KR20030062430A - 운반체가 없는 전기영동 방법 및 이러한 방법을 수행하기위한 전기영동 디바이스 - Google Patents

운반체가 없는 전기영동 방법 및 이러한 방법을 수행하기위한 전기영동 디바이스 Download PDF

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Abstract

본 발명은 샘플 물질을 분석물질로 분리하기 위한 자유 유동의 전기영동 방법에 관한 것이다. 상기 방법은 수개의 단계, 즉 샘플 물질의 거친 분별을 위한 제 1 단계와, 거칠게 분별된 샘플 물질이 미세하게 분별되는 하나 이상의 제 2 단계를 포함한다. 이들 단계는 병렬 동시 방법, 직렬 방법, 또는 이들 방법의 조합으로 수행될 수 있다.

Description

운반체가 없는 전기영동 방법 및 이러한 방법을 수행하기 위한 전기영동 디바이스{FREE FLOW ELECTROPHORESIS METHOD AND ELECTROPHORESIS DEVICE FOR CARRYING OUT THIS METHOD}
그러나 이러한 FFE가 프로테오믹스(proteomics) 연구 영역에서 사용하려면, 최대의 분리 출력 및 샘플 물질의 가능한한 높은 처리율로, 짧은 기간안에 많은 수의 다른 샘플 물질을 분리시킬 수 있어야만 한다.
그러나, 대부분의 분리 방법의 경우와 같이, 분리 성능과 샘플 처리량을 고려한 전기영동 디바이스의 동시 최적화는 FFE의 경우 매우 좁은 한계 내에서만 가능한데, 그 이유는 샘플 물질 양의 증가가 분리 성능의 감소를 초래하기 때문이다.
더욱이, 분리 성능의 최적화는, 가능한한 좁고 정확한 분리 챔버 간극을 갖는 분리 공간을 필요로 하고, 또한 예컨대 상대적으로 낮은 선형 유동율, 가능한한 긴 분리 기간, 그리고 관심 대상의 샘플 물질이 분별되려하는 분리 공간의 영역 및/또는 분리 공간의 전체 폭에 걸쳐 가능한한 많은 분별 사이트(fractionation sites)와 같은 특별한 분리 경계 조건을 필요로 한다. 그러나, 선형 유동율은 뜻대로 줄어들 수 없으므로, 분리 시간의 연장은 대응하는 전극 길이의 증가를 필요로한다. 이것은 차례로 분리 챔버의 외측 크기가 동시에 증가될 필요가 있고, 따라서 원하는 정확도를 갖는 분리 챔버 간극의 제조를 어렵게 하거나 불가능하게 한다.
독일특허(DE 2 215 761 A1)로부터, 전기여과 방법에 따라 동작하는 전기영동 디바이스가 알려졌다. 알려진 전기영동 디바이스에는 하나의 분리 챔버, 상기 분리 챔버의 양측에 배열된 전극, 분별 사이트 및 샘플 입력 사이트(input site)가 장착되고, 상기 분리 챔버를 서로 연결된 많은 수의 분리 공간으로 분할하는 수개의 막이 상기 분리 챔버 내에 제공된다. 상기 막은 필터로 작용하고, 각 경우에 분리제거될 종(species)에 대해 투과성이다.
유럽특허(EP 0 203 713 A2)로부터, 이러한 전기영동 디바이스의 경우, 막으로 경계가 지워지는 각 분리 공간을 위한 분리된 전극 쌍을 제공하는 것이 또한 알려졌다.
결과적으로, 본 발명의 목적은, 증가된 분리 성능, 짧은 분리 시간 및 더 큰 처리량이 달성될 수 있도록 하는, 운반체 없는 전기영동 방법과 이러한 방법을 수행하기 위한 전기영동 디바이스를 생성하는 것이다.
본 발명은 샘플 물질을 분석물질로 분리하기 위한 운반체 없는 전기영동 방법 및 이러한 방법을 수행하기 위한 전기영동 디바이스에 관한 것이다.
알려진 운반체가 없는 FFE(free flow electrophoresis) 전기영동 방법은 일반적으로, 오직 두개의 분리 전극 공간과 이들 전극 공간 사이의 오직 하나의 분리 공간만이 제공되는 분리 챔버를 구비한 전기영동 디바이스로 동작한다.
도 1, 도 2 및 도 3은 본 발명의 3 개의 실시예의 분리 챔버 설계를 개략적으로 도시하는 도면.
