JP5971182B2 - Maldi質量分析装置 - Google Patents
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Description
a)サンプルプレート上に形成された所定のサンプルを含む所定範囲を撮影して画像を取得する撮影部と、
b)該撮影部により得られた画像を構成する複数の画素の輝度値の情報を利用して、又は該輝度値の情報とその輝度値毎の出現度数の情報とを利用して、輝度値毎に満遍なくプリスキャン測定を実施する測定点を抽出するプリスキャン測定点抽出部と、
c)該プリスキャン測定点抽出部により抽出された複数の測定点について、それぞれレーザ光を照射し前記質量分析部により質量分析データを収集するプリスキャン測定実行制御部と、
d)前記輝度値毎に抽出された測定点に対して得られた質量分析データを用いて、その輝度値毎に、サンプルが存在する又は該サンプル中の試料成分が存在する可能性を示す期待値を算出する期待値算出部と、
e)該期待値算出部により求まる輝度値と期待値との関係から、サンプルが存在する又はサンプル中の試料成分が存在するとみなせる領域を識別するための輝度閾値を決定する閾値決定部と、
を備え、前記閾値決定部により決定された輝度閾値を利用して、サンプルを含む所定範囲の撮影画像から該サンプルが存在する又は該サンプル中の試料成分が存在する領域を識別することを特徴としている。
また測定点抽出の別の方法としては、輝度値と画素の出現数度数との関係を示す輝度値ヒストグラムを作成し、その出現度数に応じて各輝度値に対する測定点の数を決めるようにしてもよい。この場合には、或る輝度値を示す画素の数が極端に多いときにその輝度値に対する測定点の数を制限するように上限値を設定したり、逆に、或る輝度値を示す画素の数が極端に少ないときにはその輝度値を示す画素全てを測定点として抽出したりして、測定点の選択数のバランスが極端に悪くならないように適宜数を調整するとよい。
そこで、本発明に係るMALDI質量分析装置の一実施態様として、
サンプルプレートの種類とマトリクスの種類の組み合わせに対応して前記閾値決定部により決定された輝度閾値をそれぞれ記憶しておく記憶部をさらに備え、
任意のサンプルの測定を行う際に、そのときに使用されるサンプルプレートの種類及びマトリクスの種類に対応した輝度閾値を前記記憶部から取得してサンプルが存在する又は該サンプル中の試料成分が存在する領域を識別するために用いる構成とすることができる。
輝度閾値を求める際には実際にサンプルを測定する必要があり、このときのサンプルとしては目的試料が含まれる目的サンプルを用いることも可能であるが、目的試料が浪費されることを避けるには、適宜のキャリブラント(較正用試料)を目的サンプルと同じマトリクスを用いて調製した較正用サンプルを使用するとよい。以下の説明では、この較正用サンプルを用いて輝度閾値を求める場合を例に挙げる。
予め輝度値毎に抽出する測定点の数nを定めておく。例えばn=10とする。このnの値が大きいほど、最終的に求まる輝度閾値の信頼性は高まるものの、それだけ測定に時間が掛かるため、測定効率を低下させることになる。そこで、輝度閾値の信頼性と測定時間との兼ね合いで、予め適当な値を定めておくのが好ましい。そして、輝度値ヒストグラムが作成されたならば、輝度値の範囲が判明するから、その輝度値ヒストグラム中の輝度値毎にn個ずつ測定点を抽出する。例えば、或る輝度値の出現度数が100であるとすると、その中からn個だけ画素を選択して該画素の位置(アドレス)を測定点とする。このとき、サンプル上又はウェル中で或る部分に集中的に一つの輝度値に対する測定点が選択されてしまうと正確性を欠くので、できるだけ空間的に分散するように同一輝度値に対するn個の画素を選択するのが好ましい。
2…試料ステージ
3…ステージ駆動部
4…アパーチャ
5…アインツェルレンズ
6…レーザ照射部
7、8…反射鏡
9…撮像部
10…質量分析部
11…自由飛行空間
12…反射器
13…イオン検出器
20…制御・処理部
21…輝度閾値自動算出部
22…輝度閾値記憶部
23…サンプル領域認識部
24…入力部
25…表示部
100…ウェル
101…測定点
S…サンプル
Claims (3)
- サンプルプレート上に形成されたサンプルにレーザ光を照射して該サンプル中の成分をイオン化するマトリクス支援脱離レーザイオン化(MALDI)法によるイオン源と、該イオン源により生成されたイオンを質量分析する質量分析部と、を具備するMALDI質量分析装置において、
a)サンプルプレート上に形成された所定のサンプルを含む所定範囲を撮影して画像を取得する撮影部と、
b)該撮影部により得られた画像を構成する複数の画素の輝度値の情報を利用して、又は該輝度値の情報とその輝度値毎の出現度数の情報とを利用して、輝度値毎に満遍なくプリスキャン測定を実施する測定点を抽出するプリスキャン測定点抽出部と、
c)該プリスキャン測定点抽出部により抽出された複数の測定点について、それぞれレーザ光を照射し前記質量分析部により質量分析データを収集するプリスキャン測定実行制御部と、
d)前記輝度値毎に抽出された測定点に対して得られた質量分析データを用いて、その輝度値毎に、サンプルが存在する又は該サンプル中の試料成分が存在する可能性を示す期待値を算出する期待値算出部と、
e)該期待値算出部により求まる輝度値と期待値との関係から、サンプルが存在する又はサンプル中の試料成分が存在するとみなせる領域を識別するための輝度閾値を決定する閾値決定部と、
を備え、前記閾値決定部により決定された輝度閾値を利用して、サンプルを含む所定範囲の撮影画像から該サンプルが存在する又は該サンプル中の試料成分が存在する領域を識別することを特徴とするMALDI質量分析装置。 - 請求項1に記載のMALDI質量分析装置であって、
前記期待値算出部は、前記輝度値毎に抽出された測定点に対してそれぞれ得られた各マススペクトルデータの総イオン量をスコアとし、輝度値毎に複数の測定点における前記スコアの平均値を求めて前記期待値とすることを特徴とするMALDI質量分析装置。 - 請求項1又は2に記載のMALDI質量分析装置であって、
サンプルプレートの種類とマトリクスの種類の組み合わせに対応して前記閾値決定部により決定された輝度閾値をそれぞれ記憶しておく記憶部をさらに備え、
任意のサンプルの測定を行う際に、そのときに使用されるサンプルプレートの種類及びマトリクスの種類に対応した輝度閾値を前記記憶部から取得して、サンプルが存在する又は該サンプル中の試料成分が存在する領域を識別するために用いることを特徴とするMALDI質量分析装置。
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