JP6978001B2 - アミノ酸定量方法及びアミノ酸定量用キット - Google Patents
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Description
[1]以下の各工程を含む工程(I):
(工程I−1)二価イオン又はポリアミンの存在下、試料中のL体及び/又はD体のアミノ酸(L-AA及び/又はD-AA)、該アミノ酸に対応するアミノアシルtRNA合成酵素(AARS)、及び、アデノシン三リン酸(ATP)を反応させて、アミノアシルアデニル酸(アミノアシルAMP)とAARSから成る複合体(アミノアシルAMP-AARS複合体)を形成させる反応(反応1)を含む工程;
(工程I−2)反応1及び/又は反応3で形成されたアミノアシルAMP-AARS複合体とヌクレオチドを反応させて、該複合体からAARS及びアミノ酸(L-AA及び/又はD-AA)を遊離させる反応(反応2)を含む工程;
(工程I−3)反応2で遊離されたアミノ酸(L-AA及び/又はD-AA)及び/又はAARSを反応1において再利用することによってアミノアシルAMP-AARS複合体反応を形成させる反応(反応3)を含む工程;及び、
(工程I−4)工程I−2及び工程I−3を繰り返す工程、並びに、
工程(I)で生じた反応産生物の量を測定し、該反応産生物の測定量に基づきL体及び/又はD体のアミノ酸の量を決定することを含む工程(II)、
を含む、試料中のアミノ酸定量方法。
[2]イオン感応性電界効果トランジスタ、ガラス電極、又は、多電極電位計測計により電位変化を測定することによって、工程(I)で生じた反応産生物の量を測定する、[1]に記載のアミノ酸定量方法。
[3]吸光度法により吸光度変化を測定することによって、工程(I)で生じた反応産生物の量を測定する、[1]に記載のアミノ酸定量方法。
[4]工程(I)で生じる反応産生物として、ピロリン酸又は水素イオンの少なくとも何れか1つを測定する、[1]〜[3]のいずれか一項に記載のアミノ酸定量方法。
[5]工程(I)で生じた反応産生物のモル数が試料中のアミノ酸のモル数より多いことを特徴とする、[1]〜[4]のいずれか一項に記載のアミノ酸定量方法。
[6]前処理として、試料中のL体又はD体のアミノ酸の何れか一方を除去することを特徴とする、[1]〜[5]のいずれか一項に記載のアミノ酸定量方法。
[7][1]〜[6]のいずれか一項に記載のアミノ酸定量法を実施するためのアミノ酸定量用キットであって、ATP、ヌクレオチド及び該アミノ酸に対応するAARSを含む、アミノ酸定量用キット。
[実施例1]
Thermus属及びThermotoga属由来のAARS配列をもつプラスミド(pET28b)で大腸菌BL21(DE3)pLys株を形質転換し、発現株として用いた。各発現株について、選択マーカーとしてカナマイシン、クロラムフェニコールを含むTB培地で37℃培養し、OD600が約0.6に到達後、IPTGを終濃度1mMとなるように添加し、25℃で一晩誘導培養を行った。培養終了後、集菌を行い、得られた菌体を超音波破砕し、無細胞抽出液を調製した。調製した無細胞抽出液を70℃、15分の熱処理を行った後、遠心分離を行った。得られた上清の一部を用いて電気泳動法により目的酵素の発現を確認した。次いで 残りの上清をHisタグカラム(商品名:TALON superflow、GEヘルスケア製)により夾雑タンパクを除去することにより、HisRS、SerRS、TrpRS、LysRSを得た。
大腸菌K12由来のAARS配列をもつプラスミド(pET28b)で大腸菌BL21(DE3)pLys株を形質転換し、発現株として用いた。各発現株について、選択マーカーとしてカナマイシン、クロラムフェニコールを含むTB培地で37℃培養し、OD600が約0.6に到達後、IPTGを終濃度1mMとなるように添加し、IPTGを添加して25℃で一晩誘導培養を行った。培養終了後、集菌を行い、得られた菌体を超音波破砕し、無細胞抽出液を調製した。さらに遠心分離を行い、得られた上清の一部を用いて電気泳動法により目的酵素の発現を確認した。次いで残りの上清をHisタグカラム(商品名:TALON superflow、GEヘルスケア製)により夾雑タンパクを除去することにより、TyrRS、HisRS、SerRS、TrpRSを得た。
