JPH0491800A - C型肝炎ウイルスおよびその関連核酸の簡便高感度検出法 - Google Patents
C型肝炎ウイルスおよびその関連核酸の簡便高感度検出法Info
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Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。
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Description
【発明の詳細な説明】
〈産業上の利用分野〉
本発明はC型肝炎ウィルス(以後HCVと略する)の関
連核酸の検出法に関する。更に詳しくは微量の検体を蛋
白変性剤にて処理後、除蛋白して得られた核酸からcD
NAを合成し、次いでDNADNAポリメラーゼを用い
て、オリゴDNAをプライマーとしてcDNAを増幅す
ることを特徴とするC型肝炎ウィルスおよびその関連核
酸を簡便高感度に検出する方法に関する。
連核酸の検出法に関する。更に詳しくは微量の検体を蛋
白変性剤にて処理後、除蛋白して得られた核酸からcD
NAを合成し、次いでDNADNAポリメラーゼを用い
て、オリゴDNAをプライマーとしてcDNAを増幅す
ることを特徴とするC型肝炎ウィルスおよびその関連核
酸を簡便高感度に検出する方法に関する。
〈従来技術及び発明が解決しようとする課題〉ウィルス
性肝炎はA型、B型、デルタ(D)型のほか、非A非B
型があり、非A非B型肝炎ウィルスには非経口伝播タイ
プと経口伝播タイプが存在すると推定されている。これ
らの中でB型肝炎および非経口伝播タイプの非A非B型
肝炎において慢性肝炎が知られており、かかるタイプの
ウィルス肝炎の予防治療が現在重要な課題となっている
。B型肝炎においては既に原因ウィルスが特定され診断
・予防方法がほぼ確立され今後新たな発症もかなり少な
くなるものと考えられる。一方、非経口伝播タイプの非
A非B型肝炎については、主に輸血により感染し、現在
受血者の15〜17%の血清肝炎発症者(日本において
年間15〜30万人く推定))の95%が、この非経口
伝播タイプの非A非B型肝炎と考えられている。更にこ
れらの非A非B型肝炎発症者のうち約50%は慢性肝炎
へ移行し10〜20年後には20%の患者において肝硬
変・肝癌への転帰を取るものと推定されている。更に該
非A、lp B型肝炎は輸血のほかに、複数人に共通で
針を使用した予防接種あるいは何等かの血液・体液など
を介する行為により、非A非B型肝炎のウィルス保持者
(日本において推定400万人)および慢性肝炎患者(
日本において推定90万人)が蓄積増加してきている。
性肝炎はA型、B型、デルタ(D)型のほか、非A非B
型があり、非A非B型肝炎ウィルスには非経口伝播タイ
プと経口伝播タイプが存在すると推定されている。これ
らの中でB型肝炎および非経口伝播タイプの非A非B型
肝炎において慢性肝炎が知られており、かかるタイプの
ウィルス肝炎の予防治療が現在重要な課題となっている
。B型肝炎においては既に原因ウィルスが特定され診断
・予防方法がほぼ確立され今後新たな発症もかなり少な
くなるものと考えられる。一方、非経口伝播タイプの非
A非B型肝炎については、主に輸血により感染し、現在
受血者の15〜17%の血清肝炎発症者(日本において
年間15〜30万人く推定))の95%が、この非経口
伝播タイプの非A非B型肝炎と考えられている。更にこ
れらの非A非B型肝炎発症者のうち約50%は慢性肝炎
へ移行し10〜20年後には20%の患者において肝硬
変・肝癌への転帰を取るものと推定されている。更に該
非A、lp B型肝炎は輸血のほかに、複数人に共通で
針を使用した予防接種あるいは何等かの血液・体液など
を介する行為により、非A非B型肝炎のウィルス保持者
(日本において推定400万人)および慢性肝炎患者(
日本において推定90万人)が蓄積増加してきている。
現在特に輸血による非A非B型肝炎の新たなる患者の発
生を防ぐ有効な方法が求められている。その一つの方法
として輸血に使いうる血液の安全性の一目安として従来
トランスアミナーゼGPT値が35以下としていた基準
値を25以下とした。しかしながらGPT値25以下の
血液のみ一応安全としてもなお輸血患者の15%は血清
肝炎となる故に、より有効な安全器の判定方法が求めら
れている。1987年米国0カイロン社によって輸血性
非A非B型肝炎の原因ウィルスの一種と考えられるC型
肝炎ウィルスが発表されたくヨーロッパ特許03182
16 、1989年5月31日公開)。該発表によると
輸血性非A非B型肝炎を発症せしめたチンパンジーの血
清より抽出した核酸を遺伝子工学的手法により分離増幅
しタンパク質を発現せしめ、非A非B型肝炎患者血清と
反応するものを選抜することにより原因ウィルスのC型
肝炎ウィルス(以後“HCV″と略称する〉を特定し、
特定の抗原タンパク質を用いて血清と反応するものはC
型肝炎と判定されるとしている。更にカイロン社発表の
具体例のC型肝炎診断キットにおいてはHCVの非構造
蛋白抗原を用いて患者血清中に存在するC型肝炎ウィル
ス抗体を検出するシステムによっているために、HCV
感染初期に既にHCV保持者となっているにも拘らず、
HCV抗体陰性と判定される可能性がある。このような
血清についてはl(CV含有面でありなからHCV抗体
陰性の判定により一応輸血に使用しても安全であると誤
って判断される。該発表ではHCVのジェノミック核酸
は一本鎖RNAであり、その塩基配列の一部も記載され
ており、C型肝炎の診断のための特定の塩基配列につい
ても一部述べている。
生を防ぐ有効な方法が求められている。その一つの方法
として輸血に使いうる血液の安全性の一目安として従来
トランスアミナーゼGPT値が35以下としていた基準
値を25以下とした。しかしながらGPT値25以下の
血液のみ一応安全としてもなお輸血患者の15%は血清
肝炎となる故に、より有効な安全器の判定方法が求めら
れている。1987年米国0カイロン社によって輸血性
非A非B型肝炎の原因ウィルスの一種と考えられるC型
肝炎ウィルスが発表されたくヨーロッパ特許03182
16 、1989年5月31日公開)。該発表によると
輸血性非A非B型肝炎を発症せしめたチンパンジーの血
