JP5908613B2 - 生体試料の自動分析装置及び方法 - Google Patents

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Description

本発明は、生体試料の自動分析装置及び方法に関し、より詳細には、生体試料から標的核酸を精製し、PCR、逆転写PCR(RT-PCR)、ネステッド(nested)PCR、及び上記の過程を定量的に行うリアルタイム定量PCR、等温遺伝子増幅などを行った後、電気泳動分析する全ての過程を一つの装備内で行う装置に関する。また、遺伝子増幅産物による偽陽性を根本的に防止するために、紫外線ランプを移動部により移動されるように備えて、遺伝子増幅産物に集中的に照射することで、PCR、逆転写PCR、ネステッドPCR、及びこれを含むリアルタイム定量PCR、等温増幅、PCR‐電気泳動分析を全自動でそれぞれまたは連続して行うことができるため、分析正確度及び効率性を高めることができる生体試料の自動分析装置及び方法に関する。
遺伝子増幅検査法は、特定配列の遺伝子を増幅して遺伝子の有無を判別する体外診断検査(in vitro diagnostic testing;IVD testing)技術であって、ヒトを始めとする各種動物、植物などの病原性微生物検査、遺伝子型検査だけでなく、食品検査、GMO検査などの様々な分野で用いられる。様々な生体試料から正確な遺伝子増幅検査を行うためには、先ず、遺伝子増幅反応を阻害する生体試料に含まれている様々な反応阻害物質を生体試料から除去し、高純度の標的核酸を得る、核酸抽出過程が必要である。ここで、標的核酸は、検出目的に応じて、DNA、RNA、またはこれらの混合物であることができる。このように抽出された標的核酸を遺伝子増幅溶液と混合し、遺伝子増幅反応を行った後、遺伝子増幅産物のDNAの長さに該当するDNAを電気泳動により確認することで、遺伝子増幅検査が完成される。
この際、本発明における「生体試料」とは、生物由来の物質であって、動物、植物、微生物、ウイルス、及び菌類の他にも、生物と定義される全ての物質を含む意味で解釈されることができる。
遺伝子増幅検査において、DNAを増幅する方法としてはPCR方法が最も多く用いられている。極微量のDNAを検出するためには、増幅されたDNAのプライマー塩基配列の内部に相補的なプライマーを用いてPCR反応をもう一度行う、ネステッドPCR方法が多く用いられている。RNAウイルスや特定遺伝子のmRNA発現量を検査するためには、逆転写PCR、すなわち、RT‐PCR(Reverse Transcription PCR)が用いられている。また、この他にも、温度循環反応を行わずに、所定温度でDNAまたはRNAを増幅する様々な方法が開発されている。
一方、このようなPCR検査法は、DNA増幅がある程度までなされると、デオキシヌクレオチド三リン酸が無くなって、それ以上増幅がなされない限界に到逹するため、定量的な分析に限界があった。例えば、鋳型核酸の初期濃度が高い場合には20サイクル以内の短い反応でも飽和され、これより初期濃度が1/1000と低い場合には少なくとも30サイクル後に飽和されるが、30サイクル後には、上記の場合の両方とも飽和されて同一量が検出される。このような問題点を解決するために、毎サイクル後に核酸の濃度を測定して、所定の核酸濃度に到逹するサイクルを測定することで、核酸の初期濃度を正確に且つ定量的に測定することができるリアルタイム定量PCR技術が開発された。この技術は、ウイルスや病原菌の濃度を定量的に測定することができるため、分子診断において非常に有用な技術として発展した。リアルタイム定量PCR技術は、DNAの量に比例して増加する蛍光を用いる方法が主に用いられている。この蛍光法は、増幅されたDNA配列特異的方法と増幅されたDNA配列非特異的方法とに分けられる。増幅されたDNA配列非特異的方法は、増幅されたDNA(複数可)の全てに結合して蛍光を増加させるインターカレーティング染料を用いる方法である。この方法を用いると、増幅されたDNA(複数可)の全ての量に比例して蛍光量が増加するため、プライマーダイマーなどの非特異的増幅物が生成されたり、2個以上の特定標的を増幅しようとする場合、標的核酸の正確な初期量が分からないという問題点がある。それに対し、増幅されたDNA配列に特異的な蛍光プローブを用いる方法は、一つのチューブ内で複数の標的核酸を増幅すると同時に多重に定量検出することが可能である。この方法は、それぞれ異なる蛍光性を有する様々な種のプローブが、プライマー対を用いて標的を増幅しながらそれぞれの増幅されたDNA(複数可)に選択的にハイブリダイズされて蛍光を示すため、それぞれの蛍光産物を検出してそれぞれの産物を定量測定するマルチプレックスリアルタイム定量PCR方法が開発された。しかし、この方法も、標的核酸の数が増加するに伴い、プライマー対及びプローブ、すなわち、標的核酸当たり3倍の種類のオリゴヌクレオチドが必要であるため、4個以上の標的を対象としてマルチプレックス定量PCRを行う場合にはその性能が急激に低下するという問題点がある。その反面、通常のマルチプレックスPCRでは、10種の標的核酸のマルチプレックスPCRも適切に行われるように最適化することができるため、複数の標的核酸を検出するためにはマルチプレックスPCRが有利である。しかし、このようなPCR方法は、定量的ではないため、多重標的を定量的に検査することができる検査法が要求されている。さらに、リアルタイム定量PCR法は、増幅されたDNAの長さが確認できないため、DNA欠失やDNA挿入有無を分析したり、VNTRなどの繰り返し塩基の数を検出したりする際には用いることができないという限界がある。
本発明は、上記のような問題点を解決するために、リアルタイム定量PCRを行った後、次いで通常のPCRで増幅された産物の長さを確認することができる全自動機器を提供することをその目的とする。これにより、多くの標的を同時に増幅することができ、それぞれの標的を定量分析することができるだけでなく、DNA欠失やDNA挿入有無を分析したり、VNTRなどの繰り返し塩基の数を検出したりするとともに、該当標的の初期DNA量を定量的に検査することができる装置を提供することができる。
一方、遺伝子増幅検査は、高い敏感度及び特異度で検出することができるため、各種微生物、遺伝子検査に多様に用いられている。しかし、高い敏感度により、遺伝子増幅産物を含む極微量のエアゾールの汚染によっても偽陽性の結果が出る遺伝子増幅産物汚染(amplicon contamination)の問題がある。この問題点を解決するために、紫外線や酵素反応を用いて増幅産物を不活化させる方法が開発されている。紫外線を用いる方法は、8‐MOP(8‐methoxypsoralene)をPCR反応液と予め混合し、増幅反応させた後、紫外線を照射してDNAと光化学反応させることで、後でPCR反応物に汚染される際にも、PCR反応で増幅されないDNAに変換させる方法である。酵素を用いる方法は、デオキシウリジン三リン酸(dUTP)及びウラシル デオキシグリコシダーゼ(UDG)酵素を用いる方法であって、dUTPをPCR反応溶液に添加することでPCR反応産物がデオキシウリジン塩基を含むようにした後、PCR反応物にUDG酵素を添加することで、PCR増幅反応前に、汚染されたPCR反応産物がUDG酵素反応により分解されて除去されるようにする方法である。しかし、PCR反応産物を用いてPCRを連続的に行わなければならないネステッドPCRなどの場合には、上記のような方法を用いることが困難である。そのため、通常、遺伝子増幅検査を行う機関では、核酸の抽出及び精製、遺伝子増幅反応試料の準備、及び電気泳動分析のための分離された実験室を設け、それぞれの実験室でそれぞれの作業を行っている。したがって、遺伝子増幅実験室を準備及び運営するに多くのコストがかかる。それにもかかわらず、作業者による汚染によって発生する偽陽性結果、核酸の抽出及び遺伝子増幅反応液の調剤中の誤りによって発生する偽陰性結果の危険性が常に存在し、これを防止するための検査操作方法が非常に難しいため、大型病院や臨床検査専門機関を中心として検査が行われている。
したがって、遺伝子増幅検査における上記のような偽陰性及び偽陽性の可能性を除去し、検査の正確度、再現性、及び効率性を高めることができる、経済的な全自動遺伝子増幅機器の需要が益々増加している。
上記のような需要を満たすための本発明について説明する前に、従来の技術による遺伝子増幅検査のそれぞれの段階について説明する。
通常、生体試料から核酸を抽出する方法として、磁性粒子を使用する方法が広く用いられている。この方法は、溶液の懸濁状態で、広い表面積の微細な磁性粒子に標的核酸を速く付着させ、磁場を加えて標的核酸が付着された磁性粒子を凝集させた後、濾液を除去し、磁性粒子を洗浄した後、純粋な核酸を溶出して精製する方法であって、これに係る様々な自動化装置が開発されている。
近年、ピペットを用いる自動化方法が広く用いられている。
Labsystems社は、特許文献1などに、使い捨てピペット形態を用いて磁性粒子を分離する様々な方法を記述している。この方法は、特許文献2や特許文献3のように、ピペットに磁性粒子を凝集させる方法に関する先行技術である。前記使い捨てピペットを用いる装置は、一つの管形であって、ジェットチャネルに直列に連結されており、ジェットチャネルは管の端の流れ出入口と定義され、分離チャンバーより小さい直径を有する構成要素;分離壁の外側に隣接する第1位置または分離チャンバー内の第2位置に位置する磁性要素であって、磁性要素が第1位置に位置するときには、磁場の影響により磁性粒子が収集されることができ、磁性要素が第2位置に位置するときには、磁性粒子がそれ以上取れないように整列された磁性要素;ジェットチャネルから離れているシリンダー状の分離チャンバーに直列に連結された2番目の部分である管が、シリンダーチャネルに移動可能なピストンが装着されて分離チャンバーに液体を吸入及び吐出することができる構造を有するもので構成されている。
この他にも、ピペット及び磁性を用いて精製する装置が多く提案されている。
しかし、上記のような全ての構造は、使い捨てピペットを用いて溶液から標的核酸を分離し、それを他の溶液に懸濁させる方法を提示しているが、磁性粒子によりピペットの下端部が詰まってしまって、核酸抽出に失敗する場合が度々発生するという大きい限界がある。
また、生化学的混合液から標的核酸を分離する一連の過程がピペット内で行われるため、溶液の均一な懸濁が困難であるという問題がある。さらに、精製の最後段階である洗浄が完了した後にも洗浄溶液が完全に除去されず、溶離時に残量の洗浄溶液が含まれていて、後続の遺伝子増幅などの過程に影響を与える恐れがあるという問題がある。
抽出された標的核酸から遺伝子増幅反応を行う段階では、標的核酸を増幅するためにPCR、ネステッドPCR、RT/PCR、等温核酸増幅法などの様々な方法が開発されている。通常、抽出された標的核酸を遺伝子増幅反応溶液と混合して遺伝子増幅産物を準備する準備段階と、反応を進行させる反応段階と、が必要である。準備段階では、プライマー、核酸重合酵素、重合単量体であるヌクレオチド三リン酸(dNTPまたはNTP)、及びバッファーを含有する遺伝子増幅反応液と、抽出された標的核酸と、を所定量混合することで反応を準備することができる。遺伝子増幅反応段階では、等温増幅の場合は所定の温度に維持するだけでよいが、PCRを用いる場合は、温度循環反応のための加熱及び冷却段階が必要である。遺伝子増幅反応のためには温度を上昇させることが必要であり、この際、蒸発を防ぐために、反応容器を密封することが一般的である。しかし、遺伝子増幅反応容器を密封する場合、遺伝子増幅反応が終わった後に遺伝子増幅産物に対する電気泳動分析を行うために、その反応容器を開封して遺伝子増幅産物を電気泳動ゲル362に移さなければならないが、この過程を自動で行うための複雑な装置が必要であり、遺伝子増幅産物の汚染が発生するという問題がある。特に、ネステッドPCRの場合、増幅産物の汚染を防止するために増幅産物を不活化する方法を用いることができないため、検査を行うための空間を分離することに依存している。
遺伝子増幅反応産物を電気泳動分析する過程では、アガロース電気泳動法が用いられている。この方法は、伝統的な方法であって、安価で、且つ簡単に分析できるという利点があるが、分析時間が比較的長く、熟練された人の手作業が多く必要であるという問題がある。近年、このような問題を解決するために、短い時間内に、自動で電気泳動を行うことができる毛細管電気泳動を用いた方法が開発されているが、装置及び消耗品の価格が高価であるため、制限的に用いられている。通常、全ての電気泳動段階では遺伝子増幅産物を用いて分析を行うため、これらから発生した微小なエアゾールがさらに遺伝子増幅反応溶液に混入して、偽陽性をもたらすという問題がある。したがって、このような問題を防止することができる方法が要求されている。
