오카보닐, 치환체가 있거나 없는 아릴옥시티오카보닐, 치환체가 있거나 없는 알킬설포닐, 치환체가 있거나 없는 아릴설포닐, 치환체가 있거나 없는 알킬포스포닐 그리고 치환체가 있거나 없는 아릴포스포닐 중에서 각자 독립적으로 선택되며;
    Z는 수소, 중수소, 하이드록시, 치환체가 있거나 없는 알킬옥시, 치환체가 있거나 없는 아릴옥시, 치환체가 있거나 없는 아미노, 치환체가 있거나 없는 알킬, 그리고 치환체가 있거나 없는 아릴 중에서 선택되며;
    B1, B2, ……, Bn -1 그리고 Bn은 아데닌, 티민, 구아닌, 시토신, 그리고 우라실을 포함하는 천연 핵산염기 및 비천연 핵산염기 중에서 각각 독립적으로 선택되며; 그리고,
    B1, B2, ……, Bn -1 그리고 Bn 중 최소한 네 개는, 치환체가 있거나 없는 아민이 지질성 공유결합성 링커를 통해 핵산염기에 공유결합으로 연결된 비천연 핵산염기다.
  2. 제 1항에 있어서, 다음의 조건을 만족하는 펩타이드 핵산 유도체 혹은 이의 약제학적으로 허용 가능한 염:
    화학식 I 중에서,
    n은 10과 21 사이의 정수이며;
    화학식 I의 화합물은 인간의 ACC2 프리-mRNA에서 18개의 염기로 이루어진 [(5'
    Figure pat00034
    3') GGCCAUUUCGUCAGUAUC] 서열과 최소한 10개 이상의 상보적인 결합을 하며;
    화학식 I의 화합물 전체가, 인간의 ACC2 프리-mRNA와 완전히 상보적인 결합을 하거나, 화학식 I의 화합물 전체 중 한 개 혹은 두 개의 염기 부정합을 포함한 부분적으로 상보적인 결합을 하며;
    S1, S2, ……, Sn -1, Sn, T1, T2, ……, Tn -1 그리고 Tn은 수소, 중수소 중에서 각자 독립적으로 선택되며;
    X와 Y는 수소, 중수소, 포밀, 아미노카보닐, 아미노티오카보닐, 치환체가 있거나 없는 알킬, 치환체가 있거나 없는 아릴, 치환체가 있거나 없는 알킬옥시, 치환체가 있거나 없는 아릴옥시, 치환체가 있거나 없는 알킬아실, 치환체가 있거나 없는 아릴아실, 치환체가 있거나 없는 알킬옥시카보닐, 치환체가 있거나 없는 아릴옥시카보닐, 치환체가 있거나 없는 알킬아미노카보닐, 치환체가 있거나 없는 아릴아미노카보닐, 치환체가 있거나 없는 알킬아미노티오카보닐, 치환체가 있거나 없는 아릴아미노티오카보닐, 치환체가 있거나 없는 알킬옥시티오카보닐, 치환체가 있거나 없는 아릴옥시티오카보닐, 치환체가 있거나 없는 알킬설포닐, 치환체가 있거나 없는 아릴설포닐, 치환체가 있거나 없는 알킬포스포닐 그리고 치환체가 있거나 없는 아릴포스포닐 중에서 각자 독립적으로 선택되며;
    Z는 수소, 하이드록시, 치환체가 있거나 없는 알킬옥시, 치환체가 있거나 없는 아릴옥시, 치환체가 있거나 없는 아미노 중에서 선택되며;
    B1, B2, ……, Bn -1 그리고 Bn은 아데닌, 티민, 구아닌, 시토신, 그리고 우라실을 포함하는 천연 핵산염기 및 비천연 핵산염기 중에서 각각 독립적으로 선택되며; 그리고,
    B1, B2, ……, Bn -1 그리고 Bn 중 최소한 네 개는, 화학식 Ⅱ, 화학식 Ⅲ, 또는 화학식 Ⅳ로 대표되는 비천연 핵산염기다:
    Figure pat00035
    [화학식 II]
    Figure pat00036
    [화학식 III]
    Figure pat00037
    [화학식 IV]
    화학식 Ⅱ, Ⅲ 및 Ⅳ 중에서,
    R1, R2, R3, R4, R5 그리고 R6는 수소 또는 치환체가 있거나 없는 알킬 중에서 각자 독립적으로 선택되며; 그리고,
    L1, L2 그리고 L3는 화학식 V로 대표되는 공유결합성 링커이며, 염기성 아민과 핵산염기를 연결시켜 준다:

    Figure pat00038
    [화학식 Ⅴ]
    화학식(V) 중에서,
    Q1과 Qm은 치환체가 있거나 없는 메틸렌이고, Qm은 염기성 아민에 연결되며;
    Q2, Q3, … 그리고 Qm -1은 치환체가 있거나 없는 메틸렌, 산소(-O-), 황(-S-), 치환체가 있거나 없는 아미노 중에서 각자 독립적으로 선택되며; 그리고,
    m 은 1과 15 사이의 정수이다.
