JPS59166097A - 食品中のサルモネラ検定法 - Google Patents
食品中のサルモネラ検定法Info
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- JPS59166097A JPS59166097A JP59008380A JP838084A JPS59166097A JP S59166097 A JPS59166097 A JP S59166097A JP 59008380 A JP59008380 A JP 59008380A JP 838084 A JP838084 A JP 838084A JP S59166097 A JPS59166097 A JP S59166097A
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- Japan
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- dna
- salmonella
- probe
- detectable
- probes
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- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/195—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
- C07K14/24—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria from Enterobacteriaceae (F), e.g. Citrobacter, Serratia, Proteus, Providencia, Morganella, Yersinia
- C07K14/255—Salmonella (G)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6813—Hybridisation assays
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
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- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
- C12Q1/689—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for bacteria
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- Y10—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC
- Y10S—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y10S435/00—Chemistry: molecular biology and microbiology
- Y10S435/8215—Microorganisms
- Y10S435/822—Microorganisms using bacteria or actinomycetales
- Y10S435/879—Salmonella
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Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。
め要約のデータは記録されません。
Description
【発明の詳細な説明】
本発明はサルモネラ属の開閉の検出に関する(本明細書
ニおいて、サルモネラ属の細菌はJlu c h、’a
nd、n等による二5ILorLer Berg−e
、y’s−Manual for Determina
tiveβacteriologγ(Williams
& 1.rVilkins、 1982年)でサルモ
ネラ属の細酌として分類された細菌に属するものとし;
このような細菌は以後単に”サルモイ、う”と記載する
)。
ニおいて、サルモネラ属の細菌はJlu c h、’a
nd、n等による二5ILorLer Berg−e
、y’s−Manual for Determina
tiveβacteriologγ(Williams
& 1.rVilkins、 1982年)でサルモ
ネラ属の細酌として分類された細菌に属するものとし;
このような細菌は以後単に”サルモイ、う”と記載する
)。
食品中のサルモネラの存在を検出づ−ろための最も一般
的に使用きれる試験は古典的な生物学的性状の測定を包
含する。この試験は数日間を費やす。
的に使用きれる試験は古典的な生物学的性状の測定を包
含する。この試験は数日間を費やす。
一般に、本発明は食品試料中のサルモネラの存在を検出
する方法に特徴があり、それはサルモネラDNAと選択
的にノ・イブリダイズ(相補性結合)して検出可能な複
合体を形成することができる少なくとも1つのDNAプ
ローブを用意し、そのDNAプローブを食品試料中に存
在するサルモネラDNAとノ・イブリダイズさせて・・
イブリッドDNA複合体を形成でせる粂件下にそのDN
Aプローブを食品試料中の細菌と接触させ、そしてその
・・イブリッドDNA複合体を食品試料Φにサルモネラ
が存在することの証拠として検出することを包含する。
する方法に特徴があり、それはサルモネラDNAと選択
的にノ・イブリダイズ(相補性結合)して検出可能な複
合体を形成することができる少なくとも1つのDNAプ
ローブを用意し、そのDNAプローブを食品試料中に存
在するサルモネラDNAとノ・イブリダイズさせて・・
イブリッドDNA複合体を形成でせる粂件下にそのDN
Aプローブを食品試料中の細菌と接触させ、そしてその
・・イブリッドDNA複合体を食品試料Φにサルモネラ
が存在することの証拠として検出することを包含する。
(本明細書で使用する″選択的に・・イブリダイズする
”という表現はサルモネラのみに・・イブリダイズして
他のどの腸内j1′(If菌にも−・イブリダイズし彦
いDNAプローブを指して言う。)本発明の好才しい実
施態様においてそのDNAプローブは標識されており、
例えば、そのプローブ中に二ンクトランスレーションC
nick−1rams−1ation)等により取り込
捷れろ放射・匣同位元素(例えば、Pまたは125I)
で標識されろ。
”という表現はサルモネラのみに・・イブリダイズして
他のどの腸内j1′(If菌にも−・イブリダイズし彦
いDNAプローブを指して言う。)本発明の好才しい実
施態様においてそのDNAプローブは標識されており、
例えば、そのプローブ中に二ンクトランスレーションC
nick−1rams−1ation)等により取り込
捷れろ放射・匣同位元素(例えば、Pまたは125I)
で標識されろ。
他の好ましい実施態様においてそのプローブはビオチン
で標識されており、このビオチンはアビジンと反応し、
このアビジンにはアビジンがビオチンと結合した場合に
そのノ・イブリッドDN/1 仮合体を検出可能なもの
にする化学種h)結合されており、その化学種は例えば
螢光団、ハイブリットDNA複合体を電子顕微鏡で検出
可能なものにすることができる電子密度の高い化合物、
ハイブリッドD N A fJf合体を免役学的に・1
莢出可能なものにすることができろ抗体、寸たはハイブ
リットDNA複合体を酵素的に検出可能なものにするこ
とができる一対の触媒/基質のうちの一方、などである
。
で標識されており、このビオチンはアビジンと反応し、
このアビジンにはアビジンがビオチンと結合した場合に
そのノ・イブリッドDN/1 仮合体を検出可能なもの
にする化学種h)結合されており、その化学種は例えば
螢光団、ハイブリットDNA複合体を電子顕微鏡で検出
可能なものにすることができる電子密度の高い化合物、
ハイブリッドD N A fJf合体を免役学的に・1
莢出可能なものにすることができろ抗体、寸たはハイブ
リットDNA複合体を酵素的に検出可能なものにするこ
とができる一対の触媒/基質のうちの一方、などである
。
細菌をそのDNAプローブと接触させる前に、細されだ
DN’Aはその後変性されてニトロセルロース膜のよう
な適当なりNA結合支持体上に固定化されろ。そしてこ
の方法は少なくとも2種、好捷しくは少なくとも3.4
″!だは5種のサルモネラ((特異的な異なるプローブ
を使用する。
DN’Aはその後変性されてニトロセルロース膜のよう
な適当なりNA結合支持体上に固定化されろ。そしてこ
の方法は少なくとも2種、好捷しくは少なくとも3.4
″!だは5種のサルモネラ((特異的な異なるプローブ
を使用する。
他の通光な実施態様においてそのプローブは標?j&さ
れず、その4灸出はサンドインチ・・イブリッド形成法
により行われる。
れず、その4灸出はサンドインチ・・イブリッド形成法
により行われる。
本発明のサルモネラ検出法は1種まだは、好ましくはそ
れ以上のサルモネラDNAプローブを使用し、それらの
プローブの谷々は大多数の既知サルモネラメ(株の全部
もしくはほとんど(好ましくは80%以上、より好寸し
くは90チ以上)に共通するサルモネラD’、NA断片
であって、他の全ての腸内細菌には明らかに4在しない
ものである。
れ以上のサルモネラDNAプローブを使用し、それらの
プローブの谷々は大多数の既知サルモネラメ(株の全部
もしくはほとんど(好ましくは80%以上、より好寸し
くは90チ以上)に共通するサルモネラD’、NA断片
であって、他の全ての腸内細菌には明らかに4在しない
ものである。
サルモネラ属全体にわたって分布するサルモネラに非常
に特異的なりNA断片の一群があるさいうこの発見は、
特にサルモネラを含む全ての腸内細菌が共通の種族であ
るらしいことを考慮すると、極めて篤くべきことであっ
た。
に特異的なりNA断片の一群があるさいうこの発見は、
特にサルモネラを含む全ての腸内細菌が共通の種族であ
るらしいことを考慮すると、極めて篤くべきことであっ
た。
本発明のプローブ群は我々が現在知っているどの蛋白質
情報もコードしておらず、また病原性に寄与することも
知られていない。従って、本発明方法はDNAプローブ
がサルモネラの特定の表現特性(phenotypic
characteristic)と適合する能力には
依存しておらず、すなわちサルモネラ属のきわ立って特
徴的々性状のどれかに寄与することが知られるD N
A kW片をプローブみして使用する必要がない。我々
の仰る限りでは、本発明のプローブは一つの細菌属全体
に広く分布するものとして最初に見出された属特異性の
、j聞直プローブである。
情報もコードしておらず、また病原性に寄与することも
知られていない。従って、本発明方法はDNAプローブ
がサルモネラの特定の表現特性(phenotypic
characteristic)と適合する能力には
依存しておらず、すなわちサルモネラ属のきわ立って特
徴的々性状のどれかに寄与することが知られるD N
A kW片をプローブみして使用する必要がない。我々
の仰る限りでは、本発明のプローブは一つの細菌属全体
に広く分布するものとして最初に見出された属特異性の
、j聞直プローブである。
サルモネラに特異的なプローブが1つだけでなく多数存
在するという我々の発見は感度の増大3よび信号の増幅