リアルタイム定量PCRのための様々な装置が開発されている。しかし、このような装置の殆どは、複雑で且つ高価である。また、一般のPCR反応のように、連続的に自動で行うことができる装置が開発されていないため、上記の作業を連続的に行うことができる、簡単で且つ便利な新しい概念の装置及び方法が要求されている。上記の核酸抽出、リアルタイム定量PCR/PCR、及び電気泳動の全過程を行うにあたり、リアルタイム定量PCR及び一般PCRを連続的に行うとともに、分析に必要な全過程を自動化することで、外部及び内部の汚染要素による汚染を防止することができ、高い信頼性を有し、便宜性、再現性、及び効率性が向上されながらも、検査の正確度が高い生体試料の全自動分析装置及び方法が要求されている。
米国特許第5647994号明細書 米国特許第5702950号明細書 米国特許第6187270号明細書
本発明は、上述の問題点を解決するためになされたものであって、本発明の目的は、生体試料から標的核酸を精製し、増幅及び分析する複雑な過程を一つの装置を用いて全自動で行うことができて、PCR、ネステッド(Nested)PCR、RT‐PCR、及び前記過程を定量的に行うリアルタイム定量PCR、等温核酸増幅法などを全自動で行うことができる、便利で、優れた再現性を有し、経済的な遺伝子検査システムを提供することにある。また、繰り返される検査で発生する慢性的な偽陽性の問題を解決し、検体試料の汚染を防止することで、正確度の高い生体試料自動分析装置及び方法を提供することにある。
本発明の生体試料自動分析装置1000は、所定領域が開閉されるように形成された開放部110を有するケース100と、複数個のウェル211が第1列〜第N列をなし、前記第1列〜第N列のうち特定列のウェルにそれぞれ生体試料、精製に必要な一つ以上の試料または試薬が収容されたマルチウェルプレートキット210を有して、前記生体試料から標的核酸を精製する精製部200と、前記精製部200により精製された標的核酸を増幅する核酸増幅部400と、電気泳動本体310を有し、前記核酸増幅部400により増幅された増幅産物を検査する電気泳動部300と、複数個が列をなし、生体試料、前記精製部200で用いられる試料または試薬、精製された標的核酸、増幅されたDNAを移動するためのピペット500と、前記ピペット500を前記ケース100の長さ方向及び高さ方向に移動させ、前記ピペット500の作動を調節する移動部600と、前記精製部200、核酸増幅部400、電気泳動部300、及び移動部600を制御する制御部(不図示)と、を含むことを特徴とする。
また、前記生体試料自動分析装置1000は、前記マルチウェルプレートキット210及び電気泳動本体310が着脱可能に備えられ、前記ケース100の下面に固定されたガイド部130により案内されて前記開放部110を介して前記ケース100の長さ方向に移動されるベースプレート700をさらに含むことを特徴とする。
また、前記生体試料自動分析装置1000は、前記移動部600に固定された第1滅菌手段800をさらに含むことを特徴とする。
尚、前記第1滅菌手段800は紫外線ランプであり、反射手段810をさらに含むことを特徴とする。
また、前記精製部200は、磁石221を有し、前記マルチウェルプレートキット210の特定列のウェルに磁場を印加する磁場印加部201と、前記磁場印加部201に隣接して形成され、同一の特定列のウェルを加熱する加熱部202と、を含むことを特徴とする。
また、前記精製部200は、標的核酸を抽出するための生体試料を入れる生体試料チューブ281を有する生体試料チューブラック280をさらに含み、前記生体試料チューブラック280が前記ベースプレート700に着脱可能に備えられることを特徴とする。
尚、前記磁場印加部201は、磁石221が装着された磁石装着部220と、前記ケース100の下面に装着され、前記磁石装着部220を上昇及び下降させる昇降部270と、を含むことを特徴とする。
また、前記マルチウェルプレートキット210の第1列〜第N列のウェルに収容された精製に必要な一つ以上の試料または試薬は、酵素、細胞溶解溶液、核酸結合溶液、磁性粒子水分散液、及び洗浄溶液の一つ以上を含むことを特徴とする。
また、前記磁石装着部220の前記磁石221が装着された面には、前記マルチウェルプレートキット210の特定列の下部が差し込まれるように差し込み溝222が形成されており、前記ベースプレート700には、前記磁石装着部220の上昇時に特定列の下部が前記差し込み溝222に載置されるように、所定領域が中空された第1露出孔701が形成されることを特徴とする。
尚、前記磁石装着部220は金属材質からなり、前記加熱部202は、前記磁石装着部220に接触して形成された発熱フィルムであることを特徴とする。
また、前記ベースプレート700には、複数個のウェル211の間に位置するように前記マルチウェルプレートキット210の下側から突出した突出固定部730、及び前記突出固定部730に備えられてウェル211に密着される弾性手段731がさらに形成されることを特徴とする。
また、前記ベースプレート700には、使用後に廃棄される溶液が貯蔵される廃液槽740が着脱可能に備えられることを特徴とする。
尚、前記生体試料自動分析装置1000において、前記移動部600は、前記ピペット500を着脱することができるピペットブロック630を含み、前記ベースプレート700には、前記ピペット500が保管されるピペットラック510が着脱可能に備えられることを特徴とする。
この際、前記移動部600のピペットブロック630は、前記ピペット500が装着されるピペット固定突出部644‐1が下側に形成され、高さ方向に移動可能なピペットブロック固定板644を有するピペット装着部により、前記ピペット500が前記ピペット固定突出部644‐1に装着されることを特徴とする。
また、前記移動部600のピペットブロック630は、上側に形成されたピストン631と、前記ピストン631が固定されて高さ方向に移動可能なピストン固定板634と、を有するピペット調節部により、前記ピペット500の吸入及び吐出が調節されることを特徴とする。
尚、前記移動部600のピペットブロック630は、前記ピペット固定突出部644‐1に対応する領域が中空されており、前記ピペット500が装着された時に、ピペットブロック固定板644の下面とピペット500の上面との間に当接するように位置されたピペット押出し板638‐1と、前記ピペットブロック630の上側に位置されたピペット押出しピン固定板639と、前記ピペットブロック630の高さより長い長さを有し、前記ピペット押出し板638‐1と前記ピペット押出しピン固定板639とを連結するピペット押出しピン638と、を含み、前記ピペット調節部の作動により前記ピペット押出しピン固定板639が下側方向に移動されると、前記ピペット押出しピン固定板639、ピペット押出しピン638‐1、及びピペット押出し板638‐1が下側に移動されて、前記ピペット500が前記ピペット固定突出部644‐1から取り外されることを特徴とする。
また、前記精製部200は、前記移動部600に着脱可能な真空モジュール291と、前記ケース100の内部の下面に装着され、前記真空モジュール291を所定位置に保管する真空モジュールラック293と、前記真空モジュール291とホースで連結された真空ポンプ295と、を有する乾燥部290をさらに含むことを特徴とする。
また、前記乾燥部290は、前記真空モジュールラック293の上面に凸部294が突出形成され、前記真空モジュール291の下面に前記凸部294に対応する凹部292が形成されることを特徴とする。
尚、前記乾燥部290は、前記真空モジュールラック293に、前記真空モジュール291の一側を支持する支持部293‐1が備えられており、前記支持部293‐1と真空モジュール291とが互いに当接する面に磁石が埋め込まれることを特徴とする。
また、前記電気泳動部300は、前記ベースプレート700に設けられた電気泳動本体固定板750に載置され、それぞれ陽極と陰極を形成する電極線311aにそれぞれ連結された孔状電気接続端子311が形成された電気泳動本体310と、電源を連結するために電気泳動本体310の孔状電気接続端子311に挿入された突出状電気接続端子341と、前記ケース100の下部の内面に固定され、前記電気泳動本体310に電源を供給する電源供給部320と、前記電気泳動本体310に励起光を照射する励起光照射部330と、電気泳動状態を撮影する撮影部350と、を含むことを特徴とする。
また、前記電気泳動部300は、前記ベースプレート700が前記ケース100に挿入されることにより互いに接触して連結される第1接触部342及び第2接触部322が、電源連結端子340の下面及び前記電源供給部320の上面に傾斜して形成されており、前記電源供給部320の第2接触部322の下側の弾性手段321により互いに密着されることを特徴とする。
また、前記励起光照射部330は、前記電気泳動本体310側に励起光波長帯の光を照射するLEDが前記ケース100の内部の下面に等間隔に配列されて備えられており、前記電気泳動本体310が載置される前記ベースプレート700の電気泳動本体固定板750は、励起光を散乱する素材からなり、前記電気泳動本体310の底板は、核酸蛍光発光帯の光は吸収し、励起光帯の光は通過させる材質からなることを特徴とする。
尚、前記撮影部350は、イメージセンサと、レンズと、短波長フィルターと、を含んで形成され、前記移動部600の移動部本体610に固定されることを特徴とする。
また、前記電気泳動部300は、マーカー(marker)及び蛍光染色物質が収容されたマーカーチューブ920、及び前記マーカーチューブ920が装着されたマーカーチューブラック910を有するマーカー貯蔵部900をさらに含み、前記マーカーチューブラック910は、前記ベースプレート700に着脱可能に備えられることを特徴とする。
また、前記電気泳動本体310はゲルトレイ360、360‐1をさらに含み、前記ゲルトレイ360、360‐1は、底面に形成された電気泳動ローディングウエル363と、電気泳動移動路と重ならない位置に形成された複数個の電気泳動ゲル固定部361と、を有することを特徴とする。
尚、前記核酸増幅部400は、一つ以上の列をなす増幅チューブ411と、下部に密着された凹状の載置溝421が形成されており、温度センサが挿入された金属からなる増幅ブロック410‐1と、第1固定磁石422が備えられ、断熱材質からなる増幅ブロックカバー410と、ペルチェ素子423と、ペルチェ素子423で発生した熱を外部に伝達する熱伝達部420と、前記増幅チューブ411の上部面より小さい孔が形成されており、前記増幅チューブ411の上側の所定領域を囲むように形成され、前記第1固定磁石422に対応する第2固定磁石431が挿入されて前記増幅チューブ411を固定し、前記増幅ブロックカバー410が形成された面から所定距離離隔される高さを有する増幅チューブ固定部430と、を含むことを特徴とする。
また、前記ベースプレート700において、前記増幅ブロック410‐1及び増幅チューブ固定部430が前記増幅チューブ固定部430に対応するように中空された第2露出孔702が形成されることを特徴とする。
また、前記核酸増幅部400が前記開放部110に隣接して位置されることを特徴とする。
尚、前記核酸増幅部400は、前記増幅チューブ411側に蛍光励起光を照射する光照射部440と、前記増幅チューブ411の上部に密着されるように上下方向に移動可能に備えられ、増幅チューブ411内の蛍光量をリアルタイムで測定する蛍光検出部450と、をさらに含むことを特徴とする。
また、前記ベースプレート700において、前記開放部110に隣接した一側の上面に取っ手710が形成されることを特徴とする。
また、前記ケース100は、外側の下面に空気が流動される流路を形成する空気流動部142と、前記空気流動部142に空気を送風する送風機141と、をさらに含むことを特徴とする。
尚、前記生体試料自動分析装置1000には、前記ベースプレート700の他側端部に第1位置固定部720がさらに形成され、前記第1位置固定部720に対応する位置の前記ケース100に固定された第2位置固定部120がさらに形成されており、前記第1位置固定部720と第2位置固定部120とは、第3固定磁石721の磁性により互いに固定されることを特徴とする。
一方、本発明による生体試料の自動分析方法は、上述の特徴を有する生体試料自動分析装置1000を用いる分析方法であって、生体試料から標的核酸を得る精製段階(S10)と、前記精製段階(S10)が完了した標的核酸を増幅する増幅段階(S20)と、電気泳動段階(S30)と、を含むことを特徴とする。
また、前記生体試料の自動分析方法は、前記精製段階(S10)の前に、ベースプレート700を前記ケース100の外部に引き出し、前記ベースプレート700に、電気泳動本体310、ピペットラック510、マルチウェルプレートキット210、生体試料チューブラック280、廃液槽740、マーカーチューブラック910、及びマーカーチューブ920を装着する第1装着段階と、前記第1位置固定部720と第2位置固定部120とが互いに当接して固定されるように前記ベースプレート700を引き込む引き込み段階と、ベースプレート700の第2露出孔702を介して露出された増幅ブロック410‐1に増幅チューブ411を載置し、前記増幅ブロックカバー410の第1固定磁石423及び増幅チューブ固定部430の第2固定磁石431により増幅チューブ411を固定する第2装着段階と、を含む準備段階(S40)をさらに含むことを特徴とする。
