JP5878875B2 - アルツハイマー病の診断法 - Google Patents
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Description
症例の発生危険因子と見なされている。
(2003) 12(24):3259−67)。Liと同僚は、GSTO‐1h SNP 7‐1(rs4825、A ヌクレオチド)は、アルツハイマー病については、6.8(+/−4.41)年、パーキンソン病については、8.6(+/−5.71)年のAAO遅延に関連すると記載している((Li, Y et al., Neurobiol Aging (2006) 27(8):1087−93)。
(i)患者からの血小板試料中の、モノアミンオキシダーゼ‐B、凝固第XIIIa因子、全トロポミオシン、WD‐リピートタンパク質1およびアポリポタンパク質E4から選ばれる少なくとも4つの血小板タンパク質の発現量を測定すること;ならびに、
(ii)(i)の結果を対照値に比較すること、
を含むアルツハイマー病の診断を支援する生体外における方法であって、対照値より高い結果がアルツハイマー病の指標となる生体外における方法を提供する。
本発明の第2の態様は、本発明の第1の態様による診断法に包含される1つ以上の血小板タンパク質の発現量における生物学的なばらつきを正規化するための、表3または表4に特定されている1つ以上のタンパク質の使用を対象とする。
本発明の第3の態様は、モノアミンオキシダーゼ‐B、凝固第XIIIa因子、全トロポミオシン、WD‐リピートタンパク質1およびApoE4から選ばれる少なくとも4つの血小板タンパク質の、担体上に固定された1つ以上のリガンドを含む固体担体を提供する。
果がアルツハイマー病の指標となる方法を提供する。したがって、対照値より高い結果を使って、アルツハイマー病陽性であると診断することができる。
固第XIII因子の触媒的活性のあるサブユニットであり、血液凝固カスケードにおいてフィブリン塊を安定化する働きをする。
(i)患者からの血小板試料中の、モノアミンオキシダーゼ‐B、凝固第XIIIa因子、全トロポミオシン(αおよびβ)、WD‐リピートタンパク質1ならびにApoE4から選ばれる少なくとも4つの血小板タンパク質の発現量を測定する工程;ならびに、
(ii)(i)の結果を対照値に比較する工程、
を含むアルツハイマー病の診断を支援する生体外における方法であって、対照値より高い結果がアルツハイマー病の指標となる生体外における方法を提供する。
y=3.2027×log[A]−0.9506×log[B]+0.1548、であ
り、
式中、患者試料における、[A]は検体Aの測定濃度、および[B]は検体Bの測定濃度Bである。
モデル1は、ApoE4の存在に依存しないアルゴリズムAに基づく(すなわち、患者が0、1または2つのApoE4対立遺伝子を有するかどうかにかかわらず、このアルゴリズムを適用することができる)。「X」で指し示したアッセイの測定値の結果を合わせて加算する。
1×標準存在量(Mao‐B)+1×標準存在量(全トロポミオシン)+1×標準存在量(凝固第XIIIa因子)+1×標準存在量(wtGSTO‐1)+1×標準存在量(ApoE4)。
モデル2は、非ApoE4アルツハイマー病患者におけるwtGSTO‐1の過剰出現
を考慮する2つの異なるアルゴリズムを使用する。それぞれのアルゴリズムの使用は、患者におけるApoE4の存在または非存在に依存し、それによって、非ApoE4患者におけるwtGSTO‐1の過剰出現を考慮する。ApoE4対立遺伝子が患者試料にない場合、アルゴリズムAを使用する。そうでなければ、アルゴリズムBを使用する。モデル1について上記で説明したように、加重係数を、各バイオマーカーの標準存在量に適用することによって結果を得る。
モデル3もまた、2つの異なるアルゴリズムを使用する。モデル2と同様に、患者のゲノムにApoE4対立遺伝子がない場合、アルゴリズムAを適用する。患者が1または2つのApoE4対立遺伝子をもつ場合、アルゴリズムCを適用する。モデル1に関して上で説明したように、加重係数を、各バイオマーカーの標準存在量に適用することによって結果を得る。
モデル4は、患者のゲノムにおけるApoE4の存在または非存在に依存して、異なるアルゴリズム(すなわち、DまたはE)を使用するという点で、モデル2および3に類似している。しかしながら、モデル4は、追加のバイオマーカーであるWD‐リピートタンパク質1を含む。モデル1、2、3または4のアルゴリズムを使って計算して得られた値を、疾患の診断を支援するために、所定の対照値と比較する。どのように対照値を決定しうるかの説明を実施例1に提供する。
ルゴリズムに含まれている血小板タンパク質のすべてについて、全標準存在量値に加算する。次に、得られた値を、診断をつけるために対照と比較する。あるいは、患者がApoE4対立遺伝子をもたない場合、追加の加重係数は、全標準存在量値に加算されない。
る、血小板タンパク質が少なくとも固定化された、個別のテスト領域を含む固体担体を含むバイオチップを提供する。好ましい実施形態では、その固体担体は、表3または表4に特定された1つ以上のタンパク質の、固定化されたリガンドをさらに含む。好ましくは、固体担体は、野生型GSTO‐1、変異型GSTO‐1およびアポリポタンパク質Eのうちの、1つ以上のリガンドをさらに含む。
順は、背景補正、参照スポットおよび補正スポット検証などの、バイオチップアレイ系を用いて得られた信号の技術的なばらつきの補正のための手順にかかわる。