(signal ctmplificat、1on)と
いう付加的利点を提供する。使用されろ異なったプロー
ブの数が多ければ多いほど、検定の感度が増す。このこ
とは、数個の異なるプローブを使用する場合に、その谷
々のプローブは単一のサルモネラ染色体のそれぞれ異な
る部分にハイブリク“イズされるからであり、こちして
その単一の染色体は多重標識をもつことを意味する。
在するという我々の発見は感度の増大3よび信号の増幅
(signal ctmplificat、1on)と
いう付加的利点を提供する。使用されろ異なったプロー
ブの数が多ければ多いほど、検定の感度が増す。このこ
とは、数個の異なるプローブを使用する場合に、その谷
々のプローブは単一のサルモネラ染色体のそれぞれ異な
る部分にハイブリク“イズされるからであり、こちして
その単一の染色体は多重標識をもつことを意味する。
本発明による検定は迅速かつ正確な結果をもたらし、食
品製造業者は出荷前の食品貯蔵期間を短縮するこ乏がで
きる。さらに、その試、験を完了さぜろのに要する時間
が短いので、実験室では短期間に非常に多くの試料を取
り扱うことが可能である。さらにまだ、その検定は細菌
の生化学的性状よりもむしろそれらの全DNA配列にの
み依存しているので、定型サルモネラ菌と同様に非定型
ザルモネラ菌ケも生化学的に検出するC吉ができ、こう
して誤った陰性の結果を避けろことができろ。
品製造業者は出荷前の食品貯蔵期間を短縮するこ乏がで
きる。さらに、その試、験を完了さぜろのに要する時間
が短いので、実験室では短期間に非常に多くの試料を取
り扱うことが可能である。さらにまだ、その検定は細菌
の生化学的性状よりもむしろそれらの全DNA配列にの
み依存しているので、定型サルモネラ菌と同様に非定型
ザルモネラ菌ケも生化学的に検出するC吉ができ、こう
して誤った陰性の結果を避けろことができろ。
この試験は精巧な装置を必要とせず、また多方面に及ぶ
技術訓練を受けていない職員でも容易に行うことができ
る。
技術訓練を受けていない職員でも容易に行うことができ
る。
本発明の他の特徴および利点は次の好ましい実施態様の
記述および特許請求の範囲から明らかになるだろう。
記述および特許請求の範囲から明らかになるだろう。
我々はまず第一に図面について簡単に説明する。
図面
第−図は本発明を実施するのに有用な装置の分解した等
角投影図である。
角投影図である。
第二図は不発明のサルモネラに特異的なプローブの制限
地図である。
地図である。
第一図には食品試料処理装置10が示される。
この装置1・才本発明の一部分を構成1−ろものではな
い。この装置は蓋12、使い捨ての上部円筒形部分14
、および下部円筒形部分16を含み、その円筒形部分1
6のノ朋くなった頂部18は円1ヒ)形部分]4のくほ
んだ底部にぴったりとはめ込まれろ。
い。この装置は蓋12、使い捨ての上部円筒形部分14
、および下部円筒形部分16を含み、その円筒形部分1
6のノ朋くなった頂部18は円1ヒ)形部分]4のくほ
んだ底部にぴったりとはめ込まれろ。
円筒形部分14には、サルモイ・うと同じ大きさの小さ
な細菌を通過させろが小プな食品粒子やもつと大きな細
菌は濾過して取り除くことのできろ大キい孔(5〜20
0ミクロン)のフィルター22が設置される。フィルタ
ー22は大きな孔の硬質プラスチックグリッド24上に
支持される。
な細菌を通過させろが小プな食品粒子やもつと大きな細
菌は濾過して取り除くことのできろ大キい孔(5〜20
0ミクロン)のフィルター22が設置される。フィルタ
ー22は大きな孔の硬質プラスチックグリッド24上に
支持される。
円筒形部分16にはニトロセルロースのDNA結合膜2
6が設置され、この膜は円筒形7513分16の床を構
成する大きな孔のプラスチックグリッド28上に支持て
れる。円筒形部分16は真空吸引装置(図示されていな
い)のマニホールドの円筒形孔にぴったりと合う大きさ
である。
6が設置され、この膜は円筒形7513分16の床を構
成する大きな孔のプラスチックグリッド28上に支持て
れる。円筒形部分16は真空吸引装置(図示されていな
い)のマニホールドの円筒形孔にぴったりと合う大きさ
である。
例示した装置は次のような本発明方法に使用される。サ
ルモネラを含有すると思われろ食品試料を円筒形部分]
4に配置する。円筒形部分14および16は一緒にぴっ
たりと合わせ、円筒形部分16の底部末端に真空を」]
4用してサルモネラと同じ大きさの細菌をフィルター2
6上に利殖させ、一方賞品粒子ともつと大きな細菌は円
筒形部分14に]11j果さ−「だ1寸残し、これはそ
の後捨てら:itろ。欠いて本発明のサルモネラ検出法
は、下に詳i;4i11に記載するごとく、フィルター
26上の細菌に1刻して行われる。
ルモネラを含有すると思われろ食品試料を円筒形部分]
4に配置する。円筒形部分14および16は一緒にぴっ
たりと合わせ、円筒形部分16の底部末端に真空を」]
4用してサルモネラと同じ大きさの細菌をフィルター2
6上に利殖させ、一方賞品粒子ともつと大きな細菌は円
筒形部分14に]11j果さ−「だ1寸残し、これはそ
の後捨てら:itろ。欠いて本発明のサルモネラ検出法
は、下に詳i;4i11に記載するごとく、フィルター
26上の細菌に1刻して行われる。
DNAプローブ
S、チフィムリウム(S、 typhimuriuTr
l)DN AのライブラリーはBroach、等にょろ
Gen、e llj 、 121(1979)に記載
されたプラスミドベクター(、ATCCe23566株
)からのDNAを制限エンドヌクレアーゼBaηtHI
を用いて完全に加水分解して異なる長さのDNA断片ケ
作り、これはその後Co h a n等によるPNAs
; 70,3240(1973)に記、伐された一般
方法を使用してYEp13の特定のBam HI部位に
結合(ligate)されろ。この結合混合物はその後
ロイ−サツカロミセス セレビセアx (Lau−8a
ccharonycescereviseae 、酵母
)宿主捷たは大腸(’i? (E、Co11A/C10
61株)の培養物のどちらかを形質転換するのに使用さ
れ、その際大腸1尉の形7り転換体はアンピシリン耐性
を基にして選別されろ。1瞥f1.および大腸菌の宿主
A11ll胞は50Qmlの容量に」・d殖させてサル
モネラDNAのライ・フ゛ラリ−を得ろ。(欠いで、S
、チフイムリウムDNAのライブラリーケ用い、サルモ
ネラDNAと選択的に7・イブリダイズするが腸内細菌
群(本明細和ては’ 1IiA17] i1萌閑”とい
う)に属するサルモネラ以外の他の示n]囚を含む食品
中に見い出されろ他の++ilB菌とはクロスーツ〜イ
ブリダイズしないD N A Vjr片を制限酵素で力
り水分′pJイして子離選別する。選別は放射性同位元
素で二ノクトランスレーンヨンされたS、デフイム1j
ウムのゲノムまだは大腸菌DNAを用いて行われる。
l)DN AのライブラリーはBroach、等にょろ
Gen、e llj 、 121(1979)に記載
されたプラスミドベクター(、ATCCe23566株
)からのDNAを制限エンドヌクレアーゼBaηtHI
を用いて完全に加水分解して異なる長さのDNA断片ケ
作り、これはその後Co h a n等によるPNAs
; 70,3240(1973)に記、伐された一般
方法を使用してYEp13の特定のBam HI部位に
結合(ligate)されろ。この結合混合物はその後
ロイ−サツカロミセス セレビセアx (Lau−8a
ccharonycescereviseae 、酵母
)宿主捷たは大腸(’i? (E、Co11A/C10
61株)の培養物のどちらかを形質転換するのに使用さ
れ、その際大腸1尉の形7り転換体はアンピシリン耐性
を基にして選別されろ。1瞥f1.および大腸菌の宿主
A11ll胞は50Qmlの容量に」・d殖させてサル
モネラDNAのライ・フ゛ラリ−を得ろ。(欠いで、S
、チフイムリウムDNAのライブラリーケ用い、サルモ
ネラDNAと選択的に7・イブリダイズするが腸内細菌
群(本明細和ては’ 1IiA17] i1萌閑”とい
う)に属するサルモネラ以外の他の示n]囚を含む食品
中に見い出されろ他の++ilB菌とはクロスーツ〜イ
ブリダイズしないD N A Vjr片を制限酵素で力
り水分′pJイして子離選別する。選別は放射性同位元
素で二ノクトランスレーンヨンされたS、デフイム1j
ウムのゲノムまだは大腸菌DNAを用いて行われる。
酵母での上記選別方法はサルモネラD’NAと選択的に
−・イブリダイズするがサルモネラ以外の他の腸内細菌
ヲ會む他のπ用菌とはノ・イブリダイズしない1つのD
NA断片を与えた。この断片をもつブラスミ1−YE、
13を含む大腸菌クローンは1983年1月10日、メ
リーランド州ロックビルにあるアメリカン クイズ カ
ルチャー コレクション(American T’/p
CCulture Co11ection)の培養・吻
コレクション中にRE2O3と識別されて寄託され、そ
してATCC寄託礪39261号と指定された。
−・イブリダイズするがサルモネラ以外の他の腸内細菌
ヲ會む他のπ用菌とはノ・イブリダイズしない1つのD
NA断片を与えた。この断片をもつブラスミ1−YE、
13を含む大腸菌クローンは1983年1月10日、メ
リーランド州ロックビルにあるアメリカン クイズ カ
ルチャー コレクション(American T’/p
CCulture Co11ection)の培養・吻
コレクション中にRE2O3と識別されて寄託され、そ
してATCC寄託礪39261号と指定された。
上記のIす1片が各種のサルモネラ菌に共通するもので
あることを立証するだめに、この断片をBam1’l
Iでプラスミドベクターから切断し、アガロースゲル電
気泳動で精製し、Rigb’/等によるJ、Mol。
あることを立証するだめに、この断片をBam1’l
Iでプラスミドベクターから切断し、アガロースゲル電
気泳動で精製し、Rigb’/等によるJ、Mol。
Biol、113 、237 (1977)に記載され
たニックトランスレーション法を使用して32pでニツ
クトランスレーションし、そして一本鎖状にして、多数
の野外分離サルモネラのDNAのスクリーニングに用い
た。この断片は試験した全部の野外分離サルモネラとハ
イブリダイズすることが見い出された。
たニックトランスレーション法を使用して32pでニツ
クトランスレーションし、そして一本鎖状にして、多数
の野外分離サルモネラのDNAのスクリーニングに用い
た。この断片は試験した全部の野外分離サルモネラとハ
イブリダイズすることが見い出された。
サルモネラに特異的なさらに別のプローブは酵射よりも
むしろ大腸菌IW’c1061から約200のプラスミ
ドミニブレノブ(7)lasm、icl m1nipr
ep)を選別して先に記載したことくして得られた。よ
り詳細には、その方法は次の通りである。
むしろ大腸菌IW’c1061から約200のプラスミ
ドミニブレノブ(7)lasm、icl m1nipr
ep)を選別して先に記載したことくして得られた。よ
り詳細には、その方法は次の通りである。
最初に、MC1061形質1舐換体のブラスミトミニブ
レノフ”fc Jio 1me s等に□よろAnal
、Bioclbern。
レノフ”fc Jio 1me s等に□よろAnal
、Bioclbern。
A14 、193 (19’81 )にb己i;戊だれ
た方法により製造する。これらのミニブレツブの:1f
ll限酵素での力O水分解物はアガロースゲル中で電気
泳動して、SouthermによろJ、Mo1.Bio
l、98 、503(]−975)に記載されたように
