JP5601898B2 - ウイルスベクター - Google Patents
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Description
(i)特定の細胞又は疾患状態に合わせてスクリーニングを適合する、
(ii)非分裂細胞型又は1次最終分化非分裂細胞などの緩慢分裂細胞型を用いて行うことのできるスクリーニングを用いる組み合わせによって、新しい標的部分及び/又は結合モジュレート部分を同定する、
(iii)2重目的スクリーニングを用いて、考えられる標的及び治療配列を同定する、
(iv)特にin vivo状態に適切である経路を用いてスクリーニングするための手段を提供するので有利である。
(i)複数のモジュレート部分をコードする一群のNOIを含む標的非分裂又は緩慢分裂細胞を提供するステップ、
(ii)任意選択で細胞を生物応答改変物質に暴露するステップ、
(iii)少なくとも1つのモジュレート部分をコードする又は発現している標的非分裂又は緩慢分裂細胞と、モジュレート部分が存在しないコントロール細胞との間の表現型の相違を検出するステップであって、表現型の相違が、モジュレート部分と細胞応答部分との結合の結果であるステップ、及び
(iv)細胞応答部分及び/又は結合モジュレート部分を回収するステップ
を含む。
任意選択で細胞を生物応答改変物質に暴露するステップ、複数のモジュレート部分をコードしており、レンチウイルスベクターに構築された一群のNOIを含む標的細胞を提供するステップ、
少なくとも1つのモジュレート部分をコードする又は発現している標的細胞と、モジュレート部分が存在しないコントロール細胞との間の表現型の相違を検出するステップであって、表現型の相違が、モジュレート部分と標的部分との結合の結果であるステップ、及び
標的部分及び/又は結合モジュレート部分を回収するステップ
を含む。
(i)選択可能マーカーをコードする任意選択の第1のヌクレオチド配列、
(ii)それぞれ独立してマーカー又はモジュレーター遺伝子をコードする1つ又は複数の任意選択の第2のヌクレオチド配列、及び
(iii)ヌクレオチド配列に結合し、その切断を直接又は間接的にもたらすことのできる遺伝子産物をコードする機能可能にプロモーターに結合した第3のヌクレオチド配列
を含むライブラリーベクターを用いることができ、
(i)、(ii)、及び(iii)は、宿主において連続RNA分子として(i)、(ii)、及び(iii)の転写を指令できる調節配列に機能しうる形で連結している。
(a)モジュレーター遺伝子をコードする第1のヌクレオチド配列、
(b)前記第1ヌクレオチド配列がモジュレートするヌクレオチド配列に機能しうる形で連結している検出可能マーカー遺伝子及びプロモーターをコードする第2のヌクレオチド配列、及び
(c)対象となるヌクレオチド配列
を含む標的ベクターを用いることができ、
(a)、(b)、及び(c)は、宿主において連続RNA分子として(a)、(b)、及び(c)の転写を指令できる調節配列に機能しうる形で連結している。
前述のとおり、遺伝子療法にウイルスベクターを用いるという概念はよく知られている(Verma及びSomia(1997)Nature 389:239〜242)。
レトロウイルスベクター系は、特にNOIを1つ又は複数の対象となる部位に移動するための送達系として提示されてきた。この移動は、in vitro、ex vivo、in vivo、又はそれらの組み合わせにおいて生じ得る。レトロウイルスベクター系は、受容体の用法、逆転写、及びRNAパッケージングを含むレトロウイルスのライフサイクルの様々な面を研究するために開発されてきた(Miller、1992、Curr Top Microbiol Immunol 158:1〜24に概説されている)。
(i)本発明の第1の態様によるウイルスゲノム、
(ii)レンチウイルスgag及びpolタンパク質をコードするヌクレオチド配列、
(iii)ii)のヌクレオチド配列によってコードされていない他の必須ウイルスパッケージング成分をコードするヌクレオチド配列
を含むベクター系を提供する。好ましい実施形態において、(iii)のヌクレオチド配列は、envタンパク質をコードすることができる。本発明はさらに、そのようなベクター系でトランスフェクトされた細胞、及びそのような細胞によって生産されたレトロウイルスベクター粒子を提供する。好ましくは、gag−pol配列は、特定のプロデューサー細胞で用いるためにコドン最適化されている(下記参照)。
レトロウイルスベクター系の設計において、拡大又は改変された範囲の細胞型に遺伝物質を送達できるように、天然ウイルスに対する種々の標的細胞特異性を有する粒子を作製することが望ましい。これを達成する一方法は、その特異性を改変するためにウイルスエンベロープタンパク質を作製することによるものである。他のアプローチは、ウイルスの天然エンベロープタンパク質を置換又はそれに追加するために、異種エンベロープタンパク質をベクター粒子に導入するものである。
第1の核酸配列は、たとえば第1の核酸配列が存在しない状態と比較して、Revの不在下、パッケージングに利用可能であるゲノムRNAのレベルを増大することのできる配列である。好ましくは、第1の核酸配列は、Revの不在下、パッケージングに利用可能なゲノムRNAのレベルを増大するオープンリーディングフレーム(ORF)又はそのフラグメントである。ORFによって、本出願人等は、終止コドンに通じる5’開始コドン(コザック配列であることができる)を含む一連のコドントリプレットを含むものとし、推定又は既知遺伝子を表す。しかしながら、パッケージングのためのゲノムRNAのレベルを増大する任意の核酸配列を用いることができる。
他の好ましい実施形態において、第1の核酸配列は、任意選択で核局在化シグナル(NLS)に連結したTet抑制因子遺伝子である。いかなる理論にも縛られることを望まないが、本出願人等は、TetRのアミノ末端はテトラサイクリンオペレーター(tetO)の結合に重要であるので、カルボキシ末端へのNLSの付加は、核におけるTetRの濃度を増大すると考える。したがって、この実施形態において、下流NOIの少なくとも1つは、tetOとなる。好ましい一実施形態において、Tet抑制因子遺伝子の少なくとも2次コピーは、IRES又は内部プロモーターの下流に存在する。
コドン最適化は、以前にWO99/41397に記載されている。種々の細胞は、特定のコドンの使用法が異なる。このコドンの偏りは、細胞型における特定のtRNAの相対的な存在量に相当する。対応するtRNAの相対的な存在量に適合するように、配列中のコドンを変更することによって、発現を増大することができる。同様に、対応するtRNAが特定の細胞型において希少であることが知られているコドンを計画的に選択することによって、発現を低減することができる。したがって、さらなる翻訳の制御を得ることができる。
本発明において、NOI(対象となるヌクレオチド配列)という用語は、任意の適切なヌクレオチド配列を含み、必ずしも完全に天然のDNA又はRNA配列である必要はない。したがって、NOIは、たとえば合成RNA/DNA配列、組換えRNA/DNA配列(すなわち、組換えDNA技術を用いて調製された配列)、cDNA配列又は部分ゲノムDNA配列であることができ、それらの組み合わせを含む。この配列は、コード領域である必要はない。配列がコード領域である場合、全コード領域である必要はない。さらに、RNA/DNA配列は、センス配向性又はアンチセンス配向性であり得る。好ましくは、センス配向性である。好ましくは、この配列は、cDNAを含むか、又はcDNAから転写される。
