JPS63282659A - 核酸の測定方法および測定剤 - Google Patents
核酸の測定方法および測定剤Info
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- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6804—Nucleic acid analysis using immunogens
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/573—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for enzymes or isoenzymes
Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。
め要約のデータは記録されません。
Description
【発明の詳細な説明】
本発明は、5−アザ−2′−デオキシシチジン(daz
aC)、DNAメチラーゼおよび抗−DNAメチラーゼ
抗体を用いる核酸の測定方法および測定剤に関する。
aC)、DNAメチラーゼおよび抗−DNAメチラーゼ
抗体を用いる核酸の測定方法および測定剤に関する。
DNAハイブリダイゼーションの技術は、遺伝性のある
いは微生物性の疾患の研究および診断に、近年広く応用
されている。DNAハイブリダイゼーションは、ハイブ
リダイゼーション条件の下に、2個の一本鎖相補DNA
分子が二重らせんを形成することに基づいている。同様
にして、一本鎖DNA分子とRNA分子は、DNA/
RNAハイブリッドを生じる。
いは微生物性の疾患の研究および診断に、近年広く応用
されている。DNAハイブリダイゼーションは、ハイブ
リダイゼーション条件の下に、2個の一本鎖相補DNA
分子が二重らせんを形成することに基づいている。同様
にして、一本鎖DNA分子とRNA分子は、DNA/
RNAハイブリッドを生じる。
特定の核酸配列を検出するには、検体中に含まれる核酸
を、変性により一本鎖に分離する。
を、変性により一本鎖に分離する。
次に、得られた一本鎖を不活性表面例えばニトロセルロ
ースまたはナイロン膜上に固定する。
ースまたはナイロン膜上に固定する。
その固定された一本鎖を相補ポリヌクレオチドと、固定
一本鎖配列および相補ポリヌクレオチド・プローブから
二本鎖が形成され得るように解離温度より低い温度で接
触させる。洗浄工程の後、ポリヌクレオチド・プローブ
と測定されるべき核酸配列より構成される生成二本鎖が
検出される。このt;めに、相補ポリヌクレオチド・プ
ローブをその位置を再び定めるのに適した方法で標識す
る。この標識は、通常、燐、ヨウ素、硫黄または水素の
ラジオアイソトープを取り込ませることによって行われ
る。
一本鎖配列および相補ポリヌクレオチド・プローブから
二本鎖が形成され得るように解離温度より低い温度で接
触させる。洗浄工程の後、ポリヌクレオチド・プローブ
と測定されるべき核酸配列より構成される生成二本鎖が
検出される。このt;めに、相補ポリヌクレオチド・プ
ローブをその位置を再び定めるのに適した方法で標識す
る。この標識は、通常、燐、ヨウ素、硫黄または水素の
ラジオアイソトープを取り込ませることによって行われ
る。
この方法の欠点の主たるものは、放射性物買を取り扱う
ことが必要となる点、およびそれに伴って様々な義務が
生じ安全措置を講じなければならない点である。このI
;め、核酸の放射性標識を非放射性検出系で置き換える
べく、多くの試みが従来より、なされている。すなわち
、ピリミジン環またはプリン環上に共有結合したビオチ
ンを含有するヌクレオチドトリホスフェート・アナロー
ブが合成されている(EP 63.879参照)。これ
らのヌクレオチド誘導体はRNAポリメラーゼおよびD
NAポリメラーゼの気質であることから、ビオチン−標
識ポリヌクレオチドを酵素的に調製しそしてそれらをハ
イブリダイゼーションに用いることができる。検出は、
従来より知られているアビジン/ビオチン相互作用に基
づいており、そして形成された二本鎖はアフイニテイ検
出系(例えばアビジン−ペルオキシダーゼ)を用いて検
出される。しかしながら、この方法には、極めて多くの
生物学的材料中にビオチンが存在し、そのため、それを
検出した結果しばしば障害となる信号が生じるという欠
点がある。
ことが必要となる点、およびそれに伴って様々な義務が
生じ安全措置を講じなければならない点である。このI
;め、核酸の放射性標識を非放射性検出系で置き換える
べく、多くの試みが従来より、なされている。すなわち
、ピリミジン環またはプリン環上に共有結合したビオチ
ンを含有するヌクレオチドトリホスフェート・アナロー
ブが合成されている(EP 63.879参照)。これ
らのヌクレオチド誘導体はRNAポリメラーゼおよびD
NAポリメラーゼの気質であることから、ビオチン−標
識ポリヌクレオチドを酵素的に調製しそしてそれらをハ
イブリダイゼーションに用いることができる。検出は、
従来より知られているアビジン/ビオチン相互作用に基
づいており、そして形成された二本鎖はアフイニテイ検
出系(例えばアビジン−ペルオキシダーゼ)を用いて検
出される。しかしながら、この方法には、極めて多くの
生物学的材料中にビオチンが存在し、そのため、それを
検出した結果しばしば障害となる信号が生じるという欠
点がある。
更に、近年では、抗原/抗体相互作用がDNAハイブリ
ダイゼーションの検出に用いられている。ハイブリダイ
ゼーションが生起した後、古典的な免疫学的方法、例え
ば、場合により標識されている特異抗体/酵素接合体(
コンジュゲート)、を検出に用いる。この抗yK/抗体