[実施例3]
250mM HEPES−KOH(pH8)、31.3mM ATP、313mM MgCl2を含む反応溶液240μLを調製し、L-ヒスチジンを終濃度30μMとなるように30μL、HisRS(好熱菌由来)を終濃度0.1μMとなるように30μL添加し、70℃、30分間処理した。反応後、トリクロロ酢酸を終濃度4%となるように60μL添加し、反応を停止した。反応停止後、遠心分離で沈殿を除去し、実施品(本発明品)1を調製した。
250mM HEPES−KOH(pH8)、31.3mM ATP、313mM MgCl2を含む反応溶液240μLを調製し、L-ヒスチジンを終濃度30μMとなるように30μL、HisRS(大腸菌由来)を終濃度0.12μM、又は、0.17μM、又は、0.21μMとなるように30μL添加し、50℃、30分間処理した。反応後、トリクロロ酢酸を終濃度4%となるように60μL添加し、反応を停止した。反応停止後、遠心分離で沈殿を除去し、実施品2、3、4を調製した。
250mM HEPES−KOH(pH8)、31.3mM ATP、313mM MgCl2を含む反応溶液240μLを調製し、L-セリンを終濃度30μMとなるように30μL、SerRS(好熱菌由来)を終濃度0.05μM、又は、0.075μM、又は、0.1μMとなるように30μL添加し、70℃、30分間処理した。反応後、トリクロロ酢酸を終濃度4%となるように60μL添加し、反応を停止した。反応停止後、遠心分離で沈殿を除去し、実施品5、6、7を調製した。
250mM HEPES−KOH(pH8)、31.3mM ATP、313mM MgCl2を含む反応溶液240μLを調製し、L-セリンを終濃度30μMとなるように30μL、SerRS(大腸菌由来)を終濃度0.12μM、又は、0.17μM、又は、0.21μMとなるように30μL添加し、50℃、30分間処理した。反応後、トリクロロ酢酸を終濃度4%となるように60μL添加し、反応を停止した。反応停止後、遠心分離で沈殿を除去し、実施品8、9、10を調製した。
[実施例7]
調製した実施品1〜10の反応溶液150μLに1Mメルカプトエタノール15μL、発色液(2.5%モリブデン酸アンモニウム/5N硫酸)60μLを混合し、室温で20分間静置した後、580nmの吸光度を測定した。なお、L-アミノ酸の代わりに水を添加したサンプルの吸光値を、ブランクとして各サンプルの吸光値から差し引いた値から、反応溶液中のピロリン酸量を求めた。その結果、図2に示す通り、添加したアミノ酸が全て酵素反応に使用された場合に産生されるピロリン酸量の理論値より多くのピロリン酸が産生されていた。従って、本発明の方法によれば、試料中に含まれるアミノ酸分子数より多くのモル数のピロリン酸が産生されることが示された。
[実施例8]
250mM HEPES−KOH(pH8)、6.3mM ATP、63.5mM MgCl2及び250mM HEPES−KOH(pH8)、31.3mM ATP、313mM MgCl2を含む反応溶液240μLを調製し、それぞれにL-ヒスチジンを終濃度30μMとなるように30μL、HisRS(好熱菌由来)を終濃度5μMとなるように30μL添加し、70℃、15分間処理した。反応後、トリクロロ酢酸を終濃度4%となるように60μL添加し、反応を停止した。反応停止後、遠心分離で沈殿を除去し、実施品11及び12を調製した。
250mM HEPES−KOH(pH8)、12.5mM ATP、125mM MgCl2及び250mM HEPES−KOH(pH8)、31.3mM ATP、313mM MgCl2を含む反応溶液240μLを調製し、それぞれにL-チロシンを終濃度30μMとなるように30μL、TyrRS(大腸菌由来)を終濃度5μMとなるように30μL添加し、50℃、30分間処理した。反応後、トリクロロ酢酸を終濃度4%となるように60μL添加し、反応を停止した。反応停止後、遠心分離で沈殿を除去し、実施品13及び14を調製した。
[実施例10]