ニトロセルロースフィルターに移し換えられろ。アルフ
ァー(32−p)dATP−にたはアルファー<、 3
2− p ) dcTPでニックトランスレーションさ
AtたMC1,061B、Il、C,23、6’41
(’1966 ) K記載されたように、これらのフィ
ルターとの・・イブリッド形成((使用される。・・イ
ブリッド形成後の洗浄は0.3 A4NaCe / 0
.03 Mクエン酸ナトリウムを用いて65℃で30分
間行う。大腸菌プローブとハイブリダイズしないサルモ
ネラDNAの断片を含むこれらのクローンは、サルモネ
ラに対するこれらの′配列の特異性を立証するだめに、
種々のサルモネラ菌株および非サルモネラ菌株に対して
さらに選別されろ。
た方法により製造する。これらのミニブレツブの:1f
ll限酵素での力O水分解物はアガロースゲル中で電気
泳動して、SouthermによろJ、Mo1.Bio
l、98 、503(]−975)に記載されたように
ニトロセルロースフィルターに移し換えられろ。アルフ
ァー(32−p)dATP−にたはアルファー<、 3
2− p ) dcTPでニックトランスレーションさ
AtたMC1,061B、Il、C,23、6’41
(’1966 ) K記載されたように、これらのフィ
ルターとの・・イブリッド形成((使用される。・・イ
ブリッド形成後の洗浄は0.3 A4NaCe / 0
.03 Mクエン酸ナトリウムを用いて65℃で30分
間行う。大腸菌プローブとハイブリダイズしないサルモ
ネラDNAの断片を含むこれらのクローンは、サルモネ
ラに対するこれらの′配列の特異性を立証するだめに、
種々のサルモネラ菌株および非サルモネラ菌株に対して
さらに選別されろ。
大腸菌プローブと−・イブリダイズしないと思われる全
部で54個のクローン化した1所片が、ミニブレツブに
より試験されたプラスミドコレクションから得られた。
部で54個のクローン化した1所片が、ミニブレツブに
より試験されたプラスミドコレクションから得られた。
これらのクローンは下の第−表に掲げた23種のサルモ
ネラ培養菌株と32種の非サルモネラ菌株に対して選別
さイtだ。ここに示したサルモネラ菌株(アリゾナエ、
αrizona、eを全部含む)はThe Sh、or
ter Bergey’s Manualof Det
erm、1native 13acteriolog’
/、I(lに基づいて各血清型につき菌種名が与えられ
ろように示される。血清型が知られているがその対応す
る菌種名が知られていない場合のみ血清型で示される。
ネラ培養菌株と32種の非サルモネラ菌株に対して選別
さイtだ。ここに示したサルモネラ菌株(アリゾナエ、
αrizona、eを全部含む)はThe Sh、or
ter Bergey’s Manualof Det
erm、1native 13acteriolog’
/、I(lに基づいて各血清型につき菌種名が与えられ
ろように示される。血清型が知られているがその対応す
る菌種名が知られていない場合のみ血清型で示される。
ジョーシア州アトランタにある疾病コントロールセンタ
ー(Centers 、for Disease Co
ntrol。
ー(Centers 、for Disease Co
ntrol。
CDC)により血清型が明らかにされた菌株を除いて、
全ての菌株はSpicer−EcLwcbris %(
Difco:57yratt等によるMol、Gen、
、、121 、347−353)を使用してH抗原特異
性について試験された。
全ての菌株はSpicer−EcLwcbris %(
Difco:57yratt等によるMol、Gen、
、、121 、347−353)を使用してH抗原特異
性について試験された。
ここに示しだ分離サルモネラ菌は下の第二表てO抗原群
により大別されている。また、Cれらの分離菌のうち、
特に興味あるものは第−表に記載した。ここに示した非
サルモネラ菌株は食品から分離され、各種の他のY+t
ll菌学的培地での生育パラメーターの試験によりEn
teric−1eん鑑定法(Difco)を使用して鑑
定された。これらの場合のいくつかにおいては属のみを
示す。
により大別されている。また、Cれらの分離菌のうち、
特に興味あるものは第−表に記載した。ここに示した非
サルモネラ菌株は食品から分離され、各種の他のY+t
ll菌学的培地での生育パラメーターの試験によりEn
teric−1eん鑑定法(Difco)を使用して鑑
定された。これらの場合のいくつかにおいては属のみを
示す。
第−表
細菌および酵母の菌株
菌株 菌属、菌種または血清型 菌株1WC
1061β、コリ XY820−41 S、セレビシェー 1−e旦−31μリー126馬傅−11ade2−GI
O DB9000 ;i、−1yイ企刃−型付p’/r
F146 axbt A trp 130 hJis5
7zeg629: Tn5 (フェルス、ブ′ラスミド
)S100 サルモネラ
aSCO):Z29C1i) S102 ブ火モネラ
。
1061β、コリ XY820−41 S、セレビシェー 1−e旦−31μリー126馬傅−11ade2−GI
O DB9000 ;i、−1yイ企刃−型付p’/r
F146 axbt A trp 130 hJis5
7zeg629: Tn5 (フェルス、ブ′ラスミド
)S100 サルモネラ
aSCO):Z29C1i) S102 ブ火モネラ
。
G<、0):Z29UJ)
Sl04 ブ匹舌ネラ
aCl Co) :G値合体(1プ) S105 1袂イv:e:47
aM’CO) :z
lo +en、複合体(11)Sl (16ブ之i本之
“FCO):en複合体
Cl−1) S108 ■五舌オー之
aCl (Q) :r+1 複合体(H)S1
10 力と±才う a
。
aCl Co) :G値合体(1プ) S105 1袂イv:e:47
aM’CO) :z
lo +en、複合体(11)Sl (16ブ之i本之
“FCO):en複合体
Cl−1) S108 ■五舌オー之
aCl (Q) :r+1 複合体(H)S1
10 力と±才う a
。
KCO): Z4 (,1−1)
Slll ”Ilぞも表2−
α(、’1 (Q) : Z29 (H)
5124 サルモネラ
aE2 Co) : i CII) S125 サルモイ・ラ
aMCO):ZloCH) 8126 サルモネラ
aFCO):に+1複合体(li ) S127 サルモネラ
α0CO) :Z4 C1−1) S128 ツニイV、さ中3−42
。
α(、’1 (Q) : Z29 (H)
5124 サルモネラ
aE2 Co) : i CII) S125 サルモイ・ラ
aMCO):ZloCH) 8126 サルモネラ
aFCO):に+1複合体(li ) S127 サルモネラ
α0CO) :Z4 C1−1) S128 ツニイV、さ中3−42
。
GCO):G複合体Cl−1)
S129 サルモネラ
aBCO):1cIi) 8130 サルモネラ
aE2CO):’en複合体CH) S131 サルモネラ
aI(O):b(H) Sl 82 f 1v−E::(5aGCO)
: Z+e n 17合体(H)SA19 s
、=ニーボート(n、ewport) 、
aS103A クレブシェラ
bS103B ノトロバクター
bSLO7エンテロバクタ−b S109A エンテロバクタ−b 、S’109B エンテロバクタ−b8115B7
”ロチウス・ブルガリスbSl17A クレプンエ
ラ bS112 エンテロ
バクタ−b S113 シトロバクタ−b S114 シトロバクタ−b S116 シI・ロバフタ−b RF8’?5 、S’、)しD’レスト(tre
ro7est) cRF876
S、−h14zl= ト Cu−t、re−cht
) cRF877
S72’yjyv(hamba7)
CIビF8T8 S、715(3cc−1−e)
c1iF879 石i
、j;/−7(4ranoya)
cRF880 、S、7−i9(a7t−
i−s) c1?F882 S−、
p ’ijA (t ojcai )
cRF883 S−、−辷遺x(b−asp l
) cRF8B4 s−ベテ
ィオ9(b−etiok’/) cRF
885 ’ 5−7v、−トン−(11tLt、
onJ 、 cRF886
7zレ−EJ−之
C(64:ん;e、x、z15
) 11F887 ”)l、:Iレモネ之
C(65ニー:1,6) RF888 5jyt3y2イ−−ル士7 (by
p o ic、f i、@I、aリ C)F889
、!¥、クー兄2547(crossness
) ’ cRF890 −.5
.7jv21yイーy、v ) ニー
cRF891 サルモネラ
C(er6:z85 ニー) ty892 s、パンゴール(bangor)
cノアF893 サルモネラ
C(66“ z65 ニー) RF894 サルモイ、ラ
C(48:z41°−) RF895 サルモネラ
C(44:4ニー) RF896 S、’/ムスバリ(simsbur
y) cRF89’l S、ラド
ガース(rrbtgers) cRF8
9B S、エーンユ(aCsch、)
cRF899 S、クロスネ
ス CRF944 ンゲ
ラ(グループB) dlンF
945 S、フレクスネリ
dRF946 ノゲラ(グループB)d
RF947 yグ之(グループB)d11F948
−イブ−2(り”ループQ)
d(’/−ersinja egtero−po
jit、i、ca)l&954 夕4≦りも7・
円Zデ三30隻デー左 dRF955
ヤピ・工Δ二F3ニョ7]2ノ九
dσ、シリカ−1σf究所(5illiker L
aboratories)b 本研究 C疾病コントロールセンター((:antar for
Disease Control) d ゲアリー・トーンCGar’l Doern )大
腸菌とハイブリダイズしない54個のクローンの多くは
非サルモネラ培養菌のいくつかにクロス−ハイブリダイ
ズする。14個のクローン(第二図に示しだ10個のク
ローンIfむ)は他の分離端とはクロス−ハイブリダイ
ズしないで、サルモネラ培養菌lF一対して非常に特異
的であることがわかった。これらはその後他のザルモイ
・う分離直を検査するために各々の甲のクローン化した
挿入物をプローブとして使用1゛ろことにより広11i
U囲に(すf死される。
aBCO):1cIi) 8130 サルモネラ
aE2CO):’en複合体CH) S131 サルモネラ
aI(O):b(H) Sl 82 f 1v−E::(5aGCO)
: Z+e n 17合体(H)SA19 s
、=ニーボート(n、ewport) 、
aS103A クレブシェラ
bS103B ノトロバクター
bSLO7エンテロバクタ−b S109A エンテロバクタ−b 、S’109B エンテロバクタ−b8115B7
”ロチウス・ブルガリスbSl17A クレプンエ
ラ bS112 エンテロ
バクタ−b S113 シトロバクタ−b S114 シトロバクタ−b S116 シI・ロバフタ−b RF8’?5 、S’、)しD’レスト(tre
ro7est) cRF876
S、−h14zl= ト Cu−t、re−cht
) cRF877
S72’yjyv(hamba7)
CIビF8T8 S、715(3cc−1−e)
c1iF879 石i
、j;/−7(4ranoya)
cRF880 、S、7−i9(a7t−
i−s) c1?F882 S−、
p ’ijA (t ojcai )
cRF883 S−、−辷遺x(b−asp l
) cRF8B4 s−ベテ
ィオ9(b−etiok’/) cRF
885 ’ 5−7v、−トン−(11tLt、
onJ 、 cRF886
7zレ−EJ−之
