JPH03500845A - 脂質分解性酵素をコードする遺伝子の分子クローニング及び発現 - Google Patents

脂質分解性酵素をコードする遺伝子の分子クローニング及び発現

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JPH03500845A JP1503441A JP50344189A JPH03500845A JP H03500845 A JPH03500845 A JP H03500845A JP 1503441 A JP1503441 A JP 1503441A JP 50344189 A JP50344189 A JP 50344189A JP H03500845 A JPH03500845 A JP H03500845A
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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるため要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 (5)前記原核細胞がバチルス、大腸菌又はシュードモナス細胞である請求の範 囲(4)記載の形質転換宿主細胞。 (6)前記DNA配列がpTMPv1gA中のリパーゼコード化遺伝子と少なく とも67%のヌクレオチド配列相同性を有する少なくとも3oobpの配列を含 む請求の範囲(1)記載の形質転換宿主細胞。 (7)前記DNA配列がpET3中のリパーゼコード化遺伝子と少なくとも67 %のヌクレオチド配列相同性を有する少なくとも300bpの断片を含む請求の 範囲(1)記載の形質転換宿主細胞。 (8)前記DNA配列が微生物細胞に由来する請求の範囲(6)又は(7)記載 の形質転換宿主細胞。 (9)前記DNA配列がシュードモナス又はアシネトバクタ一種に由来する請求 の範囲(8)記載の形質転換宿主細胞。 (10)前記DNA配列がP、スツゼリ、P、アルカリゲンス、P。 シュードモナスアルカリゲンス、P、アルギノサ又はA、カルコアセチカスに由 来する請求の範囲(9)に由来する形質転換宿主細胞。 (11)前記DNA配列がP、スツゼリThairV17 1株(CBS461 .85)、PG−1−3株(CBS 137.89) 、 PG−1−4株(C BS138.89)、PC−It−11,1株(CBSl、 39.89 )又 はPG−It−11,2株(CBS 140.89) 。 P、77L/ギノサPAO(ATCC15692)、P、アルカリゲンスDSM 50342.P、 シュードアル力リゲンスlN11−5 (CBS468.8 5)、P、シュードアル力リゲンスM−1’(CBS468.85)又はA、カ ルコアセチカスGrV−39(CBS 460.85)に由来する請求の範囲( lO)記載の形質転換宿主細胞。 (12) T L U測定条件下、pH一定で測定して、8〜10.5の至適p Hを有し、かつ温度約60℃以下及びp)17〜11という洗浄条件下、10g /lまでの濃度で洗剤を含む水溶液中でリパーゼ活性を示すことを特徴とする実 質的に純粋な脂質分解性酵素で、転写の5’−3’方向に、宿主細胞中で機能す る転写調節領域及び翻訳開始領域、前記脂質分解性酵素をコードするDNA配列 、及び宿主細胞中で機能する翻訳及び転写終止領域を含み、該DNA配列の発現 が該転写及び翻訳調節領域の制御下にある発現カセソ゛トを含む形質転換微生物 宿主から得られる酵素。 (13)前記酵素が104〜10’ TLU/gの比活性を存する請求の範囲( 12)記載の脂質分解性酵素。 (14)請求の範囲(1)乃至(14)記載の形質転換微生物宿主により生産さ れる請求の範囲(12)記載の脂質分解性酵素。 (15) T L U測定条件下pn一定での測定で8〜10.5の至適pl+ 範囲を有し、かつ温度約60℃以下でかつpH7〜11の洗浄条件下、10g/ jlまでの濃度で洗剤を含む水溶液中でリパーゼ活性を示す脂質分解性酵素を調 製する方法で、(イ)栄養培地中、転写の5 ’−3’の方向に宿主細胞中で機 能する転写調節領域及び翻訳開始領域、前記脂質分解性酵素をコードするDNA 配列及び宿主細胞中で機能する翻訳及び転写終止領域を含み、該DNA配列が該 転写及び翻訳調節領域制御下にある発現力セントを含む宿主細胞を増殖する、( [1)前記脂質分解性酵素を単離する以上のステップを含む方法。 (16)脂質分解性酵素を生産する方法で、(イ)栄養培地中、請求の範囲(1 )乃至(]1)記載の形質転換微生物宿主細胞を培養し、リンチブイヨンを作る 、(U)該培地から該脂質分解性酵素を単離する、以上のステップを含む方法。 (17)転写の方向に、微生物宿主細胞中で機能する転写調節領域、TLU測定 条件下pH一定で8〜10.5の至適p)I範囲を有し、かつ温度約60℃以下 でかつpH1〜11の洗浄条件下で10g/lまでの濃度の洗剤を含む水溶液中 でリパーゼ活性を示す脂質分解性酵素をコードするDNA配列、及び宿主細胞中 で機能する転写終止UfJ節領域を含むDNA構築物。 (I8)請求の範囲(17)記載のDNA構築物で、さらに選択マーカー遺伝子 及び分泌リーダー配列のうちの1つを含むDNA構築物。 (19)pTMPv 18A又はpET3上のリパーゼ遺伝子の1つと少なくと も67%のヌクレオチド配列相同性を有する少なくとも300bρの断片を含む 請求の範囲(17)又は(1B)記載のDNA構築物。 (20)プラスミドpAT1、pAT3、pETl、pET3、PAMI、9M 6−5、pP5−4、pTMPv18A又はpsW103゜(21)P、スツゼ リThaiIV17−1株(CBS 461..85) 。 PG−1−3株(CBS437.89)、PG−1−4株(CBS138.89 )、PG−n−11,1株(CBS 139.89)又はPG−II−11,2 株(CBS 140.89) 、P、アルギノサPAO(ATCC15692) 、P、アルカリゲンスDSM50342、P、シュードアル力リゲンスlNn− 5(CBS468.85)、P、シュードアル力リゲンスM−1(CBS473 .85)又はA、力Jl/]アセチカスGr V−39(CBS460.85) 由来の脂質分解性酵素のアミノ酸配列をコードする配列とハイブリダイズし得る ヌクレオチドから選ばれた連続する少なくとも10個のヌクレオチドを含むオリ ゴヌクレオチド単離物。 (22)前記オリゴヌクレオチドがDNAである請求の範囲(21)記載のオリ ゴヌクレオチド。 (23)前記オリゴヌクレオチドがRNAである請求の範囲(21)記載のオリ ゴヌクレオチド。 (24)前記オリゴヌクレオチドが放射性ラベルを含む請求の範囲(21)記載 のオリゴヌクレオチド。 (25)前記オリゴヌクレオチドが少なくとも14個の連続するヌクレオチドを 含む請求の範囲(21)記載のオリゴヌクレオチド。 脂質分解性酵素をコードする遺伝子の 分子クローニング及び発現 明細書 序文 (技術分野ン 本発明は組換えDNA技術による脂肪の酵素的分解に用いる酵素、特に洗剤添加 物として使用するのに適する特性を有する脂質分解性酵素の調製に関する。 (背 景) クリーニングに関する1つの問題は脂肪性のシミの除去にある。 現在、脂肪を含む汚れは高温と高アルカリの組合せによりエマルジヨン化され除 去されている。しかし、最近は特に脂肪性シミの除去には適さない比較的低温、 すなわち約40を以下での洗浄が主流となっている。それゆえより低い洗浄温度 で効果的であり、高アルカリ洗剤溶液中で安定であり、かつ固体及び液体洗剤組 成物中の保存条件下で安定な洗剤添加物に対する需要がある。トリグリセ、リド を加水分解する一群の酵素はリパーゼ(ε、C,3,1,1,3,)である、リ パーゼは真核細胞の他多種の原核生物中にあって広く分布している。その酵素の 起源に応じて基質特異性の他に種々の条件下での安定性を含む特性も様々である 。リパーゼはこれまでに洗剤組成物中で使用されてきたが、ここで用いられてい るものは洗濯条件下で低い洗浄効果しか示さず、さらに洗剤に適した安定性を満 していない、 ゛ 現代の洗濯条件下でリパーゼ活性を示し得る脂質分解性酵素、すなわち高洗剤濃 度、高pH及び低洗浄温度の条件で有効なものはシュードモナス・シェードアル カリゲンス(Pseudomonas pseudo−alcaLigenes )+ シュードモナス”スタゼリ(Pseudomonas 5tutzerυ 及びアシネトバクタ−・カフLz:17−!’チヵス(Acinetobact er calco−aticus)種に属する特定の株(ヨーロンバ特許出願E P−A−0218272参照)から生産される。しかしこれらの微生物種は潜在 的に植物及び動物に対して病因性を有し、かつこれらの微生物を用いたリパーゼ 生産プロセスに有効な発酵条件に関してはほとんどデータがない。 それゆえ洗剤添加物に対して望ましい特性を有する脂質分解酵素を生産する上で 有効でかつ安全な方法の開発が望まれる。さらに、その酵素を発酵混合物の細胞 外液から直接回収し得るようその宿主生物から分泌されることが望ましい。 (関連文献) シュードモナス(Pseudopaonas)種によって生産されるリパーゼに 関してはその培養条件がそれらの酵素の最終的存在位置に強く影響することが知 られている(スギウラ(Sugiura) *“リパーゼ”B、ポーゲストロム (Borgs trom)及びH,L、ブロックマン(Brockwan)!( 1984)505〜523、エルスバイア版、アムステルダム)、シばしば形成 するタンパク質の折りたたみ方の誤りや、タンパク質の分解、タンパク質の不適 正な存在位置を含む、微生物において異質遺伝子を効果的に発現する上での問題 につき当る。 ハリス01arris)“遺伝子工学”、第4巻(1983)アカデミツクブレ ス版、ニューヨーク参照、大腸菌における分泌クローニングベクターの使用は一 般に細胞周辺校への異質遺伝子産物の輸送を可能にし、またその生産物は時たま 培養培地中に見られる。ラン(Lunn)等、“微生物学及び免疫学における最 新のトピックス”125 (1986)59−74参照、宿主細胞として大腸菌 を用いた場合のボッCGotz>等(ヌクレイフクアシッズリサーチ(Nucl eicAcrds Res+)上3 (1985)5895−5906、クギミ ャ(Xugigiya)等(バイオケム・バイオフィズ・リサーチ・コミュニケ ーション(Biochem、 Biophys、 Res、 Comm、) 1 41 (1986)1.85− ]、 90 )及びオデラ(Odera)等( ジャーナル・オブ・)゛1アーメンタル・テクノロジー(J、 Fer+++e nta1. Technol、) 64(1986)363−371)により報 告されているクローン化した微生物リパーゼは培養培地中にほとんど分泌されな い。 ウォルファース(Wohlfarth)及びウィンクラ−(Winkler)  (ジャーナル・オブ・ゼネラル・マイクロバイオロジー(J、 Gen。 Microbiol、)上主土(1988)433−440)はシュードモナス アルギノサ(Pseudomonas aeruginosa) P A O2 302株由来の新しく単離されたリパーゼ欠損変異株の生理学的特性及び相当す る遺伝子の染色体地図及びクローニングに関して報告している。 バチルス種、特にバチルス・サチルス株は外来及び内在遺伝子の発現及びコード されているクンバク質産物の分泌に関して宿主株として用いられ種々の成功をお さめている。レヴユーについては例えばサーバス(Sarvas)、′微生物学 及び免疫学における最近のトピックス”工又工(1986)103−125、H ,C,つ(−)及びp、c、タイ(Tai) kJA、スプリンガー・パーラグ 版及びヒメノ(旧meno)等、F、E、l’1.S、マイクロバイオロジカル ・レターズ(Micro−biol、 Letters)35 (1986)  17−21参照。 米国特許第3,950,277号及び英国特許明細書番号第1,442,418 号は各々活性化因子及びカルシウムイオン及び、又はマグネシウムイオンと合せ てリパーゼ酵素を公開しており、それらを汚れた生地を浸し各々ポリエステル又 はポリエステル/綿混紡の生地からトリグリセリドのシミ及び汚れを除去するの に使用している。公開された存用な微生物リパーゼにはシェードモナス(Pse udomonas) +アスベルギラス(Aspergillus)、ニューモ コフカス(Pneumococcus) +スタフィロコフカス(Staphy lococcus) + マイコバクテリウム・スべlレクロシス(Mycob acterium tuberculosis)+ マイコトルラリポリティカ (Mycotorula 1ipolytica)及びスフレロチニア(Scl erO−tinia)由来のものが含まれる。 英国特許明細書番号第1,372.034号はシュードモナススッゼリ(Pse udomonas 5tutzeri) A T CC19154株により生産 される細菌性リパーゼを含む洗剤組成物を公開している。さらにこの特許はこの 好ましい脂質分解性酵素がpH6〜10の至適pH値を存し、かつこのpH範囲 、好ましくはpH7〜9で活性を示すことを公開している。(ここでシュードモ ナス・スッゼリ(Pseudomonas 5tut−zeri)株と推定され ている株はシュードモナスアルギノサ(Pseudo−monas aerug inosa)として再分類されている。)英国特許出願(EP−A)01300 64は従来のリパーゼよりも高い脂質分解洗浄効率を有するフザリウム・オキシ スポラム(Fusarium oxysporumから単離されたリパーゼを含 む酵素性洗剤添加物を公開している。また例えば英国特許明細書番号第1 、2 93.、613号及びカナダ特許第835,343号も脂質分解性洗剤添加物を 公開している。 ヨーロッパ特許出@EP−A−0205208及びEP−A−0206396は 洗剤へのシュードモナス(Pseudomonas)及びクロモベクター(Ch romobacter)由来のリパーゼの使用を公開している。洗剤添加物とし てのリパーゼに関する包括的レヴユーに関してはアンドリー(Andree)等 のジャーナル・オブ・アプライド・バイオケミストリー(J、 Appl、 B iochem、) 2 (1980) 21 B−229参照せよ。 本発明の概要 洗剤組成物への使用に適した脂質分解性酵素を生産する形質転換微生物細胞を含 む新しい組成物及びそれらの調製法が提供されている。アルカリ性pHで活性を 有し、洗濯条件下で安定な脂質分解性酵素をコードするDNA配列を含む発現力 セントで宿主微生物細胞をトランスホームする。脂質分解性酵素の調製法には微 生物システムにおけるクローニング及び発現及びDN’Aホモロジーに基づくス クリーニングが含まれる。 2つのDNA配列も提供されてお°す、これらの配列は各々シュードモナスシュ ードアルカリゲンス(Pseudomonas Peudoalcalr−ge nes)株及びシュードモナスアルギノサ(Pseudomonas aeru ginosa)株に由来する脂質分解性酵素をコードする遺伝子を含んでいる。 特定のシュードモナス(Pseudomonas)種由来のリパーゼ遺伝子はリ パーゼ生産に関して特に興味深い。 図の簡単な説明 第1図;脂質分解性酵素遺伝子クローニングの戦略。記号については第2図の脚 注参照。 第2図ζpAT1の制限地図。プラスミドpAT1における多くの制限酵素認識 部位がfIi認されている。 