JPH06503718A - メチロトローフ酵母細胞におけるヒトリゾチムの産生とその効率的な分泌 - Google Patents

メチロトローフ酵母細胞におけるヒトリゾチムの産生とその効率的な分泌

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JPH06503718A JP3517836A JP51783691A JPH06503718A JP H06503718 A JPH06503718 A JP H06503718A JP 3517836 A JP3517836 A JP 3517836A JP 51783691 A JP51783691 A JP 51783691A JP H06503718 A JPH06503718 A JP H06503718A
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スティルマン,キャシー・アン
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ヴェドヴィック,トーマス・スコット
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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるため要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 15、請求項4記載のDNA断片で形質転換されたメチロトローフ酵母細胞。 16、請求項9記載のDNA断片で形質転換されたメチロトローフ酵母細胞。 17、請求項7記載のDNA断片で形質転換されたピキアパストリス細胞。 18、上記細胞力G+ABZ106S7、G+AH2108S20. G+AH 2109S25、まりltG+MH2109s25カら選択されたものである、 請求項17記載のピキアパストリス細胞。 19、請求項13記載の生育可能なメチロトローフ酵母細胞の培養物。 20、請求項17記載の生育可能なピキアパストリス細胞の培養物。 21、請求項18記載の可視ピキアバストリス細胞の培養物。 22、上記細胞中での上記発現カセットの発現、および培地中への上記HLZ産 物の分泌を許容する条件下で、請求項13記載の細胞を生育することからなる、 ヒトリゾチーム(HLZ)の生産方法。 23、上記メチロトローフ酵母がピキアバストリスの株である、請求項22記載 の方法。 24、上記細胞が炭素源としてメタノールを含む培地中で培養される、請求項2 2記載の方法。 25、上記細胞がMut”表現型を有する、請求項22記載の方法。 26、上記細胞がMut−表現型を有する、請求項22記載の方法。 27、以下の工程: (a)陽イオン交換樹脂を、樹脂1グラム当り、請求項22記載の方法で得られ た約10−20ミリリツトルの範囲の発酵培養物と接触させ;(b)生じるHL Zをロードした樹脂を、内在性ピキアパストリスのタンパク質の溶出を引き起こ すのに適したpHと伝導性を有する、充分量の溶媒により洗浄し:そして (C)正しくプロセシングをうけたHLZを溶媒の勾配によって選択的に溶出す る ことからなる、ヒトリゾチームと、そのN末端伸長相同物の混合物を精製する方 法。 、 28、イオン交換クロマトグラフィーにより組換え生産されたヒトリゾチームを 精製する方法において、請求項22記載の方法により得られた発酵培養物を、樹 脂1グラム当り10−20ミリリツトルの発酵培養物の範囲で、陽イオン交換樹 脂に直接ロードすること、生じるHLZをロードされた樹脂を内在性ピキアパス トリスのタンパク質の溶出を引き起こすのに適したpHと伝導性を有する、充分 量の溶媒により洗浄すること:そしてその後に正しくプロセシングを受けたHL Zを溶媒の勾配により選択的に溶出すること、を含む改良法。 明細書 メチロトローフ酵母細胞におけるヒトリゾチムの産生とその効率的な分泌産業上 の利用分野 本発明はヒトリゾチーム(HLZ)ペプチドを、ピキアバストリス(Pichi apastoris)等のメチロトローフ酵母内で産生ずるための組換えDNA 技術法に関する。本発明はさらに、それらの産生および、同様物を含む培養物に 用いられた、メチロトローフ酵母形質転換体、DNA断片および、発現ベクター に関する。 従来の技術 リゾチームは基本的な酵素で、細菌細胞を溶解することが出来る性質のため、直 接的な抗細菌作用を示し、さらに、多形核白血球及び大食細胞の食作用に対して 刺激的に働くことが可能なため、間接的な抗細菌作用を示す(ジョレスら(Jo lles et al、)、 Mol、 and Ce1l、 Biocheo +、 63: 165 (1984)) o リゾチームは植■A 細菌およびファージと同様、ヒト、その他のを推動物および無を推動物の多くの 組織や分泌系に存在している。細菌感染に対して生物体を保護するための基本的 な機能を行なうにあたって、1.4−β−N−アセチルムラミダーゼとしても知 られるリゾチームは、細菌のペプチドグリカン(細菌細胞壁の構成成分である短 い交差したペプチドに付着しているアミノ糖のポリサッカライド)中の、N−ア セチルムラミン酸のC−1とN−アセチルグルコサミンのC−4の間のグリコシ ディック結合を切断する。グラム陰性細菌は単または2層のペプチドグリカンを 含む細胞壁を有しており、一方、ダラム陽性菌は非常に複雑な多層のペプチドグ リカンを含む細胞壁を有している。上述の切断の結果、すべてこのような細菌は 溶解され、その結果死滅する。キチン中の1,4−β−N−アセチル−グルコサ ミン結合の無差別の加水分解に対応するより顕著な、あるいはより弱いキチナー ゼ活性を示し、その結果キチンでおおわれた多数の病原体から生物体を保護する 、更なる能力を持つことになったリゾチームもいくつか存在する。リゾチームの わずかなエステラーゼ活性もまた、報告されている。 細菌を溶菌する活性を持つため、リゾチームは単独で、そしてその他の組成物、 例えば、ラクトトランスフェリン(鉄をキレートすることによっである種の細菌 の生育を阻害する)、補体、抗体、ビタミン、その他の酵素及び様々な抗生物質 (例えばテトラサイクリンおよびパンドラシン)と組み合わせて、抗細菌剤とし て、食物(例えばチーズ、ソーセージ、および海産物)保存剤として、チーズの 発酵剤として、そしてその他の様々な応用に利用されている。リゾチームはまた 、多様な抗原に対する抗体の産生を間接的に刺激する能力を持っているため、そ のような酵素はまた、感染に対する抵抗性を強めるためにも利用され得る。 ”チキン(chicken)”を表わすC−タイプのリゾチームは、成熟した、 分泌型の状態で129−130アミノ酸を含んでいる。これら129−130ア ミノ酸のうち40は、その他の種においても不変であることが知られている。酵 素の触媒活性を担っており、リゾチーム活性に必要不可欠な、リゾチーム分子の 数個のカルボキシル基の内の二つ(チキン卵白リゾチームアミノ酸配列のGlu −35およびAsp−52に対応する)は、全てのC−タイプリゾチーム中で類 似した位置に存在している。基質結合相互作用に関与している3番目のカルボキ シル基(チキン卵白リゾチーム中のAsp−101に対応する)は、はとんどの C−タイプリゾチーム中に存在する。8個の半一システィン残基は、全てのC− タイプリゾチームにおいて不変である。システィン間で形成されたジスルフィド 結合は、酵素の2次及び3次構造を形成し、保つために重要な役割を果たしてい る。3次元構造および、mRNA5の翻訳に際した、これらの構造を形成するた めのフォールディングの過程は、全てのリゾチームCにおいて非常に類似してい ると考えられている。以下の供給源から得られた成熟リゾチームCに対する完全 な1次構造は知られている: (1)めんどり、うずら、七面鳥、ホロホロチョ ウ、アヒル、キジ、チャチャラ力およびチキン卵白; (2)ヒト乳および尿;  (3)ガ; (4)ヒト、ネズミ、およびウシ胃;および(5)T2およびT 4ファージ。成熟ヒト乳リゾチームCをコードするDNA配列もまた知られてい る。欧州特許出願第0181634号、第0208472号および第02223 66号参照。 リゾチームの多くの利用を考えると、ヒトリゾチーム(HLZ)−発現組換え生 物体の発酵に起因するような、HLZの迅速な供給は、医学及び生物技術分野に おいて大きな価値を与えることになるであろう。 天然資源から単離することは技術的に困難で、費用がかかり、時間を消費するた め、近年は、HLZを産生ずるための効率的な組換え技術の開発に力が注がれて いる。 外来タンパク質の組換え産生に広く用いられている宿主の内で、おそら(E、  c。 11およびサッカロミセスセルビシエ(ペイカーの酵母)は最もよく理解されて いる。しかしながら、E、 coliはHLZの様なジスルフィド結合を持った タンバグ質を還元型で産生ずる傾向にあり、その状態では外来細菌性蛋白分解酵 素の存在下でしばしば不安定で、凝集して活性を失った複合体を形成する傾向に ある。例えば、ムラキら(Muraki et al、) 、 in Agri c、 Biol、 Chew、、 49: 2829−2831 (1X8 5)参照。この問題を解決するための試みとして、例えば、細胞培養液から迅速 に回収し得るような可溶性HLZを産生ずるために、適切なリーダー配列を用い ることが行なわれるが、これはしばしばその他の不便な結果をもたらす。とりわ け、産物の精製の過程には、望むタンパク質の大部分が細胞ペーストと一体化し てしまう可能性がある。 シグナル配列によって培養液中に分泌させることによる外来性タンパク質の産生 は、様々なアスペルギルス種、サッカロミセスセルビシエ、および様々なタイプ の哺乳類細胞を含む多くの生命体用に、記述されている。これらの種では、天然 の(すなわち、属特異的な)および哺乳類シグナル配列が、ある種の外来性タン パク質を培養液中に分泌させるために、記述されている。しかしながらこれらの 宿主系は、それぞれ、様々な不利な点をもっている。 例えばアスペルギルス種は培養液中に多量の外来性タンパク質を分泌し、したが って、望むタンパク質産物を精製するための操作が、顕著に複雑になり、経費が 増大する。サツ力ロミセスセルビシエからの分泌による外来性タンパク質産生の 効率は、少な(とも分泌され得るタンパク質に関して、なんらかの限度があるよ うである。哺乳類細胞宿主に付随した主な不利な点は、そのような宿主系を維持 し、大規模にそのような宿主を培養することが困難であり、莫大な費用がかかる 点である。 酵母は外来性のタンパク質の産生に関しては細菌よりも明らかに有利な点かある が、それは、培養液中に外来性タンパク質を分泌する能力があることを含んでい る。細胞からのタンパク質の分泌は一般に細胞質内のタンパク質を産生ずること よりも優れている。分泌された産物は最初の純度を高度に保ったまま得られる: そしてさらに分泌された産物の精製は、細胞破片の非存在下でより容易に行なわ れる。スルフィドリルに富んだタンパク質の場合は、そのようなタンパク質を培 養液中に分泌することが可能な真核細胞宿主の開発のための、その他の強制的な 理由がある。それらの正しい3次元構造はジスルフィド結合を通じて生み出され 、保持されている。それは、細胞の分泌経路および細胞外培地は、酸化を促進す る環境にあり、ジスルフィド結合の形成を支えることが可能であるからである( スミスら、(Smith、 et al、) 5cience、 229.12 19 (1985)) ニ一方これと対照的に、細胞質は還元を促進する環境に あり、ジスルフィド結合は形成され得ない。 細胞の崩壊に際して、ジスルフィド結合があまりにも急速に形成されると、ラン ダムなジスルフィド結合の形成が起こり得る。その結果、HLZのような、適切 に形成されたジスルフィド結合を含む、スルフィドリルに富んだタンパク質の産 生は分泌経路を通じて行なわれることが、おそら(最適であろう。 ヒトリゾチームを酵母、サツ力ロミセスセルビシエ内で組換え産生することに関 した出版物は数多く出ている。例えば欧州特許出願第255,233号はヒトリ ゾチームをコードするDNA断片の5°端にメントリ卵白リゾチームのシグナル ペプチドが結合した、DNA配列によって形質転換された細胞を培養することに よる、ヒトリゾチームの産生を記述している。この構築物によって形質転換され たサツ力ロミセスセルビシエの培養によっては、1リツトル当りわずかに数ミリ グラムのヒトリゾチームが産生され、産生されたHLZの約半分が培地中に分泌 される。 欧州特許出願第251.730号は同様に、ヒトリゾチームの分泌による産生に 関してメントリ卵白リゾチームのものよりも優れていると言われている合成シグ ナルペプチドを用いた、ヒトリゾチームの産生を記述している。しかしながらた った約5ミリグラム/リツトルの分泌されたHLZの産生が、記述されている全 てである。 酵母サツ力ロミセスセルビシエによるHLZの分泌による産生を開示した参考文 献は以下のものを含んでいる:スズキら(Suzuki et al、 ) 、  14th Int、 Conf。 on Yeast Genetics and Mo1ecular Biol ogy、 p、 E34 (1988;野生型親株と比較して、HLZを過分泌 する酵母突然変異株で、チキンリゾチームシグナル配列と成熟ヒトリゾチームの 一部をコードしたDNA断片を用いたものを記述している);ジガミら(Jig ami et al、 ) 、 Gene 43:273−279 (1986 ;サッ力ロミセスセルビシエ内でHLZを合成して分泌することを目的に、合成 チキンリゾチームシグナル配列と合成HLZ遺伝子を含んだプラスミドを用いる ことを記述している);ナガホラら(Nagahora et at、) 、F EBS Letters、 238: 329−332 (1988:付随した 天然のチキンリゾチームシグナル配列の切断部位を変化させることによる、ヒト リゾチームの分泌への効果を記述している);タニャマら(Taniyama  et al、 ) 、 Biochemical and Biophysic al Re5earch Coma+unications、@152: 96 2−96 7 (1988;サッ力ロミセスセルビシエ内のヒトリゾチームのフォールディ ングと分泌に於て、ジスルフィド結合の果たす役割を検討している):ヨシムラ ら(Yoshimura et al、 ) 、 Biochemical a nd biophysical Re5earch Communica狽奄盾 獅刀A 145 : 712−718 (1987;サッ力ロミセスセルビシエによって分泌産生 されたHLZとバチルスサブチルスによって分泌産生されたHLZの間の違いを 比較している);ヤマモトら(Yamamoto et al、 ) 、 Bi ochea+1cal and Biophysical Re5earc■@ C。 mll1unications、 149: 431−436 (1987;チ キンリゾチームの設計された形のシグナル配列を用いたサツ力ロミセスセルビシ エによるHLZの分泌を記述している);ヨシムラら(Yoshimura e t al、 ) 、 Biochemical and Biophysica l Re5earc■@C ommunications、 150: 794−801 (1988:ヒト 胎盤ライブラリーからのヒトリゾチーム(ヒトリゾチームのシグナル配列を含む )をコードしているcDNAの単離を記述している。サツ力ロミセスセルビシエ 内でのこのcDNAからの数ミリグラム/リットルのHLZの発現と分泌もまた 記述されている);カスタノンら(Castanon et al、) 、 G ene、 66: 223−234 (1988;ヒト組轍球細胞系統およびヒ ト胎盤のcDNAライブラリーからのヒトリゾチームをコードするcDNAクロ ーンの単離を開示している。