KR20130128663A - 탄산무수화 효소 및 포스포에놀피루브산 카르복실화 효소를 이용한 유기산 생산 시스템 - Google Patents
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Abstract
본 발명은 탄산무수화 효소 및 포스포에놀피루브산 카르복실화 효소를 이용한 유기산 생산 시스템에 관한 것으로서, 탄산무수화 효소(carbonic anhydrase)의 존재 하에서 이산화탄소(CO2)와 물(H2O)을 반응시켜 바이카보네이트(bicarbonate)를 생산하는 단계; 및 상기 바이카보네이트를 포스포에놀피루브산 카르복시화 효소(phosphoenolpyruvate carboxylase)의 존재 하에서 포스포에놀피루브산(phosphoenolpyruvate)과 반응시켜 옥살로아세테이트(oxaloacetate)를 생산하는 단계를 포함하는 옥살로아세트산(oxaloacetic acid) 생산 방법 및 탄산무수화 효소(carbonic anhydrase, CA) 및 포스포에놀피루브산 카르복시화 효소(phosphoenolpyruvate carboxylase, PEPCase)를 포함하는 발현벡터가 숙주세포에 형질전환된, 옥살로아세트산(oxaloacetic acid) 생산용 형질전환체를 제공한다. 본 발명의 유기산 생성 시스템은 탄산무수화 효소 및 포스포에놀피루브산 카르복시화 효소를 동시에 사용함으로써, 향상된 수율로 유기산을 대량생산할 수 있고, 유기산을 지속적으로 생산할 수 있는 효과가 있으며, 이산화탄소의 저감 기술에도 접목될 수 있는 장점이 있다.
Description
본 발명은 유기산 생산 시스템에 관한 것으로, 보다 구체적으로는 탄산무수화 효소 및 포스포에놀피루브산 카르복실화 효소를 이용한 유기산 생산 시스템에 관한 것이다.
해양 미세조류는 해양 표면뿐만 아니라 심해에 이르기까지 무기 탄소의 유기화합물로의 고정 역할을 하는 매우 중요한 기능을 수행하고 있다. 해양 미생조류는 대기 중의 이산화탄소를 바이카보네이트(bicarbonate)로 전환할 수 있는 탄산무수화 효소(carbonic anhydrase, CA)를 생체촉매로 이용하고, 이렇게 생성된 바이카보네이트는 식물보다 광합성과 이산화탄소 고정 효율이 훨씬 높은 포스포에놀피루브산 카르복실화 효소(phosphoenolpyruvate carboxylase, PEPCase)의 작용을 거쳐 다양한 종류의 유기산으로 합성된다.
상기 CA는 대기 중에 존재하는 이산화탄소를 물과 결합시켜 수소이온과 바이카보네이트로 전환시키는 효소로서, 생체 내에서 이산화탄소를 1차적으로 고정하는 역할을 한다. 상기와 같이 CA에 의하여 이산화탄소가 고정되어 형성된 바이카보네이트는 PEPCase의 기질이 된다.
상기 PEPCase는 이산화탄소의 고정으로 생성되는 바이카보네이트와 포스포에놀피루브산(phosphoenolpyruvate, PEP)을 이용하여 다양한 유기산의 전구체가 되는 옥살로아세트산(oxaloacetic acid, OAA)를 생성하는 효소이다. 상기 효소의 반응을 통해 흡수된 이산화탄소가 최종적으로 OAA로 고정된다. 상기 OAA는 C3 화합물로서, 다양한 종류의 C4 화합물이 합성됨에 있어 전구 물질이 된다. 특히, 상기 OAA로부터 합성되는 대표적인 C4 화합물로서 숙신산(succinic acid)이 대표적이다. 상기 숙신산은 테트라하이드로퓨란(Tertahydrofuran, THF), 1,4-부탄디올(1,4-butanediol, 1,4-BDO), 감마부틸로 락톤(γ-Butyrolactone, GBL), N-메틸피롤리돈(N-methylpyrolidone, NMP) 아디프산(adipic acid) 등의 용매 및 고분자의 중간체 물질(intermediate material)로 전환되어 이용될 수 있다.
상기 CA와 PEPCase는 탄소 고정 생물 반응의 중요한 열쇠로서 탄소 고정 효율을 높혀 유용한 유기산의 생성 효율을 향상시키려는 연구 목표와 잘 부합된다. 그러나 이산화탄소의 고정과 관련된 종래의 연구는 CA에 국한되어 진행되어 왔고, 특히 CA의 작용에 의한 탄산칼슘의 생성이 잘 알려져 있을 뿐이다. 또한, PEPCase에 관한 연구도 유전자의 특성을 탐색하는 방향으로 연구가 진행되고 있을 뿐, 이를 이용한 유기산의 생성에 관한 연구는 진행된 바가 없다.
이에, 상기와 같은 단편적이고 개별적인 종래의 연구를 보완하여, 상기 두 효소를 하나의 시스템으로 묶어 이산화탄소의 고정 및 이를 이용한 유용한 유기산의 생성 효율을 하는 기술의 개발이 필요하다.
본 발명의 목적은 수율이 향상된 인비트로(in vitro) 및 인비보(in vivo) 유기산 생산 시스템을 제공하는 것이다.
상기의 목적을 달성하기 위하여, 본 발명의 일 측면은 탄산무수화 효소(carbonic anhydrase)의 존재 하에서 이산화탄소(CO2)와 물(H2O)을 반응시켜 바이카보네이트(bicarbonate)를 생산하는 단계; 및 상기 바이카보네이트를 포스포에놀피루브산 카르복시화 효소(phosphoenolpyruvate carboxylase)의 존재 하에서 포스포에놀피루브산(phosphoenolpyruvate)과 반응시켜 옥살로아세테이트(oxaloacetate)를 생산하는 단계를 포함하는 옥살로아세트산(oxaloacetic acid) 생산 방법을 제공한다.
또한, 상기 목적을 달성하기 위하여 본 발명의 다른 측면은 탄산무수화 효소(carbonic anhydrase, CA)의 유전자 및 포스포에놀피루브산 카르복시화 효소(phosphoenolpyruvate carboxylase, PEPCase)의 유전자를 포함하는 발현벡터가 숙주세포에 형질전환된, 옥살로아세트산(oxaloacetic acid) 생산용 형질전환체를 제공한다
아울러, 상기 목절을 달성하기 위하여 본 발명의 또 다른 측면은 탄산무수화 효소(carbonic anhydrase, CA)의 유전자를 포함하는 제1 발현벡터 및 포스포에놀피루브산 카르복시화 효소(phosphoenolpyruvate carboxylase, PEPCase)의 유전자를 포함하는 제2 발현벡터가 숙주세포에 형질전환된, 옥살로아세트산(oxaloacetic acid) 생산용 형질전환체를 제공한다.
본 발명의 유기산 생성 시스템은 탄산무수화 효소 및 포스포에놀피루브산 카르복시화 효소를 동시에 사용함으로써, 향상된 수율로 유기산을 대량생산할 수 있고, 유기산을 지속적으로 생산할 수 있는 효과가 있다. 또한, 상기 시스템은 대기 중의 이산화탄소를 고정하여 유기산을 생성할 수 있는 바, 이산화탄소의 저감 기술에도 접목될 수 있는 장점이 있다.
다만, 본 발명의 효과는 상기에서 언급한 효과로 제한되지 아니하며, 언급되지 않은 또 다른 효과들은 하기의 기재로부터 당업자에게 명확히 이해될 수 있을 것이다.
도 1은 재조합 발현벡터 pET-28a::BCAⅡ_opt의 벡터맵을 나타내는 도면이다.
도 2는 BCAⅡ_opt 유전자가 성공적으로 삽입되었음을 확인한 결과이다.
도 3은 BCAⅡ_opt 단백질의 유도발현 여부를 확인한 결과이다.
도 4는 BCAⅡ_opt 단백질의 분리 및 정제를 확인한 결과이다.
도 5는 Dunaliella sp. 유래의 탄산무수화 효소 α의 N-말단 및 C-말단의 반복 서열을 확인한 결과이다.
도 6은 재조합 발현벡터 pET-44b::DspαCA-CO의 벡터맵을 나타내는 도면이다.
도 7은 DspαCA-CO 유전자가 성공적으로 삽입되었음을 확인한 결과이다.
도 8은 DspαCA-CO 단백질의 분리 및 정제를 확인한 결과이다.
도 9는 재조합 발현벡터 pMAL-c2x::PtmαCA3의 벡터맵을 나타내는 도면이다.
도 10은 PtmαCA3 유전자가 성공적으로 삽입되었음을 확인한 결과이다.
도 11은 PtmαCA3 단백질의 유도발현 여부를 확인한 결과이다.
도 12는 PtmαCA3 단백질의 분리 및 정제를 확인한 결과이다.
도 13은 재조합 발현벡터 pColdI::PtPEPCase1의 벡터맵을 나타내는 도면이다.
도 14는 PtPEPCase1 유전자가 성공적으로 삽입되었음을 확인한 결과이다.
도 15는 PtPEPCase1 단백질의 분리 및 정제를 확인한 결과이다.
도 16 및 도 17은 OAA의 생성 여부를 확인한 결과이다.
도 18은 재조합 발현벡터 pCDF-1b::DspγCA의 벡터맵을 나타내는 도면이다.
도 19는 DspγCA 유전자가 성공적으로 삽입되었음을 확인한 결과이다.
도 20은 재조합 발현벡터 pET-21a(+)::PtPEPCase2의 벡터맵을 나타내는 도면이다.
도 21은 PtPEPCase2 유전자가 성공적으로 삽입되었음을 확인한 결과이다.
도 22는 재조합 발현벡터 공형질전환된 재조합 발현벡터 pCDF-1b::DspγCA 및 pET-21a(+)::PtPEPCase2의 벡터맵을 나타내는 도면이다.
도 23은 DspγCA 및 PtPEPCase2 유전자가 성공적으로 삽입되었음을 확인한 결과이다.
도 24는 형질전환된 대장균을 배양하는 배양기의 개략도이다.
도 25는 DspγCA 및 PtPEPCase2 단백질의 유도발현 여부를 확인한 결과이다.
도 26은 pDspγCA 및 PtPEPCase2가 모두 도입된 대장균에 의하여 생성된 OAA를 확인한 결과로서,
blank는 oxaloacetate assay kit에서 OAA enzyme mix를 뺀 상태의 반응물;
control은oxaloacetate assay kit에 OAA enzyme mix가 포함된 반응물;
1은 E. coli BL21;
2는 DspγCA가 형질전환된 E. coli BL21;
3은 PtPEPCase2가 형질전환된 E. coli BL21;
4는 DspγCA-PtPEPCase2 단백질이 유도발현된 E. coli BL21; 및
5는 DspγCA-PtPEPCase2 단백질이 유도발현되지 않은 E. coli BL21이다.
도 2는 BCAⅡ_opt 유전자가 성공적으로 삽입되었음을 확인한 결과이다.
도 3은 BCAⅡ_opt 단백질의 유도발현 여부를 확인한 결과이다.
도 4는 BCAⅡ_opt 단백질의 분리 및 정제를 확인한 결과이다.
도 5는 Dunaliella sp. 유래의 탄산무수화 효소 α의 N-말단 및 C-말단의 반복 서열을 확인한 결과이다.
도 6은 재조합 발현벡터 pET-44b::DspαCA-CO의 벡터맵을 나타내는 도면이다.
도 7은 DspαCA-CO 유전자가 성공적으로 삽입되었음을 확인한 결과이다.
도 8은 DspαCA-CO 단백질의 분리 및 정제를 확인한 결과이다.
도 9는 재조합 발현벡터 pMAL-c2x::PtmαCA3의 벡터맵을 나타내는 도면이다.
도 10은 PtmαCA3 유전자가 성공적으로 삽입되었음을 확인한 결과이다.
도 11은 PtmαCA3 단백질의 유도발현 여부를 확인한 결과이다.
도 12는 PtmαCA3 단백질의 분리 및 정제를 확인한 결과이다.
도 13은 재조합 발현벡터 pColdI::PtPEPCase1의 벡터맵을 나타내는 도면이다.
도 14는 PtPEPCase1 유전자가 성공적으로 삽입되었음을 확인한 결과이다.
도 15는 PtPEPCase1 단백질의 분리 및 정제를 확인한 결과이다.
도 16 및 도 17은 OAA의 생성 여부를 확인한 결과이다.
도 18은 재조합 발현벡터 pCDF-1b::DspγCA의 벡터맵을 나타내는 도면이다.
도 19는 DspγCA 유전자가 성공적으로 삽입되었음을 확인한 결과이다.
도 20은 재조합 발현벡터 pET-21a(+)::PtPEPCase2의 벡터맵을 나타내는 도면이다.
도 21은 PtPEPCase2 유전자가 성공적으로 삽입되었음을 확인한 결과이다.
도 22는 재조합 발현벡터 공형질전환된 재조합 발현벡터 pCDF-1b::DspγCA 및 pET-21a(+)::PtPEPCase2의 벡터맵을 나타내는 도면이다.
도 23은 DspγCA 및 PtPEPCase2 유전자가 성공적으로 삽입되었음을 확인한 결과이다.
도 24는 형질전환된 대장균을 배양하는 배양기의 개략도이다.
도 25는 DspγCA 및 PtPEPCase2 단백질의 유도발현 여부를 확인한 결과이다.
