KR20180056701A - 패스트-오프 레이트 혈청 알부민 결합 피브로넥틴 유형 iii 도메인 - Google Patents

패스트-오프 레이트 혈청 알부민 결합 피브로넥틴 유형 iii 도메인 Download PDF

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KR20180056701A
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스탠리 리차드 주니어 크리스텍
트레이시 에스. 미첼
마이클 엘. 고셀린
다사 리포브섹
주히 주네자
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브리스톨-마이어스 스큅 컴퍼니
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Abstract

혈청 알부민에 결합하는 제10 피브로넥틴 유형 III 도메인 (10Fn3)을 포함하는 폴리펩티드가 본원에 제공된다. 진단 및 치료 용도에 사용하기 위한 이종 단백질에 연결된 혈청 알부민 결합 10Fn3을 포함하는 융합 분자가 또한 제공된다.

Description

패스트-오프 레이트 혈청 알부민 결합 피브로넥틴 유형 III 도메인
본 출원은 2015년 9월 23일에 출원된 미국 가출원 번호 62/222,508을 우선권 주장하며, 그 내용은 본원에 참조로 구체적으로 포함된다. 본 명세서 전반에 걸쳐 인용된 임의의 특허, 특허 출원, 및 참고문헌의 내용은 그 전문이 본원에 참조로 포함된다.
치료제의 부적합한 반감기는 종종 치료 효과에 필요한 혈청 수준을 유지하기 위해, 높은 빈도 및/또는 보다 높은 용량에서의 그의 투여, 또는 지속 방출 제제의 사용을 필요로 한다. 그러나, 이는 종종 부정적 부작용과 연관된다. 부적합한 반감기를 극복하기 위한 하나의 전략은 치료제를 반감기-연장 폴리펩티드에 융합시키는 것이다. 하지만, 반감기의 연장이 유익할 수 있는 반면에, 과도하게 안정화된 치료제는 또한 부정적 부작용을 유발할 수 있다. 따라서, 치료제의 반감기를 미세 조정하는 능력은 유익할 수 있다. 본 출원은 다양한 치료제의 혈청 반감기를 미세 조정하는 화합물 및 그를 생성하는 방법을 제공한다.
본 발명은, 적어도 부분적으로, 융합 파트너 (예를 들어, 치료 폴리펩티드)의 반감기를 제어하는 데 있어서 다용성을 제공하는 신규 인간 혈청 알부민 (HSA) 결합 피브로넥틴 유형 III 제10 (10Fn3) 도메인의 개발에 기초한다.
한 측면에서, 10Fn3 도메인을 포함하는 폴리펩티드가 본원에 제공되며, 여기서 10Fn3 도메인은 1 μM 이하의 KD로 HSA에 결합하고 AB, BC, CD, DE, EF, 및 FG 루프를 포함하고, 여기서 서열식별번호(SEQ ID NO): 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 CD 및 FG 루프에 비해, CD 루프는 1, 2, 또는 3개의 아미노산 치환을 갖고, FG 루프는 임의로 1, 2, 또는 3개의 아미노산 치환을 갖고, 여기서 10Fn3 도메인에 연결된 모이어티 (예를 들어, 폴리펩티드)의 혈청 반감기는 10Fn3 도메인에 연결되지 않은 모이어티의 것에 비해 연장된다.
특정 실시양태에서, 폴리펩티드는 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 오프-레이트(off-rate) (kd) 초과의 kd로 HSA에 결합한다. 특정 실시양태에서, 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 오프-레이트에 대한 폴리펩티드의 오프-레이트의 비는 적어도 약 3이다. 특정 실시양태에서, 비는 적어도 약 25이다. 특정 실시양태에서, 비는 적어도 약 25이다. 특정 실시양태에서, 비는 적어도 약 50이다.
특정 실시양태에서, 폴리펩티드는 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 온-레이트(on-rate) (ka)의 한 자릿수 내 (즉, 10-배 내)에 있는 ka로 HSA에 결합한다.
특정 실시양태에서, CD 루프는 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 상응하는 CD 루프에 비해 1 또는 2개의 아미노산 치환을 갖는다. 특정 실시양태에서, FG 루프는 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 FG 루프에 비해 1개의 아미노산 치환을 갖는다. 특정 실시양태에서, 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 CD 루프 및 FG 루프에 비해 CD 루프는 1개의 아미노산 치환을 갖고 FG 루프는 1개의 치환을 갖는다.
특정 실시양태에서, 10Fn3 도메인의 CD 루프는 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 상응하는 CD 루프에 비해 1 또는 2개의 아미노산 치환을 가지며, 여기서 1 또는 2개의 치환은
(i) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 2의 아르기닌 (R)이 D, E, A, Q, 또는 N으로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
(ii) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 5의 글루타민 (Q)이 D로 치환된 것;
(iii) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 7의 티로신 (Y)이 S 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
(iv) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 10의 류신 (L)이 S, T, 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
(v) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 13의 류신 (L)이 D, S, 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
(vi) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 14의 티로신 (Y)이 A 또는 T로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
(vii) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 15의 이소류신 (I)이 D, S, 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것; 및
(viii) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 16의 티로신 (Y)이 Q, E, S, 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것
으로 이루어진 군으로부터 선택된다.
특정 실시양태에서, 10Fn3 도메인은 상기 기재된 바와 같이, 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 상응하는 CD 루프에 비해 1 또는 2개의 아미노산 치환을 갖고/거나, 10Fn3 도메인은 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 상응하는 FG 루프에 비해 1개의 아미노산 치환을 갖는다. 특정 실시양태에서, FG 루프 (서열식별번호: 29)의 위치 12의 리신 (K)은 A, T, 또는 S로부터 선택된 아미노산으로 치환된다.
특정 실시양태에서, 폴리펩티드는 서열식별번호: 23-27, 30-34, 36-40, 42-46, 48, 49, 51, 52, 54, 55, 57, 58, 60, 61, 62, 63, 65-68, 70, 71, 73-76, 78, 79, 81-84, 86, 87, 89-98, 100-109, 및 111-118 중 어느 하나의 비-CD 루프 영역과 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하고, 임의로 단 서열은 ADX_2629_E06의 것이 아니다. 특정 실시양태에서, 폴리펩티드는 서열식별번호: 30-34, 36-40, 42-46, 48, 49, 51, 52, 54, 55, 57, 58, 60, 61, 62, 63, 65-68, 70, 71, 73-76, 78, 79, 81-84, 86, 87, 89-98, 100-109, 및 111-118 중 어느 하나와 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하고, 임의로 단 서열은 ADX_2629_E06의 것이 아니다.
특정 실시양태에서, 10Fn3 도메인은 HSA의 도메인 I-II에 결합한다.
특정 실시양태에서, 본원에 기재된 폴리펩티드는 이종 단백질, 예컨대 치료 모이어티 (예를 들어, 10Fn3 도메인)를 추가로 포함한다.
특정 측면에서, 본원에 기재된 바와 같은 HSA 결합 10Fn3 도메인 중 어느 것을 포함하는 폴리펩티드 또는 이를 포함하는 융합 폴리펩티드, 및 담체 (예를 들어, 제약상 허용되는 담체)를 포함하는 조성물 (예를 들어, 제약 조성물)이 본원에 제공된다.
특정 측면에서, 본원에 기재된 바와 같은 HSA 결합 10Fn3 도메인 중 어느 하나를 코딩하거나 (예를 들어, 서열식별번호: 30-34, 36-40, 42-46, 48, 49, 51, 52, 54, 55, 57, 58, 60, 61, 62, 63, 65-68, 70, 71, 73-76, 78, 79, 81-84, 86, 87, 89-98, 100-109, 및 111-118 중 어느 하나를 코딩하는 단리된 핵산) 또는 이를 포함하는 융합 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산, 그를 포함하는 발현 벡터, 및 핵산 분자를 포함하는 세포가 본원에 제공된다.
특정 측면에서, 본원에 기재된 바와 같은 HSA 결합 10Fn3 도메인 또는 이를 포함하는 융합 폴리펩티드를 생산하는 방법이 본원에 제공되며, 이는 그를 코딩하는 핵산 분자를 포함하는 세포를 10Fn3 도메인 또는 융합 폴리펩티드를 발현시키는 데 적합한 조건 하에 배양하고, 그를 정제하는 것을 포함한다.
특정 측면에서, 모이어티에 본원에 기재된 HSA 결합 10Fn3 도메인을 연결시키는 것을 포함하는, 모이어티의 반감기를 증진시키는 방법이 본원에 제공된다.
도 1 및 2는 결합의 오프-레이트의 차이를 설명하기 위해 해리 단계의 시작에서 정규화된, HSA에 대한 애드넥틴 결합의 SPR 센소그램이다.
도 3은 결합의 오프-레이트의 차이를 설명하기 위해 해리 단계의 시작에서 정규화된, HSA 및 마우스 혈청 알부민 (MSA)에 대한 추가의 애드넥틴 결합의 SPR 센소그램을 제시한다.
도 4a-4d는 HSA, MSA, 래트 혈청 알부민 (래트 SA), 및 시노몰구스 혈청 알부민 (시노 SA)에 대한 친화도를 결정하기 위한 모 애드넥틴 (ADX_7016_A01; PKE2), 및 7016_C03, 7016_E02, 및 7016_G01 애드넥틴의 SPR 동역학적 데이터이다.
도 5는 모 애드넥틴 (ADX_7016_A01; PKE2), 및 7016_C03, 7016_E02, 및 7016_G01 애드넥틴의 래트에서의 혈장 반감기를 도시하는 그래프이다.
도 6은 모 애드넥틴 (ADX_7016_A01; PKE2), 및 7016_C03, 7016_E02, 및 7016_G01 애드넥틴의 마우스에서의 혈장 반감기를 도시하는 그래프이다.
정의
달리 정의되지 않는 한, 본원에 사용된 모든 기술 과학 용어는 통상의 기술자에 의해 통상적으로 이해되는 것과 동일한 의미를 갖는다. 본원에 기재된 것과 유사하거나 또는 동등한 임의의 방법 및 조성물이 본 발명의 실시 또는 시험에 사용될 수 있지만, 바람직한 방법 및 조성물이 본원에 기재되어 있다.
본원에 사용된 바와 같은 "폴리펩티드"는 길이, 번역후 변형, 또는 기능에 관계없이, 2개 이상의 아미노산의 임의의 서열을 지칭한다. "폴리펩티드" 및 "펩티드"는 본원에 상호교환가능하게 사용된다. 폴리펩티드는 천연 아미노산 및 비-천연 아미노산 예컨대 본원에 참조로 포함된 미국 특허 번호 6,559,126에 기재된 것을 포함할 수 있다. 폴리펩티드는 또한 다양한 표준 화학적 방식 중 어느 것으로 변형될 수 있다 (예를 들어, 아미노산은 보호기로 변형될 수 있거나; 카르복시-말단 아미노산은 말단 아미드 기로 제조될 수 있거나; 아미노-말단 잔기는, 예를 들어, 친지성을 증진시키는 기로 변형될 수 있거나; 또는 폴리펩티드는 안정성 또는 생체내 반감기를 증가시키도록 화학적으로 글리코실화되거나 또는 달리 변형될 수 있음). 폴리펩티드 변형은 폴리펩티드에 대한 또 다른 구조 예컨대 시클릭 화합물 또는 다른 분자의 부착을 포함할 수 있고 또한 1개 이상의 아미노산을 변경된 배위 (즉, R 또는 S; 또는, L 또는 D)로 함유하는 폴리펩티드를 포함할 수 있다.
본원에 사용된 바와 같은 "폴리펩티드 쇄"는 각각의 그의 도메인이 비-공유 상호작용 또는 디술피드 결합과 대조적으로 펩티드 결합(들)에 의해 다른 도메인(들)에 연결된 폴리펩티드를 지칭한다.
"단리된" 폴리펩티드는 그의 자연 환경의 성분으로부터 확인 및 분리 및/또는 회수된 것이다. 그의 자연 환경의 오염 성분은 폴리펩티드의 진단 또는 치료 용도를 방해하는 물질이고, 이는 효소, 호르몬, 및 다른 단백질성 또는 비단백질성 용질을 포함할 수 있다. 바람직한 실시양태에서, 폴리펩티드는 (1) 로우리 방법에 의해 결정 시 폴리펩티드의 95 중량% 초과, 및 가장 바람직하게는 99 중량% 초과까지, (2) 스피닝 컵 서열분석기를 사용하여 적어도 N-말단 또는 내부 아미노산 서열의 잔기를 수득하기에 충분한 정도까지, 또는 (3) 쿠마시 블루 또는, 바람직하게는, 은 염색을 사용하여 환원 또는 비환원 조건 하에 SDS-PAGE에 의해 균질할 때까지 정제될 것이다. 단리된 폴리펩티드는 폴리펩티드의 자연 환경의 적어도 1종의 성분이 존재하지 않을 것이기 때문에 재조합 세포 내의 계내 폴리펩티드를 포함한다. 그러나, 통상적으로, 단리된 폴리펩티드는 적어도 1회의 정제 단계에 의해 제조될 것이다.
본원에 사용된 바와 같은 "10Fn3 도메인" 또는 "10Fn3 모이어티" 또는 "10Fn3 분자"는 야생형 10Fn3 및 그의 생물학적 활성 변이체, 예를 들어, 표적, 예컨대 표적 단백질에 특이적으로 결합하는 생물학적 활성 변이체를 지칭한다. 야생형 인간 10Fn3 도메인은 서열식별번호: 1에 제시된 아미노산 서열을 포함할 수 있다. 야생형 인간 10Fn3 도메인의 생물학적 활성 변이체는 서열식별번호: 1을 포함하는 10Fn3 도메인에 비해, 적어도, 많게는 또는 약 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 30, 35, 40 또는 45개의 아미노산 변화, 즉, 치환, 부가 또는 결실을 포함하는 10Fn3 도메인을 포함한다.
본원에 사용된 바와 같은 10Fn3 도메인의 "영역"은 인간 10Fn3 도메인의 루프 (AB, BC, CD, DE, EF 및 FG), β-가닥 (A, B, C, D, E, F 및 G), N-말단 (서열식별번호: 1의 아미노산 잔기 1-8에 상응함), 또는 C-말단 (서열식별번호: 1의 아미노산 잔기 93-94에 상응함)을 지칭한다.
"노스 폴 루프(north pole loop)"는 피브로넥틴 인간 피브로넥틴 유형 3 제10 (10Fn3) 도메인의 BC, DE 및 FG 루프 중 어느 하나를 지칭한다.
"사우스 폴 루프(south pole loop)"는 피브로넥틴 인간 피브로넥틴 유형 3 제10 (10Fn3) 도메인의 AB, CD 및 EF 루프 중 어느 하나를 지칭한다.
본원에 사용된 바와 같은 "애드넥틴"은 관심 표적에 특이적으로 결합하도록 변형된 10Fn3 도메인을 지칭한다.
"스캐폴드 영역"은 인간 10Fn3 도메인의 임의의 비-루프 영역을 지칭한다. 스캐폴드 영역은 A, B, C, D, E, F 및 G β-가닥뿐만 아니라 N-말단 영역 (서열식별번호: 1의 잔기 1-8에 상응하는 아미노산) 및 C-말단 영역 (서열식별번호: 1의 잔기 93-94에 상응하고 임의로 인간 피브로넥틴의 Fn3 도메인의 제10 및 제11 반복부 사이에 천연 링커를 구성하는 7개의 아미노산을 포함하는 아미노산)을 포함한다.
본원에서 "퍼센트 (%) 아미노산 서열 동일성"은 서열을 정렬하고 필요한 경우에 갭을 도입하여 최대 퍼센트 서열 동일성을 달성하고, 서열 동일성의 일부로서 어떠한 보존적 치환도 고려하지 않은 후, 선택된 서열 내의 아미노산 잔기와 동일한 후보 서열 내의 아미노산 잔기의 백분율로서 정의된다. 퍼센트 아미노산 서열 동일성을 결정하기 위한 정렬은 관련 기술분야 기술 내에 있는 다양한 방식으로, 예를 들어, 공중 이용가능한 컴퓨터 소프트웨어 예컨대 BLAST, BLAST-2, ALIGN, ALIGN-2 또는 메갈라인(Megalign) (DNASTAR) 소프트웨어를 사용하여 달성될 수 있다. 관련 기술분야의 통상의 기술자는 비교되는 서열의 전장에 걸쳐 최대 정렬을 달성하는 데 필요한 임의의 알고리즘을 포함하는, 정렬을 측정하기 위한 적절한 파라미터를 결정할 수 있다. 그러나, 본원의 목적을 위해, % 아미노산 서열 동일성 값은 하기 기재된 바와 같이 서열 비교 컴퓨터 프로그램 ALIGN-2를 사용함으로써 수득된다. ALIGN-2 서열 비교 컴퓨터 프로그램은 제넨테크, 인크.(Genentech, Inc.) 소유로서, 미국 저작권청 (워싱턴 D.C., 20559)에 사용자 문서로 제출되어 있고, 미국 저작권 등록 번호 TXU510087 하에 등록되어 있고, 제넨테크, 인크. (캘리포니아주 사우스 샌프란시스코)를 통해 공중 이용가능하다. ALIGN-2 프로그램은 UNIX 작동 시스템, 바람직하게는 디지털 UNIX V4.0D 상의 사용을 위해 컴파일링되어야 한다. 모든 서열 비교 파라미터는 ALIGN-2 프로그램에 의해 설정되고 달라지지 않는다.
본원의 목적을 위해, 주어진 아미노산 서열 B에 대한, B와의, 또는 B 대비 주어진 아미노산 서열 A의 % 아미노산 서열 동일성 (대안적으로 주어진 아미노산 서열 B에 대한, B와의, 또는 B 대비 특정 % 아미노산 서열 동일성을 갖거나 또는 포함하는 주어진 아미노산 서열 A라는 어구로 기재될 수 있음)은 하기와 같이 계산된다: 100 x 분율 X/Y (여기서 X는 서열 정렬 프로그램 ALIGN-2에 의해 A 및 B의 프로그램의 정렬 시 동일한 매치로 점수화된 아미노산 잔기의 수이고, Y는 B 내의 아미노산 잔기의 총수임). 아미노산 서열 A의 길이가 아미노산 서열 B의 길이와 동일하지 않은 경우에, B에 대한 A의 % 아미노산 서열 동일성은 A에 대한 B의 % 아미노산 서열 동일성과 동일하지 않을 것으로 인지될 것이다.
본원에 상호교환가능하게 사용된 용어 "특이적으로 결합한다", "특이적 결합", "선택적 결합", 및 "선택적으로 결합한다"는 HSA에 대한 친화도를 나타내지만, 관련 기술분야에 이용가능한 기술 예컨대, 비제한적으로, 스캐차드 분석 및/또는 경쟁적 결합 검정 (예를 들어, 경쟁 ELISA, 비아코어(BIACORE) 검정)에 의해 측정 시 상이한 폴리펩티드에 유의하게 결합하지 않는 (예를 들어, 약 10% 미만의 결합) 애드넥틴을 지칭한다. 용어는 또한 예를 들어, 본 발명의 애드넥틴의 결합 도메인이 HSA에 특이적인 경우에 적용가능하다.
폴리펩티드의 "반감기"는 일반적으로, 예를 들어 천연 메카니즘에 의한 폴리펩티드의 분해 및/또는 폴리펩티드의 클리어런스 또는 제거로 인해, 폴리펩티드의 혈청 농도가 생체내에서 50%만큼 감소하는 데 소요되는 시간으로서 정의될 수 있다. 반감기는 임의의 방식 그 자체로, 예컨대 약동학적 분석에 의해 결정될 수 있다. 적합한 기술은 관련 기술분야의 통상의 기술자에게 명백할 것이고, 예를 들어, 일반적으로 적합한 용량의 폴리펩티드를 영장류에게 투여하는 단계; 상기 영장류로부터 규칙적 간격으로 혈액 샘플 또는 다른 샘플을 수집하는 단계; 상기 혈액 샘플 중 폴리펩티드의 수준 또는 농도를 결정하는 단계; 및 이와 같이 수득된 데이터(의 플롯)로부터, 폴리펩티드의 수준 또는 농도가 투여 시 초기 수준과 비교하여 50%만큼 감소할 때까지의 시간을 계산하는 단계를 수반할 수 있다. 반감기를 결정하는 방법, 예를 들어, 문헌 [Kenneth et al., Chemical Stability of Pharmaceuticals: A Handbook for Pharmacists (1986); Peters et al., Pharmacokinetic analysis: A Practical Approach (1996); 및 "Pharmacokinetics", M Gibaldi & D Perron, published by Marcel Dekker, 2nd Rev. edition (1982)]에서 찾아볼 수 있다.
반감기는 파라미터 예컨대 t1/2-알파, t1/2-베타 및 곡선하 면적 (AUC)을 사용하여 표현될 수 있다. 본 명세서에서, "반감기의 증가"는 이들 파라미터 중 어느 1개, 이들 파라미터 중 어느 2개, 또는 3개의 모든 이들 파라미터의 증가를 지칭한다. 특정 실시양태에서, 반감기의 증가는 t1/2-알파 및/또는 AUC 또는 둘 다의 증가를 동반하거나 또는 동반하지 않는 t1/2-베타의 증가를 지칭한다.
단백질에 대한 애드넥틴 결합과 관련하여 본원에 사용된 용어 "KD"는 표면 플라즈몬 공명 검정 또는 세포 결합 검정을 사용하여 측정 시 특정한 애드넥틴-단백질 상호작용의 해리 평형 상수 또는 애드넥틴의 단백질 (예를 들어, HSA)에 대한 친화도를 지칭한다. 본원에 사용된 바와 같은 "목적하는 KD"는 고려되는 목적에 충분한 애드넥틴의 KD를 지칭한다. 예를 들어, 목적하는 KD는 시험관내 검정, 예를 들어, 세포-기반 루시페라제 검정에서 기능적 효과를 도출하는 데 요구되는 애드넥틴의 KD를 지칭할 수 있다.
용어 "kass", "k온", 및 "ka"는 본원에 상호교환가능하게 사용되고, 애드넥틴의 애드넥틴/단백질 복합체로의 회합에 대한 회합률 상수를 지칭한다.
용어 "kdiss", "k오프", 및 "kd"는 본원에 상호교환가능하게 사용되고, 애드넥틴/단백질 복합체로부터의 애드넥틴의 해리에 대한 해리율 상수를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "IC50"은 시험관내 또는 생체내 검정에서 최대 억제 반응의 50%인 수준까지, 즉, 최대 억제 반응과 비처리된 반응 사이의 절반으로 반응을 억제하는 애드넥틴의 농도를 지칭한다.
용어 "치료 유효량"은 포유동물에서 질환 또는 장애를 치료하고/거나 장애와 연관된 증상 중 1종 이상을 어느 정도까지 완화시키는 데 유효한 약물의 양을 지칭한다.
본원에 사용된 바와 같은 질환 또는 장애를 "예방하는"은 비처리된 대조군 샘플에 비해 통계적 샘플에서 질환-상태의 발생 확률을 감소시키거나, 또는 비처리된 대조군 샘플에 비해 질환 또는 장애의 1종 이상의 발병을 지연시키거나 또는 그의 증상의 중증도를 감소시키는 것을 지칭한다. 환자는 일반 인구와 비교하여 임상 질환 상태를 앓게 될 위험을 증가시키는 것으로 공지된 인자에 기초하여 예방적 요법을 위해 선택될 수 있다.
본원에 사용된 용어 "치료하는"은 (a) 질환-상태를 억제하는 것, 즉, 그의 발생을 정지시키는 것; 및/또는 (b) 질환-상태를 완화시키는 것, 즉, 이미 확립된 질환 상태의 퇴행을 유발하는 것을 포함한다.
본원에 사용된 용어 "약"은 열거된 값의 ±10%를 의미한다.
개관
본원에 기재된 신규 피브로넥틴-기반 스캐폴드 폴리펩티드는 HSA에 결합하고 추가의 분자(들), 예컨대 상이한 표적에 결합하는 다른 10Fn3 도메인, 또는 증가된 반감기가 유익한 폴리펩티드에 커플링될 수 있다.
A. 인간 혈청 알부민 결합 10Fn3 도메인
Fn3은 피브로넥틴으로부터의 유형 III 도메인을 지칭한다. Fn3 도메인은 소형이고, 단량체이고, 가용성이고, 안정하다. 이는 디술피드 결합이 결여되고, 따라서, 환원 조건 하에 안정하다. Fn3의 전체 구조는 이뮤노글로불린 폴드와 유사하다. Fn3 도메인은, N-말단으로부터 C-말단으로의 순서로, 베타 또는 베타-유사 가닥, A; 루프, AB; 베타 또는 베타-유사 가닥, B; 루프, BC; 베타 또는 베타-유사 가닥, C; 루프, CD; 베타 또는 베타-유사 가닥, D; 루프, DE; 베타 또는 베타-유사 가닥, E; 루프, EF; 베타 또는 베타-유사 가닥, F; 루프, FG; 및 베타 또는 베타-유사 가닥, G를 포함한다. 7개의 역평행 β-가닥은 베타 또는 베타-유사 가닥을 연결하는 루프로 구성된 2개의 "면"을 생성하면서, 안정한 코어를 형성하는 2개의 베타 시트로서 배열된다. 루프 AB, CD, 및 EF는 1개의 면 ("사우스 폴")에 위치하고 루프 BC, DE, 및 FG는 대향 면 ("노스 폴")에 위치한다. 루프 AB, BC, CD, DE, EF 및 FG 중 어느 것 또는 모두는 리간드 결합에 참여할 수 있다. 적어도 15개의 상이한 Fn3 모듈이 인간 피브로넥틴에 존재하고, 모듈 사이의 서열 상동성은 낮은 반면에, 이들은 모두 3차 구조에 있어서 높은 유사성을 공유한다.
특정 실시양태에서, Fn3 도메인은 인간 피브로넥틴 유형 III 도메인의 야생형 제10 모듈 (10Fn3)로부터 유래된 Fn3 도메인이다:
Figure pct00001
(AB, CD, 및 EF 루프는 밑줄로 표시되고, BC, DE, 및 FG 루프는 볼드체로 표시됨).
특정 실시양태에서, 10Fn3의 비-리간드 결합 서열은 변경될 수 있으며, 단 10Fn3은 리간드 결합 기능 및/또는 구조적 안정성을 유지한다. 다양한 돌연변이체 10Fn3 스캐폴드가 보고되었다. 한 측면에서, Asp 7, Glu 9, 및 Asp 23 중 1개 이상은 또 다른 아미노산, 예컨대, 예를 들어, 비-음으로 하전된 아미노산 잔기 (예를 들어, Asn, Lys 등)에 의해 대체된다. 이들 돌연변이는 야생형 형태와 비교하여 중성 pH에서 돌연변이체 10Fn3의 보다 큰 안정성을 촉진하는 효과를 갖는 것으로 보고되었다 (예를 들어, PCT 공개 번호 WO 02/04523 참조). 유익하거나 또는 중성인 10Fn3 스캐폴드에서의 다양한 추가의 변경이 개시되었다. 예를 들어, 문헌 [Batori et al., Protein Eng 2002;15:1015-20; Koide et al., Biochemistry, 2001;40:10326-33]을 참조한다.
변이체 및 야생형 10Fn3 단백질 둘 다는 동일한 구조, 즉 A 내지 G로 지정된 7개의 베타-가닥 도메인 서열 및 7개의 베타-가닥 도메인 서열을 연결하는 6개의 루프 영역 (AB 루프, BC 루프, CD 루프, DE 루프, EF 루프, 및 FG 루프)을 특징으로 한다. N- 및 C-말단에 가장 근접하게 위치하는 베타 가닥은 용액 중에서 베타-유사 입체형태를 채택할 수 있다. 서열식별번호: 1에서, AB 루프는 잔기 14-17에 상응하고, BC 루프는 잔기 23-31에 상응하고, CD 루프는 잔기 37-47에 상응하고, DE 루프는 잔기 51-56에 상응하고, EF 루프는 잔기 63-67에 상응하고, FG 루프는 잔기 75-87에 상응한다. 많은 가변성은 일반적으로 1개 이상의 루프에서 발생할 것이다. 그러나, 목적하는 표적에 대한 강한 친화도를 갖는 10Fn3 결합 도메인을 달성하기 위해 루프 영역 내의 모든 잔기가 변형될 필요는 없는 것으로 이해되어야 한다. 일부 실시양태에서, 단지 루프, 예를 들어, CD 루프 내의 잔기만이 고친화도 표적 결합 10Fn3 도메인을 생산하도록 변형된다.
10Fn3 폴리펩티드의 각각의 베타 또는 베타-유사 가닥은 서열식별번호: 1, 30-34, 36-40, 42-46, 48, 49, 51, 52, 54, 55, 57, 58, 60, 61, 62, 63, 65-68, 70, 71, 73-76, 78, 79, 81-84, 86, 87, 89-98, 100-109, 및 111-118 중 어느 하나의 상응하는 베타 또는 베타-유사 가닥의 서열과 적어도 80%, 85%, 90%, 95% 또는 100% 동일한 아미노산 서열로 본질적으로 이루어질 수 있으며, 단 이러한 변이는 생리학적 조건 하에 폴리펩티드의 안정성을 방해하지 않는다.
추가적으로, 루프 영역에서의 삽입 및 결실은 또한 여전히 HSA 결합 10Fn3 결합 도메인을 생산하면서 이루어질 수 있다. 따라서, 일부 실시양태에서, AB, BC, CD, DE, EF 및 FG로부터 선택된 1개 이상의 루프는 야생형 인간 10Fn3의 상응하는 루프에 비해 길이가 연장되거나 또는 단축될 수 있다. 임의의 주어진 폴리펩티드에서, 1개 이상의 루프는 길이가 연장될 수 있거나, 1개 이상의 루프는 길이가 감소될 수 있거나, 또는 이들이 조합될 수 있다. 특정 실시양태에서, 주어진 루프의 길이는 2-25, 2-20, 2-15, 2-10, 2-5, 5-25, 5-20, 5-15, 5-10, 10-25, 10-20, 또는 10-15개의 아미노산만큼 연장될 수 있다. 특정 실시양태에서, 주어진 루프의 길이는 1-15, 1-11, 1-10, 1-5, 1-3, 1-2, 2-10, 또는 2-5개의 아미노산만큼 감소될 수 있다.
특정 실시양태에서, 1μM 이하의 KD로 HSA에 특이적으로 결합하는 10Fn3 도메인을 포함하는 폴리펩티드가 본원에 제공되며, 여기서 10Fn3 도메인은 AB, BC, CD, DE, 및 FG 루프를 포함하고, 서열식별번호: 1의 인간 10Fn3 도메인 또는 서열식별번호: 23의 HSA 결합 10Fn3 도메인의 상응하는 루프의 서열에 비해 변경된 아미노산 서열을 갖는 CD 및 FG 루프로부터 선택된 적어도 1개의 루프를 갖는다. 일부 실시양태에서, CD 및 FG 루프는 변경된다. 특정 실시양태에서, 단지 CD 루프만이 변경된다. 특정 실시양태에서, 단지 FG 루프만이 변경된다. 특정 실시양태에서, 1개 이상의 특정한 스캐폴드 변경은 1개 이상의 루프 변경과 조합된다. "변경된"은 주형 서열 (즉, 상응하는 야생형 인간 피브로넥틴 도메인 또는 서열식별번호: 23에 제시된 10Fn3 도메인)에 비해 1개 이상의 아미노산 서열 변경을 의미하고 아미노산 부가, 결실, 및 치환을 포함한다.
특정 실시양태에서, 10Fn3 도메인은 노스 및 사우스 폴 루프 변경의 조합을 갖는다. 예를 들어, 루프 CD 및 FG 중 1개 이상은, 루프 AB, BC, DE, 및 EF 중 1개 이상과 조합되어, 서열식별번호: 1의 인간 10Fn3 도메인 또는 서열식별번호: 23의 HSA 결합 10Fn3 도메인의 상응하는 루프에 비해 변경될 수 있다.
특정 실시양태에서, 폴리펩티드는 서열식별번호: 30-34, 36-40, 42-46, 48, 49, 51, 52, 54, 55, 57, 58, 60, 61, 62, 63, 65-68, 70, 71, 73-76, 78, 79, 81-84, 86, 87, 89-98, 100-109, 및 111-118 중 어느 하나의 비-루프 영역 및/또는 비-변형된 루프 영역과 적어도 80, 85, 90, 95, 98, 99, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인을 포함하며, 여기서 AB, BC, CD, DE, EF, 또는 FG로부터 선택된 적어도 1개의 루프는 변경된다. 예를 들어, 특정 실시양태에서, 서열식별번호: 30-34, 36-40, 42-46, 48, 49, 51, 52, 54, 55, 57, 58, 60, 61, 62, 63, 65-68, 70, 71, 73-76, 78, 79, 81-84, 86, 87, 89-98, 100-109, 및 111-118의 상응하는 AB, BC, CD, DE, EF, 및/또는 FG 루프에 비해, AB 루프는 최대 4개의 아미노산 치환, 최대 10개의 아미노산 삽입, 최대 3개의 아미노산 결실, 또는 그의 조합을 가질 수 있고/거나; BC 루프는 최대 9개의 아미노산 치환, 최대 4개의 아미노산 삽입, 최대 3개의 아미노산 결실, 또는 그의 조합을 가질 수 있고/거나; CD 루프는 최대 6개의 아미노산 치환, 최대 10개의 아미노산 삽입, 최대 4개의 아미노산 결실, 또는 그의 조합을 가질 수 있고/거나; DE 루프는 최대 6개의 아미노산 치환, 최대 10개의 아미노산 삽입, 최대 4개의 아미노산 결실, 또는 그의 조합을 가질 수 있고/거나; EF 루프는 최대 5개의 아미노산 치환, 최대 10개의 아미노산 삽입, 최대 3개의 아미노산 결실, 또는 그의 조합을 가질 수 있고/거나; FG 루프는 최대 12개의 아미노산 치환, 최대 11개의 아미노산 결실, 최대 25개의 아미노산 삽입, 또는 그의 조합을 가질 수 있다.
일부 실시양태에서, 인테그린-결합 모티프 "아르기닌-글리신-아스파르트산" (RGD) (서열식별번호: 1의 아미노산 78-80)의 1개 이상의 잔기는 인테그린 결합을 방해하도록 치환될 수 있다. 일부 실시양태에서, 본원에 제공된 폴리펩티드의 FG 루프는 RGD 인테그린 결합 부위를 함유하지 않는다. 특정 실시양태에서, RGD 서열은 극성 아미노산-중성 아미노산-산성 아미노산 서열 (N-말단에서 C-말단 방향으로)에 의해 대체된다. 특정 실시양태에서, RGD 서열은 SGE로 대체된다. 다른 특정 실시양태에서, RGD 서열은 RGE로 대체된다.
특정 실시양태에서, 피브로넥틴 기반 스캐폴드 단백질은 일반적으로 하기 서열에 의해 정의되는 10Fn3 도메인을 포함한다:
Figure pct00002
서열식별번호: 2에서, AB 루프는 (X)u에 의해 나타내어지고, BC 루프는 (X)v에 의해 나타내어지고, CD 루프는 (X)w에 의해 나타내어지고, DE 루프는 (X)x에 의해 나타내어지고, EF 루프는 (X)y에 의해 나타내어지고 FG 루프는 Xz에 의해 나타내어진다. X는 임의의 아미노산을 나타내고 X에 이어지는 아래첨자는 아미노산의 수의 정수를 나타낸다. 특히, u, v, w, x, y 및 z는 각각 독립적으로 2-20, 2-15, 2-10, 2-8, 5-20, 5-15, 5-10, 5-8, 6-20, 6-15, 6-10, 6-8, 2-7, 5-7, 또는 6-7개의 아미노산 중 임의의 것일 수 있다. 베타 가닥의 서열 (밑줄로 표시됨)은 서열식별번호: 2에 제시된 상응하는 아미노산에 비해 모든 7개의 스캐폴드 영역에 걸쳐 0 내지 10, 0 내지 8, 0 내지 6, 0 내지 5, 0 내지 4, 0 내지 3, 0 내지 2, 또는 0 내지 1개의 치환, 결실 또는 부가 중 임의의 것을 가질 수 있다. 특정 실시양태에서, 베타 가닥의 서열은 서열식별번호: 2에 제시된 상응하는 아미노산에 비해 모든 7개의 스캐폴드 영역에 걸쳐 0 내지 10, 0 내지 8, 0 내지 6, 0 내지 5, 0 내지 4, 0 내지 3, 0 내지 2, 또는 0 내지 1개의 보존적 치환 중 임의의 것을 가질 수 있다. 특정 실시양태에서, 소수성 코어 아미노산 잔기 (상기 서열식별번호: 2 내의 볼드체로 표시된 잔기)는 고정되고, 임의의 치환, 보존적 치환, 결실 또는 부가는 소수성 코어 아미노산 잔기 이외의 잔기에서 발생한다. 일부 실시양태에서, 본원에 제공된 폴리펩티드의 소수성 코어 잔기는 야생형 인간 10Fn3 도메인 (서열식별번호: 1)에 비해 변형되지 않았다.