口二二コ 、pUN121ベクターDNA[;Thai ■17−lDNA挿入 物使用されている記号ニ ーOrf E、 colj ;大腸菌の複製オリジンA p r ;アンピシリ ン耐性をコードするpUN121の遺伝子 −Tc’;テトラサイタリン耐性をコードするpUN121の遺伝子 −cI;clリプレッサーをコードするバクテリオファージラムダの遺伝子 シュードモナススツゼリ(Pseudo+oonas 5tutzeri)Th ai IV 17−1 (CBS461.85)の染色体DNAの5an3A部 分分解物をpUN121にライゲーションした位置はBcl I / San  3 Aで示されている。脂質分解活性をコードする遺伝子の位置は点線で示しで ある。 第3図HpAT3の制限地回、記号は第2図で使用したものと同様。 第4図;pETlの制限地図、記号は第2図で使用したものと同様。 第5図;pE73の制限地図。記号は第2図で使用したものと同様。 第6図HpAM1の制限地図。記号は第2図で使用したものと同様。 第7図;pMS−5の制限地図。記号は第2図で使用したものと同様。 第8図; pps−4の制限地図。記号は第2図で使用したものと同様。アシネ トバクタ−・カルコアセチカス(Acinetobactercalcoace ticus)GRV −39(CB S 460.85)の染色体DNAのEc oRI”部分消化物をpUNI21にライゲーションした位置はEcoRI /  EcoRI ”で示しである。 第9図、5DS10−15%グラジェントファストゲル(ファルマシア社) 第9A図;コマージブリリアントブルー染色後第9B図:β−ナフチルアセテー ト/フプストブルBB染色後レしン1;95℃、10分間SDSとともに加熱し た、ptJN121を宿す大腸菌JMIOIIdS recA株由来の分解物。 レーン2:95℃、10分間SDSとともに加熱した、PBr3を宿す大腸菌J M101hsdΣ rec A株由来の分解物。 レーン3;95℃、10分間SDSとともに加熱した、P、スッゼリ(stut zeri)Thai rV 17 1株由来の培養物上清。 レーン4・:95℃、5分間SDSとともに加熱したこと以外はレーン2と同様 のサンプル。 レーン5;95℃、5分間SDSとともに加熱したこと以外はレーン3と同様の サンプル。 レーン6;室温10分間SDSとともにインキュベー・トしたこと以外はレーン 2と同様のサンプル。 レーン7;室温10分間SDSとともにインキュベートしたこと以外はレーン3 と同様のサンプル。 レーン8;ファルマシア社の低分子量タンパク質マーカー。 第10図;コマ−ジブグリアントプル−染色後の5D313%ポリアクリルアミ ドゲル。 レーン1;精製M−1リパーゼ。 レーン2;低分子量タンパク質マーカー(ファルマシア社)。 第11図i p、TMPvl 8Aの制限地図。 口==コ ;pTZ18RベクターDNA竪乙7Z久 ;M−I DNA挿入物 使用した記号ニ ーOri E、coli;pBR322ベクター由来の大腸菌の複製オリジン floriH繊維状バタテリオファージf1由来の複製オリジPT’r:インビ トロ転写物を調製するためのバクテリオファージT7のプロモーター AP’ ;アンピシリン耐性をコードする遺伝子−Lip;M−1リパーゼをコ ードする遺伝子第12図;第12図はM−1リパーゼ遺伝子のヌクレオチド配列 (すなわち最初の942ヌクレオチド)及びそれに由来するM−1リパーゼのア ミノ配列を示している。終止コドンTGAはアステリスクで示されている。Aボ ックスはリパーゼタンパク質の活性中心を表わしている。矢印は推定されるシグ ナルペプチダーゼ切断部位を示している。成熟リパーゼタンパク質のアミノ末端 配列は下線が引かれている。 第13図、pSW103の制限地図。 ロ二二];pUc19ベクターDNA 竪乙クグ圀 、PAol DNA挿入物使用されている記号; 一0ri E、coli;pBR322ベクター由来の大腸菌の複製オリジン P Iac i大腸菌波オペロンのプロモーター−Apr 、アンピシリン耐性 をコードする遺伝子−Lip;PAOIリパーゼをコードする遺伝子第14図、 PAOリパーゼ遺伝子の部分ヌクレオチド配列(すなわち内部の5ai1部位か ら)及びそれに由来するPAOリパーゼのアミノ酸配列、終止コドンTAGはア ステリスクで示しである。Aボックスはリパーゼタンパク質の活性中心を表わし ている。 第15図;プラスミドpBHAM1及びpBHcMlの構築。 使用している記号ニ ーBacillus ori ;バチルスの複製オリジン−に+w’;カナマイ シン耐性をコードするpUBlloの遺伝子 −C++;クロラムフェニコール耐性をコードするTa2)ランスボゾン遺伝子 P 、Ipa U ;プラスミドP UB 1100)Hpamルミmプロモー ター号は第11図と同様である。 第16図;第16図はプラスミドpBRAMIN1の構築を示している。記号は 第15図で使用しているものと同様である。 第17図り第17図はプラスミドpTZNIM1の構築を説明している。使用し ている記号はり −Iac Zα;β−ガラクトシダーゼのα−ドメインをコードする■匹Z遺伝 子のN末端部分 Ptmc;大腸菌1acオペロンのプロモーター他の記号は第11図と同様であ る。 第18図;第18図はプラスミドpMcTM1の構築を示している。使用してい る記号はニ ーCm’;クロラムフェニコール耐性をコードする遺伝子Ptmci大腸菌のハ イブリッド触−セにプロモーター他の記号は第11図及び第15図と同様である 。 第19図;トランスホームした大腸菌細胞から生産されるM−1リパーゼタンパ ク質のイムノプロット検出。 レーンA−Dは次の構築物を宿す大腸菌細胞の細胞周辺校両分を含む: レーンA;pTZ18RN レーンB ; pTZNIMル −ンC;pMcMル −ンD:シュードモナス・シェードアルカリゲンス(Pseudo−monas  pseudoalcaligens) M −1株由来の精製M−1リパーゼ 。 マーカータンパク質(アマーシ十ム社レインボー)の分子量は右側にkDaで示 しである。 第20図;プラスミドpBHMIN1の構築。記号は第15図のものと同様であ る。 第21図;インビトロで合成した353ラベル化タンパク質のオートラジオグラ フ。 レーンA−D ; M−1リパーゼに対するモノクローナル抗体によるインビボ で翻訳されたタンパク質の免疫沈殿化。 レーンE−Hi次のプラスミドのインビトロにおける転写/翻訳産物: レーンA及びE;pTZ18RN レーンB及びF ; pTMPv 18AレーンC及びG;pMcTMル −ンD及びH; pMCTb 1 iM1第22A図及び第22B図;バクテリ アDNA中のリパーゼをコードする配列の検出。プラスミドDNA5ナノグラム 及び染色体DNA5マイクログラムを示されている制限酵素で消化し、0.8% アガロースゲルで分画後ニトロセルロースフィルターにブロッティングし各々p ET3及びpTMPv18Aのニックトランスレーションした挿入物とハイブリ ダイズさせた。 第22A図;第22A図はp ET 3 EcoRI挿入物によるハイブリダイ ゼーション後のオートラジオグラフ。 第22B図;第22B図はpTMPv 18A XhoI −EcoRV挿入物 によるハイブリダイゼーション後のオートラジオグラフを示している。 レーンA;プラスミドpTMPV18AのHindI[[/5Stl消化物 レーンB;プラスミドpET3のEcoRI消化物BRL DNAゲルマ−カー MW、0.5.1.0.1.6.2.0.3.0.4.0.5.0.6.0.7 .8.9.10.11.12kb。 レーンc ; p、シュードアル力リゲンス(Pseudoalcaljgen es)M−1(CBS473.85)の5all消化物レーンD、P、 シュー ドアル力リゲンス(Pseudoalcaligenes)INn−5(CBS 468.85)の5all消化物レーンE ; P、アルカリゲンス(alca ligenes) D S M50342の5ail消化物 レーンFip、アルギノサ(aeruginosa) P A CI R(CB  5136.89)の5ail消化物 レーンcip、アルギノサ(aerugjnosa) P A O2302(6 −1)の5all消化物 レーンH、P、スツゼリ(stutzeri)That IV 17−1 (C B Sl 461.85)の5all消化物 レーンT、P、スツゼリ(stutzeri) P G −1−3(CB Sl 、37.89)の5all消化物 レーンJ 、 P、スツゼリ(stutzeri) P G −T −4(CB  5138.89)の5all消化物 レーンKiP、スツゼリ(stutzeri) P C−IIノ11.1(CB S468.89)の5all消化物 レーンLiP、スツゼリ(stutzeri)PG−U −11,2(CBS4 6889)の5all消化物 レーンMAP、フラジ(fragi) Serm、DB 1051 (=ファー ムBP1051)の5ail消化物 レーンN、P、グラジオリ(gladioli) (CB S 176.86  )の5alI消化物 レーン0;A、カルコアセチカス(calcoaceticus) Gr −V  −39(CBS 460.85)の5all消化物レーンP 、 S、オーレ ウス(aureus) (ATCC27661)の5ail消化物 特定の態様の説明 本発明に従がい新しいDNA構築物及び脂質分解性酵素を生産する微生物株を含 む新しい組成物が提供されている0本発明で興味が持たれるリパーゼは約8から 10.5の至適pH値を有し、6〇 −℃以下の温度、好ましくは30〜40℃ でかつ約7〜11のpH値、好ましくは約9〜10.5のpH値の洗浄条件下約 10g/j!までの濃度で洗浄組成物を含む水溶液中で効果的なリパーゼ活性を 示す。 望ましい特性を有するリパーゼをコードするDNA配列を含むプラスミド構築物 が真核細胞又は原核細胞のいずれかの宿主細胞をトランスホームするのに用いら れる。その後このトランスホームした宿主細胞を増殖させこの遺伝子が発現され る。 リパーゼ遺伝子を単離するのに用いる技術は当分野ではよく知られており、これ らには合成、ゲノムDNAからの単離、c DNAからの調製又はその組換えな どが含まれる。この遺伝子を取扱う種々の技術はよく知られており、これらには 制限切断、消化、切断、ライゲーション、インビトロ突然変異誘発、プライマー 修復、リンカ−及びアダプターの使用等が含まれる。マニアチス(Mani=a tis) 等、”モレキュラークローニングコールドスプリングノ1−バーラボ ラトリー、コールドスプリングハーバ−、ニューヨーク、1982年参照。 −Mに、この方法は、望ましい特性を有するリパーゼを発現する生物からのゲノ ムライブラリーの作成を含んでいる。これらのリパーゼの例にはシュードモナス (Pseudomonas)及びアシネトバクタ−(Acinetobacte r)から得られるもの、特にシュードモナスアルカリゲンス(Pseudomo nas alcaligenes) + シュードモナス・シュードアルカリゲ ンス(Pseudoa+onas pseudoalcaligenes)、シ ュードモナスアルギノサ(Pseudomonas aeruginosa)+  シュードモナス・スツゼリ(Pseudomonas 5tutzeri)及 びアシネトバクタ−・アルコアセチカス(Acinetobacter cal coaceticus)種に属する株から得られるものがある。これらのリパー ゼ及び株については、ここで参考として引用するEP−A−0218272に十 分記述されている。供与;、ス生物のゲノムを単離し、ついで5au3Aのよう な適当な制限酵素でこれを切断する。得られた断片を予め適合する制限酵素で切 断したベクター分子に結合する。適当なベクターの例には制限エンドヌクレアー ゼBc11で切断し得るプラスミドpUN121がある。さらにそのアミノ酸配 列はリパーゼ遺伝子に関してmRNAから調製されるc DNA又はゲノムライ ブラリー又は供与細胞由来のDNAをスクリーニングするのに用いるプローブを 投函するのに使用し得る。 さらに、ハイブリダイゼーションプローブとしてそのリパーゼDNA又はその断 片を用いることにより、他の微生物中に存在する構造的に関連する遺伝子のクロ ーニングも容易に行ない得る。 本発明は特にEP−A−0218272に述べられている生物に由来するリパー ゼ遺伝子のヌクレオチド配列に基づくオリゴヌクレオチドプローブを用いた、脂 質分解活性を示す生物からの遺伝子の単離に関する。別に、これらのオリゴヌク レオチドは目的とするリパーゼのアミノ酸配列からも誘導し得る。これらのプロ ーブはその全配列よりもかなり短かくすることができるが少なくとも10個、好 ましくは少なくとも14個のヌクレオチド長であるべきである。またその遺伝子 の全長までで、好ましくは多くとも500個、より好ましくは多くとも300個 のヌクレオチド長のより長いオリゴヌクレオチドも有用である。RNA及びDN Aプローブの両方とも使用し得る。 使用に際し、一般的にこのプローブは検出様式に応じてラベル化され(例えばs z p 、 ss 3 、 s H、ビオチン又はアビジンによる)、ついで遺 伝子を探索する生物に由来する一本鎖DNA及びRNAと共にインキュベートす る。−末鎖及び二本鎖(ハイブリダイズしたもの)DNA (DNA/RNA) を分離後(一般的にはニトロセルロースペーパーを使用する)ラベルによりハイ ブリダイゼーションを検出する。オリゴヌクレオチドの使用に適したハイブリダ イゼーション技術は当分野ではよく知られている。 通常プローブは簡単に同定し得る検出可能ラベルと共に使用されるが、非ラベル 化オリゴヌクレオチドもラベル化プローブの前駆体として、並びに二本鎖DNA  (又はDNA/RNA)の直接的検出を提供する方法で使用するのに有用であ る。従って、“オリゴヌクレオチドプローブという語句はラベル化型及び非ラベ ル化型の両方を意味する。 本発明の好ましい態様の1つの場合シュードモナス・シュードアルカリゲンス( Pseudomonas pseudoalcaligenes)のリパーゼ由 来の配列をCB5473.85 (M−1)株からクローン化する。 驚くべきことに、かつて配列決定されたシェードモナスアルギノサ(Pseud omonas aeruginosa)PAO(AT CC15692)のクロ ーン化したリパーゼはM−1のリパーゼ遺伝子配列と高い配列ホモロジーを示し た。さらに驚くべきことにこの高い配列ホモロジーはM−1株のリパーゼ遺伝子 配列及び多くのシュードモナススツゼリ(Pseudomonas 5tutz eri)単離物(PGI−3(CB5137.89) 、PG−1−4(CBS I 38.89)、PG−11−1t1(CBS l 39.89) 、PG− 11−t 1.2 (CB3140.89))及びシュードモナスアルカリゲン ス(Pseudomonas’ alcalLgenes)DSM50342の 染色体DNAの間にも見受けられた。この明細書中で用いられている“高度のハ イブリダイゼーション′とは少なくとも67%のホモロジーを有する少なくとも 300bpの連続するDNAと定義される。 P、アルギノサ(aeruginosa)及びP、スッゼリ(stutzeri )のリパーゼ酵素を生産し、SLMテストで洗浄性能のテストを行った。 驚くべきことにM−1!Jパーゼ遺伝子と高度のホモロジーを示す全ての酵素は 、現代の洗浄プロセスを真似た条件下で優れた安定性、有効性及び性能を示すこ とが分った。オウスベル(Ausubel)等の方法に従かい(カレントブロト コールス・イン・モレキュラー1バイオロジー(Current Protoc ols in Mo1ecular Biology)。 