JP6085829B2 - ピリミジンジャイレースおよびトポイソメラーゼiv阻害剤 - Google Patents
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Description
本出願は、2011年1月14日に出願された米国仮特許出願第61/432,965号、2011年8月4日に出願された米国仮特許出願第61/515,174号、2011年8月4日に出願された米国仮特許出願第61/515,249号、および2011年6月20日に出願された米国仮特許出願第61/499,134号の利益を米国特許法§119の下、主張する。これら各出願の全内容が、参考として本明細書に援用される。
抗生物質に対する細菌耐性は、長い間認識されてきており、これは、今日では、深刻な世界的健康問題であると考えられている。耐性の結果として、いくつかの細菌感染症は、抗生物質で処置することが困難であり、または処置不能でさえある。この問題は、細菌のある特定の系統、例えば、Streptococcus pneumoniae(SP)、Mycobacterium tuberculosis、およびEnterococcusなどにおける多剤耐性の最近の展開を伴って特に深刻となっている。バンコマイシン耐性enterococcusの出現は、特に憂慮すべきことであった。その理由は、バンコマイシンは、以前は、この感染症を処置するための唯一の有効な抗生物質であり、多くの感染症にとって「最後の手段」の薬物であると考えられていたためである。enterococciなどの多くの他の薬物耐性細菌は、生命を危うくする疾患を引き起こさないが、耐性を誘発する遺伝子が、メチシリン耐性がすでに蔓延しているStaphylococcus aureusなどのより死に至る危険のある生物に蔓延し得るという恐怖がある(非特許文献1;非特許文献2)。
例えば、本発明は以下の項目を提供する。
(項目1)
式
(式中、Rは、水素もしくはフッ素であり、Xは、水素、−PO(OH) 2 、−PO(OH)O − M + 、−PO(O − ) 2 ・2M + 、もしくは−PO(O − ) 2 ・D 2+ であり、M + は、薬学的に許容される一価陽イオンであり、D 2+ は、薬学的に許容される二価陽イオンである)の化合物、または薬学的に許容されるその塩。
(項目2)
式
(式中、Rは、水素もしくはフッ素である)を有する項目1に記載の化合物、または薬学的に許容されるその塩。
(項目3)
式
(式中、Xは、−PO(OH) 2 、−PO(OH)O − M + 、−PO(O − ) 2 ・2M + 、もしくは−PO(O − ) 2 ・D 2+ であり、M + は、薬学的に許容される一価陽イオンであり、D 2+ は、薬学的に許容される二価陽イオンである)を有する項目1に記載の化合物、または薬学的に許容されるその塩。
(項目4)
式
(式中、Rは、水素もしくはフッ素である)を有する項目1に記載の化合物、または薬学的に許容されるその塩。
(項目5)
(R)−1−エチル−3−(5−(2−(2−ヒドロキシプロパン−2−イル)ピリミジン−5−イル)−7−(テトラヒドロフラン−2−イル)−1H−ベンゾ[d]イミダゾール−2−イル)尿素である、項目4に記載の化合物、または薬学的に許容されるその塩。
(項目6)
(R)−1−エチル−3−(6−フルオロ−5−(2−(2−ヒドロキシプロパン−2−イル)ピリミジン−5−イル)−7−(テトラヒドロフラン−2−イル)−1H−ベンゾ[d]イミダゾール−2−イル)尿素である、項目4に記載の化合物、または薬学的に許容されるその塩。
(項目7)
(R)−1−エチル−3−(5−(2−(2−ヒドロキシプロパン−2−イル)ピリミジン−5−イル)−7−(テトラヒドロフラン−2−イル)−1H−ベンゾ[d]イミダゾール−2−イル)尿素のメタンスルホン酸塩である、項目4に記載の塩。
(項目8)
(R)−1−エチル−3−(6−フルオロ−5−(2−(2−ヒドロキシプロパン−2−イル)ピリミジン−5−イル)−7−(テトラヒドロフラン−2−イル)−1H−ベンゾ[d]イミダゾール−2−イル)尿素のメタンスルホン酸塩である、項目4に記載の塩。
(項目9)
Xが、−PO(OH)O − M + 、−PO(O − ) 2 ・2M + 、または−PO(O − ) 2 ・D 2+ であり、M + が、Li + 、Na + 、K + 、N−メチル−D−グルカミン、およびN(R 9 ) 4 + (式中、各R 9 は、独立して水素もしくはC 1 〜C 4 アルキル基である)からなる群から選択され、D 2+ が、Mg 2+ 、Ca 2+ 、およびBa 2+ からなる群から選択される、項目3に記載の化合物。
(項目10)
Xが、−PO(OH)O − M + 、または−PO(O − ) 2 ・2M + であり、M + が、Li + 、Na + 、K + 、N−メチル−D−グルカミン、およびN(R 9 ) 4 + (式中、各R 9 は、独立して水素もしくはC 1 〜C 4 アルキル基である)からなる群から選択される、項目9に記載の化合物。
(項目11)
Xが−PO(O − ) 2 ・2M + であり、M + が、Li + 、Na + 、K + 、N−メチル−D−グルカミン、およびN(R 9 ) 4 + (式中、各R 9 は、独立して水素またはC 1 〜C 4 アルキル基である)からなる群から選択される、項目9に記載の化合物。
(項目12)
M + がNa + である、項目9に記載の化合物。
(項目13)
(R)−2−(5−(2−(3−エチルウレイド)−6−フルオロ−7−(テトラヒドロフラン−2−イル)−1H−ベンゾ[d]イミダゾール−5−イル)ピリミジン−2−イル)プロパン−2−イルリン酸二ナトリウムである、項目3に記載の化合物。
(項目14)
項目1に記載の化合物または薬学的に許容されるその塩、および薬学的に許容される担体、アジュバント、もしくはビヒクルを含む、医薬組成物。
(項目15)
項目2に記載の化合物または薬学的に許容されるその塩、および薬学的に許容される担体、アジュバント、もしくはビヒクルを含む、医薬組成物。
(項目16)
項目3に記載の化合物または薬学的に許容されるその塩、および薬学的に許容される担体、アジュバント、もしくはビヒクルを含む、医薬組成物。
(項目17)
生物学的試料中のStreptococcus pneumoniae、Staphylococcus epidermidis、Enterococcus faecalis、Staphylococcus aureus、Clostridium difficile、Moraxella catarrhalis、Neisseria gonorrhoeae、Neisseria meningitidis、Mycobacterium avium complex、Mycobacteriumabscessus、Mycobacterium kansasii、Mycobacterium ulcerans、Chlamydophila pneumoniae、Chlamydia trachomatis、Haemophilus influenzae、Streptococcus pyogenes、またはβ−溶血性streptococciの細菌量を減少させるか、または抑制する方法であって、前記生物学的試料を項目1に記載の化合物と接触させるステップを含む、方法。
(項目18)
患者における院内または非院内細菌感染症を制御、処置、またはその進行、重症度、もしくは影響を低減する方法であって、前記患者に、項目1に記載の化合物を投与するステップを含む、方法。
(項目19)
前記細菌感染症が、Streptococcus pneumoniae、Staphylococcus epidermidis、Enterococcus faecalis、Staphylococcus aureus、Clostridium difficile、Moraxella catarrhalis、Neisseria gonorrhoeae、Neisseria meningitidis、Mycobacterium avium complex、Mycobacterium abscessus、Mycobacterium kansasii、Mycobacterium ulcerans、Chlamydophila pneumoniae、Chlamydia trachomatis、Haemophilus influenzae、Streptococcus pyogenes、またはβ−溶血性streptococciのうちの1つまたは複数の存在を特徴とする、項目18に記載の方法。
(項目20)
前記細菌感染症が、以下、即ち、上気道感染症、下気道感染症、耳感染症、胸膜肺感染症および気管支感染症、複雑性尿路感染症、単純性尿路感染症、腹腔内感染症、心血管感染症、血流感染症、敗血症、菌血症、CNS感染症、皮膚感染症および軟部組織感染症、GI感染症、骨関節症および関節感染症、生殖器感染症、眼感染症、または肉芽腫性感染症、単純性皮膚および皮膚構造感染症(uncomplicated skin and skin structure infection)(uSSSI)、複雑性皮膚および皮膚構造感染症(complicated skin and skin structure infection)(cSSSI)、カテーテル感染症、咽頭炎、副鼻腔炎、外耳炎、中耳炎、気管支炎、膿胸、肺炎、市中細菌性肺炎(CABP)、院内肺炎(HAP)、院内細菌性肺炎、人工呼吸器関連肺炎(VAP)、糖尿病性足感染症、バンコマイシン耐性enterococci感染症、膀胱炎および腎盂腎炎、腎結石、前立腺炎、腹膜炎、複雑性腹腔内感染症(cIAI)、ならびに他の腹腔内感染症、透析関連腹膜炎、内臓膿瘍、心内膜炎、心筋炎、心膜炎、輸血関連敗血症、髄膜炎、脳炎、脳膿瘍、骨髄炎、関節炎、生殖器潰瘍、尿道炎、膣炎、子宮頸管炎、歯肉炎、結膜炎、角膜炎、眼内炎、嚢胞性線維症患者の感染症、または発熱性好中球減少症患者の感染症のうちの1つまたは複数から選択される、項目19に記載の方法。