C(64:ん;e、x、z15
) 11F887 ”)l、:Iレモネ之
C(65ニー:1,6) RF888 5jyt3y2イ−−ル士7 (by
p o ic、f i、@I、aリ C)F889
、!¥、クー兄2547(crossness
) ’ cRF890 −.5
.7jv21yイーy、v ) ニー
cRF891 サルモネラ
C(er6:z85 ニー) ty892 s、パンゴール(bangor)
cノアF893 サルモネラ
C(66“ z65 ニー) RF894 サルモイ、ラ
C(48:z41°−) RF895 サルモネラ
C(44:4ニー) RF896 S、’/ムスバリ(simsbur
y) cRF89’l S、ラド
ガース(rrbtgers) cRF8
9B S、エーンユ(aCsch、)
cRF899 S、クロスネ
ス CRF944 ンゲ
ラ(グループB) dlンF
945 S、フレクスネリ
dRF946 ノゲラ(グループB)d
RF947 yグ之(グループB)d11F948
−イブ−2(り”ループQ)
d(’/−ersinja egtero−po
jit、i、ca)l&954 夕4≦りも7・
円Zデ三30隻デー左 dRF955
ヤピ・工Δ二F3ニョ7]2ノ九
dσ、シリカ−1σf究所(5illiker L
aboratories)b 本研究 C疾病コントロールセンター((:antar for
Disease Control) d ゲアリー・トーンCGar’l Doern )大
腸菌とハイブリダイズしない54個のクローンの多くは
非サルモネラ培養菌のいくつかにクロス−ハイブリダイ
ズする。14個のクローン(第二図に示しだ10個のク
ローンIfむ)は他の分離端とはクロス−ハイブリダイ
ズしないで、サルモネラ培養菌lF一対して非常に特異
的であることがわかった。これらはその後他のザルモイ
・う分離直を検査するために各々の甲のクローン化した
挿入物をプローブとして使用1゛ろことにより広11i
U囲に(すf死される。
この選別は次のように実7iI!i烙れる。最初に、1
4個のサルモネラに特異的な10〒片f J3arnH
Iを使用してプラスミドベクターから切断し、アガロー
スゲルを通して電気泳動し、電気溶離し、そして先に記
載したごと°くニノクトランスレーションにより32P
で標識する。
4個のサルモネラに特異的な10〒片f J3arnH
Iを使用してプラスミドベクターから切断し、アガロー
スゲルを通して電気泳動し、電気溶離し、そして先に記
載したごと°くニノクトランスレーションにより32P
で標識する。
上記プローブを使用して検査されるサルモネラ分離菌お
よび他の細菌分離物のドツト・プロント(1)ot b
lot )は、Lプロ゛ス培地甲の+NI] 1ajl
培養物を約20倍に濃縮し、次いでニトロセルロースフ
ィルター上に1マイクロリツトルずつ滴下点在きせるこ
とにより作られる。その、に1月面イはそのj易で溶劇
され、それらのDNAは変性されて引き続き0.2 M
NctOHlo、6 MNaC12bよび1八4(・リ
ス(ph18.0 ) / 0,6 M NaCl1
で胞和塾せたワットマン3M紙(’Whatmnnn
、 1tJi票名う上1/Cソt7) 7 ’1 #
ターを置き、その後そのフィルターを無水エタンール
中に浸漬してそれらを+:i乞燥させることによりi屯
1定化されろ。
よび他の細菌分離物のドツト・プロント(1)ot b
lot )は、Lプロ゛ス培地甲の+NI] 1ajl
培養物を約20倍に濃縮し、次いでニトロセルロースフ
ィルター上に1マイクロリツトルずつ滴下点在きせるこ
とにより作られる。その、に1月面イはそのj易で溶劇
され、それらのDNAは変性されて引き続き0.2 M
NctOHlo、6 MNaC12bよび1八4(・リ
ス(ph18.0 ) / 0,6 M NaCl1
で胞和塾せたワットマン3M紙(’Whatmnnn
、 1tJi票名う上1/Cソt7) 7 ’1 #
ターを置き、その後そのフィルターを無水エタンール
中に浸漬してそれらを+:i乞燥させることによりi屯
1定化されろ。
上記選別方法の結果は下の第二衣に示されろ。
そこに示されるごとく、クローンRF821(第二衣)
は試験したサルモネラ分馳物の全てとハイブリダイズす
る。
は試験したサルモネラ分馳物の全てとハイブリダイズす
る。
S、オハイオ(olvio) 1
1 1 1S、オス口Ioslo)
1 1 1 1S、パラテイ
フイ<parat、ypM) C1111峠―鹸−□ S、ボッダム(potstiam)
1 1 1 1S、テネ:
/−(tennessee) 2
2 2 2s、トムソン(thompson
) 6 6 6 G□□□
□− グループ C2 S、ブロックリ−(bloclcley)
44 4 4S、クロストラップ(g
loSt恍p) 1 1
1+SH”−ト(ha、ardt)
2 2 2 2S、m
llヒトス(kottbus) 1
1 1 ’、fS、リッヂフィーー
)レドl1itchfielcl)
1 1 1 iS、
マンダカ(mandaka) 1
1 1 1S、ミュンヘン(mu
e n c h e n ) 4
4. 4 4−ンとハイブリダイズし
た分1:il試料の数9 lt1イ133311づjr
i゛305−1 lI:F2O37I:F:34417
F31811:li′347−311づjri゛367
11 01110 4 4 0 0 0 Q
11100110 11 00110 1 1 0.0. 1 1’02200
000 6、、 6 0 0 5 5 0
1100110 2 2 0 0 1 1 011 .
4 0 0 4 4 111
00110 1 1 0 0 0 0 011 00
000 2200’1.10 1 1 0 0 1 1 011 0
01 10 1100000 41 004 40 S、ナランノInarashino) 1
7− 1 1 1S、ニュ
ーボート(neufport)6 6
6 6 6S、タラハツセ−(talla
hassee) 1 、 1
1 1 1S、ツーリール(t
ulear) 1 1
1’ 1 1グループ C3 S、ケンタラキー(kentuclcy)
l 1 1 1.
IS、バージニア(virginia、) 、
1 1 1 ]
IS、ボルナム(bornum)
1 1 1 L 1
グループ D S、ベルタ(berta) 1
1 1 1 1S、グレグダム(gleg
dtrm) ’ 1 1
1 ]、 IS、タブ20ス9ラ
ーム(dar−es−saa、ltm+、)
1 1 1 1
1S、ダブリン(d、ubrLin)
1 1 1 1
1S、イーストフ’/l/不(eastbourne)
1 1 1
1 1S、エンラ1リテイデイス(ente
ritidis) 4 4
4 4 48゜ガ
リナルムCgallinaruynl 1
1 1 1 1S、
ジャビアナ(javiana) 3
3 3 3 3S、モスコラ(
moscow) 1 1
1 1 1イブリダイズした分離試料
の数 lビF305−I RE2O314;’344 17
p″318 ノアF347−3 7<F3671.00
110 1 016 6 0 1 001 1 (J l 000 0 0 1 001 1 0 10’o1 1 ’0 1 0 0’OO0 100110 100110 100110 1001、10 111000 400444 100110 313220 100111 S、ナポリ(napoli) l
1 1 1 1s、7、ナー(pana
yrrヶ) 4 /l
4 4 4S、ベンザコラ(prm、sa、
cola) 1 1 1
1 1S、oストック(rostocん)
l 1111S、セン
ダイ(send、ai) 1 1
1 1 1S、テイフイ(typh、i)
7 7 7 7
7S、フレスノげresno) 1
1 1 1 、IS、ゲイツヘッド(g
ateshaatl) 1 1
1 、 1 1S、ストラス
ブルグ(s trasbcmrg) 1
1 1 1 1グループ E ザルモネラ (3,10:1,6:−) 1
1 1 1 1S、アナタム(ana、t
um) 4 4 4.
/l yIS6ブタンタン(butc
m、tan) 1 1
1 1 1S、ギブ(give)
1 1 1 1 1S、
ロンドンl1onclon) 2
2 2 2 2S
、ルアクリディス<malCagri’、+i、q’、
s) 11 1 1 1S、
ムエンスター(muenster) 、 2
2 2 2 、 280ナ
イボール(yborg) 11
1 1 トイブリダイスした分離試料の
数 一1ゼF3(15−I RE2O31−M3441イF
318 RF347−31<F3671’ 0
1 110 00000 10(JIIO 10011、1 100000 00000 1,0,00(J’0 1 010 00 +−00110 100110 710044,0 1010,00 101,000 20200、0 1、00000 20’2 0 、、o 01 0
1 0 0 ’0S、オリオン(ori
on) l 1 1 1S
、プロラム(pullorum) 1
1 1 4S、アーカンサスIa
rlcansas) 1 1
1 1S、ネビントンInewingto
n) 1 1 1
1S、イリノイ(illinois)
2 2 2 2S、ミ不アポ
リスーnneapolis) 1 1
1 1S、二二□フランス゛ウィック(
newbranswiclc) 3 3
3 3S、チタゴングCclLit
tagoru)) 1 1
1 1S、タレイフエルド(IcrefeicL
) 1 1
1 1S、ルシアナ(luciana)
l 1 1 1
S、セフテノJzグ(seftenberg)
2 2 2 2S、ベ
スターステード(westerstede)
1 1 1 1グ
ループF、G S、アバジーン(abercleen)
1 1 1 1S、ルビス
ロー(rubislaw) 2
2 2 2S、マーンヤ/l/
(rnarshtbll) 1
1 1 1S、ボーナ(poona
) 3 3 3 3S
、ハハナ(ha、vana) 、1’
1 1 1S、ミシシソビ−1m1ss
issippi) 1 1
1 10−ンとハイブリダイズした分離試料の
数19 1イF3 :33 ノでF2O3,−11七
F304 RF’344 Ml;’318 1ンF
’347−3 1tF367110011 0 1 10(Jll O l 1 0 1 1 1−
。
1 1 1S、オス口Ioslo)
1 1 1 1S、パラテイ
フイ<parat、ypM) C1111峠―鹸−□ S、ボッダム(potstiam)
1 1 1 1S、テネ:
/−(tennessee) 2
2 2 2s、トムソン(thompson
) 6 6 6 G□□□
□− グループ C2 S、ブロックリ−(bloclcley)
44 4 4S、クロストラップ(g
loSt恍p) 1 1
1+SH”−ト(ha、ardt)
2 2 2 2S、m
llヒトス(kottbus) 1
1 1 ’、fS、リッヂフィーー
)レドl1itchfielcl)
1 1 1 iS、
マンダカ(mandaka) 1
1 1 1S、ミュンヘン(mu
e n c h e n ) 4
4. 4 4−ンとハイブリダイズし
た分1:il試料の数9 lt1イ133311づjr
i゛305−1 lI:F2O37I:F:34417
F31811:li′347−311づjri゛367
11 01110 4 4 0 0 0 Q
11100110 11 00110 1 1 0.0. 1 1’02200
000 6、、 6 0 0 5 5 0
1100110 2 2 0 0 1 1 011 .
