JPWO2013035678A1 - 変異型エンドグルカナーゼ - Google Patents
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Abstract
Description
(a)配列番号1、7、13、19、25、31または37で示されるアミノ酸配列であって、エンドグルカナーゼ活性を有するタンパク質をコードするアミノ酸配列;
(b)配列番号1、7、13、19、25、31または37で示されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸が欠失、置換、または付加されたアミノ酸配列であって、エンドグルカナーゼ活性を有するタンパク質をコードするアミノ酸配列;あるいは
(c)配列番号1、7、13、19、25、31または37で示されるアミノ酸配列と90%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列であって、エンドグルカナーゼ活性を有するタンパク質をコードするアミノ酸配列、
のいずれかのアミノ酸配列を含む、[1]の変異型エンドグルカナーゼ。
(2)該形質転換細胞により生産された変異型エンドグルカナーゼを精製する工程を含む、変異型エンドグルカナーゼの製造方法。
EGPhのアミノ酸配列と同一性の高い好熱性菌由来エンドグルカナーゼを探索するため、BLAST検索をおこなった。
EGPh、EGIa1、EGIa2、EGSh、EGPa、EGAc、EGSt遺伝子は、それぞれ配列番号1、7、13、19、25、31、37記載の遺伝子を全合成し、pET11dのNcoIおよびBamHIにDNA Ligation Kit<Mighty Mix>(タカラバイオ)を使用して連結し、JM109(タカラバイオ)に形質転換した。スクリーニングはアンピシリンを抗生物質として含むLB寒天培地を用いて行った。形質転換されたJM109株より、作製したベクターpET-EGPh、EGIa1、EGIa2、EGSh、EGPa、EGAc、EGStをミニプレップキット(キアゲン)により単離し、塩基配列解析を行った。pET-EGPh、EGIa1、EGIa2、EGSh、EGPa、EGAc、EGStは、発現用大腸菌BL21(DE3)pLysS株に形質転換し、BL21-PfuBGL株を作製した。BL21-PfuBGL株を、アンピシリン含有LB培地10mLに植菌し、37℃で一晩振とう培養(前培養)を行った。本培養として、アンピシリン含有LB培地1Lに、前培養で得られた菌体を植菌し、波長600 nmでの吸光度OD600が0.6となるまで振とう培養を行った。その後、最終濃度が0.5mMになるようにイソプロピル-1-チオ-β-D-ガラクトシド(IPTG)を加え、さらに25℃で一晩培養した。培養後、菌体を遠心分離により回収し、 50mM リン酸カリウム緩衝液(pH7.0)に再懸濁した。この溶液を氷冷しながら、超音波破砕を行い、その上清を無細胞抽出液として遠心分離により回収した。得られた無細胞抽出液を、85℃で15分保温し、該エンドグルカナーゼ以外の大腸菌に由来するタンパク質を凝集沈殿した。遠心分離により沈殿物を除去し、上清を分画分子量10000の再生セルロース製透析膜(スペクトラム・ラボラトリーズ製)を使用して、50mM 酢酸緩衝液(pH5.0)に透析した。得られたタンパク質溶液を、野生型のEGPh、EGIa1、EGIa2、EGSh、EGPa、EGAc、EGStとして使用した。
エンドグルカナーゼの加水分解活性を測定する際に基質として使用するリン酸膨潤セルロースは、Walseth (1971) Tappi 35:228(1971)及びWood Biochem J.121:353(1971)に記載の方法に従って、アビセル(Avicel)から調製した。この物質を緩衝液及び水を用いて希釈して2重量%混合物を得て、酢酸ナトリウムの最終濃度が50mM、pH5.2 になるようにした。これをリン酸膨潤セルロースとして、以下の実施例に使用した。
実施例2で得られた変異体と、参考例1で調製した親エンドグルカナーゼのリン酸膨潤セルロース分解活性を以下実験にて比較した。基質に1%リン酸膨潤セルロース/50mM酢酸緩衝液(pH5.2)を用い、それぞれ参考例1、実施例2で調製した酵素を終濃度0.5μMで添加し、50℃で1時間酵素反応をおこなった。上記反応条件下における親エンドグルカナーゼにより生成されたグルコース濃度(g/L)を100%として、各変異体におけるリン酸膨潤セルロース分解活性を相対値で表2に示す。
コニフェリルアルデヒド存在下における、野生型及び変異型エンドグルカナーゼのリン酸膨潤セルロースの分解活性を測定した。基質に1%リン酸膨潤セルロース/50mM酢酸緩衝液(pH5.2)を用い、コニフェリルアルデヒド(シグマアルドリッチ)を終濃度0、5、10、15mMになるように添加し、それぞれ参考例1、実施例2で調製した酵素を終濃度0.5μMで添加後、50℃で1時間酵素反応をおこなった。添加濃度0mMにおいて親エンドグルカナーゼにより生成されたグルコース濃度(g/L)を100%として、それぞれの変異体におけるリン酸膨潤セルロース分解活性を相対値で表3に示す。
