KR20060106790A - 실시간 핵산 증폭 데이터로부터 초기 핵산 농도를정량화하는 방법 - Google Patents
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- (a) 핵산을 증폭하는 단계;(b) 상기 핵산의 증폭 사이클 수 또는 증폭 시간에 따라 실시간으로 나타나는 상기 증폭 사이클 또는 증폭 시간 동안의 증폭 효율을 나타내는 함수를 생성하는 단계;(c) 상기 함수를 이용하여 상기 증폭 효율의 최대 값에 해당하는 증폭 사이클 수 또는 증폭 시간을 산출하는 단계; 및(d) 상기 산출한 증폭 사이클 수 또는 증폭 시간으로부터 상기 핵산의 초기 농도를 구하는 단계;를 포함하는 것을 특징으로 하는 초기 핵산 농도를 정량화하는 방법.
- 제 1항에 있어서, 상기 (a) 단계는,효소를 이용하여 상기 핵산을 증폭하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 초기 핵산 농도를 정량화하는 방법.
- 제 1항에 있어서, 상기 (a) 단계는,열적 사이클(Thermal cycling)을 필요로 하는 핵산 증폭 방법에 의해 상기 핵산을 증폭하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 초기 핵산 농도를 정량화하는 방법.
- 제 1항에 있어서, 상기 (a) 단계는,등온(isothermal) 핵산 증폭 방법에 의해 상기 핵산을 증폭하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 초기 핵산 농도를 정량화하는 방법.
- 제 6항에 있어서,상기 Rb는 초기 형광 신호의 세기에 해당하는 값인 것을 특징으로 하는 초기 핵산 농도를 정량화하는 방법.
- 제 6항에 있어서,상기 Rb는 첫 번째 증폭 사이클에서의 형광 신호의 세기(R1)인 것을 특징으로 하는 초기 핵산 농도를 정량화하는 방법.
- 제 6항에 있어서,상기 Rb는 상기 핵산의 증폭 사이클 수 또는 증폭 시간에 따라 실시간으로 나타나는 상기 핵산의 증폭 양에 따른 형광 신호 사이의 상관관계를 나타내는 함수로부터 구한 상기 핵산의 배경 형광 신호의 세기인 것을 특징으로 하는 초기 핵산 농도를 정량화하는 방법.
- 제 6항에 있어서,상기 Rb는 상기 증폭 효율의 최대값이(En)이 1이 되도록 하는 값인 것을 특징으로 하는 초기 핵산 농도를 정량화하는 방법.
- 제 1항에 있어서, 상기 (c) 단계는,상기 함수로부터 curve fitting을 이용하여 상기 최대 증폭 효율에 해당하는 증폭 사이클 수 또는 증폭 시간을 산출하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 초기 핵산 농도를 정량화하는 방법.
- 제 11항에 있어서, 상기 curve fitting은,n차 다항식(n은 2 이상의 정수)을 사용하는 것을 특징으로 하는 초기 핵산 농도를 정량화하는 방법.
- 제 11항에 있어서, 상기 curve fitting은,sine 함수나 cosine 함수를 사용하는 것을 특징으로 하는 초기 핵산 농도를 정량화하는 방법.
- 제 11항에 있어서, 상기 curve fitting은,Gaussian 분포 함수를 사용하는 것을 특징으로 하는 초기 핵산 농도를 정량 화하는 방법.
- 제 11항에 있어서, 상기 curve fitting은,Cubic spline 보간 방법을 사용하는 것을 특징으로 하는 초기 핵산 농도를 정량화하는 방법.
- 제 1항에 있어서, 상기 (d) 단계는,최대 증폭 효율에 해당하는 증폭 사이클 수 또는 증폭 시간과 핵산의 초기 농도와의 관계를 나타내는 보정 곡선을 이용하여 상기 (c) 단계에서 산출한 증폭 사이클 수 또는 증폭 시간으로부터 상기 핵산의 초기 농도를 구하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 초기의 핵산 농도를 정량화하는 방법.
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