反応における抗原は、例えば、DNAまたはDNA/R
NAから形成された二本鎖とすることができる。すなわ
ち、ヨーロッパ特許出願EP 135.159では、二
本鎖天然(native)DNAに対するモノクローナ
ル抗体が用いられている。ヨーロッパ特許出願EP 1
63.220においては、プローブとしてのリボ核酸、
および特異抗−DNA/ RNAハイブリッド抗体が用
いられている。いずれの場合においても、測定されるべ
き核酸は、ハイブリダイゼーションが生起した後、特異
標識抗体を生成二重らせんまたはDNA/ RNAまた
はRNA/ RNAハイブリッドに結合させることによ
って検出される。
ダイゼーションの検出に用いられている。ハイブリダイ
ゼーションが生起した後、古典的な免疫学的方法、例え
ば、場合により標識されている特異抗体/酵素接合体(
コンジュゲート)、を検出に用いる。この抗yK/抗体
反応における抗原は、例えば、DNAまたはDNA/R
NAから形成された二本鎖とすることができる。すなわ
ち、ヨーロッパ特許出願EP 135.159では、二
本鎖天然(native)DNAに対するモノクローナ
ル抗体が用いられている。ヨーロッパ特許出願EP 1
63.220においては、プローブとしてのリボ核酸、
および特異抗−DNA/ RNAハイブリッド抗体が用
いられている。いずれの場合においても、測定されるべ
き核酸は、ハイブリダイゼーションが生起した後、特異
標識抗体を生成二重らせんまたはDNA/ RNAまた
はRNA/ RNAハイブリッドに結合させることによ
って検出される。
天然DNAに対する特異抗体を使用することの重大な欠
点は、ポリヌクレオチド・プローブが、ハイブリダイゼ
ーション条件下に、検出されるべきDNAとハイブリダ
イズするとき、検出されるべきDNA二重らせんの部分
が形成され、この結果、抗体の非特異的結合を招く点で
ある。もう一つの欠点はプローブがリポ核酸に制約され
る点である。何故ならば、リポ核酸を使用する場合、p
Hが高すぎたり、あるいはりボヌクレアーゼ活性が導入
されたりすることにょろりポ核酸の損傷または破壊を防
ぐには、特に厳しい条件がハイブリダイゼーション反応
に課せられるからである。
点は、ポリヌクレオチド・プローブが、ハイブリダイゼ
ーション条件下に、検出されるべきDNAとハイブリダ
イズするとき、検出されるべきDNA二重らせんの部分
が形成され、この結果、抗体の非特異的結合を招く点で
ある。もう一つの欠点はプローブがリポ核酸に制約され
る点である。何故ならば、リポ核酸を使用する場合、p
Hが高すぎたり、あるいはりボヌクレアーゼ活性が導入
されたりすることにょろりポ核酸の損傷または破壊を防
ぐには、特に厳しい条件がハイブリダイゼーション反応
に課せられるからである。
免疫学的反応における抗原は、ハプテンにより共有結合
的に修飾されたポリヌクレオチド・プローブとすること
もできる。これは、例えば、ハプテンをブリッジング・
メンバーを介してポリヌクレオチド・プローブに共有結
合的に結合することによって行われる(EP 173.
251)。この方法の欠点は、ハプテンによってポリヌ
クレオチドプローブと検出されるべきDNAの間の効率
的ハイブリダイゼーションが制限される点である。修飾
されt;ヌクレオチドトリホスフェートの形で酵素的に
DNA中に取り込むこともできるような比較的小さ目の
ハプテンは、ハイブリダイゼーション反応においてこの
ような大きな障害を生じることはない。従って例えば、
ブロモウラシル(EP 102.228参照)およびN
−2−アセチルアミノフルオレン(EP 97.66
4参照)の使用が開示されている。ハイブリダイゼーシ
ョンは次いで、このDNA含有修飾ヌクレオチドに対す
る特異抗体により検出される。しかしながら、使用され
る修飾ヌクレオチドは、はとんど発癌物質であり、その
取扱いには必然的に予防措置をとらなければならず、ま
た健康に対する危険の可能性が伴う。
的に修飾されたポリヌクレオチド・プローブとすること
もできる。これは、例えば、ハプテンをブリッジング・
メンバーを介してポリヌクレオチド・プローブに共有結
合的に結合することによって行われる(EP 173.
251)。この方法の欠点は、ハプテンによってポリヌ
クレオチドプローブと検出されるべきDNAの間の効率
的ハイブリダイゼーションが制限される点である。修飾
されt;ヌクレオチドトリホスフェートの形で酵素的に
DNA中に取り込むこともできるような比較的小さ目の
ハプテンは、ハイブリダイゼーション反応においてこの
ような大きな障害を生じることはない。従って例えば、
ブロモウラシル(EP 102.228参照)およびN
−2−アセチルアミノフルオレン(EP 97.66
4参照)の使用が開示されている。ハイブリダイゼーシ
ョンは次いで、このDNA含有修飾ヌクレオチドに対す
る特異抗体により検出される。しかしながら、使用され
る修飾ヌクレオチドは、はとんど発癌物質であり、その
取扱いには必然的に予防措置をとらなければならず、ま
た健康に対する危険の可能性が伴う。
本発明の目的は、前述の諸欠点のない新しい剤および方
法を利用可能にすることにある。
法を利用可能にすることにある。
この目的は、本発明により、DNAメチラーゼ、抗−D
NAメチラーゼ抗体および5−アザ−2′−デスオキシ
シチジンまたは5−アザシチジンを用いた核酸測定方法
および核酸測定剤により達成される。
NAメチラーゼ抗体および5−アザ−2′−デスオキシ
シチジンまたは5−アザシチジンを用いた核酸測定方法
および核酸測定剤により達成される。
本発明は、測定されるべき核酸配列を一本鎖に変えそし
てそれら一本鎖を相補ポリヌクレオチド・プローブと反