도 26은 pDspγCA 및 PtPEPCase2가 모두 도입된 대장균에 의하여 생성된 OAA를 확인한 결과로서,
blank는 oxaloacetate assay kit에서 OAA enzyme mix를 뺀 상태의 반응물;
control은oxaloacetate assay kit에 OAA enzyme mix가 포함된 반응물;
1은 E. coli BL21;
2는 DspγCA가 형질전환된 E. coli BL21;
3은 PtPEPCase2가 형질전환된 E. coli BL21;
4는 DspγCA-PtPEPCase2 단백질이 유도발현된 E. coli BL21; 및
5는 DspγCA-PtPEPCase2 단백질이 유도발현되지 않은 E. coli BL21이다.
이하, 본 발명을 상세히 설명한다.
1.
옥살로아세트산 생산 방법
본 발명의 일 측면은 탄산무수화 효소(carbonic anhydrase)의 존재 하에서 이산화탄소(CO2)와 물(H2O)을 반응시켜 바이카보네이트(bicarbonate)를 생산하는 단계; 및 상기 바이카보네이트를 포스포에놀피루브산 카르복시화 효소(phosphoenolpyruvate carboxylase)의 존재 하에서 포스포에놀피루브산(phosphoenolpyruvate)과 반응시켜 옥살로아세테이트(oxaloacetate)를 생산하는 단계를 포함하는 옥살로아세트산(oxaloacetic acid) 생산 방법을 제공한다.
본 발명의 옥살로아세트산 생산 방법은 탄산무수화 효소(carbonic anhydrase)의 존재 하에서 이산화탄소(CO2)와 물(H2O)을 반응시키는 단계 및 상기 바이카보네이트를 포스포에놀피루브산 카르복시화 효소(phosphoenolpyruvate carboxylase)의 존재 하에서 포스포에놀피루브산(phosphoenolpyruvate)과 반응시키는 단계를 포함한다.
상기 탄산무수화 효소(carbonic anhydrase, CA)는 이산화탄소(CO2)와 물(H2O)로부터 바이카보네이트(bicarbonate)가 생성되는 하기 반응식 1의 반응을 촉매하는 효소로서, 이산화탄소와 물을 기질로 한다.
[반응식 1]
CO2 + H2O → HCO3 - + H+
상기 CA는 조류에서 유래한 것일 수 있고, 상기 조류는 두날리엘라(Dunaliella) 속 또는 패오닥틸룸(Phaeodactylum) 속일 수 있다. 특히, 상기 CA가 두날리엘라 속의 조류에서 유래한 것일 경우, 상기 CA는 Dunaliella sp. 유래일 수 있고, 서열번호 3으로 기재되는 아미노산 서열을 포함하는 단백질 또는 서열번호 4로 기재되는 핵산 서열에 의하여 암호화되는 단백질일 수 있으며, 서열번호 9로 기재되는 아미노산 서열을 포함하는 단백질 또는 서열번호 10으로 기재되는 핵산 서열에 의하여 암호화되는 단백질일 수 있다. 또한, 상기 CA가 패오닥틸룸 속의 조류에서 유래한 것일 경우, 상기 CA는 Phaeodactylum tricornutum 유래일 수 있고, 서열번호 5로 기재되는 아미노산 서열을 포함하는 단백질 또는 서열번호 6으로 기재되는 핵산 서열에 의하여 암호화되는 단백질일 수 있다.
또한, 상기 CA는 보스 타우루스(Bos taurus)에서 유래한 것일 수 있고, 서열번호 1로 기재되는 아미노산 서열을 포함하는 단백질 또는 서열번호 2로 기재되는 핵산 서열에 의하여 암호화되는 단백질일 수 있다.
상기 조류 또는 보스 타우루스 유래의 CA는 개체로부터 단백질을 직접 추출 및 정제하여 이용될 수 있으나, 상기 조류 또는 보스 타우루스 유래의 CA의 유전자를 포함하는 발현벡터로 형질전환된 형질전환체로부터 발현되어 대량생산된 것이 바람직하다.
상기 포스포에놀피루브산 카르복시화 효소(phosphoenolpyruvate carboxylase, PEPCase)는 바이카보네이트와 포스포에놀피루브산(phosphoenolpyruvate, PEP)로부터 옥살로아세테이트(oxaloactate)가 생성되는 하기 반응식 2의 반응을 촉매하는 효소로서, 바이카보네이트와 PEP를 기질로 한다.
[반응식 2]
HCO3 - + PEP → oxaloacetate + Pi
상기 PEPCase는 조류에서 유래한 것일 수 있고, 상기 조류는 패오닥틸룸(Phaeodactylum) 속일 수 있다. 특히, 상기 PEPCase가 패오닥틸룸 속의 조류에서 유래한 것일 경우, 상기 PEPCase는 Phaeodactylum tricornutum 유래일 수 있고, 서열번호 7로 기재되는 아미노산 서열을 포함하는 단백질 또는 서열번호 8으로 기재되는 핵산 서열에 의하여 암호화되는 단백질일 수 있으며, 서열번호 11로 기재되는 아미노산 서열을 포함하는 단백질 또는 서열번호 12로 기재되는 핵산 서열에 의하여 암호화되는 단백질일 수 있다.
상기 조류 유래의 PEPCase도 상기 CA와 마찬가지로 개체로부터 단백질을 직접 추출 및 정제하여 이용될 수 있으나, 상기 조류 유래의 PEPCase의 유전자를 포함하는 발현벡터로 형질전환된 형질전환체로부터 발현되어 대량생산된 것이 바람직하다.
상기 옥살로아세트산 생산 방법은 상기 PEPCase에 의하여 생성된 상기 옥살로아세테이트를 양성자화(protonation)시키는 단계를 더 포함할 수 있다. 상기 옥살로아세테이트는 이온화된 음이온 상태로서, 추가적으로 양성자화(protonation)되는 단계를 거쳐 옥살로아세트산으로 된다. 상기 양성자화는 옥살로아세트산(oxaloacetic acid, OAA)에 비하여 pKa 값이 더 작은 강산의 첨가 등 당업계에 널리 알려진 방법에 의하여 수행될 수 있다.
상기 옥살로아세트산 생산 방법은 인 비트로(in vitro)에서 CA 및 PEPCase의 효소 활성을 이용하는 것이다. 다시 말해서, CA의 효소 활성을 이용하여 PEPCase의 기질 중의 하나인 바이카보네이트를 생성하고, 상기 CA에 의하여 생성된 바이카보네이트를 PEPCase가 이용하여 옥살로아세트산을 생성하는 것이다. 즉, CA를 이용하여 PEPCase의 기질 중의 하나인 바이카보네이트의 농도를 높혀줌으로써, 상기 반응식 2의 정반응을 더욱 촉진할 수 있게 되고, 따라서 최종 산물인 옥살로아세트산의 생성 효율 또한 향상시킬 수 있게 된다.
상기 CA는 대기 중의 이산화탄소를 이용할 수 있다. 즉, 상기 CA는 상기 CA 주변의 물 분자와 대기 중의 이산화탄소를 이용하여 바이카보네이트를 생성할 수 있다. 따라서, 상기 CA는 상기 PEPCase의 기질 중의 하나인 바이카보네이트를 지속적으로 제공할 수 있다. 다만, 보다 효율적인 바이카보네이트의 생성을 위하여 상기 CA가 존재하는 환경으로 이산화탄소를 주입해 줄 수도 있다.
상기 PEP는 외부에서 주입되는 것이 바람직하고, 상기 PEP는 목적하는 옥살로아세트산의 양에 맞추어 충분한 양이 주입되어야 한다. 또한, 상기 PEP의 주입은 연속적으로 수행될 수 있다. 특히 상기 PEP가 연속적으로 주입되는 경우, 상기 CA에 의하여 지속적으로 공급되는 바이카보네이트를 이용하여 옥살로아세트산을 지속적으로 생성할 수 있다.
본 발명의 구체적인 실시예에서는 보스 타우루스(Bos taurus), 두날리엘라(Dunaliella sp.) 및 패오닥틸룸 트리코르누툼(Phaeodactylum tricornutum)에서 각각 유래한 서열번호 1, 서열번호 3 및 서열번호 5의 아미노산 서열을 갖는 어느 하나의 CA 10 ㎍과, 패오닥틸룸 트리코르누툼(Phaeodactylum tricornutum)에서 유래한 서열번호 7의 아미노산 서열을 갖는 PEPCase 10 ㎍을 0.1 M의 포스포에놀피루브산(phosphoenolpyruvate, PEP) 3 ㎕와 함께 PEPCase 익스트랙션 버퍼(PEPCase extraction buffer)(50 mM Tris-HCl(pH 8.0), 1mM MgCl2)에서 10분 동안 상온으로 반응시킴으로써, 약 10 ㎍의 OAA를 수득하였다(도 16 및 17 참조).
2.
옥살로아세트산(oxaloacetic acid) 생산용 형질전환체
본 발명의 다른 측면은 탄산무수화 효소(carbonic anhydrase, CA)의 유전자 및 포스포에놀피루브산 카르복시화 효소(phosphoenolpyruvate carboxylase, PEPCase)의 유전자를 포함하는 발현벡터가 숙주세포에 형질전환된, 옥살로아세트산(oxaloacetic acid) 생산용 형질전환체를 제공한다.
본 발명의 또 다른 측면은 탄산무수화 효소(carbonic anhydrase, CA)의 유전자를 포함하는 제1 발현벡터 및 포스포에놀피루브산 카르복시화 효소(phosphoenolpyruvate carboxylase, PEPCase)의 유전자를 포함하는 제2 발현벡터가 숙주세포에 형질전환된, 옥살로아세트산(oxaloacetic acid) 생산용 형질전환체를 제공한다.
본 발명의 상기 옥살로아세트산 생산용 형질전환체는 CA의 유전자 및 PEPCase의 유전자를 포함하는 발현벡터를 포함한다.
상기 CA는 조류에서 유래한 것일 수 있고, 상기 조류는 두날리엘라(Dunaliella) 속 또는 패오닥틸룸(Phaeodactylum) 속일 수 있다. 특히, 상기 CA가 두날리엘라 속의 조류에서 유래한 것일 경우, 상기 CA는 Dunaliella sp. 유래일 수 있고, 서열번호 3으로 기재되는 아미노산 서열을 포함하는 단백질 또는 서열번호 4로 기재되는 핵산 서열에 의하여 암호화되는 단백질일 수 있으며, 서열번호 9로 기재되는 아미노산 서열을 포함하는 단백질 또는 서열번호 10으로 기재되는 핵산 서열에 의하여 암호화되는 단백질일 수 있다. 또한, 상기 CA가 패오닥틸룸 속의 조류에서 유래한 것일 경우, 상기 CA는 Phaeodactylum tricornutum 유래일 수 있고, 서열번호 5로 기재되는 아미노산 서열을 포함하는 단백질 또는 서열번호 6으로 기재되는 핵산 서열에 의하여 암호화되는 단백질일 수 있다.
상기 PEPCase는 조류에서 유래한 것일 수 있고, 상기 조류는 패오닥틸룸(Phaeodactylum) 속일 수 있다. 특히, 상기 PEPCase가 패오닥틸룸 속의 조류에서 유래한 것일 경우, 상기 PEPCase는 Phaeodactylum tricornutum 유래일 수 있고, 서열번호 7로 기재되는 아미노산 서열을 포함하는 단백질 또는 서열번호 8으로 기재되는 핵산 서열에 의하여 암호화되는 단백질일 수 있으며, 서열번호 11로 기재되는 아미노산 서열을 포함하는 단백질 또는 서열번호 12로 기재되는 핵산 서열에 의하여 암호화되는 단백질일 수 있다.
상기 발현벡터는 상기 CA 및 PEPCase가 삽입되어 상기 CA 및 PEPCase가 숙주세포 내에서 각각 발현될 수 있도록 하는 것으로서, 상용화된 발현벡터를 이용할 수 있고, 바람직하게는 pCDF-1b, pT7, pET/Rb, pGEX, pET28a(+), pET-21a(+), pET-22b(+) 및 pGEX로 이루어진 군에서 선택되는 어느 하나일 수 있다.
또한, 상기 발현벡터는 하나의 발현벡터에 상기 CA 유전자 및 상기 PEPCase 유전자가 모두 포함될 수도 있고, 제1 및 제2 발현벡터에 CA 유전자 및 PEPCase 유전자 중 어느 하나가 각각 포함될 수도 있다.
상기 숙주세포는 상기 발현벡터가 형질도입되고, 또는 CA 유전자 및 PEPCase 유전자가 각각 제1 및 제2 발현벡터에 하나씩 포함되어 있는 경우에는 제1 및 제2 발현벡터가 공형질도입되어 상기 CA 단백질과 PEPCase 단백질을 함께 발현시킬 수 있는 세포를 의미하는 것으로서, 대장균(Escherichia coli)일 수 있다.
상기 옥살로아세트산 생산용 형질전환체는 CA 및 PEPCase를 발현한다. 상기 형질전환체 내에서 발현된 CA는 외부의 이산화탄소와 숙주세포 내의 물을 이용하여 바이카보네이트를 생성하고, 상기 PEPCase는 상기 바이카보네이트와 숙주세포 내의 PEP를 이용하여 옥살로아세트산을 생산할 수 있다.
본 발명의 구체적인 실시예에서는 서열번호 10의 CA 유전자와 서열번호 12의 PEPCase 유전자를 pCDF-1b에 삽입하여 대장균(E. coli BL21(DE3))에 형질전환하였고, 상기 형질전환된 대장균에서 OAA가 대량 생산됨을 확인하였다(도 26 및 표 1 참조). 아울러, 상기 대장균을 혐기 배양시켜 상기 OAA의 후속 대사 생성물의 하나인 숙신산의 생산이 증가하는 것도 확인하였다(표 2 참조).
