JP6859259B2 - ＢＡＣＥｌに対する抗体及び神経疾患免疫療法のためのその使用 - Google Patents

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Description

関連出願の相互参照
本出願は、その全体が参照により本明細書中に組み込まれる２０１４年１１月１９日出願の米国仮出願第６２／０８１，９６６号の優先権の利益を主張する。
配列表
本出願は、電子形式の配列表と共に出願される。配列表は、２０１５年１１月１６日に作成された「２０１５−１１−１６＿０１１４６−００４０−００ＰＣＴ＿ＳＴ２５．ｔｘｔ」と題されるファイル（サイズ：１８１，８９３バイト）として提供される。この配列表の電子形式の情報は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
本発明は概して、例えば、ＢＡＣＥ１活性を阻害または低下させるＢＡＣＥ１アンタゴニストである抗体、及びかかる抗体を含む組成物に関する。さらなる実施形態には、様々な神経系の疾患または障害を治療及び診断する方法、ならびに、患者のＡＰＰ及び／またはＡβポリペプチドを減少させる方法が含まれる。
アミロイドーシスは、単一の疾病ではなく、むしろ、１つ以上の臓器または身体系に蓄積するアミロイドと呼ばれるろう状のデンプン様タンパク質の細胞外組織沈着を特徴とする進行性疾患経過の多様な群である。アミロイド沈着が蓄積していくと、臓器または身体系の正常な機能を妨害し始める。少なくとも１５種の異なる種類のアミロイドーシスが存在する。主な形態は、前例が知られていない原発性アミロイドーシス、他のいくつかの症状を伴う続発性アミロイドーシス及び遺伝性アミロイドーシスである。
老化による多くの疾患は、アミロイド様タンパク質に基づき、または、関連し、部分的には、疾患の発症及び進行に寄与するアミロイドまたはアミロイド様物質の細胞外沈着の集積を特徴とする。これらの疾患としては、限定はされないが、アルツハイマー病（ＡＤ）、レーヴィ小体認知症、ダウン症候群、アミロイドーシス（ダッチタイプ）遺伝性脳出血といった神経系の障害；グアムパーキンソン認知症症候群が挙げられる。アミロイド様タンパク質に基づくまたは関連する他の疾患は、進行性核上性麻痺、多発性硬化症、クロイツフェルト・ヤコブ病、パーキンソン病、ＨＩＶ関連認知症、ＡＬＳ（筋萎縮性側索硬化症）、成人発祥型糖尿病、老人性心臓アミロイドーシス、内分泌腺腫瘍、及び黄斑変性といったその他のものである。
ポリペプチドβ−アミロイド（Ａβ）は、アルツハイマー病（ＡＤ）の発症に重要な役割を果たす可能性が高い。Ｖａｓｓａｒ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｎｅｕｒｏｓｃｉ．２９：１２７８７−１２７９４（２００９）。ＣＮＳにおけるＡβポリペプチドの蓄積は、シナプスの機能障害、軸索変性及びニューロン死をもたらす。ＡＤ患者の脳は、神経原線維変化（ＮＦＴ）及びアミロイドに富む老人斑のような、顕著な神経病理学的病変の特徴的な病理を示す。アミロイド斑の主な成分はＡβである。これらの病変は、中枢系神経系（ＣＮＳ）のニューロンの集団の多大な量の損失と関連し、その進行には、ＡＤに関連する臨床認知症が伴う。
Ａβは、前駆体タンパク質であるベータアミロイド前駆体タンパク質（β−ＡＰＰまたはＡＰＰ）のタンパク質分解産物である。ＡＰＰは、タイプＩ膜貫通タンパク質であり、連続して、２種のセクレターゼ、β−及びγ−セクレターゼによって切断される。β部位アミロイド前駆体タンパク質切断酵素１（ＢＡＣＥ１）として知られるβセクレターゼは、まずＡＰＰを切断してＡβのＮ末端を曝し、それによって、Ｃ９９として知られる膜が結合した断片を産生する。Ｖａｓｓａｒ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｎｅｕｒｏｓｃｉ．，２９：１２７８７−１２７９４（２００９）及びＵｎｉＰｒｏｔＫＢ／Ｓｗｉｓｓ−Ｐｒｏｔ Ｅｎｔｒｙ Ｐ５６８１７（ＢＡＣＥ１＿ＨＵＭＡＮ）。γセクレターゼは、Ｃ９９を切断し、成熟したＡβポリペプチドを産生することができる。Ａβは、長さが３８〜４３のアミノ酸の範囲で、異種Ｃ末端で産生される。Ａβの４２アミノ酸形態（Ａβ４２）は、Ａβの原線維形成形態であり、ダウン症候群の患者で過剰生産され、ＡＤの初期病態形成で役割を果たすと示唆されてきた。Ｖａｓｓａｒ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｎｅｕｒｏｓｃｉ．２９：１２７８７−１２７９４（２００９）。したがって、ＢＡＣＥ１は、その阻害がＡＰＰ及びＡβ産生を阻害すると推定されるので、治療ターゲットとなっている。
実際に、ＢＡＣＥ１ノックアウトマウス（ＢＡＣＥ１−／−）では、脳のＡβが産生されず、ＢＡＣＥ１が、脳でＡβを産生する原因となる、唯一ではないにしろ重要な酵素であることが確認された。Ｒｏｂｅｒｄｓ ｅｔ ａｌ．，Ｈｕｍａｎ Ｍｏｌ．Ｇｅｎｅｔｉｃｓ １０：１３１７−１３２４（２００１）。さらに、ＡＤモデルのＢＡＣＥ１ノックアウトマウスは、アミロイド斑を形成せず、認知的な欠陥及びコリン作用性機能障害も改善される。ＭｃＣｏｎｌｏｇｕｅ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２８２：２６３２６−２６３３４（２００７）；Ｏｈｎｏ ｅｔ ａｌ．，Ｎｅｕｒｏｎ ４１：２７−３３（２００４）；及びＬａｉｒｄ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｎｅｕｒｏｓｃｉ．２５：１１６９３−１１７０９（２００５）。さらに、ヘテロ接合のＢＡＣＥ１ノックアウトマウスでは、斑形成が減少し、ＢＡＣＥ１活性の完全な阻害が斑減少に必要ではないことを示す。ＭｃＣｏｎｌｏｇｕｅ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２８２：２６３２６−２６３３４（２００７）。
ＡＤといった神経系の疾患及び障害を有する患者の、ＡＰＰ及びＡβ産生を低下させるＢＡＣＥ１の有効な治療阻害剤を有することは有利である。本明細書で開示される本発明はかかる阻害剤に関し、当該阻害剤を各種方法で使用することも含む。
本明細書において引用される特許出願及び出版物を含むすべての参照文献は、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる。
本発明は、ＢＡＣＥ１アンタゴニスト抗体及びそれを使用する方法を提供する。具体的には、当該抗体は、ＢＡＣＥ１の活性を阻害または低下させる。
いくつかの実施形態では、ＢＡＣＥ１に結合する単離抗体が提供され、当該抗体は、
ａ）配列番号１〜６から選択されるＨＶＲ−Ｈ１配列；配列番号２２〜２５から選択されるＨＶＲ−Ｈ２配列；配列番号５０及び５１から選択されるＨＶＲ−Ｈ３配列；配列番号６２及び６３から選択されるＨＶＲ−Ｌ１配列；配列番号６９及び７０から選択されるＨＶＲ−Ｌ２配列；ならびに、配列番号７５〜７８及び９８から選択されるＨＶＲ−Ｌ３配列；または
ｂ）配列番号７〜２１、２１８及び２２２〜２２４から選択されるＨＶＲ−Ｈ１配列；配列番号２６〜４９、２３２、２１９及び２２５から選択されるＨＶＲ−Ｈ２配列；配列番号５２〜６１、２２０、２２１、２２６及び２２７から選択されるＨＶＲ−Ｈ３配列；配列番号６４〜６８から選択されるＨＶＲ−Ｌ１配列；配列番号６９〜７４及び２１７から選択されるＨＶＲ−Ｌ２配列；配列番号７９〜９７から選択されるＨＶＲ−Ｌ３配列を含む。
いくつかの実施形態では、ＢＡＣＥ１に結合する単離抗体が提供され、当該抗体は、表１の抗体から選択される抗体のＨＶＲ−Ｈ１、ＨＶＲ−Ｈ２、ＨＶＲ−Ｈ３、ＨＶＲ−Ｌ１、ＨＶＲ−Ｌ２及びＨＶＲ−Ｌ３を含む。いくつかの実施形態では、抗体は、６２６６及び６２６６変異体１〜１５から選択される。いくつかの実施形態では、抗体は、配列番号１５、２１８及び２２２〜２２４から選択されるＨＶＲ−Ｈ１配列；配列番号２９、２１９及び２５５から選択されるＨＶＲ−Ｈ２配列；配列番号５２、２２０、２２１、２２６及び２２７から選択されるＨＶＲ−Ｈ３配列；配列番号６５のＨＶＲ−Ｌ１配列；配列番号７１、７３及び２１７から選択されるＨＶＲ−Ｌ２配列；ならびに、配列番号８０のＨＶＲ−Ｌ３配列を含む。いくつかの実施形態では、抗体は、
ａ）配列番号９９〜１４７、１９４〜２００及び２０９〜２１６から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９０％の配列同一性を有する重鎖可変ドメイン配列；または
ｂ）配列番号１４８〜１７８、１８７〜１９４及び２０１〜２０８から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９０％の配列同一性を有する軽鎖可変ドメイン配列；または
ｃ）（ａ）のような重鎖可変ドメイン配列及び（ｂ）のような軽鎖可変ドメイン配列を含む。
いくつかの実施形態では、ＢＡＣＥ１に結合する単離抗体は、
ａ）配列番号９９〜１４７、１９４〜２００及び２０９〜２１６から選択される重鎖可変ドメイン配列；または
ｂ）配列番号１４８〜１７８、１８７〜１９４及び２０１〜２０８から選択される軽鎖可変ドメイン配列；または
ｃ）（ａ）のような重鎖可変ドメイン配列及び（ｂ）のような軽鎖可変ドメイン配列を含む。
いくつかの実施形態では、ＢＡＣＥ１に結合する単離抗体は、
ａ）配列番号１３８、１９４〜２００及び２０９〜２１６から選択される配列と少なくとも９０％の配列同一性を有する重鎖可変ドメイン配列；または
ｂ）配列番号１５６、１８７〜１９４及び２０１〜２０８から選択される配列と少なくとも９０％の配列同一性を有する軽鎖可変ドメイン配列；または
ｃ）（ａ）のような重鎖可変ドメイン配列及び（ｂ）のような軽鎖可変ドメイン配列を含む。
いくつかの実施形態では、ＢＡＣＥ１に結合する単離抗体は、
ａ）配列番号１３８、１９４〜２００及び２０９〜２１６から選択される重鎖可変ドメイン配列；または
ｂ）配列番号１５６、１８７〜１９４及び２０１〜２０８から選択される軽鎖可変ドメイン配列；または
ｃ）（ａ）のような重鎖可変ドメイン配列及び（ｂ）のような軽鎖可変ドメイン配列；または
ｄ）６２６６及び６２６６変異体１〜１５から選択される抗体の重鎖可変ドメイン配列及び軽鎖可変ドメイン配列を含む。
いくつかの実施形態では、単離抗体は、ＢＡＣＥ１の活性を調節する。いくつかの実施形態では、抗体は、ＢＡＣＥ１の活性を阻害する。いくつかの実施形態では、ＢＡＣＥ１活性は、均一時間分解蛍光（ＨＴＲＦ）アッセイを用いて測定される。いくつかの実施形態では、ＢＡＣＥ１活性は、ＢＡＣＥ１基質を発現する細胞株を用いて測定される。いくつかの実施形態では、ＢＡＣＥ１基質は、アミロイド前駆体タンパク質（ＡＰＰ）である。いくつかの実施形態では、ＢＡＣＥ１活性は、抗ＢＡＣＥ１抗体を投与された動物由来の組織で測定される。いくつかの実施形態において、組織は、脳組織である。いくつかの実施形態では、動物は、マウス、ラット、ウサギ、イヌ、サル及び非ヒト霊長類から選択される。
いくつかの実施形態では、抗体は、ＢＡＣＥ１の活性のアロステリック阻害剤である。いくつかの実施形態では、抗体は、表面プラズモン共鳴（ＳＰＲ）によって測定される０．１ｎＭ〜１０ｎＭ、または０．１ｎＭ〜８ｎＭ、または０．１ｎＭ〜７ｎＭ、または０．１ｎＭ〜５ｎＭ、または０．５ｎＭ〜５ｎＭ、または０．１ｎＭ〜３ｎＭ、または０．５ｎＭ〜３ｎＭの親和性（ＫＤ）でＢＡＣＥ１と結合する。いくつかの実施形態では、抗体は、例えば、解離した皮質のニューロンの培養アッセイを用いて、６０％超、７０％超、７５％超または８０％超のＢＡＣＥ１活性の最大阻害を達成する。
本発明の抗体は、あらゆる数の形態であり得る。例えば、本発明の抗体は、ヒト抗体またはキメラ抗体であり得る。他の態様では、本発明の抗体は、完全長の抗体またはその断片（例えば、抗原結合成分を含む断片）である。いくつかの実施形態では、抗体断片は、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆａｂ’−ＳＨ、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆｖ及びｓｃＦｖから選択される。いくつかの実施形態では、抗体は、完全長ＩｇＧ１抗体である。本発明の他の態様では、抗体は、モノクローナル抗体である。別の態様では、本発明の抗体は、剤または部分、例えば細胞傷害性薬剤と結合または抱合して免疫抱合体を形成し得る。
いくつかの実施形態では、本発明の抗体と、薬学的に許容される担体とを含む、医薬製剤が提供される。さらなる実施形態では、本発明の抗体をコードする単離核酸が提供され、及び、本発明の抗体をコードする単離核酸を含むベクターが提供される。別の態様では、本発明の抗体をコードする核酸を含む宿主細胞及び本発明の抗体の産生方法が提供され、当該方法は、本発明の抗体をコードする核酸を含む宿主細胞を抗体の産生に適した条件下で培養することを含む。
別の実施形態では、神経系の疾患または障害を有する個体を治療する方法が提供され、当該方法は、有効な量の本発明の抗体を個体に投与することを含む。
追加の実施形態では、神経系の疾患または障害に罹患しているまたはそれに罹患するリスクのある患者において、アミロイド斑を減少するまたはアミロイド斑形成を阻害する方法が提供され、当該方法は、有効な量の本発明の抗体を個体に投与することを含む。
いくつかの実施形態では、患者のＡβタンパク質を減少させる方法であって、有効な量の本発明の抗体を患者に投与することを含む、方法。いくつかの態様では、患者は、神経系の疾患または障害に罹患しているかまたはそれに罹患するリスクがある。
別の実施形態では、患者の軸索変性を阻害する方法が提供され、当該方法は、有効な量の本発明の抗体を患者に投与することを含む。
追加の実施形態では、患者の神経系の疾患または障害を診断する方法であって、患者から単離した生体試料と、本発明の抗体とを、抗体がＢＡＣＥ１ポリペプチドに結合するのに適した条件下で接触させること、及び、抗体とＢＡＣＥ１ポリペプチドとの間に複合体が形成されるかどうかを検出することを含む、方法。
いくつかの実施形態では、患者が抗ＢＡＣＥ１抗体での治療に適格であるかどうかを決定する方法であって、患者から単離した生体試料と、本発明の抗体とを、抗体がＢＡＣＥ１ポリペプチドに結合するのに適した条件下で接触させること、及び、複合体が抗体及びＢＡＣＥ１ポリペプチド間に形成されるかどうかを検出することを含み、抗体とＢＡＣＥ１ポリペプチドとの間の複合体の存在は、患者が抗ＢＡＣＥ１抗体での治療に適格であることを示す、方法。いくつかの態様では、患者は、神経系の疾患または障害に罹患しているまたはそれに罹患するリスクがある。
いくつかの態様では、神経系の疾患または症状の診断に用いられ得る生体試料；または、ＢＡＣＥ１抗体での治療に対する患者の応答性を予測するもしくは適格性を決定するために用いられ得る生体試料としては、限定はされないが、血清、血漿、唾液、胃液分泌、粘液、脳脊髄液、リンパ液のような体液またはニューロン組織、脳組織、心臓組織もしくは血管組織のような臓器から採取した組織もしくは細胞試料が挙げられる。
本発明の方法のいくつかの態様では、患者は哺乳動物である。別の態様では、患者はヒトである。別の態様では、神経系の疾患または障害は、アルツハイマー病（ＡＤ）、外傷性脳損傷、脳卒中、緑内障、認知症、筋ジストロフィー（ＭＤ）、多発性硬化症（ＭＳ）、筋萎縮性側索硬化症（ＡＬＳ）、嚢胞性繊維症、アンジェルマン症候群、リドル症候群、パジェット病、外傷性脳損傷、レーヴィ小体病、ポリオ後遅発性筋萎縮症、シャイ・ドレーガー症候群、オリーブ橋小脳萎縮、パーキンソン病、多系統萎縮症、線条体黒質変性症、核上麻痺、牛海綿状脳症、スクラピー、クロイツフェルト・ヤコブ症候群、クールー、ゲルストマン・シュトロイスラー・シャインカー病、慢性消耗病、致死性家族性不眠症、球麻痺、運動ニューロン疾患、カナバン病、ハンチントン舞踏病、ニューロンセロイド脂褐素症、アレキサンダー病、トゥーレット症状群、メンケス縮れ毛症候群、コケーン症候群、ハラーフォルデン・シュパッツ症候群、ラフォーラ病、レット症候群、肝レンズ核変性症、レッシュ・ナイハン症候群及びウンフェルリヒト・ルントボルク症候群、認知症（限定はされないがピック病及び脊髄小脳失調症）からなる群から選択される。いくつかの態様では、神経系の疾患または障害は、アルツハイマー病である。いくつかの実施形態では、神経系の疾患または障害は、アルツハイマー病、脳卒中、外傷性脳損傷及び緑内障からなる群から選択される。
本明細書に記載される特定の抗ＢＡＣＥ１抗体のエピトープビン及び重鎖ＨＶＲ−Ｈ１、ＨＶＲ−Ｈ２及びＨＶＲ−Ｈ３配列を示す。 本明細書に記載される特定の抗ＢＡＣＥ１抗体のエピトープビン及び重鎖ＨＶＲ−Ｈ１、ＨＶＲ−Ｈ２及びＨＶＲ−Ｈ３配列を示す。 本明細書に記載される特定の抗ＢＡＣＥ１抗体のエピトープビン及び重鎖ＨＶＲ−Ｈ１、ＨＶＲ−Ｈ２及びＨＶＲ−Ｈ３配列を示す。 本明細書に記載される特定の抗ＢＡＣＥ１抗体のエピトープビン及び重鎖ＨＶＲ−Ｈ１、ＨＶＲ−Ｈ２及びＨＶＲ−Ｈ３配列を示す。 本明細書に記載される特定の抗ＢＡＣＥ１抗体のエピトープビン及び軽鎖ＨＶＲ−Ｌ１、ＨＶＲ−Ｌ２及びＨＶＲ−Ｌ３配列を示す。 本明細書に記載される特定の抗ＢＡＣＥ１抗体のエピトープビン及び軽鎖ＨＶＲ−Ｌ１、ＨＶＲ−Ｌ２及びＨＶＲ−Ｌ３配列を示す。 本明細書に記載される特定の抗ＢＡＣＥ１抗体のエピトープビン及び軽鎖ＨＶＲ−Ｌ１、ＨＶＲ−Ｌ２及びＨＶＲ−Ｌ３配列を示す。 本明細書に記載される特定の抗ＢＡＣＥ１抗体のエピトープビン及び重鎖可変領域（ＶＨ）配列を示す。 本明細書に記載される特定の抗ＢＡＣＥ１抗体のエピトープビン及び重鎖可変領域（ＶＨ）配列を示す。 本明細書に記載される特定の抗ＢＡＣＥ１抗体のエピトープビン及び重鎖可変領域（ＶＨ）配列を示す。 本明細書に記載される特定の抗ＢＡＣＥ１抗体のエピトープビン及び重鎖可変領域（ＶＨ）配列を示す。 本明細書に記載される特定の抗ＢＡＣＥ１抗体のエピトープビン及び重鎖可変領域（ＶＨ）配列を示す。 本明細書に記載される特定の抗ＢＡＣＥ１抗体のエピトープビン及び重鎖可変領域（ＶＨ）配列を示す。 本明細書に記載される特定の抗ＢＡＣＥ１抗体のエピトープビン及び重鎖可変領域（ＶＨ）配列を示す。 本明細書に記載される特定の抗ＢＡＣＥ１抗体のエピトープビン及び軽鎖可変領域（ＶＬ）配列を示す。 本明細書に記載される特定の抗ＢＡＣＥ１抗体のエピトープビン及び軽鎖可変領域（ＶＬ）配列を示す。 本明細書に記載される特定の抗ＢＡＣＥ１抗体のエピトープビン及び軽鎖可変領域（ＶＬ）配列を示す。 本明細書に記載される特定の抗ＢＡＣＥ１抗体のエピトープビン及び軽鎖可変領域（ＶＬ）配列を示す。 本明細書に記載される特定の抗ＢＡＣＥ１抗体のエピトープビン及び軽鎖可変領域（ＶＬ）配列を示す。 本明細書に記載される特定の抗ＢＡＣＥ１抗体のエピトープビン及び軽鎖可変領域（ＶＬ）配列を示す。 Ｏｃｔｅｔ（登録商標）システム（ＦｏｒｔｅＢｉｏ）を用いたｐＨ７．５のヒトＢＡＣＥ１（２列目）、ｐＨ７．５のマウスＢＡＣＥ１（３列目）、ｐＨ５．０のヒトＢＡＣＥ１（４列目）、及びｐＨ５．０のマウスＢＡＣＥ１（５列目）に対する特定の抗ＢＡＣＥ１抗体の親和性（ＫＤ）、ならびに表面プラズモン共鳴（Ｂｉａｃｏｒｅ（商標））によるヒトＢＡＣＥ１に対する特定の抗ＢＡＣＥ１抗体の親和性（ＫＤ）を示す。特定の抗体に関しては、２つの別々のアッセイで決定した親和性が示される。 Ｏｃｔｅｔ（登録商標）システム（ＦｏｒｔｅＢｉｏ）を用いたｐＨ７．５のヒトＢＡＣＥ１（２列目）、ｐＨ７．５のマウスＢＡＣＥ１（３列目）、ｐＨ５．０のヒトＢＡＣＥ１（４列目）、及びｐＨ５．０のマウスＢＡＣＥ１（５列目）に対する特定の抗ＢＡＣＥ１抗体の親和性（ＫＤ）、ならびに表面プラズモン共鳴（Ｂｉａｃｏｒｅ（商標））によるヒトＢＡＣＥ１に対する特定の抗ＢＡＣＥ１抗体の親和性（ＫＤ）を示す。特定の抗体に関しては、２つの別々のアッセイで決定した親和性が示される。 Ｏｃｔｅｔ（登録商標）システム（ＦｏｒｔｅＢｉｏ）を用いたｐＨ７．５のヒトＢＡＣＥ１（２列目）、ｐＨ７．５のマウスＢＡＣＥ１（３列目）、ｐＨ５．０のヒトＢＡＣＥ１（４列目）、及びｐＨ５．０のマウスＢＡＣＥ１（５列目）に対する特定の抗ＢＡＣＥ１抗体の親和性（ＫＤ）、ならびに表面プラズモン共鳴（Ｂｉａｃｏｒｅ（商標））によるヒトＢＡＣＥ１に対する特定の抗ＢＡＣＥ１抗体の親和性（ＫＤ）を示す。特定の抗体に関しては、２つの別々のアッセイで決定した親和性が示される。 Ｏｃｔｅｔ（登録商標）システム（ＦｏｒｔｅＢｉｏ）を用いたｐＨ７．５のヒトＢＡＣＥ１（２列目）、ｐＨ７．５のマウスＢＡＣＥ１（３列目）、ｐＨ５．０のヒトＢＡＣＥ１（４列目）、及びｐＨ５．０のマウスＢＡＣＥ１（５列目）に対する特定の抗ＢＡＣＥ１抗体の親和性（ＫＤ）、ならびに表面プラズモン共鳴（Ｂｉａｃｏｒｅ（商標））によるヒトＢＡＣＥ１に対する特定の抗ＢＡＣＥ１抗体の親和性（ＫＤ）を示す。特定の抗体に関しては、２つの別々のアッセイで決定した親和性が示される。 短基質アッセイを用いた抗ＢＡＣＥ１抗体によるＢＡＣＥ１活性の調節を示す。 長基質アッセイ及び短基質アッセイを用いた抗ＢＡＣＥ１抗体によるＢＡＣＥ１活性の調節を示す。 長基質アッセイ及び短基質アッセイを用いた抗ＢＡＣＥ１抗体によるＢＡＣＥ１活性の調節を示す。 抗ＢＡＣＥ１抗体による細胞内でのＡＰＰ処理のインビトロ調節を示す。 抗ＢＡＣＥ１抗体による細胞内でのＡＰＰ処理のインビトロ調節を示す。 抗ＢＡＣＥ１抗体による細胞内でのＡＰＰ処理のインビトロ調節を示す。 指定した抗ＢＡＣＥ１抗体の内因性アミロイド前駆体タンパク質（ＡＰＰ）の処理に対する効果を示す。実験は、野生型ＣＤ１マウスのＥ１６．５皮質ニューロンの培養物を用いて実施された。 １００ｍｇ／ｋｇの指定された抗ＢＡＣＥ１抗体または対照ＩｇＧ抗体で治療したマウスの脳（皮質）で観察されたＡβｘ−４０レベルを示す。 単回ＩＶ投与後のカニクイザルの経時的な血清抗体濃度を示す。 抗体６２６６の親和性成熟変異体１〜７の（Ａ）軽鎖可変領域配列及び（Ｂ）重鎖可変領域配列を示す。 抗体６２６６の親和性成熟変異体１〜７の（Ａ）軽鎖可変領域配列及び（Ｂ）重鎖可変領域配列を示す。 抗体６２６６の親和性成熟変異体８〜１５の（Ａ）軽鎖可変領域配列及び（Ｂ）重鎖可変領域配列を示す。 抗体６２６６の親和性成熟変異体１〜１５の（Ａ）軽鎖可変領域配列及び（Ｂ）重鎖可変領域配列を示す。 抗体６２６６の親和性成熟変異体に関する親和定数及び融解温度を示す。
Ｉ．定義
本明細書では、「アクセプターヒトフレームワーク」は、下に記載される、ヒト免役グロブリンフレームワークまたはヒトコンセンサスフレームワークに由来する、軽鎖可変ドメイン（ＶＬ）フレームワークまたは重鎖可変ドメイン（ＶＨ）フレームワークのアミノ酸配列を含むフレームワークである。ヒト免役グロブリンフレームワークまたはヒトコンセンサスフレームワーク「に由来する」アクセプターヒトフレームワークは、その同じアミノ酸配列を含んでもよく、またはそれは、アミノ酸配列変化を含有し得る。いくつかの実施形態において、アミノ酸変化の数は、１０以下、９以下、８以下、７以下、６以下、５以下、４以下、３以下、または２以下である。いくつかの実施形態において、ＶＬアクセプターヒトフレームワークは、配列において、ＶＬヒト免役グロブリンフレームワーク配列またはヒトコンセンサスフレームワーク配列と同一である。
「親和性」は、分子（例えば、抗体）の単一の結合部位とその結合パートナー（例えば、抗原）との間の非共有性相互作用の総計の強度を指す。別途指定されない限り、本明細書で使用されるとき、「結合親和性」は、結合対のメンバー（例えば、抗体及び抗原）間の１：１の相互作用を反映する本来の結合親和性を指す。分子ＸのそのパートナーＹに対する親和性は、一般に、解離定数（Ｋｄ）によって表すことができる。親和性は、本明細書に記載される方法を含む、当該技術分野で既知の一般的な方法によって測定することができる。結合親和性を測定するための具体的な例示説明及び例示的な実施形態が、以下に記載される。
「親和性成熟」抗体は、変化を有しない親抗体と比較して、１つ以上の超可変領域（ＨＶＲ）において１つ以上の変化を有し、かかる変化が抗原に対する抗体の親和性の改善をもたらす、抗体を指す。
「抗ベータセクレターゼ抗体」、「抗ＢＡＣＥ１抗体」、「ベータセクレターゼに結合する抗体」及び「ＢＡＣＥ１に結合する抗体」という用語は、抗体が診断剤及び／または治療剤としてＢＡＣＥ１を標的とすることに有用となるような十分な親和性でＢＡＣＥ１と結合することができる抗体を指す。いくつかの実施形態では、無関係の非ＢＡＣＥ１タンパク質への抗ＢＡＣＥ１抗体の結合の程度は、例えば、放射免疫測定法（ＲＩＡ）によって測定した場合に、この抗体のＢＡＣＥ１への結合の約１０％未満である。特定の実施形態では、ＢＡＣＥ１に結合する抗体は、≦１μＭ、≦１００ｎＭ、≦１０ｎＭ、≦１ｎＭ、≦０．１ｎＭ、≦０．０１ｎＭまたは≦０．００１ｎＭ（例えば１０−８Ｍ以下、例えば１０−８Ｍ〜１０−１３Ｍ、例えば、１０−９Ｍ〜１０−１３Ｍ）の解離定数（Ｋｄ）を有する。ある特定の実施形態では、抗ＢＡＣＥ１抗体は、異なる種及びアイソフォームに由来するＢＡＣＥ１間で保存されているＢＡＣＥ１のエピトープに結合する。
