JP6312591B2 - 多能性幹細胞からの胚体内胚葉の効率的な誘導 - Google Patents
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Description
DO:あらゆる処理の前の未分化細胞
Ctrl:Chir処理なしD1。薬物刺激期間において細胞をRPMIに維持し、続いてAA D2およびD3以降からAA+血清代替物(serum replacement)(B27)。
D'Am:Chir処理なし、Kroonら、Nat.Biotech.、2008に従ったプロトコール(1日間のアクチビンA 100ng/ml+Wnt 25ng/ml、2日間のアクチビンA 1OOng/ml+0.2%FBS)。
D1:Chir添加後1日目
D2〜4:AA添加後1〜3日目
全遺伝子発現グラフは、Log10値を示す。
図2は無処理細胞と比較した、hES SA121(図2A)およびchIPS4(図2B)における24時間のCHIR処理後(D1)のPSマーカー、ブラキュリ(Brachyury)(T)、MIXL1、EOMESおよびグースコイド(Goosecoid)(GSC)の転写発現を示す図である。ICCによりTタンパク質レベルも確認した(図2C)。24時間CHIR処理後のT倍数(fold)誘導は、未分化細胞(n>60)と比較して500〜100000の間に及んだ。バーは、未分化細胞DOと相対的なLog10値を示す。
図3はCHIRで前処理していない細胞と比較した、CHIRをアクチビンA(AA)に置き換えた1日後のDEマーカー(SOX17、CXCR4、FOXA2、CER)の遺伝子発現を示す図である。hESC SA121(図3A)およびiPSC chIPS4(図3B)の両方における発現を示す。バーは、未分化細胞DOと相対的なLog10値を示す。
図4は、CHIR(3μM)、BIO(0,5uM)、Wnt3a(200ng/ml)またはAA単独(1OOng/ml)のいずれかにより、2日間AA処理(D3)に先立ち24時間(D1)処理したhESC SA121(4A〜4B)およびiPSC chIPS4(4C)細胞を示す図である。その上、D'Amour(Kroonら、2008に記載されているプロトコール)を解析した。ブラキュリおよびSOX17の発現を解析した。AAまたはBIOで最初の24時間処理したhES細胞は、3日目まで生存しなかった。
図5は、D'Amourと比較したCHIR誘導後のDEマーカーSOX17、FOXA2およびCXCR4(図5A〜図5C)ならびにOCT4(図5E)の遺伝子発現レベルと、chIPS4細胞におけるSOX17/OCT4の定量化したICCタンパク質レベル(図5D、図5F)を示す図である。OCT4およびSOX17(D1〜3)の陽性染色細胞の対応する%もTable 2(表2)に示す。2つのプロトコールのうちいずれかを用いたchIPS/SA121 DE細胞を、以前に発表されたPE分化プロトコール(Ameriら、2010)を用いて膵臓内胚葉(PE)へとさらに分化させた。PDX1タンパク質レベルのICCを用いて、7日間のPE誘導後に細胞を解析した。並行して、細胞からmRNAを収集し、chIPS4細胞(図5G)およびSA121細胞(図5H)両方のリアルタイムPCRによりPDX1発現を解析した。両方の細胞株において実験を2回反復した(図5G、図5H)。
図6は、RPMIのみ、AAおよびWnt3aまたはCHIR D1のいずれかで処理し、続いてAAまたはAAおよびWnt3a D2ならびにAA D3の組み合わせ(図6A)のいずれかにより処理した、hES SA121(図6A)またはchIPS4(図6C)におけるSOX17 D3の遺伝子発現を示す図である。細胞は、CHIR D1とAA D2(「CHIR」)、D'AmourまたはD'Amourに加えたCHIRのいずれかによっても処理し、SOX17発現(図6B)および形態(図6C)を解析した。
図7は1〜7uMの間の濃度においてCHIRを滴定し、24時間後(D1)および2日間のAA処理後(D3)に解析したことを示す図である。CHIR 0,5〜1uMおよびCHIR 7uMは、D3生存しなかった。SA121(図7A)およびchIPS細胞(図7C)において、24時間処理後にブラキュリ発現を解析した。SA121(図7B)およびchIPS細胞(図7D)において、SOX17発現をD3解析した。