4 0 0 4 4 111
00110 1 1 0 0 0 0 011 00
000 2200’1.10 1 1 0 0 1 1 011 0
01 10 1100000 41 004 40 S、ナランノInarashino) 1
7− 1 1 1S、ニュ
ーボート(neufport)6 6
6 6 6S、タラハツセ−(talla
hassee) 1 、 1
1 1 1S、ツーリール(t
ulear) 1 1
1’ 1 1グループ C3 S、ケンタラキー(kentuclcy)
l 1 1 1.
IS、バージニア(virginia、) 、
1 1 1 ]
IS、ボルナム(bornum)
1 1 1 L 1
グループ D S、ベルタ(berta) 1
1 1 1 1S、グレグダム(gleg
dtrm) ’ 1 1
1 ]、 IS、タブ20ス9ラ
ーム(dar−es−saa、ltm+、)
1 1 1 1
1S、ダブリン(d、ubrLin)
1 1 1 1
1S、イーストフ’/l/不(eastbourne)
1 1 1
1 1S、エンラ1リテイデイス(ente
ritidis) 4 4
4 4 48゜ガ
リナルムCgallinaruynl 1
1 1 1 1S、
ジャビアナ(javiana) 3
3 3 3 3S、モスコラ(
moscow) 1 1
1 1 1イブリダイズした分離試料
の数 lビF305−I RE2O314;’344 17
p″318 ノアF347−3 7<F3671.00
110 1 016 6 0 1 001 1 (J l 000 0 0 1 001 1 0 10’o1 1 ’0 1 0 0’OO0 100110 100110 100110 1001、10 111000 400444 100110 313220 100111 S、ナポリ(napoli) l
1 1 1 1s、7、ナー(pana
yrrヶ) 4 /l
4 4 4S、ベンザコラ(prm、sa、
cola) 1 1 1
1 1S、oストック(rostocん)
l 1111S、セン
ダイ(send、ai) 1 1
1 1 1S、テイフイ(typh、i)
7 7 7 7
7S、フレスノげresno) 1
1 1 1 、IS、ゲイツヘッド(g
ateshaatl) 1 1
1 、 1 1S、ストラス
ブルグ(s trasbcmrg) 1
1 1 1 1グループ E ザルモネラ (3,10:1,6:−) 1
1 1 1 1S、アナタム(ana、t
um) 4 4 4.
/l yIS6ブタンタン(butc
m、tan) 1 1
1 1 1S、ギブ(give)
1 1 1 1 1S、
ロンドンl1onclon) 2
2 2 2 2S
、ルアクリディス<malCagri’、+i、q’、
s) 11 1 1 1S、
ムエンスター(muenster) 、 2
2 2 2 、 280ナ
イボール(yborg) 11
1 1 トイブリダイスした分離試料の
数 一1ゼF3(15−I RE2O31−M3441イF
318 RF347−31<F3671’ 0
1 110 00000 10(JIIO 10011、1 100000 00000 1,0,00(J’0 1 010 00 +−00110 100110 710044,0 1010,00 101,000 20200、0 1、00000 20’2 0 、、o 01 0
1 0 0 ’0S、オリオン(ori
on) l 1 1 1S
、プロラム(pullorum) 1
1 1 4S、アーカンサスIa
rlcansas) 1 1
1 1S、ネビントンInewingto
n) 1 1 1
1S、イリノイ(illinois)
2 2 2 2S、ミ不アポ
リスーnneapolis) 1 1
1 1S、二二□フランス゛ウィック(
newbranswiclc) 3 3
3 3S、チタゴングCclLit
tagoru)) 1 1
1 1S、タレイフエルド(IcrefeicL
) 1 1
1 1S、ルシアナ(luciana)
l 1 1 1
S、セフテノJzグ(seftenberg)
2 2 2 2S、ベ
スターステード(westerstede)
1 1 1 1グ
ループF、G S、アバジーン(abercleen)
1 1 1 1S、ルビス
ロー(rubislaw) 2
2 2 2S、マーンヤ/l/
(rnarshtbll) 1
1 1 1S、ボーナ(poona
) 3 3 3 3S
、ハハナ(ha、vana) 、1’
1 1 1S、ミシシソビ−1m1ss
issippi) 1 1
1 10−ンとハイブリダイズした分離試料の
数19 1イF3 :33 ノでF2O3,−11七
F304 RF’344 Ml;’318 1ンF
’347−3 1tF367110011 0 1 10(Jll O l 1 0 1 1 1−
。
110011 0
220022 0
1100110
3 3 0 3 3 3 011001
.1 0 1111110 110111 0 220022 0 1 10011 0 j 1 0 0 1 1
0220222 0 110000 0 333300’0 110011 0 1 1 0 1 0 0’
0クローンRF856、RF352、RF354、
およびRF355−1はlンF305−1と同じく全て
の分離サルモ不う菌とハイブリダイズする(ATCCに
寄託されたクローン11F305はその後RF305−
1と改名畑れた)。クローンRF321、RF352、
RF854およびlンF355=1のうち少なくとも3
個は独立したクローンであるが、これらは同一の挿入片
を含むことがわかった。RF321とRF354は同じ
BarnHI断片を含むが、その方向性はプラスミドベ
クターに関して反対である。uF355−1は1.4に
’Bの大きさの第二のlコaηtlJl断片をきらに包
むクローンから誘導され:5.6KB断片の方向性はR
F354と同じである。RF352はlンF321に一
致する。クロニン12F356は太きさおよび制限地図
により他のものと異なる。
.1 0 1111110 110111 0 220022 0 1 10011 0 j 1 0 0 1 1
0220222 0 110000 0 333300’0 110011 0 1 1 0 1 0 0’
0クローンRF856、RF352、RF354、
およびRF355−1はlンF305−1と同じく全て
の分離サルモ不う菌とハイブリダイズする(ATCCに
寄託されたクローン11F305はその後RF305−
1と改名畑れた)。クローンRF321、RF352、
RF854およびlンF355=1のうち少なくとも3
個は独立したクローンであるが、これらは同一の挿入片
を含むことがわかった。RF321とRF354は同じ
BarnHI断片を含むが、その方向性はプラスミドベ
クターに関して反対である。uF355−1は1.4に
’Bの大きさの第二のlコaηtlJl断片をきらに包
むクローンから誘導され:5.6KB断片の方向性はR
F354と同じである。RF352はlンF321に一
致する。クロニン12F356は太きさおよび制限地図
により他のものと異なる。
クローンRF319、IIF88B、l七F326、お
よび11F805−1は検奔した全サルモネラ分離菌の
うち100%より少ないものとハイブリダイズする。大
きさ、:l1lJ限地図および・・イブリッド形成パタ
ーンにより、クローンRI”:3BBと11F326は
これらがプラスミドベクター中で反対の方向性をもつと
いうことを除いて同一である。
よび11F805−1は検奔した全サルモネラ分離菌の
うち100%より少ないものとハイブリダイズする。大
きさ、:l1lJ限地図および・・イブリッド形成パタ
ーンにより、クローンRI”:3BBと11F326は
これらがプラスミドベクター中で反対の方向性をもつと
いうことを除いて同一である。
第二図に示したμノ「片のうち5つは1983年6月2
9日にビオ−リアにある国際寄託機+aのアダリ力ルチ
ュラル リサーチ カルチャー コレクション(Agr
icultrtral Re5earc)L Cu1t
ureCal 1action、 NRIIL )に寄
託された。谷々の断片は大腸菌にiすれろプラスミドY
E7A3に挿入されろ。これらの断片のNRRL識別番
号は次の通りである。
9日にビオ−リアにある国際寄託機+aのアダリ力ルチ
ュラル リサーチ カルチャー コレクション(Agr
icultrtral Re5earc)L Cu1t
ureCal 1action、 NRIIL )に寄
託された。谷々の断片は大腸菌にiすれろプラスミドY
E7A3に挿入されろ。これらの断片のNRRL識別番
号は次の通りである。
ノンF856:NlンRLB−15484RF888:
NjンノンLB−1547312F’319:NRIン
LB−1547211F305 :NR11L 13
−15479RF821:NIIRL B−1548
0クローンlンF304、lイF344、JンF3]8
、RF347−8、およびRF367は試験した全サル
モネラ分離菌の50%もしくはそれ以下とノ・イブリダ
イズし、こうしてこれらのクローンは、はとんど疑いな
く染色体で。あって完全な染色体よりも小さ女部分から
なる鵠二図のプローブよりも、プローブとしてあ丑り適
さないものである。RF344およびRF347−3に
ついて、そのハイブリッド形成パターンは互いに異なる
。i< p 3 i BはR,FB47−3と同じ分布
をもつが大きさ2よひ制限地図において異なる。クロー
ンRF:304とRF867はその属中で狭い分布をも
つ。しかしながら、これらの2つのクローンについての
ハイブリッド形成パターンは異なる。これらのクローン
の全てはS、チフィムリウムに通常見い出されろ潜在プ
ラスミド(cryptlc plasmicl) ”i
、)欠失しているΣチフィムリ?一台L T 2菌株、
J) R9000からのDNAとハイブリダイズづ−る
。これらのクローン化された1祈片の分布は広傾1ノ月
に変化するので、RF304.1ゼF344、j6よび
JイF347−3は異なるファージまだはプラスミドの
一部であるかも知れない;もしそうなら、RF81Bと
RF847−1は2そらく同じプラスミドまたはバクテ
リオファージから誘導きれたものだろう。
NjンノンLB−1547312F’319:NRIン
LB−1547211F305 :NR11L 13
−15479RF821:NIIRL B−1548
0クローンlンF304、lイF344、JンF3]8
、RF347−8、およびRF367は試験した全サル
モネラ分離菌の50%もしくはそれ以下とノ・イブリダ
イズし、こうしてこれらのクローンは、はとんど疑いな
く染色体で。あって完全な染色体よりも小さ女部分から
なる鵠二図のプローブよりも、プローブとしてあ丑り適
さないものである。RF344およびRF347−3に
ついて、そのハイブリッド形成パターンは互いに異なる
。i< p 3 i BはR,FB47−3と同じ分布
