JP7436710B2 - 新規のヌクレオリン-結合ペプチド及びその用途 - Google Patents
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Description
本発明の他の目的は、前記ペプチド及び抗癌剤を含む接合体を提供することにある。
本発明の更に他の目的は、前記ペプチドを含む2個以上の多量体(multimer)を提供することにある。
本発明の更に他の目的は、前記多量体及び抗癌剤を含む接合体を提供することにある。
本発明の更に他の目的は、前記ペプチドと細胞透過性ペプチド(Cell Penetrating Peptide;CPP)とが結合された融合ペプチド、及び前記多量体と細胞透過性ペプチドとが結合された融合ペプチドを提供することにある。
本発明の更に他の目的は、前記ペプチド又は多量体を含む癌診断用組成物、癌診断方法、癌診断のための前記ペプチド又は多量体の用途、及び癌診断用薬剤製造のための前記ペプチド又は多量体の使用を提供することにある。
本発明の更に他の目的は、前記ペプチド、前記接合体又は多量体を含む癌予防又は治療用組成物、癌予防又は治療方法、癌予防又は治療のための前記ペプチド、接合体又は多量体の用途、及び癌予防又は治療用薬剤製造のための前記ペプチド、接合体又は多量体の使用を提供することにある。
(a)配列番号1乃至配列番号8のうちいずれか一つで表されるアミノ酸配列;及び
(b)配列番号1で表されるアミノ酸配列において、
(i)N-末端から5番目のメチオニン残基の置換、
(ii)N-末端から7番目のチロシン残基の置換、及び
(iii)C-末端へのロイシン又はリシン残基の挿入
で構成された群から選ばれる一つ以上のアミノ酸変異を含むアミノ酸配列;
で構成された群から選ばれるアミノ酸配列を含むことを特徴とするヌクレオリン(nucleolin;NCL)に特異的に結合するペプチドを提供する。
また、本発明は、前記ペプチド及び抗癌剤を含む接合体を提供する。
また、本発明は、前記ペプチドを含む多量体を提供する。
また、本発明は、前記多量体及び抗癌剤を含む接合体を提供する。
また、本発明は、前記ペプチドと細胞透過性ペプチド(Cell Penetrating Peptide;CPP)とが結合された融合ペプチドを提供する。
また、本発明は、前記多量体と細胞透過性ペプチドとが結合された融合ペプチドを提供する。
また、本発明は、前記ペプチド又は多量体を含む癌診断用組成物、癌診断方法、癌診断のための前記ペプチド又は多量体の用途、及び癌診断用薬剤製造のための前記ペプチド又は多量体の使用を提供する。
また、本発明は、前記ペプチド、前記接合体又は多量体を含む癌予防又は治療用組成物、癌予防又は治療方法、癌予防又は治療のための前記ペプチド、接合体又は多量体の用途、及び癌予防又は治療用薬剤製造のための前記ペプチド、接合体又は多量体の使用を提供する。
(a)配列番号1乃至配列番号8のうちいずれか一つで表されるアミノ酸配列;及び
(b)配列番号1で表されるアミノ酸配列において、
(i)N-末端から5番目のメチオニン残基の置換;
(ii)N-末端から7番目のチロシン残基の置換;及び
(iii)C-末端へのロイシン又はリシン残基の挿入;
で構成された群から選ばれる一つ以上のアミノ酸変異を含むアミノ酸配列;
で構成された群から選ばれるアミノ酸配列を含むことを特徴とするヌクレオリン(nucleolin;NCL)に特異的に結合するペプチドに関する。
(i)N-末端から5番目のメチオニン残基の置換;
(ii)N-末端から7番目のチロシン残基の置換;及び
(iii)C-末端へのロイシン又はリシン残基の挿入;
で構成された群から選ばれた一つ以上の変異であり得るが、これに限定されない。
好ましくは、前記アミノ酸変異は、配列番号1のアミノ酸配列において、
(i)N-末端から5番目のメチオニン(methionine)残基のロイシン(leucine)又はノルロイシン(norleucine)への置換;
(ii)N-末端から7番目のチロシン(tyrosine)残基のフェニルアラニン(phenylalanine)への置換;及び
(iii)C-末端へのロイシン(leucine)及びリシン残基の挿入;
で構成された群から選ばれた一つ以上の変異であり得るが、これに限定されない。
AGM-L1-PEG(構造式1)
前記構造式1において、「PEG」は、ポリエチレングリコール鎖を意味し、L1は、リンカーを意味する。
前記リンカーL1は、好ましくは単一結合(直接結合)、C1-C20アルキル、C1-C20アルキレン、-S-、-NH-及び-O-で構成された群から選ばれ得るが、これに限定さなく、AGMペプチドのC-末端アミノ酸のカルボキシ基と共に、-CONH-の形態をなすペプチド結合(peptide bond)を含み得るが、これに限定されない。
また、前記構造式1のAGMペプチド-PEG接合体のうちAGMと結合しているPEGに、他側末端には他の物質、好ましくは薬物(drug)を接合させるための官能基(functional group)が導入され得る。このような官能基には、カルボキシル(COOH)、アミン(NH2)及びチオール(thiol)基などが例示され得るが、これに限定されない。
AGM-L1-PEG-K(構造式2)
AGM-L1-PEG-C(構造式3)
AGM-L1-PEG-K-C(構造式4)
例示的に、本発明の一実施例において、AGMペプチドのうちAGM-300とPEGの接合体であるAGM-330-PEG接合体のAGMと結合しているPEGの他側末端にリシン及びシステインが導入されたAGM-330単量体(AGMm)は、構造式5のような形態であり得る。
RHGAMVYLK-L1-PEG-K-C(構造式5)
前記構造式5において、PEGは、C末端のリシン(K)のカルボキシ基とアミンとの縮合反応を通じて構造式6のような形態のペプチド結合を含むリンカー(L1)によってAGM-330のC末端に連結された形態であり得るが、これに限定されない。
実施例1-1:OBOCライブラリ合成
OBOCライブラリを固相(solid-phase)TentaGel MB NH2レジン(Rapp Polymere GmbH、Tubingen、Germany)で合成した。「split-mix」合成方法を行い、それぞれ数百万個のビード/リガンドのランダムライブラリを含有する組み合わせOBOCライブラリを構築した。約2,600,000個のOBOCライブラリを合成するために、5gのTentagel MB NH2レジン(200μm、520,000beads/g)が使用された。ビードの表面上のリガンドは、9-フルオレニルメトキシカルボニル(Fmoc)ケミストリー及びN-ヒドロキシベンゾトリアゾール(HOBt)(GL Biochem、Shanghai、China)/N,N’-ジイソプロピルカルボジイミド(DIC)(GL Biochem)カップリングを用いた標準固相ペプチド合成技術によって合成された。カップリングの完了は、ニンヒドリン(ninhydrin)テストで確認した。ビードは、使用前まで4℃で70%のエタノールに貯蔵された。
