KR101811731B1 - Met 저해제에 대한 감수성 예측용 신규한 바이오 마커 및 이의 용도 - Google Patents
Met 저해제에 대한 감수성 예측용 신규한 바이오 마커 및 이의 용도 Download PDFInfo
- Publication number
- KR101811731B1 KR101811731B1 KR1020150107604A KR20150107604A KR101811731B1 KR 101811731 B1 KR101811731 B1 KR 101811731B1 KR 1020150107604 A KR1020150107604 A KR 1020150107604A KR 20150107604 A KR20150107604 A KR 20150107604A KR 101811731 B1 KR101811731 B1 KR 101811731B1
- Authority
- KR
- South Korea
- Prior art keywords
- met
- igsf1
- inhibitor
- cancer
- expression
- Prior art date
Links
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
- C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/33—Heterocyclic compounds
- A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
- A61K31/40—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having five-membered rings with one nitrogen as the only ring hetero atom, e.g. sulpiride, succinimide, tolmetin, buflomedil
- A61K31/403—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having five-membered rings with one nitrogen as the only ring hetero atom, e.g. sulpiride, succinimide, tolmetin, buflomedil condensed with carbocyclic rings, e.g. carbazole
- A61K31/404—Indoles, e.g. pindolol
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/70—Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
- A61K31/7088—Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/70—Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
- A61K31/7088—Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
- A61K31/713—Double-stranded nucleic acids or oligonucleotides
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P1/00—Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
- A61P1/04—Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system for ulcers, gastritis or reflux esophagitis, e.g. antacids, inhibitors of acid secretion, mucosal protectants
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P11/00—Drugs for disorders of the respiratory system
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
- A61P35/02—Antineoplastic agents specific for leukemia
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
- C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
- C12N15/1138—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing against receptors or cell surface proteins
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y207/00—Transferases transferring phosphorus-containing groups (2.7)
- C12Y207/10—Protein-tyrosine kinases (2.7.10)
- C12Y207/10001—Receptor protein-tyrosine kinase (2.7.10.1)
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
- G01N33/57484—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer involving compounds serving as markers for tumor, cancer, neoplasia, e.g. cellular determinants, receptors, heat shock/stress proteins, A-protein, oligosaccharides, metabolites
- G01N33/57492—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer involving compounds serving as markers for tumor, cancer, neoplasia, e.g. cellular determinants, receptors, heat shock/stress proteins, A-protein, oligosaccharides, metabolites involving compounds localized on the membrane of tumor or cancer cells
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/10—Type of nucleic acid
- C12N2310/14—Type of nucleic acid interfering N.A.
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/10—Type of nucleic acid
- C12N2310/14—Type of nucleic acid interfering N.A.
- C12N2310/141—MicroRNAs, miRNAs
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/50—Physical structure
- C12N2310/53—Physical structure partially self-complementary or closed
- C12N2310/531—Stem-loop; Hairpin
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2320/00—Applications; Uses
- C12N2320/30—Special therapeutic applications
- C12N2320/31—Combination therapy
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/106—Pharmacogenomics, i.e. genetic variability in individual responses to drugs and drug metabolism
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/158—Expression markers
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
- G01N2333/435—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans
- G01N2333/705—Assays involving receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
- G01N2333/70503—Immunoglobulin superfamily, e.g. VCAMs, PECAM, LFA-3
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Public Health (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Immunology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Oncology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Pathology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Hospice & Palliative Care (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Pulmonology (AREA)
Abstract
본 발명은 MET 저해제에 대한 감수성 예측용 신규한 바이오 마커 및 이의 용도에 관한 것으로, 보다 상세하게는, IGSF1(Immunoglobulin Superfamily member 1, NM_001555.2) 유전자를 포함하는 MET 저해제에 대한 감수성 예측용 바이오 마커; 상기 바이오 마커 유전자 발현 수준 또는 이의 단백질의 발현 수준을 측정하는 제제를 포함하는 MET 저해제에 대한 감수성 예측용 조성물; 상기 바이오 마커 유전자의 발현 또는 상기 유전자의 단백질의 발현 또는 활성을 억제하는 억제제를 유효성분으로 포함하는 MET 신호전달 경로의 조절이상과 관련된 질환의 치료용 약학적 조성물; 상기 조성물을 포함하는 MET 저해제에 대한 감수성 예측용 키트; 및 MET 저해제에 대한 감수성 예측 방법을 제공한다. 본 발명에 따르면, 본 발명은 위암 또는 폐암에서의 MET 저해제제에 대한 감수성 예측 효과가 우수하므로, 본 발명은 위암 또는 폐암 치료에 유용하게 이용될 수 있다.
Description
본 발명은 MET 저해제에 대한 감수성 예측용 신규한 바이오 마커 및 이의 용도에 관한 것이다.
일반적으로 항암 요법에서, 항암제를 투여하였을 때의 생체의 반응성은 약제의 표적이 되는 암세포의 이 약제에 대한 감수성에 크게 의존한다. 이러한 암세포의 약제에 대한 감수성은, 암세포마다 크게 상이하다. 이러한 감수성의 차이는, 이 약제의 표적 분자 또는 이에 관련하는 인자의 양적 또는 질적 차이, 또는 약제 내성의 획득 등에 기인한다. 이러한 배경을 근거로, 표적이 되는 암세포가 약제에 대하여 감수성을 나타낼 경우에 특이적으로 나타나는 암세포의 유전적 변화를 확인할 수 있다면, 조기에 약제의 효과 판정, 치료법의 확립, 새로운 치료법의 선택 등이 가능해져 대단히 유익하다. 또한, 치료에 앞서 생체 조직편 등에 의해 취득된 암 조직에서, 통상의 방법에 따라 암세포를 분리한 후 약제 처리를 실시하여, 이 암세포가 약제 감수성인지 여부를 상기 변화에 의해 측정하면, 이 약제에 의한 치료가 유효한지 여부를 미리 예측할 수 있기 때문에 임상적으로 매우 유용하다.
즉, 이러한 항암제는 내성과 독성에 관해서 개인차가 크며 동일한 환자에서도 약 반수이상에서 내성을 보이는 문제가 있으므로 적합한 치료반응성 표식자를 이용한 선별은 항암제 치료의 획기적인 진보를 초래할 수 있다.
이에, 특정 유전자에 따른 개별 항암제의 치료반응성에 관한 연구가 최근 지속적으로 활발하게 전개되고 있다.
그러나 특정약제에 대한 생체반응 관련요소의 복합적 작용, 치료제 및 투여방식의 다양성과 방대한 시료확보의 어려움으로 아직 괄목할 만한 성과가 미약한 현실이다.
한편, 세포 조절이 실시되는 주요 메커니즘 중 하나는, 세포 내에서 생화학적 경로를 차례로 조정하여 세포밖 신호들을 전달하는 것이다. 단백질 인산화란, 분자에서 분자까지 세포내 신호들을 전달시켜 최종적으로 세포 반응을 도모하는 하나의 과정을 나타낸다. 이들 신호 전달 연속단계는 다수의 단백질 키나제 뿐만 아니라 인산분해효소의 존재에서 명백히 드러나듯이 고도로 조절되고 종종 중복된다. 인산화는 세포 내에 상당히 편재되어 있는 과정이고, 세포의 표현형은 이러한 경로의 활성도에 의해 크게 영향받기 때문에, 현재, 대다수의 질병 상태 및/또는 질병은 키나제 연속단계의 분자 성분들에서의 비정상 활성화 또는 기능성 돌연변이에 기인한 것으로 여겨지고 있다(Weinstein-Oppenheimer et al. Pharma. &. Therap., 2000, 88, 229-279).
그 중 MET(c-MET)은 세포 표면에 존재하는 대표적인 수용체 타이로신 카이네이즈(Receptor Tyrosine Kinase; RTK)로써 많은 종류의 암에서 과발현되고 있으며, 특히 MET의 과발현이 있는 환자들은 암의 치료 예후가 나쁜 경우가 대부분이다.
암에서의 이러한 MET 신호 전달은 두 가지 방법으로 활성화 될 수 있다: (i) MET 활성화는 그 리간드인 간세포성장인자(Hepatocyte Growth Factor; HGF)와 결합하여 세포 내 신호전달을 촉진하는 HGF-의존적 메커니즘; 또는 (ii) MET 유전자의 증폭 또는 MET 유전자의 돌연변이와 같은 HGF-비의존적 메커니즘에 의해서 매개된다.
그러나, 일반적으로 MET를 타겟으로 하여 개발된 대부분의 저해제들은 HGF-의존적 메커니즘에 의한 MET 활성화에 초점을 맞춰 진행된 것이며, 현재 HGF-비의존적 메커니즘으로 매개된 MET 활성화로 인해 발생된 암과 같은 질환에 대한 바이오 마커를 활용한 치료법은 알려진 바가 없다.
이러한 상황 하에서, 본 발명자들은 HGF-비의존적 메커니즘에 의해 매개된 MET 활성화로 인한 암에서 MET 저해제에 대한 감수성을 예측할 수 있는 바이오 마커를 개발하기 위하여 예의 노력하였다. 그 결과, 위암 및 폐암에서의 MET 저해제에 대한 감수성을 예측하는 바이오 마커로서 IGSF1 및 MET 유전자 및/또는 단백질의 발현 양상을 분석하였고, 위암 및 폐암 세포주에서 IGSF1 및 MET 유전자를 억제시켰을 때 암세포의 생존율, 전이성 및 이동성이 유의하게 감소한 것을 확인함으로써, 본 발명을 완성하였다.
따라서, 본 발명의 목적은 MET 저해제에 대한 감수성 예측용 바이오 마커를 제공하는 데 있다.
또한, 본 발명의 다른 목적은 MET 저해제에 대한 감수성 예측용 조성물을 제공하는 데 있다.
또한, 본 발명의 또 다른 목적은 MET 저해제에 대한 감수성 예측용 키트를 제공하는 데 있다.
또한, 본 발명의 또 다른 목적은 MET 저해제에 대한 감수성 증진제를 제공하는 데 있다.
또한, 본 발명의 또 다른 목적은 MET 저해제에 대한 감수성 예측 방법을 제공하는 데 있다.
또한, 본 발명의 또 다른 목적은 MET 저해제에 대한 감수성 증진 방법을 제공하는 데 있다.
또한, 본 발명의 또 다른 목적은 MET 신호전달 경로의 조절이상과 관련된 질환의 예방 또는 치료용 약학적 조성물을 제공하는 데 있다.
이하, 본 발명에 대하여 보다 상세히 설명한다.
본 발명의 일 양태에 따르면, 본 발명은 IGSF1(Immunoglobulin Superfamily member 1, NM_001555.2) 유전자를 포함하는, MET 저해제에 대한 감수성 예측용 바이오 마커를 제공한다.
본 발명의 가장 큰 특징은 IGSF1 유전자 및 이의 산물인 단백질을 바이오 마커로 이용하여 MET 저해제에 대한 감수성을 예측하는 것이다.
본 발명의 바이오 마커는 MET 저해제인 항암제에 대한 감수성의 지표가 될 수 있으며, 항암제에 대한 감수성 마커로서의 정확성 및 신뢰도도 탁월하므로 암의 발생, 발전 및/또는 전이의 치료에 이용될 수 있다.
본 명세서에서 사용되는 용어 "감수성"은 개개의 환자의 암에 대하여 특정약물이 효과를 나타내는 지 여부를 의미한다.
예컨대, 상기 특정약물은 주로 항암제이며, 이들 항암제에는 암의 종류에 따라 효과를 나타내는 경우와 효과를 나타내지 않는 경우가 있다. 또한, 유효한 것으로 인정되고 있는 종류의 암이어도, 개개의 환자에 따라 효과를 나타내는 경우와 효과를 나타내지 않는 경우가 있는 것이 알려져 있다. 이와 같은 개개의 환자의 암에 대해 항암제가 효과를 나타내는 지 여부를 항암제 감수성이라고 한다. 따라서, 본 발명에 따라 치료 개시 전에 효과를 기대할 수 있는 환자(반응자)와, 효과를 기대할 수 없는 환자(무반응자)를 예측할 수 있으면, 유효성과 안전성이 높은 화학 요법이 실현될 수 있다.