1987−1988)、サウザンハイブリダイゼーション技術でこのレベルのホ モロジーを検出し得る。この発見されたホモロジーはEP−A−0205208 及びEP−A−0206390に述だられているP、グラジオリ(gladio li)又はBP−A−0305216に述べられているフミコラ・ランギノサ( Humicola Ianguinosa)のリパーゼには観察されなかった。 このDNA挿入断片を含むクローンは大腸菌(クン(にuhn)等、ジーン(G ene)44 (1986) 253−263)及びB、サチラス(subti lis) (グリクデン(Gryczan)及びドゥブナウ([1ubnau) 。 ジーン(Gene)20 (1982)459−469)に対して開発された直 接又はポジティブ選択操作を用い同定し得る。大腸菌に対するポジティブ選択ベ クターの例としてはpUN121にルソン(Nilsson)等ヌクレイックア シッズリサーチ(Nucleic Ac1dsRes、)11 (1983)8 019−8030)がある。 さらに、脂質分解性酵素を発現するクローンは例えばローダミンBとともにトリ ブチリン又はオリーブ油を含む寒天培地などの(クーカー(Kouker)及び ジャガー(Jaegar)、アプライドエンバイロメンタルマイクロバイオロジ ー(Appl、 Env、 Microbiol、) 53(1987)211 )適当なインジケータプレート検定法を用いて同定し得る。さらに複製コロニー はエステラーゼ活性を検出するために述べられた操作(ヒルガード(Hilge rd)及びスピジゼン(Spizizen) +ジャーナル・オブ・バクテリオ ロジー(J、Bacteriol、)114 (1978)1184)に基づく 軟寒天技術改良法を用いてスクリーニングし得る。別に、脂質分解性酵素を発現 するクローンはウォルファース(Wohlfarth)及びウィンクラ−(Wi nkler)(ジャーナル・オブ・ゼネラル・マイクロバイオロジー(J、 G en。 Microbiol、)上主土(1988)433−440)により述べられて いるような適当なリパーゼ欠損受容株における遺伝子的相補により同定し得る。 一度完全な遺伝子がcDNAにしろ染色体DNAにしろ同定されればそれを発現 させるための種々の方法で取り扱うことができる。微生物宿主には例えば大腸菌 、タルイベロミセス(Kluyvero−myces) + アスベルギラス( Aspergillus)、バチルス(Baci 1lus)及びシュードモナ ス(Pseudo+5onas)種のような細菌、イースト及び菌類を用いるこ とができる。それゆえ、その遺伝子はそのリパーゼの野生型転写及び翻訳調節領 域を認識する宿主中で発現されることから、野生型5′及び3′調節領域を有す る全遺伝子が適当な発現ベクター中に導入されなければならない。原核性細胞由 来の複製システムを有する種々の発現ベクターが存在する0例えばボーウェルス (Pouwels)等、′クローニングベクター、ラボラトリ−マニュアル1、 エルスピア版1985参照、これらの複製システムはトランスホーマントの選択 を可能にするマーカーを提供し、かつ遺伝子を挿入し得る簡便な制限部位を提供 するよう開発されてきている。 天然の野生型転写及び翻訳調節領域を認識しない宿主中でその遺伝子を発現する 場合、別の操作が必要となる。簡便には、種々の3′転写調節領域が知られてい ることから、これを終止コドンの下流に挿入することができる。構造遺伝子の上 流の5′側非コード領域はエンドヌクレアーゼ制限処理、Ba131切除等で除 去し得る。別に構造遺伝子の5′末端近傍に便利な制限部位がある場合には、そ の構造遺伝子を制限処理し、かつ構造遺伝子の欠失したヌクレオチドを補うアダ プターがその構造遺伝子をプロモーター領域に結合するのに用いられる。 5’−3’の転写方向に調節の誘導を可能にする調節配列も含む転写調節領域及 び翻訳開始領域、好ましくは指定された宿主細胞により認識される分泌用リーダ ー配列を含む脂質分解性酵素をコードする読み枠及び翻訳及び転写終止領域を有 する発現カセットを提供する種々の戦略が用いられる。さらにこの発現カセット は少なくとも1個のマーカー遺伝子を含む。この開始及び終止領域は宿主細胞中 で機能するもので、これらは同種(その宿主に由来するもの)又は異種でその宿 主に由来するもの、もしくは異種で別の起源又は合成りNA配列に由来するもの のいずれかである。 このようにこの発現カセットは全体的に又は部分的に天然のものに由来すること もあるし、全体的に又は部分的に宿主細胞と同種の起源に由来することもあり、 もしくはその宿主細胞と異種の起源に由来することもある。本発明の種々のDN A構築物(DNA配列、ベクター、プラスミド、発現カセット)は単離され、及 び、又は精製又は合成されるもので、従って“天然に存在するもの”ではない。 適当な調節配列の選択には発現に影響する次の因子が考慮される。転写調節につ いてはメツセンジャーRNAの量及び安定性が遺伝子産物の発現を左右する重要 な因子である。mRNAの量は特定の遺伝子のコピー数、プロモーターの相対的 効率及びエンハンサ−又はリプレッサー等のプロモーターを調節する因子により 決定する。mRNAの安定性はりボヌクレアーゼに対するmRNAの怒受性に支 配される。一般にエクソヌクレアーゼ切断は−RNAの末端の構造様式パリンド ローム構造、修飾ヌクレオチドあるいは特異的ヌクレオチド配列の存在により阻 害される。エンドヌクレアーゼ切断はmRNA内の特異的認識部位で起こると考 えられており、安定なmRNAはこれらの部位を欠いているのであろう。 また高いレベルで翻訳を行うmRNAはmRNA上のりボゾームの存在によって も分解から保護されているといういくつかの証拠もある。 翻訳については、mRNAが存在するならばその発現は開始速度(mRNAへの りボゾームの結合)、伸長速度(mRNA上のりポゾームの移動)、翻訳後の修 正速度及び遺伝子産物の安定性により調節され得る。伸長速度はおそら(使用す るコドンに影響される。すなわち少ないtRNAに対するコドンの使用は翻訳速 度を減少させる。開始はコード配列の始めの直前の領域で起こると考えられてい る。原核生物においてほとんどの場合、この領域にはAGGAのコンセンサスヌ クレオチド配列が含まれており、これはシャイン・ダルガルノ配列と呼ばれてい る。この配列はりボゾーム結合部位となる特徴を有する一方、この配列の上流及 び下流の配列は翻訳開始に影響しうろことは明白である。 また、別の証拠は、おそらく開始部位をリボゾームが認識する構造様式の形成に よってリボゾーム結合に影響を与えうるコード領域内のヌクレオチド配列の存在 も指摘している。開始コドンATGに対するAGGA配列の位置は発現に影響を 与え得る。従って特定の発現速度を決定するのはこれら全ての因子の相互作用に よる。しかし、発現される遺伝子はこれら全ての因子の組合せを展開して特定の 発現速度を生み出してきた。商いレベルの遺伝子産物を生ずる発現システムの設 計は、発現に影響すると決定された特定の領域だけでなく、それらの領域(配列 )が互いにどのように影響し合うかを考慮しなければならない。 代表的な転写調節領域又はプロモーターには例えば工業的生産に用いられる株中 で過剰発現される遺伝子由来の配列が含まれる。 さらに転写調節領域には、例えば生育培地中の栄養物又は発現産物の有無又は温 度等により調節される構造遺伝子の発現を可能にする調節配列も含まれる。例え ば原核細胞において構造遺伝子の発現はバタテリオファージラムダOLオペレー ター及び温度感受性リプレッサーとともにバクテリオファージラムダPLプロモ ータ・−を含む調節配列を用いると温度によって調節できる。このプロモーター の調節はリプレッサーとオペレーター間の相互作用を通して行なわれる。バチル ス(Baci I Ius)のアミラーゼとプロテアーゼの遺伝子の調節配列を 用いた脂質分解性酵素を発現し得る発現力セントは特に興味深い。目的の構造遺 伝子はりボゾーム結合部位の下流に結合され、そうすることにより転写調節領域 及び翻訳開始領域の調節制御下に置かれることになる。 また分泌リーダーシグナル及びプロセシングシグナルをコードする配列を構造遺 伝子の5′側に付けることにより融合遺伝子が調製される。もし選択した宿主細 胞中で機能的であるなら、リパーゼ遺伝子それ自体のシグナル配列も用いられる 。代表的異種分泌リーダー配列にはベニシリナーゼ、アミラーゼ、プロテアーゼ 及びイーストのα因子の分泌リーダー配列が含まれる。目的とする構造遺伝子と 分泌リーダー配列を適正な読み枠で融合することにより成熟した脂質分解性酵素 が培養培地中に分泌される。 発現力セントは適当な宿主微生物中エビソーム的維持を可能にする複製システム 内に含まれていてもよいし、また複製システムなしに提供され、宿主ゲノムに組 込まれる場合もある。宿主微生物への種々のDNA構築物のトランスホーメーシ ヲンの方法は本発明にとってあまり重要ではない。DNAは、リン酸カルシウム 沈殿化DNA、接合、エレクトロポレーション、細胞のウィルスとの接触による トランスフェクション、細胞へのDNAのマイクロインジェクション等を用いた トランスホーメーション等の従来技術に従かい宿主細胞中に導入される。この宿 主細胞は細胞自体でもちよいしプロトプラストでもよい。 宿主生物としては脂質分解性酵素の生産と抽出に適したものであればどの微生物 でもよい。また、この宿主生物は生産した酵素を分泌でき、それにより無細胞発 酵液からその酵素を回収し得ることが望ましい。また宿主微生物は非病原性生物 であることが望ましい。上記の条件を満足する宿主生物の例には大腸菌、シュー ドモナスプチダ(Pseudoionas putida)及びバチルス(Ba cillus)株、特にB、サチラス(subtilis)及びB、リチェニホ ルミス(licheni−。 for+ais)+ストレプトミセス(Streptomyces)株及び各々 アスベルギラス(Aspergillus)及びタルイベロミセス(Kluyv eromyces)等の菌類及びイースト株が含まれる。 宿主株は研究用の株でもよいし、又工業用の微生物株も含みうる。工業用の菌株 はファージ感染又はトランスホーメーションなど遺伝的変化に耐性を持つ特徴が ある。この株は安定であり、また胞子を形成し得るものと形成し得ないものがあ る。それらは独立栄養性であり、またα−アミラーゼや種々のプロテアーゼのよ うな内在性タンパク質産物を高収率で提供しろるよう変えられる。 工業生産プロセスにおいて得られる内在性タンパク質産物の収量は少なくとも5 g/f(0,5%w / v )にまで高め得る。また工業用株はDNaseを 分泌し、これが培地中のDNAを分解することにより遺伝的変化に対する耐性を 与えている。 一度構造遺伝子を適当な宿主の中に導入すれば、その宿主細胞を増殖しその構造 遺伝子を発現させ得る。脂質分解活性の生産レベルはその遺伝子が由来する本来 の株と同様かもしくはそれより高い。その宿主細胞を適当な培地中で高密度に増 殖させて富栄養培地を作る。プロモーターが誘導可能な場合、例えば温度変化、 貧栄養又は過剰の代謝産物又は栄養物などの誘導条件が用いられる。 分泌が行なわれる場合、発現産物は従来法により生育培地がら単離される。生産 された脂質分解性酵素の放出は希薄な界面活性剤溶液で促進し得る0分泌が行な われない場合、宿主細胞を収穫し、従来の条件の従って分解する。それから望ま しい産物を単離しクロマトグラフィー、電気泳動法、溶剤抽出、相分離等の既知 技術に従って精製する。 本組成物は巾広い方法で使用し得る。トランスホームした宿主微生物は洗剤組成 物で有用となる特性を有するリパーゼ生産を増加するのに使用し得る。また、ク ローン化したリパーゼ遺伝子は、エステラーゼではなくリパーゼとしての脂質分 解性遺伝子の同定を含むリパーゼ遺伝子のスクリーニングに使用し得る。 またそれらは、必要とされる修正した特性を有するリパーゼを生ずるランダム又 は部位指定突然変異誘発に関する従来技術を用いて酵素工学で使用される。 脂質分解性酵素組成物は一般に洗浄組成物で用いられる洗剤及び別に添加される 成分を含む洗濯組成物に使用し得る。これらの成分には、少なくとも1種の界面 活性剤、複合リン酸、アルカリ金属ケイ酸塩及び重炭酸塩などの柔軟剤、アルカ リ金属硫酸塩などのファイラー、プロテアーゼ及びアミラーゼなどの酵素、漂白 剤、及び香料、ケイ光漂白剤などのその他の化合物が含まれ得る。 本発明に従かう酵素的洗浄組成物において、そのリパーゼ活性は1〜20,00 0TLU/g (Mi成物)の範囲であることが好ましく、一方タンパク質分解 酵素活性は50〜10.000デルフトユニツト(Delft Units)  / g (洗浄組成物)の範囲であることが好ましい。ITLU (真リパーゼ 単位)はpua、o、25℃でオリーブ油/アラビアゴムエマルジョンから放出 される、1μa+oleNaOH/lll1nと等価の滴定値をもつ脂肪酸と定 義される。テルフトユニットはジャーナル・オブ・アメリカン・オイル・ケミカ ル・ソサイアテI (J、 Amer、 O4l Chew、 Soc、) 6 0 (1983) 1672に定義されている。 本発明の洗剤は通常の方法、例えば各成分を一緒に混合すること、又は予備混合 物を調製し、つづいて他の成分と混合することにより調合される。ある調合経路 では、1つ以上のリパーゼ調製物を1つ以上の他の化合物と混合して所定の酵素 活性濃縮物を作り、それからこの濃縮物を他の望ましい成分と混合する。 本発明の脂質分解性酵素は酵素性洗剤添加物の形で使われることが望ましい。ま たこの添加物には例えば現在の洗剤で使用し得るプロテアーゼ及び/又はアミラ ーゼなど他の1つ以上の酵素及び例えば非イオン性、塩、安定化剤及び/又はコ ーティング剤など一般にこの分野で用いられている他の1つ以上の成分が含まれ る。酵素性洗剤添加物はリパーゼに加えてプロテアーゼ及び場合によってはα− アミラーゼを含み得る。このタンパク質分解性酵素はこの調合物中の脂質分解性 酵素とうまく適合する。一般に酵素性洗剤添加物を当分野で知られている1個以 上の洗剤及び他の成分と混合し洗剤を調合する。一般に酵素性洗剤添加物は10 ”〜10’ TLU/g (添加物)の範囲で用いられる一方、場合により存在 するタンパク質分解活性は5X10’〜10”デルフトユニット/gの範囲であ る。 本発明の酵素性洗剤添加物は例えば一般に当分野で知られている方法によって調 製される顆粒又は粒(prill)の形をしている。 例えば英国特許第1,324,116号及び第1,362,365号及び米国特 許第3.519,570号、第4,106.991号及び第4,242,219 号参照。 酵素性洗剤添加物は例えばプロピレングリコールなどの酵素安定化剤と共に液体 状とすることもできる。またそれらは可溶性又は不溶性サポートに固定するか、 又は1種以上の安定化剤の存在下水性又は無水溶液中の有機性又は無機性スラリ ー、エマルジョン又はカプセルの形状とすることができる。このような添加剤は 液体洗剤中で用いることが望ましい。 以下に述べる例は説明のためのものであり発明を制限するものではない。 実験 一般的なりローニング技術はマニアチス(?Ianiatis)等(1モレキユ ラークローニング、ラボラトリ−マニュアル”コールドスプリングハーバ−ラボ ラトリ−11982、C3H,ニューヨーク)により報告されているものを用い た。全てのDNA修正酵素は市販されているものを用いた。それらは業者の説明 書に従って用いた。