(項目21)
前記細菌感染症が、以下、即ち、市中細菌性肺炎(CABP)、院内肺炎(HAP)、院内細菌性肺炎、人工呼吸器関連肺炎(VAP)、菌血症、糖尿病性足感染症、カテーテル感染症、単純性皮膚および皮膚構造感染症(uSSSI)、複雑性皮膚および皮膚構造感染症(cSSSI)、バンコマイシン耐性enterococci感染症、または骨髄炎のうちの1つまたは複数から選択される、項目20に記載の方法。
本明細書において、用語「ハロゲン」は、F、Cl、Br、またはIを意味する。
(1)Xが、
(a)−PO(OH)O−M+、
(b)−PO(O−)2・2M+、または
(c)−PO(O−)2・D2+
である化合物、
(2)M+が、
(a)Li+、Na+、K+、N−メチル−D−グルカミン、もしくはN(R9)4 +、または
(b)Na+であり、
(c)各R9が独立して水素またはC1〜C4アルキル基
である化合物、
(3)D2+が、
(a)Mg2+、Ca2+、およびBa2+、または
(b)Ca2+
である化合物、
(4)化合物(R)−2−(5−(2−(3−エチルウレイド)−6−フルオロ−7−(テトラヒドロフラン−2−イル)−1H−ベンゾ[d]イミダゾール−5−イル)ピリミジン−2−イル)プロパン−2−イルホスフェート;ならびに
(5)化合物(R)−2−(5−(2−(3−エチルウレイド)−6−フルオロ−7−(テトラヒドロフラン−2−イル)−1H−ベンゾ[d]イミダゾール−5−イル)ピリミジン−2−イル)プロパン−2−イルリン酸二ナトリウム。
Ac アセチル
Bu ブチル
Et エチル
Ph フェニル
Me メチル
THF テトラヒドロフラン
DCM ジクロロメタン
CH2Cl2 ジクロロメタン
EtOAc 酢酸エチル
CH3CN アセトニトリル
EtOH エタノール
Et2O ジエチルエーテル
MeOH メタノール
MTBE メチルtert−ブチルエーテル
DMF N,N−ジメチルホルムアミド
DMA N,N−ジメチルアセトアミド
DMSO ジメチルスルホキシド
HOAc 酢酸
TEA トリエチルアミン
TFA トリフルオロ酢酸
TFAA トリフルオロ酢酸無水物
Et3N トリエチルアミン
DIPEA ジイソプロピルエチルアミン
DIEA ジイソプロピルエチルアミン
K2CO3 炭酸カリウム
Na2CO3 炭酸ナトリウム
Na2S2O3 チオ硫酸ナトリウム
Cs2CO3 炭酸セシウム
NaHCO3 炭酸水素ナトリウム
NaOH 水酸化ナトリウム
Na2SO4 硫酸ナトリウム
MgSO4 硫酸マグネシウム
K3PO4 リン酸カリウム
NH4Cl 塩化アンモニウム
LC/MS 液体クロマトグラフィー/質量スペクトル
GCMS ガスクロマトグラフィー質量スペクトル
HPLC 高速液体クロマトグラフィー
GC ガスクロマトグラフィー
LC 液体クロマトグラフィー
IC イオンクロマトグラフィー
IM 筋肉内
CFU/cfu コロニー形成単位
MIC 最小阻害濃度
Hrまたはh 時間
atm 気圧
rtまたはRT 室温
TLC 薄層クロマトグラフィー
HCl 塩酸
H2O 水
EtNCO イソシアン酸エチル
Pd/C 炭素上のパラジウム
NaOAc 酢酸ナトリウム
H2SO4 硫酸
N2 窒素ガス
H2 水素ガス
n−BuLi n−ブチルリチウム
DI 脱イオン化された
Pd(OAc)2 酢酸パラジウム(II)
PPh3 トリフェニルホスフィン
i−PrOH イソプロピルアルコール
NBS N−ブロモスクシンイミド
Pd[(Ph3)P]4 テトラキス(トリフェニルホスフィン)パラジウム(0)
PTFE ポリテトラフルオロエチレン
rpm 毎分回転数
SM 出発物質
Equiv. 当量
1H−NMR プロトン核磁気共鳴
HPMCAS 酢酸ヒドロキシプロピルメチルセルロース
PVP ポリビニルピロリドン
EDTA エチレンジアミン四酢酸
K2EDTA 二塩基性エチレンジアミン四酢酸カリウム
mCPBA メタ−クロロペルオキシ安息香酸
aq 水性
Boc2O ジ−tert−ブチルジカルボネート
DMAP N,N−ジメチルアミノピリジン
mL ミリリットル
L リットル
mol モル
g グラム
LCMS 液体クロマトグラフィー−質量分析法
MHz メガヘルツ
CDCl3 ジュウテロクロロホルム
NEt3 トリエチルアミン
mmol ミリモル
psi 1平方インチ当たりのポンド
iPrOH イソプロピルアルコール
ppm 百万分率
NH4NO3 硝酸アンモニウム
Hz ヘルツ
Pd(dppf)Cl2 [1,1’−ビス(ジフェニルホスフィノ)フェロセン]ジクロロパラジウム(II)
L リットル
MeOD ジュウテロ−メタノール
CD3OD ジュウテロ−メタノール
ee エナンチオマー過剰率
min 分
Bn ベンジル
RBF 丸底フラスコ
MeCN アセトニトリル
PES ポリエーテルスルホン
mm ミリメートル
μm マイクロメートル
M モル
N ノルマル
Boc tert−ブトキシカルボニル
ESMS エレクトロスプレー質量分析法
CV カラム容積
D2O 酸化ジュウテリウム
NH3 アンモニア
OBD 最適ベッド密度
mg ミリグラム
CLSI 臨床検査標準協会
ATCC アメリカンタイプカルチャーコレクション
MHII ミューラーヒントンII
μL マイクロリットル
WT 野生型
CGSC 大腸菌遺伝子ストックセンター
MS 質量分析法
IS 内部標準
APCI 大気圧化学イオン化
MRM 多重反応モニタリング
m/z 質量対電荷比
LLOQ 定量化の下限
ng ナノグラム
UV 紫外
SD 標準偏差
%CV 変動係数
PO 口周囲
MC 微結晶性セルロース
EDTA エチレンジアミン四酢酸またはエチレンジアミンテトラアセテート
PK 薬物動態学的
IV 静脈内
D5W 水溶液中5%のデキストロース
HPMC−AS ヒドロキシプロピルメチルセルロースアセチルスクシネート
PVP ポリビニルピロリドン(polyvinylprrolidone)
CAPT カプチソール
ATP アデノシン三リン酸
ADP アデノシン二リン酸
NADH ニコチンアミドアデニンジヌクレオチド(還元型)
NAD+ ニコチンアミドアデニンジヌクレオチド(酸化型)
TRIS トリス(ヒドロキシメチル)アミノメタン
mM ミリモル
MgCl2 塩化マグネシウム
KCl 塩化カリウム
μM マイクロモル
DTT ジチオトレイトール
nM ナノモル
Ki 解離定数
IC50 最大半量の阻害濃度
μg マイクログラム
BSA ウシ血清アルブミン
LDH 乳酸デヒドロゲナーゼ
PVDF フッ化ポリビニリデン
AcN アセトニトリル
VMAX 反応の最大初期ベロシティまたは速度。
2−(2−ニトロフェニル)−2,5−ジヒドロフランおよび2−(2−ニトロフェニル)−2,3−ジヒドロフラン(3a&3b)の調製。
2−テトラヒドロフラン−2−イル−アニリン(4)の調製。
(R)−2−(テトラヒドロフラン−2−イル)アニリン(4a)の調製。
4−ブロモ−2−テトラヒドロフラン−2−イル−アニリン(5)の調製。
N−(4−ブロモ−2−ニトロ−6−テトラヒドロフラン−2−イル−フェニル)−2,2,2−トリフルオロ−アセトアミド(6)の調製。
4−ブロモ−2−ニトロ−6−テトラヒドロフラン−2−イル−アニリン(6a)の調製。
2−[5−(4−アミノ−3−ニトロ−5−テトラヒドロフラン−2−イル−フェニル)ピリミジン−2−イル]プロパン−2−オール(8)の調製。
2−[5−(4−アミノ−3−ニトロ−5−テトラヒドロフラン−2−イル−フェニル)ピリミジン−2−イル]プロパン−2−オール(8)の代替的な調製。
2−[5−(3,4−ジアミノ−5−テトラヒドロフラン−2−イル−フェニル)ピリミジン−2−イル]プロパン−2−オール(9)の調製。
1−エチル−3−[5−[2−(1−ヒドロキシ−1−メチル−エチル)ピリミジン−5−イル]−7−テトラヒドロフラン−2−イル−1H−ベンゾイミダゾール−2−イル]尿素(11)の調製。
1−エチル−3−[5−[2−(1−ヒドロキシ−1−メチル−エチル)ピリミジン−5−イル]−7−[(2R)−テトラヒドロフラン−2−イル]−1H−ベンゾイミダゾール−2−イル]尿素(12)のキラルクロマトグラフィー単離。
1−エチル−3−[5−[2−(1−ヒドロキシ−1−メチル−エチル)ピリミジン−5−イル]−7−[(2R)−テトラヒドロフラン−2−イル]−1H−ベンゾイミダゾール−2−イル]尿素のメタンスルホン酸塩(13)の調製。
2−(2−フルオロ−6−ニトロ−フェニル)−2,3−ジヒドロフラン(15A)および2−(2−フルオロ−6−ニトロ−フェニル)−2,5−ジヒドロフラン(15B)の調製。