C’:V1i’=V1i×10C’(ii)
を使って、第1のスポットマップ中のスポット体積を正規化する。
式中、V1i’は、第1のゲル像中のスポットiの正規化された体積;及およびV1iは第1のゲル画像中のスポットiの体積である。
試料を2つの段階で採集し、発見セットおよび検証セットに分けた。各血小板タンパク質の標準的な存在量を2D‐DIGEを使って測定し、各バイオマーカーについての最適カットオフ、実際のカットオフ、感度および特異性の値を得るために、ROC曲線を作成した。これら単一タンパク質アッセイの各々についての結果を表5に示す。
最適化され、本発明を限定するよりはむしろ、例示的に説明するために、本明細書に提示されていることに注意しなければならない。バイオチップデータに対して最適化されたモデルおよび最適化されたアルゴリズムは、2D DIGEデータとは異なる。モデルの原理は、同じままでありうるが、特定のADバイオマーカーの加重は異なる可能性が非常に高いであろう。
24人のアルツハイマー病患者、および24人の性別および年齢が一致した対照からの12.5μgの血小板タンパク質を、1D ウェスタンブロットで分析した。結果を図6に図示し、その図は14‐3‐3ガンマの信号(シグナル)の強度は、すべての試料において等しいのに対して、Mao‐Bの信号は、アルツハイマーの患者からの血小板試料のほうが、対照試料より強いことを示す。図7に示すように、全く正規化することなしに12.5μgの血小板タンパク質のMoa‐B信号を測定すると、低い有意性(P<0.01)の増加しか、アルツハイマーの試料中に検出されない。しかしながら、14‐3‐3ガンマを用いて正規化をした後、有意性はP<0.00000007に増加し、このことは、試料中でタンパク質を定量することができる精度が、内部抽出標準の適用で大幅に増加することを示す。
2Dゲル電気泳動分析は、6.19、5.87および5.64のpI値をもつ3つのGSTO‐1アイソフォームを明らかにした(図9)。これらのアイソフォームは、3つの群:AD患者、PD患者ならびに年齢および性別が一致した対照において異なる発現パターン示す。ゲルろ過した非ApoEアルツハイマーの患者の血小板試料は、pI6.19をもつGSTO‐1アイソフォームが著しく上方制御(35%の増加)され、一方、pI5.87をもつGSTO‐1アイソフォームが60%下方制御されることを明らかにした。
本発明の方法は、アルツハイマー病を患う患者パーキンソン病(PD)と患う患者とを識別するために使用することができ、表10は、AD試料とPD試料との比較を示す。
ついての散布図を示す。この結果は、本発明の方法にしたがって、モデル1のアルゴリズムをパーキンソン病患者の群およびアルツハイマー病患者の群に由来する血小板試料に適用することによって得た。発見段階におけるアルツハイマー病患者についての算出平均は、6.92±1.25(SD)であり、パーキンソン病患者については5.00±0.74(SD)であった。カットオフを5.535に設定し、その値は、モデル1に関するアルツハイマー病発見セットにために決定されたカットオフ値である(図2aおよび2bを参照のこと)。得られた散布図をみてわかるように、2つの患者群からの結果の間に明らかな差異がある。
Claims (8)
- (i)患者から単離された血小板試料中の、モノアミンオキシダーゼ‐B、凝固第XIIIa因子、全トロポミオシン(αおよびβ)、およびアポリポタンパク質E4(ApoE4)の4つの血小板タンパク質の発現量を測定すること;ならびに、
(ii)(i)の結果を対照値に比較すること、
を含む、患者におけるアルツハイマー病の診断を支援する生体外における方法であって、対照値より高い結果がアルツハイマー病の指標となり、(i)が野生型GSTO‐1または変異型GSTO‐1のいずれかの発現量を測定することをさらに含み、患者に1つまたは2つのApoE4対立遺伝子がある場合、変異型GSTO‐1の発現量を測定し、患者にApoE4対立遺伝子がない場合、野生型GSTO‐1の発現量を測定する、生体外における方法。 - WD‐リピートタンパク質1の発現量を測定することをさらに含む請求項1に記載の方法。
- 対照値より高い結果がアルツハイマー病の陽性診断に合致する請求項1または2に記載の方法。
- 血小板タンパク質の発現における生物学的なばらつきが14‐3‐3タンパク質ガンマの発現を基準とすることにより正規化される、請求項1〜3のいずれかに記載の方法。
- 請求項1〜4のいずれかに記載の診断支援法に包含される1つ以上の血小板タンパク質の発現量における生物学的なばらつきを正規化するための、14‐3‐3タンパク質ガンマの発現量の使用。
- 14‐3‐3タンパク質ガンマが、定量されるタンパク質として、同じ血小板試料中に存在する、請求項5に記載の14‐3‐3タンパク質ガンマの発現量の使用。
- モノアミンオキシダーゼ‐B、凝固第XIIIa因子、トロポミオシン(αおよびβ)、ApoE4、および野生型GSTO−1タンパク質または変異型GSTO−1タンパク質
の5つの血小板タンパク質の、担体上に固定された1つ以上のリガンド、並びに14‐3‐3タンパク質ガンマの、担体上に固定された1つ以上のリガンドを含む固体担体。 - WD‐リピートタンパク質1の1つ以上のリガンドをさらに含む請求項7に記載の固体担体。
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