DNA精製及び分離用の物質及び装置は業者の説明書に従っ て使用した。 例1 トリアシルクリセロール・アシルヒドロラーゼの分子クローニング A、DNA及び選択ベクターの起源 BP−A−0218272は洗剤への使用に通したリパーゼを生産する一数種の バクテリア株を公開している。その中のアシネトバクタ−カルコアセチカス(A cinetobacter calcoaceticus) G rV−39( CBS460.85) 、シュードモナススツゼリ(Pseudo−monas  5tutzeri) Thai rVl 7 1 (CBS461.85)  、シュードモナス・シュードアル力リゲンス(Pseudoraonas Ps udoalcali−genes)M−1(CBS473.85)が脂質分解性 遺伝子の起源として選択した。 アンピシリン耐性遺伝子、テトラサイクリン耐性遺伝子及びバクテリオファージ ラムダのclレセプター遺伝子を存するプラスミドベクターpUN121にルソ ン(Nilsson)等、ヌクレイツク・アシソズ・リサーチ(Nacleic  Ac1ds Res、)土工(1983)8019)はM、ウールン博士(王 立技術研究所、生化学科、スウェーデン・ストックホルムS−10044、テク ニクリンゲン(Tekr+ikringen) 10 )から入手した。テトラ サイクリン遺伝子の転写はCIリプレッサーにより妨かれる。外来DNAの単一 の制限部位(Bcl I 、 Sea I、H4ndn[及びECOR■)への 挿入はテトラサイクリン遺伝子を活性化する。このことは8μg / m 1テ トラサイクリン及び50μg / m 1!アンピシリンを含むルリア(Lur ia)培地寒天プレート上で組換えトランスホーマントの直接的(ポジティブ) 選択を可能にする。 B、遺伝子ライブラリーの調製(第1図参照)プラスミド及び染色体DNAはア ンドレオリ(Andreoli) (モレキュラーアンドゼネラルジエネテイク ス(Mo1. Gen、 Genet、)199(1985)372−380) により報告されている方法で単離した。 That TVI 7 1及びM−1 から単離した各染色体DNAを5an3Aで部分消化した。それからそのDNA を74DNAリガーゼを用いマニアチス(Maniatis)等(上述)により 報告されている方法に従がいBclIで消化したpUN121DNAにライゲー トし大腸菌JM101hsdS recA株(ダガート(口agert)及びア ーリッヒ(εhrl 1ch) +ジーン(Gene)6 (1979)23− 28)のコンピテント細胞にトランスホームした。大腸菌JMIOIhsdS  recAはファバゲン・コレクション(受El1号PC2495)(オランダウ レン) (U trech t)から入手した。シリア培地寒天プレート中8μ g / a+ l!のテトラサイクリンに耐性のトランスホーマントを選択した 。 C,)ランスホーマントのスクリーニング上記のようにして得られた遺伝子ライ ブラリーのレプリカプレートを作り、以下の2つの操作を用い脂質分解活性でス クリーニングした。第1の操作では複製コロリーをトリブチリン含有のペプトン 寒天培地上の脂質分解活性でスクリーニングした。脂質分解活性は濁った脂質エ マルジョンの分解によるコロニー周辺の透明領域(ハロー)として検出した。第 2の操作においては複製コロニーを軟寒天重層技術を用いてニーステラーゼ活性 でスクリーニングした。この方法はヒルガード(tlilgerd)及びスピジ ゼン(Spiztzen)(7)方法(ジャーナル・オブ・バクテリオロジ−( J。 Bacteriol、) 114 (1987) 1184)に基づいている。 基本的には0.4%低融点アガロース、0.5Mリン酸カリウム(pH7,5) 、アセトンに溶解した0、 5 wag/ itβ−ナフチルアセテート及び0 .5−g/12ファーストブルーBB(例2参照)の混合物をトランスホーマン トに注ぐと、数分以内にエステラーゼ又はリパーゼ活性を有するコロニーは紫色 に変色する。 Thai IVI 7 1/pUN121遺伝子バンクから得た1200個のテ トラサイクリン耐性トランスホーマントのうち3個がトリブチリン寒天プレート 上にハローを作った。M−1/p UN121遺伝子バンク由来の、テストした 12000個の組換えトランスホーマントのうちわずか1個のクローンが弱い脂 質分解活性を示した。 このトリブチリンポジティブクローンを2TY培地(16g/Eバクトドリプト ン、Log/j!バクトイ−ストエクストラクト、5 g// NaCl2.  pH7,0>中−晩増殖させ、ついでプラスミド含量(下のID参照)及び脂質 分解活性の指標となる種々のβ−ナフチル基質の転換能(例2A参照)の両方に ついて検定を行った。 D、プラスミドの単離 り、I ThatlV17 1リパーゼ遺伝子の包含化Thai IVI 7  1/1)UNI 21 )ランスホーマントから単離したプラスミドはpATl 及びpAT3と命名した。それらの構造を各々第2図及び第3図に示す、pAT 2と命名した第3のクローンはpAT1構築物と同じプラスミドを宿していた。 脂質分解活性をコードする遺伝子はpATlの2.7 kb EcoRI断片内 (第2図、点線)及びpAT3の3.2kb EcoRI断片内(第3図、点v A)に位置する。これら2つのEcoRI断片をDNA配列決定用及び高収率脂 質分解活性獲得用に適当なベクターにサブクローンした。 pUN121ベクターへのpAT1由来の2.7kb EcoRI断片のクロー ニングにより組換えプラスミドpEIを作った(第4図)、プラスミドpET1 を宿す大腸菌JMI O1hsdS rtにA株はCB5157.87として、 1987.2月5日CBSに登録された。 ’pUN12Jベクターへのr+AT3由来の−3,2kb EcoRI断片の クローニングにより組換えプラスミドpET3を作った(第5図)。プラスミド p、ET3を宿す大腸菌J M 101 hsdS recA株はCBSL55 .87として、1987.2月5日CBSに登録した。 D、2M−1リパーゼ遺伝子の包含化 pAM1と命名されたM−1/pUN 121 )ランスホーマントから単離し た組換えプラスミドを単離し、特性を明らかにした(第6図)。しかし、pAM lの脂質分解活性の生化学的特性はこのプラスミドが目的とするリパーゼをコー ドしていないことを示した(例2及び例3参照)。それゆえ以後説明する他の戦 略を開発しなければならなかった。 大腸菌J M 101 hsdS recA中のプラスミドpAM1は第154 .87号として1987年、2月5日CBSに登録した。 D、3 1NII−5リパーゼ遺伝子の包含化プラスミドベクターpUN121 を使用し5au3Aで部分消化したシュードモナス・シュードアル力リゲンス( Pseudomo口aSpseudoalcaligenes) I N II  −5D N A断片を大腸菌に12DH1株(ATCC33849)にクロー ン化した。ライゲーション及びハナハン(t(a n a h a n ) ( ジャーナル・オブ・モレキュラー・バイオロジー(J、Mo1.Bias、)1 66 (1983)557−580)により報告されている方法で調製したDH Iコンピテント細胞へのトランスホーメーション後、50μg/mllアンピシ リン及び8μg /rr11テトラサイクリンに耐性の約1500個のトランス ホーマントが得られた。トリブチリン及びβ−ナフチルアセテートを加水分解し 得るトランスホーマントはICで述べた方法で選択した。1個のポジティブコロ ニーからプラスミドDNAを単離し、数種の制限酵素認識部位の決定たよる特性 化を行った。9M6−5と命名されたこのプラスミドの物理マツプを第7図に示 す。 β−ナフチルエステルに対する大腸菌DHI (9M6−5)の活性を測定した (第1表)、プラスミドpMS−5を宿す大腸菌DHI株を、第153.87号 として1987年2月5日CBSに登録した。 D、4GrV−39リパーゼ遺伝子の包含化EcoRI”で部分消化した(ガー ドナー(Gardner)等、DNA1 (1982)109−114に従う条 件下)アシネトバクタ−カルコアセチカス(Acinetobacter ca lcoaceticus) Gr V −39DNAt−EcoRI T:線状 化したpUN121DNAと混合し、T4ポリヌクレオチドリガーゼを用いて再 環状化した後、このDNA混合物をこの例で先に述べたトランスホーメーシジン 操作を用い大腸菌DHI (ATCC33849)に導入した。得られた全18 00個のテトラサイクリン耐性トランスホーマントをICで述べた脂質分解活性 でスクリーニングした。 このGr V−39/pUN121遺伝子ライブラリーのうちの3個のコロニー は脂質分解性酵素を生産した。pps−tと命名した3個のクローンのうちの1 個に由来するプラスミドDNAを単離し、制限エンドヌクレアーゼで特徴づけた 。このプラスミドpP5−4の物理マツプを第8図に示した。それから大腸菌D HI(pP5−4)由来の酵素粗調製物によるβ−ナフチルエステルの加水分解 を測定した(第1表)。大腸菌DHI中のプラスミドpps−4は第151.8 7号として1987年2月5日CBSに登録した。 例2 クローン化した脂質分解性酵素調製物の特性A、脂質分解活性の測定 トリブチリンポジティブ大腸菌コロニーを500mj!コニカルフラスコ中のア ンピシリン及びテトラサイクリンを含む100mj!の2TY培地に接種した。 この大腸菌培養物を25Orpmのシェーカー中30℃で40時間振盪した。4 0時間後、575nmの光学密度を測定し、ついでその培地をGSAローターを 用いたソーパル(Sorvall)’ RC5B遠心機により6000rpm、 10分の遠心を行った。酵素検定までその上清を4℃で保存した。 trEJ2を4mpの溶菌バッファ (25%スクロース、50mM)リス−H Cβp87.5 )中に懸濁した。リゾチームを添加し、21℃、30分のイン キュベーション後DNase (201J g/mjりを加え、さらに37℃、 30分間インキュベーションを続けた。トリトンX−100(0,1%v /  v )を添加し、その細胞サスペンションをラブソニック(Labsonic)  1510超音波装置を用い氷上で超音波処理した(1分間隔を置いて1ワット 30秒間の処理5回)。 それから細胞破片をヘチクミクロラピンド/ K (Hettich 11ik r。 Rapid/K)遠心機を用い1.200Orpm、15分間の遠心で除去した 。得られた上清脂質分解活性を検定した。この検定は脂質分解性酵素によるβ− ナフチルエステルの加水分解に基づいている。放出されたβ−ナフチルはジアゾ ニム塩ファーストブルーBBと反応し540n+mに吸収をもつアゾ色素を生ず る。この方法は基本的にマクケラ−(?Ic)tel jar)の方法(ジャー ナル・オプ・ディリーリサーチ(J、 DairyRes、) 53 (198 6) 117 127)であり、以下のように行った。 反応管中の最終容積は2.0+*fであった:1.8閉1−55all YES (N−トリス(ヒドロキシ−メチル)メチル−2−アミノエクンスルホン酸、シ グマ社);ジメチルスルホキシド(DMSO,メルク社)又はメチル・セルソル ブアセテート(メルク社)に溶解した0、 02’+an 100mMβ−ナフ チルエチテル、0.1mJ120mM NaTC(Na )−ロクロレート、シ グマ)、及び0.1mj!の酵素調製物。 酵素を欠くコントロール及び酵素及び基質をかくβ−ナフチル(シグマ社)標準 物質も使用した。 反応混合物を入れたコーニングの遠心管(15mjりを37℃又は指定されに温 度で30分間インキュベートした。0.02+eA100mMFB溶液(DMS Oに溶かしたファストブルーBB塩(シグマ))を加え、さらに10分間インキ ュベーションする。 0.2mAの0.72NTCA()リクロロ酢酸、リーデルデハン(Riede l De Haen))を加えて反応を停止し、発色複合体を2.5ml!1− ブタノール(メルク)と激しく混ぜることにより抽出した。 その層はへりウスクリストミンフユージ(Heraeus Christ Mi ni−fuge) RFを用い5000rpIm、5分間の遠心で分離した。上 層の吸光度をLKBウルトラスペク■分光光度計を用い540nmで測定した。 コントロールを差引いた後、その測定値を標準物質としてカンディダ・シリンド ラセア(Candjda cylindracea)のリパーゼ(L1754、 シグマ)を用いたTLU値(真リパーゼ単位)に変換した。IT2Uは1 μm ole NaOH/sinと等価の脂肪酸滴定値と定義される(EP−A−02 18272参照)、その結果を以下の第1表に示す。 アシル鎖長をC4〜C18と種々に変化させたβ−ナフチルエステルの加水分解 のデータを比較すると以下のことが示される。 1″、pAT3及びpET3プラスミドを宿すクローンは真のリパーゼを生産す る。及び2°、pATl、I)ETI、pAMl、pP5−4及び9M6−5プ ラスミドを宿すクローンは実質的にエステラーゼ活性を有する酵素を生産する。 組換えプラスミドを有する大腸菌によって合成される全んどの脂質分解酵素は細 胞分解物中に存在した。 B、クローン化した脂質分解性調製物のより詳細な特性クローン化した脂質分解 性酵素調製物は業者の指示に従かいファストゲル勾配置0〜15%を使用したフ ァストゲルシステム(ファルマシア)によるSDSゲル電気泳動を行ない、その 特性を調べた。 大腸菌のクローンpET3及びpUN121ベクターを含むDHI株由来の無細 胞抽出物を供与株Thai■17−1由来の部分精製酵素(スチュア(Stuo r)等、ジャーナル・オブ・バタテリオロジ−(J、 Bacteriol、)  168 (1986) 1070−1079)と比較した。 (サンプル調製)酵素調製物の適当な希釈液4部に10%SO3゜10%β−メ ルカプトエタノールの0.5 M )リス・IICj2(PH6,8)溶液1部 を混合する。この溶液を3等分した。その1つはゲル電気泳動するまでなにも処 理を行なわず室温で保存した。第2及び第3のものは各々5分及び10分間95 ℃に加熱し、氷水中で冷却した後ゲル電気泳動するまで室温で保存した。 (電気泳動)処理したサンプルは2度65ボルト/時間のファストゲルシステム による電気泳動を行った。1つのゲルはファルマシア開発技術ファイル番号20 0に従かいコマージブリリアントブルーによるタンパク質染色を行った。第2の ゲルは50mM) ’)ス−,lIC’A (pH7,5) 、0.1%) ! J ):/X−100テ洗浄しSDSを除き酵素活性を再活性化した。洗浄ゲル 中の脂質分解活性の存在は例ICで述べたβ−ナフチルアセテート/ファストブ ルーBB塩法に基づく軟寒天重層技術で可視化した。30℃で30分間インキュ ベーションした後、透明な背景に紫色のバンドが出現してきた。第9B図に示し たように、大腸菌pET3クローン由来のリパーゼ及び天然のP、スツゼリ ( Stutzeri) ThairV17−1のリパーゼ(MW40kDa )は SDSゲル電気泳動で同じ移動度を示した。同様の熱変化性が大腸菌に12の別 の外膜タンパク質(御上A遺伝子産物)についても報告されている(フリュード ル(FreudI)等、ジャーナル・オブ・バイオロジカル・広域宿主ベクター におけるシュードモナスシュードアル力リゲンス(Pseudomonas p seudoalcaligenes)遺伝子ライブラリーの構築 P、シュードアル力リゲンス(pseudoalcaligenes) M − 1株のリパーゼ遺伝子クローニングに対する別の戦略として、二要素性広域宿主 クローニングシステムを使用した。