本明細書における「抗体」という用語は、最も広義に使用され、それらが所望の抗原結合活性を示す限り、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、多重特異性抗体（例えば、二重特異性抗体）、及び抗体断片を含むが、これらに限定されない、種々の抗体構造を包含する。
「抗体断片」は、インタクトな抗体が結合する抗原に結合する、インタクトな抗体の一部を含むインタクトな抗体以外の分子を指す。抗体断片の例としては、Ｆｖ、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆａｂ’−ＳＨ、Ｆ（ａｂ’）２；ダイアボディ；線状抗体；１本鎖抗体分子（例えば、ｓｃＦｖ）；及び抗体断片から形成される多重特異性抗体が挙げられるが、これらに限定されない。
参照抗体と「同じエピトープに結合する抗体」は、競合アッセイにおいて、その抗原への参照抗体の結合を５０％以上遮断する抗体を指し、また、逆に、参照抗体は、競合アッセイにおいて、その抗原への抗体の結合を５０％以上遮断する。例示的な競合アッセイが本明細書に提供される。
「キメラ」抗体という用語は、重鎖及び／または軽鎖の一部分が特定の源または種に由来する一方で、重鎖及び／または軽鎖の残りの部分が異なる源または種に由来する抗体を指す。
抗体の「クラス」は、その重鎖によって保有される定常ドメインまたは定常領域の型を指す。５つの主要な抗体クラスＩｇＡ、ＩｇＤ、ＩｇＥ、ＩｇＧ、及びＩｇＭが存在し、これらのうちの数個は、サブクラス（アイソタイプ）、例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ１及びＩｇＡ２にさらに分割され得る。免役グロブリンの異なるクラスに対応する重鎖定常ドメインは、それぞれα、δ、ε、γ及びμと呼ばれる。
本明細書で使用される「細胞傷害性薬剤」という用語は、細胞機能を阻害するもしくは阻止する、かつ／または細胞死もしくは破壊を引き起こす物質を指す。細胞傷害性薬剤には、放射性同位体（例えば、Ａｔ２１１、Ｉ１３１、Ｉ１２５、Ｙ９０、Ｒｅ１８６、Ｒｅ１８８、Ｓｍ１５３、Ｂｉ２１２、Ｐ３２、Ｐｂ２１２、及びＬｕの放射性同位体）；化学療法薬剤もしくは化学療法薬物（例えば、メトトレキサート、アドリアマイシン、ビンカアルカロイド（ビンクリスチン、ビンブラスチン、エトポシド）、ドキソルビシン、メルファラン、マイトマイシンＣ、クロラムブシル、ダウノルビシン、または他のインターカレート剤）；成長阻害剤；核酸分解酵素等の酵素及びそれらの断片；抗生物質；細菌、真菌、植物、または動物起源の小分子毒素または酵素活性毒素（それらの断片及び／または変異体を含む）等の毒素；ならびに下に記載される種々の抗腫瘍または抗がん薬剤が含まれるが、これらに限定されない。
「エフェクター機能」は、抗体アイソタイプにより様々である、抗体のＦｃ領域に起因し得る生物活性を指す。抗体エフェクター機能の例としては、Ｃ１ｑ結合及び補体依存性細胞傷害作用（ＣＤＣ）；Ｆｃ受容体結合；抗体依存性細胞媒介性細胞傷害作用（ＡＤＣＣ）；食作用；細胞表面受容体（例えば、Ｂ細胞受容体）の下方制御；ならびにＢ細胞活性化が挙げられる。
薬剤、例えば、医薬製剤の「有効量」は、必要な複数回投薬量で一定期間にわたる、所望の治療的または予防的結果を達成するために有効な量を指す。
本明細書における「Ｆｃ領域」という用語は、定常領域の少なくとも一部分を含有する、免役グロブリン重鎖のＣ末端領域を定義するように使用される。この用語は、天然配列Ｆｃ領域及び変異体Ｆｃ領域を含む。いくつかの実施形態では、ヒトＩｇＧ重鎖Ｆｃ領域は、Ｃｙｓ２２６から、またはＰｒｏ２３０から、重鎖のカルボキシル末端までに及ぶ。しかしながら、Ｆｃ領域のＣ末端リジン（Ｌｙｓ４４７）は、存在する場合もあれば、しない場合もある。本明細書で別途指定がない限り、Ｆｃ領域または定常領域内のアミノ酸残基の番号付けは、ＥＵインデックスとも呼ばれるＥＵ付番システムに従い、Ｋａｂａｔ ｅｔ ａｌ．，Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ Ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｏｆ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ Ｉｎｔｅｒｅｓｔ，５ｔｈ Ｅｄ．Ｐｕｂｌｉｃ Ｈｅａｌｔｈ Ｓｅｒｖｉｃｅ，Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅｓ ｏｆ Ｈｅａｌｔｈ，Ｂｅｔｈｅｓｄａ，ＭＤ，１９９１に説明されるとおりである。
「フレームワーク」または「ＦＲ」は、超可変領域（ＨＶＲ）残基以外の可変ドメイン残基を指す。可変ドメインのＦＲは、一般に、４つのＦＲドメイン：ＦＲ１、ＦＲ２、ＦＲ３、及びＦＲ４からなる。したがって、ＨＶＲ及びＦＲ配列は、一般に、ＶＨ（またはＶＬ）において次の配列で現れる：ＦＲ１−Ｈ１（Ｌ１）−ＦＲ２−Ｈ２（Ｌ２）−ＦＲ３−Ｈ３（Ｌ３）−ＦＲ４。
「完全長抗体」、「インタクトな抗体」及び「全抗体」という用語は、本明細書では同じ意味で用いられ、天然の抗体構造に実質的に類似した構造または本明細書で定義したＦｃ領域を含有する重鎖を有する抗体を指す。
「宿主細胞」、「宿主細胞株」、及び「宿主細胞培養物」という用語は、互換的に使用され、外因性核酸が導入された細胞を指し、かかる細胞の子孫を含む。宿主細胞には、初代形質転換細胞及び継代の数に関わらずそれに由来する子孫を含む、「形質転換体」及び「形質転換細胞」が含まれる。子孫は、核酸含量が親細胞と完全に同一でない場合があるが、突然変異を含有し得る。元々形質転換された細胞においてスクリーニングまたは選択されたものと同じ機能または生物活性を有する突然変異体子孫が、本明細書に含まれる。
「ヒト抗体」は、ヒトもしくはヒト細胞によって産生された、またはヒト抗体レパートリーを利用する非ヒト源に由来する抗体のアミノ酸配列、または他のヒト抗体コード配列に対応するアミノ酸配列を保有するものである。ヒト抗体のこの定義は、非ヒト抗原結合残基を含むヒト化抗体を具体的に除外する。
「ヒトコンセンサスフレームワーク」は、ヒト免役グロブリンＶＬまたはＶＨフレームワーク配列の選択において最も一般的に生じるアミノ酸残基を表すフレームワークである。一般に、ヒト免役グロブリンＶＬまたはＶＨ配列の選択は、可変ドメイン配列の下位集団から行われる。一般に、配列の下位集団は、Ｋａｂａｔ ｅｔ ａｌ．，Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ Ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｏｆ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ Ｉｎｔｅｒｅｓｔ，Ｆｉｆｔｈ Ｅｄｉｔｉｏｎ，ＮＩＨ Ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎ ９１−３２４２，Ｂｅｔｈｅｓｄａ ＭＤ（１９９１），ｖｏｌｓ．１−３にあるような下位集団である。いくつかの実施形態では、ＶＬについて、下位集団は、上記のＫａｂａｔ ｅｔ ａｌにあるような下位集団カッパＩである。いくつかの実施形態では、ＶＨについて、下位集団は、上記のＫａｂａｔ ｅｔ ａｌにあるような下位集団ＩＩＩである。
「ヒト化」抗体は、非ヒトＨＶＲからのアミノ酸残基及びヒトＦＲからのアミノ酸残基を含む、キメラ抗体を指す。ある特定の実施形態において、ヒト化抗体は、少なくとも１つ、典型的には２つの可変ドメインの実質的にすべてを含むことになり、そのＨＶＲ（例えば、ＣＤＲ）のすべてまたは実質的にすべてが、非ヒト抗体のものに対応し、そのＦＲのすべてまたは実質的にすべてが、ヒト抗体のものに対応する。ヒト化抗体は任意に、ヒト抗体に由来する抗体定常領域の少なくとも一部分を含んでもよい。抗体、例えば非ヒト抗体の、「ヒト化型」は、ヒト化を経た抗体を指す。
本明細書で使用される「超可変領域」または「ＨＶＲ」という用語は、配列が高度に変化する、かつ／または構造的に規定されたループ（「超可変ループ」）を形成する、抗体可変ドメインの領域の各々を指す。一般に、天然４本鎖抗体は、６つのＨＶＲを含み、このうち３つがＶＨ（Ｈ１、Ｈ２、Ｈ３）にあり、３つがＶＬ（Ｌ１、Ｌ２、Ｌ３）にある。ＨＶＲは一般に、超可変ループからの及び／または「相補性決定領域」（ＣＤＲ）からのアミノ酸残基を含み、このうち後者が、配列可変性が最も高く、かつ／または抗原認識に関与する。例示的な超可変ループは、アミノ酸残基２６〜３２（Ｌ１）、５０〜５２（Ｌ２）、９１〜９６（Ｌ３）、２６〜３２（Ｈ１）、５３〜５５（Ｈ２）、及び９６〜１０１（Ｈ３）において生じる。（Ｃｈｏｔｈｉａ ａｎｄ Ｌｅｓｋ，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１９６：９０１−９１７（１９８７）。）例示的なＣＤＲ（ＣＤＲ−Ｌ１、ＣＤＲ−Ｌ２、ＣＤＲ−Ｌ３、ＣＤＲ−Ｈ１、ＣＤＲ−Ｈ２、及びＣＤＲ−Ｈ３）は、アミノ酸残基Ｌ１の２４〜３４、Ｌ２の５０〜５６、Ｌ３の８９〜９７、Ｈ１の３１〜３５Ｂ、Ｈ２の５０〜６５、及びＨ３の９５〜１０２において生じる（Ｋａｂａｔ ｅｔ ａｌ．，Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ Ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｏｆ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ Ｉｎｔｅｒｅｓｔ，５ｔｈ Ｅｄ．Ｐｕｂｌｉｃ Ｈｅａｌｔｈ Ｓｅｒｖｉｃｅ，Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅｓ ｏｆ Ｈｅａｌｔｈ，Ｂｅｔｈｅｓｄａ，ＭＤ（１９９１）。）。ＶＨにおけるＣＤＲ１を除いて、ＣＤＲは一般に、超可変ループを形成するアミノ酸残基を含む。ＣＤＲはまた、抗原に接触する残基である、「特異性決定残基」または「ＳＤＲ」も含む。ＳＤＲは、短縮型（ａｂｂｒｅｖｉａｔｅｄ）ＣＤＲ、またはａ−ＣＤＲと呼ばれるＣＤＲの領域内に含有される。例示的なａ−ＣＤＲ（ａ−ＣＤＲ−Ｌ１、ａ−ＣＤＲ−Ｌ２、ａ−ＣＤＲ−Ｌ３、ａ−ＣＤＲ−Ｈ１、ａ−ＣＤＲ−Ｈ２、及びａ−ＣＤＲ−Ｈ３）は、アミノ酸残基Ｌ１の３１〜３４、Ｌ２の５０〜５５、Ｌ３の８９〜９６、Ｈ１の３１〜３５Ｂ、Ｈ２の５０〜５８、及びＨ３の９５〜１０２において生じる。（Ａｌｍａｇｒｏ ａｎｄ Ｆｒａｎｓｓｏｎ，Ｆｒｏｎｔ．Ｂｉｏｓｃｉ． １３：１６１９−１６３３（２００８）を参照。）別途指定されない限り、可変ドメインにおけるＨＶＲ残基及び他の残基（例えば、ＦＲ残基）は、本明細書において上記のＫａｂａｔ ｅｔ ａｌ．に従って付番される。
「免疫複合体」は、細胞傷害性薬剤を含むが、これらに限定されない１個以上の異種性分子（複数可）に複合される抗体である。
「個体」または「対象」は、哺乳動物である。哺乳動物には、家畜（例えば、ウシ、ヒツジ、ネコ、イヌ、及びウマ）、霊長類（例えば、ヒト、及びサル等の非ヒト霊長類）、ウサギ、及び齧歯類（例えば、マウス及びラット）が含まれるが、これらに限定されない。ある特定の実施形態において、個体または対象は、ヒトである。
「単離」抗体は、その自然環境の構成成分から分離されているものである。いくつかの実施形態において、本抗体は、例えば、電気泳動法（例えば、ＳＤＳ−ＰＡＧＥ、等電点電気泳動（ＩＥＦ）、キャピラリー電気泳動）またはクロマトグラフ法（例えば、イオン交換または逆相ＨＰＬＣ）によって決定するとき、９５％超または９９％超の純度まで精製される。抗体純度の評価方法の概要に関しては、例えば、Ｆｌａｔｍａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｃｈｒｏｍａｔｏｇｒ．Ｂ ８４８：７９−８７（２００７）を参照されたい。
「単離」核酸は、その天然環境の構成成分から分離された核酸分子を指す。単離核酸には、核酸分子を通常含有する細胞内に含有される核酸分子が含まれるが、その核酸分子は、染色体外に、またはその天然の染色体位置とは異なる染色体位置に存在する。
「抗ＢＡＣＥ１抗体をコードする単離核酸」は、抗体重鎖及び軽鎖（またはそれらの断片）をコードする１つ以上の核酸分子を指し、それには単一のベクターまたは別個のベクターにおけるかかる核酸分子（複数可）が含まれ、かかる核酸分子（複数可）は、宿主細胞内の１つ以上の場所に存在する。
本明細書で使用される「モノクローナル抗体」という用語は、実質的に同種の抗体の集団から得られる抗体を指し、すなわち、その集団に含まれる個々の抗体は、同一であり、かつ／または同じエピトープに結合するが、例えば、自然発生突然変異を含有する、またはモノクローナル抗体調製物の生産中に発生する可能性のある変異形抗体は例外であり、かかる変異形は一般に少量で存在する。異なる決定基（エピトープ）に対する異なる抗体を典型的に含む、ポリクローナル抗体調製物とは対照的に、モノクローナル抗体調製物の各モノクローナル抗体は、抗原上の単一の決定基を対象とする。したがって、「モノクローナル」という修飾語は、実質的に同種の抗体の集団から得られる抗体の特徴を示しており、任意の特定の方法による抗体の産生を必要とするものとして解釈されるものではない。例えば、本発明に従って使用されるモノクローナル抗体は、ハイブリドーマ法、組み換えＤＮＡ法、ファージディスプレイ法、及びヒト免役グロブリン遺伝子座のすべてまたは一部を含有するトランスジェニック動物を利用する方法を含むが、これらに限定されない、多様な技法によって産生されてもよく、モノクローナル抗体を産生するためのかかる方法及び他の例示的な方法が、本明細書に記載されている。
「裸の抗体」は、異種性部分（例えば、細胞傷害性部分）または放射標識に複合されていない抗体を指す。裸の抗体は、医薬製剤中に存在してもよい。
「天然抗体」は、様々な構造を有する自然発生免役グロブリン分子を指す。例えば、天然ＩｇＧ抗体は、ジスルフィド結合されている２つの同一の軽鎖及び２つの同一の重鎖から構成される、約１５０，０００ダルトンのヘテロ四量体糖タンパク質である。Ｎ末端からＣ末端まで、各重鎖は、可変重ドメインまたは重鎖可変ドメインとも呼ばれる可変領域（ＶＨ）、続いて３つの定常ドメイン（ＣＨ１、ＣＨ２、及びＣＨ３）を有する。同様に、Ｎ末端からＣ末端まで、各軽鎖は、可変軽ドメインまたは軽鎖可変ドメインとも呼ばれる可変領域（ＶＬ）、続いて定常軽（ＣＬ）ドメインを有する。抗体の軽鎖は、その定常ドメインのアミノ酸配列に基づいて、カッパ（κ）及びラムダ（λ）と呼ばれる２つの型うちの１つに割り当てられ得る。
「添付文書」という用語は、かかる治療薬の適応症、使用法、投薬量、投与、併用療法、禁忌症についての情報、及び／またはその使用に関する警告を含有する、治療薬の商用のパッケージに通例含まれる指示書を指すように使用される。
参照ポリペプチド配列に関する「アミノ酸配列同一性パーセント（％）」は、配列をアライメントし、配列同一性最大パーセントを得るのに必要な場合はギャップを導入した後に、いかなる保存的置換も配列同一性の部分として考慮せずに、参照ポリペプチド配列におけるアミノ酸残基と同一である、候補配列におけるアミノ酸残基の割合として定義される。アミノ酸配列同一性パーセントを決定する目的のためのアライメントは、当該技術分野における技術の範囲内である種々の方式で、例えばＢＬＡＳＴ、ＢＬＡＳＴ−２、ＡＬＩＧＮ、またはＭｅｇａｌｉｇｎ（ＤＮＡＳＴＡＲ）ソフトウェア等の、公的に利用可能なコンピュータソフトウェアを使用して達成することができる。当業者は、比較されている配列の完全長にわたる最大のアライメントを得るために必要とされる任意のアルゴリズムを含む、配列をアライメントするために適切なパラメータを決定することができる。しかしながら、本明細書では、アミノ酸配列同一性％値は、配列比較コンピュータプログラムＡＬＩＧＮ−２を使用して生成される。ＡＬＩＧＮ−２配列比較コンピュータープログラムは、Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ， Ｉｎｃ．によって作成され、及び、ソースコードは、ユーザー文書と一緒にアメリカ合衆国著作権局、ワシントンＤ．Ｃ．、２０５５９に提出されており、米国著作権登録番号ＴＸＵ５１００８７で登録されている。ＡＬＩＧＮ−２プログラムは、Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ，Ｉｎｃ．，Ｓｏｕｔｈ Ｓａｎ Ｆｒａｎｃｉｓｃｏ，Ｃａｌｉｆｏｒｎｉａから公的に利用可能であるか、またはソースコードから編集されてもよい。ＡＬＩＧＮ−２プログラムは、デジタルＵＮＩＸ Ｖ４．０Ｄを含むＵＮＩＸオペレーティングシステムで使用する場合は編集すべきである。すべての配列比較パラメータは、ＡＬＩＧＮ−２プログラムによって設定され、変更されない。
アミノ酸配列比較のためにＡＬＩＧＮ−２が用いられる場合、所与のアミノ酸配列Ｂに対する、それとの、またはそれに対する所与のアミノ酸配列Ａのアミノ酸配列同一性％（代替的に、所与のアミノ酸配列Ｂに対する、それとの、またはそれに対するある特定のアミノ酸配列同一性％を有する、またはそれを含む、所与のアミノ酸配列Ａと表現され得る）は、次のように算出される：
１００×分数Ｘ／Ｙ
（式中、Ｘは、配列アライメントプログラムＡＬＩＧＮ−２によって、そのプログラムのＡ及びＢのアライメントにおいて完全な一致としてスコア化されたアミノ酸残基の数であり、Ｙは、Ｂ中のアミノ酸残基の総数である）。アミノ酸配列Ａの長さがアミノ酸配列Ｂの長さと等しくない場合、Ｂに対するＡのアミノ酸配列同一性％は、Ａに対するＢのアミノ酸配列同一性％と等しくはならないことが理解されよう。特に別途定めのない限り、本明細書で使用されるすべてのアミノ酸配列同一性％値は、直前の段落に記載されるように、ＡＬＩＧＮ−２コンピュータプログラムを使用して得られる。
「医薬製剤」という用語は、調製物の中に含有される活性成分の生物活性が有効になるような形態であり、製剤が投与されることになる対象にとって許容できないほど有毒である追加の構成成分を何ら含有しない調製物を指す。
「薬学的に許容される担体」は、対象にとって無毒である、活性成分以外の医薬製剤中の成分を指す。薬学的に許容される担体には、緩衝液、賦形剤、安定剤、または防腐剤が含まれるが、これらに限定されない。
本明細書で使用される「ＢＡＣＥ１」という用語は、特に明記しない限り霊長類（例えばヒト）及齧歯動物（例えばマウス及びラット）のような哺乳動物を包含する任意の脊椎動物由来の任意の天然ベータセクレターゼ１（β部位アミロイド前駆体タンパク質切断酵素１、膜結合アスパラギン酸プロテアーゼ２、メマプシン２、アスパルチルプロテアーゼ２またはＡｓｐ２とも呼ばれる）を指す。この用語は、「完全長」未処理のＢＡＣＥ１、ならびに細胞内の処理から生じるＢＡＣＥ１の任意の形態を包含する。この用語は、ＢＡＣＥ１の天然に存在する変異型、例えば、スプライス変異型または対立遺伝子変異型も包含する。例示的なＢＡＣＥ１ポリペプチドのアミノ酸配列は、以下の配列番号１７９で表され、ヒトＢＡＣＥ１に関する配列、Ｖａｓｓａｒ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ ２８６：７３５−７４１（１９９９）で報告されるアイソフォームＡであり、本文献は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
ＭＡＱＡＬＰＷＬＬＬＷＭＧＡＧＶＬＰＡＨＧＴＱＨＧＩＲＬＰＬＲＳＧＬＧＧＡＰＬＧＬＲＬＰＲＥＴＤＥＥＰＥＥＰＧＲＲＧＳＦＶＥＭＶＤＮＬＲＧＫＳＧＱＧＹＹＶＥＭＴＶＧＳＰＰＱＴＬＮＩＬＶＤＴＧＳＳＮＦＡＶＧＡＡＰＨＰＦＬＨＲＹＹＱＲＱＬＳＳＴＹＲＤＬＲＫＧＶＹＶＰＹＴＱＧＫＷＥＧＥＬＧＴＤＬＶＳＩＰＨＧＰＮＶＴＶＲＡＮＩＡＡＩＴＥＳＤＫＦＦＩＮＧＳＮＷＥＧＩＬＧＬＡＹＡＥＩＡＲＰＤＤＳＬＥＰＦＦＤＳＬＶＫＱＴＨＶＰＮＬＦＳＬＱＬＣＧＡＧＦＰＬＮＱＳＥＶＬＡＳＶＧＧＳＭＩＩＧＧＩＤＨＳＬＹＴＧＳＬＷＹＴＰＩＲＲＥＷＹＹＥＶＩＩＶＲＶＥＩＮＧＱＤＬＫＭＤＣＫＥＹＮＹＤＫＳＩＶＤＳＧＴＴＮＬＲＬＰＫＫＶＦＥＡＡＶＫＳＩＫＡＡＳＳＴＥＫＦＰＤＧＦＷＬＧＥＱＬＶＣＷＱＡＧＴＴＰＷＮＩＦＰＶＩＳＬＹＬＭＧＥＶＴＮＱＳＦＲＩＴＩＬＰＱＱＹＬＲＰＶＥＤＶＡＴＳＱＤＤＣＹＫＦＡＩＳＱＳＳＴＧＴＶＭＧＡＶＩＭＥＧＦＹＶＶＦＤＲＡＲＫＲＩＧＦＡＶＳＡＣＨＶＨＤＥＦＲＴＡＡＶＥＧＰＦＶＴＬＤＭＥＤＣＧＹＮＩＰＱＴＤＥＳＴＬＭＴＩＡＹＶＭＡＡＩＣＡＬＦＭＬＰＬＣＬＭＶＣＱＷＣＣＬＲＣＬＲＱＱＨＤＤＦＡＤＤＩＳＬＬＫ（配列番号１７９）
ヒトＢＡＣＥ１の他のアイソフォームが複数存在し、アイソフォームＢ、Ｃ及びＤが挙げられる。その全体が参照により本明細書に組み込まれるＵｎｉＰｒｏｔＫＢ／Ｓｗｉｓｓ−Ｐｒｏｔ Ｅｎｔｒｙ Ｐ５６８１７を参照されたい。アイソフォームＢは、配列番号１８０で表され、アイソフォームＡ（配列番号１７９）とは、アミノ酸１９０〜２１４を欠く（すなわち配列番号１７９のアミノ酸１９０〜２１４の欠失）点で異なる。アイソフォームＣは、配列番号１８１で表され、アイソフォームＡ（配列番号１７９）とは、アミノ酸１４６〜１８９を欠く（すなわち（配列番号１７９）のアミノ酸１４６〜１８９の欠失）点で異なる。アイソフォームＤは、配列番号１８２で表され、アイソフォームＡ（配列番号１７９）とは、アミノ酸１４６〜１８９及び１９０〜２１４を欠く（すなわち配列番号１７９のアミノ酸１４６〜１８９及び１９０〜２１４の欠失）点で異なる。
本明細書で使用されるとき、「治療」（及び「治療する」または「治療すること」等のその文法上の変形形態）は、治療されている個体の自然過程を変えることを目的とした臨床介入を指し、予防のために、または臨床病理過程の間に行うことができる。治療の望ましい効果には、疾患の発生または再発の予防、症状の緩和、疾患の任意の直接的または間接的な病理学的結果の減少、転移の予防、疾患進行速度の低減、病状の回復または緩和、及び寛解または予後の改善が含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態において、本発明の抗体を使用して、疾患の発症を遅らせるか、または疾患の進行を減速させる。
「可変領域」または「可変ドメイン」という用語は、抗体を抗原に結合することに関与する、抗体重鎖または軽鎖のドメインを指す。天然抗体の重鎖及び軽鎖の可変ドメイン（それぞれ、ＶＨ及びＶＬ）は一般に、同様の構造を有し、各ドメインは、４つの保存されたフレームワーク領域（ＦＲ）及び３つの超可変領域（ＨＶＲ）を含む。（例えば、Ｋｉｎｄｔ ｅｔ ａｌ．Ｋｕｂｙ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，６ｔｈ ｅｄ．，Ｗ．Ｈ．Ｆｒｅｅｍａｎ ａｎｄ Ｃｏ．，ｐａｇｅ ９１（２００７）を参照）。抗原結合特異性を付与するためには、単一のＶＨまたはＶＬドメインで十分であり得る。さらに、抗原に結合する抗体からのＶＨまたはＶＬドメインを使用して、それぞれ、相補的ＶＬまたはＶＨドメインのライブラリをスクリーニングして、特定の抗原に結合する抗体を単離してもよい。例えば、Ｐｏｒｔｏｌａｎｏ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１５０：８８０−８８７（１９９３）；Ｃｌａｒｋｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ ３５２：６２４−６２８（１９９１）を参照されたい。
本明細書で使用される「ベクター」という用語は、連結している別の核酸を増殖することが可能な核酸分子を指す。この用語には、自己複製核酸構造としてのベクター、ならびに導入された宿主細胞のゲノムに組み込まれたベクターが含まれる。ある特定のベクターは、作動的に連結された核酸の発現を導くことが可能である。かかるベクターは、本明細書で「発現ベクター」と称される。