をもつが大きさ2よひ制限地図において異なる。クロー
ンRF:304とRF867はその属中で狭い分布をも
つ。しかしながら、これらの2つのクローンについての
ハイブリッド形成パターンは異なる。これらのクローン
の全てはS、チフィムリウムに通常見い出されろ潜在プ
ラスミド(cryptlc plasmicl) ”i
、)欠失しているΣチフィムリ?一台L T 2菌株、
J) R9000からのDNAとハイブリダイズづ−る
。これらのクローン化された1祈片の分布は広傾1ノ月
に変化するので、RF304.1ゼF344、j6よび
JイF347−3は異なるファージまだはプラスミドの
一部であるかも知れない;もしそうなら、RF81Bと
RF847−1は2そらく同じプラスミドまたはバクテ
リオファージから誘導きれたものだろう。
定量的サルモネラ検出法
本発明プローブを使用してのサルモネラ検出法を詳細に
述べる前に、本発明プローブとサルモネラDNAとの間
に形成されろ・・イブリッド複合体の検出は種々の方法
で達成することができろということを指摘しておかなけ
ればならない。一つの方法はプローブを標識しておくこ
とにより、そのプローブが形成した・・イブリント被合
体を標識することである。プローブはいろいろなフ5法
のうちいずれかで1票6成することができる。いくつか
の4票識方法は直接的なものであり、すなわちプローブ
に結合される・瀦識それ自体か検出可能なものであって
、その例は放射性同位元累である。他の標識は間接的な
ものであり、すなわちその標識はハイブリッド形成後に
1つまたはそれ以上の反応を行うlでそれ自体検出不可
能なものであって、その例はビオチンのような化合物で
あり、ビオチンそれ自体は検出されないが、螢光団や西
洋ワサビ被層オキ/ダーゼC111?、P)のようなト
Iイ素のごとき検出可能な化学種に結合ざイtたアビジ
ンと反応しだ後に検出可能になる。H11Fの場合に、
検出はIf RPのだめの基質を使用して行われ、好適
々そのよう々基質は色原体ジアミノベンジジンである。
述べる前に、本発明プローブとサルモネラDNAとの間
に形成されろ・・イブリッド複合体の検出は種々の方法
で達成することができろということを指摘しておかなけ
ればならない。一つの方法はプローブを標識しておくこ
とにより、そのプローブが形成した・・イブリント被合
体を標識することである。プローブはいろいろなフ5法
のうちいずれかで1票6成することができる。いくつか
の4票識方法は直接的なものであり、すなわちプローブ
に結合される・瀦識それ自体か検出可能なものであって
、その例は放射性同位元累である。他の標識は間接的な
ものであり、すなわちその標識はハイブリッド形成後に
1つまたはそれ以上の反応を行うlでそれ自体検出不可
能なものであって、その例はビオチンのような化合物で
あり、ビオチンそれ自体は検出されないが、螢光団や西
洋ワサビ被層オキ/ダーゼC111?、P)のようなト
Iイ素のごとき検出可能な化学種に結合ざイtたアビジ
ンと反応しだ後に検出可能になる。H11Fの場合に、
検出はIf RPのだめの基質を使用して行われ、好適
々そのよう々基質は色原体ジアミノベンジジンである。
今俊本明#Il書甲で使用する゛標識“′という用語は
、便宜上、放射性同位元素のような面接的に検出可能な
化学種およびビオチンのような間接的に検出可能な化学
種の両刀を意味する。間接的に検出可能な標識全検出可
能にするために結合されろ化学種(例えば、l1RP
/アビジン)は本明細書に2いて゛表示体“とじて示さ
れろ。
、便宜上、放射性同位元素のような面接的に検出可能な
化学種およびビオチンのような間接的に検出可能な化学
種の両刀を意味する。間接的に検出可能な標識全検出可
能にするために結合されろ化学種(例えば、l1RP
/アビジン)は本明細書に2いて゛表示体“とじて示さ
れろ。
プローブのだめの最も好捷しいiq、A Iイあはプロ
ーブのンドシン塩基とアテニン塔基に結合基を経て結合
される非同位体標識である。このような標識化は本件出
願さ同日F士で出、願され、本件出願の出願人に譲渡さ
れた′°像識されたDNA”と題するLandesによ
る米国特許出願明細書(参照することによりここに引用
される)に記載されている。
ーブのンドシン塩基とアテニン塔基に結合基を経て結合
される非同位体標識である。このような標識化は本件出
願さ同日F士で出、願され、本件出願の出願人に譲渡さ
れた′°像識されたDNA”と題するLandesによ
る米国特許出願明細書(参照することによりここに引用
される)に記載されている。
上記のLandesによる米国特許出願明細書に記載き
れた非同位体標識化法は、酵素分子をDNAに結合させ
るために架橋剤を使用することが必要て゛あり:この反
応を実施するためにDNAは一本鎖の形でなけれげなら
力い。この型の標識化を使用する場合に、標識化の前に
プローブを一本鎖の形に保持することが有利である。こ
のことはファージベクター、例えばZjnder等によ
ろGene19.1(1982,)に記載されて公的に
入手できろファージベクターFd、の中にそこに記載さ
れた方法を使用して一本領ブローブを組み入れることに
より行われる。その方法はプローブの末端に1Jint
l Ill結合剤を加え、その後ファージベクターFd
、の特定のHincH1部位に挿入したプローブをクロ
ーン化することを包合する。一本領プローブを標識化す
る場合、1iindpd制限酵素を使用してこのプロー
ブr、) Fd、から切断する。
れた非同位体標識化法は、酵素分子をDNAに結合させ
るために架橋剤を使用することが必要て゛あり:この反
応を実施するためにDNAは一本鎖の形でなけれげなら
力い。この型の標識化を使用する場合に、標識化の前に
プローブを一本鎖の形に保持することが有利である。こ
のことはファージベクター、例えばZjnder等によ
ろGene19.1(1982,)に記載されて公的に
入手できろファージベクターFd、の中にそこに記載さ
れた方法を使用して一本領ブローブを組み入れることに
より行われる。その方法はプローブの末端に1Jint
l Ill結合剤を加え、その後ファージベクターFd
、の特定のHincH1部位に挿入したプローブをクロ
ーン化することを包合する。一本領プローブを標識化す
る場合、1iindpd制限酵素を使用してこのプロー
ブr、) Fd、から切断する。
プローブを同位体で標識する場合は、該プローブは通常
標識化の前にプラスミドベクター(例え’yf、YEア
13)の中に担持される。標識化は最も一般的にはハイ
ブリッド形成検定法で使用するプローブをそのプラスミ
ドから切断し、その後そのプローブをニックトランスレ
ーションするこトラ包會する。別の方法として、完全な
プラスミドを二ツクトランスレーションして検定に使用
づ−ろことかできる。どちらの場合にも、プラスミドの
中で二本知になっているプローブを壕ず第一に、例えば
熱処理や墳墓との処理により、一本領にし斤ければなら
ない。
標識化の前にプラスミドベクター(例え’yf、YEア
13)の中に担持される。標識化は最も一般的にはハイ
ブリッド形成検定法で使用するプローブをそのプラスミ
ドから切断し、その後そのプローブをニックトランスレ
ーションするこトラ包會する。別の方法として、完全な
プラスミドを二ツクトランスレーションして検定に使用
づ−ろことかできる。どちらの場合にも、プラスミドの
中で二本知になっているプローブを壕ず第一に、例えば
熱処理や墳墓との処理により、一本領にし斤ければなら
ない。
プローブの標識化を必要としない他の検出方法は欧州特
許出願第0079139号明細書(参照することにより
ここに引用されろ)に記載されたいわゆるザンドイツチ
ノ・イブリッド形成法と呼ばれるものである。この検定
においては、−重鎖ベクター甲に苫まれろ未(票;識ブ
″ローブはサルモネラDNAと)・イブリダイズし、そ
し7てプローブ不言の標識された一本鎖ベクターがプロ
ーブ含有ベクターとハイブリダイズすることによって7
1イブ;jノド俵合体の全体を標識1ヒする。
許出願第0079139号明細書(参照することにより
ここに引用されろ)に記載されたいわゆるザンドイツチ
ノ・イブリッド形成法と呼ばれるものである。この検定
においては、−重鎖ベクター甲に苫まれろ未(票;識ブ
″ローブはサルモネラDNAと)・イブリダイズし、そ
し7てプローブ不言の標識された一本鎖ベクターがプロ
ーブ含有ベクターとハイブリダイズすることによって7
1イブ;jノド俵合体の全体を標識1ヒする。
本発明のサルモネラに特異的な、例えば32pで標識さ
れたプローブはどれも次のようにn聞直混合物中のサル
モネラの存在を証明するのに使用され釈し、次いで一連
の二rロセルロースj摸上に点在略せる。平行に置いた
もう一組のニド。ロセルロース膜にはS、テフイムリウ
ムの同じ段階的希釈液液だし各希釈液は一定量の大腸菌
と混合される)全点在きせる。細菌を溶菌し、それらの
DNAは例えば膜をNa OH/N’a CA中に浸漬
することにより変性され、そしてその変性溶液は例えば
トリス/Na Cβ 中に丹び浸漬することにより中和
される。
れたプローブはどれも次のようにn聞直混合物中のサル
モネラの存在を証明するのに使用され釈し、次いで一連
の二rロセルロースj摸上に点在略せる。平行に置いた
もう一組のニド。ロセルロース膜にはS、テフイムリウ
ムの同じ段階的希釈液液だし各希釈液は一定量の大腸菌
と混合される)全点在きせる。細菌を溶菌し、それらの
DNAは例えば膜をNa OH/N’a CA中に浸漬
することにより変性され、そしてその変性溶液は例えば
トリス/Na Cβ 中に丹び浸漬することにより中和
される。
その後細菌DNAはその膜を無水エタノール中に浸漬し
て、次いでそれらを乾燥させることによりj漢上に固定
される。膜はそれからデン・・−ト(De n、har
d t )によるBBRC23,641(1966)に
記載されグζような予備・・イブリッド形成溶液中に3
7℃で2時間、浸漬する。その予備ハイブリッド形成溶
液は45%ホルムアミド、25 mM’ Na2P(J
)4、p i−16,8,5×デン・・−ト溶液(1×
は0.02v1/v%のポリビニルピロリドン、フィコ
ール500、および牛血清アルブミンである)、および
250μj;/ArLl!の超音波処理され変性された
担体DNA(例えば子牛の胸腺まだはサケの精液由来の
もの)から成る。その後、・・イブリント形成はにru
、n5tein等によるPNAS USA72.3L
61(1975)tだはFalkow等によろ米国特許
第4358535号明細書(参照することによりここに
引用される)K記載された方法のよう力慣用の−・イブ
リッド形成法を使用して、上で述べた1つ一!たはそれ
以上のDNAプローブを用いて実施される。そのハイブ
リッド形成溶液はそれがさらに10 /V%のデギスト
