JP7297745B2 - ヒトフェリチンおよびプロテアーゼ切断可能ペプチドに基づく融合タンパク質ならびに化学療法用担体としてのそれらの使用 - Google Patents

ヒトフェリチンおよびプロテアーゼ切断可能ペプチドに基づく融合タンパク質ならびに化学療法用担体としてのそれらの使用 Download PDF

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Description

本発明は、融合タンパク質、該融合タンパク質の複数のモノマーから構成されるナノ粒子、該融合タンパク質をコードする核酸、ならびにそれらの診断用途および治療用途に関する。本発明は、融合タンパク質、該融合タンパク質の複数のモノマーにより構成されるナノ粒子、およびそれらの使用に関する。タンパク質のN末端に少なくとも1つのメタロプロテイナーゼ切断配列と、タンパク質-薬物安定性を増大させるマスキングポリマーとして作用する修飾されたPASポリペプチドとを含む、ヒトフェリチンの重鎖に基づく融合タンパク質、ならびに該融合タンパク質の複数のモノマーから構成されるナノ粒子、該融合タンパク質をコードする核酸、およびそれらの診断用途および治療用途を記載する。
疾患領域での治療剤の選択的放出は、現在の治療、特に抗癌治療を改善するための最も重要な課題の1つである。この文脈では、治療剤の担体(ナノベクター)としてのナノ粒子の使用は、投与部位と最終標的との間に存在し得る生物学的障壁を回避可能にし、より具体的には、正常組織ではなく疾患領域に選択的な方法で薬物を蓄積することを潜在的に可能にする。基本的な前提条件として、ナノベクターは大量の薬物に効果的に結合することができなければならない。
標的化された薬物放出のための公知の担体の中で、フェリチン(Ft)に基づくナノ粒子は、生体適合性、生物学的障壁を越える能力、機能化の多様性、および特定の種類の薬物と結合する能力という並外れた特徴のため、ますます興味深いものになっている。Ftは、24個のサブユニットからなる非常に対称性の高い多量体タンパク質構造体であり、この24個のサブユニットは、鉄を貯蔵するために生理学的に使用される空洞を取り囲む、本質的に球形の殻を有する分子構造体に集合する。外径は12nm、内径は8nmである。このような殻状の分子構造体を、以下「ナノ粒子」または「HFtナノ粒子」と呼ぶ。ヒトフェリチン(HFt)の重鎖に基づくナノ粒子は、特にインビボでのヒトへの用途に関して、他の薬物放出系と比較して多くの利点を示す。実際、HFt分子は生物学的障壁(20nmの小径)を越えるように設計されており、生理的条件下では低濃度(約20μg/L)であるが細胞内および血液中の両方に存在する。
HFt分子は天然の要素であるため、強力な非自己(外来性)抗体および/またはT細胞免疫応答を惹起しにくい。さらに、HFtはそれ自体が効果的かつ選択的に腫瘍細胞に結合することができる数少ない天然ナノ粒子の1つである。実際、標的癌治療にとって最も魅力的な分子の1つであるトランスフェリン受容体1(TfR1)を使用することにより、HFtが内在化されることが示されている。TfR1は実際、多くの種類の癌の表面で正常にアップレギュレートされ(正常細胞の最大100倍)、効率的に内在化される。474を超える臨床組織試料では、HFtは、ヒトフェリチンの軽鎖(LFt)ではなく、TfR1によって内在化され、非腫瘍組織と比較して多くの種類の腫瘍(すなわち、肝癌、肺癌、膵癌、大腸癌、子宮頸癌、卵巣癌、前立腺癌、乳癌、肉腫および胸腺癌)を特異的に認識することが証明され、感度98%、特異性95%であった(Fan K,Cao C,Pan Y,Lu D,Yang D,Feng J,et al.Magnetoferritin nanoparticles for targeting and visualizing tumour tissues.Nat Nanotechnol.2012;7:459-64)。ただし、天然のHFtはいくつかの欠点を示す。第一に、例えばドキソルビシン(幅広い抗腫瘍スペクトルを有する抗腫瘍薬の1つ)などの特定の種類の薬物に結合することができる収率は低く、これにより、天然のHFtの可能な用途および臨床開発が制限される可能性がある。第二に、天然のHFtは、全身経路を介して注入された場合、約2~3時間と非常に短い血漿半減期を示す。最後に、その天然のフェロキシダーゼ活性は、ヒト骨芽細胞の発達および成熟を阻害し、石灰化の減少、骨減少症および骨粗鬆症をもたらす可能性がある(Zarjou A,Jeney V,Arosio P,Poli M,Zavaczki E,Balla G,Balla J.Ferritin ferroxidase activity:a potent inhibitor of osteogenesis.J Bone Miner Res.2010,25:164-72)。このため、部位特異的変異により得られ、阻害作用を示さない、フェロキシダーゼ活性を欠くHFt変異体(以下vHFtと呼ぶ)を使用することが望ましい。
近年、天然のHFtのインビボ半減期、およびHFt‐薬物複合体の安定性の両方を増大させるために、HFt-MP-PASと名付けられ、薬物送達に適した新規のHFtベースの構築物が国際公開第2016051340号パンフレットに開示された。この構築物では、各HFtサブユニットのN末端は、i)PASポリペプチド配列、すなわち、プロリン(P)残基、アラニン(A)残基およびセリン(S)残基に富む配列、ならびにii)各HFtサブユニットと外側のPASポリペプチドとの間に挿入された腫瘍プロテアーゼ(MMP)によるタンパク質分解切断に応答する腫瘍選択的配列(MP)に遺伝的に融合されている。PASシールド(PAS shield)は、薬物カプセル化プロセス中、好ましくは薬物ドキソルビシンについて、タンパク質の安定性を増大させ、タンパク質-薬物複合体の安定性を増大させることを目的とするものであった。PASの存在は、タンパク質表面をマスキングし、したがって、その血漿半減期を延長することもできる。MP配列は、得られたマスクされていないHFtが癌細胞内で過剰発現されたTfR1と自由に相互作用し、このTfR1によって内在化されることができるように、腫瘍微小環境(すなわち、この配列に特異的なMMP)に存在する刺激によって、PASシールドを選択的に除去することを可能にする。HFt-MP-PAS構築物は、i)野生型HFtの3倍のドキソルビシン(DOX)を内部空洞にカプセル化し、ii)比較的安定な複合体(すなわち、薬物漏出はごくわずかであった)を形成し、iii)比較的高いインビボ循環時間を有することを証明した。重要なことに、DOXを搭載したHFt-MP-PAS(HFt-MP-PAS-DOX)は、ヒト膵癌モデルではインビボで優れた治療効果を示し、動物の総生存率を有意に増加させた。これは、HFtに関して、DOXカプセル化、タンパク質‐薬物複合体安定性および血漿中循環時間が増大するPASシールドに起因した。しかし、治療剤の担体(ナノベクター)として改善されたナノ粒子を提供する必要性が依然として存在する。