「神経系の障害」または「神経系の疾患」という用語は、哺乳動物の中枢及び／または末梢神経系の疾患または障害を指すか、またはそれを説明する。神経系の障害の例としては、限定はされないが次のリストの疾患及び障害が挙げられる。神経障害疾患は、不適当または制御されない神経シグナリングまたはその欠如を特徴とする神経系の疾患または異常で、限定されないが、慢性的疼痛（侵害受容性疼痛（体内組織への損傷によって引き起こされる疼痛、癌関連の疼痛を含む）、神経障害痛（神経、脊髄または脳の異常によって引き起こされる疼痛）及び心因性疼痛（完全にまたは主に精神障害に関連）、頭痛、片頭痛、神経障害、ならびに、かかる神経障害にしばしば伴う、眩暈または吐き気といった兆候及び症候群が挙げられる。アミロイドーシスはＣＮＳにおける細胞外タンパク性沈着に関連した疾患及び障害の群であり、限定されないが、続発性アミロイドーシス、年齢関連のアミロイドーシス、アルツハイマー病（ＡＤ）、軽度認識障害（ＭＣＩ）、レーヴィ小体認知症、ダウン症候群、アミロイドーシス（ダッチタイプ）遺伝性脳出血；グアムパーキンソン認知症症候群、脳アミロイド血管症、ハンチントン舞踏病、進行性核上性麻痺、多発性硬化症；クロイツフェルト・ヤコブ症候群、パーキンソン病、伝達性海綿状脳症、ＨＩＶ関連痴呆症筋萎縮性側索硬化症（ＡＬＳ）、封入体筋炎（ＩＢＭ）、及び、ベータアミロイド沈着に関する視覚性疾患（すなわち、黄斑変性、ドルーゼン関連の視神経症及び白内障）が挙げられる。ＣＮＳのがんは、１つ以上のＣＮＳの細胞（つまり神経細胞）の異常な増殖を特徴とし、限定されないが、神経膠腫、多形膠芽腫、髄膜腫、星状細胞腫、聴神経腫、軟骨腫、乏突起膠腫、髄芽細胞腫、神経細胞神経膠腫、シュヴァン鞘腫、神経繊維腫、神経芽細胞腫及び硬膜外、髄内または硬膜内の腫瘍が挙げられる。視覚性疾患または障害は、目の疾患または障害であり、本明細書ではＢＢＢの影響を受けるＣＮＳ臓器として考えられる。視覚性疾患または障害は、限定されないが、強膜、角膜、虹彩及び毛様体の障害（すなわち、鞏膜炎、角膜炎、角膜潰瘍、角膜摩耗、雪盲、弧目、タイゲソン表層点状角膜炎、角膜新血管新生、フックスのジストロフィー、円錐角膜、乾性角結膜炎、虹彩炎及びブドウ膜炎）、レンズの障害（すなわち白内障）、脈絡膜及び網膜の障害（すなわち網膜剥離、網膜分離、高血圧網膜症、糖尿病性網膜症、網膜症、末熟児網膜症、加齢黄斑変性症、黄斑変性（滲出型または萎縮型）、網膜上膜、色素性網膜炎及び黄斑の浮腫、緑内障、浮遊物、視神経の障害及び視覚伝導路の障害（すなわち、レーベル遺伝性視神経症及び視神経乳頭ドルーゼン）（眼筋／両眼運動順応／屈折の障害（すなわち斜視、眼筋麻痺、進行性外眼筋麻痺、内斜視、外斜視、遠視、近視、乱視、屈折不同、老視及び眼筋麻痺）、視覚障害及び失明（すなわち弱視、レーベル先天性黒内障、暗点、色盲、色覚異常、夜盲症、失明、河川盲目症およ小眼球症／欠損症）、充血した目、アーガイル・ロバートソン瞳孔、角膜糸状菌症、眼球乾燥症ならびに無虹彩が挙げられる。ＣＮＳのウイルス性または微生物感染は、限定されないが、ウイルスによる感染（すなわちインフルエンザ、ＨＩＶ、ポリオウイルス、風疹）、細菌（すなわちＮｅｉｓｓｅｒｉａ ｓｐ．、Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｓｐ．、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｐｒｏｔｅｕｓ ｓｐ．、大腸菌、Ｓ．ａｕｒｅｕｓ、Ｐｎｅｕｍｏｃｏｃｃｕｓ ｓｐ．、Ｍｅｎｉｎｇｏｃｏｃｃｕｓ ｓｐ．、Ｈａｅｍｏｐｈｉｌｕｓ ｓｐ．及び結核菌）による感染、ならびに、限定されないが、急性または慢性であり得る脳膜炎、脳炎、脊髄炎、脈管炎及び膿瘍といったＣＮＳ病態生理を引き起こす真菌類（つまり酵母菌、Ｃｒｙｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｎｅｏｆｏｒｍａｎｓ）、寄生虫（つまりトキソプラズマ原虫）またはアメーバといった他の微生物が挙げられる。ＣＮＳの炎症は、ＣＮＳに対する損傷によって引き起こされる炎症であり、物理的損傷（すなわち事故、手術、脳損傷、脊髄損傷、震盪によるもの）または１種以上の他のＣＮＳ疾患または障害によるまたは関する損傷（すなわち膿瘍、癌、ウイルス性または微生物感染）であり得る。本明細書で使用されるＣＮＳの虚血は、脳の異常な血流または脈管の挙動に関する障害の群またはその原因を指し、限定されないが、局所性脳虚血、全脳虚血、脳卒中（すなわちクモ膜下出血及び脳内出血）ならびに動脈瘤が挙げられる。神経変性疾患は、ＣＮＳにおける神経細胞の機能の消失または死に関連した疾患及び障害の群であり、限定されないが、副腎白質ジストロフィー、アレキサンダー病、アルパース病、筋萎縮性側索硬化症、毛細血管拡張性運動失調、バッテン病、コケーン症候群、大脳皮質基底核変性症、アミロイドーシスに引き起こされるまたは関連した変性、フリードライヒ運動失調症、前頭側頭葉変性、ケネディ病、多系統萎縮症、多発性硬化症、原発性側索硬化、進行性核上性麻痺、脊髄筋萎縮症、横断脊髄炎、レフスム病及び脊髄小脳失調症が挙げられる。ＣＮＳの発作疾患及び障害は、ＣＮＳにおける不適切かつ／または異常な電気伝導に関与し、限定されないが、癲癇（すなわちアブサンス発作、脱力発作、良性ローランド癲癇、幼年期アブサンス、間代発作、複雑部分発作、前頭葉癲癇、熱性けいれん、点頭痙攣、若年性ミオクローヌス癲癇、若年性欠神癲癇、レノックス・ガストー症候群ランドークレフナー症候群、ドラベ症候群、大田原症候群、ウェスト症候群、ミオクローヌス発作、ミトコンドリア障害、進行性ミオクローヌス癲癇、心因発作、反射性癲癇、ラスムッセの症候群、単純部分発作、二次性全身性発作、側頭葉癲癇、強直・間代発作、強直発作、精神運動発作、辺縁系癲癇、部分発病性発作、全身発病性発作、癲癇重積症、腹部癲癇、無動発作、自律神経発作、巨大両側ミオクローヌス、月経癲癇、失立発作、情緒的な発作、焦点性発作、笑い発作、ジャクソン行進、ラフォーラ病、運動発作、多焦点性発作、夜行性発作、感光性発作、擬似発作、知覚性発作、かすかな発作、シルバン発作、離脱症状発作及び視覚反射発作）が挙げられる。行動障害は、苦しむ対象の異常な行動を特徴とするＣＮＳの障害であり、限定されないが、睡眠障害（すなわち不眠症、錯睡眠、野驚症、概日リズム睡眠障害及びナルコレプシー）、気分障害（つまりうつ病、自殺行為的うつ病、不安障害、慢性情動障害、恐怖症、パニック発作、強迫障害、注意欠陥多動性障害（ＡＤＨＤ））、注意力欠如障害（ＡＤＤ）、慢性疲労症候群、広場恐怖症、外傷後ストレス障害、双極性障害、摂食障害（すなわち拒食症または過食症）、精神病、進行性行動障害（つまり自閉症、レット症候群、アスペルガー症候群）、人格障害及び精神異常（すなわち統合失調症、妄想性障害等）が挙げられる。リソソーム貯蔵障害は、いくつかの場合でＣＮＳに関連した代謝障害またはＣＮＳ特有の兆候を有する代謝異常であり、かかる障害としては、限定されないが、テイ・サックス病、ゴーシェ病、ファブリ病、ムコ多糖沈着（タイプＩ、ＩＩ、ＩＩＩ、ＩＶ、Ｖ、ＶＩ及びＶＩＩ）、糖原病、ＧＭ１ガングリオシド蓄積症、異染性白質萎縮症、ファーバー病、カナバンの白質萎縮症ならびに神経セロイドリポフスチン症タイプ１及び２、ニーマン・ピック病、ポンペ病及びクラッベ病が挙げられる。
ＩＩ．組成物及び方法
いくつかの態様では、本発明は、部分的に、ＢＡＣＥ１と結合し、ＢＡＣＥ１活性を低下及び／または阻害する抗体に基づく。特定の実施形態では、ＢＡＣＥ１の活性部位または非活性部位に結合する抗体が提供される。
Ａ．例示的な抗ＢＡＣＥ１抗体
いくつかの実施形態では、抗ＢＡＣＥ１抗体が提供される。いくつかの実施形態では、本明細書で提供される抗ＢＡＣＥ１抗体は、ＢＡＣＥ１の活性のアロステリック阻害剤である。非限定的な例示的抗ＢＡＣＥ１抗体としては、表１に列挙する抗体の重鎖及び軽鎖可変領域を含む抗体が挙げられる。表１に列挙する抗体の重鎖及び軽鎖可変領域を、図３及び図４でそれぞれ示す。
表１：抗ＢＡＣＥ１抗体
Figure 0006859259
いくつかの実施形態では、限定はしないが、表１に列挙する抗体の１つ以上のＨＶＲまたは全６つのＨＶＲを含む抗体を包含する、本明細書に記載される抗ＢＡＣＥ１抗体は、ＢＡＣＥ１の活性のアロステリック阻害剤である。いくつかの実施形態では、表面プラズモン共鳴（ＳＰＲ）によって測定される１０ｎＭ未満、９ｎＭ未満、８ｎＭ未満、７ｎＭ未満、６ｎＭ未満、５ｎＭ未満、４ｎＭ未満または３ｎＭ未満の親和性（ＫＤ）で、抗ＢＡＣＥ１抗体はＢＡＣＥ１と結合する。いくつかの実施形態では、抗ＢＡＣＥ１抗体は、０．１ｎＭ〜１０ｎＭ、または０．１ｎＭ〜８ｎＭ、または０．１ｎＭ〜７ｎＭ、または０．１ｎＭ〜５ｎＭ、または０．５ｎＭ〜５ｎＭ、または０．１ｎＭ〜３ｎＭ、または０．５ｎＭ〜３ｎＭの表面プラズモン共鳴（ＳＰＲ）によって測定される親和性（ＫＤ）で、ＢＡＣＥ１と結合する。いくつかの実施形態では、抗ＢＡＣＥ１抗体は、例えば、実施例２Ｅで説明する解離した皮質のニューロンの培養アッセイを用いて測定される、６０％超、７０％超、７５％超または８０％超のＢＡＣＥ１活性の最大阻害を達成する。
いくつかの態様では、本発明は、表１に列挙される抗ＢＡＣＥ１抗体から選択される抗体の少なくとも１、２、３、４、５または６つのＨＶＲを含む抗ＢＡＣＥ１抗体を提供する。図１及び図２では、それぞれ、これら抗体のそれぞれの重鎖及び軽鎖ＨＶＲ配列が示される。いくつかの実施形態では、本発明は、表１に列挙される抗ＢＡＣＥ１抗体から選択される抗体のＨＶＲ−Ｈ１、ＨＶＲ−Ｈ２、ＨＶＲ−Ｈ３、ＨＶＲ−Ｌ１、ＨＶＲ−Ｌ２及びＨＶＲ−Ｌ３を含む抗ＢＡＣＥ１抗体を提供する。
いくつかの実施形態では、抗ＢＡＣＥ１抗体が提供され、当該抗体は、配列番号１〜６から選択されるＨＶＲ−Ｈ１配列；配列番号２２〜２５から選択されるＨＶＲ−Ｈ２配列；配列番号５０及び５１から選択されるＨＶＲ−Ｈ３配列；配列番号６２及び６３から選択されるＨＶＲ−Ｌ１配列；配列番号６９及び７０から選択されるＨＶＲ−Ｌ２配列；配列番号７５〜７８及び９８から選択されるＨＶＲ−Ｌ３配列を含む。いくつかの実施形態では、抗ＢＡＣＥ１抗体が提供され、当該抗体は、配列番号７〜２１、２１８及び２２２〜２２４から選択されるＨＶＲ−Ｈ１配列；配列番号２６〜４９、２３２、２１９及び２２５から選択されるＨＶＲ−Ｈ２配列；配列番号５２〜６１、２２０、２２１、２２６及び２２７から選択されるＨＶＲ−Ｈ３配列；配列番号６４〜６８から選択されるＨＶＲ−Ｌ１配列；配列番号６９〜７４及び２１７から選択されるＨＶＲ−Ｌ２配列；配列番号７９〜９７から選択されるＨＶＲ−Ｌ３配列を含む。いくつかの実施形態では、抗ＢＡＣＥ１抗体が提供され、当該抗体は、配列番号１５、２１８及び２２２〜２２４から選択されるＨＶＲ−Ｈ１配列；配列番号２９、２１９及び２５５から選択されるＨＶＲ−Ｈ２配列；配列番号５２、２２０、２２１、２２６及び２２７から選択されるＨＶＲ−Ｈ３配列；配列番号６５のＨＶＲ−Ｌ１配列；配列番号７１、７３及び２１７から選択されるＨＶＲ−Ｌ２配列；ならびに、配列番号８０のＨＶＲ−Ｌ３配列を含む。いくつかの実施形態では、抗ＢＡＣＥ１抗体が提供され、当該抗体は、配列番号１５のＨＶＲ−Ｈ１配列；配列番号２９のＨＶＲ−Ｈ２配列；配列番号５２のＨＶＲ−Ｈ３配列；配列番号６５のＨＶＲ−Ｌ１配列；配列番号７１のＨＶＲ−Ｌ２配列；配列番号８０のＨＶＲ−Ｌ３配列を含む。いくつかの実施形態では、抗ＢＡＣＥ１抗体が提供され、当該抗体は、抗体６２６６変異体１〜１５から選択される抗体のＨＶＲ−Ｈ１、ＨＶＲ−Ｈ２、ＨＶＲ−Ｈ３、ＨＶＲ−Ｌ１、ＨＶＲ−Ｌ２及びＨＶＲ−Ｌ３を含む。
いくつかの態様では、本発明は、表１に列挙される抗ＢＡＣＥ１抗体から選択される抗体から選択される少なくとも１つ、少なくとも２つまたは、３つすべてのＶＨ ＨＶＲ配列を含む抗体を提供する。いくつかの実施形態では、本発明は、表１に列挙される抗ＢＡＣＥ１抗体から選択される抗体のＨＶＲ−Ｈ１、ＨＶＲ−Ｈ２及びＨＶＲ−Ｈ３を含む抗体を提供する。いくつかの実施形態では、抗ＢＡＣＥ１抗体が提供され、当該抗体は、配列番号１〜６から選択されるＨＶＲ−Ｈ１配列；配列番号２２〜２５から選択されるＨＶＲ−Ｈ２配列；ならびに、配列番号５０及び５１から選択されるＨＶＲ−Ｈ３配列を含む。いくつかの実施形態では、抗ＢＡＣＥ１抗体が提供され、当該抗体は、配列番号７〜２１、２１８及び２２２〜２２４から選択されるＨＶＲ−Ｈ１配列；配列番号２６〜４９、２３２、２１９及び２２５から選択されるＨＶＲ−Ｈ２配列；ならびに、配列番号５２〜６１、２２０、２２１、２２６及び２２７から選択されるＨＶＲ−Ｈ３配列を含む。いくつかの実施形態では、抗ＢＡＣＥ１抗体が提供され、当該抗体は、配列番号１５、２１８及び２２２〜２２４から選択されるＨＶＲ−Ｈ１配列；配列番号２９、２１９及び２５５から選択されるＨＶＲ−Ｈ２配列；ならびに、配列番号５２、２２０、２２１、２２６及び２２７から選択されるＨＶＲ−Ｈ３配列を含む。いくつかの実施形態では、抗ＢＡＣＥ１抗体が提供され、当該抗体は、配列番号１５のＨＶＲ−Ｈ１配列；配列番号２９のＨＶＲ−Ｈ２配列；配列番号５２のＨＶＲ−Ｈ３配列を含む。いくつかの実施形態では、抗ＢＡＣＥ１抗体が提供され、当該抗体は、抗体６２６６変異体１〜１５から選択される抗体のＨＶＲ−Ｈ１、ＨＶＲ−Ｈ２及びＨＶＲ−Ｈ３を含む。
いくつかの態様では、本発明は、表１に列挙される抗ＢＡＣＥ１抗体から選択される抗体から選択される少なくとも１つ、少なくとも２つまた３つ全てのＶＬ ＨＶＲ配列を含む抗体を提供する。いくつかの実施形態では、本発明は、表１に列挙される抗ＢＡＣＥ１抗体から選択される抗体のＨＶＲ−Ｌ１、ＨＶＲ−Ｌ２及びＨＶＲ−Ｌ３を含む抗体を提供する。いくつかの実施形態では、抗ＢＡＣＥ１抗体が提供され、当該抗体は、配列番号６２及び６３から選択されるＨＶＲ−Ｌ１配列；配列番号６９及び７０から選択されるＨＶＲ−Ｌ２配列；配列番号７５〜７８及び９８から選択されるＨＶＲ−Ｌ３配列を含む。いくつかの実施形態では、抗ＢＡＣＥ１抗体が提供され、当該抗体は、配列番号６４〜６８から選択されるＨＶＲ−Ｌ１配列；配列番号６９〜７４及び２１７から選択されるＨＶＲ−Ｌ２配列；配列番号７９〜９７から選択されるＨＶＲ−Ｌ３配列を含む。いくつかの実施形態では、抗ＢＡＣＥ１抗体が提供され、当該抗体は、配列番号６５のＨＶＲ−Ｌ１配列；配列番号７１、７３または２１７のＨＶＲ−Ｌ２配列；配列番号８０のＨＶＲ−Ｌ３配列を含む。いくつかの実施形態では、抗ＢＡＣＥ１抗体が提供され、当該抗体は、配列番号６５のＨＶＲ−Ｌ１配列；配列番号７１のＨＶＲ−Ｌ２配列；配列番号８０のＨＶＲ−Ｌ３配列を含む。いくつかの実施形態では、抗ＢＡＣＥ１抗体が提供され、当該抗体は、抗体６２６６変異体１〜１５から選択される抗体のＨＶＲ−Ｌ１、ＨＶＲ−Ｌ２及びＨＶＲ−Ｌ３を含む。
別の態様では、表１に列挙される抗ＢＡＣＥ１抗体から選択される抗体の少なくとも１つ、少なくとも２つまたは３つ全てのＶＨ ＨＶＲ配列を含むＶＨドメインを含む重鎖が提供される。いくつかの実施形態では、表１に列挙される抗ＢＡＣＥ１抗体から選択される抗体の３つ全てのＶＨ ＨＶＲ配列を含むＶＨドメインを含む重鎖が提供される。別の態様では、配列番号１〜６から選択されるＨＶＲ−Ｈ１配列；配列番号２２〜２５から選択されるＨＶＲ−Ｈ２配列；ならびに、配列番号５０及び５１から選択されるＨＶＲ−Ｈ３配列を含むＶＨドメインを含む重鎖が提供される。別の態様では、配列番号７〜２１、２１８及び２２２〜２２４から選択されるＨＶＲ−Ｈ１配列；配列番号２６〜４９、２３２、２１９及び２２５から選択されるＨＶＲ−Ｈ２配列；ならびに、配列番号５２〜６１、２２０、２２１、２２６及び２２７から選択されるＨＶＲ−Ｈ３配列を含むＶＨドメインを含む重鎖が提供される。いくつかの実施形態では、配列番号１５、２１８及び２２２〜２２４から選択されるＨＶＲ−Ｈ１配列；配列番号２９、２１９及び２５５から選択されるＨＶＲ−Ｈ２配列；ならびに、配列番号５２、２２０、２２１、２２６及び２２７から選択されるＨＶＲ−Ｈ３配列を含むＶＨドメインを含む重鎖が提供される。いくつかの実施形態では、配列番号１５のＨＶＲ−Ｈ１配列；配列番号２９のＨＶＲ−Ｈ２配列；配列番号５２のＨＶＲ−Ｈ３配列を含むＶＨドメインを含む重鎖が提供される。いくつかの実施形態では、抗体６２６６変異体１〜１５から選択される抗体のＨＶＲ−Ｈ１、ＨＶＲ−Ｈ２及びＨＶＲ−Ｈ３を含むＶＨドメインを含む重鎖が提供される。
別の態様では、表１に列挙される抗ＢＡＣＥ１抗体から選択される抗体の少なくとも１つ、少なくとも２つまたは３つ全てのＶＬ ＨＶＲ配列を含むＶＬドメインを含む軽鎖が提供される。いくつかの実施形態では、表１に列挙される抗ＢＡＣＥ１抗体から選択される抗体の３つ全てのＶＬ ＨＶＲ配列を含むＶＬドメインを含む軽鎖が提供される。別の態様では、配列番号６２及び６３から選択されるＨＶＲ−Ｌ１配列；配列番号６９及び７０から選択されるＨＶＲ−Ｌ２配列；ならびに、配列番号７５〜７８及び９８から選択されるＨＶＲ−Ｌ３配列を含むＶＬドメインを含む軽鎖が提供される。別の態様では、配列番号６４〜６８から選択されるＨＶＲ−Ｌ１配列；配列番号６９〜７４及び２１７から選択されるＨＶＲ−Ｌ２配列；ならびに、配列番号７９〜９７から選択されるＨＶＲ−Ｌ３配列を含むＶＬドメインを含む軽鎖が提供される。いくつかの実施形態では、配列番号６５のＨＶＲ−Ｌ１配列；配列番号７１、７３または２１７のＨＶＲ−Ｌ２配列；配列番号８０のＨＶＲ−Ｌ３配列を含むＶＬドメインを含む軽鎖が提供される。いくつかの実施形態では、配列番号６５のＨＶＲ−Ｌ１配列；配列番号７１のＨＶＲ−Ｌ２配列；配列番号８０のＨＶＲ−Ｌ３配列を含むＶＬドメインを含む軽鎖が提供される。いくつかの実施形態では、抗体６２６６変異体１〜１５から選択される抗体のＨＶＲ−Ｌ１、ＨＶＲ−Ｌ２及びＨＶＲ−Ｌ３を含むＶＬドメインを含む軽鎖が提供される。
別の態様では、抗ＢＡＣＥ１抗体は、表１の抗ＢＡＣＥ１抗体のＶＨに対して少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％の配列同一性を有する重鎖可変ドメイン（ＶＨ）配列を含む。いくつかの実施形態では、抗ＢＡＣＥ１抗体は、配列番号９９〜１４７、１９４〜２００及び２０９〜２１６から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％の配列同一性を有する重鎖可変ドメイン（ＶＨ）配列を含む。いくつかの実施形態では、抗ＢＡＣＥ１抗体は、配列番号１３８、１９４〜２００及び２０９〜２１６から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％の配列同一性を有する重鎖可変ドメイン（ＶＨ）配列を含む。いくつかの実施形態では、抗ＢＡＣＥ１抗体は、配列番号１３８のアミノ酸配列に対して少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％の配列同一性を有する重鎖可変ドメイン（ＶＨ）配列を含む。特定の実施形態では、少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％または９９％の同一性を有するＶＨ配列は、参照配列に対して置換（例えば、保存的な置換）、挿入または欠失を含有するが、その配列を含む抗ＢＡＣＥ１抗体は、ＢＡＣＥ１に結合するかつ／またはＢＡＣＥ１活性を阻害もしくは低下する能力を保持する。特定の実施形態では、総計１〜１０個のアミノ酸が、配列番号９９〜１４７のいずれか１つで置換、挿入かつ／または欠失されている。ある特定の実施形態において、置換、挿入、または欠失は、ＨＶＲの外側の領域で（すなわち、ＦＲにおいて）生じる。任意に、抗ＢＡＣＥ１抗体は、配列番号９９〜１４７、１９４〜２００及び２０９〜２１６のうちのいずれかのＶＨ配列（その配列の翻訳後修飾も含む）を含む。特定の実施形態では、ＶＨは、表１に列挙される抗ＢＡＣＥ１抗体の１、２または３つのＨＶＲを含む。いくつかの実施形態では、ＶＨは、配列番号１〜６から選択されるＨＶＲ−Ｈ１配列；配列番号２２〜２５から選択されるＨＶＲ−Ｈ２配列；ならびに、配列番号５０及び５１から選択されるＨＶＲ−Ｈ３配列を含む。いくつかの実施形態では、ＶＨは、配列番号７〜２１、２１８及び２２２〜２２４から選択されるＨＶＲ−Ｈ１配列；配列番号２６〜４９、２３２、２１９及び２２５から選択されるＨＶＲ−Ｈ２配列；ならびに、配列番号５２〜６１、２２０、２２１、２２６及び２２７から選択されるＨＶＲ−Ｈ３配列を含む。いくつかの実施形態では、ＶＨは、配列番号１５、２１８及び２２２〜２２４から選択されるＨＶＲ−Ｈ１配列；配列番号２９、２１９及び２５５から選択されるＨＶＲ−Ｈ２配列；ならびに、配列番号５２、２２０、２２１、２２６及び２２７から選択されるＨＶＲ−Ｈ３配列を含む。いくつかの実施形態では、ＶＨは、配列番号１５のＨＶＲ−Ｈ１配列；配列番号２９のＨＶＲ−Ｈ２配列；配列番号５２のＨＶＲ−Ｈ３配列を含む。いくつかの実施形態では、ＶＨは、抗体６２６６変異体１〜１５から選択される抗体のＨＶＲ−Ｈ１、ＨＶＲ−Ｈ２及びＨＶＲ−Ｈ３を含む。
別の態様では、抗ＢＡＣＥ１抗体は、表１の抗ＢＡＣＥ１抗体のＶＬに対して、少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％の配列同一性を有する軽鎖可変ドメイン（ＶＬ）配列を含む。別の態様では、抗ＢＡＣＥ１抗体が提供され、当該抗体は、配列番号１４８〜１７８、１８７〜１９４及び２０１〜２０８から選択されるアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％の配列同一性を有する軽鎖可変ドメイン（ＶＬ）を含む。いくつかの実施形態では、抗ＢＡＣＥ１抗体が提供され、当該抗体は、配列番号１５６のアミノ酸配列に対して少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％の配列同一性を有する軽鎖可変ドメイン（ＶＬ）を含む。特定の実施形態では、少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％または９９％の同一性を有するＶＬ配列は、参照配列に対して置換（例えば、保存的な置換）、挿入または欠失を含有するが、その配列含む抗ＢＡＣＥ１抗体は、ＢＡＣＥ１に結合するかつ／またはＢＡＣＥ１活性を阻害または低下する能力を保持する。特定の実施形態では、総計１〜１０個のアミノ酸が、配列番号１４８〜１７８、１８７〜１９４及び２０１〜２０８のいずれか１つで置換、挿入かつ／または欠失されている。ある特定の実施形態において、置換、挿入、または欠失は、ＨＶＲの外側の領域で（すなわち、ＦＲにおいて）生じる。任意に、抗ＢＡＣＥ１抗体は、配列番号１４８〜１７８、１８７〜１９４及び２０１〜２０８のうちのいずれか１つのＶＬ配列（その配列の翻訳後修飾も含む）を含む。特定の実施形態では、ＶＬは、表１に列挙される抗ＢＡＣＥ１抗体の１、２または３つのＨＶＲを含む。いくつかの実施形態では、ＶＬは、配列番号６２及び６３から選択されるＨＶＲ−Ｌ１配列；配列番号６９及び７０から選択されるＨＶＲ−Ｌ２配列；配列番号７５〜７８及び９８から選択されるＨＶＲ−Ｌ３配列を含む。いくつかの実施形態では、ＶＬは、配列番号６４〜６８から選択されるＨＶＲ−Ｌ１配列；配列番号６９〜７４及び２１７から選択されるＨＶＲ−Ｌ２配列；配列番号７９〜９７から選択されるＨＶＲ−Ｌ３配列を含む。いくつかの実施形態では、ＶＬは、配列番号６５から選択されるＨＶＲ−Ｌ１配列；配列番号７１、７３または２１７から選択されるＨＶＲ−Ｌ２配列；配列番号８０から選択されるＨＶＲ−Ｌ３配列を含む。いくつかの実施形態では、ＶＬは、配列番号６５から選択されるＨＶＲ−Ｌ１配列；配列番号７１から選択されるＨＶＲ−Ｌ２配列；配列番号８０から選択されるＨＶＲ−Ｌ３配列を含む。いくつかの実施形態では、ＶＬは、抗体６２６６変異体１〜１５から選択される抗体のＨＶＲ−Ｌ１、ＨＶＲ−Ｌ２及びＨＶＲ−Ｌ３を含む。
別の態様では、抗ＢＡＣＥ１抗体が提供され、当該抗体は、上記の実施形態のいずれかにあるようなＶＨ、及び上記の実施形態のいずれかにあるようなＶＬを含む。いくつかの実施形態では、抗ＢＡＣＥ１抗体が提供され、当該抗体は、配列番号９９〜１０６から選択されるＶＨ配列及び配列番号１４８〜１５２から選択されるＶＬ配列を含む。いくつかの実施形態では、抗ＢＡＣＥ１抗体が提供され、当該抗体は、配列番号１０７〜１４７、１９４〜２００及び２０９〜２１６から選択されるＶＨ配列及び配列番号１５３〜１７８、１８７〜１９４及び２０１〜２０８から選択されるＶＬ配列を含む。いくつかの実施形態では、抗ＢＡＣＥ１抗体が提供され、当該抗体は、表１に列挙される抗ＢＡＣＥ１抗体のＶＨ及びＶＬを含む。いくつかの実施形態では、抗体は、配列番号１３８、１９４〜２００及び２０９〜２１６から選択されるＶＨ配列及び配列番号１５６、１８７〜１９４及び２０１〜２０８から選択されるＶＬ配列（これら配列の翻訳後修飾も含む）を含む。いくつかの実施形態では、抗体は、それぞれ配列番号１３８及び配列番号１５６のＶＨ及びＶＬ配列（これら配列の翻訳後修飾も含む）を含む。いくつかの実施形態では、抗ＢＡＣＥ１抗体が提供され、当該抗体は、抗体６２６６変異体１〜１５から選択される抗体のＶＨ及びＶＬを含む。
さらなる態様では、本発明は、表１に列挙する抗ＢＡＣＥ１抗体といった本明細書で提供する抗ＢＡＣＥ１抗体と同じエピトープに結合する抗体を提供する。例えば、特定の実施形態では、配列番号９９〜１０６から選択されるＶＨ配列及び配列番号１４８〜１５２から選択されるＶＬ配列を含む抗ＢＡＣＥ１抗体と同じエピトープに結合する抗体が提供される。特定の実施形態では、配列番号１０７〜１４７、１９４〜２００及び２０９〜２１６から選択されるＶＨ配列及び配列番号１５３〜１７８、１８７〜１９４及び２０１〜２０８から選択されるＶＬ配列を含む抗ＢＡＣＥ１抗体と同一のエピトープに結合する抗体が提供される。特定の実施形態では、それぞれ配列番号１３８及び配列番号１５６のＶＨ及びＶＬ配列を含む抗ＢＡＣＥ１抗体と同じエピトープに結合する抗体が提供される。