ランナルフ工−トおよび0.1−10μ97Mの標識プ
ローブを含むということを除いて、上記の予備ハイブリ
ッド形成溶液と同じ組成をもつ。
て、次いでそれらを乾燥させることによりj漢上に固定
される。膜はそれからデン・・−ト(De n、har
d t )によるBBRC23,641(1966)に
記載されグζような予備・・イブリッド形成溶液中に3
7℃で2時間、浸漬する。その予備ハイブリッド形成溶
液は45%ホルムアミド、25 mM’ Na2P(J
)4、p i−16,8,5×デン・・−ト溶液(1×
は0.02v1/v%のポリビニルピロリドン、フィコ
ール500、および牛血清アルブミンである)、および
250μj;/ArLl!の超音波処理され変性された
担体DNA(例えば子牛の胸腺まだはサケの精液由来の
もの)から成る。その後、・・イブリント形成はにru
、n5tein等によるPNAS USA72.3L
61(1975)tだはFalkow等によろ米国特許
第4358535号明細書(参照することによりここに
引用される)K記載された方法のよう力慣用の−・イブ
リッド形成法を使用して、上で述べた1つ一!たはそれ
以上のDNAプローブを用いて実施される。そのハイブ
リッド形成溶液はそれがさらに10 /V%のデギスト
ランナルフ工−トおよび0.1−10μ97Mの標識プ
ローブを含むということを除いて、上記の予備ハイブリ
ッド形成溶液と同じ組成をもつ。
ハイブリッド形成反応は37℃で2時間進行きせる。そ
の後、ハイブリダイズされなかったプローブを既定の洗
浄法(例えば、10 mu NaC−eを用いて37℃
で10分間ずつ3回洗浄する)でその固体支持体を繰返
し洗浄jろことにより除去する。
の後、ハイブリダイズされなかったプローブを既定の洗
浄法(例えば、10 mu NaC−eを用いて37℃
で10分間ずつ3回洗浄する)でその固体支持体を繰返
し洗浄jろことにより除去する。
膜に固定された標識DNA複合体は各膜上のサルモ不う
の量に定量的に一致する。各希釈液に関しては、純粋な
サルモイ、う試料に対して得られる定量的結果は大腸菌
を含む試料に対して得られる定量的結果と同じであり、
このことは大腸菌DNAの:σ在がプローブと存在する
サルモネラDNAとのハイブリッド形成に何ら影響を及
ぼさないこと、および本発明のサルモネラに特異的なプ
ローブは細菌混合物中のサルモネラの存在を検出するの
に使用するこさができろことを示している。
の量に定量的に一致する。各希釈液に関しては、純粋な
サルモイ、う試料に対して得られる定量的結果は大腸菌
を含む試料に対して得られる定量的結果と同じであり、
このことは大腸菌DNAの:σ在がプローブと存在する
サルモネラDNAとのハイブリッド形成に何ら影響を及
ぼさないこと、および本発明のサルモネラに特異的なプ
ローブは細菌混合物中のサルモネラの存在を検出するの
に使用するこさができろことを示している。
本発明プローブを1つたけ使用しても良い結果が得られ
るけれども、我々は上で論じたように1つ以上の異なる
プローブを同時に使用する時最も良い結果が得られろと
いうことを見い出した。
るけれども、我々は上で論じたように1つ以上の異なる
プローブを同時に使用する時最も良い結果が得られろと
いうことを見い出した。
食品中のサルモネラの検定
食品中のサルモネラの存在を検出する方法は次のように
要約される。
要約される。
無作為に選択した試験されるべき25!;Iの食品試料
15個を30〜37℃において20〜24時間栄養培地
中で培養する。その培養・吻のl m1分画を第一図の
円筒形部分14の中にピ被ソトで計って入れ真空′ff
適用する。こうして上で述べたよりに、サルモネラと同
じ大きさの小さな細菌をニトロセルロースフィルター2
6上に捕集し、食品粒子と大きな細菌とを含む円筒形部
分14はその後捨てられろ。
15個を30〜37℃において20〜24時間栄養培地
中で培養する。その培養・吻のl m1分画を第一図の
円筒形部分14の中にピ被ソトで計って入れ真空′ff
適用する。こうして上で述べたよりに、サルモネラと同
じ大きさの小さな細菌をニトロセルロースフィルター2
6上に捕集し、食品粒子と大きな細菌とを含む円筒形部
分14はその後捨てられろ。
次に、細菌を溶菌しかつ細菌DNAを変性することがで
きる溶液(例えばNaOH7NaC君)を円筒形部分1
6に力りえる。DNAを変性した後にトリス/ N(L
C,eを加えてNa OII/Na C(Jの溶液を
中和する。
きる溶液(例えばNaOH7NaC君)を円筒形部分1
6に力りえる。DNAを変性した後にトリス/ N(L
C,eを加えてNa OII/Na C(Jの溶液を
中和する。
細菌DNAはその後、本件出願の出願人に譲渡された1
982年12月13日イ寸のGroet等による米国特
許出願i4489791明副書(参照することによりこ
こに引用される)に記載されるように、無水エタノール
を膜26に雄刃(lし、次いでそれを乾燥させろことに
より膜26上に固定される。
982年12月13日イ寸のGroet等による米国特
許出願i4489791明副書(参照することによりこ
こに引用される)に記載されるように、無水エタノール
を膜26に雄刃(lし、次いでそれを乾燥させろことに
より膜26上に固定される。
固定した後に、]I莫IO2上記の予備−・イブリッド
形成緩衝液中に15−80分間浸漬する。それから上で
述べたように32P−標識プローブを含む・・イブリッ
ド形成緩衝液を雄刃1」[2て・・イブリッド形成を3
7℃で2−3時間進行きせる。放射性・・イブリッドD
N、4 複合体は食品試料中にサルモネラが存在するこ
とを表示するものである。
形成緩衝液中に15−80分間浸漬する。それから上で
述べたように32P−標識プローブを含む・・イブリッ
ド形成緩衝液を雄刃1」[2て・・イブリッド形成を3
7℃で2−3時間進行きせる。放射性・・イブリッドD
N、4 複合体は食品試料中にサルモネラが存在するこ
とを表示するものである。
上記方法は全ての食品中の第二光に掲げたサルモネラの
存在を検出するのに使用することができる。
存在を検出するのに使用することができる。
ハイブリッド形成による検定を行う前に、食品試料は米
国食品医薬凸周CFDA)食品部微生物課によろBac
t erial og、Anal 、Manual
、 第5版。
国食品医薬凸周CFDA)食品部微生物課によろBac
t erial og、Anal 、Manual
、 第5版。
ワ/ントンDC,分析化学協会(1978)に記載され
た方法に従って処理されろ。
た方法に従って処理されろ。
第二光に示すように、試験した食品培養物のいくつかは
一晩インキュベ−7ヨンする前腎予め決められた数のサ
ルモネラを接種した。これらの場合にはサルモネラをL
グロス培地で約2X108細胞/ m13に増殖させ、
Lグロス培地で希釈し、そして食品培養物に加えられた
。
一晩インキュベ−7ヨンする前腎予め決められた数のサ
ルモネラを接種した。これらの場合にはサルモネラをL
グロス培地で約2X108細胞/ m13に増殖させ、
Lグロス培地で希釈し、そして食品培養物に加えられた
。
5つのNRRL−寄託プローブ(32Pで二ノクトラン
スレーンヨンしたもの)の全部につき、核酸ハイブリッ
ド形成を使用して、次の食品群(試、験した食品試料は
サルモネラを接種したものさ汚染されていない試料の両
方であった)を検定ツーろのに使用した:ピーナツツバ
ター、大豆粉、マカロニ、板チョコレート、脱脂粉乳、
凍結保存したフィッシュスティック、乾燥卵、ドンダフ
ード、ザワークリーム、およびインスタントマツ/ユボ
テト。
スレーンヨンしたもの)の全部につき、核酸ハイブリッ
ド形成を使用して、次の食品群(試、験した食品試料は
サルモネラを接種したものさ汚染されていない試料の両
方であった)を検定ツーろのに使用した:ピーナツツバ
ター、大豆粉、マカロニ、板チョコレート、脱脂粉乳、
凍結保存したフィッシュスティック、乾燥卵、ドンダフ
ード、ザワークリーム、およびインスタントマツ/ユボ
テト。
サルモネラを接種した各種の食品試料は非常に強い・・
イブリット形成結果を与え、一方汚染されていない試料
は非常にはっきりとした1ぢで性の結果を与えた。
イブリット形成結果を与え、一方汚染されていない試料
は非常にはっきりとした1ぢで性の結果を与えた。
食品中に一般に見い出されろ異なったサルモネラ菌株が
ハイブリッド形成による検定で同じようにふる丑うかど
うかを決定するために、大豆粉に1982年12月に発
行さイtた疾病コントロールセンターの1980サルモ
ネラ ザーベイランスアニュアル ザマリー(19,8
0SalmonallaSurveillance A
nruba、l Sunmary )によれば、食品、
ヒトの臨床試料および他の動物中に最も−tfy?的に
見い出されろとされた4種のサルモネラ菌株約1000
個を接種する。これらの4棟の菌株は一晩インキュベー
ションを行う。各培養物から反後試験フィルター全作り
、そして321)でニックトランスレーションされた5
つのNlンRL−w託プローブを使用して検定する。そ
のフィルターはオートラジオグラフィー用のフィルムに
感光させ、後でンンチレーション計数計で数える。
ハイブリッド形成による検定で同じようにふる丑うかど
うかを決定するために、大豆粉に1982年12月に発
行さイtた疾病コントロールセンターの1980サルモ
ネラ ザーベイランスアニュアル ザマリー(19,8
0SalmonallaSurveillance A
nruba、l Sunmary )によれば、食品、
ヒトの臨床試料および他の動物中に最も−tfy?的に
見い出されろとされた4種のサルモネラ菌株約1000
個を接種する。これらの4棟の菌株は一晩インキュベー
ションを行う。各培養物から反後試験フィルター全作り
、そして321)でニックトランスレーションされた5
つのNlンRL−w託プローブを使用して検定する。そ
のフィルターはオートラジオグラフィー用のフィルムに
感光させ、後でンンチレーション計数計で数える。
−サルモネラのいくつかの菌株1’u、Hls、ハイデ
ルベルグ)(才、ハイブリッド形成の強さが等しい数の
他のサルモネラ菌株の強さよりも弱いという点で、ハイ
ブリット形成での決定において違ったようにふるまうか
も知れない。しかしながら、この相違はプローブの相違
(でより生ずるものではなくフィルム上の細菌の不十分
な溶菌(ハイブリット形成反応にぢらされるDNAの数
を減少させろ)のようなある種の機械的現象から生ずる
ものと思われろ。この相違は多量のDNAプローブを検
定で使用することにより少なくすることができるかも知
れない。・・イブリッド形成の強さがやや小さいにもか
かわらず、S/・イデルベルグはザルモ不うに特異的な
プローブのいずれかまたはそれらの全部を使用してこの
検定で容易に検出することができろ。
ルベルグ)(才、ハイブリッド形成の強さが等しい数の