본 명세서에서 사용되는 용어 "예측"은 본원에서 대상 환자가 약물 또는 약물 세트에 대해 유리하게 또는 불리하게 반응할 가능성을 지칭하는데 사용된다. 한 실시양태에서, 예측은 이러한 반응의 정도에 관한 것이다. 예컨대, 예측은 환자가 처치 후, 예를 들어 특정한 치료제의 처치 및/또는 원발성 종양의수술적 제거 및/또는 특정 기간 동안의 화학요법 후에 암 재발 없이 생존할 지의 여부 및/또는 그러할 확률에 관한 것이다. 본 발명의 예측은 대장암 환자에 대한 가장 적절한 치료 방식을 선택함으로써 치료를 결정하는데 임상적으로 사용될 수 있다. 본 발명의 예측은 환자가 치료 처치, 예컨대 주어진 치료적 처치, 예를 들어 주어진 치료제 또는 조합물의 투여, 수술적 개입, 화학요법 등에 유리하게 반응할 것인지 또는 치료적 처치 후에 환자의 장기 생존이 가능한 지의 여부를 예측하는데 있어서 유용한 도구이다.
또한, 본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 상기 MET는 HGF(Hepatocyte Growth Factor)-비의존적(independent)으로 활성화된 것이다.
MET 활성화는 그 리간드인 간세포성장인자(Hepatocyte Growth Factor; HGF)와 결합하여 세포 내 신호전달을 촉진하는 HGF-의존적 메커니즘; 또는 MET 유전자의 증폭 또는 MET 유전자의 돌연변이와 같은 HGF-비의존적 메커니즘에 의해서 매개된다. 본 발명의 MET는 HGF-비의존적 메커니즘에 의해서 활성화된 것으로서, HGF 유전자 및/또는 이의 산물인 단백질이 발현되지 않거나 저발현된다.
또한, 본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 상기 활성화는 IGSF1(Immunoglobulin Superfamily member 1) 및 MET(Mesenchymal-Epithelial Transition factor, NM_0011275000.1) 유전자의 동시 발현에 의해 MET 인산화가 유도된 것이다.
따라서, 본 발명에 따르면, 본 발명의 마커는 MET가 HGF-비의존적 메커니즘에 의해 활성화되는 경우 MET 저해제에 대한 감수성을 예측하는 것으로서, HGF가 고발현되는 암세포에는 소망하는 효과를 얻지 못하는 경우에 적용할 수 있다.
즉, 본 발명의 바이오 마커는 HGF 유전자 및/또는 이의 산물인 단백질이 발현되지 않거나 저발현되는 암세포 또는 암을 갖는 객체를 대상으로 하여, 세포 내 상기 유전자의 발현 수준을 확인한다.
본 발명의 다른 양태에 따르면, 본 발명은 IGSF1(Immunoglobulin Superfamily member 1, NM_001555.2) 유전자의 발현 수준; 또는 이의 단백질의 발현 수준을 측정하는 제제를 포함하는, MET 저해제에 대한 감수성 예측용 조성물을 제공한다.
본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 본 발명의 MET는 HGF-비의존적 메커니즘에 의해서 활성화된 것으로서, HGF 유전자 및/또는 이의 산물인 단백질이 발현되지 않거나 저발현된다.
또한, 본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 상기 활성화는 IGSF1(Immunoglobulin Superfamily member 1) 및 MET(Mesenchymal-Epithelial Transition factor, NM_001127500.1) 유전자의 동시 발현에 의해 MET 인산화가 유도된 것이다.
따라서, 본 발명에 따르면, 본 발명의 조성물은 MET가 HGF-비의존적 메커니즘에 의해 활성화되는 경우 MET 저해제에 대한 감수성을 예측하는 것으로서, HGF가 고발현되는 암세포에는 소망하는 효과를 얻지 못하는 경우에 적용할 수 있다.
또한, 본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 상기 MET 저해제는 ACTH(adrenocorticotropic hormone) 생성 종양, 급성 림프구성 또는 림프아구성 백혈병, 급성 또는 만성의 림포구성 백혈병, 급성 비림프구성 백혈병, 방광암, 뇌종양, 유방암, 경관암, 만성 골수성 백혈병, 림프종, 자궁내막증, 식도암, 방광암, 에윙스 육종(Ewing's sarcoma), 설암, 홉킨스 림프종, 카포시스 육종, 신장암, 간암, 폐암, 중피종, 다발성 골수종, 신경아세포종, 비홉킨 림프종, 골육종, 난소암, 유선암, 전립선암, 췌장암, 대장암, 페니스암, 레티노블라스토마, 피부암, 위암, 갑상선압, 자궁암, 고환암, 윌름스 종양 및 트로포블라스토마로 이루어진 군에서 선택된 1 종 이상의 암에 대한 치료제이다. 보다 바람직하게는 ACTH 생성 종양, 급성 림프구성 또는 림프아구성 백혈병, 급성 또는 만성의 림포구성 백혈병, 급성 비림프구성 백혈병, 방광암, 뇌종양, 유방암, 경관암, 만성 골수성 백혈병, 장암, T-존 림프종, 자궁내막증, 식도암, 담즙 방광암, 에윙스 육종(Ewing's sarcoma), 설암, 홉킨스 림프종, 카포시스 육종, 신장암, 간암, 폐암, 중피종, 다발성 골수종, 신경아세포종, 비홉킨 림프종, 골육종, 난소암, 신경아세포종, 유선암, 경관암, 전립선암, 췌장암, 대장암, 페니스암, 레티노블라스토마, 피부암, 위암, 갑상선압, 자궁암, 고환암, 윌름스 종양, 또는 트로포블라스토마이며, 가장 바람직하게는 폐암 또는 위암이다.
본 발명에서, 상기 MET 저해제는 항암제를 의미하며, 항암 효과를 나타내는 한, 어떠한 MET 저해제도 적용할 수 있으며, 바람직하게는 항-MET 항체, 유인 MET 수용체, MET 펩티드 길항제, 우성 네가티브 MET 돌연변이, MET 특이적 안티센스 올리고뉴클레오티드 및 리보자임, 및 선택적 소분자 MET 키나제 억제제로 이루어진 군에서 선택된 1 종 이상이다.
본 명세서에서 특별한 언급이 없는 한, 본 명세서에서 사용되는 표현 "유전자의 발현 수준; 또는 이의 단백질의 발현 수준 측정"은 해당 시료 내에서 검출하고자 하는 대상을 검출하는 것을 의미한다. 본 발명에서는, 그 검출하고자 하는 대상은 시료 내 해당 유전자의 mRNA 및/또는 단백질이다. 즉, 유전자의 전사 산물인 RNA 또는 유전자 산물인 단백질을 검출함으로써 상기 유전자의 발현 여부를 확인 할 수 있다.
RNA 또는 단백질의 검출은 통상적으로는 시료부터 RNA 또는 단백질을 추출하여, 추출물 중의 RNA 또는 단백질을 검출함으로써 실시할 수 있다. 이러한 RNA 또는 단백질의 검출은 면역분석학적 방법, 하이브리드화 반응 및 증폭반응에 의해 측정될 수 있으나, 이에 제한되지 않고 당업계에 공지된 다양한 기술을 이용하여 용이하게 실시될 수 있다.
또한, 본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 상기 유전자 발현 수준을 측정하는 제제는 상기 유전자의 mRNA에 특이적으로 결합하는 안티센스 올리고뉴클레오티드, 프라이머 쌍 또는 프로브를 포함한다.
상기 mRNA의 발현 여부를 측정하는 제제는 상기 유전자에 특이적인 안티센스 올리고뉴클레오티드, 프라이머 쌍, 프로브 및 이들의 조합으로 이루어진 군에서 선택된다. 즉, 핵산의 검출은 유전자를 암호화하는 핵산 분자 또는 상기 핵산 분자의 상보물에 하이브리드화되는 하나 이상의 올리고뉴클레오타이드 프라이머를 사용하는 증폭반응에 의해 수행될 수 있다.
예컨대, 프라이머를 이용한 mRNA의 검출은 PCR과 같은 증폭 방법을 사용하여 유전자 서열을 증폭한 다음 당 분야에 공지된 방법으로 유전자의 증폭 여부를 확인함으로써 수행될 수 있다.
또한, 본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 상기 단백질의 발현 수준을 측정하는 제제는 상기 단백질에 특이적으로 결합하는 항체, 펩타이드 또는 뉴클레오티드를 포함한다.
상기 단백질의 발현 수준을 측정하는 제제는 상기 단백질에 대하여 특이적으로 결합하는 항체를 의미하고, 다클론 항체, 단클론 항체, 재조합 항체 및 이들의 조합을 모두 포함한다.
상기 항체는 다클론 항체, 단클론 항체, 재조합 항체 및 2개의 전체 길이의 경쇄 및 2개의 전체 길이의 중쇄를 가지는 완전한 형태뿐만 아니라 및 항체 분자의 기능적인 단편, 예를 들어, Fab, F(ab'), F(ab')2 및 Fv를 모두 포함한다. 항체 생산은 본 발명이 속하는 분야에 널리 공지된 기술을 이용하여 용이하게 제조할 수 있고, 제조되어 상업적으로 판매되는 항체를 이용할 수 있다.
본 발명의 조성물은 상술한 유전자의 발현 여부를 측정하는 제제뿐만 아니라, 항원-항체 복합체의 형성을 정량 또는 정성적으로 측정 가능하게 하는 라벨, 면역학적 분석에 사용되는 통상적인 도구, 시약 등을 더 포함할 수 있다.
항원-항체 복합체의 형성을 정성 또는 정량적으로 측정 가능하게 하는 라벨에는 효소, 형광물, 리간드, 발광물, 미소입자(microparticle), 산화환원 분자 및 방사선 동위원소 등이 있으며, 반드시 이로 제한되는 것은 아니다. 검출 라벨로 이용 가능한 효소에는 β-글루쿠로니다제, β-D-글루코시다제, β-D-갈락토시다제, 우레아제, 퍼옥시다아제, 알칼라인포스파타아제, 아세틸콜린에스테라제, 글루코즈옥시다제, 헥소키나제와 GDPase, RNase, 글루코즈옥시다제와루시페라제, 포스포프럭토키나제, 포스포에놀피루베이트카복실라제, 아스파르테이트아미노트랜스페라제, 포스페놀피루베이트데카복실라제, β-라타마제 등이 있으며 이로 제한되지 않는다. 형광물에는 플루오레신, 이소티오시아네이트, 로다민, 피코에리테린, 피코시아닌, 알로피코시아닌, o-프탈데히드, 플루오레스카민 등이 있으며 이로 제한되지 않는다. 리간드에는바이오틴 유도체 등이 있으며 이로 제한되지 않는다. 발광물에는 아크리디늄에스테르, 루시페린, 루시퍼라아제 등이 있으며 이로 제한되지 않는다. 미소입자에는 콜로이드 금, 착색된 라텍스 등이 있으며 이로 제한되지 않는다. 산화환원 분자에는 페로센, 루테늄착화합물, 바이올로젠, 퀴논, Ti 이온, Cs 이온, 디이미드, 1,4-벤조퀴논, 하이드로퀴논, K4 W(CN)8, [Os(bpy)3]2+, [RU(bpy)3]2+, [MO(CN)8]4-등이 있으며 이로 제한되지 않는다. 방사선동위원소에는 3H, 14C, 32P, 35S, 36Cl, 51Cr, 57Co, 58Co, 59Fe, 90Y, 125I, 131I, 186Re 등이 있으며 이로 제한되지 않는다.
상기 도구 또는 시약의 일 예로, 적합한 담체, 용해제, 세정제, 완충제, 안정화제 등이 포함되나 이에 제한되지 않는다. 표지물질이 효소인 경우에는 효소 활성을 측정할 수 있는 기질 및 반응 정지제를 포함할 수 있다. 담체는가용성 담체, 불용성 담체가 있고, 가용성 담체의 일 예로 당 분야에서 공지된 생리학적으로 허용되는 완충액, 예를 들어 PBS가 있고, 불용성 담체의 일 예로 폴리스틸렌, 폴리에틸렌, 폴리프로필렌, 폴리에스테르, 폴리아크릴로니트릴, 불소 수지, 가교 덱스트란, 폴리사카라이드, 기타 종이, 유리, 금속, 아가로오스 및 이들의 조합일 수 있다.