이하, 본 발명을 실시예에 의하여 상세히 설명한다.
단, 하기 실시예는 본 발명의 이해를 돕기 위한 것일 뿐, 본 발명이 하기의 실시예에 의하여 한정되는 것은 아니다.
탄산무수화효소(Carbonic Anhydrase, CA)의 분리
<1-1>
보스 타우루스(
Bos taurus
) 유래 CA의 분리
<1-1-1>
보스
타우루스
(
Bos
taurus
) 유래
CA
의
클로닝
및 형질전환
CA의 활성이 잘 알려진 Bos taurus 유래의 CAⅡ의 유전자 서열(NM_178572.2)을 기초로 대장균(E. coli)에 맞게 코돈 최적화(codon optimization)하여 서열번호 2로 기재되는 핵산 서열(이하, 'BCAⅡ_opt'이라 함)을 얻었다.
상기와 같이 얻어진 서열번호 2의 유전자를 발현벡터인 pET-28a(Novagen독일)에 넣어, 도 1과 같이 재조합 발현벡터인 pET-28a::BCAⅡ_opt를 제작하고, 서열번호 14 및 서열번호 15의 프라이머를 이용하여 중합효소연쇄반응(Polymerase chain reaction, PCR)을 수행함으로써, 상기 BCAⅡ_opt 유전자가 성공적으로 도입되었음을 확인하였다(도 2). 그런 다음, 상기 pET-28a::BCAⅡ_opt를 대장균(E. coli Origami 2)에 형질전환하였다.
<1-1-2>
보스 타우루스(
Bos taurus
) 유래 CA의 발현유도
상기 실시예 <1-1-1>과 같이 제조된 형질전환체는 엠피실린(ampicillin)에 저항성을 보이는 바, 상기 형질전환체를 100 ㎍/㎖의 엠피실린이 포함된 LB배지에서 현탁하고 37 ℃에서 배양하였다. 상기와 같은 배양된 형질전환체의 배양액에 OD600을 기준으로 0.4 내지 0.5 사이의 단계에서 0.5 mM의 IPTG(isopropylthio-β-D-galactoside)(Sigma, 미국)를 처리하고 37 ℃에서 3시간 동안 현탁배양시켜, 서열번호 1의 아미노산 서열을 갖는 BCAⅡ_opt 단백질의 발현을 유도하였다. 상기와 같이 BCAⅡ_opt 단백질이 유도발현된 대장균을 수확(harvest)하고, 20 mM의 Tris-SO4(pH 8.3)로 재현탁한 다음, 소니케이션(sonication) 방법으로 세포를 파쇄하여 세포용해물(cell lysate)를 수득하였다. 상기와 같이 수득된 세포용해물을 20,000Xg에서 20분간 원심분리하여 상층액을 수득하였고, 상기 상층액을 수용성 분획과 불용성 분획으로 나누어 SDS-PAGE를 수행함으로써 상기 BCAⅡ_opt 단백질의 유도발현 여부를 확인하였다.
그 결과, 도 3에 나타난 바와 같이 상기 상층액의 수용성 분획에서 35 kDa 정도 크기의 BCAⅡ_opt 단백질이 검출되었고, 이로부터 BCAⅡ_opt 단백질이 성공적으로 유도발현되었음을 확인하였다.
<1-1-3>
보스 타우루스(
Bos taurus
) 유래 CA의 정제(purification)
상기 실시예 <1-1-2>에서 수득한 상층액으로부터 His-Taq 컬럼인 Ni-NTA 아가로즈(agarose)(QIAGEN, 독일)을 이용하여 6X His-Taq이 융합된 BCAⅡ_opt 단백질을 분리하였다. 이 때, BCAⅡ_opt 단백질의 일루션(elution)은 일루션 버퍼(elution buffer)(20 mM Tris-SO4(pH 8.3), 250 mM imidazol)를 이용하여 4회 수행하였고, 상기 각각의 일루션된 분획으로 SDS-PAGE를 수행하여 BCAⅡ_opt 단백질의 정제 여부를 확인하였다.
그 결과, 도 4에 나타난 바와 같이 수용성 분획에서 존재하던 38 kDa 정도 크기의 BCAⅡ_opt 단백질이 4개의 일루션 분획 모두에서 특이적으로 검출되었다. 상기와 같은 결과로부터, BCAⅡ_opt 단백질이 특이적으로 정제되었음을 확인하였다.
<1-2>
두날리엘라(
Dunaliella sp.
) 유래 CA의 분리
<1-2-1>
두날리엘라(
Dunaliella sp.
) 유래 CA의 클로닝 및 형질전환
서열번호 15의 핵산 서열을 갖는 Dunaliella sp. 유래의 탄산무수화 효소 α는 도 5에 도시된 바와 같이 N-말단 부위와 C-말단 부위가 반복되는 서열을 가지므로, C 말단 부위의 서열를 대장균(E. coli)에 맞게 코돈 최적화(codon optimization)하여 서열번호 4로 기재되는 핵산 서열(이하, 'DspαCA-CO'라 함)을 얻었다.
상기와 같이 얻어진 서열번호 4의 유전자를 발현벡터인 pET-44b(Novagen, 독일)에 넣어, 도 6과 같이 재조합 발현벡터인 pET-44b::DspαCA-CO를 제작한 후, 상기 pET-44b::DspαCA-CO를 제한효소(NdeI 및 HindⅢ)로 절단하여 아가로즈 젤 전기영동함으로써 상기 DspαCA-CO 유전자의 성공적인 삽입을 확인하였다(도 7). 그런 다음, 상기 pET-44b::DspαCA-CO를 대장균(E. coli BL21(DE3))에 형질전환하였다.
<1-2-2>
두날리엘라(
Dunaliella sp.
) 유래 CA의 발현유도
상기 실시예 <1-2-1>과 같이 제조된 형질전환체는 카나마이신(kanamycin)에 저항성을 보이는 바, 상기 형질전환체를 50 ㎍/㎖의 카나마이신이 포함된 LB배지에서 현탁하고 37 ℃에서 배양하였다. 상기와 같은 배양된 형질전환체의 배양액에 OD600을 기준으로 0.4 내지 0.5 사이의 단계에서 30분간 15 ℃로 정치한 후, 1 mM의 IPTG(isopropylthio-β-D-galactoside)(Sigma, 미국)를 처리하고 15 ℃에서 24시간동안 현탁배양시켜, 서열번호 3의 아미노산 서열을 갖는 DspαCA-CO 단백질의 발현을 유도하였다.
<1-2-3>
두날리엘라(
Dunaliella sp.
) 유래 CA의 정제(purification)
상기 실시예 <1-2-2>에서와 같이 DspαCA-CO 단백질이 유도발현된 대장균을 수확(harvest)하고, 25 mM의 Tris-SO4(pH 7.6)로 재현탁한 다음, 소니케이션(sonication) 방법으로 세포를 파쇄하여 세포용해물(cell lysate)를 수득하였다. 상기와 같이 수득된 세포용해물을 20,000Xg에서 20분간 원심분리하여 상층액을 수득하였다. 상기와 같이 수득한 상층액으로부터 His-Taq 컬럼인 Ni-NTA 아가로즈(agarose)(QIAGEN, 독일)을 이용하여 6X His-Taq이 융합된 DspαCA-CO 단백질을 분리하였다. 이 때, DspαCA-CO 단백질의 일루션(elution)은 일루션 버퍼(elution buffer)(25 mM Tris-SO4(pH 7.6), 250 mM imidazol)를 이용하여 3회 수행하였고, 상기 각각의 일루션된 분획으로 SDS-PAGE를 수행하여 DspαCA-CO 단백질의 정제 여부를 확인하였다.
그 결과, 도 8에 나타난 바와 같이 30 kDa 정도 크기의 DspαCA-CO 단백질이 3개의 일루션 분획 모두에서 특이적으로 검출되었다. 상기와 같은 결과로부터, DspαCA-CO 단백질이 특이적으로 정제되었음을 확인하였다.
<1-3>
패오닥틸룸 트리코르누툼(
Phaeodactylum tricornutum
) 유래 CA의 분리
<1-3-1>
패오닥틸룸 트리코르누툼(
Phaeodactylum tricornutum
) 유래 CA의 클로닝 및 형질전환
Phaeodactylum tricornutum CCMP 632 유래의 탄산무수화 효소 α의 유전자 서열(XM_002183864.1)을 기초로 신호펩티드(signal peptide)를 제거하여 서열번호 6으로 기재되는 핵산 서열(이하, 'PtmαCA3'이라 함)을 얻었다.
상기와 같이 얻어진 서열번호 6의 유전자를 발현벡터인 pMAL-c2x(NEB, 영국)에 넣어, 도 9와 같이 재조합 발현벡터인 pMAL-c2x::PtmαCA3를 제작하고, 서열번호 16 및 서열번호 17의 프라이머를 이용하여 중합효소연쇄반응(Polymerase chain reaction, PCR)을 수행함으로써, 상기 PtmαCA3 유전자가 성공적으로 도입되었음을 확인하였다(도 10). 그런 다음, 상기 pMAL-c2x::PtmαCA3를 대장균(E. coli Origami 2)에 형질전환하였다.
<1-3-2>
패오닥틸룸 트리코르누툼(
Phaeodactylum tricornutum
) 유래 CA의 발현유도
상기 실시예 <1-3-1>과 같이 제조된 형질전환체는 엠피실린(ampicillin)에 저항성을 보이는 바, 상기 형질전환체를 100 ㎍/㎖의 엠피실린이 포함된 LB배지에서 현탁하고 37 ℃에서 배양하였다. 상기와 같은 배양된 형질전환체의 배양액에 OD600을 기준으로 0.4 내지 0.5 사이의 단계에서 0.3 mM의 IPTG(isopropylthio-β-D-galactoside)(Sigma, 미국)를 처리하고 37 ℃에서 4시간 동안 현탁배양시켜, 서열번호 5의 아미노산 서열을 갖는 PtmαCA3 단백질의 발현을 유도하였다. 상기와 같이 PtmαCA3 단백질이 유도발현된 대장균을 수확(harvest)하고, 20 mM의 Tris-SO4(pH 8.3)로 재현탁한 다음, 소니케이션(sonication) 방법으로 세포를 파쇄하여 세포용해물(cell lysate)를 수득하였다. 상기와 같이 수득된 세포용해물을 20,000Xg에서 20분간 원심분리하여 상층액을 수득하였고, 상기 상층액을 수용성 분획과 불용성 분획으로 나누어 SDS-PAGE를 수행함으로써 상기 PtmαCA3 단백질의 유도발현 여부를 확인하였다.
그 결과, 도 11에 나타난 바와 같이 상기 상층액의 불용성 분획에 비하여 수용성 분획에서 현저하게 과발현된 70 kDa 정도 크기의 PtmαCA3 단백질이 검출되었고, 이로부터 PtmαCA3 단백질이 성공적으로 유도발현되었음을 확인하였다.
<1-3-3>
패오닥틸룸 트리코르누툼(
Phaeodactylum tricornutum
) 유래 CA의 정제(purification)
상기 실시예 <1-3-2>에서 수득한 상층액으로부터 MBP(Maltose binding protein)-Taq 컬럼인 아밀로즈 아가로즈(amylose agarose)(NEB, 영국)를 이용하여 MBP-Taq이 융합된 PtmαCA3 단백질을 분리하였다. 이 때, PtmαCA3 단백질의 일루션(elution)은
일루션 버퍼(elution buffer)(20 mM Tris-SO4(pH 8.3), 10 mM maltose)를 이용하여 2회 수행하였고, 상기 각각의 일루션된 분획으로 SDS-PAGE를 수행하여 PtmαCA3 단백질의 정제 여부를 확인하였다.
그 결과, 도 12에 나타난 바와 같이 수용성 분획에서 유독 현저하게 발현되었던 70 kDa 정도 크기의 PtmαCA3 단백질이 2개의 일루션 분획 모두에서 특이적으로 검출되었다. 상기와 같은 결과로부터, PtmαCA3 단백질이 특이적으로 정제되었음을 확인하였다.
포스포에놀피루브산 카르복실화효소(Phosphoenolpyruvate Carboxylase, PEPCase)의 분리
<2-1>
패오닥틸룸 트리코르누툼(
Phaeodactylum tricornutum
) 유래 PEPCase의 클로닝 및 형질전환
서열번호 8의 Phaeodactylum tricornutum CCMP 632 유래의 포스포에놀피루브산 카르복실화 효소 1의 유전자(PtPEPCase1)(XM_002180991)를 5'쪽에 Nde I 과 3'쪽에 Pst I 제한효소를 이용하여 발현벡터인 pColdI(Takara, 일본)에 넣어, 도 13과 같이 재조합 발현벡터인 pColdI::PtPEPCase1을 제작하고, 서열번호 22 및 서열번호 23의 프라이머를 이용하여 중합효소연쇄반응(Polymerase chain reaction, PCR)을 수행함으로써, 상기 PtPEPCase1 유전자의 성공적인 삽입을 확인하였다(도 14). 그런 다음, 상기 pColdI::PtPEPCase1를 대장균(E. coli Origami 2)에 형질전환하였다.