  3. 제 2항에 있어서, 다음의 조건을 만족하는 펩타이드 핵산 유도체 혹은 이의 약제학적으로 허용 가능한 염:
    화학식 I 중에서,
    n은 11과 16 사이의 정수이며;
    화학식 I의 화합물은 인간의 ACC2 프리-mRNA에서 18개의 염기로 이루어진 [(5'
    Figure pat00039
    3') GGCCAUUUCGUCAGUAUC] 서열과 최소한 10개 이상의 상보적인 결합을 하며;
    화학식 I의 화합물 전체가, 인간의 ACC2 프리-mRNA와 완전히 상보적인 결합을 하며;
    S1, S2, ……, Sn -1, Sn, T1, T2, ……, Tn -1 그리고 Tn은 수소이며;
    X와 Y는 수소, 치환체가 있거나 없는 알킬아실, 치환체가 있거나 없는 알킬옥시카보닐 중에서 각자 독립적으로 선택되며;
    Z는 치환체가 있거나 없는 아미노이며;
    B1, B2, ……, Bn -1 그리고 Bn은 아데닌, 티민, 구아닌, 시토신, 그리고 우라실을 포함하는 천연 핵산염기 및 비천연 핵산염기 중에서 각각 독립적으로 선택되며; 그리고,
    B1, B2, ……, Bn -1 그리고 Bn 중 최소한 다섯 개는, 화학식 Ⅱ, 화학식 Ⅲ, 또는 화학식 Ⅳ로 대표되는 비천연 핵산염기이며;
    R1, R2, R3, R4, R5 그리고 R6는 수소이며;
    Q1과 Qm은 메틸렌이고, Qm은 염기성 아민에 연결되며;
    Q2, Q3, …, 그리고 Qm -1은 메틸렌, 산소 중에서 각자 독립적으로 선택되며; 그리고,
    m 은 1과 9 사이의 정수이다.
  4. 제 3항에 있어서, 다음의 조건을 만족하는 펩타이드 핵산 유도체 혹은 이의 약제학적으로 허용 가능한 염:
    화학식 I 중에서,
    n은 11과 16 사이의 정수이며;
    화학식 I의 화합물은 인간의 ACC2 프리-mRNA에서 18개의 염기로 이루어진 [(5'
    Figure pat00040
    3') GGCCAUUUCGUCAGUAUC] 서열과 최소한 10개 이상의 상보적인 결합을 하며;
    화학식 I의 화합물 전체가, 인간의 ACC2 프리-mRNA와 완전히 상보적인 결합을 하며;
    S1, S2, ……, Sn -1, Sn, T1, T2, ……, Tn -1 그리고 Tn은 수소이며;
    X는 수소이며;
    Y는 치환체가 있거나 없는 알킬옥시카보닐이며;
    Z는 치환체가 있거나 없는 아미노이며;
    B1, B2, ……, Bn -1 그리고 Bn은 아데닌, 티민, 구아닌, 시토신, 그리고 우라실을 포함하는 천연 핵산염기 및 비천연 핵산염기 중에서 각각 독립적으로 선택되며; 그리고,
    B1, B2, ……, Bn -1 그리고 Bn 중 최소한 다섯 개는, 화학식 Ⅱ, 화학식 Ⅲ, 또는 화학식 Ⅳ로 대표되는 비천연 핵산염기이며;
    R1, R2, R3, R4, R5 그리고 R6는 수소이며;
    L1은 -(CH2)2-O-(CH2)2-, -CH2-O-(CH2)2-, -CH2-O-(CH2)3-, -CH2-O-(CH2)4-, 혹은 -CH2-O-(CH2)5- 이며; 그리고,
    L2와 L3는 -(CH2)2-O-(CH2)2-, -(CH2)3-O-(CH2)2-, -(CH2)2-O-(CH2)3-, -(CH2)2-, -(CH2)3-, -(CH2)4-, -(CH2)5-, -(CH2)6-, -(CH2)7-, 그리고 -(CH2)8- 중에서 각자 독립적으로 선택된다.
