JP5661250B2 - 新規グルコース−6−リン酸定量方法および定量試薬 - Google Patents
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Description
本発明は、グルコース−6−リン酸デヒドロゲナーゼを使用しないグルコース−6−リン酸の新規な定量方法、定量試薬、及び定量試薬キットを提供することを解決すべき課題とする。
[1] 2−デオキシ−シロ−イノソース合成酵素を用いてグルコース−6−リン酸を2−デオキシ−シロ−イノソースとリン酸へと変換する工程を含む、グルコース−6−リン酸の定量方法。
[2] 2−デオキシ−シロ−イノソース合成酵素を用いてグルコース−6−リン酸を2−デオキシ−シロ−イノソースとリン酸へと変換する工程を含む、グルコース−6−リン酸に導くことが可能である物質又は補酵素の定量方法。
[3] 2−デオキシ−シロ−イノソース合成酵素が、グルコース−1−リン酸および/又はフルクトース−6−リン酸および/またはフルクトース−1,6−ビスリン酸に作用しない酵素である、[1]又は[2]に記載の方法。
[4] 2−デオキシ−シロ−イノソース合成酵素が、安定温度範囲が少なくとも46℃まで安定である耐熱性酵素である、[1]から[3]の何れかに記載の方法。
[5] 2−デオキシ−シロ−イノソース合成酵素が、pH6.0〜 8.0で安定な酵素である、[1]から[4]の何れかに記載の方法。
[6] 2−デオキシ−シロ−イノソース合成酵素が下記の特性を有する酵素である、[1]から[2]の何れかに記載の方法。
(1)作用:本酵素は、グルコース−6−リン酸を2−デオキシ−シロ−イノソースへと変換する機能を有する。
(2)補酵素としてNAD+を利用
(3)至適pH範囲:7.0〜 7.7
(4)至適温度範囲:55 〜 70 ℃
(5)分子量:39000〜42000
(6)補因子:Co2+イオンの添加により活性向上
(7)安定温度範囲:少なくとも46℃ まで安定である。
(8)安定pH範囲:少なくとも6.0〜 8.0の範囲で安定である。
(9)比活性:1.0μmol/min/mg以上(反応温度65℃)
(10)グルコース−1−リン酸および/又はフルクトース−6−リン酸および/またはフルクトース−1,6−ビスリン酸に作用しない。
[7] 2−デオキシ−シロ−イノソース合成酵素が、配列番号2、4、6、8、10又は12に記載のアミノ酸配列を有する2−デオキシ−シロ−イノソース合成酵素である、[1]から[2]の何れかに記載の方法。
[8] 2−デオキシ−シロ−イノソース合成酵素が、配列番号2、4、6、8、10又は12で示されるアミノ酸配列において1個または複数個のアミノ酸の欠失、付加、及び/又は置換を含み、配列番号2、4、6、8、10又は12で示されるアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有して且つ、高温安定性及び/又は広範囲pH安定性を持つ2−デオキシ−シロ−イノソース合成酵素である、[1]から[6]の何れかに記載の方法。
[9] 2−デオキシ−シロ−イノソース合成酵素を含む、[1]から[8]の何れかに記載の定量方法で使用するためのグルコース−6−リン酸定量試薬。
[10] 2−デオキシ−シロ−イノソース合成酵素を含む、[1]から[8]の何れかに記載の定量方法で使用するためのグルコース−6−リン酸定量試薬キット。
[DOI合成酵素]
本発明を実施するための形態(以下、本実施の形態という)のDOI合成酵素は、下記の特性を有し、
(1)作用:本酵素は、グルコース−6−リン酸を2−デオキシ−シロ−イノソース(以下、DOIとする)へと変換する機能を有する。
また、下記に示す一部またはすべての特性を有する。
(2)補酵素としてNAD+を利用
(3)至適pH範囲:7.0〜 7.7
(4)至適温度範囲:55 〜 70 ℃
(5)分子量:39000〜42000
(6)補因子:Co2+イオンの添加により活性向上