サツ力ロミセスセルビシエ内でのヒトリゾチームの 発現および分泌(約15ミリグラム/リツトルまで)が、す・ソカロミセスセル ビシエの^DHI遺伝子のプロモーターおよびアルファーファクターのペプチド リーダー配列の制御下にクローン化されたcDNAをお(ことによって、達成さ れている):ハヤカワら(Hayakawa et al、) 、 Gene、  56: 53−59 (1987:不溶性かつ生物学的に活性のない状態のヒ トリゾチームで、生物学的に活性のある状態にするためには可溶化と酸化による 再生が必要であるものの産生を報告している);および欧州特許出願第208. 432号(サツ力ロミセスセルビシエによるヒトリゾチームの非−分泌による産 生を記述している)。 HLZの組換え産生を扱ったその他の刊行物は以下のものを含む:日本出願第2 027989号(1/30/90; 優先権JP 88177754(7/15 /88);住友化学工業(株) (Sumitomo CheIl、 Ind、  KK)に譲渡);日本出願第2005879号(1/10/90.優先権JP  88151106 (6/21/88);大田化学工業(株) (Taked a Chemical Ind、 KK)に譲渡);日本出願第1074989 号(3/20/89 :優先権 JP 872298752 (9/16/87 ):大田化学工業(株) (Takeda Chemical Ind、 KK )に譲渡):日本出願第83052882号(3/7/88 :優先権JP 8 6196226(8/21/86);住友化学工業(株) (Sumitomo  Chew、 Ind、KK)に譲渡);日本出願第83052881号(3/ 7/88 ;優先権JP 86195885 (8/20/86);住友化学工 業(株)に譲渡):日本出願第83052876号(3/7/88.優先権JP  86195886 (8/20/86);住友化学工業(株)に譲渡);日本 出願第62166884号(7/23/87;優先権JP 865092 (1 /16/86):大田化学工業(株)に譲渡);および日本出願第610783 87号(4/21/86.優先権JP 84201367 (9/26/84) ;科学技術庁および住友化学(株)に譲渡)。 外来性の宿主内で発現され分泌されたポリペプチドの中には、しかしながら、天 然に存在している対応物と比較して、生物学的活性が全く見られなかったり、減 少していたりするものもある。この減少した生物学的活性は、活性を減少させる 分解または切断なしにはポリペプチドが宿主系の分泌機構を通過すること力くで きないことや、分泌過程に於て正しいフォールディングやジスルフィド結合を形 成することができないことを含む、多(の因子の結果である可能性がある。 自律性プラスミドに基づいたサン力ロミセスセルビシエのような酵母の系で外来 性のタンパク質の産生規模を拡大する場合、および報告されている組換え技術を 用いてなされた仕事に於て達成されたヒトリゾチームの低い発現レベルとしばし ば直面する問題と同様に、上述した問題の観点から、現在利用可能な組換え系を 用いてHLZの産生をさらに追求しようとする動機は技術的に供給されない。 サツ力ロミセスセルビシエにおいて組換え遺伝子産物の発現に付随した主な問題 (例えば高い細胞密度で操作された培養物中での、プラスミド保持のための選択 の欠失および、プラスミド分布コピー数及び安定性に関する問題)を克服するた めに、例えばピキアパストリスのようなメチロトローフ酵母に基づいた酵母発現 系が開発されてきた。 例えばピキアパストリスのようなメチロトローフ酵母は、連続的な工業的規模の 発酵過程にすぐに対応でき、それによって酵母は定められた安価な発酵培地中で 高い細胞密度で生育する。ピキアパストリスを用いると例えば産生水準は、通常 、振盪フラスコ培養から、大規模な発酵培養に拡大する。安価で、発熱物質、毒 素の供給源となる可能性のある、定められていない成分を含まない単純培地は、 そのような酵母に対して用いられ得る。さらに酸化的リン酸化といった、酵母の 多くの重大な機能は細胞内小器官内で行なわれるため、そのような機能は、原核 宿主細胞中にある場合のように宿主細胞に対して異質なポリペプチドを産生ずる ことで起こり得る有害な効果を直接的に受けることはない。しかも、酵母は真核 細胞生物で、その細胞内環境は原核細胞生物の場合と比べて、真核細胞タンパク 質の正しいフォールディングに、よりふされしい傾向にある。さらに、酵母の培 養は、とりわけピキアパストリスの場合、その他の多くの宿主に比べて容易であ る。メタノール依存的な生育をするピキアパストリス培養物の汚染は、その他の タイプの宿主の培養に比べて容易に防ぐことが可能であり、それによって外来性 ポリペプチド産生の信頼性と安全性を増加させている。 メチロトローフ酵母に基づいた発現系の鍵となる特色は、外来性遺伝子発現を行 なうために用いられたプロモーターである。メチロトローフ酵母のメタノール応 答性遺伝子から得られたこのプロモーターは、しばしば高発現し、厳密に制御さ れる(例えば合衆国特許No、 4.855.231参照)。メチロトローフ酵 母に基づいた発現系のその他の鍵となる特色は、発現カセットが宿主であるメチ ロトローフ酵母のゲノムに組み込まれる能力を持ち、従ってベクターを失う機会 を大幅に減少させたところである。メチロトローフ酵母であるピキアパストリス は、選択された外来性タンパク質、例えばH8表面抗原(フレラグら(Creg g et al、)、 Bio/Technology 5.479 (198 7)) 、リゾチーム(国際公開89103907参照、5/18/89刊行: ソーク研究所生物技術/工業連合に譲渡:天然のりゾチームシグナル配列によっ て促進されたウシリゾチームの分泌を記述している)およびインベルターゼ(デ ィガンら(Digan et at、 )、 Developments in  Industrial Microbiology 29.T9 (19 88):チョ、ブら(Tschopp et al、 )、 Bjo/Tech nology 5.1305 (1987))の産生に用いられ成功してきた。 ピキア内でその他の外来性遺伝子産物を産生ずる努力は、とりわけ分泌による場 合、混合した結果が得られている。メチオドローフ酵母発現系の現時点での理解 のレベルでは、そのような酵母内で評価できる水準まで与えられた遺伝子が発現 され得るか、あるいは、そのような酵母は、細胞内に組換え遺伝子産物を存在さ せておくことを許容するかどうかは予測不能である。さらに、特定のタンパク質 がメチロトローフ宿主酵母によって分泌されるか、そして、分泌されるならどの くらいの効率であるのかを予測することは非常に難しい。ピキアパストリスより もさらに研究が進んでいる、非メチロトローフ酵母であるサツ力ロミセスセルビ シエに関しても、タンパク質分泌の機構はきちんと明らかにされ、理解されてい るわけではない。 発明の概要 本発明に従って、我々は生物学的に活性のあるヒトリゾチーム(HLZ)分子の 産生のための改良された発現系を開発した。本発明は、メチロトローフ酵母内で の分泌されたHLZペプチドの産生のための効力にある方法を提供する。さらに 、本発明はHLZ産生効率を失うことなしに、振盪フラスコ培養から、大規模な 発酵培養へ容易に規模を拡大することができる。そのうえ、形質転換株の小規模 な培養に比べて、形質転換株の大規模な培養のための発酵培養条件を大幅に変化 させる必要もなく、すぐに本発明の規模を上げることが可能である。 我々は、驚くべきことにHLZペプチドが、非常に効率的に、例えばピキアバス トリス内等のメチロトローフ酵母内で産生され、分泌され得ることを見(\だし た。これはメチロトローフ酵母を、少なくとも1コピーのHLZペプチドを実用 可能なようにコードした第−DNA配列(ここでは当該第−DNA配列が、す・ ソカロミセスセルビシエのα−接合因子(AMF)プレープロ配列(タンノくり 質加水分解部位:リジンーアルギニンを含む)と実用可能な状態に連結されてお り、当該DNA配列の両方がメチロトローフ酵母遺伝子のメタノール応答性プロ モーター領域の制御下にある)によって形質転換するか、望ましくは酵母ゲノム 中に挿入することによって実施される。これらのDNA配列を少なくとも1コピ ーゲノム内に保持しているメチロトローフ酵母細胞は、生物学的に活性のあるH LZペプチドを効率的に産生じ、培地中に分泌する。 本発明は上述した状況と、それらを実施するための全ての付随した方法と手段を 目的とする。例えば、本発明は宿主メチロトローフ酵母細胞の適切な生育、発酵 およびHLZ遺伝子産物の単離と精製に必要な技術を含んでLzる。 図面の簡単な説明 図1は実施例で用いられたヒトリゾチーム遺伝子の核酸配列を提供する。 図2はプラスミドpAO815の制限酵素地図である。 図3はプラスミドpi(LZ103の制限酵素地図である。 図4はプラスミドpHLZ105の制限酵素地図である。 図5はプラスミドpAH2106の制限酵素地図である。 図6はプラスミドpAH2108の制限酵素地図である。 図7はプラスミドpMH2109の制限酵素地図である。 発明の詳細な説明 本発明に従えば、以下に示すDNA配列を、転写の読み枠方向(こ沿って含む第 一の発現カセットを少なくとも1コピー含むDNA断片が供給される:(i)メ チロトローフ酵母のメタノール応答性遺伝子のプロモーター領域(ii)以下の ものからなるポリペプチドをコードしたDNA配列:(a)タンパク質加水分解 切断部位:リジンーアルギニンを含む、サツ力ロミセスセルビンエのへMFブレ ープロ配列及び(b)ヒI・リゾチーム(HLZ)ペプチドをコードするDNA 配列:および(iii)メチオドローフ酵母中で機能する転写終結因子;及び選 択として、以下に示すDNA配列を、転写の読み棒方向に沿って含む、第2の発 現カセットを少な(とも1コピーさらに含む:(i′)メチロトローフ酵母のメ タノール応答性遺伝子のプロモーター領域(ii’ )以下のものからなるポリ ペプチドをコードしたDNA配列;(ao)天然のヒトリゾチームシグナル配列 ペプチド及び(b′)ヒトリゾチームペプチドをコードするDNA配列:および (iii’)メチオドローフ酵母中で機能する転写終結因子;、m;では当該プ ロモーター領域及び当該転写終結因子は、同じあるいは異なった遺伝子から、そ れぞれ独立に選択される;そして、ここでは当該DNA配列は当該ポリペプチド をコードする配列の転写のためにお互いに機能的に連結されている。 本発明に従フたDNA断片は、当該DNA断片を標的遺伝子の位!へ組み込ませ ることを促進するために、標的遺伝子と充分なホモロジーをもったDNA配列に はさまれた直鎖状断片の状態で、メチロトローフ酵母細胞を形質転換し得る。 この場合、標的遺伝子の部位へ付加するか、もしくは!換することによって挿入 できる。そのかわりに、DNA断片は、挿入を促進するために直鎖状化されるこ ともある、環状プラスミドの一部として存在し、宿主とプラスミド配列の間のホ そロジーのある部位における付加によって挿入される。 本発明のその他の態様にしたがって、上述したDNA断片を少なくとも1コピー 含む発現ベクターが供給される。 本発明の別の観点に従って、上述のDNA断片をゲノム中に少なくとも1コピー 含んだ新しいメチロトローフ酵母細胞が供給される。 本発明のさらに別の態様に従って、ゲノムに少なくとも1コピーのDNA配列( HLZペプチドを実用可能な状態にコードし、サッカロミセスセルビシェのAM Fブレープロ分泌シグナル配列(リジン−アルギニンタンパク質加水分解切断部 位を含む)をコードするDNAを実用可能な状態に連結しており、そして、さら に選択としては、天然HLZ分泌シグナルをコードするDNA配列と実用可能な 状態に連結されたH L Zペプチドをコードするが、その場合、翻訳領域配列 とシグナル配列の両方が、メチロトローフ酵母のメタノール応答性遺伝子のプロ モーター領域の制御下にあり、当該形質転換体内で、当該DNAの発現と培地中 へのHLZペプチドの分泌を許容する条件下にある)を含むメチロトローフ酵母 形質転換体を生育させることによる、HLZペプチドの産生の方法を供給してい る。HLZペプチドを産生ずることが可能な、生育可能なメチロトローフ酵母細 胞の培養も本発明の範囲内である。 本発明に従って産生されたポリペプチド産物は、驚くべき高濃度で培地中に分泌 される。 AMFブレープロ分泌シグナル配列のみによって調節されるHLZペ プチドの分泌のレベルは、分泌が天然のりゾチームシグナル配列のみによって調 節されている株から得られるものの10倍以上である。本発明の発現系の特有の 性質に加えて、本発明の実施によって得られる素晴らしい結果は、サッカロミセ スセルビシエのα−接合因子前駆プロ分泌シグナル配列(単独で用いられる場合 、あるいは天然ヒトリゾチーム分泌シグナル配列と組み合わせて用いられる場合 )がメチロトローフ酵母内でのHLZペプチドの分泌のために予想外によく機能 する、という事実にもよる。 ”ヒトリゾチーム”あるいは”HLZペプチド”あるいは単に” HLZ“とい う語は、本発明および特許請求の範囲で用いられている場合、認可された生物学 的分析に於て、天然ヒトリゾチームと類似し、同種の生物学的活性を示し、そし て天然HLZと実質的に同じアミノ酸配列を有するポリペプチド産物を意味する 。 天然に存在するHLZについて文献で報告されているアミノ酸配列中の、1つか またはそれ以上のアミノ酸が異なるポリペプチド、または、さらにアミノ酸を余 分に含んでいるポリペプチドまたは、天然HLZのアミノ酸配列のアミノ酸がそ の他のアミノ酸に置換されているポリペプチドは、それらがHLZの機能的活性 、例えば、細胞の溶解能、多形核白血球および大食細胞の食作用の刺激の誘導能 、を示す限りにおいては、本発明の範囲に含まれる。本発明はHLZの対立遺伝 子変異株の全てを包合することを意図している。さらに、これまでに言及したよ うに、天然に存在する産物のアミノ酸配列を単純に修飾することによって、例え ば、部位特異的変異導入またはその他の標準的な手法によって、得られた派生物 は、本発明の範囲に含まれる。宿主細胞のタンパク質加水分解によって産生され 、成熟した、天然に存在するHLZと類似した生物学的活性を示すHLZの形態 も本発明に包合される。 本明細書中で言及された様々なアミノ酸配列中で見られたアミノ酸は、技術速決 って用いられる、通常の3文字および1文字略語を有する。すなわち・アミノ酸  略語 L−アラニン Ala ^ L−アルギニン Arg R L−アスパラギン Asn N L−アスパラギン酸 Asp D L−ンステイン Cys C L−グルタミン Gin Q L−グルタミン酸 Glu E L−グリシン Gly G L−ヒスチジン His H L−メチオニン Met M L−フェニルアラニン Phe F L−バリン Val V 本発明に従って、ゲノム中に少な(とも1コピーの、サッヵロミセスセルビン工 のα−接合因子(AMF)プレープロ分泌シグナル配列(タンパク質加水分解部 位を含む:リジンーアルギニン)を含むDNAと実用可能な状態に連結されたH I−Zペプチドを実用可能な状態でコードするDNA配列を持ち、さらに選択と して、メチロトローフ酵母のメタノール応答遺伝子のプロモーター領域の制御下 にあるヒトリゾチーム分泌シグナルをコードするDNAと実用可能な状態に連結 されたHLZペプチドをコードしているDNA配列を有する、メチロトローフ酵 母によって、HLZペプチドは産生される。 ここで用いられている”実用可能な状態にHLZペプチドをコードするDNA配 列”は、HLZまたは上記で定義されたその他のいかなる”HLZペプチド”を コードするDNA配列をも含む。HLZをコードするDNA配列は技術的に知ら れている。