  5. 제 4항에 있어서, 다음 식의 펩타이드 핵산 유도체 혹은 이의 약제학적으로 허용 가능한 염:
    (N→C) Fethoc-CTG(6)-ACG(6)-AA(5)A-TG(6)G-C(1O2)C-NH2;
    (N→C) Fethoc-TA(5)C(1O2)-TGA(5)-CGA(5)-AA(5)T-G(6)GC(1O2)-C-NH2;
    (N→C) Fethoc-TA(5)C-TG(5)A-C(1O2)GA(5)-AA(5)T-G(5)G-NH2;
    (N→C) Fethoc-AC(1O2)T-GA(5)C-GA(5)A-A(5)TG(5)-GC(1O2)-NH2;
    (N→C) Fethoc-CTG(6)-AC(1O2)G-A(5)AA(5)-TG(6)G-NH2;
    (N→C) Fethoc-CTG(6)-AC(1O2)G-A(5)AA(5)-TG(6)G-C(1O2)C-NH2;
    상기 식에서,
    A, T, G, 그리고 C는 각각 천연 핵산염기인 아데닌, 티민, 구아닌, 그리고 시토신을 포함하는 펩타이드 핵산 모노머이며;
    C(pOq), A(p)와 G(p)는 각각 화학식 VI, 화학식 VII과 화학식 VIII로 대표되는, 비천연 핵산염기로 변형된 시토신, 아데닌과 구아닌을 포함하는 펩타이드 핵산 모노머이다:
    Figure pat00041
    [화학식 VI]
    Figure pat00042
    [화학식 VII]
    Figure pat00043
    [화학식 VIII]
    화학식 VI, 화학식 VII과 화학식 VIII에서,
    p와 q는 정수인데, 상기 식의 PNA 유도체 중에서 (N→C) Fethoc-AC(1O2)T-GA(5)C-GA(5)A-A(5)TG(5)-GC(1O2)-NH2에서는 p가 1 또는 5에 해당되고 q가 2에 해당되며; 그리고,
    약자인 "Fethoc-"는 "[2-(9-플루오레닐)에틸-1-옥시]카보닐"을 의미한다.
  6. 제 1항의 펩타이드 핵산 유도체 혹은 이의 약제학적으로 허용 가능한 염을 투여하는 것을 포함하는, 인간 ACC2 유전자의 전사에 관련된 징후 또는 증상을 개선하기 위한 사용 방법.
  7. 제 1항의 펩타이드 핵산 유도체 혹은 이의 약제학적으로 허용 가능한 염을 투여하는 것을 포함하는, 피부 노화를 개선하기 위한 사용 방법.
  8. 제 1항의 펩타이드 핵산 유도체 혹은 이의 약제학적으로 허용 가능한 염을 포함하는, 인간 ACC2 유전자 전사 관련 징후 또는 증상 개선용 약학 조성물.
  9. 제 1항의 펩타이드 핵산 유도체 혹은 이의 약제학적으로 허용 가능한 염을 포함하는, 인간 ACC2 유전자 전사 관련 징후 또는 증상 개선용 화장품.
  10. 제 1항의 펩타이드 핵산 유도체 혹은 이의 약제학적으로 허용 가능한 염을 포함하는, 피부 노화 개선용 약학 조성물.
  11. 제 1항의 펩타이드 핵산 유도체 혹은 이의 약제학적으로 허용 가능한 염을 포함하는, 피부 노화 개선용 화장품.
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