図8はmTeSR系におけるCHIR前処理またはD'Amourプロトコール後のSOX17 D3の遺伝子発現を示す(図8) 図である。
図9はMEFフィーダーにおいて培養したときのDO、D2およびD3におけるマーカー、ブラキュリおよびSOX17の遺伝子発現レベルを示す図である。
a.少なくとも2μM CHIRを含む培地において幹細胞をインキュベートする第1の薬物刺激ステップであって、アクチビンAが、前記薬物刺激ステップにおいて存在しないステップと、
b.アクチビンAを含む培地において幹細胞をインキュベートする第2のそれに続くステップと
を含む方法に関する。
1. 幹細胞を胚体内胚葉へと分化させるための方法であって、
c.少なくとも2μM CHIRを含む培地において幹細胞をインキュベートする第1の薬物刺激ステップであって、アクチビンAが、前記薬物刺激ステップにおいて存在しないステップと、
d.アクチビンAを含む培地において幹細胞をインキュベートする第2のそれに続くステップと、
を含む方法。
81.幹細胞を胚体内胚葉へと分化させるための方法であって、
a.少なくとも2μM CHIRを含む培地において幹細胞をインキュベートする第1の薬物刺激ステップであって、アクチビンAが、前記薬物刺激ステップにおいて存在しないステップと、
b.少なくとも25ng/mlアクチビンAを含む培地において幹細胞をインキュベートする第2のそれに続くステップと
を含む方法。
a.少なくとも2μM CHIRを含む培地において幹細胞をインキュベートする少なくとも12時間の第1の薬物刺激ステップであって、アクチビンAが、前記薬物刺激ステップにおいて存在しないステップと、
c.少なくとも25ng/mlアクチビンAを含む培地において幹細胞をインキュベートする少なくとも12時間の第2のそれに続くステップと
を含む方法。
b.少なくとも2μM CHIRを含む培地において幹細胞をインキュベートする少なくとも24時間の第1の薬物刺激ステップであって、アクチビンAが、前記薬物刺激ステップにおいて存在しないステップと、
d.少なくとも25ng/mlアクチビンAを含む培地において幹細胞をインキュベートする少なくとも24時間の第2のそれに続くステップと
を含む方法。
a.少なくとも3,1μM CHIRを含む培地において幹細胞をインキュベートする第1の薬物刺激ステップであって、アクチビンAが、前記薬物刺激ステップにおいて存在しないステップと、
b.少なくとも25ng/mlアクチビンAを含む培地において幹細胞をインキュベートする第2のそれに続くステップと
を含む方法。
a.少なくとも3,5μM CHIRを含む培地において幹細胞をインキュベートする第1の薬物刺激ステップであって、アクチビンAが、前記薬物刺激ステップにおいて存在しないステップと、
b.少なくとも25ng/mlアクチビンAを含む培地において幹細胞をインキュベートする第2のそれに続くステップと
を含む方法。
136.幹細胞を胚体内胚葉へと分化させるための方法であって、
a.少なくとも2μM CHIRを含む培地において幹細胞をインキュベートするステップと、
b.それに続いて、アクチビンAを含む培地において幹細胞をインキュベートするステップと
を含む方法。
AA:アクチビンA
D'Am:D'Amourプロトコール(Kroonら、2008)
DE:胚体内胚葉
bFGF:塩基性線維芽細胞増殖因子(FGF2)
Gsk3b:グリコーゲン合成酵素キナーゼ3ベータ
hBSC;ヒト胚盤胞由来の幹細胞
hESC:ヒト胚性幹細胞
hIPSC:ヒト人工多能性細胞
hPSC:ヒト多能性幹細胞
KO-SR:ノックアウト血清代替物
RNA:リボ核酸
PCR:ポリメラーゼ連鎖反応
PS:原条
SOX17:SRY(性決定領域Y)-ボックス17
T:ブラキュリ
(実施例1)
ヒトES/iPS細胞のin vitro培養
2種の異なるフィーダーフリー(DEF、mTeSR)培養系および1種のフィーダー依存的(MEF-ES)培養系においてDEプロトコールを確認した。