別の実施形態では、結合に関して競合する（例えば、同一のエピトープに結合する）抗体が本明細書で説明する任意の抗ＢＡＣＥ１抗体として提供される。
本発明のさらなる態様において、上の実施形態のいずれかによる抗ＢＡＣＥ１抗体は、キメラまたはヒト抗体を含むモノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、抗ＢＡＣＥ１抗体は、抗体断片、例えば、Ｆｖ、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、ｓｃＦｖ、ダイアボディ、またはＦ（ａｂ’）２断片である。別の実施形態において、本抗体は、完全長の抗体、例えば、本明細書に定義されるインタクトなＩｇＧ１抗体または他の抗体クラスもしくはアイソタイプである。
さらなる態様において、上の実施形態のいずれかによる抗ＢＡＣＥ１抗体は、下の第１〜７節に記載される特長のうちのいずれをも、単独でまたは組み合わせて組み込んでもよい。
１．抗体親和性
特定の実施形態では、本明細書で提供される抗体は、≦１μＭ、≦１００ｎＭ、≦１０ｎＭ、≦１ｎＭ、≦０．１ｎＭ、≦０．０１ｎＭまたは≦０．００１ｎＭ（例えば１０−８Ｍ以下、例えば１０−８Ｍ〜１０−１３Ｍ、例えば、１０−９Ｍ〜１０−１３Ｍ）の解離定数（Ｋｄ）を有する。
いくつかの実施形態では、Ｋｄは、目的の抗体のＦａｂバージョン及びその抗原と共に行われる放射標識抗原結合アッセイ（ＲＩＡ）によって、次のアッセイによって記載されるように測定される。抗原に対するＦａｂの溶液結合親和性は、標識化されていない抗原の滴定シリーズの存在下で、（１２５Ｉ）標識化抗原の最小濃度でＦａｂを平衡化することにより測定され、次いで、抗Ｆａｂ抗体コート板で結合した抗原を捕捉する（例えば、Ｃｈｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２９３：８６５−８８１（１９９９）を参照）。アッセイのための条件を確立するために、ＭＩＣＲＯＴＩＴＥＲ（登録商標）マルチウェルプレート（Ｔｈｅｒｍｏ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ）を、５０ｍＭの炭酸ナトリウム（ｐＨ９．６）中５μｇ／ｍｌの捕捉抗Ｆａｂ抗体（Ｃａｐｐｅｌ Ｌａｂｓ）で一晩コーティングし、その後、ＰＢＳ中２％（ｗ／ｖ）ウシ血清アルブミンにより、室温（およそ２３℃）で２〜５時間ブロッキングする。非吸着性の板（Ｎｕｎｃ＃２６９６２０）において、１００ｐＭまたは２６ｐＭ［１２５Ｉ］抗原は、目的のＦａｂの連続希釈液と混合される（例えば、Ｐｒｅｓｔａ ｅｔ ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ．５７：４５９３−４５９９（１９９７）における抗ＶＥＧＦ抗体、Ｆａｂ−１２の評価と一致）。目的のＦａｂを次いで一晩インキュベートするが、インキュベーションは、平衡に到達することを確実にするために、より長い期間（例えば、約６５時間）継続してもよい。その後、混合物を、室温での（例えば、１時間にわたる）インキュベーションのために、捕捉プレートに移す。次いで溶液を除去し、プレートを、０．１％ポリソルベート２０（ＴＷＥＥＮ−２０（登録商標））含有ＰＢＳで８回洗浄する。プレートが乾燥したとき、１５０μｌ／ウェルのシンチラント（ｓｃｉｎｔｉｌｌａｎｔ）（ＭＩＣＲＯＳＣＩＮＴ−２０（商標）；Ｐａｃｋａｒｄ）を添加し、プレートをＴＯＰＣＯＵＮＴ（商標）γ計数器（Ｐａｃｋａｒｄ）により１０分間計数する。最大結合の２０％以下をもたらす各Ｆａｂの濃度を、競合結合アッセイにおいて使用するために選定する。
別の実施形態によれば、Ｋｄは、ＢＩＡＣＯＲＥ（登録商標）−２０００またはＢＩＡＣＯＲＥ（登録商標）−３０００（ＢＩＡｃｏｒｅ，Ｉｎｃ．，Ｐｉｓｃａｔａｗａｙ，ＮＪ）を使用した表面プラスモン共鳴アッセイを使用して、２５℃で、約１０応答単位（ＲＵ）で固定化された抗原ＣＭ５チップを用いて測定される。簡潔に述べると、カルボキシメチル化デキストランバイオセンサチップ（ＣＭ５、ＢＩＡＣＯＲＥ，Ｉｎｃ．）を、Ｎ−エチル−Ｎ’−（３−ジメチルアミノプロピル）−カルボジイミド塩酸塩（ＥＤＣ）及びＮ−ヒドロキシコハク酸イミド（ＮＨＳ）により、供給業者の指示に従って活性化する。抗原を１０ｍＭの酢酸ナトリウム（ｐＨ４．８）で５μｇ／ｍｌ（約０．２μＭ）まで希釈した後、５μｌ／分の流速で注射して、カップリングされたタンパク質のおよそ１０応答単位（ＲＵ）を達成する。抗原の注射後、１Ｍのエタノールアミンを注射して、未反応の基をブロッキングする。動態測定のために、Ｆａｂの２倍段階希釈液（０．７８ｎＭ〜５００ｎＭ）を、０．０５％ポリソルベート２０（ＴＷＥＥＮ−２０（商標））界面活性剤を含むＰＢＳ（ＰＢＳＴ）中に、２５℃で、およそ２５μｌ／分の流速で注入する。会合速度（ｋオン）及び解離速度（ｋオフ）は、会合及び解離のセンサーグラムを同時に適合させることにより、単純一対一ラングミュア結合モデル（ＢＩＡＣＯＲＥ（登録商標）評価ソフトウェアバージョン３．２）を使用して計算される。平衡状態解離定数（Ｋｄ）は、ｋオフ／ｋオン比として算出される。例えば、Ｃｈｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２９３：８６５−８８１（１９９９）を参照。オン速度が、上の表面プラスモン共鳴アッセイによって、１０６Ｍ−１ ｓ−１を超える場合、オン速度は、撹拌されたキュベットを備えるストップトフロー装着分光光度計（Ａｖｉｖ Ｉｎｓｔｒｕｍｅｎｔｓ）または８０００−シリーズＳＬＭ−ＡＭＩＮＣＯ（商標）分光光度計（ＴｈｅｒｍｏＳｐｅｃｔｒｏｎｉｃ）等の分光計において測定される、漸増濃度の抗原の存在下で、２５℃で、ＰＢＳ（ｐＨ７．２）中２０ｎＭ抗−抗原抗体（Ｆａｂ型）の蛍光発光強度（励起＝２９５ｎｍ、発光＝３４０ｎｍ、１６ｎｍ帯域通過）の増加または減少を測定する、蛍光消光技法を使用することによって、決定することができる。
２．抗体断片
ある特定の実施形態において、本明細書に提供される抗体は、抗体断片である。抗体断片には、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆａｂ’−ＳＨ、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆｖ、及びｓｃＦｖ断片、ならびに下に記載される他の断片が含まれるが、これらに限定されない。特定の抗体断片の概要に関しては、Ｈｕｄｓｏｎ ｅｔ ａｌ．Ｎａｔ．Ｍｅｄ．９：１２９−１３４ （２００３）を参照されたい。ｓｃＦｖ断片の概要に関しては、Ｐｌｕｃｋｔｈｕｎ，ｉｎ Ｔｈｅ Ｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｙ ｏｆ Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ，ｖｏｌ．１１３，Ｒｏｓｅｎｂｕｒｇ ａｎｄ Ｍｏｏｒｅ ｅｄｓ．，（Ｓｐｒｉｎｇｅｒ−Ｖｅｒｌａｇ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ），ｐｐ．２６９−３１５（１９９４）；ならびにＷＯ９３／１６１８５；ならびに米国特許第５，５７１，８９４号及び同第５，５８７，４５８号を参照されたい。エピトープ残基に結合し、インビボでの半減期が増大したサルベージレセプターを含むＦａｂ及びＦ（ａｂ’）２断片の考察に関しては、米国特許第５，８６９，０４６号を参照されたい。
ダイアボディは、二価性または二重特異性であり得る２つの抗原結合部位を有する抗体断片である。例えば、ＥＰ４０４，０９７；ＷＯ１９９３／０１１６１；Ｈｕｄｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔ．Ｍｅｄ．９：１２９−１３４（２００３）；及びＨｏｌｌｉｎｇｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９０：６４４４−６４４８（１９９３）を参照されたい。三重特異性抗体及び四重特異性抗体もＨｕｄｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔ．Ｍｅｄ．９：１２９−１３４（２００３）で説明されている。
単一ドメイン抗体は、抗体の重鎖可変ドメインのすべてもしくは一部分または軽鎖可変ドメインのすべてもしくは一部分を含む抗体断片である。特定の実施形態では、単一ドメイン抗体は、ヒト単一ドメイン抗体である（Ｄｏｍａｎｔｉｓ，Ｉｎｃ．，Ｗａｌｔｈａｍ，ＭＡ；例えば米国特許第６，２４８，５１６ Ｂ１号を参照されたい）。
抗体断片は、本明細書に記載される、インタクトな抗体のタンパク質分解消化、ならびに組み換え宿主細胞（例えば、大腸菌またはファージ）による産生を含むが、これらに限定されない、種々の技法によって産生することができる。
３．キメラ及びヒト化抗体
ある特定の実施形態において、本明細書に提供される抗体は、キメラ抗体である。特定のキメラ抗体は、例えば、米国特許第４，８１６，５６７号；及びＭｏｒｒｉｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，８１：６８５１−６８５５（１９８４））で説明されている。一例において、キメラ抗体は、非ヒト可変領域（例えば、マウス、ラット、ハムスター、ウサギ、またはサル等の非ヒト霊長類に由来する可変領域）及びヒト定常領域を含む。さらなる実施例において、キメラ抗体は、クラスまたはサブクラスが親抗体のそれから変更された、「クラススイッチされた」抗体である。キメラ抗体には、それらの抗原結合断片が含まれる。
ある特定の実施形態において、キメラ抗体は、ヒト化抗体である。典型的に、非ヒト抗体は、親の非ヒト抗体の特異性及び親和性を保持しながら、ヒトに対する免疫原性を低減するためにヒト化される。一般に、ヒト化抗体は、ＨＶＲ、例えば、ＣＤＲ（またはそれらの部分）が非ヒト抗体に由来し、ＦＲ（またはそれらの部分）がヒト抗体配列に由来する、１つ以上の可変ドメインを含む。任意にヒト化抗体はまた、ヒト定常領域の少なくとも一部分も含む。いくつかの実施形態において、ヒト化抗体におけるいくつかのＦＲ残基は、例えば、抗体特異性または親和性を復元するまたは改善するために、非ヒト抗体（例えば、ＨＶＲ残基が由来する抗体）由来の対応する残基で置換される。
ヒト化抗体及びヒト化抗体を産生する方法は、例えば、Ａｌｍａｇｒｏ ａｎｄ Ｆｒａｎｓｓｏｎ，Ｆｒｏｎｔ．Ｂｉｏｓｃｉ．１３：１６１９−１６３３（２００８）で説明されており、さらに、たとえばＲｉｅｃｈｍａｎｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ ３３２：３２３−３２９（１９８８）；Ｑｕｅｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８６：１００２９−１００３３（１９８９）；米国特許第５，８２１，３３７号、同第７，５２７，７９１号、同第６，９８２，３２１号及び同第７，０８７，４０９号；Ｋａｓｈｍｉｒｉ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ ３６：２５−３４（２００５）（ＳＤＲ（ａ−ＣＤＲ）グラフティングを説明）；Ｐａｄｌａｎ，Ｍｏｌ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２８：４８９−４９８（１９９１）（「再表面化」を説明）；Ｄａｌｌ’Ａｃｑｕａ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ ３６：４３−６０（２００５）（「ＦＲシャッフリング」を説明）；ならびに、Ｏｓｂｏｕｒｎ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ ３６：６１−６８（２００５）及びＫｌｉｍｋａ ｅｔ ａｌ．，Ｂｒ．Ｊ．Ｃａｎｃｅｒ，８３：２５２−２６０（２０００）（ＦＲシャフリングに対する「先導された選択」アプローチを説明）で説明されている。
ヒト化に用いられ得るヒトフレームワーク領域としては、限定はされないが：「最良適合」法を用いて選択されたフレームワーク領域（例えば、Ｓｉｍｓ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１５１：２２９６（１９９３）を参照）；軽鎖または重鎖可変領域の特定の下位群のヒト抗体のコンセンサス配列由来のフレームワーク領域（例えば、Ｃａｒｔｅｒ ｅｔ ａｌ．Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ、８９：４２８５（１９９２）；及びＰｒｅｓｔａ ｅｔ ａｌ． Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１５１：２６２３（１９９３）を参照）；ヒトの成熟（体細胞変異）フレームワーク領域またはヒト生殖細胞系列フレームワーク領域（例えば、Ａｌｍａｇｒｏ ａｎｄ Ｆｒａｎｓｓｏｎ，Ｆｒｏｎｔ．Ｂｉｏｓｃｉ．１３：１６１９−１６３３（２００８）を参照）；及びＦＲライブラリのスクリーニングによるフレームワーク領域（例えば、Ｂａｃａ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７２：１０６７８−１０６８４（１９９７）及びＲｏｓｏｋ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７１：２２６１１−２２６１８（１９９６）を参照）が挙げられる。
４．ヒト抗体
ある特定の実施形態において、本明細書に提供される抗体は、ヒト抗体である。ヒト抗体は、当該技術分野において既知の種々の技法を使用して生成され得る。ヒト抗体は、ｖａｎ Ｄｉｊｋ ａｎｄ ｖａｎ ｄｅ Ｗｉｎｋｅｌ，Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．５：３６８−７４（２００１）及びＬｏｎｂｅｒｇ，Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２０：４５０−４５９（２００８）で概して説明される。
ヒト抗体は、免疫原を、抗原投与に応答してインタクトなヒト抗体またはヒト可変領域を含むインタクトな抗体を産生するように修飾されたトランスジェニック動物に投与することによって調製されてもよい。かかる動物は典型的に、内因性免役グロブリン遺伝子座を置き換える、または染色体外に存在するか、もしくは動物の染色体中に無作為に組み込まれる、ヒト免役グロブリン遺伝子座のすべてまたは一部分を含有する。かかるトランスジェニックマウスにおいて、内因性免役グロブリン遺伝子座は一般に、不活性化されている。トランスジェニック動物からヒト抗体を得る方法の概要は、Ｌｏｎｂｅｒｇ，Ｎａｔ．Ｂｉｏｔｅｃｈ．２３：１１１７−１１２５（２００５）を参照されたい。また、例えば、ＸＥＮＯＭＯＵＳＥ（商標）技術を説明する米国特許第６，０７５，１８１号及び同第６，１５０，５８４号；ＨＵＭＡＢ（登録商標）技術を説明する米国特許第５，７７０，４２９号；Ｋ−Ｍ ＭＯＵＳＥ（登録商標）技術を説明する米国特許第７，０４１，８７０号並びにＶＥＬＯＣＩＭＯＵＳＥ（登録商標）技術を説明する米国特許出願公開第２００７／００６１９００号を参照されたい。かかる動物によって生成されるインタクトな抗体由来のヒト可変領域は、例えば、異なるヒト定常領域と組み合わせることによって、さらに修飾されてもよい。
ヒト抗体はまた、ハイブリドーマベースの方法によって産生することもできる。ヒトモノクローナル抗体の産生のためのヒト骨髄腫細胞株及びマウス−ヒトヘテロ骨髄腫細胞株が記載されている。（例えば、Ｋｏｚｂｏｒ Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１３３：３００１（１９８４）；Ｂｒｏｄｅｕｒ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｙ Ｐｒｏｄｕｃｔｉｏｎ Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ ａｎｄ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ，ｐｐ．５１−６３（Ｍａｒｃｅｌ Ｄｅｋｋｅｒ，Ｉｎｃ．，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，１９８７）；及びＢｏｅｒｎｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１４７：８６（１９９１）を参照）ヒトＢ細胞ハイブリドーマ技術によって産生されたヒト抗体は、Ｌｉ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，１０３：３５５７−３５６２（２００６）でも説明されている。追加の方法には、例えば、米国特許第７，１８９，８２６号（ハイブリドーマ細胞株由来のモノクローナルヒトＩｇＭ抗体の産生を記載する）、及びＮｉ，Ｘｉａｎｄａｉ Ｍｉａｎｙｉｘｕｅ，２６（４）：２６５−２６８（２００６）（ヒト−ヒトハイブリドーマを記載する）に記載されるものが含まれる。ヒトハイブリドーマ技術（トリオーマ技術）はまた、Ｖｏｌｌｍｅｒｓ ａｎｄ Ｂｒａｎｄｌｅｉｎ，Ｈｉｓｔｏｌｏｇｙ ａｎｄ Ｈｉｓｔｏｐａｔｈｏｌｏｇｙ，２０（３）：９２７−９３７（２００５）及びＶｏｌｌｍｅｒｓ ａｎｄ Ｂｒａｎｄｌｅｉｎ，Ｍｅｔｈｏｄｓ ａｎｄ Ｆｉｎｄｉｎｇｓ ｉｎ Ｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔａｌ ａｎｄ Ｃｌｉｎｉｃａｌ Ｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｙ，２７（３）：１８５−９１（２００５）にも記載される。
ヒト抗体はまた、ヒト由来ファージディスプレイライブラリから選択されたＦｖクローン可変ドメイン配列を単離することによって、生成されてもよい。かかる可変ドメイン配列は次いで、所望のヒト定常ドメインと組み合わされてもよい。抗体ライブラリからヒト抗体を選択するための技法が、下に記載される。
５．ライブラリ由来抗体
本発明の抗体は、コンビナトリアルライブラリを、所望の活性を有する抗体についてスクリーニングすることによって単離されてもよい。例えば、ファージディスプレイライブラリを生成し、かかるライブラリを所望の結合特性を保有する抗体についてスクリーニングするための、多様な方法が当該技術分野で知られている。かかる方法は、例えば、Ｈｏｏｇｅｎｂｏｏｍ ｅｔ ａｌ．ｉｎ Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ １７８：１−３７（Ｏ’Ｂｒｉｅｎ ｅｔ ａｌ．，ｅｄ．，Ｈｕｍａｎ Ｐｒｅｓｓ，Ｔｏｔｏｗａ，ＮＪ，２００１）で説明され、さらに、例えばＭｃＣａｆｆｅｒｔｙ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ ３４８：５５２−５５４；Ｃｌａｃｋｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ ３５２：６２４−６２８（１９９１）；Ｍａｒｋｓ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２２２：５８１−５９７（１９９２）；Ｍａｒｋｓ ａｎｄ Ｂｒａｄｂｕｒｙ，ｉｎ Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ ２４８：１６１−１７５（Ｌｏ，ｅｄ．，Ｈｕｍａｎ Ｐｒｅｓｓ，Ｔｏｔｏｗａ，ＮＪ，２００３）；Ｓｉｄｈｕ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．３３８（２）：２９９−３１０（２００４）；Ｌｅｅ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．３４０（５）：１０７３−１０９３（２００４）；Ｆｅｌｌｏｕｓｅ，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ １０１（３４）：１２４６７−１２４７２（２００４）；及びＬｅｅ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ ２８４（１−２）：１１９−１３２（２００４）で説明されている。
ある特定のファージディスプレイ法において、ＶＨ及びＶＬ遺伝子のレパートリーが、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）によって別個にクローニングされ、ファージライブラリ中で無作為に組み換えられ、次いで、それを、抗原結合ファージに対してＷｉｎｔｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ａｎｎ．Ｒｅｖ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１２：４３３−４５５（１９９４）で説明される通りにスクリーニングしてもよい。ファージは典型的に、１本鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）断片としてまたはＦａｂ断片としてのいずれかで抗体断片を提示する。免疫された源からのライブラリは、ハイブリドーマを構築する必要なしに、免疫原に対する高親和性抗体を提供する。代替的に、Ｇｒｉｆｆｉｔｈｓ ｅｔ ａｌ．，ＥＭＢＯ Ｊ，１２：７２５−７３４（１９９３）によって記載されるように、ナイーブレパートリーをクローニングして（例えば、ヒトから）、いかなる免疫化も伴わずに、広範な非自己抗原及びまた自己抗原に対する抗体の単一の源を提供することができる。最後に、ナイーブライブラリはまた、Ｈｏｏｇｅｎｂｏｏｍ ａｎｄ Ｗｉｎｔｅｒ，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．，２２７：３８１−３８８（１９９２）に記載されるように、幹細胞からの再配列されていないＶ遺伝子セグメントをクローニングし、無作為配列を含有するＰＣＲプライマーを使用して高度可変ＣＤＲ３領域をコードし、かつインビトロで再配列を達成することによって、合成的に産生することができる。ヒト抗体ファージライブラリを説明する特許文献としては、例えば：米国特許第５，７５０，３７３号及び米国特許公開第２００５／００７９５７４号、同第２００５／０１１９４５５号、同第２００５／０２６６０００号、同第２００７／０１１７１２６号、同第２００７／０１６０５９８号、同第２００７／０２３７７６４号、同第２００７／０２９２９３６号及び同第２００９／０００２３６０号が挙げられる。
ヒト抗体ライブラリから単離された抗体または抗体断片は、本明細書でヒト抗体またはヒト抗体断片と見なされる。
６．多重特異性抗体
特定の実施形態において、本明細書に提供される抗体は、多重特異性抗体、例えば、二重特異性抗体である。多重特異性抗体は、少なくとも２つの異なる部位に対する結合特異性を有するモノクローナル抗体である。特定の実施形態において、結合特異性のうちの一方は、ＢＡＣＥ１に対するものであり、他方は、任意の他の抗原に対するものである。特定の実施形態において、二重特異性抗体は、ＢＡＣＥ１の２つの異なるエピトープに結合し得る。また、二重特異性抗体を使用して、細胞傷害性薬剤を、ＢＡＣＥ１を発現する細胞に限局させてもよい。二重特異性抗体は、完全長抗体または抗体断片として調製することができる。
多重特異性抗体を産生するための技法には、異なる特異性を有する２つの免疫グロブリン重鎖−軽鎖対の組換え共発現（Ｍｉｌｓｔｅｉｎ ａｎｄ Ｃｕｅｌｌｏ，Ｎａｔｕｒｅ ３０５：５３７（１９８３））、ＷＯ９３／０８８２９及びＴｒａｕｎｅｃｋｅｒ ｅｔ ａｌ．，ＥＭＢＯ Ｊ．１０：３６５５（１９９１）参照）、ならびに、「ノブ・イン・ホール」操作（例えば、米国特許第５，７３１，１６８号参照）があるが、これらに限定されない。多重特異性抗体は、抗体Ｆｃ−ヘテロ二量体分子を産生するために静電的ステアリング効果を操作すること（ＷＯ２００９／０８９００４Ａ１）；２つ以上の抗体または断片を架橋させること（例えば、米国特許第４，６７６，９８０号及びＢｒｅｎｎａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２２９：８１（１９８５）を参照）；ロイシンジッパーを用いて二重特異性抗を産生すること（例えば、Ｋｏｓｔｅｌｎｙ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１４８（５）：１５４７−１５５３（１９９２）を参照）；「ダイアボディ」技術を二重特異性抗体断片を産生するために用いること（例えば、Ｈｏｌｌｉｎｇｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，９０：６４４４−６４４８（１９９３）を参照）；及び、単鎖Ｆｖ（ｓＦｖ）二量体を使用すること（例えば、Ｇｒｕｂｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１５２：５３６８（１９９４）を参照）；及び、例えば、Ｔｕｔｔ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１４７：６０（１９９１）で説明される通りに三重特異性抗体を調製することで産生され得る。