본 발명의 조성물은 상술한 바이오 마커를 유효성분으로 포함하므로, 중복된 내용은 본 명세서의 과도한 복잡성을 피하기 위하여 그 기재를 생략한다.
본 발명의 다른 양태에 따르면, 본 발명은 상기 조성물을 포함하는, MET 저해제에 대한 감수성 예측용 키트를 제공한다.
상기 키트에는 상기 유전자의 발현; 또는 상기 이의 단백질의 발현 수준을 측정하는 제제뿐만 아니라, 면역학적 분석에 사용되는 당 분야에서 일반적으로 사용되는 도구, 시약 등이 포함될 수 있다.
상기 도구 또는 시약의 일 예로, 적합한 담체, 검출 가능한 신호를 생성할 수 있는 표지 물질, 발색단(chromophores), 용해제, 세정제, 완충제, 안정화제 등이 포함되나 이에 제한되지 않는다. 표지물질이 효소인 경우에는 효소 활성을 측정할 수 있는 기질 및 반응 정지제를 포함할 수 있다. 담체는 가용성 담체, 불용성 담체가 있고, 가용성 담체의 일 예로 당 분야에서 공지된 생리학적으로 허용되는 완충액, 예를 들어 PBS가 있고, 불용성 담체의 일 예로 폴리스틸렌, 폴리에틸렌, 폴리프로필렌, 폴리에스테르, 폴리아크릴로니트릴, 불소 수지, 가교 덱스트란, 폴리사카라이드, 라텍스에 금속을 도금한 자성 미립자와 같은 고분자, 기타 종이, 유리, 금속, 아가로오스 및 이들의 조합일 수 있다.
본 발명의 키트는 상술한 바이오 마커 및 조성물을 구성으로 포함하므로, 중복된 내용은 본 명세서의 과도한 복잡성을 피하기 위하여 그 기재를 생략한다.
본 발명의 또 다른 양태에 따르면, 본 발명은 IGSF1(Immunoglobulin Superfamily member 1,NM_001555.2) 유전자의 발현; 또는 상기 유전자의 단백질의 발현 또는 활성을 억제하는 억제제를 유효성분으로 포함하는, 대상의 MET(Mesenchymal-Epithelial Transition factor) 저해제에 대한 감수성 증진제 또는 감수성 증진용 조성물을 제공한다.
본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 상기 증진제 또는 증진용 조성물은 MET(Mesenchymal-Epithelial Transition factor, NM_001127500.1) 유전자의 발현; 또는 상기 유전자의 단백질의 발현 또는 활성을 억제하는 억제제를 추가적으로 포함한다.
본 발명에서, 상기 대상은 HGF(Hepatocyte Growth Factor)-비의존적(independent)으로 MET가 활성화(인산화)된 경우, MET 저해제에 대한 감수성을 증진시키는 것으로, HGF(Hepatocyte Growth Factor)-의존적(independent)으로 MET가 활성화(인산화)된 암세포에는 소망하는 효과를 얻지 못하는 경우에 적용할 수 있다.
즉, 본 발명의 IGSF1 및/또는 MET 유전자의 발현; 또는 상기 유전자의 단백질의 발현 또는 활성을 억제하는 억제제는 MET의 인산화를 감소시키고, 암세포의 이동성 및 전이성을 감소시켜서 탁월한 항암 효과를 나타낼 수 있다.
또한, 본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 상기 억제제는 siRNA(small interference RNA), shRNA(short hairpin RNA), miRNA(microRNA), 리보자임(ribozyme), DNAzyme, PNA(peptide nucleic acids), 안티센스 올리고뉴클레오타이드, 항체, 앱타머, 천연추출물 및 화학물질로 이루어진 군으로부터 선택된 1 종 이상이다. 보다 바람직하게는 상기 유전자의 mRNA에 특이적으로 결합하는 안티센스 올리고뉴클레오티드, 압타머, siRNA(small interference RNA), shRNA(short hairpin RNA) 또는 miRNA(microRNA)이며, 가장 바람직하게는 siRNA(small interference RNA), shRNA(short hairpin RNA) 또는 miRNA(microRNA)이다.
본 명세서에서 사용되는 용어 "miRNA(microRNA)"는, mRNA의 3' 비번역 영역(UTR) 부위와의 염기결합을 통해 전사후 억제자 역할을 하는 대략 22 nt의 비번역 RNA를 의미한다. miRNA의 제조방법으로는 특별히 한정되지 않으며, 당업계에 공지된 방법을 사용할 수 있다.
본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 상기 miRNA(microRNA)는 서열번호 1의 염기서열을 포함하는 MiR34a; 또는 서열번호 2의 염기서열을 포함하는 miR34c이다.
본 명세서에서 사용되는 용어 "siRNA"는, 이중가닥의 RNA가 다이서에 의해 절단되어 생성되는 21-25 뉴클레오티드 크기의 작은 RNA 조각으로 상보적인 서열을 갖는 mRNA에 특이적으로 결합하여 발현을 억제하는 것을 말한다. 본 발명의 목적 mRNA에 특이적으로 결합하여 상기 유전자의 발현을 억제하는 것을 의미한다. siRNA는 화학적으로 또는 효소학적으로 합성될 수 있다. siRNA의 제조방법으로는 특별히 한정되지 않으며, 당업계에 공지된 방법을 사용할 수 있다.
본 명세서에서 사용되는 용어 "shRNA"는, 45 내지 70 뉴클레오티드의 길이를 가지는 단일가닥의 RNA로서 타겟유전자 siRNA 염기서열의 sense와 상보적인 nonsense 사이에 3-10 개의 염기 링커를 연결하는 올리고 DNA를 합성한 후 플라스미드 벡터에 클로닝하거나 또는 shRNA를 레트로바이러스인 렌티바이러스(lentivirus) 및 아데노바이러스 (adenovirus)에 삽입하여 발현시키면 루프(loop)가 있는 헤어핀(hairpin) 구조의 shRNA (short hairpin RNA)가 만들어지고 세포 내의 Dicer에 의해 siRNA로 전환되어 RNAi 효과를 나타내는 것을 의미한다. shRNA (small hairpin RNA)를 포함한 발현 컨스트럭트/벡터는 당분야에서 공지된 방법으로 제조할 수 있다.
본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 상기 siRNA(small interference RNA)는 서열번호 3의 염기서열을 포함하는 IGSF1 siRNA, 서열번호 4의 염기서열을 포함하는 IGSF1 siRNA 또는 서열번호 5의 염기서열을 포함하는 MET siRNA이고; 상기 shRNA(short hairpin RNA)는 서열번호 6의 염기서열을 포함하는 IGSF1 shRNA 또는 서열번호 7의 염기서열을 포함하는 MET shRNA이다.
본 발명에 따르면, 암세포의 IGSF1 유전자 또는 이의 산물인 단백질의 발현을 RNAi 방법(siRNA, shRNA, microRNA)으로 억제시킨 경우, siRNA 농도-의존적으로 MET의 인산화가 감소된다.
또한, 본 발명에서 IGSF1 및/또는 MET 유전자 또는 이의 산물인 단백질의 발현이 억제된 암세포는, 그렇지 않은 암세포에 비해 생존율, 이동성 및 전이성(침윤)이 현저히 떨어지는 결과를 나타낸다.
따라서, 이는 IGSF1 및/또는 MET 유전자의 발현; 또는 상기 유전자의 단백질의 발현 또는 활성 억제가 MET 저해제에 대한 암세포의 감수성을 증진시킨다는 것을 제시하며, 이를 기반으로 하여 본 발명은 대상의 MET 저해제에 대한 탁월한 감수성 증진 효과를 제공한다.
본 발명의 감수성 증진제 또는 증진용 조성물은 약학적으로 허용 가능한 담체를 추가로 포함할 수 있다. 본 발명에 사용될 수 있는 약학적으로 허용 가능한 담체는 통상적인 부형제, 붕해제, 결합제, 활택제, 기타 첨가제, 예를 들면, 안정제, 완화제, 유화제 등을 선택하여 사용할 수 있다. 예를 들어, 부형제로서 미결정 셀룰로오소, 유당, 저치환도 히드록시셀룰로오스 등이 사용될 수 있고, 붕해제로서 전분글리콜산 나트륨, 무수인산일수소 칼슘 등이 사용될 수 있다. 결합제로는 폴리비닐피롤리돈, 저치환도 히드록시프로필셀룰로오스 등이 사용될 수 있고, 활택제로는 스테아린산 마그네슘, 이산화규소, 탈크 등으로부터 선택하여 사용할 수 있다.
본 발명의 조성물은 상술한 바이오 마커의 발현 수준을 이용하여 EGFR-표적제제에 대한 감수성을 증진시키므로, 중복된 내용은 본 명세서의 과도한 복잡성을 피하기 위하여 그 기재를 생략한다.
본 발명의 또 다른 양태에 따르면, 본 발명은 상술한 MET 저해제에 대한 감수성 증진제 및 MET 저해제를 유효성분으로 포함하는, MET 신호전달 경로의 조절이상과 관련된 질환의 예방 또는 치료용 약학적 조성물을 제공한다.
본 발명에서, 상기 MET 신호전달 경로의 조절이상과 관련된 질환은 암, 아테롬성 동맥경화증, 폐 섬유증, 신장 섬유증 및 재생, 간 질환, 알러지 질환, 염증 질환, 자가면역 질환, 뇌혈관 질환, 심혈관 질환, 또는 기관 이식과 관련된 증상이며, 바람직하게는, 암이다.
즉, 본 발명의 MET 저해제에 대한 감수성 증진제인 IGSF1 및/또는 MET 유전자의 발현; 또는 상기 유전자의 단백질의 발현 또는 활성을 억제하는 억제제는 항암제에 대한 감수성을 증가시켜, 이들 항암제와 함께 투여되는 경우 항암제의 항암작용을 증가시킴으로써 암의 치료를 더욱 용이하게 할 수 있다.
본 발명의 조성물에 의한 개선, 예방 또는 치료 대상 질병인 "암(cancer) "은 세포가 정상적인 성장 한계를 무시하고 분열 및 성장하는 공격적(aggressive) 특성, 주위 조직에 침투하는 침투적(invasive) 특성, 및 체내의 다른 부위로 퍼지는 전이적(metastatic) 특성을 갖는 세포에 의한 질병을 총칭하는 의미이다. 본 명세서에서 상기 암은 악성 종양(malignant tumor)과 동일한 의미로도 사용된다.
본 발명의 조성물이 적용될 수 있는 암은 유방암(breast cancer), 폐암(lung cancer), 위암(stomach cancer), 간암(liver cancer), 혈액암(blood cancer), 뼈암(bone cancer), 췌장암(pancreatic cancer), 피부암(skin cancer), 머리 또는 목암(head or neck cancer), 피부 또는 안구 흑색종(cutaneous or intraocular melanoma), 자궁육종(uterine sarcoma), 난소암(ovarian cancer), 직장암(rectal cancer), 항문암(anal cancer), 대장암(colon cancer), 난관암(fallopian tube carcinoma), 자궁내막암(endometrial carcinoma), 자궁경부암(cervical cancer), 소장암(small intestine cancer), 내분비암(endocrine cancer), 갑상선암(thyroid cancer), 부갑상선암(parathyroid cancer), 신장암(adrenal cancer), 연조직종양(soft tissue tumor), 요도암(urethral cancer), 전립선암(prostate cancer), 기관지암(bronchogenic cancer), 골수암(bone marrow tumor)등을 포함하나, 이에 한정되는 것은 아니다.
바람직하게는, 본 발명의 조성물은 위암 또는 폐암의 예방 또는 치료에 적용할 수 있다.
본 명세서에서 용어 "예방" 은 질환 또는 질병을 보유하고 있다고 진단된 적은 없으나, 이러한 질환 또는 질병에 걸리기 쉬운 경향이 있는 동물에서 질환 또는 질병의 발생을 억제하는 것을 의미한다. 본 명세서에서 용어 "치료"는 (i) 질환 또는 질병의 발전의 억제; (ii) 질환 또는 질병의 경감; 및 (iii) 질환 또는 질병의 제거를 의미한다.
본 발명의 약학적 조성물은 약학적으로 허용되는 담체를 추가적으로 포함할 수 있다.
