JPH08304404A - 抗クラミジア・ニューモニエ抗体の検出・測定方法及びその試薬、並びにクラミジア・ニューモニエ感染の診断薬 - Google Patents

抗クラミジア・ニューモニエ抗体の検出・測定方法及びその試薬、並びにクラミジア・ニューモニエ感染の診断薬

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JPH08304404A
JPH08304404A JP7106014A JP10601495A JPH08304404A JP H08304404 A JPH08304404 A JP H08304404A JP 7106014 A JP7106014 A JP 7106014A JP 10601495 A JP10601495 A JP 10601495A JP H08304404 A JPH08304404 A JP H08304404A
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Abstract

(57)【要約】 (修正有) 【目的】 クラミジア・トラコマチスやクラミジア・シ
ッタシ等のクラミジア・ニューモニエ以外のクラミジア
属細菌に対する抗体に反応せず、クラミジア・ニューモ
ニエ特異的抗体とのみ反応し、これを検出するための抗
原ポリペプチドを提供し、抗クラミジア・ニューモニエ
抗体の検出・測定方法及びその試薬、並びにクラミジア
・ニューモニエ感染の診断薬を提供する。 【構成】 配列番号1のポリペプチドの中の連続した少
なくとも5個のアミノ酸配列を含むポリペプチドCを抗
原として用いることを特徴とする、抗クラミジア・ニュ
ーモニエ抗体の検出・測定方法、配列番号1のポリペプ
チドの中の連続した少なくとも5個のアミノ酸配列を含
むポリペプチドCを抗原として含有してなる、クラミジ
ア・ニューモニエ感染の診断薬。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】
【産業上の利用分野】本発明は、抗クラミジア・ニュー
モニエ抗体の検出・測定方法及びその試薬、並びにクラ
ミジア・ニューモニエ感染の診断薬に関する。本発明は
医薬品工業、特にクラミジア・ニューモニエ感染症の診
断薬の製造において有効に利用される。
【0002】
【従来の技術】クラミジア属の細菌は、クラミジア・ト
ラコマチス、クラミジア・シッタシ、クラミジア・ニュ
ーモニエ等の種(Species)が知られている。クラミジ
ア・トラコマチスは、トラコーマ、性病性リンパ肉芽
腫、泌尿生殖器感染症、封入体結膜炎、新生児肺炎等を
引き起こす原因菌であり、クラミジア・シッタシは、オ
ウム病等の原因菌であり、またクラミジア・ニューモニ
エは、呼吸器感染症、異形肺炎等の原因菌である。
【0003】クラミジア・ニューモニエの引き起こす呼
吸器感染症の症状は、マイコプラズマ・ニューモニエや
インフルエンザウイルスが原因で起こる感染症の症状と
類似しているので、しばしば誤診されやすい。そのた
め、クラミジア・ニューモニエの簡便な診断方法の開発
が望まれていた。
【0004】感染症の診断は、通常、感染部位等におけ
る原因菌の存在の検出か、血清・その他の体液中におけ
る(原因菌に対する)抗体の存在の検出により確定的に
なされる。前者は抗原検査、後者は抗体検査と呼ばれ、
いずれも臨床で重要な意義があり、クラミジア・ニュー
モニエの抗体検査としては、クラミジア・ニューモニエ
の基本小体を用いて抗体の存在を検出する方法が知られ
ている。
【0005】
【発明が解決しようとする課題】しかし、クラミジア・
ニューモニエの基本小体は、クラミジア・ニューモニエ
以外のクラミジア属細菌、すなわち、クラミジア・トラ
コマチス又はクラミジア・シッタシにも共通に存在する
抗原を含むため、この基本小体を用いる方法ではクラミ
ジア・ニューモニエに対する抗体だけでなく、他の種の
クラミジアに対する抗体とも反応し、特異性に欠ける難
点があった。本発明は、クラミジア・トラコマチスやク
ラミジア・シッタシ等のクラミジア・ニューモニエ以外
のクラミジア属細菌に対する抗体に反応せず、クラミジ
ア・ニューモニエ特異的抗体とのみ反応し、これを検出
するための抗原ポリペプチドを提供し、また、クラミジ
ア・ニューモニエ、クラミジア・トラコマチス、クラミ
ジア・シッタシ等のクラミジア属細菌に共通に反応する
抗体を検出するための抗原ポリペプチドを提供し、これ
により、抗クラミジア・ニューモニエ抗体の検出・測定
方法及びその試薬、並びにクラミジア・ニューモニエ感
染の診断薬を提供することを目的とする。
【0006】
【課題を解決するための手段】本発明者らは、クラミジ
ア・ニューモニエ特異的抗原ポリペプチド又はクラミジ
ア属細菌特異的(すなわち、クラミジア・ニューモニ
エ、クラミジア・トラコマチス、クラミジア・シッタシ
等のクラミジア属細菌共通の抗原ポリペプチド)を純粋
に、かつアミノ酸配列が解明された形で取得するため、
先ず、クラミジア・ニューモニエを宿主細胞中に培養
し、そのクラミジア・ニューモニエからゲノムDNAを
抽出し、制限酵素で部分分解し、これをλgt11DNA
に挿入してゲノムDNAライブラリーを作成し、これを
大腸菌Y1090r−株に感染させ、クラミジア・ニュ
ーモニエ特異的モノクローナル抗体又はクラミジア属細
菌特異的モノクローナル抗体を用いてクラミジア・ニュ
ーモニエの抗原ポリペプチドを発現する感染大腸菌のコ
ロニーをスクリーニングし、陽性の感染大腸菌からλフ
ァージを抽出し、この操作を繰り返してλファージを精
製し、これを大腸菌Y1090r−株に感染させて増幅
させた後そのDNAの塩基配列を分析し、これをポリペ
プチドに翻訳して、抗原ポリペプチドのアミノ酸配列を
決定し、本発明を完成した。
【0007】本発明は下記(1)〜(15)に関するも
のである。 (1)配列番号1のポリペプチドの中の連続した少なく
とも5個のアミノ酸配列を含むポリペプチドCを抗原と
して用いることを特徴とする、抗クラミジア・ニューモ
ニエ抗体の検出・測定方法。 (2)ポリペプチドCが配列番号1のポリペプチドから
アミノ酸1〜250個が欠落しているポリペプチドであ
る、上記(1)記載の検出・測定方法。 (3)ポリペプチドCが、配列番号1のポリペプチドの
中のアミノ酸1〜100個が他のアミノ酸で置換されて
いるポリペプチドである、上記(1)記載の検出・測定
方法。 (4)ポリペプチドCが、配列番号1のポリペプチドの
中の連続した少なくとも5個のアミノ酸配列にアミノ酸
若しくは2〜1000個のアミノ酸配列が結合したポリ
ペプチドである、上記(1)記載の検出・測定方法。 (5)ポリペプチドCが配列番号1のアミノ酸配列から
なるポリペプチドである、上記(1)記載の検出・測定
方法。 (6)配列番号1のポリペプチドの中の連続した少なく
とも5個のアミノ酸配列を含むポリペプチドCを抗原と
して含有してなる、抗クラミジア・ニューモニエ抗体の
検出・測定用試薬。 (7)ポリペプチドCが配列番号1のポリペプチドから
アミノ酸1〜250個が欠落しているポリペプチドであ
る、上記(6)記載の検出・測定用試薬。 (8)ポリペプチドCが、配列番号1のポリペプチドの
中のアミノ酸1〜100個が他のアミノ酸で置換されて
いるポリペプチドである、上記(6)記載の検出・測定
用試薬。 (9)ポリペプチドCが、配列番号1のポリペプチドの
中の連続した少なくとも5個のアミノ酸配列にアミノ酸
若しくは2〜1000個のアミノ酸配列が結合したポリ
ペプチドである、上記(6)記載の検出・測定用試薬。 (10)ポリペプチドCが配列番号1のアミノ酸配列か
らなるポリペプチドである、上記(6)記載の検出・測
定用試薬。 (11)配列番号1のポリペプチドの中の連続した少な
くとも5個のアミノ酸配列を含むポリペプチドCを有効
成分とする、クラミジア・ニューモニエ感染の診断薬。 (12)ポリペプチドCが配列番号1のポリペプチドか
らアミノ酸1〜250個が欠落しているポリペプチドで
ある、上記(11)記載の診断薬。 (13)ポリペプチドCが、配列番号1のポリペプチド
の中のアミノ酸1〜100個が他のアミノ酸で置換され
ているポリペプチドである、上記(11)記載の診断
薬。 (14)ポリペプチドCが、配列番号1のポリペプチド
の中の連続した少なくとも5個のアミノ酸配列にアミノ
酸若しくは2〜1000個のアミノ酸配列が結合したポ
リペプチドである、上記(11)記載の診断薬。 (15)ポリペプチドCが配列番号1のアミノ酸配列か
らなるポリペプチドである、上記(11)記載の診断
薬。
【0008】以下、本発明の詳細を、1.形質転換体の
作製、2.抗原ポリペプチドの製造方法、3.得られた
抗原ポリペプチド、4.抗原ポリペプチドをコードする
DNA、、5.抗原ポリペプチドを抗原として用いる抗
クラミジア・ニューモニエ抗体の検出・測定方法及び試
薬、並びに抗原ポリペプチドを有効成分とするクラミジ
ア・ニューモニエ感染の診断薬、の順に説明する。
【0009】1.形質転換体の作製 1.1 クラミジア・ニューモニエの培養 培養したHL細胞から細胞浮遊液を調製し、培養上清を
除去した後にクラミジア・ニューモニエの浮遊液を添加
してこれを培養し、遠心分離してクラミジア・ニューモ
ニエ感染HL細胞を取得する。クラミジア・ニューモニ
エとしては、例えばクラミジア・ニューモニエYK41
株(金本ら:ミクロバイオロジカル・イムノロジー、37
巻、495-498頁、1993年(Y.Kanamoto et al., Microbio
l. Immunol., Vol.37, p.495-498, 1993))が使用でき
る。 1.2 クラミジア・ニューモニエの基本小体の精製 クラミジア・ニューモニエ感染HL細胞を破砕し、遠心
分離し、上清を回収する。ウログラフィン(シェーリン
グ社製)を用いた連続密度勾配液にこの上清を添加して
遠心分離し、クラミジア・ニューモニエの基本小体に相
当するバンドを回収する。
【0010】1.3 クラミジア・ニューモニエのゲノ
ムDNAの調製 クラミジア・ニューモニエの基本小体を、1mM ED
TAを含む10mMトリス−塩酸緩衝液(pH8.0)
(以下、TE緩衝液という)に懸濁し、1%ドデシル硫
酸ナトリウム(SDS)水溶液及び1mg/mlプロテイナ
ーゼK水溶液を加えて保温し、基本小体を溶解させる。
0.1Mトリス−塩酸緩衝液(pH8.0)飽和フェノー
ルを加えて撹拌し、遠心分離し、水層を回収する。さら
にRNA分解酵素(RNase)処理をし、フェノール
/クロロホルム/イソアミルアルコール処理とエタノー
ル沈殿処理をし、クラミジア・ニューモニエのゲノムD
NAを取得する。
【0011】1.4 ゲノムDNA発現ライブラリーの