「オクトパス（Ｏｃｔｏｐｕｓ）抗体」を含む、３つ以上の機能的抗原結合部位を有する操作された抗体もまた、本明細書に含まれる（例えば、米国公開特許第２００６／００２５５７６Ａ１号を参照されたい）。
本明細書における抗体または断片にはまた、ＢＡＣＥ１及び別の異なる抗原に結合する抗原結合部位を含む、「二重作用（Ｄｕａｌ Ａｃｔｉｎｇ）ＦＡｂ」または「ＤＡＦ」が含まれる（例えば、ＵＳ２００８／００６９８２０を参照されたい）。
７．抗体変異形
特定の実施形態において、本明細書に提供される抗体のアミノ酸配列変異形が企図される。例えば、抗体の結合親和性及び／または他の生物学的特性を改善することが望ましい場合がある。抗体のアミノ酸配列変異形は、適切な修飾を、抗体をコードするヌクレオチド配列中に導入することによって、またはペプチド合成によって、調製されてもよい。かかる修飾には、例えば、抗体のアミノ酸配列からの残基の欠失、及び／またはそこへ残基の挿入、及び／またはその内部の残基の置換が含まれる。欠失、挿入、及び置換を任意に組み合わせて、最終構築物に到達することができるが、但し、その最終構築物が、所望の特性、例えば、抗原結合性を保有することを条件とする。
ａ）置換、挿入、及び欠失変異形
ある特定の実施形態において、１つ以上のアミノ酸置換を有する抗体変異形が提供される。置換型突然変異生成に対する目的の部位には、ＨＶＲ及びＦＲが含まれる。保存的な置換が、表２で、「保存的な置換」の見出しの下に提供される。より実質的な変化は、表２において、「例示的な置換」の見出しの下に提供され、またアミノ酸側鎖クラスを参照して以下でさらに説明される。アミノ酸置換が目的の抗体中に導入され、産物が、所望の活性、例えば、抗原結合の保持／改善、免疫原性の減少、またはＡＤＣＣもしくはＣＤＣの改善についてスクリーニングされてもよい。
表２
Figure 0006859259
アミノ酸は、次の一般的な側鎖特性に従って分類されてもよい：
（１）疎水性：ノルロイシン、Ｍｅｔ、Ａｌａ、Ｖａｌ、Ｌｅｕ、Ｉｌｅ、
（２）中性親水性：Ｃｙｓ、Ｓｅｒ、Ｔｈｒ、Ａｓｎ、Ｇｌｎ、
（３）酸性：Ａｓｐ、Ｇｌｕ；
（４）塩基性：Ｈｉｓ、Ｌｙｓ、Ａｒｇ；
（５）鎖配向に影響を及ぼす残基：Ｇｌｙ、Ｐｒｏ、
（６）芳香族：Ｔｒｐ、Ｔｙｒ、Ｐｈｅ。
非保存的置換は、これらのクラスのうちの１つのメンバーを別のクラスと交換することを伴うことにある。
置換型変異形の１つの種類は、親抗体（例えば、ヒト抗体）の１つ以上の超可変領域残基を置換することを伴う。一般に、さらなる研究のために選択される、結果として生じる変異形（複数可）は、親抗体と比べて、ある特定の生物学的特性における修飾（例えば、改善）（例えば、増加した親和性、低減された免疫原性）を有することになり、かつ／または、親抗体の実質的に保持されたある特定の生物学的特性を有することになる。例示的な置換型変異形は、例えば、本明細書に記載されるもの等のファージディスプレイベースの親和性成熟技法を使用して好都合に生成され得る親和性成熟抗体である。簡潔に述べると、１つ以上のＨＶＲ残基を突然変異させ、変異形抗体をファージ上で提示され、特定の生物活性（例えば、結合親和性）についてスクリーニングされる。
変化（例えば、置換）をＨＶＲにおいて行って、例えば、抗体親和性を改善してもよい。かかる改変は、ＨＶＲの「ホットスポット」、すなわち、体細胞成熟プロセスの際に高い頻度で成熟を経るコドンによりコードされた残基（例えば、Ｃｈｏｗｄｈｕｒｙ、Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２０７：１７９−１９６（２００８）を参照）及び／またはＳＤＲ（ａ−ＣＤＲ）でなされ得、結果として得た変異体ＶＨまたはＶＬの結合親和性を試験する。二次ライブラリを構築し、そこから再選択することによる親和性成熟は、例えば、Ｈｏｏｇｅｎｂｏｏｍ ｅｔ ａｌ．ｉｎ Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ １７８：１−３７（Ｏ’Ｂｒｉｅｎ ｅｔ ａｌ．，ｅｄ．，Ｈｕｍａｎ Ｐｒｅｓｓ，Ｔｏｔｏｗａ，ＮＪ，（２００１））に記載されている。親和性成熟のいくつかの実施形態において、多様性が、多様な方法（例えば、エラープローンＰＣＲ、鎖シャフリング、またはオリゴヌクレオチド指向性突然変異生成）のうちのいずれかによって、成熟のために選定された可変遺伝子中に導入される。次いで、二次ライブラリが作成される。次いで、ライブラリは、所望の親和性を有する任意の抗体変異形を特定するためにスクリーニングされる。多様性を導入するための別の方法は、数個のＨＶＲ残基（例えば、１回に４〜６個の残基）が無作為化されるＨＶＲ指向性アプローチを伴う。抗原結合に関与するＨＶＲ残基は、例えば、アラニンスキャニング突然変異生成またはモデリングを使用して、具体的に特定されてもよい。特にＣＤＲ−Ｈ３及びＣＤＲ−Ｌ３が、標的とされることが多い。
ある特定の実施形態において、置換、挿入、または欠失は、かかる変化が、抗原に結合する抗体の能力を実質的に低減しない限り、１つ以上のＨＶＲ内で生じてもよい。例えば、結合親和性を実質的に低減しない保存的変化（例えば、本明細書に提供される保存的置換）が、ＨＶＲにおいて行われてもよい。かかる変化は、ＨＶＲ「ホットスポット」またはＳＤＲの外側にあってもよい。上に提供される変異形ＶＨ及びＶＬ配列のある特定の実施形態において、各ＨＶＲは、変化させられないか、または１つ、２つ、もしくは３つ以下のアミノ酸置換を含有するにすぎないかのいずれかである。
突然変異生成のための標的とされ得る、抗体の残基または領域の特定のための有用な方法は、Ｃｕｎｎｉｎｇｈａｍ ａｎｄ Ｗｅｌｌｓ（１９８９）Ｓｃｉｅｎｃｅ，２４４：１０８１−１０８５によって説明される「アラニンスキャニング変異生成」と呼ばれるものである。この方法において、残基または標的残基の群（例えば、Ａｒｇ、Ａｓｐ、Ｈｉｓ、Ｌｙｓ、及びＧｌｕ等の荷電残基）は特定され、かつ中性または負に荷電されたアミノ酸（例えば、アラニンまたはポリアラニン）により交換されて、抗体と抗原との相互作用が影響を受けたかどうかを決定する。さらなる置換が、最初の置換に対する機能的感受性を示すアミノ酸の場所に導入されてもよい。代替的に、または追加的に、抗体と抗原との間の接触点を特定するための抗原−抗体複合体の結晶構造。かかる接触残基及び隣接する残基は、置換の候補として標的とされるか、または排除されてもよい。変異形をスクリーニングして、それらが所望の特性を含有するかどうかを決定してもよい。
アミノ酸配列挿入には、１個の残基〜１００個以上の残基を含有するポリペプチドの範囲の長さである、アミノ末端及び／またはカルボキシル末端融合、ならびに単一のまたは多数のアミノ酸残基の配列内（ｉｎｔｒａｓｅｑｕｅｎｃｅ）挿入が含まれる。末端挿入の例としては、Ｎ末端メチオニル残基を有する抗体が挙げられる。抗体分子の他の挿入型変異形には、抗体の血清半減期を増加させる酵素（例えば、ＡＤＥＰＴのための）またはポリペプチドに対する抗体のＮ末端もしくはＣ末端への融合が含まれる。
ｂ）グリコシル化変異体
ある特定の実施形態において、本明細書に提供される抗体は、抗体がグリコシル化される程度を増加または減少させるように変化する。抗体へのグリコシル化部位の付加または欠失は、１つ以上のグリコシル化部位が形成されるか、または除去されるように、アミノ酸配列を変化させることによって、好都合に遂行されてもよい。
抗体がＦｃ領域を含む場合、そこに結合した炭水化物が変化してもよい。哺乳類細胞によって産生される天然抗体は、典型的に、一般にＮ−結合によって、Ｆｃ領域のＣＨ２ドメインのＡｓｎ２９７に結合される、分岐した二分岐オリゴ糖を含む。例えば、Ｗｒｉｇｈｔ ｅｔ ａｌ．ＴＩＢＴＥＣＨ １５：２６−３２（１９９７）を参照。オリゴ糖類には、種々の炭水化物、例えば、マンノース、Ｎ−アセチルグルコサミン（ＧｌｃＮＡｃ）、ガラクトース、及びシアル酸、ならびに二分岐オリゴ糖類構造の「ステム」においてＧｌｃＮＡｃに結合したフコースが含まれる。いくつかの実施形態において、本発明の抗体におけるオリゴ糖の修飾は、ある特定の特性が改善された抗体変異形を形成するために行われてもよい。
いくつかの実施形態において、Ｆｃ領域に（直接的にまたは間接的に）結合されるフコースを欠いた炭水化物構造を有する、抗体変異形が提供される。例えば、かかる抗体におけるフコースの量は、１％〜８０％、１％〜６５％、５％〜６５％、または２０％〜４０％であってもよい。フコースの量は、例えば、ＷＯ２００８／０７７５４６に記載されるように、ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ質量分析法によって測定するとき、Ａｓｎ ２９７に結合したすべての糖鎖構造（例えば、複合体、ハイブリッド、及び高マンノース構造）の合計と比べた、Ａｓｎ２９７における糖鎖内のフコースの平均量を算出することによって決定される。Ａｓｎ２９７は、Ｆｃ領域における約２９７位（Ｆｃ領域残基のＥｕ付番）に位置するアスパラギン残基を指すが、Ａｓｎ２９７はまた、抗体における小規模な配列変異に起因して、２９７位から約±３アミノ酸上流または下流、すなわち、２９４位〜３００位の間にも位置する。かかるフコシル化変異形は、改善されたＡＤＣＣ機能を有し得る。例えば、米国特許公開第ＵＳ２００３／０１５７１０８号（Ｐｒｅｓｔａ、Ｌ．）；ＵＳ２００４／００９３６２１（Ｋｙｏｗａ Ｈａｋｋｏ Ｋｏｇｙｏ Ｃｏ．，Ｌｔｄ）を参照されたい。「脱フコシル化」または「フコース欠損」抗体変異形に関連する刊行物の例としては、ＵＳ２００３／０１５７１０８；ＷＯ２０００／６１７３９；ＷＯ２００１／２９２４６；ＵＳ２００３／０１１５６１４；ＵＳ２００２／０１６４３２８；ＵＳ２００４／００９３６２１；ＵＳ２００４／０１３２１４０；ＵＳ２００４／０１１０７０４；ＵＳ２００４／０１１０２８２；ＵＳ２００４／０１０９８６５；ＷＯ２００３／０８５１１９；ＷＯ２００３／０８４５７０；ＷＯ２００５／０３５５８６；ＷＯ２００５／０３５７７８；ＷＯ２００５／０５３７４２；ＷＯ２００２／０３１１４０；Ｏｋａｚａｋｉ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．３３６：１２３９−１２４９（２００４）；Ｙａｍａｎｅ−Ｏｈｎｕｋｉ ｅｔ ａｌ．Ｂｉｏｔｅｃｈ．Ｂｉｏｅｎｇ．８７：６１４（２００４）がある。脱フコシル化抗体を産生することができる細胞株の例には、タンパク質フコシル化が欠損したＬｅｃ１３ＣＨＯ細胞（Ｒｉｐｋａ ｅｔ ａｌ．Ａｒｃｈ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．２４９：５３３−５４５（１９８６）；米国特許出願第２００３／０１５７１０８Ａ１号、Ｐｒｅｓｔａ，Ｌ；及びＷＯ２００４／０５６３１２ Ａ１、Ａｄａｍｓ ｅｔ ａｌ．，特に実施例１１）、ならびに、ノックアウト細胞株、例えばアルファ−１，６−フコシルトランスフェラーゼ遺伝子、ＦＵＴ８、ノックアウトＣＨＯ細胞（例えばＹａｍａｎｅ−Ｏｈｎｕｋｉ ｅｔ ａｌ．Ｂｉｏｔｅｃｈ．Ｂｉｏｅｎｇ．８７：６１４（２００４）；Ｋａｎｄａ，Ｙ．ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．Ｂｉｏｅｎｇ．，９４（４）：６８０−６８８（２００６）；及びＷＯ２００３／０８５１０７を参照）がある。
二分されたオリゴ糖類を有する、例えば、抗体のＦｃ領域に結合した二分岐オリゴ糖類がＧｌｃＮＡｃによって二分される、抗体変異形がさらに提供される。かかる抗体変異形では、フコシル化が低減され、かつ／またはＡＤＣＣ機能が改善され得る。かかる抗体変異体の例は、例えばＷＯ２００３／０１１８７８（Ｊｅａｎ−Ｍａｉｒｅｔ ｅｔ ａｌ．）；米国特許第６，６０２，６８４号（Ｕｍａｎａ ｅｔ ａｌ．）；及びＵＳ ２００５／０１２３５４６（Ｕｍａｎａ ｅｔ ａｌ．）に記載されている。Ｆｃ領域に結合したオリゴ糖類において少なくとも１個のガラクトース残基を有する、抗体変異形もまた提供される。かかる抗体変異形は、改善されたＣＤＣ機能を有し得る。かかる抗体変異体は、例えば、ＷＯ１９９７／３００８７（Ｐａｔｅｌ ｅｔ ａｌ．）；ＷＯ１９９８／５８９６４（Ｒａｊｕ，Ｓ．）；及びＷＯ１９９９／２２７６４（Ｒａｊｕ，Ｓ．）に記載されている。
ｃ）Ｆｃ領域変異形
ある特定の実施形態において、１つ以上のアミノ酸修飾が、本明細書に提供される抗体のＦｃ領域に導入され、それによってＦｃ領域変異形を生成してもよい。Ｆｃ領域変異形は、１つ以上のアミノ酸位置にアミノ酸修飾（例えば、置換）を含む、ヒトＦｃ領域配列（例えば、ヒトＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、またはＩｇＧ４ Ｆｃ領域）を含んでもよい。
ある特定の実施形態において、本発明は、いくつかのエフェクター機能を保有するが、これにより、すべてのエフェクター機能は保有せず、それにより、インビトロでの抗体の半減期が重要であるが、なおもある特定のエフェクター機能（補体及びＡＤＣＣ等）が不必要または有害である場合の適用に対する望ましい候補となる、抗体変異形を企図する。インビトロ及び／またはインビボ細胞傷害性アッセイを実行して、ＣＤＣ及び／またはＡＤＣＣ活性の低減／枯渇を確認することができる。例えば、Ｆｃ受容体（ＦｃＲ）結合アッセイを実行して、抗体がＦｃγＲ結合を欠いている（したがって、ＡＤＣＣ活性を欠いている可能性が高い）が、ＦｃＲｎ結合能力を保持していることを確実にすることができる。ＡＤＣＣを媒介するための主要な細胞であるＮＫ細胞はＦｃγＲＩＩＩのみを発現するが、一方で単球はＦｃγＲＩ、ＦｃγＲＩＩ、及びＦｃγＲＩＩＩを発現する。造血細胞上のＦｃＲ発現は、Ｒａｖｅｔｃｈ ａｎｄ Ｋｉｎｅｔ，Ａｎｎｕ．Ｒｅｖ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．９：４５７−４９２（１９９１）の４６４頁の表３に要約されている。対象の分子のＡＤＣＣ活性を評価するためのインビトロアッセイの非限定的な例が、米国特許第５，５００，３６２号（例えばＨｅｌｌｓｔｒｏｍ，Ｉ．ｅｔ ａｌ．Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８３：７０５９−７０６３（１９８６）を参照）及びＨｅｌｌｓｔｒｏｍ，Ｉ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８２：１４９９−１５０２（１９８５）；第５，８２１，３３７号（Ｂｒｕｇｇｅｍａｎｎ，Ｍ．ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．１６６：１３５１−１３６１（１９８７）参照）に記載されている。代替的に、非放射性アッセイ法を使用してもよい（例えば、フローサイトメトリーのためのＡＣＴＩ（登録商標）非放射性細胞傷害性アッセイ（ＣｅｌｌＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｉｎｃ．、Ｍｏｕｎｔａｉｎ Ｖｉｅｗ、ＣＡ；及びＣｙｔｏＴｏｘ ９６（登録商標）非放射性細胞傷害性アッセイ（Ｐｒｏｍｅｇａ、Ｍａｄｉｓｏｎ，ＷＩ）を参照）。かかるアッセイに有用なエフェクター細胞には、末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）及びナチュラルキラー細胞が含まれる。代替的に、または追加的に、目的の分子のＡＤＣＣ活性は、インビボで、例えば、Ｃｌｙｎｅｓ ｅｔ ａｌ．Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ９５：６５２−６５６（１９９８）で開示されるような動物モデルにおいて、評価されてもよい。また、Ｃ１ｑ結合アッセイを行って、抗体がＣ１ｑに結合不可能であり、したがってＣＤＣ活性を欠いていることを確認してもよい。例えば、ＷＯ２００６／０２９８７９及びＷＯ２００５／１００４０２におけるＣ１ｑ及びＣ３ｃ結合ＥＬＩＳＡを参照されたい。補体活性化を評価するために、ＣＤＣアッセイを行ってもよい（例えば、Ｇａｚｚａｎｏ−Ｓａｎｔｏｒｏ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ ２０２：１６３（１９９６）；Ｃｒａｇｇ，Ｍ．Ｓ．ｅｔ ａｌ．，Ｂｌｏｏｄ １０１：１０４５−１０５２（２００３）；及びＣｒａｇｇ，Ｍ．Ｓ．ａｎｄ Ｍ．Ｊ．Ｇｌｅｎｎｉｅ，Ｂｌｏｏｄ １０３：２７３８−２７４３（２００４）を参照）。ＦｃＲｎ結合及びインビボ排除／半減期の決定は、当技術分野で既知の方法を使用しても実施され得る（例えば、Ｐｅｔｋｏｖａ，Ｓ．Ｂ．ｅｔ ａｌ．，Ｉｎｔｌ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１８（１２）：１７５９−１７６９（２００６）を参照）。
低下したエフェクター機能を有する抗体には、Ｆｃ領域残基２３８、２６５、２６９、２７０、２９７、３２７及び３２９の１つ以上の置換を有するものが包含される（米国特許第６，７３７，０５６号）。かかるＦｃ突然変異体には、アラニンへの残基２６５及び２９７の置換を有するいわゆる「ＤＡＮＡ」Ｆｃ突然変異体を含む（米国特許第７，３３２，５８１号）、アミノ酸２６５、２６９、２７０、２９７、及び３２７位のうちの２つ以上において置換を有するＦｃ突然変異体が含まれる。
ＦｃＲへの結合が改善されたまたは減少したある特定の抗体変異形が記載される。（例えば、米国特許第６，７３７，０５６号；ＷＯ２００４／０５６３１２及びＳｈｉｅｌｄｓ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．９（２）：６５９１−６６０４（２００１）を参照。）
ある特定の実施形態において、抗体変異形は、ＡＤＣＣを改善する１つ以上のアミノ酸置換、例えば、Ｆｃ領域の２９８、３３３、及び／または３３４位（残基のＥＵ付番）における置換を有する、Ｆｃ領域を含む。
いくつかの実施形態では、例えば、米国特許第６，１９４，５５１号、ＷＯ９９／５１６４２及びＩｄｕｓｏｇｉｅ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１６４：４１７８−４１８４（２０００）に記載されているように、Ｃ１ｑ結合及び／または補体依存性細胞傷害性（ＣＤＣ）の改変（すなわち、改善または減少）がＦｃ領域にもたらされる。
半減期が増加し、母体ＩｇＧの胎児への移動に関与する（Ｇｕｙｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１１７：５８７（１９７６）及びＫｉｍ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２４：２４９（１９９４））新生児Ｆｃ受容体（ＦｃＲｎ）へ結合が改善された抗体は、ＵＳ２００５／００１４９３４Ａ１（Ｈｉｎｔｏｎ ｅｔ ａｌ．）に記載されている。これらの抗体は、ＦｃＲｎに対するＦｃ領域の結合性を向上させる１つ以上の置換を内部に有するＦｃ領域を含む。このようなＦｃ変異体には、Ｆｃ領域残基：２３８、２５６、２６５、２７２、２８６、３０３、３０５、３０７、３１１、３１２、３１７、３４０、３５６、３６０、３６２、３７６、３７８、３８０、３８２、４１３、４２４または４３４のうちの１つ以上における置換、例えば、Ｆｃ領域の置換残基４３４の置換（米国特許第７，３７１，８２６号）を有するものが包含される。
また、Ｆｃ領域変異形の他の例に関して、Ｄｕｎｃａｎ ＆ Ｗｉｎｔｅｒ，Ｎａｔｕｒｅ ３２２：７３８−４０（１９８８）；米国特許第５，６４８，２６０号；米国特許第５，６２４，８２１号；及びＷＯ９４／２９３５１を参照されたい。
ｄ）システイン操作された抗体変異形
ある特定の実施形態において、抗体の１個以上の残基がシステイン残基で置換されている、システイン操作された抗体、例えば、「チオＭＡｂ」を作製することが望ましい場合がある。特定の実施形態において、置換残基は、抗体の利用しやすい部位において生じる。それらの残基をシステインで置換することによって、反応性のチオール基はそれによって、抗体の利用しやすい部位に位置付けられ、それを使用して、抗体を、薬物部分またはリンカー−薬物部分等の他の部分に複合して、本明細書にさらに記載される、免疫複合体を作製してもよい。ある特定の実施形態において、次の残基のうちの任意の１個以上が、システインで置換されてもよい：軽鎖のＶ２０５（Ｋａｂａｔ付番）、重鎖のＡ１１８（ＥＵ付番）、及び重鎖Ｆｃ領域のＳ４００（ＥＵ付番）。システイン操作抗体は、例えば、米国特許第７，５２１，５４１号に記載されるように産生され得る。
ｅ）抗体誘導体
ある特定の実施形態において、本明細書に提供される抗体は、当該技術分野で既知であり、容易に入手可能な追加の非タンパク質性部分を含有するようにさらに修飾されてもよい。抗体の誘導体化に好適な部分には、水溶性ポリマーが含まれるが、これらに限定されない。水溶性ポリマーの非限定的な例としては、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、エチレングリコール／プロピレングリコールのコポリマー、カルボキシメチルセルロース、デキストラン、ポリビニルアルコール、ポリビニルピロリドン、ポリ−１，３−ジオキソラン、ポリ−１，３，６−トリオキサン、エチレン／無水マレイン酸コポリマー、ポリアミノ酸（ホモポリマーまたはランダムコポリマーのいずれか）、及びデキストランまたはポリ（ｎ−ビニルピロリドン）ポリエチレングリコール、プロプロピレン（ｐｒｏｐｒｏｐｙｌｅｎｅ）グリコールホモポリマー、プロリプロピレン（ｐｒｏｌｙｐｒｏｐｙｌｅｎｅ）オキシド／エチレンオキシドコポリマー、ポリオキシエチル化ポリオール（例えば、グリセロール）、ポリビニルアルコール、ならびにそれらの混合物が挙げられるが、これらに限定されない。ポリエチレングリコールプロピオンアルデヒドは、水中でのその安定性に起因して、製造における利点を有し得る。ポリマーは、任意の分子量のものであってもよく、分岐していても非分岐であってもよい。抗体に結合したポリマーの数は、様々であってもよく、１つを超えるポリマーが結合される場合、それらは、同じ分子または異なる分子であり得る。一般に、誘導体化に使用されるポリマーの数及び／または種類は、改善対象の抗体の特定の特性または機能、抗体誘導体が規定の条件下で療法において使用されるかどうか等を含むが、これらに限定されない考慮事項に基づいて、決定することができる。
別の実施形態において、放射線への曝露によって選択的に加熱され得る、抗体及び非タンパク質性部分の複合体が提供される。いくつかの実施形態において、非タンパク質性部分は、カーボンナノチューブである（Ｋａｍ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ １０２：１１６００−１１６０５（２００５））。放射線は、任意の波長のものであってもよく、通常の細胞を害さないが、非タンパク質性部分を、抗体−非タンパク質性部分に近位の細胞を死滅させる温度まで加熱する波長が含まれるが、これらに限定されない。
Ｂ．組み換え法および組成物
抗体は、例えば、米国特許第４，８１６，５６７号で説明されている組み換え法及び組成物を用いて産生され得る。いくつかの実施形態において、本明細書に記載される抗ＢＡＣＥ１抗体をコードする単離核酸が提供される。かかる核酸は、抗体のＶＬを含むアミノ酸配列及び／またはＶＨを含むアミノ酸配列（例えば、抗体の軽鎖及び／または重鎖）をコードし得る。さらなる実施形態において、かかる核酸を含む１つ以上のベクター（例えば、発現ベクター）が提供される。さらなる実施形態において、かかる核酸を含む宿主細胞が提供される。１つのかかる実施形態において、宿主細胞は、（１）抗体のＶＬを含むアミノ酸配列および抗体のＶＨを含むアミノ酸配列をコードする核酸を含むベクター、または（２）抗体のＶＬを含むアミノ酸配列をコードする核酸を含む第１のベクター及び抗体のＶＨを含むアミノ酸配列をコードする核酸を含む第２のベクターを含む（例えば、それらで形質転換されている）。いくつかの実施形態において、宿主細胞は、真核性、例えば、チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞またはリンパ系細胞（例えば、Ｙ０、ＮＳ０、Ｓｐ２０細胞）である。いくつかの実施形態において、抗ＢＡＣＥ１抗体を産生する方法が提供され、本方法は、上に提供される抗体をコードする核酸を含む宿主細胞を、抗体の発現に好適な条件下で培養することと、任意に、抗体を宿主細胞（または宿主細胞培養培地）から回収することとを含む。