도 4및 도 5는 본 발명의 일실시예의 경우, 분리 챔버의 단면을 개략적으로 도시하는 도면.
도 6및 도 7은 매체 공급 및 분별 영역에서 분리 챔버의 전면부와 분리 챔버의 후면부의 구조를 각각 도시하는 도면.
도 8, 도 9 및 도 10은 다른 분별 사이트와 교차-유동 공급 라인의 상대적인 공간 배치를 도시하는 도면.
도 11, 도 12 및 도 13은 교차-유동에 의한 유동 프로파일의 영향을 도시하는 도면.
* 도면의 부호 설명 *
---> -- -> - - ->
매체 입구 분별 출구 다음 단계를 위한 부분 흐름
이러한 목적은 청구항 1항에 자세히 기술된 운반체 없는 전기영동 방법에 의해 본 발명에 따라 달성된다.
본 발명에 따른 방법의 특별히 바람직한 추가의 개선점 및 실시예는 청구항 2항 내지 5항의 요지이다.
본 발명에 따른 전기영동 디바이스는 청구항 6항의 요지이다.
본 발명에 따른 전기영동 디바이스의 특별히 바람직한 추가의 개선점 및 실시예는 청구항 7항 내지 12항의 요지이다.
본 발명에 따라, 분리 성능과 샘플 처리량의 동시 최적화에 단일 단계의 분리 방법 대신에 2 단계의 분리 방법이 사용되는데, 이 방법은 가능한한 높은 샘플 처리량을 목적으로 하는 매우 빠른 예비 분리, 즉 거친 분별을 달성하고, 후속적으로 하나 이상의 제 2 단계에서 샘플 물질의 거칠게 분별된 부분 스트림의 목표가 되는 미세 분별을 달성한다.
거친 분별의 제 1 단계에서 샘플 처리량의 증가는, 특히 FFE를 통해 증가된 선형 유동률과, 분석물질이 분리되기 위해 동시에 짧아진 이동 경로로 분리 방법을 수행함으로써 달성된다. 이러한 관점에서, 거친 분별을 위한 분별 사이트(fractionation site)의 수는 상당히 줄어들 수 있고, 오직 하나의 분별이 관심 대상일 경우 단일 분별 사이트가 제공된다. 이러한 2 단계의 방법이 병렬의 동시 다중 방법의 형태로 수행된다면, 추가의 샘플 처리율 증가가 가능하다.
이하에서, 본 발명의 바람직일실시예가 대응하는 도면을 통해 보다 상세하게기술된다.
도 1, 도 2 및 도 3에 있어서, 본 발명에 따른 분리 챔버의 세 가지 예가 전기영동 디바이스의 다른 실시예에 대해 개략적으로 도시되었다. 분리 챔버가 분리 챔버 간극이 필요한 정확도로 제작될 수 있도록 허용하는, 일정한 외측 크기를 갖기 위해서, 수 개의 개별적인 분리 공간이 분리 챔버 내에 제공된다. 도 1에 따라, 4개의 개별적인 분리 공간에는 4개의 개별적인 매체 공급부와, n 개의 분별 사이트를 갖는 4개의 개별적인 분별부가 각각 제공되는데, 여기서 n은 15보다 적다. 도 2는 2개의 개별적인 분리 공간과, 각각 n 개의 분별 사이트를 갖는 2개의 개별적인 분별부를 위한 2개의 개별적인 매체 입구부를 구비한 분리 챔버를 도시하는데, 여기서 n은 50보다 크다. 마지막으로, 도 3은 3 개의 개별적인 분리 공간, 3 개의 개별적인 매체 입구부, n1 및 n3 개의 분별 사이트를 갖는 2 개의 개별적인 분별부(n1은 15보다 적고, n3은 50보다 크다), 및 n2개의 분별 사이트를 갖는 하나의 개별적인 추가 분별부(n2는 15보다 크다)를 구비하는 하나의 분리 챔버를 도시한다.
설계에 따라, 도 1 내지 도 3에 도시된 분리 공간에는 개별적인 전극 또는 해당 전극 공간에서 동일한 매체가 사용될 수 있다면 인접 분리 공간과 공통인 전극이 장착된다.
도 1 내지 도 3에 도시된 분리 챔버를 통해, 샘플 물질을 이들의 분석 물질로 분리시키기 위하여 운반체 없는 FFE 전기영동은 적어도 2 단계 방법의 형태로, 즉 제 1 단계에서 일어나는 샘플 물질의 거친 분별과 하나 이상의 제 2 단계에서 일어나는 거칠게 분별된 샘플 물질의 미세 분별의 형태로 수행될 수 있다.