作製 ゲノムDNAを制限酵素AccI、HaeIII及びAl
uIで消化し、フェノール/クロロホルム/イソアミル
アルコール処理とエタノール沈殿処理をし、部分消化D
NAを取得する。この部分消化DNAにリンカー、アデ
ノシン−5′−三リン酸(adenosine 5′-triphosphat
e、以下、ATPと略す)及びT4リガーゼを添加し
て、部分消化DNAにリンカーを付加させる。これを、
0.1M NaCl及び1mM EDTA含有10mM
トリス−塩酸緩衝液を移動相とするクロマ・スピン60
00(Chroma spin 6000)カラムにかけ、溶出液を分取
し、1kbpから7kbpのDNA断片を含む分画を回
収する。得られた分画にATP及びT4ポリヌクレオチ
ドキナーゼを加えて反応させ、DNA断片の5′端をリ
ン酸化する。反応液をフェノール/クロロホルム/イソ
アミルアルコール処理及びエタノール沈殿処理し、5′
端がリン酸化されたDNA断片を取得する。このDNA
断片に、予め制限酵素EcoRIで切断しておいたλgt
11DNA、ATP及びT4リガーゼを加えて反応さ
せ、市販のパッケージングキットを用い、得られた組換
えλgt11DNAをパッケージングし、ゲノムDNA発
現ライブラリーを作製する。
【0012】1.5 抗原ポリペプチドをコードするD
NAのクローニング 大腸菌Y1090r−株の培養液に上記ゲノムDNA発
現ライブラリーを感染させ、寒天培地上で培養し、イソ
プロピルチオ−β−D−ガラクトシド(IPTG)水溶
液に浸漬したニトロセルロースフィルターを利用して、
挿入DNAの発現により菌体内に産生されたタンパク質
をニトロセルロースフィルターに付着させる。このフィ
ルターを牛血清アルブミンを用いてブロッキング反応さ
せ、洗浄し、次いでフィルターを抗クラミジア・ニュー
モニエモノクローナル抗体と反応させる。抗クラミジア
・ニューモニエモノクローナル抗体としては、例えば、
70、AY6E2E8及びSCP53を使用することが
できる。70及びSCP53をは本発明者の一人の松本
等がクラミジア・ニューモニエKKpn−1株を抗原と
してマウスを免疫し、その脾臓細胞をミエローマ細胞と
融合させて得られたハイブリドーマ70及びハイブリド
ーマSCP53が分泌する抗体である。SCP53を産
生するハイブリドーマについてはジャーナル・オブ・ク
リニカル・ミクロバイオロジー、132巻、583-588頁(199
4)(J. Clin. Microbiol.,Vol.132, p.583-588, 1994)
に記載されている。また、AY6E2E8は本発明者の
一人の井筒等が、クラミジア・ニューモニエYK−41
株の基本小体を抗原として、マウスを免疫し、その脾臓
細胞をミエローマと細胞融合させて得られたハイブリド
ーマAY6E2E8が分泌する抗体AY6E2E8であ
り、AY6E2E8を産生するハイブリドーマは工業技
術院生命工学工業技術研究所に受託番号FERMP−1
3688として寄託されている。反応後、フィルターを
洗浄し、パーオキシダーゼ等の酵素で標識された抗マウ
スIgG抗体を反応させる。反応後、フィルターを洗浄
し、発色基質液を添加して反応させる。発色基質液とし
ては、例えば、過酸化水素水溶液及び4−クロロ−1−
ナフトールのメタノール溶液を含む液を利用することが
できる。反応後、フィルターを洗浄し、風乾させる。
【0013】フィルターの発色スポットに対応する寒天
培地上のプラークを同定し、プラークに含まれるλファ
ージを取得する。プラークが全て上記モノクローナル抗
体と反応するようになるまで前記操作を繰り返し、抗原
ポリペプチドをコードするDNAをクローン化し、抗ク
ラミジア・ニューモニエモノクローナル抗体反応性のク
ラミジア・ニューモニエ抗原ポリペプチドを発現するλ
ファージを取得する。
【0014】1.6 クラミジア・ニューモニエ抗原ポ
リペプチドをコードするDNAの取得 取得したλファージを大腸菌Y1090r−株に感染さ
せ、培養し、λファージを大量に生産する。市販のキッ
トを用いてλファージからDNAを取得・精製する。こ
のDNAにプライマー、タックポリメラーゼ(Taq Poly
merase)及びデオキシヌクレオチド類を添加し、加熱、
冷却、保温の工程を繰り返し、λgt11に挿入されたD
NAを増幅させる。プライマーとしては、例えば、λgt
11・フォワード・プライマー(λgt11 forward pri
mer)及びλgt11・リバース・プライマー(λgt11
reverse primer)(いずれも宝酒造株式会社製)があ
り、タックポリメラーゼとしては、例えば、アンプリタ
ック・DNA・ポリメラーゼ(AmpliTaq DNA Polymeras
e)がある。このDNA増幅方法の一般的手法はPCR
法として知られており、詳細は「サムブロック他編集、
モレキュラー・クローニング 第2版(コールド・スプ
リング・ハーバー・ラボラトリー)(1989年)」(J.Samb
look et al., Molecular Cloning 2nd ed., Cold Sprin
g Harbor Laboratory Press (1989)、以下、本文献を
文献″モレキュラー・クローニング″という)に記載さ
れている。
【0015】増幅されたDNAを取得し、塩基配列を決
定・解析する。DNAの取得には市販のキットを使用す
ることができ、例えばウイザード・PCR・プレップキ
ット(Wizard PCR Prep kit)(プロメガ(Promega)社製品)
を使用することができる。また、塩基配列を決定はタッ
クポリメラーゼを用いた蛍光標識ターミネータサイクル
シークエンス法で行うことができ、この方法を用いるに
は、パーキン・エルマー・ジャパン社から販売されてい
るキットを使用することができる。また、分析にあたっ
ては市販の機械、例えば373A型DNAシークエンサ
(アプライドバイオシステムズ社)を利用することがで
きる。
【0016】塩基配列の決定後、得られたDNA塩基配
列を遺伝子配列分析ソフトで解析し、編集、連結、アミ
ノ酸翻訳領域の推定を行なう。遺伝子配列分析ソフトと
しては、「DNASIS」(日立ソフトウェアエンジニ
アリング社)を用いることができる。解析の結果、完全
長の遺伝子が取得できていない場合は、既に取得されて
いるDNAの前後のDNAをゲノムウォーキングによっ
て取得する。ゲノムウォーキングを行うには、宝酒造
(株)から販売されているキットを使用することができ
る。
【0017】1.7 抗原ポリペプチドをコードするD
NAを含む組換えベクターの作製、及びそれを含む形質
転換体の作製 上記1.6で取得したλファージ自体も上記抗原ポリペ
プチドをコードするDNAを含む組換えベクターである
が、上記1.6で取得したクラミジア・ニューモニエ抗
原ポリペプチドをコードするDNAを常法で既存のプラ
スミドベクターやファージベクター等に挿入して、新た
に組換えベクターを作製することもできる。その際、必
要に応じ、リンカーを使用する。既存のプラスミドベク
ターとしては、例えばpBR322、pUC18、pU
C19等を使用することができ、これらは市販されてい
る。また、ファージベクターとしてはλgt11ファー
ジ、λgt10ファージ等が利用できる。いずれも、用い
た親ベクターに対応する組換えベクターが得られる。上
記抗原ポリペプチドをコードするDNAを含む組換えベ
クターとしては、後述するように、53−3Sλファー
ジ、70−2Sλファージ等がある。
【0018】得られた組換えベクターを宿主に入れ、形
質転換体を作製する。大腸菌由来のプラスミドやλファ
ージを使用する場合は宿主としては大腸菌を使用するこ
とができ、例えば大腸菌HB101株を使用することが
できる。この宿主をコンピテントセルとなるように処理
をする。大腸菌HB101株を処理して得たコンピテン
トセルは宝酒造から販売されている。上記連結の反応物
を宿主に入れ、形質転換体を作製する方法は文献″モレ
キュラー・クローニング″に記載されている。得られた
形質転換体を培養してコロニーを形成させ、各コロニー
からプラスミドDNAを取得し、適切な制限酵素で切断
し、アガロースゲル電気泳動で分析し、所望の組換えプ
ラスミドをもつ形質転換体を選択する。
【0019】2.抗原ポリペプチドの製造方法 本発明の抗原ポリペプチドを製造する場合は、形質転換
体の培養、形質転換体の破砕、ストレプトマイシン処
理、硫安沈殿、液体クロマトグラフィー、の各工程を行
う。形質転換体の培養は、その形質転換体が成長しうる
培地でこの抗原ポリペプチドが形質転換体内に十分蓄積
されるまで適温で培養器を振とうする。形質転換体とし
て、プラスミドベクターpBR322に本発明のDNA
を挿入した組換えベクターを入れた大腸菌HB101株
を使用する場合は、アンピシリンを含むLB培地で37
℃で一晩振とう培養し、その後、この培養液をアンピシ
リンを含むTB培地等に接種してさらに37℃で一晩振
とう培養する。TB培地の調製方法は、文献″モレキュ
ラー・クローニング″に記載されている。培養した形質
転換体を破砕するには、遠心分離で形質転換体を集め、
緩衝液に懸濁し、これに超音波を照射する。形質転換体
が大腸菌の場合は、上記懸濁液にリゾチームを加え、S
DSを含む緩衝液を加えることよって菌体を溶菌させて
もよい。
【0020】形質転換体の破砕後、遠心分離して細胞残
渣を除去し、上清を取得する。この上清にストレプトマ
イシン硫酸塩を添加し、しばらく撹拌し、遠心分離する
ことによって、核酸を沈殿物として除去し、上清を取得
する。この上清を液体クロマトグラフィーによって分画
し、各画分に含まれる蛋白質について、前述のクラミジ
ア・ニューモニエ特異的モノクローナル抗体を用い、ウ
ェスタン・ブロット法行い、抗原ポリペプチドを含む画
分を取得する。細胞膜等の残渣の除去、ストレプトマイ
シン硫酸塩を添加するDNAの除去、硫酸アンモニウム
を添加する蛋白質の取得、及びウェスタン・ブロット法
の具体的方法は、文献″モレキュラー・クローニング″
に記載されている。
【0021】3.得られた抗原ポリペプチド 本発明に係る抗原ポリペプチドは、配列番号1のポリペ
プチドの中の連続した少なくとも5個のアミノ酸配列を
含むポリペプチドCからなるものである。配列番号1の
ポリペプチドの中の連続した少なくとも5個のアミノ酸
配列を含むポリペプチドCは、望ましくは20個以上、
より望ましくは100個以上、さらに望ましくは250
個以上のアミノ酸からなるものがよい。ポリペプチドC
としては、例えば配列番号1のポリペプチドを使用する
ことができるし、配列番号1のポリペプチドからアミノ
酸1〜250個が欠落しているポリペプチドや配列番号
1のポリペプチドの中のアミノ酸1〜100個が他のア