특정 측면에서, 본 출원은 HSA에 특이적으로 결합하여 10Fn3 도메인에 연결된 모이어티의 t1/2를 연장하는 사우스 폴 및/또는 노스 폴 변형을 갖는 10Fn3 도메인을 제공한다.
HSA는 인간에서 600 μM의 혈청 농도 및 19일의 t1/2를 갖는다. HSA의 연장된 t1/2는, 부분적으로, 신생아 Fc 수용체 (FcRn)를 통한 그의 재순환에 기인한다. HSA는 내피 세포 내로의 엔도솜 흡수 후 pH-의존성 방식으로 FcRn에 결합하고; 이 상호작용은 HSA를 다시 혈류 내로 재순환시켜, 이를 리소솜 분해로부터 회피시킨다. FcRn은 광범위하게 발현되고 재순환 경로는 구성적인 것으로 여겨진다. 대부분의 세포 유형에서, 대부분의 FcRn은 세포내 분류 엔도솜 내에 존재한다. HSA는 유체 상 음세포작용의 비특이적 메카니즘에 의해 용이하게 내재화되고 FcRn에 의해 리소솜에서의 분해로부터 구출된다. 엔도솜에서 발견되는 산성 pH에서, FcRn에 대한 HSA의 친화도는 증가한다 (pH 6.0에서 5 μM). FcRn에 결합되면, HSA는 리소솜 분해 경로로부터 벗어나고, 세포통과하고 세포 표면에서 방출된다.
노스 폴-기반 HSA 결합 애드넥틴은 "제1 세대" 혈청 알부민 결합 애드넥틴으로 지칭되고, 예를 들어, WO2011140086에 기재되어 있다. 그 중 일부가 마우스 또는 래트 혈청 알부민에 결합하지 않고, 종에 걸쳐 혈청 알부민에 대해 고친화도를 갖지 않고, 다가 10Fn3-기반 플랫폼에 항상 상용성이 아닌 제1 세대 노스 폴-기반 혈청 알부민 결합 애드넥틴 (SABA)을 개선시키기 위해, 변형된 사우스 폴 루프를 갖는 제2 세대 사우스 폴-기반 HSA 결합 애드넥틴 (PKE2 애드넥틴)이 개발되었다 (그 전문이 본원에 참조로 구체적으로 포함된 PCT/US15/21535 참조). 1개의 이러한 애드넥틴은 HSA의 도메인 I-II에 결합하고 하기 코어 서열을 갖는 ADX_7016_A01 (제2 세대 PKE2 애드넥틴)이다:
Figure pct00003
(서열식별번호: 23; CD 및 FG 루프는 밑줄로 표시됨)
ADX_7016_A01은 낮은 면역원성을 갖고 약 3-6 nM의 KD로 HSA에 결합한다. ADX_7016_A01에 융합된 이종 10Fn3 도메인을 포함하는 융합 폴리펩티드는 마우스에서 약 82시간의 반감기를 갖는다. ADX_7016_A01이 실질적으로 융합 파트너의 반감기를 연장하는 반면에, 특정 상황은 융합 파트너가 ADX_7016_A01에 의해 부여되는 반감기보다 더 짧은 반감기를 갖도록 요구할 수 있다.
따라서, HSA에 결합하는 10Fn3 도메인을 포함하는 폴리펩티드가 본원에 제공되며, 여기서 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 CD 및 FG 루프에 비해 10Fn3 도메인의 CD 및/또는 FG 루프는 1, 2, 또는 3개의 아미노산 치환을 갖고, FG 루프는 임의로 1, 2, 또는 3개의 아미노산 치환을 갖고, 여기서 10Fn3 도메인에 연결된 모이어티 (예를 들어, 폴리펩티드)의 혈청 반감기는 10Fn3 도메인에 연결되지 않은 모이어티의 것에 비해 연장된다.
특정 실시양태에서, CD 루프는 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 상응하는 CD 루프에 비해 2개의 아미노산 치환을 갖는다.
특정 실시양태에서, CD 루프는 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 CD 루프에 비해 1개의 아미노산 치환을 갖는다.
특정 실시양태에서, FG 루프는 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 FG 루프에 비해 1개의 아미노산 치환을 갖는다.
특정 실시양태에서, 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 CD 루프 및 FG 루프에 비해 CD 루프는 1개의 아미노산 치환을 갖고 FG 루프는 1개의 치환을 갖는다.
특정 실시양태에서, 폴리펩티드는 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 오프-레이트 (kd) 초과의 kd로 HSA에 결합한다.
서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 오프-레이트 (kd) 초과의 kd를 갖는 10Fn3 도메인을 포함하는 폴리펩티드는 본원에서 "PKE3" 애드넥틴으로 지칭된다.
따라서, 1μM 이하의 KD로 HSA에 결합하는 10Fn3 도메인을 포함하는 폴리펩티드가 본원에 제공되며, 여기서 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 CD 및 FG 루프에 비해 10Fn3 도메인의 CD 및/또는 FG 루프는 1, 2, 또는 3개의 아미노산 치환을 갖고, FG 루프는 임의로 1, 2, 또는 3개의 아미노산 치환을 갖고, 여기서 10Fn3 도메인은 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 오프-레이트 (kd) 초과의 kd로 HSA에 결합하고, 여기서 폴리펩티드의 혈청 반감기는 10Fn3 도메인이 결여된 폴리펩티드에 비해 연장된다.
특정 실시양태에서, 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 오프-레이트에 대한 10Fn3 도메인의 오프-레이트의 비는 적어도 약 2, 예컨대 적어도 약 3, 적어도 약 4, 적어도 약 5, 적어도 약 6, 적어도 약 7, 적어도 약 8, 적어도 약 9, 적어도 약 10, 적어도 약 15, 적어도 약 20, 적어도 약 25, 적어도 약 30, 적어도 약 35, 적어도 약 40, 적어도 약 45, 적어도 약 50, 적어도 약 75, 적어도 약 100 또는 그 초과이다. 특정 실시양태에서, 비는 약 1, 약 2, 약 3, 약 4, 약 5, 약 6, 약 7, 약 8, 약 9, 약 10, 약 11, 약 12, 약 13, 약 14, 약 15, 약 16, 약 17, 약 18, 약 19, 약 20, 약 21, 약 22, 약 23, 약 24, 약 25, 약 26, 약 27, 약 28, 약 29, 약 30, 약 31, 약 32, 약 33, 약 34, 약 35, 약 36, 약 37, 약 38, 약 39, 약 40, 약 41, 약 42, 약 43, 약 44, 약 45, 약 46, 약 47, 약 48, 약 49, 약 50, 약 51, 약 52, 약 53, 약 54, 약 55, 약 56, 약 57, 약 58, 약 59, 또는 약 60이다. 특정 실시양태에서, 비는 1.0, 1.1, 1.2, 3.3, 3.9, 4.0, 4.1, 4.8, 5.0, 5.6, 6.5, 6.6, 8, 11, 14, 17, 20, 23, 28, 28.9, 30.3, 32.0, 34.0, 34.3, 37.3, 50.0, 52, 52.7, 53.0, 56.0, 또는 79.4이다. 특정 실시양태에서, 비는 2-100, 2-75, 2-50, 2-45, 2-40, 2-35, 2-30, 2-25, 2-20, 2-15, 2-10, 2-5, 5-100, 5-75, 5-50, 5-45, 5-40, 5-35, 5-30, 5-25, 5-20, 5-15, 5-10, 10-100, 10-75, 10-50, 10-45, 10-40, 10-35, 10-30, 10-25, 10-20, 10-15, 20-100, 20-75, 20-50, 20-45, 20-40, 20-35, 20-30, 20-25, 30-100, 30-75, 30-50, 30-45, 30-40, 30-35, 40-100, 40-75, 40-50, 40-45, 50-100, 50-75, 60-100, 60-75, 70-100, 70-75, 80-100, 80-90, 90-100, 3-4, 3-5, 3-6, 3-7, 25-40, 30-40, 50-55, 75-85, 1-80, 1-70, 1-60, 1-50, 1-40, 1-30, 1-20, 1-10, 또는 1-5의 범위이다.
특정 실시양태에서, HSA에 결합하는 10Fn3 도메인의 오프-레이트는 적어도 2.5 x 10-4 s-1; 2.5 x 10-4 s-1; 3 x 10-4 s-1; 5 x 10-4 s-1; 10-3 s-1; 3 x 10-3 s-1; 5 x 10-3 s-1; 7 x 10-3 s-1; 10-2 s-1; 3 x 10-2 s-1; 또는 5 x 10-2 s- 1이다. 특정 실시양태에서, HSA에 결합하는 10Fn3 도메인의 오프-레이트는 2.5 x 10-4 s-1 내지 5 x 10-4 s-1; 3 x 10-4 s-1 내지 10 x 10-4 s-1; 5 x 10-4 s-1 내지 10 x 10-4 s-1; 7 x 10-4 s-1 내지 10 x 10-4 s-1; 3 x 10- 4 내지 3 x 10-3 s-1; 10-3 s-1 내지 10-2 s-1; 또는 3 x 10-4 s-1 내지 10-3 s-1의 범위이다.
특정 실시양태에서, 폴리펩티드는 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 온-레이트 (ka)의 약 한 자릿수 내 (즉, 약 10-배 내)에 있는 ka로 HSA에 결합한다.
따라서, 1μM 이하의 KD로 HSA에 결합하는 10Fn3 도메인을 포함하는 폴리펩티드가 본원에 제공되며, 여기서 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 CD 및 FG 루프에 비해 10Fn3 도메인의 CD 및/또는 FG 루프는 1, 2, 또는 3개의 아미노산 치환을 갖고, FG 루프는 임의로 1, 2, 또는 3개의 아미노산 치환을 갖고, 여기서 폴리펩티드는 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 오프-레이트 (kd) 초과의 kd로 HSA에 결합하고, 여기서 폴리펩티드는 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 온-레이트 (ka)의 약 한 자릿수 내 (즉, 약 10-배 내)에 있는 ka로 HSA에 결합하고, 여기서 10Fn3 도메인에 연결된 모이어티 (예를 들어, 폴리펩티드)의 혈청 반감기는 10Fn3 도메인에 연결되지 않은 모이어티의 것에 비해 연장된다.
특정 실시양태에서, 10Fn3 도메인의 CD 루프는 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 상응하는 CD 루프에 비해 2개의 아미노산 치환을 갖는다.
특정 실시양태에서, 10Fn3 도메인의 CD 루프는 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 상응하는 CD 루프에 비해 2개의 아미노산 치환을 갖고, 여기서 2개의 아미노산 치환은
(i) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 2의 아르기닌 (R)이 D, E, A, Q, 또는 N으로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
(ii) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 5의 글루타민 (Q)이 D로 치환된 것;
(iii) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 7의 티로신 (Y)이 S 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
(iv) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 10의 류신 (L)이 S, T, 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
(v) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 13의 류신 (L)이 D, S, 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
(vi) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 14의 티로신 (Y)이 A 또는 T로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
(vii) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 15의 이소류신 (I)이 D, S, 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것; 및
(viii) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 16의 티로신 (Y)이 Q, E, S, 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것
으로 이루어진 군으로부터 선택된다.
특정 실시양태에서, 10Fn3 도메인의 CD 루프는 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 상응하는 CD 루프에 비해 1개의 아미노산 치환을 갖는다.
특정 실시양태에서, 10Fn3 도메인의 CD 루프는 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 상응하는 CD 루프에 비해 1개의 아미노산 치환을 갖고, 여기서 1개의 아미노산 치환은
(i) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 2의 아르기닌 (R)이 D, E, A, Q, 또는 N으로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
(ii) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 5의 글루타민 (Q)이 D로 치환된 것;
(iii) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 7의 티로신 (Y)이 S 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
(iv) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 10의 류신 (L)이 S, T, 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
(v) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 13의 류신 (L)이 D, S, 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
(vi) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 14의 티로신 (Y)이 A 또는 T로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
(vii) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 15의 이소류신 (I)이 D, S, 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것; 및
(viii) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 16의 티로신 (Y)이 Q, E, S, 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것
으로 이루어진 군으로부터 선택된다.
특정 실시양태에서, 10Fn3 도메인의 FG 루프는 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 FG 루프에 비해 1개의 아미노산 치환을 갖는다.
특정 실시양태에서, 10Fn3 도메인의 FG 루프는 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 FG 루프에 비해 1개의 아미노산 치환을 갖고, 여기서 FG 루프 (서열식별번호: 29)의 위치 12의 리신 (K)은 A, T, 또는 S로부터 선택된 아미노산으로 치환된다.
특정 실시양태에서, 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 CD 루프 및 FG 루프에 비해 10Fn3 도메인의 CD 루프는 1개의 아미노산 치환을 갖고 FG 루프는 1개의 치환을 갖는다.
특정 실시양태에서, 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 CD 루프 및 FG 루프에 비해 10Fn3 도메인의 CD 루프는 1개의 아미노산 치환을 갖고 FG 루프는 1개의 치환을 갖고, 여기서
a) CD 루프에서의 1개의 아미노산 치환은
(i) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 2의 아르기닌 (R)이 D, E, A, Q, 또는 N으로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
(ii) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 5의 글루타민 (Q)이 D로 치환된 것;
(iii) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 7의 티로신 (Y)이 S 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
(iv) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 10의 류신 (L)이 S, T, 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
(v) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 13의 류신 (L)이 D, S, 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
(vi) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 14의 티로신 (Y)이 A 또는 T로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
(vii) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 15의 이소류신 (I)이 D, S, 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것; 및
(viii) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 16의 티로신 (Y)이 Q, E, S, 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것
으로 이루어진 군으로부터 선택되고;
b) FG 루프 (서열식별번호: 29)의 위치 12의 리신은 A, T, 또는 S로부터 선택된 아미노산으로 치환된다.
특정 실시양태에서, HSA 결합 10Fn3 도메인은 서열식별번호: 30-34, 36-40, 42-46, 48, 49, 51, 52, 54, 55, 57, 58, 60, 61, 62, 63, 65-68, 70, 71, 73-76, 78, 79, 81-84, 86, 87, 89-98, 100-109, 및 111-118 중 어느 하나에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인에 대한 적어도 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 동일성을 갖는 서열을 포함하거나, 또는 많게는 1, 2, 3, 1-2, 또는 1-3개의 아미노산 차이 (즉, 치환, 예를 들어, 결실, 부가 또는 보존적 치환), 예컨대 1개 이상의 본원에 기재된 아미노산 치환을 포함한다. 특정 실시양태에서, HSA 결합 분자는 서열식별번호: 23-27, 30-34, 36-40, 42-46, 48, 49, 51, 52, 54, 55, 57, 58, 60, 61, 62, 63, 65-68, 70, 71, 73-76, 78, 79, 81-84, 86, 87, 89-98, 100-109, 및 111-118의 비-CD 루프 영역과 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 98%, 99% 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
특정 실시양태에서, 본원에 기재된 HSA 결합 10Fn3 도메인의 CD 루프는 하기로 이루어진 군으로부터 선택된 아미노산 서열을 포함한다:
Figure pct00004
.
특정 실시양태에서, 본원에 기재된 HSA 결합 10Fn3 도메인의 FG 루프는 하기로 이루어진 군으로부터 선택된 아미노산 서열을 포함한다:
Figure pct00005
.
특정 실시양태에서, 10Fn3 도메인의 추가의 영역, 예컨대 β-가닥, N-말단 및/또는 C-말단 영역은 또한 서열식별번호: 23, 30-34, 36-40, 42-46, 48, 49, 51, 52, 54, 55, 57, 58, 60, 61, 62, 63, 65-68, 70, 71, 73-76, 78, 79, 81-84, 86, 87, 89-98, 100-109, 및 111-118에 비해 서열에서 변형될 수 있고, 이러한 추가의 변형은 또한 표적에 대한 결합에 기여할 수 있다.
본원에 기재된 HSA 결합 10Fn3 도메인의 비 결합 영역은 서열식별번호: 1, 23, 30-34, 36-40, 42-46, 48, 49, 51, 52, 54, 55, 57, 58, 60, 61, 62, 63, 65-68, 70, 71, 73-76, 78, 79, 81-84, 86, 87, 89-98, 100-109, 및 111-118의 스캐폴드 아미노산 잔기에 비해 0 내지 20, 0 내지 15, 0 내지 10, 0 내지 8, 0 내지 6, 0 내지 5, 0 내지 4, 0 내지 3, 0 내지 2, 또는 0 내지 1개의 치환, 보존적 치환, 결실, 또는 부가 중 임의의 것을 가질 수 있다. 이러한 스캐폴드 변형은, HSA 결합 10Fn3 도메인이 목적하는 KD로 HSA에 결합할 수 있는 한 이루어질 수 있다.
특정 실시양태에서, 본원에 제공된 폴리펩티드의 N-말단 및/또는 C-말단 영역의 아미노산 서열은 야생형 인간 10Fn3 도메인 (서열식별번호: 1)의 상응하는 영역의 아미노산 서열에 비해 결실, 치환, 또는 삽입에 의해 변형될 수 있다. 10Fn3 도메인은 일반적으로 서열식별번호: 1의 아미노산 번호 1로 시작한다. 그러나, 아미노산 결실을 갖는 도메인이 또한 포괄된다.
추가의 서열은 또한 서열식별번호: 30-34, 36-40, 42-46, 48, 49, 51, 52, 54, 55, 57, 58, 60, 61, 62, 63, 65-68, 70, 71, 73-76, 78, 79, 81-84, 86, 87, 89-98, 100-109, 및 111-118 중 어느 하나의 아미노산 서열을 갖는 10Fn3 도메인의 N- 또는 C-말단에 부가될 수 있다. 예를 들어, 일부 실시양태에서, N-말단 연장은, 예를 들어, 서열식별번호: 1에서와 같이 "VSD"로 시작하는 10Fn3 도메인에 부가될 수 있는 M, MG, 및 G로 이루어진 군으로부터 선택된 아미노산 서열로 이루어진다. 예시적인 실시양태에서, 1-20, 1-15, 1-10, 1-8, 1-5, 1-4, 1-3, 1-2, 또는 1개의 아미노산 길이를 갖는 대안적 N-말단 영역은 서열식별번호: 30-34, 36-40, 42-46, 48, 49, 51, 52, 54, 55, 57, 58, 60, 61, 62, 63, 65-68, 70, 71, 73-76, 78, 79, 81-84, 86, 87, 89-98, 100-109, 및 111-118 중 어느 하나의 N-말단 영역에 부가될 수 있다. 예시적인 대안적 N-말단 영역은 (단일 문자 아미노산 코드에 의해 나타내어짐) M, MG, G, MGVSDVPRDL (서열식별번호: 3) 및 GVSDVPRDL (서열식별번호: 4)을 포함한다. 다른 적합한 대안적 N-말단 영역은, 예를 들어, XnSDVPRDL (서열식별번호: 5), XnDVPRDL (서열식별번호: 6), XnVPRDL (서열식별번호: 7), XnPRDL (서열식별번호: 8), XnRDL (서열식별번호: 9), XnDL (서열식별번호: 10), 또는 XnL을 포함하며, 여기서 n = 0, 1 또는 2개의 아미노산이고, 여기서 n = 1인 경우에, X는 Met 또는 Gly이고, n = 2인 경우에, X는 Met-Gly이다. Met-Gly 서열이 10Fn3 도메인의 N-말단에 부가된 경우에, M은 통상적으로 절단 제거되어, G를 N-말단에 남길 것이다. 특정 실시양태에서, 대안적 N-말단 영역은 아미노산 서열 MASTSG (서열식별번호: 11)를 포함한다.
예시적인 실시양태에서, 1-20, 1-15, 1-10, 1-8, 1-5, 1-4, 1-3, 1-2, 또는 1개의 아미노산 길이를 갖는 대안적 C-말단 영역은 서열식별번호: 30-34, 36-40, 42-46, 48, 49, 51, 52, 54, 55, 57, 58, 60, 61, 62, 63, 65-68, 70, 71, 73-76, 78, 79, 81-84, 86, 87, 89-98, 100-109, 및 111-118 중 어느 하나의 C-말단 영역에 부가될 수 있다. 대안적 C-말단 서열의 구체적 예는, 예를 들어, EIEK (서열식별번호: 12), EGSGC (서열식별번호: 13), EIEKPCQ (서열식별번호: 14), EIEKPSQ (서열식별번호: 15), EIEKP (서열식별번호: 16), EIEKPS (서열식별번호: 17), 또는 EIEKPC (서열식별번호: 18)를 포함하거나, 이로 본질적으로 이루어지거나, 또는 이로 이루어진 폴리펩티드를 포함한다. 특정 실시양태에서, 대안적 C-말단 영역은 EIDK (서열식별번호: 19)를 포함하고, 특정한 실시양태에서, 대안적 C-말단 영역은 EIDKPCQ (서열식별번호: 20) 또는 EIDKPSQ (서열식별번호: 21)이다. 추가의 적합한 대안적 C-말단 영역은 서열식별번호: 148-172에 제시된 것을 포함한다.
특정 실시양태에서, C-말단 연장 서열은 E 및 D 잔기를 포함하고, 8 내지 50, 10 내지 30, 10 내지 20, 5 내지 10, 및 2 내지 4개의 아미노산 길이일 수 있다. 특정 실시양태에서, 꼬리 서열은 서열이 ED의 탠덤 반복부를 포함하는 ED-기반 링커를 포함한다. 특정 실시양태에서, 꼬리 서열은 2-10, 2-7, 2-5, 3-10, 3-7, 3-5, 3, 4 또는 5개의 ED 반복부를 포함한다. 특정 실시양태에서, ED-기반 꼬리 서열은 또한 추가의 아미노산 잔기, 예컨대, 예를 들어: EI, EID, ES, EC, EGS, 및 EGC를 포함할 수 있다. 이러한 서열은, 부분적으로, 기지의 애드넥틴 꼬리 서열, 예컨대 EIDKPSQ (서열식별번호: 21)에 기초하고, 여기서 잔기 D 및 K는 제거되었다. 특정 실시양태에서, ED-기반 꼬리는 ED 반복부 앞에 E, I 또는 EI 잔기를 포함한다.
특정 실시양태에서, 본원에 제공된 10Fn3 도메인 중 어느 것의 C-말단 아미노산 RT (즉, 서열식별번호: 1의 아미노산 93-94에 상응함)에 연결될 수 있는 대안적 C-말단 모이어티는 아미노산 PmXn을 포함하며, 여기서 P는 프롤린이고, X는 임의의 아미노산이고, m은 적어도 1인 정수이고 n은 0 또는 적어도 1인 정수이다. 특정 실시양태에서, 대안적 C-말단 모이어티는 아미노산 PC를 포함한다. 특정 실시양태에서, 대안적 C-말단 모이어티는 아미노산 PI, PC, PID, PIE, PIDK (서열식별번호: 159), PIEK (서열식별번호: 160), PIDKP (서열식별번호: 161), PIEKP (서열식별번호: 162), PIDKPS (서열식별번호: 163), PIEKPS (서열식별번호: 164), PIDKPC (서열식별번호: 165), PIEKPC (서열식별번호: 166), PIDKPSQ (서열식별번호: 167), PIEKPSQ (서열식별번호: 168), PIDKPCQ (서열식별번호: 169), PIEKPCQ (서열식별번호: 170), PHHHHHH (서열식별번호: 171), 및 PCHHHHHH (서열식별번호: 172)를 포함한다.
특정 실시양태에서, 본원에 기재된 HSA 결합 10Fn3 도메인은 6X his 꼬리를 포함하거나, 또는 대안적으로 결여된다.
특정 실시양태에서, HSA 결합 10Fn3 도메인은 서열식별번호: 30, 36, 42, 48, 51, 54, 57, 60, 62, 65, 67, 70, 73, 75, 78, 81, 83, 86, 89, 91, 93, 95, 97, 100, 102, 104, 106, 108, 111, 113, 115, 및 117에 제시된 바와 같이 N-말단 리더 및 C-말단 꼬리가 결여된 코어 10Fn3 도메인에 상응한다.
일부 실시양태에서, 예를 들어, 이종 모이어티 (예를 들어, 이종 폴리펩티드 예컨대 10Fn3 도메인)에 대한 화학적 접합을 허용하도록 특정한 위치에 도입된 시스테인 잔기를 갖는 돌연변이체 HSA 결합 10Fn3 도메인이 본원에 제공된다. 바람직한 실시양태에서, 시스테인 돌연변이는 HSA 결합 10Fn3 도메인의 HSA에 대한 결합을 실질적으로 변경하지 않는다.
특정 실시양태에서, 프롤린 잔기는, 예를 들어, 서열식별번호: 33, 34, 39, 40, 45, 및 46에 예를 들어 제시된 바와 같은 10Fn3 도메인의 C-말단에 도입된다. 본원에 기재된 다른 HSA 결합 10Fn3 도메인, 예를 들어, 서열식별번호: 48, 51, 54, 57, 60, 62, 65, 67, 70, 73, 75, 78, 81, 83, 86, 89, 91, 93, 95, 97, 100, 102, 104, 106, 108, 111, 113, 115, 및 117의 코어 서열을 갖는 것은 유사한 방식으로 변형될 수 있다. 특정 실시양태에서, 프롤린 잔기는 탠덤 HSA 결합 애드넥틴의 C-말단에 도입된다. 프롤린 잔기의 부가는 HSA 결합 10Fn3 도메인 또는 탠덤 HSA 결합 애드넥틴의 C-말단에의 추가의 아미노산 서열의 부가를 배제하지 않는다.
특정 실시양태에서, 본원에 기재된 HSA 결합 10Fn3 도메인은 3 μM, 2.5 μM, 2 μM, 1.5 μM, 1 μM, 500 nM, 100 nM, 50 nM, 10 nM, 1 nM, 500 pM, 100 pM, 100 pM, 50 pM, 또는 10 pM 미만의 KD로 HSA에 결합한다. KD는, 예를 들어, 0.1 nM 내지 50 nM, 0.1 nM 내지 100 nM, 0.1 nM 내지 1 μM, 0.5 nM 내지 50 nM, 0.5 nM 내지 100 nM, 0.5 nM 내지 1 μM, 1 nM 내지 50 nM, 1 nM 내지 100 nM, 1 nM 내지 1 μM, 50 nM 내지 3 μM, 50 nM 내지 2 μM, 50 nM 내지 1 μM, 50 nM 내지 500 nM, 50 nM 내지 100 nM, 100 nM 내지 3 μM, 100 nM 내지 2 μM, 100 nM 내지 1 μM, 250 nM 내지 3 μM, 250 nM 내지 2 μM, 250 nM 내지 1 μM, 250 nM 내지 500 nM, 500 nM 내지 3 μM, 500 nM 내지 2 μM, 500 nM 내지 1 μM, 1 μM 내지 3 μM, 또는 1 μM 내지 2 μM의 범위일 수 있다.
특정 실시양태에서, 본원에 기재된 HSA 결합 10Fn3 도메인은 또한 시노몰구스 원숭이, 레서스 원숭이, 래트, 또는 마우스 중 1종 이상으로부터의 혈청 알부민에 결합할 수 있다.
특정 실시양태에서, 본원에 기재된 HSA 결합 10Fn3 도메인은 3 μM, 2.5 μM, 2 μM, 1.5 μM, 1 μM, 500 nM, 100 nM, 50 nM, 10 nM, 1 nM, 500 pM, 100 pM, 100 pM, 50 pM, 또는 10 pM 미만의 KD로 레서스 혈청 알부민 (RhSA) 또는 시노몰구스 원숭이 혈청 알부민 (CySA)에 결합한다. KD는, 예를 들어, 0.1 nM 내지 50 nM, 0.1 nM 내지 100 nM, 0.1 nM 내지 1 μM, 0.5 nM 내지 50 nM, 0.5 nM 내지 100 nM, 0.5 nM 내지 1 μM, 1 nM 내지 50 nM, 1 nM 내지 100 nM, 1 nM 내지 1 μM, 50 nM 내지 3 μM, 50 nM 내지 2 μM, 50 nM 내지 1 μM, 50 nM 내지 500 nM, 50 nM 내지 100 nM, 100 nM 내지 3 μM, 100 nM 내지 2 μM, 100 nM 내지 1 μM, 250 nM 내지 3 μM, 250 nM 내지 2 μM, 250 nM 내지 1 μM, 250 nM 내지 500 nM, 500 nM 내지 3 μM, 500 nM 내지 2 μM, 500 nM 내지 1 μM, 1 μM 내지 3 μM, 또는 1 μM 내지 2 μM의 범위일 수 있다.
특정 실시양태에서, 본원에 기재된 HSA 결합 10Fn3 도메인은 3 μM, 2.5 μM, 2 μM, 1.5 μM, 1 μM, 500 nM, 100 nM, 50 nM, 10 nM, 1 nM, 500 pM, 100 pM, 100 pM, 50 pM, 또는 10 pM 미만의 KD로 레서스 혈청 알부민 (RhSA), 시노몰구스 원숭이 혈청 알부민 (CySA), 및 마우스 혈청 알부민 (MSA)에 결합한다. KD는, 예를 들어, 0.1 nM 내지 50 nM, 0.1 nM 내지 100 nM, 0.1 nM 내지 1 μM, 0.5 nM 내지 50 nM, 0.5 nM 내지 100 nM, 0.5 nM 내지 1 μM, 1 nM 내지 50 nM, 1 nM 내지 100 nM, 1 nM 내지 1 μM, 50 nM 내지 3 μM, 50 nM 내지 2 μM, 50 nM 내지 1 μM, 50 nM 내지 500 nM, 50 nM 내지 100 nM, 100 nM 내지 3 μM, 100 nM 내지 2 μM, 100 nM 내지 1 μM, 250 nM 내지 3 μM, 250 nM 내지 2 μM, 250 nM 내지 1 μM, 250 nM 내지 500 nM, 500 nM 내지 3 μM, 500 nM 내지 2 μM, 500 nM 내지 1 μM, 1 μM 내지 3 μM, 또는 1 μM 내지 2 μM의 범위일 수 있다.
특정 실시양태에서, 본원에 기재된 HSA 결합 10Fn3 도메인은 3 μM, 2.5 μM, 2 μM, 1.5 μM, 1 μM, 500 nM, 100 nM, 50 nM, 10 nM, 1 nM, 500 pM, 100 pM, 100 pM, 50 pM, 또는 10 pM 미만의 KD로 레서스 혈청 알부민 (RhSA), 시노몰구스 원숭이 혈청 알부민 (CySA), 마우스 혈청 알부민 (MSA), 및 래트 혈청 알부민 (RSA)에 결합한다. KD는, 예를 들어, 0.1 nM 내지 50 nM, 0.1 nM 내지 100 nM, 0.1 nM 내지 1 μM, 0.5 nM 내지 50 nM, 0.5 nM 내지 100 nM, 0.5 nM 내지 1 μM, 1 nM 내지 50 nM, 1 nM 내지 100 nM, 1 nM 내지 1 μM, 50 nM 내지 3 μM, 50 nM 내지 2 μM, 50 nM 내지 1 μM, 50 nM 내지 500 nM, 50 nM 내지 100 nM, 100 nM 내지 3 μM, 100 nM 내지 2 μM, 100 nM 내지 1 μM, 250 nM 내지 3 μM, 250 nM 내지 2 μM, 250 nM 내지 1 μM, 250 nM 내지 500 nM, 500 nM 내지 3 μM, 500 nM 내지 2 μM, 500 nM 내지 1 μM, 1 μM 내지 3 μM, 또는 1 μM 내지 2 μM의 범위일 수 있다.
특정 실시양태에서, 본원에 기재된 HSA 결합 10Fn3 도메인은 5.5 내지 7.4의 pH 범위에서 HSA에 결합한다.
특정 실시양태에서, 본원에 기재된 HSA 결합 10Fn3 도메인은 HSA의 도메인 I-II에 결합한다.
특정 실시양태에서, 본원에 기재된 HSA 결합 10Fn3 도메인의 혈청 반감기 또는 이종 모이어티 (예를 들어, 제2 10Fn3 도메인)에 연결된 HSA 결합 10Fn3 도메인의 혈청 반감기는 적어도 2시간, 2.5시간, 3시간, 4시간, 5시간, 6시간, 7시간, 8시간, 9시간, 10시간, 15시간, 20시간, 25시간, 30시간, 35시간, 40시간, 50시간, 60시간, 70시간, 80시간, 90시간, 100시간, 110시간, 120시간, 130시간, 135시간, 140시간, 150시간, 160시간, 또는 200시간이다. 특정 실시양태에서, HSA 결합 10Fn3 도메인의 혈청 반감기 또는 이종 모이어티 (예를 들어, 제2 10Fn3 도메인)에 연결된 HSA 결합 10Fn3 도메인의 혈청 반감기는 2-200시간, 5-200시간, 10-200시간, 25-200시간, 50-200시간, 100-200시간, 150-200시간, 2-150시간, 2-100시간, 2-50시간, 2-25시간, 2-10시간, 2-5시간, 5-150시간, 10-100시간, 또는 25-50시간이다.
B. 교차-경쟁 애드넥틴 및/또는 동일한 애드넥틴 결합 부위에 결합하는 애드넥틴
HSA에 대한 결합에 대해 본원에 기재된 특정한 HSA 결합 10Fn3 도메인, 예를 들어, 서열식별번호: 30-34, 36-40, 42-46, 48, 49, 51, 52, 54, 55, 57, 58, 60, 61, 62, 63, 65-68, 70, 71, 73-76, 78, 79, 81-84, 86, 87, 89-98, 100-109, 및 111-118 중 어느 하나에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 HSA 결합 10Fn3 도메인 (애드넥틴)과 경쟁 (예를 들어, 교차-경쟁)하는 단백질, 예컨대 애드넥틴, 항체 또는 그의 항원 결합 단편, 소분자, 펩티드 등이 본원에 제공된다. 이러한 경쟁 단백질은 표준 혈청 알부민 결합 검정에서 본원에 기재된 혈청 알부민 결합 10Fn3 도메인의 HSA에 대한 결합을 경쟁적으로 억제하는 그의 능력에 기초하여 확인될 수 있다. 예를 들어, 재조합 HSA를 플레이트 상에 고정시키고, 단백질 중 하나를 형광 표지하고 표지된 단백질의 결합과 경쟁하는 비-표지된 단백질의 능력을 평가하는 표준 ELISA 검정이 사용될 수 있다.