バニリン存在下における、野生型及び変異型エンドグルカナーゼのリン酸膨潤セルロースの分解活性を測定した。基質に1%リン酸膨潤セルロース/50mM酢酸緩衝液(pH5.2)を用い、バニリン(シグマアルドリッチ)を終濃度0、5、10、15mMになるように添加し、それぞれ参考例1、実施例2で調製した酵素を終濃度0.5μMで添加後、50℃で1時間酵素反応をおこなった。添加濃度0mMにおいて親エンドグルカナーゼにより生成されたグルコース濃度(g/L)を100%として、それぞれの変異体におけるリン酸膨潤セルロース分解活性を相対値で表4に示す。
フェルラ酸存在下における、野生型及び変異型エンドグルカナーゼのリン酸膨潤セルロースの分解活性を測定した。基質に1%リン酸膨潤セルロース/50mM酢酸緩衝液(pH5.2)を用い、フェルラ酸(シグマアルドリッチ)を終濃度0、5、10、15mMになるように添加し、それぞれ参考例1、実施例2で調製した酵素を終濃度0.5μMで添加後、50℃で1時間酵素反応をおこなった。添加濃度0mMにおいて親エンドグルカナーゼにより生成されたグルコース濃度(g/L)を100%として、それぞれの変異体におけるリン酸膨潤セルロース分解活性を相対値で表5に示す。
エンドグルカナーゼの加水分解活性を測定する際に基質として使用するリン酸膨潤セルロース1〜3を以下のように調製した。
セルロースとして、稲藁を使用した。前記セルロースを小型反応器(耐圧硝子工業製、TVS−N2 30ml)に投入し、液体窒素で冷却した。この反応器にアンモニアガスを流入し、試料を完全に液体アンモニアに浸漬させた。リアクターの蓋を閉め、室温で15分ほど放置した。次いで、150℃のオイルバス中にて1時間処理した。処理後、反応器をオイルバスから取り出し、ドラフト中で直ちにアンモニアガスをリーク後、さらに真空ポンプで反応器内を10Paまで真空引きし乾燥させた。これをリグノセルロース1として以下の実施例に使用した。
セルロースとして、稲藁を使用した。セルロースを硫酸1%水溶液に浸し、150℃で30分オートクレーブ処理(日東高圧製)した。処理後、固液分離を行い、硫酸水溶液(以下、希硫酸処理液)と硫酸処理セルロースに分離した。次に硫酸処理セルロースと固形分濃度が10重量%となるように希硫酸処理液と攪拌混合した後、水酸化ナトリウムによって、pHを5付近に調製した。これをリグノセルロース2として以下の実施例に使用した。
セルロースとして、稲藁を使用した。前記セルロースを水に浸し、撹拌しながら180℃で20分間オートクレーブ処理(日東高圧株式会社製)した。その際の圧力は10MPaであった。処理後は溶液成分(以下、水熱処理液)と処理バイオマス成分に遠心分離(3000G)を用いて固液分離した。この処理バイオマス成分をリグノセルロース3として以下の実施例に使用した。
リグノセルロース基質に該酵素組成物を作用させた場合のグルコース生成量の変化を比較した。50mM酢酸緩衝液(pH5.2)に5重量%のリグノセルロース1〜3(参考例3で調製)を懸濁したものを基質とした。反応は50℃において24時間まで行い、適宜サンプリングして生成したグルコース濃度の測定を行った。糸状菌由来セルラーゼ混合物としては、市販のトリコデルマ・リーセイ由来セルラーゼ(セルクラスト、シグマ)を用いた。エンドグルカナーゼとしては、実施例2で調製した変異型エンドグルカナーゼと参考例1で調製した野生型エンドグルカナーゼをそれぞれ用いた。酵素添加量は、セルラーゼ1.0mg/mL、エンドグルカナーゼ0.1mg/mL(セルラーゼの1/10量)である。表6、7、8にそれぞれリグノセルロース1、2、3から反応24時間後に生成したグルコース濃度(g/L)を比較した。
トリコデルマ属由来セルラーゼを以下の方法で調製した。
コーンスティップリカー2.5%(w/vol)、グルコース2%(w/vol)、酒石酸アンモニウム0.37%(w/vol)、硫酸アンモニウム0.14%(w/vol)、リン酸二水素カリウム0.2%(w/vol)、塩化カルシウム二水和物0.03%(w/vol)、硫酸マグネシウム七水和物0.03%(w/vol)、塩化亜鉛0.02%(w/vol)、塩化鉄(III)六水和物0.01%(w/vol)、硫酸銅(II)五水和物0.004%(w/vol)、塩化マンガン四水和物 0.0008%(w/vol)、ホウ酸0.0006%(w/vol)、七モリブデン酸六アンモニウム四水和物0.0026%(w/vol)となるよう蒸留水に添加し、100mLを500mLバッフル付き三角フラスコに張り込み、121℃で15分間オートクレーブ滅菌した。放冷後、これとは別にそれぞれ121℃で15分間オートクレーブ滅菌したPE−MとTween80をそれぞれ0.1%添加した。この前培養培地にトリコデルマ・リーセイATCC66589(Tricoderma reesei ATCC66589)の胞子を、1×107個/ml培地になるように植菌し、28℃、72時間、180rpmで振とう培養し、前培養とした(振とう装置:TAITEC社製 BIO−SHAKER BR−40LF)。