本発明者らは、驚くべきことに、PASドメインに対してグルタマートまたはアスパルタートから選択される少なくとも1つの負に帯電した残基を挿入すると、本開示の例および図面に報告された実験データから明らかに示されるように、融合タンパク質HFt-MP-PASの特性が劇的に改善することを発見した。特に、本発明者らは、PASドメインに対してグルタマートなどの負に帯電した残基を挿入した新しい構築物(HF-MP-PASE)が、薬物のカプセル化のための反応の終了時に回収されたタンパク質の量に関して、天然のHFt、およびHFt-MP-PASの両タンパク質よりも優れていることを予期せず発見した。さらに、新しい構築物HF-MP-PASEは、天然のHFt、およびHFt-MP-PASと比較して、細胞の核での薬物の蓄積が高く、血清中での安定性が高く、腫瘍への蓄積が高いことを示した。
したがって、本発明の第1の目的は、少なくとも3つのドメインを含む融合タンパク質であって、
(a)第1のドメインは、天然のヒトフェリチンの重鎖または天然のヒトフェリチンの重鎖のアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するその変異体のアミノ酸配列を含み、
(b)第2のドメインは、マトリックスメタロプロテイナーゼ(MMP)切断部位のアミノ酸配列を含み、
(c)第3のN末端ドメインは、プロリン、セリン、アラニン、およびグルタマートまたはアスパルタートから選択される少なくとも1つの負に帯電した残基から本質的になるか、またはそれらからなる、少なくとも20アミノ酸残基のポリペプチドのアミノ酸配列からなる、融合タンパク質である。
本発明はまた、本発明の化合物を含む組成物、および治療用途における特定の使用を提供する。この目的および他の目的は、添付の請求項1に定義されている融合タンパク質によって達成される。他の独立請求項および従属請求項は、本発明のさらなる態様および特定の実施形態に関し、本願明細書の不可欠な部分を形成する。
本発明者らは、フェリチン空洞内の薬物結合を改善および促進するために、タンパク質表面からシステイン残基を除去し、タンパク質空洞に追加のシステイン残基を導入することを決定した。このようにして、チオール反応性モチーフを含むあらゆる分子、例えば、薬物、リンカー、フルオロフォアなどを非常に効果的に内部空洞に結合することができた(例および図を参照)。
したがって、本発明のさらなる目的は、天然のヒトフェリチンの重鎖のムテインであり、該ムテインは、タンパク質表面にシステインの残基がなく、タンパク質の内部空洞に少なくとも1つのシステインがある。
さらに、本発明者らは、フェリチン空洞内の正の薬物の結合を改善および促進するために、タンパク質表面からシステイン残基を除去し、タンパク質空洞にグルタマートまたはアスパルタートから選択される追加の負に帯電した残基を導入することを決定した。このようにして、正に帯電したモチーフを含む分子、例えば、薬物、リンカー、フルオロフォアなどを非常に効果的に内部空洞に結合することができた(例および図を参照)。
したがって、本発明のさらなる目的は、天然のヒトフェリチンの重鎖のムテインであり、該ムテインは、タンパク質表面にシステインの残基がなく、タンパク質の内部空洞に少なくとも1つの追加のグルタマート残基またはアスパルタート残基がある。
本発明のさらなる目的は、本明細書に開示される実施形態のいずれか1つによる融合タンパク質またはナノ粒子をコードする単離された核酸である。
本発明のさらなる目的は、該核酸を含むベクター、および該核酸または該ベクターを含む宿主細胞である。
本発明のさらなる特徴および利点は、添付の図面を参照して、限定としてではなく、例示の目的でのみ提供される以下の詳細な説明から明らかになるであろう。
HFtベースのナノ粒子の製造の略図であり、ここで、24個のモノマーの各々のN末端は、切断可能なペプチド配列に、ならびにプロリン、アラニン、セリンおよびグルタマート(PASE)から本質的になる配列に遺伝的に結合している。 ネイティブアガロースゲル電気泳動バンド移動プロファイルを示す。レーンHFt-MP-PAS(15μg);レーン2、HFt-MP-PASE(15μg)。 薬物ミトキサントロン(MIT)またはピクサントロン(PIX)を含有するHFt-MP-PASEの合成の略図である。明確にするために、24個の修飾されたHFt N末端のうちの4個のみが示されている。 新規HFt-MP-PASEタンパク質および文献からの他のデータと比較した、以前のHFt構築物(HFt-MP-PAS)がミトキサントロンまたはピクサントロンをカプセル化する能力を示す。タンパク質回収率と、結合した薬物分子の数とに関して相対収率が示されている。この特許の構築物の主題は、天然のHFtまたは修飾されたHFt(HFt-MP-PAS)の両方と比較して、タンパク質回収に関して驚くほどかつ予想外に優れた収率を有することが分かる。 HFtベースの構築物のゲル濾過溶出プロファイル(SEC)および粒径分布(DLS)を示す。(A)MIT添加HFt-MP-PAS(黒)構築物およびHFt-MP-PASE(赤)構築物のSEC分析。それぞれ280nm(実線)および610nm(点線)での、同時のタンパク質およびMITの寄与後に取得された溶出プロファイル。(B)同じ構築物のDLSプロファイル。 HFt-MP-PASE-MIT複合体からの薬物放出を示す。MIT添加ナノ担体をPBS中4℃および37℃で保存し、所定の時間にSECによってそれらのミトキサントロン含有量についてアッセイした。ミトキサントロン漏出の割合は、280nmおよび610nmで同時に収集した溶出プロファイルを比較することによって評価した。 3時間のインキュベーション後のSW480(上部パネル)およびSW620(下部パネル)大腸癌細胞株内のHFt-MP-PASE-MIT(20μM MIT濃度)の局在化を示す。左パネル:ラミンA/C染色(核膜マーカー、緑);中央パネル:MIT(青);右パネル:組合せ。白いバーは10μmの長さを示す。 