KR101617087B1 - 돼지 고급육 관련 단일염기다형성 마커 조성물 및 이를 이용한 돼지 고급육 판별방법 - Google Patents

돼지 고급육 관련 단일염기다형성 마커 조성물 및 이를 이용한 돼지 고급육 판별방법 Download PDF

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Abstract

본 발명은 돼지 고급육 관련 단일염기다형성(single nucleotide polymorphism; SNP) 마커 조성물 및 이를 이용한 돼지 고급육 판별방법에 관한 것으로서, 서열번호 1 내지 서열번호 138의 26번째 뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상의 단일염기다형성(SNP) 마커를 포함하는 5-50개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오티드를 포함하는 돼지 고급육 판별용 조성물을 제공한다. 또한 본 발명은 상기 SNP 마커를 이용한 돼지 고급육 판별방법 및 판별용 키트를 제공한다. 이를 토대로 돼지의 고급육과 관련된 정보를 신속하게 판별할 수 있어, 맛이 뛰어난 돈육을 개발하는데 유용하게 사용될 수 있다.

Description

돼지 고급육 관련 단일염기다형성 마커 조성물 및 이를 이용한 돼지 고급육 판별방법{Single nucleotide polymorphism marker composition associated with high quality meat in pig and method for determination of high quality meat in pig using same marker}
본 발명은 돼지 고급육 관련 단일염기다형성(single nucleotide polymorphism; SNP) 마커 조성물 및 이를 이용한 돼지 고급육 판별방법에 관한 것이다.
최근 다양한 돼지 품종들과 이들의 교배조합을 이용하여 양적 유전형질을 조절하는 양적 형질좌위(quantitative traits loci, QTL)에 대한 연구들이 활발히 수행되고 있다. 우리 나라의 경우 돼지의 개량은 과거 수십 년 동안, 성장능력 위주로 개량되어 왔다. 그 결과, 급격한 성장으로 인해서 스트레스에 대한 저항성이 약해지고 육질이 저하되면서, 이상돈육 및 폐사율 증가 등의 문제점이 발생하였다.
근래에 들어서 국민 식생활 수준의 변화가 웰빙 열풍으로 변함으로 육류 소비 경향이 양에서 질 위주로 전환되어 소비자가 맛있고 고품질 고기를 선호하는 추세로, 돼지 고급육 관련 단일염기다형성 유전자형은 돼지 선발에 매우 유용하다.
한국공개특허 제10-2013-0110140호 (2013.10.08)
본 발명의 목적은 서열번호 1 내지 서열번호 138의 26번째 뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상의 단일염기다형성(SNP) 마커를 포함하는 5-50개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오티드를 포함하는 돼지 고급육 판별용 조성물을 제공하는데 있다.
본 발명의 다른 목적은 상기 SNP 마커를 이용한 돼지 고급육 판별방법 및 판별용 키트를 제공하는데 있다.
상기 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 서열번호 1 내지 서열번호 138의 26번째 뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상의 단일염기다형성(SNP) 마커를 포함하는 5-50개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오티드를 포함하는 돼지 고급육 판별용 조성물을 제공한다.
또한, 본 발명은 (1) 개체로부터 DNA 샘플을 수득하는 단계; (2) 상기 (1)단계로부터 수득한 DNA을 주형으로 하여, 서열번호 1 내지 서열번호 138의 26번째 뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상의 SNP 마커를 증폭시킬 수 있는 프라이머를 이용하여 PCR을 수행하는 단계; (3) 상기 PCR 산물로부터 상기 SNP 마커의 유전자형을 확인하는 단계; 및 (4) 상기 유전자형으로 도체중(CWT), 등지방두께(BFT), 육색_Hunter_L, 육색_Hunter_A, 육색_Hunter_B, 보수력(WHC), 조지방(Fat), 조단백질(Protein), 수분(Moisutre), 콜라겐(Collagen), 드립감량(Driploss), 가열감량(Heatloss), 전단력(Shearforce), 색상(NPPC_color), 마블링색상(NPPC_marbling), 여과지흡입량(Filtering) 및 pH45로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상의 특성을 판별하는 단계를 포함하는 돼지 고급육 판별방법을 제공한다.
또한, 본 발명은 서열번호 1 내지 서열번호 138의 26번째 뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상의 단일염기다형성(SNP) 마커를 포함하는 5-50개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오티드를 증폭시킬 수 있는 프라이머, 또는 상기 폴리뉴클레오티드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오티드를 검출할 수 있는 프로브를 포함하는 돼지 고급육 판별용 키트를 제공한다.
본 발명은 돼지 고급육 관련 단일염기다형성(single nucleotide polymorphism; SNP) 마커 조성물 및 이를 이용한 돼지 고급육 판별방법에 관한 것으로서, 본 발명에 따른 단일염기다형성 마커는 돼지의 고급육과 관련된 정보를 신속하게 판별할 수 있어, 맛이 뛰어난 돈육을 개발하는데 유용하게 사용될 수 있다.
본 발명은 서열번호 1 내지 서열번호 138의 26번째 뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상의 단일염기다형성(SNP) 마커를 포함하는 5-50개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오티드를 포함하는 돼지 고급육 판별용 조성물을 제공한다.
본 발명에서 “단일염기다형성(single nucleotide polymorphism; SNP)”은 유전체 상에서 A, T, C, G로 구성되는 염기서열의 한 개가 다른 염기서열로 변한 것을 의미한다.
본 발명에서 “마커”란 돼지 고급육을 판별할 수 있는 특성으로, 도체중(CWT), 등지방두께(BFT), 육색_Hunter_L, 육색_Hunter_A, 육색_Hunter_B, 보수력(WHC), 조지방(Fat), 조단백질(Protein), 수분(Moisutre), 콜라겐(Collagen), 드립감량(Driploss), 가열감량(Heatloss), 전단력(Shearforce), 색상(NPPC_color), 마블링색상(NPPC_marbling), 여과지흡입량(Filtering) 및 pH45를 포함한다.
상기 SNP 마커는 그 개개로도 돼지 고급육 판별용 마커로서 유용하며, 상기 마커를 조합하여 마커수를 많이 포함할수록 돼지 고급육 판별의 정확도가 높아질 수 있다.
본 명세서에서 사용되는 용어 "N>M" (이때, N 및 M은 각각 독립적으로 A, C, T 또는 G이다.)은 유전자 염기서열에서 N 염기가 M 염기로 치환된 것을 의미한다. 한편, 본 명세서의 서열번호 1 내지 서열번호 138의 염기서열은 각각 다중염기기재 방식에 따라 작성하였다.