ヒト組織と関連した全ての研究は、光州科学技術院(Gwangju Institute of Science and Technology)の研究倫理審議委員会(IRB)によって事前に承認された(#20191008-BR-48-03-02)。全ての動物実験は、光州科学技術院の実験動物運営委員会(IACUC)の指針に従って行われた(GIST-2019-040)。全ての培養物を95%エア/5%CO2と共に、37℃で維持される加湿インキュベーターで成長させた。正常ヒト乳房細胞株MCF-10Aは、ATCC(American Type Culture Collection)から入手し、BPE(bovine pituitary extract)(Cambrex Bioscience、Walkersville、MD)が補充されたMEGM完全成長培地(MEGM、Lonza、Walkersville、MD)に増殖させた。正常ヒト結腸直腸細胞株CCD-18Coは、韓国細胞株銀行(Seoul、Republic of Korea)で入手した。MCF-7、MDA-MB-231、HT-29及びHCT-116を含むヒト乳癌及び結腸直腸癌細胞株は、韓国細胞株銀行で入手した。Jurkat T細胞も韓国細胞株銀行で入手した。ルシフェラーゼ(Luciferase)-発現MDA-MB-231癌細胞株は、PerkinElmer(PerkinElmer、Hopkinton、MA)から入手した。それぞれの癌細胞株は、10%加熱不活性化(heat-inactivated)FBS(fetal bovine serum)(Gibco)、0.1mg/mlストレプトマイシン(Gibco)、及び100units/mlペニシリン(Gibco)が補充されたRPMI1640(Gibco、Waltham、USA)及びDMEM(Gibco)で成長させた。
スクリーニング前に、ビードを二重蒸留水及びリン酸塩緩衝食塩水(PBS;Welgene Inc.,Republic of Korea)で広範囲に洗浄した。トリプシン/EDTA(Gibco)を用いて癌細胞及び正常細胞を培養皿から分離し、相応する培養培地で洗浄した後、106cells/mlで再懸濁させ、ペトリ皿のOBOCビードと37℃加湿CO2インキュベーターで振盪しながら(60rpm)培養した。細胞によって結合されたビードは、顕微鏡下で一つ以上の細胞層で覆われた中心ビードを有するロゼット状(rosettes)として表れた。倒立顕微鏡(inverted microscope)下でポジティブビードをピペットで選び出し、グアニジン-HCL(8M、20min)で処理し、ビードの表面の細胞及びタンパク質を除去し、正常乳腺上皮細胞で2次スクリーニングを行い、偽陽性結合を除去した。両ラウンドで細胞結合を有するビードのみを選別し、ペプチドシーケンシングを行った。
全てのペプチド及び2’-マレイミド-PTXは、それぞれ固相ペプチド合成(peptide synthesis)及びシュテークリヒエステル化(Steglich esterification)を用いてAnyGen(Gwangju、Republic of Korea)によって合成された。ペプチド及び2’-マレイミド-PTXの純度及び分子量は、それぞれHPLC及びMALDI-TOF MS(matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry)を使用して決定された(Shimadzu、Kyoto、Japan)。
ペプチド分岐-チオール中間体(Peptide branched-thiol intermediates)をDMF(500μM)(Duksan Chemical、Korea)に溶解させ、DMF(5mM)(10Equivalents)及び0.1%v/v DIPEA(Duksan)で2’-マレイミド-PTX溶液と混合させた。反応物を室温で30分間撹拌した後、HPLC(Shimadzu)で精製した。HPLCで精製した後、MALDI-TOF MS(Shimadzu)を使用してAGM-330-PTXの分子量を測定した。
予熱された100%ヒト血清(Sigma-Aldrich)を用いてペプチドの貯蔵溶液(100μM)を10倍希釈し、37℃で0時間、3時間、6時間、9時間及び24時間にわたって培養した。PBSでのペプチドが対照群として含まれた。4℃で10分間3Mの最終濃度で尿素(urea)を用いて血清タンパク質を変性させた後、最終濃度7%(v/v)(4℃、10分)でトリクロロ酢酸(trichloroacetic acid)で血清タンパク質を沈澱させ、遠心分離(17,000×g、10分)することによって反応を停止させた。それぞれのサンプルの上澄み液を回収し、溶媒A(0.05%(v/v)TFA in H2O)で5%~65%溶媒B(アセトニトリル90%(v/v)と0.045%(v/v)TFA in H2O)の線形勾配を使用して215nmでモニタリングしながら1ml/minの流速で25分にわたって分析カラム(analytical column)を行った。各ペプチドの溶出プロファイルは、0時点からPBSサンプルによって確認された。血清-処理されたサンプルに残っているペプチドの百分率は、各時点で収得されたペプチドピークの高さと0時点で収得されたペプチドピークの高さとを比較することによって決定した。各実験は3回行われた。
FACS(Fluorescence-activated cell-sorting)分析を使用してFITC-ペプチドの結合を確認した。FITC-ペプチド用貯蔵溶液(100μM)は、ペプチドをPBSに溶解させて製造した。MCF-10A、MCF-7、MDA-MB-231、CCD-18Co、HT-29及びHCT-116細胞を3ml培地を含有する6-ウェルプレートに105cells/wellでシーディングし、プレートを37℃で一晩中培養した。翌日、FITC-標識されたペプチド(1μM)を含有する新しいFBS-フリー培地(1ml)に培地を交替し、37℃で30分間さらに培養した。その後、培地を除去し、細胞が冷たいPBSで洗浄し、任意の残留ペプチドを除去した。適切なトリプシン/EDTAを各ウェルに添加した後、37℃で3分~5分間培養した。培地を添加することによってトリプシン/EDTAを直ぐ中和させ、細胞懸濁液を遠心分離チューブに移した。細胞を分離し、PBSで2回洗浄した。対照群細胞も、ペプチドを除いては、類似する方式で処理された。製造された細胞をFACScanto II(BD Biosciences)フローサイトメーター(flow cytometer)で分析した。FACSデータは、FlowJoソフトウェア(TreeStar)で分析された。