それらは化学的合成によって、あるいは、HLZに対応する伝達RN A (mRNA)を相補DNA (cDNA)に転写し、生じたcDNAを2本 鎖cDNAに転換することにより得られる。HLZの遺伝子の化学的合成は、例 えば、ムラリーら(Muralli et al、) 、 Agric、 Bi ol、 Chew、 50: 713−723(1986)に開示されている: また、イケハラら(Ikehara et al、) 、 Chew、 Pha rm、 Bull、、 34: 2202 (1986)を参照せよ。必要なり NA配列は、例えばHLZを含む既知のベクターの制御限酵素消化により取り除 くことも可能である。そのようなベクターとその調製法の例は、本開示の”従来 の技術”の項に示されている。本発明に従って用いられる、現在好ましいHLZ 遺伝子の構造は、図1に図解され、実施例でさらに説明される。 本発明の実施に際し、使用を意図された酵母の種は、メチロトローフ、すなわち (他の炭素源の場合と同様に)メタノール炭素源栄養条件で生育できる種類であ る。メタノールを利用するために必要な生物学的経路を持つ種は、4つの属に分 類される、すなわち、カンジダ、ハンセヌラ、ピキア、およびトルロプシスであ る。これらのうちで、ハンセヌラポルモルファ種およびピキアパストリス種の一 員の分子生物学については充分知られている。 本発明の実施に用いられる、現在好ましい酵母は、ピキアパストリスで、唯一の 炭素源およびエネルギー源としてメタノールを有効に利用することのできる、既 知の工業用酵母株である。 メチロトローフ酵母には、多くのメタノール応答性遺伝子があり、それぞれの発 現は、メタノール応答性調節領域(プロモーターとも呼ばれている)により制御 される。そのようなメタノール応答性プロモーターの如何なるものでも、本発明 を実施する際に用いることが適切である。特定の調節領域の例は、ピキアパスト リス由来の1次アルコール酸化酵素遺伝子(AOXI)のプロモーター、ピキア パストリス由来の2次アルコール酸化酵素遺伝子(AOX2)のプロモーター、 ピキアパストリス由来のジヒドロキシアセトン合成酵素遺伝子(DAS)のプロ モーター、ピキアパストリス由来のP40遺伝子のプロモーター、ピキアパスト リス由来のカタラーゼ遺伝子のプロモーター、及びその類似物を含む。 HLZ遺伝子発現を促すために用いられた、現在好ましいプロモーター領域は、 ピキアパストリスのメタノール調節を受けたアルコール酸化酵素遺伝子由来のも のである。ピキアパストリスは、2つの機能的なアルコール酸化酵素遺伝子を含 むことが知られている:アルコール酸化酵素1 (AOXI)およびアルコール 酸化酵素II (AOX2)遺伝子である。2つのAOX遺伝子のコード部分は 、DNA及び推定されるアミノ酸配列のレベルの両方で、非常に類似しており、 共通の制限酵素切断部位を有する。この2つの遺伝子から発現されたタンパク質 は、類似の酵素特性を有するが、AOXI遺伝子のプロモーターはより効率的で 、より多(発現される;従って、その利用はHLZの発現に好ましい。そのプロ モーターを含むAOX1遺伝子は単離され、完全に性質が調べられている:エリ スら(Ellis et al、) 、 Mo1. Ce11. Biol、  5.1111 (1985)および合衆国特許第4.855.231号参照。 メチロトローフ酵母細胞を形質転換するときに用いるDNA断片は、メチロトロ ーフ酵母遺伝子のメタノール応答性プロモーター及びHLZをコードするDNA 配列(HLZ遺伝子)に加えて、読み枠にあった形で、サツ力ロミセスセルビシ エへ肝ブレープロ分泌シグナル配列(プロセシング部位:リジン−アルギニンを コードするDNA配列(リジン−アルギニン コード配列とも呼ばれる)を含む )をコードするDNA配列及び、メチロトローフ酵母内に於て機能する転写終結 因子を含む、少なくとも1コピーの第一の発現カセットを含んでいる。メチロト ローフ酵母細胞を形質転換するために用いられたDNA断片は、選択として、さ らにメチロトローフ酵母遺伝子のメタノール応答性プロモーター遺伝子及びHL ZをコードするDNAに加えて、天然HLZの分泌シグナル配列を読み枠に沿っ てコードする配列をも含む、第2の発現カセットを少な(とも1コピー含む。 サツ力ロミセスセルビシエのα−接合因子は、13残基からなるペプチドで、” α“接合型の細胞から分泌され、反対の“a′接合型の細胞に対して作用し、2 つの細胞型の間の効率のよい接合を促進し、それによって”a−α“2倍体細胞 の形成を促進する[トーネルら(Thorner et al、) 、 The  1lolecular Biologythe Yeast Sacchar omyces、 Co1d Spring Harbor Laborator y、 Co1d Sp窒奄獅■@Harb or、 NY、 143 (1981)] 、 AMFブレープロ配列は、AM F前駆体分子中ニ含t’tL、?、!J −グー配列で、タンパク質加水分解プ ロセシング及び分泌に必要なりジン−アルギニン コード配列を含んでいる(例 えば、ブレイクら(Brake et al、 ) 、 Proc。 Natl、^cad、Sci、 USA、 vol、 81.4642 (19 84) 参照)。本発明の実施に用いられたAMFブレープロ配列は、ここに参 考文献として本明細書の一部をなす国際公開89103907中で記載された、 プラスミドp^0208から得られた255塩基対の断片である。 本発明に用いられたメチロトローフ酵母中で機能する転写終結因子は、(a)転 写産物中のポリアデニル化シグナル及びポリアデニル化部位をコードする相補断 片、および/または、(b)発現カセットで用いられたプロモーターからの転写 終結因子を提供する断片、の何れかを有する。ここで用いられ、そして、本明細 書および請求の範囲を通じて用いられている、”発現カセット”という語は、発 現および分泌過程の両方に機能を持つ配列を含むDNA配列を示す。完全な転写 終結因子は、プロモーターの供給源である遺伝子と同じか、または別の、タンパ ク質をコードする遺伝子由来のものである。 本発明の実施のために、多コピーの上記発現カセットが、頭から尾の向きに1つ のDNA断片上に含まれていることが望ましい。 本発明に従ったDNA断片は、選択としてさらに、選択できるマーカー遺伝子を 含む。この目的のために、メチオドローフ酵母中で機能する如何なる選択マーカ ー遺伝子も使用され得る、すなわち、メチロトローフ酵母細胞に対して、それら が同定され、その他の形質転換されない大多数の細胞の中で選択的に生育するこ とを可能にするような表現型を与える、いかなる遺伝子も使用され得る。適切な 選択マーカー遺伝子は、例えば、栄養要求性変異ピキアパストリス宿主株および 宿主の変異を相補する野生型生合成遺伝子から成る選択マーカーシステムを含む 。l’(is4−ピキアパストリス株の形質転換には、例えば、サツ力ロミセス セルビシエまたはピキアパストリスのHIS4遺伝子を、あるいは、Arg4− 変異株の形質転換にはサツ力ロミセスセルビシェのARG4遺伝子またはピキア パストリスのARG4遺伝子が用いられ得る。 宿主酵母が、ピキアバストリス遺伝子のプロモーター領域の制御下にあるHLZ 遺伝子と、プロセシングおよび分泌に必要なシグナル配列を含む直鎖状DNA断 片により形質転換される場合、DNA断片は宿主ゲノム中に挿入されるが、それ は、1段階遺伝子買換[例えば、ロースシュタイン(Rothstein) 、  Methods Enzymol、 101.202 (1983);フレラ グら(Cregg et al、 ) 、 Bio/Technology 5 .S 79 (1987);および合衆国特許第4.882.279号コあるいは2段 階遺伝子置換法[シェーレルとディビス(Scherer and Davis ) 、 Proc、 Natl、 Acad、 Sci、 ll5A、 76、 4951 (1979)]のような、技術的に知られた遺伝子置換技術の何れか により成される。直鎖状DNA断片は、望む位置、すなわち、破壊される標的遺 伝子に向かうが、遺伝子破壊は、そこにDNA断片が挿入されるための、標的遺 伝子との充分なホモロジーを持ったDNA配列を両側に連結することにより行な われる。導入されるDNAが標的遺伝子の断片部位と、 0.2kbはどの小さ いホモロジーを持つ場合には、1段階遺伝子破壊は通常成功する;しかしながら 、効率よ(行なうためにはホモロン−の度合を最大にすることが望ましい。 本発明に従ったDNA断片が、例えば環状プラスミド等の発現ベクター中に含ま れていたり、発現ベクターそのものである場合には、1つまたはそれ以上のコピ ー数のプラスミドは遺伝子を破壊する代わりにゲノムに付加することによって、 同じあるいは池の部位に挿入される場合がある。適切な内部切断制限酵素により プラスミドを直鎖状化することは挿入を促進する。 ここで用いられている”発現ベクター”という語は、ここに含まれるDNA配列 (その発現に影響を与えることのできる他の配列、すなわちプロモーター配列と 、実施可能な状態に連結されている)を発現することのできるベクターを含むこ とが意図されている。一般に、組換えDNA技術で一般に用いられている発現ベ クターは、しばしば”プラスミド”の形状にある、すなわち、環状2本鎖DNA ループであり、ベクターの形態としては染色体と結合していない。本明細書では “ベクター“と”プラスミド“の語は、相互変換可能なものとして用いられてい る。 本発明のDNA断片中では、単数または複数の発現カセット断片は互いに″実施 可能なように連結”されていると言われている。HLZペプチドをコードするD NA配列は、プロモーター、プロセシング及び分泌シグナルをコードするDNA 配列、すなわちサッカロミセスセルビシエのAMFプレプロ配列(AMFプロセ シング部位:リジン−アルギニンをコードするDNA配列を含む)または天然H LZ分泌シグナル配列、及び転写終結因子に関して、機能を持つように配置され 、方向付けられている。従って、断片をコードするポリペプチドは、プロモータ ー領域の制御のもとに転写され、翻訳にあたって望むポリペプチドを提供するこ とができるような転写産物を生じる。シグナル配列が存在するため、発現された HLZ産物は、分泌された存在物として培地中に見いだされる。発現カセットの 様々な部分の適切な読み枠の配置と方向付けは、通常の熟練した技術を持つ者の 知識の範囲内である;更なる詳細は実施例に与えられている。 本発明によって供給されるDNA断片は、その複製を細菌、とりわけ大腸菌(E 、 coli)内での選択を可能にする配列を含むことができる。この方法で、 大量のDNA断片が細菌内の複製により産生されつる。 例えばピキアパストリス等のメチロトローフ酵母を形質転換する方法は、遺伝子 中に外来タンパク質をコードするゲノムを含むメチロトローフ酵母を培養する場 合に適用可能な方法と同様、技術的に一般に知られている。 本発明に従って、発現カセットは、クレグら(Cregg et aL) 、  Mol、 Ce11.、 Biol、 5.3376 (+985)および合衆 国特許第4.879.231号により記載されたスフェロプラスト技法または、 ピキアバストリス等のメチロトローフ酵母への適合に必要な修飾[合衆国特許第 4.929.555号参照]を伴った、細胞全体酢酸リチウム酵母形質転換系[ イトウら(Ito et al、)、 Agric、 Biol、 Chew、  48.341 (1984)]によりメチロトローフ酵母細胞を形質転換しつ る。本発明のためには、スフェロプラスト法の方が望ましい。 有望な形質転換体は、DNA挿入位置に関してはサザンプロット分析[マニアテ イスら(Maniatis et al、) 、 Mo1ecular Clo ning: A Laboratory Manual、 C盾Pd Sp ring Harbor Laboratory Press、 Co1d S pring Harbor、 New York、 USA@(1982)] ;メタノール応答性HLZ遺伝子発現に関してはノーザンプロット分析[マニア ティス、Op、 Cit、; R,S、ツィトメルとB、 D、ホール(R,S 、 Zitomer and B、 D、 Hall)。 J、 Biol、 Chell、 251.6320 (1976)] ;およ び成長培地中における分泌されたHLZペプチドの存在についての産物解析を行 なうことによって、性質を特徴付ける。 望む表現型および遺伝子型を持つ形質転換された株は、発酵器中で培養される。 メチロトローフ酵母中での組換えDNAに基づいた産物の大規模な産生のために は、三段階、高細胞密度、培地バッチ発酵系が通常用いられている好ましい発酵 法である。最初に、すなわち成長段階には、発現宿主は過剰の非誘導性炭素源( 例えばグリセロール)を伴う、定義された最小培地中で培養される。そのような 炭素源で生育された場合は、外来性遺伝子の発現は完全に抑えられ、外来性タン パク賃発現が欠落した状態で細胞の体積が増大する。次に、非誘導性炭素源制限 条件下での短時間の生育が行なわれる。制限条件下での生育期間に続き、メタノ ールのみ(ここで“メタノール培地バッチ方式0と呼ばれる)あるいは限定され た量の非誘導炭素源にメタノールを加えたもの(ここでは”混合培地バッチ方式 ”と呼ばれる)が発酵器に加えられ、メタノール応答性プロモーターによるHL Z遺伝子の発現が誘導される。この3番目の段階は、いわゆる産生段階である。 “培養物”という語は、細胞の生育に影響力のある培地中での細胞の増殖を意味 している。”副培養物”という語は、その他の培養物(源培養物)の細胞をもと にして生育した細胞の培養物、あるいは、興味のある副培養物と源培養物の間で 行なわれた複数の副培養物の数を考慮しない、源培養物のいかなる副培養物をも 意味している。 本発明の好ましい態様に従えば、HLZ産生産生性来性タンパク質発現系は、ピ キアパストリスのメタノール制御を受けたAOXI遺伝子(これは、非常に効率 よく発現され、厳密に制御されている)から得られたプロモーターを利用する。 この遺伝子は、転写終結因子の供給源になり得る。現在好ましい発現カセットは 、実施可能なように互いに連結された、ピキアバストリスのAOXIプロモータ ー、サッカロミセスセルビシエのAMFプレープロ配列をコードするD N A  (AMFプロセシング部位:リジン−アルギニンを含む)、成熟HLZをコー ドするDNA配列およびピキアパストリスAOXI遺伝子から得られた転写終結 因子を含む。2つまたはそれ以上のこのような発現カセットが、1つのDNA断 片上に、頭から尾の方向に含まれており、単独の連続したDNA断片上の複合的 な発現カセットを形成することが望ましい。現在好ましい複合的な発現カセット により形質転換される宿主細胞は、形質転換するDNA断片上に存在するマーカ ー遺伝子により相補され得る少なくとも1つの変異を持つピキアバストリス細胞 である。B154” (GS115)またはArg−(GS190)栄養要求性 ピキアバストリス変異株を用いることが望ましい。 一つまたはそれ以上の発現カセットを含む断片は、宿主の変異を相補するマーカ ー遺伝子を含むプラスミド中へ挿入される。pBR322に基づいたプラスミド 、例えばpAO815が望ましい。1つまたはそれ以上のコピー数の、AMFに 基づいたHLZ発現発現7カ泌カセツトプラスミド(7)pAO815中に挿入 することにより、プラスミドpAH2106及びpAlIZ108が生じる;一 方、1コピーのAMFに基づいた発現カセットを挿入することによりプラスミド pMllI2109が生じる。 ピキアパストリスのMut−発現株(Mutはメタノール利用の表現型を表わす )を開発するために、発現カセットを含む形質転換用DNAは、1段階遺伝子置 換技術により宿主ゲノム中へ挿入されていることが望ましい。