또한, 본 발명은 (1) 개체로부터 DNA 샘플을 수득하는 단계; (2) 상기 (1)단계로부터 수득한 DNA을 주형으로 하여, 서열번호 1 내지 서열번호 138의 26번째 뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상의 SNP 마커를 증폭시킬 수 있는 프라이머를 이용하여 PCR을 수행하는 단계; (3) 상기 PCR 산물로부터 상기 SNP 마커의 유전자형을 확인하는 단계; 및 (4) 상기 유전자형으로 도체중(CWT), 등지방두께(BFT), 육색_Hunter_L, 육색_Hunter_A, 육색_Hunter_B, 보수력(WHC), 조지방(Fat), 조단백질(Protein), 수분(Moisutre), 콜라겐(Collagen), 드립감량(Driploss), 가열감량(Heatloss), 전단력(Shearforce), 색상(NPPC_color), 마블링색상(NPPC_marbling), 여과지흡입량(Filtering) 및 pH45로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상의 특성을 판별하는 단계를 포함하는 돼지 고급육 판별방법을 제공한다.
상기 DNA의 공급부위는 특별히 한정된 것은 아니며, 일례로, 근육, 표피, 혈액, 뼈, 장기로부터 얻을 수 있고, 바람직하게는 근육 또는 혈액으로부터 얻을 수 있다. 본 발명의 일례로, 출발물질이 gDNA인 경우, gDNA의 분리는 당업계에 공지된 통상의 방법에 따라 실시될 수 있으며 (참조: Rogers & Bendich (1994), 출발물질이 mRNA인 경우에는, 역전사효소를 이용하여 cDNA로 합성될 수 있다.
또한, 본 발명은 서열번호 1 내지 서열번호 138의 26번째 뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상의 단일염기다형성(SNP) 마커를 포함하는 5-50개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오티드를 증폭시킬 수 있는 프라이머, 또는 상기 폴리뉴클레오티드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오티드를 검출할 수 있는 프로브를 포함하는 돼지 고급육 판별용 키트를 제공한다.
본 발명에 있어서, 상기 돼지 고급육 판별은 도체중(CWT), 등지방두께(BFT), 육색_Hunter_L, 육색_Hunter_A, 육색_Hunter_B, 보수력(WHC), 조지방(Fat), 조단백질(Protein), 수분(Moisutre), 콜라겐(Collagen), 드립감량(Driploss), 가열감량(Heatloss), 전단력(Shearforce), 색상(NPPC_color), 마블링색상(NPPC_marbling), 여과지흡입량(Filtering) 및 pH45로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상의 특성을 판별할 수 있다.
상기 "증폭시킬 수 있는 프라이머"란 짧은 자유 3말단 수산화기(free 3' hydroxyl group)를 가지는 염기 서열로 상보적인 템플레이트(template)와 염기쌍(base pair)을 형성할 수 있고 주형 가닥 복사를 위한 시작 지점으로 기능을 하는 짧은 서열을 의미하며, 적절한 버퍼 중의 적절한 조건 (예를 들면, 4개의 다른 뉴클레오시드 트리포스페이트 및 DNA, RNA 폴리머라제 또는 역전사 효소와 같은 중합제) 및 적당한 온도 하에서 주형-지시 DNA 합성의 시작점으로서 작용할 수 있는 단일가닥 올리고뉴클레오티드를 말한다. 상기 프라이머의 적절한 길이는 사용 목적에 따라 달라질 수 있으나, 통상 15 내지 30 뉴클레오티드이다. 짧은 프라이머 분자는 일반적으로 주형과 안정한 혼성체를 형성하기 위해서는 더 낮은 온도를 필요로 한다. 프라이머 서열은 주형과 완전하게 상보적일 필요는 없으나, 주형과 혼성화 할 정도로 충분히 상보적이어야 한다.
상기 "프로브"는 특정 뉴클레오타이드 서열에 혼성화될 수 있는 디옥시리보뉴클레오타이드 및 리보뉴클레오타이드를 포함하는 자연 또는 변형되는 모노머 또는 결합을 갖는 선형의 올리고머를 의미한다. 본 발명에 이용되는 프로브는 본 발명의 SNP를 포함하는 서열에 완전하게 (perfectly) 상보적인 서열이 이용될 수 있으나, 특이적 혼성화를 방해하지 않는 범위 내에서 실질적으로 (substantially) 상보적인 서열이 이용될 수도 있다.
상기 진단용 키트에는 본 발명의 돼지 고급육 판별용 마커를 증폭시킬 수 있는 프라이머 뿐만 아니라, 중합 반응에 필요한 시약, 예를 들면 dNTP, 각종의 중합효소 및 발색제 등을 포함할 수 있다. 한편, 본 발명의 키트는 DNA 칩, 마이크로어레이 등으로 응용될 수도 있다.
이하, 본 발명을 실시예에 의거하여 보다 구체적으로 설명한다. 실시예는 오로지 본 발명을 보다 구체적으로 설명하기 위한 것으로, 본 발명의 요지에 따라 발명의 범위가 이들 실시예에 의해 제한되지 않는다는 것은 당업계에서 통상의 지식을 가진 자에 있어서 자명할 것이다.
< 실시예 1> 돼지 시료 수집
시료는 2012년 5월부터 2013년 까지 다산육종(주) 농장에서 사육되어진 361두의 도체형질을 수집하여 17개 도체/고급육 성분 형질들을 수집하였다.
< 실시예 2> 유전자형 분석
상기 실시예 1에서 수집한 돈육을 대상으로 고밀도 Illumina porcine 62,123 SNPs 어레이를 이용하여 분석하였다. 각각의 SNP에 대하여 형질과 연관분석을 최소자승법을 이용하여 하기 두 단계로 전장연관분석(GWAS)을 수행하였다.
먼저, 표현형을 보정하기 위해, 표현형에 영향을 미치는 생시차수(1년차, 2년차), 성별을 고정효과로 도체일령을 공변이로 일반선형모델을 적용하여 SAS 9.0을 실시해 수행한 뒤, Genome relaionship matrix로 하는 혼합모형(Genomic BLUP)을 적용하여 ASREML version 3.0 software을 실시하였다. 그 후 잔차, 즉 보정한 표현형 값을 각 SNP에 대하여 연관분석을 실시하였다. 상기 시료들은 임의로 선택된 시료이기에 유전적 관계는 독립적이라 가정하였다.
본 모델은 단순 회귀분석 형태로 분석식은 다음과 같다.