抗ＢＡＣＥ１抗体の組み換え生産のために、例えば、上述のもの等の、抗体をコードする核酸が単離され、宿主細胞内でのさらなるクローニング及び／または発現のために、１つ以上のベクター中に挿入される。かかる核酸は、従来の手順を使用して（例えば、抗体の重鎖及び軽鎖をコードする遺伝子に特異的に結合可能であるオリゴヌクレオチドプローブを使用することによって）、容易に単離され、配列決定され得る。
抗体コードベクターのクローニングまたは発現に好適な宿主細胞には、本明細書に記載される原核細胞または真核細胞が含まれる。例えば、抗体は、特にグリコシル化及びＦｃエフェクター機能が必要とされない場合に、細菌において産生されてもよい。細菌における抗体断片及びポリペプチドの発現に関しては、例えば、米国特許第５，６４８，２３７号、同第５，７８９，１９９号及び同第５，８４０，５２３号を参照されたい。（大腸菌における抗体断片の発現を記載するＣｈａｒｌｔｏｎ，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｖｏｌ．２４８（Ｂ．Ｋ．Ｃ．Ｌｏ，ｅｄ．，Ｈｕｍａｎａ Ｐｒｅｓｓ，Ｔｏｔｏｗａ，ＮＪ，２００３），ｐｐ．２４５−２５４も参照されたい。）発現後、抗体は、可溶性画分において細菌細胞ペーストから単離されてもよく、またさらに精製することができる。
原核生物に加えて、糸状菌または酵母等の真核微生物は、抗体コードベクターに好適なクローニングまたは発現宿主であり、それには、グリコシル化経路が「ヒト化」されており、それにより部分的または完全ヒトグリコシル化パターンを有する抗体の産生をもたらす、真菌及び酵母株が含まれる。Ｇｅｒｎｇｒｏｓｓ，Ｎａｔ．Ｂｉｏｔｅｃｈ．２２：１４０９−１４１４（２００４）及びＬｉ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔ．Ｂｉｏｔｅｃｈ．２４：２１０−２１５（２００６）を参照されたい。
グリコシル化抗体の発現に好適な宿主細胞はまた、多細胞生物（無脊椎動物及び脊椎動物）にも由来する。無脊椎動物細胞の例としては、植物及び昆虫細胞が挙げられる。昆虫細胞と併せて、特にヨトウガ細胞のトランスフェクションのために使用され得る、多数のバキュロウイルス株が特定されている。
植物細胞培養物もまた、宿主として利用することができる。例えば、米国特許第５，９５９，１７７号、同第６，０４０，４９８号、同第６，４２０，５４８号、同第７，１２５，９７８号、及び同第６，４１７，４２９号を参照されたい（遺伝子組み換え植物内で抗体を産生するためのＰＬＡＮＴＩＢＯＤＩＥＳ（商標）技術を記載する）。
脊椎動物細胞もまた、宿主として使用され得る。例えば、懸濁液中で成長するように適合される哺乳類細胞株が、有用であり得る。有用な哺乳動物宿主細胞株の他の例としては、ＳＶ４０（ＣＯＳ−７）により形質転換されたサル腎臓ＣＶ１株；ヒト胚性腎臓株（例えば、Ｇｒａｈａｍ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｇｅｎ Ｖｉｒｏｌ．３６：５９（１９７７）に記載の２９３または２９３細胞；ベビーハムスター腎細胞（ＢＨＫ）；マウスセルトリ細胞（例えば、Ｍａｔｈｅｒ，Ｂｉｏｌ．Ｒｅｐｒｏｄ．２３：２４３−２５１（１９８０）に記載のＴＭ４細胞）；サル腎臓細胞（ＣＶ１）；アフリカミドリザル腎細胞（ＶＥＲＯ−７６）；ヒト子宮頚癌細胞（ＨＥＬＡ）；イヌ腎細胞（ＭＤＣＫ；バッファローラット肝細胞（ＢＲＬ ３Ａ）；ヒト肺細胞（Ｗ１３８）；ヒト肝細胞（Ｈｅｐ Ｇ２）；マウス乳房腫瘍（ＭＭＴ ０６０５６２）；例えばＭａｔｈｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ａｎｎａｌｓ Ｎ．Ｙ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．３８３：４４−６８（１９８２）に記載のＴＲＩ細胞；ＭＲＣ ５細胞；及びＦＳ４細胞が挙げられる。他の有用な哺乳動物宿主細胞株としては、ＤＨＦＲ−ＣＨＯ細胞（Ｕｒｌａｕｂ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ７７：４２１６（１９８０））が包含されるチャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞；及びＹ０、ＮＳ０及びＳｐ２／０といった骨髄腫細胞株が挙げられる。抗体産生に適した特定の哺乳動物宿主細胞株の概要に関しては、例えば、Ｙａｚａｋｉ ａｎｄ Ｗｕ，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｖｏｌ．２４８（Ｂ．Ｋ．Ｃ．Ｌｏ，ｅｄ．，Ｈｕｍａｎａ Ｐｒｅｓｓ，Ｔｏｔｏｗａ，ＮＪ），ｐｐ．２５５−２６８（２００３）を参照されたい。
Ｃ．アッセイ
本明細書に提供される抗ＢＡＣＥ１抗体は、それらの物理／化学特性及び／または生物活性について、当該技術分野で既知の種々のアッセイによって、特定され、スクリーニングされ、または特徴付けられてもよい。
１．結合アッセイ及び他のアッセイ
いくつかの態様では、本発明の抗体の抗原結合活性について、例えば、ＥＬＩＳＡ、ウェスターンブロット等の公知の方法で試験する。
別の態様において、競合アッセイを使用して、ＢＡＣＥ１への結合について本明細書に記載される抗ＢＡＣＥ１抗体抗体のいずれかと競合する抗体を特定してもよい。ある特定の実施形態において、かかる競合抗体は、本明細書に記載されるいずれかの抗体によって結合される、同じエピトープ（例えば、直線状または立体配座エピトープ）に結合する。抗体が結合するエピトープをマッピングするための例示的な方法の詳細は、Ｍｏｒｒｉｓ（１９９６）“Ｅｐｉｔｏｐｅ Ｍａｐｐｉｎｇ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ，” ｉｎ Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ ｖｏｌ．６６（Ｈｕｍａｎａ Ｐｒｅｓｓ，Ｔｏｔｏｗａ，ＮＪ）で提供される。
例示的な競合アッセイにおいて、固定化されたＢＡＣＥ１は、ＢＡＣＥ１に結合する第１の標識抗体（例えば、本明細書に記載される抗ＢＡＣＥ１抗体）、及びＢＡＣＥ１への結合について第１の抗体と競合するその能力について試験されている第２の未標識抗体を含む溶液中でインキュベートされる。第２の抗体は、ハイブリドーマ上清中に存在してもよい。対照として、固定化されたＢＡＣＥ１が、第１の標識抗体を含むが、第２の未標識抗体を含まない溶液中でインキュベートされる。ＢＡＣＥ１に第１の抗体が結合することを許容する条件下でのインキュベーション後、過剰な非結合抗体が除去され、固定化されたＢＡＣＥ１に関連する標識の量が測定される。固定化されたＢＡＣＥ１に関連する標識の量が、対照試料と比較して試験試料中で実質的に低減される場合、それは、第２の抗体がＢＡＣＥ１への結合について第１の抗体と競合していることを示す。Ｈａｒｌｏｗ ａｎｄ Ｌａｎｅ（１９８８）Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ： Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ ｃｈ．１４（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ，ＮＹ）を参照されたい。
２．活性アッセイ
いくつかの態様では、生物学的活性を有する抗ＢＡＣＥ１抗体を同定するためのアッセイが提供される。生物学的活性としては、例えば、ＢＡＣＥ１アスパルチルプロテアーゼ活性の阻害または減少；またはＢＡＣＥ１によるＡＰＰ切断の阻害または減少；またはＡβ産生の阻害または減少が挙げられ得る。インビボ及び／またはインビトロでかかる生物学的活性を有する抗体も提供される。
特定の実施形態において、本発明の抗体は、かかる生物学的活性に関して試験される。例えば、ＢＡＣＥ１プロテアーゼ活性は、合成基質ペプチドを用いて、実施例で詳細に説明されている均一時間分解蛍光ＨＴＲＦアッセイで試験することができる。
簡潔にまとめると、均一時間分解蛍光（ＨＴＲＦ）アッセイを用いて、アミロイド前駆体タンパク質ＢＡＣＥ１切断部位ペプチドの使用によってＢＡＣＥ１アスパルチルプロテアーゼ活性を測定し得る。例えば、Ｂｉ２７ペプチド（ビオチン−ＫＴＥＥＩＳＥＶＮＬＤＡＥＦＲＨＤＳＧＹＥＶＨＨＱＫＬ（配列番号１８３）、Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｐｅｐｔｉｄｅ Ｃｏｍｐａｎｙ）を、３８４ウェルプレート（Ｐｒｏｘｉｐｌａｔｅ（商標）、（Ｐｅｒｋｉｎ−Ｅｌｍｅｒ）において、ＢＡＣＥ反応緩衝液（５０ｍＭ酢酸ナトリウム、ｐＨ４．４及び０．１％ＣＨＡＰＳ）中で抗ＢＡＣＥ抗体とプレインキュベートしたＢＡＣＥ１と組み合わせる。タンパク質分解反応混合物を周囲温度で７５分間インキュベートし、検出緩衝液（２００ｍＭトリス、ｐＨ８．０、２０ｍＭのＥＤＴＡ、０．１％ＢＳＡ、及び０．８ＭのＫＦ）中２ｎＭのストレプトアビジン−Ｄ２及びユーロピウムクリプテートで標識した１５０ｎＭの抗アミロイドベータ抗体を含有する５μＬのＨＴＲＦ検出混合物を添加してクエンチした。最終反応混合物を周囲温度で６０分間インキュベートし、ＥｎＶｉｓｉｏｎ Ｍｕｌｔｉｌａｂｅｌ Ｐｌａｔｅ Ｒｅａｄｅｒ（商標）（Ｐｅｒｋｉｎ−Ｅｌｍｅｒ）を用いてＴＲ−ＦＲＥＴシグナルを３２０ｎｍの励起波長及び６１５及び６６５ｎｍの発光波長で測定する。
いくつかの実施形態において、ＢＡＣＥ１プロテアーゼ活性は、マイクロ流体キャピラリー電気泳動（ＭＣＥ）アッセイを用いて測定することができる。ＭＣＥアッセイ反応は標準的な酵素反応で実行され得、これは、酵素ならびにヒトＢＡＣＥ１（細胞外ドメイン）、アミロイド前駆体タンパク質ベータセクレターゼ活性部位ペプチド（ＦＡＭ−ＫＴＥＥＩＳＥＶＮＬＤＡＥＦＲＷＫＫ−ＣＯＮＨ２（配列番号１８６）、５０ｍＭのＮａＯＡｃ（ｐＨ４．４）及び０．１％ＣＨＡＰＳを含有する４ｘ複合体に基質を添加することで開始される。周囲温度で６０分間インキュベートした後、ＬＣ３０００（登録商標）で分析される１２個の細管（ｓｉｐｐｅｒ）を備えるマイクロ流体チップを用いて、各反応の生成物及び基質を分離する（いずれもＣａｌｉｐｅｒ Ｌｉｆｅ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ）。生成物と基質の分離は、製造者の最適化ソフトウェアを使用して電圧と圧力を選択することによって最適化される。基質の転化は、ＨＴＳウェルアナライザーソフトウェア（Ｃａｌｉｐｅｒ Ｌｉｆｅ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ）を用いて電気泳動図から計算する。
さらに、ＢＡＣＥ１プロテアーゼ活性は、本明細書の実施例に記載のように、ＡＰＰといったＢＡＣＥ１基質を発現する細胞株においてインビボで試験され得るか、または、ＰＣＴ公開第ＷＯ２０１２／０６４８３６Ａ１号に記載されているように、ヒトＡＰＰといったＢＡＣＥ１基質を発現するトランスジェニックマウスにおいて試験されてもよい。
さらに、ＢＡＣＥ１プロテアーゼ活性は、動物モデルにおいて抗ＢＡＣＥ１抗体で試験され得る。例えば、種々の神経系疾患及び障害の動物モデル、ならびにこれらのモデルに関連する病理学的過程を検査するための関連技法が、当技術分野において容易に利用可能である。種々の神経系障害の動物モデルには、非組み換え動物及び組み換え（トランスジェニック）動物の両方が包含される。非組み換え動物モデルには、例えば、マウスモデル等の齧歯動物が包含される。かかるモデルは、標準的な技法、例えば、例えば皮下注射、尾部静脈注入、脾臓移植、腹腔内移植、腎被膜下の移植を用いて同系マウスに細胞を導入することで産生され得る。インビボモデルには、脳卒中／脳虚血のモデル、パーキンソン病のマウスモデル；アルツハイマー病のマウスモデル；筋萎縮性側索硬化症のマウスモデル；脊髄筋萎縮症のマウスモデルのような神経変性疾患のインビボモデル；局所及び全脳虚血のマウス／ラットモデル、例えば総頸動脈閉塞症または中大脳動脈閉塞モデルが挙げられ；またはイクスビボの全胚培養物におけるものがある。非限定的な一例として、アルツハイマー病に関しては多数のマウスモデルが当該技術分野で公知である（例えばＲａｋｏｖｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｎｅｕｒｏｄｅｇｅｎｅｒ．Ｄｉｓ．（２００７）；４（５）：３９２−４０２；Ｍｏｕｒｉ ｅｔ ａｌ．，ＦＡＳＥＢ Ｊ．（２００７）Ｊｕｌ；２１（９）：２１３５−４８；Ｍｉｎｋｅｖｉｃｉｅｎｅ ｅｔ ａｌ ．，Ｊ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．Ｅｘｐ．Ｔｈｅｒ．（２００４）Ｎｏｖ；３１１（２）：６７７−８２及びＹｕｅｄｅ ｅｔ ａｌ．，Ｂｅｈａｖ Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．（２００７）Ｓｅｐ；１８（５−６）：３４７−６３を参照）。種々のアッセイが公知のインビトロまたはインビボアッセイ形式で実行され得、当該技術分野において知られ、文献に記載されている通りである。かかる動物モデル各種も、Ｊａｃｋｓｏｎ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ等の市販業者から入手可能である。
Ｄ．免疫抱合体
本発明はまた、本明細書において、化学療法薬剤もしくは化学療法薬物、成長阻害性薬剤、毒素（例えば、タンパク質毒素、細菌、真菌、植物、もしくは動物起源の酵素活性毒素、またはそれらの断片）、または放射性同位体等の、１種以上の細胞傷害性薬剤に複合される抗ＢＡＣＥ１抗体を含む、免疫複合体も提供する。
いくつかの実施形態では、免疫複合体は、抗体が１種以上の薬物に複合される抗体−薬剤抱合体（ＡＤＣ）であり、当該薬物としては、限定はしないが、マイタンシノイド（米国特許第５，２０８，０２０号、同第５，４１６，０６４号及び欧州特許第ＥＰ０４２５２３５Ｂ１号参照）；モノメチルアウリスタチン薬物部分ＤＥ及びＤＦといったオーリスタチン（ＭＭＡＥ及びＭＭＡＦ）（米国特許第５，６３５，４８３号及び同第５，７８０，５８８号及び同第７，４９８，２９８号参照）；ドラスチン；カリチアマイシンまたはその誘導体（米国特許第５，７１２，３７４号、同第５，７１４，５８６号、同第５，７３９，１１６号、同第５，７６７，２８５号、同第５，７７０，７０１号、同第５，７７０，７１０号、同第５，７７３，００１号、及び同第５，８７７，２９６号；Ｈｉｎｍａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ．５３：３３３６−３３４２（１９９３）；及びＬｏｄｅ ｅｔ ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ．５８：２９２５−２９２８（１９９８）参照）；ダウノマイシンまたはドキソルビシンといったアントラサイクリン（Ｋｒａｔｚ ｅｔ ａｌ．，Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．１３：４７７−５２３（２００６）；Ｊｅｆｆｒｅｙ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｏｒｇａｎｉｃ ＆ Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．Ｌｅｔｔｅｒｓ １６：３５８−３６２（２００６）；Ｔｏｒｇｏｖ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｃｏｎｊ．Ｃｈｅｍ．１６：７１７−７２１（２００５）；Ｎａｇｙ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９７：８２９−８３４（２０００）；Ｄｕｂｏｗｃｈｉｋ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｏｒｇ．＆ Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．Ｌｅｔｔｅｒｓ １２：１５２９−１５３２（２００２）；Ｋｉｎｇ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．４５：４３３６−４３４３（２００２）；及び米国特許第６，６３０，５７９号参照）；メトトレキセート；ビンデシン；ドセタキセル、パクリタキセル、ラロタキセル、テセタキセル及びオルタタキセルのようなタキサン；トリコテセン；及びＣＣ１０６５が挙げられる。
別の実施形態では、免疫抱合体は、酵素的に活性な毒素またはその断片に複合された本明細書に記載される抗体を含み、限定されないが、ジフテリアＡ鎖、ジフテリア毒素の非結合性活性断片、外毒素Ａ鎖（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ由来）、リシンＡ鎖、アブリンＡ鎖、モデシンＡ鎖、アルファ−サルシン、Ａｌｅｕｒｉｔｅｓ ｆｏｒｄｉｉタンパク質、ジアンチンタンパク質、Ｐｈｙｔｏｌａｃａ ａｍｅｒｉｃａｎａタンパク質（ＰＡＰＩ、ＰＡＰＩＩ及びＰＡＰ−Ｓ）、ｍｏｍｏｒｄｉｃａ ｃｈａｒａｎｔｉａ阻害剤、クルシン、クロチン、ｓａｐａｏｎａｒｉａ ｏｆｆｉｃｉｎａｌｉｓ阻害剤、ゲロニン、ミトゲリン、レストリクトシン、フェノマイシン、エノマイシン及びトリコテセンが挙げられる。
別の実施形態において、免疫複合体は、放射性原子に複合されて放射性複合体を形成する、本明細書に記載される抗体を含む。種々の放射性同位体が、放射性複合体の産生のために利用可能である。例としてはＡｔ２１１、Ｉ１３１、Ｉ１２５、Ｙ９０、Ｒｅ１８６、Ｒｅ１８８、Ｓｍ１５３、Ｂｉ２１２、Ｐ３２、Ｐｂ２１２及びＬｕの放射性同位体が挙げられる。放射性複合体が検出のために使用されるとき、それは、シンチグラフィー研究のための放射性原子、例えばｔｃ９９ｍもしくはＩ１２３、または核磁気共鳴（ＮＭＲ）画像法（別名、磁気共鳴画像法、ｍｒｉ）のためのスピン標識、例えば、再びヨード−１２３、ヨード−１３１、インジウム−１１１、フッ素−１９、炭素−１３、窒素−１５、酸素−１７、ガドリニウム、マンガン、もしくは鉄を含んでよい。
抗体及び細胞傷害性剤の複合体は、Ｎ−サクシニミジル−３−（２−ピリジルジチオ）プロピオン酸塩（ＳＰＤＰ）、サクシニミジル−４−（Ｎ−マレイミドメチル）シクロヘキサン−１−カルボン酸塩（ＳＭＣＣ）、イミノチオラン（ＩＴ）、イミドエステルの二官能性誘導体（アジプイミド酸ジメチルＨＣｌ等）、活性エステル（スベリン酸ジサクシニミジル等）、アルデヒド（グルタルアルデヒド等）、ビス−アジド化合物（ビス（ｐ−アジドベンゾイル）ヘキサンジアミン等）、ビス−ジアゾニウム誘導体（ビス−（ｐ−ジアゾニウムベンゾイル）−エチレンジアミン等）、ジイソシアネート（トルエン２，６−ジイソシアネート等）、及びビス活性フッ素化合物（１，５−ジフルオロ−２，４−ジニトロベンゼン等）等の種々の二官能性タンパク質結合薬剤を使用して産生されてよい。例えば、リシン免疫毒素は、Ｖｉｔｅｔｔａ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ ２３８：１０９８（１９８７）で記載されるように調製され得る。炭素−１４標識１−イソチオシアナトベンジル−３−メチルジエチレントリアミンペンタ酢酸（ＭＸ−ＤＴＰＡ）は、抗体への放射性ヌクレオチドの複合のための例示的なキレート剤である。ＷＯ９４／１１０２６を参照されたい。リンカーは、細胞内の細胞傷害性薬物の放出を容易にする「切断可能なリンカー」であってもよい。例えば、酸不安定性リンカー、ペプチダーゼ感受性リンカー、感光性リンカー、ジメチルリンカー、またはジスルフィド含有リンカー（Ｃｈａｒｉ ｅｔ ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ．５２：１２７−１３１（１９９２）；米国特許第５，２０８，０２０号）が用いられ得る。
本明細書の免疫複合体またはＡＤＣは、ＢＭＰＳ、ＥＭＣＳ、ＧＭＢＳ、ＨＢＶＳ、ＬＣ−ＳＭＣＣ、ＭＢＳ、ＭＰＢＨ、ＳＢＡＰ、ＳＩＡ、ＳＩＡＢ、ＳＭＣＣ、ＳＭＰＢ、ＳＭＰＨ、スルホ−ＥＭＣＳ、スルホ−ＧＭＢＳ、スルホ−ＫＭＵＳ、スルホ−ＭＢＳ、スルホ−ＳＩＡＢ、スルホ−ＳＭＣＣ、及びスルホ−ＳＭＰＢ、ならびに（例えば、Ｐｉｅｒｃｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｉｎｃ．，Ｒｏｃｋｆｏｒｄ，ＩＬ．，Ｕ．Ｓ．Ａから）市販されるＳＶＳＢ（サクシニミジル−（４−ビニルスルホン）安息香酸塩）が含まれるが、これらに限定されない架橋剤試薬で調製されたかかる複合体を明白に企図するが、これらに限定されない。
Ｅ．診断及び検出のための方法及び組成物
特定の実施形態において、本明細書に提供される抗ＢＡＣＥ１抗体のいずれも、生体試料中のＢＡＣＥ１の存在の検出に有用である。本明細書で使用される「検出すること」という用語は、定量または定性検出を包含する。特定の実施形態では、生体試料は、血清、血漿、唾液、胃液分泌、粘液、脳脊髄液、リンパ液、神経組織、脳組織、心臓組織または血管組織等の細胞または組織を含む。
いくつかの実施形態において、診断または検出方法において使用するための抗ＢＡＣＥ１抗体が提供される。さらなる態様において、生体試料中のＢＡＣＥ１の存在を検出する方法が提供される。ある特定の実施形態において、本方法は、抗ＢＡＣＥ１抗体をＢＡＣＥ１に結合するのに許容的な条件下で、生体試料を本明細書に記載される抗ＢＡＣＥ１抗体と接触させることと、複合体が抗ＢＡＣＥ１抗体とＢＡＣＥ１との間で形成されているかどうかを検出することと、を含む。かかる方法は、インビトロ方法であっても、インビボ方法であってもよい。いくつかの実施形態において、例えば、ＢＡＣＥ１が患者の選択のためのバイオマーカーである場合、抗ＢＡＣＥ１抗体を使用して、抗ＢＡＣＥ１抗体での治療法に適格な対象を選択する。
本発明の抗体を使用して診断され得る例示的な障害としては、神経系の疾患（例えば限定されないがレーヴィ小体病、ポリオ後遅発性筋萎縮症、シャイ・ドレーガー症候群、オリーブ橋小脳萎縮、パーキンソン病、多系統萎縮症、線条体黒質変性症、タウオパシー（例えば限定されないがアルツハイマー病及び核上麻痺）、プリオン病（例えば限定されないが牛海綿状脳症、スクラピー、クロイツフェルト・ヤコブ症候群、クールー、ゲルストマン・シュトロイスラー・シャインカー病、慢性消耗病及び致死性家族性不眠症）、脳卒中、筋ジストロフィー、多発性硬化症、筋萎縮性側索硬化症（ＡＬＳ）、アンジェルマン症候群、リドル症候群、パジェット病、外傷性脳損傷、球麻痺、運動ニューロン疾患、ならびに、神経系ヘテロ変性障害（例えば限定されないが、カナバン病、ハンチントン舞踏病、ニューロンセロイド脂褐素症、アレキサンダー病、トゥーレット症状群、メンケス縮れ毛症候群、コケーン症候群、ハラーフォルデン・シュパッツ症候群、ラフォーラ病、レット症候群、肝レンズ核変性症、レッシュ・ナイハン症候群及びウンフェルリヒト・ルントボルク症候群）、認知症（例えば限定はされないがピック病及び脊髄小脳失調症）が挙げられる。
特定の実施形態において、標識された抗ＢＡＣＥ１抗体が提供される。標識には、直接検出される標識または部分（蛍光標識、発色団標識、高電子密度標識、化学発光標識、及び放射性標識等）、ならびに例えば、酵素反応または分子相互作用を介して、間接的に検出される酵素またはリガンド等の部分が含まれるが、これらに限定されない。例示的な標識としては、限定されないが、放射性同位体３２Ｐ、１４Ｃ、１２５Ｉ、３Ｈ及び１３１Ｉ、希土類キレート化合物またはフルオレセインのようなフルオロフォア及びその誘導体、ローダミン及びその誘導体、ダンシル、ウンベリフェロン、ルセリフェラーゼ（ｌｕｃｅｒｉｆｅｒａｓｅｓ）、例えばホタルルシフェラーゼ、細菌ルシフェラーゼ（米国特許第４，７３７，４５６号）、ルシフェリン、２，３−ジヒドロフタルアジンジオン、西洋わさびペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）、アルカリホスファターゼ、β−ガラクトシダーゼ、グルコアミラーゼ、リゾチーム、糖オキシダーゼ、例えば、グルコースオキシダーゼ、ガラクトースオキシダーゼ及びグルコース−６−ホスフェートデヒドロゲナーゼ、ＨＲＰ、ラクトペルオキシダーゼまたはマイクロペルオキシダーゼといった過酸化水素を用いて染料前駆体を酸化させる酵素と結び付けられたウリカーゼ及びキサンチンオキシダーゼのような複素環オキシダーゼ、ビオチン／アビジン、スピン標識、バクテリオファージ標識、安定した遊離基等が挙げられる。
Ｆ．医薬製剤