応させることより成る検体中の核酸の測定方法において
、該ポリヌクレオチド・プローブ中のシチジンを5−ア
ザ−2′−デスオキシシチジンまたは5−アザシチジン
で置き換え、そしてこのプローブを場合により標識され
ていることのあるDNAメチラーゼを結合しそしてその
メチラーゼを場合により標識されていることのある特異
抗−メチラーゼ抗体を介して、またはマーカーを介して
検出することによって測定することを特徴とする前記方
法に関する。
てそれら一本鎖を相補ポリヌクレオチド・プローブと反
応させることより成る検体中の核酸の測定方法において
、該ポリヌクレオチド・プローブ中のシチジンを5−ア
ザ−2′−デスオキシシチジンまたは5−アザシチジン
で置き換え、そしてこのプローブを場合により標識され
ていることのあるDNAメチラーゼを結合しそしてその
メチラーゼを場合により標識されていることのある特異
抗−メチラーゼ抗体を介して、またはマーカーを介して
検出することによって測定することを特徴とする前記方
法に関する。
本発明は、更に、シチジンの代わりに5−アザ−2′−
デオキシシチジンまたは5−アザシチジンを含むポリヌ
クレオチド・プローブを含み、そして場合により標識さ
れていることのあるメチラーゼ、および場合により標識
されていることのある抗−メチラーゼ抗体を含む核酸の
測定剤に関する。ポリヌクレオチド・プローブは二本鎖
、一本鎖、または場合により標識されているメチラーゼ
との複合体の形であってもよい。
デオキシシチジンまたは5−アザシチジンを含むポリヌ
クレオチド・プローブを含み、そして場合により標識さ
れていることのあるメチラーゼ、および場合により標識
されていることのある抗−メチラーゼ抗体を含む核酸の
測定剤に関する。ポリヌクレオチド・プローブは二本鎖
、一本鎖、または場合により標識されているメチラーゼ
との複合体の形であってもよい。
驚くべきことに、哺乳動物細胞からのDNAメチラーゼ
の5−アザシチジンに対する高い結合親和性を利用する
ことにより測定されるべき核酸種の検出を首尾よく行う
ことができることを見出した。このために、ポリヌクレ
オチド・プローブ中のd−シチジンを5−アザ−2′−
デオキシシチジンで置き換える。検出は、生成するDN
Aハイブリッドを真核生物のDNAメチルトランスフェ
ラーゼ(−DNAメチラーゼ)と共にインキュベーショ
ンし、安定なdazaC/メチルトランスフェラーゼ複
合体を形成することにより行われる。これらの複合体は
、次いで、既知の免疫学的方法を用いて、DNAメチル
トランスフェラーゼに対する特異抗体により検出するこ
とができる。
の5−アザシチジンに対する高い結合親和性を利用する
ことにより測定されるべき核酸種の検出を首尾よく行う
ことができることを見出した。このために、ポリヌクレ
オチド・プローブ中のd−シチジンを5−アザ−2′−
デオキシシチジンで置き換える。検出は、生成するDN
Aハイブリッドを真核生物のDNAメチルトランスフェ
ラーゼ(−DNAメチラーゼ)と共にインキュベーショ
ンし、安定なdazaC/メチルトランスフェラーゼ複
合体を形成することにより行われる。これらの複合体は
、次いで、既知の免疫学的方法を用いて、DNAメチル
トランスフェラーゼに対する特異抗体により検出するこ
とができる。
真核生物のDNAメチラーゼは、既知の方法により、例
えばヒト胎盤から単離される(Biochem。
えばヒト胎盤から単離される(Biochem。
Biophys、 Acta、 740.323 (1
983)参照)。精製酵素は「コンサーペーション(c
onservat 1on)Jおよび「ドノポ(de
novo)」メチラーゼ活性を有するl 90KDポリ
ペプチドである。これらの活性によって、DNAメチラ
ーゼは、一本鎖核酸および二本鎖核酸の両方に結合する
。しかしながらdazaCで修飾されたDNAへの結合
は、極めて安定性が高く、そのため、それは不安定化条
件、例えば高い塩濃度、の下でも解離しない。これによ
って、驚くべきことに、核酸への非特異的結合を完全に
抑え、そしてdazaC−含有DNAに対するメチラー
ゼの結合のみを許す条件を見出すことが可能となる。メ
チラーゼとdazaC−含有DNAとで構成される複合
体は厳しいハイブリダイゼーション条件にも耐えるので
、DNAメチラーゼおよびdazaCはハイブリダイゼ
ーション反応の検出に著しく適している。
983)参照)。精製酵素は「コンサーペーション(c
onservat 1on)Jおよび「ドノポ(de
novo)」メチラーゼ活性を有するl 90KDポリ
ペプチドである。これらの活性によって、DNAメチラ
ーゼは、一本鎖核酸および二本鎖核酸の両方に結合する
。しかしながらdazaCで修飾されたDNAへの結合
は、極めて安定性が高く、そのため、それは不安定化条
件、例えば高い塩濃度、の下でも解離しない。これによ
って、驚くべきことに、核酸への非特異的結合を完全に
抑え、そしてdazaC−含有DNAに対するメチラー
ゼの結合のみを許す条件を見出すことが可能となる。メ
チラーゼとdazaC−含有DNAとで構成される複合
体は厳しいハイブリダイゼーション条件にも耐えるので
、DNAメチラーゼおよびdazaCはハイブリダイゼ
ーション反応の検出に著しく適している。
真核生物のDNAメチラーゼに対するモノクローナル抗
体は、既知の方法により、例えばマウスを精製メチラー
ゼ免疫し、そしてハイブリドーマ細胞クローンを構築す
ることにより調製される(Eur、 J、 Ce11.
Biol、 34.330 (1984)参照)。
体は、既知の方法により、例えばマウスを精製メチラー
ゼ免疫し、そしてハイブリドーマ細胞クローンを構築す
ることにより調製される(Eur、 J、 Ce11.