これは種々のシュードモナス(Pseudo monas)の変異株に対する相補性により遺伝子バンクの直接スクリーニング を可能にする。2つの広域宿主ベクターpLAFR1(フリートマン(Frie dman)等、ジーン(Gene)1主(1982)289−296)及びpK T248(バグダサリアン(Bagdasarian)等、ジーン(Gene)  16 (1981)237−247)を用いた。プラスミドp LAFR1は テトラサイクリン耐性を供与するRK2由来の広域宿主コスミドであり、これは 転移可能であるが自立転移することはできない、プラスミドpKT248はスト レプトマイシン耐性及びクロラムフェニコール耐性を供与する転移可能なR30 0B由来の広域宿主プラスミドである。大腸菌からシュードモナス(Pseud omonas)へのこれらのベクターの転移はRK2転移機能を有する(ジンク (Ditta)等、プロシイ−ディング・イン・ナショナルアカデミ−・オブ・ 7347−7351)pRK2013の助けを借り、フリートマン(Fried a+an)等(ジーン(Gene) 18 (1982) 289 296)の 三親交配操作に従って行った。P、アルギノサ(aeruginosa)PAO 2302株のリバーゼマイナム変異株(ウォルファース(Wohlfarth) 及びU、に、ウィンクラ−(Winkler)、(ルア大学、ポカム、FRG) から入手した)を受容シュードモナス(Pseudo−1lonas)として使 用した(ジャーナル・オブ・ゼネラル・マイクロインビトロからのラムダファー ジバッキング抽出物の調製及びpLAFRI DNAのパフキングは基本的にイ シュホロヴイソツ(Ish−Horowicz)及びパーク (Burke)  (ヌクレイソファシラズリサーチ(Nucleic Actds Res、)  9 (1981) 2989−2998)の方法で行った。r3単に言うと、全 P、シュードアルカリゲンス(pseudoalcaligenes)M −I  D N AをEcoRr又は5a11で部分切断し、EcoRI制限切断pL AFRI DNA又は5ail制限切断pKT248DNAにライゲーションし た。ベクターに対する挿入物の比を1;5にしてベクターとベクターのライゲー ションの可能性を減らした。インビトロでライゲーションしたM−1/pLAF RI DNAをラムダファージの頭部にパフキングし、大腸菌DHIへ注入した (マニアチス(Maniatis)等、上述1982)。 P、シュードアル力リゲンス(pseudoalcaligenes) M − 11部g当たり約2.500個のテトラサイクリン耐性のトランスホーマントが 得られた。P、シュードアルカリゲンス(pseudoalcali−gene s)が5000kbのゲノムサイズを有し、かつ少くともテトラサイタリン耐性 トランスダクタントの50%が20kbの挿入物を有すると仮定すると、特定の I)NA配列を99%の確立で発見することを保証するには2300個の異なる クローンが必要である(クラーク(C1ark)及びカーボン(Carbon) 、セル(Cell) 9(1976)91)、この遺伝子ライブラリーは850 0個以上の異なる組換えコロニーを含んでいるのでおそらくそれは全P。 シュードアルカリゲンス(pseudoalcaligenes)のゲノムを含 んでいるであろう。 ライゲーションしたM−1/pKT248DNAを例1で述べたようにコンピテ ント大腸菌にトランスホームした。大腸菌JM101、 hsdS recAの トランスホーマントをストレプトマイシン耐性(Ss”)で選択し、かつクロラ ムフェニコール感受性(C+ms)で逆選択した。5000個の5IIRCIn Sクローンが得られた。大腸菌宿主中に得られた2つのM−1遺伝子ライブラリ ーのレプリカをプレートにとり、例1で述べたように脂質分解活性についてスク リーニングした。13000個の組換えトランスホーマントのいずれもリパーゼ 活性を示さなかった。 それゆえ大腸菌からP、アルギノサ(aeruginosa) P A O23 02(6−1)へのそのクローンの転移を以下のように行った。組換えプラスミ ドは、供与株を受容株(PA002302/6−1)及びヘルパー株(pRK2 013プラスミドを宿す大腸菌?IC1061又はDH1)の下地にレプリカを とることによりシュードモナス受容株に転移させた。供与株、受容株及びヘルパ ー株を、ノ\−トインフユージョン寒天プレート上で一晩増殖させた後、0.2 %クエン酸塩、メチオニン(10μg / va It )及びストレプトマイ シン又はテトラサイクリンを含む最小寒天培地にレプリカをとることによるエク スコンシュカントを選択した。 クエン酸塩は大腸菌によって代謝されない。組換えプラスミドを有するリパーゼ 欠損変異体のリエ発現型の保は、クーカー(Kouker)及びジャガー(Ja eger)が報告しているように(アプライド・アンド・エンバイロメンタル・ マイクロバイオロジー(Appl、 Env、 Microbiol、) 53  (1987) 211−213)そのP、アルギノサ(aeruginosa )のエクスコンシュカントのレプリカをトリオレオイルグリセロール及び蛍光色 素ローダミンBを含む栄養寒天培地にとることによりテストした。 13000個のスクリーニングを行ったエクスコンシュガントのうちの4個は、 37℃、40時間のインキュベーション後、細菌コマニーの周辺に360no+ の光で可視光を発するオレンジの蛍光性ハローを発現することで確認されるリパ ーゼ活性を示した。 これらのポジティブクローンのうちの1つ、pALM5を選んでさらに特性を調 べた。 、最後に、pALM5を宿ずpA02302/6−1エクスコンシユガントによ り生産されるリパーゼがP、シュードアル力リゲンス(pseudoalcal igenes) M −1株由来のリパーゼが示す望ましい特性を有することを 確認するため、酵素サンプルを調製し生化る)を行った。これらのテストで得ら れた結果は、pALM5クローンにより生産された酵素の脂質分解活性は、親株 のM−1に由来する酵素と同じ特性を存していた。 例4 シュードモナスシュードアル力リゲンス(Pseudomonas pseud o−alcaligenes) M −1リパーゼ遺伝子の分子クローニングA 、タンパク質の精製及び配列決定 シュードモナスシュードアル力リゲンス(Pseudomonas pseud o−alcaligenes) M −1株の凍結乾燥上清の醗酵及び調製は、 BP−A−0218272に述べられている。脂質分解性酵素は基本的にウィン ゲルダ−(Wingerder)等(アプライドマイクロバイオロジーアンドバ イオテクノロジー(Appl、 Microbiol、 Biotechnol 、)叢7 (1987)139−145)の方法に従がい、この上清から精製し た。精製後のこのタンパク質調製物はSDSポリアクリルアミドゲル電気泳動と つづくコマージブリリアントブルー染色による検定で80%以上の純度を有して いた(第10図参照)。 N−末端配列分析は、マツダイラ(Matudaira) (ジャーナル・オブ ・バイオロジカル・ケミトリー(J、 Biol、 Chew、)1工1(19 87)10035−10038)の方法に従がいSDSゲル電気泳動及びイムモ ビロントランスファーメンブレン(ミリボア社)へのエレクトロブロッティング 後に行った。この分析は以下の配列を示した(簡便な1文字アミノ酸コードを使 用している)。 GLFGSTGYTKTKYP I VLTHGMLGFl 10 20 B、M−1リパーゼ遺伝子のクローニング2つの327−の合成オリゴヌクレオ チド5 ’ ACCGGCTACACCAAG ACCAAG TACCCCA TCGT−3’及び5 ’ ACCGGCTACACCAAG ACCAAG  TACCCG ATCGT−3’は、P、シュードモナス(Pseudomon as)のコドン選択性及び遺伝子コードの縮重を考慮し、先に述べた成熟リパー ゼタンパク質のN末端配列のアミノ酸6番−15番(TGYTKTKYP I) から誘導した。ハイブリダイゼーションプローブとして使用するため、このオリ ゴヌクレオチドはT4ポリヌクレオチドキナーゼを用いて末端ラベルした。 染色体DNAをアンドレオリ (Andreol i)の方法(モレキュラー・ アンド・ゼネラル・ジエネテイクス(Mo1. Gen、 Genet、)19 9 (1985)372−380)に従かいシュードモナスシュードアル力リゲ ンス(Pseudomonas pseudoalcaligenes)M − 1株(CBS473.85>から単離し、いくつかの制限エンドヌクレアーゼで 消化した後、0.8%アガロースゲルで分離した。プローブとして放射性ラベル した32マーのオリゴヌクレオチドを用いたこれらのゲルのサウザンプロット分 析は、以下に示す独特のハイブリダイズするDNAバンドを示した: 1.8k b BclI。 2.0kbPvuII及び1.7kbSa11.それゆえM−1染色体DNAを これら三種の制限エンドヌクレアーゼで別々に消化し、0.8%アカ1−スゲル ミ気泳動で分画したのち、上述の)1イブリダイズした両分を、シレイチ−?  −(Schleicher)及びシュル(Schull)社から市販されている バイオトラップBT100O装置での電気溶出により回収した。 1、8 kbのBclI消化画分をBamHI切断後脱リン酸化したベクターp TZ18R/19R(ファルマシアから市販されている、ウォーデン、オランダ )にライゲーションした。2.0kbのPvulI消化画分はSmaI切断後脱 リン酸化したベクターpTZ18R/19Rにライゲーションした。1.7 k bの5alI切断画分は、5alI切断後脱リン酸化したベクターpZT18R /19Rにライゲーションした。これら三つのライゲーション物質を大腸菌J  M 101 hsdS recAのコンピテント細胞(アンドレオリ(Andr eoli)により報告されている、上述)にトランスホームレ、アンピシリン、 X−gel(5−ブロモ−4−クロロ−インドリル−β−D−ガラクトピラノシ ド)及びIPTG(イソプロピル−β−D−チオガラクトピラノシド)を含むル リア培地寒天プレートにブレーティングした。 新鮮な寒天プレート上に約4000個の白色コロニーをピックアップし、放射性 ラベルした327−のオリゴヌクレオチドへのコロニーハイブリダイゼーション によりスクリーニングした。この方法により12個のポジティブコロニーが得ら れた。これらのポジティブコロニーのそれぞれからアルカリ分解法によりプラス ミドミニプレフプを調製し、業者の説明書に従って適当な制限エンドヌクレアー ゼで消化した。6個のプラスミドは期待されるハイブリダイズ挿入物を含んでい た。pTMPv18Aと命名された2、0kb PvuI+断片のみを含むプラ スミドの1つをさらに詳細に分析するために選んだ。プラスミドpTMPν18 Aを宿す大腸菌JM101罫S工Aのサンプルを、CBSL42.89として、 1989.3月8日CBSに登録した。 上記のようにして得た大腸菌のpTZl 8R/19R組換えトランスホーマン トのレプリカをとり、例2で述べたように脂質分解活性でスクリーニングにた。 試験した5X10’個の大腸菌トランスホーマントのうちのいずれも脂質分解活 性を示さなかった。 この失敗のいくつかの理由としては以下のものが考えられる。a)M−1リパー ゼ遺伝子の遺伝子発現開始シグナルが大腸菌の転写/翻訳システムに認識されな い(例えばジーンズ(Jeenes)等、モレキュラー・アンド・ゼネラル・ジ ェネティクス(Mo1. Gen。 Genet、)203 (1986)421 429参照)、b)このM−1リ パーゼ遺伝子に関しては調節配列又は調節タンパク質を変える必要性がある。  c)大腸菌中ではM−1リパーゼの適正な折りたたみ又は分泌がうまく行なわれ ない。 C,M−1リパーゼ遺伝子の特性及び配列決定プラスミドpTMPv18Aを6 bpの認識配列をもつい(つかpTMPv18Aの2.Okb PvuI[挿入 物の予備的制限エンドヌクレアーゼ切断地図を作ることができた。この地図を第 11図に示す。 使用したpT218/19RベクターはDNAクローニング、ジデオキシDNA シーケンシング、インビトロ突然変異誘発及びインビトロ転写を可能にする多目 的性′オールワンシステム”を提供した(ミード(Mead)等、プロティンエ ンジニアリング(Protein Engineering)土(1986)6 7−74)、二本鎖プラスミドはファルマシアから入手できるヘルパーファージ )113KO7を用いた重感染により一本鎖DNAに転換した。pTMPv18 AのXhol及びEcoRV部位間の0.94kbDNA断片のDNA配列を第 12図に示す。全ての可能な読み枠で翻訳されたとき、このDNA配列は直接的 アミノ酸配列決定で決定されたように、リパーゼタンパク質のNH,末端アミノ 酸残基(残基1−24)を含・む大きな読み枠を持つことを明らかにした(本例 のA参照)。 位置−24のメチオニンは、バクテリアのシグナルペプチドに典型的な一連のア ミノ酸に先行することからタンパク質前駆体の開始コドンである(フォンヘイン (Von Heyne)、ジャーナル・オプ・モレキュラー・バイオロジー(J 、 Mo1. Biol、)上92(1986)287−290)、24個のア ミノ酸からなるこのシグナルペプチドは、分泌プロセルの際にAEA(−3〜− 1)シグナルペプチダーゼ認識シグナルの後ろで切り離される。このシグナル配 列のシスティン残基の回りの領域は脂質タンパク質コンセンサスシグナルペプチ ド(フォノへイン(Van I(eyne)、同上)に非常に似ていることが注 目される。 このDNA配列から予想されるアミノ酸配列は、成熟M−1リパーゼはTGA終 止コドンで終わる289個のアミノ酸から成ることを示している(第12図参照 )、この成熟タンパク質の予想分子量は30,323であり、これはSDSポリ アクリルアミドゲル電気泳動によりM−1リパーゼについて測定された分子量( MW31500)と非常によく一致している(第10図参照)。 例5 シュードモナスアルギノサ(Pseudomonas aeruginosa)  P A Oリパーゼ遺伝子の分子クローニング シュードモナスアルギノサ(Pseudomonas aeruginosa) のリパーゼは分子量約29000の脂質加水分解酵素(EC3,]、1.3)で あり、これは後期対数増殖期に培地中に分泌される(スチュア(Stuer)等 、ジャーナル・オブ・バクテリオロジ−(J、 Bacteriol)土工主( 1986)1070−1074)。 A、クローニング及び特性 シュードモナスアルギノサ(Pseudomonas aeruginosa)  P A 01株(ATCC15692)のリパーゼ遺伝子をクローニングする ため、シュードモナス(Pseudo+nonaceae)の種々の突然変異株 に対する相補性により直接遺伝子バンクをスクリーニングし得る広域宿主クロー ニングシステムを使用した。広域宿主ベクターとしてpK7248(バグダサリ アン(Bagdasarian)等、ジーン(Gene)上6 (1981)2 37−247)を用いた。これはストレプトマイシン及びクロラムフェニコール 耐性を有する転移性R300B由来の広域宿主プラスミドである。 シュードモナスアルギノサ(Pseudomonas aeruginosa)  P A 01 DNAを制限エンドヌクレアーゼ5a11で部分分解し、pK 7248ベクターの単一の5ai1部位にライゲーションした。