清より抽出した核酸を遺伝子工学的手法により分離増幅
しタンパク質を発現せしめ、非A非B型肝炎患者血清と
反応するものを選抜することにより原因ウィルスのC型
肝炎ウィルス(以後“HCV″と略称する〉を特定し、
特定の抗原タンパク質を用いて血清と反応するものはC
型肝炎と判定されるとしている。更にカイロン社発表の
具体例のC型肝炎診断キットにおいてはHCVの非構造
蛋白抗原を用いて患者血清中に存在するC型肝炎ウィル
ス抗体を検出するシステムによっているために、HCV
感染初期に既にHCV保持者となっているにも拘らず、
HCV抗体陰性と判定される可能性がある。このような
血清についてはl(CV含有面でありなからHCV抗体
陰性の判定により一応輸血に使用しても安全であると誤
って判断される。該発表ではHCVのジェノミック核酸
は一本鎖RNAであり、その塩基配列の一部も記載され
ており、C型肝炎の診断のための特定の塩基配列につい
ても一部述べている。
しかし−重鎖RNAをゲノムとするウィルスにおいては
塩基配列がかなり変異していることが多く、HCVにお
いても同様と考えられることがらHC■関連核酸を高感
度に検出する方法については、未だ不十分と言わざるを
得ない。
塩基配列がかなり変異していることが多く、HCVにお
いても同様と考えられることがらHC■関連核酸を高感
度に検出する方法については、未だ不十分と言わざるを
得ない。
以上の記述からも明らかのように、先述のカイロン社発
表の特定抗原および塩基配列が全ての非A非B型肝炎の
診断に有効とは考えられず、なお検討が必要であること
は明白である。
表の特定抗原および塩基配列が全ての非A非B型肝炎の
診断に有効とは考えられず、なお検討が必要であること
は明白である。
く課題を解決するための手段〉
検体からの核酸の調整方法には、プロテネスにのごとき
タンパク分解酵素を用いて行うことが一般的であるが、
この場合比較的多量のサンプルを必要とする欠点があっ
た。本発明においてはかかる欠点をタンパク変性剤を用
いることにより微量検体からでも高感度かつ簡便に検出
する方法を提供するものである。即ち、本発明は非経口
的に怒染伝播する非A非B型肝炎の一種であるHCVに
関連する核酸を微量の検体から簡便高感度に検出する方
法に関する。更に詳しくは、微量の検体を蛋白変性剤に
て処理後、除蛋白して得られた核酸からcDNAを合成
し、ついでcDNAに対し、DNAポリメラーゼおよび
プライマーDNAセットを用いて、cDNAを増幅する
ことを特徴とするC型肝炎ウィルスおよびその関連核酸
を簡便高感度に検出する方法である。
タンパク分解酵素を用いて行うことが一般的であるが、
この場合比較的多量のサンプルを必要とする欠点があっ
た。本発明においてはかかる欠点をタンパク変性剤を用
いることにより微量検体からでも高感度かつ簡便に検出
する方法を提供するものである。即ち、本発明は非経口
的に怒染伝播する非A非B型肝炎の一種であるHCVに
関連する核酸を微量の検体から簡便高感度に検出する方
法に関する。更に詳しくは、微量の検体を蛋白変性剤に
て処理後、除蛋白して得られた核酸からcDNAを合成
し、ついでcDNAに対し、DNAポリメラーゼおよび
プライマーDNAセットを用いて、cDNAを増幅する
ことを特徴とするC型肝炎ウィルスおよびその関連核酸
を簡便高感度に検出する方法である。
本発明においてはプライマーDNAセットとして下記D
NA群1およびDNA群2よりそれぞれ少なくとも一種
選ばれなオリゴDNAを用いることが好適である。
NA群1およびDNA群2よりそれぞれ少なくとも一種
選ばれなオリゴDNAを用いることが好適である。
DNA群1:
オリゴDNAI (5’−GGTCATAGTGGG
CAGGGTCGTCTT−3’)オリゴDNA3
(5’−ACCTGGTAGCGTACCAAGCC−
3’オリゴDNA5 (5’−CTGCTTGTGG
ATGATGCTAC−3’オリゴDNA7 (5’
−GACGCCCACTTCTTGTCCCA−3オリ
ゴDNA9 5’−GAGTGGGGAGAACCT
TCCTT−3’オリゴDNAII +5’ −ACC
GGCTATACCGGCGACTT−3’オリゴDN
A13 (5’ −GTCACCCAGACAGTCG
ATTT−3’ )オリゴDNA21 <5’ −GG
CGACACTCCACCATAGCT−3’ )オリ
ゴDNA23 (5’ −TGTGAGGAACTAC
TGTC−3’ )オリゴDNA25+5’ −TTC
ACGCAGAAAGGTCTG−3’ )DNA群2
: オリゴDNA2 5’−CCAGGCAGCGTTG
ACAAGCCCGCCAAG−3’)オリゴDNA4
(5’−TATGCTTCGCCCAGAAGGT
C−3’オリゴDNA6 (5’−TCCACACG
TGCAGTTGCGCT−3’オリゴDNAl0 (
5’ −ATGAAGCAATGGCGGGGTTA−
3’むゴDNA12 +5’ −CATGCATGTC
ATGATGTATT−3’オリゴDNA14 (5’
−TCCACATCTGGTCCCACGAT−3’
オリゴDNA22 (5’ −GGTGCACGGTC
TACGAGACC−3’オリゴDNA24 5’−T
TTACCAAGAAAGGACCC−3’)オリゴD
NA26 5’−AACACTACTCGGCTAGC
AGT−31本発明においては、)ICV関連核酸の存
在を診断しようとする対象検体は微量の血清または肝臓
組織である。血清の場合1〜500μ(、特に5〜10
0μpである。肝臓組織の場合1〜500μg、特に5
〜100μgである。
CAGGGTCGTCTT−3’)オリゴDNA3
(5’−ACCTGGTAGCGTACCAAGCC−
3’オリゴDNA5 (5’−CTGCTTGTGG
ATGATGCTAC−3’オリゴDNA7 (5’
−GACGCCCACTTCTTGTCCCA−3オリ
ゴDNA9 5’−GAGTGGGGAGAACCT
TCCTT−3’オリゴDNAII +5’ −ACC
GGCTATACCGGCGACTT−3’オリゴDN
A13 (5’ −GTCACCCAGACAGTCG
ATTT−3’ )オリゴDNA21 <5’ −GG
CGACACTCCACCATAGCT−3’ )オリ
ゴDNA23 (5’ −TGTGAGGAACTAC