3時間のインキュベーション後のSW480(パネルA、CおよびE)およびSW620(パネルB、DおよびF)大腸癌細胞株内のMIT(パネルA、B)、HFt-MP-PAS-MIT(パネルC、D)およびHFt-MP-PASE-MIT(パネルE、F)の局在化を示す。いずれの実験でもMIT濃度は20μMである。白いバーは20μmの長さを示す。 ヒト細胞株PaCa-44、Capan-1およびMiaPaCa2(膵癌)、HT1080(線維肉腫)、MDA-MB-231(乳癌)ならびにSW480およびSW620(結腸直腸癌)に対するMITおよびHFt-MP-PASE-MITの殺傷効果を示す。平均±S.E.M.(n=3) ドキソルビシン含有化合物に対する生体内分布実験の結果を示す。裸の薬物ドキソルビシン、またはフェリチンベースの化合物、すなわち、天然のHFt、HFt-MP-PASおよびHFt-MP-PASE内にカプセル化されたドキソルビシンのヒト膵腫瘍(異種移植片)を担持するマウスに静脈内注射した24時間後に、ドキソルビシンの血漿中濃度を計算した。 HFtベースのナノ粒子の製造の略図であり、ここで、以前に示されたN末端修飾(HFt-MP-PAS)に加えて、天然のシステイン残基はセリン残基により置換され、非天然のシステイン残基またはグルタマート残基(赤い球形内)は内部空洞に含まれる(HFt-Cys-MP-PASEまたはHFt-Glu-MP-PASE)。 システインのチオール基に応答する薬物(例えばマレイミド)または正のモチーフを含有する薬物を含有するHFt-Cys-MP-PASEまたはHFt-Glu-MP-PASEの合成の略図である。明確にするために、24個の修飾されたHFt N末端のうちの4個のみが示されている。タンパク質の内部空洞内の非天然のシステイン残基は赤で示されている。 新規HFt-Cys2-MP-PASEタンパク質(モノマー1つ当たり4つの非天然のシステイン、24量体当たり96を含有)による、ドキソルビシンの6-マレイミドカプロイルヒドラゾン誘導体(DOX-EMCH)、もしくはマレイミド-プロピオン酸とGenz-644282との組合せをカプセル化する能力、またはHFt-Glu-MP-PASE(モノマー1つ当たり4つの非天然のグルタマート、24量体当たり96を含有)による、天然のミトキサントロンもしくはGenz-644282をカプセル化する能力を示す。タンパク質回収率と、コンジュゲートした薬物分子の数とに関して相対収率が示されている。
本発明の主題である融合タンパク質は、少なくとも3つのドメインを含む。
第1のドメインは、ヒトフェリチンの重鎖のアミノ酸配列を含む。そのようなアミノ酸配列は、少なくとも90%の配列同一性を有する天然の配列である。ヒトフェリチンの重鎖は183アミノ酸(配列番号1)の長さを有するため、少なくとも90%の配列同一性を有する変異体は、天然の配列と比較して最大19のアミノ酸置換を含む。
一実施形態では、ヒトフェリチンの重鎖は、タンパク質表面からシステイン残基が除去され、少なくとも1つのシステインまたは負の(アスパルタートまたはグルタマート)残基がタンパク質の内部空洞に挿入され、好ましくは2つ、3つまたは4つのシステインまたはアスパルタートもしくはグルタマートがタンパク質の内部空洞に挿入されたムテインである。タンパク質表面からの天然のシステイン残基は、チオール反応基のない残基によって置換され、好ましくはシステインはセリンによって置換される。本明細書では、ヒトフェリチンのタンパク質表面は、溶媒に曝露された任意の残基として定義される。本明細書では、ヒトフェリチンの内部空洞は、溶媒に曝露されていない任意の残基として定義される。
例えば、一実施形態では、システインは、リジン71、リジン143および/またはグリシン182の代わりに挿入される。
好ましい一実施形態では、ヒトフェリチンの重鎖は、代替の変異体を表す、天然のシステイン残基を欠き、内部空洞に3つの非天然のシステイン残基を含むHFt変異体(HFt-Cys1)のアミノ酸配列(配列番号2)である。HFt-Cys1のアミノ酸配列は、6つのアミノ酸置換、すなわち、システイン90の代わりにセリン、システイン102の代わりにセリン、システイン130の代わりにセリン、リジン71の代わりにシステイン、リジン143の代わりにシステインおよびグリシン182の代わりにシステインによって特徴付けられる。
好ましい一実施形態では、ヒトフェリチンの重鎖は、代替の変異体(HFt-Cys2)を表す、天然のシステイン残基を欠き、内部空洞に4つの非天然のシステイン残基を含む。このもう1つの変異体のアミノ酸配列は、7つのアミノ酸置換、すなわち、システイン90の代わりにセリン、システイン102の代わりにセリン、システイン130の代わりにセリン、リジン53の代わりにシステイン、リジン71の代わりにシステイン、スレオニン135の代わりにシステインおよびリジン143の代わりにシステインによって特徴付けられる。
好ましい一実施形態では、ヒトフェリチンの重鎖は、代替の変異体(HFt-Glu)を表す、天然のシステイン残基を欠き、内部空洞に4つの非天然のグルタマート残基を含む。このもう1つの変異体のアミノ酸配列は、7つのアミノ酸置換、すなわち、システイン90の代わりにセリン、システイン102の代わりにセリン、システイン130の代わりにセリン、リジン53の代わりにグルタマート、リジン71の代わりにグルタマート、スレオニン135の代わりにグルタマートおよびリジン143の代わりにグルタマートによって特徴付けられる。
本明細書に開示されるヒトフェリチンのムテイン/変異体はいずれも、本発明の目的である。ヒトフェリチンの重鎖の、本明細書に開示される実施形態はいずれも、本発明による融合タンパク質内の第1のドメインとして使用され得る。
天然のHFtのアミノ酸配列は以下の通りである(最初のメチオニンはコード領域の開始であり、タンパク質の後のプロセシングで除去することができると考えられる):
Figure 0007297745000001
いくつかの実施形態では、本発明の融合タンパク質HFtは、外表面上の天然のシステイン残基を欠き、内部空洞に3つの非天然のシステイン残基を含むHFt変異体(HFt Cys1)を含む。一実施形態では、変異体HFt Cys1のアミノ酸配列は以下の通りである:
Figure 0007297745000002
変異体HFt Cys2のアミノ酸配列は以下の通りである:
Figure 0007297745000003