본 발명의 약학적 조성물에 포함되는 약학적으로 허용되는 담체는 제제시에 통상적으로 이용되는 것으로서, 락토스, 덱스트로스, 수크로스, 솔비톨, 만니톨, 전분, 아카시아 고무, 인산 칼슘, 알기네이트, 젤라틴, 규산 칼슘, 미세결정성 셀룰로스, 폴리비닐피롤리돈, 셀룰로스, 물, 시럽, 메틸 셀룰로스, 메틸히드록시벤조에이트, 프로필히드록시벤조에이트, 활석, 스테아르산 마그네슘 및 미네랄 오일 등을 포함하나, 이에 한정되는 것은 아니다. 본 발명의 약학적 조성물은 상기 성분들 이외에 윤활제, 습윤제, 감미제, 향미제, 유화제, 현탁제, 보존제 등을 추가로 포함할 수 있다. 적합한 약학적으로 허용되는 담체 및 제제는 Remington's Pharmaceutical Sciences (19th ed., 1995)에 상세히 기재되어 있다.
본 발명의 약학적 조성물의 적합한 투여량은 제제화 방법, 투여 방식, 환자의 연령, 체중, 성, 병적 상태, 음식, 투여 시간, 투여 경로, 배설 속도 및 반응 감응성과 같은 요인들에 의해 다양하게 처방될 수 있다.
한편, 본 발명의 약학적 조성물의 투여량은 바람직하게는 1일 당 0.0001-100 mg/kg(체중)이다.
본 발명의 약학적 조성물은 경구 또는 비경구로 투여할 수 있고, 비경구로 투여되는 경우, 정맥내 주입, 피하 주입, 근육 주입, 복강 주입, 경피 투여 등으로 투여할 수 있다. 본 발명의 약제학적 조성물은 적용되는 질환의 종류에 따라, 투여 경로가 결정되는 것이 바람직하다.
본 발명의 조성물에 포함되는 유효성분인 증진제 내 해당 유전자 또는 이의 단백질의 발현 억제제의 농도는 치료 목적, 환자의 상태, 필요 기간, 질환의 위중도 등을 고려하여 결정하며 특정 범위의 농도로 한정되지 않는다.
본 발명의 약학적 조성물은 당해 발명이 속하는 기술분야에서 통상의 지식을 가진 자가 용이하게 실시할 수 있는 방법에 따라, 약학적으로 허용되는 담체 및/또는 부형제를 이용하여 제제화함으로써 단위 용량 형태로 제조되거나 또는 다용량 용기내에 내입시켜 제조될 수 있다. 이때 제형은 오일 또는 수성 매질중의 용액, 현탁액 또는 유화액 형태이거나 엑스제, 분말제, 과립제, 정제 또는 캅셀제 형태일 수도 있으며, 분산제 또는 안정화제를 추가적으로 포함할 수 있다.
본 발명의 조성물은 상술한 감수성 증진제 및 항암제인 MET 저해제를 이용하여 암세포의 세포사를 향상시키므로, 중복된 내용은 본 명세서의 과도한 복잡성을 피하기 위하여 그 기재를 생략한다.
본 발명의 또 다른 양태에 따르면, 본 발명은 다음 단계를 포함하는 MET 저해제에 대한 감수성 예측 방법을 제공한다: (a) 대상으로부터 생물학적 시료를 준비하는 단계; 및 (b) 상기 생물학적 시료 내 IGSF1(Immunoglobulin Superfamily member 1, NM_001555.2) 유전자의 발현 수준; 또는 이의 단백질의 발현 수준을 측정하는 단계로,
상기 (b) 단계에서 IGSF1 유전자의 발현 수준 또는 이의 단백질의 발현 수준이 대조군에 비하여 고발현인 경우, 대상의 MET 저해제에 대한 감수성이 있는 것으로 판정한다.
본 명세서에서 특별한 언급이 없는 한, 본 명세서에서 사용되는 용어 "대조군"은 정상인 건강한 사람의 해당 유전자 또는 이의 단백질 발현 수준; 또는 비교 대상인 환자의 해당 유전자 또는 이의 단백질 발현 수준을 의미한다.
본 발명의 예측 방법은, 대상 환자로부터 생물학적 시료를 획득하고, 상기 시료 내에서 IGSF1의 발현 여부를 측정한 후, 대조군 시료와 비교하여, 기재된 유전자 또는 단백질의 발현이 증가된 경우에, 당해 시료가 MET 저해제에 대하여 감수성이 있다라고 판정하는 공정을 포함하여 이루어진다.
또한, 본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 상기 대상은 HGF 유전자 또는 이의 단백질 발현 수준이 대조군과 비교하여 저발현 또는 비발현된 것이다.
또한, 본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 상기 대상은 MET 유전자 또는 이의 단백질 발현 수준이 대조군에 비하여 고발현된 것이다.
보다 상세하게는, HGF 유전자 또는 이의 단백질 발현 수준이 대조군과 비교하여 저발현 또는 비발현되고; IGSF1 및 MET 유전자 또는 이들의 단백질 발현 수준이 대조군의 값에 비하여 증가된 것으로 확인된 경우, 대상 환자로부터 획득된 당해 종양 세포가 항암제인 MET 저해제에 대하여 감수성이 있는 것으로 판정하는 것이다.
즉, HGF-비발현 또는 저발현 환자에게서 IGSF1 유전자 또는 이의 단백질 수준이 고발현 된 경우, IGSF1 유전자가 MET의 활성화를 유도하므로 MET 저해제에 대한 감수성을 나타낸다고 판단한다.
본 명세서에서 상기 유전자들의 발현 수준을 언급하면서 사용되는 용어 "저발현"은 바이오 마커가 비정상 프로세스, 질환 혹은 개체 내 기타 병태를 나타내거나 이의 징후인 경우, 건강하거나 정상인 개체 또는 비교 대상인 개체로부터 획득된 생물학적 시료에서 검출되는 바이오 마커의 값 혹은 수준 범위 보다 낮은 생물학적 시료 내의 바이오 마커의 값 혹은 수준을 지칭한다.
본 명세서에서 상기 유전자들의 발현 수준을 언급하면서 사용되는 용어 "고발현"은 바이오 마커가 비정상 프로세스, 질환 혹은 개체 내 기타 병태를 나타내거나 이의 징후인 경우, 건강하거나 정상인 개체 또는 비교 대상인 개체로부터 획득된 생물학적 시료에서 검출되는 바이오 마커의 값 혹은 수준 범위 보다 높은 생물학적 시료 내의 바이오 마커의 값 혹은 수준을 지칭한다.
또한, 상기 유전자들의 발현 수준을 언급하면서 사용되는 용어들은 바이오 마커의 "정상" 발현 수준 혹은 값과 비교해서 "차동(differential) 수준" 혹은 "차동 값"을 지니거나 "상이하게 발현된" 것으로서 지칭될 수 있으며, 발현에 있어서 정량적 차이뿐만 아니라 정성적 차이의 둘 모두를 포함한다.
본 명세서에서 사용되는 용어 "생물학적 시료"란 본 발명의 바이오 마커의 발현이 검출될 수 있는 개체로부터 얻어지는 모든 시료를 의미한다.
본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 상기 생물학적 시료는 타액(saliva), 생검(biopsy), 혈액, 피부 조직, 액체 배양물, 분변 및 소변으로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나이며, 특별히 이에 제한되지 않고, 본 발명의 기술분야에서 통상적으로 사용되는 방법으로 처리하여 준비될 수 있다.
본 발명의 방법은 상술한 바이오 마커를 이용하여 감수성이 있는 것으로 판정하므로, 중복된 내용은 본 명세서의 과도한 복잡성을 피하기 위하여 그 기재를 생략한다.
본 발명의 또 다른 양태에 따르면, 본 발명은 상술한 MET 저해제에 대한 감수성 증진제 및 MET 저해제를 대상에게 공동 투여하는 단계를 포함하는, MET 저해제에 대한 감수성 증진 방법을 제공한다.
본 발명의 방법은 상술한 감수성 증진제 및 항암제인 MET 저해제를 이용하여 감수성을 증진시키므로, 중복된 내용은 본 명세서의 과도한 복잡성을 피하기 위하여 그 기재를 생략한다.
본 발명의 MET 저해제에 대한 감수성 예측용 바이오 마커를 이용하면, 개개의 환자의 상기 감수성을 치료 개시 전에 확실하게 판정할 수 있어, 치료 효과가 높은 항암제의 선택이 가능해진다. 또한, 효과가 얻어지지 않는 항암제의 사용을 회피할 수 있기 때문에 불필요한 부작용을 회피할 수 있다.
도 1a은 HGF-비의존적 MET 인산화 유도 마커를 동정 과정을 나타낸다.
도 1b는 HGF-비의존적 MET 인산화 유도 마커로서 IGSF1(immunoglobulin superfamily member 1)을 동정한 MALDI-TOF 분석 결과를 보여준다.
도 2a는 인간 위암 세포주에서의 HGF-비의존적(independent) MET 인산화 유도 마커 IGSF1과 MET 인산화간의 발현 분석 결과를 보여준다.
도 2b는 인간 폐암 세포주에서의 HGF-비의존적 MET 인산화 유도 마커 IGSF1과 MET 인산화 간의 발현 분석 결과를 보여준다.
도 2c는 인간 위암 세포주에서의 HGF-비의존적 MET 인산화 유도 마커 IGSF1과 MET 단백질 간의 결합 분석 결과를 보여준다.
도 2d는 인간 위암 세포주에서의 HGF-비의존적 MET 인산화 유도 마커 IGSF1과 MET 간의 구체적인 결합 위치를 보여준다. 또한, MET과 IGSF1 단백질 간의 결합 분석 결과도 보여준다.
도 2e는 인간 위암 세포주 및 폐암 세포주에서의 HGF-비의존적 MET 인산화 유도 마커 IGSF 발현 억제시 MET 인산화 변화를 보여준다.
도 2f는 위암 세포주에서 IGSF1 또는 MET 발현 변화에 따른 조절 기전 분석 결과를 보여준다.
도 3a는 인간 위암 세포주에서의 HGF-비의존적 MET 인산화 유도 마커 IGSF1 발현 억제시 암세포의 성장 억제 결과를 보여준다.
도 3b는 인간 폐암 세포주에서의 HGF-비의존적 MET 인산화 유도 마커 IGSF1 발현 억제시 암세포의 성장 억제 결과를 보여준다.
도 4a는 인간 위암 세포주에서의 HGF-비의존적 MET 인산화 유도 마커 IGSF1 발현 억제시 암세포의 전이성 및 이동성 억제 분석 결과를 보여준다.
도 4b는 인간 폐암 세포주에서의 HGF-비의존적 MET 인산화 유도 마커 IGSF1 발현 억제시 암세포의 전이성 억제 분석 결과를 보여준다.
도 5a는 위암 세포주에 IGSF1 발현 유무에 따른 MET 저해제의 효능 비교 분석 결과를 보여준다.
도 5b는 폐암 세포주에 IGSF1 발현 유무에 따른 MET 저해제의 효능 비교 분석 결과를 보여준다.
도 6a는 microRNA를 이용한 HGF-비의존적 MET 인산화 유도 마커 IGSF1 및 MET의 동시 억제 확인 결과를 보여준다.
도 6b는 HGF-비의존적 MET 인산화 유도 마커 IGSF1 및 MET을 동시 억제하는 miR34a 및 miR34c에 의한 IGSF1과 MET의 발현 변화 결과를 보여준다.
도 6c는 HGF-비의존적 MET 인산화 유도 마커 IGSF1 및 MET을 동시 억제하는 miR34a 및 miR34c에 의한 세포성장 분석 결과를 보여준다.
도 6d는 HGF-비의존적 MET 인산화 유도 마커 IGSF1 및 MET을 동시 억제하는 miR34a 및 miR34c에 의한 세포 전이성 및 이동성 억제 분석 결과를 보여준다.
도 6e는 mir-34a와 mir-34c에 의한 IGSF1과 MET의 억제를 antagomir로 recovery 유도한 결과를 보여준다.
도 7은 위암 환자 조직에서 HGF-비의존적 MET 인산화 유도 인자 IGSF1과 MET 활성화 발현이 나타나는 비율을 확인한 결과를 보여준다. 또한, 대표적인 환자 샘플 결과를 보여준다.