細胞溶解物(500μg/ml)をビオチン化(biotinylated)AGM-330(500ng/ml)と共に、4℃で12時間にわたって培養した後、ストレプトアビジンビード(Thermo Fisher Scientific、Rockford、IL)によって1時間にわたって室温でプルダウンさせた。培養後、ビードを洗浄バッファーで3回洗浄した。溶出バッファーをビードに添加し、ビードからタンパク質を抽出した後、最終的にSDS-PAGEで分析した。ビオチンプルダウン分析で由来したタンパク質を識別して特徴付けるために、ProteomeTech(Seoul、Korea)でLC-結合(coupled)ESI-MS/MS分析を行った。
ヒトNCL cDNAクローン(Addgene)からGFP-NCL(残基1-710)、GFP-△N-NCL(残基322-710)及びGFP-△C-NCL(残基1-321)を含むNCL構築物(constructs)を作り、pEGFP-C2ベクター(Addgene)のXhoI及びBamHIサイトにサブクローニングさせた。これらのベクターは、製造社の勧告によってリポフェクタミン2000(Invitrogen、Carlsbad、CA、USA)によって形質注入(transfection)させた。ビオチン化AGM-330ペプチドをストレプトアビジンビード(Thermo Fisher Scientific)に添加し、混合物を室温で1時間にわたって振盪しながら培養した。ビードは、洗浄バッファーで3回洗浄された。洗浄後、GFP-タグ付き(tagged)NCLタンパク質を含有する形質注入された細胞溶解物から製造された溶解物(300μl)にビードを添加した。反応混合物を4℃で12時間にわたって培養し、AGM-330とGFP-タグ付きNCLタンパク質とが結合されるようにした。続いて、ビードを洗浄バッファーで洗浄した。同一の体積の2×電気泳動サンプルバッファーをビードに添加し、95℃で5分間加熱することによってビードからタンパク質を抽出した。SDS-PAGE及び免疫ブロット分析でタンパク質を最終的に分析した。
25mlの20mMトリス/HCl、pH7.5、150mM NaCl、5mM MgCl2、5mM β-メルカプトエタノール、0.5%(v/v)トリトンX-100、1mMマリマスタット(AdooQ Bioscience、Irvine、CA、USA)、プロテアーゼ阻害剤カクテル(Millipore、Billerica、MA、USA)で1.0X109 Jurkat細胞を4℃で1時間にわたって溶解させ、NCLを製造した。v)トリトンX-100、1mMのマリマスタット(AdooQ Bioscience、Irvine、CA、USA)、プロテアーゼ阻害剤カクテル(Millipore、Billerica、MA、USA)。核を1200×gで5分間遠心分離することによってペレット化した後、上澄み液を12,000×gで30分間遠心分離し、-80℃で貯蔵した。核のない(nucleus-free)抽出物からNCLを精製するために、速い2段階クロマトグラフィー手順を使用した。全ての段階は、1mMマリスタット及び完全なプロテアーゼ阻害剤カクテルの存在下で氷冷(ice-cold)バッファー及びカラムを使用して4℃で行った。Jurkat細胞(25ml)の細胞質抽出物をpH7.0、20mMリン酸ナトリウムで10倍希釈し、5mlのMono Q5/50GLカラム(Sigma-Aldrich)に通過させた。pH7.0、150mlの20mMリン酸ナトリウムでカラムを洗浄した後、1M NaClを含有する同一のバッファーの10mlで吸着したタンパク質を溶出させた。溶出液を50mMトリス/HCl、pH7.9、5mM MgCl2、0.1mM EDTA、1mM β-メルカプトエタノール(バッファーA)で10倍希釈し、同一のバッファーで平衡させた1ml HiFiQヘパリンHPカラム(Protein Ark、UK)にローディングした。0.2M硫酸アンモニウムを含有する20mlのバッファーAでゲルを洗浄し、0.6M硫酸アンモニウムを含有した2mlのバッファーAでタンパク質を50μl分画に溶出させた。NCLを集め、4℃で2時間にわたって1mMマリマスタットを含有するPBSに透析した後、-80℃で貯蔵した。クマシーブルーで染色された10% SDSアクリルアミドゲルに対する追加制御により、単一105kDaタンパク質バンドとして精製されたNCLの存在を確認した。NCLの部分分解産物に該当する2個の70及び50kDaタンパク質バンドが全体のタンパク質の10%未満の量で観察された。
結合親和度は、SPR(surface plasmone resonance)分光法(spectroscopy)(Biacore T-200)によってテストされた。組換えヌクレオリンタンパク質をCM5センサーチップに固定した後、AGM-330を濃度別に(20nM~2.5μM)処理し、それぞれに対するセンサーグラムを分析し、KD値を決定した。
プロテアーゼ阻害剤カクテル(Millipore)を含有するRIPAバッファー(20mMトリス-HCl、pH7.5、200mM NaCl、0.5%トリトンX-100)に細胞を溶解させた。製造社のプロトコルによって、タンパク質分析キット(Bio-Rad)を用いてタンパク質の濃度を測定した。総タンパク質をSDS-PAGEに適用し、ポリフッ化ビニリデン膜に移動させた。ブロットは、NCL(Abcam)及びGFP(Abcam)に対する1次抗体でプローブされた。ローディング対照群として、抗-β-アクチン抗体(Santa Cruz Biotechnology)、抗-P-カドヘリン(Abcam)及び抗-ラミンA/C(Abcam)が使用された。続いて、ブロットをTBST(10mMトリス-HCl、50mM NaCl及び0.25%ツイン-20)で洗浄し、ホースラディシュペルオキシダーゼ-接合2次抗体と共に培養した。強化された化学発光(chemiluminescence)試薬(Thermo Fisher Scientific)を使用して標的タンパク質の存在を探知した。