<2-2>
패오닥틸룸 트리코르누툼(
Phaeodactylum tricornutum
) 유래 PEPCase의 발현유도
상기 실시예 <2-1>과 같이 제조된 형질전환체는 엠피실린(ampicillin)에 저항성을 보이는 바, 상기 형질전환체를 50 ㎍/㎖의 엠피실린이 포함된 LB배지에서 현탁하고 37 ℃에서 배양하였다. 상기와 같은 배양된 형질전환체의 배양액에 OD600을 기준으로 0.4 내지 0.5 사이의 단계에서 30분 동안 15 ℃로 냉각(콜드(cold) 처리)시킨 후, 1 mM의 IPTG(isopropylthio-β-D-galactoside)(Sigma, 미국)를 처리하고 15 ℃에서 24시간 동안 현탁배양시켜, 서열번호 7의 아미노산 서열을 갖는 PtPEPCase1 단백질의 발현을 유도하였다.
<2-3>
패오닥틸룸 트리코르누툼(
Phaeodactylum tricornutum
) 유래 PEPCase의 정제(purification)
상기 실시예 <2-2>에서와 같이 PtPEPCase1 단백질이 유도발현된 대장균을 수확(harvest)하고, 라이시스 버퍼(lysis buffer)(20 mM Tris-HCl (pH7.5), 0.5M NaCl, 10 mM imidazole, 5% glycerol, 20 mM KCl, 10 mM MgCl2, 0.1% Triton X-100, 1 mM PMSF)로 재현탁한 다음, 소니케이션(sonication) 방법으로 세포를 파쇄하여 세포용해물(cell lysate)를 수득하였다. 상기와 같이 수득된 세포용해물을 10,000Xg에서 30분간 원심분리하여 상층액을 수득하였다. 상기와 같이 수득한 상층액으로부터 His-Taq 컬럼인 Ni-NTA 아가로즈(agarose)(QIAGEN, 독일)을 이용하여 6X His-Taq이 융합된 PtPEPCase1 단백질을 분리하였다. 이 때, PtPEPCase1 단백질의 일루션(elution)은 일루션 버퍼(elution buffer)(20 mM Tris-SO4(pH 7.5), 0.5 M NaCl, 300 mM imidazole, 5% glycerol, 20 mM KCl, 10 mM MgCl2)를 이용하여 5회 수행하였고, 상기 각각의 일루션된 분획으로 SDS-PAGE를 수행하여 PtPEPCase1 단백질의 정제 여부를 확인하였다.
그 결과, 도 15에 나타난 바와 같이 112 kDa 정도 크기의 PtPEPCase1 단백질이 첫 번째 및 두 번째 일루션 분획에서 특이적으로 검출되었다. 상기와 같은 결과로부터, PtPEPCase1 단백질이 특이적으로 정제되었음을 확인하였다.
In vitro
에서 옥살로아세트산(oxaloacetic acid, OAA)의 생산
<3-1>
OAA의 생산
20 웰의 플레이트에 상기 실시예 <1-1> 내지 <1-3>에서 각각 정제한 Bos taurus, Dunaliella sp. 및 Phaeodactylum tricornutum CCMP 632 유래의 어느 한 CA와 상기 실시예 2에서 정제한 Phaeodactylum tricornutum CCMP 632 유래의 PEPCase를 각각 10 ㎍ 씩 첨가하고, 0.1 M의 포스포에놀피루브산(phosphoenolpyruvate, PEP)을 3 ㎕ 첨가하였다. 그런 다음, PEPCase 익스트랙션 버퍼(PEPCase extraction buffer)(50 mM Tris-HCl(pH 8.0), 1mM MgCl2)를 첨가하여 반응물의 최종 부피를 50 ㎕로 맞추어 주고, 상온에서 10분간 반응시켰다. 일부 실험군에서는 각 효소(CA 또는 PEPCase)와 PEP를 첨가하지 않음으로써, 상기 효소 및 PEP가 OAA의 합성에 미치는 영향을 확인하였다.
<3-2>
OAA의 정량
BioVison사의 옥살로아세트산 분석 시약를 이용하여, 상기 실시예 <3-1>의반응 결과 생성된 OAA를 정량하였다. 상기 OAA의 정량은 BioVison사에서 제시한 실험방법에 따라 수행되었다. 보다 상세하게는, 상기 실시예 <3-1>의 20 웰 플레이트에 상기 분석 시약 50 ㎕를 더 첨가하여 총 100 ㎕의 부피가 되도록 한 다음, 암소상태에서 약 1분 동안 반응을 진행시켰다. 그런 다음, 상기 반응 결과를 사진 및 570nm 파장의 흡광도값을 측정하여 정량화하였다.
그 결과, 도 16 및 도 17에서 나타난 바와 같이 PEPCase 및 PEP를 넣은 반응물에서 붉은색을 띄는 변색 반응이 일어나 OAA가 합성되었음을 확인할 수 있었다. 상기에서 생성된 OAA에서 측정된 흡광도 값은 10 ㎍의 OAA에서 측정되는 흡광도 값과 비슷하였다(도 16 및 도 17의 OAA). 또한, 상기 반응물에 CA가 첨가된 실험군에서 더 붉은색을 나타내는 변색 반응이 나타냈고, PEP 또는 PEPCase가 첨가되지 않은 실험군에서는 옥살로아세트산 합성이 되지 않았다.
상기와 같은 결과로부터, PEPCase에 의한 OAA가 합성되고, CA에 의해 OAA의 생산이 더욱 증가됨을 알 수 있다. 이는 CA에 의하여 PEPCase의 다른 기질인 바이카보네이트의 생성이 촉진되기 때문인 것으로 판단된다. 또한, 10 ㎍의 CA 및 PEPCase와 약 50 ㎍ 정도의 PEP를 반응시킴으로써 약 10 ㎍ 정도의 OAA를 생성할 수 있음을 알 수 있다.
In vivo
에서 옥살로아세트산(oxaloacetic acid, OAA)의 생산
<4-1>
두날리엘라(
Dunaliella sp.
) 유래 CA의 클로닝 및 형질전환
Dunaliella sp.로부터 서열번호 9의 핵산 서열을 갖는 탄산무수화 효소 γ의 유전자(DspγCA)를 동정하여 발현벡터인 pCDF-1b(Merck, 독일)에 넣어 도 18과 같은 재조합 발현벡터인 pCDF-1b::DspγCA를 제작하고, 서열번호 18 및 서열번호 19의 프라이머를 이용하여 중합효소연쇄반응(Polymerase chain reaction, PCR)을 수행함으로써, 상기 DspγCA 유전자가 성공적으로 도입되었음을 확인하였다(도 19). 그런 다음, 상기 pCDF-1b::DspγCA를 대장균(E. coli BL21(DE3))에 형질전환하였다.
<4-2>
패오닥틸룸 트리코르누툼(
Phaeodactylum tricornutum
) 유래 PEPCase의 클로닝 및 형질전환
Phaeodactylum tricornutum으로부터 서열번호 11의 핵산 서열을 갖는 포스포에놀피루브산 카르복실화 효소 2의 유전자(PtPEPCase2)(XM_002182793)를 동정하여 발현벡터인 pET-21a(+)(Novagen, 독일)에 넣어 도 20과 같은 재조합 발현벡터인 pET-21a(+)::PtPEPCase2를 제작하고, 서열번호 20 및 서열번호 21의 프라이머를 이용하여 중합효소연쇄반응(Polymerase chain reaction, PCR)을 수행함으로써, 상기 PtPEPCase2 유전자가 성공적으로 도입되었음을 확인하였다(도 21). 그런 다음, 상기 pET-21a(+)::PtPEPCase2를 대장균(E. coli BL21(DE3))에 형질전환하였다.
<4-3>
CA 및 PEPCase의 대장균으로의 형질전환
상기 실시예 <4-1> 및 <4-2>에서 제조된 재조합 발현벡터 pCDF-1b::DspγCA 및 pET-21a(+)::PtPEPCase2를 각각 제한효소 SacI, KpnI와 제한효소 XhoI, EagI으로 절단하여 아가로즈 젤 전기영동함으로써 상기 DspγCA 및 PtPEPCase2 유전자의 성공적인 삽입을 다시 한번 확인하였다(도 23). 그런 다음, 상기 pCDF-1b::DspγCA-PtPEPCase2를 대장균(E. coli BL21(DE3))에 형질전환하였다.
<4-4>
형질전환된 대장균의 혐기 배양
상기 실시예 <4-1>, <4-2> 및 <4-3>에서 각각 형질전환된 대장균을 도 24와 같은 500 ㎖ 크기의 발효기에 200 ㎖의 액체 LB 배지를 담아, 진탕배양기에서 37 ℃, 150 rpm으로 배양하였다. 또한, 상기 형질전환된 대장균의 성장을 돕고 적절한 pH의 유지를 위하여 MgCO3를 첨가하였다. 상기 대장균의 성장이 정체기(stationary phase)에 이르렀을 때, 재조합 발현벡터에 삽입된 CA 및 PEPCase의 유전자가 발현되게 1 mM의 IPTG를 첨가하였으며, 전체 배지가 10 g/ℓ의 농도가 되도록 포도당 용액을 첨가하였다. 그런 다음, 혐기 배양을 위해 배양기 내부를 이산화탄소로 충전하고, 배양기를 밀폐시켰다.
<4-5>
OAA의 생산 및 분석
상시 실시예 <4-4>와 같이 ITPG를 첨가하여 대장균을 혐기 배양하되, 첨가된 ITPG의 농도가 0 mM, 0.2 mM 및 1mM이 되도록 각각 첨가하였고, 상기 대장균을 26 ℃에서 6시간 동안 배양한 다음 회수하였다. CA 및 PEPCase 단백질의 발현을 확인하기 위하여, 상기 회수된 대장균을 20 mM의 Tris-SO4(pH 8.3)로 재현탁한 다음, 소니케이션(sonication) 방법으로 세포를 파쇄하여 세포용해물(cell lysate)를 수득하였다. 상기와 같이 수득된 세포용해물을 20,000Xg에서 20분간 원심분리하여 상층액을 수득하였고, 상기 상층액과 남은 침전물을 20 mM의 Tris-SO4(pH 8.3)으로 재현탁한 다음 소니케이션(sonication)을 1회 재처리하였다. 상기 상층액에서 수득한 샘플(S, 수용성 단백질)과 재처리한 샘플(P, 비수용성 단백질)을 세포의 총 단백질(T)과 함께 SDS-PAGE를 수행함으로써 상기 CA 및 PEPCase 단백질의 유도발현 여부를 확인하였다.
그 결과, 도 25에서 나타난 바와 같이 형질전환 대장균에서 DspγCA와 PtPEPCase2가 성공적으로 유도발현되었음을 확인하였다. 또한, DspγCA는 비수용성 형태로, PtPEPCase 2는 수용성 형태로 발현되는 것을 확인하였다.
상기 실시예 <4-4>와 같은 혐기 배양에 의하여 생산된 OAA를 분석하기 위하여, oxaloacetate assay kit(abcam, 미국)를 이용한 변색 반응을 관찰하였다. 보다 구체적으로, 상기 실시예 <4-4>와 같은 혐기 배양 중인 대장균을 소니케이션(sonication) 방법으로 파쇄한 후, 제조사인 abcam에서 지시에 따라 실험을 수행하였고, 반응 후에는 Bioscreen C (Oy Growth Curves Ab Ltd., 핀란드)를 이용하여 580 nm 파장에서 흡광도를 측정하였다.
그 결과, 도 26 및 하기 표 1에서 나타난 바와 같이 IPTG에 의해 CA 및 PEPCase가 함께 유도발현된 실시예 <4-3>의 형질전환 대장균에서 가장 선명한 붉은색이 관찰되었고, 흡광도도 0.63으로 가장 높게 측정되었다. 상기와 같은 결과로부터, 상기 실시예 <4-3>에서 제조된 대장균이 가장 좋은 OAA 생산력을 나타냄을 알 수 있다.
<4-6>
유기산의 생산 및 분석
상기 실시예 <4-4>와 같은 혐기 배양동안, 대장균은 탄소원인 포도당을 이용하여 다양한 유기산을 생성한다. 상기 혐기 배양에 의하여 생성된 유기산의 생성량을 확인하기 위하여, 상기 실시예 <4-4>의 혐기 배양의 배양액을 회수하여 고압 액체크로마토그래피(HPLC)로 분석하였다. 분석에 사용된 검출기는 RI detector RID-10A(Shimadzu, 일본)이며, 컬럼은 aminex HPX-87H(Bio-Rad, 미국)를 사용하였다. 분석 시, 0.5 mM 황산용액을 이동상으로 사용하였으며, 유속은 0.6 ㎖/min, 컬럼의 온도는 50 ℃로 유지시켰다.
분석 결과는 하기 표 1과 같으며, DspγCA와 PtPEPCase2의 발현으로 인해 유기산의 생산량에 현저한 변화가 생겼다. 특히, 숙신산(succinic acid)의 생성량은 야생형 균주가 0.9694 g/ℓ, 상기 DspγCA와 PtPEPCase2 유전자의 발현이 유도되지 않은 경우 0.7202 g/ℓ의 생산을 보인 것과 비교해 상기 실시예 <4-3>에서 제조된 대장균에서 상기 DspγCA와 PtPEPCase2 유전자의 발현을 유도한 경우에 3.8384 g/L의 생산량을 나타내어, 약 4배 정도 향상되었다. 이러한 숙신산의 생성량 증가는 DspγCA와 PtPEPCase2의 유도발현으로 인해 상기 숙신산의 전구체인 OAA의 생성량이 증가되었기 때문인 것으로 판단된다.