本発明の第1の態様のウイルスゲノムは、1つ又は複数のNOIを含む。複数のNOIが発現されるために、それぞれのNOIに対して1つ、ベクターゲノム内に2つ以上の転写単位が存在できる。しかしながら、レトロウイルスベクターが遺伝子的に単純なままである場合、レトロウイルスベクターは最高の力価、及び非常に強力な遺伝子発現特性を獲得し(PCT/GB96/01230、Bowtell等、1988、J.Virol.62、2464、Correll等、1994、Blood 84、1812、Emerman及びTemin、1984、Cell 39、459、Ghattas等、1991、Mol.Cell.Biol.11、5848、Hantzopoulos等、1989、PNAS 86、3519、Hatzoglou等、1991、J.Biol.Chem 266、8416、Hatzoglou等、1988、J.Biol.Chem 263、17798、Li等、1992、Hum.Gen.Ther.3、381、McLachlin等、1993、Virol.195、1、Overell等、1988、Mol.Cell Biol.8、1803、Scharfman等、1991、PNAS 88、4626、Vile等、1994、Gene Ther 1、307、Xu等、1989、Virol.171、331、Yee等、1987、PNAS 84、5197)、そのためポリシストロン性メッセージにおいて第2(及びそれに続く)コード配列の翻訳を開始するためにIRESを用いることが好ましい(Adam等、1991、J.Virol.65、4985)ことが文献から明らかである。
[(NOI1−n−1)−(IRES1−n−1)]−NOIn
NOI1−IRES1−NOI2
NOI1−IRES1−NOI2−IRES2−NOI3
本発明はさらに、本発明の第1の態様によるウイルスゲノムを含むベクター系で形質導入された細胞に関する。
本発明はさらに、IRES又は内部プロモーターなどの調節エレメントによって機能可能に結合された2つ以上のNOI及びORFを含むマルチシストロン性カセットを提供する。このカセットは、プロデューサー細胞でベクターゲノムを生産する方法において用いることができる。
LTR−ORF−プロモーター/IRES−(NOI1)−(IRES1)−NOI2)
LTR−ORF−プロモーター/IRES−(NOI1)−(IRES1)−(NOI2)−(IRES2)−(NOI3)
本発明の態様は、シグナル伝達経路の同定されていない成分の同定を可能にする。そのような成分は、本明細書では「標的部分」と呼ばれる。シグナル伝達経路の同定成分又は標的部分は、薬剤標的として有用である可能性がある。「シグナル伝達経路」という表現は、経路の活性化をもたらす、又は経路の活性化から生じる(及び含む)任意の1つ又は複数の事象をいう。好ましくは、「シグナル伝達経路」によって、本出願人等は、遺伝子的及び/又は分子的に相互作用するエレメントを含むシグナル伝達経路をいう。このシグナル伝達経路には、細胞外又は細胞膜で起こるシグナル伝達事象、並びに細胞内、たとえば細胞質内部、又は細胞核内部で起こるシグナル伝達事象が含まれる。
モジュレート部分は、標的部分と結合することによってシグナル伝達経路に影響を及ぼすことができ、すなわちシグナル伝達経路をアップレギュレート又はダウンレギュレートできる化合物である。
(a)(i)抑制因子の優性阻害又は阻害因子、及び(ii)活性化因子によるシグナル伝達経路の活性化、並びに
(b)(i)活性化因子の優性阻害又は阻害因子、及び(ii)阻害因子によるシグナル伝達経路の遮断
を含む。
本明細書では、「ライブラリー」という用語には、これに限定されるものではないが、候補モジュレート部分をコードする核酸フラグメントの集積が含まれる(本明細書では候補モジュレート部分のライブラリーと呼ぶ)。
リボザイムなどの阻害RNA分子の選択は、理論上、通常どおりに設計されている。しかしながら、この方法で試験されたリボザイムは、多くの場合、細胞環境では良好に機能しない。本出願人等はここにin vivo選択法を提供し、これは本出願人等のWO00/75370に記載の方法の別法である。
(i)選択可能マーカーをコードする任意選択の第1のヌクレオチド配列、
(ii)それぞれ独立してマーカー又はモジュレーター遺伝子をコードする1つ又は複数の任意選択の第2のヌクレオチド配列、及び
(iii)ヌクレオチド配列に結合し、その切断を直接又は間接的にもたらすことのできる遺伝子産物をコードする、機能可能にプロモーターに結合した第3のヌクレオチド配列
を含む、in vivoで用いるのに適したベクターが提供され、
(i)、(ii)、及び(iii)は、宿主において連続RNA分子として(i)、(ii)、及び(iii)の転写を指令できる調節配列に機能しうる形で連結している。
(a)モジュレーター遺伝子をコードする第1のヌクレオチド配列、
(b)前記第1ヌクレオチド配列がモジュレートするヌクレオチド配列に機能しうる形で連結している検出可能マーカー遺伝子及びプロモーターをコードする第2のヌクレオチド配列、及び
(c)対象となるヌクレオチド配列を含み、
(a)、(b)、及び(c)は、宿主において連続RNA分子として(a)、(b)、及び(c)の転写を指令できる調節配列に機能しうる形で連結している。
(i)標的ベクター及びライブラリーベクターを宿主細胞に導入し、
(ii)検出マーカー遺伝子が宿主細胞で発現される場合、その宿主細胞を選択し、任意選択で、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列を単離して、そのヌクレオチド配列を決定することにより、複数の阻害分子から選択する方法を提供する。
候補物質、すなわちモジュレート部分は、標的非分裂細胞又は緩慢分裂細胞を形質導入することのできる任意のベクターにおいて非分裂細胞又は緩慢分裂細胞に投与することができる。たとえば、細胞に注入することができる。或いは、ポリペプチド候補物質の場合、細胞においてポリペプチドの発現を方向づける核酸構築物で細胞をトランスフェクトすることができる。好ましくは、ポリペプチドの発現は、調節プロモーターの制御下にある。一実施形態において、モジュレート部分は、レンチウイルスベクターに送達される。
当分野でよく知られているように、ベクターは、1つの環境から別の環境へのある実体の移入を可能にする、又は容易にするツールである。本発明によれば、例として、組換えDNA技法に用いられるいくつかのベクターは、DNAのセグメント(異種DNAセグメント、異種cDNAセグメントなど)などの実体が、DNAのセグメントを含むベクターの複製のために宿主細胞に移入されることを可能にする。組換えDNA技法に用いられるベクターの例には、これに限定されるものではないが、プラスミド、染色体、人工染色体、又はウイルスが含まれる。
好ましくは、標的非分裂細胞又は緩慢分裂細胞を形質導入することのできるウイルスベクターは、レンチウイルスベクターである。
本発明の他の実施形態において、候補モジュレート部分のライブラリーは、アデノウイルスベクターに導入することができる。