MDA-MB-231-luc異種移植組織には、免疫蛍光染色のためにホルマリン-固定及びパラフィン-包埋が行われた。細胞をポリ-L-リシン及びコラーゲンI-コートカバーガラス(coated cover glasses)にシーディングし、4%ホルマリンで固定させた。組織スライド及び細胞を、0.1%トリトンX-100で透過性を有するように作り、2%BSA(Sigma-Aldrich)でブロッキングした。1次抗-NC(1:200)、抗-TUNEL(1:200)及び抗-Ki-67(1:500)抗体を使用し、上述したように染色を行った。全ての核は、DAPIで対照染色された。免疫蛍光イメージをH&E-染色イメージとマッチングさせた。
NCLを標的とするsiRNA(NM_005381.3 in NCBI database)及びスクランブルsiRNA(scr) は、Bioneer(Daejeon、Republic of Korea)から購入した。効率的なNCL形質注入のために、製造社のプロトコルに従ってリポフェクタミン2000(Invitrogen)を使用してsiRNA形質注入を行った。3個の相違するsiRNA配列が使用され、これらの効率性はリアルタイムPCRによって評価された。
(アンチセンス)5’-UACAGAUAAGGGUUAGCUC(dTdT)-3’(配列番号22)
siNCL2:(センス)5’-CACAAGGAAAGAAGACGAA(dTdT)-3’(配列番号23)
(アンチセンス)5’-UUCGUCUUCUUUCCUUGUG(dTdT)-3’(配列番号24)
siNCL3:(センス)5’-GACGAAGUUUGAAUAGCUU(dTdT)-3’(配列番号25)
(アンチセンス)5’-AAGCUAUUCAAACUUCGUC(dTdT)-3’(配列番号26)
RNAiso(Takara、Shiga、Japan)を使用して全体のRNAを抽出し、260/280吸光度比率を測定することによってRNA純度を検証した。PrimeScriptTMファーストストランドcDNA合成キット(1st strand cDNA Synthesis Kit)(Takara、Shiga、Japan)を使用して第一鎖cDNAを合成し、PowerSYBR(登録商標)グリーンPCRマスターミックス(Green PCR Master Mix)(Applied Biosystems)と共に、各PCR混合物に10分の1のcDNAを使用した。リアルタイムPCRは、StepOnePlusリアルタイムPCRシステム(Applied Biosystems)を使用して行われた。選択された遺伝子の相対的mRNA発現をβ-アクチンの発現に標準化し、ddCt方法を使用して定量化した。PCRプライマーの配列を下記の表6に羅列した。
100μlの培地を含有する96-ウェルプレートに1×104cells/wellで癌及び正常細胞株をシーディングし、プレートを37℃で一晩中培養した。一晩中培養した後、細胞を37℃で一晩中抗-NCL抗体(Cell Signaling Technology、Beverly、MA、USA)の不在又は存在下で24時間にわたって培養した。培養後、製造社の指示に従ってCellVia WST-1アッセイ(Young In Frontier、Seoul、Korea)で細胞生存力を評価した。
アポトーシス細胞の定量的評価は、アネキシンV-FITC(fluorescein isothiocyanate)アポトーシス検出キットI(BD Biosciences、San Jose、CA、USA)を使用して行われた。細胞を収集し、冷たいPBSで2回洗浄した後、結合バッファー(1×106cells/ml)に再懸濁させた。次に、100μlの懸濁液をチューブに移し、5μlのFITCアネキシンV及びPI(propidium iodide)と混合した。続いて、混合物を穏やかにボルテックス(vortexing)した後、暗室において15分間室温で培養した。培養後、400μlの1×結合バッファーを添加し、細胞に対してフローサイトメトリーで分析した。
癌細胞及び正常細胞(1×104cells/well)を96-ウェルプレートにシーディングした。24時間にわたって培養した後、細胞を、増加する濃度のAGM-330、PTX及びAGM-330-PTXで48時間にわたって処理した。細胞生存力は、製造社の指示に従ってCellVia WST-1アッセイ(Young In Frontier)で評価した。生存細胞の数は、VersaMax ELISAプレートリーダー(Molecular Devices)を使用して450nmの波長で測定された。
全ての動物実験は、IACUC指針に従って行われた(GIST-2019-040)。腫瘍形成実験のために、麻酔された6週齢の雌NOD-scid Il2rg-/-マウス(NPGTM、VITALSTAR)を100μl体積の1×106MDA-MB-231-luc細胞がある乳腺脂肪パッドに接種した(n=5~6 for each group)。腫瘍細胞の接種後、腫瘍の体積が約100mm3に到逹したとき、マウスを下記の5個の群に無作為に分けた:(i)対照群(control)、(ii)低用量のパクリタキセル(low-dose paclitaxel)(2mg/kg)、(iii)高用量のパクリタキセル(high-dose paclitaxel)(10mg/kg)、(iv)AGM-330(16.68mg/kg又は8.34mg/kg)、及び(v)AGM-330-PTX(19.05mg/kg又は10.71mg/kg)。週に二回腫瘍の大きさを測定し、次の式を用いて腫瘍の体積を計算した:
体積(mm3)=(長さ(mm))×(幅(mm))2×0.5
生物発光イメージング実験のために、D-ルシフェリン(150mg/kg)(PerkinElmer)をそれぞれのマウスの腹腔内に注射し、IVIS 100イメージングシステム(Xenogen、Corporation、Alameda、CA)を生物発光モニタリングに使用した。気体イソフルラン(BK Pharm、Ilsan、Korea)でマウスを麻酔させ、イメージングチャンバーに配置した。10分後、各動物を1分の露出時間でイメージングした。全ての生物発光イメージデータは、リビングイメージソフトウェア(バージョン4.5.2、PerkinElmer)によって提供された。腫瘍から検出された光子は、平均光度(photon/sec/cm2/sr)に変換された。平均光度値は、強度領域(region of intensity;ROI)で得た定量的データであり、各マウスの全身に割り当てられた直四角形の領域で生物発光細胞によって放出された光子を含む。