3−フルオロ−2−テトラヒドロフラン−2−イル−アニリン(16)の調製。
4−ブロモ−3−フルオロ−2−テトラヒドロフラン−2−イル−アニリン(17)の調製。
N−(4−ブロモ−3−フルオロ−6−ニトロ−2−テトラヒドロフラン−2−イル−フェニル)−2,2,2−トリフルオロ−アセトアミド(18)の調製。
4−ブロモ−3−フルオロ−6−ニトロ−2−テトラヒドロフラン−2−イル−アニリン(19)の調製。
2−[5−(4−アミノ−2−フルオロ−5−ニトロ−3−テトラヒドロフラン−2−イル−フェニル)ピリミジン−2−イル]プロパン−2−オール(20)の調製。
2−[5−(4,5−ジアミノ−2−フルオロ−3−テトラヒドロフラン−2−イル−フェニル)ピリミジン−2−イル]プロパン−2−オール(21)の調製。
1−エチル−3−[6−フルオロ−5−[2−(1−ヒドロキシ−1−メチル−エチル)ピリミジン−5−イル]−7−テトラヒドロフラン−2−イル−1H−ベンゾイミダゾール−2−イル]尿素(22)の調製。
1−エチル−3−[6−フルオロ−5−[2−(1−ヒドロキシ−1−メチル−エチル)ピリミジン−5−イル]−7−[(2R)−テトラヒドロフラン−2−イル]−1H−ベンゾイミダゾール−2−イル]尿素(23)のキラルクロマトグラフィー単離。
1−エチル−3−[6−フルオロ−5−[2−(1−ヒドロキシ−1−メチル−エチル)ピリミジン−5−イル]−7−[(2R)−テトラヒドロフラン−2−イル]−1H−ベンゾイミダゾール−2−イル]尿素のメタンスルホン酸塩(23A)の調製。
(R)−2−(5−(2−(3−エチルウレイド)−6−フルオロ−7−(テトラヒドロフラン−2−イル)−1H−ベンゾ[d]イミダゾール−5−イル)ピリミジン−2−イル)プロパン−2−イルリン酸ジベンジル(24)の調製。
(R)−2−(5−(2−(3−エチルウレイド)−6−フルオロ−7−(テトラヒドロフラン−2−イル)−1H−ベンゾ[d]イミダゾール−5−イル)ピリミジン−2−イル)プロパン−2−イルリン酸二ナトリウム(W)の調製。
Boc−1−エチル−3−[6−フルオロ−5−[2−(1−ヒドロキシ−1−メチル−エチル)ピリミジン−5−イル]−7−[(2R)−テトラヒドロフラン−2−イル]−1H−ベンゾイミダゾール−2−イル]尿素(25)の調製。
Boc−1−エチル−3−[6−フルオロ−5−[2−(1−ヒドロキシ−1−メチル−エチル)ピリミジン−5−イル]−7−[(2R)−テトラヒドロフラン−2−イル]−1H−ベンゾイミダゾール−2−イル]尿素ジベンジルホスフェート(26)の調製。
(R)−2−(5−(2−(3−エチルウレイド)−6−フルオロ−7−(テトラヒドロフラン−2−イル)−1H−ベンゾ[d]イミダゾール−5−イル)ピリミジン−2−イル)プロパン−2−イルリン酸ジベンジル(24)の調製。
(R)−2−(5−(2−(3−エチルウレイド)−6−フルオロ−7−(テトラヒドロフラン−2−イル)−1H−ベンゾ[d]イミダゾール−5−イル)ピリミジン−2−イル)プロパン−2−イルリン酸二ナトリウム(W)の調製。
ジBoc−1−エチル−3−[6−フルオロ−5−[2−(1−ヒドロキシ−1−メチル−エチル)ピリミジン−5−イル]−7−[(2R)−テトラヒドロフラン−2−イル]−1H−ベンゾイミダゾール−2−イル]尿素(28)の調製。
ジBoc−1−エチル−3−[6−フルオロ−5−[2−(1−ヒドロキシ−1−メチル−エチル)ピリミジン−5−イル]−7−[(2R)−テトラヒドロフラン−2−イル]−1H−ベンゾイミダゾール−2−イル]尿素ジベンジルホスフェート(29)の調製。
(R)−2−(5−(2−(3−エチルウレイド)−6−フルオロ−7−(テトラヒドロフラン−2−イル)−1H−ベンゾ[d]イミダゾール−5−イル)ピリミジン−2−イル)プロパン−2−イルリン酸ナトリウム(W)の調製。
液体培地における感受性試験
本発明の化合物を、液体培地における感受性試験により抗菌活性に関して試験した。このようなアッセイは、このような実施を統制する最新のCLSI文書の指針内で行った。「M07−A8 Methods for Dilution Antimicrobial Susceptibility Tests for Bacteria that Grow Aerobically; Approved Standard−−Eighth Edition(2009年)」。「Antibiotics in Laboratory Medicine」(V. Lorian編集、出版社Williams and Wilkins、1996年)等、他の刊行物は、研究室の抗生物質試験における基本的な実際の技法を提供する。用いた具体的なプロトコールは、次の通りであった。
材料:
丸底96ウェルマイクロタイタープレート(Costar 3788)
Mueller Hinton II寒天プレート(MHII;BBLプレミックス)
Mueller Hinton II液体ブロス(MHII;BBLプレミックス)
BBL Prompt接種システム(Fisher B26306)
Test Reading Mirror(Fisher)
細菌を画線してシングルコロニーとした寒天プレート、新たに調製
無菌DMSO
ヒト血清(U.S.Biologicals S1010−51)
溶血させたウマ血液(Quad Five 270−100)
レサズリン0.01%
スプラーグドーリーラット(Sprague Dawley Rat)血清(U.S. Biologicals 1011−90BまたはValley BioMedical AS3061SD)
プールしたマウス血清(Valley BioMedical AS3054) 。
1.Staphylococcus aureus ATCC#29213
a.MHII
b.MHII+50%ヒト血清
c.MHII+50%ラット血清
d.MHII+50%マウス血清
2.Staphylococcus aureus ATCC#29213GyrB T173I(MHII)
3.Staphylococcus aureus、JMIコレクション株;表5を参照(MHII)
4.Staphylococcus epidermidis、JMIコレクション株;表5を参照(MHII)
5.Enterococcus faecalis ATCC#29212(MHII+3% 溶血させたウマ血液)
6.Enterococcus faecium ATCC#49624(MHII+3% 溶血させたウマ血液)
7.Enterococus faecalis、JMIコレクション株;表5を参照(MHII+3% 溶血させたウマ血液)
8.Enterococus faecium、JMIコレクション株;表5を参照(MHII+3% 溶血させたウマ血液)
9.Streptococcus pneumoniae ATCC#10015(MHII+3% 溶血させたウマ血液)
10.Streptococcus pneumoniae、JMIコレクション株;表5を参照(MHII+3% 溶血させたウマ血液)
11.β−haemolytic streptococci、群A、B、C、G)JMIコレクション株;表5を参照(MHII+3% 溶血させたウマ血液)
12.Bacillus cereus ATCC10987(MHII)
13.Bacillus cereus ATCC14579(MHII)
14.Bacillus subtilis ATCC6638(MHII)
15.Bacillus subtilis(168)ATCC6051(MHII) 。
1.BBL Promptキットを使用して、上に表示する適切な寒天培地において増殖した培養物から、5個の大型または10個の小型の十分に離間したコロニーをつついて、キットに提供されている1mLの無菌食塩水に接種した。
2.約30秒間ウェルをボルテックスして、約108細胞/mLの懸濁液を生じた。実際の密度は、この懸濁液の希釈物をプレーティングする(plate out)ことにより確認することができた。
3.試験する化合物のプレート毎に0.15mLの細胞を15mL(約106細胞/mL)無菌ブロス(または後述を参照)に移すことにより、懸濁液を1/100希釈し、次に回旋して混合した。化合物(>8化合物)の2枚以上のプレートを試験する場合、容積はそれに応じて増加した。
4.50μlの細胞(約5×104細胞)を用いて、ブロス(後述を参照)に希釈した薬物を50μl含有する各マイクロタイターウェルに接種した。
1.全薬物/化合物ストックは通常、100%DMSOにおいて12.8mg/mL濃度で調製した。
2.薬物/化合物ストックを、50μLのDMSOにおいて200×所望の最終濃度に希釈した。MICの出発濃度が8μg/mL最終濃度である場合、6.25μLのストック+43.75μL DMSOを必要とした。各200×ストックを、新しい96ウェルマイクロタイタープレートのカラム1の別個の列に置いた。
3.25μLのDMSOを、200×化合物ストックを含有するマイクロタイタープレートの全列のカラム2〜12に添加し、カラム1の25μLをカラム11まで系列的に希釈し、カラム毎にチップを交換した。即ち、25μL化合物+25μL DMSO=2×希釈。対照のため、系列の最後に「化合物なし」DMSOウェルを残した。
4.試験した株(S.aureus+50%ヒト血清を除く)毎に、マトリックスピペッターを用いて50μLのMHIIブロスを有する2枚のマイクロタイタープレートを調製した。