調製した実施品11〜14のピロリン酸を実施例7に記載のモリブデンブルー法により測定した。その結果、図3に示す通り、ATPの濃度の増加と共にピロリン酸の増加傾向が見られた。また、添加したアミノ酸が全て酵素反応に使用された場合に産生されるピロリン酸量の理論値より多くのピロリン酸が産生されていた。従って、本発明の方法によれば、試料中に含まれるアミノ酸分子数より多くのモル数のピロリン酸が産生されることが示された。
[実施例11]
250mM HEPES−KOH(pH8)、31.3mM ATP、31.3mM MgCl2、又は、MnCl2、又は、CoCl2を含む反応溶液240μLを調製し、L-セリンを終濃度30μMとなるように30μL、SerRS(大腸菌由来)を終濃度5μMとなるように30μL添加し、50℃、30分間処理した。反応後、トリクロロ酢酸を終濃度4%となるように60μL添加し、反応を停止した。反応停止後、遠心分離で沈殿を除去し、実施品15〜17を調製した。
250mM HEPES−KOH(pH8)、31.3mM ATP、31.3mM MgCl2、又は、MnCl2、又は、CoCl2を含む反応溶液240μLを調製し、L-チロシンを終濃度30μMとなるように30μL、TyrRS(大腸菌由来)を終濃度5μMとなるように30μL添加し、50℃、30分間処理した。反応後、トリクロロ酢酸を終濃度4%となるように60μL添加し、反応を停止した。反応停止後、遠心分離で沈殿を除去し、実施品18〜20を調製した。
250mM HEPES−KOH(pH8)、31.3mM ATP、31.3mM MgCl2、又は、MnCl2、又は、CoCl2を含む反応溶液240μLを調製し、L-ヒスチジンを終濃度30μMとなるように30μL、HisRS(好熱菌由来)を終濃度5μMとなるように30μL添加し、70℃、30分間処理した。反応後、トリクロロ酢酸を終濃度4%となるように60μL添加し、反応を停止した。反応停止後、遠心分離で沈殿を除去し、実施品21〜23を調製した。
250mM HEPES−KOH(pH8)、31.3mM ATP、31.3mM MgCl2、又は、MnCl2、又は、CoCl2を含む反応溶液240μLを調製し、L-セリンを終濃度30μMとなるように30μL、SerRS(好熱菌由来)を終濃度5μMとなるように30μL添加し、70℃、30分間処理した。反応後、トリクロロ酢酸を終濃度4%となるように60μL添加し、反応を停止した。反応停止後、遠心分離で沈殿を除去し、実施品24〜26を調製した。
[実施例15]
実施例11〜14で調製した実施品15〜26を、実施例7に記載のモリブデンブルー法により測定した。その結果、図4に示す通り、二価陽イオンの種類によって、同じAARSでもピロリン酸産生量が異なることが示された。また、AARSの種類によっても、二価イオンのピロリン酸産生量に対する影響は異なるが、MgやMnがAARS共通に要求性のある最適な二価イオンであることが示された。
[実施例16]
250mM HEPES−KOH(pH8)、31.3mM ATP、313mM MgCl2を含む反応溶液、又は、250mM HEPES−KOH(pH8)、31.3mM ATP、31.3mM ADP、313mM MgCl2を含む反応溶液、又は、250mM HEPES−KOH(pH8)、31.3mM ATP、31.3mM AMP、313mM MgCl2を含む反応溶液240μLを調製し、L-トリプトファンを終濃度50μMとなるように30μL、TrpRS(大腸菌由来)を終濃度5μMとなるように30μL添加し、50℃、30分間処理した。反応後、トリクロロ酢酸を終濃度4%となるように60μL添加し、反応を停止した。反応停止後、遠心分離で沈殿を除去し、実施品27〜29を調製した。
250mM HEPES−KOH(pH8)、31.3mM ATP、313mM MgCl2を含む反応溶液又は、250mM HEPES−KOH(pH8)、31.3mM ATP、31.3mM ADP、313mM MgCl2を含む反応溶液240μLを調製し、L-ヒスチジンを終濃度50μMとなるように30μL、HisRS(大腸菌由来)を終濃度5μMとなるように30μL添加し、50℃、30分間処理した。反応後、トリクロロ酢酸を終濃度4%となるように60μL添加し、反応を停止した。反応停止後、遠心分離で沈殿を除去し、実施品30及び31を調製した。