하기 예시적인 경쟁 검정이 HSA에 대한 결합에 대해 본원에 기재된 HSA 결합 10Fn3 도메인 중 하나와 경쟁하는 HSA 결합 10Fn3 도메인과 관련하여 제공된다. 비-애드넥틴 단백질을 경쟁에 대해 시험하는 동일한 검정이 수행될 수 있다. 한 실시양태에서, 경쟁적 ELISA 포맷은 2종의 HSA 결합 애드넥틴이 HSA 상의 중첩되는 애드넥틴 결합 부위 (에피토프)에 결합하는지 여부를 결정하는 데 수행될 수 있다. 한 포맷에서, 애드넥틴 #1을 플레이트 상에 코팅하고, 이어서 차단하고 세척한다. 이 플레이트에 HSA 단독, 또는 포화 농도의 애드넥틴 #2와 함께 사전-인큐베이션된 HSA를 첨가한다. 적합한 인큐베이션 기간 후, 플레이트를 세척하고 폴리클로날 항-HSA 항체로 프로빙하고, 이어서 스트렙타비딘-HRP 접합체 및 표준 테트라메틸벤지딘 발색 절차를 사용하여 검출한다. OD 신호가 애드넥틴 #2와의 사전인큐베이션의 존재 또는 부재 하에 동일한 경우에, 2종의 애드넥틴은 서로 독립적으로 결합하고, 그의 애드넥틴 결합 부위는 중첩되지 않는다. 그러나, 혈청 알부민/애드넥틴#2 혼합물을 받은 웰에 대한 OD 신호가 HSA 단독을 받은 것보다 더 낮은 경우에, 애드넥틴 #2의 결합은 애드넥틴 #1의 HSA에 대한 결합을 차단하는 것으로 확인된다.
대안적으로, 유사한 실험이 표면 플라즈몬 공명 (SPR, 예를 들어, 비아코어)에 의해 수행된다. 애드넥틴 #1을 SPR 칩 표면 상에 고정시키고, 이어서 HSA 단독 또는 포화 농도의 애드넥틴 #2와 함께 사전-인큐베이션된 HSA를 주사한다. HSA/애드넥틴#2 혼합물에 대한 결합 신호가 HSA 단독의 것과 동일하거나 또는 그보다 더 높은 경우에, 2종의 애드넥틴은 서로 독립적으로 결합하고, 그의 애드넥틴 결합 부위는 중첩되지 않는다. 그러나, HSA/애드넥틴#2 혼합물에 대한 결합 신호가 HSA 단독의 결합 신호보다 더 낮은 경우에, 애드넥틴 #2의 결합은 애드넥틴 #1의 HSA에 대한 결합을 차단하는 것으로 확인된다. 이들 실험의 특색은 포화 농도의 애드넥틴 #2의 사용이다. HSA가 애드넥틴 #2로 포화되지 않은 경우에, 상기 결론은 유지되지 않는다. 유사한 실험을 사용하여 임의의 2종의 HSA 결합 단백질이 중첩되는 애드넥틴 결합 부위에 결합하는지 여부를 결정할 수 있다.
상기 예시된 검정 둘 다는 또한 애드넥틴#2를 고정시키고 HSA-애드넥틴#1을 플레이트에 첨가하는 역순으로 수행될 수 있다. 대안적으로, 애드넥틴 #1 및/또는 #2는 모노클로날 항체 및/또는 가용성 수용체-Fc 융합 단백질로 대체될 수 있다.
특정 실시양태에서, 경쟁은 HTRF 샌드위치 검정을 사용하여 결정될 수 있다.
후보 경쟁 HSA 결합 단백질, 예를 들어, 애드넥틴은 본원의 기재된 애드넥틴의 HSA에 대한 결합을 적어도 50%, 적어도 55%, 적어도 60%, 적어도 65%, 적어도 70%, 적어도 75%, 적어도 80%, 적어도 85%, 적어도 90%, 적어도 95%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99%만큼 억제할 수 있다. % 경쟁은 상기 기재된 방법을 사용하여 결정될 수 있다.
특정 실시양태에서, 본원에 기재된 HSA 결합 10Fn3 도메인과 동일한 애드넥틴 결합 부위에 결합하는 애드넥틴이 본원에 제공된다. 특정한 애드넥틴에 의해 결합된 에피토프는 관련 기술분야에 인지된 에피토프 맵핑 방법, 예컨대 항원:애드넥틴 복합체의 결정의 X선 분석 (에피토프의 원자 분해를 제공함), 프로테아제 맵핑, 수소/중수소 교환 질량 분광측정법 (HDX-MS), 2-차원 핵 자기 공명, 알라닌 스캐닝, 및 심층 돌연변이 스캐닝 (예를 들어, 문헌 [Epitope Mapping Protocols in Methods in Molecular Biology, Vol. 66, G. E. Morris, Ed. (1996)] 참조)을 사용하여 결정될 수 있다.
C. 다가/탠덤 애드넥틴
적어도 그 중 하나가 HSA에 특이적으로 결합하는 2종 이상의 10Fn3 도메인을 포함하는 다가 단백질이 본원에 제공된다. 예를 들어, 다가 단백질은 공유 회합된 2, 3종 또는 그 초과의 10Fn3 도메인을 포함할 수 있다. 특정 실시양태에서, 다가 단백질은 2종의 10Fn3 도메인을 포함하는 이중특이적 또는 이량체 단백질이다. 특정 실시양태에서, 다가 단백질은 HSA에 결합하는 제1 10Fn3 도메인 (예를 들어, 상기 섹션 A에 기재된 10Fn3 도메인) 및 제2 표적 분자에 결합하는 제2 10Fn3 도메인을 포함한다. 제1 및 제2 표적 분자 둘 다가 HSA인 경우에, 제1 및 제2 10Fn3 도메인은 동일하거나 또는 상이한 에피토프에 결합할 수 있다. 추가적으로, 제1 및 제2 표적 분자가 동일한 경우에, 표적 결합과 연관된 10Fn3 도메인의 변형의 영역은 동일하거나 또는 상이할 수 있다.
특정 실시양태에서, 다가 피브로넥틴-기반 단백질 스캐폴드의 각각의 10Fn3 도메인은 3 μM, 2.5 μM, 2 μM, 1.5 μM, 1 μM, 500 nM, 100 nM, 50 nM, 10 nM, 1 nM, 500 pM, 100 pM, 100 pM, 50 pM, 또는 10 pM 미만의 KD로 HSA에 결합한다. KD는, 예를 들어, 0.1 nM 내지 50 nM, 0.1 nM 내지 100 nM, 0.1 nM 내지 1 μM, 0.5 nM 내지 50 nM, 0.5 nM 내지 100 nM, 0.5 nM 내지 1 μM, 1 nM 내지 50 nM, 1 nM 내지 100 nM, 1 nM 내지 1 μM, 50 nM 내지 3 μM, 50 nM 내지 2 μM, 50 nM 내지 1 μM, 50 nM 내지 500 nM, 50 nM 내지 100 nM, 100 nM 내지 3 μM, 100 nM 내지 2 μM, 100 nM 내지 1 μM, 250 nM 내지 3 μM, 250 nM 내지 2 μM, 250 nM 내지 1 μM, 250 nM 내지 500 nM, 500 nM 내지 3 μM, 500 nM 내지 2 μM, 500 nM 내지 1 μM, 1 μM 내지 3 μM, 또는 1 μM 내지 2 μM의 범위일 수 있다. 예시적인 실시양태에서, 다가 피브로넥틴 기반 단백질 스캐폴드의 각각의 10Fn3 도메인은 HSA, 즉, 야생형 10Fn3 도메인, 특히 야생형 인간 10Fn3 도메인에 의해 결합되지 않은 표적에 특이적으로 결합한다.
다가 피브로넥틴 기반 스캐폴드 단백질의 10Fn3 도메인은 폴리펩티드 링커에 의해 연결될 수 있다. 예시적인 폴리펩티드 링커는 1-20, 1-15, 1-10, 1-8, 1-5, 1-4, 1-3, 또는 1-2개의 아미노산을 갖는 폴리펩티드를 포함한다. 10Fn3 도메인을 연결하는 데 적합한 링커는 별개의 도메인이 서로 독립적으로 폴딩되어 표적 분자에 대한 고친화도 결합을 가능하게 하는 3차원 구조를 형성하도록 허용하는 것이다. 적합한 링커의 구체적 예는 글리신-세린 기반 링커, 글리신-프롤린 기반 링커, 프롤린-알라닌 기반 링커뿐만 아니라 아미노산 서열 PSTPPTPSPSTPPTPSPS (서열식별번호: 120)를 갖는 링커를 포함한다. 특정 실시양태에서, 링커는 글리신-세린 기반 링커이다. 특정 실시양태에서, 링커는 글리신-세린 기반 링커이다. 이들 링커는 글리신 및 세린 잔기를 포함하고 8 내지 50, 10 내지 30, 및 10 내지 20개의 아미노산 길이일 수 있다. 예는 아미노산 서열 (GS)7 (서열식별번호: 121), G(GS)6 (서열식별번호: 122), 및 G(GS)7G (서열식별번호: 123)를 갖는 링커를 포함한다. 다른 링커는 글루탐산을 함유하고, 예를 들어, (GSE)5 (서열식별번호: 124) 및 GGSEGGSE (서열식별번호: 125)를 포함한다. 다른 예시적인 글리신-세린 링커는 (GS)4 (서열식별번호: 126), (GGGGS)7 (서열식별번호: 127), (GGGGS)5 (서열식별번호: 128), 및 (GGGGS)3G (서열식별번호: 129)를 포함한다. 일부 실시양태에서, 링커는 글리신-프롤린 기반 링커이다. 이들 링커는 글리신 및 프롤린 잔기를 포함하고 3 내지 30, 10 내지 30, 및 3 내지 20개의 아미노산 길이일 수 있다. 예는 아미노산 서열 (GP)3G (서열식별번호: 130), (GP)5G (서열식별번호: 131), 및 GPG를 갖는 링커를 포함한다. 특정 실시양태에서, 링커는 3 내지 30, 10 내지 30, 및 3 내지 20개의 아미노산 길이를 갖는 프롤린-알라닌 기반 링커일 수 있다. 프롤린 알라닌 기반 링커의 예는, 예를 들어, (PA)3 (서열식별번호: 132), (PA)6 (서열식별번호: 133) 및 (PA)9 (서열식별번호: 134)를 포함한다. 최적 링커 길이 및 아미노산 조성은 관련 기술분야에 널리 공지된 방법에 의한 상용 실험에 의해 결정될 수 있는 것으로 고려된다. 예시적인 실시양태에서, 링커는 어떠한 Asp-Lys (DK) 쌍도 함유하지 않는다.
특정 실시양태에서, 링커는 아미노산 서열 PSPEPPTPEP (서열식별번호: 135), PSPEPPTPEPPSPEPPTPEP (서열식별번호: 136), PSPEPPTPEPPSPEPPTPEPPSPEPPTPEP (서열식별번호: 137), 또는 PSPEPPTPEPPSPEPPTPEPPSPEPPTPEPPSPEPPTPEP (서열식별번호: 138)를 갖는다. 일반적으로 링커는 아미노산 서열 (PSPEPPTPEP)n (서열식별번호: 144)을 포함할 수 있으며, 여기서 n은 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 1-5 또는 1-10이다. 특정 실시양태에서, 링커는 아미노산 서열 EEEEDE (서열식별번호: 139), EEEEDEEEEDE (서열식별번호: 140), EEEEDEEEEDEEEEDEEEEDE (서열식별번호: 141), EEEEDEEEEDEEEEDEEEEDEEEEDEEEEDE (서열식별번호: 142)를 갖는다. 일반적으로, 링커는 서열 (EEEEDE)nE (서열식별번호: 145)를 포함할 수 있으며, 여기서 n은 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 1-5 또는 1-10이다. 특정 실시양태에서, 링커는 아미노산 서열 RGGEEKKKEKEKEEQEERETKTP (서열식별번호: 143)를 갖는다. 이러한 링커는 HSA 결합 애드넥틴을 또 다른 폴리펩티드 (예를 들어, 또 다른 애드넥틴)에 연결하는 데 사용될 수 있다. PSPEPPTPEP (서열식별번호: 135) 링커의 예시적인 사용이 하기 제시된다 (서열식별번호: 74 내의 YRTP 및 서열식별번호: 75 내의 TPEP 뒤의 "G"는 임의적임).
C-말단 폴리펩티드에 연결된 N-말단 애드넥틴:
Figure pct00006
C-말단 애드넥틴에 연결된 N-말단 폴리펩티드:
Figure pct00007
특정 실시양태에서, 다가 애드넥틴은 HSA에 결합하는 제1 10Fn3 도메인 (예를 들어, PKE3 애드넥틴), 및 특이적 표적에 결합하는 제2 10Fn3 도메인을 포함하는 탠덤 애드넥틴이다. 탠덤 애드넥틴은 구성 HSA 결합 애드넥틴-X 및 X-HSA 결합 애드넥틴을 가질 수 있으며, 여기서 X는 표적 특이적 10Fn3 도메인이다. 통상의 기술자는 이러한 탠덤 애드넥틴 분자의 기능적 활성을 시험하고 생물물리학적 특성을 평가하는 방법에 익숙할 것이다.
한 측면에서, 본 발명은 제1 피브로넥틴 유형 III 제10 (10Fn3) 도메인 및 제2 10Fn3 도메인을 포함하는 융합 폴리펩티드를 제공하며, 여기서 제1 10Fn3 도메인은 HSA에 결합하고 AB, BC, CD, DE, EF, 및 FG 루프를 포함하고, 여기서 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 CD 및 FG 루프에 비해, CD 루프는 1, 2, 또는 3개의 아미노산 치환을 갖고, FG 루프는 임의로 1, 2, 또는 3개의 아미노산 치환을 갖고 (예를 들어, 상기 섹션 A에 기재된 CD 및/또는 FG 루프에 대한 아미노산 치환), 여기서 10Fn3 도메인에 연결된 모이어티 (예를 들어, 폴리펩티드)의 혈청 반감기는 10Fn3 도메인에 연결되지 않은 모이어티의 것에 비해 연장된다. "제1" 도메인 및 제2 "도메인"은 N-에서 C-말단 또는 C-에서 N-말단 배향으로 존재할 수 있다.
특정 실시양태에서, 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 오프-레이트에 대한 제1 10Fn3 도메인의 오프-레이트의 비는 적어도 약 2, 예컨대 적어도 약 3, 적어도 약 4, 적어도 약 5, 적어도 약 6, 적어도 약 7, 적어도 약 8, 적어도 약 9, 적어도 약 10, 적어도 약 15, 적어도 약 20, 적어도 약 25, 적어도 약 30, 적어도 약 35, 적어도 약 40, 적어도 약 45, 적어도 약 50, 적어도 약 75, 적어도 약 100 또는 그 초과이다. 특정 실시양태에서, 비는 약 1, 약 2, 약 3, 약 4, 약 5, 약 6, 약 7, 약 8, 약 9, 약 10, 약 11, 약 12, 약 13, 약 14, 약 15, 약 16, 약 17, 약 18, 약 19, 약 20, 약 21, 약 22, 약 23, 약 24, 약 25, 약 26, 약 27, 약 28, 약 29, 약 30, 약 31, 약 32, 약 33, 약 34, 약 35, 약 36, 약 37, 약 38, 약 39, 약 40, 약 41, 약 42, 약 43, 약 44, 약 45, 약 46, 약 47, 약 48, 약 49, 약 50, 약 51, 약 52, 약 53, 약 54, 약 55, 약 56, 약 57, 약 58, 약 59, 또는 약 60이다. 특정 실시양태에서, 비는 1.0, 1.1, 1.2, 3.3, 3.9, 4.0, 4.1, 4.8, 5.0, 5.6, 6.5, 6.6, 8, 11, 14, 17, 20, 23, 28, 28.9, 30.3, 32.0, 34.0, 34.3, 37.3, 50.0, 52, 52.7, 53.0, 56.0, 또는 79.4이다. 특정 실시양태에서, 비는 2-100, 2-75, 2-50, 2-45, 2-40, 2-35, 2-30, 2-25, 2-20, 2-15, 2-10, 2-5, 5-100, 5-75, 5-50, 5-45, 5-40, 5-35, 5-30, 5-25, 5-20, 5-15, 5-10, 10-100, 10-75, 10-50, 10-45, 10-40, 10-35, 10-30, 10-25, 10-20, 10-15, 20-100, 20-75, 20-50, 20-45, 20-40, 20-35, 20-30, 20-25, 30-100, 30-75, 30-50, 30-45, 30-40, 30-35, 40-100, 40-75, 40-50, 40-45, 50-100, 50-75, 60-100, 60-75, 70-100, 70-75, 80-100, 80-90, 90-100, 3-4, 3-5, 3-6, 3-7, 25-40, 30-40, 50-55, 75-85, 1-80, 1-70, 1-60, 1-50, 1-40, 1-30, 1-20, 1-10, 또는 1-5의 범위이다.
특정 실시양태에서, 제1 10Fn3 도메인은 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 온-레이트 (ka)의 한 자릿수 내 (즉, 10-배 내)에 있는 ka로 HSA에 결합한다.
예를 들어, 다가 애드넥틴의 특정 실시양태에서, 제1 10Fn3 도메인은 서열식별번호: 30-34, 36-40, 42-46, 48, 49, 51, 52, 54, 55, 57, 58, 60, 61, 62, 63, 65-68, 70, 71, 73-76, 78, 79, 81-84, 86, 87, 89-98, 100-109, 및 111-118 중 어느 하나와 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하거나, 또는 많게는 1, 1-2, 1-5, 1-10 또는 1-20개의 아미노산이 그로부터 상이하다 (예를 들어, 아미노산 결실, 부가 또는 치환 (예를 들어, 보존적 아미노산 치환), 예컨대 본원에 기재된 아미노산 치환 중 1개 이상).
특정 실시양태에서, 제1 10Fn3 도메인은 서열식별번호: 30-34, 36-40, 42-46, 48, 49, 51, 52, 54, 55, 57, 58, 60, 61, 62, 63, 65-68, 70, 71, 73-76, 78, 79, 81-84, 86, 87, 89-98, 100-109, 및 111-118 중 어느 하나의 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시양태에서, 다가 애드넥틴은 HSA 이외의 표적 단백질, 예를 들어, 하기 섹션 D에 기재된 표적 단백질에 특이적으로 결합하는 10Fn3 도메인 (예를 들어, 치료 모이어티)인 제2 10Fn3 도메인을 포함한다.
한 측면에서, 본원에 기재된 HSA 결합 탠덤 애드넥틴은 3 μM, 2.5 μM, 2 μM, 1.5 μM, 1 μM, 500 nM, 100 nM, 50 nM, 10 nM, 1 nM, 500 pM, 100 pM, 100 pM, 50 pM, 또는 10 pM 미만의 KD로 HSA에 결합한다. KD는, 예를 들어, 0.1 nM 내지 50 nM, 0.1 nM 내지 100 nM, 0.1 nM 내지 1 μM, 0.5 nM 내지 50 nM, 0.5 nM 내지 100 nM, 0.5 nM 내지 1 μM, 1 nM 내지 50 nM, 1 nM 내지 100 nM, 1 nM 내지 1 μM, 50 nM 내지 3 μM, 50 nM 내지 2 μM, 50 nM 내지 1 μM, 50 nM 내지 500 nM, 50 nM 내지 100 nM, 100 nM 내지 3 μM, 100 nM 내지 2 μM, 100 nM 내지 1 μM, 250 nM 내지 3 μM, 250 nM 내지 2 μM, 250 nM 내지 1 μM, 250 nM 내지 500 nM, 500 nM 내지 3 μM, 500 nM 내지 2 μM, 500 nM 내지 1 μM, 1 μM 내지 3 μM, 또는 1 μM 내지 2 μM의 범위일 수 있다.
특정 실시양태에서, 본원에 기재된 HSA 결합 탠덤 애드넥틴은 또한 시노몰구스 원숭이, 레서스 원숭이, 래트, 또는 마우스 중 1종 이상으로부터의 혈청 알부민에 결합할 수 있다.
특정 실시양태에서, 본원에 기재된 HSA 결합 탠덤 애드넥틴은 3 μM, 2.5 μM, 2 μM, 1.5 μM, 1 μM, 500 nM, 100 nM, 50 nM, 10 nM, 1 nM, 500 pM, 100 pM, 100 pM, 50 pM, 또는 10 pM 미만의 KD로 레서스 혈청 알부민 (RhSA) 또는 시노몰구스 원숭이 혈청 알부민 (CySA)에 결합한다. KD는, 예를 들어, 0.1 nM 내지 50 nM, 0.1 nM 내지 100 nM, 0.1 nM 내지 1 μM, 0.5 nM 내지 50 nM, 0.5 nM 내지 100 nM, 0.5 nM 내지 1 μM, 1 nM 내지 50 nM, 1 nM 내지 100 nM, 1 nM 내지 1 μM, 50 nM 내지 3 μM, 50 nM 내지 2 μM, 50 nM 내지 1 μM, 50 nM 내지 500 nM, 50 nM 내지 100 nM, 100 nM 내지 3 μM, 100 nM 내지 2 μM, 100 nM 내지 1 μM, 250 nM 내지 3 μM, 250 nM 내지 2 μM, 250 nM 내지 1 μM, 250 nM 내지 500 nM, 500 nM 내지 3 μM, 500 nM 내지 2 μM, 500 nM 내지 1 μM, 1 μM 내지 3 μM, 또는 1 μM 내지 2 μM의 범위일 수 있다.
특정 실시양태에서, 본원에 기재된 HSA 결합 탠덤 애드넥틴은 3 μM, 2.5 μM, 2 μM, 1.5 μM, 1 μM, 500 nM, 100 nM, 50 nM, 10 nM, 1 nM, 500 pM, 100 pM, 100 pM, 50 pM, 또는 10 pM 미만의 KD로 레서스 혈청 알부민 (RhSA), 시노몰구스 원숭이 혈청 알부민 (CySA), 및 마우스 혈청 알부민 (MSA)에 결합한다. KD는, 예를 들어, 0.1 nM 내지 50 nM, 0.1 nM 내지 100 nM, 0.1 nM 내지 1 μM, 0.5 nM 내지 50 nM, 0.5 nM 내지 100 nM, 0.5 nM 내지 1 μM, 1 nM 내지 50 nM, 1 nM 내지 100 nM, 1 nM 내지 1 μM, 50 nM 내지 3 μM, 50 nM 내지 2 μM, 50 nM 내지 1 μM, 50 nM 내지 500 nM, 50 nM 내지 100 nM, 100 nM 내지 3 μM, 100 nM 내지 2 μM, 100 nM 내지 1 μM, 250 nM 내지 3 μM, 250 nM 내지 2 μM, 250 nM 내지 1 μM, 250 nM 내지 500 nM, 500 nM 내지 3 μM, 500 nM 내지 2 μM, 500 nM 내지 1 μM, 1 μM 내지 3 μM, 또는 1 μM 내지 2 μM의 범위일 수 있다.
특정 실시양태에서, 본원에 기재된 HSA 결합 탠덤 애드넥틴은 3 μM, 2.5 μM, 2 μM, 1.5 μM, 1 μM, 500 nM, 100 nM, 50 nM, 10 nM, 1 nM, 500 pM, 100 pM, 100 pM, 50 pM, 또는 10 pM 미만의 KD로 레서스 혈청 알부민 (RhSA), 시노몰구스 원숭이 혈청 알부민 (CySA), 마우스 혈청 알부민 (MSA), 및 래트 혈청 알부민 (RSA)에 결합한다. KD는, 예를 들어, 0.1 nM 내지 50 nM, 0.1 nM 내지 100 nM, 0.1 nM 내지 1 μM, 0.5 nM 내지 50 nM, 0.5 nM 내지 100 nM, 0.5 nM 내지 1 μM, 1 nM 내지 50 nM, 1 nM 내지 100 nM, 1 nM 내지 1 μM, 50 nM 내지 3 μM, 50 nM 내지 2 μM, 50 nM 내지 1 μM, 50 nM 내지 500 nM, 50 nM 내지 100 nM, 100 nM 내지 3 μM, 100 nM 내지 2 μM, 100 nM 내지 1 μM, 250 nM 내지 3 μM, 250 nM 내지 2 μM, 250 nM 내지 1 μM, 250 nM 내지 500 nM, 500 nM 내지 3 μM, 500 nM 내지 2 μM, 500 nM 내지 1 μM, 1 μM 내지 3 μM, 또는 1 μM 내지 2 μM의 범위일 수 있다.
특정 실시양태에서, 본원에 기재된 HSA 결합 탠덤 애드넥틴은 5.5 내지 7.4의 pH 범위에서 혈청 알부민에 결합한다.
특정 실시양태에서, 본원에 기재된 HSA 결합 탠덤 애드넥틴은 HSA의 도메인 I-II에 결합한다.
특정 실시양태에서, 본원에 기재된 HSA 결합 탠덤 애드넥틴은 HSA, 시노몰구스 원숭이 혈청 알부민, 레서스 원숭이 혈청 알부민, 마우스 혈청 알부민, 및/또는 래트 혈청 알부민의 존재 하에 적어도 1시간, 2시간, 5시간, 10시간, 20시간, 30시간, 40시간, 50시간, 60시간, 70시간, 80시간, 90시간, 100시간, 150시간, 200시간, 또는 적어도 약 300시간의 혈청 반감기를 갖는다.
특정 실시양태에서, 본원에 기재된 HSA 결합 탠덤 애드넥틴은 HSA, 시노몰구스 원숭이 혈청 알부민, 레서스 원숭이 혈청 알부민, 마우스 혈청 알부민, 및/또는 래트 혈청 알부민의 존재 하에 1-300시간, 예컨대 1-250시간, 1-200시간, 1-150시간, 1-100시간, 1-90시간, 1-80시간, 1-70시간, 1-60시간, 1-50시간, 1-40시간, 1-30시간, 1-20시간, 1-10시간, 1-5시간, 5-300시간, 10-300시간, 20-300시간, 30-300시간, 40-300시간, 50-300시간, 60-300시간, 70-300시간, 80-300시간, 90-300시간, 100-300시간, 150-300시간, 200-300시간, 250-300시간, 5-250시간, 10-200시간, 50-150시간, 또는 80-120시간의 혈청 반감기를 갖는다.
특정 실시양태에서, HSA 결합 탠덤 애드넥틴의 파트너 애드넥틴의 혈청 반감기는 HSA 결합 애드넥틴에 접합되지 않은 경우 파트너 애드넥틴의 혈청 반감기에 비해 증가된다.
특정 실시양태에서, HSA 결합 탠덤 애드넥틴의 혈청 반감기는 HSA 결합 애드넥틴에 융합되지 않은 경우 파트너 애드넥틴의 혈청 반감기에 비해 적어도 20, 40, 60, 80, 100, 120, 150, 180, 200, 400, 600, 800, 1000, 1200, 1500, 1800, 1900, 2000, 2500, 또는 3000% 더 길다.
특정 실시양태에서, HSA 결합 탠덤 애드넥틴의 혈청 반감기는 HSA 결합 애드넥틴에 융합되지 않은 경우 파트너 애드넥틴의 혈청 반감기에 비해 20-3000%, 예컨대 40-3000%, 60-3000%, 80-3000%, 100-3000%, 120-3000%, 150-3000%, 180-3000%, 200-3000%, 400-3000%, 600-3000%, 800-3000%, 1000-3000%, 1200-3000%, 1500-3000%, 1800-3000%, 1900-3000%, 2000-3000%, 2500-3000%, 20-2500%, 20-2000%, 20-1900%, 20-1800%, 20-1500%, 20-1200%, 20-1000%, 20-800%, 20-600%, 20-400%, 20-200%, 20-180%, 20-150%, 20-120%, 20-100%, 20-80%, 20-60%, 20-40%, 50-2500%, 100-2000%, 150-1500%, 200-1000%, 400-800%, 또는 500-700% 더 길다.
특정 실시양태에서, HSA 결합 탠덤 애드넥틴의 혈청 반감기는 HSA 결합 애드넥틴에 융합되지 않은 경우 파트너 애드넥틴의 혈청 반감기보다 적어도 1.5-배, 2-배, 2.5-배, 3-배, 3.5배, 4-배, 4.5- fold, 5-배, 6-배, 7-배, 8-배, 10-배, 12-배, 13-배, 15-배, 17-배, 20-배, 22-배, 25 -배, 27-배, 30-배, 35 -배, 40-배, 또는 50-배 더 크다.
특정 실시양태에서, HSA 결합 탠덤 애드넥틴의 혈청 반감기는 HSA 결합 애드넥틴에 융합되지 않은 경우 파트너 애드넥틴의 혈청 반감기보다 1.5-50배, 예컨대 1.5-40배, 1.5-35배, 1.5-30배, 1.5-27배, 1.5-25배, 1.5-22배, 1.5-20배, 1.5-17배, 1.5-15배, 1.5-13배, 1.5-12배, 1.5-10배, 1.5-9배, 1.5-8배, 1.5-7배, 1.5-6배, 1.5-5배, 1.5-4.5배, 1.5-4배, 1.5-3.5배, 1.5-3배, 1.5-2.5배, 1.5-2배, 2-50배, 2.5-50배, 3-50배, 3.5-50배, 4-50배, 4.5-50배, 5-50배, 6-50배, 7-50배, 8-50배, 10-50배, 12-50배, 13-50배, 15-50배, 17-50배, 20-50배, 22-50배, 25-50배, 27-50배, 30-50배, 40-50배, 2-40배, 5-35배, 10-20배, 또는 10-15배 더 크다.
특정 실시양태에서, HSA 결합 탠덤 애드넥틴의 혈청 반감기는 적어도 2시간, 2.5시간, 3시간, 4시간, 5시간, 6시간, 7시간, 8시간, 9시간, 10시간, 15시간, 20시간, 25시간, 30시간, 35시간, 40시간, 50시간, 60시간, 70시간, 80시간, 90시간, 100시간, 110시간, 120시간, 130시간, 135시간, 140시간, 150시간, 160시간, 또는 200시간이다.
특정 실시양태에서, HSA 결합 탠덤 애드넥틴의 혈청 반감기는 2-200시간, 2.5-200시간, 3-200시간, 4-200시간, 5-200시간, 6-200시간, 7-200시간, 8-200시간, 9-200시간, 10-200시간, 15-200시간, 20-200시간, 25-200시간, 30-200시간, 35-200시간, 40-200시간, 50-200시간, 60-200시간, 70-200시간, 80-200시간, 90-200시간, 100-200시간, 125-200시간, 150-200시간, 175-200시간, 190-200시간, 2-190시간, 2-175시간, 2-150시간, 2-125시간, 2-100시간, 2-90시간, 2-80시간, 2-70시간, 2-60시간, 2-50시간, 2-40시간, 2-35시간, 2-30시간, 2-25시간, 2-20시간, 2-15시간, 2-10시간, 2-9시간, 2-8시간, 2-7시간, 2-6시간, 2-5시간, 2-4시간, 2-3시간, 5-175시간, 10-150시간, 15-125시간, 20-100시간, 25-75시간, 또는 30-60시간이다.
D. HSA 결합 애드넥틴의 접합체
본 발명의 특정 측면은 HSA 결합 10Fn3 도메인 (예를 들어, 상기 섹션 A 및 B에 기재된 바와 같음) 및 적어도 1종의 추가의 모이어티 (예를 들어, 치료 모이어티)를 포함하는 접합체를 제공한다. 추가의 모이어티는 임의의 진단, 영상화, 또는 치료 목적에 유용할 수 있다.
일부 실시양태에서, HSA 결합 10Fn3 도메인은 유기 소분자, 핵산, 펩티드, 또는 단백질인 제2 모이어티에 융합된다.
특정 실시양태에서, HSA 결합 10Fn3 도메인은 수용체, 수용체 리간드, 바이러스 코트 단백질, 면역계 단백질, 호르몬, 효소, 항원, 또는 세포 신호전달 단백질을 표적화하는 치료 모이어티에 융합된다. 융합체는 제2 모이어티를 HSA 결합 10Fn3 도메인의 어느 한 말단에 부착시킴으로써, 즉, HSA 결합 10Fn3 도메인-치료 분자 또는 치료 분자-HSA 결합 10Fn3 도메인 배열로 형성될 수 있다.
특정 실시양태에서, 10Fn3 도메인에 연결된 모이어티 (예를 들어, 폴리펩티드)의 혈청 반감기는 10Fn3 도메인에 연결되지 않는 모이어티의 것에 비해 연장된다. 특정 실시양태에서, HSA 결합 10Fn3 도메인 융합체의 혈청 반감기는 10Fn3 도메인에 융합되지 않은 경우 모이어티의 혈청 반감기에 비해 적어도 5, 10, 15, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 120, 150, 180, 200, 400, 600, 800, 1000, 1200, 1500, 1800, 1900, 2000, 2500, 또는 3000% 더 길다. 특정 실시양태에서, HSA 결합 10Fn3 도메인 융합체의 혈청 반감기는 10Fn3 도메인에 융합되지 않은 경우 모이어티의 혈청 반감기에 비해 5-3000%, 예컨대 10-3000%, 15-3000%, 20-3000%, 30-3000%, 40-3000%, 50-3000%, 60-3000%, 70-3000%, 80-3000%, 90-3000%, 100-3000%, 120-3000%, 150-3000%, 180-3000%, 200-3000%, 400-3000%, 600-3000%, 800-3000%, 1000-3000%, 1200-3000%, 1500-3000%, 1800-3000%, 1900-3000%, 2000-3000%, 2500-3000%, 20-2500%, 20-2000%, 20-1900%, 20-1800%, 20-1500%, 20-1200%, 20-1000%, 20-800%, 20-600%, 20-400%, 20-200%, 20-180%, 20-150%, 20-120%, 20-100%, 20-80%, 20-60%, 20-40%, 10-2000%, 10-1900%, 10-1800%, 10-1500%, 10-1200%, 10-1000%, 10-800%, 10-600%, 10-400%, 10-200%, 10-180%, 10-150%, 10-120%, 10-100%, 10-80%, 10-60%, 10-40%, 10-20%, 5-2000%, 5-1900%, 5-1800%, 5-1500%, 5-1200%, 5-1000%, 5-800%, 5-600%, 5-400%, 5-200%, 5-180%, 5-150%, 5-120%, 5-100%, 5-80%, 5-60%, 5-40%, 5-20%, 5-15%, 5-10%, 50-2500%, 100-2000%, 150-1500%, 200-1000%, 400-800%, 또는 500-700% 더 길다.
특정 실시양태에서, HSA 결합 10Fn3 도메인 융합체의 혈청 반감기는 10Fn3 도메인에 융합되지 않은 경우 모이어티의 혈청 반감기보다 적어도 1.1-배, 1.2-배, 1.3-배, 1.4-배, 1.5-배, 1.6-배, 1.7-배, 1.8-배, 1.9-배, 2-배, 2.5-배, 3-배, 3.5배, 4-배, 4.5-배, 5-배, 6-배, 7-배, 8-배, 10-배, 12-배, 13-배, 15-배, 17-배, 20-배, 22-배, 25-배, 27-배, 30-배, 35-배, 40-배, 또는 50-배 더 크다.
특정 실시양태에서, HSA 결합 10Fn3 도메인 융합체의 혈청 반감기는 10Fn3 도메인에 융합되지 않은 경우 모이어티의 혈청 반감기보다 1.5-50배, 예컨대 1.5-40배, 1.5-35배, 1.5-30배, 1.5-27배, 1.5-25배, 1.5-22배, 1.5-20배, 1.5-17배, 1.5-15배, 1.5-13배, 1.5-12배, 1.5-10배, 1.5-9배, 1.5-8배, 1.5-7배, 1.5-6배, 1.5-5배, 1.5-4.5배, 1.5-4배, 1.5-3.5배, 1.5-3배, 1.5-2.5배, 1.5-2배, 2-50배, 2.5-50배, 3-50배, 3.5-50배, 4-50배, 4.5-50배, 5-50배, 6-50배, 7-50배, 8-50배, 10-50배, 12-50배, 13-50배, 15-50배, 17-50배, 20-50배, 22-50배, 25-50배, 27-50배, 30-50배, 40-50배, 2-40배, 5-35배, 10-20배, 또는 10-15배 더 크다.