5.50μlの細胞の添加前に、50μLの培地/マイクロタイターウェルに0.5μLの各希釈物を移した(w/マトリックス自動ピペッター)。化合物の通常の出発濃度は、培地+細胞に1/200希釈した後に8μg/mLであった − 化合物濃度は、マイクロタイタープレートの列にわたり2×ステップで減少した。全MICは、2連で行った。
6.全ウェルに、50μlの希釈細胞懸濁液(前述を参照)を接種して、最終容積100μlとした。
7.接種物を添加した後、手動の多チャネルピペッターにより、各ウェルを徹底的に混合した。同一マイクロタイタープレートにおける低濃度から高濃度の薬物に向かう場合、同一チップを用いた。
8.プレートを37℃で少なくとも18時間インキュベートした。
9.18時間後にtest reading mirrorによりプレートを観測して、MICを、増殖が観察されなかった(ウェルにおける光学的透明性)薬物の最低濃度として記録した。
1.15mLのMHII+15mLヒト血清を合わせることにより、50%血清培地を調製した − 合計30mL。2枚以上の化合物プレートを試験する場合、容積を30mL増分で増加させた。
2.上に記載されている通り、S.aureus ATCC#29213の同じBBL Prompt接種物を用いて、上述において調製した30mL(約5×105細胞/mL)の50%ヒト血清培地に0.15mLの細胞を移すことにより1/200希釈し、回旋して混合した。
3.所望の数のマイクロタイタープレートの全試験ウェルを、50%血清培地における100μL細胞で満たした。
4.0.5μLの各化合物希釈物を100μLの細胞/培地に移した(w/マトリックス自動ピペッター)。化合物の通常の出発濃度は、培地+細胞に1/200希釈した後に8μg/mLであった − 化合物濃度は、マイクロタイタープレートの列にわたり2×ステップで減少した。全MICは、2連で行った。
5.手動の多チャネルピペッターにより各ウェルを徹底的に混合した。同一マイクロタイタープレートにおける低濃度から高濃度の薬物に向かう場合、同一チップを用いた。
6.プレートを37℃で少なくとも18時間インキュベートした。インキュベーション後に、25μLの0.01%レサズリンを各ウェルに添加し、37℃で少なくとも追加的に1時間またはレサズリンの色が変化するまでインキュベートを継続した。
7.test reading mirrorによりプレートを観測し、MICを記録した。レサズリンを用いる場合、該色素の色は、増殖なしのウェルにおいて紺青色から明るいピンク色へと変化する。色素をピンク色にする薬物の最低濃度がMICである。
材料:
丸底96ウェルマイクロタイタープレート(Costar 3788)
Mueller Hinton II寒天プレート(MHII;BBLプレミックス)
Mueller Hinton II液体ブロス(MHII;BBLプレミックス)
BBL Prompt接種システム(Fisher b26306)
Test Reading Mirror(Fisher)
細菌を画線してシングルコロニーとした寒天プレート、新たに調製
無菌DMSO 。
1.Escherichia coli ATCC#25922
2.Escherichia coli、JMIコレクション株、表5を参照
3.Escherichia coliAG100 WT
4.Escherichia coli AG100 tolC
5.Acinetobacter baumannii ATCC#BAA−1710
6.Acinetobacter baumannii ATCC#19606
7.Acinetobacter baumannii、JMIコレクション株、表5を参照
8.Klebsiella pneumoniae ATCC#BAA−1705
9.Klebsiella pneumoniae ATCC#700603
10.Klebsiella pneumoniae、JMIコレクション株、表5を参照
11.Moraxella catarrhalis ATCC#25238
12.Moraxella catarrhalis ATCC#49143
13.Moraxella catarrhalis、JMIコレクション株、表5を参照
14.Haemophilus influenzae ATCC49247
15.Haemophilus influenzae(Rd1 KW20)ATCC51907
16.Haemophilus influenzae Rd0894(AcrA−)
17.Haemophilus influenzae、JMIコレクション株、表5を参照
18.Pseudomonas aeruginosa PAO1
19.Pseudomonas aeruginosa、JMIコレクション株、表5を参照
20.Proteus mirabilis、JMIコレクション株、表5を参照
21.Enterobacter cloacae、JMIコレクション株、表5を参照
22.Stenotrophomonas maltophilia ATCC BAA−84
23.Stenotrophomonas maltophilia ATCC13637 。
1.BBL Promptキットを用いて、寒天培地において増殖した培養物から5個の大型または10個の小型の十分に離間したコロニーをつついて、キットに添えられた1mL無菌食塩水に接種した。
2.約30秒間ウェルをボルテックスし、約108細胞/mLの懸濁液を得た。実際の密度は、この懸濁液の希釈物をプレーティングすることにより確認することができた。
3.試験する化合物のプレート毎に0.15mLの細胞を15mL(約106細胞/mL)無菌ブロス(後述を参照)に移すことにより、懸濁液を1/100希釈し、回旋して
混合した。化合物(>8化合物)の2枚以上のプレートを試験する場合、それに応じて容積を増加させた。
4.50μlの細胞(約5×104細胞)を用いて、ブロス(後述を参照)に希釈した薬物を50μl含有する各マイクロタイターウェルに接種した。
1.全薬物/化合物ストックは通常、100%DMSOにおける12.8mg/mL濃度で調製した。
2.薬物/化合物ストックを、50μL DMSOにおいて200×所望の最終濃度に希釈した。MICの出発濃度が8μg/mL最終濃度である場合、6.25μLのストック+43.75μL DMSOを必要とした。各200×ストックを、新しい96ウェルマイクロタイタープレートのカラム1の別個の列に置いた。
3.25μLのDMSOを、200×化合物ストックを含有するマイクロタイタープレートの全列のカラム2〜12に添加し、カラム1の25μLをカラム11まで系列的に希釈し、カラム毎にチップを交換した。即ち、25μL化合物+25μL DMSO=2×希釈。対照のため、系列の最後に「化合物なし」DMSOウェルを残した。
4.試験した株毎に、マトリックスピペッターを用いて50μLのMHIIブロスを有する2枚のマイクロタイタープレートを調製した。
5.50μlの細胞の添加前に、50μLの培地/マイクロタイターウェルに0.5μLの各希釈物を移した(w/マトリックス自動ピペッター)。化合物の通常の出発濃度は、培地+細胞に1/200希釈した後、8μg/mLであった − 化合物濃度は、マイクロタイタープレートの列にわたり2×ステップで減少した。全MICは、2連で行った。
6.全ウェルに、50μlの希釈細胞懸濁液(前述を参照)を接種して、最終容積100μlとした。
7.接種物を添加した後、各ウェルを手動の多チャネルピペッターにより徹底的に混合した。同一マイクロタイタープレートにおける低濃度から高濃度の薬物に向かう場合、同一チップを用いた。
8.プレートを37℃で少なくとも18時間インキュベートした。
9.18時間後にtest reading mirrorによりプレートを観測し、MICを、増殖が観察されなかった(ウェルにおける光学的透明性)薬物の最低濃度として記録した。
材料:
ペトリプレート60×15mm(Thermo Scientific Cat.#12567100)
遠心分離チューブ、15mL(Costar)
BBL Prompt接種システム(Fisher b26306)
細菌を画線してシングルコロニーとした寒天プレート、新たに調製
無菌DMSO
GasPak(商標)インキュベーションコンテナ(BD Cat.#260672)
GasPak(商標)EZ嫌気性菌コンテナシステムサシェ(BD Cat.#260678)
GasPak(商標)EZ C02コンテナシステムサシェ(BD Cat.#260679)
GasPak(商標)EZ Campyコンテナシステムサシェ(BD Cat.#260680) 。
1.Clostridium difficile ATCC BAA−1382;
2.Clostridium difficile、CMIコレクション株、表4を参照
3.Clostridium perfringens、CMIコレクション株、表4を参照
4.Bacteroides fragilisおよびBacteroides spp.、CMIコレクション株、表4を参照
5.Fusobacterium spp.、CMIコレクション株、表4を参照
6.Peptostreptococcus、spp.、CMIコレクション株、表4を参照
7.Prevotella spp.、CMIコレクション株、表4を参照
8.N. gonorrhoeae ATCC 35541