また、前記精製段階(S10)は、移動部600が移動して、ピペットブロック630にピペット500を装着するピペット装着段階と、前記移動部600が移動して、前記マルチウェルプレートキット210の第1列〜第N列のウェルにそれぞれ収容された生体試料、精製に必要な一つ以上の試料または試薬を移動及び混合して、磁性粒子を除いた混合物である標的核酸含有溶液を得る標的核酸含有溶液獲得段階と、を含み、必要に応じて、磁場印加部201により、前記マルチウェルプレートキット210の特定列のウェルに磁場を印加する磁場印加段階と、加熱部202により、前記マルチウェルプレートキット210の特定列のウェルを加熱する加熱段階と、をさらに行うことを特徴とする。
また、前記標的核酸含有溶液獲得段階は、前記精製部200で、生体試料を溶解して核酸を溶出する試料溶解段階と、標的核酸に磁性粒子を付着させ、残存溶液を除去する標的核酸付着段階と、前記標的核酸が付着された磁性粒子を洗浄して不純物を除去する磁性粒子洗浄段階と、前記移動部本体610に装着されたピペット500を取り外し、前記移動部600の移動部本体610に真空モジュール291を固定して、前記マルチウェルプレートキット210の特定列のウェルの洗浄溶媒を吸入することで、磁性粒子を乾燥する磁性粒子乾燥段階と、乾燥された磁性粒子に溶出バッファーを加えて標的核酸を得る獲得段階と、を含むことを特徴とする。
また、前記増幅段階(S20)で、前記精製段階(S10)により得られた標的核酸含有溶液を増幅チューブ411に移動して混合する混合段階と、熱伝達部420により、温度を調節して増幅する温度調節段階と、を含むことを特徴とする。
また、前記電気泳動段階(S30)は、増幅産物とマーカー溶液とを混合するマーカー混合段階と、電源供給部320及び電源連結端子340により電気泳動本体310に電源を供給して増幅産物を分離する電気泳動遂行段階と、前記励起光照射部330により光を照射し、撮影部350を用いて増幅産物の電気泳動パターンを測定して分子量を分析する分析段階と、を含むことを特徴とする。
尚、前記生体試料の自動分析方法は、前記増幅段階(S20)と電気泳動段階(S30)との間に、第1滅菌手段800を駆動して、増幅された核酸を不活化する不活化段階(S50)をさらに含むことを特徴とする。
また、前記増幅段階(S20)は、光照射部440により所定の励起光を照射しながら、所定時間またはサイクル毎に発生する蛍光量を蛍光検出部450で測定することで、臨界蛍光値が検出される時点を検出して、核酸の初期濃度を計算するリアルタイム定量増幅分析が可能であることを特徴とする。
また、前記生体試料の自動分析方法は、前記増幅段階(S20)により得られた定量増幅分析値を、前記電気泳動段階(S30)により得られた分子量及び増幅産物の個数を含む結果に基づいて補正及び分析することができることを特徴とする。
一方、本発明の定量免疫PCRを用いた抗原濃度獲得方法は、上述の特徴を有する生体試料自動分析装置1000を用いた定量免疫PCRを行うことで、生体試料に含有された抗原の濃度を定量検査することを特徴とする。
上述のように、本発明の生体試料自動分析装置及び方法は、生体試料から標的核酸を精製し、増幅及び分析する装置及び方法であって、PCR、ネステッド(Nested)PCR、RT‐PCR、及び上記の反応を含むリアルタイム定量PCR、等温核酸増幅法などの様々な遺伝子増幅分析を一つの装置で全自動で効率的に行うことができ、汚染を防止することができるシステムが備えられているため、分析精度を高めることができる。
特に、本発明の生体試料自動分析装置及び方法は、リアルタイム定量PCRにより核酸を定量分析し、次いで電気泳動を行うことで、増幅されたDNAの長さを分析することができるため、VNTR、遺伝子挿入、欠失、突然変異などを定量的に分析することができる。上記の利点は、様々な診断分野に応用されることができる。例えば、各種ウイルス疾病を治療するために、ウイルスの血中濃度を定量PCRにより検査し、ウイルスの変種を遺伝子塩基配列決定方法により検査するには、多くのコスト及び時間がかかる。本発明の装置を用いると、それぞれの変種に選択的で、且つ互いに異なる長さを有するPCR反応物が生成されるように設計されたプライマー対が収容されているマルチプレックスPCRチューブを用いてリアルタイム定量PCRを行うことで、ウイルスを定量することができる蛍光値を測定した後、反応物の電気泳動を行うことで、増幅されたDNAの長さを測定することにより、ウイルスの定量検査と変種検査を同時に行うことができる。このような全ての操作が全自動で行われるため、ウイルスの定量検査及び変種検査を一つの臨床試料を用いて簡便で且つ速く行うことができる。
また、本発明の生体試料自動分析装置及び方法は、紫外線ランプが移動部に移動可能に備えられることで、遺伝子増幅直後に遺伝子増幅産物を不活化させることができるため、遺伝子増幅産物の汚染による偽陽性結果を防止することができる。また、生体試料に含まれている病原菌による装置の汚染を防ぐために、全体滅菌のための滅菌手段がさらに備えられており、ケースの内部で全過程が行われるため、外部からの汚染源が遮断されて、分析の信頼性がさらに向上されることができる。
また、本発明の生物学的物質自動分析装置及び方法は、前記マルチウェルプレートキット、廃液槽、電気泳動本体、生体試料チューブラック、ピペットラック、及びマーカーチューブラックが前記ベースプレートに着脱可能に形成されるため、それぞれのモジュールの装着が容易であり、各構成を装着して挿入するだけの簡単な方法で分析を準備することができる。
また、本発明の生体試料自動分析装置及び方法は、前記磁石装着部が金属材質からなり、加熱部が前記磁石装着部を加熱する手段である場合、前記特定列のウェルに磁場印加及び加熱を同時に行うことができるため、精製効率がさらに向上されることができる。
また、本発明の生体試料自動分析装置及び方法は、乾燥部を備えることで、精製された標的核酸溶液に残存する洗浄溶媒が増幅過程に与える悪影響を予め防止するように、短時間内に残存溶媒を除去することができ、特に、前記乾燥部の真空モジュールを着脱及び移動させるために前記移動部本体を用いることで、装置の全体構成が簡素化され、作動が容易である。
また、本発明の生体試料自動分析装置及び方法は、温度調節手段の上面に増幅チューブが載置される載置溝が形成され、前記固定部が前記増幅チューブの上部に支持されて前記増幅チューブを囲むように形成されることで、前記増幅チューブが安定して固定され、温度変化が防止されて、増幅効率が向上されることができる。
また、本発明の生体試料自動分析装置及び方法は、前記撮影部が前記移動部に固定されることで、撮影距離が短くなるため、高感度且つ高精度の電気泳動画像が得られる。
尚、本発明の生体試料自動分析装置及び方法は、第1位置固定部及び第2位置固定部が形成されることで、ベースプレートが簡単に固定されることができる。また、前記ベースプレートの挿入時、前記電源連結端子の第1傾斜部と前記電源供給部の第2傾斜部とが互いに当接して案内されながら、前記弾性手段が圧縮され、前記ベースプレートの最終挿入位置で前記電源連結端子の第1接触部と前記電源供給部の第2接触部とが互いに接触されるため、電気泳動部の作動が容易となる。
本発明の生体試料自動分析装置及び方法は、ケースの下面を放熱板として用い、空気流動部及び送風機が備えられることで、ケースの下面を適切に冷却して、ペルチェ冷却素子を効率的に用いることができる。
本発明による生体試料自動分析装置を示した斜視図である。 本発明による生体試料自動分析装置を示した底面斜視図である。 本発明による生体試料自動分析装置の斜視図であって、ケースの外部カバーが除去された状態である。 本発明による生体試料自動分析装置の斜視図であって、外部カバー及び一部骨格が除去された状態である。 本発明による生体試料自動分析装置の移動部本体及び移動部を示した図面である。 本発明による生体試料自動分析装置のピペットの装着を示した図面である。 本発明による生体試料自動分析装置のピペットの吸入及び吐出調節を示した図面である。 本発明による生体試料自動分析装置のピペットの着脱動作を示した図面である。 本発明による生体試料自動分析装置のベースプレートの分離状態を示した図面である。 本発明による生体試料自動分析装置のベースプレートの上部の結合斜視図である。 本発明による生体試料自動分析装置のベースプレートの上部の分解斜視図である。 本発明による生体試料自動分析装置のベースプレートとマルチウェルプレートキットの固定状態を示した分解斜視図である。 本発明による生体試料自動分析装置の磁場印加部及び加熱部を示した斜視図である。 本発明による生体試料自動分析装置の磁場印加部及び加熱部を示した底面斜視図である。 本発明による生体試料自動分析装置の乾燥部を示した図面である。 本発明による生体試料自動分析装置の乾燥部を示した図面である。 本発明による生体試料自動分析装置の乾燥部の利用を説明するための図面である。 本発明による生体試料自動分析装置のリアルタイム核酸増幅のための核酸増幅部を示した斜視図である。 本発明による生体試料自動分析装置のリアルタイム核酸増幅のための核酸増幅部を示した断面図である。 本発明による生体試料自動分析装置の核酸増幅部を示した他の図面である。 本発明による生体試料自動分析装置の核酸増幅部を示した他の図面である。 本発明による生体試料自動分析装置の電気泳動部を示した図面である。 本発明による生体試料自動分析装置の電気泳動部を示した図面である。 本発明による生体試料自動分析装置の電気泳動部の電気接続形態を示した図面である。 本発明による生体試料の自動分析方法を示した概略図である。 本発明による生体試料の自動分析方法を示した概略図である。
以下、上述の特徴を有する本発明の生体試料自動分析装置1000及び方法を添付図面を参照して詳細に説明する。
本発明の生体試料自動分析装置1000は、ケース100と、前記生体試料から標的核酸を精製する精製部200と、前記精製部200により精製された標的核酸を増幅する核酸増幅部400と、電気泳動本体310を有し、前記核酸増幅部400により増幅された増幅産物を検査する電気泳動部300と、生体試料、前記精製部200で用いられる試料または試薬、精製された標的核酸、増幅された標的核酸を移動するためのピペット500と、前記ピペット500の作動を調節し、前記ピペット500を前記ケース100の長さ方向及び高さ方向に移動させる移動部600と、第1滅菌手段800と、制御部(不図示)と、を含んで構成される。
前記ケース100は、本発明の生体試料自動分析装置1000を構成する基本本体であって、骨格及び外部カバーを含んで形成されることができる。
本発明の添付図面の一部で、ケース100の内部に備えられた構成をより容易に説明するために、ケース100の一部が除去された状態で示した。
前記ケース100には、ベースプレート700が前記ケース100の長さ方向に移動して引き出されるか引き込まれるように、所定領域を開閉することができる開放部110が形成されている。
前記ベースプレート700は、本発明の生体試料自動分析装置1000に付加可能な構成であって、下記でさらに説明する。
図1には、前記ケース100の左側面の所定領域が開閉されるように前記開放部110が形成された例を図示している。この際、前記開放部110は、開放された時に前記ベースプレート700が引き出されることができるサイズに形成されるべきである。
前記ケース100は、外側下面が装着される地面から所定距離離隔するように位置される。前記ケース100の外側下面には、空気が流動される流路を形成する空気流動部142と、前記空気流動部142に空気を送風する送風機141がさらに備えられることができる。
前記空気流動部142は、前記ケース100の長さ方向に長く形成された複数の放熱ピンが密に備えられて、複数の空気流路を形成するように形成されることができる。
前記送風機141は、前記空気流動部142に空気を送風するための構成である。
本発明の生体試料自動分析装置1000は、前記空気流動部142及び送風機141が形成されることで、ケース100の下面を効率的に冷却することができる。この際、冷却効率を高めるために、前記ケース100の下面は熱伝導度の高い材質(例えば、アルミニウム素材)からなることができる。
前記精製部200は、生体試料から標的核酸を精製する構成要素である。
前記精製部200は、マルチウェルプレートキット210と、磁場印加部201と、加熱部202と、を含む。前記マルチウェルプレートキット210は、複数個のウェル211が第1列〜第N列をなし、前記第1列〜第N列のうち特定列のウェルに、生体試料、精製に必要な一つ以上の試料または試薬がそれぞれ収容される。より詳細に、前記マルチウェルプレートキット210は、横方向に備えられた複数個のウェル211が複数個の列をなし、前記第1列〜第N列のそれぞれウェルに、生体試料、精製に必要な一つ以上の試料または試薬が収容される。さらに詳細に、前記精製に必要な試料または試薬は、酵素、細胞溶解溶液、核酸結合溶液、磁性粒子水分散液、及び洗浄溶液を含むことができる。この際、前記マルチウェルプレートキット210の一部列のウェルは、空いている状態であってもよい。