Y = μ + βX + e, X = (1 0), (0 1), (-1 0) for 각 SNP의 AA, AB, BB 유전자형
(β는 해당 표현형에 대한 SNP의 상가적(additive) 효과와 우성(dominance) 효과를 나타냄)
각 형질별 연관분석 결과, 유의수준이 1x10- 3이하인 P 값을 가진 SNP 중 상위 SNP를 해당 형질과 통계적 유의도를 가진 연관성을 보인다고 판단하고 이를 선별하였다. 그 결과 도체중(CWT, kg), 등지방두께(BFT, mm), 육색_Hunter_L, 육색_Hunter_A, 육색_Hunter_B, 보수력(WHC, %), 조지방(Fat, %), 조단백질(Protein, %), 수분(Moisutre, %), 콜라겐(Collagen, %), 드립감량(Driploss, %), 가열감량(Heatloss, %), 전단력(Shearforce, kg), 색상(NPPC_color), 마블링색상(NPPC_marbling), 여과지흡입량(Filtering), pH45와 관련된 17개의 도체/고급육 관련 형질과 관련하여 138개의 SNP를 확인하였다.
17개의 도체/고급육 관련 형질의 기초 통계량을 하기 표 1에 나타내었다.
No Trait Name Mean Stdev 변이계수 Min Max
T1 도체중(CWT, kg) 86.75 5.68 0.07 111.00 71.00
T2 등지방두께(BFT, mm) 25.09 5.23 0.21 46.00 12.00
T3 육색_Hunter_L 40.52 2.39 0.06 49.04 34.44
T4 육색_Hunter_A 5.54 0.99 0.18 8.84 3.38
T5 육색_Hunter_B 1.66 0.66 0.40 3.83 0.25
T6 보수력(WHC, %) 58.36 3.36 0.06 67.82 50.13
T7 조지방(Fat, %) 2.66 1.19 0.45 10.15 0.42
T8 조단백질(Protein, %) 23.72 0.91 0.04 26.24 20.95
T9 수분(Moisutre, %) 75.38 1.02 0.01 77.57 69.98
T10 콜라겐(Collagen, %) 0.89 0.13 0.15 1.39 0.53
T11 드립감량(Driploss, %) 4.02 2.05 0.51 14.38 0.11
T12 가열감량(Heatloss, %) 23.41 6.35 0.27 39.02 6.81
T13 전단력(Shearforce, kg) 2.96 0.79 0.27 6.14 1.27
T14 색상(NPPC_color) 3.46 0.61 0.18 5.00 1.50
T15 마블링색상(NPPC_marbling) 2.19 0.67 0.31 5.00 1.00
T16 여과지흡입량(Filtering) 53.88 21.34 0.40 130.00 10.00
T17 pH45 6.06 0.29 0.05 6.72 5.30
본 발명을 통해 수득한 형질별로 유의적으로 연관된 SNP 정보를 하기 표 2 내지 표 18에 나타내었다. 각 표에서 Minor allele에 대한 additive 추정값으로 나타내었다.
도체중(CWT, kg) 관련 SNP 정보
SNP ID SNP
(MinorA/
MajorB)		 SSC position
(bp)		 Additive
estimate		 StdErr Dominance
estimate		 StdErr Model (-)LOGP σ2 SNP/
σ2 P
MARC0039651 [G/A] 1 306299060 -4.53 1.42 5.55 1.48 3.54 0.03
INRA0016200 [A/G] 4 102018110 7.90 1.74 -8.06 1.78 4.53 0.04
ALGA0027612 [A/G] 4 102049562 7.89 1.74 -8.17 1.78 4.59 0.05
ALGA0027632 [G/A] 4 102207404 10.21 2.46 -10.48 2.50 3.82 0.05
ALGA0027533 [A/G] 4 109161179 7.90 1.74 -8.00 1.78 4.51 0.05
ASGA0045150 [A/G] 9 75478572 2.97 0.93 -2.01 1.00 3.41 0.02
ALGA0075815 [G/A] 14 18422668 -0.59 0.28 1.49 0.36 3.62 0.02
ASGA0070932 [G/A] 15 87352560 0.21 0.22 1.19 0.30 3.53 0.02
INRA0052780 [A/G] 17 12918022 0.31 0.29 -1.39 0.38 3.23 0.01
등지방두께(BFT, mm) 관련 SNP 정보
SNP ID SNP
(MinorA/
MajorB)		 SSC position
(bp)		 Additive
estimate		 StdErr Dominance
estimate		 StdErr Model (-)LOGP σ2 SNP/
σ2 P
M1GA0024950 [A/G] 2 519058 -0.50 0.24 -0.55 0.30 4.28 0.02
M1GA0025119 [A/C] 2 1021191 -1.20 0.34 0.54 0.40 3.83 0.02
INRA0023683 [A/G] 7 13857623 1.55 0.35 -1.66 0.41 4.42 0.02
ALGA0038804 [G/A] 7 14435577 1.55 0.35 -1.56 0.40 4.42 0.02
ALGA0042468 [A/G] 7 72414751 0.86 0.33 -1.59 0.39 3.92 0.02
H3GA0022027 [A/G] 7 72517972 0.76 0.28 -1.65 0.34 5.24 0.02
ALGA0042514 [G/A] 7 73878617 0.20 0.20 -1.03 0.27 3.44 0.01
ALGA0061762 [A/G] 11 23023046 -0.23 0.20 1.09 0.27 3.83 0.02
육색_Hunter_L 관련 SNP 정보
SNP ID SNP
(MinorA/
MajorB)		 SSC position
(bp)		 Additive
estimate		 StdErr Dominance
estimate		 StdErr Model (-)LOGP σ2 SNP/
σ2 P
ASGA0011559 [G/A] 2 122818169 -0.29 0.29 1.89 0.41 4.59 0.12
ALGA0044281 [G/A] 7 109738081 -0.71 0.28 -1.32 0.39 3.63 0.12
H3GA0022821 [A/G] 7 109762962 -0.71 0.28 -1.32 0.39 3.63 0.12
ALGA0062575 [G/A] 11 46920485 4.21 1.14 -5.00 1.22 3.69 0.23
H3GA0034274 [A/C] 12 19032715 0.51 0.30 -1.52 0.39 3.67 0.11
ASGA0059086 [A/G] 13 89016649 -0.90 0.45 -0.69 0.55 3.66 0.11
ALGA0072331 [G/A] 13 89105667 -0.90 0.44 -0.76 0.56 3.91 0.12
ASGA0059108 [G/A] 13 89786866 -0.67 0.27 1.38 0.38 4.72 0.12
MARC0031939 [A/G] 13 155498991 -0.61 0.48 -1.09 0.59 3.66 0.11
육색_Hunter_A 관련 SNP 정보
SNP ID SNP
(MinorA/
MajorB)		 SSC position
(bp)		 Additive
estimate		 StdErr Dominance
estimate		 StdErr Model (-)LOGP σ2 SNP/
σ2 P
ALGA0046922 [A/G] 8 8841233 -0.40 0.18 0.91 0.22 3.79 0.09
MARC0077431 [A/G] 8 21762993 -0.43 0.17 0.92 0.21 4.10 0.11
ALGA0073422 [A/C] 13 110852621 0.47 0.15 0.10 0.19 3.63 0.12
ALGA0079036 [C/A] 14 79077104 -0.15 0.14 0.71 0.18 3.57 0.12
ASGA0073283 [G/A] 16 28000952 1.74 0.47 -1.31 0.49 4.25 0.42
H3GA0046586 [A/G] 16 29167307 0.97 0.28 -0.55 0.31 3.71 0.19
ASGA0098651 [A/C] 17 48193363 -0.03 0.12 -0.66 0.16 3.81 0.11
육색_Hunter_B 관련 SNP 정보
SNP ID SNP
(MinorA/
MajorB)		 SSC position
(bp)		 Additive
estimate		 StdErr Dominance
estimate		 StdErr Model (-)LOGP σ2 SNP/
σ2 P
DIAS0003115 [G/A] 8 63242315 0.11 0.12 0.22 0.14 3.47 0.10
ASGA0059581 [G/A] 13 109059269 0.08 0.07 0.27 0.08 3.66 0.11
H3GA0043362 [G/A] 14 144982306 -0.05 0.06 -0.30 0.08 3.73 0.11
ASGA0073079 [G/A] 16 20613940 0.34 0.09 -0.41 0.11 3.47 0.20