Oncomine癌マイクロアレイデータベース(http://www.oncomine.org/)を使用し、正常乳房及び結腸直腸組織と乳癌腫及び結腸直腸腺癌腫組織でNCLの発現レベルを分析した。これらの遺伝子発現データはlog2変換され、中央値中心であった。全てのグラフィック及び統計値は、GraphPadプリズム5.0を用いて分析し、P-値は、スチューデントの両側t検定(two-tailed Student’s t-test)(P<0.05)によって計算された。R2プラットホームを使用し、カプランマイヤープロットを生成し、乳房腫瘍及び結腸直腸腫瘍でのNCL発現レベルによって患者をグループ化した。
全ての統計データは、平均±SD(n=3)で表示された。二つのグループの間の統計的比較は、スチューデントのt検定(Student’s t test)によって決定され、多くのグループの間の比較は、一元配置分散分析とダネットの多重比較(one-way ANOVA with Dunnett’s multiple comparison)によって決定された。in vivo実験の場合、マウスの数は各凡例に表示された。ログランク検定は、カプランマイヤー分析に使用された。*、**及び***は、それぞれP<0.05、P<0.01及びP<0.001を示す。
新しい癌-特異的ペプチドリガンドを同定するために、5gのTentagel MBNH2レジン(200μm、520,000beads/g、図3)を使用して2,600,000個のライブラリを合成した。ビードに羅列されたペプチドライブラリ(一度に50,000個~100,000個のビードが使用される)をヒト乳癌細胞株(MDA-MB-231)と混合した。合計~1,000,000個のビードをスクリーニングし、8個のポジティブビードを検出し、マイクロシーケンシングのために分離した。これらの8個のペプチドのうち3個(AGM-330、AGM-331及びAGM-332)は、MDA-MB-231に対して強い優先的な結合を示しており、ヒト正常乳房細胞株(MCF-10A)には結合しないか、弱く結合した(図4A、図4B)。その次に、これらの3個のペプチドをFITC(fluorescein isothiocyanate)で標識し、MDA-MB-231細胞に結合できるか否かを確認した。AGM-331及びAGM-332と比較するとき、AGM-330で最も強い蛍光信号が検出された(図4C)。細胞成長ビード分析(cell-growth-on-bead assay)及び蛍光イメージングからスクリーニング結果を確認するために、AGM-330をTentagel MB NH2レジンで再合成した。細胞成長ビードの分析結果、AGM-330ビードは、15分内にヒト乳癌細胞株(MCF7及びMDA-MB-231)とヒト結腸直腸癌細胞株(HT-29及びHCT-116)によって完全に覆われた(図4D)。一方、AGM-331及びAGM-332は、相対的に非特異的であり、ヒト正常乳房細胞株(MCF-10A)及びヒト正常結腸直腸細胞株(CCD-18Co)に結合した。また、AGM-330は、MCF-10A又はCCD-18Co細胞に非常に弱く結合したり、全く結合しなかったので、イメージング及び治療的標的化製剤の全てに対する優秀な候補になり得る。
AGM-330の未知の標的タンパク質を確認するために、親和性カラムクロマトグラフィー(affinity column chromatography)及び質量分析法ベースのプロテオミクス接近方式を使用し、MDA-MB-231細胞の細胞溶解物からAGM-330-相互作用タンパク質を確認した(図7A)。親和性カラムクロマトグラフィーを行った後、SDS-PAGE分析を通じて溶出分画にのみ存在する様々な別個のタンパク質バンド(55-100kDa)を確認した(図7B)。LC-MS/MS分析を使用して6個のタンパク質を確認し、これらの切除されたバンドのペプチド識別は、100kDaで主要なタンパク質バンドのうち一つがヌクレオリン(NCL)として特性化されたことを示した。NCLは710個のアミノ酸で構成され、LC-MS/MS分析によって識別された22個の他のペプチド断片は、NCLのアミノ酸配列と一致した(NCBIデータベースのヒトNCL(accession number:gi189306)に対する総スコア(total score)881及び24%のシーケンスカバレッジ(sequence coverage))(図7C-D)。また、抗-NCL抗体を使用した免疫ブロット分析を通じて、AGM-330親和性カラムでの溶出物でNCLの濃縮をさらに確認した(図7E)。よって、プロテオミクス研究は、NCLがAGM-330-相互作用タンパク質であることを示唆する。
癌細胞(1×104cells/well)を96-ウェルプレートに24時間にわたって培養した。AGM-330及びPEG化させた前記表2の12種のペプチドをビオチン連結させ、細胞を、2時間にわたって増加する濃度の前記13種のペプチドで処理した。
蛍光顕微鏡を使用して他の細胞株に対する細胞結合分析でNCLに対するAGM-330の特異性を評価した。実験は、多数の癌細胞株、MCF-7、MDA-MB-231、HT-29及びHCT-116と、正常細胞株、MCF-10A及びCCD-18Coを用いて行った。5μmol/L AGM-330-FITCで細胞を1時間にわたって培養した後、共焦点イメージングによって結合特異性を確認した。細胞をDAPIと共に培養し、核(青色蛍光)を対照染色した。NCLのN-末端ドメインに結合する抗-NCL抗体及びAGM-330-FITCでの二重-免疫蛍光染色を通じて、AGM-330がNCLに結合することを示すNCLとAGM-330-FITCとの間の重畳を確認した(図11A-B)。
前記各実施例に基づいて、癌細胞株でNCL発現パターンを確認した。ヒト癌組織でのNCL発現を調査するために、Oncomineデータセットレポジトリ(dataset repository)(www.oncomine.org)を使用して、利用可能な乳癌及び結腸直腸癌データセットを分析した。144個の1次乳房組織に比べて、67個の乳癌腫でNCLが相対的に発現することをCurtisデータセットで分析した。NCL mRNA発現は、正常乳房組織と比較して乳癌腫で有意に上向き調節された(P<0.001、図13A)。また、Alonデータセットにおいて、NCL mRNAの発現は、結腸直腸腺癌腫で正常組織より有意に高かった(P<0.01、図13A)。その次に、本発明者等は、乳癌と結腸直腸癌の患者において、高いNCL発現が、疾病のない低い生存率などの不良な予後と関連していることを確認した(Bertucci and Sveen dataset from ‘R2:Genomics Analysis and Visualization platform(http://r2.amc.nl)’)(図13B)。