250mM HEPES−KOH(pH8)、31.3mM ATP、313mM MgCl2を含む反応溶液又は、250mM HEPES−KOH(pH8)、31.3mM ATP、31.3mM AMP、313mM MgCl2を含む反応溶液240μLを調製し、L-チロシンを終濃度50μMとなるように30μL、TyrRS(大腸菌由来)を終濃度5μMとなるように30μL添加し、50℃、30分間処理した。反応後、トリクロロ酢酸を終濃度4%となるように60μL添加し、反応を停止した。反応停止後、遠心分離で沈殿を除去し、実施品32及び33を調製した。
[実施例19]
実施例16〜18で調製した実施品27〜33を、実施例7に記載のモリブデンブルー法により測定した。その結果、図5に示す通り、ATPのみを添加した場合に比べ、ATPとADP、又は、ATPとAMPを添加した場合、ピロリン酸産生量が増加していた。このことから、ADPやAMPはAARS反応に用いられるヌクレオチドとして有効であることが示された。
[比較例1]
非特許文献6記載の反応条件に従い、4.7μM HisRS(好熱菌由来)、50μM L-ヒスチジン、0.2mM ATP、5mM MgCl2、15mM HEPES−KOH(pH8)、10mM KClを含む反応液150μLを調製し、80℃で30分間酵素反応を行った。酵素反応後、トリクロロ酢酸を終濃度4%となるように30μL添加し反応を停止した。反応停止後、遠心分離で沈殿を除去し、比較品1を調製した。
非特許文献7記載の反応条件に従い、3.1μM SerRS(好熱菌由来)、50μM L-セリン、2mM ATP、5mM MgCl2、100mM Tris−HCl(pH8)、10mM KClを含む反応液150μLを調製し、80℃で30分間酵素反応を行った。酵素反応後、トリクロロ酢酸を終濃度4%となるように30μL添加し反応を停止した。反応停止後、遠心分離で沈殿を除去し、比較品2を調製した。
非特許文献6記載の反応条件に従い、4.5μM LysRS(好熱菌由来)、50μM L-リジン、0.2mM ATP、5mM MgCl2、15mM HEPES−KOH(pH8)、10mM KClを含む反応液150μLを調製し、80℃で30分間酵素反応を行った。酵素反応後、トリクロロ酢酸を終濃度4%となるように30μL添加し反応を停止した。反応停止後、遠心分離で沈殿を除去し、比較品3を調製した。
5.2μM HisRS(好熱菌由来)、50μM L-ヒスチジン、25.9mM ATP、259mM MgCl2、20mM HEPES−KOH(pH8)を含む反応液を150μL調製し、70℃で30分間酵素反応を行った。酵素反応後、トリクロロ酢酸を終濃度4%となるように30μL添加し反応を停止した。反応停止後、遠心分離で沈殿を除去し、実施品34を調製した。
5.1μM SerRS(好熱菌由来)、50μM L-セリン、25.6mM ATP、256mM MgCl2、20mM HEPES−KOH(pH8)を含む反応液を150μL調製し、70℃で30分間酵素反応を行った。酵素反応後、トリクロロ酢酸を終濃度4%となるように30μL添加し反応を停止した。反応停止後、遠心分離で沈殿を除去し、実施品35を調製した。
4.4μM LysRS(好熱菌由来)、50μM L-リジン、22mM ATP、220mM MgCl2、20mM HEPES−KOH(pH8)を含む反応液を150μL調製し、70℃で30分間酵素反応を行った。酵素反応後、トリクロロ酢酸を終濃度4%となるように30μL添加し反応を停止した。反応停止後、遠心分離で沈殿を除去し、実施品36を調製した。
比較例1〜3及び実施例20〜22で得られた比較品1〜3及び実施品34〜36のピロリン酸を実施例7に記載のモリブデンブルー法により測定した。その結果、図6に示すように本発明の方法では、添加したアミノ酸が全て反応に使用された場合に産生されると推測されるピロリン酸量の理論値より多くのピロリン酸が産生されていた。一方、比較品は、理論値以下であった。このことから、従来のAARSを用いた測定法で産生されるピロリン酸の分子数はアミノ酸分子数より少ないが、本発明方法ではアミノ酸分子数より多くのピロリン酸が産生されることが示された。
[比較例4]