前記マルチウェルプレートキット210は、生体試料、及び精製に必要な試薬または試料が収容された状態で、前記ベースプレート700に着脱可能に備えられる。これにより、ユーザは、精製のためにマルチウェルプレートキット210を装着する操作以外には、別の工程が不要であるため、使用が非常に便利である利点がある。
前記磁場印加部201は、磁石221を含み、前記マルチウェルプレートキット210の特定列のウェルに磁場を印加することで、標的核酸が付着された磁性粒子を溶液から分離する役割をする。また、前記精製部200は、加熱部202を含み、各種反応を加速化することで精製効率をさらに高めることができる。前記加熱部202は、前記磁場印加部201に隣接して形成され、同一の特定列のウェルを加熱する構成である。前記同一の特定列とは、前記マルチウェルプレートキット210に形成された第1列〜第N列から選択される列を意味する。前記磁場印加部201及び加熱部202は、特定列のウェルにそれぞれ磁場を印加したり、磁場及び加熱を同時に印加したりすることができる。この際、前記磁場の印加は、磁石221が装着された磁石装着部220を上昇及び下降させる昇降部270により行われ、磁場の印加効率及び加熱時における熱伝達効率を高めるために、前記磁石装着部220には、特定列のウェルの下部が載置される差し込み溝222が形成されることができる。
前記マルチウェルプレートキット210の特定列が位置されるベースプレート700の部分には、前記特定列のウェルが前記磁場印加部201の差し込み溝222に直接載置されるように、所定領域が中空された第1露出孔701が形成されるべきである。
前記加熱部202は、特定列のウェルを加熱する様々な形態に形成されることができる。より詳細に、磁石装着部220は金属材質からなり、前記加熱部202は、前記磁石装着部220を加熱するための手段であって、発熱フィルムが用いられることができる。
本発明の生体試料自動分析装置1000は、前記磁石装着部220が金属材質からなり、加熱部202が前記磁石装着部220を加熱する手段である場合、前記特定列のウェルに磁場印加及び加熱を同時に行うことができるため、精製効率がさらに向上されることができる。
前記昇降部270は、前記ケース100の下面の内部に装着され、前記磁石装着部220を上昇及び下降させる構成であって、多様な形態に形成されることができ、その一実施例を図13及び図14を参照して説明する。
前記昇降部270は、昇降モータ271と、一側端部が前記昇降モータ271に連結されて回転する第1昇降軸272と、前記第1昇降軸272の他側端部に一体に連結された昇降カム273と、前記昇降カム273の回転時に円運動しながら高さ方向(上・下方向)に移動できるように、一側端部が前記昇降カム273に連結された第2昇降軸274と、を含むことができる。
また、前記磁場印加部201は、前記磁石装着部220を支持する磁石装着部支持台230を含み、前記磁石装着部支持台230の下面にはガイド棒240が連結されることができる。
前記ガイド棒240は、高さ方向に摺動可能に形成されたガイドブロック250のガイド孔に挿入される。
この際、前記磁石装着部220と支持台との間に引張バネ260が備えられ、前記磁石装着部220が前記マルチウェルプレートキット210に安定して載置されることができる。
前記昇降部270の形態は一実施例に過ぎず、本発明の生体試料自動分析装置1000がこれに限定されるものではない。
前記移動部600により移動及び作動される前記移動部本体610にピペット500が装着され、前記ピペット500の吸入及び吐出により、前記マルチウェルプレートキット210に収容された生体試料、精製に必要な試料または試薬が移送されて前記精製部200で混合される。上記の過程中に、前記磁場印加部201により磁場が印加され、前記加熱部202により加熱されることで、精製が行われる。
前記移動部600の詳細な構成例は以下でさらに説明する。
前記昇降部270は、センシング部275‐1及びセンシング標的部275‐2を含む高さ検知センサ275と連動して作動されることができる。
尚、前記精製部200は、標的核酸を抽出するための生体試料を入れる生体試料チューブ281を有する生体試料チューブラック280をさらに含むことができる。前記生体試料チューブラック280は、容易な移送のために、前記ベースプレート700に着脱可能に備えられることが好ましい。
本発明の生体試料自動分析装置1000において、前記精製部200のマルチウェルプレートキット210に磁場及び熱を印加する工程を行うために、前記磁場印加部201及び加熱部202が、昇降部270により高さ方向に移動されながら複数個のウェル211に隣接して位置されることができる。この際、前記マルチウェルプレートキット210がベースプレート700に安定して固定されるように、前記マルチウェルプレートキット210が載置されるベースプレート700には、複数個のウェル211の間に位置するように突出した突出固定部730と、前記突出固定部730に備えられてウェル211に密着された弾性手段731と、がさらに形成されることができる。
前記弾性手段731は、前記突出固定部730に固定された構成であって、ゴムリングのように摩擦力を提供することができる材質からなり、前記マルチウェルプレートキット210を安定して固定させる。
本発明の生体試料自動分析装置1000において、前記ベースプレート700が特定位置に固定されると、前記マルチウェルプレートキット210も正確な位置に固定されるため、移動部600の制御が容易である。したがって、精製作業を容易に行うことができる利点がある。
本発明の生体試料自動分析装置1000は、前記移動部600の移動部本体610にピペット500が着脱可能に備えられる。前記ピペット500は、一つの分析が完了すると入れ替えたり、洗浄して再使用するが、これを容易にするために、ピペット500を保管することができるピペットラック510が備えられることができる。
この際、前記ベースプレート700を引き出す時に、前記ピペット500が備えられたピペットラック510をベースプレート700に装着してケース100内に挿入し、前記移動部600の移動部本体610にピペット500が着脱可能であるように前記ピペット500を固定して、移動及び作動するようにすることが好ましい。
すなわち、前記ピペット500を固定するピペットラック510は、前記ベースプレート700に着脱可能に装着されることが好ましい。
また、洗浄効率を高めるために、前記精製部200には、マルチウェルプレートキット210の特定列のウェルの空気を排気する乾燥部290がさらに形成されることができる(図15〜図17参照)。前記移動部600が乾燥部290の作動に係る作業を行う時に、前記ピペット500は前記ピペットラック510に保管される。
前記乾燥部290は、真空モジュール291と、前記ケース100の内部の下面に装着され、前記真空モジュール291を所定位置に保管する真空モジュールラック293と、前記真空モジュール291とホースを介して連結された真空ポンプ295と、を含んで構成される。前記真空モジュールラック293は、真空モジュール291が用いられない時に、前記真空モジュール291を所定位置に保管するための構成である。前記真空モジュールラック293の上面には凸部294が突出形成され、前記真空モジュール291の下面には前記凸部294に対応する凹部292が形成されていて、前記真空モジュール291が前記真空モジュールラック293の正確な位置に容易に保管されることができる。この際、前記凸部294は、前記真空モジュール291が容易に載置されるように、下側方向に向かって直径が広くなるように傾斜して形成されることが好ましい。
さらに、前記真空モジュール291の動きを防止する効果をより極大化するために、前記乾燥部290の前記真空モジュールラック293には、前記真空モジュール291の一側を支持する支持部293‐1が備えられており、前記支持部293‐1と真空モジュール291とが互いに当接する面に、固定磁石296が埋め込まれることができる。
図16の(a)は、真空モジュール291の下側部分を、(b)は真空モジュールラック293の部分を示した図面である。
前記真空モジュール291は、前記移動部600の移動部本体610と着脱可能であるように、その上部に孔が形成されていて、真空乾燥が必要な場合に、前記移動部600の移動部本体610が真空モジュールラック293の正確な位置に移動して真空モジュール291を付着し、マルチウェルプレートキット210の特定列に移動して、前記真空ポンプ295の作動により前記特定列のウェルに空気を排気させる。
前記真空ポンプ295が作動されると、前記マルチウェルプレートキット210の特定列のウェル内に残存する洗浄溶媒が速く除去される。乾燥が完了されると、前記真空モジュール291がさらに前記真空モジュールラック293の位置に移動して前記移動部本体610から取り外され、前記真空モジュールラック293に保管される。
また、次の作動のために、前記移動部600の移動部本体610がピペットラック510の位置に移動した後、前記ピペットブロック630に固定されたピペット500がさらに固定される。
換言すれば、前記乾燥部290は、真空モジュール291を固定及び移動させるための別の構成を用いるのではなく、前記ピペット500を作動させる移動部600の構成を用いる。これにより、本発明の生体試料自動分析装置1000は、装置の全体構成が簡素化され、作動が容易である。
また、本発明の生体試料自動分析装置1000は、前記乾燥部290が備えられることで、精製された標的核酸の内部に残存する洗浄溶媒の乾燥時間が著しく減少され、増幅過程に悪影響を与える洗浄溶媒を速く除去することができる。
前記核酸増幅部400は、前記精製部200により精製された標的核酸を増幅する構成であって、前記精製部200により精製された標的物質を増幅する構成である。図20及び図21を参照すれば、前記核酸増幅部400は、増幅チューブ411と、増幅ブロックカバー410と、熱伝達部420と、増幅チューブ固定部430と、を含んで構成されることができる。
前記増幅チューブ411は、核酸増幅のための試薬が収容される空間であって、前記マルチウェルプレートキット210の単一列をなす横方向に位置されたウェル211とそれぞれ対応するように位置される。また、図面には、前記増幅チューブ411が2列に形成された例を示したが、本発明の生体試料自動分析装置1000及び方法がこれに限定されるものではなく、必要に応じて一つ以上に多様に構成されることができる。
前記増幅チューブ411が2列からなる場合、PCR及び等温増幅の場合は、1列のチューブを用いる。増幅された後に、一つの列に収容された増幅産物は前記電気泳動部300に移動され、残りの列に収容された増幅産物は、さらに電気泳動部300に移動されて再検査されたり、他の検査に用いられたり、別に保管されたりすることができる。
また、RT‐PCRやネステッド(nested)PCR方法で遺伝子増幅を行う場合には、互いに異なる物質が収容された2列の増幅チューブ411を用い、それぞれの反応段階に適するように各列の温度が調節されることができる。
より詳細に、前記RT‐PCR方法で遺伝子増幅を行う場合、増幅チューブ411の1列に逆転写反応液が入っていて、それを標的核酸含有溶液と混合して逆転写反応を行い、増幅チューブ411の2列にPCR反応溶液が入っていて、逆転写反応の反応物と混合してPCR反応を行うことができる。
前記ネステッドPCRの場合、増幅チューブ411の1列に1次PCR反応液が入っていて、それを標的核酸含有溶液と混合して1次PCR反応を行い、増幅チューブ411の2列に2次PCR反応溶液が入っていて、1次PCR反応の反応物と混合してネステッドPCR反応を行うことができる。
前記増幅チューブ411の内部にはそれぞれの増幅過程を行うために必要な物質が収容されており、ユーザは、前記増幅チューブ411を前記ベースプレート700の第2露出孔702を貫通して前記増幅ブロックカバー410の載置溝421に載置し、前記増幅チューブ固定部430で固定する簡単な工程を行うだけで、増幅過程を準備することができる。前記熱伝達部420は、前記増幅チューブ411を加熱及び冷却するための構成であって、前記増幅チューブ411が載置される載置溝421が形成された増幅ブロックカバー410の下部に形成される。