本発明の他の実施形態において、候補モジュレート部分のライブラリーは、ポックスウイルスベクターに導入される。
好ましくは、ポックスウイルスベクターは、ワクシニアウイルスベクターである。
典型的に、候補モジュレート部分をコードする核酸フラグメント又は核酸フラグメント群は、相同組換えによってポックスウイルスゲノムに導入される。候補モジュレート部分をコードする核酸フラグメント又は核酸フラグメント群は、ポックスウイルスの非必須領域に相同の配列に隣接したワクシニアプロモーターの後ろにクローニングされ、プラスミド中間体は、相同組換えによってウイルスゲノムに組み換えられる。この方法は、原核生物宿主に許容される比較的小さな挿入部分に関して、効率的に機能する。
上述の3分子組換え法は、100%に近いウイルス組換えを生じる。これは、プラスミド転移ベクターをワクシニアウイルス感染細胞にトランスフェクションしてウイルス組換えを生産する現行の方法に比べて、非常に顕著な改善である。後者の手順は、わずか0.1%程度の頻度でウイルス組換えを生じる。3分子組換えにおけるウイルス組換えの高収率により、ワクシニアウイルス由来ベクターでの効率的なライブラリーの構築が可能になる。20マイクログラムのNotI及びApaI消化ワクシニアベクターアームと等モル濃度の腫瘍細胞cDNAとの混合物によるトランスフェクション後に、6×10の力価の組換えウイルスを得ることができる。この技術的進歩は、候補モジュレート部分を含む特定のゲノム及びクローンを単離するための、新しく効率的なスクリーニング及び選択戦略を創出する。
「標的細胞」という用語は、ベクターがトランスフェクト又は形質導入することのできる適切な生物から誘導可能な任意の細胞を含む。好ましくは、この細胞は、非分裂細胞又は緩慢分裂細胞である。
非分裂細胞又は緩慢分裂細胞から誘導された不朽化細胞系の使用に伴う利点の1つは、一般の細胞系の使用に比べて、in vivo状態を反映する確率が高いことである。本発明の一実施形態において、標的細胞は非分裂細胞又は緩慢分裂細胞であるが、NOIによる形質導入直後、又は同時に、標的細胞は不朽化される。不朽化は、テロメラーゼの添加又は新生細胞との融合によるハイブリドーマの形成、或いはタンパク質又は遺伝子送達によるSV40大型T抗原の添加によって行うことができる。
候補部分の発現をモジュレートするか、又は発現した候補モジュレート部分を所望の特定の様式で修飾し、プロセシングする宿主細胞株を選択することができる。タンパク質産物のそのような修飾(たとえばグリコシル化)及びプロセシング(たとえば切断)は、タンパク質の機能にとって重要である可能性がある。種々の宿主細胞は、タンパク質及び遺伝子産物の翻訳後プロセシング及び修飾に関して特徴及び特定の機構を有する。適切な細胞系又は宿主系を選択することによって、発現した外来タンパク質の正しい修飾を確実なものにすることができる。この目的を達成するために、1次転写物の適切なプロセシング、遺伝子産物のグリコシル化及びリン酸化のための細胞機構を有する真核生物宿主細胞を用いることができる。そのような哺乳動物宿主細胞には、これに限定されるものではないが、CHO、VERO、BHK、HeLa、COS、MDCK、293、3T3、HT1080、及びWI38細胞系が含まれる。
対象となる経路は、それ自体では刺激物質に応答性である必要はない。例として、本発明のスクリーニング法は、構成的に発現された対象となる遺伝子の場合に適用することができる。他の実施形態において、BRMを用いて、研究中のシグナル伝達経路をモジュレートすることができる。
神経アポトーシス応答は、そのような疾患状態を模倣するために用いることのできる刺激によってin vitroで誘導することができる。考えられる刺激には、低酸素、虚血、低酸素/虚血、グルタミン酸、カイニン酸、6−ヒドロキシドーパミン、スタウロスポリン、一酸化窒素、又はウォルトマニン(wortmanin)がある。
虚血は、特定の器官又は組織への不充分な血液の供給であり得る。血液供給の減少の結果として、器官又は組織への酸素の供給が不適切となる(低酸素)。長期にわたる低酸素は、罹患器官又は組織の傷害をもたらす可能性がある。
本明細書では、「低酸素」という用語は、脊椎動物又はその血液中の通常より低量の二酸素の存在をいう。炎症組織、及び充実性腫瘍、特に壊死領域は、低い酸素分圧(<1%酸素)又は酸素の不適切な供給を有する可能性が高い。低い酸素分圧を有するこれらの組織は、低酸素組織と呼ばれる。したがって、「低酸素」という用語には、低酸素及び炎症部位の両方が含まれる。
本発明は、標的細胞とコントロール細胞との間の表現型の相違を検出することを含む。コントロール細胞は、本発明の方法を開始する前の標的細胞であることができ、すなわちこの実施形態において、独立したコントロール細胞は存在せず、標的細胞がモジュレート部分を導入される前後に、標的細胞の表現型の特性が観察される。
この原理は、遺伝子の発現がその転写プロモーターに制御されているという仮設に基づいている。レポーター遺伝子発現(EGFPなど)のレベルは、その特定の遺伝子のRNAの内因性レベルに相関している可能性がある。細胞は、その特定の遺伝子の発現レベルの変化に関して機能的に選択することができる。たとえば、レポーター遺伝子のレベルは、リボザイムライブラリー形質導入細胞及び非形質導入細胞において比較することができる。選択されたリボザイムが選択された遺伝子プロモーター媒介遺伝子発現を増大させ、レポーター遺伝子のレベルを上昇させる細胞を選択することができる。
レポーター遺伝子は、当分野で知られている標準的な技法に従って構築することができる。一般に、このレポーターは、選択された調節配列に非相同なコード配列であるか(下記参照)、通常は選択された調節配列に結合しているコード配列の発現を検出可能にするような修飾であることができ、場合によっては、その配列の発現が検出可能な事象をもたらす場合、通常は選択された調節配列に結合している天然コード配列をレポーター遺伝子として用いることができる。
本発明のさらなる態様によれば、この方法は、遺伝因子を増幅するさらなるステップを含む。所望の遺伝子産物をコードする遺伝因子を富化する手段として、選択的増幅を用いることができる。
本発明によるアッセイを行うのに適切な細胞は、好ましくは、多細胞生物由来の高等真核生物細胞であり、有利には哺乳動物細胞である。好ましい細胞型は神経細胞であり、神経系統の細胞の初代培養物、又は神経系統の不朽化細胞系であることができる。
典型的に接触は、約1から約24時間、好ましくは約2から約12時間行われる。さらに、接触は典型的に、試験される分子の複数の所定量で行われる。これらの方法において、試験される分子は、精製分子、分子の混合物、又は均質サンプルであり得る。
検出可能シグナルは、本発明の方法に用いられるレポーター遺伝子の性質に応じて、いくつかの方法のうち任意の1つの方法で生成することができる。たとえば、検出可能シグナルは、発光性シグナル、たとえばGFPなどの蛍光シグナルとすることができる。GFPは、基質又は補助因子を必要とせずに蛍光シグナルを生成する蛍光ポリペプチドである。GFPの発現及び検出技法は当分野でよく知られており、キットは、たとえばClontechから市販され入手可能である。GFPの発現は、細胞を溶解したり、さらなる試薬を添加したりする必要なしに、無傷細胞でアッセイすることができる。或いは、検出可能シグナルは、酵素活性、又は細胞表面マーカー、たとえばLNGFRの認識の結果として発生したシグナル、或いは抗生物質選択後、又は自殺遺伝子の活性化によって、たとえばTKを発現する細胞へのGCVの添加によって発生したシグナルであることができる。