특정 실시양태에서, HSA 결합 10Fn3 도메인 융합체의 혈청 반감기는 적어도 2시간, 2.5시간, 3시간, 4시간, 5시간, 6시간, 7시간, 8시간, 9시간, 10시간, 15시간, 20시간, 25시간, 30시간, 35시간, 40시간, 50시간, 60시간, 70시간, 80시간, 90시간, 100시간, 110시간, 120시간, 130시간, 135시간, 140시간, 150시간, 160시간, 또는 200시간이다. 특정 실시양태에서, HSA 결합 애드넥틴 융합체의 혈청 반감기는 2-200시간, 2.5-200시간, 3-200시간, 4-200시간, 5-200시간, 6-200시간, 7-200시간, 8-200시간, 9-200시간, 10-200시간, 15-200시간, 20-200시간, 25-200시간, 30-200시간, 35-200시간, 40-200시간, 50-200시간, 60-200시간, 70-200시간, 80-200시간, 90-200시간, 100-200시간, 125-200시간, 150-200시간, 175-200시간, 190-200시간, 2-190시간, 2-175시간, 2-150시간, 2-125시간, 2-100시간, 2-90시간, 2-80시간, 2-70시간, 2-60시간, 2-50시간, 2-40시간, 2-35시간, 2-30시간, 2-25시간, 2-20시간, 2-15시간, 2-10시간, 2-9시간, 2-8시간, 2-7시간, 2-6시간, 2-5시간, 2-4시간, 2-3시간, 5-175시간, 10-150시간, 15-125시간, 20-100시간, 25-75시간, 또는 30-60시간이다.
특정 실시양태에서, HSA 결합 10Fn3 도메인 융합 단백질은 3 μM, 2.5 μM, 2 μM, 1.5 μM, 1 μM, 500 nM, 100 nM, 50 nM, 10 nM, 1 nM, 500 pM, 100 pM, 100 pM, 50 pM 또는 10 pM 미만의 KD로 HSA에 결합한다. KD는, 예를 들어, 0.1 nM 내지 50 nM, 0.1 nM 내지 100 nM, 0.1 nM 내지 1 μM, 0.5 nM 내지 50 nM, 0.5 nM 내지 100 nM, 0.5 nM 내지 1 μM, 1 nM 내지 50 nM, 1 nM 내지 100 nM 또는 1 nM 내지 1 μM의 범위일 수 있다.
특정 실시양태에서, 치료 모이어티는, 예를 들어, 본원에 기재된 바와 같은 중합체 링커 (예를 들어, 상기 섹션 C에 기재된 바와 같은 링커)를 통해 HSA 결합 10Fn3 도메인에 직접 또는 간접적으로 연결될 수 있다. 중합체 링커는 하기 특징 중 하나 이상을 갖는 단백질 융합체를 생성하도록 융합체의 각각의 성분 사이의 거리를 최적으로 변화시키는 데 사용될 수 있다: 1) 관심 단백질에 결합할 때, 1개 이상의 단백질 도메인의 결합의 감소된 또는 증가된 입체 장애, 2) 증가된 단백질 안정성 또는 용해도, 3) 감소된 단백질 응집, 및 4) 단백질의 증가된 전체 결합력 또는 친화도.
2종의 애드넥틴을 연결하는 링커 중 어느 것, 예를 들어, 본원의 섹션 C에 기재된 것은 애드넥틴을 이종 모이어티, 예컨대 폴리펩티드에 연결하는 데 사용될 수 있다.
특정 실시양태에서, 모이어티, 예를 들어, 폴리펩티드는 혈액 또는 표적 조직 내의 프로테아제에 의해 절단가능한 프로테아제 부위를 갖는 폴리펩티드 링커를 통해 HSA 결합 애드넥틴에 연결된다. 이러한 실시양태는 보다 우수한 전달 또는 치료 특성 또는 보다 효율적인 생산을 위해 치료 단백질을 방출시키는 데 사용될 수 있다.
추가의 링커 또는 스페이서는 10Fn3 도메인과 폴리펩티드 링커 사이의 10Fn3 도메인의 C-말단에 도입될 수 있다.
특정 실시양태에서, 치료 모이어티는 생체적합성 중합체 예컨대 중합체 당을 통해 HSA 결합 10Fn3 도메인에 연결된다. 중합체 당은 혈액 또는 표적 조직 내의 효소에 의해 절단가능한 효소적 절단 부위를 포함할 수 있다. 이러한 실시양태는 보다 우수한 전달 또는 치료 특성 또는 보다 효율적인 생산을 위해 치료 단백질을 방출시키는 데 사용될 수 있다.
본원에 기재된 HSA 결합 10Fn3 도메인 융합 분자는 치료 모이어티와 HSA 결합 10Fn3 도메인 사이에 융합체를 생성함으로써 치료 모이어티의 반감기를 증가시키는 데 유용하다. 이러한 융합 분자는 융합체에 함유된 치료 모이어티의 생물학적 활성에 반응하는 상태를 치료하는 데 사용될 수 있다. 따라서, 하기 단백질 또는 분자 중 어느 것의 조절이상에 의해 유발되는 질환에서의 HSA 결합 10Fn3 도메인 융합 분자의 용도가 본원에 제공된다.
특정 실시양태에서, HSA 결합 10Fn3 도메인에 (C-말단 또는 N-말단) 연결된 치료 모이어티는 VEGF, VEGF-R1, VEGF-R2, VEGF-R3, Her-1, Her-2, Her-3, EGF-I, EGF-2, EGF-3, 알파3, cMet, ICOS, CD40L, LFA-I, c-Met, ICOS, LFA-I, IL-6, B7.1, W1.2, OX40, IL-1b, TACI, IgE, BAFF 또는 BLys, TPO-R, CD19, CD20, CD22, CD33, CD28, IL-I-R1, TNF-알파, TRAIL-R1, 보체 수용체 1, FGFa, 오스테오폰틴, 비트로넥틴, 에프린 A1-A5, 에프린 B1-B3, 알파-2-마크로글로불린, CCL1, CCL2, CCL3, CCL4, CCL5, CCL6, CCL7, CXCL8, CXCL9, CXCL10, CXCL11, CXCL12, CCL13, CCL14, CCL15, CXCL16, CCL16, CCL17, CCL18, CCL19, CCL20, CCL21, CCL22, PDGF, TGFb, GMCSF, SCF, p40 (IL12/IL23), IL1b, IL1a, IL1ra, IL2, IL3, IL4, IL5, IL6, IL8, IL10, IL12, IL15, IL23, Fas, FasL, Flt3 리간드, 41BB, ACE, ACE-2, KGF, FGF-7, SCF, 네트린1,2, IFNa,b,g, 카스파제-2,3,7,8,10, ADAM S1,S5,8,9,15,TS1,TS5; 아디포넥틴, ALCAM, ALK-I, APRIL, 아넥신 V, 안지오제닌, 암피레귤린, 안지오포이에틴-1,2,4, B7-1/CD80, B7-2/CD86, B7-H1, B7-H2, B7-H3, Bcl-2, BACE-I, BAK, BCAM, BDNF, bNGF, bECGF, BMP2,3,4,5,6,7,8; CRP, 카드헤린 6, 8, 11; 카텝신 A,B,C,D,E,L,S,V,X; CD11a/LFA-1, LFA-3, GP2b3a, GH 수용체, RSV F 단백질, IL-23 (p40, p19), IL-12, CD80, CD86, CD28, CTLA-4, 알파4-베타1, 알파4-베타7, TNF/림프독소, IgE, CD3, CD20, IL-6, IL-6R, BLYS/BAFF, IL-2R, HER2, EGFR, CD33, CD52, 디곡신, Rho (D), 바리셀라, 헤파타이티스, CMV, 테타누스, 백시니아, 항뱀독소, 보툴리눔, Trail-R1, Trail-R2, cMet, TNF-R 패밀리, 예컨대 LA NGF-R, CD27, CD30, CD40, CD95, 림프독소 a/b 수용체, WsI-I, TL1A/TNFSF15, BAFF, BAFF-R/TNFRSF13C, TRAIL R2/TNFRSF10B, TRAIL R2/TNFRSF10B, Fas/TNFRSF6 CD27/TNFRSF7, DR3/TNFRSF25, HVEM/TNFRSF14, TROY/TNFRSF19, CD40 리간드/TNFSF5, BCMA/TNFRSF17, CD30/TNFRSF8, LIGHT/TNFSF14, 4-1BB/TNFRSF9, CD40/TNFRSF5, GITR/[감마]NFRSF 18, 오스테오프로테게린/TNFRSF1 IB, RANK/TNFRSF1 IA, TRAIL R3/TNFRSF10C, TRAIL/TNFSFIO, TRANCE/RANK L/TNFSF11, 4-1BB 리간드/TNFSF9, TWEAK/TNFSF12, CD40 리간드/TNFSFS, Fas 리간드/TNFSF6, RELT/TNFRSF19L, APRIL/TNFSF13, DcR3/TNFRSF6B, TNF RI/TNFRSFIA, TRAIL R1/TNFRSFIOA, TRAIL R4/TNFRSF10D, CD30 리간드/TNFSF8, GITR 리간드/TNFSF18, TNFSF18, TACI/TNFRSF13B, NGF R/TNFRSF16, OX40 리간드/TNFSF4, TRAIL R2/TNFRSF10B, TRAIL R3/TNFRSF10C, TWEAK R/TNFRSF12, BAFF/BLyS/TNFSF13, DR6/TNFRSF21, TNF-알파/TNFSF1 A, 프로-TNF-알파/TNFSF1A, 림프독소 베타 R/TNFRSF3, 림프독소 베타 R (LTbR)/Fc 키메라, TNF RI/TNFRSFIA, TNF-베타/TNFSF1B, PGRP-S, TNF RI/TNFRSFIA, TNF RII/TNFRSFIB, EDA-A2, TNF-알파/TNFSFIA, EDAR, XEDAR, TNF RI/TNFRSFIA이다.
특정 실시양태에서, HSA 결합 10Fn3 도메인에 (C-말단 또는 N-말단) 연결된 치료 모이어티는 하기 단백질 또는 그에 결합하는 단백질 중 어느 것이다: 4EBP1, 14-3-3 제타, 53BP1, 2B4/SLAMF4, CCL21/6Ckine, 4-1BB/TNFRSF9, 8D6A, 4-1BB 리간드/TNFSF9, 8-옥소-dG, 4-아미노-1,8-나프탈이미드, A2B5, 아미노펩티다제 LRAP/ERAP2, A33, 아미노펩티다제 N/ANPEP, Aag, 아미노펩티다제 P2/XPNPEP2, ABCG2, 아미노펩티다제 P1/XPNPEP1, ACE, 아미노펩티다제 PILS/ARTS1, ACE-2, 암니온레스, 액틴, 암피레귤린, 베타-액틴, AMPK 알파 1/2, 액티빈 A, AMPK 알파 1, 액티빈 AB, AMPK 알파 2, 액티빈 B, AMPK 베타 1, 액티빈 C, AMPK 베타 2, 액티빈 RIA/ALK-2, 안드로겐 R/NR3C4, 액티빈 RIB/ALK-4, 안지오제닌, 액티빈 RIIA, 안지오포이에틴-1, 액티빈 RIIB, 안지오포이에틴-2, ADAMS, 안지오포이에틴-3, ADAM9, 안지오포이에틴-4, ADAM10, 안지오포이에틴-유사 1, ADAM12, 안지오포이에틴-유사 2, ADAM15, 안지오포이에틴-유사 3, TACE/ADAM17, 안지오포이에틴-유사 4, ADAM19, 안지오포이에틴-유사 7/CDT6, ADAM33, 안지오스타틴, ADAMTS4, 아넥신 A1/아넥신 I, ADAMTS5, 아넥신 A7, ADAMTS1, 아넥신 A10, ADAMTSL-1/펑틴, 아넥신 V, 아디포넥틴/Acrp30, ANP, AEBSF, AP 부위, 아그레칸, APAF-I, 아그린, APC, AgRP, APE, AGTR-2, APJ, AIF, APLP-I, Akt, APLP-2, Akt1, 아포지단백질 AI, Akt2, 아포지단백질 B, Akt3, APP, 혈청 알부민, APRIL/TNFSF13, ALCAM, ARC, ALK-I, 아르테민, ALK-7, 아릴술파타제 AJARSA, 알칼리성 포스파타제, ASAH2/N-아실스핑고신 아미도히드롤라제-2, 알파 2u-글로불린, ASC, 알파-1-산 당단백질, ASGR1, 알파-태아단백질, ASK1, ALS, ATM, 사기질모세포성 ATRIP, AMICA/JAML, 오로라 A, AMIGO, 오로라 B, AMIG02, 액신-1, AMIG03, AxI, 아미노아실라제/ACY1, 아주로시딘/CAP37/HBP, 아미노펩티다제 A/ENPEP, B4GALT1, BIM, B7-1/CD80, 6-비오틴-17-NAD, B7-2/CD86, BLAME/SLAMF8, B7-H1/PD-L1, CXCL13/BLC/BCA-1, B7-H2, BLIMP1, B7-H3, BIk, B7-H4, BMI-I, BACE-I, BMP-1/PCP, BACE-2, BMP-2, Bad, BMP-3, BAFF/TNFSF13B, BMP-3b/GDF-10, BAFF R/TNFRSF 13C, BMP-4, Bag-1, BMP-5, BAK, BMP-6, BAMBI/NMA, BMP-7, BARD 1, BMP-8, Bax, BMP-9, BCAM, BMP-10, Bcl-10, BMP-15/GDF-9B, Bcl-2, BMPR-IA/ALK-3, Bcl-2 관련 단백질 A1, BMPR-IB/ALK-6, Bcl-w, BMPR-II, Bcl-x, BNIP3L, Bcl-xL, BOC, BCMA/TNFRSF17, BOK, BDNF, BPDE, 벤즈아미드, 브라키우리, 공통 베타 쇄, B-Raf, 베타 IG-H3, CXCL14/BRAK, 베타셀룰린, BRCA1, 베타-데펜신 2, BRCA2, BID, BTLA, 비글리칸, Bub-1, Bik-유사 킬러 단백질, c-jun, CD90/Thyl, c-Rel, CD94, CCL6/C10, CD97, CIq R1/CD93, CD151, CIqTNF1, CD160, ClqTNF4, CD163, ClqTNF5, CD164, 보체 성분 CIr, CD200, 보체 성분 CIs, CD200 R1, 보체 성분 C2, CD229/SLAMF3, 보체 성분 C3a, CD23/Fc 엡실론 R11, 보체 성분 C3d, CD2F-10/SLAMF9, 보체 성분 C5a, CD5L, 카드헤린-4/R-카드헤린, CD69, 카드헤린-6, CDC2, 카드헤린-8, CDC25A, 카드헤린-11, CDC25B, 카드헤린-12, CDCP1, 카드헤린-13, CDO, 카드헤린-17, CDX4, E-카드헤린, CEACAM-1/CD66a, N-카드헤린, CEACAM-6, P-카드헤린, 세르베루스 1, VE-카드헤린, CFTR, 칼빈딘 D, cGMP, 칼시뉴린 A, Chem R23, 칼시뉴린 B, 케메린, 칼레티쿨린-2, 케모카인 샘플러 팩, CaM 키나제 II, 키티나제 3-유사 1, cAMP, 키토트리오시다제/CHIT1, 칸나비노이드 R1, Chk1, 칸나비노이드 R2/CB2/CNR2, Chk2, CAR/NR1I3, CHL-1/L1CAM-2, 탄산 안히드라제 I, 콜린 아세틸트랜스퍼라제/CbAT, 탄산 안히드라제 II, 콘드로렉틴, 탄산 안히드라제 III, 코르딘, 탄산 안히드라제 IV, 코르딘-유사 1, 탄산 안히드라제 VA, 코르딘-유사 2, 탄산 안히드라제 VB, CINC-I, 탄산 안히드라제 VI, CINC-2, 탄산 안히드라제 VII, CINC-3, 탄산 안히드라제 VIII, 클라스핀, 탄산 안히드라제 IX, 클라우딘-6, 탄산 안히드라제 X, CLC, 탄산 안히드라제 XII, CLEC-I, 탄산 안히드라제 XIII, CLEC-2, 탄산 안히드라제 XIV, CLECSF 13/CLEC4F, 카르복시메틸 리신, CLECSF8, 카르복시펩티다제 A1/CPA1, CLF-I, 카르복시펩티다제 A2, CL-P1/COLEC12, 카르복시펩티다제 A4, 클루스테린, 카르복시펩티다제 B1, 클루스테린-유사 1, 카르복시펩티다제 E/CPE, CMG-2, 카르복시펩티다제 X1, CMV UL146, 카디오트로핀-1, CMV UL147, 카르노신 디펩티다제 1, CNP, 카론테, CNTF, CART, CNTF R 알파, 카스파제, 응고 인자 II/트롬빈, 카스파제-1, 응고 인자 I11/조직 인자, 카스파제-2, 응고 인자 VII, 카스파제-3, 응고 인자 X, 카스파제-4, 응고 인자 XI, 카스파제-6, 응고 인자 XIV/단백질 C, 카스파제-7, COCO, 카스파제-8, 코헤신, 카스파제-9, 콜라겐 I, 카스파제-10, 콜라겐 II, 카스파제-12, 콜라겐 IV, 카스파제-13, 공통 감마 쇄/IL-2 R 감마, 카스파제 펩티드 억제제, COMP/트롬보스폰딘-5, 카탈라제, 보체 성분 CIrLP, 베타-카테닌, 보체 성분 CIqA, 카텝신 1, 보체 성분 CIqC, 카텝신 3, 보체 인자 D, 카텝신 6, 보체 인자 I, 카텝신 A, 보체 MASP3, 카텝신 B, 코넥신 43, 카텝신 C/DPPI, 콘탁틴-1, 카텝신 D, 콘탁틴-2/TAG1, 카텝신 E, 콘탁틴-4, 카텝신 F, 콘탁틴-5, 카텝신 H, 코린, 카텝신 L, 코르눌린, 카텝신 O, CORS26/ClqTNF,3, 카텝신 S, 래트 피질 줄기 세포, 카텝신 V, 코르티솔, 카텝신 XITJ?, COUP-TF I/NR2F1, CBP, COUP-TF II/NR2F2, CCI, COX-I, CCK-A R, COX-2, CCL28, CRACC/SLAMF7, CCR1, C-반응성 단백질, CCR2, 크레아틴 키나제, 근육/CKMM, CCR3, 크레아티닌, CCR4, CREB, CCR5, CREG, CCR6, CRELD1, CCR7, CRELD2, CCR8, CRHBP, CCR9, CRHR-I, CCR10, CRIM1, CD155/PVR, 크립토, CD2, CRISP-2, CD3, CRISP-3, CD4, 크로스베인레스-2, CD4+/45RA-, CRTAM, CD4+/45RO, CRTH-2, CD4+/CD62L-/CD44, CRY1, CD4+/CD62L+/CD44, 크립틱(Cryptic), CD5, CSB/ERCC6, CD6, CCL27/CTACK, CD8, CTGF/CCN2, CD8+/45RA-, CTLA-4, CD8+/45RO-, 쿠빌린, CD9, CX3CR1, CD14, CXADR, CD27/TNFRSF7, CXCL16, CD27 리간드/TNFSF7, CXCR3, CD28, CXCR4, CD30/TNFRSF8, CXCR5, CD30 리간드/TNFSF8, CXCR6, CD31/PECAM-1, 시클로필린 A, CD34, Cyr61/CCN1, CD36/SR-B3, 시스타틴 A, CD38, 시스타틴 B, CD40/TNFRSF5, 시스타틴 C, CD40 리간드/TNFSF5, 시스타틴 D, CD43, 시스타틴 E/M, CD44, 시스타틴 F, CD45, 시스타틴 H, CD46, 시스타틴 H2, CD47, 시스타틴 S, CD48/SLAMF2, 시스타틴 SA, CD55/DAF, 시스타틴 SN, CD58/LFA-3, 시토크롬 c, CD59, 아포시토크롬 c, CD68, 홀로시토크롬 c, CD72, 시토케라틴 8, CD74, 시토케라틴 14, CD83, 시토케라틴 19, CD84/SLAMF5, 시토닌, D6, DISP1, DAN, Dkk-1, DANCE, Dkk-2, DARPP-32, Dkk-3, DAX1/NR0B1, Dkk-4, DCC, DLEC, DCIR/CLEC4A, DLL1, DCAR, DLL4, DcR3/TNFRSF6B, d-루시페린, DC-SIGN, DNA 리가제 IV, DC-SIGNR/CD299, DNA 폴리머라제 베타, DcTRAIL R1/TNFRSF23, DNAM-I, DcTRAIL R2/TNFRSF22, DNA-PKcs, DDR1, DNER, DDR2, 도파 데카르복실라제/DDC, DEC-205, DPCR-I, 데카펜타플레직, DPP6, 데코린, DPP A4, 덱틴-1/CLEC7A, DPPA5/ESG1, 덱틴-2/CLEC6A, DPPII/QPP/DPP7, DEP-1/CD148, DPPIV/CD26, 데저트 헤지호그, DR3/TNFRSF25, 데스민, DR6/TNFRSF21, 데스모글레인-1, DSCAM, 데스모글레인-2, DSCAM-L1, 데스모글레인-3, DSPG3, 디쉐블드-1, Dtk, 디쉐블드-3, 다이나민, EAR2/NR2F6, EphA5, ECE-I, EphA6, ECE-2, EphA7, ECF-L/CHI3L3, EphA8, ECM-I, EphB1, 에코틴, EphB2, EDA, EphB3, EDA-A2, EphB4, EDAR, EphB6, EDG-I, 에프린, EDG-5, 에프린-A1, EDG-8, 에프린-A2, eEF-2, 에프린-A3, EGF, 에프린-A4, EGF R, 에프린-A5, EGR1, 에프린-B, EG-VEGF/PK1, 에프린-B1, eIF2 알파, 에프린-B2, eIF4E, 에프린-B3, EIk-I, 에피겐, EMAP-II, 에피모르핀/신탁신 2, EMMPRIN/CD147, 에피레귤린, CXCL5/ENA, EPR-1/Xa 수용체, 엔도칸, ErbB2, 엔도글린/CD105, ErbB3, 엔도글리칸, ErbB4, 엔도뉴클레아제 III, ERCC1, 엔도뉴클레아제 IV, ERCC3, 엔도뉴클레아제 V, ERK1/ERK2, 엔도뉴클레아제 VIII, ERK1, 엔도레펠린/페를레칸, ERK2, 엔도스타틴, ERK3, 엔도텔린-1, ERK5/BMK1, 엔그레일드-2, ERR 알파/NR3B1, EN-RAGE, ERR 베타/NR3B2, 엔테로펩티다제/엔테로키나제, ERR 감마/NR3B3, CCL1 1/에오탁신, 에리트로포이에틴, CCL24/에오탁신-2, 에리트로포이에틴 R, CCL26/에오탁신-3, ESAM, EpCAM/TROP-1, ER 알파/NR3A1, EPCR, ER 베타/NR3A2, Eph, 엑소뉴클레아제 III, EphA1, 엑소스토신-유사 2/EXTL2, EphA2, 엑소스토신-유사 3/EXTL3, EphA3, FABP1, FGF-BP, FABP2, FGF R1-4, FABP3, FGF R1, FABP4, FGF R2, FABP5, FGF R3, FABP7, FGF R4, FABP9, FGF R5, 보체 인자 B, Fgr, FADD, FHR5, FAM3A, 피브로넥틴, FAM3B, 피콜린-2, FAM3C, 피콜린-3, FAM3D, FITC, 섬유모세포 활성화 단백질 알파/FAP, FKBP38, Fas/TNFRSF6, Flap, Fas 리간드/TNFSF6, FLIP, FATP1, FLRG, FATP4, FLRT1, FATP5, FLRT2, Fc 감마 R1/CD64, FLRT3, Fc 감마 RIIB/CD32b, Flt-3, Fc 감마 RIIC/CD32c, Flt-3 리간드, Fc 감마 RIIA/CD32a, 폴리스타틴, Fc 감마 RIII/CD16, 폴리스타틴-유사 1, FcRH1/IRTA5, FosB/G0S3, FcRH2/IRTA4, FoxD3, FcRH4/IRTA1, FoxJ1, FcRH5/IRTA2, FoxP3, Fc 수용체-유사 3/CD16-2, Fpg, FEN-I, FPR1, 페투인 A, FPRL1, 페투인 B, FPRL2, FGF 산성, CX3CL1/프랙탈카인, FGF 염기성, 프리즐드-1, FGF-3, 프리즐드-2, FGF-4, 프리즐드-3, FGF-5, 프리즐드-4, FGF-6, 프리즐드-5, FGF-8, 프리즐드-6, FGF-9, 프리즐드-7, FGF-10, 프리즐드-8, FGF-11, 프리즐드-9, FGF-12, Frk, FGF-13, sFRP-1, FGF-16, sFRP-2, FGF-17, sFRP-3, FGF-19, sFRP-4, FGF-20, 푸린, FGF-21, FXR/NR1H4, FGF-22, Fyn, FGF-23, G9a/EHMT2, GFR 알파-3/GDNF R 알파-3, GABA-A-R 알파 1, GFR 알파-4/GDNF R 알파-4, GABA-A-R 알파 2, GITR/TNFRSF18, GABA-A-R 알파 4, GITR 리간드/TNFSF18, GABA-A-R 알파 5, GLI-I, GABA-A-R 알파 6, GLI-2, GABA-A-R 베타 1, GLP/EHMT1, GABA-A-R 베타 2, GLP-I R, GABA-A-R 베타 3, 글루카곤, GABA-A-R 감마 2, 글루코사민 (N-아세틸)-6-술파타제/GNS, GABA-B-R2, GIuR1, GAD1/GAD67, GluR2/3, GAD2/GAD65, GluR2, GADD45 알파, GluR3, GADD45 베타, Glut1, GADD45 감마, Glut2, 갈렉틴-1, Glut3, 갈렉틴-2, Glut4, 갈렉틴-3, Glut5, 갈렉틴-3 BP, 글루타레독신 1, 갈렉틴-4, 글리신 R, 갈렉틴-7, 글리코포린 A, 갈렉틴-8, 글리피칸 2, 갈렉틴-9, 글리피칸 3, GalNAc4S-6ST, 글리피칸 5, GAP-43, 글리피칸 6, GAPDH, GM-CSF, Gas1, GM-CSF R 알파, Gas6, GMF-베타, GASP-1/WFIKKNRP, gpl30, GASP-2/WFIKKN, 글리코겐 포스포릴라제 BB/GPBB, GATA-I, GPR15, GATA-2, GPR39, GATA-3, GPVI, GATA-4, GR/NR3C1, GATA-5, Gr-1/Ly-6G, GATA-6, 그라눌리신, GBL, 그랜자임 A, GCNF/NR6A1, 그랜자임 B, CXCL6/GCP-2, 그랜자임 D, G-CSF, 그랜자임 G, G-CSF R, 그랜자임 H, GDF-I, GRASP, GDF-3 GRB2, GDF-5, 그렘린, GDF-6, GRO, GDF-7, CXCL1/GRO 알파, GDF-8, CXCL2/GRO 베타, GDF-9, CXCL3/GRO 감마, GDF-11, 성장 호르몬, GDF-15, 성장 호르몬 R, GDNF, GRP75/HSPA9B, GFAP, GSK-3 알파/베타, GFI-I, GSK-3 알파, GFR 알파-1/GDNF R 알파-1, GSK-3 베타, GFR 알파-2/GDNF R 알파-2, EZFIT, H2AX, 히스티딘, H60, HM74A, HAI-I, HMGA2, HAI-2, HMGB1, HAI-2A, TCF-2/HNF-1 베타, HAI-2B, HNF-3 베타/FoxA2, HAND1, HNF-4 알파/NR2A1, HAPLN1, HNF-4 감마/NR2A2, 기도 트립신-유사 프로테아제/HAT, HO-1/HMOX1/HSP32, HB-EGF, HO-2/HMOX2, CCL 14a/HCC-1, HPRG, CCL14b/HCC-3, Hrk, CCL16/HCC-4, HRP-I, 알파 HCG, HS6ST2, Hck, HSD-I, HCR/CRAM-A/B, HSD-2, HDGF, HSP 10/EPF, 헤모글로빈, HSP27, 헤파소신, HSP60, HES-1, HSP70, HES-4, HSP90, HGF, HTRA/프로테아제 Do, HGF 활성화제, HTRA1/PRSS11, HGF R, HTRA2/0 ml, HIF-I 알파, HVEM/TNFRSF14, HIF-2 알파, 히알루로난, HIN-1/세크레토글로불린 3A1, 4-히드록시노넨알, Hip, CCL1/I-309/TCA-3, IL-IO, cIAP (범), IL-IO R 알파, cIAP-1/HIAP-2, IL-10 R 베타, cIAP-2/HIAP-1, IL-11, IBSP/시알로단백질 II, EL-11 R 알파, ICAM-1/CD54, IL-12, ICAM-2/CD102, IL-12/IL-23 p40, ICAM-3/CD50, IL-12 R 베타 1, ICAM-5, IL-12 R 베타 2, ICAT, IL-13, ICOS, IL-13 R 알파 1, 이두로네이트 2-술파타제/EOS, IL-13 R 알파 2, EFN, IL-15, IFN-알파, IL-15 R 알파, IFN-알파 1, IL-16, IFN-알파 2, IL-17, IFN-알파 4b, IL-17 R, IFN-알파 A, IL-17 RC, IFN-알파 B2, IL-17 RD, IFN-알파 C, IL-17B, IFN-알파 D, IL-17B R, IFN-알파 F, IL-17C, IFN-알파 G, IL-17D, IFN-알파 H2, IL-17E, IFN-알파 I, IL-17F, IFN-알파 J1, IL-18/IL-1F4, IFN-알파 K, IL-18 BPa, IFN-알파 WA, IL-18 BPc, IFN-알파/베타 R1, IL-18 BPd, IFN-알파/베타 R2, IL-18 R 알파/IL-1 R5, IFN-베타, IL-18 R 베타/IL-1 R7, IFN-감마, IL-19, IFN-감마 R1, IL-20, IFN-감마 R2, IL-20 R 알파, IFN-오메가, IL-20 R 베타, IgE, IL-21, IGFBP-I, IL-21 R, IGFBP-2, IL-22, IGFBP-3, IL-22 R, IGFBP-4, IL-22BP, IGFBP-5, IL-23, IGFBP-6, IL-23 R, IGFBP-L1, IL-24, IGFBP-rp1/IGFBP-7, IL-26/AK155, IGFBP-rPIO, IL-27, IGF-I, EL-28A, IGF-I R, IL-28B, IGF-II, IL-29/EFN-람다 1, IGF-II R, IL-31, IgG, EL-31 RA, IgM, IL-32 알파, IGSF2, IL-33, IGSF4A/SynCAM, ILT2/CD85J, IGSF4B, ILT3/CD85k, IGSF8, ILT4/CD85d, IgY, ILT5/CD85a, IkB-베타, ILT6/CD85e, IKK 알파, 인디안 헤지호그, IKK 엡실론, INSRR, EKK 감마, 인슐린, IL-1 알파/IL-IF1, 인슐린 R/CD220, IL-1 베타/IL-1F2, 프로인슐린, IL-1ra/IL-1F3, 인슐리신/EDE, IL-1F5/FIL1 델타, 인테그린 알파 2/CD49b, IL-1F6/FIL1 엡실론, 인테그린 알파 3/CD49c, IL-1F7/FIL1 제타, 인테그린 알파 3 베타 1/VLA-3, IL-1F8/FIL1 에타, 인테그린 알파 4/CD49d, IL-1F9/IL-1 H1, 인테그린 알파 5/CD49e, IL-1F10/IL-1HY2, 인테그린 알파 5 베타 1, IL-I RI, 인테그린 알파 6/CD49f, IL-I RII, 인테그린 알파 7, IL-I R3/IL-1 R AcP, 인테그린 알파 9, IL-I R4/ST2, 인테그린 알파 E/CD103, IL-I R6/IL-1 R rp2, 인테그린 알파 L/CD1 Ia, IL-I R8, 인테그린 알파 L 베타 2, IL-I R9, 인테그린 알파 M/CD1 Ib, IL-2, 인테그린 알파 M 베타 2, IL-2 R 알파, 인테그린 알파 V/CD51, IL-2 R 베타, 인테그린 알파 V 베타 5, IL-3, 인테그린 알파 V 베타 3, IL-3 R 알파, 인테그린 알파 V 베타 6, IL-3 R 베타, 인테그린 알파 XJCD1 Ic, IL-4, 인테그린 베타 1/CD29, IL-4 R, 인테그린 베타 2/CD18, IL-5, 인테그린 베타 3/CD61, IL-5 R 알파, 인테그린 베타 5, IL-6, 인테그린 베타 6, IL-6 R, 인테그린 베타 7, IL-7, CXCL10/EP-10/CRG-2, IL-7 R 알파/CD127, IRAKI, CXCR1/IL-8 RA, IRAK4, CXCR2/IL-8 RB, ERS-I, CXCL8/IL-8, Islet-1, IL-9, CXCL1 1/I-TAC, IL-9 R, 재기드 1, JAM-4/IGSF5, 재기드 2, JNK, JAM-A, JNK1/JNK2, JAM-B/VE-JAM, JNK1, JAM-C, JNK2, 키니노겐, 칼리크레인 3/PSA, 키니노스타틴, 칼리크레인 4, KER/CD158, 칼리크레인 5, KER2D1, 칼리크레인 6/뉴로신, KIR2DL3, 칼리크레인 7, KIR2DL4/CD158d, 칼리크레인 8/뉴롭신, KIR2DS4, 칼리크레인 9, KIR3DL1, 혈장 칼리크레인/KLKB1, KER3DL2, 칼리크레인 10, 키렐2, 칼리크레인 11, KLF4, 칼리크레인 12, KLF5, 칼리크레인 13, KLF6, 칼리크레인 14, 클로토, 칼리크레인 15, 클로토 베타, KC, KOR, Keap1, 크레멘-1, KeI1, 크레멘-2, KGF/FGF-7, LAG-3, LINGO-2, LAIR1, 리핀 2, LAIR2, 리포칼린-1, 라미닌 알파 4, 리포칼린-2/NGAL, 라미닌 감마 1,5-리폭시게나제, 라미닌 I, LXR 알파/NR1H3, 라미닌 S, LXR 베타/NR1H2, 라미닌-1, 리빈, 라미닌-5, LEX, LAMP, LMIR1/CD300A, 랑게린, LMIR2/CD300c, LAR, LMIR3/CD300LF, 라텍신, LMIR5/CD300LB, 라일린, LMIR6/CD300LE, LBP, LMO2, LDL