発現ベクターは、 両側の相同性配列により^OX1部位と相同性を持つ両端のある直鎖状DNAを 生じさせるために適切な酵素で切断される。この方法は高レベルの発現を達成す るために発現カセットが多コピープラスミド上に存在しなければならないような 、サツ力ロミセスセルビシエの遭遇する問題を避けている。遺伝子置換の結果M ut−株が得られる。Mut〜株内では、AOXI遺伝子は発現力セントを置換 されているため、株に備わったメタノール利用能は減少している。メタノール依 存性の遅い成長速度は^OX2遺伝子産物の発現により保持されている。部位特 異的組換えによりAOX1部位中へ発現力セントが挿入された形質転換体は、相 補遺伝子の存在に関して、最初にスクリーニングすることにより同定される。こ れは、細胞を相補する遺伝子産物を欠く培地中で生育させ、相補する遺伝子を発 現する性質のために生育可能となった細胞を同定することにより行なわれること が望ましい。次に、選択された細胞は、メタノールの存在下で培養し、その生育 速度を測定することによりMut表現型を確認するスクリーニングを行い、それ により選択される。 Mut”HL Z−発現株を開発するために、1つまたはそれ以上の発現カセッ トを含む断片は、発現カセットを含む直鎖状化されたプラスミドにより宿主を形 質転換することにより宿主ゲノム中に挿入されることが望ましい。挿入は、形質 転換用ベクター上に存在する1つまたはそれ以上の配列とホモロジーを持つ、1 つまたはそれ以上の部位を付加することにより生じる。 陽性の形質転換体は、DNA挿入部位に関してはサザン分析で、HLZ遺伝子の メタノール応答性に関してはノザン分析で;培地中の分泌されたHLZペプチド の存在に関しては産物分析により、特性を決定される。望む部位に発現カセット を1つか、多コピーで挿入されたメチロトローフ酵母細胞は、サザンブロ・ソト 分析で同定され得る。HLZの発現が促進されている株はノザンまたは産物分析 で同定され得る;しかしながらこの特性は、振盪フラスコ実験では常に検出が容 易という訳ではない。望む遺伝子型及び表現型を持つと同定されたメチロトロー フ酵母形質転換体は発酵器中で培養される。上述した3段階産生過程の使用が現 在好ましい。培地中へ分泌されるHLZのレベルは、標準HLZと比較した、培 地のウェスタンプロット分析を、抗HLZ血清を用いて;放射性免疫分析(RI A)により;酵素阻害活性により:あるいは培地の適切な前処理後のHPLCに より決定され得る。 ヒトリゾチームはイオン交換カラムにより、見かけ上均−に精製される。典型的 に用いられる精製方法は以下の段階を含む。最初に、培養器培養物は超濾過され 、濾液は陽イオン交換カラムに直接ロードされる。ロードされたカラムは、増加 するpHと様々な伝導性の一連の緩衝液で順次洗われる(内在性ビキアノくスト リスタンパク質を除(ため)。最後にHLZ産物は、高伝導性緩衝液により溶出 され、透析され、そして凍結乾燥される。 HLZのAMFに基づいた分泌は、正しく切断されたヒトリゾチームのみならず 、少なくとも2つの正しくなく切断された形のりゾチーム産物を産生ずるため、 AMFに基づいた、分泌されたHLZの切断された形のものから本来のHLZを 分離することができなければならない。このことは、上記精製方法にいくつかの 修飾を加えることによりすぐに達成され得ることが知られている。最初に、超濾 過の段階は省(ことができ、細胞培養物は直接陽イオン交換カラムにロードする ことが可能である。このこと単独でも、精製されたHLZを調製するために必要 なプロセシングにかかる時間に関して、実質的な時間の節約となっている。 陽イオン交換材(たとえばスルフオブロピルセルロース、スルフオニチルセルロ −ス シメチルセファデックス及びその同様物)の分離度を上げるため憂こ、発酵培養 物に対するイオン交換材の比率は、通常用いられる樹脂の量と比較して、少なく とも2倍にする。従って、イオン交換樹脂1グラム当り、約10から20ミリリ ・ソトルの範囲のレベルの発酵培地をロードすることが行なわれる。内在性のピ キア、<ストリスのタンパク質の溶出に効果的なptlと伝導性を持つ、充分な 量の溶媒で完全に洗浄した後、正しくな(切断された形から本来のヒトリゾチー ムを分離するための溶媒の勾配によって、正しく切断されたHLZが選択的に溶 出される。完全な洗浄は典型的には段階をもうけて行なわれ、そこでは、(1) (イオン交換樹脂に対して)1−2倍の体積の約15−25mMhaの範囲の伝 導性で発酵培養物のpnより高いpH(例えば約3. 5−5. 5の範囲)を 持つ緩衝剤、引き続(1て(2)2−4倍の体積の、最初の洗浄よりも低い伝導 性(例えば約10−1511IMhosの範囲)で最初の洗浄よりも高い0口( 例えば約5.5−7.0の範囲)の緩衝剤で行なわれる。 洗浄された陽イオン交換樹脂からの本来のHLZの選択的な溶出に用いられた勾 配は、(用いられたイオン交換樹脂の体積と比較して)少なくとも6倍の、約7 .7から8.2までの範囲のpHを持つ緩衝剤を含む:そこでは伝導性が約5− 25mMhosから始ま1八最終的な伝導性が約40−6040−6Oの範囲に なるような1次関数的な勾配が用いられる。 本発明は、以下の、制限されない実施例により非常に詳細に記載されることにな る。 実施例 P、パストリス(P、 pastoris)は、本明細書中ではメチル栄養性酵 母宿主を利用するモデル系として記述される。利用可能な他のメチル栄養性酵母 は、カンジダ(Candida)、ハンセヌラ(Hansenula)、ピキア (Pichia)及びトルロプシス(Torulopsis)と呼ばれる4つの 属から選択できる。これらの属の同種は、メタノールを唯一の炭素栄養源として 生育及び利用可能であるという性質が示されており、主としてこの性質を持つた め、本明細書中の宿主として用いることができると予想される。例として、グレ ッソン(Glesson)ら、Yeast 4.1(198g)を参照せよ。 実施例1:ヒトリゾチーム発現ベクターの構築本出願に開示されている発現ベク ターの構築は、例えば、マニアナイスら、上記、及びデーヴイス(Davis) ら、Ba5ic Methods in Mo1ecular Biology 、 Elsevier 5cience Publishing、 Inc、、 ニューヨークo9g6)に記載されているような標準的方法を用いて行った。 a、天然ヒトリゾチームシグナル配列:pHLZ103、pHLZ105プラス ミドpHL100 (国際特許89103907記載、ヒトリゾチームのほぼ全 長cDN^クローンをPstI部位に挿入したpUC8ベクター)を用いて大腸 菌株MC1061を形質転換した。このcDNAクローンの配列(第1図参照) は、シグナル配列の最初の4アミノ酸をコードするコドンを欠失していた。形質 転換体を、BamHI−HindIII制限酵素で消化したDNAを調べ、内部 にPstr部位を含む約570bpの挿入があるかどうかによりスクリーンした 。予想された制限パターンのコロニーを用いてプラスミドDNAを調製した。5 70bp断片をmp18のI(indIII−3O1丁部位にクローン化し、プ ラスミドpHLZ1.01を作製した。 部位特異的変異導入法(シラー(Zoller)及びスミス(Smith)、M eth、 Enzya+o1.。 100:468(1983))を用いて翻訳終了コドンの直後にEcoRI部位 を挿入した。変異導入用オリゴヌクレオチドは以下の配列であった。 5’ −GCCAGT GCCAAG CTT GAA TTCTTA CAC TCCACA ACC変異導入したクローンの塩基配列を決定してEcoRI部 位が望ましく付加されていることを確認し、その後そのクローンを用いて二回目 の部位特異的変異導入を行ってN末端の4アミノ酸を戻し、さらに翻訳開始コド ンの直前にEcoRI部位を挿入した。変異導入用オリゴヌクレオチドは以下の 配列であった:5°−AAG CCCCAG AACAAT GAG AGCC TT CAT GAA TTCGTCGACTCT AGA GGA完全に変異 導入したプラスミドをpHLZ102と名付けた。 二回目の変異導入を塩基配列決定により確認した後、リゾチーム遺伝子をEco R工断片(500ng)として単離し、ピキアバストリス ベクターp^080 4及びp^08I5 (25−50ng)の唯一のEcoRI部位に各々挿入し た。p^0804の構築を実施例8で記載する。 プラスミドpA0815とp^0804では一つの制限酵素部位、BamHIが 異なっている(pA0804のHindIII/C1aI/HaeIII部位を BamHI部位に変化させてプラスミドpAO815を提供する)。pAO81 5の制限酵素地図を第2図に示す。ライゲーション混合液でMCl061細胞を 形質転換し、a m p Rコロニーを選択した。正しいプラスミドはPstI で消化すると2100及び6180bpのサイズのバンドを示した。結果として 生じた発現ベクター、I)EILZ103 (親プラスミドpA0804由来) 及びptLZ105 (親プラスミドp^0815由来)はそれぞれ、ヒトリゾ チーム遺伝子を、ピキアバストリスのAOXIプロモーター及び調節領域並びに AOX1転写終結コドンとポリA付加シグナルの制御下に含む。さらに、ベクタ ーは、HlS−宿主における選択に用いるためにピキアバストリスHIS4遺伝 子、及び宿主また染色体に直接挿入するための追加3′AOX1配列を含む。こ れらのプラスミドを第3図と第4図にそれぞれ示す。 plTLZ103中のリゾチーム遺伝子全長、及びプロモーターと終結領域の各 約20−25塩基の配列を決定し、クローニングの際変化が起きていないことを 確認した。 b サンカロミセスセレビシエ(S、 cerevisiae)アルファー接合 Σ子(mating factor)のシグナル配列 1 単一コピーベクターpAHz106αM F (mating facto r)プレープロ配列は、分泌系路を通じてそれに融合したペプチドを運ぶ機能を 持つ89アミノ酸から成る。αMFブレープロ領域は3箇所のプロセシング部位 、lys−arg及び(glu−ala) 2に続(83アミノ酸のシグナル配 列を含むが、これらの部位は2種の特異的なプロテアーゼによる蛋白分解反応を 受ける。αMFプレープロ配列とペプチド配列の結合部位において融合タンパク 質が分泌系路に局在するプロテアーゼにより切断されるとペプチドは細胞外に放 出される。 リゾチーム遺伝子と天然(native)シグナル配列DNAを、pflLZ1 02 (実施例1参照)から5aII−HindIII断片として単離した。次 に、この5aII−HindIII断片(1400ng)を1113ベクター( 100ng)に挿入したが、該ベクターは、3箇所のプロセシング部位を含むα MFプレープロ領域をコードするpAO208由来の275bpのEcoRI− HindIII断片をEcoRI−SmaI部位に含む。プラスミドpAO20 8については実施例6で記載する。ライゲーション産物でJM103細胞を形質 転換し、プラークから抽出したDNAを解析した。正しいプラスミドは、Hin dIII−SalIで消化すると450と7500bpサイズのバンドを示した 。結果として生じたプラスミド(pHLZ104)に部位特異的変異導入を行っ て、M13ポリリンカー、(glu−ala) 2プロセッシング部位をコード するヌクレオチド及び天然シグナル配列をコードするDNAを欠失させ、それに より83アミノ酸ブレープロ領域及びlys−argプロセッシング部位をコー ドする配列を直接成熟ヒトリゾチームの最初のコドンに融合した。この変異導入 を行うのに用いたオリゴヌクレオチドは以下の配列であった:5’ −GTA  TCT TTG GAT AA^^GA AAG GTCTTT GAA AG G TGT変異導入をDNAシークエンシングによって確認した後、lys−a rgブロッセッノング部位で終結するαMFブレープロ領域、及び成熟ヒトリゾ チーム遺伝子をコードするDNA配列から成る融合遺伝子をEcoRI断片(5 00ng)として分離し、EcoRIif4化したピキアバストリス ベクター pAO815(50ng)に挿入した。ライゲーションでMc1061細胞を形 質転換し、amp″コロニーを選択した。正しいプラスミドはPstIで消化す ると1825.530及び6130bpのサイズのバンドを示した。結果として 生じた単一コピー発現ベクター1)AH2106(第5図)は、αMFプレープ ローヒトリゾチーム融合遺伝子1コピーを、ピキアバストリスのAOX1プロモ ーター及び調節領域並びにAOX1転写終結コドン及びポリA付加シグナルの転 写制御下に含む。さらに、ベクターはHis−宿主における選択に用いるための ピキアパストリスHIS4遺伝子、及び追加3’AOX1−配列を含む。 pAH2106中のαMFプレープローヒトリゾチーム融合遺伝子全長、及びプ ロモーターと終結領域の各約20塩基の配列を決定し、クローニングの際配列に 変化が起きていないことを確認した。 11.2コピーベクターpAHz108AOX]プロモーター、αMFプレープ ローヒトリゾチーム融合遺伝子、及びAOX1転写終結領域から成る発現カセッ トをpAH2106よりBglII−BamHI断片(250ng)として単離 し、pAH2106(25ng)の唯一のBamH1部位に再び挿入し直した。 ライゲーション産物でMC1061細胞を形質転換し、a m p 11コロニ ーを選択した。正しいプラスミドはBglll−BamHIで消化すると240 0.3700、及び4235bpのサイズのバンドを示した。結果として生じた ベクター、pAH2108(第6図)は、タンデムリピート単位として発現カセ ットを2コピー含んでいる。 i i i、天然及びαMFプレープロシグナル配列を含む2コピーベクター: pMz109 ベクターpMH2109は、天然シグナル配列ヒトリゾチーム発現カセット1コ ピーとαMFプレープローヒトリゾチーム発現カセットlコピーを含み、これを 第7図に示す。AOX1プロモーター、αMFプレープローヒトリゾチーム融合 遺伝子、及びAOX1転写終結領域から成る発現カセットをpAH2106より BglII−BamHI断片(250ng)として単離し、pHLZ105 ( 25ng)の唯一のBamHI部位に挿入した。 ライゲーション産物でMC1061細胞を形質転換し、a m p Rコロニー を選択した。 正しいプラスミドはBgIII−Ban+tIIで消化すると2400.350 0、及び4235bpのサイズのバンドを示した。pMH2109を制限酵素で 消化して解析し、カセットがタンデムリピート単位として結合していることを確 認した。 実施例2 ヒトリゾチーム発現P パストリス株の開発a、Mut+株 発現ベクターp1(LZ103、pHLZ105、pA11Z106、pAH2 108、及びpMH2109を用いてP。 バストリスMut”株を開発した。Mut表現型とはメタノール(!ethan ol)利用性(utilization)を指す。Mut”株は、遺伝子破壊で はな(付加することにより発現カセットを染色体に挿入した性質により、野生型 株と同様にメタノールを利用する。Mut”株は、発現ベクター全長を、AOX lあるいはHIS4遺伝子座に付加的相補組替えによって挿入して開発した。A OXI遺伝子座に単一コピーベクターを部位特異的に付加するために、単一コピ ーベクターを5acIで消化し、AOX1プロモーター領域内でベクターを直鎖 状化した。同様に、HIS4遺伝子座に特異的に付加するために、マルチコピー ベクターを5tuIで消化し、HIS4領域内でプラスミドを直鎖状化した。追 加的なアプローチとして、未消化のプラスミドを、プラスミド内に存在する5゛ あるいは3゛領域でAOXI遺伝子座にあるいはHIS遺伝子座にランダムに挿 入させた。これらの各々の付加的挿入では、AOX1遺伝子のコード領域は破壊 されなかった。 