ミノ酸で置換されているポリペプチドを使用することも
できる。また、ポリペプチドCとして、配列番号1のポ
リペプチドの中の連続した少なくとも5個のアミノ酸配
列にアミノ酸若しくは2〜1000個のアミノ酸配列が
結合したポリペプチドも使用することもできる。
【0022】配列番号1のポリペプチドからアミノ酸1
〜250個が欠落しているポリペプチドとしては、例え
ば、配列番号1のポリペプチドの1〜321番目のアミ
ノ酸配列からなるポリペプチドがある。配列番号1のポ
リペプチドの中のアミノ酸1〜100個が他のアミノ酸
で置換されているポリペプチドとしては、配列番号1の
ポリペプチドの中の任意の箇所のアミノ酸を類似の性質
をもつ他のアミノ酸に置換したポリペプチドがあり、例
えば、配列番号1のポリペプチドの571番目のアミノ
酸であるグリシンがアラニンに置換されたポリペプチド
がある。配列番号1のポリペプチドの中の連続した少な
くとも5個のアミノ酸配列に結合するアミノ酸若しくは
2〜1000個のアミノ酸配列としては、例えば、ロイ
シン、ロイシン−メチオニン、ジヒドロ葉酸還元酵素
(DHFR)、β−ガラクトシダーゼ等がある。ポリペ
プチドCの具体例としては、例えば配列番号1のポリペ
プチド、配列番号1のポリペプチドの1〜321番目の
アミノ酸配列からなるポリペプチドがある。
【0023】本発明に係る配列番号1のポリペプチド
は、配列表に示すとおり、571個のアミノ酸残基から
成る抗原ポリペプチドである。本発明に係る配列番号3
のポリペプチドは、配列表に示すとおり、259個のア
ミノ酸残基から成る抗原ポリペプチドである。ポリペプ
チドCの中では、クラミジア・ニューモニエの73KD
aの抗原ポリペプチドのアミノ酸配列そのものを含む配
列番号1のポリペプチドが望ましい。
【0024】4.抗原ポリペプチドをコードするDNA 本発明において、配列番号1のポリペプチドをコードす
るDNAとは、配列番号1のポリペプチドをトリプレッ
ト暗号表(それぞれのアミノ酸に対して、1〜6通りの
ヌクレオチド配列が割り当てられている)に従ってアミ
ノ酸をヌクレオチド配列に読み替えたときのDNA群
(この中には、配列番号2のDNAも含まれる。)から
選ばれるDNAのことである。同様に、本発明におい
て、配列番号3のポリペプチドをコードするDNAと
は、配列番号3のポリペプチドをトリプレット暗号表
(それぞれのアミノ酸に対して、1〜6通りのヌクレオ
チド配列が割り当てられている)に従ってアミノ酸をヌ
クレオチド配列に読み替えたときのDNA群(この中に
は、配列番号4のDNAも含まれる)から選ばれるDN
Aのことである。
【0025】5.抗原ポリペプチドを抗原として用いる
抗クラミジア・ニューモニエ抗体の検出・測定方法及び
試薬、並びに抗原ポリペプチドを有効成分とするクラミ
ジア・ニューモニエ感染の診断薬 抗クラミジア・ニューモニエ抗体を検出・測定するに
は、例えば、上記抗原ポリペプチドを担体に固定化し、
検体を添加し、洗浄し、標識化された二次抗体を添加
し、洗浄し、この標識を直接的又は間接的に検出・測定
する。担体としては、例えば、ラテックスの粒子やセル
ロースの糸、その他プラスチック製のアッセイプレート
や粒子等を利用することができる。上記抗原ポリペプチ
ドを担体に固定化するには、例えば共有結合や物理吸着
を利用する。検体としては、例えばヒトの血清等を使用
する。なお、検体中の他の抗体等が担体に非特異的に結
合するのを防止するため、検体の添加前に牛血清アルブ
ミン等で担体の表面をブロッキングしておくことが望ま
しい。洗浄は界面活性剤を含むリン酸緩衝液等を利用し
て行う。
【0026】標識化された二次抗体としては、例えば標
識化された抗ヒトモノクローナル抗体がある。標識とし
ては種々のものが利用でき、例えばアルカリフォスファ
ターゼ(Alkaline phosphatase)、ルシフェラーゼ(Lu
ciferase)、ペルオキシダーゼ(Peroxidase)、β−ガ
ラクトシダーゼ(β-galactosidase)等の酵素、フルオ
レセイン(Fluorescine)等の蛍光物質を利用すること
ができる。また、抗体と標識物の間にビオチン(Bioti
n)、アビジン(Avidin)、ストレプトアビジン(Strep
toavidin)、ディゴキシゲニン(Digoxigenin)等の化
学物質を介在させてもよい。標識を直接的又は間接的に
検出・測定するには、例えば、その標識が酵素である場
合は基質を添加し、酵素の触媒作用により発生する光や
発色を検出・測定するか吸光度の変化を測定する。ま
た、標識が蛍光物質である場合は反応系に紫外線を照射
し、発生する蛍光を検出・測定する。必要に応じ、増感
剤を使用する。
【0027】上記抗原ポリペプチドを抗原として用いる
抗クラミジア・ニューモニエ抗体の検出・測定用試薬と
しては、例えば上記抗原ポリペプチドを担体に固定化し
たものやさらに上記標識化された二次抗体や基質等が必
要量同封されたものがある。上記抗原ポリペプチドを有
効成分とするクラミジア・ニューモニエ感染の診断薬と
しては、例えば上記試薬をそのまま利用することができ
る。
【0028】
【実施例】以下、実施例により本発明を詳細に説明する
が、本発明はこれにより何ら制限されるものではない。
【0029】以下の実施例において使用したモノクロー
ナル抗体は、表1に示されるように、モノクローナル抗
体のSCP53及びAY6E2E8は C.ニューモニエ
に特異的であり、モノクローナル抗体の70はクラミジ
ア属細菌に特異的である。
【0030】
【表1】 以下、クラミジア・ニューモニエの宿主細胞の培養か
ら、クラミジア・ニューモニエの抗原ポリペプチドの遺
伝子DNA配列/アミノ酸配列の決定まで、順を追って
説明する。
【0031】実施例1 クラミジア・ニューモニエの7
3K抗原ポリペプチドをコードするDNAの作製 (A)宿主細胞(HL細胞)の培養 予め、プラスチック製培養フラスコ(75cm2)の底面
いっぱいに増殖させたHL細胞をリン酸緩衝化生理食塩
液(以下、PBSという)マグネシウム不含(−)液5
mlで洗浄し、0.1%(w/v)トリプシンを含むPB
Sを5ml加えて細胞表面全体に行き渡らせ、その液を捨
てた後、37℃で10分間保温し、10%(v/v)牛
胎児血清を含むダルベッコMEM培地5mlを加え、ピペ
ッテイングによりHL細胞を剥離して、細胞浮遊液を調
製した。
【0032】75cm2のプラスチック製培養フラスコで
培養するときは、培養フラスコに上記細胞浮遊液1ml及
び10%(v/v)牛胎児血清含有ダルベッコMEM培
地15〜20mlを加え、また、6ウェルプラスチック製
培養容器で培養するときは、上記細胞浮遊液8mlと10
%牛胎児血清含有ダルベッコMEM培地292mlとの混
合液4mlずつを各ウェルに加え、5%(v/v)炭酸ガ
ス雰囲気下で培養した。
【0033】(B)クラミジア・ニューモニエ YK4
1の培養 6ウェルプラスチック製培養容器(底面上)に増殖した
HL細胞の培養上清をピペットで取り除き、これに前述
のクラミジア・ニューモニエYK41株の浮遊液〔クラ
ミジア・ニューモニエYK41保存液を、1リットルあ
たり庶糖75g、リン酸一カリウム0.52g、リン酸
二カリウム1.22g及びグルタミン酸0.72gを含
む水溶液(以下、SPGという)で12ないし24倍に
希釈し、超音波で1分間処理し、2,000rpmで3分
間遠心分離した上清〕を1ウェルあたり2ml加えて、
2,000rpmで1時間遠心吸着を行った。遠心吸着
後、クラミジア・ニューモニエ浮遊液を除き、1μg/ml
シクロヘキシミド及び10%(v/v)牛胎児血清を含
むダルベッコMEM培地をウェルあたり4ml加え、5%
(v/v)炭酸ガス雰囲気下、36℃で3日間培養し
た。培養後、滅菌したシリコン片で細胞を剥離し、細胞
を回収した。これを8,000rpmで30分間遠心分離
して、沈殿をSPGに再懸濁し、−70℃で保存した
(以下、これをクラミジア・ニューモニエYK41保存
液という)。
【0034】(C)クラミジア・ニューモニエYK41
の基本小体の精製 −70℃に保存しておいたクラミジア・ニューモニエY
K41感染凍結HL細胞浮遊液を融解し、テフロンホモ
ジナイザーでホモジナイズした。2,500rpmで10
分間遠心分離し、上清を回収した。沈殿は再びSPGに
懸濁し、同様の操作を行い、上清を回収した。同様の操
作を更に2回行い、得られた上清は集めて合わせた。
【0035】別途、遠心管に50%(w/v)庶糖を含
む0.03Mトリス−塩酸緩衝液(pH7.4)、次い
で、ウログラフィン76%(シェーリング社製)3容量
と0.03Mトリス−塩酸緩衝液(pH7.4)7容量と
の混合液を重層し、この上に先に回収した上清を注意深
く重層し、8,000rpmで1時間遠心分離した。50
%(w/v)庶糖を含む0.03Mトリス−塩酸緩衝液
(pH7.4)層及び沈殿を回収し、この回収液に同容量
のSPGを加え、10,000rpmで30分間遠心分離
した。上清を捨て、沈殿をSPGに懸濁した。遠心分離
管に、ウログラフィン76%(シェーリング社製)と
0.03Mトリス−塩酸緩衝液(pH7.4)の35%か
ら50%(総量に対する前者の容量比)までの連続密度
勾配液を作製し、この上に懸濁液を重層し、8000rp
mで1時間遠心分離した。クラミジア・ニューモニエ Y
K41の基本小体に相当するバンドを回収し、これをS
PGで2倍に希釈し、10000rpmで30分間遠心分
離した。得られた沈殿をSPGに懸濁し、タンパク質濃
度を測定(バイオラッド社のタンパク測定キットを用
い、牛血清アルブミンを標準とした)後、−70℃で保
存した。
【0036】(D)クラミジア・ニューモニエYK−4
1株のゲノムDNAの調製 上記精製クラミジア・ニューモニエYK−41株の基本
小体の懸濁液300μl(タンパク質濃度:1.37mg
/ml)を4℃、12,000rpmで5分間遠心分離した。
沈殿に1mM EDTAを含む10mMトリス−塩酸緩
衝液pH8.0(以下、TE緩衝液という)500μlを
加えて懸濁した。同様の遠心分離を再度行い、沈殿を3
00μlのTE緩衝液に懸濁した。1%SDS水溶液3
0μl及び1mg/mlプロテイナーゼK水溶液30μlを
加え、56℃で30分間インキュベートし、基本小体を
溶解させた。0.1Mトリス−塩酸緩衝液(pH8.0)
飽和フェノール350μlを加え、ボルテックスミキサ
ーでよく混合後、4℃、12,000rpmで5分間遠心
分離し、水層を回収した(DNAの抽出)。この抽出操
作はもう一度繰り返した。10mg/mlのRNase溶液
を2μl加え、37℃で2時間インキュベートし、RN
Aを分解した。0.1Mトリス−塩酸緩衝液(pH8.