さらには、下記に示す一部またはすべての特性を有することが好ましい。
(7)安定温度範囲:少なくとも46℃ まで安定である。
(8)安定pH範囲:少なくとも6.0〜 8.0の範囲で安定である。
(9)比活性:1.0μmol/min/mg以上(反応温度65℃)
(10)グルコース−1−リン酸および/又はフルクトース−6−リン酸および/またはフルクトース−1,6−ビスリン酸に作用しない。
本実施の形態のDOI合成酵素遺伝子は、メタゲノムや微生物から単離・抽出した天然のものでも良く、また、その塩基配列に従ってPCR法、人工合成法等の公知の方法によって合成したものでも良い。また、新規DOI酵素キメラ遺伝子の作成には、既知DOI合成酵素遺伝子を組み合わせてもよく、例示される遺伝子としてはPaenibacillus sp.NBRC13157株、Streptoalloteichus hindustanus JCM3268、Streptomyces fradiae NBRC12773株などに由来するDOI合成酵素遺伝子が挙げられる。
本実施の形態の組換えベクターは、プラスミド等の公知のベクターに本実施の形態の遺伝子を連結(挿入)して得ることができる。前記ベクターは宿主中で複製可能なものであれば特に限定されず、例えばプラスミドDNA、ファージDNA等が挙げられる。
本実施の形態の酵素は、本実施の形態の形質転換体を適当な培地で培養し、その培養物から該酵素活性を有するタンパク質を採取することによって得ることができる。本実施の形態の形質転換体を培養する方法は、宿主に応じて決定すればよい。例えば、大腸菌や酵母等の微生物を宿主とする形質転換体の場合は、微生物が資化しうる炭素源、窒素源、無機塩類等を含有し、形質転換体を効率的に培養しうる培地であれば、天然培地、合成培地のいずれを用いても良い。
本実施の形態におけるDOI合成酵素の高温安定性とは、安定温度範囲が46℃以下、より好ましくは、50℃以下、さらにより好ましくは60℃以下、さらに特に好ましくは95℃以下まで安定なことである。高温安定性を有する2−デオキシ−シロ−イノソース合成酵素としては、例えば、50℃で1時間インキュベートした後の残存酵素活性(最大活性を100とする相対活性)が50以上である酵素を選抜することができる。
本実施の形態における広範囲pH安定性を持つDOI合成酵素は、安定pH範囲が少なくともpH6.0〜7.0、好ましくはpH6.0〜7.4、より好ましくはpH6.0〜7.7、より好ましくはpH6.0〜8.0、特により好ましくはpH4.0〜9.0である特性を有する。
本実施の形態においては、2−デオキシ−シロ−イノソース合成酵素を用いてグルコース−6−リン酸を2−デオキシ−シロ−イノソースとリン酸へと変換することによって、グルコース−6−リン酸を定量することができる。即ち、本実施の形態によれば、2−デオキシ−シロ−イノソース合成酵素を含むグルコース−6−リン酸定量試薬が提供される。
該グルコース−6−リン酸定量試薬キットには、緩衝剤としてトリス−塩酸緩衝剤、イミダゾール−酢酸緩衝剤、リン酸緩衝剤、クエン酸緩衝剤、リンゴ酸緩衝剤、シュウ酸緩衝剤、フタル酸緩衝剤、グリシン緩衝剤、酢酸緩衝剤、コハク酸緩衝剤、ホウ酸緩衝剤、炭酸緩衝剤、グッドバッファー等の0.005〜2mol/l溶液が用いられ、他の酵素、発色剤および界面活性剤等が含有されていてもよい。
(1)染色体DNAの調製
常法に従ってPaenibacillus sp.NBRC13157株の染色体DNAを調製した。
Paenibacillus sp.NBRC13157株をNR寒天プレート(1% Bacto Tryptone、0.2% Yeast Extract、1% エルリッヒカツオエキス、1.5% Bacto Agar、pH7.0)で、30℃、1日間培養してコロニーを形成させた。その1白金耳を、NR培地(1% Bacto Tryptone、0.2% Yeast Extract、1% エルリッヒカツオエキス、pH7.0)30mLを150mL三角フラスコに分注したものに接種して、30℃、180rpmで1日間培養した。この培養液を、4℃で、12,000g、1分間遠心分離して上清を除去し、菌体を回収した。