ランダムなあるいは部位特異的な発現プラスミドの付加による挿入の結果生じた Mut”形質転換体を、ヒスチジン非栄養要求性により最初にスクリーンした。 その後His+形質転換体をサザンプロットにより解析し、プラスミドの挿入部 位と挿入コピー数を確認した。このために、染色体DNAをEcoRIあるいは BglIIで消化した。EcoRI消化断片は、AOXlの5′及び3°領域、 あるいはピキアバストリスHIS4遺伝子のいずれかを含むpBR322骨格の プラスミドでプローブした。BglII消化断片はヒトリゾチーム遺伝子と相同 なオリゴヌクレオチドでプローブした。 b、Mut−株 Mut−株(野生型株よりメタノールの利用速度が遅い株)を作製するために、 プラスミドpHLZ103をBglIIで消化した。これによってAOX1プロ モーター領域、ヒトリゾチーム遺伝子、AOX1転写終結シグナル、選択用HI S4遺伝子及びAOX 13’ 領域から成る発現カセットが遊離された。この 発現力セントの両端はAOXI遺伝子座の5°及び3′端に相同な長い配列を含 む。発現力セントをAOXI遺伝子座に、AOX1構造遺伝子をBglII末端 の発現カセットに結果として置き換えるような相同的組換えにより挿入している 。陽性形質転換体をHiS千表現型により最初に選択し、その後それらのMut −表現型即ち、メタノール上での遅い生育により選択した。 pHLZ103のBglII断片を挿入した結果生じた形質転換体を、まず初め にヒスチジン非栄養要求性によりスクリーンし、その後メタノールを含むプレー ト上で生育を解析した。約30%は生育が遅く、これはAOX1遺伝子が破壊さ れていることを示した。これらMut−形質転換体の中で8個を上記のサザンプ ロットにより解析した。 C9結果 以下の代表的な株を1及び10リツトルでの発酵でのさらなる解析の為に選択し た。 実施例3・ヒトリゾチームを発現させた菌株の1リツトルおよび10リットル発 酵時における増殖 以下に述べる発酵に用いた培地組成は下記の通りである。 A、 IOX基本組成塩 化学薬品 グラム/リットル 85%リン酸 42.0ml 硫酸カルシウム2水和物 1.8 硫酸カルシウム 28.6 硫酸マグネシウム7水和物 23.4 水酸化カリウム 6.5 B、 PTMI微量塩 化学薬品 グラム/リットル 硫酸銅5水和物 6.0 ヨウ化カリウム 0.08 硫酸マンガン1水和物 3,0 モリブデン酸ナトリウム2水和物 領 2ホウ酸 0.02 塩化コバルト 0.5 塩化亜鉛 20.0 硫酸鉄7水和物 65.0 ビオチン 0・ 20 硫酸 5. Qml a、lリットル酵母:Mut”菌株 試験686 G+MH2109S25 (1コピーのヒト由来シグナル配列−ヒ トリゾチーム遺伝子と1コピーのαMFプレープローヒトリゾチーム融合遺伝子 を持つ) 試験687 G+AH2108S20 (2コピーのαMFプレープローヒトリ ゾチーム融合遺伝子を持つ) 試験688 G+AH2106S7 (1コピーのαMFプレープローヒトリゾ チーム融合遺伝子を持つ) 試験689 G+HLZ105S3 (1コピーのヒト由来シグナル配列−ヒト リゾチーム融合遺伝子を持つ) 500mlの10×基本組成塩、5%グリセロールに脱イオン水を加えて101 00Oとした培地を発酵装置に入れオートクレーブした。滅菌後、4mlのPT MI微量塩を加え、NH40111濃縮液によりpHを5.0とした。 培地のpl(を5に保つため、0.1% ストルクトルJ−673消泡剤を含む 50%Ni140Hを加えた。接種する細胞は2%グリセロールを含む緩衝化Y NBから調製した。00゜ooが1−8に達するまで培養した細胞1O−5hl を発酵装置に接種し、18−24時間にわたって培養細胞の栄養源の制御を行っ た。グリセロール消費には、可溶化した酸素量の増大により示されるとおり、グ リセロールの供給(50%グリセロール+121111/L PTMI塩)を5 −5−2O/時間で開始し最終的に200m1のグリセロールを加えた。グリセ ロールの供給を終えると、続けてメタノールの供給(100%メタノール+12 m1/L PTMI塩)を開始した。開始時の供給速度はおよそ21117時間 である。2時間後にメタノールの供給速度を30分毎に10%増加の割合で増大 させ、最終的に5−5.5ml/時間となるようにした。メタノールによる誘導 の70−100時間後に容器を回収した。以下に結果をまとめた。 試験 菌株 シグナル 発現 メタノール細胞収量 ヒトリゾチーム686 G +MH2109S25 σMF/ヒト由来 2 94 350 2852406 87 G+AH2108S20 aMF 2 94 416 680 5506 88G+AH2106S7 aMF 1 94 350 200 155689  G+HLZ105S3 ヒト由来 1 94 368 17 16表1のとお り、4種の菌株の増殖速度は同じであり、発酵により最終的に得られた細胞の湿 重量は1リツトルあたりおよそ350−420グラムであった。このような細胞 濃度は、ピキアバストリス菌株を標準的なMut”株の培養条件下で培養した時 の一般的なレベルである。1コピーまたは2コピーのαMFプレープローヒトリ ゾチーム融合遺伝子の発現カセットをもつ菌株で同一の細胞収量を得られたこと は、カセットが余分な数存在しても、細胞の増殖に阻害的な影響がないことを示 している。 1リツトルの発酵でこれらの菌株により分泌されたヒトリゾチームのレベルを酵 素活性測定(実施例5.0)とRIA (実施例5.d)により測定した。各発 酵でのヒトリゾチーム発現レベルのデータは表1に示した。G+HLZ105S 3株は1コピーのヒト由来シグナル配列−ヒトリゾチーム遺伝子を持つが、メタ ノール誘導の94時間後においても17mg凡のヒトリゾチームしか分泌しない 。1コピーのαMFプレープローヒトリゾチーム融合遺伝子の発現カセットを持 っG+AH2106S7株は(培養液の酵素活性アッセイで測定されたとおり) およそ200mgルを分泌した。 同じ発現カセット2コピーを持っG+AH2108S20株は600mg八以上 を分泌した。G+MH2109S25株は、それぞれの発現カセットを1コピー ずつ持つが、分泌するヒトリゾチームはG+^1IZ106s7株よりわずかに 多く (200+agルに対して285o+g/L) 、G+AH2108S2 0株よりもすくなかった。 b、1リツトル発酵:Mut−株 試験518 G−1(LZ103S5 (1コピーのネガティブなシグナル配列 −ヒトリゾチーム遺伝子) 接種源を選択プレートから選択し、2%グリセロールを含む緩衝済みYNB中で 30℃で一晩、OD6゜。が1−8になるまで増殖させた。−晩培養液の5−5 −5Oを2リツトル容量の発酵槽に加え、5mlのPTM、塩を含む5×塩基塩 中、30℃で抑制された増殖期が続いた。pHは50%(V/V)の水酸化アン モニウムの添加により維持し、泡立ちは5%(v/v)のストルクトール消泡剤 の添加により制御した。 溶解酸素量は必要に応じてエアレーションや振蓋を良くすることにより20%以 上に維持した。このバッチの増殖期をグリセロールが使い果たされるまで、18 −24時間続けた。初期増殖期のグリセロールが枯渇した後、50%(W/V) のグリセロール供給(12mlルのPTMI微量塩を含む)を5−5−2O/時 間の割合で開始した。 約100m1の50%グリセロールを加えた後、メタノール供給(100%+1 2m1ルのPTM1微量塩)を1 ml/時間の割合で開始した。添加速度は発 酵の間に増加され、残存メタノール濃度が0.5%未満を維持するようにした。 メタノール誘導後70−150時間してから容器を回収した。 G−HLZ103S5株のヒトリゾチームの平均収率は、細胞を含まない発酵槽 ブロースにして約1kg/L (酵素活性)であった。 0.10リツトル発酵:Mut十株 i、標準Mut+プロトコール tt験660 G+HLZ103S16試験695 G+AHz108S20 15リットル容量の発酵槽を5.5リツトルの10×ベース塩と525gのグリ セロールを含む溶液6.5リツトルと共にオートクレーブした。滅菌後、NH3 ガスでpHを5.0に調整し、30m1のPTM、微量塩を加えた。この発酵槽 に、2%グリセロールを含む緩衝済みYNBで増殖させた一晩培養液50hlを 植えた。pHはNH3ガスの添加により5.0に維持し、温度は30℃に維持し た。ストルクトールJ−673の5%溶液を、泡立ちを制御するのに必要なだけ 加えた。溶解酸素の量は、必要に応じてエアレーンヨンや振蒼を良(することに より20%飽和以上に維持した。 グリセロールが枯渇した時点(溶解酸素の量が増加することで示される)で、グ リセロール供給(50%グリセロール+121111ルのPTM、微量塩)を5 0−200111]、/時間の割合で開始し、700m1が加えられるまで続け た。このグリセロール供給のバッチ期に続イテ、メタノール供給(100%+1 2m1./LのP T M +微量塩)を7.5−5−1O/時間の割合で開始 した。この添加速度で2時間供給した後、メタノール供給を。 30分ごとに10%ずつ最終速度60m1/時間まで増加され、これは残りの発 酵時間の間維持された。 試験660において、細胞1度はメタノールで92時間後に500gルに達し、 発酵ブロース1リツトルあたり約24mgのヒトリゾチームが分泌された。試験 695では、細胞濃度はメタノールで72時間後に452gルに達し、1リツト ルあたり約57Qmgのヒトリゾチームが分泌された。これらの分泌されたリゾ チームのレベルはこれらの菌株の1リツトル発酵において達成されたものと同様 であり、菌株G+AIIIZ108S20とG+HLZ103S16が大規模発 酵においても生産性を損なうことなく増殖できることを示している。 ii メタノール供給を増加したプロトコール試験704 G+AH2108S 20 菌株G+^H2108S20 (aMF プレープロ ヒトリゾチーム融合遺伝 子カセット2つを含む)も、誘導期の間にメタノール供給を増加させる方法を用 いて行った10リットル発酵で増殖させた。試験704の最初の2つのフェイズ は、上記の標準的な条件に従って行われた。グリセロール供給パッチフェイズの 後、メタノール供給を20m]、/時間で開始した。3時間後、供給速度を15 分ごとに20%ずつ最終速度60m1/時間まで増加された。 細胞収率(最終細胞密度459g/L)はこの菌株の以前の10リットル発酵( 試験695)において達成された密度と同様であった。そして、若干低いが、ヒ トリゾチームの収率(550mg/L)も同様であった。それ故、いづれのプロ トコールもこの菌株の10リットル発酵に利用可能であると思われる。 d、10リットル発酵・ Mut−株 試験667 G−11LZ103s5 (1コピー)Mut−株G−HLZ10 3S5を標準的なMut−プロトコールに従って10リットル発酵で増殖させた 。試験667の最初の2フエイズは標準的なMut″″10リットル発酵プロト コールについて記載されたようにして行った。誘導期においては、メタノール供 給を、7.5−]、Oml/時間で導入し、2時間後に、最終速度が30011 /時間に達するまで、30分ごとに10%ずつ増加させた。このメタノール添加 速度では、発酵槽中の残留メタノールレベルは0.1から0.5%の間に維持さ れた。 標準的なMut−条件において、菌株G−HLZ103S5は最終細胞密度が4 28g湿重量ルになるまで増殖した。これは10リットル発酵で増殖させた他の Mut−組み換え株について典型的なものであった。試験667で産生されたヒ トリゾチームのヒトリゾチームのレベルは約20mgルであった。 実施例4: 分泌されたヒトリゾチームの精製a、ネイティブなシグナル配列を 用いて分泌されたヒトリゾチームの精製一般に、精製スキームは4つの基本的な ステップからなる。第1に、発酵ブロースを100.000の分子量を遮断する らせんカートリッジに通して濾過した。第2に、濾過物(ヒトリゾチームを含む )を放射状のフロースルフォプロピルカートリッジに直接かけた。第3ステツプ においては、そのカートリッジを一連の緩衝液で逐次的に洗浄し、そこでpHを 上げつつ且つ電導度を変えることで内在的なピキアバストリス(Pichia  pastoris)のタンパク質を除いた。最後に、ヒトリゾチームを高い電導 度の緩衝液を用いてカートリッジから溶出し、透析し、そして凍結乾燥した。 この操作を、3コピ一株G+HLZ103S16 (試験660 実施例3参照 )の標準的な10リツトルのMut+発酵において産生されたヒトリゾチーム( メタノールで92時間増殖させた後回収)にたいして適用した。発酵槽の内容物 を6500Xgで30分間遠心して得た細胞を含まないブロースを一20℃で凍 結保存した。この培養液を4℃で一装置き、そして精製の直前に37℃で融解し た。以下の精製ステップは全て4℃で行われた。このブロース(約5050ml )を、20psiの逆圧を生じるのに十分な速度で引き、100.000の分子 量を遮断するらせんカートリッジ(アミコンらせん限外濾過カートリッジ(^m 1con 5piral Ultrafiltration Cartridg e) 、タイプ5IY100)に通した。約4.5リツトルを濾過した後、溶液 の電導度を24.7mMha/cm” (発酵ブロースの電導度にほぼ等しい) にするのに十分なNaC1を含む50mM酢酸ナトリウム(pH5,1) 1リ ツトルをリザーバーに加え濾過した。約5.4リツトルの濾過物をカートリッジ から回収し、0.7リツトルの保持液を残した。 25hlのゼータプレツブ モジュラ−(ZetaPrep Modular) の放射状フロースルフォブロピルカートリッジ(Cuno Inc、、メリデン 、CT)を製造元の勧める方法により活性化した。らせん限外濾過カートリッジ からの濾過物をポンプで引いて5m17分の割合でスロフォブロピルカートリッ ジに直接導いた。このカートリッジを次に以下の様な一連の6つの緩衝液でpH と電導度を上げながら洗浄した: 1、電導度を24.7mMha/cm2にするのに十分なNaC1を含む50m M酢酸ナトリウム(pH5,1) 1リツトル 2.5hM酢酸ナトリウム(pH5,1,8,9mMha/cn+2) 0.5 リツトル3.5hMリン酸ナトリウム緩衝液(pH7,0,6,8mMho/c m2) 0.25!J ットル4、電導度を14.8mMho/cm”にするの に十分なtシaclを含む50mMリン酸ナトリウム(1)H7,0> 0.5 リツトル 5、50mMリン酸ナトリウム(pH7,0,6,8mMha/cm2) 0. 25リツトル6、50mMリン酸ナトリウム(pH8,0,7,311IMho /cm2) 0.5リツトル洗浄に続き、電導度を約100mMho/cm”に するのに十分なNaC1を含む50mM IJン酸ナトリウム(pH8,0)  1リツトルで、ヒトリゾチームをスルフォブロピルカートリッジから溶出した。 約30m1の画分を回収していき、その画分の吸光度を280nMで測定した。 280nMにおける吸光度を持つ物質を含むピーク画分をプールし、6000− 8000の分子量を遮断するスペクトレーバーチューブにおいて2リツトルのミ リQ純水に対して透析した。透析は2日間にわたり4時間毎に液の交換をした。 それから試料を凍らせ凍結乾燥した。 精製スキームの概要および各ステップでのヒトリゾチームの収率(RIAにより 決定)を表2に表す。始めの細胞を含まないブロース中のヒトリゾチーム10h gの約82%(89mg)が100.000の分子量を遮断するらせんカートリ ッジから回収された。この物質を次にゼータブレツブカートリッジにかけて、高 電導度の緩衝液でシングルピークとしてカートリッジから溶出した。最も高い純 度の産物を確実に得るために、ピークの主要部分からの両分のみをプールした。 この試料は約74mgのヒトリゾチームを含んでおり、始めの材料の68%が回 収された。