0)飽和フェノール、クロロホルム及びイソアミルアル
コールの25:24:1(容量比)の混合液(以下、P
CIという)300μlを加え、ボルテックスミキサー
でよく混合し、4℃、12,000rpmで5分間遠心分
離し、水層を回収した。この操作を合計5回繰り返し
た。
【0037】得られた液にその1/10容の10M酢酸
アンモニウム水溶液及び2容のエタノールを加え、5分
間放置し、DNAを析出させたのち、4℃、12,00
0rpmで5分間遠心分離した。沈殿は70%エタノール
水溶液600μlを加え、混合し、4℃、12,000
rpmで5分間遠心分離する洗浄を2回繰り返した。遠沈
管のふたを開けたまま15分間放置して沈殿を乾燥さ
せ、これにTE200μlを加えて溶かし、−20℃に
保存した。
【0038】(E)ゲノムDNA発現ライブラリーの作
製 ゲノムDNA溶液100μlに、制限酵素用M-buffer1
0μl、制限酵素混合液(AccI、HaeIII及び1
/50希釈のAluI各0.4μlとTE20μlを混
合)10μlを加え、37℃で20分間反応させた。な
お、上記20分の反応時間は、DNAが1kbp〜7k
bpの大きさの部分消化DNAに分解される時間で、予
め少量のゲノムDNAを用いて試験した。上記反応液に
PCIを100μl加え、ボルテックスミキサーでよく
混ぜ、4℃、12,000rpmで5分間遠心分離し、水
層を回収した。これに3M酢酸ナトリウム水溶液10μ
l及びエタノール220μlを加え、−80℃に15分
間静置し、部分消化DNAを析出させた。4℃、12,
000rpmで5分間遠心分離し、上清液を捨てたのち、
沈殿に70%エタノール水溶液500μlを加えて混
ぜ、再び、12,000rpmで5分間遠心分離した。上
清液を捨て、沈殿を減圧下に乾燥した。
【0039】得られた部分消化DNAを精製水20μl
に溶かし、その19μlをとり、これに下記化1で示す
リンカー(20pmole/μl)14μl、10mM AT
P4.5μl、50mM MgCl2、50mMジチオ
スレイトール及び500μg/ml牛血清アルブミン含有
0.2Mトリス−塩酸緩衝液(pH7.6、以下、10倍
濃度ライゲーション用緩衝液という)4.5μl、精製
水2μl及びT4リガーゼ1μlを加え、16℃で4時
間反応させ、リンカーを付加させた。
【化1】
【0040】リンカーを付加させた部分消化DNAを、
0.1M NaCl及び1mM EDTA含有10mMト
リス−塩酸緩衝液を移動相とするChroma spin 6000カラ
ムにかけた。溶出液2滴ずつを分取し、各分画の一部を
0.8%アガロースゲル電気泳動で分析して、1kbp
から7kbpのDNA断片を含む分画を回収した。得ら
れた分画144μlに、精製水13μl、10mM A
TP 20μl、0.1M MgCl2、50mMジチオ
スレイトール、1mMスペルミジン塩酸塩及び1mM
EDTA含有0.5Mトリス−塩酸緩衝液(pH7.6、
以下、10倍濃度リン酸化反応用緩衝液という)20μ
l、及びT4ポリヌクレオチドキナーゼ3μlを加え、
37℃で30分間反応させ、DNA断片の5′端をリン
酸化した。PCI 200μlを加えてよく振り混ぜた
後、4℃、12,000rpmで5分間遠心分離し、水層
を回収した。20mg/mlグリコーゲン水溶液1μl、3
M酢酸ナトリウム水溶液20μl及びエタノール400
μlを加えてヌクレオチドを析出させた。4℃、12,
000rpmで10分間遠心分離し、上清を捨て、沈殿に
70%エタノール200μlを加え混ぜ、再び遠心分離
し、上清を捨て、沈殿を風乾し、精製水1μlを加え溶
かした。
【0041】この液0.6μlに、予め制限酵素Eco
RIで切断したλgt11 DNA(1μg/μl、ストラタ
ジーン(Stratagene)社)1μl、10倍濃度ライゲー
ション用緩衝液0.5μl、10mM ATP0.5μ
l、T4リガーゼ0.4μl及び精製水2μlを加え、
4℃で一晩反応させた。次いで、ギガパック(Gigapac
k)II Goldパッケージングキット(ストラタジーン社)
を用い、得られた組換えλgt11DNAをパッケージン
グした。
【0042】(F)抗原ポリペプチドをコードするDN
Aのクローニング 大腸菌Y1090r−株の一白金耳を10mM MgS
43ml、0.2%マルトース及び50μg/mlアンピ
シリン含有のLB(水1L中にNaCl 5g、ポリペ
プトン10g及び酵母エキス5gを含む)培地に接種
し、37℃で一晩振とう培養したのち、これを2,00
0rpmで10分間遠心分離した。沈殿(大腸菌)に10
mM MgSO4水溶液9mlを加えて混ぜ、この大腸菌懸
濁液の0.35mlを採り、これにλgt11(DNAライ
ブラリー)懸濁液を0.1〜10μl加え、37℃で2
0分間インキューベートし、大腸菌にλgt11を感染さ
せた。予め47℃に保温した液状LB寒天培地2.5ml
に、上記λgt11感染大腸菌を加え、これを直ちにLB
寒天培地上に撒いた。上層寒天培地が固化した後、42
℃で3〜4時間培養し、プラークが観察された時点で1
0mM IPTG水溶液に浸漬したニトロセルロースフ
ィルター(φ82mm)を上層寒天培地に乗せ、37℃で
12時間培養した。黒インクをつけた注射針で非対称に
3ヵ所突き刺してフィルターに目印をつけた後、フィル
ターを寒天培地からとり出し、150mMNaCl及び
0.1%ツィーン20含有20mMトリス−塩酸緩衝液
(pH7.5)(以下、TTBS緩衝液という)で3回洗
浄した。寒天培地は冷蔵庫中に保存した。
【0043】フィルターを150mM NaCl含有2
0mMトリス−塩酸緩衝液(pH7.5)(以下、TBS
緩衝液という)の0.1%牛血清アルブミン含有液に浸
し、37℃で1時間振とうし、ブロッキング反応を行っ
た。次いで、フィルターをTTBS緩衝液で2回洗浄し
たのち、5〜10μg/mlのクラミジア属細菌に特異的な
モノクローナル抗体(70)のTTBS溶液に浸し、3
7℃、1時間振とうした。フィルターをTTBS緩衝液
で3回洗浄した後、パーオキシダーゼ標識の(50ng/m
l)抗マウスIgG抗体溶液(TTBS緩衝液)中、3
7℃で1時間振とうした。フィルターをTTBS緩衝液
で3回、及びTBS緩衝液で3回洗浄した後、発色基質
液(TBS緩衝液100mlに30%過酸化水素水溶液6
0μlと0.3% 4−クロロ−1−ナフトールのメタ
ノール溶液20mlを加えて調製)に浸漬し、室温で約3
0分間放置した。十分発色した時点でフィルターをとり
出し、精製水で洗浄し、風乾した。
【0044】フィルターの発色スポットに対応する寒天
培地上のプラークを捜して同定し、この部分の寒天をパ
スツールピペットでつき刺し、プラークを回収した。回
収したプラークはクロロホルム1滴を加えた0.1M
NaCl、8mM硫酸マグネシウム及び0.01%ゼラ
チン含有50mMトリス−塩酸緩衝液(pH7.5)(以
下、SM緩衝液という。)中に採り、4℃で一晩放置し
プラーク中のλファージを抽出した。プラークが全て上
記モノクローナル抗体と反応するようになるまで、前記
操作を繰り返し、抗原ポリペプチドをコードするDNA
をクローン化した。このようにして、クラミジア属細菌
特異的モノクローナル抗体反応性のクラミジア・ニュー
モニエ抗原ポリペプチドを発現するλファージが得ら
れ、これを70−2Sλファージと命名した。
【0045】(G)70−2Sλファージの培養とDN
A精製 前記(F)で述べた方法と同様にしてプラークを形成さ
せ、一つのプラークを回収し、100μlのSM緩衝液
に入れ、4℃で一晩放置しλファージを抽出した。LB
培養液で一晩培養した大腸菌Y1090r−株250μ
lに、λファージ液5〜10μlを加え、37℃で20
分間放置し、大腸菌にλファージを感染させた。予め3
7℃に温めておいた10mM硫酸マグネシウムを含むL
B培地50mlに接種し、λファージによる大腸菌の溶
菌が起こるまで37℃で5〜7時間振とう培養した。2
50μlのクロロホルムを加え、3,000rpmで10
分間遠心分離し大腸菌細胞残渣を除き、λファージ懸濁
液を得た。λファージDNAは、Wizard λ preps キッ
ト(プロメガ社)を用いて精製した。
【0046】(H)クラミジア・ニューモニエ抗原ポリ
ペプチドをコードするDNAの増幅 600μl用のマイクロチューブに、精製水61.5μ
l、10倍濃度 反応用緩衝液(500mM KCl、
15mM MgCl2、0.01%ゼラチンを含むトリ
ス−塩酸緩衝液pH8.3)10μl、20mM dN
TP 1μl、70−2SλファージDNA溶液0.1
μl、20nM λgt11 forward primer(宝酒造株
式会社)1μl、20nM λgt11 reverse primer
(宝酒造株式会社)1μl、AmpliTaq DNA Polymerase
0.5μlを入れ、ミネラルオイルを2〜3滴重層し
た。94℃ 30秒、55℃ 30秒、73℃ 2分の
サイクルのインキュベーションを30回繰返し、DNA
を増幅した。反応後、1.2%低温融解アガロースゲル
電気泳動を行い、増幅されたDNAを切り出して Wizar
d PCR Prep キット(プロメガ社)で精製した。
【0047】(I)DNA塩基配列分析 DNA塩基配列分析は、PCRで増幅したDNAを鋳型
として、Taq DNA ポリメラーゼを用いた蛍光標識ターミ
ネータサイクルシークエンス法でシークエンス反応を行
い、373A型DNAシークエンサ(アプライドバイオ
システムズ社)で分析を行った。得られたDNA塩基配
列を遺伝子配列分析ソフト「DNASIS」(日立ソフ
トウェアエンジニアリング社)を用いて、編集、連結、
アミノ酸翻訳領域の推定を行ない、配列番号5の配列を
得た。配列番号5の配列の解析結果から、73KDa抗
原ポリペプチドについて、そのN末端からC末端に向け
て約90%のアミノ酸配列が解明されたことが分かっ
た。また、コード領域の塩基配列は配列番号2の配列と
なっており、その推定アミノ酸配列は配列番号1の配列
となっていた。
【0048】実施例2 クラミジア・ニューモニエの抗
原ポリペプチドを含むポリペプチドをコードするDNA
を含む組換えベクターの作製、及びそれを含む形質転換
体の作製 70−2SλファージDNAを制限酵素EcoRIで切
断し、このDNA断片50ngに、予め制限酵素EcoR
Iで切断してあるプラスミドpBR322のDNA10
0ngを添加し、DNAライゲーションキット(宝酒造)
を用いてこれらのDNAを連結する。この反応物を大腸
菌HB101株コンピテントセル(宝酒造)に入れ、形
質転換体を作製する。このプラスミドは、73K抗原ポ
リペプチドの一部をコードするDNAを含むものであ
る。この73K抗原ポリペプチドの一部をコードするD
NAの塩基配列は配列番号2のようになっており、この
塩基配列から推定されるアミノ酸配列はを配列番号1の
ようになっている。プラスミドから73K抗原ポリペプ
チドの一部をコードするDNAを切りだし、発現ベクタ
ーに入れ、これを大腸菌等の宿主に入れてDNAを発現
させると、コードされているタンパク質が菌体内に蓄積
される。このタンパク質を電気泳動、ニトロセルロース
膜への転写、モノクローナル抗体での検出を同様に行う
と上記ポリペプチドに相当するバンドが観察され、クラ
ミジア属の細菌に特異的に反応するモノクローナル抗体
と反応することができる73K抗原ポリペプチドを発現
していることが示される。
【0049】実施例3 クラミジア・ニューモニエの5
3K抗原ポリペプチドをコードするDNAの作製 モノクローナル抗体70の代わりに、モノクローナル抗
体AY6E2E8又はSCP53を使用し、実施例1と
同様の手順で操作した。クローン53−3Sλファージ