いくつかの実施形態では、本発明の融合タンパク質HFtは、外表面上の天然のシステイン残基を欠き、内部空洞に4つの非天然のグルタマート残基を含むHFt変異体(HFt Glu)を含む。一実施形態では、変異体HFt Gluのアミノ酸配列は以下の通りである:
Figure 0007297745000004
本発明の融合タンパク質の第2のドメインは、少なくとも1つのマトリックスメタロプロテイナーゼ(MMP)切断部位、特にMMP 2、MMP 3、MMP 7またはMMP 9のアミノ酸配列を含む。非限定的な例として、以下にいくつかのペプチドを列挙し、これらのペプチドはコラーゲン鎖の切断配列を模倣し、MMP 2およびMMP 9によって特に効果的に切断される:
Figure 0007297745000005
目的の酵素の切断部位を含むアミノ酸配列は、例えば以下に示すような配列などでは、切断部位が数回繰り返されるように構築することもできる。
Figure 0007297745000006
前述のアミノ酸配列はいずれも、本発明による融合タンパク質およびナノ粒子の製造の代表的な例であるが、これらに限定されるものではない。
N末端に連結された、本発明の融合タンパク質の第3のドメインは、プロリン、セリン、アラニン、およびグルタマートまたはアスパルタートなどの少なくとも1つの負のアミノ酸(簡潔にするために「PASE」と呼ばれる)に富み、特にタンパク質タンパク質凝集を促進し得る薬物を用いて薬物カプセル化プロセス中のタンパク質の安定性を増大させ、負のアミノ酸(PAS)を欠くポリペプチドと比較してタンパク質薬物複合体の安定性を増大させるという目的を有する、ポリペプチドのアミノ酸配列から本質的になるか、それらからなる。
ポリペプチドPASEは、Pro、AlaおよびSer、ならびに負に帯電した非構造化ポリマーを形成する少なくとも1つ以上のGluおよび/またはAspに富むアミノ酸配列から本質的になり、その長さは好ましくは80アミノ酸残基未満であり、さらに好ましくは20~80アミノ酸残基から構成され、さらになお好ましくは30~70アミノ酸残基から構成される。好ましい実施形態では、前述のポリペプチドPASEのプロリン残基は、ポリペプチドPASEの総アミノ酸残基の10~40%に達する。
一実施形態によれば、PASEドメインは、1つ、2つ、3つまたは4つのグルタマートおよび/またはアスパルタートを含む。好ましい一実施形態では、PASEドメインは、PASドメインの15、16、17、18、19または20残基内に1つ以下のグルタマートまたはアスパルタートを含む。
本発明の範囲内での使用に特に適しており、したがって好ましいPASEポリペプチドの例は以下の通りである:
Figure 0007297745000007

本明細書に開示されているPASEドメインはいずれも、本発明の目的である。
本明細書では、「ポリペプチドはPro、AlaおよびSerに富むアミノ酸配列から本質的になる」という用語を用いて、Pro、AlaおよびSer残基の1~5%が、ポリペプチドの安定なランダムコイルコンフォメーションを変化させない他のアミノ酸、例えばグリシンなどによって置換されている、Pro、AlaおよびSerからなる安定なランダムコイルコンフォメーションを形成するポリペプチドを定義する。上記のように、本発明の生合成ランダムコイルポリペプチド(またはランダムコイルポリペプチドセグメント)は、プロリン残基およびアラニン残基、ならびにグルタマートまたはアスパルタートの少なくとも1つの残基のみからなり、安定なランダムコイルコンフォメーションを形成する。本明細書で使用される用語「ランダムコイル」は、一般に、アミノ酸ポリマー/アミノ酸配列/ポリペプチドを含むポリマー分子の任意のコンフォメーションに関し、該ポリマー構造を形成する個々のモノマー要素は、隣接するモノマー要素に向かって本質的にランダムに配向されるが、該隣接するモノマー要素に依然として化学的に結合されている。特に、「ランダムコイルコンフォメーション」を採用する/有する/形成するポリペプチド、アミノ酸配列またはアミノ酸ポリマーは、定義された二次構造および三次構造を実質的に欠いている。ポリペプチドランダムコイルの性質およびそれらの実験的同定方法は当業者に知られており、科学文献に記載されている(Cantor(1980)Biophysical Chemistry,2nd ed.,W.H.Freeman and Company,New York;Creighton(1993)Proteins-Structures and Molecular Properties,2nd ed.,W.H.Freeman and Company,New York;Smith(1996)Fold Des 1:R95 R106)。
安定化およびマスキングPASEポリペプチドは、前述のように、1つ以上のメタロプロテイナーゼ切断部位を含む短いペプチド配列を介してHFtの表面に付加され、本発明の融合タンパク質に置換可能なマスキングを提供する。実際、PASEポリペプチドは、細胞外マトリックスメタロプロテイナーゼ(MMP)によって標的組織で選択的に除去することができる。MMP 2およびMMP 9は、腫瘍微小環境で過剰発現し、血管新生、浸潤および腫瘍転移に関与する重要なメタロプロテイナーゼであることが示された。
本発明のさらなる目的はまた、PASEまたはPASドメインおよびMMP切断可能ドメインがN末端の代わりにHFtタンパク質のC末端に連結されている融合タンパク質である。一実施形態によれば、融合タンパク質は、配列番号16または配列番号17を有する。
Figure 0007297745000008

Figure 0007297745000009
本発明の範囲内のフェリチンの多量体表面上のPASEポリペプチドの使用は、先行技術を超えるいくつかの利点を提供する。タンパク質薬物複合体の形成中にさらに高い収率と単分散材料とを得るために、PAS配列にグルタマート(E)残基またはアスパルタート(D)残基を付加することによって以前に報告されたHFt MP PASを遺伝的に再操作し、HFt MP PASEと名付けた新しい構築物を得た。この修飾の結果、フェリチンに基づくタンパク質は、天然のHFtまたは修飾されたHFt MP PAS対応物よりも可溶性かつ単分散の様式でタンパク質凝集(例えば、ミトキサントロンおよびピクサントロン)を促進することができる薬物と複合体を形成することができた。