9.N. gonorrhoeae ATCC 49226
10.Neisseria gonorrhoeae、JMIコレクション株、表4を参照
11.Neisseria meningitidis、JMIコレクション株、表4を参照 。
CLSI刊行物「M11−A7 Methods for Antimicrobial Susceptibility Testing of Anaerobic Bacteria; Approved Standard − 第7版(2007年)」に従って、各微生物種に推奨される増殖培地を調製したが、例外として、N.gonorrhoeaeおよびN.meningitidisの培地は、「M07−A8 Methods for Dilution Antimicrobial Susceptibility Tests for Bacteria that Grow Aerobically; Approved Standard−−第8版(2009年)」に従って調製した。
1.表1に記載されている各被験化合物の100×薬物ストックを調製した。15mL遠心分離チューブを用いて、100μLの各薬物ストックを、10mLの融解した寒天(水浴において約55℃まで冷却)に添加した。チューブを2〜3回反転することにより混合し、次に、個々にラベル付けした60×15mmペトリ皿に注ぎ入れた。
2.慣用的な試験濃度:0.002μg/mL〜16μg/mL(14プレート)であった。
3.4枚の薬物不含プレートを注いだ:2枚は陽性対照、2枚は好気的対照。
4.プレートを乾かした。同日に使用、あるいはRTで一晩保存、あるいは最大3日間4℃で保存した。
5.薬物濃度および株の配置に従ってプレートにラベル付けした。
1.嫌気細菌を用いて行った全作業は、可能な限り迅速になされた。バイオセーフティーキャビネット内(即ち、好気的環境)で行う作業は、細胞を嫌気チャンバーに戻す前に30分未満で完了させた。
2.嫌気細菌のインキュベーションは、GasPak(商標)チャンバーを用いて達成した。大型のボックススタイルのチャンバー(VWR90003−636)は、2個の嫌気的サシェ(VWR90003−642)を必要としたが、背の高いシリンダースタイルのチャンバー(VWR90003−602)は、1個のサシェしか必要としなかった。
1.上に記載されている個々の寒天プレート上に各株を画線した。要求される時間および環境条件(即ち、嫌気性、微好気性等)でインキュベートした。
2.直接的なコロニー懸濁方法を用いて、白金耳量の新たに画線した細胞を、約4mLの0.9%NaCl2に懸濁して、ボルテックスした。
3.懸濁液をO.D.600 0.05(5×10e7 cfu/mL)に調整した。ボルテックスして混合した。
4.約0.2mLの調整・混合済培養物を96ウェルプレートに移した。5つ以下の株を試験する場合、全株を共に一列に並べた。5つより多い株を試験する場合、5株以下が一列に収まるよう株をプレートに移した。このことは、小型のプレートに適合させるために必要であった。
5.多チャネルピペッターを用いて、調製した96ウェルプレートから、各MIC試験プレートへと0.002mLの各株をスポットした。これにより、約1×10e5 cfu/スポットとなった。C.difficileを試験する場合、株は増殖の際にスウォーミングするが、多チャネルピペッタースポット間の距離は、スウォーミングする細胞がアッセイ結果を損なわないように、十分に開いている。
6.接種物を乾燥させ(必要な限り短い時間)、次に、適切な数のサシェと共にGasPakにおいてひっくり返して置き、インキュベートした。
7.Neisseria spp.を、37℃、5%CO2環境で24時間インキュベートした。
正確なインキュベーション時間後に試験プレートを検査し、陽性対照プレートにおける増殖の出現と比較して試験プレートにおける増殖の出現において著しい低下が生じた濃度におけるMICエンドポイントを読み取った。
材料
丸底96ウェルマイクロタイタープレート(Costar 3788)または類似物
フィルムプレートシール(PerkinElmer、TopSeal−A#6005250または類似物)
Middlebrook 7H10ブロス、0.2%グリセロール含有
Middlebrook 7H10寒天、0.2%グリセロール含有
Middlebrook OADC Enrichment
M.tuberculosisの接種物調製:
1.−70℃に保存した調製済凍結M.tuberculosisストックを用いた。M.tuberculosisは、7H10ブロス+10%OADCにおいて増殖させ、次に100 Klettまたは5×107cfu/mlの濃度で凍結した。
2.1mlの凍結ストックを取り出し、これを19mlの7H10ブロス+10%OADCに添加することにより、1:20希釈物を調製した(最終濃度2.5×106cfu/ml)。
3.この希釈物から、第二の1:20希釈物を調製した、即ち、1mlを取り出して、これを19mlの新鮮ブロスに添加した。これが、96ウェルプレートに添加するための最終接種物である。
1.10 Klettまたは5×107/mlの濃度の、7H10ブロスにおいて増殖した培養物の調製済凍結ストックまたは新鮮培養物を用いた。
2.1.0mlの培養ストックを取り出し、これを19mlの7H10ブロスに添加することにより、1:20希釈物を調製した(最終濃度2.5×106cfu/ml)。
3.この希釈物から、1:20希釈物を調製した、即ち、1mlを取り出し、これを19mlの新鮮ブロスに添加した(最終懸濁液)。
1.プレートにラベル付けした。
2.多チャネル電子ピペッターを用いて、50μlの7H10ブロス+10%OADCを、MICの決定に利用されている全ウェルに添加した。
3.試験する薬物のストック溶液(例えば、1mg/ml濃度)を調製した。
4.凍結ストック溶液を解凍し、7H10ブロス+10%OADCを用いて希釈して、作業溶液(working solution)4×被験最大濃度を得た(例えば、最終濃度32μg/ml、被験最高濃度8μg/ml)。ストック溶液から希釈物を作製した。1μg/mlの濃度から出発するために4μg/mlの薬物を調製し、これにより出発濃度は1μg/mlとなった。1mg/mlストックの25μlを取り出し、6.2mlのブロスに添加した。薬物の全希釈は、ブロスにおいて行った。
5.50μlの4×作業溶液を、指定の列の第一のウェルに添加した。試験する全化合物に対し継続した。多チャネル電子ピペッターを用いて、4×を混合し、11番目のウェルまで化合物を系列希釈した。残った50μlを廃棄した。12番目のウェルを陽性対照として用いた。
6.M.tuberculosisは、約18日間;M.aviumおよびM.kansasiiは、約7日間;NocardiaおよびM.abcessusは、約4日間、プレートをフィルムシールして37℃でインキュベートした。
7.結果を視覚的に読み取り、記録した。増殖が観察されなかった(ウェルにおける光学的透明性)薬物の最低濃度としてMICを記録した。
材料および試薬:
Costar#3904 側面が黒色の平底96ウェルマイクロタイタープレート
Middlebrook 7H9ブロス(BD271310)、0.2%グリセロール含有
Middlebrook OADC Enrichment
ウシ胎仔血清
カタラーゼ(Sigma C1345)
デキストロース
NaCl2
BBL Prompt接種システム(Fisher b26306)
寒天プレート(Middlebrook 7H11、0.2%グリセロールおよびOADC enrichment含有)、細菌を画線してシングルコロニーとした
無菌DMSO 。
1.血清シフトMICのため、すべて7H9+0.2%グリセロールの基剤を有する3種の異なる培地が必要とされる。あらゆる培地およびサプリメントをMIC前に滅菌することが重要であった。
2.下の全培地を調製し、次のセクションに記載されている通りに接種した。各培地を用いて全化合物をMtbに対し試験した。
1.BBL Promptを用いて、5〜10個の十分に離間したコロニーをつついて、キットに添えられた1mlの無菌食塩水に接種した。この生物は培養物において増殖が遅いため、通例、プレートは、本アッセイに用いるときには培養2〜3週間経過したものである。
2.十分にボルテックスし、次に水浴において30秒間超音波処理して、約108細胞/mlの懸濁液を得た。実際の密度は、この懸濁液の希釈物のプレーティングにより確認することができた。
3.BBL Prompt懸濁液を1/200希釈することにより(例えば、0.2mlの細胞を40mlの培地に移し)、3種の培地処方物それぞれにおいて接種物を調製して、約106細胞/mlの出発細胞密度を得た。
4.100μlの細胞(約5×104細胞)を用いて、1μlのDMSOに溶解させた薬物(後述を参照)を含有する各マイクロタイターウェルに接種した。
1.対照薬物ストック、イソニアジドおよびノボビオシンは、100%DMSOにおける10mMで調製し、一方、シプロフロキサシンおよびリファンピンは、それぞれ50%DMSOおよび100%DMSOにおいて1mMで調製した。希釈物の調製 − 100μLのストック溶液を、96ウェルプレートの第一のカラムに分注した。カラム1の50μlを、カラム2における50μlのDMSOに移すことにより、化合物毎に列にわたり、11ステップの2倍系列希釈物を調製した。混合し、カラム毎にチップを交換しつつ、引き続きカラム2の50μLをカラム11まで移した。対照としてカラム12をDMSOのみのまま残した。