도 1b는 HGF-비의존적 MET 인산화 유도 마커로서 IGSF1(immunoglobulin superfamily member 1)을 동정한 MALDI-TOF 분석 결과를 보여준다.
도 2a는 인간 위암 세포주에서의 HGF-비의존적(independent) MET 인산화 유도 마커 IGSF1과 MET 인산화간의 발현 분석 결과를 보여준다.
도 2b는 인간 폐암 세포주에서의 HGF-비의존적 MET 인산화 유도 마커 IGSF1과 MET 인산화 간의 발현 분석 결과를 보여준다.
도 2c는 인간 위암 세포주에서의 HGF-비의존적 MET 인산화 유도 마커 IGSF1과 MET 단백질 간의 결합 분석 결과를 보여준다.
도 2d는 인간 위암 세포주에서의 HGF-비의존적 MET 인산화 유도 마커 IGSF1과 MET 간의 구체적인 결합 위치를 보여준다. 또한, MET과 IGSF1 단백질 간의 결합 분석 결과도 보여준다.
도 2e는 인간 위암 세포주 및 폐암 세포주에서의 HGF-비의존적 MET 인산화 유도 마커 IGSF 발현 억제시 MET 인산화 변화를 보여준다.
도 2f는 위암 세포주에서 IGSF1 또는 MET 발현 변화에 따른 조절 기전 분석 결과를 보여준다.
도 3a는 인간 위암 세포주에서의 HGF-비의존적 MET 인산화 유도 마커 IGSF1 발현 억제시 암세포의 성장 억제 결과를 보여준다.
도 3b는 인간 폐암 세포주에서의 HGF-비의존적 MET 인산화 유도 마커 IGSF1 발현 억제시 암세포의 성장 억제 결과를 보여준다.
도 4a는 인간 위암 세포주에서의 HGF-비의존적 MET 인산화 유도 마커 IGSF1 발현 억제시 암세포의 전이성 및 이동성 억제 분석 결과를 보여준다.
도 4b는 인간 폐암 세포주에서의 HGF-비의존적 MET 인산화 유도 마커 IGSF1 발현 억제시 암세포의 전이성 억제 분석 결과를 보여준다.
도 5a는 위암 세포주에 IGSF1 발현 유무에 따른 MET 저해제의 효능 비교 분석 결과를 보여준다.
도 5b는 폐암 세포주에 IGSF1 발현 유무에 따른 MET 저해제의 효능 비교 분석 결과를 보여준다.
도 6a는 microRNA를 이용한 HGF-비의존적 MET 인산화 유도 마커 IGSF1 및 MET의 동시 억제 확인 결과를 보여준다.
도 6b는 HGF-비의존적 MET 인산화 유도 마커 IGSF1 및 MET을 동시 억제하는 miR34a 및 miR34c에 의한 IGSF1과 MET의 발현 변화 결과를 보여준다.
도 6c는 HGF-비의존적 MET 인산화 유도 마커 IGSF1 및 MET을 동시 억제하는 miR34a 및 miR34c에 의한 세포성장 분석 결과를 보여준다.
도 6d는 HGF-비의존적 MET 인산화 유도 마커 IGSF1 및 MET을 동시 억제하는 miR34a 및 miR34c에 의한 세포 전이성 및 이동성 억제 분석 결과를 보여준다.
도 6e는 mir-34a와 mir-34c에 의한 IGSF1과 MET의 억제를 antagomir로 recovery 유도한 결과를 보여준다.
도 7은 위암 환자 조직에서 HGF-비의존적 MET 인산화 유도 인자 IGSF1과 MET 활성화 발현이 나타나는 비율을 확인한 결과를 보여준다. 또한, 대표적인 환자 샘플 결과를 보여준다.
이하, 실시예는 오로지 본 발명을 보다 구체적으로 설명하기 위한 것으로서, 본 발명의 요지에 따라 본 발명의 범위가 이들 실시예에 의해 제한되지 않는다는 것은 본 발명이 속하는 기술분야에서 통상의 지식을 가진 자에게 있어서 자명할 것이다.
실험방법 및 조건
HGF
-
비의존적
MET 인산화 유도
HGF-비의존적 인간 위암 세포주 AGS 세포주에 MET 야생형 구조물(plasmid)을 48시간 동안 형질감염(transfection) 시킨 후 세포 배양액을 수거하여 HGF elisa assay (R&D Systems, Inc, Minneapolis, MN, USA)를 수행하였다. 세포 용해물은 수거하여 MET과 IGSF1 단백질들의 변화를 웨스턴 블롯으로 검증하였다.
면역침강법
및
MALDI
-TOFF
HGF-비의존적인 MET 활성화에 관련된 유전자를 동정하기 위해서 인간 위암 AGS 세포주에 MET 야생형 플라스미드를 48시간 동안 과발현 시킨 후 세포 용해물을 수거하였다. 인간 위암 세포주 용해액 500㎍을 항-pMET 항체 1㎍과 혼합한 후, 4℃에서 12시간 동안 배양한 후 Protein-Sepharose bead (Santa Cruz Biotehcnology, Santa Cruz, CA, USA) 20㎕를 첨가한 후 2시간 동안 추가 반응하였다. 면역침강물을 완충액(Nondiet P-40 lysis buffer)으로 5회 세척한 후, 2XSDS 샘플 용액 20㎕를 첨가하고 가열한 후 SDS-PAGE를 수행한 후, Silver staining kit (GE Healthcare Bio-Sciences Corp, NJ, USA)를 사용하여 염색하였다. HGF-비의존적 MET 활성화에 관련된 단백질을 동정하기 위하여 Silver staining을 통해 확인된 단백질을 질량분석법 (Mass Spectrometry)을 통하여 동정하였다.
웨스턴
블롯
웨스턴 블롯을 수행하기 위하여, 각 세포로부터 분리한 단백질을 SDS-PAGE를 통해 분리한 후, 이를 멤브레인 (PolyScreen membranes (New England Nuclear, Boston, MA, USA)으로 옮긴 후, 다양한 항체 (anti-phospho MET, E-cadherin, (Cell signaling Technology, Beverly, MA, USA), anti-MET, anti-r-tubulin (Santa Cruz Biotechnology, Santa Cruz, CA, USA), anti-IGSF1 (Abnova, Jhouzih, Taipei, Taiwan)를 이용하여 4℃에서 12시간 동안 반응시킨 후 1XTBS-T 완충액으로 10분간 3번 세척하였다. 적절한 항 rabbit-HRP 혹은 항 mouse-HRP secondary 항체를 상온에서 2시간 반응시킨 후에 1XTBS-T 완충액으로 10분간 3번 세척한 후 ECL solution (GE Healthcare Bio-Sciences Corp)을 사용하여 단백질의 발현을 검증하였다.
세포 침윤 측정법(invasion chamber assay) 및 세포 이동 측정법(migration assay)
HGF-비의존적 인간 위암 세포주 MKN45, SNU638 및 폐암 HCC827 세포주에 IGSF1 siRNA 혹은 MET siRNA를 48시간동안 transfection 하였다. 24 well plate에 8mm pore size의 insert plate (BD Biosceinces)를 넣고, insert plate matrigel 200㎍/ml (BD Biosciences) 농도로 100㎕씩 분주한 후 CO2 incubator에서 30분간 반응시켰다. MET 혹은 IGSF1 siRNA를 transfection 한 2.5X104 세포를 serum free media에 total volume을 100㎕로 맞추어 insert plate에 넣어주었다. Bottom plate에 growth media (RPMI1640+10%FBS)를 400㎕ 분주한 후 CO2 incublator에서 24시간 배양하였다. 24시간 후에 insert plate를 PBS로 washing 한 후, 위에 남아있는 세포들을 면봉으로 닦아준 후에 10% formalin으로 20분간 고정하였다. 2차수로 washing한 후에 0.01% crystal violet 용액으로 20분간 염색한 후에 warm water로 washing 후 말린 후에 이동한 세포 수를 측정하였다. Migration assay의 경우에는 insert plate를 coating 하지 않고, 위와 동일한 방법으로 진행하였다. Control과 MET 혹은 IGSF1 siRNA를 transfection한 위암 및폐암 세포주에서 insert plate를 통과하여 이동한 세포수를 측정하여 검증하였다.
유전자 발현 억제 방법
siRNA
및
shRNA
제작 방법
HGF-비의존적 인간 위암 세포주 MKN45, SNU638 및 폐암 HCC827 세포주에 IGSF1 siRNA(서열번호 3 IGSF1#1; 5'-GCAGGUCUUUACCGGUGCU-3', 서열번호 4 IGSF1 #2; 5'-GGUGCUGCUACUGGAAGGA-3'), MET siRNA (서열번호 5; 5'-AAAGATAAACCTCTCATAATG-3'), IGSF1 shRNA (서열번호 6; 5'-CAAAGAUGGAAGUGAAAUA UCUCUAUUUCACUUCCAUCUUUGUU-3') 및/또는 MET shRNA (서열번호 7; 5'- GCCAGCCUGAAUGAUGACAUCUCUGUCAUCAUUCAGGCUGGCUU-3')을 48시간 동안 형질감염(transfection) 시킨 후, 세포 용해물은 수거하여 MET과 IGSF1 단백질들의 변화를 웨스턴 블롯으로 검증하였다.
microRNA
제작 방법
인간 miRNA34a (서열번호 1; UGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGU) 또는 miRNA34c (서열번호 2; AGGCAGUGUAGUUAGCUGAUUGC)를 Thermo Fisher Scientific 회사로부터 구입하여 사용하였다. HGF-비의존적 인간 위암 SNU638 세포 4X105 cells를 seeding 한 후 miRNA34a 혹은 miRNA34c 300nM을 형질감염 시킨 후 0,1,2,3 일 동안 trypan blue exclusion method를 사용하여 세포수를 측정하였다.
세포 성장 확인
HGF-비의존적 인간 위암 SNU638 세포 4X105 cell혹은 MKN45 세포 3X105 cell seeding 한 후 miRNA34a(서열번호 1) 또는 miRNA34c(서열번호 2) 300nM을 형질감염 시킨 후 0,1,2,3 일 동안 trypan blue exclusion method를 사용하여 세포수를 측정하였다.
안타고미어
제작 방법
인간 miRNA34a와 miRNA34c의 antagomir를 Thermo Fisher Scientific 회사로부터 구입하여 사용하였다. HGF-비의존적 인간 위암 SNU638 세포 4X105 cells 혹은 MKN45세포 3X105를 seeding 한 후 miRNA34a 혹은 miRNA34c 300nM을 형질감염 시킨 후 0,1,2,3 일 동안 trypan blue exclusion method를 사용하여 세포수를 측정하였다.
실시예
1.
HGF
-
비의존적
(independent) MET 인산화 유도
마커로서
IGSF1
의 동정
본 발명자들은 HGF-비의존적 MET 인산화 유도 마커를 동정하고자, HGF-음성인 인간 위암 세포주 AGS에 MET 야생형 DNA를 과발현시킴으로서 HGF-비의존적 MET 인산화를 유도시켰다(도 1a, 왼쪽 그래프). 여기에 p-MET 항체를 이용하여 면역침강법(immunoprecipitation)을 실시한 후, MET과 결합하는 단백질을 동정하기 위해 은 염색법(silver staining)을 실시하였다(도 1a, 오른쪽 젤 이미지).
또한, 상기 결과물에 MALDI-TOF 분석을 실시하여 MET과 결합하는 단백질을 확인하였다.
그 결과, 도 1b에 나타낸 바와 같이, HGF-비의존적 MET 인산화 유도 마커로서 IGSF1(immunoglobulin superfamily member 1)을 동정하였다.
실시예
2.
HGF
-
비의존적
MET 인산화 유도
마커
IGSF1
과 MET 인산화 간의
연관성확인
2-1. 인간 위암 세포주에서의
HGF
-
비의존적
MET 인산화 유도
마커
IGSF1
과 MET
인산화간의
발현 분석
본 발명자들은 인간 위암 세포주에서 HGF-비의존적 MET 인산화 유도 마커 IGSF1과 MET 인산화 간의 연관성을 분석하고자, 총 8 종의 위암 세포주에 IGSF1, pMET(인산화된 활성형 MET) 항체를 이용하여 웨스턴 블롯을 실시하였다.
