JPWO2020185846A5 - - Google Patents

Download PDF

Info

Publication number
JPWO2020185846A5
JPWO2020185846A5 JP2021554678A JP2021554678A JPWO2020185846A5 JP WO2020185846 A5 JPWO2020185846 A5 JP WO2020185846A5 JP 2021554678 A JP2021554678 A JP 2021554678A JP 2021554678 A JP2021554678 A JP 2021554678A JP WO2020185846 A5 JPWO2020185846 A5 JP WO2020185846A5
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
target
sample
probe
nucleic acid
double
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
JP2021554678A
Other languages
English (en)
Other versions
JP2022525101A (ja
Publication date
Application filed filed Critical
Priority claimed from PCT/US2020/022010 external-priority patent/WO2020185846A1/en
Publication of JP2022525101A publication Critical patent/JP2022525101A/ja
Publication of JPWO2020185846A5 publication Critical patent/JPWO2020185846A5/ja
Abandoned legal-status Critical Current

Links

Claims (22)

  1. 2本鎖核酸の検出方法であって、
    (A)2本鎖核酸を1つ以上含む細胞を含む試料を、標的プローブセットと接触させることであって、前記標的プローブセットが、標的2本鎖核酸の第1の鎖に特異的にハイブリダイゼーションする第1のプローブと、前記2本鎖核酸の第2の鎖に特異的にハイブリダイゼーションする第2のプローブを含む標的プローブ対を含む、前記接触させることと、
    (B)その試料と、前記第1の標的プローブに対する結合部位と、前記第2の標的プローブに対する結合部位と、増幅剤に対する複数の結合部位を含むプレ増幅剤とを接触させることと、
    (C)その試料を複数の増幅剤と接触させることであって、前記増幅剤が、前記プレ増幅剤に対する結合部位と、標識プローブに対する複数の結合部位を含む、前記接触させることと、
    (D)その試料を複数の標識プローブと接触させることであって、前記標識プローブが、標識と、前記増幅剤に対する結合部位を含む、前記接触させることと、
    (E)前記標的2本鎖核酸に結合した前記標識プローブを検出することによって、前記標的2本鎖核酸を検出することと、
    を含む前記方法。
  2. 前記標的プローブセットが、同じ標的核酸に特異的にハイブリダイゼーションする標的プローブ対を2対以上含む、請求項1に記載の方法。
  3. 前記2本鎖核酸が、DNA、RNAまたはDNA/RNAハイブリッドである、請求項1に記載の方法。
  4. 前記試料が、組織検体であるか、または組織検体から抽出したものである、請求項1に記載の方法。
  5. 前記試料が、血液試料であるか、または血液試料から抽出したものである、請求項1に記載の方法。
  6. 前記試料が、細胞学的試料であるか、または細胞学的試料から抽出したものである、請求項1に記載の方法。
  7. (A)標的2本鎖核酸を含む少なくとも1つの固定された浸透化細胞と、
    (B)前記標的2本鎖核酸の第1の鎖に特異的にハイブリダイゼーションした第1のプローブと、前記2本鎖核酸の第2の鎖に特異的にハイブリダイゼーションした第2のプローブを含む標的プローブ対を含む標的プローブセットと、
    (C)前記第1の標的プローブに対する結合部位と、前記第2の標的プローブに対する結合部位と、増幅剤に対する複数の結合部位を含むプレ増幅剤であって、前記第1の標的プローブと前記第2の標的プローブにハイブリダイゼーションされている前記プレ増幅剤と、
    (D)前記プレ増幅剤に対する結合部位と、標識プローブに対する複数の結合部位を含む複数の増幅剤であって、前記プレ増幅剤にハイブリダイゼーションされている前記複数の増幅剤と、