1μM HisRS(好熱菌由来)、30μM L-ヒスチジン、2mM ATP、20mM MgCl2、400mM ヒドロキシルアミン(求核剤)、200mM HEPES−KOH(pH8)を含む反応液を150μL調製し、70℃で30分間酵素反応を行った。酵素反応後、トリクロロ酢酸を終濃度4%となるように30μL添加し反応を停止した。反応停止後、遠心分離で沈殿を除去し、比較品4を調製した。
1μM HisRS(好熱菌由来)、30μM L-ヒスチジン、2mM ATP、20mM MgCl2、200mM HEPES−KOH(pH8)、及び5μM SerRS(好熱菌由来)、30μM L-セリン、2mM ATP、6mM MgCl2、200mM HEPES−KOH(pH8)を含む反応液を150μL調製し、70℃で30分間酵素反応を行った。酵素反応後、トリクロロ酢酸を終濃度4%となるように30μL添加し反応を停止した。反応停止後、遠心分離で沈殿を除去し、実施品37及び38を調製した。
比較例4及び実施例24で得られた比較品4、実施品37及び38のピロリン酸を実施例7に記載のモリブデンブルー法により測定した。その結果、図7に示すとおり、本発明の方法は添加したアミノ酸が全て反応に使用された場合に産生されると推測されるピロリン酸量の理論値より多くのピロリン酸が産生された。一方、比較品は、理論値以下だった。このことから、求核剤を使用した従来のAARSを用いた測定法では、産生されるピロリン酸の分子数はアミノ酸分子数より少ないが、本発明方法では、アミノ酸分子数より多くのピロリン酸が産生されることが示された。
[実施例26]
250mM HEPES−KOH(pH8)、31.3mM ATP、313mM MgCl2を含む反応溶液120μLに、L-セリンを終濃度50μMとなるように15μL、SerRS(大腸菌由来)を終濃度5μMとなるように15μL添加した酵素反応溶液を、10℃、30℃、40℃、45℃、50℃、60℃、70℃、80℃の各温度で30分間反応させた。反応後、トリクロロ酢酸を終濃度4%となるように30μL添加し、反応を停止した。反応停止後、遠心分離で沈殿を除去し、上清中のピロリン酸を実施例7に記載のモリブデンブルー法により測定した。その結果、図8に示すとおり、10℃から80℃の範囲でピロリン酸産生が認められ、特に30℃から60℃の範囲において良好なピロリン酸の産生が認められた。
250mM HEPES−KOH(pH8)、12.5mM ATP、125mM MgCl2を含む反応溶液120μLに、L-ヒスチジンを終濃度30μMとなるように15μL、HisRS(好熱菌由来)を終濃度5μMとなるように15μL添加した酵素反応溶液を、10℃、30℃、40℃、50℃、70℃、80℃、90℃、95℃の各温度で15分間反応させた。反応後、トリクロロ酢酸を終濃度4%となるように30μL添加し、反応を停止した。反応停止後、遠心分離で沈殿を除去し、上清中のピロリン酸を実施例7に記載のモリブデンブルー法により測定した。その結果、図8に示すとおり、10℃から95℃の範囲で良好なピロリン酸の産生が認められた。
[実施例28]
250mM HEPES−KOH(pH8)、31.3mM ATP、313mM MgCl2を含む反応溶液120μLに、L-チロシンが終濃度0μM、30μM、70μM、100μMとなるように15μL添加した各サンプルを調製後、さらに各サンプルにTyrRS(大腸菌由来)を終濃度5μMとなるように15μL添加し、50℃、30分間反応させた。反応後、トリクロロ酢酸を終濃度4%となるように30μL添加し、反応を停止した。反応停止後、遠心分離で沈殿を除去し、上清中のピロリン酸を実施例7に記載のモリブデンブルー法により測定した。その結果、図9に示すように添加したアミノ酸が全て反応に使用された場合に産生されると推測されるピロリン酸量の理論値より多くのピロリン酸が産生されていた。また、0〜100μM のアミノ酸濃度範囲においてアミノ酸濃度とピロリン酸量に相関関係(R=0.97)が認められ、L-チロシンの定量が可能であることが示された。