前記熱伝達部420としては、様々な形態が用いられることができ、容易な温度制御のために、ペルチェ素子423及び温度センサが用いられる。前記核酸増幅部400は、前記増幅チューブ411を固定するために前記増幅ブロックカバー410に第1固定磁石422が挿着されており、前記第1固定磁石422に対応する第2固定磁石431が挿着された増幅チューブ固定部430が備えられる。前記増幅チューブ固定部430は、前記増幅チューブ411の上部により支持され、前記増幅チューブ411を囲むように形成される。これにより、前記増幅チューブ411が載置溝421に安定して密着され、温度伝達が容易になり、温度変化が防止されて増幅効率が向上される。この際、増幅チューブ411が安定して密着されるように、前記増幅チューブ固定部430の下面は、前記増幅ブロックカバー410の載置溝421が形成された面から所定距離離隔される空間Sが形成されるようにする高さを有するように形成されることが好ましい。また、前記ベースプレート700には、前記増幅ブロックカバー410の上面に前記増幅チューブ411及び増幅チューブ固定部430が位置されるように中空された第2露出孔702が形成される。換言すれば、前記第2露出孔702は、前記ベースプレート700が前記ケース100の内部に挿入された時に、前記熱伝達部420が位置する領域に形成される構成であって、前記増幅チューブ固定部430より大きいサイズに形成される。前記ベースプレート700が前記ケース100の長さ方向に移動されるため、前記ベースプレート700が前記ケース100の内部に挿入された後、前記増幅チューブ411及び増幅チューブ固定部430は、前記ベースプレート700の第2露出孔702を介して前記熱伝達部420に固定される。
また、図18及び図19に図示したように、本発明の生体試料自動分析装置1000において、前記核酸増幅部400は、前記増幅チューブ411側に励起光を照射する光照射部440と、前記移動部600に固定され、前記増幅チューブ411の内部をリアルタイムで測定することができる蛍光検出部450と、をさらに含むことができる。
前記光照射部440及び蛍光検出部450は、リアルタイムPCRを可能とする構成であって、前記光照射部440としてLEDが用いられることができる。
前記蛍光検出部450は、前記移動部600に固定されて移動可能に構成され、図3及び図4に図示したように、高さが個別的に調節されるように形成されることができる。
前記蛍光検出部450は、撮影により蛍光量を測定できる手段であって、フォトダイオード、レンズ、及びフィルターを含んで構成されることができる。
前記蛍光検出部450が形成される場合、前記第1滅菌手段800は、前記移動部600の領域のうち前記蛍光検出部450の前側に位置されることができる。
前記電気泳動部300は、前記核酸増幅部400により増幅された増幅産物を検査する部分であって、DNAの長さ及び量を検査する。
より詳細に、前記電気泳動部300は、電気泳動本体310と、電源供給部320と、励起光照射部330と、撮影部350と、を含んで構成され、前記ベースプレート700に電源連結端子340が形成される。先ず、前記電気泳動本体310は、電気泳動に必要な物質(例えば、アガロースゲル)が収容されて、電源供給により電気泳動工程が行われる部分であって、増幅されたDNAを長さに応じて分離する。前記電源供給部320は、前記ケースの底面140に備えられ、前記電気泳動本体310に直流電源を供給する構成である。前記電源連結端子340は、前記ベースプレート700に固定されて形成される構成であって、前記電源供給部320と接触して前記電気泳動本体310に電源を連結する。前記電源連結端子340と電気泳動本体310の固定と同時に電源を供給するように、前記電源連結端子340には、前記電気泳動本体310側に突出した突出部341が形成され、前記電気泳動本体310には、前記突出部341が挿入される孔状電気接続端子311が形成されることが好ましい。
前記励起光照射部330は、前記電気泳動本体310が載置される位置のケース100の内部下面に備えられ、前記電気泳動本体310側に励起光を照射する構成である。この際、前記電気泳動本体310及びベースプレート700の前記電気泳動本体310が載置される所定空間は、前記励起光照射部330により照射される励起光が透過される材質で形成される。一方、前記励起光照射部330が、前記電気泳動本体310の全体に均一な光を照射するようにすることが好ましいため、前記励起光照射部330が複数個のLEDで形成される場合、前記ベースプレート700の前記電気泳動本体310が載置される所定空間である電気泳動本体固定板750には、励起光を散乱する素材、例えば、白乳色アクリルなどの光分散素材層が存在することが好ましい。尚、励起光波長帯の光を多く発光するLEDが前記励起光照射部330に用いられ、電気泳動本体310の底板は、ベースプレート700を通過しながら分散された励起光中に含まれている核酸蛍光発光帯の光を全て吸収し、励起光波長帯の光は最大限通過させる材質で製作される。これにより、蛍光検出時におけるバックグラウンド光が最小化されて、核酸検出の敏感度が最大になる。一例として、DNA蛍光染料としてサイバーグリーン(Sybr Green)を用いる場合には、光を通過する青色素材層を用いる。
前記撮影部350は、前記電気泳動状態を撮影する構成であって、CCDまたはCMOSセンサ上に電気泳動ゲル362の画像を得るためのレンズと、レンズに入射する励起光を遮断し、DNAで発生した蛍光波長帯以上の光を通過させる短波長カツトオフ(cut‐off)フィルターと、で構成される。前記撮影部350は、電気泳動の進行状況及び最終結果を撮影して伝送することができる(図5参照)。前記撮影部350は、前記ケース100の上面に形成されてもよいが、より隣接した位置で前記電気泳動部300の状態を確認できるように、前記移動部600の移動部本体610に形成されることがより好ましい。この際、前記撮影部350が前記電気泳動本体310に隣接して位置する必要がある場合には、前記ピペット500が前記ピペットラック510に保管される。前記撮影部350が前記移動部600の移動部本体610に固定されることで、撮影距離が短くなって、高感度の撮影が可能となる。
また、前記電源供給部320と電源連結端子340とが前記ベースプレート700の挿入により安定して連結されるように、前記電源供給部320の下側に弾性手段321が介在され、前記ベースプレート700が前記ケース100に挿入されることで、互いに接触連結される第1接触部342及び第2接触部322が前記電源連結端子340の下面及び前記電源供給部320の下面に形成されることが好ましい。また、前記電源連結端子340の第1接触部342と前記電源供給部320の第2接触部322とが完璧に接触するように、前記電源連結端子340の第1接触部342は、前記ベースプレート700の挿入方向に角部分が前記第1接触部342の中心方向に傾斜した第1傾斜部343を有し、前記電源供給部320の第2接触部322は、前記ケース100の長さ方向に、前記ベースプレート700の挿入反対方向に角部分が前記第2接触部322の中心方向に傾斜した第2傾斜部323を有することが好ましい。前記ベースプレート700の挿入時、前記電源連結端子340の第1傾斜部343と前記電源供給部320の第2傾斜部323とが互いに当接して案内されながら、前記弾性手段321が圧縮され、前記電源連結端子340の第1接触部342と前記電源供給部320の第2接触部322とが前記ベースプレート700の最終挿入位置で互いに強く接触するため、電気伝達が容易となる利点がある。
また、本発明の生体試料自動分析装置1000は、図22に図示したように、前記電気泳動本体310の全体領域で電気泳動が行われるようにすることができるゲルトレイ360を用いることができる。または、図23に図示したように、前記電気泳動本体310に2個の電気泳動ゲル362が収容されるゲルトレイ360‐1を用いて、試料の半分のみに対して電気泳動が行われるようにすることができる。
図23に図示したような場合、生体試料の半分及びピペット500を装着し、精製部及び増幅部でも試料の半分のみを用いて、残りは後で用いることができる。尚、前記電気泳動本体310の内部において、電気泳動に必要な溶液がこぼれないように、縁部の上側に顎が形成されることができる。
図22及び図23には、前記ゲルトレイ360、360‐1の下面内部に、電気泳動ゲル362を固定するための電気泳動ゲル固定部361が突出形成された例を示した。
前記電気泳動ゲル362は、この分野において通常の知識を有する者が容易に製造できるものである。例えば、前記電気泳動ゲル362を製造するために、1〜5%のアガロースを含有する溶液を沸騰させた後、溶液が固まる前に、ピペット500の列と同一の位置にローディングウエル363が形成されたコームを装着し、ゲルトレイ360、360‐1の両面を塞いだ状態でゲルトレイ360、360‐1を水平面に位置させる。その後、液体状態のゲル溶液を注いで冷却させることで、ゲルを製造することができる。この際、前記電気泳動ゲル固定部361に対応するゲルの中空部が形成されて、ゲルが前・後側に動くことを防止することができるため、ピペット500を用いて増幅産物をローディングウエル363にローディングする時に、位置を正確に維持することができる。
本発明の生体試料自動分析装置1000は、様々な形態の電気泳動ゲル362が使用可能であり、電気泳動本体310の形態も、図面に図示した例の他に多様に変形されることができる。
また、本発明の生体試料自動分析装置1000において、前記電気泳動部300には、マーカー及び蛍光染色物質が収容されたマーカー貯蔵部900がさらに形成されることができる。
前記マーカー貯蔵部900は、マーカー(marker)及び蛍光染色物質が収容されたマーカーチューブ920と、前記マーカーチューブ920が装着されたマーカーチューブラック910と、を含む構成である。前記マーカーチューブラック910は、マーカーが容易に収容されるように、前記ベースプレート700に着脱可能に備えられることが好ましい。
前記ピペット500は、複数個が装着されて列をなし、前記精製部200、核酸増幅部400、及び電気泳動部300の全体領域で、生体試料、前記精製部200で用いられる試料または試薬、精製された標的核酸、増幅されたDNAを移動させるための構成である。換言すれば、前記ピペット500は、前記生体試料、前記精製部200で用いられる試料または試薬、精製された標的核酸、増幅されたDNAを吸入して吐出する構成であって、前記精製部200のマルチウェルプレートキット210の第1列〜第N列のウェルに移動しながら精製が行われるようにし、精製された標的核酸を前記核酸増幅部400に移送し、増幅されたDNAをマーカーチューブ、電気泳動部300などに移送する役割をする。
前記ピペット500は、本発明の生体試料自動分析装置1000の全体にわたって、様々な物質を移送するための構成であり、複数個が列をなす。一つの列をなして横方向に備えられたピペット500の個数は、前記マルチウェルプレートキット210の横方向に位置されたウェル211の個数と同一である。
尚、前記増幅チューブ411も、前記ピペット500の単一列をなすピペット500の個数と前記マルチウェルプレートキット210のウェル211の個数とが一致するように用いられることが好ましい。図面には、前記マルチウェルプレートキット210の横方向の12個のウェル211が8列をなし、前記ピペット500が単一列をなす例を示したが、本発明の生体試料自動分析装置1000がこれに限定されるものではない。より詳細に、検査処理回数を1回増加させるために、複数の列を用いてもよく、12個以上のウェルを用いてもよい。
前記移動部600は、ピペットブロック630によりピペット500の装着、吸入及び吐出、着脱、移動させることができる構成であって、以下、上記の作動を具現するための詳細な構成について説明する。
前記移動部600は、様々な形態に構成されることができ、下記では図3から図8に図示した形態を説明する。しかし、本発明の生体試料自動分析装置1000がこれに限定されるものではない。
先ず、前記移動部600は、前記ケース100の長さ方向に移動される。例えば、前記ケース100の内部には支持棒150が長さ方向に設けられており、前記移動部本体610にスライダ621が形成されて、前記支持棒150により案内されて長さ方向に移動されることができる。この際、前記移動部600には、X軸移動モータ622と、前記X軸移動モータ622に連結されて前記移動部600を移動させるX軸移動ベルト623と、が形成されることができる。
次に、ピペット500の装着のための構成を図6に示した。図6を参照すれば、本発明の生体試料自動分析装置1000は、ピペットブロック固定板644を有するピペット装着部を含み、ピペット500をピペットブロック630に装着することができる。
図6は、ピペットブロック固定板644の作動によりピペット500がピペット固定突出部644‐1に固定された状態を示した図面であって、ピペット固定突出部644‐1はピペット500に遮られて見えない(ピペット固定突出部644‐1の構成は図8に示している)。
ピペット装着部は、ピペット500が装着されるピペット固定突出部644‐1と、前記ピペット固定突出部644‐1が形成されたピペットブロック固定板644と、前記ピペットブロック固定板644を高さ方向に移動させる構成と、を含む。
前記ピペットブロック固定板644を高さ方向に移動させる構成として、図6には、Z軸スクリュー641と、Z軸スクリューナット645と、Z軸ガイド棒646と、Z軸ガイド棒スライド647と、移動部本体610に固定されたZ軸モータ642と、Z軸スクリュー641を回転させるためにZ軸モータ642の回転運動をZ軸スクリュー641に伝達するZ軸移動ベルト643と、を含んで構成された例を示した。
この際、前記Z軸モータ642が作動されると、前記ピペットブロック固定板644は、移動部本体610に固定されたZ軸スクリュー641の回転によりZ軸ガイド棒646に沿って移動される。