が得られ、これから配列番号6の配列が得られた。配列
番号6の配列の解析結果から、クラミジア・ニューモニ
エに特異的な53K抗原タンパク質については、そのN
末端からC末端に向けて約60%のアミノ酸配列が解明
されたことが分かった。また、コード領域の塩基配列は
配列番号3の配列となっており、その推定アミノ酸配列
は配列番号4の配列となっていた。
【0050】実施例4 抗原ポリペプチドを抗原として
用いる抗クラミジア・ニューモニエ抗体の検出・測定 抗原ポリペプチドとして、配列番号1のアミノ酸配列か
らなるポリペプチドを用い、これをマイクロタイタープ
レートに固定し、牛血清アルブミンを含むPBSを加
え、4℃で一晩以上放置し、ブロッキングを行なう。牛
血清アルブミンを含むPBSを除いた後、0.02%
(w/v)ツィーン20を含むPBSで同様に2回洗浄
後、ウェルに患者の血清を加え、室温で2時間放置す
る。0.02%(w/v)ツィーン20を含むPBSで
同様に3回洗浄後、ウェルにパーオキシダーゼ標識化マ
ウス抗ヒトIgG抗体を加え、室温で2時間放置する。
0.02%(w/v)ツィーン20を含むPBSで同様
に3回洗浄後、ウェルにABTS溶液(KPL社製)を
加え、室温で15分〜1時間放置して発色反応させ、9
6ウエルEIAプレート用光度計で405nmの吸光度を
測定する。
【0051】
【発明の効果】請求項1記載の検出・測定方法は、クラ
ミジア・ニューモニエの抗体検査等に好適である。請求
項2記載の検出・測定方法は、請求項1記載の検出・測
定方法の効果を奏し、さらに、抗原として用いられるポ
リペプチドのアミノ酸配列の長さが短いため、担体等に
固定化できる抗原ペプチドの数を多くすることができ、
高感度である。請求項3記載の検出・測定方法は、請求
項1記載の検出・測定方法の効果を奏し、さらに、抗原
として用いられるポリペプチドがタンパク質分解酵素に
よる分解を受けにくい構造をつくることができるので安
定性に優れており、検出・測定結果の信頼性が高い。請
求項4記載の検出・測定方法は、請求項1記載の検出・
測定方法の効果を奏し、さらに、抗原として用いられる
ポリペプチドをアミノ酸若しくは2〜1000個のアミ
ノ酸配列を利用して担体等に固定化することができるの
で、固定化による抗原性の低下又は喪失が生じにくく、
クラミジア・ニューモニエ感染を診断する上で優れてい
る。請求項5記載の検出・測定方法は、請求項1記載の
検出・測定方法の効果を奏し、さらに、抗原として用い
られるポリペプチドがクラミジア属細菌に特異的な抗原
ポリペプチドの抗原部分を有するので、抗体検査やクラ
ミジア属細菌感染の正確な診断に極めて適切であり、ま
た、抗原としてクラミジア・ニューモニエに特異的な抗
原ポリペプチドを合わせて利用することにより、感染し
ている種の容易な区別に利用できる。請求項6記載の検
出・測定用試薬は、クラミジア・ニューモニエの抗体検
査やクラミジア・ニューモニエ感染の診断に好適であ
る。請求項7記載の検出・測定用試薬は、請求項6記載
の検出・測定用試薬の効果を奏し、さらに、抗原ポリペ
プチドのアミノ酸配列の長さが短いため、担体等に固定
化できる抗原ポリペプチドの数を多くすることができ、
高感度である。請求項8記載の検出・測定用試薬は、請
求項6記載の検出・測定用試薬の効果を奏し、さらに、
抗原ポリペプチドがタンパク質分解酵素による分解を受
けにくい構造を作ることができるので安定性に優れてお
り、検出・測定結果の信頼性が高い。請求項9記載の検
出・測定用試薬は、請求項6記載の検出・測定用試薬の
効果を奏し、さらに、抗原として用いられるポリペプチ
ドをアミノ酸若しくは2〜1000個のアミノ酸配列を
利用して担体等に固定化できるので、固定化による抗原
性の低下又は喪失が生じにくく、クラミジア・ニューモ
ニエ感染を診断する上で優れている。請求項10記載の
検出・測定用試薬は、請求項6記載の検出・測定用試薬
の効果を奏し、さらに、抗原として用いられるポリペプ
チドがクラミジア属細菌に特異的な抗原ポリペプチドの
抗原部分を有するので、抗体検査やクラミジア属細菌感
染の正確な診断に極めて適切であり、また、抗原として
クラミジア・ニューモニエに特異的な抗原ポリペプチド
を合わせて利用することにより、感染している種の容易
な区別に利用できる。請求項11記載の診断薬は、クラ
ミジア・ニューモニエ感染の診断に好適である。請求項
12記載の診断薬は、請求項11記載の診断薬の効果を
奏し、さらに、抗原ポリペプチドのアミノ酸配列の長さ
が短いため、担体等に固定化できる抗原ポリペプチドの
数を多くすることができ、高感度である。請求項13記
載の診断薬は、請求項11記載の診断薬の効果を奏し、
さらに、抗原ポリペプチドがタンパク質分解酵素による
分解を受けにくい構造を作ることができるので安定性に
優れており、検出・測定結果の信頼性が高い。請求項1
4記載の診断薬は、請求項11記載の診断薬の効果を奏
し、さらに、抗原として用いられるポリペプチドをアミ
ノ酸若しくは2〜1000個のアミノ酸配列を利用して
担体等に固定化できるので、固定化による抗原性の低下
又は喪失が生じにくく、クラミジア・ニューモニエ感染
を診断する上で優れている。請求項15記載の診断薬
は、請求項11記載の診断薬の効果を奏し、さらに、抗
原として用いられるポリペプチドがクラミジア属細菌に
特異的な抗原ポリペプチドの抗原部分を有するので、抗
体検査やクラミジア属細菌感染の正確な診断に極めて適
切であり、また、抗原としてクラミジア・ニューモニエ
に特異的な抗原ポリペプチドを合わせて利用することに
より、感染している種の容易な区別に利用できる。
【0052】
【配列表】
配列番号:1 配列の長さ:571 配列の型:アミノ酸 トポロジー:直鎖状 配列の種類:ペプチド 配列 Met Pro Lys Gln Ala Glu Tyr Thr Trp Gly Ser Lys Lys Ile Leu Asp 1 5 10 15 Asn Ile Glu Cys Leu Thr Glu Asp Val Ala Glu Phe Lys Asp Leu Leu 20 25 30 Tyr Thr Ala His Arg Ile Thr Ser Ser Glu Glu Glu Ser Asp Asn Glu 35 40 45 Ile Gln Pro Gly Ala Ile Leu Lys Gly Thr Val Val Asp Ile Asn Lys 50 55 60 Asp Phe Val Val Val Asp Val Gly Leu Lys Ser Glu Gly Val Ile Pro 65 70 75 80 Met Ser Glu Phe Ile Asp Ser Ser Glu Gly Leu Val Leu Gly Ala Glu 85 90 95 Val Glu Val Tyr Leu Asp Gln Ala Glu Asp Glu Glu Gly Lys Val Val 100 105 110 Leu Ser Arg Glu Lys Ala Thr Arg Gln Arg Gln Trp Glu Tyr Ile Leu 115 120 125 Ala His Cys Glu Glu Gly Ser Ile Val Lys Gly Gln Ile Thr Arg Lys 130 135 140 Val Lys Gly Gly Leu Ile Val Asp Ile Gly Met Glu Ala Phe Leu Pro 145 150 155 160 Gly Ser Gln Ile Asp Asn Lys Lys Ile Lys Asn Leu Asp Asp Tyr Val 165 170 175 Gly Lys Val Cys Glu Phe Lys Ile Leu Lys Ile Asn Val Glu Arg Arg 180 185 190 Asn Ile Val Val Ser Arg Arg Glu Leu Leu Glu Ala Glu Arg Ile Ser 195 200 205 Lys Lys Ala Glu Leu Ile Glu Gln Ile Ser Ile Gly Glu Tyr Arg Lys 210 215 220 Gly Val Val Lys Asn Ile Thr Asp Phe Gly Val Phe Leu Asp Leu Asp 225 230 235 240 Gly Ile Asp Gly Leu Leu His Ile Thr Asp Met Thr Trp Lys Arg Ile 245 250 255 Arg His Pro Ser Glu Met Val Glu Leu Asn Gln Glu Leu Glu Val Ile 260 265 270 Ile Leu Ser Val Asp Lys Glu Lys Gly Arg Val Ala Leu Gly Leu Lys 275 280 285 Gln Lys Glu His Asn Pro Trp Glu Asp Ile Glu Lys Lys Tyr Pro Pro 290 295 300 Gly Lys Arg Val Leu Gly Lys Ile Val Lys Leu Leu Pro Tyr Gly Ala 305 310 315 320 Phe Ile Glu Ile Glu Glu Gly Ile Glu Gly Leu Ile His Ile Ser Glu 325 330 335 Met Ser Trp Val Lys Asn Ile Val Asp Pro Ser Glu Val Val Asn Lys 340 345 350 Gly Asp Glu Val Glu Ala Ile Val Leu Ser Ile Gln Lys Asp Glu Gly 355 360 365 Lys Ile Ser Leu Gly Leu Lys Gln Thr Glu Arg Asn Pro Trp Asp Asn 370 375 380 Ile Glu Glu Lys Tyr Pro Ile Gly Leu His Val Asn Ala Glu Ile Lys 380 385 390 395 Asn Leu Thr Asn Tyr Gly Ala Phe Val Glu Leu Glu Pro Gly Ile Glu 400 405 410 Gly Leu Ile His Ile Ser Asp Met Ser Trp Ile Lys Lys Val Ser His 415 420 425 Pro Ser Glu Leu Phe Lys Lys Gly Asn Ser Val Glu Ala Val Ile Leu 430 435 440 Ser Val Asp Lys Glu Ser Lys Lys Ile Thr Leu Gly Val Lys Gln Leu 445 450 455 Ser Ser Asn Pro Trp Asn Glu Ile Glu Ala Met Phe Pro Ala Gly Thr 460 465 470 475 Val Ile Ser Gly Val Val Thr Lys Ile Thr Ala Phe Gly Ala Phe Val 480 485 490 Glu Leu Gln Asn Gly Ile Glu Gly Leu Ile His Val Ser Glu Leu Ser 495 500 505 Asp Lys Pro Phe Ala Lys Ile Glu Asp Ile Ile Ser Ile Gly Glu Asn 510 515 520 Val Ser Ala Lys Val Ile Lys Leu Asp Pro Asp His Lys Lys Val Ser 525 530 535 Leu Ser Val Lys Glu Tyr Leu Ala Asp Asn Ala Tyr Asp Gln Asp Ser 540 545 550 560 Arg Thr Glu Leu Asp Phe Lys Asp Ser Gln Gly 565 570 571