    (E)標識と、前記増幅剤に対する結合部位を含む複数の標識プローブであって、前記増幅剤にハイブリダイゼーションされている前記複数の標識プローブと、
    を含む、固定された浸透化細胞の試料であって、
    前記ハイブリダイゼーションにより、検出可能な標識が前記標的2本鎖核酸上に供給される前記試料。
  8. 前記標的プローブセットが、同じ標的核酸に特異的にハイブリダイゼーションする標的プローブ対を2対以上含む、請求項7に記載の試料。
  9. 前記2本鎖核酸が、DNA、RNAまたはDNA/RNAハイブリッドである、請求項7に記載の試料。
  10. 前記試料が、組織検体であるか、または組織検体から抽出したものである、請求項7に記載の試料。
  11. 前記試料が、血液試料であるか、または血液試料から抽出したものである、請求項7に記載の試料。
  12. 前記試料が、細胞学的試料であるか、または細胞学的試料から抽出したものである、請求項7に記載の試料。
  13. (A)標的2本鎖核酸を含む固定された浸透化細胞を少なくとも1つ含む複数の固定された浸透化細胞が上に固定化されているスライドと、
    (B)前記標的2本鎖核酸の第1の鎖に特異的にハイブリダイゼーションした第1のプローブと、前記2本鎖核酸の第2の鎖に特異的にハイブリダイゼーションした第2のプローブを含む標的プローブ対を含む標的プローブセットと、
    (C)前記第1の標的プローブに対する結合部位と、前記第2の標的プローブに対する結合部位と、増幅剤に対する複数の結合部位を含むプレ増幅剤であって、前記第1の標的プローブと前記第2の標的プローブにハイブリダイゼーションされている前記プレ増幅剤と、
    (D)前記プレ増幅剤に対する結合部位と、標識プローブに対する複数の結合部位を含む複数の増幅剤であって、前記プレ増幅剤にハイブリダイゼーションされている前記複数の増幅剤と、
    (E)標識と、前記増幅剤に対する結合部位を含む複数の標識プローブであって、前記増幅剤にハイブリダイゼーションされている前記複数の標識プローブと、
    を含むスライドであって、
    前記ハイブリダイゼーションにより、検出可能な標識が前記標的2本鎖核酸上に供給される前記スライド。
  14. 前記標的プローブセットが、同じ標的核酸に特異的にハイブリダイゼーションする標的プローブ対を2対以上含む、請求項13に記載のスライド。
  15. 前記2本鎖核酸が、DNA、RNAまたはDNA/RNAハイブリッドである、請求項13に記載のスライド。
  16. 前記試料が、組織検体であるか、または組織検体から抽出したものである、請求項13に記載のスライド。
  17. 前記試料が、血液試料であるか、または血液試料から抽出したものである、請求項13に記載のスライド。
  18. 前記試料が、細胞学的試料であるか、または細胞学的試料から抽出したものである、請求項13に記載のスライド。
  19. 標的2本鎖核酸を検出するためのキットであって、
    (A)第1の標的プローブに対する結合部位と、第2の標的プローブに対する結合部位と、増幅剤に対する複数の結合部位を含むプレ増幅剤と、
    (B)前記プレ増幅剤に対する結合部位と、標識プローブに対する複数の結合部位を含む複数の増幅剤と、
    (C)標識と、前記増幅剤に対する結合部位を含む複数の標識プローブと、
    を含む前記キット。
  20. 前記キットが、標的プローブセットを含み、前記標的プローブセットが、標的2本鎖核酸の第1の鎖に特異的にハイブリダイゼーションする第1のプローブと、前記標的2本鎖核酸の第2の鎖に特異的にハイブリダイゼーションする第2のプローブを含む標的プローブ対を含む、請求項19に記載のキット。
  21. 前記標的プローブセットが、同じ標的核酸に特異的にハイブリダイゼーションする標的プローブ対を2対以上含む、請求項20に記載のキット。
  22. 細胞を浸透化するための試薬を少なくとも1つ含む、請求項19に記載のキット。
JP2021554678A 2019-03-12 2020-03-11 in situでの2本鎖核酸の検出、及びその関連方法 Abandoned JP2022525101A (ja)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201962817449P 2019-03-12 2019-03-12
US62/817,449 2019-03-12
PCT/US2020/022010 WO2020185846A1 (en) 2019-03-12 2020-03-11 Detection of double stranded nucleic acids in situ and methods related thereto

Publications (2)