すなわち、本発明の生体試料自動分析装置1000は、Z軸モータ642の回転に伴ってピペットブロック固定板644が上下方向に移動し、ピペットブロック固定板644の下側方向への移動により、ピペット固定突出部644‐1がピペット500の上側に挿入されることで、前記ピペット500が装着されることができる。
一方、ピペット500の装着時には、ピストン631の位置が十分に上側に位置するようにした後、Z軸スクリュー641を回してピペットブロック固定板644がピペット500の方に下がるようにしてから、ピペット500を挿入することができる。
また、前記移動部600の上下に移動するピペットブロック固定板644に、前記ピペット500の作動に係る装置が設けられて、ピペット500が安定して作動するようにすることが好ましい。
前記ピペットブロック630は、前記ピペットブロック固定板644の上下運動の基準点である移動部本体610に装着され、前記ピペット500の吸入及び吐出作動を調節し、前記ピペット500を前記ケース100の長さ方向(X軸)及び高さ方向(Z軸)に移動させることができる。ピペット500の吸入及び吐出調節のための構成を図7を参照して説明する。
本発明の生体試料自動分析装置1000は、ピペットブロック630の上側に備えられたピストン631及び前記ピストン631が固定されて高さ方向に移動可能なピストン固定板634を有するピペット調節部により、前記ピペット500の吸入及び吐出が調節されることができる。
この際、前記ピペット500の吸入及び吐出作動が調節されるようにする構成として、ピペット500との気密を保持するように、前記ピペットブロック630はピペット調節部を含む。この際、前記ピペット調節部は、ピストン631と、ピストン固定板634と、前記ピストン固定板634を高さ方向に移動させるための手段(ピストン631を圧縮できる手段)と、を含む。
前記ピストン固定板634を高さ方向に移動させるための手段は、前記ピストン631を上下運動させるピストンモータ632と、ピストンベルト633により回転されるピストン移動スクリュー635と、ピストン固定板634に固定され、ピストン移動スクリュー635の回転によりピストン固定板634を上下に移動させるピストン移動スクリューナット636と、前記ピストン631の上部で前記ピストン631及びピストン移動スクリューナット636を固定するピストン固定板634と、を含んで構成されることができる。
前記ピストンモータ632は、前記ピストン固定板634に設けられたピストンガイド棒647により支持された最上端の板に備えられることができる。
前記ピストン移動スクリューナット636の上下移動とピストン631の移動を連動させるために、ピストン固定板634がピストン631の上部に設けられ、ピストン631及びピストン移動スクリューナット636が固定されている。
作動について説明すれば、前記ピストン移動スクリュー635の回転に伴い、上下方向への移動を案内するピストンガイド棒637に沿ってピストン固定板634が上下方向に移動することで、ピストン631がピペットブロック630内で気密を保持しながら上下運動する。これにより、ピペット500の吸入、吐出作動が行われる。
ピペット500を取り外すための一例を図8に示した。図8に図示した例は、ピペット押出し板638‐1、ピペット押出しピン固定板639、及びピペット押出しピン638を用いる。
より詳細に、前記ピペット押出し板638‐1は、前記ピペット固定突出部644‐1に対応する領域が中空されており、前記ピペット500が前記ピペット固定突出部644‐1に装着された時に、ピペットブロック固定板644の下面とピペット500の上面との間に当接するように位置される。
前記ピペット押出しピン固定板639は、前記ピペットブロック630の上側に位置された板状である。前記ピペット押出しピン638は、前記ピペットブロック630の高さより長い長さを有し、前記ピペット押出し板638‐1と前記ピペット押出しピン固定板639とを連結する。
すなわち、本発明の生体試料自動分析装置1000は、前記ピペット調節部の作動により前記ピペット押出しピン固定板639が下側方向に移動すると、前記ピペット押出しピン固定板639、ピペット押出しピン638‐1、及びピペット押出し板638‐1が下側に移動して前記ピペット500を押し出すことで、前記ピペット500が前記ピペット固定突出部644‐1から取り外されることを特徴とする。
換言すれば、本発明の生体試料自動分析装置1000は、ピペット500が装着されると、ピペット500によりピペット押出し板638‐1及びピペット押出しピン638が押されて、図6に図示したように、ピペット押出しピン固定板639がピペットブロック630の上部に押されることで、ピペットブロック630の上部から所定間隔離隔して位置することになる。ピペット500を取り外すためには、ピストン移動スクリュー635を回してピストン固定板634をピペットブロック630の上部と接触するように下部に移動させると、ピペット押出しピン固定板639、ピペット押出しピン638、及びピペット押出し板638‐1が押されて、図8に図示したように、ピペット500が取り外される。
前記第1滅菌手段800は、前記移動部600に固定される構成であって、紫外線ランプを用いることができる。
前記第1滅菌手段800は、滅菌対象部位に近接して位置して位置制御が容易となるように、前記移動部600をなす全体構成の中でも、特に、蛍光検出部450に固定されることが好ましい。図5には、前記第1滅菌手段800が前記蛍光検出部450の側面に固定され、下側方向に紫外線またはオゾンを照射するように形成された例を示した。また、本発明の生体試料自動分析装置1000は、前記第1滅菌手段800の滅菌効果が特定位置で集中的に発揮されるように、反射手段810をさらに含むことができる。前記第1滅菌手段800は、遺伝子増幅産物の不活化のために用いられるものであって、遺伝子増幅産物の不活化のために、前記移動部600の作動により遺伝子増幅反応容器に近接して用いられる。これにより、遺伝子増幅産物の不活化が極大化されることができる。
本発明の生体試料自動分析装置1000は、前記第1滅菌手段800とともに、ケース100の内部に備えられ、紫外線ランプ及びオゾン発生器の一つからなる第2滅菌手段820をさらに含むことができる。また、前記第1滅菌手段800が、前記移動部600の移動により前記精製部200、核酸増幅部400、電気泳動部300の各構成を滅菌するようにしてもよく、第2滅菌手段820を用いて全体構成を滅菌してもよい。
尚、本発明の生体試料自動分析装置1000は、ベースプレート700をさらに含むことができる。
前記ベースプレート700には、前記マルチウェルプレートキット210及び電気泳動本体310が着脱可能に備えられている。前記ベースプレート700は、前記ケース100の下面に固定されたガイド部130により案内されて、前記開放部110を介して前記ケース100の長さ方向に移動される構成である。尚、上述のように、前記ベースプレート700には、前記生体試料チューブラック280、ピペットラック510、及びマーカーチューブラック910が着脱可能に備えられることができる。前記マルチウェルプレートキット210には、生体試料とともに、精製に必要な試料または試薬が収容されており、前記電気泳動本体310には、電気泳動に必要な物質が収容されており、前記マーカーチューブ920には、前記電気泳動に必要なマーカー及びDNA蛍光染色物質が収容されている。前記ベースプレート700に、各構成要素であるマルチウェルプレートキット210、電気泳動本体310、生体試料チューブラック280、ピペットラック510、及びマーカーチューブラック910が着脱可能に備えられるため、ユーザは、各構成を装着して挿入するという簡単な方法で分析を準備することができる。一方、前記増幅チューブ411及び増幅チューブ固定部430は、前記ベースプレート700の第2露出孔702を介して熱伝達部420に直接固定される構成であって、前記ベースプレート700が前記ケース100の内部に挿入された後、固定される。
前記ベースプレート700の長さ方向への移動のために、前記ケース100の内部の下面にはガイド部130が形成され、前記開放部110に隣接した一側上面には取っ手710が形成される。これにより、ユーザは、前記ベースプレート700を容易に引き出して必要な構成を装着し、前記ベースプレート700を挿入することができる。
尚、本発明の生体試料自動分析装置1000において、前記ベースプレート700が前記ケース100の内部に挿入及び固定される位置が正確となるように、前記ベースプレート700の他側端部(前記開放部110と隣接した側の反対側)には第1位置固定部720が形成され、前記第1位置固定部720に対応する前記ケース100の部分に第2位置固定部120が形成されており、前記第1位置固定部720と第2位置固定部120とは磁性により互いに固定されることができる。図4には、前記第1位置固定部720に第3固定磁石721が形成され、前記第3固定磁石721が前記第2位置固定部120に固定された形態を示した。この他にも、本発明の生体試料自動分析装置1000において、前記第3固定磁石721が前記第2位置固定部120に位置されてもよく、前記第1位置固定部720及び第2位置固定部120に結合された第3固定磁石721がそれぞれ位置されてもよい。また、前記第2位置固定部120は、前記第1位置固定部720の形態に対応する溝を有していてもよい。これにより、本発明の生体試料自動分析装置1000は、前記ベースプレート700が前記ケース100に挿入される位置を決定することができ、分析工程中に正確な位置をそのまま維持することができる。
また、前記ベースプレート700には、使用された廃液が貯蔵される廃液槽740が着脱可能に備えられることができる。
前記廃液は、生体試料を精製する過程などで捨てられる廃液であり、前記廃液槽740がベースプレート700に着脱可能に備えられることで、使用が容易になる。
前記制御部は、前記精製部200、核酸増幅部400、電気泳動部300、及び移動部600を制御する構成であって、その他にも、制御が必要な全ての構成を制御する。
一方、本発明の生体試料自動分析方法は、上述の生体試料自動分析装置1000を用いる方法である。
これにより、本発明の生体試料自動分析方法は、一つの装置(本発明の生体試料自動分析装置1000)を用いて、精製、増幅、及び電気泳動定量分析により増幅産物のサイズを定性分析するに必要な全過程を行うことができるため、複数個の装置を用いる際の不便さを解消し、全体分析効率及び正確度を高めることができる。
図24を参照して、本発明の生体試料自動分析装置1000を用いた生体試料自動分析方法を説明する。本発明の生体試料自動分析方法は、生体試料から標的核酸を得る精製段階(S10)と、前記精製段階(S10)を完了した標的核酸を増幅する増幅段階(S20)と、電気泳動段階(S30)と、を含むことを特徴とする。
また、前記精製段階(S10)は、移動部600が移動して、固定されたピペットブロック630にピペット500を挿入するピペット装着段階と、前記移動部600が移動して、前記生体試料チューブに含有された生体試料及びマルチウェルプレートキット210の第1列〜第N列のウェルにそれぞれ収容された精製に必要な一つ以上の試料または試薬を移動/混合することで、標的核酸含有溶液を得る標的核酸含有溶液獲得段階と、を含んで行われる。
前記標的核酸含有溶液獲得段階は、標的核酸を含む生体試料を溶解させて標的核酸を溶出する試料溶解段階と、生体試料の均質溶液に含まれている標的核酸を磁性粒子に付着させ、その他の生体物質溶液を除去する標的核酸付着段階と、標的核酸が付着された磁性粒子のその他の不純物を除去する磁性粒子洗浄段階と、磁性粒子に含有された洗浄用溶媒を除去する磁性粒子乾燥段階と、磁性粒子に付着された標的核酸を取り外すために溶出溶液を加える獲得段階と、を含む。
この際、前記精製段階(S10)で、必要に応じて、磁場印加部201により、前記マルチウェルプレートキット210の特定列のウェルに磁場を印加する磁場印加段階と、加熱部202により、前記マルチウェルプレートキット210の特定列のウェルを加熱する加熱段階と、が行われることを特徴とする。
また、前記磁性粒子乾燥段階では、前記移動部600の移動部本体610に挿入されたピペット500を取り外して移動させ、真空モジュール291を挿入した後、前記マルチウェルプレートキット210の磁性粒子を含むウェルの内部に接触しないように移動させる。次いで、真空ポンプ295で空気を吸入及び排出する。同時に、加熱部202によりウェルを加熱することで、洗浄溶媒の乾燥時間を短縮させることができる。
また、前記増幅段階(S20)は、前記精製段階(S10)により得られた標的核酸含有溶液を増幅チューブ411に移動させて混合する混合段階と、熱伝達部420により温度を調節して増幅する温度調節段階と、を含むことができる。
増幅段階(S20)についてより詳細に説明すれば、前記混合段階は、移動部600が移動して、移動部本体610に固定されたピペット500を固定させ、前記精製段階(S10)により得られた標的核酸含有溶液を増幅部の増幅チューブ411に移送させた後、反応液と混合する段階である。