R, LOX-1/SR-E1, LECT2, LRH-1/NR5A2, LEDGF, LRIG1, 레프티, LRIG3, 레프티-1, LRP-I, 레프티-A, LRP-6, 레구마인, LSECtin/CLEC4G, 렙틴, 루미칸, 렙틴 R, CXCL15/렁카인, 류코트리엔 B4, XCL1/림포탁틴, 류코트리엔 B4 R1, 림프독소, LEF, 림프독소 베타/TNFSF3, LIF R 알파, 림프독소 베타 R/TNFRSF3, LIGHT/TNFSF14, Lyn, 리미틴, Lyp, LIMPII/SR-B2, 리실 옥시다제 상동체 2, LIN-28, LYVE-I, LINGO-I, 알파 2-마크로글로불린, CXCL9/MIG, MAD2L1, 미메칸, MAdCAM-1, 민딘, MafB, 미네랄로코르티코이드 R/NR3C2, MafF, CCL3L1/MIP-1 알파 이소형 LD78 베타, MafG, CCL3/MIP-1 알파, MafK, CCL4L1/LAG-1, MAG/Siglec-4-a, CCL4/MIP-1 베타, MANF, CCL15/MEP-1 델타, MAP2, CCL9/10/MIP-1 감마, MAPK, MIP-2, 마랍신/판크레아신, CCL19/MIP-3 베타, MARCKS, CCL20/MIP-3 알파, MARCO, MIP-I, Mash1, MIP-II, 마트릴린-2, MIP-III, 마트릴린-3, MIS/AMH, 마트릴린-4, MIS RII, 매트립타제/ST14, MIXL1, MBL, MKK3/MKK6, MBL-2, MKK3, 멜라노코르틴 3R/MC3R, MKK4, MCAM/CD146, MKK6, MCK-2, MKK7, McI-I, MKP-3, MCP-6, MLH-I, CCL2/MCP-1, MLK4 알파, MCP-11, MMP, CCL8/MCP-2, MMP-1, CCL7/MCP-3/MARC, MMP-2, CCL13/MCP-4, MMP-3, CCL12/MCP-5, MMP-7, M-CSF, MMP-8, M-CSF R, MMP-9, MCV-유형 II, MMP-IO, MD-I, MMP-I 1, MD-2, MMP-12, CCL22/MDC, MMP-13, MDL-1/CLEC5A, MMP-14, MDM2, MMP-15, MEA-I, MMP-16/MT3-MMP, MEK1/MEK2, MMP-24/MT5-MMP, MEK1, MMP-25/MT6-MMP, MEK2, MMP-26, 멜루신, MMR, MEPE, MOG, 메프린 알파, CCL23/MPIF-1, 메프린 베타, M-Ras/R-Ras3, Mer, Mrel 1, 메소텔린, MRP1 메테오린, MSK1/MSK2, 메티오닌 아미노펩티다제 1, MSK1, 메티오닌 아미노펩티다제, MSK2, 메티오닌 아미노펩티다제 2, MSP, MFG-E8, MSP R/Ron, MFRP, Mug, MgcRacGAP, MULT-I, MGL2, 무사시-1, MGMT, 무사시-2, MIA, MuSK, MICA, MutY DNA 글리코실라제, MICB, MyD88, MICL/CLEC12A, 미엘로퍼옥시다제, 베타 2 마이크로글로불린, 미오카르딘, 미드카인, 미오실린, MIF, 미오글로빈, NAIP NGFI-B 감마/NR4A3, 나노그, NgR2/NgRH1, CXCL7/NAP-2, NgR3/NgRH2, Nbsl, 니도겐-1/엔탁틴, NCAM-1/CD56, 니도겐-2, NCAM-L1, 산화질소, 넥틴-1, 니트로티로신, 넥틴-2/CD1 12, NKG2A, 넥틴-3, NKG2C, 넥틴-4, NKG2D, 네오게닌, NKp30, 네프릴리신/CDIO, NKp44, 네프릴리신-2/MMEL1/MMEL2, NKp46/NCR1, 네스틴, NKp80/KLRF1, NETO2, NKX2.5, 네트린-1, NMDA R, NR1 서브유닛, 네트린-2, NMDA R, NR2A 서브유닛, 네트린-4, NMDA R, NR2B 서브유닛, 네트린-Gla, NMDA R, NR2C 서브유닛, 네트린-G2a, N-Me-6,7-디OH-TIQ, 뉴레귤린-1/NRG1, 노달, 뉴레귤린-3/NRG3, 노긴, 뉴리틴, Nogo 수용체, 뉴로D1, Nogo-A, 뉴로파신, NOMO, 뉴로게닌-1, Nope, 뉴로게닌-2, 노린, 뉴로게닌-3, eNOS, 뉴로리신, iNOS, 뉴로피신 II, nNOS, 뉴로필린-1, Notch-1, 뉴로필린-2, Notch-2, 뉴로포이에틴, Notch-3, 뉴로트리민, Notch-4, 뉴르투린, NOV/CCN3, NFAM1, NRAGE, NF-H, NrCAM, NFkB1, NRL, NFkB2, NT-3, NF-L, NT-4, NF-M, NTB-A/SLAMF6, NG2/MCSP, NTH1, NGF R/TNFRSF16, 뉴클레오스테민, 베타-NGF, Nurr-1/NR4A2, NGFI-B 알파/NR4A1, OAS2, 오렉신 B, OBCAM, OSCAR, OCAM, OSF-2/페리오스틴, OCIL/CLEC2d, 온코스타틴 M/OSM, OCILRP2/CLEC21, OSM R 베타, Oct-3/4, 오스테오액티빈/GPNMB, OGG1, 오스테오아드헤린, Olig 1, 2, 3, 오스테오칼신, Olig1, 오스테오크린, Olig2, 오스테오폰틴, Olig3, 오스테오프로테게린/TNFRSF1 IB, 핍지교세포 마커 01, Otx2, 핍지교세포 마커 O4, OV-6, OMgp, OX40/TNFRSF4, 옵티신, OX40 리간드/TNFSF4, 오렉신 A, OAS2, 오렉신 B, OBCAM, OSCAR, OCAM, OSF-2/페리오스틴, 0CIL/CLEC2d, 온코스타틴 M/OSM, OCILRP2/CLEC2i, OSM R 베타, Oct-3/4, 오스테오액티빈/GPNMB, OGG1, 오스테오아드헤린, Olig 1, 2, 3, 오스테오칼신, Olig1, 오스테오크린, Olig2, 오스테오폰틴, Olig3, 오스테오프로테게린/TNFRSF1 IB, 핍지교세포 마커 01, Otx2, 핍지교세포 마커 04, OV-6, OMgp, OX40/TNFRSF4, 옵티신, OX40 리간드/TNFSF4, 오렉신 A, RACK1, Ret, Rad1, REV-ERB 알파/NR1D1, Rad17, REV-ERB 베타/NR1D2, Rad51, Rex-1, Rae-1, RGM-A, Rae-1 알파, RGM-B, Rae-1 베타, RGM-C, Rae-1 델타, Rheb, Rae-1 엡실론, 리보솜 단백질 S6, Rae-1 감마, RIP1, Raf-1, ROBO1, RAGE, ROBO2, Ra1A/Ra1B, R0B03, RaIA, ROBO4, RaIB, R0R/NR1F1-3 (범), RANK/TNFRSF1 1A, ROR 알파/NR1F1, CCL5/RANTES, ROR 감마/NR1F3, Rap1A/B, RTK-유사 오르판 수용체 1/ROR1, RAR 알파/NR1B1, RTK-유사 오르판 수용체 2/ROR2, RAR 베타/NR1B2, RP105, RAR 감마/NR1B3, RP A2, Ras, RSK (범), RBP4, RSK1/RSK2, RECK, RSK1, Reg 2/PAP, RSK2, Reg I, RSK3, Reg II, RSK4, Reg III, R-스폰딘 1, Reg I1ia, R-스폰딘 2, Reg IV, R-스폰딘 3, 렐락신-1, RUNX1/CBFA2, 렐락신-2, RUNX2/CBFA1, 렐락신-3, RUNX3/CBFA3, RELM 알파, RXR 알파/NR2B1, RELM 베타, RXR 베타/NR2B2, RELT/TNFRSF19L, RXR 감마/NR2B3, 레지스틴, S1OOAlO, SLITRK5, S100A8, SLPI, S100A9, SMAC/디아블로, S1OOB, Smad1, S1OOP, Smad2, SALL1, Smad3, 델타-사르코글리칸, Smad4, Sca-1/Ly6, Smad5, SCD-I, Smad7, SCF, Smad8, SCF R/c-kit, SMC1, SCGF, 알파-평활근 액틴, SCL/Tall, SMUG1, SCP3/SYCP3, Snail, CXCL12/SDF-1, 나트륨 칼슘 교환제 1, SDNSF/MCFD2, Soggy-1, 알파-세크레타제, 소닉 헤지호그, 감마-세크레타제, S 또는 CS1, 베타-세크레타제, S 또는 CS3, E-셀렉틴, 소르틸린, L-셀렉틴, SOST, P-셀렉틴, SOX1, 세마포린 3A, SOX2, 세마포린 3C, SOX3, 세마포린 3E, SOX7, 세마포린 3F, SOX9, 세마포린 6A, SOX1O, 세마포린 6B, SOX 17, 세마포린 6C, SOX21 세마포린 6D, SPARC, 세마포린 7A, SPARC-유사 1, 세파라제, SP-D, 세린/트레오닌 포스파타제 기질 I, 스피네신, 세르핀 A1, F-스폰딘, 세르핀 A3, SR-AI/MSR, 세르핀 A4/칼리스타틴, Src, 세르핀 A5/단백질 C 억제제, SREC-I/SR-F1, 세르핀 A8/안지오텐시노겐, SREC-II, 세르핀 B5, SSEA-I, 세르핀 C1/항트롬빈-III, SSEA-3, 세르핀 D1/헤파린 보조인자 II, SSEA-4, 세르핀 E1/PAI-1, ST7/LRP12, 세르핀 E2, 스타빌린-1, 세르핀 F1, 스타빌린-2, 세르핀 F2, 스탄니오칼신 1, 세르핀 G1/C1 억제제, 스탄니오칼신 2, 세르핀 12, STAT1, 혈청 아밀로이드 A1, STAT2, SF-1/NR5A1, STAT3, SGK, STAT4, SHBG, STAT5a/b, SHIP, STAT5a, SHP/NR0B2, STAT5b, SHP-I, STATE, SHP-2, VE-스타틴, SIGIRR, 스텔라/Dppa3, Siglec-2/CD22, STRO-I, Siglec-3/CD33, 물질 P, Siglec-5, 술파미다제/SGSH, Siglec-6, 술파타제 변형 인자 1/SUMF1, Siglec-7, 술파타제 변형 인자 2/SUMF2, Siglec-9, SUMO1, Siglec-10, SUMO2/3/4, Siglec-11, SUMO3, Siglec-F, 슈퍼옥시드 디스뮤타제, SIGNR1/CD209, 슈퍼옥시드 디스뮤타제-1/Cu[0099]--Zn SOD, SIGNR4, 슈퍼옥시드 디스뮤타제-2/Mn-SOD, SIRP 베타 1, 슈퍼옥시드 디스뮤타제-3/EC-SOD, SKI, 서바이빈, SLAM/CD150, 시냅신 I, 슬리핑 뷰티 트랜스포사제, 신데칸-I/CD 138, Slit3, 신데칸-2, SLITRK1, 신데칸-3, SLITRK2, 신데칸-4, SLITRK4, TACI/TNFRSF13B, TMEFF 1/토모레귤린-1, TAO2, TMEFF2, TAPP1, TNF-알파/TNFSF IA, CCL17/TARC, TNF-베타/TNFSF1B, 타우, TNF R1/TNFRSFIA, TC21/R-Ras2, TNF RII/TNFRSF1B, TCAM-I, TOR, TCCR/WSX-1, TP-I, TC-PTP, TP63/TP73L, TDG, TR, CCL25/TECK, TR 알파/NR1A1, 테나신 C, TR 베타 1/NR1A2, 테나신 R, TR2/NR2C1, TER-119, TR4/NR2C2, TERT, TRA-1-85, 테스티칸 1/SPOCK1, TRADD, 테스티칸 2/SPOCK2, TRAF-1, 테스티칸 3/SPOCK3, TRAF-2, TFPI, TRAF-3, TFPI-2, TRAF-4, TGF-알파, TRAF-6, TGF-베타, TRAIL/TNFSF10, TGF-베타 1, TRAIL R1/TNFRSFIOA, LAP (TGF-베타 1), TRAIL R2/TNFRSF10B, 잠재성 TGF-베타 1, TRAIL R3/TNFRSF10C, TGF-베타 1.2, TRAIL R4/TNFRSF10D, TGF-베타 2, TRANCE/TNFSF1 1, TGF-베타 3, TfR (트랜스페린 R), TGF-베타 5, 아포-트랜스페린, 잠재성 TGF-베타 bp 1, 홀로-트랜스페린, 잠재성 TGF-베타 bp2, 트래핀-2/엘라핀, 잠재성 TGF-베타 bp4, TREM-1, TGF-베타 R1/ALK-5, TREM-2, TGF-베타 R11, TREM-3, TGF-베타 RIIb, TREML1/TLT-1, TGF-베타 RIII, TRF-I, 써모리신, TRF-2, 티오레독신-1, TRH-분해 외효소/TRHDE, 티오레독신-2, TRIMS, 티오레독신-80, 트리펩티딜-펩티다제 I, 티오레독신-유사 5/TRP14, TrkA, THOP1, TrkB, 트롬보모듈린/CD141, TrkC, 트롬보포이에틴, TROP-2, 트롬보포이에틴 R, 트로포닌 I 펩티드 3, 트롬보스폰딘-1, 트로포닌 T, 트롬보스폰딘-2, TROY/TNFRSF 19, 트롬보스폰딘-4, 트립신 1, 티모포이에틴, 트립신 2/PRSS2, 흉선 케모카인-1, 트립신 3/PRSS3, Tie-1, 트립타제-5/Prss32, Tie-2, 트립타제 알파/TPS1, TIM-I/KIM-I/HAVCR, 트립타제 베타-1/MCPT-7, TIM-2, 트립타제 베타-2/TPSB2, TIM-3, 트립타제 엡실론/BSSP-4, TIM-4, 트립타제 감마-1/TPSG1, TIM-5, 트립토판 히드록실라제, TIM-6, TSC22, TIMP-I, TSG, TIMP-2, TSG-6, TIMP-3, TSK, TIMP-4, TSLP, TL1A/TNFSF15, TSLP R, TLR1, TSP50, TLR2, 베타-III 튜불린, TLR3, TWEAK/TNFSF12, TLR4, TWEAK R/TNFRSF 12, TLR5, Tyk2, TLR6, 포스포-티로신, TLR9, 티로신 히드록실라제, TLX/NR2E1, 티로신 포스파타제 기질 I, 유비퀴틴, UNC5H3, Ugi, UNC5H4, UGRP1, UNG, ULBP-I, uPA, ULBP-2, uPAR, ULBP-3, URB, UNC5H1, UVDE, UNC5H2, 바닐로이드 R1, VEGF R, VASA, VEGF R1/Flt-1, 바소히빈, VEGF R2/KDR/Flk-1, 바소린, VEGF R3/FU-4, 바소스타틴, 베르시칸, Vav-1, VG5Q, VCAM-1, VHR, VDR/NR1I1, 비멘틴, VEGF, 비트로넥틴, VEGF-B, VLDLR, VEGF-C, vWF-A2, VEGF-D, 시뉴클레인-알파, Ku70, WASP, Wnt-7b, WIF-I, Wnt-8a WISP-1/CCN4, Wnt-8b, WNK1, Wnt-9a, Wnt-1, Wnt-9b, Wnt-3a, Wnt-10a, Wnt-4, Wnt-10b, Wnt-5a, Wnt-11, Wnt-5b, wnvNS3, Wnt7a, XCR1, XPE/DDB1, XEDAR, XPE/DDB2, Xg, XPF, XIAP, XPG, XPA, XPV, XPD, XRCC1, Yes, YY1, EphA4.
수많은 인간 이온 채널은 특히 관심있는 표적이다. 비제한적 예는 5-히드록시트립타민 3 수용체 B 서브유닛, 5-히드록시트립타민 3 수용체 전구체, 5-히드록시트립타민 수용체 3 서브유닛 C, AAD 14 단백질, 아세틸콜린 수용체 단백질, 알파 서브유닛 전구체, 아세틸콜린 수용체 단백질, 베타 서브유닛 전구체, 아세틸콜린 수용체 단백질, 델타 서브유닛 전구체, 아세틸콜린 수용체 단백질, 엡실론 서브유닛 전구체, 아세틸콜린 수용체 단백질, 감마 서브유닛 전구체, 산 감지 이온 채널 3 스플라이스 변이체 b, 산 감지 이온 채널 3 스플라이스 변이체 c, 산 감지 이온 채널 4, ADP-리보스 피로포스파타제, 미토콘드리아 전구체, 알파1 A-전압-의존성 칼슘 채널, 아밀로리드-민감성 양이온 채널 1, 뉴런, 아밀로리드-민감성 양이온 채널 2, 뉴런 아밀로리드-민감성 양이온 채널 4, 이소형 2, 아밀로리드-민감성 나트륨 채널, 아밀로리드-민감성 나트륨 채널 알파-서브유닛, 아밀로리드-민감성 나트륨 채널 베타-서브유닛, 아밀로리드-민감성 나트륨 채널 델타-서브유닛, 아밀로리드-민감성 나트륨 채널 감마-서브유닛, 아넥신 A7, 정단-유사 단백질, ATP-민감성 내향 정류 칼륨 채널 1, ATP-민감성 내향 정류 칼륨 채널 10, ATP-민감성 내향 정류 칼륨 채널 11, ATP-민감성 내향 정류 칼륨 채널 14, ATP-민감성 내향 정류 칼륨 채널 15, ATP-민감성 내향 정류 칼륨 채널 8, 칼슘 채널 알파12.2 서브유닛, 칼슘 채널 알파12.2 서브유닛, 칼슘 채널 알파1E 서브유닛, 델타19 델타40 델타46 스플라이스 변이체, 칼슘-활성화 칼륨 채널 알파 서브유닛 1, 칼슘-활성화 칼륨 채널 베타 서브유닛 1, 칼슘-활성화 칼륨 채널 베타 서브유닛 2, 칼슘-활성화 칼륨 채널 베타 서브유닛 3, 칼슘-의존성 클로라이드 채널-1, 양이온 채널 TRPM4B, CDNA FLJ90453 fis, 클론 NT2RP3001542, (칼륨 채널 사량체화 도메인 함유 6과 고도로 유사함), CDNA FLJ90663 fis, 클론 PLACE 1005031, (클로라이드 세포내 채널 단백질 5와 고도로 유사함), CGMP-게이팅 양이온 채널 베타 서브유닛, 클로라이드 채널 단백질, 클로라이드 채널 단백질 2, 클로라이드 채널 단백질 3, 클로라이드 채널 단백질 4, 클로라이드 채널 단백질 5, 클로라이드 채널 단백질 6, 클로라이드 채널 단백질 C1C-Ka, 클로라이드 채널 단백질 C1C-Kb, 클로라이드 채널 단백질, 골격근, 클로라이드 세포내 채널 6, 클로라이드 세포내 채널 단백질 3, 클로라이드 세포내 채널 단백질 4, 클로라이드 세포내 채널 단백질 5, CHRNA3 단백질, Clcn3e 단백질, CLCNKB 단백질, CNGA4 단백질, 쿨린-5, 시클릭 GMP 게이팅 칼륨 채널, 시클릭-뉴클레오티드-게이팅 양이온 채널 4, 시클릭-뉴클레오티드-게이팅 양이온 채널 알파 3, 시클릭-뉴클레오티드-게이팅 양이온 채널 베타 3, 시클릭-뉴클레오티드-게이팅 후각 채널, 낭성 섬유증 막횡단 전도도 조절인자, 시토크롬 B-245 중쇄, 디히드로피리딘-민감성 L형, 칼슘 채널 알파-2/델타 서브유닛 전구체, FXYD 도메인-함유 이온 수송 조절인자 3 전구체, FXYD 도메인-함유 이온 수송 조절인자 5 전구체, FXYD 도메인-함유 이온 수송 조절인자 6 전구체, FXYD 도메인-함유 이온 수송 조절인자 7, FXYD 도메인-함유 이온 수송 조절인자 8 전구체, G 단백질-활성화 내향 정류 칼륨 채널 1, G 단백질-활성화 내향 정류 칼륨 채널 2, G 단백질-활성화 내향 정류 칼륨 채널 3, G 단백질-활성화 내향 정류 칼륨 채널 4, 감마-아미노부티르산 수용체 알파-1 서브유닛 전구체, 감마-아미노부티르산 수용체 알파-2 서브유닛 전구체, 감마-아미노부티르산 수용체 알파-3 서브유닛 전구체, 감마-아미노부티르산 수용체 알파-4 서브유닛 전구체, 감마-아미노부티르산 수용체 알파-5 서브유닛 전구체, 감마-아미노부티르산 수용체 알파-6 서브유닛 전구체, 감마-아미노부티르산 수용체 베타-1 서브유닛 전구체, 감마-아미노부티르산 수용체 베타-2 서브유닛 전구체, 감마-아미노부티르산 수용체 베타-3 서브유닛 전구체, 감마-아미노부티르산 수용체 델타 서브유닛 전구체, 감마-아미노부티르산 수용체 엡실론 서브유닛 전구체, 감마-아미노부티르산 수용체 감마-1 서브유닛 전구체, 감마-아미노부티르산 수용체 감마-3 서브유닛 전구체, 감마-아미노부티르산 수용체 파이 서브유닛 전구체, 감마-아미노부티르산 수용체 rho-1 서브유닛 전구체, 감마-아미노부티르산 수용체 rho-2 서브유닛 전구체, 감마-아미노부티르산 수용체 세타 서브유닛 전구체, GluR6 카이네이트 수용체, 글루타메이트 수용체 1 전구체, 글루타메이트 수용체 2 전구체, 글루타메이트 수용체 3 전구체, 글루타메이트 수용체 4 전구체, 글루타메이트 수용체 7, 글루타메이트 수용체 B, 글루타메이트 수용체 델타-1 서브유닛 전구체, 글루타메이트 수용체, 이온성 카이네이트 1 전구체, 글루타메이트 수용체, 이온성 카이네이트 2 전구체, 글루타메이트 수용체, 이온성 카이네이트 3 전구체, 글루타메이트 수용체, 이온성 카이네이트 4 전구체, 글루타메이트 수용체, 이온성 카이네이트 5 전구체, 글루타메이트 [NMDA] 수용체 서브유닛 3A 전구체, 글루타메이트 [NMDA] 수용체 서브유닛 3B 전구체, 글루타메이트 [NMDA] 수용체 서브유닛 엡실론 1 전구체, 글루타메이트 [NMDA] 수용체 서브유닛 엡실론 2 전구체, 글루타메이트 [NMDA] 수용체 서브유닛 엡실론 4 전구체, 글루타메이트 [NMDA] 수용체 서브유닛 제타 1 전구체, 글리신 수용체 알파-1 쇄 전구체, 글리신 수용체 알파-2 쇄 전구체, 글리신 수용체 알파-3 쇄 전구체, 글리신 수용체 베타 쇄 전구체, H/ACA 리보핵단백질 복합체 서브유닛 1, 고친화도 이뮤노글로불린 엡실론 수용체 베타-서브유닛, 가설 단백질 DKFZp31310334, 가설 단백질 DKFZp761M1724, 가설 단백질 FLJ12242, 가설 단백질 FLJ14389, 가설 단백질 FLJ14798, 가설 단백질 FLJ14995, 가설 단백질 FLJ16180, 가설 단백질 FLJ16802, 가설 단백질 FLJ32069, 가설 단백질 FLJ37401, 가설 단백질 FLJ38750, 가설 단백질 FLJ40162, 가설 단백질 FLJ41415, 가설 단백질 FLJ90576, 가설 단백질 FLJ90590, 가설 단백질 FLJ90622, 가설 단백질 KCTD15, 가설 단백질 MGC15619, 이노시톨 1,4,5-트리스포스페이트 수용체 유형 1, 이노시톨 1,4,5-트리스포스페이트 수용체 유형 2, 이노시톨 1,4,5-트리스포스페이트 수용체 유형 3, 중간 전도도 칼슘-활성화 칼륨 채널 단백질 4, 내향 정류 칼륨 채널 13, 내향 정류 칼륨 채널 16, 내향 정류 칼륨 채널 4, 내향 정류 K(+) 채널 음성 조절인자 Kir2.2v, 카이네이트 수용체 서브유닛 KA2a, KCNH5 단백질, KCTD 17 단백질, KCTD2 단백질, 각질세포 연관 막횡단 단백질 1, Kv 채널-상호작용 단백질 4, 멜라스타틴 1, 막 단백질 MLC1, MGC 15619 단백질, 뮤코리핀-1, 뮤코리핀-2, 뮤코리핀-3, 다중약물 내성-연관 단백질 4, N-메틸-D-아스파르테이트 수용체 2C 서브유닛 전구체, NADPH 옥시다제 상동체 1, Nav1.5, 뉴런 아세틸콜린 수용체 단백질, 알파-10 서브유닛 전구체, 뉴런 아세틸콜린 수용체 단백질, 알파-2 서브유닛 전구체, 뉴런 아세틸콜린 수용체 단백질, 알파-3 서브유닛 전구체, 뉴런 아세틸콜린 수용체 단백질, 알파-4 서브유닛 전구체, 뉴런 아세틸콜린 수용체 단백질, 알파-5 서브유닛 전구체, 뉴런 아세틸콜린 수용체 단백질, 알파-6 서브유닛 전구체, 뉴런 아세틸콜린 수용체 단백질, 알파-7 서브유닛 전구체, 뉴런 아세틸콜린 수용체 단백질, 알파-9 서브유닛 전구체, 뉴런 아세틸콜린 수용체 단백질, 베타-2 서브유닛 전구체, 뉴런 아세틸콜린 수용체 단백질, 베타-3 서브유닛 전구체, 뉴런 아세틸콜린 수용체 단백질, 베타-4 서브유닛 전구체, 뉴런 전압-의존성 칼슘 채널 알파 2D 서브유닛, P2X 퓨린수용체 1, P2X 퓨린수용체 2, P2X 퓨린수용체 3, P2X 퓨린수용체 4, P2X 퓨린수용체 5, P2X 퓨린수용체 6, P2X 퓨린수용체 7, 췌장 칼륨 채널 TALK-Ib, 췌장 칼륨 채널 TALK-Ic, 췌장 칼륨 채널 TALK-Id, 포스포레만 전구체, 플라스모리핀, 다낭성 신장 질환 2 관련 단백질, 다낭성 신장 질환 2-유사 1 단백질, 다낭성 신장 질환 2-유사 2 단백질, 다낭성 신장 질환 및 난자 젤리 관련 단백질 전구체에 대한 수용체, 폴리시스틴-2, 칼륨 채널 조절인자, 칼륨 채널 서브패밀리 K 구성원 1, 칼륨 채널 서브패밀리 K 구성원 10, 칼륨 채널 서브패밀리 K 구성원 12, 칼륨 채널 서브패밀리 K 구성원 13, 칼륨 채널 서브패밀리 K 구성원 15, 칼륨 채널 서브패밀리 K 구성원 16, 칼륨 채널 서브패밀리 K 구성원 17, 칼륨 채널 서브패밀리 K 구성원 2, 칼륨 채널 서브패밀리 K 구성원 3, 칼륨 채널 서브패밀리 K 구성원 4, 칼륨 채널 서브패밀리 K 구성원 5, 칼륨 채널 서브패밀리 K 구성원 6, 칼륨 채널 서브패밀리 K 구성원 7, 칼륨 채널 서브패밀리 K 구성원 9, 칼륨 채널 사량체화 도메인 함유 3, 칼륨 채널 사량체화 도메인 함유 단백질 12, 칼륨 채널 사량체화 도메인 함유 단백질 14, 칼륨 채널 사량체화 도메인 함유 단백질 2, 칼륨 채널 사량체화 도메인 함유 단백질 4, 칼륨 채널 사량체화 도메인 함유 단백질 5, 칼륨 채널 사량체화 도메인 함유 10, 칼륨 채널 사량체화 도메인 함유 단백질 13, 칼륨 채널 사량체화 도메인-함유 1, 칼륨 전압-게이팅 채널 서브패밀리 A 구성원 1, 칼륨 전압-게이팅 채널 서브패밀리 A 구성원 2, 칼륨 전압-게이팅 채널 서브패밀리 A 구성원 4, 칼륨 전압-게이팅 채널 서브패밀리 A 구성원 5, 칼륨 전압-게이팅 채널 서브패밀리 A 구성원 6, 칼륨 전압-게이팅 채널 서브패밀리 B 구성원 1, 칼륨 전압-게이팅 채널 서브패밀리 B 구성원 2, 칼륨 전압-게이팅 채널 서브패밀리 C 구성원 1, 칼륨 전압-게이팅 채널 서브패밀리 C 구성원 3, 칼륨 전압-게이팅 채널 서브패밀리 C 구성원 4, 칼륨 전압-게이팅 채널 서브패밀리 D 구성원 1, 칼륨 전압-게이팅 채널 서브패밀리 D 구성원 2, 칼륨 전압-게이팅 채널 서브패밀리 D 구성원 3, 칼륨 전압-게이팅 채널 서브패밀리 E 구성원 1, 칼륨 전압-게이팅 채널 서브패밀리 E 구성원 2, 칼륨 전압-게이팅 채널 서브패밀리 E 구성원 3, 칼륨 전압-게이팅 채널 서브패밀리 E 구성원 4, 칼륨 전압-게이팅 채널 서브패밀리 F 구성원 1, 칼륨 전압-게이팅 채널 서브패밀리 G 구성원 1, 칼륨 전압-게이팅 채널 서브패밀리 G 구성원 2, 칼륨 전압-게이팅 채널 서브패밀리 G 구성원 3, 칼륨 전압-게이팅 채널 서브패밀리 G 구성원 4, 칼륨 전압-게이팅 채널 서브패밀리 H 구성원 1, 칼륨 전압-게이팅 채널 서브패밀리 H 구성원 2, 칼륨 전압-게이팅 채널 서브패밀리 H 구성원 3, 칼륨 전압-게이팅 채널 서브패밀리 H 구성원 4, 칼륨 전압-게이팅 채널 서브패밀리 H 구성원 5, 칼륨 전압-게이팅 채널 서브패밀리 H 구성원 6, 칼륨 전압-게이팅 채널 서브패밀리 H 구성원 7, 칼륨 전압-게이팅 채널 서브패밀리 H 구성원 8, 칼륨 전압-게이팅 채널 서브패밀리 KQT 구성원 1, 칼륨 전압-게이팅 채널 서브패밀리 KQT 구성원 2, 칼륨 전압-게이팅 채널 서브패밀리 KQT 구성원 3, 칼륨 전압-게이팅 채널 서브패밀리 KQT 구성원 4, 칼륨 전압-게이팅 채널 서브패밀리 KQT 구성원 5, 칼륨 전압-게이팅 채널 서브패밀리 S 구성원 1, 칼륨 전압-게이팅 채널 서브패밀리 S 구성원 2, 칼륨 전압-게이팅 채널 서브패밀리 S 구성원 3, 칼륨 전압-게이팅 채널 서브패밀리 V 구성원 2, 칼륨 전압-게이팅 채널, 서브패밀리 H, 구성원 7, 이소형 2, 칼륨/나트륨 과분극-활성화 시클릭 뉴클레오티드-게이팅 채널 1, 칼륨/나트륨 과분극-활성화 시클릭 뉴클레오티드-게이팅 채널 2, 칼륨/나트륨 과분극-활성화 시클릭 뉴클레오티드-게이팅 채널 3, 칼륨/나트륨 과분극-활성화 시클릭 뉴클레오티드-게이팅 채널 4, 추정 미토콘드리아 내수송 수용체 서브유닛 TOM40 상동체, 퓨린성 수용체 P2X5, 이소형 A, 추정 4 반복부 전압-게이팅 이온 채널, 추정 클로라이드 채널 단백질 7, 추정 GluR6 카이네이트 수용체, 추정 이온 채널 단백질 CATSPER2 변이체 1, 추정 이온 채널 단백질 CATSPER2 변이체 2, 추정 이온 채널 단백질 CATSPER2 변이체 3, 칼륨 채널 단백질 변이체 1의 추정 조절인자, 추정 티로신-단백질 포스파타제 TPTE, 리아노딘 수용체 1, 리아노딘 수용체 2, 리아노딘 수용체 3, SH3 KBP1 결합 단백질 1, 짧은 일시적 수용체 전위 채널 1, 짧은 일시적 수용체 전위 채널 4, 짧은 일시적 수용체 전위 채널 5, 짧은 일시적 수용체 전위 채널 6, 짧은 일시적 수용체 전위 채널 7, 소전도도 칼슘-활성화 칼륨 채널 단백질 1, 소전도도 칼슘-활성화 칼륨 채널 단백질 2, 이소형 b, 소전도도 칼슘-활성화 칼륨 채널 단백질 3, 이소형 b, 소-전도도 칼슘-활성화 칼륨 채널 SK2, 소-전도도 칼슘-활성화 칼륨 채널 SK3, 나트륨 채널, 나트륨 채널 베타-1 서브유닛 전구체, 나트륨 채널 단백질 유형 II 알파 서브유닛, 나트륨 채널 단백질 유형 III 알파 서브유닛, 나트륨 채널 단백질 유형 IV 알파 서브유닛, 나트륨 채널 단백질 유형 IX 알파 서브유닛, 나트륨 채널 단백질 유형 V 알파 서브유닛, 나트륨 채널 단백질 유형 VII 알파 서브유닛, 나트륨 채널 단백질 유형 VIII 알파 서브유닛, 나트륨 채널 단백질 유형 X 알파 서브유닛, 나트륨 채널 단백질 유형 XI 알파 서브유닛, 나트륨- 및 클로라이드-활성화 ATP-민감성 칼륨 채널, 나트륨/칼륨-수송 ATPase 감마 쇄, 정자-연관 양이온 채널 1, 정자-연관 양이온 채널 2, 이소형 4, 신탁신-1B1, 일시적 수용체 전위 양이온 채널 서브패밀리 A 구성원 1, 일시적 수용체 전위 양이온 채널 서브패밀리 M 구성원 2, 일시적 수용체 전위 양이온 채널 서브패밀리 M 구성원 3, 일시적 수용체 전위 양이온 채널 서브패밀리 M 구성원 6, 일시적 수용체 전위 양이온 채널 서브패밀리 M 구성원 7, 일시적 수용체 전위 양이온 채널 서브패밀리 V 구성원 1, 일시적 수용체 전위 양이온 채널 서브패밀리 V 구성원 2, 일시적 수용체 전위 양이온 채널 서브패밀리 V 구성원 3, 일시적 수용체 전위 양이온 채널 서브패밀리 V 구성원 4, 일시적 수용체 전위 양이온 채널 서브패밀리 V 구성원 5, 일시적 수용체 전위 양이온 채널 서브패밀리 V 구성원 6, 일시적 수용체 전위 채널 4 엡실론 스플라이스 변이체, 일시적 수용체 전위 채널 4 제타 스플라이스 변이체, 일시적 수용체 전위 채널 7 감마 스플라이스 변이체, 종양 괴사 인자, 알파-유도 단백질 1, 내피, 2-공 칼슘 채널 단백질 2, VDAC4 단백질, 전압 게이팅 칼륨 채널 Kv3.2b, 전압 게이팅 나트륨 채널 베타1B 서브유닛, 전압-의존성 음이온 채널, 전압-의존성 음이온 채널 2, 전압-의존성 음이온-선택적 채널 단백질 1, 전압-의존성 음이온-선택적 채널 단백질 2, 전압-의존성 음이온-선택적 채널 단백질 3, 전압-의존성 칼슘 채널 감마-1 서브유닛, 전압-의존성 칼슘 채널 감마-2 서브유닛, 전압-의존성 칼슘 채널 감마-3 서브유닛, 전압-의존성 칼슘 채널 감마-4 서브유닛, 전압-의존성 칼슘 채널 감마-5 서브유닛, 전압-의존성 칼슘 채널 감마-6 서브유닛, 전압-의존성 칼슘 채널 감마-7 서브유닛, 전압-의존성 칼슘 채널 감마-8 서브유닛, 전압-의존성 L형 칼슘 채널 알파-1C 서브유닛, 전압-의존성 L형 칼슘 채널 알파-1D 서브유닛, 전압-의존성 L형 칼슘 채널 알파-IS 서브유닛, 전압-의존성 L형 칼슘 채널 베타-1 서브유닛, 전압-의존성 L형 칼슘 채널 베타-2 서브유닛, 전압-의존성 L형 칼슘 채널 베타-3 서브유닛, 전압-의존성 L형 칼슘 채널 베타-4 서브유닛, 전압-의존성 N형 칼슘 채널 알파-1B 서브유닛, 전압-의존성 P/Q형 칼슘 채널 알파-1A 서브유닛, 전압-의존성 R형 칼슘 채널 알파-1E 서브유닛, 전압-의존성 T형 칼슘 채널 알파-1G 서브유닛, 전압-의존성 T형 칼슘 채널 알파-1H 서브유닛, 전압-의존성 T형 칼슘 채널 알파-1I 서브유닛, 전압-게이팅 L형 칼슘 채널 알파-1 서브유닛, 전압-게이팅 칼륨 채널 베타-1 서브유닛, 전압-게이팅 칼륨 채널 베타-2 서브유닛, 전압-게이팅 칼륨 채널 베타-3 서브유닛, 전압-게이팅 칼륨 채널 KCNA7을 포함한다. 인간 전압-게이팅 나트륨 채널의 Nav1.x 패밀리는 또한 특히 유망한 표적이다. 이 패밀리는, 예를 들어, 채널 Nav1.6 및 Nav1.8을 포함한다.