Biol、 34.330 (1984)参照)。
dazaC−またはazaC−含有ポリヌクレオチド・
プローブの調製は、既知の酵素的方法により、例えばポ
リメラーゼIの使用によるdazaCTPの取込みにツ
クトランスレーション; Proc。
プローブの調製は、既知の酵素的方法により、例えばポ
リメラーゼIの使用によるdazaCTPの取込みにツ
クトランスレーション; Proc。
Natl、 Acad、 Sci、 USA 72.1
184 (1975)参照)により行うことができる。
184 (1975)参照)により行うことができる。
しかしながら、このためには、5”dazaCを相当す
るトリホスフェートに変えなければならない。これは、
1.5モル過剰のPOCQ、を5’−dazaCに0°
Cで添加し、そして反応を18°Cで1時間撹拌しなが
ら行うことにより行われる。次に2倍過剰のトリエチル
アンモニウムピロホスフェートを0℃で添加し、そして
反応を18℃で1時間行う。形成された5 ’−daz
aCTPは、セルロース薄層クロマトグラフィーにより
、またはHPLCによって精製する。
るトリホスフェートに変えなければならない。これは、
1.5モル過剰のPOCQ、を5’−dazaCに0°
Cで添加し、そして反応を18°Cで1時間撹拌しなが
ら行うことにより行われる。次に2倍過剰のトリエチル
アンモニウムピロホスフェートを0℃で添加し、そして
反応を18℃で1時間行う。形成された5 ’−daz
aCTPは、セルロース薄層クロマトグラフィーにより
、またはHPLCによって精製する。
酵素的取込みにより5’−dazaCTPで標識された
DNAプローブは一本鎖または二本鎖の形でハイブリダ
イゼーションアッセイに用いることができる。5−アザ
−2′−デオキシシチジンはある条件下に加水分解され
、開環してデオキシリボフラノシル−3−グアニル尿素
を与える。この加水分解の起こり方は、一本鎖DNAの
場合よりも二本鎖DNAの場合の方がゆっくりとしてい
る。
DNAプローブは一本鎖または二本鎖の形でハイブリダ
イゼーションアッセイに用いることができる。5−アザ
−2′−デオキシシチジンはある条件下に加水分解され
、開環してデオキシリボフラノシル−3−グアニル尿素
を与える。この加水分解の起こり方は、一本鎖DNAの
場合よりも二本鎖DNAの場合の方がゆっくりとしてい
る。
この効果を利用すれば、ハイブリダイゼーションが生起
した後に、ハイブリダイズされないポリヌクレオチド・
プローブを除去せずに済ませることができる。
した後に、ハイブリダイズされないポリヌクレオチド・
プローブを除去せずに済ませることができる。
本発明により誘導体化された核酸と、分析されるべき検
体中の相補核酸との間の実際のハイブリダイゼーション
工程は、既知の方法により行われる。固相でのハイブリ
ダイゼーションが好ましい。このためには、核酸を一本
鎖に分離した後、検出されるべき核酸を固相に固定する
。
体中の相補核酸との間の実際のハイブリダイゼーション
工程は、既知の方法により行われる。固相でのハイブリ
ダイゼーションが好ましい。このためには、核酸を一本
鎖に分離した後、検出されるべき核酸を固相に固定する
。
ニトロセルロースまたはナイロン膜が常法にならって用
いられる。その固定された核酸を、次に、ハイブリダイ
ゼーション条件下にdazaC−含有ポリヌクレオチド
・プローブと接触させる。
いられる。その固定された核酸を、次に、ハイブリダイ
ゼーション条件下にdazaC−含有ポリヌクレオチド
・プローブと接触させる。
そのハイブリダイゼーションは、次いで、常法にならっ
た洗浄およびプロッキング工程の後、DNAメチラーゼ
の添加の添加およびそれとのインキュベーションにより
検出することができる。
た洗浄およびプロッキング工程の後、DNAメチラーゼ
の添加の添加およびそれとのインキュベーションにより
検出することができる。
dazaC−含有DNAとDNAメチラーゼの間の結合
定数が極めて高いことは、検出されるべきDNA。
定数が極めて高いことは、検出されるべきDNA。
ポリヌクレオチド・プローブおよびDNAメチラーゼで
構成される極めて安定な複合体が形成されることを意味
する。未結合DNAメチラーゼおよびハイブリダイズさ
れないポリヌクレオチド・プローブを除去した後、ハイ
ブリダイゼーションを、例えば、モノクローナル・マウ
ス抗−DNAメチラーゼ抗体およびβ−ガラクトシダー
ゼと接合した第2の抗−マウスIgGを用いて結合DN
Aメチラーゼを検出することにより、検出することがで
きる。
構成される極めて安定な複合体が形成されることを意味
する。未結合DNAメチラーゼおよびハイブリダイズさ
れないポリヌクレオチド・プローブを除去した後、ハイ
ブリダイゼーションを、例えば、モノクローナル・マウ
ス抗−DNAメチラーゼ抗体およびβ−ガラクトシダー
ゼと接合した第2の抗−マウスIgGを用いて結合DN
Aメチラーゼを検出することにより、検出することがで
きる。
更に、dazaCおよびDNAメチラーゼの使用は、D
NAハイブリダイゼーションを簡単に検出するための多
くの他の可能性をも提供する。すなわち、遺伝子操作に
よりまたは化学的に調製されたDNAメチラーゼ/酵素
接合体、またはマーカーに結合されたDNAメチラーゼ
を形成されたハイブリッドの検出に用いることができ、
また既知の結合アッセイに用いられるあらゆるマーカ−
(標識)を用いることができる。これによって抗−メチ
ラーゼ抗体とインキュベーションする必要がなくなる。
NAハイブリダイゼーションを簡単に検出するための多
くの他の可能性をも提供する。すなわち、遺伝子操作に
よりまたは化学的に調製されたDNAメチラーゼ/酵素
接合体、またはマーカーに結合されたDNAメチラーゼ
を形成されたハイブリッドの検出に用いることができ、
また既知の結合アッセイに用いられるあらゆるマーカ−
(標識)を用いることができる。これによって抗−メチ
ラーゼ抗体とインキュベーションする必要がなくなる。
別の態様例においては、dazaC−含有ポリヌクレオ
チド・プローブをハイブリダイゼーションの前にDNA
メチラーゼとインキュベートし、そして形成されたDN
Aメチラーゼ/ポリヌクレオチド・プローブ複合体をハ
イブリダイゼーションに用いる。この場合にも、検出さ
れるべき核酸とのハイブリダイゼーションは、ノ1イブ
リダイゼーションおよび常法にならった洗浄工程を行っ