この物質をさらに解析したところ、ヒトリゾチームが正しくプロセッ シングされ、5DS−PAGE、イムノプロット、アミノ酸分析、および/また はタンパク質の配列解析(実施例5.e−h参照)による解析により少なくとも 95%の純度であることが明らかとなった。このピークの後の方の両分もプール した。このプールのRIA分析により、これにはさらに16mg (始めの材料 の14%)のヒトリゾチームが含まれていることが示された。以上のようにして 、全体の回収率は始めの材料の約82%であり、そのリゾチームの100%をゼ ータプレツブカートリッジにがけた。 菌株G+HLZ103S16により生産されたヒトリゾチームの精製精製工程  体積 ヒトリゾチームヒトリゾチーム回収率」製】−(μg/ml) −総量( mg) □無細胞培養液発酵槽試験660 5050 21. 5 108.  6 100100、000境界分子量 らせんカートリッジ 溶出液 5400 16.5 89. 1. 82残留液 700 37.6  26.3 24濾過液 5000 0.8 4.0 3.6洗浄1゜ 50mM酢酸ナトリウム pH5,1,24mMha/cm21000 0. 2 、 02 <0.1洗 浄2: 5QmM酢酸ナトリウム pH5,1,8,9mMha/cII!2500 、 94 0. 47 0.  4洗浄3: 50mM酢酸ナトリウム pH7,0,6,8mMho/cm2250 0.01 0.002 <0.1 洗浄4゜ 50mM酢酸ナトリウム pH7,Q、 14.8mMha/cm2500 、01 0.005 <Q、  1洗浄5: 50d酢酸ナトリウム pH7,0,6,8mMha/cm2250 、 01 0.002 <0.1 洗浄4: 50mM酢酸ナトリウム pt18.0.7.3mMha/cm2500 、01 0.005 <0.1 溶出液 50mM酢酸ナトリウム pH8,0,100mMha/cI112プール1 155 476 73.8  68プール2 180 87.4 15.7 14b、パン酵母(S、 ce revisiae)のα−接合因子のシグナル配列を用いて分泌されたヒトリゾ チームの精製 AMFブレープロ分泌シグナル配列を含む株の発酵培地中に異なる型のヒトリゾ チームがいくつか存在してので、菌株G+E[LZ103S16により産生され るヒトリゾチームの精製に用いられるスキームは、これらの菌株により産生され るリゾチームの精製用に徹底的に改変された。全体の約66%を占める主要な型 は本来のヒトリゾチームである。残りの型はN末端に9または11アミノ酸が余 分についた(プレープロAMFのC末端領域に由来する)ヒトリゾチームからな る。 発酵ブロース中のヒトリゾチームのレベルを増加させるために、2つのスルフォ ブロビルカートリッジを連続して使用した。第2に、スルフォプロピルカートリ ッジからのヒトリゾチームの溶出を、新しい菌株により産生されたタンパク質の 主要な型を分離するために改良された勾配系を用いて行った。さらに、全体の精 製操作を簡素化するために別の改変を導入した。細胞を含まないブロースの10 0.000の分子量を遮断するらせんカートリッジへの濾過を除き、ゼータブレ ツブカートリッジの洗浄回数を減らした。 この改変スキームを用いて、菌株G+AH2108S20の10リットル発酵  試験704において産生されたヒトリゾチームを精製した。発酵槽の内容物をメ タノールで70時間増殖させた後に回収し、6500Xgで30分間遠心した。 この細胞を含まないブロース(6100ml)を5m17分の割合でポンプで引 き、連続的に接続された2つのゼ−タブレノブモジュラ〜の放射状フロースルフ ォブロピルカートリッジに直接導いた。このカートリッジを、電導度を20mM ho/cm2にするのに十分なNaC1を含む50■麗酢酸ナトリウム(pH5 ,0) 0.8リツトルで洗浄し、次いで電導度を13.8mMho/am2に するのに十分なNaC1を含む5QmMリン酸ナトリウム(pH7,0) 1. 4リツトルで洗浄した。 4リツトルの5hMリン酸ナトリウム(pF18.0)で電導度が10から50 mMha/cm2までの線形勾配をかけながら、このカートリッジからヒトリゾ チームを溶出した。 約10m1毎の画分を回収し、両分の吸光度を280MMで測定した。280M Mの吸光度を持つ物質を含む画分の一部をトリシン5DS−PAGEにより分析 し、菌株G+AH2108S20により産生されたリゾチームの二つの型の溶出 をモニターした。正しくプロセッシングされたヒトリゾチームのみを含む両分( ゲル電気泳動およびタンパク質配列決定により決定した)をプールし、6(10 0−8000の分子量を遮断するスペクトレーバーチューブにおいて連続的に流 れている脱イオン水に対して24時間透析した。 透析した試料をそれから凍らせ凍結乾燥した。 精製スキームの概要および各ステップでのヒトリゾチームの収率(RI Aによ り決定)を表3に表す。遠心に続いて、発酵 試験704からの細胞を含まない ブロースはゼータブレツブカートリッジにポンプで直接導入するのに十分なほど 透明であった。(精製前にこの細胞を含まないブロースを一20℃で保存する場 合、ゼータブレツブカートリッジに結合させる前に100.000の分子量を遮 断するらせんカートリッジによる濾過を含ませる必要が有り得る。凍ったブロー スはしばしば粘性が高(なり、容易にゼータブレツブカートリッジを詰まらせつ る不溶性物質を含む。)最も高い純度を確保するために、吸収ピークの領域に相 当する画分(#281−34のをプールした(溶出プール1、表3)。このプー ルは、5DS−PAGE、イムノプロット、アミノ酸分析および/またはタンパ ク質の配列決定による分析(実施例5.e−h参照)から正しくプロセッシング され、かつ最低でも95%の純度と見られる約1グラムのヒトリゾチームを含ん でいた。ピークの他の領域を含む画分(画分261−280)もプールし、解析 した。このプール(溶出ブール2、表3)は、同じ< 5DS−PAGE、イム ノプロット、アミノ酸分析および/またはタンパク質の配列決定による分析(実 施例5.e−h参照)から正しくプロセッシングされていると見られるヒトリゾ チームをさらに694mg含んでいた。 細胞を含まないブロースはRIAによる決定によれば約2.8gのヒトリゾチー ム免疫反応物質を含んでおり、そのうち約1.9g(66%)が正しくプロセッ シングされていると評価された。表3に示されるように、免疫反応する開始物質 2.8gのうち約1,7グラム(即ち61%)が分離された。しかしながら、開 始物質2.8グラムには、正しいプロセッングを受けたヒトリゾチームと誤った プロセッシングを受けたヒトリゾチームの両方が、それぞれ約1.9と0.9グ ラム含まれていた。以上のことから、表3に示した約60%の回収率というのは 、正しくプロセッシングされたヒトリゾチームの約89%を回収したことを表し ている。 菌株G+AH2108S20により生産されたヒトリゾチームの精製精製工程  体積 ヒトリゾチームヒトリゾチーム回収率□ −堕p−一ふ(7mm) 総量 (ffig)無細胞培養液発酵槽試験704 6100 458 2793 1 00濾過液 6000 5. 2 31. 2 <0.1洗浄1゜ 50mM酢酸ナトリウム pH5,0,20,0mMho/cm” 800 6. 6 5. 3 <11 洗浄2: 5軸M酢酸ナトリウム pH7,0,13,8mMho/am21400 0.8 1.1 <0.1洗 浄3: 50mM酢酸ナトリウム 溶出液 50mM酢酸ナトリウム WT3B、0.10mMho− 50m31ho/cm ” プールl: 両分281−340 770 3569 987. 0 33.0実施例5・ア ッセイ ピキアパストリス(Pichia pastoris)の組換え株から分泌され たヒトリゾチームの量をRIAと、発酵槽での株の増殖で得られた無細胞培養液 の溶解アッセイ(lysis assay)によって定量した。 a、標準ヒトリゾチームとポリクローン抗血清2つの由来を持つヒトリゾチーム をRIA、イミュノプロット(Immunoblot)、酵素活性アッセイの標 準として用いた。白血病の患者の尿から得られたりゾチームは、グリーンクロス コーポレイション(Green Cross Corporation) (販 売元・アル7フーセラピーテイツクコーポレイシヨン(Alpha Thera peutic Corporation)カルホルニア州ロサンジェルス)より 購入し、ヒト乳から得られたりゾチームは、シグマケミカルカンパニー(Sig ma Chemical Company) (ミズリー州セントルイス)より 購入した。2つのりゾチームは、RIAと酵素活性アッセイで比較され、実験誤 差の範囲内で同一であった。ストック溶液の濃度は、Ezsa−(1%、 1c m)25.5という吸光係数をもとに分光光度計を用いて決定した。 ヒトリゾチームに対するウサギポリクローン抗血清は、ダコーイミュノグロブリ ンズ(Dako−Immunoglobulins)(カルホルニア州すンタバ ーバラ)より購入し、RIAとイムノプロット分析で使用された。 b1組換えピキアパストリス細胞の無細胞培養液と細胞抽出物の調製ピキアパス トリスのヒトリゾチーム発現株の発酵槽培養物のサンプルは、培養液と細胞を分 離するために、6500 X gで5分間遠心分離した。培養液は、細胞ペレッ トから別の容器に注ぎ、イミュノプロット、RIA、酵素活性アッセイに用いた 。 細胞抽出物は、発酵槽で培養された細胞175mgから調製した。細胞は、抽出 緩衝液(10mMリン酸ナトリウム、pH7,5,0,1% ドライド:zX− 100(Triton X−100)、0゜5M NaC1,2mm PMSF )で2回洗い、065關のグラスビーズ0.5gと抽出緩衝液0.35m1と共 に1分ずつ4回渦動した。ビーズに、溶解物と化合した緩衝液0.35m1をさ らに加え洗い、微量遠心機で15分間遠心分離した。上清を除き、全タンパク量 が、ブラッドフォード法(Bradford method) [Anal、  Biochem、 72: 248(1976)]により決定された。残りの細 胞ベレットは、2×サンプル緩衝液(0,125M Tr4s−HCI。 pH6,8,4%SDS、 200mMディチオスレイトール(DTT)、20 %グリセロール、0.005%ブロモフェノールブルー、20ug/mlピロニ ンY)0.7mmに!濁し、10分間ボイルし、15分微量遠心機で遠心した。 さらなる遠心で上清を別の容器に除いた。細胞溶解物と、再墾濁された不溶性ベ レットの遠心の結果得られる上清は、イミュノプロットにより分析された。 C1酵素活性アッセイ ピキアパストリスでつくられたヒトリゾチームの溶解活性を、[スガー等(Sh ugar et al、 Biochem、 Biophys、^cta 8  : 302(1952)]に記載されている改良法で測定した。リゾチームをミ クロコッカスリソディクティクス(Micrococcus lys。 deikticus)の懸濁液に加え、405Mmの吸光度の減少を分光光度計 で測定した。アッセイで用いられた標準条件は、25℃で、0.1%BSAを含 む0.033Mリン酸カリウムpH7゜4とした。典型的なアッセイでは、0. 1%BSAを含むpH7,4の0.033Mリン酸カリウムに、濃度0. ll l1g/mlで懸濁したミクロコッカスリソデイクティクス1mlを1mlプラ スチックキュベツトにピペットで取り、OD4 o sを測定した。標準ヒトリ ゾチームあるいは、発酵槽培養液(0,1%BSAを含むpH7,4の0.03 3Mリン酸カリウムで必要量希釈したもの)0.05〜0.25ug (25μ m以下)を、時間0に加えた。標準あるいはサンプルを加えた後、2分毎にOD 4゜、の吸光度を記録した。標準ヒトリゾチームの特異的活性は、mgリゾチー ムあたり、1分あたりのOD4゜5の変化で定義される。乳リゾチームと尿リゾ チームの平均特異的活性は、標準条件下での酵素活性アッセイで11000D4 05/分/mgであった。発酵槽培養液中のヒトリゾチームの濃度は、同じアッ セイで標準について得られた特異的活性をもとに計算された。 酵素活性アッセイが粗製培養液サンプルに有効であることを確認するため、ヒト リゾチーム発現株の発酵槽から得られた無細胞培養液の存在下で、ヒト乳リゾチ ームのアッセイを行った。培養液は、標準の活性に何の影響も与えなっかた。 つまり培養液中の標準リゾチームと培養液中のピキアバストリス生産リゾチーム の活性は相加的であった。この結果より、無細胞培養液はアッセイを阻害しない ことが示される。 d、RIA ラジオイミュノアッセイ(radioimmunoassay) (RI A) は、ヒトリゾチーム発現の測定用に開発された。RIAに必要なヨウ化されたヒ トリゾチームは商品化されていなかったので、ヒト白血病の患者の尿より得られ たリゾチームをヨードビーズ法(Iodobead procedure)によ ってヨウ化した。このために5hgのりゾチームを、pH7,4の50mM N aPO4中で、ヨードビーズ(ピアース(Pierce)イリノイ州ロックフォ ード)と1mC1[”’I]NaI(NENマサチューセッツ州ボストン)と結 合した。 氷上30分放置の後、lH■−リゾチームをセファデックスG−25カラム(S ephadex G−25calumn)により遊離ヨウ素より分離した。ピー ク画分に集められた試料は、3クロロ酢酸沈降によって95%そのままの状態で あることがわかった。 標準RIAプロトコールに従うと、無視できないレベルのヨウ化リゾチームの非 特異的結合が存在し、高いバックグランドが出た。バックグランドを減らすよう にインキュベーションの条件が調べられた。そして、非特異的結合は、ラベルさ れたリゾチームがパンソルビン(Pansorbin)に吸収されることに起因 するとわかった。そこで、パンソルビンの濃度をシグナルを損なわず、十分に低 いバックグランドしか出さないようなレベルとした。 ヒトリゾチームRIAの最良のプロトコールでは、約12.000cpmの12 31−リゾチームをポリクローン抗血清(最終希釈1:25,000)と、様々 な量のラベルされてない標準リゾチームか培養液サンプルと共に4℃で一晩イン キユベートした。結合反応は5hMリン酸ナトリウムpH7,510,LM N aC1/25mM EDTAlo、 1%NaN310.1%BSA(フラクシ ョンY)10.1%Triton X−100を含み最終的に0.5mlとして ガラスチューブ内で行った。インキュベーション後、100μmのパンソルビン (作用希釈1 :320 ;カルバイオケム(Calbiochem)カルホル ニア州すンディエゴ)を加え、室温で15分チューブをインキュベートした。洗 浄溶液(0,9%NaC115mM EDTAlo、 1%Triton X− 100) 2mMを加え、4℃3200rpmで68分チューブを遠心しくJ6 M遠心機)、上清を捨て、各ペレットの放射活性をカウントした。ラベルされて ないリゾチーム非存在下での全結合は、ヨウ化リゾチームの全カウントの約32 %であり、非特異的結合は6%以下であった。 ラベルされてないリゾチームとの125ニーリゾチームの競合のED、。は2. 5ngであり、アッセイの感度は約0.3ngであった。尿と乳より精製された ヒトリゾチームのRIAで得られる標準曲線は、重ね合わせることができる。 e、5DS−PAGE SOS−PAGE分析は、基本的にはラエムリ(LaeIIlmli)[Nat ure 227 : 680(1970)]により記載されている方法で行われ た。