これは、乳癌及び結腸直腸癌の患者において、高いNCL発現が、不良な予後マーカーとしての役割をするという以前の報告書と一致する(van Long FN,et al.Cancers.2018;10:390)。ヒト癌及び正常組織でのNCL発現分布を決定するために、免疫組織化学(immunohistochemistry;IHC)分析でNCL発現を分析した。IHC分析を通じて、NCLが正常乳房及び結腸直腸組織と比較してヒト乳癌及び結腸直腸癌組織の膜及び細胞質領域で増加したことが明らかになり(図13C-D)、これは、免疫蛍光イメージング(図11A-B)及びウェスタンブロッティング(図11C)の結果と一致する。また、以前の報告書によると、上向き調節された膜NCLが、癌増殖及びアポトーシスの抑制に関与するリガンドに対する受容体として相互作用することが明らかになった(Chen SC,et al.Oncotarget.2015;6:16253-70)。これによって、膜発現NCLが癌細胞での機能調節に必須的であるか否かを調査するために、本発明者等は、in vitro MDA-MB-231とHCT-116細胞及びMCF-10AとCCD-18Co細胞で単一クローン抗-NCL抗体を使用して膜発現NCLを中和させた。まず、24時間にわたって相違する濃度で抗体で処理された正常及び癌細胞において細胞生存力を評価した。NCL抗体(50μg/ml)の処理時、MDA-MB-231及びHCT-116細胞で細胞生存率がそれぞれ35%と32%減少したが、対照群及びIgG処理群と比較して、正常細胞では有意な減少が観察されなかった(MCF-10A及びCCD-18Co)(図13E-H)。また、癌細胞に対する抗-NCL抗体の細胞毒性効果の原因を調査するためにアポトーシス分析を行った。24時間にわたって相違する濃度で抗体で処理したMDA-MB-231及びHCT-116細胞は、アネキシンV及びPIを使用して染色した。フローサイトメトリーによると、初期及び後期アポトーシス段階で癌細胞の百分率が抗-NCL抗体濃度-依存的方式で増加した(図13I)。
パクリタキセル(PTX)をAGM-330と接合させ、よく確立された化学療法剤に連結された癌-標的リガンド(AGM-330-PTX)を得た。PTXは、マレイミド-カルボキシ二官能性リンカーと直交接合(orthogonal conjugation)された。AGM-330t-PTXが癌細胞増殖を抑制するか否かを調査するために、MCF-7、MDA-MB-231、HT-29及びHCT-116を含む多くの癌細胞株でIC50値を評価した(図14A)。MDA-MB-231細胞において、PTX単独及びAGM-330t-PTXに対するIC50値は、それぞれ6.8μM及び3.6μMであった。結果は、3つの癌細胞株の全てにおいて類似していた(MCF-7、HCT-116及びHT-29)。しかし、MCF-10A細胞において、PTX単独及びAGM-330t-PTXに対するIC50値は、それぞれ22.1μM及び35.3μMであった。
さらに、PEG化免疫原性の影響を減少させるために、AGM-330tよりPEG化程度の低いAGM-330d-PTXを使用して抗癌効能を試験した(図16A)。その結果、AGM-330d-PTX-処理マウスは、PTX-処理マウスと比較してルシフェラーゼ活性の劇的な減少を示した(図16C-D)。また、AGM-330d-PTX処理によると、PTX-処理群と比較して腫瘍の体積及び重量が著しく減少した(図16E-G)。AGM-330-PTXと同様に、マウスの体重は、ビヒクル(PBS)投与と比較してAGM-330d-PTX投与によって影響を受けなかった(図16H)。AGM-330dの癌特異性は、PTXの効能を向上させ、腫瘍組織で治療薬物の濃度を増加させることができる。
AGM-330の細胞透過性を増加させるために、細胞透過性ペプチド(Cell Penetrating Peptide;CPP)を結合させ、融合ペプチドを製作した。
AGM-330tにマレイミドと結合したCPP(RIMRILRILKLAR;配列番号48)をpH7.0~7.5で反応させると、AGM-330tの官能基であるチオール基とチオール-マレイミド反応によって結合され、AGM-330t-mCPP融合ペプチドが合成される(図17)。
実施例8で製作されたAGM-330t-mCPP融合ペプチドの細胞毒性を調査するために、MCF-7、MDA-MB-231、HT-29、HCT-116及びPANC-1を含む多くの癌細胞とCCD-18Coの正常細胞でIC50値を評価した(表7)。
実施例8で製作されたAGM-330t-mCPP融合ペプチドの癌細胞アポトーシス誘導効果を調査するために、48時間にわたってCPP、AGM-330t及びAGM-330t-CPPで処理したHCT-116、HT-29及びCCD-18Co細胞をアネキシンV及びPIを使用して染色した。その結果、癌細胞特異的アポトーシス誘導効果を確認し(図20)、AGM-330t-mCPPの濃度別の実験結果、濃度-依存的方式でアポトーシス促進タンパク質が増加することを確認した(図21)。
実施例8のような方法によって製作されたAGM-330m-mCPP、AGM-330d-dCPP及びAGM-330t-tCPP融合ペプチドのそれぞれとこれらの組み合わせの細胞毒性を調査するために、HCT-116、HT-29、MCF-7及びMDA-MB-231でIC50値を評価した。
Claims (20)
- 配列番号1、配列番号9乃至配列番号15及び配列番号20のうちいずれか一つで表されるアミノ酸配列からなる、ヌクレオリン(nucleolin;NCL)に特異的に結合するAGMペプチド。
- 請求項1に記載のAGMペプチドとポリエチレングリコール(polyethyleneglycol、PEG)鎖とが接合されたAGMペプチド-PEG接合体。
- 前記ポリエチレングリコール鎖は、2個乃至24個のエチレングリコール基を含むことを特徴とする、請求項2に記載のAGMペプチド-PEG接合体。
- 前記AGMペプチドとポリエチレングリコール鎖はリンカーを介して連結されることを特徴とする、請求項2に記載のAGMペプチド-PEG接合体。
- 請求項2に記載のAGMペプチド-PEG接合体及び薬物を含むAGMペプチド-PEG-薬物接合体。