ドキソルビシンとは異なる(例えば、ミトキサントロンおよびピクサントロン)タンパク質薬物複合体カプセル化収率の安定性のこの改善は、遺伝子融合技術、および組換えタンパク質の生産技術の両方を使用して、ヒトフェリチン(HFt)の重鎖に基づくナノ粒子を構築した本発明者によって、驚くべきことにかつ予想外に達成された。特に、例に関連するセクションに詳細に記載されるように、1つの単一核酸配列(例えばDNA)内で、図1に記載の3つの配列、すなわち、i)HFt、ii)MMP 2/9によって切断可能な短いペプチド配列(MP)、iii)Pro、Ser、AlaおよびGlu(PASE)に富み、好ましくは20~80残基から構成される長さを有する非構造化ポリペプチド配列をコードする遺伝子構築物を作製した。配列ii)およびiii)は、その可逆的マスキングのためにHFtのN末端に結合される。
すでに上述したように、本発明者らによって得られたHFt融合タンパク質は、治療薬(化学化合物、モノクローナル抗体、ペプチドなど)を担持することができるHFtナノ粒子を自発的に形成する(図2)。
一実施形態では、1つ以上、好ましくは5つの治療用分子および/または診断用分子が、HFtナノ粒子の内部空洞内にカプセル化されるか、HFtナノ粒子の表面に共有結合されるか、HFtの内部空洞に共有結合される。PASEポリペプチドの存在により、未修飾タンパク質(HFt)またはPAS修飾タンパク質(HFt MP PAS)と比較して、結合した薬物の量と、タンパク質薬物複合体自体の均一性とが大幅に増大した。得られた材料の均一性は、沈殿、クラスタリング、および治療用分子を担持する最終生成物の欠失などの負の効果の欠如を示すため、製薬分野では非常に望ましい特性である。
治療用分子は、例えば、医薬活性成分である。本明細書で使用される場合、「医薬活性成分」またはさらに単純に「活性成分」という表現は、任意の医薬活性分子(化学化合物、モノクローナル抗体、ペプチドなど)、例えば癌治療に使用することができる分子を指す。本発明に使用するのに好ましい活性成分は、例えば、限定するものではないが、ドキソルビシン、ミトキサントロン、ピクサントロン、Genz 644282、パクリタキセル、オーリスタチン、カンプトテシン、ゲムシタビンおよび白金系活性成分である。上記の活性成分の前駆体を使用してもよい。
治療用途では、標的化担体系として作用する本発明のHFtナノ粒子は、任意の好適な投与経路、例えば、経口、非経口、静脈内、腹腔内、筋肉内、坐剤として、病巣内、鼻腔内もしくは皮下、髄腔内、リンパ管内、微小液滴の吸入を介して、または徐放装置、例えば浸透圧ポンプの埋め込みによって、対象または患者に投与することができる。本明細書で使用される場合、用語「対象」は、ヒト、ウシ、ヒツジ、ヤギ、ウマ、イヌ、ネコ、ウサギ、ラット、マウスなどを含む哺乳動物などの動物に関する。
本明細書で使用される場合、用語「治療する(treating)」または「治療(treatment)」は、特定の疾患、病変、状態もしくは症状の治療での成功もしくは改善の証拠、または特定の状況では症状もしくは状態の発症の予防を指す。
治療用途では、本発明のHFtナノ粒子は、治療上有効な用量の医薬活性成分の投与に使用される。「治療上有効な用量」とは、そのためにそれが投与される治療効果をもたらす用量を意味することを意図している。正確な用量は、治療の目的、対象、治療される疾患などを含むいくつかの因子に依存し、それ自体公知の方法を使用することにより、当業者によって容易に決定され得る。(例えば、Lieberman,Pharmaceutical Dosage Forms(vols.1 3,1992);Lloyd,The Art,Science and Technology of Pharmaceutical Compounding(1999);Pickar,Dosage Calculations(1999);およびRemington:The Science and Practice of Pharmacy,20th Edition,2003,Gennaro,Ed.,Lippincott,Williams&Wilkinsを参照)。
本発明のHFtナノ粒子は、例えば、ナノ粒子の空洞内に活性成分を隔離することによって、またはナノ粒子表面に活性成分を共有結合させることによって、医薬成分の投与を必要とする任意の疾患を治療するために使用され得る。ナノ粒子はまた、ナノ粒子の空洞内にイメージング剤を隔離することによって、またはナノ粒子表面にイメージング剤を共有結合させることによって、診断、さらに具体的には疾患の画像化のために使用することもできる。
本発明のHFtナノ粒子は、任意の疾患、好ましくは癌を含む過剰増殖性の疾患、例えば、癌腫、神経膠腫、中皮腫、黒色腫、肉腫、リンパ腫、白血病、腺癌、乳癌、卵巣癌、子宮頸癌(cervical cancer)、神経膠芽腫、白血病、リンパ腫、前立腺癌、バーキットリンパ腫、頭頸部癌、大腸癌、結腸直腸癌、非小細胞肺癌、小細胞肺癌、食道癌、胃癌、膵癌、肝胆道癌、膀胱癌、小腸癌、直腸癌、腎癌、胆嚢癌、陰茎癌、尿道癌、精巣癌、子宮頸癌(cervix cancer)、膣癌、子宮癌、甲状腺癌、副甲状腺癌、副腎癌、膵内分泌癌、カルチノイド腫瘍、骨癌、皮膚癌、網膜芽細胞腫、多発性骨髄腫、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫(他の種類の癌については、CANCER:PRINCIPLES AND PRACTICE(DeVita,V.T.et al.2008 Edition)を参照)の治療のために対象に投与することができる。
一実施形態によれば、HFtナノ粒子は、例えば内部空洞に挿入された1つ以上のシステインを使用して、チオール反応性モチーフを含むあらゆる分子、例えば、薬物、リンカー、フルオロフォアなどに結合される。好ましい一実施形態によれば、HFtナノ粒子は、内部空洞に挿入された1つ以上のシステインを使用して、ドキソルビシンの6マレイミドカプロイルヒドラゾン誘導体(DOX EMCH)、またはリンカーマレイミドプロピオン酸および薬物Genz 644282をカプセル化する。
以下の例は、例示の目的で提供され、添付の特許請求の範囲で定義される本発明の範囲を限定するものではない。

例1
HFt-MP-PASE融合タンパク質の発現ベクターの構築
タンパク質凝集を減少させ、安定性を増大させる試みとして、各HFtサブユニットに融合したPAS配列を形成する外側シールドに、負に帯電した残基を導入することを決定した。実際に、以前に得られたHFt-MP-PAS構築物の分析から、40残基のPAS配列内に2つのグルタマート残基を導入すると、24量体内のサブユニットアセンブリに影響を与えることなく、異なる24量体アセンブリ間の凝集を防止するのに十分な静電反発力が引き起こされることが示唆された。構築物の表面上の負電荷をできるだけ分散させるために、グルタミン酸残基を20残基の距離に配置した。