상기에서는 본 발명의 바람직한 실시예를 예시적으로 설명하였으나, 본 발명의 범위는 상기와 같은 특정 실시예에만 한정되지 아니하며, 해당 분야에서 통상의 지식을 가진 자라면 본 발명의 특허청구범위에 기재된 범주 내에서 적절하게 변경이 가능할 것이다.
<110> Industry-University Cooperation Foundation Hanyang University
<120> Organic acid synthetic system using carbonic anhydrase and
phosphoenolpyruvate carboxylase
<130> HY120024N
<160> 23
<170> KopatentIn 1.71
<210> 1
<211> 260
<212> PRT
<213> Bos taurus
<400> 1
Met Ser His His Trp Gly Tyr Gly Lys His Asn Gly Pro Glu His Trp
1 5 10 15
His Lys Asp Phe Pro Ile Ala Asn Gly Glu Arg Gln Ser Pro Val Asp
20 25 30
Ile Asp Thr Lys Ala Val Val Gln Asp Pro Ala Leu Lys Pro Leu Ala
35 40 45
Leu Val Tyr Gly Glu Ala Thr Ser Arg Arg Met Val Asn Asn Gly His
50 55 60
Ser Phe Asn Val Glu Tyr Asp Asp Ser Gln Asp Lys Ala Val Leu Lys
65 70 75 80
Asp Gly Pro Leu Thr Gly Thr Tyr Arg Leu Val Gln Phe His Phe His
85 90 95
Trp Gly Ser Ser Asp Asp Gln Gly Ser Glu His Thr Val Asp Arg Lys
100 105 110
Lys Tyr Ala Ala Glu Leu His Leu Val His Trp Asn Thr Lys Tyr Gly
115 120 125
Asp Phe Gly Thr Ala Ala Gln Gln Pro Asp Gly Leu Ala Val Val Gly
130 135 140
Val Phe Leu Lys Val Gly Asp Ala Asn Pro Ala Leu Gln Lys Val Leu
145 150 155 160
Asp Ala Leu Asp Ser Ile Lys Thr Lys Gly Lys Ser Thr Asp Phe Pro
165 170 175
Asn Phe Asp Pro Gly Ser Leu Leu Pro Asn Val Leu Asp Tyr Trp Thr
180 185 190
Tyr Pro Gly Ser Leu Thr Thr Pro Pro Leu Leu Glu Ser Val Thr Trp
195 200 205
Ile Val Leu Lys Glu Pro Ile Ser Val Ser Ser Gln Gln Met Leu Lys
210 215 220
Phe Arg Thr Leu Asn Phe Asn Ala Glu Gly Glu Pro Glu Leu Leu Met
225 230 235 240
Leu Ala Asn Trp Arg Pro Ala Gln Pro Leu Lys Asn Arg Gln Val Arg
245 250 255
Gly Phe Pro Lys
260
<210> 2
<211> 783
<212> DNA
<213> Bos taurus
<400> 2
atgtcccatc attgggggta cggcaagcat aacggccccg agcactggca taaagatttt 60
ccgattgcta atggcgaacg ccagtcaccg gtggatattg ataccaaagc cgtcgttcag 120
gatcctgcat taaaaccttt agcacttgtc tatggcgaag ccacgtcgcg gcgaatggtc 180
aataatggtc attcttttaa cgttgagtat gatgactccc aggacaaagc agtgctgaaa 240
gatggacctc ttacaggtac ttacagattg gttcagtttc attttcactg gggctcatct 300
gatgatcaag gtagtgagca caccgtggat cgcaagaagt atgcagcgga attacacctg 360
gtacattgga acaccaaata cggggatttt ggaacagctg cacaacagcc agacgggctg 420
gctgtagtgg gagttttttt aaaagttggt gatgctaatc cagccctgca gaaagtcttg 480
gatgcgctgg attctattaa aacaaaaggt aaaagtacag acttccccaa ctttgatccg 540
ggtagcctgc ttcctaacgt actagactat tggacgtatc ccggttcact gactacgcca 600
cctctcttag aaagcgtgac ttggatcgtg ttaaaagaac caatatctgt tagctcgcag 660
caaatgttga aattccgtac ccttaatttc aatgcggagg gcgaaccaga actcctgatg 720
ttagccaatt ggcgcccggc gcagccgctg aagaatcgtc aagtaagagg tttcccgaaa 780
taa 783
<210> 3
<211> 273
<212> PRT
<213> Dunaliella
<400> 3
Met Glu Pro Asn Asp Lys Tyr Asn Tyr Val Gln His Gly Phe Asp Trp
1 5 10 15
Arg Asp Asn Gly Leu Asp Ser Cys Ala Gly Asp Val Gln Ser Pro Ile
20 25 30
Asp Ile Val Thr Ser Thr Leu Gln Ala Gly Ser Ser Arg Ser Asp Val
35 40 45
Ser Ser Val Asn Leu Asn Asp Leu Asn Thr Asp Ala Phe Thr Leu Thr
50 55 60
Gly Asn Thr Val Asn Ile Gly Gln Gly Met Gln Ile Asn Phe Gly Asp
65 70 75 80
Pro Pro Ala Gly Asp Leu Pro Val Ile Arg Ile Gly Thr Arg Asp Val
85 90 95
Thr Phe Arg Pro Leu Gln Val His Trp His Phe Phe Leu Ser Glu His
100 105 110
Thr Val Asp Gly Val His Tyr Pro Leu Glu Ala His Ile Val Met Lys
115 120 125
Asp Asn Asp Asn Leu Gly Asp Ser Ala Gly Gln Leu Ala Val Ile Gly
130 135 140
Ile Met Tyr Lys Tyr Gly Asp Ala Asp Pro Phe Ile Thr Asp Met Gln
145 150 155 160
Lys Arg Val Ser Asp Lys Ile Ala Ser Gly Ala Ile Thr Tyr Gly Gln
165 170 175
Ser Gly Val Ser Leu Asn Asn Pro Asp Asp Pro Phe Asn Val Asn Ile
180 185 190
Lys Asn Asn Phe Leu Pro Ser Glu Leu Gly Tyr Ala Gly Tyr Asp Gly
195 200 205
Ser Leu Thr Thr Pro Pro Cys Ser Glu Ile Val Lys Trp His Val Phe
210 215 220
Leu Glu Pro Arg Thr Val Ser Val Glu Gln Met Glu Val Phe Ala Asp
225 230 235 240
Val Thr Leu Asn Ser Asn Pro Gly Ala Thr Val Thr Thr Asn Arg Met
245 250 255
Ile Gln Pro Leu Glu Gly Arg Thr Val Tyr Gly Tyr Asn Gly Ala Ala
260 265 270
Ala
<210> 4
<211> 821
<212> DNA
<213> Dunaliella
<400> 4
atggaaccga acgacaaata caactacgtt cagcacggtt tcgactggcg tgacaacggt 60
ctggactctt gcgctggtga cgttcagtct ccgatcgaca tcgttacctc taccctgcag 120
gctggttctt ctcgttctga cgtttcttct gttaacctga acgacctgaa caccgacgct 180
ttcaccctga ccggtaacac cgttaacatc ggtcagggta tgcagatcaa cttcggtgac 240
ccgccggctg gtgacctgcc ggttatccgt atcggtaccc gtgacgttac cttccgtccg 300
ctgcaggttc actggcactt cttcctgtct gaacacaccg ttgacggtgt tcactacccg 360
ctggaagctc acatcgttat gaaagacaac gacaacctgg gtgactctgc tggtcagctg 420
gctgttatcg gtatcatgta caaatacggt gacgctgacc cgttcatcac cgacatgcag 480
aaacgtgttt ctgacaaaat cgcttctggt gctatcacct acggtcagtc tggtgtttct 540
ctgaacaacc cggacgaccc gttcaacgtt aacatcaaaa acaacttcct gccgtctgaa 600
ctgggttacg ctggttacga cggttctctg accaccccgc cgtgctctga aatcgttaaa 660
tggcacgttt tcctggaacc gcgtaccgtt tctgttgaac agatggaagt tttcgctgac 720
gttaccctga actctaaccc gggtgctacc gttaccacca accgtatgat ccagccgctg 780
gaaggtcgta ccgtttacgg ttacaacggt gctgctgcta a 821
<210> 5
<211> 297
<212> PRT
<213> Phaeodactylum tricornutum
<400> 5
Leu Asn Lys Thr Ala Phe Ser Tyr Asn Lys Lys Asp Glu Tyr Ser Pro
1 5 10 15
Asp Asn Trp Tyr Arg Leu Asp Ile Ala Gly Asn Val Cys Arg Gly Pro
20 25 30
Arg Asn Ser Pro Ile Ala Leu Glu Ser Thr Pro Cys Asp Ala Tyr Glu
35 40 45
Gly Tyr Gly Leu Tyr Ser Gly Thr Cys Thr Leu Asn Asp Leu Asp Phe
50 55 60
Gln Leu Thr Glu Leu Gly Val Lys Ile Asn Tyr Pro Lys Asp Gly Ser
65 70 75 80
Cys Asp Ile Asn Thr Leu Thr Val Pro Gly Val Ser Gly Thr Phe Arg
85 90 95
Leu Leu Glu Val Thr Ile His Gly Gly Ser Glu His Ser Ile Asp Gly
100 105 110
Asn Phe Ser Gly Ala Glu Ile Gln Leu Val His Glu Lys Ile Asn Ser
115 120 125
Gln Glu Gly His Leu Ala Val Leu Ala Ile Leu Val Glu Pro Glu Gly
130 135 140
Pro Lys Asp Asn Leu Phe Phe Gly Thr Leu Leu Asp Glu Trp Arg Ala
145 150 155 160
Val Arg Ala Asp Ser Thr Ala Ser Cys Ala Lys Ala Gly Tyr Asp Val
165 170 175
Pro Thr Leu Tyr Trp Leu Ala Ser Gly Thr Pro Val Asn Thr Arg His
180 185 190
Thr Tyr Ile Arg Ser Tyr Phe Thr Ser Pro Arg Phe Asn Ala Tyr Ser
195 200 205
Leu Leu Pro Thr Asn Thr Ser Phe Tyr Arg Tyr Tyr Gly Gly Leu Thr
210 215 220
Thr Pro Pro Cys Ser Glu Ile Val Trp Trp Ser Val Ala Asp Thr Val
225 230 235 240
Met Arg Ile Ser Thr Gly Gln Tyr Ala Glu Leu Val Thr Met Ile Thr
245 250 255
Thr Gly Tyr Val Asn Val Thr Asp Glu Ala Gly Cys Glu Pro Trp Ser
260 265 270
Val Ala Ser Pro Ser Gly Ser Thr Ser Arg Pro Leu Gln Ala Arg Asn
275 280 285
Gly Arg Pro Val Asp Arg Ile Cys Pro
290 295
<210> 6
<211> 897
<212> DNA
<213> Phaeodactylum tricornutum
<400> 6
ctgaacaaga ctgccttttc ctacaataag ggagacgagt attcccccga caactggtat 60
aggctagaca ttgcaggaaa cgtctgccga gggccacgca atagtcctat agctttggag 120
tccacgccct gcgatgcgta cgaaggctat ggactctatt ctggaacgtg taccctcaat 180
gaccttgact tccagttgac cgaactcggt gtgaagatca aataccccaa ggatggatct 240
tgcgacatca acacgcttac agttccaggt gtatcgggta actttcgtct attggaggtt 300
accattcacg gaggttccga gcacagcatt gacggcaatt tctcgggagc cgaaattcag 360
ctcgtccacg agaagataaa tagccaagag ggacatctgg ctgtcttggc cattttggta 420
gagcctgaag gtcccaaaga caacttattc tttggaacgc tgttggacga atggcgggca 480
gtccgcgccg actccaccgc ttcttgtgca aaggccggct acgacgtacc cacgttgtat 540
tggttggctt ccgggactcc agtcaacacc cgtcacagct acgtccgctc gtacttcacc 600
tcaccacgtt tcaacgctta ttcactactt cctaccaata cttcattcta ccggtactat 660
ggaggcctca cgacacctcc ctgttcagag attgtgtggt ggagtgtggc ggacacagtg 720
atgcgcattt ctaccggcca atacgccgag ctgatgacaa tgatcacgac gggatacgtc 780
aatgtgacgg acgaagcagg gtgtgaaccg tggagtgtgg cgtcgcccag tggctcgacc 840
agccggccgc ttcaagcccg aaatggtcgt cccgttgacc gcatttgtcc cgtctaa 897
<210> 7
<211> 1009
<212> PRT
<213> Phaeodactylum tricornutum
<400> 7
Met Leu Ser Ser Ser Cys Arg Arg Ser Phe Leu Ala Ala Lys Thr Arg
1 5 10 15
Leu Arg Ser Cys Val Thr Thr Ser Leu Ser Thr Gly Cys Pro Trp Ser
20 25 30
Ala Ile Ser Ser Gly Ser Thr Ser Arg His Ile Asp Arg Phe Phe Ser
35 40 45
Thr His Ser Ser Phe Asp Glu Pro Asn Pro Ser Leu Phe Gly Ala Ser
50 55 60
Pro Leu Gln Ala Ser Thr Val Ser Ser Asp Ala Thr Ser Ile Pro Ser
65 70 75 80
Asn Glu Ala Asp Arg Asp Ile Gln Leu Arg Ala Asp Ile Lys Val Met
85 90 95
Gly Ser Leu Leu Gly Arg Ile Ile Gln Thr His Glu Gly Ala Glu Val
100 105 110
Leu Glu Lys Val Glu Thr Met Arg Gly Leu Ala Lys Thr Trp Arg Asp
115 120 125