挿入物二ベクタ ーの比を5:1としベクター−ベクターライゲーシッンの可能性を減少させた。 ライゲーションしたPAO/pKT248DNAは、例IBで述べたように大腸 菌5K110Bコンピテント細胞にトランスホームした(トノパン(Donov an)及びクシュナ−(Kushner)、ジーン(Gene)2j (198 3)39−48)。 大腸菌S K 1.108のトランスホーマントをストレプトマイシン耐性(S m”)で選択し、かつクロラムフェニコール惑受性(Cms)で逆選択した。 6000個の5IllCIlsクローンが得られ、それらを例2で述べたように 脂質分解活性でスクリーニングした。おそらく大腸菌中ではシュードモナス(P seudomonas)のプロモーターがよく認識されないため、これらのクロ ーンのいずれもその活性を示さなかった(ジーンズ(Jeenes)等、上述) 。 それゆえ、そのクローンの、大腸菌からシェードモナスアルギノサ(Pseud omonas aeruginosa) P A O2302リパ一ゼ欠損変異 株6−1 (ウォルファース(Woh 1 f ar th)及びウィンクラ− (Winkler) 、ジャーナル・オブ・ゼネラル・マイクロバイオロジー  (J、 Gen、 Microbtol、) 134 (1988) 433− 440)への転移を以下のように行った。6000個のクローンを各々50個づ つから成る120のグループに分けた。各グループからフラスミYtA製物を作 り、PAO2302(6−1) 1ip−変異体のコンピテント細胞へのトラン スホームに用いた。シュードモナス(Pseudo+5onas)のコンピテン ト細胞の調製はオルセン(Olsen)等(ジャーナル・オブ・バクテリオロジ −(J、 Bacteriol、)150(1982)60−69)に従った。 選択はストレプトマイシン(50μs/af)を補ったカルシウムトリオレイン (CT)寒天プレート(つtシフ1−ス(jlohlfarth)及びウィンク ラ−(Wtnkler) 、上述)で行った。スクリーニングした5000個の PA○トランスホーマントのうちの10個がコロニー先端の白色結晶によって確 認されるリパーゼ活性を示した。さらに特性を明らかにするため、これらのポジ ティブPAO)ランスホーマントのうちの個、p S W 1を選んだ。 これに含まれるプラスミドを、制限分析及びアガロースゲル電気泳動により特性 を調べてみると、1.3 kb、0.97kb及び0.76kbの5allサブ フラグメントからなる3、Ikbの3all挿入物を含むことが分った。DNA 配列決定及びリパーゼ遺伝子の発現を行うため、これらの挿入物を適当なベクタ ーにサブクローン化した。 psW103と命名したpUc19由来のサブクローンのプラスミドDNA ( 1,3kb及び0.97kb挿入物を含む)を単離し、制限エンドヌクレアーゼ で分析した。このプラスミドpsW103の物理地図を第43図に示す。プラス ミドpsW103を宿す大腸菌J M 101 hsdS recAのサンプル を、第141.89号として、1989年、3月8日OBSに登録した。 B、シュードモナスアルギノサ(Pseudomonas aeruginos a) PAOIリパーゼ遺伝子の配列決定と特性 PAOIリパーゼ遺伝子を含むpsW103の2.3 kbS al l挿入物 を2つの操作で配列決定した:バクテリオファージM13誘導体mp18及びm p19(ヤニシューペラン(Yanisch−Perron)等、ジーン(Ge ne)33 (1985)103−119)を用いたデニンガ−(Deinin ger)の“強制”クローニング配列決定法あるいは“ショットガン“クローニ ング配列決定法(アナリティカル・バイオケミストリー (Anal、 Bio chem、) 129 (1983) 216−223)及びミズサワ (Mi zusawa)等のジデオキシチェーンターミネーション技術(ヌクレイックア シッズリサーチ (NucleicAcidRes、)14 (1986)13 19−1324)。 “強制“クローニング配列決定操作では、psW103の2.3kb挿入物の5 alI/PstI及びS al I / EcoRI断片を精製し、適当なM1 3mp18ベクターにライゲーションした。得られたDNA配列の断片を継ぎ合 せることにより全DNA配列を確定した。全んどのDNA配列は両鎮について測 定した。全ての可能な読み枠で翻訳されたとき、このDNA配列は、psW10 3の0、97 kbsal I断片のみが(第14図参照)成熟PAO1リパー ゼをコードしていることを明らかにした。 pSW103サブクローンの1.3 kbs al I断片は、全ての可能な読 み枠で翻訳してみた時も、直接的アミノ酸配列決定で測定されたようなPAO1 リパーゼタンパク質の24個のN末端アミノ酸残基をコードしていなかった。 0、97 kbの3alI断片のDNA配列から予想されるアミノ酸配列は、1 個の興味あるドメインを示している(第14画人で示しである)。 、ドメインAは真核性リパーゼ(ライオン(Wion)等、サイエンス (Sc ience)235 (1987)1638−1641) 、ボドマ−(Bod mer)等、バイオケム・バイオロジー・アクタ(Biochem。 Biophys、 Acta)909 (1987) 237−244)及び原 核性リパーゼ(クギミャ(1(ugim 1ya)等、バイオケム・バイオロジ ー・すでに決定されているアミノ酸配列G−H−S−H−Gをコードしている。 例6 A、バクテリアにおけるクローン化したM−1リパーゼの発現異種宿主における M−1リパーゼの発現レベルを向上させるため、M−1リパーゼ遺伝子を含むp TMPv18Aの2.0 kbK pn l−HlndII[断片をKpnl及 びHindII[で消化したpBHA/Clベクターにライゲーションした。p BHA1ベクターのヌクレオチド配列はEP−A−0275598に述べられて いる。以下の抗生物質耐性遺伝子の発現が異なること以外はpBHc1ベクター とpBHA1ベクターは同じである:クロラムフエニコールアセチルトランスフ エラーゼ遺伝子はpBHc1ベクターを宿す大腸菌WK6株中で発現し、またβ −ラクタマーゼ遺伝子はpBHA1ベクターを宿す大腸菌WK6株中で発現する 。大腸菌WK6株についてはR,ゲル(Zell)及びH,J、フリフッ(Fr i tz)によッテ報告されテイル(EMBOJ、6 (1987) 1809 )。 WK6株のトランスホーメーション及び得られたアンピシリン(pBHAlの場 合)及びクロラムフェニコール(pBHclの場合)耐性コロニーの分析の結果 各々プラスミドpBHAM−1及びpBHCH−1が検出された(第15図参照 )。 次のステップはM−1前駆体タンパク質のATG開始コドンへのHdel制限エ ンドヌクレアーゼ部位の導入である。スタンセンス(Stanssens)等じ タンパク質工学及び部位指定突然変異誘発”、24回ハーダー(Harder) 会議、1985、A、R,ファースト(Feersht)及びG、ウィンター( Winter) W)の方法に従がいpBHA/CM−1プラスミドの部位指定 突然変異誘発を行った。 突然変異誘発後、制限酵素分析及びミヅザワ(Mizusawa)等のジデオキ シ法を用いた配列分析により(例5参照)関連する突然変異を有する潜在的変異 体のチェックを行った。これらの分析後、pBHAMINlと命名した適正なプ ラスミドを発見した(第16図参照)、大腸菌中でのM−1リパーゼの発現を調 節するため、M−1リパーゼ構造遺伝子を含むpBHAMINIの1.7 kb Hdel Hind m断片を単離し、2つの発現ベクターにライゲーションし た。 −pTZ18RN:β−ガラクトシダーゼのATG開始コドンに単一のNdeI 部位を含むpTZ18R誘導体(ミード(Mead)等、タンパク質工学(Pr otein [Engineering)土(1986)6?−74)。 −pMCTN: tacプロモーター及びリボゾーム結合部位の後に単一のNd eI部位を含むpMC誘導体(スタンセンス(Stanssens)等、上述) 。 2つのライゲーション調製物を大腸菌J M 101 hsdS recAのコ ンピテント細胞にトランスホーメーションした後、このトランスホーマントを0 .5mM I PTG (イソプロピル−β−D−チオガラクトシド)を含むト リブチリン寒天プレートを用G)脂質分解活性でスクリーニングした。これらの トリブチリンプレートの30℃48時間のインキュベーションとそれにつづく数 日間の冷蔵庫保存の後、いくつかのコロニーが脂質分解活性を示す淡0710− を形成した。これらのトリブチリンポジティブクローンのプラスミドの特性を制 限酵素分析で調べた請求めていた2つのプラスミドが発見された: pTZNIMl + Iacコントロール配列の後にM−1リノ(−ゼ遺伝子を 有する(第17図参照)、 −pMcTMl : tacコントロール配列の後にM−1リノず一ゼ遺伝子を 有する(第18図参照)。 プラスミドpTZNIM−1及びpMCTM−1をそれぞれ宿す大腸菌トランス ホーマントによって生産される脂質分解活性を同定するため、これらのクローン を30℃で一晩、100mj!の2TY培地(16g/lバクトドリプトン、1 0g71)くクトイーストエキストラクト、5g/1lNac1、pH7,0> 中で増殖させ、ついで0.5mM IPTGを用い、30℃3時間の誘導を行つ た。ネガ1イブコントロ・−ルとしてはpTZ18RNを宿す大腸菌J M 1 01hsdSμにへ株を用いた。細胞を遠心により培養上清を分離した後、テラ アキ(Tetuaki)等(アプライド・エンバイロメンタル・マイクロバイオ ロジー(Appl、 Env、 Mjcrobiol、) 50(1985)2 98−303)の方法に従がいペリプラズマ及び膜/細胞質成分に分画した。各 両分は、レムリ (Laem*1i)の方法に従かい(ネイチ+ (Natur e) 227 (1970) 680−685)13%の分離ゲル及び5%のス タンキングゲルから成るSDSポリアクリルアミドゲルで分析した。電気泳動は ブロモフェノールプル(BPB)マーカー色素がゲルの底に到達するまで60m Aで運転した。サンプル調製及びタンパク質プロッティング操作はEP−A−0 253455に述べられているように行った。ウェスタンプロット分析には、P 、シェードアルカリゲンス(pseudoalcaligenes) M −1 株由来の精製リパーゼに対する多価ウサギ抗血清を用いた。第19図に示した結 果から、各々pTZNIM1及びpMCTMlを宿す大腸菌はM−1リパーゼ特 異的31.5kDaポリペプチドを合成し、かつ細胞周辺腔に分泌し得ると結論 される(第19図、レーンB及びC参照)、この31.5kDaポリペプチドの 脂質分解活性は例ICで述べたβ−ナフチルアセテート/ファーストブルーBB 塩法に基づく軟寒天重層技術により確認した。 EP−A−0275598及びEP−A−0253455は目的遺伝子を含むベ ビクルをバチルス(Bacillus)に効率的に転移し、望ましいポリペプチ ド産物を効率的に分泌するバチルス(Bacil Ius)株を得るための方法 を公開している。この方法はThaiTV 17−1及びM−1リパーゼ遺伝子 の両方に用いた。 M−1リパーゼ遺伝子の場合、pBHAMIN1ブラスミド(上述)をNdel で消化し、再結合した。このライゲーション混合物をバチルスリチェニホルミス (Bacillus l1chenifor++1s)T9のプロトプラストに トランスホームした。多くのネオマイシン耐性トリブチリンポジティブコロニー を分析し、適正なプラスミドを得た。このプラスミドはpUBlloのHpaI Iプロモーター(ジブリアン(Zyprian)及びマツバラ(Ma Luba ra)、DNA 5(1986)219−225参照)の後ろにM−1の前駆体 タンパク質を含んでおりpBHMINlと命名された(第20図参照)。 プラスミドpBHMIN1を宿すT9)ランスホーマントを例2で述べた方法に 従かい工業用培地中での醗酵の後β−ナフチルエステルの加水分解能についてテ ストした。その結果は、このT9クローンによって生産される酵素の脂質分解活 性が親株のシュードモナスシュードアル力リゲンスCPseudotaonas  pseudoalcalige−nes)M 1株のリパーゼと同様の特性で あることを示した。 シュードモナス(Pseudomonas)宿主における発現については、シュ ードモナス(Pseudomonas)特異的バクテリオファージPt3のp7 8遺伝子の構成プロモーターを用いた(R,G、M、ルイテン(Luiten)  “繊維状バクテリオファージ”Pf3:分子遺伝学的研究”、PhDセシス( Thesis) 、1987、ニメゲンカソリック大学、オランダ)、このPf 3プロモーターをコードする合成りNA断片: TCTAGGTGCATCTGAATGGAGCTCGGTAC3’AGATC CACにTAGACTTACCTCGAGC5’を合成した。 この断片をEcoRI及びKpnlで切断したベクターpTZ18Hにライゲー ションし、プラスミドpTZPf31Aを作った。 シュードモナス(Pseudomonas)中でクローン化したM−1リパーゼ 遺伝子を発現させるため、pTMPvl 8A、pMcTMl、及びpTZPf 3MI中に存在するM−1発現カセントを広域宿主ベクターpKT231 (バ グダサリオン(Bagdasarion)等、ジーン(Gene)16 (19 81)237 247) 、pLAFR3(スタスカウィス(Staskawi sz)等、ジャーナル・オブ・バクテ(1987)275−280)に挿入した 。M−1発現カセントを宿す広域宿主プラスミドをフリートマン(Friedm an)等、(ジーン(Gene)18 (1982)289 296)の二組交 配操作に従がい、次のシュードモナス(Pseudomonas)株に転移させ た。 −P、アルギノサ(aeruginosa) P A O2302株のリパーゼ 欠損変異株6−1 (ウォルファース(Wohlfarth)及びウィンクラ− 01inkler))。 一すパーゼ欠損P、プチダ(putida) K T 2442株(ゼヤー(Z eyer)等、アプライド・エンバイロメンタルマイクロバイオローP、 シュ ードアルカリゲンス(pseudoalcaligenes) M −1株(C BS473.85)。 −P、シュードアル力リゲンス(pseudoalcaligenes) I  N ll−5株(CBS468.85)。 ミドの転移の別の操作法としてシーンパルサー(バイオラドラボラトリ−社)の 使用マニュアルに従かう電場によるトランスホーマントョ7(’エレクトロポレ ーション”)を使用した。 得られたシュードモナス(PseudomonaS)のトランスホーマントのリ パーゼ生産テストをオデラ(Odera)等(ジャーナル・オブ・ファーメンタ )Lt−テクノロジー(J、 Fer+ment、 Technol、) 64 (1986)363−371>により報告されているオリーブ油培地中の発酵後 行った。 以下の第2表では種々の株の脂質分解活性生産性を示した。 第2表 特定のトランスホームを受けたM−1リパーゼ遺伝子を含むシュードモナス(P seudomonas)株のリパーゼ生産性” 脂質分解活性は例2で述べた方 法を用い、培養上清につ0て測定した。 