그 결과, 도 2a(왼쪽)에 나타낸 바와 같이, 인간 위암 세포주인 SNU638, MKN45에서 MET과 IGSF1이 동시 발현되는 경우, MET이 인산화되는 것이 관찰되었다.
또한, 상기 SNU638, MKN45의 HGF 발현을 확인한 결과, 도 2a(오른쪽)에 나타낸 바와 같이, 양성 대조군인 U87MG 세포주에 비하여, HGF가 검출되지 않았다.
따라서, HGF-음성(비의존적)이고, MET과 IGSF1이 동시 발현하는 경우에만 MET 인산화가 유도됨을 알 수 있었다.
2-2. 인간 폐암 세포주에서의
HGF
-
비의존적
MET 인산화 유도
마커
IGSF1
과 MET 인산화 간의 발현 분석
본 발명자들은 인간 폐암 세포주에서의 HGF-비의존적 MET 인산화 유도 마커 IGSF1과 MET 인산화 간의 발현을 분석하고자, 총 9 종의 폐암 세포주에 IGSF1, pMET(인산화된 활성형 MET) 항체를 이용하여 웨스턴 블롯을 실시하였다.
그 결과, 도 2b(왼쪽)에 나타낸 바와 같이, 인간 폐암 세포주 H1944, H2228, HCC827에서 MET과 IGSF1이 동시 발현되는 경우, MET이 인산화되는 것이 관찰되었다.
또한, 상기 H1944, H2228, HCC827의 HGF 발현을 확인한 결과, 도 2b (오른쪽)에 나타낸 바와 같이, 양성 대조군인 U87MG 세포주에 비하여, HGF가 검출되지 않았다.
따라서, HGF-음성(비의존적)이고, MET과 IGSF1이 동시 발현하는 경우에만 MET 인산화가 유도됨을 알 수 있었다.
2-3. 인간 위암 세포주에서의
HGF
-
비의존적
MET 인산화 유도
마커
IGSF1
과 MET 단백질 간의 결합 확인
본 발명자들은 인간 위암 세포주에서의 HGF-비의존적 MET 인산화 유도 마커 IGSF1과 MET 단백질 간의 결합을 분석하고자, 인간 위암 세포주 AGS에 MET과 IGSF1을 과발현시키고, pMET 항체를 이용하여 면역침강법을 실시한 후, IGSF1과의 결합을 웨스턴 블롯으로 확인하였다.
그 결과, 도 2c(왼쪽)에 나타낸 바와 같이, HGF-음성인 인간 위암 세포주 AGS에 MET을 과발현시킨 경우, MET와 IGSF1가 결합하는 것을 확인하였다.
또한, 도 2c(오른쪽)에 나타낸 바와 같이, MET을 과발현시킨 HGF-음성 인간 위암 세포주 AGS의 세포질(cytosol) 및 세포막(membrane)을 분획하여 확인한 경우, 세포막에서 MET와 IGSF1가 결합하는 것을 확인하였다.
두 단백질이 어느 위치에서 결합하는지 알아보기 위해 IGSF1 단백질을 domain별로 deletion시킨 constructs를 제작하였다. Extracellular domain을 deletion한 contructs와 Helical 혹은 cytoplasmic domain을 deletion한 contructs를 제작하였다. MET WT과 IGSF1 deletion constructs를 293T 세포에 transfection을 한 후 면역침강법을 통해 어느 위치에서 결합하는지를 확인하였다.
그 결과, 도 2d에 나타낸 바와 같이, 571-1328 deletion (extracellular domain)된 곳에서 binding을 하지 않는 것을 확인하여, 두 단백질이 이 위치에서 결합하여 작용하는 것을 확인할 수 있었다. 또한 WT MET과 IGSF1이 결합하는 것도 확인할 수 있었다.
2-4. 인간 위암 세포주 및 폐암 세포주에서의
HGF
-
비의존적
MET 인산화 유도
마커
IGSF
발현 억제시 MET 인산화 변화
본 발명자들은 인간 위암 세포주(AGS, MKN45, SNU638) 및 폐암 세포주(HCC827)에서의 HGF-비의존적 MET 인산화 유도 마커 IGSF 발현 억제시 MET 인산화 변화를 분석하고자, 인간 위암 및 폐암 세포주에 IGSF1 또는 MET을 siRNA 방법으로 발현을 억제시킨 후, MET 단백질의 인산화의 변화를 웨스턴 블롯으로 확인하였다.
그 결과, 도 2e에 나타낸 바와 같이, 인간 위암(AGS, MKN45, SNU638) 및 폐암(HCC827) 세포주에서 IGSF1 siRNA 혹은 shRNA 농도 의존적으로 MET의 인산화가 감소하였다. 또한, MET shRNA 농도 의존적으로 IGSF1의 발현이 감소하였다.
2-5. 위암 세포주에서
IGSF1
또는 MET 발현 변화에 따른 조절 기전 분석
본 발명자들은 인간 위암 세포주인 SNU638과 MKN45에 IGSF1 또는 MET을 shRNA로 억제시킨 후 각 유전자의 발현 변화를 real-time PCR로 확인하였다.
그 결과, 도 2f 상단 패널에 나타낸 바와 같이, 두 세포주에서 MET을 억제한 경우 IGSF1의 발현이 감소하며, IGSF1을 억제한 후에는 반대로 MET의 발현이 감소하였다. 이 결과를 통해 RNA 수준에서 조절되고 있는 것을 확인할 수 있었다.
또한, 도 2f 하단 패널에 나타낸 바와 같이, 위암 세포주에서 IGSF1과 MET의 발현 조절은 단백질 수준에서 조절되는 것이 아닌 것을 확인하였다. MET 억제제를 처리한 후 IGSF1의 발현이 어떻게 조절되는지 각각의 억제제(inhibitor) 처리 후 웨스턴 블롯 분석 방법을 통해 확인한 결과이다.
(PHA665752: c-MET 억제제, MG132: 프로테아좀(proteasome) 억제제, Leupeptin & NH4Cl: 리소좀 단백질분해효소(lysosomal protease) 억제제)
실시예
3.
HGF
-
비의존적
MET 인산화 유도
마커
IGSF1
억제시 세포 성장
억제능
3-1. 인간 위암 세포주에서
HGF
-
비의존적
MET 인산화 유도
마커
IGSF1
발현 억제시 세포 성장
억제능
분석
본 발명자들은 인간 위암 세포주 SNU638과 MKN45에서 IGSF1 발현 혹은 MET의 발현을 shRNA 기법으로 억제시킨 후 세포 성장 억제능을 분석하였다.
그 결과, 도 3a 상단 패널에 나타낸 바와 같이, 3 일 동안 세포수를 측정하였을 때, MET 혹은 IGSF1 억제시 세포의 성장이 억제되는 것을 확인할 수 있었다.
또한, 인간 위암 세포주 SNU638과 MKN45에서 IGSF1 혹은 MET 발현을 억제시킨 후 세포 성장 억제 정도를 콜로니 형성 어세이(colony forming assay) 방법으로 확인하였다.
그 결과, 도 3a 하단 패널에 나타낸 바와 같이, IGSF1 혹은 MET을 억제한 경우 콜로니 수가 감소하는 것을 확인할 수 있었다.
3-2. 인간 폐암 세포주에서
HGF
-
비의존적
MET 인산화 유도
마커
IGSF1
발현 억제시 세포 성장
억제능
분석
본 발명자들은 인간 폐암 세포주 HCC827과 HCC1944에서 IGSF1 발현 혹은 MET의 발현을 shRNA 기법으로 억제시킨 후 세포 성장 억제능을 분석하였다.
도 3b에 나타낸 바와 같이, 24 시간, 48 시간에 세포 수를 측정한 결과 MET 혹은 IGSF1을 억제한 그룹에서 세포 성장이 억제되는 것을 확인할 수 있었다.
실시예
4.
HGF
-
비의존적
MET 인산화 유도
마커
IGSF1
억제시 암세포의 전이성 및 이동성 억제 확인
4-1. 인간 위암 세포주에서의
HGF
-
비의존적
MET 인산화 유도
마커
IGSF1
발현 억제시 암세포의 전이성 및 이동성 억제 분석
본 발명자들은 인간 위암 세포주 SNU638과 MKN45에서 IGSF1 발현을 siRNA 기법으로 억제시킨 후, 전이성과 이동성의 억제 정도를 세포 침윤 측정법(invasion chamber assay)과 상처 치유 측정법(wound healing assay)으로 분석하였다.
그 결과, 도 4a에 나타낸 바와 같이, IGSF1 발현을 억제시킨 세포와 MET의 발현을 억제시킨 세포가 동일하게 전이성과 이동성을 억제하는 것으로 관찰되었다.
4-2. 인간 폐암 세포주에서의
HGF
-
비의존적
MET 인산화 유도
마커
IGSF1
발현 억제시 암세포의 전이성 및 이동성 억제 분석
본 발명자들은 인간 폐암 세포주 HCC827과 H1944에서 IGSF1 발현을 shRNA 기법으로 억제시킨 후, 암세포의 전이성 및 이동성 억제 정도를 세포 침윤 측정법(invasion chamber assay)과 세포 이동 측정법(migration assay)으로 분석하였다.
그 결과, 도 4b에 나타낸 바와 같이, HCC827과 H1944에서 IGSF1의 억제는 대조군(sc)과 비교하여 전이능이 80% 이하로 감소하는 것으로 관찰되었다. MET 억제의 경우에도 비슷한 양상을 보였다.
실시예
5. 위암 및 폐암 세포주에 MET 억제제 적용시
IGSF1
의 영향 분석
5-1. 위암 세포주에
IGSF1
발현 유무에 따른 MET 저해제의 효능 비교 분석
본 발명자들은 위암 세포주인 SNU638과 MKN45에서 IGSF1을 억제하였을 때 MET 저해제에 대한 반응성이 증가하는 것을 확인하였다. 도 5a에 나타낸 바와 같이, MET 저해제인 PHA665752를 농도 별로 처리하였을 때 세포 사멸이 유도되는 것을 트립판 블루 배제(trypan blue exclusion) 방법으로 확인하였고, 이 때 cleaved caspase 3 발현이 증가하는 것을 증명하였다.
5-2. 폐암 세포주에
IGSF1
발현 유무에 따른 MET 저해제의 효능 비교 분석
본 발명자들은 폐암 세포주인 HCC827에 IGSF1 발현을 억제한 결과 세포 사멸이 증가하고, MET 저해제에 대한 반응성도 증가하는 것을 확인하였다.
실시예
6.
microRNA
를 이용한
HGF
-
비의존적
MET 인산화 유도
마커
IGSF1
및 c-MET의 동시 억제
6-1.
HGF
-
비의존적
MET 인산화 유도
마커
IGSF1
및 c-MET을 동시 억제하는
miR34a
및
miR34c
에 의한 IGSF1과 MET
억제능
분석
본 발명자들은 HGF-비의존적 MET 인산화 유도 마커 IGSF1 및 MET을 동시 억제하는 miR34a 및 miR34c에 의한 억제 정도를 분석하고자, 인간 293 세포주에 각각 야생형 IGSF1, 야생형 MET, 이들의 3'UTR 부위를 변이(mutation)시킨 루시퍼라아제(luciferase) 플라스미드를 이용하여 miR34a 또는 miR34c와 함께 형질감염(transfection)시켰다.
그 결과, 도 6a에 나타낸 바와 같이, miR34a 및 miR34c는 야생형 MET에서 낮은 루시퍼라아제 활성을 나타냈다. 즉, MiR34a 및 miR34c에 의한 IGSF1과 MET의 루시퍼라아제 활성은 야생형에서만 억제되었다. miR34a 및 miR34c는 MET과 IGSF1 유전자의 3'UTR 부위에 결합하여 두 가지 유전자를 동시 저해하는 것으로 확인하였다.
6-2
HGF
-
비의존적
MET 인산화 유도
마커
IGSF1
및 c-MET을 동시 억제하는
miR34a
및
miR34c
에 의한
IGSF1
과 c-MET의 발현 변화
본 발명자들은 HGF-비의존적 MET 인산화 유도 마커 IGSF1 및 MET을 동시 억제하는 miR34a 및 miR34c에 의한 IGSF1과 MET의 발현 변화 정도를 분석하고자, 인간 위암 세포주 MKN45 및 SNU638에 miR34a 또는 miR34c를 형질감염 시킨 후, MET 발현과 IGSF1의 발현을 real-time PCR 방법으로 확인하였다.