Gln Gly Ala Gly Arg Asp Pro Ser Thr Lys Gln Ala Ala Asp Gln Thr
130 135 140
Phe Gln Asn Leu Ala Ala Tyr Ala Lys Ser Phe Thr Asp Ala Glu Leu
145 150 155 160
Phe Thr Val Ser Arg Ala Phe Thr His Phe Leu Ala Ile Ala Asn Ala
165 170 175
Ala Glu Ser His His Arg Gly Arg Arg Leu Lys Gln Ser Arg Leu Leu
180 185 190
Ser Asp Glu Ser Ser Gly Ala Leu Tyr Pro Lys Pro Asp Ser Val Gly
195 200 205
Gly Val Leu Pro Ser Leu Leu Ala Gln Gly His Asp Ala Asp Ala Ile
210 215 220
Tyr Asp Ala Leu Thr Ser Gln Thr Thr Glu Leu Val Leu Thr Ala His
225 230 235 240
Pro Thr Glu Val Asn Arg Arg Thr Ile Leu Asn Lys Lys Arg Arg Ile
245 250 255
Gln Arg Ile Leu Thr Met Ala Asp Gln Gln Arg Gln Leu Gly Ala Ser
260 265 270
Ser Val Phe Glu Gln Ala Glu Leu Asn Asp Ala Leu Tyr Arg Glu Ile
275 280 285
Ser Ser Ile Trp Leu Ser Asp Glu Val Ser Arg Ile Lys Pro Ser Pro
290 295 300
Glu Thr Glu Ala Glu Lys Gly Thr Leu Val Leu Glu Thr Val Leu Trp
305 310 315 320
Glu Ala Val Pro Thr Phe Leu Arg Lys Leu Asp Ala Thr Thr Arg Glu
325 330 335
Phe Leu Gly Lys Pro Leu Pro Leu Asp Ser Ser Pro Ile Arg Phe Ala
340 345 350
Ser Trp Met Gly Gly Asp Arg Asp Gly Asn Pro Asn Val Lys Pro Asp
355 360 365
Thr Thr Arg Gln Val Cys Leu Arg Asn Arg Gln Lys Ala Ala Thr Leu
370 375 380
Phe Ala Arg Asn Leu Arg Thr Leu Glu Ala Glu Leu Ser Leu Thr Thr
385 390 395 400
Cys Ser Arg Glu Val Arg Glu Val Val Gly Ala Ala Arg Glu Pro Tyr
405 410 415
Arg Ile Phe Leu Gln Pro Met Ile Arg Lys Met Glu Ala Thr Thr Asp
420 425 430
Trp Ala Ala Gln Glu Leu Ala Ile Leu Gln Lys Arg Arg Ser Gly Asp
435 440 445
Lys Ser Ala Ser Gly Ile Ala Ser Val Ala Ser Thr Asn Val Glu Gly
450 455 460
Ile Tyr Leu Asp Gln Glu Glu Phe Arg Ala Glu Leu Leu Thr Ile Tyr
465 470 475 480
Arg Ser Leu Gln Glu Thr Gly Asn Glu Val Ala Ala Ser Gly Ile Leu
485 490 495
Thr Asp Ile Ile Arg Asn Leu Ser Ser Phe Gly Leu Thr Leu Ile Pro
500 505 510
Leu Asp Val Arg Gln Glu Ser Asp Arg His Glu Glu Ala Leu Asp Ala
515 520 525
Ile Thr Arg Tyr Leu Gly Leu Gly Ser Tyr Ile Gln Trp Asp Glu Gln
530 535 540
Thr Arg Val Ser Trp Leu Thr Thr Gln Ile Ser Ser Lys Arg Pro Leu
545 550 555 560
Leu Arg Ala Gly Val Trp Tyr Glu His Pro Asp Tyr Phe Ser Pro Thr
565 570 575
Ala Ile Asp Thr Leu Glu Ile Ser Arg Met Ile Ala Glu Gln His Glu
580 585 590
Gly Ser Leu Gly Ala Tyr Val Ile Ser Gln Ala Thr Ser Ala Ser Asp
595 600 605
Val Leu Ala Val Leu Leu Leu Gln Leu Asp Ala Gly Val Lys Lys Pro
610 615 620
Leu Arg Val Ala Pro Leu Phe Glu Thr Leu Asp Asp Leu Asn Gly Ala
625 630 635 640
Ala Asp Thr Met Arg Gln Leu Phe Ser Leu Pro Ala Tyr Met Gly Thr
645 650 655
Ile Gly Gly Lys Gln Glu Val Met Ile Gly Tyr Ser Asp Ser Ala Lys
660 665 670
Asp Ala Gly Arg Met Ala Ala Thr Trp Ala Gln Tyr Glu Thr Gln Glu
675 680 685
Thr Leu Ala Lys Leu Ala Lys Glu Phe Gly Val Asp Met Thr Phe Phe
690 695 700
His Gly Lys Gly Gly Thr Val Gly Arg Gly Gly Asn Pro Gln Thr Phe
705 710 715 720
Thr Ala Ile Met Ala His Ala Pro Lys Thr Ile Asn Gly His Phe Arg
725 730 735
Val Thr Glu Gln Gly Glu Met Ile Ser Gln Asn Phe Gly Tyr Ala Asp
740 745 750
Arg Ala Glu Arg Thr Met Asp Ile Tyr Thr Ala Ala Val Leu Ala Glu
755 760 765
Lys Leu Ser Glu Arg Pro Lys Val Lys Asp Glu Trp Arg Ser Met Met
770 775 780
Lys Ile Leu Ser Asp Ile Ser Cys Glu Ala Tyr Arg Gln Val Val Arg
785 790 795 800
Lys Asp Glu Arg Phe Val Pro Tyr Phe Arg Ser Ala Thr Pro Glu Leu
805 810 815
Glu Leu Ser Asn Leu Asn Ile Gly Ser Arg Pro Ala Lys Arg Lys Ala
820 825 830
Thr Gly Gly Val Glu Ser Leu Arg Ala Ile Pro Trp Asn Phe Ala Trp
835 840 845
Thr Gln Thr Arg Phe Asn Leu Pro Thr Trp Leu Gly Val Gly Asp Ala
850 855 860
Ile Gly Gln Leu Leu Lys Ser Asp Arg Ala Pro Leu Leu Arg Glu Leu
865 870 875 880
Tyr Arg Glu Ala Arg Ala Phe Gln Thr Met Val Asp Leu Val Glu Met
885 890 895
Val Leu Ala Lys Ser Glu Pro Ala Ile Ala Ala His Tyr Asp Ser Val
900 905 910
Leu Val Lys Asp Pro Lys Ala Lys Glu Leu Gly Lys Glu Val Arg Gln
915 920 925
Leu His Met Ala Thr Glu Glu Ala Ile Leu Asp Leu Thr Glu His Lys
930 935 940
Lys Leu Gly Glu Asn Asn Ala Val Leu Gln Arg Ala Leu Val Val Arg
945 950 955 960
Asn Pro Tyr Val Asp Cys Leu Asn Ile Leu Gln Val Glu Thr Leu Asp
965 970 975
Arg Leu Arg Gln Val Glu Glu Gly Lys Glu Asp Lys Val Leu Lys Asp
980 985 990
Ala Leu Leu Thr Thr Ile Thr Gly Val Ala Asn Gly Met Gly Asn Thr
995 1000 1005
Gly
<210> 8
<211> 3030
<212> DNA
<213> Phaeodactylum tricornutum
<400> 8
atgttgtcgt cttcctgccg tcgaagtttc cttgcggcga agactcggtt gcgctcatgc 60
gtgaccacgt cgttgtcgac gggttgtccg tggagtgcca tttccagcgg atccacaagt 120
cgccatatcg atcggttttt ttcgacccac agttccttcg atgaacccaa cccgtccttg 180
tttggtgctt ctccattgca agcgtcgacg gtatccagcg atgctacttc gatcccttcc 240
aacgaagccg atcgcgatat tcaattgcga gcagacatta aagtcatggg tagtttactg 300
ggacgaatca ttcaaacgca cgaaggcgcg gaggtactgg aaaaggtcga aaccatgcgc 360
ggcttggcca agacctggcg cgatcaaggg gcaggccgcg atcccagtac gaagcaagcc 420
gctgaccaaa cctttcaaaa cctcgccgcg tacgccaaga gcttcaccga tgcggaactc 480
tttaccgtta gtcgggcttt cacgcacttt ttggccattg cgaatgcggc cgaatcgcat 540
catcgtggac ggcgtctgaa gcaatcacgc cttctttcgg acgagtcgtc gggagcgctc 600
tatcccaagc cggacagtgt tggaggggtt cttccttctc tgctcgctca gggacacgat 660
gcggacgcga tctacgacgc cctcacgtcg caaaccaccg agcttgtttt gacagcccat 720
ccgactgaag ttaatcggcg cactattctc aacaagaagc gcaggatcca gcgcattctc 780
accatggccg atcaacagcg tcagcttggt gcctctagcg tctttgagca agccgaactc 840
aatgacgcct tgtatcggga gatctccagt atttggctat ctgatgaagt ctctcgtatc 900
aaaccatctc cagaaacgga agctgaaaaa ggaacgctcg tgttggaaac ggtgttgtgg 960
gaggccgtac cgaccttttt gcgtaaattg gacgccacca cgcgcgagtt cctcggtaag 1020
cctttgcctc tcgattcgtc cccgattcgg tttgcatcct ggatgggcgg agatcgggac 1080
gggaatccta acgtgaaacc ggatacgacc cggcaagtgt gcttgcgtaa tcgtcaaaag 1140
gcagccaccc tttttgcccg taatttgcga acgctcgagg cggagttatc cttgaccacg 1200
tgcagccgcg aagtccggga agtggtaggc gctgcccgag aaccttaccg tatattctta 1260
cagcccatga ttcggaaaat ggaagcgacc actgattggg ccgcccaaga gttggcgatt 1320
ttgcaaaaac gtcgtagcgg tgacaagagt gcctcgggta ttgcatctgt cgctagcacc 1380
aacgtggaag gcatctacct tgatcaggaa gaattcaggg cggaactgct cacaatctac 1440
cgctctctac aagaaacagg aaacgaagtg gctgccagcg gcattttgac agatattatt 1500
cggaatcttt cctcctttgg gttgacgctc attcctttgg acgtccgcca ggaaagcgac 1560
cgccacgaag aagccctaga cgctattacc cggtacctcg gattaggtag ttacatacag 1620
tgggatgaac agacgcgcgt tagctggttg acaactcaaa tttcgtccaa acgcccattg 1680
cttcgagcag gagtctggta cgaacatccg gactacttct cgccaaccgc aattgataca 1740
ctagaaatct ctcgaatgat tgccgaacag cacgaaggga gtttgggggc ctacgtcatt 1800
agtcaagcga ccagtgcaag cgatgtcctt gccgtgctct tgctgcaatt ggatgctggt 1860
gtcaaaaagc ctcttcgtgt cgcgcctctt tttgaaactt tggacgatct gaacggcgcc 1920
gctgatacaa tgcgacagct gttcagtctt cctgcgtaca tgggtaccat aggtgggaag 1980
caagaggtca tgataggata ctccgattcc gcgaaagatg ccggtcgaat ggcggcaacg 2040
tgggctcaat atgagacaca agagacgttg gccaagctcg ccaaagaatt tggagtcgac 2100
atgacgtttt tccacgggaa gggtggtacc gttggccgtg gtggtaatcc gcaaaccttc 2160
acagccatta tggcacatgc gccgaaaacg atcaacgggc acttccgcgt aaccgaacaa 2220
ggtgaaatga tcagccagaa ctttggatac gcagatcgcg ccgaacgtac aatggatatt 2280
tacactgctg cggtcctggc cgagaagctg agtgaacgac cgaaggtcaa agacgaatgg 2340
agaagtatga tgaagatctt gtcggatatt agctgcgaag cctaccgcca ggtcgtacgc 2400
aaagatgagc gcttcgtacc ctactttcgc tccgctaccc ccgaactaga actctcgaac 2460
ctcaacattg gatcgcggcc cgccaaacga aaggcgacgg gaggtgtcga aagtcttcgc 2520
gctattcctt ggaactttgc ttggacccag actcgattca atctacccac gtggttgggc 2580
gttggcgatg ccatcggaca actgctaaag agcgatagag ctcctttact ccgggaactc 2640
tatcgtgaag cgcgcgcctt tcaaaccatg gtggatttgg tcgaaatggt cctggcaaaa 2700
tccgagcccg cgattgccgc tcactacgac agtgttctcg tcaaggaccc caaggcgaaa 2760
gaactaggta aggaggttcg tcaacttcac atggcgacgg aagaggcaat tctagatttg 2820
acggaacaca aaaagttggg cgaaaacaac gcggtgcttc agcgtgctct ggttgtgcgc 2880
aatccctacg tagattgcct gaatattttg caagtcgaga ccttggatag gctccggcaa 2940
gtggaagaag ggaaggaaga taaggtcttg aaggacgcgc tcctcacgac cattacaggg 3000
gttgccaatg gaatgggcaa cactggttaa 3030
<210> 9
<211> 309
<212> PRT
<213> Dunaliella
<400> 9
Met Leu Gln Ser Ser Phe Arg His Ala Gly Trp Ser Phe Pro Phe Arg
1 5 10 15
His Pro Pro Ala Ser Gly Ala Leu Glu Lys Thr Leu Ala Gly Val Gly
20 25 30
Ser Leu Phe Arg Val Leu Gly Ser Ala Ile Asp Gly Phe Gly Ala Thr
35 40 45
Leu Gln Gly Pro Gly Ala Leu Arg Glu Gln Val Gln Pro Asn Leu Ala
50 55 60