コーンスティップリカー2.5%(w/vol)、グルコース2%(w/vol)、セルロース(アビセル)10%(w/vol)、酒石酸アンモニウム0.37%(w/vol)、硫酸アンモニウム0.14%(w/vol)、リン酸二水素カリウム0.2%(w/vol)、塩化カルシウム二水和物0.03%(w/vol)、硫酸マグネシウム七水和物0.03%(w/vol)、塩化亜鉛0.02%(w/vol)、塩化鉄(III)六水和物0.01%(w/vol)、硫酸銅(II)五水和物0.004%(w/vol)、塩化マンガン四水和物0.0008%(w/vol)、ホウ酸0.0006%(w/vol)、七モリブデン酸六アンモニウム四水和物0.0026%(w/vol)となるよう蒸留水に添加し、2.5Lを5L容撹拌ジャー(ABLE社製 DPC−2A)容器に張り込み、121℃で15分間オートクレーブ滅菌した。放冷後、これとは別にそれぞれ121℃で15分間オートクレーブ滅菌したPE−MとTween80をそれぞれ0.1%添加し、あらかじめ前記の方法にて液体培地で前培養したトリコデルマ・リーセイATCC66589(Tricoderma reesei ATCC66589)を250mL接種した。その後、28℃、96時間、300rpm、通気量1vvmにて培養を行い、遠心分離後、上清を膜濾過(ミリポア社製 ステリカップ−GV 材質:PVDF)した。
参考例3で調製したリグノセルロース1〜3を基質とし、参考例4で調製したトリコデルマ・リーセイ培養液を糸状菌由来セルラーゼ混合物として使用し、酵素添加量をセルラーゼ1.0mg/mL、β―グルコシダーゼ0.1mg/mL(セルラーゼの1/10量)、β―グルコシダーゼ(Novozyme188)0.01mg/mL(セルラーゼの1/100量)とした以外は、実施例6と同様にしてリグノセルロース1〜3の加水分解を実施した。
比較例1で得られた変異体を実施例3と同様の手法で活性を比較した。上記反応条件下における親エンドグルカナーゼにより生成されたグルコース濃度(g/L)を100%として、各変異体におけるリン酸膨潤セルロース分解活性を相対値で表13に示す。
コニフェリルアルデヒド存在下における、野生型及び比較例1の変異型エンドグルカナーゼのリン酸膨潤セルロースの分解活性を測定した。実験は実施例4と同じ手順で行い、それぞれの変異体におけるリン酸膨潤セルロース分解活性を相対値で表14に示す。
Claims (12)
- 好熱性菌由来のエンドグルカナーゼのアミノ酸配列において、配列番号1のアミノ酸配列の273番目のトリプトファンに相当するアミノ酸残基が、芳香族アミノ酸以外から選ばれるアミノ酸に置換されているアミノ酸配列を含む、変異型エンドグルカナーゼ。
- 好熱性菌由来のエンドグルカナーゼのアミノ酸配列が、以下:
(a)配列番号1、7、13、19,25、31または37で示されるアミノ酸配列であって、エンドグルカナーゼ活性を有するタンパク質をコードするアミノ酸配列;
(b)配列番号1、7、13、19,25、31または37で示されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸が欠失、置換、または付加されたアミノ酸配列であって、エンドグルカナーゼ活性を有するタンパク質をコードするアミノ酸配列;あるいは
(c)配列番号1、7、13、19,25、31または37で示されるアミノ酸配列と90%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列であって、エンドグルカナーゼ活性を有するタンパク質をコードするアミノ酸配列、
のいずれかのアミノ酸配列を含む、請求項1に記載の変異型エンドグルカナーゼ。 - 配列番号1のアミノ酸配列の273番目のトリプトファンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換されている、請求項1または2に記載の変異型エンドグルカナーゼ。
- 配列番号2、8、14、20、26、32または38で示されるアミノ酸配列を含む、請求項1〜3のいずれか1項に記載の変異型エンドグルカナーゼ。
- 請求項1〜4のいずれか1項に記載の変異型エンドグルカナーゼをコードするDNA。
- 配列番号4、10、16、22、28、34または40で示される塩基配列を含む、請求項5に記載のDNA。
- 請求項5または6に記載のDNAを含む、発現ベクター。
- 請求項7に記載の発現ベクターを用いた形質転換により作製された、形質転換細胞。
- (1)請求項8に記載の形質転換細胞を培養する工程;および
(2)該形質転換細胞により生産された変異型エンドグルカナーゼを精製する工程を含む、変異型エンドグルカナーゼの製造方法。 - 請求項1〜4のいずれか1項に記載の変異型エンドグルカナーゼおよび/または請求項8に記載の形質転換細胞の処理物を含む、バイオマス分解用組成物。
- セルロース含有バイオマス懸濁液に、請求項10に記載のバイオマス分解用組成物を添加して加水分解することを含む、セルロース由来バイオマスより糖液を製造する方法。
- さらに、糸状菌由来セルラーゼを添加することを含む、請求項11に記載の方法。
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