그 결과, 도 6b 상단 패널에 나타낸 바와 같이, SNU638 세포주에서 MiR34a 또는 miR34c에 의해서 HGF-비의존적 MET 인산화 유도 마커 IGSF1과 MET의 발현이 감소되는 것으로 관찰되었다.
또한, 도 6b 하단 패널에 나타낸 바와 같이, 인간 위암 MKN45, SNU638 세포주에 miR34a 또는 miR34c를 형질감염시켜 MET 발현과 IGSF1의 발현을 분석한 결과, MiR34a 또는 miR34c에 의해서 HGF-비의존적 c-MET 인산화 유도 마커 IGSF1과 c-MET의 발현이 억제되는 것으로 관찰되었다.
6-3.
HGF
-
비의존적
MET 인산화 유도
마커
IGSF1
및 c-MET을 동시 억제하는
miR34a
및
miR34c
에 의한 세포성장 분석
본 발명자들은 HGF-비의존적 MET 인산화 유도 마커 IGSF1 및 MET을 동시 억제하는 miR34a 및 miR34c에 의한 세포 성장을 분석하고자, 인간 위암 세포주 SNU638에 miR34a 또는 miR34c를 형질감염 시킨 후, 암세포의 성장을 확인하였다.
그 결과, 도 6c 상단 패널에 나타낸 바와 같이, MiR34a 또는 miR34c에 의해서 암세포의 성장이, 대조군과 비교하여 유의하게 억제되는 것으로 관찰되었다.
또한, 도 6c 하단 패널에 나타낸 바와 같이, 인간 위암 세포주에 miR34a 또는 miR34c를 형질감염시켰을 때, 관련 신호 기전의 발현이 감소하는 것을 확인하였다.
6-4.
HGF
-
비의존적
MET 인산화 유도
마커
IGSF1
및 c-MET을 동시 억제하는
miR34a
및
miR34c
에 의한 세포 전이성 및 이동성 억제 분석
도 6d 상단 패널에 나타낸 바와 같이, 본 발명자들은 위암 세포주인 SNU638과 MKN45에 mir-34a 또는 mir-34c를 형질감염시켰을 때, 세포 이동성이 억제되는 것을 확인하였다.
또한, 도 6d 중간 패널에 나타낸 바와 같이, 위암 세포주에 mir-34a 또는 mir-34c를 형질감염시켰을 때, 세포의 전이성이 약 50% 정도 억제되는 결과를 확인할 수 있었다.
또한, 도 6d 하단 패널에 나타낸 바와 같이, 위암 세포주인 SNU638에 mir-34a 또는 mir-34c를 형질감염시켰을 때, 세포의 이동성이 억제되고, 이 때, MMP9의 발현이 감소하는 것을 확인하였다.
6-5.
mir
-34a 및
mir
-34c에 의한
IGSF1
및 MET의 억제를 안타고미어(
antagomir
)로 회복(recovery) 유도
도 6e 상단 패널에 나타낸 바와 같이, 본 발명자들은 위암 세포주인 SNU638에 ant-mir34a 혹은 anti-mir34c를 형질 감염시켰을 때, mir-34a 또는 mir-34c에 의해 억제되었던 MET과 IGSF1의 발현이 회복되는 것을 RNA 수준(왼쪽)과 단백질 수준(오른쪽)에서 확인하였다.
또한, 도 6e 하단 패널에 나타낸 바와 같이, 폐암 세포주인 HCC827과 H1944에 mir-34a, mir-34c를 형질감염시킨 후 pMET과 IGSF1의 발현이 감소하고, anti-mir34a와 anti-mir-34c에 의해 감소되었던 단백질의 발현이 다시 회복되는 것을 확인할 수 있었다.
한편, 도 6f 상단 패널에 나타낸 바와 같이, 위암 세포주인 SNU638과 MKN45에 anti-mir34a 또는 anti-mir34c에 의해 세포의 성장이 다시 회복되는 것을 mir34a, mir34c의 결과와 비교하였다.
또한, 도 6f 하단 패널에 나타낸 바와 같이, 폐암 세포주에 위와 동일한 실험을 하였을 때, 세포 성장이 회복되는 것을 확인하였다.
한편, 도 6g 상단 패널에 나타낸 바와 같이, 위암 세포주에서 anti-mir34a 또는 anti-mir34c에 의해 세포의 이동성이 회복되는 것을 확인하였다.
또한, 도 6g 중간 패널에 나타낸 바와 같이, 위암 세포주에서 anti-mir34a 또는 anti-mir34c에 의해 세포의 전이성이 회복되는 것을 확인하였다.
또한, 도 6g 하단 패널에 나타낸 바와 같이, 폐암 세포주 (HCC827)에서 anti-mir34a 또는 anti-mir34c에 의해 세포의 전이성과 이동성이 회복되는 것을 확인하였다.
따라서, HGF-비의존적 MET 인산화를 유도하는 IGSF1과 MET는 MET 저해제에 대한 감수성 예측용 바이오마커로서의 가능성을 보여준다.
실시예
7. 위암 환자 조직에서의 MET 활성,
IGSF1
및
HGF
의 발현 수준 확인
본 발명자들은 실제 위암 환자 조직에서의 MET 활성, IGSF1 및 HGF의 발현 수준을 확인하기 위해, US Biomax에서 TMA slide를 구입한 후 면역화학염색법을 실시하였다.
그 결과, 도 7의 상단 패널에 나타낸 바와 같이, 위암 환자 TMA(tissue microarray) 조직에서 MET 활성을 보이면서, IGSF1을 발현하고, HGF가 발현되지 않은 비율은 약 30%를 차지하는 것으로 나타났다.
<110> THE ASAN FOUNDATION
<120> Novel Biomarkers for Predicting Susceptibility to MET Inhibitor
and Uses Thereof
<130> Asan1.91p-1
<150> KR 10-2014-0096636
<151> 2014-07-29
<160> 7
<170> KopatentIn 2.0
<210> 1
<211> 22
<212> RNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> miRNA34a
<400> 1
uggcaguguc uuagcugguu gu 22
<210> 2
<211> 23
<212> RNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> miRNA34c
<400> 2
aggcagugua guuagcugau ugc 23
<210> 3
<211> 19
<212> RNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> IGSF1 siRNA
<400> 3
gcaggucuuu accggugcu 19
<210> 4
<211> 19
<212> RNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> IGSF1 siRNA
<400> 4
ggugcugcua cuggaagga 19
<210> 5
<211> 21
<212> RNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> MET siRNA
<400> 5
aaagataaac ctctcataat g 21
<210> 6
<211> 44
<212> RNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> IGSF1 shRNA
<400> 6
caaagaugga agugaaauau cucuauuuca cuuccaucuu uguu 44
<210> 7
<211> 44
<212> RNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> MET shRNA
<400> 7
gccagccuga augaugacau cucugucauc auucaggcug gcuu 44
Claims (21)
- IGSF1(Immunoglobulin Superfamily member 1, NM_001555.2) 유전자를 포함하는, MET(Mesenchymal-Epithelial Transition factor) 저해제에 대한 감수성 예측용 바이오 마커 조성물로서,
상기 MET는 HGF(Hepatocyte Growth Factor)-비의존적(independent)으로 활성화된 것을 특징으로 하는, 조성물. - 삭제
- 제 1 항에 있어서, 상기 활성화는 IGSF1(Immunoglobulin Superfamily member 1) 및 MET(Mesenchymal-Epithelial Transition factor, NM_001127500.1) 유전자의 동시 발현에 의해 MET 인산화가 유도된 것을 특징으로 하는, 조성물.
- IGSF1(Immunoglobulin Superfamily member 1, NM_001555.2) 유전자의 발현 수준; 또는 이의 단백질의 발현 수준을 측정하는 제제를 포함하는, MET(Mesenchymal-Epithelial Transition factor) 저해제에 대한 감수성 예측용 조성물로서,
상기 MET는 HGF(Hepatocyte Growth Factor)-비의존적(independent)으로 활성화된 것을 특징으로 하는, 조성물. - 삭제
- 제 4 항에 있어서, 상기 활성화는 IGSF1(Immunoglobulin Superfamily member 1, NM_001555.2) 및 MET(Mesenchymal-Epithelial Transition factor, NM_001127500.1) 유전자의 동시 발현에 의해 MET 인산화가 유도된 것을 특징으로 하는, MET 저해제에 대한 감수성 예측용 조성물.
- 제 4 항에 있어서, 상기 MET 저해제는 ACTH(adrenocorticotropic hormone) 생성 종양, 급성 림프구성 또는 림프아구성 백혈병, 급성 또는 만성의 림포구성 백혈병, 급성 비림프구성 백혈병, 방광암, 뇌종양, 유방암, 경관암, 만성 골수성 백혈병, 림프종, 자궁내막증, 식도암, 방광암, 에윙스 육종(Ewing's sarcoma), 설암, 홉킨스 림프종, 카포시스 육종, 신장암, 간암, 폐암, 중피종, 다발성 골수종, 신경아세포종, 비홉킨 림프종, 골육종, 난소암, 유선암, 전립선암, 췌장암, 대장암, 페니스암, 레티노블라스토마, 피부암, 위암, 갑상선압, 자궁암, 고환암, 윌름스 종양 및 트로포블라스토마로 이루어진 군에서 선택된 1 종 이상에 대한 치료제인 것을 특징으로 하는, MET 저해제에 대한 감수성 예측용 조성물.
- 제 7 항에 있어서, 상기 MET 저해제는 항-MET 항체, 유인 MET 수용체, MET 펩티드 길항제, 우성 네가티브 MET 돌연변이, MET 특이적 안티센스 올리고뉴클레오티드 및 리보자임, 및 선택적 소분자 MET 키나제 억제제로 이루어진 군에서 선택된 1 종 이상인 것을 특징으로 하는, MET 저해제에 대한 감수성 예측용 조성물.
- 제 4 항에 있어서, 상기 유전자 발현 수준을 측정하는 제제는 상기 유전자의 mRNA에 특이적으로 결합하는 안티센스 올리고뉴클레오티드, 프라이머 쌍 또는 프로브를 포함하는 것을 특징으로 하는, MET 저해제에 대한 감수성 예측용 조성물.
- 제 4 항에 있어서, 상기 단백질의 발현 수준을 측정하는 제제는 상기 단백질에 특이적으로 결합하는 항체, 펩타이드 또는 뉴클레오티드를 포함하는 것을 특징으로 하는, MET 저해제에 대한 감수성 예측용 조성물.
- 제 4 항, 및 제 6 항 내지 제 10 항 중 어느 한 항의 조성물을 포함하는, MET 저해제에 대한 감수성 예측용 키트.
- (a) IGSF1(Immunoglobulin Superfamily member 1,NM_001555.2) 유전자의 발현; 또는 상기 유전자의 단백질의 발현 또는 활성을 억제하는 억제제; 및 (b) MET(Mesenchymal-Epithelial Transition factor, NM_001127500.1) 유전자의 발현; 또는 상기 유전자의 단백질의 발현 또는 활성을 억제하는 억제제를 유효성분으로 포함하는, 대상의 MET(Mesenchymal-Epithelial Transition factor) 저해제에 대한 감수성 증진제로서,
상기 (a)의 억제제는 서열번호 1의 염기서열을 포함하는 MiR34a; 서열번호 2의 염기서열을 포함하는 miR34c, 서열번호 3의 염기서열을 포함하는 IGSF1 siRNA, 서열번호 4의 염기서열을 포함하는 IGSF1 siRNA 및 서열번호 6의 염기서열을 포함하는 IGSF1 shRNA로 이루어진 군으로부터 선택되는 것이고;
상기 (b)의 억제제는 서열번호 1의 염기서열을 포함하는 MiR34a; 서열번호 2의 염기서열을 포함하는 miR34c, 서열번호 5의 염기서열을 포함하는 MET siRNA 및 서열번호 7의 염기서열을 포함하는 MET shRNA로 이루어진 군으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는, 감수성 증진제. - 삭제
- 삭제
- 삭제
- 삭제
- 대상체 유래의 생물학적 시료 내 IGSF1(Immunoglobulin Superfamily member 1, NM_001555.2) 유전자 또는 이의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계를 포함하는 MET(Mesenchymal-Epithelial Transition factor) 저해제에 대한 감수성 예측을 위한 정보제공 방법으로서,
상기 IGSF1 유전자 또는 이의 단백질 발현 수준이 대조군에 비하여 고발현인 경우, 대상체가 MET 저해제에 대한 감수성이 있는 것으로 판정하는 것을 특징으로 하는 방법. - 제 17 항에 있어서, 상기 시료 내 HGF 유전자 또는 이의 단백질 발현 수준이 대조군과 비교하여 저발현 또는 비발현된 경우, 상기 대상체가 MET 저해제에 대한 감수성이 있는 것으로 판정하는 것을 특징으로 하는, 방법.