- 前記薬物は、タキソール(taxol)、タキサン、マイタンシノイド、アウリスタチン、アミノプテリン、アクチノマイシン、ブレオマイシン、タリソマイシン、カンプトテシン、N8-アセチルスペルミジン、1-(2クロロエチル)-1,2-ジメチルスルホニルハイドラザイド、エスペラマイシン、エトポシド、6-メルカプトプリン、ドラスタチン、トリコテセン、カリケアミシン、メトトレキサート、ビンクリスチン、ビンブラスチン、ドキソルビシン、メルファラン、マイトマイシンA、マイトマイシンC、クロラムブシル、デュオカルマイシン、L-アスパラギナーゼ(L-asparaginase)、メルカプトプリン(mercaptopurine)、チオグアニン(thioguanine)、ヒドロキシウレア(hydroxyurea)、シタラビン(cytarabine)、シクロホスファミド(cyclophosphamide)、イホスファミド(ifosfamide)、ニトロソウレア(nitrosourea)、シスプラチン(cisplatin)、カルボプラチン(carboplatin)、マイトマイシン(mitomycin)、ダカルバジン(dacarbazine)、プロカルバジン(procarbazine)、トポテカン(topotecan)、窒素マスタード(nitrogen mustard)、シトキサン(cytoxan)、α-アマニチン、エトポシド(etoposide)、5-フルオロウラシル(5-fluorouracil)、CNU(bischloroethylnitrosourea)、イリノテカン(irinotecan)、カンプトテシン(camptothecin)、ブレオマイシン(bleomycin)、イダルビシン(idarubicin)、ダウノルビシン(daunorubicin)、ダクチノマイシン(dactinomycin)、プリカマイシン(plicamycin)、ミトキサントロン(mitoxantrone)、アスパラギナーゼ(asparaginase)、ビノレルビン(vinorelbine)、クロラムブシル(chlorambucil)、メルファラン(melphalan)、ピロロベンゾジアゼピン、カルムスチン(carmustine)、ロムスチン(lomustine)、ブスルファン(busulfan)、トレオスルファン(treosulfan)、デカルバジン(decarbazine)、エトポシド(etoposide)、テニポシド(teniposide)、トポテカン(topotecan)、9-アミノカンプトテシン(9-aminocamptothecin)、クリスナトール(crisnatol)、マイトマイシンC(mitomycin C)、トリメトレキサート(trimetrexate)、ミコフェノール酸(mycophenolic acid)、チアゾフリン(tiazofurin)、リバビリン(ribavirin)、EICAR(5-ethynyl-1-beta-Dribofuranosylimidazole-4-carboxamide)、ヒドロキシウレア(hydroxyurea)、デフェロキサミン(deferoxamine)、フロクスウリジン(floxuridine)、ドキシフルリジン(doxifluridine)、ラルチトレキセド(raltitrexed)、シタラビン(cytarabine(ara C))、シトシンアラビノシド(cytosine arabinoside)、フルダラビン(fludarabine)、タモキシフェン(tamoxifen)、ラロキシフェン(raloxifene)、メゲストロール(megestrol)、ゴセレリン(goserelin)、リュープロレリン酢酸塩(leuprolide acetate)、フルタミド(flutamide)、ビカルタミド(bicalutamide)、EB1089、CB1093、KH1060、ベルベリン、ベルテポルフィン(verteporfin)、クルクミン、アブラキサン、フォルフィリノックス、オキサリプラチン、ゼローダ及びインドールカルボキサミド、フタロシアニン(phthalocyanine)、チューブリシン、光減作剤Pe4(photosensitizer Pe4)、デメトキシ-ヒポクレリンA(demethoxy-hypocrellin A)、インターフェロン-α(Interferon-α)、インターフェロン-γ(Interferon-γ)、腫瘍壊死因子(tumor necrosis factor)、ゲムシタビン(Gemcitabine)、ベルケイド(velcade)、レバミド(revamid)、タラミド(thalamid)、ロバスタチン(lovastatin)、1-メチル-4-フェニルピリジニウムイオン(1-methyl-4-phenylpyridiniumion)、スタウロスポリン(staurosporine)、アクチノマイシンD(actinomycin D)、ダクチノマイシン(dactinomycin)、ブレオマイシンA2(bleomycin A2)、ブレオマイシンB2(bleomycin B2)、ペプロマイシン(peplomycin)、エピルビシン(epirubicin)、ピラルビシン(pirarubicin)、ゾルビシン(zorubicin)、ミトキサントロン(mitoxantrone)、ベラパミル(verapamil)、タプシガルギン(thapsigargin)、核酸分解酵素、及び細菌や動植物由来の毒素からなる群から選ばれたいずれか一つ以上であることを特徴とする、請求項5に記載のAGMペプチド-PEG-薬物接合体。
- 前記AGMペプチド-PEG接合体と薬物はリンカーを介して連結されることを特徴とする、請求項5に記載のAGMペプチド-PEG-薬物接合体。
- 請求項2に記載のAGMペプチド-PEG接合体を2個以上含む多量体。
- 2個乃至8個のAGMペプチド-PEG接合体を含むことを特徴とする、請求項8に記載の多量体。
- 前記2個以上のAGMペプチド-PEG接合体がリンカーによって互いに連結されることを特徴とする、請求項8に記載の多量体。
- 請求項8に記載の多量体及び薬物を含む多量体-薬物接合体。