6〜96ウェルプレートにおいて、30ng/ml bFGF(Invitrogen)および10ng/mlノギン(Peprotech)を有するDEF培養培地(Cellartis)におけるヒトフィブロネクチン(Sigma)上でヒト胚性幹(hES)細胞SA121およびchIPS4(Cellartis)を培養した。細胞を、Rock阻害剤Y-27632(Calbiochem)により単細胞継代し、実験のために40000細胞/cm2の密度で播種した。継代後4日目に実験を開始した。
hES細胞(SA121)を、フィーダー(MEF)からmTeSR1培地(Cell Signaling Techologies)におけるMatrigel(BD Biosciences)へとクラスター継代し、培養系プロトコールに従ってDispase(BD Biosciences)によりさらに継代した。クラスターが互いに触れ始めたらDEを開始した。
hES細胞(SA121)をhES培地(KO-DMEM、PEST、Glutamax、NEAA、2-メルカプトエタノール、KO血清代替物、10ng/ml bFGF)においてMEFを前播種したゼラチンコートプレートで継代した。80%集密度においてDEを開始した。
CHIR DEプロトコール
RPMIにおける0,5〜7μM CHIR99021(Stemgent)による24時間前処理前に、集密的培養物をRPMI1640(Invitrogen)において1回洗浄した。対照細胞は、RPMI中に未処理のまま置き、D'Amour細胞は、実験設定に応じてRPMI中に置くか、あるいは前処理なしでAA(Peprotech)+Wnt3a(R&D Systems)で処理した。
RNA抽出および定量的リアルタイムPCR
24時間の前処理後(D1)、1日間のAA処理の後(D2)および1〜2日間のAA+B27処理の後(D3〜4)にRNA試料を収集した。Rneasy Plus Miniキット(Qiagen)により全RNAを抽出し、StepOnePLusシステム(Applied Biosystems)を用いて定量的リアルタイムPCRを行った。
細胞をPBS+/+において洗浄し、4%ホルムアルデヒドにおいて30分間固定した(10%ホルマリン(formaline)、VWR)。次に、細胞を再度PBSにおいて3回洗浄し、染色までPBS(4℃)中に置いた。固定した細胞をPBSで1回洗浄し、次にPBSにおける0,5%Triton X-100で6分間透過処理し、PBSにおいて洗浄し、TNBバッファー(0.1M Tris-HCl pH7.5、0.15M NaCl、0.5%ブロッキング試薬(Perkin Elmer))で30分間ブロッキングした。0,1%TritonX-100+PBSにおいて一次抗体(ヤギ抗SOX17(AF1924、RnD Systems);ヤギ抗ブラキュリ(AF2085、RnD Systems);マウス抗OCT4(sc5279、SantaCruz Biotechnology);ヤギ抗PDX1(AB47383、Abcam))を1時間RTまたは4℃O/Nにて添加した。PBSにおける徹底的な洗浄ステップの後、0,1%Triton X-100+PBSにおいてDAPIと共に二次抗体を45分間RTにて添加し、PBSにおいて徹底的に洗浄し、写真ドキュメンテーション(photodocumentation)までPBS中に置いた。
スピードおよび効率
DEF培地における未分化SA121 hESおよびchIPS4 iPS細胞(DO)を、CHIRなしRPMI(Ctrl D1)において、あるいはRPMIにおけるCHIRで24時間処理(CHIR D1)して培養した。次に細胞を洗浄してCHIRの非存在を確実にし、両方の条件を1日間AAで処理した(CtrlおよびCHIR d2)。1日間のCHIR処理の後、ブラキュリ(T)、MIXL1、EOMESおよびGSC等、PSマーカーは、非前処理細胞と比較して高度に上方調節された(図2A〜図2C)。24時間CHIR処理後のT倍数誘導は、未分化細胞(dO)と比較して500〜100000の間に及んだ。ICCによりTタンパク質レベルも確認した(図2C)。
CHIR特異性