Trp Ala Pro Thr Lys Leu Asp Glu Arg Cys Pro Pro Ser Arg Gly Gln
65 70 75 80
Val Val Asn Leu Pro Ser Met Ala Ala Met Pro Ser Leu Lys His Val
85 90 95
Val Leu Pro Leu Lys Gly Asp Asn Val Phe Ile Ala Pro Asn Ala Asn
100 105 110
Val Met Gly Asp Val Lys Ile Gly Ala Asn Ser Ser Ile Trp Tyr Gly
115 120 125
Ala Val Leu Arg Gly Asp Val Asn Ser Ile Glu Val Gly Ser Asn Thr
130 135 140
Asn Ile Gln Asp Asn Ala Ile Ile His Val Ala Lys His Ser Ile Ser
145 150 155 160
Gly Asp Ala Lys Pro Thr Ile Ile Gly Asn Asn Val Thr Ile Gly His
165 170 175
Gly Ala Thr Val His Ala Ala Thr Ile Glu Asp Asn Val Leu Ile Gly
180 185 190
Met Gly Ala Thr Val Leu Asp Gly Cys Val Val Glu Ala Gly Ala Ile
195 200 205
Val Ala Ala Gly Ser Met Val Thr Pro Gly Lys Arg Val Pro Ala Gly
210 215 220
Gln Val Trp Ala Gly Asn Pro Ala Arg Tyr Leu Arg Asp Val Glu Pro
225 230 235 240
Glu Glu His Gly Phe Val Glu Ser Ser Ala Ser Asn Tyr Ala Glu Leu
245 250 255
Ala Asp Leu His Lys Phe Glu Asn Ser Lys Thr Phe Glu Glu Leu Ser
260 265 270
Ala Glu Arg Ala Ile Glu Val Asp Arg Tyr Val Ala Ser Asp Ser Thr
275 280 285
Asn Ser Val His Gln Met Trp Ile Phe Asp Lys Gln Thr Leu Leu Ala
290 295 300
Thr Arg Pro Lys Lys
305
<210> 10
<211> 930
<212> DNA
<213> Dunaliella
<400> 10
atgttacagt cgtcatttcg ccatgcgggg tggagtttcc ctttccgcca cccccctgca 60
tccggagccc ttgagaagac cctggctggt gtaggctcct tgttccgtgt gctgggctct 120
gctattgatg gctttggagc cacgctgcaa gggcctggag cgttgagaga acaagttcag 180
cccaatctgg cctgggcccc caccaagctg gatgagcgct gcccgccctc gcgcggccag 240
gtggtgaacc tgccatccat ggccgcgatg ccgtctttga agcatgttgt gttgccgctc 300
aagggcgaca acgtctttat cgctcccaat gccaatgtga tgggtgacgt gaagattggc 360
gccaactcct ccatctggta tggagccgta ttgagaggtg acgtgaacag cattgaagta 420
ggcagcaaca ccaacattca ggacaacgcc atcatccacg tggccaagca cagcatcagt 480
ggcgatgcca agcccacaat cattggcaac aacgtgacaa ttgggcatgg agccactgtg 540
catgccgcca ccattgaaga caacgtgctc attgggatgg gggcgacagt gcttgatgga 600
tgcgtggtgg aggctggagc gattgtagca gcaggatcaa tggtaactcc agggaagaga 660
gtgcctgcag ggcaggtctg ggcaggcaac cccgcgcgct acctgaggga tgtggagcca 720
gaggagcacg gctttgtgga gtcaagtgcc tctaattatg ccgagctggc agacttgcat 780
aaattcgaga actcaaagac ctttgaggag ttgagcgcgg agcgagctat tgaggtcgac 840
cgctacgttg ccagtgactc caccaatagc gtgcaccaaa tgtggatctt tgataagcag 900
accttgcttg caacaaggcc taagaagtaa 930
<210> 11
<211> 877
<212> PRT
<213> Phaeodactylum tricornutum
<400> 11
Met Ile Asp Ala Ala Ser Lys Leu Thr Ala Thr Glu Ala Leu Gly Val
1 5 10 15
Thr Arg Val Phe Ser Ile Met Leu Asn Leu Val Asn Ala Ala Glu Val
20 25 30
Gln His Arg Asn Arg Gln Ile Arg Ala His Glu Ser Thr Lys Asp Pro
35 40 45
Ser Gly Gly Pro Leu Pro Lys Thr Glu Asp Ser Ile Arg Gly Thr Met
50 55 60
Glu Thr Leu Leu Glu Ser Lys Gln Ala Thr Pro Glu Glu Ile Phe Ala
65 70 75 80
Gln Leu Gln Lys Gln Lys Val Glu Ile Val Leu Thr Ala His Pro Thr
85 90 95
Gln Val Gln Arg Lys Ser Leu Leu Arg Lys Tyr Arg Arg Val Ser Glu
100 105 110
Met Leu Ala Tyr Leu Glu Arg Pro Asp Leu Asp Gly Phe Glu Lys Ser
115 120 125
Ser Ala Gln Thr Ser Leu Gln Thr Ile Leu Ser Ser Ile Trp Gly Ala
130 135 140
Asp Glu Ile Arg Arg Gln Lys Pro Thr Pro Gln Gln Glu Ala Ala Gly
145 150 155 160
Gly Asn Ala Ile Leu Glu Ser Val Leu Trp Asp Ala Val Pro Ala Tyr
165 170 175
Leu Arg Lys Leu Asp Gln Gln Cys Arg Leu Thr Leu Gly Gln Ser Leu
180 185 190
Pro Val Asp Val Cys Pro Ile Lys Phe Ala Ser Trp Ile Gly Gly Asp
195 200 205
Arg Asp Gly Asn Pro Asn Val Thr Pro Glu Val Thr Arg Glu Val Val
210 215 220
Leu Gln Gln Arg Leu Arg Ala Ala Arg Leu Leu Leu Lys Asp Met Tyr
225 230 235 240
Asp Leu Ile Ser Glu Leu Ala Ile Ser Ser Arg Phe Ser Pro Ala Met
245 250 255
Asp Ala Leu Ala Asp Ser Val Lys Asp Ser Gln His Lys Arg Glu Lys
260 265 270
Tyr Arg Arg Val Ile Gly His Leu Ile Lys Arg Leu Val Lys Thr Ala
275 280 285
Arg Glu Cys Glu Leu Glu Leu Ser Lys Leu Asn Thr Ser Ala Ser Met
290 295 300
Val Ser Gln Thr Leu Val Glu Glu Ala Val Asp Gly Trp Gln Asp Val
305 310 315 320
Asp Ala Leu Asp Asp Ala Thr Asp Leu Ile Lys Pro Leu Arg Ile Met
325 330 335
Tyr Asp Ser Leu Val Glu Thr Gly Phe Gly Leu Val Ala Asp Gly Leu
340 345 350
Leu Val Asp Ile Ile Arg Arg Leu Tyr Val Phe Gly Met Ser Leu Val
355 360 365
Pro Leu Asp Ile Arg Glu Glu Ser Thr Lys His Thr Glu Ala Leu Asp
370 375 380
Ala Ile Thr Arg Trp Leu Gly Ile Gly Ser Tyr Ser Glu Trp Thr Glu
385 390 395 400
Glu Ala Arg Leu Ser Trp Leu Thr Ser Glu Leu Ser Asn Lys Arg Pro
405 410 415
Leu Tyr Arg Ile Arg Glu Leu Pro Lys Leu Gly Phe Asn Asp Ser Val
420 425 430
Leu Lys Thr Leu Asn Val Phe Gly Thr Ile Ala Thr Leu Arg Pro Ser
435 440 445
Cys Leu Gly Ala Tyr Val Ile Ser Gln Ala Gln Thr Ala Ser Asp Val
450 455 460
Leu Ala Val Met Leu Leu Gln Lys Gln Tyr Gly Met Thr Asp Lys Asn
465 470 475 480
Arg Asn Met Met Arg Val Val Pro Leu Phe Glu Thr Leu Asn Asp Leu
485 490 495
Thr Asn Ala Pro Asp Lys Leu Glu Gln Leu Phe Ser Ile Pro Leu Tyr
500 505 510
Val Gly Ala Val Lys Gly Lys Gln Glu Val Met Val Gly Tyr Ser Asp
515 520 525
Ser Ala Lys Asp Ala Gly Arg Leu Ala Ala Cys Trp Ala Gln Tyr Asn
530 535 540
Ser Gln Glu Arg Met Val Lys Val Ala Ala Lys His Asn Ile Glu Leu
545 550 555 560
Thr Phe Phe His Gly Lys Gly Gly Thr Val Gly Arg Gly Gly Asn Pro
565 570 575
Ser Val Tyr Arg Ala Ile Met Ser His Pro Pro Asn Thr Ile Asn Gly
580 585 590
Arg Phe Arg Val Thr Glu Gln Gly Glu Met Ile Thr Gln Asn Phe Gly
595 600 605
Ala Pro Ser Ile Ala Glu Arg Thr Leu Asp Ile Tyr Thr Ala Gly Val
610 615 620
Cys Arg Glu Ala Phe Ser Glu Arg Val Glu Pro Ser Gln Ala Trp Arg
625 630 635 640
Asp Gln Met Gln Arg Ile Ser Asp Val Ser Cys Ala Glu Tyr Arg His
645 650 655
Leu Val Arg Glu Glu Pro Arg Phe Val Pro Tyr Phe Arg Gln Ala Thr
660 665 670
Pro Glu Leu Glu Leu Gly Ser Leu Asn Ile Gly Ser Arg Pro Ala Lys
675 680 685
Arg Asn Pro Lys Gly Gly Ile Glu Ser Leu Arg Ala Ile Pro Trp Thr
690 695 700
Phe Ala Trp Thr Gln Thr Arg Thr His Leu Ser Ala Trp Leu Gly Val
705 710 715 720
Gly Ala Gly Leu Thr Thr Thr Asp Gln Ser Glu Leu Lys Thr Leu Arg
725 730 735
Ala Met Tyr Ile Glu Trp Pro Trp Phe Arg Glu Thr Ile Asp Leu Ile
740 745 750
Ala Met Ile Val Ser Lys Thr Asp Phe Ser Ile Ser Lys Asn Tyr Asp
755 760 765
Asp Gln Leu Val Glu Lys Lys Glu Gly Leu Leu Lys Leu Gly Asp Glu
770 775 780
Val Arg Glu Lys Met Val Gln Thr Arg Gln Ala Val Leu Asp Val Thr
785 790 795 800
Glu Ser Thr Asp Val Ala Gly Ala His Val Ala Leu Met Arg Gly Ser
805 810 815
Ser Thr Ile Arg His Pro Tyr Val Asp Pro Val Asn Val Ile Gln Ala
820 825 830
Glu Leu Leu Lys Arg Leu Arg Val Met Asp Lys Lys Lys Ser Leu Ser
835 840 845
Ala Asp Glu Met Glu Glu Gln Glu Ile Leu Lys Asp Ala Leu Ile Ile
850 855 860
Ser Ile Asn Gly Ile Ala Gln Gly Met Arg Asn Ser Gly
865 870 875
<210> 12
<211> 2634
<212> DNA
<213> Phaeodactylum tricornutum
<400> 12
atgattgacg ccgccagcaa gctcaccgcg acggaagccc tgggcgtgac gcgcgtcttt 60
tccatcatgc tcaatctcgt caacgccgcc gaagtccagc accgcaaccg acagattcgg 120
gcacacgagt ccaccaagga cccctccggt ggccctctcc ccaaaacgga agattccatt 180
cgcggaacca tggagacgct gttggaatcg aaacaggcga caccggaaga aatatttgcc 240
cagctgcaga agcaaaaagt ggaaatcgtc ctgacggctc atccgactca agtccagcgc 300
aaatcgcttc tgcgcaagta ccgtcgcgtt tcggagatgc tcgcttattt ggagcgaccc 360
gatttggatg gttttgaaaa gtcgtccgcc caaacgagct tgcaaacaat cttgagcagc 420
atttggggag ctgacgaaat tcgaagacaa aaaccgacac cacaacaaga ggccgcaggg 480
ggtaacgcaa tattggagtc ggttttgtgg gacgcggtgc cagcctatct gcgcaaattg 540
gatcaacagt gccgacttac cctggggcag tcgctgcccg tggacgtatg ccccatcaag 600
tttgcttcct ggatcggtgg ggatcgcgat ggtaacccca acgtgacgcc cgaagttacc 660
cgcgaggttg ttctgcaaca acgattgcgg gctgctcgtt tgcttctcaa ggacatgtac 720
gatttgatct ccgaattggc aatttctagc cgcttttcgc ccgccatgga tgccttggca 780
gattccgtca aggactcgca gcataagcgt gaaaagtacc gtcgtgtgat tggacacttg 840
atcaaacgtc tcgtcaaaac ggcccgtgaa tgtgaattag aattgtcgaa actcaacacc 900
tcagctagta tggtcagtca gactctcgtt gaggaagcag tggatggttg gcaagacgtc 960
gatgctcttg acgatgcgac tgatttgatc aagcctttgc gcataatgta cgattcgttg 1020
gttgaaacgg gcttcggttt ggtggccgac ggtttattgg tcgatatcat tcgtcgattg 1080
tatgtgtttg gtatgtccct cgtgcccttg gatattcgcg aggagagtac caagcacacg 1140
gaagcgttag atgccattac gcgttggttg ggaattggct cctatagtga atggaccgaa 1200
gaggctcgtc tcagctggtt gacttctgag ctttccaaca aacgtccctt gtaccgaatt 1260
cgcgaattgc ccaagctggg tttcaatgac agtgtcttga agacgctcaa cgtattcggc 1320
accatagcta ccctacgacc atcttgtttg ggagcctacg tcattagtca ggcgcagacc 1380