各サンプルを2×サンプル緩衝液(0,125M Tris−HCI、 p Ff6.8.4%SDS、 200m1J DTT、 20%グリセロール、0 .005%ブOモア エンールブルー、20ug/mlビロニンY)で11に希 釈し、10分間ボイルし、5%スタッキングゲルと15%アクリルアミドゲル、 あるいは17−27%勾配セプラゲル成型ケル(gradient Sepra gel precast gelXインテグレイテッドセパレイションシステム ズ(Integrated 5eparation Systems)vサチコ ウセッッ州ハイドバーク)のミニタンパクゲル装置(Mini−Protein  gel apparatus)(バイオラド(ビオラ)カルポルニア州すッチ モンド)で分離した。タンパク標準(バイオラド)を分子量マーカーとして用い た。 もう一つの方法として、4%スタッキングヶルと16%アクリルアミドゲルで、 シェイガーとフォンジャゴウ(Schagger and van Jagov )が記載している[Anal、 Biochem、 166:368(1987 )] トリシンシステム(tricine system)を用いて5DS−P AGEを行った。トリシンシステム用の2×サンプル緩衝液の組成は、8%SD S、 0. IM Tris HCl、 pH6,8,200mMDTTS0. 004%り7シープリリアントブ/I/−G テアツタ。 ゲルはクマジーブリリアントブルーR1その後銀で染色した。クマジー染色とし て、50%エタノール、10%酢酸、5%TCA、 200mgルクマジーブリ リアントブルーでゲルを一晩染色した。翌日、10%エタノール、10%酢酸、 1%TCA、 50mg/Lクマジーブリリアントブルーで1時間ゲルを再水和 し、10%エタノール、10%酢酸で脱染色した。銀染色は、グルタルアルデヒ ド固定は行わず、基本的にモリッシ−(Morrissey)の記載[Anal 、 Biochem、117:307(1981)コに従い行った。 f、イミュノプロット 一1ミュノブロットで分析した細胞抽出物と無細胞培養液サンプルは、上述した ように、まず5DS−PAGEで分離した。ゲルの染色は行わなかった。ニトロ セルロースへのタンパクのトランスファーは、O,lampsで1.5時間行っ た。メンブレンを37℃で1時間、ウェスタン緩衝液(0,25%ケラチン、I  XPBS、 0.05% トウイー :/−20(Tween−20)、00 2%アジ化ナトリウム)でブロックし、ヒト尿より単離したリゾチームに対する 抗血清を1:2000希釈で含むウェスタン緩衝液中で一晩室温でインキュベー トした。そして、メンブレンをウェスタン緩衝液でよ(洗い(15分洗いを4回 )、室温で60分約3μCiの125丁−タンパクAにューイングランドニュー クリアー(New England Nuclear、 7サチユーセツツ州ボ ストン)とインキュベートし、上述したように洗い、風乾し、フィルムを露光し た。これらの条件下では、lngのヒトリゾチームでも検出可能である。 g、アミノ酸分析 精製ヒトリゾチームを加水分解し、アミノ酸分析を行った[スパックマン等(S packman et al、 (1958)、 Anal、 Biochem 、 30:1190] o既知の量の精製ヒトリゾチームをガラスチューブに加 え、チューブを約0.51111の6NHC1を含む反応フラスコに置いた。排 気した後、サンプルを110℃で24時間気相加水分解によって加水分解した。 加水分解したサンプルを500μmの0.2M酢酸ナトリウム、pH2,2に取 り、50I11をベックマン6300アミノ酸分析機に用いた(Beckman  6300 Am1no Ac1d Analyzer)。 h、タンパク配列決定 精製ピキシアパストリス生産ヒトリゾチーム サンプルのN端アミノ酸配列を、 ハンクアピラーとフッド(Hunkapiller and Hood)の方法 [5cience 219:650 (1983)]に従って決定した。l n molの精製試料の分析にアブライドバイオシステムダ4フ0/120気相タン パク配列決定機(Applied Biosystems 470/120 G as Phase 5equencer)を使用した。 実施例6:プラスミドpAO208の構築5tuI消化、次いで0,2マイクロ グラムの5alIリンカ−(GGTCGACC)の付加により、AOX1転写タ ーミネータ−を20マイクログラムのpPG2.0 [pPG2.0=pG4. 0のBamHI−HindIII断片(NRRL 1.5868) +pBR3 22]から単離した。次ぎにこのプラスミドをHindIIIで消化し、aso bpの断片を10%アクリルアミドゲルから単離し、HindIIIとSa、I Iで消化したpUc18 (ベーリンガー マンハイム)にサブクローン化した 。ライゲーション混合液をJM103細胞(広範に用いられている)に導入し、 amp’のコロニーを選択した。正しい構築物はHindIIIと5alIによ る消化(350bpの断片を生じる)により確認し、pAO201と命名した。 5マイクログラムのpA0201をHindIIIで消化し、大腸菌DNAポリ メラーゼIのフレノウ断片で平滑化し、0.1マイクログラムのBglIIリン カ−(GAGATCTC)を添加した。過剰なりglIIリンカ−を消化した後 、このプラスミドを再び閉じMC1061細胞に導入した。amp”の細胞を選 択し、DNAを調製し、そして正しいプラスミドをBglII、 Sal、に重 消化(350bpの断片を生じる)およびHindIII消化(HindIII 部位の喪失を示す)により確認した。このプラスミドをpAO202と命名した 。 アルファ 77クタ一−GRF融合体をpYsv2olカら(0360bpO) BamHI−PstuJi分消化物として単離した。プラスミドpYSV201 は、M13mp18 にューイングランドバイオラボ(New England  Biolabs) )に挿入されたGRF−E−3のEcoRI−BamHI 断片である。プラスミドGRF−E−3は欧州特許出願第206.783号に記 載されている。20マイクログラムのpYsV201プラスミドをBamHIで 消化、PstIで部分消化した。この部分消化物に以下のオリゴヌクレオチドを 添加した:オリゴヌクレオチドのアンチセンス鎖のみをリン酸化標識し、このオ リゴヌクレオチドが5′端で重合しないようにした。アクリルアミドゲル電気泳 動(10%)後、385bpの断片を電気溶出により分離した。この385bp のEcoRI〜BamHI断片を、EcoRIとBamHIで切断したpAO2 02にクローン化した。通常は、適当な酵素で切断しウシ小腸アルカリフォスフ ァターゼで処理したベクター5ナノグラムを、挿入断片50ナノグラムと連結し た。MCl061を形7it転換し、amp’の細胞を選択し、そしてDNAを 調製した。この場合、得られるプラスミドpAO203は、700bp以上の断 片を生じるEcoRI 、!: BglIIで切断した。α−ファクター−GR F断片はGRFの(1−40)leu”変異型をコードし、lys−arg−g lu−ala−glu−alaのプロセシング部位を含む。 AOXフ0−T−−9−ヲ20マイ’y Oクラム(7)pAOP3から(1’ ) 1900bp(7)EcoRI断片として単離し、EcoRI消化したpA O203にサブクローン化した。pAOP3の開発は欧州特許第226.846 号に開示されており、本明細書中において以下に記載されている。MC1061 細胞をライゲーション反応液で形質転換し、amp’:+口二一を選択し、そし てDNAを調製した。正しい方向は約376bpのHindIII断片を含んで おり、一方誤りた方向は約675bpの断片を持つ。そのような形質転換体を− っ単離しpAO204と命名した。 pA0208の親ベクターは、pYJ32 (十BglII)を産生ずるために PYJ32をEcoRVで消化しBglIIリンカ−を付加することにより、t etRa伝子のEcoRV部位をBglII部位1:変(IJfル改変ヲ施Lり 1lIS4. PAR32プラスミドpYJ32 (NRRL B−15189 1) テある。このプラスミドをBglIIで消化し、AOX1プロモーター− α接合因子−GRF −A OX 1 3− 発Tjl fy セラ) ヲ含ム pAO204カラノ1.75kbノBglH!Fr片ヲ挿入した。得られたベク ターをpAO208と命名した。pAO208のEcoRI消化は850bpの 断片+ベクターを生じ、一方別の方向を持つベクターは1.1kbの断片+ベク ターを生じた。 プラスミドpAOP3の構築 1、プラスミドpPG2.5[プラスミドpPG4.0からの約2.5kbのE coRI−3alI断片を含むpBR322由来のプラスミド。このプラスミド は主要なアルコールオキシダーゼ遺伝子(AOXI)と調節領域を含み、イリノ イ州ベオリアの米国農務省の北方リサーチセンターからの大腸菌宿主においてN RRL B−151868として有用である。コをBamHIで直鎖状化した。 2、直鎖状にしたプラスミドをBAL31で消化した。 3、得られたDNAを大腸菌DNAポリメラーゼIのフレノウ断片で処理するこ とで末端を平滑化し、そしてEcoRIリンカ−に連結した。 4、ライゲーション産物を大腸菌株MM294に導入した。 5、以下の配列を持つ合成オリゴヌクレオチドを用いたコロニーノゾブリダイゼ ーション法により、形質転換体をスクリーニングした:5”−TrATTCGA AACGGGAATTCC−3−このオリゴヌクレオチドは、EcoRIリンカ −の配列に融合された、ATG開始コドンまで(開始コドンは含まない)のAO XIプロモーター配列を含む。 6、ポジティブクローンをマクサム−ギルバート法により配列決定をした。3つ のポジティブはすべて以下の配列を持っていた:5−. 、 、 TTATTC GAAACGAGGAATTCC,、、3−それらはすべてATGの”A”を保 持していた(上記配列の下線を引いた部分)。 このAは多分害をもたらさないであろうと決めたので、以下のすべてのクローン はこれらポジティブクローンの誘導体である。これらのクローンはそれぞれ研究 用名称1)AOPl、 pAOP2およびpA(lP3が与えられた。 実施例7. プラスミドpAO815の構築プラスミドpAO815はプラスミ ドpAO807(代わって以下に示すようにして調製した)に変異導入し、pA 0807のAOX1転写ターミネータ−の下流のHindIII/C1aI/H indIII部位をBamHI部位に変えることにより構築した。pAO807 の変異導入に使用したオリゴヌクレオチドは以下の配列を持つ:5−GACGT T CGT TrG TGCGGA TCCAAT GCG GTA GTT  TAT−3−変異導入したプラスミドをpA0807−Bamと命名した。プラ スミドpAO804をBglIIで消化し、25ナノグラムの2400bp断片 を、BgIII消化したI)AO807−Bamからの250ナノグラムの54 00bpのBglII断片に連結した。ライゲーション混合液をMC1061細 胞に導入し、正しい構築物をPst/BamHI消化で6100と2100bp のサイズのバンドを同定することにとにより確認した。正しい構築物をpAO8 15と命名した。この発現ベクターp^0815の制限酵素地図を図3に示す。 プラスミドpAO807の構築 1、fl−ori DNAの調製 f1バクテリオファージDNA (50マイクログラム)を50ユニツトのRs aIとDraIで消化しく製造元の指示に従った)、f1複製オリジン(ori )を含む約458bpのDNA断片を放出させた。この消化混合液を等量のフェ ノール:クロロホルム(V/V)で抽出し、次いで等量のクロロホルムで水層を 抽出し、最後に水相にあるDNAをNaC1濃度を0.2Mに調整し2.5倍量 の絶対エタノールを加えることにより沈殿させた。この混合液を氷上(4℃)で 10分間静置し、DNA沈殿物を微量遠心機で10.0OOX gで4℃、30 分間遠心分離することで回収した。 このDNAベレットを70%水エタノールで2回洗った。洗浄したペレットを真 空乾燥し25マイクロリツトルのTEバッファー[1,OOIM EDTAlo 、OIM (p[17,4) トリスバッファーコに溶解した。このDNAを1 .5%アガロースゲルで電気泳動し約458bpのfl−ori断片を含む部分 のゲルを切り出して、ゲル内のDNAをDE81 (ホワットマン)紙上に電気 溶出し、LM NaC1中で濾紙から溶出した。このDNA溶液を上記のように して沈殿させ、DNA沈殿物を25マイクロリツトルのTEバッファーに溶解し た(fl−ori断片)。 2、pBR322のDraI部位へのfl−oriのクローン化pBR322( 2マイクログラム)を(製造元の指示に従って)2ユニツトの叶aIで部分消化 した。反応はフェノール、クロロホルム抽出により停止させ、ついで上記ステッ プ1のようにしてDNAを沈殿させた。このDNA約100ナノグラムを、20 マイクロリツトルのライゲーションバッファー中で1ユニツトのT4 DNAリ ガーゼとともに14℃で一晩インキユベートすることにより、100ナノグラム のfl−ori断片(ステップ1)と連結させた。連結反応は70℃で10分間 加熱することにより停止させ、それから大腸菌株JM103 [ジャニッシュー ペロン(Janisch−Perron)ら、Gene、 vol 22.10 3 (1983)コの形質転換に用いた。a m p Rの形質転換体をプール し、ヘルパーファージR408[ラッセル(Russel)ら、上巻]で重複感 染させた。−末鎖ファージを培地から分離し、JM103の再感染に用いた。  。 a m p R形質転換体は、pBR322のDraI部位(ヌクレオチド番号 3232および3251)にクローン化されたfl−oriを含むpBRfl− oriを含んでいた。 3、プラスミドpAO807の構築 pBRfl−ori (10マイクログラム)を各々10ユニツトのPstIお よびNdeIで37℃で4時間消化した。消化したDNAをステップ1のように してフェノール:クロロホルム抽出し、沈殿させ、25マイクロリツトルのTE バッファーに溶解した。この物質を1.2%アガロースゲルで電気泳動し、fl −oriを含むNdeI−PstI断片(約0゜8kb)を分離し、ステップ1 と同様にして20マイクロリツトルのTEバッファーに溶解した。このDNA約 100ナノグラムをPstIとNdeIで消化し、脱リン酸化処理した100ナ ノグラムのpAO804と混合した。この混合液を20マイクロリツトルのライ ゲーションバッファー中で1ユニツトのT4 DNAリガーゼと共に14℃で一 晩インキユベートして連結させた。連結反応は70℃で10分間加熱することに より停止させた。このDNAを大腸菌株JM103の形質転換に用い、pAO8 07を得た。 実施例8・ プラスミドpAO804の構築プラスミドp^0804はPCT国 際公開89104320号に記載されている。このプラスミドの構築には以下の ステップが含まれる・プラスミドpBR322を以下のように改変してEcoR I部位を排除しPvuII部位にBglIr部位を挿入した: pBR322をEcoRIで消化し、突出端を大腸菌DNAポリメラーゼ■のフ レノウ断片で埋め、得られたDNAをT4 DNAリガーゼを用いて再び環状化 した。この環状化したDNAを用いて大腸菌MC1061をアンピシリン耐性に 形質転換し、形質転換体で、EcoRI部位を持たない約4.37kbpのプラ スミドを持つものをスクリーニングした。そのような形質転換体を一つ選択し培 養してプラスミド(pBR322ΔR工と命名)を得た。これはEcoRI部位 が:5−GAATT^^TTC−3− 3−CTTAATTAAG−5− という配列に置き換えられたpBR322である。 pBR322Δl?IをPvuIIで消化し:5−CAGATCTG−3− 3”−GTCTAGAC−5− という配列を持つリンカ−を、得られた平滑末端にT4 DNAリガーゼを用い て連結した。得られたDNAを再びT4 DNAリガーゼを用いて環状化し、次 にBglIIで消化し再度T4 DNAリガーゼを用いて環状化し、PvuII 消化したpBR322ΔRIに複数のリンカ−が連結したことによる複数のBg llI部位を排除した。