2.100μlの細胞の添加前に、1μlの各希釈物を空のマイクロタイターウェルに移した。イソニアジドおよびノボビオシンの出発濃度は、培地+細胞に希釈した後に100μMであった。シプロフロキサシンおよびリファンピンの出発濃度は、培地+細胞に希釈した後に10μMであった。化合物濃度は、マイクロタイタープレートの列にわたり進む毎に2×ステップで減少した。全MICは、3種の培地条件のそれぞれにおいて2連で行った。
3.化合物の試験セットは通例、10mMおよび50μL容積であった。
4.多チャネルピペッターを用いて、マスタープレートの各カラムから全容積を取り出し、新しい96ウェルマイクロタイタープレートの第一のカラムに移した。マスタープレートにおける化合物の各カラムについて反復し、新しい96ウェルプレートのカラム1に移した。
5.対照化合物に関して上に記載されている通り、DMSOを希釈剤として用いて、各化合物の2倍、11点の希釈物を作製した。全事例において、対照のためカラム12はDMSOのみとして残した。全希釈を完了した後、100μlの細胞の添加前に、対照化合物に対してなされた通り、各希釈物の1μlを空のマイクロタイターウェルに再度移した。
6.全ウェルを100μlの希釈細胞懸濁液(前述を参照)で接種した。
7.接種物を添加した後、プレートの側面を穏やかにタッピングすることによりプレートを混合した。
8.プレートを加湿した37℃チャンバーにおいて9日間インキュベートした。
9.9日目に、25μlの0.01%無菌レサズリンを各ウェルに添加した。励起492nm、発光595nmでバックグラウンド蛍光を測定し、プレートをさらに24時間インキュベーターに戻した。
マウスS.aureus腎感染モデル
動物:Charles River Laboratoriesから雌CD−1マウス(8〜10週齢;6匹/群)を入手し、実験動物の管理および使用に関する指針(Guide to the Care and Use of Experimental Animals)にしたがって収容および維持した。
アメリカ合衆国培養細胞系統保存機関からメチシリン感受性S.aureus(MSSA)株ATCC29213を入手した。動物研究のためのストックを調製するため、S.aureusをMueller Hinton寒天プレート上にプレーティングし、37℃で一晩インキュベートした。プレートの3〜4個のコロニーを用いて、5mLのMueller Hintonブロス(MHB)に接種し、これを300RPMで振盪しつつ8時間37℃でインキュベートした。5mLの8時間培養物を、100mLに20倍希釈し、一晩(12〜14時間)インキュベートした。細菌を20分間3000xでペレットにし、0.5%ウシ血清アルブミン(BSA)を含有するリン酸緩衝食塩水(PBS)で2回洗浄した。PBS/20%グリセロール中に約1×1010cfuを含有するアリコート(1mL)を凍結し、使用日まで−80℃で保存した。系列希釈し、Mueller Hinton寒天プレート上にプレーティングすることにより、ストック力価を確認した。
接種前に、細菌ストックを解凍し、PBS/BSAで1回洗浄した。次にストックを最終濃度1×109cfu/mLとなるようPBS/BSAで希釈して、100μL容積においてマウス1匹につきおよそ1〜2×108cfuの接種物を得た。106〜109S.aureus生物/マウスの攻撃誘発用量を利用して、感染後26時間目に死亡なしで約106cfu/腎臓負荷を確立した予備実験(データ図示せず)において、この接種物が最適であることが見出された。これらの予備研究において、107cfu/マウス未満のS.aureusによる攻撃誘発は、一貫性がない感染を誘導したか慢性感染症を誘導しなかったが、一方、109cfu/マウスの用量は、高い百分率のマウスにおいて急速な疾病および死亡をもたらした。無菌30ゲージ針を用いて、尾静脈を介した静脈内注射を行った。マウス感染を完了した後、マウスへの攻撃誘発に用いた細菌ストックをプレーティングし、計数して、接種物の濃度を検証した。
好中球減少性ラット大腿感染モデル
動物:Charles River Laboratories,Inc.(マサチューセッツ州ウィルミントン)から、76〜100グラムの間の重さがある、特定病原体除去、雄スプラーグドーリーラットを入手し、本実験において利用した。研究開始前に動物を最小7日間順化させた。
ラットにおける7日間経口(経管栄養)毒性および毒物動態学研究
本研究の目的は、1)雄ラットに7連続日にわたり、経管栄養により経口投与した場合の化合物13および化合物23Aの潜在的な毒性を評価し、2)1回目および7回目の用量の後に化合物13および化合物23Aの毒物動態学を評価することである。
種、供給源、病歴および正当化
ニューヨーク州ストーンリッジのCharles River LaboratoriesからCrl:CD(SD)ラットを入手した。動物は、研究室で飼育され、実験的に未処置であった。非臨床毒性評価に一般的に用いられる種であるため、ラットを選んだ。
40匹のラット(20匹の非カニューレ処置雄および頸静脈カニューレを備える20匹の雄)を注文した。これらの動物から、15匹の非カニューレ処置雄および15匹のカニューレ処置雄を用いた。動物は、可能な限り齢が均一であった。ラットは、思春期前から若年成体であり、投薬開始においておよそ9週齢であった。これらの供給者が計算した生年月日を研究記録に保持した。群への割り付け時点における動物の重量範囲は、218.5〜306.3gであった。
下の表10に示す通り、ラットを割り当てた。動物に、経口経管栄養により7連続日被験物またはビヒクルを与え、投薬完了の翌日に屠殺した。投薬の最初の日を研究1日目と指定した。臨床徴候、体重および後述する他のパラメータの変化に関して動物を評価した。
経口経管栄養により1日1回を7連続日、用量容積10mL/kg体重でそれぞれ群Aおよび群B〜Dに、ビヒクルおよび被験物を投与した。経口経管栄養によりおよそ8時間空けて1日2回を7連続日、用量容積10mL/kg体重でそれぞれ群Eおよび群Fに、被験物およびビヒクルを投与した。各動物に投与した実際の容積を計算し、各動物の最新の体重に基づき調整した。
観察
研究の間、少なくとも朝に1回、午後に1回、少なくとも4時間空けて、生存率に関して動物を観察した。治療期間中、毎日ケージ横での(cageside)観察を行い、投薬前および投薬後(1回目の用量後のみ)に記録した。投薬後観察を、以前の研究由来の2種の化合物のCmax/Tmaxに基づく次に記す時間になされた治療において行った。
ケージ横での観察を剖検の日に1回行った。
予定の観察時間以外の時に観察されたいかなる所見も、予定外の観察またはProvantisに記録する必要があった。しかし、研究の間、異常は観察されなかった。Provantisは、本技術分野において一般的に用いられる電子データ収集、管理および報告システムである。
投薬を始める前に、1日目に無作為化のために体重を測定した。治療において、1日目および7日目に体重を測定した。加えて、臓器/体重比の計算のため、剖検前に絶食時の体重を測定した。
研究の間、投薬開始3日前から開始して、食物消費を毎日測定した。
血液学、凝固および血清化学パラメータの評価のための血液試料を、剖検前に全動物の、後眼窩神経叢(CO2/O2麻酔下、主研究動物について)または頸静脈カニューレ(毒物動態学動物について)から収集した。毒物動態学動物のためのカニューレ開存性を維持するために用いた残留ヘパリンのため、これらラットの凝固試料は、解析することができなかった。血液収集前に動物を一晩絶食させた。臨床病理学解析のための血液収集日において血液を収集し、試料が臨床病理学群に許容されると判断するまで動物を剖検しなかった。
適切な量の血液を、EDTA含有チューブに収集した。下の表11に表示するパラメータに関して全血試料を解析した。
適切な量の血液を、抗凝固剤を含まないチューブに収集した。試料を凝血させ、続いて遠心分離して、血清を得た。下の表12に表示するパラメータに関して血清を解析した。
投薬1および7日目に、血液試料(およそ0.5mL/試料)を、下に列挙する時点において全毒物動態学動物の頸静脈カニューレから収集して、K3EDTA含有チューブに入れた。対照群(群F)の毒物動態学動物は、各収集日の1時間時点(その日の1回目の用量投与後の)における1回の血液収集サンプリングしか行わなかった。各収集の前にカニューレから少量の血液試料(ヘパリンブロッキング溶液含)を除去し、廃棄した。カニューレに新しいシリンジを置き、プロトコールの要求する試料を採取した。血液試料の入ったシリンジを取り外し、食塩水の入った新しいシリンジをカニューレに取り付けた。血液容積を等容積の食塩水と置き換え、次に、カニューレ内にブロッキング溶液を置いた。次の収集時点まで各動物をそのケージに戻した。
研究において瀕死であるように見えた動物はいなかった。プロトコールの定める日数の治療の後、全研究動物を安楽死させ、剖検に付した。全動物は、失血によって屠殺した(深いCO2/O2麻酔下で腹部大動脈を切断)。
研究において、屠殺した全動物に剖検と組織収集を行った。剖検は、次の検査を包含した。
屠殺体および筋肉/骨格系;全外表面および開口部;