gcaagtgatg tcttggccgt catgcttttg caaaagcagt acggtatgac ggacaagaac 1440
agaaacatga tgcgtgtggt tccgttgttt gagaccttga atgacttgac caacgcgccc 1500
gacaaactcg aacagctctt cagtattccg ctttacgtcg gcgccgtcaa agggaaacag 1560
gaagtaatgg tcgggtatag tgacagtgcc aaggatgccg gacgtctggc tgcctgctgg 1620
gcgcagtaca actcgcaaga acgaatggtg aaggtagcgg cgaagcacaa cattgaattg 1680
actttcttcc acggcaaagg gggtaccgta ggacgtggcg gtaacccatc cgtctatcgt 1740
gccattatga gccatccgcc caataccatt aatggccgtt tccgggtgac ggaacagggt 1800
gaaatgataa cgcaaaactt tggagctccg tccattgctg aacgaacttt ggacatttac 1860
acggctggcg tatgtcgcga agctttttct gagcgcgtgg aaccgtcgca agcatggcgt 1920
gaccagatgc aacggatctc cgatgtgagt tgtgccgagt accgccactt agtccgtgag 1980
gaaccgcggt ttgttcccta ctttcgccag gcgacaccgg agttggaact cggaagtttg 2040
aacataggca gtcgtccggc caaacgtaac ccgaaaggcg gtattgaaag tctccgcgcg 2100
attccgtgga cctttgcttg gacgcagacg cgcacacact tatcggcgtg gctgggagtt 2160
ggcgctggtc tcacaacgac agatcaaagc gaattgaaga cgcttcgagc aatgtacatt 2220
gaatggcctt ggtttcgtga aactattgat ctaattgcca tgattgtatc caagacagac 2280
ttttccatat ccaaaaatta tgacgatcaa ctggtggaaa agaaagaagg tttgttgaag 2340
ctgggagacg aggtcaggga gaaaatggtg caaactcgtc aagctgttct tgatgtgacc 2400
gagtctacgg atgttgctgg ggctcacgtc gcccttatgc gagggtcgtc gaccattcgt 2460
catccatacg tcgatccggt caacgttatt caagccgaat tgctcaagcg attgcgagtc 2520
atggacaaga aaaagtctct gtcggcggat gaaatggaag aacaagaaat tttaaaggat 2580
gccctgatta tcagtatcaa tggcatcgct cagggaatgc gaaacagtgg ataa 2634
<210> 13
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Forward primer for BCAII_opt
<400> 13
taatacgact cactataggg 20
<210> 14
<211> 19
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Reverse primer for BCAII_opt
<400> 14
gctagttatt gctcagcgg 19
<210> 15
<211> 1770
<212> DNA
<213> Dunaliella
<400> 15
atgggatccc gccgcatcac cctcttgggg gctctgttcg ctgtcctggc ggtcgcaatc 60
gaagggcgta ccctgcttac acacaacctg aaggccgagg ctgctgagac agtggatgca 120
gtgagctctg tggtagctgg ttctgcaggc aggcagttgc tggtgagtga gcctcacgac 180
tacaactatg agaaagttgg ctttgattgg acgggggggg tctgcgtcaa taccgggacc 240
agcaagcaga gcccaatcaa cattgagact gacagcctgg ctgaggaatc agagaggctg 300
gggaccgcgg atgacacttc acgcctggcc ttgaagggcc tactgtcttc atcctaccag 360
ctgaccagcg aagtggcaat caacctggag caggatatgc agttttcttt taatgcgcct 420
gatgaagact tgcctcaact tactattggt ggggttgtcc acaccttcaa gcctgtgcaa 480
atccactttc accactttgc cagcgagcac gctattgacg gccagcttta tcctcttgag 540
gcccacatgg tgatggcatc ccagaatgac ggctctgacc agcttgctgt cattggcatc 600
atgtacaagt acggggaaga agatcctttc ctcaaaaggc tgcaagaaac tgcacagagc 660
aatggcgaag ctggcgacaa aaatgtggag ctgaactcgt tttccatcaa tgtggccagg 720
gatttgctgc ctgagtcaga cctgacctac tatggatatg atggtagctt gactaccccc 780
ggttgtgatg agcgagtgaa gtggcatgtg ttcaaggagg caaggactgt ctcagtggcg 840
cagctcaagg tgttttcaga ggtcacgctg gctgcccacc ctgaagctac ggttaccaac 900
aaccgtgtca ttcagccgct caatggcagg aaggtctacg agtacaaggg tgaacccaac 960
gacaagtaca actatgtcca gcatggcttt gactggcgcg ataatggctt ggatagctgt 1020
gctggcgacg tccagagccc tattgacatc gtgaccagca ctttgcaagc tggatcttct 1080
cggagtgatg tttctagtgt caacctgaat gacttgaaca ccgacgcgtt cacgctgacc 1140
ggcaacactg tgaatattgg gcaaggcatg caaatcaatt ttggtgaccc ccctgcgggt 1200
gacctgcccg tcatcagaat tggtactagg gacgtcactt tcaggcccct ccaggtgcac 1260
tggcacttct ttttgagtga gcacactgtg gatggagtgc actaccccct ggaagctcat 1320
attgttatga aggacaatga caaccttggt gattctgccg gccagcttgc tgtcatcggt 1380
attatgtaca agtacggcga tgcagacccc ttcattactg atatgcagaa gagggtgtca 1440
gataaaattg catcaggtgc catcacctat ggacaatcag gagtgtctct gaacaatcct 1500
gatgatccct tcaatgtcaa catcaagaat aatttcctgc cctctgagct tggatatgct 1560
ggctacgatg gcagcctgac cacccctcct tgctctgaga ttgtgaagtg gcatgtgttc 1620
ctggagccta ggactgtttc agtggagcag atggaggtct ttgcagatgt gactctgaac 1680
tctaatccag gtgcgaccgt gacaaccaac cgaatgatcc agccactgga gggtaggact 1740
gtgtacggat ataacggtgc tgctgcttaa 1770
<210> 16
<211> 26
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Forward primer for PtmaCA3
<400> 16
cggaattcct gaacaagact gccttt 26
<210> 17
<211> 28
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Reverse primer for PtmaCA3
<400> 17
cccaagcttt tagacgggac aaatgcgg 28
<210> 18
<211> 35
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Forward primer for DspgCA
<400> 18
gtgggtacca tgttacagtc gtcatttcgc catgc 35
<210> 19
<211> 34
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Reverse primer for DspgCA
<400> 19
tgggacctct tacttcttag gccttgttgc aagc 34
<210> 20
<211> 28
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Forward primer for PtPEPCase2
<400> 20
cggccgatga ttgacgccgc cagcaagc 28
<210> 21
<211> 35
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Reverse primer for PtPEPCase2
<400> 21
ccgctcgagc ggttatccac tgtttcgcat tccct 35
<210> 22
<211> 19
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Forward primer for PtPEPCase1
<400> 22
acgccatatc gccgaaagg 19
<210> 23
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Reverse primer for PtPEPCase1
<400> 23
ggcagggatc ttagattctg 20
Claims (18)
- 탄산무수화 효소(carbonic anhydrase)의 존재 하에서 이산화탄소(CO2)와 물(H2O)을 반응시켜 바이카보네이트(bicarbonate)를 생산하는 단계; 및
상기 바이카보네이트를 포스포에놀피루브산 카르복시화 효소(phosphoenolpyruvate carboxylase)의 존재 하에서 포스포에놀피루브산(phosphoenolpyruvate)과 반응시켜 옥살로아세테이트(oxaloacetate)를 생산하는 단계를 포함하는 옥살로아세트산(oxaloacetic acid) 생산 방법. - 제1항에 있어서, 상기 탄산무수화 효소는 조류에서 유래한 것을 특징으로 하는 옥살로아세트산 생산 방법.
- 제2항에 있어서, 상기 조류는 두날리엘라(Dunaliella) 속 또는 패오닥틸룸(Phaeodactylum) 속의 조류인 것을 특징으로 하는 옥살로아세트산 생산 방법.
- 제1항에 있어서, 상기 탄산무수화 효소는 보스 타우루스(Bos taurus)에서 유래한 것을 특징으로 하는 옥살로아세트산 생산 방법.
- 제1항에 있어서, 상기 탄산무수화 효소는 서열번호 1, 서열번호 3, 서열번호 5 및 서열번호 9로 구성되는 군에서 선택되는 어느 하나의 아미노산 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 옥살로아세트산 생산 방법.
- 제1항에 있어서, 상기 포스포에놀피루브산 카르복시화 효소는 패오닥틸룸(Phaeodactylum) 속의 조류에서 유래한 것을 특징으로 하는 특징으로 하는 옥살로아세트산 생산 방법.
- 제1항에 있어서, 상기 포스포에놀피루브산 카르복시화 효소는 서열번호 7 또는 서열번호 11의 아미노산 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 옥살로아세트산 생산 방법.
- 제1항에 있어서, 상기 포스포에놀피루브산은 외부에서 주입되는 것을 특징으로 하는 옥살로아세트산 생산 방법.
- 탄산무수화 효소(carbonic anhydrase)의 유전자 및 포스포에놀피루브산 카르복시화 효소(phosphoenolpyruvate carboxylase)의 유전자를 포함하는 발현벡터가 숙주세포에 형질전환된, 옥살로아세트산(oxaloacetic acid) 생산용 형질전환체.
- 탄산무수화 효소(carbonic anhydrase)의 유전자를 포함하는 제1 발현벡터 및 포스포에놀피루브산 카르복시화 효소(phosphoenolpyruvate carboxylase)의 유전자를 포함하는 제2 발현벡터가 숙주세포에 형질전환된, 옥살로아세트산(oxaloacetic acid) 생산용 형질전환체.
- 제9항 또는 제10항에 있어서, 상기 탄산무수화 효소는 조류에서 유래한 것을 특징으로 하는 옥살로아세트산 생산용 형질전환체.
- 제11항에 있어서, 상기 조류는 두날리엘라(Dunaliella) 속의 조류인 것을 특징으로 하는 옥살로아세트산 생산용 형질전환체.
- 제9항 또는 제10항에 있어서, 상기 탄산무수화 효소는 서열번호 1, 서열번호 3, 서열번호 5 및 서열번호 9로 구성되는 군에서 선택되는 어느 하나의 아미노산 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 옥살로아세트산 생산용 형질전환체.
- 제9항 또는 제10항에 있어서, 상기 포스포에놀피루브산 카르복시화 효소는 패오닥틸룸(Phaeodactylum) 속의 조류에서 유래한 것을 특징으로 하는 옥살로아세트산 생산용 형질전환체.
- 제9항 또는 제10항에 있어서, 상기 포스포에놀피루브산 카르복시화 효소는 서열번호 7 또는 서열번호 11의 아미노산 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 옥살로아세트산 생산용 형질전환체.
- 제9항에 있어서, 상기 발현벡터는 pCDF-1b, pT7, pET/Rb, pGEX, pET28a(+), pET-21a(+), pET-22b(+) 및 pGEX로 이루어진 군에서 선택되는 어느 하나인 것을 특징으로 하는 옥살로아세트산 생산용 형질전환체.
- 제10항에 있어서, 상기 제1 발현벡터 또는 제2 발현벡터는 pCDF-1b, pT7, pET/Rb, pGEX, pET28a(+), pET-21a(+), pET-22b(+) 및 pGEX로 이루어진 군에서 선택되는 어느 하나인 것을 특징으로 하는 옥살로아세트산 생산용 형질전환체.
- 제9항 또는 제10항에 있어서, 상기 숙주세포는 대장균(Escherichia coli)인 것을 특징으로 하는 옥살로아세트산 생산용 형질전환체.
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KR1020120052556A KR20130128663A (ko) | 2012-05-17 | 2012-05-17 | 탄산무수화 효소 및 포스포에놀피루브산 카르복실화 효소를 이용한 유기산 생산 시스템 |
Country Status (1)
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KR (1) | KR20130128663A (ko) |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR20180093391A (ko) * | 2017-02-13 | 2018-08-22 | 고려대학교 세종산학협력단 | 단백질 발현량 및 가용성 증가 활성을 갖는 신규 펩타이드 및 이의 용도 |
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2012
- 2012-05-17 KR KR1020120052556A patent/KR20130128663A/ko not_active Application Discontinuation
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Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR20180093391A (ko) * | 2017-02-13 | 2018-08-22 | 고려대학교 세종산학협력단 | 단백질 발현량 및 가용성 증가 활성을 갖는 신규 펩타이드 및 이의 용도 |
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E90F | Notification of reason for final refusal | ||
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