複数のBglII部位を排除したDNAを用いて大腸菌 MC1061をアンピシリン耐性に形質転換した。形質転換体をBglII部位 を持つ約4.38kbpのプラスミドについてスクリーニングした。そのような プラスミドを一つ選択し培養してプラスミド(pBR322ΔRIBGLと命名 )を得て次の段階に使用した。プラスミドpBR322ΔRIBGLは、pBR 322ΔRIBGLがpBR322ΔRIのPvuII部位の場所に5’−CA GCAGATCTGCTG−3−3−GTCGTCTAGACGAC−5−とい う配列を持つ以外はpBR322ΔPIと同じである。 pBR322ΔRIBGLを5aIIとBglIIで消化し、大きな断片(約2 .97kbp)を分離した。 プラスミドpBSAGI5I (欧州特許出願第0226752号に記載されて いる)をBglIIとXhoIで完全に消化し、P、パストリス(pastor is)のA、OX1遺伝子座のAOX1遺伝子転写ターミネータ−の(AOXI プラスミドからの転写の方向に対して)下流の領域からの約850bpの断片を 分離した。pBSAGI5IからのBglII−XhoI断片とpBR322Δ RIBGLからの約2.97kbpのSalI−BglII断片を組み合わせて 74 DNAリガーゼで連結させた。ライゲーション混合液を用いて大腸菌MC 1061をアンピシリン耐性に形質転換し、形質転換体をBglII部位を持つ 予想されたサイズの(約3.8kbp)プラスミドについてスクリーニングした 。このプラスミドpAO801と命名した。 pBR322ΔRIBGLの5alI突出端は850b[)のpBSAGI5I 断片上のXhoI部位の突出端に連結させ、この過程によりpAO801の5a lIおよびXhoI部位の両方が排除された。 pBSAGI5Iを次にC1aIで消化し約2.0kbpの断片を分離した。こ の2.0kbpの断片は、P、パストリス AOXIプロモーターと転写開始部 位を含む約1.0kbpのセグメント、ヘパティティスBウィルス表面抗原(” HBsAg“)をコードする約700bpのセグメント、およびP、パストリス  AOXI遺伝子ポリアデニル化シグナルとその部位コード領域および転写ター ミネータ−を含む約3oobpのセグメントを持つ。2.0kbpの断片のセグ メントをコードするHBsAgは、AOX1プロモーターを持つ1.0kbpの セグメントの隣接末端(EcoRI部位がある)、およびAOX1転写ターミネ ータ−をもつ300bpのセグメントの隣接末端(StuI部位がある)で区切 られており、HBsAgをコードするサブセグメント(AOXIプロモーターか らの転写に際してHBsAgが効果的に発現されるよう、1.0kbpのプロモ ーターを含むセグメントおよびaoobpの転写ターミネータ−を含むセグメン トのそれぞれについて方向付けられ、位置付けられている)を持つ。このプロモ ーターセグメントを、HBsAgをコードするセグメントに繋げているEcoR I部位は、AOX1プロモーターの翻訳開始シグナルをコードするトリブレット の(AOXIプロモーターからの転写の方向に関して)すぐ上流に位置している 。 pBsAGI5rの2.0kbpのClaI部位で区切られた断片のプロモータ ーおよびターミネータ−セグメントについてのより詳細な記載は、欧州特許出願 第226.846号およびエリス(Ellis)ら、Mat、 Ce11. B iol、5.1111. (1985)を参照されたい。 プラスミド1)A0801をC1aIで切断し、T4 リガーゼを用いた連結に 、pBsA(J51からの約2.0kbpのClaI部位で区切られた断片と組 み合わせた。ライゲーション混合液を用いて大腸菌MC1061をアンピシリン 耐性に形質転換し、形質転換体を、予想されたサイズ(約5.8kbp)を持ち 、C1aIとBglIIで消化すると約2.32kbp (pBR322由来の 複製起点とアンピシリン耐性遺伝子をもつ)および約1.9kbp、 1.48 kbpそしてtoobpの断片を生じるプラスミドについてスクリーニングした 。BglIIとEcoRIで消化すると、このプラスミドは、AOX!遺伝子か らのaoobpのターミネータ−セグメントとHBsAgコードセグメントを持 つ約2.48kbpの断片、AOX1遺伝子座内のAOX1遺伝子のAOX1タ ンパク質をコードするセグメントの上流からのセグメントを含む約900bpの 断片、およびpBR322からの複製起点とアンビシリ耐性遺伝子、モしてAO X1遺伝子座の約100bpのC1aI−BglIIセグメント(上述の9oo bpのEcoRI−BglIIセグメントよりもAOXIコードセグメントから 更に上流)を含む約2.42kbpの断片を生じた。そのようなプラスミドはp BSAGI5IからのC1aI断片をめる方向に、望ましくない方向とは逆向き に持っていた(EcoRI−BglII断片は約3.3kbp、 2.38kb p、および900bpとなる)。 求めるプラスミドを持つ形質転換体の一つ(pAO802と命名)を次の段階用 に選択して、培養しそのプラスミドを得た。pAO802中のpBSAGI5I からのC1aI断片のめる方向性には、AOX1遺伝子座のAOX1遺伝子の下 流からの800bpの断片の末端のBglII部位で切断することにより作製し た線状化したプラスミドをP。 パストリスのゲノムのAOX1遺伝子座に正しく挿入されるように、正しく方向 付けられたAOX1遺伝子座のAOX1遺伝子が含まれていた。 pAO802をそれから、EcoR1部位と5tuI部位で区切られたHBsA gをコードするセグメントを除く処理を施した。このプラスミドを5tuIで消 化し、この平滑末端に:5−GGAATTCC−3− 3−CCTTAAGG−5− なる配列のリンカ−をT4リガーゼを用いて連結した。この混合液をそれからE coRIで処理し、再びT4リガーゼを用いて連結させた。次にこのライゲーシ ョン混合液を用いて大腸菌MC1061をアンピシリン耐性に形質転換し、形質 転換体を、予想されたサイズ(5,1kbp)を持ち、約1.78kbp、 9 00bpおよび2.42kbpのEcoRI −Bg1丁I断片、そして約10 0bp、 2.32kbp、 1.48kbpおよび1.2kbpのBglII −C1,aI断片を生じるプラスミドについてスクリーニングした。このプラス ミドをp^0803と命名した請求めるプラスミドを持つ形質転換体を次の段階 用に選択し、培養してp^0803を得た。 次に、p^0803中のpBR322からのBamHI部位にP、パストリスの HIS4遺伝子からの約2.75kbpのBglII断片を挿入することにより 、プラスミドpAO804をpAO803から作製した。例えば、フレラグ(C regg)ら、Mo1. Ce1l、 Biol、5.3376 (1985) および欧州特許出願第180.899と188.677を参照。pAO803を BamHIで消化しHIS4遺伝子を含むBglII部位で区切られた断片と混 合し、この混合液をT4リガーゼを用いて連結させた。このライゲーション混合 液を用いて大腸菌MC1061をアンピシリン耐性に形質転換し、形質転換体を 、予想されたサイズ(7,85kbp)を持ち、5alIにより切断されるプラ スミドについてスクリーニングした。そのような形質転換体の一つを次の段階用 に選択し、これが持つプラスミドをpAO804と命名した。 pAO804は約1.5kbpの5alI−C1aI断片を一つ、約5.0kb pの5alI−C1aI断片を一つ、そして1.3kbpのC1aI−C1aI 断片を持つ;このことは、このプラスミドのHIS4遺伝子の転写の方向がアン ピシリン耐性遺伝子の転写の方向と同じであり、AOX1プロモーターからの転 写の方向と逆であることを示している。 p^0804中のHIS4遺伝子の方向性は、このプラスミドの機能、またはそ のA○X1プロモーターとターミネータ−セグメントの間のEcoRI部位にc DNAコードセグメントを挿入した誘導体の機能に重要ではない。従って、pA O804のHIS4遺伝子とは逆の向きにあるHIS4遺伝子を持つプラスミド もまた、本発明に従った用途に有効であるだろう。 本発明はその特定の実施態様に関して詳細に記載されている。しかし、様々な変 更および改変が本発明の精神と範囲を逸脱することな(有効であることは理解さ れるであろう。 FIG、 2 FIG、3 EGθ Elgln BamHI FIG、7 国際調査報告 ’l’−1’l’l’AIa’4111’N@ PCT/US91106326 \ : 1 1 ゛ 1、j PCT/US91106326 Group X、clalrns 1−26. drawn to DNA f ragments and method of useGroup XX、  ClalmS 27 and 2a、 drawn to a proeels  of purlflcatlcm Ff hu+=an lysozyme。 フロントページの続き (51) Int、 C1,’ 識別記号 庁内整理番号//CC12N 1/ 19 C12R1:84) (C12N 9/36 C12R1:84) (72)発明者 ステイルマン、キャリー・アンアメリカ合衆国カリフォルニア 用92109゜サン・ディエゴ、トーマス・アヴエニュー1739 、ナンバー 5 (72)発明者 プライアリ−、ラッセル・アーサーアメリカ合衆国カリフォル ニア州92126゜サン・ディエゴ、ロット・ポイント I (72)発明者 スイル、グレゴリ−・パトリックアメリカ合衆国カリフォルニ ア州92111゜サン・ディエゴ、オールド・ヘザー・ロード 3202 (72)発明者 ヴエドヴイック、トーマス・スコツトアメリカ合衆国カリフォ ルニア用92009゜カールスパッド、ジャカランダ・アヴエニュー 2708

Claims (28)

    【特許請求の範囲】
  1. 1.少なくとも1コピーの第一発現カセットを含むが、その際、上記発現カセッ トが以下のDNA配列: (i)メチロトローフ酵母のメタノール応答性遺伝子のプロモーター領域、(i i)以下のものからなるポリペプチドをコードするDNA配列:(a)プロセシ ング部位:リジン−アルギニン を含む、サッカロミセスセルビシエのAMF前 駆プロ分泌シグナル配列、および(b)ヒトリゾチーム(HLZ)ペプチドをコ ードするDNA配列;および(iii)メチロトローフ酵母中で機能する転写タ ーミネーター;および、選択としてさらに、転写の読み枠方向に以下に示すDN A配列を含む第二の発現カセットを少なくとも1コピー含んでいる:(i′)メ チロトローフ酵母のメタノール応答性遺伝子のプロモーター領域、(ii′)以 下のものからなるポリペプチドをコードするDNA配列:(a′)天然ヒトリゾ チームシグナル配列ペプチド、および(b′)ヒトリゾチームペプチドをコード するDNA配列;および(iii′)メチロトローフ酵母中で機能する転写ター ミネーター;を含むが、その際、上記プロモーター領域及び上記転写ターミネー ターはそれぞれ、同じまたは異なった遺伝子から独立に選択されている;そして 、ここでは上記DNA配列は、上記ポリペプチドをコードする配列の転写のため に、互いに実行可能なように連結されている を転写方向に含むDNA断片。
  2. 2.少なくとも1つの選択マーカー遺伝子及び、細菌の複製開始点をさらに含む 、請求項1記載のDNA断片。
  3. 3.環状プラスミド中に上記断片が含まれる、請求項2記載のDNA断片。
  4. 4.請求項1に従ったDNA断片でHLZペプチドをコードする上記配列が先に 図1に示された配列のセットを有しているもの。
  5. 5.上記酵母がピキアパストリスの株である、請求項1記載のDNA断片。
  6. 6.メチロトローフ酵母の上記メタノール応答性遺伝子および転写ターミネータ ーの両方が、ピキアパストリスのAOX1遺伝子から得られたものである、請求 項5記載のDNA断片。
  7. 7.さらに、3′−および5′−端に、上記標的遺伝子中への上記断片の部位特 異的組込みをもたらすための上記DNA断片と宿主酵母の標的遺伝子との充分な 相同性を有する、請求項6記載のDNA断片。
  8. 8.さらに、3′−および5′−端に、上記標的遺伝子中への上記断片の部位特 異的組込みをもたらすための上記DNA断片と宿主酵母の標的遺伝子との充分な 相同性を有する、請求項1記載のDNA断片。
  9. 9.上記第一発現カセットを多コピーで含む、請求項1記載のDNA断片。
  10. 10.上記多コピーの上記第一発現カセットが、頭から尾の向きに配列されてい る、請求項9記載のDNA断片。
  11. 11.少なくとも1コピーの上記第一発現カセットと少なくとも1コピーの上記 第2発現カセットを含む、請求項1記載のDNA断片。
  12. 12.ピキア発現ベクターpALZ106のSacI消化物、あるいはピキア発 現ベクターpALZ108またはpMHZ109のStuI消化物から得られた ものである、請求項7記載のDNA断片。
  13. 13.請求項1記載のDNA断片で形質転換されたメチロトローフ酵母細胞。
  14. 14.上記酵母がピキアパストリスの株である、請求項13記載のメチロトロー フ酵母細胞。
  15. 15.請求項4記載のDNA断片で形質転換されたメチロトローフ酵母細胞。
  16. 16.請求項9記載のDNA断片で形質転換されたメチロトローフ酵母細胞。
  17. 17.請求項7記載のDNA断片で形質転換されたピキアパストリス細胞。
  18. 18.上記細胞がG+AHZ106S7、G+AHZ108S20,G+AHZ 109S25、またはG+MHZ109S25から選択されたものである、請求 項17記載のピキアパストリス細胞。
  19. 19.請求項13記載の生育可能なメチロトローフ酵母細胞の培養物。
  20. 20.請求項17記載の生育可能なピキアパストリス細胞の培養物。
  21. 21.請求項18記載の可視ピキアパストリス細胞の培養物。
  22. 22.上記細胞中での上記発現カセットの発現、および培地中への上記HLZ産 物の分泌を許容する条件下で、請求項13記載の細胞を生育することからなる、 ヒトリゾチーム(HLZ)の生産方法。
  23. 23.上記メチロトローフ酵母がピキアパストリスの株である、請求項22記載 の方法。
  24. 24.上記細胞が炭素源としてメタノールを含む培地中で培養される、請求項2 2記載の方法。
  25. 25.上記細胞がMut+表現型を有する、請求項22記載の方法。
  26. 26.上記細胞がMut−表現型を有する、請求項22記載の方法。
  27. 27.以下の工程: (a)陽イオン交換樹脂を、樹脂1グラム当り、請求項22記載の方法で得られ た約10−20ミリリットルの範囲の発酵培養物と接触させ;(b)生じるHL Zをロードした樹脂を、内在性ピキアパストリスのタンパク質の溶出を引き起こ すのに適したpHと伝導性を有する、充分量の溶媒により洗浄し;そして (c)正しくプロセシングをうけたHLZを溶媒の勾配によって選択的に溶出す る ことからなる、ヒトリゾチームと、そのN末端伸長相同物の混合物を精製する方 法。
  28. 28.イオン交換クロマトグラフィーにより組換え生産されたヒトリゾチームを 精製する方法において、請求項22記載の方法により得られた発酵培養物を、樹 脂1グラム当り10−20ミリリットルの発酵培養物の範囲で、陽イオン交換樹 脂に直接ロードすること、生じるHLZをロードされた樹脂を内在性ピキアパス トリスのタンパク質の溶出を引き起こすのに適したpHと伝導性を有する、充分 量の溶媒により洗浄すること;そしてその後に正しくプロセシングを受けたHL Zを溶媒の勾配により選択的に溶出すること、を含む改良法。
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