上記(1)において調製した染色体DNAからDOI合成酵素遺伝子を増幅するためのPCRプライマーとして、センスプライマーは配列番号15の配列を有するオリゴDNAを、アンチセンスプライマーは配列番号16の配列を有するオリゴDNAをそれぞれ合成した。
ここで得られたPCR産物の遺伝子配列をDNAシークエンサーで解析することで確認し、配列番号13の塩基配列を有する既知DOI合成酵素(BtrC)遺伝子を得た。また、配列番号14には、既知DOI合成酵素(BtrC)のアミノ酸配列を示した。
上記(2)で取得したPCR産物の平滑末端化、リン酸化を行い、pUC19に大腸菌由来のgapAプロモーター、SD配列、ターミネーターを連結したプラスミドにライゲーションした。このプラスミドベクターには大腸菌中で外来遺伝子として連結された遺伝子を効率的に転写できるgapAプロモーターが導入されており、グルコースを含む培地で組換え微生物を培養した場合においてもDOI合成酵素遺伝子を効率的に発現・製造させることができる。
ここで得られたプラスミドベクターを、塩化カルシウム法で調製した大腸菌JM109株のコンピテントセルにヒートショック法で形質転換し、組換え微生物を作製した。
上記(3)で取得したプラスミドベクターに対し、常法による変異導入を行うことで、配列番号1(DOIS−1)、配列番号3(DOIS−2)、配列番号5(DOIS−3)、配列番号7(DOIS−4)に記載の耐熱性DOI合成酵素遺伝子を得ることができる。また、これらの遺伝子配列に対応するそれぞれのアミノ酸配列を配列番号2、4、6又は8に示した。ここで取得したDOI合成酵素遺伝子についても(3)と同様に形質転換体の取得を行った。
上記(3)で取得したプラスミドベクターに対し、常法による変異導入を行うことで、配列番号9(DOIS−5)、配列番号11(DOIS−6)、に記載の広範囲pH安定型DOI合成酵素遺伝子を得ることができる。また、これらの遺伝子配列に対応するそれぞれのアミノ酸配列を配列番号10及び12に示した。
[精製酵素の取得]
実施例1で作製したDOI合成酵素(DOIS−1)の形質転換体を100mg/Lのアンピシリンを含むLBプレートで、37℃、一日間培養して、コロニーを形成させた。
次いで100mg/Lのアンピシリンを含むLB培地30mLを150mL容の三角フラスコに入れ、上記プレートからコロニーを白金耳で植菌し、37℃で、3〜8時間、OD(600nm)が0.5程度になるまで180rpmで回転振盪培養を行い、これを本培養の前培養液とした。
次いでこの培養液を、4℃で、10,000g×30分間遠心分離して上清を除去し、0.2mg/L塩化コバルト六水和物を含む50mM Tris−HCl緩衝液(pH7.7)で数回洗浄しながら菌体を回収した。回収した菌体は、−80℃で凍結保存した。
菌体破砕後の溶液を、4℃で、10,000g×30分間遠心分離して菌体残渣を除去し、上清を回収した。
この上清にさらに硫酸アンモニウムを加えて40.0%飽和とし、4℃でしばらく攪拌した後に、生じた沈殿を、4℃で、10,000g×30分間遠心分離して上清を除去し、沈殿を回収した。次いでこの沈殿を0.2mg/L塩化コバルト六水和物を含む50mM Tris−HCl緩衝液(pH7.7)に溶解させた。
上記で得られた酵素溶液を、50mM Tris−HCl緩衝液(pH7.7)で平衡化した「DEAE Sepharose FF」(GEヘルスケア バイオサイエンス株式会社)に吸着させた後、0〜0.4Mの塩化ナトリウムを含有する50mM Tris−HCl緩衝液(pH7.7)の濃度勾配法によって酵素を溶出させた。
上記で溶出した活性画分を集め、平均分画分子量10,000の限外濾過膜を用いて濃縮し、50mM Tris−HCl緩衝液(pH7.7)で平衡化した「MonoQ 5/50 GL」(GEヘルスケア バイオサイエンス株式会社)に吸着させた後、0〜0.2Mの塩化ナトリウムを含有する50mM Tris−HCl緩衝液(pH7.7)の濃度勾配法によって酵素を溶出させた。