ALGA0090414 [A/G] 16 22684463 0.86 0.23 -0.70 0.25 3.48 0.23
ALGA0090430 [G/A] 16 23300223 0.86 0.23 -0.70 0.25 3.48 0.24
ASGA0073283 [G/A] 16 28000952 0.88 0.23 -0.72 0.24 3.66 0.42
보수력(WHC, %) 관련 SNP 정보
SNP ID SNP
(MinorA/
MajorB)		 SSC position
(bp)		 Additive
estimate		 StdErr Dominance
estimate		 StdErr Model (-)LOGP σ2 SNP/
σ2 P
CASI0009899 [A/C] 4 97951453 -0.34 0.16 0.81 0.20 3.55 0.02
ASGA0021392 [A/G] 4 98004303 -0.38 0.16 0.80 0.20 3.54 0.02
ALGA0037164 [G/A] 6 37616692 0.11 0.12 0.67 0.17 3.62 0.02
ALGA0037412 [A/G] 6 39904206 -1.96 0.61 1.33 0.65 3.50 0.03
ASGA0029925 [A/C] 6 40001181 -1.96 0.61 1.30 0.65 3.62 0.03
ALGA0037575 [A/C] 6 41687568 -0.06 0.20 -0.69 0.25 3.87 0.02
ASGA0101886 [C/A] 6 154446076 0.48 0.12 -0.09 0.17 3.53 0.02
ALGA0058657 [A/G] 10 27183632 -0.25 0.15 0.80 0.19 3.95 0.02
조지방(Fat, %) 관련 SNP 정보
SNP ID SNP
(MinorA/
MajorB)		 SSC position
(bp)		 Additive
estimate		 StdErr Dominance
estimate		 StdErr Model (-)LOGP σ2 SNP/
σ2 P
ASGA0028030 [A/G] 6 7608302 0.86 0.18 -0.88 0.19 5.14 0.03
ALGA0118175 [G/A] 6 25118038 0.90 0.20 -0.91 0.22 4.26 0.03
CASI0009866 [A/G] 10 10653456 0.56 0.25 -0.83 0.26 3.60 0.06
DIAS0000635 [A/G] 12 26289830 -0.08 0.05 0.30 0.07 4.43 0.03
H3GA0038523 [G/A] 14 6230507 0.49 0.13 -0.46 0.14 3.26 0.04
INRA0043022 [A/G] 14 19662544 0.94 0.20 -0.92 0.22 4.64 0.04
H3GA0046123 [G/A] 16 9322147 0.20 0.07 -0.33 0.08 3.32 0.03
INRA0054308 [A/C] 17 45920699 0.16 0.05 -0.20 0.06 3.46 0.02
조단백질(Protein, %) 관련 SNP 정보
SNP ID SNP
(MinorA/
MajorB)		 SSC position
(bp)		 Additive
estimate		 StdErr Dominance
estimate		 StdErr Model (-)LOGP σ2 SNP/
σ2 P
DIAS0000914 [A/G] 2 31051370 -0.14 0.03 0.14 0.05 4.04 0.02
ALGA0013819 [C/A] 2 32380515 -0.13 0.03 0.12 0.05 3.42 0.02
H3GA0031679 [G/A] 11 20422565 0.01 0.04 -0.18 0.05 3.33 0.02
INRA0036347 [G/A] 11 35567018 0.27 0.12 -0.43 0.13 3.17 0.02
H3GA0041844 [C/A] 14 111788929 -0.01 0.03 0.17 0.05 3.18 0.02
ALGA0090620 [C/A] 16 28478963 0.21 0.05 -0.20 0.07 3.17 0.03
ALGA0097202 [A/G] 18 17012597 -0.13 0.04 0.20 0.05 3.42 0.02
수분(Moisutre, %) 관련 SNP 정보
SNP ID SNP
(MinorA/
MajorB)		 SSC position
(bp)		 Additive
estimate		 StdErr Dominance
estimate		 StdErr Model (-)LOGP σ2 SNP/
σ2 P
ASGA0009568 [A/G] 2 23458627 -0.32 0.08 0.36 0.09 4.18 0.04
ASGA0015627 [A/C] 3 46261128 -0.21 0.06 0.26 0.07 3.30 0.03
ALGA0116277 [A/G] 9 116240271 -0.91 0.21 0.85 0.22 4.28 0.08
DIAS0000500 [A/C] 12 20003522 -0.26 0.08 0.36 0.09 3.20 0.04
ALGA0077175 [G/A] 14 42555323 -0.19 0.07 0.32 0.08 3.30 0.02
ALGA0081261 [A/G] 14 120492714 -0.30 0.08 0.34 0.09 3.59 0.03
ASGA0073978 [A/G] 16 72134280 0.08 0.04 -0.21 0.06 3.27 0.02
ASGA0077916 [A/G] 17 50428013 -0.04 0.04 -0.21 0.06 3.69 0.02
콜라겐(Collagen, %) 관련 SNP 정보
SNP ID SNP
(MinorA/
MajorB)		 SSC position
(bp)		 Additive
estimate		 StdErr Dominance
estimate		 StdErr Model (-)LOGP σ2 SNP/
σ2 P
ALGA0001436 [A/G] 1 14625398 -0.01 0.01 0.04 0.01 3.92 0.03
ALGA0001445 [A/C] 1 14685880 -0.01 0.01 0.04 0.01 3.92 0.03
ASGA0003493 [A/G] 1 64129132 -0.03 0.01 0.06 0.02 3.54 0.03
ASGA0003498 [A/G] 1 64165755 -0.03 0.01 0.06 0.02 3.56 0.03
ASGA0030712 [C/A] 7 4801888 0.02 0.01 -0.04 0.01 4.34 0.02
H3GA0028354 [G/A] 9 70734244 0.04 0.03 -0.09 0.03 3.64 0.02
M1GA0015850 [G/A] 12 1613755 0.02 0.01 -0.03 0.01 3.58 0.02
MARC0010535 [A/G] 12 59638289 0.04 0.01 -0.07 0.02 4.08 0.03
ASGA0096371 [A/G] 12 59650488 0.03 0.01 -0.06 0.02 3.58 0.03
드립감량(Driploss, %) 관련 SNP 정보
SNP ID SNP
(MinorA/
MajorB)		 SSC position
(bp)		 Additive
estimate		 StdErr Dominance
estimate		 StdErr Model (-)LOGP σ2 SNP/
σ2 P
ASGA0009032 [A/G] 2 4976028 3.89 0.76 -3.97 0.77 5.81 0.08
ALGA0011938 [A/G] 2 10321914 1.43 0.34 -1.42 0.36 3.80 0.02
ALGA0019574 [G/A] 3 69151453 1.09 0.24 -1.27 0.27 5.05 0.02
ASGA0020402 [G/A] 4 75675556 0.17 0.09 -0.55 0.11 5.27 0.02
H3GA0037269 [A/G] 13 79193056 0.98 0.23 -1.20 0.25 4.89 0.03
H3GA0046416 [C/A] 16 18456403 3.90 0.76 -3.88 0.77 5.76 0.06
ALGA0091441 [G/A] 16 43547282 0.40 0.54 0.23 0.56 3.65 0.02
ALGA0114198 [A/G] 16 76477777 0.38 0.38 0.27 0.40 4.84 0.02
MARC0029189 [G/A] 18 4829959 0.81 0.17 -0.72 0.20 4.94 0.02
가열감량(Heatloss, %) 관련 SNP 정보
SNP ID SNP
(MinorA/
MajorB)		 SSC position
(bp)		 Additive
estimate		 StdErr Dominance
estimate		 StdErr Model (-)LOGP σ2 SNP/
σ2 P
ASGA0007712 [A/C] 1 238682766 -0.80 0.27 1.30 0.32 3.53 0.01
ALGA0010501 [A/G] 1 281949682 -0.71 0.23 1.29 0.29 4.45 0.02
ALGA0013817 [A/G] 2 32360325 0.62 0.18 -0.89 0.25 3.49 0.01
M1GA0007212 [A/G] 5 1457531 -0.22 0.19 -0.65 0.24 3.48 0.01
ALGA0031831 [G/A] 5 45197690 -1.73 0.50 2.24 0.56 3.44 0.01