本明細書に記載の抗ＢＡＣＥ１抗体の医薬製剤は、所望の程度の純度を有するかかる抗体を、１種以上の任意の薬学的に許容される担体と混合することで（Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ １６ｔｈ ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｏｓｏｌ，Ａ．Ｅｄ．（１９８０））、凍結乾燥製剤または水溶液の形態で調製される。薬学的に許容される担体は、一般に、用いられる投薬量及び濃度で、受容者に対して非毒性であり、リン酸塩、クエン酸塩、及び他の有機酸等の緩衝液；アスコルビン酸及びメチオニンを含む酸化防止剤；防腐剤（塩化オクタデシルジメチルベンジルアンモニウム等；塩化ヘキサメトニウム；塩化ベンザルコニウム；塩化ベンゼトニウム；フェノール、ブチル、もしくはベンジルアルコール；メチルもしくはプロピルパラベン等のアルキルパラベン；カテコール；レゾルシノール；シクロヘキサノール；３−ペンタノール；及びｍ−クレゾール等）；低分子量（約１０残基未満）ポリペプチド；血清アルブミン、ゼラチン、もしくは免役グロブリン等のタンパク質；ポリビニルピロリドン等の親水性ポリマー；グリシン、グルタミン、アスパラギン、ヒスチジン、アルギニン、もしくはリジン等のアミノ酸；単糖類、二糖類、及びグルコース、マンノース、もしくはデキストリンを含む他の炭水化物；ＥＤＴＡ等のキレート薬剤；ショ糖、マンニトール、トレハロース、もしくはソルビトール等の糖類；ナトリウム等の塩形成対イオン；金属複合体（例えば、Ｚｎ−タンパク質複合体）；ならびに／またはポリエチレングリコール（ＰＥＧ）等の非イオン性界面活性剤が含まれるが、これらに限定されない。本明細書における例示的な薬学的に許容される担体には、例えば、介在性（ｉｎｓｔｅｒｓｔｉｔｉａｌ）薬物分散剤、例えば可溶性の中性活性ヒアルロニダーゼ糖タンパク質（ｓＨＡＳＥＧＰ）、例えばヒト可溶性ＰＨ−２０ヒアルロニダーゼ糖タンパク質、例えばｒＨｕＰＨ２０（ＨＹＬＥＮＥＸ（登録商標）Ｂａｘｔｅｒ Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ，Ｉｎｃ．）がさらに含まれる。ｒＨｕＰＨ２０を含むある特定の例示的なｓＨＡＳＥＧＰ及び使用方法は、米国特許公開第２００５／０２６０１８６号及び同第２００６／０１０４９６８号に記載されている。いくつかの態様では、ｓＨＡＳＥＧＰは、１つ以上の追加のグリコサミノグリカナーゼ、例えばコンドロイチナーゼと組み合わされる。
例示的な凍結乾燥抗体製剤は、米国特許第６，２６７，９５８号に記載される。水性抗体製剤には、米国特許第６，１７１，５８６号及びＷＯ２００６／０４４９０８に記載されるものが含まれ、後者の製剤はヒスチジン−酢酸緩衝液を含む。
本明細書における製剤はまた、治療されている特定の適応症に対する必要に応じて、１つを超える活性成分、好ましくは相互に悪影響を及ぼさない相補的活性を有する成分を含有してもよい。このような活性成分は、意図する目的に有効な量で組み合わせて適切に存在する。
活性成分は、例えば、コアセルベーション技術によって、または界面重合によって調製されるマイクロカプセル、例えば、それぞれ、コロイド状薬物送達系（例えば、リポソーム、アルブミンミクロスフェア、マイクロエマルション、ナノ粒子及びナノカプセル）中、またはマクロエマルション中のヒドロキシメチルセルロースまたはゼラチン−マイクロカプセル及びポリ−（メチルメタクリレート（ｍｅｔｈｙｌｍｅｔｈａｃｙｌａｔｅ））マイクロカプセル中に封入されてもよい。かかる技術は、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ １６ｔｈ ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｏｓｏｌ，Ａ．Ｅｄ．（１９８０）で開示されている。
徐放性調製物が調製されてもよい。徐放性製剤の好適な例としては、抗体を含有する固体疎水性ポリマーの半透性マトリクスが挙げられ、そのマトリクスは、造形品、例えば、フィルム、またはマイクロカプセルの形態である。
体内投与のために使用されるべき製剤は、一般に滅菌されている。滅菌状態は、例えば、滅菌濾過膜を介した濾過によって、容易に実行され得る。
Ｇ．治療法及び組成物
本明細書で提供される抗ＢＡＣＥ１抗体のいずれも、治療方法において使用され得る。
いくつかの態様では、薬として使用するための抗ＢＡＣＥ１抗体が提供される。さらなる態様では、神経系の疾患または障害を治療する際に使用するための抗ＢＡＣＥ１抗体が提供される（例えばＡＤ）。特定の実施形態では、治療方法において使用するための抗ＢＡＣＥ１抗体が提供される。特定の実施形態では、本発明は、神経系の疾患または障害を有する個体を治療する方法においての使用のための抗ＢＡＣＥ１抗体を提供し、本方法は、個体に有効量の抗ＢＡＣＥ１抗体を投与することを含む。かかる一実施形態では、本方法は、少なくとも１種の追加の治療剤を有効量で個体に投与することをさらに含む。さらなる実施形態では、本発明は、神経系の疾患または障害のリスクがあるかまたはそれに罹患している（例えば、ＡＤ）患者において、アミロイド斑形成を減少または阻害する際に使用するための抗ＢＡＣＥ１抗体を提供する。特定の実施形態では、本発明は、個体におけるＡβ産生を減少または阻害する方法において使用するための抗ＢＡＣＥ１抗体を提供し、個体に有効量の抗ＢＡＣＥ１抗体を投与することを含む。上記実施形態のいずれかによる「個体」は、好ましくはヒトである。特定の態様では、本発明の方法における使用のための抗ＢＡＣＥ抗体は、ＢＡＣＥ１活性を低下または阻害する。例えば、抗ＢＡＣＥ１抗体は、ＡＰＰを切断するＢＡＣＥ１の能力を低下または阻害する。
さらなる態様において、本発明は、薬物の製造または調製における抗ＢＡＣＥ１抗体の使用を提供する。いくつかの実施形態では、薬物は、神経系の疾患または障害の治療を目的とするものである。さらなる実施形態では、薬物は、神経系の疾患または障害を治療する方法における使用のためのものであり、神経系の疾患または障害を有する個体に有効量の薬物を投与することを含む。かかる一実施形態では、本方法は、例えば以下で説明するように、少なくとも１種の追加の治療剤を有効量で個体に投与することをさらに含む。さらなる実施形態では、薬物は、ＢＡＣＥ１活性を阻害するためのものである。さらなる実施形態では、薬物は、個体におけるＡβ産生または斑形成を阻害する方法での使用のためのものであり、Ａβ産生または斑形成を阻害するのに有効な量の薬物を個体に投与することを含む。上の実施形態のいずれかによる「個体」は、ヒトであり得る。
さらなる態様では、本発明は、アルツハイマー病を治療するための方法を提供する。いくつかの実施形態では、本方法は、ＡＤを有する個体に有効量の抗ＢＡＣＥ１抗体を投与することを含む。かかる一実施形態では、本方法は、有効量の少なくとも１種の追加の治療剤を個体に投与することをさらに含む。上記実施形態のいずれかによる「個体」は、ヒトであり得る。
さらなる態様において、本発明は、例えば、上記治療方法のいずれかにおいて使用するための、本明細書に提供される抗ＢＡＣＥ１抗体のいずれかを含む医薬製剤を提供する。いくつかの実施形態では、医薬製剤は、本明細書で提供される抗ＢＡＣＥ１抗体のいずれかと、薬学的に許容される担体と、を含む。別の実施形態において、医薬製剤は、本明細書に提供される抗ＢＡＣＥ１抗体のいずれかと、例えば、以下に記載される少なくとも１種の追加の治療剤と、を含む。
本発明の抗体は、治療法において、単独で、または他の薬剤と組み合わせて使用することができる。例えば、本発明の抗体は、少なくとも１種の追加の治療剤と同時投与されてもよい。
上述のかかる併用療法は、組み合わせた投与（２種以上の治療剤が同じまたは別個の製剤中に含まれる）、及び別個の投与を包含し、この場合、本発明の抗体の投与は、追加の治療剤及び／またはアジュバントの投与の前、それと同時、及び／またはその後に行われ得る。本発明の抗体はまた、放射線療法と組み合わせて使用することもできる。
本発明の抗体（および任意の追加の治療剤）は、非経口、肺内、および鼻腔内、ならびに局所療法で所望される場合、病変内投与を含む、任意の好適な手段によって投与することができる。非経口注入には、筋肉内、静脈内、動脈内、腹腔内、または皮下投与が含まれる。投薬は、任意の好適な経路によるものであり、例えば、投与が短期間のものであるか長期間ものであるかに部分的に応じた、静脈内または皮下注射等の注射によるものであり得る。単回または種々の時点にわたる複数回投与、ボーラス投与、及びパルス注入を含むが、これらに限定されない、種々の投薬スケジュールが本明細書で企図される。
本発明のある特定の実施形態は、血液脳関門を超える抗体またはその断片を提供する。ある神経変性疾患は、抗体またはその活性断片が容易に脳に導入することができるように、血液脳関門の透過性の増大と関連している。血液脳関門がインタクトなままである場合には、いくつかの当該技術分野で周知の手法が、それを横切って分子を輸送するために存在し、限定されないが、物理的方法、脂質に基づく方法、ならびに受容体及びチャネルに基づく方法が挙げられる。
血液脳関門を越えて抗体またはその断片を輸送する身体的方法としては、限定されないが、血液脳関門を全体的に回避するか、または血液脳関門内に開口を形成することが挙げられる。回避方法には、限定はされないが、脳への直接的な注入（例えば、Ｐａｐａｎａｓｔａｓｓｉｏｕ ｅｔ ａｌ．，Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒａｐｙ ９：３９８−４０６（２００２）を参照）及び脳への送達デバイスの埋め込み（例えば、Ｇｉｌｌ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ Ｍｅｄ．９：５８９−５９５（２００３）、及びＧｌｉａｄｅｌ Ｗａｆｅｒｓ（商標）、Ｇｕｉｌｄｆｏｒｄ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌを参照）が包含される。関門に開口を形成する方法としては、限定はされないが、超音波（例えば、米国特許公開第２００２／００３８０８６号）、浸透圧（例えば、高塩濃度のマンニトールの投与によるもの（Ｎｅｕｗｅｌｔ，Ｅ．Ａ．，［Ｉｍｐｌｉｃａｔｉｏｎ ｏｆ ｔｈｅ Ｂｌｏｏｄ−Ｂｒａｉｎ Ｂａｒｒｉｅｒ ａｎｄ ｉｔｓ Ｍａｎｉｐｕｌａｔｉｏｎ］，Ｖｏｌｓ １ ＆ ２，Ｐｌｅｎｕｍ Ｐｒｅｓｓ，Ｎ．Ｙ．（１９８９）参照）、例えばブラジキニンまたは透過化剤Ａ−７による透過化（例えば、米国特許第５，１１２，５９６号、同第５，２６８，１６４号、同第５，５０６，２０６号、及び同第５，６８６，４１６号参照）及び血液脳関門をまたがるニューロンを、抗体またはその断片をコードする遺伝子を含有するベクターでトランスフェクションすること（例えば、米国特許公開第２００３／００８３２９９号参照）が挙げられる。
血液脳関門を越えて抗体またはその断片を輸送するための脂質に基づく方法には、限定はされないが、抗体またはその断片を、血液脳関門の血管内皮上の受容体に結合する抗体結合断片と結合したリポソーム内に被包すること（例えば、米国特許出願公開第２００２００２５３１３号参照）及び抗体またはその活性断片を、低密度のリポタンパク質粒子（例えば、米国特許出願公開第２００４０２０４３５４号参照）またはアポリポタンパク質Ｅでコーティングすること（例えば、米国特許出願公開第２００４０１３１６９２号参照）が挙げられる。
本発明の抗体は、良好な医療行為と一致した様式で、製剤化され、投薬され、投与される。この文脈における考慮の要因には、治療されている特定の障害、治療されている特定の哺乳動物、個々の患者の臨床的病態、障害の原因、薬剤の送達部位、投与方法、投与のスケジュール管理、及び医療従事者に既知の他の要因が含まれる。抗体は、必須ではないが、任意に、問題の障害を予防または治療するために現在使用される１種以上の薬剤と共に製剤化される。かかる他の薬剤の有効量は、製剤中に存在する抗体の量、障害または治療の種類、及び上に考察された他の要因によって決定する。これらは、一般に、本明細書に記載されるものと同じ投薬量及び投与経路で、または本明細書に記載される投薬量の約１〜９９％、または適切であると経験的／臨床的に決定される任意の投薬量及び任意の経路で使用される。
疾患の予防または治療のために、本発明の抗体の適切な投薬量（単独でまたは１種以上の他の追加の治療剤と組み合わせて使用されるとき）は、治療対象の疾患の種類、抗体の種類、疾患の重症度及び経過、抗体が予防目的または治療目的で投与されるかどうか、以前の治療法、患者の病歴及び抗体への反応、ならびに主治医の裁量によって決定する。抗体は、患者に、１回で、または一連の治療にわたって、好適に投与される。疾患の種類及び重症度に応じて、例えば、約１μｇ／ｋｇ〜１５ｍｇ／ｋｇ（例えば、０．１ｍｇ／ｋｇ〜１０ｍｇ／ｋｇ）の抗体が、１回以上の別個の投与によるものであれ、連続注入によるものであれ、患者への投与のための初回の候補投薬量であり得る。１つの典型的な１日投薬量は、上述の要因に応じて、約１μｇ／ｋｇ〜１００ｍｇ／ｋｇ以上の範囲であり得る。病態に応じた数日間またはより長い日数にわたる反復投与について、治療は、一般に、疾患症状の所望の抑制が生じるまで持続される。抗体の１つの例示的な投薬量は、約０．０５ｍｇ／ｋｇ〜約１０ｍｇ／ｋｇの範囲内となる。したがって、約０．５ｍｇ／ｋｇ、２．０ｍｇ／ｋｇ、４．０ｍｇ／ｋｇ、または１０ｍｇ／ｋｇ（もしくはこれらの任意の組み合わせ）の１回以上の用量が患者に投与され得る。かかる用量は、断続的に、例えば、毎週または３週間毎に（例えば、患者に抗体の約２〜約２０回、または例えば、約６回用量を投与するように）投与されてもよい。初回により多い負荷量を投与し、続いてより少ない投与量を１回以上投与してもよい。しかし、他の投薬レジメンが有用であり得る。この治療法の進行は、従来の技術及びアッセイによって容易に監視される。
上記製剤または治療方法のうちのいずれも、抗ＢＡＣＥ１抗体の代わりに、またはそれに加えて、本発明の免疫複合体を使用して行われ得ることが理解される。
Ｈ．製品
本発明の別の態様において、上述の障害の治療、予防、及び／または診断に有用な物質を含有する製品が提供される。製品は、容器、及び容器上のまたは容器と関連したラベルまたは添付文書を含む。好適な容器としては、例えば、ボトル、バイアル、シリンジ、ＩＶ溶液バッグ等が挙げられる。容器は、ガラスまたはプラスチック等の様々な材料から形成され得る。容器は、組成物を、それ自体で、または症状を治療する、予防する、かつ／もしくは診断するのに有効な別の組成物と組み合わせて保有し、また滅菌アクセスポートを有し得る（例えば、容器は、静脈注射用溶液バッグまたは皮下注射針によって貫通可能な栓を有するバイアルであり得る）。組成物中の少なくとも１つの活性な薬剤は、本発明の抗体である。ラベルまたは添付文書は、組成物が選定した病態を治療するために使用されることを表示する。さらに、製品は、（ａ）組成物を含有する第１の容器（この組成物は本発明の抗体を含む）、及び（ｂ）組成物を含有する第２の容器（この組成物はさらなる細胞傷害性薬剤または治療剤を含む）を含んでもよい。本発明のこの実施形態の製品は、組成物が特定の病態を治療するために使用され得ることを表示する添付文書をさらに含んでもよい。代替としてまたは追加として、製品は、注射用静菌水（ＢＷＦＩ）、リン酸緩衝食塩水、リンガー溶液、及びデキストロース溶液といった、薬学的に許容される緩衝液を含む第２（または第３）の容器をさらに含んでもよい。製品は、他の緩衝液、希釈剤、フィルター、針、及びシリンジを含む、商業的及びユーザの観点から望ましい他の材料をさらに含んでもよい。
上記の製品のうちのいずれも、抗ＢＡＣＥ１抗体の代わりに、またはそれに加えて、本発明の免疫複合体を含んでよいことが理解される。
ＩＩＩ．実施例
以下は、本発明の方法及び組成物の実施例である。上に提供される一般的説明を考慮すると、種々の他の実施形態が実施され得ることが理解される。
実施例１：抗ＢＡＣＥ１抗体の産生
ＢＡＣＥ１に特異的に結合する完全ヒト抗体を、ヒトＢＡＣＥ１細胞外ドメイン（ＢＡＣＥ１−ＥＣＤ）、配列番号１７９のアミノ酸１−４５７に対して選択した酵母菌ベースのヒト抗体ディスプレーライブラリを用いて産生した。
前述の通り、それぞれが約１０９の多様性を有する８つのナイーブヒト合成酵母菌ライブラリを増殖した（例えばＸｕ ｅｔ ａｌ，２０１３，Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｅｎｇ．Ｄｅｓ．Ｓｅｌ．，２６：６６３−７０；ＷＯ２００９０３６３７９；ＷＯ２０１０１０５２５６；ＷＯ２０１２００９５６８を参照）。記載されているように、最初の選択２回のためにＭｉｌｔｅｎｙｉ ＭＡＣｓシステムを利用する磁気ビーズ選別技法を実施した（例えば、Ｓｉｅｇｅｌ ｅｔ ａｌ．，２００４，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ，２８６：１４１−５３を参照）。簡単に述べると、ＦＡＣＳ洗浄緩衝液（リン酸緩衝化生理食塩水（ＰＢＳ）／０．１％ウシ血清アルブミン（ＢＳＡ））中で、酵母細胞（約１０１０個の細胞／ライブラリ）を、２００ｎＭのビオチン化ＢＡＣＥ１−ＥＣＤで、室温で１５分間インキュベートした。５０ｍｌの氷冷した洗浄緩衝液で１回洗浄した後、細胞ペレットを４０ｍＬの洗浄緩衝液に再懸濁し、ストレプトアビジンマイクロビーズ（５００μｌ）を酵母に添加し、４℃で１５分間インキュベートした。次に、酵母をペレット化し、５ｍＬの洗浄緩衝液に再懸濁し、ＭｉｌｔｅｎｙｉのＬＳカラムに充填した。５ｍＬを充填した後、カラムを３ｍｌのＦＡＣＳ洗浄緩衝液で３回洗浄した。次いで、カラムを磁場から取り出し、酵母を５ｍＬの増殖培地で溶離し、次いで一晩増殖させた。フローサイトメトリーを用いて以下の複数回の選別を行った。約１×１０８個の酵母をペレット化し、洗浄緩衝液で３回洗浄し、室温の平衡条件下で、濃度を漸減させたビオチン化ＢＡＣＥ１−ＥＣＤ（１００〜１ｎＭ）でインキュベートした。次いで、酵母を２回洗浄し、４℃で１５分間、ＬＣ−ＦＩＴＣ（１：１００希釈）及びＳＡ−６３３（１：５００希釈）またはＥＡ−ＰＥ（１：５０希釈）の二次試薬で染色した。氷冷洗浄緩衝液で２回洗浄した後、細胞ペレットを０．４ｍＬの洗浄緩衝液に再懸濁し、ろ過器でキャップした選別管に移した。選別はＦＡＣＳ ＡＲＩＡソーター（ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）を用いて行い、選別ゲートを決定してバインダーを選択した。最後の回の選別後、酵母を播種し、個々のコロニーを特徴付けのために採取した。
選択抗体の最適化は、それぞれ以下に記載する軽鎖及び重鎖双方の多様化を行うことによって実施した。
軽鎖の多様化：重鎖プラスミドを抽出し、約１×１０６の多様性を有する軽鎖ライブラリに形質転換した。選択は、上記のようにビオチン化ＢＡＣＥ１−ＥＣＤの滴定を用いたＭＡＣＳ選別１回及びＦＡＣＳ選別２回で行い、より高い親和性を選択した。
重鎖の多様化：ＣＤＲＨ３を、１×１０８の多様性を有するＣＤＲＨ１及びＣＤＲＨ２変異体を有する事前に作製したライブラリ内へ組み換え、選択を上記のように行った。抗原抗体酵母複合体を、親Ｆａｂまたは非ビオチン化抗原で、異なる時間にわたってインキュベートすることで親和性圧力を適用し、最も高い親和性の抗体を選択した。多様化のさらなるサイクルは、重鎖及び軽鎖のエラープローンＰＣＲベースの突然変異形成を利用した。選択は、全３回に対してＦＡＣＳ選別を用い、Ｆａｂ圧力の時間を増やして、前のサイクルと同様に行った。
７８個の抗体が、配列決定及びさらなる特徴付けのために選択プロセスから選択された。７８個の抗体の重鎖及び軽鎖ＨＶＲがそれぞれ図１及び２に示される。重鎖及び軽鎖可変領域配列がそれぞれ図３及び４に示される。
抗体は、２つの異なるエピトープビンであることが決定された。各抗体に対するエピトープビン（ビン「２」またはビン「３」のいずれか）が図１〜４に示される。
実施例２：抗ＢＡＣＥ１抗体の特徴付け
実施例１で選択した抗ＢＡＣＥ１抗体を、以下のアッセイを用いてさらに特徴付けした。
Ａ．Ｏｃｔｅｔ（登録商標）システムを用いた結合動態
ヒト及びマウスのＢＡＣＥ１ ＥＣＤについて、実施例１で選択した７８個の抗ＢＡＣＥ１抗体の結合親和性を、以下のようにＯｃｔｅｔ（登録商標）システム（ＦｏｒｔｅＢｉｏ）を用いて決定した。抗ＢＡＣＥ１抗体を抗ヒト捕捉（ＡＨＣ）センサー（先端）に載せ、アッセイ緩衝液中６０秒間のベースラインに従った。次に、２００ｎＭのヒトＢＡＣＥ１ ＥＣＤ（ＣＨＯ細胞で産生またはＲ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓから購入）またはネズミＢＡＣＥ１ ＥＣＤ（ＣＨＯ細胞で産生、配列番号２３１）に先端を曝した。オフ比測定のために、オフ比に応じて、先端をアッセイ緩衝液に５分間、３０分間、または１２０分間移した。アッセイ緩衝液は、ＰＢＳ＋０．１％ＢＳＡ、ｐＨ７．５、またはＰＢＳ＋０．１％ＢＳＡ、ｐＨ５．０のいずれかであった。動態を、１：１結合モデルを用いて分析した。
この実験の結果を図５に示す。ＫＤの前にある「＜」の記号を伴う測定値は、そのアッセイの実行関して測定可能なオフ比の下限に到達している。
Ｂ．表面プラスモン共鳴（ＢＩＡｃｏｒｅ（商標））を用いた結合動態
特定の抗ＢＡＣＥ１ ＩｇＧの結合親和性を、表面プラスモン共鳴（ＳＲＰ）によって、ＢＩＡｃｏｒｅ（商標）−Ｔ１００装置を用いて測定した。抗ＢＡＣＥ１ヒトＩｇＧを、ＣＭ５バイオセンサーチップにコーティングしたマウス抗ヒトＦｃ抗体（ＧＥ Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ，ｃａｔ＃ＢＲ−１００８−３９）で捕捉し、およそ１５０反応単位（ＲＵ）を達成した。動態測定のために、ヒトＢＡＣＥ１（Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ）の２倍連続希釈液（１２５ｎＭ〜０ｎＭ）を、ＨＢＳ−Ｐ緩衝液（０．０１ＭのＨＥＰＥＳ、ｐＨ７．４、０．１５ＭのＮａＣｌ、０．０５％ｖ／ｖ界面活性剤Ｐ２０、ＧＥ Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ）に、２５℃、３０μｌ／分の流速で注入した。会合速度（ｋオン）と解離速度（ｋオフ）は、単純一対一ラングミュア結合モデル（ＢＩＡｃｏｒｅ評価ソフトウェアバージョン３．２）を使用して計算された。平衡状態解離定数（ＫＤ）は、ｋオフ／ｋオン比として算出した。
この実験の結果を図５に示す。
Ｃ．エピトープビニング
７８個の抗体のエピトープビニングを、Ｏｃｔｅｔ（登録商標）システムを用いて実施した。簡潔に述べると、最初の抗体を複数のＡＨＣ先端に載せ、続いてアッセイ緩衝液、ｐＨ７．５中６０秒間のベースラインに従った。次いで、先端を２００ｎＭのヒトＢＡＣＥ１に１８０秒間曝し、抗原結合を可能にさせた。アッセイ緩衝液中５０μｇ／ｍｌの第２抗体を含むウェルに先端を９０秒間移す。第２の抗体が明確な結合を示す場合、それは非競合先（すなわち、第１の抗体とは異なるエピトープビンである）であると見なされる。第２の抗体が明確な結合を示さない場合、それは競合者（すなわち、第１の抗体と同一のエピトープビンである）であると見なされる。結合判定は、第１の抗体の存在下でＢＡＣＥ１に結合する第２の抗体と、自身をブロックする第１の抗体とを比較することによって行われる。第１の抗体を選択するために、上記アッセイと同様のアッセイを行い、相互に排他的な結合を示す抗体を選択する。
各抗体に対するエピトープビンが図１〜４に示される。７８個の抗体は、２つエピトープビンに分類された。
Ｄ．インビトロ阻害アッセイ
さらに、特定のＢＡＣＥ基質でのＢＡＣＥ１タンパク質分解活性を調節する抗体の能力を、ＨＴＲＦアッセイを用いてインビトロで評価した。
第１のアッセイでは、特定の抗ＢＡＣＥ１抗体を反応緩衝液（５０ｍＭ酢酸Ｎａ、ｐＨ４．４、０．１％ＣＨＡＰＳ）で約０．６μＭに希釈した。ＢＡＣＥ１ ＥＣＤを、反応緩衝液で０．３μＭまで希釈した。３μＬのＢＡＣＥ１及び３μＬの抗ＢＡＣＥ１抗体を、３８４ウェルプレートのウェル内で合わせて、３０分間インキュベートした。ＦＲＥＴ短基質Ｍｃａ−ＳＥＶＮＬＤＡＥＦＲＫ（Ｄｎｐ）ＲＲ−ＮＨ２（Ｍｃａ：（７−メトキシクマリン−４−イル）アセチル、Ｄｎｐ：２，４−ジニトロフェニル；Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ）（配列番号１８４）３μＬを添加し、パルススピンで混合した。切断された基質の蛍光を１０分ごとに１時間にわたってモニターした（励起３２０ｎｍ、発光４０５ｎｍ）。各抗ＢＡＣＥ１抗体を４回反復して試験した。ＢＡＣＥ１活性の調節は、（（遊離酵素活性）−（ＩｇＧ：エンキシム（ｅｎｘｙｍｅ）活性）／（遊離酵素活性）として計算した。正の値は阻害を表し、負の値は活性化を表す。
この実験の結果を図６に示す。この短基質アッセイでは、酵素阻害（陽性パーセンテージ）及び酵素活性化（陰性値）の両方が観察された。