- 제 17 항에 있어서, 상기 시료 내 MET(Mesenchymal-Epithelial Transition factor, NM_001127500.1) 유전자 또는 이의 단백질 발현 수준이 대조군에 비하여 고발현된 경우, 상기 대상체가 MET 저해제에 대한 감수성이 있는 것으로 판정하는 것을 특징으로 하는, 방법.
- 삭제
- 제 12 항의 감수성 증진제를 유효성분으로 포함하는, 암의 예방 또는 치료용 약학적 조성물.
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
KR20140096636 | 2014-07-29 | ||
KR1020140096636 | 2014-07-29 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
KR20160014564A KR20160014564A (ko) | 2016-02-11 |
KR101811731B1 true KR101811731B1 (ko) | 2018-01-25 |
Family
ID=55217870
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
KR1020150107604A KR101811731B1 (ko) | 2014-07-29 | 2015-07-29 | Met 저해제에 대한 감수성 예측용 신규한 바이오 마커 및 이의 용도 |
Country Status (7)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US11186873B2 (ko) |
EP (2) | EP3800270B1 (ko) |
JP (1) | JP6667967B2 (ko) |
KR (1) | KR101811731B1 (ko) |
CN (1) | CN107532199B (ko) |
ES (2) | ES2898343T3 (ko) |
WO (1) | WO2016018088A1 (ko) |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2023211073A1 (ko) * | 2022-04-25 | 2023-11-02 | 웰마커바이오 주식회사 | 항-igsf1 항체에 대한 암 환자의 감수성 예측용 바이오마커 조성물 및 이를 이용하는 방법 |
Families Citing this family (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2020175898A1 (ko) * | 2019-02-26 | 2020-09-03 | 서울대학교 산학협력단 | Tut4/7 발현 조절인자를 포함하는 암 예방 또는 치료용 약학적 조성물 |
WO2021201571A1 (ko) * | 2020-03-31 | 2021-10-07 | 웰마커바이오 주식회사 | Igsf1 에 대한 항체를 유효성분으로 포함하는 암 예방 또는 치료용 약학 조성물 및 이를 이용한 암 치료 방법 |
US20240262906A1 (en) | 2021-08-20 | 2024-08-08 | Wellmarker Bio Co., Ltd. | Anti-igsf1 antibody and use thereof |
KR20230151913A (ko) | 2022-04-25 | 2023-11-02 | 웰마커바이오 주식회사 | 항-igsf1 항체 및 항-pd-1 항체를 포함하는 암 치료용 약학 조성물 |
KR20230163144A (ko) * | 2022-05-23 | 2023-11-30 | 웰마커바이오 주식회사 | Igsf1의 c-말단에 결합하는 항체 및 이의 용도 |
KR20240057508A (ko) * | 2022-10-24 | 2024-05-03 | 웰마커바이오 주식회사 | 항-igsf1 항체를 포함하는 암 치료용 약학 조성물 |
CN117721131A (zh) * | 2023-12-19 | 2024-03-19 | 吉林大学 | 一种重组骨形态发生蛋白突变体的制备方法和应用 |
Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20090227533A1 (en) | 2007-06-08 | 2009-09-10 | Bader Andreas G | miR-34 Regulated Genes and Pathways as Targets for Therapeutic Intervention |
WO2013106747A2 (en) | 2012-01-12 | 2013-07-18 | Oncocyte Corporation | Methods and compositions for the treatment and diagnosis of thyroid cancer |
US20140141996A1 (en) | 2011-06-22 | 2014-05-22 | Oncocyte Corporation | Methods and Compositions for the Treatment and Diagnosis of Cancer |
Family Cites Families (10)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2006006948A2 (en) * | 2002-11-14 | 2006-01-19 | Dharmacon, Inc. | METHODS AND COMPOSITIONS FOR SELECTING siRNA OF IMPROVED FUNCTIONALITY |
US7872117B2 (en) * | 2004-03-26 | 2011-01-18 | Van Andel Research Institute | c-met siRNA adenovirus vectors inhibit cancer cell growth, invasion and tumorigenicity |
US8652786B2 (en) * | 2005-04-05 | 2014-02-18 | The General Hospital Corporation | Method for predicting responsiveness to drugs |
EP2307570B1 (en) * | 2008-06-27 | 2018-07-18 | Institut Pasteur | Molecular signature of liver tumor grade and use to evaluate prognosis and therapeutic regimen |
US20110201103A1 (en) * | 2008-08-07 | 2011-08-18 | University Of Southern California | System For Synergetic Expression Of Multiple Small Functional RNA Elements |
US20120100157A1 (en) * | 2010-10-11 | 2012-04-26 | Van Andel Research Institute | Biomarker and Method for Predicting Sensitivity to MET Inhibitors |
RU2608644C2 (ru) * | 2010-11-03 | 2017-01-23 | арДЖЕН-ИКС Н.В. | Антитела против белка рецептора с-мет |
JP2014506791A (ja) * | 2011-02-03 | 2014-03-20 | マーナ セラピューティクス インコーポレイテッド | miR−34の合成模倣体 |
ES2734673T3 (es) * | 2011-03-02 | 2019-12-11 | Nestle Sa | Predicción de la sensibilidad farmacológica de tumores de pulmón basándose en identificaciones moleculares y genéticas |
WO2016081773A2 (en) * | 2014-11-19 | 2016-05-26 | Mirna Therapeutics, Inc. | Combination cancer therapy with c-met inhibitors and synthetic oligonucleotides |
-
2015
- 2015-07-29 CN CN201580050842.0A patent/CN107532199B/zh active Active
- 2015-07-29 WO PCT/KR2015/007965 patent/WO2016018088A1/ko active Application Filing
- 2015-07-29 JP JP2017504723A patent/JP6667967B2/ja active Active
- 2015-07-29 KR KR1020150107604A patent/KR101811731B1/ko active IP Right Grant
- 2015-07-29 US US15/329,904 patent/US11186873B2/en active Active
- 2015-07-29 EP EP20207150.2A patent/EP3800270B1/en active Active
- 2015-07-29 EP EP15828125.3A patent/EP3176269B1/en active Active
- 2015-07-29 ES ES20207150T patent/ES2898343T3/es active Active
- 2015-07-29 ES ES15828125T patent/ES2851925T3/es active Active
Patent Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20090227533A1 (en) | 2007-06-08 | 2009-09-10 | Bader Andreas G | miR-34 Regulated Genes and Pathways as Targets for Therapeutic Intervention |
US20140141996A1 (en) | 2011-06-22 | 2014-05-22 | Oncocyte Corporation | Methods and Compositions for the Treatment and Diagnosis of Cancer |
WO2013106747A2 (en) | 2012-01-12 | 2013-07-18 | Oncocyte Corporation | Methods and compositions for the treatment and diagnosis of thyroid cancer |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
NCBI GenBank Accession No. NM_001555.2 (2008.02.24.)* |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2023211073A1 (ko) * | 2022-04-25 | 2023-11-02 | 웰마커바이오 주식회사 | 항-igsf1 항체에 대한 암 환자의 감수성 예측용 바이오마커 조성물 및 이를 이용하는 방법 |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
JP2017529831A (ja) | 2017-10-12 |
EP3176269A1 (en) | 2017-06-07 |
EP3800270A1 (en) | 2021-04-07 |
ES2898343T3 (es) | 2022-03-07 |
EP3176269B1 (en) | 2020-12-02 |
US20170327894A1 (en) | 2017-11-16 |
KR20160014564A (ko) | 2016-02-11 |
CN107532199A (zh) | 2018-01-02 |
WO2016018088A1 (ko) | 2016-02-04 |
JP6667967B2 (ja) | 2020-03-18 |
CN107532199B (zh) | 2021-10-22 |
EP3176269A4 (en) | 2018-01-10 |
EP3800270B1 (en) | 2021-10-27 |
US11186873B2 (en) | 2021-11-30 |
ES2851925T3 (es) | 2021-09-09 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
KR101811731B1 (ko) | Met 저해제에 대한 감수성 예측용 신규한 바이오 마커 및 이의 용도 | |
Liu et al. | PIWIL3/OIP5-AS1/miR-367-3p/CEBPA feedback loop regulates the biological behavior of glioma cells | |
Yan et al. | Hsa_circ_0035483 sponges hsa-miR-335 to promote the gemcitabine-resistance of human renal cancer cells by autophagy regulation | |
Chen et al. | Down-regulation of long non-coding RNA FOXD3 antisense RNA 1 (FOXD3-AS1) inhibits cell proliferation, migration, and invasion in malignant glioma cells | |
JP7369672B2 (ja) | Egfr-標的製剤に対する感受性予測用の新規なバイオマーカー及びその用途 | |
JP6223451B2 (ja) | がんの診断及び治療方法 | |
Hong et al. | Upregulation of adenylate cyclase 3 (ADCY3) increases the tumorigenic potential of cells by activating the CREB pathway | |
Geismann et al. | Binding of the transcription factor Slug to the L1CAM promoter is essential for transforming growth factor-β1 (TGF-β)-induced L1CAM expression in human pancreatic ductal adenocarcinoma cells | |
Xu et al. | Sprouty2 suppresses progression and correlates to favourable prognosis of intrahepatic cholangiocarcinoma via antagonizing FGFR 2 signalling | |
KR101844541B1 (ko) | Parp 저해제에 대한 감수성 예측용 신규한 바이오 마커 및 이의 용도 | |
Xu et al. | miR-519 inhibits epithelial-mesenchymal transition and biologic behavior of gastric cancer cells by down-regulating FOXQ1 | |
KR101875935B1 (ko) | Her2 저해제 내성 바이오마커 | |
KR102238258B1 (ko) | 간암 진단을 위한 신규 바이오마커 및 이를 이용한 치료 방법 | |
US20120201837A1 (en) | Use of eif3m for the diagnosis and treatment of cancer | |
Nikolova et al. | Cetuximab attenuates metastasis and u-PAR expression in non–small cell lung cancer: u-PAR and E-cadherin are novel biomarkers of cetuximab sensitivity | |
KR102237463B1 (ko) | 암 진단 또는 치료 표적으로서 lypd1의 용도 | |
KR20170052454A (ko) | 소라페닙 민감성 예측용 바이오마커 조성물 | |
KR20190090623A (ko) | 전암성 병변에서 조기 간암을 진단 및 예측할 수 있는 바이오 마커 및 이의용도 | |
KR102620797B1 (ko) | Blzf1 과발현 종양 예방 또는 치료용 약학 조성물 | |
Chu et al. | EGF-Activated Grb7 Confers to STAT3-Mediated EPHA4 Gene Expression in Regulating Lung Cancer Progression | |
KR101986267B1 (ko) | Met 저해제에 대한 감수성 예측용 조성물 | |
KR101793174B1 (ko) | Golgb1 또는 sf3b3을 이용한 재발암의 진단방법 및 golgb1 또는 sf3b3의 억제제를 함유하는 재발암 치료용 조성물 | |
KR101927577B1 (ko) | 간암 바이오 마커로서 h2a.z.1의 용도 | |
Dai et al. | Miltirone suppresses ESCC cell viability and invasion by promoting E3 ligase mediated‐FZD2 ubiquitination and degradation | |
US9567627B2 (en) | Method for predicting the response to treatment with an HER2-blocking agent |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A201 | Request for examination | ||
E902 | Notification of reason for refusal | ||
E701 | Decision to grant or registration of patent right | ||
GRNT | Written decision to grant |