た後、抗−DNAメチラーゼ抗体をメチラーゼに既知の
方法により結合させることにより検出される。マーカー
または酵素に結合されたDNAメチラーゼとポリヌクレ
オチド・プローブとで構成される複合体を直接用いれば
、この工程を省くことができる。
チド・プローブをハイブリダイゼーションの前にDNA
メチラーゼとインキュベートし、そして形成されたDN
Aメチラーゼ/ポリヌクレオチド・プローブ複合体をハ
イブリダイゼーションに用いる。この場合にも、検出さ
れるべき核酸とのハイブリダイゼーションは、ノ1イブ
リダイゼーションおよび常法にならった洗浄工程を行っ
た後、抗−DNAメチラーゼ抗体をメチラーゼに既知の
方法により結合させることにより検出される。マーカー
または酵素に結合されたDNAメチラーゼとポリヌクレ
オチド・プローブとで構成される複合体を直接用いれば
、この工程を省くことができる。
更に、抗−dazaC抗体を、検出されるべきDNAと
ハイブリダイゼーションさせた後でdazaC−含有ポ
リヌクレオチド・プローブとインキュベートすることも
できる。そのハイブリダイゼーションは、次いで、マー
カーを付した第2の抗体を用いて既知の免疫学的方法に
より、あるいはその抗−dazaC抗体がマーカーまた
は酵素に結合されている場合には直接的に、検出される
。
ハイブリダイゼーションさせた後でdazaC−含有ポ
リヌクレオチド・プローブとインキュベートすることも
できる。そのハイブリダイゼーションは、次いで、マー
カーを付した第2の抗体を用いて既知の免疫学的方法に
より、あるいはその抗−dazaC抗体がマーカーまた
は酵素に結合されている場合には直接的に、検出される
。
DNAメチラーゼは天然DNAに対しても結合すること
から、DNAメチラーゼ、またはマーカーまたは酵素に
結合されたメチラーゼ、および天然の一本鎖または二本
鎖のDNAから構成される共有結合複合体を、近紫外線
域での照射により、あるいはタンパクおよび核酸間の他
の既知の化学的架橋反応により、容易に形成することが
できる。この複合体は次いでハイブリダイゼーションに
直接使用でき、また常法により検出することができる。
から、DNAメチラーゼ、またはマーカーまたは酵素に
結合されたメチラーゼ、および天然の一本鎖または二本
鎖のDNAから構成される共有結合複合体を、近紫外線
域での照射により、あるいはタンパクおよび核酸間の他
の既知の化学的架橋反応により、容易に形成することが
できる。この複合体は次いでハイブリダイゼーションに
直接使用でき、また常法により検出することができる。
核酸をdazaCTPの取込みによって修飾してもハイ
ブリダイゼーション反応には全く影響しないばかりか、
ハイブリダイゼーション反応で形成されたDNA/DN
Aハイブリッドは、次いでDNAメチラーゼを結合させ
ることにより強化される。
ブリダイゼーション反応には全く影響しないばかりか、
ハイブリダイゼーション反応で形成されたDNA/DN
Aハイブリッドは、次いでDNAメチラーゼを結合させ
ることにより強化される。
DNAメチラーゼ上のいくつかのエピトープが特異抗体
に結合できそれによって付加的な増幅が生じるので、感
度を更に増大させることができる。
に結合できそれによって付加的な増幅が生じるので、感
度を更に増大させることができる。
本発明の方法を用いることにより、既知の核酸測定方法
と少くとも同程度に良好な分析結果を簡単に得ることが
できる。DNAメチラーゼのdazaC−含有DNAに
対する結合定数は極めて高く、従って極めて低い濃度域
においてさえ、DNAメチラーゼのdazaC不含DN
Aに対する障害となる非特異的結合を伴うことのない検
出が可能である。
と少くとも同程度に良好な分析結果を簡単に得ることが
できる。DNAメチラーゼのdazaC−含有DNAに
対する結合定数は極めて高く、従って極めて低い濃度域
においてさえ、DNAメチラーゼのdazaC不含DN
Aに対する障害となる非特異的結合を伴うことのない検
出が可能である。
実施例 l
ニックトランスレーションによるdatac−含有ポリ
ヌクレオチド・プローブの調製 lagのプラスミドDNA(pBcam 3225)を
500UMdazaCTP、および2p9のDNA5e
Iおよび500UのDNAポリメラーゼIと共に50
μa容量として標準的条件下(dATP、 dGTP、
dTTP(各50μM)、1μM dCTP、 5m
M MnCff、、50Jn/ mQ BSA、 50
+M トリス−HCQ。
ヌクレオチド・プローブの調製 lagのプラスミドDNA(pBcam 3225)を
500UMdazaCTP、および2p9のDNA5e
Iおよび500UのDNAポリメラーゼIと共に50
μa容量として標準的条件下(dATP、 dGTP、
dTTP(各50μM)、1μM dCTP、 5m
M MnCff、、50Jn/ mQ BSA、 50
+M トリス−HCQ。
pH7,5)に15℃でインキュベートする。1時間後
、toouの12.5mM EDTA、 0.5%ドデ
シル硫酸ナトリウム(SDS)の添加により反応を止め
る。その混合物を5ephadex G−50カラムで
のクロマトグラフィにかけてazaCで修飾されたDN
Aを未反応ヌクレオチドトリホスフェートから除去する
。
、toouの12.5mM EDTA、 0.5%ドデ
シル硫酸ナトリウム(SDS)の添加により反応を止め
る。その混合物を5ephadex G−50カラムで
のクロマトグラフィにかけてazaCで修飾されたDN
Aを未反応ヌクレオチドトリホスフェートから除去する
。
そのDNAは排斥容量中を移行しそして400μQの1
011Mトリス緩衝液、pH7,6に溶出される。
011Mトリス緩衝液、pH7,6に溶出される。
実施例 2
一本鎖dazaC−含有ポリヌクレオチド・プローブの
調製 5pmoQの一本鎖M13camp5DNAを、M13
camp5にクローン化されたカンピロバクタ−(Ca
mpy 1o−bacter) DNAに相補的な5p
mo<+の合成オリゴヌクレオチド(6ON)でハイブ
リダイズさせる。得られるプライマー/鋳型複合体を1
00UのDNAポリメラーゼ(クレノー(Klenow
)酵素)およびdGTP。
調製 5pmoQの一本鎖M13camp5DNAを、M13
camp5にクローン化されたカンピロバクタ−(Ca
mpy 1o−bacter) DNAに相補的な5p