シュードモナス(Pseudomonas)のトランスホーマントによって生産 されるリパーゼをSDS・ゲル電気泳動で分析してみると、本来のP、シュード アルカリゲンス(pseudoalecaligenes) M 1株によって 生産されるリパーゼと同じ移動度を示した。 P、シュードアル力リゲンス(pseudoalecaligenes)中にM −1発現カセントを多数導入することにより供与株によって生産されるリパーゼ レベルと比較すると2〜4倍の向上が見られる。さらにM−1リパーゼ遺伝子の 本来の遺伝子発現開始シグナル又はプロモーターは、PAOI株及びKT244 2株とは対照的にシュードモナスシュードアル力リゲンス(Pseudomon as pseudoalcali−genes)において活性をもつと結論する ことができる。 B、クローン化したM−1リパーゼ遺伝子のインビトロでの発現M−1リパーゼ を含むクローンのインビトロでの発現は真核性DNA依存翻訳キット(アマージ ャムインターナショナル社)を用いて行った。このシステムはもし関連するコン トロールシグナルが存在するなら、そのバクテリアプラスミド上の遺伝子のイン ビトロの発現を可能にする。以下の4つのバクテリアプラスミドについて分析し た。 B、1. M−1リパーゼ及びβ−ラクタマーゼ遺伝子産物をコードし、かつア ンピシリン(Ap)耐性を付与するプラスミドpTMPv18A(第11図参照 )、さらにpTMPv18Aは自分自身の調節シグナル、プロモーター、シャイ ン・ダルガルノ配列及びリーダー配列を存している。 B、2.M−1リパーゼ遺伝子及びクロラムフェニルコール耐性遺伝子(Cm) を存するプラスミドI)MCTMI <第18図参照)。 この構築物の場合リパーゼプロモーターは強力なtacプロモーターに交換して いる。 B、3. プラスミドII)MCTb 1 iMlもM−1リパーゼ遺伝子及び クロラムフェニコール耐性遺伝子を有している。この構築物の場合、リバーゼシ クナル配列はα−アミラーゼシグナル配列に交換されている(BP−A−022 4294参照)。プロモーターは構築物pMcTM1と同じである。 B、4. プラスミドpTZ18RNはネガティブコントロールとして使用した (第17図参照)。 上述したプラスミドのDNA(0,5!g)をインビトロで転写した。この反応 は0.5 p j!の10 xTB/10 xNTPミックス(20xTB及び 20XNTPの等景況合物; 20 xTBは800mM)リス−HC1,pH 1,5,120+wM MgC7! 、及び40w1Mスペルミジン;20XN TPミツクスには10+aM ATP、 10mM CTP、10謡M GTP 及び10閣M UTP)、0.5μlの0.IMDTT、0.5.171のRN asin (40u/μ#、プロメガ社)及び0.5 p IlのT7RNAポ リメラーゼ(15u/、c+l。 プロメガ社)又は1μEの大腸菌RNAポリメラーゼ(1u/μE゛、ベーリン ガー社)を加えることにより行った。この反応混合物を39.5℃で1時間イン キュベーションした。 RNA転写物のインビトロでの翻訳は業者の説明書に従って行った。M−1リパ ーゼはヴアンモリク(Van Mourik) (ジャーナル・オブ・バイオロ ジカル・ケミストリー(J、 Biol、 Chew、) 260(1985) 11300−11306)の方法に従かいM−117バーゼに対するモノクロー ナル抗体を用いて免疫沈殿化した。 ネガティブコントロールとしてはpTZ18RNを使用した(第21図、レーン A及びE)−pTMPv18Aの免疫沈殿化(レーンB)はプロセシングを受け ていない34kDaM−1!Jバーゼを示した。pMcTM−1の免疫沈殿化( レーンC)ではプロセシングを受けていない34kDaのM−11Jバーゼ及び 31、5 k D aの成熟M−1リパーゼが示された。一方pMcTbliM 1の免疫沈殿化(レーンD)は31.5 k Dの成熟M−11Jバーゼを示し た。このインビトロでの翻訳実験からM−1リパーゼ遺伝子は大腸菌の5−30 抽出物中で発現し得ると結論できる。pTMPv18Aのインビトロ転写/翻訳 実験から得られたデータはM−1!Jバーゼがプロセシングを受けてない理由か らトリブチリンプレート上で脂質分解活性を示さない事を裏付けた(例4B参照 )。 例7 プローブとして特性の明らかなリパーゼ遺伝子を用いた酵素分子のスクリーニン グ さらに本発明の一般的応用性を説明するために、別の微生物に由来する同等の特 性を有するリパーゼ遺伝子の探索に本出願で公開されているプローブを使用した 。ここでは同様又は同等の洗浄応用性を有するリパーゼをコードするリパーゼ遺 伝子を選択し得ることを示した。 例8において我々は本ハイブリダイゼーション技術によって他ゲンス(Pseu domonas pseudoalcaligenes) M −1(CB 5 473.85)+P、シュードモナスシュードアル力リゲすスlNll−5(C BS468.85) 、P、 アルカリゲンス(DSM50342)、P。 アルギノサ(aeruginosa) (PACI R(CBS 136.85 ) P。 アルギノサ(aeruginosa)PAO(ATCC15692) (ウォル ファース(Wohlfarth)及びウィンクラ−(Winkler) 、19 88、ジャーナル・オブ・ゼネラル・マイクロバイオロジー(J、 Gen。 Microbiol、) 134. 433−440) 、P、スツゼリ(st utzeri)Thai rVl ? −1(CBS 461.85) ; P 、スツゼリ(stutzeri)PG−I−3(CBS 137.89)、P、  スツゼリ(stutzeri)PG−1−4(CBS 13&89)、P、  スツゼリ(stutzeri)PG−n−11,1(CBS 139.89>、 P、 スツゼリ(stutzeri)PG−n−11,2(CBS140.89 )、P、フラジ(fragi)DB1051.P、グラジオリ(gladior i) (CB 5176.86 )。 アシネトバクタ−カルコアセチカス(Acinetobacter calco aceticus)Gr−V−39(CBS 460.85)及びスタフイ(1 1−17カスオーレウス(Staphyrococcua aureus) ( ATCC27661)の染色体D N Aを単離し、その5μgを消化してから サウザンブロツティング技術で分析した(マニアラス(&1aniatis)等 、上述)。そ(7)DNAをニトロセルロースフィルター(シュレイチャー・ア ンド・シュエル(Schleicher & 5chuell)社、BA85  : 0.45rIIM)に移した。このフィルターを6xSSC15xデンノ1 −ト液、0.5%SDS及びl OOtt g/ml変性ウシ胸つDNA中でプ リハイブリダイズした。 2時間のブレインキュベーション後、各々32Pラベル化したpTMPv18A 又はpET3の挿入物を加え、ハイブリダイゼーションを55℃、16時間で行 った。 挿入DNAf!−XhoT及びEC0RVによるpTMPv 18A及びEC0 RIによるpET3の消化によりそれぞれ単離し、その断片を0.8%アガロー スゲル電気泳動で分画した後ガラスミルク操作(シーンクリーン)によりそれら を回収した。pTMPv18Aの挿入物であるlkb XhoI/EcoRV断 片及びpETT3(D挿入物である3、 2 kb EcoRI断片をα32P ATPを用いたニックトランスレーションによりインビトロで高い放射性をもつ ように(2〜5 X 10 ’ cpm/μg)ラベル化した(フエインバーグ (Peinberg)及びボゲルスタイン(Vogelstein)、アナリテ イカルバイオケミストリ−(Anal Biochem、)↓32 (1983 )6−13)。 プローブ断片は平均300〜800塩基長を有することが示された。 それからフィルターを6xSSC,0,1%SDS中55℃で30分の条件で2 回洗浄した。フィルターを室温で乾燥後−70℃で増感スクリーン(クロネック ス、ライティングプラスGH220020)を用いコダックX−omatARフ ィルム又はクロネックス4NI’F100X線フィルム(デュポン)に1〜3日 間露光することによりオートラジオグラフを得た。 ハイブリッドの安定性に関する種々の因子の影響を分析して誘導された以下の式 %式% (′分子生物学における最新プロトコール”、1987−1988、オースベル (Ausubel)等線) (式中 n−プローブの最小鎖長 Ci=イオン強度(M) G+C=塩基組成) を我々の実験で検出された相同性を測定するのに用いた。プローブ長を300塩 基と仮定すると、300塩基以上の断片内の少なくとも67%の相同性を示す遺 伝子を検出し得た。相同性の割合を測定する上でシュードモナス(Pseudo monas)のGC含量は65%と仮定した(ノーモア(Normore) 、 1973. ラスキン(Laskin)及びレチェバリア(Lechevali er) (m) “微生物学ハンドブック1■巻、CRCブレス、ポカレイトン 、F la)第22A図はpET3のEcoRIをハイブリダイズした場合の染 色体DNAの3alI消化物のハイブリダイゼーションパターンを示している。 全んどのシュードモナス(Pseudomonas)株はりET3クローンと相 同的遺伝子を含んでいることが分る。P、フラジ(flagi)DB1051  (レーンM)、A、カルコアセチカス(ca Icoacet 1cus)Gr −V−39(レーン0)及びS、オーレウス(aureus) (レーンP)の 場合、相同的遺伝子は検出されなかった。P、アルカリゲンス(alcalig enes) (レーンE)、P、シュードアル力リゲンス(Pseudomal igenes) (レーンC及びレーンD)、P−アルギノサ(aerugin osa) (レーンF及びレーンG)には中程度のハイブリダイゼーションシグ ナルが観察されたが、一方、P、グラジオリ(gladioli) (レーンN )には弱ハイブリダイゼーションシグナルが観察された。非常に強いハイブリダ イゼーションシグナルがP。 スツゼリ(stutzeri) (レーンH−L)で見られるがこれはpET3 が本来P、スツゼリ(stutzeri)Thai IV 17−1株に由来す るので驚くべきことではない。 第22B図はpTMPv18AのEcoRV/XhoI挿入物を用いたときのハ イブリダイゼーションパターンを示している。 強いハイブリダイゼーションシグナルがP、シュードアル力リゲンス(psud oalcaligenes) (レーンC及びD)、P、 アルカリゲンス(a lcaligenes) (レーンE)及びP、スツゼリ(stutzeri) 株(レーンH−L)由来の染色体DNAから得られることが分る。 P、アルギノサ(aeruginosa)の染色体DNAにはより弱いハイブリ ダイゼーションが見られ(レーンF及びG)、P、フラジ(fragi) (レ ーンM)、P、 グラジオリ軸1adioli) (レーンN)。 A、カルコアセチカス(calcoaceticus) Gr−V −39(レ ーン0)及びS、オーレウス(aureus) (レーンP)の染色体DNAに はハイブリダイゼーションは全くみられなかった。 例8 他の微生物由来の相同的リパーゼ遺伝子のクローニングここに公開した本発明の 応用性を示すため、P、アルカリゲンス(alcaligenes) (D S  M 50342 )由来の相同遺伝子をクローニングするためのプラスミドp TMPv18Aの使用を説明する(第22B図レーンE参照)。 第22B図レーンEにおいて、P、アルカリゲンス(alcaligenes) は、プローブとハイブリダイズする明確な5.0kbSalI断片及び薄い0. 5kbSa11断片を示すことが分る。このことはP、アルカリゲンス(a I ca 1 igenes )がプラスミドpTMPv18AのXho I /  EcoRV挿入物に対し、300以上の塩基対断片内に少なくとも67%の相同 性を有する遺伝子を含むことを示している。 P、アルカリゲンス(alcaligenes)の5.0 kb Sal !断 片がリパーゼをコードする遺伝子を含んでいるかどうかを確めるため、5alI 断片をクローン化した。5ail遺伝子ライブラリーはベクターpUc19を用 いて構築し、大腸菌JM109にトランスホームした(ヤニシューペラン(Ya nish−Perron)等・ジーン(Gene)■(1985)103−11 9)。 遺伝子ライブラリのレプリカフィルターを例7で述べた条件を用い、pTMPv 18Aのα32Pラベル化挿入物とハイブリダイズさせた。5.Okhの5al I断片を含む3個のポジティブクローンをそのライブラリーから単離した;pc Hl、pCH2及びpCH3,pcHlの5. Okb Sal I断片を、ク ロラムフェニコール耐性遺伝子中に存在する5alI部位を利用してベクターp KT248(バグダサリアン(Bagdasarian)等、ジーン(Gene )土工(1981)237−247)に再クローン化した。大腸菌JM109の ストレプトマイシン耐性クロラムフェニコール感受性トランスホーマントを選択 した9期待される5、Okbの5all挿入物を含むこれらのトランスホーマン トのうちの1つ、pcHlolをシュードモナスアルギノサ(Pseudomo nas aeruginosa) 2302(6−1)lip−株にトランスホ ームした(例5参照)。 コロニーをNB−カルシウムトリオレイン寒天上で増殖させた。 増殖後このプレートを10℃で保存した。数日後、トランスホームしたコロニー の回りにカルシウムの沈殿が現れ、また抗生物質を含まない同じ寒天プレート上 で増殖したトランスホームしていないP、アルギノサ(aeruginosa)  2302 (61) 1ip−株の回りには現れない、我々はクローン化した 5、0kbSall断片がP、アルギノサ(aeruginosa)2302  (61) Itp−株の] ip−発現型を相補し、従って適当な宿主内で生産 され得る細胞外リノく−ゼをコードしていると結論する。 DNAハイブリダイゼーション実験に基づき、これらのリノ々−ゼはM−1リパ ーゼとの相同性を示し、かつ結果的にプローブとして用いられるpTMPv18 A挿入物とハイブリダイズする他のリパーゼに対しても相同性を示すと結論し得 る。P、ブルカリゲンス(alcaligenes)のリパーゼのクローニング の説明はM−1リパーゼに対する相同性を示すリパーゼをクローン化する一般的 な応用方法を表わしている。 例9 シュードモナスシェードアルカリゲンス(Pseudomonas pseud o−alcaligenes) M −1由来のリパーゼと他のリパーゼのヌク レオチド配列の比較 シュー・ドモナスシュードアルカリゲンス(Pseudomonas pseu do−alcaligenes)のM−1リパーゼのヌクレオチド配列(第12 図)をシュードモナスフラジ(Pseudomonas fragi) (I  F O−3458)のリパーゼ(クギミャ0[ugiwiya)等、バイオケム ・ノイイオフイズ・リサーチ・コミュニケーション(Bioches、 Bio phys、 Res。 Co*m、)141 (1986)185 190) 、スタフィロコッカスハ イカス(Staphylococcus hyicus)のリパーゼ(ボッ(G otz)等、ヌクレイフクアシッズリサーチ(Nucleic Ac1ds R es、)1主(1985)1891−1903)及びシェードモナスアルギノサ (Pseudomonas aeruginosa) P A O1のリパーゼ (第14図)のものと比較した6M−1リパーゼ及びP、アルギノサ(aeru gi−nosa) P A O1リパーゼの間には81%の高い相同性がみられ 、またM−1リパーゼとP、フラジ(fragi) (IFO−3458)の間 には62%の相同性がみられた。