M1GA0013565 [A/G] 10 3311547 -1.95 0.54 2.34 0.60 3.36 0.01
ALGA0059426 [A/G] 10 34313169 -3.10 0.80 3.40 0.84 3.57 0.03
H3GA0050765 [G/A] 18 23104618 0.25 0.15 0.76 0.21 3.71 0.01
ALGA0098047 [A/G] 18 23129186 0.25 0.15 0.76 0.21 3.71 0.01
전단력(Shearforce, kg)관련 SNP 정보
SNP ID SNP
(MinorA/
MajorB)		 SSC position
(bp)		 Additive
estimate		 StdErr Dominance
estimate		 StdErr Model (-)LOGP σ2 SNP/
σ2 P
ALGA0110679 [G/A] 1 11261185 0.00 0.04 0.16 0.05 3.51 0.01
ASGA0036842 [A/G] 7 126525777 -0.15 0.08 -0.01 0.09 3.55 0.01
ASGA0059105 [A/G] 13 153037942 0.79 0.20 -0.85 0.21 3.58 0.02
H3GA0038277 [A/G] 14 1106687 0.26 0.07 -0.19 0.08 3.73 0.02
ASGA0067563 [G/A] 14 141114235 -0.03 0.03 0.17 0.04 3.96 0.02
ALGA0110306 [G/A] 15 36828337 -0.02 0.03 -0.17 0.04 4.07 0.02
ASGA0071087 [C/A] 15 89413072 1.19 0.35 -1.33 0.35 3.71 0.06
ASGA0079835 [A/G] 18 26002117 0.05 0.04 0.13 0.05 3.68 0.01
H3GA0051216 [G/A] 18 32703313 -0.10 0.03 0.13 0.04 3.67 0.01
색상(NPPC_color) 관련 SNP 정보
SNP ID SNP
(MinorA/
MajorB)		 SSC position
(bp)		 Additive
estimate		 StdErr Dominance
estimate		 StdErr Model (-)LOGP σ2 SNP/
σ2 P
ASGA0000934 [A/G] 1 7815866 -0.11 0.04 0.23 0.06 3.51 0.04
SIRI0000226 [G/A] 1 7841348 -0.11 0.04 0.23 0.06 3.51 0.04
ASGA0089621 [A/G] 1 10942526 -0.11 0.04 0.23 0.06 3.51 0.04
ALGA0123033 [A/G] 2 153685013 0.13 0.04 -0.23 0.06 3.66 0.06
ASGA0082869 [G/A] 2 154117695 0.12 0.04 -0.21 0.06 3.29 0.05
ASGA0033071 [G/A] 7 41784513 0.08 0.04 -0.17 0.05 3.30 0.04
ASGA0105918 [G/A] 10 17831863 0.20 0.06 -0.24 0.07 3.22 0.08
ALGA0091367 [G/A] 16 71784981 0.48 0.11 -0.51 0.12 4.35 0.26
ALGA0091378 [G/A] 16 71808394 0.48 0.11 -0.51 0.12 4.35 0.26
마블링색상(NPPC_marbling) 관련 SNP 정보
SNP ID SNP
(MinorA/
MajorB)		 SSC position
(bp)		 Additive
estimate		 StdErr Dominance
estimate		 StdErr Model (-)LOGP σ2 SNP/
σ2 P
ALGA0018576 [A/G] 3 42183266 0.01 0.05 -0.23 0.06 3.91 0.05
H3GA0012396 [A/C] 4 26766257 0.09 0.04 -0.18 0.05 3.18 0.04
ALGA0039404 [G/A] 7 22768050 -0.19 0.12 0.39 0.13 3.22 0.06
ALGA0044519 [G/A] 7 115234121 0.10 0.05 -0.24 0.06 3.14 0.05
ASGA0053654 [G/A] 12 10041783 -0.04 0.04 0.20 0.05 3.21 0.04
ALGA0066408 [A/C] 12 21071557 0.44 0.11 -0.38 0.12 3.48 0.13
ALGA0078259 [C/A] 14 64777508 0.03 0.05 -0.22 0.06 3.08 0.04
H3GA0046523 [G/A] 16 22474224 0.06 0.04 -0.24 0.06 3.31 0.03
여과지흡입량(Filtering) 관련 SNP 정보
SNP ID SNP
(MinorA/
MajorB)		 SSC position
(bp)		 Additive
estimate		 StdErr Dominance
estimate		 StdErr Model (-)LOGP σ2 SNP/
σ2 P
H3GA0012885 [A/C] 4 71596251 4.06 1.60 -8.39 2.19 3.63 0.04
H3GA0053185 [A/G] 6 36220940 10.57 3.76 -16.93 4.19 3.84 0.09
ALGA0039405 [C/A] 7 22759576 -0.80 4.95 10.82 5.42 3.50 0.04
ASGA0031851 [G/A] 7 23138961 4.46 3.76 4.88 4.24 3.68 0.04
ALGA0042514 [G/A] 7 73878617 3.75 1.69 -9.35 2.30 3.67 0.04
ALGA0113380 [A/G] 9 54936329 3.51 2.13 5.06 2.69 3.51 0.04
MARC0019805 [A/G] 14 22270117 3.86 1.70 -9.29 2.32 3.56 0.04
pH45 관련 SNP 정보
SNP ID SNP
(MinorA/
MajorB)		 SSC position
(bp)		 Additive
estimate		 StdErr Dominance
estimate		 StdErr Model (-)LOGP σ2 SNP/
σ2 P
ALGA0041577 [A/C] 7 53276693 -0.22 0.06 0.16 0.07 3.44 0.01
ALGA0041859 [G/A] 7 55188550 -0.19 0.05 0.12 0.06 3.61 0.05
M1GA0010398 [A/G] 7 56081133 -0.03 0.04 0.15 0.05 3.59 0.04
ALGA0056895 [G/A] 10 10804758 0.09 0.02 -0.09 0.03 3.81 0.02
ALGA0078930 [A/G] 14 76817512 0.04 0.02 -0.08 0.03 3.32 0.04
ASGA0100169 [G/A] 17 3751012 -0.02 0.02 0.11 0.03 3.36 0.04
ALGA0092880 [G/A] 17 5953523 -0.07 0.03 0.14 0.03 3.85 0.03
SNP: 첫 번째 allele (빈도가 낮은 minor allele); 두 번째 allele (빈도가 높은 major allele)
SSC: 염색체 번호
position(bp): SNP 위치 (base pairs)
Additive estimate: SNP 효과로 두 번째 allele이 첫 번째 allele로 대체될 때 기대치
Dominance estimate: SNP 효과로 대립유전자내의 상호 작용에 의한 효과
stderr: 효과 측정치의 표준오차
-Log10(P): P값의 10의 log지수값
σ2 SNP/σ2 P: SNP 효과크기로 표현형 분산중에서 해당 SNP에 의하여 설명되어지는 분산의 비율
본 발명을 통해 수득한 형질별로 유의적으로 연관된 SNP 염기서열을 하기 표 19 내지 표 35에 나타내었다. 하기 표 19 내지 표 35에서 [A/B]란 염기 A가 염기 B로 돌연변이된 SNP임을 의미한다.
도체중(CWT, kg)
SNP RefSeq
번호		 Probe 서열번호
MARC0039651 rs81232543 CGACTGAACCCTTTTGAAGTCACAC[A/G]CCTTCCCCTAAGCACAACCAGAGGT 1
INRA0016200 rs334162789 GTGGCCTTTAAAGGGCAGTTAAACC[A/G]CCATATCACCTAAAACCACAAACAA 2
ALGA0027612 s80782809 CAAATGCCAGGCAGACGCAAATAGC[A/G]CACTTTCCTACAAATAGCCTCCCCA 3
ALGA0027632 rs80783544 ACACTGAAAGGCAAGAGCTGAGATA[A/G]TGAGGTGGCCCAGGGCACATGCGGT 4
ALGA0027533 rs80855553 CATGTGGGAAGCTAAGAGTGCCCAT[A/G]GGCCAGTTGGAGGAATCCACAGGTG 5
ASGA0045150 rs81418579 CAAGTGTCAGTTCCAGCTCTAACAC[A/G]TAGCAGCTCTGTGACCTTGGACAAG 6
ALGA0075815 rs80836401 AGCCTGAGCTGCACTGTCTGAGGAC[A/G]GGGGGCACCAGTGTCGTCTTTACCA 7