上記で溶出した活性画分を集め、平均分画分子量10,000の限外濾過膜を用いて濃縮し、精製DOI合成酵素(DOIS−1)を得た。
[新規DOI合成酵素の評価]
実施例2で得られた精製DOI合成酵素を用いて、その作用に関する実験を行った。
(1)至適pH範囲
各pHにおける活性測定では、反応液に精製DOI合成酵素(DOIS−1)を適量添加し、グルコース−6−リン酸二ナトリウム塩(オリエンタル酵母製)が20mM、NAD+(オリエンタル酵母製)が5mM、塩化コバルト六水和物が5mM、各種緩衝液が100mMとなるようにして反応液を調整した。緩衝液としては、Bis−Tris緩衝液(pH6.0〜7.7)およびTris緩衝液(pH7.4〜8.0) を使用した。反応温度は30℃とし、生成するDOIを定量することで活性を測定した。最大活性を100とする相対活性を求め、この結果を図1に示す。本発明酵素における至適pH範囲は、pH7.0〜 7.7であった。
pH5.5〜8.0の範囲の100mMの緩衝液を用いて、精製DOI合成酵素(DOIS−1)を各pHで30℃、60分間インキュベートし、その残存酵素活性を測定した。インキュベートに用いた緩衝液としては、Bis−Tris緩衝液(pH5.5〜8.0)およびTris緩衝液(pH7.4〜8.0) を使用した。
残存酵素活性測定は、グルコース−6−リン酸二ナトリウム塩(オリエンタル酵母製)が20mM、NAD+(オリエンタル酵母製)が5mM、塩化コバルト六水和物が5mMとなる100mMBis−Tris緩衝液(pH7.0)中で、反応温度30℃で実施した。最大活性を100とする相対活性を求め、この結果を図2に示した。本酵素の安定pH範囲は、pH6.0〜 8.0であり、非常に幅広いpH範囲で安定であった。精製DOI合成酵素(DOIS−2)および精製DOI合成酵素(DOIS−3)も同様の結果を示した。
反応温度10〜70℃の各反応温度条件において、グルコース−6−リン酸二ナトリウム塩(オリエンタル酵母製)が20mM、NAD+(オリエンタル酵母製)が5mM、塩化コバルト六水和物が5mMとなる100mMBis−Tris緩衝液(pH7.0)中で、精製DOI合成酵素(DOIS−1)の酵素活性測定を実施した。最大活性を100とする相対活性を求め、この結果を図3に示す。至適温度範囲は55〜70℃であり、反応温度65℃における比活性は1.8μmol(DOI)/min/mg(酵素)と非常に高い値を示した。
精製DOI合成酵素(DOIS−1)を添加して且つ、NAD+(オリエンタル酵母製)が5mM、塩化コバルト六水和物が5mMとなるように調整した100mMBis−Tris緩衝液(pH7.0)を、温度範囲25〜60℃の各温度で1時間インキュベートした後、それぞれの残存酵素活性を測定した。
分離ゲル濃度が10%の「レディーゲルJ」(日本バイオ・ラッド ラボラトリーズ株式会社)を用いるSDS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動により、分子量を求めたところ、精製DOI合成酵素(DOIS−1)の分子量は約40,000であり、アミノ酸配列から推定される分子量40,656とほぼ一致した。
[既知DOI合成酵素の評価]
配列番号14に記載のアミノ酸配列を有する精製既知DOI合成酵素(BtrC)に関して、実施例3−(4)安定温度範囲と同様にして以下実験を行った。
精製既知DOI合成酵素(BtrC)を添加して且つ、NAD+(オリエンタル酵母製)が5mM、塩化コバルト六水和物が5mMとなるように調整した100mMBis−Tris緩衝液(pH7.0)を、温度範囲25〜60℃の各温度で1時間インキュベートした後、それぞれの残存酵素活性を測定した。
精製既知DOI合成酵素(BtrC)を各pHで30℃、60分間インキュベートし、その残存酵素活性を測定した。インキュベートに用いた緩衝液としては、Bis−Tris緩衝液(pH5.5〜7.0)およびTris緩衝液(pH7.4〜8.0) を使用した。