이러한 방법은 병렬의 동시 동작 또는 직렬 동작으로 수행될 수 있고, 병렬동시 동작에서, 도 1 및 도 2에 도시된 분리 공간을 거친 분별을 위한 분리 공간(도 1)으로서와, 미세 분별을 위한 분리 공간(도 2)으로서 사용하는 것이 가능하다. 도 3은, 직렬인 거친 분별부가 2 단계인 미세 분별부와 결합된 3단계의 방법 형태인 직렬 동작을 위한 분리 공간을 도시한다.
병렬 동작 방법의 경우, 단일 샘플 물질이 수 개의 분리 공간으로 동시에 계량 주입되거나, 또는 다른 샘플 물질이 별도의 분리 공간으로 주입될 수 있다. 병렬 동시 방법에서 샘플 물질의 분리는 샘플 물질 처리 비율 또는 샘플 물질의 수를 증가시킬 수 있게 한다.
개별적인 분리 공간의 폭을 줄임으로써, 분석물질의 이동 경로는 짧아질 수 있고, 상기 분리 방법은 분리 매체 및 샘플 물질의 더 높은 유동율로 수행될 수 있다. 분리 공간의 수가가 증가함에 따라, 결과적으로 분리 공간의 폭은 충분히 더 작아지지만, 더 높은 샘플 처리량을 얻는다 할지라도 오직 하나의 거친 분별만이 가능하다.
분리 공간이 완전히 개별적인 전극 공간과 직렬로 연결된다면, 하나의 분리 공간 내의 분리에 의해 얻어진 분획물은, 동일한 분리 조건하의 후속하는 분리 공간 내에서 추가로 분별되고, 이는 더 높은 분리 산출을 달성할 수 있게 한다. 그러나, 직렬로 연결된 분리 공간에 있어서, 분리 기술, 분리 매체 및/또는 사용된 일반적인 전기영동 분리 파라미터를 고려한 다른 조건 하에서 분리 동작이 이루어질 수도 있다.
개별적인 분리 공간의 분리 공간 및 기술 설계는 다음에 기술되는 바와 같이상술한 구조를 통해 거의 뜻대로 결합될 수 있다.
도 4 및 도 5에 도시된 바와 같이, 하나의 분리 챔버는 주로 두개의 하위 조립체, 즉 분리 챔버의 전면부와 분리 챔버의 후면부로 이루어진다. 그러나, 본 발명에 따른 설계의 경우, 개별적인 하위 조립체는 도 4 및 도 5에 개략적으로 도시된 수개의 개별적인 구조 요소로 이루어진다.
자세히 보면, 도 4에 도시된 경우에 있어서, 강성 합성 수지 시트(2)와 유연 합성 수지 시트(3)를 갖는 합성 수지 블록(1)로 이루어진 분리 챔버의 전면부와, 글래스 시트(10)와 유연 합성 수지 시트(11)를 갖는 금속 블록(8)로 이루어진 분리 챔버의 후면부는 스페이서(5)를 사이에 두고 인접하여 배치된다. 합성 수지 블록(1)에 있어서, 수개(도시된 실시예에서는 4개)의 전극 공간(4)이 제공된다. 금속 블록(8)에는 냉각 파이프(9)가 제공된다. 덧붙여, 매체 입구부(7)와 많은 수의 분별 사이트(6)이 제공된다. 도 5는 사전 분별된 샘플의 전달(12)을 도시한다.
도 4의 분리 챔버의 전면부의 하위 조립체는 결과적으로 기본 빌딩 블록, 즉 매체 공급부와 분별부의 특정 방법 모듈을 위한 개구부와 8개까지의 전극 공간(4)이 수용되는 플렉시글라스(plexiglass)의 고체 블록(1)으로 구성된다. 이러한 기본 빌딩 블록(1)에는 강성 합성 수지 재질의 얇은 시트(2)가 제공되고, 상기 시트(2)는 관련된 응용을 위하여 필요한 합성 수지 블록(1)의 전극 공간 영역에서의 흐름을 전달하기 위하여, 또한 필요한 합성 수지 블록(1)의 전극 공간을 폐쇄하지 않기 위하여 개구부를 제공한다. 매체 공급부(7)와 분별부(6)의 영역에서 강성 합성 수지 시트(2)의 설계에도 동일하게 적용된다. 분리 공간과 접하는 강성 합성 수지 시트(2)의 표면은 직접 화학적으로 변형되거나, 도시된 방식으로 합성 수지 시트(3)에 의해 덮힐 수 있는데, 분리 공간의 직접적인 경계를 형성하는 상기 합성 수지 시트(3)의 표면은 샘플종의 전기삼투와 수착이 최소화되는 정도로 화학적으로 변형된다.