他のサルモネラ菌株の強さよりも弱いという点で、ハイ
ブリット形成での決定において違ったようにふるまうか
も知れない。しかしながら、この相違はプローブの相違
(でより生ずるものではなくフィルム上の細菌の不十分
な溶菌(ハイブリット形成反応にぢらされるDNAの数
を減少させろ)のようなある種の機械的現象から生ずる
ものと思われろ。この相違は多量のDNAプローブを検
定で使用することにより少なくすることができるかも知
れない。・・イブリッド形成の強さがやや小さいにもか
かわらず、S/・イデルベルグはザルモ不うに特異的な
プローブのいずれかまたはそれらの全部を使用してこの
検定で容易に検出することができろ。
こうして種々の食品はこの試(倹において容易に取り扱
うことができろ。これらの艮品は栄養培地中で一晩イン
キコーベートすることが望1しく、強化培養による細菌
の選択的増殖は必要としない。
うことができろ。これらの艮品は栄養培地中で一晩イン
キコーベートすることが望1しく、強化培養による細菌
の選択的増殖は必要としない。
本発明の方法の利点は数多くある。1つの食品試料の分
析に要する時間は一般に微生物学的検定に要する5−7
日からかなり短縮ζt+、ろ。その」=、大多数の食品
試料を短時間で処理することかできる。これらの試験に
おいて、−・イブリッド形成の基底値(陰性試料の放射
能値)は非常に低り1.このことは陽性の結果と陰性の
結果との間のはっきりとした区別を可能にするものであ
る。ここに記載したプローブは丑だ糞便のサルモネラの
存在を試験するだめの臨床項目に適用され、尻便試料は
食品試料と同じ方法で処理されろ。
析に要する時間は一般に微生物学的検定に要する5−7
日からかなり短縮ζt+、ろ。その」=、大多数の食品
試料を短時間で処理することかできる。これらの試験に
おいて、−・イブリッド形成の基底値(陰性試料の放射
能値)は非常に低り1.このことは陽性の結果と陰性の
結果との間のはっきりとした区別を可能にするものであ
る。ここに記載したプローブは丑だ糞便のサルモネラの
存在を試験するだめの臨床項目に適用され、尻便試料は
食品試料と同じ方法で処理されろ。
他の実施態様は特許請求の範囲内のものである。
例えば、すでに述べたように、プローブは各種の標識を
使用して標識される。ニトロセルロース膜がDNAt結
合させるのに好適であるが、他の適当なりNA結合支持
体(例えば、ジアゾベンジルオキシメチル紙)も使用す
ることができろ。
使用して標識される。ニトロセルロース膜がDNAt結
合させるのに好適であるが、他の適当なりNA結合支持
体(例えば、ジアゾベンジルオキシメチル紙)も使用す
ることができろ。
第一図は本発明を実施するのに肩側な装置の分JQイし
た等角投影図である。 第二図は本発明のサルモネラに特異的なプローブの制限
地図である。 10:食品試料処理装置 12:蓋 14:上部円筒形部分 16゛下部円筒形部分18:頂
部 22°大きい孔のフィルタ、−24=硬質プラ
スチツクグリツド 26:ニトロセルロース膜 28:硬質ブラスチソクグリッド 手 続 補 正 書 昭和i年3月夕日 特許庁長官若 杉 和 夫殿 1、事件の表示 昭和Sゴ年特許願第 F3¥′0 号2発明の名称 ・蝕′。孕のサル8才う杖佑二転 6補正をする者 事件との関係 特許出願人 住所 名將 インチク゛レテ、1−・ −“−オティシフス
イ、コー+、°b−テ、1−゛ 4代理人 5、補正の対象 556−
た等角投影図である。 第二図は本発明のサルモネラに特異的なプローブの制限
地図である。 10:食品試料処理装置 12:蓋 14:上部円筒形部分 16゛下部円筒形部分18:頂
部 22°大きい孔のフィルタ、−24=硬質プラ
スチツクグリツド 26:ニトロセルロース膜 28:硬質ブラスチソクグリッド 手 続 補 正 書 昭和i年3月夕日 特許庁長官若 杉 和 夫殿 1、事件の表示 昭和Sゴ年特許願第 F3¥′0 号2発明の名称 ・蝕′。孕のサル8才う杖佑二転 6補正をする者 事件との関係 特許出願人 住所 名將 インチク゛レテ、1−・ −“−オティシフス
イ、コー+、°b−テ、1−゛ 4代理人 5、補正の対象 556−
Claims (1)
- 【特許請求の範囲】 (1) サルモネラDNAと選択的にハイブリダイズ
(相補性結合)して検出可能な複合体を形成することが
できろ少なくとも1つのDNAプローブを用意し、該D
NAプローブを食品試料中に存在するサルモネラDNA
と−・イプリタ′イスさせて・・イブリットDNA復合
体ケ形成させろ条件下に、該DNAプローブを食品試料
中の灯附と接触させ、そして該ハイブリットDNA′O
g、合体を食品試料中にサルモネラか存在することの表
示として咲出j乙、ことから成るi面liA含有食品試
料甲のサルモネラの存在を検出する方法。 (2)プローブが・標識して用いられろ!14許請求の
範囲第1項に記載の方法。 (3)標ii哉はそイを自体1灸出可能なものであるか
、あるいは表示体に選択的に結合して検出可能な複合体
を形成することができろものである特許請求の範囲第2
項に記載の方法。 (4)プローブは放射性同位元素で標識されろ特許請求
の範囲、第3項に記載の方法。 (5)放射性同位元素は二ツクトランスレーションで該
プローブに組み入れられた32pである特許請求の範囲
第4項に記載の方法。 (6)放射性同位元素はニックトランスレー/コンで8
亥ブロー7″に組み入れられだ125Jである住寺許言
青求の範囲第4項に記載の方法。 (7)標識はビオチンでありかつ表示体はバイブリソl
−D# A 9合体上のビオチンと結合する場合に検出
可能な化学種を結合しているアビジンである唱“許請求
の範囲1児3項VC記槙の方法。 (8)化学種は・・イブリッドn # A複合体を螢光
測定により検出可能にする螢光団である特許請求の範し
!IJ第7項に記載の方法。 (9)化学種はバイブリソ)DNA?)2合体を7E子
顕微鏡により検出可能にする電子密度の高い化合物であ
るt特許請求の範囲第7項に記載の方法。 (10)化学種はハイブリッドD N A lt合体を
免疫学的に検出可能にする抗体である特許請求の範囲第
7項に記載の方法。 (11)化学種は・・イブリッドDNA複合体を酵素的
に検出可能にする一対の触媒/基質のうちの一方である
特許請求の範囲第7項に記載の方法。 (12) 細菌をプローブ吉接触させる前に、該1別
画は試料から分離されかつ溶菌されてそれらのDNAを
放出し、その後膣DNAは変性されてDNA結合支持体
上に固定されろ特許請求の範囲語1項に記載の方法。 (刊 支持体はニトロセルロース膜である特許請求の+
犯四第12項に記載の方法。 (14)完全外サルモネラ染色体を含丑ず、かつザルモ
ネラ種の80%まだはそれ以上からのDNAと・・イブ
リターイズすることができるか他の腸内a を茅]とは
ハイブリダイズしないサルモネラ染色体の一部分から成
るDNAプローブ。 (ト))サルモイ・う紳の90%またはそれ以上とハイ
ブリダイズすることができる特許請求の範lal第14
項に記載のDNAプローブ。 (16)標識された特許請求の範囲第14項に記載のD
NAプローブ。 t、17) 大腸菌(NlでRL B−1,548
0)に含まれるプラスミドYEp13中に挿入されたサ
ルモネラD N A Bam HI断片である特許請
求の範囲第14項に記載のDNAプローブ。 (18) 大腸菌CNRRL B−A5479.A
TCC39261)に含まれろプラスミドYE、13中
に挿入されたサルモネラD N A Bam、 li
I断片である特許請求の範囲第14項に記載のDNA
プローブ0 (19)大腸菌(NlイlンL B−15472)に
言まオ′しろプラスミドYE7)1B中に挿入されたサ
ルモネラD N A Bar7t 111断片である
特許請求の範囲第14項に記載のf)NAプローブ。 (20〕 大腸菌(NjでlンL H−15473)
に含まれろプラスミドYE、p13中に挿入されたサル
モネラDNABαmHI蹄f片である特許請求の範囲第
14項に記載のDNAプローブ。 c21)大腸菌(NRRL B−15474)VC言
111.るプラスミドYE、13中に挿入されたサルモ
ネラD N A Bam HI断片である特許請求の
範囲第14項に記載のDNAプローブ。 (22)少なくとも2種の異なるプローブを使用する特
許請求の範囲第1項に記載の方法。 (23)少なくとも3種の異なるプローブ全使用する特
許請求の範囲第22項に記載の方法。 [株] 少なくとも4棟の異なるプローブを使用する特
許請求の範囲第23項に記載の方法。 (25)少なくとも5種の異々ろプローブを使用する特
許請求の範囲第24項に記載の方法。 (26)フ“ローフ゛は4票i哉されてεらず、・・イ
フ゛リッドD# A 複合体の検出はサンドイノチノ・
イフ゛リッド形成法により行われる特許請求の範lBA
第1項に記載の方法。
Applications Claiming Priority (4)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US45947183A | 1983-01-20 | 1983-01-20 | |
US459471 | 1983-01-20 | ||
US06/529,031 US4689295A (en) | 1983-01-20 | 1983-09-02 | Test for Salmonella |
US529031 | 1983-09-02 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JPS59166097A true JPS59166097A (ja) | 1984-09-19 |
JP2780773B2 JP2780773B2 (ja) | 1998-07-30 |
Family
ID=27039368
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP59008380A Expired - Lifetime JP2780773B2 (ja) | 1983-01-20 | 1984-01-20 | サルモネラ検定法 |
Country Status (5)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US4689295A (ja) |
EP (1) | EP0114668B1 (ja) |
JP (1) | JP2780773B2 (ja) |
CA (1) | CA1208577A (ja) |
DE (1) | DE3484751D1 (ja) |
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J BACTERIOL=1981 * |
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