3つの異なる配列、すなわち、HFt(配列番号1)、MP(配列番号5)およびPASE(配列番号10)を1つの単一配列に組み合わせることによって、HFt-MP-PASE遺伝子を得た。この構築物は、PAS配列内の2つのアミノ酸置換、すなわち、アラニン13の代わりのグルタマートおよびアラニン33の代わりのグルタマートについてのみ、以前に開示されたHFt-MP-PAS構築物(以前はHFt MMP PAS 40と名付けられた;国際公開第2016051340号)とは異なる。これら2つの構築物を使用して、この新規特許に開示されているあらゆる比較実験を行った。
GENEART AG(ドイツ)を使用して、HFt-MP-PASE遺伝子を含むpET 11a発現ベクターを合成した。大腸菌(Escherichia coli)での高レベルの発現のためのコドン最適化を考慮して遺伝子合成を行った。
組換えタンパク質技術を用いて融合タンパク質HFt MP PASEを得、HFt-MP-PAS(約150mg/Lの大腸菌(E.coli)細胞培養物)と同様に、高収率で細胞可溶性画分から精製した。ネイティブの条件下でアガロースゲル電気泳動を行うことによって、タンパク質表面に挿入された負に帯電したグルタマート残基(タンパク質1つ当たり48)のタンパク質移動度に及ぼす影響を評価した(図1)。変性剤SDS PAGEとは異なり、ネイティブ電気泳動では、タンパク質移動度は、タンパク質の電荷および分子量の両方に依存する。後者がHFt MP PASおよびHFt MP PASEでは同等であると仮定すると、観察されたタンパク質移動度の差は、HFt-MP-PASE構築物内の付加的な負電荷に起因しなければならない(図2)。
例2
化学療法薬を担持するHFt-MP-PASおよびHFt-MP-PASEの調製
本発明者は、化学療法剤として、薬物ミトキサントロン(MIT)またはピクサントロン(PIX)が使用された例を報告した。Falvo et al.,2016,Biomacromolecules.17(2):514 22に開示されているプロトコルに従って、pHの関数としてタンパク質アンカップリングカップリング(protein uncoupling coupling)プロセスを利用することによって、融合タンパク質のタンパク質空洞内にこれらの薬物をカプセル化した。分解/再組立て手順を図3に示す。
例3
薬物ミトキサントロンおよびピクサントロンのカプセル化収率の試験
HFt-MP-PASEでのMITまたはPIXカプセル化の効率と、天然のHFtの効率、およびHFt MP PASでの効率とを比較した(図4)。行った実験ではいずれも、HFt-MP-PASEは、反応の終了時に回収されたタンパク質の量に関して、天然のHFt、およびHFt-MP-PASの両タンパク質よりも優れている。これは、HFt-MP-PASEの方が安定であり、タンパク質薬物複合体の形成中に溶液から凝集/沈殿しないことを示している。
例4
タンパク質ミトキサントロン複合体の均一性および安定性の試験
MITを添加したHFt-MP-PASE複合体は、HFt-MP-PAS対応物よりも可溶性かつ単分散性であり、溶液中に高分子量種を示さなかった(図5)。動的光散乱(DLS)実験により、HFt-MP-PASE-MIT試料は、本発明者らが以前に報告したHFt-MP-PAS-DOX(薬物としてドキソルビシンを含有する)とほぼ同じサイズを有し、平均直径は17.0±1.1nmであることが示された(図5B)。これらの結果は、HFt-MP-PASE-MITにグルタマート残基を挿入すると、驚くべきことに、HFt-MP-PAS対応物に比べてはるかに高いタンパク質可溶性および均一性がもたらされ、溶液中でのMIT媒介タンパク質間相互作用が防がれる可能性が高いことを示している。さらに、HFt-MP-PASEと比較してHFt-MP-PASに観察された24量体当たりのMIT分子の数がわずかに多い(55.0対49.0)のは、HFt-MP-PAS構築物の表面にMIT分子が存在し、これによりタンパク質タンパク質凝集が促進され得るためと考えることができる。
溶液を4℃または37℃のPBS中で2カ月保存し、サイズクロマトグラフィー(SEC)分析によって7日ごとにMIT含有量を評価することによって、HFt-MP-PASE-MIT複合体の安定性を試験した。HFt-MP-PASE-MITは優れた安定性を示し、4℃で2カ月保存した後に10%未満のMITが放出され(図6)、混濁または沈殿の兆候はなかった。
例5
HFtベースのナノ担体の細胞内在化および局在化の試験
MITを含有するHFtベースの構築物が細胞表面結合および/または内在化を受けるかどうかを決定するために、それらを大腸癌細胞SW480およびSW620と37℃で1時間または3時間インキュベートし、共焦点顕微鏡によってMIT関連の蛍光を可視化した。
図7は、SW480(上部パネル)およびSW620(下部パネル)細胞株内のHFt MP PASE MITの局在化を示す。核膜マーカーラミンA/C(緑)による染色によって示されるように、3時間のインキュベーション後、HFt-MP-PASE-MITは両細胞株の核に大量に蓄積する。特に、MITは、結腸癌細胞および乳癌細胞に関して以前に提案されたように、サイズ、位置および形状に基づいて核小体であると想定される核内構造に局在する。
遊離MIT、HFt-MP-PAS-MITまたはHFt-MP-PASE MITを用いて処理した細胞間の比較を図8に示す。いずれの場合もMITは細胞核内に局在するが、遊離MITおよびHFt-MP-PAS-MITの場合、薬物は細胞質にも部分的に存在する。全体として、HFt-MP-PASE-MITを用いて処理した細胞は、核内にMITの最も高い蓄積を示した。
例6
インビトロでのHFt MP PASE MITの抗増殖効果
MITを添加したHFt-MP-PASEがインビトロで癌細胞を殺傷する能力を評価するために、様々な起源の広範囲のヒト癌細胞、すなわち、線維肉腫HT1080癌細胞;トリプルネガティブ乳癌MDA MB 231癌細胞;膵癌PaCa44、Capan1およびMiaPaCa2癌細胞;結腸直腸癌SW480およびSW620癌細胞に対してXTT生存率アッセイを行った。