第２のアッセイでは、特定の抗ＢＡＣＥ１抗体を以下のようにＨＴＲＦアッセイで試験した。ＢＡＣＥ１切断に対する感受性を増加させるための置換を有するアミロイド前駆体タンパク質ＢＡＣＥ１切断部位ペプチドである、３７５ｎＭのＢｉ２７（ビオチン−ＫＴＥＥＩＳＥＶＮＬＤＡＥＦＲＨＤＳＧＹＥＶＨＨＱＫＬ（配列番号１８３）、Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｐｅｐｔｉｄｅ Ｃｏｍｐａｎｙ）２マイクロリットルを、３８４ウェルプレート（Ｐｒｏｘｉｐｌａｔｅ（商標）、Ｐｅｒｋｉｎ−Ｅｌｍｅｒ）において、ＢＡＣＥ反応緩衝液（５０ｍＭ酢酸ナトリウムｐＨ４．４及び０．１％ＣＨＡＰＳ）中の抗ＢＡＣＥ抗体でプリインキュベートした、３μＬの１２５ｎＭのＢＡＣＥ１と組み合わせた。タンパク質分解反応混合物を周囲温度で７５分間インキュベートし、検出緩衝液（２００ｍＭトリス、ｐＨ８．０、２０ｍＭのＥＤＴＡ、０．１％ＢＳＡ、及び０．８ＭのＫＦ）中の２ｎＭのストレプトアビジン−Ｄ２及びユーロピウムクリプテートで標識した１５０ｎＭの６Ｅ１０抗アミロイドベータ抗体（Ｃｏｖａｎｃｅ、Ｅｍｏｒｙｖｉｌｌｅ、ＣＡ）を含有する５μＬのＨＴＲＦ検出混合物を添加してクエンチした。最終反応混合物を周囲温度で６０分間インキュベートし、ＥｎＶｉｓｉｏｎ Ｍｕｌｔｉｌａｂｅｌ Ｐｌａｔｅ Ｒｅａｄｅｒ（商標）（Ｐｅｒｋｉｎ−Ｅｌｍｅｒ）を用いてＴＲ−ＦＲＥＴシグナルを３２０ｎｍの励起波長及び６１５及び６６５ｎｍの発光波長で測定した。ＢＡＣＥ１酵素を欠いている反応及び抗ＢＡＣＥ１抗体を欠いている反応を対照として用いた。さらに、短ＦＲＥＴぺプチド（Ｒｈ−ＥＶＮＬＤＡＥＦＫ−クエンチャー（配列番号１８５）、Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）を用いた反応も、上記のＨＴＲＦ反応と同様に実施した。
ＢＡＣＥ１合成ペプチド阻害剤、ＯＭ９９−２（ＣａｌＢｉｏｃｈｅｍ（登録商標）、カタログ＃４９６０００）を対照として用いた。対照の反応から得られた蛍光発生生成物を、励起波長５４５ｎｍ及び発光波長５８５ｎｍで、上記のように測定した。得られたデータをＧｒａｐｈＰａｄ Ｐｒｉｓｍ ５（商標）（ＬａＪｏｌｌａ、ＣＡ）を用いて分析した。
この実験の結果を図７に示す。「減少する」データモードは阻害を示し、「増加する」データモードは活性化を示した。
いかなる特定の理論にも束縛されることを意図することなく、アロステリック阻害剤による酵素活性の調節は、場合によっては、基質に応じて活性の活性化または阻害のいずれかをもたらし得る。例えば、アロステリック阻害剤によって引き起こされる立体配座の変化は、１つの基質のより良好な結合を引き起こし得、また、別の基質の結合を妨害し得、結果として、異なるまたは反対の活性調節をもたらし得る。
Ｅ．初代培養におけるインビボ活性アッセイ
ＡＰＰ処理に対する抗ＢＡＣＥ１抗体の観察されたインビトロ阻害作用が細胞状況で存在するかどうかを判定するために、インビボでの試験を行った。内因性レベルの野生型ヒトアミロイド前駆体タンパク質を発現するマウス皮質ニューロンの初代培養におけるＡβｘ−４０産生を阻害する抗体の能力を以下のように評価した。簡潔には、解離した皮質ニューロン培養物をＥ１６．５ ＣＤ１マウスから調製した。ニューロンを９６ウェルプレートに２．５×１０４細胞／ウェルの密度で播種し、インビトロのＮｅｕｒｏｂａｓａｌ培地（Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）で５日間増殖させた。８点の希釈系列で調製した抗ＢＡＣＥ抗体または対照ＩｇＧ１を含有する５０μｌの新鮮な培地をニューロンと共に３７℃で２４時間インキュベートした。細胞上清を採取し、サンドイッチＥＬＩＳＡを用いてマウスＡβＸ−４０の存在についてアッセイした。簡潔に述べると、Ａβｘ−４０（Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ，Ｂｅｄｆｏｒｄ，ＭＡ）のＣ末端に特異的なウサギポリクローナル抗体をプレート上にコーティングし、ビオチン化抗マウスＡβモノクローナル抗体Ｍ３．２（Ｃｏｖａｎｃｅ、Ｄｅｄｈａｍ、ＭＡ）を検出のために使用した。このアッセイは、血漿中１．９６ｐｇ／ｍｌ及び脳内３９．１ｐｇ／ｇの定量値の下限を有していた。ＣｅｌｌＴｉｔｅｒ−Ｇｌｏ Ｌｕｍｉｎｅｓｃｅｎｔ Ｃｅｌｌ Ｖｉａｂｉｌｉｔｙ Ａｓｓａｙ（Ｐｒｏｍｅｇａ）を用いて測定した通りに、Ａβｘ−４０値を細胞生存率に対して正規化した。４パラメータの非線形回帰曲線あてはめプログラム（Ｐｒｉｓｍ，Ｇｒａｐｈｐａｄ）を用いてデータをプロットした。
この実験の結果を図８に示す。阻害パーセントは、各抗体で見られる最大阻害（対照の％として）を意味する。阻害パーセントは、次のように決定された：（ベースラインＡβｘ−４０−最小Ａβｘ−４０）／ベースラインＡβｘ−４０ ＊１００（ベースラインＡβｘ−４０にはいずれの治療も不在である）。
同様の実験を抗体６２６６及びＹＷ４１２．８．３１で行った。
この実験の結果を図９に示す。抗体ＹＷ４１２．８．３１が示した２．９ｎＭのＩＣ５０及び６２％の最大阻害と比べて、抗体６２６６は、１．７ｎＭのＩＣ５０及び７９％の最大阻害を有した（ＰＣＴ公開第ＷＯ２０１２／０６４８３６Ａ１号を参照）。
Ｆ．マウスにおけるインビボ活性アッセイ
アミロイド形成処理を調節する抗ＢＡＣＥ１抗体の能力も、野生型マウスにおいて評価した。８週齢の野生型Ｃ５７Ｂｌ／６Ｊマウス（１群当たりｎ＝６）への腹腔内（ＩＰ）注射によって、対照ＩｇＧ抗体または抗ＢＡＣＥ１抗体（１００ｍｇ／ｋｇ）の単回投与を全身に送達した。２４時間後、脳試料を採取してＰＢＳ灌流を行った後、一方の半脳から得た前脳を５ＭのＧｕＨＣＬ、５０ｍＭのＴｒｉｓ、ｐＨ ８．０で均質化し、さらにカゼインブロッキング緩衝液（０．２５％カゼイン／０．０５％アジ化ナトリウム、２０μｇ／ｍｌアプロチニン／５ｍＭのＥＤＴＡ、ｐＨ８．０／ＰＢＳ中１０μｇ／ｍｌロイペプチン）でＡβｘ−４０分析のために希釈した。脳の総マウスＡβｘ−４０の濃度を、サンドイッチＥＬＩＳＡを用いて決定した。簡潔に述べると、Ａβ１−４０（Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ，Ｂｅｄｆｏｒｄ，ＭＡ）のＣ末端に特異的なウサギポリクローナル抗体をプレート上にコーティングし、ビオチン化抗マウスＡβモノクローナル抗体Ｍ３．２（Ｃｏｖａｎｃｅ，Ｄｅｄｈａｍ，ＭＡ）を検出のために使用した。このアッセイは、血漿中１．９６ｐｇ／ｍｌ及び脳内３９．１ｐｇ／ｇの定量値の下限を有していた。
この実験の結果を図１０に示す。抗体５８８４の投与は、マウスの脳におけるＡβｘ−４０レベルの最も大きい低下を示した。抗体６２２６は、抗体５８８４に由来し、及び重鎖（ＨＶＲ−Ｈ１）における２つの位置でのみ変化する。
Ｇ．カニクイザルにおける薬物動態
抗体６２６６及び抗体６３１０のＰＫプロファイルを、抗体ＹＷ４１２．８．３１のＰＫプロファイルを比較した（ＰＣＴ公開第ＷＯ２０１２／０６４８３６Ａ１号を参照）。抗体は、１０ｍｇ／ｋｇの単回の静脈内（ＩＶ）投薬で投与された。各抗体を４匹のサルに投与した。血清の抗体濃度を次の時点で測定した：投薬の７日前、投薬から１５分及び８時間後、ならびに投薬から１、３、７、１０、１４、１７、２１、２８、３５及び４２日後。カニクイザル血清中の投薬された抗体の濃度を、ヒツジ抗ヒトＩｇＧサル吸着抗体コーティングを用い、次に１：１００の希釈で開始して血清試料を添加し、最後に検出のために吸着された西洋わさびペルオキシダーゼサルに複合したヤギ抗ヒトＩｇＧ抗体を添加して、ＥＬＩＳＡで測定した。アッセイは、０．７８〜５０ｍｇ／ｍＬの標準曲線範囲及び０．０８ｍｇ／ｍＬの検出限界を有していた。この検出限界の以下の結果は、それほど報告価値がないもの（ＬＴＲ）として報告された。
この実験の結果を図１１に示す。抗体６２６６のカニクイザルの薬物動態では、ＹＷ４１２．８．３１と比較して、顕著な違いは観察されなかった。抗体６３１０はＹＷ４１２．８．３１よりおよそ２倍速く除去された。
実施例３：６２６６抗体の親和性成熟
抗体６２６６は、次のように親和性成熟した。
ＮＮＫウォークライブラリ設計及びファージパンニング
ライブラリランダム化のために、ＣＤＲの各位置を、「ＮＮＫ」コドンでオリゴヌクレオチド指向性突然変異生成によってランダム化したが、この場合、Ｎは４つの天然ヌクレオチドのいずれかであり、Ｋは５０％Ｔ（チミン）及び５０％Ｇ（グアニン）である。ＮＮＫコドンは、２０個の天然アミノ酸のいずれかをコードし得る。軽鎖及び重鎖のためのライブラリは別々に作製され、各鎖の３つのＣＤＲはそれぞれ同時にランダム化した。これによって、各ＣＤＲに最大１つの突然変異を伴う０〜３つのランダムなアミノ酸変化を各鎖に有するクローンがもたらされる。ライブラリは、標準的な方法により、ファージＦａｂ断片ディスプレーベクターで作製された。連続した選択回数で５、０．５及び０．１ｎＭのビオチン化ＢＡＣＥ１でファージディスプレイライブラリをインキュベートすることによって結合クローンを選択し、次いで室温または３７℃で１００ｎＭの非ビオチン化ＢＡＣＥ１と競合させて、ＢＡＣＥ１への親和性がより低い結合を減少させた。結合したクローンを、ニュートラアビジンでコーティングしたＥＬＩＳＡプレート上で捕捉し、洗浄し、室温で２０分間、１００ｍＭのＨＣｌで溶離した。溶離したファージを、１／１０容量の１ＭトリスｐＨ８．０で中和し、次の選択回のための増幅のために大腸菌を感染させるのに用いた。
ディープシーケンシング及びデータ分析
ディープ配列決定のために、ファージミドＤＮＡを選択された回から単離した。各試料からのＶＨ及びＶＬセグメントを、Ｐｈｕｓｉｏｎ ＤＮＡポリメラーゼ（Ｎｅｗ Ｅｎｇｌａｎｄ Ｂｉｏｌａｂｓ）を用いた１８サイクルＰＣＲ増幅によって増幅した。アンプリコンを２％アガロースゲルで精製した。アンプリコンは、ＴｒｕＳｅｑ ＤＮＡ Ｓａｍｐｌｅ Ｐｒｅｐ（Ｉｌｌｕｍｉｎａ）を使用して、標準イルミナライブラリ調製法を用いて調製した。アダプター連結ライブラリをＰＣＲの単一サイクルに供し、Ｉｌｌｕｍｉｎａ ＭｉＳｅｑ上で、アンプリコンの完全長を包含する対となる末端２００ｂｐまたは３００ｂｐを適切に配列決定した。配列決定データは、統計的プログラミング言語ＲとＳｈｏｒｔＲｅａｄパッケージを使用して解析された。同定されたＣＤＲ配列について品質管理を行い、各ＣＤＲ配列を正確な長さについて検査し、最大１つＮＮＫ突然変異のみを有し、及び、非ＮＮＫ突然変異を一切有さないようにした。すべてのランダム化された位置のすべての突然変異の頻度を計算し、位置の重み行列を作成した。以前にＦｏｗｌｅｒらが説明したように、選別された試料中の所与の位置における所与の突然変異の頻度を、選別されていない試料中の全く同じ突然変異の頻度で割ることによって、すべての単一突然変異の濃縮比を計算した。二重突然変異の濃縮比は、３つめのＮＮＫ突然変異は無視して２つの所与の位置にＮＮＫ突然変異を有するクローンすべての濃縮比を計算することで得た。サンプリング効果を除外するために、選別されたサンプルまたは選別されていないサンプルのいずれかで１０個未満の配列カウントを有する突然変異の対を分析から除外した。エピスタシスは、乗法モデルでの単一突然変異及び二重突然変異の濃縮比を組み合わせることによって計算した：濃縮ＡＢ＝濃縮Ａ×濃縮Ｂ。したがって、用いられるエピスタシスは、次のように定義される：エピスタシス＝濃縮ＡＢ−濃縮Ａ×濃縮Ｂ。単一突然変異解析及び二重突然変異解析から得られた最も高い濃縮突然変異を合成のために選択した。
図１２及び１３は、親和性成熟抗体６２６６変異体１〜１５の重鎖及び軽鎖可変領域配列を示す。
表面プラスモン共鳴を用いた親和性決定
ＢＩＡｃｏｒｅ（商標）Ｔ２００装置による表面プラズモン共鳴（ＳＲＰ）測定を用いて、単一サイクル動態による抗ＢＡＣＥ１ Ｆａｂ抗体の結合親和性を測定した。簡潔に述べると、シリーズＳセンサーチップＣＭ５を製造者の指示に従ってＥＤＣ及びＮＨＳ試薬で活性化し、抗Ｈｉｓ抗体を結合させておよそ１０００応答単位（ＲＵ）を達成し、次いで未反応基を１Ｍエタノールアミンでブロッキングした。動態測定のために、ＨｉｓでタグしたＢＡＣＥ１タンパク質を最初に１０μｌ／分の流速で注入し、ＦＣ１（参照）を除いた３つの異なるフローセル（ＦＣ）でおよそ１００ＲＵを捕捉し、次いで、Ｆａｂの５倍連続希釈液を含むＨＢＳ−Ｐ緩衝液（０．０１ＭのＨＥＰＥＳ、ｐＨ７．４、０．１５ＭのＮａＣｌ、０．００５％、界面活性剤Ｐ２０）を、低濃度（０．０８ｎＭ）〜高濃度（５０ｎＭ）で、注入間に再成されない同一サイクル内で次々と注入した（流速：３０μｌ／分）。センサーグラムを記録し、ＢＩＡｃｏｒｅ（商標）Ｔ２００評価ソフトウェア（バージョン２．０）で評価する前に、参照と緩衝液の減算を行った。会合速度（ｋオン）及び解離速度（ｋオフ）は、単純一対一ラングミュア結合モデルを使用して計算された。平衡状態解離定数（Ｋｄ）は、ｋオフ／ｋオン比として算出された。
示差走査型蛍光測定（ＤＳＦ）による熱溶融温度（Ｔｍ）決定
ＤＳＦは、蛍光色素の存在下でのタンパク質の熱アンフォールディングをモニターし、典型的には、リアルタイムＰＣＲ装置（例えば、Ｂｉｏ−Ｒａｄ ＣＦＸ）を使用することによって実行される。ＳＹＰＲＯオレンジ色素（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ、カタログ番号Ｓ６６５０）をＰＢＳで１：２０に希釈する。希釈した色素１μｌを、ウェル中２４μｌのＦａｂタンパク質（約１００ｕｇ／ｍｌ）に添加する。リアルタイムＰＣＲ装置（Ｂｉｏ−Ｒａｄ ＣＦＸ）で温度が２０℃から１００℃に上昇するにつれ、蛍光強度がプロットされ、転移曲線の変曲点（Ｔｍ）は、例えば、ボルツマン方程式を用いて算出される。Ｎａｔｕｒｅ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ，２００７，２：２２１２−２２２１を参照されたい。
図１４は、親和性成熟抗体６２６６変異体１〜１５の会合速度、解離速度、解離定数、及び融解温度を示す。変異体はすべて、抗体６２６６と比べて改善された親和性（ＫＤ）を示した。
前述の発明は、理解を明確にするために、例示及び実施例によって詳細に説明されているが、説明及び実施例は、本発明の範囲を限定するものと解釈されるべきではない。本明細書中に引用されるすべての特許及び科学文献の開示は、参照によりその全体が明示的に組み込まれる。
配列表
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Claims (40)

  1. ＢＡＣＥ１に結合する単離抗体であって、前記抗体は、
    配列番号１５、２１８及び２２２〜２２４から選択されるＨＶＲ−Ｈ１配列；配列番号２９、２１９及び２２５から選択されるＨＶＲ−Ｈ２配列；配列番号５２、２２０、２２１、２２６及び２２７から選択されるＨＶＲ−Ｈ３配列；配列番号６５のＨＶＲ−Ｌ１配列；配列番号７１、７３及び２１７から選択されるＨＶＲ−Ｌ２配列；配列番号８０のＨＶＲ−Ｌ３配列を含む、前記単離抗体。
  2. それぞれ、配列番号
    （ａ）１５、２９、５２、６５、７１及び８０；
    （ｂ）２１８、２１９、５２、６５、７１及び８０；
    （ｃ）２１８、２１９、５２、６５、７３及び８０；
    （ｄ）２１８、２１９、５２、６５、２１７及び８０；
    （ｅ）２１８、２１９、２２０、６５、７３及び８０；
    （ｆ）２１８、２１９、２２０、６５、２１７及び８０；
    （ｇ）２１８、２１９、２２１、６５、２１７及び８０；
    （ｈ）２２２、２９、２２６、６５、２１７及び８０；
    （ｉ）２２２、２９、２２６、６５、７３及び８０；
    （ｊ）１５、２９、５２、６５、７３及び８０；
    （ｋ）１５、２９、５２、６５、２１７及び８０；
    （ｌ）２２３、２９、５２、６５、７１及び８０；
    （ｍ）２２４、２９、５２、６５、７１及び８０；
    （ｎ）１５、２２５、２２７、６５、７１及び８０；
    （ｏ）１５、２９、２２１、６５、７１及び８０
    の、ＨＶＲ−Ｈ１、ＨＶＲ−Ｈ２、ＨＶＲ−Ｈ３、ＨＶＲ−Ｌ１、ＨＶＲ−Ｌ２及びＨＶＲ−Ｌ３を含む、請求項１に記載の単離抗体。
  3. ａ）配列番号１３８、１９４〜２００及び２０９〜２１６から選択される配列と少なくとも９０％の配列同一性を有する重鎖可変ドメイン配列；または
    ｂ）配列番号１５６、１８７〜１９３及び２０１〜２０８から選択される配列と少なくとも９０％の配列同一性を有する軽鎖可変ドメイン配列；または
    ｃ）（ａ）に記載の重鎖可変ドメイン配列及び（ｂ）に記載の軽鎖可変ドメイン配列を含む、請求項１または請求項２に記載の単離抗体。
  4. ａ）配列番号１３８、１９４〜２００及び２０９〜２１６から選択される重鎖可変ドメイン配列；または
    ｂ）配列番号１５６、１８７〜１９３及び２０１〜２０８から選択される軽鎖可変ドメイン配列；または
    ｃ）（ａ）に記載の重鎖可変ドメイン配列及び（ｂ）に記載の軽鎖可変ドメイン配列
    を含む、請求項３に記載の単離抗体。
  5. ＢＡＣＥ１の活性を調節する、請求項1〜４のいずれか１項に記載の単離抗体。
  6. ＢＡＣＥ１の活性を阻害する、請求項５に記載の単離抗体。
  7. ＢＡＣＥ１活性が、均一時間分解蛍光（ＨＴＲＦ）アッセイを用いて測定される、請求項５または請求項６に記載の単離抗体。
  8. ＢＡＣＥ１活性が、ＢＡＣＥ１基質を発現する細胞株を用いて測定される、請求項５または請求項６に記載の単離抗体。
  9. 前記ＢＡＣＥ１基質がアミロイド前駆体タンパク質（ＡＰＰ）である、請求項８に記載の単離抗体。
  10. ＢＡＣＥ１活性が、抗ＢＡＣＥ１抗体を投与された動物由来の組織で測定される、請求項５または請求項６に記載の単離抗体。
  11. 前記組織が脳組織である、請求項１０に記載の単離抗体。
  12. 前記動物が、マウス、ラット、ウサギ、イヌ、サル及び非ヒト霊長類から選択される、請求項１０または請求項１１に記載の単離抗体。
  13. ＢＡＣＥ１の活性のアロステリック阻害剤である、請求項１〜１２のいずれか１項に記載の単離抗体。
  14. 表面プラズモン共鳴（ＳＰＲ）によって測定される０．１ｎＭ〜１０ｎＭ、または０．１ｎＭ〜８ｎＭ、または０．１ｎＭ〜７ｎＭ、または０．１ｎＭ〜５ｎＭ、または０．５ｎＭ〜５ｎＭ、または０．１ｎＭ〜３ｎＭ、または０．５ｎＭ〜３ｎＭの親和性（ＫＤ）でＢＡＣＥ１と結合する、請求項１〜１３のいずれか１項に記載の単離抗体。
  15. 解離した皮質のニューロンの培養アッセイを用いて測定されたときに６０％超、７０％超、７５％超または８０％超のＢＡＣＥ１活性の最大阻害を達成する、請求項１〜１４のいずれか１項に記載の単離抗体。
  16. モノクローナル抗体である、請求項１〜１５のいずれか１項に記載の単離抗体。
  17. ヒト抗体またはキメラ抗体である、請求項１〜１６のいずれか１項に記載の単離抗体。
  18. 抗体断片である、請求項１〜１７のいずれか１項に記載の単離抗体。
  19. 前記抗体断片が、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆａｂ’−ＳＨ、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆｖ及びｓｃＦｖから選択される、請求項１８に記載の単離抗体。
  20. 完全長ＩｇＧ１抗体である、請求項１〜１７のいずれか１項に記載の単離抗体。
  21. 請求項１〜２０のいずれか１項に記載の抗体をコードする、単離核酸。
  22. 請求項２１に記載の核酸の分子を含む宿主細胞。
  23. 抗体を産生する方法であって、請求項２２に記載の宿主細胞を培養して前記抗体を産生する、前記方法。
  24. 請求項１〜２０のいずれか１項に記載の抗体及び細胞傷害性薬剤を含む、イムノコンジュゲート。
  25. 請求項１〜２０のいずれか１項に記載の抗体及び薬学的に許容される担体を含む、医薬製剤。
  26. 有効量の請求項１〜２０のいずれか１項に記載の抗体を含む、神経系の疾患または障害を有する個体を治療するための医薬。
  27. 有効量の請求項１〜２０のいずれか１項に記載の抗体を含む、神経系の疾患または障害に罹患しているまたはそれに罹患するリスクのある患者においてアミロイド斑を減少させるための医薬。
  28. 有効量の請求項１〜２０のいずれか１項に記載の抗体を含む、神経系の疾患または障害に罹患しているまたはそれが進行するリスクのある患者においてアミロイド斑形成を阻害するための医薬。
  29. 前記神経系の疾患または障害が、アルツハイマー病（ＡＤ）、外傷性脳損傷、脳卒中、緑内障、認知症、筋ジストロフィー（ＭＤ）、多発性硬化症（ＭＳ）、筋萎縮性側索硬化症（ＡＬＳ）、嚢胞性繊維症、アンジェルマン症候群、リドル症候群、パジェット病、外傷性脳損傷、レヴーィ小体病、ポリオ後遅発性筋萎縮症、シャイ・ドレーガー症候群、オリーブ橋小脳萎縮、パーキンソン病、多系統萎縮症、線条体黒質変性症、核上麻痺、牛海綿状脳症、スクラピー、クロイツフェルト・ヤコブ症候群、クールー、ゲルストマン・シュトロイスラー・シャインカー病、慢性消耗病、致死性家族性不眠症、球麻痺、運動ニューロン疾患、カナバン病、ハンチントン舞踏病、ニューロンセロイド脂褐素症、アレキサンダー病、トゥーレット症状群、メンケス縮れ毛症候群、コケーン症候群、ハラーフォルデン・シュパッツ症候群、ラフォーラ病、レット症候群、肝レンズ核変性症、レッシュ・ナイハン症候群及びウンフェルリヒト・ルントボルク症候群、ピック病及び脊髄小脳失調症からなる群から選択される、請求項２６〜２８のいずれか１項に記載の医薬。
  30. 前記神経系の疾患または障害が、アルツハイマー病、脳卒中、外傷性脳損傷及び緑内障からなる群から選択される、請求項２９に記載の医薬。
  31. 有効量の請求項１〜２０のいずれか１項に記載の抗体を含む、患者のアミロイド−β（Ａβ）タンパク質を低下させるための医薬。
  32. 前記患者が、神経系の疾患または障害に罹患しているまたはそれに罹患するリスクがある、請求項３１に記載の医薬。
  33. 前記神経系の疾患または障害が、アルツハイマー病、脳卒中、外傷性脳損傷及び緑内障からなる群から選択される、請求項３２に記載の医薬。
  34. 請求項１〜２０のいずれか１項に記載の抗体を含む、患者の神経系の疾患または障害を診断するためのキットであって、前記抗体が、前記患者から単離した生体試料と、前記抗体がＢＡＣＥ１ポリペプチドに結合するのに適した条件下で接触させられ、かつ複合体が、前記抗体と前記ＢＡＣＥ１ポリペプチドとの間で形成されるかどうかを検出する、前記キット。
  35. 患者が抗ＢＡＣＥ１抗体での治療に適格であるかどうかを決定する方法であって、前記患者から単離した生体試料と、請求項１〜２０のいずれか１項に記載の抗体とを、前記抗体がＢＡＣＥ１ポリペプチドに結合するのに適した条件下で接触させること、及び、複合体が前記抗体と前記ＢＡＣＥ１ポリペプチドとの間で形成されるかどうかを検出することを含み、前記抗体とＢＡＣＥ１ポリペプチドとの間の複合体の存在は、患者が抗ＢＡＣＥ１抗体での治療に適格であることを示す、前記方法。
  36. 請求項１〜２０のいずれか１項に記載の抗体を含む、患者が抗ＢＡＣＥ１抗体での治療に適格であるかどうかを決定するためのキットであって、前記抗体が、前記患者から単離した生体試料と、前記抗体がＢＡＣＥ１ポリペプチドに結合するのに適した条件下で接触させられ、複合体が、前記抗体と前記ＢＡＣＥ１ポリペプチドとの間で形成されるかどうかを検出され、かつ前記抗体とＢＡＣＥ１ポリペプチドとの間の複合体の存在が、患者が抗ＢＡＣＥ１抗体での治療に適格であることを示す、前記キット。
  37. 前記生体試料が、血清、血漿、唾液、胃液分泌、粘液、脳脊髄液、リンパ液、神経組織、脳組織、心臓組織または血管組織からなる群から選択される、請求項３４または３６に記載のキット。
  38. 医薬の製造における請求項１〜２０のいずれか１項に記載の抗体の使用。
  39. 前記医薬が、アルツハイマー病（ＡＤ）、外傷性脳損傷、脳卒中、緑内障、認知症、筋ジストロフィー（ＭＤ）、多発性硬化症（ＭＳ）、筋萎縮性側索硬化症（ＡＬＳ）、嚢胞性繊維症、アンジェルマン症候群、リドル症候群、パジェット病、外傷性脳損傷、レーヴィ小体病、ポリオ後遅発性筋萎縮症、シャイ・ドレーガー症候群、オリーブ橋小脳萎縮、パーキンソン病、多系統萎縮症、線条体黒質変性症、核上麻痺、牛海綿状脳症、スクラピー、クロイツフェルト・ヤコブ症候群、クールー、ゲルストマン・シュトロイスラー・シャインカー病、慢性消耗病、致死性家族性不眠症、球麻痺、運動ニューロン疾患、カナバン病、ハンチントン舞踏病、ニューロンセロイド脂褐素症、アレキサンダー病、トゥーレット症状群、メンケス縮れ毛症候群、コケーン症候群、ハラーフォルデン・シュパッツ症候群、ラフォーラ病、レット症候群、肝レンズ核変性症、レッシュ・ナイハン症候群及びウンフェルリヒト・ルントボルク症候群、ピック病及び脊髄小脳失調症からなる群から選択される神経系の障害を治療するためのものである、請求項３８に記載の使用。
  40. 前記医薬がアミロイド−β（Ａβ）タンパク質産生を減少及び／または阻害するためのものである請求項３９に記載の使用。
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