[グルコース−6−リン酸の定量]
各種濃度(0.02、0.1、0.5、1、3,5、10mM)のグルコース−6−リン酸を含有した試料とDOI合成酵素を含有する定量試薬組成物を1:1で混合し、グルコース−6−リン酸の定量試験を実施した。定量試薬組成物は、適量のDOI合成酵素を含有し、且つ、10mM NAD+(オリエンタル酵母製)、10mM 塩化コバルト六水和物、150mM Bis−Tris緩衝液(pH7.0)を含んでなる。反応温度を30℃とし、それぞれのグルコース−6−リン酸濃度条件において十分な時間反応させた。反応後、遊離する無機リン酸濃度を市販の試薬キット(和光純薬工業株式会社、商品名:ホスファC−テストワコー)で測定したところ、誤差5%の範囲内でグルコース−6−リン酸初発濃度と対応した。グルコース−6−リン酸初発濃度と、反応後に遊離した無機リン酸濃度との関係を図6に示す。一方、上記グルコース−6−リン酸と同様の条件で、フルクトース−6−リン酸およびグルコース−1−リン酸の反応試験を実施したところ、遊離の生成無機リン酸は検出されなかった(グルコース−6−リン酸を基質とした場合の活性の11/100以下)。
Claims (9)
- 2−デオキシ−シロ−イノソース合成酵素を用いてグルコース−6−リン酸を2−デオキシ−シロ−イノソースとリン酸へと変換する工程を含む、グルコース−6−リン酸の定量方法。
- 2−デオキシ−シロ−イノソース合成酵素が、グルコース−1−リン酸および/又はフルクトース−6−リン酸および/またはフルクトース−1,6−ビスリン酸に作用しない酵素である、請求項1に記載の方法。
- 2−デオキシ−シロ−イノソース合成酵素が、安定温度範囲が少なくとも46℃まで安定である耐熱性酵素である、請求項1又は2に記載の方法。
- 2−デオキシ−シロ−イノソース合成酵素が、pH6.0〜 8.0で安定な酵素である、請求項1から3の何れかに記載の方法。
- 2−デオキシ−シロ−イノソース合成酵素が下記の特性を有する酵素である、請求項1に記載の方法。
(1)作用:本酵素は、グルコース−6−リン酸を2−デオキシ−シロ−イノソースへと変換する機能を有する。
(2)補酵素としてNAD+を利用
(3)至適pH範囲:7.0〜 7.7
(4)至適温度範囲:55 〜 70 ℃
(5)分子量:39000〜42000
(6)補因子:Co2+イオンの添加により活性向上
(7)安定温度範囲:少なくとも46℃ まで安定である。
(8)安定pH範囲:6.0〜 8.0
(9)比活性:1.0μmol/min/mg以上(反応温度65℃)
(10)グルコース−1−リン酸および/又はフルクトース−6−リン酸および/またはフルクトース−1,6−ビスリン酸に作用しない。 - 2−デオキシ−シロ−イノソース合成酵素が、配列番号2、4、6、8、10又は12に記載のアミノ酸配列を有する2−デオキシ−シロ−イノソース合成酵素である、請求項1に記載の方法。
- 2−デオキシ−シロ−イノソース合成酵素が、配列番号2、4、6、8、10又は12で示されるアミノ酸配列において1個または複数個のアミノ酸の欠失、付加、及び/又は置換を含み、配列番号2、4、6、8、10又は12で示されるアミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有して且つ、高温安定性及び/又は広範囲pH安定性を持つ2−デオキシ−シロ−イノソース合成酵素である、請求項1から5の何れかに記載の方法。
- 2−デオキシ−シロ−イノソース合成酵素を含む、請求項1から7の何れかに記載の定量方法で使用するためのグルコース−6−リン酸定量試薬。
- 2−デオキシ−シロ−イノソース合成酵素を含む、請求項1から7の何れかに記載の定量方法で使用するためのグルコース−6−リン酸定量試薬キット。
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