Publication Number Publication Date
JP2022525101A JP2022525101A (ja) 2022-05-11
JPWO2020185846A5 true JPWO2020185846A5 (ja) 2023-03-09

Family

ID=72427590

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2021554678A Abandoned JP2022525101A (ja) 2019-03-12 2020-03-11 in situでの2本鎖核酸の検出、及びその関連方法

Country Status (5)

Country Link
US (1) US20220177953A1 (ja)
EP (1) EP3938535A4 (ja)
JP (1) JP2022525101A (ja)
CN (1) CN113795592A (ja)
WO (1) WO2020185846A1 (ja)

Family Cites Families (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO1999011813A2 (en) * 1997-09-04 1999-03-11 Bayer Corporation Oligonucleotide probes bearing quenchable fluorescent labels, and methods of use thereof
CN104673905B (zh) * 2005-06-20 2016-09-07 领先细胞医疗诊断有限公司 检测单个细胞中的核酸和鉴定异质大细胞群中罕见细胞的方法
US20120003648A1 (en) * 2010-07-01 2012-01-05 Affymetrix, Inc. Signal Multiplexing and Signal Amplification
US20120052498A1 (en) * 2010-07-01 2012-03-01 Affymetrix, Inc. Detection of Nucleic Acids
US20120004132A1 (en) * 2010-07-02 2012-01-05 Affymetrix, Inc. Detection of Nucleic Acids and Proteins
US9273349B2 (en) * 2013-03-14 2016-03-01 Affymetrix, Inc. Detection of nucleic acids
US20150232935A1 (en) * 2014-02-14 2015-08-20 The General Hospital Corporation Methods for diagnosing igg4-related disease
EP3913068B1 (en) * 2015-10-12 2023-08-02 Advanced Cell Diagnostics, Inc. In situ detection of nucleotide variants in high noise samples, and compositions and methods related thereto
EP4282974A3 (en) * 2016-03-28 2024-03-13 Ncan Genomics, Inc. Linked duplex target capture

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US20220251618A1 (en) Amplicon rescue multiplex polymerase chain reaction for amplification of multiple targets
US8673595B2 (en) Sample analysis method and assay kit used therein
JP2846018B2 (ja) 核酸配列の増幅および検出
US11479819B2 (en) Non-invasive method for monitoring transplanted organ status in organ-transplant recipients
EP3348640A1 (en) Amplified nucleic acid detection method and detection device
WO2011134332A1 (zh) 基于微阵列芯片的多重pcr测定
CN102643910B (zh) 非对称多色荧光发夹探针链反应在病原菌检测中的应用
JP2022145606A (ja) 核酸の正確な並行定量のための高感度な方法
CN115011713B (zh) 基于DNAzyme双循环体系的牛结核分枝杆菌检测探针组及其检测方法
JP2022145605A (ja) 希釈または非精製試料における核酸の正確な並行定量のための方法
KR20190017698A (ko) 결핵 진단용 키트 및 이를 이용한 결핵의 진단방법
JP2014501494A (ja) 核酸標的の定量的多重同定
CN112359143A (zh) 一种基于y型探针组的等温指数扩增方法及其应用
JPWO2020185846A5 (ja)
Morgunova et al. Preparation and processing of dried blood spots for microRNA sequencing
JP2011004733A (ja) 複数検体中の標的核酸を検出するマイクロアレイ
JP2003524168A (ja) 核酸検出のための電気化学的方法
JP4441259B2 (ja) グラム陽性菌の検出方法
WO2004050906A1 (fr) Procede de detection de la methylation de l'adn
CN114085892B (zh) 用于检测靶标核酸分子的可视化检测体系、试剂或试剂盒及检测方法
US20090081650A1 (en) Method for Identifying Nucleotide Sequences, Use of the Method and Test Kit
JPWO2020168162A5 (ja)
CN115058493B (zh) 一种用于多重核酸检测的dna探针、crispr-反向点杂交核酸检测系统及应用
JPWO2021102237A5 (ja)
WO2024207580A1 (zh) 一种高特异性快速核酸检测方法及其应用