특정 실시양태에서, 치료 단백질은 G-단백질 커플링된 수용체 (GPCR)일 수 있다. 예시적인 GPCR은 클래스 A 로돕신 유사 수용체 예컨대 무스카틴성 (Muse.) 아세틸콜린 척추동물 유형 1, Muse. 아세틸콜린 척추동물 유형 2, Muse. 아세틸콜린 척추동물 유형 3, Muse. 아세틸콜린 척추동물 유형 4; 아드레날린수용체 (알파 아드레날린수용체 유형 1, 알파 아드레날린수용체 유형 2, 베타 아드레날린수용체 유형 1, 베타 아드레날린수용체 유형 2, 베타 아드레날린수용체 유형 3, 도파민 척추동물 유형 1, 도파민 척추동물 유형 2, 도파민 척추동물 유형 3, 도파민 척추동물 유형 4, 히스타민 유형 1, 히스타민 유형 2, 히스타민 유형 3, 히스타민 유형 4, 세로토닌 유형 1, 세로토닌 유형 2, 세로토닌 유형 3, 세로토닌 유형 4, 세로토닌 유형 5, 세로토닌 유형 6, 세로토닌 유형 7, 세로토닌 유형 8, 다른 세로토닌 유형, 미량 아민, 안지오텐신 유형 1, 안지오텐신 유형 2, 봄베신, 브라디키닌, C5a 아나필라톡신, Fmet-leu-phe, APJ 유사체, 인터류킨-8 유형 A, 인터류킨-8 유형 B, 인터류킨-8 유형 기타, C--C 케모카인 유형 1 내지 유형 11 및 다른 유형, C--X--C 케모카인 (유형 2 내지 6 및 기타), C--X3-C 케모카인, 콜레시스토키닌 CCK, CCK 유형 A, CCK 유형 B, CCK 기타, 엔도텔린, 멜라노코르틴 (멜라닌세포 자극 호르몬, 부신피질자극 호르몬, 멜라노코르틴 호르몬), 더피 항원, 프로락틴-방출 펩티드 (GPR10), 뉴로펩티드 Y (유형 1 내지 7), 뉴로펩티드 Y, 뉴로펩티드 Y 기타, 뉴로텐신, 오피오이드 (유형 D, K, M, X), 소마토스타틴 (유형 1 내지 5), 타키키닌 (물질 P (NK1), 물질 K (NK2), 뉴로메딘 K (NK3), 타키키닌 유사 1, 타키키닌 유사 2, 바소프레신/바소토신 (유형 1 내지 2), 바소토신, 옥시토신/메소토신, 코노프레신, 갈라닌 유사체, 프로테이나제-활성화 유사체, 오렉신 & 뉴로펩티드 FF.QRFP, 케모카인 수용체-유사체, 뉴로메딘 U 유사체 (뉴로메딘 U, PRX아미드), 호르몬 단백질 (여포 자극 호르몬, 루트로핀-코리오고나도트로핀 호르몬, 티로트로핀, 고나도트로핀 유형 I, 고나도트로핀 유형 II), 로돕신, 로돕신 척추동물 (유형 1-5), 로돕신 척추동물 유형 5, 로돕신 절지동물, 로돕신 절지동물 유형 1, 로돕신 절지동물 유형 2, 로돕신 절지동물 유형 3, 로돕신 연체동물, 로돕신, 후각 (후각 II 패밀리 1 내지 13), 프로스타글란딘 (프로스타글란딘 E2 하위유형 EP1, 프로스타글란딘 E2/D2 하위유형 EP2, 프로스타글란딘 E2 하위유형 EP3, 프로스타글란딘 E2 하위유형 EP4, 프로스타글란딘 F2-알파, 프로스타시클린, 트롬복산, 아데노신 유형 1 내지 3, 퓨린수용체, 퓨린수용체 P2RY1-4,6,1 1 GPR91, 퓨린수용체 P2RY5,8,9,10 GPR35,92,174, 퓨린수용체 P2RY12-14 GPR87 (UDP-글루코스), 칸나비노이드, 혈소판 활성화 인자, 고나도트로핀-방출 호르몬, 고나도트로핀-방출 호르몬 유형 I, 고나도트로핀-방출 호르몬 유형 II, 지방동원 호르몬 유사체, 코라조닌, 티로트로핀-방출 호르몬 & 분비촉진제, 티로트로핀-방출 호르몬, 성장 호르몬 분비촉진제, 성장 호르몬 분비촉진제 유사체, 탈피-촉발 호르몬 (ETHR), 멜라토닌, 리소스핑고지질 & LPA (EDG), 스핑고신 1-포스페이트 Edg-1, 리소포스파티드산 Edg-2, 스핑고신 1-포스페이트 Edg-3, 리소포스파티드산 Edg-4, 스핑고신 1-포스페이트 Edg-5, 스핑고신 1-포스페이트 Edg-6, 리소포스파티드산 Edg-7, 스핑고신 1-포스페이트 Edg-8, Edg 기타 류코트리엔 B4 수용체, 류코트리엔 B4 수용체 BLT1, 류코트리엔 B4 수용체 BLT2, 클래스 A 오르판/기타, 추정 신경전달물질, SREB, Mas 원종양유전자 & Mas-관련 (MRG), GPR45 유사체, 시스테이닐 류코트리엔, G-단백질 커플링된 담즙산 수용체, 유리 지방산 수용체 (GP40, GP41, GP43), 클래스 B 세크레틴 유사체, 칼시토닌, 코르티코트로핀 방출 인자, 위 억제 펩티드, 글루카곤, 성장 호르몬-방출 호르몬, 부갑상선 호르몬, PACAP, 세크레틴, 혈관활성 장 폴리펩티드, 라트로필린, 라트로필린 유형 1, 라트로필린 유형 2, 라트로필린 유형 3, ETL 수용체, 뇌-특이적 혈관신생 억제제 (BAI), 메투셀라-유사 단백질 (MTH), 카드헤린 EGF LAG (CELSR), 초대형 G-단백질 커플링된 수용체, 클래스 C 대사성 글루타메이트/페로몬, 대사성 글루타메이트 I군 내지 III군, 칼슘-감지 유사체, 세포외 칼슘-감지, 페로몬, 칼슘-감지 유사체 기타, 추정 페로몬 수용체, GABA-B, GABA-B 하위유형 1, GABA-B 하위유형 2, GABA-B 유사체, 오르판 GPRC5, 오르판 GPCR6, 브라이드 오브 세븐레스 단백질 (BOSS), 미각 수용체 (T1R), 클래스 D 진균 페로몬, 진균 페로몬 A-인자 유사체 (STE2.STE3), 진균 페로몬 B 유사체 (BAR,BBR,RCB,PRA), 클래스 E cAMP 수용체, 안구 백색증 단백질, 프리즐드/스무슨드 패밀리, 프리즐드 A군 (Fz 1&2&4&5&7-9), 프리즐드 B군 (Fz 3 & 6), 프리즐드 C군 (기타), 보습코 수용체, 선충류 화학수용체, 곤충 냄새 수용체, 및 클래스 Z 고세균/박테리아/진균 옵신을 포함하나, 이에 제한되지는 않는다.
특정 실시양태에서, 본원에 기재된 HSA 결합 10Fn3 도메인 융합체는 하기 활성 폴리펩티드 중 어느 것을 포함할 수 있다: 보톡스(BOTOX), 마이오블록(Myobloc), 뉴로블록(Neurobloc), 디스포트(Dysport) (또는 보툴리눔 신경독소의 다른 혈청형), 알글루코시다제 알파, 답토마이신, YH-16, 코리오고나도트로핀 알파, 필그라스팀, 세트로렐릭스, 인터류킨-2, 알데스류킨, 테세류킨, 데니류킨 디프티톡스, 인터페론 알파-n3 (주사), 인터페론 알파-n1, DL-8234, 인터페론, 선토리 (감마-Ia), 인터페론 감마, 티모신 알파 1, 타소네르민, DigiFab, ViperaTAb, EchiTAb, CroFab, 네시리티드, 아바타셉트, 알레파셉트, 레비프(Rebif), 엡토테르민 알파, 테리파라티드 (골다공증), 주사가능한 칼시토닌 (골 질환), 칼시토닌 (비강, 골다공증), 에타네르셉트, 헤모글로빈 글루타머 250 (소), 드로트레코긴 알파, 콜라게나제, 카르페리티드, 재조합 인간 표피 성장 인자 (국소 겔, 상처 치유), DWP-401, 다르베포에틴 알파, 에포에틴 오메가, 에포에틴 베타, 에포에틴 알파, 데시루딘, 레피루딘, 비발리루딘, 노나코그 알파, 모노닌(Mononine), 엡타코그 알파 (활성화), 재조합 인자 VIII+VWF, 리콤비네이트(Recombinate), 재조합 인자 VIII, 인자 VIII (재조합), 알파네이트(Alphanate), 옥토코그 알파, 인자 VIII, 팔리페르민, 인디키나제(Indikinase), 테넥테플라제, 알테플라제, 파미테플라제, 레테플라제, 나테플라제.몬테플라제, 폴리트로핀 알파, rFSH, hpFSH, 미카펀진, 페그필그라스팀, 레노그라스팀, 나르토그라스팀, 세르모렐린, 글루카곤, 엑세나티드, 프람린티드, 이미글루세라제, 갈술파제, 류코트로핀(Leucotropin), 몰그라모스팀, 트립토렐린 아세테이트, 히스트렐린 (피하 이식물, 히드론(Hydron)), 데슬로렐린, 히스트렐린, 나파렐린, 류프롤리드 지속 방출 데포(depot) (아트리겔(ATRIGEL)), 류프롤리드 이식물 (듀로스(DUROS)), 고세렐린, 소마트로핀, 유트로핀(Eutropin), KP-102 프로그램, 소마트로핀, 소마트로핀, 메카세르민 (성장 부전), 엔푸비르티드, Org-33408, 인슐린 글라진, 인슐린 글루리신, 인슐린 (흡입), 인슐린 리스프로, 인슐린 데테미르, 인슐린 (협측, 래피드미스트(RapidMist)), 메카세르민 린파베이트, 아나킨라, 셀모류킨, 99 mTc-압시티드 주사, 미엘로피드, 베타세론(Betaseron), 글라티라머 아세테이트, 게폰, 사르그라모스팀, 오프렐베킨, 인간 백혈구-유래 알파 인터페론, 빌리브(Bilive), 인슐린 (재조합), 재조합 인간 인슐린, 인슐린 아스파르트, 메카세르민, 로페론-A(Roferon-A), 인터페론-알파 2, 알파페론(Alfaferone), 인터페론 알파콘-1, 인터페론 알파, 아보넥스(Avonex) 재조합 인간 황체형성 호르몬, 도르나제 알파, 트라페르민, 지코노티드, 탈티렐린, 디보테르민 알파, 아토시반, 베카플레르민, 엡티피바티드, 제마이라(Zemaira), CTC-111, 샨박(Shanvac)-B, HPV 백신 (4가), NOV-002, 옥트레오티드, 란레오티드, 안세스팀, 아갈시다제 베타, 아갈시다제 알파, 라로니다제, 프레자티드 아세트산구리 (국소 겔), 라스부리카제, 라니비주맙, 액티뮨(Actimmune), PEG-인트론(PEG-Intron), 트리코민(Tricomin), 재조합 집 먼지 응애 알레르기 탈감작 주사, 재조합 인간 부갑상선 호르몬 (PTH) 1-84 (sc, 골다공증), 에포에틴 델타, 트랜스제닉 항트롬빈 III, 그란디트로핀(Granditropin), 비트라제(Vitrase), 재조합 인슐린, 인터페론-알파 (경구 로젠지), GEM-2 IS, 바프레오티드, 이두르술파제, 오마파트릴라트, 재조합 혈청 알부민, 세르톨리주맙 페골, 글루카르피다제, 인간 재조합 C1 에스테라제 억제제 (혈관부종), 라노테플라제, 재조합 인간 성장 호르몬, 엔푸비르티드 (바늘-무함유 주사, 바이오젝터 2000(Biojector 2000)), VGV-I, 인터페론 (알파), 루시나크탄트, 아비프타딜 (흡입, 폐 질환), 이카티반트, 에칼란티드, 오미가난, 아우로그라브(Aurograb), 펙시가난 아세테이트, ADI-PEG-20, LDI-200, 데가렐릭스, 신트레데킨 베수도톡스, FavId, MDX-1379, ISAtx-247, 리라글루티드, 테리파라티드 (골다공증), 티파코긴, AA-4500, T4N5 리포솜 로션, 카투막소맙, DWP-413, ART-123, 크리살린, 데스모테플라제, 아메디플라제, 코리폴리트로핀 알파, TH-9507, 테두글루티드, 디아미드(Diamyd), DWP-412, 성장 호르몬 (지속 방출 주사), 재조합 G-CSF, 인슐린 (흡입, AIR), 인슐린 (흡입, 테크노스피어(Technosphere)), 인슐린 (흡입, AERx), RGN-303, DiaPep277, 인터페론 베타 (C형 간염 바이러스 감염 (HCV)), 인터페론 알파-n3 (경구), 벨라타셉트, 경피 인슐린 패치, AMG-531, MBP-8298, 세레셉트(Xerecept), 오페바칸, 에이즈박스(AIDSVAX), GV-1001, 림포스캔(LymphoScan), 란피르나제, 리폭시산(Lipoxysan), 루수풀티드, MP52 (베타-트리칼슘포스페이트 담체, 골 재생), 흑색종 백신, 시푸류셀-T, CTP-37, 인세지아(Insegia), 비테스펜(vitespen), 인간 트롬빈 (동결, 외과적 출혈), 트롬빈, 트랜스MID(TransMID), 알피메프라제, 퓨리카제(Puricase), 테를리프레신 (정맥내, 간신증후군), EUR-1008M, 재조합 FGF-I (주사가능, 혈관 질환), BDM-E, 로티갑티드, ETC-216, P-113, MBI-594AN, 듀라마이신 (흡입, 낭성 섬유증), SCV-07, OPI-45, 엔도스타틴, 안지오스타틴, ABT-510, 보우만 버크 억제제 농축물, XMP-629, 99 mTc-Hynic-아넥신 V, 카할랄리드 F, CTCE-9908, 테베렐릭스 (연장 방출), 오자렐릭스, 로미뎁신, BAY-50-4798, 인터류킨-4, PRX-321, 펩스칸(Pepscan), 이보크타데킨, rh 락토페린, TRU-015, IL-21, ATN-161, 실렌기티드, 알부페론(Albuferon), 비파식스(Biphasix), IRX-2, 오메가 인터페론, PCK-3145, CAP-232, 파시레오티드, huN901-DM1, 난소암 면역요법 백신, SB-249553, 온코박스(Oncovax)-CL, 온코박스-P, BLP-25, 세르박스(CerVax)-16, 다중-에피토프 펩티드 흑색종 백신 (MART-I, gp100, 티로시나제), 네미피티드, rAAT (흡입), rAAT (피부과용), CGRP (흡입, 천식), 페그수네르셉트, 티모신 베타-4, 플리티뎁신, GTP-200, 라모플라닌, GRASPA, OBI-I, AC-100, 연어 칼시토닌 (경구, 엘리겐(eligen)), 칼시토닌 (경구, 골다공증), 엑사모렐린, 카프로모렐린, 카르데바(Cardeva), 벨라페르민, 131I-TM-601, KK-220, TP-10, 울라리티드, 데펠레스타트, 헤마티드, 크리살린 (국소), rNAPc2, 재조합 인자 VIII (PEG화 리포솜), bFGF, PEG화 재조합 스타필로키나제 변이체, V-10153, 소놀리시스 프롤리세(SonoLysis Prolyse), 뉴로박스(NeuroVax), CZEN-002, 도세포 신생 요법, rGLP-1, BIM-51077, LY-548806, 엑세나티드 (제어 방출, 메디소르브(Medisorb)), AVE-0010, GA-GCB, 아보렐린, AOD-9604, 리나클로티드 아세테이트, CETi-I, 헤모스판(Hemospan), VAL (주사가능), 빠른-작용 인슐린 (주사가능, 비아델(Viadel)), 비강내 인슐린, 인슐린 (흡입), 인슐린 (경구, 엘리겐), 재조합 메티오닐 인간 렙틴, 피트라킨라 피하 주사, 습진), 피트라킨라 (흡인용 건조 분말, 천식), 멀티카인(Multikine), RG-1068, MM-093, NBI-6024, AT-001, PI-0824, Org-39141, Cpn1O (자가면역 질환/염증), 탈락토페린 (국소), rEV-131 (안과용), rEV-131 (호흡 질환), 경구 재조합 인간 인슐린 (당뇨병), RPI-78M, 오프렐베킨 (경구), CYT-99007 CTLA4-Ig, DTY-001, 발레이트그라스트, 인터페론 알파-n3 (국소), IRX-3, RDP-58, 타우페론(Tauferon), 담즙 염 자극 리파제, 메리스파제(Merispase), 알칼리성 포스파타제, EP-2104R, 멜라노탄-II, 브레멜라노티드, ATL-104, 재조합 인간 마이크로플라스민, AX-200, SEMAX, ACV-I, Xen-2174, CJC-1008, 디노르핀 A, SI-6603, LAB GHRH, AER-002, BGC-728, 말라리아 백신 (비로솜, 페비프로(PeviPRO)), ALTU-135, 파르보바이러스 B 19 백신, 인플루엔자 백신 (재조합 뉴라미니다제), 말라리아/HBV 백신, 탄저병 백신, Vacc-5q, Vacc-4x, HIV 백신 (경구), HPV 백신, Tat 톡소이드, YSPSL, CHS-13340, PTH(1-34) 리포솜 크림 (노바솜(Novasome)), 오스타볼린-C(Ostabolin-C), PTH 유사체 (국소, 건선), MBRI-93.02, MTB72F 백신 (결핵), MVA-Ag85 A 백신 (결핵), FAR-404, BA-210, 재조합 흑사병 F1V 백신, AG-702, OxSODro1, rBetV1, Der-p1/Der-p2/Der-p7 알레르겐-표적화 백신 (먼지 응애 알레르기), PR1 펩티드 항원 (백혈병), 돌연변이체 ras 백신, HPV-16 E7 리포펩티드 백신, 미로 백신 (선암종), CML 백신, WT1-펩티드 백신 (암), IDD-5, CDX-110, 펜트리스(Pentrys), 노렐린(Norelin), CytoFab, P-9808, VT-111, 이크로캅티드, 텔베르민 (피부과용, 당뇨병성 족부 궤양), 루핀트리비르, 레티쿨로스, rGRF, P1A, 알파-갈락토시다제 A, ACE-011, ALTU-140, CGX-1160, 안지오텐신 치료 백신, D-4F, ETC-642, APP-018, rhMBL, SCV-07 (경구, 결핵), DRF-7295, ABT-828, ErbB2-특이적 면역독소 (항암), DT388IL-3, TST-10088, PRO-1762, 콤보톡스, 콜레시스토키닌-B/가스트린-수용체 결합 펩티드, 1 1 1ln-hEGF, AE-37, 트라스투주맙-DM1, 길항제 G, IL-12 (재조합), PM-02734, IMP-321, rhIGF-BP3, BLX-883, CUV-1647 (국소), L-19 기반 방사선면역치료제 (암), Re-188-P-2045, AMG-386, DC/I540/KLH 백신 (암), VX-001, AVE-9633, AC-9301, NY-ESO-I 백신 (펩티드), NA17.A2 펩티드, 흑색종 백신 (펄스 항원 치료), 전립선암 백신, CBP-501, 재조합 인간 락토페린 (안구 건조), FX-06, AP-214, WAP-8294A2 (주사가능), ACP-HIP, SUN-11031, 펩티드 YY [3-36] (비만, 비강내), FGLL, 아타시셉트, BR3-Fc, BN-003, BA-058, 인간 부갑상선 호르몬 1-34 (비강, 골다공증), F-18-CCR1, AT-1001 (복강 질환/당뇨병), JPD-003, PTH(7-34) 리포솜 크림 (노바솜), 듀라마이신 (안과용, 안구 건조), CAB-2, CTCE-0214, 글리코PEG화 에리트로포이에틴, EPO-Fc, CNTO-528, AMG-114, JR-013, 인자 XIII, 아미노칸딘, PN-951, 716155, SUN-E7001, TH-0318, BAY-73-7977, 테베렐릭스 (즉시 방출), EP-51216, hGH (제어 방출, 바이오스피어(Biosphere)), OGP-I, 시푸비르티드, TV-4710, ALG-889, Org-41259, rhCCIO, F-991, 티모펜틴 (폐 질환), r(m)CRP, 간선택적 인슐린, 수발린, L 19-IL-2 융합 단백질, 엘라핀, NMK-150, ALTU-139, EN-122004, rhTPO, 트롬보포이에틴 수용체 효능제 (혈소판감소성 장애), AL-108, AL-208, 신경 성장 인자 길항제 (통증), SLV-317, CGX-1007, INNO-105, 경구 테리파라티드 (엘리겐), GEM-OS1, AC-162352, PRX-302, LFn-p24 융합 백신 (테라포어(Therapore)), EP-1043, 에스. 뉴모니아에(S. pneumoniae) 소아 백신, 말라리아 백신, 네이세리아 메닌기티디스(Neisseria meningitidis) B군 백신, 신생아 B군 연쇄구균 백신, 탄저병 백신, HCV 백신 (gpE1+gpE2+MF-59), 중이염 요법, HCV 백신 (코어 항원+이스코매트릭스(ISCOMATRIX)), hPTH(1-34) (경피, 비아덤(ViaDerm)), 768974, SYN-101, PGN-0052, 아비스쿠민, BIM-23190, 결핵 백신, 다중-에피토프 티로시나제 펩티드, 암 백신, 엔카스팀, APC-8024, G1-5005, ACC-OO1, TTS-CD3, 혈관-표적화 TNF (고형 종양), 데스모프레신 (협측 제어-방출), 오네르셉트, TP-9201.
추가의 변형
특정 실시양태에서, HSA 결합 10Fn3 도메인 및 그의 융합체는 번역후 변형을 추가로 포함할 수 있다. 예시적인 번역후 단백질 변형은 인산화, 아세틸화, 메틸화, ADP-리보실화, 유비퀴틴화, 글리코실화, 카르보닐화, SUMO화, 비오티닐화 또는 폴리펩티드 측쇄 또는 소수성 기의 첨가를 포함한다. 그 결과, HSA 결합 10Fn3 도메인 및 그의 융합체는 비-아미노산 요소, 예컨대 지질, 폴리- 또는 모노-사카라이드, 및 포스페이트를 함유할 수 있다. 글리코실화의 바람직한 형태는 1개 이상의 시알산 모이어티를 폴리펩티드에 접합시키는 시알릴화이다. 시알산 모이어티는 또한 단백질의 가능한 면역원성을 감소시키면서 용해도 및 혈청 반감기를 개선시킨다. 예를 들어, 문헌 [Raju et al. Biochemistry 2001;40:8868-76]을 참조한다. HSA 결합 10Fn3 도메인 및 그의 융합체의 기능성에 대한 이러한 비-아미노산 요소의 효과는 특정한 HSA 결합 10Fn3 도메인에 결합하는 그의 능력 및/또는 융합체와 관련하여 특정한 비-10Fn3 모이어티에 의해 부여되는 기능적 역할에 대해 시험될 수 있다.
E. 벡터 & 폴리뉴클레오티드 실시양태
본원에 기재된 폴리펩티드 (예를 들어, HSA 결합 10Fn3 도메인 및 그의 융합체를 포함하는 폴리펩티드) 중 어느 것을 코딩하는 핵산이 또한 본원에 제공된다. 따라서, 특정 실시양태에서, 서열식별번호: 30-34, 36-40, 42-46, 48, 49, 51, 52, 54, 55, 57, 58, 60, 61, 62, 63, 65-68, 70, 71, 73-76, 78, 79, 81-84, 86, 87, 89-98, 100-109, 및 111-118 중 어느 하나를 코딩하는 핵산이 본원에 제공되며, 그의 핵산 서열은 관련 기술분야의 통상의 기술자에 의해 모 7016_A01 핵산 서열 (서열식별번호: 173)로부터 용이하게 결정될 수 있다.
관련 기술분야의 통상의 기술자에 의해 인지된 바와 같이, 제3 염기 축중성으로 인해, 거의 모든 아미노산은 코딩 뉴클레오티드 서열에서 1종 초과의 삼중 코돈에 의해 나타내어질 수 있다. 또한, 미미한 염기 쌍 변화는 코딩된 아미노산 서열에서 보존적 치환을 일으킬 수 있지만 유전자 산물의 생물학적 활성을 실질적으로 변경할 것으로 예상되지는 않는다. 따라서, 본원에 기재된 폴리펩티드를 코딩하는 핵산 서열은 서열에서 약간 변형될 수 있지만 여전히 그의 각각의 유전자 산물을 코딩할 수 있다. 일부 실시양태에서, 뉴클레오티드 치환은 생성된 번역된 아미노산 서열을 변경하지 않도록 도입된다. 특정 실시양태에서, HSA 결합 10Fn3 도메인 및 그의 융합체를 코딩하는 핵산은 (서열식별번호: 23에 비해) 본원에 기재된 아미노산 치환을 코딩하는 핵산 서열을 갖는다.
본원에 개시된 다양한 단백질 또는 폴리펩티드 중 어느 것을 코딩하는 핵산은 화학적으로 합성될 수 있다. 코돈 용법은 세포에서의 발현을 개선시키도록 선택될 수 있다. 이러한 코돈 용법은 선택된 세포 유형에 따라 달라질 것이다. 특화된 코돈 용법 패턴은 이. 콜라이(E. coli) 및 다른 박테리아뿐만 아니라 포유동물 세포, 식물 세포, 효모 세포 및 곤충 세포에 대해 개발되었다. 예를 들어: 문헌 [Mayfield et al., PNAS 2003;100:438-42; Sinclair et al. Protein Expr Purif 2002;26::96-105; Connell., Curr Opin Biotechnol 2001;12:446-9; Makrides et al. Microbiol Rev 1996;60:512-38; 및 Sharp et al. Yeast 1991;7:657-78]을 참조한다.
핵산 조작에 대한 일반적 기술은 관련 기술분야의 통상의 기술자의 이해 범위 내에 있고 또한 예를 들어 본원에 참조로 포함된 문헌 [Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Vols. 1-3, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2 ed., 1989, 또는 F. Ausubel et al., Current Protocols in Molecular Biology (Green Publishing and Wiley-Interscience: New York, 1987)] 및 주기적 최신판에 기재되어 있다. 단백질을 코딩하는 DNA는 포유동물, 바이러스, 또는 곤충 유전자로부터 유래된 적합한 전사 또는 번역 조절 요소에 작동가능하게 연결된다. 이러한 조절 요소는 전사 프로모터, 전사를 제어하는 임의적인 오퍼레이터 서열, 적합한 mRNA 리보솜 결합 부위를 코딩하는 서열, 및 전사 및 번역의 종결을 제어하는 서열을 포함한다. 통상적으로 복제 기점에 의해 부여되는, 숙주에서 복제하는 능력, 및 형질전환체의 인식을 용이하게 하는 선택 유전자가 추가적으로 포함된다. 적합한 조절 요소는 관련 기술분야에 널리 공지되어 있다.
본원에 기재된 폴리펩티드 및 그의 융합체는 바람직하게는 성숙 단백질 또는 폴리펩티드의 N-말단에서 특이적 절단 부위를 갖는 신호 서열 또는 다른 폴리펩티드인 이종 폴리펩티드와의 융합 단백질로서 생산될 수 있다. 바람직하게는 선택된 이종 신호 서열은 숙주 세포에 의해 인식되고 프로세싱 (즉, 신호 펩티다제에 의해 절단)되는 것이다. 천연 신호 서열은 인식하고 프로세싱하지 않는 원핵 숙주 세포의 경우, 신호 서열은, 예를 들어, 알칼리성 포스파타제, 페니실리나제, 1 pp, 또는 열-안정성 장독소 II 리더의 군으로부터 선택된 원핵 신호 서열에 의해 치환된다. 효모 분비의 경우, 천연 신호 서열은, 예를 들어, 효모 인버타제 리더, 인자 리더 (사카로미세스(Saccharomyces) 및 클루이베로미세스(Kluyveromyces) 알파-인자 리더를 포함함), 또는 산 포스파타제 리더, 씨. 알비칸스(C. albicans) 글루코아밀라제 리더, 또는 PCT 공개 번호 WO 90/13646에 기재된 신호에 의해 치환될 수 있다. 포유동물 세포 발현에서, 포유동물 신호 서열뿐만 아니라 바이러스 분비 리더, 예를 들어, 단순 포진 gD 신호가 이용가능하다. 이러한 전구체 영역에 대한 DNA는 리딩 프레임에서 단백질을 코딩하는 DNA에 라이게이션될 수 있다.
진핵 숙주 세포 (예를 들어, 효모, 진균, 곤충, 식물, 동물, 인간, 또는 다른 다세포 유기체로부터의 유핵 세포)에 사용되는 발현 벡터는 또한 전사의 종결 및 mRNA 안정화에 필요한 서열을 함유할 것이다. 이러한 서열은 통상적으로 진핵 또는 바이러스 DNA 또는 cDNA의 5' 및, 때때로 3' 비번역 영역으로부터 이용가능하다. 이들 영역은 다가 항체를 코딩하는 mRNA의 비번역 부분에서 폴리아데닐화 단편으로서 전사되는 뉴클레오티드 절편을 함유한다. 1종의 유용한 전사 종결 성분은 소 성장 호르몬 폴리아데닐화 영역이다. PCT 공개 번호 WO 94/11026 및 본원에 개시된 발현 벡터를 참조한다.
재조합 DNA는 또한 단백질을 정제하는 데 유용할 수 있는 임의의 유형의 단백질 태그 서열을 포함할 수 있다. 단백질 태그의 예는 히스티딘 태그, 플래그 태그, myc 태그, HA 태그, 또는 GST 태그를 포함하나 이에 제한되지는 않는다. 박테리아, 진균, 효모, 및 포유동물 세포 숙주에 사용하기 위한 적절한 클로닝 및 발현 벡터는 문헌 [Cloning Vectors: A Laboratory Manual, (Elsevier, New York, 1985)]에서 찾아볼 수 있고, 그의 관련 개시내용은 본원에 참조로 포함된다.
발현 구축물은 관련 기술분야의 통상의 기술자에게 명백할 바와 같이, 숙주 세포에 적절한 방법을 사용하여 숙주 세포 내로 도입된다. 핵산을 숙주 세포 내로 도입하는 다양한 방법은 관련 기술분야에 공지되어 있고, 이는 전기천공; 칼슘 클로라이드, 루비듐 클로라이드, 칼슘 포스페이트, DEAE-덱스트란, 또는 다른 물질을 사용하는 형질감염; 미세발사체 충격; 리포펙션; 및 (벡터가 감염원인 경우) 감염을 포함하나, 이에 제한되지는 않는다.
적합한 숙주 세포는 원핵생물, 효모, 포유동물 세포, 또는 박테리아 세포를 포함한다. 적합한 박테리아는 그람 음성 또는 그람 양성 유기체, 예를 들어, 이. 콜라이 또는 바실루스 종(Bacillus spp .)을 포함한다. 효모, 바람직하게는 사카로미세스 종, 예컨대 에스. 세레비지아에(S. cerevisiae)로부터의 것이 또한 폴리펩티드의 생산에 사용될 수 있다. 다양한 포유동물 또는 곤충 세포 배양 시스템이 또한 재조합 단백질을 발현시키는 데 사용될 수 있다. 곤충 세포에서의 이종 단백질의 생산을 위한 바큘로바이러스 시스템이 문헌 [Luckow and Summers, (Bio/Technology, 6:47, 1988)]에서 검토된다. 일부 경우에서 척추동물 세포에서 단백질을 생산하는 것이, 예컨대 글리코실화를 위해 바람직할 것이고, 배양물 (조직 배양물)에서의 척추동물 세포의 번식은 상용 절차가 되었다. 적합한 포유동물 숙주 세포주의 예는 내피 세포, COS-7 원숭이 신장 세포, CV-1, L 세포, C127, 3T3, 차이니즈 햄스터 난소 (CHO), 인간 배아 신장 세포, HeLa, 293, 293T, 및 BHK 세포주를 포함한다. 많은 적용의 경우, 본원에 기재된 단백질 다량체의 작은 크기는 이. 콜라이가 발현을 위한 바람직한 방법이 되도록 할 것이다.
F. 단백질 생산
숙주 세포는 단백질 생산을 위해 본원에 기재된 발현 또는 클로닝 벡터로 형질전환되고 프로모터를 도입하거나, 형질전환체를 선택하거나, 또는 목적하는 서열을 코딩하는 유전자를 증폭시키도록 적절하게 변형된 통상적인 영양 배지에서 배양된다.
본원에 기재된 바와 같은 HSA 결합 10Fn3 도메인 및 이를 포함하는 융합 분자를 생산하는 데 사용되는 숙주 세포는 다양한 배지에서 배양될 수 있다. 상업적으로 입수가능한 배지 예컨대 햄 F10 (시그마(Sigma)), 최소 필수 배지 ((MEM), (시그마)), RPMI-1640 (시그마), 및 둘베코 변형 이글 배지 ((DMEM), (시그마))가 숙주 세포를 배양하는 데 적합하다. 또한, 문헌 [Ham et al., Meth Enz 58:44 (1979), Barnes et al., Anal Biochem 102:255 (1980)], 미국 특허 번호 4,767,704; 4,657,866; 4,927,762; 4,560,655; 또는 5,122,469; WO90/03430; WO87/00195; 또는 미국 특허 번호 Re. 30,985에 기재된 배지 중 어느 것이 숙주 세포를 위한 배양 배지로서 사용될 수 있다. 이들 배지 중 어느 것은 필요에 따라 호르몬 및/또는 다른 성장 인자 (예컨대 인슐린, 트랜스페린, 또는 표피 성장 인자), 염 (예컨대 염화나트륨, 칼슘, 마그네슘, 및 포스페이트), 완충제 (예컨대 HEPES), 뉴클레오티드 (예컨대 아데노신 및 티미딘), 항생제 (예컨대 겐타마이신(GENTAMYCIN)™ 약물), 미량 원소 (통상적으로 마이크로몰 범위의 최종 농도로 존재하는 무기 화합물로 정의됨), 및 글루코스 또는 등가 에너지원으로 보충될 수 있다. 임의의 다른 필요한 보충물이 또한 관련 기술분야의 통상의 기술자에게 공지된 적절한 농도로 포함될 수 있다. 배양 조건, 예컨대 온도, pH 등은 발현을 위해 선택된 숙주 세포에 이전에 사용된 것이고, 통상의 기술자에게 명백할 것이다.
본원에 기재된 바와 같은 HSA 결합 10Fn3 도메인 및 이를 포함하는 융합 분자는 또한 무세포 번역 시스템을 사용하여 생산될 수 있다. 이러한 목적을 위해 피브로넥틴 기반 스캐폴드 단백질을 코딩하는 핵산은 mRNA를 생산하는 시험관내 전사를 가능하게 하고 이용되는 특정한 무세포 시스템 (진핵 예컨대 포유동물 또는 효모 무세포 번역 시스템 또는 원핵 예컨대 박테리아 무세포 번역 시스템)에서 mRNA의 무세포 번역을 가능하게 하도록 변형되어야 한다.
본원에 기재된 바와 같은 HSA 결합 10Fn3 도메인 및 이를 포함하는 융합 분자는 또한 화학적 합성에 의해 (예를 들어, 문헌 [Solid Phase Peptide Synthesis, 2nd ed., 1984, The Pierce Chemical Co., Rockford, IL]에 기재된 방법에 의해) 생산될 수 있다. 피브로넥틴 기반 스캐폴드 단백질에 대한 변형은 또한 화학적 합성에 의해 생성될 수 있다.
본원에 기재된 바와 같은 HSA 결합 10Fn3 도메인 및 이를 포함하는 융합 분자는 단백질 화학의 분야에 일반적으로 공지된, 단백질을 위한 단리/정제 방법에 의해 정제될 수 있다. 비제한적 예는 추출, 재결정화, 염석 (예를 들어, 황산암모늄 또는 황산나트륨을 사용함), 원심분리, 투석, 한외여과, 흡착 크로마토그래피, 이온 교환 크로마토그래피, 소수성 크로마토그래피, 정상 크로마토그래피, 역상 크로마토그래피, 겔 여과, 겔 투과 크로마토그래피, 친화성 크로마토그래피, 전기영동, 향류 분배 또는 이들의 임의의 조합을 포함한다. 정제한 후, 본원에 기재된 혈청 알부민 결합제 및 융합 분자는 상이한 완충제로 교환되고/거나 여과 및 투석을 포함하나, 이에 제한되지는 않는, 관련 기술분야에 공지된 다양한 방법 중 어느 것에 의해 농축될 수 있다.