mo<+の合成オリゴヌクレオチド(6ON)でハイブ
リダイズさせる。得られるプライマー/鋳型複合体を1
00UのDNAポリメラーゼ(クレノー(Klenow
)酵素)およびdGTP。
dATP、 dTTP(各200μM)、5μM dC
TP、 750UM dazaCTPと共に、50uQ
の5mM MnCQ、、50+M)すスーHCR,pH
7,5、および50μgl mQ BSA中、15℃で
インキュベートする。45分後に反応を止め、そしてそ
の混合物を8%変性ポリアクリルアミドゲルで分画する
。15ONより大きい一本鎖dazaC−含有DNAを
溶出させそしてそれはハイブリダイゼーションに用いら
れる。
TP、 750UM dazaCTPと共に、50uQ
の5mM MnCQ、、50+M)すスーHCR,pH
7,5、および50μgl mQ BSA中、15℃で
インキュベートする。45分後に反応を止め、そしてそ
の混合物を8%変性ポリアクリルアミドゲルで分画する
。15ONより大きい一本鎖dazaC−含有DNAを
溶出させそしてそれはハイブリダイゼーションに用いら
れる。
実施例 3
a) dazaC−含有ポリヌクレオチド・プローブ
とのハイブリダイゼーション 様々な量の変性カンピロバクタ−DNA(1on9〜1
1)9)をドツト−プロット装置を用いてナイロン膜に
適用する。そのフィルターを60°Cで6×SSC(塩
化ナトリウム/クエン酸ナトリウム)、5 X Den
hardt (牛血清アルブミン/ポリビニルピロリド
ン/フィコール)、0.5%SO3および20μg /
ra Q変性ニシン精子DNA、中で1時間プレハイ
ブリダイズさせた後、本格的なハイブリダイゼーション
を、300 n 9 / m Q濃度の実施例1で得た
ニックトランスレーションによるdazac−含有DN
Aグローブの添加により、60℃で3時間行う。次にそ
のフィルターを既知の方法により漸減SSC濃度を用い
て所望の厳格度(stringency)まで洗浄する
。
とのハイブリダイゼーション 様々な量の変性カンピロバクタ−DNA(1on9〜1
1)9)をドツト−プロット装置を用いてナイロン膜に
適用する。そのフィルターを60°Cで6×SSC(塩
化ナトリウム/クエン酸ナトリウム)、5 X Den
hardt (牛血清アルブミン/ポリビニルピロリド
ン/フィコール)、0.5%SO3および20μg /
ra Q変性ニシン精子DNA、中で1時間プレハイ
ブリダイズさせた後、本格的なハイブリダイゼーション
を、300 n 9 / m Q濃度の実施例1で得た
ニックトランスレーションによるdazac−含有DN
Aグローブの添加により、60℃で3時間行う。次にそ
のフィルターを既知の方法により漸減SSC濃度を用い
て所望の厳格度(stringency)まで洗浄する
。
b) DNAメチラーゼのDNA/dazaC−DN
Aハイブリッドへの結合 前記ハイブリダイゼーション反応で形成され、そして検
出されるべきDNAおよびdazaC−含有DNAプロ
ーブから構成されるハイブリッドを検出するために、ハ
イブリッドをDNAメチラーゼと共にインキュベートす
る。これは、前記ナイロン膜を20mM トリス緩衝剤
、pH7,5,5+nlJ EDTA。
Aハイブリッドへの結合 前記ハイブリダイゼーション反応で形成され、そして検
出されるべきDNAおよびdazaC−含有DNAプロ
ーブから構成されるハイブリッドを検出するために、ハ
イブリッドをDNAメチラーゼと共にインキュベートす
る。これは、前記ナイロン膜を20mM トリス緩衝剤
、pH7,5,5+nlJ EDTA。
0 、5mMジチオエリトロール、2%グリセロール、
1%BSA、 10μMS−アデノシルメチオニン、中
の1μ9/raQ DNAメチラーゼと共に37℃で1
5分間振盪しながらインキュベートすることにより行わ
れる。未結合DNAメチラーゼは、そのフィルターを各
々5分間、2011M )リス緩衝剤、pH7,5,5
DIM EDTA、 0.4M NaC(+を用い、次
いで20mM トリス緩衝剤、pH7,5,5mM E
DTA、 0.IM Na(Jを用いて室温で洗浄する
ことにより除去する。
1%BSA、 10μMS−アデノシルメチオニン、中
の1μ9/raQ DNAメチラーゼと共に37℃で1
5分間振盪しながらインキュベートすることにより行わ
れる。未結合DNAメチラーゼは、そのフィルターを各
々5分間、2011M )リス緩衝剤、pH7,5,5
DIM EDTA、 0.4M NaC(+を用い、次
いで20mM トリス緩衝剤、pH7,5,5mM E
DTA、 0.IM Na(Jを用いて室温で洗浄する
ことにより除去する。
C) モノクローナル・マウス抗−DNAメチラーゼ
抗体、およびβ−ガラクトシダーゼと接合した第2の抗
−マウスIgGによる結合メチラーゼの検出 b)で得た膜を、IXPBs(燐酸ナトリウム)、pH
7,5、および0.1%ツイ−7(tween)20
’t’洗浄後、それを1XPBs、 0.1%BSA中
、マウス抗−DNAメチラーゼ抗体(1μ9/ l11
2)と共に室温で30分間インキュベートする。次に、
β−ガラクトシダーゼ抗−マウスー1gG抗体を添加し
、再び室温で30分間インキュベートする。未結合抗体
をIXPBsで5回洗浄することにより除去する。
抗体、およびβ−ガラクトシダーゼと接合した第2の抗
−マウスIgGによる結合メチラーゼの検出 b)で得た膜を、IXPBs(燐酸ナトリウム)、pH
7,5、および0.1%ツイ−7(tween)20
’t’洗浄後、それを1XPBs、 0.1%BSA中
、マウス抗−DNAメチラーゼ抗体(1μ9/ l11
2)と共に室温で30分間インキュベートする。次に、
β−ガラクトシダーゼ抗−マウスー1gG抗体を添加し
、再び室温で30分間インキュベートする。未結合抗体
をIXPBsで5回洗浄することにより除去する。
次にその混合物を酵素基質溶液(PBS、 pH7,5
、中、0.5111g/ mQ 5−ブロモ−4−クロ
ロ−3−インドリル−ガラクトシド、l mM MgC
Q*、3mMフェリシアン化カリウム、3mMフェロシ
アニド)と共に室温で少くとも1時間インキュベートす
る。このようにして、50pgのカンピロバクタ−DN
Aを容易に検出することができる。
、中、0.5111g/ mQ 5−ブロモ−4−クロ
ロ−3−インドリル−ガラクトシド、l mM MgC