前記温度調節段階は、熱伝達部420により温度を調節して増幅する段階である。
この際、前記増幅段階(S20)が行われる核酸増幅部400には増幅チューブ411を2列まで装着することができるため、1列の増幅チューブ411を用いてもよく、後で異なる分析のために2列の増幅チューブ411を用いてもよい。
また、RT‐PCRやネステッド(nested)PCRを用いて遺伝子増幅を行う場合には、互いに異なる物質が収容された2列の増幅チューブ411を用い、それぞれの反応段階に適するように各列の温度が調節されることができる。
より詳細に、前記RT‐PCRの場合、増幅チューブ411の1列に逆転写反応液が入っていて、それを標的核酸含有溶液と混合して逆転写反応を行い、増幅チューブ411の2列にPCR反応溶液が入っていて、逆転写反応の反応物と混合してPCR反応を行うことができる。
前記ネステッドPCRの場合、増幅チューブ411の1列に1次PCR反応液が入っていて、それを標的核酸含有溶液と混合して1次PCR反応を行い、増幅チューブ411の2列に2次PCR反応溶液が入っていて、1次PCR反応の反応物と混合してネステッド(nested)PCR反応を行うことができる。
この際、前記混合段階と温度調節段階との間に、反応液の蒸発を防止するためのシール段階がさらに行われることができる。
前記シール段階は、前記増幅チューブ411の上部が開放されているため、反応中に蒸発が発生することを防止するための段階であって、蒸発防止物質を反応液の上層部に形成することで行われることができる。
前記蒸発防止物質は、100℃で蒸発されず、前記遺伝子増幅反応に影響を与えない物質で、且つ反応液より比重が軽い物質でなければならない。前記蒸発防止物質の例として、ミネラルオイルを用いてもよく、60〜70℃程度で溶けるパラフィンを用いてもよい。
蒸発防止物質として用いられるパラフィンが、反応液とともに増幅チューブに含まれている場合には、前記シーリング段階が省略されることができる。
前記電気泳動段階(S30)は、マーカー混合段階と、電気泳動遂行段階と、分析段階と、を含んで行われる。
前記マーカー混合段階は、移動部600により、最終的に増幅された増幅産物が収容されている増幅チューブ411にピペット500を移動させ、所定量の増幅産物を吸入した後、マーカー及び蛍光染色物質が含有された溶液が収容されているマーカーチューブ910に移動させて、増幅産物とマーカー溶液とを混合することで行われることができる。
前記電気泳動遂行段階は、マーカーが混合された増幅産物を電気泳動本体310のアガロスゲルローディングウエル363に移動させ、アガロスゲルローディングウエルに前記増幅産物混合物をローディングした後、前記電源供給部320及び電源連結端子340により電気泳動本体310に電源を供給することで、電気泳動を行う段階である。
前記分析段階(S30)は、前記励起光照射部330により光を照射し、撮影部350を用いて電気泳動結果を確認する段階である。
この際、図25に図示したように、前記精製段階(S10)の前に、準備段階(S40)が行われることができる。前記準備段階(S40)は、前記ベースプレート700を前記ケース100の外部に引き出し、前記ベースプレート700に、電気泳動本体310、ピペットラック510、マルチウェルプレートキット210、生体試料チューブラック280、廃液槽740、マーカーチューブラック910、及びマーカーチューブ920を装着する第1装着段階と、前記第1位置固定部720と第2位置固定部120とが互いに当接して固定されるように、前記ベースプレート700を引き込む引き込み段階と、ベースプレート700の第2露出孔702を介して露出された熱伝達部420の載置溝410‐1に増幅チューブ411を載置させた後、増幅チューブ固定部430により増幅チューブ411を固定する第2装着段階と、を含むことを特徴とする。
また、前記増幅段階(S20)と電気泳動段階(S30)との間に、不活化段階(S40)がさらに行われることができる。
前記不活化段階(S40)は、遺伝子増幅段階(S20)が終わった後、電気泳動段階(S30)を行うためのマーカー混合段階の前に、増幅された核酸を不活化させるための段階であって、移動部600の移動により、第1滅菌手段800が付着された蛍光検出部450を増幅チューブ411の上部に移動させ、前記第1滅菌手段800を作動して紫外線を照射することで、核酸増幅産物を光化学反応で不活化させる段階である。
上述のように、本発明の生体試料自動分析装置1000及び方法は、生体試料から標的核酸を精製し、増幅及び分析する全過程を一つの装置で行うことができるため、分析信頼性及び効率性が向上される利点がある。
一方、本発明は、生体試料自動分析装置1000を用いて、定量免疫PCRを利用した抗原濃度獲得方法を行うことができる。これにより、定量免疫PCRを行うことで、生体試料に含有された抗原の濃度を定量検査することができる。
本発明は、上記の実施例に限定されず、適用範囲が多様であることは勿論、特許請求の範囲で請求する本発明の要旨を外れることなく、様々な変形実施が可能である。
1000 生体試料自動分析装置
100 ケース
110 開放部
120 第2位置固定部
130 ガイド部
140 ケースの底面
141 送風機
142 空気流動部
150 支持棒
200 精製部
201 磁場印加部
202 加熱部
210 マルチウェルプレートキット
211 ウェル
220 磁石装着部
221 磁石
222 差し込み溝
230 磁石装着部支持台
240 ガイド棒
250 ガイドブロック
260 引張バネ
270 昇降部
271 昇降モータ
272 第1昇降軸
273 昇降カム
274 第2昇降軸
275 高さ検知センサ
275‐1 センシング部
275‐2 センシング標的部
280 生体試料チューブラック
281 生体試料チューブ
290 乾燥部
291 真空モジュール
292 凹部
293 真空モジュールラック
293‐1 支持部
294 凸部
295 真空ポンプ
296 固定磁石
300 電気泳動部
310 電気泳動本体
311 孔状電気接続端子
320 電源供給部
321 弾性手段
322 第2接触部
323 第2傾斜部
330 励起光照射部
340 電源連結端子
341 突出部
342 第1接触部
343 第1傾斜部
350 撮影部
360、360‐1 ゲルトレイ
361 電気泳動ゲル固定部
362 電気泳動ゲル
363 ローディングウエル
400 核酸増幅部
410 増幅ブロックカバー
410‐1 増幅ブロック
411 増幅チューブ
420 熱伝達部
421 載置溝
422 第1固定磁石
423 ペルチェ素子
430 増幅チューブ固定部
431 第2固定磁石
440 光照射部
450 蛍光検出部
500 ピペット
510 ピペットラック
600 移動部
610 移動部本体
621 スライダ
622 X軸移動モータ
623 X軸移動ベルト
630 ピペットブロック
631 ピストン
632 ピストンモータ
633 ピストンベルト
634 ピストン固定板
635 ピストン移動スクリュー
636 ピストン移動スクリューナット
637 ピストンガイド棒
638 ピペット押出しピン
638‐1 ピペット押出し板
639 ピペット押出しピン固定板
641 Z軸スクリュー
642 Z軸モータ
643 Z軸移動ベルト
644 ピペットブロック固定板
644‐1 ピペット固定突出部
645 Z軸スクリューナット
646 Z軸ガイド棒
647 Z軸ガイド棒スライド
700 ベースプレート
701 第1露出孔
702 第2露出孔
710 取っ手
720 第1位置固定部
721 第3固定磁石
730 突出固定部
731 弾性手段
740 廃液槽
750 電気泳動本体固定板
800 第1滅菌手段
810 反射手段
820 第2滅菌手段
900 マーカー貯蔵部
910 マーカーチューブラック
920 マーカーチューブ

Claims (42)

  1. 所定領域が開閉されるように形成された開放部110を有するケース100と前記ケース100に移動可能に備えられるベースプレート700とを有する生体試料自動分析装置であって、
    前記ベースプレート700は、
    複数個のウェル211が第1列〜第N列をなし、前記第1列〜第N列のうち特定列のウェルにそれぞれ生体試料、精製に必要な一つ以上の試料または試薬が収容されたマルチウェルプレートキット210を有して、前記生体試料から標的核酸を精製する精製部200と、
    前記精製部200により精製された標的核酸を増幅する核酸増幅部400と、
    電気泳動本体310を有し、前記核酸増幅部400により増幅された増幅産物を検査する電気泳動部300と、
    複数個が列をなし、生体試料、前記精製部200で用いられる試料または試薬、精製された標的核酸、増幅されたDNAを移動するためのピペット500と、
    前記ピペット500を前記ケース100の長さ方向及び高さ方向に移動させ、前記ピペット500の作動を調節する移動部600と、
    前記精製部200、核酸増幅部400、電気泳動部300、及び移動部600を制御する制御部と、
    を少なくとも備えており、
    前記核酸増幅部400は、一つ以上の列をなす増幅チューブ411を含み、前記増幅チューブ411は、それぞれ横方向にマルチウェルプレートキット210内の単一列をなすウェル211に対応するように位置しており、
    前記マルチウェルプレートキット210及び電気泳動本体310が、前記ベースプレート700に着脱可能に備えられ、
    前記移動部600は、移動部本体610を含み、前記移動部本体610は、前記ベースプレート700の内部に装着され、複数のピペット500が前記移動部本体610に設けられている、
    生体試料自動分析装置。
  2. 前記ベースプレート700は、前記ケース100の下面に固定されたガイド部130により案内されて前記開放部110を介して前記ケース100の長さ方向に移動可能である、請求項1に記載の生体試料自動分析装置。
  3. 前記移動部600に固定された第1滅菌手段800をさらに含むことを特徴とする、請求項1に記載の生体試料自動分析装置。
  4. 前記第1滅菌手段800は紫外線ランプであり、反射手段810をさらに含むことを特徴とする、請求項3に記載の生体試料自動分析装置。
  5. 前記精製部200は、
    磁石221を有し、前記マルチウェルプレートキット210の特定列のウェルに磁場を印加する磁場印加部201と、
    前記磁場印加部201に隣接して形成され、同一の特定列のウェルを加熱する加熱部202と、を含むことを特徴とする、請求項2に記載の生体試料自動分析装置。
  6. 前記精製部200は、
    標的核酸を抽出するための生体試料を入れる生体試料チューブ281を有する生体試料チューブラック280をさらに含み、
    前記生体試料チューブラック280が前記ベースプレート700に着脱可能に備えられることを特徴とする、請求項5に記載の生体試料自動分析装置。
  7. 前記磁場印加部201は、
    磁石221が装着された磁石装着部220と、
    前記ケース100の下面に装着され、前記磁石装着部220を上昇及び下降させる昇降部270と、を含むことを特徴とする、請求項5に記載の生体試料自動分析装置。
  8. 前記マルチウェルプレートキット210の第1列〜第N列のウェルに収容された精製に必要な一つ以上の試料または試薬は、酵素、細胞溶解溶液、核酸結合溶液、磁性粒子水分散液、及び洗浄溶液の一つ以上を含むことを特徴とする、請求項5に記載の生体試料自動分析装置。
  9. 前記磁石装着部220の前記磁石221が装着された面には、前記マルチウェルプレートキット210の特定列の下部が差し込まれるように差し込み溝222が形成されており、
    前記ベースプレート700には、前記磁石装着部220の上昇時に特定列の下部が前記差し込み溝222に載置されるように、所定領域が中空された第1露出孔701が形成されることを特徴とする、請求項7に記載の生体試料自動分析装置。
  10. 前記磁石装着部220は金属材質からなり、前記加熱部202は、前記磁石装着部220に接触して形成された発熱フィルムであることを特徴とする、請求項9に記載の生体試料自動分析装置。
  11. 前記ベースプレート700には、
    複数個のウェル211の間に位置するように前記マルチウェルプレートキット210の下側から突出した突出固定部730、及び前記突出固定部730に備えられてウェル211に密着される弾性手段731がさらに形成されることを特徴とする、請求項5に記載の生体試料自動分析装置。
  12. 前記ベースプレート700には、使用後に廃棄される溶液が貯蔵される廃液槽740が着脱可能に備えられることを特徴とする、請求項8に記載の生体試料自動分析装置。
  13. 前記移動部600は、前記ピペット500を着脱することができるピペットブロック630を含み、
    前記ベースプレート700には、前記ピペット500が保管されるピペットラック510が着脱可能に備えられることを特徴とする、請求項5に記載の生体試料自動分析装置。