- 前記薬物は、タキソール(taxol)、タキサン、マイタンシノイド、アウリスタチン、アミノプテリン、アクチノマイシン、ブレオマイシン、タリソマイシン、カンプトテシン、N8-アセチルスペルミジン、1-(2クロロエチル)-1,2-ジメチルスルホニルハイドラザイド、エスペラマイシン、エトポシド、6-メルカプトプリン、ドラスタチン、トリコテセン、カリケアミシン、メトトレキサート、ビンクリスチン、ビンブラスチン、ドキソルビシン、メルファラン、マイトマイシンA、マイトマイシンC、クロラムブシル、デュオカルマイシン、L-アスパラギナーゼ(L-asparaginase)、メルカプトプリン(mercaptopurine)、チオグアニン(thioguanine)、ヒドロキシウレア(hydroxyurea)、シタラビン(cytarabine)、シクロホスファミド(cyclophosphamide)、イホスファミド(ifosfamide)、ニトロソウレア(nitrosourea)、シスプラチン(cisplatin)、カルボプラチン(carboplatin)、マイトマイシン(mitomycin)、ダカルバジン(dacarbazine)、プロカルバジン(procarbazine)、トポテカン(topotecan)、窒素マスタード(nitrogen mustard)、シトキサン(cytoxan)、α-アマニチン、エトポシド(etoposide)、5-フルオロウラシル(5-fluorouracil)、CNU(bischloroethylnitrosourea)、イリノテカン(irinotecan)、カンプトテシン(camptothecin)、ブレオマイシン(bleomycin)、イダルビシン(idarubicin)、ダウノルビシン(daunorubicin)、ダクチノマイシン(dactinomycin)、プリカマイシン(plicamycin)、ミトキサントロン(mitoxantrone)、アスパラギナーゼ(asparaginase)、ビノレルビン(vinorelbine)、クロラムブシル(chlorambucil)、メルファラン(melphalan)、ピロロベンゾジアゼピン、カルムスチン(carmustine)、ロムスチン(lomustine)、ブスルファン(busulfan)、トレオスルファン(treosulfan)、デカルバジン(decarbazine)、エトポシド(etoposide)、テニポシド(teniposide)、トポテカン(topotecan)、9-アミノカンプトテシン(9-aminocamptothecin)、クリスナトール(crisnatol)、マイトマイシンC(mitomycin C)、トリメトレキサート(trimetrexate)、ミコフェノール酸(mycophenolic acid)、チアゾフリン(tiazofurin)、リバビリン(ribavirin)、EICAR(5-ethynyl-1-beta-Dribofuranosylimidazole-4-carboxamide)、ヒドロキシウレア(hydroxyurea)、デフェロキサミン(deferoxamine)、フロクスウリジン(floxuridine)、ドキシフルリジン(doxifluridine)、ラルチトレキセド(raltitrexed)、シタラビン(cytarabine(ara C))、シトシンアラビノシド(cytosine arabinoside)、フルダラビン(fludarabine)、タモキシフェン(tamoxifen)、ラロキシフェン(raloxifene)、メゲストロール(megestrol)、ゴセレリン(goserelin)、リュープロレリン酢酸塩(leuprolide acetate)、フルタミド(flutamide)、ビカルタミド(bicalutamide)、EB1089、CB1093、KH1060、ベルベリン、ベルテポルフィン(verteporfin)、クルクミン、アブラキサン、フォルフィリノックス、オキサリプラチン、ゼローダ及びインドールカルボキサミド、フタロシアニン(phthalocyanine)、チューブリシン、光減作剤Pe4(photosensitizer Pe4)、デメトキシ-ヒポクレリンA(demethoxy-hypocrellin A)、インターフェロン-α(Interferon-α)、インターフェロン-γ(Interferon-γ)、腫瘍壊死因子(tumor necrosis factor)、ゲムシタビン(Gemcitabine)、ベルケイド(velcade)、レバミド(revamid)、タラミド(thalamid)、ロバスタチン(lovastatin)、1-メチル-4-フェニルピリジニウムイオン(1-methyl-4-phenylpyridiniumion)、スタウロスポリン(staurosporine)、アクチノマイシンD(actinomycin D)、ダクチノマイシン(dactinomycin)、ブレオマイシンA2(bleomycin A2)、ブレオマイシンB2(bleomycin B2)、ペプロマイシン(peplomycin)、エピルビシン(epirubicin)、ピラルビシン(pirarubicin)、ゾルビシン(zorubicin)、ミトキサントロン(mitoxantrone)、ベラパミル(verapamil)、タプシガルギン(thapsigargin)、核酸分解酵素、及び細菌や動植物由来の毒素からなる群から選ばれたいずれか一つ以上であることを特徴とする、請求項11に記載の多量体-薬物接合体。
- 前記多量体と薬物はリンカーを介して連結されることを特徴とする、請求項12に記載の多量体-薬物接合体。
- 請求項2に記載のAGMペプチド-PEG接合体と、細胞透過性ペプチド(Cell Penetrating Peptide;CPP)とが結合されたAGMペプチド-PEG-CPP融合ペプチド。
- 前記細胞透過性ペプチドは、配列番号31乃至配列番号80のアミノ酸配列で構成された群から選ばれることを特徴とする、請求項14に記載のAGMペプチド-PEG-CPP融合ペプチド。
- 前記AGMペプチド-PEG接合体と細胞透過性ペプチドはリンカーを介して連結されることを特徴とする、請求項14に記載のAGMペプチド-PEG-CPP融合ペプチド。
- 請求項8に記載の多量体と、細胞透過性ペプチド(Cell Penetrating Peptide;CPP)とが結合された多量体-CPP融合ペプチド。
- 請求項1に記載のAGMペプチド、請求項2~4のいずれか一項に記載のAGMペプチド-PEG接合体、請求項5~7のいずれか一項に記載のAGMペプチド-PEG-薬物接合体、請求項8~10のいずれか一項に記載の多量体、請求項11~13のいずれか一項に記載の多量体-薬物接合体、請求項14~16のいずれか一項に記載のAGMペプチド-PEG-CPP融合ペプチド又は請求項17に記載の多量体-CPP融合ペプチドを含む癌診断用組成物。
- 請求項5~7のいずれか一項に記載のAGMペプチド-PEG-薬物接合体、又は請求項11~13のいずれか一項に記載の多量体-薬物接合体を含む癌予防又は治療用組成物。
- 請求項1に記載のAGMペプチド、請求項2~4のいずれか一項に記載のAGMペプチド-PEG接合体、請求項8~10のいずれか一項に記載の多量体、請求項14~16のいずれか一項に記載のAGMペプチド-PEG-CPP融合ペプチド、又は請求項17に記載の多量体-CPP融合ペプチドを含む薬物担体。
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