본원에 기재된 바와 같은 정제된 HSA 결합 10Fn3 도메인 및 이를 포함하는 융합 분자는, 바람직하게는 적어도 85% 순수하고, 보다 바람직하게는 적어도 95% 순수하고, 가장 바람직하게는 적어도 98% 순수하다. 순도의 정확한 수치와 관계없이, 본원에 기재된 바와 같은 HSA 결합 10Fn3 도메인 및 이를 포함하는 융합 분자는 제약 제품으로서 사용하기에 충분히 순수하다.
본원에 기재된 바와 같은 HSA 결합 10Fn3 도메인 및 이를 포함하는 융합 분자는 또한 하기 프로토콜을 사용하여 생산될 수 있다.
애드넥틴을 HIS6태그의 상류에서 PET9d 벡터 내로 클로닝하고 이. 콜라이 BL21 DE3 plysS 세포 내로 형질전환시킬 수 있고 이를 50 μg/mL 카나마이신을 함유하는 5 ml LB 배지에 24-웰 포맷으로 접종하고 37℃에서 밤새 성장시킨다. 신선한 5 ml LB 배지 (50 μg/mL 카나마이신) 배양물을 유도성 발현을 위해 밤샘 배양물로부터 200 μl를 흡인하고 이를 적절한 웰에 분주함으로써 제조한다. 배양물을 37℃에서 A600 0.6-0.9까지 성장시킨다. 1 mM 이소프로필-β-티오갈락토시드 (IPTG)로 유도한 후, 배양물을 30℃에서 6시간 동안 발현시키고 2750 g에서 4℃에서 10분 동안 원심분리하여 수거한다.
세포 펠릿 (24-웰 포맷)을 450 μl의 용해 완충제 (50 mM NaH2PO4, 0.5 M NaCl, 1x 완전 ™ 프로테아제 억제제 칵테일-EDTA 무함유 (로슈(Roche)), 1 mM PMSF, 10 mM CHAPS, 40 mM 이미다졸, 1 mg/ml 리소자임, 30 μg/ml DNAse, 2 μg/ml 아프로토닌, pH 8.0) 중에 재현탁시켜 용해시키고 실온에서 1-3시간 동안 진탕시킨다. 용해물을 소거하고 96-웰, 1.2 ml 캐치 플레이트가 장착된 96-웰 와트만 GF/D 유니필터(Whatman GF/D Unifilter)로 옮겨 96-웰 포맷 내로 재-래킹하고 양압에 의해 여과한다. 소거된 용해물을 평형 완충제 (50 mM NaH2PO4, 0.5 M NaCl, 40 mM 이미다졸, pH 8.0)로 평형화된 96-웰 니켈 또는 코발트-킬레이트화 플레이트로 옮기고 5분 동안 인큐베이션한다. 미결합 물질을 양압에 의해 제거한다. 수지를 세척 완충제 #1 (50 mM NaH2PO4, 0.5 M NaCl, 5 mM CHAPS, 40 mM 이미다졸, pH 8.0)을 포함한 0.3 ml/웰로 2회 세척한다. 각각의 세척물을 양압에 의해 제거한다. 용리 전에, 각각의 웰을 50 μl 용리 완충제 (PBS + 20 mM EDTA)로 세척하고, 5분 동안 인큐베이션하고, 이 세척물을 양압에 의해 폐기한다. 단백질을 추가의 100 μl의 용리 완충제를 각각의 웰에 적용함으로써 용리한다. 실온에서 30분 인큐베이션한 후, 플레이트(들)를 5분 동안 200 g에서 원심분리하고 용리 전에 용리 캐치 플레이트의 바닥에 첨가된 5 μl의 0.5 M MgCl2를 함유하는 96-웰 캐치 플레이트에 수집된 단백질을 용리한다. 용리된 단백질을 단백질 표준으로서 야생형 10Fn3 도메인을 사용하는 총 단백질 검정을 사용하여 정량화한다.
불용성 애드넥틴의 발현을 위해, 애드넥틴(들)을 코딩하는 핵산에 이어 HIS6태그를 pET9d (EMD 바이오사이언스(EMD Bioscience), 캘리포니아주 샌디에고) 벡터 내로 클로닝하고 이. 콜라이 HMS174 세포에서 발현시킨다. 20 ml의 접종 배양물 (단일 플레이팅된 콜로니로부터 생성됨)을 사용하여 50 μg/ml 카르베니실린 및 34 μg/ml 클로람페니콜을 함유하는 1 리터의 LB 배지에 접종한다. 배양물을 37℃에서 A600 0.6-1.0까지 성장시킨다. 1 mM 이소프로필-β-티오갈락토시드 (IPTG)를 사용하여 유도한 후 배양물을 30℃에서 4시간 동안 성장시키고 > 10,000 g에서 4℃에서 30분 동안 원심분리하여 수거한다. 세포 펠릿을 -80℃에서 동결시킨다. 세포 펠릿을 얼음 상에서 울트라-투락스(ULTRA-TURRAX)® 균질화기 (IKA 웍스(IKA works))를 사용하여 25 ml의 용해 완충제 (20 mM NaH2PO4, 0.5 M NaCl, lx 완전 프로테아제 억제제 칵테일-EDTA 무함유 (로슈), 1 mM PMSF, pH 7.4) 중에 재현탁시킨다. 세포 용해를 모델 M-l 10S 마이크로플루이다이저(MICROFLUIDIZER)® (마이크로플루이딕스(Microfluidics))를 사용하여 고압 균질화 (>18,000 psi)에 의해 달성한다. 불용성 분획을 23,300 g에서 4℃에서 30분 동안 원심분리하여 분리한다. 용해물의 원심분리로부터 회수된 불용성 펠릿을 20 mM 인산나트륨/500 mM NaCl, pH7.4로 세척한다. 펠릿을 초음파처리하면서 20 mM 인산나트륨/500 M NaCl pH 7.4 중 6.0 M 구아니딘 히드로클로라이드 중에 재가용화시키고 이어서 37℃에서 1- 2시간 동안 인큐베이션한다. 재가용화된 펠릿을 0.45 μm로 여과하고 20 mM 인산나트륨/500 M NaCl/6.0 M 구아니딘 pH 7.4 완충제로 평형화된 히스트랩(Histrap) 칼럼 상에 로딩한다. 로딩한 후, 칼럼을 추가의 25 CV를 위해 동일한 완충제로 세척한다. 결합된 단백질을 20 mM 인산나트륨/500 mM NaCl/6.0 M 구안-HCl pH7.4 중 50 mM 이미다졸로 용리한다. 정제된 단백질을 50 mM 아세트산나트륨/150 mM NaCl pH 4.5에 대한 투석에 의해 재폴딩시킨다.
가용성 애드넥틴의 발현을 위해, 애드넥틴(들)을 코딩하는 핵산에 이어 HIS6태그를 pET9d (EMD 바이오사이언스, 캘리포니아주 샌디에고) 벡터 내로 클로닝하고 이. 콜라이 HMS174 세포에서 발현시킨다. 20 ml의 접종 배양물 (단일 플레이팅된 콜로니로부터 생성됨)을 사용하여 50 μg/ml 카르베니실린 및 34 μg/ml 클로람페니콜을 함유하는 1 리터의 LB 배지에 접종한다. 배양물을 37℃에서 A600 0.6-1.0까지 성장시킨다. 1 mM 이소프로필-β-티오갈락토시드 (IPTG)를 사용하여 유도한 후, 배양물을 30℃에서 4시간 동안 성장시키고 >10,000 g에서 4℃에서 30분 동안 원심분리하여 수거한다. 세포 펠릿을 -80℃에서 동결시킨다. 세포 펠릿을 얼음 상에서 울트라-투락스® 균질화기 (IKA 웍스)를 사용하여 25 ml의 용해 완충제 (20 mM NaH2PO4, 0.5 M NaCl, lx 완전 프로테아제 억제제 칵테일-EDTA 무함유 (로슈), 1 mM PMSF, pH 7.4) 중에 재현탁시킨다. 세포 용해를 모델 M-1 10S 마이크로플루이다이저® (마이크로플루이딕스)를 사용하여 고압 균질화 (>18,000 psi)에 의해 달성한다. 가용성 분획을 23,300 g에서 4℃에서 30분 동안 원심분리하여 분리한다. 상청액을 0.45 μm 필터를 통해 정화한다. 정화된 용해물을 20 mM 인산나트륨/500 M NaCl pH 7.4로 사전-평형화된 히스트랩 칼럼 (GE) 상에 로딩한다. 이어서 칼럼을 25 칼럼 부피의 동일한 완충제에 이어 20 칼럼 부피의 20 mM 인산나트륨/500 M NaCl/25 mM 이미다졸, pH 7.4 및 이어서 35 칼럼 부피의 20mM 인산나트륨/500 M NaCl/40 mM 이미다졸, pH 7.4로 세척한다. 단백질을 15 칼럼 부피의 20 mM 인산나트륨/500 M NaCl/500 mM 이미다졸, pH 7.4로 용리하고, 분획을 A2so에서의 흡광도에 기초하여 합하고 lx PBS, 50 mM Tris, 150 mM NaCl; pH 8.5 또는 50 mM NaOAc; 150 mM NaCl; pH4.5에 대해 투석한다. 임의의 침전물을 0.22 μm에서 여과함으로써 제거한다.
G. 영상화, 진단, 및 다른 용도
본원에 제공된 HSA 결합 10Fn3 융합체는 HSA 결합 10Fn3 도메인에 융합된 이종 분자의 정체성에 기초하여 다양한 질환 및 장애를 치료하는 데 사용될 수 있다. HSA 결합 10Fn3 융합체의 용도는 관련 기술분야의 지식 및 본원에 제공된 정보에 기초하여 통상의 기술자에 의해 결정될 수 있다. 다양한 HSA 결합 10Fn3 융합 단백질의 용도가 본원에 상세하게 기재되어 있다. HSA 결합 10Fn3 융합체는 인간 및 비-인간 유기체 둘 다를 포함하는 임의의 포유동물 대상체 또는 환자에게 투여될 수 있다.
본원에 기재된 HSA 결합 10Fn3 도메인 및 융합 분자는 검출가능하게 표지될 수 있고 영상화 또는 진단 용도를 위해, 예를 들어, 융합 분자에 의해 결합된 단백질을 발현하는 세포와 접촉시키는 데 사용될 수 있다. 문헌 [Hunter et al., Nature 1962;144:945; David et al., Biochemistry 1974;13:1014; Pain et al., J Immunol Meth 1981;40:219; 및 Nygren, Histochem and Cytochem 1982;30:407]에 의해 기재된 방법을 포함하는, 단백질을 검출가능한 모이어티에 접합시키는 관련 기술분야에 공지된 임의의 방법이 사용될 수 있다.
특정 실시양태에서, 본원에 기재된 바와 같은 HSA 결합 10Fn3 도메인 및 이를 포함하는 융합 분자는 추가로 검출될 수 있는 표지 (예를 들어, 표지는 방사성동위원소, 형광 화합물, 효소 또는 효소 보조-인자일 수 있음)에 부착되어 있다. 표지는 방사성 작용제, 예컨대: 방사성 중금속 예컨대 철 킬레이트, 가돌리늄 또는 망가니즈의 방사성 킬레이트, 산소, 질소, 철, 탄소, 또는 갈륨의 양전자 방출체, 43K, 52Fe, 57Co, 67Cu, 67Ga, 68Ga, 123I, 125I, 131I, 132I, 또는 99Tc일 수 있다. 특정 실시양태에서, 표지는 형광 또는 화학발광 화합물, 예컨대 플루오레세인 이소티오시아네이트, 로다민, 또는 루시페린; 또는 효소, 예컨대 알칼리성 포스파타제, 베타-갈락토시다제 또는 양고추냉이 퍼옥시다제일 수 있다. 이러한 모이어티에 부착되어 있는 HSA 결합 10Fn3 도메인 또는 융합 분자는 영상화제로서 사용될 수 있고 포유동물 예컨대 인간에서 진단 용도에 효과적인 양으로 투여된 다음, 영상화제의 국재화 및 축적이 검출된다. 영상화제의 국재화 및 축적은 방사성섬광조영, 핵 자기 공명 영상화, 컴퓨터 단층촬영 또는 양전자 방출 단층촬영에 의해 검출될 수 있다. 통상의 기술자에게 명백할 바와 같이, 투여될 방사성동위원소의 양은 방사성동위원소에 따라 달라진다. 관련 기술분야의 통상의 기술자는 활성 모이어티로서 사용되는 주어진 방사성핵종의 특이적 활성 및 에너지에 기초하여 투여될 영상화제의 양을 용이하게 제제화할 수 있다.
본원에 기재된 바와 같은 HSA 결합 10Fn3 도메인 및 이를 포함하는 융합 분자는 또한 친화도 정제 작용제로서 유용하다. 이러한 공정에서, 단백질은 관련 기술분야에 널리 공지된 방법을 사용하여, 적합한 지지체, 예컨대 세파덱스(Sephadex) 수지 또는 여과지 상에 고정된다. 단백질은 임의의 공지된 검정 방법, 예컨대 경쟁적 결합 검정, 직접 및 간접 샌드위치 검정, 및 면역침전 검정에 사용될 수 있다 (Zola, Monoclonal Antibodies: A Manual of Techniques, pp. 147-158 (CRC Press, Inc., 1987)).
H. 생물물리학적 및 생화학적 특징화
결합 친화도에 대한 시험관내 검정
HSA에 결합하는 애드넥틴은 다양한 시험관내 검정을 사용하여 확인될 수 있다. 특정 실시양태에서, 검정은 다수의 후보 애드넥틴을 동시에 스크리닝하는 것을 허용하는 고처리량 검정이다.
애드넥틴의 그의 표적에 대한 결합 친화도를 결정하는 예시적인 검정은 용액 상 방법 예컨대 동역학적 배제 검정 (KinExA) (Blake et al., JBC 1996; 271:27677-85; Drake et al., Anal Biochem 2004; 328:35-43), 비아코어® 시스템 (스웨덴 웁살라) (Welford et al., Opt. Quant. Elect 1991; 23:1; Morton and Myszka, Methods in Enzymology 1998; 295:268)을 사용한 표면 플라즈몬 공명 (SPR) 및 균질 시간 분해 형광 (HTRF) 검정 (Newton et al., J Biomol Screen 2008; 13:674-82; Patel et al., Assay Drug Dev Technol 2008; 6:55-68)을 포함하나, 이에 제한되지는 않는다.
특정 실시양태에서, 생체분자 상호작용은 SPR을 사용하여 최대 300 nm의 표면의 굴절률의 변화로 인한 유리 지지체 상의 금 박막의 표면에서 광의 공명각의 변화를 검출하는 비아코어® 시스템을 사용하여 실시간으로 모니터링될 수 있다. 비아코어 분석은 회합률 상수, 해리율 상수, 평형 해리 상수, 및 친화도 상수를 생성한다. 결합 친화도는 비아코어 표면 플라즈몬 공명 시스템 (비아코어, 인크.(Biacore, Inc.))을 사용하여 회합률 및 해리율 상수를 평가함으로써 수득된다. 바이오센서 칩은 표적의 공유 커플링에 대해 활성화된다. 이어서 표적을 희석하고 칩 상으로 주사하여 고정된 물질의 반응 단위로 신호를 수득한다. 공명 단위 (RU)의 신호가 고정된 물질의 질량에 비례하기 때문에, 이는 매트릭스 상의 고정된 표적 밀도의 범위를 나타낸다. 회합 및 해리 데이터는 전반적 분석에서 동시에 피팅되어 1:1 이분자 상호작용에 대한 순 레이트 표현을 해결하고, 이는 k온, k오프, 및 Rmax (포화에서의 최대 반응)에 대한 최적 적합성 값을 산출한다. 결합에 대한 평형 해리 상수인 KD는 SPR 측정으로부터 k오프/k온으로서 계산된다.
본원에 기재된 HSA 결합 10Fn3 도메인의 인간, 시노몰구스 원숭이, 래트, 마우스로부터의 혈청 알부민에 대한 결합에 대한 오프-레이트 (kd), 온-레이트 (ka), 및 해리 평형 상수 (KD)는 SPR 비아코어 분석을 사용하여 결정될 수 있다. 특정 실시양태에서, 각각의 혈청 알부민은 표준 NHS/EDC 커플링을 사용하여 비아코어 CM5 칩 상에 ~1200RU의 표면 밀도로 가동화된다. 소정의 농도 범위 (0.25nM - 5uM)의 시험될 HSA 결합 10Fn3 도메인은 HBS-P+ (0.01M HEPES pH 7.4, 0.15M NaCl, 0.05% v/v 계면활성제 P-20) 또는 아세테이트 (0.02mM 아세트산나트륨 pH 5.5, 0.15M NaCl, 0.05% v/v 계면활성제 P-20) 구동 완충제 중에서 고정된 알부민에 적용된다. 동역학적 측정은 3분 회합 및 6 - 10분 해리 단계를 사용하여 수행된다. 참조-차감된 센소그램의 동역학적 트레이스는 비아이밸루에이션(Biaevaluation) 소프트웨어를 사용하여 1:1 결합 모델에 피팅된다.
본원에 상기 기재된 검정은 예시적이고, 단백질 사이의 결합 친화도를 결정하는 관련 기술분야에 공지된 임의의 방법 (예를 들어, 형광 기반-전달 (FRET), 효소-연결 면역흡착 검정, 및 경쟁적 결합 검정 (예를 들어, 방사선면역검정))은 본원에 기재된 혈청 알부민 결합 10Fn3 도메인의 결합 친화도를 평가하는 데 사용될 수 있다는 것이 이해되어야 한다.
특정 실시양태에서, 본원에 기재된 HSA 결합 10Fn3 도메인, 또는 이를 포함하는 융합 단백질의 용융 온도 (Tm)는 시차 주사 열량측정 (DSC) 또는 열 주사 형광 (TSF)을 사용하여 측정 시 적어도 50℃, 예컨대 적어도 51℃, 적어도 52℃, 적어도 53℃, 적어도 54℃, 적어도 55℃, 적어도 56℃, 적어도 57℃, 적어도 58℃, 적어도 59℃, 적어도 60℃, 적어도 61℃, 적어도 62℃, 적어도 63℃, 적어도 64℃, 적어도 65℃, 적어도 66℃, 적어도 67℃, 적어도 68℃, 적어도 69℃, 적어도 70℃, 적어도 71℃, 적어도 72℃, 적어도 73℃, 적어도 74℃, 또는 적어도 75℃이다.
특정 실시양태에서, 본원에 기재된 HSA 결합 10Fn3 도메인, 또는 이를 포함하는 융합 단백질의 용융 온도 (Tm)는 시차 주사 열량측정 (DSC) 또는 열 주사 형광 (TSF)을 사용하여 측정 시 50-75℃, 예컨대 51-75℃, 52-75℃, 53-75℃, 54-75℃, 55-75℃, 56-75℃, 57-75℃, 58-75℃, 59-75℃, 60-75℃, 61-75℃, 62-75℃, 63-75℃, 64-75℃, 65-75℃, 66-75℃, 67-75℃, 68-75℃, 69-75℃, 70-75℃, 50-74℃, 50-73℃, 50-72℃, 50-71℃, 50-70℃, 50-69℃, 50-68℃, 50-67℃, 50-66℃, 50-65℃, 50-64℃, 50-63℃, 50-62℃, 50-61℃, 50-60℃, 50-59℃, 50-58℃, 50-57℃, 50-56℃, 50-55℃, 51-74℃, 52-73℃, 53-71℃, 54-70℃, 또는 55-65℃이다.
I. 생체내 치료 용도
장애의 치료에 유용한 HSA 결합 10Fn3 도메인 및 이를 포함하는 융합 분자가 본원에 제공된다. HSA 결합 10Fn3 도메인을 포함하는 융합 단백질의 경우에, 치료될 수 있는 질환 또는 장애는 애드넥틴에 연결된 모이어티, 예를 들어, 제2 10Fn3 도메인의 결합 특이성에 의해 좌우될 것이다. 본원에 기재된 바와 같이, 피브로넥틴 기반 스캐폴드 단백질은 임의의 관심 표적에 결합하도록 설계될 수 있다. 한 실시양태에서, 표적은 PCSK9이다. PSCK9에 결합하는 피브로넥틴 기반 스캐폴드 단백질 및 이를 포함하는 융합 단백질은 아테롬성동맥경화증, 고콜레스테롤혈증 및 다른 콜레스테롤 관련 질환을 치료하는 데 사용될 수 있다.
본 출원은 또한 대상체에게 피브로넥틴 기반 스캐폴드 단백질을 투여하는 방법을 제공한다. 특정 실시양태에서, 대상체는 인간이다. 특정 실시양태에서, 피브로넥틴 기반 스캐폴드 단백질은 포유동물, 특히 인간에게 제약상 허용된다. "제약상 허용되는" 조성물은 유의한 유해 의학적 예후 없이 동물에게 투여되는 조성물을 지칭한다. 제약상 허용되는 조성물의 예는 인테그린-결합 도메인 (RGD)이 결여된 10Fn3 도메인을 포함하는 폴리펩티드를 포함하는 조성물 및 본질적으로 내독소 또는 발열원 무함유이거나 또는 매우 낮은 내독소 또는 발열원 수준을 갖는 조성물을 포함한다.
J. 제제 및 투여
HSA 결합 10Fn3 도메인에 융합된 모이어티 (예를 들어, 치료 모이어티)를 투여하는 방법이 본원에 제공되며, 여기서 HSA 결합 10Fn3 도메인에 융합된 경우 모이어티의 반감기는 연장된다. 융합 구축물의 투여 기술 및 투여량은 HSA 결합 10Fn3 도메인에 융합된 치료 모이어티의 유형 및 치료될 구체적 상태에 따라 달라질 것이나 통상의 기술자에 의해 용이하게 결정될 수 있다. 일반적으로, 규제 기관은 치료제로서 사용될 단백질 시약이 허용가능하게 낮은 수준의 발열원을 갖도록 제제화되는 것을 필요로 한다. 따라서, 치료 제제는 일반적으로 실질적으로 발열원 무함유이거나, 또는 적어도 적절한 규제 기관 (예를 들어, FDA)에 의해 결정된 바와 같은 허용되는 수준 이하의 발열원을 함유한다는 점에서 다른 제제와 구별될 것이다.
특정 실시양태에서, 본원에 기재된 바와 같은 HSA 결합 10Fn3 도메인 및 이를 포함하는 융합 분자의 제약 제제는, 예를 들어, pH 4.0-7.0에서 1-20 mM 숙신산, 2-10% 소르비톨, 및 1-10% 글리신을 포함한다. 예시적인 실시양태에서, HSA 결합 10Fn3 도메인 및 그의 융합 분자의 제약 제제는, 예를 들어, pH 6.0에서 10 mM 숙신산, 8% 소르비톨, 및 5% 글리신을 포함한다.
특정 실시양태에서, 본원에 기재된 바와 같은 HSA 결합 10Fn3 도메인 및 이를 포함하는 융합체는 포유동물, 특히 인간에게 제약상 허용된다. "제약상 허용되는" 폴리펩티드는 유의한 유해 의학적 예후 없이 동물에게 투여되는 폴리펩티드를 지칭한다. 본원에 기재된 바와 같은 제약상 허용되는 HSA 결합 10Fn3 도메인 및 이를 포함하는 융합체의 예는 인테그린-결합 도메인 (RGD)이 결여된 10Fn3 도메인 및 본질적으로 내독소 무함유이거나 또는 매우 낮은 내독소 수준을 갖는 HSA 결합 10Fn3 도메인 또는 HSA 결합 10Fn3 도메인 융합체의 조성물을 포함한다.
조성물 (예를 들어, 치료 조성물)은 담체 (예를 들어, 제약상 허용되는 희석제, 담체, 또는 부형제)와 함께 단위 투여 형태로 투여될 수 있다. 투여는 비제한적 예로서 비경구 (예를 들어, 정맥내, 피하), 경구, 또는 국소일 수 있다. 조성물은 경구 투여를 위한 환제, 정제, 캡슐, 액체, 또는 지속 방출 정제; 정맥내, 피하 또는 비경구 투여를 위한 액체; 또는 국소 투여를 위한 겔, 로션, 연고, 크림, 또는 중합체 또는 다른 지속 방출 비히클의 형태일 수 있다.
제제를 제조하는 관련 기술분야에 널리 공지된 방법은, 예를 들어, 문헌 ["Remington: The Science and Practice of Pharmacy" (20th ed., ed. A. R. Gennaro A R., 2000, Lippincott Williams & Wilkins, Philadelphia, Pa.)]에서 발견된다. 비경구 투여를 위한 제제는, 예를 들어, 부형제, 멸균수, 염수, 폴리알킬렌 글리콜 예컨대 폴리에틸렌 글리콜, 식물 기원의 오일, 또는 수소화 나프탈렌을 함유할 수 있다. 생체적합성, 생분해성 락티드 중합체, 락티드/글리콜리드 공중합체, 또는 폴리옥시에틸렌-폴리옥시프로필렌 공중합체는 화합물의 방출을 제어하는 데 사용될 수 있다. 나노미립자 제제 (예를 들어, 생분해성 나노입자, 고체 지질 나노입자, 리포솜)는 화합물의 생체분포를 제어하는 데 사용될 수 있다. 다른 잠재적으로 유용한 비경구 전달 시스템은 에틸렌-비닐 아세테이트 공중합체 입자, 삼투 펌프, 이식형 주입 시스템, 및 리포솜을 포함한다. 제제 중 화합물의 농도는 투여되는 약물의 투여량, 및 투여 경로를 포함하는 다수의 인자에 따라 달라진다.
폴리펩티드는 임의로 제약 산업에 통상적으로 사용되는 제약상 허용되는 염, 예컨대 비-독성 산 부가염 또는 금속 착물로서 투여될 수 있다. 산 부가염의 예는 유기 산 예컨대 아세트산, 락트산, 파모산, 말레산, 시트르산, 말산, 아스코르브산, 숙신산, 벤조산, 팔미트산, 수베르산, 살리실산, 타르타르산, 메탄술폰산, 톨루엔술폰산, 또는 트리플루오로아세트산 등; 중합체 산 예컨대 탄닌산, 카르복시메틸 셀룰로스 등; 및 무기 산 예컨대 염산, 브로민화수소산, 황산 인산 등을 포함한다. 금속 착물은 아연, 철 등을 포함한다. 한 예에서, 폴리펩티드는 열 안정성을 증가시키기 위해 아세트산나트륨의 존재 하에 제제화된다.
경구 용도를 위한 제제는 비-독성 제약상 허용되는 부형제와의 혼합물로 활성 성분(들)을 함유하는 정제를 포함한다. 이들 부형제는, 예를 들어, 불활성 희석제 또는 충전제 (예를 들어, 수크로스 및 소르비톨), 윤활제, 활택제, 및 항-접착제 (예를 들어, 스테아르산마그네슘, 스테아르산아연, 스테아르산, 실리카, 수소화 식물성 오일, 또는 활석)일 수 있다.
경구 용도를 위한 제제는 또한 저작성 정제, 또는 활성 성분이 불활성 고체 희석제와 혼합된 경질 젤라틴 캡슐, 또는 활성 성분이 물 또는 오일 매질과 혼합된 연질 젤라틴 캡슐로서 제공될 수 있다.
치료 유효 용량은 투여되는 대상체에 대해 치료 효과를 생성하는 용량을 지칭한다. 정확한 용량은 치료될 장애에 따라 달라질 것이고, 공지된 기술을 사용하여 관련 기술분야의 통상의 기술자에 의해 확인될 수 있다. 일반적으로, HSA 결합 10Fn3 도메인 또는 HSA 결합 10Fn3 도메인 융합체는 1일 약 0.01 μg/kg 내지 약 50 mg/kg, 바람직하게는 1일 0.01 mg/kg 내지 약 30 mg/kg, 가장 바람직하게는 1일 0.1 mg/kg 내지 약 20 mg/kg으로 투여된다. 폴리펩티드는 매일 (예를 들어, 1일 1회, 2회, 3회, 또는 4회) 또는 보다 덜 빈번하게 (예를 들어, 격일 1회, 매주 1회 또는 2회, 2주마다 1회, 또는 매월) 제공될 수 있다. 또한, 관련 기술분야에 공지된 바와 같이, 연령뿐만 아니라 체중, 전반적 건강, 성별, 식이, 투여 시간, 약물 상호작용, 및 질환의 중증도에 대한 조정이 필요할 수 있고, 관련 기술분야의 통상의 기술자에 의한 상용 실험으로 확인가능할 것이다.
K. 예시적 실시양태
실시양태 1. 피브로넥틴 유형 III 제10 (10Fn3) 도메인을 포함하는 폴리펩티드이며, 여기서 10Fn3 도메인은 1μM 미만의 KD로 인간 혈청 알부민 (HSA)에 결합하고 AB, BC, CD, DE, EF, 및 FG 루프를 포함하고, 여기서 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 CD 및 FG 루프에 비해, CD 루프는 1, 2, 또는 3개의 아미노산 치환을 갖고, FG 루프는 임의로 1, 2, 또는 3개의 아미노산 치환을 갖고, 여기서 10Fn3 도메인에 연결된 모이어티 (예를 들어, 폴리펩티드)의 혈청 반감기는 10Fn3 도메인에 연결되지 않은 모이어티의 것에 비해 연장된 것인 폴리펩티드.
실시양태 2. 실시양태 1에 있어서, 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 오프-레이트 (kd) 초과의 kd로 HSA에 결합하는 폴리펩티드.
실시양태 3. 실시양태 1 또는 2에 있어서, 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 온-레이트 (ka)의 한 자릿수 내 (즉, 10-배 내)에 있는 ka로 HSA에 결합하는 폴리펩티드.
실시양태 4. 실시양태 1 내지 3에 있어서, CD 루프가 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 상응하는 CD 루프에 비해 2개의 아미노산 치환을 갖는 것인 폴리펩티드.
실시양태 5. 실시양태 1 내지 3에 있어서, CD 루프가 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 CD 루프에 비해 1개의 아미노산 치환을 갖는 것인 폴리펩티드.
실시양태 6. 실시양태 1 내지 3에 있어서, FG 루프가 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 FG 루프에 비해 1개의 아미노산 치환을 갖는 것인 폴리펩티드.
실시양태 7. 실시양태 1 내지 3에 있어서, 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 CD 루프 및 FG 루프에 비해 CD 루프가 1개의 아미노산 치환을 갖고 FG 루프가 1개의 치환을 갖는 것인 폴리펩티드.
실시양태 8. 실시양태 4에 있어서, 2개의 아미노산 치환이
(i) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 2의 아르기닌 (R)이 D, E, A, Q, 또는 N으로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
(ii) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 5의 글루타민 (Q)이 D로 치환된 것;
(iii) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 7의 티로신 (Y)이 S 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
(iv) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 10의 류신 (L)이 S, T, 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
(v) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 13의 류신 (L)이 D, S, 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
(vi) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 14의 티로신 (Y)이 A 또는 T로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
(vii) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 15의 이소류신 (I)이 D, S, 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것; 및
(viii) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 16의 티로신 (Y)이 Q, E, S, 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것
으로 이루어진 군으로부터 선택된 것인 폴리펩티드.
실시양태 9. 실시양태 5에 있어서, 1개의 아미노산 치환이
(i) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 2의 아르기닌 (R)이 D, E, A, Q, 또는 N으로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
(ii) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 5의 글루타민 (Q)이 D로 치환된 것;
(iii) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 7의 티로신 (Y)이 S 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
(iv) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 10의 류신 (L)이 S, T, 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
(v) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 13의 류신 (L)이 D, S, 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
(vi) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 14의 티로신 (Y)이 A 또는 T로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
(vii) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 15의 이소류신 (I)이 D, S, 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것; 및
(viii) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 16의 티로신 (Y)이 Q, E, S, 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것
으로 이루어진 군으로부터 선택된 것인 폴리펩티드.
실시양태 10. 실시양태 9에 있어서, CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 16의 티로신 (Y)이 세린 (S)으로 치환된 것인 폴리펩티드.
실시양태 11. 실시양태 9에 있어서, CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 10의 류신 (L)이 트레오닌 (T)으로 치환된 것인 폴리펩티드.
실시양태 12. 실시양태 9에 있어서, CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 16의 티로신 (Y)이 글루타민 (Q)으로 치환된 것인 폴리펩티드.
실시양태 13. 실시양태 6에 있어서, FG 루프 (서열식별번호: 29)의 위치 12의 리신 (K)이 A, T, 또는 S로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것인 폴리펩티드.
실시양태 14. 실시양태 7에 있어서,
a) CD 루프에서의 1개의 아미노산 치환이
(i) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 2의 아르기닌 (R)이 D, E, A, Q, 또는 N으로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
(ii) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 5의 글루타민 (Q)이 D로 치환된 것;
(iii) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 7의 티로신 (Y)이 S 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
(iv) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 10의 류신 (L)이 S, T, 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
(v) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 13의 류신 (L)이 D, S, 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
(vi) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 14의 티로신 (Y)이 A 또는 T로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
(vii) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 15의 이소류신 (I)이 D, S, 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것; 및
(viii) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 16의 티로신 (Y)이 Q, E, S, 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것
으로 이루어진 군으로부터 선택되고;
b) FG 루프 (서열식별번호: 29)의 위치 12의 리신이 A, T, 또는 S로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것인 폴리펩티드.
실시양태 15. 실시양태 1 내지 14 중 어느 한 실시양태에 있어서, 서열식별번호: 30-34, 36-40, 42-46, 48, 49, 51, 52, 54, 55, 57, 58, 60, 61, 62, 63, 65-68, 70, 71, 73-76, 78, 79, 81-84, 86, 87, 89-98, 100-109, 및 111-118의 비-CD 루프 영역과 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩티드.
실시양태 16. 실시양태 1 내지 15 중 어느 한 실시양태에 있어서, 서열식별번호: 30-34, 36-40, 42-46, 48, 49, 51, 52, 54, 55, 57, 58, 60, 61, 62, 63, 65-68, 70, 71, 73-76, 78, 79, 81-84, 86, 87, 89-98, 100-109, 및 111-118 중 어느 하나와 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩티드.
실시양태 17. 실시양태 1 내지 16 중 어느 한 실시양태에 있어서, 10Fn3 도메인이 HSA의 도메인 I-II에 결합하는 것인 폴리펩티드.
실시양태 18. 실시양태 1 내지 17 중 어느 한 실시양태에 있어서, 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 오프-레이트에 대한 폴리펩티드의 오프-레이트가 적어도 약 3의 비를 갖는 것인 폴리펩티드.
실시양태 19. 실시양태 17에 있어서, 비가 적어도 약 25인 폴리펩티드.
실시양태 20. 실시양태 17에 있어서, 비가 적어도 약 50인 폴리펩티드.
실시양태 21. 실시양태 1 내지 20 중 어느 한 실시양태에 있어서, 이종 단백질을 포함하는 폴리펩티드.
실시양태 22. 실시양태 20에 있어서, 이종 단백질이 치료 모이어티인 폴리펩티드.
실시양태 23. 실시양태 21 또는 22에 있어서, 이종 단백질이 10Fn3 도메인을 포함하는 폴리펩티드인 폴리펩티드.
실시양태 24. 실시양태 1 내지 23 중 어느 한 실시양태의 폴리펩티드 또는 융합 폴리펩티드, 및 담체를 포함하는 조성물.
실시양태 25. 실시양태 1 내지 23 중 어느 한 실시양태의 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자.
실시양태 26. 실시양태 1 내지 23 중 어느 한 실시양태의 폴리펩티드를 코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함하는 발현 벡터.
실시양태 27. 실시양태 25의 핵산 분자 또는 실시양태 26의 발현 벡터를 포함하는 세포.