TGTC−3’ )オリゴDNA25+5’ −TTC
ACGCAGAAAGGTCTG−3’ )DNA群2
: オリゴDNA2 5’−CCAGGCAGCGTTG
ACAAGCCCGCCAAG−3’)オリゴDNA4
(5’−TATGCTTCGCCCAGAAGGT
C−3’オリゴDNA6 (5’−TCCACACG
TGCAGTTGCGCT−3’オリゴDNAl0 (
5’ −ATGAAGCAATGGCGGGGTTA−
3’むゴDNA12 +5’ −CATGCATGTC
ATGATGTATT−3’オリゴDNA14 (5’
−TCCACATCTGGTCCCACGAT−3’
オリゴDNA22 (5’ −GGTGCACGGTC
TACGAGACC−3’オリゴDNA24 5’−T
TTACCAAGAAAGGACCC−3’)オリゴD
NA26 5’−AACACTACTCGGCTAGC
AGT−31本発明においては、)ICV関連核酸の存
在を診断しようとする対象検体は微量の血清または肝臓
組織である。血清の場合1〜500μ(、特に5〜10
0μpである。肝臓組織の場合1〜500μg、特に5
〜100μgである。
本発明ではまず微量検体を蛋白変性剤にて処理後、除蛋
白した水溶液を調製する蛋白変性剤処理法としては、塩
酸グアニジンあるいはグアニジンチオシアネートの如き
変性剤による処理方法、デオキシコール酸ナトリウム塩
、ラウリル硫酸ナトリウム塩、あるいはN−ラウロイル
サルコシンナトリウム塩の如きイオン性の界面活性性の
変性剤による変性処理、更にTriton X−100
(ポリエチレングリコールモノ−p−インオクチルフェ
ニルエーテル) 、 Br1ji−58<ポリオキシエ
チレンセチルアルコールエーテル) 、 Br1ji−
35(ポリオキシエチレンラウリルアルコールエーテル
)7またはTween (ポリオキシエチレンソルビ
タンモノラウレート、ポリオキシエチレンソルビタンモ
ノオレート、ポリオキシエチレンソルビタンモノパルミ
テート、ポリオキシエチレンソルビタンモノステアレー
ト等)の如き中性の界面活性剤による変性処理方法があ
る。
白した水溶液を調製する蛋白変性剤処理法としては、塩
酸グアニジンあるいはグアニジンチオシアネートの如き
変性剤による処理方法、デオキシコール酸ナトリウム塩
、ラウリル硫酸ナトリウム塩、あるいはN−ラウロイル
サルコシンナトリウム塩の如きイオン性の界面活性性の
変性剤による変性処理、更にTriton X−100
(ポリエチレングリコールモノ−p−インオクチルフェ
ニルエーテル) 、 Br1ji−58<ポリオキシエ
チレンセチルアルコールエーテル) 、 Br1ji−
35(ポリオキシエチレンラウリルアルコールエーテル
)7またはTween (ポリオキシエチレンソルビ
タンモノラウレート、ポリオキシエチレンソルビタンモ
ノオレート、ポリオキシエチレンソルビタンモノパルミ
テート、ポリオキシエチレンソルビタンモノステアレー
ト等)の如き中性の界面活性剤による変性処理方法があ
る。
塩酸グアニジンあるいはグアニジンチオシアネートの如
き変性剤による処理の場合は、これらの変性剤の検体処
理溶液で終濃度0.1〜IOM、好ましくは1〜6Mと
なるように添加する。デオキシコール酸ナトリウム塩、
ラウリル硫酸ナトリウム塩、あるいはN−ラウロイルサ
ルコシンナトリウム塩の如きイオン性の界面活性性の変
性剤による変性処理の場合は、これらの界面活性性の変
性剤を検体処理溶液での終濃度が0.05〜20%、好
ましくは0,5〜10%となるように添加する。
き変性剤による処理の場合は、これらの変性剤の検体処
理溶液で終濃度0.1〜IOM、好ましくは1〜6Mと
なるように添加する。デオキシコール酸ナトリウム塩、
ラウリル硫酸ナトリウム塩、あるいはN−ラウロイルサ
ルコシンナトリウム塩の如きイオン性の界面活性性の変
性剤による変性処理の場合は、これらの界面活性性の変
性剤を検体処理溶液での終濃度が0.05〜20%、好
ましくは0,5〜10%となるように添加する。
Triton X−100(ポリエチレングリコールモ
ノ−p−インオクチルフェニルエーテル) 、 Br1
ji−58〈ポリオキシエチレンセチルアルコールエー
テル)、 Br1ji−35<ポリオキシエチレンラウ
リルアルコールエーテル)、またはTween (ポ
リオキシエチレンソルビタンモノラウレート、ポリオキ
シエチレンソルビタンモノオレート、ポリオキシエチレ
ンソルビタンモノパルミテート、ポリオキシエチレンソ
ルビタンモノステアレート等)の如き中性の界面活性剤
による変性処理の場合、これらの界面活性剤の終濃度を
0.2〜30%、好ましくは0.5〜20%となるよう
にする。
ノ−p−インオクチルフェニルエーテル) 、 Br1
ji−58〈ポリオキシエチレンセチルアルコールエー
テル)、 Br1ji−35<ポリオキシエチレンラウ
リルアルコールエーテル)、またはTween (ポ
リオキシエチレンソルビタンモノラウレート、ポリオキ
シエチレンソルビタンモノオレート、ポリオキシエチレ
ンソルビタンモノパルミテート、ポリオキシエチレンソ
ルビタンモノステアレート等)の如き中性の界面活性剤
による変性処理の場合、これらの界面活性剤の終濃度を
0.2〜30%、好ましくは0.5〜20%となるよう
にする。
また検体からの蛋白成分の変性をより効果的にするため
に、上記の各種の変性剤の単独使用の外、二種以上の併
用は好ましいものである。更に蛋白変性溶液にβ−メル
カプトエタノールの如き蛋白変性剤の添加もまた好まし
いものであり、かかる変性剤の好ましい添加量として終
濃度0.1〜2%である。
に、上記の各種の変性剤の単独使用の外、二種以上の併
用は好ましいものである。更に蛋白変性溶液にβ−メル
カプトエタノールの如き蛋白変性剤の添加もまた好まし
いものであり、かかる変性剤の好ましい添加量として終
濃度0.1〜2%である。
また検体からの蛋白成分の変性処理温度は、核酸、特に
−重鎖のRNAが化学的な変性を受けない条件であれば
何等特別な制限を受けないが、10〜98℃で行える。
−重鎖のRNAが化学的な変性を受けない条件であれば
何等特別な制限を受けないが、10〜98℃で行える。
変性処理時間として1秒〜2時間、好ましくは10秒〜
30分間である。
30分間である。
本発明においては蛋白変性剤にて処理後、次に除蛋白を