【0053】配列番号:2 配列の長さ:1712 配列の型:核酸 鎖の数:二本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:Genomic DNA 配列 ATGCCAAAAC AAGCTGAATA TACTTGGGGA TCTAAAAAAA TTCTGGACAA TATAGAATGC 60 CTCACAGAAG ACGTTGCCGA ATTTAAAGAT TTGCTTTATA CGGCACACAG AATTACTTCG 120 AGCGAAGAAG AATCTGATAA CGAAATACAG CCTGGCGCCA TCCTAAAAGG TACCGTAGTT 180 GATATTAATA AAGACTTTGT CGTAGTTGAT GTTGGTCTGA AGTCTGAGGG AGTGATCCCT 240 ATGTCAGAGT TCATAGACTC TTCAGAAGGT TTAGTGCTTG GAGCTGAAGT AGAAGTCTAT 300 CTCGACCAAG CCGAAGACGA AGAGGGCAAA GTTGTCCTTT CTAGAGAAAA AGCCACACGA 360 CAACGTCAAT GGGAATACAT CTTAGCTCAT TGTGAAGAAG GTTCTATTGT TAAAGGTCAA 420 ATTACACGTA AAGTCAAAGG CGGCCTTATT GTAGATATTG GAATGGAAGC CTTCCTACCT 480 GGATCACAAA TTGACAACAA GAAAATCAAA AATTTAGATG ATTATGTCGG AAAAGTTTGT 540 GAATTCAAAA TTTTAAAAAT TAACGTTGAA CGTCGCAATA TTGTTGTCTC AAGAAGAGAA 600 CTCTTAGAAG CTGAGAGAAT CTCTAAGAAA GCCGAACTTA TTGAACAAAT TTCTATCGGA 660 GAATACCGCA AAGGAGTTGT TAAAAACATT ACTGACTTTG GTGTATTCTT AGATCTCGAT 720 GGTATTGACG GTCTTCTCCA CATTACCGAT ATGACCTGGA AGCGCATACG ACATCCTTCC 780 GAAATGGTCG AATTGAATCA AGAGTTGGAA GTAATTATTT TAAGCGTAGA TAAAGAAAAA 840 GGACGAGTTG CTCTAGGTCT CAAACAAAAA GAGCATAATC CTTGGGAAGA TATTGAGAAG 900 AAATACCCTC CTGGAAAACG AGTTCTTGGT AAAATTGTGA AGCTTCTCCC CTACGGAGCT 960 TTCATTGAAA TTGAAGAGGG CATTGAAGGT CTAATTCACA TTTCTGAAAT GTCTTGGGTG 1020 AAAAATATTG TAGATCCTAG TGAAGTCGTA AATAAAGGCG ATGAAGTTGA AGCCATTGTT 1080 CTATCTATTC AGAAGGACGA AGGAAAAATT TCTCTAGGAT TAAAGCAAAC AGAACGTAAT 1140 CCTTGGGACA ATATCGAAGA AAAATATCCT ATAGGTCTCC ATGTCAATGC TGAAATCAAG 1200 AACTTAACCA ATTACGGTGC TTTCGTTGAA TTAGAACCAG GAATTGAGGG TCTGATTCAT 1260 ATTTCTGACA TGAGTTGGAT TAAAAAAGTC TCTCACCCTT CAGAACTATT CAAAAAAGGA 1320 AATTCTGTAG AGGCTGTTAT TTTATCAGTA GACAAAGAAA GTAAAAAAAT TACTTTAGGA 1380 GTTAAGCAAT TAAGTTCTAA TCCTTGGAAT GAAATTGAAG CTATGTTCCC TGCTGGCACA 1440 GTAATTTCAG GAGTTGTGAC TAAAATCACT GCATTTGGAG CCTTTGTTGA GCTACAAAAC 1500 GGGATTGAAG GATTGATTCA CGTTTCAGAA CTTTCTGACA AGCCCTTTGC AAAAATTGAA 1560 GATATTATCT CCATTGGAGA AAATGTTTCT GCAAAAGTAA TTAAGCTAGA TCCAGATCAT 1620 AAAAAAGTTT CTCTTTCTGT AAAAGAATAC TTAGCTGACA ATGCTTATGA TCAAGACTCT 1680 AGGACTGAAT TAGATTTCAA GGATTCTCAA GG 1712
【0054】配列番号:3 配列の長さ:259 配列の型:アミノ酸 トポロジー:直鎖状 配列の種類:ペプチド 配列 Met Ser Ile Ser Ser Ser Ser Gly Pro Asp Asn Gln Lys Asn Ile Met 1 5 10 15 Ser Gln Val Leu Thr Ser Thr Pro Gln Gly Val Pro Gln Gln Asp Lys 20 25 30 Leu Ser Gly Asn Glu Thr Lys Gln Ile Gln Gln Thr Arg Gln Gly Lys 35 40 45 Asn Thr Glu Met Glu Ser Asp Ala Thr Ile Ala Gly Ala Ser Gly Lys 50 55 60 Asp Lys Thr Ser Ser Thr Thr Lys Thr Glu Thr Ala Pro Gln Gln Gly 65 70 75 80 Val Ala Ala Gly Lys Glu Ser Ser Glu Ser Gln Lys Ala Gly Ala Asp 85 90 95 Thr Gly Val Ser Gly Ala Ala Ala Thr Thr Ala Ser Asn Thr Ala Thr 100 105 110 Lys Ile Ala Met Gln Thr Ser Ile Glu Glu Ala Ser Lys Ser Met Glu 115 120 125 Ser Thr Leu Glu Ser Leu Gln Ser Leu Ser Ala Ala Gln Met Lys Glu 130 135 140 Val Glu Ala Val Val Val Ala Ala Leu Ser Gly Lys Ser Ser Gly Ser 145 150 155 160 Ala Lys Leu Glu Thr Pro Glu Leu Pro Lys Pro Gly Val Thr Pro Arg 165 170 175 Ser Glu Val Ile Glu Ile Gly Leu Ala Leu Ala Lys Ala Ile Gln Thr 180 185 190 Leu Gly Glu Ala Thr Lys Ser Ala Leu Ser Asn Tyr Ala Ser Thr Gln 195 200 205 Ala Gln Ala Asp Gln Thr Asn Lys Leu Gly Leu Glu Lys Gln Ala Ile 210 215 220 Lys Ile Asp Lys Glu Arg Glu Glu Tyr Gln Glu Met Lys Ala Ala Glu 225 230 235 240 Gln Lys Ser Lys Asp Leu Glu Gly Thr Met Asp Thr Val Asn Thr Val 245 250 255 Met Ile Ala 259
【0055】配列番号:4 配列の長さ:777 配列の型:核酸 鎖の数:二本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:Genomic DNA 配列 ATGTCTATTT CATCTTCTTC AGGACCTGAC AATCAAAAAA ATATCATGTC TCAAGTTCTG 60 ACATCGACAC CCCAGGGCGT GCCCCAACAA GATAAGCTGT CTGGCAACGA AACGAAGCAA 120 ATACAGCAAA CACGTCAGGG TAAAAACACT GAGATGGAAA GCGATGCCAC TATTGCTGGT 180 GCTTCTGGAA AAGACAAAAC TTCCTCGACT ACAAAAACAG AAACAGCTCC ACAACAGGGA 240 GTTGCTGCTG GGAAAGAATC CTCAGAAAGT CAAAAGGCAG GTGCTGATAC TGGAGTATCA 300 GGAGCGGCTG CTACTACAGC ATCAAATACT GCAACAAAAA TTGCTATGCA GACCTCTATT 360 GAAGAGGCGA GCAAAAGTAT GGAGTCTACC TTAGAGTCAC TTCAAAGCCT CAGTGCCGCG 420 CAAATGAAAG AAGTCGAAGC GGTTGTTGTT GCTGCCCTCT CAGGGAAAAG TTCGGGTTCC 480 GCAAAATTGG AAACACCTGA GCTCCCCAAG CCCGGGGTGA CACCAAGATC AGAGGTTATC 540 GAAATCGGAC TCGCGCTTGC TAAAGCAATT CAGACATTGG GAGAAGCCAC AAAATCTGCC 600 TTATCTAACT ATGCAAGTAC ACAAGCACAA GCAGACCAAA CAAATAAACT AGGTCTAGAA 660 AAGCAAGCGA TAAAAATCGA TAAAGAACGA GAAGAATACC AAGAGATGAA GGCTGCCGAA 720 CAGAAGTCTA AAGATCTCGA AGGAACAATG GATACTGTCA ATACTGTGAT GATCGCG 777
【0056】配列番号:5 配列の長さ:1954 配列の型:核酸 鎖の数:二本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:Genomic DNA 起源 生物名:C. ニューモニエ 株名:YK-41 直接の起源 クローン:70-2S 配列の特徴 特徴を表す記号:−35 signal 存在位置:146..151 特徴を決定した方法:S 配列の特徴 特徴を表す記号:−10 signal 存在位置:169..174 特徴を決定した方法:S 配列の特徴 特徴を表す記号:RBS 存在位置:199..205 特徴を決定した方法:S 配列の特徴 特徴を表す記号:CDS 存在位置:215..1927 特徴を決定した方法:S 配列 TTGACACCAG ACCAACTGGT AATGGTAGCG ACC