250mM HEPES−KOH(pH8)、31.3mM ATP、313mM MgCl2を含む反応溶液120μLに、L-セリンが終濃度0μM、60μM、100μM、150μM、200μM、250μM、300μMとなるように15μL添加した各サンプルを調製後、さらに各サンプルにSerRS(好熱菌由来)を終濃度5μMとなるように15μL添加し、70℃、30分間反応させた。反応後、トリクロロ酢酸を終濃度4%となるように30μL添加し、反応を停止した。反応停止後、遠心分離で沈殿を除去し、上清中のピロリン酸を実施例7に記載のモリブデンブルー法により測定した。その結果、図9に示すように添加したアミノ酸が全て反応に使用された場合に産生されると推測されるピロリン酸量の理論値より多くのピロリン酸が産生されていた。また、0〜300μMのアミノ酸濃度範囲においてアミノ酸濃度とピロリン酸量に相関関係(R=0.99)が、認められ、L-セリンの定量が可能であることが示された。
250mM HEPES−KOH(pH8)、31.3mM ATP、313mM MgCl2を含む反応溶液120μLに、L-ヒスチジンが終濃度0μM、1.0μM、3.0μM、5.0μMとなるように15μL添加した各サンプルを調製後、さらに各サンプルにHisRS(大腸菌由来)を終濃度5μMとなるように15μL添加し、50℃、30分間反応させた。反応後、トリクロロ酢酸を終濃度4%となるように30μL添加し、反応を停止した。反応停止後、遠心分離で沈殿を除去し、上清中のピロリン酸を実施例7に記載のモリブデンブルー法により測定した。その結果、図9に示すように添加したアミノ酸が全て反応に使用された場合に産生されると推測されるピロリン酸量の理論値より多くのピロリン酸が産生されていた。また、0〜5μMのアミノ酸濃度範囲においてアミノ酸濃度とピロリン酸量に相関関係(R=0.99)が認められ、L-ヒスチジンの定量が可能であることが示された。
250mM HEPES−KOH(pH8)、31.3mM ATP、313mM MgCl2を含む反応溶液120μLに、L-トリプトファン終濃度0μM、1.0μM、3.0μM、5.0μMとなるように15μL添加した各サンプルを調製後、さらに各サンプルにTrpRS(好熱菌由来)を終濃度5μMとなるように15μL添加し、70℃、30分間反応させた。反応後、トリクロロ酢酸を終濃度4%となるように30μL添加し、反応を停止した。反応停止後、遠心分離で沈殿を除去し、上清中のピロリン酸を実施例7に記載のモリブデンブルー法により測定した。その結果、図9に示すように添加したアミノ酸が全て反応に使用された場合に産生されると推測されるピロリン酸量の理論値より多くのピロリン酸が産生されていた。また、0〜5μMのアミノ酸濃度範囲においてアミノ酸濃度とピロリン酸量に相関関係(R=0.99)が認められ、L-トリプトファンの定量が可能であることが示された。
[実施例32]
終濃度5μM TrpRS(好熱菌由来)、0μM、15μM、20μM、40μM、50μM L-トリプトファン、10mM ATP、100mM MgCl2、1mM HEPES−KOH(pH8)を反応組成物として含む各サンプルを100μL調製し、70℃で30分間反応させた。反応後、10分室温に静置した。
終濃度5μM LysRS(好熱菌由来)、0μM、15μM、20μM、40μM、50μM L-リジン、10mM ATP、100mM MgCl2、1mM HEPES−KOH(pH8)を反応組成物として含む各サンプルを100μL調製し、実施例32と同様の処理を行った。
終濃度5μM SerRS(好熱菌由来)、0μM、20μM、50μM、60μM L-セリン、10mM ATP、100mM MgCl2、1mM HEPES−KOH(pH8)を反応組成物として含む各サンプルを100μL調製し、実施例32と同様の処理を行った。
生理活性反応測定装置(AMIS-101X、バイオエックス社製)を用いた測定を行った。累積型ISFETセンサは、参照電極内蔵AMISセンサー(AMIS-051)を使用した。AMIS-051のセンシング部A、Bに終濃度1mM HEPES−KOH(pH8)、200mM MgCl2、10mKClを含む溶液を各70μLずつ添加した。30℃で3分の予備加温を実施し、シグナルが安定した後、センシング部Aに、調製した測定対象物(実施例32〜34の各サンプル)を、センシング部Bに、アミノ酸の代わりに水を添加した以外は実施例32〜34の各サンプルと同じ組成の溶液を、30μL添加及び混合してシグナル変化量(センシング部Bからのシグナルと比較してのセンシング部Aのシグナル変化)を5秒ごとに250秒計測した。累積型ISFETセンサの累積回数は10回で計測した。その結果、図10に示す通り、各アミノ酸において検量線を作成でき、累積型ISFETセンサにおいてアミノ酸の定量が可能であることが示された。