  14. 前記移動部600のピペットブロック630は、
    前記ピペット500が装着されるピペット固定突出部644‐1が下側に形成され、高さ方向に移動可能なピペットブロック固定板644を有するピペット装着部により、前記ピペット500が前記ピペット固定突出部644‐1に装着されることを特徴とする、請求項13に記載の生体試料自動分析装置。
  15. 前記移動部600のピペットブロック630は、
    上側に形成されたピストン631と、前記ピストン631が固定されて高さ方向に移動可能なピストン固定板634と、を有するピペット調節部により、前記ピペット500の吸入及び吐出が調節されることを特徴とする、請求項14に記載の生体試料自動分析装置。
  16. 前記移動部600のピペットブロック630は、
    前記ピペット固定突出部644‐1に対応する領域が中空されており、前記ピペット500が装着された時に、ピペットブロック固定板644の下面とピペット500の上面との間に当接するように位置されたピペット押出し板638‐1と、
    前記ピペットブロック630の上側に位置されたピペット押出しピン固定板639と、
    前記ピペットブロック630の高さより長い長さを有し、前記ピペット押出し板638‐1と前記ピペット押出しピン固定板639とを連結するピペット押出しピン638と、を含み、
    前記ピペット調節部の作動により前記ピペット押出しピン固定板639が下側方向に移動されると、前記ピペット押出しピン固定板639、ピペット押出しピン638、及びピペット押出し板638‐1が下側に移動されて、前記ピペット500が前記ピペット固定突出部644‐1から取り外されることを特徴とする、請求項15に記載の生体試料自動分析装置。
  17. 前記精製部200は、
    前記移動部600に着脱可能な真空モジュール291と、前記ケース100の内部の下面に装着され、前記真空モジュール291を所定位置に保管する真空モジュールラック293と、前記真空モジュール291とホースで連結された真空ポンプ295と、を有する乾燥部290をさらに含むことを特徴とする、請求項13に記載の生体試料自動分析装置。
  18. 前記乾燥部290は、前記真空モジュールラック293の上面に凸部294が突出形成され、前記真空モジュール291の下面に前記凸部294に対応する凹部292が形成されることを特徴とする、請求項12に記載の生体試料自動分析装置。
  19. 前記乾燥部290は、前記真空モジュールラック293に、前記真空モジュール291の一側を支持する支持部293‐1が備えられており、
    前記支持部293‐1と真空モジュール291とが互いに当接する面に磁石が埋め込まれることを特徴とする、請求項18に記載の生体試料自動分析装置。
  20. 前記電気泳動部300は、
    前記ベースプレート700に設けられた電気泳動本体固定板750に載置され、それぞれ陽極と陰極を形成する電極線311aにそれぞれ連結された孔状電気接続端子311が形成された電気泳動本体310と、
    電源を連結するために電気泳動本体310の孔状電気接続端子311に挿入された突出状電気接続端子341と、
    前記ケース100の下部の内面に固定され、前記電気泳動本体310に電源を供給する電源供給部320と、
    前記電気泳動本体310に励起光を照射する励起光照射部330と、
    電気泳動状態を撮影する撮影部350と、を含むことを特徴とする、請求項2に記載の生体試料自動分析装置。
  21. 前記電気泳動部300は、
    前記ベースプレート700が前記ケース100に挿入されることにより互いに接触して連結される第1接触部342及び第2接触部322が、電源連結端子340の下面及び前記電源供給部320の上面に傾斜して形成されており、
    前記電源供給部320の第2接触部322の下側の弾性手段321により互いに密着されることを特徴とする、請求項20に記載の生体試料自動分析装置。
  22. 前記励起光照射部330は、前記電気泳動本体310側に励起光波長帯の光を照射するLEDが前記ケース100の内部の下面に等間隔に配列されて備えられており、
    前記電気泳動本体310が載置される前記ベースプレート700の電気泳動本体固定板750は、励起光を散乱する素材からなり、前記電気泳動本体310の底板は、核酸蛍光発光帯の光は吸収し、励起光帯の光は通過させる材質からなることを特徴とする、請求項20に記載の生体試料自動分析装置。
  23. 前記撮影部350は、イメージセンサと、レンズと、短波長フィルターと、を含んで形成され、
    前記移動部600の移動部本体610に固定されることを特徴とする、請求項20に記載の生体試料自動分析装置。
  24. 前記電気泳動部300は、
    マーカー(marker)及び蛍光染色物質が収容されたマーカーチューブ920、及び前記マーカーチューブ920が装着されたマーカーチューブラック910を有するマーカー貯蔵部900をさらに含み、
    前記マーカーチューブラック910は、前記ベースプレート700に着脱可能に備えられることを特徴とする、請求項20に記載の生体試料自動分析装置。
  25. 前記電気泳動本体310はゲルトレイ360、360‐1をさらに含み、
    前記ゲルトレイ360、360‐1は、底面に形成された電気泳動ローディングウエル363と、電気泳動移動路と重ならない位置に形成された複数個の電気泳動ゲル固定部361と、を有することを特徴とする、請求項20に記載の生体試料自動分析装置。
  26. 前記核酸増幅部400は、
    一つ以上の列をなす増幅チューブ411と、
    下部に密着された凹状の載置溝421が形成されており、温度センサが挿入された金属からなる増幅ブロック410‐1と、
    第1固定磁石422が備えられ、断熱材質からなる増幅ブロックカバー410と、
    ペルチェ素子423と、
    ペルチェ素子423で発生した熱を外部に伝達する熱伝達部420と、
    前記増幅チューブ411の上部面より小さい孔が形成されており、前記増幅チューブ411の上側の所定領域を囲むように形成され、前記第1固定磁石422に対応する第2固定磁石431が挿入されて前記増幅チューブ411を固定し、前記増幅ブロックカバー410が形成された面から所定距離離隔される高さを有する増幅チューブ固定部430と、を含むことを特徴とする、請求項2に記載の生体試料自動分析装置。
  27. 前記ベースプレート700において、前記増幅ブロック410‐1及び増幅チューブ固定部430が前記増幅チューブ固定部430に対応するように中空された第2露出孔702が形成されることを特徴とする、請求項26に記載の生体試料自動分析装置。
  28. 前記核酸増幅部400が前記開放部110に隣接して位置されることを特徴とする、請求項26に記載の生体試料自動分析装置。
  29. 前記核酸増幅部400は、
    前記増幅チューブ411側に蛍光励起光を照射する光照射部440と、
    前記増幅チューブ411の上部に密着されるように上下方向に移動可能に備えられ、増幅チューブ411内の蛍光量をリアルタイムで測定する蛍光検出部450と、をさらに含むことを特徴とする、請求項26に記載の生体試料自動分析装置。
  30. 前記ベースプレート700において、前記開放部110に隣接した一側の上面に取っ手710が形成されることを特徴とする、請求項2に記載の生体試料自動分析装置。
  31. 前記ケース100は、外側の下面に空気が流動される流路を形成する空気流動部142と、前記空気流動部142に空気を送風する送風機141と、をさらに含むことを特徴とする、請求項1に記載の生体試料自動分析装置。
  32. 前記生体試料自動分析装置1000には、
    前記ベースプレート700の他側端部に第1位置固定部720がさらに形成され、前記第1位置固定部720に対応する位置の前記ケース100に固定された第2位置固定部120がさらに形成されており、
    前記第1位置固定部720と第2位置固定部120とは、第3固定磁石721の磁性により互いに固定されることを特徴とする、請求項2に記載の生体試料自動分析装置。
  33. 請求項1乃至32の何れか一項に記載の生体試料自動分析装置1000を用いる分析方法であって、
    生体試料から標的核酸を得る精製段階(S10)と、
    前記精製段階(S10)が完了した標的核酸を増幅する増幅段階(S20)と、
    電気泳動段階(S30)と、を含む、生体試料の自動分析方法。
  34. 前記精製段階(S10)の前に、
    ベースプレート700を前記ケース100の外部に引き出し、前記ベースプレート700に、電気泳動本体310、ピペットラック510、マルチウェルプレートキット210、生体試料チューブラック280、廃液槽740、マーカーチューブラック910、及びマーカーチューブ920を装着する第1装着段階と、
    前記第1位置固定部720と第2位置固定部120とが互いに当接して固定されるように前記ベースプレート700を引き込む引き込み段階と、
    ベースプレート700の第2露出孔702を介して露出された増幅ブロック410‐1に増幅チューブ411を載置し、前記増幅ブロックカバー410の第1固定磁石423及び増幅チューブ固定部430の第2固定磁石431により増幅チューブ411を固定する第2装着段階と、を含む準備段階(S40)をさらに含むことを特徴とする、請求項33に記載の生体試料の自動分析方法。
  35. 前記精製段階(S10)は、
    移動部600が移動して、ピペットブロック630にピペット500を装着するピペット装着段階と、
    前記移動部600が移動して、前記マルチウェルプレートキット210の第1列〜第N列のウェルにそれぞれ収容された生体試料、精製に必要な一つ以上の試料または試薬を移動及び混合して、磁性粒子を除いた混合物である標的核酸含有溶液を得る標的核酸含有溶液獲得段階と、を含み、
    必要に応じて、磁場印加部201により、前記マルチウェルプレートキット210の特定列のウェルに磁場を印加する磁場印加段階と、加熱部202により、前記マルチウェルプレートキット210の特定列のウェルを加熱する加熱段階と、をさらに行うことを特徴とする、請求項34に記載の生体試料の自動分析方法。
  36. 前記標的核酸含有溶液獲得段階は、
    前記精製部200で、生体試料を溶解して核酸を溶出する試料溶解段階と、
    標的核酸に磁性粒子を付着させ、残存溶液を除去する標的核酸付着段階と、
    前記標的核酸が付着された磁性粒子を洗浄して不純物を除去する磁性粒子洗浄段階と、
    前記移動部本体610に装着されたピペット500を取り外し、前記移動部600の移動部本体610に真空モジュール291を固定して、前記マルチウェルプレートキット210の特定列のウェルの洗浄溶媒を吸入することで、磁性粒子を乾燥する磁性粒子乾燥段階と、
    乾燥された磁性粒子に溶出バッファーを加えて標的核酸を得る獲得段階と、を含むことを特徴とする、請求項35に記載の生体試料の自動分析方法。
  37. 前記増幅段階(S20)は、
    前記精製段階(S10)により得られた標的核酸含有溶液を増幅チューブ411に移動して混合する混合段階と、
    熱伝達部420により、温度を調節して増幅する温度調節段階と、を含むことを特徴とする、請求項33に記載の生体試料の自動分析方法。
  38. 前記電気泳動段階(S30)は、
    増幅産物とマーカー溶液とを混合するマーカー混合段階と、
    電源供給部320及び電源連結端子340により電気泳動本体310に電源を供給して増幅産物を分離する電気泳動遂行段階と、
    前記励起光照射部330により光を照射し、撮影部350を用いて増幅産物の電気泳動パターンを測定して分子量を分析する分析段階と、を含むことを特徴とする、請求項33に記載の生体試料の自動分析方法。
  39. 前記増幅段階(S20)と電気泳動段階(S30)との間に、
    第1滅菌手段800を駆動して、増幅された核酸を不活化する不活化段階(S50)をさらに含むことを特徴とする、請求項33に記載の生体試料の自動分析方法。
  40. 前記増幅段階(S20)で、
    光照射部440により所定の励起光を照射しながら、所定時間またはサイクル毎に発生する蛍光量を蛍光検出部450で測定することで、臨界蛍光値が検出される時点を検出して、核酸の初期濃度を計算するリアルタイム定量増幅分析が可能であることを特徴とする、請求項37に記載の生体試料の自動分析方法。
  41. 前記増幅段階(S20)により得られた定量増幅分析値を、前記電気泳動段階(S30)により得られた分子量及び増幅産物の個数を含む結果に基づいて補正及び分析することができることを特徴とする、請求項40に記載の生体試料の自動分析方法。
  42. 請求項1乃至32の何れか一項に記載の生体試料自動分析装置1000を用いた定量免疫PCRを行うことで、生体試料に含有された抗原の濃度を定量検査することを特徴とする、定量免疫PCRを用いた抗原濃度獲得方法。
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