ASGA0070932 rs81455284 GCCAATGGAAACCACTGAGCTTCAG[A/G]AAGTCCATGAGCCAGGATTCCTGTT 8
INRA0052780 rs333311249 TTCTATAACTTTCATCATCTTAGCT[C/T]TGGAGTTTATTGTATCTTTGTTTTC 9
등지방두께(BFT, mm)
SNP RefSeq
번호		 Probe 서열번호
M1GA0024950 rs81343851 AGCAAATAGAGCAGCCGGTGCGAGG[A/G]AAGGAAGGACTTGGAGGAGTAAGTC 10
M1GA0025119 rs81346169 TTACAGGCAGGCTTTTATTGGGATG[A/C]GATGTGGGCGTCAGGCCGGCTCTGG 11
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ALGA0042468 rs80846471 CTTCTCAGCCCTCTCCCCTTTAACT[A/G]TAGCGGCTGCTCATAGAATGCCACC 14
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보수력(WHC, %)
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조지방(Fat, %)
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조단백질(Protein, %)
SNP RefSeq
번호		 Probe 서열번호
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수분(Moisutre, %)
SNP RefSeq
번호		 Probe 서열번호
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콜라겐(Collagen, %)
SNP RefSeq
번호		 Probe 서열번호
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드립감량(Driploss, %)
SNP RefSeq
번호		 Probe 서열번호
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가열감량(Heatloss, %)
SNP RefSeq
번호		 Probe 서열번호
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전단력(Shearforce, kg)
SNP RefSeq
번호		 Probe 서열번호
ALGA0110679 rs81338992 AAGGACCTCAGGACCCGACAGCTGA[C/T]AAAGGGAGAGCACCTGGTCCTGTTC 99
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H3GA0051216 rs81471255 AACCTTCAAATGTTTCTTCTTGACC[C/T]CTCTGGGCCTTGATTTCAGCAGAAA 107
색상(NPPC_color)
SNP RefSeq
번호		 Probe 서열번호
ASGA0000934 rs81355262 GGCAAATCTACGTTGTGGAGCTAGC[C/T]ATAAAACAGCTGACCTGATCTCTTT 108
SIRI0000226 rs81355271 AGCTGAGCTGAGTTTGGGGCGGGGG[A/G]TGTCTCTCTGGGTCTCTTCCTTGAG 109
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ALGA0091378 rs81461482 AGGAAGGTTTTACTAGCTCACTTTT[C/T]AGGTTTTGAGAGTTATAAATATTAG 116
마블링색상(NPPC_marbling)
SNP RefSeq
번호		 Probe 서열번호
ALGA0018576 rs81369327 TTGTAGCTAATATGTTTGCAAGTTA[C/T]ACAGTAATAATTAGTGTGAGAGGAA 117
H3GA0012396 rs80931510 GTTGCTTATATATCACAATAGTGAA[G/T]AGTGCTGCATTGAACACTGGGGAGG 118
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H3GA0046523 rs81458829 ATGGGCATAATGGCCTTCCATTGCT[C/T]TAGAGAAGACTTTAAAGCAAAATGC 124
여과지흡입량(Filtering)
SNP RefSeq
번호		 Probe 서열번호
H3GA0012885 rs80854716 TCCTCCTTCAGTCTTATCTCTTTCC[A/C]TGTGGGCCCATCCCATCCCCTGATC 125
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pH45
SNP RefSeq
번호		 Probe 서열번호
ALGA0041577 rs80943101 GTGAATACGGAAGCTGGGAGAGAAA[A/C]AGCCAGGGGGCCAAAGCCAGCAGAC 132
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<110> Research Cooperation Foundation of Yeungnam University <120> Single nucleotide polymorphism marker composition associated with high quality meat in pig and method for determination of high quality meat in pig using same marker <130> ADP-2014-0194 <160> 138 <170> KopatentIn 2.0 <210> 1 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 1 cgactgaacc cttttgaagt cacacrcctt cccctaagca caaccagagg t 51 <210> 2 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 2 gtggccttta aagggcagtt aaaccrccat atcacctaaa accacaaaca a 51 <210> 3 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 3 caaatgccag gcagacgcaa atagcrcact ttcctacaaa tagcctcccc a 51 <210> 4 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 4 acactgaaag gcaagagctg agatartgag gtggcccagg gcacatgcgg t 51 <210> 5 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 5 catgtgggaa gctaagagtg cccatrggcc agttggagga atccacaggt g 51 <210> 6 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 6 caagtgtcag ttccagctct aacacrtagc agctctgtga ccttggacaa g 51 <210> 7 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 7 agcctgagct gcactgtctg aggacrgggg gcaccagtgt cgtctttacc a 51 <210> 8 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 8 gccaatggaa accactgagc ttcagraagt ccatgagcca ggattcctgt t 51 <210> 9 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 9 ttctataact ttcatcatct tagctytgga gtttattgta tctttgtttt c 51 <210> 10 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 10 agcaaataga gcagccggtg cgaggraagg aaggacttgg aggagtaagt c 51 <210> 11 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 11 ttacaggcag gcttttattg ggatgmgatg tgggcgtcag gccggctctg g 51 <210> 12 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 12 ccagatatta gaagtttaaa aaactrctag ggaaaagaaa tttcccagtg a 51 <210> 13 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 13 cagtgataaa gcttggtgat ggggaytggt tggatatggc agatgagaga a 51 <210> 14 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 14 cttctcagcc ctctcccctt taactrtagc ggctgctcat agaatgccac c 51 <210> 15 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 