本明細書では、「転写調節制御エレメント」という用語には、これに限定されるものではないが、転写因子に結合し、正(誘導)又は負(抑制)の方向に遺伝子プロモーターを結合し、その活性を改変するエレメントが含まれる。例として、「ストレス応答性エレメント」又は「ストレス応答性調節エレメント」は、環境ストレスに応答して細胞によって活性化された転写因子に結合する調節エレメントである。
調節制御エレメントの他の例には、これに限定されるものではないが、組織特異的プロモーター、誘導プロモーター、生理的調節プロモーター、又は他の種類の任意の最適化プロモーターが含まれる。これらのプロモーターエレメントは、天然由来プロモーターエレメント、又は合成プロモーターエレメントであることができる。合成プロモーターエレメントは、Edelman等((2000)前出)に概説されている新しい合成プロモーター構築法(SPCM)によって調製することができる。
「機能可能に結合」という用語は、記載の成分が意図する様式で機能することを可能にするような関係にあることを意味する。レポーター配列に「機能しうる形で連結された」調節配列を含むライブラリーは、コントロール配列に適合する条件下で核酸レポーター配列の発現が得られるような方法で連結される。
プロモーターという用語は当分野でよく知られており、当分野の通常の意味で、たとえばRNAポリメラーゼ結合部位として用いられる。この用語は、最小プロモーターから、上流エレメント及びエンハンサーを含むプロモーターにわたる大きさ及び複雑性の核酸領域を包含する。
さらに、本発明のこれらのプロモーターは、さらなる調節配列、たとえばエンハンサー配列を付加することによって修飾することができる。上述の2つ以上の異なるプロモーター由来の配列エレメントを含むキメラプロモーターを用いることもできる。
上述のように、低酸素は、広範囲の種々の細胞型において遺伝子発現の強力な調節因子であり、同種DNA認識部位に結合する低酸素誘導性因子1(HIF−1、Wang及びSemenza、1993、Proc Natl Acad Sci、90:430)、種々の遺伝子プロモーターの低酸素応答エレメント(HRE)などの低酸素誘導性転写因子の活性の誘導によって作用する。Dachs等(1997、Nature Med 5:515)は、in vitro、及びin vivo充実性腫瘍内部で低酸素に応答するヒト線維肉腫細胞によるマーカー遺伝子及び治療遺伝子両方の発現を制御するために、マウスホスホグリセリン酸キナーゼ1(PGK−1)遺伝子由来の多量体型HRE(Firth等、1994、Proc Natl Acad Sci、91:6496〜6500)を用いた(Dachs等、前出)。
本発明の候補標的部分及び/又はモジュレート部分の発現及び/又は検出は、その候補部分を直接又は間接的に認識することのできる作用物質を用いて行うことができる。作用物質には、これに限定されるものではないが、被験体から得たサンプル又は動物から得たサンプル、或いは組織のサンプル又は体液のサンプルを含み得るサンプルを含むことができるが、これに限定されない。
本発明の候補標的及び/又はモジュレート部分の発現の検出は、たとえば、本発明のレポーター部分と特異的に反応することのできる結合パートナーの適用によって達成することができる。
好ましくは、結合パートナーは抗体である。
本発明のレポーター部分の発現の直接又は間接検出は、たとえばレポーター部分の発現産物に特異的に免疫反応性である標識抗体を適用することによって達成できる。この抗体は、ヒト又は動物から摘出された組織又は体液サンプルから得ることができる。当分野の技術者に知られている典型的な免疫アッセイの様々な形態をこれに適用することができる。これらのアッセイには、競合アッセイ及び非競合アッセイの両方が含まれる。たとえば、「サンドイッチアッセイ」と呼ばれることもあるアッセイの一様式では、特異的にレポーター部分と反応する固定化抗体を、生物組織又は体液サンプルに接触させる。次いで、固定化レポーター部分抗体複合体の存在は、レポーター部分、又はレポーター部分−抗体複合体に免疫反応性の第2の標識抗体を適用することによって達成できる。本発明の他の実施形態において、ウエスタンブロット様式のアッセイを用いることもできる。
本発明の同定された標的及び/又はモジュレート部分は、調節制御領域及び/又は対象となるヌクレオチド配列(NOI)に機能しうる形で連結されたベクターにおいて用いることができる。一実施形態において、本発明の同定された標的及び/又はモジュレート部分は、ベクターをたとえば標的細胞又は標的組織に送達するために、ベクターの調節制御領域及び/又はヌクレオチド配列に機能しうる形で連結していることができる。
一態様において、本発明は、調節制御領域及び/又はNOIに機能しうる形で連結された同定されたモジュレート部分を含むベクター、及び薬剤として許容される担体、希釈剤、又は賦形剤(それらの組み合わせを含む)を含む医薬組成物を提供する。
典型的に、医師は、個々の被験体により適切な実際の投与量を決定し、これは特定の患者の年齢、体重、及び反応、並びに疾患の重篤度によって異なる。以下の投与量は、平均的な場合の例である。当然ながら、より多い又は少ない投与量が有益である個々の場合が存在し得る。
NOIに機能しうる形で連結された同定されたモジュレート部分を含む有効量のベクターを含む医薬組成物は、WO−A−98/09985に挙げられているものなどの疾患の治療に用いることができる。参照を容易にするために、リストの一部を以下に示す。マクロファージ阻害及び/又はT細胞阻害活性、及びそれによる抗炎症活性;抗免疫活性、すなわち炎症に関連しない応答を含む細胞及び/又は体液性免疫応答に対する阻害作用;ウイルス及び/又は他の細胞内病原体に関連する疾患;マクロファージ及びT細胞の細胞外マトリクス成分及びフィブロネクチンへの接着能力、並びにT細胞におけるアップレギュレートされたfas受容体発現の阻害;望ましくない免疫反応及び炎症の阻害、関節リウマチを含む関節炎、過敏症に伴う炎症、アレルギー反応、喘息、全身性エリテマトーデス、抗原病及び他の自己免疫疾患、アテローム性動脈硬化症に伴う炎症、動脈硬化、動脈硬化性心疾患、再潅流傷害、心停止、心筋梗塞、血管炎症性疾患、呼吸窮迫症候群又は他の心肺疾患、消化性潰瘍に伴う炎症、潰瘍性大腸炎、及び他の胃腸管疾患、肝線維症、肝硬変又は他の肝疾患、甲状腺炎又は他の腺疾患、糸球体腎炎又は他の腎臓及び泌尿器疾患、耳炎又は他の耳鼻咽喉疾患、皮膚炎又は他の皮膚疾患、歯周病又は他の歯科疾患、精巣炎又は精巣−精巣上体炎、不妊症、精巣外傷又は他の免疫関連精巣疾患、胎盤機能障害、胎盤機能不全、習慣性流産、子癇、子癇前症並びに他の免疫及び/又は炎症関連婦人科疾患、後部ブドウ膜炎、中間部ブドウ膜炎、前部ブドウ膜炎、結膜炎、脈絡網膜炎、ブドウ膜網膜炎、視神経炎、眼内炎症、たとえば網膜炎又は類嚢胞黄斑水腫、交感性眼炎、強膜炎、色素性網膜炎、変性眼底疾患の免疫及び炎症成分、眼外傷の炎症成分、感染による眼の炎症、増殖性硝子体網膜症、急性虚血性視神経障害、たとえば緑内障濾過手