CHIR特異性(d1)を示すため、hES SA121およびChIPS4細胞を、AA添加に先立ちCHIR(3μM)、BIO(0,5uM)、Wnt3a(200ng/ml)またはAA単独(100ng/ml)のいずれかで24時間処理した。その上、D'Amour(Kroonら、2008に記載のプロトコール)を並行して検査した。
CHIR対D'Amourプロトコール(DEおよびPE誘導)
未分化ChIPS4細胞(dO)を、CHIR(3uM)で24時間前処理、あるいはKroonら、2008に従ってAA(100ng/ml)およびWnta3a(25ng/ml)に直接的に曝露した。次に細胞を洗浄し、AAを1〜4日間添加した。詳細な設定に関してはTable 1(表1)を参照されたい。
タイミング
AA+/-Wnt3a(25ng/ml)d2およびAA d3の添加に先立ち、RPMI(ctrl)、CHIR 3uM、CHIR 3uM+AA 100ng/mlまたは100ng/ml AA+25ng/ml Wnt3a(D'Amour)のいずれかにより細胞を1日間前処理した(Table 3(表3))。CtrlおよびCHIR d3においてB27を添加し、FBSをD'Amour d2〜3に添加した。
用量依存性
Chirを1〜7uMの間の濃度で滴定し、24時間Chir処理後(D1)および2日間の続くAA処理後(D3)に解析した。CHIR 0,5〜1uMおよびCHIR 7uMは、d3生存しなかった。
他の細胞培養系におけるCHIR前処理後のDE誘導
CHIR前処理後のOCT4下方調節およびT/SOX17上方調節D3における効果もまた、mTeSR等、他のhESCフィーダーフリー培養系(図8A、Table 4(表4))およびMEFフィーダーにおいて培養したhESC(図9)において、D'Amourプロトコールよりも優れていた。
Claims (13)
- 幹細胞を胚体内胚葉へと分化させるための方法であって、
a.少なくとも2μMのCHIRを含む培地において幹細胞をインキュベートする第1の薬物刺激ステップであって、アクチビンA及び他の誘導因子が、前記薬物刺激ステップにおいて存在しないステップと、
b.少なくとも60ng/mlのアクチビンAを含む培地において幹細胞をインキュベートする第2のそれに続くステップと
を含み、前記幹細胞が、ヒト胚性幹細胞または人工多能性幹細胞である方法。 - 前記培地が、RPMI-1640である、請求項1に記載の方法。
- CHIRの濃度が、少なくとも2.5μM、少なくとも3.1μM、2.5〜15μMの範囲、3.1〜15μMの範囲、3.1〜7μMの範囲、3.5〜7μMの範囲、3.5〜6μMの範囲または3.5〜5μMの範囲である、請求項1または2に記載の方法。
- CHIRの濃度が、少なくとも3.1μMである、請求項1から3のいずれか一項に記載の方法。
- CHIRの濃度が、少なくとも3.5μMである、請求項1から4のいずれか一項に記載の方法。
- CHIRとの前記インキュベーションが、少なくとも24時間である、請求項1から5のいずれか一項に記載の方法。
- アクチビンAとの前記インキュベーションが、少なくとも24時間である、請求項1から6のいずれか一項に記載の方法。
- アクチビンAとの前記インキュベーションが、48〜72時間である、請求項1から7のいずれか一項に記載の方法。
- 内胚葉細胞が、前記胚体内胚葉細胞から得られる、請求項1から8のいずれか一項に記載の方法。
- 前記内胚葉細胞が、膵臓内胚葉細胞である、請求項9に記載の方法。
- 培養培地におけるCHIRの濃度が、少なくとも2μM、少なくとも3μM、2〜15μMの範囲、3〜15μMの範囲、3.1〜15μMの範囲、3.1〜7μMの範囲、3.5〜15μMの範囲、または3.5〜7μMの範囲である、請求項1に記載の方法。
- 胚性幹細胞から原条細胞を誘導するための、培養培地におけるCHIRが少なくとも2μMの濃度である、請求項1に記載の方法。
- 胚性幹細胞から胚体内胚葉細胞を誘導するための、CHIRが3.5〜7μMの範囲内の濃度である、請求項1に記載の方法。
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