15 cccccatttg tgacagtaat acagaraagg aagacacatt cagcagtcaa g 51 <210> 16 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 16 gtaaattact tccaaaagtg atttcyagtg acttcatgga agttcagcta a 51 <210> 17 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 17 cttgaatgga ggccactggt tggtartgtt ggattgctga gaccagctca g 51 <210> 18 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 18 catgtgctcc aggagaagct gtctcyactt gcagccctag tggtggatac t 51 <210> 19 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 19 gagcagtgga aatttgagtt gcccartgtg tatgtacatt cccagctgag g 51 <210> 20 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 20 gaggtaataa tgctggccac tgtcaytgtg tacactctct caggcatgca g 51 <210> 21 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 21 ttatctcacc atcaaccaat cagaaraaga tctgtgagct gaacaagcat c 51 <210> 22 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 22 gagaactcct tactccttta tttttkactt catctttttg ggccgctgta a 51 <210> 23 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 23 tttgggagca agggtgaggt gttatrtaaa agctaaatac caaagttcca a 51 <210> 24 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 24 ttggacatga gcttctagta gtgccygcat gcctctaccc tgagactgca c 51 <210> 25 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 25 cacagaccta tttgccaaat aagacyacat tmtcagcttc tacgatctaa g 51 <210> 26 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 26 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aaatacatct cttaaaattt gatgcyatta acctattgtt tgtaactact a 51 <210> 55 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 55 gggtcacaac ttggtgcctg ccctgrtggc cgactttgcc cagctcctgt c 51 <210> 56 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 56 gattgagaaa ccctacctta aatggmtgca atttttttta acataaatta c 51 <210> 57 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 57 tggctgggat ctagggtcca gggcgrgcca aaatgtcaag ggccaggtgt g 51 <210> 58 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 58 atcctaccag aggacagagg gagctkggta ttgatctacc agttcccatc a 51 <210> 59 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 59 gttttataaa agcacattcg tttgayttga gatgcgtatg tgacggggcc c 51 <210> 60 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 60 gggaaaaatg tgtcatgtgg cacttrtaaa ggaagcaact gacaccaaat g 51 <210> 61 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 61 ccaaggtttc agagcatatc agttamgact cttatgtgaa agtggcagaa a 51 <210> 62 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 62 gatgtaagct gaattgagcc agaggmgtaa gaagatcatg agaagcagga g 51 <210> 63 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 63 aaacacttga aaatgtgcag ctaacrgcat gacaggcatg tcactgagca g 51 <210> 64 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 64 ccaagtgcct tttcacagct taggtrgtgg gtgcagaggg gggctgtcta c 51 <210> 65 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 65 cctgactatt ccaggaacaa gtgggkacat tctctggcca agctctagga g 51 <210> 66 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 66 actggtaaac aggaccatct gcatcraccc caaagctact aaaacattcc c 51 <210> 67 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 67 caatggctgt ttagtcccag ccacgmngct acatgcgacc tgcctgaccc t 51 <210> 68 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 68 attggtatct aaaatgagct tgctcdcaaa tctgtccttg gcactgctct t 51 <210> 69 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 69 tgaaccagca aacatttgaa aggcaragct gtagaatgga attaagatgg t 51 <210> 70 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 70 taagctccag agccctcaaa tcatayattt gtgaaattgg aaataaagag g 51 <210> 71 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 71 aaattgtgaa gctctttatt gtgtarcaat attacagaaa tataaatttg c 51 <210> 72 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 72 tggcgccctc tactgacaag gttgarcatc atgccagctt taaaggagaa a 51 <210> 73 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ctgggctgca cagcctgtgg cttctyccca ccccgtagct ggaccctcac c 51 <210> 83 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 83 acttaggatt ctatccagct ctcctytacc agtttaatga ggtaaaggag a 51 <210> 84 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 84 actgcaggag caggtgctga gtcatygccc ctaagctgcc tccaagctga a 51 <210> 85 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 85 gagtttagaa gaggccgaat cctgarctac aacgcaattt atgagttaga t 51 <210> 86 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 86 tctagcaagg actagtctgc acttcmctgg ttgtcactgg cccccagaaa g 51 <210> 87 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 87 acatcaaaat gttagcagtg tcctgrgagg ggagcagatt tcatacagct t 51 <210> 88 