術後の過剰瘢痕、眼移植片に対する免疫及び/又は炎症反応、並びに他の免疫及び炎症関連眼疾患、中枢神経系(CNS)又は他の器官において免疫及び/又は炎症の抑制が有益である自己免疫疾患又は状態又は障害に伴う炎症、パーキンソン病、パーキンソン病治療の合併症及び/又は副作用、AIDS関連痴呆複合HIV関連脳症、デビック病、シドナム舞踏病、アルツハイマー疾患及び他のCNSの変性疾患、状態、又は障害、ストークスの炎症成分、ポリオ後症候群、精神障害の免疫及び炎症成分、脊髄炎、脳炎、亜急性硬化性汎脳炎、脳脊髄炎、急性神経障害、亜急性神経障害、慢性神経障害、ギラン−バレー症候群、シドナム舞踏症、重症筋無力症、偽脳腫瘍、ダウン症候群、ハンチントン病、筋萎縮性側索硬化症、CNS圧迫又はCNS外傷又はCNS感染の炎症成分、筋萎縮及びジストロフィーの炎症成分、中枢神経系及び末梢神経系の免疫及び炎症関連疾患、状態、及び障害、外傷後炎症、敗血症性ショック、感染症、手術の炎症性合併症又は副作用、骨髄移植又は他の移植の合併症及び/又は副作用、たとえばウイルスキャリアからの感染による遺伝子治療の炎症及び/又は免疫合併症及び副作用、又はAIDSに伴う炎症、体液性及び/又は細胞性免疫応答を抑制又は阻害、一定量の単球又はリンパ球を低減することによる、単球又は白血球増殖疾患、たとえば白血病の治療又は緩和、天然又は人工の細胞、組織、及び器官、たとえば角膜、骨髄、器官、レンズ、ペースメーカー、天然又は人工皮膚組織などの移植時の移植片拒絶の予防及び/又は治療を含む。特定の癌関連疾患には、これに限定されるものではないが、充実性腫瘍;白血病などの血液性腫瘍;腫瘍転移;良性腫瘍、たとえば血管腫、聴神経腫、神経線維腫、トラコーマ、及び化膿性肉芽腫;関節リウマチ;乾癬;眼脈管形成疾患、たとえば糖尿病性網膜症、未熟児網膜症、黄斑変性、角膜移植拒絶、血管新生緑内障、水晶体後繊維増殖、ルベオーシス;オスラー−ウェーバー症候群;心筋新脈管形成;プラーク形成新生血管;毛細血管拡張症;血友病関節症;血管線維腫;創傷肉芽形成;冠側副;脳側副;動静脈奇形;虚血性四肢新脈管形成;血管新生緑内障;水晶体後繊維増殖;糖尿病性新生血管形成;ヘリオバクター関連疾患、骨折、脈管形成、造血、排卵、月経、及び胎盤形成が含まれる。
・標的遺伝子の同定(発現プロファイリングを使用)
・標的細胞の同定
・レポーター遺伝子(たとえばGFP、LNGFR)に機能しうる形で連結されたプロモーター(及びエンハンサー)を含む構築物の標的細胞への導入
・細胞の培養、及び適切に形質導入された細胞の同定
・対象となるライブラリーによる細胞の形質導入
・細胞応答経路を活性化し、検出可能な表現型(たとえばレポーター発現/転写の増加など、細胞死など)をもたらす条件下での細胞のスクリーニング
・表現型に変化を示す細胞の回収
・単離、ライブラリー挿入、増幅
・これにより細胞応答部分及びモジュレート部分の同定が可能になる
・任意選択のモジュレート部分再試験
本発明は、対象となる細胞応答経路に適合されているシグナル伝達経路の未同定成分を単離するためのスクリーニング法を提供する。
レポーター遺伝子に機能しうる形で連結されたNOIのプロモーターを含む構築物を調製する。例として、その後、NOIのプロモーターは、GFP又はLNGFRなどのレポーター遺伝子の発現を駆動するために用いられる。
標的細胞を同定し、この構築物を、対象となる部位での相同組換えを可能にする充分な配列が隣接しているレポーターcDNAからなる構築物でトランスフェクトすることにより、標的細胞に導入することができる(Hanson及びSedivy、1995、Mol cell Biol 15(1):45〜51)。このアプローチは、任意のエンハンサーを含む完全長プロモーターがレポーター発現を駆動する利点を有する。
トランスフェクト/形質導入細胞を、トランスフェクト/形質導入細胞の同定を可能にする適切な細胞培養条件下で維持する。
安定にトランスフェクト/形質導入された細胞がクローニングされるか、類似のGFPレベルを発現する細胞がプールされたら、リボザイムライブラリー、又はアンチセンスライブラリーなどのモジュレート部分のライブラリーを、トランスフェクション又は形質導入によって標的細胞に導入することができる。ライブラリーベクターの略図を図2に示す。
このベクターゲノムは、コードされたcDNAの発現が構成的であるか(この技術は本出願人等のWO98/17816、WO99/32646、及びWO98/17815に記載のとおりである)、又は形質導入細胞のみに限定される(この技術は本出願人等のWO99/15683に記載のとおりである)ように設計することができる。
その後、細胞応答経路を活性化し、それによりレポーター発現を活性化する条件下で、このトランスフェクト/形質導入細胞をスクリーニングする。例として、経路の活性化によってダウンレギュレートされるプロモーターの場合、GFPスイッチオンに関して形質導入細胞をスクリーニングする。
対象となる表現型(たとえばGFP発現のアップレギュレーション又はダウンレギュレーション)を発現する同定された細胞をFACSによって収集し、ライブラリー挿入物を、隣接領域のプライマーを用いるPCRによって増幅する。標的細胞の再形質導入によって、候補をさらに試験する。
最終分化しているか、又は限定された増殖可能性の初代細胞(非分裂又は緩慢分裂/老化/休止と説明することもできる)であってもよい標的細胞を、細胞分裂を誘導/維持することができるNOIをコードするレンチウイルスベクターを用いて形質導入する(不朽化)。NOIは1つ又は複数の「不朽化遺伝子」であることができ、たとえば、ヒトテロメラーゼ(hTERT)とシミアンウイルスラージ腫瘍抗原の温度感受性突然変異体との組み合わせの異所性発現は、新しく単離された乳房線維芽細胞及び内皮細胞を条件付きで不朽化することが示されている(O’Hare、M.J.等、Proc Natl Acad Sci USA(2001年1月16日)98(2):646〜51)。阻害タンパク質が細胞分裂を妨げる場合、NOIはリボザイムを含むことができる。
1.in vitro初代細胞
2.レンチウイルスベクターによる適切なNOIの送達によって「不朽化」された初代細胞
3.確立された不朽化細胞系
Neu−Ras経路
乳癌は女性ではもっとも一般的な悪性疾患である。ほとんどの乳癌ではサイクリンD1が過剰に発現されている(Gillett等、1994、Cancer Res 54(7):1812〜7)。乳房上皮細胞において、Neu−Ras経路は、サイクリンD1によって細胞周期装置に連結しており(Yu等、2001、Nature 411(6841):1017〜21)、これはこの組織の悪性転換に絶対的な要件である。抗サイクリンD1療法は、Neu−Ras経路活性化を伴うヒト乳癌の治療において大きな可能性を持つと考えられている。本発明の方法は、サイクリンD1プロモーターの不適切なアップレギュレーションをもたらすNeu−Rasシグナルを伝えるサイクリンD1以外の標的を同定するために用いることができる。
レポーター遺伝子に機能しうる形で連結されたサイクリンD1プロモーターを含む構築物を調製する。