頭蓋腔および脳の外表面;
首と、それに伴う臓器および組織;ならびに
胸腔、腹腔および骨盤腔と、それらに伴う臓器および組織。
予定の剖検において安楽死させた全動物に対し、腎臓、肝臓および前立腺を秤量した。秤量後、肝臓および腎臓のおよそ1グラム試料を秤量し、Precellys7mL CK28組織ホモジナイズチューブ(Cat.No.0904−01)に移し、スナップ凍結して解析した。
下の表14に表示する組織および臓器を全動物から収集し、精巣、精巣上体および眼を除いて10%中性緩衝ホルマリンに保存した。精巣、精巣上体および眼と付随の視神経は、Modified Davidson’s溶液に約24〜48時間固定し、水でリンスし、次に保存のため10%中性緩衝ホルマリンに移した。
終末的剖検を予定する全動物に対し、腎臓、肝臓および前立腺をパラフィンに包埋し、切片を作製して、光学顕微鏡検査によりさらに検査するためにヘマトキシリンおよびエオシンで染色した。群A、D、EおよびFのみに対し、上に列挙されている残りの組織をパラフィンに包埋し、切片を作製して、光学顕微鏡検査によりさらに検査するためにヘマトキシリンおよびエオシンで染色した。
適宜、数値的動物データを統計的に評価した。
異なる投与量レベルの化合物23Aおよび化合物13の曝露は、用量に関係した。平均体重に対する有害な観察も効果も、化合物13または化合物23Aのいずれで治療した動物においても観察されなかった。平均食物消費は、1日1回化合物13(100または200mg/kg)および1日2回化合物23A(300mg/kg)で治療した動物の研究の異なる間隔において低下した。しかし、食物消費の減少は、化合物13および化合物23A群において体重変化と相関しなかったため、これらの効果は、有害または生物学的に有意であるとはみなされなかった。平均カルシウムイオン濃度(CA)は、統計的により低かったが、300mg/kg化合物23Aを日に2回投与したラット群の平均ALTおよびASTは、日に2回治療した対照と比較した場合、統計的により高かった。被験物に関係する病理組織学的所見は、任意の用量レジメンの化合物13または化合物23Aのいずれを与えた動物に対しても見られなかった。
雄カニクイザルにおける経口範囲所見毒性および毒物動態学研究
本研究の目的は、1)雄カニクイザルに7連続日、経管栄養により経口投与した場合の化合物23の潜在的な毒性を評価し、2)1回目および7回目の用量の後に、化合物23の毒物動態学を評価することである。
種、供給源、病歴および正当化
カナダ、ケベック州ピンコート(PinCourt)のPrimus Bio−Resources Inc.から、カニクイザル(Macaca Fascicularis)を入手した。非臨床毒性評価に一般的に用いられる非げっ歯類の種であるため、カニクイザルを選んだ。
研究において、8頭(2頭の未処置および6頭の処置済み)の雄を用いた。動物は、若年成体であり、投薬開始において2〜4kgの間の重さがあった。
下の表15に示す通り、動物を割り当てた。動物は、経口経管栄養により1日当たり1回、7連続日にわたり化合物23またはビヒクルを与え、投薬完了の翌日に屠殺した。投薬の最初の日は、研究1日目と指定した。各動物に投与された実際の容積を計算し、各動物の最新の体重に基づき調整した。
群割り当て前、1日目(投薬前)、3日目および7日目ならびに剖検前に終末的(絶食)に、全動物の体重を記録した。
前治療期間において1回、そして7日目(投薬後)に再度、全サルの心電図(双極肢誘導I、IIおよびIIIならびに増大単極誘導aVR、aVLおよびaVF)を得た。
一連の7種の血液試料(それぞれおよそ0.5mL)を、1および7日目に次の時点において各サルから収集した。投薬前、投薬後30分、および2、3、6、12および24時間。このために各サルを静脈穿刺により出血させ、抗凝固剤、K2EDTAを含有するチューブに試料を収集した。加工の準備が整うまで、湿った氷の上にチューブを置いた。
治療開始前および8日目の終結前に、全動物において研究室調査(血液学、凝固、臨床化学および検尿)を行った。
EDTA抗凝固剤に収集した血液試料において、次のパラメータを測定した。赤血球数、平均赤血球ヘモグロビン量(計算)、ヘマトクリット(計算)、平均赤血球容積、ヘモグロビン、細胞形態、白血球数、血小板数、白血球百分率数(絶対)、網状赤血球(絶対および百分率)ならびに平均赤血球ヘモグロビン濃度(計算)。
シトレート抗凝固剤に収集した血液試料において、活性化部分トロンボプラスチン時間およびプロトロンビン時間を測定した。
凝血活性化因子を含有するチューブに収集した血液試料において、次のパラメータを測定した。a/g比(計算)、クレアチニン、アラニンアミノトランスフェラーゼ、グロブリン(計算)、アルブミン、グルコース、アルカリホスファターゼ、リン(無機)、アスパラギン酸アミノトランスフェラーゼ、カリウム、ビリルビン(総)、ナトリウム、カルシウム、総タンパク質、塩化物、トリグリセリド、コレステロール(総)、尿素、γグルタミルトランスフェラーゼおよびソルビトールデヒドロゲナーゼ。
尿試料において次のパラメータを測定した。ビリルビン、タンパク質、血液、沈降顕微鏡検査、色および外観、比重、グルコース、ウロビリノーゲン、ケトン、容積ならびにpH。
治療期間の完了時である、一晩の食物なし期間の後の8日目に、全動物を安楽死させた。サルをケタミンにより前麻酔し、次に、ペントバルビタールナトリウムの静脈内過量投与と、続く主要血管の離断による失血により安楽死させた。
研究において、屠殺した全動物において剖検と組織収集を行った。剖検は、次の検査を包含した。
屠殺体および筋肉/骨格系;
全外表面および開口部;
頭蓋腔および脳の外表面;
首と、それに伴う臓器および組織;ならびに
胸腔、腹腔および骨盤腔と、それらに伴う臓器および組織。
肉眼的検査および選択された臓器秤量の完了において、下の表16に記す通り、組織および臓器を保持した。他に断りがなければ固定および保存のため、中性緩衝10%ホルマリンを用いた。
異なる投与量レベルの化合物23の曝露は、用量に関係した。
薬物動態研究
後述する実験において、本発明の選択された化合物の薬物動態パラメータを決定した。一般解析手順および具体的な実験プロトコールを次の通りに用いた。
後述する薬物動態実験において、次の一般解析手順を用いた。
雄カニクイザル(用量群当たりn=3)に、経管栄養により化合物Wの3、30および300mg/kgの単一の名目上のPO用量を投与した。0.5%MC(微結晶性セルロース)において化合物Wを処方した。動物は、投薬前後に食物および水を自由に入手できた。
雄カニクイザル(用量群当たりn=3)に、頸静脈カニューレにより、化合物Wの1mg/kgの単一の名目上IVボーラス用量を投与した。化合物Wは、D5W(水中5%デキストロース溶液)において処方した。動物は、投薬前後に食物および水を自由に入手できた。
雄スプラーグドーリーラットの群(用量群当たりn=3)に、経管栄養により化合物Wの3、10、30、300mg/kgの単一の名目上の経口用量を投与した。化合物Wは、0.5%MC(微結晶性セルロース)か、あるいは20%Captisol、1%HPMC−AS(ヒドロキシプロピルメチルセルロースアセチルスクシネート)、1%PVP(ポリビニルピロリドン)のいずれかにおいて処方した。動物は、投薬前後に食物および水を自由に入手できた。投薬前および投薬後0(投薬前)、0.25、0.5、1、1.5、2、4、6、8、12、24時間目に、頸動脈カテーテルにより血液試料(それぞれおよそ0.25mL)を収集した。湿った氷の上に維持し、かつ抗凝固剤としてカリウムEDTAを含有したチューブに、各血液試料を収集した。血漿を分離し、解析までおよそ−70℃で保存した。
雄スプラーグドーリーラットの群(用量群当たりn=3)に、頸静脈カニューレにより化合物Wの1および5mg/kgの単一の名目上のIVボーラス用量を投与した。化合物Wは、D5Wにおいて処方した。動物は、投薬前後に食物および水を自由に入手できた。投薬前および投薬後0(投薬前)、5分、10分、0.25、0.5、1、1.5、2、4、6、8、12、24時間目に、頸動脈カテーテルにより血液試料(それぞれおよそ0.25mL)を収集した。湿った氷の上に維持し、かつ抗凝固剤としてカリウムEDTAを含有したチューブに、各血液試料を収集した。血漿を分離し、解析までおよそ−70℃で保存した。
雌CD−1マウスの群(用量群当たりn=3)に、経管栄養により化合物Wの10、30、100mg/kgの単一の名目上の経口用量を投与した。化合物Wは、0.5%MCにおいて処方した。動物は、投薬前後に食物および水を自由に入手できた。投薬前および投薬後0(投薬前)、0.25、0.5、1、1.5、2、4、6、8、12、24時間目に、顎下静脈から血液試料(それぞれおよそ0.025mL)を収集した。湿った氷の上に維持し、かつ抗凝固剤としてカリウムEDTAを含有したチューブに、各血液試料を収集した。血漿を分離し、解析までおよそ−70℃で保存した。
酵素学研究
後述する実験において、本発明の選択された化合物の酵素阻害活性を決定した。
ピルビン酸キナーゼ/乳酸デヒドロゲナーゼによるADP産生を、NADHの酸化にカップリングさせることにより、S.aureus DNAジャイレースのATP加水分解活性を測定した。この方法は、以前に記載されている(TamuraおよびGellert、1990年、J. Biol. Chem.、265巻、21342頁)。