Q*、3mMフェリシアン化カリウム、3mMフェロシ
アニド)と共に室温で少くとも1時間インキュベートす
る。このようにして、50pgのカンピロバクタ−DN
Aを容易に検出することができる。
実施例 4
一本鎖dazaC−含有DNAプローブとDNAメチラ
ーゼとのインキュベーション 実施例2で調製された一本鎖dazac−含有DNAプ
ローブを実施例3bに記載した方法と同様にしてDNA
メチラーゼ(10μg/IIQ)と共にインキュベート
する。未結合メチラーゼ部分を除去するために、その混
合物を5ephadex G−200カラムでのクロマ
トグラフィーにかける。得られるDNAグローブ/メチ
ラーゼ複合体は極めて安定していて、実施例3aに記載
されているようなカンピロバクタ−DNAの検出に用い
ることができる。
ーゼとのインキュベーション 実施例2で調製された一本鎖dazac−含有DNAプ
ローブを実施例3bに記載した方法と同様にしてDNA
メチラーゼ(10μg/IIQ)と共にインキュベート
する。未結合メチラーゼ部分を除去するために、その混
合物を5ephadex G−200カラムでのクロマ
トグラフィーにかける。得られるDNAグローブ/メチ
ラーゼ複合体は極めて安定していて、実施例3aに記載
されているようなカンピロバクタ−DNAの検出に用い
ることができる。
このためのハイブリダイゼーション温度は、DNAメチ
ラーゼで標識されていないプローブ/DNAハイブリッ
ドに対して予測される解離温度よりも35℃低い。生じ
たハイブリダイゼーションの検出は、実施例3cに記載
されているように行われる。
ラーゼで標識されていないプローブ/DNAハイブリッ
ドに対して予測される解離温度よりも35℃低い。生じ
たハイブリダイゼーションの検出は、実施例3cに記載
されているように行われる。
実施例 5
DNAメチラーゼ/ペルオキシダーゼ接合体とのハイブ
リダイゼーションの検出 実施例3で形成され、そして検出されるべきDNAおよ
びdazaC−含有DNAプローブで構成されるハイブ
リッドを検出するために、それをDNAメチラーゼ/ペ
ルオキシダーゼ接合体と共にインキュベートする。その
インキュベーションは、実施例3bに記載されているよ
うなりNAメチラーゼとのインキュベーションと同様に
して行われる。
リダイゼーションの検出 実施例3で形成され、そして検出されるべきDNAおよ
びdazaC−含有DNAプローブで構成されるハイブ
リッドを検出するために、それをDNAメチラーゼ/ペ
ルオキシダーゼ接合体と共にインキュベートする。その
インキュベーションは、実施例3bに記載されているよ
うなりNAメチラーゼとのインキュベーションと同様に
して行われる。
結合、および未結合DNAメチラーゼ/酵素接合体の除
去の後、1oOn+M酢酸ナトリウム緩衝液、pH4,
5、中の0.025%過酸化水素および400μg/m
Qアミノエチルカルバゾールより成るペルオキシダーゼ
基質溶液を添加し、室温で顕著な呈色反応が起こるまで
インキュベーションすることにより、ハイブリダイゼー
ションが直接検出される。
去の後、1oOn+M酢酸ナトリウム緩衝液、pH4,
5、中の0.025%過酸化水素および400μg/m
Qアミノエチルカルバゾールより成るペルオキシダーゼ
基質溶液を添加し、室温で顕著な呈色反応が起こるまで
インキュベーションすることにより、ハイブリダイゼー
ションが直接検出される。
DNAメチラーゼおよび西洋ワサビペルオキシダーゼの
接合体は、ヘテロニ官能性結合試剤であるN−スクシン
イミジル3−(2−ピリジルジチオ)プロピオネートを
用いて既知の方法により調製される。
接合体は、ヘテロニ官能性結合試剤であるN−スクシン
イミジル3−(2−ピリジルジチオ)プロピオネートを
用いて既知の方法により調製される。
特許出願人 メルク・パテント・ゲゼルシャフト・ミ
ツト豐ベシュレンクテルφハフツング71□ ′ で、 代理人 弁理士南 孝 夫Xブー1・・1ジ・ \・・−・:・7゛′
ツト豐ベシュレンクテルφハフツング71□ ′ で、 代理人 弁理士南 孝 夫Xブー1・・1ジ・ \・・−・:・7゛′
Claims (1)
- 【特許請求の範囲】 1)検体中の核酸を測定するために、測定されるべき核
酸配列を一本鎖に変え、そしてそれら一本鎖を相補ポリ
ヌクレオチド・プローブと反応させることより成る検体
中の核酸の測定方法であって、該ポリヌクレオチド・プ
ローブ中のシチジンを5−アザ−2′−デオキシシチジ
ンまたは5−アザシチジンで置き換え、そしてこのプロ
ーブを、場合により標識されていることのあるDNAメ
チラーゼと結合させそしてそのメチラーゼを、場合によ
り標識されていることのある特異抗−メチラーゼ抗体を
介して、またはマーカーを介して検出することによって
測定することを特徴とする前記検体中の核酸の測定方法
。 2)DNAメチラーゼ/DNAプローブ複合体が、マウ
ス抗−DNAメチラーゼ抗体およびマウスIgG抗体に
より、または抗−マウスIgG抗体/酵素接合体により
、検出される請求項1記載の方法。 3)5−アザ−2′−デオキシシチジンまたは5−アザ
シチジンを含有するポリヌクレオチ ド・プローブが、5−アザ−2′−デオキシシチジンま
たは5−アザシチジンを含有する核酸に対する、場合に
より標識されていることのある特異抗体、または抗体/
酸素接合体により検出される、請求項1記載の方法。 4)検出されるべき核酸が、固相に対して、直接に、ま
たは固定された相補核酸を介して、結合される請求項1
〜3のいずれかに記載の方法。 5)シチジンの代わりに5−アザ−2′−デオキシシチ
ジンまたは5−アザシチジンを含むポリヌクレオチド・
プローブを含み、そして場合により標識されていること
のあるメチラーゼ、および場合により標識されているこ
とのある抗−メチラーゼ抗体を含む核酸の測定 剤。 6)ポリヌクレオチド・プローブが、二本鎖、一本鎖ま
たは場合により標識されていることのあるメチラーゼと
の複合体の形である請求項5記載の測定剤。
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
DE3712786.1 | 1987-04-15 | ||