経路の活性化は、Ras又はNeu(Rasの上流である)の過剰発現によって達成できる。レポーター発現は、細胞周期のステージに依存する可能性がある。したがって、通常はサイクリンD1が高発現である細胞周期のあるステージ(たとえばG1)にスクリーニングが行われるように、このスクリーニング法を適合させることができる。或いは、スクリーニングの前に、ブロック及びリリース、又はエルトリエーションによって標的細胞を同調することができる。他の選択肢は、細胞周期の適切な時期にスクリーニングされるすべての細胞の確率が一致するように連続的スクリーニングを行うことである。
炎症性疾患
多くの炎症性疾患状態は、Tヘルパー細胞集団の不均衡が原因であると考えられる(Stirling及びChung、2000、Eur Respir J 16(6):1158〜74)。CD4前駆細胞のTh1分化ではなくTh2分化をもたらすシグナル伝達経路における標的の同定が、一連の炎症性疾患型において有益であることがわかる。
喘息反応は、好酸球レベルのアップレギュレーションを特徴とする多因子応答経路である。IL−5受容体は好酸球系統の細胞に発現して、好酸球分化を誘導し、それらの生存を延長する作用をする。喘息反応も、Tヘルパー細胞集団の不均衡が原因であると考えられる。したがって、以下の1つの段階での介入は、好酸球増加を軽減する一助となる可能性がある。
好酸球におけるIL−5経路の阻害/遮断
Th2由来サイトカイン発現、たとえばIL−5の阻害
Th2分化の阻害による、循環Th2細胞数の低減が含まれる。
IL−5受容体は好酸球系統の細胞に発現して、好酸球分化を誘導し、それらの生存を延長する作用をする。好酸球増加は喘息の特徴であり、IL−5シグナル伝達経路の阻害は、この疾患の症状を軽減するはずである。
IL−5によってアップレギュレートされるNOIのプロモーターを、適切な細胞型においてレポーター遺伝子の発現を駆動するために用いる。
TF−1.8細胞系などの、適切なIL−5依存性標的細胞を選択する。或いは、Th1及びTh2細胞などの標的T細胞の使用によって、一連の炎症性疾患型において有益である、CD4前駆細胞のTh1分化ではなくTh2分化をもたらすシグナル伝達経路における標的を同定できる可能性がある。
アルツハイマー病は、多くの脳領域におけるAβ−アミロイドの沈着及び神経細線維のもつれを特徴とする。2種のβ−セクレターゼ、BACE1及びBACE2が、毒性アルツハイマー疾患Aβペプチドの生産に関与する。これらは、β及びγ−セクレターゼによるβ−アミロイド前駆体タンパク質(APP)のエンドプロテアーゼ切断によって生産される。Aβペプチドの分泌は、BACE−1欠乏皮質ニューロンの培養で根絶されることが報告されている(Cai、H.等、Nat Neurosci(2001年3月)4(3):233〜4)。脳において、BACE1mRNAは高レベルである。BACE1はプロ酵素として合成され、これはフューリン(furin)によって切断され、成熟酵素を生成する。マウスではBACE1欠乏に伴う明らかな悪影響は存在せず、したがってヒトにおけるBACE1の阻害は機構に基づく毒性を持たない可能性が示されている(Luo等、2001)。
レポーター発現を駆動するようにBACE1プロモーターを選択する。
標的細胞はニューロンである。
この場合、レポーターの発現は構成的になる。
ライブラリーによる形質導入に続いて(アンチセンス、cDNA、又はリボザイム)、レポータースイッチオフに関して細胞をスクリーニングする。
レポーターの発現を除去する分子、したがってBACE1は、アルツハイマーの治療の潜在的な治療/薬剤標的である。
アポトーシス応答を妨げる遺伝子
パーキンソン病
神経細胞において低酸素誘導アポトーシス
ラット神経細胞
神経細胞のアポトーシスは、パーキンソン病を含むいくつかの神経疾患の病因の重要な因子である。
神経アポトーシス応答は、そのような疾患状態を模倣するために用いることのできる刺激によってin vitroで誘導することができる。考えられる刺激には、低酸素、虚血、低酸素/虚血、グルタミン酸、カイニン酸、6−ヒドロキシドーパミン、スタウロスポリン、一酸素窒素、又はウォルトマニンがある。
遺伝子を最小CMVプロモーター及びHREの制御下で発現させる。
ラット神経細胞を、このレンチウイルスベクターライブラリーで形質導入する。
低酸素誘導アポトーシスで生存する細胞を、この形質導入ベクターによって発現したcDNAを増幅するように設計されたPCRをベースにしたアッセイで分析する。
遺伝子が単離、配列決定、及び同定されたら、ベクターゲノムを再構築し、低酸素誘導アポトーシス及び他の刺激によって誘導されるアポトーシスの両方を阻害する遺伝子の能力を試験するように2次スクリーニングを設計する。
対象となる遺伝子の作用様式を特徴づけ、治療又は他の分野でのその遺伝子の可能な用途を同定するために、さらなる研究を行う。
好酸球、及びTF−1などの好酸球細胞系は、in vitroでの生存に関して外因性IL−5に依存している。これらの細胞からのIL−5の除去は、急速な細胞死をもたらす。
好酸球細胞系AML14.3D10から単離されたcDNAを発現するライブラリー。この細胞系は、その生存に関して外因性IL−5に依存しない。
レンチウイルスcDNAライブラリーベクターを構築する(たとえば、好酸球細胞系AML14.3D10から単離されたcDNAを発現するライブラリー。この細胞系は、その生存に関して外因性IL−5に依存しない)
IL−5依存性好酸球又はTF−1細胞を、このライブラリーで形質導入し、外因性IL−5を除去する。
IL−5の不在下で生存できる細胞を単離する。
この形質導入ベクターによって発現したcDNAを、PCRによって増幅、クローニング、配列決定する。好酸球及びTF−1細胞からのIL−5の除去に伴う細胞死を阻害する遺伝子の能力を試験するように2次スクリーニングを設計する。対象となる遺伝子の作用様式を特徴づけ、治療(たとえば喘息)又は他の分野でのその遺伝子の可能な用途を同定するために、さらなる研究を行う。
構成的に活性なプロモーターの制御下で、種々のヒト免疫細胞型からcDNAを発現するcDNAライブラリーを調製する。
ヒトT細胞系を、GFP(LNGFR)などのNFAT依存性レポーター遺伝子で安定にトランスフェクトする。
これらの細胞を、構成的に活性なプロモーターの制御下で、種々のヒト免疫細胞型からcDNAを発現するレンチウイルスベクターcDNAライブラリーで形質導入する。
形質導入された細胞を、通常はGFPレポーター遺伝子の活性化をもたらす刺激に暴露する。
高レベルのGFPを発現する細胞を除去するために、細胞をFACSによって選別する。これらの細胞を、連続刺激下で増殖させ、さらなる一連のFACSによる低レベルGFP発現細胞富化に供する。
CMLは、幹細胞起源の造血系悪性疾患である。これは、特定の細胞遺伝学的損傷であるフィラデルフィア染色体転座に関連する。22番染色体上のBCR遺伝子内のゲノム配列が、9番染色体上のABLチロシンキナーゼ遺伝子のゲノム配列と並列している。これにより、ABLの第1のエキソンによってコードされた配列とBCR誘導配列との交換、及び調節されていないキナーゼ活性を有する210Kdキメラ融合タンパク質Bcr−Ablの発現が起こる。急性リンパ芽球性白血病(ALL)の一部では、別のBCR再配列部位を反映して、185kDaのキメラタンパク質産物が形成される。