行う。除蛋白はフェノールまたはフェノール/クロロフ
ォルム混合液さらに必要な場合イソアミルアルコールを
フェノールの1/10〜1/20程度添加した混合液に
て1回以上抽出操作を行い、水相を回収し3M酢酸ナト
リウムの如き適当な塩溶液を10分の1容量添加後つい
てエタノールを2〜3倍容量またはインプロパツールを
等容量加えて高速遠心して沈澱として核酸+11を得る
ことができる。本発明においては、上記のフェノールあ
るいはフェノール/クロロフォルムによる抽出除蛋白操
作後得られた水相に対して、り四ロフォルムまたはヂエ
チルエーテルの如き難水溶性の溶剤にて水相からフェノ
ールを除去するのみでも核酸の水溶液として得ることが
できる。
行う。除蛋白はフェノールまたはフェノール/クロロフ
ォルム混合液さらに必要な場合イソアミルアルコールを
フェノールの1/10〜1/20程度添加した混合液に
て1回以上抽出操作を行い、水相を回収し3M酢酸ナト
リウムの如き適当な塩溶液を10分の1容量添加後つい
てエタノールを2〜3倍容量またはインプロパツールを
等容量加えて高速遠心して沈澱として核酸+11を得る
ことができる。本発明においては、上記のフェノールあ
るいはフェノール/クロロフォルムによる抽出除蛋白操
作後得られた水相に対して、り四ロフォルムまたはヂエ
チルエーテルの如き難水溶性の溶剤にて水相からフェノ
ールを除去するのみでも核酸の水溶液として得ることが
できる。
本発明においてはこのようにして得た核酸に対しDNA
オリゴマーまたはD N Aオリゴマーの混合物、好ま
しくはDNAのテトラマールオクタマーの混合物、更に
好ましくはDNAのヘプタマールペンタマーの混合物、
特に好ましくはDNAヘキサマーの混合物、例えばベー
リンガー・マンハイム山之内■の゛ランダム′″p(d
N)6の如きものを用いてcDNAを合成する。さらに
該cDNAを合成するに際して逆転写酵素を使用する。
オリゴマーまたはD N Aオリゴマーの混合物、好ま
しくはDNAのテトラマールオクタマーの混合物、更に
好ましくはDNAのヘプタマールペンタマーの混合物、
特に好ましくはDNAヘキサマーの混合物、例えばベー
リンガー・マンハイム山之内■の゛ランダム′″p(d
N)6の如きものを用いてcDNAを合成する。さらに
該cDNAを合成するに際して逆転写酵素を使用する。
逆転写酵素としては一般市販のものが使用でき特定の制
限はないが、AMV (エイビアン・ミエロブラストシ
・ウィルス)の逆転写酵素、R3V(ラウス・サルコー
マ・ウィルス)の逆転写酵素。
限はないが、AMV (エイビアン・ミエロブラストシ
・ウィルス)の逆転写酵素、R3V(ラウス・サルコー
マ・ウィルス)の逆転写酵素。
M−MLV(モロニー・ミュリーン・リュウケミア・ウ
ィルス)の逆転写酵素などが、使用可能である。このな
かでもM−MLVの逆転写酵素は合成されなcDNAに
対してエンドヌクレアーゼ活性がなくかつRNaseH
酵素活性が低いので好ましく使用される。これらの逆転
写酵素は各々の酵素の供給者の使用能書に従って使用し
cDNAを調製することができる。cDNAを合成する
際に使用したランダムなりNAオリゴマーの過剰量を必
要ならば、一般に知られたアルコール沈澱やゲル濾過の
如き操作により除去する。
ィルス)の逆転写酵素などが、使用可能である。このな
かでもM−MLVの逆転写酵素は合成されなcDNAに
対してエンドヌクレアーゼ活性がなくかつRNaseH
酵素活性が低いので好ましく使用される。これらの逆転
写酵素は各々の酵素の供給者の使用能書に従って使用し
cDNAを調製することができる。cDNAを合成する
際に使用したランダムなりNAオリゴマーの過剰量を必
要ならば、一般に知られたアルコール沈澱やゲル濾過の
如き操作により除去する。
本発明においては、次にDNAポリメラーゼを用いてc
DNAの増幅を行う。使用するDNAポリメラーゼとし
ては大腸菌DNAポリメラーゼ■。
DNAの増幅を行う。使用するDNAポリメラーゼとし
ては大腸菌DNAポリメラーゼ■。
T4DNAポリメラーゼ、あるいは耐熱DNAポリメラ
ーゼで知られる7thDNAポリメラーゼまたはTaq
DNAポリメラーゼなどを挙げることができる。これら
のDNAポリメラーゼは夫々供給者の使用能書に従って
使用し得る。これらのDNAポリメラーゼのうち、耐熱
DNAポリメラーゼで知られるTthDNAポリメラー
ゼまたはTaqDNAポリメラーゼが好ましい。使用す
る7thDNAポリメラーゼは東洋紡製(No、 TT
H−103)、TaqDNAポリメラーゼはProme
ga社〈例えばno、 101423)、ボクスイ・ブ
ラウン社、ベセスダ・リサーチ・ラボラトリ−社、宝酒
造社などから夫々販売されているものを使用できる。こ
れらのDNAポリメラーゼのうちTthDNAポリメラ
ーゼ、 Promega社のT a q D N Aポ
リメラーゼが酵素活性が高いので一層好ましい。
ーゼで知られる7thDNAポリメラーゼまたはTaq
DNAポリメラーゼなどを挙げることができる。これら
のDNAポリメラーゼは夫々供給者の使用能書に従って
使用し得る。これらのDNAポリメラーゼのうち、耐熱
DNAポリメラーゼで知られるTthDNAポリメラー
ゼまたはTaqDNAポリメラーゼが好ましい。使用す
る7thDNAポリメラーゼは東洋紡製(No、 TT
H−103)、TaqDNAポリメラーゼはProme
ga社〈例えばno、 101423)、ボクスイ・ブ
ラウン社、ベセスダ・リサーチ・ラボラトリ−社、宝酒
造社などから夫々販売されているものを使用できる。こ
れらのDNAポリメラーゼのうちTthDNAポリメラ
ーゼ、 Promega社のT a q D N Aポ
リメラーゼが酵素活性が高いので一層好ましい。
本発明において、DNAポリメラーゼを用いてDNAの
増幅を行うに際して使用するブライマーとしてオリゴD
NAセットを用いる。オリゴDNAセットとしては前記
のDNA群1のオリゴDNAのなかの少なくとも一種お
よびDNAN2O2リゴDNAのなかの少なくとも一種
の組合せのセットが好適である。プライマーとしてどこ
を選定するかによって検出状況が変化し、場合によって
は検出不能となる故にこの選定組合せは大事である。
増幅を行うに際して使用するブライマーとしてオリゴD