실시양태 28. 실시양태 1 내지 23 중 어느 한 실시양태의 폴리펩티드를 생산하는 방법이며, 폴리펩티드를 발현시키는 데 적합한 조건 하에 실시양태 27의 세포를 배양하고, 폴리펩티드를 정제하는 것을 포함하는, 실시양태 1 내지 23 중 어느 한 실시양태의 폴리펩티드를 생산하는 방법.
실시양태 29. 모이어티에 실시양태 1 내지 23 중 어느 한 실시양태의 인간 혈청 알부민 결합 폴리펩티드를 연결하는 것을 포함하는, 모이어티의 반감기를 증진시키는 방법.
본 출원 전반에 걸쳐 인용된 모든 도면 및 모든 참고문헌, 진뱅크(Genbank) 서열, 특허 및 공개 특허 출원의 내용은 명백하게 본원에 참조로 포함된다. 특히, PCT 출원 번호 PCT/US2015/021535 및 WO2011/140086의 개시내용은 명백하게 본원에 참조로 포함된다.
상기 개시내용은 일반적으로 하기 실시예에 의해 추가로 예시되는 본 개시내용을 기재한다. 이들 구체적 실시예는 단지 예시를 위해 기재되고, 본 개시내용의 범주를 제한하는 것으로 의도되지 않는다. 특정한 표적, 용어, 및 값이 본원에 사용되었지만, 이러한 표적, 용어, 및 값은 마찬가지로 본 개시내용의 범주를 예시하고 비제한적인 것으로 이해될 것이다.
실시예
실시예 1: 인간 혈청 알부민 결합 ADX_2629_E06-기반 변이체 10Fn3 도메인의 생성
애드넥틴 ADX_7016_A01 (또한 본원에서 PKE2 애드넥틴으로 지칭됨)을 하기 코어 서열을 갖는, HSA의 도메인 I-II에 결합하는 폴리펩티드로서 단리하였다:
Figure pct00008
(서열식별번호: 23; CD 및 FG 루프는 밑줄로 표시됨)
ADX_7016_A01은 낮은 면역원성을 갖고 약 3-6 nM의 KD로 HSA에 결합한다. ADX_7016_A01에 융합된 PCSK9-결합 애드넥틴을 포함하는 폴리펩티드는 마우스에서 약 82시간의 반감기를 갖는다. 융합 파트너의 반감기 범위의 다용성을 증가시키기 위해 (예를 들어, 특정 상황에서, ADX_7016_A01에 의해 부여된 반감기보다 더 짧은 반감기가 바람직할 수 있음), ADX_7016_A01의 CD 및/또는 FG 루프를 돌연변이유발시키고 (단일 또는 이중 치환) ADX_7016_A01보다 더 낮은 오프-레이트 (kd)를 나타내는 애드넥틴을 확인하였다. 이들 애드넥틴은 본원에서 "PKE3" 애드넥틴으로 지칭된다.
폴리펩티드의 낮은 면역원성을 유지하는 (ADX_7016_A01의 CD 또는 FG 루프에 비해) CD 또는 FG 루프에서의 단일 아미노산 치환을 HSA에 대한 상이한 친화도의 범위 (낮은 nM 내지 μM 범위로 예상되는 KD)를 갖는 일련의 분자를 확인하기 위해 생성하였다.
상동성 모델을 몰레큘라 오퍼레이팅 인바이런먼트(Molecular Operating Environment) (MOE), (케미칼 컴퓨팅 그룹 인크.(Chemical Computing Group Inc.), 캐나다 퀘백주 몬트리올) 내의 표준 상동성 모델링 도구를 사용하여 ADX_7016_A01 (그의 모 애드넥틴에 기초함)에 대해 생산하였다. HSA와 복합체화된 ADX_7016_A01의 모델링된 결합 부위는 접촉하는 애드넥틴의 2개의 영역이 존재한다는 것을 제시하였다. FG 루프로부터의 선택 잔기는 HSA와 약한 상호작용을 형성하는 반면에, 주요 접촉 잔기는 CD 루프 ("사우스 폴"에 위치함)에서 발견된다. 디스커버리 스튜디오(DISCOVERY STUDIO)로부터의 칼큘레이트인터액션에너지 프로토콜(CalculateInteractionEnergy protocol) (다쏘 시스템즈 바이오비아(Dassault Systemes BIOVIA), 디스커버리 스튜디오 모델링 인바이런먼트(Discovery Studio Modeling Environment), 샌디에고)을 사용하여, 상호작용 에너지를 HSA에 결합된 애드넥틴에 대해 계산하였다. HSA에 결합하는 데 가장 기여하는 것으로 예측되는 모든 잔기는 CD 루프 내에 위치한다. 명백한 잔기 상호작용을 나타내는 표를 바이오루미네이트(BIOLUMINATE)로부터의 단백질 상호작용 분석 프로토콜을 사용하여 생성하였다. 상호작용 에너지를 상호작용의 유형 및 양과 조합함으로써, 애드넥틴의 CD 및 FG 루프 내의 잔기를 돌연변이 연구를 위해 등급화하였다.
결합 부위 분석의 결과에 기초하여, 돌연변이유발을 위한 위치를 선택하였다. 이들 아미노산은 소형이고 극성이도록 선택되었고 돌연변이 연구에 사용될 때 HSA의 아미노산과의 표면 접촉을 감소시키는 것으로 예측될 것이다. 컴퓨터 돌연변이 연구가 수행되었으며 여기서 각각의 위치가 치환되고 상호작용 에너지는 HSA에 결합된 애드넥틴에 대해 계산되었다. 계산된 상호작용이 애드넥틴-HSA 친화도의 감소를 예측하게 될 특정 위치가 확인되었다. 돌연변이체를 또한 T-세포 에피토프에 대한 예측된 위험을 증가시키지 않도록 설계하였다. 돌연변이체를 이들이 T-세포 에피토프의 예측된 위험을 증가시키지 않는다는 점에 기초하여 선택하였고 이는 가장 낮은 가능한 면역원성 점수 (iDAB 점수)를 가졌다.
iDAB 면역원성 점수는 IEDB (문헌 [Vita et al., Nucleic Acids Res 2015;43(Database issue):D405-12]에 기재된 바와 같음)에 기초하고, 8개의 세계 인구에서 통상적으로 발견되는 대립유전자 중 적어도 4개에 대한 높은 결합 친화도를 나타내는 것으로 예측되는 단백질 서열에서의 15-량체의 분율에 비례한다. 점수는 실험 결합 친화도에 대한 강한-결합 15-량체의 분율의 선형 회귀 피트를 통해 수득된다. 결합 부위 분석에서 확인된 위치에 대해, 낮은 면역원성 점수를 갖는 것으로 예측된 단일 돌연변이체를 확인하고 이중 돌연변이체로 조합하였다.
생성된 단일 및 이중 돌연변이체가 표 1-3에 요약되어 있다 (열거된 치환은 서열식별번호: 23에 제시된 코어 7016_A01 서열 내의 위치와 관련됨).
표 1.
Figure pct00009
ADX_7016_A01의 CD 루프에 비해, CD 루프에서의 이중 아미노산 치환 (즉, CD/CD 돌연변이)이 표 2에 제시된 바와 같이 이루어졌다.
표 2.
Figure pct00010
ADX_7016_A01의 CD 및 FG 루프에 비해, CD 및 FG 루프에서의 이중 아미노산 치환 (CD/FG 돌연변이)이 표 3에 제시된 바와 같이 이루어졌다.
표 3.
Figure pct00011
돌연변이체는 유리한 생물물리학적 특성을 나타냈고, 단지 2개의 돌연변이체만이 2의 SEC를 가졌다. 나머지 돌연변이체는 1의 SEC를 가졌다. 모든 돌연변이체는 또한 ≥1 mg/mL로 고도로 발현되었다.
실시예 2: 패스트 오프-레이트 인간 혈청 알부민 결합 애드넥틴에 대한 스크리닝
돌연변이체 HSA 결합 애드넥틴을 야생형 모 애드넥틴 (즉, ADX_7016_A01)보다 더 높은 오프-레이트를 갖는 애드넥틴을 확인하기 위해 HSA에 대한 결합 친화도에 대해 스크리닝하였다.
실시예 1에서 생성된 돌연변이체 애드넥틴의 스크리닝은 4개의 부류의 애드넥틴을 확인하였다: 모 애드넥틴과 유사한 친화도로 결합된 것, 높은 결합 친화도 (100% 결합에 도달)를 갖는 것, 중간 결합 친화도 (모 애드넥틴에 비해 <100% 결합)를 갖는 것, 및 낮은 결합 친화도 (모 애드넥틴에 비해 <50% 결합)를 갖는 것.
측정을 SPR 및 ELISA에 의해 수행하였다. SPR을 하기와 같이 수행하였다. 전장 HSA 또는 마우스 알부민을 표준 NHS/EDC 커플링을 사용하여 10 mM 아세테이트 완충제 (pH 5.0) 완충제 중 15 ug/mL에서 비아코어 T 시리즈 CM5 칩 상에 대략 1000-1100 RU의 표면 밀도로 고정시켰다. 25℃에서의 오프-레이트의 측정을 위해, PKE 애드넥틴을 분석물로서 HBS-P+ (0.01 M HEPES pH 7.4, 0.15 M NaCl, 0.005% v/v 계면활성제 P20) 구동 완충제 중 500nM에서 20ul/분의 유량으로 120초 동안 고정된 알부민 상으로 적용하고, 이어서 800초 동안 해리시켰다. 37℃에서 수행되는 동역학적 친화도 측정을 위해, PKE 애드넥틴의 농도 시리즈 (0.05 - 333nM)를 HBS-P+ 구동 완충제에 40ul/분의 유량으로 180초 동안 적용하고 이어서 240초 또는 600초 동안 해리시켰다. 사이클 사이의 칩 표면의 재생을 2회의 10 mM 글리신, pH 2.0의 30초 펄스로 달성하였다. 참조-차감된 센소그램의 동역학적 트레이스를 비아이밸루에이션 소프트웨어를 사용하여 친화도에 대한 1:1 결합 모델에 피팅하였다. 단지 해리 단계만을 오프-레이트의 결정을 위해 피팅하였다.
직접 결합 ELISA 검정을 하기와 같이 수행하였다. PBS 중 10ug/ml의 전장 인간 및 뮤린 혈청 알부민을 눈크 맥시소르프(Nunc Maxisorp) 플레이트 상에 4℃에서 밤새 코팅하였다. 플레이트를 카세인/PBS 완충제 중에서 차단하였다. PKE 애드넥틴을 HSA에 대해 0.032 - 4uM 및 MSA에 대해 0.008 - 1uM의 4-포인트 농도 범위에 걸쳐 결합되도록 하였다. 결합된 애드넥틴을 카세인/PBS 중에 1:1500 희석된 HRP (양고추냉이 퍼옥시다제)에 접합된 항-His 항체에 의해 검출하였다. 플레이트를 TMB 기질을 사용하여 발색시키고 450nm에서 흡광도 판독하였다. 애드넥틴을 농도 반응 곡선의 관찰된 Ymax에 기초하여 높은, 중간 및 낮은 친화도 결합제로서 비닝하였다.
HSA 및 마우스 혈청 알부민 (MSA)에 대한 결합 둘 다에 대한 SPR 분석 및 ELISA 데이터를 포함하는, 변이체 애드넥틴의 하위세트에 대한 결과가 표 4에 제공된다.
표 4.
Figure pct00012
Figure pct00013
*주: HTTP 단백질에 대한 오프-레이트를 25℃에서 측정하였다. 애드넥틴의 이름 아래 괄호에 열거된 아미노산 치환의 넘버링은 ADX_7016_A01 (서열식별번호: 23)의 코어 아미노산 서열에 기초한다.
도 1 및 2에 제시된 바와 같이, HSA 오프-레이트 센소그램 (SPR 분석에 의해 수득됨)은 DB ELISA 비닝과 상관관계가 있다.
추가의 15개의 변이체 HSA 결합 애드넥틴을 추가의 분석을 위해 선택하였다. HSA 및 MSA 결합 데이터 둘 다를 포함하는, 이들 변이체에 대한 SPR 및 ELISA 데이터의 개요가 표 5에 제공되고, 이들 변이체에 대한 오프-레이트 센소그램이 도 3에 제공된다.
표 5.
Figure pct00014
*주: HTTP 단백질에 대한 오프-레이트를 25℃에서 측정하였다. 애드넥틴의 이름 아래 괄호에 열거된 아미노산 치환의 넘버링은 ADX_7016_A01 (서열식별번호: 23)의 코어 아미노산 서열에 기초한다.
집합적으로, 데이터는 4pt DB HSA/MSA ELISA 데이터가 오프-레이트 스크린과 크게 상관관계가 있고, 즉, 보다 느린 오프-레이트를 갖는 HSA 결합 애드넥틴이 ELISA에 보다 우수한 결합제라는 것을 제시한다 (몇몇의 예외 존재).
실시예 3: 패스트 오프-레이트 PKE3 변이체의 혈청 알부민에 대한 결합 친화도
3개의 변이체 HSA 결합 애드넥틴을 SPR 분석을 사용하여 HSA, MSA, 래트 혈청 알부민 (래트 SA), 및 시노몰구스 원숭이 혈청 알부민 (시노SA)에 대한 결합 친화도에 대해 시험하였다.
SPR을 하기와 같이 수행하였다. 전장 인간, 마우스, 래트 및 시노몰구스 원숭이 혈청 알부민을 표준 NHS/EDC 커플링을 사용하여 10 mM 아세테이트 완충제 (pH 5.0) 완충제 중 15 ug/mL에서 비아코어 T 시리즈 CM5 칩 상에 대략 1000-1100 RU의 표면 밀도로 고정시켰다. 25℃에서의 오프-레이트의 측정을 위해, PKE 애드넥틴을 분석물로서 HBS-P+ (0.01 M HEPES pH 7.4, 0.15 M NaCl, 0.005% v/v 계면활성제 P20) 구동 완충제 중 500nM에서 20ul/분의 유량으로 120초 동안 고정된 알부민 상으로 적용하고, 이어서 800초 동안 해리시켰다. 37℃에서 수행되는 동역학적 친화도 측정을 위해, PKE 애드넥틴의 농도 시리즈 (0.05 - 333nM)를 HBS-P+ 구동 완충제에 40ul/분의 유량으로 180초 동안 적용하고 이어서 240초 또는 600초 동안 해리시켰다. 사이클 사이의 칩 표면의 재생을 2회의 10 mM 글리신, pH 2.0의 30초 펄스로 달성하였다. 참조-차감된 센소그램의 동역학적 트레이스를 비아이밸루에이션 소프트웨어를 사용하여 친화도에 대한 1:1 결합 모델에 피팅하였다. 단지 해리 단계만을 오프-레이트의 결정을 위해 피팅하였다.
결과가 표 6에 요약되어 있고, 센소그램이 도 4a-4d에 제공된다.
표 6.
Figure pct00015
주: 시노SA 실험을 상이한 비아코어 칩을 사용하여 수행하였다
실시예 4: 패스트 오프-레이트 PKE3 애드넥틴은 야생형 모 PKE2 애드넥틴보다 더 빠른 클리어런스를 나타낸다
실시예 3으로부터의 3개의 PKE3 애드넥틴의 클리어런스를 생체내에서 스프라그 돌리 래트에서 시험하였다 (n=2/군). 래트에게 단일 IV 용량의 각각의 PKE3 애드넥틴 (2 mg/kg)을 투여하고, 혈장을 하기 시점에서 수집하였다: 5분, 1시간, 2시간, 4시간, 8시간, 1일, 2일, 3일, 5일, 및 7일.
도 5에 제시된 바와 같이, 모 PKE2 애드넥틴 (ADX_7016_A01)은 가장 긴 반감기를 나타낸 반면에, 3종의 PKE3 애드넥틴은 보다 짧은 반감기를 가졌다. 유사한 결과가 마우스에서 관찰되었다 (도 6).
표 7: 서열의 개요
Figure pct00016
Figure pct00017
Figure pct00018
Figure pct00019
Figure pct00020
Figure pct00021
Figure pct00022
Figure pct00023
Figure pct00024
Figure pct00025
등가물
관련 기술분야의 통상의 기술자는 상용 실험에 지나지 않는 것을 사용하여, 본원에 기재된 본 발명의 구체적 실시양태의 많은 등가물을 인식할 것이거나, 또는 확인할 수 있다. 이러한 등가물은 하기 청구범위에 의해 포괄되는 것으로 의도된다.
SEQUENCE LISTING <110> BRISTOL-MYERS SQUIBB COMPANY <120> FAST-OFF RATE SERUM ALBUMIN BINDING FIBRONECTIN TYPE III DOMAINS <130> MXI-545PC <140> PCT/US2016/053183 <141> 2016-09-22 <150> US 62/222,508 <151> 2015-09-23 <160> 173 <170> PatentIn version 3.5 <210> 1 <211> 94 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <223> Wild-type human 10Fn3 domain <400> 1 Val Ser Asp Val Pro Arg Asp Leu Glu Val Val Ala Ala Thr Pro Thr 1 5 10 15 Ser Leu Leu Ile Ser Trp Asp Ala Pro Ala Val Thr Val Arg Tyr Tyr 20 25 30 Arg Ile Thr Tyr Gly Glu Thr Gly Gly Asn Ser Pro Val Gln Glu Phe 35 40 45 Thr Val Pro Gly Ser Lys Ser Thr Ala Thr Ile Ser Gly Leu Lys Pro 50 55 60 Gly Val Asp Tyr Thr Ile Thr Val Tyr Ala Val Thr Gly Arg Gly Asp 65 70 75 80 Ser Pro Ala Ser Ser Lys Pro Ile Ser Ile Asn Tyr Arg Thr 85 90 <210> 2 <211> 166 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <221> misc_feature <223> Wild-type human 10Fn3 domain w/loop sequences generically defined <220> <221> misc_feature <222> (14)..(33) <223> At least 2 and up to 20 Xaa may be present; if present, Xaa can be any naturally occurring amino acid <220> <221> misc_feature <222> (39)..(58) <223> At least 2 and up to 20 Xaa may be present; if present, Xaa can be any naturally occurring amino acid <220> <221> misc_feature <222> (64)..(83) <223> At least 2 and up to 20 Xaa may be present; if present, Xaa can be any naturally occurring amino acid <220> <221> misc_feature <222> (87)..(106) <223> At least 2 and up to 20 Xaa may be present; if present, Xaa can be any naturally occurring amino acid <220> <221> misc_feature <222> (113)..(132) <223> At least 2 and up to 20 Xaa may be present; if present, Xaa can be any naturally occurring amino acid <220> <221> misc_feature <222> (140)..(159) <223> At least 2 and up to 20 Xaa may be present; if present, Xaa can be any naturally occurring amino acid <400> 2 Val Ser Asp Val Pro Arg Asp Leu Glu Val Val Ala Ala Xaa Xaa Xaa 1 5 10 15 Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa 20 25 30 Xaa Leu Leu Ile Ser Trp Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa 35 40 45 Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Tyr Arg Ile Thr Tyr Xaa 50 55 60 Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa 65 70 75 80 Xaa Xaa Xaa Phe Thr Val Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa 85 90 95 Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Ala Thr Ile Ser Gly Leu 100 105 110 Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa 115 120 125 Xaa Xaa Xaa Xaa Tyr Thr Ile Thr Val Tyr Ala Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa 130 135 140 Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Ile 145 150 155 160 Ser Ile Asn Tyr Arg Thr 165 <210> 3 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: N-terminal leader <400> 3 Met Gly Val Ser Asp Val Pro Arg Asp Leu 1 5 10 <210> 4 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: N-terminal leader <400> 4 Gly Val Ser Asp Val Pro Arg Asp Leu 1 5 <210> 5 <211> 12 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: N-terminal leader <220> <221> misc_feature <222> (1)..(5) <223> Any one or all Xaa can either be present or absent; if present, Xaa can be any naturally occurring amino acid <400> 5 Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Ser Asp Val Pro Arg Asp Leu 1 5 10 <210> 6 <211> 11 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: N-terminal leader <220> <221> misc_feature <222> (1)..(5) <223> Any one or all Xaa can either be present or absent; if present, Xaa can be any naturally occurring amino acid <400> 6 Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Asp Val Pro Arg Asp Leu 1 5 10 <210> 7 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: N-terminal leader <220> <221> misc_feature <222> (1)..(5) <223> Any one or all Xaa can either be present or absent; if present, Xaa can be any naturally occurring amino acid <400> 7 Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Val Pro Arg Asp Leu 1 5 10 <210> 8 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: N-terminal leader <220> <221> misc_feature <222> (1)..(5) <223> Any one or 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Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly 20 25 30 Gly Gly Ser 35 <210> 128 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: Linker <400> 128 Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly 1 5 10 15 Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser 20 25 <210> 129 <211> 16 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: Linker <400> 129 Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly 1 5 10 15 <210> 130 <211> 7 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: Linker <400> 130 Gly Pro Gly Pro Gly Pro Gly 1 5 <210> 131 <211> 11 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: Linker <400> 131 Gly Pro Gly Pro Gly Pro Gly Pro Gly Pro Gly 1 5 10 <210> 132 <211> 6 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: Linker <400> 132 Pro Ala Pro Ala Pro Ala 1 5 <210> 133 <211> 12 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: Linker <400> 133 Pro Ala Pro Ala Pro Ala Pro Ala Pro Ala Pro Ala 1 5 10 <210> 134 <211> 18 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: Linker <400> 134 Pro Ala Pro Ala Pro Ala Pro Ala Pro Ala Pro Ala Pro Ala Pro Ala 1 5 10 15 Pro Ala <210> 135 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: Linker <400> 135 Pro Ser Pro Glu Pro Pro Thr Pro Glu Pro 1 5 10 <210> 136 <211> 20 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: Linker <400> 136 Pro Ser Pro Glu Pro Pro Thr Pro Glu Pro Pro Ser Pro Glu Pro Pro 1 5 10 15 Thr Pro Glu Pro 20 <210> 137 <211> 30 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: Linker <400> 137 Pro Ser Pro Glu Pro Pro Thr Pro Glu Pro Pro Ser Pro Glu Pro Pro 1 5 10 15 Thr Pro Glu Pro Pro Ser Pro Glu Pro Pro Thr Pro Glu Pro 20 25 30 <210> 138 <211> 40 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: Linker <400> 138 Pro Ser Pro Glu Pro Pro Thr Pro Glu Pro Pro Ser Pro Glu Pro Pro 1 5 10 15 Thr Pro Glu Pro Pro Ser Pro Glu Pro Pro Thr Pro Glu Pro Pro Ser 20 25 30 Pro Glu Pro Pro Thr Pro Glu Pro 35 40 <210> 139 <211> 6 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: Linker <400> 139 Glu Glu Glu Glu Asp Glu 1 5 <210> 140 <211> 11 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: Linker <400> 140 Glu Glu Glu Glu Asp Glu Glu Glu Glu Asp Glu 1 5 10 <210> 141 <211> 21 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: Linker <400> 141 Glu Glu Glu Glu Asp Glu Glu Glu Glu Asp Glu Glu Glu Glu Asp Glu 1 5 10 15 Glu Glu Glu Asp Glu 20 <210> 142 <211> 31 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: Linker <400> 142 Glu Glu Glu Glu Asp Glu Glu Glu Glu Asp Glu Glu Glu Glu Asp Glu 1 5 10 15 Glu Glu Glu Asp Glu Glu Glu Glu Asp Glu Glu Glu Glu Asp Glu 20 25 30 <210> 143 <211> 23 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: Linker <400> 143 Arg Gly Gly Glu Glu Lys Lys Lys Glu Lys Glu Lys Glu Glu Gln Glu 1 5 10 15 Glu Arg Glu Thr Lys Thr Pro 20 <210> 144 <211> 100 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: Linker <220> <221> misc_feature <222> (1)..(100) <223> At least one PSPEPPTPEP and up to ten PSPEPPTPEP may be present <400> 144 Pro Ser Pro Glu Pro Pro Thr Pro Glu Pro Pro Ser Pro Glu Pro Pro 1 5 10 15 Thr Pro Glu Pro Pro Ser Pro Glu Pro Pro Thr Pro Glu Pro Pro Ser 20 25 30 Pro Glu Pro Pro Thr Pro Glu Pro Pro Ser Pro Glu Pro Pro Thr Pro 35 40 45 Glu Pro Pro Ser Pro Glu Pro Pro Thr Pro Glu Pro Pro Ser Pro Glu 50 55 60 Pro Pro Thr Pro Glu Pro Pro Ser Pro Glu Pro Pro Thr Pro Glu Pro 65 70 75 80 Pro Ser Pro Glu Pro Pro Thr Pro Glu Pro Pro Ser Pro Glu Pro Pro 85 90 95 Thr Pro Glu Pro 100 <210> 145 <211> 61 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: Linker <220> <221> misc_feature <222> (1)..(60) <223> At least one EEEEDE and up to ten EEEEDE may be present <400> 145 Glu Glu Glu Glu Asp Glu Glu Glu Glu Glu Asp Glu Glu Glu Glu Glu 1 5 10 15 Asp Glu Glu Glu Glu Glu Asp Glu Glu Glu Glu Glu Asp Glu Glu Glu 20 25 30 Glu Glu Asp Glu Glu Glu Glu Glu Asp Glu Glu Glu Glu Glu Asp Glu 35 40 45 Glu Glu Glu Glu Asp Glu Glu Glu Glu Glu Asp Glu Glu 50 55 60 <210> 146 <211> 16 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: Exemplary use of linker <400> 146 Asn Tyr Arg Thr Pro Gly Pro Ser Pro Glu Pro Pro Thr Pro Glu Pro 1 5 10 15 <210> 147 <211> 15 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: Exemplary use of linker <400> 147 Pro Ser Pro Glu Pro Pro Thr Pro Glu Pro Gly Val Ser Asp Val 1 5 10 15 <210> 148 <211> 7 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: C-terminal tail <400> 148 Glu Ile Glu Pro Lys Ser Ser 1 5 <210> 149 <211> 6 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: C-terminal tail <400> 149 Glu Ile Asp Lys Pro Cys 1 5 <210> 150 <211> 5 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: C-terminal tail <400> 150 Glu Ile Asp Lys Pro 1 5 <210> 151 <211> 6 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: C-terminal tail <400> 151 Glu Ile Asp Lys Pro Ser 1 5 <210> 152 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: C-terminal tail <400> 152 Glu Ile Asp Lys Pro Ser Gln Leu Glu 1 5 <210> 153 <211> 12 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: C-terminal tail <400> 153 Glu Ile Glu Asp Glu Asp Glu Asp Glu Asp Glu Asp 1 5 10 <210> 154 <211> 5 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: C-terminal tail <400> 154 Glu Gly Ser Gly Ser 1 5 <210> 155 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: C-terminal tail <400> 155 Glu Ile Asp Lys Pro Cys Gln Leu Glu 1 5 <210> 156 <211> 13 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: C-terminal tail <400> 156 Glu Ile Asp Lys Pro Ser Gln His His His His His His 1 5 10 <210> 157 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: C-terminal tail <400> 157 Gly Ser Gly Cys His His His His His His 1 5 10 <210> 158 <211> 11 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: C-terminal tail <400> 158 Glu Gly Ser Gly Cys His His His His His His 1 5 10 <210> 159 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Pro Cys 1 5 <210> 167 <211> 7 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: C-terminal tail <400> 167 Pro Ile Asp Lys Pro Ser Gln 1 5 <210> 168 <211> 7 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: C-terminal tail <400> 168 Pro Ile Glu Lys Pro Ser Gln 1 5 <210> 169 <211> 7 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: C-terminal tail <400> 169 Pro Ile Asp Lys Pro Cys Gln 1 5 <210> 170 <211> 7 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: C-terminal tail <400> 170 Pro Ile Glu Lys Pro Cys Gln 1 5 <210> 171 <211> 7 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: C-terminal tail <400> 171 Pro His His His His His His 1 5 <210> 172 <211> 8 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: C-terminal tail <400> 172 Pro Cys His His His His His His 1 5 <210> 173 <211> 351 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic: 7016_A01 (nucleic acid sequence) <400> 173 atgggagttt ctgatgtgcc gcgcgacctg gaagtggttg ctgccacccc caccagcctg 60 ctgatcagct gggatgcacc tgccgtcaca gtgcgatatt accgcatcac ttacggcagg 120 gaggttcaga agtactcgga cttgggtccg ttgtacatct accaagagtt cactgtgcct 180 gggagcaagt ccacagctac catcagcggc cttaaacctg gcgttgatta taccatcact 240 gtgtatgctg tcactggctc tggagagagc cccgcaagca gcaagccaat ttccattaat 300 taccgcacag aaattgacaa accatcccag caccatcacc accaccactg a 351

Claims (29)

  1. 피브로넥틴 유형 III 제10 (10Fn3) 도메인을 포함하는 폴리펩티드이며, 여기서 10Fn3 도메인은 1μM 미만의 KD로 인간 혈청 알부민 (HSA)에 결합하고 AB, BC, CD, DE, EF, 및 FG 루프를 포함하고, 여기서 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 CD 및 FG 루프에 비해, CD 루프는 1, 2, 또는 3개의 아미노산 치환을 갖고, FG 루프는 임의로 1, 2, 또는 3개의 아미노산 치환을 갖고, 여기서 10Fn3 도메인에 연결된 모이어티 (예를 들어, 폴리펩티드)의 혈청 반감기는 10Fn3 도메인에 연결되지 않은 모이어티의 것에 비해 연장된 것인 폴리펩티드.
  2. 제1항에 있어서, 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 오프-레이트 (kd) 초과의 kd로 HSA에 결합하는 폴리펩티드.
  3. 제1항 또는 제2항에 있어서, 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 온-레이트 (ka)의 한 자릿수 내 (즉, 10-배 내)에 있는 ka로 HSA에 결합하는 폴리펩티드.
  4. 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서, CD 루프가 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 상응하는 CD 루프에 비해 2개의 아미노산 치환을 갖는 것인 폴리펩티드.
  5. 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서, CD 루프가 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 CD 루프에 비해 1개의 아미노산 치환을 갖는 것인 폴리펩티드.
  6. 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서, FG 루프가 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 FG 루프에 비해 1개의 아미노산 치환을 갖는 것인 폴리펩티드.
  7. 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서, 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 CD 루프 및 FG 루프에 비해 CD 루프가 1개의 아미노산 치환을 갖고 FG 루프가 1개의 치환을 갖는 것인 폴리펩티드.
  8. 제4항에 있어서, 2개의 아미노산 치환이
    (i) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 2의 아르기닌 (R)이 D, E, A, Q, 또는 N으로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
    (ii) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 5의 글루타민 (Q)이 D로 치환된 것;
    (iii) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 7의 티로신 (Y)이 S 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
    (iv) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 10의 류신 (L)이 S, T, 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
    (v) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 13의 류신 (L)이 D, S, 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
    (vi) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 14의 티로신 (Y)이 A 또는 T로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
    (vii) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 15의 이소류신 (I)이 D, S, 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것; 및
    (viii) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 16의 티로신 (Y)이 Q, E, S, 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것
    으로 이루어진 군으로부터 선택된 것인 폴리펩티드.
  9. 제5항에 있어서, 1개의 아미노산 치환이
    (i) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 2의 아르기닌 (R)이 D, E, A, Q, 또는 N으로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
    (ii) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 5의 글루타민 (Q)이 D로 치환된 것;
    (iii) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 7의 티로신 (Y)이 S 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
    (iv) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 10의 류신 (L)이 S, T, 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
    (v) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 13의 류신 (L)이 D, S, 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
    (vi) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 14의 티로신 (Y)이 A 또는 T로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
    (vii) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 15의 이소류신 (I)이 D, S, 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것; 및
    (viii) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 16의 티로신 (Y)이 Q, E, S, 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것
    으로 이루어진 군으로부터 선택된 것인 폴리펩티드.
  10. 제9항에 있어서, CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 16의 티로신 (Y)이 세린 (S)으로 치환된 것인 폴리펩티드.
  11. 제9항에 있어서, CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 10의 류신 (L)이 트레오닌 (T)으로 치환된 것인 폴리펩티드.
  12. 제9항에 있어서, CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 16의 티로신 (Y)이 글루타민 (Q)으로 치환된 것인 폴리펩티드.
  13. 제6항에 있어서, FG 루프 (서열식별번호: 29)의 위치 12의 리신 (K)이 A, T, 또는 S로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것인 폴리펩티드.
  14. 제7항에 있어서,
    a) CD 루프에서의 1개의 아미노산 치환이
    (i) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 2의 아르기닌 (R)이 D, E, A, Q, 또는 N으로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
    (ii) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 5의 글루타민 (Q)이 D로 치환된 것;
    (iii) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 7의 티로신 (Y)이 S 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
    (iv) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 10의 류신 (L)이 S, T, 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
    (v) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 13의 류신 (L)이 D, S, 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
    (vi) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 14의 티로신 (Y)이 A 또는 T로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것;
    (vii) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 15의 이소류신 (I)이 D, S, 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것; 및
    (viii) CD 루프 (서열식별번호: 28)의 위치 16의 티로신 (Y)이 Q, E, S, 또는 A로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것
    으로 이루어진 군으로부터 선택되고;
    b) FG 루프 (서열식별번호: 29)의 위치 12의 리신이 A, T, 또는 S로부터 선택된 아미노산으로 치환된 것인 폴리펩티드.
  15. 제1항 내지 제14항 중 어느 한 항에 있어서, 서열식별번호: 30-34, 36-40, 42-46, 48, 49, 51, 52, 54, 55, 57, 58, 60, 61, 62, 63, 65-68, 70, 71, 73-76, 78, 79, 81-84, 86, 87, 89-98, 100-109, 및 111-118의 비-CD 루프 영역과 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩티드.
  16. 제1항 내지 제15항 중 어느 한 항에 있어서, 서열식별번호: 30-34, 36-40, 42-46, 48, 49, 51, 52, 54, 55, 57, 58, 60, 61, 62, 63, 65-68, 70, 71, 73-76, 78, 79, 81-84, 86, 87, 89-98, 100-109, 및 111-118 중 어느 하나와 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩티드.
  17. 제1항 내지 제16항 중 어느 한 항에 있어서, 10Fn3 도메인이 HSA의 도메인 I-II에 결합하는 것인 폴리펩티드.
  18. 제1항 내지 제17항 중 어느 한 항에 있어서, 서열식별번호: 23에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 10Fn3 도메인의 오프-레이트에 대한 폴리펩티드의 오프-레이트가 적어도 약 3의 비를 갖는 것인 폴리펩티드.
  19. 제17항에 있어서, 비가 적어도 약 25인 폴리펩티드.
  20. 제17항에 있어서, 비가 적어도 약 50인 폴리펩티드.
  21. 제1항 내지 제20항 중 어느 한 항에 있어서, 이종 단백질을 포함하는 폴리펩티드.
  22. 제20항에 있어서, 이종 단백질이 치료 모이어티인 폴리펩티드.
  23. 제21항 또는 제22항에 있어서, 이종 단백질이 10Fn3 도메인을 포함하는 폴리펩티드인 폴리펩티드.
  24. 제1항 내지 제23항 중 어느 한 항의 폴리펩티드 또는 융합 폴리펩티드, 및 담체를 포함하는 조성물.
  25. 제1항 내지 제23항 중 어느 한 항의 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 분자.
  26. 제1항 내지 제23항 중 어느 한 항의 폴리펩티드를 코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함하는 발현 벡터.
  27. 제25항의 핵산 분자 또는 제26항의 발현 벡터를 포함하는 세포.
  28. 제1항 내지 제23항 중 어느 한 항의 폴리펩티드를 생산하는 방법이며, 폴리펩티드를 발현시키는 데 적합한 조건 하에 제27항의 세포를 배양하고, 폴리펩티드를 정제하는 것을 포함하는, 제1항 내지 제23항 중 어느 한 항의 폴리펩티드를 생산하는 방법.
  29. 모이어티에 제1항 내지 제23항 중 어느 한 항의 인간 혈청 알부민 결합 폴리펩티드를 연결시키는 것을 포함하는, 모이어티의 반감기를 증진시키는 방법.
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