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 88 caagagtgga gctatttcct tgtggrattt actggggaaa gaaatgttcc c 51 <210> 89 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 89 gaaccaagtg gcaaatggct tgggtrgttg gggctctgga aggagttaca g 51 <210> 90 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 90 tgatattttc agctgcgttg gtaaakctta gttcctgctc gggaccttga a 51 <210> 91 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 91 taggggtaac ggaggagata gctctycttg ctcctggagg actgggctga g 51 <210> 92 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 92 gtactcattg ctaaagcaga tgtacrcaca attccccaac ttttaggatg t 51 <210> 93 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 93 gaagatatcc ggcgtccagt ggtggrcggg ccgaacttga gaagaggtcg c 51 <210> 94 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 94 agtgggtgta gcaagctgga gcaagrcaat cacaagtcag gccagcagaa c 51 <210> 95 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 95 atctggggct acacctccgg tgtccytctc ctcctgcctt ggtccaatca a 51 <210> 96 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 96 cgtcctgctg agctggtctc tgcagragag gaacagagaa atctcagaca c 51 <210> 97 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 97 acataaccac ccacatggat gcacayattc ccacatccac acattcaccc c 51 <210> 98 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 98 agaaccagaa agtgccaagg agcccrtgga gagggagggg cttaggaaag c 51 <210> 99 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 99 aaggacctca ggacccgaca gctgayaaag ggagagcacc tggtcctgtt c 51 <210> 100 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 100 taaatgagta gtcattattc tgaagyagac agttcccaca gtagaatagc t 51 <210> 101 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 101 aaagtgaaca gctggtggca gaaaaraggt tctcctgaaa ggtcagaagt c 51 <210> 102 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 102 gcgtacgtcc agtgggcatc tgactraagc cagatttgag agccttggaa g 51 <210> 103 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 103 tctgtgttaa cttccttatc cttttrtcat tggcagtgtt ttttaaaaaa t 51 <210> 104 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 104 cacctgggac tggaggcaag aacagrtcaa ggggctgtgc acacagagct g 51 <210> 105 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 105 ctcatcttaa acattaaatg tctttkaggt tttgtgtttg tcctaaaaca t 51 <210> 106 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 106 caagagaaaa gagtgcttct gttcarcaaa agaaagcatt ggagacagtg c 51 <210> 107 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 107 aaccttcaaa tgtttcttct tgaccyctct gggccttgat ttcagcagaa a 51 <210> 108 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 108 ggcaaatcta cgttgtggag ctagcyataa aacagctgac ctgatctctt t 51 <210> 109 <211> 51 <212> DNA <213> pig <400> 109 agctgagctg agtttggggc gggggrtgtc tctctgggtc tcttccttga g 51 <210> 110 <211> 51 <212> 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Claims (5)

  1. 서열번호 1 내지 서열번호 138에서 26번째 위치의 단일염기다형성(SNP) 마커를 포함하는 5-50개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오티드를 포함하는 돼지 고급육 판별용 조성물.
  2. 제 1 항에 있어서, 상기 돼지 고급육 판별은 도체중(CWT), 등지방두께(BFT), 육색_Hunter_L, 육색_Hunter_A, 육색_Hunter_B, 보수력(WHC), 조지방(Fat), 조단백질(Protein), 수분(Moisutre), 콜라겐(Collagen), 드립감량(Driploss), 가열감량(Heatloss), 전단력(Shearforce), 색상(NPPC_color), 마블링색상(NPPC_marbling), 여과지흡입량(Filtering) 및 pH45로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상의 특성을 판별하는 것을 특징으로 하는 돼지 고급육 판별용 조성물.
  3. (1) 개체로부터 DNA 샘플을 수득하는 단계;
    (2) 상기 (1)단계로부터 수득한 DNA을 주형으로 하여, 서열번호 1 내지 서열번호 138에서 26번째 위치의 SNP 마커를 증폭시킬 수 있는 프라이머를 이용하여 PCR을 수행하는 단계;
    (3) 상기 PCR 산물로부터 상기 SNP 마커의 유전자형을 확인하는 단계; 및
    (4) 상기 유전자형으로 도체중(CWT), 등지방두께(BFT), 육색_Hunter_L, 육색_Hunter_A, 육색_Hunter_B, 보수력(WHC), 조지방(Fat), 조단백질(Protein), 수분(Moisutre), 콜라겐(Collagen), 드립감량(Driploss), 가열감량(Heatloss), 전단력(Shearforce), 색상(NPPC_color), 마블링색상(NPPC_marbling), 여과지흡입량(Filtering) 및 pH45로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상의 특성을 판별하는 단계를 포함하는 돼지 고급육 판별방법.
  4. 서열번호 1 내지 서열번호 138에서 26번째 위치의 단일염기다형성(SNP) 마커를 포함하는 5-50개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오티드를 증폭시킬 수 있는 프라이머, 또는 상기 폴리뉴클레오티드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오티드를 검출할 수 있는 프로브를 포함하는 돼지 고급육 판별용 키트.
  5. 제 4 항에 있어서, 상기 돼지 고급육 판별은 도체중(CWT), 등지방두께(BFT), 육색_Hunter_L, 육색_Hunter_A, 육색_Hunter_B, 보수력(WHC), 조지방(Fat), 조단백질(Protein), 수분(Moisutre), 콜라겐(Collagen), 드립감량(Driploss), 가열감량(Heatloss), 전단력(Shearforce), 색상(NPPC_color), 마블링색상(NPPC_marbling), 여과지흡입량(Filtering) 및 pH45로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상의 특성을 판별하는 것을 특징으로 하는 돼지 고급육 판별용 키트.
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