NAセットを用いる。オリゴDNAセットとしては前記
のDNA群1のオリゴDNAのなかの少なくとも一種お
よびDNAN2O2リゴDNAのなかの少なくとも一種
の組合せのセットが好適である。プライマーとしてどこ
を選定するかによって検出状況が変化し、場合によって
は検出不能となる故にこの選定組合せは大事である。
本発明においてオリゴDNAセットとして好ましい組合
せは、オリゴD N A 11−10のセット、オリゴ
D N A 11−2のセット、オリゴD N A 1
1−4のセット、オリゴD N A 11−12のセッ
ト、オリゴDNA1l−14のセット、オリゴD N
A 13−2のセットオリゴD N A 13−4のセ
ット、オリゴD N A 13〜12のセット、オリゴ
D N A 13−14のセット、オリゴD N A
7−2のセット、オリゴD N A 7−4のセットオ
リゴDNA7−12のセット、オリゴD N A 7−
14のセット、オリゴD N A 3−10のセット、
オリゴDNA3−4のセット、オリゴD N A 3−
12のセット、オリゴD N A 21−22のセット
、オリゴD N A 21−26のセット、オリゴD
N A 21−24のセット、オリゴDNA23−22
のセット、オリゴD N A 23−26のセット、オ
リゴD N A 23−24のセット、オリゴDNA
25−22のセット、オリゴD N A 25−26の
セット。
せは、オリゴD N A 11−10のセット、オリゴ
D N A 11−2のセット、オリゴD N A 1
1−4のセット、オリゴD N A 11−12のセッ
ト、オリゴDNA1l−14のセット、オリゴD N
A 13−2のセットオリゴD N A 13−4のセ
ット、オリゴD N A 13〜12のセット、オリゴ
D N A 13−14のセット、オリゴD N A
7−2のセット、オリゴD N A 7−4のセットオ
リゴDNA7−12のセット、オリゴD N A 7−
14のセット、オリゴD N A 3−10のセット、
オリゴDNA3−4のセット、オリゴD N A 3−
12のセット、オリゴD N A 21−22のセット
、オリゴD N A 21−26のセット、オリゴD
N A 21−24のセット、オリゴDNA23−22
のセット、オリゴD N A 23−26のセット、オ
リゴD N A 23−24のセット、オリゴDNA
25−22のセット、オリゴD N A 25−26の
セット。
オリゴD N A 25−24のセットである。
更に本発明においては、これらのオリゴDNAのセット
の2セット以上の組合せで核酸増幅反応を実施すること
は、−層核酸の検出をよくするので好ましい。
の2セット以上の組合せで核酸増幅反応を実施すること
は、−層核酸の検出をよくするので好ましい。
検出はDNA発色剤にて発色させる、あるいは特定の化
合物にて標識された既知のC型肝炎ウィルスの増幅核酸
プローブとのハイブリダイゼーションにより行うことが
好適である。
合物にて標識された既知のC型肝炎ウィルスの増幅核酸
プローブとのハイブリダイゼーションにより行うことが
好適である。
検出は増幅させたDNAをアガロースゲル電気泳動し次
いでエチヂウムブロマイドにて染色したものをUV照射
して発色せしめ特定核酸バンドを検出する。DNAのア
ガロースゲル電気泳動・エチヂウムブロマイドによる染
色・UV照射による発色特定核酸バンドの検出の操作は
当業界一般公知の方法で実施できる。
いでエチヂウムブロマイドにて染色したものをUV照射
して発色せしめ特定核酸バンドを検出する。DNAのア
ガロースゲル電気泳動・エチヂウムブロマイドによる染
色・UV照射による発色特定核酸バンドの検出の操作は
当業界一般公知の方法で実施できる。
特定DNAバンドが発色で見られないときは、再度核酸
の増幅を行うか、あるいは特定の化合物にて標識された
既知のHCVの増幅核酸とのサザーンハイプリダイゼー
ションを行う。再度の核酸増幅は前記1回目の核酸増幅
で得られた水溶液の一部〈例えば115〜1/20)に
対してプライマーとしてのオリゴDNAは1回目増幅で
使用したと同じオリゴDNAセットまたは該オリゴDN
Aのそれぞれ3′側下流に位!するオリゴDNAを使用
できる。
の増幅を行うか、あるいは特定の化合物にて標識された
既知のHCVの増幅核酸とのサザーンハイプリダイゼー
ションを行う。再度の核酸増幅は前記1回目の核酸増幅
で得られた水溶液の一部〈例えば115〜1/20)に
対してプライマーとしてのオリゴDNAは1回目増幅で
使用したと同じオリゴDNAセットまたは該オリゴDN
Aのそれぞれ3′側下流に位!するオリゴDNAを使用
できる。
サザーンハイプリダイゼーションを行って検出する場合
、使用するプローブ核酸としてはジゴキシゲニンあるい
はビオチンにて標識されなHCVの増幅核酸を用いる。
、使用するプローブ核酸としてはジゴキシゲニンあるい
はビオチンにて標識されなHCVの増幅核酸を用いる。
ここで用いる70−ブ用核酸はさきに記載したと同様の
方法でも調製できるが、検出しようとするDNAと同し
領域内の塩基配列であって15塩基以上であればよい。
方法でも調製できるが、検出しようとするDNAと同し
領域内の塩基配列であって15塩基以上であればよい。
ハイブリダイゼーションのプローブに使用する核酸にジ
ゴキシゲニンを標識として入れるにはベーリンガー・マ
ンハイム社製のDNAラベリング・デテクション・キッ
ト(no、 1.093657)を用いて、あるいはビ
オチンを標識として入れるにはベセスダ・リサーチ・ラ
ボラトリ−社製のビオチンラベリング・キットなどを用
いて、供給者の使用マニュアルに従って行うことができ
る。
ゴキシゲニンを標識として入れるにはベーリンガー・マ
ンハイム社製のDNAラベリング・デテクション・キッ
ト(no、 1.093657)を用いて、あるいはビ
オチンを標識として入れるにはベセスダ・リサーチ・ラ
ボラトリ−社製のビオチンラベリング・キットなどを用
いて、供給者の使用マニュアルに従って行うことができ
る。
また、これらの標識核酸を用いたハイブリダイゼーショ
ンは、夫々の検出システム即ちジゴキシゲニン標識の場
合は上記デテクション・キット(no、 109365
7)にて、ビオチン標識の場合はベセスダ・リサーチ・
ラボラトリ−社製のDNA検出システム(no、 82