MITが、HFt MP PASE構築物にカプセル化された後、その薬理活性を維持しただけでなく、MITを添加したナノ担体は、試験されたあらゆる細胞株で裸のMITと同様のIC50値を示し、場合によってはさらに低いIC50値を示した(図9を参照)。これは、裸の薬物は細胞内に自由に拡散することができるが、HFt-MP-PASE構築物は、律速受容体(rate limiting receptor)が媒介する取り込みを受けることによってのみMITを送達することができるという点で注目に値する。さらに、新しいナノ系HFt-MP-PASE-MITは、膵臓細胞株に対して、現在使用されている薬物ゲムシタビンの約10倍の殺傷効果を示した(すなわち、Paca44細胞、Capan1細胞およびMiaPaCa2細胞それぞれについて、0.43対6.75μM、0.10対2.8μMおよび0.07対1.15μM)。
例7
マウスを対象としたドキソルビシン含有化合物の生体内分布実験
腫瘍および臓器の薬物蓄積に関してHFt-MP-PASEがHFt-MP-PASに匹敵するかどうかを比較するために、薬物を用いて両融合タンパク質をカプセル化した。両融合タンパク質が、ミトキサントロン薬物とは対照的に、ドキソルビシン(DOX)をカプセル化する点で類似した能力を有するため、薬物としてドキソルビシン(DOX)を選択した。裸の薬物Dox、またはフェリチンベースの化合物、すなわち、天然のHFt、HFt-MP-PASおよびHFt-MP-PASE内にカプセル化されたドキソルビシンのヒト膵腫瘍(異種移植片)を担持するマウスに静脈内注射した24時間後に、Doxの血漿中濃度を計算した。図10は、HFt-MP-PASEの方が、血清中での安定性が高く、腫瘍への蓄積も高いことを示している。
例8
HFt-MP-PASE-CysまたはGlu融合タンパク質のための発現ベクターの構築
フェリチン空洞内の薬物結合を改善および促進する試みとして、タンパク質表面からシステイン残基を除去し、タンパク質空洞に追加のシステイン残基またはグルタマート残基を導入することを決定した。このようにして、チオール反応性モチーフまたは正に帯電したモチーフを含むあらゆる分子、例えば、薬物、リンカー、フルオロフォアなどを非常に効果的な方法で内部空洞に結合することが可能である。図11および図12は、HFtベースのナノ粒子の製造および合成の略図であり、ここで、以前に示されたN末端修飾(HFt-MP-PAS)に加えて、天然のシステイン残基はセリン残基により置換され、非天然のシステイン残基またはグルタマート残基(赤い球形内)は内部空洞に含まれる(HFt-Cys-MP-PASEまたはHFt Glu MP PASE)。図13は、新規HFt-Cys2-MP-PASEタンパク質(モノマー1つ当たり4つの非天然のシステイン、24量体当たり96を含有)がドキソルビシンの6マレイミドカプロイルヒドラゾン誘導体(DOX EMCH)をカプセル化する能力を示す。同じ図に、HFt-Cys-MP-PASEがリンカーマレイミドプロピオン酸および薬物Genz 644282をカプセル化する能力も示されている。同じ図に、HFt-Glu-MP-PASEが遊離薬物ミトキサントロンまたはGenz644282をカプセル化する能力も示されている。1つの修正を含むが、Falvo et al.,2016,Biomacromolecules.17(2):514 22に開示されているプロトコルに従って、pHの関数としてタンパク質アンカップリングカップリングプロセスを利用することによって、融合タンパク質のタンパク質空洞内にこれらの薬物をいずれもカプセル化した。マレイミド含有分子を使用する反応では、低pH値による分子損傷の可能性を回避するために、pH酸工程の後にこれらをpH6.5~7.5で加えた。また、リンカーマレイミドプロピオン酸および薬物Genz644282を使用する反応では、前者を薬物の前にリンカー/チオール比1.2:1で加えた。
タンパク質回収率と、コンジュゲートした薬物分子の数とに関して相対収率が示されている。
例9
インビトロでのHFt-Glu-MP-PASE Genz 644282の抗増殖効果
増殖を試験するために、ヒト肉腫(HT1080およびA204)細胞、ヒト乳癌(MDA MB 231)細胞、ヒト黒色腫(Colo38)細胞およびヒト膵癌(PaCa44およびMiaPaCa2)細胞を、37℃で200μlの完全培地中に約5×10/ウェルで96ウェル15プレート上に播種した。翌日、ウェルに、Genz644282では様々な濃度で、Genz644282またはHFt Glu MP PASE Genz644282を3連で投与し、細胞を72時間培養した。培養の最後の4時間の間、3(4,5ジメチルチオゾール2イル)2,5ジフェニルテトラゾリウムブロミド(MTT)の還元によって細胞生存率を評価した。合計1mg/mLのMTTを各ウェルに加え、試料を37℃で30分間インキュベートした。洗浄後、ホルマザン結晶を100μLのジメチルスルホキシドに溶解させた。550nmで吸光度を測定した。
培養癌細胞に対するHFt Glu MP PASE Genz644282の抗増殖効果を図14に示す。結果は、HFt Glu MP PASE Genz644282が濃度依存的に、インビトロで増殖した癌細胞を効果的に阻害し、IC50値が裸の薬物と同じかそれよりも低いことを示している。これらの結果は、潜在的な治療用途に照らして非常に重要である。同じ結果が、構築物HFt-Cys-MP-PASE Genz644282を使用しても得られた。
インビボでのHFt Glu MP PASE Genz 644282の抗増殖効果
5週齢の雌のCD1ヌードマウス(Charles River Laboratories、レッコ、イタリア)に、200μlのRPMI 1640培地+1%BSAに再懸濁した4x10PaCa-44細胞を皮下注射(すなわち、右側腹部)した。腫瘍が約100mmの体積に達した際に、マウスを6匹の群に無作為化し、200μLの生理食塩水、Genz-644282(1.9mg/Kg)またはHFt-Glu-MP-PASE-Genz(0.95または1.9mg/Kg)を静注した。3週間にわたり、マウスに週2回注射した。デジタルキャリパーを用いて腫瘍体積を週2回測定し、マウスの体重をモニターした。マウスの腫瘍が1500mm以上の体積に達した際に、動物を殺処分した。図15に、最後の治療から約2週間後の腫瘍成長曲線を報告する。この図では、HFt-Glu-MP-PASE-Genzが癌の進行を劇的に低下させる能力が明らかであり、100%の完全な腫瘍応答が観察される。図16は、動物の総生存率を示している。HFt-Glu-MP-PASE-Genzを用いて処置された全動物は疾患がなく、治療開始から100日後に生存し、試験された化合物の大きな効果が示された。