GGCGCTC AGCTGGAATT CGAACCCCTT 60 CGCCTTATAC ATCTCTAGAA CGGAAGTATA GGATTTTACG ATTAATTCGA TTATATAGAA 120 CTAATCGTCT CCTGCAAGGG AGGTCTTGCC TTTTTTAAGG TTTATATTTA CACTGTCTTT 180 TTTGACTTTG TAGTTTTTAG GAGAATAACA ATAA ATG CCA AAA CAA GCT GAA TAT 235 Met Pro Lys Gln Ala Glu Tyr 1 5 ACT TGG GGA TCT AAA AAA ATT CTG GAC AAT ATA GAA TGC CTC ACA GAA 283 Thr Trp Gly Ser Lys Lys Ile Leu Asp Asn Ile Glu Cys Leu Thr Glu 10 15 20 GAC GTT GCC GAA TTT AAA GAT TTG CTT TAT ACG GCA CAC AGA ATT ACT 331 Asp Val Ala Glu Phe Lys Asp Leu Leu Tyr Thr Ala His Arg Ile Thr 25 30 35 TCG AGC GAA GAA GAA TCT GAT AAC GAA ATA CAG CCT GGC GCC ATC CTA 379 Ser Ser Glu Glu Glu Ser Asp Asn Glu Ile Gln Pro Gly Ala Ile Leu 40 45 50 55 AAA GGT ACC GTA GTT GAT ATT AAT AAA GAC TTT GTC GTA GTT GAT GTT 427 Lys Gly Thr Val Val Asp Ile Asn Lys Asp Phe Val Val Val Asp Val 60 65 70 GGT CTG AAG TCT GAG GGA GTG ATC CCT ATG TCA GAG TTC ATA GAC TCT 475 Gly Leu Lys Ser Glu Gly Val Ile Pro Met Ser Glu Phe Ile Asp Ser 75 80 85 TCA GAA GGT TTA GTG CTT GGA GCT GAA GTA GAA GTC TAT CTC GAC CAA 523 Ser Glu Gly Leu Val Leu Gly Ala Glu Val Glu Val Tyr Leu Asp Gln 90 95 100 GCC GAA GAC GAA GAG GGC AAA GTT GTC CTT TCT AGA GAA AAA GCC ACA 571 Ala Glu Asp Glu Glu Gly Lys Val Val Leu Ser Arg Glu Lys Ala Thr 105 110 115 CGA CAA CGT CAA TGG GAA TAC ATC TTA GCT CAT TGT GAA GAA GGT TCT 619 Arg Gln Arg Gln Trp Glu Tyr Ile Leu Ala His Cys Glu Glu Gly Ser 120 125 130 135 ATT GTT AAA GGT CAA ATT ACA CGT AAA GTC AAA GGC GGC CTT ATT GTA 667 Ile Val Lys Gly Gln Ile Thr Arg Lys Val Lys Gly Gly Leu Ile Val 140 145 150 GAT Ile Gly Met Glu Ala Phe Leu Pro Gly Ser Gln Ile Asp Asn Lys 715 Asp ATT GGA ATG GAA GCC TTC CTA CCT GGA TCA CAA ATT GAC AAC AAG 155 160 165 Lys ATC AAA AAT TTA GAT GAT TAT GTC GGA AAA GTT TGT GAA TTC AAA 763 AAA Ile Lys Asn Leu Asp Asp Tyr Val Gly Lys Val Cys Glu Phe Lys 170 175 180 ATT TTA AAA ATT AAC GTT GAA CGT CGC AAT ATT GTT GTC TCA AGA AGA 811 Ile Leu Lys Ile Asn Val Glu Arg Arg Asn Ile Val Val Ser Arg Arg 185 190 195 GAA CTC TTA GAA GCT GAG AGA ATC TCT AAG AAA GCC GAA CTT ATT GAA 859 Glu Leu Leu Glu Ala Glu Arg Ile Ser Lys Lys Ala Glu Leu Ile Glu 200 205 210 215 CAA ATT TCT ATC GGA GAA TAC CGC AAA GGA GTT GTT AAA AAC ATT ACT 907 Gln Ile Ser Ile Gly Glu Tyr Arg Lys Gly Val Val Lys Asn Ile Thr 220 225 230 GAC TTT GGT GTA TTC TTA GAT CTC GAT GGT ATT GAC GGT CTT CTC CAC 955 Asp Phe Gly Val Phe Leu Asp Leu Asp Gly Ile Asp Gly Leu Leu His 235 240 245 ATT ACC GAT ATG ACC TGG AAG CGC ATA CGA CAT CCT TCC GAA ATG GTC 1003 Ile Thr Asp Met Thr Trp Lys Arg Ile Arg His Pro Ser Glu Met Val 250 255 260 GAA TTG AAT CAA GAG TTG GAA GTA ATT ATT TTA AGC GTA GAT AAA GAA 1051 Glu Leu Asn Gln Glu Leu Glu Val Ile Ile Leu Ser Val Asp Lys Glu 265 270 275 AAA GGA CGA GTT GCT CTA GGT CTC AAA CAA AAA GAG CAT AAT CCT TGG 1099 Lys Gly Arg Val Ala Leu Gly Leu Lys Gln Lys Glu His Asn Pro Trp 280 285 290 295 GAA GAT ATT GAG AAG AAA TAC CCT CCT GGA AAA CGA GTT CTT GGT AAA 1147 Glu Asp Ile Glu Lys Lys Tyr Pro Pro Gly Lys Arg Val Leu Gly Lys 300 305 310 ATT GTG AAG CTT CTC CCC TAC GGA GCT TTC ATT GAA ATT GAA GAG GGC 1195 Ile Val Lys Leu Leu Pro Tyr Gly Ala Phe Ile Glu Ile Glu Glu Gly 315 320 325 ATT GAA GGT CTA ATT CAC ATT TCT GAA ATG TCT TGG GTG AAA AAT ATT 1243 Ile Glu Gly Leu Ile His Ile Ser Glu Met Ser Trp Val Lys Asn Ile 330 335 340 GTA GAT CCT AGT GAA GTC GTA AAT AAA GGC GAT GAA GTT GAA GCC ATT 1291 Val Asp Pro Ser Glu Val Val Asn Lys Gly Asp Glu Val Glu Ala Ile 345 350 355 GTT CTA TCT ATT CAG AAG GAC GAA GGA AAA ATT TCT CTA GGA TTA AAG 1339 Val Leu Ser Ile Gln Lys Asp Glu Gly Lys Ile Ser Leu Gly Leu Lys 360 365 370 375 CAA ACA GAA CGT AAT CCT TGG GAC AAT ATC GAA GAA AAA TAT CCT ATA 1387 Gln Thr Glu Arg Asn Pro Trp Asp Asn Ile Glu Glu Lys Tyr Pro Ile 380 385 390 GGT CTC CAT GTC AAT GCT GAA ATC AAG AAC TTA ACC AAT TAC GGT GCT 1435 Gly Leu His Val Asn Ala Glu Ile Lys Asn Leu Thr Asn Tyr Gly Ala 395 400 405 TTC GTT GAA TTA GAA CCA GGA ATT GAG GGT CTG ATT CAT ATT TCT GAC 1483 Phe Val Glu Leu Glu Pro Gly Ile Glu Gly Leu Ile His Ile Ser Asp 410 415 420 ATG AGT TGG ATT AAA AAA GTC TCT CAC CCT TCA GAA CTA TTC AAA AAA 1531 Met Ser Trp Ile Lys Lys Val Ser His Pro Ser Glu Leu Phe Lys Lys 425 430 435 GGA AAT TCT GTA GAG GCT GTT ATT TTA TCA GTA GAC AAA GAA AGT AAA 1579 Gly Asn Ser Val Glu Ala Val Ile Leu Ser Val Asp Lys Glu Ser Lys 440 445 450 455 AAA ATT ACT TTA GGA GTT AAG CAA TTA AGT TCT AAT CCT TGG AAT GAA 1627 Lys Ile Thr Leu Gly Val Lys Gln Leu Ser Ser Asn Pro Trp Asn Glu 460 465 470 ATT GAA GCT ATG TTC CCT GCT GGC ACA GTA ATT TCA GGA GTT GTG ACT 1675 Ile Glu Ala Met Phe Pro Ala Gly Thr Val Ile Ser Gly Val Val Thr 475 480 485 AAA ATC ACT GCA TTT GGA GCC TTT GTT GAG CTA CAA AAC GGG ATT GAA 1723 Lys Ile Thr Ala Phe Gly Ala Phe Val Glu Leu Gln Asn Gly Ile Glu 490 495 500 GGA TTG ATT CAC GTT TCA GAA CTT TCT GAC AAG CCC TTT GCA AAA ATT 1771 Gly Leu Ile His Val Ser Glu Leu Ser Asp Lys Pro Phe Ala Lys Ile 505 510 515 GAA GAT ATT ATC TCC ATT GGA GAA AAT GTT TCT GCA AAA GTA ATT AAG 1919 Glu Asp Ile Ile Ser Ile Gly Glu Asn Val Ser Ala Lys Val Ile Lys 520 525 530 535 CTA GAT CCA GAT CAT AAA AAA GTT TCT CTT TCT GTA AAA GAA TAC TTA 1867 Leu Asp Pro Asp His Lys Lys Val Ser Leu Ser Val Lys Glu Tyr Leu 540 545 550 GCT GAC AAT GCT TAT GAT CAA GAC TCT AGG ACT GAA TTA GAT TTC AAG 1915 Ala Asp Asn Ala Tyr Asp Gln Asp Ser Arg Thr Glu Leu Asp Phe Lys 555 560 565 GAT TCT CAA GGC GAA GGG GTT CGA ATT CCG CCG ATA CTG 1954 Asp Ser Gln Gly Glu Gly Val Arg Ile Pro Pro Ile Leu 570 575 580