[実施例36]
250mM HEPES−KOH(pH8)、31.3mM ATP、31.3mM MnCl2を含む反応溶液240μL、又は、250mM HEPES−KOH(pH8)、50mM ATP、50mM MnCl2を含む反応溶液240μL、又は、250mM HEPES−KOH(pH8)、62.5mM ATP、62.5mM MnCl2を含む反応溶液240μLを調製し、D-ヒスチジンを終濃度50μMとなるように30μL、HisRS(大腸菌由来)を終濃度5μMとなるように30μL添加し、50℃、30分間処理した。反応後、トリクロロ酢酸を終濃度4%となるように60μL添加し、反応を停止した。反応停止後、遠心分離で沈殿を除去し、実施品39〜41を調製した。
250mM HEPES−KOH(pH8)、31.3mM ATP、31.3mM MnCl2を含む反応溶液240μL、又は、250mM HEPES−KOH(pH8)、50mM ATP、50mM MnCl2を含む反応溶液240μL、又は、250mM HEPES−KOH(pH8)、62.5mM ATP、62.5mM MnCl2を含む反応溶液240μL調製し、D-トリプトファンを終濃度50μMとなるように30μL、TrpRS(好熱菌由来)を終濃度5μMとなるように30μL添加し、70℃、30分間処理した。反応後、トリクロロ酢酸を終濃度4%となるように60μL添加し、反応を停止した。反応停止後、遠心分離で沈殿を除去し、実施品42〜44を調製した。
[実施例38]
実施例36、37で調製した実施品39〜44を、実施例7に記載のモリブデンブルー法により測定したところ、図11に示す通り、ATP、MnCl2濃度の増加とともにピロリン酸の増加が認められた。また、添加したアミノ酸が全て酵素反応に使用された場合に産生されるピロリン酸量の理論値より多くのピロリン酸が産生されていた。従って、本発明の方法によれば、試料中に含まれるアミノ酸分子数より多くのモル数のピロリン酸が産生されることが示された。
[実施例39]
250mM HEPES−KOH(pH8)、50mM ATP、50mM MnCl2を含む反応溶液120μLに、D-チロシンが終濃度0μM、3μM、5μM、10μMとなるように15μL添加した各サンプルを調製後、さらに各サンプルにTyrRS(大腸菌由来)を終濃度5μMとなるように15μL添加し、40℃、30分間反応させた。反応後、トリクロロ酢酸を終濃度4%となるように30μL添加し、反応を停止した。反応停止後、遠心分離で沈殿を除去し、上清中のピロリン酸を実施例7に記載のモリブデンブルー法により測定した。その結果、図12に示すように、添加したアミノ酸が全て反応に使用された場合に産生されると推測されるピロリン酸量の理論値より多くのピロリン酸が産生されていた。また、0〜10μM のアミノ酸濃度範囲においてアミノ酸濃度とピロリン酸量に相関関係(R=0.96)が認められ、D-チロシンの定量が可能であることが示された。
250mM HEPES−KOH(pH8)、50mM ATP、50mM MnCl2を含む反応溶液120μLに、D-ヒスチジンが終濃度0μM、30μM、50μM、80μM、100μM、150μMとなるように15μL添加した各サンプルを調製後、さらに各サンプルにHisRS(大腸菌由来)を終濃度5μMとなるように15μL添加し、40℃、30分間反応させた。反応後、トリクロロ酢酸を終濃度4%となるように30μL添加し、反応を停止した。反応停止後、遠心分離で沈殿を除去し、上清中のピロリン酸を実施例7に記載のモリブデンブルー法により測定した。その結果、図12に示すように、添加したアミノ酸が全て反応に使用された場合に産生されると推測されるピロリン酸量の理論値より多くのピロリン酸が産生されていた。また、0〜150μM のアミノ酸濃度範囲においてアミノ酸濃度とピロリン酸量に相関関係(R=0.99)が認められ、D-ヒスチジンの定量が可能であることが示された。