配列表1 <223>1 天然のHFtのアミノ酸配列
配列表2 <223>2 HFT変異体
配列表3 <223>配列番号3
配列表4 <223>配列番号4
配列表5 <223>配列番号5
配列表6 <223>配列番号6
配列表7 <223>配列番号7
配列表8 <223>配列番号8
配列表9 <223>配列番号9
配列表10 <223>配列番号10
配列表11 <223>配列番号11
配列表12 <223>配列番号12
配列表13 <223>配列番号13
配列表14 <223>配列番号14
配列表15 <223>配列番号15
配列表16 <223>配列番号16
配列表17 <223>配列番号17
配列表18 <223>HFt Glu配列番号18

Claims (21)

  1. 少なくとも第1のドメイン、第2のドメイン、および第3のN末端ドメインを含む融合タンパク質であって、
    (a)前記第1のドメインが、天然のヒトフェリチンの重鎖または前記天然のヒトフェリチンの重鎖のアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有するその変異体のアミノ酸配列を含み、
    (b)前記第2のドメインが、マトリックスメタロプロテイナーゼ(MMP)切断部位のアミノ酸配列を含み、
    (c)前記第3のN末端ドメインが、プロリン、セリンおよびアラニン、ならびに1つ、2つ、3つまたは4つグルタマートまたはアスパルタートからなり、15~20残基内に1つより多くのグルタマートまたはアスパルタートを含まない、少なくとも20アミノ酸残基のポリペプチドのアミノ酸配列からなり、安定なランダムコイルコンフォメーションを形成する、融合タンパク質。
  2. 前記第3のN末端ドメインが、80アミノ酸残基未満の長さを有する、請求項1に記載の融合タンパク質。
  3. 前記第3のN末端ドメインが、40~75アミノ酸残基の長さを有する、請求項2に記載の融合タンパク質。
  4. 前記第3のN末端ドメインが、20残基内に1つより多くのグルタマートまたはアスパルタートを含まない、請求項1から3のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
  5. 前記第3のN末端ドメインのプロリン残基が、その総アミノ酸残基の10~40%に達する、請求項1から4のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
  6. 前記第3のN末端ドメインが、配列番号9、配列番号10、配列番号11、配列番号12、配列番号13または配列番号14から選択されるポリペプチドからなる、請求項1から5のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
  7. 前記第1のドメインが、配列番号1の天然のヒトフェリチンの重鎖のアミノ酸配列を含む、請求項1から6のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
  8. 前記第1のドメインが、タンパク質表面上にシステイン残基がなく、前記融合タンパク質の内部空洞内に少なくとも1つのシステインもしくはアスパルタートもしくはグルタマートを有する、天然ヒトフェリチンの重鎖の変異体を含む、請求項1から6のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
  9. 前記天然ヒトフェリチンの重鎖の変異体が、前記融合タンパク質の内部空洞内に2つ、3つもしくは4つのシステインもしくはアスパルタートもしくはグルタマートを有する、請求項8に記載の融合タンパク質。
  10. 前記天然ヒトフェリチンの重鎖の変異体が、前記融合タンパク質表面上にシステイン残基を有しない、請求項8または9に記載の融合タンパク質。
  11. 前記天然ヒトフェリチンの重鎖の変異体が、配列番号2、配列番号15または配列番号18のアミノ酸配列を有する、請求項8に記載の融合タンパク質。
  12. 前記天然ヒトフェリチンの重鎖の変異体が、配列番号2のアミノ酸配列を有する、請求項8に記載の融合タンパク質。
  13. 前記第2のドメインが、MMP2、MMP3、MMP7およびMMP9からなる群から選択されるマトリックスメタロプロテイナーゼ(MMP)切断部位のアミノ酸配列を含む、請求項1から12のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
  14. 前記マトリックスメタロプロテイナーゼ(MMP)切断部位の前記アミノ酸配列が、配列番号3、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号7または配列番号8からなる群から選択される、請求項13に記載の融合タンパク質。
  15. 前記第1のドメインを前記第2のドメインに、および/または前記第2のドメインを前記第3のN末端ドメインにそれぞれ連結する第1および/または第2のリンカーアミノ酸配列を含み、前記第1および前記第2のリンカーアミノ酸配列が互いに同じであるか異なる、請求項1から14のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
  16. 活性成分および/またはイメージング剤に連結している、請求項1から15のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
  17. 請求項1から16のいずれか一項に記載の融合タンパク質の複数のモノマーを含むナノ粒子。
  18. ドキソルビシン、ミトキサントロン、ピクサントロン、Genz644282、パクリタキセル、オーリスタチン、カンプトテシン、ゲムシタビンおよび白金系から選択される活性成分が、前記ナノ粒子に連結されているか、または前記ナノ粒子内にカプセル化されている、請求項17に記載のナノ粒子。
  19. 少なくとも1つの薬学的に許容される賦形剤、担体または希釈剤と組み合わせて、請求項1から16のいずれか一項に記載の融合タンパク質、または請求項17または18に記載のナノ粒子を含む医薬組成物。
  20. 薬剤として使用するための、請求項19に記載の医薬組成物。
  21. 腫瘍の治療的処置および/または診断に使用するための、請求項20に記載の医薬組成物。
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