1つのアプローチは、その転写がBcr−Ablによってアップレギュレートされる遺伝子を同定し、融合タンパク質の下流エフェクターを同定するために、それらのプロモーターを用いてレポーター発現を駆動することである。しかしながら、この方法の欠点は、チロシンキナーゼが多くの基質を有する可能性が高く、たとえばSTAT5を直接リン酸化し(Sillaber等、2000、Blood、2000年3月15日、95(6):2118〜25)、Bcr−Ablに活性化されるすべての経路を標的にするのは困難なことである。さらに、これらのシグナル伝達経路は正常細胞の機能に重要である可能性が高い。
1.BCRプロモーターの制御下、LNGFRレポーター遺伝子カセットを含むレンチウイルスベクターを構築
2.フィラデルフィア染色体陽性及び陰性細胞系において構築物を試験
3.レポーター構築物を含む安定な細胞系又はプールを確立
4.レンチウイルスリボザイムライブラリー(抗生物質耐性マーカーを含有)でレポーター細胞を形質導入
5.抗生物質選択により形質導入細胞を単離
6.MACビーズを用いて、LNGFR発現細胞を除去
7.再試験のために残存細胞からライブラリー構築物を単離
8.さらなる下流試験及び確認
発現をアップレギュレートするエレメントを同定するための別のアプローチは、cDNAライブラリーのスクリーニングを含む(Gateway(商標)適合ベクターのAPh+CMLライブラリーが利用可能である)。
PKD1遺伝子は、1:400から1:1000の発生頻度のもっとも一般的なヒト遺伝性疾患であり、成人の末期腎不全の症例のほぼ10%の原因である常染色体優性多発性嚢胞腎(ADPKD)の85%を占める(Dalgaard、1957、Acta Med Scand、1957、328:1〜255)。この疾患は一般に遅発性であり(30年から70年)、主として腎臓での液体の充満した嚢胞の形成を特徴とする。
図4は、提示されたポリシスチンシグナル伝達経路の2つの成分を示す。
1.A431細胞におけるPKD1の発現の確認(ノザン)
2.相同的組換えによる削除(2巡)
3.ノックアウト遺伝子発現対コントロールのアレイプロファイリング
4.その発現/抑制がPKD1を要する遺伝子のショートリスト
5.レポーター遺伝子発現を駆動する候補プロモーターを選択
6.プロモーター/レポーターカセットを用いて安定な細胞系を構築
7.レンチウイルスライブラリーによる形質導入
8.レポーター遮断/スイッチオンに関してスクリーニング
活性化T細胞の核因子(Nuclear Factor of Activated T−cells)(NFAT)は、最初にヒトT細胞において同定された転写因子のファミリーである。NFATは、5つのメンバーからなり(現在)、もっとも特徴的な4種(NFAT1〜4)は、偏在的に発現したCa2+依存性Ser/Thrタンパク質ホスファターゼ、カルシニューリン(CaN)によって調節される。NFATは、カルシウムイオノフォア(たとえばイオノマイシン)及びホルバルエステル(非特異的にPKCを活性化するPMA)で刺激することによってin vitroで活性化され得る。CaNは、免疫抑制薬剤、シクロスポリンA(CsA)の主要な標的である。CsAは、まずイムノフィリンリガンドシクロフィリンA(CypA)に結合し、次いでこの薬剤−イムノフィリン複合体がCaNホスファターゼに結合して、その活性を不活性化することによって作用する。CaNの阻害により、CsAはNFATのCaN媒介活性化を妨げ、したがってNFAT依存性遺伝子転写を妨げる。不活性NFATは、休止T細胞の細胞質においてリン酸化状態にあり、細胞内Ca2+の放出によってCaNが活性化されると、NFATはCaNによって脱リン酸化される。これが核局在化シグナル(NLS)の暴露をもたらし、NFATは核に移行する。ひとたび核に入ると、NFATは、転写補助活性化因子AP−1(PKC経路によって活性化)と共に作用して、そのプロモーター−エンハンサー調節ドメインにNFATエレメントを含有する遺伝子の転写を開始する。CsAは、数十億ドル規模の臓器移植市場において、現在の第1選択薬である。別の免疫抑制薬剤(FK506)は、イムノフィリンFKBP12への結合、CaNホスファターゼ活性の不活性化により、類似の方法で作用する。ラパマイシンは、他の機構によるにもかかわらず、同様にNFATを阻害する代替薬剤である。NFATの調節及び機能は、Rao等、Annu.Rev.Immunol.15、707〜747に概説されている。
ヒトT細胞系を、GFP(又はLNGFR)などのNFAT依存性レポーター遺伝子を含有するように操作する。これは、T細胞(Alo−T細胞、又はJurkatなどの細胞系)を形質導入することによって達成される。このレポーターは、いくつかの異なる形態を取ることができる。1つの可能性は、最小CMVプロモーター上流のNFATエンハンサーエレメントの3タンデムコピーを含有する人工NFATプロモーター−エンハンサー領域を用いて、レポーター遺伝子の発現を制御することである。第2の可能性は、既知のNFAT依存性遺伝子(CD4+T細胞のIL−2など)のプロモーターをクローニングすることである。しかしながら、いくつかの他の転写因子もIL−2転写制御をもたらすことが知られているので、これはほぼ確実により混乱した結果を生じる。さらなる可能性は、NFAT−NFATc2によってサイレンスされ、ヒトTヘルパー細胞においてインターロイキン−12(IL−12)受容体ベータ2近接プロモーターのサイレンサー活性を有することのできるプロモーターである。このレポーターは、既知のNFAT依存性遺伝子転写阻害剤(たとえばシクロスポリンAは、NFAT依存性遺伝子発現の有効な阻害剤である)又はASFVのA238Lを用いて検証される。
リボザイムの選択は、in vivo(組織培養)で行う。in vitroで「理論的に」構築され、試験されたリボザイムは、多くの場合、細胞環境でうまく機能しない。
レポーター細胞(標的ベクターを含有)をリボザイムライブラリーで形質導入する。
遺伝子Xの切断は、TetRをコードするmRNAの分解をもたらす。
Tetオペレーターは抑制が解除され、LNGFRが発現する。
細胞をα−LNGFRで標識し、適切にコンジュゲートされたMACSビーズと共にインキュベートし、MACSカラムを通す。このアプローチを図7に例示する。
一連のpONY8.4ベクターは、力価には有害な影響を与えずに、アクセサリータンパク質に完全に非依存性である一過性又は永続性ベクター系の一部として機能できるようにいくつかの修飾を有する。通常は適切な力価を得るために、レンチウイルスベクターゲノムは、プロデューサー細胞(一過性又は永続性)にウイルスタンパク質revの存在を必要とした。これには現在のHIVベクター系、並びに以前のEIAVベクターが含まれる。一連のpONY8.1ベクターゲノムと比較すると、4つの修飾が存在する。それらは、以下のとおりである。
a)gagから誘導され、パッケージングシグナルの一部を形成するATGモチーフはすべて、ATTGを読み取るように修飾されている。これによりLTRのプロモーターによって駆動され得るオープンリーディングフレームの挿入が可能になる。
b)ゲノムの長さ、すなわちR領域間の距離は、野生型ウイルスに見られる距離に近い(7.9kb)。
c)3’U3領域は、モロニー白血病ウイルス(MLV)U3領域由来の配列を含むように修飾されており、そのため形質導入されると、内部カセットに加えて第2のオープンリーディングフレーム(ORF)を駆動することができる。この実施例において、本出願人等はMLVを用いるが、任意のプロモーターであることができる。