DE19873712786 DE3712786A1 (de) | 1987-04-15 | 1987-04-15 | Verfahren und mittel zur bestimmung von nucleinsaeuren |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JPS63282659A true JPS63282659A (ja) | 1988-11-18 |
Family
ID=6325680
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP63091897A Pending JPS63282659A (ja) | 1987-04-15 | 1988-04-15 | 核酸の測定方法および測定剤 |
Country Status (3)
Country | Link |
---|---|
EP (1) | EP0286958A3 (ja) |
JP (1) | JPS63282659A (ja) |
DE (1) | DE3712786A1 (ja) |
Families Citing this family (8)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US6905669B2 (en) | 2001-04-24 | 2005-06-14 | Supergen, Inc. | Compositions and methods for reestablishing gene transcription through inhibition of DNA methylation and histone deacetylase |
US6982253B2 (en) | 2002-06-05 | 2006-01-03 | Supergen, Inc. | Liquid formulation of decitabine and use of the same |
US20050123944A1 (en) * | 2003-08-01 | 2005-06-09 | U.S. Genomics, Inc. | Methods and compositions related to the use of sequence-specific endonucleases for analyzing nucleic acids under non-cleaving conditions |
US7250416B2 (en) | 2005-03-11 | 2007-07-31 | Supergen, Inc. | Azacytosine analogs and derivatives |
US7700567B2 (en) | 2005-09-29 | 2010-04-20 | Supergen, Inc. | Oligonucleotide analogues incorporating 5-aza-cytosine therein |
LT2750768T (lt) | 2011-08-30 | 2019-02-11 | Astex Pharmaceuticals, Inc. | Decitabino darinio kompozicijos |
JP6768722B2 (ja) | 2015-07-02 | 2020-10-14 | 大塚製薬株式会社 | 凍結乾燥医薬組成物 |
CA3071755A1 (en) | 2017-08-03 | 2019-02-07 | Otsuka Pharmaceutical Co., Ltd. | Drug compound and purification methods thereof |
Family Cites Families (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
FR2518755B1 (fr) * | 1981-12-23 | 1986-04-11 | Pasteur Institut | Sonde contenant un acide nucleique modifie et reconnaissable par des anticorps specifiques et utilisation de cette sonde pour detecter et caracteriser une sequence d'adn homologue |
US4529700A (en) * | 1982-08-20 | 1985-07-16 | University Of Miami | Hybridoma cells secreting a monoclonal antibody specific for 5-bromo and 5-iodoeoxyuridine and reagents for measuring cellular proliferation |
US4585736A (en) * | 1983-10-18 | 1986-04-29 | The United States Of America As Represented By The United States Department Of Energy | Flow cytometric measurement of total DNA and incorporated halodeoxyuridine |
WO1986006726A1 (en) * | 1985-05-15 | 1986-11-20 | Integrated Genetics, Inc. | Cytidine analogs |
-
1987
- 1987-04-15 DE DE19873712786 patent/DE3712786A1/de not_active Withdrawn
-
1988
- 1988-04-06 EP EP88105441A patent/EP0286958A3/de not_active Withdrawn
- 1988-04-15 JP JP63091897A patent/JPS63282659A/ja active Pending
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
DE3712786A1 (de) | 1988-11-03 |
EP0286958A3 (de) | 1989-12-13 |
EP0286958A2 (de) | 1988-10-19 |
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