S.aureus TopoIV酵素によるATPからADPへの変換を、NADHからNAD+への変換にカップリングさせ、340nmにおける吸光度の変化により反応の進行を測定した。TopoIV(64nM)を、緩衝液中で選択された化合物(3%DMSO最終)と共に10分間30℃でインキュベートした。緩衝液は、100mM Tris7.5、1.5mM MgCl2、200mM K・グルタメート、2.5mMホスホエノールピルベート、0.2mM NADH、1mM DTT、5μg/mL直鎖化DNA、50μg/mL BSA、30μg/mLピルビン酸キナーゼおよび10μg/mL乳酸デヒドロゲナーゼ(LDH)からなった。ATPにより反応を開始し、20分間30℃でMolecular Devices SpectraMAXプレートリーダーにおいて、率を継続的にモニターした。密接な結合阻害剤のためのMorrison方程式に適合させた、率vs.選択された化合物の濃度のプロットから、阻害定数KiおよびIC50を決定した。
肝性および肝臓S9細胞におけるIN VIVO代謝研究
ラット、イヌ、サルおよびヒトの肝臓および腸S9画分において、化合物Wから化合物23への変換を研究した。肝臓S9画分において0.1、0.3、1、3、10、20、40、100、200、300μM、また、腸S9画分においては1、3、10、20、100、300、500、1000μMの化合物Wをインキュベートした。0、5、10、15、30、45または60分間インキュベーションを行った。LC/MS−MSにより化合物23の生成を定量化し、Michaelis Menten方程式にデータを適合させた。下の表25におけるデータは、化合物Wが、これらの肝性および腸S9画分において化合物23へと迅速に変換することを表示する。
Claims (22)
- (R)−1−エチル−3−(5−(2−(2−ヒドロキシプロパン−2−イル)ピリミジン−5−イル)−7−(テトラヒドロフラン−2−イル)−1H−ベンゾ[d]イミダゾール−2−イル)尿素である、請求項4に記載の化合物、または薬学的に許容されるその塩。
- (R)−1−エチル−3−(6−フルオロ−5−(2−(2−ヒドロキシプロパン−2−イル)ピリミジン−5−イル)−7−(テトラヒドロフラン−2−イル)−1H−ベンゾ[d]イミダゾール−2−イル)尿素である、請求項4に記載の化合物、または薬学的に許容されるその塩。
- (R)−1−エチル−3−(5−(2−(2−ヒドロキシプロパン−2−イル)ピリミジン−5−イル)−7−(テトラヒドロフラン−2−イル)−1H−ベンゾ[d]イミダゾール−2−イル)尿素のメタンスルホン酸塩である、請求項4に記載の塩。
- (R)−1−エチル−3−(6−フルオロ−5−(2−(2−ヒドロキシプロパン−2−イル)ピリミジン−5−イル)−7−(テトラヒドロフラン−2−イル)−1H−ベンゾ[d]イミダゾール−2−イル)尿素のメタンスルホン酸塩である、請求項4に記載の塩。
- Xが、−PO(OH)O−M+、−PO(O−)2・2M+、または−PO(O−)2・D2+であり、M+が、Li+、Na+、K+、N−メチル−D−グルカミン、およびN(R9)4 +(式中、各R9は、独立して水素もしくはC1〜C4アルキル基である)からなる群から選択され、D2+が、Mg2+、Ca2+、およびBa2+からなる群から選択される、請求項3に記載の化合物。
- Xが、−PO(OH)O−M+、または−PO(O−)2・2M+であり、M+が、Li+、Na+、K+、N−メチル−D−グルカミン、およびN(R9)4 +(式中、各R9は、独立して水素もしくはC1〜C4アルキル基である)からなる群から選択される、請求項9に記載の化合物。
- Xが−PO(O−)2・2M+であり、M+が、Li+、Na+、K+、N−メチル−D−グルカミン、およびN(R9)4 +(式中、各R9は、独立して水素またはC1〜C4アルキル基である)からなる群から選択される、請求項9に記載の化合物。
- M+がNa+である、請求項9に記載の化合物。
- (R)−2−(5−(2−(3−エチルウレイド)−6−フルオロ−7−(テトラヒドロフラン−2−イル)−1H−ベンゾ[d]イミダゾール−5−イル)ピリミジン−2−イル)プロパン−2−イルリン酸二ナトリウムである、請求項3に記載の化合物。
- 請求項3に記載の化合物または薬学的に許容されるその塩、および薬学的に許容される担体、アジュバント、もしくはビヒクルを含む、医薬組成物。
- 生物学的試料中のMycobacterium tuberculosis、Streptococcus pneumoniae、Staphylococcus epidermidis、Enterococcus faecalis、Staphylococcus aureus、Clostridium difficile、Moraxella catarrhalis、Neisseria gonorrhoeae、Neisseria meningitidis、Mycobacterium avium complex、Mycobacteriumabscessus、Mycobacterium kansasii、Mycobacterium ulcerans、Chlamydophila pneumoniae、Chlamydia trachomatis、Haemophilus influenzae、Streptococcus pyogenes、またはβ−溶血性streptococciの細菌量を減少させるか、または抑制するための組成物であって、式
(式中、Rは、水素もしくはフッ素であり、Xは、水素、−PO(OH) 2 、−PO(OH)O − M + 、−PO(O − ) 2 ・2M + 、もしくは−PO(O − ) 2 ・D 2+ であり、M + は、薬学的に許容される一価陽イオンであり、D 2+ は、薬学的に許容される二価陽イオンである)の化合物、または薬学的に許容されるその塩を含む、組成物。 - 前記細菌感染症が、Mycobacterium tuberculosis、Streptococcus pneumoniae、Staphylococcus epidermidis、Enterococcus faecalis、Staphylococcus aureus、Clostridium difficile、Moraxella catarrhalis、Neisseria gonorrhoeae、Neisseria meningitidis、Mycobacterium avium complex、Mycobacterium abscessus、Mycobacterium kansasii、Mycobacterium ulcerans、Chlamydophila pneumoniae、Chlamydia trachomatis、Haemophilus influenzae、Streptococcus pyogenes、またはβ−溶血性streptococciのうちの1つまたは複数の存在を特徴とする、請求項18に記載の組成物。
- 前記細菌感染症が、以下、即ち、上気道感染症、下気道感染症、耳感染症、胸膜肺感染症および気管支感染症、複雑性尿路感染症、単純性尿路感染症、腹腔内感染症、心血管感染症、血流感染症、敗血症、菌血症、CNS感染症、皮膚感染症および軟部組織感染症、GI感染症、骨関節症および関節感染症、生殖器感染症、眼感染症、または肉芽腫性感染症、単純性皮膚および皮膚構造感染症(uncomplicated skin and
skin structure infection)(uSSSI)、複雑性皮膚および皮膚構造感染症(complicated skin and skin structure infection)(cSSSI)、カテーテル感染症、咽頭炎、副鼻腔炎、外耳炎、中耳炎、気管支炎、膿胸、肺炎、市中細菌性肺炎(CABP)、院内肺炎(HAP)、院内細菌性肺炎、人工呼吸器関連肺炎(VAP)、糖尿病性足感染症、バンコマイシン耐性enterococci感染症、膀胱炎および腎盂腎炎、腎結石、前立腺炎、腹膜炎、複雑性腹腔内感染症(cIAI)、ならびに他の腹腔内感染症、透析関連腹膜炎、内臓膿瘍、心内膜炎、心筋炎、心膜炎、輸血関連敗血症、髄膜炎、脳炎、脳膿瘍、骨髄炎、関節炎、生殖器潰瘍、尿道炎、膣炎、子宮頸管炎、歯肉炎、結膜炎、角膜炎、眼内炎、嚢胞性線維症患者の感染症、または発熱性好中球減少症患者の感染症のうちの1つまたは複数から選択される、請求項19に記載の組成物。 - 前記細菌感染症が、以下、即ち、市中細菌性肺炎(CABP)、院内肺炎(HAP)、院内細菌性肺炎、人工呼吸器関連肺炎(VAP)、菌血症、糖尿病性足感染症、カテーテル感染症、単純性皮膚および皮膚構造感染症(uSSSI)、複雑性皮膚および皮膚構造感染症(cSSSI)、バンコマイシン耐性enterococci感染症、または骨髄炎のうちの1つまたは複数から選択される、請求項20に記載の組成物。
- 前記化合物が、リン酸二水素(R)−2−(5−(2−(3−エチルウレイド)−6−フルオロ−7−(テトラヒドロフラン−2−イル)−1H−ベンゾ[d]イミダゾール−5−イル)ピリミジン−2−イル)プロパン−2−イルである、請求項1に記載の化合物。
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