しかし、このP、フラジ(fragi)のリパ ーゼの配列は他の二つのシュードモナス(Pseudo−請onas)のリパー ゼのものよりかなり短かい0M−1リノく−ゼとスタフィロコッカスハイカス( Staphylococcus hyicus)のりノく一ゼの間には相同性が みられなかった。 これらの結果は、pTM Pv 18 Aをプローブとして使用したときシュー ドモナスフラジ(Pseudomonas fragi)及びスタフイロコンカ スオーリウス(Staphylococcus aureus)由来の染色体D NAにハイブリダイズしないという例7で得られたデータを支持している。 P、シェードアルカリゲンスM−1リパーゼのヌクレオチド配列か・ら誘導され るアミノ酸配列も他のリパーゼと比較した。M−1リパーゼのP、アルギノサ( aeruginosa) P A O1リパ一ゼ間の全体にわたる相同性は78 %であり、M−1リノ々−ゼとP、フラジ(fragDリパーゼ間の相同性は4 8%であることが分った。 M−1リパーゼとスタフィロコッカスハイカス(Staphylococcus hyjcus)リパーゼのアミノ酸配列の間にも相同性はみられなかった。しか し成熟M−1リパーゼの重要な87番セリンの領域においては、この4種のリパ ーゼ間には高い相同性がみられた。クギミャ(Kugimiya)等は、この領 域G−H−3−H−Gの配列がリパーゼ酵素の活性中心であると提唱した。 例11 05Lテストにおける相同的リパーゼの洗剤適合性この例は現代の洗濯用洗剤中 のこれらの酵素の適合性をテストするSLMテスト修正法に従がい、洗浄プロセ スにおける、M−1遺伝子と高いDNA配列相同性を示す、P、アルギノサ(a eruginosa) 、P、スツゼリ(stutzeri)及びP、アルカリ ゲンス(alcaligenes)株によって生産されるリパーゼ酵素の性能を 説明している。 使用している洗剤は粉洗剤(ALL”ベース、EP−A−0218272に報告 されている)及び液体洗剤(液体TIDE”これもEP−A−0218272に 報告されているがプロテアーゼの不活性化は行っていない)である。これらのリ パーゼ酵素の調製は以下の操作に従かいバクテリアを培養することにより行った :バクテリアを100tnl!のプレインハートインフュージョン(BHI)培 地中、30℃、24時間、ロータリーシェーカーを用いて培養することにより接 種培地を調製した。その後、以下に述べる組成の培地IEを含むラボファーメン タ−(21)に接種した。 培地組成 プレインハートインフュージョン 18..50(BHI)(ディフコ) イーストエキストラクト (ディフコ> If)、 00塩化カルシウム・28 20 0.80 硫酸マグネシウム・7H,03,20 硫酸マンガニ/ −)1.0 0.030大豆油 5.0 リン酸二カリウム 6・4 発酵は30℃で行った。接種から16時間後、1g/hの速度で大豆油を注入し 始め、さらに発酵を続けた。通気速度は6ol/h及び撹拌速度は700rpn +で行った。発酵は計64時間行った。 発酵後、そのバクテリアを遠心で除去した。その上清を室温で撹拌しながら2. 5倍容のアセトンと迅速に混合した。それからこの混合物を10分間撹拌してか ら放置し、これを吸引口過した。 口過固形分を70%アセトンで洗浄後、100%アセトンで洗浄し、これを減圧 下で乾燥した。 このようにして得たリパーゼ酵素調製物をSLMテスト法でテストした。SLM テストの操作はEP−A−0218272に述べられている。この操作は以下の ように修正して行った。 アセトンに溶かした10mgのオリーブ油(25%)を含む溶液をポリエステル スワッチ(3X3cm)上にスポツティングし、室温で空気乾燥した。10mf の5HW(標準硬水:0.75mMCaCA’、 、0.25 mM MgCL  )又はSHWに溶がした洗剤からなる洗浄液をスリ栓付三角フラスコ(25+ nf)に入れ、40℃の振盪水槽中に保持した。テストした洗剤は粉末洗剤(A LLRベース)及び液体洗剤<TIDE液)である。ALLベース洗浄液の濃度 は4g/l (pH9,5)で行ない、液体TIDEの濃度は1.5g/(!  (pH7,5)で行った。洗浄プロセスは酵素調製物を三角フラスコに加え、直 ちに汚れた標本を入れて40℃で40分以上振盪した。最終的リパーゼ濃度は2 TLU/mβであった。 洗浄後、その標本をSHWですすいだ後55℃で1時間乾燥した。そのように乾 燥した標本を再び新しい洗剤及び酵素液を用いた40分間の二次洗浄サイクルで 洗浄した。二次洗浄サイクル後、標本を0.01NのHCnで処理し、すすいだ 後に室温で一晩乾燥した。乾燥標本を、5+++fの溶媒(n−ヘキサン/イソ プロピルアルコール/ギ酸; 975 : 25 :2.5 (v/v) 、1 mJ/m1n)を入れたガラス管中で回転させることにより抽出を行った。生成 した残渣のトリグリセリド、ジグリセリド及び遊離脂肪酸を1(PLCで測定し た。 HP L C装置及び条件 カラム二〇Pマイクロスフイア−3i (クロムバック)、100X4.6+1 1111 注入システム: ウィスブ(ミリボア)10μ!ポンプ : モデル2150  (LKB)検出器 : 屈折率モニター(ジョビンジボン)インチグレーター:  5P4270 (スペクトラフィジス)m出液 : m−ヘキサン/イソプロ ピルアルコール/ギ酸975 : 25 : 2.5 (v/v) 、1+nj !/min温度 : 室温 トリオレインの保持時間は1.2分、1,3ジグリセリドは2.5分、1. 2 −ジグリセリドは3.6分及びオレイン酸は1.6分であった。ピーク面積又は ピーク高さをトリグリセリド及び脂肪酸の回収の指標として測定した。非洗浄標 本から抽出したトリグリセリド回収量を100%とした。トリオレイン及びオレ イン酸の屈折率の比はピーク高さから1.Oであることが分った。 これらのSLMテストの結果を以下の表に示す。これらの表にはトリグリセリド 回収率及び全脂質回収率を示した。全脂質回収物とはトリグリセリド、1.2及 び1,3ジグリセリド、及び遊離脂肪酸をたし合せたものである。全脂質回収率 キトリグリセリド回収率の差は、リパーゼの活性及び性能の尺度となる。全脂質 回収率とコントロール(リパーゼ酵素なし)の差は布からの油汚れの除去を示し ており、これらの酵素がSLMテストに模倣された現実的洗浄条件で安定かつ有 効であることを示した。 第3表 液体TIDE組成物中の種々のリパーゼのSLMテストの結果第4表 ALT、−ベース組成物における種々のリパーゼのSLMテストの結果 ?:’ = !片言に変更なし) 大腸菌 /pUN121 Y工G[7RE2 F工GURE3 FIGURE 4 く Ω YIC罫こ 5 FIGURE6 の の− F工GURE7 FIGURE8 FIGURE 9人 FIGURE 9B 1234567B r工σσR1? 11 FIGURE JLU LIPASE ML FTGIjぴ 13 F工GURE :t4 uPAsE P入01 CτCGgTACIQ;丁1ζgaT’TTo:CaGCECT130ATHe c=TGOCCAGIOrWFGJ5QILA1111OAOflGEuLLO OVEEIVAL5 α:QにTTCC1GαχCAG ATCα論α刀αππ蕩α=嘱C届α講σC 口℃AIIFLk01PP(isAOIAVLCTTTCCAE+:A:AGG GTACGCIJAATTCACTGIXcTCGCTGGAGiceL55G 5TGrQISLG5L(5 0uCE&rC+XtACC丁CGGo:TZgGIAGGCGCCTIJ:M uGτCAAC)OGIPT5AC(ilGAYKVNACAAIC丁1cCT CuATCCGAEQCGCCTTCCTCODCGCCTCGTCGCTG^ SC丁11FLDPSDAfLGA55LTC5511LOII マ 11+1  れ Yffillll)1rrcwACCx:’c’;σ丁CA’Efflc TACCF、CIGCACGCCAACCf;CC了C入みGrtτbトマ5V 1kullAIIltLKr VYVTECOPVGl15E 4 AccACCRCQjα’::匡4 CAC+J!; (AT TCG C ACAC:TSVGAPHKGSOT コ3o36G TCCCEσO(TCAAC^父ctc GGCc−t CX ATCAGOn c5GLVllSLGALJSF 510 MO GGCGTGAOCτATTACTCCτGGAGCGGTτC:TCCCCG CTGGVSTISld S G55PL 丁1\:AAGA八〇GへAceC−ご:^ツバ:GACG:督:CT、;G丁 C::五CCFKIIGTAND(iLV(iT LDfYllOVFGLT5L 人AF:GCCa;(TdTA; 19自(内宮に変更なし) NdeI 浄書(内容に変更なし) 浄書(内容に変更なし) F工CσRE19 ABCD 浮口(rν3に交Zなし) F工GURE 21 M ARCD EFGH F工GURE 22A P工GURE 22B 平成 年 月 日

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 (1)転写の5′−3′方向に、宿主細胞中で機能する転写調節領域及び翻訳開 始領域、脂質分解性酵素をコードするDNA配列及び宿主細胞中で機能する翻訳 及び転写終止領域を含み、該DNA配列の発現が該転写及び翻訳調節領域の制御 下にある発現カセットを含む微生物の形質転換宿主細胞。 (2)前記発現カセットがさらにマーカー遺伝子を含む請求の範囲(1)記載の 形質転換宿主細胞。 (3)前記DNA配列が前記脂質分解性酵素をコードする遺伝子に適当な読み枠 で結合するリーダー配列を含む請求の範囲(1)記載の形質転換宿主細胞。 (4)前記宿主細胞が原核細胞である請求の範囲(1)記載の形質転換宿主細胞 。 (5)前記原核細胞がバチルス、大腸菌又はシュードモナス細胞である請求の範 囲(4)記載の形質転換宿主細胞。 (6)前記DNA配列がpTMPv18A中のリパーゼコード化遺伝子と少なく とも67%のヌクレオチド配列相同性を有する少なくとも300bpの配列を含 む請求の範囲(1)記載の形質転換宿主細胞。 (7)前記DNA配列がpET3中のリパーゼコード化遺伝子と少なくとも67 %のヌクレオチド配列相同性を有する少なくとも300bpの断片を含む請求の 範囲(1)記載の形質転換宿主細胞。 (8)前記DNA配列が微生物細胞に由来する請求の範囲(6)又は(7)記載 の形質転換宿主細胞。 (9)前記DNA配列がシュードモナス又はアシネドバクター種に由来する請求 の範囲(8)記載の形質転換宿主細胞。 (10)前記DNA配列がP.スツゼリ、P.アルカリデンス、P.シュードモ ナスアルカリデンス、P.アルギノサ又はA.カルコアセチカスに由来する請求 の範囲(9)に由来する形質転換宿主細胞。 (11)前記DNA配列がP.スツゼリThai IV17−1株(CBS46 1.85),PG−1−3株(CBS137.89),PG−1−4株(CBS 138.89),PG−II−11.1株(CBS139.89)又はPG−I I−11.2株(CBS140.89),P.アルギノサPAO(ATCC15 692),P.アルカリデンスDSM50342,P.シユードアルカリデンス INII−5(CBS468.85),P.シュードアルカリデンスM−1(C BS473.85)又はA.カルコアセチカスGrV−39(CBS460.8 5)に由来する請求の範囲(10)記載の形質転換宿主細胞。 (12)TLU測定条件下、pH一定で測定して、8〜10.5の至適pHを有 し、かつ温度約60℃以下及びpH7〜11という洗浄条件下、10g/lまで の濃度で洗剤を含む水溶液中でリパーゼ活性を示すことを特徴とする実質的に純 粋な脂質分解性酵素で、転写の5′−3′方向に、宿主細胞中で機能する転写調 節領域及び翻訳開始領域、前記脂質分解性酵素をコードするDNA配列、及び宿 主細胞中で機能する翻訳及び転写終止領域を含み、該DNA配列の発現が該転写 及び翻訳調節領域の制御下にある発現カセットを含む形質転換微生物宿主から得 られる酵素。 (13)前記酵素が104〜107TLU/gの比活性を有する請求の範囲(1 2)記載の脂質分解性酵素。 (14)請求の範囲(1)乃至(14)記載の形質転換微生物宿主により生産さ れる請求の範囲(12)記載の脂質分解性酵素。 (15)TLU測定条件下pH一定での測定で8〜10.5の至適pH範囲を有 し、かつ温度約60℃以下でかつpH7〜11の洗浄条件下、10g/lまでの 濃度で洗剤を含む水溶液中でリパーゼ活性を示す脂質分解性酵素を調製する方法 で、(イ)栄養培地中、転写の5′−3′の方向に宿主細胞中で機能する転写調 節領域及び翻訳開始領域、前記脂質分解性酵素をコードするDNA配列及び宿主 細胞中で機能する翻訳及び転写終止領域を含み、該DNA配列が該転写及び翻訳 調節領域制御下にある発現カセットを含む宿主細胞を増殖する、(ロ)前記脂質 分解性酵素を単離する 以上のステップを含む方法。 (16)脂質分解性酵素を生産する方法で、(イ)栄養培地中、請求の範囲(1 )乃至(11)記載の形質転換微生物宿主細胞を培養し、リッチブイヨンを作る 、(ロ)該培地から該脂質分解性酵素を単離する、以上のステップを含む方法。 (17)転写の方向に、微生物宿主細胞中で機能する転写調節領域、TLU測定 条件下pH一定で8〜10.5の至適pH範囲を有し、かつ温度約60℃以下で かつpH7〜11の洗浄条件下で10g/lまでの濃度の洗剤を含む水溶液中で リパーゼ活性を示す脂質分解性酵素をコードするDNA配列、及び宿主細胞中で 機能する転写終止調節領域を含むDNA構築物。 (18)請求の範囲(17)記載のDNA構築物で、さらに選択マーカー遺伝子 及び分泌リーダー配列のうちの1つを含むDNA構築物。 (19)pTMPv18A又はpET3上のリパーゼ遺伝子の1つと少なくとも 67%のヌクレオチド配列相同性を有する少なくとも300bpの断片を含む請 求の範囲(17)又は(18)記載のDNA構築物。 (20)プラスミドpAT1、pAT3、pET1、pET3、pAM1、pM 6−5、pP5−4、pTMPv18A又はpSW103。 (21)P.スツゼリThai IV17−1株(CBS461.85),PG −1−3株(CBS137.89),PG−1−4株(CBS138.89), PG−II−11.1株(CBS139.89)又はPG−II−11.2株( CBS140.89),P.アルギノサPAO(ATCC15692),P.ア ルカリデンスDSM50342,P.シュードアルカリデンスINII−5(C BS468.85),P.シュードアルカリデンスM−1(CBS473.85 )又はA.カルコアセチカスGrV−39(CBS460.85)由来の脂質分 解性酵素のアミノ酸配列をコードする配列とハイブリダイズし得るヌクレオチド から選ばれた連続する少なくとも10個のヌクレオチドを含むオリゴヌクレオチ ド単離物。 (22)前記オリゴヌクレオチドがDNAである請求の範囲(21)記載のオリ ゴヌクレオチド。 (23)前記オリゴヌクレオチドがRNAである請求の範囲(21)記載のオリ ゴヌクレオチド。 (24)前記オリゴヌクレオチドが放射性ラベルを含む請求の範囲(21)記載 のオリゴヌクレオチド。 (25)前記オリゴヌクレオチドが少なくとも14個の連続するヌクレオチドを 含む請求の範囲(21)記載のオリゴヌクレオチド。
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