79SA)を用いて、各供給者の使用能書に従って実施
し得る。
ンは、夫々の検出システム即ちジゴキシゲニン標識の場
合は上記デテクション・キット(no、 109365
7)にて、ビオチン標識の場合はベセスダ・リサーチ・
ラボラトリ−社製のDNA検出システム(no、 82
79SA)を用いて、各供給者の使用能書に従って実施
し得る。
〈発明の効果〉
本発明の方法はHCVの抗原抗体系によるC型肝炎判定
と異なりHCV関連核酸を増幅検出するので、HCV感
染初期あるいはHCV抗体が非常に少ない場合にも高感
度にて)ICV関連核酸を検出できるので有用な方法で
ある。
と異なりHCV関連核酸を増幅検出するので、HCV感
染初期あるいはHCV抗体が非常に少ない場合にも高感
度にて)ICV関連核酸を検出できるので有用な方法で
ある。
〈実施例〉
以下実施例を挙げて更に具体的に述べるが、本発明はこ
れらの実施例に限るものではない。
れらの実施例に限るものではない。
〈実施例1および比較例1〉
非A非B型慢性肝炎と診断されかつ米国オーツ社製HC
V抗体<ELISA)テストシステムで抗体陽性者の血
清50μgにグアニヂンチオシアネート水溶液(5Mグ
アニジンチオシアネート/25mMクエン酸ナトリウム
1065%サルコシル10.2Mβ−メルカプトエタノ
ール)200μgを添加し37℃・30分間・1100
rpで振盪後、フェノール/り四ロフォルム(4/1
)混合液400μpで3回抽出した。この水相に10分
の1容の3M酢酸ナトリウム(pH5,4)、1Mgグ
リコーゲン、2.5倍容のエタノールを添加し、−80
℃。30分間保持後、遠心して得られたペレットを70
%エタノール次いで100%エタノールで洗浄後、核酸
を得、これを20μfJ TE [10mM Tris
HCI / 1+nM EDTA (PH7,5)
]水溶液に溶解した。
V抗体<ELISA)テストシステムで抗体陽性者の血
清50μgにグアニヂンチオシアネート水溶液(5Mグ
アニジンチオシアネート/25mMクエン酸ナトリウム
1065%サルコシル10.2Mβ−メルカプトエタノ
ール)200μgを添加し37℃・30分間・1100
rpで振盪後、フェノール/り四ロフォルム(4/1
)混合液400μpで3回抽出した。この水相に10分
の1容の3M酢酸ナトリウム(pH5,4)、1Mgグ
リコーゲン、2.5倍容のエタノールを添加し、−80
℃。30分間保持後、遠心して得られたペレットを70
%エタノール次いで100%エタノールで洗浄後、核酸
を得、これを20μfJ TE [10mM Tris
HCI / 1+nM EDTA (PH7,5)
]水溶液に溶解した。
このようにして得られた核酸のTE溶液10μρに対し
て50mM Tris HCI(pH8,3)/75m
bl KCI /10mMヂチオスレイトール/ 5
mM MgCb / 4 mll!燐酸ナトリウム
/1mM dNTPs (N=、A、C,G。
て50mM Tris HCI(pH8,3)/75m
bl KCI /10mMヂチオスレイトール/ 5
mM MgCb / 4 mll!燐酸ナトリウム
/1mM dNTPs (N=、A、C,G。
T)/1.6μgランダムプライマー(ベーリンガー・
マンハイム社製no、1034731) 、 0.2u
/μJ) AMV逆転写酵素(総量20μp)となるよ
うに各成分を加え、42°Cで1時間cDNAの合成を
行った。
マンハイム社製no、1034731) 、 0.2u
/μJ) AMV逆転写酵素(総量20μp)となるよ
うに各成分を加え、42°Cで1時間cDNAの合成を
行った。
このようにして得られたcDNA溶液に対して10倍の
耐熱DNAポリメラーゼ溶液<0.5MKCO,1M
Tris )ICI、 15mM NgCh 、 0
.1%ゼラチン、0.1%Triton X−100の
水溶液)5μρ、滅菌水29μfJ 、dNTPsミク
スチャ−(dATP、 dcTPdGTP、 dTTP
各々の1.25mM溶液)の8μg、下記オリゴDNA
、13および14<各オリゴDNA、(濃度0.1 u
g/1tfJ >を各々2.5μJ))、更にTaqD
NAポリメラーゼ(Promega社製no、 101
423)1.25ユニツト、更に流動パラフィン50μ
gを加え、95℃・1分間、次いで57℃・2分間、次
いで72°C・3分間更にこの3段階の温度時間変化の
操作を30回繰り返し、最後に72℃で7分間ポリメラ
ーゼ反応を行った。次に反応溶液8μρを2%アガロー
スゲル上で電気泳動しエチヂウムブロマイドで染色後、
UV照射し大きさ約450bpのDNAバンドを観察し
た。
耐熱DNAポリメラーゼ溶液<0.5MKCO,1M
Tris )ICI、 15mM NgCh 、 0
.1%ゼラチン、0.1%Triton X−100の
水溶液)5μρ、滅菌水29μfJ 、dNTPsミク
スチャ−(dATP、 dcTPdGTP、 dTTP
各々の1.25mM溶液)の8μg、下記オリゴDNA
、13および14<各オリゴDNA、(濃度0.1 u
g/1tfJ >を各々2.5μJ))、更にTaqD
NAポリメラーゼ(Promega社製no、 101
423)1.25ユニツト、更に流動パラフィン50μ
gを加え、95℃・1分間、次いで57℃・2分間、次
いで72°C・3分間更にこの3段階の温度時間変化の
操作を30回繰り返し、最後に72℃で7分間ポリメラ
ーゼ反応を行った。次に反応溶液8μρを2%アガロー
スゲル上で電気泳動しエチヂウムブロマイドで染色後、
UV照射し大きさ約450bpのDNAバンドを観察し
た。
オリゴDNA13: 5’−GTCACCCAGAC
AGTCGATTT−3’オリゴDNA14: 5’
−TCCACATCTGGTCCCACGAT−3’く
比較例1〉 実施例1の血清25μ℃に対して、米国オーツ社製HC
V抗体<ELISA)テストシステムにてHCV抗体を
検出しようとしたが、陽性の判定を明確に得ることがで
きなかった。
AGTCGATTT−3’オリゴDNA14: 5’
−TCCACATCTGGTCCCACGAT−3’く
比較例1〉 実施例1の血清25μ℃に対して、米国オーツ社製HC
V抗体<ELISA)テストシステムにてHCV抗体を
検出しようとしたが、陽性の判定を明確に得ることがで
きなかった。