기술된 바와 같이, 기본 빌딩 블록, 즉 합성 수지 블록(1)을, 특정 응용에 적합하도록 변경되는 두 개의 합성 수지 시트(2, 3)와 조합함으로써, 요구되는 분리 단계의 수, 분리 공간의 기하학 및 특별한 전기영동 경계 조건을 고려한 상술한 모든 요건은 관련 분리 방법의 단계에서 충족될 수 있다.
도 6 및 도 7에 있어서, 분리 챔버의 전면부와 분리 챔버의 후면부의 구조가 상세하게 도시된다. 도 7에 도시된 바와 같이, 분리 챔버의 후면부는 수개의 층, 즉 금속 블록(8), 글래스 시트(10) 및 유연 합성 수지 시트(11)로 이루어진다. 이들 층은 관련 응용을 위하여 분리 디바이스를 최적화하기 위하여 다른 방법으로 결합될 수 있다.
분리 챔버의 후면부의 기본 빌딩 블록은 결과적으로, 외부 냉각부와 결합하여 전기영동 분리 도중에 생성된 열을 효과적으로 제거할 수 있도록 하는 고체 금속 블록(8)이 된다. 분리 공간과 접하는 금속 블록(8)의 표면은 글라스 또는 세라믹 시트의 전기적으로 절연된 얇은 시트(10)로 덮이고, 이러한 전기 절연 시트는 합성 수지 시트(11)로 덮이며, 직접 분리 공간의 경계를 형성하는 합성 수지 시트(11)의 표면은 분리 방법의 최적화가 달성되도록 화학적으로 변경된다. 일반적으로, 분리 공간과 접하는 합성 수지 시트, 즉 시트(3 및 11)는 재질과 화학적 변경유형에 관해 동일하거나 유사하지만, 특정 방법의 결합의 경우 다를 수도 있다.
도 8, 도 9 및 도 10에 있어서, 본 발명에 따른 방법에 사용될 수 있는, 다른 분별 모듈이 도시된다. 표준 설계에 있어서, 도 8의 분별 모듈은 분별을 위한 3 개의 출구부를 포함하고, 도 9 및 도 10에 각각 도시된 바와 같이, 특별한 응용의 경우에 5개 및 7개의 분별 출구부가 제공된다. 이들 도면에 있어서, 분리 매체의 유동 방향은 화살표(13)에 의해 표시되고, 교차-유동을 위한 공급 사이트(14), 샘플 물질을 위한 n개의 분별 사이트(15) 및 나머지 매체를 위한 n+1개의 출구부(16)가 도시된다.
동작 동안에, 계량 펌프의 동일한 전달율을 갖는 두 개의 개별적인 컨베이어 채널이 전극 근처의 분별 출구부의 영역에서 각각 분리 공간과 연결되고, 컨베이어 펌프의 회전에 따라 매체는 전극 근처의 분리 공간과의 연결부를 통해 주입되며, 이와 동시에 동일한 체적율로 제 2 연결부를 통해 분리 공간으로부터 배출된다. 전극 근처의 분리 공간에서 매체의 동시 주입과 배출의 결과, 도 11, 도 12 및 도 13에 도시된 것과 같이 유동 프로파일은 샘플의 분별 사이트의 영역에서 변경된다.
도 11은 두 개의 분석물질(17, 18), 교차-유동을 위한 펌프(21), 교차-유동을 위한 공급 라인(20) 및 유동 프로파일을 위한 마스크(19)를 도시한다. 도 11에 있어서, 교차-유동이 없는 유동 프로파일이 도시되고, 도 12는 교차-유동이 시작된 상태에서의 프로파일을 도시하고, 도 13은 교차-유동이 시작되었지만 펌프(21)의 회전방향과 반대방향인 유동 프로파일을 도시한다.
다음의 기술에 있어서, 긴 기간의 예비 테스트, 즉 두 가지 전형적인 다른응용을 위한 분별 모듈의 동작이 기술된다.