d)このベクターは、ウイルスLTRに機能しうる形で連結されたヌクレオチド配列を含有し、前記ヌクレオチド配列は、内部プロモーターの上流であり、前記ヌクレオチド配列は、ポリペプチド又はそのフラグメントをコードする。
図11は、ハイブリッドU3領域の略図である。
図12は、ハイブリッドLTRの配列を示す。
PCRは以下のように行った。
産物A=プライマーKM001+KM003、標的としてpONY8.1Z
産物B=プライマーKM004+KM005、標的としてpHIT111
産物C=プライマーKM006+KM002、標的としてpONY8.1Z
EIAV/MLVハイブリッドU3
チロシンヒドロキシラーゼ(TH)は、ドーパミン合成に必要とされる酵素である。神経成長因子は、ラット交感神経節、副腎髄質、交感神経ニューロン、及びクロム親和細胞においてTHを誘導することが知られている。
方法
1.チロシンヒドロキシラーゼプロモーターを、緑色蛍光タンパク質(GFP)、低親和性成長因子受容体(LNGFR)、又はチミジンキナーゼ(TK)などの適切なレポーター遺伝子によってその活性がモニターされるように、クローニングする。
2.プロモーター−レポーターカセットを、通常はチロシンヒドロキシラーゼを発現してもしなくてもよい1次ニューロン又は1RB3AN27などのドーパミン作動性細胞系に導入する。
3.レポーター細胞をEIAVベクターの適切なライブラリー(cDNA又はリボザイムなど)で形質導入する。
4.任意選択で細胞を、GDNF又は他の増殖因子の存在下、増殖させる。
5.レポーター遺伝子発現が改変されている細胞を単離し、配列決定によってライブラリーベクターからモジュレート部分を単離する。
6.ライブラリー挿入物の配列から標的部分を同定する。
図19及び20)。このTetO2プロモーターを哺乳動物細胞での発現のためにコドン最適化した(図21)。GFPをレポーター遺伝子として用い、発現を測定した。pONY8.4TsynCoG1の発現レベル(図23)は、TetRに結合し、TetO2の抑制を解除するドキシサイクリン(dox)の不在下に比べて、その存在下で10倍高いことが示された。親プラスミドpONY8.4ZCG及びpONY8.4TCOG1によるGFP発現の比較は、dox不在下での抑制は、pONY8.4ZTsynCOG1でのみ得られることを示す。
図24は、発現はdox添加の24時間以内にほぼ最大であり、NLS標識コドン最適化TetRは非標識型に比べて低い基底発現を有さないことを示す。
Claims (22)
- ウイルス長末端反復(LTR)の下流で、かつプロモーターの上流に異種オープン・リーディング・フレーム(ORF)又はその一部を含み、前記プロモーターが、パーキンソン病の治療に有用な少なくとも1つの下流の対象となるヌクレオチド(NOI)の発現を制御し、補助遺伝子rev又はその機能的等価物をコードする核酸配列が、前記補助遺伝子が機能的補助タンパク質をコードできないように破壊されているか、又はベクターゲノム構築物から除去されており、且つトランスで供給されておらず、前記NOIが、チロシンヒドロキシラーゼ、GTP−シクロヒドロラーゼI、芳香族アミノ酸ドーパデカルボキシラーゼ、若しくは小胞モノアミントランスポーター2(VMAT2)の1又は2以上をコードする、マルチシストロン性レンチウイルスベクターゲノム構築物から作製されるパーキンソン病治療剤。
- 異種ORF又はその一部が、LTRに機能しうる形で連結している、請求項1に記載の治療剤。
- 異種ORF又はその一部が、レポーター部分又は選択可能マーカーである請求項1又は2に記載の治療剤。
- 異種ORF又はその一部が、モジュレーター遺伝子をコードする請求項1〜3のいずれかに記載の治療剤。
- ベクターゲノム構築物が、HIV−1、HIV−2、SIV、FIV、BIV、EIAV、CEV、CAEV、MVV、又はビスナレンチウイルスに由来する請求項1〜4のいずれかに記載の治療剤。
- ベクターゲノム構築物が、中央ポリプリントラクト(cPPT)配列を含む、請求項1〜5のいずれかに記載の治療剤。
- ベクターゲノム構築物が、転写後調節エレメント、又は翻訳エレメントを含む請求項1〜6のいずれかに記載の治療剤。
- 野生型レンチウイルスベクターゲノムのgagパッケージングシグナルのATGモチーフがATTGモチーフである、請求項1〜7のいずれかに記載の治療剤。
- ベクターゲノム構築物のR領域間の距離が、野生型レンチウイルスベクターにおける距離と実質的に同じである、請求項1〜8のいずれかに記載の治療剤。
- ベクターゲノム構築物の3’U3領域が、ウイルス及び/又は真核生物プロモーターの配列を含む、請求項1〜9のいずれかに記載の治療剤。
- ベクターゲノム構築物の3’U3領域が、野生型ウイルス及び/又は真核生物プロモーターを含む、請求項1〜10のいずれかに記載の治療剤。
- ウイルスプロモーターが、EIAV又はMLV U3領域である、請求項1〜11のいずれかに記載の治療剤。
- ウイルスプロモーターが、自己不活型LTRである、請求項1〜12のいずれかに記載の治療剤。
- ベクターゲノム構築物が、2、3又は4シストロン性である、請求項1〜13のいずれかに記載の治療剤。
- Gag及びPolタンパク質、Envタンパク質、又はそれらの機能的代替物を含むベクターの成分をコードする核酸配列のセットを含むレンチウイルスベクター生産システムから作製されるレンチウイルスベクター粒子を含み、
前記核酸配列のセットが、ベクターゲノム構築物を含み、
前記粒子が由来するレトロウイルスの補助遺伝子rev、又はその機能的等価物をコードする核酸配列が、前記補助遺伝子が機能的補助タンパク質をコードできないように破壊されているか、又はシステムから除去されている、
請求項1〜14のいずれかに記載の治療剤。 - 粒子が由来するレトロウイルスの補助遺伝子vpr、vif、tat、及びnef、又は類似補助遺伝子の少なくとも1つをコードする核酸配列も、前記補助遺伝子が機能的補助タンパク質をコードできないように破壊されているか、又はシステムから除去されている請求項15に記載の治療剤。
- 核酸配列のセットが、ベクターのRNAゲノム、Gag及びPolタンパク質、並びにEnvタンパク質、又はそれらの機能的代替物をコードする3つのDNA構築物を含む、請求項15又は16に記載の治療剤。
- RNAゲノム、Gag及びPolタンパク質、並びにEnvタンパク質、又はそれらの機能的代替物を含むレンチウイルス由来ベクター粒子を含む請求項1〜14のいずれかに記載の治療剤。
- 粒子が由来するレンチウイルスの補助遺伝子vpr、vif、tat、及びnef、又は類似補助遺伝子の少なくとも1つをコードする核酸配列も、前記補助遺伝子が機能的補助タンパク質をコードできないように破壊されているか、又はシステムから除去されている請求項18に記載の治療剤。
- 請求項15〜19のいずれかに記載の治療剤で形質導入された細胞。
- 薬学的に許容される担体又は希釈剤をさらに含む、請求項1〜19のいずれかに記載の治療剤、又は請求項20に記載の細胞。
- 請求項1〜19のいずれかに記載の治療剤、又は請求項20に記載の細胞を含む、パーキンソン病の治療に用いる送達システム。
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