実施例1および比較例1からも明らかなように、本発明
の方法によれば、微少量の検体を使用して、逆転者によ
りcDNAを調製し、適当なオリゴDNAセットのプラ
イマーを用いてDNAポリメラーゼ反応を繰り返し行う
ことによりC型肝炎のRNAを検出することができ、米
国オーツ社製HC■抗体検出キットにて検出困難な検体
でもC型肝炎を高感度にかつ簡便に検出でき、本発明の
方法が優れた方法であることが判る。
の方法によれば、微少量の検体を使用して、逆転者によ
りcDNAを調製し、適当なオリゴDNAセットのプラ
イマーを用いてDNAポリメラーゼ反応を繰り返し行う
ことによりC型肝炎のRNAを検出することができ、米
国オーツ社製HC■抗体検出キットにて検出困難な検体
でもC型肝炎を高感度にかつ簡便に検出でき、本発明の
方法が優れた方法であることが判る。
〈実施例2および比較例2〉
非A非B型慢性肝炎と診断されかつ米国オーツ社製HC
V抗体(ELI SA)テストシステムで抗体陽性者の
血清5μgにグアニヂンチオシアネート水溶液<2Mグ
アニジンチオシアネート15%Triton X−10
0) 15 μfJを添加し50℃・3分間更に95℃
・2分間保持後、フェノール/クロロフォルム(4,/
1)混合液30μρで3回抽出した。
V抗体(ELI SA)テストシステムで抗体陽性者の
血清5μgにグアニヂンチオシアネート水溶液<2Mグ
アニジンチオシアネート15%Triton X−10
0) 15 μfJを添加し50℃・3分間更に95℃
・2分間保持後、フェノール/クロロフォルム(4,/
1)混合液30μρで3回抽出した。
この水相をヂエチルエーテル30μfで3回抽出し得ら
れた水相の5μgに対して50mM Tris HC(
pH8,3) / 75mM KCI/ 10mMヂチ
オスレイトール15mM MgCh /4mMm酸ナ
トリウム/1mMdNTPs (N=A、C,G、T)
/1.6 μgシランムプライマー〈ベーリンガー・マ
ンハイム社製n01034731)、0.2u/μρA
MV逆転写酵素(総量20μρ)となるように各成分を
加え、42℃で1時間cDNAの合成反応を行った。
れた水相の5μgに対して50mM Tris HC(
pH8,3) / 75mM KCI/ 10mMヂチ
オスレイトール15mM MgCh /4mMm酸ナ
トリウム/1mMdNTPs (N=A、C,G、T)
/1.6 μgシランムプライマー〈ベーリンガー・マ
ンハイム社製n01034731)、0.2u/μρA
MV逆転写酵素(総量20μρ)となるように各成分を
加え、42℃で1時間cDNAの合成反応を行った。
このようにして得られたcDNA溶液10μgに対して
10倍の耐熱DNAポリメラーゼ溶液<0.5MKCl
、 0.1M Tris HCI、 15mM
MgCl。、 0.1%ゼラチン、0.1%Trito
n X−100の水溶液)5μρ、滅菌水29μρ、d
NTPsミクスチャ−(clATPdCTP、 dGT
P、 dTTP各々の1.25mM溶液)の8ufJ
、下記オリゴD N A 13および14<各オリゴD
NA (濃度0.1μf/μ、!2)を各々2.5μg
)更にTaqDNAポリメラーゼ(Promega社製
no、10142311.25ユニツト、更に流動パ
ラフィン50μρを加え、95℃・2分間処理後、次い
で92℃・30秒間、55℃・1分間、72℃・2分間
の3段階の温度・時間変化の操作を40回繰り返し、最
後に72℃・7分間ポリメラーゼ反応を行った。次に反
応溶液8μgを2%アガロースゲル上で電機泳動しエチ
ヂウムブロマイドで染色後、UV照射し大きさ約450
bpのDNAバンドを観察した。
10倍の耐熱DNAポリメラーゼ溶液<0.5MKCl
、 0.1M Tris HCI、 15mM
MgCl。、 0.1%ゼラチン、0.1%Trito
n X−100の水溶液)5μρ、滅菌水29μρ、d
NTPsミクスチャ−(clATPdCTP、 dGT
P、 dTTP各々の1.25mM溶液)の8ufJ
、下記オリゴD N A 13および14<各オリゴD
NA (濃度0.1μf/μ、!2)を各々2.5μg
)更にTaqDNAポリメラーゼ(Promega社製
no、10142311.25ユニツト、更に流動パ
ラフィン50μρを加え、95℃・2分間処理後、次い
で92℃・30秒間、55℃・1分間、72℃・2分間
の3段階の温度・時間変化の操作を40回繰り返し、最
後に72℃・7分間ポリメラーゼ反応を行った。次に反
応溶液8μgを2%アガロースゲル上で電機泳動しエチ
ヂウムブロマイドで染色後、UV照射し大きさ約450
bpのDNAバンドを観察した。
オリゴDNA13: 5’−GTCACCCAGAC
AGTCGATTT−3’オリゴDNA14: 5’
−TCCACATCTGGTCCCACGAT−3’〈
比較例2〉 実施例1の血清25μgに対して、米国オーツ社製HC
V抗体(ELISA)テストシステムにてHCV抗体を
検出しようとしたが、陽性の判定を明確に得ることがで
きなかった。
AGTCGATTT−3’オリゴDNA14: 5’
−TCCACATCTGGTCCCACGAT−3’〈
比較例2〉 実施例1の血清25μgに対して、米国オーツ社製HC
V抗体(ELISA)テストシステムにてHCV抗体を
検出しようとしたが、陽性の判定を明確に得ることがで
きなかった。
実施例2および比較例2からも明らかなように、本発明
の方法によれば、微少量の検体を使用して、逆転者によ
りcDNAを調製し、適当なオリゴDNAセットのプラ
イマーを用いてDNAポリメラーゼ反応を緑り返し行う
ことによりC型肝炎のRNAを検出することができ、米
国オーツ社製HC■抗体検出キットにて検出困難な検体
でもC型肝炎を高感度にかつ簡便に検出でき、本発明の
方法が優れた方法であることが判る。
の方法によれば、微少量の検体を使用して、逆転者によ
りcDNAを調製し、適当なオリゴDNAセットのプラ
イマーを用いてDNAポリメラーゼ反応を緑り返し行う
ことによりC型肝炎のRNAを検出することができ、米
国オーツ社製HC■抗体検出キットにて検出困難な検体
でもC型肝炎を高感度にかつ簡便に検出でき、本発明の
方法が優れた方法であることが判る。
〈実施例3〜6および比較例3〜6〉
非A非B型慢性肝炎と診断された患者(#3゜4.5.