희망하는 임의의 분리된 물질의 예비 분리 도중에, 2-채널 펌프의 전달율은, 분리될 물질이 이러한 목적을 위해 제공된 샘플 출구부를 통해 수집될 수 있도록 선택된다. 2-채널 펌프의 전달율은 예비 분리 지속시간을 통해 변하지 않고 유지된다. 샘플 분별 라인에서 배출되는 분석물질이 오직 약간의 시간 지연으로 정량적으로 검출될 수 있다면, 분리방법을 제어하기 위한 검출 신호는, 분석물질이 최적의 수율과 순도로 분리될 수 있도록, 사용될 수 있다.
그러나, 펌프의 전달율이 전기영동 분리 방법 도중에 연속적으로 변한다면, 번갈아 분리된 물질은 샘플 분별 사이트를 통해 수집된다. 전달율을 변화시키고, 2-채널 펌프의 회전을 변화시킴으로써, 분리된 모든 종은 분별 사이트를 통해 연속하여 추출되고, 후속하여 수집 용기의 시간-제어 또는 피크-제어 변경을 하는 분획물 수집기 및 검출 시스템에 전달될 수 있다.
샘플 분별 사이트의 방향에서 샘플 밴드의 20 mm 이상의 국부적인 변위를 달성하려면, 샘플 분별 출구부의 수를 증가시키는 것이 추천되는데, 샘플의 최적의 추출 품질을 허용하기 위하여 분리 공간 폭의 더 높은 값을 가지고 뜻대로 이러한 수를 증가시키는 것이 가능하다.

Claims (12)

  1. 샘플 물질을 분석물질(analytes)로 분리하기 위한 운반체 없는 전기영동(carrierless electrophoresis) 방법에 있어서,
    제 1 단계에서, 상기 샘플 물질의 거친 분별이 수행되고, 하나 이상의 제 2 단계에서 상기 거칠게 분별된 샘플 물질의 미세 분별이 수행되는 것을 특징으로 하는 운반체 없는 전기영동 방법.
  2. 제 1항에 있어서, 상기 제 1 단계에서, 분리될 상기 분석물질의 높은 선형 유동율과 짧은 이동 경로가 사용되는 것을 특징으로 하는 운반체 없는 전기영동 방법.
  3. 제 1항 또는 제 2항에 있어서, 상기 제 1 단계에서, 상기 제 2 단계에서 보다 더 적은 수의 분별 사이트(fractionation sites)가 사용되는 것을 특징으로 하는 운반체 없는 전기영동 방법.
  4. 제 1항 내지 제 3항 중 어느 한 항에 있어서, 모든 단계가 병렬로 동시에 수행되는 것을 특징으로 하는 운반체 없는 전기영동 방법.
  5. 제 1항 내지 제 3항 중 어느 한 항에 있어서, 병렬 동시 방법에서의 단계의 실행은 적어도 한 단계의 직렬 실행과 결합되는 것을 특징으로 하는 운반체 없는 전기영동 방법.
  6. 분리 챔버, 전극, 분별부 및 샘플 입력부를 포함하는, 제 1항 내지 제 5항 중 어느 한 항의 방법을 수행하기 위한 전기영동 디바이스에 있어서,
    상기 분리 챔버는, 개별적인 전극, 개별적인 분별부 및 개별적인 샘플 입력부를 각각 갖는 많은 수의 개별적인 분리 공간으로 분할되는 것을 특징으로 하는 전기영동 디바이스.
  7. 제 6항에 있어서, 인접 분리 공간을 위한 공통 전극이 제공되는 것을 특징으로 하는 전기영동 디바이스.
  8. 제 6항 또는 제 7항에 있어서, 상기 개별적인 분별부는 다른 수의 분별 사이트를 구비하는 것을 특징으로 하는 전기영동 디바이스.
  9. 제 1항 내지 제 8항 중 어느 한 항에 있어서, 매체를 주입하고 이와 동일한 체적의 매체를 배출하기 위하여, 하나의 개량 펌프로 이루어진 2개의 개별적인 전달 채널이 전극 근처의 분별 출구부의 영역에서 상기 분리 공간과 연결되는 것을 특징으로 하는 전기영동 디바이스.
  10. 제 1항 내지 제 9항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 분리 챔버는, 각각 수개의 개별적인 구조의 챔버 요소로 이루어진 전면부와 후면부로 구성되는 것을 특징으로 하는 전기영동 디바이스.
  11. 제 10항에 있어서, 상기 후면부는 고체 금속 블록으로 이루어지는 것을 특징으로 하는 전기영동 디바이스.
  12. 제 11항에 있어서, 냉각 파이프가 상기 금속 블록 내에 제공되는 것을 특징으로 하는 전기영동 디바이스.
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