[実施例41]
各終濃度が200mM HEPES−KOH(pH8)、0.5mM L−トリプトファン、0.5mM D−トリプトファン、25μM ピリドキサールリン酸、0.8U/mL トリプトファナーゼとなるように調製し、37℃で5分間反応させた。反応後、80℃、30分で熱処理し、遠心分離で沈殿を除去した。
250mM HEPES−KOH(pH8)、50mM ATP、50mM MnCl2を
含む反応溶液240μLに、実施例41で調製したアミノ酸溶液を30μL添加した各サンプルを調製後、さらに各サンプルにTrpRS(大腸菌由来)を終濃度5μMとなるように30μL添加し、40℃、30分間反応させた。反応後、トリクロロ酢酸を終濃度4%となるように60μL添加し、反応を停止した。反応停止後、遠心分離で沈殿を除去し、実施品45を調製した。同様にして、アミノ酸として、夫々、0.5mM D-トリプトファン及び0.5mM L-トリプトファンのみを含み、トリプトファナーゼ処理をしていないアミノ酸溶液からAARS反応により産生されるピロリン酸産生量について測定するため、比較品5と比較品6を調製した。
実施例42で得られた実施品45及び比較品5、6の上清中のピロリン酸を実施例7に記載のモリブデンブルー法により測定した。その結果、図13に示す通り、実施品45と比較品5がほぼ同等のピロリン酸産生量となった。このことから、D体とL体のトリプトファン混合液中のL−トリプトファンが、酵素処理によって除去できたと考えられた。従って、L-アミノ酸を除去することで、D体とL体のアミノ酸混合液中のD-アミノ酸を測定できることが示された。
Claims (6)
- 以下の各工程を含む工程(I):
(工程I−1)二価イオン又はポリアミンの存在下、試料中のL体及び/又はD体のアミノ酸(L-AA及び/又はD-AA)、該アミノ酸に対応するアミノアシルtRNA合成酵素(AARS)、及び、アデノシン三リン酸(ATP)を反応させて、アミノアシルアデニル酸(アミノアシルAMP)とAARSから成る複合体(アミノアシルAMP-AARS複合体)を形成させる反応(反応1)を含む工程;
(工程I−2)反応1及び/又は反応3で形成されたアミノアシルAMP-AARS複合体とヌクレオチドを反応させて、該複合体からAARS及びアミノ酸(L-AA及び/又はD-AA)を遊離させる反応(反応2)を含む工程;
(工程I−3)反応2で遊離されたアミノ酸(L-AA及び/又はD-AA)及び/又はAARSを反応1において再利用することによってアミノアシルAMP-AARS複合体反応を形成させる反応(反応3)を含む工程;及び、
(工程I−4)工程I−2及び工程I−3を繰り返す工程、並びに、
工程(I)で生じた反応産生物の量を測定し、該反応産生物の測定量に基づきL体及び/又はD体のアミノ酸の量を決定することを含む工程(II)、
を含む、試料中のアミノ酸定量方法であって、
前記工程(I)に於ける反応開始時の反応液中のヌクレオチドの濃度が5〜50mMであることを特徴とする、前記方法。 - イオン感応性電界効果トランジスタ、ガラス電極膜、又は、多電極電位計測計により電位変化を測定することによって、工程(I)で生じた反応産生物の量を測定する、請求項1に記載のアミノ酸定量方法。
- 吸光度法により吸光度変化を測定することによって、工程(I)で生じた反応産生物の量を測定する、請求項1に記載のアミノ酸定量方法。
- 工程(I)で生じる反応産生物として、ピロリン酸又は水素イオンの少なくとも何れか1つを測定する、請求項1〜3のいずれか一項に記載のアミノ酸定量方法。
- 工程(I)で生じた反応産生物のモル数が試料中のアミノ酸のモル数より多いことを特徴とする、請求項1〜4のいずれか一項に記載のアミノ酸定量方法。
- 前処理として、試料中のL体又はD体のアミノ酸の何れか一方を除去することを特徴とする、請求項1〜5のいずれか一項に記載のアミノ酸定量方法。
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