6)の各々の血清15μβに実施例1と同様のグアニヂ
ンチオシアネート水溶液50μgを添加し40℃・5分
間保持後、フェノール/クロロフォルム(4/1 )混
合液80μgで3回抽出した。
6)の各々の血清15μβに実施例1と同様のグアニヂ
ンチオシアネート水溶液50μgを添加し40℃・5分
間保持後、フェノール/クロロフォルム(4/1 )混
合液80μgで3回抽出した。
この水相に10分の1容の3M酢酸ナトリウム<pH5
,4)、1μgグリコーゲン、2.5倍容のエタノール
を添加し、−80℃・30分間保持後、遠心して得られ
たペレットを70%エタノール次いで100%エタノー
ルで洗浄後、核酸を得、これを10μ、QTE[10m
M Tris HCI / 1 mM EDTA (p
H7,5)]水溶液に溶解した。
,4)、1μgグリコーゲン、2.5倍容のエタノール
を添加し、−80℃・30分間保持後、遠心して得られ
たペレットを70%エタノール次いで100%エタノー
ルで洗浄後、核酸を得、これを10μ、QTE[10m
M Tris HCI / 1 mM EDTA (p
H7,5)]水溶液に溶解した。
このようにして得られた核酸のTE浴溶液0μgに対し
て50mM Tris HCI (pH8,3) /
75mM KCI/10m1ヂチオスレイトール/ 5
mM MgCh / 4 mMgA酸ナトツナトリ
ウム/1mMNTPs (N=A、C,G。
て50mM Tris HCI (pH8,3) /
75mM KCI/10m1ヂチオスレイトール/ 5
mM MgCh / 4 mMgA酸ナトツナトリ
ウム/1mMNTPs (N=A、C,G。
T)/1.6μgランダムプライマーくベーリンガー・
マンハイム社製no、1034731) 、0.2u/
μρAMV逆転写酵素(総量20μ、!2)となるよう
に各成分を加え、42℃で1時間cDNAの合成反応を
行った。
マンハイム社製no、1034731) 、0.2u/
μρAMV逆転写酵素(総量20μ、!2)となるよう
に各成分を加え、42℃で1時間cDNAの合成反応を
行った。
得られた各々のcDNA溶液に対して10倍の耐熱DN
Aポリメラーゼ溶液(0,5M KCl10. LMT
ris HCI/15mb! MgCh 10゜1%
ゼラチン、0,1%Triton X−100の水溶液
)5μJ)、滅菌水29μfJ 。
Aポリメラーゼ溶液(0,5M KCl10. LMT
ris HCI/15mb! MgCh 10゜1%
ゼラチン、0,1%Triton X−100の水溶液
)5μJ)、滅菌水29μfJ 。
dNTPsミクスチャー(dATP、 dCTP、 d
GTP、 dTTP各々の1.25mM溶液> 8μJ
l) 、各cDNAに対し表]の如きオリゴDNA [
各オリゴDNA (濃度01t−ttr/1tfl”)
を各々2.5μJ)]を、更にT a qDNAポリメ
ラーゼ(Promega社製 no、 101423)
1.25ユニツト、更に流動パラフィン50μρを加え
、95℃・1分間、次いで57℃・2分間次いで72℃
・3分間更にこの3段階の温度・時間変化の操作を30
回縁り返し、i&後に後に72℃・7分間ポリメラーゼ
反応を行った。次にエチヂウムブロマイドで染色後、U
V照射し大きさ表1のようなりNAバンドが観察された
。
GTP、 dTTP各々の1.25mM溶液> 8μJ
l) 、各cDNAに対し表]の如きオリゴDNA [
各オリゴDNA (濃度01t−ttr/1tfl”)
を各々2.5μJ)]を、更にT a qDNAポリメ
ラーゼ(Promega社製 no、 101423)
1.25ユニツト、更に流動パラフィン50μρを加え
、95℃・1分間、次いで57℃・2分間次いで72℃
・3分間更にこの3段階の温度・時間変化の操作を30
回縁り返し、i&後に後に72℃・7分間ポリメラーゼ
反応を行った。次にエチヂウムブロマイドで染色後、U
V照射し大きさ表1のようなりNAバンドが観察された
。
オリゴDNA3
オリゴDNAII
オリゴDNA13
オリゴDNA4
オリゴDNA12
オリゴDNA14
表
5’ −ACCTGGTAGCGTACCAAGCC−
35’ −ACCGGCTATACCGGCGACTT
−3’5’ −GTCACCCAGACAGTCGAT
TT−3’5’ −TATGCTTCGCCCAGAA
GGTC−3’5’−CATGCATGTCATGAT
GTATT−3’5’ −TCCACATCTGGTC
CCACGAT−3’く比較例3〜6〉 実施例3〜6の各血清15μρに対して、米国オーツ社
製HCV抗体(ELISA)テストシステムにてHCV
抗体を検出しようとしたが、いずれの血清に対しても陽
性の判定を明確に得ることができなかった。
35’ −ACCGGCTATACCGGCGACTT
−3’5’ −GTCACCCAGACAGTCGAT
TT−3’5’ −TATGCTTCGCCCAGAA
GGTC−3’5’−CATGCATGTCATGAT
GTATT−3’5’ −TCCACATCTGGTC
CCACGAT−3’く比較例3〜6〉 実施例3〜6の各血清15μρに対して、米国オーツ社
製HCV抗体(ELISA)テストシステムにてHCV
抗体を検出しようとしたが、いずれの血清に対しても陽
性の判定を明確に得ることができなかった。
実施例3〜6および比較例3〜6からも明らかなように
、本発明の方法によれば、微少量の検体を使用して、逆
転写によりcDNAを調製し、適当なオリゴDNAセッ
トのブライマーを用いてDNAポリメラーゼ反応を繰り
返し行うことによりC型肝炎のRNAを検出することが
でき、米国オーツ社製HCV抗体検出キットにて検出困
難な検体でもC型肝炎を高感度にかつ簡便に検出できる
ことが判る。
、本発明の方法によれば、微少量の検体を使用して、逆
転写によりcDNAを調製し、適当なオリゴDNAセッ
トのブライマーを用いてDNAポリメラーゼ反応を繰り
返し行うことによりC型肝炎のRNAを検出することが
でき、米国オーツ社製HCV抗体検出キットにて検出困
難な検体でもC型肝炎を高感度にかつ簡便に検出できる
ことが判る。
Claims (1)
- 【特許請求の範囲】 1、検体を蛋白変性剤にて処理後、除蛋白して得られた
核酸から、cDNAを合成し、ついで該cDNAに対し
、DNAポリメラーゼおよびプライマーDNAセットを
用いてcDNAを増幅することを特徴とするC型肝炎ウ
ィルスおよびその関連核酸を簡便高感度に検出する方法
。 2、該DNAプライマーセットが下記DNA群1および
DNA群2よりそれぞれ少なくとも一種選ばれたオリゴ
DNAである請求項1記載の方法。 DNA群1: 【遺伝子配列があります】 【遺伝子配列があります】
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2207677A JPH0491800A (ja) | 1990-08-07 | 1990-08-07 | C型肝炎ウイルスおよびその関連核酸の簡便高感度検出法 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2207677A JPH0491800A (ja) | 1990-08-07 | 1990-08-07 | C型肝炎ウイルスおよびその関連核酸の簡便高感度検出法 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JPH0491800A true JPH0491800A (ja) | 1992-03-25 |
Family
ID=16543744
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2207677A Pending JPH0491800A (ja) | 1990-08-07 | 1990-08-07 | C型肝炎ウイルスおよびその関連核酸の簡便高感度検出法 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
JP (1) | JPH0491800A (ja) |
-
1990
- 1990-08-07 JP JP2207677A patent/JPH0491800A/ja active Pending
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