【0057】配列番号:6 配列の長さ:1048 配列の型:核酸 鎖の数:二本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:Genomic DNA 起源 生物名:C. ニューモニエ 株名:YK-41 直接の起源 クローン:53-3S 配列の特徴 特徴を表す記号:CDS 存在位置:236..1012 特徴を決定した方法:P 配列 TCAGTATCGG CGGAATTCGA ACCCCTTCGC GGCTCTTTCT GGAACTCTAG AATCTTTACA 60 TCTCGAAGAG TTAACTCAAG GATTATTCCC TTCTGCCCAA GAAGATGCCA ACTTCGCAAA 120 GGAGTTATCT TCAGTAGTAC ACGGATTAAA AAACCTAACC ACTGTAGTTA ATAAACAAAT 180 GGTTAAAGGC GCTGAGTAAA GCCCTTTGCA GAATCAAACC CCTTAGGATA CAAAC ATG 238 Met 1 TCT ATT TCA TCT TCT TCA GGA CCT GAC AAT CAA AAA AAT ATC ATG TCT 286 Ser Ile Ser Ser Ser Ser Gly Pro Asp Asn Gln Lys Asn Ile Met Ser 5 10 15 CAA GTT CTG ACA TCG ACA CCC CAG GGC GTG CCC CAA CAA GAT AAG CTG 334 Gln Val Leu Thr Ser Thr Pro Gln Gly Val Pro Gln Gln Asp Lys Leu 20 25 30 TCT GGC AAC GAA ACG AAG CAA ATA CAG CAA ACA CGT CAG GGT AAA AAC 382 Ser Gly Asn Glu Thr Lys Gln Ile Gln Gln Thr Arg Gln Gly Lys Asn 35 40 45 ACT GAG ATG GAA AGC GAT GCC ACT ATT GCT GGT GCT TCT GGA AAA GAC 430 Thr Glu Met Glu Ser Asp Ala Thr Ile Ala Gly Ala Ser Gly Lys Asp 50 55 60 65 AAA ACT TCC TCG ACT ACA AAA ACA GAA ACA GCT CCA CAA CAG GGA GTT 478 Lys Thr Ser Ser Thr Thr Lys Thr Glu Thr Ala Pro Gln Gln Gly Val 70 75 80 GCT GCT GGG AAA GAA TCC TCA GAA AGT CAA AAG GCA GGT GCT GAT ACT 526 Ala Ala Gly Lys Glu Ser Ser Glu Ser Gln Lys Ala Gly Ala Asp Thr 85 90 95 GGA GTA TCA GGA GCG GCT GCT ACT ACA GCA TCA AAT ACT GCA ACA AAA 574 Gly Val Ser Gly Ala Ala Ala Thr Thr Ala Ser Asn Thr Ala Thr Lys 100 105 110 ATT GCT ATG CAG ACC TCT ATT GAA GAG GCG AGC AAA AGT ATG GAG TCT 622 Ile Ala Met Gln Thr Ser Ile Glu Glu Ala Ser Lys Ser Met Glu Ser 115 120 125 ACC TTA GAG TCA CTT CAA AGC CTC AGT GCC GCG CAA ATG AAA GAA GTC 670 Thr Leu Glu Ser Leu Gln Ser Leu Ser Ala Ala Gln Met Lys Glu Val 130 135 140 145 GAA GCG GTT GTT GTT GCT GCC CTC TCA GGG AAA AGT TCG GGT TCC GCA 718 Glu Ala Val Val Val Ala Ala Leu Ser Gly Lys Ser Ser Gly Ser Ala 150 155 160 AAA TTG GAA ACA CCT GAG CTC CCC AAG CCC GGG GTG ACA CCA AGA TCA 766 Lys Leu Glu Thr Pro Glu Leu Pro Lys Pro Gly Val Thr Pro Arg Ser 165 170 175 GAG GTT ATC GAA ATC GGA CTC GCG CTT GCT AAA GCA ATT CAG ACA TTG 814 Glu Val Ile Glu Ile Gly Leu Ala Leu Ala Lys Ala Ile Gln Thr Leu 180 185 190 GGA GAA GCC ACA AAA TCT GCC TTA TCT AAC TAT GCA AGT ACA CAA GCA 862 Gly Glu Ala Thr Lys Ser Ala Leu Ser Asn Tyr Ala Ser Thr Gln Ala 195 200 205 CAA GCA GAC CAA ACA AAT AAA CTA GGT CTA GAA AAG CAA GCG ATA AAA 910 Gln Ala Asp Gln Thr Asn Lys Leu Gly Leu Glu Lys Gln Ala Ile Lys 210 215 220 225 ATC GAT AAA GAA CGA GAA GAA TAC CAA GAG ATG AAG GCT GCC GAA CAG 958 Ile Asp Lys Glu Arg Glu Glu Tyr Gln Glu Met Lys Ala Ala Glu Gln 230 235 240 AAG TCT AAA GAT CTC GAA GGA ACA ATG GAT ACT GTC AAT ACT GTG ATG 1006 Lys Ser Lys Asp Leu Glu Gly Thr Met Asp Thr Val Asn Thr Val Met 245 250 255 ATC GCG AAGGGGTTCG AATTCCAGCT GAGCGCCGGT CGCTAC 1048 Ile Ala 259
─────────────────────────────────────────────────────
【手続補正書】
【書類名】 受託番号変更届
【提出日】 平成7年7 月20日
【旧寄託機関の名称】 工業技術院生命工学工業技術研
究所
【旧受託番号】 FERM P−13688
【新寄託機関の名称】 工業技術院生命工学工業技術研
究所
【新受託番号】 FERM BP−5154
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.6 識別記号 庁内整理番号 FI 技術表示箇所 C12N 15/09 ZNA C12P 21/02 C C12P 21/02 9162−4B C12N 15/00 ZNAA (C12P 21/02 C12R 1:19)

Claims (15)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 配列番号1のポリペプチドの中の連続し
    た少なくとも5個のアミノ酸配列を含むポリペプチドC
    を抗原として用いることを特徴とする、抗クラミジア・
    ニューモニエ抗体の検出・測定方法。
  2. 【請求項2】 ポリペプチドCが配列番号1のポリペプ
    チドからアミノ酸1〜250個が欠落しているポリペプ
    チドである、請求項1記載の検出・測定方法。
  3. 【請求項3】 ポリペプチドCが、配列番号1のポリペ
    プチドの中のアミノ酸1〜100個が他のアミノ酸で置
    換されているポリペプチドである、請求項1記載の検出
    ・測定方法。
  4. 【請求項4】 ポリペプチドCが、配列番号1のポリペ
    プチドの中の連続した少なくとも5個のアミノ酸配列に
    アミノ酸若しくは2〜1000個のアミノ酸配列が結合
    したポリペプチドである、請求項1記載の検出・測定方
    法。
  5. 【請求項5】 ポリペプチドCが配列番号1のアミノ酸
    配列からなるポリペプチドである、請求項1記載の検出
    ・測定方法。
  6. 【請求項6】 配列番号1のポリペプチドの中の連続し
    た少なくとも5個のアミノ酸配列を含むポリペプチドC
    を抗原として含有してなる、抗クラミジア・ニューモニ
    エ抗体の検出・測定用試薬。
  7. 【請求項7】 ポリペプチドCが配列番号1のポリペプ
    チドからアミノ酸1〜250個が欠落しているポリペプ
    チドである、請求項6記載の検出・測定用試薬。
  8. 【請求項8】 ポリペプチドCが、配列番号1のポリペ
    プチドの中のアミノ酸1〜100個が他のアミノ酸で置
    換されているポリペプチドである、請求項6記載の検出
    ・測定用試薬。
  9. 【請求項9】 ポリペプチドCが、配列番号1のポリペ
    プチドの中の連続した少なくとも5個のアミノ酸配列に
    アミノ酸若しくは2〜1000個のアミノ酸配列が結合
    したポリペプチドである、請求項6記載の検出・測定用
    試薬。
  10. 【請求項10】 ポリペプチドCが配列番号1のアミノ
    酸配列からなるポリペプチドである、請求項6記載の検
    出・測定用試薬。
  11. 【請求項11】 配列番号1のポリペプチドの中の連続
    した少なくとも5個のアミノ酸配列を含むポリペプチド
    Cを有効成分とする、クラミジア・ニューモニエ感染の
    診断薬。
  12. 【請求項12】 ポリペプチドCが配列番号1のポリペ
    プチドからアミノ酸1〜250個が欠落しているポリペ
    プチドである、請求項11記載の診断薬。
  13. 【請求項13】 ポリペプチドCが、配列番号1のポリ
    ペプチドの中のアミノ酸1〜100個が他のアミノ酸で
    置換されているポリペプチドである、請求項11記載の
    診断薬。
  14. 【請求項14】 ポリペプチドCが、配列番号1のポリ
    ペプチドの中の連続した少なくとも5個のアミノ酸配列
    にアミノ酸若しくは2〜1000個のアミノ酸配列が結
    合したポリペプチドである、請求項11記載の診断薬。
  15. 【請求項15】 ポリペプチドCが配列番号1のアミノ
    酸配列からなるポリペプチドである、請求項11記載の
    診断薬。
JP10601495A 1995-04-28 1995-04-28 抗クラミジア・ニューモニエ抗体の検出・測定方法及びその試薬、並びにクラミジア・ニューモニエ感染の診断薬 Expired - Lifetime JP3578233B2 (ja)

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WO2013008743A1 (ja) * 2011-07-11 2013-01-17 富士レビオ株式会社 クラミジアニューモニエ抗原及びその利用

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